Recherche:Les clusters de gènes tRNA et rRNA chez les procaryotes/Fiche/Ftableur

Fiche mémoire sur Ftableur

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Les clusters de gènes tRNA et rRNA chez les procaryotes/Fiche/Ftableur », n'a pu être restituée correctement ci-dessus.

fiche en préparation

Tanger le 2.11.19

Firmicutes

bacilli

bacilli blocs

Lien fiche: Bacilli blocs

lien;blocs;16s;total aas;avec;sans;total page;Bc001-25;;;;;Notes
;;;;;;;;'’’16s23s5s;'’’atcgca;'’’autres;'’’avant 16s;
bc001;16s23s5s;4;60;40;20;;'’’sans;19;4;;;'''avant
;16atcgca235-aac-acc;;;;;;'’’1-3;3;2;;3;3*cgt gga 16s23s5s atgf gac
;16atcgca235-22aas;;;;;;'’’4-8;3;;;;
;16s23s5s-12aas;;;;;;'’’9-23;13;2;;;'''1-3
;;;;;;;'’’24-43;;;;;2*16atcgca235-aac-acc
bc002;16s23s5s-tca;6;65;1;64;49;'’’total;38;8;0;3;2*16s23s5s-atgf-gac
;5*16s23s5s;;;;;;;;;;;16s23s5s-tca
;;;;;;;;;;;;
bc004;2*16s23s5s;6;56;28;28;;;;;;;'''autres incomplets
;16atcgca235-aac-acc;;;;;;;;;;;16s°atcgca235
;16s23s5s-atgf-gac;;;;;;;;;;;16s°23s5s-16 aas 
;2*16s23s5s-13,9 aas;;;;;;;;;;;16s°atcgca235
;;;;;;;;;;;;
bc008;2*16atcgca235;10;95;68;27;;;;;;;
;2*16s23s5s;;;;;;;;;;;
;5*16s23s5s-21,16,9,9,5 aas;;;;;;;;;;;
;cgt gga 16s23s5s atgf gac;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
bc014;4*16s23s5s;8;89;59;30;;;;;;;
;cgt-gga-16s23s5s-atgf-gac;;;;;;;;;;;
;2*16s23s5s-9,7 aas ;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-21 aas;;;;;;;;;;;
;16s°atcgca235;;;;;;;;;;;
;16s°23s5s-16 aas ;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
bc015;3*16s23s5s;9;89;52;37;;;;;;;
;16atcgca235;;;;;;;;;;;
;4*16s23s5s-21,16,9,7 aas  ;;;;;;;;;;;
;16s23s5s-atgf-gac;;;;;;;;;;;
;16s°atcgca235;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
bc025;2*16s23s5s;6;70;41;29;;;;;;;
;16atcgca235;;;;;;;;;;;
;cgt-gga-16s23s5s-atgf-gac;;;;;;;;;;;
;2*16s23s5s-21,16 aas;49;;;;;;;;;;
lien;blocs;16s;total aas;avec;sans;total page;Bc029-74;;;;;Notes
bc029;4*16s23s5s;11;112;98;14;;;'’’16s23s5s;'’’atcgca;'’’autres;'’’avant 16s;
;2*16atcgca235;;;;;;'’’sans;33;6;;1;'''avant
;4*16s23s5s-20,19,11,9 aas;;;;;;'’’1-3;5;;;3;3*33,12,11aas-16s23s5s-atgf-gac
;33aas-16s23s5s-atgf-gac;;;;;;'’’4-8;1;;;;13aas-16s23s5s
;;;;;;;'’’9-23;22;2;;;
bc034;5*16s23s5s;10;94;81;13;;'’’24-43;;;;;'''1-3
;16atcgca235-15aas;;;;;73;'’’total;61;8;0;4;3*16s23s5s-atgf-gac
;3*16s23s5s-22,20,9aas;;;;;;;;;;;2*16s23s5s-aac-acc
;11aas-16s23s5s-atgf-gac;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
bc063;16s23s5s;7;75;45;30;;;;;;;
;2*16atcgca235;;;;;;;;;;;
;16s23s5s-aac-acc;;;;;;;;;;;
;16s23s5s-atgf-gac;;;;;;;;;;;
;2*16s23s5s-21,16 aas;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
bc065;3*16s23s5s;8;80;50;30;;;;;;;
;16s23s5s-atgf-gac;;;;;;;;;;;
;16s23s5s-aac-acc;;;;;;;;;;;
;3*16s23s5s-21,16,9 aas;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
bc066;8*16s23s5s;13;95;68;27;;;;;;;
;4*16s23s5s-22,19,15,8 aas;;;;;;;;;;;
;12aas-16s23s5s-atgf-gac;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
bc067;7*16s23s5s;10;83;43;40;;;;;;;
;16atcgca235-9aas;;;;;;;;;;;
;2*16s23s5s-16,16aas;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
bc074;5*16s23s5s;14;118;94;24;;;;;;;
;16s23s5s-atgf-gac;;;;;;;;;;;
;2*16atcgca235;;;;;;;;;;;
;5*16s23s5s-22,20,15,9,9 aas;;;;;;;;;;;
;13aas-16s23s5s;73;;;;;;;;;;
lien;blocs;16s;total aas;avec;sans;total page;Bc090-244;;;;;Notes
bc090;7*16s23s5s;13;95;83;12;;;'’’16s23s5s;'’’atcgca;'’’autres;'’’avant 16s;
;16atcgca235;;;;;;'’’sans;35;13;;;'''avant
;4*16s23s5s-22,20,15,9 aas;;;;;;'’’1-3;1;;;6;5*(3*12),11,10aas-16s23s5s-atgf-gac
;11aas-16s23s5s-atgf-gac;;;;;;'’’4-8;3;1;;;cgt-gga-16s23s5s-atgf-gac
;;;;;;;'’’9-23;26;;;;
bc097;5*16s23s5s;13;107;93;14;;'’’24-43;;;;;'''1-3
;2*16atcgca235;;;;;85;'’’total;65;14;0;6;16s23s5s-gaa
;12aas-16s23s5s-atgf-gac;;;;;;;;;;;
;5*16s23s5s-22,20,15,9,9aas;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
bc125;16s23s5s;12;123;107;16;;;;;;;
;2*16atcgca235;;;;;;;;;;;
;suite3-16s23s5s;;;;;;;;;;;
;10aas-16s23s5s-atgf-gac;;;;;;;;;;;
;7*16s23s5s-21,16,14,12,10,9,9;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
bc147;3*16s23s5s   encadrés;9;86;60;26;;;;;;;
;2*16atcgca235;;;;;;;;;;;
;cgt-gga-16s23s5s-atgf-gac;;;;;;;;;;;
;3*16s23s5s-21, 16, 9, 6aas;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
bc158;5*16s23s5s;14;142;93;49;;;;;;;
;2*16atcgca235;;;;;;;;;;;
;suite2-16s23s5s;;;;;;;;;;;
;5*16s23s5s-22,20,15,9,9aas;;;;;;;;;;;
;12aas-16s23s5s-atgf-gac;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
bc165;10*16s23s5s;15;78;59;19;;;;;;;
;16s23s5s-gaa;;;;;;;;;;;
;3*16s23s5s-20,15,9;;;;;;;;;;;
;12aas-16s23s5s-atgf-gac;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
bc244;4*16atcgca235;9;98;26;72;;;;;;;
;16atcgca235-5aas;;;;;;;;;;;
;2*16s23s5s dont un encadré ici;;;;;;;;;;;
;2*16s23s5s-6, 5aas;85;;;;;;;;;;
lien;blocs;16s;total aas;avec;sans;total page;Bc328-656;;;;;Notes
bc328;2*16s23s5s dont un encadré ici;;67;50;17;;;'’’16s23s5s;'’’atcgca;'’’autres;'’’avant 16s;
;2*16s23s5s-21,9;6;;;;;'’’sans;18;2;1;2;'''avant
;16atcgca235-14aas;;;;;;'’’1-3;1;1;4;1;5s-8aas-16s-atc-235
;16atcgca235-aac-acc;;;;;;'’’4-8;1;1;2;;ctc-gga-16s23s5s
;;;;;;;'’’9-23;15;2;6;;11aas-16s23s5s-atgf-gac
bc384;5*16s23s5s;14;175;138;37;;'’’24-43;;1;;;
;9*16s23s5s-23  22  19  17  ;;;;;58;'’’total;35;7;13;3;'''1-3
;16  12  11  9  9 aas;;;;;;;;;;;16atcgca235-aac-acc
;;;;;;;;;;;;16s23s5s-aac-acc
bc393;7*16s23s5s;13;165;73;92;;;;;;;2*16-gca-235-aac
;16s-gca-235;;;;;;;;;;;2*16-gca-235-aac-cgt
;16s-5s-atcgca-23s-8aas;;;;;;;;;;;
;16s-5s-atcgca-23s-5s-11aas;;;;;;;;;;;'''autres
;3*16s23s5s-11, 17, 21 aas;;;;;;;;;;;16s-gca-235
;;;;;;;;;;;;16s-5s-atcgca-23s-8aas
bc413;16atcgca235;5;63;47;16;;;;;;;16s-5s-atcgca-23s-5s-11aas
;16atcgca-235-26aas;;;;;;;;;;;
;16s23s5s-6aas;;;;;;;;;;;2*16-gca-235-aac
;5s-8aas-16s-atc-235;;;;;;;;;;;5*16-gca-235-17,15,12,9,4 aas
;ctc-gga-16s23s5s;;;;;;;;;;;2*16-gca-235-aac-cgt
;23s°5s;;;;;;;;;;;3*16s-gca-235-17, 12, 7 aas
;;;;;;;;;;;;
bc499;2*16-gca-235-aac;7;80;66;14;;;;;;;'''5s en trop
;5*16-gca-235-17,15,12,9,4 aas;;;;;;;;;;;16s-5s-atcgca-23s-5s-11aas
;;;;;;;;;;;;23s°5s
bc655;2*16-gca-235-aac-cgt;5;59;45;14;;;;;;;5s-8aas-16s-atc-235
;3*16s-gca-235-17, 12, 7 aas;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
bc656;4*16s23s5s;8;56;30;26;;;;;;;
;16s23s5s-aac-acc;;;;;;;;;;;
;16atcgca235;;;;;;;;;;;
;11aas-16s23s5s-atgf-gac;;;;;;;;;;;
;16s23s5s-13aas;58;;;;;;;;;;
lien;blocs;16s;total aas;avec;sans;total page;Bc657-660;;;;;Notes
bc657;16s23s5s;5;62;36;26;;;'’’16s23s5s;'’’atcgca;'’’autres;'’’avant 16s;
;16s23s5s-aac;;;;;;'’’sans;7;1;;;'''avant
;2*16s-gca-235-25, 8aas ;;;;;;'’’1-3;2;1;;2;12aas-16s23s5s-atgf-gac
;16s23s5s-12aas;;;;;;'’’4-8;1;2;1;;gga-16atcgca235-gta
;;;;;;;'’’9-23;3;2;;;
bc658;16s-5s-23s;5;61;58;3;;'’’24-43;;;1;;'''1-3
;16s-5s-23s-atgf-ctc-ctg;;;;;23;'’’total;13;6;2;2;16s23s5s-aac
;2*16s-5s-atcgca-23s-9,5aas;;;;;;;;;;;16s-5s-23s-atgf-ctc-ctg
;16s-5s-23s-14aas;;;;;;;;;;;16atcgca235-aac-acc
;;;;;;;;;;;;
bc659;4*16s23s5s;7;54;32;22;;;;;;;'''autres
;16atcgca235-aac-acc;;;;;;;;;;;16s-5s-23s-14aas
;12aas-16s23s5s-atgf-gac;;;;;;;;;;;2*16s-5s-atcgca-23s-9,5aas
;16s23s5s-14aas;;;;;;;;;;;2*16s-gca-235-25, 8aas 
;;;;;;;;;;;;
bc660;16atcgca235;6;75;38;37;;;;;;;'''5s en trop
;16s23s5s;;;;;;;;;;;16atcgca235-4aas-5s-aac
;16s23s5s-6aas:gta-gac-tgg-cac-ttg-cca;;;;;;;;;;;
;2*16atcgca235-17aas, 4aas-5s-aac;;;;;;;;;;;
;gga-16atcgca235-gta;;;;;;;;;;;
;;23;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;aas;total aas;avec;sans;total pages;Total;;;;;
32;;;;;;;;'’’16s23s5s;'’’atcgca;'’’autres;'’’avant 16s;
;;;;;;;'’’sans;112;26;1;3;
;'’’Total;;2827;1902;925;;'’’1-3;12;4;4;15;
;'’’Moyenne;;88;59;29;;'’’4-8;9;4;3;0;
;'’’ecartype;;30;28;19;;'’’9-23;79;8;6;0;
;'’’max;;175;138;92;;'’’24-43;0;1;1;0;
;'’’min;;54;1;3;288;'’’total;212;43;15;18;

bacilli notes

Lien fiche: Bacilli notes

avant::1-3
33,5*12,3*11,10aas-16s23s5s-atgf-gac::4*16atcgca235-aac-acc
4*cgt-gga-16s23s5s-atgf-gac::2*16-gca-235-aac
13aas-16s23s5s::2*16-gca-235-aac-cgt
5s-8aas-16s-atc-235::
ctc-gga-16s23s5s::5*16s23s5s-atgf-gac
::3*16s23s5s-aac-acc
gga-16atcgca235-gta::16s23s5s-gaa
::16s23s5s-tca
autres::16s23s5s-aac
16s-gca-235::16s-5s-23s-atgf-ctc-ctg
2*16-gca-235-aac::
2*16-gca-235-aac-cgt::autres incomplets
9*16-gca-235-2*17,15,2*12,9,8,7,4 aas::16s°atcgca235
16s-gca-235-25aas::16s°23s5s-16 aas 
3*16s-5s-atcgca-23s-9,8,5aas::16s°atcgca235
16s-5s-atcgca-23s-5s-11aas::
16s-5s-23s-14aas::5s en trop
::16atcgca235-4aas-5s-aac
zéro cds::16s-5s-atcgca-23s-5s-11aas
::5s-8aas-16s-atc-235
incomplets::23s°5s

Bacilli typage

bacilli blocs 16s-y-23s5s-z

Lien tableur: bacilli blocs 16s-y-23s5s-z
Légende:

distribution des avant 16s en après;;;avant-16s23s5s-après;;;blocs;génomes;;distribution des avant 16s en avant comme si c’était des après longs.;;;;;;avant-16s23s5s-après
tableau blocs;;;;;;288;32;;tableau blocs;;;;;;
16-y-235-z;16s23s5s;atcgca;gca;atc;avant 16s;16s5s-*;;;16-y-235-z;16s23s5s;atcgca;gca;atc;avant 16s;16s5s-*
'''sans;112;26;1;;3;;;;'''sans;112;26;1;;3;
'''1-3;12;4;4;;15;;;;'''1-3;12;4;4;;15;
'''4-8;9;4;3;;;;;;'''4-8;9;4;3;;;
'''9-23;79;8;6;;;;;;'''9-23;79;8;6;;;
'''24-43;0;1;1;;;;;;'''24-43;0;1;1;;;
'''total;212;43;15;0;18;;;;'''total;212;43;15;0;18;
;;;;;;;;;;;;;;;
avant 16s z;Long=avant;;;;;;;;avant 16s, x;Long=après;;;;;
x-16-y-235-z;16s23s5s;atcgca;gca;atc;total;16s5s-*;;;x-16-y-235-z;16s23s5s;atcgca;gca;atc;total;16s5s-*
'''sans;2;;;1;3;;;;'''sans;;;;;;
'''1-3;14;1;;;15;;;;'''1-3;5;1;;;6;
'''4-8;;;;;;;;;'''4-8;;;;1;1;
'''9-23;;;;;;;;;'''9-23;10;;;;10;
'''24-43;;;;;;;;;'''24-43;1;;;;;
'''total;16;1;0;1;18;;;;'''total;16;1;0;1;18;
;;;;;;;;;;;;;;;
cumuls;;;;;;;;;cumuls;;;;;;
16-y-235-z;16s23s5s;atcgca;gca;atc;16235-z;16s5s-*;;;16-y-235-z;16s23s5s;atcgca;gca;atc;16235-z;16s5s-*
'''sans;114;26;1;1;142;;;;'''sans;112;26;1;;139;
'''1-3;26;5;4;;35;*1;;;'''1-3;17;5;4;;26;*1
'''4-8;9;4;3;;16;*2;;;'''4-8;9;4;3;;16;*2
'''9-23;79;8;6;;93;*3;;;'''9-23;89;8;6;1;104;*3
'''24-43;0;1;1;;2;;;;'''24-43;1;1;1;;3;
'''16-y-235;228;44;15;1;288;;;;'''16-y-235;228;44;15;1;288;
16s5s-*-23s;*2;*4;;;;;;;16s5s-*-23s;*2;*4;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;
Bacilli %;;;;;;;;;Bacilli %;;;;;;
16-y-235-z;16s23s5s;atcgca;gca;atc;16235-z;16s5s-*;;;16-y-235-z;16s23s5s;atcgca;gca;atc;16235-z;16s5s-*
'''sans;'''40;9;0,3;0,3;'''49;;;;'''sans;'''39;'''9;0,3;;'''48;
'''1-3;'''9;1,7;1,4;0;'''12;*1;;;'''1-3;'''5,9;1,7;1,4;;'''9;*1
'''4-8;3,1;1,4;1;0;'''5,6;*2;;;'''4-8;3,1;1,4;1;;'''5,6;*2
'''9-23;'''27;2,8;2,1;0;'''32;*3;;;'''9-23;'''31;2,8;2,1;0,3;'''36;*3
'''24-43;0;0,3;0,3;0;0,7;;;;'''24-43;0,3;0,3;0,3;;1;
'''16-y-235;'''79;'''15;'''5,2;0,3;100;;;;'''16-y-235;'''79;'''15;'''5,2;0,3;100;
16s5s-*-23s;*2;*4;;;;;;;16s5s-*-23s;*2;*4;;;;

bacilli blocs intégrés

Lien fiche: bacilli blocs intégrés

avant inversé;Total intégré;;;;;;
16s23s5s;;16s23s5s;atcgca;gca;autres;atc;total
0;sans;112;26;1;*0;;139
1;1-3;13;5;4;*0;;22
4;4-8;13;4;3;*2;1;21
10;9-23;89;8;6;*3;;103
1;24-43;1;1;1;*0;;3
16;total;228;44;15;*5;1;288
0;Dont 16s5s-*-23s;1;4;0;*5;;5

bacilli blocs 1-3

Lien fiche: bacilli blocs 1-3

bacilli 1-3;;;;
type;effectif;tRNA;effectif;%
1-3 après;;atgf;20;31
aac-acc;7;gac;19;29
atgf-gac;5;aac;12;18
aac;3;acc;7;11
aac-cgt;2;cgt;2;
atgf-ctc-ctg;1;ctc;1;
gaa;1;ctg;1;
tca;1;gaa;1;
1-3 avant/ap;;tca;1;
atgf-gac;14;gta;1;
gta;1;;;
total;35;total;65;89

bacilli blocs 4-8

Lien fiche: bacilli blocs 4-8
Tableau

Bacilli 4-8;;effectifs;;;;;
tot;;93;;atgf;0;5s;1
ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;2;tcc;1;tac;4;tgc;
atc;2;acc;5;aac;10;agc;1
ctc;;ccc;;cac;;cgt;7
gtc;;gcc;;gac;5;ggc;7
tta;1;tca;;taa;;tga;
atgi;;aca;4;aaa;5;aga;
cta;2;cca;6;caa;2;cga;
gta;11;gca;4;gaa;6;gga;1
ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;5;acg;1;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;

Liste

bc499;bc008;bc244;bc244;bc658;bc660;bc147;bc244;bc413;bc014;bc015;bc655;bc066;bc393;bc657
4;5;5;5;5;5;6;6;6;7;7;7;8;8;8
16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s
gca;23s;atc;23s;5s;other;23s;23s;23s;23s;23s;gca;23s;5s;gca
23s;5s;gca;5s;atc;gca;5s;5s;5s;5s;5s;23s;5s;atc;23s
5s;;23s;;gca;23s;;;;;;5s;;gca;5s
;;5s;;23s;5s;;;;;;;;23s;
gta;aac;aac;ggc;atgj;aac;aac;aac;aac;aac;aac;gta;aac;agc;gta
gga;acc;tcc;cgt;gta;acg;acc;cca;gaa;acc;acc;gac;acc;atgj;aaa
atc;ggc;atgj;gta;gac;gta;ggc;ggc;gta;ggc;ggc;aaa;gaa;gta;cta
gaa;cgt;gaa;gaa;ttc;aca;cgt;cgt;tac;cgt;cgt;cta;gta;aca;aca
;cca;gta;gac;tac;5s;cca;gta;caa;cca;cca;aca;tac;gac;ggc
;;;;;aac;gca;gac;aaa;gca;gca;atc;caa;ttc;tta
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;;;;;;23s;;;;;;gca;aaa;cca
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bacilli blocs 9-23

Lien fiche: bacilli blocs 9-23
Tableau. Voir plus bas les 97 blocs et les 45 blocs sans doubles.

tot;45 blocs #;;;atgf;atgi;5s;cds;;tot;97 blocs ;;;atgf;atgi;5s;cds
709;;;;34;7;;;;1471;;;;66;20;;
ttt;;tct;;tat;;tgt;;;ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;27;tcc;14;tac;27;tgc;15;;ttc;60;tcc;29;tac;52;tgc;30
atc;24;acc;9;aac;28;agc;13;;atc;42;acc;15;aac;65;agc;26
ctc;4;ccc;;cac;24;cgt;30;;ctc;4;ccc;;cac;53;cgt;60
gtc;3;gcc;1;gac;37;ggc;41;;gtc;3;gcc;1;gac;69;ggc;91
tta;19;tca;24;taa;;tga;;;tta;55;tca;46;taa;;tga;
ata;;aca;33;aaa;32;aga;1;;ata; ;aca;81;aaa;67;aga;1
cta;20;cca;28;caa;29;cga;;;cta;46;cca;58;caa;55;cga;
gta;39;gca;22;gaa;38;gga;23;;gta;91;gca;57;gaa;75;gga;37
ttg;16;tcg;2;tag;;tgg;21;;ttg;32;tcg;2;tag;;tgg;41
atgj;14;acg;2;aag;;agg;;;atgj;27;acg;2;aag;;agg;
ctg;7;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;11;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;1
;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;
tot;45 blocs #;;;atgf;atgi;5s;cds;;tot;97 blocs ;;;atgf;atgi;5s;cds
1000;;;;48;10;;;;1000;;;;45;14;;
ttt;;tct;;tat;;tgt;;;ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;38;tcc;20;tac;38;tgc;21;;ttc;41;tcc;20;tac;35;tgc;20
atc;34;acc;13;aac;39;agc;18;;atc;29;acc;10;aac;44;agc;18
ctc;6;ccc;;cac;34;cgt;42;;ctc;3;ccc;;cac;36;cgt;41
gtc;4;gcc;1;gac;52;ggc;58;;gtc;2;gcc;1;gac;47;ggc;62
tta;27;tca;34;taa;;tga;;;tta;37;tca;31;taa;;tga;
ata;;aca;47;aaa;45;aga;1;;ata;;aca;55;aaa;46;aga;1
cta;28;cca;39;caa;41;cga;;;cta;31;cca;39;caa;37;cga;
gta;55;gca;31;gaa;54;gga;32;;gta;62;gca;39;gaa;51;gga;25
ttg;23;tcg;3;tag;;tgg;30;;ttg;22;tcg;1;tag;;tgg;28
atgj;20;acg;3;aag;;agg;;;atgj;18;acg;1;aag;;agg;
ctg;10;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;7;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;1
;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;
tot;45 blocs #;;;atgf;atgi;5s;cds;;;;;;;;;
1000;;;;3;;;;;;;;;;;;
ttt;;tct;;tat;;tgt;;;;;;;;;;
att;;act;;aat;;agt;;;;;;;;;;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;;;;;;;;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;;;;;;;;
ttc;-3;tcc;0;tac;3;tgc;1;;;;;;;;;
atc;5;acc;2;aac;-5;agc;1;;;;;;;;;
ctc;3;ccc;;cac;-2;cgt;2;;;;;;;;;
gtc;2;gcc;1;gac;5;ggc;-4;;;;;;;;;
tta;-11;tca;3;taa;;tga;;;;;;;;;;
ata;;aca;-9;aaa;0;aga;1;;;;;;;;;
cta;-3;cca;0;caa;4;cga;;;;;;;;;;
gta;-7;gca;-8;gaa;3;gga;7;;;;;;;;;
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;2;;;;;;;;;
atgj;1;acg;1;aag;;agg;;;;;;;;;;
ctg;2;ccg;;cag;;cgg;;;;;;;;;;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;1;;;;;;;;;

97 blocs, sont inclus 1 bloc 25 et 1 bloc 26.

bc004;bc008;bc008;bc014;bc015;bc029;bc034;bc065;bc067;bc074;bc074;bc090;bc097;bc097;bc125;bc125;bc147;bc158;bc158;bc165;bc328;bc384;bc384;bc499;bc658;bc125;bc029;bc384;bc393;bc393;bc001;bc125;bc384;bc499;bc655;bc657;bc004;bc656;bc125;bc328;bc658;bc659;bc034;bc066;bc074;bc090;bc097;bc158;bc165;bc499;bc008;bc014;bc015;bc025;bc063;bc065;bc067;bc067;bc125;bc147;bc384;bc384;bc393;bc499;bc655;bc660;bc029;bc066;bc384;bc029;bc034;bc074;bc090;bc097;bc158;bc165;bc008;bc014;bc015;bc025;bc063;bc065;bc125;bc147;bc328;bc393;bc001;bc034;bc066;bc074;bc090;bc097;bc158;bc384;bc384;bc657;bc413
9;9;9;9;9;9;9;9;9;9;9;9;9;9;9;9;9;9;9;9;9;9;9;9;9;10;11;11;11;11;12;12;12;12;12;12;13;13;14;14;14;14;15;15;15;15;15;15;15;15;16;16;16;16;16;16;16;16;16;16;16;17;17;17;17;17;19;19;19;20;20;20;20;20;20;20;21;21;21;21;21;21;21;21;21;21;22;22;22;22;22;22;22;22;23;25;26
16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s°;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s
23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;atc;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;gca;5s;23s;23s;23s;23s;5s;23s;23s;23s;gca;gca;23s;23s;23s;23s;atc;5s;23s;atc;23s;23s;23s;23s;23s;23s;gca;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;gca;gca;atc;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;atc;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;atc;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;gca;atc
5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;gca;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;23s;atc;5s;5s;5s;5s;atc;5s;5s;5s;23s;23s;5s;5s;5s;5s;gca;23s;5s;gca;5s;5s;5s;5s;5s;5s;23s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;23s;23s;gca;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;gca;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;gca;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;23s;gca
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;;;;;;;;5s;;;;;;;;;;;;;;;;23s;;;;;23s;;;;;;;;;;5s;;;5s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;5s;;;;;;;;;;;;5s;;;;;;;;;5s;;;;;;;;;;5s
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;5s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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cgt;cgt;cgt;cgt;cgt;aaa;aaa;cgt;cgt;aaa;cgt;aaa;aaa;cgt;cgt;cgt;cgt;aaa;cgt;aaa;cgt;cgt;aca;tta;ggc;caa;cac;aaa;aaa;cta;tac;atgj;aaa;ttc;ttc;tac;tac;ttc;ttc;ttc;aca;ttc;ttc;ttc;ttc;ttc;ttc;ttc;ttc;gaa;ttc;ttc;ttc;ttc;ttc;ttc;ttc;cac;cca;ttc;acg;ttc;gac;tta;tta;atgj;cgt;cgt;aac;cgt;tta;tta;tta;tta;tta;tta;cgt;cgt;cgt;cgt;cgt;cgt;cgt;cgt;cgt;gta;cgt;cgt;cgt;cgt;cgt;cgt;cgt;gac;gta;cgt;cgt
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45 blocs, sont inclus les blocs 25 et 26. Les doubles sont mis en bas dans la 2ème partie.

bc004;;;;;bc029;;;;;;;;;;;;;;;;bc384;bc384;bc499;bc658;bc125;bc029;bc384;bc393;bc393;bc001;bc125;bc384;bc499;;;bc004;bc656;;;bc658;bc659;bc034;;;;;;;bc499;bc008;;;;;bc065;;bc067;bc125;;bc384;bc384;bc393;bc499;;bc660;bc029;;bc384;bc029;bc034;;bc090;bc097;;;;;;;;;;bc147;bc328;bc393;bc001;bc034;;;;;;bc384;bc384;bc657;bc413;52
9;;;;;9;;;;;;;;;;;;;;;;9;9;9;9;10;11;11;11;11;12;12;12;12;;;13;13;;;14;14;15;;;;;;;15;16;;;;;16;;16;16;;16;17;17;17;;17;19;;19;20;20;;20;20;;;;;;;;;;21;21;21;22;22;;;;;;22;23;25;26;709
16s;;;;;16s;;;;;;;;;;;;;;;;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;;;16s;16s;;;16s;16s;16s;;;;;;;16s;16s;;;;;16s;;16s;16s;;16s;16s;16s;16s;;16s;16s;;16s;16s;16s;;16s;16s;;;;;;;;;;16s;16s;16s;16s;16s;;;;;;16s;16s;16s;16s;
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;9;9;9;9;9;9;9;9;9;9;9;9;9;;9;9;9;9;9;9;;;;;;;;;;;;;;12;12;;;14;14;;;;15;15;15;15;15;15;;;16;16;16;16;16;16;;;;;;;;17;;;19;;;;20;;;20;20;21;21;21;21;21;21;21;;;;;;22;22;22;22;22;;;;;
;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;;16s;16s;16s;16s;16s;16s;;;;;;;;;;;;;;16s;16s;;;16s;16s;;;;16s;16s;16s;16s;16s;16s;;;16s°;16s;16s;16s;16s;16s;;;;;;;;16s;;;16s;;;;16s;;;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;;;;;;16s;16s;16s;16s;16s;;;;;
;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;;23s;23s;23s;23s;23s;23s;;;;;;;;;;;;;;gca;23s;;;23s;atc;;;;23s;23s;23s;23s;23s;23s;;;23s;23s;23s;23s;23s;23s;;;;;;;;gca;;;23s;;;;23s;;;23s;23s;23s;atc;23s;23s;23s;23s;23s;;;;;;23s;23s;23s;23s;23s;;;;;
;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;;5s;5s;5s;5s;5s;5s;;;;;;;;;;;;;;23s;5s;;;5s;gca;;;;5s;5s;5s;5s;5s;5s;;;5s;5s;5s;5s;5s;5s;;;;;;;;23s;;;5s;;;;5s;;;5s;5s;5s;gca;5s;5s;5s;5s;5s;;;;;;5s;5s;5s;5s;5s;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;5s;;;;;23s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;5s;;;;;;;;;;;;;23s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;5s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;5s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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;cca;cca;cca;cca;cca;cca;cca;cca;cca;cca;cca;cca;cca;;ggc;ggc;ggc;ggc;ggc;ggc;;;;;;;;;;;;;;tac;tgg;;;tac;tac;;;;aca;aca;aca;aca;aca;aca;;;aca;aca;aca;aca;aca;aca;;;;;;;;cgt;;;cca;;;;cgt;;;cgt;cgt;cca;cca;cca;cca;cca;cca;cca;;;;;;cca;cca;cca;cca;cca;;;;;
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;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;ttg;ttg;;;ggc;ggc;;;;caa;caa;caa;caa;caa;caa;;;caa;caa;caa;caa;caa;caa;;;;;;;;tca;;;atgf;;;;tca;;;tca;tca;tca;tca;tca;tca;tca;tca;tca;;;;;;tca;tca;tca;tca;tca;;;;;
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;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;ttg;ttg;ttg;ttg;ttg;ttg;;;tta;tta;tta;tta;tta;tta;;;;;;;;gga;;;aca;;;;ttc;;;ttc;ttc;ttc;ttc;ttc;ttc;ttc;ttc;ttc;;;;;;ttc;ttc;ttc;ttc;ttc;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;ttg;ttg;ttg;ttg;ttg;ttg;;;;;;;;atc;;;tgg;;;;aca;;;aca;aca;cac;cac;cac;cac;cac;cac;cac;;;;;;aca;aca;aca;aca;aca;;;;;
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;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;aac;;;;atc;;;atc;atc;atc;atc;atc;atc;atc;atc;atc;;;;;;gga;gga;gga;gga;gga;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;gaa;;;;aac;;;aac;aac;aac;aac;aac;aac;aac;aac;aac;;;;;;atc;atc;atc;atc;atc;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;gaa;;;gaa;gaa;agc;agc;agc;agc;agc;agc;agc;;;;;;aac;aac;aac;aac;aac;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;gaa;gaa;gaa;gaa;gaa;gaa;gaa;;;;;;agc;agc;agc;agc;agc;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;gaa;gaa;gaa;gaa;gaa;;;;;

bacilli blocs avant

Lien fiche: bacilli blocs avant
tableau

effectifs;xbacilli;;;;;;;;effectifs;xbacilli;sans doubons;;;;;;;x clostridia;cd118
tot;x longs;bacilli;;atgf;atgi;5s;cds;;tot;x longs;bacilli;;atgf;atgi;5s;cds;;;17
158;;;;5;;1;;;123;;;;3;;1;;;;tgc
ttt;;tct;;tat;;tgt;;;ttt;;tct;;tat;;tgt;;;;gtc
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;;gaa
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;;tac
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;;caa
ttc;1;tcc;;tac;;tgc;;;ttc;1;tcc;;tac;;tgc;;;;aaa
atc;3;acc;;aac;12;agc;11;;atc;3;acc;;aac;9;agc;8;;;atgj
ctc;10;ccc;;cac;;cgt;13;;ctc;7;ccc;;cac;;cgt;10;;;aac
gtc;;gcc;;gac;13;ggc;3;;gtc;;gcc;;gac;10;ggc;3;;;atgf
tta;3;tca;2;taa;;tga;;;tta;3;tca;2;taa;;tga;;;;agc
ata;;aca;2;aaa;12;aga;;;ata;;aca;2;aaa;9;aga;;;;ctg
cta;6;cca;13;caa;12;cga;;;cta;6;cca;10;caa;9;cga;;;;ggc
gta;10;gca;2;gaa;12;gga;11;;gta;7;gca;2;gaa;9;gga;8;;;cgt
ttg;;tcg;;tag;;tgg;1;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;1;;;ccc
atgj;;acg;;aag;;agg;;;atgj;;acg;;aag;;agg;;;;atc
ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;;ggc
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;;16s
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;5s
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;gca
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;23s
;;;;;;;;; 
x-16s longs 123;bacilli;différences significatives avec z9-23;;;;;
atgi;-1_0_3.4;cds;;5s;°1_0_10.5;atgf;1.2_3_10.6
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;0.4_1_8.9;tcc;-0.7_0_5.5;tac;°0.4_0_8.9;tgc;-0.6_0_5.8
atc;0.2_3_8.2;acc;-0.9_0_4;aac;0.5_9_9.2;agc;°-0.7_8_5.2
ctc;°-1_7_2.4;ccc;;cac;°0.2_0_8;cgt;°0.7_10_9.7
gtc;-1_0_2;gcc;-0.7_0_1;gac;1.5_10_11.4;ggc;1.9_3_12.3
tta;-0.3_3_6.9;tca;0.2_2_8.2;taa;;tga;
ata;;aca;1.1_2_10.4;aaa;0.9_9_10.2;aga;-0.7_0_1
cta;-0.2_6_7.1;cca;°0.5_10_9.2;caa;0.6_9_9.4;cga;
gta;1.7_7_11.8;gca;0_2_7.7;gaa;1.6_9_11.6;gga;°0.1_8_7.9
ttg;-1_0_6;tcg;-0.8_0_2;tag;;tgg;-0.1_1_7.4
atgj;-0.7_0_5.5;acg;-0.8_0_1.5;aag;;agg;
ctg;-1_0_3.4;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;-0.7_0_1

Liste

bc147;bc008;bc413;bc125;bc034;bc074;bc090;bc656;bc066;bc097;bc158;bc165;bc659;bc029
4;4;9;12;13;13;13;13;14;14;14;14;14;35
;;5s;aac;aac;aac;aac;aac;aac;aac;aac;aac;aac;aac
;;gta;agc;agc;agc;agc;agc;agc;agc;agc;agc;agc;agc
;;aca;gaa;gaa;gaa;gaa;gaa;gaa;gaa;gaa;gaa;gaa;gaa
;;aaa;;gta;gta;gta;;gta;gta;gta;gta;;gta
;;ggc;;gac;atgf;gac;gac;atgf;gac;atgf;atgf;gac;gac
;;tta;gac;caa;gac;caa;caa;gac;caa;gac;gac;caa;caa
;;cgt;caa;aaa;caa;aaa;aaa;caa;aaa;caa;caa;aaa;aaa
cgt;cgt;cca;cta;;aaa;;;aaa;cta;aaa;aaa;cta;cta
gga;gga;gca;ctc;ctc;cta;ctc;ctc;ctc;ctc;ctc;ctc;ctc;ggc
16s;16s;16s;cgt;cgt;ctc;cgt;cgt;cgt;cgt;cgt;cgt;cgt;tta
23s;23s;atc;cca;cca;cgt;cca;cca;cca;cca;cca;cca;cca;cgt
5s;5s;23s;gga;gga;cca;gga;gga;gga;gga;gga;gga;gga;cca
atgf;atgf;5s;;;gga;;atc;;;;;atc;gca
gac;gac;;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;tca
;;;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;23s;tca
;;;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;5s;atgf
;;;atgf;atgf;;atgf;atgf;atgf;atgf;atgf;atgf;atgf;gac
;;;gac;gac;;gac;gac;gac;gac;gac;gac;gac;ttc
;;;;;;;;;;;;;aca
;;;;;;;;;;;;;tgg
;;;;;;;;;;;;;atc
;;;;;;;;;;;;;aac
;;;;;;;;;;;;;gaa
;;;;;;;;;;;;;gta
;;;;;;;;;;;;;gac
;;;;;;;;;;;;;caa
;;;;;;;;;;;;;aaa
;;;;;;;;;;;;;cta
;;;;;;;;;;;;;ggc
;;;;;;;;;;;;;tta
;;;;;;;;;;;;;cgt
;;;;;;;;;;;;;cca
;;;;;;;;;;;;;gga
;;;;;;;;;;;;;16s
;;;;;;;;;;;;;23s
;;;;;;;;;;;;;5s
;;;;;;;;;;;;;atgf
;;;;;;;;;;;;;gac

bacilli total blocs longs

Lien fiche: bacilli total blocs longs

bacilli total blocs longs;;effectifs;;;;;;;bacilli total blocs longs;;Pour 1000;;;;;
tot;;1720;;atgf;;71;;;tot;;1000;;atgf;;41;
ttt;;tct;;tat;;tgt;;;ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;63;tcc;30;tac;56;tgc;30;;ttc;37;tcc;17;tac;33;tgc;17
atc;47;acc;20;aac;87;agc;38;;atc;27;acc;12;aac;51;agc;22
ctc;14;ccc;0;cac;53;cgt;80;;ctc;8;ccc;0;cac;31;cgt;46
gtc;3;gcc;1;gac;87;ggc;101;;gtc;2;gcc;1;gac;51;ggc;59
tta;59;tca;48;taa;0;tga;0;;tta;34;tca;28;taa;0;tga;0
atgi;20;aca;87;aaa;84;aga;1;;atgi;12;aca;51;aaa;49;aga;1
cta;54;cca;77;caa;69;cga;0;;cta;31;cca;45;caa;40;cga;0
gta;112;gca;63;gaa;93;gga;49;;gta;65;gca;37;gaa;54;gga;28
ttg;32;tcg;2;tag;0;tgg;42;;ttg;19;tcg;1;tag;0;tgg;24
atgj;32;acg;3;aag;0;agg;0;;atgj;19;acg;2;aag;0;agg;0
ctg;11;ccg;0;cag;0;cgg;0;;ctg;6;ccg;0;cag;0;cgg;0
gtg;0;gcg;0;gag;0;ggg;1;;gtg;0;gcg;0;gag;0;ggg;1

clostridia

clostridia blocs

Lien fiche: clostridia blocs

28.11.19 Tanger;;Ftableur;;;;;;;;;;;;;
clostridia;blocs;;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;16s;total aas;avec;sans;total page;Cd001-32;;;;;;;;Notes 1
cd001;3*16s23s5s;5;62;21;41;;;'’’16s23s5s;'’’atcgca;'’’gcaatc;'’’gca;'’’atc;'’’autres;'’’avant 16s;
;16s-gcaatc-235-6aas;;;;;;'’’sans;15;1;2;2;2;;;'’’avant
;5aas-16s-gcaatc-235-6aas;;;;;;'’’1-3;7;;1;1;;;;5aas-16s-gcaatc-235-6aas
;5s;;;;;;'’’4-8;1;1;1;;;;3;'’’agc-16s5s23s-6aas
;;;;;;;'’’9-23;5;;;2;;;;'’’tca-tcc-16s5s23s-5aas
cd002;16atcgca235;5;67;34;33;;'’’24-43;;;;;;;;
;16atcgca235-6aas;;;;;44;'’’total;28;2;4;5;2;0;3;'’’autres
;3*16s23s5s-12,9,4 aas;;;;;;;;;;;;;;'’’16s5s-atc-23s
;;;;;;;;;;;;;;;'’’16s5s-gca-23-aac-gaa-tgc
cd003;3*16s23s5s;10;110;83;27;;;;;;;;;;'’’16s5s23s-gac-aca
;16-gca-2355;;;;;;;;;;;;;;'’’16s5s23s
;16-atc-235;;;;;;;;;;;;;;incomplet
;3*16s23s5s-22,13,9aas;;;;;;;;;;;;;;16s-atc-23s-aac
;2*16-gca-235-22,13aas;;;;;;;;;;;;;;'’’1-3
;;;;;;;;;;;;;;;16s-gcaatc-23s5s-ttc-tgc
cd011;'’’16s5s23s;6;51;21;30;;;;;;;;;;'’’16s5s-gca-23-aac-gaa-tgc
;'’’16s5s23s-gac-aca;;;;;;;;;;;;;;16235-aaa-cds-5s-aaa
;'’’16s5s-atc-23s;;;;;;;;;;;;;;'’’16s5s23s-gac-aca
;'’’agc-16s5s23s-6aas;;;;;;;;;;;;;;2*16s23s5s-atgi-gca
;'’’tca-tcc-16s5s23s-5aas;;;;;;;;;;;;;;16s23s5s-ttc-gac-gaa
;'’’16s5s-gca-23-aac-gaa-tgc;;;;;;;;;;;;;;2*16s23s-aac-5s
;;;;;;;;;;;;;;;
cd013;16s23s5s;3;52;4;48;;;;;;;;;;'’’différents
;2*16-gca-atc-235;;;;;;;;;;;;;;2*16s23s-aac-5s
;;;;;;;;;;;;;;;16235-aaa-cds-5s-aaa
cd032;'’’NCBI # gtRNAdb;;93;18;75;;;;;;;;;;
;7*16s23s5s;16;;;;;;;;;;;;;'’’cds
;2*16s23s5s-atgi-gca;;;;;;;;;;;;;;16235-aaa-cds-5s-aaa
;16s23s5s-ttc-gac-gaa;;;;;;;;;;;;;;
;2*16s23s-aac-5s;;;;;;;;;;;;;;'’’5s en trop
;16s-atc-23s-aac;;;;;;;;;;;;;;16235-aaa-cds-5s-aaa
;16s-gca-23s5s;;;;;;;;;;;;;;16-gca-2355
;16235-aaa-cds-5s-aaa;;;;;;;;;;;;;;5s-ttc
;16s-gcaatc-23s5s-ttc-tgc;;;;;;;;;;;;;;5s
;5s-ttc;45;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;16s;total aas;avec;sans;total page;Cd045-59;;;;;;;;Notes 2
cd045;3*16s23s5s;10;87;22;65;;;'’’16s23s5s;'’’atcgca;'’’gcaatc;'’’gca;'’’atc;'’’autres;'’’avant 16s;
;16s23s5s-atgi-gca;;;;;;'’’sans;8;;;4;2;;1;'’’avant
;16s23s5s-aaa;;;;;;'’’1-3;15;;1;2;1;;1;gca-atc-gga-16s23s5s
;16s23s-aac-5s-aac;;;;;;'’’4-8;;;1;;;;;5s-atgi-gca-16-gca-atc-235-aac-aac
;16s23s5s-ttc-5s-ttc-aaa;;;;;;'’’9-23;;;;;;;;
;16s-gca-atc-235-6aas;;;;;;'’’24-43;;;;;;;;'’’1-3
;gca-atc-gga-16s23s5s;;;;;36;'’’total;23;0;2;6;3;0;2;3*16s23s5s-aaa
;16s-gca-atc-23s-aac;;;;;;;;;;;;;;3*16s23s5s-aac
;;;;;;;;;;;;;;;2*16s23s5s-ttc
cd047;16s23s5s;5;53;6;47;;;;;;;;;;16s23s5s-ggc
;16s23s5s-aac;;;;;;;;;;;;;;16s23s5s-ttc-tgc
;16s23s5s-ttc;;;;;;;;;;;;;;16s23s5s-aac-aac
;16s23s5s-aac-aac;;;;;;;;;;;;;;2*16s23s5s-atgi-gca
;16s5s-atgi-gca;;;;;;;;;;;;;;16s23s-aac-5s-aac
;;;;;;;;;;;;;;;16s23s5s-ttc-5s-ttc-aaa
cd055;3*16-gca-235;8;65;9;56;;;;;;;;;;2*16-gca-235-aac
;16-gca-235-aac;;;;;;;;;;;;;;16-atc-235-tgg
;16-atc-235-tgg;;;;;;;;;;;;;;16-gca-atc-235-aac
;16-atc-235;;;;;;;;;;;;;;
;16s23s5s-aac;;;;;;;;;;;;;;'’’incomplets
;16s23s5s;;;;;;;;;;;;;;16s5s-atgi-gca
;;;;;;;;;;;;;;;16s-gca-atc-23s-aac
cd057;16s23s5s;9;80;17;63;;;;;;;;;;
;16s23s5s-atgi-gca;;;;;;;;;;;;;;'’’différents
;16s23s5s-ggc;;;;;;;;;;;;;;16s23s-aac-5s-aac
;2*16s23s5s-aaa;;;;;;;;;;;;;;16s23s5s-ttc-5s-ttc-aaa
;16s23s5s-ttc;;;;;;;;;;;;;;
;16s23s5s-ttc-tgc;;;;;;;;;;;;;;'’’5s en trop
;16-gca-atc-235-aac;;;;;;;;;;;;;;16s23s5s-ttc-5s-ttc-aaa
;5s-atgi-gca-16 –;;;;;;;;;;;;;;5s-atgi-gca-16-gca-atc-235-aac-aac
;gca-atc-235-aac-aac;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;
cd059;2*16s23s5s;6;59;5;54;;;;;;;;;;
;16-atc-235;;;;;;;;;;;;;;
;16-gca-235;;;;;;;;;;;;;;
;16s23s5s-aac;;;;;;;;;;;;;;
;16-gca-235-aac;38;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;16s;total aas;avec;sans;total page;Cd060-64;;;;;;;;Notes 3
cd060;16s23s5s;7;63;10;53;;;'’’16s23s5s;'’’atcgca;'’’gcaatc;'’’gca;'’’atc;'’’autres;'’’avant 16s;
;16s23s5s-atgi-gca;;;;;;'’’sans;8;;;;;;1;'’’avant
;16-gca-atc-235-atgi-gca;;;;;;'’’1-3;16;;2;;2;;1;atgf-16s23s5s
;16-atc-235-ttc;;;;;;'’’4-8;1;;1;;;;;atgi-gca-16s23s5s-aac
;16s23s5s-aac;;;;;;'’’9-23;;;;;;;;
;16s23s5s-aaa;;;;;;'’’24-43;;;;;;;;'’’1-3
;16s23s;;;;;32;'’’total;25;0;3;0;2;0;2;16s23s5s-atgi
;;;;;;;;;;;;;;;2*16s23s5s-aac
cd062;2*16s23s5s;9;74;13;61;;;;;;;;;;2*16s23s5s-ttc
;16s23s5s-atgi;;;;;;;;;;;;;;5*16s23s5s-aaa
;16s23s5s-aaa;;;;;;;;;;;;;;3*16s23s5s-atgi-gca
;16s23s5s-ttc;;;;;;;;;;;;;;16s23s-aac-5s-aac
;16-gca-atc-235-aac;;;;;;;;;;;;;;16s23s5s-atgi-gca-aac
;atgf-16s23s5s;;;;;;;;;;;;;;16s23s5s-ttc-5s-ttc-aaa
;16s23s5s-atgi-gca-aac;;;;;;;;;;;;;;16-atc-235-ttc
;16-gca-atc-23s;;;;;;;;;;;;;;16-atc-235-ttc-tgc
;5s-ttc;;;;;;;;;;;;;;16-gca-atc-235-aac
;;;;;;;;;;;;;;;16-gca-atc-235-atgi-gca
cd063;4*16s23s5s;10;81;18;63;;;;;;;;;;
;16s23s-aac-5s-aac;;;;;;;;;;;;;;'’’incomplets
;16-gca-atc-23-aac;;;;;;;;;;;;;;16s23s
;16s23s5s-ttc-5s-ttc-aaa;;;;;;;;;;;;;;16-gca-atc-23s
;16s23s5s-aaa;;;;;;;;;;;;;;16-gca-atc-23-aac
;16s23s5s-atgi-gca;;;;;;;;;;;;;;
;16-gca-atc-235-6 aas;;;;;;;;;;;;;;'’’différents
;;;;;;;;;;;;;;;16s23s5s-ttc-5s-ttc-aaa
cd064;16s23s5s;9;77;17;60;;;;;;;;;;16s23s-aac-5s-aac
;16s23s5s-atgi-gca;;;;;;;;;;;;;;
;2*16s23s5s-aaa;;;;;;;;;;;;;;'’’5s en trop
;16s23s5s-ttc;;;;;;;;;;;;;;5s-ttc
;16-atc-235-ttc-tgc;;;;;;;;;;;;;;16s23s5s-ttc-5s-ttc-aaa
;16s23s5s-aac;;;;;;;;;;;;;;
;atgi-gca-16s23s5s-aac;;;;;;;;;;;;;;
;16s23s5s-5aas;35;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;16s;total aas;avec;sans;total page;Cd067-92;;;;;;;;Notes 4
cd067;2*16s23s5s-atc-gca;10;96;16;80;;;'’’16s23s5s;'’’atcgca;'’’gcaatc;'’’gca;'’’atc;'’’autres;'’’avant 16s;
;16s23s5s-gaa, aaa, aac, ttc;;;;;;'’’sans;9;5;0;5;;1;;'’’1-3
;16-gca-atc-235-ttc, aaa;;;;;;'’’1-3;16;;4;;;;;3*16s23s5s-aaa
;16-gca-atc-23-aac;;;;;;'’’4-8;;;;;;;;3*16s23s5s-ttc
;16-gca-atc-235 –;;;;;;'’’9-23;;;;;;;;4*16s23s5s-aac
;aac-5s-ttc-tgc;;;;;;'’’24-43;;;;;;;;16s23s5s-gaa
;;;;;;40;'’’total;25;5;4;5;0;1;0;2*16s23s5s-atgi-gca
cd071;3*16s23s5s-aac;9;66;12;54;;;;;;;;;;3*16s23s5s-atc-gca
;16-gca-atc-235-ttc;;;;;;;;;;;;;;16-gca-atc-235-aaa
;16s23s5s-ttc, aaa;;;;;;;;;;;;;;
;16s23s5s;;;;;;;;;;;;;;2*16-gca-atc-235-ttc
;16s23s5s-atc-gca;;;;;;;;;;;;;;16-gca-atc-235-aac-5s-ttc-tgc 
;16s23s5s-atgi-gca;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;'’’incomplets
cd079;16s23s5s-atgi-gca;4;53;9;44;;;;;;;;;;8aas-16s
;16s23s5s-aaa;;;;;;;;;;;;;;16s-atc-23s
;16s23s5s-ttc;;;;;;;;;;;;;;16-gca-atc-23-aac
;16s-atc-23s;;;;;;;;;;;;;;
;16s°-atc-235-atgi-gca;;;;;;;;;;;;;;'’’autres incomplets
;23s5s-aaa;;;;;;;;;;;;;;23s5s-aaa
;;;;;;;;;;;;;;;16s°-atc-235-atgi-gca
cd083;16s23s5s;2;48;2;46;;;;;;;;;;
;16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;'’’différents
;;;;;;;;;;;;;;;16-gca-atc-235-aac-5s-ttc-tgc 
cd084;2*16-gca-235;4;54;4;50;;;;;;;;;;
;16s23s5s;;;;;;;;;;;;;;'’’cds
;16atcgca-cds-235;;;;;;;;;;;;;;16atcgca-cds-235
;;;;;;;;;;;;;;;
cd089;2*16atcgca235;5;76;6;70;;;;;;;;;;'’’5s en trop
;2*16-gca-235;;;;;;;;;;;;;;16-gca-atc-235-aac-5s-ttc-tgc 
;16s23s5s;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;'''autres
cd092;5*16s23s5s;9;68;13;55;;;;;;;;;;16atcgca-cds-235
;2*16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;
;16-gca-235;;;;;;;;;;;;;;
;8aas-16s;43;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;16s;total aas;avec;sans;total page;Cd095-118;;;;;;;;Notes 5
cd095;'’’3*16-5s-23s;10;70;16;54;;;'’’16s23s5s;'’’atcgca;'’’gcaatc;'’’gca;'’’atc;'’’autres;'’’avant 16s;
;'’’16s-5s-atcgca-23s-gta-tta;;;;;;'’’sans;6;1;;2;1;5;3;'’’avant
;'’’16-5s-atcgca-23-aac;;;;;;'’’1-3;2;6;;;1;1;1;'’’gac-ttc-ggc-16s-5s-23s
;'’’2*16-5s-atgf-23s;;;;;;'’’4-8;4;;;;;1;0;'’’15aas-16s5s-atcgca-23s
;16-gcc-235-gta;;;;;;'’’9-23;2;;;4;;1;2;'’’cgg-tgg-16s5s-gcc-23s
;'’’gac-ttc-ggc-16s-5s-23s;;;;;;'’’24-43;;;;;;;;'’’ttc-cds-16s5s-atc-23s-aac-atgf
;16s-23s;;;;;43;'’’total;14;7;0;6;2;8;6;tcc-16s-cds-235-19aas
;;;;;;;;;;;;;;;tcg-16s23s-gca-5s-12aas
cd102;2*16-gca-235;7;69;55;14;;;;;;;;;;
;2*16s23s5s;;;;;;;;;;;;;;'’’autres
;2*16-gca-235-22,21aas;;;;;;;;;;;;;;16-gcc-235-gta
;16s23s5s-8aas;;;;;;;;;;;;;;'’’2*16s5s-gcc-23s
;;;;;;;;;;;;;;;'’’2*16s5s-gcc-23s-19, 5aas
cd112;16s23s-gca-5s-gta-tac-gga-cga;;;;;;;;;;;;;;'’’2*16-5s-atgf-23s
;tcc-16s-cds-235-19aas;;;;;;;;;;;;;;16s-cds-235
;16s-cds-235;4;48;39;9;;;;;;;;;;'’’3*16-5s-23s
;tcg-16s23s-gca-5s-12aas;;;;;;;;;;;;;;'’’16s-5s-atcgca-23s-gta-tta
;;;;;;;;;;;;;;;'’’16-5s-atcgca-23-aac
cd113;16s-atc-235;4;48;32;16;;;;;;;;;;'’’16s5s-atcgca-23s-aac-atgf
;16s23s5s;;;;;;;;;;;;;;'’’16s5s-atc-23s-aac
;16s-gca-235-11 aas;;;;;;;;;;;;;;
;16s-gca-235-18 aas;;;;;;;;;;;;;;'’’1-3
;;;;;;;;;;;;;;;16-gcc-235-gta
cd114;16atcgca235;4;59;21;38;;;;;;;;;;'’’16s5s-atc-23s-aac
;2*16atcgca235-acc;;;;;;;;;;;;;;'’’16-5s-atcgca-23-aac
;16s23s5s-13 aas;;;;;;;;;;;;;;3*16atcgca235-acc
;;;;;;;;;;;;;;;'’’16s-5s-atcgca-23s-gta-tta
cd116;16s23s5s-aac;5;78;35;43;;;;;;;;;;'’’16s5s-atcgca-23s-aac-atgf
;16s23s5s-caa-gaa-tac-ggc;;;;;;;;;;;;;;16s23s5s-aac
;16atcgca235-acc;;;;;;;;;;;;;;'’’16s5s23s-aaa-acc-ctc
;16s23s5s-8 aas;;;;;;;;;;;;;;
;16s23s5s-21 aas;;;;;;;;;;;;;;'’’incomplets
;;;;;;;;;;;;;;;16s-23s
cd118;'’’2*16s5s-gcc-23s;10;109;61;48;;;;;;;;;;
;'’’16s5s-gcc-23s-19aas;;;;;;;;;;;;;;'’’cds
;'’’16s5s-gcc-23s-5aas;;;;;;;;;;;;;;16s-cds-235
;'’’16s5s23s-aaa-acc-ctc;;;;;;;;;;;;;;tcc-16s-cds-235-19aas
;'’’16s5s-atc-23s-aac;;;;;;;;;;;;;;'’’ttc-cds-16s5s-atc-23s-aac-atgf
;'’’16s5s-atcgca-23s-aac-atgf;;;;;;;;;;;;;;
;'’’15aas-16s5s-atcgca-23s;44;;;;;;;;;;;;;'’’différents
;'’’cgg-tgg-16s5s-gcc-23s;;;;;;;;;;;;;;16s23s-gca-5s-gta-tac-gga-cga
;'’’ttc-cds-16s5s-atc-23s-aac-atgf;;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;16s;total aas;avec;sans;total page;Cd133-153;;;;;;;;Notes 6
cd133;3*16s23s5s;10;85;75;10;;;'’’16s23s5s;'’’atcgca;'’’gcaatc;'’’gca;'’’atc;'’’autres;'’’avant 16s;
;2*16s-gca-235;;;;;;'’’sans;9;;;2;;;;'’’1-3
;16s23s-gga-5s;;;;;;'’’1-3;4;;;1;;;;16’-gca-235-tta-atgi
;16s23s5s-43aas;;;;;;'’’4-8;;;;;;;;2*16s23s-gga-5s
;16s23s5s-18aas;;;;;;'’’9-23;5;;;1;;;;16s23s5s-tta-atgi
;16s-gca-235-9aas;;;;;;'’’24-43;1;;;;;;;16s23s5s-gtg-gaa-cgg
;16s23s-aca;;;;;23;'’’total;19;0;0;4;0;0;0;
;;;;;;;;;;;;;;;'’’incomplets
cd136;3*16s23s5s;16;110;99;11;;;;;;;;;;2*16s23s-aca
;16s’-gca-23s°-16s°-23s    ;;;;;;;;;;;;;;16s’-gca-23s°-16s°-23s    
;16s°-gca-23s’;;;;;;;;;;;;;;16s-cds-23s°-5s-43aas
;16s23s-gga-5s;;;;;;;;;;;;;;16s23s°-cds
;16s23s-aca;;;;;;;;;;;;;;3*16s-23s°
;16s-cds-23s°-5s-43aas;;;;;;;;;;;;;;16s
;cds-cds-23s°-5s-18aas;;;;;;;;;;;;;;
;16s°-23s°-5s-9aas;;;;;;;;;;;;;;'’’autres incomplets
;;;;;;;;;;;;;;;16s°-gca-23s’
;16s23s5s-19aas;;;;;;;;;;;;;;23s5s
;16s23s5s-tta-atgi;;;;;;;;;;;;;;16s°-23s°-23s’-5s
;16s23s5s;;;;;;;;;;;;;;16s°gca-23s°
;16’-gca-235-tta-atgi;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;'’’cds
;23s5s;;;;;;;;;;;;;;16s-cds-23s°-5s-43aas
;16s;;;;;;;;;;;;;;cds-cds-23s°-5s-18aas
;;;;;;;;;;;;;;;16s23s°-cds
;16s23s°-cds;;;;;;;;;;;;;;
;3*16s-23s°;;;;;;;;;;;;;;'’’différents
;;;;;;;;;;;;;;;2*16s23s-gga-5s
;16s°-23s°-23s’-5s;;;;;;;;;;;;;;
;23s°-5s;;;;;;;;;;;;;;'’’5s en trop
;16s°gca-23s°;;;;;;;;;;;;;;cds-cds-23s°-5s-18aas
;;;;;;;;;;;;;;;16s°-23s°-5s-9aas
cd153;2*16s23s5s;6;98;40;58;;;;;;;;;;23s°-5s
;16s23s5s-gtg-gaa-cgg;;;;;;;;;;;;;;
;2*16s23s5s-12aas;;;;;;;;;;;;;;
;16s23s5s-13aas;32;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;16s;total aas;avec;sans;total page;Cd154-174;;;;;;;;Notes 7
cd154;2*16s-gcc-235;4;55;6;49;;;'’’16s23s5s;'’’atcgca;'’’gcaatc;'’’gca;'’’atc;'’’autres;'’’avant 16s;
;2*16atcgca235;;;;;;'’’sans;13;7;;;;4;;'’’avant
;;;;;;;'’’1-3;2;1;2;;;2;1;cag-gag-16atcgca235-aac
cd155;16atcgca235;4;48;2;46;;'’’4-8;;;1;;;1;;
;16s23s5s;;;;;;'’’9-23;;;;;;;;'’’autres
;16s23s°23s5s;;;;;;'’’24-43;;;;;;;;2*16s-gcc-235
;16s23s°23s5s-5s-5s;;;;;34;'’’total;15;8;3;0;0;7;1;2*16-cds-atcgca-23s16s°5s
;;;;;;;;;;;;;;;16s-cds-16s°-23s-cds-5s
cd156;16s23s5s;2;47;2;45;;;;;;;;;;16s-23s°-gca-atc-23s-16s°-5s-6aas
;16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;23s°-16s-16s°-23s-5s-aac-ggg
;;;;;;;;;;;;;;;
cd157;16s23s5s-aac;2;106;4;102;;;;;;;;;;'’’1-3
;16-gcaatc-235-aac;;;;;;;;;;;;;;16s23s5s-aac
;;;;;;;;;;;;;;;16s23s5s-aac-ggg
cd158;2*16s23s5s;3;53;3;50;;;;;;;;;;23s°-16s-16s°-23s-5s-aac-ggg
;16atcgca235-aac;;;;;;;;;;;;;;16atcgca235-aac
;;;;;;;;;;;;;;;2*16-gcaatc-235-aac
cd159;16atcgca235;2;51;7;44;;;;;;;;;;16s-cds-16s°-23s-cds-5s
;cag-gag-16atcgca235-aac;;;;;;;;;;;;;;'’’cds
;;;;;;;;;;;;;;;2*16-cds-atcgca-23s16s°5s
cd160;2*16-cds-atcgca-23s16s°5s;;53;4;49;;;;;;;;;;16s-cds-16s°-23s-cds-5s
;16s-cds-16s°-23s-cds-5s;3;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;'’’différents
cd161;2*16s23s5s;4;57;10;47;;;;;;;;;;16s23s°23s5s
;16s-23s°-gca-atc-23s-16s°-5s-6aas;;;;;;;;;;;;;;16s23s°23s5s-5s-5s
;23s°-16s-16s°-23s-5s-aac-ggg;;;;;;;;;;;;;;16s-23s°-gca-atc-23s-16s°-5s-6aas
;;;;;;;;;;;;;;;23s°-16s-16s°-23s-5s-aac-ggg
cd170;3*16s23s5s;5;58;10;48;;;;;;;;;;
;16s23s5s-aac-ggg;;;;;;;;;;;;;;'’’5s en trop
;16-gcaatc-235-6aas;;;;;;;;;;;;;;16s23s°23s5s-5s-5s
;;;;;;;;;;;;;;;
cd173;2*16atcgca235;2;48;4;44;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;
cd174;2*16s23s5s;3;53;3;50;;;;;;;;;;
;16-gcaatc-235-aac;34;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;16s;total aas;avec;sans;total page;Total;;;;;;;;
43;;;;;;;;'’’16s23s5s;'’’atcgca;'’’gcaatc;'’’gca;'’’atc;'’’autres;'’’avant 16s;
;;;;;;;'’’sans;68;14;2;15;5;10;5;
;'’’Total;;2938;888;2050;;'’’1-3;62;7;10;4;4;3;4;
;'’’Moyenne;;68;21;48;;'’’4-8;6;1;4;0;0;2;3;
;'’’ecartype;;19;23;19;;'’’9-23;12;0;0;7;0;1;2;
;'’’max;;110;99;102;;'’’24-43;1;0;0;0;0;0;0;
;'’’min;;47;2;9;252;'’’total;149;22;16;26;9;16;14;
;;;;;;;Dont 16s5s-*-23s;5;3;0;1;2;6;6;

clostridia notes

Liens aux notes

Lien fiche: liens aux notes
Notice: avant inversé n'est pas ajouté ici.Cela correspond aux rRNAs suivis de tous les tRNAs après 5s. Le lien au tableau principal est donc le même que pour les avant 16s.

1-3;1-3;1-3;1-3;1-3;1-3;1-3
;3*16s23s5s-aaa;16s23s5s-atgi;3*16s23s5s-aaa;16-gcc-235-gta;16’-gca-235-tta-atgi;16s23s5s-aac
16s-gcaatc-23s5s-ttc-tgc;3*16s23s5s-aac;2*16s23s5s-aac;3*16s23s5s-ttc;16s5s-atc-23s-aac;2*16s23s-gga-5s;16s23s5s-aac-ggg
16s5s-gca-23-aac-gaa-tgc;2*16s23s5s-ttc;2*16s23s5s-ttc;4*16s23s5s-aac;16-5s-atcgca-23-aac;16s23s5s-tta-atgi;23s°-16s-16s°-23s-5s-aac-ggg
16235-aaa-cds-5s-aaa;16s23s5s-ggc;5*16s23s5s-aaa;16s23s5s-gaa;3*16atcgca235-acc;16s23s5s-gtg-gaa-cgg;16atcgca235-aac
16s5s23s-gac-aca;16s23s5s-ttc-tgc;3*16s23s5s-atgi-gca;2*16s23s5s-atgi-gca;16s-5s-atcgca-23s-gta-tta;;2*16-gcaatc-235-aac
2*16s23s5s-atgi-gca;16s23s5s-aac-aac;16s23s-aac-5s-aac;3*16s23s5s-atc-gca;16s5s-atcgca-23s-aac-atgf;;16s-cds-16s°-23s-cds-5s
16s23s5s-ttc-gac-gaa;2*16s23s5s-atgi-gca;16s23s5s-atgi-gca-aac;16-gca-atc-235-aaa;16s23s5s-aac;;
2*16s23s-aac-5s;16s23s-aac-5s-aac;16s23s5s-ttc-5s-ttc-aaa;;16s5s23s-aaa-acc-ctc;;
;16s23s5s-ttc-5s-ttc-aaa;16-atc-235-ttc;2*16-gca-atc-235-ttc;;;
;2*16-gca-235-aac;16-atc-235-ttc-tgc;16-gca-atc-235-aac-5s-ttc-tgc ;;;
;16-atc-235-tgg;16-gca-atc-235-aac;;;;
;16-gca-atc-235-aac;16-gca-atc-235-atgi-gca;;;;
avant;avant;avant;avant;avant;avant;avant
5aas-16s-gcaatc-235-6aas;gca-atc-gga-16s23s5s;atgf-16s23s5s;;gac-ttc-ggc-16s-5s-23s;;cag-gag-16atcgca235-aac
agc-16s5s23s-6aas;5s-atgi-gca-16-gca-atc-235-aac-aac;atgi-gca-16s23s5s-aac;;15aas-16s5s-atcgca-23s;;
tca-tcc-16s5s23s-5aas;;;;cgg-tgg-16s5s-gcc-23s;;
;;;;ttc-cds-16s5s-atc-23s-aac-atgf;;
;;;;tcc-16s-cds-235-19aas;;
;;;;tcg-16s23s-gca-5s-12aas;;
autres;autres;autres;autres;autres;autres;autres
16s5s-atc-23s;;;16atcgca-cds-235;16-gcc-235-gta;;2*16s-gcc-235
16s5s-gca-23-aac-gaa-tgc;;;;2*16s5s-gcc-23s;;2*16-cds-atcgca-23s16s°5s
16s5s23s-gac-aca;;;;2*16s5s-gcc-23s-19, 5aas;;16s-cds-16s°-23s-cds-5s
16s5s23s;;;;2*16-5s-atgf-23s;;16s-23s°-gca-atc-23s-16s°-5s-6aas
;;;;16s-cds-235;;23s°-16s-16s°-23s-5s-aac-ggg
;;;;3*16-5s-23s;;
;;;;16s-5s-atcgca-23s-gta-tta;;
;;;;16-5s-atcgca-23-aac;;
;;;;16s5s-atcgca-23s-aac-atgf;;
;;;;16s5s-atc-23s-aac;;
différents;différents;différents;différents;différents;différents;différents
2*16s23s-aac-5s;16s23s-aac-5s-aac;16s23s5s-ttc-5s-ttc-aaa;16-gca-atc-235-aac-5s-ttc-tgc ;16s23s-gca-5s-gta-tac-gga-cga;2*16s23s-gga-5s;16s23s°23s5s
16235-aaa-cds-5s-aaa;16s23s5s-ttc-5s-ttc-aaa;16s23s-aac-5s-aac;;;;16s23s°23s5s-5s-5s
;;;;;;16s-23s°-gca-atc-23s-16s°-5s-6aas
;;;;;;23s°-16s-16s°-23s-5s-aac-ggg
incomplets;incomplets;incomplets;incomplets;incomplets;incomplets;incomplets
16s-atc-23s-aac;16s5s-atgi-gca;16s23s;8aas-16s;16s-23s;2*16s23s-aca;
;16s-gca-atc-23s-aac;16-gca-atc-23s;16s-atc-23s;;16s’-gca-23s°-16s°-23s    ;
;;16-gca-atc-23-aac;16-gca-atc-23-aac;;16s-cds-23s°-5s-43aas;
;;;;;16s23s°-cds;
;;;;;3*16s-23s°;
;;;;;16s;
autres incomplets;autres incomplets;autres incomplets;autres incomplets;autres incomplets;autres incomplets;autres incomplets
;;;23s5s-aaa;;16s°-gca-23s’;
;;;16s°-atc-235-atgi-gca;;23s5s;
;;;;;16s°-23s°-23s’-5s;
;;;;;16s°gca-23s°;
cds;cds;cds;cds;cds;cds;cds
16235-aaa-cds-5s-aaa;;;16atcgca-cds-235;16s-cds-235;16s-cds-23s°-5s-43aas;2*16-cds-atcgca-23s16s°5s
;;;;tcc-16s-cds-235-19aas;cds-cds-23s°-5s-18aas;16s-cds-16s°-23s-cds-5s
;;;;ttc-cds-16s5s-atc-23s-aac-atgf;16s23s°-cds;
5s en trop;5s en trop;5s en trop;5s en trop;5s en trop;5s en trop;5s en trop
16235-aaa-cds-5s-aaa;16s23s5s-ttc-5s-ttc-aaa;5s-ttc;16-gca-atc-235-aac-5s-ttc-tgc ;;cds-cds-23s°-5s-18aas;16s23s°23s5s-5s-5s
16-gca-2355;5s-atgi-gca-16-gca-atc-235-aac-aac;16s23s5s-ttc-5s-ttc-aaa;;;16s°-23s°-5s-9aas;
5s-ttc;;;;;23s°-5s;
5s;;;;;;

Cumuls notes

Lien fiche: Cumuls notes

30.11.19 Tanger;;;;;;;;;
cumuls Notes;;;;;;;;;
;;;;;;;;;
avant;;;incomplets;;;Type 1-3;;tRNAs;nbre
atgf-16s23s5s;;;16s23s*2;;;16s23s5s;;aaa;11
gca-atc-gga-16s23s5s;;;16s23s-aca*2;;;;;aac;11
atgi-gca-16s23s5s-aac;;;16-gcaatc-23s;;;;;ttc;7
;;;16s-gcaatc-23s-aac*3;;;;;ggc;1
cag-gag-16-atcgca-235-aac;;;16s-atc-23s;;;;;atgi;1
5aas-16s-gcaatc-235-6aas;;;16s’-gca-23s°-16s°-23s    ;;;;;gaa;1
5s-atgi-gca-16-gcaatc-235-aac-aac;;;16s-atc-23s-aac;;;;;atgi-gca;9
tcg-16s23s-gca-5s-12aas;;;16s5s-atgi-gca;;;;;atc-gca;3
;;;16s-cds-23s°-5s-43aas;;;;;ttc-tgc;1
tcc-16s-cds-235-19aas;;;16s-gcaatc-23s-aac;;;;;aac-aac;1
;;;16s;;;;;tta-atgi;1
gac-ttc-ggc-16s5s23s;;;8aas-16s;;;;;aac-ggg;1
tca-tcc-16s5s23s-5aas;;;16s-23s° *3;;;;;gac-aca;1
agc-16s5s23s-6aas;;;16s23s°-cds;;;;;aaa-cds-5s-aaa;1
15aas-16s5s-atcgca-23s;;;;;;;;atgi-gca-aac;1
ttc-cds-16s5s-atc-23s-aac-atgf;;;autres incomplets;;;;;gtg-gaa-cgg;1
cgg-tgg-16s5s-gcc-23s;;;23s5s-aaa;;;;;ttc-gac-gaa;1
;;;23s5s;;;;;ttc-5s-ttc-aaa;2
autres;;;16s°-23s°-23s’-5s;;;;;aaa-acc-ctc;1
16s5s23s*4;;;16s°-atc-235-atgi-gca;;;;;;
16s5s23s-gac-aca;;;16s°-gca-23s’;;;16s23s-gga-5s;;gga;2
16-5s-atcgca-23-aac;;;16s°gca-23s°;;;;;aac;2
16s-5s-atcgca-23s-gta-tta;;;;;;16s23s-aac-5s-aac;;aac-aac;2
16s5s-atcgca-23s-aac-atgf;;;cds;;;23s°-16s-16s°-23s5s;;aac-ggg;1
16s5s-gca-23-aac-gaa-tgc;;;16s-cds-235;;;;16s-cds-16s°-23s-cds-5s;cds;1
16s5s-atc-23s;;;tcc-16s-cds-235-19aas;;;;;;
16s5s-atc-23s-aac;;;16-atcgca-cds-235;;;16-atcgca-235;;acc;4
;;;;;;;;aac;1
16s-gcc-235*2;;;16s-cds-23s°-5s-43aas;;;;;gta-tta;1
16-gcc-235-gta;;;16s-cds-16s°-23s-cds-5s;;;;;aac-atgf;1
16s5s-gcc-23s*2;;;16-cds-atcgca-23s16s°5s*2;;;;;;
16s5s-gcc-23s-19, 5aas*2;;;;;;16-gcaatc-235;;aac;4
16-5s-atgf-23s*2;;;16235-aaa-cds-5s-aaa;;;;;ttc;2
;;;ttc-cds-16s5s-atc-23s-aac-atgf;;;;;aaa;1
16s-cds-235;;;;;;;;atgi-gca;1
16-atcgca-cds-235;;;16s23s°-cds;;;;;ttc-tgc;1
16-cds-atcgca-23s16s°5s*2;;;cds-cds-23s°-5s-18aas;;;;;aac-5s-ttc-tgc ;1
16s-cds-16s°-23s-cds-5s;;;;;;;;;
23s°-16s-16s°-23s-5s-aac-ggg;;;5s en trop;;;;;;
16s-23s°-gca-atc-23s-16s°-5s-6aas;;;16s23s5s-ttc-5s-ttc-aaa*2;;;16s-atc-235;;aac;1
;;;16-gca-2355;;;;;tgg;1
différents;;;16-gca-atc-235-aac-5s-ttc-tgc ;;;;;ttc;1
16s23s-gga-5s*2;;;5s-atgi-gca-16-gca-atc-235-aac-aac;;;;;ttc-tgc;1
16s23s-aac-5s*2;;;;;;;;;
16s23s-aac-5s-aac*2;;;16s°-23s°-5s-9aas;;;;;;
16s23s5s-ttc-5s-ttc-aaa*2;;;16s23s°23s5s-5s-5s;;;16-gca-235;;aac;2
16s23s-gca-5s-gta-tac-gga-cga;;;;;;;;aac-gaa-tgc;1
;;;cds-cds-23s°-5s-18aas;;;16s’-gca-235;;tta-atgi;1
16-gcaatc-235-aac-5s-ttc-tgc ;;;16235-aaa-cds-5s-aaa;;;;;;
16s-23s°-gcaatc-23s-16s°-5s-6aas;;;;;;16-gcc-235;;gta;1
;;;23s°-5s;;;;;;
16s23s°23s5s;;;2*5s-ttc;;;total;;;90
16s23s°23s5s-5s-5s;;;5s;;;;;;
23s°-16s-16s°-23s5s-aac-ggg;;;;;;;;;
16235-aaa-cds-5s-aaa;;;;;;;;;

clostridia cds notes

Lien fiche: cds notes

;24.7.20 Tanger;;cds ;contrôles;;;;
;;;;;;;;
;clostridia;cd032;Clostridium beijerinckii strain NCIMB 14988;;;;06/04/20;
;;;;;;;;
;6182670..6183419;;cds;190;250;signal peptidase II;;
comp;6183610..6183685;;aaa;5;;;;
comp;6183691..6183807;;5s;159;;;;
comp;6183967..6184914;;cds;294;316;L-lactate dehydrogenase;;
comp;6185209..6185284;;aag;7;;;;
comp;6185292..6185408;;5s;138;;;;
comp;6185547..6188463;;23s;339;;;;
comp;6188803..6190314;;16s;776;;;;
comp;6191091..6192203;;cds;;371;glucose-1-phosphate adenylyltransferase subunit GlgD;;
;lactate;MSLKKSKVAIIGTGLVGSSTAFSLMTQGVCDEILMIDINEEKAL;;;;;;
;;GEVMDLNHCIEYLNRNIRIVRGNYEQCGDVDIVVITAGAPPKQGQTRLDTLELSAKIV;;;;;;
;;ESIVRPIMKSGFKGHFIVISNPVDMIAYHVYKISGLPKSHIIGTGTSVDSARLKNFIG;;;;;;
;;ELLNVDPRSVQGYSMGEHGDSQMVPWSHVTVGGKSFYEILKDNKDRVGEVDLDKLVLE;;;;;;
;;TARAGWEVYNRKGTTYYGIATAAVGIIKAIINDENRIMPVSTLLDGEYGEKDVFCGVP;;;;;;
;;AVLNADGVKEVVEIHMTKEELGKFKKSIELIKEYTEKIK;;;;;;
;;;;;;;;
;;;;;;;;
clostridia;cd084;Dehalobacter restrictus DSM 9455 strain PER-K23;;;;15/04/20;;
;;;;;;;;
;333741..334942;;cds;406;401;tyrosine--tRNA ligase;;
;335349..336923;;16s;134;;;;
;337058..337134;;atc;61;;;;
;337196..337271;;gca;47;;;;
comp;337319..337477;;cds;238;53;hp;;
;337716..341116;;23s;154;;;;
;341271..341375;;5s;144;;;;
<;341520..341612;;cds;558;31;transcriptional regulator;;
;342171..343746;;16s;417;;;;
;344164..347563;;23s;154;;;;
;347718..347822;;5s;111;;;;
;347934..348683;;cds;;250;endoribonuclease L-PSP;;
;hp;MAKSDKERRAMDGAMLKCATDGINILTSDLIDHRFLCGRIVILTFLSQLFNP;;;;;;
;;;;;;;;
;;;;;;;;
;;;;;;;;
clostridia;cd112;Filifactor alocis ATCC 35896;;;;16/07/20;;2 disparus
;;;;;;;;
clostridia;cd118;Heliobacterium modesticaldum Ice1 strain Ice1;;;;25/08/19;;
;;;;;;;;
;2342094..2342804;;cds;158;237;FadR family transcriptional regulator;;
comp;2342963..2343030;;ttc;213;;;;
;2343244..2343936;;cds;563;231;heptaprenylglyceryl phosphate synthase;;
;2344500..2346019;;16s;258;;;;
;2346278..2346394;;5s;64;;;;
;2346459..2346535;;atc;141;;;;
;2346677..2349594;;23s;100;;;;
;2349695..2349769;;aac;6;;;;
;2349776..2349851;;atgf;102;;;;
;2349954..2350976;;cds;;341;polysaccharide deacetylase;;
;hepta;MAKMILKLDPDRQLDDERLRVILRSDVDAIVVGGTQGITPEKVK;;;;;;
;;VLLDRLQGFPREIILEVTDARCAAEGAHRFWVPVVLNSRDPHWIVRAHARAIGQWKDP;;;;;;
;;HLTDRLLPVGYIVLNEESAVASLTVADTTLDDEELIGLCMVGHYLFRFPFIYIEYSGK;;;;;;
;;WGCMDRLARIRGRVPQVPLVYGGGIRESWQARTAASLVDTVVVGNMLYENHAQELESR;;;;;;
;;LRMFCQAIRADA;;;;;;
;;;;;;;;
;;;;;;;;
clostridia;cd136;Peptoclostridium difficile M68 ;;;voir annexe;M68;;3 abimés
;;;;;;;;
;;;;;;;;
clostridia;cd160;Thermincola potens JR ;;;;21/12/19;;3 disparus

clostridia typage

clostridia blocs 16s-y-23s5s-z

Lien fiche: clostridia blocs 16s-y-23s5s-z

;;;tableau des blocs;;;;;;;;;;;;
;;;16-y-235-z;16s23s5s;atcgca;gcaatc;gca;atc;gcc;cds;autres;avant 16s;--;blocs;génomes
;;;'''sans;68;14;2;15;5;4;4;2;5;;252;42
;;;'''1-3;62;7;10;4;4;1;2;;4;;;
;;;'''4-8;6;1;4;0;0;1;1;;3;;;
;;;'''9-23;12;0;0;7;0;1;;;2;;;
;;;'''24-43;1;0;0;0;0;;;;0;;;
;;;'''total;149;22;16;26;9;7;7;2;14;;;
;;;;;;;;;;;;;;avant;
;;;;;;;;;;;;;;;
autres;;;;;;;;;;;;;;15aas-16s5s-atcgca-23s;
;;;avant/après;;;;;;;;;;;gca-atc-gga-16s23s5s;
16s5s-atc-23s;;;16-y-235-z;16s23s5s;atcgca;gcaatc;gca;atc;gcc;cds;atgf;total;16s5s-*-23s;atgf-16s23s5s;
16s5s23s;;;'''sans;3;;;;;1;;;4;*2;gac-ttc-ggc-16s-5s-23s;
3*16-5s-23s;;;'''1-3;1;1;1;;1;;;;4;*1;;
2*16s5s-gcc-23s;;;'''4-8;2;;1;;;;;;3;*2;atgi-gca-16s23s5s-aac;
2*16-5s-atgf-23s;;;'''9-23;1;1;;;;;1;;3;*1;5s-atgi-gca-16-gca-atc-235-aac-aac;
;;;'''24-43;;;;;;;;;0;;cag-gag-16atcgca235-aac;
16s5s-gca-23-aac-gaa-tgc;;;'''total;7;2;2;0;1;1;1;;14;;ttc-cds-16s5s-atc-23s-aac-atgf;
16s-5s-atcgca-23s-gta-tta;;;Dont 16s5s-*-23s;*3;*1;;;*1;*1;;;;;;
16-5s-atcgca-23-aac;;;;;;;;;;;;;;cgg-tgg-16s5s-gcc-23s;
16s5s-atcgca-23s-aac-atgf;;;1;15aas-16s5s-atcgca-23s;;est considéré comme inversé;;;;;;;;agc-16s5s23s-6aas;
16s5s-atc-23s-aac;;;différent;tcg-16s23s-gca-5s-12aas;;5s comme un aa;;;;;;;;tca-tcc-16s5s23s-5aas;
16s5s23s-gac-aca;;;;;;;;;;;;;;5aas-16s-gcaatc-235-6aas;
;;;;;;;;;;;;;;;
2*16s5s-gcc-23s-19, 5aas;;;autres;;;;;;;;;;;tcc-16s-cds-235-19aas;
;;;16s5-y-23-z;16s23s5s;atcgca;gcaatc;gca;atc;gcc;cds;atgf;total;16s5s-*-23s;tcg-16s23s-gca-5s-12aas;
2*16s-gcc-235;;;'''sans;4;;;;1;2;;2;;*9;;
2*16-cds-atcgca-23s16s°5s;;;'''1-3;1;3;;1;1;;;;;*6;;
16s-cds-16s°-23s-cds-5s;;;'''4-8;;;;;;1;;;;*1;;
16s-23s°-gca-atc-23s-16s°-5s-6aas;;;'''9-23;;;;;;1;;;;*1;;
23s°-16s-16s°-23s-5s-aac-ggg;;;'''24-43;;;;;;;;;;;;
16-gcc-235-gta;;;Dont 16s5s-*-23s;*5;*3;*0;*1;*2;*4;;*2;;;;
16s-cds-235;;;;;;;;;;;;;;;
16atcgca-cds-235;;;cumuls;;;;;;;;;;;;
;;;16-y-235-z;16s23s5s;atcgca;gcaatc;gca;atc;gcc;cds;atgf;total;16s5s-*-23s;;
incomplets;;;'''sans;71;14;2;15;5;5;4;2;118;*11;;
;;;'''1-3;63;8;11;4;5;1;2;0;94;*7;;
16s23s*2;;;'''4-8;8;1;5;0;0;1;1;0;16;*3;;
16s23s-aca*2;;;'''9-23;13;1;0;7;0;1;1;0;23;*2;;
16-gcaatc-23s;;;'''24-43;1;0;0;0;0;0;0;0;1;;;
16s-gcaatc-23s-aac*3;;;'''total;156;24;18;26;10;8;8;2;252;;;
16s-atc-23s;;;incomplets;4;;5;;2;;1;0;12;;;
16s’-gca-23s°-16s°-23s    ;;;'''total +;160;24;23;26;12;8;9;2;264;;;
16s-atc-23s-aac;;;Dont 16s5s-*-23s;*8;*4;*0;*1;*3;5*;0;*2;*23;;;
16s-gcaatc-23s-aac;;;;;;;;;;;;;;;
;;;%;;;;;;;;;;;;
;;;16-y-235-z;16s23s5s;atcgca;gcaatc;gca;atc;gcc;cds;atgf;total;16s5s-*-23s;;
;;;'''sans;28;5,6;0,8;6,0;2,0;2,0;1,6;0,8;'''47;*11
;;;'''1-3;25;3,2;4,4;1,6;2,0;0,4;0,8;;'''37;*7
;;;'''4-8;3,2;0,4;2,0;;;0,4;0,4;;'''6,3;*3
;;;'''9-23;5,2;0,4;;2,8;;0,4;0,4;;'''9;*2
;;;'''24-43;0,4;;;;;;;;'''0,4;
;;;'''total;'''62;'''10;'''7;'''10;'''4,0;'''3,2;'''3,2;'''0,8;100;
;;;'''total +;61;9;9;10;4,5;3;3,4;0,8;100;
;;;16s5s-*-23s;*8;*4;*0;*1;*3;5*;0;*2;*23;;;

clostridia blocs intégrés

Lien fiche: clostridia blocs intégrés

avant inversé;;16s23s5s;atcgca;gcaatc;gca;atc;gcc;atgf;autres-cds;total
-;'’’sans;68;14;2;15;5;4;2;5;115
5;'’’1-3;63;7;10;4;5;1;0;1;91
5;'’’4-8;6;1;4;0;;1;;1;13
4;'’’9-23;12;;;7;;1;;;20
;'’’24-43;1;;;;;;;;1
14;'’’total;150;22;16;26;10;7;2;7;240
6;Dont 16s5s-*-23s;5;3;0;1;2;4;2;0;17

clostridia blocs 1-3

clostridia type 1-3

Lien fiche: clostridia type 1-3
blocs 1-3 et avant 16s

1-3;;;;;;avant 16s;;Types;
$'''16s23s5s;;$'''16s*235s;;$'''16s*235s;;$'''blocs;;$'''1-3 avant;$'''1-3 après
16s23s5s-aaa;11;type;;tRNAs;;'''agc-16s5s23s-6aas;;agc;ap1
16s23s5s-aaa-cds-5s-aaa;1;aac;17;aac;23;'''tca-tcc-16s5s23s-5aas;;tca-tcc;ap2
;;aaa;12;ttc;19;'''gac-ttc-ggc-16s5s23s;;gac-ttc-ggc;
16s23s5s-aac;11;atgi-gca;10;aaa;16;'''cgg-tgg-16s5s-gcc-23s;;cgg-tgg;
16s23s5s-aac-aac;1;ttc;10;atgi;14;'''ttc-cds-16s5s-atc-23s-aac-atgf;;ttc-cds;aac-atgf
16s23s5s-aac-ggg;1;acc;4;gca;14;;;;
;;atc-gca;3;5s;4;gca-atc-gga-16s23s5s;;gca-atc-gga;
16s23s5s-atc-gca;3;ttc-tgc;3;tgc;4;atgf-16s23s5s;;atgf;
;;aac-ggg;2;acc;4;atgi-gca-16s23s5s-aac;;atgi-gca;aac
16s23s5s-atgi;1;tta-atgi;2;atc;3;tcg-16s23s-gca-5s-12aas;;tcg;
16s23s5s-atgi-gca;9;ttc-5s-ttc-aaa;2;gaa;3;;;;
16s23s5s-atgi-gca-aac;1;aac-aac;1;ggg;2;cag-gag-16atcgca235-aac;;cag-gag;aac
;;atgi;1;tta;2;5s-atgi-gca-16-gcaatc-235-aac-aac;;5s-atgi-gca;aac-aac
16s23s5s-gaa;1;atgi-gca-aac;1;cds;1;tcc-16s-cds-235-19aas;;tcc;
16s23s5s-ggc;1;gaa;1;cgg;1;;;;
16s23s5s-gtg-gaa-cgg;1;ggc;1;gac;1;15aas-16s5s-atcgca-23s;;av1;
16s23s5s-tta-atgi;1;gta;1;ggc;1;5aas-16s-gcaatc-235-6aas;;av2;ap3
;;gtg-gaa-cgg;1;gta;1;Les 1-3 avant, des avant 16s, sont différents des 1-3;;;
16s23s5s-ttc;7;tgg;1;gtg;1;;;;
;;ttc-gac-gaa;1;tgg;1;Les 1-3 après, des avant 16s, sont analogues aux 1-3;;;
16s23s5s-ttc-5s-ttc-aaa;2;aaa-cds-5s-aaa;1;;115;;;;
16s23s5s-ttc-gac-gaa;1;aac-5s-ttc-tgc ;1;;;;;;
16s23s5s-ttc-tgc;1;;76;$'''total 1-3;;$'''Totaux tRNAs avant 16s;;;
;;&$'''reste;;tRNAs;;Avant / avant 16s;;Après / avant 16s;
$'''16s-*-23s5s;;$'''16s23s-*-5s;;;;&'''1-3;&'''5,6aas;&'''1-3;&'''5,6aas
16-atc-235-tgg;1;cds-5s;1;aac;33;;;°5;°2
16-atc-235-ttc;1;aac-5s;2;ttc;19;2;1;;°1
16-atc-235-ttc-tgc;1;aac-5s-aac;2;aaa;17;;;;°1
16-atc-gca-235-acc;4;gga-5s;2;atgi;14;2;;;°1
;;;7;gca;14;3;;;
16’-gca-235-tta-atgi;1;$'''16s5s-*-23s;;acc;5;1;;;
16-gca-235-aac;2;type;;tgc;5;;;;
16-gca-atc-235-aaa;1;aaa-acc-ctc;1;5s;4;;1;;
16-gca-atc-235-aac;4;aac;2;gaa;4;;;;°2
16-gca-atc-235-aac-5s-ttc-tgc ;1;aac-atgf;1;atc;3;°1;;;
16-gca-atc-235-atgi-gca;1;aac-gaa-tgc;1;tta;3;;;;1
16-gca-atc-235-ttc;2;gac-aca;1;gac;2;°1;°1;;2
16-gca-atc-235-ttc-tgc;1;gta-tta;1;gga;2;°1;;;
;;;7;ggg;2;;;;
16-gcc-235-gta;1;$'''reste;;gta;2;;1;;2
23s°-16s-16s°-23s5s-aac-ggg;1;tRNAs;;aca;1;;;;2
;;aaa;1;atgf;1;°1;;1;1
$'''16s5s-*-23s;;aac;10;cds;2;°1;;;
16s5s-23s-gac-aca;1;gga;2;cgg;1;°1;;;
16s5s-23s-aaa-acc-ctc;1;acc;1;ctc;1;;;;
16s5s-atcgca-23s-gta-tta;1;ctc;1;ggc;1;;1;;
16s5s-atcgca-23s-aac-atgf;1;atgf;1;gtg;1;;;;
16s5s-atcgca-23s-aac;1;gaa;1;tgg;1;°1;;;
16s5s-atc-23s-aac;1;tgc;1;agc;;°1;;;
16s5s-gca-23s-aac-gaa-tgc;1;gac;1;cag;;°1;;;
$'''16s23s-*-5s;;aca;1;gag;;°1;;;
16s-cds-16s°-23s-cds-5s;1;gta;1;tca;;°1;;;
16s23s-aac-5s;2;tta;1;tcc;;2;;;
16s23s-aac-5s-aac;2;cds;1;tcg;;°1;;;
16s23s-gga-5s;2;;23;&tac;&;&;&;&;&2
;90;;;total;138;22;5;6;17
16-gcaatc-23s-aac;§;;;;;$'''rapports;;;
16s-atc-23s-aac;§;;;;;°14/22;°'1/5;°'5/6;°12/17

clostridia tRNA 1-3

Lien fiche: clostridia tRNA 1-3

Clostridia 1-3;;total;;atgf;;cds;5s
tRNA;;144;;2;;2;4
ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;19;tcc;;tac;;tgc;5
atc;3;acc;5;aac;38;agc;
ctc;1;ccc;;cac;;cgt;
gtc;;gcc;;gac;2;ggc;1
tta;3;tca;;taa;;tga;
atgi;14;aca;1;aaa;17;aga;
cta;;cca;;caa;;cga;
gta;2;gca;14;gaa;4;gga;2
ttg;;tcg;;tag;;tgg;1
atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;1
gtg;1;gcg;;gag;;ggg;2
;;;;;;;
;;;;;;;
Clostridia 1-3;;total;;atgf;;cds;5s
tRNA;;1000;;14;;14;28
ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;132;tcc;;tac;;tgc;35
atc;21;acc;35;aac;264;agc;
ctc;7;ccc;;cac;;cgt;
gtc;;gcc;;gac;14;ggc;7
tta;21;tca;;taa;;tga;
atgi;97;aca;7;aaa;118;aga;
cta;;cca;;caa;;cga;
gta;14;gca;97;gaa;28;gga;14
ttg;;tcg;;tag;;tgg;7
atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;7
gtg;7;gcg;;gag;;ggg;14

clostridia blocs 4-8

Lien fiche: clostridia blocs 4-8
Légende
- s° ribosomal RNA rRNA prediction is too short

- s’ possible 23S ribosomal RNA but does not have good blast hits on one or both of the ends
Tableau

Clostridia;;;;;;;;Clostridia;;;;;;;
4-8;;;;;;;;4-8;;;;;;;
83;;;;atgf;;atgi;2;100;;;;atgf;1;atgi;3
ttt;;tct;;tat;;tgt;;ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;2;tcc;;tac;5;tgc;1;ttc;3;tcc;;tac;7;tgc;1
atc;;acc;1;aac;5;agc;1;atc;;acc;1;aac;7;agc;1
ctc;;ccc;;cac;;cgt;;ctc;;ccc;;cac;;cgt;
gtc;;gcc;;gac;8;ggc;4;gtc;;gcc;;gac;10;ggc;4
tta;1;tca;1;taa;;tga;;tta;2;tca;1;taa;;tga;
ata;;aca;4;aaa;4;aga;3;ata;;aca;6;aaa;5;aga;3
cta;4;cca;1;caa;7;cga;1;cta;4;cca;1;caa;7;cga;1
gta;5;gca;1;gaa;11;gga;7;gta;7;gca;1;gaa;13;gga;7
ttg;;tcg;;tag;;tgg;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;;acg;2;aag;;agg;;atgj;;acg;2;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;;ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;2;ggg;;gtg;;gcg;;gag;2;ggg;

Liste

cd116;cd002;c112;cd064;cd118;cd001;cd002;cd045;cd063;cd161;cd170;cd092;cd102;cd116
4;4;5;5;5;6;6;6;6;6;6;8;8;8
16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s
23s;23s;23s;23s;5s;gca;atc;gca;gca;23s°;gca;;23s;23s
5s;5s;;5s;gcc;atc;gca;atc;atc;gca;atc;;5s;5s
;;;;23s;23s;23s;23s;23s;atc;23s;;;
;;;;;5s;5s;5s;5s;23s;5s;;;
;;;;;;;;;16s°;;;;
;;;;;;;;;5s;;;;
caa;caa;gca;gaa;caa;aac;aac;gaa;gaa;aac;aac;gac;gaa;caa
gaa;gaa;5s;cta;aaa;gaa;caa;cta;cta;gaa;gaa;tca;gta;gaa
tac;tac;gta;ggc;gaa;gac;gta;gga;gga;atgi;atgi;acc;gac;gta
ggc;ggc;tac;gga;gta;aca;gac;aga;aga;gac;gac;agc;aca;gac
;;gga;aga;gac;tac;aca;caa;caa;ttc;ttc;aac;tac;aca
;;cga;;;aaa;aaa;gag;gag;acg;acg;gga;cta;aaa
;;;;;;;;;;;tgc;ggc;gga
;;;;;;;;;;;tta;gga;cca

clostridia blocs 9-23

Lien fiche: clostridia blocs 9-23
Légende
- s° ribosomal RNA rRNA prediction is too short

- s’ possible 23S ribosomal RNA but does not have good blast hits on one or both of the ends
Le tableau. voir plus bas les blocs.

;;clostridia sans doubles;;C136, 8 18 13 aas en moins;;;
;;;;;;;
tot;21 blocs #;;;atgf;atgi;5s;cds
351;;;;20;9;;
ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;17;tcc;1;tac;14;tgc;5
atc;8;acc;4;aac;13;agc;7
ctc;1;ccc;2;cac;10;cgt;6
gtc;3;gcc;4;gac;21;ggc;12
tta;10;tca;8;taa;;tga;
ata;;aca;16;aaa;19;aga;13
cta;11;cca;12;caa;13;cga;
gta;21;gca;0;gaa;21;gga;17
ttg;0;tcg;1;tag;;tgg;6
atgj;13;acg;1;aag;1;agg;
ctg;4;ccg;2;cag;1;cgg;2
gtg;;gcg;;gag;2;ggg;
;;;;;;;
;;;;;;;
tot;21 blocs #;;;atgf;atgi;5s;cds
1000;;;;57;26;;
ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;48;tcc;3;tac;40;tgc;14
atc;23;acc;11;aac;37;agc;20
ctc;3;ccc;6;cac;28;cgt;17
gtc;9;gcc;11;gac;60;ggc;34
tta;28;tca;23;taa;;tga;
ata;;aca;46;aaa;54;aga;37
cta;31;cca;34;caa;37;cga;
gta;60;gca;0;gaa;60;gga;48
ttg;0;tcg;3;tag;;tgg;17
atgj;37;acg;3;aag;3;agg;
ctg;11;ccg;6;cag;3;cgg;6
gtg;;gcg;;gag;6;ggg;

Tous les blocs 9-23

cd002;cd003;cd133;cd136;cd113;cd002;cd153;cd153;cd003;cd003;cd114;cd153;cd113;cd133;cd136;cd118;cd136;cd102;cd116;cd003;cd003;cd102;cd133;cd136
9;9;9;9;11;12;12;12;13;13;13;13;18;18;18;19;19;21;21;22;22;22;43;43
16s;16s;16s;16s°;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;cds;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s;16s
23s;23s;gca;23s°;gca;23s;23s;23s;gca;23s;23s;23s;gca;23s;23s°;5s;23s;gca;23s;23s;gca;gca;23s;cds
5s;5s;23s;5s;23s;5s;5s;5s;23s;5s;5s;5s;23s;5s;5s;gcc;5s;23s;5s;5s;23s;23s;5s;23s°
;;5s;;5s;;;;5s;;;;5s;;;23s;;5s;;;5s;5s;;5s
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
caa;gaa;aac;aac;aac;caa;aac;cag;aac;aac;caa;aag;aac;aac;aac;tcc;aac;aac;caa;atgf;aac;aac;aac;aac
gaa;gta;tta;tta;tta;gaa;ggc;gag;tta;tta;aaa;gag;tta;gaa;gaa;ccg;tta;atgf;gaa;gaa;tta;tta;tta;tta
gta;aca;atgf;atgf;atgf;gta;atgj;ctc;atgf;atgf;atgf;atgj;atgf;gta;gta;gga;atgf;gaa;gta;gta;atgf;atgf;atgf;atgf
gac;gga;gaa;gaa;atgj;gac;ttc;ctg;atgj;gaa;gga;ttc;gaa;gac;gac;cac;gaa;gta;gac;gac;gaa;gaa;gaa;gaa
aca;aga;gga;gga;gaa;aca;tac;acc;gaa;gta;atgj;tac;gta;aca;aca;tgc;gga;gac;aca;aca;gta;gta;gga;gga
aaa;caa;gta;gta;gta;aaa;ggc;cgt;gta;gac;agc;ggc;gac;tac;tac;gtc;gta;aca;aaa;gga;gac;gac;gta;gta
atgf;aaa;gac;gac;gac;atgf;gtc;cgg;gac;aca;gaa;gcc;aca;gga;gga;ttc;gac;tac;atgf;aga;aca;aca;gac;gac
gga;atc;ggc;ggc;aca;ttc;gac;tgg;tac;tac;gta;gtc;tac;aga;aga;tac;aca;gga;ttc;caa;tac;cta;aca;aca
cca;ttc;aga;aga;tac;cta;ctg;cac;cta;cta;gac;gac;gga;caa;caa;caa;tac;aga;cta;aaa;cta;ggc;tac;tac
;;;;ggc;gga;atc;gcc;ggc;ggc;acc;ctg;aga;aaa;aaa;aaa;cta;caa;gga;tca;ggc;aga;cta;cta
;;;;cgt;aga;acg;ccc;cac;aaa;gcc;acc;gaa;tca;tca;gaa;aga;aaa;aga;agc;aaa;caa;aga;aga
;;;;;cac;tcg;ccg;tgc;atc;tac;atc;aaa;agc;agc;gta;caa;tca;cac;cca;cta;aaa;caa;caa
;;;;;;;;cgt;ttc;ggc;atgf;tca;cca;cca;gac;tca;ttc;gaa;atgi;agc;tca;tca;tca
;;;;;;;;;;;;agc;tgg;tgg;agc;ttc;atgj;gta;tgg;cca;agc;ttc;ttc
;;;;;;;;;;;;atgi;cca;cca;ccc;atgj;atgi;gcc;cca;atgi;cca;atgj;atgj
;;;;;;;;;;;;ttc;atc;atc;ctg;atgi;cca;aaa;atc;tgg;atc;atgi;atgi
;;;;;;;;;;;;tgg;ttc;ttc;ggc;cca;cac;atgf;ttc;cca;atgi;cca;cca
;;;;;;;;;;;;cgg;atgj;atgj;cgt;cac;aaa;ttc;atgj;atc;tgg;cac;aca
;;;;;;;;;;;;;;;acc;aaa;tgc;gga;atgf;ttc;cca;aaa;aaa
;;;;;;;;;;;;;;;;;cta;aga;gac;atgf;atgi;tgc;tgc
;;;;;;;;;;;;;;;;;cgt;cac;aca;atgj;ttc;aac;aac
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;gga;gga;atgj;tta;tta
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;atgf;atgf
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;gaa;gaa
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;gga;gga
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;gta;gta
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;gac;gac
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;aca;aca
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;tac;tac
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;cta;cta
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;ggc;ggc
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;aga;aga
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;caa;caa
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;aaa;aaa
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;tca;tca
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;ttc;ttc
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;atgj;atgj
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;atgi;atgi
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;cac;cac
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;aaa;aaa
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;tgc;tgc
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;cgt;cgt
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;gta;gta

clostridia blocs avant

Lien fiche: clostridia blocs avant
Légende
- s° ribosomal RNA rRNA prediction is too short

- s’ possible 23S ribosomal RNA but does not have good blast hits on one or both of the ends
Tableau

x-16s longs;clostridia;;;;;;
69;;;;atgf;3;;
ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;3;tcc;;tac;4;tgc;3
atc;1;acc;;aac;4;agc;2
ctc;;ccc;1;cac;1;cgt;1
gtc;1;gcc;;gac;5;ggc;4
tta;2;tca;1;taa;;tga;
atgi;2;aca;4;aaa;4;aga;1
cta;1;cca;1;caa;2;cga;
gta;5;gca;1;gaa;5;gga;1
ttg;;tcg;;tag;;tgg;1
atgj;2;acg;;aag;1;agg;1
ctg;1;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;

Liste

;;;;;;cd112;;;cd112
cd011;cd011;cd118;cd001;;;14;;;20
7;7;17;13;;cd002;tcg;;cd136;tcc
agc;tca;tgc;gta;;12;16s;;19;16s
16s;tcc;gtc;gac;;16s;23s;;16s;cds
5s;16s;tac;ttc;;23s;gca;;23s;23s
23s;5s;caa;ggc;;5s;5s;;5s;5s
gac;23s;aaa;tgc;;caa;gaa;;aac;aac
gta;aac;gaa;16s;;gaa;gta;;tta;tta
aca;gaa;aac;gca;;gta;gac;;atgf;atgf
tac;atgi;atgf;atc;;gac;aca;;gaa;gaa
atgf;gta;agc;23s;;aca;tac;;gga;gta
ttc;tta;atgj;5s;;aaa;gga;;gta;gac
;;ggc;aac;;atgf;aaa;;gac;aca
;;cgt;gaa;;ttc;aag;;aca;cta
;;ccc;gac;;cta;agc;;tac;ggc
;;ctg;aca;;gga;cca;;cta;aga
;;ggc;tac;;aga;atc;;aga;caa
;;16s;aaa;;cac;tgg;;caa;aaa
;;5s;;;;;;tca;tca
;;atc;;;;;;ttc;ttc
;;gca;;;;;;atgj;atgj
;;23s;;;;;;atgi;atgi
;;;;;;;;cca;cac
;;;;;;;;cac;tgc
;;;;;;;;aaa;agg

clostridia total blocs longs

Lien fiche: clostridia total blocs longs

clostridia total longs;;;;;;;;;clostridia total longs;;;;;;;
tot;572;;;atgf;26;;;;1000;;;;atgf;45;;
ttt;;tct;;tat;;tgt;;;ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;25;tcc;1;tac;26;tgc;11;;ttc;44;tcc;2;tac;45;tgc;19
atc;10;acc;5;aac;26;agc;11;;atc;17;acc;9;aac;45;agc;19
ctc;1;ccc;3;cac;12;cgt;8;;ctc;2;ccc;5;cac;21;cgt;14
gtc;4;gcc;4;gac;38;ggc;22;;gtc;7;gcc;7;gac;66;ggc;38
tta;16;tca;13;taa;0;tga;0;;tta;28;tca;23;taa;0;tga;0
atgi;15;aca;28;aaa;31;aga;21;;atgi;26;aca;49;aaa;54;aga;37
cta;18;cca;17;caa;25;cga;1;;cta;31;cca;30;caa;44;cga;2
gta;36;gca;1;gaa;41;gga;29;;gta;63;gca;2;gaa;72;gga;51
ttg;0;tcg;1;tag;0;tgg;8;;ttg;0;tcg;2;tag;0;tgg;14
atgj;18;acg;3;aag;2;agg;1;;atgj;31;acg;5;aag;3;agg;2
ctg;5;ccg;2;cag;1;cgg;2;;ctg;9;ccg;3;cag;2;cgg;3
gtg;0;gcg;0;gag;4;ggg;0;;gtg;0;gcg;0;gag;7;ggg;0

bacilli-clostridia

B-C blocs 1-3

Comparaison B/C z1-3

Lien fiche: Comparaison B/C z1-3

Bacilli 1-3;;total;;atgf;;cds;5s
tRNA;;;;308;;;
ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;;tcc;;tac;;tgc;
atc;;acc;108;aac;185;agc;
ctc;15;ccc;;cac;;cgt;31
gtc;;gcc;;gac;292;ggc;
tta;;tca;15;taa;;tga;
atgi;;aca;;aaa;;aga;
cta;;cca;;caa;;cga;
gta;15;gca;;gaa;15;gga;
ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;15;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;

Comparaison B+C z2/z1

Lien fiche: Comparaison B+C z2/z1
Voir B et C

B+C  2;;;B+C 1;;
B;;;B;;
aac-acc;7;;aac;3;
atgf-gac;5;;gaa;1;
aac-cgt;2;;tca;1;
atgf-gac;14;;gta;1;
;;;;;
C;;;C;;C avant
atgi-gca;10;;aac;17;1-3 après
atc-gca;3;;aaa;12;
ttc-tgc;3;;ttc;10;aac-atgf
aac-ggg;2;;acc;4;
tta-atgi;2;;atgi;1;
aac-aac;1;;gaa;1;
aac-5s-aac;2;;ggc;1;aac
aac-atgf;1;;gta;1;
gac-aca;1;;tgg;1;
gta-tta;1;;aac-5s;2;aac
;;;gga-5s;2;aac-aac
;54;;aac;2;
;;;;60;

Comparaison B+C z4-8/z1-3

Lien fiche: Comparaison B+C z4-8/z1-3
Voir B et C pour les z1-3 et B+C pour les z4-8.
effectifs

Clostridia 1-3;;;Bacili 1-3;
;;;;
aac;38;;atgf;20
ttc;19;;gac;19
aaa;17;;aac;12
atgi;14;;acc;7
gca;14;;cgt;2
acc;5;;ctc;1
tgc;5;;ctg;1
5s;4;;gaa;1
gaa;4;;tca;1
atc;3;;gta;1
tta;3;;;
gac;2;;;
gga;2;;;
ggg;2;;;
gta;2;;;
aca;1;;;
atgf;2;;;
cds;2;;;
cgg;1;;;
ctc;1;;;
ggc;1;;;
gtg;1;;;
tgg;1;;;

différences significatives

atgi;°6_3_19.9;cds;-0.9_0_4.6;5s;-0.1_2_7.5;atgf;°11.8_1_28.8
ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;°9.6_5_25.5;tcc;&-1_0_3.2;tac;$5.2_0_18.6;tgc;0.4_1_8.9
atc;-0.5_2_6.1;acc;4.6_6_17.5;aac;°34.3_17_58;agc;&-0.8_0_5.1
ctc;-0.9_0_4.6;ccc;;cac;;cgt;°-0.9_7_4.6
gtc;;gcc;;gac;11_15_27.7;ggc;°-1_11_2.8
tta;-0.5_3_6.1;tca;-1_1_2.8;taa;;tga;
ata;;aca;°-1.9_10_1.9;aaa;8.1_10_23.3;aga;&-0.3_0_6.8
cta;$1.5_0_11.5;cca;$2.2_0_13;caa;$3.6_0_15.8;cga;&-1_0_3.2
gta;°-0.5_18_6.1;gca;°6_5_19.9;gaa;°0.4_19_8.9;gga;°-0.9_8_4.6
ttg;;tcg;;tag;;tgg;-1_0_2.8
atgj;$0.8_0_10;acg;&-0.3_0_6.8;aag;;agg;
ctg;-1_0_2.8;ccg;;cag;;cgg;-1_0_2.8
gtg;-1_0_2.8;gcg;;gag;&-0.8_0_5.1;ggg;-0.9_0_4.6

B-C total blocs longs

Lien fiche: B-C total blocs longs

+ grande variation du pour 1000;;;Bacilli-clostridia;;atgf;-12;
B-C;;;;;;;
tot;0;;;atgf;;-10;
ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;-19;tcc;898;tac;-40;tgc;-10
atc;56;acc;33;aac;11;agc;15
ctc;6;ccc;-5;cac;47;cgt;233
gtc;-5;gcc;-6;gac;-31;ggc;53
tta;23;tca;23;taa;0;tga;0
atgi;-126;aca;3;aaa;-11;aga;-6215
cta;0;cca;51;caa;-9;cga;-2
gta;3;gca;1995;gaa;-33;gga;-78
ttg;1860;tcg;-1;tag;0;tgg;75
atgj;-69;acg;-3;aag;-3;agg;-2
ctg;-37;ccg;-3;cag;-2;cgg;-3
gtg;0;gcg;0;gag;-7;ggg;1

B-C blocs longs différences significatives

Lien fiche: B-C blocs longs différences significatives

tot;45 blocs #;;;atgf;atgi;5s;cds;;tot;21 blocs #;;;atgf;atgi;5s;cds; - ;tot;21 blocs #;;atgf;;atgi;5s;cds
709;;;;34;7;;;;351;;;;20;9;;;;351;2σ;;8,8 - 20 - 24,8;;'-0,2 - 9 - 7,2;;
ttt;;tct;;tat;;tgt;;;ttt;;tct;;tat;;tgt;;;ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;27;tcc;14;tac;27;tgc;15;;ttc;17;tcc;1;tac;14;tgc;5;;ttc;6,2 - 17 - 20,5;tcc;1,7 - 1 - 12,1;tac;6,2 - 14 - 20,5;tgc;2,0 - 5 - 12,8
atc;24;acc;9;aac;28;agc;13;;atc;8;acc;4;aac;13;agc;7;;atc;5,1 - 8 - 18,7;acc;0,3 - 4 - 8,7;aac;6,6 - 13 - 21,2;agc;1,4 - 7 - 11,5
ctc;4;ccc;;cac;24;cgt;30;;ctc;1;ccc;2;cac;10;cgt;6;;ctc;'-0,8 - 1 - 4,8;ccc;;cac;5,1 - 10 - 18,7;cgt;7,3 - 6 - 22,4
gtc;3;gcc;1;gac;37;ggc;41;;gtc;3;gcc;4;gac;21;ggc;12;;gtc;'-0,9 - 3 - 3,9;gcc;'-0,9 - 4 - 1,9;gac;10,0 - 21 - 26,7;ggc;11,6 - 12 - 29
tta;19;tca;24;taa;;tga;;;tta;10;tca;8;taa;;tga;;;tta;3,4 - 10 - 15,5;tca;5,1 - 8 - 18,7;taa;;tga;
ata;;aca;33;aaa;32;aga;1;;ata;;aca;16;aaa;19;aga;13;;ata;;aca;8,4 - 16 - 24,2;aaa;8,1 - 19 - 23,6;aga;'-0,9 - 13 - 1,9
cta;20;cca;28;caa;29;cga;;;cta;11;cca;12;caa;13;cga;;;cta;3,7 - 11 - 16,1;cca;6,6 - 12 - 21,2;caa;6,9 - 13 - 21,8;cga;
gta;39;gca;22;gaa;38;gga;23;;gta;21;gca;0;gaa;21;gga;17;;gta;10,8 - 21 - 27,9;gca;4,4 - 0 - 17,4;gaa;10,4 - 21 - 27,3;gga;4,7 - 17 – 18,0
ttg;16;tcg;2;tag;;tgg;21;;ttg;0;tcg;1;tag;;tgg;6;;ttg;2,4 - 0 - 13,5;tcg;'-1,0 - 1 - 3,0;tag;;tgg;4,0 - 6 - 16,7
atgj;14;acg;2;aag;;agg;;;atgj;13;acg;1;aag;1;agg;;;atgj;1,7 - 13 - 12,1;acg;'-1,0 - 1 - 3,0;aag;;agg;
ctg;7;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;4;ccg;2;cag;1;cgg;2;;ctg;'-0,2 - 4 - 7,2;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;2;ggg;0;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;'-0,9 - 0 - 1,9
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
tot;124 blocs=;;;atgf;atgi;5s;cds;;tot;44 blocs=;;;atgf;atgi;5s;cds; - ;tot;44 blocs=;;;atgf;atgi;5s;cds
1722;;;;71;20;2;;;573;;;;26;15;1;;;573;2σ;;;14,1 - 26 - 33,1;1,5 - 15 - 11,8;'-1,0 - 1 - 2,3;
ttt;;tct;;tat;;tgt;;;ttt;;tct;;tat;;tgt;;;ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;63;tcc;30;tac;56;tgc;30;;ttc;25;tcc;1;tac;26;tgc;11;;ttc;12,0 - 25 - 29,9;tcc;3,7 - 1 - 16,2;tac;10,1 - 26 - 27,1;tgc;3,7 - 11 - 16,2
atc;47;acc;20;aac;87;agc;38;;atc;10;acc;5;aac;26;agc;11;;atc;7,8 - 10 - 23,4;acc;1,5 - 5 - 11,8;aac;18,5 - 26 – 39,4;agc;5,6 - 11 - 19,7
ctc;14;ccc;;cac;53;cgt;80;;ctc;1;ccc;3;cac;12;cgt;8;;ctc;0,4 - 1 – 9,0;ccc;;cac;9,4 - 12 - 25,9;cgt;16,6 - 8 - 36,7
gtc;3;gcc;1;gac;87;ggc;101;;gtc;4;gcc;4;gac;38;ggc;22;;gtc;'-1,0 - 4 – 3,0;gcc;'-0,8 - 4 - 1,5;gac;18,5 - 38 - 39,4;ggc;22,4 - 22 - 44,8
tta;59;tca;48;taa;;tga;;;tta;16;tca;13;taa;;tga;;;tta;10,9 - 16 - 28,3;tca;8,1 - 13 - 23,8;taa;;tga;
ata;;aca;87;aaa;84;aga;1;;ata;;aca;28;aaa;31;aga;21;;ata;;aca;18,5 - 28 - 39,4;aaa;17,6 - 31 - 38,3;aga;'-0,8 - 21 - 1,5
cta;54;cca;77;caa;69;cga;;;cta;18;cca;17;caa;25;cga;1;;cta;9,6 - 18 - 26,3;cca;15,7 - 17 - 35,5;caa;13,6 - 25 - 32,3;cga;
gta;112;gca;63;gaa;93;gga;49;;gta;36;gca;1;gaa;41;gga;29;;gta;25,5 - 36 - 49,1;gca;12,0 - 1 - 29,9;gaa;20,1 - 41 - 41,8;gga;8,4 - 29 - 24,3
ttg;32;tcg;2;tag;;tgg;42;;ttg;0;tcg;1;tag;;tgg;8;;ttg;4,2 - 0 - 17,1;tcg;'-1,0 - 1 - 2,3;tag;;tgg;6,6 - 8 - 21,4
atgj;32;acg;3;aag;;agg;;;atgj;18;acg;3;aag;2;agg;1;;atgj;4,2 - 18 - 17,1;acg;'-1,0 - 3 – 3,0;aag;;agg;
ctg;11;ccg;;cag;;cgg;;;ctg;5;ccg;2;cag;1;cgg;2;;ctg;'-0,2 - 5 - 7,5;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;1;;gtg;;gcg;;gag;4;ggg;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg;'–0,8 -0 - 1,5

B-C blocs longs référence

Lien fiche: B-C blocs longs référence

intervalle réduit;;;;4 bascule;2 faibles;acc   ctg;aga atgi
;;;;22 dedans;2 externes;atgi  cgt;gca cgt
comparaison B-C;;écart par rapport 2 sigma;;;;;
tot;%;;;atgf;atgi;5s;cds
−;;;;24;-20;;
ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;21;tcc;-70;tac;46;tgc;60
atc;36;acc;92;aac;49;agc;64
ctc;;ccc;;cac;49;cgt;-22
gtc;;gcc;;gac;27;ggc;3
tta;55;tca;36;taa;;tga;
ata;;aca;47;aaa;24;aga;-85
cta;46;cca;45;caa;47;cga;
gta;33;gca;-100;gaa;30;gga;6
ttg;-100;tcg;;tag;;tgg;33
atgj;-7;acg;;aag;;agg;
ctg;75;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;
;;;;;;;
référence;caractérisation des tRNA en xyz;;;13;6 bascule;aga 1 atgi 7;
;;;;46;22>19;2 faibles;
Bactéries;9-23;;;;;;
tot;%;1060;;atgf;atgi;5s;cds
1000;;;;51;15;0;0
ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;42;tcc;14;tac;39;tgc;19
atc;30;acc;12;aac;39;agc;19
ctc;5;ccc;2;cac;32;cgt;34
gtc;6;gcc;5;gac;55;ggc;50
tta;27;tca;30;taa;;tga;
ata;;aca;46;aaa;48;aga;13
cta;29;cca;38;caa;40;cga;
gta;57;gca;21;gaa;56;gga;38
ttg;15;tcg;3;tag;;tgg;25
atgj;25;acg;3;aag;1;agg;0
ctg;10;ccg;2;cag;1;cgg;2
gtg;0;gcg;0;gag;2;ggg;1
;;;;;;;
fréquences;;;;bascule max;;;
2;19;agc tgc;;tcc;;;
3;25-27;tgg atgj tta;;ttg atgi;;;
4;29-32;cta atc tca cac;;gca;;;
6;38-42;cca gga aac tac caa ttc;;cgt aga;;;
4;46-51;aca aaa ggc atgf;;;;;
3;55-57;gac gaa gta;;;;;
22;;;;;;;

B-C blocs longs 4-8

B-C blocs longs 4-8 somme

Lien fiche: B-C blocs longs 4-8 somme

z4-8 ;B-C;;;;;;
somme;193;;;;;;
cds;0;5s;1;atgf;1;atgi;3
ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;5;tcc;1;tac;11;tgc;1
atc;2;acc;6;aac;17;agc;2
ctc;;ccc;;cac;;cgt;7
gtc;;gcc;;gac;15;ggc;11
tta;3;tca;1;taa;;tga;
ata;;aca;10;aaa;10;aga;3
cta;6;cca;7;caa;9;cga;1
gta;18;gca;5;gaa;19;gga;8
ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;5;acg;3;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;2;ggg;

B-C blocs longs 4-8 différences significatives B-C

Lien fiche: B-C blocs longs 4-8 différences significatives B-C

tot;;;atgf;;atgi;;5s
100;2σ;;°-1.9_0_0.9;atgf;-3.3_0_2.8;atgi;&-1.1_1_2.1
ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;-1.3_2_4.8;tcc;&-2.1_0_2.1;tac;-0.9_4_10.5;tgc;-1.9_0_0.9
atc;&-2.9_0_2.9;acc;3.1_5_5.9;aac;5.1_10_16.5;agc;&-0.9_1_2.9
ctc;;ccc;;cac;°;cgt;1.7_7_14.5
gtc;;gcc;;gac;-0.8_5_14.3;ggc;3.2_7_10.7
tta;-1.7_1_2.9;tca;°-1.9_0_0.9;taa;;tga;
ata;;aca;-0.6_4_9.6;aaa;0.8_5_9.7;aga;-3.3_0_2.8
cta;-1.8_2_5.7;cca;4.1_6_6.9;caa;-2.9_2_8.5;cga;-1.9_0_0.9
gta;6.1_11_17.5;gca;2.1_4_4.9;gaa;-0.5_6_18.1;gga;-3.9_1_7.5
ttg;;tcg;;tag;;tgg;°
atgj;&-4.5_0_4.5;acg;-1.7_1_2.9;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;-2.7_0_1.9;ggg;

B-C blocs longs 4-8 différences significatives, 9-23/4-8

Lien fiche: B-C blocs longs 4-8 différences significatives, 9-23/4-8

différences significatives avec la référence;;;;;;;
total;4-8 B+C;;intervalle;atgf;atgi;;
176;;;;3,1−0−14,8;-0,6−2−5,9;;
ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;2,0−4−12,6;tcc;-0,6−1−5,6;tac;1,7−9−11,9;tgc;-0,3−1−6,9
atc;0,8−2−9,9;acc;-0,8−6−5,1;aac;1,7−15−11,9;agc;-0,3−2−6,9
ctc;-1,0−0−2,6;ccc;-0,8−0−1,5;cac;1,0−0−10,3;cgt;1,2−7−10,8
gtc;-1,0−0−3,0;gcc;-1,0−0−2,6;gac;3,6−13−15,7;ggc;3,0−11−14,6
tta;0,5−2−9,1;tca;0,8−1−9,9;taa;*;tga;*
ata;*;aca;2,6−8−13,7;aaa;2,8−9−14,1;aga;-0,7−3−5,4
cta;0,7−6−9,6;cca;1,6−7−11,7;caa;1,8−9−12,1;cga;*
gta;3,8−16−16,1;gca;-0,1−5−7,4;gaa;3,7−17−15,9;gga;1,6−8−11,7
ttg;-0,6−0−5,9;tcg;-0,9−0−1,9;tag;*;tgg;0,3−0−8,7
atgj;0,3−5−8,7;acg;-0,9−3−1,9;aag;-0,6−0−1,0;agg;*
ctg;-0,9−0−4,5;ccg;-0,8−0−1,5;cag;-0,6−0−1,0;cgg;-0,8−0−1,5
gtg;*;gcg;*;gag;-0,8−2−1,5;ggg;-0,6−0−1,0

B-C blocs longs 4-8 comparaison 9-23

Lien fiche: B-C blocs longs 4-8 comparaison 9-23

total;4-8 B+C;intervalle réduit;;atgf;atgi;;
175;;;;-100;130;;
ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;50;tcc;160;tac;32;tgc;130
atc;60;acc;-15;aac;-21;agc;115
ctc;100;ccc;100;cac;-100;cgt;53
gtc;100;gcc;100;gac;20;ggc;32
tta;75;tca;20;taa;*;tga;*
ata;*;aca;69;aaa;57;aga;77
cta;60;cca;66;caa;34;cga;*
gta;0;gca;48;gaa;-7;gga;45
ttg;100;tcg;100;tag;*;tgg;-100
atgj;72;acg;-37;aag;100;agg;*
ctg;100;ccg;100;cag;100;cgg;100
gtg;*;gcg;*;gag;-25;ggg;100
;;;;;;;
B-C 4-8;pourcentage;;;atgf;atgi;5s;
1000;175;;;;11;;
ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;23;tcc;6;tac;51;tgc;6
atc;11;acc;34;aac;86;agc;11
ctc;;ccc;;cac;;cgt;40
gtc;;gcc;;gac;74;ggc;63
tta;11;tca;6;taa;;tga;
ata;;aca;46;aaa;51;aga;17
cta;34;cca;40;caa;51;cga;6
gta;91;gca;29;gaa;97;gga;46
ttg;;tcg;;tag;;tgg;
atgj;29;acg;17;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;11;ggg;

B-C blocs longs bascules z9-23 dans tout type

Lien fiche: B-C blocs longs bascules z9-23 dans tout type

;;bascules z9-23  dans tout type;;;;;;;;
type;ttg;gca;tcc;cgt;;atgi;atgj;aga;total;aas
B9z;16;22;14;30;*;7;14;1;104;709
C9z;0;0;1;6;*;9;13;13;42;351
B9z %;23;31;20;42;*;10;20;1;147;1000
C9z %;0;0;3;17;*;26;37;37;120;1000
B9x;0;2;0;13;*;0;0;0;15;158
C9x;0;0;0;1;*;0;1;0;2;15
B9z’;néant;;;;*;néant;;;0;−
C9z’;0;1;0;0;*;1;1;1;4;32
B4x-z’;néant;;;;*;néant;;;;
B4z;0;4;1;7;*;0;5;0;17;93
C4-8;0;1;0;0;*;3;0;3;7;105

B-C blocs longs comparaisons synthèse

Lien fiche: B-C blocs longs comparaisons synthèse

17.6.20 Tanger;;bascules;;;;;
B-C ;;;;atgf;atgi;5s;cds
b709;c351;b93;c105;&d9-4;§i9;;
ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;$;tcc;§d9;tac;$;tgc;$
atc;$;acc;°i9-4 d4;aac;?i9-4;agc;$
ctc;;ccc;;cac;&d9-4;cgt;§d9
gtc;;gcc;;gac;$;ggc;$
tta;$;tca;?d9-4;taa;*;tga;*
ata;*;aca;$;aaa;$;aga;§i9
cta;$;cca;°d4;caa;°i4;cga;*
gta;?i9-4;gca;§d9;gaa;°i9-4 i4;gga;°i4
ttg;§d9;tcg;;tag;*;tgg;&d9-4
atgj;§i9 d4;acg;;aag;;agg;
ctg;$;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;

B-C blocs longs Cz'

B-C blocs longs Cz' B-C9-23

Lien tableur: B-C blocs longs Cz’ B-C9-23

+z'9-23;bacilli;;;;;;
tot;45 blocs #;;;atgf;atgi;5s;cds
709;;;;34;7;;
ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;27;tcc;14;tac;27;tgc;15
atc;24;acc;9;aac;28;agc;13
ctc;4;ccc;;cac;24;cgt;30
gtc;3;gcc;1;gac;37;ggc;41
tta;19;tca;24;taa;;tga;
ata;;aca;33;aaa;32;aga;1
cta;20;cca;28;caa;29;cga;
gta;39;gca;22;gaa;38;gga;23
ttg;16;tcg;2;tag;;tgg;21
atgj;14;acg;2;aag;;agg;
ctg;7;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;1
;;;;;;;
;clostridia;;;;;;
tot;23 blocs #;;;atgf;atgi;5s;cds
383;;;;21;10;;
ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;18;tcc;1;tac;15;tgc;6
atc;9;acc;4;aac;14;agc;8
ctc;1;ccc;2;cac;11;cgt;6
gtc;3;gcc;4;gac;23;ggc;13
tta;11;tca;9;taa;;tga;
ata;;aca;18;aaa;21;aga;14
cta;12;cca;13;caa;14;cga;
gta;23;gca;1;gaa;23;gga;18
ttg;0;tcg;1;tag;;tgg;7
atgj;14;acg;1;aag;2;agg;1
ctg;4;ccg;2;cag;1;cgg;2
gtg;;gcg;;gag;2;ggg;0
;;;;;;;
;;;;;;;
total;;;intervalle;atgf;atgi;;
383;;;;10_21_26.7;-0.1_10_7.7;;
ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;7.1_18_22.1;tcc;2.1_1_13;tac;7.1_15_22.1;tgc;2.5_6_13.7
atc;5.9_9_20;acc;0.5_4_9.2;aac;7.5_14_22.7;agc;1.8_8_12.3
ctc;-0.8_1_5.1;ccc;-0.1_0_7.5;cac;5.9_11_20;cgt;8.3_6_24.1
gtc;-0.9_3_4.2;gcc;-0.9_4_2;gac;11.3_23_28.7;ggc;13_13_31.3
tta;3.9_11_16.6;tca;5.9_9_20;taa;;tga;
ata;;aca;9.6_18_26.1;aaa;9.2_21_25.4;aga;-0.9_14_2
cta;4.3_12_17.3;cca;7.5_13_22.7;caa;7.9_14_23.4;cga;
gta;12.1_23_30;gca;5.1_1_18.7;gaa;11.7_23_29.3;gga;5.5_18_19.4
ttg;2.8_0_14.5;tcg;-1_1_3.2;tag;;tgg;4.7_7_18
atgj;2.1_14_13;acg;-1_1_3.2;aag;-0.1_0_7.5;agg;-0.9_0_4.6
ctg;-0.1_4_7.7;ccg;-0.1_0_7.5;cag;-0.9_0_4.6;cgg;-0.1_0_7.5
gtg;;gcg;;gag;-0.1_0_7.5;ggg;-0.9_0_2

B-C blocs longs Cz' B-C9-4

Lien tableur: B-C blocs longs Cz’ B-C9-4

z+z’9-23;;;;;;;
1092;;;;;;;
tot;;;;atgf;atgi;5s;cds
1092;;;;55;17;;
ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;45;tcc;15;tac;42;tgc;21
atc;33;acc;13;aac;42;agc;21
ctc;5;ccc;2;cac;35;cgt;36
gtc;6;gcc;5;gac;60;ggc;54
tta;30;tca;33;taa;*;tga;*
ata;*;aca;51;aaa;53;aga;15
cta;32;cca;41;caa;43;cga;*
gta;62;gca;23;gaa;61;gga;41
ttg;16;tcg;3;tag;*;tgg;28
atgj;28;acg;3;aag;2;agg;1
ctg;11;ccg;2;cag;1;cgg;2
gtg;;gcg;;gag;2;ggg;1
;;;;;;;
z+z’4-8;;;;;;;
193;;;;;;;
tot;;;;atgf;atgi;5s;cds
193;;;;1;3;1;
ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;5;tcc;1;tac;11;tgc;1
atc;2;acc;6;aac;17;agc;2
ctc;0;ccc;0;cac;0;cgt;7
gtc;0;gcc;0;gac;15;ggc;11
tta;3;tca;1;taa;*;tga;*
ata;*;aca;10;aaa;10;aga;3
cta;6;cca;7;caa;9;cga;1
gta;18;gca;5;gaa;19;gga;8
ttg;0;tcg;0;tag;*;tgg;0
atgj;5;acg;3;aag;0;agg;0
ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;0
gtg;;gcg;;gag;2;ggg;0
;;;;;;;
total;;;intervalle;atgf;atgi;;
193;;;;3,6−1−15,8;-0,4−3−6,4;;
ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;2,4−5−13,5;tcc;-0,6−1−5,9;tac;2,1−11−12,8;tgc;-0,1−1−7,5
atc;1,1−2−10,6;acc;-0,7−6−5,3;aac;2,1−17−12,8;agc;-0,1−2−7,5
ctc;-1,0−0−2,8;ccc;-0,8−0−1,5;cac;1,3−0−11,1;cgt;1,4−7−11,3
gtc;-1,0−0−3,1;gcc;-1,0−0−2,8;gac;4,3−15−16,9;ggc;3,5−11−15,6
tta;0,8−3−9,8;tca;1,1−1−10,6;taa;*;tga;*
ata;*;aca;3,2−10−14,9;aaa;3,4−10−15,3;aga;-0,6−3−5,9
cta;1,0−6−10,3;cca;2,0−7−12,5;caa;2,2−9−13,0;cga;*
gta;4,5−18−17,4;gca;0,1−5−8,1;gaa;4,4−19−17,2;gga;2,0−8−12,5
ttg;-0,5−0−6,2;tcg;-0,9−0−2,0;tag;*;tgg;0,6−0−9,3
atgj;0,6−5−9,3;acg;-0,9−3−2,0;aag;-0,8−0−1,5;agg;-1,0−0−1,0
ctg;-0,8−0−4,7;ccg;-0,8−0−1,5;cag;-0,7−0−1,0;cgg;-0,8−0−1,5
gtg;;gcg;;gag;-0,8−2−1,5;ggg;-0,7−0−1,0

Autres firmicutes

Autres firmicutes blocs

Lien fiche: Autres firmicutes blocs

en002;Erysipelotrichia;;;;;;;;;;;
en003;Lactobacillales;;;;;;;;;;;
lien;blocs;16s;total aas;avec;sans;total page;en002-3;;;;;Notes
en002;3*16s23s5s;3;53;0;53;;;'''16s23s5s;'''atcgca;'''gcaatc;'''gca;
;5s;;;;;;'''sans;3;;;;'''1-3
;;;;;;;'''1-3;1;;;;16s23s5s-cds-tgc-taa 
;;;;;;;'''4-8;;;;;
en003;16s23s5s-cds-tgc-taa ;;40;2;38;;'''9-23;;;;;'''cds
;;1;;;;;'''24-43;;;;;16s23s5s-cds-tgc-taa 
total;;;93;2;91;4;'''total;4;0;0;0;
;;;;;;;;;;;;'''5s en trop
;;;;;;;;;;;;5s
;;;;;;;;;;;;
Negativicutes;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;en004-9;;;;Notes
en004;16s23s5s;7;77;63;14;;;'''16s23s5s;'''atcgca;'''gcaatc;'''gca;
;16atcgca235-9aas;;;;;;'''sans;16;4;;3;'''1-3
;2*16atcgca235-12aas;;;;;;'''1-3;3;2;;;16s23s5s-cds-tac-caa
;16235-19aas;;;;;;'''4-8;;;;;16235-aac-gaa-acg
;16s23s5s-cds-tac-caa;;;;;;'''9-23;1;3;;;16atcgca235-tgg-cgt
;16235-aac-gaa-acg;;;;;;'''24-43;;;;;16atcgca235-aac
;;;;;;32;'''total;20;9;0;3;16s23s5s-aac
;;;;;;;;;;;;
en005;4*16s23s5s;6;60;4;56;;;;;;;'''cds
;2*16atcgca235;;;;;;;;;;;16s23s5s-cds-tac-caa
;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;'''5s en trop
en006;3*16s23s5s;3;53;0;53;;;;;;;16s23s5s-5s
;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
en008;4*16s23s5s;7;65;6;59;;;;;;;
;2*16-gca-235;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-tgg-cgt;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
en009;3*16s23s5s;9;77;9;68;;;;;;;
;16s23s5s-aac;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-aac;;;;;;;;;;;
;2*16atcgca235;;;;;;;;;;;
;16-gca-235;;;;;;;;;;;
;16s23s5s-5s;;;;;;;;;;;
;;32;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;16s;total aas;avec;sans;total page;en010-13;;;;;Notes
en010;6*16s23s5s;15;99;28;71;;;'''16s23s5s;'''atcgca;'''gcaatc;'''gca;
;3*16atcgca235;;;;;;'''sans;15;4;1;1;'''1-3
;16-gca-235;;;;;;'''1-3;2;2;1;1;16-gca-235-aac
;16s23s5s-5s;;;;;;'''4-8;;;;;16-gcaatc-235-cac-tgg-agc
;16-gca-235-aac;;;;;;'''9-23;1;;1;;16atcgca235-aac
;16atcgca235-aac;;;;;;'''24-43;;;;;16atcgca235-tgg-cgt
;16s23s5s-acc;;;;;29;'''total;18;6;3;2;16s23s5s-acc
;16s-23s°;;;;;;;;;;;16s23s5s-cac-tgg
;gga-5s-5aas-ncRNA-9aas;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;'''incomplets
en011;4*16s23s5s;7;73;20;53;;;;;;;16s23s
;16-gcaatc-235-cac-tgg-agc;;;;;;;;;;;16s-23s°
;16-gcaatc-2355-13 aas;;;;;;;;;;;
;16s23s;;;;;;;;;;;'''5s en trop
;;;;;;;;;;;;16s23s5s-5s
en012;16s23s5s;4;55;16;39;;;;;;;gga-5s-5aas-ncRNA-9aas
;16-gca-atc-235;;;;;;;;;;;16-gcaatc-2355-13 aas
;16s23s5s-cac-tgg;;;;;;;;;;;
;16s23s5s-12aas;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
en013;2*16s23s5s;4;49;6;43;;;;;;;
;16atcgca235;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-tgg-cgt;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
;;30;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;16s;total aas;avec;sans;total pages;total;;;;;Notes
9;;;;;;;;'''16s23s5s;'''atcgca;'''gcaatc;'''gca;
;;;;;;;'''sans;31;8;1;4;
;'''Total;;608;152;456;;'''1-3;5;4;1;1;
;'''Moyenne;;17;51;31;;'''4-8;0;0;0;0;
;'''ecartype;;19;17;2;;'''9-23;2;3;1;0;
;'''max;;63;71;32;;'''24-43;;;;;
;'''min;;0;14;29;61;'''total;38;15;3;5;

negativicutes 9-23

Lien fiche: negativicutes 9-23
Tableau

autres firmicutes;;;;;;;
9-23;;;;;;;
tot;93;;;atgf;3;5s;1
ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;6;tcc;2;tac;3;tgc;2
atc;1;acc;;aac;5;agc;2
ctc;2;ccc;;cac;3;cgt;4
gtc;;gcc;;gac;7;ggc;3
tta;4;tca;1;taa;;tga;
atgi;1;aca;5;aaa;5;aga;
cta;1;cca;2;caa;5;cga;
gta;7;gca;;gaa;5;gga;4
ttg;2;tcg;;tag;;tgg;2
atgj;1;acg;;aag;2;agg;
ctg;2;ccg;;cag;;cgg;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;

Liste

en004;en004;en004;en012;en011;en010;en004
9;12;12;12;13;15;19
16s;16s;16s;16s;16s;;16s
atc;atc;atc;23s;gca;;23s
gca;gca;gca;5s;atc;;5s
23s;23s;23s;;23s;;
5s;5s;5s;;5s;;
;;;;5s;;
;;;;;;
gta;aac;aac;aac;aac;gga;gta
aaa;tcc;tcc;caa;caa;5s;aaa
cta;gaa;gaa;aaa;aaa;aac;aca
aca;gta;gta;aag;gaa;atgf;ggc
ggc;gac;gac;gta;aag;cac;tta
tta;ttc;ttc;gac;gta;caa;cgt
cgt;tac;tac;ttc;gac;agc;cca
cgt;tgg;tgg;aca;ttc;ncRNA;atgj
cca;cac;cac;gga;aca;cgt;atgi
;caa;caa;tta;gga;ttc;tca
;tgc;tgc;ctg;tta;aca;atgf
;ttg;ttg;ctc;ctg;tac;gac
;;;;ctc;aaa;ttc
;;;;;gaa;gga
;;;;;gta;atc
;;;;;gac;agc
;;;;;ggc;gaa
;;;;;;atgf
;;;;;;gac

Firmicutes z9-23

Lien fiche: Firmicutes z9-23

z9-23 des firmicutes;;;;;
tRNA;bacilli;clostridia;negativicutes;Bx9-23;Cz’4-23
atgi;10;26;11;0;29
atgj;20;37;11;0;29
tgc;21;14;22;0;43
tgg;30;17;22;8;14
gca;31;0;0;16;14
cac;34;28;32;0;14
atc;34;23;11;24;14
ttc;38;48;65;8;43
tac;38;40;32;0;58
aac;39;37;54;73;58
cca;39;34;22;81;14
caa;41;37;54;73;29
aaa;45;54;54;73;58
atgf;48;57;32;24;43
gac;52;60;75;81;72
gaa;54;60;54;73;72
gta;55;60;75;57;72
aga;1;37;0;0;14
cgt;42;17;43;81;14
gga;32;34;43;65;14
ggc;58;48;32;24;58
acc;13;11;0;0;0
aca;47;46;54;16;58
agc;18;20;22;65;29
tcc;20;3;22;0;0
tca;34;23;11;16;14
ctg;10;11;22;0;14
ttg;23;0;22;0;0
tta;27;28;43;24;29
cta;28;31;11;49;14
4 xxc;11;29;22;57;29
11 xxg;7;30;22;0;29
;;;;;
eff;709;351;93;123;69

Comparaison avec z4-8 et z9-23

Lien fiche: Comparaison avec z4-8 et z9-23

tRNA;B+C z9-23;B+C z4-8;Bx9-23;B+C z1-3;;tRNA;B+C z9-23;B+C z4-8;Bx9-23;B+C z1-3
$atgi;&16;16;;'''67;;$aga;&14;16;;
$atgj;&26;26;;;;$cgt;&33;36;'''81;10
tgc;&19;5;;24;;gga;38;41;'''65;10
tgg;&26;° ;8;5;;ggc;49;57;24;°5
$gca;&21;26;16;'''67;;acc;&14;'''31;;'''57
cac;&32;° ;§ ;° ;;aca;&14;52;16;°5
atc;&30;10;24;14;;agc;19;10;'''65;
ttc;41;26;§8;'''91;;$tcc;14;5;;
tac;38;57;§ ;° ;;tca;30;°5;16;5
aac;38;'''88;73;'''239;;ctg;&10;;;5
cca;38;36;'''81;° ;;$ttg;&15;;;
caa;39;47;73;° ;;tta;&27;16;24;14
aaa;49;52;73;'''81;;cta;&29;31;49;° 
atgf;50;°5;24;'''105;;4 xxc;16;;'''57;10
gac;55;78;81;'''100;;11 xxg;16;26;;19
gaa;56;'''98;73;24;;autres;;10;8;29
gta;57;'''93;57;14;;eff;1092;193;123;209

Liste des chaînes de 2 et 3 aas des types 1-3

Lien fiche: Liste des chaînes de 2 et 3 aas des types 1-3

Types 1-3 z z’ x longs de 2 ou 3 aas;;;;;
;;;;;
clade type;tRNA;eff;clade type;tRNA;eff
'''negativ   z;tgg-cgt;2;'''clostri  z;°atgi-gca;10
;cac-tgg;;;atc-gca;3
;tac-caa;;;ttc-tgc;3
;cac-tgg-agc;;;&aac-ggg;2
;&aac-gaa-acg;;;tta-atgi;2
;;;;°aac-aac;
'''clostri  z’;aac-atgf;;;aac-atgf;
;°aac-aac;;;gac-aca;
;;;;gta-tta;
'''bacilli  z’;$atgf-gac;14;;aac-5s-aac;2
;;;;aaa-5s-aaa;
'''bacilli  x;cgt-gga;4;;atgi-gca-aac;
;&ctc-gga;;;ttc-gac-gaa;
;&ctc;;;aac-gaa-tgc;
;;;;&gtg-gaa-cgg;
'''clostri  x;tca-tcc;;;&aaa-acc-ctc;
;°atgi-gca;;;ttc-5s-ttc-aaa;2
;&cgg-tgg;;;aac-5s-ttc-tgc ;
;&cag-gag;;;;
;gac-ttc-ggc;;'''bacilli  z;aac-acc;7
;gca-atc-gga;;;$atgf-gac;5
;5s-atgi-gca;;;aac-cgt;2
;&tcg;;;&atgf-ctc-ctg;

Firmicutes x1-3

Lien fiche: Firmicutes x1-3

x1-3;effectifs;B+C;;atgf;atgi;;cds
;34;;;1;2;;1
ttc;2;tcc;2;tac;;tgc;
atc;1;acc;1;aac;;agc;1
ctc;2;ccc;;cac;;cgt;4
gtc;;gcc;;gac;1;ggc;
tta;;tca;1;taa;;tga;
ata;;aca;;aaa;;aga;
cta;;cca;;caa;;cga;
gta;;gca;3;gaa;;gga;7
ttg;;tcg;1;tag;;tgg;1
atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;;ccg;;cag;1;cgg;1
gtg;;gcg;;gag;1;ggg;
;;;;;;;
z1-3;effectifs;B+C;z+z’;atgf;atgi;5s;cds
;209;;;22;14;4;2
ttc;19;tcc;;tac;;tgc;5
atc;3;acc;12;aac;50;agc;
ctc;2;ccc;;cac;;cgt;2
gtc;;gcc;;gac;21;ggc;1
tta;3;tca;1;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;17;aga;
cta;;cca;;caa;;cga;
gta;3;gca;14;gaa;5;gga;2
ttg;;tcg;;tag;;tgg;1
atgj;;acg;;aag;;agg;
ctg;1;ccg;;cag;;cgg;1
gtg;1;gcg;;gag;;ggg;2

Noms firmicutes

Lien fiche: Noms firmicutes

;2.9.19 Paris;fait vers le 20.8.19;;;;;;
Firmicutes;;;;;génomes;ruptures;faits;total
NCBI 1;https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NZ_CP009902;;;;total;324;86;850
NCBI 2;https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_000964.3;;;;bacilli;189;32;663
;;;;;clostridia;123;43;174
notes;x*y;KEGG;;;autres;12;11;13
rRNAs;(5S, 16S, 23S);;;;total tRNAs;61644;;
;;;;;;;;
ruptures;notes;rRNAs;fait;code;tRNAs;génomes;;
1;;444;1;bc001;60;Aerococcus urinae ACS-120-V-Col10a ;;
1;;666;1;bc002;65;Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 ;;
;;;;bc003;64;Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 ;;
1;;666;1;bc004;56;Amphibacillus xylanus NBRC 15112 ;;
1;;;;bc005;77;Anoxybacillus flavithermus WK1 ;;
1;;;;bc006;87;Bacillus amyloliquefaciens CC178 ;;
;;;;bc007;94;Bacillus amyloliquefaciens DSM 7 ;;
;;10,10,10;1;bc008;95;Bacillus amyloliquefaciens IT-45 ;;
;;;;bc009;85;Bacillus amyloliquefaciens L-H15 ;;
;;;;bc010;92;Bacillus amyloliquefaciens L-S60 ;;
;;;;bc011;94;Bacillus amyloliquefaciens LFB112 ;;
;;;;bc012;72;Bacillus amyloliquefaciens LL3 ;;
;;;;bc013;72;Bacillus amyloliquefaciens SQR9 ;;
1;;10,8,10;1;bc014;89;Bacillus amyloliquefaciens subsp. amyloliquefaciens KHG19 ;;
1;;10,9,10;1;bc015;89;Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 ;;
;;;;bc016;95;Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum CAU B946 ;;
;;;;bc017;90;Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum FZB42 ;;
;;;;bc018;92;Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum NAU-B3 ;;
;;;;bc019;81;Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum NJN6 ;;
;;;;bc020;77;Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum TrigoCor1448 ;;
;;;;bc021;86;Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5033 UCMB-5033 ;;
;;;;bc022;89;Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 ;;
;;;;bc023;89;Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5113 ;;
;;;;bc024;92;Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum YAU B9601-Y2 ;;
;;666;1;bc025;70;Bacillus amyloliquefaciens TA208 ;;
;;;;bc026;75;Bacillus amyloliquefaciens XH7 ;;
;;;;bc027;88;Bacillus amyloliquefaciens Y2 ;;
1;;;;bc028;96;Bacillus anthracis 2000031021 ;;
;NCBI 1;11,11,11;1;bc029;112;Bacillus anthracis 2002013094 ;;
;;;;bc030;95;Bacillus anthracis A0157 ;;
;;;;bc031;96;Bacillus anthracis A1144 ;;
;;;;bc032;95;Bacillus anthracis Ames A0462 ;;
;;;;bc033;98;Bacillus anthracis Ames BA1004 ;;
1;;10,10,10;1;bc034;94;Bacillus anthracis BA1015 ;;
;;;;bc035;96;Bacillus anthracis BA1035 ;;
;;;;bc036;95;Bacillus anthracis BFV ;;
;;;;bc037;83;Bacillus anthracis Canadian bison ;;
;;;;bc038;95;Bacillus anthracis Cvac02 ;;
;;;;bc039;107;Bacillus anthracis delta Sterne ;;
;;;;bc040;95;Bacillus anthracis Han ;;
;;;;bc041;96;Bacillus anthracis HYU01 ;;
;;;;bc042;96;Bacillus anthracis K3 ;;
;;;;bc043;101;Bacillus anthracis Ohio ACB ;;
;;;;bc044;98;Bacillus anthracis PAK-1 ;;
;;;;bc045;96;Bacillus anthracis Pasteur ;;
;;;;bc046;95;Bacillus anthracis Pollino ;;
;;;;bc047;94;Bacillus anthracis RA3 ;;
;;;;bc048;97;Bacillus anthracis SK-102 ;;
;;;;bc049;95;Bacillus anthracis str. A0248 ;;
;;;;bc050;93;Bacillus anthracis str. A16 ;;
;;;;bc051;93;Bacillus anthracis str. A16R ;;
;;;;bc052;33;Bacillus anthracis str. A2012 ;;
;;;;bc053;95;Bacillus anthracis str. Ames ;;
;;;;bc054;95;Bacillus anthracis str. Ames Ancestor A2084 ;;
;;;;bc055;97;Bacillus anthracis str. CDC 684 ;;
;;;;bc056;96;Bacillus anthracis str. H9401 ;;
;2*95;;;bc057;190;Bacillus anthracis str. Sterne ;;
;;;;bc058;96;Bacillus anthracis str. SVA11 ;;
;;;;bc059;99;Bacillus anthracis str. Turkey32 ;;
;;;;bc060;96;Bacillus anthracis str. V770-NP-1R ;;
;;;;bc061;95;Bacillus anthracis str. Vollum ;;
;;;;bc062;95;Bacillus anthracis Vollum 1B ;;
1;;777;1;bc063;75;Bacillus atrophaeus 1942 ;;
;;;;bc064;81;Bacillus atrophaeus NRS 1221A ;;
;;888;1;bc065;80;Bacillus atrophaeus subsp. globigii BSS ;;
1;;13,13,13;1;bc066;95;Bacillus bombysepticus str. Wang ;;
1;;10,10,10;1;bc067;83;Bacillus cellulosilyticus DSM 2522 ;;
1;2*106;;;bc068;212;Bacillus cereus 03BB102 ;;
;;;;bc069;105;Bacillus cereus 03BB108 ;;
;;;;bc070;107;Bacillus cereus 03BB87 ;;
;;;;bc071;108;Bacillus cereus 3a ;;
;;;;bc072;106;Bacillus cereus AH187 ;;
;;;;bc073;97;Bacillus cereus AH820 ;;
;;14,14,14;1;bc074;118;Bacillus cereus Al Hakam ;;
;;;;bc075;99;Bacillus cereus ATCC 10987 ;;
;;;;bc076;108;Bacillus cereus ATCC 14579 ;;
;;;;bc077;107;Bacillus cereus ATCC 4342 ;;
;;;;bc078;108;Bacillus cereus B4264 ;;
;;;;bc079;102;Bacillus cereus biovar anthracis str. CI ;;
;;;;bc080;105;Bacillus cereus D17 ;;
;96+103;;;bc081;199;Bacillus cereus E33L ;;
;;;;bc082;105;Bacillus cereus F837/76 ;;
;;;;bc083;102;Bacillus cereus FM1 ;;
;;;;bc084;106;Bacillus cereus FORC 005 ;;
;;;;bc085;107;Bacillus cereus FRI-35 ;;
;;;;bc086;92;Bacillus cereus FT9 ;;
;;;;bc087;105;Bacillus cereus G9241 ;;
;;;;bc088;99;Bacillus cereus G9842 ;;
;;;;bc089;106;Bacillus cereus NC7401 ;;
;;13,13,13;1;bc090;95;Bacillus cereus Q1 ;;
;;;;bc091;106;Bacillus cereus S2-8 ;;
1;;;;bc092;75;Bacillus clausii KSM-K16 ;;
1;;;;bc093;73;Bacillus coagulans 2-6 ;;
;;;;bc094;85;Bacillus coagulans 36D1 ;;
;;;;bc095;86;Bacillus coagulans DSM 1 ATCC 7050 ;;
;;;;bc096;85;Bacillus coagulans HM-08 ;;
1;;13,13,13;1;bc097;107;Bacillus cytotoxicus NVH 391-98 ;;
1;;;;bc098;78;Bacillus halodurans C-125 ;;
1;;;;bc099;88;Bacillus infantis NRRL B-14911 ;;
1;;;;bc100;69;Bacillus lehensis G1 ;;
1;;;;bc101;73;Bacillus licheniformis 9945A ;;
;;;;bc102;73;Bacillus licheniformis BL-09 ;;
;74*2;;;bc103;148;Bacillus licheniformis DSM 13 ATCC 14580 ;;
1;;;;bc104;116;Bacillus megaterium DSM 319 ;;
;;;;bc105;128;Bacillus megaterium NBRC 15308 ATCC 14581 ;;
;bmq;;;bc106;142;Bacillus megaterium QM B1551 ;;
;;;;bc107;119;Bacillus megaterium WSH-002 ;;
1;;;;bc108;92;Bacillus methanolicus MGA3 ;;
1;;;;bc109;82;Bacillus methylotrophicus JS25R ;;
1;bmyc;;;bc110;118;Bacillus mycoides 219298 ;;
;;;;bc111;107;Bacillus mycoides ATCC 6462 ;;
1;;;;bc112;78;Bacillus pseudofirmus OF4 ;;
1;;;;bc113;81;Bacillus pumilus MTCC B6033 ;;
;;;;bc114;70;Bacillus pumilus SAFR-032 ;;
;;;;bc115;70;Bacillus pumilus W3 ;;
1;;;;bc116;69;Bacillus selenitireducens MLS10 ;;
1;;;;bc117;91;Bacillus sp. 1NLA3E ;;
1;;;;bc118;87;Bacillus sp. BH072 ;;
1;;;;bc119;86;Bacillus sp. BS34A ;;
1;;;;bc120;86;Bacillus sp. JS ;;
1;;;;bc121;86;Bacillus sp. LM 4-2 ;;
1;;;;bc122;83;Bacillus sp. OxB-1 ;;
1;;;;bc123;84;Bacillus sp. Pc3 ;;
1;;;;bc124;81;Bacillus sp. WP8 ;;
1;gst;12,12,12;1;bc125;123;Bacillus sp. X12014 ;;
1;;;;bc126;87;Bacillus sp. YP1 ;;
1;;;;bc127;72;Bacillus subtilis ATCC 13952 ;;
;;;;bc128;72;Bacillus subtilis ATCC 19217 ;;
;;;;bc129;59;Bacillus subtilis B-1 ;;
;;;;bc130;92;Bacillus subtilis BEST7003 ;;
;NCBI 2;;;bc131;130;Bacillus subtilis BEST7613 ;;
;;;;bc132;86;Bacillus subtilis Bs-916 ;;
;;;;bc133;86;Bacillus subtilis BS49 ;;
;;;;bc134;83;Bacillus subtilis BSn5 ;;
;;;;bc135;71;Bacillus subtilis HJ5 ;;
;;;;bc136;86;Bacillus subtilis KCTC 1028 ;;
;;;;bc137;86;Bacillus subtilis PS832 ;;
;;;;bc138;86;Bacillus subtilis PY79 ;;
;;;;bc139;86;Bacillus subtilis QB928 ;;
;;;;bc140;84;Bacillus subtilis SG6 ;;
;;;;bc141;88;Bacillus subtilis subsp. natto BEST195 ;;
;;;;bc142;77;Bacillus subtilis subsp. spizizenii NRS 231 ;;
;;;;bc143;77;Bacillus subtilis subsp. spizizenii str. W23 ;;
;;;;bc144;92;Bacillus subtilis subsp. spizizenii TU-B-10 ;;
;;;;bc145;86;Bacillus subtilis subsp. subtilis 3NA ;;
;;;;bc146;86;Bacillus subtilis subsp. subtilis 6051-HGW ;;
;2*86;10,10,10;1;bc147;172;Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 ;;
;;;;bc148;86;Bacillus subtilis subsp. subtilis str. AG1839 ;;
;;;;bc149;89;Bacillus subtilis subsp. subtilis str. BAB-1 ;;
;;;;bc150;86;Bacillus subtilis subsp. subtilis str. BSP1 ;;
;;;;bc151;86;Bacillus subtilis subsp. subtilis str. JH642 substr. AG174 ;;
;;;;bc152;80;Bacillus subtilis subsp. subtilis str. OH 131.1 ;;
;;;;bc153;86;Bacillus subtilis subsp. subtilis str. RO-NN-1 ;;
;;;;bc154;77;Bacillus subtilis T30 ;;
;;;;bc155;77;Bacillus subtilis XF-1 ;;
1;;;;bc156;105;Bacillus thuringiensis 97-27 ;;
;;;;bc157;104;Bacillus thuringiensis BMB171 ;;
;btg;14,14,14;1;bc158;142;Bacillus thuringiensis Bt407 ;;
;;;;bc159;99;Bacillus thuringiensis HD-771 ;;
;;;;bc160;122;Bacillus thuringiensis HD-789 ;;
;;;;bc161;134;Bacillus thuringiensis HD1002 ;;
;;;;bc162;104;Bacillus thuringiensis HD1011 ;;
;;;;bc163;104;Bacillus thuringiensis HD571 ;;
;;;;bc164;105;Bacillus thuringiensis HD682 ;;
;;15,15,15;1;bc165;78;Bacillus thuringiensis MC28 ;;
;;;;bc166;86;Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 ;;
;;;;bc167;108;Bacillus thuringiensis serovar finitimus YBT-020 ;;
;;;;bc168;115;Bacillus thuringiensis serovar galleriae HD-29 ;;
;;;;bc169;105;Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27 ;;
;;;;bc170;108;Bacillus thuringiensis serovar kurstaki HD 1 ;;
;;;;bc171;98;Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD-1 ;;
;;;;bc172;104;Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 ;;
;99+108;;;bc173;207;Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. YBT-1520 ;;
;;;;bc174;98;Bacillus thuringiensis serovar morrisoni BGSC 4AA1 ;;
;;;;bc175;86;Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 ;;
;;;;bc176;104;Bacillus thuringiensis str. Al Hakam ;;
;;;;bc177;95;Bacillus thuringiensis YBT-1518 ;;
1;;;;bc178;98;Bacillus toyonensis BCT-7112 ;;
1;;;;bc179;108;Bacillus weihenstephanensis KBAB4 ;;
;;;;bc180;79;Bacillus weihenstephanensis WSBC 10204 ;;
1;bbe;;;bc181;127;Brevibacillus brevis NBRC 100599 NBRC 100599 47 ;;
1;blr;;;bc182;113;Brevibacillus laterosporus LMG 15441 ;;
1;;;;bc183;59;Carnobacterium maltaromaticum LMA28 ;;
1;;;;bc184;67;Carnobacterium sp. 17-4 ;;
1;;;;bc185;74;Carnobacterium sp. WN1359 ;;
1;;;;bc186;60;Enterococcus casseliflavus EC20 ;;
1;;;;bc187;57;Enterococcus faecalis 62 ;;
;;;;bc188;63;Enterococcus faecalis ATCC 29212 ;;
;;;;bc189;65;Enterococcus faecalis D32 ;;
;;;;bc190;64;Enterococcus faecalis DENG1 ;;
;;;;bc191;60;Enterococcus faecalis OG1RF ;;
;;;;bc192;65;Enterococcus faecalis str. Symbioflor 1 ;;
;;;;bc193;71;Enterococcus faecalis V583 ;;
1;;;;bc194;47;Enterococcus faecium Aus0004 ;;
;;;;bc195;76;Enterococcus faecium Aus0085 AUS0085 ;;
;;;;bc196;64;Enterococcus faecium DO ;;
;;;;bc197;48;Enterococcus faecium NRRL B-2354 ;;
;;;;bc198;65;Enterococcus faecium T110 ;;
1;;;;bc199;72;Enterococcus hirae ATCC 9790 ;;
1;;;;bc200;66;Enterococcus mundtii QU 25 QU25 ;;
1;;;;bc201;33;Enterococcus sp. 7L76 ;;
1;;;;bc202;67;Exiguobacterium antarcticum B7 Eab7 ;;
1;;;;bc203;69;Exiguobacterium sibiricum 255-15 ;;
1;;;;bc204;68;Exiguobacterium sp. AT1b ;;
1;;;;bc205;61;Exiguobacterium sp. MH3 ;;
1;;;;bc206;88;Geobacillus kaustophilus HTA426 ;;
1;;;;bc207;89;Geobacillus sp. C56-T3 ;;
1;;;;bc208;88;Geobacillus sp. GHH01 ;;
1;;;;bc209;89;Geobacillus sp. JF8 ;;
1;;;;bc210;93;Geobacillus sp. WCH70 ;;
1;;;;bc211;92;Geobacillus sp. Y4.1MC1 ;;
1;;;;bc212;89;Geobacillus sp. Y412MC52 ;;
1;;;;bc213;89;Geobacillus sp. Y412MC61 ;;
1;;;;bc214;88;Geobacillus thermodenitrificans NG80-2 ;;
1;;;;bc215;91;Geobacillus thermoglucosidasius C56-YS93 ;;
1;;;;bc216;89;Geobacillus thermoleovorans CCB US3 UF5 ;;
1;;;;bc217;69;Halobacillus halophilus DSM 2266 ;;
1;jeo;;;bc218;124;Jeotgalibacillus sp. D5 ;;
1;;;;bc219;56;Jeotgalicoccus sp. 13MG44 air ;;
1;;;;bc220;60;Kyrpidia tusciae DSM 2912 ;;
1;;;;bc221;63;Lactobacillus acidophilus 30SC ;;
;;;;bc222;61;Lactobacillus acidophilus FSI4 ;;
;;;;bc223;61;Lactobacillus acidophilus La-14 ;;
;;;;bc224;61;Lactobacillus acidophilus NCFM ;;
1;;;;bc225;60;Lactobacillus amylovorus GRL 1112 ;;
;;;;bc226;62;Lactobacillus amylovorus GRL1118 ;;
1;;;;bc227;65;Lactobacillus brevis ATCC 367 ;;
;;;;bc228;49;Lactobacillus brevis BSO 464 ;;
;;;;bc229;64;Lactobacillus brevis KB290 ;;
1;;;;bc230;61;Lactobacillus buchneri CD034 ;;
;;;;bc231;63;Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 ;;
1;;;;bc232;57;Lactobacillus casei 12A ;;
;;;;bc233;59;Lactobacillus casei ATCC 334 ;;
;;;;bc234;61;Lactobacillus casei BD-II ;;
;;;;bc235;61;Lactobacillus casei BL23 ;;
;;;;bc236;59;Lactobacillus casei LC2W ;;
;;;;bc237;61;Lactobacillus casei LOCK919 ;;
;;;;bc238;60;Lactobacillus casei str. Zhang ;;
;;;;bc239;59;Lactobacillus casei subsp. casei ATCC 393 ;;
;;;;bc240;61;Lactobacillus casei W56 ;;
1;;;;bc241;64;Lactobacillus crispatus ST1 ;;
1;;;;bc242;89;Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus 2038 ;;
;;;;bc243;95;Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus ATCC 11842 JCM 1002 ;;
;;999;1;bc244;98;Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus ATCC BAA-365 ;;
;;;;bc245;98;Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus ND02 ;;
1;;;;bc246;58;Lactobacillus fermentum CECT 5716 ;;
;;;;bc247;58;Lactobacillus fermentum F-6 ;;
;;;;bc248;58;Lactobacillus fermentum IFO 3956 ;;
1;;;;bc249;75;Lactobacillus gasseri ATCC 33323 JCM 1131 ;;
1;;;;bc250;64;Lactobacillus helveticus CNRZ32 ;;
;;;;bc251;61;Lactobacillus helveticus DPC 4571 ;;
;;;;bc252;63;Lactobacillus helveticus H10 ;;
;;;;bc253;61;Lactobacillus helveticus H9 ;;
;;;;bc254;61;Lactobacillus helveticus KLDS1.8701 ;;
;;;;bc255;61;Lactobacillus helveticus R0052 ;;
1;;;;bc256;56;Lactobacillus hokkaidonensis LOOC260 ;;
1;;;;bc257;55;Lactobacillus johnsonii DPC 6026 ;;
;;;;bc258;54;Lactobacillus johnsonii FI9785 ;;
;;;;bc259;54;Lactobacillus johnsonii N6.2 ;;
;;;;bc260;78;Lactobacillus johnsonii NCC 533 ;;
1;;;;bc261;60;Lactobacillus kefiranofaciens ZW3 ;;
1;;;;bc262;92;Lactobacillus mucosae LM1 ;;
1;;;;bc263;61;Lactobacillus paracasei N1115 ;;
;;;;bc264;59;Lactobacillus paracasei subsp. paracasei 8700 2 ;;
;;;;bc265;61;Lactobacillus paracasei subsp. paracasei JCM 8130 ;;
1;;;;bc266;69;Lactobacillus plantarum 16 ;;
;;;;bc267;67;Lactobacillus plantarum B21 ;;
;;;;bc268;62;Lactobacillus plantarum JDM1 ;;
;;;;bc269;72;Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 ;;
;;;;bc270;71;Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III ;;
;;;;bc271;74;Lactobacillus plantarum WCFS1 ;;
;;;;bc272;65;Lactobacillus plantarum ZJ316 ;;
1;;;;bc273;68;Lactobacillus reuteri DSM 20016 ;;
;;;;bc274;70;Lactobacillus reuteri I5007 ;;
;;;;bc275;65;Lactobacillus reuteri JCM 1112 ;;
;;;;bc276;70;Lactobacillus reuteri SD2112 ;;
;;;;bc277;70;Lactobacillus reuteri TD1 ;;
1;;;;bc278;60;Lactobacillus rhamnosus ATCC 8530 ;;
;;;;bc279;59;Lactobacillus rhamnosus GG ATCC 53103 ;;
;;;;bc280;57;Lactobacillus rhamnosus GG GG ATCC 53103 ;;
;;;;bc281;61;Lactobacillus rhamnosus Lc 705 ;;
;;;;bc282;59;Lactobacillus rhamnosus LOCK900 ;;
;;;;bc283;62;Lactobacillus rhamnosus LOCK908 ;;
1;;;;bc284;67;Lactobacillus ruminis ATCC 27782 ;;
1;;;;bc285;65;Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K ;;
1;;;;bc286;77;Lactobacillus salivarius CECT 5713 ;;
;;;;bc287;77;Lactobacillus salivarius JCM1046 ;;
1;;;;bc288;61;Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 ;;
1;;;;bc289;56;Lactobacillus sp. wkB8 ;;
1;;;;bc290;63;Lactococcus garvieae ATCC 49156 ;;
;;;;bc291;63;Lactococcus garvieae Lg2 ;;
1;;;;bc292;62;Lactococcus lactis AI06 ;;
1;;;;bc293;64;Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 ;;
;;;;bc294;62;Lactococcus lactis subsp. cremoris KW2 ;;
;;;;bc295;64;Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363 ;;
;;;;bc296;64;Lactococcus lactis subsp. cremoris NZ9000 ;;
;;;;bc297;62;Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 ;;
;;;;bc298;61;Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 ;;
1;;;;bc299;66;Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 ;;
;;;;bc300;63;Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403 IL1403 ;;
;;;;bc301;65;Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1 ;;
;;;;bc302;69;Lactococcus lactis subsp. lactis KF147 ;;
;;;;bc303;66;Lactococcus lactis subsp. lactis KLDS 4.0325 ;;
;;;;bc304;69;Lactococcus lactis subsp. lactis NCDO 2118 ;;
;;;;bc305;64;Lactococcus lactis subsp. lactis S0 ;;
1;;;;bc306;65;Leuconostoc carnosum JB16 ;;
1;;;;bc307;70;Leuconostoc citreum KM20 ;;
1;;;;bc308;67;Leuconostoc gelidum JB7 ;;
;;;;bc309;67;Leuconostoc gelidum subsp. gasicomitatum LMG 18811 ;;
1;;;;bc310;68;Leuconostoc kimchii IMSNU 11154 ;;
1;;;;bc311;69;Leuconostoc mesenteroides KFRI-MG ;;
;;;;bc312;71;Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293 ;;
;;;;bc313;71;Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 ;;
1;;;;bc314;67;Leuconostoc sp. C2 ;;
1;;;;bc315;67;Listeria ivanovii subsp. ivanovii PAM 55 ;;
;;;;bc316;67;Listeria ivanovii subsp. ivanovii WSLC 3010 ;;
;;;;bc317;67;Listeria ivanovii subsp. londoniensis WSLC 30151 ;;
;;;;bc318;67;Listeria ivanovii subsp. londoniensis WSLC 30167 ;;
;;;;bc319;67;Listeria ivanovii WSLC3009 ;;
1;;;;bc320;67;Listeria monocytogenes 07PF0776 ;;
;;;;bc321;58;Listeria monocytogenes 08-5578 ;;
;;;;bc322;58;Listeria monocytogenes 08-5923 ;;
;;;;bc323;67;Listeria monocytogenes 10403S ;;
;;;;bc324;49;Listeria monocytogenes 6179 ;;
;;;;bc325;67;Listeria monocytogenes ATCC 19117 ;;
;;;;bc326;67;Listeria monocytogenes C1-387 ;;
;;;;bc327;67;Listeria monocytogenes CFSAN006122 ;;
;;666;1;bc328;67;Listeria monocytogenes EGD ;;
;;;;bc329;67;Listeria monocytogenes Finland 1998 Finland 1988 ;;
;;;;bc330;67;Listeria monocytogenes FSL R2-561 ;;
;;;;bc331;67;Listeria monocytogenes HCC23 ;;
;;;;bc332;65;Listeria monocytogenes IZSAM Lm hs2008 ;;
;;;;bc333;59;Listeria monocytogenes J0161 ;;
;;;;bc334;67;Listeria monocytogenes J1-220 ;;
;;;;bc335;67;Listeria monocytogenes J1776 ;;
;;;;bc336;58;Listeria monocytogenes J1816 ;;
;;;;bc337;67;Listeria monocytogenes J1817 ;;
;;;;bc338;67;Listeria monocytogenes J1926 ;;
;;;;bc339;67;Listeria monocytogenes J2-031 ;;
;;;;bc340;58;Listeria monocytogenes J2-064 ;;
;;;;bc341;67;Listeria monocytogenes J2-1091 ;;
;;;;bc342;67;Listeria monocytogenes L312 ;;
;;;;bc343;67;Listeria monocytogenes L99 ;;
;;;;bc344;67;Listeria monocytogenes La111 ;;
;;;;bc345;67;Listeria monocytogenes Lm60 ;;
;;;;bc346;67;Listeria monocytogenes M7 ;;
;;;;bc347;67;Listeria monocytogenes N1-011A ;;
;;;;bc348;67;Listeria monocytogenes N2306 ;;
;;;;bc349;67;Listeria monocytogenes N53-1 ;;
;;;;bc350;67;Listeria monocytogenes NE dc2014 ;;
;;;;bc351;67;Listeria monocytogenes NTSN ;;
;;;;bc352;67;Listeria monocytogenes R2-502 ;;
;;;;bc353;58;Listeria monocytogenes R479a ;;
;;;;bc354;67;Listeria monocytogenes serotype 4b str. CLIP 80459 Clip80459 ;;
;;;;bc355;67;Listeria monocytogenes serotype 4b str. F2365 4b F2365 ;;
;;;;bc356;67;Listeria monocytogenes serotype 4b str. LL195 ;;
;;;;bc357;67;Listeria monocytogenes serotype 7 str. SLCC2482 ;;
;;;;bc358;67;Listeria monocytogenes SLCC2372 ;;
;;;;bc359;67;Listeria monocytogenes SLCC2376 ;;
;;;;bc360;67;Listeria monocytogenes SLCC2378 ;;
;;;;bc361;65;Listeria monocytogenes SLCC2479 ;;
;;;;bc362;67;Listeria monocytogenes SLCC2540 ;;
;;;;bc363;67;Listeria monocytogenes SLCC2755 ;;
;;;;bc364;67;Listeria monocytogenes SLCC5850 ;;
;;;;bc365;68;Listeria monocytogenes SLCC7179 ;;
;;;;bc366;67;Listeria monocytogenes WSLC1001 ;;
;;;;bc367;67;Listeria monocytogenes WSLC1042 ;;
1;;;;bc368;67;Listeria seeligeri serovar 1/2b str. SLCC3954 ;;
1;;;;bc369;66;Listeria welshimeri serovar 6b str. SLCC5334 ;;
1;;;;bc370;107;Lysinibacillus fusiformis RB-21 ;;
1;;;;bc371;86;Lysinibacillus sphaericus C3-41 ;;
1;;;;bc372;98;Lysinibacillus varians GY32 ;;
1;;;;bc373;50;Macrococcus caseolyticus JCSC5402 ;;
1;;;;bc374;61;Melissococcus plutonius ATCC 35311 ;;
;;;;bc375;55;Melissococcus plutonius DAT561 ;;
1;;;;bc376;71;Oceanobacillus iheyensis HTE831 ;;
1;;;;bc377;45;Oenococcus kitaharae DSM 17330 ;;
1;;;;bc378;46;Oenococcus oeni PSU-1 ;;
1;;;;bc379;90;Paenibacillus beijingensis DSM 24997 ;;
1;;;;bc380;86;Paenibacillus borealis DSM 13188 ;;
1;;;;bc381;87;Paenibacillus durus DSM 1735 ;;
1;;;;bc382;89;Paenibacillus graminis DSM 15220 ;;
1;;;;bc383;81;Paenibacillus larvae subsp. larvae DSM 25430 ;;
1;pmq;14,14,14;1;bc384;175;Paenibacillus mucilaginosus 3016 ;;
;pmw;;;bc385;152;Paenibacillus mucilaginosus K02 ;;
;;;;bc386;113;Paenibacillus mucilaginosus KNP414 ;;
1;;;;bc387;88;Paenibacillus odorifer DSM 15391 ;;
1;;;;bc388;107;Paenibacillus polymyxa CF05 ;;
;;;;bc389;90;Paenibacillus polymyxa CR1 ;;
;;;;bc390;91;Paenibacillus polymyxa E681 ;;
;;;;bc391;111;Paenibacillus polymyxa M1 ;;
;;;;bc392;109;Paenibacillus polymyxa Sb3-1 ;;
;ppm;14,13,13;1;bc393;165;Paenibacillus polymyxa SC2 ;;
;;;;bc394;112;Paenibacillus polymyxa SQR-21 SQR21 ;;
1;;;;bc395;82;Paenibacillus sabinae T27 ;;
1;;;;bc396;86;Paenibacillus sp. FSL H7-0357 ;;
1;;;;bc397;93;Paenibacillus sp. FSL H7-0737 ;;
1;;;;bc398;87;Paenibacillus sp. FSL P4-0081 ;;
1;;;;bc399;90;Paenibacillus sp. FSL R5-0345 ;;
1;;;;bc400;90;Paenibacillus sp. FSL R5-0912 ;;
1;;;;bc401;85;Paenibacillus sp. FSL R7-0273 ;;
1;;;;bc402;85;Paenibacillus sp. FSL R7-0331 ;;
1;;;;bc403;90;Paenibacillus sp. IHBB 10380 ;;
1;;;;bc404;89;Paenibacillus sp. JDR-2 ;;
1;;;;bc405;73;Paenibacillus sp. Y412MC10 ;;
1;;;;bc406;88;Paenibacillus stellifer DSM 14472 ;;
1;;;;bc407;90;Paenibacillus terrae HPL-003 ;;
1;;;;bc408;57;Pediococcus claussenii ATCC BAA-344 ;;
1;;;;bc409;55;Pediococcus pentosaceus ATCC 25745 ;;
1;;;;bc410;51;Pediococcus pentosaceus SL4 ;;
;;;;bc411;60;Planococcus sp. PAMC 21323 ;;
1;;;;bc412;97;Solibacillus silvestris StLB046 ;;
1;;755;1;bc413;63;Staphylococcus aureus 04-02981 ;;
;;;;bc414;58;Staphylococcus aureus 08BA02176 ;;
;;;;bc415;56;Staphylococcus aureus 144 S7 ;;
;;;;bc416;62;Staphylococcus aureus 2395 USA500 ;;
;;;;bc417;54;Staphylococcus aureus 25b MRSA ;;
;;;;bc418;54;Staphylococcus aureus 26b MRSA ;;
;;;;bc419;54;Staphylococcus aureus 27b MRSA ;;
;;;;bc420;54;Staphylococcus aureus 29b MRSA ;;
;;;;bc421;54;Staphylococcus aureus 31b MRSA ;;
;;;;bc422;54;Staphylococcus aureus 33b ;;
;;;;bc423;61;Staphylococcus aureus 502A ;;
;;;;bc424;31;Staphylococcus aureus 71A S11 ;;
;;;;bc425;58;Staphylococcus aureus 79 S10 ;;
;;;;bc426;31;Staphylococcus aureus 93b S9 ;;
;;;;bc427;62;Staphylococcus aureus Bmb9393 ;;
;;;;bc428;61;Staphylococcus aureus CA-347 ;;
;;;;bc429;58;Staphylococcus aureus FCFHV36 ;;
;;;;bc430;61;Staphylococcus aureus ILRI Eymole1/1 ;;
;;;;bc431;58;Staphylococcus aureus M1 ;;
;;;;bc432;53;Staphylococcus aureus NRS 100 ;;
;;;;bc433;61;Staphylococcus aureus RF122 ;;
;;;;bc434;52;Staphylococcus aureus SA17 S6 ;;
1;;;;bc435;60;Staphylococcus aureus subsp. aureus 11819-97 ;;
;;;;bc436;53;Staphylococcus aureus subsp. aureus 55/2053 ;;
;;;;bc437;58;Staphylococcus aureus subsp. aureus 6850 ;;
;;;;bc438;58;Staphylococcus aureus subsp. aureus 71193 ;;
;;;;bc439;60;Staphylococcus aureus subsp. aureus ATCC 25923 ;;
;;;;bc440;58;Staphylococcus aureus subsp. aureus CN1 ;;
;;;;bc441;53;Staphylococcus aureus subsp. aureus COL ;;
;;;;bc442;61;Staphylococcus aureus subsp. aureus ECT-R 2 ;;
;;;;bc443;60;Staphylococcus aureus subsp. aureus ED133 ;;
;;;;bc444;62;Staphylococcus aureus subsp. aureus ED98 ;;
;;;;bc445;60;Staphylococcus aureus subsp. aureus FORC 001 ;;
;;;;bc446;62;Staphylococcus aureus subsp. aureus Gv69 ;;
;;;;bc447;59;Staphylococcus aureus subsp. aureus H-EMRSA-15 ;;
;;;;bc448;61;Staphylococcus aureus subsp. aureus HO 5096 0412 ;;
;;;;bc449;61;Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1 ;;
;;;;bc450;60;Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9 ;;
;;;;bc451;58;Staphylococcus aureus subsp. aureus JKD6159 ;;
;;;;bc452;61;Staphylococcus aureus subsp. aureus LGA251 ;;
;;;;bc453;60;Staphylococcus aureus subsp. aureus M013 ;;
;;;;bc454;60;Staphylococcus aureus subsp. aureus MRSA252 ;;
;;;;bc455;59;Staphylococcus aureus subsp. aureus MSHR1132 ;;
;;;;bc456;60;Staphylococcus aureus subsp. aureus MSSA476 ;;
;;;;bc457;61;Staphylococcus aureus subsp. aureus Mu3 ;;
;;;;bc458;61;Staphylococcus aureus subsp. aureus Mu50 ;;
;;;;bc459;61;Staphylococcus aureus subsp. aureus MW2 ;;
;;;;bc460;63;Staphylococcus aureus subsp. aureus N315 ;;
;;;;bc461;61;Staphylococcus aureus subsp. aureus NCTC 8325 ;;
;;;;bc462;61;Staphylococcus aureus subsp. aureus SA268 ;;
;;;;bc463;61;Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40 ;;
;;;;bc464;60;Staphylococcus aureus subsp. aureus SA957 ;;
;;;;bc465;506;Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 ;;
;;;;bc466;61;Staphylococcus aureus subsp. aureus ST398 ;;
;;;;bc467;61;Staphylococcus aureus subsp. aureus ST772-MRSA-V DAR4145 ;;
;;;;bc468;84;Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 ;;
;;;;bc469;61;Staphylococcus aureus subsp. aureus str. Newman ;;
;;;;bc470;55;Staphylococcus aureus subsp. aureus T0131 ;;
;;;;bc471;61;Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 ;;
;;;;bc472;62;Staphylococcus aureus subsp. aureus TW20 ;;
;;;;bc473;54;Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300 FPR3757 ;;
;;;;bc474;61;Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300 TCH1516 ;;
;;;;bc475;61;Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 ;;
;;;;bc476;62;Staphylococcus aureus subsp. aureus Z172 ;;
;;;;bc477;61;Staphylococcus aureus UA-S391 USA300 ;;
;;;;bc478;61;Staphylococcus aureus USA300-ISMMS1 ;;
;;;;bc479;59;Staphylococcus aureus XN108 ;;
1;;;;bc480;61;Staphylococcus carnosus subsp. carnosus TM300 ;;
1;;;;bc481;58;Staphylococcus epidermidis 949 S8 ;;
;;;;bc482;61;Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 ;;
;;;;bc483;61;Staphylococcus epidermidis PM221 ;;
;;;;bc484;61;Staphylococcus epidermidis RP62A ;;
;;;;bc485;60;Staphylococcus epidermidis SEI ;;
1;;;;bc486;62;Staphylococcus haemolyticus JCSC1435 ;;
;;;;bc487;62;Staphylococcus haemolyticus Sh29/312/L2 ;;
1;;;;bc488;59;Staphylococcus hyicus ATCC 11249 ;;
1;;;;bc489;61;Staphylococcus lugdunensis HKU09-01 ;;
;;;;bc490;56;Staphylococcus lugdunensis N920143 ;;
1;;;;bc491;49;Staphylococcus pasteuri SP1 ;;
1;;;;bc492;68;Staphylococcus pseudintermedius E140 ;;
;;;;bc493;58;Staphylococcus pseudintermedius ED99 ;;
;;;;bc494;59;Staphylococcus pseudintermedius HKU10-03 ;;
1;;;;bc495;60;Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305 ;;
1;;;;bc496;59;Staphylococcus warneri SG1 ;;
1;;;;bc497;55;Staphylococcus xylosus HKUOPL8 ;;
;;;;bc498;59;Staphylococcus xylosus SMQ-121 ;;
1;;777;1;bc499;80;Streptococcus agalactiae 09mas018883 ;;
;;;;bc500;72;Streptococcus agalactiae 138P ;;
;;;;bc501;71;Streptococcus agalactiae 138spar ;;
;;;;bc502;72;Streptococcus agalactiae 2-22 ;;
;;;;bc503;80;Streptococcus agalactiae 2603V/R ;;
;;;;bc504;80;Streptococcus agalactiae A909 ;;
;;;;bc505;80;Streptococcus agalactiae CNCTC 10/84 ;;
;;;;bc506;80;Streptococcus agalactiae COH1 ;;
;;;;bc507;82;Streptococcus agalactiae GBS1-NY ;;
;;;;bc508;80;Streptococcus agalactiae GBS2-NM ;;
;;;;bc509;80;Streptococcus agalactiae GBS6 ;;
;;;;bc510;77;Streptococcus agalactiae GD201008-001 ;;
;;;;bc511;81;Streptococcus agalactiae ILRI005 ;;
;;;;bc512;79;Streptococcus agalactiae ILRI112 ;;
;;;;bc513;81;Streptococcus agalactiae NGBS061 ;;
;;;;bc514;81;Streptococcus agalactiae NGBS572 ;;
;;;;bc515;80;Streptococcus agalactiae SA20-06 ;;
1;;;;bc516;58;Streptococcus anginosus C1051 ;;
;;;;bc517;58;Streptococcus anginosus C238 ;;
;;;;bc518;59;Streptococcus anginosus SA1 ;;
;;;;bc519;67;Streptococcus anginosus subsp. whileyi MAS624 ;;
1;;;;bc520;59;Streptococcus constellatus subsp. pharyngis C1050 ;;
;;;;bc521;59;Streptococcus constellatus subsp. pharyngis C232 ;;
;;;;bc522;59;Streptococcus constellatus subsp. pharyngis C818 ;;
1;;;;bc523;57;Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis 167 ;;
;;;;bc524;57;Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis AC-2713 ;;
;;;;bc525;57;Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis ATCC 12394 ;;
;;;;bc526;57;Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis GGS 124 ;;
;;;;bc527;57;Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis RE378 ;;
1;;;;bc528;66;Streptococcus equi subsp. equi 4047 ;;
;;;;bc529;57;Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 ;;
;;;;bc530;51;Streptococcus equi subsp. zooepidemicus CY ;;
;;;;bc531;57;Streptococcus equi subsp. zooepidemicus H70 ;;
1;;;;bc532;57;Streptococcus equi subsp. zooepidemicus MGCS10565 ATCC BAA1716 ;;
;;;;bc533;61;Streptococcus gallolyticus subsp. gallolyticus ATCC 43143 ;;
;;;;bc534;81;Streptococcus gallolyticus subsp. gallolyticus ATCC BAA-2069 ;;
;;;;bc535;72;Streptococcus gallolyticus UCN34 ;;
1;;;;bc536;60;Streptococcus gordonii str. Challis substr. CH1 ;;
1;;;;bc537;69;Streptococcus infantarius subsp. infantarius CJ18 ;;
1;;;;bc538;45;Streptococcus iniae ISET0901 ;;
;;;;bc539;45;Streptococcus iniae ISNO ;;
;;;;bc540;47;Streptococcus iniae SF1 ;;
;;;;bc541;58;Streptococcus iniae YSFST01-82 ;;
1;;;;bc542;60;Streptococcus intermedius B196 ;;
;;;;bc543;60;Streptococcus intermedius C270 ;;
;;;;bc544;67;Streptococcus intermedius JTH08 ;;
1;;;;bc545;60;Streptococcus lutetiensis 033 ;;
1;;;;bc546;71;Streptococcus macedonicus ACA-DC 198 ;;
1;;;;bc547;61;Streptococcus mitis B6 ;;
1;;;;bc548;65;Streptococcus mutans GS-5 ;;
;;;;bc549;65;Streptococcus mutans LJ23 ;;
;;;;bc550;65;Streptococcus mutans NN2025 ;;
;;;;bc551;65;Streptococcus mutans UA159 ;;
;;;;bc552;65;Streptococcus mutans UA159-FR ;;
1;;;;bc553;51;Streptococcus oligofermentans AS 1.3089 ;;
1;;;;bc554;61;Streptococcus oralis Uo5 ;;
1;;;;bc555;62;Streptococcus parasanguinis ATCC 15912 ;;
;;;;bc556;62;Streptococcus parasanguinis FW213 ;;
1;;;;bc557;60;Streptococcus parauberis KCTC 11537 ;;
;;;;bc558;58;Streptococcus parauberis NCFD 2020 ;;
1;;;;bc559;60;Streptococcus pasteurianus ATCC 43144 ;;
1;;;;bc560;60;Streptococcus pneumoniae 670-6B ;;
;;;;bc561;59;Streptococcus pneumoniae 70585 ;;
;;;;bc562;59;Streptococcus pneumoniae A026 ;;
;;;;bc563;58;Streptococcus pneumoniae AP200 ;;
;;;;bc564;58;Streptococcus pneumoniae ATCC 700669 ;;
;;;;bc565;58;Streptococcus pneumoniae CGSP14 ;;
;;;;bc566;59;Streptococcus pneumoniae D39 ;;
;;;;bc567;59;Streptococcus pneumoniae G54 ;;
;;;;bc568;58;Streptococcus pneumoniae gamPNI0373 ;;
;;;;bc569;59;Streptococcus pneumoniae Hungary19A-6 ;;
;;;;bc570;59;Streptococcus pneumoniae INV104 ;;
;;;;bc571;59;Streptococcus pneumoniae INV200 ;;
;;;;bc572;59;Streptococcus pneumoniae JJA ;;
;;;;bc573;60;Streptococcus pneumoniae NT 110 58 ;;
;;;;bc574;59;Streptococcus pneumoniae OXC141 ;;
;;;;bc575;59;Streptococcus pneumoniae P1031 ;;
;;;;bc576;54;Streptococcus pneumoniae PCS8235 ;;
;;;;bc577;59;Streptococcus pneumoniae R6 ;;
;;;;bc578;59;Streptococcus pneumoniae SPN032672 ;;
;;;;bc579;59;Streptococcus pneumoniae SPN033038 ;;
;;;;bc580;59;Streptococcus pneumoniae SPN034156 SNP034156 ;;
;;;;bc581;59;Streptococcus pneumoniae SPN034183 SNP034183 ;;
;;;;bc582;59;Streptococcus pneumoniae SPN994038 SNP994038 ;;
;;;;bc583;59;Streptococcus pneumoniae SPN994039 SNP994039 ;;
;;;;bc584;59;Streptococcus pneumoniae SPNA45 ;;
;;;;bc585;59;Streptococcus pneumoniae ST556 ;;
;;;;bc586;59;Streptococcus pneumoniae Taiwan19F-14 ;;
;;;;bc587;59;Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A ;;
;;;;bc588;59;Streptococcus pneumoniae TIGR4 ;;
;;;;bc589;59;Streptococcus pneumoniae TIGR4 ATCC BAA-334 ;;
1;;;;bc590;42;Streptococcus pseudopneumoniae IS7493 ;;
1;;;;bc591;67;Streptococcus pyogenes 1E1 ;;
;;;;bc592;67;Streptococcus pyogenes 7F7 ;;
;;;;bc593;67;Streptococcus pyogenes A20 ;;
;;;;bc594;67;Streptococcus pyogenes Alab49 ;;
;;;;bc595;68;Streptococcus pyogenes ATCC 19615 ;;
;;;;bc596;69;Streptococcus pyogenes HKU QMH11M0907901 ;;
;;;;bc597;69;Streptococcus pyogenes HKU360 ;;
;;;;bc598;67;Streptococcus pyogenes HSC5 ;;
;;;;bc599;57;Streptococcus pyogenes M1 476 ;;
;2*60;;;bc600;120;Streptococcus pyogenes M1 GAS SF370 ;;
;;;;bc601;57;Streptococcus pyogenes M23ND ;;
;;;;bc602;67;Streptococcus pyogenes MGAS10270 ;;
;;;;bc603;67;Streptococcus pyogenes MGAS10394 ;;
;;;;bc604;67;Streptococcus pyogenes MGAS10750 ;;
;;;;bc605;57;Streptococcus pyogenes MGAS15252 ;;
;;;;bc606;57;Streptococcus pyogenes MGAS1882 ;;
;;;;bc607;68;Streptococcus pyogenes MGAS2096 ;;
;;;;bc608;67;Streptococcus pyogenes MGAS315 ;;
;;;;bc609;67;Streptococcus pyogenes MGAS5005 ;;
;;;;bc610;67;Streptococcus pyogenes MGAS6180 ;;
;;;;bc611;68;Streptococcus pyogenes MGAS8232 ;;
;;;;bc612;68;Streptococcus pyogenes MGAS9429 ;;
;;;;bc613;67;Streptococcus pyogenes NZ131 ATCC BAA-1633 ;;
;;;;bc614;57;Streptococcus pyogenes SSI-1 ;;
;;;;bc615;66;Streptococcus pyogenes STAB1102 ;;
;;;;bc616;67;Streptococcus pyogenes STAB901 ;;
;;;;bc617;59;Streptococcus pyogenes STAB902 ;;
;;;;bc618;66;Streptococcus pyogenes str. Manfredo ;;
1;;;;bc619;68;Streptococcus salivarius 57.I ;;
;;;;bc620;68;Streptococcus salivarius CCHSS3 ;;
;;;;bc621;68;Streptococcus salivarius JIM8777 ;;
;;;;bc622;68;Streptococcus salivarius NCTC 8618 ;;
1;;;;bc623;61;Streptococcus sanguinis SK36 ;;
1;;;;bc624;60;Streptococcus sp. I-G2 ;;
1;;;;bc625;86;Streptococcus sp. I-P16 ;;
1;;;;bc626;69;Streptococcus sp. VT 162 ;;
1;;;;bc627;56;Streptococcus suis 05HAS68 ;;
;;;;bc628;56;Streptococcus suis 05ZYH33 ;;
;;;;bc629;59;Streptococcus suis 6407 ;;
;;;;bc630;56;Streptococcus suis 98HAH33 ;;
;;;;bc631;56;Streptococcus suis A7 ;;
;;;;bc632;56;Streptococcus suis BM407 ;;
;;;;bc633;56;Streptococcus suis D12 ;;
;;;;bc634;54;Streptococcus suis D9 ;;
;;;;bc635;49;Streptococcus suis GZ1 ;;
;;;;bc636;62;Streptococcus suis JS14 ;;
;;;;bc637;56;Streptococcus suis P1/7 ;;
;;;;bc638;56;Streptococcus suis S735 ;;
;;;;bc639;56;Streptococcus suis SC070731 ;;
;;;;bc640;56;Streptococcus suis SC84 ;;
;;;;bc641;59;Streptococcus suis SS12 ;;
;;;;bc642;58;Streptococcus suis ST1 ;;
;;;;bc643;56;Streptococcus suis ST3 ;;
;;;;bc644;56;Streptococcus suis T15 ;;
;;;;bc645;56;Streptococcus suis TL13 ;;
;;;;bc646;56;Streptococcus suis YB51 ;;
1;;;;bc647;55;Streptococcus thermophilus ASCC 1275 ;;
;;;;bc648;67;Streptococcus thermophilus CNRZ1066 ;;
;;;;bc649;67;Streptococcus thermophilus JIM 8232 ;;
;;;;bc650;67;Streptococcus thermophilus LMD-9 ;;
;;;;bc651;67;Streptococcus thermophilus LMG 18311 ;;
;;;;bc652;57;Streptococcus thermophilus MN-ZLW-002 ;;
;;;;bc653;57;Streptococcus thermophilus ND03 ;;
;;;;bc654;67;Streptococcus thermophilus SMQ-301 ;;
1;;555;1;bc655;59;Streptococcus uberis 0140J ;;
1;;888;1;bc656;56;Terribacillus aidingensis MP602 ;;
1;;555;1;bc657;62;Tetragenococcus halophilus NBRC 12172 ;;
1;;555;1;bc658;61;Thermobacillus composti KWC4 ;;
1;;777;1;bc659;54;Virgibacillus sp. SK37 ;;
1;;766;1;bc660;75;Weissella ceti WS08 ;;
;;;;bc661;71;Weissella ceti WS105 ;;
;;;;bc662;77;Weissella ceti WS74 ;;
1;;;;bc663;56;Weissella koreensis KACC 15510 ;;
1;;;;en001;55;Erysipelothrix rhusiopathiae str. Fujisawa ;;
;;433;1;en002;53;Erysipelothrix rhusiopathiae SY1027 ;;
1;;111;1;en003;40;Faecalitalea cylindroides T2-87 ;;
1;;777;1;en004;77;Lactobacillus salivarius UCC118 ;;
1;;666;1;en005;60;Acidaminococcus fermentans DSM 20731 ;;
1;;333;1;en006;53;Acidaminococcus intestini RyC-MR95 ;;
1;;;;en007;51;Megamonas hypermegale ART12/1 ;;
1;;777;1;en008;65;Megasphaera elsdenii DSM 20460 ;;
1;;10,9,9;1;en009;77;Pelosinus fermentans JBW45 ;;
1;;16,15,14;1;en010;99;Pelosinus sp. UFO1 ;;
1;;777;1;en011;73;Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 ;;
1;;444;1;en012;55;Selenomonas sputigena ATCC 35185 ;;
1;;444;1;en013;49;Veillonella parvula DSM 2008 ;;
1;;655;1;cd001;62;Acetobacterium woodii DSM 1030 ;;
1;;555;1;cd002;67;Acetohalobium arabaticum DSM 5501 ;;
1;;11,10,10;1;cd003;110;Alkaliphilus metalliredigens QYMF ;;
1;;;;cd004;88;Alkaliphilus oremlandii OhILAs ;;
1;;;;cd005;51;Ammonifex degensii KC4 ;;
1;;;;cd006;48;Anaerococcus prevotii DSM 20548 ;;
1;;;;cd007;27;butyrate-producing bacterium SM4/1 ;;
;;;;cd008;57;butyrate-producing bacterium SS3/4 ;;
;;;;cd009;53;butyrate-producing bacterium SSC/2 ;;
1;;;;cd010;60;Butyrivibrio fibrisolvens 16/4 ;;
1;;666;1;cd011;51;Butyrivibrio proteoclasticus B316 ;;
1;;;;cd012;56;Caldanaerobacter subterraneus subsp. tengcongensis MB4 ;;
1;;333;1;cd013;52;Caldicellulosiruptor bescii DSM 6725 ;;
1;;;;cd014;50;Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 ;;
1;;;;cd015;51;Caldicellulosiruptor kristjanssonii I77R1B ;;
1;;;;cd016;48;Caldicellulosiruptor kronotskyensis 2002 ;;
1;;;;cd017;47;Caldicellulosiruptor lactoaceticus 6A ;;
1;;;;cd018;46;Caldicellulosiruptor obsidiansis OB47 ;;
1;;;;cd019;49;Caldicellulosiruptor owensensis OL ;;
1;;;;cd020;48;Caldicellulosiruptor saccharolyticus DSM 8903 ;;
1;;;;cd021;41;Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-Japan ;;
;;;;cd022;40;Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-NL ;;
;;;;cd023;40;Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-Yit ;;
1;;;;cd024;39;Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Yit ;;
1;;;;cd025;47;Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C ;;
1;;;;cd026;53;Carboxydothermus hydrogenoformans Z-2901 ;;
1;;;;cd027;75;Clostridium acetobutylicum ATCC 824 ;;
;;;;cd028;75;Clostridium acetobutylicum DSM 1731 ;;
;;;;cd029;77;Clostridium acetobutylicum EA 2018 ;;
1;;;;cd030;69;Clostridium autoethanogenum DSM 10061 ;;
1;;;;cd031;79;Clostridium baratii str. Sullivan ;;
1;;17,16,16;1;cd032;70;Clostridium beijerinckii 59B ;;
;;;;cd033;95;Clostridium beijerinckii ATCC 35702 SA-1 ;;
;;;;cd034;95;Clostridium beijerinckii NCIMB 8052 ;;
1;;;;cd035;84;Clostridium botulinum 111 ;;
;;;;cd036;70;Clostridium botulinum 202F ;;
;;;;cd037;81;Clostridium botulinum A str. ATCC 19397 ;;
;;;;cd038;80;Clostridium botulinum A str. ATCC 3502 ;;
;;;;cd039;81;Clostridium botulinum A str. Hall ;;
;;;;cd040;81;Clostridium botulinum A2 str. Kyoto ;;
;;;;cd041;81;Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree ;;
;;;;cd042;77;Clostridium botulinum B str. Eklund 17B NRP ;;
;;;;cd043;82;Clostridium botulinum B1 str. Okra ;;
;;;;cd044;83;Clostridium botulinum Ba4 str. 657 ;;
;;10,10,10;1;cd045;87;Clostridium botulinum BKT015925 ;;
;;;;cd046;73;Clostridium botulinum CDC 1436 ;;
;;554;1;cd047;53;Clostridium botulinum CDC 297 ;;
;;;;cd048;79;Clostridium botulinum E3 str. Alaska E43 ;;
;;;;cd049;72;Clostridium botulinum F str. 230613 ;;
;;;;cd050;82;Clostridium botulinum F str. Langeland ;;
;;;;cd051;72;Clostridium botulinum H04402 065 ;;
;;;;cd052;79;Clostridium botulinum NCTC 8266 ;;
;;;;cd053;79;Clostridium botulinum NCTC 8550 ;;
;;;;cd054;76;Clostridium botulinum Prevot 594 ;;
1;;888;1;cd055;65;Clostridium cellulolyticum H10 ATCC 35319 ;;
1;;;;cd056;60;Clostridium cellulosi ;;
1;;10,9,9;1;cd057;80;Clostridium cellulovorans 743B ;;
1;;;;cd058;50;Clostridium cf. saccharolyticum K10 ;;
1;;666;1;cd059;61;Clostridium clariflavum DSM 19732 ;;
1;;677;1;cd060;63;Clostridium kluyveri DSM 555 ;;
;;;;cd061;63;Clostridium kluyveri NBRC 12016 ;;
1;;999;1;cd062;74;Clostridium ljungdahlii DSM 13528 ;;
1;;10,10,10;1;cd063;81;Clostridium novyi NT ;;
1;;999;1;cd064;77;Clostridium pasteurianum BC1 ;;
;2*81;;;cd065;162;Clostridium pasteurianum DSM 525 ATCC 6013 ;;
1;;;;cd066;93;Clostridium perfringens ATCC 13124 ;;
;;10,10,10;1;cd067;96;Clostridium perfringens str. 13 ;;
1;;;;cd068;85;Clostridium saccharobutylicum DSM 13864 ;;
;;;;cd069;68;Clostridium saccharolyticum WM1 ;;
1;;;;cd070;71;Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4HMT ;;
1;;999;1;cd071;66;Clostridium scatologenes ATCC 25775 ;;
1;;;;cd072;84;Clostridium sordellii ATCC9714 ;;
;;;;cd073;85;Clostridium sordellii JGS6382 ;;
1;;;;cd074;62;Clostridium sp. BNL1100 ;;
1;;;;cd075;53;Clostridium sp. SY8519 ;;
1;;;;cd076;81;Clostridium sporogenes NCIMB 10696 ;;
1;2*49;;;cd077;98;Clostridium stercorarium subsp. stercorarium DSM 8532 ;;
1;;;;cd078;60;Clostridium sticklandii DSM 519 ;;
1;;546;1;cd079;53;Clostridium tetani 12124569 ;;
;;;;cd080;54;Clostridium tetani E88 Massachusetts substr. E88 ;;
1;;;;cd081;46;Coprococcus catus GD/7 ;;
1;;;;cd082;28;Coprococcus sp. ART55/1 ;;
1;;222;1;cd083;48;Coprothermobacter proteolyticus DSM 5265 ;;
1;;444;1;cd084;54;Dehalobacter restrictus DSM 9455 PER-K23 ;;
1;;;;cd085;53;Dehalobacter sp. CF ;;
1;;;;cd086;53;Dehalobacter sp. DCA ;;
1;;;;cd087;76;Desulfitobacterium dehalogenans ATCC 51507 ;;
1;;;;cd088;73;Desulfitobacterium dichloroeliminans LMG P-21439 ;;
1;;555;1;cd089;76;Desulfitobacterium hafniense DCB-2 ;;
;;;;cd090;63;Desulfitobacterium hafniense Y51 ;;
1;;;;cd091;73;Desulfitobacterium metallireducens DSM 15288 853-15A ;;
1;;898;1;cd092;68;Desulfosporosinus acidiphilus SJ4 ;;
1;;;;cd093;82;Desulfosporosinus meridiei DSM 13257 ;;
1;;;;cd094;77;Desulfosporosinus orientis DSM 765 ;;
1;;9,10,10;1;cd095;70;Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771 ;;
1;;;;cd096;66;Desulfotomaculum carboxydivorans CO-1-SRB ;;
1;;;;cd097;67;Desulfotomaculum gibsoniae DSM 7213 ;;
1;;;;cd098;49;Desulfotomaculum kuznetsovii DSM 6115 ;;
1;;;;cd099;74;Desulfotomaculum reducens MI-1 ;;
1;;;;cd100;67;Desulfotomaculum ruminis DSM 2154 ;;
1;;;;cd101;60;Ethanoligenens harbinense YUAN-3 ;;
1;;777;1;cd102;69;Eubacterium acidaminophilum DSM 3953 ;;
1;;;;cd103;47;Eubacterium eligens ATCC 27750 ;;
1;;;;cd104;60;Eubacterium limosum KIST612 ;;
1;;;;cd105;60;Eubacterium rectale ATCC 33656 ;;
;;;;cd106;44;Eubacterium rectale DSM 17629 ;;
;;;;cd107;53;Eubacterium rectale M104/1 ;;
1;;;;cd108;50;Eubacterium siraeum 70/3 ;;
;;;;cd109;38;Eubacterium siraeum V10Sc8a ;;
1;;;;cd110;60;Faecalibacterium prausnitzii L2-6 L2/6 ;;
1;;;;cd111;71;Faecalibacterium prausnitzii SL3/3 ;;
1;;444;1;cd112;48;Filifactor alocis ATCC 35896 ;;
1;;444;1;cd113;48;Finegoldia magna ATCC 29328 ;;
1;;444;1;cd114;59;Halanaerobium hydrogeniformans ;;
1;;;;cd115;55;Halanaerobium praevalens DSM 2228 ;;
1;;555;1;cd116;78;Halobacteroides halobius DSM 5150 ;;
1;;;;cd117;57;Halothermothrix orenii H 168 DSM 9562 ;;
1;hmo;10,10,10;1;cd118;109;Heliobacterium modesticaldum Ice1 ATCC 51547 ;;
1;;;;cd119;61;Lachnoclostridium phytofermentans ISDg ;;
1;;;;cd120;46;Mageeibacillus indolicus UPII9-5 ;;
1;;;;cd121;51;Mahella australiensis 50-1 BON ;;
1;;;;cd122;52;Moorella thermoacetica ATCC 39073 ;;
1;;;;cd123;52;Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF ;;
1;;;;cd124;72;Oscillibacter valericigenes Sjm18-20 ;;
1;;;;cd125;42;Parvimonas micra KCOM 1535 ChDC B708 ;;
1;;;;cd126;53;Pelotomaculum thermopropionicum SI ;;
1;;;;cd127;67;Peptoclostridium difficile 2007855 ;;
;;;;cd128;89;Peptoclostridium difficile 630 ;;
;;;;cd129;91;Peptoclostridium difficile 630 cultivar NCTC 13307 /strain ;;
;;;;cd130;91;Peptoclostridium difficile 630Derm ;;
;;;;cd131;80;Peptoclostridium difficile BI1 ;;
;;;;cd132;22;Peptoclostridium difficile BI9 ;;
;;9,10,10;1;cd133;85;Peptoclostridium difficile CD196 ;;
;;;;cd134;66;Peptoclostridium difficile CF5 ;;
;;;;cd135;88;Peptoclostridium difficile M120 ;;
;;14,16,13;1;cd136;110;Peptoclostridium difficile M68 ;;
;;;;cd137;67;Peptoclostridium difficile R20291 ;;
1;;;;cd138;53;Peptoniphilus sp. 1-1 ;;
1;;;;cd139;58;Roseburia hominis A2-183 ;;
1;;;;cd140;52;Roseburia intestinalis M50/1 ;;
;;;;cd141;66;Roseburia intestinalis XB6B4 ;;
1;;;;cd142;57;Ruminiclostridium thermocellum ATCC 27405 ;;
;;;;cd143;57;Ruminiclostridium thermocellum DSM 1313 ;;
1;;;;cd144;79;Ruminococcus albus 7 DSM 20455 ;;
1;;;;cd145;57;Ruminococcus bicirculans 80/3 ;;
1;;;;cd146;36;Ruminococcus bromii L2-63 ;;
1;;;;cd147;45;Ruminococcus champanellensis 18P13 JCM 17042 ;;
1;;;;cd148;46;Ruminococcus obeum A2-162 ;;
1;;;;cd149;47;Ruminococcus sp. SR1/5 ;;
1;;;;cd150;47;Ruminococcus torques L2-14 ;;
1;;;;cd151;57;Sulfobacillus acidophilus DSM 10332 ;;
;;;;cd152;56;Sulfobacillus acidophilus TPY ;;
1;;666;1;cd153;98;Symbiobacterium thermophilum IAM 14863 IAM14863 ;;
1;;444;1;cd154;55;Syntrophobotulus glycolicus DSM 8271 ;;
1;;533;1;cd155;48;Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen G311 ;;
1;;222;1;cd156;47;Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 ;;
1;2*53;222;1;cd157;106;Tepidanaerobacter acetatoxydans Re1 ;;
1;;333;1;cd158;53;Thermacetogenium phaeum DSM 12270 ;;
1;;222;1;cd159;51;Thermaerobacter marianensis DSM 12885 ;;
1;;333;1;cd160;53;Thermincola potens JR ;;
1;;444;1;cd161;57;Thermoanaerobacter brockii subsp. finnii Ako-1 ;;
1;;;;cd162;56;Thermoanaerobacter italicus Ab9 ;;
1;;;;cd163;58;Thermoanaerobacter kivui DSM 2030 ;;
1;;;;cd164;59;Thermoanaerobacter mathranii subsp. mathranii str. A3 ;;
1;;;;cd165;57;Thermoanaerobacter pseudethanolicus ATCC 33223 39E ;;
1;;;;cd166;56;Thermoanaerobacter sp. X513 ;;
1;;;;cd167;54;Thermoanaerobacter sp. X514 ;;
1;;;;cd168;57;Thermoanaerobacter wiegelii Rt8.B1 ;;
1;;;;cd169;58;Thermoanaerobacterium saccharolyticum JW/SL-YS485 ;;
1;;555;1;cd170;58;Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum DSM 571 ;;
;;;;cd171;58;Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum M0795 ;;
1;;;;cd172;58;Thermoanaerobacterium xylanolyticum LX-11 ;;
1;;222;1;cd173;48;Thermodesulfobium narugense DSM 14796 ;;
1;;333;1;cd174;53;Thermosediminibacter oceani DSM 16646 ;;

génomes bacilli

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60;Aerococcus urinae ACS-120-V-Col10a ;;;;56;Amphibacillus xylanus NBRC 15112 ;;;;95;Bacillus amyloliquefaciens IT-45 ;;;;;;;;;89;Bacillus amyloliquefaciens subsp. amyloliquefaciens KHG19 ;;;;;;89;Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 ;;;;;;70;Bacillus amyloliquefaciens TA208 ;;;;112;Bacillus anthracis 2002013094 ;;;;;;;;;94;Bacillus anthracis BA1015 ;;;;;;;;;75;Bacillus atrophaeus 1942 ;;;;80;Bacillus atrophaeus subsp. globigii BSS ;;;;95;Bacillus bombysepticus str. Wang ;;;;;;;;83;Bacillus cellulosilyticus DSM 2522 ;;;;;;118;Bacillus cereus Al Hakam ;;;;;;;95;Bacillus cereus Q1 ;;;;;;;;;107;Bacillus cytotoxicus NVH 391-98 ;;;;;;;;;;;;123;Bacillus sp. X12014 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;86;Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 ;;;;;;;;142;Bacillus thuringiensis Bt407 ;;;;;;;;;78;Bacillus thuringiensis MC28 ;;;;;;;;98;Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus ATCC BAA-365 ;;;;67;Listeria monocytogenes EGD ;;;;;;175;Paenibacillus mucilaginosus 3016 ;;;;;;;;;;165;Paenibacillus polymyxa SC2 ;;;;;;63;Staphylococcus aureus 04-02981 ;;;;;80;Streptococcus agalactiae 09mas018883 ;;;;59;Streptococcus uberis 0140J ;;;;;;;;56;Terribacillus aidingensis MP602 ;;;;;62;Tetragenococcus halophilus NBRC 12172 ;;;;;;;;61;Thermobacillus composti KWC4 ;;;;;;;;54;Virgibacillus sp. SK37 ;;;;;75;Weissella ceti WS08 ;;;;;
bc001;444;Chromosome ;;;bc004;666;Chromosome ;;;bc008;10,10,10;Chromosome;;;;;;;;bc014;10,8,10;Chromosome;16s°;court;;;bc015;10,9,10;Chromosome;;;;;bc025;666;Chromosome;;;bc029;11,11,11;Chromosome;;;;;;;;bc034;10,10,10;Chromosome;;;;;;;;bc063;777;Chromosome;;;bc065;888;Chromosome;;;bc066;13,13,13;Chromosome;;;;;;;bc067;10,10,10;Chromosome;;;;;bc074;14,14,14;Chromosome;;;;;;bc090;13,13,13;Chromosome;;;;;;;;bc097;13,13,13;Chromosome;;;;;;;;;;;bc125;12,12,12;Chromosome;;;;;;;;;;;;;;;;;;bc147;10,10,10;Chromosome;;;;;;;bc158;14,14,14;Chromosome;;;;;;;;bc165;15,15,15;Chromosome;;;;;;;bc244;999;Chromosome;;;bc328;666;Chromosome;;;;;bc384;14,14,14;Chromosome;;;;;;;;;bc393;14,13,13;Chromosome;;;;;bc413;755;Chromosome;;;;bc499;777;Chromosome;;;bc655;555;Chromosome ;;;;;;;bc656;888;Chromosome;;;;bc657;555;Chromosome;;;;;;;bc658;555;Chromosome;;;;;;;bc659;777;Chromosome;;;;bc660;766;Chromosome;;;;
16s23s5s;;;;;2*16s23s5s;;;;;2*16atcgca235;;;;;;;;;;4*16s23s5s;;;;;;;3*16s23s5s;;;;;;;2*16s23s5s;;;;;4*16s23s5s;;;;;;;;;;5*16s23s5s;;;;;;;;;;16s23s5s;;;;;3*16s23s5s;;;;;8*16s23s5s;;;;;;;;;7*16s23s5s;;;;;;;5*16s23s5s;;;;;;;;7*16s23s5s;;;;;;;;;;5*16s23s5s;;;;;;;;;;;;;16s23s5s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;3*16s23s5s   encadrés;;;;;;;;;5*16s23s5s;;;;;;;;;;10*16s23s5s;;;;;;;;;4*16atcgca235;;;;;2*16s23s5s dont un encadré ici;;;;;;;5*16s23s5s;;;;;;;;;;;7*16s23s5s;;;;;;;16atcgca235;;;;;;2*16-gca-235-aac;;;;;2*16-gca-235-aac-cgt;;;dir : direct;;;;;;4*16s23s5s;;;;;;16s23s5s;;;;;;;;;16s23s5s;;;;;;;;;4*16s23s5s;;;;;;16atcgca235;;;;;;
16atcgca235-aac-acc;;;;;16atcgca235-aac-acc;;;;;2*16s23s5s;;;;;;;;;;cgt-gga-16s23s5s-atgf-gac;;;;;;;16atcgca235;;;;;;;16atcgca235;;;;;2*16atcgca235;;;;;;;;;;16atcgca235-15aas;;;;;;;;;;2*16atcgca235;;;;;16s23s5s-atgf-gac;;;;;4*16s23s5s-22,19,15,8 aas;;;;;;;;;16atcgca235-9aas;;;;;;;16s23s5s-atgf-gac;;;;;;;;16atcgca235;;;;;;;;;;2*16atcgca235;;;;;;;;;;;;;2*16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;2*16atcgca235;;;;;;;;;2*16atcgca235;;;;;;;;;;16s23s5s-gaa;;;;;;;;;16atcgca235-5aas;;;;;2*16s23s5s-21,9;;;;;;;9*16s23s5s-23  22  19  17  16  12  11  9  9;;;;;;;;;;;16s-gca-235;;;;;;;16atcgca-235-26aas;;;;;;5*16-gca-235-17,15,12,9,4 aas;;;;;16s-gca-235-17, 12, 7 aas;;;comp : complement;;;;;;16s23s5s-aac-acc;;;;;;16s23s5s-aac;;;;;;;;;16s-5s-23s-atgf-ctc-ctg;;;;;;;;;16atcgca235-aac-acc;;;;;;16s23s5s;;;;;;
16atcgca235-22aas;;;;;16s23s5s-atgf-gac;;;;;5*16s23s5s-21,16,9,9,5 aas;;;;;;;;;;16s°atcgca235;;;;;;;16s23s5s-21,16,9,7 aas  ;;;;;;;cgt-gga-16s23s5s-atgf-gac;;;;;4*16s23s5s-20,19,11,9 aas;;;;;;;;;;3*16s23s5s-22,20,9aas;;;;;;;;;;16s23s5s-aac-acc;;;;;16s23s5s-aac-acc;;;;;12aas-16s23s5s-atgf-gac;;;;;;;;;2*16s23s5s-16,16aas;;;;;;;2*16atcgca235;;;;;;;;4*16s23s5s-22,20,15,9 aas;;;;;;;;;;12aas-16s23s5s-atgf-gac;;;;;;;;;;;;;suite3-16s23s5s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;cgt-gga-16s23s5s-atgf-gac;;;;;;;;;suite2-16s23s5s;;;;;;;;;;3*16s23s5s-20,15,9;;;;;;;;;2*16s23s5s dont un encadré ici;;;;;16atcgca235-14aas;;;;;;;;;;;;;;;;;;16s-5s-atcgca-23s-8aas;;;;;;;16s23s5s-6aas;;;;;;;interc;;interc;;;;;;;;;;;16atcgca235;;;;;;2*16s-gca-235-25, 8aas ;;;;;;;;;2*16s-5s-atcgca-23s-9,5aas;;;;;;;;;12aas-16s23s5s-atgf-gac;;;;;;16s23s5s-6aas:gta-gac-tgg-cac-ttg-cca;;;;;;
16s23s5s-12aas;;;;;16s23s5s-9aas;;;;;cgt gga 16s23s5s atgf gac;;;;;;;;;;16s23s5s-x aas  et 16atcgca235-x aas;;;;;;;16s23s5s-atgf-gac;;;;;;;16s23s5s-x aas;;;;;33aas-16s23s5s-atgf-gac;;;;;;;;;;11aas-16s23s5s-atgf-gac;;;;;;;;;;16s23s5s-atgf-gac;;;;;3*16s23s5s-21,16,9 aas;;;;;interc;;interc;;interc;;interc;;;interc;;interc;;interc;;;5*16s23s5s-22,20,15,9,9 aas;;;;;;;;11aas-16s23s5s-atgf-gac;;;;;;;;;;5*16s23s5s-22,20,15,9,9aas;;;;;;;;;;;;;10aas-16s23s5s-atgf-gac;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;16s23s5s-21, 16, 9, 6aas;;;;;;;;;5*16s23s5s-22,20,15,9,9aas;;;;;;;;;;12aas-16s23s5s-atgf-gac;;;;;;;;;16s23s5s-6, 5aas;;;;;16atcgca235-aac-acc;;;;;;;;interc;;interc;;interc;;interc;;interc;;16s-5s-atcgca-23s-5s-11aas;;;;;;;5s-8aas-16s-atc-235;;;;;;16s;47;16s;47;;;interc;;;interc;;;;;11aas-16s23s5s-atgf-gac;;;;;;16s23s5s-12aas;;;;;;;;;16s-5s-23s-14aas;;;;;;;;;16s23s5s-14aas;;;;;;2*16atcgca235-17aas, 4aas-5s-aac;;;;;;
interc;;interc;;;16s23s5s-13aas;;;;;interc;;interc;;interc;;interc;;;;interc;;interc;;interc;;;16s°atcgca235;;;;;;;interc;-;interc;;;interc;;;interc;;;interc;;;;interc;;interc;;interc;;interc;;;;2*16s23s5s-21,16 aas;;;;;interc;;interc;;;140;16s;140;16s;5;gaa;3;aac;;159;16s;303;16s;71;aaa;;13aas-16s23s5s;;;;;;;;interc;;interc;;interc;;interc;;;;°;interc;;;;;;;;;;;;7*16s23s5s-21,16,14,12,10,9,9;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;interc;;à enlever;interc;;;interc;;12aas-16s23s5s-atgf-gac;;;;;;;;;;Les blocs sont emboités. Ils sont tous de type 16s23s5s-xaas, 20  15  9,  sauf  14 avec 12aas-16s23s5s-atgf-gac.;;;;;;;;;;interc;;interc;;;interc;;interc;;interc;;cds;342;cds;677;cds;537;cds;373;cds;324;;3*16s23s5s-11, 17, 21 aas;;;;;;;ctc-gga-16s23s5s;;;;;;gca;153;gca;155;;dir    ;361;cds;amino acid permease;;;;;;16s23s5s-13aas;;;;;;;interc;;;;;;;;;interc;;;;;;;;;interc;;;;;gga-16atcgca235-gta;;;;;;
203;16s;16;gaa;;interc;;interc;;;170;16s;246;ttg;4;gca;16;cca;;;3;gaa;-2934;16s°;228;16s;;interc;-;interc;-;interc;;;3;gaa;228;16s;;139;16s;;10;gca;;3;gac;comp;;10;ttg;140;16s;1;gaa;3;gac;comp;;interc;;interc;;;176;16s;4;gaa;;96;23s;97;23s;7;agc;8;agc;;13;atc;67;23s;32;gaa;;interc;;interc;;;interc;;;141;16s;140;16s;6;gaa;3;aac;direct;;comp;753;cds;efflux RND transporter permease subunit;;;;;;;;;;Les blocs sont emboités. Ils sont tous 16s23s5s. Met avec atgj. Quand les blocs se suivent j’ajoute une ligne pour le 16s suivant.;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;16s;164;;cgt;13;;gaa;25;;Les blocs sont emboités. Ils sont tous de type 16s23s5s-xaas, 22 20  15  9  9,  sauf  14 avec 12aas-16s23s5s-atgf-gac.;;;;;;;;;;;interc;;;;;;;;cds;161;cds;298;;16s;244;gaa;5;ttg;45;;ctc;28;16s;268;16s;252;16s;260;16s;258;;;interc;;interc;;interc;;23s°5s;;;;;;23s;72;23s;72;;dir    ;66;16s;;;;;;;;interc;;;;;comp;208;cds;methionine adenosyltransferase;;;;;;dir    ;368;cds;MFS transporter;;;;;;dir     ;175;cds;SprT family protein;*;;;interc;;;;;
75;23s;12;ttc;;388;16s;483;16s;;47;23s;7;tta;16;cca;32;cgt;;;3;agc;98;23s;47;23s;;3;gaa;170;16s;170;16s;;3;agc;98;23s;;97;23s;;5;ggc;;12;atgf;comp;;14;tgc;97;23s;8;aac;12;atgf;comp;;176;16s;4;gaa;;106;23s;3;agc;;8;5s;4;5s;7;aac;5;gaa;;176;gca;8;5s;5;agc;;1;gaa;10;ttg;;10;gca;;96;23s;97;23s;7;agc;8;agc;direct;;dir     ;242;16s;;;;;;;;;;;Première boîte, les blocs sont tous 16s23s5s-xaas,   21  16  12  9.;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;23s;55;;gga;159;;agc;3;;;interc;;;;;;;;;dir    ;139;cds;hp;;;;;;gta;3;5s;68;;23s;80;agc;34;tgc;19;;tcc;12;23s;95;23s;94;23s;168;23s;166;;cds;392;cds;1 116;cds;726;;;interc;à enlever;interc;;;5s;3;5s;3;;dir    ;193;gca;dir    ;592;cds;50S ribosomal protein L17;*;;dir    ;167;cds;SprT family protein;;;comp;7;gaa;;;;;;;dir    ;101;16s;;;;;;;dir     ;3;aac;;;;dir    ;434;cds;lysine--tRNA ligase;;;
13;5s;22;gac;;186;23s;201;23s;;23;5s;6;tgc;11;cgt;296;ggc;;;10;aac;9;5s;23;5s;;3;agc;97;23s;47;23s;;10;aac;9;5s;;4;5s;;5;aaa;;46;5s;comp;;5;ggc;4;5s;10;atc;45;5s;comp;;106;23s;3;agc;;9;5s;17;aac;;2;aac;4;gta;10;atc;25;gta;;67;23s;3;aac;1;aac;;3;aac;14;tgc;;9;cca;;8;5s;5;5s;7;aac;4;gaa;direct;;dir     ;222;23s;°;long;interc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;5s;20;;16s;167;;aac;10;;comp;680;cds;L-lactate dehydrogenase;;;;;;;dir    ;141;16s;;;;;;;gaa;138;23s;208;;5s;13;aac;6;ggc;5;;atgf;14;5s;55;5s;43;5s;9;5s;31;;16s;207;16s;207;gga;9;;ttg;38;5s;70;comp;;gta;2;gta;2;;dir    ;200;23s;dir    ;66;16s;;;;dir    ;2;aac;;;;comp;24;agc;dir     ;230;cds;site-specific integrase;*;;dir    ;63;5s;comp;132;cds;undecaprenyl/decaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphate transferase;*;;dir     ;7;agc;;;;dir    ;84;16s;;;;
34;aac;41;atgf;;4;5s;11;5s;;29;gta;53;ggc;14;tta;2;acc;;;15;atc;5;aac;5;gta;;10;aac;9;5s;23;5s;;15;atc;5;aac;;4;gta;;65;caa;;141;23s;comp;;63;caa;4;gta;6;tgg;141;23s;comp;;9;5s;17;aac;;5;acc;15;atc;;17;tcc;9;aca;13;gga;3;atgf;;8;5s;11;tcc;32;atc;;10;atc;5;ggc;;3;cgt;;2;aac;8;gta;10;atc;46;gta;direct;;dir     ;4;5s;dir   ;465;101;cds;SprT family protein;;;;;;comp;466;;cds;1,4-alpha-glucan branching protein GlgB;;;;;;;;;;;;;;;;gta;4;;23s;55;;atc;15;;comp;6;gaa;dir    ;113;cds;hp;;;;dir    ;97;23s;;interc;;;;;atgj;6;16s;436;;gta;8;atc;25;caa;29;;atgj;14;atc;19;atc;19;aac;6;aac;6;;23s;76;23s;76;cca;22;;gga;103;23s;468;comp;;gac;2;gac;2;;dir    ;15;5s;dir    ;193;gca;;;;dir    ;8;agc;;;;comp;19;atc;comp;18;ttg;;;;dir    ;21;atc;comp;15;tac;;;;dir     ;25;gaa;;;;dir    ;6;atc;;;;
13;tcc;9;gaa;;3;gta;4;aac;;37;aca;9;caa;24;ggc;45;aac;;;8;gga;36;tcc;36;aca;;15;atc;5;aac;5;gta;;9;gga;35;tcc;;9;aca;;17;tac;;75;16s;comp;;19;cac;9;aca;9;aca;75;16s;comp;;5;aac;15;atc;;35;tcc;9;gga;;4;gaa;22;cac;10;aaa;87;gac;;5;gta;150;gaa;39;gga;;3;tgg;65;caa;;16;tta;;17;tcc;11;tac;13;gga;87;gac;direct;;dir     ;9;gta;dir   ;72;6;aac;;;;;;;comp;5;;gaa;;;;;;;;;;;;;;;;;aca;36;;5s;13;;gga;10;;comp;7;agc;dir    ;140;16s;;;;;dir    ;4;5s;dir    ;403;cds;hp;;;tcc;8;cds;-8;;aca;41;gga;23;cac;15;;agc;8;gca;16;gca;17;tcc;38;tcc;38;;5s;34;5s;82;cgt;5;;gga;7;16s;118;comp;;aaa;9;aaa;9;;dir    ;18;gta;dir    ;200;23s;;;;dir    ;30;gaa;;;;comp;9;gga;comp;41;tgc;;;;dir    ;179;gca;comp;10;ttc;;;;dir     ;5;gac;;;;dir    ;202;gca;;interc;;
21;gaa;12;agc;;21;aca;43;tcc;;10;aaa;29;cac;6;cta;47;5s;;;20;cac;10;gaa;6;aaa;;8;gga;36;tcc;36;aca;;21;cac;10;gaa;;22;cac;;5;gta;;1;gga;comp;;7;tgg;22;cac;8;ttc;1;gga;comp;;35;tcc;9;gga;;10;gaa;24;cac;;26;gta;29;cta;14;aca;5;caa;;18;aca;261;gta;3;cgt;;16;aca;12;cac;;29;ggc;;5;gaa;4;caa;10;aaa;5;caa;direct;;dir     ;10;tac;dir   ;91;6;agc;°;interc;;;;;comp;3;;agc;comp;808;;cds;SIS domain-containing protein;;;;;;;;;;;;aaa;6;;atgf;60;;cac;17;;comp;7;aac;dir    ;97;23s;;;;;dir    ;8;gta;comp;141;16s;;;;aac;7;cds;138;;aaa;5;cac;28;tgg;7;;tcg;4;gaa;9;gaa;8;gaa;11;gaa;11;;atc;22;gca;4;ggc;10;;tgc;5;gga;21;comp;;cta;10;cta;10;;dir    ;73;gac;dir    ;15;5s;;;;dir    ;5;gac;;;;comp;4;ttc;comp;11;caa;;;;dir    ;85;23s;comp;21;gac;;;;dir     ;263;caa;;;;dir    ;103;23s;dir     ;452;cds;hp
14;gta;10;atc;;7;aaa;32;gaa;;9;ctg;10;tgg;36;aaa;170;23s;;;10;ttc;7;gta;24;cta;;20;cac;10;gaa;6;aaa;;11;ttc;7;gta;;29;cta;;24;gaa;;4;cca;comp;;10;tac;29;cta;4;gac;4;cca;comp;;10;gaa;24;cac;;7;gta;14;ttc;;3;atgf;16;ggc;13;ttc;16;aaa;;14;aaa;55;atgf;6;ggc;;10;ttc;14;tgg;;13;cta;;24;gta;14;aaa;14;aca;17;aaa;direct;;dir     ;5;caa;dir   ;75;5;gaa;dir     ;381;cds;lysine--tRNA ligase;*;;comp;149;;aac;comp;17;;aac;;;;;;;;;;;;;cta;40;;gac;:4;;ttc;12;;comp;10;atc;dir    ;5;5s;;;;;dir    ;12;tac;comp;98;23s;;;;5s;69;gac;3;;cta;14;ttc;4;tac;20;;acc;4;tac;20;gta;5;gta;17;gta;17;;gca;4;aac;3;cta;11;;caa;11;ctc;:2;comp;;aca;35;aca;28;;dir    ;5;aaa;dir    ;9;gta;;;;dir    ;16;caa;;;;comp;43;gac;comp;2;cac;;;;dir    ;3;aac;comp;5;gta;;;;dir     ;17;aaa;;;;dir    ;4;5s;dir     ;84;16s;
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7;ttc;17;gac;;45;ggc;26;gac;;9;tta;3;aca;23;gta;;;;;19;atgf;10;gac;11;tta;;6;gac;7;atgf;14;ggc;;19;atgf;12;gac;;3;tta;;9;aac;;16;tta;comp;;9;ttc;3;tta;54;tca;16;ctc;comp;;38;atgf;39;gac;;15;gac;36;atgf;;18;ttc;10;cgt;27;atgf;4;cgt;;25;ggc;10;ttc;19;cac;;24;atgf;14;aca;;5;aca;;9;gac;16;ggc;1;gac;4;cgt;direct;;dir     ;29;cta;dir   ;76;74;gac;dir     ;144;23s;;;;comp;17;;gga;comp;9;;tgc;comp;4;;atc;;;;;;;;;tta;9;;16s;167;;atgf;17;;comp;10;aaa;dir    ;11;tac;;;;;dir    ;18;aaa fin;comp;2;aac;;;;gca;69;cgt;35;;tta;12;atgf;42;gac;6;;ncRNA;36;gta;19;tac;18;gac;49;gac;67;;atgj;3;gaa;9;caa;55;;tgg;15;5s;12;direct;;tta;11;gaa;13;;dir    ;13;aca;dir    ;16;atc;;;;dir    ;58;ctc;;;;comp;16;tca;comp;4;tac;;;;dir    ;40;gaa;comp;166;23s;;;;dir     ;58;ctc;;;;dir    ;42;aaa;dir     ;203;gca;
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11;tgc;5;gca;;;;6;caa;;7;atgi;36;gaa;4;gca;10;gac;comp;;17;cca;9;cac;;;;4;gca;29;tgg;;;;18;cca;9;cac;;20;cta;;1;gaa;;46;gac;comp;;2;tcc;17;atgi;16;tta;8;gaa;comp;;25;tgg;6;gca;;9;cac;14;cca;;5;caa;3;atgf;10;cca;12;5s;;;;7;caa;25;atgj;;3;cgt;10;gaa;;;;;63;cac;51;tca;16;gca;12;5s;direct;;dir     ;14;gca;dir   ;77;4;cgt;dir     ;29;cta;;;;comp;17;;tca;comp;104;;tca;comp;19;;atgj;dir;161;;gta;;;;;23s;55;;gaa;9;;cca;15;;comp;17;tca;dir    ;3;tta;;;;;dir    ;15;cca;comp;11;gac;;;;cds;200;23s;208;;23s;80;cca;10;aac;14;;aaa;9;ggc;12;cac;13;cac;26;ggc;40;;gac;50;tac;102;5s;76;;atgf;14;tta;5;direct;;tca;10;tgg;14;;dir    ;24;atgj;dir    ;5;tac;;;;dir    ;173;16s;;;;comp;47;atgf;comp;47;tcc;;;;dir    ;7;cgt;comp;:7;cds;SigmaK-factor processing regulatory protein BofA;*;;dir     ;309;16s;;;;dir    ;24;atgj;dir     ;33;gta;
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;;32;tta;;;;:13;ttg;;10;gac;99;5s;14;tta;228;23s;comp;;9;ggc;7;tgc;46;5s;;19;tta;6;ggc;47;23s;;9;ggc;7;tgc;;14;ttc;;6;tgg;;8;aac;comp;;77;23s;12;gac;4;aaa;;;;;5;ggc;14;tta;;6;tgc;42;ggc;;:15;ttg;3;aca;29;ggc;:14;;;;;41;tta;316;23s;;16;cta;92;5s;;4;5s;;10;tgc;9;gac;16;tta;;;;;dir     ;3;atgf;dir   ;1554;242;16s;dir     ;8;cgt;;;;comp;17;;gca;comp;12;;cgt;comp;5;;tta;dir;8;;cta;;;;;16s;164;;gac;12;;ggc;5;;comp;15;gca;dir    ;20;gca;;;;;dir    ;20;tca;comp;7;tac;;;;gta;2;;;;à enlever;;ggc;15;gca;46;;gac;12;cca;158;ctc;13;tgc;10;cca;19;;tac;16;cta;10;atc;38;;tca;9;gca;121;direct;;gga;34;ttg;:16;;dir    ;21;atgf;dir    ;22;caa;;;;dir    ;70;atgf;;;;comp;22;atgj;comp;218;23s;;;;;;;;;;;;;dir     ;131;atgf;;;;dir    ;8;gac;dir     ;63;aac;
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;;7;cta;;;;;;;15;gga;;;36;aaa;:4;cgt;comp;;29;aca;;;32;ggc;;37;aaa;:16;ttg;342;acc;;29;aca;;;;10;gga;;4;gac;;9;aca;comp;;:17;16s;13;aaa;5;gta;5;aaa;;;:16;ttg;37;aaa;;;;41;aca;;86;23s;1;aac;4;aca;;;;;;;;;;;9;tac;;;;24;cac;;;;10;tgg;9;cac;9;5s;;;dir     ;6;aca;dir   ;77;3;atgf;;;;;;;comp;5;;tta;comp;104;;aca;comp;186;;aca;dir;17;;cgt;;;;;aac;4;;tac;5;;aca;32;;comp;16;tta;dir    ;3;atgf;;;;;dir    ;10;ttc;comp;5;caa;;;;5s;68;;;;5s;80;aca;8;;;;tac;8;tcg;19;tgc;10;ttg;147;cds;:16;;aaa;15;ttg;7;cds;:13;;gca;17;23s;70;direct;;;;gca;153;;dir    ;7;atc;;;;;;;;;;;;;comp;13;cgt;;;;;;;comp;15;cgt;;;;;;;;;;;;;dir    ;17;gga;;;;
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;;10;gta;;;;;;;3;aac;;;23;gta;;;;;47;5s;;;4;cca;;23;gta;;;16;cgt;;47;5s;;;;7;aac;;54;tca;;4;gac;comp;;;;7;atc;141;23s;17;tac;;;;;22;gta;;54;23s;54;5s;;4;aac;;;97;5s;;;;;;;;;;;98;5s;140;23s;comp;16;ggc;;;;1;acc;4;gta;24;acc;;;dir     ;9;atc;dir   ;474;:14;cds;tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex ATPase subunit type 1 TsaE;;;;*;;comp;9;;cta;comp;41;;gaa;comp;307;;23s;dir;:9;;gca;;;;;ggc;30;;cac;9;;5s;55;;comp;22;cta;dir    ;10;ttc;;;;;dir    ;10;tgg;comp;10;tgc;;;;16s;153;;;;gca;46;5s;81;;;;gaa;15;gtc;5;cca;105;;;cds;83;;ggc;10;gga;1 133;cds;107;;cgt;18;;;;;gca;153;5s;3;;dir    ;:18;cds;rod shape-determining protein MreC;;;;;;dir    ;173;16s;;;;comp;11;ggc;;;;;;;comp;6;ggc;;;;;;;dir    ;329;16s;;;;dir    ;4;gga;;;;
;;75;5s;;;;;;;3;agc;;;47;5s;;;;;81;23s;;;20;gca;;47;5s;;;4;cca;;170;23s;;;;:20;agc;;20;tca;;20;atgf;comp;;;;7;aac;:20;16s;5;gta;;;;;54;5s;;22;5s;176;23s;;24;acc;;;140;23s;;;;;;;;;;;140;23s;75;16s;comp;3;tta;;;;:20;gaa;98;5s;5;gaa;;;dir     ;1;caa;;;;;;;;;;;comp;163;;aaa;comp;91;;5s;comp;555;;16s;dir;-;;16s;suite2;;;;cgt;27;;caa;49;;23s;167;;comp;10;cac;dir    ;3;aca;;;;;dir    ;9;atc;comp;152;ttg;;;;cds;:5;;;;atc;127;23s;244;;;;gcc;9;acg;39;cds;:19;cds;797;gga;5;;tgc;26;cds;:17;cca;7;;tta;10;aaa;3;;;23s;72;gta;2;;;;;;;;;;;dir    ;233;23s;;;;comp;11;aca;;;;;;;comp;10;caa;;;;;;;dir    ;151;23s;;;;dir    ;42;atc;;;;
;;165;23s;;;;;;;:21;gaa;;;170;23s;;;;;14;gca   ;;;:7;atgj;;170;23s;;;20;gca;;:21;16s;;;;;;;16;gca;;54;tca;comp;;;;6;agc;;;24;gaa;;;;;176;23s;;30;gta;:21;16s;;5;gaa;;;:22;16s;;;;;;;;;;;:20;16s;1;gga;comp;10;cgt;;;;;;141;23s;17;gta;;;dir     ;167;gaa;;;;;;;;;;;comp;162;;aca;comp;284;;23s;comp;:12;;cds;exodeoxyribonuclease III;;;;;;;;cca;8;;ggc;5;;16s;:21;;comp;4;aca;dir    ;10;tgg;;;;;dir    ;1;aac;dir    ;:15;cds;DUF3884 family protein;*;;;;;;;16s;:4;16s;:21;;;;atc;54;tcc;41;;;16s;261;cca;16;;cgt;22;;;ttg;12;;ggc;3;caa;9;;;5s;3;gac;2;;dir    ;83;cds;hp;;;;;;dir    ;12;5s;;;;comp;13;cta;;;;;;;comp;20;cac;;;;;;;dir    ;36;5s;;;;dir    ;71;agc;;;;
;;34;gca;;;;;;;;;;;:9;16s;;;;;96;atc;;;;;;:21;16s;;;:7;atgj;;;;;;;10;ttg;;10;cca;;20;tca;comp;;;;:22;gaa;;;4;acc;;;;;:21;16s;;37;aca;;;;17;gta;;;;;;;;;;;;;;;;;3;cca;comp;14;cca;;;;;;:22;16s;65;tac;;;dir     ;:20;cds;CBS domain-containing protein;;;;;;;;;;comp;8;;gta;comp;437;;16s;;;;;;;;;;;;;gca;171;;tgc;7;;;;;comp;4;gta;dir    ;8;atc;;;;;dir    ;132;gaa;;;;;;;;;;;;;;;;;;;5s;112;ctc;283;cds;298;23s;94;cgt;4;;cca;9;cds;412;cgt;5;;cta;3;tac;29;;;gta;5;aaa;9;;comp;16;gaa;;;;;;;dir    ;1;aac;;;;comp;2;aaa;;;;;;;comp;39;tgg;;;;;;;dir    ;2;aac;;;;dir    ;:19;cds;hp;;;
;;75;atc;;;;;;;;;;;;;;;;;:23;16s;;;;;;;;;;;;;;;;;;14;tgc;;3;cgt;;16;gca;comp;;;;;;;;9;aac;;;;;;;;8;aaa;;;;65;tac;;;;;;;;;;;;;;;10;gca;92;cgt;comp;16;gca;;;;;;;;5;caa;;;;;;;;;;;;;;;;comp;145;;5s;comp;:16;;cds;6-phospho-3-hexuloisomerase;;;;;;;;;;;;16s;164;;tta;265;;;;;comp;97;5s;dir    ;1;aac;;;;;dir    ;:20;cds;CBS domain-containing protein;;;;;;;;;;;;;;;;;;23s;258;cds;:22;16s;254;5s;43;ggc;8;;gga;204;16s;108;ggc;35;;aaa;5;gta;7;;;gga;36;cta;10;;comp;50;atc;;;;;;;dir    ;17;tcc;;;;comp;7;gta;;;;;;;comp;89;aca;;;;;;;dir    ;16;tcc;;;;;;;;;;
;;:24;16s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;5;ggc;;16;tta;;10;cca;comp;;;;;;;;82;5s;;;;;;;;42;cta;;;;5;caa;;;;;;;;;;;;;;;5;ggc;3;ctc;comp;4;atgj;;;;;;;;5;aaa;;;< dir;273;cds;group-specific protein;;;;;;;;;;comp;286;;23s;;;;;;;;;;;;;;;;;23s;55;;ttg;:16;;;;;comp;140;23s;dir    ;129;gaa;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;16s;403;;;23s;168;atc;11;cta;42;;cds;:21;5s;39;aaa;28;;aca;16;gaa;1;;;atc;10;aca;35;;comp;10;aca;;;;;;;dir    ;20;gaa;;;;comp;79;5s;;;;;;;comp;37;gac;;;;;;;dir    ;4;gaa;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;63;caa;;29;ggc;;3;cgt;comp;;;;;;;;141;23s;;;;;;;;14;ggc;;;;86;aaa;;;;;;;;;;;;;;;5;aaa;15;cta;comp;17;atgi;;;;;;;;10;ggc;;;comp;7;gaa;;;;;;;;;;;comp;506;;16s;;;;;;;;;;;;;;;;;5s;183;;;;;;;;comp;103;16s;dir    ;:20;cds;CBS domain-containing protein;*;;;dir    ;114;cds;SprT family protein;;;;;;;;;;;;;;;;;;cds;:23;cds;104;5s;15;gaa;5;aaa;8;;;;atc;20;gac;26;;gta;11;aac;10;;;gaa;13;ggc;8;;comp;5;cta;;;;;;;dir    ;36;gta;;;;comp;181;23s;;;;;;;comp;41;atgf;;;;;;;dir    ;24;gta;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;19;cac;;22;cta;;16;tta;comp;;;;;;;;:9;16s;;;;;;;;9;tta;;;;:8;gca;;;;;;;;;;;;;;;65;caa;5;aaa;comp;24;tca;;;;;;;;:9;gca;;;comp;4;agc;°;interc;;;;;;;;;dir     ;:21;;cds;MgtC/SapB family protein;;;;;;;;;;;;;;;;16s;164;;;;;;;;comp;:22;;cds;hp;;;;;;dir    ;3;aac;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;ggg;5;agc;29;gtc;5;caa;9;;;;gca;128;atgf;30;;5s;70;5s;70;;;tca;10;tta;11;;comp;73;aaa;;;;;;;dir    ;122;atgf;;;;comp;60;gca;;;;;;;comp;82;gta;;;;;;;dir    ;46;atgf;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;7;tgg;;9;cac;;29;ggc;comp;;;;;;;;;;;;;;;;;14;cgt;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;16;tac;85;caa;comp;2;atgf;;;;;;;;;;;;comp;4;aac;comp;344;cds;hp;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;23s;55;;;;;;;;;interc;;;;;;;;;dir    ;8;agc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;cca;106;atgj;39;atgf;4;tgg;4;;;;23s;130;gta;9;;23s;212;23s;468;;;atgf;2;cgt;7;;comp;18;gac;;;;;;;dir    ;28;gac;;;;comp;538;16s;;;;;;;comp;18;gaa;;;;;;;dir    ;38;gac;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;17;tac;;4;aca;;13;cta;comp;;;;;;;;;;;;;;;;;6;cca;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;5;gta;2;gac;comp;11;gac;;;;;;;;;;;;comp;11;atc;dir     ;242;16s;;;;;;;;Deuxième boîte, les blocs sont tous 16s23s5s-xaas,  (14  10  12  9), sauf la boîte 12 qui est 10aas-16s23s5s-atgf-gac.;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;5s;:6;;;;;;;;dir    ;113;cds;SprT family protein;;;;;;;dir    ;4;gaa;dir    ;224;cds;hp;*;;;;;;;;;;;;;;;;cgt;11;gta;15;tgg;9;atgf;5;;;;agc;28;gaa;17;;gca;18;16s;:6;;;ttc;11;cca;:10;;comp;15;gta;;;;;;;dir    ;8;ttc;;;;comp;:26;cds;lysine--tRNA ligase;;;;;;comp;6;tcc;;;;;;;dir    ;21;ttc;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;5;gta;;4;gta;;5;aaa;comp;;;;;;;;;;;;;;;;;:9;gca;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;23;gaa;24;atgf;comp;14;ttc;;;;;;;;;;;;comp;13;gga;dir     ;149;23s;°;interc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir    ;3;aac;;interc;;;;;;dir    ;25;gta;dir    ;141;16s;;;;;;;;;;;;;;;;;;ggc;5;atgf;14;caa;8;gtc;5;;;;atgj;10;tcc;3;;atc;89;;;;;tac;6;;;;comp;200;5s;;;;;;;dir    ;1;tac;;;;;;;;;;;;;comp;146;aac;;;;;;;dir    ;22;tac;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;24;gaa;;97;5s;;87;caa;comp;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;4;acc;5;gta;comp;10;aca;;;;;;;;;;;;comp;10;aaa;dir     ;8;5s;dir     ;218;cds;hp;;*;;dir    ;271;;cds;hp;;;;;dir    ;146;;cds;SprT family protein;;;;;;;;;;;;;;;;dir    ;8;agc;dir    ;372;cds;lysine--tRNA ligase;*;;;dir    ;3;atgf;dir    ;86;23s;;;;;;;;;;;;;;;;;;ctg;13;gac;48;aaa;18;gaa;11;;;;gta;4;aac;18;;16s;:28;;;;;tgg;14;16s;47;;comp;193;23s;;;;;;;dir    ;16;tgg;;;;dir    ;40;cds;ISL3 family transposase;;;;;;comp;97;23s;;;;;;;dir    ;10;tgg;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;4;acc;;141;23s;;46;gac;comp;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;8;aac;8;gaa;comp;12;aaa;;;;;;;;;;;;comp;14;aca;dir     ;5;aac;dir     ;242;16s;;;;;dir    ;284;;16s;;;;;;dir    ;4;;aac;;;;;;;;;;;;;;;;;dir    ;4;gaa;dir    ;140;16s;;;;;dir    ;87;gac;dir    ;9;5s;;;;;;;;;;;;;;;;;;ctc;16;ttc;5;ctg;4;atc;43;;;;aca;19;5s;76;;;;;;;;cac;6;gca;153;;comp;66;gca;;;;;;;dir    ;74;cac;;;;dir    ;69;rpr;;;;;;;comp;104;5s;;;;;;;dir    ;22;cac;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;9;aac;;:19;16s;;4;gta;comp;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;98;5s;3;agc;comp;11;gga;;;;;;;;;;;;comp;9;ttc;dir     ;12;tcc;dir     ;145;23s;;;;;dir    ;143;;23s;dir    ;254;;cds;hp;dir    ;15;;agc;dir     ;307;;16s;suite2;;;;;;;;;;;;dir    ;26;gta;dir    ;97;23s;;;;;dir    ;5;caa;dir    ;4;aac;;;;;;;;;;;;;;;;;;aaa;10;aca;9;ggc;11;5s;94;;;;gac;77;23s;400;;;;;;;;caa;10;23s;72;;comp;345;16s;;;;;;;dir    ;5;ggc;;;;comp;3;cca;;;;;;;comp;378;16s;;;;;;;dir    ;3;caa;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;96;5s;;;;;8;gaa;comp;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;141;23s;:13;aac;comp;4;atc;;;;;;;;;;;;comp;1;gac;dir     ;5;gaa;dir     ;8;5s;;;;;dir    ;10;;5s;dir    ;142;;16s;;dir    ;49;;gaa;dir     ;91;;23s;;;;;;;;;;;;;dir    ;3;atgf;dir    ;4;5s;;;;;dir    ;16;aaa;dir    ;22;acc;;;;;;;;;;;;;;;;;;tac;28;tac;15;cgt;12;23s;255;;;;ttc;6;16s;493;;;;;;;;ttg;:13;5s;3;;comp;:8;cds;ribosome-associated translation inhibitor RaiA;;;;;;dir    ;15;tgc;;;;comp;13;cgt;;;;;;;comp;:14;cds;hp;;;;;;dir    ;9;ggc;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;141;23s;;;;;3;agc;comp;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;:9;16s;;;;8;aac;;;;;;;;;;;;comp;19;atgf;dir     ;23;gta;dir     ;4;aac;;;;;dir    ;7;;aac;dir    ;144;;23s;;dir    ;22;;gac;dir     ;7;;5s;;;;;;;;;;;;;dir    ;86;gac;dir    ;4;gta;;;;;dir    ;98;ctc;dir    ;5;gaa;;;;;;;;;;;;;;;;;;ttc;12;aaa;183;cca;577;16s;306;;;;tac;7;cds;:11;;;;;;;;;;gta;5;;;;;;;;;;;dir    ;215;ttg;;;;comp;15;tta;;;;;;;;;;;;;;;;dir    ;7;tgc;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;:11;16s;;;;;:35;aac;comp;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;6;agc;;;;;;;;;;;;comp;17;tca;dir     ;3;atgf;dir     ;23;acc;;;;;dir    ;18;;tcc;dir    ;10;;5s;;dir    ;8;;caa;dir     ;161;;gta;;;;;;;;;;;;;dir    ;5;caa;dir    ;13;aca;;;;;dir    ;4;cgt;dir    ;16;gta;;;;;;;;;;;;;;;;;;5s;159;cds;:9;cds;:11;cds;:12;;;;aaa;154;;;;;;;;;;;;gga;36;;;;;;;;;;;<>dir    ;:13;cds;hp;;;comp;11;ggc;;;;;;;;;;;;;;;;dir    ;219;ttg;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;:22;gaa;;;;;;;;;;;;comp;4;atgi;dir     ;8;gac;dir     ;5;gaa;;;;;dir    ;4;;gaa;dir    ;26;;aac;;dir    ;62;;cta;dir     ;19;;aca;;;;;;;;;;;;;dir    ;17;aaa;dir    ;14;aaa;;;;;dir    ;1;cca;dir    ;65;tac;;;;;;;;;;;;;;;;;;23s;256;;;;;;;;;;cds;:10;;;;;;;;;;;;atc;10;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;11;aca;;;;;;;;;;;;;;;;dir    ;:14;cds;ISL3 family transposase;*;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;17;atgj;dir     ;14;ttc;dir     ;9;gta;;;;;dir    ;20;;gta;dir    ;18;;acc;;dir    ;60;;ctc;dir     ;9;;aaa;;;;;;;;;;;;;dir    ;93;ctc;dir    ;29;cta;;;;;dir    ;76;gga;dir    ;5;caa;;;;;;;;;;;;;;;;;;16s;537;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;gaa;:5;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;13;cta;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;14;gca;dir     ;9;aca;dir     ;63;tac;;;;;dir    ;3;;atgf;dir    ;7;;gaa;;dir    ;16;;cgt;dir     ;8;;cta;;;;;;;;;;;;;dir    ;4;cgt;dir    ;16;ggc;;;;;dir    ;141;16s;dir    ;5;aaa;;;;;;;;;;;;;;;;;;cds;:9;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;2;aaa;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;8;cca;dir     ;7;tac;dir     ;5;caa;;;;;dir    ;38;;gac;dir    ;176;;gta;;dir    ;15;;cca;dir     ;5;;ggc;;;;;;;;;;;;;dir    ;1;cca;dir    ;3;tta;;;;;dir    ;45;23s;dir    ;10;ggc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;7;gta;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;3;cgt;dir     ;10;tgg;dir     ;5;aaa;;;;;dir    ;32;;ttc;dir    ;8;;aca;;dir    ;106;;gga;dir     ;13;;tta;;;;;;;;;;;;;dir    ;76;gga;dir    ;8;cgt;;;;;dir    ;12;5s;dir    ;117;gca;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;82;5s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;10;tta;dir     ;113;cac;dir     ;10;ggc;;;;;dir    ;7;;tac;dir    ;46;;tac;;dir    ;308;;16s;dir     ;17;;cgt;;;;;;;;;;;;;dir    ;139;16s;dir    ;9;cca;;;;;dir    ;2;atgf;dir    ;:9;cds;glycerate kinase;*;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;181;23s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;29;ggc;dir     ;4;caa;dir     ;97;gca;;;;;dir    ;14;;tgg;dir    ;8;;caa;;dir    ;91;;23s;dir     ;18;;cca;;;;;;;;;;;;;dir    ;46;23s;dir    ;:9;gca;;;;;dir    ;174;gac;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;60;gca;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;18;cta;dir     ;10;ggc;dir     ;:9;cds;glycerate kinase;;*;;dir    ;41;;cac;dir    ;56;;aaa;;dir    ;165;;5s;dir     ;:9;;gca;;;;;;;;;;;;;dir    ;12;5s;dir    ;-;16s;suite2;;;;dir    ;:14;cds;tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex ATPase subunit type 1 TsaE;;;;*;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;596;16s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;9;cac;dir     ;11;tgc;;;;;;;;dir    ;5;;caa;dir    ;6;;ggc;;dir    ;3;;atgf;dir     ;-;;16s;suite3;;;;;;;;;;;;dir    ;3;atgf;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir    ;:9;cds;response regulator transcription factor;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;5;aca;dir     ;309;ttg;;;;;;;;dir    ;8;;ggc;dir    ;255;;gca;;dir    ;155;;gac;;;;;;;;;;;;;;;;;dir    ;174;gac;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;4;gta;dir     ;:15;cds;HNH endonuclease;;;;;;;dir    ;6;;tgc;dir    ;:10;;cds;arginase;dir    ;:12;;cds;tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex ATPase subunit type 1 TsaE;;;;*;;;;;;;;;;;;dir    ;:14;cds;tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex ATPase subunit type 1 TsaE;;;;*;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;144;5s;;;;;;;;;;;dir    ;132;;ttg;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;237;23s;;;;;;;;;;;dir    ;:14;;cds;tyrosine-type recombinase/integrase;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir    ;112;cds;hp;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;366;16s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir    ;139;16s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir     ;:22;cds;MgtC/SapB family protein;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir    ;97;23s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir    ;8;5s;dir     ;103;cds;hp;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir    ;2;aac;dir     ;140;16s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir    ;17;tcc;dir     ;86;23s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir    ;4;gaa;dir     ;9;5s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir    ;26;gta;dir     ;4;aac;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir    ;3;atgf;dir     ;21;acc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir    ;9;gac;dir     ;5;gaa;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir    ;18;ttc;dir     ;16;gta;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir    ;10;aca;dir     ;65;tac;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir    ;19;tgg;dir     ;5;aaa;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir    ;63;cac;dir     ;10;ggc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir    ;5;caa;dir     ;116;gca;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir    ;14;ggc;dir     ;:9;cds;glycerate kinase;*;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir    ;10;tgc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir    ;144;ttg;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;:15;cds;DUF3884 family protein;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;

génomes clostridia

Lien fiche: génomes clostridia

62;Acetobacterium woodii DSM 1030 ;;;;67;Acetohalobium arabaticum DSM 5501 ;;;;;;;;;;;;;;;;51;Butyrivibrio proteoclasticus B316 ;;;;70;Clostridium beijerinckii 59B ;;;;87;Clostridium botulinum BKT015925 ;;;53;Clostridium botulinum CDC 297 ;;;81;Clostridium novyi NT ;;;;;77;Clostridium pasteurianum BC1 ;;;;;;53;Clostridium tetani 12124569 ;;;;54;Dehalobacter restrictus DSM 9455 PER-K23 ;;;;68;Desulfosporosinus acidiphilus SJ4 ;;;;;69;Eubacterium acidaminophilum DSM 3953 ;;;;;;;;;48;Filifactor alocis ATCC 35896 ;;;;;48;Finegoldia magna ATCC 29328 ;;;;;59;Halanaerobium hydrogeniformans ;;;;;78;Halobacteroides halobius DSM 5150 ;;;;;109;Heliobacterium modesticaldum Ice1 ATCC 51547 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;98;Symbiobacterium thermophilum IAM 14863 IAM14863 ;;;;;48;Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen G311 ;;;;;;53;Thermincola potens JR ;;;;;;57;Thermoanaerobacter brockii subsp. finnii Ako-1 ;;;;;;58;Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum DSM 571 ;;;
cd001;655;Chromosome;;;cd002;555;Chromosome ;;;cd003;11,10,10;chromosome;;110 tRNAs;;;;;;;;cd011;666;Chromosome;;;cd032;17,16,16;Chromosome;;;cd045;10,10,10;Chromosome;;cd047;554;Chromosome;;cd063;10,10,10;Chromosome;;;;cd064;999;Chromosome;;;;;cd079;546;Chromosome;;;cd084;444;Chromosome;;;cd092;898;Chromosome;;;;cd102;777;Chromosome;;;;;;;;cd112;444;Chromosome ;;;;cd113;444;Chromosome;;;;cd114;444;Chromosome;;;;cd116;555;Chromosome;;;;cd118;10,10,10;Chromosome;;;;;;;cd133;9,10,10;chromosome;;;;;;;;cd136;14,16,13;Chromosome;;;;;;;;;;;cd153;666;Chrpmosome;;;;cd155;533;Chromosome;;;;;cd160;333;Chromosome;;;;;cd161;444;Chromosome;;;;;cd170;555;Chromosome;;
3*16s23s5s;;;;;16atcgca235;;;;;3*16s23s5s;;;;;;;;;;;;16s5s23s;;;;;7*16s23s5s;;;;;3*16s23s5s;;;;16s23s5s;;;;4*16s23s5s;;;;;;16s23s5s;;;;;;;16s23s5s-atgi-gca;;;;;2*16-gca-235;;;;;5*16s23s5s;;;;;;2*16-gca-235;;;;;;;;;;16s23s-gca-5s-gta-tac-gga-cga;;;;;;16s-atc-235;;;;;;16atcgca235;;;;;;16s23s5s-aac;;;;;;2*16s5s-gcc-23s;;;;;;;;;3*16s23s5s;;;;;;;;;;s°   ribosomal RNA rRNA prediction is too short;;;;;;;;;;;;;2*16s23s5s;;;;;;16atcgca235;;;;;;;16-cds-atcgca-23s16s°5s  cds ci-dessous;;;;;;;2*16s23s5s;;;;;;;3*16s23s5s;;;;
16s-gcaatc-235-6aas;;;;;16atcgca235-6aas;;;;;16-gca-2355;;;beCoA;bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate  acetyltransferase;;*;;;;;;16s5s23s-gac-aca;;;;;NCBI et gtRNAdb ne concordent pas.;;;;;16s23s5s-atgi-gca;;;;16s23s5s-aac;;;;16s23s-aac-5s-aac;;;;;;16s23s5s-atgi-gca;;;;;;;16s23s5s-aaa;;;;;16s23s5s;;;;;2*16atcgca235;;;;;;2*16s23s5s;;;;;;;;;;tcc-16s-cds-235-19aas;;;;;;16s23s5s;;;;;;2*16atcgca235-acc;;;;;;16s23s5s-caa-gaa-tac-ggc;;;;;;16s5s-gcc-23s-19aas;;;;;;;;;2*16s-gca-235;;;;;;;;;;s’ possible 23S ribosomal RNA but does not have good blast hits on one or both of the ends ;;;;;;;;;;;;;16s23s5s-gtg-gaa-cgg;;;;;;16s23s5s;;;;;;;MRSRKKVVQKRAWQGRQTDGTGGVLMYVEDDMRLADAVRRSFSTTGNPRSIDHLSQDCLAVTSHCSVLRDHSS;;;;;*;;16s-23s°-gca-atc-23s-16s°-5s-6aas;;;;;;;16s23s5s-aac-ggg;;;;
5aas-16s-gcaatc-235-6aas;;;;;3*16s23s5s-12,9,4 aas;;;;;16-atc-235;;;2pK;two pore domain potassium channel family protein;;;;;;;;16s5s-atc-23s;;;;;2*16s23s5s-atgi-gca;;;;;16s23s5s-aaa;;;;16s23s5s-ttc;;;;16-gca-atc-23-aac;;;;;;2*16s23s5s-aaa;;;;;;;16s23s5s-ttc;;;;;16atcgca-cds-235;;;;;16-gca-235;;;;;;2*16-gca-235-22,21aas;;;;;;;;;;16s-cds-235;;;;;;16s-gca-235-11 aas;;;;;;16s23s5s-13 aas;;;;;;16atcgca235-acc;;;;;;16s5s-gcc-23s-5aas;;;;;;;;;16s23s-gga-5s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;2*16s23s5s-12aas;;;;;;16s23s°23s5s;;;;;;;;long;interc;;;;;23s°-16s-16s°-23s-5s-aac-ggg;;;;;;;16-gcaatc-235-6aas;;;;
5s;;;;;interc;;interc;;;3*16s23s5s-22,13,9aas;;;Aspam;aspartate aminotransferase family protein;;;;;;;;agc-16s5s23s-6aas;;;;;16s23s5s-ttc-gac-gaa;;;;;16s23s-aac-5s-aac;;;;16s23s5s-aac-aac;;;;16s23s5s-ttc-5s-ttc-aaa;;;;;;16s23s5s-ttc;;;;;;;16s-atc-23s;;;;;;;;;;8aas-16s;;;;;;16s23s5s-8aas;;;;;;;;;;tcg-16s23s-gca-5s-12aas;;;;;;16s-gca-235-18 aas;;;;;;;;;;;;16s23s5s-8 aas;;;;;;16s5s23s-aaa-acc-ctc;;;;;;;;;16s23s5s-43aas;;;;;;;;;;C196;9,10,10;;M8;;;;;;;;;;16s23s5s-13aas;;;;;;16s23s°23s5s-5s-5s;;;;;;;<comp;411;185;cds;hp;;;;long;interc;;;;;;;;;
interc;;interc;;;80;16s;109;16s;;2*16-gca-235,22,13aas;;;;;;;;;;;;tca-tcc-16s5s23s-5aas;;;;;2*16s23s-aac-5s;;;;;16s23s5s-ttc-5s-ttc-aaa;;;;16s5s-atgi-gca;;;;16s23s5s-aaa;;;;;;16-atc-235-ttc-tgc;;;;;;;16s°-atc-235-atgi-gca;;;;;MLMPSVAHFNIAPSMARRSLSLFAIHGIAILEHPCSLKTAQREKQNAKCESKDNEMAFKF;;;*;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;interc;;;;;comp;184;cds;alanine--glyoxylate aminotransferase family protein;*;;16s23s5s-21 aas;;;;;;16s5s-atc-23s-aac;;;;;;;;;16s23s5s-18aas;;;;;;;;;;3*16s23s5s;;;3*16s23s5s;;;;;;;;;;;;;;;;;long;interc;;;;;dir    ;1541;12;16s;;;;dir     ;393;324;cds;30S ribosomal protein S9;*;;;interc;;;
226;aaa;169;aaa;;20;atc;109;23s;;cd003;long;inter;;;;;;;;;;16s5s-gca-23s-aac-gaa-tgc;;;;;16s-atc-23s-aac;;;;;16s-gca-atc-235-6aas;;;;interc;;long;;16s23s5s-atgi-gca;;;;;;16s23s5s-aac;;;;;;;23s5s-aaa;;;;;;;;;;comp;456;cds;cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase;*;;interc;long;;interc;long;;interc;long;;;tcc-16s-cds-235-19aas hp ci-dessous;;;;;;dir    ;337;cds;peptidoglycan-binding protein;*;;comp;4;ggc;;;;;;;;;;16s5s-atcgca-23s-aac-atgf;;;;;;;;;16s-gca-235-9aas;;;;;;;;;;2*16s-gca-235;;;16s’-gca-23s°-16s°-23s    16s°-gca-23s’;;;;;;;;;;;interc;;;;;comp;1119;606;cds;sulfate permease;*;;dir    ;222;207;cds;hp;;;dir     ;1622;-1554;16s;;;;dir     ;353;cds;30S ribosomal protein S9;*
22;tac;23;tac;;53;gca;28;5s;;comp;1538;315;16s;suite1;;;;;;;;interc;;interc;;;5s-ttc;;;;;gca-atc-gga-16s23s5s;;;;3;gca;;;16-gca-atc-235-6 aas;;;;;;atgi-gca-16s23s5s-aac;;;;;;;interc;long; ;;;;;;;;comp;4;tta;;;;356;1911;cds;415;1605;cds;196;828;cds;;MRKEGAYKRYVTDRRRNPTKKIPKSEARKVFLKRRRSVKHCNFTESKREQTKAIQSERKQAENNKFSKVKTFTRYFFVNSRRMMRREGVYINT;;;;*;;dir    ;42;16s;;;;comp;48;tac;;;;comp;381;cds;hp;;;15aas-16s5s-atcgca-23s;;;;;;;;;16s23s-aca;;;;;;;;;;16s23s-gga-5s;;;16s23s-gga-5s;;;;;;;;;;dir    ;463;cds;glutamate--tRNA ligase;*;;dir     ;1706;-1607;16s;;;;dir    ;77;94;atc;;;;dir     ;106;1501;23s°;;;;dir     ;273;16s;;
77;aca;163;aca;;109;23s;9;caa;;comp;74;8;gga;;;;;;;;;510;agc;59;tca;;16s-gca-23s5s;;;;;16s-gca-atc-23s-aac;;;;8;atgi;;;;;;;;;16s23s5s-5aas;;;;;;;200;2848;23s;comp;;;;;;;comp;11;tgc;;;;65;1534;16s;65;1534;16s;5;;gga;;;interc;;;;;dir    ;124;gca;;;;comp;8;gcc;;;;dir     ;95;16s;;;;cgg-tgg-16s5s-gcc-23s-5aas;;;;;;;;;;;;;;;;;;;16s23s-aca;;;16s23s-aca;;;;;;;;;;dir    ;212;16s;;;;dir     ;104;1767;23s°;;;;dir    ;76;356;gca;;;;dir     ;76;1;gca;;;;dir     ;1;gca;;
15;gac;15;gac;;27;5s;117;gaa;;comp;76;13;aca;;;;;;;;;61;16s;156;tcc;;16235-aaa-cds-5s-aaa;;;;;interc;;;;79;5s;;;;interc;;;;;;;;;;;;66;;atc;comp;;;;;;;comp;1;gga;;;;34;;gca;34;;gca;27;;ggc;;comp;403;cds;DUF2232 domain-containing protein;*;;dir    ;43;23s;;;;comp;6;acc;;;;dir     ;89;23s;;;;ttc-cds-16s5s-atc-23s-aac-atgf;;;;;;;;;long;interc;;;long;interc;;;;;16s23s5s-43aas ;;;16s-cds-23s°-5s-43aas;;;;;;;;;;dir    ;46;23s;;;;dir     ;3095;50;23s;;;;dir    ;3168;-2889;23s;;;;dir     ;77;64;atc;;;;dir     ;74;atc;;
53;gaa;53;gaa;;9;aac;5;gta;;comp;77;12;gac;;;long;interc;;;;;256;5s;61;16s;;16s-gcaatc-23s5s-ttc-tgc;;;;;61;gag;;;117;16s;;;comp;237;cds;DNA/RNA nuclease SfsA;;;;long;interc;;;;;166;553;16s°;comp;;;;;;;comp;7;aac;;;;93;2916;23s;93;2916;23s;79;;cta;;comp;109;agg;;;;dir    ;318;5s;;;;comp;74;gac;;;;dir     ;76;5s;;;;;;;;;;;;;1206;505;cds;glycosyl transferase;705;281;cds;N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase CwlD;*;;16s23s5s-18aas ;;;cds-cds-23s°-5s-18aas;;;;;;;;;;dir    ;58;5s;;;;dir     ;114;602;5s;;;;dir    ;102;3026;16s°;;;;dir     ;3351;-3087;23s;;;;dir     ;266;23s;;
11;aac;11;aac;;132;caa;3;gac;;comp;77;83;atgf;;dir    ;909;505;cds;beCoA;;;76;23s;256;5s;;interc;long aas;;;;6;caa;;;:2;cds;108 pb;;comp;53;gag;;;;dir   ;255;844;cds;pro-sigmaK processing inhibitor BofA;*;;;;;;;;;;;;comp;61;agc;;;;5;117;5s;5;117;5s;11;;tac;;comp;6;tgc;;;;dir    ;3;aac;;;;comp;29;gta;;;;dir     ;22;caa;;;;interc;;interc;;interc;;interc;;;1508;279;16s;;1509;279;16s;;;;16s-gca-235-9aas ;;;16s°-23s°-5s-9aas;;;;;;;;;;dir    ;3;aac;;;;dir     ;3084;:0;cds;HAMP domain-containing protein;*;;dir    ;117;89;5s;;;;dir     ;86;3032;16s°;;;;dir     ;6;5s;;
346;5s;346;5s;;5;gta;8;aca;;comp;76;77;atgj;;dir    ;1538;61;16s;;;;34;gac;77;23s;;190;250;cds;direct;;4;aga;;;;;;;comp;6;caa;;;;dir   ;1513;235;16s;;;;6;;gca;comp;;;;;;;comp;6;acc;;;;17;;aac;11;;aac;6;;aca;;comp;41;cac;;;;dir    ;4;tta;;;;comp;11;gaa;;;;dir     ;54;gaa;;;;541;cds;260;cds;219;cds;487;cds;;2900;180;23s;;2901;131;23s;;;;;;;;;;;long;interc;;;;;dir    ;6;ggc;;;;;;;;;;;comp;1143;:2;cds;peptidase C45;;;dir     ;152;9;5s;;;;dir     ;6;aac;;
333;23s;330;23s;;3;gac;17;aaa;;comp;76;9;ttc;;dir    ;76;290;gca;;;;30;gta;41;aac;;5;;aaa;comp;;19;gga;;;;;;;comp;5;aga;;;;dir   ;2907;118;23s;;;;6;;atgi;comp;;;;;;;comp;6;tca;;;;7;;atgf;15;;tta;6;;gac;;comp;9;atgi;;;;dir    ;26;atgf;;;;comp;11;agc;;;;dir     ;128;gta;;;;253;16s;5;gac;236;23s;252;16s;;117;6;5s;;117;6;5s;;;;;;+;16s23s5s-19aas;;;dir   ;705;281;cds;N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase CwlD;*;;dir    ;95;atgj;;;;16s23s5s-5s5s;;;;;;;;;;;;;;dir     ;75;6;aac;;;;dir     ;7;gaa;;
18;atc;18;atc;;8;aca;57;atgf;;comp;77;5;atc;;dir    ;2938;179;23s;;;;6;aca;5;gaa;;159;;5s;comp;;16;cta;;;;;;;comp;14;gga;;;;dir   ;117;26;5s;;;;107;117;5s;comp;;;;;;;comp;215;gac;;;;17;;gaa;7;;atgf;16;;gta;;comp;14;atgj;;;;dir    ;101;atgj;;;;comp;12;atgj;;;;dir     ;4;gac;;;;64;5s;10;gta;6;gca;64;5s;;75;6;aac;;75;4;aac;;;;;;+;16s23s5s-tta-atgi;;;dir   ;977;100;16s°;;;;dir    ;5;ttc;;;;dir     ;660;232;cds;sporulation protein YunB;*;;16-cds-atcgca-23s16s°5s  cds ci-dessous;;;;;;;dir     ;75;9;gaa;;;;dir     ;18;atgi;;
245;gca;92;gca;;:8;aaa;16;ttc;;comp;77;6;cca;;dir    ;117;8;5s;;;;66;tac;36;atgi;;294;316;cds;comp;;4;gaa;;;;;;;comp;17;cta;;;;dir   ;75;62;gaa;;;;200;2822;23s;comp;;;;;;;comp;47;16s;;;;5;;gta;17;;gaa;5;;gaa;;comp;4;ttc;;;;dir    ;7;gaa;;;;comp;36;gga;;;;dir     ;6;aca;;;;234;gcc;4;gaa;64;atc;6;atc;;86;15;tta;;75;5;gaa;;;;;;+;16s23s5s;;;dir   ;1519;126;23s°;;;;dir    ;6;tac;;;;dir     ;1656;-1583;16s;;;;MRSRKKVVQKRAWQGRQTDGTGGVLMYVEDDMRLADAVRRSFSTTGNPRSIDHLSQDCLAVTSHCSVLRDHSS;;;;;*;;dir     ;76;25;atgi;;;;dir     ;13;gac;;
268;16s;:8;16s;;;;10;cta;;comp;76;22;tgg;;dir    ;75;5;aac;;;;6;atgf;57;gta;;7;;aaa;comp;;97;5s;;;;;;;comp;6;gaa;;;;dir   ;84;7;cta;;;;66;;atc;comp;;;;;;;dir;:8;cds;hp;;;9;;gac;5;;gta;93;117;5s;;comp;15;tca;;;;dir    ;41;gta;;;;comp;8;atgf;;;;dir     ;18;aaa;;;;119;23s;18;aaa;328;5s;229;gca;;76;7;atgf;;76;5;gta;;;;;;+;16’-gca-235-tta-atgi;;;dir   ;117;7;5s;;;;dir    ;7;ggc;;;;dir     ;107;1859;23s°;;;;;long;interc;;;;;dir     ;77;9;gac;;;;dir     ;269;ttc;;
9;tgc;;;;30;cca;8;gga;;comp;77;14;atgi;;dir    ;89;15;tta;;;;:7;ttc;:7;tta;;138;;5s;comp;;94;23s;;;;;;;comp;24;5s;;;;dir   ;75;7;ggc;;;;:3;1467;16s;comp;;;;;;;;;;;;;5;;aca;49;;gac;82;2916;23s;;comp;4;aaa;;;;dir    ;5;gac;;;;comp;20;aaa;;;;dir     ;4;gga;;;;6;tcc;103;caa;505;16s;112;23s;;75;9;gaa;;77;10;gac;;;;;;;;;;dir   ;75;6;aac;;;;dir    ;116;gtc;;;;dir     ;3267;50;23s;;;;comp;429;185;cds;hp;;;dir     ;76;29;ttc;;;;comp;186;acg;;
6;ggc;;;;56;gga;13;aga;;comp;77;9;cca;;dir    ;76;5;atgf;;;;;;;;;339;;23s;comp;;3;atc;;;;;;;comp;127;23s;;;;dir   ;74;3;gga;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;7;;tac;8;;aca;510;1534;16s;;comp;10;caa;;;;dir    ;23;aca;;;;comp;29;caa;;;;dir     ;150;cca;;;;10;ccg;237;23s;1;ggc;6;aac;;74;5;gga;;75;14;aca;;;;;;+;23s5s;;;dir   ;86;15;tta;;;;dir    ;5;gac;;;;dir     ;114;330;5s;;;;dir    ;1541;12;16s;;;;dir     ;75;254;acg;;;;dir     ;:8;cds;HlyD family efflux transporter periplasmicadaptor subunit;*
311;ttc;;;;17;atgf;:12;cac;;comp;92;14;agc;;dir    ;77;9;atgj;;;;61;16s;;;;771;;16s;comp;;74;gca;;;;;;;comp;3;atc;;;;dir   ;77;509;aga;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;9;;gga;24;;cta;:8;888;cds;;comp;11;aga;;;;dir    ;11;tac;;;;comp;32;5s;;;;dir     ;:8;cds;signal peptide peptidase SppA;*;;14;gga;64;gcc;32;ctg;243;atgf;;76;5;gta;;85;9;tac;;;;Décompte;;+;16s;;;dir   ;76;7;atgf;;;;dir    ;3;ctg;;;;dir     ;109;557;5s;;;;dir    ;222;207;cds;hp;;;dir     ;1287;:8;cds;tetratricopeptide repeat protein;*;;;;;;
12;gac;;;;8;aaa;;;;comp;89;8;tca;;dir    ;75;8;gaa;;;;5;5s;;;;:2;371;cds;comp;;:8;16s;;;;;;;comp;80;gca;;;;dir   ;693;;cds;DNA/RNA nuclease SfsA;;;;;;;;;;;;;;;;;;;10;;aga;9;;ggc;;;;;comp;6;ggc;;;;dir    ;39;ggc;;;;comp;94;23s;;;;;;;;;;1;cac;328;5s;42;ccc;:4;cds;;77;9;gac;;74;10;gga;;;;16s;14;;;;;dir   ;75;8;gaa;;;;dir    ;18;atc;;;;dir     ;109;564;5s;;;;dir    ;77;94;atc;;;;;;;;;;;;;;;
:13;gta;;;;3;aca;109;16s;;comp;76;4;aaa;;dir    ;76;125;gta;;;;212;gca;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;405;16s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;8;;caa;23;;aga;;;;;comp;6;cta;;;;dir    ;875;cgt;;;;comp;680;16s;;;;comp;110;cds;tRNA 2-thiouridine(34) synthase MnmA  assembly pathway, ATPase PilB;*;;9;tgc;651;16s;4;cgt;;;;75;14;aca;;77;9;aga;;;;16s’;2;+;16s23s°-cds;;;dir   ;74;4;gga;;;;dir    ;2;acg;;;;dir     ;2277;:0;cds;5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-homocysteine S-methyltransferase;*;;dir    ;76;186;gca;;;;;long;interc;;;;;;;;;
;;;;;5;gac;109;23s;;comp;76;6;caa;;dir    ;77;69;gac;;;;113;23s;;;;543;341;cds;comp;;;;;;;;;;comp;:8;cds;hp;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;34;;aaa;9;;caa;;;;;comp;28;aca;;;;dir    ;:12;cds;hp   4904 aas !!;;;comp;:13;cds;D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase;*;;comp;131;riboswitch;;;;3;gtc;:6;cds;120;ggc;155;cds;;85;8;tac;;76;11;caa;;;;16s°;5;+;3*16s-23s°;;;dir   ;76;5;gta;;;;dir    ;145;tcg;;;;;;;;;;;dir    ;3166;-2889;23s;;;;comp;738;128;cds;SDR family oxidoreductase;*;;;;;;
;;;;;132;gta;28;5s;;comp;77;8;aga;;dir    ;85;39;tac;;;;43;aac;;;;140;;16s;direct;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;7;;tca;11;;aaa;;;;;comp;5;gac;;;;;;;;;;;;;;;;comp;133;cac;;;;6;ttc;;;42;atgj;213;ttc;;84;29;cta;;76;2;aaa;;;;23s;11;;;;;dir   ;77;10;gac;;;;dir    ;:12;cds;polyamine aminopropyltransferase;*;;;;;;;;;dir    ;102;3026;16s°;;;;comp;75;13;ggg;;;;;;;;
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;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir   ;77;10;aga;;;dir    ;540;778;cds;anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein;*;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir   ;76;9;caa;;;dir    ;1537;261;16s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir   ;76;3;aaa;;;dir    ;2899;201;23s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir   ;89;4;tca;;;dir    ;117;5;5s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir   ;76;7;ttc;;;dir    ;89;11;tta;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir   ;77;12;atgj;;;dir    ;77;108;atgi;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir   ;77;18;atgi;;;dir    ;1508;184;16s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir   ;77;9;cac;;;dir    ;645;100;23s°;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir   ;76;8;aaa;;;<dir    ;259;112;cds;hp;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir   ;74;8;tgc;;;comp;2110;375;23s’;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir   ;77;13;cgt;;;comp;76;52;gca;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir   ;76;76;gta;:43;;comp;578;282;16s°;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir   ;414;308;cds;hp;;dir    ;204;12;cds;hp;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;dir   ;3432;;cds;pyruvate carboxylase;;dir    ;1278;;cds;phage portal protein;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;

génomes negativicutes

Lien fiche: génomes negativicutes

77;Lactobacillus salivarius UCC118 ;;;;;;;;99;Pelosinus sp. UFO1 ;;73;Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 ;;;;55;Selenomonas sputigena ATCC 35185 ;
en004;777;Chromosome;;;;;;;en010;16,15,14;Chromosome;;en011;777;Chromosome;;en012;444;Chromosome
16s23s5s;;;;;;;;;6*16s23s5s;;;;4*16s23s5s;;;;16s23s5s;;
16atcgca235-9aas;;;;;;;;;3*16atcgca235;;;;16-gcaatc-235-cac-tgg-agc;;;;16-gca-atc-235;;
2*16atcgca235-12aas;;;;;;;;;16-gca-235;;;;16-gcaatc-2355-13 aas;;;;16s23s5s-cac-tgg;;
16235-19aas;;;;;;;;;16s23s5s-5s;;;;16s23s;;;;16s23s5s-12aas;;
16s23s5s-cds-tac-caa;;;;;;;;;16-gca-235-aac;;;;interc;;;;interc;;
16235-aac-gaa-acg;;;;;;;;;16atcgca235-aac;;;;133;cds ;comp ;;320;cds;comp
;;;;;;;;;16s23s5s-acc;;;;87;16s;;;27;ctc;comp
interc;;interc;;interc;;interc;;;16s-23s°;;;;4;gca;;;31;ctg;comp
331;cds;356;cds;3;caa;15;acg;;gga-5s-5aas-ncRNA-9aas;;;;168;atc;;;10;tta;comp
103;16s;13;16s;151;tac;4;gaa;;;interc;;;70;23s;;;12;gga;comp
31;atc;244;23s;248;cds;5;aac;;;212;gga;;4;5s;;;8;aca;comp
126;gca;5;5s;35;5s;240;5s;;;8;5s;;26;5s;;;5;ttc;comp
244;23s;3;gta;13;23s;13;23s;;;5;aac;;24;aac;;;4;gac;comp
5;5s;65;aaa;:2;16s;:3;16s;;;53;atg;;6;caa;;;61;gta;comp
14;aac;4;aca;;;;;;;14;cac;;8;aaa;;;41;aag;comp
14;tcc;12;ggc;527;cds;30;ttg;;;4;caa;;7;gaa;;;4;aaa;comp
2;gaa;8;tta;103;16s;24;tgc;;;44;agc;;6;aag;;;18;caa;comp
9;gta;6;cgt;31;atc;10;caa;;;25;ncRNA;;6;gta;;;4;aac;comp
25;gac;24;cca;126;gca;6;cac;;;6;cgt;;39;gac;;;174;5s;comp
4;ttc;16;atg;244;23s;12;tgg;;;1;ttc;;10;ttc;;;406;23s;comp
12;tac;40;atg;5;5s;4;tac;;;9;aca;;14;aca;;;159;16s;comp
6;tgg;10;tca;3;gta;25;ttc;;;11;tac;;18;gga;;;293;cds;dir
11;cac;4;atg;15;aaa;9;gac;;;2;aaa;;23;tta;;;24;cgt;comp
9;caa;9;gac;8;cta;2;gta;;;6;gaa;;55;ctg;;;74;atg;comp
30;tgc;19;ttc;4;aca;14;gaa;;;20;gta;;102;ctc;;;5;ggc;comp
149;ttg;8;gga;9;ggc;14;tcc;;;3;gac;;:15;cds;;;105;ggc;comp
:14;cds;3;atc;8;tta;5;aac;;;:15;ggc;;;;;;:15;cds;comp
;;4;agc;47;cgt;244;5s;;;;;;;;;;;;
;;22;gaa;4;cgt;126;23s;;;;;;;;;;;;
;;4;atg;403;cca;31;gca;;;;;;;;;;;;
;;201;gac;:11;cds;103;atc;;;;;;;;;;;;
;;:19;cds;;;:14;16s;;;;;;;;;;;;

Proteobacteria

Gamma

gamma blocs

Lien fiche: gamma blocs

lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;Gm001-47;;;;;;;;;Notes
gm0001;atgf-16atcgca235;;2;54;3;51;;;16s23s5s;atcgca;gcaatc;gaa;atcgaa;autres;av16s;;
;16atcgca235;;;;;;;sans;;27;;11;1;;4;;avant
;;;;;;;;gac-tgg;;1;;0;;;3;;3*atgf-16atcgca235
gm0003;atgf-16atcgca235;;2;51;3;48;;gac;;1;;3;;;;;cgg-cac-cca-16atcgca2355-gac-tgg
;16atcgca235;;;;;;;acc-5s;;;;;;;;;cgg-cac-cca-16atcgca235
;;;;;;;;tgg;;;;;;;;;2*cgg-cac-cca-16gaa2355-gac-tgg
gm0005;atgf-16atcgca235;;2;50;3;47;51;total;0;29;0;14;1;0;7;;
;16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;incomplets
;;;;;;;;;;;;;;;;;16gaa23?
gm0017;16atcgca235 +5s;;1;63;2;61;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;différents
gm0036;6*16atcgca235;;6;70;12;58;;;;;;;;;;;16gaa235-acc
;;;;;;;;;;;;;;;;;16atcgca235-acc
gm0037;6*16atcgca235;;6;72;12;60;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;5s en trop
gm0039;2*16atcgca235;;6;64;14;50;;;;;;;;;;;16atcgca2355-gac-tgg
;3*16gaa235;;;;;;;;;;;;;;;;cgg-cac-cca-16atcgca2355-gac-tgg
;cgg-cac-cca-16atcgca2355-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;2*cgg-cac-cca-16gaa2355-gac-tgg
;;;;;;;;;;;;;;;;;5s
gm0040;16atcgaa235;;6;64;16;48;;;;;;;;;;;
;cgg-cac-cca-16gaa2355-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;4*16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0043;16atcgca235;;6;61;14;47;;;;;;;;;;;
;cgg-cac-cca-16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca2355-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;3*16gaa235;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0045;2*16gaa235;;6;60;14;46;;;;;;;;;;;
;cgg-cac-cca-16gaa2355-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;3*16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0047;3*16gaa235+16gaa23?;;11;129;20;109;;;;;;;;;;;
;3*16gaa235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-acc;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-acc;;54;;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;Gm055-64;;;;;;;;;Notes
gm0055;3*16gaa235;;;131;17;114;;;16s23s5s;atcgca;gcaatc;gaa;atcgaa;autres;av16s;;
;16atcgca235;;;;;;;sans;4;10;;11;;;1;;avant
;2*16atcgca235-gac;;;;;;;gac-tgg;;1;;0;;;1;;cgg-cac-cca-16atcgca235-x-tgg
;16gaa235-acc;;;;;;;gac;;2;;6;2;;;;cgg-cac-cca-16atcgca235
;16gaa235-acc-5s;;;;;;;acc- 5s;;2;;1;;;;;
;16gaa235-gac;;9;;;;;tgg;;;;;;;;;différents
;;;;;;;41;total;4;15;0;18;2;0;2;;2*16gaa235-acc
gm0056;3*16gaa235;;;111;17;94;;;;;;;;;;;16atcgca235-acc
;3*16gaa235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;16gaa235-tca
;16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;5s en trop
;16atcgca235-acc;;9;;;;;;;;;;;;;;16atcgca2355-gac-tgg
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0057;3*16gaa235;;;103;18;85;;;;;;;;;;;
;2*16gaa235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;2*16atcgaa235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-tca;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgaa235-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-acc;;10;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0058;2*16atcgca235;;;52;13;39;;;;;;;;;;;
;2*16gaa235;;;;;;;;;;;;;;;;
;cgg-cac-cca-16atcgca235-x-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;16s23s5s;;6;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0062;4*16atcgca235;;;60;17;43;;;;;;;;;;;
;cgg-cac-cca-16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca2355-gac-tgg;;6;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0063;2*16s23s5s;;;43;2;41;;;;;;;;;;;
;16atcgca235;;3;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0064;16atcgca235;;2;45;2;43;;;;;;;;;;;
;16s23s5s;;45;;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;Gm065-73;;;;;;;;;Notes
gm0065;2*16atcgca235;;2;48;4;44;;;16s23s5s;atcgca;gcaatc;gaa;atcgaa;autres;av16s;;
;;;;;;;;sans;11;8;2;;;6;;;autres
gm0066;2*16s23s5s;;;104;26;78;;gac-tgg;;;;1;;1;;;16gcc235-gac-tgg
;2*16s23s5s-gac;;;;;;;gac;4;1;;1;;2;;;16 atc-gcc 235-gac
;16s23s5s-acc-5s;;;;;;;acc-5s;2;;;;;;;;16-gaa-aaa-gta-235
;16atcgca235;;;;;;;tgg;;;;;;1;;;16-gaa-aaa-gta-235-gac
;16atcgca235-gac;;;;;;40;total;17;9;2;2;0;10;0;;16-gaa-aaa-gta-235-tgg
;16gcc235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;16-gaa-aaa-gca-gta-235
;16-gaa-aaa-gta-235;;;;;;;;;;;;;;;;4*16-gca-cca-235
;16-gaa-aaa-gta-235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;16-gaa-aaa-gta-235-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;incomplets
;16-gaa-aaa-gca-gta-235;;12;;;;;;;;;;;;;;16s-gaa-aaa-gta-5s
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0067;2*16235-gac;;;91;14;77;;;;;;;;;;;à l’envers
;16 atc-gcc 235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;2*5s-23s-16s
;16gaa235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;16235-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;16s-gaa-aaa-gta-5s;;7;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0068;2*16atcgca235;;2;49;4;45;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0069;3*16atcgca235;;3;54;6;48;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0070;2*16s23s5s;;;68;6;62;;;;;;;;;;;
;3*16-gca-cca-235;;5;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0071;16-gca-cca-235;;5;57;2;55;;;;;;;;;;;
;4*16s23s5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0073;2*16-gca-atc-235;;5;54;4;50;;;;;;;;;;;
;2*5s-23s-16s;;;;;;;;;;;;;;;;
;16s23s5s5s;;41;;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;Gm079-129;;;;;;;;;Notes
gm0079;2*16-gca-atc-235;;5;77;10;67;;;16s23s5s;atcgca;gcaatc;gaa;atcgaa;autres;av16s;;
;16-gca-atc-2355;;;;;;;sans;2;13;3;3;;;1;;avant
;2*5s-23s-cp(atc-gca)-16s;;;;;;;gac-tgg;;2;;1;;;;;cgg-cac-cca-16atcgca235
;;;;;;;;gac;;1;;1;;;;;
gm0086;6*16atcgca235;;12;70;12;58;;acc-5s;;;;;;;;;incomplets
gm0087;6*16atcgca235;;;66;12;54;;tgg;;1;;2;;;;;16gaa23
;;;;;;;30;total;2;17;3;7;0;0;1;;2*16atcgca23
gm0090;2*16gaa235;;6;58;15;43;;;;;;;;;;;2*16s23s
;16gaa235-gac-5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;cgg-cac-cca-16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;à l’envers
;16atcgca235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;2*5s-23s-cp(atc-gca)-16s
;16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;autres incomplets
gm0094;16gaa23+5s;;1;38;1;37;;;;;;;;;;;gaa-23s5s-gac
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0098;16atcgca23+gaa-5s;;1;32;3;29;;;;;;;;;;;5s en trop
;;;;;;;;;;;;;;;;;16-gca-atc-2355
gm0114;16gaa235;;2;40;4;36;;;;;;;;;;;16gaa235-gac-5s
;16gaa235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;2*5s
;;;;;;;;;;;;;;;;;gaa-5s
gm0115;16atcgca23+5s;;1;41;2;39;;;;;;;;;;;atc-5s-aaa
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0119;16s23s;;1;27;0;27;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0126;16s23s + atc-5s-aaa;;1;33;2;31;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0127;2*16gaa235-tgg;;3;45;7;38;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0128;2*16s23s5s;;3;37;4;33;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0129;16atcgca235-gac;;1;42;5;37;;;;;;;;;;;
;gaa-23s5s-gac;;37;;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;Gm131-150;;;;;;;;;Notes
gm0131;16gaa235;;;40;3;37;;;16s23s5s;atcgca;gcaatc;gaa;atcgaa;autres;av16s;;
;16s23s5s;;;;;;;sans;2;16;;9;;1;;;autres
;16gaa23-tgg;;3;;;;;gac-tgg;;1;;3;;;;;16-atc-235
;;;;;;;;gac;;;;3;;;;;
gm0137;16-atc-235;;1;33;1;32;;acc-5s;;2;;1;;;;;incomplets
;;;;;;;;tgg;;;;;;;;;16gaa23-tgg
gm0140;16atcgca235;;2;33;3;30;38;total;2;19;0;16;0;1;0;;16atcgca
;16gaa235;;;;;;;;;;;;;;;;2*16s
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0141;16atcgca235;;1;37;2;35;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0142;16atcgca235+16atcgca;;5;57;7;50;;;;;;;;;;;
;16gaa235-gac-tgg+2*16s;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0143;2*16atcgca235;;;83;14;69;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;2*16gaa235;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-gac;;7;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0147;3*16atcgca235;;3;49;6;43;;;;;;;;;;;
gm0148;5*16atcgca235;;5;70;10;60;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0149;3*16gaa235;;;84;14;70;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;
;16s23s5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-gac;;8;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0150;2*16gaa235;;;84;13;71;;;;;;;;;;;
;16gaa235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;2*16atcgca235;;7;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-acc-5s;;42;;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;Gm151-169;;;;;;;;;Notes
gm0151;2*16gaa235;;;87;14;73;;;16s23s5s;atcgca;gcaatc;gaa;atcgaa;autres;av16s;;
;16gaa235-gac;;;;;;;sans;;13;;5;;9;;;autres
;2*16atcgca235;;;;;;;gac-tgg;;2;;1;;;;;7*16-gca-cds-235
;16gaa235-gac-tgg;;;;;;;gac;;1;;2;;;;;16-atc-235
;16atcgca235-acc-5s;;7;;;;;acc-5s;;2;;1;;;;;16-atc-235
;;;;;;;;tgg;;;;;;;;;
gm0152;7*16-gca-cds-235;;;89;10;79;36;total;0;18;0;9;0;9;0;;différents
;16-atc-2355-tac;;;;;;;;;;;;;;;;16-atc-2355-tac
;16-atc-235;;9;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;incomplets
gm0155;16atcgca235;;;44;2;42;;;;;;;;;;;16atcgca23
gm0158;16atcgca23+5s;;;43;2;41;;;;;;;;;;;
gm0161;16atcgca235;;3;39;2;37;;;;;;;;;;;cds
;;;;;;;;;;;;;;;;;7*16-gca-cds-235
gm0162;2*16gaa235;;;85;14;71;;;;;;;;;;;
;16gaa235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;5s en trop
;16gaa235-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;5s
;16atcgca235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;16-atc-2355-tac
;2*16atcgca235;;7;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0166;2*16atcgca235;;;86;16;70;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;16-atc-235;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235;;7;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0167;16atcgca235;;1;36;2;34;;;;;;;;;;;
gm0168;16atcgca235;;1;36;2;34;;;;;;;;;;;
gm0169;3*16atcgca235;;3;47;6;41;;;;;;;;;;;
;;;38;;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;Gm170-182;;;;;;;;;Notes
gm0170;3*16gaa235;;;76;13;63;;;16s23s5s;atcgca;gcaatc;gaa;atcgaa;autres;av16s;;
;16atcgca235;;;;;;;sans;;8;;18;;;;;différents
;16gaa235-gac;;;;;;;gac-tgg;;3;;2;;;;;2*16gaa235-gac-gac
;16atcgca235-gac-tgg;;;;;;;gac;;;;3;;;;;
;16gaa235-acc-5s;;7;;;;;acc-5s;;3;;2;;;;;
;;;;;;;;tgg;;;;;;;;;
gm0173;3*16gaa235;;;91;14;77;39;total;0;14;0;25;0;0;0;;
;16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac-tgg;;7;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0175;2*16atcgca235;;2;53;4;49;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0177;3*16gaa235;;;95;15;80;;;;;;;;;;;
;2*16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-acc-5s;;8;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0178;5*16gaa235;;;96;15;81;;;;;;;;;;;
;16gaa235-gac-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-acc-5s;;8;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0180;4*16gaa235;;;96;14;82;;;;;;;;;;;
;16gaa235-gac-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-acc-5s;;8;;;;;;;;;;;;;;
;;;1;;;;;;;;;;;;;;
gm0182;16atcgca235;;41;43;2;41;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;Gm183-202;;;;;;;;;Notes
gm0183;4*16gaa235;;;90;15;75;;;16s23s5s;atcgca;gcaatc;gaa;atcgaa;autres;av16s;;
;16atcgca235-gac;;;;;;;sans;3;6;;14;;;;;différents
;16atcgca235;;;;;;;gac-tgg;;5;;;;;;;16s23s5s-acc-5s-acc-5s
;16atcgca235-gac-tgg;;;;;;;gac;;5;;;;;;;16gaa235-ttc
;16s23s5s-acc-5s-acc-5s;;8;;;;;acc-5s;;;;4;;;;;
;;;;;;;;tgg;;;;;;;;;5s en trop
gm0185;2*16gaa235;;;85;15;70;37;total;3;16;0;18;0;0;0;;16s23s5s-acc-5s-acc-5s
;16atcgca235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-ttc;;;;;;;;;;;;;;;;
;16s23s5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-acc-5s;;8;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0190;3*16gaa235;;;90;14;76;;;;;;;;;;;
;16s23s5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac-tgg;;8;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0198;2*16atcgca235;;;89;15;74;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;2*16gaa235;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;16s23s5s;;8;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0202;3*16gaa235;;;83;14;69;;;;;;;;;;;
;16gaa235-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235;;7;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac-tgg;;39;;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;Gm203-211;;;;;;;;;Notes
gm0203;3*16gaa235;;;87;14;73;;;16s23s5s;atcgca;gcaatc;gaa;atcgaa;autres;av16s;;
;16atcgca235-gac;;;;;;;sans;2;6;;15;;;;;différents
;16gaa235-acc-5s;;;;;;;gac-tgg;;4;;1;;;;;16gaa235-ttc
;16atcgca235;;;;;;;gac;;4;;1;;;;;
;16atcgca235-gac-tgg;;7;;;;;acc-5s;;1;;3;;;;;incomplets
;;;;;;;;tgg;;;;;;;;;16s-atc-gca-tgg
gm0204;3*16gaa235;;;89;18;71;37;total;2;15;0;20;0;0;0;;16s-23s°-5s-gac
;16atcgca235-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;16s-atc-gca-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;16s23s5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;16s-23s°-5s-gac;;10;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0205;4*16gaa235;;;88;15;73;;;;;;;;;;;
;16gaa235-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-ttc;;;;;;;;;;;;;;;;
;16s23s5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac-tgg;;9;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0206;3*16atcgca235;;;79;15;64;;;;;;;;;;;
;16gaa235;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-acc-5s;;7;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0211;4*16gaa235;;;78;13;65;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac;;7;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235;;40;;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;Gm212-319;;;;;;;;;Notes
gm0212;2*16atcgca235;;;76;14;62;;;16s23s5s;atcgca;gcaatc;gaa;atcgaa;autres;av16s;;
;16gaa235-gac-tgg;;;;;;;sans;;9;;16;;;;;
;2*16gaa235;;;;;;;gac-tgg;;2;;4;;;;;
;16atcgca235-acc-5s;;7;;;;;gac;;4;;1;;;;;
;16gaa235-gac;;;;;;;acc-5s;;4;;2;;;;;
;;;;;;;;tgg;;;;;;;;;
gm0214;3*16gaa235;;;78;14;64;42;total;0;19;0;23;0;0;0;;
;16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac;;7;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0215;16atcgca235;;;82;15;67;;;;;;;;;;;
;3*16gaa235;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac;;7;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0216;2*16gaa235;;;89;14;75;;;;;;;;;;;
;2*16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-acc-5s;;7;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0309;3*16gaa235;;;86;13;73;;;;;;;;;;;
;2*16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-gac-tgg;;7;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0319;3*16gaa235;;;89;14;75;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235;;7;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;42;;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;Gm320-361;;;;;;;;;Notes
gm0320;16s23s5s-5s;;;122;11;111;;;16s23s5s;atcgca;gcaatc;gaa;atcgaa;autres;av16s;;
;16atcgca235;;;;;;;sans;1;27;;5;;1;4;;avant
;16s23s5s-gac;;;;;;;gac-tgg;;;;2;;;;;3*agc-gta-16atcgca235
;16atcgca235-acc;;;;;;;gac;1;1;;;;;;;cgg-cac-cca-16gaa235
;16s23s5s-tgg;;;;;;;acc-5s;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac;;;;;;;tgg;1;;;;;;;;autres
;16s23s5s-acc;;7;;;;43;total;3;28;0;7;0;1;4;;16atcgca-cds-2355
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0321;3*16atcgca235+5s;;;39;6;33;;;;;;;;;;;différents
gm0322;3*16atcgca235+5s;;;39;6;33;;;;;;;;;;;16atcgca235-acc
gm0323;3*16atcgca235+5s;;9;39;6;33;;;;;;;;;;;16s23s5s-acc
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0324;2*16atcgca235+5s;;;40;8;32;;;;;;;;;;;cds
;agc-gta-16atcgca235;;3;;;;;;;;;;;;;;16atcgca-cds-2355
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0326;2*16atcgca235+5s;;;41;8;33;;;;;;;;;;;5s en trop
;agc-gta-16atcgca235;;3;;;;;;;;;;;;;;16gaa2355-gac-tgg
;;;;;;;;;;;;;;;;;16atcgca-cds-2355
gm0333;3*16atcgca235+5s;;3;39;6;33;;;;;;;;;;;16s23s5s-5s
;;;;;;;;;;;;;;;;;8*5s
gm0334;2*16atcgca235+5s;;;40;8;32;;;;;;;;;;;
;agc-gta-16atcgca235;;3;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0335;3*16atcgca235+5s;;3;39;6;33;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0359;4*16atcgca235;;4;76;8;68;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0360;16atcgca235;;;54;8;46;;;;;;;;;;;
;16gaa235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca-cds-2355;;4;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0361;4*16gaa235;;;59;11;48;;;;;;;;;;;
;16gaa235-5s-gac-tgg;;6;;;;;;;;;;;;;;
;cgg-cac-cca-16gaa235;;45;;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;Gm363-392;;;;;;;;;Notes
gm0363;3*16atcgca235;;;53;9;44;;;16s23s5s;atcgca;gcaatc;gaa;atcgaa;autres;av16s;;
;16gaa235-gac-tgg;;4;;;;;sans;8;30;2;10;;1;1;;avant
;;;;;;;;gac-tgg;;2;;2;;1;;;cgg-cac-cca-16-gaa-cds-235
gm0364;4*16atcgca235;;4;55;8;47;;gac;;;;1;;;;;
gm0365;6*16atcgca235;;6;60;12;48;;acc-5s;;;;1;;;;;autres
;;;;;;;;tgg;;;;;;;;;16-gaa-cds-23555-gac-tgg
gm0366;3*16atcgca235;;5;62;10;52;59;total;8;32;2;14;0;2;1;;16-gaa-cds-235
;2*16-gca-atc-235;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0367;4*16s23s5s;;4;50;0;50;;;;;;;;;;;différents
;;;;;;;;;;;;;;;;;16gaa23-cds-5s-5s
gm0368;2*16atcgca235;;6;50;11;39;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-5s-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;cds
;3*16gaa235;;;;;;;;;;;;;;;;cgg-cac-cca-16-gaa-cds-235
;;;;;;;;;;;;;;;;;16-gaa-cds-23555-gac-tgg
gm0369;3*16atcgca235;;6;59;14;45;;;;;;;;;;;16-gaa-cds-235
;cgg-cac-cca-16-gaa-cds-235;;;;;;;;;;;;;;;;16gaa23-cds-5s-5s
;16-gaa-cds-23555-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;16-gaa-cds-235;;;;;;;;;;;;;;;;5s en trop
;;;;;;;;;;;;;;;;;16atcgca2355-gac-tgg
gm0386;4*16gaa235;;6;57;8;49;;;;;;;;;;;16gaa2355-gac-tgg
;16gaa23-cds-5s-5s;;;;;;;;;;;;;;;;16-gaa-cds-23555-gac-tgg
;16gaa235-5s-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;16gaa23-cds-5s-5s
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0390;3*16gaa235;;8;94;15;79;;;;;;;;;;;
;2*16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0391;5*16atcgca235;;5;69;10;59;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0392;4*16s23s5s;;6;61;4;57;;;;;;;;;;;
;2*16atcgca235;;60;;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;Gm393-409;;;;;;;;;Notes
gm0393;4*16atcgca235;;4;71;8;63;;;16s23s5s;atcgca;gcaatc;gaa;atcgaa;autres;av16s;;
;;;;;;;;sans;6;19;;8;;;1;;avant
gm0394;4*16s23s5s;;6;65;4;61;;gac-tgg;;1;;1;;;;;aaa-16atcgca235
;2*16atcgca235;;;;;;;gac;;2;;2;;;;;
;;;;;;;;acc-5s;1;1;;1;;;;;incomplets
gm0396;16atcgca235;;2;48;2;46;;tgg;;;;;;;;;16s
;16235;;;;;;43;total;7;23;0;12;0;0;1;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;autres incomplets
gm0397;16atcgca235;;2;45;5;40;;;;;;;;;;;23s5s
;aaa-16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;atc-gca-235-gac-tgg
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0398;4*16atcgca235;;4;57;8;49;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0400;2*16atcgca235;;2;42;4;38;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0401;2*16atcgca235;;7;85;15;70;;;;;;;;;;;
;16gaa235 + 23s5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;2*16gaa235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0402;3*16gaa235;;8;87;14;73;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;16s23s5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0409;4*16gaa235 + 16s;;9;92;16;76;;;;;;;;;;;
;16s235-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;2*16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;atc-gca-235-gac-tgg;;44;;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;Gm413-487;;;;;;;;;Notes
gm0413;4*16gaa235;;8;87;14;73;;;16s23s5s;atcgca;gcaatc;gaa;atcgaa;autres;av16s;;
;16s235-acc-5s;;;;;;;sans;4;16;;14;;;2;;avant
;16atcgca235-gac-tgg;;;;;;;gac-tgg;;3;;1;;;;;ttc-16atcgca235
;16atcgca235;;;;;;;gac;;3;;1;;;;;cgg-cac-cca-16atcgca235
;16atcgca235-gac;;;;;;;acc-5s;2;;;1;;;;;
;;;;;;;;tgg;;;;;;;;;5s en trop
gm0420;4*16gaa235 + 5s;;7;70;12;58;47;total;6;22;0;17;0;0;2;;16atcgca235-5s-gac
;16atcgca235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;5s
;16gaa235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;16gaa235-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0441;4*16gaa235;;8;86;14;72;;;;;;;;;;;
;16s235-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0470;2*16-gaa-235;;6;66;15;51;;;;;;;;;;;
;16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;
;cgg-cac-cca-16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;
;16-gaa-235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-5s-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0476;3*16atcgca235;;3;57;6;51;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0478;3*16atcgca235;;3;52;6;46;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0483;4*16s23s5s;;7;81;6;75;;;;;;;;;;;
;3*16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0486;2*16atcgca235;;2;47;4;43;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0487;2*16atcgca235;;3;47;7;40;;;;;;;;;;;
;ttc-16atcgca235;;47;;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;Gm488-538;;;;;;;;;Notes
gm0488;2*16atcgca235;;3;47;7;40;;;16s23s5s;atcgca;gcaatc;gaa;atcgaa;autres;av16s;;
;16atcgca235-tta;;;;;;;sans;7;20;;2;;;2;;avant
;;;;;;;;gac-tgg;1;1;;1;;;1;;aaa-16atcgca235
gm0489;2*16atcgca235;;3;44;7;37;;gac;1;5;;2;;2;;;ttg-16-gaa-aaa-gta-235-gac-tgg
;aaa-16atcgca235;;;;;;;acc-5s;1;;;0;;;;;atgj-16atcgca235
;;;;;;;;tgg;;;;;;;;;
gm0491;3*16atcgca235;;4;50;9;41;46;total;10;26;0;5;0;2;3;;autres
;atgj-16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;2*16-gaa-aaa-gta-235-gac
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0494;2*16-gaa-235 + 16atcgca-23s°-5s-gac;;;82;14;68;;;;;;;;;;;
;2*16atcgca235;;7;;;;;;;;;;;;;;incomplets
;16-gaa-235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;16atcgca-23s°-5s-gac
;16-gaa-23-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;différents
gm0495;3*16atcgca235;;11;132;25;107;;;;;;;;;;;16atcgca235-tta
;5*16atcgca235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;16atcgca235-tgg-tgg
;2*16atcgca235-5s;;;;;;;;;;;;;;;;16-gaa-23-acc-5s
;16atcgca235-tgg-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;5s en trop
gm0526;2*16-gaa-235-gac;;9;137;25;112;;;;;;;;;;;2*16atcgca235-5s
;2*16-gaa-aaa-gta-235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;16s23s5s-5s-gac-tgg
;ttg-16-gaa-aaa-gta-235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;16s23s5s-5s
;16atcgca235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;16s23s5s-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;16s23s5s-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;16s23s5s-5s-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0535;6*16s23s5s;;9;108;4;104;;;;;;;;;;;
;2*16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;
;16s23s5s-5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm0538;4*16atcgca235;;4;66;8;58;;;;;;;;;;;
;;;50;;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;Gm666-1048;;;;;;;;;Notes
gm0666;3*16-gaa-235;;;83;14;69;;;16s23s5s;atcgca;gcaatc;gaa;atcgaa;autres;av16s;;
;16atcgca235-gac;;;;;;;sans;8;5;2;8;;1;;;autres
;16atcgca235;;;;;;;gac-tgg;;1;;3;;2;;;16-gcc-gaa-235-gac-tgg
;16-gaa-235-gac-tgg;;;;;;;gac;2;3;;1;;1;;;16-gaa-aaa-gca-gta-235-gac-tgg
;16atcgca235-acc-5s;;7;;;;;acc-5s;1;2;;1;;;;;16-gaa-aaa-gta-cds-235
;;;;;;;;tgg;;;;;;;;;16-gaa-aaa-gta-cds-235-gac
gm0942;2*16-gaa-235;;;87;15;72;41;total;11;11;2;13;0;4;0;;
;16-gaa-235-gac;;7;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;différents
;16-gaa-235-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;16atcgca-235-acc-5s-gac
;16atcgca235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;16atcgca-235-tca
;16atcgca-23s°;;;;;;;;;;;;;;;;16-gaa-aaa-gta-cds-235-tca
;16s°-gaa-235;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;incomplets
gm0973;6*16s23s5s;;11;149;9;140;;;;;;;;;;;16atcgca-23s°
;16atcgca235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;16s23s5s-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;autres incomplets
;2*16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;16s°-gaa-235
;16s23s5s-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;cds
gm0984;3*16-gaa-235;;7;103;14;89;;;;;;;;;;;16-gaa-aaa-gta-cds-235
;16atcgca235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;16-gaa-aaa-gta-cds-235-gac
;16atcgca235-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;16-gaa-aaa-gta-cds-235-tca
;16-gaa-235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;5s en trop
;;;;;;;;;;;;;;;;;16-gca-atc-235-5s
gm1003;16-gca-atc-235;;2;71;4;67;;;;;;;;;;;16atcgca-235-acc-5s-gac
;16-gca-atc-235-5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm1048;16-gcc-gaa-235-gac-tgg;;;126;32;94;;;;;;;;;;;
;16atcgca-235-acc-5s-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;16-gaa-235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;16-gaa-aaa-gca-gta-235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;2*16s23s5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;16s23s5s-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca-235-tca;;11;;;;;;;;;;;;;;
;16-gaa-aaa-gta-cds-235;;;;;;;;;;;;;;;;
;16-gaa-aaa-gta-cds-235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;16-gaa-aaa-gta-cds-235-tca;;45;;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;Gm1066-1149;;;;;;;;;Notes
gm1066;2*16-gca-atc-235;;2;55;4;51;;;16s23s5s;atcgca;gcaatc;gaa;atcgaa;autres;av16s;;
;;;;;;;;sans;;5;5;11;;;1;;avant
gm1072;2*16-gca-atc-235;;2;55;4;51;;gac-tgg;;2;;2;;;;;cgg-16-gca-atc-235
;;;;;;;;gac;;1;;3;;;;;
gm1100;3*16-gaa-235;;7;82;13;69;;acc-5s;;2;;2;;;;;
;16-gaa-235-gac;;;;;;;tgg;;;;;;;;;
;16atcgca235;;;;;;34;total;0;10;5;18;;0;1;;
;16-gaa-235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm1106;16-gca-atc-235;;2;53;5;48;;;;;;;;;;;
;cgg-16-gca-atc-235;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm1115;3*16-gaa-235;;7;85;14;71;;;;;;;;;;;
;16-gaa-235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm1128;3*16-gaa-235;;7;73;12;61;;;;;;;;;;;
;16-gaa-235-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;16-gaa-235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;16-gaa-235-gac;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;
gm1149;2*16-gaa-235;;7;82;15;67;;;;;;;;;;;
;2*16atcgca235;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac-tgg;;;;;;;;;;;;;;;;
;16-gaa-235-acc-5s;;;;;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-gac;;34;;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;Total;;;;;;;;;
144;;;;;;;;;16s23s5s;atcgca;gcaatc;gaa;atcgaa;autres;av16s;;
;;;;;;;;sans;58;238;14;160;1;19;17;;
;Total;;;9736;1401;8335;;gac-tgg;1;31;0;25;0;4;5;;
;Moyenne;;;68;10;58;;gac;8;34;0;31;2;5;0;;
;ecartype;;;25;6;20;;acc- 5s;7;19;0;20;;0;0;;
;max;;;149;32;140;;tgg;1;1;0;2;0;1;0;;
;min;;;27;0;27;704;total;75;323;14;238;3;29;22;;

gamma notes

Lien fiche: gamma notes

13.12.19 Paris ;;gamma notes;;;;;
avant;;;;autres;;;5s en trop
3*agc-gta-16atcgca235;;;;3*16-atc-235;;;2*16s23s5s-5s
3*atgf-16atcgca235;;;;16gcc235-gac-tgg;;;16s23s5s-5s-gac-tgg
4*cgg-cac-cca-16atcgca235;;;;16 atc-gcc 235-gac;;;16s23s5s-acc-5s-acc-5s
cgg-cac-cca-16atcgca2355-gac-tgg;;;;16-gcc-gaa-235-gac-tgg;;;
cgg-cac-cca-16atcgca235-x-tgg;;;;4*16-gca-cca-235;;;2*16atcgca235-5s
2*aaa-16atcgca235;;;;;;;16atcgca235-5s-gac
ttc-16atcgca235;;;;16-gaa-aaa-gta-235;;;3*16atcgca2355-gac-tgg
atgj-16atcgca235;;;;3*16-gaa-aaa-gta-235-gac;;;16atcgca-235-acc-5s-gac
;;;;16-gaa-aaa-gta-235-tgg;;;cgg-cac-cca-16atcgca2355-gac-tgg
2*cgg-cac-cca-16gaa2355-gac-tgg;;;;;;;16atcgca-cds-2355
cgg-cac-cca-16gaa235;;;;16-gaa-aaa-gca-gta-235;;;
;;;;16-gaa-aaa-gca-gta-235-gac-tgg;;;2*cgg-cac-cca-16gaa2355-gac-tgg
cgg-16-gca-atc-235;;;;;;;16gaa23-cds-5s-5s
;;;;16atcgca-cds-2355;;;16gaa235-gac-5s
cgg-cac-cca-16-gaa-cds-235;;;;16-gaa-cds-23555-gac-tgg;;;2*16gaa2355-gac-tgg
ttg-16-gaa-aaa-gta-235-gac-tgg;;;;16-gaa-cds-235;;;16-gaa-cds-23555-gac-tgg
;;;;7*16-gca-cds-235;;;
différents;;;;16-gaa-aaa-gta-cds-235;;;16-atc-2355-tac
16s23s5s-acc;;;;16-gaa-aaa-gta-cds-235-gac;;;2*16-gca-atc-2355
16s23s5s-acc-5s-acc-5s;;;;;;;
;;;;incomplets;;;gaa-5s
16gaa235-tca;;;;3*16atcgca23;;;atc-5s-aaa
3*16gaa235-acc;;;;2*16s23s;;;13*5s
2*16gaa235-ttc;;;;2*16gaa23;;;
16gaa23-cds-5s-5s;;;;16gaa23-tgg;;;cds
2*16gaa235-gac-gac;;;;;;;16gaa23-cds-5s-5s
16-gaa-23-acc-5s;;;;16s-gaa-aaa-gta-5s;;;
;;;;16atcgca-23s°-5s-gac;;;16atcgca-cds-2355
3*16atcgca235-acc;;;;16s-23s°-5s-gac;;;16-gaa-cds-23555-gac-tgg
16atcgca-235-tca;;;;;;;16-gaa-cds-235
16atcgca235-tta;;;;16s-atc-gca-tgg;;;7*16-gca-cds-235
16atcgca235-tgg-tgg;;;;16atcgca-23s°;;;16-gaa-aaa-gta-cds-235
16atcgca-235-acc-5s-gac;;;;16atcgca;;;16-gaa-aaa-gta-cds-235-gac
;;;;3*16s;;;cgg-cac-cca-16-gaa-cds-235
16-atc-2355-tac;;;;;;;16-gaa-aaa-gta-cds-235-tca
16-gaa-aaa-gta-cds-235-tca;;;;autres incomplets;;;
;;;;23s5s;;;à l’envers
;;;;16s°-gaa-235;;;2*5s-23s-16s
;;;;gaa-23s5s-gac;;;2*5s-23s-cp(atc-gca)-16s
;;;;atc-gca-235-gac-tgg;;;

gamma cds notes

Lien fiche: cds notes

;23.7.20 Tanger;;cds ;contrôles;;date NCBI;;
;;;;;;;;
;gamma;gm0152;Colwellia psychrerythraea 34H;;;25/08/19;;7 cds
;;;;;;;;
;42409..43659;;cds;668;417;DEAD/DEAH box helicase;;
;44328..45874;;16s;94;;;;
;45969..46044;;gca;95;;;;
;46140..46343;;cds;130;68;hp;;
;46474..49391;;23s;152;;;;
;49544..49658;;5s;511;;;;
;50170..51718;;16s;94;;;;
;51813..51888;;gca;38;;;;
<>;51927..52118;;cds;199;64;P-hp;;
;52318..55235;;23s;152;;;;
;55388..55502;;5s;886;;;;
;56389..56775;;cds;;129;ATP synthase subunit I;;
;hp;MRANLNSLTIWKADINIGIYKVSTVSRCCLHDYKYQAVISFSYRECGNGDSASPQGCIIKFILLARA;;;;;;
;;;;;;;;
comp;349644..350126;;cds;798;161;RNA-binding protein;;
;350925..352471;;16s;94;;;;
;352566..352641;;gca;95;;;;
;352737..352940;;cds;130;68;hp1;;
;353071..355988;;23s;152;;;;
;356141..356255;;5s;518;;;;
;356774..358322;;16s;94;;;;
;358417..358492;;gca;95;;;;
;358588..358791;;cds;130;68;hp2;;
;358922..361839;;23s;152;;;;
;361992..362106;;5s;1173;;;;
comp;363280..364287;;cds;;336;tRNA dihydrouridine(20/20a) synthase DusA;;
;hp1;MRANLNSLTIWKADINIGIYKVSTVSRCCLHDYKYQAVISFSYRECGNGDSASPQGCIIKFILLARA;;;;;;
;hp2;MRANLNSLTIWKADINIGIYKVSTVSRCCLHDYKYQAVISFSYRECGNGDSASPQGCIIKFILLARA;;;;;;
;;;;;;;;
;552484..553779;;cds;855;432;phosphoribosylamine--glycine ligase;;
;554635..556181;;16s;94;;;;
;556276..556351;;gca;95;;;;
;556447..556650;;cds;130;68;hp1;;
;556781..559698;;23s;152;;;;
;559851..559965;;5s;511;;;;
;560477..562025;;16s;94;;;;
;562120..562195;;gca;92;;;;
;562288..562491;;cds;130;68;hp2;;
;562622..565539;;23s;144;;;;
;565684..565798;;5s;731;;;;
comp;566530..568614;;cds;;695;YjbH domain-containing protein;;
;hp1;MRANLNSLTIWKADINIGIYKVSTVSRCCLHDYKYQAVISFSYRECGNGDSASPQGCIIKFILLARA;;;;;;
;hp2;MRANLNSLTIWKADINIGIYKVSTVSRCCLHDYKYQAVISFSYRECGNGDSASPQGCIIKFILLARA;;;;;;
;;;;;;;;
comp;4071788..4073749;;cds;983;654;molecular chaperone HtpG;;
comp;4074733..4074847;;5s;150;;;;
comp;4074998..4077915;;23s;130;;;;
comp;4078046..4078249;;cds;112;68;hp;;
comp;4078362..4078437;;gca;94;;;;
comp;4078532..4080078;;16s;999;;;;
;4081078..4084206;;cds;;1043;S8 family serine peptidase;;
;hp;MRANLNSLTIWKADINIGIYKVNTVSRCCLHDYKYQAVISFSYRECGNGDSASPQGCIIEFILFERT;;;;;;
;;;;;;;;
;;;;;;;;
;gamma;gm0360;Frischella perrara strain PEB0191;;;08/06/20;;1 cds
;;;;;;;;
;129653..130189;;cds;517;179;D-glycero-beta-D-manno-heptose 1,7-bisphosphate 7-phosphatase;;
;130707..132243;;16s;57;;;;
;132301..132377;;atc;90;;;;
;132468..132543;;gca;313;;;;
;132857..134053;;cds;433;399;histidinol-phosphate aminotransferase family protein;;
;134487..137401;;23s;60;;;;
;137462..137577;;5s;224;;;;
;137802..137917;;5s;169;;;;
;138087..138686;;cds;;200;RNA pyrophosphohydrolase;;
;histidinol;MSESNDKVILSRRNFLTYSGIAIGGISLSSVLTKSYAKQLVSPS;;;;;;
;;IDALPAIDETITPSLENPVRLNFNENALGMSPNAKQAAISAVSKANRYAKHEMPLLSQ;;;;;;
;;SIATSHGLSTQYVLLTAGSSEGIRSSIMAFAKENTQFVISDLTYGDGEYFAKIAKLSV;;;;;;
;;KKVPSLKDWTIDIDGLKKQVEKYNGNSIVYLVNPNNPTSTITDTKKMFAWIRSKPKNT;;;;;;
;;MFIIDEAYAEFVNEPTYQSVDSFIEQGYENVILLKTFSKIHAMAGLRVGYVLAHPKNI;;;;;;
;;THIAQYVAGEKLNYCGVCAALASMEDKAYLNYSKKVNDTSRQIMQKTLKELGFDYLSS;;;;;;
;;QTNFIFHKIPTDLTKYQQLLKDNYILVGRAFPPAERWCRISLGTPGEMLYTTKILTQL;;;;;;
;;REQNLI;;;;;;
;;;;;;;;
;;;;;;;;
;gamma;gm0386;;;;21/12/19;;1 cds
;;;;;;;;
;1509917..1513153;;cds;373;1079;Ig-like domain-containing protein;;
;1513527..1515080;;16s;132;;;;
;1515213..1515288;;gaa;207;;;;
;1515496..1518536;;23s;129;;;;
comp;1518666..1519652;;cds;264;329;IS110 family transposase;;
;1519917..1520032;;5s;51;;;;
;1520084..1520199;;5s;211;;;;
;1520411..1522102;;cds;;564;D-lactate dehydrogenase;;
;IS110;MDNPLYYVGIDIAKAKFDVAIKLQNGKHKHKVFKNNPEGFQSLM;;;;;;
;;QWLNTFGETFHCVMEATNIYHEALADFLFQQQITVSVINPKCSANFTKTDNLRSKTDK;;;;;;
;;IDAKMLADYADEKRHKLPIYQPISPAQRELLRKNRQLDHLKKQLAQEKTRLTMLLDSD;;;;;;
;;CIASTQQMIAFIKAQIKALEKTIKQCINADNTLKNNVKLLCTIPAIGFATAVQLIAHL;;;;;;
;;GDGNRFKNAKAAATFAGLTPMIKSSGKSLNTVIGISKIGQSDIRKALFCPAMNFAFGS;;;;;;
;;YKNSVYRSFVLRLLECGKPKMVIITALMRKLVTIAQAVLQKQTAFNLDTFMK;;;;;;
;;;;;;;;
gamma;gm0369;Haemophilus influenzae 10810;;;;02/06/20;;
;3 cds;perdus;;;;;;
;;;;;;;;
gamma;gm1048;Vibrio parahaemolyticus BB22OP;;;;10/02/20;;
;3 cds;perdus;;;;;;

gamma typage

gamma type 16235-z après 5s

Lien fiche: gamma type 16235-z après 5s

Blocs;sans;gac-tgg;gac;acc- 5s;tgg;total
16s23s5s;58;1;8;7;1;75
atcgca;238;31;34;19;1;323
gcaatc;14;0;0;0;0;14
gaa;160;25;31;20;2;238
atcgaa;1;0;2;;0;3
autres;19;4;5;0;1;29
av16s;17;5;0;0;0;22
total;507;66;80;46;5;704
;;;;;;
'''16s23s5s-z;;;;;;
Type;total;%;;tRNA;total;%
blocs;;;;sans;507;599
sans;507;699;;gac;151;178
gac-tgg;66;91;;tgg;73;86
gac;80;110;;acc;57;67
acc- 5s;46;63;;5s;50;59
tgg;5;7;;tca;3;4
différents;;;;ttc;2;2
acc;7;10;;tta;1;1
acc-5s-acc-5s;1;1;;tac;1;1
acc-5s-gac;1;1;;cds;1;1
'''23-acc-5s;1;1;;;846;1000
'''23-cds-5s-5s;1;1;;;;
tca;3;4;;;;
ttc;2;3;;;;
gac-gac;2;3;;;;
tta;1;1;;;;
tgg-tgg;1;1;;;;
tac;1;1;;;;
;725;1000;;;;

gamma type 16-y-235 après 16s

Lien fiche: gamma type 16-y-235 après 16s

16s-y-23s5s:blocs:autres:avant 16s:incomplets:différents:total
16s23s5s:75:::2:2:79
 ::::::
atc-gca:323::16:3:7:349
gca-atc:14::1:::15
atc::3:::1:4
gaa:238::3:3:10:254
atc-gaa:3:::::3
 ::::::
gcc::1::::1
atc-gcc::1::::1
gcc-gaa::1::::1
 ::::::
gca-cca::4::::4
 ::::::
gaa-aaa-gta::5:1:::6
gaa-aaa-gca-gta::2::::2
 ::::::
atc-gca-cds::1::::1
gaa-cds::2:1:::3
gca-cds::7::::7
gaa-aaa-gta-cds::2:::1:3
:653:29:22:8:21:733
 ::::::
Type:total:  %::tRNA:total: %
atc-gca:349:476::gca:378:330
gaa:254:347::atc:373:326
16s23s5s:79:108::gaa:272:238
gca-atc:15:20::16s:79:69
gca-cds:7:10::cds:14:12
gaa-aaa-gta:6:8::aaa:11:10
atc:4:5::gta:11:10
gca-cca:4:5::cca:4:3
atc-gaa:3:4::gcc:3:3
gaa-cds:3:4:::1145:1000
gaa-aaa-gta-cds:3:4::::
gaa-aaa-gca-gta:2:3::::
gcc:1:1::::
atc-gcc:1:1::::
gcc-gaa:1:1::::
atc-gca-cds:1:1::::
:733:1000::::

gamma type x-16235 avant 16s

Lien fiche: gamma type x-16235 avant 16s

x-16235;;;;
Par séquence;;Par tRNA;;
avant;;;x-16235;%
cgg-cac-cca;10;cgg;11;24
agc-gta;3;cac;10;22
atgf;3;cca;10;22
aaa;2;atgf;3;7
ttc;1;agc;3;7
atgj;1;gta;3;7
cgg;1;aaa;2;4
ttg;1;ttc;1;2
;;atgj;1;2
;;ttg;1;2
;;total;45;

gamma comparaison des types x y z

Lien fiche: gamma comparaison des types x y z

comparaison des 3 types x y z;;;;;;;;;;;
Effectifs;;3 +;31;1027;281;;;;;;
;x-16-y-235-z;total;45;1070;289;;1404;;;;
atgf;3;act;;aat;;cds;15;;ttc;2;z
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ttc;1;x
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;;;
ttt;;tct;;tat;;tgt;;;cds;14;y
;;;;;;;;;cds;1;z
atc;375;acc;57;aac;;agc;3;;;;
ctc;;ccc;;cac;10;cgt;;;gta;11;y
gtc;;gcc;3;gac;151;ggc;;;gta;3;x
ttc;3;tcc;;tac;1;tgc;;;;;
;;;;;;;;;cca;10;x
atgi;;aca;;aaa;13;aga;;;cca;4;y
cta;;cca;14;caa;;cga;;;;;
gta;14;gca;380;gaa;272;gga;;;aaa;11;y
tta;1;tca;3;taa;;tga;;;aaa;2;x
;;;;;;;;;;;
atgj;1;acg;;aag;;agg;;;;;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;11;;;;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;;;
ttg;1;tcg;;tag;;tgg;73;;;;
;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;
%;;3 +;69;96;97;;;;;;
;;total;100;100;100;;300;;;;
atgf;6.7;act;;aat;;cds;1.7;;ttc;0.69;z
ctt;;cct;;cat;;cgc;;;ttc;2.22;x
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;;;
ttt;;tct;;tat;;tgt;;;cds;1.31;y
;;;;;;;;;cds;0.35;z
atc;35;acc;20;aac;;agc;6.7;;;;
ctc;;ccc;;cac;22;cgt;;;gta;1.03;y
gtc;;gcc;0.3;gac;52;ggc;;;gta;6.67;x
ttc;2.9;tcc;;tac;0.3;tgc;;;;;
;;;;;;;;;cca;22.22;x
atgi;;aca;;aaa;5.5;aga;;;cca;0.37;y
cta;;cca;23;caa;;cga;;;;;
gta;7.7;gca;36;gaa;25;gga;;;aaa;1.03;y
tta;0.3;tca;1.0;taa;;tga;;;aaa;4.44;x
;;;;;;;;;;;
atgj;2.2;acg;;aag;;agg;;;;;
ctg;;ccg;;cag;;cgg;24;;;;
gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;;;
ttg;2.2;tcg;;tag;;tgg;25;;;;

gamma. 5s se comporte comme un tRNA

Lien fiche: gamma. 5s se comporte comme un tRNA

5s en trop;;;;;;;;;;
;16s23s5s;atcgca;gcaatc;gaa;atcgaa;autres;av16s;différents;total 5s+;total
sans;56;236;12;160;1;18;17;;;500
5s;2;2;2;;;1;;;7;7
gac-tgg;0;28;;23;;3;2;;;56
5s-gac-tgg;1;3;;2;;;3;;9;9
55-gac-tgg;;;;;;1;;;1;1
gac;8;33;;30;2;5;;;;78
gac-5s;;;;1;;;;;1;1
5s-gac;;1;;;;;;;1;1
acc-5s;7;19;;20;;;;;;46
tgg;1;1;;2;;1;;;;5
acc;1;3;;3;;;;;;7
acc-5s-acc-5s;1;;;;;;;;1;1
acc-5s-gac;;1;;;;;;;1;1
tca;;1;;1;;1;;;;3
ttc;;;;2;;;;;;2
23-cds-5s-5s;;;;1;;;;;1;1
gac-gac;;;;2;;;;;;2
23-acc-5s;;;;1;;;;;;1
tta;;1;;;;;;;;1
tgg-tgg;;1;;;;;;;;1
16-atc-2355-tac;;;;;;;;1;1;1
;77;330;14;248;3;30;22;1;23;725
;75;323;14;238;3;29;22;0;19;704

Noms gamma

Lien fiche: Tableau des noms gamma

noms gamma;;;;;;
rupture;notes;rRNAs;fait;codes;tRNAs;génomes
1;;222;1;gm0001;§54;Acidithiobacillus caldus ATCC 51756 
;;;;gm0002;55;Acidithiobacillus caldus SM-1 
1;;222;1;gm0003;§51;Acidithiobacillus ferrivorans SS3 
1;;;;gm0004;§88;Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270 
;;222;1;gm0005;50;Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 
1;;;;gm0006;§72;Acinetobacter baumannii 1656-2 
;;;;gm0007;75;Acinetobacter baumannii 6200 
;;;;gm0008;73;Acinetobacter baumannii 6411 
;;;;gm0009;74;Acinetobacter baumannii A1 
;;;;gm0010;74;Acinetobacter baumannii AB0057 
;;;;gm0011;75;Acinetobacter baumannii AB030 
;;;;gm0012;74;Acinetobacter baumannii AB031 
;;;;gm0013;74;Acinetobacter baumannii AB307-0294 
;;;;gm0014;75;Acinetobacter baumannii AB5075-UW 
;;;;gm0015;73;Acinetobacter baumannii AbH12O-A2 
;;;;gm0016;39;Acinetobacter baumannii AC12 
;;211;1;gm0017;63;Acinetobacter baumannii AC29 
;;;;gm0018;48;Acinetobacter baumannii AC30 
;;;;gm0019;65;Acinetobacter baumannii ACICU 
;;;;gm0020;71;Acinetobacter baumannii ATCC 17978 
;;;;gm0021;73;Acinetobacter baumannii AYE 
;;;;gm0022;75;Acinetobacter baumannii BJAB07104 
;;;;gm0023;76;Acinetobacter baumannii BJAB0715 
;;;;gm0024;76;Acinetobacter baumannii BJAB0868 
;;;;gm0025;66;Acinetobacter baumannii D1279779 
;;;;gm0026;75;Acinetobacter baumannii IOMTU 433 
;;;;gm0027;73;Acinetobacter baumannii LAC-4 
;;;;gm0028;76;Acinetobacter baumannii MDR-TJ 
;;;;gm0029;70;Acinetobacter baumannii MDR-ZJ06 
;;;;gm0030;75;Acinetobacter baumannii NCGM 237 
;;;;gm0031;81;Acinetobacter baumannii PKAB07 
;;;;gm0032;65;Acinetobacter baumannii SDF 
;;;;gm0033;43;Acinetobacter baumannii TCDC-AB0715 
;;;;gm0034;76;Acinetobacter baumannii TYTH-1 
;;;;gm0035;72;Acinetobacter baumannii ZW85-1 
1;;666;1;gm0036;§70;Acinetobacter calcoaceticus PHEA-2 
1;;666;1;gm0037;§72;Acinetobacter oleivorans DR1 
;;;;gm0038;77;Acinetobacter sp. ADP1 
1;;766;1;gm0039;§64;Actinobacillus equuli subsp. equuli 19392 
1;;766;1;gm0040;§64;Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 3 str. JL03 
;;;;gm0041;63;Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 5b str. L20 
;;;;gm0042;65;Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 7 str. AP76 
1;;766;1;gm0043;§61;Actinobacillus succinogenes 130Z 
1;;;;gm0044;§64;Actinobacillus suis ATCC 33415 
;;766;1;gm0045;60;Actinobacillus suis H91-0380 
1;;;;gm0046;§106;Aeromonas hydrophila 4AK4 
;;11,11,11;1;gm0047;129;Aeromonas hydrophila AH10 
;;;;gm0048;115;Aeromonas hydrophila AL06-06 
;;;;gm0049;114;Aeromonas hydrophila AL09-71 
;;;;gm0050;113;Aeromonas hydrophila J-1 
;;;;gm0051;114;Aeromonas hydrophila ML09-119 
;;;;gm0052;114;Aeromonas hydrophila pc104A 
;;;;gm0053;128;Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966 
;;;;gm0054;129;Aeromonas hydrophila YL17 
1;;10,9,9;1;gm0055;§131;Aeromonas media WS 
1;;10,9,9;1;gm0056;§111;Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449 
1;;11,10,10;1;gm0057;§103;Aeromonas veronii B565 
1;;666;1;gm0058;§52;Aggregatibacter actinomycetemcomitans ANH9381 
;;;;gm0059;57;Aggregatibacter actinomycetemcomitans D11S-1 
;;;;gm0060;55;Aggregatibacter actinomycetemcomitans D7S-1 
;;;;gm0061;55;Aggregatibacter actinomycetemcomitans HK1651 
1;;766;1;gm0062;§60;Aggregatibacter aphrophilus NJ8700 
1;;333;1;gm0063;§43;Alcanivorax borkumensis SK2 
1;;222;1;gm0064;§45;Alcanivorax dieselolei B5 
1;;222;1;gm0065;§48;Alcanivorax pacificus W11-5 
1;;13,12,12;1;gm0066;§104;Aliivibrio salmonicida LFI1238 
1;;876;1;gm0067;§91;Aliivibrio wodanis 
1;;222;1;gm0068;§49;Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 
1;;333;1;gm0069;§54;Allochromatium vinosum DSM 180 
1;;555;1;gm0070;§68;Alteromonas australica DE170 
 ;;555;1;gm0071;57;Alteromonas australica H 17 
1;;;;gm0072;§69;Alteromonas macleodii AltDE1 
 ;;655;1;gm0073;54;Alteromonas macleodii ATCC 27126 
;;;;gm0074;67;Alteromonas macleodii str. Aegean Sea MED64 
;;;;gm0075;72;Alteromonas macleodii str. Balearic Sea AD45 
;;;;gm0076;70;Alteromonas macleodii str. Black Sea 11 
;;;;gm0077;64;Alteromonas macleodii str. Deep ecotype 
;;;;gm0078;68;Alteromonas macleodii str. English Channel 615 
;;655;1;gm0079;77;Alteromonas macleodii str. English Channel 673 
;;;;gm0080;63;Alteromonas macleodii str. Ionian Sea U4 
;;;;gm0081;63;Alteromonas macleodii str. Ionian Sea U7 
;;;;gm0082;64;Alteromonas macleodii str. Ionian Sea U8 
;;;;gm0083;59;Alteromonas macleodii str. Ionian Sea UM4b 
;;;;gm0084;65;Alteromonas macleodii str. Ionian Sea UM7 
1;;;;gm0085;§66;Alteromonas sp. SN2 
1;;666;1;gm0086;§70;Azotobacter chroococcum NCIMB 8003 
1;;666;1;gm0087;§66;Azotobacter vinelandii CA 
;;;;gm0088;66;Azotobacter vinelandii CA6 
;;;;gm0089;66;Azotobacter vinelandii DJ ATCC BAA-1303 
1;;766;1;gm0090;§58;Bibersteinia trehalosi USDA-ARS-USMARC-188 
;;;;gm0091;58;Bibersteinia trehalosi USDA-ARS-USMARC-189 
;;;;gm0092;59;Bibersteinia trehalosi USDA-ARS-USMARC-190 
;;;;gm0093;58;Bibersteinia trehalosi USDA-ARS-USMARC-192 
1;;111;1;gm0094;§38;Blochmannia endosymbiont of Camponotus Colobopsis obliquus 757 
;;;;gm0095;38;Blochmannia endosymbiont of Polyrhachis Hedomyrma turneri 675 
;;;;gm0096;31;Buchnera aphidicola BCc 
;;;;gm0097;31;Buchnera aphidicola Cinara tujafilina 
1;;111;1;gm0098;§32;Buchnera aphidicola str. 5A Acyrthosiphon pisum 
;;;;gm0099;32;Buchnera aphidicola str. Ak Acyrthosiphon kondoi 
;;;;gm0100;32;Buchnera aphidicola str. APS Acyrthosiphon pisum 
;;;;gm0101;32;Buchnera aphidicola str. Bp Baizongia pistaciae 
;;;;gm0102;32;Buchnera aphidicola str. F009 Myzus persicae 
;;;;gm0103;32;Buchnera aphidicola str. G002 Myzus persicae 
;;;;gm0104;32;Buchnera aphidicola str. JF98 Acyrthosiphon pisum 
;;;;gm0105;32;Buchnera aphidicola str. JF99 Acyrthosiphon pisum 
;;;;gm0106;32;Buchnera aphidicola str. LL01 Acyrthosiphon pisum 
;;;;gm0107;32;Buchnera aphidicola str. LSR1 Acyrthosiphon pisum 
;;;;gm0108;32;Buchnera aphidicola str. Sg Schizaphis graminum 
;;;;gm0109;32;Buchnera aphidicola str. TLW03 Acyrthosiphon pisum 
;;;;gm0110;32;Buchnera aphidicola str. Tuc7 Acyrthosiphon pisum 
;;;;gm0111;32;Buchnera aphidicola str. Ua Uroleucon ambrosiae 
;;;;gm0112;32;Buchnera aphidicola str. USDA Myzus persicae 
;;;;gm0113;32;Buchnera aphidicola str. W106 Myzus persicae 
1;;222;1;gm0114;§40;Candidatus Baumannia cicadellinicola BGSS 
1;;111;1;gm0115;§41;Candidatus Blochmannia chromaiodes str. 640 
;;;;gm0116;37;Candidatus Blochmannia floridanus 
;;;;gm0117;41;Candidatus Blochmannia pennsylvanicus str. BPEN 
;;;;gm0118;38;Candidatus Blochmannia vafer str. BVAF 
1;;011;1;gm0119;§27;Candidatus Carsonella ruddii CE isolate Thao2000 
;;;;gm0120;26;Candidatus Carsonella ruddii CS isolate Thao2000 
;;;;gm0121;27;Candidatus Carsonella ruddii DC 
;;;;gm0122;24;Candidatus Carsonella ruddii HC isolate Thao2000 
;;;;gm0123;26;Candidatus Carsonella ruddii HT isolate Thao2000 
;;;;gm0124;27;Candidatus Carsonella ruddii PC isolate NHV 
;;;;gm0125;26;Candidatus Carsonella ruddii PV 
1;;111;1;gm0126;§33;Candidatus Evansia muelleri 
1;;333;1;gm0127;§45;Candidatus Hamiltonella defensa 5AT Acyrthosiphon pisum T5A 
1;;333;1;gm0128;§37;Candidatus Ishikawaella capsulata Mpkobe 
1;;212;1;gm0129;§42;Candidatus Moranella endobia PCIT 
;;;;gm0130;42;Candidatus Moranella endobia PCVAL 
1;;233;1;gm0131;§40;Candidatus Pantoea carbekii 
;;;;gm0132;39;Candidatus Pantoea carbekii US 
;;;;gm0133;34;Candidatus Portiera aleyrodidarum AD-CAI 
;;;;gm0134;35;Candidatus Portiera aleyrodidarum AF-CAI 
; 2*33;;;gm0135;66;Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-B-HRs    
;;;;gm0136;66;Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-QVLC 
1;;111;1;gm0137;§33;Candidatus Portiera aleyrodidarum MED Bemisia tabaci BT-Q 
;;;;gm0138;34;Candidatus Portiera aleyrodidarum TV 
;;;;gm0139;34;Candidatus Portiera aleyrodidarum TV-BCN 
1;;222;1;gm0140;§33;Candidatus Riesia pediculicola USDA 
1;;111;1;gm0141;§37;Candidatus Ruthia magnifica str. Cm Calyptogena magnifica 
1;;252;1;gm0142;§57;Candidatus Sodalis pierantonius str. SOPE 
1;;877;1;gm0143;§83;Cedecea neteri M006 
;;;;gm0144;84;Cedecea neteri ND14a 
;;;;gm0145;77;Cedecea neteri ND14b 
;;;;gm0146;83;Cedecea neteri SSMD04 
1;;333;1;gm0147;§49;Cellvibrio japonicus Ueda107 
1;;555;1;gm0148;§70;Chromohalobacter salexigens DSM 3043 
1;;988;1;gm0149;§84;Citrobacter freundii CFNIH1 
1;;877;1;gm0150;§84;Citrobacter koseri ATCC BAA-895 
1;;877;1;gm0151;§87;Citrobacter rodentium ICC168 
1;;10,9,9;1;gm0152;§89;Colwellia psychrerythraea 34H BAA-681 
;;;;gm0153;43;Coxiella burnetii Cb175 Guyana 
;;;;gm0154;43;Coxiella burnetii CbuG Q212 
1;;111;1;gm0155;§44;Coxiella burnetii CbuK Q154 
;;;;gm0156;44;Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 
;;;;gm0157;43;Coxiella burnetii RSA 331 
1;;111;1;gm0158;§43;Coxiella burnetii RSA 493 
;;;;gm0159;44;Coxiella burnetii str. Namibia 
;;;;gm0160;43;Coxiella burnetii Z3055 
1;;111;1;gm0161;§39;Coxiella endosymbiont of Amblyomma americanum 
1;;877;1;gm0162;§85;Cronobacter sakazakii ATCC BAA-894 
;;;;gm0163;85;Cronobacter sakazakii CMCC 45402 CMCC45402 
;;;;gm0164;81;Cronobacter sakazakii ES15 
;;;;gm0165;85;Cronobacter sakazakii SP291 Sp291 
1;;877;1;gm0166;§86;Cronobacter turicensis z3032 
1;;111;1;gm0167;§36;Cycloclasticus sp. P1 MCCC 1A01040 
1;;111;1;gm0168;§36;Cycloclasticus zancles 7-ME 
1;;333;1;gm0169;§47;Dichelobacter nodosus VCS1703A 
1;;877;1;gm0170;§76;Dickeya dadantii 3937 
;;;;gm0171;78;Dickeya dadantii Ech586 
;;;;gm0172;75;Dickeya dadantii Ech703 
1;;877;1;gm0173;§91;Dickeya zeae EC1 
;;;;gm0174;76;Dickeya zeae Ech1591 
1;;222;1;gm0175;§53;Dyella japonica A8 
1;;;;gm0176;§57;Dyella jiangningensis SBZ 3-12 
1;;988;1;gm0177;§95;Edwardsiella ictaluri 93-146 
1;;988;1;gm0178;§96;Edwardsiella piscicida C07-087 
1;;;;gm0179;§99;Edwardsiella tarda 080813 
 ;;988;1;gm0180;96;Edwardsiella tarda EIB202 
;;;;gm0181;96;Edwardsiella tarda FL6-60 
1;;111;1;gm0182;§43;endosymbiont of unidentified scaly snail isolate Monju 
1;;10,8,8;1;gm0183;§90;Enterobacter aerogenes EA1509E 
;;;;gm0184;85;Enterobacter aerogenes KCTC 2190 
1;;988;1;gm0185;§85;Enterobacter asburiae L1 
;;;;gm0186;84;Enterobacter asburiae LF7a 
1;;;;gm0187;§87;Enterobacter cloacae 34399 
;;;;gm0188;86;Enterobacter cloacae 34977 
;;;;gm0189;86;Enterobacter cloacae 34983 
;;988;1;gm0190;90;Enterobacter cloacae ECNIH2 
;;;;gm0191;84;Enterobacter cloacae ECNIH3 
;;;;gm0192;85;Enterobacter cloacae ECNIH4 
;;;;gm0193;84;Enterobacter cloacae ECNIH5 
;;;;gm0194;84;Enterobacter cloacae ECR091 
;;;;gm0195;84;Enterobacter cloacae EcWSU1 
;;;;gm0196;85;Enterobacter cloacae GGT036 
;;;;gm0197;104;Enterobacter cloacae P101 
;;988;1;gm0198;89;Enterobacter cloacae subsp. cloacae ATCC 13047 
;;;;gm0199;84;Enterobacter cloacae subsp. cloacae ENHKU01 
;;;;gm0200;65;Enterobacter cloacae subsp. cloacae NCTC 9394 
;;;;gm0201;80;Enterobacter cloacae subsp. dissolvens SDM 
1;;877;1;gm0202;§83;Enterobacter lignolyticus SCF1 
1;;877;1;gm0203;§87;Enterobacter sp. 638 
1;;11,10,8;1;gm0204;§89;Enterobacter sp. R4-368 
1;;10,9,9;1;gm0205;§88;Enterobacteriaceae bacterium strain FGI 57 
1;;877;1;gm0206;§79;Erwinia amylovora ATCC 49946 
;;;;gm0207;78;Erwinia amylovora CFBP1430 
;;;;gm0208;60;Erwinia amylovora LA635 
;;;;gm0209;60;Erwinia amylovora LA636 
;;;;gm0210;60;Erwinia amylovora LA637 
1;;777;1;gm0211;§78;Erwinia billingiae Eb661 
1;;877;1;gm0212;§76;Erwinia pyrifoliae DSM 12163 
;;;;gm0213;76;Erwinia pyrifoliae Ep1/96 
1;;877;1;gm0214;§78;Erwinia sp. Ejp617 
1;;877;1;gm0215;§82;Erwinia tasmaniensis Et1/99 
1;;877;1;gm0216;§89;Escherichia albertii KF1 
1;;;;gm0217;§93;Escherichia coli 
;;;;gm0218;95;Escherichia coli 042 
;;;;gm0219;91;Escherichia coli 1303 
;;;;gm0220;81;Escherichia coli 536 
;;;;gm0221;96;Escherichia coli 55989 
;;;;gm0222;87;Escherichia coli 6409 
;;;;gm0223;93;Escherichia coli 94-3024 
;;;;gm0224;89;Escherichia coli ABU 83972 
;;;;gm0225;89;Escherichia coli APEC IMT5155 
;;;;gm0226;98;Escherichia coli APEC O1 
;;;;gm0227;91;Escherichia coli APEC O78 
;;;;gm0228;85;Escherichia coli ATCC 25922 
;;;;gm0229;87;Escherichia coli ATCC 8739 
;;;;gm0230;87;Escherichia coli B str. REL606 
;;;;gm0231;87;Escherichia coli B7A 
;;;;gm0232;86;Escherichia coli BL21 TaKaRa 
;;;;gm0233;86;Escherichia coli BL21-GoldDE3pLysS AG 
;;;;gm0234;172;Escherichia coli BL21DE3 
;;;;gm0235;88;Escherichia coli BW25113 K-12 substr. BW25113 
;;;;gm0236;89;Escherichia coli BW2952 K-12 substr. BW2952 
;;;;gm0237;86;Escherichia coli C41DE3 
;;;;gm0238;89;Escherichia coli CFT073 
;;;;gm0239;92;Escherichia coli CI5 
;88+89;;;gm0240;177;Escherichia coli DH1 
;;;;gm0241;91;Escherichia coli ECC-1470 
;;;;gm0242;94;Escherichia coli ECONIH1 
;;;;gm0243;92;Escherichia coli ED1a 
;;;;gm0244;89;Escherichia coli ER2796 
;;;;gm0245;92;Escherichia coli ETEC H10407 
;;;;gm0246;95;Escherichia coli FAP1 
;;;;gm0247;90;Escherichia coli HS 
;;;;gm0248;93;Escherichia coli HUSEC2011 
;;;;gm0249;87;Escherichia coli IAI1 
;;;;gm0250;89;Escherichia coli IAI39 
;;;;gm0251;100;Escherichia coli IHE3034 
;;;;gm0252;91;Escherichia coli JJ1886 
;;;;gm0253;89;Escherichia coli K-12 ER3413 
;;;;gm0254;89;Escherichia coli K-12 ER3435 
;;;;gm0255;89;Escherichia coli K-12 ER3440 
;;;;gm0256;89;Escherichia coli K-12 ER3445 
;;;;gm0257;89;Escherichia coli K-12 ER3446 
;;;;gm0258;89;Escherichia coli K-12 ER3454 
;;;;gm0259;89;Escherichia coli K-12 ER3466 
;;;;gm0260;89;Escherichia coli K-12 ER3475 
;;;;gm0261;89;Escherichia coli K-12 ER3476 
;;;;gm0262;89;Escherichia coli K-12 substr. HMS174 
;;;;gm0263;89;Escherichia coli K-12 substr. RV308 
;;;;gm0264;89;Escherichia coli KLY 
;2*86;;;gm0265;172;Escherichia coli KO11FL 
;;;;gm0266;87;Escherichia coli LF82 
;;;;gm0267;86;Escherichia coli LY180 
;;;;gm0268;88;Escherichia coli MNCRE44 
;;;;gm0269;82;Escherichia coli NA114 
;NCBI;11,10,8;;gm0270;123;Escherichia coli Nissle 1917 
;;;;gm0271;104;Escherichia coli O103 H2 str. 12009 
;;;;gm0272;99;Escherichia coli O104 H4 str. 2009EL-2050 
;;;;gm0273;99;Escherichia coli O104 H4 str. 2009EL-2071 
;;;;gm0274;94;Escherichia coli O104 H4 str. 2011C-3493 
;;;;gm0275;116;Escherichia coli O111 H- str. 11128 
;;;;gm0276;93;Escherichia coli O127 H6 str. E2348/69 
;;;;gm0277;93;Escherichia coli O139 H28 str. E24377A 
;;;;gm0278;113;Escherichia coli O145 H28 str. RM12581 
;;;;gm0279;104;Escherichia coli O145 H28 str. RM12761 
;;;;gm0280;113;Escherichia coli O145 H28 str. RM13514 
;;;;gm0281;104;Escherichia coli O145 H28 str. RM13516 
;;;;gm0282;96;Escherichia coli O157 H16 Santai 
;;;;gm0283;113;Escherichia coli O157 H7 str. EC4115 
;;;;gm0284;210;Escherichia coli O157 H7 str. EDL933 
;;;;gm0285;108;Escherichia coli O157 H7 str. Sakai Sakai substr. RIMD 0509952 
;;;;gm0286;112;Escherichia coli O157 H7 str. SS17 
;;;;gm0287;111;Escherichia coli O157 H7 str. SS52 
;;;;gm0288;112;Escherichia coli O157 H7 str. TW14359 
;;;;gm0289;106;Escherichia coli O26 H11 str. 11368 
;;;;gm0290;105;Escherichia coli O55 H7 str. CB9615 
;;;;gm0291;108;Escherichia coli O55 H7 str. RM12579 
;;;;gm0292;94;Escherichia coli O7 K1 str. CE10 
;;;;gm0293;84;Escherichia coli O83 H1 str. NRG 857C 
;;;;gm0294;88;Escherichia coli P12b 
;;;;gm0295;90;Escherichia coli PMV-1 
;;;;gm0296;96;Escherichia coli RM9387 
;;;;gm0297;94;Escherichia coli S88 
;;;;gm0298;92;Escherichia coli SE11 
;;;;gm0299;87;Escherichia coli SE15 
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;;;;gm0304;89;Escherichia coli str. clone D i14 
;;;;gm0305;89;Escherichia coli str. clone D i2 
;;;;gm0306;90;Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B 
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;;;;gm0308;86;Escherichia coli str. K-12 substr. MDS42 
 ;4*86;877;1;gm0309;356;Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 
;;;;gm0310;89;Escherichia coli str. K-12 substr. W3110 
;;;;gm0311;86;Escherichia coli UM146 
;;;;gm0312;89;Escherichia coli UMN026 
;;;;gm0313;106;Escherichia coli UMNF18 
;;;;gm0314;99;Escherichia coli UMNK88 
;;;;gm0315;90;Escherichia coli UTI89 
;;;;gm0316;94;Escherichia coli VR50 
;;;;gm0317;176;Escherichia coli W 
;;;;gm0318;97;Escherichia coli Xuzhou21 
1;;877;1;gm0319;§89;Escherichia fergusonii ATCC 35469 
1;;877;1;gm0320;§122;Ferrimonas balearica DSM 9799 
1;;433;1;gm0321;§39;Francisella cf. novicida Fx1 
1;;433;1;gm0322;§39;Francisella cf. tularensis subsp. novicida 3523 
1;;433;1;gm0323;§39;Francisella guangzhouensis 08HL01032 
1;;433;1;gm0324;§40;Francisella noatunensis subsp. orientalis LADL--07-285A 
;;;;gm0325;36;Francisella noatunensis subsp. orientalis str. Toba 04 
1;;433;1;gm0326;§41;Francisella philomiragia GA01-2794 
;;;;gm0327;41;Francisella philomiragia GA01-2801 
;;;;gm0328;40;Francisella philomiragia O#319-029 
;;;;gm0329;40;Francisella philomiragia O#319-036 FSC 153 
;;;;gm0330;40;Francisella philomiragia O#319-067 
;;;;gm0331;40;Francisella philomiragia subsp. philomiragia ATCC 25015 O#319L 
;;;;gm0332;40;Francisella philomiragia subsp. philomiragia ATCC 25017 
1;;433;1;gm0333;§39;Francisella sp. FSC1006 
1;;433;1;gm0334;§40;Francisella sp. TX077308 
1;;433;1;gm0335;§39;Francisella tularensis subsp. holarctica 425 
;;;;gm0336;39;Francisella tularensis subsp. holarctica F92 
;;;;gm0337;39;Francisella tularensis subsp. holarctica FSC200 
;;;;gm0338;39;Francisella tularensis subsp. holarctica FTNF002-00 
;;;;gm0339;39;Francisella tularensis subsp. holarctica FTT 1 
;;;;gm0340;78;Francisella tularensis subsp. holarctica LVS 
;;;;gm0341;78;Francisella tularensis subsp. holarctica OSU18 
;;;;gm0342;39;Francisella tularensis subsp. holarctica PHIT-FT049 
;;;;gm0343;39;Francisella tularensis subsp. holarctica VT68 
;;;;gm0344;39;Francisella tularensis subsp. mediasiatica FSC147 GIEM 543 
;;;;gm0345;39;Francisella tularensis subsp. novicida D9876 
;;;;gm0346;39;Francisella tularensis subsp. novicida F6168 
;;;;gm0347;78;Francisella tularensis subsp. novicida U112 
;;;;gm0348;39;Francisella tularensis subsp. tularensis FSC198 FSC 198 
;;;;gm0349;39;Francisella tularensis subsp. tularensis NE061598 
;;;;gm0350;37;Francisella tularensis subsp. tularensis NIH B-38 
;;;;gm0351;37;Francisella tularensis subsp. tularensis Scherm 
;;;;gm0352;39;Francisella tularensis subsp. tularensis SCHU S4 
;;;;gm0353;39;Francisella tularensis subsp. tularensis SCHU S4 SHU-S4 
;;;;gm0354;39;Francisella tularensis subsp. tularensis str. SCHU S4 substr. NR-28534 
;;;;gm0355;39;Francisella tularensis subsp. tularensis TI0902 
;;;;gm0356;40;Francisella tularensis subsp. tularensis TIGB03 
;;;;gm0357;39;Francisella tularensis subsp. tularensis WY96 
;;;;gm0358;39;Francisella tularensis subsp. tularensis WY96-3418 
1;;444;1;gm0359;§76;Frateuria aurantia DSM 6220 
1;;544;1;gm0360;§54;Frischella perrara PEB0191 
1;;766;1;gm0361;§59;Gallibacterium anatis UMN179 
1;;;;gm0362;§51;gamma proteobacterium HdN1 
1;;444;1;gm0363;§53;Gilliamella apicola wkB1 
1;;444;1;gm0364;§55;Glaciecola nitratireducens FR1064 
1;;666;1;gm0365;§60;Glaciecola psychrophila 170 
1;;555;1;gm0366;§62;Glaciecola sp. 4H-3-7+YE-5 
1;;444;1;gm0367;§50;Gynuella sunshinyii YC6258 
1;;766;1;gm0368;§50;Haemophilus ducreyi 35000HP 
1;;866;1;gm0369;§59;Haemophilus influenzae 10810 
;;;;gm0370;60;Haemophilus influenzae 2019 
;;;;gm0371;61;Haemophilus influenzae 477 
;;;;gm0372;60;Haemophilus influenzae 723 
;;;;gm0373;60;Haemophilus influenzae 86-028NP 
;;;;gm0374;58;Haemophilus influenzae C486 
;;;;gm0375;60;Haemophilus influenzae CGSHiCZ412602 
;;;;gm0376;61;Haemophilus influenzae F3031 
;;;;gm0377;59;Haemophilus influenzae F3047 
;;;;gm0378;61;Haemophilus influenzae Hi375 
;;;;gm0379;59;Haemophilus influenzae KR494 
;;;;gm0380;59;Haemophilus influenzae PittEE 
;;;;gm0381;58;Haemophilus influenzae PittGG 
;;;;gm0382;58;Haemophilus influenzae R2846 
;;;;gm0383;62;Haemophilus influenzae R2866 
;;;;gm0384;59;Haemophilus influenzae Rd KW20 
;;;;gm0385;59;Haemophilus parainfluenzae T3T1 
1;;866;1;gm0386;§57;Haemophilus parasuis KL0318 
;;;;gm0387;57;Haemophilus parasuis SH0165 
;;;;gm0388;60;Haemophilus parasuis SH03 
;;;;gm0389;64;Haemophilus parasuis ZJ0906 
1;;988;1;gm0390;§94;Hafnia alvei FB1 
1;;555;1;gm0391;§69;Hahella chejuensis KCTC 2396 
1;;666;1;gm0392;§61;Halomonas campaniensis LS21 
1;;444;1;gm0393;§71;Halomonas elongata DSM 2581 
1;;666;1;gm0394;§65;Halomonas sp. KO116 
1;;;;gm0395;§48;Halorhodospira halochloris str. A 
1;;222;1;gm0396;§48;Halorhodospira halophila SL1 
1;;222;1;gm0397;§45;Halothiobacillus neapolitanus c2 
1;;444;1;gm0398;§57;Idiomarina loihiensis GSL 199 
;;;;gm0399;57;Idiomarina loihiensis L2TR 
1;;222;1;gm0400;§42;Kangiella koreensis DSM 16069 
1;;978;1;gm0401;§85;Klebsiella michiganensis RC10 
1;;988;1;gm0402;§87;Klebsiella oxytoca E718 
;;;;gm0403;87;Klebsiella oxytoca HKOPL1 
;;;;gm0404;85;Klebsiella oxytoca KCTC 1686 
;;;;gm0405;88;Klebsiella oxytoca KONIH1 
;;;;gm0406;83;Klebsiella oxytoca M1 
;;;;gm0407;80;Klebsiella pneumoniae 30660/NJST258 1 
;;;;gm0408;88;Klebsiella pneumoniae 30684/NJST258 2 
1;;10,9,9;1;gm0409;§92;Klebsiella pneumoniae 32192 
;;;;gm0410;89;Klebsiella pneumoniae 342 
;;;;gm0411;89;Klebsiella pneumoniae 34618 
;;;;gm0412;88;Klebsiella pneumoniae ATCC BAA-2146 
1;;988;1;gm0413;§87;Klebsiella pneumoniae blaNDM-1 
;;;;gm0414;82;Klebsiella pneumoniae CG43 
;;;;gm0415;89;Klebsiella pneumoniae HK787 
;;;;gm0416;86;Klebsiella pneumoniae JM45 
;;;;gm0417;90;Klebsiella pneumoniae KCTC 2242 
;;;;gm0418;86;Klebsiella pneumoniae Kp52.145 
;;;;gm0419;90;Klebsiella pneumoniae PMK1 
1;;977;1;gm0420;§70;Klebsiella pneumoniae SB3432 
;;;;gm0421;81;Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae 1084 
;;;;gm0422;87;Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae 1158 
;;;;gm0423;87;Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae ATCC 43816 KPPR1 
;;;;gm0424;91;Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 
;;;;gm0425;87;Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae Kp13 
;;;;gm0426;79;Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae KP5-1 
;;;;gm0427;91;Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae KPNIH1 
;;;;gm0428;91;Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae KPNIH10 
;;;;gm0429;89;Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae KPNIH24 
;;;;gm0430;87;Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae KPNIH27 
;;;;gm0431;88;Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae KPNIH29 
;;;;gm0432;89;Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae KPNIH30 
;;;;gm0433;86;Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae KPNIH31 
;;;;gm0434;91;Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae KPNIH32 
;;;;gm0435;91;Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae KPNIH33 
;;;;gm0436;87;Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae KPR0928 
;;;;gm0437;88;Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 ATCC 700721 
;;;;gm0438;88;Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae NTUH-K2044 
;;;;gm0439;87;Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae PittNDM01 
;;;;gm0440;86;Klebsiella pneumoniae XH209 
1;;988;1;gm0441;§86;Klebsiella variicola At-22 
;;;;gm0442;87;Klebsiella variicola DSM 15968 
;;;;gm0443;89;Klebsiella variicola DX120E 
1;;;;gm0444;§83;Kosakonia sacchari SP1 
1;;;;gm0445;§49;Legionella fallonii LLAP-10 
1;;;;gm0446;§45;Legionella hackeliae ATCC35250 
1;;;;gm0447;§50;Legionella longbeachae NSW150 
1;;;;gm0448;§45;Legionella oakridgensis ATCC 33761 DSM 21215 OR-10 
1;;;;gm0449;§48;Legionella pneumophila 2300/99 Alcoy 
;;;;gm0450;49;Legionella pneumophila str. Corby 
;;;;gm0451;44;Legionella pneumophila str. Lens 
;;;;gm0452;47;Legionella pneumophila str. Paris 
;;;;gm0453;46;Legionella pneumophila subsp. pneumophila ATCC 43290 
;;;;gm0454;48;Legionella pneumophila subsp. pneumophila HL06041035 
;;;;gm0455;46;Legionella pneumophila subsp. pneumophila Lorraine 
;;;;gm0456;46;Legionella pneumophila subsp. pneumophila LPE509 
;;;;gm0457;43;Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Hextuple 2q Philadelphia 1 substr. Lp02 
;;;;gm0458;43;Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Hextuple 3a Philadelphia 1 substr. Lp02 
;;;;gm0459;46;Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1 
;;;;gm0460;41;Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Thunder Bay 
1;;;;gm0461;§67;Mannheimia haemolytica 89010807N 
;;;;gm0462;67;Mannheimia haemolytica 89010807N lktA- 
;;;;gm0463;64;Mannheimia haemolytica D153 
;;;;gm0464;61;Mannheimia haemolytica D171 
;;;;gm0465;68;Mannheimia haemolytica D174 
;;;;gm0466;63;Mannheimia haemolytica M42548 
;;;;gm0467;67;Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183 
;;;;gm0468;64;Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-184 
;;;;gm0469;63;Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-185 
;;766;1;gm0470;66;Mannheimia haemolytica USMARC 2286 
1;;;;gm0471;§61;Mannheimia succiniciproducens MBEL55E 
1;;;;gm0472;§64;Mannheimia varigena USDA-ARS-USMARC-1261 
;;;;gm0473;63;Mannheimia varigena USDA-ARS-USMARC-1296 
;;;;gm0474;62;Mannheimia varigena USDA-ARS-USMARC-1312 
;;;;gm0475;62;Mannheimia varigena USDA-ARS-USMARC-1388 
1;;333;1;gm0476;§57;Marichromatium purpuratum 984 987 
1;;;;gm0477;§55;Marinobacter adhaerens HP15 
1;;333;1;gm0478;§52;Marinobacter hydrocarbonoclasticus ATCC 49840 
;;;;gm0479;54;Marinobacter hydrocarbonoclasticus VT8 
1;;;;gm0480;§44;Marinobacter salarius R9SW1 
1;;;;gm0481;§48;Marinobacter similis A3d10 
1;;;;gm0482;§54;Marinobacter sp. BSs20148 
1;;777;1;gm0483;§81;Marinomonas mediterranea MMB-1 
1;;;;gm0484;§80;Marinomonas posidonica IVIA-Po-181 
1;;;;gm0485;§83;Marinomonas sp. MWYL1 
1;;222;1;gm0486;§47;Methylococcus capsulatus str. Bath 
1;;333;1;gm0487;§47;Methylomicrobium alcaliphilum 20Z 
1;;333;1;gm0488;§47;Methylomonas methanica MC09 
1;;333;1;gm0489;§44;Methylophaga frappieri JAM7 
1;;;;gm0490;§47;Methylophaga nitratireducenticrescens JAM1 
1;;444;1;gm0491;§50;Moraxella catarrhalis 25239 
;;;;gm0492;50;Moraxella catarrhalis 25240 
;;;;gm0493;50;Moraxella catarrhalis BBH18 
1;;776;1;gm0494;§82;Morganella morganii subsp. morganii KT 
1;;13,11,11;1;gm0495;§132;Moritella viscosa 
1;;;;gm0496;§48;Nitrosococcus halophilus Nc 4 
1;;;;gm0497;§48;Nitrosococcus oceani ATCC 19707 
1;;;;gm0498;§48;Nitrosococcus watsonii C-113 
1;;;;gm0499;§92;Oceanimonas sp. GK1 
1;;;;gm0500;§52;Oleispira antarctica RB-8 
1;;;;gm0501;§79;Pantoea ananatis AJ13355 
;;;;gm0502;73;Pantoea ananatis LMG 20103 
;;;;gm0503;80;Pantoea ananatis LMG 5342 
;;;;gm0504;87;Pantoea ananatis PA13 
1;;;;gm0505;§80;Pantoea rwandensis ND04 
1;;;;gm0506;§83;Pantoea sp. At-9b 
1;;;;gm0507;§85;Pantoea sp. PSNIH1 
1;;;;gm0508;§87;Pantoea sp. PSNIH2 
1;;;;gm0509;§80;Pantoea vagans C9-1 
1;;;;gm0510;§56;Pasteurella multocida 36950 
;;;;gm0511;59;Pasteurella multocida ATCC 43137 
;;;;gm0512;61;Pasteurella multocida OH1905 
;;;;gm0513;59;Pasteurella multocida subsp. multocida OH4807 
;;;;gm0514;56;Pasteurella multocida subsp. multocida str. 3480 
;;;;gm0515;55;Pasteurella multocida subsp. multocida str. HB03 
;;;;gm0516;57;Pasteurella multocida subsp. multocida str. HN06 
;;;;gm0517;58;Pasteurella multocida subsp. multocida str. Pm70 
1;;;;gm0518;§79;Pectobacterium atrosepticum 21A 
;;;;gm0519;78;Pectobacterium atrosepticum JG10-08 
;;;;gm0520;78;Pectobacterium atrosepticum SCRI1043 
1;;;;gm0521;§79;Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1 
;;;;gm0522;78;Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PCC21 
;;;;gm0523;78;Pectobacterium carotovorum subsp. odoriferum BC S7 
1;;;;gm0524;§78;Pectobacterium sp. SCC3193 
1;;;;gm0525;§76;Pectobacterium wasabiae WPP163 
1;;11,9,9;1;gm0526;§137;Photobacterium gaetbulicola Gung47 
1;;;;gm0527;§97;Photorhabdus asymbiotica 
1;;;;gm0528;§62;Plautia stali symbiont 
1;;;;gm0529;§86;Pluralibacter gergoviae FB2 
1;;;;gm0530;§83;Proteus mirabilis BB2000 
;;;;gm0531;85;Proteus mirabilis HI4320 
1;;;;gm0532;§81;Providencia stuartii ATCC 33672 
;;;;gm0533;78;Providencia stuartii MRSN 2154 
1;;;;gm0534;§63;Pseudoalteromonas atlantica T6c 
1;;10,9,9;1;gm0535;§108;Pseudoalteromonas haloplanktis TAC125 
1;;;;gm0536;§97;Pseudoalteromonas sp. OCN003 
1;;;;gm0537;§63;Pseudoalteromonas sp. SM9913 
1;;444;1;gm0538;§66;Pseudomonas aeruginosa 19BR 
;;;;gm0539;66;Pseudomonas aeruginosa 213BR 
;;;;gm0540;67;Pseudomonas aeruginosa B136-33 
;;;;gm0541;64;Pseudomonas aeruginosa c7447m C7447m 
;;;;gm0542;65;Pseudomonas aeruginosa DK2 
;;;;gm0543;66;Pseudomonas aeruginosa F22031 
;;;;gm0544;67;Pseudomonas aeruginosa FRD1 
;;;;gm0545;69;Pseudomonas aeruginosa LES400 
;;;;gm0546;68;Pseudomonas aeruginosa LES431 
;;;;gm0547;69;Pseudomonas aeruginosa LESB58 
;;;;gm0548;65;Pseudomonas aeruginosa LESB65 
;;;;gm0549;65;Pseudomonas aeruginosa LESlike1 
;;;;gm0550;65;Pseudomonas aeruginosa LESlike4 
;;;;gm0551;65;Pseudomonas aeruginosa LESlike5 
;;;;gm0552;64;Pseudomonas aeruginosa LESlike7 
;;;;gm0553;66;Pseudomonas aeruginosa M18 
;;;;gm0554;68;Pseudomonas aeruginosa MTB-1 
;;;;gm0555;72;Pseudomonas aeruginosa NCGM 1900 
;;;;gm0556;73;Pseudomonas aeruginosa NCGM 1984 
;;;;gm0557;70;Pseudomonas aeruginosa NCGM2.S1 
;;;;gm0558;67;Pseudomonas aeruginosa PA1 
;;;;gm0559;67;Pseudomonas aeruginosa PA1R 
;;;;gm0560;67;Pseudomonas aeruginosa PA38182 
;;;;gm0561;67;Pseudomonas aeruginosa PA7 
;;;;gm0562;66;Pseudomonas aeruginosa PA96 
;;;;gm0563;65;Pseudomonas aeruginosa PACS2 
;;;;gm0564;64;Pseudomonas aeruginosa PAO1 
;;;;gm0565;64;Pseudomonas aeruginosa PAO1-VE13 
;;;;gm0566;64;Pseudomonas aeruginosa PAO1-VE2 
;;;;gm0567;64;Pseudomonas aeruginosa PAO1H2O 
;;;;gm0568;64;Pseudomonas aeruginosa PAO581 
;;;;gm0569;65;Pseudomonas aeruginosa PSE305 
;;;;gm0570;66;Pseudomonas aeruginosa RP73 
;;;;gm0571;66;Pseudomonas aeruginosa SCV20265 
;;;;gm0572;66;Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14 
;;;;gm0573;73;Pseudomonas aeruginosa VRFPA04 
;;;;gm0574;67;Pseudomonas aeruginosa YL84 
1;;;;gm0575;§72;Pseudomonas alkylphenolia KL28 
1;;;;gm0576;§62;Pseudomonas balearica DSM 6083 DSM6083 SP1402 
1;;;;gm0577;§66;Pseudomonas brassicacearum DF41 
;;;;gm0578;68;Pseudomonas brassicacearum subsp. brassicacearum NFM421 
1;;;;gm0579;§72;Pseudomonas chlororaphis PA23 
;;;;gm0580;81;Pseudomonas chlororaphis PCL1606 
;;;;gm0581;70;Pseudomonas chlororaphis subsp. aurantiaca JD37 
1;;;;gm0582;§67;Pseudomonas cichorii JBC1 
1;;;;gm0583;§76;Pseudomonas cremoricolorata ND07 
;;;;gm0584;64;Pseudomonas denitrificans ATCC 13867 
1;;;;gm0585;§78;Pseudomonas entomophila L48 
1;;;;gm0586;§69;Pseudomonas fluorescens A506 
;;;;gm0587;66;Pseudomonas fluorescens F113 
;;;;gm0588;69;Pseudomonas fluorescens LBUM223 
;;;;gm0589;71;Pseudomonas fluorescens PCL1751 
;;;;gm0590;74;Pseudomonas fluorescens Pf0-1 
;;;;gm0591;69;Pseudomonas fluorescens PICF7 
;;;;gm0592;67;Pseudomonas fluorescens SBW25 
;;;;gm0593;70;Pseudomonas fluorescens UK4 
1;;;;gm0594;§67;Pseudomonas fulva 12-X 
1;;;;gm0595;§62;Pseudomonas knackmussii B13 
1;;;;gm0596;§68;Pseudomonas mandelii JR-1 
1;;;;gm0597;§67;Pseudomonas mendocina NK-01 
;;;;gm0598;67;Pseudomonas mendocina ymp 
1;;;;gm0599;§69;Pseudomonas monteilii SB3078 
;;;;gm0600;67;Pseudomonas monteilii SB3101 
;;;;gm0601;81;Pseudomonas mosselii SJ10 
1;;;;gm0602;§77;Pseudomonas parafulva CRS01-1 
1;;;;gm0603;§73;Pseudomonas plecoglossicida NyZ12 
1;;;;gm0604;§65;Pseudomonas poae RE1-1-14 
1;;;;gm0605;§72;Pseudomonas protegens Cab57 
;;;;gm0606;73;Pseudomonas protegens CHA0 
;;;;gm0607;74;Pseudomonas protegens Pf-5 
1;;;;gm0608;§69;Pseudomonas pseudoalcaligenes 
;;;;gm0609;69;Pseudomonas pseudoalcaligenes CECT 5344 CECT5344 
1;;;;gm0610;§66;Pseudomonas putida BIRD-1 
;;;;gm0611;74;Pseudomonas putida DLL-E4 
;;;;gm0612;62;Pseudomonas putida DOT-T1E 
;;;;gm0613;76;Pseudomonas putida F1 
;;;;gm0614;76;Pseudomonas putida GB-1 
;;;;gm0615;70;Pseudomonas putida H8234 
;;;;gm0616;72;Pseudomonas putida HB3267 PC9 
;;;;gm0617;76;Pseudomonas putida KT2440 
;;;;gm0618;75;Pseudomonas putida NBRC 14164 
;;;;gm0619;76;Pseudomonas putida ND6 
;;;;gm0620;61;Pseudomonas putida S12 
;;;;gm0621;69;Pseudomonas putida S16 
;;;;gm0622;77;Pseudomonas putida W619 
1;;;;gm0623;§74;Pseudomonas resinovorans NBRC 106553 
1;;;;gm0624;§72;Pseudomonas rhizosphaerae DSM 16299 
1;;;;gm0625;§66;Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola 1448A BAA-978 
1;;;;gm0626;§65;Pseudomonas simiae WCS417 
1;;;;gm0627;§55;Pseudomonas sp. 20 BN 
1;;;;gm0628;§75;Pseudomonas sp. FGI182 
1;;;;gm0629;§77;Pseudomonas sp. MRSN12121 
1;;;;gm0630;§59;Pseudomonas sp. MT-1 
1;;;;gm0631;§72;Pseudomonas sp. StFLB209 
1;;;;gm0632;§68;Pseudomonas sp. TKP 
1;;;;gm0633;§72;Pseudomonas sp. UW4 
1;;;;gm0634;§83;Pseudomonas sp. VLB120 
1;;;;gm0635;§76;Pseudomonas sp. WCS374 
1;;;;gm0636;§63;Pseudomonas stutzeri 19SMN4 
;;;;gm0637;61;Pseudomonas stutzeri 28a24 
;;;;gm0638;62;Pseudomonas stutzeri A1501 
;;;;gm0639;61;Pseudomonas stutzeri ATCC 17588 LMG 11199 
;;;;gm0640;64;Pseudomonas stutzeri CCUG 29243 
;;;;gm0641;62;Pseudomonas stutzeri DSM 10701 
;;;;gm0642;62;Pseudomonas stutzeri DSM 4166 
;;;;gm0643;63;Pseudomonas stutzeri RCH2 
1;;;;gm0644;§63;Pseudomonas syringae CC1557 
;;;;gm0645;66;Pseudomonas syringae pv. syringae B728a 
;;;;gm0646;69;Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 
1;;;;gm0647;§50;Pseudoxanthomonas spadix BD-a59 
1;;;;gm0648;§52;Pseudoxanthomonas suwonensis 11-1 
;;;;gm0649;48;Pseudoxanthomonas suwonensis J1 
1;;;;gm0650;§50;Psychrobacter arcticus 273-4 
1;;;;gm0651;§49;Psychrobacter cryohalolentis K5 
1;;;;gm0652;§49;Psychrobacter sp. G 
1;;;;gm0653;§61;Psychrobacter sp. PRwf-1 
1;;;;gm0654;§86;Psychromonas ingrahamii 37 
1;;;;gm0655;§92;Psychromonas sp. CNPT3 
1;;;;gm0656;§77;Rahnella aquatilis CIP 78.65 ATCC 33071 
;;;;gm0657;77;Rahnella aquatilis HX2 
1;;;;gm0658;§77;Rahnella sp. Y9602 
1;;;;gm0659;§80;Raoultella ornithinolytica B6 
;;;;gm0660;86;Raoultella ornithinolytica S12 
1;;;;gm0661;§51;Rhodanobacter denitrificans 2APBS1 
1;;;;gm0662;§41;Saccharophagus degradans 2-40 
1;;;;gm0663;§88;Salmonella bongori N268-08 
;;;;gm0664;88;Salmonella bongori NCTC 12419 
;;;;gm0665;84;Salmonella bongori serovar 48 z41 -- str. RKS3044 
1;;877;1;gm0666;§83;Salmonella enterica subsp. arizonae serovar 62 z36 str. RKS2983 
;;;;gm0667;88;Salmonella enterica subsp. arizonae serovar 62 z4 z23 RSK2980 
;;;;gm0668;91;Salmonella enterica subsp. enterica serovar 4 5 12 i str. 08-1736 
;;;;gm0669;85;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Abaetetuba str. ATCC 35640 
;;;;gm0670;89;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Abony str. 0014 
;;;;gm0671;87;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. 24249 
;;;;gm0672;87;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. 460004 2-1 
;;;;gm0673;87;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 
;;;;gm0674;85;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Anatum str. ATCC BAA-1592 
;;;;gm0675;86;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Anatum str. CDC 06-0532 
;;;;gm0676;83;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Anatum str. USDA-ARS-USMARC-1175 
;;;;gm0677;86;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189 
;;;;gm0678;77;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 
;;;;gm0679;87;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bredeney str. CFSAN001080 
;;;;gm0680;86;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis C500 
;;;;gm0681;89;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67 
;;;;gm0682;88;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Cubana str. CFSAN002050 
;;;;gm0683;81;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin 
;;;;gm0684;87;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT 02021853 
;;;;gm0685;87;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis Durban 
;;;;gm0686;88;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis OLF-SE1-1019-1 
;;;;gm0687;86;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis OLF-SE10-10052 
;;;;gm0688;87;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis OLF-SE11-10058 
;;;;gm0689;85;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis OLF-SE2-98984-6 
;;;;gm0690;85;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis OLF-SE3-98983-4 
;;;;gm0691;86;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis OLF-SE4-0317-8 
;;;;gm0692;87;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis OLF-SE5-1104-2 
;;;;gm0693;87;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis OLF-SE6-00219-16 
;;;;gm0694;86;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis OLF-SE7-100819 
;;;;gm0695;84;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis OLF-SE8-1021710 
;;;;gm0696;83;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis OLF-SE9-10012 
;;;;gm0697;86;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis SEJ 
;;;;gm0698;90;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. 77-1427 
;;;;gm0699;89;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. CDC 2010K 0968 CDC 2010K-0968 
;;;;gm0700;89;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. EC20090135 
;;;;gm0701;87;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. EC20090193 
;;;;gm0702;80;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. EC20090195 
;;;;gm0703;88;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. EC20090332 
;;;;gm0704;83;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. EC20090530 
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;;;;gm0715;82;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. EC20100131 
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;;;;gm0724;86;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. EC20110356 
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;;;;gm0732;88;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. EC20111175 
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;;;;gm0849;71;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. SA20084824 
;;;;gm0850;48;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. SA20085285 
;;;;gm0851;47;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. SA20090419 
;;;;gm0852;81;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. SA20090435 
;;;;gm0853;80;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. SA20090877 
;;;;gm0854;81;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. SA20091739 
;;;;gm0855;102;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. SA20092320 
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;;;;gm0857;80;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. SA20093421 
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;;;;gm0865;80;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. SA20094079 
;;;;gm0866;74;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. SA20094177 
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;;;;gm0872;80;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. SA20094521 
;;;;gm0873;80;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. SA20094642 
;;;;gm0874;81;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. SA20094682 
;;;;gm0875;84;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. SA20094803 
;;;;gm0876;83;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. SA20095309 
;;;;gm0877;68;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. SA20095440 
;;;;gm0878;47;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. SA20100239 
;;;;gm0879;65;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. SA20100349 
;;;;gm0880;77;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. SA20121703 
;;;;gm0881;80;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. SA20123395 
;;;;gm0882;79;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 
;;;;gm0883;78;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67 
;;;;gm0884;75;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 
;;;;gm0885;89;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578 
;;;;gm0886;88;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. B182 
;;;;gm0887;88;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. CFSAN002064 
;;;;gm0888;88;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. CFSAN002069 
;;;;gm0889;89;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476 
;;;;gm0890;86;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis 1326/28 
;;;;gm0891;88;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992 
;;;;gm0892;88;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Montevideo str. 507440-20 
;;;;gm0893;86;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Montevideo str. USDA-ARS-USMARC-1903 
;;;;gm0894;86;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Montevideo str. USDA-ARS-USMARC-1921 
;;;;gm0895;87;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. CDC 2010K-2159 
;;;;gm0896;89;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. CVM 21538 
;;;;gm0897;90;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. CVM 21550 
;;;;gm0898;87;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. CVM 21554 
;;;;gm0899;91;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. CVM 22425 
;;;;gm0900;91;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. CVM 22462 
;;;;gm0901;89;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. CVM 22513 
;;;;gm0902;89;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. CVM N1543 
;;;;gm0903;86;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. CVM N18486 
;;;;gm0904;89;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 
;;;;gm0905;88;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USDA-ARS-USMARC-1927 
;;;;gm0906;92;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1 
;;;;gm0907;103;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A CMCC 50503 
;;;;gm0908;105;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A CMCC 50973 
;;;;gm0909;86;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU 12601 AKU12601 
;;;;gm0910;87;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150 
;;;;gm0911;87;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7 SGSC4150 
;;;;gm0912;87;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C str. RKS4594 
;;;;gm0913;72;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum 
;;;;gm0914;81;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004 
;;;;gm0915;87;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633 
;;;;gm0916;88;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Tennessee str. TXSC TXSC08-19 
;;;;gm0917;82;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836 
;;;;gm0918;83;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18 
;;;;gm0919;81;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12 
;;;;gm0920;81;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 
;;;;gm0921;81;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a 
;;;;gm0922;89;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium 138736 
;;;;gm0923;88;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium ATCC 13311 
;;;;gm0924;89;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S 
;;;;gm0925;87;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 
;;;;gm0926;87;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. CDC 2011K-0870 
;;;;gm0927;93;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. D23580 
;;;;gm0928;89;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT104 
;;;;gm0929;87;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2 
;;;;gm0930;90;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. L-3553 
;;;;gm0931;88;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 
;;;;gm0932;90;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344 
;;;;gm0933;90;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 
;;;;gm0934;88;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240 
;;;;gm0935;87;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288 
;;;;gm0936;89;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 
;;;;gm0937;90;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. USDA-ARS-USMARC-1899 
;;;;gm0938;89;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921 
;;;;gm0939;89;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium VNP20009 
1;;;;gm0940;§40;secondary endosymbiont of Ctenarytaina eucalypti 
1;;;;gm0941;§38;secondary endosymbiont of Heteropsylla cubana 
1;;877;1;gm0942;§87;Serratia liquefaciens ATCC 27592 
;;;;gm0943;88;Serratia liquefaciens HUMV-21 
1;;;;gm0944;§85;Serratia marcescens FGI94 
;;;;gm0945;90;Serratia marcescens SM39 
;;;;gm0946;90;Serratia marcescens subsp. marcescens Db11 
;;;;gm0947;84;Serratia marcescens WW4 
1;;;;gm0948;§82;Serratia multitudinisentens RB-25 
1;;;;gm0949;§83;Serratia plymuthica 4Rx13 
;;;;gm0950;88;Serratia plymuthica AS9 
;;;;gm0951;85;Serratia plymuthica RVH1 
;;;;gm0952;87;Serratia plymuthica S13 
;;;;gm0953;67;Serratia plymuthica V4 
1;;;;gm0954;§87;Serratia proteamaculans 568 
1;;;;gm0955;§88;Serratia sp. AS12 
1;;;;gm0956;§88;Serratia sp. AS13 
1;;;;gm0957;§93;Serratia sp. FS14 
1;;;;gm0958;§84;Serratia sp. SCBI 
1;;;;gm0959;§36;Serratia symbiotica str. Cinara cedri 
1;;;;gm0960;§102;Shewanella amazonensis SB2B 
1;;;;gm0961;§110;Shewanella baltica BA175 
;;;;gm0962;100;Shewanella baltica OS117 
;;;;gm0963;122;Shewanella baltica OS155 
;;;;gm0964;109;Shewanella baltica OS185 
;;;;gm0965;109;Shewanella baltica OS195 
;;;;gm0966;112;Shewanella baltica OS223 
;;;;gm0967;107;Shewanella baltica OS678 
1;;;;gm0968;§97;Shewanella denitrificans OS217 
1;;;;gm0969;§99;Shewanella frigidimarina NCIMB 400 
1;;;;gm0970;§128;Shewanella halifaxensis HAW-EB4 
1;;;;gm0971;§102;Shewanella loihica PV-4 
1;;;;gm0972;§106;Shewanella oneidensis MR-1 
1;;12,11,11;1;gm0973;§149;Shewanella pealeana ATCC 700345 
1;;;;gm0974;§94;Shewanella piezotolerans WP3 
1;;;;gm0975;§102;Shewanella putrefaciens 200 
;;;;gm0976;103;Shewanella putrefaciens CN-32 
1;;;;gm0977;§134;Shewanella sediminis HAW-EB3 
1;;;;gm0978;§108;Shewanella sp. ANA-3 
1;;;;gm0979;§105;Shewanella sp. MR-4 
1;;;;gm0980;§107;Shewanella sp. MR-7 
1;;;;gm0981;§101;Shewanella sp. W3-18-1 
1;;;;gm0982;§133;Shewanella violacea DSS12 
1;;;;gm0983;§134;Shewanella woodyi ATCC 51908 
1;;877;1;gm0984;§103;Shigella boydii CDC 3083-94 BS512 
;;;;gm0985;94;Shigella boydii Sb227 
1;;;;gm0986;§88;Shigella dysenteriae 1617 
;;;;gm0987;87;Shigella dysenteriae Sd197 
1;;;;gm0988;§99;Shigella flexneri 
;;;;gm0989;104;Shigella flexneri 2002017 
;;;;gm0990;99;Shigella flexneri 2003036 
;;;;gm0991;103;Shigella flexneri 2a str. 2457T 
;;;;gm0992;100;Shigella flexneri 2a str. 301 
;;;;gm0993;99;Shigella flexneri 5 str. 8401 
;;;;gm0994;100;Shigella flexneri Shi06HN006 
1;;;;gm0995;§98;Shigella sonnei 53G 
;;;;gm0996;98;Shigella sonnei Ss046 
1;;;;gm0997;§90;Shimwellia blattae DSM 4481 NBRC 105725 
1;;;;gm0998;§42;Simiduia agarivorans SA1 DSM 21679 
1;;;;gm0999;§76;Sodalis glossinidius str. morsitans 
1;;;;gm1000;§78;Sodalis praecaptivus HS1 
1;;;;gm1001;§46;Spiribacter salinus M19-40 
1;;;;gm1002;§46;Spiribacter sp. UAH-SP71 
1;;322;1;gm1003;§71;Stenotrophomonas maltophilia 13637 
;;;;gm1004;77;Stenotrophomonas maltophilia D457 
;;;;gm1005;75;Stenotrophomonas maltophilia JV3 
;;;;gm1006;76;Stenotrophomonas maltophilia K279a 
;;;;gm1007;74;Stenotrophomonas maltophilia R551-3 
1;;;;gm1008;§67;Stenotrophomonas rhizophila DSM14405 
1;;;;gm1009;§89;synthetic Escherichia coli C321.deltaA 
1;;;;gm1010;§47;Tatlockia micdadei ATCC33218 
1;;;;gm1011;§41;Teredinibacter turnerae T7901 
1;;;;gm1012;§51;Thalassolituus oleivorans MIL-1 
;;;;gm1013;49;Thalassolituus oleivorans R6-15 
1;;;;gm1014;§43;Thioalkalimicrobium aerophilum AL3 
1;;;;gm1015;§41;Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 
1;;;;gm1016;§46;Thioalkalivibrio nitratireducens DSM 14787 
1;;;;gm1017;§49;Thioalkalivibrio sp. K90mix 
1;;;;gm1018;§45;Thioalkalivibrio sulfidiphilus HL-EbGr7 HL-EbGR7 
1;;;;gm1019;§48;Thioalkalivibrio thiocyanoxidans ARh 4 
1;;;;gm1020;§53;Thiocystis violascens DSM 198 
1;;;;gm1021;§48;Thioflavicoccus mobilis 8321 
1;;;;gm1022;§40;Thiolapillus brandeum Hiromi 1 
1;;;;gm1023;§45;Thiomicrospira crunogena XCL-2 
1;;;;gm1024;§45;Thioploca ingrica 
1;;;;gm1025;§92;Tolumonas auensis DSM 9187 
1;;;;gm1026;§106;Vibrio alginolyticus NBRC 15630 ATCC 17749 
1;;;;gm1027;§87;Vibrio anguillarum 775 
;;;;gm1028;§94;Vibrio anguillarum NB10 
1;;;;gm1029;96;Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 
;;;;gm1030;121;Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 BB120 
1;;;;gm1031;§94;Vibrio cholerae 10432-62 
;;;;gm1032;104;Vibrio cholerae 1154-74 
;;;;gm1033;99;Vibrio cholerae 2012EL-2176 
;;;;gm1034;81;Vibrio cholerae H1 
;;;;gm1035;98;Vibrio cholerae IEC224 
;;;;gm1036;95;Vibrio cholerae LMA3984-4 
;;;;gm1037;97;Vibrio cholerae M66-2 
;;;;gm1038;98;Vibrio cholerae MJ-1236 
;;;;gm1039;90;Vibrio cholerae MS6 
;;;;gm1040;94;Vibrio cholerae O1 biovar El Tor FJ147 
;;;;gm1041;98;Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 
;;;;gm1042;79;Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 
;2*96;;;gm1043;192;Vibrio cholerae O395 
1;;;;gm1044;§87;Vibrio coralliilyticus OCN014 
;;;;gm1045;117;Vibrio coralliilyticus RE98 
1;;;;gm1046;§100;Vibrio furnissii NCTC 11218 
1;;;;gm1047;§104;Vibrio nigripulchritudo SFn1 
1;;12,11,11;1;gm1048;§126;Vibrio parahaemolyticus BB22OP 
1;;;;gm1049;§130;Vibrio parahaemolyticus O1 K33 str. CDC K4557 
;;;;gm1050;131;Vibrio parahaemolyticus O1 Kuk str. FDA R31 
;;;;gm1051;127;Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 O3 K6 substr. RIMD 2210633 
;;;;gm1052;122;Vibrio parahaemolyticus UCM-V493 
1;;;;gm1053;§121;Vibrio sp. EJY3 
1;;;;gm1054;§125;Vibrio sp. Ex25 EX25 
1;;;;gm1055;§114;Vibrio tasmaniensis LGP32 
1;;;;gm1056;§118;Vibrio tubiashii ATCC 19109 
1;;;;gm1057;§109;Vibrio vulnificus 93U204 
;;;;gm1058;113;Vibrio vulnificus CMCP6 
;;;;gm1059;114;Vibrio vulnificus MO6-24/O 
;;;;gm1060;113;Vibrio vulnificus YJ016 
1;;;;gm1061;§34;Wigglesworthia glossinidia endosymbiont of Glossina brevipalpis 
1;;;;gm1062;§53;Xanthomonas albilineans GPE PC73 
1;;;;gm1063;§55;Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 
;;;;gm1064;54;Xanthomonas axonopodis pv. citrumelo F1 
;;;;gm1065;55;Xanthomonas axonopodis Xac29-1 
1;;222;1;gm1066;§55;Xanthomonas campestris 17 
;;;;gm1067;55;Xanthomonas campestris pv. campestris B100 
;;;;gm1068;57;Xanthomonas campestris pv. campestris str. 8004 
;;;;gm1069;58;Xanthomonas campestris pv. campestris str. ATCC 33913 
;;;;gm1070;58;Xanthomonas campestris pv. raphani 756C 
;;;;gm1071;59;Xanthomonas campestris pv. vesicatoria str. 85-10 
1;;222;1;gm1072;§55;Xanthomonas citri subsp. citri 5208 
;;;;gm1073;55;Xanthomonas citri subsp. citri A306 
;;;;gm1074;57;Xanthomonas citri subsp. citri Aw12879 
;;;;gm1075;57;Xanthomonas citri subsp. citri AW13 
;;;;gm1076;57;Xanthomonas citri subsp. citri AW14 
;;;;gm1077;57;Xanthomonas citri subsp. citri AW15 
;;;;gm1078;57;Xanthomonas citri subsp. citri AW16 
;;;;gm1079;55;Xanthomonas citri subsp. citri BL18 
;;;;gm1080;55;Xanthomonas citri subsp. citri FB19 
;;;;gm1081;55;Xanthomonas citri subsp. citri gd2 
;;;;gm1082;55;Xanthomonas citri subsp. citri gd3 
;;;;gm1083;55;Xanthomonas citri subsp. citri jx4 
;;;;gm1084;55;Xanthomonas citri subsp. citri jx5 
;;;;gm1085;55;Xanthomonas citri subsp. citri mf20 
;;;;gm1086;55;Xanthomonas citri subsp. citri MN10 
;;;;gm1087;55;Xanthomonas citri subsp. citri MN11 
;;;;gm1088;55;Xanthomonas citri subsp. citri MN12 
;;;;gm1089;55;Xanthomonas citri subsp. citri NT17 
;;;;gm1090;55;Xanthomonas citri subsp. citri UI6 
;;;;gm1091;55;Xanthomonas citri subsp. citri UI7 
1;;;;gm1092;§55;Xanthomonas fuscans subsp. fuscans 4834-R 
1;;;;gm1093;§55;Xanthomonas oryzae pv. oryzae KACC 10331 KACC10331 
;;;;gm1094;54;Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAFF 311018 
;;;;gm1095;54;Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO86 
;;;;gm1096;55;Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A 
;;;;gm1097;54;Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BLS256 
;;;;gm1098;57;Xanthomonas oryzae pv. oryzicola CFBP7342 
1;;;;gm1099;§57;Xanthomonas sacchari R1 
1;;877;1;gm1100;§82;Xenorhabdus bovienii CS03 
;;;;gm1101;88;Xenorhabdus bovienii SS-2004 
1;;;;gm1102;§79;Xenorhabdus doucetiae FRM16 
1;;;;gm1103;§81;Xenorhabdus nematophila AN6/1 
;;;;gm1104;81;Xenorhabdus nematophila ATCC 19061 
1;;;;gm1105;§80;Xenorhabdus poinarii G6 
1;;222;1;gm1106;§53;Xylella fastidiosa 9a5c 
;;;;gm1107;52;Xylella fastidiosa M12 
;;;;gm1108;50;Xylella fastidiosa M23 
;;;;gm1109;50;Xylella fastidiosa MUL0034 
;;;;gm1110;49;Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 
;;;;gm1111;55;Xylella fastidiosa subsp. sandyi Ann-1 
;;;;gm1112;49;Xylella fastidiosa Temecula1 
1;;;;gm1113;§84;Yersinia aldovae 670-83 
1;;;;gm1114;§79;Yersinia enterocolitica 2516-87 
;;877;1;gm1115;85;Yersinia enterocolitica 8081 
;;;;gm1116;83;Yersinia enterocolitica subsp. enterocolitica 8081 
;;;;gm1117;73;Yersinia enterocolitica subsp. palearctica 105.5Rr 
;;;;gm1118;72;Yersinia enterocolitica subsp. palearctica Y11 
;;;;gm1119;79;Yersinia enterocolitica type O 5 str. YE53/03 
;;;;gm1120;86;Yersinia enterocolitica WA 
1;;;;gm1121;§86;Yersinia frederiksenii Y225 
1;;;;gm1122;§82;Yersinia intermedia Y228 
1;;;;gm1123;§85;Yersinia kristensenii ATCC 33639 
;;;;gm1124;85;Yersinia kristensenii Y231 
1;;;;gm1125;§140;Yersinia pestis A1122 
;;;;gm1126;141;Yersinia pestis Angola 
;;;;gm1127;142;Yersinia pestis Antiqua 
;;877;1;gm1128;73;Yersinia pestis biovar Medievalis str. Harbin 35 
;;;;gm1129;73;Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 
;;;;gm1130;71;Yersinia pestis CO92 
;;;;gm1131;71;Yersinia pestis D106004 
;;;;gm1132;74;Yersinia pestis D182038 
;;;;gm1133;72;Yersinia pestis Dodson 
;;;;gm1134;70;Yersinia pestis El Dorado 
;;;;gm1135;71;Yersinia pestis Harbin35 
;;;;gm1136;72;Yersinia pestis Java9 
;;;;gm1137;74;Yersinia pestis KIM10+ 
;;;;gm1138;75;Yersinia pestis KIM5 
;;;;gm1139;72;Yersinia pestis Nairobi 
;;;;gm1140;73;Yersinia pestis Nepal516 
;;;;gm1141;73;Yersinia pestis Nicholisk 41 
;;;;gm1142;72;Yersinia pestis PBM19 
;73+74;;;gm1143;147;Yersinia pestis Pestoides F 
;;;;gm1144;74;Yersinia pestis Pestoides G 
;;;;gm1145;71;Yersinia pestis Shasta 
;;;;gm1146;74;Yersinia pestis str. Pestoides B 
;;;;gm1147;69;Yersinia pestis Z176003 
1;;;;gm1148;§83;Yersinia pseudotuberculosis 1 
;;877;1;gm1149;82;Yersinia pseudotuberculosis ATCC 6904 
;;;;gm1150;84;Yersinia pseudotuberculosis EP2/+ 
;;;;gm1151;87;Yersinia pseudotuberculosis IP 31758 
;;;;gm1152;87;Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 
;;;;gm1153;87;Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 IP32953 
;;;;gm1154;86;Yersinia pseudotuberculosis MD67 
;;;;gm1155;170;Yersinia pseudotuberculosis PB1/+ 
;;;;gm1156;88;Yersinia pseudotuberculosis str. PA3606 Pa3606 
;2*85;;;gm1157;170;Yersinia pseudotuberculosis YPIII 
1;;;;gm1158;§82;Yersinia rohdei YRA 
1;;;;gm1159;§84;Yersinia ruckeri Big Creek 74 
;;;;gm1160;82;Yersinia ruckeri YRB 
1;;;;gm1161;§88;Yersinia similis 228

Alpha

alpha blocs

Lien tableur: alpha blocs
Légende:

alpha blocs;;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;alf001-34;;;;;;Notes
alf001;5*16atcgca235-atgf;;9;60;15;45;;;6-atcgca-35;6-gcaatc-35;6-atc-35;6-gca-35;16, 235;
alf010;2*16atcgca235-atgf;;;48;6;42;;sans;16;;;;;incomplets
alf011;2*16atcgca235-atgf;;;48;6;42;;atgf;30;;;;;2*16s23s
;;;4;;;;;autres 1-3;1;;;;;16atcgca23
alf012;3*16atcgca-cds-23-cds-5-atgf ;;;55;12;43;;cds;;;;;3;
;16atcgca-cds-cds-23-cds-5-atgf;;;;;;;cds, atgf;13;;;;;Autres 1-3
;;;;;;;63;total;60;0;;;3;16atcgca235-cgg
alf013;3*16atcgca235-atgf;;;56;9;47;;;;;;;;différents
;;;3;;;;;;;;;;;3*16atcgca-cds-23-cds-5-atgf 
alf014  agr;5*16atcgca-cds-23-5-atgf;;;58;15;43;;;;;;;;16atcgca-cds-cds-23-cds-5-atgf
;;;5;;;;;;;;;;;
alf015;4*16atcgca-cds-23-5-atgf;;;57;15;42;;;;;;;;
;16atcgca23-5-atgf;;5;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
alf017;4*16atcgca235-atgf;;;56;12;44;;;;;;;;
;;;4;;;;;;;;;;;
alf020;16s-cds, 23s-5s;;;37;0;37;;;;;;;;
alf021;16s-cds, 23s-5s;;3;35;0;35;;;;;;;;
alf025;16s-cds-cds, 23s-5s ;;;37;0;37;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
alf029;2*16atcgca235-atgf;;;51;9;42;;;;;;;;
;16atcgca235-cgg;;3;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
alf030;3*16atcgca235;;;54;6;48;;;;;;;;
;;;3;;;;;;;;;;;
alf031 abq;5*16atcgca235;;;88;21;67;;;;;;;;
;3*16atcgca235-atgf;;9;;;;;;;;;;;
;16atcgca23;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
alf033;4*16atcgca235-atgf;;;83;20;63;;;;;;;;
;4*16atcgca235;;9;;;;;;;;;;;
;16s23s;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
alf034;4*16atcgca235-atgf;;9;84;20;64;;;;;;;;
;4*16atcgca235;;;;;;;;;;;;;
;16s23s;;66;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;alf035-159;;;;;;Notes
alf035;2*16atcgca235-atgf;;10;43;6;37;;;6-atcgca-35;6-gcaatc-35;6-atc-35;6-gca-35;16, 235;
alf036;2*16atcgca235-atgf;;;45;6;39;;sans;13;;;;2;
alf037;2*16atcgca235-atgf;;;42;6;36;;atgf;19;8;;;;
alf038;2*16atcgca-cds-235-atgf;;;43;6;37;;autres 1-3;;;;;;
alf039;2*16atcgca235-atgf;;;43;6;37;;cds;;1;;;;
;;;;;;;;cds, atgf;14;;;;;
alf043;2*16atcgca-cds-235-atgf;;4;43;6;37;57;total;46;9;;;2;
alf044;2*16atcgca-cds-235-atgf;;;43;6;37;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
alf046;2*16atcgca-cds-235-atgf;;8;43;6;37;;;;;;;;
alf047;3*16atcgca235-atgf;;;54;9;45;;;;;;;;
alf048;16atcgca235;;;60;2;58;;;;;;;;
alf049;2*16atcgca235;;;64;4;60;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
alf052;2*16atcgca235;;12;57;4;53;;;;;;;;
alf053;2*16atcgca235;;;56;4;52;;;;;;;;
alf054;2*16atcgca235;;;52;4;48;;;;;;;;
alf055;16atcgca235;;;50;2;48;;;;;;;;
alf056;2*16atcgca235-atgf;;;49;6;43;;;;;;;;
alf057;3*16atcgca-cds-235-atgf;;;55;9;46;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
alf071;3*16atcgca-cds-235-atgf;;11;55;9;46;;;;;;;;
alf105;16-gca-atc-235-atgf;;;42;3;39;;;;;;;;
alf111;3*16-gca-atc-235-atgf;;;46;9;37;;;;;;;;
alf117;2*16atcgca235;;;43;4;39;;;;;;;;
alf123;2*16atcgca235-atgf;;;52;6;46;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
alf130;16s, 23s5s;;2;36;0;36;;;;;;;;
alf131;16s, 23s5s;;;37;0;37;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
alf146;4*16atcgca235-atgf;;5;60;12;48;;;;;;;;
alf159;16atcgca235;;;53;2;51;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
alf162;4*16-gca-atc-235-atgf;;5;58;14;44;;;;;;;;
;16-gca-atc-cds-235;;57;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;alf166-317;;;;;;Notes
alf166;5*16-gca-atc-235-atgf;;7;66;15;51;;;6-atcgca-35;6-gcaatc-35;6-atc-35;6-gca-35;16, 235;différents
alf174;2*16atcgca235-atgf;;;55;6;49;;sans;10;;;2;2;16atcgca23-cds-5-atgf
;;;;;;;;atgf;35;9;;;;
alf187;4*16atcgca235-atgf;;6;72;14;58;;autres 1-3;;;;;;
;2*16-gca-235;;;;;;;cds;;;;;;
;;;;;;;;cds, atgf;4;;;;;
alf198;16atcgca235;;16;58;2;56;62;total;49;9;;2;2;
alf202;3*16atcgca235-atgf;;;59;9;50;;;;;;;;
alf203 oan;4*16atcgca-cds-235-atgf;;;61;12;49;;;;;;;;
alf212;4*16atcgca235-atgf;;;62;12;50;;;;;;;;
alf218;4*16-gca-atc-235-atgf;;;61;12;49;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
alf223;4*16atcgca235;;6;70;14;56;;;;;;;;
;2*16atcgca235-atgf;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
alf224;3*16atcgca235-atgf;;3;54;9;45;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
alf298 rtb;16s,235s;;2;33;0;33;;;;;;;;
alf301;16s,235s;;;39;0;39;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
alf303;16atcgca235;;5;38;2;36;;;;;;;;
alf304;16atcgca235;;;38;2;36;;;;;;;;
alf305;2*16atcgca235-atgf;;;54;8;46;;;;;;;;
;16atcgca235;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
alf306;5*16atcgca235-atgf;;5;64;15;49;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
alf307;2*16atcgca235-atgf;;3;56;9;47;;;;;;;;
;16atcgca23-cds-5-atgf;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
alf308;3*16atcgca235-atgf;;6;56;9;47;;;;;;;;
alf309;3*16atcgca235-atgf;;;56;9;47;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
alf317;2*16atcgca235;;3;62;7;55;;;;;;;;
;16atcgca235-atgf;;62;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;alf321-343;;;;;;Notes
alf321;2*16atcgca235;;3;63;7;56;;;6-atcgca-35;6-gcaatc-35;6-atc-35;6-gca-35;16, 235;
;16atcgca235-atgf;;;;;;;sans;5;;;0;1;
;;;;;;;;atgf;8;;4;;;
alf326;16atcgca235-atgf;;1;47;3;44;;autres 1-3;;;;;;
;;;;;;;;cds;;;;;;
alf329;3*16atcgca235-atgf;;4;61;11;50;;cds, atgf;;;;;;
;16atcgca235;;;;;;18;total;13;0;4;0;1;
;;;;;;;;;;;;;;
alf330;4*16-atc-235-atgf;;7;58;8;50;;;;;;;;
alf331;16s,235s;;;34;0;34;;;;;;;;
alf341;2*16atcgca235;;;55;4;51;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
alf343;3*16atcgca235-atgf;;3;52;9;43;;;;;;;;
;;;18;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;total;;;;;;Notes
70;;;;;;;;;6-atcgca-35;6-gcaatc-35;6-atc-35;6-gca-35;16, 235;incomplets
;;;;;;;;sans;44;0;0;2;5;2*16s23s
;Total;;;3715;525;3190;;atgf;92;17;4;0;0;16atcgca23
;Moyenne;;;53;8;46;;autres 1-3;1;0;0;0;0;Autres 1-3
;ecartype;;;11;5;8;;cds;0;1;0;0;3;16atcgca235-cgg
;max;;;88;21;67;;cds, atgf;31;0;0;0;0;différents
;min;;;33;0;33;200;total;168;18;4;2;8;3*16atcgca-cds-23-cds-5-atgf
;;;;;;;;;;;;;;16atcgca-cds-cds-23-cds-5-atgf
;;;;;;;;;;;;;;16atcgca-23-cds-5-atgf

alpha notes

Lien tableur: alpha notes
Légende:

alpha typage

alpha type 16-y-235 après 16s

Lien tableur: alpha type 16-y-235 après 16s
Légende:

'''16s-y-23s5s;tableau;incomplets;16s, 235;total;%
'''16s23s5s;0;2;8;10;4,9
'''atcgca;137;1;;138;67
'''gcaatc;17;;;17;8
'''gca;4;;;4;2,0
'''atc;2;;;2;1,0
'''atcgca-cds°;31;;;31;16
'''gcaatc-cds;1;;;1;0,5
total;192;3;8;203;100
atcgca-cds° : dont un 16atcgca-cds-cds-23-cds-5-atgf ;;;;;

alpha type 16235-z après 5s

Lien tableur: alpha type 16235-z après 5s
Légende:

16s23s5s-z;sans;atgf;cgg;23-cds-5s-atgf;total
tableau;47;139;1;5;192
;;;;;
%;24,5;72,4;0,5;2,6;100

alpha type x-16235 avant 16s

Lien tableur: alpha type x-16235 avant 16s
Légende:

alpha gamma typage

Lien tableur: alpha gamma typage
Légende:

16-y-235-z;16s23s5s;atcgca;gcaatc;gaa;autres;total;%
après 16s;;;;;;;
gamma;;;;;;;
sans z;58;238;14;160;37;507;72
avec z;17;85;0;78;17;197;28
total;75;323;14;238;54;704;
%;11;46;2;34;8;;
;;;;;;;
alpha;;;;;;;
sans z;0;44;1;0;10;55;27.5
avec z;0;124;17;0;4;145;72.5
total;0;168;18;0;14;200;
%;0;84;9;0;7;;
après 5s;;;;;;;
16-235-z,z’;gac-tgg;gac;acc-5s;atgf;autres;total;
gamma;66;80;46;0;26;218;
%;30;37;21;0;12;;
;;;;;;;
alpha;0;0;0;144;1;145;
%;0;0;0;99;1;;

alpha typage cds

Lien tableur: alpha typage cds
Légende:

Les cds intra bloc des alphas;;;;;;;;;;
date NCBI;génome;sens;adresse;;cds;après;aas;égale en aas;séquence aas;
03/08/16;alf12;comp;59238..59627;;c11;gca cp;129;c11=c22;MDQSLFAAPHGFSQRITSFFACACQGIHQMPLIHFFVLIVYAHHLLDLAEPFLLAYAQRGAKSGNPGKTQSAAKAIPSLTIKRGTTVTVTFYNRNTNDDIDVFDTILFEGTPVHFEVVSLRPASRDIIR;*
;;;62235..62492;;c12;23s;85;c12=c23;MFPIRAVEDDHVDRTGVEAQQCVKLTVTNSSIDFFVPIDYVHRTKVDDICSVFTLTWPSATTLQTARQTIGDGLASCMAAKLDLE;*
;;;2516197..2516583;;c21;gca cp;128;;MPRTSDPSYLQPLHQFRPTKPSHGFSGIGLGRFGPKPKTPGRFQTYLLFTMYSEQASILANDANVFSSKGYSSTHAPKALREGAKLLATRYRAVLLADQITHAGSASRRPSLAGPCEAQRQSRDSVST;*
;;;2515743..2516132;;c22;cds  cp;129;;MDQSLFAAPHGFSQRITSFFACACQGIHQMPLIHFFVLIVYAHHLLDLAEPFLLAYAQRGAKSGNPGKTQSAAKAIPSLTIKRGTTVTVTFYNRNTNDDIDVFDTILFEGTPVHFEVVSLRPASRDIIR;*
;;comp;2512878..2513135;;c23;23s;85;;MFPIRAVEDDHVDRTGVEAQQCVKLTVTNSSIDFFVPIDYVHRTKVDDICSVFTLTWPSATTLQTARQTIGDGLASCMAAKLDLE;*
;;comp;1044310..1044699;;l11;gca cp;129;c11=l11;MDQSLFAAPHGFSQRITSFFACACQGIHQMPLIHFFVLIVYAHHLLDLAEPFLLAYAQRGAKSGNPGKTQSAAKAIPSLTIKRGTTVTVTFYNRNTNDDIDVFDTILFEGTPVHFEVVSLRPASRDIIR;*
;;;1047307..1047564;;l12;23s;85;c12=l12;MFPIRAVEDDHVDRTGVEAQQCVKLTVTNSSIDFFVPIDYVHRTKVDDICSVFTLTWPSATTLQTARQTIGDGLASCMAAKLDLE;*
;;comp;1306725..1307114;;l21;gca cp;129;;MDQSLFAAPHGFSQRITSFFACACQGIHQMPLIHFFVLIVYAHHLLDLAEPFLLAYAQRGAKSGHPGKTQSAAKAIPSLTIKRGTTVTVTFYNRNTNDDIDVFDTILFEGTPVHFEVVSLRPASRDIIR;*
;;;1309700..1309999;;l22;23s;99;;MFPIRAVEDDHVDRTGVEAQQCVKLTVTNSSIDFFVPIDYVHRTKVDDICSVFTLTWPSATTLQTARQTIGDGLASCMVAMLDLEQRNIRNKSQKDVLN;*
;;;;;;;;;;*
26/08/19;alf14 agr;comp;<59429..59626;;c11;gca cp;66;;P-hp;*
;;;2496166..>2496363;;c21;gca cp;67;;P-hp;*
;;comp;<1429429..1429626;;l11;gca cp;68;;P-hp;*
;;comp;<1690307..1690504;;l21;gca cp;69;;P-hp;*
;;comp;<2105696..2105893;;l31;gca cp;70;;P-hp;*
;;;;;;;;;;*
07/01/20;alf15;comp;<59347..59592;;c11;gca cp;82;;P-hp;*
;;;2508109..2508427;;c21;gca cp;106;;P-hp;*
;;comp;<1122642..1122887;;l11;gca cp;82;;P-hp;*
*01/09/2019;avant;?;2044048..2044367;;l21;gca;-;;P-hp;*
;;;;;;;;;;*
25/08/19;alf020;comp;1001462..1001845;;c11;16s;127;sdhC;MVLRSRPLSPHLQIYRLPVAAWLSITHRASGLLLFFGLLVLSWLFVLLRCAPDCVMPFLANPWGFFLVKLLSFSCCVAFCYHYFNGVRHLLWDCGVGLDKTVVTASNTFVLLLTAAFSVVTFFFVWL;*
;;comp;1001115..1001450;;c12;cds;111;sdhD;MGGRSVYFWWMQRIAGLVMLPVPFLFVFFYRSYGFESVYAADYGFCASISGIALLVAAFYHGVLGVQVVLEDYVQSEVARAFMVTFFRLFSAVTIGAVVLALFFGHGVGGS;*
;;;;;;;;;;
27/08/19;alf021;;249441..249824;;c11;16s;127;sdhC;MVLRSRPLSPHLQVYKLPVAALLSITHRASGLFLFFGLSVLSWLFVLLRCAPDCIAPFLANPLGFFLVKLLSFSCCVAFCYHYFNGVRHLLWDCGVGLDKTAVTASSAFVLLLTAAFSVVAFFFVWL;*
;;;249836..250165;;c12;cds;109;sdhD;MGGRSVYFWWMQRIAGLVMLPVPFLFAFFYRSYGFESVHAADYGFCASVSAIALLVAAFYHGVLGVQVVLEDYVHSEVLRAFMITFFRLFALVTVCAVTLAMLFGHNIR;*
;;;;;;;;;;*
29/11/19;alf025;comp;1055653..1056036;;c11;16s;127;sdhC;MSRSRPLSPHLSVYKLPITAWLSITHRITGVLLLMGLTLFTWLLISLHWTSGQLWGLLDSWIGVLLVKVIIGGCIAALCYHYYNGIRHLFWDCGIGFGKSEATFSGWLMLGFAVTSLIGLGFIGFFS;*
;;comp;1055320..1055649;;c12;cds;109;sdhD;MSGKSILHWWMQRMTAVVMLPVPIFLVKALLVSDFATGLLDLTHGYKGALTALFLMPAFYHGVLGVQVVLEDYVRSDALRAFLITFIKLFAVLTVCVFSLVVLLRTLGM;*
;;;;;;;;;;*
25/08/19;alf038;;1751403..1751597;;c11;gca cp;64;c11=c21;MIVLIANIHSLFVRILCLVQNKAQNKHKYQQKRPASRDIFNGAVKLPIISKGFEHSPATQCLFF;*
;;;1896294..1896488;;c21;gca cp;64;;MIVLIANIHSLFVRILCLVQNKAQNKHKYQQKRPASRDIFNGAVKLPIISKGFEHSPATQCLFF;*
;;;;;;;;;;*
*01/09/2019;alf043;;-;;c11;gca;72;c11=c21;MIVLIANIHSMFVGILCLVQNKAQNKQKYQQKRPASRDIFSGAVKLPIIGKGFENSLATQVPFSVLFLFSVF;*
05/01/20;néant;;-;;c21;gca;72;;MIVLIANIHSMFVGILCLVQNKAQNKQKYQQKRPASRDIFSGAVKLPIIGKGFENSLATQVPFSVLFLFSVF;*
;;;;;;;;;;*
08/08/19;alf044;comp;1854849..1855037;;c11;gca;62;c11=c21;MMCRKGMLKALAYDWKLNRAIEYISRSWSFLLIFVFVLRFVLHKTKNADKQSSYYYSMMLIQ;*
;;comp;2061198..2061386;;c21;gca;62;;MMCRKGMLKALAYDWKLNRAIEYISRSWSFLLIFVFVLRFVLHKTKNADKQSSYYYSMMLIQ;*
;;;;;;;;;;*
26/08/19;alf046;;1353691..1353915;;c11;gca cp;74;c11=c21;MIVLIANIHSAFVSFFALCKTKRAKQTKYQQKRPASRDIFNGAVKLPIISKGFEHSLATQCFLVSFLDFFERPF;*
;;;1496257..1496481;;c21;gca cp;74;;MIVLIANIHSAFVSFFALCKTKRAKQTKYQQKRPASRDIFNGAVKLPIISKGFEHSLATQCFLVSFLDFFERPF;*
;;;;;;;;;;*
24/12/19;alf057;;1602851..1603093;;c11;gca cp;80;c11=c21;MRRRMLPFDCKCSFQQYQQKDQLLEIQSVMAVKHINHYARLEQASCDINSSVDPITSSLHDFIQNRQTFVKVRKLVSFFC;*
;;;1806931..1807173;;c21;gca cp;80;c11=c31;MRRRMLPFDCKCSFQQYQQKDQLLEIQSVMAVKHINHYARLEQASCDINSSVDPITSSLHDFIQNRQTFVKVRKLVSFFC;*
;;;1057289..1057531;;c31;gca cp;80;;MRRRMLPFDCKCSFQQYQQKDQLLEIQSVMAVKHINHYARLEQASCDINSSVDPITSSLHDFIQNRQTFVKVRKLVSFFC;*
;;;;;;;;alf057=alf071;;*
30/03/17;alf071;;1586714..1586956;;c11;gca cp;80;c11=c21;MRRRMLPFDCKCSFQQYQQKDQLLEIQSVMAVKHINHYARLEQASCDINSSVDPITSSLHDFIQNRQTFVKVRKLVSFFC;*
;;;1791119..1791361;;c21;gca cp;80;c11=c31;MRRRMLPFDCKCSFQQYQQKDQLLEIQSVMAVKHINHYARLEQASCDINSSVDPITSSLHDFIQNRQTFVKVRKLVSFFC;*
;;;1106853..1107095;;c31;gca cp;80;;MRRRMLPFDCKCSFQQYQQKDQLLEIQSVMAVKHINHYARLEQASCDINSSVDPITSSLHDFIQNRQTFVKVRKLVSFFC;*
;;;;;;;;;;*
18/12/14;alf162;;1548251..1548361;;c11;atc cp;36;;MDQSLFSAPHGLSQSITSFIASYCQGIHQTPFSRLI;*
;;;;;;;;;;*
*27/12/2019;alf203  oan;comp;1085980..>1086168;;c11;gca cp;63;;P-hp;*
05/01/20;néant;comp;1348203..>1348391;;c21;gca cp;63;;P-hp;*
;;comp;458785..>458973;;c31;gca cp;63;;P-hp;*
;;;<1601419..1601607;;c41;gca cp;63;;P-hp;*
;;;;;;;;;;*
27/07/17;alf307;comp;3626306..3626473;;c11;23s cp;55;;MNTSCVLSGQLQQPAEPSRQSSGAPSAAPLAREDRRMMLIYDEHKQWERSSRSND;*
;;;;;;;;;;*
28/08/19;aua;;4501..4851;;c11;gca cp;76;;MIVLIAHVHQTSSEDEGERDEQDGFFSSLSALNTGPRATGVGVLRRRSASSRALDGRELAKDQLPETDPDNGGQAR;*

alpha typage absence de cds

Lien tableur: alpha typage absence de cds
Légende:
alf036,les intercalaires du 28/11/19.

;après 5s-atgf-cds;;;;;;
28/11/19;alf036;NCBI;;;;;
comp;<250713..250865;;cds;1022;51;transcriptional repressor;
;251888..253381;;16s;315;1494;;
;253697..253773;;atc;122;;;
;253896..253971;;gca;305;;;
;254277..257097;;23s;96;2821;;
;257194..257308;;5s;128;115;;
;257437..257513;;atgf;1208;;;
;258722..259111;;cds;;130;MGSFVNLIIYGGIYLMKRIVLVAALCSALSSVIVPVTANALPVGGGWGTVRDKVVGALVTEGNLGEGGRAILEKIVVPSRKNLFEYKDKAFEIQERYRSIISALGLRVSCGLLNPDRYSGQRWMSCEFK;hp   129
;;;;;;;
comp;1106662..1107051;;cds;1227;130;MGSFVNLIIYGEIYLMKRIVLVAALCSALSSVIVPVTANALPVGGGWGTVRDKVVGALVTEGNLGEGGRAILEKIVVPSRKNLFEYKDKAFEIQERYRSIISALGLRVSCGLLNPDRYSGQRWMSCEFK;hp   129
comp;1108279..1108355;;atgf;128;;;
comp;1108484..1108598;;5s;96;115;;
comp;1108695..1111515;;23s;305;2821;;
comp;1111821..1111896;;gca;122;;;
comp;1112019..1112095;;atc;315;;;
comp;1112411..1113904;;16s;1022;1494;;
;1114927..1115313;;cds;;129;transcriptional repressor;

alpha typage cds et intercalaires

Lien fiche: alpha typage cds et intercalaires

génome;16s-aa1;aa2-23s;16s-23s;n blocs;type;lien;notes
;;;;;;;
alpha typage, cds et intercalaires;;;;;;;
alf036;315;305;-;2;atc-gca;Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Fiche/Proteobacteria#alpha_typage_absence_de_cds;*
alf254 rru;184;362;-;4;atc-gca;Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rru_blocs;*
alf031 abq;94-110;254-266;-;8;atc-gca;Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#abq_blocs;*
“;-;-;262;1;16s-23s;;
alf032 abs;107-110;269-272;-;4;atc-gca;Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#abs_blocs_tableau;*
alf253 rpm;112;212-216;-;6;atc;Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#rpm_blocs_construits;*
“;182;196;-;1;gca;;*
alf203 oan;268;266;-;4;atc-gca cds;Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#oan_blocs;0 cds
alf014 agr;337;585;-;5;atc-gca cds;Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#agr_blocs;0 cds
aua;236;478;-;1;atc-gca cds;Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/alpha#aua_remarques;ok
;;;;;;;*
gamma typage, cds et intercalaires;;;;;;;*
spl;-;-;338-374;8;atc-gca;Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#spl_blocs;*
“;71;329-364;-;3;atc-gca;;*
vpb;80;257;-;1;gaa, gta;Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#vpb_blocs;*
“;80;253-312;-;3;gaa, gta cds;;0 cds
“;80;258;-;1;gaa;;*
“;88;258;-;1;gcc-gaa;;*
“;56;257;-;2;atc-gca;;*
“;-;-;261;3;16s-23s;;*
eal;85;198;-;4;gaa;Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#eal_blocs;*
“;68-70;186;-;3;atc-gca;;*
eco;68;174-183;-;3;atc-gca;Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#eco_blocs;*
“;85;193;-;2;gaa;;*
“;171;184-193;-;2;gaa;;*
vha;97;265-290;-;4;atc-gca cds;Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#vha_blocs;0/3 cds
“;56;290;-;1;atc-gca;;*
“;82;310;-;1;gaa, gta;;*
“;114-122;253-310;-;3;gaa, gta cds;;*
“;129;257;-;1;gcc-gaa cds;;*
amed;66;231;-;3;atc-gca;Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/gamma#amed_blocs;*
“;192-268;229-245;-;6;gaa;;*
;;;;;;;*
bacilli typage, cds et intercalaires;;;;;;;*
bsu;-;-;164-167;13;16s-23s;Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#bsu_blocs;*
“;99;81;-;2;atc-gca;;*
lmo;-;-;244;6;16s-23s;Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#lmo_blocs;*
“;127;172;-;2;atc-gca;;*
lam;-;-;192;2;16s-23s cds;Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#lam_blocs;0 cds
“;125;115;-;2;atc-gca;;*
ppm;-;-;207-221;6;16s-23s;Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#ppm_cumuls;*
“;-;-;280-400;4;16s-23s;;*
“;93-108;128;-;2;5s-atc-gca;;*
“;89;185;-;1;gca;;*
pmq;-;-;248-269;14;16s-23s;Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#pmq_blocs;*
lbu;-;-;208;4;16s-23s;Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#lbu_blocs;*
“;105;126;-;5;atc-gca;;*
ban;-;-;141;7;16s-23s;Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/bacilli#ban_blocs;*
“;-;-;153-173;2;16s-23s;;*
“;130;77;-;2;atc-gca;;*
;;;;;;;
clostridia typage, cds et intercalaires;;;;;;;*
psor;-;-;196;9;16s-23s;Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#psor_blocs;*
“;-;-;137;1;16s-23s;;*
“;54;114;-;4;gca;;*
“;109-123;95-152;-;3;gca;;*
cdc;-;-;279-320;5;16s-23s;Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cdc_blocs;*
“;-;-;184-217;2;16s-23s;;*
“;52-68;249-373;-;3;gca;;*
cdc8;-;-;261-321;5;16s-23s;Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cdc8_blocs;*
“;-;-;184-217;2;16s-23s;;*
cbc;-;-;228;4;16s-23s;Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbc_blocs;*
cbn;-;-;233;8;16s-23s;Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbn_blocs;*
“;74-121;96;-;2;gca-atc;;*
cle;196*;262-282;-;4;5s-gca*;Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cle_blocs;*
“;262*;258;-;1;5s-atc*;;*
“;196*;261;-;2;5s-atc-gca*;;*
hmo;508*;233;-;3;5s-gcc*;Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#hmo_blocs;*
“;433*;233;-;2;5s-gcc*;;*
“;432*;141-194;-;2;5s-atc*;;*
“;433*;229;-;1;5s-atc-gca*;;*
“;508*;236;-;1;5s-atc-gca*;;*
“;-;-;569;1;5s-16s-23s;;*
cbei;-;-;339;7;16s-23s;Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/clostridia#cbei_blocs;*
“;-;-;502-578;3;16s-23s;;*
“;-;-;214;3;16s-23s;;*
“;140;111;-;1;gca-atc;;*
“;132;84;-;1;atc;;*
“;137;118;-;1;gca;;*

Tableau des noms alpha

Lien tableur: Tableau des noms alpha
Légende:

;;;;;348;alphaprote-;17165
;;;;;;;
ruptures;notes;rRNAs;fait;code;tRNAs;génomes;
1;;555;1;alf001;60;Acetobacter pasteurianus 386B ;
;;;;alf002;60;Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01 IFO 3283 substr. IFO 3283-01 ;
;;;;alf003;57;Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01-42C IFO 3283 substr. IFO 3283-01-42C ;
;;;;alf004;60;Acetobacter pasteurianus IFO 3283-03 IFO 3283 substr. IFO 3283-03 ;
;;;;alf005;60;Acetobacter pasteurianus IFO 3283-07 IFO 3283 substr. IFO 3283-07 ;
;;;;alf006;60;Acetobacter pasteurianus IFO 3283-12 IFO 3283 substr. IFO 3283-12 ;
;;;;alf007;60;Acetobacter pasteurianus IFO 3283-22 IFO 3283 substr. IFO 3283-22 ;
;;;;alf008;60;Acetobacter pasteurianus IFO 3283-26 IFO 3283 substr. IFO 3283-26 ;
;;;;alf009;60;Acetobacter pasteurianus IFO 3283-32 IFO 3283 substr. IFO 3283-32 ;
1;;222;1;alf010;48;Acidiphilium cryptum JF-5 ;
1;;222;1;alf011;48;Acidiphilium multivorum AIU301 ;
1;;444;1;alf012;55;Agrobacterium fabrum str. C58 ;
1;;333;1;alf013;56;Agrobacterium radiobacter K84 ;
1;agr;555;1;alf014;58;Agrobacterium sp. H13-3 ;
1;;555;1;alf015;57;Agrobacterium tumefaciens Ach5 ;
;;;;alf016;57;Agrobacterium tumefaciens LBA4213 Ach5 ;
1;;444;1;alf017;56;Agrobacterium vitis S4 ;
1;;-;;alf018;32;alpha proteobacterium HIMB5 ;
1;;-;;alf019;35;alpha proteobacterium HIMB59 ;
1;;111;1;alf020;37;Anaplasma centrale str. Israel ;
1;;111;1;alf021;35;Anaplasma marginale str. Dawn ;
;;;;alf022;37;Anaplasma marginale str. Florida ;
;;;;alf023;37;Anaplasma marginale str. Gypsy Plains ;
;;;;alf024;37;Anaplasma marginale str. St. Maries ;
1;;111;1;alf025;37;Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 ;
;;;;alf026;37;Anaplasma phagocytophilum str. HZ ;
;;;;alf027;37;Anaplasma phagocytophilum str. HZ2 ;
;;;;alf028;37;Anaplasma phagocytophilum str. JM ;
1;;333;1;alf029;51;Asticcacaulis excentricus CB 48 ;
1;;333;1;alf030;54;Azorhizobium caulinodans ORS 571 ;
1;abq;899;1;alf031;88;Azospirillum brasilense Az39 ;
;abs;;;alf032;85;Azospirillum brasilense Sp245 ;
1;;899;1;alf033;83;Azospirillum lipoferum 4B ;
1;;899;1;alf034;84;Azospirillum sp. B510 ;
1;;222;1;alf035;43;Bartonella australis Aust/NH1 ;
1;;222;1;alf036;45;Bartonella bacilliformis KC583 ATCC 35685 ;
1;;222;1;alf037;42;Bartonella clarridgeiae 73 ;
1;;222;1;alf038;43;Bartonella grahamii as4aup ;
1;;222;1;alf039;43;Bartonella henselae BM1374163 ;
;;;;alf040;45;Bartonella henselae BM1374165 ;
;;;;alf041;44;Bartonella henselae str. Houston-1 ;
1;;;;alf042;43;Bartonella quintana RM-11 ;
;;222;1;alf043;43;Bartonella quintana str. Toulouse ;
1;;222;1;alf044;43;Bartonella tribocorum BM1374166 ;
;;;;alf045;43;Bartonella tribocorum CIP 105476 ;
1;;222;1;alf046;43;Bartonella vinsonii subsp. berkhoffii str. Winnie ;
1;;333;1;alf047;54;Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 ;
1;;111;1;alf048;60;Bradyrhizobium diazoefficiens USDA 110 USDA110 ;
1;;222;1;alf049;64;Bradyrhizobium japonicum E109 ;
;;;;alf050;59;Bradyrhizobium japonicum SEMIA 5079 ;
;;;;alf051;66;Bradyrhizobium japonicum USDA 6 ;
1;;222;1;alf052;57;Bradyrhizobium oligotrophicum S58 ;
1;;222;1;alf053;56;Bradyrhizobium sp. BTAi1 ;
1;;222;1;alf054;52;Bradyrhizobium sp. ORS 278 ORS278 ;
1;;111;1;alf055;50;Bradyrhizobium sp. S23321 ;
1;;222;1;alf056;49;Brevundimonas subvibrioides ATCC 15264 ;
1;;333;1;alf057;55;Brucella abortus 2308 ;
;;;;alf058;55;Brucella abortus 3196 ;
;;;;alf059;55;Brucella abortus 63 75 ;
;;;;alf060;55;Brucella abortus A13334 ;
;;;;alf061;55;Brucella abortus BDW ;
;;;;alf062;54;Brucella abortus BER ;
;;;;alf063;54;Brucella abortus BFY ;
;;;;alf064;55;Brucella abortus bv. 1 str. 9-941 ;
;;;;alf065;55;Brucella abortus bv. 2 str. 86/8/59 ;
;;;;alf066;55;Brucella abortus bv. 6 str. 870 ;
;;;;alf067;55;Brucella abortus bv. 9 str. C68 ;
;;;;alf068;55;Brucella abortus NCTC 10505 ;
;;;;alf069;55;Brucella abortus S19 ;
;;;;alf070;47;Brucella abortus ZW053 ;
1;;333;1;alf071;55;Brucella canis ATCC 23365 ;
;;;;alf072;55;Brucella canis HSK A52141 ;
;;;;alf073;55;Brucella canis RM6/66 ;
;;;;alf074;49;Brucella canis str. Oliveri ;
;;;;alf075;55;Brucella canis SVA13 ;
1;;;;alf076;54;Brucella ceti TE10759-12 ;
;;;;alf077;54;Brucella ceti TE28753-12 ;
1;;;;alf078;55;Brucella melitensis ATCC 23457 ;
;;;;alf079;108;Brucella melitensis bv. 1 str. 16M ;
;;;;alf080;55;Brucella melitensis bv. 2 str. 63/9 ;
;;;;alf081;55;Brucella melitensis bv. 3 str. Ether ether ;
;;;;alf082;55;Brucella melitensis M28 ;
;;;;alf083;55;Brucella melitensis M5-90 ;
;;;;alf084;54;Brucella melitensis NI ;
1;;;;alf085;55;Brucella microti CCM 4915 ;
1;;;;alf086;53;Brucella ovis ATCC 25840 ;
1;;;;alf087;55;Brucella pinnipedialis 6/566 ;
;;;;alf088;55;Brucella pinnipedialis B2/94 ;
1;;;;alf089;110;Brucella suis 1330 ;
;;;;alf090;55;Brucella suis 513UK ;
;;;;alf091;54;Brucella suis ATCC 23445 ;
;;;;alf092;55;Brucella suis BSP ;
;;;;alf093;55;Brucella suis bv. 1 str. S2 ;
;;;;alf094;54;Brucella suis bv. 2 Bs143CITA ;
;;;;alf095;54;Brucella suis bv. 2 Bs364CITA ;
;;;;alf096;54;Brucella suis bv. 2 Bs396CITA ;
;;;;alf097;54;Brucella suis bv. 2 PT09143 ;
;;;;alf098;54;Brucella suis bv. 2 PT09172 ;
;;;;alf099;55;Brucella suis bv. 3 str. 686 ;
;;;;alf100;55;Brucella suis Human/AR/US/1981 ;
;;;;alf101;55;Brucella suis VBI22 ;
;;;;alf102;58;Brucella suis ZW043 ;
;;;;alf103;55;Brucella suis ZW046 ;
1;;-;;alf104;44;Candidatus Caedibacter acanthamoebae ;
1;;111;1;alf105;42;Candidatus Endolissoclinum faulkneri L2 ;
;;;;alf106;42;Candidatus Endolissoclinum faulkneri L5 ;
1;;-;;alf107;19;Candidatus Hodgkinia cicadicola ;
;;-;;alf108;14;Candidatus Hodgkinia cicadicola Dsem ;
;;-;;alf109;13;Candidatus Hodgkinia cicadicola TETUND1 ;
;;-;;alf110;17;Candidatus Hodgkinia cicadicola TETUND2 ;
1;;333;1;alf111;46;Candidatus Liberibacter americanus str. Sao Paulo ;
;;;;alf112;45;Candidatus Liberibacter asiaticus str. gxpsy ;
;;;;alf113;45;Candidatus Liberibacter asiaticus str. Ishi-1 ;
;;;;alf114;45;Candidatus Liberibacter asiaticus str. psy62 ;
;;;;alf115;46;Candidatus Liberibacter solanacearum CLso-ZC1 ;
1;;;;alf116;35;Candidatus Midichloria mitochondrii IricVA ;
1;;222;1;alf117;43;Candidatus Paracaedibacter acanthamoebae ;
1;;;;alf118;32;Candidatus Pelagibacter sp. IMCC9063 ;
;;;;alf119;32;Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062 ;
1;;;;alf120;44;Candidatus Phaeomarinobacter ectocarpi Ec32 ;
1;;;;alf121;38;Candidatus Puniceispirillum marinum IMCC1322 ;
1;;;;alf122;33;Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V ;
1;;222;1;alf123;52;Caulobacter crescentus CB15 ;
;;;;alf124;52;Caulobacter crescentus NA1000 ;
1;;;;alf125;53;Caulobacter segnis ATCC 21756 ;
1;;;;alf126;51;Caulobacter sp. K31 ;
1;;;;alf127;50;Celeribacter indicus P73 ;
1;;;;alf128;54;Chelativorans sp. BNC1 ;
1;;;;alf129;47;Dinoroseobacter shibae DFL 12 DSM 16493 ;
1;;111;1;alf130;36;Ehrlichia canis str. Jake ;
1;;111;1;alf131;37;Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas ;
;;;;alf132;37;Ehrlichia chaffeensis str. Heartland ;
;;;;alf133;37;Ehrlichia chaffeensis str. Jax ;
;;;;alf134;37;Ehrlichia chaffeensis str. Liberty ;
;;;;alf135;37;Ehrlichia chaffeensis str. Osceola ;
;;;;alf136;37;Ehrlichia chaffeensis str. Saint Vincent ;
;;;;alf137;37;Ehrlichia chaffeensis str. Wakulla ;
;;;;alf138;37;Ehrlichia chaffeensis str. West Paces ;
1;;;;alf139;37;Ehrlichia muris AS145 ;
1;;;;alf140;36;Ehrlichia ruminantium str. Gardel ;
;;;;alf141;72;Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden ;
1;;;;alf142;36;Ehrlichia sp. HF ;
1;;;;alf143;38;endosymbiont of Acanthamoeba sp. UWC8 ;
1;;;;alf144;63;Ensifer adhaerens OV14 ;
1;;;;alf145;43;Erythrobacter litoralis HTCC2594 ;
1;;444;1;alf146;60;Gluconacetobacter diazotrophicus PA1 5 ;
;;;;alf147;58;Gluconacetobacter diazotrophicus PA1 5 PAl 5 ;
1;;;;alf148;57;Gluconobacter oxydans 621H ;
;;;;alf149;57;Gluconobacter oxydans DSM 3504 ;
;;;;alf150;60;Gluconobacter oxydans H24 ;
1;;;;alf151;52;Granulibacter bethesdensis CGDNIH1 ;
;;;;alf152;53;Granulibacter bethesdensis CGDNIH2 ;
;;;;alf153;52;Granulibacter bethesdensis CGDNIH3 ;
;;;;alf154;52;Granulibacter bethesdensis CGDNIH4 ;
1;;;;alf155;39;Hirschia baltica ATCC 49814 ;
1;;;;alf156;48;Hyphomicrobium denitrificans 1NES1 ;
;;;;alf157;47;Hyphomicrobium denitrificans ATCC 51888 ;
1;;;;alf158;49;Hyphomicrobium nitrativorans NL23 ;
1;;111;1;alf159;53;Hyphomicrobium sp. MC1 ;
1;;;;alf160;43;Hyphomonas neptunium ATCC 15444 ;
1;;;;alf161;43;Jannaschia sp. CCS1 ;
1;;555;1;alf162;58;Ketogulonicigenium vulgare WSH-001 ;
;;;;alf163;60;Ketogulonicigenium vulgare Y25 ;
1;;;;alf164;59;Komagataeibacter medellinensis NBRC 3288 ;
1;;;;alf165;60;Komagataeibacter xylinus E25 ;
1;;555;1;alf166;66;Leisingera methylohalidivorans DSM 14336 MB2 ;
1;;;;alf167;47;Liberibacter crescens BT-1 ;
1;;;;alf168;45;Magnetococcus marinus MC-1 ;
1;;;;alf169;48;Magnetospira sp. QH-2 ;
1;;;;alf170;54;Magnetospirillum gryphiswaldense MSR-1 v2 ;
1;;;;alf171;53;Magnetospirillum magneticum AMB-1 ;
1;;;;alf172;45;Maricaulis maris MCS10 ;
1;;;;alf173;57;Martelella endophytica YC6887 ;
1;;222;1;alf174;55;Mesorhizobium australicum WSM2073 ;
1;;;;alf175;54;Mesorhizobium ciceri biovar biserrulae WSM1271 ;
1;;;;alf176;55;Mesorhizobium huakuii 7653R ;
1;;;;alf177;55;Mesorhizobium loti MAFF303099 ;
1;;;;alf178;55;Mesorhizobium opportunistum WSM2075 ;
1;;;;alf179;68;Methylobacterium extorquens AM1 ;
;;;;alf180;67;Methylobacterium extorquens CM4 ;
;;;;alf181;62;Methylobacterium extorquens DM4 ;
;;;;alf182;63;Methylobacterium extorquens PA1 ;
1;;;;alf183;83;Methylobacterium nodulans ORS 2060 ;
1;;;;alf184;62;Methylobacterium oryzae CBMB20 ;
1;;;;alf185;61;Methylobacterium populi BJ001 ;
1;;;;alf186;63;Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 ;
1;;666;1;alf187;72;Methylobacterium sp. 4-46 ;
1;;;;alf188;50;Methyloceanibacter caenitepidi Gela4 ;
1;;;;alf189;51;Methylocella silvestris BL2 ;
1;;;;alf190;48;Methylocystis sp. SC2 ;
1;;;;alf191;44;Micavibrio aeruginosavorus ARL-13 ;
;;;;alf192;40;Micavibrio aeruginosavorus EPB ;
1;;;;alf193;52;Neorhizobium galegae bv. officinalis bv. officinalis str. HAMBI 1141 ;
;;;;alf194;52;Neorhizobium galegae bv. orientalis str. HAMBI 540 ;
1;;;;alf195;33;Neorickettsia helminthoeca str. Oregon ;
1;;;;alf196;33;Neorickettsia risticii str. Illinois ;
1;;;;alf197;33;Neorickettsia sennetsu str. Miyayama ;
1;;111;1;alf198;58;Nitrobacter hamburgensis X14 ;
1;;;;alf199;50;Nitrobacter winogradskyi Nb-255 ;
1;;;;alf200;59;Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444 ;
1;;;;alf201;57;Novosphingobium pentaromativorans US6-1 ;
1;;333;1;alf202;59;Novosphingobium sp. PP1Y ;
1;oan;444;1;alf203;61;Ochrobactrum anthropi ATCC 49188 ;
;;;;alf204;59;Ochrobactrum anthropi OAB ;
1;;;;alf205;51;Octadecabacter antarcticus 307 ;
1;;;;alf206;49;Octadecabacter arcticus 238 ;
1;;;;alf207;54;Oligotropha carboxidovorans OM4 ;
;;;;alf208;54;Oligotropha carboxidovorans OM5 ;
;;;;alf209;54;Oligotropha carboxidovorans OM5 ATCC 49405 ;
1;;;;alf210;34;Orientia tsutsugamushi str. Boryong ;
;;;;alf211;34;Orientia tsutsugamushi str. Ikeda ;
1;;444;1;alf212;62;Paracoccus aminophilus JCM 7686 ;
1;;;;alf213;55;Paracoccus denitrificans PD1222 ;
1;;;;alf214;46;Parvibaculum lavamentivorans DS-1 ;
1;;;;alf215;44;Parvularcula bermudensis HTCC2503 ;
1;;;;alf216;50;Pelagibacterium halotolerans B2 ;
1;;;;alf217;58;Phaeobacter gallaeciensis 2.10 ;
;;444;1;alf218;61;Phaeobacter gallaeciensis DSM 26640 ;
1;;;;alf219;59;Phaeobacter inhibens DSM 17395 ;
1;;;;alf220;43;Phenylobacterium zucineum HLK1 ;
1;;;;alf221;45;Planktomarina temperata RCA23 ;
1;;;;alf222;53;Polymorphum gilvum SL003B-26A1 ;
1;;666;1;alf223;70;Pseudovibrio sp. FO-BEG1 ;
1;;333;1;alf224;54;Rhizobium etli bv. mimosae str. IE4771 ;
;;;;alf225;51;Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 ;
;;;;alf226;55;Rhizobium etli bv. phaseoli str. IE4803 ;
;;;;alf227;50;Rhizobium etli CFN 42 ;
;;;;alf228;54;Rhizobium etli CIAT 652 ;
1;;;;alf229;52;Rhizobium gallicum bv. gallicum R602 ;
1;;;;alf230;51;Rhizobium leguminosarum bv. trifolii CB782 ;
;;;;alf231;54;Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 ;
;;;;alf232;51;Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1689 ;
;;;;alf233;52;Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 ;
;;;;alf234;52;Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 ;
1;;;;alf235;57;Rhizobium sp. IRBG74 ;
1;;;;alf236;55;Rhizobium sp. LPU83 ;
1;;;;alf237;51;Rhizobium sp. NT-26 ;
1;;;;alf238;54;Rhizobium tropici CIAT 899 ;
1;;;;alf239;54;Rhodobacter capsulatus SB 1003 ;
1;2*56;;;alf240;112;Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 ;
;;;;alf241;57;Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 ;
;;;;alf242;58;Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029 ;
;;;;alf243;58;Rhodobacter sphaeroides KD131 KCTC 12085 ;
;;;;alf244;55;Rhodobacter sphaeroides WS8N ;
1;;;;alf245;52;Rhodomicrobium vannielii ATCC 17100 ;
1;;;;alf246;50;Rhodopseudomonas palustris BisA53 ;
;;;;alf247;52;Rhodopseudomonas palustris BisB18 ;
;;;;alf248;51;Rhodopseudomonas palustris BisB5 ;
;;;;alf249;51;Rhodopseudomonas palustris DX-1 ;
;;;;alf250;51;Rhodopseudomonas palustris HaA2 ;
;;;;alf251;55;Rhodopseudomonas palustris TIE-1 ;
1;;;;alf252;53;Rhodospirillum centenum SW ATCC 51521 ;
1;rpm;;;alf253;95;Rhodospirillum photometricum DSM 122 ;
1;rru;;;alf254;55;Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 ;
;;;;alf255;55;Rhodospirillum rubrum F11 ;
1;;;;alf256;33;Rickettsia africae ESF-5 ;
1;;;;alf257;33;Rickettsia akari str. Hartford ;
1;;;;alf258;33;Rickettsia australis str. Cutlack ;
1;;;;alf259;35;Rickettsia bellii OSU 85-389 ;
;;;;alf260;35;Rickettsia bellii RML369-C ;
1;;;;alf261;33;Rickettsia canadensis str. CA410 ;
;;;;alf262;33;Rickettsia canadensis str. McKiel ;
1;;;;alf263;33;Rickettsia conorii str. Malish 7 ;
1;;;;alf264;33;Rickettsia felis URRWXCal2 California 2 ;
1;;;;alf265;33;Rickettsia heilongjiangensis 054 ;
1;;;;alf266;33;Rickettsia helvetica C9P9 ;
1;;;;alf267;33;Rickettsia japonica YH ;
1;;;;alf268;33;Rickettsia massiliae MTU5 ;
;;;;alf269;33;Rickettsia massiliae str. AZT80 ;
1;;;;alf270;32;Rickettsia monacensis IrR/Munich ;
;;;;alf271;34;Rickettsia montanensis str. OSU 85-930 ;
1;;;;alf272;34;Rickettsia parkeri str. Portsmouth ;
1;;;;alf273;34;Rickettsia peacockii str. Rustic ;
1;;;;alf274;33;Rickettsia philipii str. 364D ;
1;rpl;;;alf275;33;Rickettsia prowazekii str. Breinl ;
1;;;;alf276;33;Rickettsia prowazekii str. BuV67-CWPP ;
;;;;alf277;33;Rickettsia prowazekii str. Chernikova ;
;;;;alf278;33;Rickettsia prowazekii str. Dachau ;
;;;;alf279;33;Rickettsia prowazekii str. GvV257 ;
;;;;alf280;33;Rickettsia prowazekii str. Katsinyian ;
;;;;alf281;33;Rickettsia prowazekii str. NMRC Madrid E ;
;;;;alf282;33;Rickettsia prowazekii str. Rp22 ;
;;;;alf283;33;Rickettsia prowazekii str. RpGvF24 ;
1;;;;alf284;33;Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP ;
1;;;;alf285;34;Rickettsia rickettsii str. Arizona ;
;;;;alf286;34;Rickettsia rickettsii str. Brazil ;
;;;;alf287;34;Rickettsia rickettsii str. Colombia ;
;;;;alf288;34;Rickettsia rickettsii str. Hauke ;
;;;;alf289;34;Rickettsia rickettsii str. Hino ;
;;;;alf290;34;Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 ;
;;;;alf291;34;Rickettsia rickettsii str. Iowa ;
;;;;alf292;35;Rickettsia rickettsii str. Morgan ;
;;;;alf293;34;Rickettsia rickettsii str. R ;
;;;;alf294;34;Rickettsia rickettsii str. Sheila Smith ;
1;;;;alf295;33;Rickettsia sibirica 246 ;
1;;;;alf296;33;Rickettsia slovaca 13-B ;
;;;;alf297;33;Rickettsia slovaca str. D-CWPP ;
1;rtb;111;1;alf298;33;Rickettsia typhi str. B9991CWPP ;
;;;;alf299;33;Rickettsia typhi str. TH1527 ;
;;;;alf300;33;Rickettsia typhi str. Wilmington ;
1;;111;1;alf301;39;Rickettsiales bacterium Ac37b ;
1;;;;alf302;48;Roseibacterium elongatum DSM 19469 DFL-43 ;
1;;111;1;alf303;38;Roseobacter denitrificans OCh 114 ;
1;;111;1;alf304;38;Roseobacter litoralis Och 149 ;
1;;333;1;alf305;54;Ruegeria pomeroyi DSS-3 ;
1;;555;1;alf306;64;Ruegeria sp. TM1040 ;
1;;333;1;alf307;56;Sinorhizobium fredii NGR234 ;
1;;333;1;alf308;56;Sinorhizobium medicae WSM419 ;
1;;333;1;alf309;56;Sinorhizobium meliloti 1021 ;
;;;;alf310;56;Sinorhizobium meliloti 2011 ;
;;;;alf311;59;Sinorhizobium meliloti AK83 ;
;;;;alf312;56;Sinorhizobium meliloti BL225C ;
;;;;alf313;57;Sinorhizobium meliloti GR4 ;
;;;;alf314;58;Sinorhizobium meliloti Rm41 ;
;;;;alf315;56;Sinorhizobium meliloti RMO17 ;
;;;;alf316;61;Sinorhizobium meliloti SM11 ;
1;;333;1;alf317;62;Sphingobium chlorophenolicum L-1 ;
1;;;;alf318;58;Sphingobium japonicum UT26S ;
1;;;;alf319;53;Sphingobium sp. SYK-6 ;
1;;;;alf320;57;Sphingobium sp. YBL2 ;
1;;333;1;alf321;63;Sphingomonas sanxanigenens DSM 19645 NX02 ;
1;;;;alf322;55;Sphingomonas sp. MM-1 ;
1;;;;alf323;53;Sphingomonas sp. WHSC-8 ;
1;;;;alf324;53;Sphingomonas taxi ATCC 55669 ;
1;;;;alf325;53;Sphingomonas wittichii RW1 ;
1;;111;1;alf326;47;Sphingopyxis alaskensis RB2256 ;
1;;;;alf327;50;Sphingopyxis sp. Kp5.2 ;
1;;;;alf328;47;Starkeya novella DSM 506 ;
1;;444;1;alf329;61;Thalassospira xiamenensis M-5 DSM 17429 ;
1;;444;1;alf330;58;Tistrella mobilis KA081020-065 ;
1;;111;1;alf331;34;Wolbachia endosymbiont of Cimex lectularius wCle ;
;;;;alf332;34;Wolbachia endosymbiont of Culex quinquefasciatus Pel wPip ;
;;;;alf333;34;Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster wMel ;
;;;;alf334;34;Wolbachia endosymbiont of Drosophila simulans wAu ;
;;;;alf335;35;Wolbachia endosymbiont of Drosophila simulans wHa ;
;;;;alf336;34;Wolbachia endosymbiont of Drosophila simulans wNo ;
;;;;alf337;34;Wolbachia endosymbiont of Onchocerca ochengi wOo ;
;;;;alf338;34;Wolbachia endosymbiont of Onchocerca volvulus str. Cameroon ;
;;;;alf339;34;Wolbachia endosymbiont strain TRS of Brugia malayi ;
1;;;;alf340;35;Wolbachia sp. wRi ;
1;;222;1;alf341;55;Xanthobacter autotrophicus Py2 ;
1;;;;alf342;49;Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 ;
;;333;1;alf343;52;Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 29191 ;
;;;;alf344;52;Zymomonas mobilis subsp. mobilis NCIMB 11163 ;
;;;;alf345;52;Zymomonas mobilis subsp. mobilis NRRL B-12526 ;
;49+52;;;alf346;101;Zymomonas mobilis subsp. mobilis str. CP4 NRRL B-14023 ;
;;;;alf347;52;Zymomonas mobilis subsp. mobilis ZM4 ATCC 31821 ;
;;;;alf348;52;Zymomonas mobilis subsp. pomaceae ATCC 29192 ;
189;;;70;;;;

Beta

beta blocs

Lien tableur: beta blocs

beta blocs;;;;;;;;;;;;
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lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;Bet173-262;;;;Notes
bet173;4*16atcgca235;;5;85;11;74;;;16s23s5s;6-atcgca-35;avant;
;agc-16atcgca235;;;;;;;sans;;26;3;avant
;;;;;;;;3aas;;;;agc-16atcgca235
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;;;;;;;;cds-3aas;;;;
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;;;;;;;;;;;;
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;;;;;;;;;;;;
bet214;16atcgca235;;1;42;2;40;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
bet219;3*16atcgca235;;3;66;6;60;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
bet224;4*16atcgca235;;4;82;8;74;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
bet228;2*16atcgca235;;2;53;4;49;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
bet236;3*16atcgca235;;3;58;6;52;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
bet257;16atcgca235;;2;47;5;42;;;;;;
;atgf-16atcgca235;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
bet262;2*16atcgca235;;2;65;4;61;;;;;;
;;;29;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;Total;;;;Notes
44;;;;;;;;;16s23s5s;6-atcgca-35;avant;
;Total;;;2732;353;2379;;sans;2;120;3;3aas
;Moyenne;;;62;8;54;;3aas;0;4;;4*16atcgca235-tac-gga-acc
;ecartype;;;14;4;11;;cds;3;26;;
;max;;;105;18;87;;cds-3aas;0;6;;cds-3aas
;min;;;40;2;36;164;total;5;156;3;6*16atcgca-cds-235-tac-gga-acc
;;;;;;;;;;;;
165 blocs;44 génomes;36 cds / 9;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;avant
;;;;;;;;;;;;agc-16atcgca235
;;;;;;;;;;;;2*atgf-16atcgca235
;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;incomplets
;;;;;;;;;;;;16atcgca-cds-23s°
;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;5 de trop
;;;;;;;;;;;;16atcgca2355

beta notes

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beta typage

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Tableau des noms beta

Lien tableur: beta noms

;;;;2.9.19 Paris;fait vers le 20.8.19;
;;;;263;betaproteob;16071
;;;;;;
1;;433;1;bet001;§60;Achromobacter xylosoxidans A8 
;;;;bet002;58;Achromobacter xylosoxidans C54 
;;;;bet003;54;Achromobacter xylosoxidans NH44784-1996 
1;;333;1;bet004;§55;Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 
1;;333;1;bet005;§57;Acidovorax citrulli AAC00-1 
1;;333;1;bet006;§53;Acidovorax ebreus TPSY 
1;;333;1;bet007;§56;Acidovorax sp. JS42 
1;;333;1;bet008;§54;Acidovorax sp. KKS102 
1;;222;1;bet009;§43;Advenella kashmirensis WT001 
1;;222;1;bet010;§42;Advenella mimigardefordensis DPN7 
1;;333;1;bet011;§57;Alicycliphilus denitrificans BC 
;;;;bet012;58;Alicycliphilus denitrificans K601 
1;;444;1;bet013;§63;Aromatoleum aromaticum EbN1 
1;;444;1;bet014;§56;Azoarcus sp. BH72 
1;;555;1;bet015;§67;Azoarcus sp. KH32C 
1;;333;1;bet016;§40;Basilea psittacipulmonis DSM 24701 
1;;-;;bet017;§43;beta proteobacterium CB 
1;;333;1;bet018;§64;Bordetella avium 197N 
1;;333;1;bet019;§57;Bordetella bronchiseptica 253 
;;;;bet020;56;Bordetella bronchiseptica MO149 
;;;;bet021;56;Bordetella bronchiseptica S798 
1;;333;1;bet022;§57;Bordetella holmesii 44057 
;;;;bet023;56;Bordetella holmesii ATCC 51541 
1;;333;1;bet024;§56;Bordetella parapertussis Bpp5 
1;;333;1;bet025;§53;Bordetella pertussis 137 
;;;;bet026;53;Bordetella pertussis 18323 
;;;;bet027;53;Bordetella pertussis B1917 
;;;;bet028;53;Bordetella pertussis CS 
1;;333;1;bet029;§53;Bordetella petrii DSM 12804 
1;2*70;;;bet030;§140;Burkholderia ambifaria AMMD 
;;666;1;bet031;69;Burkholderia ambifaria MC40-6 
1;;666;1;bet032;§72;Burkholderia cenocepacia AU 1054 
;;;;bet033;73;Burkholderia cenocepacia DDS 22E-1 
;;;;bet034;69;Burkholderia cenocepacia DWS 37E-2 
;;;;bet035;67;Burkholderia cenocepacia H111 
;;;;bet036;73;Burkholderia cenocepacia HI2424 
;;;;bet037;77;Burkholderia cenocepacia J2315 
;;;;bet038;75;Burkholderia cenocepacia MC0-3 
1;;666;1;bet039;§70;Burkholderia cepacia DDS 7H-2 
;;;;bet040;60;Burkholderia cepacia GG4 
;;;;bet041;70;Burkholderia cepacia LO6 
1;;555;1;bet042;§70;Burkholderia dolosa AU0158 
1;;666;1;bet043;§65;Burkholderia fungorum ATCC BAA-463 
1;;555;1;bet044;§71;Burkholderia gladioli ATCC 10248 
;;;;bet045;72;Burkholderia gladioli BSR3 
1;;555;1;bet046;§71;Burkholderia glumae BGR1 
;;;;bet047;67;Burkholderia glumae LMG 2196 ATCC 33617 
;;;;bet048;68;Burkholderia glumae PG1 
1;;666;1;bet049;§71;Burkholderia lata 383 
1;;343;1;bet050;§59;Burkholderia mallei 11 
;;;;bet051;59;Burkholderia mallei 2000031063 
;;;;bet052;59;Burkholderia mallei 2002721276 
;;;;bet053;59;Burkholderia mallei 2002734299 
;;;;bet054;56;Burkholderia mallei 2002734306 
;;;;bet055;57;Burkholderia mallei 23344 
;;;;bet056;59;Burkholderia mallei 6 
;;;;bet057;59;Burkholderia mallei ATCC 23344 
;;;;bet058;57;Burkholderia mallei BMQ 
;;;;bet059;59;Burkholderia mallei FMH 23344 
;;;;bet060;56;Burkholderia mallei India86-567-2 
;;;;bet061;57;Burkholderia mallei KC 1092 
;;;;bet062;59;Burkholderia mallei NCTC 10229 
;2*58;;;bet063;116;Burkholderia mallei NCTC 10247 
;;;;bet064;57;Burkholderia mallei SAVP1 
1;2*67;;;bet065;§134;Burkholderia multivorans ATCC 17616 
;;;;bet066;69;Burkholderia multivorans ATCC BAA-247 
;;555;1;bet067;70;Burkholderia multivorans DDS 15A-1 
1;;;;bet068;§62;Burkholderia oklahomensis C6786 
;;;;bet069;62;Burkholderia oklahomensis EO147 
1;;;;bet070;§64;Burkholderia phenoliruptrix BR3459a 
1;;;;bet071;§67;Burkholderia phymatum STM815 
1;;;;bet072;§66;Burkholderia phytofirmans PsJN 
1;2*65;;;bet073;§130;Burkholderia pseudomallei 1026b 
;2*62;;;bet074;124;Burkholderia pseudomallei 1106a 
;;;;bet075;64;Burkholderia pseudomallei 1710b 
;;;;bet076;64;Burkholderia pseudomallei 3921 
;;;;bet077;63;Burkholderia pseudomallei 406e 
;;;;bet078;63;Burkholderia pseudomallei 576 
;;;;bet079;64;Burkholderia pseudomallei 668 
;;444;1;bet080;66;Burkholderia pseudomallei 7894 
;;;;bet081;64;Burkholderia pseudomallei A79A 
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;;;;bet090;64;Burkholderia pseudomallei K42 
;2*66;;;bet091;132;Burkholderia pseudomallei K96243 
;;;;bet092;62;Burkholderia pseudomallei Mahidol-1106a 
;;;;bet093;63;Burkholderia pseudomallei MSHR1153 
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;;;;bet097;64;Burkholderia pseudomallei MSHR2543 
;;;;bet098;64;Burkholderia pseudomallei MSHR305 
;;;;bet099;63;Burkholderia pseudomallei MSHR346 
;;;;bet100;65;Burkholderia pseudomallei MSHR3965 
;;;;bet101;66;Burkholderia pseudomallei MSHR491 
;;;;bet102;65;Burkholderia pseudomallei MSHR511 
;;;;bet103;64;Burkholderia pseudomallei MSHR520 
;;;;bet104;64;Burkholderia pseudomallei MSHR5848 
;;;;bet105;64;Burkholderia pseudomallei MSHR5855 
;;;;bet106;63;Burkholderia pseudomallei MSHR5858 
;;;;bet107;62;Burkholderia pseudomallei MSHR62 
;;;;bet108;64;Burkholderia pseudomallei MSHR668 
;;;;bet109;62;Burkholderia pseudomallei MSHR840 
;;;;bet110;65;Burkholderia pseudomallei NAU20B-16 
;;;;bet111;65;Burkholderia pseudomallei NAU35A-3 
;;;;bet112;63;Burkholderia pseudomallei NCTC 13178 
;;;;bet113;64;Burkholderia pseudomallei NCTC 13179 
;;;;bet114;70;Burkholderia pseudomallei Pasteur 52237 
;;;;bet115;63;Burkholderia pseudomallei PB08298010 
;;;;bet116;63;Burkholderia pseudomallei TSV 48 
;;;;bet117;67;Burkholderia pseudomallei vgh07 
1;;;;bet118;§51;Burkholderia rhizoxinica HKI 454 
1;;;;bet119;§64;Burkholderia sp. 2002721687 
1;;;;bet120;§64;Burkholderia sp. BGK 
1;;;;bet121;§65;Burkholderia sp. CCGE1001 
1;;;;bet122;§75;Burkholderia sp. CCGE1002 
1;;;;bet123;§65;Burkholderia sp. CCGE1003 
1;;;;bet124;§70;Burkholderia sp. KJ006 
1;;;;bet125;§63;Burkholderia sp. RPE64 
1;;;;bet126;§67;Burkholderia sp. RPE67 
1;;;;bet127;§63;Burkholderia sp. TSV202 
1;;;;bet128;§67;Burkholderia sp. YI23 
1;;;;bet129;§63;Burkholderia thailandensis 2002721643 
;;;;bet130;63;Burkholderia thailandensis 2002721723 
;;;;bet131;63;Burkholderia thailandensis 2003015869 
;;;;bet132;65;Burkholderia thailandensis 34 
;;;;bet133;62;Burkholderia thailandensis E254 
;;;;bet134;63;Burkholderia thailandensis E264 ATCC 700388 
;;;;bet135;63;Burkholderia thailandensis E444 
;;;;bet136;61;Burkholderia thailandensis H0587 
;;;;bet137;60;Burkholderia thailandensis MSMB121 
;;;;bet138;60;Burkholderia thailandensis MSMB59 
;;;;bet139;62;Burkholderia thailandensis USAMRU Malaysia #20 
1;;;;bet140;§75;Burkholderia ubonensis MSMB22 
1;;;;bet141;§71;Burkholderia vietnamiensis G4 
;;;;bet142;75;Burkholderia vietnamiensis LMG 10929 
1;2*68;;;bet143;§136;Burkholderia xenovorans LB400 
1;;;;bet144;§48;Burkholderiales bacterium GJ-E10 
1;;;;bet145;§50;Candidatus Accumulibacter phosphatis clade IIA str. UW-1 
1;;;;bet146;§44;Candidatus Kinetoplastibacterium blastocrithidii ex Strigomonas culicis 
;;;;bet147;44;Candidatus Kinetoplastibacterium blastocrithidii TCC012E 
1;;;;bet148;§45;Candidatus Kinetoplastibacterium crithidii ex Angomonas deanei ATCC 30255 
;;;;bet149;45;Candidatus Kinetoplastibacterium crithidii TCC036E 
1;;;;bet150;§44;Candidatus Kinetoplastibacterium desouzaii TCC079E 
1;;;;bet151;§44;Candidatus Kinetoplastibacterium galatii TCC219 
1;;;;bet152;§44;Candidatus Kinetoplastibacterium oncopeltii TCC290E 
1;;;;bet153;§29;Candidatus Nasuia deltocephalinicola str. NAS-ALF 
1;;;;bet154;§34;Candidatus Profftella armatura DC 
1;;;;bet155;§45;Candidatus Symbiobacter mobilis CR 
1;;;;bet156;§31;Candidatus Tremblaya phenacola PAVE 
1;;;;bet157;§16;Candidatus Tremblaya princeps PCIT 
;;;;bet158;16;Candidatus Tremblaya princeps PCVAL 
1;;;;bet159;§25;Candidatus Zinderia insecticola CARI 
1;;222;1;bet160;§46;Castellaniella defragrans 65Phen 
1;;888;1;bet161;§101;Chromobacterium violaceum ATCC 12472 
1;;;;bet162;§60;Collimonas arenae Cal35 
1;;;;bet163;§59;Collimonas fungivorans Ter331 
1;;;;bet164;§45;Comamonadaceae bacterium A1 
;;;;bet165;45;Comamonadaceae bacterium B1 
1;;;;bet166;§85;Comamonas testosteroni CNB-2 CNB-1 substr. CNB-2 
1;;999;1;bet167;§105;Comamonas testosteroni TK102 
1;;;;bet168;§73;Cupriavidus basilensis 4G11 
1;;;;bet169;§67;Cupriavidus metallidurans CH34 
1;;;;bet170;§73;Cupriavidus necator N-1 
1;;;;bet171;§66;Cupriavidus taiwanensis LMG 19424 LMG19424 
1;;;;bet172;§65;Dechloromonas aromatica RCB 
1;;555;1;bet173;§85;Delftia acidovorans SPH-1 
1;;;;bet174;§83;Delftia sp. Cs1-4 
1;;;;bet175;§53;Gallionella capsiferriformans ES-2 
1;;;;bet176;§59;Herbaspirillum seropedicae SmR1 
1;;;;bet177;§47;Herminiimonas arsenicoxydans 
1;;;;bet178;§76;Janthinobacterium agaricidamnosum NBRC 102515 DSM 9628 
1;;;;bet179;§49;Janthinobacterium sp. Marseille 
1;;;;bet180;§80;Laribacter hongkongensis HLHK9 
1;;;;bet181;§51;Leptothrix cholodnii SP-6 
1;;111;1;bet182;§72;Methylibium petroleiphilum PM1 
1;;222;1;bet183;§47;Methylobacillus flagellatus KT 
1;;;;bet184;§47;Methylotenera mobilis JLW8 
1;;;;bet185;§48;Methylotenera versatilis 301 
1;;;;bet186;§50;Methylovorus glucosetrophus SIP3-4 
1;;;;bet187;§48;Methylovorus sp. MP688 
1;;444;1;bet188;§66;Neisseria elongata subsp. glycolytica ATCC 29315 
1;;;;bet189;§56;Neisseria gonorrhoeae FA 1090 
;;;;bet190;56;Neisseria gonorrhoeae MS11 
;;;;bet191;56;Neisseria gonorrhoeae NCCP11945 
1;;;;bet192;§60;Neisseria lactamica 020-06 
1;;;;bet193;§61;Neisseria meningitidis 053442 
;;;;bet194;61;Neisseria meningitidis 510612 
;;;;bet195;61;Neisseria meningitidis 8013 
;;;;bet196;60;Neisseria meningitidis alpha14 
;;;;bet197;58;Neisseria meningitidis alpha710 
;;;;bet198;60;Neisseria meningitidis FAM18 
;;;;bet199;61;Neisseria meningitidis G2136 
;;;;bet200;60;Neisseria meningitidis H44/76 
;;;;bet201;60;Neisseria meningitidis LNP21362 
;;;;bet202;61;Neisseria meningitidis M01-240149 
;;;;bet203;61;Neisseria meningitidis M01-240355 
;;;;bet204;60;Neisseria meningitidis M04-240196 
;;;;bet205;60;Neisseria meningitidis M10208 
;;;;bet206;62;Neisseria meningitidis M7124 
;;;;bet207;60;Neisseria meningitidis MC58 
;;;;bet208;60;Neisseria meningitidis NM3682 
;;;;bet209;62;Neisseria meningitidis NM3683 
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;;;;bet211;61;Neisseria meningitidis NZ-05/33 
;;;;bet212;57;Neisseria meningitidis WUE 2594 
;;;;bet213;60;Neisseria meningitidis Z2491 
1;;111;1;bet214;§42;Nitrosomonas europaea ATCC 19718 
1;;;;bet215;§42;Nitrosomonas eutropha C91 
1;;;;bet216;§43;Nitrosomonas sp. AL212 
1;;;;bet217;§44;Nitrosomonas sp. Is79A3 
1;;;;bet218;§43;Nitrosospira multiformis ATCC 25196 
1;;333;1;bet219;§66;Pandoraea apista TF81F4 
1;;;;bet220;§69;Pandoraea oxalativorans DSM 23570 
1;;;;bet221;§70;Pandoraea pnomenusa 3kgm 
;;;;bet222;69;Pandoraea pnomenusa DSM 16536 
;;;;bet223;71;Pandoraea pnomenusa RB38 
1;;444;1;bet224;§82;Pandoraea pulmonicola DSM 16583 
1;;;;bet225;§68;Pandoraea sp. RB-44 
1;;;;bet226;§67;Pandoraea sputorum DSM 21091 
1;;;;bet227;§68;Pandoraea vervacti NS15 
1;;222;1;bet228;§53;Polaromonas naphthalenivorans CJ2 
1;;;;bet229;§46;Polaromonas sp. JS666 
1;;;;bet230;§40;Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus MWH-MoK4 
;;;;bet231;42;Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1 
;;;;bet232;37;Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1 
1;;;;bet233;§90;Pseudogulbenkiania sp. NH8B 
1;;;;bet234;§49;Pusillimonas sp. T7-7 
1;;;;bet235;§52;Ralstonia mannitolilytica SN82F48 
1;;333;1;bet236;§58;Ralstonia pickettii 12D 
;;;;bet237;58;Ralstonia pickettii 12J 
;;;;bet238;70;Ralstonia pickettii DTP0602 
1;;;;bet239;§54;Ralstonia solanacearum CFBP2957 
;;;;bet240;62;Ralstonia solanacearum CMR15 
;;;;bet241;55;Ralstonia solanacearum FQY 4 
;;;;bet242;60;Ralstonia solanacearum GMI1000 
;;;;bet243;55;Ralstonia solanacearum Po82 
;;;;bet244;58;Ralstonia solanacearum PSI07 
1;;;;bet245;§46;Ramlibacter tataouinensis TTB310 
1;;;;bet246;§49;Rhodocyclaceae bacterium PG1-Ca6 
1;;;;bet247;§48;Rhodoferax ferrireducens T118 DSM 15236 
1;;;;bet248;§51;Rubrivivax gelatinosus IL144 
1;;;;bet249;§46;Sideroxydans lithotrophicus ES-1 
1;;;;bet250;§61;Snodgrassella alvi wkB2 
1;;;;bet251;§46;Sulfuricella denitrificans skB26 
1;;;;bet252;§48;Sulfuritalea hydrogenivorans sk43H DSM22779 
1;;;;bet253;§39;Taylorella asinigenitalis MCE3 
1;;;;bet254;§38;Taylorella equigenitalis ATCC 35865 
;;;;bet255;38;Taylorella equigenitalis MCE9 
1;;;;bet256;§58;Thauera sp. MZ1T 
1;;222;1;bet257;§47;Thiobacillus denitrificans ATCC 25259 
1;;;;bet258;§49;Thiomonas arsenitoxydans 3As 
1;;;;bet259;§49;Thiomonas intermedia K12 
1;;;;bet260;§50;Variovorax paradoxus B4 
;;;;bet261;60;Variovorax paradoxus EPS 
;;222;1;bet262;65;Variovorax paradoxus S110 
1;;;;bet263;§49;Verminephrobacter eiseniae EF01-2 
130;;;44;;;

Delta

delta blocs

Lien tableur: delta blocs

delta blocs;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;Del001-62;;;;;Notes
del01;2*16atcgca235;;2;49;4;45;;;'''16s23s5s;'''16-atcgca-35;'''16-gca-235;'''16-atc-235;
del03;2*16atcgca235;;2;53;4;49;;'''sans;17;40;1;2;'''1-3
;;;;;;;;'''1-3;;1;;;16atcgca235-atgj
del05;16s23s5s;;2;36;2;34;61;'''total;17;41;1;2;
;gca-16-atc-235;;;;;;;;;;;;'''avant
;;;;;;;;;;;;;gca-16-atc-235
del11;3*16atcgca235;;3;61;6;55;;;;;;;
del13;2*16atcgca235;;2;62;4;58;;;;;;;'''incomplets
;;;;;;;;;;;;;16s-23s
del15;4*16s23s5s;;6;55;0;55;;;;;;;16-atc
;16s23s5s-5s;;;;;;;;;;;;16atcgca-23-23-5s
;16atccga235;;;;;;;;;;;;
;5s;;;;;;;;;;;;'''5s de trop
;;;;;;;;;;;;;16atcgca2355
del19;16s23s5s;;1;54;0;54;;;;;;;16s23s5s-5s
;;;;;;;;;;;;;16atcgca235-5s-5s
del23;5*16s23s5s;;7;68;4;64;;;;;;;3*5s
;2*16atcgca235;;;;;;;;;;;;
;5s;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
del26;4*16s23s5s;;4;72;0;72;;;;;;;
del30;5*16atcgca235;;5;79;10;69;;;;;;;
del33;5*16atcgca235;;5;92;10;82;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
del34;4*16atcgca235;;5;72;8;64;;;;;;;
;16atcgca2355;;;;2;-2;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
del41;4*16atcgca235;;4;61;8;53;;;;;;;
del46;4*16atcgca235;;4;65;8;57;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
del52;16-atc-235;;2;49;2;47;;;;;;;
;16-gca-235;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
del53;16atcgca235;;2;49;5;44;;;;;;;
;16atcgca235-atgj;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
del56;16atcgca235;;3;87;5;82;;;;;;;
;16-atc-235;;;;;;;;;;;;
;16atcgca-23-23-5s;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
del59;2*16atcgca235;;2;56;4;52;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
del62;16atcgca235-5s-5s;;4;66;3;63;;;;;;;
;16s23s5s;;;;;;;;;;;;
;16s-23s;;;;;;;;;;;;
;16-atc;;;;;;;;;;;;
;5s;;65;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;Total;;;;;Notes
19;;;;;;;;;'''16s23s5s;'''16-atcgca-35;'''16-gca-235;'''16-atc-235;
;Total;;;1186;89;1097;;'''sans;17;40;1;2;'''1-3
;Moyenne;;;62;5;58;;'''1-3;;1;;;16atcgca235-atgj
;ecartype;;;14;3;12;61;'''total;17;41;1;2;
;max;;;92;10;82;;;;;;;'''avant
;min;;;36;0;34;;;;;;;gca-16-atc-235
;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;'''incomplets
;;;;;;;;;;;;;16s-23s
;;;;;;;;;;;;;16-atc
;;;;;;;;;;;;;16atcgca-23-23-5s
65 blocs;19 génomes;0 cds;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;'''5s de trop
;;;;;;;;;;;;;16atcgca2355
;;;;;;;;;;;;;16s23s5s-5s
;;;;;;;;;;;;;16atcgca235-5s-5s
;;;;;;;;;;;;;3*5s

delta notes

Lien tableur: delta notes

delta typage

Lien tableur: delta typage

Tableau des noms delta

Lien tableur: delta noms

;;;2.9.19 Paris;fait vers le 20.8.19;;
;;;55;65;deltaproteo;3635
;;;;;;
rupture;notes;rRNAs;fait;code;tRNAs;genomes
1;;222;1;del01;§49;Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1 
;;;;del02;49;Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C 
1;;222;1;del03;§53;Anaeromyxobacter sp. Fw109-5 
1;;;;del04;§51;Anaeromyxobacter sp. K 
1;;222;1;del05;§36;Bacteriovorax marinus SJ 
1;;;;del06;§37;Bdellovibrio bacteriovorus 109J 
;;;;del07;37;Bdellovibrio bacteriovorus str. Tiberius 
;;;;del08;35;Bdellovibrio bacteriovorus W 
1;;;;del09;§34;Bdellovibrio exovorus JSS 
1;;;;del10;§38;Candidatus Babela massiliensis 673862 
1;;333;1;del11;§61;Corallococcus coralloides DSM 2259 
1;;;;del12;§48;Desulfarculus baarsii DSM 2075 
1;;222;1;del13;§62;Desulfatibacillum alkenivorans AK-01 
1;;;;del14;§49;Desulfobacca acetoxidans DSM 11109 
1;;866;1;del15;§55;Desulfobacterium autotrophicum HRM2 
1;;;;del16;§52;Desulfobacula toluolica Tol2 
1;;;;del17;§54;Desulfobulbus propionicus DSM 2032 
1;;;;del18;§47;Desulfocapsa sulfexigens DSM 10523 
1;;111;1;del19;§54;Desulfococcus oleovorans Hxd3 
1;;;;del20;§50;Desulfohalobium retbaense DSM 5692 
1;;;;del21;§66;Desulfomicrobium baculatum DSM 4028 
1;;;;del22;§61;Desulfomonile tiedjei DSM 6799 
1;;877;1;del23;§68;Desulfotalea psychrophila LSv54 
1;;;;del24;§56;Desulfovibrio aespoeensis Aspo-2 
1;;;;del25;§62;Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay 
1;;444;1;del26;§72;Desulfovibrio alaskensis G20 
1;;;;del27;§58;Desulfovibrio desulfuricans ND132 
1;;;;del28;§54;Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774 
1;;;;del29;§49;Desulfovibrio gigas DSM 1382 ATCC 19364 
1;;555;1;del30;§79;Desulfovibrio hydrothermalis AM13 DSM 14728 
1;;;;del31;§61;Desulfovibrio magneticus RS-1 
1;;;;del32;§64;Desulfovibrio piezophilus C1TLV30 
1;;555;1;del33;§92;Desulfovibrio salexigens DSM 2638 
1;;655;1;del34;§72;Desulfovibrio vulgaris DP4 
;;;;del35;71;Desulfovibrio vulgaris RCH1 
;;;;del36;72;Desulfovibrio vulgaris str. Hildenborough 
;;;;del37;66;Desulfovibrio vulgaris str. Miyazaki F 
1;;;;del38;§49;Desulfurella acetivorans A63 
1;;;;del39;§49;Desulfurivibrio alkaliphilus AHT2 
1;;;;del40;§55;Geoalkalibacter subterraneus Red1 
1;;444;1;del41;§61;Geobacter bemidjiensis Bem 
1;;;;del42;§50;Geobacter daltonii FRC-32 
1;;;;del43;§45;Geobacter lovleyi SZ 
1;;;;del44;§51;Geobacter metallireducens GS-15 
1;;;;del45;§53;Geobacter pickeringii G13 
1;;444;1;del46;§65;Geobacter sp. M18 
1;;;;del47;§60;Geobacter sp. M21 
1;;;;del48;§56;Geobacter sulfurreducens AM-1 
;;;;del49;49;Geobacter sulfurreducens KN400 
;;;;del50;51;Geobacter sulfurreducens PCA 
1;;;;del51;§50;Geobacter uraniireducens Rf4 
1;;222;1;del52;§49;Haliangium ochraceum DSM 14365 
1;;222;1;del53;§49;Hippea maritima DSM 10411 
1;;;;del54;§46;Lawsonia intracellularis N343 
;;;;del55;46;Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 
1;;334;1;del56;§70;Myxococcus fulvus HW-1 
1;;-;;del57;§87;Myxococcus stipitatus DSM 14675 
1;;;;del58;§69;Myxococcus xanthus DK 1622 
1;;222;1;del59;§56;Pelobacter carbinolicus DSM 2380 
1;;;;del60;§55;Pelobacter propionicus DSM 2379 
1;;;;del61;§66;Sorangium cellulosum So ce56 So ce 56 
;;543;1;del62;66;Sorangium cellulosum So0157-2 
1;;;;del63;§54;Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 
1;;;;del64;§54;Syntrophobacter fumaroxidans MPOB 
1;;;;del65;§50;Syntrophus aciditrophicus SB 
55;;;19;;;

Epsilon

epsilon blocs

Lien tableur: epsilon blocs

113 blocs;38 génomes ;1 cds;;;;;;;;;;;;
11 blocs cassés,  (16s,235), pour 6 génomes;;;aag-caa-atg-16s-cds-235;;;;;;;;;;;
zéro blocs 16235;;;;;;;;;;;;;;
Les s° sont considérés comme des intercalaires;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
epsilon blocs;;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;ep001-23;;;;;;Notes
ep001;4*16atcgca235;;5;54;11;43;;;6-atcgca-35;16-gcaatc-35;16-gca-35;16-atc-35;avant;
;aac-16atcgca235;;;;;;;sans;12;9;8;4;3;1-3
;;;;;;;;1-3;3;;;;;3*16atcgca235-acc
ep004;2*16atcgca235;;4;56;9;47;;;;;;;;
;2*16atcgca235-acc;;;;;;39;total;15;9;8;4;3;avant
;;;;;;;;;;;;;;aac-16atcgca235
ep005;3*16atcgca235;;5;56;13;43;;;;;;;;aac-aac-16atcgca235
;aac-aac-16atcgca235;;;;;;;;;;;;;aag-caa-atg-16s-cds-235
;16atcgca235-acc;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;incomplets
ep006;3*16-gca-atc-235;;3;45;6;39;;;;;;;;2*16s-gca-atc-cds
;;;;;;;;;;;;;;
ep007;2*16-gca-atc-235;;3;41;6;35;;;;;;;;autres incomplets
;16-gca-atc-2355;;;;;;;;;;;;;2*235
;;;;;;;;;;;;;;3*16-16s°-gca-atc-235
ep013;3*16atcgca235;;3;47;6;41;;;;;;;;4*16-gca-23-23s°-5s
;;;;;;;;;;;;;;2*16-atc-23-23s°-5s
ep014;3*16-16s°-gca-atc-235;;3;47;6;41;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;5s de trop
ep015;2*16-gca-23-23s°-5s;;3;45;3;42;;;;;;;;16-gca-atc-2355
;16-atc-23-23s°-5s;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
ep018;2*16-gca-235;;3;44;3;41;;;;;;;;
;16-atc-235;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
ep019;2*16-gca-23-23s°-5s;;3;44;3;41;;;;;;;;
;16-atc-23-23s°-5s;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
ep022;aag-caa-atg-16s-cds-235;;3;44;7;37;;;;;;;;
;2*16s-gca-atc-cds;;;;;;;;;;;;;
;2*235;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
ep023;2*16-gca-235;;3;44;3;41;;;;;;;;
;16-atc-235;;41;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;ep024-151;;;;;;Notes
ep024;3*16-gca-atc-235;;3;43;6;37;;;6-atcgca-35;16-gcaatc-35;16-gca-35;16-atc-35;avant;
ep025;3*16-gca-atc-235;;3;45;6;39;;sans;17;20;;;1;avant
;;;;;;;;1-3;;;;;;8aas-16-gca-atc-235-cds
ep057;2*16-gca-atc-235;;3;47;14;33;;;;;;;;
;8aas-16-gca-atc-235-cds;;;;;;38;total;17;20;0;0;1;exception
;;;;;;;;;;;;;;16-gca-atc-235-cds
ep063;3*16-gca-atc-235;;3;47;6;41;;;;;;;;
ep064;3*16-gca-atc-235;;3;46;6;40;;;;;;;;incomplets
ep065;3*16-gca-atc-235;;3;47;6;41;;;;;;;;9*16s, 235
;;;;;;;;;;;;;;2*16s, 235, 5
ep067;2*16-gca-atc-235;;3;44;6;38;;;;;;;;16s
;16-gca-atc-235-cds;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;autres incomplets
ep068;2*16s, 235;;2;37;0;37;;;;;;;;23s-23s’-23s°-5s
ep069;2*16s, 235;;2;37;0;37;;;;;;;;23s°-23s’-5s
ep070;2*16s, 235;;2;39;0;39;;;;;;;;23s5s
;;;;;;;;;;;;;;
ep072;2*16atcgca235;;2;40;2;38;;;;;;;;5s de trop
;;;;;;;;;;;;;;2*16s, 235, 5s
ep074;2*16s, 235, 5s;;2;37;0;37;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;ep057
ep075;16s;;1;42;0;42;;;;;;;;aaa
;23s-23s’-23s°-5s;;;;;;;;;;;;;gta
;23s°-23s’-5s;;;;;;;;;;;;;gac
;;;;;;;;;;;;;;aaa
ep076;16atcgca235;;1;38;2;36;;;;;;;;gta
ep077;2*16atcgca235;;2;39;4;35;;;;;;;;gac
;;;;;;;;;;;;;;aaa
ep078;16s, 235;;1;36;0;36;;;;;;;;gag
;;;;;;;;;;;;;;
ep146;2*16s, 235;;2;37;0;37;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
ep148;4*16atcgca235;;4;49;8;41;;;;;;;;
ep149;2*16atcgca235;;2;45;4;41;;;;;;;;
ep150;3*16atcgca235;;3;45;6;39;;;;;;;;
ep151;3*16atcgca235;;3;51;6;45;;;;;;;;
;;;50;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;ep152-158;;;;;;Notes
ep152;2*16-gca-235;;4;44;4;40;;;6-atcgca-35;16-gcaatc-35;16-gca-35;16-atc-35;avant;
;2*16-atc-235;;;;;;;sans;6;;10;5;;1-3
;;;;;;;;1-3;1;;;;;16atcgca235-cgc
ep153;3*16-gca-235;;4;46;4;42;;;;;;;;
;16-atc-235;;;;;;22;total;7;0;10;5;0;
;;;;;;;;;;;;;;
ep154;3*16-gca-235;;4;50;4;46;;;;;;;;
;16-atc-235;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;Total Notes
ep155;2*16atcgca235;;2;42;4;38;;;;;;;;1-3
;;;;;;;;;;;;;;16atcgca235-cgc
ep156;2*16atcgca235;;3;44;7;37;;;;;;;;3*16atcgca235-acc
;16atcgca235-cgc;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;avant
ep157;2*16atcgca235;;2;47;4;43;;;;;;;;aac-16atcgca235
;;;;;;;;;;;;;;aac-aac-16atcgca235
ep158;2*16-gca-235;;3;45;3;42;;;;;;;;aag-caa-atg-16s-cds-235
;16-atc-235;;22;;;;;;;;;;;8aas-16-gca-atc-235-cds
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;Total;;;;;;
40;;;;;;;;;6-atcgca-35;16-gcaatc-35;16-gca-35;16-atc-35;avant;incomplets
;Total;;;1776;188;1588;;sans;35;29;18;9;4;9*16s, 235
;Moyenne;;;44;5;40;;1-3;4;0;0;0;0;2*16s, 235, 5
;ecartype;;;5;3;3;;;;;;;;16s
;max;;;56;14;47;99;total;39;29;18;9;4;2*16s-gca-atc-cds
;min;;;36;0;33;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;autres incomplets
;;;;;;;;;;;;;;3*16-16s°-gca-atc-235
;;;;;;;;;;;;;;4*16-gca-23-23s°-5s
;;;;;;;;;;;;;;2*16-atc-23-23s°-5s
;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;23s-23s’-23s°-5s
;;;;;;;;;;;;;;23s°-23s’-5s
;;;;;;;;;;;;;;3*235
;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;exception
;;;;;;;;;;;;;;16-gca-atc-235-cds
113 blocs;40 génomes ;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;5s de trop
1 cds;zéro blocs 16235;;;;;;;;;;;;;16-gca-atc-2355
;;;;;;;;;;;;;;2*16s, 235, 5

epsilon notes

Lien tableur: epsilon notes

epsilon typage

epsilon type 16-y-235 après 16s

Lien tableur: epsilon type 16-y-235 après 16s

16s-y-23s5s;;;;;;;
types;;tableau;décompte;avant 16s;incomplets;total;%
atcgca;;39;39;2;;41;37
gcaatc;;29;26;1;;27;24
gca;;18;14;;;14;13
atc;;9;7;;;7;6
16s-16s°-gcaatc-235 ;;;3;;;3;3
16s-gca-23-23s°-5s;;;4;;;4;4
16s-atc-23-23s°-5s ;;;2;;;2;2
;;;;;;;
16s-cds-235;;;;1;;1;1
;;;;;;;
16s, 235;;;;;9;9;8
16s, 235, 5s;;;;;2;2;2
;;;;;;;
16s, -;;;;;1;1;1
23s°-23s’-5s;;;;;;;
23s-23s’-23s°-5s ;;;;;;;
total;;;;;;111;100
total atc, gca;;95;95;3;;98;88
;;;;;;;
16s-y-23s5s;;;;;;;
tRNA;total;%;;;;;
atc;74;40;;;;;
gca;89;48;;;;;
cds;12;6;;;;;
16s;11;6;;;;;
;186;;;;;;

epsilon type 16235-z après 5s

Lien tableur: epsilon type 16235-z après 5s

epsilon type x-16235 avant 16s

Lien tableur: epsilon type x-16235 avant 16s

Tableau des noms epsilon

Lien tableur: epsilon noms

;;;3.9.19 Paris;fait vers le 20.8.19;;
;;;38;158;epsilonprote;6638
;;;;;;
ruptures;notes;rRNAs;fait;code;tRNAs;génomes
1;;555;1;ep001;$54;Arcobacter butzleri 7h1h 
;;;;ep002;54;Arcobacter butzleri ED-1 
;;;;ep003;54;Arcobacter butzleri RM4018 
1;;444;1;ep004;$56;Arcobacter nitrofigilis DSM 7299 
1;;555;1;ep005;$56;Arcobacter sp. L 
1;;333;1;ep006;$45;Campylobacter coli 15-537360 
;;433;1;ep007;41;Campylobacter coli 76339 
;;;;ep008;45;Campylobacter coli CVM N29710 
;;;;ep009;45;Campylobacter coli FB1 
;;;;ep010;45;Campylobacter coli RM1875 
;;;;ep011;41;Campylobacter coli RM4661 
;;;;ep012;45;Campylobacter coli RM5611 
1;;333;1;ep013;$47;Campylobacter concisus 13826 
1;;333;1;ep014;$47;Campylobacter curvus 525.92 
1;;333;1;ep015;$45;Campylobacter fetus subsp. fetus 04/554 
;;;;ep016;44;Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40 
;;;;ep017;44;Campylobacter fetus subsp. testudinum 03-427 
;;333;1;ep018;44;Campylobacter fetus subsp. testudinum pet-3 
;;333;1;ep019;44;Campylobacter fetus subsp. venerealis 97/608 
;;;;ep020;44;Campylobacter fetus subsp. venerealis cfvi03/293 
;;;;ep021;44;Campylobacter fetus subsp. venerealis str. 84-112 
1;;333;1;ep022;$44;Campylobacter hominis ATCC BAA-381 
1;;333;1;ep023;$44;Campylobacter iguaniorum 1485E 
1;;333;1;ep024;$43;Campylobacter insulaenigrae NCTC 12927 
1;;333;1;ep025;$45;Campylobacter jejuni 32488 
;;;;ep026;45;Campylobacter jejuni 4031 
;;;;ep027;45;Campylobacter jejuni RM1221 
;;;;ep028;45;Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97 
;;;;ep029;45;Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-0949 
;;;;ep030;45;Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-1597 
;;;;ep031;41;Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2425 
;;;;ep032;45;Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2426 
;;;;ep033;45;Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2538 
;;;;ep034;45;Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2544 
;;;;ep035;45;Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-6200 
;;;;ep036;45;Campylobacter jejuni subsp. jejuni 01-1512 
;;;;ep037;45;Campylobacter jejuni subsp. jejuni 35925B2 
;45+41;;;ep038;86;Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 
;;;;ep039;45;Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81116 NCTC 11828 
;;;;ep040;45;Campylobacter jejuni subsp. jejuni CG8421 
;;;;ep041;47;Campylobacter jejuni subsp. jejuni F38011 
;;;;ep042;45;Campylobacter jejuni subsp. jejuni IA3902 
;;;;ep043;45;Campylobacter jejuni subsp. jejuni ICDCCJ07001 
;;;;ep044;45;Campylobacter jejuni subsp. jejuni M1 
;;;;ep045;45;Campylobacter jejuni subsp. jejuni MTVDSCj20 
;;;;ep046;45;Campylobacter jejuni subsp. jejuni NCTC 11168 ATCC 700819 
;;;;ep047;45;Campylobacter jejuni subsp. jejuni NCTC 11168-BN148 
;;;;ep048;45;Campylobacter jejuni subsp. jejuni NCTC 11168-GSv NCTC 11168-rNRC 
;;;;ep049;45;Campylobacter jejuni subsp. jejuni NCTC 11168-K12E5 
;;;;ep050;45;Campylobacter jejuni subsp. jejuni NCTC 11168-Kf1 
;;;;ep051;45;Campylobacter jejuni subsp. jejuni NCTC 11168-mcK12E5 
;;;;ep052;45;Campylobacter jejuni subsp. jejuni NCTC 11168-mfK12E5 
;;;;ep053;42;Campylobacter jejuni subsp. jejuni PT14 
;;;;ep054;45;Campylobacter jejuni subsp. jejuni R14 
;;;;ep055;45;Campylobacter jejuni subsp. jejuni S3 
;;;;ep056;45;Campylobacter jejuni subsp. jejuni YH001 
1;;333;1;ep057;$47;Campylobacter lari CCUG 22395 
;;;;ep058;47;Campylobacter lari NCTC 11845 
;;;;ep059;44;Campylobacter lari RM16701 
;;;;ep060;44;Campylobacter lari RM16712 
;;;;ep061;47;Campylobacter lari RM2100 ATCC BAA-1060D 
;;;;ep062;44;Campylobacter lari subsp. concheus LMG 11760 
1;;333;1;ep063;$47;Campylobacter peloridis LMG 23910 
1;;333;1;ep064;$46;Campylobacter sp. RM16704 
1;;333;1;ep065;$47;Campylobacter subantarcticus LMG 24374 
;;;;ep066;48;Campylobacter subantarcticus LMG 24377 
1;;333;1;ep067;$44;Campylobacter volucris LMG 24379 
1;;222;1;ep068;$37;Helicobacter acinonychis str. Sheeba 
1;;222;1;ep069;$37;Helicobacter bizzozeronii CIII-1 
1;;222;1;ep070;$39;Helicobacter cetorum MIT 00-7128 
;;;;ep071;38;Helicobacter cetorum MIT 99-5656 
1;;222;1;ep072;$40;Helicobacter cinaedi ATCC BAA-847 
;;;;ep073;40;Helicobacter cinaedi PAGU611 
1;;221;1;ep074;$37;Helicobacter felis ATCC 49179 
1;;213;1;ep075;$42;Helicobacter heilmannii ASB1.4 
1;;111;1;ep076;$38;Helicobacter hepaticus ATCC 51449 
1;;222;;ep077;$39;Helicobacter mustelae 12198 
1;;111;;ep078;$36;Helicobacter pylori 2017 
;;;;ep079;36;Helicobacter pylori 2018 
;;;;ep080;74;Helicobacter pylori 26695 
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;;;;ep082;37;Helicobacter pylori 26695-1CH 
;;;;ep083;37;Helicobacter pylori 26695-1CL 
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;;;;ep099;38;Helicobacter pylori Cuz20 
;;;;ep100;37;Helicobacter pylori ELS37 
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;;;;ep117;37;Helicobacter pylori oki102 
;;;;ep118;37;Helicobacter pylori oki112 
;;;;ep119;36;Helicobacter pylori oki128 
;;;;ep120;37;Helicobacter pylori oki154 
;;;;ep121;37;Helicobacter pylori oki422 
;;;;ep122;37;Helicobacter pylori oki673 
;;;;ep123;37;Helicobacter pylori oki828 
;;;;ep124;37;Helicobacter pylori oki898 
;;;;ep125;36;Helicobacter pylori P12 
;;;;ep126;37;Helicobacter pylori PeCan18 
;;;;ep127;37;Helicobacter pylori PeCan4 
;;;;ep128;37;Helicobacter pylori Puno120 
;;;;ep129;37;Helicobacter pylori Puno135 
;;;;ep130;37;Helicobacter pylori Rif1 
;;;;ep131;37;Helicobacter pylori Rif2 
;;;;ep132;37;Helicobacter pylori Sat464 
;;;;ep133;38;Helicobacter pylori Shi112 
;;;;ep134;37;Helicobacter pylori Shi169 
;;;;ep135;37;Helicobacter pylori Shi417 
;;;;ep136;37;Helicobacter pylori Shi470 
;;;;ep137;36;Helicobacter pylori SJM180 
;;;;ep138;36;Helicobacter pylori SNT49 Santal49 
;;;;ep139;36;Helicobacter pylori SouthAfrica20 
;;;;ep140;37;Helicobacter pylori SouthAfrica7 
;;;;ep141;37;Helicobacter pylori UM032 
;;;;ep142;37;Helicobacter pylori UM037 
;;;;ep143;37;Helicobacter pylori UM066 
;;;;ep144;37;Helicobacter pylori UM298 
;;;;ep145;37;Helicobacter pylori UM299 
;;222;1;ep146;37;Helicobacter pylori v225d 
;;;;ep147;37;Helicobacter pylori XZ274 
1;;444;1;ep148;$49;Nautilia profundicola AmH 
1;;222;1;ep149;$45;Nitratifractor salsuginis DSM 16511 
1;;333;1;ep150;$45;Nitratiruptor sp. SB155-2 
1;;333;1;ep151;$51;Sulfuricurvum kujiense DSM 16994 
1;;444;1;ep152;$44;Sulfurimonas autotrophica DSM 16294 
1;;444;1;ep153;$46;Sulfurimonas denitrificans DSM 1251 
1;;444;1;ep154;$50;Sulfurimonas gotlandica GD1 
1;;222;1;ep155;$42;Sulfurospirillum barnesii SES-3 
1;;333;1;ep156;$44;Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946 
1;;222;1;ep157;$47;Sulfurospirillum multivorans DSM 12446 
1;;333;1;ep158;$45;Sulfurovum sp. NBC37-1 
36;;;38;;;

Actinobacteria

actino

actino blocs

Lien tableur: actino blocs

actino blocs;;;;;;;;;;;
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;;;;;;;;;;;
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;;;120;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;act162-401;;;Notes
act162;3*16s23s5s;;3;54;0;54;;;'''16s23s5s;'''16-cds-235;
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;;;60;;;;;;;;
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99;;;;;;;;;'''16s23s5s;'''16-cds-235;
;Total;;;5356;2;5354;;'''sans;329;22;'''1-3
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;max;;;110;1;110;353;'''total;329;24;'''incomplets
;min;;;45;0;45;;;;;16s23s
;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;'''autres incomplets
354 blocs;99 génomes;24 cds;;;;;;;;;2*23s5s
blocs type;16s23s5s;354;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;'''5s de trop
;;;;;;;;;;;4*5s

actino notes

Lien tableur: actino notes

actino typage

Lien tableur: actino typage

Tableau des noms actino

Lien tableur: Tableau des noms actino

;rRNA;;;213;417;actinobacteria;;22215
;ruptures;notes;rRNAs;fait;code;tRNAs;génomes;
acid;1;;222;1;act001;§46;Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 ;
;1;;111;1;act002;§47;Acidothermus cellulolyticus 11B ATCC 43068 ;
;1;;333;1;act003;§46;Actinobaculum schaalii CCUG 27420 ;
;1;;333;1;act004;§76;Actinoplanes friuliensis DSM 7358 ;
;1;;666;1;act005;§62;Actinoplanes missouriensis 431 ;
;1;;444;1;act006;§64;Actinoplanes sp. N902-109 ;
;1;;666;1;act007;§110;Actinoplanes sp. SE50/110 ;
;1;;455;1;act008;§63;Actinosynnema mirum DSM 43827 ;
cori;1;;222;1;act009;§49;Adlercreutzia equolifaciens DSM 19450 ;
;1;;444;1;act010;§58;Amycolatopsis japonica MG417-CF17 ;
;1;;-;;act011;§56;Amycolatopsis lurida NRRL 2430 ;
;1;;444;1;act012;§55;Amycolatopsis mediterranei RB ;
;;2*55;;;act013;110;Amycolatopsis mediterranei S699 ;
;;;;;act014;55;Amycolatopsis mediterranei U32 ;
;1;;333;1;act015;§52;Amycolatopsis methanolica 239 ;
;1;;444;1;act016;§52;Amycolatopsis orientalis HCCB10007 ;
;1;;333;1;act017;§47;Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 ;
;1;;444;1;act018;§50;Arcanobacterium haemolyticum DSM 20595 ;
;1;;766;1;act019;§64;Arthrobacter arilaitensis Re117 ;
;1;;666;1;act020;§58;Arthrobacter aurescens TC1 ATCC BAA-1386 ;
;1;;555;1;act021;§88;Arthrobacter chlorophenolicus A6 ;
;1;;444;1;act022;§50;Arthrobacter phenanthrenivorans Sphe3 ;
;1;;555;1;act023;§52;Arthrobacter sp. FB24 ;
;1;;222;1;act024;§46;Arthrobacter sp. IHBB 11108 ;
;1;;666;1;act025;§53;Arthrobacter sp. PAMC25486 ;
;1;;666;1;act026;§54;Arthrobacter sp. Rue61a ;
cori;1;;111;1;act027;§46;Atopobium parvulum DSM 20469 ;
;1;;222;1;act028;§46;Beutenbergia cavernae DSM 12333 ;
;1;;544;1;act029;§55;Bifidobacterium adolescentis 22L ;
;;;;;act030;54;Bifidobacterium adolescentis ATCC 15703 ;
;;;;;act031;56;Bifidobacterium adolescentis BBMN23 ;
;1;;656;1;act032;§53;Bifidobacterium animalis A6 ;
;;;;;act033;53;Bifidobacterium animalis RH ;
;;;;;act034;52;Bifidobacterium animalis subsp. animalis ATCC 25527 ;
;;;;;act035;53;Bifidobacterium animalis subsp. lactis AD011 ;
;;;;;act036;52;Bifidobacterium animalis subsp. lactis ATCC 27673 ;
;;;;;act037;53;Bifidobacterium animalis subsp. lactis B420 ;
;;;;;act038;53;Bifidobacterium animalis subsp. lactis BB-12 ;
;;;;;act039;53;Bifidobacterium animalis subsp. lactis BF052 ;
;;;;;act040;53;Bifidobacterium animalis subsp. lactis Bi-07 ;
;;;;;act041;53;Bifidobacterium animalis subsp. lactis Bl-04 ATCC SD5219 ;
;;;;;act042;53;Bifidobacterium animalis subsp. lactis Bl12 ;
;;;;;act043;53;Bifidobacterium animalis subsp. lactis BLC1 ;
;;;;;act044;53;Bifidobacterium animalis subsp. lactis CNCM I-2494 ;
;;;;;act045;52;Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 ;
;;;;;act046;53;Bifidobacterium animalis subsp. lactis KLDS2.0603 ;
;;;;;act047;53;Bifidobacterium animalis subsp. lactis V9 ;
;1;;222;1;act048;§45;Bifidobacterium asteroides PRL2011 ;
;1;;333;1;act049;§53;Bifidobacterium bifidum BGN4 ;
;;;;;act050;54;Bifidobacterium bifidum PRL2010 ;
;;;;;act051;54;Bifidobacterium bifidum S17 ;
;1;;222;1;act052;§52;Bifidobacterium breve 12L ;
;;;;;act053;53;Bifidobacterium breve 689b ;
;;;;;act054;53;Bifidobacterium breve ACS-071-V-Sch8b ;
;;;;;act055;54;Bifidobacterium breve JCM 7017 ;
;;;;;act056;58;Bifidobacterium breve JCM 7019 ;
;;;;;act057;53;Bifidobacterium breve NCFB 2258 ;
;;;;;act058;53;Bifidobacterium breve S27 ;
;;;;;act059;54;Bifidobacterium breve UCC2003 ;
;1;;333;1;act060;§46;Bifidobacterium coryneforme LMG18911 ;
;1;;544;1;act061;§56;Bifidobacterium dentium Bd1 ;
;1;;333;1;act062;§47;Bifidobacterium indicum LMG 11587 DSM 20214 ;
;1;;655;1;act063;§58;Bifidobacterium kashiwanohense PV20-2 ;
;1;;444;1;act064;§56;Bifidobacterium longum 105-A ;
;;;;;act065;55;Bifidobacterium longum BXY01 ;
;;;;;act066;60;Bifidobacterium longum DJO10A ;
;;;;;act067;57;Bifidobacterium longum NCC2705 ;
;;;;;act068;62;Bifidobacterium longum subsp. infantis 157F ;
;;86*2;;;act069;172;Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697 JCM 1222 DSM 20088 ;
;;;;;act070;55;Bifidobacterium longum subsp. longum BBMN68 ;
bifi;1;;111;1;act071;§58;Bifidobacterium longum subsp. longum F8 ;
;;;;;act072;56;Bifidobacterium longum subsp. longum GT15 ;
;;;;;act073;78;Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 ;
;;;;;act074;55;Bifidobacterium longum subsp. longum JDM301 ;
;;;;;act075;56;Bifidobacterium longum subsp. longum KACC 91563 ;
;1;;444;1;act076;§53;Bifidobacterium pseudolongum PV8-2 ;
;1;;444;1;act077;§47;Bifidobacterium thermophilum RBL67 ;
;1;;333;1;act078;§55;Blastococcus saxobsidens DD2 ;
;1;;333;1;act079;§52;Brachybacterium faecium DSM 4810 ;
;1;;333;1;act080;§65;Catenulispora acidiphila DSM 44928 ;
;1;;222;1;act081;§47;Cellulomonas fimi ATCC 484 ;
;1;;222;1;act082;§46;Cellulomonas flavigena DSM 20109 ;
;1;;222;1;act083;§46;Cellvibrio gilvus ATCC 13127 ;
;1;;222;1;act084;§47;Clavibacter michiganensis subsp. insidiosus R1-1 ;
;;;;;act085;46;Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 ;
;;;;;act086;46;Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis NCPPB 2581 ;
;;;;;act087;46;Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus ATCC33113 ;
rub;1;;111;1;act088;§47;Conexibacter woesei DSM 14684 ;
cori;1;;222;1;act089;§49;Coriobacteriaceae bacterium 68-1-3 ;
cori;1;;222;1;act090;§47;Coriobacterium glomerans PW2 ;
;1;;444;1;act091;§50;Corynebacterium argentoratense DSM 44202 ;
;1;;444;1;act092;§52;Corynebacterium atypicum R2070 ;
;1;;434;1;act093;§58;Corynebacterium aurimucosum ATCC 700975 ;
;1;;777;1;act094;§62;Corynebacterium callunae DSM 20147 ;
cory;1;;444;1;act095;§52;Corynebacterium camporealensis DSM 44610 ;
;1;;444;1;act096;§51;Corynebacterium casei LMG S-19264 ;
;1;;555;1;act097;§50;Corynebacterium diphtheriae 241 ;
;;;;;act098;51;Corynebacterium diphtheriae 31A ;
;;;;;act099;53;Corynebacterium diphtheriae BH8 ;
;;;;;act100;58;Corynebacterium diphtheriae C7 beta ;
;;;;;act101;54;Corynebacterium diphtheriae CDCE 8392 ;
;;;;;act102;53;Corynebacterium diphtheriae HC01 ;
;;;;;act103;54;Corynebacterium diphtheriae HC02 ;
;;;555;1;act104;51;Corynebacterium diphtheriae HC03 ;
;;;;;act105;51;Corynebacterium diphtheriae HC04 ;
;;;;;act106;50;Corynebacterium diphtheriae INCA 402 ;
;;;;;act107;53;Corynebacterium diphtheriae PW8 ;
;;;;;act108;51;Corynebacterium diphtheriae VA01 ;
;1;;444;1;act109;§57;Corynebacterium doosanense CAU 212 DSM 45436 ;
;1;;555;1;act110;§56;Corynebacterium efficiens YS-314 ;
;1;;333;1;act111;§51;Corynebacterium falsenii DSM 44353 BL 8171 ;
;1;;666;1;act112;§58;Corynebacterium glutamicum AR1 ;
;;;;;act113;60;Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 ;
;;;666;1;act114;61;Corynebacterium glutamicum ATCC 21831 ;
;;;;;act115;60;Corynebacterium glutamicum B253 ;
;;;;;act116;60;Corynebacterium glutamicum K051 ATCC 13032 substr. K051 ;
;;;;;act117;59;Corynebacterium glutamicum MB001 ;
;;;666;1;act118;60;Corynebacterium glutamicum R ;
;;;;;act119;61;Corynebacterium glutamicum SCgG1 ;
;;;666;1;act120;61;Corynebacterium glutamicum SCgG2 ;
;1;;444;1;act121;§52;Corynebacterium glyciniphilum AJ 3170 ;
;1;;444;1;act122;§54;Corynebacterium halotolerans YIM 70093 DSM 44683 ;
;1;;444;1;act123;§54;Corynebacterium humireducens NBRC 106098 DSM 45392 ;
;1;;444;1;act124;§54;Corynebacterium imitans DSM 44264 ;
cory;1;;333;1;act125;§52;Corynebacterium jeikeium K411 ;
;1;;333;1;act126;§47;Corynebacterium kroppenstedtii DSM 44385 ;
cory;1;;444;1;act127;§52;Corynebacterium kutscheri DSM 20755 ;
;1;;444;1;act128;§54;Corynebacterium marinum DSM 44953 ;
;1;;444;1;act129;§55;Corynebacterium maris DSM 45190 ;
;1;;444;1;act130;§49;Corynebacterium pseudotuberculosis 1/06-A ;
;;;;;act131;48;Corynebacterium pseudotuberculosis 1002 ;
;;;;;act132;49;Corynebacterium pseudotuberculosis 226 ;
;;;;;act133;48;Corynebacterium pseudotuberculosis 258 ;
;;;;;act134;49;Corynebacterium pseudotuberculosis 267 ;
;;;;;act135;49;Corynebacterium pseudotuberculosis 3/99-5 ;
;;;;;act136;49;Corynebacterium pseudotuberculosis 31 ;
;;;;;act137;49;Corynebacterium pseudotuberculosis 316 ;
;;;;;act138;49;Corynebacterium pseudotuberculosis 42/02-A ;
;;;;;act139;49;Corynebacterium pseudotuberculosis 48252 ;
;;;;;act140;48;Corynebacterium pseudotuberculosis C231 ;
;;;;;act141;48;Corynebacterium pseudotuberculosis CIP 52.97 ;
;;;;;act142;49;Corynebacterium pseudotuberculosis Cp162 ;
;;;;;act143;49;Corynebacterium pseudotuberculosis CS 10 ;
;;;;;act144;49;Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 ;
;;;;;act145;49;Corynebacterium pseudotuberculosis Ft 2193/67 ;
;;;;;act146;49;Corynebacterium pseudotuberculosis I19 ;
;;;;;act147;49;Corynebacterium pseudotuberculosis P54B96 ;
;;;;;act148;48;Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 ;
;;;;;act149;49;Corynebacterium pseudotuberculosis VD57 ;
;1;;333;1;act150;§52;Corynebacterium resistens DSM 45100 ;
;1;;444;1;act151;§55;Corynebacterium singulare IBS B52218 ;
;1;;555;1;act152;§53;Corynebacterium sp. ATCC 6931 ;
;1;;555;1;act153;§57;Corynebacterium terpenotabidum Y-11 ;
;1;;444;1;act154;§53;Corynebacterium ulcerans 0102 ;
;;;;;act155;50;Corynebacterium ulcerans 05146 ;
;;;;;act156;50;Corynebacterium ulcerans 131002 ;
;;;;;act157;53;Corynebacterium ulcerans 210931 ;
;;;;;act158;52;Corynebacterium ulcerans 210932 ;
;;;;;act159;53;Corynebacterium ulcerans 809 ;
;;;;;act160;53;Corynebacterium ulcerans BR-AD22 ;
;;;;;act161;52;Corynebacterium ulcerans FRC11 ;
;1;;333;1;act162;§54;Corynebacterium urealyticum DSM 7109 ;
;;;;;act163;56;Corynebacterium urealyticum DSM 7111 ;
;1;;444;1;act164;§52;Corynebacterium ureicelerivorans IMMIB RIV-2301 ;
;1;;666;1;act165;§61;Corynebacterium variabile DSM 44702 ;
;1;;555;1;act166;§55;Corynebacterium vitaeruminis DSM 20294 ;
cori;1;;333;1;act167;§48;Cryptobacterium curtum DSM 15641 ;
;1;;333;1;act168;§50;Dermacoccus nishinomiyaensis M25 ;
cori;1;;333;1;act169;§49;Eggerthella lenta DSM 2243 ;
cori;1;;333;1;act170;§51;Eggerthella sp. YY7918 ;
;1;;;;act171;§47;Frankia alni ACN14a ACN14A ;
;1;;;;act172;§47;Frankia sp. CcI3 ;
;1;;;;act173;§53;Frankia sp. EAN1pec EAN1.pec ;
;1;;;;act174;§50;Frankia sp. EuI1c ;
;1;;;;act175;§50;Frankia symbiont of Datisca glomerata 4085684 ;
;1;;;;act176;§45;Gardnerella vaginalis 409-05 ;
;;;;;act177;45;Gardnerella vaginalis ATCC 14019 ;
;;;;;act178;45;Gardnerella vaginalis HMP9231 ;
;1;;;;act179;§55;Geodermatophilus obscurus DSM 43160 ;
;1;;;;act180;§50;Gordonia bronchialis DSM 43247 ;
;1;;;;act181;§50;Gordonia polyisoprenivorans VH2 ;
;1;;;;act182;§48;Gordonia sp. KTR9 ;
cori;1;;111;1;act183;§49;Gordonibacter pamelaeae 7-10-1-b 7-10-1-bT ;
acid;1;;-;;act184;§47;Ilumatobacter coccineus YM16-304 ;
;1;;;;act185;§50;Intrasporangium calvum DSM 43043 ;
;1;;;;act186;§49;Isoptericola variabilis 225 ;
;1;;;;act187;§55;Jonesia denitrificans DSM 20603 ;
;1;;;;act188;§49;Kineococcus radiotolerans SRS30216 ATCC BAA-149 ;
;1;;;;act189;§82;Kitasatospora setae KM-6054 ;
;1;;;;act190;§47;Kocuria rhizophila DC2201 DC2201 NBRC 103217 ;
;1;;;;act191;§57;Kribbella flavida DSM 17836 ;
;1;;;;act192;§49;Kutzneria albida DSM 43870 ;
;1;;;;act193;§48;Kytococcus sedentarius DSM 20547 ;
;1;;;;act194;§47;Leifsonia xyli subsp. cynodontis DSM 46306 ;
;;;;;act195;46;Leifsonia xyli subsp. xyli str. CTCB07 ;
;1;;;;act196;§47;Microbacterium testaceum StLB037 ;
;1;;;;act197;§48;Micrococcus luteus NCTC 2665 ;
;;;;;act198;48;Micrococcus luteus trpE16 ;
;1;;;;act199;§50;Microlunatus phosphovorus NM-1 ;
;1;;;;act200;§58;Micromonospora aurantiaca ATCC 27029 ;
;1;;;;act201;§58;Micromonospora sp. L5 ;
;1;;;;act202;§46;Mobiluncus curtisii ATCC 43063 ;
;1;;333;1;act203;§53;Modestobacter marinus BC501 ;
;1;;;;act204;§49;Mycobacterium abscessus ;
;;;;;act205;46;Mycobacterium abscessus 4529 ;
;;;;;act206;46;Mycobacterium abscessus DJO-44274 ;
;;;;;act207;50;Mycobacterium abscessus subsp. bolletii 103 ;
;;;;;act208;52;Mycobacterium abscessus subsp. bolletii 50594 ;
;;;;;act209;49;Mycobacterium abscessus subsp. bolletii CCUG 48898 JCM 15300 ;
;;;;;act210;49;Mycobacterium abscessus subsp. bolletii MA 1948 ;
;;;;;act211;49;Mycobacterium abscessus subsp. bolletii MC1518 ;
;;;;;act212;48;Mycobacterium abscessus subsp. bolletii MM1513 ;
;;;;;act213;46;Mycobacterium abscessus subsp. bolletii str. GO 06 ;
;1;;;;act214;§46;Mycobacterium africanum GM041182 ;
;1;;;;act215;§47;Mycobacterium avium 104 ;
;;;;;act216;47;Mycobacterium avium subsp. avium 2285 R ;
;;;;;act217;47;Mycobacterium avium subsp. avium 2285 S ;
;;;;;act218;47;Mycobacterium avium subsp. avium DJO-44271 ;
;;;;;act219;48;Mycobacterium avium subsp. hominissuis TH135 ;
;;;;;act220;47;Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis E1 ;
;;;;;act221;47;Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis E93 ;
;;;;;act222;47;Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10 ;
;;;;;act223;47;Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4 ;
;1;;;;act224;§46;Mycobacterium bovis ATCC BAA-935 ;
;;;;;act225;46;Mycobacterium bovis BCG str. ATCC 35743 63839 ;
;;;;;act226;46;Mycobacterium bovis BCG str. Korea 1168P ;
;;;;;act227;46;Mycobacterium bovis BCG str. Mexico ;
;;;;;act228;46;Mycobacterium bovis BCG str. Moreau RDJ ;
;;;;;act229;48;Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2 BCG Pasteur 1173P2 ;
;;;;;act230;46;Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172 ;
;1;;;;act231;§46;Mycobacterium canettii CIPT 140010059 ;
;;;;;act232;46;Mycobacterium canettii CIPT 140060008 ;
;;;;;act233;46;Mycobacterium canettii CIPT 140070008 ;
;;;;;act234;47;Mycobacterium canettii CIPT 140070010 ;
;;;;;act235;47;Mycobacterium canettii CIPT 140070017 ;
;1;;;;act236;§49;Mycobacterium chelonae ATCC 35752 ;
;1;;;;act237;§46;Mycobacterium chubuense NBB4 ;
;1;;;;act238;§47;Mycobacterium gilvum PYR-GCK ;
;1;;;;act239;§49;Mycobacterium gilvum Spyr1 ;
;1;;;;act240;§48;Mycobacterium indicus pranii MTCC 9506 ;
;1;;;;act241;§48;Mycobacterium intracellulare 1956 ;
;;;;;act242;49;Mycobacterium intracellulare ATCC 13950 ;
;;;;;act243;48;Mycobacterium intracellulare MOTT-02 ;
;;;;;act244;47;Mycobacterium intracellulare MOTT-64 ;
;1;;;;act245;§49;Mycobacterium kansasii 662 ;
;;;;;act246;49;Mycobacterium kansasii 824 ;
;;;;;act247;49;Mycobacterium kansasii ATCC 12478 ;
;1;;;;act248;§45;Mycobacterium leprae Br4923 ;
;1;;;;act249;§48;Mycobacterium liflandii 128FXT ;
;1;;;;act250;§50;Mycobacterium marinum E11 ;
;;;;;act251;49;Mycobacterium marinum M ;
;1;;;;act252;§48;Mycobacterium neoaurum VKM Ac-1815D ;
;1;;;;act253;§48;Mycobacterium rhodesiae NBB3 ;
;1;;;;act254;§49;Mycobacterium smegmatis INHR1 ;
;;;;;act255;49;Mycobacterium smegmatis INHR2 ;
;;;;;act256;50;Mycobacterium smegmatis JS623 ;
;;49*3;;;act257;147;Mycobacterium smegmatis str. MC2 155 ;
;1;;;;act258;§48;Mycobacterium sp. JDM601 ;
;1;;;;act259;§49;Mycobacterium sp. JLS ;
;1;;;;act260;§50;Mycobacterium sp. KMS ;
;1;;;;act261;§49;Mycobacterium sp. MCS ;
;1;;;;act262;§46;Mycobacterium sp. MOTT36Y ;
;1;;;;act263;§55;Mycobacterium sp. VKM Ac-1817D ;
;1;;;;act264;§45;Mycobacterium tuberculosis 0A005DS ;
;;;;;act265;46;Mycobacterium tuberculosis 0A012DS ;
;;;;;act266;46;Mycobacterium tuberculosis 0A029DS ;
;;;;;act267;46;Mycobacterium tuberculosis 0A033DS ;
;;;;;act268;44;Mycobacterium tuberculosis 0A036DS ;
;;;;;act269;46;Mycobacterium tuberculosis 0A087DS ;
;;;;;act270;46;Mycobacterium tuberculosis 0A092DS ;
;;;;;act271;46;Mycobacterium tuberculosis 0A093DS ;
;;;;;act272;45;Mycobacterium tuberculosis 0A094DS ;
;;;;;act273;45;Mycobacterium tuberculosis 0A115DS ;
;;;;;act274;45;Mycobacterium tuberculosis 0A117DS ;
;;;;;act275;44;Mycobacterium tuberculosis 0B026XDR ;
;;;;;act276;30;Mycobacterium tuberculosis 0B049XDR ;
;;;;;act277;46;Mycobacterium tuberculosis 0B070XDR ;
;;;;;act278;44;Mycobacterium tuberculosis 0B076XDR ;
;;;;;act279;46;Mycobacterium tuberculosis 0B123ND ;
;;;;;act280;42;Mycobacterium tuberculosis 0B169XDR ;
;;;;;act281;45;Mycobacterium tuberculosis 0B218DS ;
;;;;;act282;45;Mycobacterium tuberculosis 0B222DS ;
;;;;;act283;46;Mycobacterium tuberculosis 0B228DS ;
;;;;;act284;45;Mycobacterium tuberculosis 0B229DS ;
;;;;;act285;46;Mycobacterium tuberculosis 0B235DS ;
;;;;;act286;46;Mycobacterium tuberculosis 0B259XDR ;
;;;;;act287;46;Mycobacterium tuberculosis 0B329XDR ;
;;;;;act288;46;Mycobacterium tuberculosis 18b ;
;;;;;act289;46;Mycobacterium tuberculosis 49-02 ;
;;;;;act290;46;Mycobacterium tuberculosis 6A024XDR ;
cory;1;;111;1;act291;§46;Mycobacterium tuberculosis 7199-99 ;
;;;;;act292;46;Mycobacterium tuberculosis 96075 ;
;;;;;act293;45;Mycobacterium tuberculosis 96121 ;
;;;;;act294;46;Mycobacterium tuberculosis Beijing-like ;
;;;;;act295;46;Mycobacterium tuberculosis BT1 ;
;;;;;act296;46;Mycobacterium tuberculosis BT2 ;
;;;;;act297;46;Mycobacterium tuberculosis CAS/NITR204 ;
;;2*46;;;act298;92;Mycobacterium tuberculosis CCDC5079 ;
;;;;;act299;92;Mycobacterium tuberculosis CCDC5180 ;
;;;111;1;act300;46;Mycobacterium tuberculosis CDC1551 ;
;;;;;act301;46;Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 ;
;;;;;act302;46;Mycobacterium tuberculosis EAI5 ;
;;;;;act303;46;Mycobacterium tuberculosis EAI5/NITR206 ;
;;;;;act304;46;Mycobacterium tuberculosis F11 ;
;;;;;act305;46;Mycobacterium tuberculosis H37Ra ATCC 25177 ;
;;;;;act306;90;Mycobacterium tuberculosis H37Rv ;
;;;;;act307;45;Mycobacterium tuberculosis H37Rv TMC 102 ;
;;;;;act308;45;Mycobacterium tuberculosis H37RvSiena ;
;;;;;act309;46;Mycobacterium tuberculosis HKBS1 ;
;;;;;act310;46;Mycobacterium tuberculosis K ;
;;;;;act311;46;Mycobacterium tuberculosis KIT87190 ;
;;;;;act312;46;Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 ;
;;;;;act313;46;Mycobacterium tuberculosis KZN 4207 ;
;;;;;act314;46;Mycobacterium tuberculosis KZN 605 ;
;;;;;act315;45;Mycobacterium tuberculosis RGTB327 ;
;;;;;act316;45;Mycobacterium tuberculosis RGTB423 ;
;1;;111;1;act317;§45;Mycobacterium tuberculosis str. Beijing/NITR203 ;
;;;;;act318;46;Mycobacterium tuberculosis str. Erdman ATCC 35801 Erdman ATCC35801 ;
;;;;;act319;46;Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem ;
;;;;;act320;45;Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202 ;
;;;;;act321;46;Mycobacterium tuberculosis str. Kurono ;
;;;;;act322;46;Mycobacterium tuberculosis UT205 ;
;;;;;act323;45;Mycobacterium tuberculosis ZMC13-264 ;
;;;;;act324;45;Mycobacterium tuberculosis ZMC13-88 ;
;1;;;;act325;§45;Mycobacterium ulcerans Agy99 ;
;1;;;;act326;§49;Mycobacterium vanbaalenii PYR-1 ;
;1;;;;act327;§48;Mycobacterium yongonense 05-1390 ;
;1;;;;act328;§50;Nakamurella multipartita DSM 44233 ;
;1;;;;act329;§53;Nocardia brasiliensis ATCC 700358 HUJEG-1 ;
;1;;;;act330;§51;Nocardia cyriacigeorgica GUH-2 ;
;1;;;;act331;§57;Nocardia farcinica IFM 10152 ;
;1;;;;act332;§52;Nocardia nova SH22a ;
;1;;;;act333;§56;Nocardioides sp. JS614 ;
;1;;;;act334;§57;Nocardiopsis alba ATCC BAA-2165 ;
;1;;;;act335;§62;Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111 ;
cori;1;;111;1;act336;§49;Olsenella uli DSM 7084 ;
;1;;;;act337;§48;Pimelobacter simplex VKM Ac-2033D ;
;1;;;;act338;§55;Propionibacterium acidipropionici ATCC 4875 ;
;1;;;;act339;§45;Propionibacterium acnes 266 ;
;;;;;act340;45;Propionibacterium acnes 6609 ;
;;;;;act341;45;Propionibacterium acnes ATCC 11828 ;
;;;;;act342;45;Propionibacterium acnes C1 ;
;;;;;act343;45;Propionibacterium acnes hdn-1 ;
;;;;;act344;45;Propionibacterium acnes HL096PA1 ;
;;;;;act345;45;Propionibacterium acnes KPA171202 ;
;;;;;act346;45;Propionibacterium acnes SK137 ;
;;;;;act347;45;Propionibacterium acnes TypeIA2 P.acn17 ;
;;;;;act348;45;Propionibacterium acnes TypeIA2 P.acn31 ;
;;;;;act349;45;Propionibacterium acnes TypeIA2 P.acn33 ;
;1;;;;act350;§46;Propionibacterium avidum 44067 ;
;1;;;;act351;§45;Propionibacterium freudenreichii subsp. freudenreichii DSM 20271 ;
prop;1;;222;1;act352;§45;Propionibacterium freudenreichii subsp. shermanii CIRM-BIA1 CIRM-B1AI ;
;1;;;;act353;§48;Propionibacterium propionicum F0230a ;
;1;;;;act354;§50;Pseudonocardia dioxanivorans CB1190 ;
;1;;;;act355;§45;Rathayibacter toxicus 70137 ;
;1;;;;act356;§45;Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 ;
;1;;;;act357;§52;Rhodococcus equi 103S ;
;1;;;;act358;§54;Rhodococcus erythropolis BG43 ;
;;;;;act359;53;Rhodococcus erythropolis CCM2595 ;
;;;;;act360;54;Rhodococcus erythropolis PR4 PR4 NBRC 100887 ;
;1;;;;act361;§53;Rhodococcus jostii RHA1 ;
;1;;;;act362;§51;Rhodococcus opacus B4 ;
;;;;;act363;52;Rhodococcus opacus PD630 ;
;;;;;act364;53;Rhodococcus opacus R7 ;
;1;;;;act365;§55;Rhodococcus pyridinivorans SB3094 ;
;1;;;;act366;§52;Rhodococcus sp. B7740 ;
;1;;;;act367;§39;Rhodoluna lacicola MWH-Ta8 ;
;1;;;;act368;§49;Rothia dentocariosa ATCC 17931 ;
;1;;;;act369;§49;Rothia mucilaginosa DY-18 ;
rub;1;;111;1;act370;§47;Rubrobacter radiotolerans RSPS-4 ;
rub;1;;111;1;act371;§48;Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 ;
;1;;;;act372;§48;Saccharomonospora viridis DSM 43017 ;
;1;;;;act373;§53;Saccharopolyspora erythraea NRRL 2338 ;
pseu;1;;444;1;act374;§60;Saccharothrix espanaensis DSM 44229 ;
;1;;;;act375;§59;Salinispora arenicola CNS-205 ;
;1;;;;act376;§55;Salinispora tropica CNB-440 ;
;1;;;;act377;§51;Sanguibacter keddieii DSM 10542 ;
;1;;;;act378;§54;Segniliparus rotundus DSM 44985 ;
cori;1;;222;1;act379;§50;Slackia heliotrinireducens DSM 20476 ;
;1;;;;act380;§50;Stackebrandtia nassauensis DSM 44728 ;
;1;;;;act381;§73;Streptomyces albulus NK660 ;
;;;;;act382;74;Streptomyces albulus ZPM ;
;;;;;act383;70;Streptomyces albus DSM 41398 ;
;;;;;act384;69;Streptomyces albus J1074 ;
strep;1;;666;1;act385;§82;Streptomyces avermitilis MA-4680 NBRC 14893 ;
;1;;;;act386;§76;Streptomyces bingchenggensis BCW-1 ;
;1;67+68;;;act387;§135;Streptomyces cattleya NRRL 8057 DSM 46488 ;
;1;;;;act388;§84;Streptomyces collinus Tu 365 ;
;1;;;;act389;§77;Streptomyces cyaneogriseus subsp. noncyanogenus NMWT 1 ;
;1;;;;act390;§72;Streptomyces davawensis JCM 4913 ;
;1;;;;act391;§76;Streptomyces fulvissimus DSM 40593 ;
;1;;;;act392;§69;Streptomyces glaucescens GLA.O ;
;1;;;;act393;§71;Streptomyces griseus subsp. griseus NBRC 13350 ;
;1;;;;act394;§76;Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 ;
;;;;;act395;76;Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis TL01 ;
;1;;;;act396;§68;Streptomyces lividans TK24 ;
;1;;;;act397;§74;Streptomyces lydicus A02 ;
;1;;;;act398;§73;Streptomyces nodosus ATCC 14899 ;
;1;;;;act399;§72;Streptomyces pratensis ATCC 33331 ;
;1;;;;act400;§70;Streptomyces rapamycinicus NRRL 5491 ;
strep;1;;666;1;act401;§84;Streptomyces scabiei 87.22 ;
;1;;;;act402;§71;Streptomyces sp. 769 ;
;1;;;;act403;§71;Streptomyces sp. PAMC26508 ;
;1;;;;act404;§69;Streptomyces sp. SirexAA-E ;
;1;;;;act405;§74;Streptomyces venezuelae ATCC 10712 ;
;1;;;;act406;§77;Streptomyces vietnamensis GIM4.0001 ;
;1;;;;act407;§69;Streptomyces violaceusniger Tu 4113 ;
;1;;;;act408;§78;Streptosporangium roseum DSM 43021 ;
;1;;;;act409;§53;Thermobifida fusca YX ;
;1;;;;act410;§55;Thermobispora bispora DSM 43833 ;
;1;;;;act411;§63;Thermomonospora curvata DSM 43183 ;
;1;;;;act412;§50;Tropheryma whipplei str. Twist ;
;1;;;;act413;§48;Trueperella pyogenes TP6375 ;
;;;;;act414;46;Trueperella pyogenes TP8 ;
;1;;;;act415;§50;Tsukamurella paurometabola DSM 20162 ;
;1;;;;act416;§55;Verrucosispora maris AB-18-032 ;
;1;;;;act417;§54;Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894 ;
;213;;;99;;;;

Bacteroidetes

bactero

bactero blocs

Lien tableur: bactero blocs

bactero blocs;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;bac001-46;;;;;Notes
bac001;2*16atcgca235;;2;38;4;34;;;'''16s23s5s;'''16-atcgca-35;'''16-atc-35;'''avant;
bac002;2*16s23s5s;;3;41;2;39;;'''sans;16;32;0;1;'''1-3
;16atcgca235;;;;;;;'''1-3;;1;;;16atcgca235-tca
;;;;;;;;;;;;;
bac003;16s23s5s;;2;53;2;51;50;'''total;16;33;0;1;'''avant
;16atcgca235;;;;;;;;;;;;cgt-16s23s5s
;;;;;;;;;;;;;
bac005;2*16s23s5s;;3;38;2;36;;;;;;;'''incomplets
;16atcgca;;;;;;;;;;;;2*16atcgca
;23s5s;;;;;;;;;;;;16s-atc-gaa-cds-agg
;;;;;;;;;;;;;16s-gca
bac007;6*16atcgca235;;6;73;12;61;;;;;;;
bac011;5*16atcgca235;;5;68;10;58;;;;;;;'''autres incomplets
bac014;6*16atcgca235;;7;85;14;71;;;;;;;3*23s5s
;16atcgca235-5s;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;'''5s de trop
bac016;4*16atcgca235;;5;62;11;51;;;;;;;16atcgca235-5s
;16atcgca235-tca;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
bac017;2*16s23s5s;;4;40;3;37;;;;;;;
;cgt-16s23s5s;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
bac018;16atcgca235;;1;33;2;31;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
bac027;16atcgca;;2;38;5;33;;;;;;;
;23s5s;;;;;;;;;;;;
;16s-atc-gaa-cds-agg;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
bac038;3*16atcgca235;;3;46;6;40;;;;;;;
bac041;5*16s23s5s;;5;45;0;45;;;;;;;
bac046;4*16s23s5s;;6;79;3;76;;;;;;;
;16atcgca235;;;;;;;;;;;;
;16s-gca;;;;;;;;;;;;
;23s5s;;54;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;bac047-138;;;;;Notes
bac047;6*16atcgca235;;6;86;12;74;;;'''16s23s5s;'''16-atcgca-35;'''16-atc-35;'''avant;
;;;3;;;;;'''sans;1;67;2;1;'''1-3
bac060;2*16atcgca235;;;74;4;70;;'''1-3;;1;;;16atcgca235-cca
;16s23s5s;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;72;'''total;1;68;2;1;'''avant
bac063;5*16atcgca235;;5;75;10;65;;;;;;;aac-16atcgca235
bac066;6*16atcgca235;;6;49;12;37;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;'''5s de trop
bac095;4*16atcgca235;;5;104;11;93;;;;;;;16atcgca235-5s
;aac-16atcgca235;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
bac096;8*16atcgca235;;8;107;16;91;;;;;;;
bac105;3*16atcgca235;;3;53;6;47;;;;;;;
bac106;7*16atcgca235;;7;83;14;69;;;;;;;
bac113;4*16atcgca235;;4;53;8;45;;;;;;;
bac117;5*16atcgca235;;5;61;10;51;;;;;;;
bac124;16atcgca235;;1;46;2;44;;;;;;;
bac127;3*16atcgca235;;3;41;6;35;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
bac137;4*16atcgca235;;4;62;8;54;;;;;;;
bac138;2*16atcgca235;;4;56;6;50;;;;;;;
;2*16-atc-235;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
bac139;6*16atcgca235;;8;88;17;71;;;;;;;
;16atcgca235-cca;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-5s;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
;;;72;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;Total;;;;;Notes
29;;;;;;;;;'''16s23s5s;'''16-atcgca-35;'''16-atc-35;'''avant;
;;;;;;;;'''sans;17;99;2;2;'''1-3
;Moyenne;;;61;8;54;;'''1-3;0;2;0;0;16atcgca235-tca
;ecartype;;;21;5;17;;;;;;;16atcgca235-cca
;max;;;107;17;93;122;'''total;17;101;2;2;
;min;;;33;0;31;;;;;;;'''avant
;;;;;;;;;;;;;cgt-16s23s5s
;;;;;;;;;;;;;aac-16atcgca235
;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;'''incomplets
;;;;;;;;;;;;;2*16atcgca
;126 blocs;;;;;;;;;;;;16s-atc-gaa-cds-agg
;29 génomes;;;;;;;;;;;;16s-gca
;1 cds incomplet;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;'''autres incomplets
;;;;;;;;;;;;;3*23s5s
;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;'''5s de trop
;;;;;;;;;;;;;2*16atcgca235-5s

bactero notes

Lien tableur: bactero notes

bactero typage

Lien tableur: bactero typage

Tableau des noms bactero

Lien tableur: Tableau des noms bactero

4.9.19 Paris;fait vers le 20.8.19;;ruptures;;;
;;;146;Bacteroidetes;;7181
;;;;;;
rupture;notes;rRNAs;fait;code;tRNAs;génomes
1;;222;1;bac001;§38;Aequorivita sublithincola DSM 14238 
1;;333;1;bac002;§41;Algoriphagus machipongonensis PR1 
1;;222;1;bac003;§53;Alistipes finegoldii DSM 17242 
;;;;bac004;45;Alistipes shahii WAL 8301 
1;;333;1;bac005;§38;Bacteroidales bacterium CF 
1;80+84;;;bac006;§164;Bacteroides dorei 
1;;666;1;bac007;§73;Bacteroides fragilis 638R 
;;;;bac008;71;Bacteroides fragilis BOB25 
;;;;bac009;73;Bacteroides fragilis NCTC 9343 
;;;;bac010;74;Bacteroides fragilis YCH46 
1;;555;1;bac011;§68;Bacteroides helcogenes P 36-108 
1;;;;bac012;§82;Bacteroides salanitronis DSM 18170 
1;;;;bac013;§71;Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 
1;;877;1;bac014;§85;Bacteroides vulgatus ATCC 8482 
1;;;;bac015;§59;Bacteroides xylanisolvens XB1A 
1;;555;1;bac016;§62;Barnesiella viscericola DSM 18177 C46 DSM 18177 
1;;444;1;bac017;§40;Belliella baltica DSM 15883 
1;;111;1;bac018;§33;Blattabacterium sp. Blaberus giganteus BGIGA 
;;;;bac019;34;Blattabacterium sp. Blatta orientalis str. Tarazona 
;;;;bac020;34;Blattabacterium sp. Blattella germanica str. Bge 
;;;;bac021;32;Blattabacterium sp. Cryptocercus punctulatus str. Cpu 
;;;;bac022;34;Blattabacterium sp. Mastotermes darwiniensis str. MADAR 
;;;;bac023;34;Blattabacterium sp. Nauphoeta cinerea 
;;;;bac024;34;Blattabacterium sp. Panesthia angustipennis spadica str. BPAA 
;;;;bac025;34;Blattabacterium sp. Periplaneta americana str. BPLAN 
1;;;;bac026;§35;Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2 
1;;121;1;bac027;§38;Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 
1;;;;bac028;§31;Candidatus Sulcia muelleri BGSS 
;;;;bac029;30;Candidatus Sulcia muelleri CARI 
;;;;bac030;31;Candidatus Sulcia muelleri DMIN 
;;;;bac031;31;Candidatus Sulcia muelleri GWSS 
;;;;bac032;30;Candidatus Sulcia muelleri ML 
;;;;bac033;30;Candidatus Sulcia muelleri PSPU 
;;;;bac034;28;Candidatus Sulcia muelleri SMDSEM 
;;;;bac035;30;Candidatus Sulcia muelleri str. Sulcia-ALF 
;;;;bac036;30;Candidatus Sulcia muelleri TETUND 
1;;;;bac037;§32;Candidatus Uzinura diaspidicola str. ASNER 
1;;333;1;bac038;§46;Capnocytophaga canimorsus Cc5 
;;;;bac039;47;Capnocytophaga ochracea DSM 7271 
1;;;;bac040;§37;Cardinium endosymbiont cEper1 of Encarsia pergandiella 
1;;555;1;bac041;§45;Cellulophaga algicola DSM 14237 
;;;;bac042;43;Cellulophaga baltica 18 
;;;;bac043;44;Cellulophaga baltica NN016038 
;;;;bac044;40;Cellulophaga lytica DSM 7489 
;;;;bac045;40;Cellulophaga lytica HI1 
1;;666;1;bac046;§79;Chitinophaga pinensis DSM 2588 
1;;666;1;bac047;§86;Chryseobacterium sp. StRB126 
1;;;;bac048;§37;Croceibacter atlanticus HTCC2559 
1;;;;bac049;§46;Cyclobacterium marinum DSM 745 
1;;;;bac050;§41;Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406 
1;;;;bac051;§43;Dokdonia sp. 4H-3-7-5 
;;;;bac052;42;Dokdonia sp. MED134 
1;;;;bac053;§46;Draconibacterium orientale FH5T 
1;;;;bac054;§39;Dyadobacter fermentans DSM 18053 
1;;;;bac055;§49;Echinicola vietnamensis DSM 17526 
1;;;;bac056;§52;Elizabethkingia anophelis NUHP1 
;;;;bac057;58;Elizabethkingia sp. BM10 
1;;;;bac058;§42;Emticicia oligotrophica DSM 17448 
1;;;;bac059;§35;endosymbiont of Llaveia axin axin 
1;;333;1;bac060;§74;Fibrella aestuarina BUZ 2 
1;;;;bac061;§42;Flavobacteriaceae bacterium 3519-10 
;;;;bac062;44;Flavobacterium branchiophilum FL-15 
;;555;1;bac063;75;Flavobacterium columnare ATCC 49512 
;;;;bac064;63;Flavobacterium indicum GPTSA100-9 DSM 17447 
;;;;bac065;62;Flavobacterium johnsoniae UW101 ATCC 17061 
1;;666;1;bac066;§49;Flavobacterium psychrophilum 3 
;;;;bac067;37;Flavobacterium psychrophilum 4 
;;;;bac068;49;Flavobacterium psychrophilum 5 
;;;;bac069;38;Flavobacterium psychrophilum 950106-1/1 
;;;;bac070;50;Flavobacterium psychrophilum CSF259-93 
;;;;bac071;50;Flavobacterium psychrophilum FPG101 
;;;;bac072;49;Flavobacterium psychrophilum FPG3 
;;;;bac073;49;Flavobacterium psychrophilum JIP02/86 
;;;;bac074;49;Flavobacterium psychrophilum MH1 
;;;;bac075;49;Flavobacterium psychrophilum PG2 
;;;;bac076;39;Flavobacterium psychrophilum V3-5 
;;;;bac077;38;Flavobacterium psychrophilum V4-24 
;;;;bac078;39;Flavobacterium psychrophilum v4-33 
;;;;bac079;49;Flavobacterium psychrophilum VQ50 
1;;;;bac080;§50;Flexibacter litoralis DSM 6794 
1;;;;bac081;§45;Fluviicola taffensis DSM 16823 
1;;;;bac082;§45;Formosa agariphila KMM 3901 
1;;;;bac083;§45;Gramella forsetii KT0803 
1;;;;bac084;§53;Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 
1;;;;bac085;§47;Hymenobacter sp. APR13 
;;;;bac086;44;Hymenobacter sp. DG25B 
;;;;bac087;48;Hymenobacter swuensis DY53 
1;;;;bac088;§36;Lacinutrix sp. 5H-3-7-4 
1;;;;bac089;§42;Leadbetterella byssophila DSM 17132 
1;;;;bac090;§40;Maribacter sp. HTCC2170 
1;;;;bac091;§41;Marivirga tractuosa DSM 4126 
1;;;;bac092;§39;Mucinivorans hirudinis 
1;;;;bac093;§40;Muricauda lutaonensis CC-HSB-11 
;;;;bac094;38;Muricauda ruestringensis DSM 13258 
1;;555;1;bac095;§104;Myroides profundi D25 
1;;888;1;bac096;§107;Myroides sp. A21 
1;;;;bac097;§41;Niabella soli DSM 19437 JS13-8 
1;;;;bac098;§67;Niastella koreensis GR20-10 
1;;;;bac099;§42;Nonlabens dokdonensis DSW-6 
;;;;bac100;37;Nonlabens marinus S1-08 
1;;;;bac101;§61;Odoribacter splanchnicus DSM 20712 DSM 220712 
1;;;;bac102;§43;Ornithobacterium rhinotracheale DSM 15997 
;;;;bac103;43;Ornithobacterium rhinotracheale ORT-UMN 88 
1;;;;bac104;§38;Owenweeksia hongkongensis DSM 17368 
1;;333;1;bac105;§53;Paludibacter propionicigenes WB4 
1;;777;1;bac106;§83;Parabacteroides distasonis ATCC 8503 
1;;;;bac107;§47;Pedobacter heparinus DSM 2366 
;;;;bac108;55;Pedobacter saltans DSM 12145 
1;;;;bac109;§35;Polaribacter sp. MED152 
1;;;;bac110;§49;Pontibacter korlensis X14-1T 
1;;;;bac111;§46;Porphyromonadaceae bacterium ING2-E5B 
1;;;;bac112;§47;Porphyromonas asaccharolytica DSM 20707 
;;444;1;bac113;53;Porphyromonas gingivalis ATCC 33277 
;;;;bac114;53;Porphyromonas gingivalis HG66 
;;;;bac115;53;Porphyromonas gingivalis TDC60 
;;;;bac116;53;Porphyromonas gingivalis W83 
1;;555;1;bac117;§61;Prevotella dentalis DSM 3688 
;;;;bac118;50;Prevotella denticola F0289 
;;;;bac119;50;Prevotella intermedia 17 
;;;;bac120;49;Prevotella melaninogenica ATCC 25845 
;;;;bac121;54;Prevotella ruminicola 23 Bryant 23 
;;;;bac122;49;Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 
1;;;;bac123;§38;Psychroflexus torquis ATCC 700755 
1;;111;1;bac124;§46;Rhodothermus marinus DSM 4252 
;;;;bac125;47;Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 
1;;;;bac126;§77;Riemerella anatipestifer ATCC 11845 DSM 15868 
1;;333;1;bac127;§41;Riemerella anatipestifer CH3 
;;;;bac128;41;Riemerella anatipestifer RA-CH-1 
;;;;bac129;41;Riemerella anatipestifer RA-CH-2 
;;;;bac130;40;Riemerella anatipestifer RA-GD 
1;;;;bac131;§41;Robiginitalea biformata HTCC2501 
1;;;;bac132;§44;Runella slithyformis DSM 19594 
1;;;;bac133;§46;Salinibacter ruber DSM 13855 M31 
;;;;bac134;47;Salinibacter ruber M8 
1;;;;bac135;§48;Saprospira grandis str. Lewin 
1;;;;bac136;§44;Siansivirga zeaxanthinifaciens CC-SAMT-1 
1;;444;1;bac137;§62;Solitalea canadensis DSM 3403 
1;;444;1;bac138;§56;Sphingobacterium sp. 21 
1;;988;1;bac139;§88;Sphingobacterium sp. ML3W 
1;;;;bac140;§52;Spirosoma linguale DSM 74 
;;;;bac141;42;Spirosoma radiotolerans DG5A 
1;;;;bac142;§46;Tannerella forsythia 92A2 
1;;;;bac143;§59;Weeksella virosa DSM 16922 
1;;;;bac144;§57;Winogradskyella sp. PG-2 
1;;;;bac145;§40;Zobellia galactanivorans DsiJT 
1;;;;bac146;§49;Zunongwangia profunda SM-A87 SMA-87 
82;;;29;;;

Archées

archeo

archeo blocs

Lien tableur: archeo blocs

'''Euryarcheota;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
clade;lien;blocs;;16s;total;avec;sans;total clade;arc001;;;;Notes;;;;;;;;;;;;
'''aciduli;arc001;16,23,5;;1;46;0;46;;;'''16235s;'''16, 23, 5;'''avant;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;1;'''sans;0;1;0;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
clade;lien;blocs;;16s;total;avec;sans;total clade;arc003-9;;;;Notes;;;;;;;;;;;;
'''archeoglobi;arc003;16gca23, 5;;1;46;1;45;;;'''16235s;'''16gca23, 5;'''avant;;;;;;;;;;;;;
;arc006;16gca23, 5;;1;53;1;52;5;'''sans;0;5;0;;;;;;;;;;;;;
;arc007;16gca23, 5;;1;47;1;46;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc008;16gca23, 5;;1;49;1;48;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc009;16gca23, 5;;1;49;1;48;;;;;;;;;;;;;;;;;;
clade;lien;blocs;;16s;total;avec;sans;total clade;arc010-39;;;;Notes;;;;;;;;;;;;
'''halobacteria;arc010;16gca235-tgc-aag;;1;50;3;47;;;'''16235s;'''16gca235;'''avant;;;;;;;;;;;;;
;arc011;16gca235-tgc;;3;49;2;47;;'''sans;4;23;2;'''1-3;;;;;;;;;;;;
;;16s23s5s;;;;;;;''''1-3;;11;;16gca235-tgc-aag;;;;;;;;;;;;
;;16s23s5s-5s;;;;;;40;'''total;4;34;2;3*16gca235-tgc-aaa;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;16gca235-tgc-tcc;;;;;;;;;;;;
;arc015;16gca235-tgc;;1;47;2;45;;;;;;6*16gca235-tgc;;;;;;;;;;;;
;arc019;2*16gca235;;2;57;2;55;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc021;16gca235;;2;53;3;50;;;;;;'''avant;;;;;;;;;;;;
;;16gca235-tgc;;;;;;;;;;;tcc-16gca235;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;atc-16gca235;;;;;;;;;;;;
;arc022;16gca235-tgc;;3;48;2;46;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;2*16s23s5s;;;;;;;;;;;'''autres incomplets;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;23s5s;;;;;;;;;;;;
;arc023;16gca235;;3;50;6;44;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;tcc-16gca235;;;;;;;;;;;'''5s en trop;;;;;;;;;;;;
;;16gca235-tgc-aaa;;;;;;;;;;;16s23s5s-5s;;;;;;;;;;;;
;;5s;;;;;;;;;;;3*16gca2355;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;2*5s;;;;;;;;;;;;
;arc025;2*16gca235;;2;45;2;43;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc026;16gca235;;1;48;1;47;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc028;16gca235-tgc;;1;51;2;49;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc029;16gca235;;2;48;4;44;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;16gca235-tgc-aaa;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc030;16gca235;;3;51;6;45;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;atc-16gca235;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;16gca235-tgc-aaa;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;5s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc032;2*16gca235;;3;50;3;47;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;16gca2355;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;23s5s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc033;2*16gca235;;3;49;3;46;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;16gca2355;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc035;3*16gca235;;3;51;3;48;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc036;3*16gca235;;4;55;4;51;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;16gca2355;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc037;16gca235-tgc-tcc;;1;46;3;43;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc038;16gca235-tgc;;1;47;2;45;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc039;16gca235;;1;47;1;46;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;40;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
clade;lien;blocs;;16s;total;avec;sans;total clade;arc042-48;;;;Notes;;;;;;;;;;;;
'''M.bacteria;arc042;16gca235;;2;47;2;45;;;'''16235s;'''16gca235;'''avant;;;;;;;;;;;;;
;;16gca2355;;;;;;10;'''sans;1;9;0;'''5s en trop;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;2*16gca2355;;;;;;;;;;;;
;arc044;3*16gca235;;3;47;3;44;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc046;16gca235;;2;59;2;57;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;16gca2355;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc048;2*16gca235;;3;36;2;34;;;;;;;;;arc054;;;;;;;arc069;;
;;16s23s5s;;10;;;;;;;;;;;;Chromosome;;;;;;;Chromosome;;
clade;lien;blocs;;16s;total;avec;sans;total clade;arc054-69;;;;Notes;;;16gca23 + aca-cca-tac-aaa-5s-gac;;;;;;;+ aca-cca-tac-aaa-5s-gac;;
'''M.cocci;arc054;6aas-16gca235;;2;38;13;25;;;'''16235s;'''16gca235;avant;;;;;;;;;;;;;
;;aca-cca-tac-aaa-5s-gac;;;;;;4;'''sans;1;2;1;'''avant;;;16gca235-;;;;;;;16s23s-;;
;;16gca23;;;;;;;;;;;6aas-16gca235;;;1008636..1009604;;CDS;122;;;;Comme Methanocaldococcus fervens AG86 ;;
;;;;;;;;;;;;;;;;1009727..1009984;;ncRNA;53;;;;Mais sans 5s et gca. Phe, ttc inversé;;
;arc067;2*16gca235;;2;40;2;38;;;;;;'''incomplet;;;1010038..1010152;;5s;70;;;;;;
;;5s;;;;;;;;;;;16gca23;;;1010223..1013210;;23s;114;;1400750..1401265;;CDS;276;
;;;;;;;;;;;;;6aas-16gs23s;;;1013325..1013397;;gca;65;;1397498..1400473;;23s;171;
;arc069;16s23s5s;;2;35;12;23;;;;;;;;;1013463..1014943;;16s;196;;1395853..1397326;;16s;197;
;;6aas-16s23s;;;;;;;;;;;'''5s en trop;;;1015140..1015211;;cac;11;;1395584..1395655;;cac;8;
;;aca-cca-tac-aaa-5s-gac;;6;;;;;;;;;2*aca-cca-tac-aaa-5s-gac;;;1015223..1015310;;cta;32;;1395491..1395575;;cta;16;
;;;;;;;;;;;;;5s;;;1015343..1015417;;gaa;13;;1395400..1395474;;gaa;62;
clade;lien;blocs;;16s;total;avec;sans;total clade;arc070-110;;;;Notes;;;1015431..1015508;;atgi;29;;1395263..1395337;;atgi;65;
'''M.microbia;arc070;2*16gca235;;3;54;2;52;;;16235s;16gca235;avant;;;;1015538..1015613;;aac;8;;1395122..1395197;;aac;96;
;;16s23s5s;;;;;;;'''sans;7;15;;'''1-3;;;1015622..1015698;;ttc;109;;1394949..1395025;;ttc;211;     comp
;;;;;;;;;'''1-3;1;15;;3*16gca235-tgc-5s;;;1015808..1016863;;CDS;;;1393589..1394737;;CDS;;
;arc073;3*16gca235-tgc-5s;;3;51;6;45;38;'''total;8;30;;10*16gca23-tgc-5s;;;;;;;;;;;;
;arc075;3*16gca235;;3;53;3;50;;;;;;2*16gca23-tgc-5s-cgg;;;;;;;;;;;;
;arc076;16gca23-tgc-5s;;1;47;2;45;;;;;;1623-tgc-5s;;;;;;;;;;;;
;arc078;2*16gca23-tgc-5s;;2;50;4;46;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc079;2*16gca23-tgc-5s;;3;53;7;46;;;;;;'''5s en trop;;;;;;;;;;;;
;;16gca23-tgc-5s-cgg;;;;;;;;;;;3*16gca235-tgc-5s;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;5s-tgc;;;;;;;;;;;;
;arc080;2*16gca235;;2;48;3;45;;;;;;5s;;;;;;;;;;;;
;;5s-tgc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc081;16gca23-tgc-5s;;1;47;2;45;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc082;2*16gca23-tgc-5s;;3;53;7;46;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;16gca23-tgc-5s-gcg;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;5s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc083;2*16gca23-tgc-5s;;2;52;4;48;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc084;1623-tgc-5s;;1;49;1;48;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc086;2*16gca235;;2;49;2;47;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc089;3*16gca235;;3;50;3;47;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc094;2*16s23s5s;;3;63;1;62;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;16gca235;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc097;2*16s23s5s;;3;58;1;57;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;16gca235;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc110;2*16s23s5s;;3;56;1;55;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;16gca235;;38;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
clade;lien;blocs;;16s;total;avec;sans;total clade;arc180-187;;;;Notes;;;;;;;;;;;;
'''tcocci;arc180;16gca23;;1;46;2;44;;;'''16gca23, 5;;;'''5s en trop;;;;;;;;;;;;
;;5s-gac;;;;;;3;'''sans;3;;;3*5s-gac;;;;;;;;;;;;
;;5s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc181;16gca23;;1;46;2;44;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;5s-gac;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;5s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc187;16gca23;;1;46;2;44;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;5s-gac;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;5s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
clade;lien;blocs;;16s;total;avec;sans;total clade;arc212-217;;;;Notes;;;;;;;;;;;;
'''tplasma;arc212;16, 23, 5;;1;46;0;46;;;'''16, 23, 5;;;'''5s en trop;;;;;;;;;;;;
;arc213;16, 23, 5;;1;46;0;46;6;'''sans;6;;;5s;;;;;;;;;;;;
;arc214;16, 23, 5;;1;47;0;47;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc215;16, 23, 5;;1;46;0;46;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc216;16, 23, 5;;1;46;0;46;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc217;16, 23, 5, 5;;1;46;0;46;;;;;;;;;;;;;;;;;;
clade;lien;blocs;;16s;total;avec;sans;total clade;Total;;;;Notes;;;;;;;;;;;;
'''Euryarcheota;;;;;;;;;;'''16235s;'''16gca235;'''avant;;;;;;;;;;;;;
;;'''Total;;;2782;150;2632;;sans;13;49;3;'''1-3;;;;;;;;;;;;
;;'''Moyenne;;;49;3;46;;1-3;1;26;0;3*16gca235-tgc-aaa;;;;;;;;;;;;
;;'''ecartype;;;5;3;6;92;total;14;75;3;16gca235-tgc-aag;;;;;;;;;;;;
;;'''max;;;63;13;62;109;;;;;16gca235-tgc-tcc;;;;;;;;;;;;
;;'''min;;;35;0;23;;;;;;3*16gca235-tgc-5s;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;6*16gca235-tgc;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;2*16gca23-tgc-5s-cgg;;;;;;;;;;;;
;;Synthèse;;;;;;;;;Notes suite;;10*16gca23-tgc-5s;;;;;;;;;;;;
;;'''génomes;;63;;;;;;;'''génomes;;1623-tgc-5s;;;;;;;;;;;;
;;'''blocs;;109;;;;;;;7*16, 23, 5;;;;;;;;;;;;;;
;;'''cds;;0;;;;;;;8*16gca23,5;;'''autres incomplets;;;;;;;;;;;;
;;'''16gca235;;75;;;;;;;;;23s5s;;;;;;;;;;;;
;;'''16s23s5s;;14;;;;;;;'''avant;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;tcc-16gca235;;'''5s en trop;;;;;;;;;;;;
;;'''16gca23-tgc-5s-z;;12;;;;;;;atc-16gca235;;2*aca-cca-tac-aaa-5s-gac;;;;;;;;;;;;
;;'''16gca235-tgc-z;;14;;;;;;;6aas-16gca235;;16s23s5s-5s;;;;;;;;;;;;
;;'''16gca23,5;;8;;;;;;;;;3*16gca2355;;;;;;;;;;;;
;;'''16, 23, 5;;7;;;;;;;'''incomplet;;5*5s;;;;;;;;;;;;
;;'''6aas-16gca23;;2;;;;;;;16gca23;;5s-tgc;;;;;;;;;;;;
;;'''4aas-5s-gac;;2;;;;;;;6aas-16s23s;;3*16gca235-tgc-5s;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;2*16gca2355;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;3*5s-gac;;;;;;;;;;;;
'''autres archées;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
clade;lien;blocs;;16s;total;avec;sans;total clade;arc119-208;;;;Notes;;;arc0130;7.2.20;;;intercalaire;cdsa;;;;
'''thanitrop;arc200;1623, 5;;1;43;0;43;;;'''1623, 5;;;;;;comp;727174..727929;;cds;422;252;hp;;;
'''thanitrosp;arc206;1623, 5;;1;46;0;46;;'''sans;20;;;'''cds;;;;728352..729801;;16s;347;;;;;
'''thaumu;arc208;1623, 5;;1;46;0;46;;'''1-3;2;;;16-cds-23-cds-gcg, 5, 5;;;comp;730149..730955;;cds;370;269;BtpA/SgcQ family protein;;;
;;;;;;;;22;'''total;22;;;;;;;731326..734348;;23s;157;;;;;
'''Kor;arc040;1623, 5;;1;46;0;46;;;;;;'''1-3;;;comp;734506..734709;;cds;109;68;hp;;;
;;;;;;;;;;;;;1623s, 5s-atc;;;;734819..734894;;gcg;17;;;;;
'''crenarcheota;;;;;;;;;;;;;;;;comp;734912..735499;;cds;;196;DUF447 family protein;;;
'''protei;arc119;1623, 5;;1;47;0;47;;;;;;'''5s en trop;;;;;;;;;;;;
;arc120;1623, 5;;1;46;0;46;;;;;;5s;;;;;;;;;;;;
;arc124;1623, 5;;1;48;0;48;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc126;1623, 5;;1;48;0;48;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc129;1623, 5;;1;47;0;47;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc130;16-cds-23-cds-gcg, 5, 5;;1;47;1;46;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc133;1623, 5;;1;47;0;47;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc136;1623, 5;;1;46;0;46;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc141;1623, 5s-atc;;1;48;1;47;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc143;1623, 5;;1;46;0;46;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc145;1623, 5;;1;50;0;50;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc161;1623, 5;;1;49;0;49;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc163;1623, 5;;1;47;0;47;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc168;1623, 5;;1;47;0;47;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc170;1623, 5;;1;46;0;46;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc172;1623, 5;;1;46;0;46;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc175;1623, 5;;1;47;0;47;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;arc176;1623, 5;;1;46;0;46;;;;;;;;;;;;;;;;;;
clade;lien;blocs;;16s;total;avec;sans;total clade;autres;;;;Notes;;;;;;;;;;;;
'''autres archées;;;;;;;;;;'''1623, 5;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;'''sans;20;;;'''cds;;;;;;;;;;;;
;;'''Moyenne;;;47;0;47;;'''1-3;2;;;16-cds-23-cds-gcg, 5, 5;;;;;;;;;;;;
;;'''ecartype;;;1;0;1;22;'''total;22;;;;;;;;;;;;;;;
;;'''max;;;50;1;50;;;;;;'''1-3;;;;;;;;;;;;
;;'''min;;;43;0;43;;;;;;1623s, 5s-atc;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;'''génomes;;22;;;;;;;;;'''5s en trop;;;;;;;;;;;;
;;'''blocs;;22;;;;;;;;;5s;;;;;;;;;;;;
;;'''cds;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;'''1623, 5;;22;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;

archeo notes

Lien tableur: archeo notes

archeo typage

Lien tableur: archeo typage

Tableau des noms archeo

Lien fiche: Tableau des noms archeo

;;;;17.8.19 Paris;;
;;;;tRNAs archées;;
;;;;;;
ruptures;clade;rRNAs;fait;code;tRNAs;génomes
1;aciduli;1, 1, 1;1;arc001;§46;Aciduliprofundum boonei T469 
1;aciduli;1, 1, 1;;arc002;§46;Aciduliprofundum sp. MAR08-339 
1;archeo;1, 1, 1;1;arc003;§46;Archaeoglobus fulgidus DSM 4304 
;archeo;1, 1, 1;;arc004;46;Archaeoglobus fulgidus DSM 8774 
1;archeo;1, 1, 1;;arc005;§49;Archaeoglobus profundus DSM 5631 
1;archeo;1, 1, 1;1;arc006;§53;Archaeoglobus sulfaticallidus PM70-1 
1;archeo;1, 1, 1;1;arc007;§47;Archaeoglobus veneficus SNP6 
1;archeo;1, 1, 1;1;arc008;§49;Ferroglobus placidus DSM 10642 
1;archeo;1, 1, 1;1;arc009;§49;Geoglobus acetivorans SBH6 
1;halo;1, 1, 1;1;arc010;§50;Halalkalicoccus jeotgali B3 
1;halo;4, 3, 3;1;arc011;§49;Haloarcula hispanica ATCC 33960 CGMCC 1.2049 
;halo;;;arc012;49;Haloarcula hispanica N601 
1;halo;;;arc013;§50;Haloarcula marismortui ATCC 43049 
1;halo;;;arc014;§49;Haloarcula sp. CBA1115 
1;halo;1, 1, 1;1;arc015;§47;Halobacterium salinarum R1 DSM 671 
1;halo;;;arc016;§47;Halobacterium sp. DL1 
1;halo;;;arc017;§47;Halobacterium sp. NRC-1 
1;halo;;;arc018;§55;Haloferax mediterranei ATCC 33500 
;halo;2, 2, 2;1;arc019;57;Haloferax mediterranei ATCC 33500 CGMCC 1.2087
1;halo;;;arc020;§53;Haloferax volcanii DS2 
1;halo;2, 2, 2;1;arc021;§53;Halogeometricum borinquense DSM 11551 PR 3 
1;halo;3, 3, 3;1;arc022;§48;Halomicrobium mukohataei DSM 12286 
1;halo;4, 3, 3;1;arc023;§50;Halopiger xanaduensis SH-6 
1;halo;;;arc024;§45;Haloquadratum walsbyi C23 
;halo;2, 2, 2;1;arc025;45;Haloquadratum walsbyi DSM 16790 HBSQ001 
1;halo;1, 1, 1;1;arc026;§48;Halorhabdus tiamatea SARL4B 
1;halo;;;arc027;§46;Halorhabdus utahensis DSM 12940 
1;halo;1, 1, 1;1;arc028;§51;Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 
1;halo;2, 2, 2;1;arc029;§48;Halostagnicola larsenii XH-48 
1;halo;4, 3, 3;1;arc030;§51;Haloterrigena turkmenica DSM 5511 
1;halo;;;arc031;§47;Halovivax ruber XH-70 
1;halo;5, 3, 4;1;arc032;§50;Natrialba magadii ATCC 43099 
1;halo;4, 3, 3;1;arc033;§49;Natrinema pellirubrum DSM 15624 
1;halo;;;arc034;§51;Natrinema sp. J7-2 
1;halo;3, 3, 3;1;arc035;§51;Natronobacterium gregoryi SP2 
1;halo;5, 4, 4;1;arc036;§55;Natronococcus occultus SP4 
1;halo;1, 1, 1;1;arc037;§46;Natronomonas moolapensis 8.8.11 
1;halo;1, 1, 1;1;arc038;§47;Natronomonas pharaonis DSM 2160 Gabara 
1;halo;1, 1, 1;1;arc039;§47;Salinarchaeum sp. Harcht-Bsk1 
1;Kor;1, 1, 1;1;arc040;§46;Candidatus Korarchaeum cryptofilum OPF8 
1;mbacteria;;;arc041;§46;Methanobacterium formicicum 
;mbacteria;3, 2, 2;1;arc042;47;Methanobacterium formicicum BRM9 
1;mbacteria;;;arc043;§43;Methanobacterium lacus AL-21 
1;mbacteria;3, 3, 3;1;arc044;§47;Methanobacterium paludis SWAN1 
1;mbacteria;;;arc045;§44;Methanobacterium sp. MB1 
1;mbacteria;3, 2, 2;1;arc046;§59;Methanobrevibacter ruminantium M1 
1;mbacteria;;;arc047;§36;Methanobrevibacter smithii ATCC 35061 PS DSMZ 861 
1;mbacteria;3, 3, 3;1;arc048;§36;Methanobrevibacter sp. AbM4 
1;mbacteria;;;arc049;§42;Methanosphaera stadtmanae DSM 3091 
1;mbacteria;;;arc050;§40;Methanothermobacter marburgensis str. Marburg 
1;mbacteria;;;arc051;§39;Methanothermobacter sp. CaT2 
1;mbacteria;;;arc052;§39;Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H 
1;mbacteria;;;arc053;§41;Methanothermus fervidus DSM 2088 
1;mcocci;2, 2, 2;1;arc054;§38;Methanocaldococcus fervens AG86 
1;mcocci;;;arc055;§38;Methanocaldococcus infernus ME 
1;mcocci;;;arc056;§37;Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 
1;mcocci;;;arc057;§37;Methanocaldococcus sp. FS406-22 
1;mcocci;;;arc058;§37;Methanocaldococcus sp. JH146 
1;mcocci;;;arc059;§38;Methanocaldococcus vulcanius M7 
1;mcocci;;;arc060;§39;Methanococcus aeolicus Nankai-3 
1;mcocci;;;arc061;§38;Methanococcus maripaludis C5 
;mcocci;;;arc062;38;Methanococcus maripaludis C6 
;mcocci;;;arc063;38;Methanococcus maripaludis C7 
;mcocci;;;arc064;38;Methanococcus maripaludis S2 
;mcocci;;;arc065;38;Methanococcus maripaludis X1 
1;mcocci;;;arc066;§38;Methanococcus vannielii SB 
1;mcocci;3, 2, 2;1;arc067;§40;Methanococcus voltae A3 
1;mcocci;;;arc068;§38;Methanothermococcus okinawensis IH1 
1;mcocci;2, 2, 2;1;arc069;§35;Methanotorris igneus Kol 5 
1;microbia;3, 3, 3;1;arc070;§54;Methanocella arvoryzae MRE50 
1;microbia;;;arc071;§50;Methanocella conradii HZ254 
1;microbia;;;arc072;§50;Methanocella paludicola SANAE 
1;microbia;6, 3, 3;1;arc073;§51;Methanococcoides burtonii DSM 6242 
1;microbia;;;arc074;§54;Methanococcoides methylutens MM1 
1;microbia;3, 3, 3;1;arc075;§53;Methanocorpusculum labreanum Z 
1;microbia;1, 1, 1;1;arc076;§47;Methanoculleus bourgensis MS2 MS2T 
1;microbia;;;arc077;§49;Methanoculleus marisnigri JR1 
1;microbia;2, 2, 2;1;arc078;§50;Methanohalobium evestigatum Z-7303 
1;microbia;3, 3, 3;1;arc079;§53;Methanohalophilus mahii DSM 5219 
1;microbia;3, 2, 2;1;arc080;§48;Methanolacinia petrolearia DSM 11571 
1;microbia;1, 1, 1;1;arc081;§47;Methanolinea tarda NOBI-1 
1;microbia;4, 3, 3;1;arc082;§53;Methanolobus psychrophilus R15 
1;microbia;2, 2, 2;1;arc083;§52;Methanomethylovorans hollandica DSM 15978 
1;microbia;1, 1, 1;1;arc084;§49;Methanoregula boonei 6A8 
1;microbia;;;arc085;§49;Methanoregula formicica SMSP 
1;microbia;2, 2, 2;1;arc086;§49;Methanosaeta concilii GP6 
1;microbia;;;arc087;§48;Methanosaeta harundinacea 6Ac 
1;microbia;;;arc088;§48;Methanosaeta thermophila PT 
1;microbia;3, 3, 3;1;arc089;§50;Methanosalsum zhilinae DSM 4017 
1;microbia;;;arc090;§58;Methanosarcina acetivorans C2A 
1;microbia;;;arc091;§61;Methanosarcina barkeri 227 
;microbia;;;arc092;60;Methanosarcina barkeri 3 
;microbia;;;arc093;59;Methanosarcina barkeri MS 
;microbia;3, 3, 3;1;arc094;63;Methanosarcina barkeri str. Fusaro 
;microbia;;;arc095;63;Methanosarcina barkeri str. Wiesmoor 
1;microbia;;;arc096;§60;Methanosarcina horonobensis HB-1 JCM 15518 
1;microbia;3, 3, 3;1;arc097;§58;Methanosarcina lacustris Z-7289 
1;microbia;;;arc098;§59;Methanosarcina mazei C16 
;microbia;;;arc099;57;Methanosarcina mazei Go1 
;microbia;;;arc100;57;Methanosarcina mazei LYC 
;microbia;;;arc101;57;Methanosarcina mazei S-6 
;microbia;;;arc102;57;Methanosarcina mazei SarPi 
;microbia;;;arc103;43;Methanosarcina mazei Tuc01 
;microbia;;;arc104;57;Methanosarcina mazei WWM610 
1;microbia;;;arc105;§57;Methanosarcina siciliae C2J 
;microbia;;;arc106;57;Methanosarcina siciliae HI350 
;microbia;;;arc107;57;Methanosarcina siciliae T4/M 
1;microbia;;;arc108;§62;Methanosarcina sp. Kolksee 
1;microbia;;;arc109;§57;Methanosarcina sp. MTP4 
1;microbia;3, 3, 3;1;arc110;§56;Methanosarcina sp. WH1 
1;microbia;;;arc111;§58;Methanosarcina sp. WWM596 
;microbia;;;arc112;§58;Methanosarcina thermophila CHTI-55 
1;microbia;;;arc113;58;Methanosarcina thermophila TM-1 
1;microbia;;;arc114;§61;Methanosarcina vacuolata Z-761 
1;microbia;;;arc115;§56;Methanosphaerula palustris E1-9c 
1;microbia;;;arc116;§51;Methanospirillum hungatei JF-1 
1;mpyri;;;arc117;§35;Methanopyrus kandleri AV19 
1;nano;;;arc118;§44;Nanoarchaeum equitans Kin4-M 
1;protei;1, 1, 1;1;arc119;§47;Acidianus hospitalis W1 
1;protei;1, 1, 1;1;arc120;§46;Acidilobus saccharovorans 345-15 
1;protei;;;arc121;§47;Aeropyrum camini SY1 JCM 12091 
1;protei;;;arc122;§49;Aeropyrum pernix K1 
1;protei;;;arc123;§46;Caldisphaera lagunensis DSM 15908 
1;protei;1, 1, 1;1;arc124;§48;Caldivirga maquilingensis IC-167 
1;protei;;;arc125;§46;Desulfurococcus fermentans DSM 16532 
1;protei;1, 1, 1;1;arc126;§48;Desulfurococcus kamchatkensis 1221n 
1;protei;;;arc127;§46;Desulfurococcus mucosus DSM 2162 
1;protei;;;arc128;§45;Fervidicoccus fontis Kam940 
1;protei;1, 1, 1;1;arc129;§47;Hyperthermus butylicus DSM 5456 
1;protei;2, 1, 1;1;arc130;§47;Ignicoccus hospitalis KIN4/I 
1;protei;;;arc131;§47;Ignisphaera aggregans DSM 17230 
1;protei;;;arc132;§46;Metallosphaera cuprina Ar-4 
1;protei;1, 1, 1;1;arc133;§47;Metallosphaera sedula CuR1 
;protei;;;arc134;47;Metallosphaera sedula DSM 5348 
1;protei;;;arc135;§47;Pyrobaculum aerophilum str. IM2 
1;protei;1, 1, 1;1;arc136;§46;Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514 
1;protei;;;arc137;§46;Pyrobaculum calidifontis JCM 11548 
1;protei;;;arc138;§46;Pyrobaculum islandicum DSM 4184 
1;protei;;;arc139;§49;Pyrobaculum oguniense TE7 
1;protei;;;arc140;§47;Pyrobaculum sp. 1860 
1;protei;1, 1, 1;1;arc141;§48;Pyrolobus fumarii 1A 
1;protei;;;arc142;§46;Staphylothermus hellenicus DSM 12710 
1;protei;1, 1, 1;1;arc143;§46;Staphylothermus marinus F1 
1;protei;;;arc144;§50;Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 
;protei;1, 1, 1;1;arc145;50;Sulfolobus acidocaldarius N8 
;protei;;;arc146;50;Sulfolobus acidocaldarius Ron12/I 
;protei;;;arc147;46;Sulfolobus acidocaldarius SUSAZ 
1;protei;;;arc148;§47;Sulfolobus islandicus HVE10/4 
;protei;;;arc149;47;Sulfolobus islandicus L.D.8.5 
;protei;;;arc150;47;Sulfolobus islandicus L.S.2.15 
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;protei;;;arc152;47;Sulfolobus islandicus M.14.25 
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;protei;;;arc155;46;Sulfolobus islandicus M.16.27 
;protei;;;arc156;47;Sulfolobus islandicus M.16.4 
;protei;;;arc157;47;Sulfolobus islandicus M.16.40 
;protei;;;arc158;46;Sulfolobus islandicus M.16.43 
;protei;;;arc159;47;Sulfolobus islandicus M.16.47 
;protei;;;arc160;48;Sulfolobus islandicus REY15A 
;protei;1, 1, 1;1;arc161;49;Sulfolobus islandicus Y.G.57.14 
;protei;;;arc162;46;Sulfolobus islandicus Y.N.15.51 
1;protei;1, 1, 1;1;arc163;§47;Sulfolobus solfataricus 98/2 
;protei;;;arc164;46;Sulfolobus solfataricus 98/2 SULC 
;protei;;;arc165;45;Sulfolobus solfataricus P2
;protei;;;arc166;47;Sulfolobus solfataricus SULA 
;protei;;;arc167;47;Sulfolobus solfataricus SULB 
1;protei;1, 1, 1;1;arc168;§47;Sulfolobus tokodaii str. 7 
1;protei;;;arc169;§46;Thermofilum carboxyditrophus 1505 
1;protei;1, 1, 1;1;arc170;§46;Thermofilum pendens Hrk 5 
1;protei;;;arc171;§46;Thermofilum sp. 1910b 
1;protei;1, 1, 1;1;arc172;§46;Thermogladius cellulolyticus 1633 
1;protei;;;arc173;§46;Thermoproteus neutrophilus V24Sta 
1;protei;;;arc174;§46;Thermoproteus tenax Kra 1 
1;protei;1, 1, 1;1;arc175;§47;Thermoproteus uzoniensis 768-20 
1;protei;1, 1, 1;1;arc176;§46;Thermosphaera aggregans DSM 11486 
1;protei;;;arc177;§46;Vulcanisaeta distributa DSM 14429 
1;protei;;;arc178;§47;Vulcanisaeta moutnovskia 768-28 
1;tcocci;;;arc179;§47;Palaeococcus pacificus DY20341 
1;tcocci;2, 1, 1;1;arc180;§46;Pyrococcus abyssi GE5 
1;tcocci;2, 1, 1;1;arc181;§46;Pyrococcus furiosus COM1 
;tcocci;;;arc182;46;Pyrococcus furiosus DSM 3638 
1;tcocci;;;arc183;§46;Pyrococcus horikoshii OT3 
1;tcocci;;;arc184;§46;Pyrococcus sp. NA2 
1;tcocci;;;arc185;§46;Pyrococcus sp. ST04 
1;tcocci;;;arc186;§47;Pyrococcus yayanosii CH1 
1;tcocci;2, 1, 1;1;arc187;§46;Thermococcus barophilus MP 
1;tcocci;;;arc188;§46;Thermococcus eurythermalis A501 
1;tcocci;;;arc189;§47;Thermococcus gammatolerans EJ3 DSM 15229 
1;tcocci;;;arc190;§48;Thermococcus kodakarensis KOD1 
1;tcocci;;;arc191;§47;Thermococcus litoralis DSM 5473 
1;tcocci;;;arc192;§47;Thermococcus nautili 30-1 
1;tcocci;;;arc193;§46;Thermococcus onnurineus NA1 
1;tcocci;;;arc194;§46;Thermococcus sibiricus MM 739 
1;tcocci;;;arc195;§46;Thermococcus sp. 4557 
1;tcocci;;;arc196;§46;Thermococcus sp. AM4 
1;tcocci;;;arc197;§46;Thermococcus sp. CL1 
1;tcocci;;;arc198;§48;Thermococcus sp. ES1 
1;thanitrop;;;arc199;§44;Candidatus Nitrosopumilus koreensis AR1 
1;thanitrop;1, 1, 1;1;arc200;§43;Candidatus Nitrosopumilus sp. AR2 
1;thanitrop;;;arc201;§44;Candidatus Nitrosopumilus sp. D3C 
1;thanitrop;;;arc202;§43;Candidatus Nitrosopumilus sp. NF5 
1;thanitrop;;;arc203;§44;Nitrosopumilus maritimus SCM1 
1;thanitrosp;;;arc204;§48;Candidatus Nitrososphaera evergladensis SR1 
1;thanitrosp;;;arc205;§47;Candidatus Nitrososphaera gargensis Ga9.2 
1;thanitrosp;1, 1, 1;1;arc206;§46;Nitrososphaera viennensis EN76 
1;thaum;;;arc207;§46;Cenarchaeum symbiosum A 
1;thaumu;1, 1, 1;1;arc208;§46;Candidatus Caldiarchaeum subterraneum 
1;thaumu;;;arc209;§47;Thaumarchaeota archaeon SAT1 
1;tplasma;;;arc210;§46;Candidatus Methanomassiliicoccus intestinalis Issoire-Mx1 
1;tplasma;;;arc211;§46;Candidatus Methanomethylophilus alvus Mx1201 
1;tplasma;1, 1, 1;1;arc212;§46;Candidatus Methanoplasma termitum MpT1 
1;tplasma;1, 1, 1;1;arc213;§46;Ferroplasma acidarmanus fer1 
1;tplasma;1, 1, 1;1;arc214;§47;Picrophilus torridus DSM 9790 
1;tplasma;1, 1, 1;1;arc215;§46;Thermoplasma acidophilum DSM 1728 
1;tplasma;1, 1, 1;1;arc216;§46;Thermoplasma volcanium GSS1 
1;tplasma;2, 1, 1;1;arc217;§46;Thermoplasmatales archaeon BRNA1 
172;;;79;;;

tenericutes

tener blocs

Lien fiche: tener blocs

Tenericutes;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;tn001-108;;;;;Notes
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;16s-atc-235-11aas;;;;;;;;;;;;2*tac-16s-atc-235-gta-aac
;;;;;;;;;;;;;tac-16s-atc-235-aac
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;;;;;;;;;;;;;aaa-cta-16s23s5s
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;16s-atc-235-11aas;;;;;;;;;;;;'''5s de trop
;;;;;;;;;;;;;16s23s5s-aac-5s-aac
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;;;;;;;;;;;;;5s
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;16s°aac-gaa-5s;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
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;5s;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
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;aaa-cta-16s23s5s;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
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;;;;;;;;;;;;;
tn038;16s23s5s;;2;33;0;33;;;;;;;
;16s23s, 5s;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
tn050;16s23s5s;;1;36;0;36;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
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tn075;16s23s, 5s;;1;28;0;28;;;;;;;
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;;;;;;;;;;;;;
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;;;;;;;;;;;;;
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;;;;;;;;;;;;;
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tn108;2*16s23s5s;;2;30;0;30;;;;;;;
;;;32;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total clade;Total;;;;;Notes
;;;;;;;;;'''16s23s5s;'''16-atc-35;'''16s23s, 5s;'''avant;
;'''Total;;;662;93;569;;'''sans;12;;5;2;'''1-3
;'''Moyenne;;;33;5;28;;'''1-3;4;;;4;2*16s23s5s-aac
;'''ecartype;;;4;7;6;;'''11aas;;4;;1;16s23s5s-aac-5s-aac
;'''max;;;46;19;37;;;;;;;16s23s5s-aac-gaa
;'''min;;;28;0;16;32;'''total;16;4;5;7;
;;;;;;;;;;;;;'''avant
;;;;;;;;;;;;;tac-16atcgca235-11aas
;;;;;;;;;;;;;tac-16s-atc-235-aac-5s-aac
;;;;;;;;;;;;;2*tac-16s-atc-235-gta-aac
;'''blocs;;32;;;;;;;;;;tac-16s-atc-235-aac
;'''génomes;;20;;;;;;;;;;6aas-16s23s5s
;'''aas longs;;7;;;;;;;;;;aaa-cta-16s23s5s
;'''1-3  aac;;10;;;;;;;;;;
;'''16s23s5s;;23;;;;;;;;;;'''5s de trop
;'''16-atc-35;;8;;;;;;;;;;16s23s5s-aac-5s-aac
;'''16-atcgca-35;;1;;;;;;;;;;tac-16s-atc-235-aac-5s-aac
;;;;;;;;;;;;;16s°aac-gaa-5s
;;;;;;;;;;;;;5s

tener notes

Lien fiche: tener notes

DUF951;DUF951 domain-containing protein;;;;;;;;;
cobalamin;ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase;;;;;;;;;
DegV;DegV family protein;;;;;;;;;
cobyrinic;cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase;;;;;;;;;
N-acetyl;N-acetyltransferase;;;;;;;;;
ABCu;ABC transporter permease subunit;;;;;;;;;
P-ligase;proline--tRNA ligase;;;;;;;;;
DUF2963;DUF2963 domain-containing protein;;;;;;;;;
NADP;NAD(P)-dependent oxidoreductase;;;;;;;;;
THF;methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;;;;;;;;;
ABCs;substrate ABC transporter permease;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;
tn001;;;16s-atc-235-11aas;;;tn003;;;;
tac-16s-atc-235-aac-5s-aac;;intercal ;long pbs;protéine;;tac-16atcgca235-11aas;;intercal ;long pbs;protéine
;cds;86;174;DUF951;;comp;cds;154;852;NADP
;tac;214;85;;;comp;ttc;7;76;
;16s;137;1536;;;comp;gac;4;76;
;atc;88;77;;;comp;atgf;55;77;
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;5s;11;111;;;comp;gca;5;76;
;aac;860;77;;;comp;tta;20;85;
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;atc;88;77;;;comp;gta;21;76;
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;5s;14;111;;;comp;23s;50;2838;
;gta;44;76;;;comp;gca;6;76;
;aca;11;76;;;comp;atc;110;77;
;aaa;7;76;;;comp;16s;206;1523;
;tta;8;87;;;comp;tac;114;84;
;gca;72;76;;;comp;cds;;171;DUF951
;atgj;7;77;;;tn004;;;;
;atgi;44;77;;;16s-atc-235-11aas;;intercal ;long pbs;protéine
;tca;8;91;;;;cds;729;582;hp
;atgf;4;77;;;;16s;98;1539;
;gac;11;76;;;;atc;54;77;
;ttc;137;76;;;;23s;19;2891;
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2*16s23s5s;;intercal ;long pbs;protéine;;;gta;53;76;
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comp;5s;34;111;;;;tta;8;86;
comp;23s;158;2854;;;;gca;38;76;
comp;16s;432;1535;;;;atgj;1;77;
comp;cds;860;105;cobalamin;;;atgi;6;77;
comp;aac;11;77;;;;tca;17;91;
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comp;23s;159;2854;;;comp;cds;;735;ABCu
comp;16s;431;1536;;;tn012;;;;
comp;cds;;531;cobyrinic;;6aas-16s23s5s;;intercal ;long pbs;protéine
tn008;;;;;;;cds;148;861;THF
16s-atc-235-11aas;;intercal ;long pbs;protéine;;;aac;8;76;
comp;cds;1035;2811;hp;;;gaa;9;76;
comp;ttc;0;76;;;;gta;9;76;
comp;gac;7;76;;;;aca;116;76;
comp;atgf;20;77;;;;aaa;4;76;
comp;tca;7;91;;;;cta;264;84;
comp;atgi;1;77;;;;16s;207;1528;
comp;atgj;22;77;;;;23s;249;2736;
comp;gca;6;76;;;;5s;97;103;
comp;tta;17;86;;;;cds;;1593;ABCs
comp;aaa;2;76;;;tn014;;;16s°aac-gaa-5s;
comp;aca;50;76;;;16s23s5s-aac-gaa;;intercal ;long pbs;protéine
comp;gta;21;76;;;comp;cds;178;597;hp
comp;5s;26;106;;;comp;gaa;8;77;
comp;23s;55;2866;;;comp;aac;67;77;
comp;atc;61;77;;;comp;5s;0;91;
comp;16s;2069;1537;;;comp;16s°;745;381;
comp;cds;;246;DUF2963;;comp;gaa;8;77;
tn086;;;;;;comp;aac;67;77;
16s23s5s;;intercal ;long pbs;protéine;;comp;5s;33;108;
;cds;570;423;hp;;comp;23s;143;2861;
comp;ncRNA;199;833;;;comp;16s;478;1544;
;16s;-445;1513;;;comp;cds;;1287;P-ligase
comp;ncRNA;221;456;;;;;;;
;23s;-262;2905;;;;;;;
comp;ncRNA;70;229;;;;;;;
;5s;183;108;;;;;;;
;cds;;765;hp;;;;;;
tn097;;;;;cds–11 aas;tn001;tn003;tn004;tn008;tn097
16s-atc-235-11aas;;intercal ;long pbs;protéine;;intercal ;intercal ;intercal ;intercal ;intercal 
;cds;217;186;hp;cds;137;154;324;1035;217
comp;ttc;2;76;;ttc;11;7;2;0;2
comp;gac;5;76;;gac;4;4;5;7;5
comp;atgf;17;77;;atgf;8;55;17;20;17
comp;tca;7;91;;tca;44;22;6;7;7
comp;atgi;1;77;;atgi;7;4;1;1;1
comp;atgj;38;77;;atgj;72;45;38;22;38
comp;gca;4;76;;gca;8;5;8;6;4
comp;tta;66;86;;tta;7;20;61;17;66
comp;aaa;7;76;;aaa;11;6;7;2;7
comp;aca;52;76;;aca;44;15;53;50;52
comp;gta;25;76;;gta;14;21;25;21;25
comp;5s;19;109;;5s;34;34;19;26;19
comp;23s;54;2890;;23s;88;50;54;55;54
comp;atc;102;77;;atc;137;-;98;61;102
comp;16s;734;1535;;16s;432;-;729;2069;734
comp;cds;;582;hp;cds;;;;;

tener typage

Lien tableur: tener typage

tener noms

Lien fiche: tener noms

;;4.9.19 Paris;fait vers le 20.8.19;;;
;;111;Tenericutes;3579;;
ruptures;notes;rRNAs;faits;code;tRNAs;génomes
1;;644;1;tn001;§46;Acholeplasma brassicae O502 
1;;;;tn002;§36;Acholeplasma laidlawii PG-8A 
1;;222;1;tn003;§35;Acholeplasma palmae J233 
1;;222;1;tn004;§32;Aster yellows witches-broom phytoplasma AYWB 
1;;111;1;tn005;§28;Candidatus Hepatoplasma crinochetorum Av 
1;;;;tn006;§31;Candidatus Mycoplasma girerdii VCU M1 
1;;;;tn007;§33;Candidatus Mycoplasma haemolamae str. Purdue 
1;;222;1;tn008;§35;Candidatus Phytoplasma australiense 
1;;;;tn009;§32;Candidatus Phytoplasma mali AT 
1;;;;tn010;§8;Candidatus Phytoplasma solani 231/09 
1;;;;tn011;§27;Candidatus Phytoplasma solani 284/09 
1;;222;1;tn012;§29;Mesoplasma florum L1 ATCC 33453 
;;;;tn013;29;Mesoplasma florum W37 
1;;211;1;tn014;§40;Mollicutes bacterium HR1 
1;;;;tn015;§34;Mycoplasma agalactiae 5632 
;;;;tn016;34;Mycoplasma agalactiae PG2 
1;;;;tn017;§33;Mycoplasma arthritidis 158L3-1 
1;;211;1;tn018;§34;Mycoplasma bovis CQ-W70 
;;;;tn019;34;Mycoplasma bovis HB0801 
;;;;tn020;34;Mycoplasma bovis Hubei-1 
;;;;tn021;34;Mycoplasma bovis PG45 
1;;;;tn022;§30;Mycoplasma bovoculi M165/69 
1;;;;tn023;§32;Mycoplasma californicum HAZ160 1 
;;;;tn024;32;Mycoplasma californicum ST-6 
1;;;;tn025;§32;Mycoplasma canadense HAZ360 1 
1;;222;1;tn026;§31;Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343 
;;;;tn027;31;Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae 87001 
;;;;tn028;31;Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae F38 
;;;;tn029;31;Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae ILRI181 
1;;111;1;tn030;§29;Mycoplasma conjunctivae HRC/581T 
1;;;;tn031;§34;Mycoplasma crocodyli MP145 
1;;;;tn032;§30;Mycoplasma cynos C142 
1;;;;tn033;§32;Mycoplasma dispar ATCC 27140 
1;;;;tn034;§36;Mycoplasma fermentans JER 
;;;;tn035;36;Mycoplasma fermentans M64 
;;;;tn036;36;Mycoplasma fermentans PG18 
1;;;;tn037;§30;Mycoplasma flocculare ATCC 27399 Ms42 
1;;222;1;tn038;§33;Mycoplasma gallisepticum CA06 2006.052-5-2P 
;;;;tn039;33;Mycoplasma gallisepticum NC06 2006.080-5-2P 
;;;;tn040;33;Mycoplasma gallisepticum NC08 2008.031-4-3P 
;;;;tn041;33;Mycoplasma gallisepticum NC95 13295-2-2P 
;;;;tn042;33;Mycoplasma gallisepticum NC96 1596-4-2P 
;;;;tn043;33;Mycoplasma gallisepticum NY01 2001.047-5-1P 
;;;;tn044;33;Mycoplasma gallisepticum S6 
;;;;tn045;32;Mycoplasma gallisepticum str. F 
;;;;tn046;32;Mycoplasma gallisepticum str. Rhigh 
;;;;tn047;32;Mycoplasma gallisepticum str. Rlow 
;;;;tn048;33;Mycoplasma gallisepticum VA94 7994-1-7P 
;;;;tn049;33;Mycoplasma gallisepticum WI01 2001.043-13-2P 
1;;111;1;tn050;§36;Mycoplasma genitalium G37 G-37 
;;;;tn051;36;Mycoplasma genitalium M2288 
;;;;tn052;36;Mycoplasma genitalium M2321 
;;;;tn053;36;Mycoplasma genitalium M6282 
;;;;tn054;36;Mycoplasma genitalium M6320 
1;;;;tn055;§32;Mycoplasma haemocanis str. Illinois 
1;;;;tn056;§32;Mycoplasma haemofelis Ohio2 
;;;;tn057;32;Mycoplasma haemofelis str. Langford 1 
1;;;;tn058;§33;Mycoplasma hominis AF1 
;;;;tn059;33;Mycoplasma hominis ATCC 23114 
;;;;tn060;33;Mycoplasma hominis ATCC 27545 LBD-4 
1;;;;tn061;§31;Mycoplasma hyopneumoniae 168 
;;;;tn062;31;Mycoplasma hyopneumoniae 168-L 
;;;;tn063;31;Mycoplasma hyopneumoniae 232 
;;;;tn064;31;Mycoplasma hyopneumoniae 7422 
;;;;tn065;31;Mycoplasma hyopneumoniae 7448 
;;111;1;tn066;31;Mycoplasma hyopneumoniae J 
1;;;;tn067;§30;Mycoplasma hyorhinis DBS 1050 
;;;;tn068;30;Mycoplasma hyorhinis GDL-1 
;;;;tn069;30;Mycoplasma hyorhinis HUB-1 
;;;;tn070;30;Mycoplasma hyorhinis MCLD 
;;;;tn071;30;Mycoplasma hyorhinis SK76 
1;;;;tn072;§31;Mycoplasma leachii 99/014/6 
;;;;tn073;31;Mycoplasma leachii PG50 
1;;;;tn074;§17;Mycoplasma meleagridis B2096 8B 
1;;111;1;tn075;§28;Mycoplasma mobile 163K 
1;;;;tn076;§31;Mycoplasma mycoides subsp. capri LC str. 95010 
;31*2;;;tn077;62;Mycoplasma mycoides subsp. capri str. GM12 
;;222;1;tn078;31;Mycoplasma mycoides subsp. mycoides izsam mm5713 
;;;;tn079;31;Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC str. Gladysdale 
;;;;tn080;31;Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC str. PG1 
1;;;;tn081;§31;Mycoplasma ovis str. Michigan 
1;;;;tn082;§32;Mycoplasma parvum str. Indiana 
1;;;;tn083;§30;Mycoplasma penetrans HF-2 
1;;;;tn084;§36;Mycoplasma pneumoniae 309 
;;;;tn085;36;Mycoplasma pneumoniae FH 
;;111;1;tn086;37;Mycoplasma pneumoniae M129 ATCC 29342 
;;;;tn087;37;Mycoplasma pneumoniae M129-B7 
;;;;tn088;37;Mycoplasma pneumoniae M29 
1;;;;tn089;§31;Mycoplasma putrefaciens KS1 
;;;;tn090;31;Mycoplasma putrefaciens Mput9231 
1;;;;tn091;§32;Mycoplasma suis KI3806 
;;;;tn092;32;Mycoplasma suis str. Illinois 
1;;;;tn093;§34;Mycoplasma synoviae 53 
;;;;tn094;34;Mycoplasma synoviae ATCC 25204 WVU1853 
1;;;;tn095;§32;Mycoplasma wenyonii str. Massachusetts 
1;;;;tn096;§31;Mycoplasma yeatsii GM274B 
1;;222;1;tn097;§32;Onion yellows phytoplasma OY-M onion yellows 
1;;111;1;tn098;§31;Spiroplasma apis B31 
1;;;;tn099;§33;Spiroplasma chrysopicola DF-1 
1;;;;tn100;§30;Spiroplasma culicicola AES-1 
1;;;;tn101;§30;Spiroplasma diminutum CUAS-1 
1;;111;1;tn102;§34;Spiroplasma mirum ATCC 29335 
;;;;tn103;34;Spiroplasma mirum ATCC 29335 SMCA 
1;;;;tn104;§30;Spiroplasma sabaudiense Ar-1343 
1;;;;tn105;§32;Spiroplasma syrphidicola EA-1 
1;;;;tn106;§30;Spiroplasma taiwanense CT-1 
1;;;;tn107;§22;Ureaplasma diversum ATCC 49782 
1;;222;1;tn108;§30;Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 27815 
;;;;tn109;30;Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970 
;;;;tn110;30;Ureaplasma parvum serovar 3 SV3F4 
1;;;;tn111;§30;Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699 
58;;;20;;;

Chlamydiae

chlam blocs

Lien fiche: chlam blocs

chlam blocs;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;chl001-124;;;;Notes
chl001;2*16s23s5s;;2;35;0;35;;;'''16s23s5s;'''6-gcaatc-35;'''avant;
;16s°-23s°-5s;;;;;;;'''sans;10;2;5;'''avant
;;;;;;;;'''1-3;;;;5*cac-16s235
chl002;cac-16s235;;1;39;1;38;;;;;;cac en direct et le reste en comp
chl003;2*16s23s5s;;2;37;0;37;17;'''total;10;2;5;les intercalaires sont très variables
;;;;;;;;;;;;entre 422-822
chl009;cac-16s235;;1;38;1;37;;;;;;
chl012;cac-16s235;;1;38;1;37;;;;;;'''autres incomplets
chl029;cac-16s235;;1;37;1;36;;;;;;16s°-23s°-5s
;;;;;;;;;;;;
chl118;16s23s5s;;1;38;0;38;;;;;;'''5s de trop
chl120;cac-16s235;;1;38;1;37;;;;;;16s-gcaatc-235-5s
chl121;16s23s5s;;1;38;0;38;;;;;;
chl122;2*16s23s5s;;3;41;2;39;;;;;;
;16s-gcaatc-235-5s;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
chl123;16s23s5s;;1;35;0;35;;;;;;
chl124;16s23s5s;;2;37;2;35;;;;;;
;16s-gcaatc-235;;;;;;;;;;;
;;;17;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;chl001-124;;;;Notes
12;;;;;;;;;'''16s23s5s;'''6-gcaatc-35;'''avant;
;;;;;;;;'''sans;10;2;5;'''avant
;'''Moyenne;;;38;1;37;;'''1-3;;;;5*cac-16s235
;'''ecartype;;;2;1;1;;;;;;cac en direct et le reste en comp
;'''max;;;41;2;39;17;'''total;10;2;5;les intercalaires sont très variables
;'''min;;;35;0;35;;;;;;entre 422-822
;;;;;;;;;;;;
;'''blocs;17;;;;;;;;;;'''autres incomplets
;'''génomes;12;;;;;;;;;;16s°-23s°-5s
;'''cds;0;;;;;;;;;;
;'''devant;0;;;;;;;;;;'''5s de trop
;'''avant;5;;;;;;;;;;16s-gcaatc-235-5s
;'''16s23s5s;15;;;;;;;;;;

chlam notes

Lien tableur: chlam notes

chlam typage

Lien tableur: chlam typage

chlam noms

Lien Fiche: chlam noms

;;4.9.19 Paris;fait vers le 20.8.19;;;
;;;124;Chlamydiae;4762;
;;;;;;
ruptures;notes;rRNAs;faits;code;tRNAs;génomes
1;;322;1;chl001;§35;Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25 
1;;111;1;chl002;§39;Chlamydia avium 10DC88 
1;;222;1;chl003;§37;Chlamydia muridarum MopnTet14 
;37*3;;;chl004;111;Chlamydia muridarum Nigg3 
;;;;chl005;37;Chlamydia muridarum str. Nigg 
;;;;chl006;37;Chlamydia muridarum str. Nigg 2 MCR 
;;;;chl007;37;Chlamydia muridarum str. Nigg CM972 
;;;;chl008;37;Chlamydia muridarum str. Nigg3 CMUT3-5 
1;;111;1;chl009;§38;Chlamydia pecorum P787 
;;;;chl010;38;Chlamydia pecorum PV3056/3 
;;;;chl011;38;Chlamydia pecorum W73 
1;;111;1;chl012;§38;Chlamydia psittaci 01DC11 
;;;;chl013;38;Chlamydia psittaci 01DC12 
;;;;chl014;38;Chlamydia psittaci 02DC15 
;;;;chl015;38;Chlamydia psittaci 08DC60 
;2*38;;;chl016;76;Chlamydia psittaci 6BC 
;;;;chl017;38;Chlamydia psittaci 84/55 
;;;;chl018;38;Chlamydia psittaci C19/98 
;;;;chl019;38;Chlamydia psittaci CP3 
;;;;chl020;38;Chlamydia psittaci GR9 
;;;;chl021;38;Chlamydia psittaci M56 
;;;;chl022;38;Chlamydia psittaci Mat116 
;;;;chl023;38;Chlamydia psittaci MN 
;;;;chl024;38;Chlamydia psittaci NJ1 
;;;;chl025;37;Chlamydia psittaci RD1 
;;;;chl026;38;Chlamydia psittaci VS225 
;;;;chl027;38;Chlamydia psittaci WC 
;;;;chl028;38;Chlamydia psittaci WS/RT/E30 
1;;111;1;chl029;§37;Chlamydia trachomatis 434/Bu 
;;;;chl030;37;Chlamydia trachomatis 6276 
;;;;chl031;37;Chlamydia trachomatis 6276s 
;;;;chl032;37;Chlamydia trachomatis 70 
;;;;chl033;37;Chlamydia trachomatis 70s 
;;;;chl034;37;Chlamydia trachomatis A/363 
;;;;chl035;37;Chlamydia trachomatis A/5291 
;;;;chl036;37;Chlamydia trachomatis A/7249 
;;;;chl037;37;Chlamydia trachomatis A/HAR-13 
;2*37;;;chl038;74;Chlamydia trachomatis A2497 
;;;;chl039;37;Chlamydia trachomatis B/Jali20/OT 
;;;;chl040;37;Chlamydia trachomatis B/TZ1A828/OT 
;;;;chl041;37;Chlamydia trachomatis C/TW-3 
;;;;chl042;37;Chlamydia trachomatis D-EC 
;;;;chl043;37;Chlamydia trachomatis D-LC 
;;;;chl044;37;Chlamydia trachomatis D/13-96 
;;;;chl045;37;Chlamydia trachomatis D/14-96 
;;;;chl046;37;Chlamydia trachomatis D/SotonD1 
;;;;chl047;37;Chlamydia trachomatis D/SotonD5 
;;;;chl048;37;Chlamydia trachomatis D/SotonD6 
;;;;chl049;37;Chlamydia trachomatis D/UW-3/CX 
;;;;chl050;37;Chlamydia trachomatis Ds2923 
;;;;chl051;37;Chlamydia trachomatis E/11023 
;;;;chl052;36;Chlamydia trachomatis E/12-94 
;;;;chl053;37;Chlamydia trachomatis E/150 
;;;;chl054;37;Chlamydia trachomatis E/Bour 
;;;;chl055;37;Chlamydia trachomatis E/C599 
;;;;chl056;37;Chlamydia trachomatis E/SotonE4 
;;;;chl057;37;Chlamydia trachomatis E/SotonE8 
;;;;chl058;37;Chlamydia trachomatis E/SW3 
;;;;chl059;37;Chlamydia trachomatis F/1-93 
;;;;chl060;37;Chlamydia trachomatis F/11-96 
;;;;chl061;37;Chlamydia trachomatis F/2-93 
;;;;chl062;37;Chlamydia trachomatis F/6-94 
;;;;chl063;37;Chlamydia trachomatis F/SotonF3 
;;;;chl064;37;Chlamydia trachomatis F/SW4 
;;;;chl065;37;Chlamydia trachomatis F/SW5 
;;;;chl066;37;Chlamydia trachomatis F/SWFPminus 
;;;;chl067;37;Chlamydia trachomatis G/11074 
;;;;chl068;37;Chlamydia trachomatis G/11222 
;;;;chl069;37;Chlamydia trachomatis G/9301 
;;;;chl070;37;Chlamydia trachomatis G/9768 
;;;;chl071;37;Chlamydia trachomatis G/SotonG1 
;;;;chl072;37;Chlamydia trachomatis Ia/SotonIa1 
;;;;chl073;37;Chlamydia trachomatis Ia/SotonIa3 
;;;;chl074;37;Chlamydia trachomatis Ia20-97 
;;;;chl075;37;Chlamydia trachomatis IU824 
;;;;chl076;37;Chlamydia trachomatis IU888 
;;;;chl077;38;Chlamydia trachomatis J/27-97 
;;;;chl078;37;Chlamydia trachomatis J/31-98 
;;;;chl079;37;Chlamydia trachomatis J/6276tet1 
;;;;chl080;37;Chlamydia trachomatis K/SotonK1 
;;;;chl081;37;Chlamydia trachomatis L1/115 
;;;;chl082;37;Chlamydia trachomatis L1/1322/p2 
;;;;chl083;37;Chlamydia trachomatis L1/224 
;;;;chl084;37;Chlamydia trachomatis L1/440/LN 
;;;;chl085;37;Chlamydia trachomatis L2/25667R 
;;;;chl086;37;Chlamydia trachomatis L2/434/Buf 
;;;;chl087;37;Chlamydia trachomatis L2/434/Bui 
;;;;chl088;37;Chlamydia trachomatis L2b/795 
;;;;chl089;37;Chlamydia trachomatis L2b/8200/07 
;;;;chl090;37;Chlamydia trachomatis L2b/Ams1 
;;;;chl091;37;Chlamydia trachomatis L2b/Ams2 
;;;;chl092;37;Chlamydia trachomatis L2b/Ams3 
;;;;chl093;37;Chlamydia trachomatis L2b/Ams4 
;;;;chl094;37;Chlamydia trachomatis L2b/Ams5 
;;;;chl095;37;Chlamydia trachomatis L2b/Canada1 
;;;;chl096;37;Chlamydia trachomatis L2b/Canada2 
;;;;chl097;37;Chlamydia trachomatis L2b/CS19/08 
;;;;chl098;37;Chlamydia trachomatis L2b/CS784/08 
;;;;chl099;37;Chlamydia trachomatis L2b/CV204 
;;;;chl100;37;Chlamydia trachomatis L2b/LST 
;;;;chl101;37;Chlamydia trachomatis L2b/UCH-1/proctitis 
;;;;chl102;37;Chlamydia trachomatis L2b/UCH-2 
;;;;chl103;37;Chlamydia trachomatis L2c 
;;;;chl104;37;Chlamydia trachomatis L2tet1 
;;;;chl105;37;Chlamydia trachomatis L3/404/LN 
;;;;chl106;37;Chlamydia trachomatis RC-F/69 
;;;;chl107;37;Chlamydia trachomatis RC-Fs/342 
;;;;chl108;37;Chlamydia trachomatis RC-Fs/852 
;;;;chl109;37;Chlamydia trachomatis RC-J/943 
;;;;chl110;37;Chlamydia trachomatis RC-J/953 
;;;;chl111;37;Chlamydia trachomatis RC-J/966 
;;;;chl112;37;Chlamydia trachomatis RC-J/971 
;;;;chl113;37;Chlamydia trachomatis RC-Js/122 
;;;;chl114;37;Chlamydia trachomatis RC-L2/55 
;;;;chl115;37;Chlamydia trachomatis RC-L2s/3 
;;;;chl116;37;Chlamydia trachomatis RC-L2s/46 
;;;;chl117;37;Chlamydia trachomatis Sweden2 
1;;111;1;chl118;§38;Chlamydophila abortus AB7 
;;;;chl119;38;Chlamydophila abortus S26/3 
1;;111;1;chl120;§38;Chlamydophila caviae GPIC 
1;;111;1;chl121;§38;Chlamydophila felis Fe/C-56 
1;;433;1;chl122;§41;Parachlamydia acanthamoebae UV-7 
1;;111;1;chl123;§35;Simkania negevensis Z 
1;;222;1;chl124;§37;Waddlia chondrophila WSU 86-1044 
12;;;12;;;

cyanobacteria

cyano blocs

Lien fiche: cyano blocs

cyano blocs;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;cya01-83;;;;Notes
cya01;2*16atcgca235;;2;77;4;73;;;'''16s23s5s;'''16-atcgca-35;'''16-atc-35;
cya02;2*16atcgca235;;4;68;4;64;;'''sans;17;44;13;'''cds
;2*16s23s5s;;;;;;;'''cds;;1;;16atcgca-23s°-cds-23s°-5s
;;;;;;;;;;;;16atcgca-cds-235
cya05;16atcgca235;;2;40;4;36;75;'''total;17;45;13;
;16atcgca23;;;;;;;;;;;'''incomplets
;5s;;;;;;;;;;;3*16atcgca23
;;;;;;;;;;;;16atcgca-23s°-cds-23s°-5s
cya08;2*16atcgca235;;3;80;4;76;;;;;;16s-atcgca –
;16s23s5s;;;;;;;;;;;23s°-16s°-atcgca
;;;;;;;;;;;;16atcgca-23s’
cya09;2*16-atc-235;;2;39;2;37;;;;;;16s
cya10;3*16atcgca235;;3;57;6;51;;;;;;
cya11;3*16-atc-235;;3;46;3;43;;;;;;'''autres incomplets
cya12;4*16s23s5s;;4;43;0;43;;;;;;2*23s5s
cya13;3*16atcgca235;;3;44;6;38;;;;;;16s°-atcgca-23s° –
cya16;2*16atcgca235;;2;46;4;42;;;;;;'''16s23s5s'''-16s°-23s° –
cya17;2*16-atc-235;;2;44;2;42;;;;;;23s°-5s
;;;;;;;;;;;;
cya23;2*16atcgca235;;4;77;4;73;;;;;;'''5s de trop
;2*16s23s5s;;;;;;;;;;;2*5s
;;;;;;;;;;;;
cya24;2*16atcgca235;;3;42;4;38;;;;;;
;16s23s5s;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
cya25;3*16atcgca235;;3;50;6;44;;;;;;
cya26;16atcgca235;;1;52;2;50;;;;;;
cya28;2*16-atc-235;;2;41;2;39;;;;;;
cya29;3*16atcgca235;;3;46;6;40;;;;;;
cya30;2*16atcgca235;;2;48;4;44;;;;;;
cya31;2*16atcgca235;;4;74;4;70;;;;;;
;2*16s23s5s;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
cya32;2*16-atc-235;;2;42;2;40;;;;;;
cya33;16s23s5s;;5;48;8;40;;;;;;
;2*23s5s;;;;;;;;;;;
;16atcgca-23s’;;;;;;;;;;;
;16s°-atcgca-23s° –;;;;;;;;;;;
;16s23s5s-16s°-23s° –;;;;;;;;;;;
;23s°-5s;;;;;;;;;;;
;16s-atcgca –;;;;;;;;;;;
;23s°-16s°-atcgca;;;;;;;;;;;
;16s;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
cya34;4*16atcgca235;;4;90;8;82;;;;;;
cya38;2*16s23s5s;;3;72;2;70;;;;;;
;16atcgca235;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
cya40;2*16-atc-235;;;42;2;40;;;;;;
;16s23s5s;;3;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
cya41;16atcgca235;;1;41;2;39;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
cya55;2*16atcgca235;;2;47;4;43;;;;;;
cya56;3*16atcgca235;;3;57;6;51;;;;;;
cya57;16atcgca235;;2;45;4;41;;;;;;
;16atcgca-23s°-cds-23s°-5s;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
cya58;2*16atcgca235;;2;46;4;42;;;;;;
cya81;16atcgca-cds-235;;1;42;2;40;;;;;;
cya83;2*16atcgca23s;;2;38;4;34;;;;;;
;5s;;82;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;cya01-83;;;;Notes
31;;;;;;;;;'''16s23s5s;'''16-atcgca-35;'''16-atc-35;
;'''Total;;;1624;119;1505;;'''sans;17;44;13;'''cds
;'''Moyenne;;;52;4;49;;'''cds;;1;;16atcgca-23s°-cds-23s°-5s
;'''Ecartype;;;14;2;14;;;;;;16atcgca-cds-235
;'''Max;;;90;8;82;75;'''total;17;45;13;
;'''Min;;;38;0;34;;;;;;'''incomplets
;;;;;;;;;;;;3*16atcgca23
;;;;;;;;;;;;16atcgca-23s°-cds-23s°-5s
;'''blocs;;82;;;;;;;;;16s-atcgca –
;'''génomes;;31;;;;;;;;;23s°-16s°-atcgca
;'''avant;;0;;;;;;;;;16atcgca-23s’
;'''après;;0;;;;;;;;;16s
;'''cds;;2;;;;;;;;;
;'''atcgca;;62%;;;;;;;;;'''autres incomplets
;'''atc;;16%;;;;;;;;;2*23s5s
;'''16s23s5s;;21%;;;;;;;;;16s°-atcgca-23s° –
;;;;;;;;;;;;'''16s23s5s'''-16s°-23s° –
;;;;;;;;;;;;23s°-5s
;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;'''5s de trop
;;;;;;;;;;;;2*5s

cyano notes

Lien tableur: cyano notes

Notes du cya033;;;;;;;
16s23s5s-16s°;;;;;;;
-23s°-23s°-5s;;intercal;long pbs;protéines;;;
<      ;cds;161;144;IS630 family transposase;*;;
comp;5s;121;118;;;;
comp;23s°;61;1836;;;;
comp;23s°;349;1103;;;;
comp;16s°;258;223;;;;
comp;5s;121;118;;;;
comp;23s;349;2834;;;;
comp;16s;60;1326;;;;
comp;23s°;123;1027;;;;
comp;gca;83;73;;;;
comp;atc;121;74;;;;
comp;16s°;66;975;;;;
comp;cds;;216;gas vesicle structural protein GvpA;*;;
;;;;;;;
16s;;;;;;;
>       ;cds;129;400;IS630 family transposase;*;;
comp;gca;83;73;;;;
comp;atc;121;74;;;;
comp;16s°;60;152;;;;
comp;23s°;314;1446;;;;
comp;gca;83;73;;;;
comp;atc;121;74;;;;
comp;16s;312;1491;;;;
dir;cds;867;;carboxylating nicotinate-nucleotide diphosphorylase;*;;
;;;;;;;
16s;;;;;;;
> comp;cds;205;1206;HNH endonuclease;*;;
comp;16s;270;1491;;;;
dir;cds;;204;hp;;;
;;;;;;;
Notes du cya057;;;;;;;
16atcgca-23s°;;;;;;;
-cds-23s°-5s;;interc;long pbs;;;;
comp;cds;93;1299;dihydroorotase;*;;
comp;5s;71;118;;;;
comp;23s°;24;1005;;;;
comp;cds;92;1176;transposase;;;
comp;23s°;174;1834;;;;
comp;gca;83;76;;;;
comp;atc;119;77;;;;
comp;16s;304;1498;;;;
comp;cds;:2;1518;4-alpha-glucanotransferase;*;;
;;;;;;;
Notes du cya057;;;;;;;
16atcgca-cds-235;;;;;;;
comp;2330492..2330734;;cds;228;243;hp;
comp;2330963..2331083;;5s;123;121;;
comp;2331207..2331512;;23s;150;306;;
comp;2331663..2332190;;cds;67;528;site-specific DNA endonuclease;*
comp;2332258..2334822;;23s suite;146;2565;;
comp;2334969..2335041;;gca;12;73;;
comp;2335054..2335127;;atc;115;74;;
comp;2335243..2336733;;16s;294;1491;;
;2337028..2337324;;cds;;297;hp;

cyano typage

Lien tableur: cyano typage

cyano noms

Lien fiche: cyano noms

;;3.9.19 Paris;fait vers le 20.8.19;;;
;;72;83;cyanobacteria;;4062
;;;;;;
ruptures;notes;rRNAs;faits;code;tRNAs;génome
1;;222;1;cya01;§77;Acaryochloris marina MBIC11017 
1;;444;1;cya02;§68;Anabaena cylindrica PCC 7122 
1;;;;cya03;§44;Anabaena sp. 90 
1;;;;cya04;§49;Anabaena variabilis ATCC 29413 
1;;222;1;cya05;§40;Arthrospira platensis NIES-39 
1;;;;cya06;§42;Arthrospira sp. PCC 8005 
1;;;;cya07;§44;Calothrix sp. PCC 6303 
1;;333;1;cya08;§80;Calothrix sp. PCC 7507 
1;;222;1;cya09;§39;Candidatus Atelocyanobacterium thalassa isolate ALOHA 
1;;333;1;cya10;§57;Chamaesiphon minutus PCC 6605 
1;;333;1;cya11;§46;Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 
1;;444;1;cya12;§43;Crinalium epipsammum PCC 9333 
1;;333;1;cya13;§44;Cyanobacterium aponinum PCC 10605 
1;;;;cya14;§40;cyanobacterium endosymbiont of Epithemia turgida isolate EtSB Lake Yunoko 
1;;;;cya15;§43;Cyanobacterium stanieri PCC 7202 
1;;222;1;cya16;§46;Cyanobium gracile PCC 6307 
1;;222;1;cya17;§44;Cyanothece sp. ATCC 51142 
1;;;;cya18;§47;Cyanothece sp. PCC 7424 
1;;;;cya19;§49;Cyanothece sp. PCC 7425 
1;;;;cya20;§52;Cyanothece sp. PCC 7822 
1;;;;cya21;§47;Cyanothece sp. PCC 8801 
1;;;;cya22;§46;Cyanothece sp. PCC 8802 
1;;444;1;cya23;§77;Cylindrospermum stagnale PCC 7417 
1;;333;1;cya24;§42;Dactylococcopsis salina PCC 8305 
1;;333;1;cya25;§50;Geitlerinema sp. PCC 7407 
1;;111;1;cya26;§52;Gloeobacter kilaueensis JS1 
1;;;;cya27;§44;Gloeobacter violaceus PCC 7421 
1;;222;1;cya28;§41;Gloeocapsa sp. PCC 7428 
1;;333;1;cya29;§46;Halothece sp. PCC 7418 
1;;222;1;cya30;§48;Leptolyngbya sp. PCC 7376 
1;;444;1;cya31;§74;Microcoleus sp. PCC 7113 
1;;222;1;cya32;§42;Microcystis aeruginosa NIES-843 
1;;454;1;cya33;§48;Nodularia spumigena CCY9414 
1;;444;1;cya34;§90;Nostoc punctiforme PCC 73102 ATCC 29133 
1;;;;cya35;§82;Nostoc sp. PCC 7107 
1;;;;cya36;§74;Nostoc sp. PCC 7120 
1;;;;cya37;§70;Nostoc sp. PCC 7524 
1;;333;1;cya38;§72;Oscillatoria acuminata PCC 6304 
1;;;;cya39;§78;Oscillatoria nigro-viridis PCC 7112 
1;;333;1;cya40;§42;Pleurocapsa sp. PCC 7327 
1;;111;1;cya41;§41;Prochlorococcus marinus str. AS9601 
;;;;cya42;40;Prochlorococcus marinus str. MIT 9211 MIT9211 
;;;;cya43;41;Prochlorococcus marinus str. MIT 9215 
;;;;cya44;38;Prochlorococcus marinus str. MIT 9301 
;;;;cya45;46;Prochlorococcus marinus str. MIT 9303 
;;;;cya46;45;Prochlorococcus marinus str. MIT 9312 
;;;;cya47;48;Prochlorococcus marinus str. MIT 9313 MIT9313 
;;;;cya48;38;Prochlorococcus marinus str. MIT 9515 
;;;;cya49;39;Prochlorococcus marinus str. NATL1A 
;;;;cya50;39;Prochlorococcus marinus str. NATL2A 
;;;;cya51;40;Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 SS120 
;;;;cya52;38;Prochlorococcus marinus subsp. pastoris str. CCMP1986 MED4 
1;;;;cya53;§43;Prochlorococcus sp. MIT 0604 
1;;;;cya54;§41;Prochlorococcus sp. MIT 0801 
1;;222;1;cya55;§47;Pseudanabaena sp. PCC 7367 
1;;333;1;cya56;§57;Rivularia sp. PCC 7116 
1;;221;1;cya57;§45;Stanieria cyanosphaera PCC 7437 
1;;222;1;cya58;§46;Synechococcus elongatus PCC 6301 
1;;;;cya59;§46;Synechococcus elongatus PCC 7942 
1;;;;cya60;§44;Synechococcus sp. CC9311 
1;;;;cya61;§52;Synechococcus sp. CC9605 
1;;;;cya62;§45;Synechococcus sp. CC9902 
1;;;;cya63;§45;Synechococcus sp. JA-2-3Ba2-13 
1;;;;cya64;§47;Synechococcus sp. JA-3-3Ab 
1;;;;cya65;§43;Synechococcus sp. KORDI-100 
1;;;;cya66;§45;Synechococcus sp. KORDI-49 
1;;;;cya67;§48;Synechococcus sp. KORDI-52 
1;;;;cya68;§42;Synechococcus sp. PCC 6312 
1;;;;cya69;§45;Synechococcus sp. PCC 7002 ATCC 27264 
1;;;;cya70;§43;Synechococcus sp. PCC 7502 
1;;;;cya71;§42;Synechococcus sp. RCC307 
1;;;;cya72;§45;Synechococcus sp. UTEX 2973 
1;;;;cya73;§45;Synechococcus sp. WH 7803 
1;;;;cya74;§44;Synechococcus sp. WH 8109 
1;;;;cya75;§42;Synechocystis sp. PCC 6714 
1;;;;cya76;§82;Synechocystis sp. PCC 6803 
1;;;;cya77;§41;Synechocystis sp. PCC 6803 GT-S 
1;;;;cya78;§41;Synechocystis sp. PCC 6803 substr. GT-I 
1;;;;cya79;§41;Synechocystis sp. PCC 6803 substr. PCC-N 
1;;;;cya80;§41;Synechocystis sp. PCC 6803 substr. PCC-P 
1;;111;1;cya81;§42;Thermosynechococcus elongatus BP-1 
1;;;;cya82;§42;Thermosynechococcus sp. NK55a 
1;;122;1;cya83;§38;Trichodesmium erythraeum IMS101 
72;;;31;;;

Spirochaetes

spiro blocs

Lien fiche: spiro blocs

spirochetes;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;spi01-70;;;;;Notes
spi01;16s-gca, cds,235;;2;32;2;30;;;'''16-atcgca-35;'''16-gca-35;'''16-atc-35;'''16s, 235s;
;16s-atc, cds,235;;;;;;;'''sans;2;7;5;2;'''incomplets
;;;;;;;;'''cds;;3;2;;4*16s
spi07;16s-gca, cds,235;;1;32;2;30;;;;;;;
;16s°-cds-atc, 235;;;;;;21;'''total;2;10;7;2;'''autres incomplets
;;;;;;;;;;;;;4*23s
spi14;16s-gca, cds,235;;2;32;2;30;;;;;;;16s°-cds-atc, 235
;16s-atc, cds,235;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;'''cds  création
spi26;16s, 235s;;1;34;0;34;;;;;;;3*(16s-gca, cds,235)
spi30;16s, 235s;;1;34;0;34;;;;;;;2*(16s-atc, cds,235)
spi33;2*16s;;2;35;0;35;;;;;;;16s°-cds-atc, 235
;2*23s;;;;;;;;;;;;
;2*5s;;;;;;;;;;;;'''5s de trop
;;;;;;;;;;;;;3*5s
spi37;2*16s;;2;37;0;37;;;;;;;
;2*23s;;;;;;;;;;;;
;5s;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
spi41;16-gca-235;;2;44;2;42;;;;;;;
;16s-atc-235;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
spi42;2*16-gca-235;;3;47;3;44;;;;;;;
;16s-atc-235;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
spi45;2*16-atc-235;;3;47;3;44;;;;;;;
;16-gca-235;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
spi49;2*16-gca-235;;2;47;2;45;;;;;;;
spi53;16-gca-235;;2;45;2;43;;;;;;;
;16s-atc-235;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
spi70;2*16atcgca235;;2;41;4;37;;;;;;;
;;;25;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;spi01-70;;;;;Notes
13;;;;;;;;;'''16-atcgca-35;'''16-gca-35;'''16-atc-35;'''16s, 235s;
;;;;;;;;'''sans;2;7;5;2;'''incomplets
;'''Moyenne;;;39;2;37;;'''cds;;3;2;;4*16s
;'''Ecartype;;;6;1;6;;;;;;;
;'''Max;;;47;4;45;21;'''total;2;10;7;2;'''autres incomplets
;'''Min;;;32;0;30;;;;;;;4*23s
;;;;;;;;;;;;;16s°-cds-atc, 235
;;;;;;;;;;;;;
;'''blocs;;25;;;;;;;;;;'''cds  création
;'''génomes;;13;;;;;;;;;;3*(16s-gca, cds,235)
;'''avant;;0;;;;;;;;;;2*(16s-atc, cds,235)
;'''après;;0;;;;;;;;;;16s°-cds-atc, 235
;'''cds;;6;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;'''5s de trop
;;;;;;;;;;;;;3*5s

spiro notes

Lien fiche: spiro notes

;Notes spirochetes;;;;;
spi01;16s-gca, 16s-atc, 235-235;;intercal;long pbs;protéines;
;comp;cds;97;4482;transporter substrate-binding domain-containing protein;*
;comp;5s;20;111;;*
;comp;23s;170;2935;;*
;comp;5s;20;111;;*
;comp;23s;198;2935;;*
;comp;cds;135;843;Cof-type HAD-IIB family hydrolase;*
;comp;cds;640;558;DNA-3-methyladenine glycosylase;*
;dir;atc;377;74;;*
;comp;16s;193;1464;;*
;comp;gca;173;74;;*
;comp;16s;209;1543;;*
;comp;cds;;549;nucleoside deoxyribosyltransferase;*
;;;;;;
spi07;16s-gca, 16s°-atc, 235-235;;;;;
;comp;cds;97;4485;response regulator;*
;comp;5s;21;111;;*
;comp;23s;178;2935;;*
;comp;5s;21;111;;*
;comp;23s;200;2935;;*
;comp;cds;135;840;Cof-type HAD-IIB family hydrolase;*
;comp;cds;374;561;DNA-3-methyladenine glycosylase;*
;dir;atc;66;74;;*
;comp;cds;168;204;hp;*
;comp;16s°;79;122;;*
;comp;gca;168;74;;*
;comp;16s;204;1545;;*
;comp;cds;;549;nucleoside deoxyribosyltransferase;*
;;;;;;
spi14;16s-gca, 16s-atc, 235-235;;;;;
;comp;cds;98;4485;transporter substrate-binding domain-containing protein;*
;comp;5s;21;111;;*
;comp;23s;177;2935;;*
;comp;5s;21;111;;*
;comp;23s;197;2935;;*
;comp;cds;124;843;Cof-type HAD-IIB family hydrolase;*
;comp;cds;1030;561;DNA-3-methyladenine glycosylase;*
;dir;atc;383;74;;*
;comp;16s;147;1087;;*
;comp;gca;166;74;;*
;comp;16s;208;1543;;*
;comp;cds;;549;nucleoside deoxyribosyltransferase;*

spiro typage

Lien tableur: spiro typage

spiro noms

Lien fiche: spiro noms

;;;4.9.19 Paris;fait vers le 20.8.19;;
;;;70;Spirochaetes;;2841
;;;;;;
ruptures;notes;rRNAs;faits;code;tRNAs;génomes
1;;222;1;spi01;§32;Borrelia afzelii HLJ01 
;;;;spi02;32;Borrelia afzelii K78 
;;;;spi03;33;Borrelia afzelii PKo 
;;;;spi04;32;Borrelia afzelii Tom3107 
1;;;;spi05;§32;Borrelia bissettii DN127 
1;32*2;;;spi06;§64;Borrelia burgdorferi B31 
;;212;1;spi07;32;Borrelia burgdorferi CA382 
;;;;spi08;32;Borrelia burgdorferi JD1 
;;;;spi09;32;Borrelia burgdorferi N40 
;;;;spi10;32;Borrelia burgdorferi ZS7 
1;;;;spi11;§31;Borrelia chilensis VA1 
1;;;;spi12;§32;Borrelia crocidurae str. Achema 
1;;;;spi13;§32;Borrelia duttonii Ly 
1;;222;1;spi14;§32;Borrelia garinii BgVir 
;;;;spi15;33;Borrelia garinii NMJW1 
;;;;spi16;32;Borrelia garinii PBi 
;;;;spi17;33;Borrelia garinii SZ 
1;;;;spi18;§32;Borrelia hermsii CC1 
1;;;;spi19;§32;Borrelia miyamotoi CT14D4 
;;;;spi20;32;Borrelia miyamotoi LB-2001 
1;;;;spi21;§32;Borrelia parkeri HR1 
1;;;;spi22;§32;Borrelia recurrentis A1 
1;;;;spi23;§32;Borrelia turicatae 91E135 
1;;;;spi24;§32;Borrelia valaisiana Tom4006 
;;;;spi25;33;Borrelia valaisiana VS116 
1;;111;1;spi26;§34;Brachyspira hyodysenteriae WA1 ATCC 49526 
1;;;;spi27;§34;Brachyspira intermedia PWS/A 
1;;;;spi28;§35;Brachyspira murdochii DSM 12563 
1;;;;spi29;§34;Brachyspira pilosicoli 95/1000 
;;111;1;spi30;34;Brachyspira pilosicoli B2904 
;;;;spi31;34;Brachyspira pilosicoli P43/6/78 
;;;;spi32;34;Brachyspira pilosicoli WesB 
1;;222;1;spi33;§35;Leptospira biflexa serovar Patoc strain Patoc 1 Ames 
;;;;spi34;35;Leptospira biflexa serovar Patoc strain Patoc 1 Paris 
1;;;;spi35;§37;Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis str. JB197 
;;;;spi36;37;Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis str. L550 
1;;122;1;spi37;§37;Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 
;;;;spi38;37;Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 
;;;;spi39;37;Leptospira interrogans serovar Lai str. IPAV 
;;;;spi40;37;Leptospira interrogans serovar Linhai str. 56609 
1;;222;1;spi41;§44;Salinispira pacifica L21-RPul-D2 
1;;333;1;spi42;§47;Sphaerochaeta coccoides DSM 17374 
1;;;;spi43;§48;Sphaerochaeta globosa str. Buddy 
1;;;;spi44;§49;Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes 
1;;333;1;spi45;§47;Spirochaeta africana DSM 8902 
1;;;;spi46;§50;Spirochaeta smaragdinae DSM 11293 
1;;;;spi47;§46;Spirochaeta thermophila DSM 6192 
;;;;spi48;46;Spirochaeta thermophila DSM 6578 
1;;222;1;spi49;§47;Treponema azotonutricium ZAS-9 
1;;;;spi50;§47;Treponema brennaborense DSM 12168 
1;;;;spi51;§48;Treponema caldaria DSM 7334 
1;;;;spi52;§44;Treponema denticola ATCC 35405 
1;;222;1;spi53;§45;Treponema pallidum str. Fribourg-Blanc 
;;;;spi54;45;Treponema pallidum subsp. endemicum str. Bosnia A 
;;;;spi55;45;Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 
;;;;spi56;90;Treponema pallidum subsp. pallidum SS14 
;;;;spi57;45;Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago 
;;;;spi58;45;Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A 
;;;;spi59;90;Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols 
;;;;spi60;45;Treponema pallidum subsp. pallidum str. Sea 81-4 
;;;;spi61;45;Treponema pallidum subsp. pertenue str. CDC2 
;;;;spi62;45;Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier 
;;;;spi63;45;Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD 
1;;;;spi64;§45;Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A 
1;;;;spi65;§45;Treponema pedis str. T A4 
1;;;;spi66;§53;Treponema primitia ZAS-2 
1;;;;spi67;§45;Treponema putidum OMZ 758 
1;;;;spi68;§49;Treponema sp. OMZ 838 
1;;;;spi69;§49;Treponema succinifaciens DSM 2489 
1;;222;1;spi70;§41;Turneriella parva DSM 21527 
39;;;13;;;

Chloroflexi

chlor blocs

Lien fiche: chlor blocs

chloroflex;;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;clo01-22;;;;;;Notes
clo01;16s23s5s;;2;54;2;52;;;'''16s23s5s;'''16-atcgca-35;'''16-atc-35;'''16s, 235s;'''16-atc,35;
;16atcgca235;;;;;;;'''sans;2;1;2;2;2;
;;;;;;;;'''atgf;4;2;;;;
clo02;2*16-atc-235;;2;48;2;46;;;;;;;;
clo03;16s23s5s;;3;49;;;15;'''total;6;3;2;2;2;
;2*(16s,235s);;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
clo06;16s-atc, 235;;1;49;1;48;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
clo17;16s-atc, 235;;1;48;1;47;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
clo19;2*16235-atgf;;2;48;2;46;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
clo21;16235-atgf;;2;50;2;48;;;;;;;;
;16atcgca235-atgf;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
clo22;16235-atgf;;2;49;2;47;;;;;;;;
;16atcgca235-atgf;;;;;;;;;;;;;
;;;15;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;total;;;;;;Notes
8;;;;;;;;;'''16s23s5s;'''16-atcgca-35;'''16-atc-35;'''16s, 235s;'''16-atc,35;
;;;;;;;;'''sans;2;1;2;2;2;
;'''Moyenne;;;49;2;48;;'''atgf;4;2;;;;
;'''Ecartype;;;2;0;2;;;;;;;;
;'''Max;;;54;2;52;15;'''total;6;3;2;2;2;
;'''Min;;;48;1;46;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
;'''blocs;;15;;;;;;;;;;;
;'''génomes;;8;;;;;;;;;;;
;'''avant;;0;;;;;;;;;;;
;'''après atgf;;6 / 3;;;;;;;;;;;
;'''cds;;0;;;;;;;;;;;
;'''16s23s5s;;8;;;;;;;;;;;
;'''16-aas-235;;7;;;;;;;;;;;

chlor notes

Lien tableur: chlor notes

chlor typage

Lien tableur: chlor typage

chlor noms

Lien fiche: chlor noms

;;;4.9.19 Paris;fait vers le 20.8.19;;
;;;22;Chloroflexi;1076;
;;;;;;
ruptures;notes;rRNAs;faits;code;tRNAs;génomes
1;;222;1;clo01;§54;Anaerolinea thermophila UNI-1 
1;;222;1;clo02;§48;Caldilinea aerophila DSM 14535 NBRC 104270 
1;;333;1;clo03;§49;Chloroflexus aggregans DSM 9485 
1;;;;clo04;§50;Chloroflexus aurantiacus J-10-fl 
1;;;;clo05;§50;Chloroflexus sp. Y-400-fl 
1;;111;1;clo06;§49;Dehalococcoides mccartyi 195 
;;;;clo07;48;Dehalococcoides mccartyi BAV1 
;;;;clo08;49;Dehalococcoides mccartyi BTF08 
;;;;clo09;47;Dehalococcoides mccartyi CBDB1 
;;;;clo10;51;Dehalococcoides mccartyi CG1 
;;;;clo11;47;Dehalococcoides mccartyi CG4 
;;;;clo12;47;Dehalococcoides mccartyi CG5 
;;;;clo13;47;Dehalococcoides mccartyi DCMB5 
;;;;clo14;48;Dehalococcoides mccartyi GT 
;;;;clo15;47;Dehalococcoides mccartyi GY50 
;;;;clo16;47;Dehalococcoides mccartyi VS 
1;;111;1;clo17;§47;Dehalogenimonas lykanthroporepellens BL-DC-9 
1;;;;clo18;§55;Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 
1;;222;1;clo19;§48;Roseiflexus castenholzii DSM 13941 
1;;;;clo20;§49;Roseiflexus sp. RS-1 
1;;222;1;clo21;§50;Sphaerobacter thermophilus DSM 20745 
1;;222;1;clo22;§49;Thermomicrobium roseum DSM 5159 
12;;;8;;;

Deinococcus-Thermus

deino blocs

Lien fiche: deino blocs

Deinococcus-thermus;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;det01-20;;;Notes
det01;16s23s5s;;4;50;3;47;;;'''16s23s5s;'''16s, 235s;
;3*16s, 23s5s-ggc;;;;;;;'''sans;2;2;'''incomplets
;;;;;;;;'''ggc;;11;2*16s
det09;16s, 23s5s-ggc;;3;51;1;50;;;;;
;2*16s;;;;;;15;'''total;2;13;'''autres incomplets
;235s;;;;;;;;;;235s
;;;;;;;;;;;
det10;2*16s, 23s5s-ggc;;2;50;2;48;;;;;
;;;;;;;;;;;
det12;2*16s, 23s5s;;2;48;0;48;;;;;
det13;2*16s, 23s5s-ggc;;2;56;2;54;;;;;
;;;;;;;;;;;
det16;2*16s, 23s5s-ggc;;2;49;2;47;;;;;
;;;;;;;;;;;
det20;16s23s5s;;2;46;1;45;;;;;
;16s,23s5s-ggc;;;;;;;;;;
;;;17;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;det01-20;;;Notes
7;;;;;;;;;'''16s23s5s;'''16s, 235s;
;;;;;;;;'''sans;2;2;'''incomplets
;'''Moyenne;;;50;2;48;;'''ggc;;11;2*16s
;'''Ecartype;;;3;1;3;;;;;
;'''Max;;;56;3;54;15;'''total;2;13;'''autres incomplets
;'''Min;;;46;0;45;;;;;235s
;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;
;'''blocs;;17;;;;;;;;
;'''génomes;;7;;;;;;;;
;'''avant;;0;;;;;;;;
;'''après ggc;;11 / 6;;;;;;;;
;'''cds;;0;;;;;;;;
;'''16s23s5s;;15;;;;;;;;
;'''16-aas-235;;0;;;;;;;;

deino notes

Lien tableur: deino notes

deino typage

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deino noms

Lien fiche: deino noms

;;4.9.19 Paris;fait vers le 20.8.19;;;
;;20;Deinococcus-Thermus;;1001;
;;;;;;
ruptures;notes;rRNAs;faits;code;tRNAs;génomes
1;;444;1;det01;§50;Deinococcus deserti VCD115 
1;;;;det02;§49;Deinococcus geothermalis DSM 11300 
1;;;;det03;§49;Deinococcus gobiensis I-0 
1;;;;det04;§58;Deinococcus maricopensis DSM 21211 
1;;;;det05;§52;Deinococcus peraridilitoris DSM 19664 
1;;;;det06;§47;Deinococcus proteolyticus MRP 
1;;;;det07;§51;Deinococcus radiodurans R1 
1;;;;det08;§47;Deinococcus swuensis DY59 
1;;232;1;det09;§51;Marinithermus hydrothermalis DSM 14884 
1;;222;1;det10;§50;Meiothermus ruber DSM 1279 
1;;;;det11;§52;Meiothermus silvanus DSM 9946 
1;;222;1;det12;§48;Oceanithermus profundus DSM 14977 
1;;222;1;det13;§56;Thermus oshimai JL-2 
1;;;;det14;§50;Thermus scotoductus SA-01 
1;;;;det15;§48;Thermus sp. CCB US3 UF1 
1;;222;1;det16;§49;Thermus thermophilus HB27 
;;;;det17;49;Thermus thermophilus HB8 
;;;;det18;50;Thermus thermophilus JL-18 
;;;;det19;49;Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 
1;;222;1;det20;§46;Truepera radiovictrix DSM 17093 
17;;;7;;;

Thermotogae

toga blocs

Lien fiche: toga blocs

Thermotogae;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page; ter01-16;;;;Notes
ter01;3*16s23s5s;;3;48;0;48;;;'''16s23s5s;'''16atcgca235;'''16-gca-235;'''16-atc-235
ter02;2*16atcgca235;;2;51;4;47;;'''sans;7;8;3;2
;;;;;;;20;;;;;
ter04;16s23s5s;;2;47;2;45;;;;;;
;16atcgca235;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
ter05;2*16-gca-235;;3;52;3;49;;;;;;
;16-atc-235;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
ter06;16s23s5s;;2;46;2;44;;;;;;
;16atcgca235;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
ter07;16-gca-235;;2;49;2;47;;;;;;
;16-atc-235;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
ter08;16atcgca235;;1;47;2;45;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
ter12;2*16s23s5s;;3;49;2;47;;;;;;
;16atcgca235;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
ter14;16atcgca235;;1;47;2;45;;;;;;
ter16;16atcgca235;;1;47;2;45;;;;;;
;;;20;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page; ter01-16;;;;Notes
10;;;;;;;;;'''16s23s5s;'''16atcgca235;'''16-gca-235;'''16-atc-235
;;;;;;;;'''sans;7;8;3;2
;'''Moyenne;;;48;2;46;20;;;;;
;'''Ecartype;;;2;1;2;;;;;;
;'''Max;;;52;4;49;;;;;;
;'''Min;;;46;0;44;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;
;'''blocs;;20;;;;;;;;;
;'''génomes;;10;;;;;;;;;
;'''avant;;0;;;;;;;;;
;'''après;;0;;;;;;;;;
;'''cds;;0;;;;;;;;;
;'''16s23s5s;;7;;;;;;;;;
;'''16-aas-235;;13;;;;;;;;;

toga notes

Lien tableur: toga notes

toga typage

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toga noms

Lien fiche: toga noms

;;;;4.9.19 Paris;fait vers le 20.8.19;
;;;25;Thermotogae;;1337
ruptures;notes;rRNAs;faits;code;tRNAs;génomes
1;;333;1;ter01;§48;Defluviitoga tunisiensis 
1;;222;1;ter02;§51;Fervidobacterium nodosum Rt17-B1 
1;;;;ter03;§49;Fervidobacterium pennivorans DSM 9078 
1;;222;1;ter04;§47;Kosmotoga olearia TBF 19.5.1 
1;;333;1;ter05;§52;Marinitoga piezophila KA3 
1;;222;1;ter06;§46;Mesotoga prima MesG1.Ag.4.2 
1;;222;1;ter07;§49;Petrotoga mobilis SJ95 
1;;111;1;ter08;§47;Pseudothermotoga elfii DSM 9442 NBRC 107921 
1;;;;ter09;§47;Pseudothermotoga hypogea DSM 11164 NBRC 106472 
1;;;;ter10;§47;Pseudothermotoga lettingae TMO 
1;;;;ter11;§47;Pseudothermotoga thermarum DSM 5069 
1;;333;1;ter12;§49;Thermosipho africanus TCF52B 
1;;;;ter13;§51;Thermosipho melanesiensis BI429 
1;;111;1;ter14;§47;Thermotoga caldifontis AZM44c09 
1;4*47;;;ter15;§188;Thermotoga maritima MSB8 
;;111;1;ter16;47;Thermotoga maritima Tma100 
;;;;ter17;47;Thermotoga maritima Tma200 
1;;;;ter18;§47;Thermotoga naphthophila RKU-10 
1;;;;ter19;§49;Thermotoga neapolitana DSM 4359 
1;;;;ter20;§47;Thermotoga petrophila RKU-1 
1;;;;ter21;§47;Thermotoga profunda AZM34c06 
1;;;;ter22;§47;Thermotoga sp. 2812B 
1;;;;ter23;§47;Thermotoga sp. Cell2 
1;;;;ter24;§47;Thermotoga sp. RQ2 
1;;;;ter25;§47;Thermotoga sp. RQ7 
23;;;10;;;

Autres

autre blocs

Lien fiche: autre blocs

autres;;;;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page; ab001-35;;;;;Notes
Acidobacteria;;;;;;;;;'''16s23s5s;'''16atcgca235;'''avant;;
ab001;16atcgca235;;1;48;2;46;;'''sans;3;17;4;;'''1-3
ab002;16atcgca235;;1;50;2;48;;'''1-3;1;1;;;16atcgca235-aga
ab004;16atcgca235;;1;48;2;46;;;;;;;16s23s5s-atgi
ab005;16atcgca235;;1;55;2;53;26;'''total;4;18;4;;
ab007;16atcgca235;;2;55;5;50;;;;;;;'''avant
;aag-16atcgca235;;;;;;;;;;;;aag-16atcgca235
Aquificae;;;;;;;;;;;;;ggc-16s23s5s
ab011;16atcgca235;;2;45;5;40;;;;;;;cca-aga-atgf-16atcgca235
;16atcgca235-aga;;;;;;;;;;;;ggc-16atcgca235
;;;;;;;;;;;;;
ab012;16atcgca235;;2;44;3;41;;;;;;;'''incomplet
;ggc-16s23s5s;;;;;;;;;;;;16s
;;;;;;;;;;;;;
ab013;16atcgca235;;1;90;2;88;;;;;;;
ab014;2*16atcgca235;;2;46;4;42;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
ab018;16atcgca235;;2;42;7;35;;;;;;;
;cca-aga-atgf-16atcgca235;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
ab019;2*16atcgca235;;2;39;4;35;;;;;;;
ab021;16atcgca235;;1;45;2;43;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
ab023;16atcgca235;;3;47;5;42;;;;;;;
;ggc-16atcgca235;;;;;;;;;;;;
;16s23s5s;;;;;;;;;;;;
Armatimonadetes;;;;;;;;;;;;;
ab027;16atcgca235;;2;47;2;45;;;;;;;
;16s;;;;;;;;;;;;
Caldiserica;;;;;;;;;;;;;
ab032;16s23s5s;;1;47;0;47;;;;;;;
Chrysiogenetes;;;;;;;;;;;;;
ab035;16s23s5s;;3;37;3;34;;;;;;;
;16s23s5s-atgi;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235;;27;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;ab041-82;;;;;Notes
Deferribacteres;;;;;;;;;'''16s23s5s;'''16atcgca235;'''avant;;
ab041;2*16atcgca235;;2;41;4;37;;'''sans;9;17;1;;'''1-3
ab042;16atcgca235;;2;44;5;39;;'''1-3;3;5;;;2*16s23s5s-aac
;16atcgca235-tgc;;;;;;;;;;;;3*16atcgca235-aac
;;;;;;;35;'''total;12;22;1;;16atcgca235-tgc
ab043;2*16atcgca235;;2;43;4;39;;;;;;;16s23s5s-aac-5s
Dictyoglomi;;;;;;;;;;;;;16atcgca235-aac-5s
ab047;16atcgca235;;2;47;2;45;;;;;;;
;16s23s5s;;;;;;;;;;;;'''avant
Elusimicrobia;;;;;;;;;;;;;cca-aga-aag-16s23s5s
ab051;16atcgca235;;1;45;2;43;;;;;;;
Fibrobacteres;;;;;;;;;;;;;'''incomplet
ab055;3*16atcgca235;;3;58;6;52;;;;;;;16s23s, 5s
Fusobacteria;;;;;;;;;;;;;
ab058;3*16s23s5s;;5;46;4;42;;;;;;;'''5s en trop
;16s23s5s-aac;;;;;;;;;;;;16s23s5s-aac-5s
;16atcgca235-aac;;;;;;;;;;;;16atcgca235-aac-5s
;;;;;;;;;;;;;16s23s5s-5s
ab063;3*16s23s5s;;8;79;10;69;;;;;;;
;16atcgca235;;;;;;;;;;;;
;16s23s5s-aac;;;;;;;;;;;;
;16s23s5s-aac-5s;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-aac;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-aac-5s;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;
ab066;16s23s5s;;3;36;3;33;;;;;;;
;16s23s5s-5s;;;;;;;;;;;;
;16atcgca235-aac;;;;;;;;;;;;
Gemmatimonadetes;;;;;;;;;;;;;
ab071;cca-aga-aag-16s23s5s;;1;50;3;47;;;;;;;
Ignavibacteriae;;;;;;;;;;;;;
ab074;16atcgca235;;1;45;2;43;;;;;;;
Nitrospirae;;;;;;;;;;;;;
ab079;2*16atcgca235;;2;53;4;49;;;;;;;
ab081;3*16atcgca235;;3;55;6;49;;;;;;;
ab082;16s23s, 5s;;1;50;0;50;;;;;;;
;;;36;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;ab085-129;;;;;Notes
Planctomycetes;;;;;;;;;'''16s23s5s;'''16atcgca235;'''16gcaatc235;;
ab085;3*16s23s5s;;3;49;0;49;;'''sans;17;5;8;;'''cds
ab088;16s, 235s;;2;48;2;46;;'''cds;;2;3;;2*16-cds-gca-atc-gta-cds-235
;16s, atcgca235;;;;;;;;;;;;16-cds-gca-atc-235
;;;;;;;35;'''total;17;7;11;;2*16atcgca23-cds-5s
ab089;2*16s, atcgca235;;2;70;4;66;;;;;;;
ab090;8*16s23s5s;;8;73;0;73;;;;;;;'''incomplet
Synergistetes;;;;;;;;;;;;;16s, 235s
ab093;2*16s23s5s;;3;48;2;46;;;;;;;16s, atcgca235
;16atcgca235;;;;;;;;;;;;2*16s
;;;;;;;;;;;;;
ab094;2*16s23s5s;;2;50;;;;;;;;;'''autres incomplets
ab096;2*16s23s5s;;3;51;2;49;;;;;;;atcgca235
;16atcgca235;;;;;;;;;;;;
Thermobaculum;;;;;;;;;;;;;
ab100;2*16atcgca235;;2;52;4;48;;;;;;;
Thermodesulfobacteria;;;;;;;;;;;;;
ab103;2*16atcgca23-cds-5s;;2;51;4;47;;;;;;;
ab104;16atcgca235;;1;47;2;45;;;;;;;<u>'''Notes total
Verrucomicrobia;;;;;;;;;;;;;'''1-3
ab108;3*16-gca-atc-235;;3;53;6;47;;;;;;;2*16s23s5s-aac
ab110;16-cds-gca-atc-235;;1;48;2;46;;;;;;;3*16atcgca235-aac
ab113;16-gca-atc-235;;1;76;2;74;;;;;;;16atcgca235-tgc
ab115;4*16-gca-atc-235;;4;71;8;63;;;;;;;16s23s5s-aac-5s
CandidatusSaccharibacteria;;;;;;;;;;;;;16atcgca235-aac-5s
ab128;16-cds-gca-atc-gta-cds-235;;1;44;3;41;;;;;;;16atcgca235-aga
ab129;16-cds-gca-atc-gta-cds-235;;1;48;3;45;;;;;;;16s23s5s-atgi
;;;39;;;;;;;;;;
lien;blocs;;16s;total aas;avec;sans;total page;total;;;;;Notes
;;;;;;;;;'''16s23s5s;'''16atcgca235;'''16gcaatc235;'''avant;
;;;;;;;;'''sans;29;39;8;5;'''avant
;'''Moyenne;;;51;3;48;;'''1-3;4;6;0;0;cca-aga-aag-16s23s5s
;'''Ecartype;;;11;2;11;;'''cds;;2;3;0;ggc-16s23s5s
;'''Max;;;90;10;88;;;;;;;aag-16atcgca235
;'''Min;;;36;0;33;96;'''total;33;47;11;5;ggc-16atcgca235
;;;;;;;;;;;;;cca-aga-atgf-16atcgca235
;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;'''incomplet
;;;;;;;;;;;;;16s, 235s
;;;;;;;;;;;;;16s, atcgca235
;;;;;;;;;;;;;3*16s
;;;;;;;;;;;;;16s23s, 5s
;'''blocs;;102;;;;;;;;;;
;'''génomes;;46;;;;;;;;;;'''autres incomplets
;'''avant;;5;;;;;;;;;;atcgca235
;'''après 1-3;;10;;;;;;;;;;
;'''cds;;5 / 4;;;;;;;;;;'''cds
;'''16s23s5s;;33;;;;;;;;;;2*16-cds-gca-atc-gta-cds-235
;'''atcgca;;47;;;;;;;;;;16-cds-gca-atc-235
;'''gcaatc;;11;;;;;;;;;;2*16atcgca23-cds-5s
;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;'''5s en trop
;;;;;;;;;;;;;16s23s5s-aac-5s
;;;;;;;;;;;;;16atcgca235-aac-5s
;;;;;;;;;;;;;16s23s5s-5s

autre notes

Lien fiche: autre notes

Notes autres;;intercalaire;long pbs;protéines;
ab103;;;;;
2*16atcgca23-cds-5s;;;;;
;cds;215;765;ABC transporter ATP-binding protein;*
comp;5s;172;117;;
comp;cds;160;213;type II toxin-antitoxin system RelE/ParE family toxin;*
comp;23s;171;3030;;
comp;gca;11;76;;
comp;atc;193;79;;
comp;16s;410;1570;;
comp;cds;;1014;hp;
;;;;;
;cds;149;684;4Fe-4S dicluster domain-containing protein;*
comp;5s;127;117;;
comp;23s;171;3030;;
comp;gca;11;76;;
comp;atc;193;79;;
comp;16s;480;1570;;
;cds;;228;hp;
ab110;;;;;
16-cds-gca-atc-235;;;;;
;cds;258;228;hp;
comp;5s;99;116;;
comp;23s;141;2850;;
comp;atc;34;74;;
comp;gca;-8;76;;
comp;cds;130;267;hp;
;16s;333;1534;;
comp;cds;;1749;glycosyltransferase family 39 protein;*
ab128;;;;;
16-cds-gca-atc-gta-cds-235;;;;;
;cds;211;432;divergent PAP2 family protein;*
;16s;285;1482;;
comp;cds;63;240;hp;
;gca;51;77;;
;atc;22;77;;
;gta;61;77;;
;cds;237;1176;dihydroorotate dehydrogenase (quinone);*
;23s;191;3110;;
;5s;103;109;;
;cds;;714;DUF3152 domain-containing protein;*
ab129;;;;;
16-cds-gca-atc-gta-cds-235;;;;;
;cds;191;435;divergent PAP2 family protein;*
;16s;211;1506;;
comp;cds;67;234;hp;
;gca;130;77;;
;atc;31;77;;
;gta;282;77;;
;cds;398;582;hp;
;23s;174;3214;;
;5s;420;110;;
;cds;;672;hp;

autre typage

Lien tableur: autre typage

19 clades, «autre»;;;;;;;
type;;16s-y-23s5s;;;;16s23s5s-z;x-16s23s5s
clade;;16s23s5s;atcgca;gcaatc;cds *;;
Acidobacteria;;;6;;;;aag
Aquificae;;2;13;;;aga;cca-aga-atgf, 2*gcc
Armatimonadetes;;;1;;;;
Caldiserica;;1;;;;;
Chrysiogenetes;;2;1;;;atgi;
Deferribacteres;;;6;;;tgc;
Dictyoglomi;;1;1;;;;
Elusimicrobia;;;1;;;;
Fibrobacteres;;;3;;;;
Fusobacteria;;11;5;;;8 **;
Gemmatimonadetes;;1;;;;;cca-aga-aag
Ignavibacteriae;;;1;;;;
Nitrospirae;;1;5;;;;
Planctomycetes;;12;3;;;;
Synergistetes;;6;2;;;;
Thermobaculum;;;2;;;;
Thermodesulfobacteria;;;3;;;2 cds *;
Verrucomicrobia;;;;8;1;;
CandidatusSaccharibacteria;;;;;2;;
total;;37;53;8;3;;
;;;;;;;
16s-y-23s5s;;16s23s5s;atcgca;gcaatc;cds;total;
total;;37;53;8;3;101;
%;;37;52;8;3;;
;;;;;;;
Fusobacteria;8 **;cds *;;;;;
aac;5;CandidatusSaccharibacteria;;;2*16-cds-gca-atc-gta-cds-235;;
aac-5s;2;Verrucomicrobia;;;16-cds-gca-atc-235;;
5s;1;Thermodesulfobacteria;;;2*16atcgca23-cds-5s;;

autre noms

Lien fiche: autre noms

;;;4.9.19 Paris;fait vers le 20.8.19;;
;;;;78;83;4081
ruptures;ordre;rRNAs;faits;code;tRNAs;génomes
;1;;;;;'''Acidobacteria
1;2;111;1;ab001;48;Acidobacterium capsulatum ATCC 51196 
1;3;111;1;ab002;50;Candidatus Koribacter versatilis Ellin345 
1;4;;;ab003;56;Candidatus Solibacter usitatus Ellin6076 
1;5;111;1;ab004;48;Chloracidobacterium thermophilum B 
1;6;111;1;ab005;55;Granulicella mallensis MP5ACTX8 
1;7;;;ab006;48;Granulicella tundricola MP5ACTX9 
1;8;222;1;ab007;55;Terriglobus roseus DSM 18391 
1;9;;;ab008;49;Terriglobus saanensis SP1PR4 
;10;;;;;
;11;;;;;'''Aquificae
1;12;222;1;ab011;45;Aquifex aeolicus VF5 
1;13;222;1;ab012;44;Desulfurobacterium thermolithotrophum DSM 11699 
1;14;111;1;ab013;90;Hydrogenobacter thermophilus TK-6 
1;15;222;1;ab014;46;Hydrogenobaculum sp. 3684 
1;16;;;ab015;46;Hydrogenobaculum sp. HO 
1;17;;;ab016;46;Hydrogenobaculum sp. SN 
1;18;;;ab017;46;Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1 
1;19;222;1;ab018;42;Persephonella marina EX-H1 
1;20;222;1;ab019;39;Sulfurihydrogenibium azorense Az-Fu1 
1;21;;;ab020;41;Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1 
1;22;111;1;ab021;45;Thermocrinis albus DSM 14484 
1;23;;;ab022;45;Thermocrinis ruber DSM 23557 
1;24;333;1;ab023;47;Thermovibrio ammonificans HB-1 
;25;;;;;
;26;;;;;'''Armatimonadetes
1;27;121;1;ab027;47;Chthonomonas calidirosea T49 
1;28;;;ab028;50;Fimbriimonas ginsengisoli Gsoil 348 
;29;;;;;
;30;;;;;'''Caldiserica
1;31;111;1;ab032;47;Caldisericum exile AZM16c01
;32;;;;;
;33;;;;;'''Chrysiogenetes
1;34;333;1;ab035;37;Desulfurispirillum indicum S5
;35;;;;;
;36;;;;;'''Cloacimonetes
1;37;;;ab038;47;Candidatus Cloacimonas acidaminovorans str. Evry
;38;;;;;
;39;;;;;'''Deferribacteres
1;40;222;1;ab041;41;Calditerrivibrio nitroreducens DSM 19672 
1;41;222;1;ab042;44;Deferribacter desulfuricans SSM1 
1;42;222;1;ab043;43;Denitrovibrio acetiphilus DSM 12809 
1;43;;;ab044;45;Flexistipes sinusarabici DSM 4947 
;44;;;;;
;45;;;;;'''Dictyoglomi
1;46;222;1;ab047;47;Dictyoglomus thermophilum H-6-12 ATCC 35947 
1;47;;;ab048;48;Dictyoglomus turgidum DSM 6724 
;48;;;;;
;49;;;;;'''Elusimicrobia
1;50;111;1;ab051;45;Elusimicrobium minutum Pei191 
1;51;;;ab052;45;uncultured Termite group 1 bacterium phylotype Rs-D17 
;52;;;;;
;53;;;;;'''Fibrobacteres
1;54;333;1;ab055;58;Fibrobacter succinogenes subsp. succinogenes S85 
;55;;;;;
;56;;;;;'''Fusobacteria
1;57;555;1;ab058;46;Fusobacterium nucleatum subsp. animalis 4 8 
;58;;;ab059;§46;Fusobacterium nucleatum subsp. animalis 7 1 
;59;;;ab060;§48;Fusobacterium nucleatum subsp. nucleatum ATCC 25586 
;60;;;ab061;§47;Fusobacterium nucleatum subsp. vincentii 3 1 27 
;61;;;ab062;§48;Fusobacterium nucleatum subsp. vincentii 3 1 36A2 
1;62;10,8,8;1;ab063;79;Ilyobacter polytropus DSM 2926 
1;63;;;ab064;47;Leptotrichia buccalis C-1013-b DSM 1135 
1;64;;;ab065;41;Sebaldella termitidis ATCC 33386 
1;65;433;1;ab066;36;Sneathia sp. Sn35 SN35 
1;66;;;ab067;39;Streptobacillus moniliformis DSM 12112 
;67;;;;;
;68;;;;;'''Gemmatimonadetes
1;69;;;ab070;50;Gemmatimonadetes bacterium KBS708 
1;70;111;1;ab071;50;Gemmatimonas aurantiaca T-27 
;71;;;;;
;72;;;;;'''Ignavibacteriae
1;73;111;1;ab074;45;Ignavibacterium album JCM 16511 
1;74;;;ab075;46;Melioribacter roseus P3M-2 
;75;;;;;
;76;;;;;'''Nitrospirae
1;77;;;ab078;49;Candidatus Nitrospira defluvii 
1;78;222;1;ab079;53;Leptospirillum ferriphilum ML-04 
;79;;;ab080;§52;Leptospirillum ferriphilum YSK 
1;80;333;1;ab081;55;Leptospirillum ferrooxidans C2-3 
1;81;111;1;ab082;50;Thermodesulfovibrio yellowstonii DSM 11347 
;82;;;;;
;83;;;;;'''Planctomycetes
1;84;333;1;ab085;49;Isosphaera pallida ATCC 43644 
1;85;;;ab086;46;Phycisphaera mikurensis NBRC 102666 
1;86;;;ab087;50;Pirellula staleyi DSM 6068 
1;87;222;1;ab088;48;Planctomyces brasiliensis DSM 5305 
1;88;121;1;ab089;70;Planctomyces limnophilus DSM 3776 
1;89;888;1;ab090;73;Singulisphaera acidiphila DSM 18658 
;90;;;;;
;91;;;;;'''Synergistetes
1;92;333;1;ab093;48;Aminobacterium colombiense DSM 12261 
1;93;222;1;ab094;50;Anaerobaculum mobile DSM 13181 
1;94;;;ab095;42;Fretibacterium fastidiosum SGP1 
1;95;333;1;ab096;51;Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589 
1;96;;;ab097;49;Thermovirga lienii DSM 17291 
;97;;;;;
;98;;;;;'''Thermobaculum
1;99;222;1;ab100;52;Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798
;100;;;;;
;101;;;;;'''Thermodesulfobacteria
1;102;222;1;ab103;51;Thermodesulfatator indicus DSM 15286 
1;103;111;1;ab104;47;Thermodesulfobacterium commune DSM 2178 
1;104;;;ab105;47;Thermodesulfobacterium geofontis OPF15 
;105;;;;;
;106;;;;;'''Verrucomicrobia
1;107;333;1;ab108;53;Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835 
1;108;;;ab109;47;Coraliomargarita akajimensis DSM 45221 
1;109;111;1;ab110;48;Methylacidiphilum fumariolicum SolV 
1;110;;;ab111;46;Methylacidiphilum infernorum V4 
1;111;;;ab112;49;Opitutaceae bacterium TAV5 
1;112;111;1;ab113;76;Opitutus terrae PB90-1 
1;113;;;ab114;49;Verrucomicrobia bacterium IMCC26134 
1;114;444;1;ab115;71;Verrucomicrobium spinosum DSM 4136 JCM 18804 
;115;;;;;
;116;;;;;'''candidate divisionNC10
1;117;;;ab118;48;Candidatus Methylomirabilis oxyfera
;118;;;;;
;119;;;;;'''candidate divisionSR1
1;120;;;ab121;37;candidate division SR1 bacterium RAAC1_SR1_1
;121;;;;;
;122;;;;;'''candidate divisionWWE3
1;123;;;ab124;46;candidate division WWE3 bacterium RAAC2_WWE3_1
;124;;;;;
;125;;;;;'''Candidatus Saccharibacteria
1;126;;;ab127;44;Candidatus Saccharibacteria bacterium RAAC3_TM7_1 
1;127;111;1;ab128;44;Candidatus Saccharibacteria oral taxon TM7x
1;128;111;1;ab129;48;Candidatus Saccharimonas aalborgensis
78;;;46;;4081;

Synthèse bactéries

Type 16s-y-23s5s

Type y cumuls

Lien fiche: Type y cumuls

M.aas avec;M.aas sans;génomes;blocs;clade;lien;16s23s5s;16s23s,5s;16s,23s5s;cds;atcgca;gcaatc;gca;atc;atcgca-cds;gcaatc-cds;gca-cds;cds-gca-atc-gta-cds;atc-gaa;atc-gcc;gca-cca;gaa;gcc-gaa;gaa-cds;gaa-aaa-gta;gaa-aaa-gca-gta;gaa-aaa-gta-cds;gcc;atgf
14 ± 19;50 ± 16;11;66;a-firmicutes;[[Recherche:Les_clusters_de_g%C3%A8nes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Fiche/Firmicutes#autres_firmicutes_type_16-y-235_apr%C3%A8s_16s|autres ]];43;;;;15;3;5;;;;;;;;;;;;;;;;
21 ± 23;48 ± 19;43;264;clostridia;[[Recherche:Les_clusters_de_g%C3%A8nes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Fiche/Firmicutes#clostridia_blocs_16s-y-23s5s-z|C4.cumuls]];160;;;5;24;23;26;12;3;1;;;;;;;;;;;;8;2
59 ± 28;29 ± 19;32;288;bacilli;[[Recherche:Les_clusters_de_g%C3%A8nes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Fiche/Firmicutes#bacilli_blocs_16s-y-23s5s-z|Bx3]];228;;;;44;;15;1;;;;;;;;;;;;;;;
8 ± 5;46 ± 8;70;203;alpha;[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Fiche/Proteobacteria#alpha_type_16-y-235_après_16s|alpha ]];2;;8;;138;17;4;2;31;1;;;;;;;;;;;;;
8 ± 4;54 ± 11;44;164;beta;[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Fiche/Proteobacteria#beta_type_16-y-235_après_16s|beta]];2;;;3;127;;;;32;;;;;;;;;;;;;;
10 ± 6;58 ± 20;144;733;gamma;[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Fiche/Proteobacteria#gamma_type_16-y-235_après_16s|gamma ]];79;;;;349;15;;4;1;;7;;3;1;4;254;1;3;6;2;3;1;
5 ± 3;58 ± 12;19;64;delta;[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Fiche/Proteobacteria#beta_type_16-y-235_après_16s|delta ]];18;;;;42;;1;3;;;;;;;;;;;;;;;
5 ± 3;40 ± 3;40;110;epsilon;[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Fiche/Proteobacteria#epsilon_type_16-y-235_après_16s|epsilon ]];;;11;1;41;30;18;9;;;;;;;;;;;;;;;
0 ± 0;54 ± 10;99;354;actinobacteria;[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Fiche/Actinobacteria#actino_type_16-y-235_après_16s|actino ]];330;;;24;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
8 ± 5;54 ± 17;29;122;bacteroides;[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Fiche/Bacteroidetes#bactero_type_16-y-235_après_16s|bactero ]];18;;;;102;;;2;;;;;;;;;;;;;;;
5 ± 7;28 ± 6;20;32;tenericutes;[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Fiche/Les_autres_bactéries#tener_type_16-y-235_après_16s|tener ]];18;5;;;1;;;8;;;;;;;;;;;;;;;
2 ± 1;48 ± 3;7;15;deinococcus;[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Fiche/Les_autres_bactéries#deino_typage|deino ]];2;;13;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
2 ± 0;48 ± 2;8;15;chloroflexi;[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Fiche/Les_autres_bactéries#chlor_typage|chlor]];8;;;;3;;;4;;;;;;;;;;;;;;;
2 ± 1;37 ± 6;13;16;spirochaetes;[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Fiche/Les_autres_bactéries#spiro_typage|spiro]];;;2;;2;;7;5;;;;;;;;;;;;;;;
4 ± 2;49 ± 14;31;78;cyanobacteria;[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Fiche/Les_autres_bactéries#cyano_typage|cyano]];17;;;;47;;;13;1;;;;;;;;;;;;;;
1 ± 1;37 ± 1;12;17;chlamydiae;[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Fiche/Les_autres_bactéries#chlam_typage|chlam]];15;;;;2;;;;;;;;;;;;;;;;;;
2 ± 1;46 ± 2;10;32;thermotogae;[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Fiche/Les_autres_bactéries#toga_typage|toga]];18;5;;;1;;;8;;;;;;;;;;;;;;;
3 ± 1;49 ± 3;5;6;acidobacteria;[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Fiche/Les_autres_bactéries#autre_typage|autre]];;;;;6;;;;;;;;;;;;;;;;;;
4 ± 2;46 ± 17;8;15;aquificae;[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Fiche/Les_autres_bactéries#autre_typage|autre]];2;;;;13;;;;;;;;;;;;;;;;;;
4 ± 1;38 ± 1;3;6;deferribacteres;[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Fiche/Les_autres_bactéries#autre_typage|autre]];;;;;6;;;;;;;;;;;;;;;;;;
6 ± 4;48 ± 19;3;16;fusobacteria;[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Fiche/Les_autres_bactéries#autre_typage|autre]];11;;;;5;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;3;6;nitrospirae;[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Fiche/Les_autres_bactéries#autre_typage|autre]];1;;;;5;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;4;15;planctomycetes;[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Fiche/Les_autres_bactéries#autre_typage|autre]];12;;;;3;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;3;8;synergistetes;[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Fiche/Les_autres_bactéries#autre_typage|autre]];6;;;;2;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;4;9;verrucomicrobia;[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Fiche/Les_autres_bactéries#autre_typage|autre]];;;;;;8;;;;1;;;;;;;;;;;;;
;;13;20;total11;[[Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Fiche/Les_autres_bactéries#autre_typage|autre]];5;;;;13;;;;;;;2;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;678;2674;total type;;995;10;34;33;991;96;76;71;68;3;7;2;3;1;4;254;1;3;6;2;3;9;2
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;% type;;373;3,7;13;12;371;36;28;27;25;0,7;2,6;0,7;1,1;0,4;1,5;95;0,4;1,1;2,2;0,7;1,1;3,4;0,7
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;% groupe;;401;;;;494;;;;;;;;;;;101;;;;;;;
;;;;groupe;;16s;;;;atc, gca;;;;;;;;;;;gaa;;;;;;;
;;;;type;;16s23s5s;16s23s,5s;16s,23s5s;cds;atcgca;gcaatc;gca;atc;atcgca-cds;gcaatc-cds;gca-cds;cds-gca-atc-gta-cds;atc-gaa;atc-gcc;gca-cca;gaa;gcc-gaa;gaa-cds;gaa-aaa-gta;gaa-aaa-gca-gta;gaa-aaa-gta-cds;gcc;atgf

Type y par tRNA

Lien fiche: Type y par tRNA

;;;effectifs et;taux des y;contenant 16s gca gaa;;;;;;;;;
blocs;clade;;total 16s;total gca,atc;total gaa;%16s;%tgca;%tgaa;gca;atc;16s;cds;gaa;rares
6;acidobacteria;;0;6;;0;100;;6;6;0;;;
6;deferribacteres;;0;6;;0;100;;6;6;0;;;
9;verrucomicrobia;;0;9;;0;100;;9;9;0;1;;
164;beta;;5;159;;3;97;;155;155;2;35;;
203;alpha;;10;193;;5;95;;191;189;10;32;;
733;gamma;;79;376;273;11;51;37;378;373;79;14;272;29
110;epsilon;;12;98;;11;89;;89;80;11;1;;
16;spirochaetes;;2;14;;13;88;;9;7;2;;;
15;aquificae;;2;13;;13;87;;13;13;2;;;
122;bacteroides;;18;104;;15;85;;102;104;18;;;
6;nitrospirae;;1;5;;17;83;;5;5;1;;;
78;cyanobacteria;;17;61;;22;78;;48;61;17;1;;
20;total11;;5;15;;25;75;;15;15;5;4;;2
64;delta;;18;46;;28;72;;43;45;18;;;
15;chloroflexi;;8;7;;53;47;;3;7;8;;;
264;clostridia;;165;99;;63;38;;75;63;160;9;;10
66;a-firmicutes;;43;23;;65;35;;23;18;43;;;
16;fusobacteria;;11;5;;69;31;;5;5;11;;;
32;tenericutes;;23;9;;72;28;;1;9;23;;;
32;thermotogae;;23;9;;72;28;;1;9;23;;;
8;synergistetes;;6;2;;75;25;;2;2;6;;;
288;bacilli;;228;60;;79;21;;59;45;228;;;
15;planctomycetes;;12;3;;80;20;;3;3;12;;;
17;chlamydiae;;15;2;;88;12;;2;2;15;;;
15;deinococcus;;15;0;;100;0;;;;;;;
354;actinobacteria;;354;0;;100;0;;;;;;;
;;;Pour 1000 blocs;;;;;;;Pour 1000 tRNAs;;;;
blocs;clade;;gca;atc;16s;cds;gaa;rares;total;gca;atc;16s;cds;gaa
164;beta;;945;945;12;213;;;2116;447;447;6;101;
203;alpha;;941;931;49;158;;;2079;453;448;24;76;
733;gamma;;516;509;108;19;371;40;1562;330;326;69;12;238
110;epsilon;;809;727;100;9;;;1645;492;442;61;6;
16;spirochaetes;;563;438;125;;;;1125;;;;;
15;aquificae;;867;867;133;;;;1867;;;;;
122;bacteroides;;836;852;148;;;;1836;455;464;80;;
6;nitrospirae;;833;833;167;;;;1833;;;;;
78;cyanobacteria;;615;782;218;13;;;1628;378;480;134;8;
64;delta;;672;703;281;;;;1656;406;425;170;;
;total;;7081;7079;1233;393;;;15786;449;448;78;25;
15;chloroflexi;;200;467;533;;;;1200;167;389;444;;
264;clostridia;;284;239;606;34;;38;1201;237;199;505;28;
66;a-firmicutes;;348;273;652;;;;1273;274;214;512;;
16;fusobacteria;;313;313;688;;;;1313;;;;;
32;tenericutes;;31;281;719;;;;1031;;;;;
32;thermotogae;;31;281;719;;;;1031;;;;;
8;synergistetes;;250;250;750;;;;1250;;;;;
288;bacilli;;205;156;792;;;;1153;178;136;687;;
15;planctomycetes;;200;200;800;;;;1200;;;;;
17;chlamydiae;;118;118;882;;;;1118;;;;;
;total;;1980;2577;7140;34;;38;11769;168;219;607;3;

Type y synthèse

Type 16s23s5s-z

Les 3 longueurs du type z

Lien fiche: Les 3 longueurs du type z

clade;sans;1-3;>3;total;% z
gamma;507;218;0;725;30
alpha;47;145;0;192;76
proteo-autres;320;23;0;343;7
28 clades;727;43;5;775;6
bacilli;142;35;111;288;51
clostridia;119;94;39;252;53
negativ;48;12;6;66;27

Les type z 1-3

Les types 1-3 majoritaires

Lien fiche: Les types 1-3 majoritaires

Types z 1-3  ;majoritaires;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;
Type;blocs;%1-3;génomes;;Type;blocs;génomes;;23 clades;blocs;génomes
;;;;;;;;;;;
gamma;725;;144;;beta;164;44;;5 clades;;
gac-tgg;66;30;62;;tac-gga-acc;10;10;;delta;61;19
gac;80;37;52;;5s;1;;;chlamydae;17;12
acc- 5s;46;21;46;;;;;;cyano;75;31
reste;26;12;;;deino;15;7;;spiro;21;13
total 1-3;218;100;;;ggc;11;6;;toga;20;10
;;;;;;;;;18 clades;;
alpha;192;;70;;chlor;15;8;;Acidobacteria;6;5
atgf;139;96;48;;atgf;6;3;;Aquificae;15;8
reste;6;4;;;;;;;Armatimonadetes;1;1
total 1-3;145;100;;;fuso;16;3;;Caldiserica;1;1
;;;;;aac;5;3;;Chrysiogenetes;3;1
bacilli;288;;32;;reste;3;;;Deferribacteres;6;3
atgf-gac;19;54;19;;;;;;Dictyoglomi;2;1
aac-acc;7;20;7;;tener;32;20;;Elusimicrobia;1;1
reste;9;26;;;aac;3;3;;Fibrobacteres;3;1
total 1-3;35;100;;;reste;5;;;Gemmatimonadetes;1;1
;;;;;;;;;Ignavibacteriae;1;1
clostridia;252;;43;;actino;353;99;;Nitrospirae;5;3
aac;19;20;16;;tcc;2;2;;Planctomycetes;11;4
aaa;12;13;7;;;;;;Synergistetes;8;3
atgi-gca;10;11;8;;bacterio;122;29;;Thermobaculum;2;1
ttc;10;11;7;;divers;2;;;Thermodesulfobacteria;3;2
reste;43;46;;;;;;;Verrucomicrobia;9;4
total 1-3;94;100;;;epsilon;111;40;;Candidatus Saccharibacteria;2;2
;;;;;divers;7;;;;274;128
a.firmicutes;66;;11;;;;;;;;
aac;5;42;2;;23 clades;274;128;;;;
reste;7;58;;;divers;11;;;;;
total 1-3;12;100;;;;;;;;;

Les types z taux des 1-3

Lien fiche: Les types z taux des 1-3

;;;;;;;fréquence des longueurs des types 1-3;;;cds sont considérés comme des intercalaires;;;;;;;;;;
;;;;;;;sans;après;;;;;;avant;;;;;;
clade;total;1-3;1-3 %;z+x;z+x %;clade;0;1;2;3;4;>4;clade;1;2;3;>4;;;
alpha;192;145;76;145;76;alpha;47;145;;;;;alpha;;;;;;;
gamma;725;218;30;240;33;gamma;507;101;115;1;1;;gamma;9;3;10;;1 cds et le 15aas-16s;;
bacilli;288;35;12;164;57;bacilli;142;6;28;1;1;110;bacilli;1;5;;12;;;
clostridia;252;94;37;108;43;clostridia;120;56;28;6;5;37;clostridia;5;6;1;2;3+2 de 4-8;;le 5s n’est pas aa
a.firm;66;12;18;18;27;a.firm;47;5;3;4;;6;a.firm;;;;;;;
beta;164;11;7;14;9;beta;153;1;;10; ;;beta;3;;;;;;
epsilon;111;7;6;11;10;epsilon;104;7;;;;;epsilon;1;1;1;1;;;
delta;61;5;8;6;10;delta;57;3;1;;;;delta;1;;;;;;
tenericutes;32;8;;20;;tenericutes;19;3;3;2;;5;tenericutes;5;1;;1;;;
deino*;15;11;;11;;deino;4;11;;;;;deino;;;;;;;
chloro;15;6;;6;;chloro;9;6;;;;;chloro;;;;;;;
fuso;16;8;;8;;fuso;8;6;2;;;;fuso;;;;;;;
chlam;17;1;;6;;chlam;16;1;;;;;chlam;5;;;;;;
Aquificae;15;1;;4;;Aquificae;14;1;;;;;Aquificae;2;;1;;;;
 ;110;35;32;55;50; ;;;;;;; ;;;;;;;
actino;353;2;0,6;2;0,6;actino;351;2;;;;;actino;;;;;;;
bacteroides;122;2;1,6;4;3,3;bacteroides;120;2;;;;;bacteroides;2;;;;;;
cyano;75;;;;;cyano;75;;;;;;cyano;;;;;;;
spiro;21;;;;;spiro;21;;;;;;spiro;;;;;;;
toga;20;;;;;toga;20;;;;;;toga;;;;;;;
Planctomycetes;11;;;;;Planctomycetes;11;;;;;;Planctomycetes;;;;;;;
;602;4;0,7;6;1,0;;;;;;;;;;;;;;;
16 clades;54;3;6;5;9;16 clades;51;3;;;;;16 clades;1;;1;;;;
total;2625;569;22;772;29;total;1896;359;180;24;7;158;total;35;16;14;16
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
16 clades;*** attention *** un 5s en 1-3 n’a pas été compté;;;;;;;;;;;;;;;;;;;

Les tRNA 1-3 majoritaires

Lien fiche: Les tRNA 1-3 majoritaires

tRNA 1-3;majoritaires;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;
gamma;total;%;;clostridia;total;%;;bacilli;total;%;;31 clades;total;
gac;151;45;;aac;38;26;;atgf;20;31;;aac;17;tener
tgg;73;22;;ttc;19;13;;gac;19;29;;5s;14;delta
acc;57;17;;aaa;17;12;;aac;12;18;;acc;13;beta
5s;50;15;;atgi;14;10;;acc;7;11;;ggc;11;deino
tca;3;;;gca;14;10;;cgt;2;;;gga;10;beta
ttc;2;;;acc;5;;;ctc;1;;;tac;10;beta
tta;1;;;tgc;5;;;ctg;1;;;atgf;6;chlor
tac;1;;;5s;4;;;gaa;1;;;cds;2;
cds;1;;;gaa;4;;;tca;1;;;gta;2;
;339;98;;atc;3;;;gta;1;;;tcc;2;actino
alpha;;;;tta;3;;;;65;89;;aga;1;
atgf;144;96;;gac;2;;;a.firmicutes;;;;atgi;1;
cds;5;;;gga;2;;;aac;6;26;;atgj;1;
cgg;1;;;ggg;2;;;tgg;4;17;;cca;1;
;150;96;;gta;2;;;cac;2;;;cgc;1;epsilon
;;;;aca;1;;;cds;2;;;gaa;1;
;;;;atgf;2;;;cgt;2;;;tca;1;
;;;;cds;2;;;acg;1;;;tgc;1;
;;;;cgg;1;;;agc;1;;;;95;
;;;;ctc;1;;;caa;1;;;;;
;;;;ggc;1;;;gaa;1;;;;;
;;;;gtg;1;;;tac;1;;;;;
;;;;tgg;1;;;tgc;1;;;;;
;;;;;144;71;;tta;1;;;;;
;;;;;;;;;23;43;;;;

Les tRNA 1-3 rares

Lien fiche: Les tRNA 1-3 rares
Les tRNAs 1-3 rares et les groupes.

Les cds sont rares en 1-3 parce qu’ils se trouvent entre 23s et 5s, localisation rare.;;;;;;;
;;;;;;;
Rares 1-3;;total;;atgf;atgi;cds;5s
tRNA;;103;;2;1;12;14
ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;1
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;2;tcc;2;tac;2;tgc;7
atc;3;acc;8;aac;;agc;1
ctc;2;ccc;;cac;2;cgt;4
gtc;;gcc;;gac;2;ggc;1
tta;5;tca;5;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;;aga;1
cta;;cca;1;caa;1;cga;
gta;5;gca;;gaa;7;gga;2
ttg;;tcg;;tag;;tgg;1
atgj;1;acg;1;aag;;agg;
ctg;1;ccg;;cag;;cgg;2
gtg;1;gcg;;gag;;ggg;2
;;;;;;;
;;;;;;;
;;;groupe;48+1+4-3;;;
;;;zéro;14;;;
;;;max;13;;;
;;;rare;14;;;
;;;cgc;1;;;
;;;peu rare ;8;;;
;;;;;;;
tRNA max;;;;tRNA rare;;;
clade;tRNA;max;divers;tRNA;divers;tRNA ;divers
alpha;atgf;170;2;cds;12;aca;1
gama;gac;170;2;gaa;7;acg;1
";tgg;77;1;tgc;7;aga;1
";acc;74;8;gta;5;agc;1
firmicutes;aac;73;0;tca;5;atgj;1
gama;5s;54;14;tta;5;caa;1
clostridia;ttc;19;2;cgt;4;cca;1
";aaa;17;0;atc;3;cgc;1
";atgi;14;1;cac;2;ctg;1
";gca;14;0;cgg;2;gtg;1
deino;ggc;11;1;ctc;2;;10
beta;gga;10;2;ggg;2;;
beta;tac;10;2;tcc;2;;
;;713;35;;58;;

Les tRNA z1-3 sur fond de référence

Lien fiche: Les tRNA z1-3 sur fond de référence

Bactéries;1-3;;;;;;
tot;maxs;rares;;atgf;atgi;5s;cds
734;748;68;;172;15;68;12
ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;1
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;21;tcc;2;tac;12;tgc;7
atc;3;acc;82;aac;73;agc;1
ctc;2;ccc;;cac;2;cgt;4
gtc;;gcc;;gac;172;ggc;12
tta;5;tca;5;taa;;tga;
ata;;aca;1;aaa;17;aga;1
cta;;cca;1;caa;1;cga;
gta;5;gca;14;gaa;7;gga;12
ttg;;tcg;;tag;;tgg;78
atgj;1;acg;1;aag;;agg;
ctg;1;ccg;;cag;;cgg;2
gtg;1;gcg;;gag;;ggg;2

Les type z supérieurs à 3

Type z synthèse

Type x-16s23s5s

Type x cumuls

Type x récapitulatif

Lien fiche: Type x récapitulatif

;;;;Récapitulatif des avant 16s, x.;;;;;;;;;
;;16 clades*;;;;;;;;;;;
;Légende;total blocs = ;Tableau + différents + incomplets;;;reste à faire le tableau des courts;;;;;;;
;Note;actino pour x et z;;;;aanalyser les tableaux des longs déjà faits.;;;;;;;
;;alpha pour x;;;;;;;;;;;
;;;Les taux des avant 16s par clade;;;;;;;Les types courts des avant 16s;;;
références;clade;type;longs;courts;sans;total x;total blocs;x %;clade;type avant;n;type après;n
;bacilli;avant;12;6;−;18;288;6;bacilli;cgt-gga;4;atgf-gac;14
;;après;;15;3;;;;;ctc-gga;1;gta;1
;clostridia;avant;2;12;−;14;264;5;;gga;1;;
;;après;5;4;5;;;;clostridia;atgf;1;aac;2
;gamma;avant;;22;−;22;742;3;;gca-atc-gga;1;aac-aac;1
;;après;;5;17;;;;;atgi-gca;1;aac-atgf;1
;epsilon;avant;1;3;−;4;113;4;;cag-gag;1;;
;;après;;;4;;;;;5s-atgi-gca;1;;
;tenericutes;avant;1;6;−;7;32;22;;tcg;1;;
;;après;1;4;2;;;;;tcc;1;;
;beta;agc;;1;1;3;165;2;;gac-ttc-ggc;1;;
;;atgf;;2;2;;;;;tca-tcc;1;;
;delta;gca;;1;1;1;64;2;;agc;1;;
;bacteroides;cgt;;1;1;2;126;2;;ttc-cds;1;;
;;aac;;1;1;;;;;cgg-tgg;1;;
;chlam;cac;;5;5;5;17;;gamma;cgg-cac-cca;10;;
;acidobacteria;aag;;1;1;1;6;;;agc-gta;3;gac-tgg;4
;aquificae;cca-aga-atgf;;1;1;3;15;;;atgf;3;x-tgg;1
;;gcc;;2;2;;;;;aaa;2;;
;gemmati;cca-aga-aag ;;1;1;1;1;;;ttc;1;;
;cyano;;;;;;82;;;atgj;1;;
;spiro;;;;;;25;;;cgg;1;;
;chlor;;;;;;15;;;ttg;1;;
;deino;;;;;;17;;epsilon;aag-caa-atgf;1;;
;toga;;;;;;20;;;aac;1;;
;alpha;;;;;;208;;;aac-aac;1;;
;actino;;;;;;354;;tenericutes;tac;5;aac;1
;16 clades*;;;;;;86;;;aaa-cta;1;aac-5s-aac;1
;a.firmicutes;;;;;;67;;;;;gta-aac;2
;totaux;;longs;courts;sans;total x;total blocs;x %;beta;agc;1;;
;avant;;16;65;-;;;;;atgf;2;;
;après;;6;24;47;;;;delta;gca;1;;
;;;;;;81;2730;3;bacteroides;cgt;1;;
;;;;;;;;;;aac;1;;
;clades étudiés;;;;;;total tRNAs;;chlam;cac;5;;
;total;;37;;;;courts av;112;acidobacteria;aag;1;;
;avec x;;12;;;;courts ap;51;aquificae;cca-aga-atgf;1;;
;sans x;;25;;;;longs av;197;;gcc;2;;
;;;;;;;longs ap;48;gemmati;cca-aga-aag;1;;

Type x tRNAs

Lien fiche: Type x tRNAs

type x ;total bactéries;;;;;;
x;;total;;atgf;atgi;cds;5s
tRNA;;82;;8;2;1;1
ttt;;tct;;tat;;tgt;
att;;act;;aat;;agt;
ctt;;cct;;cat;;cgc;
gtt;;gct;;gat;;ggt;
ttc;3;tcc;2;tac;5;tgc;
atc;1;acc;;aac;4;agc;5
ctc;1;ccc;;cac;5;cgt;5
gtc;;gcc;2;gac;1;ggc;1
tta;;tca;1;taa;;tga;
ata;;aca;;aaa;3;aga;2
cta;1;cca;2;caa;1;cga;
gta;3;gca;4;gaa;;gga;7
ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1
atgj;1;acg;;aag;3;agg;
ctg;;ccg;;cag;1;cgg;2
gtg;;gcg;;gag;1;ggg;
;;;;;;;
tRNA;max-z;x;tRNA;divers;tRNA ;divers;
atgf;-;8;cds;1;atgj;1;
gac;-;1;gaa;0;cca;2;
tgg;-;1;tgc;0;caa;1;
acc;-;0;gta;3;agc;5;
aac;-;4;tca;1;aga;2;
5s;-;1;tta;0;;11;
ttc;-;3;cgt;5;cta;1;
aaa;-;3;atc;1;ttg;1;
atgi;-;2;cac;5;gcc;2;
gca;-;4;cgg;2;tcg;1;
ggc;-;1;ctc;1;aag;3;
gga;-;7;ggg;0;cag;1;
tac;-;5;tcc;2;gag;1;
;;40;;21;zéros;10;
;;;;;;;
;x;trna;trna z;z;;;
rares;21;8;14;20;;;
zéros;10;7;14;0;;;
peu rares;11;5;13;48;;cgg-cac-cca;

Type x synthèse

Les cds intra bloc

cds cumuls

cds synthèse

Synthèse archées