Recherche:Les clusters de gènes tRNA et rRNA chez les procaryotes/Fiche/Actinobacteria

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Les clusters de gènes tRNA et rRNA chez les procaryotes/Fiche/Actinobacteria
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  • Fiche en préparation

Paris le 5.2.20

Actinobacteria[modifier | modifier le wikicode]

actino blocs[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien tableur: actino blocs
  • Légende:
    - 23s': possible 23S ribosomal RNA but does not have good blast hits on one or both of the ends.
    - 23s°: 23S ribosomal RNA rRNA prediction is too short
    - 16s': possible 16S ribosomal RNA but does not have good blast hits on one or both of the ends.
    - 16s°: 16S ribosomal RNA rRNA prediction is too short
actino blocs
lien blocs 16s total aas avec sans total page act001-29 Notes
act001 2*16s23s5s 2 46 0 46 16s23s5s 16-cds-235
act002 16s23s5s 1 47 0 47 sans 93 6 1-3
act003 3*16s23s5s 3 46 0 46 1-3 1 16s-cds-235-tcc
act004 3*16s23s5s 3 76 0 76
act005 6*16s23s5s 6 62 0 62 100 total 93 7 incomplets
act006 4*16s23s5s 4 64 0 64 16s23s
act007 6*16s23s5s 6 110 0 110
act008 4*16s23s5s 5 63 0 63 5s de trop
16s23s 0 2*5s
act009 2*16s23s5s 2 49 0 49
act010 4*16s23s5s 4 58 0 58
act012 4*16s23s5s 4 55 0 55
act015 3*16s23s5s 3 52 0 52
act016 3*16s23s5s 4 47 0 47
16-cds-s23s5s
act017 3*16s23s5s 3 47 0 47
act018 4*16s23s5s 4 50 0 50
act019 6*16s23s5s 6 64 0 64
5s
act020 6*16s23s5s 6 58 0 58
act021 5*16s23s5s 5 88 0 88
act022 4*16s23s5s 4 50 0 50
act023 5*16s23s5s 5 52 0 52
act024 2*16-cds-235 2 46 0 46
act025 6*16s23s5s 6 53 0 53
act026 6*16s23s5s 6 54 0 54
act027 16s23s5s 1 46 0 46
act028 2*16s23s5s 2 46 0 46
act029 3*16-cds-235 4 55 1 54
16s-cds-235-tcc
5s 101
lien blocs 16s total aas avec sans total page act032-93 Notes
act032 5*16s23s5s 5 53 0 53 16s23s5s 16-cds-235
23s5s sans 63 9 1-3
1-3 1 16-cds-235-tcc
act048 2*16-cds-235 2 45 0 45
act049 3*16s23s5s 3 53 0 53 73 total 63 10 autres incomplets
act052 2*16-cds-235 2 52 0 52 2*23s5s
act060 3*16s23s5s 3 46 0 46 5s de trop
act061 3*16s23s5s 4 56 1 55 2*5s
16-cds-235-tcc
5s
act062 3*16s23s5s 3 47 0 47
act063 4*16s23s5s 5 58 0 58
16-cds-235
5s
act064 4*16s23s5s 4 56 0 56
act071 16s23s5s 1 58 0 58
act076 4*16-cds-235 4 53 0 53
act077 4*16s23s5s 4 47 0 47
act078 3*16s23s5s 3 55 0 55
act079 3*16s23s5s 3 52 0 52
act080 3*16s23s5s 3 65 0 65
act081 2*16s23s5s 2 47 0 47
act082 2*16s23s5s 2 46 0 46
act083 2*16s23s5s 2 46 0 46
act084 2*16s23s5s 2 47 0 47
act088 16s23s5s 1 47 0 47
act089 2*16s23s5s 2 49 0 49
act090 2*16s23s5s 2 47 0 47
act091 4*16s23s5s 4 50 0 50
act092 4*16s23s5s 4 52 0 52
act093 3*16s23s5s 3 58 0 58
23s5s 73
lien blocs 16s total aas avec sans total page act094-154 Notes
act094 7*16s23s5s 7 62 0 62 16s23s5s 16-cds-235
act095 4*16s23s5s 4 52 0 52 sans 113 7
act096 4*16s23s5s 4 51 0 51 1-3
act097 5*16s23s5s 5 50 0 50
120 total 113 7
act104 5*16s23s5s 5 51 0 51
act109 4*16s23s5s 4 57 0 57
act110 4*16s23s5s 5 56 0 56
16-cds-235
act111 3*16s23s5s 3 51 0 51
act112 6*16-cds-235 6 58 0 58
act114 6*16s23s5s 6 61 0 61
act118 6*16s23s5s 6 60 0 60
act120 6*16s23s5s 6 61 0 61
act121 4*16s23s5s 4 52 0 52
act122 4*16s23s5s 4 54 0 54
act123 4*16s23s5s 4 54 0 54
act124 4*16s23s5s 4 54 0 54
act125 3*16s23s5s 3 52 0 52
act126 3*16s23s5s 3 47 0 47
act127 4*16s23s5s 4 52 0 52
act128 4*16s23s5s 4 54 0 54
act129 4*16s23s5s 4 55 0 55
act130 4*16s23s5s 4 49 0 49
act150 3*16s23s5s 3 52 0 52
act151 4*16s23s5s 4 55 0 55
act152 5*16s23s5s 5 53 0 53
act153 5*16s23s5s 5 57 0 57
act154 4*16s23s5s 4 53 0 53
120
lien blocs 16s total aas avec sans total page act162-401 Notes
act162 3*16s23s5s 3 54 0 54 16s23s5s 16-cds-235
act164 4*16s23s5s 4 52 0 52 sans 60
act165 6*16s23s5s 6 61 0 61 1-3
act166 5*16s23s5s 5 55 0 55
act167 3*16s23s5s 3 48 0 48 60 total 60 0
act168 3*16s23s5s 3 50 0 50
act169 3*16s23s5s 3 49 0 49
act170 3*16s23s5s 3 51 0 51
act183 16s23s5s 1 49 0 49
act203 3*16s23s5s 3 53 0 53
act291 16s23s5s 1 46 0 46
act300 16s23s5s 1 46 0 46
act317 16s23s5s 1 45 0 45
act336 16s23s5s 1 49 0 49
act352 2*16s23s5s 2 45 0 45
act370 16s23s5s 1 47 0 47
act371 16s23s5s 1 48 0 48
act374 4*16s23s5s 4 60 0 60
act379 2*16s23s5s 2 50 0 50
act385 6*16s23s5s 6 82 0 82
act401 6*16s23s5s 6 84 0 84
60
lien blocs 16s total aas avec sans total page Total Notes
99 16s23s5s 16-cds-235
sans 329 22 1-3
Moyenne 54 0 54 1-3 0 2 2*16s-cds-235-tcc
ecartype 10 0 10
max 110 1 110 353 total 329 24 incomplets
min 45 0 45 16s23s
autres incomplets
354 blocs 99 génomes 24 cds 2*23s5s
blocs type 16s23s5s 354
5s de trop
4*5s

actino notes[modifier | modifier le wikicode]

actino notes, les cds							
	contrôle date NCBI		prélèvement du 20.8.19				
act016	6.2.20 ne contient pas de cds					72 aas				
act024	6.2.20 ne contient pas de cds	Les 2 cds sont identiques	63 aas	MLVPLGVGVGFEGFVVLVFLPLSLITSDDPLVLVFAGAGGVVGGVLWGVGLLFENCIVDASIL	
act029	10.2.20 ne contient pas de cds	Les 3 cds sont identiques	59 aas 	MPYSVDAGVEEIIGLDGIRPVREWYGYAFGLPDRHPTGLFLWCGSMPIIVSLVSFVGFG	
act048	26.8.19 contient les mêmes	Les 2 cds sont identiques	82 aas	MRLWHGCAVGFPGRHPCGWCSRRPSGSSWGVAPWRVPAARWWLENWIVDASGWPAVRPVVCCIVSSGPMRVGSGRSFCDRLV	
act052	30.11.19 ne contient pas de cds	Les 2 cds sont identiques	67 aas	MGIESRQAEAWGGDPGAQKRIRTTPAEHPTTDAPKAHDLFHTSSPRPPRLPRRRGSHRRTNIRLHSP
act061	25.8.19 ne contient pas de cds					16s-cds-235-tcc				
act063	10.2.20 ne contient pas de cds					99 aas	MLVWKRSWASRVPLGACGEWYGYAFGFPDRHPRRLVACGFPDAPGGRRGLWPRAGSCRGAWWFENWIVDASNAGLLSCLLYRDFARLFFWSLVSRSIVL
act076	12.2.20 ne contient aucun cds					68 aas				
act110	4.2.20 ne contient aucun cds					71 aas	MRINDDKCLAWNNTCHPRHPTACHLLITTISVMCLPTSRVMIHPITTCWWQPHPGSNTNNPPHEHSPWWVY	
act112	10.2.20 ne contient aucun cds					2*61 aas cds comp				

actino typage[modifier | modifier le wikicode]

actino type 16-y-235 après 16s[modifier | modifier le wikicode]

  • Typpe
type		tableau	incomplet	total	%
16s23s5s	329	1		330	93
16-cds-235	24			24	7
total		353	1		354	

actino type 16235-z après 5s[modifier | modifier le wikicode]

  • Type
type	total	%
sans	351	99
tcc	2	1
total	353	

actino type x-16235 avant 16s[modifier | modifier le wikicode]

  • Type: néant

Tableau des noms actino[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien tableur: Tableau des noms actino
  • Prélèvement: fait vers le 20.8.19 et mise en forme le 1.9.19 Paris.
  • Légende
    - notes
    • - 2*55, à partir de gtRNAdb et la méthode de construction de la liste des noms, le même noms peut regrouper quelques échantillons ayant le même nombre de tRNAs.
    - rRNAs, 666 ou "10,10,10", sous la forme indiquée par NCBI, (5S, 16S, 23S).
    - rupture, sélection des génomes sur les 2 premiers attributs
    - fait, dans génomes actino
    - code, utilisé dans les génomes "fait"
    - tRNAs, nombre de tRNAs tel qu'il est déduit de la de la construction des noms.
tRNAs           total           22215
génomes		ruptures	faits	total
total		212		99	417
F. Noms des gamma
ruptures notes rRNAs fait code tRNAs génomes
1 222 1 act001 46 Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331
1 111 1 act002 47 Acidothermus cellulolyticus 11B ATCC 43068
1 333 1 act003 46 Actinobaculum schaalii CCUG 27420
1 333 1 act004 76 Actinoplanes friuliensis DSM 7358
1 666 1 act005 62 Actinoplanes missouriensis 431
1 444 1 act006 64 Actinoplanes sp. N902-109
1 666 1 act007 110 Actinoplanes sp. SE50/110
1 455 1 act008 63 Actinosynnema mirum DSM 43827
1 222 1 act009 49 Adlercreutzia equolifaciens DSM 19450
1 444 1 act010 58 Amycolatopsis japonica MG417-CF17
1 - act011 56 Amycolatopsis lurida NRRL 2430
1 444 1 act012 55 Amycolatopsis mediterranei RB
2*55 act013 110 Amycolatopsis mediterranei S699
act014 55 Amycolatopsis mediterranei U32
1 333 1 act015 52 Amycolatopsis methanolica 239
1 444 1 act016 52 Amycolatopsis orientalis HCCB10007
1 333 1 act017 47 Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1
1 444 1 act018 50 Arcanobacterium haemolyticum DSM 20595
1 766 1 act019 64 Arthrobacter arilaitensis Re117
1 666 1 act020 58 Arthrobacter aurescens TC1 ATCC BAA-1386
1 555 1 act021 88 Arthrobacter chlorophenolicus A6
1 444 1 act022 50 Arthrobacter phenanthrenivorans Sphe3
1 555 1 act023 52 Arthrobacter sp. FB24
1 222 1 act024 46 Arthrobacter sp. IHBB 11108
1 666 1 act025 53 Arthrobacter sp. PAMC25486
1 666 1 act026 54 Arthrobacter sp. Rue61a
1 111 1 act027 46 Atopobium parvulum DSM 20469
1 222 1 act028 46 Beutenbergia cavernae DSM 12333
1 544 1 act029 55 Bifidobacterium adolescentis 22L
act030 54 Bifidobacterium adolescentis ATCC 15703
act031 56 Bifidobacterium adolescentis BBMN23
1 656 1 act032 53 Bifidobacterium animalis A6
act033 53 Bifidobacterium animalis RH
act034 52 Bifidobacterium animalis subsp. animalis ATCC 25527
act035 53 Bifidobacterium animalis subsp. lactis AD011
act036 52 Bifidobacterium animalis subsp. lactis ATCC 27673
act037 53 Bifidobacterium animalis subsp. lactis B420
act038 53 Bifidobacterium animalis subsp. lactis BB-12
act039 53 Bifidobacterium animalis subsp. lactis BF052
act040 53 Bifidobacterium animalis subsp. lactis Bi-07
act041 53 Bifidobacterium animalis subsp. lactis Bl-04 ATCC SD5219
act042 53 Bifidobacterium animalis subsp. lactis Bl12
act043 53 Bifidobacterium animalis subsp. lactis BLC1
act044 53 Bifidobacterium animalis subsp. lactis CNCM I-2494
act045 52 Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140
act046 53 Bifidobacterium animalis subsp. lactis KLDS2.0603
act047 53 Bifidobacterium animalis subsp. lactis V9
1 222 1 act048 45 Bifidobacterium asteroides PRL2011
1 333 1 act049 53 Bifidobacterium bifidum BGN4
act050 54 Bifidobacterium bifidum PRL2010
act051 54 Bifidobacterium bifidum S17
1 222 1 act052 52 Bifidobacterium breve 12L
act053 53 Bifidobacterium breve 689b
act054 53 Bifidobacterium breve ACS-071-V-Sch8b
act055 54 Bifidobacterium breve JCM 7017
act056 58 Bifidobacterium breve JCM 7019
act057 53 Bifidobacterium breve NCFB 2258
act058 53 Bifidobacterium breve S27
act059 54 Bifidobacterium breve UCC2003
1 333 1 act060 46 Bifidobacterium coryneforme LMG18911
1 544 1 act061 56 Bifidobacterium dentium Bd1
1 333 1 act062 47 Bifidobacterium indicum LMG 11587 DSM 20214
1 655 1 act063 58 Bifidobacterium kashiwanohense PV20-2
1 444 1 act064 56 Bifidobacterium longum 105-A
act065 55 Bifidobacterium longum BXY01
act066 60 Bifidobacterium longum DJO10A
act067 57 Bifidobacterium longum NCC2705
act068 62 Bifidobacterium longum subsp. infantis 157F
86*2 act069 172 Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697 JCM 1222 DSM 20088
act070 55 Bifidobacterium longum subsp. longum BBMN68
1 111 1 act071 58 Bifidobacterium longum subsp. longum F8
act072 56 Bifidobacterium longum subsp. longum GT15
act073 78 Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217
act074 55 Bifidobacterium longum subsp. longum JDM301
act075 56 Bifidobacterium longum subsp. longum KACC 91563
1 444 1 act076 53 Bifidobacterium pseudolongum PV8-2
1 444 1 act077 47 Bifidobacterium thermophilum RBL67
1 333 1 act078 55 Blastococcus saxobsidens DD2
1 333 1 act079 52 Brachybacterium faecium DSM 4810
1 333 1 act080 65 Catenulispora acidiphila DSM 44928
1 222 1 act081 47 Cellulomonas fimi ATCC 484
1 222 1 act082 46 Cellulomonas flavigena DSM 20109
1 222 1 act083 46 Cellvibrio gilvus ATCC 13127
1 222 1 act084 47 Clavibacter michiganensis subsp. insidiosus R1-1
act085 46 Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382
act086 46 Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis NCPPB 2581
act087 46 Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus ATCC33113
1 111 1 act088 47 Conexibacter woesei DSM 14684
1 222 1 act089 49 Coriobacteriaceae bacterium 68-1-3
1 222 1 act090 47 Coriobacterium glomerans PW2
1 444 1 act091 50 Corynebacterium argentoratense DSM 44202
1 444 1 act092 52 Corynebacterium atypicum R2070
1 434 1 act093 58 Corynebacterium aurimucosum ATCC 700975
1 777 1 act094 62 Corynebacterium callunae DSM 20147
1 444 1 act095 52 Corynebacterium camporealensis DSM 44610
1 444 1 act096 51 Corynebacterium casei LMG S-19264
1 555 1 act097 50 Corynebacterium diphtheriae 241
act098 51 Corynebacterium diphtheriae 31A
act099 53 Corynebacterium diphtheriae BH8
act100 58 Corynebacterium diphtheriae C7 beta
act101 54 Corynebacterium diphtheriae CDCE 8392
act102 53 Corynebacterium diphtheriae HC01
act103 54 Corynebacterium diphtheriae HC02
555 1 act104 51 Corynebacterium diphtheriae HC03
act105 51 Corynebacterium diphtheriae HC04
act106 50 Corynebacterium diphtheriae INCA 402
act107 53 Corynebacterium diphtheriae PW8
act108 51 Corynebacterium diphtheriae VA01
1 444 1 act109 57 Corynebacterium doosanense CAU 212 DSM 45436
1 555 1 act110 56 Corynebacterium efficiens YS-314
1 333 1 act111 51 Corynebacterium falsenii DSM 44353 BL 8171
1 666 1 act112 58 Corynebacterium glutamicum AR1
act113 60 Corynebacterium glutamicum ATCC 13032
666 1 act114 61 Corynebacterium glutamicum ATCC 21831
act115 60 Corynebacterium glutamicum B253
act116 60 Corynebacterium glutamicum K051 ATCC 13032 substr. K051
act117 59 Corynebacterium glutamicum MB001
666 1 act118 60 Corynebacterium glutamicum R
act119 61 Corynebacterium glutamicum SCgG1
666 1 act120 61 Corynebacterium glutamicum SCgG2
1 444 1 act121 52 Corynebacterium glyciniphilum AJ 3170
1 444 1 act122 54 Corynebacterium halotolerans YIM 70093 DSM 44683
1 444 1 act123 54 Corynebacterium humireducens NBRC 106098 DSM 45392
1 444 1 act124 54 Corynebacterium imitans DSM 44264
1 333 1 act125 52 Corynebacterium jeikeium K411
1 333 1 act126 47 Corynebacterium kroppenstedtii DSM 44385
1 444 1 act127 52 Corynebacterium kutscheri DSM 20755
1 444 1 act128 54 Corynebacterium marinum DSM 44953
1 444 1 act129 55 Corynebacterium maris DSM 45190
1 444 1 act130 49 Corynebacterium pseudotuberculosis 1/06-A
act131 48 Corynebacterium pseudotuberculosis 1002
act132 49 Corynebacterium pseudotuberculosis 226
act133 48 Corynebacterium pseudotuberculosis 258
act134 49 Corynebacterium pseudotuberculosis 267
act135 49 Corynebacterium pseudotuberculosis 3/99-5
act136 49 Corynebacterium pseudotuberculosis 31
act137 49 Corynebacterium pseudotuberculosis 316
act138 49 Corynebacterium pseudotuberculosis 42/02-A
act139 49 Corynebacterium pseudotuberculosis 48252
act140 48 Corynebacterium pseudotuberculosis C231
act141 48 Corynebacterium pseudotuberculosis CIP 52.97
act142 49 Corynebacterium pseudotuberculosis Cp162
act143 49 Corynebacterium pseudotuberculosis CS 10
act144 49 Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41
act145 49 Corynebacterium pseudotuberculosis Ft 2193/67
act146 49 Corynebacterium pseudotuberculosis I19
act147 49 Corynebacterium pseudotuberculosis P54B96
act148 48 Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10
act149 49 Corynebacterium pseudotuberculosis VD57
1 333 1 act150 52 Corynebacterium resistens DSM 45100
1 444 1 act151 55 Corynebacterium singulare IBS B52218
1 555 1 act152 53 Corynebacterium sp. ATCC 6931
1 555 1 act153 57 Corynebacterium terpenotabidum Y-11
1 444 1 act154 53 Corynebacterium ulcerans 0102
act155 50 Corynebacterium ulcerans 05146
act156 50 Corynebacterium ulcerans 131002
act157 53 Corynebacterium ulcerans 210931
act158 52 Corynebacterium ulcerans 210932
act159 53 Corynebacterium ulcerans 809
act160 53 Corynebacterium ulcerans BR-AD22
act161 52 Corynebacterium ulcerans FRC11
1 333 1 act162 54 Corynebacterium urealyticum DSM 7109
act163 56 Corynebacterium urealyticum DSM 7111
1 444 1 act164 52 Corynebacterium ureicelerivorans IMMIB RIV-2301
1 666 1 act165 61 Corynebacterium variabile DSM 44702
1 555 1 act166 55 Corynebacterium vitaeruminis DSM 20294
1 333 1 act167 48 Cryptobacterium curtum DSM 15641
1 333 1 act168 50 Dermacoccus nishinomiyaensis M25
1 333 1 act169 49 Eggerthella lenta DSM 2243
1 333 1 act170 51 Eggerthella sp. YY7918
1 act171 47 Frankia alni ACN14a ACN14A
1 act172 47 Frankia sp. CcI3
1 act173 53 Frankia sp. EAN1pec EAN1.pec
1 act174 50 Frankia sp. EuI1c
1 act175 50 Frankia symbiont of Datisca glomerata 4085684
1 act176 45 Gardnerella vaginalis 409-05
act177 45 Gardnerella vaginalis ATCC 14019
act178 45 Gardnerella vaginalis HMP9231
1 act179 55 Geodermatophilus obscurus DSM 43160
1 act180 50 Gordonia bronchialis DSM 43247
1 act181 50 Gordonia polyisoprenivorans VH2
1 act182 48 Gordonia sp. KTR9
1 111 1 act183 49 Gordonibacter pamelaeae 7-10-1-b 7-10-1-bT
1 - act184 47 Ilumatobacter coccineus YM16-304
1 act185 50 Intrasporangium calvum DSM 43043
1 act186 49 Isoptericola variabilis 225
1 act187 55 Jonesia denitrificans DSM 20603
1 act188 49 Kineococcus radiotolerans SRS30216 ATCC BAA-149
1 act189 82 Kitasatospora setae KM-6054
1 act190 47 Kocuria rhizophila DC2201 DC2201 NBRC 103217
1 act191 57 Kribbella flavida DSM 17836
1 act192 49 Kutzneria albida DSM 43870
1 act193 48 Kytococcus sedentarius DSM 20547
1 act194 47 Leifsonia xyli subsp. cynodontis DSM 46306
act195 46 Leifsonia xyli subsp. xyli str. CTCB07
1 act196 47 Microbacterium testaceum StLB037
1 act197 48 Micrococcus luteus NCTC 2665
act198 48 Micrococcus luteus trpE16
1 act199 50 Microlunatus phosphovorus NM-1
1 act200 58 Micromonospora aurantiaca ATCC 27029
1 act201 58 Micromonospora sp. L5
1 act202 46 Mobiluncus curtisii ATCC 43063
1 333 1 act203 53 Modestobacter marinus BC501
1 act204 49 Mycobacterium abscessus
act205 46 Mycobacterium abscessus 4529
act206 46 Mycobacterium abscessus DJO-44274
act207 50 Mycobacterium abscessus subsp. bolletii 103
act208 52 Mycobacterium abscessus subsp. bolletii 50594
act209 49 Mycobacterium abscessus subsp. bolletii CCUG 48898 JCM 15300
act210 49 Mycobacterium abscessus subsp. bolletii MA 1948
act211 49 Mycobacterium abscessus subsp. bolletii MC1518
act212 48 Mycobacterium abscessus subsp. bolletii MM1513
act213 46 Mycobacterium abscessus subsp. bolletii str. GO 06
1 act214 46 Mycobacterium africanum GM041182
1 act215 47 Mycobacterium avium 104
act216 47 Mycobacterium avium subsp. avium 2285 R
act217 47 Mycobacterium avium subsp. avium 2285 S
act218 47 Mycobacterium avium subsp. avium DJO-44271
act219 48 Mycobacterium avium subsp. hominissuis TH135
act220 47 Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis E1
act221 47 Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis E93
act222 47 Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10
act223 47 Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4
1 act224 46 Mycobacterium bovis ATCC BAA-935
act225 46 Mycobacterium bovis BCG str. ATCC 35743 63839
act226 46 Mycobacterium bovis BCG str. Korea 1168P
act227 46 Mycobacterium bovis BCG str. Mexico
act228 46 Mycobacterium bovis BCG str. Moreau RDJ
act229 48 Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2 BCG Pasteur 1173P2
act230 46 Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172
1 act231 46 Mycobacterium canettii CIPT 140010059
act232 46 Mycobacterium canettii CIPT 140060008
act233 46 Mycobacterium canettii CIPT 140070008
act234 47 Mycobacterium canettii CIPT 140070010
act235 47 Mycobacterium canettii CIPT 140070017
1 act236 49 Mycobacterium chelonae ATCC 35752
1 act237 46 Mycobacterium chubuense NBB4
1 act238 47 Mycobacterium gilvum PYR-GCK
1 act239 49 Mycobacterium gilvum Spyr1
1 act240 48 Mycobacterium indicus pranii MTCC 9506
1 act241 48 Mycobacterium intracellulare 1956
act242 49 Mycobacterium intracellulare ATCC 13950
act243 48 Mycobacterium intracellulare MOTT-02
act244 47 Mycobacterium intracellulare MOTT-64
1 act245 49 Mycobacterium kansasii 662
act246 49 Mycobacterium kansasii 824
act247 49 Mycobacterium kansasii ATCC 12478
1 act248 45 Mycobacterium leprae Br4923
1 act249 48 Mycobacterium liflandii 128FXT
1 act250 50 Mycobacterium marinum E11
act251 49 Mycobacterium marinum M
1 act252 48 Mycobacterium neoaurum VKM Ac-1815D
1 act253 48 Mycobacterium rhodesiae NBB3
1 act254 49 Mycobacterium smegmatis INHR1
act255 49 Mycobacterium smegmatis INHR2
act256 50 Mycobacterium smegmatis JS623
49*3 act257 147 Mycobacterium smegmatis str. MC2 155
1 act258 48 Mycobacterium sp. JDM601
1 act259 49 Mycobacterium sp. JLS
1 act260 50 Mycobacterium sp. KMS
1 act261 49 Mycobacterium sp. MCS
1 act262 46 Mycobacterium sp. MOTT36Y
1 act263 55 Mycobacterium sp. VKM Ac-1817D
1 act264 45 Mycobacterium tuberculosis 0A005DS
act265 46 Mycobacterium tuberculosis 0A012DS
act266 46 Mycobacterium tuberculosis 0A029DS
act267 46 Mycobacterium tuberculosis 0A033DS
act268 44 Mycobacterium tuberculosis 0A036DS
act269 46 Mycobacterium tuberculosis 0A087DS
act270 46 Mycobacterium tuberculosis 0A092DS
act271 46 Mycobacterium tuberculosis 0A093DS
act272 45 Mycobacterium tuberculosis 0A094DS
act273 45 Mycobacterium tuberculosis 0A115DS
act274 45 Mycobacterium tuberculosis 0A117DS
act275 44 Mycobacterium tuberculosis 0B026XDR
act276 30 Mycobacterium tuberculosis 0B049XDR
act277 46 Mycobacterium tuberculosis 0B070XDR
act278 44 Mycobacterium tuberculosis 0B076XDR
act279 46 Mycobacterium tuberculosis 0B123ND
act280 42 Mycobacterium tuberculosis 0B169XDR
act281 45 Mycobacterium tuberculosis 0B218DS
act282 45 Mycobacterium tuberculosis 0B222DS
act283 46 Mycobacterium tuberculosis 0B228DS
act284 45 Mycobacterium tuberculosis 0B229DS
act285 46 Mycobacterium tuberculosis 0B235DS
act286 46 Mycobacterium tuberculosis 0B259XDR
act287 46 Mycobacterium tuberculosis 0B329XDR
act288 46 Mycobacterium tuberculosis 18b
act289 46 Mycobacterium tuberculosis 49-02
act290 46 Mycobacterium tuberculosis 6A024XDR
1 111 1 act291 46 Mycobacterium tuberculosis 7199-99
act292 46 Mycobacterium tuberculosis 96075
act293 45 Mycobacterium tuberculosis 96121
act294 46 Mycobacterium tuberculosis Beijing-like
act295 46 Mycobacterium tuberculosis BT1
act296 46 Mycobacterium tuberculosis BT2
act297 46 Mycobacterium tuberculosis CAS/NITR204
2*46 act298 92 Mycobacterium tuberculosis CCDC5079
act299 92 Mycobacterium tuberculosis CCDC5180
111 1 act300 46 Mycobacterium tuberculosis CDC1551
act301 46 Mycobacterium tuberculosis CTRI-2
act302 46 Mycobacterium tuberculosis EAI5
act303 46 Mycobacterium tuberculosis EAI5/NITR206
act304 46 Mycobacterium tuberculosis F11
act305 46 Mycobacterium tuberculosis H37Ra ATCC 25177
act306 90 Mycobacterium tuberculosis H37Rv
act307 45 Mycobacterium tuberculosis H37Rv TMC 102
act308 45 Mycobacterium tuberculosis H37RvSiena
act309 46 Mycobacterium tuberculosis HKBS1
act310 46 Mycobacterium tuberculosis K
act311 46 Mycobacterium tuberculosis KIT87190
act312 46 Mycobacterium tuberculosis KZN 1435
act313 46 Mycobacterium tuberculosis KZN 4207
act314 46 Mycobacterium tuberculosis KZN 605
act315 45 Mycobacterium tuberculosis RGTB327
act316 45 Mycobacterium tuberculosis RGTB423
1 111 1 act317 45 Mycobacterium tuberculosis str. Beijing/NITR203
act318 46 Mycobacterium tuberculosis str. Erdman ATCC 35801 Erdman ATCC35801
act319 46 Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem
act320 45 Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202
act321 46 Mycobacterium tuberculosis str. Kurono
act322 46 Mycobacterium tuberculosis UT205
act323 45 Mycobacterium tuberculosis ZMC13-264
act324 45 Mycobacterium tuberculosis ZMC13-88
1 act325 45 Mycobacterium ulcerans Agy99
1 act326 49 Mycobacterium vanbaalenii PYR-1
1 act327 48 Mycobacterium yongonense 05-1390
1 act328 50 Nakamurella multipartita DSM 44233
1 act329 53 Nocardia brasiliensis ATCC 700358 HUJEG-1
1 act330 51 Nocardia cyriacigeorgica GUH-2
1 act331 57 Nocardia farcinica IFM 10152
1 act332 52 Nocardia nova SH22a
1 act333 56 Nocardioides sp. JS614
1 act334 57 Nocardiopsis alba ATCC BAA-2165
1 act335 62 Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111
1 111 1 act336 49 Olsenella uli DSM 7084
1 act337 48 Pimelobacter simplex VKM Ac-2033D
1 act338 55 Propionibacterium acidipropionici ATCC 4875
1 act339 45 Propionibacterium acnes 266
act340 45 Propionibacterium acnes 6609
act341 45 Propionibacterium acnes ATCC 11828
act342 45 Propionibacterium acnes C1
act343 45 Propionibacterium acnes hdn-1
act344 45 Propionibacterium acnes HL096PA1
act345 45 Propionibacterium acnes KPA171202
act346 45 Propionibacterium acnes SK137
act347 45 Propionibacterium acnes TypeIA2 P.acn17
act348 45 Propionibacterium acnes TypeIA2 P.acn31
act349 45 Propionibacterium acnes TypeIA2 P.acn33
1 act350 46 Propionibacterium avidum 44067
1 act351 45 Propionibacterium freudenreichii subsp. freudenreichii DSM 20271
1 222 1 act352 45 Propionibacterium freudenreichii subsp. shermanii CIRM-BIA1 CIRM-B1AI
1 act353 48 Propionibacterium propionicum F0230a
1 act354 50 Pseudonocardia dioxanivorans CB1190
1 act355 45 Rathayibacter toxicus 70137
1 act356 45 Renibacterium salmoninarum ATCC 33209
1 act357 52 Rhodococcus equi 103S
1 act358 54 Rhodococcus erythropolis BG43
act359 53 Rhodococcus erythropolis CCM2595
act360 54 Rhodococcus erythropolis PR4 PR4 NBRC 100887
1 act361 53 Rhodococcus jostii RHA1
1 act362 51 Rhodococcus opacus B4
act363 52 Rhodococcus opacus PD630
act364 53 Rhodococcus opacus R7
1 act365 55 Rhodococcus pyridinivorans SB3094
1 act366 52 Rhodococcus sp. B7740
1 act367 39 Rhodoluna lacicola MWH-Ta8
1 act368 49 Rothia dentocariosa ATCC 17931
1 act369 49 Rothia mucilaginosa DY-18
1 111 1 act370 47 Rubrobacter radiotolerans RSPS-4
1 111 1 act371 48 Rubrobacter xylanophilus DSM 9941
1 act372 48 Saccharomonospora viridis DSM 43017
1 act373 53 Saccharopolyspora erythraea NRRL 2338
1 444 1 act374 60 Saccharothrix espanaensis DSM 44229
1 act375 59 Salinispora arenicola CNS-205
1 act376 55 Salinispora tropica CNB-440
1 act377 51 Sanguibacter keddieii DSM 10542
1 act378 54 Segniliparus rotundus DSM 44985
1 222 1 act379 50 Slackia heliotrinireducens DSM 20476
1 act380 50 Stackebrandtia nassauensis DSM 44728
1 act381 73 Streptomyces albulus NK660
act382 74 Streptomyces albulus ZPM
act383 70 Streptomyces albus DSM 41398
act384 69 Streptomyces albus J1074
1 666 1 act385 82 Streptomyces avermitilis MA-4680 NBRC 14893
1 act386 76 Streptomyces bingchenggensis BCW-1
1 67+68 act387 135 Streptomyces cattleya NRRL 8057 DSM 46488
1 act388 84 Streptomyces collinus Tu 365
1 act389 77 Streptomyces cyaneogriseus subsp. noncyanogenus NMWT 1
1 act390 72 Streptomyces davawensis JCM 4913
1 act391 76 Streptomyces fulvissimus DSM 40593
1 act392 69 Streptomyces glaucescens GLA.O
1 act393 71 Streptomyces griseus subsp. griseus NBRC 13350
1 act394 76 Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008
act395 76 Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis TL01
1 act396 68 Streptomyces lividans TK24
1 act397 74 Streptomyces lydicus A02
1 act398 73 Streptomyces nodosus ATCC 14899
1 act399 72 Streptomyces pratensis ATCC 33331
1 act400 70 Streptomyces rapamycinicus NRRL 5491
1 666 1 act401 84 Streptomyces scabiei 87.22
1 act402 71 Streptomyces sp. 769
1 act403 71 Streptomyces sp. PAMC26508
1 act404 69 Streptomyces sp. SirexAA-E
1 act405 74 Streptomyces venezuelae ATCC 10712
1 act406 77 Streptomyces vietnamensis GIM4.0001
1 act407 69 Streptomyces violaceusniger Tu 4113
1 act408 78 Streptosporangium roseum DSM 43021
1 act409 53 Thermobifida fusca YX
1 act410 55 Thermobispora bispora DSM 43833
1 act411 63 Thermomonospora curvata DSM 43183
1 act412 50 Tropheryma whipplei str. Twist
1 act413 48 Trueperella pyogenes TP6375
act414 46 Trueperella pyogenes TP8
1 act415 50 Tsukamurella paurometabola DSM 20162
1 act416 55 Verrucosispora maris AB-18-032
1 act417 54 Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894
213 99