Recherche:Corrélation entre les codons dans les gènes de protéines/Annexe/Tableur

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Annexe 3
Recherche : Corrélation entre les codons dans les gènes de protéines
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Corrélation entre les codons dans les gènes de protéines/Annexe/Tableur
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Diagrammes codons-GC-DRNA[modifier | modifier le wikicode]

Compilation DRNA[modifier | modifier le wikicode]

codons DRNA[modifier | modifier le wikicode]

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a2777A;a27771;a27761;a27762;a6114;a6115;
Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
aae;55;11;136;54;83;266;228;398;106;155;33;31;21;14;92;41;29;223;30;184;143;2;9;189;9;0;6;109;41;119;232;107;44;44;436;235;81;275;112;93;96;61;26;36;112;75;30;53;34;169;189;152;76;65;54;54;86;90;71;286;76;2;3;1;
aba;6;89;50;11;180;283;92;348;28;219;16;15;12;113;70;89;41;170;37;190;5;10;84;3;292;29;39;116;37;203;65;70;320;27;302;235;149;289;59;76;214;219;12;63;171;66;29;32;171;88;82;30;217;205;28;12;118;202;60;3;323;4;2;0;
ade;0;2;3;0;304;314;4;372;0;226;0;0;0;133;87;56;1;171;2;173;1;0;4;3;377;139;0;139;0;198;4;6;433;89;3;552;13;396;1;3;384;322;1;51;135;78;1;4;277;80;1;0;348;210;0;0;100;190;1;1;334;0;2;4;
age;0;11;2;0;345;305;3;459;1;231;7;0;6;94;110;96;4;187;7;181;0;4;29;12;316;94;10;121;4;218;16;56;366;62;26;550;55;344;5;12;242;324;1;55;134;69;3;7;152;166;4;1;334;192;2;1;153;170;10;0;338;0;2;4;
amd;0;11;7;1;394;188;3;249;1;212;3;3;2;155;86;40;5;185;1;181;0;5;30;0;278;173;1;145;0;212;9;62;375;82;93;382;18;440;13;13;337;305;3;33;127;91;2;0;266;64;7;2;176;351;8;1;147;209;3;0;269;0;1;5;
amo;54;176;176;25;142;85;124;288;114;118;41;25;11;68;88;105;90;123;53;144;72;27;44;197;83;15;62;68;66;137;147;74;170;79;227;355;204;222;80;77;62;228;19;61;146;86;27;73;70;142;95;89;156;156;36;36;100;95;67;231;146;4;2;0;
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bbd;103;218;140;41;42;47;371;161;164;130;139;84;47;19;34;47;148;96;213;117;197;25;41;27;15;12;79;49;143;98;133;207;59;32;422;141;335;87;148;177;45;70;28;13;155;75;101;110;23;18;149;160;98;59;123;91;30;64;232;41;226;5;0;1;
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dte;115;19;351;59;7;80;454;231;206;60;120;72;55;9;32;27;143;110;103;117;265;5;30;40;3;0;52;54;86;79;238;164;35;17;563;126;259;104;136;214;16;43;55;12;119;68;130;131;12;15;309;147;13;31;109;145;21;29;256;164;79;4;0;2;
dvl;1;14;66;3;263;302;21;338;8;227;12;10;6;132;92;67;31;161;7;180;2;14;91;17;316;36;34;109;13;193;35;93;313;55;275;224;67;392;66;23;117;355;13;79;184;78;4;25;101;209;18;17;232;224;5;27;111;256;18;22;310;1;4;1;
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rru;3;67;65;3;389;86;30;298;21;213;2;1;3;135;66;78;97;69;45;110;2;2;48;4;341;95;70;66;16;180;16;48;404;67;174;327;181;279;0;20;142;544;4;63;185;73;4;7;170;146;57;1;206;252;3;3;54;274;29;0;344;3;2;1;
saci;2;87;46;4;194;335;63;301;16;199;5;5;11;129;51;120;45;147;23;163;3;54;46;6;204;166;30;114;30;200;43;67;265;137;175;345;72;344;24;36;169;337;7;54;148;81;17;23;167;149;44;4;108;338;12;21;101;212;30;0;337;3;0;3;
salb;0;2;4;0;355;241;0;288;1;228;1;0;1;116;144;39;0;180;2;186;0;5;50;2;288;121;3;132;1;217;7;83;385;45;12;514;3;452;10;9;219;406;4;38;150;97;0;5;205;113;3;2;127;388;1;2;77;311;2;0;288;0;0;6;
say;100;203;39;16;137;96;124;80;109;67;15;8;35;100;48;45;115;66;64;77;2;44;69;6;144;216;72;66;137;104;63;67;148;157;259;204;167;193;30;37;199;232;23;21;127;104;4;32;185;100;49;39;243;162;21;19;123;142;181;8;95;3;1;2;
sbn;154;123;65;52;172;64;218;161;112;121;85;77;30;45;16;69;103;90;58;185;13;7;242;2;113;6;66;64;164;87;14;273;175;17;382;145;246;180;117;138;153;172;40;25;179;71;111;85;53;26;156;91;158;74;120;52;54;127;175;12;234;6;0;0;
sbw;388;32;71;32;8;8;594;25;281;17;160;88;59;11;11;26;227;20;319;65;89;25;153;7;14;4;115;11;188;15;154;157;21;18;373;24;285;25;134;152;6;4;56;8;135;67;90;102;11;11;188;133;14;12;125;94;21;14;392;203;34;3;2;1;
sbz;24;47;48;18;436;57;281;113;88;131;72;19;20;44;93;58;97;117;50;173;3;6;234;7;139;12;53;70;45;210;25;206;217;61;336;188;227;213;91;75;274;117;27;32;188;72;52;39;192;15;147;96;155;90;63;12;88;177;145;6;234;5;0;1;
sep;330;50;92;56;9;13;358;74;149;81;99;103;89;9;9;18;180;61;218;79;88;22;170;5;19;1;116;35;203;21;87;242;31;23;439;74;312;98;160;137;30;22;25;4;144;61;122;101;17;5;188;148;55;24;129;144;47;17;269;96;80;6;0;0;
sgr;0;2;7;0;369;210;1;302;2;227;2;1;2;114;146;34;5;172;6;190;1;5;64;7;266;109;2;134;1;213;14;81;365;54;28;484;9;439;6;12;267;363;3;39;157;96;0;2;209;119;7;5;156;368;2;3;134;253;4;1;281;0;2;4;
sho;0;5;11;0;386;187;0;295;4;223;0;1;0;98;152;45;2;183;1;183;0;5;67;5;276;104;0;137;3;212;7;91;394;26;19;510;4;435;8;14;246;394;3;39;152;97;0;1;221;107;7;1;171;331;7;3;102;276;2;0;300;3;1;2;
sma;0;5;11;0;376;209;1;311;1;231;3;2;1;122;143;43;10;170;4;183;1;5;85;3;273;76;0;132;3;220;19;117;356;27;31;501;8;431;11;15;292;330;3;37;150;98;1;3;221;103;14;7;166;339;7;5;150;223;3;0;283;2;1;3;
smf;379;23;134;38;6;0;536;113;214;41;118;143;76;7;2;16;260;19;326;41;244;0;16;14;0;1;92;12;140;19;214;155;6;41;546;65;394;28;159;140;3;14;43;4;159;54;108;97;1;2;208;216;13;3;179;132;2;4;194;372;8;5;1;0;
smk;1;23;77;4;230;237;34;325;21;230;9;6;4;176;95;43;72;108;41;171;2;12;80;18;289;72;58;73;15;210;29;88;364;41;201;296;140;347;54;46;261;303;2;49;201;76;3;12;264;64;50;13;145;282;8;13;143;166;31;7;364;5;0;1;
spi;90;149;186;32;27;50;283;101;158;87;88;96;41;14;21;49;117;106;133;103;21;13;224;8;44;13;66;62;167;61;71;224;58;48;360;112;263;165;101;216;45;115;19;4;168;68;134;85;15;9;220;53;94;82;111;122;35;85;227;9;155;5;1;0;
spl;95;112;151;165;77;20;179;227;112;117;105;89;26;35;7;65;84;116;64;188;20;12;251;1;78;2;56;72;130;121;21;316;125;8;331;213;284;159;153;215;106;85;50;12;191;72;132;95;40;15;221;127;95;41;122;85;37;102;185;10;225;6;0;0;
ssdc;464;37;60;15;1;3;497;61;257;12;168;104;50;12;11;11;231;10;369;18;95;34;152;9;11;2;110;4;168;19;126;178;17;30;304;53;299;15;106;130;37;20;63;9;136;60;123;80;17;5;167;117;15;9;137;99;11;22;434;199;22;6;0;0;
ssm;12;56;224;9;155;140;180;274;146;109;30;18;51;59;107;70;126;93;99;125;25;49;107;46;71;89;74;53;29;189;113;156;99;90;256;317;264;150;78;57;84;223;26;38;171;71;17;68;78;120;152;49;102;159;25;24;48;214;136;41;248;3;1;2;
sty;18;43;34;12;456;63;271;126;82;139;65;15;10;48;98;62;91;124;42;179;4;6;230;5;149;9;53;74;35;224;20;208;232;52;349;177;216;225;71;78;279;130;21;39;185;72;32;43;215;8;153;74;161;107;47;12;93;189;126;5;255;5;0;1;
sus;3;79;34;7;335;145;59;338;34;204;7;4;12;115;60;89;53;148;53;144;5;14;44;10;275;98;37;98;25;198;64;38;305;96;232;294;163;237;26;29;318;179;6;78;169;78;10;17;219;71;29;29;309;110;10;12;165;138;98;2;302;3;1;2;
synd;0;68;54;3;381;178;73;227;17;152;11;21;38;59;116;119;40;121;39;159;3;17;100;8;202;99;22;105;39;243;44;132;260;55;179;287;182;278;41;86;119;344;7;48;125;79;18;43;124;152;64;8;316;113;20;15;65;243;51;1;253;1;0;5;
tai;7;46;82;18;349;165;9;301;23;203;11;4;9;54;210;96;19;152;6;146;7;22;29;180;51;241;18;96;8;200;38;85;176;242;13;527;111;337;8;19;154;279;15;78;160;90;10;16;100;197;59;14;355;163;6;3;26;197;12;182;142;2;2;2;
tde;135;97;223;35;38;80;323;263;200;75;77;50;33;59;73;63;159;89;121;150;64;45;52;56;76;17;58;53;81;106;151;121;136;39;442;148;220;174;117;136;27;165;28;45;162;71;17;95;54;110;195;132;18;61;52;105;52;134;186;147;143;3;3;0;
thl;254;129;61;59;20;11;338;72;166;49;106;69;68;24;15;32;193;51;219;73;45;32;176;10;42;23;77;32;223;34;111;182;63;38;454;63;324;89;133;215;31;46;22;4;165;70;92;113;39;9;194;146;58;52;113;131;48;45;271;32;90;5;1;0;
tli;61;214;156;44;99;65;202;254;111;108;80;42;55;42;78;75;107;90;102;123;128;29;28;171;42;18;62;57;76;120;151;142;84;87;272;353;271;140;102;118;87;127;54;30;136;87;57;120;46;72;160;112;186;102;69;48;54;85;100;241;62;3;2;1;
tma;9;54;146;20;150;225;289;243;64;177;76;32;28;43;81;51;47;219;55;172;213;19;13;105;16;6;27;87;25;132;190;130;56;24;453;183;198;165;80;74;100;102;30;17;131;72;67;74;75;92;156;56;201;119;45;93;83;77;85;200;179;0;1;5;
tme;208;99;161;61;11;18;470;154;199;46;83;89;78;23;27;18;177;97;203;90;179;8;12;72;3;0;67;43;120;25;155;160;14;48;465;108;292;57;165;80;32;25;45;7;121;62;145;83;14;21;197;187;62;23;76;154;42;34;226;277;47;4;1;1;
tos;10;32;70;26;289;334;18;326;49;191;1;1;0;22;127;71;6;217;3;121;1;2;6;55;254;234;8;119;8;180;5;11;225;262;55;635;14;313;1;5;148;443;0;35;131;87;2;17;54;332;15;3;363;150;2;0;53;205;15;6;243;2;3;1;
tpas;68;138;170;30;108;100;164;193;209;53;140;40;57;62;50;34;143;116;130;73;41;45;165;26;133;72;87;77;87;175;105;141;59;122;242;253;260;129;192;87;214;54;88;38;168;72;48;104;86;51;138;105;250;56;72;75;127;79;212;57;119;1;3;2;
tsu;31;102;356;8;31;34;349;236;158;119;106;84;18;29;46;87;112;141;132;150;54;10;80;18;131;10;61;59;31;175;233;89;125;16;429;144;217;214;147;150;102;61;25;75;163;82;60;117;107;4;274;100;32;36;132;155;32;24;281;79;106;4;0;2;
uur;385;48;35;48;1;2;466;57;222;20;48;158;89;12;5;9;229;29;373;48;30;26;122;3;14;2;92;22;213;14;91;142;25;29;345;37;331;39;107;143;24;16;30;9;118;4;100;73;6;8;219;76;22;9;84;150;15;13;475;39;54;4;2;48;
vin;0;4;13;5;217;435;5;378;5;254;10;2;1;148;114;69;14;154;3;187;2;15;39;16;291;189;9;134;5;217;29;62;390;82;39;558;70;380;24;34;291;334;2;56;144;82;1;19;185;169;16;2;280;284;5;3;138;218;7;0;364;1;1;4;
vpr;161;208;130;31;3;39;331;102;108;120;142;15;36;3;85;45;139;92;154;126;10;13;256;1;86;7;103;50;185;17;21;287;120;28;491;106;302;145;152;211;60;56;59;22;171;75;137;114;18;1;182;266;51;25;136;170;47;31;217;13;176;6;0;0;
xcb;1;53;7;1;528;74;18;293;17;200;6;0;11;126;71;101;35;156;35;176;1;1;109;1;354;27;36;105;13;246;6;93;398;30;229;234;110;362;50;22;259;368;0;51;162;78;3;7;251;59;15;2;330;160;7;7;59;263;23;0;318;1;0;5;
ype;77;175;44;27;296;32;267;111;115;110;81;42;31;33;57;60;115;89;65;157;4;11;251;5;101;28;65;61;109;162;21;257;176;56;326;181;282;156;125;167;151;125;32;32;195;76;108;75;87;25;201;86;119;80;88;31;67;150;176;10;207;4;1;1;

Bactéries n'ayant pas  la polymérase 1 (a27771), remplacée par EC 6.1.1.9 (a6119);
a2777A;a6119;a27761;a27762;a6114;a6115;
Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
hcr;373;29;140;20;0;4;653;48;265;23;121;148;37;6;12;9;255;19;462;25;131;21;38;1;5;2;76;6;201;9;154;102;8;13;370;26;330;8;128;85;9;7;22;1;87;1;76;92;6;1;132;90;3;3;59;144;2;6;496;132;59;4;2;67;
rip;255;116;84;67;34;33;520;131;244;93;227;113;53;37;51;16;193;50;261;102;250;77;44;38;4;8;115;26;180;47;263;76;7;18;396;87;316;58;90;109;19;10;67;18;176;81;101;70;30;8;161;95;52;47;110;95;30;27;296;213;161;1;2;3;
ple;402;104;44;51;9;5;560;79;259;10;102;132;91;13;10;17;243;36;315;80;156;23;70;31;12;19;84;25;160;19;129;178;41;29;296;53;242;42;145;106;15;10;96;8;131;79;87;91;17;8;172;148;32;19;110;166;22;13;276;398;35;3;2;1;
zin;492;8;7;9;0;0;1082;19;394;8;127;86;50;1;2;3;330;12;736;17;108;0;4;0;0;0;51;2;82;3;69;111;2;7;171;0;127;2;38;40;2;1;48;3;66;3;53;67;0;4;65;51;1;0;85;66;1;0;373;558;5;6;0;52;
crp;468;48;33;35;2;1;822;39;506;21;144;115;74;12;3;11;304;47;576;68;101;4;7;1;0;0;56;16;88;3;123;60;4;5;186;6;156;12;36;36;6;2;80;11;62;44;56;37;4;2;115;65;5;0;86;73;5;5;480;367;20;4;0;2;

Bactéries dont EC 6.1.1.4 (a6114) est en 2 morceaux. ci-dessous le petit morceau (a61142);
a61142;
Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
aae;4;1;10;1;2;6;11;18;8;4;1;3;1;0;2;0;1;8;4;11;7;0;0;7;0;0;0;3;6;8;5;1;4;3;22;13;8;7;10;2;3;2;0;0;4;4;3;4;1;4;9;9;5;3;5;3;2;2;6;17;1;0;0;1;
hth;5;3;16;1;4;7;10;17;9;5;3;0;2;0;4;2;5;8;4;9;8;0;1;6;0;1;2;5;0;4;4;3;4;3;15;18;9;5;5;8;2;3;0;1;6;3;2;6;0;2;2;6;7;2;2;4;4;3;4;12;3;0;0;1;

Total codons DRNA[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Total codons DRNA
  • Sommation des résultats directs du chapitre précédent. A copier dans un tableur avec une largeur de colonne de 1,3 cm.
Total codons;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga
aae;59;12;146;55;85;272;239;416;114;159;34;34;22;14;94;41;30;231;34;195;150;2;9;196;9;0;6;112;47;127;237;108;48;47;458;248;89;282;122;95;99;63;26;36;116;79;33;57;35;173;198;161;81;68;59;57;88;92;77;303;77;2;3;2
aba;6;89;50;11;180;283;92;348;28;219;16;15;12;113;70;89;41;170;37;190;5;10;84;3;292;29;39;116;37;203;65;70;320;27;302;235;149;289;59;76;214;219;12;63;171;66;29;32;171;88;82;30;217;205;28;12;118;202;60;3;323;4;2;0
ade;0;2;3;0;304;314;4;372;0;226;0;0;0;133;87;56;1;171;2;173;1;0;4;3;377;139;0;139;0;198;4;6;433;89;3;552;13;396;1;3;384;322;1;51;135;78;1;4;277;80;1;0;348;210;0;0;100;190;1;1;334;0;2;4
age;0;11;2;0;345;305;3;459;1;231;7;0;6;94;110;96;4;187;7;181;0;4;29;12;316;94;10;121;4;218;16;56;366;62;26;550;55;344;5;12;242;324;1;55;134;69;3;7;152;166;4;1;334;192;2;1;153;170;10;0;338;0;2;4
amd;0;11;7;1;394;188;3;249;1;212;3;3;2;155;86;40;5;185;1;181;0;5;30;0;278;173;1;145;0;212;9;62;375;82;93;382;18;440;13;13;337;305;3;33;127;91;2;0;266;64;7;2;176;351;8;1;147;209;3;0;269;0;1;5
amo;54;176;176;25;142;85;124;288;114;118;41;25;11;68;88;105;90;123;53;144;72;27;44;197;83;15;62;68;66;137;147;74;170;79;227;355;204;222;80;77;62;228;19;61;146;86;27;73;70;142;95;89;156;156;36;36;100;95;67;231;146;4;2;0
apt;8;71;105;20;371;36;139;177;123;102;93;19;13;22;100;56;83;82;59;116;5;10;212;8;192;59;84;52;37;202;17;198;214;96;412;93;295;129;180;164;123;215;21;48;174;83;68;69;130;84;168;55;250;45;25;110;107;120;212;6;136;3;0;3
axl;283;68;93;95;24;16;291;132;164;71;58;126;68;29;5;23;179;45;155;94;69;71;120;2;47;15;82;48;212;56;98;214;55;28;358;153;312;95;145;145;67;24;25;3;133;62;134;56;55;0;210;132;36;45;80;158;65;9;318;26;107;4;2;0
bae;87;82;229;15;108;56;316;118;127;95;74;83;29;22;54;66;121;94;96;124;64;23;121;9;89;24;76;57;105;122;129;119;134;48;404;137;237;144;101;131;120;72;16;18;149;62;30;98;134;6;144;110;110;96;54;124;93;32;190;26;156;3;3;0
bbd;103;218;140;41;42;47;371;161;164;130;139;84;47;19;34;47;148;96;213;117;197;25;41;27;15;12;79;49;143;98;133;207;59;32;422;141;335;87;148;177;45;70;28;13;155;75;101;110;23;18;149;160;98;59;123;91;30;64;232;41;226;5;0;1
bfl;434;127;50;27;11;7;423;76;252;10;179;101;80;18;19;12;268;26;404;38;82;68;124;24;6;18;143;10;235;54;180;142;10;47;275;73;368;13;128;164;29;9;67;10;163;72;89;105;26;11;156;180;53;21;181;98;12;12;412;214;45;2;0;4
bla;1;63;32;3;257;229;35;282;8;225;5;17;12;123;118;64;71;159;62;178;2;25;137;12;224;26;75;86;34;205;39;120;337;37;136;360;151;393;68;27;173;303;5;44;186;83;17;29;236;58;21;7;337;142;10;17;144;189;61;4;270;0;1;5
bmf;2;51;124;7;271;127;53;320;54;188;21;15;8;141;91;49;124;59;73;139;1;7;127;5;302;21;85;41;26;201;16;112;329;41;324;193;238;228;84;108;234;230;10;41;200;78;18;39;229;39;129;14;178;183;23;20;140;154;96;3;303;2;2;2
bmv;1;38;21;3;322;283;21;348;16;226;1;4;3;212;24;51;40;171;15;191;1;18;88;7;380;75;31;112;30;221;10;53;474;41;220;314;107;369;38;11;521;193;5;51;177;77;3;9;263;64;17;9;286;241;1;4;231;105;30;4;319;3;0;3
bsu;81;70;227;28;128;46;309;119;125;98;95;86;30;15;34;68;120;94;78;135;53;22;122;13;96;29;70;58;107;118;113;123;149;46;404;140;248;137;110;121;123;73;14;19;147;63;48;89;121;9;163;99;95;102;56;136;97;19;187;18;169;6;0;0
bvs;6;124;34;1;234;201;206;313;68;200;8;7;23;201;52;67;111;164;66;254;9;17;141;1;171;41;15;111;77;138;61;206;161;45;200;362;130;311;24;94;21;330;18;46;176;72;4;63;81;168;62;132;199;101;17;24;92;230;167;49;277;3;0;3
caa;7;63;63;15;207;255;80;313;41;184;11;27;34;65;129;88;40;151;87;165;3;22;158;0;181;13;27;101;90;155;32;223;187;29;297;243;150;307;125;65;169;207;23;38;131;79;97;18;156;49;111;27;102;198;53;46;44;220;112;2;340;6;0;0
cad;240;31;116;115;14;4;402;136;173;61;100;112;93;17;5;26;210;46;227;78;268;2;17;18;0;1;72;24;109;33;238;134;14;27;477;136;305;116;142;121;22;12;43;6;149;62;128;89;14;1;163;236;31;6;144;152;22;9;97;393;20;4;1;1
cbd;269;195;79;28;65;48;361;77;174;43;50;45;48;69;51;42;126;79;156;74;15;85;103;7;134;72;78;66;190;69;95;135;133;62;396;106;292;114;99;142;157;131;28;26;140;73;33;86;83;87;149;88;157;111;59;50;125;127;251;34;125;4;1;1
cbl;326;37;110;63;3;2;447;114;191;52;123;100;84;3;16;16;230;33;275;52;241;2;16;24;0;0;85;16;134;28;187;139;28;38;507;95;356;57;133;168;6;26;53;12;165;58;120;106;5;6;186;230;21;8;116;156;5;10;113;383;12;3;3;0
cff;200;68;243;75;21;19;503;112;246;34;69;70;125;22;10;132;208;53;272;78;164;13;71;26;25;3;82;35;134;43;146;156;83;28;310;221;388;84;143;206;44;55;33;34;164;62;72;104;47;8;198;160;34;24;137;93;40;28;156;329;77;3;2;1
cgq;6;109;98;12;251;119;32;280;45;163;79;22;6;29;166;17;43;167;31;205;5;20;181;2;182;8;15;113;32;193;62;211;242;17;217;298;216;267;165;193;108;118;14;19;167;87;148;95;45;18;172;20;174;145;66;15;41;243;119;1;232;4;2;0
chp;246;123;119;77;40;40;301;173;180;77;178;53;65;26;45;34;166;66;163;78;89;37;144;22;49;16;106;50;139;74;165;155;47;70;380;160;317;82;100;234;44;44;56;26;151;71;67;162;21;30;203;124;67;70;123;108;39;48;268;84;127;3;2;1
cje;280;93;233;26;4;12;583;87;275;23;93;55;131;13;8;69;212;32;298;46;153;1;81;10;22;2;101;22;184;18;127;193;48;32;491;110;369;32;177;188;61;32;53;22;149;57;74;123;12;6;176;127;79;4;126;76;15;48;311;104;111;4;1;1
cmi;0;5;1;1;236;381;0;244;0;212;0;0;0;115;111;106;0;147;2;152;1;4;20;8;399;88;2;121;1;225;20;34;385;76;4;483;10;466;12;13;312;297;0;25;130;92;1;6;169;146;0;2;186;319;4;2;179;185;0;1;305;1;1;4
cmn;206;164;131;59;45;45;320;147;186;92;184;46;61;33;59;31;152;69;150;70;56;76;119;20;35;35;93;54;133;103;188;89;45;115;353;190;303;86;100;244;64;57;46;31;143;70;78;142;20;37;237;96;83;72;113;87;66;41;273;49;114;4;1;1
crp;468;48;33;35;2;1;822;39;506;21;144;115;74;12;3;11;304;47;576;68;101;4;7;1;0;0;56;16;88;3;123;60;4;5;186;6;156;12;36;36;6;2;80;11;62;44;56;37;4;2;115;65;5;0;86;73;5;5;480;367;20;4;0;2
cta;198;165;119;73;50;49;290;168;168;105;173;46;57;31;58;37;153;68;139;75;68;76;114;15;50;26;82;56;125;116;186;92;50;111;344;205;292;90;104;247;68;68;50;32;144;70;66;149;28;34;197;116;88;86;111;85;55;50;266;46;126;3;1;2
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tpas;68;138;170;30;108;100;164;193;209;53;140;40;57;62;50;34;143;116;130;73;41;45;165;26;133;72;87;77;87;175;105;141;59;122;242;253;260;129;192;87;214;54;88;38;168;72;48;104;86;51;138;105;250;56;72;75;127;79;212;57;119;1;3;2
tsu;31;102;356;8;31;34;349;236;158;119;106;84;18;29;46;87;112;141;132;150;54;10;80;18;131;10;61;59;31;175;233;89;125;16;429;144;217;214;147;150;102;61;25;75;163;82;60;117;107;4;274;100;32;36;132;155;32;24;281;79;106;4;0;2
uur;385;48;35;48;1;2;466;57;222;20;48;158;89;12;5;9;229;29;373;48;30;26;122;3;14;2;92;22;213;14;91;142;25;29;345;37;331;39;107;143;24;16;30;9;118;4;100;73;6;8;219;76;22;9;84;150;15;13;475;39;54;4;2;48
vin;0;4;13;5;217;435;5;378;5;254;10;2;1;148;114;69;14;154;3;187;2;15;39;16;291;189;9;134;5;217;29;62;390;82;39;558;70;380;24;34;291;334;2;56;144;82;1;19;185;169;16;2;280;284;5;3;138;218;7;0;364;1;1;4
vpr;161;208;130;31;3;39;331;102;108;120;142;15;36;3;85;45;139;92;154;126;10;13;256;1;86;7;103;50;185;17;21;287;120;28;491;106;302;145;152;211;60;56;59;22;171;75;137;114;18;1;182;266;51;25;136;170;47;31;217;13;176;6;0;0
xcb;1;53;7;1;528;74;18;293;17;200;6;0;11;126;71;101;35;156;35;176;1;1;109;1;354;27;36;105;13;246;6;93;398;30;229;234;110;362;50;22;259;368;0;51;162;78;3;7;251;59;15;2;330;160;7;7;59;263;23;0;318;1;0;5
ype;77;175;44;27;296;32;267;111;115;110;81;42;31;33;57;60;115;89;65;157;4;11;251;5;101;28;65;61;109;162;21;257;176;56;326;181;282;156;125;167;151;125;32;32;195;76;108;75;87;25;201;86;119;80;88;31;67;150;176;10;207;4;1;1
zin;492;8;7;9;0;0;1082;19;394;8;127;86;50;1;2;3;330;12;736;17;108;0;4;0;0;0;51;2;82;3;69;111;2;7;171;0;127;2;38;40;2;1;48;3;66;3;53;67;0;4;65;51;1;0;85;66;1;0;373;558;5;6;0;52

acides aminés DRNA[modifier | modifier le wikicode]

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a2777A;a27771;a27761;a27762;a6114;a6115;
Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
aae;605;626;261;232;252;214;352;115;160;427;671;356;362;62;112;75;286;482;284;433;6;
aba;619;440;247;315;211;227;423;155;240;482;537;438;568;75;171;66;320;534;360;386;6;
ade;623;376;226;276;172;175;524;139;198;532;555;409;710;52;135;78;362;559;290;336;6;
age;663;462;232;313;191;188;455;131;222;500;576;399;583;56;134;69;328;531;326;348;6;
amd;601;252;213;289;190;182;486;146;212;528;475;458;668;36;127;91;332;536;365;272;6;
amo;658;412;232;338;213;197;438;130;203;470;582;426;447;80;146;86;312;496;267;444;6;
apt;611;316;225;303;165;175;486;136;239;525;505;424;682;69;174;83;351;518;362;354;6;
axl;579;423;235;309;224;249;324;130;268;395;511;407;381;28;133;62;245;423;312;451;6;
bae;577;434;222;328;215;220;330;133;227;430;541;381;424;34;149;62;268;460;303;372;6;
bbd;591;532;294;370;244;330;317;128;241;431;563;422;440;41;155;75;252;466;308;499;6;
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bmf;582;373;242;325;183;212;463;126;227;498;517;466;656;51;200;78;325;504;337;402;6;
bmv;668;369;242;295;211;206;569;143;251;578;534;476;763;56;177;77;339;553;341;353;6;
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cgq;595;312;208;319;210;236;398;128;225;532;515;483;584;33;167;87;306;511;365;352;6;
chp;645;474;257;401;232;241;357;156;213;437;540;399;422;82;151;71;280;464;318;479;6;
cje;648;670;298;369;244;344;269;123;202;400;601;401;458;75;149;57;215;386;265;526;6;
cmi;624;244;212;332;147;154;520;123;226;515;487;476;634;25;130;92;322;507;370;306;6;
cmn;650;467;278;414;221;220;341;147;236;437;543;389;465;77;143;70;277;488;307;436;6;
cta;654;458;273;402;221;214;349;138;241;439;549;382;487;82;144;70;277;487;301;438;6;
dal;603;494;248;310;200;215;362;132;237;473;565;436;524;88;212;64;301;524;339;381;6;
dba;623;391;262;337;206;196;414;140;196;489;520;421;524;91;167;63;308;486;318;388;6;
ddr;630;310;232;340;227;202;495;136;253;546;547;453;621;43;168;82;346;512;399;311;6;
din;603;370;248;346;213;230;386;145;248;478;515;402;505;82;176;58;282;459;313;425;6;
dpt;651;299;220;346;218;178;495;128;268;555;573;456;670;41;166;91;350;497;344;293;6;
dte;631;685;266;315;253;220;343;106;165;454;689;363;409;67;119;68;288;500;304;499;6;
dvl;649;359;235;319;192;187;476;143;206;496;499;459;561;92;184;78;339;491;399;350;6;
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eno;634;395;219;316;212;216;395;128;253;512;526;445;558;58;197;73;297;480;342;381;6;
fbt;631;498;298;308;257;313;401;146;274;483;595;461;531;54;165;76;311;507;368;458;6;
fnc;597;613;225;338;271;329;278;102;157;401;595;382;340;47;153;57;214;424;301;515;6;
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hhd;578;414;222;353;230;255;347;127;262;417;563;403;401;34;150;67;263;483;290;348;6;
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hmr;578;635;271;344;266;273;321;116;154;409;562;428;406;56;145;56;243;482;290;507;6;
hth;627;546;233;313;277;194;379;125;187;424;593;358;335;63;127;66;271;472;271;433;6;
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mcac;594;584;260;356;267;465;210;87;256;302;416;418;285;33;118;2;179;373;306;581;65;
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pae;663;365;227;297;191;227;426;139;249;519;504;436;637;64;165;73;295;519;310;352;6;
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ppoy;593;383;210;319;208;221;379;143;232;453;528;407;465;43;155;71;285;492;335;384;6;
pub;596;676;310;414;201;387;258;112;194;375;515;436;348;71;123;59;238;375;319;556;6;
ret;604;375;236;330;192;213;460;122;221;504;510;475;664;51;190;76;329;505;337;395;6;
roa;605;295;205;329;193;195;442;137;215;536;499;497;615;38;142;93;319;548;351;316;6;
rpr;628;547;303;416;247;377;298;135;238;387;482;383;391;76;141;63;235;430;328;604;6;
rru;613;328;234;285;166;155;492;136;196;535;501;460;706;67;185;73;327;516;334;373;6;
saci;668;364;215;321;192;186;479;144;230;512;520;416;566;61;148;81;356;494;346;367;6;
salb;602;288;229;301;180;188;466;135;218;520;526;455;644;42;150;97;323;520;391;290;6;
say;591;204;176;251;181;141;481;138;241;435;463;360;498;44;127;104;321;493;305;284;6;
sbn;630;379;233;322;193;243;383;130;251;479;527;426;580;65;179;71;275;479;353;421;6;
sbw;539;619;298;355;247;384;292;126;203;350;397;310;296;64;135;67;214;347;254;629;6;
sbz;630;394;219;306;214;223;401;123;255;509;524;440;557;59;188;72;298;488;340;385;6;
sep;550;432;230;327;241;297;305;151;224;383;513;410;349;29;144;61;245;415;337;445;6;
sgr;588;303;229;299;177;196;452;136;214;514;512;448;648;42;157;96;330;536;392;286;6;
sho;589;295;227;296;185;184;457;137;215;518;529;439;662;42;152;97;329;510;388;302;6;
sma;601;312;232;314;180;187;443;132;223;519;532;439;648;40;150;98;328;526;385;286;6;
smf;580;649;255;362;279;367;275;104;159;416;611;422;316;47;159;54;208;440;317;574;6;
smk;572;359;251;333;180;212;473;131;225;522;497;487;664;51;201;76;343;490;330;402;6;
spi;534;384;245;309;223;236;323;128;228;401;472;428;477;23;168;68;243;449;353;391;6;
spl;620;406;229;327;200;252;364;128;251;470;544;443;559;62;191;72;282;484;346;420;6;
ssdc;580;558;269;356;241;387;303;114;187;351;357;314;293;72;136;60;225;308;269;655;6;
ssm;596;454;255;335;219;224;387;127;218;458;573;414;442;64;171;71;283;462;311;425;6;
sty;626;397;221;298;215;221;403;127;259;512;526;441;558;60;185;72;298;495;341;386;6;
sus;603;397;238;287;201;197;446;135;223;503;526;400;552;84;169;78;317;477;325;402;6;
synd;684;300;169;364;161;198;429;127;282;491;466;460;590;55;125;79;337;501;343;305;6;
tai;667;310;226;384;171;152;530;114;208;541;540;448;460;93;160;90;323;591;232;336;6;
tde;608;586;275;355;248;271;310;111;187;447;590;394;445;73;162;71;276;406;343;476;6;
thl;534;410;215;314;244;292;328;109;257;394;517;413;425;26;165;70;253;450;337;393;6;
tli;639;456;219;372;197;225;416;119;196;464;625;411;434;84;136;87;295;560;256;403;6;
tma;604;532;241;311;266;227;372;114;157;400;636;363;356;47;131;72;308;532;298;464;6;
tme;558;624;245;318;274;293;274;110;145;377;573;349;302;52;121;62;263;469;306;550;6;
tos;761;344;240;222;223;124;552;127;188;503;690;327;597;35;131;87;405;531;260;264;6;
tpas;614;357;262;383;259;203;482;164;262;427;495;389;547;126;168;72;289;549;353;388;6;
tsu;562;585;277;370;253;282;303;120;206;463;573;431;460;100;163;82;288;442;343;466;6;
uur;519;523;242;321;258;421;197;114;227;287;382;370;290;39;118;4;187;326;262;568;54;
vin;674;383;259;344;168;190;552;143;222;563;597;450;683;58;144;82;374;582;364;371;6;
vpr;572;433;228;326;231;280;373;153;202;456;597;447;479;81;171;75;270;524;384;406;6;
xcb;664;311;217;315;191;211;493;141;259;527;463;472;699;51;162;78;320;507;336;341;6;
ype;651;378;225;304;204;222;400;126;271;510;507;438;568;64;195;76;295;486;336;393;6;

Bactéries n'ayant pas  la polymérase 1 (a27771), remplacée par EC 6.1.1.9 (a6119);
a2777A;a6119;a27761;a27762;a6114;a6115;
Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
hcr;566;701;288;333;274;487;198;82;210;277;396;338;229;23;87;1;175;228;211;687;73;
rip;589;651;337;497;243;363;421;141;227;364;483;374;228;85;176;81;209;355;262;670;6;
ple;615;639;269;365;279;395;311;109;179;377;349;284;276;104;131;79;203;371;311;709;6;
zin;516;1101;402;269;342;753;112;53;85;189;171;129;81;51;66;3;124;117;152;936;58;
crp;587;861;527;359;351;644;113;72;91;192;192;168;80;91;62;44;99;185;169;867;6;

Bactéries dont EC 6.1.1.4 (a6114) est en 2 morceaux. ci-dessous le petit morceau (a61142);
a61142;
Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
aae;24;29;12;7;9;15;14;3;14;13;35;15;17;0;4;4;12;26;12;24;1;
hth;36;27;14;11;13;13;16;7;4;14;33;14;18;1;6;3;10;17;13;19;1;

Total acides aminés DRNA[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Total acides aminés DRNA
  • Sommation des résultats directs du chapitre précédent. A copier dans un tableur avec une largeur de colonne de 1,3 cm.
Total acides aminés DRNA;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp
aae;629;655;273;239;261;229;366;118;174;440;706;371;379;62;116;79;298;508;296;457;7
aba;619;440;247;315;211;227;423;155;240;482;537;438;568;75;171;66;320;534;360;386;6
ade;623;376;226;276;172;175;524;139;198;532;555;409;710;52;135;78;362;559;290;336;6
age;663;462;232;313;191;188;455;131;222;500;576;399;583;56;134;69;328;531;326;348;6
amd;601;252;213;289;190;182;486;146;212;528;475;458;668;36;127;91;332;536;365;272;6
amo;658;412;232;338;213;197;438;130;203;470;582;426;447;80;146;86;312;496;267;444;6
apt;611;316;225;303;165;175;486;136;239;525;505;424;682;69;174;83;351;518;362;354;6
axl;579;423;235;309;224;249;324;130;268;395;511;407;381;28;133;62;245;423;312;451;6
bae;577;434;222;328;215;220;330;133;227;430;541;381;424;34;149;62;268;460;303;372;6
bbd;591;532;294;370;244;330;317;128;241;431;563;422;440;41;155;75;252;466;308;499;6
bfl;656;499;262;409;294;442;322;153;289;379;348;381;330;77;163;72;231;410;303;671;6
bla;585;317;233;339;230;240;426;161;239;533;496;544;571;49;186;83;340;507;360;335;6
bmf;582;373;242;325;183;212;463;126;227;498;517;466;656;51;200;78;325;504;337;402;6
bmv;668;369;242;295;211;206;569;143;251;578;534;476;763;56;177;77;339;553;341;353;6
bsu;580;428;223;328;214;213;335;128;225;431;544;385;427;33;147;63;267;459;308;374;6
bvs;600;519;268;358;275;320;380;126;215;473;562;441;469;64;176;72;316;494;363;493;6
caa;610;393;225;354;191;252;377;128;245;471;540;457;566;61;131;79;320;438;363;454;6
cad;520;538;234;353;256;305;306;96;142;413;613;421;297;49;149;62;232;436;327;510;6
cbd;684;438;217;305;205;230;416;144;259;425;502;406;529;54;140;73;289;505;361;410;6
cbl;541;561;243;342;263;327;283;101;162;392;602;413;333;65;165;58;237;445;287;508;6
cff;626;615;280;428;261;350;302;117;177;413;531;472;448;67;164;62;231;416;298;562;6
cgq;595;312;208;319;210;236;398;128;225;532;515;483;584;33;167;87;306;511;365;352;6
chp;645;474;257;401;232;241;357;156;213;437;540;399;422;82;151;71;280;464;318;479;6
cje;648;670;298;369;244;344;269;123;202;400;601;401;458;75;149;57;215;386;265;526;6
cmi;624;244;212;332;147;154;520;123;226;515;487;476;634;25;130;92;322;507;370;306;6
cmn;650;467;278;414;221;220;341;147;236;437;543;389;465;77;143;70;277;488;307;436;6
crp;587;861;527;359;351;644;113;72;91;192;192;168;80;91;62;44;99;185;169;867;6
cta;654;458;273;402;221;214;349;138;241;439;549;382;487;82;144;70;277;487;301;438;6
dal;603;494;248;310;200;215;362;132;237;473;565;436;524;88;212;64;301;524;339;381;6
dba;623;391;262;337;206;196;414;140;196;489;520;421;524;91;167;63;308;486;318;388;6
ddr;630;310;232;340;227;202;495;136;253;546;547;453;621;43;168;82;346;512;399;311;6
din;603;370;248;346;213;230;386;145;248;478;515;402;505;82;176;58;282;459;313;425;6
dpt;651;299;220;346;218;178;495;128;268;555;573;456;670;41;166;91;350;497;344;293;6
dte;631;685;266;315;253;220;343;106;165;454;689;363;409;67;119;68;288;500;304;499;6
dvl;649;359;235;319;192;187;476;143;206;496;499;459;561;92;184;78;339;491;399;350;6
eal;641;402;211;301;216;222;399;126;247;502;526;445;570;61;191;72;303;493;339;376;6
eco;636;399;211;301;217;223;399;126;248;504;527;439;575;61;192;72;300;496;333;376;6
eno;634;395;219;316;212;216;395;128;253;512;526;445;558;58;197;73;297;480;342;381;6
fbt;631;498;298;308;257;313;401;146;274;483;595;461;531;54;165;76;311;507;368;458;6
fnc;597;613;225;338;271;329;278;102;157;401;595;382;340;47;153;57;214;424;301;515;6
gau;675;324;253;320;173;199;541;132;219;536;536;475;699;50;127;87;342;579;390;358;6
gva;604;367;249;384;221;284;415;147;242;505;512;511;587;59;176;84;311;516;356;340;6
hcr;566;701;288;333;274;487;198;82;210;277;396;338;229;23;87;68;175;228;211;687;6
hhd;578;414;222;353;230;255;347;127;262;417;563;403;401;34;150;67;263;483;290;348;6
hhl;579;442;190;268;225;257;279;113;260;384;581;433;373;54;119;55;229;419;290;418;6
hmr;578;635;271;344;266;273;321;116;154;409;562;428;406;56;145;56;243;482;290;507;6
hth;663;573;247;324;290;207;395;132;191;438;626;372;353;64;133;69;281;489;284;452;7
ial;557;604;300;327;239;324;315;114;224;391;553;437;380;46;140;57;268;479;341;516;6
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lat;605;476;272;517;199;297;385;150;270;397;447;428;404;94;170;77;284;464;303;577;6
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ljf;545;482;221;301;233;280;308;133;212;396;452;455;429;27;157;66;273;432;318;382;6
lla;582;391;250;303;209;274;349;120;175;405;532;392;462;20;158;63;263;418;332;394;6
lpl;559;370;214;297;234;241;325;139;284;409;410;462;498;22;179;67;276;443;362;361;6
mah;626;371;221;337;204;242;394;152;263;470;507;451;549;65;168;69;282;510;321;388;6
mcac;594;584;260;356;267;465;210;87;256;302;416;418;285;33;118;61;179;373;306;581;6
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tli;639;456;219;372;197;225;416;119;196;464;625;411;434;84;136;87;295;560;256;403;6
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tsu;562;585;277;370;253;282;303;120;206;463;573;431;460;100;163;82;288;442;343;466;6
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zin;516;1101;402;269;342;753;112;53;85;189;171;129;81;51;66;55;124;117;152;936;6

Contenu en GC des génomes DRNA[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Contenu en GC des génomes DRNA
  • Le contenu en GC (%GC) de 80 bactéries sont tirés des tableaux numériques de l'article "répétition des bases dans l'ADN des procaryotes". Pour la cyanobactérie synd voir dans cyanobactérie de la même annexe.
synd
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KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
aae;1551335;43.4761673010665;4828;4872;591;641;85156;86380;64379;65865;9170;9276;2805;2659;0
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crp;159662;16.5643672257644;2208;2307;3;1;11715;11640;1856;1655;1923;1940;21;10;0
cta;1044459;41.3026265272261;3432;3408;298;331;57496;57848;33854;33988;5388;5499;1299;1382;0
dba;3942657;58.6469987117824;6013;5709;2349;2296;128342;128977;247250;245417;10055;9879;10289;10144;0
ddr;2819842;63.3881614643657;1141;1141;2325;2271;72453;72851;190167;190035;2681;2802;7741;7887;0
dpt;2147060;66.1626596368988;984;992;2416;2403;50298;50108;153924;153369;2162;2164;7415;7470;0
dvl;3462887;63.0119319515768;802;927;4317;4191;99406;98997;207175;208396;2448;2453;12405;12173;0
eal;4701875;49.6961743985112;9155;9178;1415;1391;213977;213634;210716;211439;16662;16491;5919;5988;0
eco;4641652;50.7907098593346;8441;8289;1278;1239;205758;205373;216669;215471;15523;15380;6067;6027;0
eno;4726582;55.0658594307684;6718;6616;2026;1761;175739;175064;247144;245935;13149;12986;7851;7838;0
fnc;2268272;27.1239075384257;15901;16899;188;205;150456;154238;44430;46164;22104;23105;909;1016;0
gau;4636964;64.2743614140632;821;831;2673;2453;114328;115447;290929;288988;2570;2662;10122;9745;0
gva;1617545;42.0163531873012;3613;3819;141;146;98250;98280;46326;46971;7958;8178;664;682;1
kpn;5315120;57.4785705684914;6826;6881;2566;2436;176067;174204;303726;304645;12619;12681;10259;10156;0
ksk;8783278;74.1973095947132;164;172;12884;12121;117011;118289;769376;762832;800;781;36895;35532;66
lat;1190853;36.321359563271;5612;5102;299;296;69592;68743;31730;32794;7633;7502;1024;1068;0
liv;2928879;37.1320221832312;13330;13151;393;397;182231;182030;85549;84245;20442;20144;2380;2231;0
ljf;1755993;34.4856727788778;7197;7391;139;123;119517;119828;45649;46581;11837;11856;1094;1109;0
lla;2365589;35.3293830838747;11874;12259;306;308;154900;154402;62832;64130;17897;17884;1642;1717;0
lpl;3308273;44.4668864993911;5986;6100;985;948;194243;193057;126982;125053;12535;12729;4041;4084;0
mcac;1017293;23.6631924135918;8400;8285;29;36;78405;77999;13198;13569;10401;10072;142;172;0
mts;3982034;70.2782487149088;104;89;4948;5132;63017;63298;264646;262789;456;464;15198;14915;21
opr;2303940;70.0248270354263;416;426;4669;4606;47540;47357;166529;168073;1395;1350;11408;11436;0
pac;2560265;60.0107410756308;697;698;1923;1929;78228;76965;154335;153541;2322;2196;7318;7468;0
pae;6264404;66.5557329955092;1354;1434;2481;2202;153530;156878;471856;459967;3401;3374;13053;11818;0
pgd;3776653;59.6245140869442;2205;2324;2835;2811;118904;119611;229006;228777;6450;6528;9786;9915;0
pgi;2343476;48.2879278473515;3967;3874;873;900;104950;104835;103058;103915;7764;7881;3403;3392;0
ple;358242;26.1736479809738;2182;2972;29;48;24576;25141;5582;7273;3131;3480;99;162;0
ppoy;5597590;45.5107644539882;11835;12067;1852;1923;278022;279031;228863;232494;22906;23777;7539;7524;0
ret;4381608;61.2722087416309;2000;1981;1456;1181;138606;141047;281098;266494;6563;6988;6900;5754;0
rip;574390;28.4825641114922;5149;4608;48;34;37848;37072;11363;11314;5367;4930;177;157;0
roa;8376953;67.3730787311657;304;315;5894;6137;175073;173980;576424;582208;1793;1897;23638;24137;67
rpr;1111523;29.0002995889424;5688;5488;60;46;75353;75109;20531;21121;9101;8657;374;348;0
rru;4352825;65.4479562123449;2105;2167;6143;6144;117691;117954;314819;315531;6056;6234;15234;15224;0
saci;9629675;62.2660577849201;4027;3918;12522;12591;311082;308165;613507;617296;10530;10237;32126;32651;0
salb;6841649;73.3211578544263;163;150;11612;11254;92662;94200;578179;575278;712;723;34189;33576;29
say;3551206;56.7620971579796;4756;4898;4114;3728;136493;138062;224664;220982;9802;10117;11598;11257;0
sbn;5347283;46.2833180888313;10050;9904;963;1056;279165;278792;207232;209063;19982;19825;5955;6005;0
sbz;4683551;51.3411511906244;9188;9107;1746;1661;197243;195799;225810;225551;16324;15916;6701;6366;0
sep;2499279;32.0951762488302;10030;9072;256;186;173063;168449;55041;52457;17327;16269;1229;1044;0
sgr;8545929;72.2274079272131;197;198;13111;12803;125513;127411;691994;689222;1042;1153;40312;40010;0
sho;9840102;72.0397308889684;248;219;12043;12293;144995;146783;806253;806814;1023;1058;38926;38906;0
sma;9025608;70.716554496938;288;338;10689;10658;147271;148799;697969;694405;1497;1590;33943;34035;0
smk;3820344;62.6668959653895;1275;1380;1438;1375;115653;117560;245820;242728;4939;4981;7019;6690;0
spi;1937111;38.3159251070279;7601;7936;274;296;114902;115665;59188;61681;11590;12071;1546;1675;0
spl;1796846;39.0916639489416;5598;5780;245;286;107498;109043;58113;58617;9461;9754;1430;1421;0
sty;4809037;52.0927162756286;9036;9129;1610;1679;198401;197326;233040;235497;16417;16153;6741;6819;0
sus;9965640;61.9024568417081;3706;3782;5063;4566;321828;322056;637709;633071;12614;12567;22278;21823;0
synd;2572069;59.0852733733037;1561;1578;2408;2369;89219;90093;155100;155007;3505;3630;7274;7056;0
tai;1848474;63.7925661924377;375;339;8098;7114;48029;46765;142542;137838;1116;1095;12183;11501;0
tde;2843201;37.8737556718642;18098;17974;618;525;158790;159051;100982;98334;22582;22554;3102;3017;0
tma;1860725;46.2477260207715;4488;4659;538;709;89126;90023;74178;78612;8868;8979;2144;2517;0
tme;1915238;31.3998573545429;13238;12800;490;431;123522;121538;50996;49107;17789;17210;1638;1550;0
tos;2072393;68.5534548707702;717;721;11907;12188;48268;48509;171568;172114;2802;2818;17743;17863;0
tpas;1139203;52.7868167482003;2304;2372;998;992;43195;42394;46858;47673;3742;3707;2611;2803;0
tsu;2731853;39.1632346249963;16370;17375;212;175;160078;161558;84833;85814;21396;22170;1279;1393;0
uur;751719;25.4996880483266;5422;5640;38;46;58304;58095;10982;11668;7387;7301;189;215;0
vin;4350553;68.9392589861565;388;361;3617;3620;88266;86551;320517;318241;1260;1271;14450;14284;0
xcb;5148708;64.9570338811212;1531;1476;1367;1328;137185;137234;344611;341465;3622;3618;7930;7928;0
ype;4653728;47.6361102324846;8789;8951;2595;2930;224229;225184;201213;204623;16816;16685;7641;8107;0
zin;208564;13.5401332099375;3112;3050;7;10;14475;14621;2251;2077;2574;2718;13;28;21
  • J'ai soumis le programme repete.pl pour les 30 autres bactéries dont les résultats sont ci-dessous:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
axl; 2569486; 35.7182720590811; 8179; 8531; 284; 328; 170932; 171483; 64149; 67845; 14575; 15230; 1450; 1592; 0
bbd; 4196595; 36.8131306452016; 17917; 18452; 633; 676; 252305; 254717; 130999; 131308; 29736; 30406; 3649; 3511; 0
bfl; 705557; 27.3831880344182; 3463; 3756; 64; 70; 48885; 48639; 13042; 14796; 4814; 5072; 303; 331; 0
bvs; 3076856; 51.6699189042321; 4455; 4947; 1933; 1709; 127405; 131768; 150963; 149272; 8475; 9052; 7525; 7031; 0
caa; 3750771; 53.6017794741401; 2758; 2619; 1585; 1728; 159815; 157925; 181725; 185832; 7542; 7149; 5835; 6135; 0
dal; 6517073; 54.4848567801159; 17587; 17686; 5674; 5421; 254602; 254345; 412164; 407704; 26656; 26671; 18214; 17436; 31T
din; 2928377; 56.1087250719426; 3500; 3527; 2322; 2399; 99019; 99060; 167348; 167454; 6769; 7046; 7566; 7837; 0
dte; 1541968; 34.9485851846472; 7576; 7913; 224; 214; 100704; 100372; 43668; 44782; 12371; 12390; 897; 943; 0
fbt; 6665617; 46.4695016230305; 16807; 16738; 2490; 2802; 300435; 302268; 308376; 311092; 30947; 30735; 10659; 11204; 0
hcr; 657101; 22.5303263881808; 6427; 6393; 56; 54; 50381; 49817; 9441; 9120; 7575; 7438; 164; 150; 0
hhd; 4150632; 41.8231247675053; 11508; 11601; 1386; 1420; 234076; 235189; 154591; 156132; 19851; 19935; 5276; 5757; 0
hhl; 2649255; 32.4558413591746; 8690; 8550; 652; 641; 187071; 188193; 67353; 67753; 16065; 16077; 2414; 2472; 0
hmr; 1694430; 37.4742538788855; 7900; 7853; 437; 467; 94543; 95109; 56139; 56577; 11775; 11770; 1953; 1865; 0
hth; 1743135; 44.0002638923549; 5049; 4910; 755; 757; 82142; 80624; 76333; 75300; 9204; 9097; 2386; 2477; 0
ial; 3658997; 33.9331242960844; 16086; 15710; 152; 182; 258926; 259364; 95175; 95611; 27336; 26860; 1268; 1295; 0
lfc; 2559538; 50.0475476433638; 7191; 7295; 2290; 2162; 109904; 110996; 135762; 134514; 10887; 11031; 6806; 6747; 0
mah; 4668296; 48.7459235661149; 11446; 11414; 1100; 1177; 234179; 234043; 209652; 212104; 18801; 18737; 5220; 5463; 0
mcu; 2146480; 55.4132812791174; 2251; 2171; 1942; 1833; 83793; 84090; 116972; 114286; 6080; 6320; 6318; 6468; 0
nis; 1877931; 39.6886254074298; 10895; 10719; 356; 345; 88490; 88367; 60256; 59148; 13902; 14266; 1770; 1716; 0
nse; 859006; 41.0843463258697; 2891; 2722; 187; 182; 46113; 46003; 28403; 27971; 4597; 4377; 808; 862; 0
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Contenu en GC des 111 génomes DRNA[modifier | modifier le wikicode]

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pmh;1738790;31.1450491433698;10643;10443;273;266;120591;119911;42641;42436;13543;12907;1153;1083;0
ppoy;5597590;45.5107644539882;11835;12067;1852;1923;278022;279031;228863;232494;22906;23777;7539;7524;0
pub;1308759;29.6830814534991;8928;9156;117;122;88435;89149;28952;29599;10984;11228;610;623;0
ret;4381608;61.2722087416309;2000;1981;1456;1181;138606;141047;281098;266494;6563;6988;6900;5754;0
rip;574390;28.4825641114922;5149;4608;48;34;37848;37072;11363;11314;5367;4930;177;157;0
roa;8376953;67.3730787311657;304;315;5894;6137;175073;173980;576424;582208;1793;1897;23638;24137;67
rpr;1111523;29.0002995889424;5688;5488;60;46;75353;75109;20531;21121;9101;8657;374;348;0
rru;4352825;65.4479562123449;2105;2167;6143;6144;117691;117954;314819;315531;6056;6234;15234;15224;0
saci;9629675;62.2660577849201;4027;3918;12522;12591;311082;308165;613507;617296;10530;10237;32126;32651;0
salb;6841649;73.3211578544263;163;150;11612;11254;92662;94200;578179;575278;712;723;34189;33576;29
say;3551206;56.7620971579796;4756;4898;4114;3728;136493;138062;224664;220982;9802;10117;11598;11257;0
sbn;5347283;46.2833180888313;10050;9904;963;1056;279165;278792;207232;209063;19982;19825;5955;6005;0
sbw;708439;25.0696249077196;7139;7400;42;62;46706;46970;11878;12110;6380;6319;185;196;0
sbz;4683551;51.3411511906244;9188;9107;1746;1661;197243;195799;225810;225551;16324;15916;6701;6366;0
sep;2499279;32.0951762488302;10030;9072;256;186;173063;168449;55041;52457;17327;16269;1229;1044;0
sgr;8545929;72.2274079272131;197;198;13111;12803;125513;127411;691994;689222;1042;1153;40312;40010;0
sho;9840102;72.0397308889684;248;219;12043;12293;144995;146783;806253;806814;1023;1058;38926;38906;0
sma;9025608;70.716554496938;288;338;10689;10658;147271;148799;697969;694405;1497;1590;33943;34035;0
smf;1662578;26.3145548659973;10208;9579;113;145;115699;115699;31659;31086;14104;13858;672;721;0
smk;3820344;62.6668959653895;1275;1380;1438;1375;115653;117560;245820;242728;4939;4981;7019;6690;0
spi;1937111;38.3159251070279;7601;7936;274;296;114902;115665;59188;61681;11590;12071;1546;1675;0
spl;1796846;39.0916639489416;5598;5780;245;286;107498;109043;58113;58617;9461;9754;1430;1421;0
ssdc;459399;24.2405838933041;3920;4009;63;77;33018;32667;7856;8453;4306;4304;181;198;0
ssm;4653970;48.9651415887941;10632;10712;3064;2968;210582;212163;226905;226997;18487;18929;10861;10930;0
sty;4809037;52.0927162756286;9036;9129;1610;1679;198401;197326;233040;235497;16417;16153;6741;6819;0
sus;9965640;61.9024568417081;3706;3782;5063;4566;321828;322056;637709;633071;12614;12567;22278;21823;0
synd;2572069;59.0852733733037;1561;1578;2408;2369;89219;90093;155100;155007;3505;3630;7274;7056;0
synd;2572069;59.0852733733037;1561;1578;2408;2369;89219;90093;155100;155007;3505;3630;7274;7056;0
tai;1848474;63.7925661924377;375;339;8098;7114;48029;46765;142542;137838;1116;1095;12183;11501;0
tde;2843201;37.8737556718642;18098;17974;618;525;158790;159051;100982;98334;22582;22554;3102;3017;0
thl;2562720;36.0410813510645;13045;13182;374;404;157992;157174;69264;71676;18613;18707;1751;1852;0
tli;1967774;47.0576397492801;4485;4562;1240;1499;93405;94061;93059;98130;9109;8749;4439;4876;0
tma;1860725;46.2477260207715;4488;4659;538;709;89126;90023;74178;78612;8868;8979;2144;2517;0
tme;1915238;31.3998573545429;13238;12800;490;431;123522;121538;50996;49107;17789;17210;1638;1550;0
tos;2072393;68.5534548707702;717;721;11907;12188;48268;48509;171568;172114;2802;2818;17743;17863;0
tpas;1139203;52.7868167482003;2304;2372;998;992;43195;42394;46858;47673;3742;3707;2611;2803;0
tsu;2731853;39.1632346249963;16370;17375;212;175;160078;161558;84833;85814;21396;22170;1279;1393;0
uur;751719;25.4996880483266;5422;5640;38;46;58304;58095;10982;11668;7387;7301;189;215;0
vin;4350553;68.9392589861565;388;361;3617;3620;88266;86551;320517;318241;1260;1271;14450;14284;0
vpr;2132142;38.6292751608476;4705;4780;338;382;124745;125694;66818;68509;10180;9955;1718;1923;0
xcb;5148708;64.9570338811212;1531;1476;1367;1328;137185;137234;344611;341465;3622;3618;7930;7928;0
ype;4653728;47.6361102324846;8789;8951;2595;2930;224229;225184;201213;204623;16816;16685;7641;8107;0
zin;208564;13.5401332099375;3112;3050;7;10;14475;14621;2251;2077;2574;2718;13;28;21

Tableau des diagrammes des codons DRNA[modifier | modifier le wikicode]

  1. récupération des contenus en GC (%GC) des résultats du chapitre précédent.
  2. Création de la colonne %AT (100-%GC)
  3. Somme de tous les codons (codons stops compris) d'une bactérie donnée, colonne aas. La colonne Trp isole les tga donnant du Trp, des tga donnant des stops.
  4. Moyenne des aas par bactérie: 6 550 aas par bactérie, avec un écart type de 304.
  5. Recalcul du codon: 6550*codon/aas.
  • Le tableau est suivi de la moyenne des codons.
6,549.649;304.215;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
aas;KEGG;%AT;%GC;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;Trp
5,710;zin;86.461;13.539;564.348;9.176;8.029;10.323;0.000;0.000;1241.107;21.794;451.937;9.176;145.675;98.646;57.352;1.147;2.294;3.441;378.526;13.765;844.228;19.500;123.881;0.000;4.588;0.000;0.000;0.000;58.499;2.294;94.058;3.441;79.146;127.322;2.294;8.029;196.145;0.000;145.675;2.294;43.588;45.882;2.294;1.147;55.058;3.441;75.705;3.441;60.794;76.852;0.000;4.588;74.558;58.499;1.147;0.000;97.499;75.705;1.147;0.000;427.849;640.053;5.735;6.882;0.000;0.000;59.647
5,760;crp;83.436;16.564;532.159;54.580;37.524;39.798;2.274;1.137;934.689;44.347;575.368;23.879;163.741;130.766;84.145;13.645;3.411;12.508;345.676;53.443;654.965;77.322;114.846;4.548;7.960;1.137;0.000;0.000;63.677;18.193;100.064;3.411;139.862;68.226;4.548;5.685;211.499;6.823;177.386;13.645;40.935;40.935;6.823;2.274;90.967;12.508;70.500;50.032;63.677;42.072;4.548;2.274;130.766;73.911;5.685;0.000;97.790;83.008;5.685;5.685;545.804;417.313;22.742;4.548;0.000;2.274;0.000
5,864;hcr;77.470;22.530;416.613;32.391;156.370;22.339;0.000;4.468;729.352;53.612;295.985;25.689;135.148;165.305;41.326;6.702;13.403;10.052;284.816;21.222;516.019;27.923;146.317;23.455;42.443;1.117;5.585;2.234;84.886;6.702;224.502;10.052;172.006;113.926;8.935;14.520;413.262;29.040;368.585;8.935;142.966;94.939;10.052;7.818;24.572;1.117;97.172;1.117;84.886;102.757;6.702;1.117;147.434;100.523;3.351;3.351;65.899;160.837;2.234;6.702;553.995;147.434;65.899;4.468;2.234;0.000;74.834
6,157;mcac;76.337;23.663;502.101;40.423;38.296;51.061;0.000;0.000;578.692;42.551;260.624;15.957;101.058;151.056;113.824;1.064;0.000;11.701;264.879;19.148;423.382;71.273;155.311;4.255;57.444;2.128;4.255;0.000;71.273;21.275;268.071;4.255;163.821;143.609;5.319;8.510;421.254;21.275;406.361;38.296;92.548;195.734;3.191;11.701;30.849;4.255;125.525;2.128;120.206;67.018;3.191;0.000;291.474;91.484;10.638;3.191;228.711;88.293;1.064;7.446;525.504;67.018;25.531;3.191;3.191;0.000;62.763
6,041;ssdc;75.759;24.241;503.069;40.115;65.052;16.263;1.084;3.253;538.847;66.136;278.639;13.010;182.146;112.757;54.210;13.010;11.926;11.926;250.450;10.842;400.070;19.516;102.999;36.863;164.798;9.758;11.926;2.168;119.262;4.337;182.146;20.600;136.609;192.987;18.431;32.526;329.597;57.463;324.176;16.263;114.925;140.946;40.115;21.684;68.305;9.758;147.451;65.052;133.357;86.736;18.431;5.421;181.061;126.851;16.263;9.758;148.535;107.336;11.926;23.852;470.543;215.756;23.852;6.505;0.000;0.000;0.000
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6,465;amd;28.707;71.293;0.000;11.144;7.092;1.013;399.159;190.462;3.039;252.260;1.013;214.776;3.039;3.039;2.026;157.029;87.126;40.524;5.065;187.422;1.013;183.370;0.000;5.065;30.393;0.000;281.640;175.265;1.013;146.899;0.000;214.776;9.118;62.812;379.910;83.074;94.218;387.002;18.236;445.761;13.170;13.170;341.412;308.993;3.039;33.432;128.663;92.191;2.026;0.000;269.483;64.838;7.092;2.026;178.304;355.596;8.105;1.013;148.925;211.737;3.039;0.000;272.522;0.000;1.013;5.065;0.000
6,559;sho;27.960;72.040;0.000;4.993;10.984;0.000;385.450;186.733;0.000;294.579;3.994;222.682;0.000;0.999;0.000;97.860;151.783;44.936;1.997;182.739;0.999;182.739;0.000;4.993;66.904;4.993;275.606;103.852;0.000;136.805;2.996;211.698;6.990;90.870;393.438;25.963;18.973;509.273;3.994;434.380;7.989;13.980;245.649;393.438;2.996;38.944;151.783;96.862;0.000;0.999;220.685;106.847;6.990;0.999;170.756;330.528;6.990;2.996;101.855;275.606;1.997;0.000;299.572;2.996;0.999;1.997;0.000
6,561;sgr;27.773;72.227;0.000;1.997;6.988;0.000;368.362;209.637;0.998;301.478;1.997;226.607;1.997;0.998;1.997;113.803;145.747;33.941;4.991;171.702;5.990;189.671;0.998;4.991;63.889;6.988;265.540;108.811;1.997;133.768;0.998;212.631;13.976;80.860;364.369;53.907;27.952;483.163;8.984;438.240;5.990;11.979;266.538;362.372;2.995;38.933;156.728;95.834;0.000;1.997;208.638;118.794;6.988;4.991;155.730;367.363;1.997;2.995;133.768;252.562;3.993;0.998;280.514;0.000;1.997;3.993;0.000
6,452;cmi;27.336;72.664;0.000;5.076;1.015;1.015;239.572;386.766;0.000;247.693;0.000;215.209;0.000;0.000;0.000;116.740;112.680;107.604;0.000;149.225;2.030;154.300;1.015;4.061;20.303;8.121;405.039;89.332;2.030;122.831;1.015;228.405;20.303;34.515;390.827;77.150;4.061;490.310;10.151;473.053;12.182;13.197;316.722;301.495;0.000;25.378;131.968;93.392;1.015;6.091;171.558;148.210;0.000;2.030;188.815;323.828;4.061;2.030;181.709;187.800;0.000;1.015;309.616;1.015;1.015;4.061;0.000
6,571;salb;26.679;73.321;0.000;1.994;3.987;0.000;353.846;240.217;0.000;287.064;0.997;227.259;0.997;0.000;0.997;115.623;143.532;38.873;0.000;179.415;1.994;185.396;0.000;4.984;49.838;1.994;287.064;120.607;2.990;131.571;0.997;216.295;6.977;82.730;383.749;44.854;11.961;512.330;2.990;450.531;9.968;8.971;218.288;404.681;3.987;37.877;149.513;96.685;0.000;4.984;204.334;112.633;2.990;1.994;126.587;386.739;0.997;1.994;76.750;309.989;1.994;0.000;287.064;0.000;0.000;5.981;0.000
6,532;ksk;25.802;74.198;0.000;6.016;3.008;0.000;401.081;200.540;0.000;259.700;1.003;216.584;1.003;0.000;0.000;134.362;137.370;44.119;0.000;188.508;1.003;180.486;0.000;1.003;25.068;5.014;324.875;117.316;1.003;135.365;1.003;206.557;4.011;47.127;428.154;27.073;19.051;492.327;2.005;436.175;2.005;3.008;199.538;470.267;4.011;40.108;147.397;100.270;2.005;1.003;244.659;98.265;2.005;0.000;156.421;371.000;1.003;1.003;40.108;328.886;2.005;0.000;280.757;0.000;1.003;5.014;0.000
6,733;ade;25.095;74.905;0.000;1.946;2.918;0.000;295.722;305.449;3.891;361.870;0.000;219.846;0.000;0.000;0.000;129.378;84.631;54.475;0.973;166.343;1.946;168.289;0.973;0.000;3.891;2.918;366.734;135.215;0.000;135.215;0.000;192.608;3.891;5.837;421.209;86.576;2.918;536.968;12.646;385.216;0.973;2.918;373.543;313.231;0.973;49.611;131.324;75.876;0.973;3.891;269.457;77.821;0.973;0.000;338.523;204.281;0.000;0.000;97.277;184.826;0.973;0.973;324.905;0.000;1.946;3.891;0.000

Moyenne des codons
6549,65;;;;120,01;80,61;96,78;29,62;180,40;103,96;247,04;202,47;122,76;124,84;68,57;50,17;38,30;58,22;65,81;54,74;115,69;106,81;133,07;128,41;59,74;20,47;102,54;24,49;131,82;44,14;58,93;69,55;88,56;131,88;88,32;142,22;168,89;53,68;295,60;225,80;216,76;201,79;91,42;108,46;125,83;163,86;26,61;31,02;154,26;71,35;58,46;64,69;101,38;61,39;131,76;83,70;137,27;117,91;68,42;65,02;70,68;121,08;168,45;83,68;181,22;3,31;1,05;1,66;2,27
304,22;;;;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;Trp

Maximum et 75% DRNA[modifier | modifier le wikicode]

  • Le nombre de codons est calculé d'après les équations des courbes de tendance pour caractériser chaque codon par un maximum de la courbe et, s'il n'existe pas (équation du second degré sans solution), par la valeur à 75% GC ou AT.

constantes des courbes DRNA[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: constantes des courbes DRNA
  • Ces constantes sont relevées à la main parce que le format de l'équation dans Libreoffice/calc est une image. Ces équations sont représentées dans les diagrammes.
codon;diagram;x3;x2;x;codon;diagram;x3;x2;x;codon;diagram;x3;x2;x;codon;diagram;x3;x2;x
ttt;%AT;0.00057;0.01185;-0.2492;tct;%AT;-0.00091;0.13691;-3.32039;tat;%AT;0.00031;0.02553;-0.17738;tgt;%AT;-0.0002;0.02954;-0.63061
ttc;%GC;-0.00075;0.11012;-0.95591;tcc;%GC;-0.0013;0.15161;-2.72647;tac;%GC;-0.0006;0.07371;0.14637;tgc;%GC;-0.00067;0.07391;-1.24162
tta;%AT;0.00219;-0.10807;0.97089;tca;%AT;-0.0003;0.06661;-1.92933;taa;%AT;-2E-05;0.00228;0.00351;tga;%GC;2E-05;-0.00178;0.05762
ttg;%AT;-0.00254;0.27112;-5.14699;tcg;%GC;-0.0002;0.0518;-0.92575;tag;%GC;2E-05;-0.00278;0.10348;tgg;%GC;0.00026;-0.04454;3.06654
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
ctt;%AT;-0.00329;0.37605;-8.20089;cct;%AT;-0.00155;0.19004;-4.23067;cat;%AT;-0.00083;0.10415;-1.92709;cgt;%AT;-0.00184;0.16536;-1.10015
ctc;%GC;0.00016;0.0552;-1.18671;ccc;%GC;-0.00069;0.10805;-2.35507;cac;%GC;-0.0002;0.0378;0.09835;cgc;%GC;-0.00054;0.15436;-3.75165
cta;%AT;-0.00085;0.10907;-2.69606;cca;%AT;-0.00132;0.17482;-4.27036;caa;%AT;-0.00151;0.21511;-5.32276;cga;%AT;-0.0005;0.05334;-0.93631
ctg;%GC;-0.00462;0.5886;-13.46935;ccg;%GC;-0.00138;0.19524;-4.04617;cag;%GC;-0.00244;0.28701;-5.10584;cgg;%GC;0.00017;0.01656;-0.45048
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
att;%AT;-0.0001;0.10638;-2.33135;act;%AT;-0.00112;0.16189;-4.01772;aat;%AT;0.00332;-0.25026;5.41105;agt;%AT;-0.0005;0.07383;-1.84844
atc;%GC;-0.0022;0.26792;-3.7806;acc;%GC;-0.0020;0.26011;-5.36981;aac;%GC;-0.00109;0.1053;0.39031;agc;%GC;-0.0010;0.09531;-1.05602
ata;%AT;0.00209;-0.15088;3.01712;aca;%AT;-0.00135;0.18781;-4.77689;aaa;%AT;0.0020;-0.05462;0.91141;aga;%AT;-0.00057;0.11578;-3.47503
atg;%GC;0.00015;-0.0808;7.01628;acg;%GC;-0.00108;0.12467;-1.87083;aag;%GC;-0.00081;0.09348;1.73297;agg;%AT;-0.00073;0.07548;-1.29967
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
gtt;%AT;-0.00322;0.3937;-8.77864;gct;%AT;-0.0029;0.34298;-7.43331;gat;%AT;-0.00373;0.45452;-8.84242;ggt;%AT;-0.00189;0.19221;-1.70625
gtc;%GC;0.00051;0.02474;-0.34814;gcc;%GC;-0.00112;0.22101;-4.8768;gac;%GC;-0.00054;0.14156;-1.61835;ggc;%GC;-0.00077;0.18284;-3.7931
gta;%AT;-0.00225;0.28412;-6.81826;gca;%AT;-0.00215;0.25617;-5.40349;gaa;%AT;-0.0050;0.57426;-9.84916;gga;%AT;-0.00133;0.1823;-4.09334
gtg;%GC;-0.00267;0.3257;-6.34715;gcg;%GC;-0.00083;0.15096;-2.8306;gag;%GC;0.00137;-0.06858;4.28255;ggg;%GC;-0.00055;0.053;-0.04165

abscisse du maximum DRNA[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: abscisse du maximum DRNA
  • C'est la solution qui annule la dérivée de l'équation de degré 3. C'est une équation du second degré qui quelque fois n'a pas de solution. Mais quand il y en a 1 ou 2 solutions, une seule est valable et doit être supérieure à 50 et inférieur à 100 %GC ou %AT. J'ai éliminé les abscisses supérieures à 90% pour tenir compte des valeurs extrêmes trouvées chez les bactéries étudiées.
  • La fonction dans calc est: "=(-2*P345-RACINE(((2*P345)^2)-12*O345*Q345))/(6*O345)" où P345 désigne la cellule de la 2ème constante, O345 la 1ère et Q345 la 3ème.
codon;diagram;;abscis;75%;codon;diagram;;abscis;75%;codon;diagram;;abscis;75%;codon;diagram;;abscis;75%
ttt;%AT;;;75;tct;%AT;;86.189;75;tat;%AT;;;75;tgt;%AT;;;75
ttc;%GC;;;75;tcc;%GC;;67.372;75;tac;%GC;;82.881;75;tgc;%GC;;63.871;75
tta;%AT;;;75;tca;%AT;;;75;taa;%AT;;76.762;75;tga;%GC;;;75
ttg;%AT;;59.880;75;tcg;%GC;;;75;tag;%GC;;;75;tgg;%GC;;;75
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
ctt;%AT;;63.015;75;cct;%AT;;68.445;75;cat;%AT;;73.062;75;cgt;%AT;;56.378;75
ctc;%GC;;;75;ccc;%GC;;;75;cac;%GC;;;75;cgc;%GC;;;75
cta;%AT;;70.561;75;cca;%AT;;73.651;75;caa;%AT;;80.347;75;cga;%AT;;60.864;75
ctg;%GC;;71.301;75;ccg;%GC;;82.468;75;cag;%GC;;68.189;75;cgg;%GC;;;75
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
att;%AT;;;75;act;%AT;;81.733;75;aat;%AT;;;75;agt;%AT;;;75
atc;%GC;;73.382;75;acc;%GC;;77.007;75;aac;%GC;;66.218;75;agc;%GC;;60.789;75
ata;%AT;;;75;aca;%AT;;77.533;75;aaa;%AT;;;75;aga;%AT;;;75
atg;%GC;;50.527;75;acg;%GC;;68.531;75;aag;%GC;;85.299;75;agg;%AT;;58.847;75
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
gtt;%AT;;68.183;75;gct;%AT;;65.876;75;gat;%AT;;69.938;75;ggt;%AT;;63.024;75
gtc;%GC;;;75;gcc;%GC;;;75;gac;%GC;;;75;ggc;%GC;;;75
gta;%AT;;69.689;75;gca;%AT;;66.912;75;gaa;%AT;;67.042;75;gga;%AT;;78.272;75
gtg;%GC;;70.013;75;gcg;%GC;;;75;gag;%GC;;;75;ggg;%GC;;63.847;75

maximum DRNA[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: maximum DRNA
  • Il est calculé avec l'équation du diagramme: "=P387*(O345*P387^2+P345*P387+Q345)" voir abscisse ci-dessus et P387 étant la cellule de l'abscisse (%AT ou %GC)
codon;diagram;abscis;max;75%;;diagram;abscis;max;75%;;diagram;abscis;max;75%;;diagram;abscis;max;75%
ttt;%AT;;;288;tct;%AT;86;148;137;tat;%AT;;;261;tgt;%AT;;;51
ttc;%GC;;;231;tcc;%GC;67;107;100;tac;%GC;83;177;172;tgc;%GC;64;48;40
tta;%AT;;;389;tca;%AT;;;120;taa;%AT;77;5;5;tga;%GC;;;3
ttg;%AT;60;119;67;tcg;%GC;;;138;tag;%GC;;;1;tgg;%GC;;;89
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
ctt;%AT;63;153;112;cct;%AT;68;104;98;cat;%AT;73;91;91;cgt;%AT;56;134;71
ctc;%GC;;;289;ccc;%GC;;;140;cac;%GC;;;131;cgc;%GC;;;359
cta;%AT;71;54;53;cca;%AT;74;106;106;caa;%AT;80;178;174;cga;%AT;61;28;19
ctg;%GC;71;357;351;ccg;%GC;82;220;213;cag;%GC;68;213;202;cgg;%GC;;;131
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
att;%AT;;;369;act;%AT;82;142;137;aat;%AT;;;399;agt;%AT;;;78
atc;%GC;73;296;295;acc;%GC;77;238;238;aac;%GC;66;171;162;agc;%GC;61;75;56
ata;%AT;;;259;aca;%AT;78;129;129;aaa;%AT;;;622;aga;%AT;;;150
atg;%GC;51;168;135;acg;%GC;69;110;105;aag;%GC;85;325;314;agg;%AT;59;36;19
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
gtt;%AT;68;211;198;gct;%AT;66;170;148;gat;%AT;70;329;320;ggt;%AT;63;183;156
gtc;%GC;;;328;gcc;%GC;;;405;gac;%GC;;;447;ggc;%GC;;;419
gta;%AT;70;143;138;gca;%AT;67;141;129;gaa;%AT;67;420;391;gga;%AT;78;159;157
gtg;%GC;70;236;230;gcg;%GC;;;287;gag;%GC;;;513;ggg;%GC;64;70;63

Caractérisation des codons par les courbes et les coefficients de corrélation[modifier | modifier le wikicode]

Les queues. À partir du tableau original normé des 111 bactéries[modifier | modifier le wikicode]

  1. queue: nombre de bactéries ayant des effectifs faibles de leur codon (en rouge)
  2. moyenne queue: total des effectifs faibles divisé par le nombre de la queue
  3. moyenne codon: total du codon divisé par 111.
  4. %queue: total effectifs faibles de la queue divisé par (moyenne codon x 111) en %.
  • Tableau non formaté à mettre !!!!!!!!
  • Les queues au complet à copier dans un tableur avec une largeur de colonne de 1,3 cm.
moyenne queue;;;;1,7;3,7;3,6;3,0;3,8;3,1;1,1;-;2,1;-;2,8;1,5;1,9;5,6;4,8;-;3,2;-;2,9;-;1,8;-;-;4,1;6,6;3,6;1,3;-;2,2;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;2,1;-;-;;1,9;2,7;-;-;1,5;2,7;-;1,6;3,1;2,0;2,5;-;1,9;7,7;-;-;-;-;-
moyenne codon;;;;120;81;97;30;180;104;247;202;123;125;69;50;38;58;66;55;116;107;133;128;60;20;103;24;132;44;59;70;89;132;88;142;169;54;296;226;217;202;91;108;126;164;27;31;154;71;58;65;101;61;132;84;137;118;68;65;71;121;168;84;181;3;1;2;2
codon;;;;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;Trp
queue;;;;35;6;5;20;12;12;8;0;12;0;19;19;16;4;4;1;11;0;15;0;31;2;1;10;19;20;10;1;12;2;0;0;1;0;1;2;0;1;2;2;1;2;19;0;0;*;19;8;1;0;4;13;1;4;14;18;4;1;9;31;0;-;-;-;-
%queue;;;;0,4;0,2;0,2;1,8;0,2;0,3;0,0;-;0,2;-;0,7;0,5;0,7;0,3;0,3;-;0,3;-;0,3;-;0,8;-;-;1,5;0,9;1,5;0,2;-;0,3;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;1,3;-;-;;0,6;0,3;-;-;0,0;0,4;-;0,0;0,6;0,6;0,1;-;0,1;2,6;-;-;-;-;-

Les queues. Les courbes à partir des équations de tendance[modifier | modifier le wikicode]

;;;x3;0,00219;-0,00254;-0,00329;-0,00085;-0,00462;0,00016;0,0020;-0,00081;0,00057;-0,00075;-0,00091;-0,0003;-0,0005;-0,0002;-0,0013;-0,0010;0,00031;-0,0006;0,00332;-0,00109;-0,00057;-0,0005;-0,00184;-0,00073;-0,00054;0,00017;-0,00083;-0,0002;-0,00151;-0,00244;-0,00133;-0,00189;-0,00077;-0,00055;-0,0050;0,00137;-0,00373;-0,00054;-0,00215;-0,0029;-0,00083;-0,00112;-0,0002;-0,00067;0,00015;0,00026;-0,00132;-0,00155;-0,00138;-0,00069;-0,00322;-0,00225;-0,00267;0,00051;-0,00112;-0,00135;-0,00108;-0,0020;-0,0001;0,00209;-0,0022;-0,00002;0,00002;0,00002
;;;x2;-0,10807;0,27112;0,37605;0,10907;0,5886;0,0552;-0,05462;0,09348;0,01185;0,11012;0,13691;0,06661;0,07383;0,0518;0,15161;0,09531;0,02553;0,07371;-0,25026;0,1053;0,11578;0,05334;0,16536;0,07548;0,15436;0,01656;0,10415;0,0378;0,21511;0,28701;0,1823;0,19221;0,18284;0,053;0,57426;-0,06858;0,45452;0,14156;0,25617;0,34298;0,15096;0,22101;0,02954;0,07391;-0,0808;-0,04454;0,17482;0,19004;0,19524;0,10805;0,3937;0,28412;0,3257;0,02474;0,16189;0,18781;0,12467;0,26011;0,10638;-0,15088;0,26792;0,00228;-0,00278;-0,00178
;;;x;0,97089;-5,14699;-8,20089;-2,69606;-13,46935;-1,18671;0,91141;1,73297;-0,2492;-0,95591;-3,32039;-1,92933;-1,84844;-0,92575;-2,72647;-1,05602;-0,17738;0,14637;5,41105;0,39031;-3,47503;-0,93631;-1,10015;-1,29967;-3,75165;-0,45048;-1,92709;0,09835;-5,32276;-5,10584;-4,09334;-1,70625;-3,7931;-0,04165;-9,84916;4,28255;-8,84242;-1,61835;-5,40349;-7,43331;-2,8306;-4,8768;-0,63061;-1,24162;7,01628;3,06654;-4,27036;-4,23067;-4,04617;-2,35507;-8,77864;-6,81826;-6,34715;-0,34814;-4,01772;-4,77689;-1,87083;-5,36981;-2,33135;3,01712;-3,7806;0,00351;0,10348;0,05762
aas;KEGG;%AT;%GC;tta;ttg*;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg*;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga*
5 710;zin;86,46;13,54;691,56;-59,96;-24,35;32,86;-85,94;-5,55;989,03;38,59;435,45;5,38;148,22;163,08;88,32;-3,53;-12,35;0,82;375,88;14,00;742,88;21,88;196,65;-5,38;-48,24;-19,95;-23,84;-2,64;75,49;7,73;171,87;-22,57;149,24;67,76;-19,75;7,79;222,54;48,81;222,39;2,70;58,18;46,87;-12,71;-28,29;62,89;-4,93;80,55;34,00;84,48;53,03;-22,42;-13,79;102,88;80,16;-32,85;1,09;138,93;118,40;-5,16;-29,86;509,65;483,81;-7,53;4,42;0,94;0,50
5 760;crp;83,44;16,56;600,71;-17,37;22,67;40,63;-82,62;-3,78;880,72;50,67;392,78;10,97;147,50;151,71;86,75;-2,03;-9,47;4,34;342,99;19,92;637,67;30,41;184,98;2,79;-9,38;-7,00;-22,24;-2,15;82,16;11,04;176,32;-16,92;155,04;97,93;-16,16;11,35;283,37;58,35;259,85;9,58;83,68;83,03;-9,24;-25,23;60,09;-3,33;94,73;39,76;94,00;69,68;-19,72;-12,50;138,00;102,13;-27,90;3,34;141,24;124,75;-1,69;-26,44;470,54;415,33;0,89;4,55;1,04;0,56
5 864;hcr;77,47;22,53;444,84;47,46;91,92;50,53;-57,54;3,11;691,28;77,23;316,83;25,78;141,35;129,41;81,38;3,16;0,66;13,72;283,61;33,85;460,84;49,79;160,64;15,12;51,70;12,91;-12,35;0,20;89,87;18,99;176,58;2,75;158,61;142,64;-1,45;19,68;368,05;77,34;308,59;29,22;119,19;134,24;3,36;-10,50;54,04;1,88;118,78;49,45;104,65;92,13;-7,84;-6,10;185,63;130,84;-8,19;10,55;139,61;129,42;8,78;-11,25;397,39;299,94;25,66;4,66;1,15;0,62
6 157;mcac;76,34;23,66;418,55;57,11;101,81;51,66;-50,38;4,95;658,76;82,62;303,59;29,10;139,55;125,22;80,05;4,46;3,15;15,79;273,13;36,79;431,58;53,77;155,86;16,93;61,12;15,90;-9,50;0,87;90,59;20,69;175,48;7,56;158,21;149,07;2,42;21,40;379,24;81,09;314,38;33,82;123,89;141,18;6,55;-6,49;52,83;3,13;122,77;51,07;105,56;94,97;-4,71;-4,37;191,70;134,28;-3,18;12,37;138,46;129,24;11,23;-7,26;384,11;280,80;31,41;4,66;1,16;0,63
6 041;ssdc;75,76;24,24;405,54;61,71;106,48;52,16;-46,46;5,95;642,59;85,40;296,98;30,85;138,56;123,09;79,34;5,16;4,48;16,87;267,89;38,31;417,18;55,82;153,40;17,80;65,67;17,34;-7,93;1,23;90,87;21,59;174,79;10,13;157,89;152,11;4,52;22,30;384,39;83,03;316,94;36,26;126,06;144,41;8,27;-4,30;52,20;3,79;124,74;51,87;105,89;96,25;-3,01;-3,43;194,45;135,81;-0,49;13,36;137,79;129,03;12,52;-5,10;377,42;271,38;34,45;4,66;1,16;0,64
6 132;sbw;74,93;25,07;387,32;67,97;112,75;52,77;-40,56;7,46;619,86;89,43;287,66;33,43;137,05;120,04;78,29;6,21;6,45;18,46;260,47;40,54;397,08;58,80;149,87;18,97;71,90;19,29;-5,55;1,79;91,18;22,89;173,65;13,94;157,29;156,20;7,69;23,60;391,12;85,85;320,15;39,89;128,89;148,67;10,84;-1,00;51,29;4,77;127,48;52,98;106,23;97,90;-0,47;-2,00;198,01;137,74;3,53;14,86;136,71;128,59;14,44;-1,87;367,90;258,21;38,94;4,65;1,16;0,64
5 709;uur;74,50;25,50;378,07;71,06;115,81;53,04;-37,36;8,29;608,28;91,54;282,90;34,79;136,24;118,46;77,72;6,77;7,50;19,29;256,67;41,71;386,92;60,36;148,03;19,55;75,00;20,26;-4,25;2,10;91,29;23,59;172,99;15,97;156,91;158,19;9,40;24,28;394,32;87,33;321,61;41,83;130,24;150,71;12,22;0,78;50,82;5,29;128,86;53,55;106,34;98,67;0,89;-1,24;199,67;138,62;5,68;15,67;136,10;128,30;15,45;-0,13;363,00;251,56;41,33;4,65;1,16;0,64
6 361;ple;73,83;26,17;363,87;75,67;120,33;53,41;-32,18;9,62;590,44;94,87;275,54;36,97;134,91;115,99;76,82;7,68;9,19;20,62;250,79;43,57;371,37;62,82;145,13;20,41;79,67;21,71;-2,13;2,60;91,41;24,68;171,87;19,23;156,24;161,15;12,17;25,36;398,94;89,67;323,61;44,94;132,18;153,68;14,45;3,68;50,07;6,12;130,98;54,41;106,42;99,76;3,10;0,01;202,04;139,83;9,14;16,98;135,08;127,76;17,08;2,68;355,38;241,37;45,14;4,64;1,16;0,65
6 600;smf;73,69;26,31;360,94;76,60;121,24;53,47;-31,07;9,91;586,76;95,57;274,02;37,43;134,62;115,48;76,62;7,88;9,55;20,90;249,57;43,96;368,18;63,34;144,53;20,58;80,62;22,00;-1,68;2,71;91,42;24,92;171,62;19,92;156,08;161,74;12,76;25,58;399,84;90,17;323,99;45,60;132,56;154,27;14,92;4,30;49,91;6,30;131,41;54,59;106,43;99,97;3,58;0,27;202,50;140,06;9,88;17,26;134,85;127,63;17,42;3,28;353,80;239,27;45,95;4,64;1,16;0,65
6 345;fnc;72,88;27,12;344,42;81,73;126,16;53,80;-24,52;11,62;565,90;99,62;265,38;40,12;132,94;112,53;75,49;9,02;11,65;22,52;242,64;46,23;350,20;66,32;141,04;21,53;85,89;23,61;1,03;3,36;91,45;26,26;170,10;23,97;155,11;164,96;16,27;26,89;404,63;93,04;325,86;49,47;134,58;157,42;17,72;7,97;49,00;7,33;133,86;55,60;106,36;101,06;6,35;1,85;204,89;141,21;14,20;18,94;133,51;126,82;19,42;6,80;344,76;227,48;50,66;4,62;1,16;0,65
6 697;bfl;72,62;27,38;339,23;83,29;127,65;53,88;-22,36;12,18;559,32;100,92;262,66;41,00;132,38;111,59;75,12;9,40;12,33;23,04;240,45;46,96;344,57;67,28;139,92;21,82;87,51;24,11;1,93;3,57;91,44;26,70;169,58;25,30;154,77;165,93;17,42;27,31;406,02;93,98;326,36;50,74;135,17;158,34;18,64;9,18;48,71;7,66;134,62;55,91;106,30;101,37;7,27;2,36;205,57;141,52;15,62;19,49;133,05;126,53;20,08;7,96;341,89;223,78;52,20;4,62;1,16;0,65
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6 576;roa;32,63;67,37;-7,30;32,46;18,47;-1,38;351,26;219,54;42,44;293,36;24,28;206,09;5,80;-1,07;1,96;111,68;106,93;70,95;32,16;160,95;25,45;171,02;-9,93;8,87;76,23;12,59;282,76;96,81;19,17;113,85;2,88;212,59;14,31;83,30;338,91;69,57;116,99;396,21;65,79;368,39;21,72;21,86;240,70;332,12;5,31;46,94;151,82;83,94;0,92;10,43;191,59;120,77;20,84;1,84;234,38;244,81;2,35;-2,82;109,57;222,55;32,66;10,41;288,62;1,85;0,47;1,92
7 207;bmv;31,85;68,15;-7,95;29,03;13,98;-2,69;353,32;226,14;39,53;295,88;22,50;208,91;3,73;-2,28;0,84;114,28;106,86;70,00;30,27;162,40;25,74;170,75;-11,65;8,13;73,26;11,59;290,32;100,02;17,46;115,65;-0,10;212,73;11,59;79,57;346,97;69,23;107,95;406,97;58,93;376,25;18,30;17,48;245,51;339,61;4,71;46,59;150,37;84,42;-1,32;7,96;194,24;122,93;15,74;-1,64;235,17;252,60;0,07;-5,24;109,68;224,90;29,46;10,57;290,35;1,78;0,47;1,99
6 617;tos;31,45;68,55;-8,24;27,27;11,67;-3,36;354,22;229,61;38,09;297,16;21,61;210,36;2,68;-2,89;0,27;115,63;106,77;69,46;29,31;163,14;25,92;170,55;-12,51;7,75;71,71;11,07;294,27;101,71;16,58;116,59;-1,62;212,70;10,19;77,64;351,17;69,03;103,29;412,66;55,41;380,36;16,54;15,23;248,00;343,50;4,41;46,37;149,59;84,67;-2,46;6,69;195,57;124,04;13,13;-3,42;235,47;256,71;-1,08;-6,48;109,70;226,05;27,84;10,67;291,16;1,74;0,47;2,03
7 209;vin;31,06;68,94;-8,48;25,58;9,49;-3,99;354,98;232,96;36,74;298,35;20,77;211,73;1,68;-3,45;-0,27;116,93;106,65;68,91;28,41;163,82;26,12;170,32;-13,32;7,40;70,22;10,58;298,05;103,35;15,75;117,48;-3,05;212,61;8,88;75,80;355,19;68,81;98,87;418,17;52,08;384,29;14,88;13,11;250,37;347,21;4,12;46,15;148,83;84,91;-3,54;5,49;196,82;125,09;10,67;-5,09;235,70;260,68;-2,17;-7,64;109,68;227,11;26,32;10,78;291,88;1,71;0,47;2,07
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6 465;amd;28,71;71,29;-9,38;15,58;-3,35;-7,62;357,14;253,94;29,41;305,17;16,10;219,79;-4,02;-6,64;-3,34;124,91;105,14;64,90;23,28;167,66;27,64;168,16;-17,83;5,25;61,16;7,62;321,42;113,65;10,87;122,89;-11,25;210,61;1,26;64,71;379,88;67,12;72,69;453,18;32,49;408,45;5,13;0,65;264,72;369,80;2,46;44,36;143,88;86,45;-9,75;-1,51;203,82;131,26;-3,74;-14,82;235,58;285,73;-8,42;-14,29;108,93;232,63;17,67;11,72;295,03;1,51;0,49;2,31
6 559;sho;27,96;72,04;-9,47;12,52;-7,23;-8,69;356,92;260,80;27,37;307,15;14,76;222,23;-5,70;-7,55;-4,24;127,47;104,37;63,38;21,78;168,76;28,22;167,19;-19,11;4,59;58,29;6,71;328,93;117,05;9,40;124,59;-13,66;209,45;-1,01;61,25;387,76;66,43;64,70;464,80;26,56;416,18;2,19;-3,09;269,22;376,93;1,96;43,64;142,20;86,97;-11,58;-3,60;205,82;133,12;-8,05;-17,70;234,98;293,99;-10,26;-16,25;108,45;234,02;15,14;12,09;295,57;1,44;0,50;2,39
6 561;sgr;27,77;72,23;-9,48;11,76;-8,18;-8,96;356,80;262,54;26,88;307,63;14,43;222,83;-6,11;-7,77;-4,46;128,11;104,16;62,98;21,41;169,02;28,37;166,92;-19,42;4,43;57,58;6,49;330,82;117,91;9,03;125,01;-14,26;209,11;-1,56;60,38;389,74;66,24;62,72;467,76;25,10;418,13;1,46;-4,02;270,34;378,71;1,84;43,44;141,77;87,10;-12,03;-4,12;206,31;133,59;-9,12;-18,41;234,78;296,08;-10,71;-16,72;108,31;234,34;14,52;12,19;295,67;1,43;0,51;2,41
6 452;cmi;27,34;72,66;-9,48;10,01;-10,38;-9,56;356,39;266,62;25,77;308,73;13,69;224,23;-7,05;-8,28;-4,96;129,61;103,62;62,02;20,56;169,63;28,73;166,26;-20,12;4,05;55,91;5,96;335,24;119,93;8,19;126,00;-15,61;208,26;-2,84;58,38;394,36;65,80;58,15;474,71;21,73;422,67;-0,20;-6,14;272,95;382,87;1,57;42,97;140,75;87,41;-13,06;-5,30;207,40;134,65;-11,55;-20,03;234,26;301,01;-11,73;-17,82;107,96;235,05;13,11;12,42;295,85;1,39;0,51;2,46
6 571;salb;26,68;73,32;-9,43;7,42;-13,61;-10,44;355,48;272,81;24,18;310,33;12,61;226,29;-8,42;-9,00;-5,69;131,87;102,72;60,49;19,33;170,49;29,28;165,17;-21,13;3,49;53,41;5,19;341,91;123,01;6,96;127,49;-17,57;206,81;-4,71;55,40;401,32;65,08;51,41;485,34;16,77;429,51;-2,65;-9,26;276,85;389,10;1,16;42,21;139,19;87,88;-14,56;-7,04;208,98;136,22;-15,13;-22,40;233,30;308,51;-13,23;-19,40;107,35;235,99;11,05;12,79;295,96;1,34;0,53;2,54
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6 733;ade;25,09;74,91;-9,08;1,43;-20,98;-12,40;351,74;288,07;20,71;313,88;10,22;231,05;-11,49;-10,58;-7,32;137,35;100,06;56,40;16,53;172,37;30,66;162,06;-23,30;2,19;47,45;3,38;358,11;130,62;4,11;131,03;-21,97;202,42;-8,94;48,36;418,14;63,10;35,78;511,78;5,39;446,09;-8,25;-16,38;286,15;404,03;0,25;40,10;135,25;89,07;-17,93;-10,99;212,39;139,85;-23,25;-27,74;230,03;327,08;-16,57;-22,94;105,46;237,66;6,43;13,73;295,45;1,21;0,56;2,73

Les écarts. Moyenne des écarts, en %, par rapport à la courbe théorique. Les queues. Les moyennes des codons.[modifier | modifier le wikicode]

aas;KEGG;%AT;%GC;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga
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6 452;cmi;27,34;72,66;100,00;49,31;109,78;110,62;32,78;45,06;100,00;19,77;100,00;4,02;100,00;100,00;100,00;9,93;8,74;73,50;100,00;12,03;92,93;7,19;105,05;0,26;63,68;36,19;20,82;25,51;75,22;2,52;106,50;9,67;815,09;40,88;0,90;17,25;93,02;3,29;53,29;11,92;6073,05;314,85;16,04;21,25;100,00;40,94;6,24;6,85;107,77;214,85;17,28;10,07;100,00;110,13;19,40;7,58;134,61;111,40;68,31;20,10;100,00;91,83;4,65;27,03;97,45;64,94
6 571;salb;26,68;73,32;100,00;73,15;129,30;100,00;0,46;11,95;100,00;7,50;92,09;0,43;111,84;100,00;117,52;12,32;39,73;35,74;100,00;5,23;93,19;12,25;100,00;42,76;6,68;61,57;16,04;1,95;57,01;3,20;105,67;4,58;248,22;49,34;4,38;31,08;76,73;5,56;82,17;4,89;475,59;196,87;21,15;4,00;242,77;10,26;7,42;10,02;100,00;170,80;2,22;17,32;119,77;108,90;45,74;25,36;107,53;110,27;28,50;31,36;81,96;100,00;3,00;100,00;100,00;135,55
6 532;ksk;25,80;74,20;100,00;48,01;116,94;100,00;13,40;28,68;100,00;16,86;91,09;5,40;109,87;100,00;100,00;0,40;35,56;24,32;100,00;9,87;96,66;10,37;100,00;63,72;49,96;20,02;7,40;7,76;81,29;4,57;105,00;0,98;156,52;8,45;4,27;57,72;55,32;1,50;80,67;0,57;134,53;122,67;29,25;18,34;519,97;2,39;7,56;13,26;112,17;110,82;15,99;28,92;110,17;100,00;32,48;16,41;106,63;104,68;62,30;38,76;76,23;100,00;5,09;100,00;84,71;89,52
6 733;ade;25,09;74,91;100,00;35,68;113,91;100,00;15,93;6,03;81,21;15,29;100,00;4,85;100,00;100,00;100,00;5,81;15,42;3,41;94,11;3,50;93,65;3,84;104,17;100,00;91,80;13,71;2,41;3,52;100,00;3,20;100,00;4,85;143,54;87,93;0,73;37,21;91,84;4,92;134,73;13,65;111,78;117,82;30,54;22,47;290,41;23,71;2,90;14,81;105,42;135,42;26,87;44,35;104,18;100,00;47,17;37,54;100,00;100,00;7,76;22,23;84,88;92,91;9,97;100,00;248,20;42,30
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;Total sans queue;;;3601;4547;4752;4168;3618;4358;3137;2959;2870;2430;3384;3477;4121;4601;3941;4159;2198;2815;3320;2277;5082;7334;5664;9294;2616;5080;3004;2198;3482;2887;4296;3372;4690;4704;2954;3341;2599;2228;3166;3049;3721;2874;3400;3876;1145;1003;3633;3266;4154;6352;2858;4431;4163;3375;3649;3533;4014;3093;3104;6410;2827;4663;14289;11587
;bactéries sans queue;;;76;106;101;91;95;99;103;111;99;111;92;92;95;107;107;111;100;111;96;111;80;111;111;101;92;91;101;111;97;111;102;111;111;111;111;111;111;111;105;102;106;102;92;106;111;104;92;103;103;102;103;98;106;107;97;93;107;103;102;80;109;111;111;111
;écart (moyenne);;;47;43;47;46;38;44;30;27;29;22;37;38;43;43;37;37;22;25;35;21;64;66;51;92;28;56;30;20;36;26;42;30;42;42;27;30;23;20;30;30;35;28;37;37;10;10;39;32;40;62;28;45;39;32;38;38;38;30;30;80;26;42;129;104
;queue ;;;35;5;10;20;16;12;8;0;12;0;19;19;16;4;4;0;11;0;15;0;31;0;0;10;19;20;10;0;14;0;9;0;0;0;0;0;0;0;6;9;5;9;19;5;0;7;19;8;8;9;8;13;5;4;14;18;4;8;9;31;2;−;−;−
;Moyenne du codon;;;120;81;97;30;180;104;247;202;123;125;69;50;38;58;66;55;116;107;133;128;60;20;103;24;132;44;59;70;89;132;88;142;169;54;296;226;217;202;91;108;126;164;27;31;154;71;58;65;101;61;132;84;137;118;68;65;71;121;168;84;181;3;1;2
;codon;;;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga

Les coefficients de corrélation[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Les coefficients de corrélation
  • Les valeurs présentées ici sont les coefficients de corrélation X 100. La corrélation entre 2 codons est celle de 2 colonnes du tableau des diagrammes normalisé. Pour obtenir les valeurs absolues il suffit de copier ce tableau (largeur de colonne 1,3 cm) et de remplacer le moins (-) par rien. Pour extraire le maximum d'une colonne il suffit de remplacer 100 par rien (format sans décimales et option de recherche 'cellule entière').
  • Légende:
  1. moyenne : moyenne des corrélations en valeurs absolues d'un codon.
  2. >74 : nombre de corrélations en valeurs absolues d'un codon supérieures à 0.74.
  3. >79 : nombre de corrélations en valeurs absolues d'un codon supérieures à 0.79.
  4. max : corrélation maximum parmi les valeurs absolues des corrélations d'un codon.
;;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
;tta;100.00;8.50;12.70;53.92;-73.34;-64.25;84.42;-71.83;84.81;-82.42;70.92;81.48;77.95;-60.75;-72.21;-64.87;90.06;-79.22;90.98;-81.58;60.60;21.26;-8.03;-8.01;-69.89;-43.60;67.01;-79.76;81.31;-86.50;58.82;25.54;-74.15;-29.50;51.11;-69.35;66.34;-78.21;47.47;49.60;-65.94;-70.97;71.16;-69.97;-40.91;-61.98;62.30;57.64;-70.31;-55.36;55.80;57.45;-71.46;-64.69;74.79;66.81;-59.61;-76.32;84.97;62.14;-78.86;45.00;4.02;-46.08;tta
;ttg;8.50;100.00;31.08;26.41;-42.83;-39.91;10.81;-23.50;18.77;-29.16;33.49;18.62;25.67;-24.92;-21.06;-9.40;22.87;-27.03;8.91;-20.36;3.20;46.30;30.03;12.58;-38.74;-12.52;46.86;-33.08;46.06;-36.14;22.81;36.90;-40.92;8.93;31.61;-30.04;45.68;-38.49;36.03;52.10;-31.52;-33.19;27.72;-14.66;16.12;5.87;31.15;49.26;-29.40;-27.73;39.92;29.39;-18.52;-32.01;30.44;25.11;1.53;-34.16;25.09;-3.83;-23.18;17.68;7.80;-27.55;ttg
;ctt;12.70;31.08;100.00;41.18;-58.20;-39.48;34.68;-22.90;40.65;-48.70;44.12;41.56;40.48;-50.61;-29.01;-8.56;33.18;-30.01;19.26;-35.39;48.52;20.28;-0.61;37.13;-57.29;-40.44;44.98;-46.41;31.31;-41.46;62.02;25.01;-56.34;-11.43;57.65;-37.20;52.42;-51.90;63.50;54.25;-54.28;-52.41;33.52;-22.24;-2.54;-19.46;45.92;68.72;-53.03;-32.86;65.18;49.40;-46.82;-49.78;43.34;61.44;-35.34;-56.30;32.41;27.58;-49.31;22.39;12.50;-33.67;ctt
;cta;53.92;26.41;41.18;100.00;-66.25;-55.10;45.72;-41.12;52.05;-61.63;59.11;61.64;68.33;-55.70;-56.67;-39.06;53.50;-51.19;41.05;-49.94;58.10;25.77;4.49;19.67;-67.99;-43.71;54.42;-57.59;64.90;-66.63;56.23;43.13;-68.69;-16.03;55.48;-45.64;65.56;-64.23;61.00;63.55;-58.84;-64.66;60.10;-56.15;-13.09;-28.57;67.81;64.08;-65.46;-46.55;64.43;68.51;-57.43;-59.77;64.73;67.45;-46.21;-66.32;47.28;40.92;-61.82;36.77;9.23;-45.09;cta
;ctg;-73.34;-42.83;-58.20;-66.25;100.00;47.57;-67.84;49.34;-72.97;73.92;-69.56;-76.22;-76.16;55.71;68.47;56.70;-74.95;66.36;-69.12;73.49;-66.37;-38.30;10.90;-16.51;77.49;43.90;-70.05;75.62;-79.19;89.57;-75.88;-29.12;83.17;22.37;-59.29;59.34;-71.82;77.57;-64.30;-66.05;74.13;76.01;-67.06;62.39;34.55;44.29;-68.94;-77.43;79.31;50.39;-70.34;-64.56;74.83;61.84;-74.08;-79.19;42.92;87.67;-70.42;-54.75;75.05;-32.95;-18.71;44.95;ctg
;ctc;-64.25;-39.91;-39.48;-55.10;47.57;100.00;-68.68;74.24;-70.31;79.79;-71.27;-66.85;-65.93;72.37;56.13;39.42;-76.56;73.08;-61.75;58.26;-45.71;-17.71;-30.46;3.47;72.60;59.38;-74.63;78.58;-70.19;65.20;-49.26;-56.02;70.26;34.25;-70.54;78.28;-80.77;79.40;-67.48;-69.56;63.86;71.78;-62.37;51.87;-10.20;44.94;-65.51;-71.03;57.75;72.53;-72.74;-67.93;62.33;78.17;-72.21;-64.93;61.26;63.98;-72.09;-38.96;70.62;-59.42;9.63;58.89;ctc
;aaa;84.42;10.81;34.68;45.72;-67.84;-68.68;100.00;-78.31;92.94;-84.30;73.28;77.65;72.26;-69.84;-68.17;-52.17;91.32;-74.08;91.53;-71.47;67.42;13.88;-5.93;-0.35;-78.36;-58.06;61.16;-81.71;66.75;-81.54;63.55;30.92;-79.50;-38.10;60.36;-75.54;64.95;-83.56;54.67;45.76;-67.74;-78.57;72.70;-64.71;-39.08;-70.04;58.84;62.01;-69.57;-61.14;62.22;61.00;-74.90;-74.92;67.18;70.33;-64.20;-77.03;83.00;71.22;-76.28;49.30;-0.93;-49.08;aaa
;aag;-71.83;-23.50;-22.90;-41.12;49.34;74.24;-78.31;100.00;-72.63;79.66;-69.49;-67.97;-64.98;61.76;59.31;46.49;-76.72;76.67;-69.80;67.57;-40.21;-27.64;-31.22;24.12;64.91;44.26;-68.56;73.04;-73.86;67.95;-43.40;-46.48;67.80;22.02;-61.72;76.27;-68.38;73.13;-59.05;-54.10;48.76;70.39;-61.88;68.63;8.36;43.93;-61.47;-57.30;51.57;66.53;-60.27;-55.33;61.94;63.88;-66.99;-63.19;52.53;62.84;-77.44;-34.09;66.07;-52.09;10.79;47.70;aag
;ttt;84.81;18.77;40.65;52.05;-72.97;-70.31;92.94;-72.63;100.00;-90.20;76.79;78.92;76.90;-69.27;-67.58;-52.90;91.45;-75.52;90.54;-77.48;63.56;23.12;-7.50;7.92;-79.17;-51.66;68.16;-82.99;69.17;-81.60;64.94;26.96;-81.99;-27.80;55.43;-73.11;67.76;-86.59;56.82;50.11;-72.50;-77.37;80.18;-60.51;-39.95;-63.18;58.89;66.61;-75.74;-55.53;63.34;59.26;-72.05;-75.42;68.54;69.33;-62.60;-78.89;87.33;69.68;-82.53;44.09;4.37;-46.50;ttt
;ttc;-82.42;-29.16;-48.70;-61.63;73.92;79.79;-84.30;79.66;-90.20;100.00;-78.17;-79.39;-83.40;76.25;69.59;50.40;-88.73;81.67;-78.58;81.96;-64.59;-32.48;-5.89;-10.40;84.93;52.33;-79.27;86.64;-81.36;82.61;-67.74;-41.70;86.71;20.50;-70.65;78.31;-82.88;91.28;-72.99;-66.12;73.33;83.39;-79.25;67.35;23.36;55.41;-70.29;-78.50;77.80;61.70;-75.70;-71.71;72.15;81.59;-77.65;-76.46;63.77;81.31;-84.59;-59.62;88.54;-49.05;-5.97;54.12;ttc
;tct;70.92;33.49;44.12;59.11;-69.56;-71.27;73.28;-69.49;76.79;-78.17;100.00;69.54;63.92;-71.59;-56.34;-57.89;74.78;-70.41;68.61;-68.84;60.32;33.65;17.74;3.56;-77.94;-58.45;73.92;-77.53;70.18;-73.08;69.13;41.60;-81.74;-26.18;61.86;-71.51;74.91;-83.42;67.42;71.24;-67.17;-83.37;82.11;-59.58;-14.94;-39.61;69.53;82.34;-71.96;-66.25;73.01;67.36;-70.05;-74.46;78.77;69.21;-59.61;-78.55;75.33;49.46;-73.46;42.45;-1.78;-45.22;tct
;tca;81.48;18.62;41.56;61.64;-76.22;-66.85;77.65;-67.97;78.92;-79.39;69.54;100.00;74.84;-67.40;-74.27;-58.98;81.44;-73.08;78.67;-70.52;67.79;16.28;-1.13;0.20;-76.48;-53.00;66.42;-77.58;79.46;-83.35;66.94;37.79;-79.27;-37.13;63.82;-73.57;74.70;-79.02;65.37;57.82;-71.65;-76.23;62.36;-71.22;-28.47;-61.52;74.31;66.80;-73.91;-61.79;74.35;58.08;-74.94;-69.96;77.20;82.27;-61.26;-81.29;81.65;53.64;-78.08;46.48;7.90;-52.03;tca
;agt;77.95;25.67;40.48;68.33;-76.16;-65.93;72.26;-64.98;76.90;-83.40;63.92;74.84;100.00;-65.14;-69.72;-43.90;81.44;-74.24;72.80;-76.79;66.44;30.68;-4.80;4.97;-78.08;-47.64;70.93;-77.23;79.74;-81.66;65.76;38.03;-81.95;-22.41;60.88;-64.15;80.25;-82.51;64.92;62.73;-71.71;-74.60;71.85;-64.99;-29.29;-52.35;68.03;70.19;-74.55;-57.04;66.79;69.74;-67.69;-70.59;75.30;72.82;-54.87;-77.91;72.24;54.38;-76.98;36.78;10.18;-44.03;agt
;tcg;-60.75;-24.92;-50.61;-55.70;55.71;72.37;-69.84;61.76;-69.27;76.25;-71.59;-67.40;-65.14;100.00;41.66;30.53;-65.50;51.69;-57.52;55.84;-56.76;-13.72;-15.14;-17.17;80.13;51.96;-56.24;65.01;-62.70;64.93;-59.93;-47.76;79.07;16.10;-68.01;62.03;-69.87;76.56;-68.96;-67.32;73.13;74.75;-61.36;55.84;14.03;46.24;-72.12;-73.45;77.63;48.63;-75.13;-68.03;59.28;80.94;-72.96;-69.30;70.88;66.99;-66.41;-46.67;72.88;-53.93;-5.05;60.32;tcg
;tcc;-72.21;-21.06;-29.01;-56.67;68.47;56.13;-68.17;59.31;-67.58;69.59;-56.34;-74.27;-69.72;41.66;100.00;39.06;-74.35;64.91;-66.36;63.64;-55.63;-14.61;-1.93;15.84;55.40;49.88;-60.77;69.51;-71.58;74.57;-50.96;-33.04;63.95;35.93;-60.48;67.70;-66.48;71.38;-55.75;-51.64;49.89;65.93;-56.47;65.28;26.12;51.50;-59.98;-57.87;57.84;58.42;-57.04;-58.53;59.19;65.13;-68.15;-66.14;39.62;75.92;-67.16;-43.81;61.61;-44.89;4.66;43.96;tcc
;agc;-64.87;-9.40;-8.56;-39.06;56.70;39.42;-52.17;46.49;-52.90;50.40;-57.89;-58.98;-43.90;30.53;39.06;100.00;-59.33;55.16;-57.70;52.10;-43.73;-16.93;-5.34;11.08;51.79;29.35;-47.10;51.78;-55.62;61.70;-42.93;-27.74;53.84;26.05;-37.97;49.55;-48.29;52.85;-41.18;-39.72;37.15;55.80;-52.10;61.53;18.57;33.45;-53.50;-40.90;39.65;53.61;-48.97;-38.91;59.92;33.94;-53.61;-50.20;31.26;54.43;-58.25;-35.20;53.08;-21.11;-7.55;23.10;agc
;tat;90.06;22.87;33.18;53.50;-74.95;-76.56;91.32;-76.72;91.45;-88.73;74.78;81.44;81.44;-65.50;-74.35;-59.33;100.00;-88.25;92.05;-82.38;64.36;24.59;0.13;-3.76;-79.30;-56.15;78.31;-92.36;77.90;-86.11;65.32;33.75;-82.46;-32.72;63.13;-78.75;78.80;-90.21;59.64;55.52;-73.36;-78.74;75.55;-66.13;-25.94;-69.10;62.28;68.20;-70.74;-66.02;65.52;67.80;-76.77;-76.49;73.12;74.52;-61.19;-81.97;85.57;66.91;-79.38;48.72;3.89;-52.04;tat
;tac;-79.22;-27.03;-30.01;-51.19;66.36;73.08;-74.08;76.67;-75.52;81.67;-70.41;-73.08;-74.24;51.69;64.91;55.16;-88.25;100.00;-76.89;82.94;-52.30;-33.80;-10.82;13.67;67.25;46.31;-85.27;91.59;-76.88;75.66;-54.05;-34.04;69.69;24.20;-60.30;74.98;-82.59;84.38;-57.82;-57.82;60.52;68.27;-66.74;55.94;8.10;55.50;-57.70;-63.93;56.88;65.57;-63.01;-57.56;69.47;64.01;-68.52;-66.32;51.05;72.78;-76.69;-45.19;66.42;-47.62;2.15;50.63;tac
;aat;90.98;8.91;19.26;41.05;-69.12;-61.75;91.53;-69.80;90.54;-78.58;68.61;78.67;72.80;-57.52;-66.36;-57.70;92.05;-76.89;100.00;-80.05;59.10;14.72;-12.90;-6.36;-67.57;-47.79;62.04;-80.73;68.34;-80.73;56.06;20.16;-72.13;-34.63;43.46;-68.60;61.19;-78.16;44.08;39.58;-66.58;-68.47;68.60;-61.05;-46.46;-71.53;53.09;53.96;-66.29;-54.72;49.65;49.61;-69.13;-64.77;65.94;62.75;-60.07;-73.42;84.85;69.32;-74.43;40.84;2.06;-40.76;aat
;aac;-81.58;-20.36;-35.39;-49.94;73.49;58.26;-71.47;67.57;-77.48;81.96;-68.84;-70.52;-76.79;55.84;63.64;52.10;-82.38;82.94;-80.05;100.00;-60.91;-37.55;15.22;-2.99;64.29;30.08;-77.31;82.53;-72.88;78.50;-64.03;-9.37;71.99;0.53;-50.65;59.96;-71.01;79.87;-51.65;-49.86;63.65;63.25;-67.09;57.80;34.48;49.66;-53.68;-64.66;67.40;43.99;-53.66;-52.41;58.91;59.37;-66.27;-68.36;52.11;76.87;-74.20;-55.60;78.48;-31.64;-12.44;38.85;aac
;aga;60.60;3.20;48.52;58.10;-66.37;-45.71;67.42;-40.21;63.56;-64.59;60.32;67.79;66.44;-56.76;-55.63;-43.73;64.36;-52.30;59.10;-60.91;100.00;6.41;-44.58;33.39;-72.14;-49.43;45.83;-64.38;47.83;-68.64;82.93;11.71;-70.50;-29.55;58.74;-48.82;58.19;-66.61;52.11;38.52;-65.03;-64.93;61.54;-54.79;-38.96;-40.87;53.12;59.77;-66.22;-41.49;56.82;63.20;-61.64;-58.11;60.03;67.85;-57.48;-70.13;45.53;75.97;-72.28;17.60;16.12;-26.65;aga
;cga;21.26;46.30;20.28;25.77;-38.30;-17.71;13.88;-27.64;23.12;-32.48;33.65;16.28;30.68;-13.72;-14.61;-16.93;24.59;-33.80;14.72;-37.55;6.41;100.00;6.41;2.97;-32.76;-0.62;45.80;-28.09;42.30;-26.08;35.33;5.27;-37.78;22.29;18.66;-20.72;36.04;-35.08;25.06;32.56;-26.16;-28.95;29.43;-17.76;-2.40;0.99;20.52;35.55;-25.16;-14.85;23.38;17.43;-22.67;-15.74;20.25;24.24;-1.55;-29.63;33.84;-4.81;-21.26;-5.11;19.12;-7.50;cga
;cgt;-8.03;30.03;-0.61;4.49;10.90;-30.46;-5.93;-31.22;-7.50;-5.89;17.74;-1.13;-4.80;-15.14;-1.93;-5.34;0.13;-10.82;-12.90;15.22;-44.58;6.41;100.00;-38.68;-7.19;-26.95;24.02;-7.17;21.16;2.91;-26.43;69.88;-9.01;-15.11;23.91;-29.59;25.28;-10.68;31.72;41.62;5.51;-19.58;3.99;-13.39;55.16;6.29;29.61;16.74;6.19;-38.50;26.71;15.17;-5.65;-21.42;20.55;3.95;3.43;0.29;15.32;-43.75;11.08;41.63;-33.42;-27.98;cgt
;agg;-8.01;12.58;37.13;19.67;-16.51;3.47;-0.35;24.12;7.92;-10.40;3.56;0.20;4.97;-17.17;15.84;11.08;-3.76;13.67;-6.36;-2.99;33.39;2.97;-38.68;100.00;-32.02;-2.31;-0.37;-5.30;-7.98;-6.94;31.94;-11.95;-21.71;25.81;2.67;15.29;2.16;-8.68;7.64;-3.63;-22.43;-10.09;13.95;15.06;-19.05;6.22;-2.93;17.07;-26.09;24.25;12.16;16.77;1.96;-11.46;-4.65;8.63;-12.50;-13.58;-13.37;43.32;-29.40;-14.50;28.41;0.29;agg
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;cgg;-43.60;-12.52;-40.44;-43.71;43.90;59.38;-58.06;44.26;-51.66;52.33;-58.45;-53.00;-47.64;51.96;49.88;29.35;-56.15;46.31;-47.79;30.08;-49.43;-0.62;-26.95;-2.31;53.82;100.00;-49.18;59.88;-44.15;49.38;-48.61;-54.53;54.46;74.87;-64.21;65.97;-61.18;59.69;-65.90;-56.82;52.15;67.21;-50.23;42.08;-1.73;49.94;-57.78;-58.58;49.61;66.39;-63.01;-60.95;62.20;65.05;-59.75;-56.22;46.30;55.52;-50.66;-38.26;44.93;-44.30;8.88;44.10;cgg
;cat;67.01;46.86;44.98;54.42;-70.05;-74.63;61.16;-68.56;68.16;-79.27;73.92;66.42;70.93;-56.24;-60.77;-47.10;78.31;-85.27;62.04;-77.31;45.83;45.80;24.02;-0.37;-70.86;-49.18;100.00;-90.01;80.54;-73.90;55.76;41.89;-73.07;-18.06;67.53;-75.42;86.61;-84.81;68.60;66.47;-63.52;-71.81;66.47;-50.00;9.03;-42.37;62.43;74.12;-59.18;-64.89;68.59;63.83;-63.45;-67.84;69.07;69.70;-41.58;-76.71;72.96;34.08;-65.54;44.03;-1.48;-47.06;cat
;cac;-79.76;-33.08;-46.41;-57.59;75.62;78.58;-81.71;73.04;-82.99;86.64;-77.53;-77.58;-77.23;65.01;69.51;51.78;-92.36;91.59;-80.73;82.53;-64.38;-28.09;-7.17;-5.30;79.73;59.88;-90.01;100.00;-78.25;83.36;-66.00;-39.23;81.44;29.47;-71.33;81.04;-87.27;92.27;-68.22;-62.73;72.71;78.96;-72.92;58.48;10.17;60.69;-65.30;-74.22;69.46;66.96;-73.30;-68.42;74.23;78.11;-74.03;-75.89;56.15;84.34;-79.84;-58.23;76.09;-50.53;0.44;54.02;cac
;caa;81.31;46.06;31.31;64.90;-79.19;-70.19;66.75;-73.86;69.17;-81.36;70.18;79.46;79.74;-62.70;-71.58;-55.62;77.90;-76.88;68.34;-72.88;47.83;42.30;21.16;-7.98;-75.39;-44.15;80.54;-78.25;100.00;-88.14;55.83;50.04;-79.39;-24.17;67.90;-74.71;82.64;-80.34;66.25;72.32;-66.14;-75.59;61.87;-72.28;-12.79;-48.87;76.20;71.46;-70.76;-62.82;71.28;64.99;-69.50;-67.95;80.01;73.20;-48.23;-78.28;82.56;30.36;-70.89;50.94;6.23;-57.04;caa
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;gga;58.82;22.81;62.02;56.23;-75.88;-49.26;63.55;-43.40;64.94;-67.74;69.13;66.94;65.76;-59.93;-50.96;-42.93;65.32;-54.05;56.06;-64.03;82.93;35.33;-26.43;31.94;-76.81;-48.61;55.76;-66.00;55.83;-68.90;100.00;6.70;-80.36;-18.46;65.57;-55.28;63.26;-70.94;56.16;53.72;-71.58;-71.43;61.88;-48.34;-32.07;-35.45;52.35;73.25;-70.24;-41.06;65.26;65.50;-65.25;-62.11;63.44;73.25;-49.81;-76.62;56.74;62.49;-75.46;19.01;22.25;-32.21;gga
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;ggg;-29.50;8.93;-11.43;-16.03;22.37;34.25;-38.10;22.02;-27.80;20.50;-26.18;-37.13;-22.41;16.10;35.93;26.05;-32.72;24.20;-34.63;0.53;-29.55;22.29;-15.11;25.81;19.38;74.87;-18.06;29.47;-24.17;29.11;-18.46;-38.78;15.56;100.00;-33.34;45.02;-27.77;24.51;-33.91;-25.63;23.39;34.80;-19.34;30.14;1.28;36.73;-34.23;-21.52;15.16;57.11;-31.62;-29.08;49.52;26.67;-36.15;-30.21;24.20;25.20;-30.90;-19.77;13.89;-25.71;20.03;15.47;ggg
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;ccg;-70.31;-29.40;-53.03;-65.46;79.31;57.75;-69.57;51.57;-75.74;77.80;-71.96;-73.91;-74.55;77.63;57.84;39.65;-70.74;56.88;-66.29;67.40;-66.22;-25.16;6.19;-26.09;80.03;49.61;-59.18;69.46;-70.76;79.78;-70.24;-35.96;84.38;15.16;-62.00;58.96;-69.29;77.99;-65.50;-66.95;89.00;69.09;-69.11;57.65;28.61;49.67;-74.20;-80.14;100.00;30.87;-70.43;-67.06;63.93;75.01;-74.57;-73.44;67.40;74.34;-70.35;-58.16;80.15;-42.09;-15.48;53.96;ccg
;ccc;-55.36;-27.73;-32.86;-46.55;50.39;72.53;-61.14;66.53;-55.53;61.70;-66.25;-61.79;-57.04;48.63;58.42;53.61;-66.02;65.57;-54.72;43.99;-41.49;-14.85;-38.50;24.25;60.60;66.39;-64.89;66.96;-62.82;58.74;-41.06;-61.03;58.11;57.11;-61.11;72.02;-72.38;67.20;-68.89;-64.05;34.02;79.31;-54.48;59.65;-4.60;41.70;-69.36;-58.31;30.87;100.00;-67.99;-59.15;68.22;59.25;-68.64;-60.73;38.09;65.49;-61.79;-27.30;48.90;-47.90;18.99;39.69;ccc
;gtt;55.80;39.92;65.18;64.43;-70.34;-72.74;62.22;-60.27;63.34;-75.70;73.01;74.35;66.79;-75.13;-57.04;-48.97;65.52;-63.01;49.65;-53.66;56.82;23.38;26.71;12.16;-81.70;-63.01;68.59;-73.30;71.28;-70.13;65.26;61.51;-81.58;-31.62;80.74;-74.87;84.97;-79.79;83.47;83.99;-68.20;-83.65;59.74;-57.75;1.30;-44.64;81.01;81.31;-70.43;-67.99;100.00;66.76;-75.85;-76.75;82.11;76.15;-58.21;-75.89;69.71;33.33;-72.27;50.81;3.54;-57.77;gtt
;gta;57.45;29.39;49.40;68.51;-64.56;-67.93;61.00;-55.33;59.26;-71.71;67.36;58.08;69.74;-68.03;-58.53;-38.91;67.80;-57.56;49.61;-52.41;63.20;17.43;15.17;16.77;-77.07;-60.95;63.83;-68.42;64.99;-69.36;65.50;53.39;-77.83;-29.08;72.43;-59.47;75.01;-75.69;74.03;67.00;-67.21;-77.31;65.52;-56.89;-6.91;-34.29;66.68;75.97;-67.06;-59.15;66.76;100.00;-67.24;-77.58;71.75;75.97;-52.55;-73.58;53.52;51.52;-70.35;48.28;-0.42;-52.97;gta
;gtg;-71.46;-18.52;-46.82;-57.43;74.83;62.33;-74.90;61.94;-72.05;72.15;-70.05;-74.94;-67.69;59.28;59.19;59.92;-76.77;69.47;-69.13;58.91;-61.64;-22.67;-5.65;1.96;75.41;62.20;-63.45;74.23;-69.50;77.13;-65.25;-45.06;74.77;49.52;-62.79;68.16;-69.06;72.36;-63.87;-63.20;68.67;74.43;-62.63;64.64;17.10;49.61;-68.01;-67.03;63.93;68.22;-75.85;-67.24;100.00;52.55;-74.54;-73.72;57.96;71.06;-70.55;-50.28;64.94;-48.83;1.90;49.70;gtg
;gtc;-64.69;-32.01;-49.78;-59.77;61.84;78.17;-74.92;63.88;-75.42;81.59;-74.46;-69.96;-70.59;80.94;65.13;33.94;-76.49;64.01;-64.77;59.37;-58.11;-15.74;-21.42;-11.46;79.55;65.05;-67.84;78.11;-67.95;70.86;-62.11;-53.26;83.09;26.67;-76.05;75.88;-81.38;87.07;-76.82;-69.49;70.86;83.98;-68.65;52.56;10.80;56.42;-70.77;-77.25;75.01;59.25;-76.75;-77.58;52.55;100.00;-75.21;-72.30;61.78;78.40;-74.13;-50.94;76.69;-53.11;-1.53;59.54;gtc
;act;74.79;30.44;43.34;64.73;-74.08;-72.21;67.18;-66.99;68.54;-77.65;78.77;77.20;75.30;-72.96;-68.15;-53.61;73.12;-68.52;65.94;-66.27;60.03;20.25;20.55;-4.65;-76.41;-59.75;69.07;-74.03;80.01;-78.92;63.44;56.11;-80.16;-36.15;69.68;-72.82;80.96;-77.75;74.13;81.91;-70.03;-81.50;66.48;-67.04;-9.23;-43.51;83.27;77.31;-74.57;-68.64;82.11;71.75;-74.54;-75.21;100.00;69.02;-66.15;-78.58;75.15;41.00;-77.06;51.84;-3.65;-53.67;act
;aca;66.81;25.11;61.44;67.45;-79.19;-64.93;70.33;-63.19;69.33;-76.46;69.21;82.27;72.82;-69.30;-66.14;-50.20;74.52;-66.32;62.75;-68.36;67.85;24.24;3.95;8.63;-77.34;-56.22;69.70;-75.89;73.20;-81.18;73.25;39.71;-80.50;-30.21;75.34;-69.09;75.37;-79.13;76.62;65.58;-74.15;-77.86;63.51;-66.10;-21.49;-48.03;74.92;77.15;-73.44;-60.73;76.15;75.97;-73.72;-72.30;69.02;100.00;-54.79;-85.32;69.86;50.68;-76.19;42.81;8.96;-49.84;aca
;acg;-59.61;1.53;-35.34;-46.21;42.92;61.26;-64.20;52.53;-62.60;63.77;-59.61;-61.26;-54.87;70.88;39.62;31.26;-61.19;51.05;-60.07;52.11;-57.48;-1.55;3.43;-12.50;63.59;46.30;-41.58;56.15;-48.23;57.34;-49.81;-32.32;61.57;24.20;-47.10;48.41;-53.30;60.80;-48.15;-48.22;73.17;49.84;-56.12;44.04;17.12;44.44;-57.87;-55.32;67.40;38.09;-58.21;-52.55;57.96;61.78;-66.15;-54.79;100.00;41.94;-57.86;-51.11;63.07;-40.47;0.47;42.48;acg
;acc;-76.32;-34.16;-56.30;-66.32;87.67;63.98;-77.03;62.84;-78.89;81.31;-78.55;-81.29;-77.91;66.99;75.92;54.43;-81.97;72.78;-73.42;76.87;-70.13;-29.63;0.29;-13.58;81.08;55.52;-76.71;84.34;-78.28;86.38;-76.62;-34.08;85.62;25.20;-70.61;71.80;-80.23;87.34;-71.99;-67.92;66.58;89.03;-71.17;64.86;29.62;54.42;-72.27;-79.18;74.34;65.49;-75.89;-73.58;71.06;78.40;-78.58;-85.32;41.94;100.00;-76.99;-58.20;81.63;-41.96;-8.70;48.70;acc
;att;84.97;25.09;32.41;47.28;-70.42;-72.09;83.00;-77.44;87.33;-84.59;75.33;81.65;72.24;-66.41;-67.16;-58.25;85.57;-76.69;84.85;-74.20;45.53;33.84;15.32;-13.37;-72.85;-50.66;72.96;-79.84;82.56;-78.69;56.74;38.43;-78.79;-30.90;60.01;-79.09;74.70;-83.89;60.07;62.12;-68.68;-76.89;67.39;-63.95;-30.32;-65.69;67.32;66.92;-70.35;-61.79;69.71;53.52;-70.55;-74.13;75.15;69.86;-57.86;-76.99;100.00;37.84;-75.43;51.61;-1.72;-51.44;att
;ata;62.14;-3.83;27.58;40.92;-54.75;-38.96;71.22;-34.09;69.68;-59.62;49.46;53.64;54.38;-46.67;-43.81;-35.20;66.91;-45.19;69.32;-55.60;75.97;-4.81;-43.75;43.32;-61.85;-38.26;34.08;-58.23;30.36;-61.00;62.49;1.49;-59.63;-19.77;30.54;-38.33;35.14;-56.49;32.25;15.66;-56.95;-53.33;64.78;-37.76;-45.19;-40.02;32.01;42.77;-58.16;-27.30;33.33;51.52;-50.28;-50.94;41.00;50.68;-51.11;-58.20;37.84;100.00;-71.17;14.51;16.02;-20.95;ata
;atc;-78.86;-23.18;-49.31;-61.82;75.05;70.62;-76.28;66.07;-82.53;88.54;-73.46;-78.08;-76.98;72.88;61.61;53.08;-79.38;66.42;-74.43;78.48;-72.28;-21.26;11.08;-29.40;82.02;44.93;-65.54;76.09;-70.89;79.49;-75.46;-29.46;84.30;13.89;-63.44;66.15;-71.26;79.82;-67.25;-61.96;75.55;78.74;-72.66;62.49;35.07;43.78;-66.31;-76.59;80.15;48.90;-72.27;-70.35;64.94;76.69;-77.06;-76.19;63.07;81.63;-75.43;-71.17;100.00;-35.89;-16.16;44.34;atc
;taa;45.00;17.68;22.39;36.77;-32.95;-59.42;49.30;-52.09;44.09;-49.05;42.45;46.48;36.78;-53.93;-44.89;-21.11;48.72;-47.62;40.84;-31.64;17.60;-5.11;41.63;-14.50;-47.38;-44.30;44.03;-50.53;50.94;-43.83;19.01;52.88;-46.16;-25.71;58.25;-60.17;52.11;-51.81;44.00;47.29;-37.49;-49.90;33.08;-40.76;8.03;-37.93;54.42;44.59;-42.09;-47.90;50.81;48.28;-48.83;-53.11;51.84;42.81;-40.47;-41.96;51.61;14.51;-35.89;100.00;-48.15;-80.24;taa
;tag;4.02;7.80;12.50;9.23;-18.71;9.63;-0.93;10.79;4.37;-5.97;-1.78;7.90;10.18;-5.05;4.66;-7.55;3.89;2.15;2.06;-12.44;16.12;19.12;-33.42;28.41;-6.13;8.88;-1.48;0.44;6.23;-13.84;22.25;-23.30;-9.90;20.03;-2.97;11.08;0.73;-2.58;7.69;-0.73;-12.86;-4.18;3.35;2.80;-10.18;-6.34;-4.77;6.18;-15.48;18.99;3.54;-0.42;1.90;-1.53;-3.65;8.96;0.47;-8.70;-1.72;16.02;-16.16;-48.15;100.00;-11.17;tag
;tga;-46.08;-27.55;-33.67;-45.09;44.95;58.89;-49.08;47.70;-46.50;54.12;-45.22;-52.03;-44.03;60.32;43.96;23.10;-52.04;50.63;-40.76;38.85;-26.65;-7.50;-27.98;0.29;52.72;44.10;-47.06;54.02;-57.04;53.23;-32.21;-45.02;54.01;15.47;-62.47;57.89;-58.58;57.50;-54.69;-52.76;47.27;55.56;-37.10;37.11;-10.15;43.44;-54.86;-53.80;53.96;39.69;-57.77;-52.97;49.70;59.54;-53.67;-49.84;42.48;48.70;-51.44;-20.95;44.34;-80.24;-11.17;100.00;tga
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Moyenne ;;61.22;26.59;39.24;51.49;61.95;59.99;62.66;56.77;63.71;67.78;62.53;63.55;62.31;58.24;54.77;42.62;66.22;60.10;58.87;57.57;53.21;22.41;18.22;13.48;66.59;48.54;60.03;66.19;63.32;66.27;55.96;39.56;68.58;26.82;58.17;61.70;65.77;69.45;59.18;56.78;59.46;66.88;57.82;53.28;19.47;43.21;60.23;63.00;61.28;53.86;62.65;58.39;60.14;62.95;64.09;63.05;48.35;66.03;63.21;44.32;63.79;41.99;9.28;44.79;
;;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
>74;;18;0;0;0;20;9;20;8;22;34;16;27;20;8;4;0;31;17;13;14;2;0;0;0;29;1;14;30;21;29;6;0;33;1;8;17;28;37;13;7;9;33;8;0;0;0;12;21;17;1;19;10;12;24;25;21;0;30;23;1;26;1;0;1;
>79;;13;0;0;0;6;4;11;1;15;25;7;12;7;3;0;0;20;8;10;8;1;0;0;0;17;0;6;19;12;21;2;0;28;0;4;6;21;27;6;4;3;17;5;0;0;0;3;11;7;1;11;0;0;7;10;6;0;17;13;0;11;1;0;1;
max;;90.98;52.10;68.72;68.69;89.57;80.77;92.94;79.66;92.94;91.28;83.42;83.35;83.40;80.94;75.92;64.87;92.36;91.59;92.05;82.94;82.93;46.30;69.88;43.32;95.68;74.87;90.01;92.36;88.14;89.57;82.93;69.88;95.68;74.87;86.37;86.37;91.48;92.27;83.47;85.36;89.00;89.03;82.11;73.30;55.16;71.53;83.27;85.36;89.00;79.31;84.97;77.83;77.13;87.07;83.27;85.32;73.17;89.03;87.33;75.97;88.54;80.24;48.15;80.24;

Tableau synthétique des diagrammes[modifier | modifier le wikicode]

Tableau des abscisses et maxima des courbes de tendance.[modifier | modifier le wikicode]
- (*): ttg et agg, sont reportés en %AT et tga en %GC.
- (75) abscisse sans maximum, valeur de max à 75.
- (75) abscisse supérieure à 75 pour le maximum, valeur de max à 75.
  • Tableau non formaté du 18.2.17
;abscis;max;;;abscis;max;;;abscis;max;;;abscis;max
ttt;75;288;;tct;75;137;;tat;75;261;;tgt;75;51
ttc;75;231;;tcc;67;107;;tac;75;172;;tgc;64;48
tta;75;389;;tca;75;120;;taa;75;5;;tga*;75;3
ttg*;60;119;;tcg;75;138;;tag;75;1;;tgg;75;89
;;;;;;;;;;;;;;
ctt;63;153;;cct;68;104;;cat;73;91;;cgt;56;134
ctc;75;289;;ccc;75;140;;cac;75;131;;cgc;75;359
cta;71;54;;cca;74;106;;caa;75;174;;cga;61;28
ctg;71;357;;ccg;75;213;;cag;68;213;;cgg;75;131
;;;;;;;;;;;;;;
att;75;369;;act;75;137;;aat;75;399;;agt;75;78
atc;73;296;;acc;75;238;;aac;66;171;;agc;61;75
ata;75;259;;aca;75;129;;aaa;75;622;;aga;75;150
atg;51;168;;acg;69;110;;aag;75;314;;agg*;59;36
;;;;;;;;;;;;;;
gtt;68;211;;gct;66;170;;gat;70;329;;ggt;63;183
gtc;75;328;;gcc;75;405;;gac;75;447;;ggc;75;419
gta;70;143;;gca;67;141;;gaa;67;420;;gga;75;157
gtg;70;236;;gcg;75;287;;gag;75;513;;ggg;64;70
Caractérisation par les diagrammes et les coefficients de corrélation[modifier | modifier le wikicode]
  1. Le paramètre R2 est le coefficient de détermination des courbes de tendance. Pour comparaison avec le paramètre écart.
  2. Le paramètre queue a été déterminé à partir des courbes calculées à partir des coefficients du polynôme de degré 3 du diagramme de chaque codon. Voir le tableau de ces calculs. Il est exprimé ici en nombre de bactéries dont les effectifs des codons sont nulles ou très faibles au début des abscisses, voir le tableau de la 1ère détermination de ces queues avec des effectifs qui ne dépassent pas 3% du total. Sur 32 queues de longueur supérieure à 4, 5 seulement ont des effectifs qui dépassent 1% du total.
  3. Le paramètre écart est l'équivalent du R2 mais calculé pour les effectifs sans la queue du codon. C'est la moyenne des différences, en valeur absolue et en % par rapport à la valeur théorique, entre cette valeur théorique et l'effectif compté du codon. Quand une différence est très élevée à cause d'un effectif théorique très faible, elle est ignorée et la queue rallongée. Voir le tableau de ces calculs.
  4. Le paramètre abscis est l'abscisse du maximum de la courbe de tendance. Il est exprimé en %GC ou %AT. Voir le tableau de ces calculs. Pour les courbes sans maximum l'abscisse 75% (AT ou GC) est utilisée pour comparaison. Quand l'abscisse du maximum dépasse 75% elle est seulement indiquée sous la forme 75/xx où xx est l'abscisse en question.
  5. Le paramètre moyen, pour moyenne, est la moyenne du codon sur les 111 bactéries. C'est la somme des effectifs d'un codon divisé par 111.
  6. La colonne %: c'est le pourcentage d'un codon dans la constitution de son acide aminé.
  7. Le paramètre max est l'ordonnée de l'abscisse abscis. C'est le maximum de la courbe ou la valeur pour l'abscisse 75% quand ce maximum n'existe pas ou si son abscisse est supérieure à 75%.
  8. La colonne %moy c'est le rapport max/moyen dans le but de normaliser les courbes.
  9. La colonne cor>79 correspond au nombre de corrélations supérieures à 0.79 pour un codon donné avec les autres codons (l'identité exclue).
  10. La colonne cor tot correspond à la moyenne des corrélations d'un codon avec les autres codons. Cette moyenne est reportée en fin du tableau des corrélations.
  • Tableaux non formatés du 13.3.17
codon;R2;écart;queue;Moyen.;%;abscis;max;%moy.;Cor>79;cor tot;;codon;R2;écart;queue;Moyen.;%;abscis;max;%moy.;Cor>79;cor tot
atg;985;10;0;154;−;51;168;109;0;19.5;;act;891;38;14;68;21;75/82;137;200;10;64.1
tgg;970;10;7*;71;−;75;89;125;0;43.2;;acc;932;30;8;121;37;75;238;196;17;66.0
;;;;;;;;;;;;aca;884;38;18;65;20;75/78;129;198;6;63.0
tat;967;22;11;116;52;75;261;226;20;66.2;;acg;832;38;4;71;22;69;110;155;0;48.4
tac;927;25;0;107;48;75/83;172;161;8;60.1;;;;;;325;;;;;;
;;;;222;;;;;;;;gct;911;30;9;108;22;66;170;156;4;56.8
cat;914;30;10;59;46;73;91;155;6;60.0;;gcc;931;28;9;164;33;75;405;247;17;66.9
cac;962;20;0;70;54;75;131;189;19;66.2;;gca;929;30;6;91;19;67;141;155;6;59.2
;;;;;128;;;;;;;gcg;882;35;5;126;26;75;287;228;3;59.5
caa;880;36;14;89;40;75/80;174;196;12;63.3;;;;;;490;;;;;;
cag;964;26;0;132;60;68;213;161;21;66.3;;gtt;944;28;8;132;28;68;211;160;11;62.7
;;;;220;;;;;;;;gtc;916;32;4;118;25;75;328;278;7;62.9
aat;966;35;15;133;51;75;399;300;10;58.9;;gta;888;45;13;84;18;70;143;171;0;58.4
aac;951;21;0;128;49;66;171;133;8;57.6;;gtg;907;39;5;137;29;70;236;172;0;60.1
;;;;261;;;;;;;;;;;;471;;;;;;
aaa;957;30;8;247;55;75;622;252;11;62.7;;ggt;900;30;0;142;31;63;183;129;0;39.6
aag;918;27;0;202;45;75/85;314;155;1;56.8;;ggc;956;42;0;169;37;75;419;248;28;68.6
;;;;450;;;;;;;;gga;847;42;9;88;19;75/78;157;178;2;56.0
gat;965;23;0;217;52;70;329;152;21;65.8;;ggg;710;42;0;54;12;64;70;131;0;26.8
gac;970;20;0;202;48;75;447;222;27;69.4;;;;;;453;;;;;;
;;;;419;;;;;;;;tta;925;47;35;120;20;75;389;324;13;61.2
gaa;951;27;0;296;57;67;420;142;4;58.2;;ttg*;765;43;5;81;13;60;119;147;0;26.6
gag;924;30;0;226;43;75;513;227;6;61.7;;;;;;;;;;;;
;;;;;521;;;;;;;ctt;805;47;10;97;16;63;153;158;0;39.2
ttt;947;29;12;123;50;75;288;235;15;63.7;;ctc;839;44;12;104;17;75;289;278;4;60.0
ttc;963;22;0;125;50;75;231;185;25;67.8;;cta;756;46;20;30;5;71;54;183;0;51.5
;;;;248;;;;;;;;ctg;878;38;16;180;30;71;357;198;6;61.9
tgt;850;37;19;27;46;75;51;193;5;57.8;;;;;;611;;;;;;
tgc;874;37;5;31;54;64;48;154;0;53.3;;agt;876;43;16;38;11;75/86;78;205;7;62.3
;;;;58;;;;;;;;agc;857;37;0;55;16;61;75;136;0;42.6
att;913;30;9;168;39;75;369;219;13;63.2;;;;;;;;;;;;
atc;938;26;2;181;42;73;296;163;11;63.8;;tct;876;37;19;69;20;75;137;200;7;62.5
ata;691;80;31;84;19;75;259;310;0;44.3;;tcc;868;37;4;66;20;67;107;162;0;54.8
;;;;433;;;;;;;;tca;893;38;19;50;15;75;120;240;12;63.5
;;;;;;;;;;;;tcg;853;43;4;58;17;75;138;236;3;58.2
tga*;727;104;−;2;−;75;3;180;1;44.8;;;;;;336;;;;;;
taa;835;42;−;3;−;75/77;5;151;1;42.0;;aga;715;64;31;60;16;75;150;251;1;53.2
tag;488;129;−;1;−;75;1;95;0;9.3;;agg*;308;92;10;24;6;59;36;148;0;13.5
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
cct;941;32;8;65;23;68;104;160;11;63.0;;cgt;736;51;0;103;27;56;134;131;0;18.2
ccc;735;62;9;61;21;75;140;228;1;53.9;;cgc;938;28;19;132;34;75;359;272;17;66.6
cca;851;39;19;58;20;74;106;182;3;60.2;;cga;571;66;0;20;5;61;28;136;0;22.4
ccg;885;40;8;101;35;75/82;213;210;7;61.3;;cgg;699;56;20;44;12;75;131;297;0;48.5
;;;;286;;;;;;;;;;;;383;;;;;;
Diagramme corcodon[modifier | modifier le wikicode]
;cor tot;moyen;;;cor tot;moyen;;;cor tot;moyen;;;cor tot;moyen
tag;9.3;1.1;;cta;51.5;29.6;;ctc;60.0;104.0;;att;63.2;168.5
agg*;13.5;24.5;;aga;53.2;59.7;;cat;60.0;58.9;;caa;63.3;88.6
cgt;18.2;102.5;;tgc;53.3;31.0;;tac;60.1;106.8;;tca;63.5;50.2
atg;19.5;154.3;;ccc;53.9;61.4;;gtg;60.1;137.3;;ttt;63.7;122.8
cga;22.4;20.5;;tcc;54.8;65.8;;cca;60.2;58.5;;atc;63.8;181.2
ttg*;26.6;80.6;;gga;56.0;88.3;;tta;61.2;120.0;;act;64.1;68.4
ggg;26.8;53.7;;aag;56.8;202.5;;ccg;61.3;101.4;;gat;65.8;216.8
ctt;39.2;96.8;;gct;56.8;108.5;;gag;61.7;225.8;;acc;66.0;121.1
ggt;39.6;142.2;;aac;57.6;128.4;;ctg;61.9;180.4;;cac;66.2;69.5
taa;42.0;3.3;;tgt;57.8;26.6;;agt;62.3;38.3;;tat;66.2;115.7
agc;42.6;54.7;;gaa;58.2;295.6;;tct;62.5;68.6;;cag;66.3;131.9
tgg;43.2;71.4;;tcg;58.2;58.2;;gtt;62.7;131.8;;cgc;66.6;131.8
ata;44.3;83.7;;gta;58.4;83.7;;aaa;62.7;247.0;;gcc;66.9;163.9
tga*;44.8;1.7;;aat;58.9;133.1;;gtc;62.9;117.9;;ttc;67.8;124.8
acg;48.4;70.7;;gca;59.2;91.4;;cct;63.0;64.7;;ggc;68.6;168.9
cgg;48.5;44.1;;gcg;59.5;125.8;;aca;63.0;65.0;;gac;69.4;201.8

Tableaux des parallèles. Diagramme / coefficient de corrélation[modifier | modifier le wikicode]

  • Voir l'article pour la définition des paramètres pour l'établissement des matrices du paramètre diag. Ces paramètres sont donnés avant la matrice pour être utilisés dans un tableur.
  1. écart: C'est la moyenne des différences, en valeur absolue et en % par rapport à la valeur théorique, entre cette valeur théorique et l'effectif compté du codon. Voir le tableau de ces calculs.
  2. q3: C'est la cotation du paramètre queue, nombre de bactéries, en continu, ayant des effectifs faibles ou nuls. Le tableau des cotations pour les paramètres q3 et a3 donne la correspondance entre le %AT ou le %GC et le rang de la dernière bactérie de la queue avant le décollage de la courbe. Voir le tableau de ces calculs.
  3. a3: Cotation du paramètre abscis, abscisse du maximum de la courbe de tendance. Il est exprimé en %GC ou %AT. Voir le tableau de ces calculs. Le tableau des cotations pour les paramètres q3 et a3 donne la correspondance entre a3 et abscis.
  4. moyen.: pour moyenne, est la moyenne des effectifs du codon sur les 111 bactéries. En tant que moyenne ce paramètre n'a pas de sens biologique, car que veut dire l'absence d'un codon pour une bactérie donnée? Par contre la somme des effectifs correspond en mathématique à l'intégrale d'une courbe continue.C'est une caractéristique mathématique du diagramme. Voir calculs.
cor>79: nombre de coefficients du codon supérieurs à 79; pour illustration. Voir le tableau des coefficients.
cor tot: corrélation moyenne, moyenne des valeurs absolues des coefficients (multipliés par 100) du codon; pour illustration. Voir calculs.
Matrice de calcul du paramètre diag %AT (diagramme)[modifier | modifier le wikicode]
diag = 200*(abs((e1-e2)/(e1+e2))+abs((q31-q32)/(q31+q32))+abs((a31-a32)/(a31+a32))+abs((moyen1-moyen2)/(moyen1+moyen2))).
La matrice de calcul de diag est une matrice symétrique dont la diagonale est nulle.
codon;aaa;aat;aca;act;aga;agg*;agt;ata;att;caa;cat;cca;cct;cga;cgt;cta;ctt;gaa;gat;gca;gct;gga;ggt;gta;gtt;taa;tat;tca;tct;tgt;tta;ttg*;ttt;;
écart;30;35;38;38;64;92;43;80;30;36;30;39;32;66;51;46;47;27;23;30;30;42;30;45;28;42;22;38;37;37;47;43;29;;
q3;11;17;20;17;35;14;20;35;11;17;14;23;11;5;5;23;14;5;5;8;11;11;5;17;11;5;14;23;23;23;38;8;14;;
Moyen.;247;133;65;68;60;24;38;84;168;89;59;58;65;20;103;30;97;296;217;91;108;88;142;84;132;3;116;50;69;27;120;81;123;;
a3;5;5;11;8;5;32;5;5;5;11;17;17;23;29;35;20;26;23;20;23;23;11;26;20;23;14;5;5;5;5;5;29;5;;
Cor>79;11;10;6;10;1;0;7;0;13;12;6;3;11;0;0;0;0;4;21;6;4;2;0;0;11;1;20;12;7;5;13;0;15;;
cor tot;62,7;58,9;63,0;64,1;53,2;13,5;62,3;44,3;63,2;63,3;60,0;60,2;63,0;22,4;18,2;51,5;39,2;58,2;65,8;59,2;56,8;56,0;39,6;58,4;62,7;42,0;66,2;63,5;62,5;57,8;61,2;26,6;63,7;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;aaa;aat;aca;act;aga;agg*;agt;ata;att;caa;cat;cca;cct;cga;cgt;cta;ctt;gaa;gat;gca;gct;gga;ggt;gta;gtt;taa;tat;tca;tct;tgt;tta;ttg*;ttt;;
aaa;0;116;272;223;297;434;239;293;38;229;258;329;250;459;358;388;290;235;234;253;208;202;265;301;199;396;129;225;203;251;223;308;96;;aaa
aat;116;0;169;119;204;394;149;194;79;119;221;230;249;459;323;305;217;340;315;251;206;178;264;192;194;413;78;129;100;170;118;284;45;;aat
aca;272;169;0;54;188;307;140;226;244;53;112;71;147;368;298;165;177;354;333;213;203;99;298;117;228;335;220;115;98;176;218;209;199;;aca
act;223;119;54;0;180;318;133;208;195;62;130;123;162;385;305;214;182;365;345;220;208;111;306;124;233;356;169;107;79;166;200;215;148;;act
aga;297;204;188;180;0;352;136;56;270;239;269;199;308;393;375;261;298;493;476;367;363;258;438;256;387;464;247;110;108;171;104;335;229;;aga
agg*;434;394;307;318;352;0;297;355;420;318;246;272;244;155;284;181;205;407;419;304;285;309;357;243;301;400;399;347;375;288;435;244;384;;agg*
agt;239;149;140;133;136;297;0;188;219;189;224;174;269;363;377;165;265;451;440;332;319;215;406;215;341;386;201;55;87;66;174;299;180;;agt
ata;293;194;226;208;56;355;188;0;261;226;321;254;345;432;365;311;288;491;468;354;350;247;427;245;375;492;232;163;135;219;95;331;217;;ata
att;38;79;244;195;270;420;219;261;0;196;232;303;222;447;324;371;256;272;246;220;174;170;228;269;162;394;93;200;174;235;187;277;60;;att
caa;229;119;53;62;239;318;189;226;196;0;121;123;157;383;263;212;136;317;293;163;152;59;253;87;178;334;169;166;133;215;209;189;148;;caa
cat;258;221;112;130;269;246;224;321;232;121;0;78;70;320;271;174;136;269;249;129;114;141;222;112;137;327;204;198;194;255;315;174;182;;cat
cca;329;230;71;123;199;272;174;254;303;123;78;0;133;327;278;97;157;331;311;198;188;161;280;95;213;333;280;129;132;191;245;189;259;;cca
cct;250;249;147;162;308;244;269;345;222;157;70;133;0;272;208;195;115;221;227;71;56;130;166;118;82;332;245;242;220;298;338;107;223;;cct
cga;459;459;368;385;393;155;363;432;447;383;320;327;272;0;178;238;269;282;298;271;310;334;235;305;326;259;476;408;435;352;469;208;457;;cga
cgt;358;323;298;305;375;284;377;365;324;263;271;278;208;178;0;304;138;201;200;150;174;213;113;196;200;293;336;377;351;428;327;106;318;;cgt
cta;388;305;165;214;261;181;165;311;371;212;174;97;195;238;304;0;184;359;345;254;241;237;326;127;260;332;357;191;221;152;293;233;336;;cta
ctt;290;217;177;182;298;205;265;288;256;136;136;157;115;269;138;184;0;264;264;116;92;125;176;64;118;353;226;269;243;322;250;93;207;;ctt
gaa;235;340;354;365;493;407;451;491;272;317;269;331;221;282;201;359;264;0;58;164;179;299;96;287;156;289;330;434;414;457;423;230;314;;gaa
gat;234;315;333;345;476;419;440;468;246;293;249;311;227;298;200;345;264;58;0;167;180;274;94;261;155;286;282;420;397;450;399;233;291;;gat
gca;253;251;213;220;367;304;332;354;220;163;129;198;71;271;150;254;116;164;167;0;49;139;103;135;76;314;238;306;274;355;330;71;216;;gca
gct;208;206;203;208;363;285;319;350;174;152;114;188;56;310;174;241;92;179;180;49;0;125;116;123;27;345;190;296;265;341;294;120;168;;gct
gga;202;178;99;111;258;309;215;247;170;59;141;161;130;334;213;237;125;299;274;139;125;0;235;113;151;285;189;212;184;266;227;133;169;;gga
ggt;265;264;298;306;438;357;406;427;228;253;222;280;166;235;113;326;176;96;94;103;116;235;0;226;104;283;283;382;353;421;350;147;250;;ggt
gta;301;192;117;124;256;243;215;245;269;87;112;95;118;305;196;127;64;287;261;135;123;113;226;0;149;336;241;218;190;274;237;118;221;;gta
gtt;199;194;228;233;387;301;341;375;162;178;137;213;82;326;200;260;118;156;155;76;27;151;104;149;0;355;189;320;290;360;300;146;164;;gtt
taa;396;413;335;356;464;400;386;492;394;334;327;333;332;259;293;332;353;289;286;314;345;285;283;336;355;0;441;409;418;392;449;302;416;;taa
tat;129;78;220;169;247;399;201;232;93;169;204;280;245;476;336;357;226;330;282;238;190;189;283;241;189;441;0;181;150;225;169;296;33;;tat
tca;225;129;115;107;110;347;55;163;200;166;198;129;242;408;377;191;269;434;420;306;296;212;382;218;320;409;181;0;34;64;154;297;159;;tca
tct;203;100;98;79;108;375;87;135;174;133;194;132;220;435;351;221;243;414;397;274;265;184;353;190;290;418;150;34;0;89;129;269;129;;tct
tgt;251;170;176;166;171;288;66;219;235;215;255;191;298;352;428;152;322;457;450;355;341;266;421;274;360;392;225;64;89;0;201;354;202;;tgt
tta;223;118;218;200;104;435;174;95;187;209;315;245;338;469;327;293;250;423;399;330;294;227;350;237;300;449;169;154;129;201;0;321;143;;tta
ttg*;308;284;209;215;335;244;299;331;277;189;174;189;107;208;106;233;93;230;233;71;120;133;147;118;146;302;296;297;269;354;321;0;276;;ttg*
ttt;96;45;199;148;229;384;180;217;60;148;182;259;223;457;318;336;207;314;291;216;168;169;250;221;164;416;33;159;129;202;143;276;0;;ttt
Matrice de calcul du paramètre diag %GC (diagramme)[modifier | modifier le wikicode]
diag = 200*(abs((e1-e2)/(e1+e2))+abs((q31-q32)/(q31+q32))+abs((a31-a32)/(a31+a32))+abs((moyen1-moyen2)/(moyen1+moyen2))).
La matrice de calcul de diag est une matrice symétrique dont la diagonale est nulle.
codon;aac;aag;acc;acg;agc;atc;atg;cac;cag;ccc;ccg;cgc;cgg;ctc;ctg;gac;gag;gcc;gcg;ggc;ggg;gtc;gtg;tac;tag;tcc;tcg;tga*;tgc;tgg;ttc;;
écart;21;27;30;38;37;26;10;20;26;62;40;28;56;44;38;20;30;28;35;42;42;32;39;25;129;37;43;104;37;10;22;;
q3;5;5;11;8;5;5;5;5;5;11;11;23;23;14;20;5;5;11;8;5;5;8;8;5;5;8;8;5;8;5;5;;
Moyen.;128;202;121;71;55;181;154;70;132;61;101;132;44;104;180;202;226;164;126;169;54;118;137;107;1;66;58;2;31;71;125;;
a3;14;5;5;11;17;5;29;5;11;5;5;5;5;5;8;5;5;5;5;5;14;5;8;5;5;11;5;5;14;5;5;;
Cor>79;8;1;17;0;0;11;0;19;21;1;7;17;0;4;6;27;6;17;3;28;0;7;0;8;0;0;3;1;0;0;25;;
cor tot;57,6;56,8;66,0;48,4;42,6;63,8;19,5;66,2;66,3;53,9;61,3;66,6;48,5;60,0;61,9;69,4;61,7;66,9;59,5;68,6;26,8;62,9;60,1;60,1;9,3;54,8;58,2;44,8;53,3;43,2;67,8;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;aac;aag;acc;acg;agc;atc;atg;cac;cag;ccc;ccg;cgc;cgg;ctc;ctg;gac;gag;gcc;gcg;ggc;ggg;gtc;gtg;tac;tag;tcc;tcg;tga*;tgc;tgg;ttc;;
aac;0;166;213;187;158;152;154;158;50;341;258;258;414;283;268;141;188;225;195;191;152;192;170;134;436;192;287;424;225;224;104;;aac
aag;166;0;137;251;258;14;257;127;120;262;182;177;328;208;213;29;23;102;120;63;256;116;169;67;329;255;204;315;319;190;67;;aag
acc;213;137;0;181;282;129;338;170;173;135;47;85;224;77;167;165;136;36;51;142;281;39;117;104;396;186;137;380;264;229;109;;acc
acg;187;251;181;0;115;245;324;185;143;170;149;260;257;184;206;278;248;214;138;215;110;142;100;201;425;9;108;406;105;240;229;;acg
agc;158;258;282;115;0;253;261;195;162;245;251;348;298;282;301;284;253;312;240;223;34;246;209;212;411;109;175;392;123;254;240;;agc
atc;152;14;129;245;253;0;243;116;107;256;175;169;323;201;205;36;37;93;112;55;251;108;161;54;331;249;198;317;316;179;54;;atc
atg;154;257;338;324;261;243;0;280;192;445;376;379;518;399;364;232;277;315;317;272;288;315;288;262;509;329;400;501;361;221;234;;atg
cac;158;127;170;185;195;116;280;0;164;191;181;226;269;210;318;99;147;191;160;156;193;143;224;67;341;187;138;327;277;72;67;;cac
cag;50;120;173;143;162;107;192;164;0;305;219;213;376;245;220;143;142;180;156;147;156;152;122;99;405;147;248;390;228;226;98;;cag
ccc;341;262;135;170;245;256;445;191;305;0;92;218;114;110;251;284;259;166;156;207;221;160;199;213;338;165;74;315;244;236;239;;ccc
ccg;258;182;47;149;251;175;376;181;219;92;0;131;181;35;166;208;180;83;67;130;236;71;110;126;375;158;92;357;242;233;155;;ccg
cgc;258;177;85;260;348;169;379;226;213;218;131;0;165;115;120;205;187;93;122;192;347;118;179;161;453;264;215;438;340;287;160;;cgc
cgg;414;328;224;257;298;323;518;269;376;114;181;165;0;153;219;351;323;252;238;273;270;243;280;287;398;252;150;375;268;317;311;;cgg
ctc;283;208;77;184;282;201;399;210;245;110;35;115;153;0;150;233;206;113;96;146;257;100;140;151;389;192;113;370;276;260;180;;ctc
ctg;268;213;167;206;301;205;364;318;220;251;166;120;219;150;0;239;212;144;176;183;293;193;116;258;472;214;246;456;286;372;257;;ctg
gac;141;29;165;278;284;36;232;99;143;284;208;205;351;233;239;0;51;129;147;89;282;143;195;85;344;282;229;332;346;166;56;;gac
gag;188;23;136;248;253;37;277;147;142;259;180;187;323;206;212;51;0;113;118;62;252;114;168;89;322;251;199;308;312;207;89;;gag
gcc;225;102;36;214;312;93;315;191;180;166;83;93;252;113;144;129;113;0;80;118;311;75;128;128;401;219;168;386;289;252;127;;gcc
gcg;195;120;51;138;240;112;317;160;156;156;67;122;238;96;176;147;118;80;0;94;240;17;66;95;357;142;94;340;220;215;93;;gcg
ggc;191;63;142;215;223;55;272;156;147;207;130;192;273;146;183;89;62;118;94;0;199;111;120;95;299;223;145;281;293;207;93;;ggc
ggg;152;256;281;110;34;251;288;193;156;221;236;347;270;257;293;282;252;311;240;199;0;245;196;211;388;104;150;367;114;249;238;;ggg
gtc;192;116;39;142;246;108;315;143;152;160;71;118;243;100;193;143;114;75;17;111;245;0;83;78;364;147;99;348;226;202;88;;gtc
gtg;170;169;117;100;209;161;288;224;122;199;110;179;280;140;116;195;168;128;66;120;196;83;0;160;396;108;136;378;188;277;159;;gtg
tac;134;67;104;201;212;54;262;67;99;213;126;161;287;151;258;85;89;128;95;95;211;78;160;0;330;206;157;316;287;130;30;;tac
tag;436;329;396;425;411;331;509;341;405;338;375;453;398;389;472;344;322;401;357;299;388;364;396;330;0;426;339;66;439;366;339;;tag
tcc;192;255;186;9;109;249;329;187;147;165;158;264;252;192;214;282;251;219;142;223;104;147;108;206;426;0;103;407;97;246;234;;tcc
tcg;287;204;137;108;175;198;400;138;248;74;92;215;150;113;246;229;199;168;94;145;150;99;136;157;339;103;0;318;172;193;184;;tcg
tga*;424;315;380;406;392;317;501;327;390;315;357;438;375;370;456;332;308;386;340;281;367;348;378;316;66;407;318;0;417;357;325;;tga*
tgc;225;319;264;105;123;316;361;277;228;244;242;340;268;276;286;346;312;289;220;293;114;226;188;287;439;97;172;417;0;336;311;;tgc
tgg;224;190;229;240;254;179;221;72;226;236;233;287;317;260;372;166;207;252;215;207;249;202;277;130;366;246;193;357;336;0;132;;tgg
ttc;104;67;109;229;240;54;234;67;98;239;155;160;311;180;257;56;89;127;93;93;238;88;159;30;339;234;184;325;311;132;0;;ttc
Paramètres q3 a3[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Paramètres q3 a3
  • Légende: voir caractérisation des codons et tableaux des parallèles.
  • Notes pour les diagrammes %AT: */86 abscisse optimale, 86 abscisse maximale, ttg* et agg* reportés en %AT au lieu de en %GC.
  • Notes pour les diagrammes %GC: */85 abscisse optimale non considérée pour les calculs, 75 abscisse maximale, tga* reporté en %GC au lieu de en %AT.
  • Tableaux non formatés du 13.3.17
codon;queue;rang;q3;écart;abscis;a3;Moyen.;Cor>79;cor tot;;codon;queue;rang;q3;écart;abscis;a3;Moyen.;Cor>79;cor tot
aaa;29.3;8;11;30;86;5;247;11;62.7;;aac;13.5;0;5;21;66;14;128;8;57.6
aat;32.6;15;17;35;86;5;133;10;58.9;;aag;13.5;0;5;27;*/85;5;202;1;56.8
aca;34.6;18;20;38;78;11;65;6;63.0;;acc;26.2;8;11;30;75;5;121;17;66.0
act;31.9;14;17;38;82;8;68;10;64.1;;acg;23.7;4;8;38;69;11;71;0;48.4
aga;40.9;31;35;64;86;5;60;1;53.2;;agc;13.5;0;5;37;61;17;55;0;42.6
agg*;30.0;10;14;92;59;32;24;0;13.5;;atc;16.6;2;5;26;73;5;181;11;63.8
agt;33.4;16;20;43;*/86;5;38;7;62.3;;atg;13.5;0;5;10;51;29;154;0;19.5
ata;40.9;31;35;80;86;5;84;0;44.3;;cac;13.5;0;5;20;75;5;70;19;66.2
att;29.7;9;11;30;86;5;168;13;63.2;;cag;13.5;0;5;26;68;11;132;21;66.3
caa;31.9;14;17;36;80;11;89;12;63.3;;ccc;26.3;9;11;62;75;5;61;1;53.9
cat;30.0;10;14;30;73;17;59;6;60.0;;ccg;26.2;8;11;40;*/82;5;101;7;61.3
cca;35.0;19;23;39;74;17;58;3;60.2;;cgc;31.4;19;23;28;75;5;132;17;66.6
cct;29.3;8;11;32;68;23;65;11;63.0;;cgg;32.1;20;23;56;75;5;44;0;48.5
cga;25.1;0;5;66;61;29;20;0;22.4;;ctc;28.3;12;14;44;75;5;104;4;60.0
cgt;25.1;0;5;51;56;35;103;0;18.2;;ctg;29.9;16;20;38;71;8;180;6;61.9
cta;35.7;20;23;46;71;20;30;0;51.5;;gac;13.5;0;5;20;75;5;202;27;69.4
ctt;30.0;10;14;47;63;26;97;0;39.2;;gag;13.5;0;5;30;75;5;226;6;61.7
gaa;25.1;0;5;27;67;23;296;4;58.2;;gcc;26.3;9;11;28;75;5;164;17;66.9
gat;25.1;0;5;23;70;20;217;21;65.8;;gcg;24.2;5;8;35;75;5;126;3;59.5
gca;28.0;6;8;30;67;23;91;6;59.2;;ggc;13.5;0;5;42;75;5;169;28;68.6
gct;29.7;9;11;30;66;23;108;4;56.8;;ggg;13.5;0;5;42;64;14;54;0;26.8
gga;29.7;9;11;42;78;11;88;2;56.0;;gtc;23.7;4;8;32;75;5;118;7;62.9
ggt;25.1;0;5;30;63;26;142;0;39.6;;gtg;24.2;5;8;39;70;8;137;0;60.1
gta;31.4;13;17;45;70;20;84;0;58.4;;tac;13.5;0;5;25;*/83;5;107;8;60.1
gtt;29.3;8;11;28;68;23;132;11;62.7;;tag;13.5;0;5;129;75;5;1;0;9.3
taa;25.1;0;5;42;77;14;3;1;42.0;;tcc;23.7;4;8;37;67;11;66;0;54.8
tat;30.6;11;14;22;86;5;116;20;66.2;;tcg;23.7;4;8;43;75;5;58;3;58.2
tca;35.0;19;23;38;86;5;50;12;63.5;;tga*;13.5;0;5;104;75;5;2;1;44.8
tct;35.0;19;23;37;86;5;69;7;62.5;;tgc;24.2;5;8;37;64;14;31;0;53.3
tgt;35.0;19;23;37;86;5;27;5;57.8;;tgg;13.5;0;5;10;75;5;71;0;43.2
tta;42.8;35;38;47;86;5;120;13;61.2;;ttc;13.5;0;5;22;75;5;125;25;67.8
ttg*;27.8;5;8;43;60;29;81;0;26.6;;;;;;;;;;;
ttt;31.1;12;14;29;86;5;123;15;63.7;;*/85;optimal non considéré pour les calculs;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;75;max;;tga*;%GC au lieu de %AT;;;;;
*/86;optimal;;ttg*;agg*;%AT au lieu de %GC;;;;;;;;;;;;;;;
86;max;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Tableaux des parallèles %AT[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Tableaux des parallèles %AT
  • Ces 30 parallèles sont faits pour les couples dont le paramètre diag est inférieur à 100. Le paramètre cor est tiré du tableau des corrélations et les autres paramètres sont ceux du tableau synthétique.
  • Légende: voir caractérisation des codons et tableaux des parallèles.
  • diag/cor la 1ère ligne indique la valeur de diag la 2ème, la corrélation entre les 2 codons du parallèle.
  • Nota: ici l’abscisse du maximum peut aller jusqu'à 86% AT car les bactéries peuvent atteindre ce taux. Quand la courbe de tendance n'a pas de maximum c'est ce taux qui est indiqué. Si le maximum a exactement 86% alors c'est indiqué sous la forme */86.
  • Les 2 tableaux non formatés du 15.3.17
codon;écart;queue;Moyen.;abscis;Cor>79;cor tot;diag/cor;;codon;écart;queue;Moyen.;abscis;Cor>79;cor tot;diag/cor
;;;;;;;;;;;;;;;;
gtt;28;8;132;68;11;62.7;27;;tca;38;19;50;86;12;63.5;64
gct;30;9;108;66;4;56.8;84;;tgt;37;19;27;86;5;57.8;62
;;;;;;;;;;;;;;;;
tat;22;11;116;86;20;66.2;33;;gta;45;13;84;70;0;58.4;64
ttt;29;12;123;86;15;63.7;91;;ctt;47;10;97;63;0;39.2;49
;;;;;;;;;;;;;;;;
tct;37;19;69;86;7;62.5;34;;tgt;37;19;27;86;5;57.8;66
tca;38;19;50;86;12;63.5;70;;agt;43;16;38;86;7;62.3;72
;;;;;;;;;;;;;;;;
att;30;9;168;86;13;63.2;38;;cct;32;8;65;68;11;63.0;70
aaa;30;8;247;86;11;62.7;83;;cat;30;10;59;73;6;60.0;74
;;;;;;;;;;;;;;;;
ttt;29;12;123;86;15;63.7;45;;ttg*;43;5;81;60;0;26.6;71
aat;35;15;133;86;10;58.9;91;;gca;30;6;91;67;6;59.2;36
;;;;;;;;;;;;;;;;
gct;30;9;108;66;4;56.8;49;;gca;30;6;91;67;6;59.2;71
gca;30;6;91;67;6;59.2;75;;cct;32;8;65;68;11;63.0;79
;;;;;;;;;;;;;;;;
aca;38;18;65;78;6;63.0;53;;cca;39;19;58;74;3;60.2;71
caa;36;14;89;80;12;63.3;73;;aca;38;18;65;78;6;63.0;75
;;;;;;;;;;;;;;;;
aca;38;18;65;78;6;63.0;54;;gtt;28;8;132;68;11;62.7;76
act;38;14;68;82;10;64.1;69;;gca;30;6;91;67;6;59.2;83
;;;;;;;;;;;;;;;;
tca;38;19;50;86;12;63.5;55;;cca;39;19;58;74;3;60.2;78
agt;43;16;38;86;7;62.3;75;;cat;30;10;59;73;6;60.0;62
;;;;;;;;;;;;;;;;
gct;30;9;108;66;4;56.8;56;;tat;22;11;116;86;20;66.2;78
cct;32;8;65;68;11;63.0;85;;aat;35;15;133;86;10;58.9;92
;;;;;;;;;;;;;;;;
aga;64;31;60;86;1;53.2;56;;tct;37;19;69;86;7;62.5;79
ata;80;31;84;86;0;44.3;76;;act;38;14;68;82;10;64.1;79
;;;;;;;;;;;;;;;;
gaa;27;0;296;67;4;58.2;58;;att;30;9;168;86;13;63.2;79
gat;23;0;217;70;21;65.8;79;;aat;35;15;133;86;10;58.9;85
;;;;;;;;;;;;;;;;
caa;36;14;89;80;12;63.3;59;;gtt;28;8;132;68;11;62.7;82
gga;42;9;88;78;2;56.0;56;;cct;32;8;65;68;11;63.0;81
;;;;;;;;;;;;;;;;
att;30;9;168;86;13;63.2;60;;gta;45;13;84;70;0;58.4;87
ttt;29;12;123;86;15;63.7;87;;caa;36;14;89;80;12;63.3;65
;;;;;;;;;;;;;;;;
act;38;14;68;82;10;64.1;62;;ata;80;31;84;86;0;44.3;95
caa;36;14;89;80;12;63.3;80;;tta;47;35;120;86;13;61.2;62
Tableaux des parallèles %GC[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Tableaux des parallèles %GC
  • Ces 30 parallèles sont faits pour les couples dont le paramètre diag est inférieur à 100. Le paramètre cor est tiré du tableau des corrélations et les autres paramètres sont ceux du tableau synthétique.
  • Légende: voir caractérisation des codons et tableaux des parallèles.
  • diag/cor la 1ère ligne indique la valeur de diag la 2ème, la corrélation entre les 2 codons du parallèle.
  • Nota: ici l’abscisse du maximum peut aller jusqu'à 75% GC car les bactéries peuvent atteindre ce taux. Quand la courbe de tendance n'a pas de maximum c'est ce taux qui est indiqué. Si le maximum a une abscisse supérieure à 75% alors cette abscisse est indiquée sous la forme */xx où xx est l'abscisse en question. Cela reste une caractéristique de la courbe même si biologiquement cette abscisse n'est pas atteinte.
  • Tableaux non formatés du 15.3.17
codon;écart;queue;Moyen.;abscis;Cor>79;cor tot;diag/cor;;codon;écart;queue;Moyen.;abscis;Cor>79;cor tot;diag/cor
;;;;;;;;;;;;;;;;
tcc;37;4;66;67;0;54.8;9;;gag;30;0;226;75;6;61.7;51
acg;38;4;71;69;0;48.4;40;;gac;20;0;202;75;27;69.4;81
;;;;;;;;;;;;;;;;
aag;27;0;202;75/85;1;56.8;14;;ttc;22;0;125;75;25;67.8;54
atc;26;2;181;73;11;63.8;66;;atc;26;2;181;73;11;63.8;89
;;;;;;;;;;;;;;;;
gtc;32;4;118;75;7;62.9;17;;tac;25;0;107;75/83;8;60.1;54
gcg;35;5;126;75;3;59.5;71;;atc;26;2;181;73;11;63.8;66
;;;;;;;;;;;;;;;;
gag;30;0;226;75;6;61.7;23;;ggc;42;0;169;75;28;68.6;55
aag;27;0;202;75/85;1;56.8;76;;atc;26;2;181;73;11;63.8;84
;;;;;;;;;;;;;;;;
gac;20;0;202;75;27;69.4;29;;ttc;22;0;125;75;25;67.8;56
aag;27;0;202;75/85;1;56.8;73;;gac;20;0;202;75;27;69.4;91
;;;;;;;;;;;;;;;;
ttc;22;0;125;75;25;67.8;30;;ggc;42;0;169;75;28;68.6;62
tac;25;0;107;75/83;8;60.1;82;;gag;30;0;226;75;6;61.7;73
;;;;;;;;;;;;;;;;
agc;37;0;55;61;0;42.6;34;;ggc;42;0;169;75;28;68.6;63
ggg;42;0;54;64;0;26.8;26;;aag;27;0;202;75/85;1;56.8;68
;;;;;;;;;;;;;;;;
ctc;44;12;104;75;4;60.0;35;;tga*;104;−;2;75;1;44.8;66
ccg;40;8;101;75/82;7;61.3;58;;tag;129;−;1;75;0;9.3;11
;;;;;;;;;;;;;;;;
gac;20;0;202;75;27;69.4;36;;gtg;39;5;137;70;0;60.1;66
atc;26;2;181;73;11;63.8;80;;gcg;35;5;126;75;3;59.5;69
;;;;;;;;;;;;;;;;
gcc;28;9;164;75;17;66.9;36;;tac;25;0;107;75/83;8;60.1;67
acc;30;8;121;75;17;66.0;89;;aag;27;0;202;75/85;1;56.8;77
;;;;;;;;;;;;;;;;
gag;30;0;226;75;6;61.7;37;;tac;25;0;107;75/83;8;60.1;67
atc;26;2;181;73;11;63.8;66;;cac;20;0;70;75;19;66.2;92
;;;;;;;;;;;;;;;;
gtc;32;4;118;75;7;62.9;39;;ttc;22;0;125;75;25;67.8;67
acc;30;8;121;75;17;66.0;78;;cac;20;0;70;75;19;66.2;87
;;;;;;;;;;;;;;;;
ccg;40;8;101;75/82;7;61.3;47;;gcg;35;5;126;75;3;59.5;67
acc;30;8;121;75;17;66.0;74;;ccg;40;8;101;75/82;7;61.3;89
;;;;;;;;;;;;;;;;
aac;21;0;128;66;8;57.6;50;;ttc;22;0;125;75;25;67.8;67
cag;26;0;132;68;21;66.3;79;;aag;27;0;202;75/85;1;56.8;80
;;;;;;;;;;;;;;;;
gcg;35;5;126;75;3;59.5;51;;gtc;32;4;118;75;7;62.9;71
acc;30;8;121;75;17;66.0;67;;ccg;40;8;101;75/82;7;61.3;75
Diagramme diagcor-gc[modifier | modifier le wikicode]
aac;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag
68;166;77;213;52;187;52;158;78;152;34;154;83;158;79;50;44;341;67;258;64;258;30;414;58;283;73;268;80;141
82;104;63;137;53;251;46;258;66;14;8;257;73;127;68;120;67;262;52;182;65;177;44;328;74;208;49;213;73;29
80;67;50;224;42;181;54;282;82;129;30;338;84;170;86;173;65;135;74;47;81;85;56;224;64;77;88;167;87;165
81;109;44;190;58;225;31;115;63;245;17;324;56;185;57;143;38;170;67;149;64;260;46;257;61;184;43;206;61;278
64;229;54;229;69;319;39;424;53;253;19;261;52;195;62;162;54;245;40;251;52;348;29;298;39;282;57;301;53;284
50;240;44;240;65;264;48;315;56;287;35;243;76;116;79;107;49;256;80;175;82;169;45;323;71;201;75;205;80;36
89;54;33;254;44;105;49;380;62;204;64;192;10;280;31;192;-5;445;29;376;20;379;-2;518;-10;399;35;364;19;232
23;234;44;179;62;123;42;406;67;137;59;255;-12;436;83;164;67;191;69;181;80;226;60;269;79;210;76;318;92;99
87;67;26;221;62;316;23;392;71;108;76;186;11;329;83;134;59;305;80;219;82;213;49;376;65;245;90;220;84;143
83;98;61;72;29;361;44;317;31;175;40;9;-9;396;77;67;59;170;31;92;61;218;66;114;73;110;50;251;67;284
62;239;55;226;58;277;-10;501;73;198;39;109;0;425;73;104;62;169;59;192;80;131;50;181;58;35;79;166;78;208
78;155;42;236;72;228;54;327;14;400;62;249;-8;411;51;201;71;117;64;116;1;152;54;165;73;115;77;120;87;205
85;160;50;233;60;244;53;390;65;138;26;329;-16;331;55;212;58;100;78;39;22;256;72;191;59;153;44;219;60;351
52;311;49;287;58;242;40;315;65;248;70;187;-10;509;66;54;60;209;62;142;25;281;68;63;64;195;48;150;79;233
80;180;50;317;63;340;54;357;49;74;75;147;0;341;8;262;65;161;34;246;24;110;86;142;49;120;63;225;78;239
74;257;45;260;42;268;53;438;78;92;58;165;-14;405;92;67;17;288;77;108;26;34;62;215;67;51;70;102;60;188
91;56;44;372;52;276;44;375;80;215;58;158;19;338;76;99;74;224;11;315;14;251;54;223;73;138;89;36;76;23
78;89;61;166;62;286;59;370;52;150;55;264;-15;375;66;213;77;122;78;143;1;288;84;55;37;240;50;214;72;136
83;127;57;207;62;346;45;456;72;113;50;252;-6;453;57;126;68;199;71;152;29;193;26;272;76;112;56;312;48;248
73;93;52;252;56;312;58;332;56;246;56;192;9;398;67;161;64;110;59;160;29;156;81;156;21;317;79;93;50;253
87;93;47;215;67;289;58;308;77;229;68;214;10;389;46;287;75;179;75;71;57;221;85;147;73;160;17;315;66;37
20;238;50;207;51;220;56;386;62;199;71;282;-19;472;73;151;62;280;80;118;15;236;58;207;76;156;79;191;-3;277
82;88;37;249;68;293;47;340;75;168;68;251;-3;344;66;258;62;140;65;243;19;347;84;130;34;156;78;180;81;147
72;159;56;202;30;114;54;281;73;94;66;219;11;322;84;85;75;116;78;100;75;270;96;192;89;67;79;166;71;142
82;30;50;277;53;226;15;367;79;145;50;142;-4;401;75;89;72;195;62;193;34;257;54;273;80;122;69;83;72;259
-6;339;55;130;65;188;60;348;16;150;64;223;-13;357;68;128;68;168;87;143;22;293;70;146;52;238;87;93;59;180
70;234;-6;366;56;287;50;378;81;99;36;104;-10;299;61;95;74;128;76;114;25;282;83;183;64;96;67;252;70;187
76;184;52;246;3;439;51;316;59;136;65;147;20;388;70;95;69;66;84;75;45;252;90;89;74;176;72;113;66;323
54;325;46;193;65;97;-11;66;52;157;59;108;-2;364;24;211;75;120;71;17;35;311;73;62;76;147;76;144;78;206
67;311;43;357;56;172;44;407;-5;339;65;206;2;396;64;78;50;196;83;111;23;240;88;118;59;118;87;129;59;212
55;132;34;336;37;417;60;318;42;103;5;426;2;330;69;160;53;83;27;245;16;199;82;94;60;80;78;113;81;51
  • Paramètre diag voir diag gc
  • Coefficients de corrélations gc:
;aac;aag;acc;acg;agc;atc;atg;cac;cag;ccc;ccg;cgc;cgg;ctc;ctg;gac;gag;gcc;gcg;ggc;ggg;gtc;gtg;tac;tag;tcc;tcg;tga;tgc;tgg;ttc
aac;100.0;67.6;76.9;52.1;52.1;78.5;34.5;82.5;78.5;44.0;67.4;64.3;30.1;58.3;73.5;79.9;60.0;63.3;63.7;72.0;0.5;59.4;58.9;82.9;-12.4;63.6;55.8;38.8;57.8;49.7;82.0
aag;67.6;100.0;62.8;52.5;46.5;66.1;8.4;73.0;67.9;66.5;51.6;64.9;44.3;74.2;49.3;73.1;76.3;70.4;48.8;67.8;22.0;63.9;61.9;76.7;10.8;59.3;61.8;47.7;68.6;43.9;79.7
acc;76.9;62.8;100.0;41.9;54.4;81.6;29.6;84.3;86.4;65.5;74.3;81.1;55.5;64.0;87.7;87.3;71.8;89.0;66.6;85.6;25.2;78.4;71.1;72.8;-8.7;75.9;67.0;48.7;64.9;54.4;81.3
acg;52.1;52.5;41.9;100.0;31.3;63.1;17.1;56.2;57.3;38.1;67.4;63.6;46.3;61.3;42.9;60.8;48.4;49.8;73.2;61.6;24.2;61.8;58.0;51.0;0.5;39.6;70.9;42.5;44.0;44.4;63.8
agc;52.1;46.5;54.4;31.3;100.0;53.1;18.6;51.8;61.7;53.6;39.7;51.8;29.4;39.4;56.7;52.9;49.6;55.8;37.1;53.8;26.1;33.9;59.9;55.2;-7.6;39.1;30.5;23.1;61.5;33.5;50.4
atc;78.5;66.1;81.6;63.1;53.1;100.0;35.1;76.1;79.5;48.9;80.1;82.0;44.9;70.6;75.0;79.8;66.2;78.7;75.5;84.3;13.9;76.7;64.9;66.4;-16.2;61.6;72.9;44.3;62.5;43.8;88.5
atg;34.5;8.4;29.6;17.1;18.6;35.1;100.0;10.2;31.3;-4.6;28.6;19.9;-1.7;-10.2;34.6;19.2;-2.6;16.7;21.2;26.3;1.3;10.8;17.1;8.1;-10.2;26.1;14.0;-10.2;29.2;25.7;23.4
cac;82.5;73.0;84.3;56.2;51.8;76.1;10.2;100.0;83.4;67.0;69.5;79.7;59.9;78.6;75.6;92.3;81.0;79.0;72.7;81.4;29.5;78.1;74.2;91.6;0.4;69.5;65.0;54.0;58.5;60.7;86.6
cag;78.5;67.9;86.4;57.3;61.7;79.5;31.3;83.4;100.0;58.7;79.8;81.5;49.4;65.2;89.6;83.9;70.8;77.9;75.8;84.9;29.1;70.9;77.1;75.7;-13.8;74.6;64.9;53.2;72.0;54.9;82.6
ccc;44.0;66.5;65.5;38.1;53.6;48.9;-4.6;67.0;58.7;100.0;30.9;60.6;66.4;72.5;50.4;67.2;72.0;79.3;34.0;58.1;57.1;59.2;68.2;65.6;19.0;58.4;48.6;39.7;59.7;41.7;61.7
ccg;67.4;51.6;74.3;67.4;39.7;80.1;28.6;69.5;79.8;30.9;100.0;80.0;49.6;57.7;79.3;78.0;59.0;69.1;89.0;84.4;15.2;75.0;63.9;56.9;-15.5;57.8;77.6;54.0;57.7;49.7;77.8
cgc;64.3;64.9;81.1;63.6;51.8;82.0;19.9;79.7;81.5;60.6;80.0;100.0;53.8;72.6;77.5;87.4;69.6;86.6;79.5;95.7;19.4;79.5;75.4;67.2;-6.1;55.4;80.1;52.7;62.8;49.4;84.9
cgg;30.1;44.3;55.5;46.3;29.4;44.9;-1.7;59.9;49.4;66.4;49.6;53.8;100.0;59.4;43.9;59.7;66.0;67.2;52.1;54.5;74.9;65.0;62.2;46.3;8.9;49.9;52.0;44.1;42.1;49.9;52.3
ctc;58.3;74.2;64.0;61.3;39.4;70.6;-10.2;78.6;65.2;72.5;57.7;72.6;59.4;100.0;47.6;79.4;78.3;71.8;63.9;70.3;34.3;78.2;62.3;73.1;9.6;56.1;72.4;58.9;51.9;44.9;79.8
ctg;73.5;49.3;87.7;42.9;56.7;75.0;34.6;75.6;89.6;50.4;79.3;77.5;43.9;47.6;100.0;77.6;59.3;76.0;74.1;83.2;22.4;61.8;74.8;66.4;-18.7;68.5;55.7;45.0;62.4;44.3;73.9
gac;79.9;73.1;87.3;60.8;52.9;79.8;19.2;92.3;83.9;67.2;78.0;87.4;59.7;79.4;77.6;100.0;80.8;87.1;76.2;90.5;24.5;87.1;72.4;84.4;-2.6;71.4;76.6;57.5;62.3;61.4;91.3
gag;60.0;76.3;71.8;48.4;49.6;66.2;-2.6;81.0;70.8;72.0;59.0;69.6;66.0;78.3;59.3;80.8;100.0;78.5;59.3;72.6;45.0;75.9;68.2;75.0;11.1;67.7;62.0;57.9;56.3;57.0;78.3
gcc;63.3;70.4;89.0;49.8;55.8;78.7;16.7;79.0;77.9;79.3;69.1;86.6;67.2;71.8;76.0;87.1;78.5;100.0;60.0;88.2;34.8;84.0;74.4;68.3;-4.2;65.9;74.8;55.6;66.6;52.3;83.4
gcg;63.7;48.8;66.6;73.2;37.1;75.5;21.2;72.7;75.8;34.0;89.0;79.5;52.1;63.9;74.1;76.2;59.3;60.0;100.0;82.1;23.4;70.9;68.7;60.5;-12.9;49.9;73.1;47.3;51.1;47.0;73.3
ggc;72.0;67.8;85.6;61.6;53.8;84.3;26.3;81.4;84.9;58.1;84.4;95.7;54.5;70.3;83.2;90.5;72.6;88.2;82.1;100.0;15.6;83.1;74.8;69.7;-9.9;64.0;79.1;54.0;68.2;50.0;86.7
ggg;0.5;22.0;25.2;24.2;26.1;13.9;1.3;29.5;29.1;57.1;15.2;19.4;74.9;34.3;22.4;24.5;45.0;34.8;23.4;15.6;100.0;26.7;49.5;24.2;20.0;35.9;16.1;15.5;30.1;36.7;20.5
gtc;59.4;63.9;78.4;61.8;33.9;76.7;10.8;78.1;70.9;59.2;75.0;79.5;65.0;78.2;61.8;87.1;75.9;84.0;70.9;83.1;26.7;100.0;52.5;64.0;-1.5;65.1;80.9;59.5;52.6;56.4;81.6
gtg;58.9;61.9;71.1;58.0;59.9;64.9;17.1;74.2;77.1;68.2;63.9;75.4;62.2;62.3;74.8;72.4;68.2;74.4;68.7;74.8;49.5;52.5;100.0;69.5;1.9;59.2;59.3;49.7;64.6;49.6;72.1
tac;82.9;76.7;72.8;51.0;55.2;66.4;8.1;91.6;75.7;65.6;56.9;67.2;46.3;73.1;66.4;84.4;75.0;68.3;60.5;69.7;24.2;64.0;69.5;100.0;2.2;64.9;51.7;50.6;55.9;55.5;81.7
tag;-12.4;10.8;-8.7;0.5;-7.6;-16.2;-10.2;0.4;-13.8;19.0;-15.5;-6.1;8.9;9.6;-18.7;-2.6;11.1;-4.2;-12.9;-9.9;20.0;-1.5;1.9;2.2;100.0;4.7;-5.1;-11.2;2.8;-6.3;-6.0
tcc;63.6;59.3;75.9;39.6;39.1;61.6;26.1;69.5;74.6;58.4;57.8;55.4;49.9;56.1;68.5;71.4;67.7;65.9;49.9;64.0;35.9;65.1;59.2;64.9;4.7;100.0;41.7;44.0;65.3;51.5;69.6
tcg;55.8;61.8;67.0;70.9;30.5;72.9;14.0;65.0;64.9;48.6;77.6;80.1;52.0;72.4;55.7;76.6;62.0;74.8;73.1;79.1;16.1;80.9;59.3;51.7;-5.1;41.7;100.0;60.3;55.8;46.2;76.3
tga;38.8;47.7;48.7;42.5;23.1;44.3;-10.2;54.0;53.2;39.7;54.0;52.7;44.1;58.9;45.0;57.5;57.9;55.6;47.3;54.0;15.5;59.5;49.7;50.6;-11.2;44.0;60.3;100.0;37.1;43.4;54.1
tgc;57.8;68.6;64.9;44.0;61.5;62.5;29.2;58.5;72.0;59.7;57.7;62.8;42.1;51.9;62.4;62.3;56.3;66.6;51.1;68.2;30.1;52.6;64.6;55.9;2.8;65.3;55.8;37.1;100.0;34.1;67.3
tgg;49.7;43.9;54.4;44.4;33.5;43.8;25.7;60.7;54.9;41.7;49.7;49.4;49.9;44.9;44.3;61.4;57.0;52.3;47.0;50.0;36.7;56.4;49.6;55.5;-6.3;51.5;46.2;43.4;34.1;100.0;55.4
ttc;82.0;79.7;81.3;63.8;50.4;88.5;23.4;86.6;82.6;61.7;77.8;84.9;52.3;79.8;73.9;91.3;78.3;83.4;73.3;86.7;20.5;81.6;72.1;81.7;-6.0;69.6;76.3;54.1;67.3;55.4;100.0
Diagramme diagcor-at[modifier | modifier le wikicode]
aaa;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag;cor;diag
92;116;70;272;67;223;67;297;0;434;72;239;71;293;83;38;67;229;61;258;59;329;62;250;14;459;-6;358;46;388;35;290
93;96;63;169;66;119;59;204;-6;394;73;149;69;194;85;79;68;119;62;221;53;230;54;249;15;459;-13;323;41;305;19;217
91;45;11;308;69;54;68;188;9;307;73;140;51;226;70;244;73;53;70;112;75;71;77;147;24;368;4;298;67;165;61;177
69;199;9;284;84;223;60;180;-5;318;75;133;41;208;75;195;80;62;69;130;83;123;77;162;20;385;21;305;65;214;43;182
69;148;25;209;91;118;73;251;33;352;66;136;76;56;46;270;48;239;46;269;53;199;60;308;6;393;-45;375;58;261;49;298
64;229;30;215;67;218;69;170;73;203;5;297;43;355;-13;420;-8;318;0;246;-3;272;17;244;3;155;-39;284;20;181;37;205
8;384;3;335;75;200;64;176;69;100;78;225;54;188;72;219;80;189;71;224;68;174;70;269;31;363;-5;377;68;165;40;265
77;180;13;244;61;104;66;166;69;98;79;129;91;129;38;261;30;226;34;321;32;254;43;345;-5;432;-44;365;41;311;28;288
70;217;26;299;-8;435;62;171;79;79;82;115;92;78;49;396;83;196;73;232;67;303;67;222;34;447;15;324;47;371;32;256
87;60;-4;331;78;174;14;288;60;108;77;107;75;220;41;413;62;199;81;121;76;123;71;157;42;383;21;263;65;212;31;136
69;148;25;277;62;95;72;66;4;375;68;110;73;169;43;335;50;194;61;301;62;78;74;70;46;320;24;271;54;174;45;136
68;182;46;189;85;187;65;219;64;87;0;347;64;247;52;356;76;228;50;192;31;265;70;133;21;327;30;278;68;97;46;157
59;259;47;174;81;209;67;235;49;135;75;55;-4;399;18;464;82;233;76;117;20;264;64;202;36;272;17;208;64;195;69;115
67;223;31;189;67;315;62;215;75;174;54;163;81;201;-15;400;57;387;72;124;40;298;56;178;46;208;6;178;26;238;20;269
23;457;49;107;62;245;66;255;70;133;82;200;67;232;37;386;12;301;63;256;56;306;73;99;40;206;55;253;4;304;-1;138
-7;318;46;208;58;338;58;191;74;194;79;166;86;93;15;492;67;341;17;243;12;438;63;111;66;203;44;251;65;234;41;184
52;336;30;106;21;469;69;298;70;132;66;198;78;169;52;394;33;375;70;215;-12;357;83;258;82;208;77;213;61;315;60;235
41;207;26;233;-8;327;29;352;82;220;74;129;78;204;51;334;70;162;52;245;38;406;32;309;39;363;74;220;75;333;43;340
55;314;31;93;54;293;4;428;34;435;67;242;62;280;44;327;71;178;54;269;1;427;66;215;-4;285;52;367;81;345;75;354
68;291;32;230;13;250;60;152;18;351;16;408;68;245;54;333;69;137;65;87;38;228;62;247;63;319;8;304;58;476;70;365
57;216;46;233;51;423;34;322;59;221;-1;377;25;476;45;332;81;213;64;112;50;253;57;170;16;350;65;332;2;419;59;493
50;168;36;71;66;399;50;457;44;243;62;191;0;336;-5;259;81;82;67;95;42;222;56;59;62;174;32;354;80;440;3;407
65;169;52;120;47;330;64;450;62;414;42;269;53;357;42;293;23;326;76;118;67;280;56;141;72;152;60;220;35;468;61;451
27;250;23;133;50;294;59;355;75;397;64;434;33;226;37;332;27;200;17;305;48;166;52;161;66;114;66;163;75;246;31;491
59;221;37;147;59;227;51;341;67;274;75;420;63;330;22;353;64;260;15;196;5;235;73;130;77;188;69;129;83;293;60;272
63;164;29;118;26;350;62;266;71;265;65;306;79;282;58;289;65;118;69;127;70;113;35;334;85;56;82;198;87;249;68;317
44;416;40;146;57;237;36;421;69;184;58;296;60;238;52;286;81;156;49;64;43;326;-26;213;33;310;79;71;77;311;68;269
91;33;18;302;56;300;66;274;42;353;67;212;56;190;44;314;85;155;72;287;25;176;56;237;42;174;25;271;83;227;72;331
79;159;23;296;45;449;60;360;67;190;38;382;65;189;47;345;83;76;75;261;51;96;62;125;64;241;32;150;36;298;73;221
77;129;19;297;90;169;33;392;73;290;58;218;34;283;19;285;84;27;74;135;59;94;66;299;54;92;61;254;25;200;19;282
80;202;33;269;81;154;76;225;42;418;74;320;68;241;53;283;65;151;67;123;67;103;63;274;70;179;63;116;66;345;24;201
85;143;28;354;71;129;62;64;75;150;46;409;66;189;48;336;62;104;66;113;64;116;56;139;81;180;79;164;52;264;55;359
19;276;8;321;71;201;82;89;70;34;81;181;49;441;51;355;67;149;53;226;7;235;54;125;75;49;81;167;79;58;58;264
  • Paramètre diag, voir diag at
  • Coefficients de corrélations at:
cor;aaa;aat;aca;act;aga;agg;agt;ata;att;caa;cat;cca;cct;cga;cgt;cta;ctt;gaa;gat;gca;gct;gga;ggt;gta;gtt;taa;tat;tca;tct;tgt;tta;ttg;ttt
aaa;100.0;91.5;70.3;67.2;67.4;-0.3;72.3;71.2;83.0;66.8;61.2;58.8;62.0;13.9;-5.9;45.7;34.7;60.4;65.0;54.7;45.8;63.6;30.9;61.0;62.2;49.3;91.3;77.6;73.3;72.7;84.4;10.8;92.9
aat;91.5;100.0;62.8;65.9;59.1;-6.4;72.8;69.3;84.9;68.3;62.0;53.1;54.0;14.7;-12.9;41.1;19.3;43.5;61.2;44.1;39.6;56.1;20.2;49.6;49.7;40.8;92.0;78.7;68.6;68.6;91.0;8.9;90.5
aca;70.3;62.8;100.0;69.0;67.8;8.6;72.8;50.7;69.9;73.2;69.7;74.9;77.1;24.2;3.9;67.5;61.4;75.3;75.4;76.6;65.6;73.3;39.7;76.0;76.2;42.8;74.5;82.3;69.2;63.5;66.8;25.1;69.3
act;67.2;65.9;69.0;100.0;60.0;-4.7;75.3;41.0;75.1;80.0;69.1;83.3;77.3;20.3;20.6;64.7;43.3;69.7;81.0;74.1;81.9;63.4;56.1;71.7;82.1;51.8;73.1;77.2;78.8;66.5;74.8;30.4;68.5
aga;67.4;59.1;67.8;60.0;100.0;33.4;66.4;76.0;45.5;47.8;45.8;53.1;59.8;6.4;-44.6;58.1;48.5;58.7;58.2;52.1;38.5;82.9;11.7;63.2;56.8;17.6;64.4;67.8;60.3;61.5;60.6;3.2;63.6
agg;-0.3;-6.4;8.6;-4.7;33.4;100.0;5.0;43.3;-13.4;-8.0;-0.4;-2.9;17.1;3.0;-38.7;19.7;37.1;2.7;2.2;7.6;-3.6;31.9;-12.0;16.8;12.2;-14.5;-3.8;0.2;3.6;13.9;-8.0;12.6;7.9
agt;72.3;72.8;72.8;75.3;66.4;5.0;100.0;54.4;72.2;79.7;70.9;68.0;70.2;30.7;-4.8;68.3;40.5;60.9;80.3;64.9;62.7;65.8;38.0;69.7;66.8;36.8;81.4;74.8;63.9;71.9;77.9;25.7;76.9
ata;71.2;69.3;50.7;41.0;76.0;43.3;54.4;100.0;37.8;30.4;34.1;32.0;42.8;-4.8;-43.8;40.9;27.6;30.5;35.1;32.3;15.7;62.5;1.5;51.5;33.3;14.5;66.9;53.6;49.5;64.8;62.1;-3.8;69.7
att;83.0;84.9;69.9;75.1;45.5;-13.4;72.2;37.8;100.0;82.6;73.0;67.3;66.9;33.8;15.3;47.3;32.4;60.0;74.7;60.1;62.1;56.7;38.4;53.5;69.7;51.6;85.6;81.7;75.3;67.4;85.0;25.1;87.3
caa;66.8;68.3;73.2;80.0;47.8;-8.0;79.7;30.4;82.6;100.0;80.5;76.2;71.5;42.3;21.2;64.9;31.3;67.9;82.6;66.3;72.3;55.8;50.0;65.0;71.3;50.9;77.9;79.5;70.2;61.9;81.3;46.1;69.2
cat;61.2;62.0;69.7;69.1;45.8;-0.4;70.9;34.1;73.0;80.5;100.0;62.4;74.1;45.8;24.0;54.4;45.0;67.5;86.6;68.6;66.5;55.8;41.9;63.8;68.6;44.0;78.3;66.4;73.9;66.5;67.0;46.9;68.2
cca;58.8;53.1;74.9;83.3;53.1;-2.9;68.0;32.0;67.3;76.2;62.4;100.0;69.6;20.5;29.6;67.8;45.9;71.6;76.9;81.7;77.3;52.4;66.6;66.7;81.0;54.4;62.3;74.3;69.5;57.8;62.3;31.2;58.9
cct;62.0;54.0;77.1;77.3;59.8;17.1;70.2;42.8;66.9;71.5;74.1;69.6;100.0;35.5;16.7;64.1;68.7;73.0;82.5;78.7;85.4;73.3;47.8;76.0;81.3;44.6;68.2;66.8;82.3;69.0;57.6;49.3;66.6
cga;13.9;14.7;24.2;20.3;6.4;3.0;30.7;-4.8;33.8;42.3;45.8;20.5;35.5;100.0;6.4;25.8;20.3;18.7;36.0;25.1;32.6;35.3;5.3;17.4;23.4;-5.1;24.6;16.3;33.6;29.4;21.3;46.3;23.1
cgt;-5.9;-12.9;3.9;20.6;-44.6;-38.7;-4.8;-43.8;15.3;21.2;24.0;29.6;16.7;6.4;100.0;4.5;-0.6;23.9;25.3;31.7;41.6;-26.4;69.9;15.2;26.7;41.6;0.1;-1.1;17.7;4.0;-8.0;30.0;-7.5
cta;45.7;41.1;67.5;64.7;58.1;19.7;68.3;40.9;47.3;64.9;54.4;67.8;64.1;25.8;4.5;100.0;41.2;55.5;65.6;61.0;63.5;56.2;43.1;68.5;64.4;36.8;53.5;61.6;59.1;60.1;53.9;26.4;52.1
ctt;34.7;19.3;61.4;43.3;48.5;37.1;40.5;27.6;32.4;31.3;45.0;45.9;68.7;20.3;-0.6;41.2;100.0;57.6;52.4;63.5;54.2;62.0;25.0;49.4;65.2;22.4;33.2;41.6;44.1;33.5;12.7;31.1;40.7
gaa;60.4;43.5;75.3;69.7;58.7;2.7;60.9;30.5;60.0;67.9;67.5;71.6;73.0;18.7;23.9;55.5;57.6;100.0;79.4;79.1;70.1;65.6;51.2;72.4;80.7;58.2;63.1;63.8;61.9;49.7;51.1;31.6;55.4
gat;65.0;61.2;75.4;81.0;58.2;2.2;80.3;35.1;74.7;82.6;86.6;76.9;82.5;36.0;25.3;65.6;52.4;79.4;100.0;81.4;81.4;63.3;58.9;75.0;85.0;52.1;78.8;74.7;74.9;64.4;66.3;45.7;67.8
gca;54.7;44.1;76.6;74.1;52.1;7.6;64.9;32.3;60.1;66.3;68.6;81.7;78.7;25.1;31.7;61.0;63.5;79.1;81.4;100.0;75.5;56.2;67.3;74.0;83.5;44.0;59.6;65.4;67.4;59.3;47.5;36.0;56.8
gct;45.8;39.6;65.6;81.9;38.5;-3.6;62.7;15.7;62.1;72.3;66.5;77.3;85.4;32.6;41.6;63.5;54.2;70.1;81.4;75.5;100.0;53.7;64.5;67.0;84.0;47.3;55.5;57.8;71.2;51.4;49.6;52.1;50.1
gga;63.6;56.1;73.3;63.4;82.9;31.9;65.8;62.5;56.7;55.8;55.8;52.4;73.3;35.3;-26.4;56.2;62.0;65.6;63.3;56.2;53.7;100.0;6.7;65.5;65.3;19.0;65.3;66.9;69.1;61.9;58.8;22.8;64.9
ggt;30.9;20.2;39.7;56.1;11.7;-12.0;38.0;1.5;38.4;50.0;41.9;66.6;47.8;5.3;69.9;43.1;25.0;51.2;58.9;67.3;64.5;6.7;100.0;53.4;61.5;52.9;33.8;37.8;41.6;36.2;25.5;36.9;27.0
gta;61.0;49.6;76.0;71.7;63.2;16.8;69.7;51.5;53.5;65.0;63.8;66.7;76.0;17.4;15.2;68.5;49.4;72.4;75.0;74.0;67.0;65.5;53.4;100.0;66.8;48.3;67.8;58.1;67.4;65.5;57.5;29.4;59.3
gtt;62.2;49.7;76.2;82.1;56.8;12.2;66.8;33.3;69.7;71.3;68.6;81.0;81.3;23.4;26.7;64.4;65.2;80.7;85.0;83.5;84.0;65.3;61.5;66.8;100.0;50.8;65.5;74.4;73.0;59.7;55.8;39.9;63.3
taa;49.3;40.8;42.8;51.8;17.6;-14.5;36.8;14.5;51.6;50.9;44.0;54.4;44.6;-5.1;41.6;36.8;22.4;58.2;52.1;44.0;47.3;19.0;52.9;48.3;50.8;100.0;48.7;46.5;42.5;33.1;45.0;17.7;44.1
tat;91.3;92.0;74.5;73.1;64.4;-3.8;81.4;66.9;85.6;77.9;78.3;62.3;68.2;24.6;0.1;53.5;33.2;63.1;78.8;59.6;55.5;65.3;33.8;67.8;65.5;48.7;100.0;81.4;74.8;75.6;90.1;22.9;91.4
tca;77.6;78.7;82.3;77.2;67.8;0.2;74.8;53.6;81.7;79.5;66.4;74.3;66.8;16.3;-1.1;61.6;41.6;63.8;74.7;65.4;57.8;66.9;37.8;58.1;74.4;46.5;81.4;100.0;69.5;62.4;81.5;18.6;78.9
tct;73.3;68.6;69.2;78.8;60.3;3.6;63.9;49.5;75.3;70.2;73.9;69.5;82.3;33.6;17.7;59.1;44.1;61.9;74.9;67.4;71.2;69.1;41.6;67.4;73.0;42.5;74.8;69.5;100.0;82.1;70.9;33.5;76.8
tgt;72.7;68.6;63.5;66.5;61.5;13.9;71.9;64.8;67.4;61.9;66.5;57.8;69.0;29.4;4.0;60.1;33.5;49.7;64.4;59.3;51.4;61.9;36.2;65.5;59.7;33.1;75.6;62.4;82.1;100.0;71.2;27.7;80.2
tta;84.4;91.0;66.8;74.8;60.6;-8.0;77.9;62.1;85.0;81.3;67.0;62.3;57.6;21.3;-8.0;53.9;12.7;51.1;66.3;47.5;49.6;58.8;25.5;57.5;55.8;45.0;90.1;81.5;70.9;71.2;100.0;8.5;84.8
ttg;10.8;8.9;25.1;30.4;3.2;12.6;25.7;-3.8;25.1;46.1;46.9;31.2;49.3;46.3;30.0;26.4;31.1;31.6;45.7;36.0;52.1;22.8;36.9;29.4;39.9;17.7;22.9;18.6;33.5;27.7;8.5;100.0;18.8
ttt;92.9;90.5;69.3;68.5;63.6;7.9;76.9;69.7;87.3;69.2;68.2;58.9;66.6;23.1;-7.5;52.1;40.7;55.4;67.8;56.8;50.1;64.9;27.0;59.3;63.3;44.1;91.4;78.9;76.8;80.2;84.8;18.8;100.0

Caractérisation des aas par les courbes et les coefficients de corrélation[modifier | modifier le wikicode]

Tableau des diagrammes aas DRNA[modifier | modifier le wikicode]

6550;304;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
aas;KEGG;%AT;%GC;A;C;D;E;F;G;H;I;K;L;M;N;P;Q;R;S;T;V;W;Y
5,710;zin;86.5;13.5;92.911;58.499;147.969;196.145;461.114;216.792;60.794;1073.638;1262.901;591.877;75.705;863.728;142.234;97.499;128.469;308.556;174.351;134.205;63.088;392.291
5,760;crp;83.4;16.6;90.967;103.475;191.031;218.322;599.247;218.322;81.871;985.859;979.036;667.473;70.500;732.287;112.572;103.475;128.491;408.216;192.169;210.362;50.032;399.119
5,864;hcr;77.5;22.5;255.776;25.689;377.521;442.302;321.674;309.388;91.588;767.328;782.964;632.180;97.172;543.943;195.462;234.554;221.151;371.936;235.671;254.659;75.951;306.037
6,157;mcac;76.3;23.7;303.175;35.104;444.657;442.529;276.581;321.259;92.548;618.052;621.243;631.881;125.525;494.654;190.415;272.326;223.392;378.703;325.514;396.787;64.890;284.027
6,041;ssdc;75.8;24.2;317.670;78.062;340.439;387.059;291.650;380.554;123.599;710.151;604.983;628.836;147.451;419.585;243.945;202.745;328.512;385.975;291.650;333.933;65.052;261.292
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7,021;gau;35.7;64.3;652.073;46.643;443.111;500.016;236.015;500.016;123.138;333.966;302.248;629.684;118.474;185.640;319.040;204.298;504.680;298.517;363.818;540.129;81.159;161.386
6,764;xcb;35.0;65.0;676.849;49.384;457.042;448.328;210.123;510.299;136.532;330.194;301.144;642.958;156.866;204.313;309.859;250.792;477.377;305.018;325.352;490.933;75.528;184.947
6,688;rru;34.6;65.4;691.395;65.614;450.484;490.636;229.159;523.933;133.187;365.284;321.215;600.319;181.173;151.794;320.236;191.945;481.822;279.104;327.091;505.326;71.490;162.566
6,845;dpt;33.8;66.2;641.091;39.231;436.324;548.276;210.507;531.053;122.477;280.357;286.099;622.910;158.837;170.320;334.898;256.436;473.642;331.071;329.157;475.555;87.073;208.594
6,664;pae;33.4;66.6;626.069;62.902;428.518;495.352;223.105;510.094;136.615;345.960;358.737;651.623;162.169;223.105;289.938;244.727;418.690;291.904;304.681;510.094;71.747;187.723
6,576;roa;32.6;67.4;612.536;37.848;495.008;497.000;204.179;533.852;136.451;314.734;293.818;602.576;141.431;194.219;317.722;214.138;440.229;327.682;349.593;545.804;92.627;192.227
7,207;bmv;31.9;68.1;693.407;50.892;432.584;485.294;219.927;525.281;129.957;320.803;335.343;607.072;160.856;187.211;308.080;228.106;517.101;268.093;309.897;502.561;69.977;191.755
6,617;tos;31.4;68.6;590.923;34.644;323.672;682.977;237.557;497.880;125.707;261.313;340.499;753.254;129.667;122.738;400.878;186.086;546.381;219.740;257.354;525.595;86.114;220.730
7,209;vin;31.1;68.9;620.531;52.695;408.842;542.397;235.311;511.507;129.921;337.068;347.970;612.354;130.829;172.622;339.793;201.695;501.513;312.537;330.708;528.769;74.500;152.634
6,713;age;30.6;69.4;568.814;54.637;389.291;561.984;226.355;487.833;127.812;339.532;450.758;646.867;130.739;183.425;320.019;216.598;443.928;305.384;318.067;518.079;67.321;186.352
6,646;opr;30.0;70.0;614.953;35.478;406.027;622.837;232.579;498.664;131.072;284.810;319.303;678.026;132.057;148.811;349.853;194.144;541.041;226.666;281.854;532.171;94.608;218.782
6,487;mts;29.7;70.3;668.393;27.261;494.732;475.549;232.221;524.012;112.072;310.975;299.868;619.930;127.217;176.690;314.004;235.250;440.211;322.081;379.631;515.935;87.840;179.719
6,581;sma;29.3;70.7;644.913;39.809;436.909;529.466;230.895;516.528;131.371;284.638;310.514;598.137;149.285;186.109;326.437;221.938;440.890;312.504;383.166;523.494;97.533;179.142
6,465;amd;28.7;71.3;676.746;36.471;463.997;481.219;215.789;534.913;147.912;275.561;255.300;608.869;128.663;184.383;336.347;214.776;492.363;292.784;369.779;543.018;92.191;192.488
6,559;sho;28.0;72.0;661.056;41.940;438.374;528.246;226.676;517.261;136.805;301.569;294.579;588.160;151.783;183.738;328.531;214.693;456.348;295.578;387.447;509.273;96.862;184.736
6,561;sgr;27.8;72.2;646.879;41.927;447.225;511.114;228.604;513.111;135.765;285.505;302.476;586.983;156.728;195.661;329.429;213.630;451.218;298.483;391.322;535.073;95.834;176.694
6,452;cmi;27.3;72.7;643.595;25.378;483.204;494.371;215.209;522.794;124.862;310.631;247.693;633.444;131.968;156.331;326.873;229.420;527.870;337.025;375.600;514.673;93.392;149.225
6,571;salb;26.7;73.3;641.907;41.864;453.522;524.291;228.256;518.310;134.561;289.058;287.064;600.044;149.513;187.389;321.950;217.292;464.486;300.022;389.730;518.310;96.685;179.415
6,532;ksk;25.8;74.2;674.818;44.119;438.181;511.378;217.586;506.364;136.367;282.762;259.700;610.645;147.397;181.489;345.932;207.559;473.275;316.854;371.000;529.427;100.270;188.508
6,733;ade;25.1;74.9;690.665;50.584;397.862;539.886;219.846;517.513;135.215;326.850;365.761;606.035;131.324;170.234;352.142;192.608;509.731;268.484;282.103;543.777;75.876;167.316
;;Moyenne;;489.562;57.628;418.549;521.403;247.595;453.108;128.477;433.359;449.512;611.379;154.256;261.483;285.912;220.434;383.199;335.807;325.198;470.634;73.624;222.499
;;Max;;693.41;121.45;525.52;693.99;599.25;538.34;162.29;1073.64;1262.90;753.25;206.81;863.73;400.88;302.06;546.38;496.36;391.32;588.10;116.56;399.12
;;min;;90.97;21.48;147.97;196.15;171.03;216.79;60.79;261.31;228.63;543.31;70.50;122.74;112.57;97.50;128.47;219.74;174.35;134.20;50.03;149.22
;;sans zin ni crp;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;Max;;693.41;121.45;525.52;693.99;326.42;538.34;162.29;767.33;782.96;753.25;206.81;543.94;400.88;302.06;546.38;496.36;391.32;588.10;116.56;306.04
;;min;;220.84;21.48;292.42;340.34;171.03;309.39;91.59;261.31;228.63;543.31;97.17;122.74;190.42;148.45;221.15;219.74;230.86;254.66;53.59;149.22

Courbes à partir des équations de tendance[modifier | modifier le wikicode]

x3;358;-129;400;931;-394;185;96;-892;-781;-100;-10;-816;109;83;157;127;303;553;26;-206
x2;-0.57849;0.16783;-0.63756;-1.4373;0.64072;-0.32993;-0.16141;1.4541;1.2957;0.14754;-0.04329;1.3475;-0.20295;-0.174;-0.26066;-0.17896;-0.46813;-0.88415;-0.02951;0.33194
x;36.621;-6.8189;33.275;70.122;-34.309;21.534;8.8177;-81.101;-74.904;-6.4651;5.2984;-74.738;14.038;11.001;18.23;6.082;23.712;47.17;1.4131;-18.906
cte;-315.43;145.47;-138.18;-539.3;836.99;-10.255;-23.863;1922.6;1883.1;691.18;24.346;1605.9;-30.062;13.33;-56.1;314.31;-62.377;-347.39;43.687;584.11
%GC;A;C;D;E;F;G;H;I;K;L;M;N;P;Q;R;S;T;V;W;Y
13.54;83.22;80.71;205.39;169.71;480.15;225.40;68.31;1068.99;1087.11;628.21;87.90;820.78;125.50;132.44;146.83;367.00;180.37;142.89;58.05;383.88
16.56;148.72;72.71;256.25;270.18;426.58;264.32;82.27;937.65;962.38;620.03;99.78;700.55;151.74;151.59;181.48;371.72;215.72;216.49;60.18;352.66
22.53;256.95;62.28;333.63;417.45;344.18;328.59;103.85;731.48;763.88;608.98;120.60;512.72;195.66;182.35;240.27;375.02;268.89;329.80;63.52;303.09
23.66;274.65;61.00;345.21;438.56;331.69;339.08;107.13;699.52;732.67;607.56;124.16;483.77;202.92;187.22;250.13;374.85;276.74;347.00;64.05;295.31
24.24;283.35;60.42;350.77;448.54;325.69;344.22;108.71;684.05;717.50;606.91;125.92;469.78;206.50;189.58;255.00;374.67;280.50;355.28;64.30;291.52
25.07;295.48;59.68;358.34;462.00;317.48;351.39;110.88;662.77;696.56;606.07;128.39;450.56;211.49;192.84;261.83;374.32;285.60;366.60;64.66;286.31
25.50;301.60;59.33;362.08;468.57;313.41;355.00;111.95;652.15;686.08;605.68;129.65;441.00;214.01;194.47;265.30;374.09;288.12;372.22;64.84;283.70
26.17;310.97;58.84;367.70;478.35;307.28;360.52;113.57;636.10;670.18;605.11;131.58;426.54;217.88;196.95;270.63;373.67;291.88;380.68;65.12;279.73
26.31;312.89;58.74;368.84;480.31;306.04;361.65;113.89;632.83;666.94;605.00;131.97;423.60;218.67;197.45;271.73;373.57;292.65;382.40;65.18;278.92
27.12;323.72;58.25;375.13;491.04;299.15;368.02;115.71;614.61;648.82;604.41;134.22;407.24;223.14;200.27;277.93;372.96;296.84;391.92;65.49;274.41
27.38;327.10;58.10;377.06;494.28;297.04;370.01;116.27;608.98;643.19;604.24;134.92;402.19;224.54;201.14;279.88;372.74;298.13;394.85;65.59;273.01
28.31;338.91;57.67;383.62;505.17;289.81;376.93;118.19;589.62;623.79;603.71;137.38;384.87;229.43;204.15;286.71;371.88;302.48;404.87;65.94;268.17
28.48;341.05;57.60;384.78;507.06;288.53;378.18;118.53;586.17;620.32;603.62;137.83;381.79;230.32;204.69;287.95;371.70;303.24;406.64;66.00;267.31
29.00;347.39;57.41;388.16;512.53;284.78;381.88;119.52;576.01;610.08;603.38;139.15;372.73;232.94;206.27;291.65;371.16;305.47;411.84;66.19;264.75
29.68;355.52;57.20;392.39;519.24;280.08;386.63;120.76;563.17;597.08;603.12;140.86;361.30;236.32;208.27;296.42;370.38;308.25;418.38;66.43;261.51
29.93;358.46;57.14;393.88;521.57;278.41;388.34;121.21;558.60;592.44;603.03;141.48;357.23;237.54;208.99;298.15;370.08;309.23;420.69;66.52;260.35
30.55;365.49;57.01;397.38;526.93;274.51;392.42;122.24;547.77;581.41;602.86;142.95;347.64;240.46;210.68;302.31;369.30;311.51;426.14;66.73;257.60
31.15;372.15;56.92;400.57;531.72;270.91;396.28;123.20;537.72;571.11;602.73;144.35;338.75;243.22;212.25;306.26;368.51;313.58;431.15;66.93;255.03
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55.07;544.78;63.49;428.79;518.30;232.68;484.00;132.55;376.49;383.27;615.58;168.14;213.84;309.56;230.09;419.51;318.63;329.79;492.47;75.43;205.59
55.41;546.68;63.46;428.60;517.10;232.83;484.71;132.47;375.76;382.14;615.81;168.00;213.64;310.11;229.87;420.83;317.91;329.69;492.51;75.62;205.22
56.11;550.51;63.36;428.24;514.79;233.10;486.09;132.31;374.27;379.88;616.27;167.68;213.24;311.21;229.41;423.48;316.50;329.53;492.61;76.00;204.45
56.76;554.12;63.23;427.94;512.73;233.34;487.38;132.16;372.83;377.73;616.69;167.33;212.84;312.22;228.95;425.97;315.20;329.42;492.75;76.37;203.71
57.16;556.32;63.13;427.77;511.55;233.47;488.15;132.07;371.93;376.42;616.93;167.09;212.58;312.82;228.65;427.48;314.43;329.37;492.86;76.60;203.26
57.48;558.12;63.04;427.65;510.62;233.57;488.78;132.00;371.19;375.35;617.12;166.88;212.36;313.31;228.41;428.71;313.82;329.34;492.96;76.79;202.89
58.38;563.22;62.71;427.35;508.20;233.80;490.53;131.81;368.98;372.26;617.63;166.22;211.66;314.66;227.68;432.18;312.13;329.32;493.33;77.34;201.82
58.65;564.72;62.60;427.29;507.56;233.85;491.04;131.75;368.31;371.34;617.77;166.02;211.44;315.05;227.46;433.19;311.65;329.34;493.46;77.51;201.50
59.09;567.23;62.39;427.20;506.54;233.92;491.88;131.66;367.15;369.78;617.99;165.65;211.03;315.70;227.09;434.89;310.87;329.38;493.71;77.79;200.95
59.62;570.35;62.10;427.13;505.41;233.98;492.92;131.55;365.66;367.82;618.25;165.16;210.48;316.49;226.61;436.98;309.93;329.47;494.07;78.14;200.26
60.01;572.61;61.88;427.10;504.68;234.00;493.66;131.48;364.55;366.38;618.42;164.80;210.05;317.05;226.26;438.49;309.28;329.56;494.36;78.40;199.76
60.49;575.44;61.57;427.11;503.87;234.00;494.58;131.40;363.10;364.54;618.63;164.31;209.46;317.75;225.82;440.37;308.48;329.70;494.77;78.73;199.12
61.27;580.12;61.00;427.20;502.81;233.92;496.09;131.27;360.57;361.43;618.92;163.46;208.36;318.88;225.07;443.45;307.24;330.02;495.55;79.29;198.03
61.90;583.97;60.48;427.37;502.19;233.78;497.32;131.18;358.37;358.80;619.13;162.73;207.35;319.79;224.45;445.97;306.29;330.35;496.31;79.75;197.11
62.27;586.22;60.15;427.50;501.94;233.66;498.03;131.14;357.02;357.23;619.24;162.28;206.70;320.32;224.08;447.43;305.76;330.58;496.79;80.03;196.56
62.67;588.73;59.77;427.68;501.76;233.51;498.82;131.09;355.48;355.44;619.34;161.76;205.93;320.89;223.67;449.05;305.20;330.86;497.37;80.34;195.94
63.01;590.91;59.42;427.86;501.68;233.35;499.51;131.06;354.09;353.86;619.42;161.31;205.22;321.39;223.31;450.45;304.73;331.12;497.91;80.61;195.39
63.39;593.32;59.02;428.10;501.68;233.15;500.26;131.03;352.52;352.09;619.50;160.79;204.40;321.94;222.92;451.99;304.23;331.44;498.54;80.91;194.77
63.79;595.94;58.57;428.39;501.79;232.90;501.07;131.00;350.75;350.12;619.56;160.22;203.45;322.52;222.49;453.66;303.72;331.82;499.27;81.24;194.09
64.27;599.10;57.99;428.78;502.06;232.55;502.05;130.98;348.53;347.69;619.63;159.50;202.22;323.22;221.97;455.67;303.13;332.32;500.22;81.64;193.26
64.96;603.68;57.11;429.46;502.74;231.97;503.47;130.97;345.17;344.09;619.68;158.45;200.31;324.22;221.23;458.54;302.35;333.11;501.70;82.22;192.02
65.45;607.04;56.43;430.02;503.45;231.47;504.50;130.98;342.60;341.36;619.69;157.65;198.79;324.95;220.69;460.63;301.84;333.76;502.88;82.66;191.09
66.16;612.04;55.37;430.97;504.81;230.64;506.03;131.01;338.59;337.19;619.66;156.44;196.36;326.01;219.89;463.72;301.14;334.80;504.77;83.30;189.67
66.56;614.84;54.75;431.56;505.73;230.12;506.89;131.04;336.25;334.79;619.62;155.74;194.90;326.60;219.45;465.44;300.79;335.44;505.91;83.67;188.86
67.37;620.82;53.36;432.95;508.08;228.89;508.72;131.13;331.05;329.52;619.49;154.23;191.60;327.84;218.52;469.07;300.14;336.89;508.48;84.45;187.09
68.15;626.67;51.93;434.48;510.86;227.53;510.51;131.26;325.69;324.17;619.30;152.72;188.08;329.05;217.63;472.59;299.61;338.45;511.22;85.23;185.31
68.55;629.78;51.14;435.36;512.53;226.74;511.46;131.35;322.72;321.25;619.18;151.91;186.11;329.68;217.16;474.45;299.37;339.33;512.76;85.64;184.34
68.94;632.81;50.35;436.26;514.26;225.94;512.39;131.44;319.78;318.36;619.04;151.11;184.11;330.29;216.72;476.24;299.18;340.22;514.31;86.04;183.39
69.45;636.88;49.27;437.53;516.78;224.80;513.64;131.58;315.70;314.40;618.83;150.02;181.33;331.11;216.13;478.64;298.95;341.47;516.47;86.58;182.08
70.02;641.58;47.99;439.10;519.94;223.41;515.08;131.76;310.84;309.71;618.56;148.76;177.96;332.05;215.46;481.40;298.75;342.98;519.08;87.21;180.55
70.28;643.69;47.40;439.83;521.44;222.75;515.73;131.84;308.62;307.58;618.42;148.19;176.40;332.47;215.17;482.62;298.68;343.68;520.29;87.49;179.85
70.72;647.39;46.35;441.15;524.19;221.56;516.87;132.01;304.64;303.78;618.17;147.18;173.59;333.21;214.66;484.76;298.58;344.95;522.46;87.99;178.62
71.29;652.35;44.91;443.01;528.13;219.88;518.40;132.25;299.16;298.58;617.80;145.82;169.67;334.19;214.00;487.62;298.51;346.71;525.49;88.65;176.93
72.04;658.98;42.94;445.65;533.78;217.51;520.46;132.60;291.59;291.46;617.26;143.99;164.20;335.49;213.14;491.40;298.51;349.18;529.71;89.54;174.64
72.23;660.67;42.43;446.35;535.30;216.87;520.98;132.70;289.61;289.61;617.11;143.52;162.75;335.82;212.92;492.36;298.53;349.83;530.83;89.77;174.04
72.66;664.68;41.20;448.04;538.99;215.34;522.23;132.94;284.87;285.18;616.75;142.41;159.27;336.61;212.42;494.63;298.59;351.40;533.51;90.31;172.63
73.32;670.85;39.27;450.76;544.97;212.87;524.16;133.33;277.38;278.23;616.15;140.69;153.71;337.81;211.68;498.09;298.76;353.90;537.77;91.14;170.41
74.20;679.36;36.54;454.71;553.78;209.28;526.84;133.92;266.70;268.38;615.26;138.30;145.70;339.47;210.70;502.83;299.12;357.50;543.90;92.28;167.29
74.91;686.48;34.20;458.19;561.60;206.12;529.10;134.46;257.49;259.93;614.45;136.30;138.71;340.85;209.91;506.75;299.53;360.64;549.24;93.23;164.63

Moyenne des écarts par rapport à la courbe théorique[modifier | modifier le wikicode]

;A;C;D;E;F;G;H;I;K;L;M;N;P;Q;R;S;T;V;W;Y
;11.64;27.52;27.96;15.57;3.97;3.82;11.01;0.43;16.17;5.78;13.87;5.23;13.33;26.38;12.50;15.93;3.33;6.08;8.67;2.19
;38.83;42.32;25.45;19.19;40.48;17.40;0.49;5.14;1.73;7.65;29.34;4.53;25.81;31.74;29.20;9.82;10.92;2.83;16.86;13.17
;0.46;58.75;13.16;5.95;6.54;5.84;11.81;4.90;2.50;3.81;19.43;6.09;0.10;28.63;7.96;0.82;12.35;22.78;19.57;0.97
;10.39;42.45;28.81;0.91;16.62;5.25;13.61;11.65;15.21;4.00;1.10;2.25;6.16;45.46;10.69;1.03;17.62;14.35;1.32;3.82
;12.11;29.20;2.94;13.71;10.45;10.55;13.69;3.82;15.68;3.61;17.10;10.68;18.13;6.94;28.83;3.02;3.98;6.01;1.16;10.37
;7.00;14.55;7.60;8.22;0.26;6.39;21.38;1.37;5.08;5.01;12.31;8.97;8.08;12.44;19.12;1.30;5.01;1.10;10.67;7.85
;10.31;24.59;17.23;6.47;11.42;7.25;16.83;0.08;12.55;1.69;4.42;9.52;0.25;33.91;14.81;1.56;4.33;0.48;8.00;4.33
;8.61;82.00;20.47;24.88;9.86;7.67;1.17;14.77;1.83;4.65;2.52;4.65;4.06;6.42;18.33;0.58;9.71;0.35;24.91;2.70
;0.22;20.60;13.54;26.24;17.31;14.15;9.38;9.99;3.43;4.86;19.56;14.02;5.60;20.09;0.43;3.84;7.50;14.19;17.78;0.74
;8.42;16.71;5.12;25.08;22.36;12.48;9.01;13.50;2.47;1.96;17.67;16.61;1.00;19.08;3.25;6.45;4.67;11.67;10.16;1.94
;1.33;29.60;1.18;31.14;13.74;0.18;28.69;7.76;24.13;6.18;18.15;7.48;0.61;40.52;12.52;7.31;0.60;1.55;7.35;5.32
;1.60;16.56;11.32;23.23;13.30;7.54;11.63;10.91;7.00;7.34;24.19;12.14;6.81;17.94;2.07;4.90;1.89;13.66;9.05;1.41
;35.25;42.95;5.85;7.74;13.13;6.77;15.23;10.71;1.65;5.49;23.69;7.91;12.11;7.42;41.61;29.51;16.31;15.44;18.87;11.95
;9.78;29.13;3.76;8.27;3.78;1.16;10.17;2.28;12.55;1.52;1.17;1.34;1.60;12.54;0.34;9.32;4.73;1.84;7.16;9.00
;2.40;23.76;10.79;1.11;10.36;3.29;7.53;1.56;12.88;1.47;12.94;6.80;0.41;7.13;13.22;11.45;3.18;10.63;11.45;23.37
;13.38;10.34;11.74;22.87;12.13;11.18;17.20;4.55;5.06;9.85;10.10;10.74;2.11;28.97;7.30;0.28;10.55;8.35;2.56;2.80
;22.39;28.49;1.44;11.40;6.03;0.45;1.73;6.21;12.55;4.98;1.80;3.35;12.67;6.35;13.09;2.41;16.91;11.53;16.57;7.49
;9.14;12.72;8.56;9.40;12.78;3.32;10.72;10.22;7.80;8.14;23.10;17.25;8.03;12.76;0.24;26.02;1.59;2.75;14.13;21.73
;15.87;4.54;9.30;12.15;5.03;1.04;7.04;7.66;14.98;3.30;12.81;8.67;12.40;28.87;7.06;9.79;1.64;13.07;3.37;12.68
;1.91;45.17;8.73;2.38;6.92;2.35;30.24;8.48;16.42;1.90;5.64;1.92;6.41;12.18;4.93;4.28;14.40;1.69;2.49;3.14
;5.90;4.15;16.65;17.78;21.00;4.12;0.98;11.39;11.87;5.35;11.42;12.13;0.82;32.30;2.79;19.85;0.08;4.10;10.47;1.22
;8.87;13.04;10.29;6.65;3.55;3.19;11.07;6.81;9.87;0.32;5.54;8.35;12.27;21.87;9.43;12.43;10.65;10.74;12.03;1.58
;6.22;20.03;4.69;0.30;15.71;6.27;11.16;2.88;13.18;8.52;7.87;5.98;3.93;1.36;3.69;11.15;4.94;5.05;16.82;3.18
;13.22;49.21;17.52;12.10;6.78;2.11;11.74;16.28;0.72;3.03;11.14;1.31;13.73;3.42;1.01;11.16;5.61;1.90;4.10;3.07
;3.36;13.89;15.49;20.84;2.29;5.31;19.73;0.14;29.19;1.58;24.22;26.75;7.82;27.46;0.96;15.68;8.93;6.10;3.15;1.92
;19.81;62.42;0.72;3.03;7.04;3.50;0.28;11.65;17.60;3.70;10.85;2.35;8.38;15.11;12.96;10.05;9.83;2.27;0.85;6.33
;1.99;47.44;4.33;1.22;1.25;0.52;8.37;2.14;9.96;3.20;7.08;5.68;0.45;29.67;4.23;8.05;3.03;1.49;2.54;0.95
;7.58;51.71;4.64;1.15;7.80;1.05;10.19;11.14;12.86;5.72;13.78;10.79;2.30;22.89;3.98;7.27;10.06;3.46;8.86;9.40
;8.32;57.24;2.39;23.03;5.59;10.38;11.23;18.42;8.16;3.69;5.37;2.57;3.16;16.18;9.55;37.89;10.90;4.09;7.86;19.26
;0.58;30.39;2.39;1.57;16.88;1.55;3.74;5.37;5.63;4.30;2.78;17.82;7.48;5.14;8.95;0.67;8.07;2.48;6.66;1.34
;10.45;44.43;8.17;4.95;0.75;3.72;1.69;6.82;10.18;1.10;5.18;2.85;2.28;8.20;5.87;7.08;18.86;0.77;0.87;3.87
;6.20;2.98;0.98;0.38;11.22;5.02;11.04;11.21;31.04;4.20;7.53;1.87;9.43;31.51;6.56;3.82;11.63;2.65;18.68;14.01
;0.62;24.43;8.52;3.82;11.82;1.93;16.24;3.83;20.30;0.65;1.47;0.92;0.94;18.19;11.56;1.90;2.90;15.03;1.50;5.31
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;12.12;13.54;6.42;10.82;9.42;1.36;4.25;4.34;12.48;3.76;1.00;2.00;4.43;13.36;4.11;0.88;2.33;2.15;8.14;3.68
;13.90;16.27;4.76;2.54;1.00;3.85;1.69;6.62;5.90;3.13;14.92;23.64;1.45;13.02;4.60;7.53;2.00;0.49;13.51;14.93
;4.75;29.15;1.24;8.61;8.73;4.94;6.51;17.20;15.15;0.52;1.53;13.26;2.73;16.62;2.14;9.94;1.69;5.79;4.52;9.97
;1.83;14.90;0.71;2.05;3.05;0.63;4.25;2.89;7.15;5.16;4.13;14.47;11.23;11.52;10.04;2.95;9.17;0.83;14.25;0.60
;1.33;29.07;14.33;2.18;10.80;4.94;4.05;4.93;10.83;2.73;8.30;1.37;3.09;2.00;6.15;9.18;3.77;7.34;9.68;2.74
;10.65;2.00;0.44;5.00;3.34;2.89;1.00;1.50;3.45;1.98;5.32;0.46;6.37;4.81;9.42;10.52;8.44;1.69;17.89;3.48
;6.17;32.26;25.65;33.26;4.77;2.66;4.29;19.03;5.99;21.65;14.64;34.05;21.60;14.31;15.16;26.60;24.16;2.50;0.55;19.74
;1.94;4.65;6.29;5.47;4.15;0.17;1.15;5.41;9.30;1.08;13.42;6.24;2.88;6.93;5.31;4.47;2.80;2.81;13.41;16.77
;10.69;10.89;11.03;8.75;0.69;5.02;2.86;7.55;43.37;4.53;12.85;1.16;3.35;0.22;7.25;2.15;6.85;0.31;22.25;2.34
;4.15;26.07;7.53;19.79;4.11;3.19;0.52;8.38;3.10;9.61;11.23;16.38;5.36;9.89;12.39;24.13;17.82;2.52;8.48;21.18
;3.84;42.49;12.48;8.80;4.25;1.61;15.00;0.76;2.51;0.24;14.15;0.16;5.56;9.33;8.79;7.84;10.46;0.84;0.40;0.07
;0.38;14.12;0.96;1.01;4.21;0.07;0.48;6.57;2.22;3.24;1.43;7.21;2.03;3.39;9.05;4.66;11.08;0.20;10.85;0.29
;3.74;18.80;4.74;8.88;1.86;3.19;11.85;7.89;14.50;1.45;11.77;8.67;0.65;0.36;0.97;1.92;6.65;3.34;3.99;8.79
;0.32;2.33;1.63;1.04;4.22;0.61;3.17;3.42;1.07;4.71;5.41;11.90;2.07;0.73;7.13;0.98;10.96;3.86;8.17;5.78
;2.09;1.18;0.20;4.52;5.41;1.51;2.31;1.42;4.44;4.88;9.20;20.22;1.90;0.33;8.36;0.02;11.86;0.80;6.75;1.52
;3.17;38.40;7.85;8.28;0.06;0.11;6.07;9.04;13.15;2.71;7.33;1.84;2.89;8.00;6.72;12.87;6.89;3.53;3.41;13.56
;4.31;6.61;0.61;3.80;7.23;1.12;0.92;4.21;3.18;2.61;6.27;21.91;4.70;2.65;6.75;0.42;10.12;3.62;6.09;5.29
;0.67;20.75;3.64;7.66;3.97;3.89;1.83;6.02;3.23;0.75;6.58;24.56;1.90;1.49;5.88;5.93;3.78;2.66;8.66;12.68
;0.61;47.91;13.17;3.87;6.66;2.19;0.56;26.94;40.71;1.37;3.65;22.73;3.31;8.24;0.59;10.36;21.78;1.00;18.62;1.63
;A;C;D;E;F;G;H;I;K;L;M;N;P;Q;R;S;T;V;W;Y
Moy;8.4;25.3;7.5;7.6;7.8;4.0;8.0;7.6;11.0;4.4;10.2;9.0;4.8;12.0;7.3;8.5;7.5;4.8;8.6;7.8
>20;12;62;6;12;5;0;4;4;18;1;15;14;2;20;4;10;4;1;8;10
ecartt;7.6;19.4;6.5;7.4;6.4;3.4;6.0;5.8;10.1;3.4;7.4;8.2;4.7;9.8;6.8;7.9;6.1;4.5;7.8;7.0

Taux de variation des acides aminés[modifier | modifier le wikicode]

  1. écart*: moyenne des écarts de l'aa calculée ci-dessus
  2. ax et cte: de l'équation de la courbe de tendance linéaire, "effectif de l'aa" = ax+cte. A calculer à partir du tableau des diagrammes des aas. Le signe de ax indique le sens de la variation de l'aa.
  3. Max et Min (avec ou sans zin et crp) sont en fin du tableau des diagrammes des aas.
  4. Les bactéries zin et crp sont extrêmes, ce qui fait que le Maximum et le minimum sans eux ne concernent que 109 bactéries et avec les écart* faibles, le rapport M/m (Maximum sur minimum) reflète mieux la courbe de tendance linéaire.
  • Tableau non formaté
;;;;Sans zin ni crp;;;Avec zin et crp;;
;ax;cte;écart*;Max;min;M/m;Max;min;M/m
A;7.49;131;8.4;693;221;3.1;693;91;7.6
C;-0.24;69;25.3;121;21;5.7;121;21;5.7
D;1.61;342;7.5;526;292;1.8;526;148;3.6
E;0.77;485;7.6;694;340;2.0;694;196;3.5
F;-1.88;338;7.8;326;171;1.9;599;171;3.5
G;3.54;284;4.0;538;309;1.7;538;217;2.5
H;0.42;109;8.0;162;92;1.8;162;61;2.7
I;-7.34;785;7.6;767;261;2.9;1074;261;4.1
K;-8.17;840;11.0;783;229;3.4;1263;229;5.5
L;0.35;595;4.4;753;543;1.4;753;543;1.4
M;0.40;135;10.2;207;97;2.1;207;70;2.9
N;-5.58;528;9.0;544;123;4.4;864;123;7.0
P;2.61;161;4.8;401;190;2.1;401;113;3.6
Q;0.47;198;12.0;302;148;2.0;302;97;3.1
R;4.79;154;7.3;546;221;2.5;546;128;4.3
S;-1.72;418;8.5;496;220;2.3;496;220;2.3
T;1.14;271;7.5;391;231;1.7;391;174;2.2
V;3.09;323;4.8;588;255;2.3;588;134;4.4
W;0.48;51;8.6;117;54;2.2;117;50;2.3
Y;-2.22;329;7.8;306;149;2.1;399;149;2.7

Les coefficients de corrélation entre aas[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Les coefficients de corrélation entre aas
  • Les valeurs présentées ici sont les coefficients de corrélation X 100. La corrélation entre 2 aas est celle de 2 colonnes du tableau des diagrammes des aas. Pour obtenir les valeurs absolues il suffit de copier ce tableau (largeur de colonne 1,3 cm) et de remplacer le moins (-) par rien. Pour extraire le maximum d'une colonne il suffit de remplacer 100 par rien (format sans décimales et option de recherche 'cellule entière').
  • Légende:
  1. moyenne : moyenne des corrélations en valeurs absolues d'un aa.
  2. >74 : nombre de corrélations en valeurs absolues d'un aa supérieures à 0.74.
  3. >79 : nombre de corrélations en valeurs absolues d'un aa supérieures à 0.79.
  4. max : corrélation maximum parmi les valeurs absolues des corrélations d'un aa.
;;A;C;D;E;F;G;H;I;K;L;M;N;P;Q;R;S;T;V;W;Y
;A;100.00;-27.32;62.75;17.01;-69.96;90.26;47.12;-88.74;-88.06;4.46;42.60;-81.23;83.57;36.83;82.79;-57.39;59.03;73.06;55.02;-83.70
;C;-27.32;100.00;-38.43;-20.73;28.85;-21.37;-0.13;27.97;21.91;5.19;1.87;11.97;-25.13;-23.24;-13.34;36.44;-36.93;-16.13;-24.81;10.86
;D;62.75;-38.43;100.00;28.10;-73.58;64.51;41.57;-71.57;-71.89;-27.74;53.56;-59.94;51.25;51.67;43.13;-19.40;66.58;60.69;32.02;-62.27
;E;17.01;-20.73;28.10;100.00;-49.50;35.11;10.16;-47.24;-23.92;0.33;14.55;-56.38;36.45;-6.71;22.32;-29.80;16.85;54.67;1.49;-22.53
;F;-69.96;28.85;-73.58;-49.50;100.00;-79.62;-50.10;82.55;79.74;-5.13;-49.55;81.03;-73.72;-50.81;-66.36;36.79;-60.30;-79.51;-44.41;71.06
;G;90.26;-21.37;64.51;35.11;-79.62;100.00;46.25;-92.73;-89.58;8.04;47.62;-89.76;88.35;30.25;86.04;-51.27;55.81;82.10;57.82;-84.39
;H;47.12;-0.13;41.57;10.16;-50.10;46.25;100.00;-56.15;-65.73;3.95;42.68;-57.56;49.51;54.10;50.89;-6.56;46.86;53.84;27.87;-49.02
;I;-88.74;27.97;-71.57;-47.24;82.55;-92.73;-56.15;100.00;92.00;-8.58;-45.82;93.08;-89.00;-40.24;-83.29;48.08;-63.17;-90.12;-54.62;82.12
;K;-88.06;21.91;-71.89;-23.92;79.74;-89.58;-65.73;92.00;100.00;-11.16;-50.09;86.47;-84.63;-53.54;-86.23;34.00;-65.83;-82.99;-60.24;83.75
;L;4.46;5.19;-27.74;0.33;-5.13;8.04;3.95;-8.58;-11.16;100.00;-34.95;-12.50;17.36;10.69;23.01;-3.25;-27.34;7.75;13.08;-10.46
;M;42.60;1.87;53.56;14.55;-49.55;47.62;42.68;-45.82;-50.09;-34.95;100.00;-45.88;31.87;39.08;29.61;-15.33;43.52;36.43;0.60;-39.48
;N;-81.23;11.97;-59.94;-56.38;81.03;-89.76;-57.56;93.08;86.47;-12.50;-45.88;100.00;-87.50;-31.46;-84.58;43.23;-52.32;-90.27;-47.85;81.37
;P;83.57;-25.13;51.25;36.45;-73.72;88.35;49.51;-89.00;-84.63;17.36;31.87;-87.50;100.00;27.00;89.01;-53.48;50.31;79.85;63.50;-79.62
;Q;36.83;-23.24;51.67;-6.71;-50.81;30.25;54.10;-40.24;-53.54;10.69;39.08;-31.46;27.00;100.00;25.09;-1.54;41.25;28.65;20.66;-38.19
;R;82.79;-13.34;43.13;22.32;-66.36;86.04;50.89;-83.29;-86.23;23.01;29.61;-84.58;89.01;25.09;100.00;-45.71;39.24;77.47;67.62;-80.17
;S;-57.39;36.44;-19.40;-29.80;36.79;-51.27;-6.56;48.08;34.00;-3.25;-15.33;43.23;-53.48;-1.54;-45.71;100.00;-27.41;-41.33;-31.84;24.20
;T;59.03;-36.93;66.58;16.85;-60.30;55.81;46.86;-63.17;-65.83;-27.34;43.52;-52.32;50.31;41.25;39.24;-27.41;100.00;52.03;35.78;-50.40
;V;73.06;-16.13;60.69;54.67;-79.51;82.10;53.84;-90.12;-82.99;7.75;36.43;-90.27;79.85;28.65;77.47;-41.33;52.03;100.00;46.88;-71.93
;W;55.02;-24.81;32.02;1.49;-44.41;57.82;27.87;-54.62;-60.24;13.08;0.60;-47.85;63.50;20.66;67.62;-31.84;35.78;46.88;100.00;-50.63
;Y;-83.70;10.86;-62.27;-22.53;71.06;-84.39;-49.02;82.12;83.75;-10.46;-39.48;81.37;-79.62;-38.19;-80.17;24.20;-50.40;-71.93;-50.63;100.00
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
moyenne;;60.57;20.29;50.99;26.49;59.03;61.70;39.61;64.91;63.54;12.81;34.58;61.84;59.86;31.90;56.28;30.54;46.22;58.48;37.87;55.14
>74;;7;;1;;7;9;;9;9;;;9;9;;8;;;7;;7
>79;;7;;0;;5;9;;9;9;;;9;8;;7;;;6;;7
max;;90.26;38.43;73.58;56.38;82.55;92.73;65.73;93.08;92.00;34.95;53.56;93.08;89.01;54.10;89.01;57.39;66.58;90.27;67.62;84.39

Diagramme coraa[modifier | modifier le wikicode]

;A;C;D;E;F;G;H;I;K;L;M;N;P;Q;R;S;T;V;W;Y
cor moy;58;20;49;25;57;60;38;63;62;12;33;60;58;31;55;30;45;56;37;54
moy. aa;490;58;419;521;248;453;128;433;450;611;154;261;286;220;383;336;325;471;74;222

Synthèse des corrélations des codons et des aas[modifier | modifier le wikicode]

Tableau synthétique[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Tableau synthétique
  • Légende: corrélations en valeur absolue et multipliée par 100 entre 2 aas ou 2 codons.
  1. Corrélations entre aas (acides aminés): d'après la matrice des corrélations.
    1. moy : moyenne des corrélations d'un aa.
    2. >74−79 : nombre de corrélations d'un aa supérieures à 0.74 − dont corrélations supérieures à 0.79.
    3. max : corrélation maximum d'un aa.
  2. Corrélations entre codons
    1. t,c,a,g,t/c,a/g : terminaison des codons (t/c pour t ou c), pour lesquels on a la moyenne "moy" sous moyt (comme pour les aas) et le nombre ">74−79" sous >74−79t (comme pour les aas).
    2. moyt : total des moyennes "moy" des codons d'un aa.
    3. >74−79t  : total des nombres ">74−79" des codons d'un aa.
    4. 0-70 : pour un codon, zéro corrélations supérieures à 0.74 − avec une corrélation maximale (en valeur absolue) de 0.70.
    5. stop : les codons stops. Les codons taa et tga ont une seule corrélation supérieure à 0.74 et c'est celle entre eux. Elle est négative (*). Sont indiqués aussi le maximum de tag et les maxima de taa et tga en dehors de leur corrélation de -0.802.
  3. Résumés :
    1. moyn : nombre des moyennes "moy" pour une gamme donnée en en-tête de la colonne.
    2. 74n : nombre des nombres ">74−79" pour une gamme donnée en en-tête de la colonne.
    3. 74t : total des corrélations supérieures à 0.74 seulement, des codons d'un aa.
    4. moyt : déjà défini dans codons
    5. %total: 20 aas et 61 codons (pour les aas).
  4. Résumé III: La corrélation entre aas traduit peu la corrélation qui existe entre codons. Ainsi
    1. Les aas à un codon, M W, sont peu corrélés avec les autres aas et peu corrélés avec les autres codons;
    2. Les aas, A F I P V Y, sont très corrélés avec les autres aas et leurs codons sont très corrélés avec les autres codons;
    3. Les aas, G K N R, sont très corrélés avec les autres aas et leurs codons sont peu corrélés avec les autres codons;
    4. Les aas, C D E H L Q S T, sont peu corrélés avec les autres aas et leurs codons sont très corrélés avec les autres codons.
  • Tableau synthétique non formaté
;A;C;D;E;F;G;H;I;K;L;M;N;P;Q;R;S;T;V;W;Y
aas;cor tot;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
moy;60.6;20.3;51.0;26.5;59.0;61.7;39.6;64.9;63.5;12.8;34.6;61.8;59.9;31.9;56.3;30.5;46.2;58.5;37.9;55.1
>74−79;7−7;;1−0;;7−5;9−9;;9−9;9−9;;;9−9;9−8;;8−7;;;7−6;;7−7
max;;38;74;56;;;66;;;35;54;;;54;;57;67;;68;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
codons ;cor tot;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
moyt;242.3;111.1;135.2;119.9;131.5;190.9;126.2;171.3;119.4;300.5;19.5;116.4;238.4;129.6;222.5;344.0;241.5;244.1;43.2;126.3
t;56.8;57.8;65.8;-;63.7;39.6;60.0;63.2;-;39.2;-;58.9;63.0;-;18.2;62.5;64.1;62.7;-;66.2
c;66.9;53.3;69.4;-;67.8;68.6;66.2;63.8;-;60.0;-;57.6;53.9;-;66.6;54.8;66.0;62.9;-;60.1
a;59.2;-;-;58.2;-;56.0;-;44.3;62.7;51.5;-;-;60.2;63.3;22.4;63.5;63.0;58.4;-;-
g;59.5;-;-;61.7;-;26.8;-;-;56.8;61.9;19.5;-;61.3;66.3;48.5;58.2;48.4;60.1;43.2;-
t/a;;;;;;;;;;61.2;;;;;53.2;62.3;;;;
c/g;;;;;;;;;;26.6;;;;;13.5;42.6;;;;
>74−79t;62−30;8−5;65−48;25−10;56−40;40−30;44−25;50−24;28−12;47−23;0−0;27−18;51−22;50−33;33−18;75−29;76−33;65−18;0−0;48−28
t;7 −4;8−5;28−21;-;22−15;0-70;14 −6;23−13;-;0-69;-;13−10;21−11;-;0-70;16 −7;25 −10;19−11;-;31−20
c;33−17;0-72;37−27;-;34−25;33−28;30−19;26−11;-;9 −4;-;14 −8;1 −1;-;29−17;4 −76;30−17;24 −7;-;17 −8
a;13 −6;-;-;8 −4;-;6 −2;-;1 −76;20−11;0-69;-;-;12 −3;21−12;0-46;27−12;21 −6;10 −78;-;-
g;9 −3;-;-;17−6;-;1-75;-;-;8 −1;20 −6;0-55;-;17 −7;29−21;1 −75;8 −3;0-73;12 −77;0-72;-
t/a;;;;;;;;;;18−13;;;;;2 −1;20 −7;;;;
c/g;;;;;;;;;;0-52;;;;;0-43;0-65;;;;
codons ;Stop;;max;suivant;;;max;;;;;;;;;;;;;
;;taa;80*;60;;tag;48;;;;;;;;;;;;;
;;tga;80*;62;;*  Corrélation taa/tga =;;;-80.2;;;;;;;;;;;
I;Résumés;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
codons ;>27;12-26;10-6;4-0;;codons ;>58;57-51;<49;;;aas;9-7;1;0;;aas;>58;57-51;<49
74n;11;23;9;18;;moyn;40;8;13;;;74n;10;1;9;;moyn;8;3;9
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
II;;;;;;Les plus faibles;;;;Les plus forts;;;;;;;;;;
;;;;;gamme;<3;%total;<33;%total;>12/7;%total;>54;%total;;;;;;;
;;;;;codons;17;27.9;6;9.8;34;55.7;45;73.8;;;;;;;
;;;;;aas;10;50.0;5;25.0;10;50.0;10;50.0;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
III;A;C;D;E;F;G;H;I;K;L;M;N;P;Q;R;S;T;V;W;Y
aas;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
>74;7;;1;;7;9;;9;9;;;9;9;;8;;;7;;7
moy ;60.6;20.3;51.0;26.5;59.0;61.7;39.6;64.9;63.5;12.8;34.6;61.8;59.9;31.9;56.3;30.5;46.2;58.5;37.9;55.1
codons ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
74t;62;8;65;25;56;40;44;50;28;47;0;27;51;50;33;75;76;65;0;48
moyt;242.3;111.1;135.2;119.9;131.5;190.9;126.2;171.3;119.4;300.5;19.5;116.4;238.4;129.6;222.5;344.0;241.5;244.1;43.2;126.3
Repartition des fréquences de corrélation des aas et des codons[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Repartition des fréquences de corrélation des aas et des codons
  • Les effectifs ou fréquence (fr) sont comptés à partir des matrices des coefficients de corrélation des aas et des codons. La matrice est formatée sans décimales et copiée dans 'writer'. L'effectif d'une corrélation donnée (exemple 3) est affiché (18) quand on exécute la recherche sur la matrice de cette corrélation avec l'option 'tout rechercher'.
  • Légende :
  1. cor : corrélation
  2. fr : fréquence
  • Les diagrammes: Repartition des corrélations codons et aas. Dans le même tableau de diagrammes: Fréquences des corrélations entre codons, Répartition des corrélations entre codons, Fréquences des corrélations entre aas, Répartition des corrélations entre aas
  • Fréquences des corrélations entre codons (multipliées par 100).
cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr
0;18;20;14;40;14;60;34;80;30;-4;10;-24;4;-44;24;-64;30;-84;10
1;12;21;10;41;12;61;26;81;34;-5;20;-25;6;-45;20;-65;40;-85;8
2;12;22;10;42;24;62;64;82;28;-6;14;-26;16;-46;16;-66;58;-86;4
3;18;23;14;43;16;63;24;83;28;-7;12;-27;8;-47;16;-67;44;-87;6
4;16;24;14;44;32;64;46;84;16;-8;10;-28;18;-48;24;-68;48;-88;4
5;8;25;18;45;14;65;46;85;14;-9;14;-29;20;-49;26;-69;60;-89;2
6;18;26;18;46;28;66;46;86;6;-10;12;-30;20;-50;20;-70;58;-90;6
7;2;27;6;47;12;67;64;87;18;-11;10;-31;4;-51;20;-71;52;-91;2
8;18;28;6;48;12;68;42;88;4;-12;6;-32;18;-52;34;-72;64;-92;2
9;14;29;14;49;26;69;40;89;6;-13;14;-33;18;-53;22;-73;52;total;4032
10;10;30;14;50;40;70;40;90;6;-14;6;-34;18;-54;24;-74;42;;
11;14;31;20;51;18;71;28;91;10;-15;16;-35;16;-55;32;-75;52;;
12;6;32;12;52;42;72;30;92;8;-16;6;-36;10;-56;34;-76;44;;
13;4;33;14;53;24;73;48;93;2;-17;6;-37;8;-57;24;-77;56;;
14;10;34;20;54;38;74;24;94;0;-18;10;-38;24;-58;50;-78;42;;
15;18;35;12;55;18;75;48;95;0;-19;10;-39;24;-59;24;-79;58;;
16;16;36;10;56;38;76;34;96;2;-20;6;-40;16;-60;34;-80;26;;
17;14;37;14;57;18;77;28;-1;12;-21;14;-41;22;-61;32;-81;18;;
18;6;38;10;58;38;78;32;-2;16;-22;10;-42;10;-62;36;-82;30;;
19;20;39;8;59;42;79;34;-3;12;-23;8;-43;6;-63;28;-83;26;;
  • Fréquences des corrélations entre aas (multipliées par 100).
cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr
0;4;20;0;40;0;60;0;80;4;-4;0;-24;2;-44;2;-64;0;-84;4
1;4;21;2;41;2;61;2;81;4;-5;2;-25;4;-45;0;-65;0;-85;4
2;2;22;4;42;2;62;0;82;4;-6;0;-26;0;-46;6;-66;6;-86;2
3;0;23;2;43;8;63;4;83;4;-7;4;-27;6;-47;2;-67;0;-87;2
4;4;24;2;44;2;64;0;84;4;-8;0;-28;2;-48;2;-68;0;-88;2
5;2;25;2;45;0;65;2;85;0;-9;2;-29;0;-49;2;-69;0;-89;4
6;0;26;0;46;2;66;0;86;4;-10;2;-30;2;-50;10;-70;2;-90;8
7;0;27;2;47;6;67;2;87;0;-11;2;-31;2;-51;6;-71;0;-91;0
8;4;28;6;48;4;68;2;88;2;-12;0;-32;2;-52;2;-72;6;-92;0
9;0;29;4;49;0;69;0;89;2;-13;4;-33;0;-53;2;-73;0;-93;2
10;2;30;4;50;4;70;0;90;2;-14;0;-34;0;-54;2;-74;4;total;380
11;4;31;0;51;4;71;2;91;0;-15;2;-35;2;-55;2;-75;0;;
12;2;32;4;52;4;72;0;92;2;-16;2;-36;0;-56;4;-76;0;;
13;2;33;0;53;0;73;2;93;2;-17;0;-37;2;-57;2;-77;0;;
14;0;34;2;54;6;74;0;94;0;-18;0;-38;4;-58;2;-78;0;;
15;2;35;2;55;4;75;0;95;0;-19;2;-39;2;-59;0;-79;0;;
16;0;36;8;56;2;76;0;96;0;-20;0;-40;2;-60;6;-80;8;;
17;6;37;4;57;0;77;2;-1;0;-21;4;-41;2;-61;0;-81;2;;
18;0;38;0;58;2;78;0;-2;2;-22;0;-42;0;-62;2;-82;0;;
19;0;39;4;59;2;79;0;-3;2;-23;4;-43;0;-63;2;-83;4;;
Tableaux triés des corrélations des aas et des codons entre eux[modifier | modifier le wikicode]
Tableau trié des corrélations des aas entre eux[modifier | modifier le wikicode]
voir ici





  • Tableau non formaté
Corrélation entre codons dans les gènes de protéines: I Diagrammes étendus.;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
111 bactéries, 6 protéines chaque, d'un total moyen de 6 550 aas.;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Tri du tableau des corrélations entre aas: Corrélations fortes entre groupe d’aas.;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;https://fr.wikiversity.org/wiki/Recherche:Corrélation_entre_les_codons_dans_les_gènes_de_protéines;;;;;;;;;;;;;;;;;
aa;G;A;P;V;R;D;Q;M;H;T;W;E;L;S;C;Y;F;N;K;I;
G;;90;88;82;86;65;30;48;46;56;58;35;8;-51;-21;-84;-80;-90;-90;-93;G
A;90;;84;73;83;63;37;43;47;59;55;17;4;-57;-27;-84;-70;-81;-88;-89;A
P;88;84;;80;89;51;27;32;50;50;63;36;17;-53;-25;-80;-74;-87;-85;-89;P
V;82;73;80;;77;61;29;36;54;52;47;55;8;-41;-16;-72;-80;-90;-83;-90;V
R;86;83;89;77;;43;25;30;51;39;68;22;23;-46;-13;-80;-66;-85;-86;-83;R
D;65;63;51;61;43;;52;54;42;67;32;28;-28;-19;-38;-62;-74;-60;-72;-72;D
Q;30;37;27;29;25;52;;39;54;41;21;-7;11;-2;-23;-38;-51;-31;-54;-40;Q
M;48;43;32;36;30;54;39;;43;44;1;15;-35;-15;2;-39;-50;-46;-50;-46;M
H;46;47;50;54;51;42;54;43;;47;28;10;4;-7;0;-49;-50;-58;-66;-56;H
T;56;59;50;52;39;67;41;44;47;;36;17;-27;-27;-37;-50;-60;-52;-66;-63;T
W;58;55;63;47;68;32;21;1;28;36;;1;13;-32;-25;-51;-44;-48;-60;-55;W
E;35;17;36;55;22;28;-7;15;10;17;1;;0;-30;-21;-23;-50;-56;-24;-47;E
L;8;4;17;8;23;-28;11;-35;4;-27;13;0;;-3;5;-10;-5;-13;-11;-9;L
S;-51;-57;-53;-41;-46;-19;-2;-15;-7;-27;-32;-30;-3;;36;24;37;43;34;48;S
C;-21;-27;-25;-16;-13;-38;-23;2;0;-37;-25;-21;5;36;;11;29;12;22;28;C
Y;-84;-84;-80;-72;-80;-62;-38;-39;-49;-50;-51;-23;-10;24;11;;71;81;84;82;Y
F;-80;-70;-74;-80;-66;-74;-51;-50;-50;-60;-44;-50;-5;37;29;71;;81;80;83;F
N;-90;-81;-87;-90;-85;-60;-31;-46;-58;-52;-48;-56;-13;43;12;81;81;;86;93;N
K;-90;-88;-85;-83;-86;-72;-54;-50;-66;-66;-60;-24;-11;34;22;84;80;86;;92;K
I;-93;-89;-89;-90;-83;-72;-40;-46;-56;-63;-55;-47;-9;48;28;82;83;93;92;;I
;G;A;P;V;R;D;Q;M;H;T;W;E;L;S;C;Y;F;N;K;I;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
90;;;corrélations fortes >79 dans les carrés  5X5.;;;;;;;;;;;;;;;;;;
39;28;24;corrélations moyennes et faibles positives.;;;;;;;;;;;;;;;;;;
-11;;;corrélations faibles positives et négatives de Leu.;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Tableau trié des corrélations des codons entre eux[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Tableau trié des corrélations des codons entre eux
  • Image du tableau formaté: Un tableau de cette taille formaté avec wikipédia serait très compliqué à faire. Aussi j'ai opté de prendre une image de ce tableau formaté sous le tableur calc de LibreOffice.
  • Construction: 3 lignes-colonnes sont ajoutées pour trier les codons. La L-C "ordre original" sert à retrouver l’ordre de la matrice des corrélations entre codons. Elle est numérotée de 1 à 64 de façon progressive sur cette matrice. Les 2 autres L-C "ordres optimisés" séparent les numéros des codons se terminant par "a,t" (en incluant agg, ttg et en excluant tga) des numéros des codons se terminant par "g,c" (en procédant de façon inverse pour agg, ttg et tga).
  • Tri sur les valeurs les plus élevées des corrélations: les numéros des 2 L-C sont obtenus par estimation de l'ordre des codons suivant le classement de leurs corrélations positives avec les autres codons. Le tableau final est optimisé pour avoir des groupes de codons fortement corrélés entre eux, les plus grands possibles. Voici ci-dessous les ordres estimés et optimisés obtenus, à recopier dans un tableur. Les codons ayant beaucoup de corrélations alternées, positives et négatives, ne sont pas inclus, c'est-à-dire atg, tag, ctg, agg. Les tris ne concernent alors que 2 carrés à corrélations positives de 29X29 codons.
Tri par le codon le plus fort;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Effectifs par tranche de corrélations positives;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
codon;;tat;ttt;aat;tta;aaa;att;gat;gtt;caa;act;cct;gca;tca;gct;aca;cca;tct;agt;cat;gaa;tgt;gta;gga;aga;cta;ata;ctt;ggt;taa;ttg;cga;cgt;agg
>82;;5;5;5;5;5;6;4;3;2;1;1;1;0;1;0;1;0;0;1;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;−;−
>89;;4;3;4;2;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;−;−
79-88;;4;4;2;5;2;7;10;7;7;6;5;5;7;4;1;3;3;3;2;3;2;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;−;−
69-78;;6;6;4;4;6;7;6;6;8;12;11;5;7;5;17;8;15;12;9;6;6;8;3;1;1;4;1;0;0;0;0;−;−
59-68;;9;8;6;7;11;6;8;10;7;6;7;10;8;7;7;10;6;9;9;10;14;12;14;14;13;4;4;5;0;0;0;−;−
49-58;;3;4;5;6;2;3;3;4;3;2;3;4;3;8;1;5;1;1;2;7;3;7;8;6;7;5;5;5;10;2;0;−;−
39-48;;;2;5;2;2;2;1;1;3;2;3;3;2;4;2;1;3;1;6;1;;1;;4;6;3;8;5;11;5;3;−;−
29-38;;2;;;;2;4;2;1;2;1;1;2;1;1;;2;2;3;1;2;4;1;1;;1;8;6;7;3;8;8;−;−
19-28;;2;3;2;2;;1;;1;;1;;1;1;;2;1;;1;;1;1;;2;;2;1;5;4;2;9;11;−;−
9-18;;;;2;2;2;;;;;;;;1;1;;;;;;;;1;;2;;2;1;1;3;4;4;−;−
<9;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;1;2;;3;;3;1;2;4;−;−
Total;;30;30;30;30;30;30;30;30;30;30;30;30;30;30;30;30;30;30;29;30;30;30;30;30;30;30;30;30;30;30;30;−;−
ordre estimé;;1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13;14;15;16;17;18;19;20;21;22;23;24;25;26;27;28;29;30;31;32;33
ordre optimisé;;1;2;3;4;5;6;8;9;10;11;12;13;7;14;19;16;17;18;15;20;21;22;23;24;25;26;27;28;29;30;31;32;33
ordre d’origine;;17;9;19;1;7;59;37;51;29;55;48;39;12;40;56;47;11;13;27;35;43;52;31;21;4;60;3;32;62;2;22;23;24
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
codon;;gac;ttc;ggc;cac;cgc;cag;gcc;acc;atc;ccg;ctg;tac;gcg;gtc;aac;tcg;ctc;gag;aag;ccc;gtg;tcc;tgc;acg;cgg;tga;agc;tgg;ggg;atg;tag;;
>89;;3;2;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;−;−;;
79-88;;10;11;11;9;11;9;8;8;7;5;3;3;2;6;5;3;3;2;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;−;−;;
69-78;;7;7;5;8;4;8;8;7;7;7;9;7;10;8;4;8;10;11;6;2;11;5;2;2;1;0;0;0;1;−;−;;
59-68;;5;3;4;4;6;5;6;6;7;4;5;8;6;9;9;7;7;9;12;12;12;11;12;8;8;3;3;2;0;−;−;;
49-58;;2;4;5;4;5;4;4;4;2;8;4;7;4;3;6;6;4;4;4;7;5;7;9;7;10;12;13;14;2;−;−;;
39-48;;;;;;;;;1;3;1;5;1;2;;2;2;3;2;4;3;;4;2;8;7;10;4;9;1;−;−;;
29-38;;;;;1;;2;1;1;1;2;1;;2;1;2;1;1;;;3;;1;4;2;2;1;6;3;7;−;−;;
19-28;;2;2;1;;2;;;1;;;1;1;2;1;;;;;1;;;1;;1;;1;3;1;11;−;−;;
9-18;;;;1;1;;;1;;1;1;;;;1;;2;;;;;1;;;1;1;1;;;5;−;−;;
<9;;;;;;;;;;;;;1;;;1;;1;1;1;1;;;;;;1;;;2;−;−;;
Total;;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;29;−;−;;
ordre estimé;;1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13;14;15;16;17;18;19;20;21;22;23;24;25;26;27;28;29;30;31;;
ordre optimisé;;1;2;3;4;5;6;7;8;9;14;10;11;15;12;13;16;17;18;19;20;21;22;23;24;25;26;27;28;29;30;31;;
ordre d’origine;;38;10;33;28;25;30;42;58;61;49;5;18;41;54;20;14;6;36;8;50;53;15;44;57;26;64;16;46;34;45;63;;
  • Tableau non formaté
;;;;;;;;;;;;;;https://fr.wikiversity.org/wiki/Recherche:Corrélation_entre_les_codons_dans_les_gènes_de_protéines  .;;;;;;;;;;;;;#Diagrammes_étendus_des_aas  .;;;;;/Annexe/Tableaux#Tableau_trié_des_corrélations_des_codons_entre_eux  .;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Corrélation entre codons dans les gènes de protéines: I Diagrammes étendus.;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
111 bactéries, 6 protéines chaque, d'un total moyen de 6 550 aas.;;;;;;;;;;;;;;;91;85;80;corrélations fortes >79 dans le carré  29X29 des positives;;;;;;;;30;-60;corrélations positives/négatives normales;;;;;;;-79;corrélations fortes <-79 dans les rectangles des négatives;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Tri du tableau des corrélations entre codons: Corrélations fortes entre groupe de codons.;;;;;;;;;;;;;;;57;40;;corrélations faibles < 59 dans le carré  29X29 des positives;;;;;;;;9;-26;corrélations positives/négatives anormales (base 3);;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
   tri sur les corrélations les plus élevées;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
ordre original;;;;17;9;19;1;7;59;12;37;51;29;55;48;39;40;27;47;11;13;56;35;43;52;31;21;4;60;3;32;62;2;22;23;24;63;45;34;46;16;64;26;57;44;15;53;50;8;36;6;14;41;49;20;54;18;5;61;58;42;30;25;28;33;10;38;
;ordres optimisés;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;31;30;29;28;27;26;25;24;23;22;21;20;19;18;17;16;15;14;13;12;11;10;9;8;7;6;5;4;3;2;1;
;;;;1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13;14;15;16;17;18;19;20;21;22;23;24;25;26;27;28;29;30;31;32;33;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;tat;ttt;aat;tta;aaa;att;tca;gat;gtt;caa;act;cct;gca;gct;cat;cca;tct;agt;aca;gaa;tgt;gta;gga;aga;cta;ata;ctt;ggt;taa;ttg;cga;cgt;agg;tag;atg;ggg;tgg;agc;tga;cgg;acg;tgc;tcc;gtg;ccc;aag;gag;ctc;tcg;gcg;ccg;aac;gtc;tac;ctg;atc;acc;gcc;cag;cgc;cac;ggc;ttc;gac;
17;;1;tat;100;91;92;90;91;86;81;79;66;78;73;68;60;56;78;62;75;81;75;63;76;68;65;64;54;67;33;34;49;23;25;0;-4;4;-26;-33;-69;-59;-52;-56;-61;-66;-74;-77;-66;-77;-79;-77;-66;-73;-71;-82;-76;-88;-75;-79;-82;-79;-86;-79;-92;-82;-89;-90;tat
9;;2;ttt;91;100;91;85;93;87;79;68;63;69;69;67;57;50;68;59;77;77;69;55;80;59;65;64;52;70;41;27;44;19;23;-8;8;4;-40;-28;-63;-53;-47;-52;-63;-61;-68;-72;-56;-73;-73;-70;-69;-73;-76;-77;-75;-76;-73;-83;-79;-77;-82;-79;-83;-82;-90;-87;ttt
19;;3;aat;92;91;100;91;92;85;79;61;50;68;66;54;44;40;62;53;69;73;63;43;69;50;56;59;41;69;19;20;41;9;15;-13;-6;2;-46;-35;-72;-58;-41;-48;-60;-61;-66;-69;-55;-70;-69;-62;-58;-67;-66;-80;-65;-77;-69;-74;-73;-68;-81;-68;-81;-72;-79;-78;aat
1;;4;tta;90;85;91;100;84;85;81;66;56;81;75;58;47;50;67;62;71;78;67;51;71;57;59;61;54;62;13;26;45;9;21;-8;-8;4;-41;-30;-62;-65;-46;-44;-60;-70;-72;-71;-55;-72;-69;-64;-61;-66;-70;-82;-65;-79;-73;-79;-76;-71;-87;-70;-80;-74;-82;-78;tta
7;;5;aaa;91;93;92;84;100;83;78;65;62;67;67;62;55;46;61;59;73;72;70;60;73;61;64;67;46;71;35;31;49;11;14;-6;0;-1;-39;-38;-70;-52;-49;-58;-64;-65;-68;-75;-61;-78;-76;-69;-70;-68;-70;-71;-75;-74;-68;-76;-77;-79;-82;-78;-82;-80;-84;-84;aaa
59;;6;att;86;87;85;85;83;100;82;75;70;83;75;67;60;62;73;67;75;72;70;60;67;54;57;46;47;38;32;38;52;25;34;15;-13;-2;-30;-31;-66;-58;-51;-51;-58;-64;-67;-71;-62;-77;-79;-72;-66;-69;-70;-74;-74;-77;-70;-75;-77;-77;-79;-73;-80;-79;-85;-84;att
12;;7;tca;81;79;79;81;78;82;100;75;74;79;77;67;65;58;66;74;70;75;82;64;62;58;67;68;62;54;42;38;46;19;16;-1;0;8;-28;-37;-62;-59;-52;-53;-61;-71;-74;-75;-62;-68;-74;-67;-67;-72;-74;-71;-70;-73;-76;-78;-81;-76;-83;-76;-78;-79;-79;-79;tca
37;;8;gat;79;68;61;66;65;75;75;100;85;83;81;83;81;81;87;77;75;80;75;79;64;75;63;58;66;35;52;59;52;46;36;25;2;1;3;-28;-52;-48;-59;-61;-53;-60;-66;-69;-72;-68;-79;-81;-70;-71;-69;-71;-81;-83;-72;-71;-80;-83;-75;-82;-87;-83;-83;-91;gat
51;;9;gtt;66;63;50;56;62;70;74;85;100;71;82;81;83;84;69;81;73;67;76;81;60;67;65;57;64;33;65;62;51;40;23;27;12;4;1;-32;-45;-49;-58;-63;-58;-58;-57;-76;-68;-60;-75;-73;-75;-68;-70;-54;-77;-63;-70;-72;-76;-84;-70;-82;-73;-82;-76;-80;gtt
29;;10;caa;78;69;68;81;67;83;79;83;71;100;80;71;66;72;81;76;70;80;73;68;62;65;56;48;65;30;31;50;51;46;42;21;-8;6;-13;-24;-49;-56;-57;-44;-48;-72;-72;-70;-63;-74;-75;-70;-63;-66;-71;-73;-68;-77;-79;-71;-78;-76;-88;-75;-78;-79;-81;-80;caa
55;;11;act;73;69;66;75;67;75;77;81;82;80;100;77;74;82;69;83;79;75;69;70;66;72;63;60;65;41;43;56;52;30;20;21;-5;-4;-9;-36;-44;-54;-54;-60;-66;-67;-68;-75;-69;-67;-73;-72;-73;-70;-75;-66;-75;-69;-74;-77;-79;-82;-79;-76;-74;-80;-78;-78;act
48;;12;cct;68;67;54;58;62;67;67;83;81;71;77;100;79;85;74;70;82;70;77;73;69;76;73;60;64;43;69;48;45;49;36;17;17;6;-8;-22;-38;-41;-54;-59;-55;-55;-58;-67;-58;-57;-67;-71;-73;-78;-80;-65;-77;-64;-77;-77;-79;-80;-72;-81;-74;-84;-79;-83;cct
39;;13;gca;60;57;44;47;55;60;65;81;83;66;74;79;100;75;69;82;67;65;77;79;59;74;56;52;61;32;64;67;44;36;25;32;8;8;5;-34;-35;-41;-55;-66;-48;-58;-56;-64;-69;-59;-72;-67;-69;-60;-66;-52;-77;-58;-64;-67;-72;-83;-64;-72;-68;-75;-73;-75;gca
40;;14;gct;56;50;40;50;46;62;58;81;84;72;82;85;75;100;66;77;71;63;66;70;51;67;54;39;64;16;54;64;47;52;33;42;-4;-1;10;-26;-30;-40;-53;-57;-48;-55;-52;-63;-64;-54;-64;-70;-67;-67;-67;-50;-69;-58;-66;-62;-68;-74;-63;-69;-63;-73;-66;-70;gct
27;;15;cat;78;68;62;67;61;73;66;87;69;81;69;74;69;66;100;62;74;71;70;68;66;64;56;46;54;34;45;42;44;47;46;24;0;-1;9;-18;-42;-47;-47;-49;-42;-50;-61;-63;-65;-69;-75;-75;-56;-64;-59;-77;-68;-85;-70;-66;-77;-72;-74;-71;-90;-73;-79;-85;cat
47;;16;cca;62;59;53;62;59;67;74;77;81;76;83;70;82;77;62;100;70;68;75;72;58;67;52;53;68;32;46;67;54;31;21;30;-3;-5;-5;-34;-39;-54;-55;-58;-58;-73;-60;-68;-69;-61;-69;-66;-72;-65;-74;-54;-71;-58;-69;-66;-72;-78;-75;-73;-65;-75;-70;-72;cca
11;;17;tct;75;77;69;71;73;75;70;75;73;70;79;82;67;71;74;70;100;64;69;62;82;67;69;60;59;49;44;42;42;33;34;18;4;-2;-15;-26;-40;-58;-45;-58;-60;-60;-56;-70;-66;-69;-72;-71;-72;-67;-72;-69;-74;-70;-70;-73;-79;-83;-73;-78;-78;-82;-78;-83;tct
13;;18;agt;81;77;73;78;72;72;75;80;67;80;75;70;65;63;71;68;64;100;73;61;72;70;66;66;68;54;40;38;37;26;31;-5;5;10;-29;-22;-52;-44;-44;-48;-55;-65;-70;-68;-57;-65;-64;-66;-65;-72;-75;-77;-71;-74;-76;-77;-78;-75;-82;-78;-77;-82;-83;-83;agt
56;;19;aca;75;69;63;67;70;70;82;75;76;73;69;77;77;66;70;75;69;73;100;75;64;76;73;68;67;51;61;40;43;25;24;4;9;9;-21;-30;-48;-50;-50;-56;-55;-66;-66;-74;-61;-63;-69;-65;-69;-74;-73;-68;-72;-66;-79;-76;-85;-78;-81;-77;-76;-81;-76;-79;aca
35;;20;gaa;63;55;43;51;60;60;64;79;81;68;70;73;79;70;68;72;62;61;75;100;50;72;66;59;55;31;58;51;58;32;19;24;3;-3;10;-33;-44;-38;-62;-64;-47;-54;-60;-63;-61;-62;-86;-71;-68;-60;-62;-51;-76;-60;-59;-63;-71;-76;-66;-72;-71;-73;-71;-75;gaa
43;;21;tgt;76;80;69;71;73;67;62;64;60;62;66;69;59;51;66;58;82;72;64;50;100;66;62;62;60;65;34;36;33;28;29;4;14;3;-25;-19;-35;-52;-37;-50;-56;-52;-56;-63;-54;-62;-62;-62;-61;-62;-69;-67;-69;-67;-67;-73;-71;-75;-72;-75;-73;-79;-79;-80;tgt
52;;22;gta;68;59;50;57;61;54;58;75;67;65;72;76;74;67;64;67;67;70;76;72;66;100;66;63;69;52;49;53;48;29;17;15;17;0;-7;-29;-34;-39;-53;-61;-53;-57;-59;-67;-59;-55;-59;-68;-68;-67;-67;-52;-78;-58;-65;-70;-74;-77;-69;-77;-68;-78;-72;-76;gta
31;;23;gga;65;65;56;59;64;57;67;63;65;56;63;73;56;54;56;52;69;66;73;66;62;66;100;83;56;62;62;7;19;23;35;-26;32;22;-32;-18;-35;-43;-32;-49;-50;-48;-51;-65;-41;-43;-55;-49;-60;-72;-70;-64;-62;-54;-76;-75;-77;-71;-69;-77;-66;-80;-68;-71;gga
21;;24;aga;64;64;59;61;67;46;68;58;57;48;60;60;52;39;46;53;60;66;68;59;62;63;83;100;58;76;49;12;18;3;6;-45;33;16;-39;-30;-41;-44;-27;-49;-57;-55;-56;-62;-41;-40;-49;-46;-57;-65;-66;-61;-58;-52;-66;-72;-70;-65;-69;-72;-64;-71;-65;-67;aga
4;;25;cta;54;52;41;54;46;47;62;66;64;65;65;64;61;64;54;68;59;68;67;55;60;69;56;58;100;41;41;43;37;26;26;4;20;9;-13;-16;-29;-39;-45;-44;-46;-56;-57;-57;-47;-41;-46;-55;-56;-59;-65;-50;-60;-51;-66;-62;-66;-65;-67;-68;-58;-69;-62;-64;cta
60;;26;ata;67;70;69;62;71;38;54;35;33;30;41;43;32;16;34;32;49;54;51;31;65;52;62;76;41;100;28;1;15;-4;-5;-44;43;16;-45;-20;-40;-35;-21;-38;-51;-38;-44;-50;-27;-34;-38;-39;-47;-57;-58;-56;-51;-45;-55;-71;-58;-53;-61;-62;-58;-60;-60;-56;ata
3;;27;ctt;33;41;19;13;35;32;42;52;65;31;43;69;64;54;45;46;44;40;61;58;34;49;62;49;41;28;100;25;22;31;20;-1;37;13;-3;-11;-19;-9;-34;-40;-35;-22;-29;-47;-33;-23;-37;-39;-51;-54;-53;-35;-50;-30;-58;-49;-56;-52;-41;-57;-46;-56;-49;-52;ctt
32;;28;ggt;34;27;20;26;31;38;38;59;62;50;56;48;67;64;42;67;42;38;40;51;36;53;7;12;43;1;25;100;53;37;5;70;-12;-23;25;-39;-18;-28;-45;-55;-32;-49;-33;-45;-61;-46;-52;-56;-48;-36;-36;-9;-53;-34;-29;-29;-34;-55;-38;-53;-39;-51;-42;-45;ggt
62;;29;taa;49;44;41;45;49;52;46;52;51;51;52;45;44;47;44;54;42;37;43;58;33;48;19;18;37;15;22;53;100;18;-5;42;-15;-48;8;-26;-38;-21;-80;-44;-40;-41;-45;-49;-48;-52;-60;-59;-54;-37;-42;-32;-53;-48;-33;-36;-42;-50;-44;-47;-51;-46;-49;-52;taa
2;;30;ttg;23;19;9;9;11;25;19;46;40;46;30;49;36;52;47;31;33;26;25;32;28;29;23;3;26;-4;31;37;18;100;46;30;13;8;16;9;6;-9;-28;-13;2;-15;-21;-19;-28;-24;-30;-40;-25;-32;-29;-20;-32;-27;-43;-23;-34;-33;-36;-39;-33;-41;-29;-38;ttg
22;;31;cga;25;23;15;21;14;34;16;36;23;42;20;36;25;33;46;21;34;31;24;19;29;17;35;6;26;-5;20;5;-5;46;100;6;3;19;-2;22;1;-17;-8;-1;-2;-18;-15;-23;-15;-28;-21;-18;-14;-26;-25;-38;-16;-34;-38;-21;-30;-29;-26;-33;-28;-38;-32;-35;cga
23;;32;cgt;0;-8;-13;-8;-6;15;-1;25;27;21;21;17;32;42;24;30;18;-5;4;24;4;15;-26;-45;4;-44;-1;70;42;30;6;100;-39;-33;55;-15;6;-5;-28;-27;3;-13;-2;-6;-39;-31;-30;-30;-15;6;6;15;-21;-11;11;11;0;-20;3;-7;-7;-9;-6;-11;cgt
24;;33;agg;-4;8;-6;-8;0;-13;0;2;12;-8;-5;17;8;-4;0;-3;4;5;9;3;14;17;32;33;20;43;37;-12;-15;13;3;-39;100;28;-19;26;6;11;0;-2;-13;15;16;2;24;24;15;3;-17;-22;-26;-3;-11;14;-17;-29;-14;-10;-7;-32;-5;-22;-10;-9;agg
63;31;;tag;4;4;2;4;-1;-2;8;1;4;6;-4;6;8;-1;-1;-5;-2;10;9;-3;3;0;22;16;9;16;13;-23;-48;8;19;-33;28;100;-10;20;-6;-8;-11;9;0;3;5;2;19;11;11;10;-5;-13;-15;-12;-2;2;-19;-16;-9;-4;-14;-6;0;-10;-6;-3;tag
45;30;;atg;-26;-40;-46;-41;-39;-30;-28;3;1;-13;-9;-8;5;10;9;-5;-15;-29;-21;10;-25;-7;-32;-39;-13;-45;-3;25;8;16;-2;55;-19;-10;100;1;26;19;-10;-2;17;29;26;17;-5;8;-3;-10;14;21;29;34;11;8;35;35;30;17;31;20;10;26;23;19;atg
34;29;;ggg;-33;-28;-35;-30;-38;-31;-37;-28;-32;-24;-36;-22;-34;-26;-18;-34;-26;-22;-30;-33;-19;-29;-18;-30;-16;-20;-11;-39;-26;9;22;-15;26;20;1;100;37;26;15;75;24;30;36;50;57;22;45;34;16;23;15;1;27;24;22;14;25;35;29;19;29;16;21;25;ggg
46;28;;tgg;-69;-63;-72;-62;-70;-66;-62;-52;-45;-49;-44;-38;-35;-30;-42;-39;-40;-52;-48;-44;-35;-34;-35;-41;-29;-40;-19;-18;-38;6;1;6;6;-6;26;37;100;33;43;50;44;34;52;50;42;44;57;45;46;47;50;50;56;56;44;44;54;52;55;49;61;50;55;61;tgg
16;27;;agc;-59;-53;-58;-65;-52;-58;-59;-48;-49;-56;-54;-41;-41;-40;-47;-54;-58;-44;-50;-38;-52;-39;-43;-44;-39;-35;-9;-28;-21;-9;-17;-5;11;-8;19;26;33;100;23;29;31;62;39;60;54;46;50;39;31;37;40;52;34;55;57;53;54;56;62;52;52;54;50;53;agc
64;26;;tga;-52;-47;-41;-46;-49;-51;-52;-59;-58;-57;-54;-54;-55;-53;-47;-55;-45;-44;-50;-62;-37;-53;-32;-27;-45;-21;-34;-45;-80;-28;-8;-28;0;-11;-10;15;43;23;100;44;42;37;44;50;40;48;58;59;60;47;54;39;60;51;45;44;49;56;53;53;54;54;54;58;tga
26;25;;cgg;-56;-52;-48;-44;-58;-51;-53;-61;-63;-44;-60;-59;-66;-57;-49;-58;-58;-48;-56;-64;-50;-61;-49;-49;-44;-38;-40;-55;-44;-13;-1;-27;-2;9;-2;75;50;29;44;100;46;42;50;62;66;44;66;59;52;52;50;30;65;46;44;45;56;67;49;54;60;54;52;60;cgg
57;24;;acg;-61;-63;-60;-60;-64;-58;-61;-53;-58;-48;-66;-55;-48;-48;-42;-58;-60;-55;-55;-47;-56;-53;-50;-57;-46;-51;-35;-32;-40;2;-2;3;-13;0;17;24;44;31;42;46;100;44;40;58;38;53;48;61;71;73;67;52;62;51;43;63;42;50;57;64;56;62;64;61;acg
44;23;;tgc;-66;-61;-61;-70;-65;-64;-71;-60;-58;-72;-67;-55;-58;-55;-50;-73;-60;-65;-66;-54;-52;-57;-48;-55;-56;-38;-22;-49;-41;-15;-18;-13;15;3;29;30;34;62;37;42;44;100;65;65;60;69;56;52;56;51;58;58;53;56;62;62;65;67;72;63;58;68;67;62;tgc
15;22;;tcc;-74;-68;-66;-72;-68;-67;-74;-66;-57;-72;-68;-58;-56;-52;-61;-60;-56;-70;-66;-60;-56;-59;-51;-56;-57;-44;-29;-33;-45;-21;-15;-2;16;5;26;36;52;39;44;50;40;65;100;59;58;59;68;56;42;50;58;64;65;65;68;62;76;66;75;55;70;64;70;71;tcc
53;21;;gtg;-77;-72;-69;-71;-75;-71;-75;-69;-76;-70;-75;-67;-64;-63;-63;-68;-70;-68;-74;-63;-63;-67;-65;-62;-57;-50;-47;-45;-49;-19;-23;-6;2;2;17;50;50;60;50;62;58;65;59;100;68;62;68;62;59;69;64;59;53;69;75;65;71;74;77;75;74;75;72;72;gtg
50;20;;ccc;-66;-56;-55;-55;-61;-62;-62;-72;-68;-63;-69;-58;-69;-64;-65;-69;-66;-57;-61;-61;-54;-59;-41;-41;-47;-27;-33;-61;-48;-28;-15;-39;24;19;-5;57;42;54;40;66;38;60;58;68;100;67;72;73;49;34;31;44;59;66;50;49;65;79;59;61;67;58;62;67;ccc
8;19;;aag;-77;-73;-70;-72;-78;-77;-68;-68;-60;-74;-67;-57;-59;-54;-69;-61;-69;-65;-63;-62;-62;-55;-43;-40;-41;-34;-23;-46;-52;-24;-28;-31;24;11;8;22;44;46;48;44;53;69;59;62;67;100;76;74;62;49;52;68;64;77;49;66;63;70;68;65;73;68;80;73;aag
36;18;;gag;-79;-73;-69;-69;-76;-79;-74;-79;-75;-75;-73;-67;-72;-64;-75;-69;-72;-64;-69;-86;-62;-59;-55;-49;-46;-38;-37;-52;-60;-30;-21;-30;15;11;-3;45;57;50;58;66;48;56;68;68;72;76;100;78;62;59;59;60;76;75;59;66;72;78;71;70;81;73;78;81;gag
6;17;;ctc;-77;-70;-62;-64;-69;-72;-67;-81;-73;-70;-72;-71;-67;-70;-75;-66;-71;-66;-65;-71;-62;-68;-49;-46;-55;-39;-39;-56;-59;-40;-18;-30;3;10;-10;34;45;39;59;59;61;52;56;62;73;74;78;100;72;64;58;58;78;73;48;71;64;72;65;73;79;70;80;79;ctc
14;16;;tcg;-66;-69;-58;-61;-70;-66;-67;-70;-75;-63;-73;-73;-69;-67;-56;-72;-72;-65;-69;-68;-61;-68;-60;-57;-56;-47;-51;-48;-54;-25;-14;-15;-17;-5;14;16;46;31;60;52;71;56;42;59;49;62;62;72;100;73;78;56;81;52;56;73;67;75;65;80;65;79;76;77;tcg
41;15;;gcg;-73;-73;-67;-66;-68;-69;-72;-71;-68;-66;-70;-78;-60;-67;-64;-65;-67;-72;-74;-60;-62;-67;-72;-65;-59;-57;-54;-36;-37;-32;-26;6;-22;-13;21;23;47;37;47;52;73;51;50;69;34;49;59;64;73;100;89;64;71;61;74;76;67;60;76;80;73;82;73;76;gcg
49;14;;ccg;-71;-76;-66;-70;-70;-70;-74;-69;-70;-71;-75;-80;-66;-67;-59;-74;-72;-75;-73;-62;-69;-67;-70;-66;-65;-58;-53;-36;-42;-29;-25;6;-26;-15;29;15;50;40;54;50;67;58;58;64;31;52;59;58;78;89;100;67;75;57;79;80;74;69;80;80;69;84;78;78;ccg
20;13;;aac;-82;-77;-80;-82;-71;-74;-71;-71;-54;-73;-66;-65;-52;-50;-77;-54;-69;-77;-68;-51;-67;-52;-64;-61;-50;-56;-35;-9;-32;-20;-38;15;-3;-12;34;1;50;52;39;30;52;58;64;59;44;68;60;58;56;64;67;100;59;83;73;78;77;63;79;64;83;72;82;80;aac
54;12;;gtc;-76;-75;-65;-65;-75;-74;-70;-81;-77;-68;-75;-77;-77;-69;-68;-71;-74;-71;-72;-76;-69;-78;-62;-58;-60;-51;-50;-53;-53;-32;-16;-21;-11;-2;11;27;56;34;60;65;62;53;65;53;59;64;76;78;81;71;75;59;100;64;62;77;78;84;71;80;78;83;82;87;gtc
18;11;;tac;-88;-76;-77;-79;-74;-77;-73;-83;-63;-77;-69;-64;-58;-58;-85;-58;-70;-74;-66;-60;-67;-58;-54;-52;-51;-45;-30;-34;-48;-27;-34;-11;14;2;8;24;56;55;51;46;51;56;65;69;66;77;75;73;52;61;57;83;64;100;66;66;73;68;76;67;92;70;82;84;tac
5;10;;ctg;-75;-73;-69;-73;-68;-70;-76;-72;-70;-79;-74;-77;-64;-66;-70;-69;-70;-76;-79;-59;-67;-65;-76;-66;-66;-55;-58;-29;-33;-43;-38;11;-17;-19;35;22;44;57;45;44;43;62;68;75;50;49;59;48;56;74;79;73;62;66;100;75;88;76;90;77;76;83;74;78;ctg
61;9;;atc;-79;-83;-74;-79;-76;-75;-78;-71;-72;-71;-77;-77;-67;-62;-66;-66;-73;-77;-76;-63;-73;-70;-75;-72;-62;-71;-49;-29;-36;-23;-21;11;-29;-16;35;14;44;53;44;45;63;62;62;65;49;66;66;71;73;76;80;78;77;66;75;100;82;79;79;82;76;84;89;80;atc
58;8;;acc;-82;-79;-73;-76;-77;-77;-81;-80;-76;-78;-79;-79;-72;-68;-77;-72;-79;-78;-85;-71;-71;-74;-77;-70;-66;-58;-56;-34;-42;-34;-30;0;-14;-9;30;25;54;54;49;56;42;65;76;71;65;63;72;64;67;67;74;77;78;73;88;82;100;89;86;81;84;86;81;87;acc
42;7;;gcc;-79;-77;-68;-71;-79;-77;-76;-83;-84;-76;-82;-80;-83;-74;-72;-78;-83;-75;-78;-76;-75;-77;-71;-65;-65;-53;-52;-55;-50;-33;-29;-20;-10;-4;17;35;52;56;56;67;50;67;66;74;79;70;78;72;75;60;69;63;84;68;76;79;89;100;78;87;79;88;83;87;gcc
30;6;;cag;-86;-82;-81;-87;-82;-79;-83;-75;-70;-88;-79;-72;-64;-63;-74;-75;-73;-82;-81;-66;-72;-69;-69;-69;-67;-61;-41;-38;-44;-36;-26;3;-7;-14;31;29;55;62;53;49;57;72;75;77;59;68;71;65;65;76;80;79;71;76;90;79;86;78;100;82;83;85;83;84;cag
25;5;;cgc;-79;-79;-68;-70;-78;-73;-76;-82;-82;-75;-76;-81;-72;-69;-71;-73;-78;-78;-77;-72;-75;-77;-77;-72;-68;-62;-57;-53;-47;-39;-33;-7;-32;-6;20;19;49;52;53;54;64;63;55;75;61;65;70;73;80;80;80;64;80;67;77;82;81;87;82;100;80;96;85;87;cgc
28;4;;cac;-92;-83;-81;-80;-82;-80;-78;-87;-73;-78;-74;-74;-68;-63;-90;-65;-78;-77;-76;-71;-73;-68;-66;-64;-58;-58;-46;-39;-51;-33;-28;-7;-5;0;10;29;61;52;54;60;56;58;70;74;67;73;81;79;65;73;69;83;78;92;76;76;84;79;83;80;100;81;87;92;cac
33;3;;ggc;-82;-82;-72;-74;-80;-79;-79;-83;-82;-79;-80;-84;-75;-73;-73;-75;-82;-82;-81;-73;-79;-78;-80;-71;-69;-60;-56;-51;-46;-41;-38;-9;-22;-10;26;16;50;54;54;54;62;68;64;75;58;68;73;70;79;82;84;72;83;70;83;84;86;88;85;96;81;100;87;90;ggc
10;2;;ttc;-89;-90;-79;-82;-84;-85;-79;-83;-76;-81;-78;-79;-73;-66;-79;-70;-78;-83;-76;-71;-79;-72;-68;-65;-62;-60;-49;-42;-49;-29;-32;-6;-10;-6;23;21;55;50;54;52;64;67;70;72;62;80;78;80;76;73;78;82;82;82;74;89;81;83;83;85;87;87;100;91;ttc
38;1;;gac;-90;-87;-78;-78;-84;-84;-79;-91;-80;-80;-78;-83;-75;-70;-85;-72;-83;-83;-79;-75;-80;-76;-71;-67;-64;-56;-52;-45;-52;-38;-35;-11;-9;-3;19;25;61;53;58;60;61;62;71;72;67;73;81;79;77;76;78;80;87;84;78;80;87;87;84;87;92;90;91;100;gac
;;;;tat;ttt;aat;tta;aaa;att;tca;gat;gtt;caa;act;cct;gca;gct;cat;cca;tct;agt;aca;gaa;tgt;gta;gga;aga;cta;ata;ctt;ggt;taa;ttg;cga;cgt;agg;tag;atg;ggg;tgg;agc;tga;cgg;acg;tgc;tcc;gtg;ccc;aag;gag;ctc;tcg;gcg;ccg;aac;gtc;tac;ctg;atc;acc;gcc;cag;cgc;cac;ggc;ttc;gac;
Tableaux triés, connexions entre codons et aas[modifier | modifier le wikicode]
original;63;45;34;46;16;64;26;57;44;15;53;50;8;36;6;14;41;49;20;54;18;5;61;58;42;30;25;28;33;10;38;;
optimisé;31;30;29;28;27;26;25;24;23;22;21;20;19;18;17;16;15;14;13;12;11;10;9;8;7;6;5;4;3;2;1;;
;tag;atg;ggg;tgg;agc;tga;cgg;acg;tgc;tcc;gtg;ccc;aag;gag;ctc;tcg;gcg;ccg;aac;gtc;tac;ctg;atc;acc;gcc;cag;cgc;cac;ggc;ttc;gac;;
Max;22.25;55.16;74.87;61.45;61.70;60.32;74.87;73.17;72.02;75.92;77.13;79.31;79.66;81.04;79.79;80.94;89.00;89.00;82.94;87.07;91.59;89.57;88.54;89.03;89.03;89.57;95.68;92.27;95.68;91.28;92.27;;
Min;-48.15;-46.46;-38.78;-71.53;-64.87;-80.24;-65.90;-66.15;-73.30;-74.35;-76.77;-72.38;-78.31;-86.37;-80.77;-75.13;-77.62;-80.14;-82.38;-81.38;-88.25;-79.19;-82.53;-85.32;-83.65;-88.14;-81.70;-92.36;-83.92;-90.20;-91.48;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;synthèse;;20+2 connectés forts;;;5 connectés moyens : 65-73;;;;;2 solitaires : tga   et    ggg;;;;;2 très faibles : ;;atg-cgt;55;;;;;;;;;;;;;
;;;;dont gtg, tcc  76;;;avec ;73;tgc  acg  tgg;;;;taa-tga :-80, -62 gaa;;;;;;tag-taa;-48;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;66;cgg  agc;;;;ggg-cgg : 75,   57 ccc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
original;24;23;22;2;17;9;19;1;7;59;12;37;51;29;55;48;39;40;27;47;11;13;56;35;43;52;31;21;4;60;3;32;62
optimisé;33;32;31;30;1;2;3;4;5;6;7;8;9;10;11;12;13;14;15;16;17;18;19;20;21;22;23;24;25;26;27;28;29
;agg;cgt;cga;ttg;tat;ttt;aat;tta;aaa;att;tca;gat;gtt;caa;act;cct;gca;gct;cat;cca;tct;agt;aca;gaa;tgt;gta;gga;aga;cta;ata;ctt;ggt;taa
max;43.32;69.88;46.30;52.10;92.05;92.94;92.05;90.98;92.94;87.33;82.27;86.61;84.97;82.64;83.27;85.36;83.47;85.36;86.61;83.27;82.34;81.44;82.27;80.74;82.11;75.97;82.93;82.93;68.51;75.97;68.72;67.35;58.25
min;-38.68;-44.58;-38.30;-42.83;-92.36;-90.20;-80.73;-86.50;-84.30;-84.59;-83.35;-91.48;-83.65;-88.14;-81.50;-83.92;-82.64;-73.65;-90.01;-77.95;-83.42;-83.40;-85.32;-86.37;-79.61;-77.83;-80.36;-72.28;-68.69;-71.17;-58.20;-61.03;-80.24
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;gcc;gcc;gga;;aga;;;
;;synthèse;;24+1 connectés forts;;;3 connectés moyens : 68;;;;;2 solitaires : taa   et    cgt;;;;;3 très faibles : ;;ttg-gct;;52;;;;;;;;;;;;
;;;;dont ata-aga   76;;;avec ;cta  ctt  ggt;;;;;tga-taa :-80, -60 gag;;;;;;agg-ata;;43;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;cgt-ggt : 70,  45 aga;;;;;;cga-cat,ttg;;46;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;20+2 connectés forts :;;;20 forts >79 connectés entre eux et 2 >75 connectés avec beaucoup de forts;;;;;;;;;;;solitaire  ggg-cgg : 75,   57 ccc ; ggg a 1 seule corrélation forte de 75 avec cgg moyen, et un maximum de 57 avec ccc fort;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;A;C;D;E;F;G;H;I;K;L;M;N;P;Q;R;S;T;V;W;Y;;;;;;;;;;;;;
Max;90.26;36.44;66.58;54.67;82.55;90.26;53.84;93.08;92.00;23.01;53.56;93.08;89.01;54.10;89.01;48.08;66.58;82.10;67.62;83.75;;;;;;;;;;;;;
Min;-88.74;-38.43;-73.58;-56.38;-79.62;-92.73;-65.73;-92.73;-89.58;-34.95;-49.55;-89.76;-89.00;-53.54;-86.23;-57.39;-65.83;-90.12;-60.24;-84.39;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;synthèse;;10 forts  >  83;     ;;;1 fort moyen  74;;;;3 moyens  67;;;6 très faibles < 57;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;KNIFY  PRAGV;;;D;;;;WHT;;;MQSCLE;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Tableau trié des 10 aas fortement corrélés entre eux[modifier | modifier le wikicode]
;;corrélations entre les 10 aas les plus corrélés + D.;;;;;;;;;
;I;K;N;F;Y;G;A;P;V;R;D
I;;92;93;83;82;-93;-89;-89;-90;-83;-72
K;92;;86;80;84;-90;-88;-85;-83;-86;-72
N;93;86;;81;81;-90;-81;-87;-90;-85;-60
F;83;80;81;;71;-80;-70;-74;-80;-66;-74
Y;82;84;81;71;;-84;-84;-80;-72;-80;-62
G;-93;-90;-90;-80;-84;;90;88;82;86;65
A;-89;-88;-81;-70;-84;90;;84;73;83;63
P;-89;-85;-87;-74;-80;88;84;;80;89;51
V;-90;-83;-90;-80;-72;82;73;80;;77;61
R;-83;-86;-85;-66;-80;86;83;89;77;;43
D;-72;-72;-60;-74;-62;65;63;51;61;43;
Tableaux triés de groupes de codons fortement corrélés entre eux[modifier | modifier le wikicode]
;;Y;F;N;L;K;I;S
;codon;tat;ttt;aat;tta;aaa;att;tca
Y;tat;100;91;92;90;91;86;81
F;ttt;91;100;91;85;93;87;79
N;aat;92;91;100;91;92;85;79
L;tta;90;85;91;100;84;85;81
K;aaa;91;93;92;84;100;83;78
I;att;86;87;85;85;83;100;82
S;tca;81;79;79;81;78;82;100
  • Tableau formaté de 8 codons moyennement corrélés se terminant par a,t.
    • Tableau non formaté
;;D;V;Q;T;P;A;A;H
;codon;gat;gtt;caa;act;cct;gca;gct;cat
D;gat; ;85;83;81;83;81;81;87
V;gtt;85; ;71;82;81;83;84;69
Q;caa;83;71; ;80;71;66;72;81
T;act;81;82;80; ;77;74;82;69
P;cct;83;81;71;77; ;79;85;74
A;gca;81;83;66;74;79; ;75;69
A;gct;81;84;72;82;85;75; ;66
H;cat;87;69;81;69;74;69;66; 
  • Tableau formaté de 12 codons fortement corrélés se terminant par g,c.
    • Tableau non formaté
;;V;Y;L;I;T;A;Q;R;H;G;F;D
;codon;gtc;tac;ctg;atc;acc;gcc;cag;cgc;cac;ggc;ttc;gac
V;gtc; ;64;62;77;78;84;71;80;78;83;82;87
Y;tac;64; ;66;66;73;68;76;67;92;70;82;84
L;ctg;62;66; ;75;88;76;90;77;76;83;74;78
I;atc;77;66;75; ;82;79;79;82;76;84;89;80
T;acc;78;73;88;82; ;89;86;81;84;86;81;87
A;gcc;84;68;76;79;89; ;78;87;79;88;83;87
Q;cag;71;76;90;79;86;78; ;82;83;85;83;84
R;cgc;80;67;77;82;81;87;82; ;80;96;85;87
H;cac;78;92;76;76;84;79;83;80; ;81;87;92
G;ggc;83;70;83;84;86;88;85;96;81; ;87;90
F;ttc;82;82;74;89;81;83;83;85;87;87; ;91
D;gac;87;84;78;80;87;87;84;87;92;90;91; 
Les Corrélations faibles entre codons[modifier | modifier le wikicode]
;cta;ata;ctt;ggt;taa;ggg;tgg;agc;tga;cgg;acg;tgc;tcc
cta;;41;41;43;37;-16;-29;-39;-45;-44;-46;-56;-57
ata;41;;28;1;15;-20;-40;-35;-21;-38;-51;-38;-44
ctt;41;28;;25;22;-11;-19;-9;-34;-40;-35;-22;-29
ggt;43;1;25;;53;-39;-18;-28;-45;-55;-32;-49;-33
taa;37;15;22;53;;-26;-38;-21;-80;-44;-40;-41;-45
ggg;-16;-20;-11;-39;-26;;37;26;15;75;24;30;36
tgg;-29;-40;-19;-18;-38;37;;33;43;50;44;34;52
agc;-39;-35;-9;-28;-21;26;33;;23;29;31;62;39
tga;-45;-21;-34;-45;-80;15;43;23;;44;42;37;44
cgg;-44;-38;-40;-55;-44;75;50;29;44;;46;42;50
acg;-46;-51;-35;-32;-40;24;44;31;42;46;;44;40
tgc;-56;-38;-22;-49;-41;30;34;62;37;42;44;;65
tcc;-57;-44;-29;-33;-45;36;52;39;44;50;40;65;
;;;;;;;;;;;;;
mcor;51.5;44.3;39.2;39.6;42;26.8;43.2;42.6;44.8;48.5;48.4;53.3;54.8
Corrélations isolées, fortes et faibles entre codons[modifier | modifier le wikicode]
ccg	ccg	aga	aac	caa	tct
gcg	ggc	gga	cac	att	tgt
89	84	83	83	83	82
					
caa	tat	gag	ttt	gct	gct
tta	agt	cac	tgt	aat	aac
81	81	81	80	40	-50
					
tga	cgt	tga	cgt	cgg	ata
taa	atg	gtc	ggt	ggg	aga
-80	55	60	70	75	76
Codons ne suivant pas le processus GC[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Codons ne suivant pas le processus GC
  • Légende: mcod, moyenne du codon − mcor, moyenne des corrélations en valeurs absolues du codon − 7 cod dans le carré des 7 codons − seul, corrélation solitaire forte − max, corrélation maximum en dehors de la solitaire.
  • tga est l’équivalent de taa puisque il y a revirement total.
  • Alors que ttg se comporte comme cga, mais à l’envers.
  • Donc il y a 6 indéterminés : ttg cga cgt agg tag atg.
  • taa et ggg sont normaux donc ont un total de 63 codons pour le décompte des processus.
  • Les 7 codons ont un total de 57 codons en dehors des 7.
  • Il y a une inconnue sur le processus de la corrélation dans le carré des 7 codons.

Corrélations entre bactéries et conformation des protéines[modifier | modifier le wikicode]

Conformation des protéines par le nombre d'aas et de codons[modifier | modifier le wikicode]

  • Légende:La conformation moyenne des 6 protéines étudiées peut être représentée par les moyennes des aas calculées dans le tableau des diagrammes des aas. Pour chaque bactérie j'ai fait le diagramme "moyenne de l'aa" /"effectif de son aa correspodant"; La conformation moyenne des 6 protéines pour cette bactérie peut être alors représentée par les 3 paramètres de la droite de tendance de ce diagramme. A savoir:
  1. R2: coefficient de détermination de la droite (ici multiplié par 100)
  2. a: la pente de la droite (ici notée ax).
  3. b: la constante de la droite.

Les 3 paramètres sont reportés tels quels en fonction du contenu en GC (%GC) des bactéries dans les diagrammes des chapitres suivants.

  • La conformation des gènes des 6 protéines est étudiée de la même manière qu'avec les aas, mais ici je considère les 64 codons d'après le tableau des diagrammes des codons.
  • Dans le chapitre des exemples qui suit sont représentés 12 tableaux de ces diagrammes.
Conformation des protéines par le nombre d'aas[modifier | modifier le wikicode]
;%GC;R2;ax;b;;%GC;R2;ax;b;;%GC;R2;ax;b;;%GC;R2;ax;b
zin;13.5;11.2;0.764;77.0;lat;36.3;84.4;0.873;41.6;ype;47.6;94.9;1.009;-3.0;ret;61.3;91.1;1.034;-11.0
crp;16.6;13.9;0.727;89.3;bbd;36.8;93.8;0.972;9.2;amo;48.0;95.9;1.046;-15.0;sus;61.9;95.1;1.000;0.0
hcr;22.5;44.0;0.917;27.2;liv;37.1;97.5;1.012;-4.0;pgi;48.3;98.6;0.962;12.4;saci;62.3;92.0;1.042;-13.9
mcac;23.7;63.1;0.918;26.9;hmr;37.5;88.4;1.043;-14.0;mah;48.7;96.0;0.995;1.6;smk;62.7;88.3;1.000;0.1
ssdc;24.2;63.0;0.881;38.8;tde;37.9;92.1;1.022;-0.6;ssm;49.0;98.4;0.999;0.3;dvl;63.0;90.2;0.985;4.9
sbw;25.1;63.4;0.868;43.1;spi;38.3;97.0;0.965;11.4;eal;49.7;95.7;1.026;-8.5;ddr;63.4;85.8;1.007;-2.3
uur;25.5;62.7;0.874;41.3;vpr;38.6;96.3;0.966;11.0;lfc;50.0;91.8;1.024;-7.9;tai;63.8;83.2;1.059;-19.2
ple;26.2;57.2;0.875;40.9;chp;39.1;96.5;0.976;7.8;eco;50.8;95.6;1.025;-8.2;gau;64.3;85.7;1.096;-31.5
smf;26.3;77.9;1.021;-6.9;spl;39.1;97.6;1.007;-2.3;sbz;51.3;96.1;1.017;-5.7;xcb;65.0;84.0;1.045;-14.8
fnc;27.1;83.3;1.047;-15.5;tsu;39.2;92.4;0.938;20.2;bvs;51.7;97.5;0.953;15.4;rru;65.4;84.1;1.069;-22.7
bfl;27.4;65.4;0.815;60.5;nis;39.7;89.3;1.058;-19.1;sty;52.1;95.9;1.016;-5.1;dpt;66.2;83.1;1.045;-14.6
cbl;28.3;84.1;0.989;34.9;cmn;40.3;96.6;0.997;1.1;tpas;52.8;90.3;0.894;34.6;pae;66.6;91.4;1.054;-17.8
rip;28.5;59.1;0.834;54.2;nse;41.1;91.6;0.953;15.5;apt;53.0;84.1;1.026;-8.5;roa;67.4;85.8;1.051;-16.8
rpr;29.0;82.2;0.920;26.1;cta;41.3;97.1;1.008;-2.7;caa;53.6;96.6;1.016;-5.2;bmv;68.1;83.5;1.067;-21.8
pub;29.7;74.5;0.968;10.6;hhd;41.8;95.3;0.990;3.2;cgq;54.1;90.3;1.023;-7.5;tos;68.6;78.7;1.188;-61.5
cad;29.9;83.3;1.008;-2.6;gva;42.0;92.0;0.953;15.3;dal;54.5;96.2;0.993;2.2;vin;68.9;88.5;1.093;-30.5
cje;30.5;82.7;1.032;-10.3;cbd;42.4;96.9;1.044;-14.4;eno;55.1;95.8;1.014;-4.5;age;69.4;94.7;1.106;-34.8
pmh;31.1;84.0;0.967;10.9;bae;43.2;98.0;1.022;-7.2;mcu;55.4;88.9;0.960;13.1;opr;70.0;82.6;1.134;-44.0
tme;31.4;79.3;1.025;-8.1;aae;43.5;84.8;1.100;-32.8;din;56.1;97.6;0.963;12.0;mts;70.3;84.3;1.082;-26.8
sep;32.1;93.1;0.939;20.0;bsu;43.5;98.1;1.031;-10.3;say;56.8;78.2;1.003;-1.1;sma;70.7;84.7;1.040;-13.1
hhl;32.5;92.2;1.042;-13.9;hth;44.0;89.7;1.057;-18.8;bmf;57.2;90.8;1.015;-5.0;amd;71.3;78.3;1.049;-16.1
cff;33.3;86.0;0.995;1.7;lpl;44.5;92.1;0.924;24.9;kpn;57.5;95.2;1.020;-6.5;sho;72.0;83.3;1.033;-10.9
ial;33.9;87.6;0.978;7.1;pdi;45.1;95.6;0.965;11.6;aba;58.4;96.7;0.997;1.1;sgr;72.2;83.3;1.026;-8.5
ljf;34.5;95.5;0.962;12.5;ppoy;45.5;97.9;1.010;-3.4;dba;58.6;96.5;1.003;-0.1;cmi;72.7;80.4;1.087;-28.5
dte;34.9;86.4;1.120;-39.3;tma;46.2;89.9;1.067;-21.9;synd;59.1;85.7;1.062;-20.4;salb;73.3;83.2;1.037;-12.1
lla;35.3;98.1;1.027;-8.8;sbn;46.3;96.4;1.016;-5.3;pgd;59.6;88.3;0.983;5.6;ksk;74.2;80.1;1.037;-12.1
axl;35.7;95.9;0.990;3.4;fbt;46.5;98.3;0.969;10.2;pac;60.0;83.9;0.980;6.4;ade;74.9;84.8;1.119;-38.8
thl;36.0;96.3;0.950;16.2;tli;47.1;94.3;1.071;-23.2;bla;60.5;87.1;0.943;18.8;;;;;
Conformation des protéines par le nombre de codons[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Conformation des protéines par le nombre de codons
  • format2 : voir 2ème diagramme.
  • Voir la légende
  • Ce diagramme est l'équivalent de celui des aas car il réunit tout les codons. Les 2 diagrammes sont cependant très différents par la grande variance de R2 avec les codons, somme de 2 variances opposées que sont celle des triplets bbc,g et celle des bbt,a, et une très faible variance de R2 avec les aas, nécessaire au maintient des fonctions de ces 6 protéines.
;%GC;R2;ax;b;;%GC;R2;ax;b;;%GC;R2;ax;b;;%GC;R2;ax;b
crp;16.6;11.1;0.987;1.3;tde;37.9;61.5;0.995;0.6;ssm;49.0;65.8;1.005;-0.5;dvl;63.0;35.7;1.065;-6.6
ssdc;24.2;18.1;0.889;11.4;spi;38.3;48.8;0.96;4.1;eal;49.7;61.9;1.204;-20.8;ddr;63.4;38.1;1.137;-14
sbw;25.1;20.4;0.943;5.9;vpr;38.6;39.1;0.969;3.2;lfc;50.0;60.9;0.823;18.2;tai;63.8;16.6;0.744;26.3
ple;26.2;15.5;0.749;25.7;chp;39.1;41.8;0.839;16.5;eco;50.8;59.2;1.22;-22.4;gau;64.3;40.4;1.055;-6.6
smf;26.3;21.1;0.969;3.2;spl;39.1;51.4;0.939;6.3;sbz;51.3;64.7;1.196;-20;xcb;65.0;37;1.227;-23.2
fnc;27.1;21.9;0.955;4.6;tsu;39.2;46.9;0.993;0.7;bvs;51.7;55.6;1.084;-8.5;rru;65.4;36.7;1.195;-19.9
bfl;27.4;15.5;0.724;28.3;nis;39.7;56.5;1.026;-2.7;sty;52.1;62.9;1.235;-24;dpt;66.2;37.7;1.208;-21.2
cbl;28.3;21.2;0.896;10.6;cmn;40.3;41.1;0.813;19.2;tpas;52.8;50.4;0.721;28.6;pae;66.6;38.3;1.239;-24.4
rip;28.5;26.3;0.843;16.1;nse;41.1;46.1;0.711;29.6;apt;53.0;56.9;1.053;-5.4;roa;67.4;30.2;1.042;-4.2
rpr;29.0;27.7;0.838;16.6;cta;41.3;45.6;0.812;19.3;caa;53.6;56.9;1.079;-8.1;bmv;68.1;30.5;1.097;-9.9
pub;29.7;28;0.993;0.8;hhd;41.8;59.9;0.958;4.3;cgq;54.1;51.7;1.031;-3.2;tos;68.6;18.5;0.939;6.3
cad;29.9;21.2;0.838;16.6;gva;42.0;42.7;0.856;14.7;dal;54.5;56.8;1.191;-19.5;vin;68.9;23.6;0.988;1.3
cje;30.5;33.1;1.076;-7.8;cbd;42.4;54.7;0.944;5.8;eno;55.1;59.5;1.227;-23.2;age;69.4;26.6;1.113;-11.5
pmh;31.1;26.3;0.813;19.2;bae;43.2;67.6;1.026;-2.6;mcu;55.4;64.3;0.998;0.2;opr;70.0;26.5;1.125;-12.8
tme;31.4;29.2;0.911;9.1;aae;43.5;33.1;0.907;9.6;din;56.1;58.6;1.129;-13.2;mts;70.3;26.2;1.045;-4.6
sep;32.1;31.2;0.933;6.9;bsu;43.5;67.4;1.035;-3.5;say;56.8;41;0.815;19;sma;70.7;26.3;1.084;-8.5
hhl;32.5;27.2;0.941;6.1;hth;44.0;36;0.799;20.6;bmf;57.2;56.9;1.156;-15.9;amd;71.3;24.6;1.039;-4
cff;33.3;30.1;0.869;13.4;lpl;44.5;44.9;0.875;12.8;kpn;57.5;58.9;1.249;-25.5;sho;72.0;25.5;1.107;-10.9
ial;33.9;39.6;1.041;-4.1;pdi;45.1;50.5;0.997;0.3;aba;58.4;50.3;1.102;-10.4;sgr;72.2;25;1.067;-6.8
ljf;34.5;32.6;0.952;4.9;ppoy;45.5;75.7;1.005;-0.5;dba;58.6;51.4;1.089;-9.1;cmi;72.7;19.9;0.987;1.3
dte;34.9;32.1;0.997;0.3;tma;46.2;51.1;0.989;1.2;synd;59.1;43.7;1.051;-5.2;salb;73.3;23.7;1.084;-8.6
lla;35.3;32.9;0.968;3.4;sbn;46.3;69.7;1.049;-5;pgd;59.6;59.4;1.191;-19.5;ksk;74.2;23.2;1.111;-11.3
axl;35.7;37.3;0.909;9.3;fbt;46.5;70;1.149;-15.2;pac;60.0;43.4;0.924;7.8;ade;74.9;22.6;1.09;-9.2
thl;36.0;35.7;0.954;4.8;tli;47.1;46.3;0.77;23.6;bla;60.5;40.5;1.067;-6.8;;;;;
lat;36.3;31.5;0.754;25.2;ype;47.6;68.3;1.063;-6.4;ret;61.3;45.9;1.182;-18.6;;;;;
bbd;36.8;47.8;0.963;3.8;amo;48.0;46.8;0.799;20.6;sus;61.9;43.4;1.089;-9.1;;;;;
liv;37.1;40.4;0.967;3.4;pgi;48.3;79.2;0.907;9.5;saci;62.3;31.1;0.942;6;;;;;
hmr;37.5;41.8;0.896;10.7;mah;48.7;67.4;0.95;5.1;smk;62.7;40.1;1.098;-10;;;;;
Conformation des protéines par le nombre de codons bbc,g[modifier | modifier le wikicode]
;%GC;R2;ax;b;;%GC;R2;ax;b;;%GC;R2;ax;b;;%GC;R2;ax;b
crp;16.6;2.6;0.062;9.7;tde;37.9;47.4;0.681;13.1;ssm;49.0;64.8;1.051;6.5;dvl;63.0;68.4;1.563;2.6
ssdc;24.2;12.7;0.178;4.2;spi;38.3;45.4;0.626;4.0;eal;49.7;51.8;1.180;-8.3;ddr;63.4;72.6;1.769;-20.0
sbw;25.1;5.4;0.111;11.3;vpr;38.6;27.2;0.512;8.8;lfc;50.0;52.9;0.556;29.6;tai;63.8;41.9;1.269;39.1
ple;26.2;9.2;0.170;14.4;chp;39.1;44.4;0.491;8.5;eco;50.8;50.3;1.217;-10.4;gau;64.3;66.3;1.402;12.5
smf;26.3;15.0;0.234;-3.2;spl;39.1;68.0;0.984;-22.5;sbz;51.3;55.7;1.214;-8.5;xcb;65.0;69.3;1.922;-31.7
fnc;27.1;16.1;0.253;-1.0;tsu;39.2;43.4;0.705;4.2;bvs;51.7;69.5;1.379;-5.9;rru;65.4;65.8;1.852;-27.0
bfl;27.4;6.8;0.163;14.6;nis;39.7;52.6;0.794;-3.3;sty;52.1;55.4;1.273;-9.2;dpt;66.2;59.4;1.763;-19.7
cbl;28.3;22.0;0.312;-3.4;cmn;40.3;32.3;0.441;21.0;tpas;52.8;37.4;0.656;27.5;pae;66.6;79.5;2.023;-41.4
rip;28.5;21.0;0.356;10.0;nse;41.1;40.3;0.507;22.7;apt;53.0;44.6;0.901;14.2;roa;67.4;82.2;1.774;-9.5
rpr;29.0;38.8;0.357;2.6;cta;41.3;40.7;0.530;15.6;caa;53.6;76.2;1.396;-12.1;bmv;68.1;57.7;1.686;-2.9
pub;29.7;34.1;0.340;-2.5;hhd;41.8;63.0;0.630;8.1;cgq;54.1;80.6;1.459;-27.7;tos;68.6;47.0;1.668;11.2
cad;29.9;33.2;0.449;-11.7;gva;42.0;39.9;0.763;5.5;dal;54.5;71.3;1.399;1.7;vin;68.9;68.9;1.785;-3.0
cje;30.5;25.3;0.325;3.6;cbd;42.4;26.6;0.409;43.7;eno;55.1;58.0;1.368;-20.0;age;69.4;81.3;2.091;-32.3
pmh;31.1;25.9;0.282;13.2;bae;43.2;67.6;0.712;10.4;mcu;55.4;72.9;1.088;17.9;opr;70.0;73.6;2.042;-27.1
tme;31.4;16.3;0.284;16.1;aae;43.5;22.4;0.792;24.0;din;56.1;70.7;1.432;-10.3;mts;70.3;74.0;1.882;-15.6
sep;32.1;34.1;0.378;-0.5;bsu;43.5;67.5;0.752;5.8;say;56.8;22.9;0.621;68.5;sma;70.7;81.0;2.049;-30.9
hhl;32.5;31.6;0.454;-10.4;hth;44.0;37.9;0.880;2.6;bmf;57.2;71.7;1.426;-10.6;amd;71.3;69.2;1.825;-4.2
cff;33.3;32.8;0.463;0.8;lpl;44.5;23.8;0.578;32.2;kpn;57.5;57.7;1.422;-16.3;sho;72.0;80.6;2.132;-36.6
ial;33.9;36.7;0.416;7.2;pdi;45.1;49.4;1.229;-15.4;aba;58.4;75.8;1.432;3.3;sgr;72.2;78.9;2.017;-24.4
ljf;34.5;28.9;0.522;-9.1;ppoy;45.5;75.3;1.036;0.1;dba;58.6;84.6;1.516;-5.9;cmi;72.7;64.5;1.890;-6.5
dte;34.9;33.8;0.503;-6.2;tma;46.2;42.5;0.793;22.7;synd;59.1;70.8;1.477;-0.2;salb;73.3;74.6;2.098;-31.3
lla;35.3;16.1;0.340;12.7;sbn;46.3;76.6;1.000;-11.7;pgd;59.6;81.9;1.572;-20.5;ksk;74.2;71.5;2.148;-34.1
axl;35.7;51.0;0.551;-6.0;fbt;46.5;67.4;1.288;-24.9;pac;60.0;84.5;1.441;-8.2;ade;74.9;74.7;2.121;-28.8
thl;36.0;26.4;0.340;13.7;tli;47.1;33.4;0.721;23.4;bla;60.5;84.2;1.702;-18.6;;;;;
lat;36.3;25.4;0.316;20.9;ype;47.6;63.8;0.947;-0.1;ret;61.3;72.5;1.678;-19.0;;;;;
bbd;36.8;33.8;0.586;6.4;amo;48.0;51.3;0.924;27.0;sus;61.9;72.9;1.476;7.2;;;;;
liv;37.1;32.3;0.398;15.1;pgi;48.3;79.3;0.934;6.3;saci;62.3;63.8;1.398;22.4;;;;;
hmr;37.5;34.6;0.699;0.4;mah;48.7;44.8;0.737;33.7;smk;62.7;74.8;1.647;-9.5;;;;;
Conformation des protéines par le nombre de codons bbt,a[modifier | modifier le wikicode]
;%GC;R2;ax;b;;%GC;R2;ax;b;;%GC;R2;ax;b;;%GC;R2;ax;b
crp;16.6;32.8;1.980;-0.6;tde;37.9;84.1;1.299;-6.6;ssm;49.0;68.0;0.932;-5.5;dvl;63.0;41.5;0.486;-15.0
ssdc;24.2;62.7;1.696;19.3;spi;38.3;77.9;1.329;5.6;eal;49.7;71.4;1.188;-29.3;ddr;63.4;53.4;0.460;-12.5
sbw;25.1;74.2;1.842;5.7;vpr;38.6;74.2;1.455;12.9;lfc;50.0;79.7;1.079;11.5;tai;63.8;4.4;0.122;15.3
ple;26.2;52.6;1.425;35.9;chp;39.1;86.4;1.248;23.5;eco;50.8;68.1;1.183;-30.6;gau;64.3;47.1;0.630;-21.2
smf;26.3;71.1;1.800;10.6;spl;39.1;53.0;0.985;25.8;sbz;51.3;75.7;1.138;-27.9;xcb;65.0;49.2;0.489;-20.3
fnc;27.1;70.6;1.749;11.4;tsu;39.2;63.6;1.299;-0.5;bvs;51.7;66.3;0.750;-11.6;rru;65.4;52.2;0.495;-17.8
bfl;27.4;57.4;1.387;40.0;nis;39.7;73.8;1.284;-1.3;sty;52.1;74.9;1.143;-34.2;dpt;66.2;59.5;0.591;-24.6
cbl;28.3;64.2;1.586;22.7;cmn;40.3;79.2;1.216;19.5;tpas;52.8;65.7;0.797;29.6;pae;66.6;46.3;0.430;-16.0
rip;28.5;65.9;1.400;22.3;nse;41.1;77.9;0.959;35.2;apt;53.0;65.5;1.156;-18.2;roa;67.4;21.3;0.251;-3.7
rpr;29.0;80.8;1.416;28.1;cta;41.3;78.3;1.135;23.0;caa;53.6;53.9;0.744;-6.6;bmv;68.1;51.1;0.425;-17.2
pub;29.7;78.3;1.723;5.7;hhd;41.8;88.4;1.307;3.1;cgq;54.1;32.6;0.641;11.9;tos;68.6;22.5;0.119;-0.1
cad;29.9;54.7;1.361;37.6;gva;42.0;52.6;0.989;21.4;dal;54.5;73.6;0.893;-35.0;vin;68.9;25.4;0.123;0.9
cje;30.5;87.7;1.867;-12.4;cbd;42.4;85.7;1.408;-17.9;eno;55.1;65.2;1.061;-25.9;age;69.4;24.9;0.104;-1.4
pmh;31.1;77.7;1.417;25.5;bae;43.2;84.3;1.329;-10.2;mcu;55.4;73.2;0.840;-12.3;opr;70.0;48.8;0.162;-6.9
tme;31.4;78.0;1.579;7.0;aae;43.5;42.7;0.986;0.2;din;56.1;79.3;0.787;-16.4;mts;70.3;15.6;0.160;-0.6
sep;32.1;87.2;1.569;14.3;bsu;43.5;83.1;1.316;-8.7;say;56.8;70.5;0.865;-14.1;sma;70.7;6.3;0.094;2.8
hhl;32.5;69.5;1.532;19.4;hth;44.0;36.9;0.769;32.6;bmf;57.2;60.7;0.841;-20.8;amd;71.3;34.6;0.175;-7.1
cff;33.3;67.9;1.359;23.7;lpl;44.5;66.7;1.138;0.8;kpn;57.5;73.6;1.029;-32.5;sho;72.0;4.4;0.062;2.4
ial;33.9;86.6;1.692;-9.3;pdi;45.1;58.4;0.793;10.1;aba;58.4;69.2;0.693;-21.2;sgr;72.2;8.4;0.078;1.3
ljf;34.5;77.4;1.474;16.3;ppoy;45.5;75.7;0.969;-1.0;dba;58.6;74.9;0.608;-13.1;cmi;72.7;2.4;0.018;2.9
dte;34.9;68.9;1.563;6.9;tma;46.2;57.0;1.134;-12.7;synd;59.1;59.8;0.565;-10.4;salb;73.3;2.9;0.042;2.7
lla;35.3;83.2;1.629;-0.4;sbn;46.3;70.1;1.125;-0.2;pgd;59.6;71.6;0.774;-20.4;ksk;74.2;8.6;0.042;0.0
axl;35.7;77.5;1.355;21.3;fbt;46.5;74.7;1.028;-9.1;pac;60.0;27.5;0.406;16.7;ade;74.9;24.0;0.019;-0.1
thl;36.0;88.0;1.600;1.3;tli;47.1;61.5;0.824;23.9;bla;60.5;40.7;0.406;-1.4;;;;;
lat;36.3;84.6;1.251;29.9;ype;47.6;72.9;1.170;-10.3;ret;61.3;61.1;0.637;-20.4;;;;;
bbd;36.8;85.8;1.370;3.6;amo;48.0;47.4;0.641;15.7;sus;61.9;68.9;0.609;-21.9;;;;;
liv;37.1;86.2;1.555;-2.2;pgi;48.3;79.0;0.889;11.6;saci;62.3;59.0;0.385;-7.1;;;;;
hmr;37.5;64.7;1.146;18.6;mah;48.7;85.2;1.091;-13.5;smk;62.7;56.9;0.491;-12.6;;;;;
Conformation, récapitulatif[modifier | modifier le wikicode]
  • La colonne 3° R2 correspond au coefficient de détermination d'un polynôme de degré 3.
Coefficient pente constante R2
Paramètre a b r2 a b r2 r'23 r23
Diagramme
aas 0.003 0.86 391 -0.99 47.5 410 540 874
codons 0.005 0.76 279 -0.50 24.6 280 320 709
bbg,c 0.040 -0.91 907 -0.54 26.3 170 260 691
bba,t -0.033 2.59 894 -0.62 30.8 250 420 665

Conformation des protéines, exemples[modifier | modifier le wikicode]

Conformation des protéines par le nombre d'aas[modifier | modifier le wikicode]
  1. moyen: moyenne de l'aa, voir la légende ci-dessus.
  2. zero: colonne à valeurs nulles pour reporter les noms des aas.
  3. hth: code KEGG de la bactérie
aa;moyen.;zero;hth;lpl;din;say
C;58;0;64;23;83;49
W;74;0;69;71;59;117
H;128;0;131;148;146;155
M;154;0;132;190;178;142
Q;220;0;190;302;250;270
Y;222;0;288;249;215;203
F;248;0;245;228;250;197
N;261;0;206;256;232;158
P;286;0;279;294;285;360
T;325;0;282;385;316;342
S;336;0;322;316;349;281
R;383;0;393;346;390;539
D;419;0;370;491;406;403
I;433;0;449;384;429;318
K;450;0;569;394;373;229
G;453;0;435;435;482;488
V;471;0;486;471;463;553
A;490;0;351;530;510;558
E;521;0;622;436;520;519
L;611;0;659;595;609;662
;;;;;;
R2;;;897;921;976;782
a;;;1057;924;963;1003
b;;;-188;249;120;-11
;;;;;;
%GC;;;44.0;44.5;56.1;56.8
Conformation des protéines par le nombre de codons bbc,g[modifier | modifier le wikicode]
  1. moyen: moyenne du codon, voir la légende ci-dessus.
  2. zero: colonne à valeurs nulles pour reporter les noms des codons.
  3. eal: code KEGG de la bactérie
codon;moyen.;zero;eal;lfc;bae;aae
tag;1;0;0;2;3;3
agg;24;0;5;57;10;193
tgc;31;0;32;24;19;35
cgg;44;0;12;72;26;0
ggg;54;0;48;92;51;46
agc;55;0;63;42;71;40
tcg;58;0;37;45;24;14
ccc;61;0;15;84;6;170
tcc;66;0;88;135;58;92
cac;70;0;83;48;61;110
acg;71;0;61;57;100;87
tgg;71;0;71;66;66;78
ttg;81;0;54;95;88;12
ccg;101;0;204;89;144;34
ctc;104;0;63;133;60;267
tac;107;0;121;55;101;227
gtc;118;0;66;144;103;67
acc;121;0;173;97;34;90
ttc;125;0;123;73;102;156
gcg;126;0;244;52;129;97
aac;128;0;185;89;133;192
cgc;132;0;135;46;95;9
cag;132;0;195;110;131;125
gtg;137;0;140;68;118;80
atg;154;0;188;158;160;114
gcc;164;0;96;134;77;62
ggc;169;0;182;85;144;47
ctg;180;0;440;124;116;84
atc;181;0;240;154;167;76
gac;202;0;237;151;154;277
aag;202;0;106;141;126;409
gag;226;0;154;169;147;244
;;;;;;
R2;;;518;529;676;224
a;;;1180;556;712;792
b;;;-83;296;104;240
;;;;;;
%GC;;;49.7;50.0;43.2;43.5
Conformation des protéines par le nombre de codons bbt,a[modifier | modifier le wikicode]
  1. moyen: moyenne du codon, voir la légende ci-dessus.
  2. zero: colonne à valeurs nulles pour reporter les noms des codons.
  3. fnc: code KEGG de la bactérie
codon;moyen.;zero;thl;lat;chp;spl
tga;2;0;0;0;1;0
taa;3;0;5;6;3;6
cga;20;0;34;36;37;12
tgt;27;0;23;67;55;49
cta;30;0;63;47;76;162
agt;38;0;72;72;64;26
tca;50;0;73;91;52;88
cca;58;0;98;75;66;130
cat;59;0;82;113;105;55
aga;60;0;48;62;88;20
cct;65;0;120;139;160;93
aca;65;0;139;110;107;84
act;68;0;120;101;122;120
tct;69;0;113;204;176;103
ata;84;0;34;169;83;10
gta;84;0;155;117;123;125
gga;88;0;118;151;163;21
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;;;;;;
;;;880;846;864;530
;;;1600;1251;1248;985
;;;13;299;235;258
;;;;;;
;;;36.0;36.3;39.1;39.1

Fréquences des corrélations entre bactéries / codons[modifier | modifier le wikicode]

cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr;cor;fr
0;62;20;68;40;80;60;116;80;126;100;8;-20;54;-40;38
1;62;21;86;41;82;61;90;81;120;-1;62;-21;60;-41;42
2;60;22;80;42;88;62;120;82;176;-2;56;-22;60;-42;52
3;76;23;84;43;88;63;126;83;182;-3;52;-23;74;-43;38
4;56;24;66;44;100;64;120;84;184;-4;50;-24;88;-44;20
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6;58;26;90;46;88;66;104;86;154;-6;62;-26;48;-46;4
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Fréquences des corrélations entre bactéries / aas[modifier | modifier le wikicode]

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roa;-1;4;36;55;54;53;54;49;66;71;59;73;50;70;63;73;70;75;68;83;84;74;76;88;76;92;86;90;78;82;91;77;80;94;93;87;95;82;77;89;84;90;90;98;94;91;76;92;80;94;85;95;81;96;91;90;97;92;92;97;91;97;88;97;97;87;97;95;98;95;99;93;97;99;95;97;98;98;97;96;98;99;100;99;98;96;98;98;98;99;95;99;98;98;98;98;100;98;91;98;96;96;99;99;99;99;99;99;99;99;97
bmv;2;5;36;52;54;53;52;49;63;69;57;69;49;68;61;69;70;70;65;79;81;72;73;86;75;90;84;87;75;80;88;75;79;91;90;84;94;80;77;87;81;88;87;96;93;89;76;89;79;92;82;93;79;95;90;88;97;91;89;96;89;96;85;97;96;85;96;95;99;93;97;92;96;97;94;96;98;97;96;95;96;98;98;96;99;97;97;98;97;98;92;99;99;99;98;98;98;100;93;99;96;97;98;98;98;99;98;98;98;98;99
tos;1;5;34;48;51;51;48;47;64;71;52;71;50;65;59;71;70;69;69;78;82;69;72;81;80;89;83;84;70;78;88;75;80;85;88;84;89;78;78;87;79;88;88;89;91;89;83;90;85;84;80;92;85;90;88;91;92;92;88;91;90;92;86;93;92;83;92;92;93;88;90;90;92;92;91;95;91;92;92;93;91;91;90;89;91;94;95;90;93;94;93;93;91;92;95;93;91;93;100;95;95;99;90;93;92;93;92;92;93;93;95
vin;5;9;39;55;58;57;55;53;69;74;60;75;56;73;66;75;74;76;71;84;85;76;78;88;81;93;87;90;80;84;92;80;83;93;93;89;96;84;81;91;85;92;91;97;95;93;81;93;84;92;86;96;85;97;93;93;97;94;93;97;93;97;90;97;97;89;97;97;99;95;97;94;97;98;96;97;99;98;98;98;97;98;98;96;99;99;99;98;99;99;95;99;98;99;98;98;98;99;95;100;98;98;98;99;98;99;99;98;99;98;99
age;17;20;51;65;66;67;65;62;78;83;67;83;64;80;75;83;83;83;81;89;91;83;86;93;89;96;92;94;84;90;96;87;91;95;96;94;97;91;89;95;90;96;95;96;98;97;89;97;91;94;92;98;91;98;96;96;98;97;96;98;97;99;93;99;98;94;98;97;96;96;96;98;98;96;97;94;97;98;99;99;96;96;95;95;97;99;99;96;98;96;94;97;95;96;96;98;96;96;95;98;100;97;95;97;94;96;96;94;96;95;97
opr;-1;3;34;50;51;51;49;47;65;71;54;72;50;66;60;72;71;70;68;80;84;71;74;84;79;91;85;87;72;80;89;76;80;89;90;85;92;80;78;87;81;89;89;93;93;90;82;91;84;88;82;94;84;93;90;91;95;93;90;94;91;95;86;95;95;85;95;94;96;91;95;92;95;95;93;97;95;95;95;95;94;95;95;94;95;96;97;94;96;97;95;97;95;96;97;96;96;97;99;98;97;100;95;97;96;97;96;96;97;97;98
mts;-1;4;35;54;53;52;53;48;64;69;59;70;49;70;63;71;70;74;65;81;82;74;74;87;74;91;85;89;77;81;90;75;79;93;91;85;95;81;76;88;82;89;88;98;94;90;74;90;78;95;84;94;78;96;91;88;97;90;91;97;89;97;86;97;97;86;97;95;99;95;99;92;97;99;94;96;98;97;96;96;98;98;99;98;98;96;97;98;98;99;92;99;99;98;98;98;99;98;90;98;95;95;100;99;99;99;99;99;99;99;97
sma;-2;2;34;52;51;51;51;47;65;70;56;71;48;69;62;72;70;73;67;82;83;73;75;87;77;92;85;89;75;81;91;76;81;93;92;86;95;82;77;88;82;90;90;97;94;91;77;91;80;93;84;95;81;96;91;90;97;91;91;96;90;97;87;97;97;87;97;95;99;94;98;93;97;99;94;96;98;97;97;96;97;98;99;98;98;97;98;98;98;99;93;99;98;98;99;98;99;98;93;99;97;97;99;100;99;100;100;99;100;100;98
amd;-8;-4;27;46;46;45;46;41;58;63;52;65;42;63;55;65;63;67;60;77;78;67;69;83;70;88;81;85;71;75;86;70;74;90;88;81;92;75;71;84;78;85;85;96;91;86;71;87;74;91;79;92;75;94;87;86;95;88;87;94;86;95;83;95;95;82;95;94;99;92;97;89;94;98;92;97;97;95;94;94;97;97;99;97;97;95;96;97;97;99;92;99;99;98;98;97;99;98;92;98;94;96;99;99;100;99;99;99;99;100;97
sho;-3;0;32;51;51;50;50;46;63;68;55;70;47;67;60;71;69;71;65;81;82;71;73;86;75;91;84;88;74;80;90;74;79;92;91;84;95;80;76;87;80;88;88;97;93;90;76;90;78;93;83;94;80;96;90;88;96;90;90;96;90;97;86;97;96;86;96;95;99;94;98;92;96;99;94;97;98;97;96;96;97;98;99;97;98;96;97;98;98;99;92;99;98;99;99;98;99;99;93;99;96;97;99;100;99;100;100;99;100;100;98
sgr;-3;1;32;51;50;50;50;46;63;68;55;70;46;67;61;71;69;71;65;81;82;71;74;86;75;91;84;88;74;80;90;74;79;92;92;84;94;80;76;87;81;88;89;97;93;90;76;90;78;93;83;94;80;96;90;88;96;90;90;96;89;96;86;97;96;86;96;95;99;94;98;92;96;99;94;96;98;97;96;95;97;98;99;98;98;96;97;98;98;99;92;99;98;98;99;98;99;98;92;99;96;96;99;100;99;100;100;99;100;100;98
cmi;-7;-2;30;49;50;48;48;44;60;65;55;66;47;66;58;68;65;70;61;79;79;69;70;83;71;89;83;86;75;77;87;71;76;90;89;83;93;76;72;86;80;87;87;96;92;88;71;88;76;92;80;93;77;94;88;87;95;90;89;95;88;95;87;95;95;83;95;95;99;93;97;89;95;98;93;98;97;96;94;95;98;97;99;97;97;95;97;97;98;99;94;99;99;98;99;97;99;98;92;98;94;96;99;99;99;99;99;100;99;99;97
salb;-4;0;32;51;50;49;50;45;63;68;55;70;47;67;60;71;68;71;65;81;82;71;73;86;75;91;84;88;74;80;90;74;79;92;92;84;94;80;76;87;81;88;89;97;93;90;75;90;78;93;83;94;79;96;90;89;96;91;90;96;90;96;86;97;96;86;96;95;99;94;98;92;96;99;94;97;98;97;96;96;97;98;99;98;98;96;98;98;98;99;93;99;98;98;99;98;99;98;93;99;96;97;99;100;99;100;100;99;100;100;98
ksk;-7;-3;28;47;48;46;47;42;59;65;53;66;44;65;57;67;65;69;62;78;79;68;70;83;72;89;82;86;72;77;88;71;76;90;89;83;93;77;73;85;79;87;87;96;92;88;72;88;76;91;80;93;77;94;88;87;95;89;89;95;87;95;85;95;95;83;95;95;99;93;98;90;95;98;93;97;97;96;95;95;97;97;99;97;97;95;97;97;97;99;93;99;99;98;99;97;99;98;93;98;95;97;99;100;100;100;100;99;100;100;98
ade;4;6;37;52;55;55;52;50;66;71;57;72;51;69;63;72;72;71;69;80;82;73;75;86;79;91;84;87;75;81;90;78;81;91;91;86;94;82;79;88;82;90;88;95;94;90;80;91;82;90;84;94;83;95;91;91;96;92;90;95;91;96;86;96;96;87;96;95;99;93;96;93;96;96;94;96;98;97;97;96;95;98;97;95;98;98;98;98;97;97;93;99;98;99;98;98;97;99;95;99;97;98;97;98;97;98;98;97;98;98;100

Les tRNAs[modifier | modifier le wikicode]

Nombres de tRNAs des 111 bactéries[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Nombres de tRNAs des 111 bactéries
  • Base de données des tRNAs [1], gtRNAdb.   Pour vin amo ssm opr age fbt cad sbw mcac j'ai utilisé la base de données KEGG [2]: fournir les 3 lettres du génome dans organism. Puis cliquer successivement sur Assembly, Genome et RefSeq. Ctrl+F: tRNA-Arg . . .
  • Légende:
colonne tRNA/8: les 8 aas à 4 et 6 codons ayant 1 seul codon avec tRNA pour le carré à 4 codons (ct pour L par exemple). Pour réduire la notation sont indiqués en 1er les aas à 4 codons suivis de ceux à 6 codons. S'il y a un seul aa avec plus d'un codon à tRNA, cet aa est noté avec le signe −.
  1. −G *: R n'a aucun tRNa pour les 4 codons cg (ceci pour *) et G a plus d'un codon à tRNA. Donc APTV ont 1 seul codon à tRNA et SL en ont plus de 1 pour leur carré.
  2. −G SR*: L n'a aucun tRNa pour les 4 codons ct (ceci pour *) et G a plus d'un codon à tRNA. Donc APTV et SR ont 1 seul codon à tRNA pour leur carré.
  3. T*: 4 codons avec tRNA pour T.
  4. 5 SRL, tRNA/8: Les 5 aas à 4 codons et SRL ont 1 seul codon à tRNA.
Colonne >2: les 8 aas à 4 et 6 codons ayant plus de 2 codons à tRNA pour le carré à 4 codons (ct pour L par exemple). Pour réduire la notation sont indiqués en 1er les aas à 4 codons suivis de ceux à 6 codons. S'il y a un seul aa avec 2 codons à tRNA, cet aa est noté avec le signe −.
  1. 8: APTVG et SRL ont plus de 2 codons à tRNA.
  2. T S: T et S ont plus de 2 codons à tRNA.
  3. −V −S: APTG et RL ont plus de 2 codons à tRNA.
  4. GT* SL: GSL ont plus de 2 codons à tRNA et T en a 4 (pour *).
Colonne 2: Les aas KEQ à 2 codons peuvent avoir les 2 codons avec tRNA. Les codons tta et ttg de L ont dans la majorité des cas un tRNA chacun, de même pour aga et agg de R. Pour S le codon agt n’a pratiquement jamais de tRNA alors que agc en a toujours. Donc S sera absent dans cette colonne.
  1. 3RL: KEQ et RL ont 2 codons à tRNA.
  2. KRL: ces 3 aas ont 2 codons à tRNA.
  3. W C I : Les codons tgg et tga, tgt et tgc, ata ont chacun un tRNA.
  • Tableau non formaté
KEGG;%GC;tRNA;tRNA/8;>2;2;;KEGG;%GC;tRNA;tRNA/8;>2;2;;KEGG;%GC;tRNA;tRNA/8;>2;2;;KEGG;%GC;tRNA;tRNA/8;>2;2
zin;13.5;25;−G SR*;0;0;;lat;36.3;44;P;T SL;KQR;;ype;47.6;70;0;G L;KQRL;;ret;61.3;50;0;GPTSL;3R
crp;16.6;28;−G *;0;0;;bbd;36.8;39;V;0;RL;;amo;48.0;48;0;8;3RLW;;sus;61.9;51;0;8;3RL
hcr;22.5;28;5 SRL;0;L;;liv;37.1;67;AP;T S;RL;;pgi;48.3;53;V;GPT L;KQRL;;saci;62.3;68;0;8;3RLC
mcac;23.7;30;−T SRL;0;KL;;hmr;37.5;48;0;8;3RL;;mah;48.7;45;0;T SL;RL;;smk;62.7;57;0;-V −R;3RL
ssdc;24.2;34;AP;L;KRL;;tde;37.9;44;0;APTSL;3RL;;ssm;49.0;48;0;8;3RL;;dvl;63.0;68;0;−R;KQRL
sbw;25.1;35;AP;L;KRL;;spi;38.3;63;APV;0;KRL;;eal;49.7;85;0;GPTSL;QRL;;ddr;63.4;48;0;−R;KQRL
uur;25.5;30;−G SL;0;KL;;vpr;38.6;48;APV;G S;KRL;;lfc;50.0;52;0;8;3RL;;tai;63.8;50;0;8;3RL
ple;26.2;33;AP;S;0;;chp;39.1;38;0;T SL;RL;;eco;50.8;87;0;GPTSL;QRL;;gau;64.3;48;0;−R;3RL
smf;26.3;39;5 SRL;0;KL;;spl;39.1;143;0;0;RL;;sbz;51.3;86;0;GPTSL;QRL;;xcb;65.0;55;0;−R;3RL
fnc;27.1;47;−G SL;0;KRL;;tsu;39.2;48;0;−V −S;3RL;;bvs;51.7;62;V;GPTSL;3RL;;rru;65.5;55;0;−R;3RL
bfl;27.4;37;AP;T SL;KRL;;nis;39.7;45;0;T;RL;;sty;52.1;79;0;GPTSL;QRL;;dpt;66.2;46;0;−G −R;KQRL
cbl;28.3;81;APV;G;3RL;;cmn;40.3;37;0;T SL;L;;tpas;52.8;45;0;−G;3RL;;pae;66.6;63;0;GPTSL;RL
rip;28.5;33;AP;0;RL;;nse;41.1;33;AP;0;RLI;;apt;53.0;57;0;−R;KQL;;roa;67.4;52;0;−R;3RL
rpr;29.0;33;P;T;0;;cta;41.3;37;0;T SL;L;;caa;53.6;46;0;GPTSL;KRL;;bmv;68.2;56;0;−R;KR
pub;29.7;32;AP L;0;L;;hhd;41.8;67;P;0;RL;;cgq;54.2;58;0;−A −R;3RL;;tos;68.6;52;0;−R;3RLI
cad;29.9;81;APV;0;LW;;gva;42.0;45;0;−P −R;3RL;;dal;54.5;56;0;−R;3RL;;vin;68.9;49;0;8;3RL
cje;30.6;43;P;0;RL;;cbd;42.4;42;0;GPTSL;KERL;;eno;55.1;83;0;GT L;QRL;;age;69.5;81;0;8;3RL
pmh;31.1;40;0;T S;RL;;bae;43.2;75;P;0;RL;;mcu;55.4;46;0;−R;3RL;;opr;70.0;46;0;−R;3RL
tme;31.4;50;0;8;3RL;;aae;43.5;44;0;GPTSL;KRL;;din;56.1;37;0;P L;RL;;mts;70.3;46;0;−R;3RL
sep;32.1;59;APV;0;L;;bsu;43.5;54;P;L;RL;;say;56.8;53;0;8;3RL;;sma;70.7;71;0;−R;3RL
hhl;32.5;44;0;0;RL;;hth;44.0;44;0;−R;KRL;;bmf1;57.2;55;0;−R;3RL;;amd;71.3;52;0;−R;3RL
cff;33.3;41;P;0;KERL;;lpl;44.5;73;V;GT* SL;3RL;;kpn;57.5;86;0;GPTSL;QRL;;sho;72.0;73;0;−R;3RL
ial;33.9;45;0;−V;3RL;;pdi;45.1;82;0;GPTSL;3RL;;aba;58.4;46;0;8;3RL;;sgr;72.2;67;0;−R;3RL
ljf;34.5;55;AV R;GT* SL;3RL;;ppoy;45.5;109;0;T SL;KL;;dba;58.7;64;0;8;3RL;;cmi;72.7;45;0;−R;3RL
dte;34.9;43;0;T SL;RL;;tma;46.3;46;0;8;3RL;;synd;59.1;46;0;−R;RL;;salb;73.3;66;0;−R;3RL
lla;35.3;63;APV;T SL;KRL;;sbn;46.3;105;0;L;RL;;pgd;59.6;60;0;−A −R;RL;;ksk;74.2;78;0;−R;3RL
axl;35.7;55;P;0;L;;fbt;46.5;47;V;L;RL;;pac;60.0;45;0;−R;3RL;;ade;74.9;49;0;8;3RL
thl;36.0;62;AV;GT SL;KRL;;tli;47.1;48;0;8;3RL;;bla;60.5;52;0;−R;3RL;;;;;;;
  • Récapitulatif
  • Tableau non formaté
;codons;0;1;2;3;4;0;1;2
aa;;;;;;;;;
A;;0;23;40;48;;;;
C;;;;;;;0;110;1
D;;;;;;;0;111;0
E;;;;;;;0;62;49
F;;;;;;;0;111;0
G;;0;3;41;67;;;;
H;;;;;;;0;111;0
I;;;;;;;0;109;2
K;;;;;;;0;38;73
L;;1;6;22;82;;0;7;104
M;;;;;;;0;111;0
N;;;;;;;0;111;0
P;;0;29;19;63;;;;
Q;;;;;;;0;51;60
R;;1;5;87;18;;0;16;95
S;;0;6;29;76;;0;111;0
T;;0;6;25;78;2;;;
V;;0;20;46;46;;;;
W;;;;;;;0;109;2
Y;;;;;;;0;111;0

Moyenne des codons t/c et a/g en %[modifier | modifier le wikicode]

ttt;122.76;tct;68.57;tat;115.69;tgt;26.61;;ttt/c;-1.68;tct;4.11;tat;7.99;tgt;-15.29
c;124.84;c;65.81;c;106.81;c;31.02;;;;;;;;;
a;120.01;a;50.17;a;3.31;a;1.66;;tta/g;39.27;a;-14.85;a;103.42;a;-190.89
g;80.61;g;58.22;g;1.05;g;71.35;;;;;;;;;
ctt;96.78;cct;64.69;cat;58.93;cgt;102.54;;ctt/c;-7.16;cct;5.25;cat;-16.52;cgt;-24.98
c;103.96;c;61.39;c;69.55;c;131.82;;;;;;;;;
a;29.62;a;58.46;a;88.56;a;20.47;;cta/g;-143.59;a;-53.70;a;-39.30;a;-73.26
g;180.40;g;101.38;g;131.88;g;44.14;;;;;;;;;
att;168.45;act;68.42;aat;133.07;agt;38.30;;att/c;-7.30;act;-55.57;aat;3.56;agt;-35.34
c;181.22;c;121.08;c;128.41;c;54.74;;;;;;;;;
a;83.68;a;65.02;a;247.04;a;59.74;;ata/g;-59.32;a;-8.35;a;19.83;a;83.71
g;154.26;g;70.68;g;202.47;g;24.49;;;;;;;;;
gtt;131.76;gct;108.46;gat;216.76;ggt;142.22;;gtt/c;11.09;gct;-40.69;gat;7.16;ggt;-17.15
c;117.91;c;163.86;c;201.79;c;168.89;;;;;;;;;
a;83.70;a;91.42;a;295.60;a;88.32;;gta/g;-48.48;a;-31.68;a;26.77;a;48.79
g;137.27;g;125.83;g;225.80;g;53.68;;;;;;;;;

Moyenne des corrélations t/c et a/g en %[modifier | modifier le wikicode]

ttt;63.71;tct;62.53;tat;66.22;tgt;57.82;;ttt/c;-6.19;tct;13.22;tat;9.69;tgt;8.17
c;67.78;c;54.77;c;60.10;c;53.28;;;;;;;;;
a;61.22;a;63.55;a;41.99;a;44.79;;tta/g;78.87;;8.71;;127.61;;3.59
g;26.59;g;58.24;g;9.28;g;43.21;;;;;;;;;
ctt;39.24;cct;63.00;cat;60.03;cgt;18.22;;ctt/c;-41.82;cct;15.63;cat;-9.76;cgt;-114.07
c;60.00;c;53.86;c;66.19;c;66.60;;;;;;;;;
a;51.49;a;60.23;a;63.32;a;22.41;;cta/g;-18.44;;-1.72;;-4.55;;-73.67
g;61.95;g;61.28;g;66.27;g;48.54;;;;;;;;;
att;63.21;act;64.09;aat;58.87;agt;62.31;;att/c;-0.90;act;-2.98;aat;2.24;agt;37.53
c;63.79;c;66.04;c;57.57;c;42.62;;;;;;;;;
a;44.32;a;63.05;a;62.66;a;53.21;;ata/g;77.92;;26.39;;9.87;;119.14
g;19.47;g;48.35;g;56.77;g;13.48;;;;;;;;;
gtt;62.65;gct;56.78;gat;65.77;ggt;39.56;;gtt/c;-0.47;gct;-16.33;gat;-5.45;ggt;-53.67
c;62.95;c;66.88;c;69.45;c;68.58;;;;;;;;;
a;58.39;a;59.17;a;58.17;a;55.97;;gta/g;-2.96;;-0.49;;-5.90;;70.41
g;60.14;g;59.46;g;61.70;g;26.82;;;;;;;;;

Les corrélations en ordre[modifier | modifier le wikicode]

;;ordre corrélations;;;;;
ttt;2a;tct;17a;tat;1a;tgt;21a
c;2g;c;22g;c;11g;c;23g
a;4a;a;7a;a;29a;a*;26g
g*;30a;g;16g;g;31g;g;28g
ctt;27a;cct;12a;cat;15a;cgt;32a
c;17g;c;20g;c;4g;c;5g
a;25a;a;16a;a;10a;a;31a
g;10g;g;14g;g;6g;g;25g
att;6a;act;11a;aat;3a;agt;18a
c;9g;c;8g;c;13g;c;27g
a;26a;a;19a;a;5a;a;24a
g;30g;g;24g;g;19g;g*;33a
gtt;9a;gct;14a;gat;8a;ggt;28a
c;12g;c;7g;c;1g;c;3g
a;22a;a;13a;a;20a;a;23a
g;21g;g;15g;g;18g;g;29g

Calcul de la multiplicité des tRNAs[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Calcul de la multiplicité des tRNAs
  • Légende: tRNAs, nombre affiché par la requête. lignes, nombre de lignes affiché dans calc après nettoyage. bactéries=lignes - tRNAs. multiplicité= tRNAs / bactéries.
  • Tableau non formaté
;;t;;;;;c;;;;;a;;;;;g;;;
;;tRNAs;lignes;bactéries;multiplicité; ;tRNAs;lignes;bactéries;multiplicité; ;tRNAs;lignes;bacteries;multiplicité; ;tRNAs;lignes;bactéries;multiplicité
 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
t;t;10;19;10;1,00;;5;9;5;1,00;;4;7;4;1,00;;3;5;3;1,00
;c;6105;10044;3940;1,55;;4520;8343;3824;1,18;;6420;10353;3934;1,63;;4473;8401;3929;1,14
;a;4749;8491;3743;1,27;;5299;9221;3923;1,35;;;;1;0,00;;1315;2619;1305;1,01
;g;3999;7835;3837;1,04;;2622;5071;2450;1,07;;;;1;0,00;;4366;8285;3920;1,11
 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
c;t;369;700;332;1,11;;10;19;10;1,00;;4;6;3;1,33;;7478;11102;3625;2,06
;c;3849;7359;3511;1,10;;2742;5399;2658;1,03;;4715;8649;3935;1,20;;333;650;318;1,05
;a;4940;8857;3918;1,26;;5453;9386;3934;1,39;;6388;10312;3925;1,63;;887;1693;807;1,10
;g;5186;7969;2784;1,86;;2183;4307;2125;1,03;;2389;4201;1813;1,32;;3355;6648;3294;1,02
 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
a;t;5;9;5;1,00;;103;195;93;1,11;;5;9;5;1,00;;1;1;1;1,00
;c;9203;13067;3865;2,38;;4513;8246;3734;1,21;;8764;12695;3932;2,23;;4422;8354;3933;1,12
;a;55;102;48;1,15;;5878;9808;3931;1,50;;9105;13036;3932;2,32;;4804;8721;3918;1,23
;g;18026;21972;3947;4,57;;2760;5415;2656;1,04;;2427;4468;2042;1,19;;3452;6600;3149;1,10
 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
g;t;9;17;9;1,00;;2;3;2;1,00;;0;0;1;0,00;;1;1;1;1,00
;c;4430;7637;3208;1,38;;4166;7201;3036;1,37;;9023;12957;3935;2,29;;9273;13153;3881;2,39
;a;8859;12791;3933;2,25;;10185;14075;3891;2,62;;9679;13603;3925;2,47;;5515;9442;3928;1,40
;g;1313;2521;1209;1,09;;1224;2404;1181;1,04;;1388;2509;1122;1,24;;2266;4505;2240;1,01

Comptes détaillés des tRNAs des 111 bactéries[modifier | modifier le wikicode]

Comptes détaillés[modifier | modifier le wikicode]
;;;;modèle;1;1;;1;;1;1;;;1;;1;;;1;1;;1;;1;1;;1;1;;1;;1;1;;1;;1;;1;;;1;1;;;1;;1;3;1;1;;;1;;1;;1;;1;;1;;;1;;;;sans pseudo gènes;
;6550;304;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;sans tga;
pseudo;aas;KEGG;%AT;%GC;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;;
0;5,710;zin;86.5;13.5;1;0;0;0;0;0;1;0;0;2;0;1;0;0;0;1;0;1;0;1;1;0;0;0;1;0;0;0;1;0;1;0;1;0;1;0;0;1;1;0;0;0;0;1;3;1;1;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;25;
3;5,760;crp;83.4;16.6;1;0;0;1;0;1;1;0;0;1;0;1;0;0;1;1;0;1;0;1;1;0;0;0;0;0;0;1;1;0;1;0;1;0;1;0;0;1;1;0;0;0;0;0;3;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;25;
2;5,864;hcr;77.5;22.5;1;1;0;1;0;0;1;0;0;1;0;1;0;0;0;1;0;1;0;1;1;0;1;0;0;0;0;1;1;0;1;0;0;0;1;0;0;1;1;0;0;0;0;1;3;1;1;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;1;26;
0;6,157;mcac;76.3;23.7;1;1;0;1;0;0;2;1;0;1;0;1;0;0;0;1;0;1;0;1;1;0;1;0;0;0;0;1;1;0;1;0;0;0;1;0;0;1;1;0;0;0;0;1;3;1;1;0;0;0;0;1;0;0;1;1;0;0;0;0;1;0;0;1;29;trp
0;6,041;ssdc;75.8;24.2;1;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;0;0;1;1;0;1;0;1;1;0;1;1;0;1;0;1;1;0;1;0;1;0;1;0;0;1;1;0;0;0;0;1;2;1;1;0;0;0;0;1;0;1;0;1;0;1;0;0;1;0;0;0;34;
0;6,132;sbw;74.9;25.1;1;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;0;0;1;1;0;1;0;1;1;0;1;1;0;1;0;1;1;0;1;0;1;0;1;0;0;1;1;0;0;0;0;1;3;1;1;0;0;0;0;1;0;1;0;1;0;1;0;0;1;0;0;0;35;
0;5,709;uur;74.5;25.5;1;1;0;1;0;0;1;1;0;1;0;1;0;0;0;1;0;1;0;1;1;1;1;0;0;0;0;1;1;0;1;0;1;0;1;0;0;1;1;0;0;0;0;1;3;1;1;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;1;29;
0;6,361;ple;73.8;26.2;1;0;0;1;0;1;1;0;0;1;0;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;0;1;0;0;1;0;1;1;0;1;0;1;0;1;0;0;1;1;0;0;0;0;1;3;1;1;0;0;0;0;1;0;1;1;1;1;0;0;0;1;0;0;0;33;
0;6,600;smf;73.7;26.3;2;1;0;1;0;0;2;1;0;1;0;1;0;0;0;1;0;1;0;3;1;0;1;0;0;0;0;1;1;0;3;0;0;0;2;0;0;2;2;0;0;0;0;1;3;1;1;0;0;0;0;2;0;0;0;2;0;0;0;0;2;0;0;0;39;
0;6,345;fnc;72.9;27.1;1;1;0;2;0;0;2;1;0;2;0;2;0;0;0;1;0;1;0;2;1;0;1;1;0;1;0;1;2;0;3;0;1;0;3;0;0;3;2;0;0;0;0;1;3;1;2;0;0;0;0;2;0;0;0;3;0;0;0;0;1;0;0;0;47;
0;6,697;bfl;72.6;27.4;1;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;0;1;1;0;1;0;1;1;0;1;0;1;0;1;0;0;1;1;0;0;0;0;1;3;1;1;0;0;0;0;1;0;1;0;1;1;1;0;0;1;0;0;0;37;
0;6,334;cbl;71.7;28.3;2;1;0;2;0;1;4;2;0;3;0;2;0;0;1;2;0;2;0;3;3;1;1;1;0;0;0;2;2;1;4;0;3;1;3;1;0;4;3;0;0;0;0;2;7;1;3;0;0;0;0;5;0;0;0;4;0;1;0;0;2;0;0;1;80;
0;6,762;rip;71.5;28.5;1;1;0;1;0;1;1;0;0;1;0;1;0;0;1;1;0;1;0;1;1;0;1;1;0;1;0;1;1;0;1;0;1;0;1;0;0;1;1;0;0;0;0;1;3;1;1;0;0;0;0;1;0;1;0;1;0;1;0;0;1;0;0;0;33;
0;6,715;rpr;71.0;29.0;1;0;0;1;0;1;1;0;0;1;0;1;0;0;1;1;0;1;0;1;1;0;1;0;0;1;0;1;1;0;1;0;1;0;1;0;0;1;1;0;0;1;0;1;3;1;1;0;0;0;0;1;0;1;0;1;1;1;0;0;1;0;0;0;33;
1;6,569;pub;70.3;29.7;1;1;0;1;0;0;1;0;0;1;0;1;0;0;1;1;0;1;0;1;1;1;1;0;0;0;0;1;1;0;1;0;1;0;1;0;0;1;1;0;0;0;0;1;3;1;1;0;0;0;0;1;0;1;0;1;0;1;0;0;1;0;0;0;31;
0;6,265;cad;70.1;29.9;3;1;0;1;0;1;4;0;0;3;0;3;0;0;1;2;0;3;0;3;3;1;1;0;0;0;0;2;3;0;5;0;2;0;5;0;0;4;2;0;0;0;0;3;9;1;3;0;0;0;0;5;0;0;0;4;0;1;0;0;2;0;0;1;81;
0;6,706;cje;69.5;30.5;1;1;0;1;0;1;2;0;0;1;0;1;0;0;1;1;0;1;0;1;2;1;0;1;1;0;0;1;1;0;1;0;2;0;1;0;0;2;3;0;0;1;0;1;3;1;1;0;0;0;0;2;0;1;0;1;0;1;0;0;3;0;0;1;43;
0;6,431;pmh;68.9;31.1;1;1;1;1;0;0;1;0;0;1;0;1;0;2;1;1;0;1;0;1;1;0;1;1;0;1;0;1;1;0;1;0;1;0;1;0;0;1;1;0;0;1;0;1;3;1;1;0;0;1;0;1;0;1;0;1;1;3;0;0;1;0;0;0;40;
0;6,271;tme;68.6;31.4;1;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;0;1;1;1;0;1;0;2;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;1;0;1;1;1;1;0;2;2;0;1;1;0;1;3;1;1;0;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;0;2;0;0;0;50;
1;6,094;sep;67.9;32.1;2;1;0;1;0;1;3;0;0;2;0;3;0;0;1;1;0;2;0;3;1;0;2;0;0;1;0;2;2;0;2;0;2;0;3;0;0;3;3;0;0;0;0;1;4;1;2;0;0;0;0;3;0;0;0;3;1;0;0;0;2;0;0;0;58;
0;5,974;hhl;67.5;32.5;5;1;0;2;0;1;5;0;0;3;0;2;0;0;1;2;0;2;0;2;2;1;1;1;0;0;0;2;3;0;3;0;2;0;5;0;0;4;1;0;0;1;0;2;5;3;2;0;0;1;0;3;0;1;0;4;0;1;0;0;1;0;0;1;75;
0;6,826;cff;66.7;33.3;1;1;0;1;0;1;2;1;0;1;0;1;0;0;1;1;0;1;0;2;1;1;0;1;1;0;0;1;1;0;1;0;2;0;1;2;0;2;2;0;0;1;0;1;3;1;1;0;0;0;0;2;0;1;0;1;0;1;0;0;1;0;0;0;43;
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0;6,490;din;43.9;56.1;1;1;0;1;1;1;1;0;0;1;0;1;0;0;1;1;0;1;0;1;1;1;1;1;0;0;0;1;1;0;1;0;1;0;1;0;0;1;1;0;0;1;0;1;3;1;1;0;1;1;0;1;0;1;0;1;0;1;0;0;1;0;0;0;37;
1;5,844;say;43.2;56.8;1;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;2;0;1;1;1;0;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;1;1;1;0;2;1;1;1;0;2;1;0;1;1;0;1;4;1;1;0;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;0;2;0;0;1;51;
0;6,773;bmf;42.8;57.2;1;1;0;1;1;2;1;1;0;1;0;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;0;1;1;0;1;0;1;1;1;1;0;2;1;2;1;0;2;3;0;1;1;0;1;5;1;1;0;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;0;3;0;0;0;55;
0;6,638;kpn;42.5;57.5;1;1;0;1;4;1;6;0;0;2;0;1;0;1;2;1;0;3;0;4;1;0;4;1;0;1;0;1;2;2;1;0;4;1;4;0;0;3;3;0;0;2;0;1;7;1;1;0;1;1;0;5;0;3;0;1;1;2;0;0;3;0;0;1;85;
0;6,820;aba;41.6;58.4;1;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;1;1;1;0;1;1;1;1;0;1;1;0;1;1;0;1;3;1;1;0;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;0;1;0;0;0;46;
0;6,546;dba;41.4;58.6;1;1;0;1;1;1;1;2;0;2;0;1;0;1;1;1;0;2;0;2;1;1;2;1;0;1;0;2;1;2;2;0;4;1;3;1;0;2;1;0;1;2;0;2;3;2;1;0;1;1;0;2;1;1;0;1;1;1;0;0;1;0;0;1;64;
0;6,472;synd;40.9;59.1;1;1;0;1;1;1;1;0;0;1;0;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;0;1;1;0;1;0;1;1;0;1;0;1;1;1;0;0;1;3;0;1;1;0;1;3;1;1;0;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;0;3;0;0;0;46;
1;6,745;pgd;40.4;59.6;1;1;0;1;2;1;1;0;0;1;0;1;0;1;1;1;0;1;0;1;2;0;2;1;0;1;0;2;1;0;1;0;3;1;2;0;0;3;4;0;0;1;0;1;6;1;1;0;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;0;4;0;0;0;59;
0;6,549;pac;40.0;60.0;1;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;0;1;1;0;1;0;1;1;1;1;0;1;1;1;1;0;1;1;0;1;1;0;1;3;1;1;0;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;0;1;0;0;0;45;
0;6,780;bla;39.5;60.5;1;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;0;1;1;1;0;1;0;2;1;0;2;1;0;1;0;1;1;1;1;0;3;1;1;1;0;2;1;0;1;2;0;1;3;1;1;0;1;1;0;1;1;2;0;1;1;1;0;0;1;0;0;0;52;
0;6,795;ret;38.7;61.3;0;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;0;1;1;0;1;0;1;1;1;1;0;1;1;2;1;0;2;3;0;0;1;0;1;5;1;1;0;1;1;0;1;0;1;0;1;1;1;0;0;3;0;0;0;50;
1;6,566;sus;38.1;61.9;1;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;1;1;1;0;1;1;1;1;0;1;2;0;1;1;0;1;4;1;1;0;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;0;2;0;0;1;49;
2;6,672;saci;37.7;62.3;1;1;0;1;2;2;0;1;0;1;0;1;0;1;2;2;0;1;0;2;1;2;1;1;0;1;0;2;2;1;1;0;1;1;2;1;0;2;2;0;1;1;1;2;6;1;1;0;2;2;0;1;1;3;0;1;1;1;0;0;2;0;0;0;66;
2;6,805;smk;37.3;62.7;1;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;0;1;1;2;0;1;0;1;1;0;1;1;0;1;0;1;1;1;1;0;1;1;3;1;0;2;3;0;1;1;0;1;5;1;1;0;1;1;0;1;0;1;0;1;1;1;0;0;3;0;0;1;54;
1;6,720;dvl;37.0;63.0;1;1;0;1;2;2;1;2;0;1;0;1;0;1;1;1;0;1;0;2;1;0;3;1;0;1;0;1;1;1;1;0;3;1;3;0;0;2;5;0;1;2;0;1;4;1;1;0;1;1;0;1;1;1;0;1;1;2;0;0;5;0;0;1;66;
0;6,859;ddr;36.6;63.4;1;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;0;2;1;1;0;1;0;1;1;0;1;1;0;1;0;1;1;1;1;0;3;1;1;0;0;2;1;0;1;1;0;1;3;1;1;0;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;0;1;0;0;0;48;
0;6,582;tai;36.2;63.8;1;1;0;1;1;1;1;2;0;1;0;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;1;1;1;0;1;1;1;2;0;1;1;0;1;1;0;1;4;1;1;0;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;0;1;0;0;1;49;
0;7,021;gau;35.7;64.3;1;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;0;1;1;2;0;1;0;2;1;0;1;1;0;1;0;1;1;1;1;0;2;1;1;1;0;1;1;0;1;1;0;1;3;1;1;0;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;0;1;0;0;0;48;
2;6,764;xcb;35.0;65.0;1;1;0;1;2;1;1;1;0;1;0;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;0;2;1;0;1;0;1;1;1;1;0;2;1;2;1;0;2;2;0;1;2;0;1;3;1;1;0;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;0;2;0;0;0;53;
0;6,688;rru;34.6;65.4;1;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;0;1;1;0;1;0;1;1;1;1;0;1;1;1;1;0;1;4;0;1;2;0;1;5;1;1;0;1;1;0;1;1;1;0;1;1;2;0;0;4;0;0;0;55;
0;6,845;dpt;33.8;66.2;1;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;1;1;1;0;3;0;1;0;0;2;1;0;1;1;0;1;2;1;1;0;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;0;1;0;0;0;46;
0;6,664;pae;33.4;66.6;1;1;0;1;2;1;2;0;0;1;0;1;0;1;1;1;0;1;0;2;1;0;3;1;0;1;0;2;1;0;1;0;3;1;3;0;0;4;4;0;0;2;0;1;4;1;1;0;1;1;0;2;0;1;0;1;1;1;0;0;4;0;0;1;62;
0;6,576;roa;32.6;67.4;1;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;0;1;1;0;1;0;1;1;1;1;0;2;3;1;1;0;1;1;0;1;1;0;2;5;1;1;0;1;1;0;1;1;2;0;1;1;1;0;0;1;0;0;0;52;
0;7,207;bmv;31.9;68.1;0;1;0;1;2;1;1;1;0;1;0;1;0;1;1;1;0;1;0;2;1;0;2;1;0;1;0;1;1;0;1;0;1;1;1;0;0;2;4;0;1;1;0;2;4;1;1;0;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;0;5;0;0;1;55;
1;6,617;tos;31.4;68.6;1;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;0;1;1;0;1;0;1;1;1;1;0;2;1;1;2;0;1;1;0;1;1;0;1;3;2;1;0;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;3;1;0;0;0;51;
1;7,209;vin;31.1;68.9;1;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;1;1;1;0;1;1;1;1;0;1;2;0;1;1;0;1;3;1;1;0;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;0;2;0;0;0;48;
0;6,713;age;30.6;69.4;1;2;0;1;3;1;1;2;0;2;0;1;0;1;1;1;0;3;0;2;1;1;2;1;0;2;0;1;2;2;1;0;4;2;1;4;0;2;4;0;1;2;0;1;5;1;1;0;3;2;0;1;2;2;0;1;2;1;0;0;4;0;0;0;81;
0;6,646;opr;30.0;70.0;1;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;0;1;1;0;1;0;1;1;1;1;0;1;1;1;1;0;2;1;0;1;1;0;1;3;1;1;0;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;0;1;0;0;0;46;
0;6,487;mts;29.7;70.3;1;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;0;1;1;0;1;0;1;1;1;1;0;1;1;1;1;0;1;1;0;1;1;0;1;4;1;1;0;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;0;1;0;0;0;46;
1;6,581;sma;29.3;70.7;1;1;0;1;1;2;1;3;0;1;0;1;0;1;1;2;0;1;0;2;1;0;1;1;0;1;0;1;1;2;3;0;3;1;1;3;0;2;1;0;1;2;0;2;6;1;1;0;1;3;0;1;3;3;0;1;1;2;0;0;1;0;0;0;70;
0;6,465;amd;28.7;71.3;1;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;0;1;1;1;0;2;0;1;1;0;1;1;0;2;0;1;1;1;1;0;2;1;1;1;0;1;1;0;1;1;0;1;4;1;1;0;1;1;0;1;2;2;0;1;1;1;0;0;1;0;0;1;51;
2;6,559;sho;28.0;72.0;1;1;0;1;1;2;1;3;0;1;0;1;0;1;1;1;0;1;0;2;1;0;1;2;0;1;0;1;1;2;2;0;3;1;1;3;0;2;1;0;1;2;0;2;8;1;1;0;1;3;0;1;2;3;0;1;1;2;0;0;1;0;0;1;70;
0;6,561;sgr;27.8;72.2;1;1;0;1;1;2;1;3;0;1;0;1;0;1;1;1;0;1;0;2;1;0;1;1;0;1;0;1;1;2;2;0;3;1;1;3;0;2;1;0;1;2;0;2;6;2;1;0;1;2;0;1;2;3;0;1;1;2;0;0;1;0;0;0;67;
0;6,452;cmi;27.3;72.7;1;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;0;1;1;0;1;0;1;1;1;1;0;1;1;1;1;0;1;1;0;1;1;0;1;3;1;1;0;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;0;1;0;0;0;45;
0;6,571;salb;26.7;73.3;1;1;0;1;1;2;1;3;0;1;0;1;0;1;1;1;0;1;0;2;1;0;1;1;0;1;0;1;1;2;2;0;3;1;1;3;0;2;1;0;1;2;0;2;6;1;1;0;1;2;0;1;2;3;0;1;1;2;0;0;1;0;0;0;66;
8;6,532;ksk;25.8;74.2;1;1;0;1;1;2;1;4;0;1;0;1;0;1;1;1;0;1;0;2;1;0;2;1;0;1;0;1;1;2;1;0;4;1;1;3;0;2;1;0;1;3;0;4;5;1;1;0;1;1;0;1;2;3;1;1;1;2;0;0;1;0;0;0;70;
0;6,733;ade;25.1;74.9;1;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;1;1;1;0;1;0;1;1;1;1;0;1;1;1;1;0;1;2;0;1;1;0;1;3;1;1;0;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;0;2;0;0;1;48;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;130;111;6;127;114;109;201;92;0;152;0;137;0;82;116;125;0;156;0;204;122;36;162;101;10;92;0;127;154;75;151;0;213;70;221;67;0;211;237;0;49;109;1;130;462;120;136;0;70;86;0;199;54;117;6;151;84;120;0;4;222;0;0;33;;
;;;;;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;0;3;4;;1;28;12;1;37;;0;;0;;34;6;0;;0;;0;0;76;11;16;;21;;2;0;50;0;;3;44;0;61;;0;0;;62;24;;2;0;1;0;;44;33;;0;65;20;;0;29;9;;;0;;;78;;
;;;;1;94;104;;97;66;89;73;62;;80;;91;;73;95;99;;82;;65;102;34;67;90;;88;;91;83;47;86;;51;65;63;40;;50;53;;49;66;;93;0;101;93;;65;72;;73;39;72;;90;80;85;;;53;;;33;;
;;;;2;9;2;;11;9;10;17;7;;22;;16;;3;9;10;;18;;21;7;1;19;4;;2;;18;18;14;14;;27;1;21;4;;35;18;;;20;;13;3;8;12;;1;4;;13;6;12;;8;2;16;;;23;;;;;
;;;;3;3;1;;1;2;;7;4;;8;;2;;1;1;2;;8;;11;2;;4;1;;;;;6;;8;;19;1;12;5;;16;24;;;1;;1;55;1;5;;1;2;;13;1;7;;7;;1;;;24;;;;;
;;;;4;1;;;0;6;;5;1;;1;;2;;;;;;2;;9;;;8;;;;;;3;;2;;8;;8;1;;8;8;;;;;2;20;;1;;;;;6;;;;6;;;;;6;;;;;
;;;;5;1;;;1;;;3;;;;;;;;;;;;;3;;;;;;;;;1;;1;;1;;2;;;1;5;;;;;;12;;;;;;;4;;;;;;;;;4;;;;;
;;;;autres;;;;;;;5;;;;;;;;;;;1;;2;;;2;;;;;;;;;;2;;5;;;1;3;;;;;;21;;;;;;;2;;;;;;;;;1;;;;;
Spectres des codons des tRNAs des 111 bactéries[modifier | modifier le wikicode]
n tRNAs;;ttc;tta;ttg;;tcc;tca;tcg;;tac;taa;tag;;tgc;tga;tgg
;;;;;;;;;;;;;;;;
0;;0;3;4;;6;0;34;;0;−;−;;2;78;1
1;;80;94;104;;95;91;73;;82;;;;93;33;101
2;;22;9;2;;9;16;3;;18;;;;13;;8
3;;8;3;1;;1;2;1;;8;;;;1;;1
4;;1;1;;;;2;;;2;;;;2;;
5;;;1;;;;;;;0;;;;;;
autres;;;;;;;;;;1;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;
;;ctc;cta;ctg;;ccc;cca;ccg;;cac;caa;cag;;cgt;cga;cgg
;;;;;;;;;;;;;;;;
0;;12;1;28;;33;0;44;;2;0;50;;11;76;21
1;;89;97;66;;72;93;65;;91;83;47;;67;34;88
2;;10;11;9;;4;12;1;;18;18;14;;19;1;2
3;;;1;2;;2;5;1;;;6;;;4;;
4;;;0;6;;;1;;;;3;;;8;;
5;;;1;;;;;;;;1;;;0;;
autres;;;;;;;;;;;;;;2;;
;;;;;;;;;;;;;;;;
;;atc;ata;atg;;acc;aca;acg;;aac;aaa;aag;;agc;aga;agg
;;;;;;;;;;;;;;;;
0;;0;;0;;9;0;29;;0;1;37;;0;0;16
1;;53;;0;;85;90;80;;65;73;62;;99;102;90
2;;23;;3;;16;8;2;;21;17;7;;10;7;4
3;;24;;55;;1;7;;;11;7;4;;2;2;1
4;;6;;20;;;6;;;9;5;1;;;;
5;;4;;12;;;;;;3;3;;;;;
autres;;1;;21;;;;;;2;5;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;
;;gtc;gta;gtg;;gcc;gca;gcg;;gac;gaa;gag;;ggc;gga;ggg
;;;;;;;;;;;;;;;;
0;;20;0;65;;24;0;62;;0;0;61;;3;0;44
1;;72;73;39;;66;53;49;;50;63;40;;51;86;65
2;;12;13;6;;20;18;;;35;21;4;;27;14;1
3;;7;13;1;;1;24;;;16;12;5;;19;8;1
4;;;6;;;;8;;;8;8;1;;8;2;
5;;;4;;;;5;;;1;2;;;1;1;
autres;;;2;;;;3;;;1;5;;;2;;
Spectre du codon atg des gènes tRNA des 111 bactéries[modifier | modifier le wikicode]
occur.;fMet;Met;Ile
0;0;0;9
1;55;78;85
2;19;22;6
3;15;1;1
4;8;;
5;1;;
6;1;;
7;1;;
9;1;;
genèse;101;101;92
dup %;95;24;9
Comptes des solitaires des tRNAs des 111 bactéries[modifier | modifier le wikicode]
			   Résultat	Formules
			nom	cellule		
4 codons	ctx	0	ES12	SI(ET(DC12=0,DD12=0,DE12=0,DF12=0),1,0)	
			ctt	ET12	SI(ET(DC12>0,DD12=0,DE12=0,DF12=0),1,0)	
			ctc	EU12	SI(ET(DC12=0,DD12>0,DE12=0,DF12=0),1,0)	
			cta	EV12	SI(ET(DC12=0,DD12=0,DE12>0,DF12=0),1,0)	
			ctg	EW12	SI(ET(DC12=0,DD12=0,DE12=0,DF12>0),1,0)	
2 codons	ctt,ctc	ctt	EX12	SI(ET(DC12>0,DD12=0),1,0)	
			ctc	EY12	SI(ET(DC12=0,DD12>0),1,0)	
			11	EZ12	SI(ET(DC12=1,DD12=1),1,0)	
			01	FA12	SI(SOMME(EX12:EZ12)=0,1,0)	
La procédure utilisée ici pour 111 bactéries est la même que j'ai utilisée pour les 4032 bactéries de la base gtRNAdb: un tRNA est dit solitaire pour un carré donné (ctx), s'il ne contient qu'un seul type (ctt), les autres (ctc cta ctg) étant nuls. Pour les 4032 bactéries je cherchais les occurrences *ctt*, *ctt;ctt*, . . . .. Ici pour le nom ctt je teste la condition ctt>0 et (ctc=0 cta=0 ctg=0) pour une bactérie donnée. Ce qui donne dans calc pour la bactérie zin (ligne 12) les codonss "ctt ctc cta ctg" (colonnes DC12 DD12 DE12 DF12). La cellule DC12 correspond à la ligne zin et à la colonne ctt du tableau des décomptes détaillés ci-dessus.
  1. 4 codons: calculs pour les 4 codons non nuls d'un carré et 0 s'il n'y a aucun tRNA.
  2. 2 codons: calculs sur 2 codons supposés lus par un seul tRNA. ctt,ctc,11,01: respectivement, seul le codon ctt ou ctc a plus d'un tRNA, ctt et ctc ont chacun 1 seul tRNA, autre combinaison. La colonne avec (*) correspond au cas où les 2 codons n'ont pas de tRNA parmi le décompte "autre combinaison".
Les xxt ne sont pas présentés sauf ctt cgt act, car ils n’ont pas de tRNA (voir tableau).
Donc il n’y a pas de résultat pour
ttt,c Phe
tct,c Ser . . . .
DC12 cellule ctt du tableau pour la bactérie zin
DD12 cellule ctc du tableau «
. . . .
EX12 cellule du résultat du test ctt pour 2 codons
EY12 cellule du résultat du test ctc pour 2 codons
EZ12 cellule du résultat du test 11 pour 2 codons
Les résultats présentés sont la somme des colonnes des noms
Leu 0
Leu ctt
. . . . . . . .
  • Tableau non formaté
Leu;0;1;;Arg;0;1;;Glu;gaa;61;;Thr;0;0;;Gly;0;0
;ctt;0;;;cgt;4;;;gag;0;;;act;0;;;ggc;0
;ctc;0;;;cgc;1;;;11;28;;;acc;0;;;gga;3
;cta;6;;;cga;0;;;01;22;;;aca;6;;;ggg;0
;ctg;0;;;cgg;0;;Trp;tga;0;;;acg;0;;;gga;44
;ctt;5;;;cgt;100;;;tgg;77;;;act;2;;;ggg;0
;ctc;99;;;cgc;10;;;11;29;;;acc;99;;;11;54
;11;0;;;11;0;;;01;5;;;11;1;;;01;13
;01;7;7*;;01;1;1*;Val;0;0;;;01;9;;;;
;cta;27;;;cga;15;; ;gtc;0;;;aca;29;;;;
;ctg;0;;;cgg;70;;;gta;20;;;acg;0;;;;
;11;63;;;11;18;;;gtg;0;;;11;72;;;;
;01;21;1*;;01;8;6*;;gta;65;;;01;10;;;;
;tta;4;;;aga;16;;;gtg;0;;Ala;0;0;;;;
;ttg;3;;;agg;0;;;11;37;;;gcc;0;;;;
;11;87;;;11;85;;;01;9;;;gca;23;;;;
;01;17;;;01;10;;Pro;0;0;;;gcg;0;;;;
Ser;0;0;;Lys;aaa;37;;;ccc;0;;;gca;62;;;;
;tcc;0;;;aag;1;;;cca;29;;;gcg;0;;;;
;tca;6;;;11;47;;;ccg;0;;;11;30;;;;
;tcg;0;;;01;26;;;cca;44;;;01;19;;;;
;tca;34;;Gln;caa;50;;;ccg;0;;;;;;;;
;tcg;0;;;cag;0;;;11;63;;;;;;;;
;11;68;;;11;41;;;01;4;;;;;;;;
;01;9;;;01;20;;;;;;;;;;;;
Comptes détaillés des tRNAs des 111 bactéries: totaux[modifier | modifier le wikicode]
4032 bactéries;;total;;;;;;;4032 bactéries;;100 * n / 3950;;;;
ttt;10;tct;5;tat;4;tgt;3;;0.3;;0.1;;0.1;;0.1
c;6105;c;4520;c;6420;c;4473;;155;;114;;163;;113
a;4749;a;5299;a;−;a;1315;;120;;134;;−;;33
g;3999;g;2622;g;−;g;4366;;101;;66;;−;;111
ctt;369;cct;10;cat;4;cgt;7478;;9.3;;0.3;;0.1;;189
c;3849;c;2742;c;4715;c;333;;97;;69;;119;;8.4
a;4940;a;5453;a;6388;a;887;;125;;138;;162;;22
g;5186;g;2183;g;2389;g;3355;;131;;55;;60;;85
att;5;act;103;aat;5;agt;1;;0.1;;2.6;;0.1;;0.0
c;9,203;c;4513;c;8,764;c;4422;;233;;114;;222;;112
a;55;a;5878;a;9,105;a;4804;;1.4;;149;;231;;122
g;18,026;g;2760;g;2427;g;3452;;456;;70;;61;;87
gtt;9;gct;2;gat;0;ggt;1;;0.2;;0.1;;0.0;;0.0
c;4430;c;4166;c;9,023;c;9,273;;112;;105;;228;;235
a;8,859;a;10,185;a;9,679;a;5515;;224;;258;;245;;140
g;1313;g;1224;g;1388;g;2266;;33;;31;;35;;57
;;;;;;;;;;;;;;;
111 bactéries;;total;;;;;;;111 bactéries;;100 * n / 111;;;;
ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;1;;0;;0;;0;;0.9
ttc;152;tcc;116;tac;156;tgc;130;;137;;105;;141;;117
tta;130;tca;137;taa;0;tga;33;;117;;123;;0;;30
ttg;111;tcg;82;tag;0;tgg;120;;100;;74;;0;;108
ctt;6;cct;0;cat;0;cgt;162;;5.4;;0;;0;;146
ctc;109;ccc;86;cac;127;cgc;10;;98;;77;;114;;9
cta;127;cca;136;caa;154;cga;36;;114;;123;;139;;32
ctg;114;ccg;70;cag;75;cgg;92;;103;;63;;68;;83
att;0;act;6;aat;0;agt;0;;0;;5.4;;0;;0
atc;222;acc;120;aac;204;agc;125;;200;;108;;184;;113
ata;4;aca;151;aaa;201;aga;122;;3.6;;136;;181;;110
atg;462;acg;84;aag;92;agg;101;;416;;76;;83;;91
gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;0;;0;;0;;0
gtc;117;gcc;109;gac;211;ggc;213;;105;;98;;190;;192
gta;199;gca;237;gaa;221;gga;151;;179;;214;;199;;136
gtg;54;gcg;49;gag;67;ggg;70;;49;;44;;60;;63
Comptes détaillés des tRNAs des 111 bactéries: solitaires[modifier | modifier le wikicode]
II. 4032;Nombre de bactéries à tRNAs solitaires des carrés à 4 codons.;;;;;;;;;III. 4032. Nombre de bactéries à tRNAs solitaires des codons ag.;;;;;;;
ttt;3948;tct;3945;tat;3934;tgt;3947;;;tt;−;tc;−;ta;−;tg;−
c;15;c;2;c;3930;c;12;;;sag;3933;sag;3943;sag;−;sag;3934
a;0;a;85;a;−;a;0;;;a;96;a;1493;a;−;a;15
g;2;g;0;g;−;g;17;;;g;190;g;22;g;−;g;2629
ctt;3942;cct;3941;cat;3948;cgt;106*;;;ct;−;cc;−;ca;−;cg;−
c;7;c;3;c;5;c;1;;;sag;3935;sag;3939;sag;3943;sag;3833
a;98;a;1173;a;6;a;7;;;a;692;a;1813;a;2130;a;539
g;0;g;1;g;2;g;7;;;g;30;g;5;g;18;g;3026
att;3949;act;3946;aat;3949;agt;3944;;;at;−;ac;−;aa;−;ag;−
c;2;c;2;c;2;c;1;;;sag;3947;sag;3944;sag;3941;sag;3928
a;0;a;152;a;5;a;0;;;a;0;a;1288;a;1899;a;780
g;81;g;3;g;1;g;0;;;g;3947;g;13;g;9;g;10
gtt;3943;gct;3934;gat;3949;ggt;3948;;;gt;−;gc;−;ga;−;gg;−
c;8;c;32;c;5;c;9;;;sag;3935;sag;3902;sag;3928;sag;3939
a;724;a;877;a;8;a;66;;;a;2724;a;2721;a;2808;a;1699
g;1;g;7;g;1;g;0;;;g;2;g;11;g;5;g;11
;;;;;;;;;;;;;;;;;
II. 111;Nombre de bactéries à tRNAs solitaires des carrés à 4 codons.;;;;;;;;;III. 111. Nombre de bactéries à tRNAs solitaires des codons ag.;;;;;;;
ttt;111;tct;111;tat;111;tgt;110;;;ttt;−;tct;-;ta;-;tgt;−
c;0;c;0;c;0;c;0;;;sag;111;sag;111;sag;−;sag;110
a;0;a;6;a;−;a;;;;a;4;a;34;a;−;a;0
g;0;g;0;g;−;g;1;;;g;3;g;0;g;−;g;77
ctt;111;cct;111;cat;111;cgt;4*;111;;ctt;−;cct;−;cat;−;cgt;−
c;0;c;0;c;0;c;1;;;sag;110;sag;111;sag;111;sag;105
a;6;a;29;a;2;a;0;;;a;27;a;44;a;50;a;15
g;0;g;0;g;0;g;0;;;g;0;g;0;g;0;g;70
att;111;act;111;aat;111;agt;111;;;at;−;act;−;aat;−;agt;−
c;0;c;0;c;0;c;0;;;sag;111;sag;111;sag;111;sag;111
a;0;a;6;a;0;a;0;;;a;0;a;29;a;37;a;16
g;0;g;0;g;0;g;0;;;g;109;g;0;g;1;g;0
gtt;111;gct;111;gat;111;ggt;111;;;gtt;−;gct;−;gat;−;ggt;−
c;0;c;0;c;0;c;0;;;sag;111;sag;111;sag;111;sag;111
a;20;a;23;a;0;a;3;;;a;65;a;62;a;61;a;44
g;0;g;0;g;0;g;0;;;g;0;g;0;g;0;g;0
;;;;;;;;;;;;;;;;;
IV. 4032. Pourcentage des solitaires;;;;;;;;;;IV. 111. Pourcentage des solitaires;;;;;;;
;tt;tc;ta;tg;;;;;;;tt;tc;ta;tg;;;
%4;−;2,2;−;−;;;;;;%4;−;5,4;−;−;;;
1a1g;2804;2114;−;1238;;;;;;1a1g;87;68;0;29;;;
%2;7;38;−;67;;;;;;%2;6;31;100;70;;;
;ct;cc;ca;cg;;;;;;;ct;cc;ca;cg;;;
%4;2,7;29,9;−;3,1;;;;;;%4;5,5;26,1;−;4,5;;;
1a1g;962;1911;996;222;;;;;;1a1g;63;63;41;18;;;
%2;18;46;54;93;;;;;;%2;25;40;45;81;;;
;at;ac;aa;ag;;;;;;;at;ac;aa;ag;;;
%4;2,1;4,0;−;−;;;;;;%4;0;5,4;−;−;;;
1a1g;0;2166;1155;2579;;;;;;1a1g;0;72;47;85;;;
%2;100;33;48;20;;;;;;%2;99;26;34;14;;;
;gt;gc;ga;gg;;;;;;;gt;gc;ga;gg;;;
%4;18,6;23,3;−;1,9;;;;;;%4;18,0;20,7;−;2,7;;;
1a1g;1 051;562;602;1973;;;;;;1a1g;37;30;28;54;;;
%2;69;70;72;43;;;;;;%2;59;56;55;40;;;
;ct;cg;ac;−;;;;;;;ct;cg;ac;−;;;
%4;2,7;3,1;4,0;−;;;;;;%4;-;-;-;−;;;
1t1c;8;10;41;−;;;;;;1t1c;0;0;1;−;;;
%2;99;99;98;−;;;;;;%2;100;100;91;−;;;
tRNAs des 111 bactéries: Diagramme des solitaires APV[modifier | modifier le wikicode]
  • Diagramme des solitaires APV .
	Effectifs des tRNAs solitaires APV							
%GC	A	P	V	T	G	L	R	S
15-20	2	2	2	2	0	0	1	1
20-25	3	3	2	1	2	2	2	2
25-30	10	11	5	3	1	4	1	3
30-35	2	3	2	0	0	0	1	0
35-40	5	6	5					
40-45	1	4	1					
45-50	0	0	2					
50-55	0	0	1					
55-60	0	0	0					
total	23	29	20	6	3	6	5	6

Diagrammes codons-GC-PDNA[modifier | modifier le wikicode]

Compilation PDNA[modifier | modifier le wikicode]

codons PDNA[modifier | modifier le wikicode]

aseca;a63551[modifier | modifier le wikicode]
aseca;a63551;a63552;a27140;a4213;a2211;a36314;a363141;a6412;
KEGG;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
ade;0;2;0;0;228;301;0;251;0;187;1;0;0;117;81;46;1;151;0;147;1;2;4;5;324;112;0;132;2;210;3;2;455;87;1;456;12;304;2;2;358;309;0;47;136;43;0;2;237;89;1;0;317;197;0;0;108;197;0;0;293;0;5;4;
amd;0;12;3;0;299;176;1;228;0;178;3;4;6;166;102;47;3;146;3;158;1;4;20;3;241;119;3;117;1;189;4;59;435;53;66;385;10;386;6;13;295;334;1;33;126;52;2;4;247;59;6;0;197;326;4;2;128;238;0;0;291;1;1;7;
apt;4;48;102;12;312;26;118;146;97;96;75;25;17;23;124;61;81;72;43;114;3;7;141;3;148;51;68;53;19;196;23;180;256;61;339;61;223;139;142;145;113;273;15;35;158;46;56;46;138;81;147;40;257;30;26;91;90;155;216;9;113;7;0;2;
bae;85;71;181;18;82;48;278;87;110;89;69;97;19;22;54;72;113;63;118;121;36;10;89;8;81;28;73;46;121;92;152;121;151;58;370;115;181;144;158;108;147;87;12;20;152;27;29;74;122;9;143;106;95;116;62;131;87;55;205;21;162;8;0;1;
bla;0;35;38;3;210;178;17;272;3;197;7;9;2;112;123;57;46;131;39;158;2;15;109;6;167;21;49;82;8;189;31;93;370;35;161;341;140;263;64;49;150;308;4;36;137;52;21;27;180;54;24;7;277;184;11;16;111;206;60;5;284;3;0;6;
bmv;2;19;8;1;248;223;14;294;10;186;4;1;1;204;23;54;27;135;17;173;0;3;31;1;263;45;21;118;16;188;3;18;469;23;154;269;75;276;17;17;440;141;4;45;151;42;1;4;227;38;12;4;224;218;3;4;233;96;20;1;342;4;0;5;
bsu;84;52;179;18;85;56;268;89;105;101;83;95;26;18;33;74;88;87;101;138;32;13;101;7;76;16;65;45;118;91;147;137;159;43;355;135;194;134;152;115;154;80;11;21;155;27;50;74;113;4;178;106;84;98;62;174;78;29;199;17;181;6;1;2;
cbd;197;132;67;23;51;43;285;55;126;65;57;40;34;51;61;37;108;64;152;59;11;65;92;6;124;40;89;57;179;56;100;131;166;87;366;104;224;97;91;129;163;139;34;30;153;47;33;56;81;89;129;54;139;83;70;37;112;99;284;24;134;5;3;1;
cbl;240;33;73;57;2;1;310;109;128;34;84;108;54;4;18;24;145;19;215;38;190;2;8;18;0;0;69;16;120;18;237;127;30;30;394;72;259;36;132;156;19;20;37;15;145;11;106;75;4;2;153;201;34;6;116;129;4;8;75;384;12;8;1;0;
cff;133;67;182;60;13;13;379;62;180;41;50;51;131;13;8;107;153;38;207;74;143;6;48;11;23;2;72;30;121;28;153;152;105;14;262;172;279;71;146;216;58;67;36;19;146;23;67;74;68;7;173;141;40;49;95;79;36;40;124;232;103;6;2;1;
cgq;3;62;90;16;192;153;33;198;20;164;56;11;4;16;196;25;9;149;18;184;1;16;120;6;193;5;5;92;23;177;48;143;319;11;219;274;109;266;273;202;71;96;16;18;134;48;144;81;24;14;168;35;115;190;50;14;13;298;93;4;249;9;0;0;
cje;225;70;159;35;4;7;391;71;213;30;75;56;122;11;12;79;157;19;271;46;112;3;73;9;27;0;83;26;156;16;146;177;59;28;388;80;277;37;178;212;38;40;39;14;141;21;80;97;9;9;158;133;64;9;89;94;13;35;253;118;98;6;0;3;
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a64121[modifier | modifier le wikicode]
a64121;
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a64122[modifier | modifier le wikicode]
a64122;
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Total codons PDNA[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Total codons PDNA
  • Total numérique: addition des 3 tableaux codons PDNA
KEGG;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga
ade;0;2;0;0;247;338;0;285;0;220;1;0;0;134;96;55;1;165;0;155;1;2;4;7;357;128;0;141;2;229;4;3;502;90;1;500;12;335;2;2;387;342;0;52;150;48;1;2;265;96;1;0;346;209;0;0;113;214;0;0;323;0;5;6
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acides aminés PDNA[modifier | modifier le wikicode]

39 bactéries 9 protéines[modifier | modifier le wikicode]
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Complément 36 bactéries protéine 6142-1[modifier | modifier le wikicode]
a64121;
Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
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Complément 36 bactéries protéine 6142-2[modifier | modifier le wikicode]
a64122;
Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
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xcb;27;13;13;20;4;5;20;6;10;26;21;15;36;7;15;2;16;14;12;13;1;
ype;27;19;9;25;3;6;19;4;15;20;22;14;32;6;17;2;15;21;12;16;1;

Total acides aminés PDNA[modifier | modifier le wikicode]

Total acides aminés;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
ade;587;285;220;286;166;155;499;141;231;599;501;347;733;52;150;48;364;556;327;323;11
amd;530;255;200;352;156;173;430;132;204;618;507;428;722;37;135;54;342;593;408;318;10
apt;562;290;214;345;161;169;399;135;240;568;441;395;747;56;185;52;361;517;400;371;11
bae;544;422;223;364;190;259;276;135;235;535;539;358;549;39;175;30;257;491;365;430;11
bla;515;307;220;348;194;215;365;153;217;586;549;445;625;43;151;55;314;555;384;369;10
bmv;560;343;224;318;173;198;385;151;231;563;469;386;682;57;175;46;302;494;363;394;11
bsu;533;413;230;361;189;255;269;127;233;538;541;367;549;39;179;30;264;499;372;437;11
cbd;580;375;214;311;191;231;377;157;261;529;523;345;582;72;167;51;287;435;346;484;11
cbl;456;478;186;321;179;286;243;90;150;465;513;326;364;61;166;15;203;424;282;526;11
cff;516;493;248;403;209;299;268;111;164;467;482;389;542;63;163;26;240;436;265;512;11
cgq;547;265;206;334;171;217;374;108;213;580;553;408;718;37;145;52;291;568;401;379;10
cje;552;512;265;400;194;337;249;118;194;455;514;349;526;61;156;24;215;393;248;522;11
dvl;494;239;192;283;159;180;392;127;183;528;389;347;598;67;178;43;287;443;312;342;9
eal;559;336;193;330;186;227;390;124;238;532;494;369;658;60;207;44;283;485;326;403;11
eco;559;337;193;332;183;220;390;128;233;533;489;377;658;59;204;44;283;488;327;398;11
eno;563;347;191;344;180;220;373;131;229;532;495;379;622;59;199;46;279;490;337;406;11
kpn;563;320;197;338;177;212;393;128;237;534;485;386;671;60;204;47;282;490;335;392;11
lat;532;346;217;468;182;239;339;149;219;472;433;339;450;88;149;38;253;413;291;549;11
liv;549;403;225;330;190;267;290;124;215;521;551;370;588;37;164;30;263;525;389;431;11
lla;540;359;233;352;190;284;295;107;216;478;534;353;546;36;181;27;251;470;380;434;11
pac;487;238;188;318;151;181;373;129;188;536;477;407;551;45;158;48;283;519;368;356;9
pae;582;321;206;339;183;192;383;138;244;559;512;373;669;70;172;47;293;479;304;386;11
pgd;522;311;206;295;162;210;347;127;230;563;487;430;753;65;205;49;305;470;395;392;11
pmh;616;454;220;420;181;337;275;107;208;480;497;354;459;82;140;39;270;401;314;514;11
ppoy;534;347;216;353;191;246;325;115;258;529;520;358;539;43;177;31;279;499;361;446;11
ret;571;334;207;333;171;231;368;137;220;589;467;387;685;52;159;45;306;492;360;428;11
roa;501;233;189;322;147;159;404;139;203;584;431;411;697;32;105;46;312;535;397;314;10
rru;592;272;197;298;166;159;430;137;206;592;452;393;752;58;180;47;327;520;382;360;11
salb;535;236;204;311;163;160;433;127;214;631;516;418;778;36;128;52;327;577;409;305;10
say;544;188;168;249;173;148;413;139;226;504;433;334;594;22;139;54;321;511;333;338;9
sbz;561;340;187;330;182;227;376;132;236;531;489;377;624;60;199;46;284;475;333;406;11
sep;538;412;219;357;213;314;281;129;247;523;540;417;460;35;174;22;250;474;363;471;11
sgr;537;250;206;325;163;165;414;123;215;631;491;414;775;37;130;47;330;577;408;305;10
sma;534;257;207;330;162;166;410;133;214;617;517;414;746;34;135;47;339;571;411;313;10
smk;568;324;204;308;175;227;396;131;217;599;480;391;716;52;164;46;311;512;354;412;11
sty;558;329;196;344;179;221;388;127;237;534;473;393;654;58;208;45;283;478;328;404;11
synd;624;247;193;359;150;201;417;118;279;554;476;388;683;69;164;43;327;483;371;355;11
xcb;569;277;199;308;169;204;418;130;271;570;463;387;710;57;164;49;289;513;332;358;11
ype;565;327;199;352;181;236;384;135;242;529;484;363;643;61;205;43;267;491;330;414;11

Tableau des diagrammes des codons PDNA[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Tableau des diagrammes des codons PDNA
  • codons des PDNA rapportés à 6 555, moyenne du total des aas des DRNA par bactérie. La moyenne correspondante des PDNA 6 391 est donnée pour indication.
6555.436;6390.718;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
%AT;aas;KEGG;%GC;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga
71.689;5,734;cbl;28.311;321.255;41.157;88.031;67.452;2.287;1.143;410.429;136.048;170.345;42.301;106.323;125.758;74.312;5.716;26.295;28.581;180.635;24.008;278.955;48.017;243.514;2.287;9.146;22.865;0.000;0.000;83.458;19.435;147.480;24.008;296.104;162.343;35.441;37.727;497.317;89.174;330.401;42.301;170.345;200.070;22.865;22.865;51.447;18.292;189.781;17.149;133.761;89.174;4.573;4.573;184.064;249.230;40.014;11.433;141.764;162.343;5.716;12.576;94.890;491.601;14.862;5;4;2
69.451;6,284;cje;30.549;259.755;79.283;186.732;38.598;4.173;7.302;455.876;78.240;244.108;32.339;92.844;62.592;142.918;11.475;14.605;92.844;182.559;19.821;303.570;47.987;131.443;4.173;82.412;9.389;32.339;0.000;92.844;30.253;181.516;20.864;173.170;202.380;66.764;32.339;445.444;90.758;320.261;43.814;204.466;255.583;42.771;45.901;45.901;17.734;162.738;25.037;87.628;116.838;10.432;9.389;177.343;153.350;67.808;11.475;101.190;103.276;13.562;40.685;292.095;139.788;112.665;11;0;0
68.855;6,368;pmh;31.145;286.183;85.443;142.062;76.178;15.442;28.824;372.655;94.708;182.210;44.266;124.562;144.121;86.472;23.677;25.736;27.795;141.032;45.295;280.006;66.913;189.416;13.383;24.706;48.383;4.118;3.088;85.443;24.706;159.562;54.560;205.887;172.945;55.589;59.707;409.715;101.914;305.742;58.678;194.563;208.975;32.942;36.030;65.884;18.530;144.121;40.148;105.002;142.062;14.412;16.471;225.446;119.414;35.001;32.942;144.121;131.768;17.500;29.854;308.830;160.592;59.707;8;0;3
67.905;6,439;sep;32.095;338.004;37.669;99.772;49.886;11.199;11.199;371.600;47.850;153.731;69.230;105.881;147.622;72.284;7.127;11.199;19.344;163.911;52.940;235.177;84.501;92.646;20.362;155.767;1.018;14.253;2.036;98.754;32.579;236.195;15.271;142.532;305.425;57.013;27.488;472.390;77.374;339.022;85.519;201.580;189.363;50.904;26.470;27.488;8.145;177.146;22.398;132.351;98.754;14.253;9.163;206.671;192.418;41.741;41.741;150.676;170.020;33.597;15.271;301.353;89.591;88.573;5;0;6
66.692;6,296;cff;33.308;161.387;74.967;205.118;65.596;14.577;15.618;444.595;68.720;213.447;44.772;62.472;60.390;147.851;14.577;9.371;124.945;175.964;41.648;230.107;81.214;174.923;9.371;54.143;12.494;26.030;2.082;81.214;34.360;138.480;32.277;178.046;170.758;121.821;15.618;310.280;191.582;324.856;80.173;171.799;246.766;64.555;81.214;41.648;23.948;169.717;27.071;80.173;88.503;72.884;8.330;194.706;162.428;43.731;53.102;104.121;89.544;39.566;42.689;135.357;283.208;114.533;9;1;1
64.671;6,266;lla;35.329;151.698;130.774;189.361;35.571;23.016;34.524;326.412;49.171;150.652;93.111;97.296;160.067;66.956;9.416;9.416;25.109;145.421;53.356;217.608;79.511;34.524;29.293;197.730;1.046;31.386;14.647;70.095;41.848;208.192;17.785;167.391;253.178;48.125;31.386;503.218;55.448;254.225;115.081;201.915;224.931;68.002;76.372;32.432;5.231;189.361;28.247;153.790;83.695;13.600;11.508;279.333;91.019;41.848;79.511;159.021;169.483;31.386;37.663;320.135;19.878;114.035;8;1;2
63.679;6,166;lat;36.321;160.537;124.390;144.590;59.537;31.895;44.653;270.042;97.811;178.611;52.095;219.011;101.000;46.779;43.590;53.158;34.021;156.284;37.211;196.684;57.411;74.421;40.400;142.463;25.516;62.726;14.884;123.326;35.084;178.611;54.221;204.126;162.663;56.347;78.674;343.400;116.947;308.316;52.095;163.726;179.674;71.232;63.790;75.484;18.074;158.411;40.400;81.863;133.958;29.768;23.389;164.790;124.390;75.484;74.421;112.695;107.379;43.590;45.716;325.327;153.095;105.253;9;0;2
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Maximum et 75% PDNA[modifier | modifier le wikicode]

Constantes des courbes PDNA[modifier | modifier le wikicode]

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abscisse du maximum PDNA[modifier | modifier le wikicode]

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maximum PDNA[modifier | modifier le wikicode]

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Diagrammes codons-GC-DRNA-39[modifier | modifier le wikicode]

Compilation DRNA-39[modifier | modifier le wikicode]

codons DRNA-39[modifier | modifier le wikicode]

a2777A;a27771;a27761;a27762;a6114;a6115;
Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
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acides aminés DRNA-39[modifier | modifier le wikicode]

a2777A;a27771;a27761;a27762;a6114;a6115;
Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
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Contenu en GC des génomes DRNA-39[modifier | modifier le wikicode]

KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
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Tableau des diagrammes des codons DRNA-39[modifier | modifier le wikicode]

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%AT;aas;KEGG;%GC;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga
71.689;6,328;cbl;28.311;337.717;38.330;113.954;65.264;3.108;2.072;463.066;118.097;197.865;53.869;127.421;103.594;87.019;3.108;16.575;16.575;238.266;34.186;284.884;53.869;249.662;2.072;16.575;24.863;0.000;0.000;88.055;16.575;138.816;29.006;193.721;143.996;29.006;39.366;525.222;98.414;368.795;59.049;137.780;174.038;6.216;26.934;54.905;12.431;170.930;60.085;124.313;109.810;5.180;6.216;192.685;238.266;21.755;8.288;120.169;161.607;5.180;10.359;117.061;396.765;12.431;3;3;0
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25.095;6,727;ade;74.905;0.000;1.949;2.923;0.000;296.247;305.992;3.898;362.513;0.000;220.236;0.000;0.000;0.000;129.608;84.781;54.572;0.974;166.639;1.949;168.588;0.974;0.000;3.898;2.923;367.385;135.455;0.000;135.455;0.000;192.950;3.898;5.847;421.957;86.730;2.923;537.922;12.668;385.900;0.974;2.923;374.207;313.788;0.974;49.699;131.557;76.011;0.974;3.898;269.935;77.960;0.974;0.000;339.125;204.644;0.000;0.000;97.450;185.154;0.974;0.974;325.482;0;2;4

Maximum et 75% DRNA-39[modifier | modifier le wikicode]

Constantes des courbes DRNA-39[modifier | modifier le wikicode]

ttt;%AT;-0.00097;0.17355;-4.30360;tct;%AT;-0.00125;0.16724;-3.91390;tat;%AT;-0.00034;0.08489;-1.41260;tgt;%AT;-0.00011;0.02402;-0.49238
ttc;%GC;-0.00050;0.09197;-0.85222;tcc;%GC;-0.00144;0.16792;-3.23600;tac;%GC;-0.00024;0.04131;0.57261;tgc;%GC;-0.00048;0.05616;-0.93180
tta;%AT;0.00308;-0.19713;3.10300;tca;%AT;0.00025;0.01538;-0.73063;taa;%AT;-0.00011;0.01130;-0.21436;tga;%GC;0.00000;0.00109;-0.03393
ttg;%AT;-0.00289;0.30669;-6.17230;tcg;%GC;-0.00018;0.05988;-1.38550;tag;%GC;0.00004;-0.00456;0.13651;tgg;%GC;0.00036;-0.05793;3.50480
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
ctt;%AT;-0.00119;0.17514;-3.87670;cct;%AT;-0.00087;0.12342;-2.77130;cat;%AT;-0.00084;0.10308;-1.75070;cgt;%AT;-0.00634;0.61326;-10.82100
ctc;%GC;0.00064;0.00340;-0.27679;ccc;%GC;-0.00030;0.06134;-1.48160;cac;%GC;0.00005;0.01230;0.59601;cgc;%GC;-0.00149;0.24750;-5.74220
cta;%AT;0.00024;-0.00179;-0.14369;cca;%AT;-0.00081;0.12143;-2.92250;caa;%AT;-0.00048;0.11500;-3.00450;cga;%AT;-0.00061;0.06221;-1.15280
ctg;%GC;-0.00851;0.99466;-22.79000;ccg;%GC;-0.00242;0.30962;-6.56890;cag;%GC;-0.00371;0.42946;-8.85790;cgg;%GC;0.00062;-0.03601;0.89487
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
att;%AT;-0.00384;0.47079;-10.67000;act;%AT;-0.00024;0.06982;-1.76330;aat;%AT;0.00260;-0.16711;3.19410;agt;%AT;0.00090;-0.05644;1.03110
atc;%GC;-0.00256;0.30946;-4.83630;acc;%GC;-0.00310;0.38721;-8.60530;aac;%GC;-0.00149;0.16036;-1.39250;agc;%GC;-0.00045;0.03038;0.87000
ata;%AT;0.00426;-0.36005;7.37420;aca;%AT;-0.00015;0.06702;-1.94960;aaa;%AT;-0.00314;0.48279;-11.73300;aga;%AT;0.00316;-0.25914;5.21690
atg;%GC;0.00030;-0.10759;8.13700;acg;%GC;-0.00052;0.06042;-0.10996;aag;%GC;0.00064;-0.01314;2.21940;agg;%AT;0.00039;-0.03622;0.96361
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
gtt;%AT;-0.00346;0.40785;-8.71300;gct;%AT;-0.00231;0.27968;-5.76350;gat;%AT;-0.00339;0.41649;-7.55340;ggt;%AT;-0.00306;0.29720;-3.52400
gtc;%GC;0.00114;-0.03240;0.80216;gcc;%GC;-0.00152;0.26874;-6.44180;gac;%GC;-0.00063;0.15838;-2.28940;ggc;%GC;-0.00168;0.27631;-5.75620
gta;%AT;-0.00089;0.15651;-3.58030;gca;%AT;-0.00211;0.24958;-5.03450;gaa;%AT;-0.00525;0.60206;-10.13000;gga;%AT;0.00074;-0.02630;0.52765
gtg;%GC;-0.00299;0.34952;-6.68610;gcg;%GC;-0.00101;0.16063;-2.31920;gag;%GC;0.00331;-0.27481;8.92780;ggg;%GC;-0.00010;-0.00479;1.58080

abscisse du maximum DRNA-39[modifier | modifier le wikicode]

ttt;%AT;;0;75;tct;%AT;;75.342;75;tat;%AT;;0;75;tgt;%AT;;0;75
ttc;%GC;;0;75;tcc;%GC;;66.472;75;tac;%GC;;0;75;tgc;%GC;;68.562;75
tta;%AT;;0;75;tca;%AT;;0;75;taa;%AT;;57.111;75;tga;%GC;;0;75
ttg;%AT;;58.598;75;tcg;%GC;;0;75;tag;%GC;;0;75;tgg;%GC;;0;75
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
ctt;%AT;;85.402;75;cct;%AT;;81.555;75;cat;%AT;;72.185;75;cgt;%AT;;53.938;75
ctc;%GC;;0;75;ccc;%GC;;0;75;cac;%GC;;0;75;cgc;%GC;;0;75
cta;%AT;;0;75;cca;%AT;;85.950;75;caa;%AT;;0;75;cga;%AT;;56.922;75
ctg;%GC;;63.965;75;ccg;%GC;;72.880;75;cag;%GC;;64.911;75;cgg;%GC;;0;75
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
att;%AT;;68.142;75;act;%AT;;0;75;aat;%AT;;0;75;agt;%AT;;0;75
atc;%GC;;71.820;75;acc;%GC;;70.065;75;aac;%GC;;67.107;75;agc;%GC;;56.428;75
ata;%AT;;0;75;aca;%AT;;0;75;aaa;%AT;;0;75;aga;%AT;;0;75
atg;%GC;;47.089;75;acg;%GC;;76.541;75;aag;%GC;;0;75;agg;%AT;;0;75
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
gtt;%AT;;65.833;75;gct;%AT;;68.591;75;gat;%AT;;71.521;75;ggt;%AT;;58.148;75
gtc;%GC;;0;75;gcc;%GC;;0;75;gac;%GC;;0;75;ggc;%GC;;0;75
gta;%AT;;0;75;gca;%AT;;66.982;75;gaa;%AT;;66.828;75;gga;%AT;;0;75
gtg;%GC;;66.767;75;gcg;%GC;;0;75;gag;%GC;;0;75;ggg;%GC;;58.359;75

maximum DRNA-39[modifier | modifier le wikicode]

ttt;%AT;;;244.230;tct;%AT;75.342;119.852;119.839;tat;%AT;;;228.124;tgt;%AT;;;51.778
ttc;%GC;;;242.477;tcc;%GC;66.472;103.916;94.350;tac;%GC;;;174.065;tgc;%GC;68.562;45.407;43.515
tta;%AT;;;423.244;tca;%AT;;;137.184;taa;%AT;57.111;4.124;1.079;tga;%GC;;;4.726
ttg;%AT;58.598;109.910;42.990;tcg;%GC;;;156.975;tag;%GC;;;1.463;tgg;%GC;;;88.879
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
ctt;%AT;85.402;205.079;192.379;cct;%AT;81.555;122.957;119.359;cat;%AT;72.185;94.791;94.148;cgt;%AT;53.938;205.612;-36.675
ctc;%GC;;;268.366;ccc;%GC;;;107.355;cac;%GC;;;134.982;cgc;%GC;;;332.929
cta;%AT;;;80.405;cca;%AT;85.950;131.556;122.138;caa;%AT;;;219.038;cga;%AT;56.922;23.443;6.128
ctg;%GC;63.965;384.723;295.556;ccg;%GC;72.880;229.017;228.008;cag;%GC;64.911;219.849;186.214;cgg;%GC;;;126.122
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
att;%AT;68.142;243.960;227.944;act;%AT;;;159.240;aat;%AT;;;396.439;agt;%AT;;;139.545
atc;%GC;71.820;300.520;297.990;acc;%GC;70.065;231.659;224.846;aac;%GC;67.107;178.423;168.994;agc;%GC;56.428;64.973;46.294
ata;%AT;;;324.971;aca;%AT;;;167.486;aaa;%AT;;;511.031;aga;%AT;;;266.730
atg;%GC;47.089;175.920;131.644;acg;%GC;76.541;112.379;112.241;aag;%GC;;;362.543;agg;%AT;;;33.065
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
gtt;%AT;65.833;206.808;180.994;gct;%AT;68.591;175.052;166.406;gat;%AT;71.521;350.000;346.095;ggt;%AT;58.148;198.351;116.513
gtc;%GC;;;358.850;gcc;%GC;;;387.278;gac;%GC;;;453.401;ggc;%GC;;;413.779
gta;%AT;;;236.378;gca;%AT;66.982;148.443;136.144;gaa;%AT;66.828;444.945;411.994;gga;%AT;;;203.824
gtg;%GC;66.767;221.759;203.186;gcg;%GC;;;303.510;gag;%GC;;;520.185;ggg;%GC;58.359;56.065;49.429

Différences entre DRNA-39 et PDNA-39[modifier | modifier le wikicode]

Différence en % par rapport à DRNA-39[modifier | modifier le wikicode]

%AT;aas;KEGG;%GC;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc
71.7;6,328;cbl;28.3;4.87;-7.38;22.75;-3.35;;;11.37;-15.20;13.91;21.48;16.56;-21.40;14.60;;-58.64;-72.44;24.19;29.77;2.08;10.86;2.46;;44.82;8.03;;;5.22;-17.26;-6.24;17.23;-52.85;-12.74;-22.18;4.16;5.31;9.39;10.41;28.36;-23.64;-14.96;;15.11;6.30;-47.15;-11.03;71.46;-7.60;18.79;;;4.47;-4.60;-83.93;;-17.97;-0.46;;-21.40;18.94;-23.90;-19.56
69.5;6,700;cje;30.5;5.18;12.87;18.09;-51.73;;;20.08;8.09;9.28;-43.71;-2.03;-16.31;-11.50;9.78;;-37.52;11.99;36.69;-4.12;-6.62;12.20;;-3.99;4.04;-50.24;;6.05;-40.54;-0.83;-18.47;-39.36;-7.17;-42.16;-3.29;7.28;15.67;11.29;-39.94;-18.07;-38.95;28.34;-46.60;11.49;17.61;-11.63;55.11;-21.03;2.92;11.15;;-2.99;-23.41;12.27;;17.92;-38.89;7.60;13.37;4.01;-37.38;-3.74
68.9;6,425;pmh;31.1;-3.88;13.67;10.75;3.04;-0.90;-13.00;10.70;14.05;4.50;3.59;22.24;-4.63;2.58;-16.03;-5.10;17.45;13.07;-19.98;17.34;-13.07;1.77;30.97;-15.31;30.26;;;2.62;-10.07;13.12;2.77;-25.34;-10.79;-13.51;-46.30;-11.55;11.61;17.68;8.71;-41.25;-57.55;-7.62;4.56;-40.38;-6.83;-29.59;47.53;0.08;-26.58;25.66;37.91;8.32;4.85;1.99;10.32;-7.01;-18.48;-0.90;34.98;-15.53;-6.35;8.56
67.9;6,088;sep;32.1;4.88;30.03;-0.72;17.27;-15.56;20.00;3.60;39.95;4.18;20.63;0.68;-33.10;24.57;;-15.56;0.20;15.43;19.40;-0.19;0.66;2.23;14.05;14.91;;30.33;;20.94;13.56;-8.06;32.47;-52.15;-17.21;-70.80;-10.99;0.07;2.90;-0.91;18.96;-17.00;-28.37;-57.58;-11.74;-2.11;;-14.25;65.90;-0.75;9.20;22.14;;-2.09;-20.74;29.52;-61.52;-8.47;-9.65;33.61;16.57;-4.04;13.33;-2.82
66.7;6,820;cff;33.3;16.05;-14.69;12.18;9.01;27.78;14.48;8.04;36.17;9.73;-37.00;5.81;10.25;-23.05;31.07;;1.52;11.99;18.25;11.99;-8.32;-10.96;25.01;20.67;50.00;-8.32;;-3.04;-2.13;-7.51;21.91;-26.87;-13.88;-52.70;41.97;-4.13;9.81;12.90;0.70;-24.99;-24.62;-52.64;-53.62;-31.30;26.72;-7.66;54.57;-15.85;11.47;-61.33;;-2.30;-5.61;-33.81;-130.19;20.93;-0.17;-2.91;-58.62;9.73;10.44;-54.75
64.7;6,092;lla;35.3;-2.15;36.37;7.87;-94.45;-94.45;5.64;13.82;-17.17;18.13;-9.53;-14.45;1.49;-63.74;;;-16.67;12.25;9.85;-5.88;10.98;-23.40;-43.28;28.22;;11.62;-4.70;15.40;9.56;-24.82;17.36;-23.46;-20.04;-24.23;37.94;1.55;9.60;13.14;10.88;-34.99;5.84;-62.04;-14.47;-77.29;;-11.38;58.33;5.98;16.37;-14.90;;-4.67;-15.87;26.62;-67.93;-1.22;-12.50;2.78;-118.75;-5.50;-67.93;-4.92
63.7;6,816;lat;36.3;11.21;0.51;9.98;-26.33;-18.44;-7.97;16.44;27.36;11.99;11.20;-6.91;-10.54;35.15;11.13;-10.54;-7.19;-0.31;-4.57;17.21;-19.39;-19.04;-13.53;18.61;-39.63;-16.46;40.48;-8.67;-14.00;1.74;30.40;-35.18;-26.22;-58.34;-18.55;-4.10;-16.92;15.19;-8.33;-37.29;-1.53;-54.30;-38.18;-12.12;21.70;3.11;45.45;-9.12;3.94;-19.04;30.52;16.01;-6.01;-6.06;-20.90;-11.59;2.92;1.47;-28.47;-13.13;9.56;-7.29
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37.3;6,799;smk;62.7;;-3.22;26.27;;-4.56;-11.06;-0.18;7.58;1.70;17.43;;;;13.20;-11.91;-8.02;-24.72;15.90;-38.46;-3.82;;;36.78;36.92;0.71;31.19;2.12;-7.46;17.43;-0.76;-21.01;20.24;-29.87;1.82;-18.11;12.82;32.17;11.06;-28.07;12.49;1.53;-22.98;;5.21;15.78;37.53;;-72.03;17.50;-19.35;-50.70;28.54;11.73;-12.00;;-19.10;-11.16;-7.57;-26.53;;-3.79
37.0;6,714;dvl;63.0;;-16.10;-30.17;;20.54;13.50;17.07;23.06;;6.40;;;;25.24;-53.96;1.23;2.63;4.09;;-4.49;;25.36;-11.00;-29.76;11.46;0.03;-43.42;9.46;1.76;-3.47;10.44;-36.07;-19.44;-47.76;26.54;-11.43;30.69;9.08;-2.03;-56.48;-31.98;-22.97;;11.82;-12.31;36.00;;-2.17;4.59;0.57;-106.40;11.22;-12.10;9.82;;26.90;16.33;4.76;-106.40;10.29;-9.73
35.0;6,758;xcb;65.0;;-8.95;;;13.51;14.88;0.85;6.84;-29.69;6.56;;;-24.08;-11.65;-12.38;14.76;-31.98;15.88;1.01;-2.00;;;28.72;;7.17;-4.99;-39.98;18.01;27.32;-11.82;;-8.37;-15.54;-4.99;-16.91;6.68;-23.12;25.18;-9.19;-24.08;-13.50;-0.42;;-4.99;-6.28;34.05;;;7.98;3.91;;;-16.44;15.35;;;-12.10;-4.59;-36.94;;-8.29
34.6;6,682;rru;65.4;;12.81;6.98;;3.31;-22.74;-19.57;18.49;12.16;13.87;;;;-11.59;-11.80;6.71;1.74;-8.43;-2.48;-6.21;;;29.54;;5.63;23.41;-5.41;-0.93;-8.89;-7.61;10.33;-25.97;-16.18;6.69;-21.92;23.21;8.84;14.78;;-7.61;-6.09;-9.83;;10.53;0.29;34.02;;;0.53;-5.29;22.69;;-7.46;-5.33;;;-44.24;-12.21;11.65;;0.49
33.4;6,658;pae;66.6;;-34.60;;;15.42;-3.19;-24.54;12.16;;8.68;;;;-4.38;-35.18;-9.26;38.08;-5.76;-40.05;16.19;;;34.33;;-9.08;40.38;1.29;-3.19;12.29;-2.29;;23.92;-26.09;20.62;-5.33;-4.52;38.90;5.98;-15.33;7.67;19.64;-27.54;;-9.74;-7.57;33.56;;;1.14;-10.23;-21.62;-28.99;4.95;12.44;-23.83;;35.50;-2.10;26.29;;-15.04
32.6;6,570;roa;67.4;;64.45;;;26.77;-11.57;;18.37;;1.68;;;;23.02;-44.58;-4.86;;17.12;;14.58;;-84.84;45.59;;-16.38;15.10;;-6.64;;7.38;-43.96;34.58;-51.56;25.35;-30.21;16.85;23.54;10.41;-97.59;-3.50;32.84;-63.14;;17.74;21.15;47.25;;;22.92;-38.63;-18.49;;28.57;-23.26;;;41.68;-56.70;33.35;;-8.79
31.9;7,201;bmv;68.1;;36.00;47.36;;2.50;6.64;-0.02;-2.92;10.18;-3.21;;;;-17.33;-10.55;-36.56;17.09;7.55;-47.40;-3.02;;;59.80;;13.02;27.78;7.28;-23.38;41.04;-7.55;;62.46;-20.11;27.20;14.08;-4.91;4.95;11.92;47.64;-111.04;-2.91;9.50;;-14.88;-9.30;33.96;;;-7.18;27.45;15.46;;6.85;-8.25;;;-20.12;-10.55;15.25;;-28.22
29.3;6,575;sma;70.7;;;27.07;;24.26;-13.71;;17.78;;11.45;;;;15.34;-29.02;13.72;;7.98;;9.59;;;32.76;;3.77;-1.59;;1.24;;3.37;5.00;20.29;-34.07;-11.42;-29.39;4.53;;6.71;8.84;;2.47;-34.61;;10.57;9.75;51.91;;;6.08;-22.67;-0.27;;2.14;-13.88;;;10.42;-21.41;;;-10.20
28.7;6,459;amd;71.3;;-6.86;;;19.95;0.48;;0.47;;7.59;;;;-11.22;-23.01;-32.24;;18.99;;8.54;;;28.17;;5.22;26.96;;12.86;;6.67;;-9.01;-26.69;28.33;12.58;-8.72;34.70;7.39;;-5.49;5.24;-20.43;;-6.86;-4.12;41.87;;;0.57;0.52;;;-21.33;-2.70;;;2.71;-19.51;;;-15.80
27.8;6,555;sgr;72.2;;;;;21.54;-14.97;;18.39;;9.53;;;;3.33;-20.08;-9.02;;9.14;;13.00;;;21.73;;2.83;11.77;;11.78;;-1.12;14.13;9.71;-36.14;7.24;-14.50;4.99;;7.35;;8.17;-3.94;-31.37;;7.52;17.05;50.95;;;-7.85;13.29;;;-2.11;-8.35;;;19.26;-17.21;;;-8.74
26.7;6,565;salb;73.3;;;;;27.27;-11.70;;18.34;;10.90;;;;19.77;-24.40;7.62;;11.04;;13.91;;;-18.09;;3.75;25.56;;5.23;;1.77;;1.13;-25.29;-20.09;-233.59;7.32;;8.12;-10.08;;-0.08;-31.87;;10.46;14.60;46.35;;;3.83;-8.93;;;-11.90;-9.62;;;18.12;-9.41;;;-5.98
25.1;6,727;ade;74.9;;;;;16.81;-10.22;;21.56;;0.33;;;;-3.16;-12.98;-0.56;;1.20;;8.26;;;;;3.04;5.71;;-3.86;;-18.42;;;-18.71;-3.54;;7.26;5.49;13.38;;;-3.19;-8.75;;-4.40;-13.77;36.99;;;2.05;-22.87;;;-1.80;-1.90;;;-15.70;-15.32;;;0.98

Corrélation entre les différences “dna-prot” de 2 codons[modifier | modifier le wikicode]

Corrélation entre les différences[modifier | modifier le wikicode]

tt;%;dna;n;;tc;%;dna;n;;ta;%;dna;n;;tg;%;dna;n
a.t;-64.6;84.6;18;;a.t;17.4;74.8;23;;a.t;−;−;−;;a.t;−;−;−
a.c;-17.2;-80.0;18;;a.c;-16.9;-70.5;21;;a.c;−;−;−;;a.c;−;−;−
a.g;2.0;42.0;18;;a.g;19.5;-67.3;21;;a.g;−;−;−;;a.g;−;−;−
t.c;-9.9;-96.6;30;;t.c;-24.9;-48.6;23;;t.c;-27.9;-92.5;33;;t.c;-25.5;-56.6;21
t.g;22.7;56.6;30;;t.g;-24.4;-79.6;23;;t.g;−;−;−;;t.g;-10.3;-37.0;24
c.g;-15.9;-64.3;35;;c.g;-22.2;36.7;34;;c.g;−;−;−;;c.g;36.6;17.2;36
;;;;;;;;;;;;;;;;;;
ct;%;dna;n;;cc;%;dna;n;;ca;%;dna;n;;cg;%;dna;n
a.t;-25.7;-74.8;21;;a.t;46.6;75.5;26;;a.t;-8.9;81.3;33;;a.t;-47.1;5.3;16
a.c;8.8;-63.3;19;;a.c;-19.8;-61.8;16;;a.c;-16.4;-78.0;33;;a.c;-5.2;-27.8;15
a.g;34.6;34.5;19;;a.g;-33.8;-82.3;25;;a.g;-58.3;-93.1;33;;a.g;-14.0;17.4;12
t.c;-12.7;-57.9;30;;t.c;-12.9;-55.8;19;;t.c;-33.3;-93.6;33;;t.c;15.2;-39.1;36
t.g;-1.9;-76.6;30;;t.g;-42.0;-88.1;28;;t.g;16.2;-75.8;33;;t.g;13.2;-49.1;29
c.g;-17.7;-82.5;37;;c.g;4.3;30.7;29;;c.g;37.4;76.6;39;;c.g;-9.5;52.8;30
;;;;;;;;;;;;;;;;;;
at;%;dna;n;;ac;%;dna;n;;aa ;%;dna;n;;ag;%;dna;n
a.t;-33.5;32.6;14;;a.t;0.8;74.3;25;;a.t;23.4;82.5;32;;a.t;27.5;84.0;12
a.c;-28.0;-69.1;14;;a.c;-14.5;-87.8;27;;a.c;-5.4;-69.3;33;;a.c;9.4;-10.5;12
a.g;-14.4;-15.2;14;;a.g;-13.8;-35.5;26;;a.g;-33.9;-89.8;33;;a.g;49.2;66.7;4
t.c;-39.1;-84.0;34;;t.c;-18.2;-75.3;28;;t.c;-49.1;-89.6;32;;t.c;-24.6;0.8;22
t.g;28.5;-11.5;34;;t.g;-4.2;-64.6;27;;t.g;-31.2;-64.0;32;;t.g;-94.6;47.5;5
c.g;-13.6;28.5;39;;c.g;-5.6;16.8;38;;c.g;-5.0;58.3;39;;c.g;8.2;-9.1;7
;;;;;;;;;;;;;;;;;;
gt;%;dna;n;;gc;%;dna;n;;ga;%;dna;n;;gg;%;dna;n
a.t;-1.4;79.1;27;;a.t;-10.2;85.4;33;;a.t;26.5;83.8;35;;a.t;-9.1;20.7;33
a.c;27.6;-78.8;25;;a.c;-9.0;-85.3;35;;a.c;-12.0;-87.4;38;;a.c;12.2;-84.6;33
a.g;-33.6;-72.8;27;;a.g;13.6;-65.5;34;;a.g;-3.7;-96.4;38;;a.g;-12.9;-5.6;33
t.c;-8.3;-84.0;32;;t.c;-31.9;-77.2;36;;t.c;-43.7;-97.4;36;;t.c;-0.3;-63.6;38
t.g;-24.2;-71.6;34;;t.g;-22.2;-76.1;35;;t.g;-0.1;-84.6;36;;t.g;13.2;-25.0;38
c.g;-5.7;37.1;37;;c.g;3.5;41.6;38;;c.g;1.6;86.1;39;;c.g;5.7;-1.6;39

Tableau des diagrammes x.y[modifier | modifier le wikicode]

bases;g.c;dna-39;;bases;t.c;dna-39
tt;-15.9;-64.3;;tt;-9.9;-96.6
tc;-22.2;36.7;;tc;-24.9;-48.6
ta;;;;ta;-27.9;-92.5
tg;36.6;17.2;;tg;-25.5;-56.6
ct;-17.7;-82.5;;ct;-12.7;-57.9
cc;4.3;30.7;;cc;-12.9;-55.8
ca;37.4;76.6;;ca;-33.3;-93.6
cg;-9.5;52.8;;cg;15.2;-39.1
at;-13.6;28.5;;at;-39.1;-84.0
ac;-5.6;16.8;;ac;-18.2;-75.3
aa;-5.0;58.3;;aa;-49.1;-89.6
ag;8.2;-9.1;;ag;-24.6;0.8
gt;-5.7;37.1;;gt;-8.3;-84.0
gc;3.5;41.6;;gc;-31.9;-77.2
ga;1.6;86.1;;ga;-43.7;-97.4
gg;5.7;-1.6;;gg;-43.7;-97.4
;;;;;;
bases;a.t;dna-39;;bases;a.c;dna-39
tt;-64.6;84.6;;tt;-17.2;-80.0
tc;17.4;74.8;;tc;-16.9;-70.5
ta;;;;ta;;
tg;;;;tg;;
ct;-25.7;-74.8;;ct;8.8;-63.3
cc;46.6;75.5;;cc;-19.8;-61.8
ca;-8.9;81.3;;ca;-16.4;-78.0
cg;-47.1;5.3;;cg;-5.2;-27.8
at;-33.5;32.6;;at;-28.0;-69.1
ac;0.8;74.3;;ac;-14.5;-87.8
aa;23.4;82.5;;aa;-5.4;-69.3
ag;27.5;84.0;;ag;9.4;-10.5
gt;-1.4;79.1;;gt;27.6;-78.8
gc;-10.2;85.4;;gc;-9.0;-85.3
ga;26.5;83.8;;ga;-12.0;-87.4
gg;-9.1;20.7;;gg;12.2;-84.6
;;;;;;
bases;a.g;dna-39;;bases;t.g;dna-39
tt;2.0;42.0;;tt;22.7;56.6
tc;19.5;-67.3;;tc;-24.4;-79.6
ta;;;;ta;;
tg;;;;tg;-10.3;-37.0
ct;34.6;34.5;;ct;-1.9;-76.6
cc;-33.8;-82.3;;cc;-42.0;-88.1
ca;-58.3;-93.1;;ca;16.2;-75.8
cg;-14.0;17.4;;cg;13.2;-49.1
at;-14.4;-15.2;;at;28.5;-11.5
ac;-13.8;-35.5;;ac;-4.2;-64.6
aa;-33.9;-89.8;;aa;-31.2;-64.0
ag;49.2;66.7;;ag;-94.6;47.5
gt;-33.6;-72.8;;gt;-24.2;-71.6
gc;13.6;-65.5;;gc;-22.2;-76.1
ga;-3.7;-96.4;;ga;-0.1;-84.6
gg;-12.9;-5.6;;gg;13.2;-25.0

Différences entre codons dues à la séquence des gènes: tableaux pour tableur[modifier | modifier le wikicode]

. − DE at
DE at;;Différences;;;;;;;prot;;DNA;;
%GC;KEGG;prot;DNA;dif;Eprot;Edna;ecart;ok;gaa;gat;gaa;gat;
74.9;ade;-169.2;-125.0;-44.2;55.5;50.0;-61.2;0;1;12;3;13;*
71.3;amd;149.5;135.1;14.3;20.5;19.0;-25.2;0;83;12;93;18;
53.0;apt;42.1;33.1;9.0;8.0;7.5;-6.6;0;374;244;412;295;
43.2;bae;66.4;52.1;14.3;8.1;7.9;-1.7;0;405;203;404;237;
60.5;bla;19.5;-10.5;30.0;11.0;11.8;7.1;1;180;148;136;151;
68.1;bmv;60.1;69.1;-9.0;12.3;11.1;-14.4;0;171;92;220;107;
43.5;bsu;57.8;47.9;9.9;8.1;7.8;-6.0;0;397;219;404;248;
42.4;cbd;50.2;30.2;19.9;7.9;7.6;4.4;1;404;242;396;292;
28.3;cbl;40.3;35.0;5.3;7.4;6.8;-8.9;0;435;289;507;356;
33.3;cff;-4.6;-22.3;17.8;8.1;7.6;2.1;1;298;312;310;388;
54.1;cgq;69.5;0.5;69.1;10.4;9.6;49.1;1;250;121;217;216;
30.5;cje;32.7;28.4;4.3;7.4;6.8;-9.9;0;427;307;491;369;
63.0;dvl;125.2;121.6;3.6;13.7;10.8;-20.9;0;174;40;275;67;
49.7;eal;62.8;57.8;5.0;8.5;8.3;-11.9;0;362;189;370;204;
50.8;eco;73.5;60.8;12.7;8.6;8.4;-4.3;0;374;173;373;199;
55.1;eno;68.4;52.7;15.7;9.2;8.8;-2.4;0;314;154;326;190;
57.5;kpn;50.2;46.8;3.4;9.4;8.9;-14.9;0;284;170;311;193;
36.3;lat;10.8;-9.7;20.5;8.1;7.4;4.9;1;323;290;343;378;
37.1;liv;53.1;63.9;-10.8;7.2;7.4;-3.8;0;486;282;483;249;
35.3;lla;65.7;54.4;11.4;7.4;7.3;-3.4;0;481;243;475;272;
60.0;pac;-20.8;-58.7;38.0;13.7;12.6;11.6;1;95;117;89;163;
66.6;pae;125.6;87.0;38.6;12.9;12.2;13.6;1;197;45;193;76;
59.6;pgd;29.0;18.4;10.6;9.7;9.4;-8.6;0;241;180;249;207;
31.1;pmh;29.1;-1.1;30.2;7.6;7.4;15.2;1;398;297;360;364;
45.5;ppoy;49.8;3.5;46.4;8.4;8.8;29.2;1;356;214;264;255;
61.3;ret;83.5;41.1;42.4;10.1;9.7;22.7;1;280;115;258;170;
67.4;roa;101.3;56.8;44.5;16.1;16.4;12.0;1;116;38;95;53;
65.4;rru;25.0;-3.9;28.9;10.4;10.6;7.9;1;207;161;174;181;
73.3;salb;172.1;120.0;52.1;30.5;51.6;-30.0;0;40;3;12;3;*
56.8;say;76.7;43.2;33.5;10.0;9.7;13.8;1;276;123;259;167;
51.3;sbz;50.7;38.7;12.0;8.6;8.4;-5.0;0;336;200;336;227;
32.1;sep;32.9;33.8;-0.9;7.1;7.3;-13.4;0;464;333;439;312;
72.2;sgr;120.0;102.7;17.3;31.6;32.9;-47.2;0;32;8;28;9;*
70.7;sma;101.9;117.9;-16.1;27.5;32.0;-43.4;0;40;13;31;8;*
62.7;smk;85.7;35.8;49.9;11.1;10.8;28.0;1;230;92;201;140;
52.1;sty;49.6;47.1;2.5;8.7;8.4;-14.5;0;332;200;349;216;
59.1;synd;40.7;-1.7;42.3;10.7;10.5;21.1;1;210;139;179;182;
65.0;xcb;65.6;70.2;-4.6;10.2;10.9;-16.5;0;255;129;229;110;
47.6;ype;24.4;14.5;9.9;8.3;8.1;-6.5;0;322;252;326;282;
;;;;;;;;15;;;;;
;;;;;;;;total ok;;;;;

Différences entre codons dues à la séquence des gènes: tableaux pour diagrammes dif-difxz[modifier | modifier le wikicode]

. − La largeur des colonnes est de 1,3 cm.
dif-difac[modifier | modifier le wikicode]
%;a − c;difS;%;a − c;difS;%;a − c;difS;%;a − c;difS;%;a − c;difS
-86;1;1;-46;1;1;-6;10;;34;0;;74;0;
-85;0;;-45;0;;-5;10;;35;3;1;75;0;
-84;0;;-44;1;1;-4;16;;36;2;;76;1;
-83;0;;-43;5;5;-3;19;;37;2;1;77;0;
-82;0;;-42;1;1;-2;22;;38;2;;78;0;
-81;0;;-41;3;2;-1;18;;39;2;;79;0;
-80;0;;-40;0;;0;44;;40;1;;80;0;
-79;0;;-39;2;2;1;19;;41;0;;81;0;
-78;0;;-38;0;;2;16;;42;2;2;82;0;
-77;0;;-37;2;1;3;27;;43;2;1;83;0;
-76;1;;-36;2;2;4;21;;44;1;1;84;0;
-75;0;;-35;0;;5;14;;45;0;;85;0;
-74;1;;-34;1;;6;20;;46;1;;86;0;
-73;0;;-33;1;1;7;12;;47;1;;87;1;1
-72;0;;-32;1;1;8;7;;48;1;1;88;0;
-71;0;;-31;2;;9;13;;49;0;;89;0;
-70;0;;-30;2;;10;13;;50;0;;90;0;
-69;0;;-29;1;1;11;3;;51;1;1;91;0;
-68;1;1;-28;2;1;12;15;;52;0;;92;0;
-67;0;;-27;2;;13;6;;53;0;;93;0;
-66;1;1;-26;1;;14;8;;54;0;;94;1;1
-65;1;1;-25;3;;15;9;;55;0;;95;0;
-64;0;;-24;0;;16;13;;56;0;;96;1;1
-63;0;;-23;3;;17;9;;57;1;;;;
-62;0;;-22;5;;18;4;;58;0;;;;
-61;0;;-21;5;;19;8;;59;1;1;;;
-60;1;1;-20;3;2;20;7;1;60;0;;;;
-59;0;;-19;3;;21;10;;61;0;;;;
-58;0;;-18;4;;22;4;1;62;0;;;;
-57;0;;-17;5;;23;2;;63;2;1;;;
-56;0;;-16;8;;24;5;1;64;1;1;;;
-55;0;;-15;4;;25;5;3;65;1;;;;
-54;0;;-14;7;;26;4;1;66;0;;;;
-53;1;1;-13;4;;27;3;2;67;0;;;;
-52;0;;-12;7;;28;5;1;68;0;;;;
-51;1;1;-11;10;;29;9;1;69;0;;;;
-50;1;1;-10;7;;30;1;1;70;2;2;;;
-49;0;;-9;10;;31;4;1;71;0;;;;
-48;0;;-8;11;;32;1;;72;0;;;;
-47;0;;-7;11;;33;0;;73;1;1;;;
dif-difag[modifier | modifier le wikicode]
%;a − g;difS;%;a − g;difS;%;a − g;difS;%;a − g;difS;%;a − g;difS
-98;1;;-58;0;;-18;5;1;22;9;2;62;1;1
-97;0;;-57;2;;-17;7;;23;4;3;63;0;
-96;1;1;-56;0;;-16;1;;24;4;;64;0;
-95;0;;-55;0;;-15;6;;25;7;;65;3;3
-94;0;;-54;0;;-14;0;;26;1;;66;0;
-93;0;;-53;0;;-13;6;;27;3;1;67;2;1
-92;0;;-52;0;;-12;5;;28;6;2;68;0;
-91;0;;-51;0;;-11;2;;29;7;1;69;0;
-90;0;;-50;0;;-10;4;;30;3;1;70;0;
-89;1;;-49;0;;-9;7;;31;3;3;71;0;
-88;0;;-48;0;;-8;5;;32;6;4;72;0;
-87;0;;-47;1;;-7;9;;33;2;2;73;0;
-86;0;;-46;0;;-6;17;;34;1;;74;1;1
-85;0;;-45;1;1;-5;11;;35;2;2;75;2;2
-84;0;;-44;3;1;-4;4;;36;1;;76;0;
-83;0;;-43;0;;-3;13;;37;5;5;77;1;1
-82;0;;-42;1;1;-2;14;;38;5;1;78;1;1
-81;0;;-41;0;;-1;12;;39;0;;79;0;
-80;0;;-40;1;;0;36;;40;3;2;80;0;
-79;0;;-39;2;1;1;14;;41;3;;81;1;1
-78;0;;-38;1;;2;25;;42;2;2;82;0;
-77;0;;-37;1;;3;18;;43;2;1;83;1;
-76;0;;-36;1;;4;11;;44;3;2;84;1;1
-75;0;;-35;2;2;5;15;;45;4;2;85;0;
-74;1;;-34;2;2;6;13;;46;3;1;86;0;
-73;1;1;-33;1;;7;13;;47;3;2;87;1;1
-72;0;;-32;2;;8;15;;48;1;1;88;0;
-71;0;;-31;0;;9;10;;49;2;1;89;0;
-70;0;;-30;2;;10;7;;50;1;;90;1;
-69;0;;-29;0;;11;11;;51;1;1;94;1;1
-68;0;;-28;3;1;12;8;;52;0;;107;1;1
-67;1;;-27;2;;13;11;;53;4;3;121;1;1
-66;0;;-26;1;1;14;10;;54;1;1;122;1;
-65;0;;-25;3;;15;7;;55;1;1;133;1;
-64;0;;-24;1;;16;6;;56;1;1;142;1;1
-63;0;;-23;3;;17;9;;57;3;1;147;1;1
-62;0;;-22;2;;18;9;1;58;0;;160;1;1
-61;0;;-21;1;;19;8;1;59;0;;164;1;1
-60;0;;-20;4;;20;9;;60;1;1;;;
-59;0;;-19;4;1;21;6;2;61;0;;;;
dif-difat[modifier | modifier le wikicode]
%;a − t;difS;%;a − t;difS;%;a − t;difS;%;a − t;difS;%;a − t;difS
-171;1;1;-59;0;;-19;4;1;21;9;1;61;1;1
-126;1;1;-58;2;2;-18;2;;22;5;;62;1;
-118;1;1;-57;0;;-17;3;;23;6;;63;2;2
-102;1;;-56;1;;-16;9;;24;8;;64;0;
-95;1;;-55;0;;-15;2;;25;5;;65;1;1
-94;0;;-54;0;;-14;7;;26;7;2;66;1;1
-93;0;;-53;0;;-13;4;;27;4;;67;3;1
-92;0;;-52;1;1;-12;7;;28;9;2;68;0;
-91;1;;-51;1;;-11;11;;29;6;4;69;3;2
-90;0;;-50;2;;-10;11;;30;4;4;70;1;
-89;0;;-49;1;;-9;7;;31;4;1;71;1;
-88;0;;-48;1;1;-8;8;;32;2;1;72;0;
-87;0;;-47;0;;-7;5;;33;6;3;73;0;
-86;1;;-46;0;;-6;5;;34;2;;74;0;
-85;0;;-45;0;;-5;10;;35;1;1;75;0;
-84;0;;-44;5;;-4;7;;36;3;;76;1;
-83;0;;-43;2;1;-3;2;;37;4;1;77;2;1
-82;0;;-42;1;;-2;6;;38;2;2;78;0;
-81;1;1;-41;0;;-1;9;;39;2;1;79;1;1
-80;1;;-40;1;;0;11;;40;1;;80;1;
-79;1;1;-39;1;;1;9;;41;3;;81;0;
-78;0;;-38;1;;2;4;;42;2;3;82;1;
-77;0;;-37;0;;3;15;;43;4;;83;0;
-76;0;;-36;2;;4;16;;44;0;1;84;1;1
-75;0;;-35;1;;5;6;;45;2;1;85;0;
-74;1;;-34;0;;6;8;;46;1;2;86;0;
-73;0;;-33;2;;7;11;;47;2;2;87;1;
-72;0;;-32;4;1;8;9;;48;5;;90;1;1
-71;0;;-31;4;2;9;9;;49;3;1;100;1;
-70;0;;-30;4;1;10;13;;50;3;1;105;2;1
-69;0;;-29;4;;11;14;;51;2;;108;1;1
-68;0;;-28;6;1;12;11;;52;2;1;114;1;
-67;1;;-27;2;;13;8;;53;1;;133;1;
-66;0;;-26;5;1;14;8;;54;1;1;150;1;
-65;0;;-25;3;1;15;5;;55;2;1;166;1;1
-64;0;;-24;4;2;16;6;;56;0;;174;1;1
-63;0;;-23;4;;17;8;;57;3;2;175;1;1
-62;0;;-22;1;;18;10;1;58;2;1;187;1;1
-61;0;;-21;3;;19;7;;59;0;;191;1;1
-60;0;;-20;3;1;20;9;2;60;2;1;200;1;1
dif-diftc[modifier | modifier le wikicode]
%;t − c;difS;%;t − c;difS;%;t − c;difS;%;t − c;difS;%;t − c;difS
-76;1;1;-36;3;2;4;14;;44;0;;84;0;
-75;0;;-35;4;3;5;15;;45;0;;85;0;
-74;0;;-34;2;2;6;19;;46;4;3;86;0;
-73;1;1;-33;2;1;7;12;;47;1;;87;0;
-72;0;;-32;3;3;8;3;;48;2;1;88;0;
-71;0;;-31;5;3;9;5;;49;0;;89;0;
-70;0;;-30;2;2;10;9;;50;0;;90;1;1
-69;0;;-29;5;3;11;8;;51;1;1;;;
-68;2;1;-28;8;5;12;5;;52;0;;;;
-67;0;;-27;6;3;13;4;;53;0;;;;
-66;1;1;-26;6;3;14;9;;54;0;;;;
-65;0;;-25;3;;15;4;;55;1;1;;;
-64;0;;-24;2;1;16;1;;56;1;1;;;
-63;0;;-23;10;4;17;10;;57;1;1;;;
-62;0;;-22;11;2;18;4;;58;0;;;;
-61;0;;-21;9;3;19;5;;59;0;;;;
-60;1;1;-20;7;;20;6;1;60;0;;;;
-59;1;1;-19;11;;21;1;;61;0;;;;
-58;0;;-18;9;;22;6;2;62;0;;;;
-57;0;;-17;4;;23;3;;63;1;1;;;
-56;0;;-16;12;;24;6;1;64;0;;;;
-55;0;;-15;12;;25;7;;65;0;;;;
-54;2;2;-14;8;;26;3;1;66;0;;;;
-53;1;1;-13;8;;27;5;3;67;0;;;;
-52;0;;-12;14;;28;0;;68;1;1;;;
-51;2;1;-11;11;;29;4;1;69;0;;;;
-50;0;;-10;4;;30;6;1;70;1;1;;;
-49;1;1;-9;6;;31;4;3;71;0;;;;
-48;2;2;-8;15;;32;2;1;72;0;;;;
-47;1;1;-7;11;;33;4;2;73;0;;;;
-46;3;3;-6;17;;34;2;1;74;0;;;;
-45;0;;-5;9;;35;2;1;75;0;;;;
-44;2;2;-4;12;;36;0;;76;0;;;;
-43;0;;-3;22;;37;1;1;77;0;;;;
-42;1;1;-2;19;;38;2;1;78;0;;;;
-41;3;2;-1;13;;39;2;2;79;0;;;;
-40;1;;0;19;;40;1;1;80;0;;;;
-39;4;2;1;18;;41;4;2;81;0;;;;
-38;4;4;2;10;;42;2;1;82;1;1;;;
-37;8;6;3;13;;43;1;1;83;0;;;;
dif-diftg[modifier | modifier le wikicode]
%;t −g;difS;%;t −g;difS;%;t −g;difS;%;t −g;difS;%;t −g;difS
-155;1;1;-40;0;;0;34;;40;2;2;80;0;
-100;1;;-39;2;;1;11;;41;3;3;81;1;1
-93;1;;-38;0;;2;14;;42;2;2;82;0;
-77;1;;-37;0;;3;13;;43;3;1;83;2;
-76;0;;-36;1;1;4;11;;44;5;3;84;0;
-75;0;;-35;0;;5;17;;45;1;1;85;0;
-74;0;;-34;1;1;6;11;;46;5;5;86;0;
-73;0;;-33;3;2;7;9;;47;1;;87;0;
-72;0;;-32;0;;8;18;;48;0;;88;0;
-71;0;;-31;2;2;9;11;;49;0;;89;1;1
-70;0;;-30;2;1;10;12;;50;3;2;90;0;
-69;0;;-29;3;3;11;12;;51;0;;91;1;1
-68;0;;-28;2;1;12;7;;52;3;3;92;1;1
-67;0;;-27;3;1;13;7;;53;1;;93;0;
-66;1;1;-26;0;;14;7;;54;0;;94;0;
-65;0;;-25;5;3;15;9;;55;1;1;95;0;
-64;0;;-24;3;3;16;6;;56;0;;96;1;1
-63;0;;-23;2;;17;8;;57;3;2;103;1;1
-62;0;;-22;5;;18;6;;58;0;;104;1;1
-61;0;;-21;3;1;19;11;;59;0;;105;0;
-60;1;1;-20;5;;20;4;;60;2;2;106;1;1
-59;0;;-19;3;;21;5;;61;2;2;107;0;
-58;1;1;-18;6;;22;11;;62;0;;108;1;1
-57;0;;-17;8;;23;4;1;63;0;;109;2;2
-56;1;1;-16;4;;24;2;;64;1;;110;1;1
-55;0;;-15;7;;25;9;4;65;1;1;129;1;1
-54;1;1;-14;7;;26;1;;66;1;1;149;1;
-53;0;;-13;12;;27;3;1;67;0;;150;1;1
-52;0;;-12;5;;28;0;;68;1;1;173;1;1
-51;1;1;-11;9;;29;3;1;69;0;;;;
-50;0;;-10;7;;30;6;2;70;1;1;;;
-49;0;;-9;11;;31;1;1;71;1;1;;;
-48;0;;-8;11;;32;2;;72;1;1;;;
-47;1;1;-7;12;;33;3;2;73;1;;;;
-46;0;;-6;12;;34;3;3;74;2;2;;;
-45;0;;-5;16;;35;0;;75;0;;;;
-44;1;1;-4;12;;36;1;1;76;1;1;;;
-43;4;4;-3;22;;37;1;1;77;2;2;;;
-42;0;;-2;15;;38;4;4;78;0;;;;
-41;2;2;-1;10;;39;0;;79;0;;;;
dif-difcg[modifier | modifier le wikicode]
%;c −g;difS;%;c −g;difS;%;c −g;difS;%;c −g;difS;%;c −g;difS
-125;1;1;-23;4;1;17;10;;57;2;2;137;0;
-62;1;1;-22;4;1;18;7;1;58;2;2;138;1;1
-61;0;;-21;6;2;19;9;1;59;0;;;;
-60;0;;-20;3;;20;11;3;60;1;1;;;
-59;0;;-19;4;1;21;8;;61;0;;;;
-58;0;;-18;7;;22;9;4;62;2;2;;;
-57;0;;-17;3;1;23;2;;63;0;;;;
-56;0;;-16;2;1;24;13;7;64;0;;;;
-55;0;;-15;6;;25;5;1;65;0;;;;
-54;1;;-14;4;;26;7;4;66;1;;;;
-53;0;;-13;6;;27;2;;67;1;;;;
-52;0;;-12;8;;28;10;6;68;2;2;;;
-51;1;;-11;7;;29;8;3;69;2;2;;;
-50;0;;-10;9;;30;3;1;70;1;1;;;
-49;0;;-9;9;;31;4;4;71;1;1;;;
-48;0;;-8;11;;32;11;5;72;1;;;;
-47;0;;-7;11;;33;7;4;73;0;;;;
-46;0;;-6;7;;34;1;1;74;0;;;;
-45;1;;-5;17;;35;5;5;75;0;;;;
-44;1;1;-4;6;;36;3;2;76;1;1;;;
-43;1;;-3;18;;37;3;2;77;1;1;;;
-42;0;;-2;12;;38;0;;78;1;1;;;
-41;0;;-1;11;;39;9;4;79;1;1;;;
-40;0;;0;24;;40;6;2;80;0;;;;
-39;0;;1;5;;41;6;6;81;1;1;;;
-38;2;;2;15;;42;7;5;82;3;3;;;
-37;0;;3;7;;43;2;1;83;0;;;;
-36;1;;4;13;;44;5;3;84;1;1;;;
-35;0;;5;10;;45;1;1;85;1;1;;;
-34;1;;6;13;;46;6;5;86;0;;;;
-33;0;;7;9;;47;1;1;87;0;;;;
-32;1;;8;13;;48;0;;88;0;;;;
-31;2;1;9;14;;49;4;4;89;0;;;;
-30;2;1;10;14;;50;4;4;90;0;;;;
-29;0;;11;3;;51;0;;91;0;;;;
-28;1;1;12;8;;52;2;2;92;0;;;;
-27;1;;13;11;;53;1;1;93;0;;;;
-26;1;1;14;13;;54;4;4;94;0;;;;
-25;5;;15;12;;55;6;6;95;0;;;;
-24;1;1;16;5;;56;3;2;96;0;;;;

Différences entre codons dues à la séquence des gènes: tableaux pour le calcul de la moyenne[modifier | modifier le wikicode]

dif-difac2[modifier | modifier le wikicode]
(*) non retenu pour les diagrammes
(") différence significative (difS)
;;;Moyen.;ecartt;;;;;;;;;;;;
;a − c ;;2.73704883802505;20.7964069191987;;" : 59;* : 4;;;;;;;;;
KEGG;S tc;SR ag;R cg;L ct;FL tt;NK aa;HQ ca;G gg;DE ga;A gc;P cc;V gt;T ac;I at;CW tg;YX ta
ade;0.00;0.13;2.23;0.00;0.00;-9.04;5.59;-0.50;-1.82;1.09;-0.81;0.00;0.00;-1.19;12.29;0.00
amd;0.80;14.29;0.23;-2.12;0.00;-1.84;6.11;-6.10;-3.26;-9.02;5.53;-1.18;1.21;0.00;12.48;2.60
apt;6.26;-15.64;-3.43;5.98;-14.14;-11.64;-60.27";3.90;-19.67";-42.58";-20.99;15.90;-41.87";15.69;-3.53;28.74
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bla;-21.80;-0.53;-11.86;2.52;-1.77;-22.20;-67.62";-7.20;48.11";-3.54;26.19;-3.18;-3.98;2.00;21.41;8.16
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dif-difag2[modifier | modifier le wikicode]
(*) non retenu pour les diagrammes
(") différence significative (difS)
(**) différence significative, non retenu pour les diagrammes (extrêmes)
;ag;;9.44392493281295;28.6570086672965;;" : 88;* : 37;** : 2;;;;;;;;
KEGG;S tc;SR ag;R cg;L ct;FL tt;NK aa;HQ ca;G gg;DE ga;A gc;P cc;V gt;T ac;I at;CW tg;YX ta
ade;0.00;*-50;6.15;0.00;*0;-4.26;3.46;-0.18;-1.36;1.02;0.06;0.00;0.00;-2.94;24.93;*0
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ype;24.42;6.84;-9.12;4.86;11.73;15.93;12.67;-38.76;8.92;16.31;21.24;-39.11";21.30;4.34;20.89;30.00
dif-difat2[modifier | modifier le wikicode]
(*) non retenu pour les diagrammes
(") différence significative (difS)
(**) différence significative, non retenu pour les diagrammes (extrêmes)
;;;Moyen.;ecartt;;;;;;;;;;;;;
;at;;9.45280027693832;37.4320827426531;;" : 85;* : 56;** : 2;;;;;;;;;
KEGG;S tc;SR ag;R cg;L ct;FL tt;NK aa;HQ ca;G gg;DE ga;A gc;P cc;V gt;T ac;I at;CW tg;YX ta;
ade;*0;*0;*133;*400;*-400;*133;*400;68.57;-44.23;*100;*53;*0;*0;*-200;80.00;*0;ade
amd;28.57;*89;16.93;-50.00;*400;*-167;*160;-28.79;14.34;-66.67;*-229;-31.75;69.84;*400;100.00;100.00;amd
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bmv;**-240;*-100;-23.48;16.67;51.47;-38.46;-44.34;-6.35;-9.04;-125.59";-20.00;-44.34;-91.43;-30.39;104.55;19.15;bmv
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dif-diftc2[modifier | modifier le wikicode]
(*) non retenu pour les diagrammes
(") différence significative (difS)
;tc;;-2.90133041337106;22.4137892617996;;" : 114;;;;;;;;;;
KEGG;S tc;SR ag;R cg;L ct;FL tt;NK aa;HQ ca;G gg;DE ga;A gc;P cc;V gt;T ac;I at;CW tg;YX ta
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dif-diftg2[modifier | modifier le wikicode]
(*) non retenu pour les diagrammes
(") différence significative (difS)
;tg;;7.17402973787434;29.8979639679912;;" : 110;* : 10;;;;;;;;;
KEGG;S tc;SR ag;R cg;L ct;FL tt;NK aa;HQ ca;G gg;DE ga;A gc;P cc;V gt;T ac;I at;CW tg;YX ta
ade;2.96;*0;0.93;-3.91;*0;-2.14;0.00;-12.36;0.17;-1.04;-2.70;0.01;0.00;-2.94;-5.06;*67
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cgq;19.74;-154.55";2.12;15.57;-15.68;-10.96;-16.54;3.32;-53.94";45.51";42.86";42.17";74.48";-7.10;43.11;17.78
cje;5.06;3.71;9.64;-1.99;3.02;8.42;-12.89;1.78;3.53;40.65";2.77;13.28;-4.72;-13.55;66.10";-0.39
dvl;1.08;-8.35;8.30;36.29";11.07;21.64;18.59;-7.78;-29.35";9.90;4.44;21.20;6.29;25.31;-1.14;-39.13
eal;16.31;91.47";9.40;0.53;-16.94;109.27";5.11;13.29;8.85;14.10;3.74;-27.62";18.36;19.19;44.05";0.00
eco;-21.74;73.33;0.06;-13.31;-12.94;108.00";11.21;12.30;14.78;29.13";15.43;-24.67";15.55;40.33";52.46";0.00
eno;-6.17;173.33";0.35;2.51;-1.91;32.71;9.36;-17.77;-10.99;-10.13;-24.75;-33.29";-15.02;26.97";45.90";-6.67
kpn;-14.80;110.00";-2.92;-11.93;-16.72;21.84;-5.06;-0.69;-8.75;-9.99;-0.35;-42.97";60.32";-1.96;50.44";0.00
lat;10.88;-60.33";12.16;-14.85;-11.72;11.85;40.66";5.56;-23.69";-30.80";-11.91;-19.19;10.29;14.00;70.07";-2.70
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lla;5.61;13.85;-8.26;-21.57;25.18";-5.90;1.52;33.25";-2.32;-33.09";-13.61;18.31;2.25;-5.03;128.79";-2.86
pac;33.23";57.33;13.88;16.66;17.23;6.93;-26.57;29.85";-23.90";8.55;-10.82;24.63;0.64;4.67;15.25;0.00
pae;8.64;150.00";7.80;9.85;50.00;8.92;-1.17;-2.54;-28.55";7.19;5.43;10.57;64.34;-13.08;18.59;0.00
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pmh;-18.69;31.97;-9.66;-4.13;8.93;-2.92;0.15;-19.75;-5.24;20.53;22.07;-3.03;2.33;-9.75;96.48";-0.40
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ret;-5.49;53.33;22.46;2.38;-20.42;13.21;-0.11;5.87;-8.82;17.99;-8.12;-4.58;-0.10;22.03;7.96;-4.40
roa;-9.18;28.57;-43.51";12.16;0.00;5.08;5.41;-10.69;-3.33;20.72;16.98;24.83;24.83;-5.72;26.72;-100.00
rru;-3.14;148.57;-7.34;-1.87;0.55;11.35;-1.66;29.71;16.10;0.62;-1.78;-20.28;-5.86;-5.43;3.22;-0.34
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say;13.76;20.44;8.24;8.86;17.09;7.52;21.55;38.45";-4.34;15.62;-8.25;18.19;-9.10;7.87;18.99;-6.64
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sep;8.11;15.72;-2.82;-4.72;21.78;33.74";7.74;1.69;2.36;-12.89;7.18;23.32;33.89";-8.62;104.13";-2.47
sgr;-3.29;44.44;-10.99;-3.34;*-100;-7.79;5.37;-2.60;-0.45;-1.93;-0.27;8.70;-2.21;-9.94;-3.79;-5.71
sma;-5.75;*-11;-41.03";-0.41;83.33;-3.52;5.58;-22.56;4.33;-7.26;4.08;0.71;-9.08;-4.90;-3.55;-20.78
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synd;15.19;-22.10;-17.67;2.02;51.87";10.92;25.36";-1.94;-17.94;33.81";16.73;6.46;-17.71;-6.17;80.78";0.00
xcb;-15.22;4.76;-27.52;7.24;13.38;2.37;10.87;2.32;25.21";2.67;3.18;-8.84;-13.01;12.13;43.64;-8.89
ype;-4.21;-2.78;8.01;3.64;-10.60;76.61";30.58";-14.89;-0.15;-26.58";17.71;-47.48";9.52;9.26;60.97";0.00
dif-difcg2[modifier | modifier le wikicode]
(*) non retenu pour les diagrammes
(") différence significative (difS)
;;;Moyen.;ecartt;;;;;;;;;;;;
;cg;;11.8442926255222;24.899720949189;;" : 144;* : 3;;;;;;;;;
KEGG;S tc;SR ag;R cg;L ct;FL tt;NK aa;HQ ca;G gg;DE ga;A gc;P cc;V gt;T ac;I at;CW tg;YX ta
ade;8.77;-24.82;2.18;27.87";-0.09;13.94;-12.55;7.39;-6.61;5.22;16.74;0.09;-0.30;-11.71;49.86";-7.14
amd;9.37;-21.05;23.79";19.72";-2.91;-8.18;-6.57;27.74";-16.02";23.95";0.04;-15.22;19.53;9.08;53.55";-3.01
apt;6.34;32.86;-14.42;-6.66;28.26;13.27;5.57;40.87";44.63";25.94";-5.01;-19.59;37.24";-14.97;22.32;0.00
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bla;4.15;15.79;-8.18;-0.89;27.89";-4.56;6.62;7.71;-30.39";12.04;17.64;32.38";32.86";29.23";24.86;2.50
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cbl;-8.27;62.22";*0;*-27;-30.97;-20.95;33.49;24.05;-21.30;-125.00";-18.18;-21.46;8.33;1.93;137.88";15.15
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eal;12.22;21.44;14.82;-8.98;14.36;42.37";2.20;23.53;-12.05;29.80";-4.92;-1.03;15.71;-12.98;42.26;0.00
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pac;-8.93;55.38";21.02;36.40";15.45;18.36;21.11;34.01";-13.13;19.45;24.99;46.62";13.60;30.72";38.87;0.00
pae;25.37;7.88;24.23";13.03;-15.23;-4.43;0.78;9.43;-10.56;41.04";5.95;-8.20;7.61;5.89;49.79";0.00
pgd;39.12";1.10;5.56;-4.54;-14.53;13.29;-16.04;13.33;-4.75;20.10";35.29";-6.60;45.83";9.70;54.45";0.00
pmh;-9.85;15.25;*95;10.47;9.75;25.85;10.39;-25.32;2.97;-11.94;-17.78;-8.88;-38.15;-30.81";52.40";1.64
ppoy;57.29";3.70;17.12;-5.39;-9.47;76.23";35.88";29.47";40.86";23.97;7.89;25.53;1.63;-19.36;52.70";0.00
ret;-6.01;21.22;18.49;28.28";14.87;17.71;18.70;8.91;18.01";8.54;5.44;-3.05;-2.06;21.98";55.63";-4.88
roa;62.46";5.11;25.77";41.79";28.37";4.36;13.52;33.00";7.43;81.77";56.90";48.80";77.04";26.40";38.57;-4.47
rru;0.16;13.96;13.39;15.24;-0.90;22.07";-4.95;9.89;10.39;2.25;5.67;-1.98;-15.00;-0.19;30.39;0.60
salb;41.7";-20.49;20.24;42.43";1.52;5.06;-3.36;1.56;-0.86;23.98";11.61;-1.54;16.85;18.74;45.55";-7.36
say;67.60";7.06;-2.51;17.18;4.25;19.01;14.24;46.15";34.89";30.59";8.42;15.00;34.67";0.02;-27.20;-14.03
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sep;44.44;66.96;-30.00;-36.36;11.72;48.85";22.34;40.25;-17.91;-32.39;65.61;78.48";18.75;-9.52;82.05";-7.55
sgr;21.00;29.27;7.79;36.81";-2.28;6.11;-12.73;14.92;-2.50;22.38";-19.51;4.90;31.57";23.84";57.94";-2.95
sma;40.60";-37.55;-3.75;39.05";-1.09;8.96;2.05;4.48;-2.29;31.52";24.19";13.02;28.18";17.49;55.37";-0.21
smk;23.92;39.46;20.88;6.02;-8.08;10.69;5.00;9.11;1.99;21.83";25.81";20.48";-3.27;18.53";41.00";-8.89
sty;3.60;18.58;-5.62;-9.93;-6.57;40.88";6.76;20.64;7.26;31.92";16.56;-14.01;33.02";-17.95;22.62;0.00
synd;-17.74;-11.47;6.04;3.03;14.71;18.71;-23.22";2.79;-3.42;9.27;20.02;5.86;-5.03;-11.27;67.77";0.00
xcb;0.60;-0.90;-3.42;-0.68;-10.63;8.59;-24.31";2.40;-21.49";-11.98;2.70;-26.37";-4.25;1.67;45.86";-3.17
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