Recherche:Répétition des bases dans l'ADN des procaryotes/Annexe/Tableaux

Une page de Wikiversité.
Aller à : navigation, rechercher
Tableaux
Image logo représentative de la faculté
Annexe 2
Recherche : Répétition des bases dans l'ADN des procaryotes
Précédent : Perl
Suivant : Repetitions
Icon falscher Titel.svg
En raison de limitations techniques, la typographie souhaitable du titre, « Annexe : Tableaux
Répétition des bases dans l'ADN des procaryotes/Annexe/Tableaux
 », n'a pu être restituée correctement ci-dessus.



Paris le 14.9.16

Sommaire

Aléas[modifier | modifier le wikicode]

Résultat[modifier | modifier le wikicode]

  •  %GC (dénominateur; numérateur) et effectif pour la courbe des aléas

Programme perl: repete-alea.pl

6;1;159,662
17;4;1,017,293
29;7;190,657
47;12;751,719
23;6;358,242
37;10;2,268,272
7;2;3,992,906
31;9;1,109,804
43;13;1,777,831
16;5;1,738,790
31;10;2,499,279
3;1;1,800,764
29;10;1,755,993
17;6;2,365,589
11;4;1,190,853
43;16;2,928,879
47;18;1,937,111
41;16;1,171,660
23;9;1,796,846
47;19;1,072,952
29;12;1,044,459
31;13;1,617,544
47;20;2,158,758
37;16;4,168,266
23;10;4,215,606
9;4;3,308,273
31;14;5,728,392
11;5;5,597,590
41;19;5,347,283
21;10;4,653,728
29;14;2,343,476
47;23;2,736,403
2;1;4,701,875
2;1;5,498,450
47;24;4,641,652
37;19;4,683,551
23;12;4,809,037
17;9;2,907,495
17;9;1,139,203
37;20;3,145,677
20;11;4,726,582
37;21;3,551,206
7;4;2,121,359
47;27;5,315,120
47;27;1,156,948
22;13;2,572,069
47;28;3,776,653
5;3;2,560,265
43;26;1,933,695
31;19;4,381,608
8;5;3,908,022
43;27;3,820,344
19;12;3,462,887
17;11;5,429,298
20;13;5,148,708
29;19;4,352,825
3;2;6,264,404
3;2;3,944,163
43;29;8,376,953
22;15;3,497,479
23;16;1,894,877
41;29;9,025,608
41;29;11,936,683
7;5;10,236,715
43;31;8,667,507
43;31;9,784,577
43;31;9,840,102
18;13;8,545,929
47;34;9,360,281
37;27;6,283,032
15;11;6,841,649
19;14;5,277,990
47;35;5,029,329
4;3;5,061,632
4;3;5,013,479

Synthèse des Tableaux des diagrammes[modifier | modifier le wikicode]

r cernarcheota     e euryarcheota     c cyanobactérie     b bactérie     a aléa     E notation nombre scientifique     ^ exposant     cte constante du polynôme
  • >4AT Puissance
        AT   Puissance                          
        cren    eury    cyano   bacter  aléa
cte     3.10    4.05    7.89    1.07    1.44
E       -7      -8      -6      -8      -7
^       4.499   5.159   3.883   5.551   4.708
%AT     >4AT r  >4AT e  >4AT c  >4AT b  >4AT a
30      1.4     1.7     4.3     1.7     1.3
32      1.8     2.4     5.5     2.4     1.8
35      2.7     3.7     7.8     4.0     2.7
37      3.5     5.0     9.7     5.4     3.5
40      5.0     7.5     13.1    8.3     5.0
42      6.2     9.6     15.9    10.9    6.3
45      8.5     13.7    20.7    16.0    8.8
47      10.3    17.1    24.6    20.4    10.7
50      13.7    23.6    31.2    28.8    14.4
52      16.3    28.9    36.4    35.8    17.3
55      21.0    38.5    45.2    48.9    22.5
57      24.6    46.3    51.9    59.6    26.6
60      31.0    60.4    63.4    79.2    33.9
62      35.9    71.5    72.0    95.0    39.6
65      44.5    91.3    86.5    123.5   49.4
67      51.0    106.7   97.3    146.1   57.0
  • >4GC Puissance
        GC  Puissace                            
        cren    eury    cyano   bacter  aléa
cte     3.47    3.45    1.18    9.62    1.84
E       -5      -3      -4      -5      -7
^       3.333   2.001   3.013   2.887   4.649
%GC     >4GC r  >4GC e  >4GC c  >4GC b  >4GC a
30      2.9     3.1     3.3     1.8     1.4
32      3.6     3.5     4.0     2.1     1.8
35      4.9     4.2     5.3     2.8     2.8
37      5.9     4.7     6.3     3.2     3.6
40      7.6     5.5     7.9     4.1     5.2
42      8.9     6.1     9.2     4.7     6.5
45      11.2    7.0     11.3    5.7     8.9
47      13.0    7.6     12.9    6.5     10.9
50      16.0    8.7     15.5    7.7     14.6
52      18.2    9.4     17.5    8.7     17.5
55      22.0    10.5    20.7    10.2    22.7
57      24.7    11.2    23.0    11.3    26.8
60      29.3    12.5    26.9    13.1    34.0
62      32.7    13.3    29.6    14.4    39.6
65      38.3    14.6    34.2    16.5    49.3
67      42.4    15.5    37.5    18.0    56.8
  • >4AT Polynôme 3°
        AT  Polynôme 3°                         
        cren    eury    cyano   bacter  aléa
x3      4.38    -4.60   4.02    3.35    9.60
        -3      -5      -3      -4      -4 
x2      -0.5971 0.0877  -0.5391 0.0037  -9.39
x       27.76   -5.60   25.42   -0.142  3.51 
cte     -429.0  94.3    -391.3  -6.07   -46.5
%AT     >4AT r  >4AT e  >4AT c  >4AT b  >4AT a
30      -15.4   4.0     -5.5    2.1     0.3
32      -8.7    3.4     1.7     4.2     1.3
35      -1.2    3.8     10.2    7.9     2.6
37      2.3     4.8     14.6    10.7    3.6
40      6.1     7.7     20.0    15.6    5.3
42      7.8     10.4    22.9    19.4    6.6
45      9.8     15.7    26.9    25.6    9.0
47      11.1    20.1    29.5    30.3    11.0
50      13.2    27.8    34.0    38.0    14.5
52      15.3    33.8    37.5    43.7    17.4
55      19.6    44.0    44.2    53.1    22.5
57      23.7    51.6    49.8    60.0    26.6
60      32.3    64.1    60.6    71.2    33.8
62      39.8    73.3    69.6    79.3    39.4
65      54.4    88.3    86.2    92.5    49.0
67      66.7    99.0    99.7    101.9   56.3

  • >4GC Polynôme 3°
        GC  Polynôme 3°                         
        cren    eury    cyano   bacter  aléa
x3      -2.33   -1.16   8.08    -4.84   7.49
E       -3      -3      -4      -4      -4
x2      0.3372  0.1591  -0.1050 0.0895  -0.0622
x       -14.91  -6.647  5.204   -4.501  1.97
cte     212.8   90.94   -81.84  70.07   -22.07
%GC     >4GC r  >4GC e  >4GC c  >4GC b  >4GC a
30      6.0     3.5     1.6     2.5     1.3
32      4.5     3.2     3.6     1.8     1.9
35      4.0     3.5     6.3     1.4     2.8
37      4.6     4.2     7.9     1.5     3.6
40      6.6     5.5     10.0    2.2     5.2
42      8.6     6.6     11.4    3.0     6.5
45      12.1    8.5     13.3    4.6     8.9
47      14.7    9.8     14.7    5.9     10.9
50      18.7    11.6    16.8    8.2     14.6
52      21.2    12.7    18.4    9.9     17.6
55      24.6    14.0    21.2    12.6    22.8
57      26.4    14.5    23.2    14.5    26.9
60      28.2    14.8    26.9    17.5    34.1
62      28.6    14.4    29.7    19.6    39.6
65      27.6    13.1    34.6    22.6    49.0
67      25.8    11.5    38.4    24.5    56.1

Autre-bactéries[modifier | modifier le wikicode]

Résultats[modifier | modifier le wikicode]

  • 192 Autre-bactéries
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
aae; 1551335; 43.4761673010665; 4828; 4872; 591; 641; 85156; 86380; 64379; 65865; 9170; 9276; 2805; 2659; 0
aba; 5650368; 58.3838433178158; 3007; 2930; 1597; 1568; 216587; 217000; 304448; 306151; 8865; 8986; 8824; 8903; 0
acp; 5029329; 74.7164880245456; 70; 68; 4055; 4183; 64534; 64285; 402195; 403461; 331; 310; 16508; 16660; 0
ade; 5013479; 74.9052703721308; 61; 81; 4074; 4122; 65238; 63038; 405130; 401504; 310; 301; 16805; 16273; 0
afw; 5277990; 73.5314011583955; 92; 82; 5959; 5741; 71624; 72226; 389468; 386090; 379; 347; 19964; 19539; 0
age; 12489432; 69.4486704756061; 594; 616; 17394; 17796; 233470; 236504; 926890; 933683; 2241; 2129; 50084; 51436; 41
amd; 10236715; 71.2927926585824; 411; 428; 6747; 7122; 180162; 183847; 807285; 805867; 2665; 2630; 29195; 29171; 0
amo; 2160700; 47.968065904568; 4344; 4682; 1272; 1205; 102227; 104668; 102592; 102289; 8025; 8552; 4617; 4498; 0
ams; 8773466; 70.8230817786266; 379; 397; 5401; 5398; 139227; 138500; 704093; 704250; 1673; 1687; 24199; 24577; 0
amt; 4929566; 36.8220244946513; 17431; 17352; 1679; 1814; 295221; 295911; 156250; 157282; 28840; 28867; 6178; 6447; 0
ank; 5061632; 74.840683795266; 65; 63; 4202; 4160; 64479; 64002; 406856; 407343; 307; 297; 16744; 16559; 0
apt; 2907495; 53.0368237950538; 5089; 5075; 2049; 1899; 118271; 118841; 154288; 151854; 9506; 9784; 6796; 6187; 0
asd; 4738809; 62.2442474469851; 809; 791; 2730; 2814; 135244; 134760; 271947; 273839; 3713; 3791; 11241; 11546; 0
asf; 1620005; 28.2602214190697; 7804; 7580; 190; 208; 111657; 111705; 33331; 34810; 12965; 12778; 868; 1037; 0
bae; 4168266; 43.2192907074549; 15434; 15431; 1084; 1015; 218137; 217670; 153936; 153615; 23502; 23708; 4593; 4419; 0
bla; 1933695; 60.4903565453704; 419; 379; 700; 836; 61134; 61617; 109473; 110985; 1366; 1339; 3141; 3393; 0
blo; 2256640; 60.1198241633579; 662; 635; 704; 760; 75322; 76641; 141691; 141232; 2257; 2303; 3664; 3582; 0
bmf1; 2121359; 57.1569922865484; 1865; 2061; 754; 666; 82815; 82277; 122246; 121243; 5928; 6089; 3267; 3200; 0
bmf2; 1156948; 57.3407793608702; 1021; 1012; 434; 445; 44644; 44081; 66165; 67936; 3234; 3180; 1743; 1950; 0
bmv; 3497479; 68.1498016142484; 982; 989; 943; 894; 84788; 81415; 198960; 193902; 2239; 2186; 4499; 4246; 0
bpn; 791654; 29.5646835612528; 3809; 4525; 95; 84; 52015; 53074; 15911; 16281; 5077; 5503; 381; 398; 0
bsu; 4215606; 43.5144081301716; 15410; 15183; 1066; 1000; 216530; 216728; 154081; 153437; 23801; 23659; 4406; 4267; 0
buc; 640681; 26.3124706367131; 5646; 6234; 43; 44; 41604; 41023; 11553; 11580; 5552; 5581; 191; 212; 0
cac; 3940880; 30.9257830738312; 18639; 19088; 493; 489; 256916; 256763; 95062; 95746; 30725; 30878; 1994; 2317; 0
cad; 3105335; 29.9346447323719; 13589; 13710; 351; 382; 197260; 197832; 64544; 66221; 21564; 21925; 1581; 1638; 0
cbd; 2158758; 42.4357894678329; 9261; 8893; 986; 960; 123823; 122286; 78415; 77558; 13184; 13043; 3195; 3148; 0
cbl; 3992906; 28.3108593089845; 23180; 21401; 585; 614; 263480; 257895; 91046; 87769; 34866; 32844; 2543; 2501; 0
ccx; 10080619; 69.8969279565074; 409; 469; 10953; 11548; 198087; 199424; 744983; 750904; 1681; 1714; 36616; 37588; 0
cdf; 4290252; 29.0605307100842; 21357; 21908; 444; 473; 279553; 282963; 89624; 91674; 33842; 33777; 1972; 1929; 0
cff; 1773615; 33.3075103672443; 10348; 11285; 93; 114; 93339; 95513; 39680; 41574; 16001; 17039; 565; 658; 0
cft; 1800764; 33.2077384932173; 10619; 11422; 92; 118; 95322; 97208; 40224; 41828; 16406; 17262; 583; 681; 0
cfv; 1866009; 33.2643090145867; 11400; 11624; 105; 124; 99429; 99965; 42196; 43000; 17278; 17556; 655; 680; 0
cgl; 3309401; 53.8102514624248; 3305; 3221; 1287; 1288; 138013; 137649; 172787; 169928; 8758; 8711; 6346; 6370; 0
cgq; 3145677; 54.1471358947533; 3083; 2948; 1185; 1272; 130555; 130090; 165246; 165796; 8350; 8055; 5923; 6266; 0
chp; 1171660; 39.0619292286158; 4007; 4060; 293; 346; 67128; 67026; 35565; 34780; 6958; 6899; 1434; 1423; 0
cje; 1641481; 30.5485716861785; 13069; 13222; 167; 184; 98949; 100335; 34726; 34614; 18044; 18356; 980; 930; 0
cjr; 1777831; 30.3061427098526; 14346; 14473; 178; 186; 107741; 109050; 37075; 36524; 19619; 20032; 1039; 1008; 0
cko; 4720462; 53.8278032955249; 7420; 7482; 1856; 1449; 186499; 187509; 241795; 230670; 14203; 14146; 7792; 6616; 0
cle; 4714237; 34.3246425667611; 16562; 16676; 851; 985; 294745; 297001; 124128; 126693; 30244; 30146; 3642; 3864; 0
clo; 1809746; 44.2120508344675; 5627; 5410; 480; 474; 97589; 97661; 75304; 73537; 9743; 9955; 2057; 2087; 29
cmi; 3297891; 72.6642269256322; 65; 68; 2706; 2893; 38532; 37498; 240973; 240965; 225; 196; 10305; 10728; 0
cmn; 1072952; 40.3369395835042; 4018; 4016; 463; 482; 60838; 61225; 33548; 34137; 6202; 6153; 1662; 1758; 0
cnt; 4876443; 55.1027459974412; 7213; 7356; 1631; 1599; 187965; 188389; 260183; 261152; 14144; 14312; 8029; 8468; 0
cpb; 2736403; 48.9270768962028; 7168; 6887; 1056; 1121; 120486; 118524; 120853; 122253; 10706; 10458; 4174; 4344; 0
cpy; 4847594; 35.3485254746994; 15556; 15864; 588; 688; 308773; 308657; 136919; 142334; 28933; 29172; 3005; 3360; 0
crp; 159662; 16.5643672257644; 2208; 2307; 3; 1; 11715; 11640; 1856; 1655; 1923; 1940; 21; 10; 0
cru; 162589; 13.9776215345058; 2589; 2789; 4; 2; 11538; 11443; 1779; 1594; 1955; 1825; 28; 19; 22
cta; 1044459; 41.3026265272261; 3432; 3408; 298; 331; 57496; 57848; 33854; 33988; 5388; 5499; 1299; 1382; 0
cth; 3843301; 38.9865899132022; 15772; 15584; 837; 861; 221562; 221117; 141436; 141065; 26529; 26553; 3802; 3852; 0
ctr; 1042519; 41.3072567502367; 3442; 3413; 292; 326; 57290; 57718; 33787; 33890; 5395; 5508; 1306; 1381; 0
cvi; 4751080; 64.8337430647348; 2376; 2347; 1534; 1551; 129965; 127871; 340980; 339775; 5742; 5305; 7234; 7287; 0
dba; 3942657; 58.6469987117824; 6013; 5709; 2349; 2296; 128342; 128977; 247250; 245417; 10055; 9879; 10289; 10144; 0
dda; 4679450; 55.0150765581425; 6962; 6884; 2285; 2285; 178698; 177316; 252100; 250768; 12312; 11749; 8069; 8153; 0
ddr; 2819842; 63.3881614643657; 1141; 1141; 2325; 2271; 72453; 72851; 190167; 190035; 2681; 2802; 7741; 7887; 0
dge; 2467205; 66.636213853328; 876; 885; 3382; 3521; 57241; 56668; 169462; 169027; 1986; 2005; 9262; 9237; 0
dpd; 3881839; 63.9743688494036; 1859; 1802; 2165; 2239; 105316; 105661; 244019; 245745; 4633; 4506; 9310; 9247; 0
dpt; 2147060; 66.1626596368988; 984; 992; 2416; 2403; 50298; 50108; 153924; 153369; 2162; 2164; 7415; 7470; 0
dvl; 3462887; 63.0119319515768; 802; 927; 4317; 4191; 99406; 98997; 207175; 208396; 2448; 2453; 12405; 12173; 0
eal; 4701875; 49.6961743985112; 9155; 9178; 1415; 1391; 213977; 213634; 210716; 211439; 16662; 16491; 5919; 5988; 0
ebf; 4762179; 54.0169531636673; 7011; 7284; 1397; 1358; 188466; 188775; 239708; 238966; 13603; 14050; 6975; 6830; 0
ebt; 4158725; 56.5083288748354; 6291; 6129; 4410; 4565; 138733; 138167; 242220; 241878; 11004; 10781; 12369; 12592; 0
eca; 5064019; 50.9673245696748; 8479; 8530; 1534; 1482; 216502; 218260; 227632; 228005; 15666; 15584; 6930; 6975; 0
ecla; 4633407; 55.1819643730844; 6675; 6475; 1820; 1674; 171378; 171581; 242875; 242173; 12607; 12485; 7815; 7828; 0
eco; 4641652; 50.7907098593346; 8441; 8289; 1278; 1239; 205758; 205373; 216669; 215471; 15523; 15380; 6067; 6027; 0
ecs; 5498450; 50.537060444307; 10559; 10451; 1635; 1787; 241834; 242329; 254721; 256257; 18618; 18564; 7511; 7699; 0
eha; 3008576; 55.5585100725393; 6379; 6556; 1389; 1252; 104057; 103700; 170091; 167694; 10971; 11198; 5482; 5331; 0
eic; 3812301; 57.43688654175; 4463; 4391; 2723; 2711; 112845; 115164; 215578; 214958; 7882; 7901; 8554; 8856; 0
eno; 4726582; 55.0658594307684; 6718; 6616; 2026; 1761; 175739; 175064; 247144; 245935; 13149; 12986; 7851; 7838; 0
ent; 4518712; 52.9817567483832; 7358; 7158; 1259; 1236; 182660; 182997; 215031; 214183; 14654; 14731; 6272; 6068; 0
esa; 4368373; 56.7670846788953; 6471; 6413; 956; 891; 153286; 151999; 229838; 231147; 12296; 12060; 5571; 5586; 0
eta; 3883467; 53.7318329214591; 6410; 6220; 1817; 1793; 147095; 145957; 198612; 198353; 11836; 11747; 6488; 6466; 0
fnc; 2268272; 27.1239075384257; 15901; 16899; 188; 205; 150456; 154238; 44430; 46164; 22104; 23105; 909; 1016; 0
fra; 5433628; 70.0788129036438; 380; 375; 6196; 5818; 89248; 90487; 428768; 429175; 1311; 1374; 19365; 19527; 0
gau; 4636964; 64.2743614140632; 821; 831; 2673; 2453; 114328; 115447; 290929; 288988; 2570; 2662; 10122; 9745; 0
gba; 5311527; 72.5609038606035; 61; 75; 2909; 2836; 73480; 74579; 339442; 339287; 269; 252; 14086; 13688; 0
gdi; 3944163; 66.4311033798552; 1185; 1194; 4290; 4220; 88919; 90727; 286621; 284178; 3364; 3421; 12163; 11882; 0
gva; 1617545; 42.0163531873012; 3613; 3819; 141; 146; 98250; 98280; 46326; 46971; 7958; 8178; 664; 682; 1
hav; 4712721; 48.9902754693096; 8866; 8601; 1316; 1268; 219701; 220930; 202331; 200962; 17348; 16821; 5719; 5535; 0
ipa; 5472964; 62.4440796614047; 1798; 1704; 6601; 7427; 194735; 189255; 357102; 365058; 6381; 6254; 18963; 21062; 0
kin; 5529134; 52.7469762895962; 9602; 9458; 2469; 2437; 223806; 222389; 271957; 273352; 17645; 17714; 9396; 9232; 0
koy; 5914407; 55.9210923428165; 9046; 9001; 2475; 2353; 211426; 213231; 320238; 320251; 16715; 16681; 10096; 10205; 0
kpn; 5315120; 57.4785705684914; 6826; 6881; 2566; 2436; 176067; 174204; 303726; 304645; 12619; 12681; 10259; 10156; 0
ksa; 4902024; 53.7441473154762; 8277; 8720; 1271; 1174; 196687; 197826; 245460; 244858; 15446; 15780; 6435; 6445; 0
ksk; 8783278; 74.1973095947132; 164; 172; 12884; 12121; 117011; 118289; 769376; 762832; 800; 781; 36895; 35532; 66
lat; 1190853; 36.321359563271; 5612; 5102; 299; 296; 69592; 68743; 31730; 32794; 7633; 7502; 1024; 1068; 0
lhk; 3169329; 62.3523149537331; 2672; 2642; 1232; 1224; 88893; 87480; 223363; 224359; 5026; 5031; 5162; 5127; 0
liv; 2928879; 37.1320221832312; 13330; 13151; 393; 397; 182231; 182030; 85549; 84245; 20442; 20144; 2380; 2231; 0
ljf; 1755993; 34.4856727788778; 7197; 7391; 139; 123; 119517; 119828; 45649; 46581; 11837; 11856; 1094; 1109; 0
lla; 2365589; 35.3293830838747; 11874; 12259; 306; 308; 154900; 154402; 62832; 64130; 17897; 17884; 1642; 1717; 0
lpl; 3308273; 44.4668864993911; 5986; 6100; 985; 948; 194243; 193057; 126982; 125053; 12535; 12729; 4041; 4084; 0
mcac; 1017293; 23.6631924135918; 8400; 8285; 29; 36; 78405; 77999; 13198; 13569; 10401; 10072; 142; 172; 0
men; 538294; 43.5187834157542; 989; 1238; 89; 97; 27436; 28901; 19887; 20196; 2078; 2214; 377; 404; 0
mhd; 2269167; 68.075818130618; 756; 755; 5720; 5871; 51880; 51866; 159263; 160524; 1918; 1879; 12990; 13439; 0
mrb; 3097457; 63.3843827371938; 2995; 2990; 7404; 7492; 82263; 81704; 212870; 215243; 5833; 5674; 14923; 14926; 0
msv; 3249394; 62.3636284180989; 2434; 2476; 6989; 7214; 94468; 93721; 211059; 213652; 5346; 5167; 16759; 17228; 0
mts; 3982034; 70.2782487149088; 104; 89; 4948; 5132; 63017; 63298; 264646; 262789; 456; 464; 15198; 14915; 21
mxa; 9139763; 68.8912393023758; 459; 469; 9978; 9650; 193176; 194296; 670374; 666172; 2002; 2020; 31954; 31496; 0
nfa; 6021225; 70.8334267528618; 129; 150; 4167; 4443; 100888; 101379; 467673; 469199; 934; 951; 16333; 16355; 0
opr; 2303940; 70.0248270354263; 416; 426; 4669; 4606; 47540; 47357; 166529; 168073; 1395; 1350; 11408; 11436; 0
pac; 2560265; 60.0107410756308; 697; 698; 1923; 1929; 78228; 76965; 154335; 153541; 2322; 2196; 7318; 7468; 0
pae; 6264404; 66.5557329955092; 1354; 1434; 2481; 2202; 153530; 156878; 471856; 459967; 3401; 3374; 13053; 11818; 0
pak; 2495334; 60.1039379898643; 660; 684; 1862; 1908; 75775; 74531; 150756; 150197; 2228; 2098; 7189; 7291; 0
pam; 4703373; 53.6907661799309; 7623; 7530; 1405; 1403; 182434; 181404; 239753; 237400; 14471; 14293; 6841; 6822; 0
pdo; 1890857; 58.3129766026728; 1234; 1206; 2415; 2374; 66798; 68351; 124850; 126393; 3561; 3787; 6641; 6884; 0
pes; 4513140; 56.0596170293853; 7196; 7211; 2630; 2486; 159881; 161003; 253406; 251076; 12201; 12410; 8513; 8325; 0
pfq; 4094629; 45.3762233403808; 8570; 8509; 1116; 1251; 213364; 214067; 171179; 175953; 15725; 15764; 5039; 5184; 0
pgd; 3776653; 59.6245140869442; 2205; 2324; 2835; 2811; 118904; 119611; 229006; 228777; 6450; 6528; 9786; 9915; 0
pge; 5489680; 59.1055762813133; 6601; 6780; 1981; 1971; 171328; 170405; 326273; 326175; 11849; 11939; 9746; 9781; 0
pgi; 2343476; 48.2879278473515; 3967; 3874; 873; 900; 104950; 104835; 103058; 103915; 7764; 7881; 3403; 3392; 0
phm; 3803225; 73.2878017997883; 107; 119; 4752; 4701; 61665; 61757; 302103; 303962; 576; 591; 14214; 14316; 0
ple; 358242; 26.1736479809738; 2182; 2972; 29; 48; 24576; 25141; 5582; 7273; 3131; 3480; 99; 162; 0
plu; 5688987; 42.825357133001; 14782; 14258; 2086; 1822; 312256; 312142; 219737; 212176; 25894; 25775; 7894; 7123; 0
pmr; 4063606; 38.8996866330053; 13897; 13869; 1322; 1165; 240213; 241260; 125656; 124920; 22004; 22048; 4507; 4438; 0
ppk; 5429298; 64.7211849487724; 1519; 1535; 3095; 3243; 147504; 149895; 318960; 321987; 4472; 4673; 10040; 10694; 0
ppm; 5728392; 45.2379306444112; 12541; 12421; 1969; 1901; 287422; 287391; 235918; 231968; 24492; 23875; 7612; 7598; 0
ppoy; 5597590; 45.5107644539882; 11835; 12067; 1852; 1923; 278022; 279031; 228863; 232494; 22906; 23777; 7539; 7524; 0
psi; 4402109; 41.2655388587607; 13429; 13318; 1594; 1580; 249489; 252078; 146652; 146063; 21875; 21887; 5782; 5505; 0
pst; 6397126; 58.3988809974979; 5446; 5592; 1994; 1943; 221412; 222767; 358716; 358180; 11560; 11674; 9557; 9458; 0
ral; 3685408; 44.2052277522597; 7769; 8180; 731; 764; 167976; 175268; 125466; 137202; 13675; 14622; 3561; 3771; 0
raq; 4861101; 52.1211141262031; 8078; 8598; 1453; 1596; 199010; 201170; 237996; 240174; 16440; 16819; 6217; 6439; 0
req; 5043170; 68.8248462772423; 118; 96; 3421; 3662; 93918; 92511; 354586; 353824; 708; 773; 13477; 13579; 0
rer; 6516310; 62.3137634642919; 774; 673; 2717; 2824; 192999; 193758; 390982; 392156; 3862; 4011; 12505; 12691; 0
ret; 4381608; 61.2722087416309; 2000; 1981; 1456; 1181; 138606; 141047; 281098; 266494; 6563; 6988; 6900; 5754; 0
rha; 7804765; 67.5158316746244; 310; 301; 5642; 6071; 162374; 160842; 540003; 544466; 1679; 1835; 22326; 22687; 0
rho; 3592125; 48.4968368305669; 8686; 8111; 914; 888; 152056; 150044; 167149; 161147; 14376; 13828; 4296; 3946; 0
rip; 574390; 28.4825641114922; 5149; 4608; 48; 34; 37848; 37072; 11363; 11314; 5367; 4930; 177; 157; 0
roa; 8376953; 67.3730787311657; 304; 315; 5894; 6137; 175073; 173980; 576424; 582208; 1793; 1897; 23638; 24137; 67
ror; 5398151; 55.8842092412754; 7813; 7689; 2233; 2228; 191240; 192723; 293031; 294234; 14648; 14677; 9359; 9476; 0
rpa; 5459213; 65.0381474399332; 839; 802; 1427; 1443; 147495; 145996; 353396; 357329; 3564; 3359; 7861; 8084; 0
rpr; 1111523; 29.0002995889424; 5688; 5488; 60; 46; 75353; 75109; 20531; 21121; 9101; 8657; 374; 348; 0
rpw; 1109804; 29.0060226850867; 5666; 5479; 59; 46; 75178; 75035; 20519; 21083; 9080; 8645; 376; 348; 0
rri; 1257710; 32.4674209475952; 5919; 5779; 132; 131; 81418; 81860; 30182; 30318; 9529; 9179; 703; 676; 0
rru; 4352825; 65.4479562123449; 2105; 2167; 6143; 6144; 117691; 117954; 314819; 315531; 6056; 6234; 15234; 15224; 0
rty; 1111496; 28.9194023190367; 5549; 5487; 49; 42; 75302; 75636; 20877; 19962; 9013; 8780; 331; 247; 0
saci; 9629675; 62.2660577849201; 4027; 3918; 12522; 12591; 311082; 308165; 613507; 617296; 10530; 10237; 32126; 32651; 0
salb; 6841649; 73.3211578544263; 163; 150; 11612; 11254; 92662; 94200; 578179; 575278; 712; 723; 34189; 33576; 29
sall; 9784577; 72.1294512512148; 333; 338; 13089; 13447; 158760; 154358; 802832; 803880; 1561; 1519; 39837; 41439; 446
salu; 9360281; 72.3203502117084; 309; 312; 12428; 12611; 148863; 145977; 773053; 771828; 1367; 1386; 38358; 39699; 0
sap; 3472898; 56.7648667084956; 4855; 4593; 3794; 3887; 134837; 133789; 218389; 218145; 9688; 9809; 11361; 11011; 21
say; 3551206; 56.7620971579796; 4756; 4898; 4114; 3728; 136493; 138062; 224664; 220982; 9802; 10117; 11598; 11257; 0
sbh; 11936683; 70.754160261946; 500; 500; 15227; 15093; 190525; 193525; 936709; 931311; 2220; 2349; 48606; 48497; 175
sbn; 5347283; 46.2833180888313; 10050; 9904; 963; 1056; 279165; 278792; 207232; 209063; 19982; 19825; 5955; 6005; 0
sbo; 4519823; 51.2128019172432; 7826; 8001; 1209; 1322; 194819; 196163; 211410; 213136; 14646; 14776; 5927; 6038; 0
sbz; 4683551; 51.3411511906244; 9188; 9107; 1746; 1661; 197243; 195799; 225810; 225551; 16324; 15916; 6701; 6366; 0
scb; 10148695; 71.4528321128973; 295; 304; 14620; 14078; 154451; 157500; 808981; 799016; 1345; 1364; 43626; 42200; 0
scl; 13033779; 71.375738379483; 785; 808; 13650; 13645; 205781; 209504; 896064; 897879; 2731; 2736; 43941; 43766; 0
sco; 8667507; 72.1186611098208; 172; 218; 10660; 10577; 127391; 126460; 701446; 707949; 972; 1019; 34063; 33951; 0
sct; 6283062; 72.9398004020989; 183; 151; 8740; 9247; 93209; 92693; 528021; 535072; 789; 712; 28770; 30253; 30
sect; 1441139; 43.2902030963009; 4364; 4442; 544; 486; 68274; 68290; 47482; 47219; 6411; 6589; 1579; 1582; 0
sep; 2499279; 32.0951762488302; 10030; 9072; 256; 186; 173063; 168449; 55041; 52457; 17327; 16269; 1229; 1044; 0
sepp; 2490012; 32.1217327466695; 9663; 9111; 259; 184; 171760; 168935; 54590; 52378; 16927; 16430; 1220; 1041; 0
ser; 2616530; 32.1513607717091; 10386; 9341; 282; 193; 182609; 175931; 58016; 54601; 18123; 16745; 1326; 1062; 0
sfl; 4607202; 50.8900181956189; 8134; 8316; 1312; 1303; 201549; 201821; 215654; 213169; 15093; 15382; 6312; 5871; 49
sfo; 5488183; 50.8788063371794; 9048; 8947; 3028; 3083; 245840; 245460; 267325; 267733; 17291; 17338; 9562; 9634; 0
sgr; 8545929; 72.2274079272131; 197; 198; 13111; 12803; 125513; 127411; 691994; 689222; 1042; 1153; 40312; 40010; 0
sho; 9840102; 72.0397308889684; 248; 219; 12043; 12293; 144995; 146783; 806253; 806814; 1023; 1058; 38926; 38906; 0
sma; 9025608; 70.716554496938; 288; 338; 10689; 10658; 147271; 148799; 697969; 694405; 1497; 1590; 33943; 34035; 0
smk; 3820344; 62.6668959653895; 1275; 1380; 1438; 1375; 115653; 117560; 245820; 242728; 4939; 4981; 7019; 6690; 0
sms; 190657; 24.0038393554918; 1603; 1717; 31; 34; 12715; 12745; 3381; 3575; 1791; 1739; 98; 92; 0
smx; 3908022; 62.6549441123924; 1344; 1357; 1360; 1498; 119845; 118942; 249032; 250823; 5147; 4987; 6769; 7209; 0
spe; 5448853; 55.0735907171656; 7014; 7283; 2505; 2318; 209840; 211117; 304200; 302872; 14411; 14666; 9334; 9218; 0
spi; 1937111; 38.3159251070279; 7601; 7936; 274; 296; 114902; 115665; 59188; 61681; 11590; 12071; 1546; 1675; 0
spl; 1796846; 39.0916639489416; 5598; 5780; 245; 286; 107498; 109043; 58113; 58617; 9461; 9754; 1430; 1421; 0
spq; 4858887; 52.1097527067413; 9141; 9267; 1632; 1577; 200326; 200314; 237126; 236676; 16399; 16469; 6814; 6738; 0
ssx; 7414440; 71.7481563004084; 196; 200; 9816; 9868; 110586; 109061; 597215; 600307; 882; 870; 31666; 31836; 0
sti; 2741033; 68.1027919036363; 118; 98; 2208; 2393; 51671; 51400; 195063; 197399; 465; 503; 9444; 9794; 0
stm; 4857432; 52.2215030493479; 9188; 9233; 1560; 1621; 199721; 198927; 237684; 237879; 16617; 16211; 6925; 6782; 0
sty; 4809037; 52.0927162756286; 9036; 9129; 1610; 1679; 198401; 197326; 233040; 235497; 16417; 16153; 6741; 6819; 0
sur; 10260756; 67.4586453473799; 1270; 1241; 19355; 19692; 239950; 237598; 731507; 733994; 3910; 4044; 43311; 43604; 0
sus; 9965640; 61.9024568417081; 3706; 3782; 5063; 4566; 321828; 322056; 637709; 633071; 12614; 12567; 22278; 21823; 0
tai; 1848474; 63.7925661924377; 375; 339; 8098; 7114; 48029; 46765; 142542; 137838; 1116; 1095; 12183; 11501; 0
tde; 2843201; 37.8737556718642; 18098; 17974; 618; 525; 158790; 159051; 100982; 98334; 22582; 22554; 3102; 3017; 0
tma; 1860725; 46.2477260207715; 4488; 4659; 538; 709; 89126; 90023; 74178; 78612; 8868; 8979; 2144; 2517; 0
tme; 1915238; 31.3998573545429; 13238; 12800; 490; 431; 123522; 121538; 50996; 49107; 17789; 17210; 1638; 1550; 0
tos; 2072393; 68.5534548707702; 717; 721; 11907; 12188; 48268; 48509; 171568; 172114; 2802; 2818; 17743; 17863; 0
tpas; 1139203; 52.7868167482003; 2304; 2372; 998; 992; 43195; 42394; 46858; 47673; 3742; 3707; 2611; 2803; 0
tra; 3260398; 68.1390124763909; 2410; 2266; 7607; 7736; 66922; 67122; 189467; 190505; 4310; 4180; 16345; 16899; 0
tro; 2003006; 63.6471020527168; 316; 314; 1214; 1166; 49694; 49051; 121109; 121935; 1527; 1539; 4698; 4657; 2
tsc; 2346803; 64.8850372187184; 1108; 1259; 8488; 8168; 66287; 66784; 190405; 188915; 4331; 4283; 16711; 16545; 0
tsu; 2731853; 39.1632346249963; 16370; 17375; 212; 175; 160078; 161558; 84833; 85814; 21396; 22170; 1279; 1393; 0
tth; 1894877; 69.4372774591702; 394; 448; 9182; 8911; 42401; 42173; 158752; 159801; 1856; 1919; 16222; 16015; 0
ttl; 1902595; 69.0919507304497; 479; 418; 8933; 9097; 43606; 43369; 159455; 159423; 2251; 2020; 16025; 16091; 0
tts; 1863201; 68.9162897615448; 493; 496; 8785; 8616; 43289; 42827; 155077; 156274; 2193; 2198; 15752; 15744; 0
uur; 751719; 25.4996880483266; 5422; 5640; 38; 46; 58304; 58095; 10982; 11668; 7387; 7301; 189; 215; 0
vin; 4350553; 68.9392589861565; 388; 361; 3617; 3620; 88266; 86551; 320517; 318241; 1260; 1271; 14450; 14284; 0
wbr; 697724; 22.478945829583; 7321; 7233; 29; 35; 47174; 47870; 11482; 11314; 7159; 7091; 170; 169; 0
xac; 5175554; 64.7718872221215; 1468; 1427; 1526; 1434; 140462; 140210; 339957; 339208; 3770; 3692; 7876; 7914; 0
xbo; 4225498; 44.9676227512118; 10957; 10804; 1723; 1421; 212954; 216541; 175188; 164027; 17825; 17986; 6321; 5659; 0
xcb; 5148708; 64.9570338811212; 1531; 1476; 1367; 1328; 137185; 137234; 344611; 341465; 3622; 3618; 7930; 7928; 0
ype; 4653728; 47.6361102324846; 8789; 8951; 2595; 2930; 224229; 225184; 201213; 204623; 16816; 16685; 7641; 8107; 0
ypg; 4504254; 47.5980262214342; 8552; 8784; 2866; 2483; 215402; 219343; 198786; 193360; 16023; 16677; 7858; 7232; 0
zin; 208564; 13.5401332099375; 3112; 3050; 7; 10; 14475; 14621; 2251; 2077; 2574; 2718; 13; 28; 21

Tableau des diagrammes[modifier | modifier le wikicode]

Tableau des diagrammes[modifier | modifier le wikicode]

  • Légende:
>4ATa, >4GCa ce sont les aléas calculés à partir de l’équation des courbes de tendance des aléas où x est %GC
* pour >4ATa l’équation est: −0.000732x3 + 0.1607x2 −11.96x + 302.42
* pour >4GCa l’équation est: 0.000746x3 −0.0609x2 + 1.869x −19.90
<5GCa, <5ATa ce sont les aléas calculés à partir de l’équation des courbes de tendance des aléas où x est %GC
* pour <5GCa l'équation est: 2.86x − 49.02
* pour <5ATa l'équation est: −2.83x + 235.7
dGCa, dATa différences avec l'aléa, dGAa = >4GC − >4GCa, dATa = >4AT − >4ATa.
  • Voir à la suite le tableau non formaté.
Répétitions chez les autre-bactéries                                                    x3 -0.000732 0.000746           
                                                                                        x2    0.1607  -0.0609           
                        Voir méthode d’analyse (3.4.1) dans l’article                   x     -11.96    1.869    2.86   -2.83
                                                                                        c     302.42   -19.90  -49.02   235.7
Tableau des diagrammes
dGCa dATa KEGG Chromosome %GC >4GC >4AT <5GC <5AT Ctrl >4ATa >4GCa <5GCa <5ATa
0.41 36.57 aae 1,551,335 43.48 7.94 62.53 87.48 122.46 0 25.96 7.53 75.37 112.50
-24.48 4.39 aba 5,650,368 58.38 5.60 10.51 111.20 79.90 0 6.11 30.08 118.02 70.26
-74.57 -0.13 acp 5,029,329 74.72 16.38 0.27 166.79 25.74 0 0.40 90.95 164.75 23.97
-75.60 -0.08 ade 5,013,479 74.91 16.35 0.28 167.49 25.71 0 0.36 91.95 165.29 23.44
-62.69 -0.32 afw 5,277,990 73.53 22.17 0.33 154.43 27.39 0 0.65 84.86 161.36 27.33
-37.88 -0.55 age 12,489,432 69.45 28.18 0.97 157.10 37.98 41 1.52 66.06 149.68 38.90
-60.59 -0.29 amd 10,236,715 71.29 13.55 0.82 163.29 36.08 0 1.11 74.14 154.95 33.68
-0.48 24.18 amo 2,160,700 47.97 11.46 41.77 99.04 103.43 0 17.59 11.94 88.22 99.77
-59.71 -0.33 ams 8,773,466 70.82 12.31 0.88 166.08 32.04 0 1.21 72.02 153.61 35.01
3.51 27.26 amt 4,929,566 36.82 7.09 70.56 66.16 131.62 0 43.30 3.57 56.33 131.35
-75.09 -0.13 ank 5,061,632 74.84 16.52 0.25 167.44 25.50 0 0.38 91.61 165.10 23.62
-5.62 24.14 apt 2,907,495 53.04 13.58 34.96 109.76 88.19 0 10.81 19.19 102.72 85.41
-28.68 -0.54 asd 4,738,809 62.24 11.70 3.38 119.98 58.56 0 3.91 40.38 129.07 59.32
1.35 18.76 asf 1,620,005 28.26 2.46 94.96 43.24 153.77 0 76.20 1.10 31.83 155.62
-2.29 47.54 bae 4,168,266 43.22 5.04 74.05 75.95 115.88 0 26.51 7.32 74.63 113.23
-27.48 -0.68 bla 1,933,695 60.49 7.94 4.13 117.39 64.88 0 4.81 35.43 124.05 64.29
-27.95 0.73 blo 2,256,640 60.12 6.49 5.75 128.58 69.36 0 5.02 34.44 122.99 65.34
-20.56 11.50 bmf1 2,121,359 57.16 6.69 18.51 117.83 83.49 0 7.00 27.25 114.51 73.73
-20.07 10.71 bmf2 1,156,948 57.34 7.60 17.57 119.10 82.23 0 6.86 27.66 115.04 73.21
-55.50 3.79 bmv 3,497,479 68.15 5.25 5.64 114.83 48.79 0 1.84 60.75 145.96 42.58
0.87 34.95 bpn 791,654 29.56 2.26 105.27 41.65 146.11 0 70.32 1.39 35.57 151.92
-2.66 46.70 bsu 4,215,606 43.51 4.90 72.57 75.00 114.03 0 25.87 7.56 75.48 112.39
0.67 99.83 buc 640,681 26.31 1.36 185.43 36.74 146.34 0 85.60 0.69 26.26 161.14
0.79 31.20 cac 3,940,880 30.93 2.49 95.73 49.51 145.98 0 64.54 1.70 39.46 148.06
0.89 19.20 cad 3,105,335 29.93 2.36 87.91 43.15 141.23 0 68.71 1.47 36.62 150.87
2.28 55.84 cbd 2,158,758 42.44 9.01 84.09 75.19 126.15 0 28.25 6.73 72.39 115.45
1.89 35.69 cbl 3,992,906 28.31 3.00 111.65 46.05 147.53 0 75.96 1.12 31.98 155.47
-45.64 -0.55 ccx 10,080,619 69.90 22.32 0.87 155.75 39.77 0 1.42 67.96 150.96 37.63
0.86 28.29 cdf 4,290,252 29.06 2.14 100.84 43.17 146.88 0 72.55 1.28 34.12 153.35
-1.17 66.74 cff 1,773,615 33.31 1.17 121.97 46.50 125.11 0 55.23 2.34 46.27 141.31
-1.14 66.80 cft 1,800,764 33.21 1.17 122.40 46.27 125.61 0 55.60 2.31 45.99 141.60
-1.10 67.99 cfv 1,866,009 33.26 1.23 123.39 46.37 125.52 0 55.39 2.33 46.15 141.44
-12.77 9.73 cgl 3,309,401 53.81 7.78 19.72 107.40 88.58 0 9.99 20.55 104.93 83.22
-13.35 9.52 cgq 3,145,677 54.15 7.81 19.17 109.11 88.07 0 9.65 21.16 105.90 82.26
0.83 32.11 chp 1,171,660 39.06 5.45 68.85 62.48 126.33 0 36.74 4.63 62.74 125.01
0.52 94.06 cje 1,641,481 30.55 2.14 160.17 43.41 143.58 0 66.10 1.61 38.38 149.13
0.49 94.98 cjr 1,777,831 30.31 2.05 162.10 42.55 144.24 0 67.13 1.56 37.69 149.82
-13.58 21.59 cko 4,720,462 53.83 7.00 31.57 103.14 85.24 0 9.98 20.58 104.98 83.17
1.24 18.94 cle 4,714,237 34.32 3.89 70.51 54.80 138.33 0 51.57 2.65 49.18 138.43
-2.87 36.57 clo 1,809,746 44.21 5.27 60.99 84.54 118.77 29 24.42 8.14 77.47 110.41
-63.61 -0.42 cmi 3,297,891 72.66 16.98 0.40 152.51 23.18 0 0.83 80.59 158.88 29.79
3.47 41.54 cmn 1,072,952 40.34 8.81 74.88 66.27 125.28 0 33.34 5.34 66.39 121.39
-16.35 21.14 cnt 4,876,443 55.10 6.62 29.88 110.29 83.01 0 8.73 22.97 108.63 79.55
-5.16 35.25 cpb 2,736,403 48.93 7.96 51.36 91.95 95.08 0 16.11 13.11 90.96 97.05
-0.37 16.76 cpy 4,847,594 35.35 2.63 64.82 58.92 139.35 0 48.05 3.00 52.11 135.53
0.25 137.74 crp 159,662 16.56 0.25 282.78 22.18 170.47 0 145.05 0.00 0.00 188.76
0.37 166.19 cru 162,589 13.98 0.37 330.82 21.04 164.62 22 164.62 0.00 0.00 196.09
0.08 34.56 cta 1,044,459 41.30 6.02 65.49 67.52 120.86 0 30.92 5.95 69.15 118.66
-0.17 44.64 cth 3,843,301 38.99 4.42 81.59 75.50 128.99 0 36.95 4.59 62.52 125.22
-0.02 34.84 ctr 1,042,519 41.31 5.93 65.75 67.49 120.78 0 30.91 5.95 69.16 118.65
-42.09 7.09 cvi 4,751,080 64.83 6.49 9.94 146.34 56.59 0 2.85 48.58 136.47 51.98
-18.93 23.80 dba 3,942,657 58.65 11.78 29.73 130.14 70.32 0 5.94 30.71 118.77 69.51
-13.03 20.77 dda 4,679,450 55.02 9.77 29.59 110.93 81.22 0 8.82 22.80 108.38 79.80
-27.57 4.68 ddr 2,819,842 63.39 16.30 8.09 140.37 53.47 0 3.41 43.87 132.34 56.07
-26.98 4.87 dge 2,467,205 66.64 27.98 7.14 144.69 47.79 0 2.27 54.96 141.63 46.87
-34.39 6.26 dpd 3,881,839 63.97 11.35 9.43 130.95 56.70 0 3.17 45.74 134.02 54.41
-30.78 6.79 dpt 2,147,060 66.16 22.44 9.20 150.06 48.78 0 2.41 53.23 140.28 48.21
-18.13 1.42 dvl 3,462,887 63.01 24.57 4.99 127.10 58.71 0 3.57 42.70 131.26 57.14
-8.15 24.00 eal 4,701,875 49.70 5.97 38.99 92.32 98.00 0 14.99 14.12 93.16 94.87
-15.14 20.23 ebf 4,762,179 54.02 5.79 30.02 103.41 85.02 0 9.78 20.92 105.53 82.63
-4.26 22.35 ebt 4,158,725 56.51 21.58 29.86 122.41 71.82 0 7.52 25.84 112.65 75.57
-9.95 20.31 eca 5,064,019 50.97 5.96 33.59 92.72 92.02 0 13.27 15.91 96.80 91.27
-15.58 19.72 ecla 4,633,407 55.18 7.54 28.38 108.06 79.43 0 8.66 23.13 108.86 79.33
-10.23 22.54 eco 4,641,652 50.79 5.42 36.04 95.71 95.23 0 13.50 15.65 96.30 91.77
-9.06 24.37 ecs 5,498,450 50.54 6.22 38.21 95.70 94.82 0 13.84 15.28 95.57 92.49
-15.10 34.67 eha 3,008,576 55.56 8.78 42.99 115.87 76.42 0 8.32 23.87 109.94 78.26
-13.63 16.43 eic 3,812,301 57.44 14.25 23.22 117.50 63.95 0 6.79 27.88 115.31 72.94
-14.89 19.44 eno 4,726,582 55.07 8.01 28.21 107.64 79.75 0 8.77 22.90 108.53 79.66
-13.58 21.25 ent 4,518,712 52.98 5.52 32.12 97.72 87.42 0 10.87 19.10 102.56 85.56
-22.17 22.19 esa 4,368,373 56.77 4.23 29.49 108.08 75.46 0 7.31 26.40 113.39 74.84
-11.11 22.45 eta 3,883,467 53.73 9.30 32.52 105.55 81.53 0 10.07 20.41 104.71 83.44
0.87 63.01 fnc 2,268,272 27.12 1.73 144.60 40.79 154.26 0 81.59 0.86 28.58 158.84
-46.63 0.01 fra 5,433,628 70.08 22.11 1.39 165.05 33.57 0 1.38 68.74 151.48 37.12
-35.66 0.50 gau 4,636,964 64.27 11.05 3.56 129.35 50.68 0 3.06 46.72 134.87 53.56
-69.27 -0.59 gba 5,311,527 72.56 10.82 0.26 133.01 27.97 0 0.85 80.09 158.58 30.08
-32.63 3.70 gdi 3,944,163 66.43 21.58 6.03 150.82 47.27 0 2.33 54.20 141.04 47.45
-4.66 16.72 gva 1,617,545 42.02 1.77 45.95 58.51 131.47 1 29.22 6.43 71.19 116.64
-7.71 21.05 hav 4,712,721 48.99 5.48 37.06 87.96 100.75 0 16.01 13.19 91.14 96.87
-15.34 2.58 ipa 5,472,964 62.44 25.63 6.40 139.26 72.47 0 3.82 40.97 129.64 58.75
-9.83 23.34 kin 5,529,134 52.75 8.87 34.47 101.99 87.09 0 11.13 18.71 101.89 86.23
-16.45 22.51 koy 5,914,407 55.92 8.16 30.51 111.73 77.45 0 8.01 24.61 110.97 77.23
-18.56 19.03 kpn 5,315,120 57.48 9.41 25.79 118.30 70.66 0 6.76 27.97 115.43 72.82
-15.44 24.61 ksa 4,902,024 53.74 4.99 34.67 102.65 86.85 0 10.06 20.43 104.75 83.40
-59.78 -0.13 ksk 8,783,278 74.20 28.47 0.38 182.69 26.97 66 0.51 88.25 163.26 25.44
1.63 45.09 lat 1,190,853 36.32 5.00 89.97 55.94 128.87 0 44.88 3.37 54.90 132.77
-32.95 12.90 lhk 3,169,329 62.35 7.75 16.77 144.51 58.82 0 3.86 40.70 129.37 59.01
-1.01 48.07 liv 2,928,879 37.13 2.70 90.41 59.55 138.23 0 42.35 3.71 57.22 130.48
-1.21 32.07 ljf 1,755,993 34.49 1.49 83.08 53.78 149.79 0 51.00 2.71 49.65 137.98
-0.40 53.90 lla 2,365,589 35.33 2.60 102.02 55.09 145.88 0 48.12 3.00 52.06 135.58
-2.52 12.63 lpl 3,308,273 44.47 5.84 36.53 78.64 124.71 0 23.90 8.36 78.20 109.69
0.54 64.36 mcac 1,017,293 23.66 0.64 164.01 26.62 173.87 0 99.65 0.10 18.68 168.64
-4.11 15.51 men 538,294 43.52 3.46 41.37 75.91 112.63 0 25.87 7.56 75.49 112.38
-9.38 4.80 mhd 2,269,167 68.08 51.08 6.66 152.57 47.39 0 1.86 60.46 145.75 42.79
4.23 15.91 mrb 3,097,457 63.38 48.09 19.32 147.85 56.65 0 3.41 43.86 132.33 56.09
2.98 11.25 msv 3,249,394 62.36 43.71 15.11 141.16 61.15 0 3.86 40.73 129.41 58.98
-44.30 -0.85 mts 3,982,034 70.28 25.31 0.48 140.02 31.95 21 1.33 69.61 152.05 36.55
-42.26 -0.64 mxa 9,139,763 68.89 21.48 1.02 153.18 42.83 0 1.66 63.74 148.08 40.48
-57.77 -0.75 nfa 6,021,225 70.83 14.30 0.46 161.02 33.91 0 1.21 72.06 153.64 34.98
-28.25 2.26 opr 2,303,940 70.02 40.26 3.65 155.15 42.38 0 1.39 68.51 151.33 37.27
-19.11 0.37 pac 2,560,265 60.01 15.05 5.45 126.03 62.38 0 5.08 34.15 122.67 65.64
-47.18 2.16 pae 6,264,404 66.56 7.48 4.45 152.72 50.63 0 2.29 54.66 141.40 47.10
-19.29 0.36 pak 2,495,334 60.10 15.11 5.39 126.41 61.97 0 5.03 34.40 122.94 65.38
-14.36 22.10 pam 4,703,373 53.69 5.97 32.22 104.35 83.47 0 10.12 20.33 104.59 83.55
-4.58 6.74 pdo 1,890,857 58.31 25.33 12.90 140.03 75.36 0 6.16 29.91 117.82 70.46
-13.56 24.03 pes 4,513,140 56.06 11.34 31.92 115.51 76.55 0 7.89 24.90 111.37 76.84
-3.41 19.59 pfq 4,094,629 45.38 5.78 41.71 87.27 112.08 0 22.12 9.19 80.80 107.11
-18.20 6.68 pgd 3,776,653 59.62 14.95 11.99 126.43 66.59 0 5.31 33.15 121.57 66.74
-24.64 18.74 pge 5,489,680 59.11 7.20 24.37 122.41 66.58 0 5.64 31.84 120.09 68.21
-4.76 16.37 pgi 2,343,476 48.29 7.57 33.46 91.22 96.19 0 17.09 12.32 89.13 98.86
-58.79 -0.11 phm 3,803,225 73.29 24.86 0.59 166.86 32.76 0 0.70 83.64 160.66 28.02
1.49 57.57 ple 358,242 26.17 2.15 143.87 36.61 157.23 0 86.30 0.66 25.86 161.53
-0.15 23.67 plu 5,688,987 42.83 6.87 51.05 78.56 118.84 0 27.38 7.02 73.51 114.34
1.58 31.14 pmr 4,063,606 38.90 6.12 68.33 63.86 129.32 0 37.19 4.54 62.27 125.47
-36.53 2.73 ppk 5,429,298 64.72 11.67 5.63 121.87 56.46 0 2.89 48.20 136.15 52.30
-2.31 21.19 ppm 5,728,392 45.24 6.76 43.58 84.33 108.79 0 22.38 9.06 80.41 107.51
-2.58 20.84 ppoy 5,597,590 45.51 6.74 42.70 85.11 107.86 0 21.87 9.32 81.19 106.73
1.29 29.75 psi 4,402,109 41.27 7.21 60.76 69.06 123.88 0 31.01 5.92 69.04 118.76
-23.96 11.15 pst 6,397,126 58.40 6.15 17.25 115.04 73.07 0 6.10 30.11 118.06 70.21
-4.08 18.85 ral 3,685,408 44.21 4.06 43.28 73.26 100.81 0 24.43 8.13 77.45 110.43
-11.41 22.45 raq 4,861,101 52.12 6.27 34.30 100.97 89.16 0 11.85 17.68 100.10 88.00
-49.42 -1.25 req 5,043,170 68.82 14.04 0.42 145.83 37.26 0 1.67 63.47 147.89 40.67
-32.08 -1.66 rer 6,516,310 62.31 8.50 2.22 124.05 60.56 0 3.88 40.59 129.26 59.12
-31.56 4.70 ret 4,381,608 61.27 6.02 9.09 127.86 66.92 0 4.39 37.58 126.28 62.07
-43.27 -1.23 rha 7,804,765 67.52 15.01 0.78 144.72 41.86 0 2.01 58.27 144.15 44.38
-7.56 30.00 rho 3,592,125 48.50 5.02 46.76 93.69 91.95 0 16.76 12.58 89.73 98.27
0.28 94.69 rip 574,390 28.48 1.43 169.87 40.06 148.36 0 75.17 1.15 32.47 154.99
-43.36 -1.31 roa 8,376,953 67.37 14.36 0.74 144.02 42.11 67 2.05 57.73 143.74 44.78
-16.27 20.68 ror 5,398,151 55.88 8.26 28.72 112.28 76.56 0 8.04 24.54 110.87 77.34
-44.02 0.22 rpa 5,459,213 65.04 5.26 3.01 133.11 55.03 0 2.78 49.28 137.06 51.40
-0.31 27.72 rpr 1,111,523 29.00 0.95 100.55 38.12 151.34 0 72.82 1.26 33.95 153.52
-0.32 27.63 rpw 1,109,804 29.01 0.95 100.42 38.14 151.32 0 72.80 1.27 33.97 153.50
-0.01 34.61 rri 1,257,710 32.47 2.09 93.01 49.20 144.70 0 58.40 2.10 43.87 143.69
-22.46 7.17 rru 4,352,825 65.45 28.23 9.81 151.81 56.96 0 2.64 50.69 138.23 50.24
-0.43 26.10 rty 1,111,496 28.92 0.82 99.29 37.26 151.81 0 73.19 1.25 33.72 153.75
-14.37 4.35 saci 9,629,675 62.27 26.08 8.25 134.54 66.46 0 3.90 40.44 129.13 59.25
-50.39 -0.24 salb 6,841,649 73.32 33.42 0.46 178.50 27.52 29 0.69 83.81 160.76 27.93
-50.91 -0.25 sall 9,784,577 72.13 27.12 0.69 172.52 32.32 446 0.94 78.03 157.35 31.30
-52.18 -0.23 salu 9,360,281 72.32 26.75 0.66 173.39 31.79 0 0.90 78.93 157.89 30.76
-4.28 19.89 sap 3,472,898 56.76 22.12 27.21 132.14 82.96 21 7.31 26.39 113.39 74.84
-4.30 19.87 say 3,551,206 56.76 22.08 27.19 131.93 82.92 0 7.31 26.39 113.38 74.85
-46.31 -0.39 sbh 11,936,683 70.75 25.40 0.84 164.63 32.56 175 1.23 71.71 153.41 35.20
-6.31 16.87 sbn 5,347,283 46.28 3.78 37.32 80.09 111.79 0 20.45 10.09 83.40 104.54
-10.67 22.06 sbo 4,519,823 51.21 5.60 35.02 96.58 93.01 0 12.96 16.27 97.50 90.58
-9.19 26.26 sbz 4,683,551 51.34 7.27 39.06 99.16 90.80 0 12.80 16.47 97.87 90.21
-46.60 -0.49 scb 10,148,695 71.45 28.28 0.59 166.90 31.00 0 1.08 74.87 155.41 33.22
-53.58 0.13 scl 13,033,779 71.38 20.94 1.22 144.37 32.28 0 1.10 74.52 155.19 33.44
-53.47 -0.49 sco 8,667,507 72.12 24.50 0.45 170.45 29.52 0 0.94 77.98 157.32 31.33
-53.30 -0.24 sct 6,283,062 72.94 28.63 0.53 178.59 29.83 30 0.77 81.93 159.67 29.01
-0.23 34.75 sect 1,441,139 43.29 7.15 61.10 67.91 103.78 0 26.36 7.38 74.84 113.03
-0.23 16.59 sep 2,499,279 32.10 1.77 76.43 43.92 150.09 0 59.84 2.00 42.81 144.75
-0.23 15.66 sepp 2,490,012 32.12 1.78 75.40 43.87 150.22 0 59.74 2.01 42.88 144.67
-0.20 15.77 ser 2,616,530 32.15 1.82 75.39 43.95 150.35 0 59.62 2.02 42.97 144.59
-10.12 22.33 sfl 4,607,202 50.89 5.68 35.71 95.72 94.17 49 13.37 15.79 96.58 91.49
-4.64 19.40 sfo 5,488,183 50.88 11.13 32.79 100.99 95.83 0 13.39 15.78 96.55 91.52
-48.17 -0.46 sgr 8,545,929 72.23 30.32 0.46 171.02 29.85 0 0.92 78.49 157.63 31.03
-52.87 -0.48 sho 9,840,102 72.04 24.73 0.47 171.84 29.86 0 0.96 77.60 157.09 31.56
-47.89 -0.54 sma 9,025,608 70.72 23.65 0.69 161.80 33.15 0 1.24 71.54 153.31 35.31
-34.28 3.23 smk 3,820,344 62.67 7.36 6.95 131.47 63.64 0 3.72 41.64 130.27 58.12
3.23 76.37 smsP 190,657 24.00 3.41 174.13 37.48 152.05 0 97.76 0.18 19.66 167.68
-34.30 3.19 smx 3,908,022 62.65 7.31 6.91 131.48 63.69 0 3.73 41.61 130.24 58.15
-14.06 17.48 spe 5,448,853 55.07 8.85 26.24 114.82 82.59 0 8.76 22.91 108.55 79.64
-1.31 41.37 spi 1,937,111 38.32 2.94 80.21 64.06 131.24 0 38.84 4.25 60.60 127.12
-1.69 26.67 spl 1,796,846 39.09 2.96 63.32 66.55 131.21 0 36.66 4.64 62.82 124.92
-11.06 26.02 spq 4,858,887 52.11 6.60 37.89 100.30 89.22 0 11.87 17.66 100.07 88.03
-49.69 -0.48 ssx 7,414,440 71.75 26.55 0.53 170.08 29.86 0 1.02 76.24 156.26 32.38
-43.78 -1.07 sti 2,741,033 68.10 16.79 0.79 150.20 37.96 0 1.86 60.56 145.83 42.71
-11.29 26.19 stm 4,857,432 52.22 6.55 37.92 100.73 88.83 0 11.74 17.84 100.39 87.72
-10.80 25.89 sty 4,809,037 52.09 6.84 37.77 100.25 89.06 0 11.89 17.64 100.02 88.08
-20.00 0.42 sur 10,260,756 67.46 38.05 2.45 151.30 47.32 0 2.03 58.05 143.98 44.54
-29.71 3.44 sus 9,965,640 61.90 9.66 7.51 131.94 67.14 0 4.08 39.38 128.09 60.28
37.14 0.62 tai 1,848,474 63.79 82.29 3.86 164.49 52.48 0 3.25 45.15 133.50 54.93
-0.02 86.75 tde 2,843,201 37.87 4.02 126.87 72.25 127.66 0 40.12 4.04 59.34 128.37
-3.35 28.65 tma 1,860,725 46.25 6.70 49.16 84.62 105.87 0 20.51 10.05 83.30 104.65
2.99 73.35 tme 1,915,238 31.40 4.81 135.95 53.93 146.23 0 62.60 1.82 40.82 146.72
53.90 5.20 tos 2,072,393 68.55 116.27 6.94 183.02 49.41 0 1.74 62.37 147.12 41.44
-1.30 29.96 tpas 1,139,203 52.79 17.47 41.05 87.73 81.67 0 11.09 18.77 102.01 86.12
-13.65 12.50 tra 3,260,398 68.14 47.06 14.34 126.74 43.72 0 1.85 60.71 145.93 42.61
-32.81 -0.16 tro 2,003,006 63.65 11.88 3.15 126.01 50.83 2 3.30 44.69 133.08 55.34
22.22 7.25 tsc 2,346,803 64.89 70.97 10.09 175.80 60.37 0 2.84 48.76 136.62 51.83
-3.26 87.07 tsu 2,731,853 39.16 1.42 123.52 63.44 133.68 0 36.46 4.68 63.03 124.72
29.48 2.92 tth 1,894,877 69.44 95.48 4.44 185.13 46.63 0 1.53 66.01 149.65 38.93
30.20 3.11 ttl 1,902,595 69.09 94.77 4.71 184.48 47.96 0 1.61 64.57 148.66 39.91
29.55 3.66 tts 1,863,201 68.92 93.39 5.31 184.01 48.58 0 1.65 63.84 148.15 40.41
0.60 57.40 uur 751,719 25.50 1.12 147.16 30.67 174.38 0 89.76 0.52 23.94 163.44
-47.30 0.08 vin 4,350,553 68.94 16.63 1.72 153.43 40.76 0 1.65 63.94 148.22 40.34
0.92 102.17 wbr 697,724 22.48 0.92 208.59 33.16 156.64 0 106.42 0.00 15.29 172.00
-42.66 2.72 xac 5,175,554 64.77 5.72 5.59 134.28 55.67 0 2.88 48.37 136.30 52.15
-1.37 28.59 xbo 4,225,498 44.97 7.44 51.50 83.11 110.12 0 22.91 8.81 79.64 108.27
-43.77 3.03 xcb 5,148,708 64.96 5.23 5.84 136.33 54.70 0 2.81 49.00 136.83 51.63
0.32 19.99 ype 4,653,728 47.64 11.87 38.12 90.59 103.77 0 18.13 11.56 87.27 100.71
0.36 20.30 ypg 4,504,254 47.60 11.88 38.49 90.41 103.78 0 18.19 11.51 87.16 100.82
0.82 127.37 zin 208,564 13.54 0.82 295.48 20.95 164.90 21 168.10 0.00 0.00 197.33
  • Tableau non formaté
dGCa;dATa;KEGG;Chromosome;%GC;>4GC;>4AT;<5GC;<5AT;Ctrl  ;>4ATa;>4GCa;<5GCa;<5ATa
0.41;36.57;aae;1,551,335;43.48;7.94;62.53;87.48;122.46;0;25.96;7.53;75.37;112.50
-24.48;4.39;aba;5,650,368;58.38;5.60;10.51;111.20;79.90;0;6.11;30.08;118.02;70.26
-74.57;-0.13;acp;5,029,329;74.72;16.38;0.27;166.79;25.74;0;0.40;90.95;164.75;23.97
-75.60;-0.08;ade;5,013,479;74.91;16.35;0.28;167.49;25.71;0;0.36;91.95;165.29;23.44
-62.69;-0.32;afw;5,277,990;73.53;22.17;0.33;154.43;27.39;0;0.65;84.86;161.36;27.33
-37.88;-0.55;age;12,489,432;69.45;28.18;0.97;157.10;37.98;41;1.52;66.06;149.68;38.90
-60.59;-0.29;amd;10,236,715;71.29;13.55;0.82;163.29;36.08;0;1.11;74.14;154.95;33.68
-0.48;24.18;amo;2,160,700;47.97;11.46;41.77;99.04;103.43;0;17.59;11.94;88.22;99.77
-59.71;-0.33;ams;8,773,466;70.82;12.31;0.88;166.08;32.04;0;1.21;72.02;153.61;35.01
3.51;27.26;amt;4,929,566;36.82;7.09;70.56;66.16;131.62;0;43.30;3.57;56.33;131.35
-75.09;-0.13;ank;5,061,632;74.84;16.52;0.25;167.44;25.50;0;0.38;91.61;165.10;23.62
-5.62;24.14;apt;2,907,495;53.04;13.58;34.96;109.76;88.19;0;10.81;19.19;102.72;85.41
-28.68;-0.54;asd;4,738,809;62.24;11.70;3.38;119.98;58.56;0;3.91;40.38;129.07;59.32
1.35;18.76;asf;1,620,005;28.26;2.46;94.96;43.24;153.77;0;76.20;1.10;31.83;155.62
-2.29;47.54;bae;4,168,266;43.22;5.04;74.05;75.95;115.88;0;26.51;7.32;74.63;113.23
-27.48;-0.68;bla;1,933,695;60.49;7.94;4.13;117.39;64.88;0;4.81;35.43;124.05;64.29
-27.95;0.73;blo;2,256,640;60.12;6.49;5.75;128.58;69.36;0;5.02;34.44;122.99;65.34
-20.56;11.50;bmf1;2,121,359;57.16;6.69;18.51;117.83;83.49;0;7.00;27.25;114.51;73.73
-20.07;10.71;bmf2;1,156,948;57.34;7.60;17.57;119.10;82.23;0;6.86;27.66;115.04;73.21
-55.50;3.79;bmv;3,497,479;68.15;5.25;5.64;114.83;48.79;0;1.84;60.75;145.96;42.58
0.87;34.95;bpn;791,654;29.56;2.26;105.27;41.65;146.11;0;70.32;1.39;35.57;151.92
-2.66;46.70;bsu;4,215,606;43.51;4.90;72.57;75.00;114.03;0;25.87;7.56;75.48;112.39
0.67;99.83;buc;640,681;26.31;1.36;185.43;36.74;146.34;0;85.60;0.69;26.26;161.14
0.79;31.20;cac;3,940,880;30.93;2.49;95.73;49.51;145.98;0;64.54;1.70;39.46;148.06
0.89;19.20;cad;3,105,335;29.93;2.36;87.91;43.15;141.23;0;68.71;1.47;36.62;150.87
2.28;55.84;cbd;2,158,758;42.44;9.01;84.09;75.19;126.15;0;28.25;6.73;72.39;115.45
1.89;35.69;cbl;3,992,906;28.31;3.00;111.65;46.05;147.53;0;75.96;1.12;31.98;155.47
-45.64;-0.55;ccx;10,080,619;69.90;22.32;0.87;155.75;39.77;0;1.42;67.96;150.96;37.63
0.86;28.29;cdf;4,290,252;29.06;2.14;100.84;43.17;146.88;0;72.55;1.28;34.12;153.35
-1.17;66.74;cff;1,773,615;33.31;1.17;121.97;46.50;125.11;0;55.23;2.34;46.27;141.31
-1.14;66.80;cft;1,800,764;33.21;1.17;122.40;46.27;125.61;0;55.60;2.31;45.99;141.60
-1.10;67.99;cfv;1,866,009;33.26;1.23;123.39;46.37;125.52;0;55.39;2.33;46.15;141.44
-12.77;9.73;cgl;3,309,401;53.81;7.78;19.72;107.40;88.58;0;9.99;20.55;104.93;83.22
-13.35;9.52;cgq;3,145,677;54.15;7.81;19.17;109.11;88.07;0;9.65;21.16;105.90;82.26
0.83;32.11;chp;1,171,660;39.06;5.45;68.85;62.48;126.33;0;36.74;4.63;62.74;125.01
0.52;94.06;cje;1,641,481;30.55;2.14;160.17;43.41;143.58;0;66.10;1.61;38.38;149.13
0.49;94.98;cjr;1,777,831;30.31;2.05;162.10;42.55;144.24;0;67.13;1.56;37.69;149.82
-13.58;21.59;cko;4,720,462;53.83;7.00;31.57;103.14;85.24;0;9.98;20.58;104.98;83.17
1.24;18.94;cle;4,714,237;34.32;3.89;70.51;54.80;138.33;0;51.57;2.65;49.18;138.43
-2.87;36.57;clo;1,809,746;44.21;5.27;60.99;84.54;118.77;29;24.42;8.14;77.47;110.41
-63.61;-0.42;cmi;3,297,891;72.66;16.98;0.40;152.51;23.18;0;0.83;80.59;158.88;29.79
3.47;41.54;cmn;1,072,952;40.34;8.81;74.88;66.27;125.28;0;33.34;5.34;66.39;121.39
-16.35;21.14;cnt;4,876,443;55.10;6.62;29.88;110.29;83.01;0;8.73;22.97;108.63;79.55
-5.16;35.25;cpb;2,736,403;48.93;7.96;51.36;91.95;95.08;0;16.11;13.11;90.96;97.05
-0.37;16.76;cpy;4,847,594;35.35;2.63;64.82;58.92;139.35;0;48.05;3.00;52.11;135.53
0.25;137.74;crp;159,662;16.56;0.25;282.78;22.18;170.47;0;145.05;0.00;0.00;188.76
0.37;166.19;cru;162,589;13.98;0.37;330.82;21.04;164.62;22;164.62;0.00;0.00;196.09
0.08;34.56;cta;1,044,459;41.30;6.02;65.49;67.52;120.86;0;30.92;5.95;69.15;118.66
-0.17;44.64;cth;3,843,301;38.99;4.42;81.59;75.50;128.99;0;36.95;4.59;62.52;125.22
-0.02;34.84;ctr;1,042,519;41.31;5.93;65.75;67.49;120.78;0;30.91;5.95;69.16;118.65
-42.09;7.09;cvi;4,751,080;64.83;6.49;9.94;146.34;56.59;0;2.85;48.58;136.47;51.98
-18.93;23.80;dba;3,942,657;58.65;11.78;29.73;130.14;70.32;0;5.94;30.71;118.77;69.51
-13.03;20.77;dda;4,679,450;55.02;9.77;29.59;110.93;81.22;0;8.82;22.80;108.38;79.80
-27.57;4.68;ddr;2,819,842;63.39;16.30;8.09;140.37;53.47;0;3.41;43.87;132.34;56.07
-26.98;4.87;dge;2,467,205;66.64;27.98;7.14;144.69;47.79;0;2.27;54.96;141.63;46.87
-34.39;6.26;dpd;3,881,839;63.97;11.35;9.43;130.95;56.70;0;3.17;45.74;134.02;54.41
-30.78;6.79;dpt;2,147,060;66.16;22.44;9.20;150.06;48.78;0;2.41;53.23;140.28;48.21
-18.13;1.42;dvl;3,462,887;63.01;24.57;4.99;127.10;58.71;0;3.57;42.70;131.26;57.14
-8.15;24.00;eal;4,701,875;49.70;5.97;38.99;92.32;98.00;0;14.99;14.12;93.16;94.87
-15.14;20.23;ebf;4,762,179;54.02;5.79;30.02;103.41;85.02;0;9.78;20.92;105.53;82.63
-4.26;22.35;ebt;4,158,725;56.51;21.58;29.86;122.41;71.82;0;7.52;25.84;112.65;75.57
-9.95;20.31;eca;5,064,019;50.97;5.96;33.59;92.72;92.02;0;13.27;15.91;96.80;91.27
-15.58;19.72;ecla;4,633,407;55.18;7.54;28.38;108.06;79.43;0;8.66;23.13;108.86;79.33
-10.23;22.54;eco;4,641,652;50.79;5.42;36.04;95.71;95.23;0;13.50;15.65;96.30;91.77
-9.06;24.37;ecs;5,498,450;50.54;6.22;38.21;95.70;94.82;0;13.84;15.28;95.57;92.49
-15.10;34.67;eha;3,008,576;55.56;8.78;42.99;115.87;76.42;0;8.32;23.87;109.94;78.26
-13.63;16.43;eic;3,812,301;57.44;14.25;23.22;117.50;63.95;0;6.79;27.88;115.31;72.94
-14.89;19.44;eno;4,726,582;55.07;8.01;28.21;107.64;79.75;0;8.77;22.90;108.53;79.66
-13.58;21.25;ent;4,518,712;52.98;5.52;32.12;97.72;87.42;0;10.87;19.10;102.56;85.56
-22.17;22.19;esa;4,368,373;56.77;4.23;29.49;108.08;75.46;0;7.31;26.40;113.39;74.84
-11.11;22.45;eta;3,883,467;53.73;9.30;32.52;105.55;81.53;0;10.07;20.41;104.71;83.44
0.87;63.01;fnc;2,268,272;27.12;1.73;144.60;40.79;154.26;0;81.59;0.86;28.58;158.84
-46.63;0.01;fra;5,433,628;70.08;22.11;1.39;165.05;33.57;0;1.38;68.74;151.48;37.12
-35.66;0.50;gau;4,636,964;64.27;11.05;3.56;129.35;50.68;0;3.06;46.72;134.87;53.56
-69.27;-0.59;gba;5,311,527;72.56;10.82;0.26;133.01;27.97;0;0.85;80.09;158.58;30.08
-32.63;3.70;gdi;3,944,163;66.43;21.58;6.03;150.82;47.27;0;2.33;54.20;141.04;47.45
-4.66;16.72;gva;1,617,545;42.02;1.77;45.95;58.51;131.47;1;29.22;6.43;71.19;116.64
-7.71;21.05;hav;4,712,721;48.99;5.48;37.06;87.96;100.75;0;16.01;13.19;91.14;96.87
-15.34;2.58;ipa;5,472,964;62.44;25.63;6.40;139.26;72.47;0;3.82;40.97;129.64;58.75
-9.83;23.34;kin;5,529,134;52.75;8.87;34.47;101.99;87.09;0;11.13;18.71;101.89;86.23
-16.45;22.51;koy;5,914,407;55.92;8.16;30.51;111.73;77.45;0;8.01;24.61;110.97;77.23
-18.56;19.03;kpn;5,315,120;57.48;9.41;25.79;118.30;70.66;0;6.76;27.97;115.43;72.82
-15.44;24.61;ksa;4,902,024;53.74;4.99;34.67;102.65;86.85;0;10.06;20.43;104.75;83.40
-59.78;-0.13;ksk;8,783,278;74.20;28.47;0.38;182.69;26.97;66;0.51;88.25;163.26;25.44
1.63;45.09;lat;1,190,853;36.32;5.00;89.97;55.94;128.87;0;44.88;3.37;54.90;132.77
-32.95;12.90;lhk;3,169,329;62.35;7.75;16.77;144.51;58.82;0;3.86;40.70;129.37;59.01
-1.01;48.07;liv;2,928,879;37.13;2.70;90.41;59.55;138.23;0;42.35;3.71;57.22;130.48
-1.21;32.07;ljf;1,755,993;34.49;1.49;83.08;53.78;149.79;0;51.00;2.71;49.65;137.98
-0.40;53.90;lla;2,365,589;35.33;2.60;102.02;55.09;145.88;0;48.12;3.00;52.06;135.58
-2.52;12.63;lpl;3,308,273;44.47;5.84;36.53;78.64;124.71;0;23.90;8.36;78.20;109.69
0.54;64.36;mcac;1,017,293;23.66;0.64;164.01;26.62;173.87;0;99.65;0.10;18.68;168.64
-4.11;15.51;men;538,294;43.52;3.46;41.37;75.91;112.63;0;25.87;7.56;75.49;112.38
-9.38;4.80;mhd;2,269,167;68.08;51.08;6.66;152.57;47.39;0;1.86;60.46;145.75;42.79
4.23;15.91;mrb;3,097,457;63.38;48.09;19.32;147.85;56.65;0;3.41;43.86;132.33;56.09
2.98;11.25;msv;3,249,394;62.36;43.71;15.11;141.16;61.15;0;3.86;40.73;129.41;58.98
-44.30;-0.85;mts;3,982,034;70.28;25.31;0.48;140.02;31.95;21;1.33;69.61;152.05;36.55
-42.26;-0.64;mxa;9,139,763;68.89;21.48;1.02;153.18;42.83;0;1.66;63.74;148.08;40.48
-57.77;-0.75;nfa;6,021,225;70.83;14.30;0.46;161.02;33.91;0;1.21;72.06;153.64;34.98
-28.25;2.26;opr;2,303,940;70.02;40.26;3.65;155.15;42.38;0;1.39;68.51;151.33;37.27
-19.11;0.37;pac;2,560,265;60.01;15.05;5.45;126.03;62.38;0;5.08;34.15;122.67;65.64
-47.18;2.16;pae;6,264,404;66.56;7.48;4.45;152.72;50.63;0;2.29;54.66;141.40;47.10
-19.29;0.36;pak;2,495,334;60.10;15.11;5.39;126.41;61.97;0;5.03;34.40;122.94;65.38
-14.36;22.10;pam;4,703,373;53.69;5.97;32.22;104.35;83.47;0;10.12;20.33;104.59;83.55
-4.58;6.74;pdo;1,890,857;58.31;25.33;12.90;140.03;75.36;0;6.16;29.91;117.82;70.46
-13.56;24.03;pes;4,513,140;56.06;11.34;31.92;115.51;76.55;0;7.89;24.90;111.37;76.84
-3.41;19.59;pfq;4,094,629;45.38;5.78;41.71;87.27;112.08;0;22.12;9.19;80.80;107.11
-18.20;6.68;pgd;3,776,653;59.62;14.95;11.99;126.43;66.59;0;5.31;33.15;121.57;66.74
-24.64;18.74;pge;5,489,680;59.11;7.20;24.37;122.41;66.58;0;5.64;31.84;120.09;68.21
-4.76;16.37;pgi;2,343,476;48.29;7.57;33.46;91.22;96.19;0;17.09;12.32;89.13;98.86
-58.79;-0.11;phm;3,803,225;73.29;24.86;0.59;166.86;32.76;0;0.70;83.64;160.66;28.02
1.49;57.57;ple;358,242;26.17;2.15;143.87;36.61;157.23;0;86.30;0.66;25.86;161.53
-0.15;23.67;plu;5,688,987;42.83;6.87;51.05;78.56;118.84;0;27.38;7.02;73.51;114.34
1.58;31.14;pmr;4,063,606;38.90;6.12;68.33;63.86;129.32;0;37.19;4.54;62.27;125.47
-36.53;2.73;ppk;5,429,298;64.72;11.67;5.63;121.87;56.46;0;2.89;48.20;136.15;52.30
-2.31;21.19;ppm;5,728,392;45.24;6.76;43.58;84.33;108.79;0;22.38;9.06;80.41;107.51
-2.58;20.84;ppoy;5,597,590;45.51;6.74;42.70;85.11;107.86;0;21.87;9.32;81.19;106.73
1.29;29.75;psi;4,402,109;41.27;7.21;60.76;69.06;123.88;0;31.01;5.92;69.04;118.76
-23.96;11.15;pst;6,397,126;58.40;6.15;17.25;115.04;73.07;0;6.10;30.11;118.06;70.21
-4.08;18.85;ral;3,685,408;44.21;4.06;43.28;73.26;100.81;0;24.43;8.13;77.45;110.43
-11.41;22.45;raq;4,861,101;52.12;6.27;34.30;100.97;89.16;0;11.85;17.68;100.10;88.00
-49.42;-1.25;req;5,043,170;68.82;14.04;0.42;145.83;37.26;0;1.67;63.47;147.89;40.67
-32.08;-1.66;rer;6,516,310;62.31;8.50;2.22;124.05;60.56;0;3.88;40.59;129.26;59.12
-31.56;4.70;ret;4,381,608;61.27;6.02;9.09;127.86;66.92;0;4.39;37.58;126.28;62.07
-43.27;-1.23;rha;7,804,765;67.52;15.01;0.78;144.72;41.86;0;2.01;58.27;144.15;44.38
-7.56;30.00;rho;3,592,125;48.50;5.02;46.76;93.69;91.95;0;16.76;12.58;89.73;98.27
0.28;94.69;rip;574,390;28.48;1.43;169.87;40.06;148.36;0;75.17;1.15;32.47;154.99
-43.36;-1.31;roa;8,376,953;67.37;14.36;0.74;144.02;42.11;67;2.05;57.73;143.74;44.78
-16.27;20.68;ror;5,398,151;55.88;8.26;28.72;112.28;76.56;0;8.04;24.54;110.87;77.34
-44.02;0.22;rpa;5,459,213;65.04;5.26;3.01;133.11;55.03;0;2.78;49.28;137.06;51.40
-0.31;27.72;rpr;1,111,523;29.00;0.95;100.55;38.12;151.34;0;72.82;1.26;33.95;153.52
-0.32;27.63;rpw;1,109,804;29.01;0.95;100.42;38.14;151.32;0;72.80;1.27;33.97;153.50
-0.01;34.61;rri;1,257,710;32.47;2.09;93.01;49.20;144.70;0;58.40;2.10;43.87;143.69
-22.46;7.17;rru;4,352,825;65.45;28.23;9.81;151.81;56.96;0;2.64;50.69;138.23;50.24
-0.43;26.10;rty;1,111,496;28.92;0.82;99.29;37.26;151.81;0;73.19;1.25;33.72;153.75
-14.37;4.35;saci;9,629,675;62.27;26.08;8.25;134.54;66.46;0;3.90;40.44;129.13;59.25
-50.39;-0.24;salb;6,841,649;73.32;33.42;0.46;178.50;27.52;29;0.69;83.81;160.76;27.93
-50.91;-0.25;sall;9,784,577;72.13;27.12;0.69;172.52;32.32;446;0.94;78.03;157.35;31.30
-52.18;-0.23;salu;9,360,281;72.32;26.75;0.66;173.39;31.79;0;0.90;78.93;157.89;30.76
-4.28;19.89;sap;3,472,898;56.76;22.12;27.21;132.14;82.96;21;7.31;26.39;113.39;74.84
-4.30;19.87;say;3,551,206;56.76;22.08;27.19;131.93;82.92;0;7.31;26.39;113.38;74.85
-46.31;-0.39;sbh;11,936,683;70.75;25.40;0.84;164.63;32.56;175;1.23;71.71;153.41;35.20
-6.31;16.87;sbn;5,347,283;46.28;3.78;37.32;80.09;111.79;0;20.45;10.09;83.40;104.54
-10.67;22.06;sbo;4,519,823;51.21;5.60;35.02;96.58;93.01;0;12.96;16.27;97.50;90.58
-9.19;26.26;sbz;4,683,551;51.34;7.27;39.06;99.16;90.80;0;12.80;16.47;97.87;90.21
-46.60;-0.49;scb;10,148,695;71.45;28.28;0.59;166.90;31.00;0;1.08;74.87;155.41;33.22
-53.58;0.13;scl;13,033,779;71.38;20.94;1.22;144.37;32.28;0;1.10;74.52;155.19;33.44
-53.47;-0.49;sco;8,667,507;72.12;24.50;0.45;170.45;29.52;0;0.94;77.98;157.32;31.33
-53.30;-0.24;sct;6,283,062;72.94;28.63;0.53;178.59;29.83;30;0.77;81.93;159.67;29.01
-0.23;34.75;sect;1,441,139;43.29;7.15;61.10;67.91;103.78;0;26.36;7.38;74.84;113.03
-0.23;16.59;sep;2,499,279;32.10;1.77;76.43;43.92;150.09;0;59.84;2.00;42.81;144.75
-0.23;15.66;sepp;2,490,012;32.12;1.78;75.40;43.87;150.22;0;59.74;2.01;42.88;144.67
-0.20;15.77;ser;2,616,530;32.15;1.82;75.39;43.95;150.35;0;59.62;2.02;42.97;144.59
-10.12;22.33;sfl;4,607,202;50.89;5.68;35.71;95.72;94.17;49;13.37;15.79;96.58;91.49
-4.64;19.40;sfo;5,488,183;50.88;11.13;32.79;100.99;95.83;0;13.39;15.78;96.55;91.52
-48.17;-0.46;sgr;8,545,929;72.23;30.32;0.46;171.02;29.85;0;0.92;78.49;157.63;31.03
-52.87;-0.48;sho;9,840,102;72.04;24.73;0.47;171.84;29.86;0;0.96;77.60;157.09;31.56
-47.89;-0.54;sma;9,025,608;70.72;23.65;0.69;161.80;33.15;0;1.24;71.54;153.31;35.31
-34.28;3.23;smk;3,820,344;62.67;7.36;6.95;131.47;63.64;0;3.72;41.64;130.27;58.12
3.23;76.37;smsP;190,657;24.00;3.41;174.13;37.48;152.05;0;97.76;0.18;19.66;167.68
-34.30;3.19;smx;3,908,022;62.65;7.31;6.91;131.48;63.69;0;3.73;41.61;130.24;58.15
-14.06;17.48;spe;5,448,853;55.07;8.85;26.24;114.82;82.59;0;8.76;22.91;108.55;79.64
-1.31;41.37;spi;1,937,111;38.32;2.94;80.21;64.06;131.24;0;38.84;4.25;60.60;127.12
-1.69;26.67;spl;1,796,846;39.09;2.96;63.32;66.55;131.21;0;36.66;4.64;62.82;124.92
-11.06;26.02;spq;4,858,887;52.11;6.60;37.89;100.30;89.22;0;11.87;17.66;100.07;88.03
-49.69;-0.48;ssx;7,414,440;71.75;26.55;0.53;170.08;29.86;0;1.02;76.24;156.26;32.38
-43.78;-1.07;sti;2,741,033;68.10;16.79;0.79;150.20;37.96;0;1.86;60.56;145.83;42.71
-11.29;26.19;stm;4,857,432;52.22;6.55;37.92;100.73;88.83;0;11.74;17.84;100.39;87.72
-10.80;25.89;sty;4,809,037;52.09;6.84;37.77;100.25;89.06;0;11.89;17.64;100.02;88.08
-20.00;0.42;sur;10,260,756;67.46;38.05;2.45;151.30;47.32;0;2.03;58.05;143.98;44.54
-29.71;3.44;sus;9,965,640;61.90;9.66;7.51;131.94;67.14;0;4.08;39.38;128.09;60.28
37.14;0.62;tai;1,848,474;63.79;82.29;3.86;164.49;52.48;0;3.25;45.15;133.50;54.93
-0.02;86.75;tde;2,843,201;37.87;4.02;126.87;72.25;127.66;0;40.12;4.04;59.34;128.37
-3.35;28.65;tma;1,860,725;46.25;6.70;49.16;84.62;105.87;0;20.51;10.05;83.30;104.65
2.99;73.35;tme;1,915,238;31.40;4.81;135.95;53.93;146.23;0;62.60;1.82;40.82;146.72
53.90;5.20;tos;2,072,393;68.55;116.27;6.94;183.02;49.41;0;1.74;62.37;147.12;41.44
-1.30;29.96;tpas;1,139,203;52.79;17.47;41.05;87.73;81.67;0;11.09;18.77;102.01;86.12
-13.65;12.50;tra;3,260,398;68.14;47.06;14.34;126.74;43.72;0;1.85;60.71;145.93;42.61
-32.81;-0.16;tro;2,003,006;63.65;11.88;3.15;126.01;50.83;2;3.30;44.69;133.08;55.34
22.22;7.25;tsc;2,346,803;64.89;70.97;10.09;175.80;60.37;0;2.84;48.76;136.62;51.83
-3.26;87.07;tsu;2,731,853;39.16;1.42;123.52;63.44;133.68;0;36.46;4.68;63.03;124.72
29.48;2.92;tth;1,894,877;69.44;95.48;4.44;185.13;46.63;0;1.53;66.01;149.65;38.93
30.20;3.11;ttl;1,902,595;69.09;94.77;4.71;184.48;47.96;0;1.61;64.57;148.66;39.91
29.55;3.66;tts;1,863,201;68.92;93.39;5.31;184.01;48.58;0;1.65;63.84;148.15;40.41
0.60;57.40;uur;751,719;25.50;1.12;147.16;30.67;174.38;0;89.76;0.52;23.94;163.44
-47.30;0.08;vin;4,350,553;68.94;16.63;1.72;153.43;40.76;0;1.65;63.94;148.22;40.34
0.92;102.17;wbr;697,724;22.48;0.92;208.59;33.16;156.64;0;106.42;0.00;15.29;172.00
-42.66;2.72;xac;5,175,554;64.77;5.72;5.59;134.28;55.67;0;2.88;48.37;136.30;52.15
-1.37;28.59;xbo;4,225,498;44.97;7.44;51.50;83.11;110.12;0;22.91;8.81;79.64;108.27
-43.77;3.03;xcb;5,148,708;64.96;5.23;5.84;136.33;54.70;0;2.81;49.00;136.83;51.63
0.32;19.99;ype;4,653,728;47.64;11.87;38.12;90.59;103.77;0;18.13;11.56;87.27;100.71
0.36;20.30;ypg;4,504,254;47.60;11.88;38.49;90.41;103.78;0;18.19;11.51;87.16;100.82
0.82;127.37;zin;208,564;13.54;0.82;295.48;20.95;164.90;21;168.10;0.00;0.00;197.33

Groupes des autre-bactéries selon l'écart relatif par rapport à l'aléa[modifier | modifier le wikicode]

  • Voir tableau non formaté à la suite
  • Légende:
>4GC %: 100*(>4GC − >4GCa)/>4GCa . Voir Tableau des diagrammes des répétitions pour >4GC et >4GCa.
>4AT %: respectivement de même que précédent.
Tableau des diagrammes : écarts relatifs par rapport à l'aléa
KEGG %GC >4GC % >4AT %
uur 25.50 116.1 64.0
ple 26.17 224.6 66.7
buc 26.31 96.3 116.6
fnc 27.12 100.6 77.2
asf 28.26 122.5 24.6
cbl 28.31 169.3 47.0
rip 28.48 23.9 126.0
rty 28.92 -34.3 35.7
rpr 29.00 -24.6 38.1
rpw 29.01 -25.2 37.9
cdf 29.06 67.3 39.0
bpn 29.56 62.8 49.7
cad 29.93 60.3 27.9
cjr 30.31 31.4 141.5
cje 30.55 32.4 142.3
cac 30.93 46.2 48.3
tme 31.40 164.0 117.2
sep 32.10 -11.6 27.7
sepp 32.12 -11.4 26.2
ser 32.15 -9.9 26.5
rri 32.47 -0.4 59.3
cft 33.21 -49.5 120.1
cfv 33.26 -47.2 122.7
cff 33.31 -50.1 120.8
cle 34.32 46.8 36.7
ljf 34.49 -44.8 62.9
lla 35.33 -13.4 112.0
cpy 35.35 -12.3 34.9
lat 36.32 48.3 100.5
amt 36.82 98.3 63.0
liv 37.13 -27.2 113.5
tde 37.87 -0.5 216.2
spi 38.32 -30.7 106.5
pmr 38.90 34.7 83.7
cth 38.99 -3.7 120.8
chp 39.06 17.9 87.4
spl 39.09 -36.3 72.7
tsu 39.16 -69.7 238.8
cmn 40.34 64.9 124.6
psi 41.27 21.8 95.9
cta 41.30 1.3 111.8
ctr 41.31 -0.4 112.7
gva 42.02 -72.4 57.2
cbd 42.44 33.9 197.6
plu 42.83 -2.2 86.5
bae 43.22 -31.3 179.3
sect 43.29 -3.2 131.8
aae 43.48 5.5 140.9
bsu 43.51 -35.2 180.5
men 43.52 -54.3 59.9
ral 44.21 -50.1 77.1
clo 44.21 -35.2 149.8
lpl 44.47 -30.1 52.9
xbo 44.97 -15.6 124.8
ppm 45.24 -25.4 94.7
pfq 45.38 -37.1 88.6
ppoy 45.51 -27.6 95.3
tma 46.25 -33.3 139.7
sbn 46.28 -62.6 82.5
ypg 47.60 3.2 111.6
ype 47.64 2.7 110.3
amo 47.97 -4.0 137.5
pgi 48.29 -38.6 95.8
rho 48.50 -60.1 179.0
cpb 48.93 -39.3 218.9
hav 48.99 -58.4 131.4
eal 49.70 -57.7 160.1
ecs 50.54 -59.3 176.2
eco 50.79 -65.3 166.9
sfo 50.88 -29.4 144.9
sfl 50.89 -64.1 167.0
eca 50.97 -62.6 153.0
sbo 51.21 -65.6 170.2
sbz 51.34 -55.8 205.2
sty 52.09 -61.2 217.8
spq 52.11 -62.6 219.3
raq 52.12 -64.5 189.4
stm 52.22 -63.3 223.1
kin 52.75 -52.6 209.6
tpas 52.79 -6.9 270.1
ent 52.98 -71.1 195.4
apt 53.04 -29.3 223.3
pam 53.69 -70.6 218.5
eta 53.73 -54.4 222.8
ksa 53.74 -75.6 244.6
cgl 53.81 -62.1 97.3
cko 53.83 -66.0 216.5
ebf 54.02 -72.3 206.8
cgq 54.15 -63.1 98.6
dda 55.02 -57.2 235.6
eno 55.07 -65.0 221.7
spe 55.07 -61.4 199.5
cnt 55.10 -71.2 242.0
ecla 55.18 -67.4 227.6
eha 55.56 -63.2 416.5
ror 55.88 -66.3 257.2
koy 55.92 -66.8 281.1
pes 56.06 -54.5 304.6
* ebt 56.51 -16.5 297.3
* say 56.76 -16.3 271.8
* sap 56.76 -16.2 272.1
esa 56.77 -84.0 303.6
bmf1 57.16 -75.4 164.2
bmf2 57.34 -72.5 156.0
eic 57.44 -48.9 241.9
kpn 57.48 -66.4 281.4
* pdo 58.31 -15.3 109.4
aba 58.38 -81.4 71.9
pst 58.40 -79.6 182.7
dba 58.65 -61.6 400.8
pge 59.11 -77.4 332.4
pgd 59.62 -54.9 125.7
pac 60.01 -55.9 7.2
pak 60.10 -56.1 7.1
blo 60.12 -81.2 14.5
bla 60.49 -77.6 -14.2
ret 61.27 -84.0 106.9
sus 61.90 -75.5 84.4
asd 62.24 -71.0 -13.7
* saci 62.27 -35.5 111.4
rer 62.31 -79.0 -42.8
lhk 62.35 -81.0 334.0
* msv 62.36 7.3 291.6
* ipa 62.44 -37.4 67.5
smx 62.65 -82.4 85.5
smk 62.67 -82.3 86.8
* dvl 63.01 -42.5 39.9
* mrb 63.38 9.7 466.4
ddr 63.39 -62.8 137.3
tro 63.65 -73.4 -4.8
* tai 63.79 82.3 19.0
dpd 63.97 -75.2 197.1
gau 64.27 -76.3 16.5
ppk 64.72 -75.8 94.4
xac 64.77 -88.2 94.5
cvi 64.83 -86.6 248.4
* tsc 64.89 45.6 255.7
xcb 64.96 -89.3 107.9
rpa 65.04 -89.3 8.1
* rru 65.45 -44.3 271.6
* dpt 66.16 -57.8 281.9
* gdi 66.43 -60.2 159.2
pae 66.56 -86.3 94.4
* dge 66.64 -49.1 215.1
* roa 67.37 -75.1 -64.0
* sur 67.46 -34.4 20.6
* rha 67.52 -74.2 -61.1
* mhd 68.08 -15.5 257.4
* sti 68.10 -72.3 -57.5
* tra 68.14 -22.5 676.6
bmv 68.15 -91.4 205.6
* tos 68.55 86.4 298.6
* req 68.82 -77.9 -74.6
* mxa 68.89 -66.3 -38.7
* tts 68.92 46.3 221.5
vin 68.94 -74.0 4.6
* ttl 69.09 46.8 193.2
* tth 69.44 44.7 191.2
* age 69.45 -57.3 -36.4
* ccx 69.90 -67.2 -38.6
* opr 70.02 -41.2 162.8
* fra 70.08 -67.8 0.8
* mts 70.28 -63.6 -63.7
* sma 70.72 -66.9 -43.9
* sbh 70.75 -64.6 -31.8
* ams 70.82 -82.9 -27.1
* nfa 70.83 -80.2 -61.8
* amd 71.29 -81.7 -26.4
* scl 71.38 -71.9 11.6
* scb 71.45 -62.2 -45.3
* ssx 71.75 -65.2 -47.5
* sho 72.04 -68.1 -50.4
* sco 72.12 -68.6 -52.1
* sall 72.13 -65.2 -26.9
* sgr 72.23 -61.4 -49.6
* salu 72.32 -66.1 -26.2
* gba 72.56 -86.5 -69.8
* cmi 72.66 -78.9 -51.3
* sct 72.94 -65.1 -31.1
* phm 73.29 -70.3 -15.1
* salb 73.32 -60.1 -34.0
* afw 73.53 -73.9 -49.3
* ksk 74.20 -67.7 -25.4
* acp 74.72 -82.0 -32.2
* ank 74.84 -82.0 -33.2
* ade 74.91 -82.2 -22.4
  • Tableau non formaté
;KEGG;%GC;>4GC %;>4AT %
;uur;25.50;116.1;64.0
;ple;26.17;224.6;66.7
;buc;26.31;96.3;116.6
;fnc;27.12;100.6;77.2
;asf;28.26;122.5;24.6
;cbl;28.31;169.3;47.0
;rip;28.48;23.9;126.0
;rty;28.92;-34.3;35.7
;rpr;29.00;-24.6;38.1
;rpw;29.01;-25.2;37.9
;cdf;29.06;67.3;39.0
;bpn;29.56;62.8;49.7
;cad;29.93;60.3;27.9
;cjr;30.31;31.4;141.5
;cje;30.55;32.4;142.3
;cac;30.93;46.2;48.3
;tme;31.40;164.0;117.2
;sep;32.10;-11.6;27.7
;sepp;32.12;-11.4;26.2
;ser;32.15;-9.9;26.5
;rri;32.47;-0.4;59.3
;cft;33.21;-49.5;120.1
;cfv;33.26;-47.2;122.7
;cff;33.31;-50.1;120.8
;cle;34.32;46.8;36.7
;ljf;34.49;-44.8;62.9
;lla;35.33;-13.4;112.0
;cpy;35.35;-12.3;34.9
;lat;36.32;48.3;100.5
;amt;36.82;98.3;63.0
;liv;37.13;-27.2;113.5
;tde;37.87;-0.5;216.2
;spi;38.32;-30.7;106.5
;pmr;38.90;34.7;83.7
;cth;38.99;-3.7;120.8
;chp;39.06;17.9;87.4
;spl;39.09;-36.3;72.7
;tsu;39.16;-69.7;238.8
;cmn;40.34;64.9;124.6
;psi;41.27;21.8;95.9
;cta;41.30;1.3;111.8
;ctr;41.31;-0.4;112.7
;gva;42.02;-72.4;57.2
;cbd;42.44;33.9;197.6
;plu;42.83;-2.2;86.5
;bae;43.22;-31.3;179.3
;sect;43.29;-3.2;131.8
;aae;43.48;5.5;140.9
;bsu;43.51;-35.2;180.5
;men;43.52;-54.3;59.9
;ral;44.21;-50.1;77.1
;clo;44.21;-35.2;149.8
;lpl;44.47;-30.1;52.9
;xbo;44.97;-15.6;124.8
;ppm;45.24;-25.4;94.7
;pfq;45.38;-37.1;88.6
;ppoy;45.51;-27.6;95.3
;tma;46.25;-33.3;139.7
;sbn;46.28;-62.6;82.5
;ypg;47.60;3.2;111.6
;ype;47.64;2.7;110.3
;amo;47.97;-4.0;137.5
;pgi;48.29;-38.6;95.8
;rho;48.50;-60.1;179.0
;cpb;48.93;-39.3;218.9
;hav;48.99;-58.4;131.4
;eal;49.70;-57.7;160.1
;ecs;50.54;-59.3;176.2
;eco;50.79;-65.3;166.9
;sfo;50.88;-29.4;144.9
;sfl;50.89;-64.1;167.0
;eca;50.97;-62.6;153.0
;sbo;51.21;-65.6;170.2
;sbz;51.34;-55.8;205.2
;sty;52.09;-61.2;217.8
;spq;52.11;-62.6;219.3
;raq;52.12;-64.5;189.4
;stm;52.22;-63.3;223.1
;kin;52.75;-52.6;209.6
;tpas;52.79;-6.9;270.1
;ent;52.98;-71.1;195.4
;apt;53.04;-29.3;223.3
;pam;53.69;-70.6;218.5
;eta;53.73;-54.4;222.8
;ksa;53.74;-75.6;244.6
;cgl;53.81;-62.1;97.3
;cko;53.83;-66.0;216.5
;ebf;54.02;-72.3;206.8
;cgq;54.15;-63.1;98.6
;dda;55.02;-57.2;235.6
;eno;55.07;-65.0;221.7
;spe;55.07;-61.4;199.5
;cnt;55.10;-71.2;242.0
;ecla;55.18;-67.4;227.6
;eha;55.56;-63.2;416.5
;ror;55.88;-66.3;257.2
;koy;55.92;-66.8;281.1
;pes;56.06;-54.5;304.6
*;ebt;56.51;-16.5;297.3
*;say;56.76;-16.3;271.8
*;sap;56.76;-16.2;272.1
;esa;56.77;-84.0;303.6
;bmf1;57.16;-75.4;164.2
;bmf2;57.34;-72.5;156.0
;eic;57.44;-48.9;241.9
;kpn;57.48;-66.4;281.4
*;pdo;58.31;-15.3;109.4
;aba;58.38;-81.4;71.9
;pst;58.40;-79.6;182.7
;dba;58.65;-61.6;400.8
;pge;59.11;-77.4;332.4
;pgd;59.62;-54.9;125.7
;pac;60.01;-55.9;7.2
;pak;60.10;-56.1;7.1
;blo;60.12;-81.2;14.5
;bla;60.49;-77.6;-14.2
;ret;61.27;-84.0;106.9
;sus;61.90;-75.5;84.4
;asd;62.24;-71.0;-13.7
*;saci;62.27;-35.5;111.4
;rer;62.31;-79.0;-42.8
;lhk;62.35;-81.0;334.0
*;msv;62.36;7.3;291.6
*;ipa;62.44;-37.4;67.5
;smx;62.65;-82.4;85.5
;smk;62.67;-82.3;86.8
*;dvl;63.01;-42.5;39.9
*;mrb;63.38;9.7;466.4
;ddr;63.39;-62.8;137.3
;tro;63.65;-73.4;-4.8
*;tai;63.79;82.3;19.0
;dpd;63.97;-75.2;197.1
;gau;64.27;-76.3;16.5
;ppk;64.72;-75.8;94.4
;xac;64.77;-88.2;94.5
;cvi;64.83;-86.6;248.4
*;tsc;64.89;45.6;255.7
;xcb;64.96;-89.3;107.9
;rpa;65.04;-89.3;8.1
*;rru;65.45;-44.3;271.6
*;dpt;66.16;-57.8;281.9
*;gdi;66.43;-60.2;159.2
;pae;66.56;-86.3;94.4
*;dge;66.64;-49.1;215.1
*;roa;67.37;-75.1;-64.0
*;sur;67.46;-34.4;20.6
*;rha;67.52;-74.2;-61.1
*;mhd;68.08;-15.5;257.4
*;sti;68.10;-72.3;-57.5
*;tra;68.14;-22.5;676.6
;bmv;68.15;-91.4;205.6
*;tos;68.55;86.4;298.6
*;req;68.82;-77.9;-74.6
*;mxa;68.89;-66.3;-38.7
*;tts;68.92;46.3;221.5
;vin;68.94;-74.0;4.6
*;ttl;69.09;46.8;193.2
*;tth;69.44;44.7;191.2
*;age;69.45;-57.3;-36.4
*;ccx;69.90;-67.2;-38.6
*;opr;70.02;-41.2;162.8
*;fra;70.08;-67.8;0.8
*;mts;70.28;-63.6;-63.7
*;sma;70.72;-66.9;-43.9
*;sbh;70.75;-64.6;-31.8
*;ams;70.82;-82.9;-27.1
*;nfa;70.83;-80.2;-61.8
*;amd;71.29;-81.7;-26.4
*;scl;71.38;-71.9;11.6
*;scb;71.45;-62.2;-45.3
*;ssx;71.75;-65.2;-47.5
*;sho;72.04;-68.1;-50.4
*;sco;72.12;-68.6;-52.1
*;sall;72.13;-65.2;-26.9
*;sgr;72.23;-61.4;-49.6
*;salu;72.32;-66.1;-26.2
*;gba;72.56;-86.5;-69.8
*;cmi;72.66;-78.9;-51.3
*;sct;72.94;-65.1;-31.1
*;phm;73.29;-70.3;-15.1
*;salb;73.32;-60.1;-34.0
*;afw;73.53;-73.9;-49.3
*;ksk;74.20;-67.7;-25.4
*;acp;74.72;-82.0;-32.2
*;ank;74.84;-82.0;-33.2
*;ade;74.91;-82.2;-22.4

Groupes 22 et 23 des autre-bactéries aux faibles taux >4GC[modifier | modifier le wikicode]

Groupe 22 bactéries au-dessus de l’aléa >4GC    Groupe 23 bactéries sous l’aléa >4GC                    KEGG    %GC     >4GC%   >4AT%
                                                                                                        gva     42.02   -72     57
KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA             KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA                     tsu     39.16   -70     239
uur     25.50   1.12    147.16  751,719         rty     28.92   0.82    99.29   1,111,496               cff     33.31   -50     121
ple     26.17   2.15    143.87  358,242         rpr     29.00   0.95    100.55  1,111,523               cft     33.21   -49     120
buc     26.31   1.36    185.43  640,681         rpw     29.01   0.95    100.42  1,109,804               cfv     33.26   -47     123
fnc     27.12   1.73    144.60  2,268,272       sep     32.10   1.77    76.43   2,499,279               ljf     34.49   -45     63
asf     28.26   2.46    94.96   1,620,005       sepp    32.12   1.78    75.40   2,490,012               spl     39.09   -36     73
cbl     28.31   3.00    111.65  3,992,906       ser     32.15   1.82    75.39   2,616,530               rty     28.92   -34     36
rip     28.48   1.43    169.87  574,390         rri     32.47   2.09    93.01   1,257,710               spi     38.32   -31     107
cdf     29.06   2.14    100.84  4,290,252       cft     33.21   1.17    122.40  1,800,764               liv     37.13   -27     114
bpn     29.56   2.26    105.27  791,654         cfv     33.26   1.23    123.39  1,866,009               rpw     29.01   -25     38
cad     29.93   2.36    87.91   3,105,335       cff     33.31   1.17    121.97  1,773,615               rpr     29.00   -25     38
cjr     30.31   2.05    162.10  1,777,831       ljf     34.49   1.49    83.08   1,755,993               lla     35.33   -13     112
cje     30.55   2.14    160.17  1,641,481       lla     35.33   2.60    102.02  2,365,589               cpy     35.35   -12     35
cac     30.93   2.49    95.73   3,940,880       cpy     35.35   2.63    64.82   4,847,594               sep     32.10   -12     28
tme     31.40   4.81    135.95  1,915,238       liv     37.13   2.70    90.41   2,928,879               sepp    32.12   -11     26
cle     34.32   3.89    70.51   4,714,237       tde     37.87   4.02    126.87  2,843,201               ser     32.15   -10     26
lat     36.32   5.00    89.97   1,190,853       spi     38.32   2.94    80.21   1,937,111               cth     38.99   -4      121
amt     36.82   7.09    70.56   4,929,566       cth     38.99   4.42    81.59   3,843,301               plu     42.83   -2      86
pmr     38.90   6.12    68.33   4,063,606       spl     39.09   2.96    63.32   1,796,846               tde     37.87   0       216
chp     39.06   5.45    68.85   1,171,660       tsu     39.16   1.42    123.52  2,731,853               rri     32.47   0       59
cmn     40.34   8.81    74.88   1,072,952       cta     41.30   6.02    65.49   1,044,459               ctr     41.31   0       113
psi     41.27   7.21    60.76   4,402,109       ctr     41.31   5.93    65.75   1,042,519               cta     41.30   1       112
cbd     42.44   9.01    84.09   2,158,758       gva     42.02   1.77    45.95   1,617,545               chp     39.06   18      87
                                                plu     42.83   6.87    51.05   5,688,987               psi     41.27   22      96
moyen.  32      3.8     111     2,335,119                                                               rip     28.48   24      126
ecart   5       2       39      1,542,011       moyen.  36      2.6     88      2,264,375               cjr     30.31   31      141
%       17      65      35      66              ecart   4       2       24      1,200,989               cje     30.55   32      142
                                                %       12      67      27      53                      cbd     42.44   34      198
                                                                                                        pmr     38.90   35      84
                                                                                                        cac     30.93   46      48
                                                                                                        cle     34.32   47      37
                                                                                                        lat     36.32   48      100
                                                                                                        cad     29.93   60      28
                                                                                                        bpn     29.56   63      50
                                                                                                        cmn     40.34   65      125
                                                                                                        cdf     29.06   67      39
                                                                                                        buc     26.31   96      117
                                                                                                        amt     36.82   98      63
                                                                                                        fnc     27.12   101     77
                                                                                                        uur     25.50   116     64
                                                                                                        asf     28.26   122     25
                                                                                                        tme     31.40   164     117
                                                                                                        cbl     28.31   169     47
                                                                                                        ple     26.17   225     67

Groupes 33 et 41 des autre-bactéries aux taux >4GC extrêmes[modifier | modifier le wikicode]

Groupe 33 bactéries sous l’aléa >4AT                    Groupe 41 bactéries au-dessus de l’aléa >4AT            KEGG    %GC     >4GC%   >4AT%
                                                                                                                req     68.82   -78     -75
KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA                     KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA                     gba     72.56   -86     -70
bla     60.49   7.94    4.13    1,933,695               pac     60.01   15.05   5.45    2,560,265               roa     67.37   -75     -64
asd     62.24   11.70   3.38    4,738,809               pak     60.10   15.11   5.39    2,495,334               mts     70.28   -64     -64
rer     62.31   8.50    2.22    6,516,310               blo     60.12   6.49    5.75    2,256,640               nfa     70.83   -80     -62
roa     67.37   14.36   0.74    8,376,953               ret     61.27   6.02    9.09    4,381,608               rha     67.52   -74     -61
rha     67.52   15.01   0.78    7,804,765               sus     61.90   9.66    7.51    9,965,640               sti     68.10   -72     -58
sti     68.10   16.79   0.79    2,741,033               saci    62.27   26.08   8.25    9,629,675               sco     72.12   -69     -52
req     68.82   14.04   0.42    5,043,170               lhk     62.35   7.75    16.77   3,169,329               cmi     72.66   -79     -51
mxa     68.89   21.48   1.02    9,139,763               msv     62.36   43.71   15.11   3,249,394               sho     72.04   -68     -50
age     69.45   28.18   0.97    12,489,432              ipa     62.44   25.63   6.40    5,472,964               sgr     72.23   -61     -50
ccx     69.90   22.32   0.87    10,080,619              smx     62.65   7.31    6.91    3,908,022               afw     73.53   -74     -49
mts     70.28   25.31   0.48    3,982,034               smk     62.67   7.36    6.95    3,820,344               ssx     71.75   -65     -47
sma     70.72   23.65   0.69    9,025,608               dvl     63.01   24.57   4.99    3,462,887               scb     71.45   -62     -45
sbh     70.75   25.40   0.84    11,936,683              mrb     63.38   48.09   19.32   3,097,457               sma     70.72   -67     -44
ams     70.82   12.31   0.88    8,773,466               ddr     63.39   16.30   8.09    2,819,842               rer     62.31   -79     -43
nfa     70.83   14.30   0.46    6,021,225               tro     63.65   11.88   3.15    2,003,006               mxa     68.89   -66     -39
amd     71.29   13.55   0.82    10,236,715              tai     63.79   82.29   3.86    1,848,474               ccx     69.90   -67     -39
scb     71.45   28.28   0.59    10,148,695              dpd     63.97   11.35   9.43    3,881,839               age     69.45   -57     -36
ssx     71.75   26.55   0.53    7,414,440               gau     64.27   11.05   3.56    4,636,964               salb    73.32   -60     -34
sho     72.04   24.73   0.47    9,840,102               ppk     64.72   11.67   5.63    5,429,298               ank     74.84   -82     -33
sco     72.12   24.50   0.45    8,667,507               xac     64.77   5.72    5.59    5,175,554               acp     74.72   -82     -32
sall    72.13   27.12   0.69    9,784,577               cvi     64.83   6.49    9.94    4,751,080               sbh     70.75   -65     -32
sgr     72.23   30.32   0.46    8,545,929               tsc     64.89   70.97   10.09   2,346,803               sct     72.94   -65     -31
salu    72.32   26.75   0.66    9,360,281               xcb     64.96   5.23    5.84    5,148,708               ams     70.82   -83     -27
gba     72.56   10.82   0.26    5,311,527               rpa     65.04   5.26    3.01    5,459,213               sall    72.13   -65     -27
cmi     72.66   16.98   0.40    3,297,891               rru     65.45   28.23   9.81    4,352,825               amd     71.29   -82     -26
sct     72.94   28.63   0.53    6,283,062               dpt     66.16   22.44   9.20    2,147,060               salu    72.32   -66     -26
phm     73.29   24.86   0.59    3,803,225               gdi     66.43   21.58   6.03    3,944,163               ksk     74.20   -68     -25
salb    73.32   33.42   0.46    6,841,649               pae     66.56   7.48    4.45    6,264,404               ade     74.91   -82     -22
afw     73.53   22.17   0.33    5,277,990               dge     66.64   27.98   7.14    2,467,205               phm     73.29   -70     -15
ksk     74.20   28.47   0.38    8,783,278               sur     67.46   38.05   2.45    10,260,756              bla     60.49   -78     -14
acp     74.72   16.38   0.27    5,029,329               mhd     68.08   51.08   6.66    2,269,167               asd     62.24   -71     -14
ank     74.84   16.52   0.25    5,061,632               tra     68.14   47.06   14.34   3,260,398               tro     63.65   -73     -5
ade     74.91   16.35   0.28    5,013,479               bmv     68.15   5.25    5.64    3,497,479               fra     70.08   -68     1
                                                        tos     68.55   116.27  6.94    2,072,393               vin     68.94   -74     5
moy     71      21      0.8     7,191,057               tts     68.92   93.39   5.31    1,863,201               pak     60.10   -56     7
ecart   3.5     7.0     0.8     2,694,790               vin     68.94   16.63   1.72    4,350,553               pac     60.01   -56     7
%       5       34      102     37                      ttl     69.09   94.77   4.71    1,902,595               rpa     65.04   -89     8
                                                        tth     69.44   95.48   4.44    1,894,877               scl     71.38   -72     12
                                                        opr     70.02   40.26   3.65    2,303,940               blo     60.12   -81     14
                                                        fra     70.08   22.11   1.39    5,433,628               gau     64.27   -76     16
                                                        scl     71.38   20.94   1.22    13,033,779              tai     63.79   82      19
                                                                                                                sur     67.46   -34     21
                                                        moy     65      30      6.9     4,202,165               dvl     63.01   -42     40
                                                        ecart   3       30      4       2,530,326               ipa     62.44   -37     67
                                                        %       5       98      58      60                      sus     61.90   -75     84
                                                                                                                smx     62.65   -82     85
                                                                                                                smk     62.67   -82     87
                                                                                                                ppk     64.72   -76     94
                                                                                                                pae     66.56   -86     94
                                                                                                                xac     64.77   -88     95
                                                                                                                ret     61.27   -84     107
                                                                                                                xcb     64.96   -89     108
                                                                                                                saci    62.27   -36     111
                                                                                                                ddr     63.39   -63     137
                                                                                                                gdi     66.43   -60     159
                                                                                                                opr     70.02   -41     163
                                                                                                                tth     69.44   45      191
                                                                                                                ttl     69.09   47      193
                                                                                                                dpd     63.97   -75     197
                                                                                                                bmv     68.15   -91     206
                                                                                                                dge     66.64   -49     215
                                                                                                                tts     68.92   46      222
                                                                                                                cvi     64.83   -87     248
                                                                                                                tsc     64.89   46      256
                                                                                                                mhd     68.08   -16     257
                                                                                                                rru     65.45   -44     272
                                                                                                                dpt     66.16   -58     282
                                                                                                                msv     62.36   7       292
                                                                                                                tos     68.55   86      299
                                                                                                                lhk     62.35   -81     334
                                                                                                                mrb     63.38   10      466
                                                                                                                tra     68.14   -22     677

Le groupe 67 des "autres" bactéries aux taux >4GC moyens[modifier | modifier le wikicode]

                                Groupe 67 bactéries sous l’aléa >4AT                                            KEGG    %GC     >4GC%  >4AT%
                                                                                                                esa     56.77   -84     304
KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA                     KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA                     aba     58.38   -81     72
bae     43.22   5.04    74.05   4,168,266               ent     52.98   5.52    32.12   4,518,712               pst     58.40   -80     183
sect    43.29   7.15    61.10   1,441,139               apt     53.04   13.58   34.96   2,907,495               pge     59.11   -77     332
aae     43.48   7.94    62.53   1,551,335               pam     53.69   5.97    32.22   4,703,373               ksa     53.74   -76     245
bsu     43.51   4.90    72.57   4,215,606               eta     53.73   9.30    32.52   3,883,467               bmf1    57.16   -75     164
men     43.52   3.46    41.37   538,294                 ksa     53.74   4.99    34.67   4,902,024               bmf2    57.34   -73     156
ral     44.21   4.06    43.28   3,685,408               cgl     53.81   7.78    19.72   3,309,401               ebf     54.02   -72     207
clo     44.21   5.27    60.99   1,809,746               cko     53.83   7.00    31.57   4,720,462               cnt     55.10   -71     242
lpl     44.47   5.84    36.53   3,308,273               ebf     54.02   5.79    30.02   4,762,179               ent     52.98   -71     195
xbo     44.97   7.44    51.50   4,225,498               cgq     54.15   7.81    19.17   3,145,677               pam     53.69   -71     218
ppm     45.24   6.76    43.58   5,728,392               dda     55.02   9.77    29.59   4,679,450               ecla    55.18   -67     228
pfq     45.38   5.78    41.71   4,094,629               eno     55.07   8.01    28.21   4,726,582               koy     55.92   -67     281
ppoy    45.51   6.74    42.70   5,597,590               spe     55.07   8.85    26.24   5,448,853               kpn     57.48   -66     281
tma     46.25   6.70    49.16   1,860,725               cnt     55.10   6.62    29.88   4,876,443               ror     55.88   -66     257
sbn     46.28   3.78    37.32   5,347,283               ecla    55.18   7.54    28.38   4,633,407               cko     53.83   -66     216
ypg     47.60   11.88   38.49   4,504,254               eha     55.56   8.78    42.99   3,008,576               sbo     51.21   -66     170
ype     47.64   11.87   38.12   4,653,728               ror     55.88   8.26    28.72   5,398,151               eco     50.79   -65     167
amo     47.97   11.46   41.77   2,160,700               koy     55.92   8.16    30.51   5,914,407               eno     55.07   -65     222
pgi     48.29   7.57    33.46   2,343,476               pes     56.06   11.34   31.92   4,513,140               raq     52.12   -65     189
rho     48.50   5.02    46.76   3,592,125               ebt     56.51   21.58   29.86   4,158,725               sfl     50.89   -64     167
cpb     48.93   7.96    51.36   2,736,403               say     56.76   22.08   27.19   3,551,206               stm     52.22   -63     223
hav     48.99   5.48    37.06   4,712,721               sap     56.76   22.12   27.21   3,472,898               eha     55.56   -63     417
eal     49.70   5.97    38.99   4,701,875               esa     56.77   4.23    29.49   4,368,373               cgq     54.15   -63     99
ecs     50.54   6.22    38.21   5,498,450               bmf1    57.16   6.69    18.51   2,121,359               spq     52.11   -63     219
eco     50.79   5.42    36.04   4,641,652               bmf2    57.34   7.60    17.57   1,156,948               sbn     46.28   -63     83
sfo     50.88   11.13   32.79   5,488,183               eic     57.44   14.25   23.22   3,812,301               eca     50.97   -63     153
sfl     50.89   5.68    35.71   4,607,202               kpn     57.48   9.41    25.79   5,315,120               cgl     53.81   -62     97
eca     50.97   5.96    33.59   5,064,019               pdo     58.31   25.33   12.90   1,890,857               dba     58.65   -62     401
sbo     51.21   5.60    35.02   4,519,823               aba     58.38   5.60    10.51   5,650,368               spe     55.07   -61     199
sbz     51.34   7.27    39.06   4,683,551               pst     58.40   6.15    17.25   6,397,126               sty     52.09   -61     218
sty     52.09   6.84    37.77   4,809,037               dba     58.65   11.78   29.73   3,942,657               rho     48.50   -60     179
spq     52.11   6.60    37.89   4,858,887               pge     59.11   7.20    24.37   5,489,680               ecs     50.54   -59     176
raq     52.12   6.27    34.30   4,861,101               pgd     59.62   14.95   11.99   3,776,653               hav     48.99   -58     131
stm     52.22   6.55    37.92   4,857,432                                                                       eal     49.70   -58     160
kin     52.75   8.87    34.47   5,529,134               moy     52      8.5     35      4,070,018               dda     55.02   -57     236
tpas    52.79   17.47   41.05   1,139,203               ecart   5       5       13      1,332,214               sbz     51.34   -56     205
                                                        %       9       53      35      33                      pgd     59.62   -55     126
                                                                                                                pes     56.06   -54     305
                                                                                                                eta     53.73   -54     223
                                                                                                                men     43.52   -54     60
                                                                                                                kin     52.75   -53     210
                                                                                                                ral     44.21   -50     77
                                                                                                                eic     57.44   -49     242
                                                                                                                cpb     48.93   -39     219
                                                                                                                pgi     48.29   -39     96
                                                                                                                pfq     45.38   -37     89
                                                                                                                clo     44.21   -35     150
                                                                                                                bsu     43.51   -35     180
                                                                                                                tma     46.25   -33     140
                                                                                                                bae     43.22   -31     179
                                                                                                                lpl     44.47   -30     53
                                                                                                                sfo     50.88   -29     145
                                                                                                                apt     53.04   -29     223
                                                                                                                ppoy    45.51   -28     95
                                                                                                                ppm     45.24   -25     95
                                                                                                                ebt     56.51   -16     297
                                                                                                                say     56.76   -16     272
                                                                                                                sap     56.76   -16     272
                                                                                                                xbo     44.97   -16     125
                                                                                                                pdo     58.31   -15     109
                                                                                                                tpas    52.79   -7      270
                                                                                                                amo     47.97   -4      137
                                                                                                                sect    43.29   -3      132
                                                                                                                ype     47.64   3       110
                                                                                                                ypg     47.60   3       112
                                                                                                                aae     43.48   5       141

Groupes des autre-bactéries selon le taux de >4GC[modifier | modifier le wikicode]

Groupes 2 7[modifier | modifier le wikicode]

  • Groupages couplés aux écarts relatifs à l'aléa
Groupe 2: 38 bactéries >4GC 0.8-4.4 %00                                                Groupe 7: 74 bactéries >4GC 5-10 %00     
                                                                                                                                
KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA                     KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA                     KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA
rty     28.92   0.82    99.29   1,111,496               tme     31.40   4.81    135.95  1,915,238               ppm     45.24   6.76    43.58   5,728,392
rpw     29.01   0.95    100.42  1,109,804               bsu     43.51   4.90    72.57   4,215,606               sty     52.09   6.84    37.77   4,809,037
rpr     29.00   0.95    100.55  1,111,523               ksa     53.74   4.99    34.67   4,902,024               plu     42.83   6.87    51.05   5,688,987
uur     25.50   1.12    147.16  751,719                 lat     36.32   5.00    89.97   1,190,853               cko     53.83   7.00    31.57   4,720,462
cft     33.21   1.17    122.40  1,800,764               rho     48.50   5.02    46.76   3,592,125               amt     36.82   7.09    70.56   4,929,566
cff     33.31   1.17    121.97  1,773,615               bae     43.22   5.04    74.05   4,168,266               sect    43.29   7.15    61.10   1,441,139
cfv     33.26   1.23    123.39  1,866,009               xcb     64.96   5.23    5.84    5,148,708               pge     59.11   7.20    24.37   5,489,680
buc     26.31   1.36    185.43  640,681                 bmv     68.15   5.25    5.64    3,497,479               psi     41.27   7.21    60.76   4,402,109
tsu     39.16   1.42    123.52  2,731,853               rpa     65.04   5.26    3.01    5,459,213               sbz     51.34   7.27    39.06   4,683,551
rip     28.48   1.43    169.87  574,390                 clo     44.21   5.27    60.99   1,809,746               smx     62.65   7.31    6.91    3,908,022
ljf     34.49   1.49    83.08   1,755,993               eco     50.79   5.42    36.04   4,641,652               smk     62.67   7.36    6.95    3,820,344
fnc     27.12   1.73    144.60  2,268,272               chp     39.06   5.45    68.85   1,171,660               xbo     44.97   7.44    51.50   4,225,498
sep     32.10   1.77    76.43   2,499,279               hav     48.99   5.48    37.06   4,712,721               pae     66.56   7.48    4.45    6,264,404
gva     42.02   1.77    45.95   1,617,545               ent     52.98   5.52    32.12   4,518,712               ecla    55.18   7.54    28.38   4,633,407
sepp    32.12   1.78    75.40   2,490,012               sbo     51.21   5.60    35.02   4,519,823               pgi     48.29   7.57    33.46   2,343,476
ser     32.15   1.82    75.39   2,616,530               aba     58.38   5.60    10.51   5,650,368               bmf2    57.34   7.60    17.57   1,156,948
cjr     30.31   2.05    162.10  1,777,831               sfl     50.89   5.68    35.71   4,607,202               lhk     62.35   7.75    16.77   3,169,329
rri     32.47   2.09    93.01   1,257,710               xac     64.77   5.72    5.59    5,175,554               cgl     53.81   7.78    19.72   3,309,401
cdf     29.06   2.14    100.84  4,290,252               pfq     45.38   5.78    41.71   4,094,629               cgq     54.15   7.81    19.17   3,145,677
cje     30.55   2.14    160.17  1,641,481               ebf     54.02   5.79    30.02   4,762,179               aae     43.48   7.94    62.53   1,551,335
ple     26.17   2.15    143.87  358,242                 lpl     44.47   5.84    36.53   3,308,273               bla     60.49   7.94    4.13    1,933,695
bpn     29.56   2.26    105.27  791,654                 ctr     41.31   5.93    65.75   1,042,519               cpb     48.93   7.96    51.36   2,736,403
cad     29.93   2.36    87.91   3,105,335               eca     50.97   5.96    33.59   5,064,019               eno     55.07   8.01    28.21   4,726,582
asf     28.26   2.46    94.96   1,620,005               eal     49.70   5.97    38.99   4,701,875               koy     55.92   8.16    30.51   5,914,407
cac     30.93   2.49    95.73   3,940,880               pam     53.69   5.97    32.22   4,703,373               ror     55.88   8.26    28.72   5,398,151
lla     35.33   2.60    102.02  2,365,589               ret     61.27   6.02    9.09    4,381,608               rer     62.31   8.50    2.22    6,516,310
cpy     35.35   2.63    64.82   4,847,594               cta     41.30   6.02    65.49   1,044,459               eha     55.56   8.78    42.99   3,008,576
liv     37.13   2.70    90.41   2,928,879               pmr     38.90   6.12    68.33   4,063,606               cmn     40.34   8.81    74.88   1,072,952
spi     38.32   2.94    80.21   1,937,111               pst     58.40   6.15    17.25   6,397,126               spe     55.07   8.85    26.24   5,448,853
spl     39.09   2.96    63.32   1,796,846               ecs     50.54   6.22    38.21   5,498,450               kin     52.75   8.87    34.47   5,529,134
cbl     28.31   3.00    111.65  3,992,906               raq     52.12   6.27    34.30   4,861,101               cbd     42.44   9.01    84.09   2,158,758
men     43.52   3.46    41.37   538,294                 blo     60.12   6.49    5.75    2,256,640               eta     53.73   9.30    32.52   3,883,467
sbn     46.28   3.78    37.32   5,347,283               cvi     64.83   6.49    9.94    4,751,080               kpn     57.48   9.41    25.79   5,315,120
cle     34.32   3.89    70.51   4,714,237               stm     52.22   6.55    37.92   4,857,432               sus     61.90   9.66    7.51    9,965,640
tde     37.87   4.02    126.87  2,843,201               spq     52.11   6.60    37.89   4,858,887               dda     55.02   9.77    29.59   4,679,450
ral     44.21   4.06    43.28   3,685,408               cnt     55.10   6.62    29.88   4,876,443                                               
esa     56.77   4.23    29.49   4,368,373               bmf1    57.16   6.69    18.51   2,121,359               moy     52      6.8     37      4,104,170
cth     38.99   4.42    81.59   3,843,301               tma     46.25   6.70    49.16   1,860,725               ecart   8       1       24      1,639,023
                                                        ppoy    45.51   6.74    42.70   5,597,590               %       16      19      66      40
moy     34      2.3     100     2,334,524                                                                                               
ecart   7       1       38      1,345,668                                                                                               
%       19      44      38      58                                                                                              
  • Groupage avec hypothèse de la résonance
                                        Groupe G7 A39   n=80                                                    Groupe G2 A158  n=22            
                                                                                                                                
KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA                     KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA                     KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA
tme     31.40   4.81    135.95  1,915,238               raq     52.12   6.27    34.30   4,861,101               zin     13.54   0.82    295.48  208,564
cle     34.32   3.89    70.51   4,714,237               stm     52.22   6.55    37.92   4,857,432               cru     13.98   0.37    330.82  162,589
lat     36.32   5.00    89.97   1,190,853               kin     52.75   8.87    34.47   5,529,134               crp     16.56   0.25    282.78  159,662
amt     36.82   7.09    70.56   4,929,566               ent     52.98   5.52    32.12   4,518,712               wbr     22.48   0.92    208.59  697,724
tde     37.87   4.02    126.87  2,843,201               pam     53.69   5.97    32.22   4,703,373               mcac    23.66   0.64    164.01  1,017,293
pmr     38.90   6.12    68.33   4,063,606               eta     53.73   9.30    32.52   3,883,467               sms     24.00   3.41    174.13  190,657
cth     38.99   4.42    81.59   3,843,301               ksa     53.74   4.99    34.67   4,902,024               uur     25.50   1.12    147.16  751,719
chp     39.06   5.45    68.85   1,171,660               cgl     53.81   7.78    19.72   3,309,401               ple     26.17   2.15    143.87  358,242
cmn     40.34   8.81    74.88   1,072,952               cko     53.83   7.00    31.57   4,720,462               buc     26.31   1.36    185.43  640,681
psi     41.27   7.21    60.76   4,402,109               ebf     54.02   5.79    30.02   4,762,179               fnc     27.12   1.73    144.60  2,268,272
cta     41.30   6.02    65.49   1,044,459               cgq     54.15   7.81    19.17   3,145,677               asf     28.26   2.46    94.96   1,620,005
ctr     41.31   5.93    65.75   1,042,519               dda     55.02   9.77    29.59   4,679,450               cbl     28.31   3.00    111.65  3,992,906
cbd     42.44   9.01    84.09   2,158,758               eno     55.07   8.01    28.21   4,726,582               rip     28.48   1.43    169.87  574,390
plu     42.83   6.87    51.05   5,688,987               spe     55.07   8.85    26.24   5,448,853               rty     28.92   0.82    99.29   1,111,496
bae     43.22   5.04    74.05   4,168,266               cnt     55.10   6.62    29.88   4,876,443               rpr     29.00   0.95    100.55  1,111,523
sect    43.29   7.15    61.10   1,441,139               ecla    55.18   7.54    28.38   4,633,407               rpw     29.01   0.95    100.42  1,109,804
aae     43.48   7.94    62.53   1,551,335               eha     55.56   8.78    42.99   3,008,576               cdf     29.06   2.14    100.84  4,290,252
bsu     43.51   4.90    72.57   4,215,606               ror     55.88   8.26    28.72   5,398,151               bpn     29.56   2.26    105.27  791,654
ral     44.21   4.06    43.28   3,685,408               koy     55.92   8.16    30.51   5,914,407               cad     29.93   2.36    87.91   3,105,335
clo     44.21   5.27    60.99   1,809,746               esa     56.77   4.23    29.49   4,368,373               cjr     30.31   2.05    162.10  1,777,831
lpl     44.47   5.84    36.53   3,308,273               bmf1    57.16   6.69    18.51   2,121,359               cje     30.55   2.14    160.17  1,641,481
xbo     44.97   7.44    51.50   4,225,498               bmf2    57.34   7.60    17.57   1,156,948               cac     30.93   2.49    95.73   3,940,880
ppm     45.24   6.76    43.58   5,728,392               kpn     57.48   9.41    25.79   5,315,120                                               
pfq     45.38   5.78    41.71   4,094,629               aba     58.38   5.60    10.51   5,650,368               moy     26      1.6     158     1,432,862
ppoy    45.51   6.74    42.70   5,597,590               pst     58.40   6.15    17.25   6,397,126               ecart   5       0.9     69      1,298,284
tma     46.25   6.70    49.16   1,860,725               pge     59.11   7.20    24.37   5,489,680               %       20      55      43      91
sbn     46.28   3.78    37.32   5,347,283               blo     60.12   6.49    5.75    2,256,640                                               
pgi     48.29   7.57    33.46   2,343,476               bla     60.49   7.94    4.13    1,933,695                       Groupe G2 A86   n=16            
rho     48.50   5.02    46.76   3,592,125               ret     61.27   6.02    9.09    4,381,608                                               
cpb     48.93   7.96    51.36   2,736,403               sus     61.90   9.66    7.51    9,965,640               KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA
hav     48.99   5.48    37.06   4,712,721               rer     62.31   8.50    2.22    6,516,310               sep     32.10   1.77    76.43   2,499,279
eal     49.70   5.97    38.99   4,701,875               lhk     62.35   7.75    16.77   3,169,329               sepp    32.12   1.78    75.40   2,490,012
ecs     50.54   6.22    38.21   5,498,450               smx     62.65   7.31    6.91    3,908,022               ser     32.15   1.82    75.39   2,616,530
eco     50.79   5.42    36.04   4,641,652               smk     62.67   7.36    6.95    3,820,344               rri     32.47   2.09    93.01   1,257,710
sfl     50.89   5.68    35.71   4,607,202               xac     64.77   5.72    5.59    5,175,554               cft     33.21   1.17    122.40  1,800,764
eca     50.97   5.96    33.59   5,064,019               cvi     64.83   6.49    9.94    4,751,080               cfv     33.26   1.23    123.39  1,866,009
sbo     51.21   5.60    35.02   4,519,823               xcb     64.96   5.23    5.84    5,148,708               cff     33.31   1.17    121.97  1,773,615
sbz     51.34   7.27    39.06   4,683,551               rpa     65.04   5.26    3.01    5,459,213               ljf     34.49   1.49    83.08   1,755,993
sty     52.09   6.84    37.77   4,809,037               pae     66.56   7.48    4.45    6,264,404               lla     35.33   2.60    102.02  2,365,589
spq     52.11   6.60    37.89   4,858,887               bmv     68.15   5.25    5.64    3,497,479               cpy     35.35   2.63    64.82   4,847,594
                                                                                                                liv     37.13   2.70    90.41   2,928,879
                                                        moy     51      6.6     39      4,106,380               spi     38.32   2.94    80.21   1,937,111
                                                        ecart   8       1.4     26      1,590,826               spl     39.09   2.96    63.32   1,796,846
                                                        %       16      20      69      39                      tsu     39.16   1.42    123.52  2,731,853
                                                                                                                gva     42.02   1.77    45.95   1,617,545
                                                                                                                men     43.52   3.46    41.37   538,294
                                                                                                                                
                                                                                                                moy     36      2.1     86      2,176,476
                                                                                                                ecart   4       0.7     27      933,080
                                                                                                                %       10      35      31      43

Groupes 14 25 68[modifier | modifier le wikicode]

  • Groupages couplés aux écarts relatifs à l'aléa
Groupe 14: 31 bactéries >4GC 11-18 %00                  Groupe 25: 31 bactéries >4GC 21-33 %00                          
                                                                                
KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA                     KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA
gba     72.56   10.82   0.26    5,311,527               scl     71.38   20.94   1.22    13,033,779
gau     64.27   11.05   3.56    4,636,964               mxa     68.89   21.48   1.02    9,139,763
sfo     50.88   11.13   32.79   5,488,183               gdi     66.43   21.58   6.03    3,944,163
pes     56.06   11.34   31.92   4,513,140               ebt     56.51   21.58   29.86   4,158,725
dpd     63.97   11.35   9.43    3,881,839               say     56.76   22.08   27.19   3,551,206
amo     47.97   11.46   41.77   2,160,700               fra     70.08   22.11   1.39    5,433,628
ppk     64.72   11.67   5.63    5,429,298               sap     56.76   22.12   27.21   3,472,898
asd     62.24   11.70   3.38    4,738,809               afw     73.53   22.17   0.33    5,277,990
dba     58.65   11.78   29.73   3,942,657               ccx     69.90   22.32   0.87    10,080,619
ype     47.64   11.87   38.12   4,653,728               dpt     66.16   22.44   9.20    2,147,060
ypg     47.60   11.88   38.49   4,504,254               sma     70.72   23.65   0.69    9,025,608
tro     63.65   11.88   3.15    2,003,006               sco     72.12   24.50   0.45    8,667,507
ams     70.82   12.31   0.88    8,773,466               dvl     63.01   24.57   4.99    3,462,887
amd     71.29   13.55   0.82    10,236,715              sho     72.04   24.73   0.47    9,840,102
apt     53.04   13.58   34.96   2,907,495               phm     73.29   24.86   0.59    3,803,225
req     68.82   14.04   0.42    5,043,170               mts     70.28   25.31   0.48    3,982,034
eic     57.44   14.25   23.22   3,812,301               pdo     58.31   25.33   12.90   1,890,857
nfa     70.83   14.30   0.46    6,021,225               sbh     70.75   25.40   0.84    11,936,683
roa     67.37   14.36   0.74    8,376,953               ipa     62.44   25.63   6.40    5,472,964
pgd     59.62   14.95   11.99   3,776,653               saci    62.27   26.08   8.25    9,629,675
rha     67.52   15.01   0.78    7,804,765               ssx     71.75   26.55   0.53    7,414,440
pac     60.01   15.05   5.45    2,560,265               salu    72.32   26.75   0.66    9,360,281
pak     60.10   15.11   5.39    2,495,334               sall    72.13   27.12   0.69    9,784,577
ddr     63.39   16.30   8.09    2,819,842               dge     66.64   27.98   7.14    2,467,205
ade     74.91   16.35   0.28    5,013,479               age     69.45   28.18   0.97    12,489,432
acp     74.72   16.38   0.27    5,029,329               rru     65.45   28.23   9.81    4,352,825
ank     74.84   16.52   0.25    5,061,632               scb     71.45   28.28   0.59    10,148,695
vin     68.94   16.63   1.72    4,350,553               ksk     74.20   28.47   0.38    8,783,278
sti     68.10   16.79   0.79    2,741,033               sct     72.94   28.63   0.53    6,283,062
cmi     72.66   16.98   0.40    3,297,891               sgr     72.23   30.32   0.46    8,545,929
tpas    52.79   17.47   41.05   1,139,203               salb    73.32   33.42   0.46    6,841,649
                                                                                
moy     63      13.8    12      4,597,594               moy     68      25.3    5       6,916,863
ecart   8       2       15      2,043,599               ecart   5       3       8       3,238,795
%       13      16      126     44                      %       8       12      159     47
                                                                                
                                                                                
Groupe 68: 12 bactéries >4GC 38-116 %00                                                                         
                                                                                
KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA                                          
sur     67.46   38.05   2.45    10,260,756                                              
opr     70.02   40.26   3.65    2,303,940                                               
msv     62.36   43.71   15.11   3,249,394                                               
tra     68.14   47.06   14.34   3,260,398                                               
mrb     63.38   48.09   19.32   3,097,457                                               
mhd     68.08   51.08   6.66    2,269,167                                               
tsc     64.89   70.97   10.09   2,346,803                                               
tai     63.79   82.29   3.86    1,848,474                                               
tts     68.92   93.39   5.31    1,863,201                                               
ttl     69.09   94.77   4.71    1,902,595                                               
tth     69.44   95.48   4.44    1,894,877                                               
tos     68.55   116.27  6.94    2,072,393                                               
                                                                                
moy     67      68      8       3,030,788                                               
ecart   3       27      5       2,339,315                                               
%       4       39      67      77                                              
  • Groupage avec hypothèse de la résonance
G14,A1          n=13                                    G25,A1          n=20                                    G7,Ar           n=53    
                                                                                                                                
KEGG    %GC     >4GC14  >4AT    DNA                     KEGG    %GC     >4GC25  >4AT    DNA                     KEGG    %GC     >4GCr   >4ATr   DNA
acp     74.72   16.38   0.27    5,029,329               afw     73.53   22.17   0.33    5,277,990               aba     58.38   5.60    10.51   5,650,368
ade     74.91   16.35   0.28    5,013,479               age     69.45   28.18   0.97    12,489,432              bla     60.49   7.94    4.13    1,933,695
amd     71.29   13.55   0.82    10,236,715              ccx     69.90   22.32   0.87    10,080,619              blo     60.12   6.49    5.75    2,256,640
ams     70.82   12.31   0.88    8,773,466               fra     70.08   22.11   1.39    5,433,628               bmf1    57.16   6.69    18.51   2,121,359
ank     74.84   16.52   0.25    5,061,632               ksk     74.20   28.47   0.38    8,783,278               bmf2    57.34   7.60    17.57   1,156,948
cmi     72.66   16.98   0.40    3,297,891               mts     70.28   25.31   0.48    3,982,034               bmv     68.15   5.25    5.64    3,497,479
gba     72.56   10.82   0.26    5,311,527               mxa     68.89   21.48   1.02    9,139,763               cgl     53.81   7.78    19.72   3,309,401
nfa     70.83   14.30   0.46    6,021,225               phm     73.29   24.86   0.59    3,803,225               cgq     54.15   7.81    19.17   3,145,677
req     68.82   14.04   0.42    5,043,170               salb    73.32   33.42   0.46    6,841,649               cko     53.83   7.00    31.57   4,720,462
rha     67.52   15.01   0.78    7,804,765               sall    72.13   27.12   0.69    9,784,577               cnt     55.10   6.62    29.88   4,876,443
roa     67.37   14.36   0.74    8,376,953               salu    72.32   26.75   0.66    9,360,281               cpb     48.93   7.96    51.36   2,736,403
sti     68.10   16.79   0.79    2,741,033               sbh     70.75   25.40   0.84    11,936,683              cvi     64.83   6.49    9.94    4,751,080
vin     68.94   16.63   1.72    4,350,553               scb     71.45   28.28   0.59    10,148,695              dda     55.02   9.77    29.59   4,679,450
                                                        scl     71.38   20.94   1.22    13,033,779              eal     49.70   5.97    38.99   4,701,875
moy     71      14.9    0.62    5,927,826               sco     72.12   24.50   0.45    8,667,507               ebf     54.02   5.79    30.02   4,762,179
ecart   3       1.9     0.41    2,22,3175               sct     72.94   28.63   0.53    6,283,062               eca     50.97   5.96    33.59   5,064,019
%       4       13      66      38                      sgr     72.23   30.32   0.46    8,545,929               ecla    55.18   7.54    28.38   4,633,407
                                                        sho     72.04   24.73   0.47    9,840,102               eco     50.79   5.42    36.04   4,641,652
G14,Ar          n=18                                    sma     70.72   23.65   0.69    9,025,608               ecs     50.54   6.22    38.21   5,498,450
                                                        ssx     71.75   26.55   0.53    7,414,440               eha     55.56   8.78    42.99   3,008,576
KEGG    %GC     >4GC14  >4AT    DNA                                                                             eno     55.07   8.01    28.21   4,726,582
amo     47.97   11.46   41.77   2,160,700               moy     72      26      0.68    8493614.05              ent     52.98   5.52    32.12   4,518,712
apt     53.04   13.58   34.96   2,907,495               ecart   1       3       0.29    2611496.81              esa     56.77   4.23    29.49   4,368,373
asd     62.24   11.70   3.38    4,738,809               %       2       13      42      31                      eta     53.73   9.30    32.52   3,883,467
dba     58.65   11.78   29.73   3,942,657                                                                       hav     48.99   5.48    37.06   4,712,721
ddr     63.39   16.30   8.09    2,819,842               G25,Ar          n=11                                    kin     52.75   8.87    34.47   5,529,134
dpd     63.97   11.35   9.43    3,881,839                                                                       koy     55.92   8.16    30.51   5,914,407
eic     57.44   14.25   23.22   3,812,301               KEGG    %GC     >4GC25  >4AT    DNA                     kpn     57.48   9.41    25.79   5,315,120
gau     64.27   11.05   3.56    4,636,964               dge     66.64   27.98   7.14    2,467,205               ksa     53.74   4.99    34.67   4,902,024
pac     60.01   15.05   5.45    2,560,265               dpt     66.16   22.44   9.20    2,147,060               lhk     62.35   7.75    16.77   3,169,329
pak     60.10   15.11   5.39    2,495,334               dvl     63.01   24.57   4.99    3,462,887               pae     66.56   7.48    4.45    6,264,404
pes     56.06   11.34   31.92   4,513,140               ebt     56.51   21.58   29.86   4,158,725               pam     53.69   5.97    32.22   4,703,373
pgd     59.62   14.95   11.99   3,776,653               gdi     66.43   21.58   6.03    3,944,163               pge     59.11   7.20    24.37   5,489,680
ppk     64.72   11.67   5.63    5,429,298               ipa     62.44   25.63   6.40    5,472,964               pgi     48.29   7.57    33.46   2,343,476
sfo     50.88   11.13   32.79   5,488,183               pdo     58.31   25.33   12.90   1,890,857               pst     58.40   6.15    17.25   6,397,126
tpas    52.79   17.47   41.05   1,139,203               rru     65.45   28.23   9.81    4,352,825               raq     52.12   6.27    34.30   4,861,101
tro     63.65   11.88   3.15    2,003,006               saci    62.27   26.08   8.25    9,629,675               rer     62.31   8.50    2.22    6,516,310
ype     47.64   11.87   38.12   4,653,728               sap     56.76   22.12   27.21   3,472,898               ret     61.27   6.02    9.09    4,381,608
ypg     47.60   11.88   38.49   4,504,254               say     56.76   22.08   27.19   3,551,206               rho     48.50   5.02    46.76   3,592,125
                                                                                                                ror     55.88   8.26    28.72   5,398,151
moy     57      13      20      3,636,871               moy     62      24      14      4,050,042               rpa     65.04   5.26    3.01    5,459,213
ecart   6       2       15      1,245,257               ecart   4       3       10      2,121,018               sbo     51.21   5.60    35.02   4,519,823
%       11      16      75      34                      %       7       10      71      52                      sbz     51.34   7.27    39.06   4,683,551
                                                                                                                sfl     50.89   5.68    35.71   4,607,202
                                                                                                                smk     62.67   7.36    6.95    3,820,344
                                                                                                                smx     62.65   7.31    6.91    3,908,022
                                                                                                                spe     55.07   8.85    26.24   5,448,853
                                                                                                                spq     52.11   6.60    37.89   4,858,887
                                                                                                                stm     52.22   6.55    37.92   4,857,432
                                                                                                                sty     52.09   6.84    37.77   4,809,037
                                                                                                                sus     61.90   9.66    7.51    9,965,640
                                                                                                                xac     64.77   5.72    5.59    5,175,554
                                                                                                                xcb     64.96   5.23    5.84    5,148,708
                                                                                                                                
                                                                                                                moy     56      6.9     25      4,554,624
                                                                                                                ecart   5       1.4     13      1,380,587
                                                                                                                %       9       20      53      30

Groupes des autre-bactéries selon le taux de >4AT[modifier | modifier le wikicode]

Groupes I II III[modifier | modifier le wikicode]

Groupe III: 56 bactéries >4AT 23−52 %00         Groupe II: 47 bactéries >4AT 3−20 %00                   Groupe I: 35 bactéries >4AT 0.3−2.5 %00
                                                                                                                                
KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA                     KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA                     KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA
xbo     44.97   7.44    51.50   4,225,498               cgl     53.81   7.78    19.72   3,309,401               sur     67.46   38.05   2.45    10,260,756
cpb     48.93   7.96    51.36   2,736,403               mrb     63.38   48.09   19.32   3,097,457               rer     62.31   8.50    2.22    6,516,310
plu     42.83   6.87    51.05   5,688,987               cgq     54.15   7.81    19.17   3,145,677               vin     68.94   16.63   1.72    4,350,553
tma     46.25   6.70    49.16   1,860,725               bmf1    57.16   6.69    18.51   2,121,359               fra     70.08   22.11   1.39    5,433,628
rho     48.50   5.02    46.76   3,592,125               bmf2    57.34   7.60    17.57   1,156,948               scl     71.38   20.94   1.22    13,033,779
gva     42.02   1.77    45.95   1,617,545               pst     58.40   6.15    17.25   6,397,126               mxa     68.89   21.48   1.02    9,139,763
ppm     45.24   6.76    43.58   5,728,392               lhk     62.35   7.75    16.77   3,169,329               age     69.45   28.18   0.97    12,489,432
ral     44.21   4.06    43.28   3,685,408               msv     62.36   43.71   15.11   3,249,394               ams     70.82   12.31   0.88    8,773,466
eha     55.56   8.78    42.99   3,008,576               tra     68.14   47.06   14.34   3,260,398               ccx     69.90   22.32   0.87    10,080,619
ppoy    45.51   6.74    42.70   5,597,590               pdo     58.31   25.33   12.90   1,890,857               sbh     70.75   25.40   0.84    11,936,683
amo     47.97   11.46   41.77   2,160,700               pgd     59.62   14.95   11.99   3,776,653               amd     71.29   13.55   0.82    10,236,715
pfq     45.38   5.78    41.71   4,094,629               aba     58.38   5.60    10.51   5,650,368               sti     68.10   16.79   0.79    2,741,033
men     43.52   3.46    41.37   538,294                 tsc     64.89   70.97   10.09   2,346,803               rha     67.52   15.01   0.78    7,804,765
tpas    52.79   17.47   41.05   1,139,203               cvi     64.83   6.49    9.94    4,751,080               roa     67.37   14.36   0.74    8,376,953
sbz     51.34   7.27    39.06   4,683,551               rru     65.45   28.23   9.81    4,352,825               sma     70.72   23.65   0.69    9,025,608
eal     49.70   5.97    38.99   4,701,875               dpd     63.97   11.35   9.43    3,881,839               sall    72.13   27.12   0.69    9,784,577
ypg     47.60   11.88   38.49   4,504,254               dpt     66.16   22.44   9.20    2,147,060               salu    72.32   26.75   0.66    9,360,281
ecs     50.54   6.22    38.21   5,498,450               ret     61.27   6.02    9.09    4,381,608               phm     73.29   24.86   0.59    3,803,225
ype     47.64   11.87   38.12   4,653,728               saci    62.27   26.08   8.25    9,629,675               scb     71.45   28.28   0.59    10,148,695
stm     52.22   6.55    37.92   4,857,432               ddr     63.39   16.30   8.09    2,819,842               ssx     71.75   26.55   0.53    7,414,440
spq     52.11   6.60    37.89   4,858,887               sus     61.90   9.66    7.51    9,965,640               sct     72.94   28.63   0.53    6,283,062
sty     52.09   6.84    37.77   4,809,037               dge     66.64   27.98   7.14    2,467,205               mts     70.28   25.31   0.48    3,982,034
sbn     46.28   3.78    37.32   5,347,283               smk     62.67   7.36    6.95    3,820,344               sho     72.04   24.73   0.47    9,840,102
hav     48.99   5.48    37.06   4,712,721               tos     68.55   116.27  6.94    2,072,393               nfa     70.83   14.30   0.46    6,021,225
lpl     44.47   5.84    36.53   3,308,273               smx     62.65   7.31    6.91    3,908,022               sgr     72.23   30.32   0.46    8,545,929
eco     50.79   5.42    36.04   4,641,652               mhd     68.08   51.08   6.66    2,269,167               salb    73.32   33.42   0.46    6,841,649
sfl     50.89   5.68    35.71   4,607,202               ipa     62.44   25.63   6.40    5,472,964               sco     72.12   24.50   0.45    8,667,507
sbo     51.21   5.60    35.02   4,519,823               gdi     66.43   21.58   6.03    3,944,163               req     68.82   14.04   0.42    5,043,170
apt     53.04   13.58   34.96   2,907,495               xcb     64.96   5.23    5.84    5,148,708               cmi     72.66   16.98   0.40    3,297,891
ksa     53.74   4.99    34.67   4,902,024               blo     60.12   6.49    5.75    2,256,640               ksk     74.20   28.47   0.38    8,783,278
kin     52.75   8.87    34.47   5,529,134               bmv     68.15   5.25    5.64    3,497,479               afw     73.53   22.17   0.33    5,277,990
raq     52.12   6.27    34.30   4,861,101               ppk     64.72   11.67   5.63    5,429,298               ade     74.91   16.35   0.28    5,013,479
eca     50.97   5.96    33.59   5,064,019               xac     64.77   5.72    5.59    5,175,554               acp     74.72   16.38   0.27    5,029,329
pgi     48.29   7.57    33.46   2,343,476               pac     60.01   15.05   5.45    2,560,265               gba     72.56   10.82   0.26    5,311,527
sfo     50.88   11.13   32.79   5,488,183               pak     60.10   15.11   5.39    2,495,334               ank     74.84   16.52   0.25    5,061,632
eta     53.73   9.30    32.52   3,883,467               tts     68.92   93.39   5.31    1,863,201                                               
pam     53.69   5.97    32.22   4,703,373               dvl     63.01   24.57   4.99    3,462,887               moyen.  71      22      1       7,534,602
ent     52.98   5.52    32.12   4,518,712               ttl     69.09   94.77   4.71    1,902,595               ecartt  3       7       1       2,707,907
pes     56.06   11.34   31.92   4,513,140               pae     66.56   7.48    4.45    6,264,404               %       4       32      68      36
cko     53.83   7.00    31.57   4,720,462               tth     69.44   95.48   4.44    1,894,877                                               
koy     55.92   8.16    30.51   5,914,407               bla     60.49   7.94    4.13    1,933,695                                               
ebf     54.02   5.79    30.02   4,762,179               tai     63.79   82.29   3.86    1,848,474                                               
cnt     55.10   6.62    29.88   4,876,443               opr     70.02   40.26   3.65    2,303,940                                               
ebt     56.51   21.58   29.86   4,158,725               gau     64.27   11.05   3.56    4,636,964                                               
dba     58.65   11.78   29.73   3,942,657               asd     62.24   11.70   3.38    4,738,809                                               
dda     55.02   9.77    29.59   4,679,450               tro     63.65   11.88   3.15    2,003,006                                               
esa     56.77   4.23    29.49   4,368,373               rpa     65.04   5.26    3.01    5,459,213                                               
ror     55.88   8.26    28.72   5,398,151                                                                                               
ecla    55.18   7.54    28.38   4,633,407               moyen.  63      26      9       3,687,892                                               
eno     55.07   8.01    28.21   4,726,582               ecartt  4       29      5       1,869,769                                               
sap     56.76   22.12   27.21   3,472,898               %       6       110     57      51                                              
say     56.76   22.08   27.19   3,551,206                                                                                               
spe     55.07   8.85    26.24   5,448,853                                                                                               
kpn     57.48   9.41    25.79   5,315,120                                                                                               
pge     59.11   7.20    24.37   5,489,680                                                                                               
eic     57.44   14.25   23.22   3,812,301                                                                                               
                                                                                                                                
moyen.  51      8       36      4,274,344                                                                                               
ecartt  4       4       7       1,195,261                                                                                               
%       9       52      19      28                                                                                              

Groupes IV V[modifier | modifier le wikicode]

Groupe IV: 35 bactéries >4AT 61−112 %00                 Groupe V: 19 bactéries >4AT 122−330 %00 
                                                                                
KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA                     KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA
cbl     28.31   3.00    111.65  3,992,906               cru     13.98   0.37    330.82  162,589
bpn     29.56   2.26    105.27  791,654                 zin     13.54   0.82    295.48  208,564
lla     35.33   2.60    102.02  2,365,589               crp     16.56   0.25    282.78  159,662
cdf     29.06   2.14    100.84  4,290,252               wbr     22.48   0.92    208.59  697,724
rpr     29.00   0.95    100.55  1,111,523               buc     26.31   1.36    185.43  640,681
rpw     29.01   0.95    100.42  1,109,804               sms     24.00   3.41    174.13  190,657
rty     28.92   0.82    99.29   1,111,496               rip     28.48   1.43    169.87  574,390
cac     30.93   2.49    95.73   3,940,880               mcac    23.66   0.64    164.01  1,017,293
asf     28.26   2.46    94.96   1,620,005               cjr     30.31   2.05    162.10  1,777,831
rri     32.47   2.09    93.01   1,257,710               cje     30.55   2.14    160.17  1,641,481
liv     37.13   2.70    90.41   2,928,879               uur     25.50   1.12    147.16  751,719
lat     36.32   5.00    89.97   1,190,853               fnc     27.12   1.73    144.60  2,268,272
cad     29.93   2.36    87.91   3,105,335               ple     26.17   2.15    143.87  358,242
cbd     42.44   9.01    84.09   2,158,758               tme     31.40   4.81    135.95  1,915,238
ljf     34.49   1.49    83.08   1,755,993               tde     37.87   4.02    126.87  2,843,201
cth     38.99   4.42    81.59   3,843,301               tsu     39.16   1.42    123.52  2,731,853
spi     38.32   2.94    80.21   1,937,111               cfv     33.26   1.23    123.39  1,866,009
sep     32.10   1.77    76.43   2,499,279               cft     33.21   1.17    122.40  1,800,764
sepp    32.12   1.78    75.40   2,490,012               cff     33.31   1.17    121.97  1,773,615
ser     32.15   1.82    75.39   2,616,530                                               
cmn     40.34   8.81    74.88   1,072,952               moyen.  27      2       175     1,230,515
bae     43.22   5.04    74.05   4,168,266               ecartt  7       1       62      894,543
bsu     43.51   4.90    72.57   4,215,606               %       26      71      36      73
amt     36.82   7.09    70.56   4,929,566                                               
cle     34.32   3.89    70.51   4,714,237                                               
chp     39.06   5.45    68.85   1,171,660                                               
pmr     38.90   6.12    68.33   4,063,606                                               
ctr     41.31   5.93    65.75   1,042,519                                               
cta     41.30   6.02    65.49   1,044,459                                               
cpy     35.35   2.63    64.82   4,847,594                                               
spl     39.09   2.96    63.32   1,796,846                                               
aae     43.48   7.94    62.53   1,551,335                                               
sect    43.29   7.15    61.10   1,441,139                                               
clo     44.21   5.27    60.99   1,809,746                                               
psi     41.27   7.21    60.76   4,402,109                                               
                                                                                
moyen.  36      4       81      2,525,415                                               
ecartt  5       2       15      1,358,428                                               
%       15      59      18      54                                              

Autre-bactéries:ruptures entre les groupes à progression homogène[modifier | modifier le wikicode]

                Autre-bactéries:taux >4GC                                       |                       Autre-bactéries:taux >4AT
KEGG    %GC     >4GC    #%    groupe    KEGG    %GC     >4GC    #%   groupe     |       KEGG    %GC     >4AT    #%  groupe      KEGG    %GC     >4AT    #%  groupe
crp     16.56   0.25    47    **2**     ecla    55.18   7.54    0               |       ank     74.84   0.25    1   ** I **     ebf     54.02   30.02   2       
cru     13.98   0.37    73              pgi     48.29   7.57    0               |       gba     72.56   0.26    7               koy     55.92   30.51   3       
mcac    23.66   0.64    28              bmf2    57.34   7.60    2               |       acp     74.72   0.27    3               cko     53.83   31.57   1       
zin     13.54   0.82    0               lhk     62.35   7.75    0               |       ade     74.91   0.28    14              pes     56.06   31.92   1       
rty     28.92   0.82    12              cgl     53.81   7.78    0               |       afw     73.53   0.33    14              ent     52.98   32.12   0       
wbr     22.48   0.92    3               cgq     54.15   7.81    2               |       ksk     74.20   0.38    5               pam     53.69   32.22   1       
rpw     29.01   0.95    1               aae     43.48   7.94    0               |       cmi     72.66   0.40    5               eta     53.73   32.52   1       
rpr     29.00   0.95    17              bla     60.49   7.94    0               |       req     68.82   0.42    6               sfo     50.88   32.79   2       
uur     25.50   1.12    4               cpb     48.93   7.96    1               |       sco     72.12   0.45    2               pgi     48.29   33.46   0       
cft     33.21   1.17    0               eno     55.07   8.01    2               |       salb    73.32   0.46    1               eca     50.97   33.59   2       
cff     33.31   1.17    5               koy     55.92   8.16    1               |       sgr     72.23   0.46    0               raq     52.12   34.30   0       
cfv     33.26   1.23    11              ror     55.88   8.26    3               |       nfa     70.83   0.46    2               kin     52.75   34.47   1       
buc     26.31   1.36    4               rer     62.31   8.50    3               |       sho     72.04   0.47    2               ksa     53.74   34.67   1       
tsu     39.16   1.42    1               eha     55.56   8.78    0               |       mts     70.28   0.48    9               apt     53.04   34.96   0       
rip     28.48   1.43    5               cmn     40.34   8.81    0               |       sct     72.94   0.53    0               sbo     51.21   35.02   2       
ljf     34.49   1.49    16              spe     55.07   8.85    0               |       ssx     71.75   0.53    10              sfl     50.89   35.71   1       
fnc     27.12   1.73    2               kin     52.75   8.87    2               |       scb     71.45   0.59    1               eco     50.79   36.04   1       
sep     32.10   1.77    0               cbd     42.44   9.01    3               |       phm     73.29   0.59    10              lpl     44.47   36.53   1       
gva     42.02   1.77    0               eta     53.73   9.30    1               |       salu    72.32   0.66    3               hav     48.99   37.06   1       
sepp    32.12   1.78    2               kpn     57.48   9.41    3               |       sall    72.13   0.69    1               sbn     46.28   37.32   1       
ser     32.15   1.82    13              sus     61.90   9.66    1               |       sma     70.72   0.69    6               sty     52.09   37.77   0       
cjr     30.31   2.05    2               dda     55.02   9.77    11              |       roa     67.37   0.74    6               spq     52.11   37.89   0       
rri     32.47   2.09    2               gba     72.56   10.82   2   **14**      |       rha     67.52   0.78    1               stm     52.22   37.92   1       
cdf     29.06   2.14    0               gau     64.27   11.05   1               |       sti     68.10   0.79    4               ype     47.64   38.12   0       
cje     30.55   2.14    1               sfo     50.88   11.13   2               |       amd     71.29   0.82    2               ecs     50.54   38.21   1       
ple     26.17   2.15    5               pes     56.06   11.34   0               |       sbh     70.75   0.84    4               ypg     47.60   38.49   1       
bpn     29.56   2.26    4               dpd     63.97   11.35   1               |       ccx     69.90   0.87    2               eal     49.70   38.99   0       
cad     29.93   2.36    4               amo     47.97   11.46   2               |       ams     70.82   0.88    9               sbz     51.34   39.06   5       
asf     28.26   2.46    1               ppk     64.72   11.67   0               |       age     69.45   0.97    5               tpas    52.79   41.05   1       
cac     30.93   2.49    4               asd     62.24   11.70   1               |       mxa     68.89   1.02    17              men     43.52   41.37   1       
lla     35.33   2.60    1               dba     58.65   11.78   1               |       scl     71.38   1.22    12              pfq     45.38   41.71   0       
cpy     35.35   2.63    2               ype     47.64   11.87   0               |       fra     70.08   1.39    19              amo     47.97   41.77   2       
liv     37.13   2.70    9               ypg     47.60   11.88   0               |       vin     68.94   1.72    22              ppoy    45.51   42.70   1       
spi     38.32   2.94    0               tro     63.65   11.88   4               |       rer     62.31   2.22    9               eha     55.56   42.99   1       
spl     39.09   2.96    2               ams     70.82   12.31   10              |       sur     67.46   2.45    19              ral     44.21   43.28   1       
cbl     28.31   3.00    14              amd     71.29   13.55   0               |       rpa     65.04   3.01    4    ** II **   ppm     45.24   43.58   5       
sms     24.00   3.41    1               apt     53.04   13.58   3               |       tro     63.65   3.15    7               gva     42.02   45.95   2       
men     43.52   3.46    9               req     68.82   14.04   1               |       asd     62.24   3.38    5               rho     48.50   46.76   5       
sbn     46.28   3.78    3               eic     57.44   14.25   0               |       gau     64.27   3.56    3               tma     46.25   49.16   4       
cle     34.32   3.89    3               nfa     70.83   14.30   0               |       opr     70.02   3.65    5               plu     42.83   51.05   1       
tde     37.87   4.02    1               roa     67.37   14.36   4               |       tai     63.79   3.86    6               cpb     48.93   51.36   0       
ral     44.21   4.06    4               pgd     59.62   14.95   0               |       bla     60.49   4.13    7               xbo     44.97   51.50   15      
esa     56.77   4.23    4               rha     67.52   15.01   0               |       tth     69.44   4.44    0               psi     41.27   60.76   0  **IV**
cth     38.99   4.42    9               pac     60.01   15.05   0               |       pae     66.56   4.45    6               clo     44.21   60.99   0       
tme     31.40   4.81    2    **7**      pak     60.10   15.11   8               |       ttl     69.09   4.71    6               sect    43.29   61.10   2       
bsu     43.51   4.90    2               ddr     63.39   16.30   0               |       dvl     63.01   4.99    6               aae     43.48   62.53   1       
ksa     53.74   4.99    0               ade     74.91   16.35   0               |       tts     68.92   5.31    1               spl     39.09   63.32   2       
lat     36.32   5.00    0               acp     74.72   16.38   1               |       pak     60.10   5.39    1               cpy     35.35   64.82   1       
rho     48.50   5.02    0               ank     74.84   16.52   1               |       pac     60.01   5.45    3               cta     41.30   65.49   0       
bae     43.22   5.04    4               vin     68.94   16.63   1               |       xac     64.77   5.59    1               ctr     41.31   65.75   4       
xcb     64.96   5.23    0               sti     68.10   16.79   1               |       ppk     64.72   5.63    0               pmr     38.90   68.33   1       
bmv     68.15   5.25    0               cmi     72.66   16.98   3               |       bmv     68.15   5.64    2               chp     39.06   68.85   2       
rpa     65.04   5.26    0               tpas    52.79   17.47   20              |       blo     60.12   5.75    2               cle     34.32   70.51   0       
clo     44.21   5.27    3               scl     71.38   20.94   3    **25**     |       xcb     64.96   5.84    3               amt     36.82   70.56   3       
eco     50.79   5.42    1               mxa     68.89   21.48   0               |       gdi     66.43   6.03    6               bsu     43.51   72.57   2       
chp     39.06   5.45    1               gdi     66.43   21.58   0               |       ipa     62.44   6.40    4               bae     43.22   74.05   1       
hav     48.99   5.48    1               ebt     56.51   21.58   2               |       mhd     68.08   6.66    4               cmn     40.34   74.88   1       
ent     52.98   5.52    1               say     56.76   22.08   0               |       smx     62.65   6.91    0               ser     32.15   75.39   0       
sbo     51.21   5.60    0               fra     70.08   22.11   0               |       tos     68.55   6.94    0               sepp    32.12   75.40   1       
aba     58.38   5.60    1               sap     56.76   22.12   0               |       smk     62.67   6.95    3               sep     32.10   76.43   5       
sfl     50.89   5.68    1               afw     73.53   22.17   1               |       dge     66.64   7.14    5               spi     38.32   80.21   2       
xac     64.77   5.72    1               ccx     69.90   22.32   1               |       sus     61.90   7.51    7               cth     38.99   81.59   2       
pfq     45.38   5.78    0               dpt     66.16   22.44   5               |       ddr     63.39   8.09    2               ljf     34.49   83.08   1       
ebf     54.02   5.79    1               sma     70.72   23.65   4               |       saci    62.27   8.25    9               cbd     42.44   84.09   4       
lpl     44.47   5.84    1               sco     72.12   24.50   0               |       ret     61.27   9.09    1               cad     29.93   87.91   2       
ctr     41.31   5.93    0               dvl     63.01   24.57   1               |       dpt     66.16   9.20    2               lat     36.32   89.97   0       
eca     50.97   5.96    0               sho     72.04   24.73   1               |       dpd     63.97   9.43    4               liv     37.13   90.41   3       
eal     49.70   5.97    0               phm     73.29   24.86   2               |       rru     65.45   9.81    1               rri     32.47   93.01   2       
pam     53.69   5.97    1               mts     70.28   25.31   0               |       cvi     64.83   9.94    1               asf     28.26   94.96   1       
ret     61.27   6.02    0               pdo     58.31   25.33   0               |       tsc     64.89   10.09   4               cac     30.93   95.73   4       
cta     41.30   6.02    2               sbh     70.75   25.40   1               |       aba     58.38   10.51   12              rty     28.92   99.29   1       
pmr     38.90   6.12    1               ipa     62.44   25.63   2               |       pgd     59.62   11.99   7               rpw     29.01   100.42  0       
pst     58.40   6.15    1               saci    62.27   26.08   2               |       pdo     58.31   12.90   10              rpr     29.00   100.55  0       
ecs     50.54   6.22    1               ssx     71.75   26.55   1               |       tra     68.14   14.34   5               cdf     29.06   100.84  1       
raq     52.12   6.27    3               salu    72.32   26.75   1               |       msv     62.36   15.11   10              lla     35.33   102.02  3       
blo     60.12   6.49    0               sall    72.13   27.12   3               |       lhk     62.35   16.77   3               bpn     29.56   105.27  6       
cvi     64.83   6.49    1               dge     66.64   27.98   1               |       pst     58.40   17.25   2               cbl     28.31   111.65  8       
stm     52.22   6.55    1               age     69.45   28.18   0               |       bmf2    57.34   17.57   5               cff     33.31   121.97  0  **V**
spq     52.11   6.60    0               rru     65.45   28.23   0               |       bmf1    57.16   18.51   3               cft     33.21   122.40  1       
cnt     55.10   6.62    1               scb     71.45   28.28   1               |       cgq     54.15   19.17   1               cfv     33.26   123.39  0       
bmf1    57.16   6.69    0               ksk     74.20   28.47   1               |       mrb     63.38   19.32   2               tsu     39.16   123.52  3       
tma     46.25   6.70    1               sct     72.94   28.63   6               |       cgl     53.81   19.72   15              tde     37.87   126.87  7       
ppoy    45.51   6.74    0               sgr     72.23   30.32   10              |       eic     57.44   23.22   5    **III**    tme     31.40   135.95  6       
ppm     45.24   6.76    1               salb    73.32   33.42   14              |       pge     59.11   24.37   5               ple     26.17   143.87  1       
sty     52.09   6.84    0               sur     67.46   38.05   6    **68**     |       kpn     57.48   25.79   2               fnc     27.12   144.60  2       
plu     42.83   6.87    2               opr     70.02   40.26   9               |       spe     55.07   26.24   3               uur     25.50   147.16  8       
cko     53.83   7.00    1               msv     62.36   43.71   8               |       say     56.76   27.19   0               cje     30.55   160.17  1       
amt     36.82   7.09    1               tra     68.14   47.06   2               |       sap     56.76   27.21   4               cjr     30.31   162.10  1       
sect    43.29   7.15    1               mrb     63.38   48.09   6               |       eno     55.07   28.21   1               mcac    23.66   164.01  3       
pge     59.11   7.20    0               mhd     68.08   51.08   39              |       ecla    55.18   28.38   1               rip     28.48   169.87  2       
psi     41.27   7.21    1               tsc     64.89   70.97   16              |       ror     55.88   28.72   3               sms     24.00   174.13  6       
sbz     51.34   7.27    1               tai     63.79   82.29   13              |       esa     56.77   29.49   0               buc     26.31   185.43  11      
smx     62.65   7.31    1               tts     68.92   93.39   1               |       dda     55.02   29.59   0               wbr     22.48   208.59  26      
smk     62.67   7.36    1               ttl     69.09   94.77   1               |       dba     58.65   29.73   0               crp     16.56   282.78  4       
xbo     44.97   7.44    0               tth     69.44   95.48   22              |       ebt     56.51   29.86   0               zin     13.54   295.48  11      
pae     66.56   7.48    1               tos     68.55   116.27                  |       cnt     55.10   29.88   0               cru     13.98   330.82          

Cyanobactéries[modifier | modifier le wikicode]

Résultats[modifier | modifier le wikicode]

  • 49 cyanobactéries
 
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
amr; 6503724; 47.2538502556382; 10416; 10587; 5035; 5129; 326355; 328365; 281253; 278396; 21993; 22178; 15244; 14978; 0
ana; 6413771; 41.3475473321389; 16139; 16308; 2701; 2590; 375551; 373179; 217679; 219026; 32204; 31846; 11639; 11672; 0
anb1; 4329264; 38.1047679236009; 13593; 14177; 1732; 1792; 273098; 273360; 136468; 136365; 25851; 25468; 6772; 6679; 0
awa; 5705437; 38.3934657415374; 18155; 17745; 2918; 2971; 358006; 356146; 181670; 182265; 33948; 33241; 9024; 9078; 0
calo; 7023215; 42.2471617343339; 17692; 17973; 2603; 2775; 394859; 395858; 238674; 236977; 34547; 34477; 12327; 12492; 0
can; 4114099; 34.9583225877647; 19398; 19033; 2471; 2506; 269395; 269454; 115224; 114077; 29524; 29218; 7231; 7224; 0
ceo; 2794318; 33.4134840773312; 13692; 13306; 883; 923; 186877; 187285; 70249; 69932; 19102; 19070; 3401; 3451; 0
cep; 5315554; 40.1620602480946; 14530; 14528; 1940; 1796; 326651; 327212; 167659; 163102; 26922; 27297; 7157; 7088; 0
cgc; 3342364; 68.7071785119754; 327; 352; 7556; 7434; 63268; 65282; 263980; 262377; 1080; 1222; 15352; 15262; 0
ccmp; 6284095; 45.7272208647387; 10774; 10577; 2761; 2828; 322135; 322676; 230737; 229250; 23856; 23875; 10511; 10328; 0
csg; 7003560; 42.3024290503687; 18567; 18625; 3461; 3387; 400542; 399679; 244069; 242873; 35554; 35302; 12278; 12290; 0
cthe; 6315792; 44.4402697238921; 13550; 13261; 3054; 2999; 345476; 344449; 216431; 214522; 28235; 28332; 9321; 9420; 0
cya; 2932766; 60.2373322658541; 2730; 2755; 5483; 5428; 93931; 93463; 187008; 187846; 6399; 6511; 12273; 12232; 0
cyh; 4669813; 39.8213375995998; 15231; 14994; 3554; 3545; 295614; 295114; 153998; 153608; 26465; 26253; 10835; 10669; 0
cytc; 4934271; 37.875402465734; 17294; 17824; 3060; 3064; 318932; 321159; 153124; 153452; 29602; 29800; 10516; 10635; 0
cyu; 1443806; 31.1167843879302; 6935; 7384; 144; 144; 99409; 99718; 32240; 33183; 10273; 10710; 789; 815; 0
dsl; 3781008; 42.438365642178; 10365; 10678; 4065; 3920; 227939; 230652; 129168; 128699; 20654; 20656; 7187; 7180; 0
fis; 5821603; 40.9862884844604; 16150; 16890; 1740; 1912; 339436; 340711; 189937; 191040; 29722; 29769; 8922; 8994; 0
gei; 4681111; 58.4630870748419; 5951; 5828; 5192; 5067; 147413; 145992; 260053; 262737; 12485; 12251; 15289; 15064; 0
gen; 4150181; 33.3448107443989; 19988; 20294; 1321; 1416; 274030; 276293; 109244; 109996; 31237; 31016; 4394; 4405; 0
glp; 5431448; 43.2694375422539; 11624; 11913; 1119; 1099; 318839; 320753; 171681; 171718; 24518; 24693; 5236; 5307; 0
gvi; 4659019; 61.9978583474332; 4727; 4949; 5596; 5574; 139766; 140310; 293549; 293291; 8395; 8595; 13546; 13515; 0
hao; 4179170; 42.9225420358588; 10669; 11153; 2960; 2941; 251074; 255329; 142989; 142124; 20936; 21362; 8889; 8982; 0
lep; 5125950; 43.8673611720754; 13297; 13745; 1417; 1474; 273441; 277369; 188578; 186836; 24163; 24931; 7403; 7344; 0
len; 6244812; 46.6455995792988; 8355; 8414; 1607; 1668; 345998; 345528; 216003; 219001; 21647; 21473; 6689; 6967; 0
mar; 5842795; 42.3306311448545; 20469; 20818; 5798; 5646; 326735; 326500; 212716; 214301; 33221; 33546; 14604; 14099; 0
mic; 7470429; 46.2148157756402; 14670; 14431; 4759; 4741; 402745; 402180; 300621; 299833; 29105; 28538; 15039; 14766; 0
naz; 5354700; 38.4485592096663; 15628; 15844; 1635; 1670; 329014; 329013; 171970; 171683; 30142; 30314; 7535; 7750; 0
non; 6463965; 40.6307583658018; 16414; 16519; 2620; 2600; 385929; 385723; 212318; 212478; 32411; 32181; 10022; 10168; 0
oac; 7689443; 47.6010941234625; 17035; 16687; 9362; 9630; 401162; 397639; 344008; 344310; 32328; 32182; 25811; 25893; 0
oni; 7479014; 45.8676504683639; 19394; 19840; 4057; 4051; 398146; 400028; 284712; 286596; 37104; 37459; 13330; 13360; 0
plp; 4986817; 45.1933367516795; 13027; 13176; 1828; 1829; 271127; 271467; 181279; 180333; 23381; 23911; 8160; 8067; 0
pma; 1751080; 36.4421385659136; 5813; 5830; 332; 306; 116283; 117515; 50854; 51126; 10441; 10544; 1460; 1428; 0
pmg; 1641879; 31.3398855823115; 9967; 9929; 258; 243; 114294; 113247; 40246; 40673; 12449; 11958; 1121; 1070; 0
pmh; 1738790; 31.1450491433698; 10643; 10443; 273; 266; 120591; 119911; 42641; 42436; 13543; 12907; 1153; 1083; 0
pmm; 1657990; 30.7991604291944; 9706; 9560; 296; 249; 116937; 116443; 40236; 39875; 12795; 12503; 1168; 1081; 0
pmt; 2410873; 50.7397738245747; 2292; 3055; 1261; 983; 106121; 122264; 117770; 106083; 5503; 7098; 4762; 3878; 1
pmb; 1669886; 31.3215393146598; 10046; 10071; 267; 266; 115742; 115453; 40731; 41448; 12608; 12330; 1164; 1118; 0
riv; 8698463; 37.5358037391203; 28658; 28772; 2727; 2503; 569332; 570162; 251812; 250448; 53968; 53707; 10338; 10006; 0
scs; 5041209; 35.9532604182846; 19418; 19090; 649; 599; 343770; 342356; 134516; 135265; 32320; 32464; 4180; 4178; 0
syc; 2696255; 55.484329189932; 2387; 2392; 1617; 1558; 108940; 109175; 133191; 132733; 5750; 5659; 6451; 6556; 0
syf; 2695903; 55.4700224748442; 2368; 2411; 1536; 1600; 108960; 109286; 132285; 133380; 5634; 5771; 6521; 6457; 0
syn; 3573470; 47.7202551021836; 9619; 9472; 5690; 5659; 184173; 183791; 174968; 176236; 16661; 16318; 12958; 13031; 0
synd; 2572069; 59.0852733733037; 1561; 1578; 2408; 2369; 89219; 90093; 155100; 155007; 3505; 3630; 7274; 7056; 0
synp; 3510253; 40.6197502003417; 8967; 8869; 1384; 1287; 206958; 207186; 122450; 121593; 17274; 17217; 6357; 6227; 0
syp; 3008047; 49.6310396745796; 8007; 7975; 3993; 3879; 142243; 142250; 143536; 143079; 13099; 13126; 10606; 10643; 0
syq; 3570114; 47.7351983718167; 9600; 9460; 5690; 5657; 183947; 183569; 174876; 176162; 16638; 16300; 12959; 13031; 0
tel; 2593857; 53.917929939854; 3401; 3324; 4511; 4614; 109114; 110208; 132923; 133267; 7053; 7100; 9503; 9446; 0
ter; 7750108; 34.1433564538714; 37143; 37166; 1995; 2070; 492579; 493214; 210252; 212491; 53851; 53094; 8276; 8325; 0

Tableau des diagrammes[modifier | modifier le wikicode]

Tableau des diagrammes[modifier | modifier le wikicode]

  • Légende:
>4ATa, >4GCa ce sont les aléas calculés à partir de l’équation des courbes de tendance des aléas où x est %GC
* pour >4ATa l’équation est: −0.000732x3 + 0.1607x2 −11.96x + 302.42
* pour >4GCa l’équation est: 0.000746x3 −0.0609x2 + 1.869x −19.90
<5GCa, <5ATa ce sont les aléas calculés à partir de l’équation des courbes de tendance des aléas où x est %GC
* pour <5GCa l'équation est: 2.86x − 49.02
* pour <5ATa l'équation est: −2.83x + 235.7
dGCa, dATa différences avec l'aléa, dGAa = >4GC − >4GCa, dATa = >4AT − >4ATa.
  • Voir à la suite le tableau non formaté.
Cyanobactéries, Tableau des diagrammes.
dGCa >dATa KEGG Chromosome %GC >4GC >4AT <5GC <5AT Ctrl base >4ATa >4GCa <5GCa <5ATa
4.50 13.53 amr 6,503,724 47.25 15.63 32.29 90.70 107.46 0 18.76 11.12 86.18 101.79
2.27 19.77 ana 6,413,771 41.35 8.25 50.59 71.72 126.72 0 30.81 5.98 69.28 118.53
3.99 24.70 anb1 4,329,264 38.10 8.14 64.14 66.13 138.08 0 39.45 4.15 60.00 127.72
6.03 24.31 awa 5,705,437 38.39 10.32 62.92 66.96 136.95 0 38.62 4.29 60.83 126.90
1.06 22.09 calo 7,023,215 42.25 7.66 50.78 71.26 122.41 0 28.69 6.59 71.85 115.98
9.23 44.04 can 4,114,099 34.96 12.10 93.41 59.25 145.25 0 49.37 2.86 51.00 136.64
-0.64 12.52 ccmp 6,284,095 45.73 8.89 33.98 76.51 110.21 0 21.46 9.53 81.81 106.12
4.09 41.78 ceo 2,794,318 33.41 6.46 96.62 52.62 147.56 0 54.84 2.37 46.58 141.01
1.79 20.87 cep 5,315,554 40.16 7.03 54.67 64.90 133.21 0 33.79 5.24 65.89 121.89
-18.14 0.33 cgc 3,342,364 68.71 44.85 2.03 166.64 39.15 0 1.70 62.99 147.56 41.00
3.14 24.54 csg 7,003,560 42.30 9.78 53.10 73.04 124.38 0 28.56 6.63 72.01 115.83
1.25 18.50 cthe 6,315,792 44.44 9.58 42.45 71.20 118.19 0 23.95 8.34 78.13 109.77
2.45 13.75 cya 2,932,766 60.24 37.20 18.70 136.17 68.30 0 4.95 34.75 123.32 65.00
10.16 30.04 cyh 4,669,813 39.82 15.20 64.72 70.48 137.79 0 34.69 5.04 64.91 122.86
8.37 31.05 cytc 4,934,271 37.88 12.41 71.17 66.42 141.76 0 40.12 4.04 59.34 128.37
0.24 35.42 cyu 1,443,806 31.12 1.99 99.18 46.42 152.45 0 63.75 1.75 40.01 147.52
14.39 27.41 dsl 3,781,008 42.44 21.12 55.65 72.00 132.21 0 28.25 6.73 72.40 115.44
0.53 25.05 fis 5,821,603 40.99 6.27 56.75 68.52 127.05 0 31.70 5.74 68.24 119.55
-8.35 19.10 gei 4,681,111 58.46 21.92 25.16 118.16 67.96 0 6.06 30.27 118.25 70.03
4.25 41.97 gen 4,150,181 33.34 6.59 97.06 54.95 147.60 0 55.09 2.35 46.38 141.21
-3.28 16.93 glp 5,431,448 43.27 4.08 43.33 65.17 126.82 0 26.40 7.36 74.78 113.08
-15.68 16.74 gvi 4,659,019 62.00 23.98 20.77 131.77 63.76 0 4.03 39.65 128.36 60.01
7.03 25.05 hao 4,179,170 42.92 14.12 52.22 72.50 131.29 0 27.16 7.09 73.78 114.07
-5.22 7.05 len 6,244,812 46.65 5.24 26.85 71.85 117.64 0 19.80 10.47 84.44 103.52
-2.21 27.63 lep 5,125,950 43.87 5.64 52.76 76.11 117.03 0 25.13 7.85 76.49 111.39
12.93 42.17 mar 5,842,795 42.33 19.59 70.66 78.00 123.23 0 28.49 6.65 72.09 115.75
2.70 18.39 mic 7,470,429 46.21 12.72 38.95 84.37 115.46 0 20.57 10.02 83.20 104.74
1.86 20.32 naz 5,354,700 38.45 6.17 58.77 67.03 134.18 0 38.46 4.31 60.98 126.75
2.56 18.36 non 6,463,965 40.63 8.08 50.95 68.84 129.37 0 32.59 5.52 67.23 120.56
13.18 25.67 oac 7,689,443 47.60 24.70 43.85 96.24 112.27 0 18.19 11.52 87.17 100.81
1.17 31.26 oni 7,479,014 45.87 10.84 52.46 79.96 116.69 0 21.20 9.67 82.21 105.72
-1.69 30.07 plp 4,986,817 45.19 7.33 52.54 75.77 118.29 0 22.47 9.02 80.28 107.63
0.23 22.00 pma 1,751,080 36.44 3.64 66.49 59.89 145.50 0 44.49 3.42 55.24 132.43
1.39 57.55 pmb 1,669,886 31.32 3.19 120.47 50.58 153.38 0 62.92 1.80 40.59 146.94
1.25 58.33 pmg 1,641,879 31.34 3.05 121.18 50.62 153.45 0 62.84 1.81 40.64 146.89
1.34 57.63 pmh 1,738,790 31.15 3.10 121.27 50.21 153.53 0 63.64 1.76 40.09 147.44
1.61 51.14 pmm 1,657,990 30.80 3.29 116.20 49.67 156.02 0 65.06 1.67 39.10 148.42
-6.27 8.61 pmt 2,410,872 50.74 9.31 22.18 96.44 99.96 1 N 13.57 15.57 96.15 91.92
2.13 24.90 riv 8,698,463 37.54 6.01 66.02 60.08 143.38 0 41.13 3.88 58.37 129.33
-0.75 30.33 scs 5,041,209 35.95 2.48 76.39 55.17 148.95 0 46.06 3.23 53.84 133.82
-11.95 9.34 syc 2,696,255 55.48 11.78 17.72 103.45 85.13 0 8.39 23.72 109.72 78.47
-12.06 9.32 syf 2,695,903 55.47 11.63 17.73 103.36 85.19 0 8.40 23.70 109.68 78.51
20.11 35.43 syn 3,573,470 47.72 31.76 53.42 105.55 112.20 0 17.99 11.65 87.51 100.47
-13.22 6.55 synd 2,572,069 59.09 18.57 12.20 126.14 72.49 0 5.65 31.79 120.03 68.27
2.10 18.19 synp 3,510,253 40.62 7.61 50.81 73.11 127.81 0 32.62 5.51 67.20 120.59
12.14 38.05 syp 3,008,047 49.63 26.17 53.13 102.35 103.30 0 15.08 14.03 92.98 95.06
20.11 35.42 syq 3,570,114 47.74 31.78 53.39 105.61 112.17 0 17.97 11.67 87.55 100.43
14.44 16.04 tel 2,593,857 53.92 35.18 25.93 109.93 90.01 0 9.88 20.74 105.24 82.91
2.65 43.68 ter 7,750,108 34.14 5.25 95.88 56.69 141.00 0 52.21 2.59 48.67 138.95
  • Tableau non formaté
dGCa;dATa;KEGG;Chromosoe;%GC;>4GC;>4AT;<5GC;<5AT;Ctrl  ;base;>4ATa;>4GCa;<5GCa;<5ATa
4.50;13.53;amr;6,503,724;47.25;15.63;32.29;90.70;107.46;0;;18.76;11.12;86.18;101.79
2.27;19.77;ana;6,413,771;41.35;8.25;50.59;71.72;126.72;0;;30.81;5.98;69.28;118.53
3.99;24.70;anb1;4,329,264;38.10;8.14;64.14;66.13;138.08;0;;39.45;4.15;60.00;127.72
6.03;24.31;awa;5,705,437;38.39;10.32;62.92;66.96;136.95;0;;38.62;4.29;60.83;126.90
1.06;22.09;calo;7,023,215;42.25;7.66;50.78;71.26;122.41;0;;28.69;6.59;71.85;115.98
9.23;44.04;can;4,114,099;34.96;12.10;93.41;59.25;145.25;0;;49.37;2.86;51.00;136.64
-0.64;12.52;ccmp;6,284,095;45.73;8.89;33.98;76.51;110.21;0;;21.46;9.53;81.81;106.12
4.09;41.78;ceo;2,794,318;33.41;6.46;96.62;52.62;147.56;0;;54.84;2.37;46.58;141.01
1.79;20.87;cep;5,315,554;40.16;7.03;54.67;64.90;133.21;0;;33.79;5.24;65.89;121.89
-18.14;0.33;cgc;3,342,364;68.71;44.85;2.03;166.64;39.15;0;;1.70;62.99;147.56;41.00
3.14;24.54;csg;7,003,560;42.30;9.78;53.10;73.04;124.38;0;;28.56;6.63;72.01;115.83
1.25;18.50;cthe;6,315,792;44.44;9.58;42.45;71.20;118.19;0;;23.95;8.34;78.13;109.77
2.45;13.75;cya;2,932,766;60.24;37.20;18.70;136.17;68.30;0;;4.95;34.75;123.32;65.00
10.16;30.04;cyh;4,669,813;39.82;15.20;64.72;70.48;137.79;0;;34.69;5.04;64.91;122.86
8.37;31.05;cytc;4,934,271;37.88;12.41;71.17;66.42;141.76;0;;40.12;4.04;59.34;128.37
0.24;35.42;cyu;1,443,806;31.12;1.99;99.18;46.42;152.45;0;;63.75;1.75;40.01;147.52
14.39;27.41;dsl;3,781,008;42.44;21.12;55.65;72.00;132.21;0;;28.25;6.73;72.40;115.44
0.53;25.05;fis;5,821,603;40.99;6.27;56.75;68.52;127.05;0;;31.70;5.74;68.24;119.55
-8.35;19.10;gei;4,681,111;58.46;21.92;25.16;118.16;67.96;0;;6.06;30.27;118.25;70.03
4.25;41.97;gen;4,150,181;33.34;6.59;97.06;54.95;147.60;0;;55.09;2.35;46.38;141.21
-3.28;16.93;glp;5,431,448;43.27;4.08;43.33;65.17;126.82;0;;26.40;7.36;74.78;113.08
-15.68;16.74;gvi;4,659,019;62.00;23.98;20.77;131.77;63.76;0;;4.03;39.65;128.36;60.01
7.03;25.05;hao;4,179,170;42.92;14.12;52.22;72.50;131.29;0;;27.16;7.09;73.78;114.07
-5.22;7.05;len;6,244,812;46.65;5.24;26.85;71.85;117.64;0;;19.80;10.47;84.44;103.52
-2.21;27.63;lep;5,125,950;43.87;5.64;52.76;76.11;117.03;0;;25.13;7.85;76.49;111.39
12.93;42.17;mar;5,842,795;42.33;19.59;70.66;78.00;123.23;0;;28.49;6.65;72.09;115.75
2.70;18.39;mic;7,470,429;46.21;12.72;38.95;84.37;115.46;0;;20.57;10.02;83.20;104.74
1.86;20.32;naz;5,354,700;38.45;6.17;58.77;67.03;134.18;0;;38.46;4.31;60.98;126.75
2.56;18.36;non;6,463,965;40.63;8.08;50.95;68.84;129.37;0;;32.59;5.52;67.23;120.56
13.18;25.67;oac;7,689,443;47.60;24.70;43.85;96.24;112.27;0;;18.19;11.52;87.17;100.81
1.17;31.26;oni;7,479,014;45.87;10.84;52.46;79.96;116.69;0;;21.20;9.67;82.21;105.72
-1.69;30.07;plp;4,986,817;45.19;7.33;52.54;75.77;118.29;0;;22.47;9.02;80.28;107.63
0.23;22.00;pma;1,751,080;36.44;3.64;66.49;59.89;145.50;0;;44.49;3.42;55.24;132.43
1.39;57.55;pmb;1,669,886;31.32;3.19;120.47;50.58;153.38;0;;62.92;1.80;40.59;146.94
1.25;58.33;pmg;1,641,879;31.34;3.05;121.18;50.62;153.45;0;;62.84;1.81;40.64;146.89
1.34;57.63;pmh;1,738,790;31.15;3.10;121.27;50.21;153.53;0;;63.64;1.76;40.09;147.44
1.61;51.14;pmm;1,657,990;30.80;3.29;116.20;49.67;156.02;0;;65.06;1.67;39.10;148.42
-6.27;8.61;pmt;2,410,872;50.74;9.31;22.18;96.44;99.96;1;N;13.57;15.57;96.15;91.92
2.13;24.90;riv;8,698,463;37.54;6.01;66.02;60.08;143.38;0;;41.13;3.88;58.37;129.33
-0.75;30.33;scs;5,041,209;35.95;2.48;76.39;55.17;148.95;0;;46.06;3.23;53.84;133.82
-11.95;9.34;syc;2,696,255;55.48;11.78;17.72;103.45;85.13;0;;8.39;23.72;109.72;78.47
-12.06;9.32;syf;2,695,903;55.47;11.63;17.73;103.36;85.19;0;;8.40;23.70;109.68;78.51
20.11;35.43;syn;3,573,470;47.72;31.76;53.42;105.55;112.20;0;;17.99;11.65;87.51;100.47
-13.22;6.55;synd;2,572,069;59.09;18.57;12.20;126.14;72.49;0;;5.65;31.79;120.03;68.27
2.10;18.19;synp;3,510,253;40.62;7.61;50.81;73.11;127.81;0;;32.62;5.51;67.20;120.59
12.14;38.05;syp;3,008,047;49.63;26.17;53.13;102.35;103.30;0;;15.08;14.03;92.98;95.06
20.11;35.42;syq;3,570,114;47.74;31.78;53.39;105.61;112.17;0;;17.97;11.67;87.55;100.43
14.44;16.04;tel;2,593,857;53.92;35.18;25.93;109.93;90.01;0;;9.88;20.74;105.24;82.91
2.65;43.68;ter;7,750,108;34.14;5.25;95.88;56.69;141.00;0;;52.21;2.59;48.67;138.95

Tableau des écarts relatifs / aléa[modifier | modifier le wikicode]

  • Voir à la suite, le tableau non formaté.
Répétitions chez 49 cyanobactéries. Voir méthode d’analyse (3.4.1) dans l’article.
  • Légende:
>4GC %: 100*(>4GC − >4GCa)/>4GCa . Voir Tableau des diagrammes des répétitions pour >4GC et >4GCa.
>4AT %: respectivement de même que précédent.
Tableau des diagrammes : écarts relatifs par rapport à l'aléa. Cyanobactéries
%GC >4GC% >4AT%
pmm 30.80 96 79
cyu 31.12 14 56
pmh 31.15 76 91
pmb 31.32 77 91
pmg 31.34 69 93
gen 33.34 181 76
ceo 33.41 173 76
ter 34.14 102 84
can 34.96 322 89
scs 35.95 -23 66
pma 36.44 7 49
riv 37.54 55 61
cytc 37.88 207 77
anb1 38.10 96 63
awa 38.39 141 63
naz 38.45 43 53
cyh 39.82 202 87
cep 40.16 34 62
synp 40.62 38 56
non 40.63 46 56
fis 40.99 9 79
ana 41.35 38 64
calo 42.25 16 77
csg 42.30 47 86
mar 42.33 194 148
dsl 42.44 214 97
hao 42.92 99 92
glp 43.27 -45 64
lep 43.87 -28 110
cthe 44.44 15 77
plp 45.19 -19 134
cmp 45.73 -7 58
oni 45.87 12 147
mic 46.21 27 89
len 46.65 -50 36
amr 47.25 40 72
oac 47.60 114 141
syn 47.72 173 197
syq 47.74 172 197
syp 49.63 87 252
pmt 50.74 -40 63
tel 53.92 70 162
syf 55.47 -51 111
syc 55.48 -50 111
gei 58.46 -28 315
synd 59.09 -42 116
cya 60.24 7 278
gvi 62.00 -40 415
cgc 68.71 -29 19
  • Tableau non formaté
;%GC;>4GC%;>4AT%
pmm;30.80;96;79
cyu;31.12;14;56
pmh;31.15;76;91
pmb;31.32;77;91
pmg;31.34;69;93
gen;33.34;181;76
ceo;33.41;173;76
ter;34.14;102;84
can;34.96;322;89
scs;35.95;-23;66
pma;36.44;7;49
riv;37.54;55;61
cytc;37.88;207;77
anb1;38.10;96;63
awa;38.39;141;63
naz;38.45;43;53
cyh;39.82;202;87
cep;40.16;34;62
synp;40.62;38;56
non;40.63;46;56
fis;40.99;9;79
ana;41.35;38;64
calo;42.25;16;77
csg;42.30;47;86
mar;42.33;194;148
dsl;42.44;214;97
hao;42.92;99;92
glp;43.27;-45;64
lep;43.87;-28;110
cthe;44.44;15;77
plp;45.19;-19;134
cmp;45.73;-7;58
oni;45.87;12;147
mic;46.21;27;89
len;46.65;-50;36
amr;47.25;40;72
oac;47.60;114;141
syn;47.72;173;197
syq;47.74;172;197
syp;49.63;87;252
pmt;50.74;-40;63
tel;53.92;70;162
syf;55.47;-51;111
syc;55.48;-50;111
gei;58.46;-28;315
synd;59.09;-42;116
cya;60.24;7;278
gvi;62.00;-40;415
cgc;68.71;-29;19

Groupes des cyanobactéries selon l'écart relatif par rapport à l'aléa[modifier | modifier le wikicode]

  • Voir à la suite, le tableau non formaté.
Répétitions chez 49 cyanobactéries. Voir méthode d’analyse (3.4.1) dans l’article.
  • Légende:
>4GC %: 100*(>4GC − >4GCa)/>4GCa . Voir Tableau des diagrammes des répétitions pour >4GC et >4GCa.
>4AT %: respectivement de même que précédent.
Cyanobactéries : écarts relatifs par rapport à l'aléa. Les groupes 22c 23c 41c 67c.
groupe 22c n=26       groupe 67c1 n=9
KEGG %GC >4GC >4AT DNA KEGG %GC >4GC% >4AT% KEGG %GC >4GC >4AT DNA
pmm 30.80 3.29 116.20 1,657,990 scs 35.95 -23 66 oni 45.87 10.84 52.46 7,479,014
cyu 31.12 1.99 99.18 1,443,806 pma 36.44 7 49 cthe 44.44 9.58 42.45 6,315,792
pmh 31.15 3.10 121.27 1,738,790 fis 40.99 9 79 mic 46.21 12.72 38.95 7,470,429
pmb 31.32 3.19 120.47 1,669,886 cyu 31.12 14 56 amr 47.25 15.63 32.29 6,503,724
pmg 31.34 3.05 121.18 1,641,879 calo 42.25 16 77 tel 53.92 35.18 25.93 2,593,857
gen 33.34 6.59 97.06 4,150,181 cep 40.16 34 62 syp 49.63 26.17 53.13 3,008,047
ceo 33.41 6.46 96.62 2,794,318 synp 40.62 38 56 oac 47.60 24.70 43.85 7,689,443
ter 34.14 5.25 95.88 7,750,108 ana 41.35 38 64 syq 47.74 31.78 53.39 3,570,114
can 34.96 12.10 93.41 4,114,099 naz 38.45 43 53 syn 47.72 31.76 53.42 3,573,470
pma 36.44 3.64 66.49 1,751,080 non 40.63 46 56
riv 37.54 6.01 66.02 8,698,463 csg 42.30 47 86 moyen. 48 22 44 5,355,988
cytc 37.88 12.41 71.17 4,934,271 riv 37.54 55 61 ecartt 3 10 10 2,126,339
anb1 38.10 8.14 64.14 4,329,264 pmg 31.34 69 93 % 6 45 23 40
awa 38.39 10.32 62.92 5,705,437 pmh 31.15 76 91
naz 38.45 6.17 58.77 5,354,700 pmb 31.32 77 91 groupe 67c2 n=10
cyh 39.82 15.20 64.72 4,669,813 anb1 38.10 96 63 KEGG %GC >4GC >4AT DNA
cep 40.16 7.03 54.67 5,315,554 pmm 30.80 96 79 glp 43.27 4.08 43.33 5,431,448
synp 40.62 7.61 50.81 3,510,253 hao 42.92 99 92 lep 43.87 5.64 52.76 5,125,950
non 40.63 8.08 50.95 6,463,965 ter 34.14 102 84 plp 45.19 7.33 52.54 4,986,817
fis 40.99 6.27 56.75 5,821,603 awa 38.39 141 63 cmp 45.73 8.89 33.98 6,284,095
ana 41.35 8.25 50.59 6,413,771 ceo 33.41 173 76 len 46.65 5.24 26.85 6,244,812
calo 42.25 7.66 50.78 7,023,215 gen 33.34 181 76 pmt 50.74 9.31 22.18 2,410,873
csg 42.30 9.78 53.10 7,003,560 mar 42.33 194 148 syf 55.47 11.63 17.73 2,695,903
mar 42.33 19.59 70.66 5,842,795 cyh 39.82 202 87 syc 55.48 11.78 17.72 2,696,255
dsl 42.44 21.12 55.65 3,781,008 cytc 37.88 207 77 gei 58.46 21.92 25.16 4,681,111
hao 42.92 14.12 52.22 4,179,170 dsl 42.44 214 97 synd 59.09 18.57 12.20 2,572,069
can 34.96 322 89
moyen. 37 8 75 4,529,192 moyen. 50 10 30 4,312,933
ecartt 4 5 25 2,083,497 KEGG %GC >4GC% >4AT% ecartt 6 6 15 1,563,339
% 11 59 33 46 syf 55.47 -51 111 % 12 56 48 36
syc 55.48 -50 111
groupe 23c len 46.65 -50 36
KEGG %GC >4GC >4AT DNA glp 43.27 -45 64
scs 35.95 2.48 76.39 5,041,209 synd 59.09 -42 116
pmt 50.74 -40 63
lep 43.87 -28 110 groupe 41c n=3
gei 58.46 -28 315 KEGG %GC >4GC >4AT DNA
plp 45.19 -19 134 gvi 62.00 23.98 20.77 4,659,019
cmp 45.73 -7 58 cgc 68.71 44.85 2.03 3,342,364
oni 45.87 12 147 cya 60.24 37.20 18.70 2,932,766
cthe 44.44 15 77
mic 46.21 27 89 moyen. 64 35 14 3644716
amr 47.25 40 72 ecartt 4 11 10 901970
tel 53.92 70 162 % 7 30 74 25
syp 49.63 87 252
oac 47.60 114 141
syq 47.74 172 197
syn 47.72 173 197
 
KEGG %GC >4GC% >4AT%
cya 60.24 7 278
cgc 68.71 -29 19
gvi 62.00 -40 415
  • Tableau non formaté.
Groupe; 22c;;N=26;;;;;;;;Groupe; 67c1;;N=9;
KEGG;%GC;>4GC;>4AT;DNA;;KEGG;%GC;>4GC%;>4AT%;;KEGG;%GC;>4GC;>4AT;DNA
pmm;30.80;3.29;116.20;1,657,990;;scs;35.95;-23;66;;oni;45.87;10.84;52.46;7,479,014
cyu;31.12;1.99;99.18;1,443,806;;pma;36.44;7;49;;cthe;44.44;9.58;42.45;6,315,792
pmh;31.15;3.10;121.27;1,738,790;;fis;40.99;9;79;;mic;46.21;12.72;38.95;7,470,429
pmb;31.32;3.19;120.47;1,669,886;;cyu;31.12;14;56;;amr;47.25;15.63;32.29;6,503,724
pmg;31.34;3.05;121.18;1,641,879;;calo;42.25;16;77;;tel;53.92;35.18;25.93;2,593,857
gen;33.34;6.59;97.06;4,150,181;;cep;40.16;34;62;;syp;49.63;26.17;53.13;3,008,047
ceo;33.41;6.46;96.62;2,794,318;;synp;40.62;38;56;;oac;47.60;24.70;43.85;7,689,443
ter;34.14;5.25;95.88;7,750,108;;ana;41.35;38;64;;syq;47.74;31.78;53.39;3,570,114
can;34.96;12.10;93.41;4,114,099;;naz;38.45;43;53;;syn;47.72;31.76;53.42;3,573,470
pma;36.44;3.64;66.49;1,751,080;;non;40.63;46;56;;;;;;
riv;37.54;6.01;66.02;8,698,463;;csg;42.30;47;86;;moyen.;48;22;44;5,355,988
cytc;37.88;12.41;71.17;4,934,271;;riv;37.54;55;61;;ecartt;3;10;10;2,126,339
anb1;38.10;8.14;64.14;4,329,264;;pmg;31.34;69;93;;%  ;6;45;23;40
awa;38.39;10.32;62.92;5,705,437;;pmh;31.15;76;91;;;;;;
naz;38.45;6.17;58.77;5,354,700;;pmb;31.32;77;91;;Groupe; 67c2;;N=10;
cyh;39.82;15.20;64.72;4,669,813;;anb1;38.10;96;63;;KEGG;%GC;>4GC;>4AT;DNA
cep;40.16;7.03;54.67;5,315,554;;pmm;30.80;96;79;;glp;43.27;4.08;43.33;5,431,448
synp;40.62;7.61;50.81;3,510,253;;hao;42.92;99;92;;lep;43.87;5.64;52.76;5,125,950
non;40.63;8.08;50.95;6,463,965;;ter;34.14;102;84;;plp;45.19;7.33;52.54;4,986,817
fis;40.99;6.27;56.75;5,821,603;;awa;38.39;141;63;;cmp;45.73;8.89;33.98;6,284,095
ana;41.35;8.25;50.59;6,413,771;;ceo;33.41;173;76;;len;46.65;5.24;26.85;6,244,812
calo;42.25;7.66;50.78;7,023,215;;gen;33.34;181;76;;pmt;50.74;9.31;22.18;2,410,873
csg;42.30;9.78;53.10;7,003,560;;mar;42.33;194;148;;syf;55.47;11.63;17.73;2,695,903
mar;42.33;19.59;70.66;5,842,795;;cyh;39.82;202;87;;syc;55.48;11.78;17.72;2,696,255
dsl;42.44;21.12;55.65;3,781,008;;cytc;37.88;207;77;;gei;58.46;21.92;25.16;4,681,111
hao;42.92;14.12;52.22;4,179,170;;dsl;42.44;214;97;;synd;59.09;18.57;12.20;2,572,069
;;;;;;can;34.96;322;89;;;;;;
moyen.;37;8;75;4,529,192;;;;;;;moyen.;50;10;30;4,312,933
ecartt;4;5;25;2,083,497;;KEGG;%GC;>4GC%;>4AT%;;ecartt;6;6;15;1,563,339
%  ;11;59;33;46;;syf;55.47;-51;111;;%  ;12;56;48;36
;;;;;;syc;55.48;-50;111;;;;;;
Groupe; 23c;;;;;len;46.65;-50;36;;;;;;
KEGG;%GC;>4GC;>4AT;DNA;;glp;43.27;-45;64;;;;;;
scs;35.95;2.48;76.39;5,041,209;;synd;59.09;-42;116;;;;;;
;;;;;;pmt;50.74;-40;63;;;;;;
;;;;;;lep;43.87;-28;110;;Groupe;41c;;N=3;
;;;;;;gei;58.46;-28;315;;KEGG;%GC;>4GC;>4AT;DNA
;;;;;;plp;45.19;-19;134;;gvi;62.00;23.98;20.77;4,659,019
;;;;;;cmp;45.73;-7;58;;cgc;68.71;44.85;2.03;3,342,364
;;;;;;oni;45.87;12;147;;cya;60.24;37.20;18.70;2,932,766
;;;;;;cthe;44.44;15;77;;;;;;
;;;;;;mic;46.21;27;89;;moyen.;64;35;14;3644716
;;;;;;amr;47.25;40;72;;ecartt;4;11;10;901970
;;;;;;tel;53.92;70;162;;%  ;7;30;74;25
;;;;;;syp;49.63;87;252;;;;;;
;;;;;;oac;47.60;114;141;;;;;;
;;;;;;syq;47.74;172;197;;;;;;
;;;;;;syn;47.72;173;197;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;KEGG;%GC;>4GC%;>4AT%;;;;;;
;;;;;;cya;60.24;7;278;;;;;;
;;;;;;cgc;68.71;-29;19;;;;;;
;;;;;;gvi;62.00;-40;415;;;;;;

Cyanobactéries:ruptures entre les groupes à progression homogène[modifier | modifier le wikicode]

        cyanobactéries:taux >4GC        |               cyanobactéries:taux >4AT
KEGG    %GC     >4GC    #%     groupe   |       KEGG    %GC     >4AT    #%   groupe
cyu     31.12   1.99    19.4   ** 2 **  |       cgc     68.71   2.03    83   ** I **
scs     35.95   2.48    18.9            |       synd    59.09   12.20   31   ** II **
pmg     31.34   3.05    1.6             |       syc     55.48   17.72   0       
pmh     31.15   3.10    2.9             |       syf     55.47   17.73   5       
pmb     31.32   3.19    2.9             |       cya     60.24   18.70   10      
pmm     30.80   3.29    9.8             |       gvi     62.00   20.77   6       
pma     36.44   3.64    10.8            |       pmt     50.74   22.18   12      
glp     43.27   4.08    22.1            |       gei     58.46   25.16   3       
len     46.65   5.24    0.0   ** 7 **   |       tel     53.92   25.93   3       
ter     34.14   5.25    7.0             |       len     46.65   26.85   17      
lep     43.87   5.64    6.2             |       amr     47.25   32.29   5       
riv     37.54   6.01    2.6             |       ccmp    45.73   33.98   13      
naz     38.45   6.17    1.6             |       mic     46.21   38.95   8       
fis     40.99   6.27    2.9             |       cthe    44.44   42.45   2       
ceo     33.41   6.46    2.0             |       glp     43.27   43.33   1       
gen     33.34   6.59    6.2             |       oac     47.60   43.85   13      
cep     40.16   7.03    4.2             |       ana     41.35   50.59   0    ** III **
plp     45.19   7.33    3.6             |       calo    42.25   50.78   0       
synp    40.62   7.61    0.6             |       synp    40.62   50.81   0       
calo    42.25   7.66    5.2             |       non     40.63   50.95   2       
non     40.63   8.08    0.8             |       hao     42.92   52.22   0       
anb1    38.10   8.14    1.3             |       oni     45.87   52.46   0       
ana     41.35   8.25    7.2             |       plp     45.19   52.54   0       
ccmp    45.73   8.89    4.4             |       lep     43.87   52.76   1       
pmt     50.74   9.31    2.9             |       csg     42.30   53.10   0       
cthe    44.44   9.58    2.0             |       syp     49.63   53.13   0       
csg     42.30   9.78    5.3             |       syq     47.74   53.39   0       
awa     38.39   10.32   4.8             |       syn     47.72   53.42   2       
oni     45.87   10.84   6.8             |       cep     40.16   54.67   2       
syf     55.47   11.63   1.2             |       dsl     42.44   55.65   2       
syc     55.48   11.78   2.7             |       fis     40.99   56.75   3       
can     34.96   12.10   2.5             |       naz     38.45   58.77   7       
cytc    37.88   12.41   2.4             |       awa     38.39   62.92   2       
mic     46.21   12.72   9.9             |       anb1    38.10   64.14   1       
hao     42.92   14.12   7.1             |       cyh     39.82   64.72   2       
cyh     39.82   15.20   2.7             |       riv     37.54   66.02   1       
amr     47.25   15.63   15.9            |       pma     36.44   66.49   6       
synd    59.09   18.57   5.2   ** 14 **  |       mar     42.33   70.66   1       
mar     42.33   19.59   7.3             |       cytc    37.88   71.17   7       
dsl     42.44   21.12   3.6             |       scs     35.95   76.39   18      
gei     58.46   21.92   8.6             |       can     34.96   93.41   3    ** IV **
gvi     62.00   23.98   2.9             |       ter     34.14   95.88   1       
oac     47.60   24.70   5.6             |       ceo     33.41   96.62   0       
syp     49.63   26.17   17.6            |       gen     33.34   97.06   2       
syn     47.72   31.76   0.1   ** 25 **  |       cyu     31.12   99.18   15      
syq     47.74   31.78   9.7             |       pmm     30.80   116.20  4    ** V **
tel     53.92   35.18   5.4             |       pmb     31.32   120.47  1       
cya     60.24   37.20   17.0            |       pmg     31.34   121.18  0       
cgc     68.71   44.85         ** 68 **  |       pmh     31.15   121.27          

Archées[modifier | modifier le wikicode]

Résultats[modifier | modifier le wikicode]

 
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<5T;<5A;<5C;<5G;Ctrl  
abi; 1486778; 39.1579644035626; 4384; 4317; 601; 525; 92031; 92388; 55219; 53398; 0
afu; 2178400; 48.5816654425266; 4176; 4092; 1438; 1352; 114638; 116220; 99861; 101337; 0
aho; 2137654; 34.148136227846; 6312; 6619; 262; 256; 157260; 159314; 64346; 62355; 0
ape; 1669696; 56.3112686381233; 582; 516; 3378; 3384; 56354; 54419; 103690; 101807; 0
asc; 1496453; 57.2173666663771; 429; 415; 1904; 1892; 53301; 52914; 95459; 94733; 0
clg; 1546846; 30.0340176074412; 6897; 7166; 392; 371; 120405; 120159; 39936; 41003; 0
cma; 2077567; 43.0958423964185; 761; 783; 1348; 1335; 134791; 135251; 98064; 97954; 0
csu; 1680938; 51.649674170017; 2545; 2506; 846; 835; 72934; 73153; 84121; 86081; 0
dka; 1365223; 45.3391130972742; 1089; 966; 930; 832; 70167; 66956; 63430; 59083; 0
ffo; 1319206; 37.474207970552; 5874; 5511; 450; 430; 86051; 83717; 41939; 40309; 0
fpl; 2196266; 44.1354098274071; 6258; 6456; 683; 792; 131349; 132255; 81895; 83302; 0
gac; 1860815; 46.8406585286555; 4264; 4505; 807; 824; 94809; 95471; 82733; 81970; 0
hal; 2014239; 67.9130430897227; 273; 326; 1919; 1913; 40356; 40586; 138237; 137574; 0
hbo; 2820544; 61.0636458782419; 807; 672; 1123; 1064; 88807; 89092; 159678; 157997; 0
hbu; 1667163; 53.7367371996619; 494; 505; 1275; 1268; 60711; 61838; 88980; 89036; 0
hla; 2735295; 66.722090304702; 445; 448; 1839; 1924; 58773; 57147; 178744; 179616; 0
hlr; 2789326; 61.9472230926037; 846; 861; 1349; 1255; 79868; 80622; 160647; 159421; 0
hma1; 3131724; 62.363860927719; 796; 733; 1372; 1318; 85627; 85805; 192091; 191723; 0
hmu; 221862; 64.1515897269474; 49; 24; 99; 114; 5125; 4887; 13743; 13384; 0
hru; 3223876; 64.3360352569392; 527; 524; 1652; 1567; 77209; 76668; 201721; 202219; 0
hsu; 2085482; 63.2908843135544; 660; 694; 1761; 1860; 53416; 53852; 133919; 134300; 0
htu; 3889038; 65.8333500469782; 532; 580; 2026; 2019; 86398; 85208; 250013; 249643; 0
hut; 3116795; 62.8999661511264; 711; 670; 1935; 2044; 80005; 82336; 193365; 194203; 0
hvo; 2847757; 66.6385860872258; 601; 578; 1668; 1684; 67985; 65659; 185760; 186125; 0
hwa; 3132494; 47.8639065230452; 2192; 2238; 894; 835; 152471; 153465; 119125; 116558; 0
hxa; 3668009; 65.9817901210166; 574; 552; 1748; 1739; 83739; 83919; 235930; 237368; 0
iag; 1875953; 35.6865550469548; 2602; 2725; 401; 460; 111622; 111901; 54171; 55053; 0
iho; 1297538; 56.5203485369985; 464; 478; 2278; 2367; 57717; 57167; 78708; 78272; 0
kcr; 1590757; 49.000695895099; 1021; 925; 1825; 1918; 67756; 69272; 76187; 79805; 0
mac; 5751492; 42.6808904541639; 22122; 21231; 2295; 2378; 334359; 330098; 238049; 236155; 0
marc; 1937883; 54.0039310938792; 1072; 1196; 1308; 1434; 75183; 76256; 112606; 112958; 0
mba; 4837408; 39.276220519971; 19314; 20134; 1027; 1062; 302213; 305746; 173835; 170335; 23
mbg; 2789774; 60.6400375084147; 1373; 1218; 3971; 3999; 81322; 79763; 182538; 185668; 0
mbn; 2542943; 54.5136088382634; 5077; 5358; 2272; 2321; 97801; 97541; 153408; 154097; 0
mbu; 2575032; 40.7580954333771; 5710; 6047; 572; 608; 155010; 154067; 91624; 94303; 0
mear; 1488669; 49.2056998567176; 2284; 2113; 689; 758; 72713; 68215; 72534; 67941; 0
mel; 2583753; 35.8286569962376; 10576; 10391; 576; 480; 179759; 177238; 86449; 83660; 0
mer; 1931651; 41.2554338231906; 4766; 4577; 337; 350; 110493; 110039; 65001; 65952; 0
mev; 2242317; 36.6288085047743; 9370; 8744; 490; 287; 143318; 140826; 76727; 71850; 0
mfe; 1485061; 32.2099226900444; 8123; 8137; 428; 438; 110638; 110684; 41694; 42664; 0
mfv; 1243342; 31.6369912703021; 7653; 7636; 144; 132; 87637; 88158; 34224; 33668; 0
mhu; 3544738; 45.1493916286523; 8114; 8214; 1719; 1717; 174451; 177892; 166148; 164438; 28
mhz; 2428904; 42.6241218261405; 5318; 5229; 593; 627; 131936; 130969; 96090; 98025; 0
mig; 1854197; 32.2999120373941; 9590; 11328; 616; 815; 136999; 139950; 49368; 56380; 0
mka; 1694969; 61.1591716426672; 351; 307; 1585; 1554; 48694; 49199; 113831; 112631; 0
mla; 1804962; 50.0065929365826; 4272; 4163; 834; 786; 79676; 79575; 88453; 87644; 0
mmh; 2012424; 42.6182057061534; 5607; 5066; 698; 703; 114331; 112751; 86553; 86497; 0
mmp; 1661137; 33.1003403090775; 10599; 10969; 343; 331; 121332; 122394; 43894; 44713; 0
mok; 1662525; 29.2986872377859; 10676; 10400; 398; 416; 121331; 121217; 45939; 45543; 0
mpd; 2957635; 54.9168846054364; 4416; 4501; 1629; 1621; 109790; 108512; 170237; 169499; 0
mpi; 2843290; 47.3991748995002; 6307; 6644; 1418; 1449; 139349; 141885; 131602; 133223; 0
mpl; 2922917; 55.3536757971574; 2593; 2687; 2607; 2609; 102084; 100067; 172981; 173730; 0
mpy; 3072769; 44.6108705210187; 5611; 5530; 796; 792; 162068; 163222; 131433; 132066; 0
mse; 2191517; 46.2253315853813; 2031; 2011; 1218; 1284; 117467; 118872; 104803; 109759; 0
msi; 1853160; 31.0342334175139; 8966; 9739; 258; 122; 137970; 144839; 51066; 44043; 0
mst; 1767403; 27.6337088937837; 8920; 9619; 133; 123; 134614; 137615; 35685; 35763; 0
mth; 1751377; 49.5439302902802; 1933; 1875; 1783; 1858; 77637; 76276; 96360; 96201; 0
mtp; 1879471; 53.5458777833941; 1016; 960; 961; 930; 63224; 63326; 97527; 94394; 21
mzh; 2138444; 39.1560405603327; 6412; 5917; 369; 423; 126620; 124792; 76751; 77178; 0
nbv; 1232128; 33.1577563370039; 6430; 6376; 60; 64; 89551; 89517; 31520; 30667; 0
neq; 490885; 31.559530236206; 2668; 2678; 221; 212; 35758; 35865; 13576; 13650; 0
nga; 2833868; 48.3472060095954; 4630; 4886; 531; 574; 137568; 141686; 121548; 124273; 0
nge; 3788356; 62.2355185204347; 850; 837; 1468; 1630; 101208; 103186; 217768; 219746; 0
nkr; 1639964; 34.1831893870841; 8432; 8113; 163; 150; 115719; 115571; 42612; 42544; 0
nmg; 3751858; 61.4208213637083; 745; 736; 1395; 1369; 105308; 105444; 213119; 212066; 0
nmr; 1645259; 34.1675079729088; 8036; 7467; 150; 129; 118629; 116138; 42722; 41466; 0
nou; 4013216; 64.9358021098291; 860; 864; 2743; 2732; 91605; 91428; 254032; 254155; 0
nph; 2595221; 63.440223395233; 764; 763; 1462; 1517; 70998; 70523; 163166; 164967; 0
pai; 2222430; 51.362517604604; 3690; 4053; 3217; 3341; 100084; 100451; 111038; 114821; 0
pdl; 2023836; 53.9139535021612; 613; 571; 1356; 1345; 70152; 69203; 107700; 105228; 0
pfm; 1843267; 54.9060819161438; 344; 386; 1241; 1199; 65361; 64788; 95338; 96118; 65
pho; 1738505; 41.8789707248469; 3197; 3090; 948; 912; 112634; 112098; 74438; 71596; 0
ppac; 1859370; 43.0442569257329; 5092; 4564; 680; 780; 114466; 112174; 71786; 75522; 0
pto; 1545895; 35.9704248994919; 6033; 6028; 140; 113; 99972; 99987; 55264; 54825; 0
sali; 3255260; 66.5859869872145; 319; 313; 1762; 1727; 66788; 66940; 218355; 218121; 0
smr; 1570485; 35.7265430742732; 3045; 3885; 511; 544; 102867; 107170; 44814; 49028; 0
sso; 2992245; 35.7874276792112; 7301; 6919; 611; 706; 212450; 209582; 94140; 94872; 21
taa; 3430706; 34.1388040828914; 12354; 12415; 574; 536; 241391; 240916; 98138; 97900; 0
tac; 1564906; 45.9943919954298; 1969; 2053; 322; 316; 76970; 78382; 71191; 72154; 0
tag; 1316595; 46.7343412362951; 1504; 1522; 951; 960; 73364; 71953; 57837; 60506; 0
tar; 1461105; 58.302996704549; 422; 473; 1744; 1674; 47042; 48223; 94261; 93375; 0
thg; 1356318; 55.6411549503877; 531; 599; 1685; 1766; 47211; 47340; 73555; 74800; 0
tko; 2088737; 51.9954881825716; 2612; 2550; 1388; 1448; 98105; 99579; 112138; 111757; 0
ton; 1847607; 51.2727003091025; 2003; 2140; 960; 996; 87319; 88895; 96099; 98522; 0
tpe; 1781889; 57.6656570639361; 1115; 1124; 2477; 2343; 62341; 61844; 102484; 100870; 0
tuz; 1936063; 59.6550835380873; 831; 899; 2090; 2152; 57989; 59605; 126490; 129724; 0
vdi; 2374137; 45.4277069941625; 1230; 1198; 629; 582; 138880; 137617; 116457; 120382; 0

Tableau des diagrammes[modifier | modifier le wikicode]

Tableau des diagrammes[modifier | modifier le wikicode]

Les 87 archées[modifier | modifier le wikicode]
Répétitions chez les archées                                                                     x3 -0.000732 0.000746          
                                                                                                 x2    0.1607  -0.0609          
                        Voir méthode d’analyse (3.4.1) dans l’article                            x     -11.96    1.869    2.86  -2.83
Différences                                                                                      c     302.42   -19.90  -49.02  235.7
avec l’aléa                                                                                                             
>4GC-   >4AT-                                                                                           Aléas équation  Aléas équation    
>4GCa   >4ATa           KEGG    effectif        %GC     >4GC    >4AT    <5GC    <5AT   Ctrl    base     >4ATa   >4GCa   <5GCa   <5ATa   KEGG   archées
2.90    22.05           abi     1,486,778       39.16   7.57    58.52   73.06   124.04  0               36.47   4.68    63.01   124.74  abi     e
0.13    21.32           afu     2,178,400       48.58   12.81   37.95   92.36   105.98  0               16.63   12.68   89.98   98.03   afu     e
-0.17   8.30            aho     2,137,654       34.15   2.42    60.49   59.27   148.09  0               52.19   2.60    48.68   138.93  aho     c
15.07   -1.10           ape     1,669,696       56.31   40.50   6.58    123.07  66.34   0               7.68    25.42   112.09  76.13   ape     c
-2.02   -1.32           asc     1,496,453       57.22   25.37   5.64    127.10  70.98   0               6.96    27.39   114.68  73.56   asc     c
3.44    22.63           clg     1,546,846       30.03   4.93    90.91   52.33   155.52  0               68.29   1.49    36.91   150.59  clg     c
5.69    -19.35          cma     2,077,567       43.10   12.91   7.43    94.35   129.98  0               26.78   7.23    74.28   113.58  cma     c
-6.94   17.63           csu     1,680,938       51.65   10.00   30.05   101.25  86.91   0               12.42   16.94   98.75   89.34   csu     t
3.75    -7.14           dka     1,365,223       45.34   12.91   15.05   89.74   100.44  0               22.19   9.16    80.70   107.22  dka     c
2.81    44.99           ffo     1,319,206       37.47   6.67    86.30   62.35   128.69  0               41.31   3.86    58.20   129.51  ffo     c
-1.36   33.32           fpl     2,196,266       44.14   6.72    57.89   75.22   120.02  0               24.57   8.07    77.25   110.63  fpl     e
-1.91   27.66           gac     1,860,815       46.84   8.76    47.12   88.51   102.26  0               19.47   10.67   84.99   102.97  gac     e
-40.79  1.07            hal     2,014,239       67.91   19.02   2.97    136.93  40.18   0               1.91    59.82   145.28  43.25   hal     e
-29.24  0.74            hbo     2,820,544       61.06   7.75    5.24    112.63  63.07   0               4.50    36.99   125.69  62.66   hbo     e
-5.16   -4.08           hbu     1,667,163       53.74   15.25   5.99    106.78  73.51   0               10.07   20.42   104.72  83.42   hbu     e
-41.52  1.03            hla     2,735,295       66.72   13.76   3.26    131.01  42.38   0               2.24    55.27   141.88  46.63   hla     e
-30.17  2.07            hlr     2,789,326       61.95   9.34    6.12    114.75  57.54   0               4.05    39.51   128.22  60.16   hlr     e
-32.14  1.02            hma1    3,131,724       62.36   8.59    4.88    122.56  54.74   0               3.86    40.73   129.41  58.98   hma1    e
-36.72  0.18            hmu     221,862         64.15   9.60    3.29    122.27  45.13   0               3.11    46.32   134.52  53.91   hmu     e
-36.94  0.22            hru     3,223,876       64.34   9.98    3.26    125.30  47.73   0               3.04    46.92   135.05  53.39   hru     e
-26.20  3.04            hsu     2,085,482       63.29   17.36   6.49    128.61  51.44   0               3.45    43.56   132.06  56.35   hsu     e
-41.65  0.35            htu     3,889,038       65.83   10.40   2.86    128.48  44.13   0               2.51    52.05   139.33  49.15   htu     e
-29.59  0.81            hut     3,116,795       62.90   12.77   4.43    124.35  52.09   0               3.62    42.35   130.94  57.46   hut     e
-43.19  1.88            hvo     2,847,757       66.64   11.77   4.14    130.59  46.93   0               2.26    54.96   141.64  46.86   hvo     e
-6.30   -3.62           hwa     3,132,494       47.86   5.52    14.14   75.24   97.67   0               17.76   11.82   87.92   100.07  hwa     e
-43.07  0.60            hxa     3,668,009       65.98   9.51    3.07    129.03  45.71   0               2.47    52.58   139.76  48.72   hxa     e
1.46    -18.54          iag     1,875,953       35.69   4.59    28.40   58.22   119.15  0               46.93   3.13    53.08   134.57  iag     c
9.93    -0.25           iho     1,297,538       56.52   35.80   7.26    120.98  88.54   0               7.51    25.87   112.69  75.54   iho     c
10.32   -3.77           kcr     1,590,757       49.00   23.53   12.23   98.06   86.14   0               16.00   13.21   91.17   96.84   kcr     k
1.21    47.68           mac     5,751,492       42.68   8.12    75.38   82.45   115.53  0               27.70   6.91    73.09   114.75  mac     e
-6.75   1.91            marc    1,937,883       54.00   14.15   11.70   116.40  78.15   0               9.80    20.90   105.49  82.67   marc    e
-0.42   45.40           mba     4,837,408       39.28   4.32    81.55   71.15   125.68  23      T       36.15   4.74    63.35   124.40  mba     e
-7.26   4.56            mbg     2,789,774       60.64   28.57   9.29    131.98  57.74   0               4.73    35.83   124.48  63.86   mbg     e
-3.78   31.74           mbn     2,542,943       54.51   18.06   41.04   120.92  76.82   0               9.29    21.84   106.95  81.22   mbn     e
-1.02   13.39           mbu     2,575,032       40.76   4.58    45.66   72.20   120.03  0               32.27   5.60    67.59   120.20  mbu     e
-3.75   13.84           mear    1,488,669       49.21   9.72    29.54   94.36   94.67   0               15.70   13.47   91.76   96.26   mear    e
0.91    34.68           mel     2,583,753       35.83   4.09    81.15   65.84   138.17  0               46.47   3.18    53.49   134.17  mel     e
-2.36   17.33           mer     1,931,651       41.26   3.56    48.37   67.79   114.17  0               31.04   5.92    69.01   118.79  mer     e
-0.03   36.88           mev     2,242,317       36.63   3.47    80.78   66.26   126.72  0               43.90   3.49    55.78   131.90  mev     e
3.80    50.10           mfe     1,485,061       32.21   5.83    109.49  56.80   149.03  0               59.39   2.03    43.13   144.42  mfe     e
0.34    61.32           mfv     1,243,342       31.64   2.22    122.97  54.60   141.39  0               61.65   1.88    41.49   146.05  mfv     e
0.71    23.51           mhu     3,544,738       45.15   9.69    46.06   93.26   99.40   28      A       22.55   8.98    80.16   107.76  mhu     e
-1.85   15.59           mhz     2,428,904       42.62   5.02    43.42   79.92   108.24  0               27.83   6.87    72.93   114.91  mhz     e
5.66    53.77           mig     1,854,197       32.30   7.72    112.81  57.03   149.36  0               59.04   2.05    43.39   144.17  mig     e
-18.74  -0.57           mka     1,694,969       61.16   18.52   3.88    133.61  57.76   0               4.45    37.26   125.96  62.39   mka     e
-5.56   32.18           mla     1,804,962       50.01   8.98    46.73   97.56   88.23   0               14.56   14.54   94.05   93.99   mla     e
0.10    25.19           mmh     2,012,424       42.62   6.96    53.04   85.99   112.84  0               27.84   6.87    72.91   114.93  mmh     e
1.78    73.84           mmp     1,661,137       33.10   4.06    129.84  53.34   146.72  0               56.00   2.28    45.68   141.90  mmp     e
3.57    55.28           mok     1,662,525       29.30   4.90    126.77  55.03   145.89  0               71.49   1.33    34.80   152.67  mok     e
-11.62  21.24           mpd     2,957,635       54.92   10.99   30.15   114.87  73.81   0               8.91    22.61   108.10  80.08   mpd     e
-1.20   27.03           mpi     2,843,290       47.40   10.08   45.55   93.14   98.91   0               18.52   11.29   86.59   101.38  mpi     e
-5.62   9.56            mpl     2,922,917       55.35   17.85   18.06   118.62  69.16   0               8.51    23.46   109.35  78.84   mpl     e
-3.32   12.65           mpy     3,072,769       44.61   5.17    36.26   85.75   105.86  0               23.61   8.49    78.61   109.28  mpy     e
1.39    -2.11           mse     2,191,517       46.23   11.42   18.44   97.91   107.84  0               20.55   10.03   83.23   104.71  mse     c
0.32    36.85           msi     1,853,160       31.03   2.05    100.94  51.32   152.61  0               64.09   1.73    39.77   147.76  msi     e
0.48    25.75           mst     1,767,403       27.63   1.45    104.89  40.43   154.03  0               79.14   0.97    30.04   157.39  mst     e
6.88    6.54            mth     1,751,377       49.54   20.79   21.74   109.95  87.88   0               15.21   13.91   92.73   95.30   mth     e
-10.02  0.25            mtp     1,879,471       53.55   10.06   10.51   102.12  67.33   21      A       10.27   20.08   104.18  83.96   mtp     e
-0.97   21.18           mzh     2,138,444       39.16   3.70    57.65   71.98   117.57  0               36.48   4.68    63.01   124.74  mzh     e
-1.29   48.15           nbv     1,232,128       33.16   1.01    103.93  50.47   145.33  0               55.79   2.29    45.85   141.74  nbv     t
6.96    46.95           neq     490,885         31.56   8.82    108.91  55.46   145.91  0               61.96   1.86    41.27   146.27  neq     n
-8.49   16.59           nga     2,833,868       48.35   3.90    33.58   86.74   98.54   0               16.99   12.39   89.30   98.70   nga     t
-32.18  0.54            nge     3,788,356       62.24   8.18    4.45    115.49  53.95   0               3.92    40.35   129.04  59.34   nge     n
-0.70   48.82           nkr     1,639,964       34.18   1.91    100.89  51.93   141.03  0               52.06   2.61    48.78   138.83  nkr     t
-30.63  -0.37           nmg     3,751,858       61.42   7.37    3.95    113.33  56.17   0               4.31    37.99   126.71  61.65   nmg     e
-0.91   42.11           nmr     1,645,259       34.17   1.70    94.23   51.17   142.69  0               52.12   2.60    48.73   138.88  nmr     t
-35.29  1.48            nou     4,013,216       64.94   13.64   4.30    126.63  45.61   0               2.82    48.93   136.77  51.69   nou     n
-32.55  2.50            nph     2,595,221       63.44   11.48   5.88    126.44  54.53   0               3.39    44.03   132.49  55.93   nph     e
13.01   22.07           pai     2,222,430       51.36   29.51   34.84   101.63  90.23   0               12.77   16.50   97.93   90.15   pai     c
-7.39   -4.04           pdl     2,023,836       53.91   13.35   5.85    105.21  68.86   0               9.89    20.74   105.23  82.92   pdl     c
-9.35   -4.96           pfm     1,843,267       54.91   13.24   3.96    103.87  70.61   65    42T,23A   8.92    22.59   108.07  80.11   pfm     c
4.36    6.62            pho     1,738,505       41.88   10.70   36.16   84.00   129.27  0               29.54   6.34    70.80   117.02  pho     e
0.66    25.04           ppac    1,859,370       43.04   7.85    51.93   79.22   121.89  0               26.89   7.19    74.13   113.72  ppac    e
-1.60   32.02           pto     1,545,895       35.97   1.64    78.02   71.21   129.35  0               46.00   3.23    53.89   133.77  pto     e
-44.05  -0.34           sali    3,255,260       66.59   10.72   1.94    134.08  41.08   0               2.28    54.77   141.49  47.01   sali    e
3.58    -2.67           smr     1,570,485       35.73   6.72    44.13   59.75   133.74  0               46.80   3.14    53.20   134.46  smr     c
1.24    0.92            sso     2,992,245       35.79   4.40    47.52   63.17   141.04  21      A       46.60   3.16    53.37   134.29  sso     c
0.64    19.98           taa     3,430,706       34.14   3.24    72.20   57.14   140.59  0               52.22   2.59    48.65   138.96  taa     t
-5.72   4.73            tac     1,564,906       45.99   4.08    25.70   91.60   99.27   0               20.97   9.80    82.57   105.36  tac     e
3.95    3.33            tag     1,316,595       46.73   14.51   22.98   89.89   110.37  0               19.65   10.56   84.69   103.27  tag     c
-6.49   -0.04           tar     1,461,105       58.30   23.39   6.13    128.42  65.20   0               6.17    29.89   117.79  70.48   tar     e
1.40    0.08            thg     1,356,318       55.64   25.44   8.33    109.38  69.71   0               8.25    24.04   110.17  78.03   thg     c
-3.90   12.71           tko     2,088,737       52.00   13.58   24.71   107.19  94.64   0               12.00   17.48   99.74   88.36   tko     e
-5.78   9.54            ton     1,847,607       51.27   10.59   22.42   105.34  95.37   0               12.89   16.36   97.67   90.41   ton     e
-1.35   5.94            tpe     1,781,889       57.67   27.05   12.57   114.12  69.69   0               6.62    28.40   115.97  72.29   tpe     c
-11.32  3.64            tuz     1,936,063       59.66   21.91   8.94    132.34  60.74   0               5.29    33.23   121.66  66.65   tuz     c
-4.14   -11.80          vdi     2,374,137       45.43   5.10    10.23   99.76   116.46  0               22.02   9.24    80.95   106.97  vdi     c
Les 57 euryarcheota[modifier | modifier le wikicode]
Répétitions chez les archées : 57 Euryarcheota                          x3 -0.000732 0.000746              
                                                                        x2    0.1607  -0.0609           
        Voir méthode d’analyse (3.4.1) dans l’article                   x     -11.96    1.869    2.86   -2.83
                                                                        c     302.42   -19.90  -49.02   235.7
                                                                                Aléas équation      Aléas (alea)        
KEGG    effectif        %GC     >4GC    >4AT    <5GC    <5AT    Ctrl            >4ATa   >4GCa   <5GCa   <5ATa
mst     1,767,403       27.63   1.45    104.89  40.43   154.03  0               79.14   0.97    30.04   157.39
mok     1,662,525       29.30   4.90    126.77  55.03   145.89  0               71.49   1.33    34.80   152.67
msi     1,853,160       31.03   2.05    100.94  51.32   152.61  0               64.09   1.73    39.77   147.76
mfv     1,243,342       31.64   2.22    122.97  54.60   141.39  0               61.65   1.88    41.49   146.05
mfe     1,485,061       32.21   5.83    109.49  56.80   149.03  0               59.39   2.03    43.13   144.42
mig     1,854,197       32.30   7.72    112.81  57.03   149.36  0               59.04   2.05    43.39   144.17
mmp     1,661,137       33.10   4.06    129.84  53.34   146.72  0               56.00   2.28    45.68   141.90
mel     2,583,753       35.83   4.09    81.15   65.84   138.17  0               46.47   3.18    53.49   134.17
pto     1,545,895       35.97   1.64    78.02   71.21   129.35  0               46.00   3.23    53.89   133.77
mev     2,242,317       36.63   3.47    80.78   66.26   126.72  0               43.90   3.49    55.78   131.90
mzh     2,138,444       39.16   3.70    57.65   71.98   117.57  0               36.48   4.68    63.01   124.74
abi     1,486,778       39.16   7.57    58.52   73.06   124.04  0               36.47   4.68    63.01   124.74
mba     4,837,408       39.28   4.32    81.55   71.15   125.68  23      T       36.15   4.74    63.35   124.40
mbu     2,575,032       40.76   4.58    45.66   72.20   120.03  0               32.27   5.60    67.59   120.20
mer     1,931,651       41.26   3.56    48.37   67.79   114.17  0               31.04   5.92    69.01   118.79
pho     1,738,505       41.88   10.70   36.16   84.00   129.27  0               29.54   6.34    70.80   117.02
mmh     2,012,424       42.62   6.96    53.04   85.99   112.84  0               27.84   6.87    72.91   114.93
mhz     2,428,904       42.62   5.02    43.42   79.92   108.24  0               27.83   6.87    72.93   114.91
mac     5,751,492       42.68   8.12    75.38   82.45   115.53  0               27.70   6.91    73.09   114.75
ppac    1,859,370       43.04   7.85    51.93   79.22   121.89  0               26.89   7.19    74.13   113.72
fpl     2,196,266       44.14   6.72    57.89   75.22   120.02  0               24.57   8.07    77.25   110.63
mpy     3,072,769       44.61   5.17    36.26   85.75   105.86  0               23.61   8.49    78.61   109.28
mhu     3,544,738       45.15   9.69    46.06   93.26   99.40   28      A       22.55   8.98    80.16   107.76
tac     1,564,906       45.99   4.08    25.70   91.60   99.27   0               20.97   9.80    82.57   105.36
gac     1,860,815       46.84   8.76    47.12   88.51   102.26  0               19.47   10.67   84.99   102.97
mpi     2,843,290       47.40   10.08   45.55   93.14   98.91   0               18.52   11.29   86.59   101.38
hwa     3,132,494       47.86   5.52    14.14   75.24   97.67   0               17.76   11.82   87.92   100.07
afu     2,178,400       48.58   12.81   37.95   92.36   105.98  0               16.63   12.68   89.98   98.03
mear    1,488,669       49.21   9.72    29.54   94.36   94.67   0               15.70   13.47   91.76   96.26
mth     1,751,377       49.54   20.79   21.74   109.95  87.88   0               15.21   13.91   92.73   95.30
mla     1,804,962       50.01   8.98    46.73   97.56   88.23   0               14.56   14.54   94.05   93.99
ton     1,847,607       51.27   10.59   22.42   105.34  95.37   0               12.89   16.36   97.67   90.41
tko     2,088,737       52.00   13.58   24.71   107.19  94.64   0               12.00   17.48   99.74   88.36
mtp     1,879,471       53.55   10.06   10.51   102.12  67.33   21      A       10.27   20.08   104.18  83.96
hbu     1,667,163       53.74   15.25   5.99    106.78  73.51   0               10.07   20.42   104.72  83.42
marc    1,937,883       54.00   14.15   11.70   116.40  78.15   0               9.80    20.90   105.49  82.67
mbn     2,542,943       54.51   18.06   41.04   120.92  76.82   0               9.29    21.84   106.95  81.22
mpd     2,957,635       54.92   10.99   30.15   114.87  73.81   0               8.91    22.61   108.10  80.08
mpl     2,922,917       55.35   17.85   18.06   118.62  69.16   0               8.51    23.46   109.35  78.84
tar     1,461,105       58.30   23.39   6.13    128.42  65.20   0               6.17    29.89   117.79  70.48
mbg     2,789,774       60.64   28.57   9.29    131.98  57.74   0               4.73    35.83   124.48  63.86
hbo     2,820,544       61.06   7.75    5.24    112.63  63.07   0               4.50    36.99   125.69  62.66
mka     1,694,969       61.16   18.52   3.88    133.61  57.76   0               4.45    37.26   125.96  62.39
nmg     3,751,858       61.42   7.37    3.95    113.33  56.17   0               4.31    37.99   126.71  61.65
hlr     2,789,326       61.95   9.34    6.12    114.75  57.54   0               4.05    39.51   128.22  60.16
hma1    3,131,724       62.36   8.59    4.88    122.56  54.74   0               3.86    40.73   129.41  58.98
hut     3,116,795       62.90   12.77   4.43    124.35  52.09   0               3.62    42.35   130.94  57.46
hsu     2,085,482       63.29   17.36   6.49    128.61  51.44   0               3.45    43.56   132.06  56.35
nph     2,595,221       63.44   11.48   5.88    126.44  54.53   0               3.39    44.03   132.49  55.93
hmu     221,862         64.15   9.60    3.29    122.27  45.13   0               3.11    46.32   134.52  53.91
hru     3,223,876       64.34   9.98    3.26    125.30  47.73   0               3.04    46.92   135.05  53.39
htu     3,889,038       65.83   10.40   2.86    128.48  44.13   0               2.51    52.05   139.33  49.15
hxa     3,668,009       65.98   9.51    3.07    129.03  45.71   0               2.47    52.58   139.76  48.72
sali    3,255,260       66.59   10.72   1.94    134.08  41.08   0               2.28    54.77   141.49  47.01
hvo     2,847,757       66.64   11.77   4.14    130.59  46.93   0               2.26    54.96   141.64  46.86
hla     2,735,295       66.72   13.76   3.26    131.01  42.38   0               2.24    55.27   141.88  46.63
hal     2,014,239       67.91   19.02   2.97    136.93  40.18   0               1.91    59.82   145.28  43.25


Les 20 crenarcheota[modifier | modifier le wikicode]
Répétitions chez les archées : 20 Crenarcheota                          x3 -0.000732 0.000746              
                                                                        x2    0.1607  -0.0609           
        Voir méthode d’analyse (3.4.1) dans l’article                   x     -11.96    1.869    2.86   -2.83
                                                                        c     302.42   -19.90  -49.02   235.7
                                                                                Aléas équation      Aléas (alea)        
KEGG    effectif        %GC     >4GC    >4AT    <5GC    <5AT    Ctrl            >4ATa   >4GCa   <5GCa   <5ATa
clg     1,546,846       30.03   4.93    90.91   52.33   155.52  0               68.29   1.49    36.91   150.59
aho     2,137,654       34.15   2.42    60.49   59.27   148.09  0               52.19   2.60    48.68   138.93
iag     1,875,953       35.69   4.59    28.40   58.22   119.15  0               46.93   3.13    53.08   134.57
smr     1,570,485       35.73   6.72    44.13   59.75   133.74  0               46.80   3.14    53.20   134.46
sso     2,992,245       35.79   4.40    47.52   63.17   141.04  21      A       46.60   3.16    53.37   134.29
ffo     1,319,206       37.47   6.67    86.30   62.35   128.69  0               41.31   3.86    58.20   129.51
cma     2,077,567       43.10   12.91   7.43    94.35   129.98  0               26.78   7.23    74.28   113.58
dka     1,365,223       45.34   12.91   15.05   89.74   100.44  0               22.19   9.16    80.70   107.22
vdi     2,374,137       45.43   5.10    10.23   99.76   116.46  0               22.02   9.24    80.95   106.97
mse     2,191,517       46.23   11.42   18.44   97.91   107.84  0               20.55   10.03   83.23   104.71
tag     1,316,595       46.73   14.51   22.98   89.89   110.37  0               19.65   10.56   84.69   103.27
pai     2,222,430       51.36   29.51   34.84   101.63  90.23   0               12.77   16.50   97.93   90.15
pdl     2,023,836       53.91   13.35   5.85    105.21  68.86   0               9.89    20.74   105.23  82.92
pfm     1,843,267       54.91   13.24   3.96    103.87  70.61   65   42T,23A    8.92    22.59   108.07  80.11
thg     1,356,318       55.64   25.44   8.33    109.38  69.71   0               8.25    24.04   110.17  78.03
ape     1,669,696       56.31   40.50   6.58    123.07  66.34   0               7.68    25.42   112.09  76.13
iho     1,297,538       56.52   35.80   7.26    120.98  88.54   0               7.51    25.87   112.69  75.54
asc     1,496,453       57.22   25.37   5.64    127.10  70.98   0               6.96    27.39   114.68  73.56
tpe     1,781,889       57.67   27.05   12.57   114.12  69.69   0               6.62    28.40   115.97  72.29
tuz     1,936,063       59.66   21.91   8.94    132.34  60.74   0               5.29    33.23   121.66  66.65
Les 30 autres archées[modifier | modifier le wikicode]
Répétitions chez les archées : 30 autres archées                        x3 -0.000732 0.000746              
                                                                        x2    0.1607  -0.0609           
        Voir méthode d’analyse (3.4.1) dans l’article                   x     -11.96    1.869    2.86   -2.83
                                                                        c     302.42   -19.90  -49.02   235.7
                                                                                Aléas équation      Aléas (alea)        
KEGG    effectif        %GC     >4GC    >4AT    <5GC    <5AT    Ctrl            >4ATa   >4GCa   <5GCa   <5ATa
clg     1,546,846       30.03   4.93    90.91   52.33   155.52  0               68.29   1.49    36.91   150.59
neq     490,885         31.56   8.82    108.91  55.46   145.91  0               61.96   1.86    41.27   146.27
nbv     1,232,128       33.16   1.01    103.93  50.47   145.33  0               55.79   2.29    45.85   141.74
taa     3,430,706       34.14   3.24    72.20   57.14   140.59  0               52.22   2.59    48.65   138.96
aho     2,137,654       34.15   2.42    60.49   59.27   148.09  0               52.19   2.60    48.68   138.93
nmr     1,645,259       34.17   1.70    94.23   51.17   142.69  0               52.12   2.60    48.73   138.88
nkr     1,639,964       34.18   1.91    100.89  51.93   141.03  0               52.06   2.61    48.78   138.83
iag     1,875,953       35.69   4.59    28.40   58.22   119.15  0               46.93   3.13    53.08   134.57
smr     1,570,485       35.73   6.72    44.13   59.75   133.74  0               46.80   3.14    53.20   134.46
sso     2,992,245       35.79   4.40    47.52   63.17   141.04  21      A       46.60   3.16    53.37   134.29
ffo     1,319,206       37.47   6.67    86.30   62.35   128.69  0               41.31   3.86    58.20   129.51
cma     2,077,567       43.10   12.91   7.43    94.35   129.98  0               26.78   7.23    74.28   113.58
dka     1,365,223       45.34   12.91   15.05   89.74   100.44  0               22.19   9.16    80.70   107.22
vdi     2,374,137       45.43   5.10    10.23   99.76   116.46  0               22.02   9.24    80.95   106.97
mse     2,191,517       46.23   11.42   18.44   97.91   107.84  0               20.55   10.03   83.23   104.71
tag     1,316,595       46.73   14.51   22.98   89.89   110.37  0               19.65   10.56   84.69   103.27
nga     2,833,868       48.35   3.90    33.58   86.74   98.54   0               16.99   12.39   89.30   98.70
kcr     1,590,757       49.00   23.53   12.23   98.06   86.14   0               16.00   13.21   91.17   96.84
pai     2,222,430       51.36   29.51   34.84   101.63  90.23   0               12.77   16.50   97.93   90.15
csu     1,680,938       51.65   10.00   30.05   101.25  86.91   0               12.42   16.94   98.75   89.34
pdl     2,023,836       53.91   13.35   5.85    105.21  68.86   0               9.89    20.74   105.23  82.92
pfm     1,843,267       54.91   13.24   3.96    103.87  70.61   65   42T,23A    8.92    22.59   108.07  80.11
thg     1,356,318       55.64   25.44   8.33    109.38  69.71   0               8.25    24.04   110.17  78.03
ape     1,669,696       56.31   40.50   6.58    123.07  66.34   0               7.68    25.42   112.09  76.13
iho     1,297,538       56.52   35.80   7.26    120.98  88.54   0               7.51    25.87   112.69  75.54
asc     1,496,453       57.22   25.37   5.64    127.10  70.98   0               6.96    27.39   114.68  73.56
tpe     1,781,889       57.67   27.05   12.57   114.12  69.69   0               6.62    28.40   115.97  72.29
tuz     1,936,063       59.66   21.91   8.94    132.34  60.74   0               5.29    33.23   121.66  66.65
nge     3,788,356       62.24   8.18    4.45    115.49  53.95   0               3.92    40.35   129.04  59.34
nou     4,013,216       64.94   13.64   4.30    126.63  45.61   0               2.82    48.93   136.77  51.69


Tableau des écarts relatifs / aléa[modifier | modifier le wikicode]

Répétitions chez les archées. Voir méthode d’analyse (3.4.1) dans l’article

Euryarcheota                                    Crenarcheota                    
                                                                
KEGG    %GC     >4GC%   >4AT%           KEGG    %GC     >4GC%   >4AT%
mst     27.63   49      33              aho     34.15   -7      16
mok     29.30   268     77              ape     56.31   59      -14
msi     31.03   18      57              asc     57.22   -7      -19
mfv     31.64   18      99              clg     30.03   230     33
mfe     32.21   187     84              cma     43.10   79      -72
mig     32.30   276     91              dka     45.34   41      -32
mmp     33.10   78      132             ffo     37.47   73      109
mel     35.83   29      75              iag     35.69   47      -39
pto     35.97   -49     70              iho     56.52   38      -3
mev     36.63   -1      84              mse     46.23   14      -10
mzh     39.16   -21     58              pai     51.36   79      173
abi     39.16   62      60              pdl     53.91   -36     -41
mba     39.28   -9      126             pfm     54.91   -41     -56
mbu     40.76   -18     41              smr     35.73   114     -6
mer     41.26   -40     56              sso     35.79   39      2
pho     41.88   69      22              tag     46.73   37      17
mmh     42.62   1       90              thg     55.64   6       1
mhz     42.62   -27     56              tpe     57.67   -5      90
mac     42.68   18      172             tuz     59.66   -34     69
ppac    43.04   9       93              vdi     45.43   -45     -54
fpl     44.14   -17     136                                     
mpy     44.61   -39     54                      Autres                  
mhu     45.15   8       104                                     
tac     45.99   -58     23              csu     51.65   -41     142
gac     46.84   -18     142             kcr     49.00   78      -24
mpi     47.40   -11     146             nbv     33.16   -56     86
hwa     47.86   -53     -20             neq     31.56   374     76
afu     48.58   1       128             nga     48.35   -69     98
mear    49.21   -28     88              nge     62.24   -80     14
mth     49.54   49      43              nkr     34.18   -27     94
mla     50.01   -38     221             nmr     34.17   -35     81
ton     51.27   -35     74              nou     64.94   -72     52
tko     52.00   -22     106             taa     34.14   25      38
mtp     53.55   -50     2                                       
hbu     53.74   -25     -40                                     
marc    54.00   -32     19                                      
mbn     54.51   -17     342                                     
mpd     54.92   -51     238                                     
mpl     55.35   -24     112                                     
tar     58.30   -22     -1                                      
mbg     60.64   -20     96                                      
hbo     61.06   -79     17                                      
mka     61.16   -50     -13                                     
nmg     61.42   -81     -9                                      
hlr     61.95   -76     51                                      
hma1    62.36   -79     27                                      
hut     62.90   -70     22                                      
hsu     63.29   -60     88                                      
nph     63.44   -74     74                                      
hmu     64.15   -79     6                                       
hru     64.34   -79     7                                       
htu     65.83   -80     14                                      
hxa     65.98   -82     24                                      
sali    66.59   -80     -15                                     
hvo     66.64   -79     83                                      
hla     66.72   -75     46                                      
hal     67.91   -68     56                                      

Groupes des archées selon l'écart relatif par rapport à l'aléa[modifier | modifier le wikicode]

Euryarcheota[modifier | modifier le wikicode]

Groupe 22ae                                             euryarcheota    25-43 %GC               Groupe 41ae                                
KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA                     KEGG    %GC     >4GC%   >4AT%           KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA
mst     27.63   1.45    104.89  1,767,403               pto     35.97   -49     70              mbg     60.64   28.57   9.29    2,789,774
msi     31.03   2.05    100.94  1,853,160               mer     41.26   -40     56              hbo     61.06   7.75    5.24    2,820,544
mfv     31.64   2.22    122.97  1,243,342               mhz     42.62   -27     56              mka     61.16   18.52   3.88    1,694,969
mmp     33.10   4.06    129.84  1,661,137               mzh     39.16   -21     58              nmg     61.42   7.37    3.95    3,751,858
mel     35.83   4.09    81.15   2,583,753               mbu     40.76   -18     41              hlr     61.95   9.34    6.12    2,789,326
mok     29.30   4.90    126.77  1,662,525               mba     39.28   -9      126             hma1    62.36   8.59    4.88    3,131,724
mfe     32.21   5.83    109.49  1,485,061               mev     36.63   -1      84              hut     62.90   12.77   4.43    3,116,795
mmh     42.62   6.96    53.04   2,012,424               mmh     42.62   1       90              hsu     63.29   17.36   6.49    2,085,482
abi     39.16   7.57    58.52   1,486,778               ppac    43.04   9       93              nph     63.44   11.48   5.88    2,595,221
mig     32.30   7.72    112.81  1,854,197               msi     31.03   18      57              hmu     64.15   9.60    3.29    221,862
ppac    43.04   7.85    51.93   1,859,370               mfv     31.64   18      99              hru     64.34   9.98    3.26    3,223,876
mac     42.68   8.12    75.38   5,751,492               mac     42.68   18      172             htu     65.83   10.40   2.86    3,889,038
pho     41.88   10.70   36.16   1,738,505               mel     35.83   29      75              hxa     65.98   9.51    3.07    3,668,009
                                                        mst     27.63   49      33              sali    66.59   10.72   1.94    3,255,260
moyen.  36      6       90      2,073,781               abi     39.16   62      60              hvo     66.64   11.77   4.14    2,847,757
ecartt  6       3       32      1,149,592               pho     41.88   69      22              hla     66.72   13.76   3.26    2,735,295
%       16      50      36      55                      mmp     33.10   78      132             hal     67.91   19.02   2.97    2,014,239
                                                        mfe     32.21   187     84                                              
Groupe 23ae                                             mok     29.30   268     77              moyen.  64      13      4       2,743,002
KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA                     mig     32.30   276     91              ecartt  2       5       2       881,493
pto     35.97   1.64    78.02   1,545,895                                                       %       4       42      40      32
mev     36.63   3.47    80.78   2,242,317                                                                                       
mzh     39.16   3.70    57.65   2,138,444                                                                                       
mba     39.28   4.32    81.55   4,837,408                                                                                       
mbu     40.76   4.58    45.66   2,575,032                                                                                       
mer     41.26   3.56    48.37   1,931,651                                                                                       
mhz     42.62   5.02    43.42   2,428,904                                                                                       
                                                                                                                        
moyen.  39      4       62      2,528,522                                                                                       
ecartt  2       1       17      1,072,297                                                                                       
%       6       29      28      42                                                                                      
                                                                                                                        
Groupe 67ae2                                            euryarcheota    43-60 %GC              euryarcheota        60-75 %GC          
KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA                     KEGG    %GC     >4GC%   >4AT%          KEGG     %GC     >4GC%   >4AT%       
tac     45.99   4.08    25.70   1,564,906               tac     45.99   -58     23              hxa     65.98   -82     24      
mpy     44.61   5.17    36.26   3,072,769               hwa     47.86   -53     -20             nmg     61.42   -81     -9      
hwa     47.86   5.52    14.14   3,132,494               mpd     54.92   -51     238             htu     65.83   -80     14      
fpl     44.14   6.72    57.89   2,196,266               mtp     53.55   -50     2               sali    66.59   -80     -15     
gac     46.84   8.76    47.12   1,860,815               mpy     44.61   -39     54              hbo     61.06   -79     17      
mla     50.01   8.98    46.73   1,804,962               mla     50.01   -38     221             hma1    62.36   -79     27      
mear    49.21   9.72    29.54   1,488,669               ton     51.27   -35     74              hmu     64.15   -79     6       
mtp     53.55   10.06   10.51   1,879,471               marc    54.00   -32     19              hru     64.34   -79     7       
mpi     47.40   10.08   45.55   2,843,290               mear    49.21   -28     88              hvo     66.64   -79     83      
ton     51.27   10.59   22.42   1,847,607               hbu     53.74   -25     -40             hlr     61.95   -76     51      
mpd     54.92   10.99   30.15   2,957,635               mpl     55.35   -24     112             hla     66.72   -75     46      
tko     52.00   13.58   24.71   2,088,737               tko     52.00   -22     106             nph     63.44   -74     74      
marc    54.00   14.15   11.70   1,937,883               tar     58.30   -22     -1              hut     62.90   -70     22      
hbu     53.74   15.25   5.99    1,667,163               gac     46.84   -18     142             hal     67.91   -68     56      
mpl     55.35   17.85   18.06   2,922,917               fpl     44.14   -17     136             hsu     63.29   -60     88      
mbn     54.51   18.06   41.04   2,542,943               mbn     54.51   -17     342             mka     61.16   -50     -13     
tar     58.30   23.39   6.13    1,461,105               mpi     47.40   -11     146             mbg     60.64   -20     96      
                                                        afu     48.58   1       128                                             
moyen.  51      11      28      2,192,331               mhu     45.15   8       104                                             
ecartt  4       5       16      590,374                 mth     49.54   49      43                                              
%       8       45      57      27                                                                                      
                                                                                                                        
Groupe 67ae1                                                                                                                    
KEGG    %GC     >4GC     >4AT   DNA                                                                                       
mhu     45.15   9.69    46.06   3,544,738                                                                                       
afu     48.58   12.81   37.95   2,178,400                                                                                       
mth     49.54   20.79   21.74   1,751,377                                                                                       
                                                                                                                        
moyen.  48      14      35      2,491,505                                                                                       
ecartt  2       6       12      936,783                                                                                 
%       5       40      35      38                                                                                      

Crenarcheota[modifier | modifier le wikicode]

Groupe 22ac                                     crenarcheota    25-43 %GC               Groupe 67ac1                               
KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA             KEGG    %GC     >4GC%   >4AT%           KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA    
clg     30.03   4.93    90.91   1,546,846       aho     34.15   -7      16              ape     56.31   40.5    6.58    1,669,696
cma     43.1    12.91   7.43    2,077,567       sso     35.79   39      2               dka     45.34   12.91   15.05   1,365,223
ffo     37.47   6.67    86.3    1,319,206       iag     35.69   47      -39             iho     56.52   35.8    7.26    1,297,538
iag     35.69   4.59    28.4    1,875,953       ffo     37.47   73      109             mse     46.23   11.42   18.44   2,191,517
smr     35.73   6.72    44.13   1,570,485       cma     43.1    79      -72             pai     51.36   29.51   34.84   2,222,430
sso     35.79   4.4     47.52   2,992,245       smr     35.73   114     -6              tag     46.73   14.51   22.98   1,316,595
                                                clg     30.03   230     33              thg     55.64   25.44   8.33    1,356,318
moyen.  36      7       51      1,678,011                                                                                       
ecartt  5       3       36      298,468         crenarcheota    43-60 %GC               moyen.  51      24      16      1,631,331
%       13      47      71      18              KEGG    %GC     >4GC%   >4AT%           ecartt  5       12      10      412,634
                                                vdi     45.43   -45     -54             %       10      48      63      25
Groupe 23ac                                     pfm     54.91   -41     -56                                             
KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA             pdl     53.91   -36     -41             Groupe 67ac2                         
aho     34.15   2.42    60.49   2,137,654       tuz     59.66   -34     69              KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA  
                                                asc     57.22   -7      -19             asc     57.22   25.37   5.64    1,496,453
                                                tpe     57.67   -5      90              pdl     53.91   13.35   5.85    2,023,836
                                                thg     55.64   6       1               pfm     54.91   13.24   3.96    1,843,267
                                                mse     46.23   14      -10             tpe     57.67   27.05   12.57   1,781,889
                                                tag     46.73   37      17              tuz     59.66   21.91   8.94    1,936,063
                                                iho     56.52   38      -3              vdi     45.43   5.1     10.23   2,374,137
                                                dka     45.34   41      -32                                             
                                                ape     56.31   59      -14             moyen.  55      18      8       1,909,274
                                                pai     51.36   79      173             ecartt  5       9       3       290,153
                                                                                        %       9       48      41      15

Autre-archeota[modifier | modifier le wikicode]

Autres                                                  Autres  écarts  
KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA             ordre   %GC     >4GC%   >4AT%
kcr     49.00   23.53   12.23   1,590,757       kor     49.00   78      -24
neq     31.56   8.82    108.91  490,885         nano    31.56   374     76
nge     62.24   8.18    4.45    3,788,356       nano    62.24   -80     14
nou     64.94   13.64   4.3     4,013,216       nano    64.94   -72     52
nbv     33.16   1.01    103.93  1,232,128       thaum   33.16   -56     86
taa     34.14   3.24    72.2    3,430,706       thaum   34.14   25      38
nmr     34.17   1.7     94.23   1,645,259       thaum   34.17   -35     81
nkr     34.18   1.91    100.89  1,639,964       thaum   34.18   -27     94
nga     48.35   3.9     33.58   2,833,868       thaum   48.35   -69     98
csu     51.65   10      30.05   1,680,938       thaum   51.65   -41     142

Archées: rupture entre les groupes à progression homogène[modifier | modifier le wikicode]

  • Euryarcheota
Euryarcheota:taux >4GC                               Euryarcheota:taux >4AT                               
KEGG    %GC     >4GC    # %    groupe           KEGG    %GC     >4AT    # %   groupe
mst     27.63   1.45    11     ** 2 **          sali    66.59   1.94    32    ** I **
pto     35.97   1.64    20                      htu     65.83   2.86    4       
msi     31.03   2.05    8                       hal     67.91   2.97    3       
mfv     31.64   2.22    36                      hxa     65.98   3.07    6       
mev     36.63   3.47    3      ** 7 **          hru     64.34   3.26    0       
mer     41.26   3.56    4                       hla     66.72   3.26    1       
mzh     39.16   3.70    9                       hmu     64.15   3.29    15      
mmp     33.10   4.06    0                       mka     61.16   3.88    2    ** II **
tac     45.99   4.08    0                       nmg     61.42   3.95    5       
mel     35.83   4.09    5                       hvo     66.64   4.14    7       
mba     39.28   4.32    6                       hut     62.90   4.43    9       
mbu     40.76   4.58    6                       hma1    62.36   4.88    7       
mok     29.30   4.90    3                       hbo     61.06   5.24    11      
mhz     42.62   5.02    3                       nph     63.44   5.88    2       
mpy     44.61   5.17    6                       hbu     53.74   5.99    2       
hwa     47.86   5.52    5                       hlr     61.95   6.12    0       
mfe     32.21   5.83    13                      tar     58.30   6.13    6       
fpl     44.14   6.72    4     ** 14 **          hsu     63.29   6.49    30      
mmh     42.62   6.96    6                       mbg     60.64   9.29    12    ** III **
nmg     61.42   7.37    3                       mtp     53.55   10.51   10      
abi     39.16   7.57    2                       marc    54.00   11.70   17      
mig     32.30   7.72    0                       hwa     47.86   14.14   22      
hbo     61.06   7.75    1                       mpl     55.35   18.06   17      
ppac    43.04   7.85    3                       mth     49.54   21.74   3       
mac     42.68   8.12    5                       ton     51.27   22.42   9       
hma1    62.36   8.59    2                       tko     52.00   24.71   4       
gac     46.84   8.76    2                       tac     45.99   25.70   13      
mla     50.01   8.98    4                       mear    49.21   29.54   2       
hlr     61.95   9.34    2                       mpd     54.92   30.15   17      
hxa     65.98   9.51    1                       pho     41.88   36.16   0    ** IV **
hmu     64.15   9.60    1                       mpy     44.61   36.26   4       
mhu     45.15   9.69    0                       afu     48.58   37.95   8       
mear    49.21   9.72    3                       mbn     54.51   41.04   5       
hru     64.34   9.98    1                       mhz     42.62   43.42   5       
mtp     53.55   10.06   0                       mpi     47.40   45.55   0       
mpi     47.40   10.08   3                       mbu     40.76   45.66   1       
htu     65.83   10.40   2                       mhu     45.15   46.06   1       
ton     51.27   10.59   1                       mla     50.01   46.73   1       
pho     41.88   10.70   0                       gac     46.84   47.12   3       
sali    66.59   10.72   2                       mer     41.26   48.37   7       
mpd     54.92   10.99   4                       ppac    43.04   51.93   2       
nph     63.44   11.48   2                       mmh     42.62   53.04   8       
hvo     66.64   11.77   8                       mzh     39.16   57.65   0       
hut     62.90   12.77   0                       fpl     44.14   57.89   1       
afu     48.58   12.81   6                       abi     39.16   58.52   22      
tko     52.00   13.58   1                       mac     42.68   75.38   3    ** V **
hla     66.72   13.76   3                       pto     35.97   78.02   3       
marc    54.00   14.15   7                       mev     36.63   80.78   0       
hbu     53.74   15.25   12                      mel     35.83   81.15   0       
hsu     63.29   17.36   3     ** 25 **          mba     39.28   81.55   19      
mpl     55.35   17.85   1                       msi     31.03   100.94  4    ** VI **
mbn     54.51   18.06   2                       mst     27.63   104.89  4       
mka     61.16   18.52   3                       mfe     32.21   109.49  3       
hal     67.91   19.02   8                       mig     32.30   112.81  8       
mth     49.54   20.79   11                      mfv     31.64   122.97  3       
tar     58.30   23.39   18    ** 68 **          mok     29.30   126.77  2       
mbg     60.64   28.57                           mmp     33.10   129.84          

  • Crenarcheota
Crenarcheota:taux >4GC                               Crenarcheota:taux >4AT                               
KEGG    %GC     >4GC    # %   groupe            KEGG    %GC     >4AT    # %     groupe
aho     34.15   2.42    45    ** 2 **           pfm     54.91   3.96    30      ** I **
sso     35.79   4.40    4     ** 7 **           asc     57.22   5.64    4       ** II **
iag     35.69   4.59    7                       pdl     53.91   5.85    11      
clg     30.03   4.93    3                       ape     56.31   6.58    9       
vdi     45.43   5.10    24                      iho     56.52   7.26    2       
ffo     37.47   6.67    1                       cma     43.10   7.43    11      
smr     35.73   6.72    41                      thg     55.64   8.33    7       
mse     46.23   11.42   12    ** 14 **          tuz     59.66   8.94    13      
dka     45.34   12.91   0                       vdi     45.43   10.23   19      
cma     43.10   12.91   2                       tpe     57.67   12.57   17      ** III **
pfm     54.91   13.24   1                       dka     45.34   15.05   18      
pdl     53.91   13.35   8                       mse     46.23   18.44   20      
tag     46.73   14.51   34                      tag     46.73   22.98   19      ** IV **
tuz     59.66   21.91   14    ** 25 **          iag     35.69   28.40   18      
asc     57.22   25.37   0                       pai     51.36   34.84   21      
thg     55.64   25.44   6                       smr     35.73   44.13   7       ** V **
tpe     57.67   27.05   8                       sso     35.79   47.52   21      
pai     51.36   29.51   18                      aho     34.15   60.49   30      ** VI **
iho     56.52   35.80   12    ** 68 **          ffo     37.47   86.30   5       
ape     56.31   40.50                           clg     30.03   90.91           

Plasmides[modifier | modifier le wikicode]

Résultats[modifier | modifier le wikicode]

plasmides cyanobactéries[modifier | modifier le wikicode]

  • Plasmides cyanobactéries:
 
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
ana; 6413771; 41.3475473321389; 16139; 16308; 2701; 2590; 375551; 373179; 217679; 219026; 32204; 31846; 11639; 11672; 0
ana1; 408101; 40.5142354466174; 1101; 1022; 141; 133; 24499; 24656; 12820; 12984; 1999; 2065; 569; 559; 0
ana2; 186614; 40.2279571736311; 401; 604; 61; 50; 10515; 12201; 6252; 5491; 737; 1141; 247; 222; 0
ana3; 101965; 41.0258422007552; 262; 236; 35; 38; 6287; 5798; 3399; 3200; 495; 461; 156; 149; 0
ana4; 55414; 41.610423358718; 136; 145; 39; 24; 3210; 3249; 1863; 1750; 254; 277; 92; 84; 0
ana5; 40340; 40.8552305404065; 117; 128; 25; 15; 2283; 2450; 1326; 1298; 201; 214; 47; 59; 0
ana6; 5584; 44.1797994269341; 5; 16; 1; 2; 242; 306; 168; 245; 22; 35; 6; 11; 0
anb1; 80384; 37.2312898089172; 259; 226; 35; 24; 5357; 5127; 2462; 2251; 486; 441; 125; 117; 0
anb2; 56037; 37.2539572068455; 205; 141; 19; 22; 3673; 3336; 1711; 1556; 359; 360; 93; 96; 0
anb3; 20025; 37.41822721598; 53; 88; 14; 13; 1168; 1264; 538; 583; 111; 139; 35; 34; 0
anba; 4329264; 38.1047679236009; 13593; 14177; 1732; 1792; 273098; 273360; 136468; 136365; 25851; 25468; 6772; 6679; 0
anbb; 819965; 38.2121188099492; 2658; 2671; 345; 365; 51092; 52288; 26118; 25949; 4841; 5038; 1285; 1302; 0
can; 4114099; 34.9583225877647; 19398; 19033; 2471; 2506; 269395; 269454; 115224; 114077; 29524; 29218; 7231; 7224; 0
can1; 62874; 33.1711041129879; 214; 262; 21; 27; 4218; 4489; 1532; 1739; 434; 462; 76; 69; 0
cyt1; 39620; 36.7995961635538; 168; 123; 15; 20; 2700; 2570; 1062; 1204; 271; 198; 56; 56; 0
cyt2; 31856; 41.4584379708689; 68; 53; 11; 43; 1958; 2059; 1127; 1198; 142; 128; 57; 94; 0
cyt3; 14685; 38.0932924753149; 66; 58; 2; 15; 984; 817; 312; 521; 87; 75; 20; 46; 0
cyt4; 10244; 36.9679812573214; 35; 32; 10; 12; 756; 625; 266; 342; 57; 45; 4; 25; 0
cytc; 4934271; 37.875402465734; 17294; 17824; 3060; 3064; 318932; 321159; 153124; 153452; 29602; 29800; 10516; 10635; 0
cytl; 429701; 38.5686791513168; 1366; 1451; 184; 205; 27135; 27802; 13346; 12975; 2255; 2582; 681; 727; 0
syn; 3573470; 47.7202551021836; 9619; 9472; 5690; 5659; 184173; 183791; 174968; 176236; 16661; 16318; 12958; 13031; 0
syn1; 103307; 44.4790769260553; 322; 267; 97; 89; 5689; 5744; 4326; 4296; 520; 468; 317; 309; 0
syn2; 44343; 48.618722233498; 66; 66; 40; 39; 2153; 2100; 1957; 2054; 140; 151; 100; 122; 0
syn3; 119895; 42.950081321156; 363; 309; 99; 94; 6841; 6716; 4758; 4698; 659; 602; 343; 310; 0
syn4; 106004; 42.7153692313498; 286; 408; 124; 109; 5929; 6108; 4032; 4328; 493; 632; 291; 290; 0
len; 6244812; 46.6455995792988; 8355; 8414; 1607; 1668; 345998; 345528; 216003; 219001; 21647; 21473; 6689; 6967; 0
len1; 325675; 47.0134336378291; 451; 450; 82; 87; 17504; 17603; 11313; 11369; 1142; 1094; 357; 368; 0
len2; 98206; 48.5448954239049; 129; 122; 31; 20; 5036; 5057; 3756; 3676; 278; 284; 138; 148; 0
len3; 92964; 47.3467938857395; 133; 132; 30; 21; 4941; 4880; 3196; 3092; 284; 296; 105; 110; 1
mic; 7470429; 46.2148157756402; 14670; 14431; 4759; 4741; 402745; 402180; 300621; 299833; 29105; 28538; 15039; 14766; 0
mic1; 146045; 45.2702934027183; 237; 275; 72; 60; 7844; 8277; 5454; 5124; 502; 600; 235; 226; 0
mic2; 93032; 47.0999226072749; 237; 164; 78; 87; 4854; 5013; 3776; 3827; 364; 326; 172; 230; 0
mic3; 92471; 46.6167771517557; 188; 180; 69; 75; 4984; 5064; 3530; 3704; 360; 328; 246; 240; 0
mic4; 50464; 44.6536144578313; 117; 103; 29; 16; 2839; 2740; 1946; 1784; 223; 186; 79; 64; 0
mic5; 38468; 47.6603930539669; 72; 65; 20; 34; 1981; 1998; 1535; 1641; 141; 132; 61; 75; 0
mic6; 28816; 46.5852304275403; 51; 68; 24; 27; 1515; 1594; 1184; 1155; 113; 121; 49; 62; 0
mic7; 25982; 46.7631437148795; 43; 47; 15; 18; 1395; 1360; 980; 1014; 94; 96; 40; 49; 0
mic8; 20803; 46.454838244484; 36; 57; 18; 17; 1176; 1068; 752; 909; 87; 71; 43; 47; 0
oac; 7689443; 47.6010941234625; 17035; 16687; 9362; 9630; 401162; 397639; 344008; 344310; 32328; 32182; 25811; 25893; 0
oac1; 64128; 47.6157060878243; 138; 165; 59; 70; 3246; 3301; 2878; 2791; 259; 260; 176; 190; 0
oac2; 50699; 49.296830312235; 94; 105; 48; 61; 2469; 2583; 2295; 2464; 174; 208; 160; 165; 0
oni; 7479014; 45.8676504683639; 19394; 19840; 4057; 4051; 398146; 400028; 284712; 286596; 37104; 37459; 13330; 13360; 0
oni1; 300164; 45.1266640902973; 730; 625; 155; 165; 16857; 16586; 10890; 11622; 1378; 1275; 451; 556; 0
oni2; 260268; 44.6090183964222; 571; 697; 142; 123; 14078; 15124; 9227; 9498; 1039; 1244; 481; 445; 0
oni3; 150927; 45.5074307446646; 301; 382; 96; 90; 7968; 8552; 5570; 5803; 630; 669; 267; 286; 0
oni4; 74236; 44.5632846597338; 212; 182; 35; 34; 4405; 3976; 2661; 2524; 417; 336; 127; 115; 0
oni5; 7645; 47.5866579463702; 13; 32; 9; 8; 352; 412; 270; 334; 21; 40; 10; 13; 0
syf; 2695903; 55.4700224748442; 2368; 2411; 1536; 1600; 108960; 109286; 132285; 133380; 5634; 5771; 6521; 6457; 0
syf1; 46366; 52.8878919898201; 37; 43; 37; 23; 1997; 1991; 2299; 1943; 102; 121; 120; 80; 0
synp; 3510253; 40.6197502003417; 8967; 8869; 1384; 1287; 206958; 207186; 122450; 121593; 17274; 17217; 6357; 6227; 0
synp1; 63272; 40.8932861297256; 167; 136; 16; 16; 3848; 3638; 2234; 1956; 297; 271; 69; 96; 0
synp2; 10210; 39.4123408423115; 40; 15; 1; 2; 597; 558; 307; 280; 59; 48; 32; 16; 0

Plasmides autres bactéries[modifier | modifier le wikicode]

  • plasmides autres bactéries
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
cac; 3940880; 30.9257830738312; 18639; 19088; 493; 489; 256916; 256763; 95062; 95746; 30725; 30878; 1994; 2317; 0
cac1; 192000; 30.9114583333333; 998; 867; 13; 16; 12723; 12407; 4809; 4594; 1491; 1469; 106; 86; 0
cje; 1641481; 30.5485716861785; 13069; 13222; 167; 184; 98949; 100335; 34726; 34614; 18044; 18356; 980; 930; 0
cje1; 4013; 30.1520059805632; 15; 55; 1; 3; 191; 311; 68; 80; 40; 51; 2; 7; 0
ecs; 5498450; 50.537060444307; 10559; 10451; 1635; 1787; 241834; 242329; 254721; 256257; 18618; 18564; 7511; 7699; 0
ecs1; 92721; 47.5997886131513; 173; 301; 27; 88; 3966; 4058; 3466; 4617; 309; 398; 118; 198; 0
ecs2; 3306; 43.40592861464; 24; 7; 1; 4; 194; 134; 100; 112; 18; 6; 5; 2; 0
ent; 4518712; 52.9817567483832; 7358; 7158; 1259; 1236; 182660; 182997; 215031; 214183; 14654; 14731; 6272; 6068; 0
ent1; 157749; 50.5702096368281; 243; 316; 55; 86; 6499; 6654; 7018; 7556; 528; 552; 252; 351; 0
kpn; 5315120; 57.4785705684914; 6826; 6881; 2566; 2436; 176067; 174204; 303726; 304645; 12619; 12681; 10259; 10156; 0
kpn3; 175879; 51.6906509588979; 295; 312; 81; 93; 6845; 7254; 8320; 8821; 537; 586; 285; 348; 0
kpn4; 107576; 53.4403584442627; 176; 178; 31; 69; 3951; 4187; 5347; 5835; 306; 362; 186; 262; 0
kpn5; 88582; 53.8168025106681; 143; 161; 47; 49; 3458; 3323; 4646; 4543; 247; 264; 171; 171; 0
kpn6; 4259; 41.4181732801127; 16; 18; 0; 3; 208; 215; 124; 171; 25; 28; 5; 5; 0
kpn7; 3478; 45.6584243818286; 8; 9; 1; 4; 194; 162; 126; 137; 21; 13; 8; 5; 0
pst; 6397126; 58.3988809974979; 5446; 5592; 1994; 1943; 221412; 222767; 358716; 358180; 11560; 11674; 9557; 9458; 0
pst1; 73661; 55.145870949349; 81; 86; 41; 52; 2799; 2747; 3736; 3971; 156; 215; 133; 143; 0
pst2; 67473; 56.1661701717724; 86; 86; 33; 51; 2376; 2390; 3511; 3796; 143; 179; 115; 125; 0
sco; 8667507; 72.1186611098208; 172; 218; 10660; 10577; 127391; 126460; 701446; 707949; 972; 1019; 34063; 33951; 0
sco1; 356023; 69.0593023484438; 11; 17; 472; 385; 6041; 6932; 28091; 25882; 81; 112; 1360; 1092; 0
sco2; 31317; 72.1173803365584; 5; 6; 33; 72; 556; 399; 2360; 2881; 3; 4; 99; 181; 0
sfl; 4607202; 50.8900181956189; 8134; 8316; 1312; 1303; 201549; 201821; 215654; 213169; 15093; 15382; 6312; 5871; 49
sfl1; 221618; 45.7670405833461; 619; 570; 110; 124; 10419; 10128; 8643; 9294; 994; 932; 307; 362; 0
stm; 4857432; 52.2215030493479; 9188; 9233; 1560; 1621; 199721; 198927; 237684; 237879; 16617; 16211; 6925; 6782; 0
stm1; 93939; 53.1280937629738; 160; 185; 44; 76; 3310; 3527; 4736; 5221; 265; 332; 191; 207; 0
tos; 2072393; 68.5534548707702; 717; 721; 11907; 12188; 48268; 48509; 171568; 172114; 2802; 2818; 17743; 17863; 0
tos1; 271713; 68.599956571824; 93; 84; 1499; 1469; 6246; 6222; 23005; 22854; 358; 342; 2212; 2278; 0
tos2; 57223; 68.4305261870227; 14; 24; 317; 315; 1220; 1382; 4374; 4764; 53; 58; 458; 521; 0
xac; 5175554; 64.7718872221215; 1468; 1427; 1526; 1434; 140462; 140210; 339957; 339208; 3770; 3692; 7876; 7914; 0
xac1; 33700; 61.8653372503635; 28; 26; 11; 27; 993; 1062; 2180; 2052; 43; 27; 54; 107; 1
xac2; 64920; 61.392483056069; 41; 29; 40; 24; 2223; 1940; 3816; 4022; 78; 74; 147; 99; 0
ype; 4653728; 47.6361102324846; 8789; 8951; 2595; 2930; 224229; 225184; 201213; 204623; 16816; 16685; 7641; 8107; 0
ype1; 70305; 44.8360714031719; 174; 138; 39; 39; 3711; 3574; 2638; 2648; 284; 254; 119; 125; 0
ype2; 9612; 45.2663337494798; 30; 37; 8; 4; 409; 474; 368; 363; 29; 55; 14; 14; 0
ype3; 96210; 50.2276270657936; 161; 137; 29; 24; 4519; 4021; 4291; 4145; 333; 239; 154; 115; 0

Tableaux des diagrammes[modifier | modifier le wikicode]

Tableaux plasmides cyanobactéries[modifier | modifier le wikicode]

Plasmides %GC[modifier | modifier le wikicode]
                                               Aléas équation   
KEGG    effectif        %GC     >4AT    >4GC    >4ATa   >4GCa
ana     6,413,771       41.35   50.59   8.25    30.81   5.98
ana1    408,101         40.51   52.02   6.71    32.89   5.45
ana2    186,614         40.23   53.85   5.95    33.62   5.28
ana3    101,965         41.03   48.84   7.16    31.60   5.77
ana4    55,414          41.61   50.71   11.37   30.18   6.15
ana5    40,340          40.86   60.73   9.92    32.03   5.66
ana6    5,584           44.18   37.61   5.37    24.48   8.11
anb1    80,384          37.23   60.34   7.34    42.04   3.75
anb2    56,037          37.25   61.74   7.32    41.97   3.76
anb3    20,025          37.42   70.41   13.48   41.48   3.83
anba    4,329,264       38.10   64.14   8.14    39.45   4.15
anbb    819,965         38.21   64.99   8.66    39.14   4.20
can     4,114,099       34.96   93.41   12.10   49.37   2.86
can1    62,874          33.17   75.71   7.63    55.74   2.30
cyt1    39,620          36.80   73.45   8.83    43.37   3.56
cyt2    31,856          41.46   37.98   16.95   30.55   6.05
cyt3    14,685          38.09   84.44   11.58   39.48   4.14
cyt4    10,244          36.97   65.40   21.48   42.85   3.64
cytc    4,934,271       37.88   71.17   12.41   40.12   4.04
cytl    429,701         38.57   65.56   9.05    38.12   4.37
len     6,244,812       46.65   26.85   5.24    19.80   10.47
len1    325,675         47.01   27.67   5.19    19.17   10.86
len2    98,206          48.54   25.56   5.19    16.69   12.64
len3    92,964          47.35   28.51   5.49    18.61   11.23
mic     7,470,429       46.21   38.95   12.72   20.57   10.02
mic1    146,045         45.27   35.06   9.04    22.32   9.09
mic2    93,032          47.10   43.10   17.74   19.02   10.95
mic3    92,471          46.62   39.80   15.57   19.85   10.44
mic4    50,464          44.65   43.60   8.92    23.53   8.53
mic5    38,468          47.66   35.61   14.04   18.09   11.58
mic6    28,816          46.59   41.30   17.70   19.91   10.40
mic7    25,982          46.76   34.64   12.70   19.60   10.59
mic8    20,803          46.45   44.71   16.82   20.14   10.27
oac     7,689,443       47.60   43.85   24.70   18.19   11.52
oac1    64,128          47.62   47.25   20.12   18.16   11.53
oac2    50,699          49.30   39.25   21.50   15.56   13.59
oni     7,479,014       45.87   52.46   10.84   21.20   9.67
oni1    300,164         45.13   45.14   10.66   22.60   8.96
oni2    260,268         44.61   48.72   10.18   23.61   8.49
oni3    150,927         45.51   45.25   12.32   21.87   9.32
oni4    74,236          44.56   53.07   9.29    23.71   8.45
oni5    7,645           47.59   58.86   22.24   18.21   11.50
syf     2,695,903       55.47   17.73   11.63   8.40    23.70
syf1    46,366          52.89   17.25   12.94   10.98   18.94
syn     3,573,470       47.72   53.42   31.76   17.99   11.65
syn1    103,307         44.48   57.01   18.00   23.87   8.37
syn2    44,343          48.62   29.77   17.82   16.57   12.73
syn3    119,895         42.95   56.05   16.10   27.10   7.12
syn4    106,004         42.72   65.47   21.98   27.62   6.94
synp    3,510,253       40.62   50.81   7.61    32.62   5.51
synp1   63,272          40.89   47.89   5.06    31.93   5.68
synp2   10,210          39.41   53.87   2.94    35.78   4.81
Plasmides hôte[modifier | modifier le wikicode]
KEGG    >4ATh   >4AT    diag            KEGG    >4GCh   >4GC    diag
ana1    50.59   52.02   50.59           ana1    8.25    6.71    8.25
ana2    50.59   53.85   50.59           ana2    8.25    5.95    8.25
ana3    50.59   48.84   50.59           ana3    8.25    7.16    8.25
ana4    50.59   50.71   50.59           ana4    8.25    11.37   8.25
ana5    50.59   60.73   50.59           ana5    8.25    9.92    8.25
ana6    50.59   37.61   50.59           ana6    8.25    5.37    8.25
anb1    64.14   60.34   64.14           anb1    8.14    7.34    8.14
anb2    64.14   61.74   64.14           anb2    8.14    7.32    8.14
anb3    64.14   70.41   64.14           anb3    8.14    13.48   8.14
anbb    64.14   64.99   64.14           anbb    8.14    8.66    8.14
can1    93.41   75.71   93.41           can1    12.10   7.63    12.10
cyt1    71.17   73.45   71.17           cyt1    12.41   8.83    12.41
cyt2    71.17   37.98   71.17           cyt2    12.41   16.95   12.41
cyt3    71.17   84.44   71.17           cyt3    12.41   11.58   12.41
cyt4    71.17   65.40   71.17           cyt4    12.41   21.48   12.41
cytl    71.17   65.56   71.17           cytl    12.41   9.05    12.41
len1    26.85   27.67   26.85           len1    5.24    5.19    5.24
len2    26.85   25.56   26.85           len2    5.24    5.19    5.24
len3    26.85   28.51   26.85           len3    5.24    5.49    5.24
mic1    38.95   35.06   38.95           mic1    12.72   9.04    12.72
mic2    38.95   43.10   38.95           mic2    12.72   17.74   12.72
mic3    38.95   39.80   38.95           mic3    12.72   15.57   12.72
mic4    38.95   43.60   38.95           mic4    12.72   8.92    12.72
mic5    38.95   35.61   38.95           mic5    12.72   14.04   12.72
mic6    38.95   41.30   38.95           mic6    12.72   17.70   12.72
mic7    38.95   34.64   38.95           mic7    12.72   12.70   12.72
mic8    38.95   44.71   38.95           mic8    12.72   16.82   12.72
oac1    43.85   47.25   43.85           oac1    24.70   20.12   24.70
oni1    52.46   45.14   52.46           oni1    10.84   10.66   10.84
oni2    52.46   48.72   52.46           oni2    10.84   10.18   10.84
oni3    52.46   45.25   52.46           oni3    10.84   12.32   10.84
oni4    52.46   53.07   52.46           oni4    10.84   9.29    10.84
oni5    52.46   58.86   52.46           oni5    10.84   22.24   10.84
syf1    17.73   17.25   17.73           syf1    11.63   12.94   11.63
syn1    53.42   57.01   53.42           syn1    31.76   18.00   31.76
syn2    53.42   29.77   53.42           syn2    31.76   17.82   31.76
syn3    53.42   56.05   53.42           syn3    31.76   16.10   31.76
syn4    53.42   65.47   53.42           syn4    31.76   21.98   31.76
synp1   50.81   47.89   50.81           synp1   7.61    5.06    7.61
synp2   50.81   53.87   50.81           synp2   7.61    2.94    7.61
oac2    43.85   39.25   43.85           oac2    24.70   21.50   24.70

Tableaux plasmides autres bactéries[modifier | modifier le wikicode]

Plasmides %GC[modifier | modifier le wikicode]
KEGG    DNA             %GC     >4GC    >4AT    >4ATa   >4GCa
cje1    4,013           30.15   9.97    174.43  67.78   1.52
cje     1,641,481       30.55   2.14    160.17  66.10   1.61
cac1    192,000         30.91   1.51    97.14   64.60   1.70
cac     3,940,880       30.93   2.49    95.73   64.54   1.70
kpn6    4,259           41.42   7.04    79.83   30.64   6.02
ecs2    3,306           43.41   15.12   93.77   26.11   7.47
ype1    70,305          44.84   11.09   44.38   23.16   8.69
ype2    9,612           45.27   12.48   69.70   22.33   9.09
kpn7    3,478           45.66   14.38   48.88   21.59   9.46
sfl1    221,618         45.77   10.56   53.65   21.39   9.57
ecs1    92,721          47.60   12.40   51.12   18.19   11.51
ype     4,653,728       47.64   11.87   38.12   18.13   11.56
ype3    96,210          50.23   5.51    30.97   14.25   14.84
ecs     5,498,450       50.54   6.22    38.21   13.84   15.28
ent1    157,749         50.57   8.94    35.44   13.79   15.33
sfl     4,607,202       50.89   5.68    35.71   13.37   15.79
kpn3    175,879         51.69   9.89    34.51   12.37   17.00
stm     4,857,432       52.22   6.55    37.92   11.74   17.84
ent     4,518,712       52.98   5.52    32.12   10.87   19.10
stm1    93,939          53.13   12.77   36.73   10.71   19.35
kpn4    107,576         53.44   9.30    32.91   10.38   19.89
kpn5    88,582          53.82   10.84   34.32   9.99    20.56
pst1    73,661          55.15   12.63   22.67   8.70    23.05
pst2    67,473          56.17   12.45   25.49   7.80    25.12
kpn     5,315,120       57.48   9.41    25.79   6.76    27.97
pst     6,397,126       58.40   6.15    17.25   6.10    30.11
xac2    64,920          61.39   9.86    10.78   4.33    37.91
xac1    33,700          61.87   11.28   16.02   4.09    39.27
xac     5,175,554       64.77   5.72    5.59    2.88    48.37
tos2    57,223          68.43   110.45  6.64    1.77    61.87
tos     2,072,393       68.55   116.27  6.94    1.74    62.37
tos1    271,713         68.60   109.23  6.51    1.73    62.55
sco1    356,023         69.06   24.07   0.79    1.62    64.43
sco2    31,317          72.12   33.53   3.51    0.94    77.97
sco     8,667,507       72.12   24.50   0.45    0.94    77.98
Plasmides hôte[modifier | modifier le wikicode]
hôte    >4GCh           >4GC    diag            hôte    >4ATh           >4AT    diag
cje     2.14    cje1    9.97    2.14            sco     0.45    sco1    0.79    0.45
cac     2.49    cac1    1.51    2.49            sco     0.45    sco2    3.51    0.45
ent     5.52    ent1    8.94    5.52            xac     5.59    xac2    10.78   5.59
sfl     5.68    sfl1    10.56   5.68            xac     5.59    xac1    16.02   5.59
xac     5.72    xac2    9.86    5.72            pst     17.25   pst1    22.67   17.25
xac     5.72    xac1    11.28   5.72            pst     17.25   pst2    25.49   17.25
pst     6.15    pst1    12.63   6.15            kpn     25.79   kpn7    48.88   25.79
pst     6.15    pst2    12.45   6.15            kpn     25.79   kpn6    79.83   25.79
ecs     6.22    ecs2    15.12   6.22            kpn     25.79   kpn3    34.51   25.79
ecs     6.22    ecs1    12.40   6.22            kpn     25.79   kpn4    32.91   25.79
stm     6.55    stm1    12.77   6.55            kpn     25.79   kpn5    34.32   25.79
kpn     9.41    kpn7    14.38   9.41            ent     32.12   ent1    35.44   32.12
kpn     9.41    kpn6    7.04    9.41            sfl     35.70   sfl1    53.65   35.70
kpn     9.41    kpn3    9.89    9.41            stm     37.92   stm1    36.73   37.92
kpn     9.41    kpn4    9.30    9.41            ype     38.12   ype1    44.38   38.12
kpn     9.41    kpn5    10.84   9.41            ype     38.12   ype2    69.70   38.12
ype     11.87   ype1    11.09   11.87           ype     38.12   ype3    30.97   38.12
ype     11.87   ype2    12.48   11.87           ecs     38.21   ecs2    93.77   38.21
ype     11.87   ype3    5.51    11.87           ecs     38.21   ecs1    51.12   38.21
sco     24.50   sco1    24.07   24.50           cac     95.73   cac1    97.14   95.73
sco     24.50   sco2    33.53   24.50           cje     160.17  cje1    174.43  160.17
tos     116.27  tos1    109.23  116.27          tos     6.94    tos1    6.51    6.94
tos     116.27  tos2    110.45  116.27          tos     6.94    tos2    6.64    6.94
Bactérie %GC − Plasmide %GC[modifier | modifier le wikicode]
KEGG    %GC b   plasm.  diag
cje1    30.55   30.15   30.55
cac1    30.93   30.91   30.93
can1    34.96   33.17   34.96
cyt1    37.88   36.80   37.88
cyt4    37.88   36.97   37.88
cyt3    37.88   38.09   37.88
cyt2    37.88   41.46   37.88
anb1    38.10   37.23   38.10
anb2    38.10   37.25   38.10
anb3    38.10   37.42   38.10
ana2    41.35   40.23   41.35
ana1    41.35   40.51   41.35
ana5    41.35   40.86   41.35
ana3    41.35   41.03   41.35
ana4    41.35   41.61   41.35
ana6    41.35   44.18   41.35
ype1    47.64   44.84   47.64
ype2    47.64   45.27   47.64
ype3    47.64   50.23   47.64
syn4    47.72   42.72   47.72
syn3    47.72   42.95   47.72
syn1    47.72   44.48   47.72
syn2    47.72   48.62   47.72
ecs2    50.54   43.41   50.54
ecs1    50.54   47.60   50.54
sfl1    50.89   45.77   50.89
stm1    52.22   53.13   52.22
ent1    52.98   50.57   52.98
kpn6    57.48   41.42   57.48
kpn7    57.48   45.66   57.48
kpn3    57.48   51.69   57.48
kpn4    57.48   53.44   57.48
kpn5    57.48   53.82   57.48
pst1    58.40   55.15   58.40
pst2    58.40   56.17   58.40
xac2    64.77   61.39   64.77
xac1    64.77   61.87   64.77
sco1    72.12   69.06   72.12
sco2    72.12   72.12   72.12
tos2    68.55   68.43   68.55
tos1    68.55   68.60   68.55
len1    46.65   47.01   46.65
len2    46.65   48.54   46.65
len3    46.65   47.35   46.65
mic1    46.21   45.27   46.21
mic2    46.21   47.10   46.21
mic3    46.21   46.62   46.21
mic4    46.21   44.65   46.21
mic5    46.21   47.66   46.21
mic6    46.21   46.59   46.21
mic7    46.21   46.76   46.21
mic8    46.21   46.45   46.21
oac1    47.60   47.62   47.60
oni1    45.87   45.13   45.87
oni2    45.87   44.61   45.87
oni3    45.87   45.51   45.87
oni4    45.87   44.56   45.87
oni5    45.87   47.59   45.87
syf1    55.47   52.89   55.47
synp1   40.62   40.89   40.62
synp2   40.62   39.41   40.62
oac2    47.60   49.30   47.60

Différences hôte − plasmide[modifier | modifier le wikicode]

Cyanobactéries[modifier | modifier le wikicode]

Cyanobactéries plasmides/hôte

Loi binomiale   p=taux de l’hôte        q=taux du plasmide                                              
2σ = 2*racine(n*p*(10000-p*5))/10000    abs(n*(p-q))/10000                              
        n=DNA du plasmide               n*q/10000  n*p/10000            
                                                                
Différence 2σ= abs(2*racine(n*p*(10000-p*5))-abs(n*(p-q)))/10000                                                
                                                                                                                                
−                                       Différences 2σ  Différences %      
KEGG    DNA     %GC     >4AT    >4GC    >4AT    >4GC    >4AT    >4GC    %GC
Groupe 7                                                                        
len     6244812 46.65   26.9    5.2                                     
len1    325675  47.01   27.7    5.2     32      24      3       -1      1
len2    98206   48.54   25.6    5.2     20      14      -5      -1      4
len3    92964   47.35   28.5    5.5     16      12      6       5       2
synp    3510253 40.62   50.8    7.6                                     
synp1   63272   40.89   47.9    5.1     17      -2      -6      -34     1
synp2   10210   39.41   53.9    2.9     11      1       6       -61     -3
anba    4329264 38.10   64.1    8.1                                     
anbb    819965  38.21   65.0    8.7     73      9       1       6       0
anb1    80384   37.23   60.3    7.3     14      10      -6      -10     -2
anb2    56037   37.25   61.7    7.3     24      9       -4      -10     -2
anb3    20025   37.42   70.4    13.5    10      -3      10      66      -2
ana     6413771 41.35   50.6    8.2                                     
ana1    408101  40.51   52.0    6.7     31      -26     3       -19     -2
ana2    186614  40.23   53.9    5.9     0       -18     6       -28     -3
ana3    101965  41.03   48.8    7.2     27      7       -3      -13     -1
ana4    55414   41.61   50.7    11.4    32      -4      0       38      1
ana5    40340   40.86   60.7    9.9     -13     5       20      20      -1
ana6    5584    44.18   37.6    5.4     3       3       -26     -35     7
Groupe 14                                                                       
oni     7479014 45.87   52.5    10.8                                    
oni1    300164  45.13   45.1    10.7    -141    31      -14     -2      -2
oni2    260268  44.61   48.7    10.2    -24     16      -7      -6      -3
oni3    150927  45.51   45.3    12.3    -53     3       -14     14      -1
oni4    74236   44.56   53.1    9.3     34      6       1       -14     -3
oni5    7645    47.59   58.9    22.2    8       -3      12      105     4
syf     2695903 55.47   17.7    11.6                                    
syf1    46366   52.89   17.3    12.9    16      9       -3      11      -5
can     4114099 34.96   93.4    12.1                                    
can1    62874   33.17   75.7    7.6     -64     -11     -19     -37     -5
cytc    4934271 37.88   71.2    12.4                                    
cytl    429701  38.57   65.6    9.1     -133    -98     -8      -27     2
cyt1    39620   36.80   73.4    8.8     24      0       3       -29     -3
cyt2    31856   41.46   38.0    17.0    -76     -2      -47     37      9
cyt3    14685   38.09   84.4    11.6    1       7       19      -7      1
cyt4    10244   36.97   65.4    21.5    11      -2      -8      73      -2
mic     7470429 46.21   39.0    12.7                                    
mic1    146045  45.27   35.1    9.0     -10     -27     -10     -29     -2
mic2    93032   47.10   43.1    17.7    -1      -25     11      39      2
mic3    92471   46.62   39.8    15.6    30      -5      2       22      1
mic4    50464   44.65   43.6    8.9     4       -3      12      -30     -3
mic5    38468   47.66   35.6    14.0    11      9       -9      10      3
mic6    28816   46.59   41.3    17.7    14      -2      6       39      1
mic7    25982   46.76   34.6    12.7    9       11      -11     0       1
mic8    20803   46.45   44.7    16.8    6       2       15      32      1
Groupe 25                                                                       
oac     7689443 47.60   43.9    24.7                                    
oac1    64128   47.62   47.2    20.1    11      -4      8       -19     0
oac2    50699   49.30   39.3    21.5    6       6       -10     -13     4
syn     3573470 47.72   53.4    31.8                                    
syn1    103307  44.48   57.0    18.0    9       -106    7       -43     -7
syn2    44343   48.62   29.8    17.8    -75     -38     -44     -44     2
syn3    119895  42.95   56.0    16.1    18      -149    5       -49     -10
syn4    106004  42.72   65.5    22.0    -81     -67     23      -31     -10

total différence avec  2σ < 0           11      20
total différence avec  2σ < -5          10      11                   

Autre-bactéries[modifier | modifier le wikicode]

Autre-bactéries         Plasmides/hôte                                  
Loi binomiale           q=taux du plasmide      p=taux de l’hôte                        
2σ = 2*racine(n*p*(10000-p*5))/10000            n=DNA du plasmide               
n*p/10000       n*q/10000       abs(n*(p-q))/10000                              
                                                                
Différence 2σ= abs(2*racine(n*P*(10000-p*5))-abs(n*(p-q)))/10000                                                
                                                                
−                                       Différences 2σ  Différences %      
KEGG    DNA     %GC     >4AT    >4GC    >4AT    >4GC    >4AT    >4GC    %GC
Groupe 2                                                                        
cje     1641481 30.55   160.2   2.1                                     
cje1    4013    30.15   174.4   10.0    10      -1      9       366     -1
cac     3940880 30.93   95.7    2.5                                     
cac1    192000  30.91   97.1    1.5     57      -5      1       -39     0
Groupe 7                                                                        
ent     4518712 52.98   32.1    5.5                                     
ent1    157749  50.57   35.4    8.9     -8      -35     10      62      -5
sfl     4607202 50.89   35.7    5.7                                     
sfl1    221618  45.77   53.7    10.6    -342    -86     50      86      -10
xac     5175554 64.77   5.6     5.7                                     
xac1    33700   61.87   16.0    11.3    -26     -10     186     97      -4
xac2    64920   61.39   10.8    9.9     -22     -15     93      72      -5
pst     6397126 58.40   17.3    6.2                                     
pst1    73661   55.15   22.7    12.6    -17     -34     31      105     -6
pst2    67473   56.17   25.5    12.4    -34     -30     48      102     -4
ecs     5498450 50.54   38.2    6.2                                     
ecs1    92721   47.60   51.1    12.4    -82     -42     34      99      -6
ecs2    3306    43.41   93.8    15.1    -11     0       145     143     -14
stm     4857432 52.22   37.9    6.5                                     
stm1    93939   53.13   36.7    12.8    26      -43     -3      95      2
kpn     5315120 57.48   25.8    9.4                                     
kpn3    175879  51.69   34.5    9.9     -111    17      34      5       -10
kpn4    107576  53.44   32.9    9.3     -43     19      28      -1      -7
kpn5    88582   53.82   34.3    10.8    -46     6       33      15      -6
kpn6    4259    41.42   79.8    7.0     -16     3       210     -25     -28
kpn7    3478    45.66   48.9    14.4    -2      2       90      53      -21
Groupe 14                                                                       
ype     4653728 47.64   38.1    11.9                                    
ype1    70305   44.84   44.4    11.1    -12     13      16      -7      -6
ype2    9612    45.27   69.7    12.5    -18     6       83      5       -5
ype3    96210   50.23   31.0    5.5     -31     -40     -19     -54     5
Groupe 25                                                                       
sco     8667507 72.12   0.4     24.5                                    
sco1    356023  69.06   0.8     24.1    -4      43      75      -2      -4
sco2    31317   72.12   3.5     33.5    -7      -11     681     37      0
Groupe 68                                                                       
tos     2072393 68.55   6.9     116.3                                   
tos1    271713  68.60   6.5     109.2   16      -82     -6      -6      0
tos2    57,223  68.43   6.6     110.4   11      17      -4      -5      0

total différence avec  2σ < 0           18      18                   
total différence avec  2σ < -5          16      17                   


rRNA[modifier | modifier le wikicode]

Résultat[modifier | modifier le wikicode]

KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
ade; 2985; 55.8793969849246; 0; 2; 1; 2; 74; 155; 140; 198; 3; 14; 8; 17; 0
bla; 3065; 60.652528548124; 0; 2; 4; 12; 74; 112; 161; 211; 2; 6; 14; 16; 0
bsu; 2928; 53.8934426229508; 0; 1; 2; 1; 91; 157; 134; 188; 1; 9; 7; 17; 0
cbl; 2902; 50.5513439007581; 1; 5; 1; 0; 91; 172; 121; 166; 0; 12; 5; 16; 0
cgq; 3080; 53.3116883116883; 3; 1; 1; 2; 114; 132; 118; 199; 5; 11; 8; 20; 0
cje; 2890; 47.3356401384083; 1; 2; 1; 3; 105; 186; 95; 140; 2; 10; 4; 11; 0
crp; 2827; 33.8167668906969; 19; 9; 1; 0; 216; 133; 95; 61; 25; 14; 6; 2; 0
cta; 2869; 48.6929243638899; 1; 3; 0; 5; 99; 187; 110; 159; 7; 13; 4; 12; 0
eco; 2904; 53.236914600551; 0; 4; 1; 7; 88; 170; 114; 177; 2; 7; 9; 11; 0
fnc; 2906; 46.9373709566414; 0; 2; 1; 5; 106; 203; 102; 161; 4; 10; 3; 7; 0
kpn; 2904; 53.030303030303; 0; 3; 1; 7; 92; 171; 114; 177; 1; 8; 9; 12; 0
lla; 2901; 49.6725267149259; 0; 2; 1; 2; 103; 164; 107; 157; 3; 11; 4; 12; 0
pgd; 2824; 53.4702549575071; 0; 2; 1; 4; 85; 145; 123; 169; 2; 6; 11; 12; 0
ple; 2869; 44.9982572324852; 0; 8; 0; 2; 105; 197; 99; 152; 4; 21; 3; 8; 0
roa; 3132; 55.6194125159642; 0; 1; 4; 5; 86; 149; 145; 197; 1; 10; 9; 17; 0
sall; 3909; 56.0245587106677; 2; 1; 7; 3; 180; 130; 268; 181; 8; 2; 22; 7; 0
sbh; 2525; 56.5544554455446; 1; 0; 3; 1; 113; 82; 169; 121; 5; 1; 12; 5; 0
sbn; 2903; 51.3951085084395; 0; 3; 1; 6; 102; 167; 108; 167; 3; 9; 7; 11; 0
ser; 2922; 50.444900752909; 0; 2; 2; 2; 116; 162; 102; 169; 2; 11; 6; 11; 0
sgr; 3129; 56.4077980185363; 1; 1; 5; 2; 141; 94; 206; 144; 6; 1; 16; 7; 0
sma; 3124; 56.8822023047375; 1; 1; 5; 2; 141; 88; 210; 153; 6; 2; 17; 7; 0
smv; 2879; 40.4654393886766; 1; 12; 1; 0; 127; 202; 75; 131; 10; 14; 3; 7; 0
spi; 2903; 49.7760936961764; 0; 1; 2; 2; 100; 158; 107; 152; 5; 14; 4; 13; 0
tth; 2893; 63.6017974421016; 1; 1; 4; 16; 44; 136; 177; 207; 0; 9; 16; 23; 0
tos; 2877; 61.4181438998957; 1; 1; 11; 1; 130; 57; 209; 171; 8; 2; 25; 11; 0
bmv; 2882; 53.4004163775156; 1; 0; 7; 1; 160; 86; 176; 118; 11; 2; 13; 7; 0
zin; 2888; 36.1149584487535; 12; 10; 1; 2; 129; 204; 66; 104; 11; 34; 2; 10; 0
wbr; 2922; 46.0301163586585; 5; 6; 0; 4; 106; 196; 106; 150; 5; 13; 4; 7; 0
tra; 2950; 56.0338983050847; 0; 0; 2; 3; 82; 148; 129; 195; 0; 13; 9; 16; 0
tai; 2972; 58.2436069986541; 1; 0; 5; 2; 131; 71; 211; 142; 8; 0; 21; 10; 0
mrb; 2893; 56.8268233667473; 1; 0; 5; 0; 147; 69; 194; 148; 10; 3; 20; 8; 0
mcac; 2908; 45.8046767537827; 1; 3; 1; 2; 118; 180; 102; 144; 6; 17; 6; 11; 0
mhd; 2917; 62.1186150154268; 0; 1; 1; 9; 63; 129; 171; 214; 1; 8; 12; 26; 0
rpr; 2761; 46.9757334299167; 2; 6; 0; 3; 98; 169; 98; 137; 5; 9; 6; 10; 0
uur; 2903; 45.4357561143645; 1; 1; 0; 4; 123; 196; 90; 133; 5; 10; 4; 10; 0

Tableau des diagrammes 3AT et 3GC[modifier | modifier le wikicode]

                                 x3  -0.001241  0.000842
                                 x2  0.292481   -0.020776
                                 x   -24.200958 0.039846
                                 c   692.8194   3.536873
                                        Aléas équation  
KEGG    Long    %GCb    >3GC    >3AT    >3ATa   >3GCa
ade     2,985   74.91   93.80   63.65   0.0     243.8
bla     3,065   60.49   150.08  32.63   24.4    116.3
bmv     2,882   68.15   97.15   48.58   9.1     176.3
bsu     2,928   43.51   92.21   37.57   91.3    35.3
cbl     2,902   28.31   75.81   62.03   213.9   7.1
cgq     3,080   54.15   100.65  64.94   42.9    78.5
cje     2,890   30.55   65.74   51.90   191.1   9.4
crp     2,827   16.56   31.84   237.00  366.6   2.3
cta     2,869   41.30   73.20   83.65   104.8   29.1
eco     2,904   50.79   96.42   44.77   55.5    62.3
fnc     2,906   27.12   55.06   55.06   226.8   6.1
kpn     2,904   57.48   99.86   41.32   32.4    97.1
lla     2,901   35.33   65.49   55.15   148.2   16.1
mcac    2,908   23.66   68.78   92.85   267.5   4.0
mhd     2,917   68.08   164.55  34.28   9.3     175.6
mrb     2,893   63.38   114.07  48.39   17.9    137.0
pgd     2,824   59.62   99.15   35.41   26.6    110.5
ple     2,869   26.17   45.31   115.02  237.5   5.4
roa     3,132   67.37   111.75  38.31   10.4    169.4
rpr     2,761   29.00   68.82   79.68   206.7   7.8
sall    3,909   72.13   99.77   33.26   3.2     214.3
sbh     2,525   70.75   83.17   27.72   5.1     200.6
sbn     2,903   46.28   86.12   51.67   76.2    44.4
ser     2,922   32.15   71.87   51.33   175.8   11.3
sgr     3,129   72.23   95.88   28.76   3.1     215.3
sma     3,124   70.72   99.23   32.01   5.2     200.2
smv     2,879   24.00   38.21   128.52  263.3   4.2
spi     2,903   38.32   72.34   68.89   125.1   21.9
tai     2,972   63.79   127.86  30.28   17.1    140.1
tos     2,877   68.55   166.84  41.71   8.5     179.9
tra     2,950   68.14   101.69  44.07   9.1     176.2
tth     2,893   69.44   203.94  38.02   7.1     188.0
uur     2,903   25.50   62.00   58.56   245.3   5.0
wbr     2,922   22.48   51.33   99.25   282.5   3.5
zin     2,888   13.54   51.94   231.99  415.7   2.4

Protéines[modifier | modifier le wikicode]

Cyanobactéries[modifier | modifier le wikicode]

Répétitions[modifier | modifier le wikicode]

  • can cyanobactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
carB; 3249; 42.1360418590335; 2; 8; 0; 4; 198; 184; 115; 128; 15; 17; 9; 10; 0
cox1; 1647; 40.5585913782635; 4; 1; 0; 3; 126; 72; 58; 68; 19; 5; 0; 9; 0
dnaE; 2640; 33.7121212121212; 12; 20; 0; 2; 164; 157; 50; 94; 13; 26; 1; 6; 0
dnaE1; 1362; 34.5080763582966; 5; 14; 2; 1; 88; 81; 30; 38; 9; 15; 2; 4; 0
ftsK; 5448; 31.0389133627019; 22; 41; 1; 0; 376; 419; 97; 154; 29; 49; 4; 5; 0
iars; 2907; 40.2820777433781; 5; 8; 3; 1; 177; 176; 85; 109; 10; 21; 7; 9; 0
lars; 2577; 40.7450523864959; 5; 11; 1; 2; 146; 159; 95; 99; 10; 20; 4; 6; 0
rpoB; 3276; 42.3382173382173; 4; 10; 2; 1; 171; 197; 119; 150; 11; 25; 6; 5; 0
rpoC; 3840; 39.9479166666667; 1; 18; 1; 1; 245; 239; 98; 146; 11; 19; 4; 16; 0
mfd; 3594; 37.7851975514747; 8; 20; 3; 2; 235; 216; 109; 114; 15; 29; 7; 7; 0
sbcC; 3024; 30.026455026455; 1; 28; 0; 1; 202; 262; 37; 58; 12; 40; 3; 1; 0
secA; 2820; 39.1489361702128; 5; 24; 2; 0; 148; 188; 69; 108; 13; 13; 7; 9; 0
  • cgc cyanobactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
carB; 3324; 70.2166064981949; 0; 0; 7; 7; 45; 65; 304; 266; 0; 1; 19; 10; 0
cox1; 1671; 64.4524236983842; 0; 0; 3; 6; 57; 31; 137; 113; 1; 0; 7; 2; 0
dnaE; 3531; 67.2330784480317; 0; 0; 5; 5; 51; 94; 299; 259; 0; 1; 16; 13; 0
iars; 2952; 70.5284552845528; 0; 0; 5; 6; 32; 58; 245; 253; 1; 0; 9; 10; 0
lars; 2625; 69.5238095238095; 0; 0; 11; 2; 40; 50; 218; 187; 0; 1; 11; 17; 0
mfd; 3591; 71.1500974658869; 0; 0; 10; 5; 48; 68; 300; 329; 1; 1; 14; 13; 0
recB; 3807; 75.0459679537694; 0; 0; 14; 11; 35; 45; 332; 366; 0; 0; 21; 21; 0
rpoB; 3291; 66.1804922515953; 0; 0; 12; 1; 38; 115; 248; 218; 0; 0; 21; 4; 0
rpoC; 4110; 67.8345498783455; 0; 0; 12; 4; 39; 119; 347; 314; 0; 0; 9; 9; 0
sbcC; 3018; 76.2094102054341; 0; 1; 3; 9; 26; 41; 298; 288; 0; 1; 6; 18; 0
secA; 2835; 66.9135802469136; 0; 0; 7; 2; 34; 84; 207; 219; 0; 0; 11; 8; 0
  • cya cyanobactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
carB; 3225; 62.9457364341085; 0; 1; 4; 11; 86; 93; 228; 210; 2; 5; 21; 13; 0
cox1; 1710; 59.3567251461988; 6; 0; 2; 6; 78; 32; 114; 110; 7; 0; 7; 5; 0
dnaE; 3486; 54.6758462421113; 2; 6; 0; 2; 137; 136; 205; 217; 10; 15; 7; 15; 0
iars; 2811; 62.0419779437922; 2; 2; 5; 3; 61; 85; 208; 195; 7; 8; 12; 12; 0
lars; 2622; 62.3569794050343; 2; 1; 5; 6; 67; 91; 156; 193; 1; 3; 15; 12; 0
mfd; 3471; 60.2420051858254; 1; 6; 11; 2; 105; 110; 232; 240; 13; 12; 16; 10; 0
rpoB; 3402; 62.0223398001176; 5; 6; 1; 9; 75; 112; 208; 251; 3; 7; 16; 9; 0
rpoC; 3909; 63.5456638526477; 1; 6; 5; 11; 88; 119; 255; 309; 1; 6; 8; 19; 0
sbcC; 3291; 64.1750227894257; 0; 1; 2; 5; 66; 127; 266; 196; 2; 6; 8; 10; 0
secA; 2865; 61.4659685863874; 2; 3; 3; 3; 57; 113; 184; 210; 4; 7; 10; 11; 0
  • mar cyanobactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
carB; 3246; 48.1823783117683; 1; 10; 3; 4; 148; 182; 165; 139; 15; 21; 13; 7; 0
cox1; 1677; 47.1675611210495; 4; 0; 4; 2; 112; 58; 77; 85; 13; 3; 5; 3; 0
dnaE; 2625; 38.3619047619048; 6; 14; 0; 0; 160; 155; 85; 101; 12; 25; 3; 5; 0
dnaE1; 1338; 39.237668161435; 7; 6; 0; 0; 69; 77; 39; 50; 5; 25; 1; 2; 0
iars; 2859; 42.2525358516964; 6; 8; 0; 1; 159; 169; 87; 127; 13; 16; 6; 9; 0
lars; 2553; 42.4990207598903; 4; 13; 2; 2; 144; 154; 116; 102; 10; 20; 6; 5; 0
mfd; 3483; 44.7602641401091; 5; 14; 2; 3; 187; 195; 129; 154; 22; 15; 13; 15; 0
rpoB; 3336; 52.4580335731415; 2; 9; 10; 2; 115; 190; 179; 159; 10; 17; 22; 9; 0
rpoC; 4005; 51.1610486891386; 0; 9; 6; 8; 169; 217; 201; 197; 6; 13; 5; 21; 0
sbcC; 3024; 38.2275132275132; 2; 19; 0; 4; 173; 233; 66; 93; 13; 22; 2; 3; 0
secA; 2817; 46.822861199858; 6; 17; 1; 2; 131; 177; 121; 135; 5; 17; 8; 10; 0
  • pmm cyanobactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
carB; 3300; 32.6969696969697; 6; 13; 0; 0; 238; 266; 72; 111; 23; 23; 1; 2; 0
dnaE; 3498; 31.8181818181818; 9; 21; 0; 1; 244; 234; 67; 104; 20; 33; 0; 4; 0
gyrB; 1968; 33.9939024390244; 2; 16; 1; 1; 120; 122; 22; 82; 10; 16; 0; 2; 0
iars; 2898; 31.9875776397516; 10; 20; 1; 0; 206; 190; 56; 101; 14; 22; 1; 3; 0
lars; 2577; 28.9483896003104; 7; 23; 0; 0; 163; 196; 51; 75; 13; 34; 1; 3; 0
mfd; 3516; 28.1854379977247; 5; 40; 0; 1; 219; 307; 58; 87; 16; 32; 0; 0; 0
recB; 3630; 23.8567493112948; 13; 25; 0; 0; 270; 323; 48; 84; 31; 34; 0; 1; 0
rpoB; 3294; 36.8852459016393; 6; 16; 1; 0; 198; 235; 79; 134; 18; 13; 1; 4; 0
rpoC; 4101; 35.5279200195074; 2; 18; 0; 1; 266; 314; 75; 157; 17; 23; 3; 4; 0
secA; 2832; 33.8629943502825; 6; 16; 0; 1; 162; 231; 43; 97; 12; 27; 1; 1; 0
  • syn cyanobactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
carB; 3318; 51.3261000602773; 1; 8; 5; 10; 179; 162; 193; 169; 12; 15; 13; 14; 0
cox1; 1656; 49.8188405797101; 5; 0; 1; 5; 96; 50; 96; 82; 19; 5; 8; 8; 0
dnaE; 2694; 43.5412026726058; 10; 8; 1; 1; 152; 152; 123; 116; 9; 17; 5; 11; 0
dnaE1; 1377; 46.1147421931736; 1; 7; 2; 1; 60; 86; 67; 66; 10; 8; 5; 5; 0
iars; 2967; 46.2756993596225; 4; 13; 4; 3; 167; 164; 131; 165; 14; 16; 9; 9; 0
lars; 2610; 49.1187739463602; 3; 10; 3; 6; 149; 126; 138; 145; 12; 10; 9; 7; 0
mfd; 3600; 47.1944444444444; 6; 16; 4; 2; 201; 170; 149; 213; 15; 16; 11; 16; 0
rpoB; 3309; 52.9465095194923; 3; 13; 10; 6; 138; 177; 187; 180; 7; 8; 18; 11; 0
rpoC; 3954; 54.147698533131; 0; 10; 4; 10; 155; 205; 219; 250; 8; 12; 11; 29; 0
sbcC; 3021; 42.1383647798742; 1; 16; 0; 1; 173; 242; 110; 119; 12; 17; 6; 8; 0
secA; 2799; 49.124687388353; 3; 11; 1; 6; 117; 170; 119; 169; 5; 15; 9; 13; 0
  • tel cyanobactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
carB; 3303; 54.3445352709658; 2; 5; 6; 3; 143; 148; 192; 169; 4; 12; 18; 10; 0
cox1; 1659; 53.2851115129596; 2; 0; 4; 4; 83; 43; 86; 95; 9; 6; 7; 6; 0
dnaE; 2619; 52.8064146620848; 5; 8; 2; 0; 95; 113; 137; 142; 6; 7; 7; 10; 0
dnaE1; 1359; 56.8064753495217; 3; 1; 6; 4; 51; 56; 77; 75; 4; 2; 4; 6; 0
iars; 2946; 54.9219280380177; 1; 5; 5; 4; 118; 122; 151; 152; 6; 15; 12; 12; 0
lars; 2574; 55.9052059052059; 3; 5; 7; 5; 86; 117; 149; 134; 2; 8; 13; 8; 0
mfd; 3429; 56.7512394284048; 0; 2; 9; 9; 141; 143; 183; 204; 12; 8; 10; 9; 0
rpoB; 3327; 54.4334235046589; 2; 10; 8; 5; 134; 137; 183; 172; 1; 12; 13; 12; 0
rpoC; 3975; 55.2452830188679; 0; 9; 6; 9; 154; 181; 207; 242; 6; 13; 11; 12; 0
sbcC; 3012; 56.5737051792829; 0; 5; 4; 4; 102; 173; 202; 119; 5; 6; 5; 6; 0
secA; 2790; 54.8387096774194; 4; 6; 4; 5; 87; 124; 134; 177; 2; 12; 8; 8; 0

Codons[modifier | modifier le wikicode]

  • can cyanobactérie codons:
protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
carB;48;11;5;3;2;11;49;16;27;11;24;8;9;6;12;7;26;10;24;12;7;5;23;3;4;3;13;0;20;13;18;30;12;17;60;33;48;9;22;28;24;22;10;1;26;5;5;34;4;14;23;36;15;8;32;10;8;24;54;7;31;1;0;0;
cox1;39;7;8;2;3;6;10;6;32;13;13;2;10;3;5;5;10;9;13;5;1;0;5;1;3;0;13;4;7;2;8;21;5;12;14;6;11;5;12;17;8;5;2;0;24;17;2;20;1;9;10;8;7;6;16;9;4;8;27;3;14;0;0;1;
dnaE;49;18;6;4;4;1;58;18;25;1;23;5;11;1;2;1;32;5;30;4;14;2;10;6;4;0;18;4;26;8;22;17;10;9;59;15;48;9;17;20;9;4;9;1;28;5;6;19;3;6;22;19;9;2;16;14;4;4;60;15;8;0;1;0;
dnaE1;29;6;1;3;0;2;31;4;17;1;10;5;11;2;6;3;14;2;24;9;6;2;2;3;2;2;4;3;13;7;8;9;2;5;29;4;19;5;9;14;4;5;3;1;9;3;2;6;2;5;13;5;7;3;8;6;0;9;25;7;2;1;0;0;
ftsK;147;15;24;16;6;4;122;11;60;6;47;29;39;6;7;5;56;4;98;20;25;9;33;6;4;5;27;4;111;17;35;30;3;7;134;12;87;11;32;45;13;14;10;3;12;28;14;42;4;5;45;29;7;12;31;29;5;6;104;26;17;1;0;0;
iars;62;8;14;4;1;12;49;18;22;11;18;8;18;1;4;9;29;12;34;11;9;3;16;2;10;1;16;5;29;9;8;34;11;9;53;22;48;11;20;19;6;20;7;3;14;23;10;15;3;17;29;19;12;8;18;12;8;16;26;0;22;1;0;0;
lars;38;8;8;6;2;9;54;9;21;10;14;7;9;4;7;4;30;5;23;15;7;11;9;6;6;0;8;5;26;10;15;17;9;8;55;18;36;17;16;16;5;19;6;2;16;21;2;28;7;10;25;16;16;7;13;11;6;17;29;6;18;1;0;0;
rpoB;62;11;7;7;7;11;55;11;20;7;20;6;11;2;12;3;26;16;25;17;21;7;26;2;15;3;11;10;34;8;29;45;10;9;67;29;49;18;11;20;15;15;3;0;24;9;9;35;3;15;24;29;23;14;18;11;3;23;39;3;16;1;0;0;
rpoC;63;20;6;5;2;6;61;10;14;16;37;5;15;2;7;4;25;5;43;8;14;5;40;2;7;3;8;6;46;20;20;48;12;20;85;27;69;23;16;30;19;11;10;3;19;7;2;28;3;13;46;40;20;10;52;16;3;23;67;2;30;1;0;0;
mfd;88;16;11;7;6;9;66;9;34;6;28;14;20;2;7;13;34;5;35;15;22;4;11;10;12;3;17;2;54;21;21;19;10;15;75;25;39;10;18;24;8;21;6;1;26;13;11;29;4;17;28;21;14;9;26;15;3;21;57;9;21;0;1;0;
sbcC;96;6;11;11;1;5;67;13;19;5;17;8;18;2;5;5;31;4;66;10;32;4;12;6;6;0;8;3;88;27;13;12;3;3;93;22;45;3;17;18;7;9;9;1;4;4;2;4;1;3;11;8;0;1;30;17;2;8;47;15;9;0;1;0;
secA;54;10;11;5;1;6;52;7;23;7;6;5;8;3;5;3;27;8;23;15;23;3;22;5;4;3;9;5;40;8;16;27;7;13;79;20;48;14;23;22;8;16;1;2;31;7;2;13;1;15;25;18;12;13;19;13;5;15;36;6;11;1;0;0;
  • can cyanobactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
carB;80;65;38;66;36;36;45;13;33;77;93;57;96;11;26;5;57;82;74;92;1;
cox1;65;16;45;38;19;18;10;17;9;46;20;16;42;2;24;17;32;31;37;44;1;
dnaE;82;76;26;43;37;34;36;22;34;58;74;57;50;10;28;5;34;52;38;83;1;
dnaE1;41;35;18;37;16;33;17;7;20;24;33;24;32;4;9;3;15;28;23;34;1;
ftsK;212;133;66;133;60;118;82;31;128;75;146;98;104;13;12;28;65;93;71;147;1;
iars;101;67;33;58;41;45;41;21;38;62;75;59;65;10;14;23;45;68;54;48;1;
lars;71;63;31;45;35;38;39;13;36;49;73;53;56;8;16;21;47;64;47;53;1;
rpoB;105;66;27;54;42;42;74;21;42;93;96;67;61;3;24;9;62;90;55;58;1;
rpoC;102;71;30;70;30;51;71;14;66;100;112;92;76;13;19;7;46;116;94;99;1;
mfd;137;75;40;84;39;50;62;19;75;65;100;49;71;7;26;13;61;72;65;87;1;
sbcC;130;80;24;55;35;76;60;11;115;31;115;48;51;10;4;4;10;20;57;71;1;
secA;87;59;30;30;35;38;60;14;48;63;99;62;69;3;31;7;31;68;52;53;1;
  • cgc cyanobactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
carB;0;2;0;0;85;23;2;23;0;33;0;0;1;13;22;19;2;20;2;26;0;1;4;2;51;25;3;10;0;37;3;5;59;18;12;76;13;46;1;1;30;108;2;11;20;8;0;1;25;41;1;1;64;22;0;1;16;51;3;0;62;0;0;1;
cox1;0;1;2;0;43;20;0;7;2;46;0;1;2;4;12;9;7;13;1;18;0;1;1;0;7;11;2;13;0;8;1;5;39;9;3;11;5;5;1;1;6;34;0;3;25;16;1;1;23;18;0;0;36;15;1;0;6;25;2;0;33;0;0;1;
dnaE;0;2;2;0;83;41;3;47;1;33;0;1;3;10;16;20;4;33;5;23;0;1;3;1;49;30;5;23;1;41;5;7;60;19;16;67;18;58;1;6;21;107;0;13;33;6;1;6;24;28;3;0;66;22;1;1;6;34;3;0;63;0;0;1;
iars;0;3;1;1;83;28;2;23;1;23;1;0;1;8;14;21;8;22;2;23;0;3;2;2;37;27;8;22;1;37;4;1;55;18;6;59;14;43;2;2;33;77;1;11;8;27;0;1;36;27;2;0;61;13;0;0;12;35;0;0;31;0;0;1;
lars;0;5;2;0;59;18;2;19;1;21;0;2;0;7;15;19;3;23;2;12;0;0;4;1;36;27;4;17;2;39;4;6;38;16;14;42;19;42;2;4;18;73;1;9;13;27;0;3;20;39;2;0;48;17;1;0;8;35;2;0;31;0;0;1;
mfd;0;2;6;0;119;26;1;37;4;30;0;2;3;3;11;25;3;18;1;14;0;0;2;3;50;45;3;21;1;61;2;6;75;15;13;84;16;42;4;2;33;109;3;8;27;15;1;0;41;37;2;1;67;10;0;4;13;34;2;0;39;0;0;1;
recB;0;2;2;1;142;39;1;9;1;25;0;4;1;6;8;35;5;15;2;11;2;4;4;5;44;63;7;26;2;48;7;5;67;42;15;72;22;52;5;3;46;144;1;5;15;30;3;3;35;54;1;0;44;16;0;0;13;33;1;0;20;0;0;1;
rpoB;0;2;2;0;62;38;2;51;0;27;0;2;1;12;22;18;1;35;0;39;0;2;5;1;47;26;0;21;1;52;2;10;72;4;19;65;16;58;1;1;8;57;0;8;21;7;0;3;17;47;0;1;58;36;4;0;3;46;3;0;60;0;0;1;
rpoC;0;0;1;0;85;37;2;63;1;29;0;0;0;22;29;24;1;16;2;29;0;0;10;0;61;18;1;23;0;51;3;14;86;11;22;94;30;63;2;6;27;100;0;11;22;9;1;0;16;41;3;0;76;44;0;0;9;91;0;0;83;0;0;1;
sbcC;0;2;2;1;75;30;2;16;1;16;1;0;1;6;10;17;0;11;1;9;0;4;5;2;39;50;2;11;1;57;2;5;44;31;15;78;15;30;9;9;53;170;0;6;4;6;1;0;18;17;2;1;41;10;0;1;12;30;2;0;21;0;0;1;
secA;0;1;2;0;66;27;1;38;0;27;1;0;2;5;16;11;3;28;3;27;0;0;3;3;48;26;3;9;0;54;1;8;47;7;14;83;13;41;1;2;16;64;0;3;29;8;0;0;19;24;0;0;53;17;0;0;9;37;0;0;44;0;0;1;
  • cgc cyanobactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
carB;110;25;33;55;22;28;83;13;37;85;88;59;140;13;20;8;67;88;68;65;1;
cox1;66;7;48;28;20;19;20;15;8;54;14;10;42;3;25;16;43;51;32;35;1;
dnaE;128;50;34;50;37;28;84;28;42;91;83;76;135;13;33;6;59;91;42;66;1;
iars;116;25;24;45;30;25;71;30;38;78;65;57;114;12;8;27;64;76;47;31;1;
lars;84;21;22;43;26;14;68;21;41;64;56;61;97;10;13;27;62;67;44;33;1;
mfd;153;38;34;44;21;15;100;24;62;98;97;58;148;11;27;15;79;80;51;41;1;
recB;186;10;26;54;20;13;122;33;50;121;87;74;198;6;15;30;95;61;46;21;1;
rpoB;104;53;27;55;36;39;81;21;53;88;84;74;67;8;21;7;67;95;53;63;1;
rpoC;123;65;30;75;17;31;89;24;51;114;116;93;135;11;22;9;58;123;100;83;1;
sbcC;110;18;17;35;11;10;100;13;58;82;93;45;241;6;4;6;36;54;43;23;1;
secA;96;39;27;35;31;30;80;12;54;63;97;54;83;3;29;8;43;70;46;44;1;
  • cya cyanobactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
carB;0;17;7;7;52;15;10;31;22;13;6;1;1;8;16;16;6;23;1;22;1;3;2;2;40;19;2;15;12;42;7;4;42;33;21;65;16;32;3;20;15;78;2;8;21;5;5;7;18;32;9;4;55;21;8;1;10;45;17;1;57;0;1;0;
cox1;0;26;3;4;30;9;2;12;29;17;4;1;2;5;9;14;3;17;1;11;0;0;0;0;7;6;1;16;1;8;3;1;29;15;2;13;6;10;2;9;14;35;1;2;25;18;2;4;14;19;6;1;23;7;5;1;6;20;9;0;29;0;1;0;
dnaE;4;41;7;8;47;22;34;26;21;14;10;0;2;11;17;15;25;23;8;24;2;9;5;2;37;20;5;17;32;32;12;6;43;23;37;51;47;21;9;20;14;52;5;8;23;10;11;8;23;12;17;5;36;15;10;6;10;26;32;0;49;0;1;0;
iars;1;16;2;9;52;24;11;32;18;16;2;0;3;5;24;18;7;32;5;21;2;0;1;1;29;25;3;18;11;38;7;3;35;15;22;50;23;19;3;9;20;52;5;6;8;23;5;6;18;31;5;3;35;20;4;3;7;32;6;1;34;0;0;1;
lars;0;19;2;4;45;14;7;30;14;15;0;1;3;7;15;9;7;22;4;21;1;2;3;5;30;16;3;11;9;35;8;2;25;25;22;46;25;24;5;10;15;54;1;6;16;27;3;6;24;25;8;5;38;16;5;3;18;20;9;0;28;1;0;0;
mfd;2;35;11;2;66;35;24;22;31;9;7;0;2;8;17;20;10;21;4;14;4;5;3;2;42;25;6;13;26;72;9;6;44;17;39;53;28;18;3;20;10;65;1;6;21;20;4;10;26;43;4;3;39;16;9;1;13;33;29;1;27;0;1;0;
rpoB;2;31;2;1;51;21;13;37;16;16;5;1;2;16;18;16;5;36;3;36;0;4;2;2;51;33;3;17;12;29;6;8;55;23;32;65;32;42;3;6;21;43;1;4;21;8;5;15;19;31;7;6;72;20;5;3;9;34;10;0;46;0;0;1;
rpoC;1;30;1;5;81;8;14;34;11;14;7;0;4;13;15;20;8;15;5;29;0;5;3;2;47;43;2;12;25;52;9;7;54;35;28;88;33;48;2;11;30;61;1;6;19;7;5;8;31;23;12;8;93;19;3;1;21;55;17;1;60;0;0;1;
sbcC;3;15;11;6;85;34;8;12;11;6;5;1;1;9;17;18;4;15;3;12;1;6;9;1;66;26;7;32;62;106;14;0;22;16;37;74;17;19;10;17;18;88;1;9;6;15;5;7;10;13;7;4;15;6;1;1;2;26;10;0;34;0;1;0;
secA;0;17;3;5;47;32;16;36;12;18;2;0;0;10;15;12;4;27;1;36;1;0;1;1;34;34;1;18;12;28;4;8;26;20;25;72;17;35;6;8;19;47;1;3;25;7;2;5;10;26;7;3;47;18;4;3;8;28;8;0;39;0;1;0;
  • cya cyanobactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
carB;98;41;35;48;29;23;67;17;54;86;86;48;116;10;21;5;62;89;64;75;1;
cox1;72;14;46;35;20;12;13;17;9;48;15;16;60;3;25;18;39;37;32;38;1;
dnaE;129;60;35;55;48;32;75;22;64;84;88;68;95;13;23;10;54;73;52;81;1;
iars;104;43;34;52;39;26;58;21;49;60;72;42;84;11;8;23;60;63;46;41;1;
lars;84;37;29;35;29;25;57;14;44;60;68;49;84;7;16;27;58;67;46;37;1;
mfd;151;46;40;54;31;18;81;19;98;76;92;46;98;7;21;20;83;62;56;57;1;
rpoB;108;50;32;58;41;39;92;20;41;92;97;74;73;5;21;8;70;105;51;56;1;
rpoC;126;48;25;59;23;34;100;14;77;105;116;81;104;7;19;7;67;132;80;78;1;
sbcC;154;20;17;51;19;15;109;39;168;52;111;36;133;10;6;15;35;32;30;44;1;
secA;104;52;30;39;31;37;71;19;40;58;97;52;80;4;25;7;43;75;43;47;1;
  • mar cyanobactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
carB;27;11;3;16;15;18;54;8;20;18;7;3;8;19;23;7;21;13;19;15;1;10;11;1;18;8;8;3;28;13;14;27;24;14;72;15;43;13;12;19;18;44;10;3;26;6;8;10;13;32;22;19;14;24;21;7;12;26;39;2;46;1;0;0;
cox1;18;12;11;5;11;11;8;1;27;19;6;2;9;6;12;5;12;7;8;6;0;1;6;0;2;4;8;8;6;4;3;21;14;9;16;6;14;1;9;16;4;15;3;1;26;17;5;7;8;14;13;3;7;8;12;1;8;17;20;4;21;1;0;0;
dnaE;53;10;7;9;7;9;60;5;23;4;15;4;4;4;8;4;23;12;24;8;9;4;11;4;6;6;13;11;25;9;19;26;7;7;60;16;48;6;10;20;15;12;6;3;24;5;10;17;1;11;20;9;8;13;15;4;5;15;47;11;13;1;0;0;
dnaE1;24;2;2;8;9;1;31;6;15;0;6;0;5;6;8;3;9;3;20;5;4;4;6;1;4;2;6;2;20;5;9;9;2;4;27;8;19;4;8;14;8;5;3;1;10;3;0;6;2;5;12;6;9;7;6;3;1;10;19;0;8;1;0;0;
iars;44;14;4;10;11;8;50;8;27;13;17;5;21;8;8;5;34;7;41;9;4;3;14;4;14;5;10;7;24;14;18;24;3;10;50;20;45;10;15;29;13;15;8;2;10;23;6;15;8;17;21;9;21;15;18;3;17;13;26;2;23;1;0;0;
lars;36;4;8;9;8;11;49;9;24;10;7;4;6;5;11;6;26;8;22;12;9;4;10;1;6;9;5;7;28;12;24;15;7;6;61;7;39;8;11;21;3;23;7;1;15;21;9;10;10;20;22;9;13;14;19;2;5;27;30;7;18;1;0;0;
mfd;61;19;13;11;12;15;47;14;32;11;14;4;10;14;13;9;26;7;30;8;12;8;18;5;18;13;13;9;45;23;21;23;11;18;63;28;49;6;17;27;21;31;7;1;18;12;11;12;12;28;18;16;18;13;12;12;12;23;49;11;26;0;1;0;
rpoB;19;10;7;18;24;29;44;7;21;9;6;3;4;5;30;9;17;22;20;32;3;9;16;1;39;17;2;14;26;19;13;34;29;13;88;10;38;30;5;11;11;37;4;1;20;8;3;5;7;47;23;10;29;33;6;1;4;44;25;1;39;1;0;0;
rpoC;39;16;4;11;27;21;43;12;12;20;7;3;22;10;31;18;17;16;20;20;3;9;23;2;29;17;6;8;39;32;20;30;28;31;90;37;70;21;11;21;15;41;11;0;19;8;5;7;19;22;19;18;51;30;19;7;10;50;40;0;47;1;0;0;
sbcC;73;13;10;14;12;8;59;15;16;5;6;4;16;7;6;6;23;1;44;6;16;9;18;3;15;10;16;3;81;46;17;15;5;6;73;33;32;11;19;26;8;17;6;2;8;10;2;7;1;6;8;6;6;5;22;4;2;12;49;9;19;0;1;0;
secA;40;10;4;8;17;11;47;9;15;12;5;1;12;6;6;4;24;10;15;22;9;6;17;4;21;11;2;13;31;15;22;15;13;13;86;20;30;24;5;14;12;37;2;1;30;7;1;0;14;19;23;10;20;16;6;4;8;24;33;1;21;1;0;0;
  • mar cyanobactérie acides aminés:
protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
carB;90;62;38;67;34;34;49;11;41;79;87;56;93;13;26;6;63;79;66;87;1;
cox1;68;9;46;40;19;14;13;16;10;47;22;15;44;4;26;17;34;31;38;45;1;
dnaE;95;65;27;39;35;32;40;24;34;59;76;54;57;9;24;5;39;50;39;71;1;
dnaE1;46;37;15;28;12;25;21;8;25;24;35;23;35;4;10;3;13;34;20;27;1;
iars;91;58;40;64;41;50;44;17;38;55;70;55;72;10;10;23;46;66;51;51;1;
lars;76;58;34;39;34;34;39;12;40;52;68;47;58;8;15;21;49;58;53;55;1;
mfd;131;61;43;64;33;38;74;22;68;73;91;55;96;8;18;12;63;65;59;86;1;
rpoB;107;51;30;57;39;52;85;16;45;89;98;68;64;5;20;8;62;95;55;65;1;
rpoC;118;55;32;91;33;40;83;14;71;109;127;91;88;11;19;8;53;118;86;87;1;
sbcC;130;74;21;45;24;50;71;19;127;43;106;43;70;8;8;10;16;25;40;77;1;
secA;90;56;27;34;34;37;68;15;46;63;106;54;68;3;30;7;34;69;42;55;1;
  • pmm cyanobactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
carB;59;22;18;8;2;4;55;18;34;8;36;24;9;5;6;3;24;6;69;8;28;6;3;3;0;1;12;2;26;7;27;31;8;4;71;15;54;3;26;38;8;5;9;6;19;5;14;28;3;4;44;12;3;4;29;16;4;3;55;38;7;1;0;0;
dnaE;60;12;35;10;1;6;79;28;33;11;33;23;17;5;10;4;34;5;51;7;36;1;5;9;0;1;18;3;32;2;34;22;11;5;48;14;79;17;21;27;2;5;13;4;29;5;19;19;0;1;36;21;2;6;17;16;5;7;64;29;16;1;0;0;
gyrB;23;15;8;5;1;3;45;7;22;2;11;13;8;4;4;0;20;5;29;3;27;3;1;9;0;0;14;0;16;4;20;26;8;4;39;13;40;2;15;15;5;2;3;3;11;3;7;7;1;3;23;11;4;5;15;15;2;0;27;18;6;0;0;1;
iars;51;16;20;8;1;5;60;19;33;5;23;24;12;1;5;0;33;5;60;10;33;2;2;7;0;0;19;2;24;4;17;26;6;7;46;25;55;1;18;16;2;6;11;5;13;28;14;16;2;4;29;16;5;6;21;13;0;4;49;16;4;1;0;0;
lars;46;7;13;5;0;2;75;15;31;5;21;21;10;1;4;2;24;2;62;8;22;3;1;4;0;0;14;1;22;4;13;19;4;1;50;9;48;9;16;11;4;7;8;1;13;22;17;14;2;1;16;19;3;2;18;14;2;4;45;32;9;0;1;0;
mfd;66;8;25;16;3;1;102;16;32;9;18;29;20;3;4;6;34;9;84;18;37;4;2;7;1;0;15;3;33;7;27;13;9;6;74;17;46;12;11;15;4;8;6;1;14;12;24;10;2;2;24;24;0;9;18;28;2;4;62;61;14;1;0;0;
recB;73;18;37;16;0;4;107;23;67;6;24;27;29;4;9;5;41;10;126;12;19;1;1;6;0;0;13;3;27;6;19;12;2;2;68;19;65;5;9;10;3;1;13;6;6;15;8;10;2;4;18;12;2;4;20;12;3;7;83;43;12;0;1;0;
rpoB;46;14;26;12;2;5;51;11;26;3;16;17;12;4;5;5;27;9;42;8;53;4;3;15;0;1;17;4;36;12;26;42;9;10;70;19;63;7;21;31;7;3;5;1;25;7;23;33;2;5;59;23;6;6;24;20;2;4;30;21;7;1;0;0;
rpoC;68;21;21;10;3;4;74;17;24;5;38;38;25;1;6;5;18;2;49;8;42;3;6;18;0;2;18;1;43;12;48;35;6;14;92;26;77;10;30;41;4;5;8;3;22;8;18;25;3;4;56;39;10;5;48;32;2;16;66;22;9;1;0;0;
secA;50;15;19;13;1;4;60;12;21;6;16;15;13;1;2;3;27;4;43;8;36;2;5;11;1;1;14;0;35;8;28;22;2;4;72;26;46;11;24;24;4;3;5;1;26;8;15;12;2;2;28;20;4;7;26;10;3;5;28;20;9;1;0;0;
  • pmm cyanobactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
carB;113;73;42;83;30;77;41;14;33;70;86;57;77;15;19;5;49;63;52;100;1;
dnaE;124;107;44;92;39;58;52;21;34;72;62;96;55;17;29;5;39;65;45;109;1;
gyrB;55;52;24;40;25;32;40;14;20;58;52;42;37;6;11;3;18;43;32;51;1;
iars;101;79;38;65;38;70;44;21;28;56;71;56;42;16;13;28;36;56;38;69;1;
lars;73;90;36;59;26;70;30;15;26;37;59;57;38;9;13;22;34;40;38;86;1;
mfd;119;118;41;80;43;102;51;18;40;55;91;58;38;7;14;12;38;57;52;137;1;
recB;148;130;73;98;51;138;27;16;33;35;87;70;23;19;6;15;24;36;42;138;1;
rpoB;105;62;29;59;36;50;76;21;48;87;89;70;62;6;25;7;63;94;50;58;1;
rpoC;127;91;29;113;20;57;71;19;55;103;118;87;80;11;22;8;50;110;98;97;1;
secA;102;72;27;50;31;51;56;14;43;56;98;57;55;6;26;8;31;59;44;57;1;
  • syn cyanobactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
carB;22;29;2;6;21;10;39;16;26;10;8;2;8;5;37;9;22;17;6;26;2;3;6;1;20;20;8;9;23;15;6;13;32;29;75;22;29;29;10;13;23;43;5;7;26;5;8;10;12;33;21;7;44;13;12;7;15;37;59;1;31;0;1;0;
cox1;9;18;4;8;14;11;6;5;34;15;8;0;8;1;12;7;6;10;7;8;0;1;2;0;7;4;8;8;6;3;6;11;15;13;14;6;8;8;5;11;8;21;1;3;27;17;6;7;8;12;11;2;15;8;7;2;8;19;30;0;12;0;1;0;
dnaE;30;27;9;10;13;7;49;13;20;4;10;4;4;1;13;5;23;13;15;14;6;6;7;4;12;12;18;7;21;14;12;17;16;13;62;12;41;22;7;16;14;24;6;5;24;6;8;9;7;16;16;14;20;6;10;3;5;21;56;2;16;1;0;0;
dnaE1;12;8;3;9;8;5;22;6;12;5;4;1;6;4;10;4;5;8;12;10;2;4;8;0;5;5;7;1;21;13;5;7;6;6;33;4;14;6;7;10;8;16;1;3;10;3;6;3;1;9;9;4;18;4;5;1;1;11;14;4;9;0;1;0;
iars;31;25;4;8;10;14;46;10;26;12;8;2;19;4;12;4;23;18;33;15;1;7;8;3;16;11;17;8;30;20;6;20;18;15;57;19;38;17;12;17;17;30;5;5;9;25;6;8;13;24;15;15;31;7;14;5;14;26;45;3;7;0;1;0;
lars;22;32;4;6;9;4;41;10;18;15;7;1;8;1;14;0;16;15;17;11;0;4;10;0;10;17;8;6;26;22;5;17;17;13;42;16;46;15;8;16;12;38;5;1;18;22;7;7;10;32;18;7;32;8;7;6;11;29;36;0;14;0;1;0;
mfd;56;41;13;13;19;10;52;18;32;5;10;5;22;7;16;8;22;10;22;6;6;9;9;8;17;28;16;5;39;31;11;32;23;15;65;29;47;12;9;28;17;36;7;0;25;15;7;10;16;34;18;12;35;10;17;13;13;25;45;2;16;0;1;0;
rpoB;10;27;9;12;27;18;41;12;13;17;3;0;8;6;34;6;17;19;19;25;0;8;13;4;17;37;5;16;31;15;9;36;25;19;78;22;33;38;3;15;9;41;2;2;22;7;6;11;6;44;20;12;37;13;2;5;4;42;39;0;31;0;1;0;
rpoC;17;30;8;8;39;18;48;21;9;19;7;2;14;4;27;15;19;17;7;23;1;3;15;1;30;32;2;10;36;36;13;30;40;37;92;28;56;46;7;15;20;51;6;5;18;8;7;8;7;24;16;17;67;21;15;1;13;55;49;0;27;1;0;0;
sbcC;51;34;8;21;14;11;46;11;22;4;8;1;14;1;7;7;14;6;25;14;8;10;13;9;17;9;15;4;103;52;10;18;13;7;77;21;34;9;15;27;7;32;10;1;7;8;2;5;1;8;6;3;14;3;14;7;3;23;48;3;11;0;1;0;
secA;15;26;2;10;18;19;40;21;16;14;4;2;4;6;12;7;21;15;18;17;0;2;11;3;17;26;7;8;23;25;6;19;16;20;81;22;33;24;7;11;16;21;0;3;27;10;2;7;8;15;10;11;40;12;10;6;11;24;34;0;17;1;0;0;
  • syn cyanobactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
carB;90;55;36;69;39;32;52;17;38;80;97;58;89;12;26;5;63;85;71;91;1;
cox1;64;11;49;36;16;15;14;16;9;45;20;16;45;4;27;17;33;36;36;42;1;
dnaE;96;62;24;37;36;29;47;25;35;58;74;63;61;11;24;6;40;56;39;74;1;
dnaE1;45;28;17;29;13;22;24;8;34;24;37;20;41;4;10;3;19;35;18;27;1;
iars;92;56;38;49;41;48;46;25;50;59;76;55;76;10;9;25;51;68;59;55;1;
lars;77;51;33;31;31;28;41;14;48;52;58;61;74;6;18;22;56;65;53;50;1;
mfd;152;70;37;68;32;28;77;21;70;81;94;59;90;7;25;15;67;75;68;63;1;
rpoB;103;53;30;57;36;44;79;21;46;89;100;71;68;4;22;7;67;82;53;70;1;
rpoC;120;69;28;69;36;30;82;12;72;120;120;102;93;11;18;8;46;121;84;76;1;
sbcC;139;57;26;38;20;39;66;19;155;48;98;43;81;11;7;8;16;26;47;62;1;
secA;90;61;30;35;36;35;59;15;48;61;103;57;55;3;27;10;32;73;51;51;1;
  • tel cyanobactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
carB;4;18;15;7;32;26;24;21;23;5;7;5;4;10;19;10;17;18;15;17;1;6;11;1;27;18;6;4;32;19;7;22;26;24;51;37;35;14;13;20;19;62;5;6;26;6;6;7;11;43;13;3;35;20;10;6;12;44;68;1;26;1;0;0;
cox1;2;15;4;8;26;13;7;7;23;15;3;4;7;6;4;5;7;14;7;11;0;0;3;0;6;4;6;10;6;4;3;13;21;9;4;11;14;4;9;6;11;19;2;2;23;20;2;5;8;20;5;1;28;6;3;1;11;21;29;2;12;0;0;1;
dnaE;5;20;13;8;33;21;26;20;20;9;0;3;9;5;13;10;19;16;9;14;0;4;7;1;25;12;12;13;28;31;8;17;26;9;30;36;28;19;13;11;17;25;7;4;27;6;5;4;9;24;6;1;29;15;4;3;4;22;35;1;21;0;1;0;
dnaE1;3;9;7;3;18;15;5;12;12;1;0;1;7;2;7;7;5;6;9;7;0;2;4;0;16;6;5;6;11;17;3;6;11;12;14;11;20;10;8;1;11;31;2;2;10;3;5;0;2;15;9;6;19;3;0;1;5;9;18;0;2;0;1;0;
iars;5;14;15;10;32;32;21;21;23;8;5;3;12;5;17;6;26;14;19;12;1;3;4;2;37;10;13;13;29;31;6;18;25;15;40;25;37;16;14;19;18;45;5;6;10;27;2;5;12;36;16;4;32;16;10;7;14;17;28;0;13;0;1;0;
lars;3;10;5;5;26;23;30;9;18;10;3;6;11;3;8;6;14;20;9;10;0;3;5;4;34;15;5;13;30;19;6;13;24;17;38;21;28;20;9;11;7;49;5;2;14;23;10;5;12;29;11;3;28;17;10;6;12;25;30;0;15;1;0;0;
mfd;9;26;11;13;48;35;18;20;26;10;3;3;17;9;10;12;18;12;8;10;0;5;8;1;45;27;13;11;54;34;6;20;24;20;32;49;38;17;14;14;24;54;5;2;20;16;9;3;15;40;23;3;34;22;8;10;15;33;41;1;14;1;0;0;
rpoB;5;18;10;13;32;23;34;20;20;13;10;5;5;6;15;12;17;21;21;21;1;4;9;0;46;24;2;13;27;23;7;24;37;18;43;40;51;29;10;8;10;38;2;3;24;7;8;14;10;39;11;6;45;27;6;4;17;33;53;0;14;1;0;0;
rpoC;6;23;17;5;41;28;37;33;15;13;1;5;12;12;22;15;5;22;12;20;0;3;9;0;45;22;6;14;37;25;8;35;41;26;74;49;58;36;14;23;20;51;3;4;16;7;6;12;6;30;20;10;66;35;14;11;21;40;60;0;23;1;0;0;
sbcC;10;22;16;12;43;43;13;10;14;5;0;0;4;6;4;19;14;13;8;9;1;8;11;3;50;21;19;14;92;78;6;5;11;14;52;38;19;11;14;14;17;70;5;6;3;7;2;1;2;15;4;7;9;10;7;2;9;31;31;1;18;1;0;0;
secA;3;18;5;10;40;19;17;27;18;11;1;7;9;5;7;7;17;16;18;12;0;7;4;0;29;29;7;10;24;28;10;14;20;13;45;51;32;22;12;9;13;42;1;3;31;7;5;2;10;23;4;7;44;16;3;5;7;24;37;0;12;1;0;0;
  • tel cyanobactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
carB;102;45;28;55;35;32;64;10;51;79;88;49;114;11;26;6;67;71;72;95;1;
cox1;68;14;38;29;21;18;13;16;10;46;15;18;45;4;23;20;35;40;36;43;1;
dnaE;100;46;29;40;35;23;49;25;59;60;66;47;66;11;27;6;42;51;33;57;1;
dnaE1;55;17;13;24;11;16;28;11;28;32;25;30;51;4;10;3;22;37;15;20;1;
iars;108;42;31;48;40;31;57;26;60;64;65;53;96;11;10;27;55;68;48;41;1;
lars;72;39;28;37;34;19;61;18;49;60;59;48;76;7;14;23;56;59;53;45;1;
mfd;142;38;36;54;30;18;86;24;88;70;81;55;106;7;20;16;67;82;66;56;1;
rpoB;101;54;33;53;38;42;84;15;50;86;83;80;66;5;24;7;71;89;60;67;1;
rpoC;120;70;28;67;27;32;79;20;62;110;123;94;108;7;16;7;54;131;86;83;1;
sbcC;146;23;19;33;27;17;94;33;170;36;90;30;115;11;3;7;20;30;49;50;1;
secA;95;44;29;36;33;30;69;17;52;57;96;54;76;4;31;7;40;71;39;49;1;

Autre-bactéries[modifier | modifier le wikicode]

Répétitions[modifier | modifier le wikicode]

  • bmv bactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
lars; 2595; 66.5895953757225; 0; 0; 0; 0; 41; 93; 120; 160; 2; 1; 1; 3; 0
iars; 2838; 66.8428470754052; 0; 0; 0; 0; 49; 100; 153; 166; 0; 2; 1; 3; 0
carB; 3255; 66.5745007680491; 0; 0; 0; 1; 47; 99; 151; 209; 0; 3; 1; 1; 0
secA; 2796; 65.5221745350501; 1; 0; 0; 0; 40; 101; 132; 168; 1; 2; 0; 3; 0
rpoC; 4239; 64.071715027129; 1; 0; 0; 0; 69; 191; 183; 258; 0; 2; 0; 2; 0
rpoB; 4107; 63.0630630630631; 0; 0; 0; 0; 79; 193; 204; 218; 0; 3; 0; 2; 0
dnaE1; 4361; 67.5533134602155; 3; 1; 1; 0; 95; 136; 230; 269; 0; 4; 3; 7; 0
ftsK; 2469; 67.6792223572296; 0; 0; 1; 0; 36; 69; 131; 156; 2; 1; 3; 2; 0
mfd; 3474; 69.4012665515256; 0; 0; 1; 0; 58; 88; 193; 183; 1; 0; 2; 1; 0
lhr; 4797; 74.9635188659579; 0; 0; 1; 0; 55; 84; 293; 269; 1; 1; 8; 4; 0
recB; 3813; 73.0396013637556; 0; 1; 0; 2; 64; 57; 174; 237; 0; 1; 1; 5; 0
recC; 4065; 73.9237392373924; 1; 0; 1; 1; 125; 43; 225; 269; 0; 0; 3; 8; 0
  • cft bactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
lars; 2436; 34.1133004926108; 8; 20; 0; 0; 117; 127; 43; 79; 16; 27; 1; 4; 0
iars; 2751; 37.4409305707016; 5; 19; 0; 0; 134; 143; 52; 98; 20; 27; 1; 2; 0
carB; 3255; 38.8018433179723; 3; 23; 0; 0; 149; 183; 75; 106; 18; 28; 0; 1; 0
ftsK; 2148; 33.5195530726257; 10; 22; 1; 0; 112; 114; 43; 59; 17; 18; 0; 1; 0
rpoC; 4527; 36.779324055666; 4; 23; 0; 0; 244; 255; 88; 153; 15; 64; 0; 2; 0
rpoB; 4140; 34.0579710144928; 12; 36; 0; 0; 208; 233; 72; 127; 17; 42; 0; 1; 0
recB; 2766; 30.115690527838; 11; 27; 0; 0; 165; 144; 30; 56; 24; 31; 1; 1; 0
secA; 2568; 35.2414330218069; 5; 27; 0; 0; 124; 138; 36; 74; 10; 26; 0; 3; 0
dnaE; 3996; 34.034034034034; 8; 29; 0; 0; 198; 237; 66; 109; 17; 47; 1; 3; 0
mfd; 2973; 32.4251597712748; 11; 22; 0; 0; 154; 181; 32; 81; 27; 31; 0; 0; 0
  • eco bactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
dnaE; 3483; 54.9526270456503; 1; 6; 0; 0; 115; 146; 162; 210; 7; 13; 3; 11; 0
ftsK; 3990; 54.0100250626566; 1; 10; 0; 3; 166; 184; 222; 180; 10; 5; 4; 7; 0
lhr; 4617; 56.898418886723; 5; 4; 2; 2; 161; 169; 223; 273; 11; 12; 6; 9; 0
mfd; 3447; 54.7722657383232; 1; 7; 0; 0; 131; 142; 157; 172; 5; 13; 3; 5; 0
mukB; 4461; 55.6601658820892; 1; 6; 0; 0; 150; 209; 178; 215; 4; 14; 1; 6; 0
recB; 3543; 54.5582839401637; 2; 6; 1; 1; 148; 152; 168; 184; 7; 5; 2; 6; 0
recC; 3369; 53.606411398041; 2; 3; 0; 0; 149; 135; 162; 180; 9; 8; 5; 8; 0
rpoB; 4029; 52.6185157607347; 0; 8; 0; 0; 138; 212; 201; 189; 2; 7; 2; 1; 0
rpoC; 4224; 53.8352272727273; 1; 6; 0; 1; 130; 214; 193; 224; 2; 9; 3; 0; 0
sbcC; 3147; 53.79726723864; 1; 8; 0; 0; 116; 183; 126; 147; 2; 17; 1; 4; 0
  • mhd bactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
dnaE; 3675; 66.6938775510204; 2; 1; 6; 12; 86; 95; 232; 253; 2; 3; 16; 30; 0
rpoB; 3366; 66.7260843731432; 0; 0; 7; 8; 67; 94; 194; 231; 0; 1; 15; 24; 0
rpoC; 4590; 66.7538126361656; 0; 1; 3; 6; 79; 127; 313; 342; 0; 2; 17; 24; 0
secA; 3018; 64.546056991385; 1; 3; 2; 5; 45; 116; 182; 212; 1; 5; 6; 13; 0
sbcC; 2718; 72.0382634289919; 0; 0; 2; 5; 53; 68; 176; 240; 0; 3; 4; 11; 0
mfd; 2958; 68.3231913455037; 0; 1; 7; 7; 74; 54; 204; 223; 5; 3; 15; 15; 0
ftsK; 2835; 68.7125220458554; 2; 0; 9; 4; 54; 74; 212; 191; 3; 3; 17; 22; 0
pdhA; 2703; 68.3314835368109; 1; 0; 1; 5; 58; 77; 190; 187; 0; 2; 13; 20; 0
topA; 2487; 70.48652995577; 0; 3; 9; 3; 38; 66; 181; 181; 0; 2; 21; 12; 0
nuoG; 2451; 71.4402284781722; 0; 0; 7; 7; 41; 56; 173; 191; 0; 0; 14; 15; 0
cox1; 2385; 64.6540880503145; 0; 2; 4; 0; 76; 41; 187; 153; 1; 2; 16; 8; 0
  • sti bactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
ftsK; 2226; 69.0925426774483; 0; 0; 4; 1; 30; 50; 157; 174; 0; 0; 6; 8; 0
rpoC; 4440; 67.6801801801802; 0; 0; 0; 1; 60; 105; 274; 401; 0; 0; 1; 12; 0
rpoB; 3480; 66.2356321839081; 0; 0; 0; 0; 64; 93; 200; 285; 0; 1; 6; 6; 0
cox1; 1896; 64.3459915611814; 0; 0; 1; 0; 62; 34; 130; 117; 0; 0; 4; 10; 0
aldo; 2829; 69.1763874160481; 0; 0; 1; 3; 53; 49; 190; 250; 2; 0; 7; 8; 0
acnA; 2778; 68.682505399568; 0; 0; 0; 1; 46; 52; 231; 190; 0; 0; 7; 7; 0
sbcC; 2553; 69.3301997649824; 0; 0; 1; 0; 26; 64; 216; 162; 0; 0; 7; 5; 0
secA; 2610; 65.2873563218391; 0; 0; 0; 2; 36; 70; 177; 188; 0; 1; 4; 5; 0
dnaE; 3966; 57.5138678769541; 5; 2; 3; 1; 133; 158; 225; 234; 14; 7; 15; 3; 0
mfd; 3522; 68.5406019307212; 0; 0; 1; 0; 58; 58; 265; 260; 1; 0; 10; 7; 0
  • tos bactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
dnaE; 3666; 67.6759410801964; 1; 1; 13; 20; 76; 79; 296; 310; 4; 7; 27; 29; 0
ftsK; 2607; 70.4257767548907; 1; 3; 22; 19; 46; 61; 241; 206; 4; 5; 26; 16; 0
secA; 2994; 66.3994655978624; 1; 2; 12; 11; 51; 92; 240; 244; 4; 4; 16; 20; 0
rpoB; 3360; 68.8690476190476; 0; 0; 19; 14; 55; 80; 265; 268; 1; 0; 26; 33; 0
rpoC; 4575; 68.1967213114754; 1; 1; 13; 16; 71; 119; 368; 392; 0; 4; 35; 35; 0
lars; 2628; 67.3135464231355; 1; 1; 13; 10; 49; 69; 197; 221; 0; 4; 23; 24; 0
iars; 3129; 67.4017257909875; 0; 2; 21; 8; 67; 85; 231; 273; 2; 5; 25; 29; 0
carB; 3087; 68.0272108843537; 0; 2; 16; 25; 53; 80; 224; 261; 1; 0; 26; 32; 0
sbcC; 2895; 68.5319516407599; 2; 2; 6; 20; 65; 85; 216; 314; 7; 3; 13; 19; 0
mfd; 2955; 70.0507614213198; 1; 2; 20; 21; 70; 52; 251; 246; 2; 3; 28; 24; 0
  • zin bactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
dnaE; 3396; 13.4275618374558; 25; 86; 0; 0; 218; 256; 20; 42; 30; 54; 0; 0; 0
rpoB; 3876; 14.0866873065015; 29; 97; 0; 1; 257; 281; 35; 53; 35; 48; 0; 1; 0
rpoC; 2346; 15.771526001705; 8; 53; 0; 1; 161; 159; 15; 40; 24; 40; 0; 0; 0
nuoG; 2283; 11.8703460359177; 17; 61; 0; 0; 151; 155; 14; 14; 28; 41; 0; 0; 0
nuoL; 1923; 9.4123764950598; 29; 27; 0; 0; 150; 115; 9; 17; 40; 24; 0; 0; 0
lars; 2424; 9.98349834983498; 21; 67; 0; 0; 156; 177; 20; 17; 23; 28; 0; 1; 0
iars; 2790; 11.6129032258065; 23; 60; 1; 0; 166; 218; 18; 27; 28; 47; 0; 0; 0
cox3; 2439; 16.6871668716687; 37; 25; 0; 1; 174; 173; 23; 42; 31; 18; 0; 0; 0
metE; 2277; 16.2055335968379; 7; 54; 0; 0; 156; 175; 23; 35; 19; 27; 0; 0; 0
gyrB; 2454; 13.121434392828; 15; 71; 0; 0; 144; 194; 13; 31; 16; 32; 0; 0; 0

Codons[modifier | modifier le wikicode]

  • zin bactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
dnaE;103;3;2;3;0;0;217;4;76;2;23;14;11;1;0;2;56;3;141;6;23;0;1;0;0;0;9;0;16;2;15;23;0;1;40;0;27;1;19;14;0;1;11;0;8;0;12;6;0;1;9;14;0;0;10;11;0;0;76;108;0;1;0;6;
rpoB;124;1;2;2;0;0;224;8;91;3;37;25;11;0;0;0;78;0;166;3;25;0;2;0;0;0;13;0;19;0;16;31;0;3;52;0;34;0;7;12;0;0;6;0;16;0;10;25;0;0;23;13;1;0;18;12;1;0;66;107;2;1;0;2;
rpoC;65;1;1;1;0;0;145;1;31;0;28;14;15;0;0;0;32;0;80;0;22;0;0;0;0;0;4;0;11;1;10;29;1;1;30;0;18;0;4;7;1;0;8;1;12;0;5;9;0;1;17;8;0;0;21;12;0;0;69;63;0;1;0;2;
nuoG;61;2;3;2;0;0;140;5;57;1;23;15;10;0;0;1;38;1;106;2;16;0;0;0;0;0;7;0;9;0;4;8;0;0;24;1;13;1;1;5;0;1;13;2;7;0;6;6;0;0;6;5;0;0;14;10;2;0;54;72;0;1;0;6;
nuoL;96;2;2;0;0;0;71;0;84;0;23;13;9;0;1;1;45;2;65;0;3;0;0;1;0;0;4;0;5;0;5;9;0;0;11;0;7;0;3;3;0;0;4;0;8;0;4;3;0;0;7;1;0;0;10;3;0;1;53;76;1;1;0;4;
lars;68;0;1;1;0;0;165;2;61;1;11;7;3;0;1;0;62;2;124;3;12;0;0;0;0;0;8;0;10;0;7;9;0;1;14;0;11;0;1;4;0;0;8;1;13;1;9;9;0;1;5;5;0;0;9;10;0;0;53;78;1;1;0;15;
iars;76;2;0;0;0;0;165;2;70;1;15;19;3;0;1;0;55;4;129;2;17;0;1;0;0;0;11;1;16;0;11;12;1;0;24;0;22;0;4;2;1;0;12;0;8;2;9;9;0;1;8;5;0;0;18;9;0;0;65;103;0;1;0;13;
cox3;88;7;1;0;0;0;60;0;89;4;24;11;9;1;1;0;41;2;60;2;10;0;0;0;0;0;14;0;5;0;21;19;1;1;17;0;10;0;6;11;0;1;6;0;26;0;12;7;1;1;14;12;0;0;19;20;0;0;54;101;1;1;0;22;
metE;68;2;0;0;0;0;129;1;38;0;18;10;8;1;0;0;38;1;84;3;19;0;1;0;0;0;9;0;13;1;12;15;2;1;33;2;17;1;5;7;0;0;9;0;14;1;11;12;0;0;7;10;2;0;14;15;0;0;50;60;0;0;1;14;
gyrB;75;2;0;0;0;0;151;5;42;0;18;20;12;1;0;0;43;4;106;0;18;0;1;0;0;0;6;0;12;0;18;11;0;0;30;0;19;1;7;4;1;1;8;0;11;0;4;6;1;1;6;7;0;0;10;14;0;0;50;89;0;1;0;2;
  • zin bactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
dnaE;111;221;78;51;59;147;24;9;18;39;40;28;34;11;8;0;19;23;21;184;7;
rpoB;129;232;94;73;78;169;27;13;19;50;52;34;19;6;16;0;35;37;31;175;3;
rpoC;68;146;31;57;32;80;22;4;12;41;30;18;12;9;12;0;15;25;33;132;3;
nuoG;68;145;58;49;39;108;16;7;9;12;25;14;7;15;7;0;12;11;26;126;7;
nuoL;100;71;84;47;47;65;4;4;5;14;11;7;6;4;8;0;7;8;14;130;5;
lars;70;167;62;22;64;127;12;8;10;17;14;11;5;9;13;1;19;10;19;132;16;
iars;78;167;71;38;59;131;18;12;16;24;24;22;7;12;8;2;19;13;27;168;14;
cox3;96;60;93;46;43;62;10;14;5;42;17;10;18;6;26;0;21;26;39;156;23;
metE;70;130;38;37;39;87;20;9;14;30;35;18;12;9;14;1;23;19;29;110;15;
gyrB;77;156;42;51;47;106;19;6;12;29;30;20;13;8;11;0;12;13;24;139;3;
  • tos bactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
dnaE;3;6;16;4;56;66;4;58;11;37;1;0;0;4;28;8;3;44;0;20;0;0;1;16;39;38;3;25;3;31;0;1;42;55;4;123;2;60;1;1;35;86;0;4;30;9;1;3;7;61;6;0;64;18;0;0;13;25;2;2;41;0;0;1;
ftsK;0;6;16;6;51;77;9;34;7;26;0;0;0;4;14;16;0;11;0;9;0;1;0;10;25;27;0;13;6;21;3;0;30;38;12;64;2;23;0;0;24;83;0;0;11;7;1;4;11;61;0;1;38;7;0;1;6;25;0;0;27;0;1;0;
secA;0;3;20;4;31;47;4;62;10;24;0;0;0;2;17;6;0;29;1;23;0;0;0;9;42;41;0;20;3;34;0;1;36;31;10;107;0;49;1;0;24;63;0;1;26;6;0;2;11;37;0;0;51;19;0;0;6;34;4;3;43;1;0;0;
rpoB;0;4;6;3;57;47;0;50;9;32;0;0;0;1;32;9;1;32;1;20;0;1;1;4;52;45;1;16;0;35;0;2;47;52;8;96;4;66;0;0;13;69;0;2;23;2;0;2;11;57;2;0;71;26;1;0;4;44;4;0;54;1;0;0;
rpoC;4;6;9;4;59;78;2;86;7;35;0;0;0;5;35;21;0;46;0;28;0;0;2;6;79;45;1;22;1;56;1;6;55;51;10;150;1;73;0;3;35;93;0;11;27;10;0;4;9;64;4;1;106;42;0;0;14;49;6;1;61;0;1;0;
lars;0;3;7;1;33;36;3;47;9;29;0;1;0;3;4;8;0;32;0;19;0;0;2;7;29;28;0;19;1;22;0;0;27;35;7;86;4;36;0;0;19;58;0;8;24;28;0;2;9;51;2;1;40;22;1;0;6;33;0;2;31;0;1;0;
iars;0;6;20;11;45;45;7;46;6;37;0;0;0;5;12;14;0;43;1;20;1;1;0;10;30;44;1;20;1;18;2;1;29;40;17;100;0;43;0;1;26;71;0;10;12;26;0;3;10;57;0;1;45;24;0;0;10;33;1;0;36;1;0;0;
carB;3;4;17;6;48;40;4;44;9;16;1;0;0;4;29;7;0;37;1;16;1;0;0;18;16;40;0;16;3;21;0;0;30;60;9;99;1;41;0;0;32;70;0;2;21;10;1;1;11;51;2;0;59;30;0;0;9;38;4;1;45;0;0;1;
sbcC;1;22;35;8;62;51;7;50;7;12;0;1;0;3;12;6;3;10;0;2;3;2;6;30;27;42;1;8;3;29;4;2;23;43;29;122;10;29;0;3;28;102;0;3;4;11;0;4;4;25;2;1;29;9;0;2;9;16;1;0;6;0;0;1;
mfd;0;10;21;4;50;78;6;32;6;31;1;0;0;3;16;8;2;33;0;7;1;1;0;13;36;45;1;20;2;24;2;0;33;48;5;93;5;36;0;2;20;73;0;0;7;6;0;5;15;55;4;2;38;20;2;0;7;29;2;0;24;0;0;1;
  • tos bactérie acides aminés:
protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
dnaE;151;62;48;41;47;20;94;28;34;98;127;62;123;4;30;9;72;88;38;45;1;
ftsK;156;43;33;34;11;9;63;13;27;71;76;25;107;0;11;7;77;46;32;27;1;
secA;105;66;34;25;29;24;92;20;37;68;117;49;88;1;26;6;50;70;40;50;1;
rpoB;117;50;41;42;33;21;103;17;35;101;104;70;82;2;23;2;70;99;49;58;1;
rpoC;160;88;42;61;46;28;132;23;57;113;160;74;131;11;27;10;77;153;63;68;1;
lars;80;50;38;16;32;19;66;19;23;62;93;40;77;8;24;28;62;65;40;33;1;
iars;127;53;43;31;43;21;86;21;19;72;117;43;98;10;12;26;70;70;43;37;1;
carB;118;48;25;41;37;17;75;16;24;90;108;42;102;2;21;10;64;91;47;50;1;
sbcC;179;57;19;22;13;2;110;9;32;72;151;39;133;3;4;11;33;41;27;7;1;
mfd;163;38;37;28;35;7;96;21;26;83;98;41;95;0;7;6;75;64;38;26;1;
  • sti bactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
ftsK;1;5;3;3;44;33;3;22;0;15;0;0;0;12;7;10;1;11;2;14;0;2;6;2;37;15;2;8;2;25;3;17;24;18;4;44;8;25;11;9;41;30;0;2;20;7;1;3;36;19;2;2;31;32;2;1;17;14;1;0;32;1;0;0;
rpoC;0;7;3;2;91;39;0;57;1;29;1;0;3;29;14;20;5;26;0;38;0;2;5;1;60;51;6;23;0;68;3;29;61;28;7;144;12;73;8;14;69;57;2;11;33;7;0;2;52;4;7;2;55;65;1;3;31;40;7;0;71;0;1;0;
rpoB;0;10;2;1;59;34;0;43;4;32;1;1;1;27;10;15;3;25;5;33;0;1;4;1;46;52;2;16;3;37;5;12;54;22;10;94;15;65;3;6;40;35;0;3;26;5;0;0;51;7;5;1;47;48;2;0;36;26;10;1;62;0;1;0;
cox1;0;3;2;1;39;31;0;7;4;46;1;2;0;18;9;8;4;17;3;15;0;1;2;0;10;10;2;13;3;15;2;8;23;20;3;11;1;17;4;2;27;22;0;0;28;21;1;2;34;11;1;1;20;27;1;1;18;19;2;1;37;0;0;1;
aldo;0;3;4;2;65;39;1;18;2;39;0;0;1;18;2;17;1;18;5;15;0;4;4;2;31;33;3;12;0;40;5;6;40;29;5;71;15;45;7;7;52;42;0;0;12;9;4;1;38;13;4;1;38;26;1;2;22;27;4;0;37;0;0;1;
acnA;0;4;2;1;48;38;1;11;0;31;3;2;0;13;9;20;2;27;3;25;1;2;10;0;49;14;1;15;0;28;2;8;50;18;6;66;11;40;11;4;25;42;0;4;11;9;4;4;41;18;6;1;44;40;5;2;26;30;1;0;36;0;0;1;
sbcC;0;4;2;8;37;47;3;15;2;16;0;1;2;6;6;8;1;9;0;12;1;5;5;4;69;34;1;12;10;46;5;5;28;2;18;90;7;43;6;5;34;75;0;7;10;2;2;1;4;9;0;1;7;25;2;3;12;32;2;1;46;0;1;0;
secA;0;5;2;2;40;32;1;34;3;19;0;0;1;6;5;11;4;30;2;23;0;3;8;0;39;28;1;24;3;40;2;14;36;16;7;72;10;47;4;2;29;28;1;3;19;4;3;0;29;6;3;2;27;32;1;1;22;25;3;0;55;1;0;0;
dnaE;7;21;11;1;70;15;22;29;29;26;10;4;5;17;12;20;8;41;14;30;1;1;12;3;53;12;17;19;10;36;9;15;49;13;57;55;37;35;12;19;40;49;4;5;37;12;7;17;24;36;15;6;55;16;6;1;15;45;33;2;39;0;0;1;
mfd;1;17;5;6;57;62;1;15;1;22;1;3;1;10;13;18;1;33;3;15;1;7;7;2;64;38;2;23;2;46;6;7;46;19;16;87;14;49;17;4;44;50;0;2;18;9;8;3;53;18;7;3;44;55;1;4;22;28;3;0;59;0;1;0;
  • sti bactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
ftsK;89;25;15;29;12;16;62;10;27;62;48;33;91;2;20;7;59;67;34;33;1;
rpoC;142;57;30;67;31;38;119;29;68;121;151;85;148;13;33;7;58;129;75;78;1;
rpoB;106;43;36;55;28;38;104;18;40;93;104;80;84;3;26;5;58;101;64;73;1;
cox1;76;7;50;38;21;18;23;15;18;53;14;18;55;0;28;21;48;49;39;40;1;
aldo;113;19;41;38;19;20;74;15;40;80;76;60;108;0;12;9;56;69;52;41;1;
acnA;93;12;31;47;29;28;76;16;28;78;72;51;82;4;11;9;67;91;63;37;1;
sbcC;98;18;18;23;10;12;118;13;56;40;108;50;120;7;10;2;16;33;49;49;1;
secA;81;35;22;23;34;25;78;25;43;68;79;57;63;4;19;4;38;64;49;58;1;
dnaE;125;51;55;68;49;44;82;36;46;86;112;72;120;9;37;12;84;92;67;74;1;
mfd;148;16;23;46;34;18;119;25;48;78;103;63;115;2;18;9;82;109;55;62;1;
  • mhd bactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
dnaE;0;25;5;1;47;60;6;52;8;39;0;0;2;8;17;14;1;46;0;27;0;1;4;1;59;33;1;23;1;37;2;4;30;60;13;108;12;55;6;4;72;50;0;5;33;12;0;3;23;34;5;3;43;32;1;1;12;28;6;0;49;1;0;0;
rpoB;0;14;3;2;59;41;5;46;4;36;0;0;1;19;14;12;2;30;0;30;0;1;11;2;54;31;2;17;8;32;4;7;37;51;6;85;20;59;0;4;46;27;0;2;23;3;1;2;34;33;1;3;68;25;0;0;13;31;3;0;57;0;0;1;
rpoC;0;14;7;2;61;62;4;82;5;32;0;0;0;18;23;16;1;49;0;30;0;1;12;2;77;29;2;25;2;55;2;8;66;45;13;138;15;71;3;4;63;67;1;10;33;13;0;4;37;33;11;5;74;45;4;0;20;48;4;0;81;1;0;0;
secA;2;7;5;7;40;33;9;55;7;24;0;0;0;6;10;12;1;31;0;25;0;5;5;1;48;30;0;25;12;28;5;7;34;22;29;85;7;47;1;4;53;36;0;5;23;8;3;0;24;17;1;4;42;22;2;2;21;20;2;0;51;0;1;0;
sbcC;4;19;5;5;33;63;4;17;5;13;0;0;1;8;6;6;1;16;0;8;0;1;5;1;76;43;3;18;10;37;1;3;32;25;30;100;6;25;3;10;73;56;0;4;4;9;1;3;10;12;3;0;43;4;1;0;10;18;0;0;11;0;0;1;
mfd;1;10;15;2;44;59;6;29;10;31;0;1;0;9;8;12;1;34;2;8;0;3;6;0;45;45;3;24;7;24;7;4;36;30;8;74;10;42;0;8;53;36;0;1;8;9;2;10;25;32;3;4;52;23;0;1;19;14;2;0;33;1;0;0;
ftsK;1;18;9;4;49;51;7;28;5;23;1;0;0;21;16;14;2;12;3;16;0;3;8;3;36;24;2;20;3;22;1;5;31;35;19;59;9;26;8;9;50;59;0;1;17;13;2;8;22;41;3;3;30;16;0;0;16;25;1;0;34;0;0;1;
pdhA;2;12;4;3;23;49;1;32;3;32;0;0;0;9;7;14;0;37;0;21;0;0;3;1;49;23;0;24;4;24;1;5;32;39;20;60;6;39;0;6;50;46;0;1;16;14;0;0;27;27;4;1;35;22;0;1;10;21;2;0;38;0;0;1;
topA;1;3;1;2;25;37;12;31;0;27;0;0;1;5;15;17;1;28;0;10;0;3;2;0;51;34;0;10;3;19;1;2;25;23;15;69;1;28;1;5;40;42;0;16;8;9;1;1;17;49;4;0;33;24;0;0;18;35;0;0;23;0;0;1;
nuoG;0;5;1;1;26;52;0;30;3;25;0;0;0;10;4;10;0;26;0;11;0;1;4;1;37;27;0;20;4;17;6;3;33;33;9;64;1;38;1;5;47;46;0;12;12;11;0;3;20;34;5;1;42;16;1;0;9;29;1;0;19;0;0;1;
cox1;1;6;4;2;47;63;10;9;2;62;0;0;0;14;11;9;2;33;0;18;0;0;2;0;17;2;1;23;3;13;4;6;39;22;3;15;2;17;1;0;30;45;0;0;25;33;0;1;17;26;2;2;28;32;2;0;14;35;1;0;38;1;0;0;
  • mhd bactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
dnaE;138;58;47;41;47;27;98;24;38;96;121;67;132;5;33;12;60;83;42;55;1;
rpoB;119;51;40;46;32;30;99;19;40;99;91;79;77;2;23;3;70;97;44;60;1;
rpoC;146;86;37;57;50;30;121;27;57;121;151;86;137;11;33;13;74;135;72;85;1;
secA;94;64;31;28;32;25;89;25;40;68;114;54;94;5;23;8;44;69;45;53;1;
sbcC;129;21;18;21;17;8;126;21;47;61;130;31;142;4;4;9;26;50;29;11;1;
mfd;131;35;41;30;35;10;99;27;31;77;82;52;97;1;8;9;69;82;34;35;1;
ftsK;132;35;28;52;14;19;74;22;25;72;78;35;126;1;17;13;73;52;41;35;1;
pdhA;93;33;35;30;37;21;76;24;28;77;80;45;102;1;16;14;54;62;32;40;1;
topA;69;43;27;38;29;10;90;10;22;51;84;29;88;16;8;9;68;61;53;23;1;
nuoG;85;30;28;24;26;11;70;20;21;75;73;39;99;12;12;11;57;64;39;20;1;
cox1;123;19;64;34;35;18;21;24;16;71;18;19;76;0;25;33;44;64;51;39;1;
  • eco bactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
dnaE;11;13;20;2;64;12;38;20;24;26;7;4;1;11;8;15;20;19;5;27;0;1;36;4;29;8;8;16;12;28;10;31;31;22;61;31;43;43;11;11;55;25;5;7;37;8;8;7;34;5;11;18;26;20;2;3;11;29;12;2;52;1;0;0;
ftsK;10;24;13;7;48;6;39;6;21;14;14;9;6;11;11;16;29;17;16;17;0;3;41;0;21;5;11;6;44;75;3;37;24;12;72;21;47;23;27;28;55;39;3;1;25;19;34;21;68;9;39;17;28;19;15;10;16;20;38;1;18;1;0;0;
lhr;24;23;22;9;78;29;22;4;28;14;14;16;17;24;15;19;20;7;19;13;6;15;38;4;57;27;21;8;35;35;15;28;51;19;76;28;51;29;37;20;56;53;4;3;27;25;18;12;38;19;22;22;30;35;12;9;25;38;39;8;26;0;1;0;
mfd;7;14;16;3;86;14;37;6;17;29;1;5;9;12;3;17;16;11;17;16;0;3;42;1;37;10;19;15;18;41;6;26;24;10;64;29;46;23;22;6;44;37;3;4;30;10;13;7;30;6;11;9;33;14;8;8;21;21;31;0;30;1;0;0;
mukB;8;17;13;5;115;19;41;8;26;21;18;8;10;17;13;32;17;14;11;46;0;5;79;0;57;4;15;17;20;94;5;23;24;7;105;55;58;31;18;18;77;32;3;7;32;8;4;4;25;1;16;7;46;16;8;1;14;33;27;0;31;1;0;0;
recB;14;32;13;7;66;12;24;7;30;14;6;3;17;11;11;16;18;12;15;17;0;6;37;0;40;9;12;17;24;47;4;19;28;13;67;29;48;26;26;13;45;33;3;7;31;23;9;5;30;8;17;9;21;15;6;9;19;26;20;3;31;1;0;0;
recC;18;20;14;12;75;15;18;5;33;17;4;10;11;6;11;27;23;12;7;23;1;6;38;3;26;8;16;6;25;52;8;18;22;12;60;24;41;33;15;11;36;23;6;8;29;27;12;10;40;5;15;3;24;11;7;5;8;17;24;3;23;0;0;1;
rpoB;1;6;6;0;99;15;56;24;11;33;23;0;2;3;31;15;14;29;3;48;0;1;61;0;28;0;1;18;8;50;0;69;35;2;89;33;30;62;22;19;29;9;5;2;37;4;10;8;38;0;41;31;24;13;17;3;6;34;18;0;66;1;0;0;
rpoC;3;1;3;0;125;7;62;25;9;26;24;1;0;5;27;14;7;27;1;47;0;0;75;0;24;0;4;17;3;47;0;85;28;2;83;26;34;47;33;28;52;11;7;8;35;9;9;3;45;0;53;32;17;7;23;1;7;46;17;0;75;1;0;0;
sbcC;24;15;19;7;64;16;30;12;9;11;2;3;9;10;4;23;7;4;16;20;0;4;24;0;28;6;11;16;69;88;2;12;14;11;62;26;31;15;16;10;59;27;4;4;10;15;7;4;11;3;11;7;13;11;10;12;26;28;23;2;11;1;0;0;

  • eco bactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
dnaE;122;58;50;46;39;32;78;24;40;94;92;86;102;12;37;8;54;75;45;66;1;
ftsK;108;45;35;67;46;33;70;17;119;76;93;70;149;4;25;19;132;103;61;57;1;
lhr;185;26;42;105;27;32;147;29;70;113;104;80;166;7;27;25;87;109;84;73;1;
mfd;140;43;46;47;27;33;93;34;59;66;93;69;109;7;30;10;56;67;58;61;1;
mukB;177;49;47;98;31;57;145;32;114;59;160;89;145;10;32;8;34;85;56;58;1;
recB;144;31;44;64;30;32;92;29;71;64;96;74;117;10;31;23;52;62;60;54;1;
recC;154;23;50;69;35;30;82;22;77;60;84;74;85;14;29;27;67;53;37;50;1;
rpoB;127;80;44;74;43;51;90;19;58;106;122;92;79;7;37;4;56;109;60;84;1;
rpoC;139;87;35;71;34;48;99;21;50;115;109;81;124;15;35;9;57;109;77;92;1;
sbcC;145;42;20;51;11;36;62;27;157;39;88;46;112;8;10;15;25;42;76;36;1;
  • cft bactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
lars;26;6;29;8;2;1;65;11;39;2;11;8;18;1;0;13;30;8;38;12;18;0;4;5;1;1;14;1;19;3;21;16;7;4;35;27;40;11;11;28;2;7;7;7;16;18;7;18;6;1;19;16;4;3;12;8;5;4;18;33;6;0;1;0;
iars;29;11;33;15;3;2;69;13;36;4;8;8;17;2;3;22;26;9;34;8;22;1;6;2;4;2;13;4;13;4;20;13;13;7;29;35;52;17;16;37;7;9;6;11;13;21;4;15;12;1;26;15;7;2;21;11;5;1;17;39;11;0;1;0;
carB;21;12;37;9;1;4;72;12;41;5;4;8;28;1;2;32;30;7;40;19;22;3;5;2;4;0;12;1;19;8;22;22;26;3;49;32;46;14;27;40;12;13;6;5;32;4;11;11;21;2;30;24;12;12;25;6;10;12;24;49;21;0;0;1;
ftsK;27;15;30;4;3;4;54;9;31;2;6;5;21;1;3;13;15;4;33;4;10;0;6;3;6;0;6;1;9;6;26;9;7;2;32;17;33;9;10;26;5;3;2;0;15;0;10;17;2;2;19;16;5;5;13;13;3;2;27;42;12;0;0;1;
rpoC;41;10;51;13;7;3;110;27;33;8;14;23;34;6;0;15;40;8;46;18;30;0;32;8;10;0;10;12;27;11;31;47;22;4;73;47;76;15;43;47;6;13;8;5;35;8;17;30;9;1;62;46;8;6;39;21;3;6;42;68;23;1;0;0;
rpoB;47;10;48;16;4;5;102;21;43;2;11;15;15;3;0;20;43;3;57;14;46;1;21;2;3;0;21;6;27;7;29;44;17;1;78;43;80;16;32;37;3;5;3;3;43;6;23;17;7;1;51;45;5;5;29;23;8;7;39;57;9;0;0;1;
recB;38;15;35;12;7;3;73;15;59;5;8;11;33;4;5;18;34;8;52;16;18;0;2;6;1;1;5;3;22;6;15;8;9;4;36;38;55;4;12;20;6;6;5;6;13;2;3;4;3;1;19;13;2;6;12;11;4;3;31;44;11;1;0;0;
secA;20;10;29;8;6;2;67;13;23;7;6;6;21;2;0;9;28;2;36;7;35;2;7;2;4;0;11;5;21;7;24;18;11;4;43;34;59;11;17;25;2;7;1;4;17;1;3;6;6;0;29;17;2;14;15;10;8;6;16;44;5;0;1;0;
dnaE;31;15;45;12;3;4;97;26;49;14;16;12;19;5;3;26;45;13;60;15;29;5;5;5;4;0;19;8;30;8;33;24;14;6;67;39;87;15;26;40;11;14;3;7;36;4;14;10;8;2;29;23;5;3;24;21;5;6;23;87;22;1;0;0;
mfd;43;19;37;16;5;4;75;14;42;5;11;14;33;2;2;22;20;9;49;9;28;2;4;7;1;0;14;2;19;5;14;17;13;3;41;26;62;11;18;26;5;6;2;5;17;2;8;3;7;0;26;20;3;9;23;5;8;4;24;53;16;0;0;1;
  • cft bactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
lars;72;76;41;51;38;50;29;15;22;48;62;51;48;14;16;18;32;42;29;57;1;
iars;93;82;40;60;35;42;37;17;17;53;64;69;69;17;13;21;32;50;38;67;1;
carB;84;84;46;75;37;59;36;13;27;73;81;60;92;11;32;4;45;78;53;94;1;
ftsK;83;63;33;49;19;37;25;7;15;44;49;42;44;2;15;0;31;45;31;81;1;
rpoC;125;137;41;92;48;64;80;22;38;104;120;91;109;13;35;8;57;122;69;133;1;
rpoB;130;123;45;64;46;71;73;27;34;91;121;96;77;6;43;6;48;106;67;105;1;
recB;110;88;64;79;42;68;28;8;28;36;74;59;44;11;13;2;11;40;30;86;1;
secA;75;80;30;44;30;43;50;16;28;57;77;70;51;5;17;1;15;62;39;65;1;
dnaE;110;123;63;81;58;75;48;27;38;77;106;102;91;10;36;4;34;60;56;132;1;
mfd;124;89;47;84;29;58;42;16;24;47;67;73;55;7;17;2;18;58;40;93;1;
  • bmv bactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
lars;0;1;1;0;35;27;2;49;3;28;0;0;0;16;4;6;3;36;0;28;1;0;1;1;38;6;3;10;2;26;0;4;62;5;13;38;10;48;2;2;69;30;0;10;32;23;0;1;33;12;1;1;42;29;1;0;29;9;2;0;29;0;0;1;
iars;0;4;1;0;44;38;3;45;2;33;0;0;0;33;2;9;7;30;0;25;0;0;1;1;53;6;9;21;7;22;1;1;66;4;22;44;11;47;1;1;79;24;1;10;17;22;0;1;35;11;0;0;27;28;0;1;39;16;1;0;39;1;0;0;
carB;1;3;1;1;39;45;3;53;2;29;0;0;0;43;3;9;7;26;0;27;0;0;6;1;52;5;0;15;2;31;0;3;80;3;17;71;16;50;1;2;89;18;0;15;30;4;1;0;50;5;0;0;47;44;0;1;47;16;1;0;69;1;0;0;
secA;0;4;3;0;40;33;1;38;2;24;0;0;0;26;2;9;2;25;4;29;0;1;5;0;51;12;6;26;4;50;0;2;64;4;26;63;17;37;2;1;74;20;1;4;24;7;0;1;21;4;2;0;31;27;0;2;34;11;3;0;52;0;0;1;
rpoC;0;5;3;1;77;45;1;85;1;41;0;0;0;60;3;3;1;29;2;44;0;1;34;0;64;4;1;17;5;51;0;20;92;1;56;59;21;58;8;2;92;19;0;13;35;6;0;0;54;3;1;0;74;48;0;0;53;27;8;0;84;1;0;0;
rpoB;0;6;1;1;65;52;0;78;2;48;0;1;1;54;6;10;7;32;4;44;0;0;23;0;69;7;2;22;6;47;0;13;87;3;66;44;12;87;6;2;70;20;3;2;37;6;0;3;47;7;4;0;61;57;0;1;42;21;8;0;71;1;0;0;
dnaE1;1;13;13;0;57;75;12;52;8;55;1;3;0;26;4;14;8;28;4;33;0;15;28;4;107;44;10;26;3;54;7;10;106;21;43;76;39;84;18;3;135;73;1;12;33;11;3;1;51;26;9;8;46;50;0;2;36;15;9;4;56;0;0;1;
ftsK;0;4;2;2;47;42;3;32;4;16;0;0;1;30;6;12;5;12;3;16;0;1;1;0;45;16;2;13;1;21;2;0;59;6;13;45;12;24;8;1;58;25;1;2;20;10;0;2;32;11;1;0;28;37;1;1;23;12;7;1;43;0;0;1;
mfd;0;2;4;0;61;61;1;38;0;50;0;1;0;23;7;17;6;24;3;16;0;1;0;0;76;18;4;32;5;49;2;1;67;6;23;56;16;58;2;0;117;30;0;7;20;6;0;1;48;14;0;0;52;21;0;1;36;18;0;0;56;0;1;0;
lhr;0;5;0;0;75;118;2;20;4;37;1;0;0;26;12;17;4;15;2;18;0;1;2;1;122;37;11;30;6;31;0;3;100;17;37;62;26;71;9;2;203;92;0;17;19;25;1;2;69;34;0;0;43;58;1;0;45;15;4;0;46;1;0;0;
recB;0;8;5;0;56;75;4;17;2;41;0;0;3;22;9;12;13;14;4;12;0;4;9;0;85;27;9;23;2;34;3;2;71;10;19;60;27;62;12;1;193;57;2;8;17;25;1;0;43;20;1;2;34;29;0;0;40;7;2;1;31;0;0;1;
recC;0;10;3;3;57;79;1;4;5;61;2;3;2;43;6;16;9;13;4;8;0;5;22;4;79;44;13;18;8;21;0;6;81;12;17;43;23;65;6;1;200;67;0;8;14;29;3;3;66;22;19;3;37;23;1;1;27;6;1;0;27;0;0;1;
  • bmv bactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
lars;64;51;31;26;39;28;47;13;28;71;51;58;103;10;32;23;46;73;39;31;1;
iars;87;48;35;44;37;25;61;30;29;72;66;58;105;11;17;22;47;55;56;40;1;
carB;90;56;31;55;33;27;64;15;33;86;88;66;110;15;30;4;56;91;64;70;1;
secA;80;39;26;37;27;33;69;32;54;70;89;54;97;5;24;7;26;60;47;55;1;
rpoC;131;86;42;66;30;46;103;18;56;113;115;79;121;13;35;6;57;123;80;92;1;
rpoB;125;78;50;72;39;48;99;24;53;103;110;99;98;5;37;6;57;122;64;79;1;
dnaE1;159;64;63;48;36;37;198;36;57;144;119;123;229;13;33;11;81;113;53;69;1;
ftsK;97;35;20;49;17;19;63;15;22;67;58;36;92;3;20;10;45;66;37;51;1;
mfd;128;39;50;48;30;19;95;36;54;76;79;74;149;7;20;6;63;73;55;56;1;
lhr;198;22;41;56;19;20;163;41;37;120;99;97;306;17;19;25;106;101;61;50;1;
recB;144;21;43;46;27;16;125;32;36;86;79;89;263;10;17;25;64;66;47;34;1;
recC;152;5;66;72;22;12;154;31;29;99;60;88;274;8;14;29;94;82;35;28;1;

Autres bactéries compléments[modifier | modifier le wikicode]

Répétitions[modifier | modifier le wikicode]

  • aae bactérie
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
acnA; 1980; 49.5454545454545; 0; 5; 0; 1; 74; 133; 94; 115; 0; 9; 5; 1; 0
dnaE; 3486; 46.5002868617326; 3; 14; 2; 1; 138; 236; 114; 185; 4; 24; 7; 7; 0
gyrB; 2379; 46.9104665825977; 3; 9; 1; 0; 95; 147; 65; 145; 0; 17; 6; 7; 0
iars; 2871; 47.0567746429815; 5; 7; 2; 0; 116; 174; 97; 168; 5; 19; 9; 6; 0
metE; 2286; 45.2318460192476; 1; 6; 0; 0; 98; 151; 89; 115; 3; 25; 6; 1; 0
rpoB; 4407; 47.2203312911277; 1; 13; 2; 0; 180; 292; 155; 257; 0; 30; 13; 6; 0
rpoC; 4724; 47.0575783234547; 1; 5; 4; 1; 183; 340; 164; 255; 1; 36; 11; 3; 0
sbcC; 2937; 41.3687436159346; 2; 27; 0; 2; 121; 242; 67; 159; 5; 37; 0; 5; 0
secA; 2955; 44.7377326565144; 1; 10; 0; 0; 104; 236; 105; 151; 2; 36; 2; 8; 0
topA; 1623; 43.6845348120764; 2; 11; 0; 0; 64; 114; 52; 84; 4; 14; 3; 4; 0
  • amo bactérie
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
carB; 3129; 53.5314797059764; 4; 8; 4; 4; 129; 130; 152; 195; 11; 10; 10; 7; 0
dnaE; 3414; 49.4434680726421; 3; 9; 0; 0; 161; 163; 136; 218; 7; 8; 5; 12; 0
ftsK; 2322; 48.7941429801895; 5; 0; 0; 1; 107; 106; 99; 135; 6; 11; 6; 6; 0
iars; 2787; 50.8073196986006; 1; 3; 1; 2; 113; 140; 124; 165; 7; 7; 3; 7; 0
lars; 2472; 53.4385113268608; 7; 2; 0; 1; 97; 102; 123; 168; 6; 12; 5; 7; 0
mfd; 3132; 49.1060025542784; 5; 4; 2; 1; 145; 154; 111; 207; 2; 12; 3; 8; 0
rpoB; 3549; 54.043392504931; 2; 2; 4; 2; 133; 163; 169; 253; 3; 9; 7; 11; 0
rpoC; 4962; 52.9423619508263; 2; 6; 3; 4; 188; 240; 212; 332; 7; 9; 7; 11; 0
sbcC; 2673; 43.7710437710438; 3; 9; 0; 1; 146; 185; 77; 138; 8; 15; 3; 3; 0
secA; 2700; 49.1481481481481; 2; 9; 0; 4; 119; 137; 97; 151; 5; 13; 5; 7; 0
  • dal bactérie
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
acnA; 1923; 59.854394175767; 3; 3; 3; 1; 66; 63; 137; 157; 10; 6; 6; 5; 0
carB; 3201; 57.7319587628866; 3; 10; 2; 0; 109; 126; 216; 244; 8; 10; 6; 11; 0
dnaE; 3507; 53.3504419731965; 3; 17; 4; 1; 121; 165; 223; 223; 12; 19; 8; 7; 0
ftsK; 2181; 57.6341127922971; 2; 10; 0; 1; 68; 95; 150; 152; 5; 7; 15; 4; 0
iars; 2799; 58.3422650946767; 3; 7; 2; 0; 80; 123; 195; 190; 6; 9; 8; 4; 0
lars; 2592; 58.3719135802469; 1; 13; 2; 0; 65; 106; 161; 194; 4; 11; 10; 3; 0
pol1; 2670; 55.0561797752809; 4; 16; 0; 1; 73; 125; 187; 181; 11; 17; 7; 3; 0
rpoB; 4095; 57.7777777777778; 4; 9; 6; 1; 135; 181; 248; 294; 7; 17; 11; 8; 0
rpoC; 4479; 59.1203393614646; 3; 8; 6; 2; 123; 207; 295; 348; 8; 12; 8; 8; 0
sbcC; 3672; 51.6884531590414; 1; 30; 2; 2; 121; 214; 228; 243; 3; 41; 3; 2; 0
secA; 2526; 55.5819477434679; 1; 8; 1; 0; 78; 113; 151; 171; 8; 12; 3; 7; 0
  • hmr bactérie
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
acnA; 1992; 41.9176706827309; 0; 7; 0; 0; 110; 124; 62; 94; 1; 17; 1; 1; 0
carB; 3207; 40.0685999376364; 7; 15; 0; 1; 180; 187; 84; 143; 13; 16; 3; 6; 0
dnaE; 3402; 39.6531452087008; 9; 19; 0; 1; 172; 209; 88; 141; 13; 23; 3; 8; 0
ftsK; 2154; 39.4614670380687; 1; 12; 0; 0; 94; 131; 71; 89; 7; 26; 1; 4; 0
iars; 2793; 41.3533834586466; 4; 8; 1; 0; 155; 143; 69; 154; 11; 16; 5; 8; 0
lars; 2445; 40.9815950920245; 2; 12; 2; 0; 145; 127; 73; 128; 11; 18; 1; 7; 0
mfd; 3099; 35.94707970313; 16; 18; 0; 0; 173; 173; 64; 115; 22; 24; 1; 6; 0
rpoB; 4035; 38.8847583643123; 5; 16; 0; 1; 222; 256; 108; 200; 16; 32; 4; 5; 0
rpoC; 4563; 39.7326320403243; 1; 19; 0; 0; 250; 295; 116; 228; 18; 27; 1; 7; 0
secA; 2409; 39.3939393939394; 5; 11; 0; 2; 142; 138; 50; 121; 6; 23; 3; 1; 0
  • hth bactérie
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
acnA; 1983; 47.2012102874433; 1; 6; 2; 1; 77; 101; 77; 123; 4; 7; 3; 3; 0
cox1; 1644; 47.2627737226277; 2; 1; 1; 1; 75; 68; 81; 99; 10; 4; 3; 3; 0
dnaE; 3468; 43.8581314878893; 5; 16; 0; 2; 159; 181; 108; 201; 16; 20; 4; 4; 0
gyrB; 2361; 44.2609063955951; 1; 10; 1; 2; 90; 128; 68; 127; 7; 18; 1; 3; 0
iars; 2769; 44.564824846515; 3; 10; 0; 2; 120; 131; 92; 152; 9; 13; 3; 5; 0
metE; 2310; 44.025974025974; 0; 10; 1; 1; 97; 108; 83; 126; 11; 12; 2; 2; 0
rpoB; 4410; 45.2380952380952; 5; 10; 0; 3; 160; 267; 161; 264; 8; 28; 6; 3; 0
rpoC; 4701; 46.3518400340353; 2; 8; 2; 2; 165; 269; 162; 291; 7; 32; 4; 3; 0
sbcC; 2892; 38.6583679114799; 5; 20; 0; 2; 121; 193; 60; 128; 14; 38; 0; 1; 0
secA; 2796; 45.0643776824034; 1; 12; 0; 1; 111; 150; 75; 188; 8; 21; 2; 3; 0
  • lfc bactérie
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
acnA; 1923; 49.869994799792; 4; 2; 1; 1; 90; 88; 96; 97; 6; 7; 5; 4; 0
carB; 3231; 48.529866914268; 3; 9; 1; 3; 174; 143; 133; 163; 15; 11; 5; 13; 0
dnaE; 3573; 49.1743632801567; 11; 24; 0; 0; 136; 148; 183; 186; 12; 17; 6; 13; 0
ftsK; 2250; 50.3555555555556; 3; 7; 2; 1; 89; 100; 129; 107; 5; 13; 13; 1; 0
iars; 2913; 54.7202197047717; 1; 11; 2; 3; 89; 112; 194; 178; 15; 9; 11; 9; 0
lars; 2487; 51.3872135102533; 2; 9; 2; 0; 108; 104; 150; 136; 11; 17; 4; 8; 0
pol1; 2607; 49.8657460682777; 5; 9; 0; 2; 138; 89; 135; 136; 14; 7; 6; 10; 0
rpoB; 5160; 39.6317829457364; 13; 26; 3; 0; 330; 315; 149; 188; 15; 34; 8; 8; 0
rpoC; 4752; 40.2356902356902; 4; 22; 0; 1; 280; 321; 132; 202; 23; 35; 5; 13; 0
secA; 2736; 44.9926900584795; 6; 12; 0; 2; 150; 135; 95; 135; 8; 10; 3; 7; 0
  • mrb bactérie
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
carB; 3117; 64.9983958934873; 0; 6; 10; 9; 64; 80; 233; 215; 1; 6; 18; 15; 0
dnaE; 3774; 64.8913619501855; 1; 7; 8; 11; 82; 107; 261; 282; 5; 4; 14; 19; 0
ftsK; 2769; 66.305525460455; 1; 3; 10; 4; 68; 72; 222; 197; 5; 4; 16; 11; 0
iars; 3282; 62.5228519195612; 4; 6; 6; 5; 78; 94; 215; 230; 3; 11; 17; 10; 0
lars; 2628; 63.0517503805175; 3; 3; 7; 6; 44; 88; 180; 186; 5; 9; 15; 9; 0
mfd; 2964; 68.9271255060729; 0; 2; 14; 6; 45; 61; 252; 220; 4; 2; 17; 13; 0
rpoB; 3375; 62.4592592592593; 1; 2; 8; 4; 94; 116; 229; 221; 5; 6; 15; 20; 0
rpoC; 4581; 64.1999563414102; 2; 3; 8; 11; 89; 160; 328; 315; 1; 5; 21; 18; 0
sbcC; 2721; 65.0863653068725; 1; 5; 4; 3; 40; 96; 216; 176; 0; 7; 10; 4; 0
secA; 3024; 64.2857142857143; 1; 6; 7; 4; 51; 105; 227; 187; 2; 4; 16; 9; 0
  • msv bactérie
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
carB; 3093; 63.3688975105076; 2; 4; 9; 8; 59; 90; 213; 191; 3; 8; 21; 12; 0
dnaE; 3789; 63.2092900501452; 2; 2; 6; 8; 100; 119; 240; 257; 3; 2; 20; 14; 0
ftsK; 2793; 65.1629072681704; 2; 2; 8; 6; 57; 78; 206; 189; 5; 2; 18; 10; 0
iars; 3276; 61.6605616605617; 2; 3; 9; 4; 79; 123; 184; 221; 2; 3; 14; 14; 0
lars; 2628; 62.4429223744292; 2; 1; 4; 4; 67; 88; 158; 173; 0; 7; 18; 12; 0
mfd; 2967; 62.5547691270644; 3; 3; 4; 7; 85; 73; 210; 195; 5; 3; 9; 21; 0
rpoB; 3378; 62.6406157489639; 1; 3; 9; 2; 86; 118; 217; 216; 4; 3; 19; 20; 0
rpoC; 4584; 62.238219895288; 0; 2; 5; 5; 102; 163; 299; 314; 2; 7; 18; 14; 0
sbcC; 2715; 65.0828729281768; 1; 1; 2; 4; 59; 107; 178; 212; 4; 5; 8; 11; 0
secA; 2997; 61.0944277610944; 0; 7; 3; 3; 68; 119; 203; 195; 6; 5; 8; 9; 0
  • nse bactérie
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
acnA; 2718; 42.6784400294334; 2; 7; 2; 0; 132; 159; 81; 119; 6; 22; 1; 4; 0
carB; 3222; 41.4649286157666; 7; 10; 0; 0; 172; 188; 92; 140; 14; 14; 1; 4; 0
dnaE; 3234; 41.3419913419913; 12; 8; 0; 1; 181; 177; 82; 130; 16; 12; 0; 2; 0
ftsK; 2430; 41.1522633744856; 3; 16; 1; 0; 102; 160; 68; 88; 10; 14; 0; 1; 0
iars; 3138; 39.5793499043977; 4; 21; 0; 1; 147; 188; 83; 128; 15; 21; 1; 2; 0
lars; 2556; 39.1236306729264; 5; 15; 0; 1; 146; 138; 60; 95; 15; 24; 1; 4; 0
pol1; 2490; 38.3534136546185; 8; 17; 0; 0; 106; 160; 74; 74; 5; 25; 3; 1; 0
rpoB; 4077; 43.4142752023547; 15; 5; 1; 3; 232; 185; 78; 224; 16; 16; 1; 8; 0
rpoC; 4128; 44.234496124031; 3; 11; 0; 6; 243; 187; 99; 201; 16; 14; 1; 11; 0
secA; 2415; 40.5383022774327; 3; 14; 0; 0; 93; 153; 54; 84; 5; 19; 0; 1; 0
  • pmh bactérie
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
carB; 3297; 33.6063087655444; 6; 13; 1; 0; 254; 236; 70; 119; 14; 25; 0; 1; 0
dnaE; 3498; 32.4185248713551; 11; 23; 0; 0; 239; 224; 60; 104; 21; 27; 1; 4; 0
gyrB; 1968; 34.4512195121951; 3; 11; 1; 1; 126; 140; 27; 78; 9; 17; 0; 5; 0
iars; 2898; 31.9875776397516; 11; 22; 0; 1; 202; 202; 53; 102; 13; 26; 0; 3; 0
lars; 2571; 29.7938545313108; 5; 23; 0; 1; 168; 198; 53; 77; 12; 23; 1; 3; 0
pol1; 2931; 32.5827362674855; 4; 27; 0; 0; 186; 214; 59; 98; 21; 29; 3; 1; 0
recB; 3627; 23.0769230769231; 19; 28; 0; 0; 273; 320; 43; 72; 27; 43; 0; 0; 0
rpoB; 3294; 38.9799635701275; 8; 12; 0; 0; 194; 224; 93; 141; 9; 19; 1; 6; 0
rpoC; 4101; 36.4301389904901; 4; 19; 0; 0; 250; 300; 87; 162; 14; 30; 2; 3; 0
secA; 2832; 33.2980225988701; 7; 21; 1; 0; 178; 222; 45; 87; 13; 20; 0; 2; 0
  • tai bactérie
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
acnA; 1935; 65.2196382428941; 0; 0; 6; 14; 48; 44; 146; 164; 1; 1; 10; 11; 0
carB; 3150; 68.6349206349206; 0; 0; 9; 30; 91; 36; 195; 317; 1; 0; 17; 46; 0
dnaE; 3399; 59.6351868196528; 1; 0; 3; 13; 107; 108; 191; 288; 2; 1; 17; 25; 0
ftsK; 2235; 64.1163310961969; 0; 0; 9; 12; 60; 51; 151; 189; 0; 0; 13; 20; 0
iars; 2784; 62.7514367816092; 0; 0; 10; 11; 72; 73; 173; 244; 1; 0; 14; 16; 0
lars; 2490; 63.2128514056225; 0; 0; 8; 9; 60; 81; 166; 204; 1; 0; 11; 16; 0
mfd; 2985; 66.8341708542714; 0; 0; 13; 23; 74; 37; 210; 280; 0; 1; 12; 19; 0
rpoB; 3606; 64.6145313366611; 1; 0; 7; 13; 72; 106; 239; 323; 0; 0; 18; 28; 0
rpoC; 4956; 64.3866020984665; 0; 0; 12; 18; 91; 151; 326; 472; 0; 0; 14; 37; 0
secA; 2646; 64.4368858654573; 0; 0; 3; 16; 58; 81; 179; 237; 0; 0; 6; 18; 0
  • tli bactérie
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
acnA; 1935; 51.6795865633075; 0; 3; 3; 1; 65; 97; 118; 122; 7; 10; 4; 3; 0
carB; 3153; 48.6203615604187; 4; 8; 0; 3; 147; 146; 124; 214; 13; 9; 8; 6; 0
dnaE; 3414; 46.4264792032806; 5; 8; 1; 2; 162; 165; 125; 195; 12; 12; 2; 8; 0
ftsK; 2268; 42.8130511463845; 3; 10; 1; 1; 114; 136; 88; 95; 11; 8; 4; 4; 0
iars; 2793; 44.0744718940208; 2; 7; 0; 0; 131; 157; 100; 164; 17; 8; 4; 2; 0
lars; 2481; 47.8839177750907; 2; 4; 0; 2; 120; 145; 85; 174; 5; 11; 7; 7; 0
pol1; 2550; 44; 6; 5; 1; 0; 138; 138; 77; 136; 10; 14; 2; 10; 0
rpoB; 3576; 48.9093959731544; 5; 3; 0; 3; 144; 196; 120; 253; 11; 6; 9; 12; 0
rpoC; 4986; 48.4356197352587; 0; 9; 0; 1; 214; 266; 166; 320; 7; 17; 10; 14; 0
secA; 2688; 45.7961309523809; 1; 7; 0; 1; 108; 154; 81; 161; 11; 13; 2; 7; 0
  • tma bactérie
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
carB; 3300; 51.5454545454545; 0; 4; 2; 0; 105; 193; 145; 191; 1; 13; 9; 5; 0
dnaE; 2529; 45.6702253855279; 2; 19; 0; 0; 103; 124; 99; 113; 8; 22; 5; 2; 0
iars; 2760; 46.7753623188406; 3; 12; 3; 2; 89; 158; 84; 139; 4; 21; 3; 4; 0
lars; 2475; 48.5656565656566; 1; 9; 0; 0; 86; 148; 103; 145; 2; 9; 6; 3; 0
metE; 2205; 46.5759637188209; 0; 13; 0; 1; 95; 128; 85; 108; 3; 15; 0; 0; 0
mfd; 2682; 45.2647278150634; 3; 12; 1; 0; 110; 152; 83; 119; 12; 17; 1; 3; 0
rpoB; 3792; 46.8618143459916; 1; 8; 0; 0; 151; 231; 138; 190; 6; 24; 4; 3; 0
rpoC; 5073; 47.585255273014; 1; 15; 0; 1; 177; 318; 181; 263; 9; 29; 5; 3; 0
sbcC; 2559; 44.2751074638531; 0; 22; 0; 1; 88; 168; 59; 118; 10; 28; 0; 4; 0
secA; 2616; 46.0626911314985; 1; 18; 1; 0; 97; 156; 88; 135; 3; 18; 1; 0; 0
  • tme bactérie
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
dnaE; 2472; 28.2766990291262; 7; 38; 0; 0; 128; 173; 49; 57; 18; 41; 3; 0; 0
gyrB; 1884; 33.4394904458599; 4; 12; 0; 1; 108; 133; 22; 80; 18; 15; 0; 2; 0
iars; 2727; 34.2867620095343; 3; 25; 1; 0; 141; 178; 62; 95; 13; 32; 2; 6; 0
lars; 2472; 32.9288025889968; 8; 23; 0; 0; 147; 166; 47; 109; 11; 25; 1; 6; 0
mfd; 2706; 29.3791574279379; 7; 34; 0; 0; 161; 211; 53; 67; 15; 38; 1; 3; 0
pol1; 2673; 30.0037411148522; 8; 28; 0; 0; 183; 176; 32; 88; 23; 29; 0; 3; 0
rpoB; 3519; 35.5214549587951; 6; 22; 0; 0; 219; 269; 91; 138; 10; 34; 1; 5; 0
rpoC; 4950; 35.5757575757576; 2; 30; 0; 0; 276; 373; 100; 206; 15; 54; 3; 7; 0
secA; 2562; 32.7868852459016; 5; 27; 0; 0; 137; 189; 34; 95; 14; 28; 0; 5; 0
topA; 2091; 31.5638450502152; 1; 36; 0; 0; 100; 140; 42; 63; 8; 39; 2; 4; 0
  • tsc bactérie
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
carB; 3108; 65.02574002574; 0; 2; 12; 14; 60; 94; 245; 243; 4; 6; 25; 23; 0
dnaE; 4941; 65.5332928556972; 3; 2; 13; 25; 143; 125; 399; 422; 13; 3; 19; 36; 0
ftsK; 2604; 66.3978494623656; 0; 0; 10; 11; 71; 83; 246; 192; 5; 9; 30; 13; 0
iars; 3132; 64.0804597701149; 0; 5; 17; 5; 74; 99; 234; 262; 4; 6; 23; 20; 0
lars; 2652; 64.6681749622926; 2; 0; 7; 9; 56; 79; 198; 226; 4; 9; 22; 18; 0
mfd; 2943; 64.9677200135916; 3; 2; 9; 7; 94; 56; 231; 260; 9; 8; 20; 28; 0
rpoB; 3360; 66.7559523809524; 0; 0; 13; 13; 76; 83; 256; 284; 6; 2; 25; 24; 0
rpoC; 4593; 66.231221423906; 0; 1; 15; 14; 83; 145; 344; 396; 5; 5; 24; 34; 0
sbcC; 2931; 66.9737291026953; 2; 6; 3; 17; 79; 82; 201; 335; 9; 3; 8; 22; 0
secA; 2997; 64.5645645645646; 1; 1; 3; 8; 64; 101; 223; 248; 5; 4; 20; 15; 0

Codons[modifier | modifier le wikicode]

  • aae bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
acnA;5;4;7;6;6;29;18;31;3;20;2;4;2;2;15;2;1;17;2;23;12;0;0;18;0;0;0;15;3;8;33;14;8;3;39;23;5;23;17;14;17;8;6;1;16;5;3;10;7;22;21;19;4;3;6;3;13;8;5;41;7;0;0;1;
dnaE;11;3;30;9;17;56;56;81;17;36;4;5;6;4;11;7;7;50;3;42;16;0;0;22;1;0;0;20;7;22;43;15;7;8;77;42;18;52;20;18;21;15;3;2;25;9;4;7;7;25;30;15;20;15;7;8;18;20;11;48;8;0;1;0;
gyrB;6;0;18;6;8;34;30;49;18;14;5;3;1;3;10;6;3;28;6;17;13;1;1;32;3;1;1;16;2;14;30;13;9;5;49;39;11;36;12;15;14;8;2;2;14;3;5;5;1;13;22;21;18;6;9;5;10;10;8;42;6;1;0;0;
iars;16;0;21;7;15;33;29;63;23;22;4;3;4;4;14;10;4;39;8;25;20;0;1;22;4;0;2;23;3;18;30;11;8;9;60;47;14;33;15;13;12;5;7;10;13;22;8;7;3;28;30;22;17;9;4;10;7;11;10;34;10;0;1;0;
metE;6;0;23;12;8;33;31;38;17;15;4;10;0;3;9;7;0;34;6;24;21;0;2;20;1;0;0;10;5;9;16;10;6;6;63;30;9;27;13;13;3;11;1;2;17;12;3;9;7;19;23;13;7;10;0;9;7;15;9;40;3;0;0;1;
rpoB;8;0;28;15;16;66;47;87;20;39;9;8;5;3;19;7;6;45;8;36;34;0;3;62;1;0;3;20;13;22;58;27;12;6;99;51;21;72;28;15;24;14;8;2;23;8;5;17;8;43;46;45;9;17;13;16;24;20;13;73;21;0;0;1;
rpoC;4;2;32;14;17;70;51;90;21;31;11;11;2;0;29;10;5;45;4;43;49;1;5;43;1;0;0;27;11;33;57;43;12;5;120;54;10;67;23;27;25;14;5;11;24;12;8;10;7;48;51;43;13;14;20;13;20;20;23;81;32;1;0;0;
sbcC;29;6;24;6;21;41;70;78;18;15;11;6;8;3;12;19;2;33;12;14;20;0;2;41;0;1;1;11;12;16;23;3;2;8;132;54;8;21;11;9;11;8;1;1;7;1;4;4;3;4;20;17;12;6;2;7;13;8;13;29;4;1;0;0;
secA;16;2;21;9;14;48;51;51;16;11;3;8;2;0;7;5;4;22;5;36;27;0;0;40;0;0;2;24;8;23;41;4;10;4;99;33;12;37;12;15;10;17;0;0;17;8;8;3;8;9;28;28;11;8;13;5;13;11;10;42;13;0;0;1;
topA;8;7;10;1;8;23;28;41;14;9;2;4;5;4;3;5;4;28;3;9;18;0;1;18;1;0;0;3;1;11;16;3;3;4;47;16;8;9;10;4;5;11;1;0;11;4;7;6;3;7;12;9;11;4;2;7;8;11;7;21;4;0;1;0;
  • aae bactérie acides aminés
Gène;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
acnA;57;49;23;27;18;25;30;15;11;58;62;28;56;7;16;5;42;47;30;53;1;
dnaE;126;137;53;37;57;45;39;20;29;73;119;70;74;5;25;9;43;80;53;67;1;
gyrB;72;79;32;28;31;23;51;17;16;57;88;47;49;4;14;3;24;67;34;56;1;
iars;92;92;45;39;43;33;47;25;21;58;107;47;45;17;13;22;46;78;32;54;1;
metE;82;69;32;33;34;30;44;10;14;38;93;36;40;3;17;12;38;53;31;52;1;
rpoB;133;134;59;51;51;44;100;23;35;103;150;93;81;10;23;8;73;117;73;107;1;
rpoC;139;141;52;63;50;47;99;27;44;117;174;77;89;16;24;12;73;121;73;136;1;
sbcC;127;148;33;59;35;26;64;12;28;36;186;29;39;2;7;1;15;55;30;46;1;
secA;110;102;27;25;26;41;67;26;31;59;132;49;54;0;17;8;28;75;42;65;1;
topA;57;69;23;23;32;12;38;3;12;26;63;17;30;1;11;4;23;36;28;32;1;
  • amo bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
carB;7;20;37;5;21;8;26;37;24;17;10;10;4;13;16;18;12;13;7;18;6;4;7;19;12;4;9;12;8;19;26;14;43;14;34;43;28;22;22;18;14;52;2;15;18;7;14;7;9;25;13;16;17;30;2;8;17;18;12;32;27;1;0;0;
dnaE;9;44;32;5;16;15;30;45;23;23;6;4;2;20;17;19;19;28;11;29;12;1;7;27;10;3;14;8;13;26;20;15;33;16;40;59;44;22;10;21;19;38;5;10;28;6;4;12;13;16;17;20;25;21;4;8;9;10;9;44;21;1;0;0;
ftsK;9;25;19;12;17;11;16;22;26;8;6;3;5;13;8;11;9;12;11;8;12;5;3;21;4;3;4;3;6;13;15;8;17;14;33;20;30;19;14;13;10;27;3;2;21;5;11;10;10;16;13;13;15;11;6;6;13;11;13;31;18;0;0;1;
iars;8;20;22;4;20;12;27;38;15;23;9;7;0;5;14;21;18;21;4;17;9;5;1;22;12;0;9;12;13;11;23;3;18;9;29;42;25;43;16;7;8;29;2;18;21;29;5;16;11;14;8;15;19;16;4;7;21;13;9;28;21;0;1;0;
lars;5;17;24;1;14;7;9;36;21;18;3;1;0;7;10;12;11;18;10;17;10;3;2;26;12;4;8;9;7;17;14;4;24;13;24;47;20;27;8;6;7;32;5;13;22;25;4;11;8;27;15;8;16;18;3;5;16;15;7;25;15;0;1;0;
mfd;16;32;28;4;27;10;22;41;21;13;10;7;4;10;11;18;18;19;14;9;19;7;7;32;8;4;8;10;23;22;18;18;29;11;42;35;39;31;15;11;16;31;2;4;25;18;10;9;10;17;12;16;20;24;9;5;12;8;18;36;18;0;1;0;
rpoB;9;31;23;2;26;15;14;44;16;23;4;4;1;10;19;15;15;17;6;36;15;8;11;42;18;0;8;16;7;32;39;16;28;14;41;73;32;52;14;9;5;43;1;1;22;8;3;13;10;33;18;15;42;35;6;0;25;22;10;42;23;1;0;0;
rpoC;9;43;44;7;44;28;21;88;17;22;12;3;4;17;21;22;14;26;13;30;14;4;15;55;26;8;11;15;16;45;35;21;52;17;55;89;52;55;19;19;10;59;3;16;37;11;6;15;19;32;24;21;42;52;12;8;21;22;26;61;48;1;0;0;
sbcC;25;37;31;7;9;11;39;31;15;12;6;2;4;12;9;12;14;4;29;24;16;11;6;26;9;2;7;5;20;16;17;9;21;6;60;22;38;14;14;9;12;23;4;3;16;7;6;7;2;6;17;12;12;19;9;4;10;6;15;18;21;0;0;1;
secA;11;30;20;4;19;9;22;40;12;13;6;4;0;7;10;14;13;16;13;17;6;7;5;30;14;1;14;10;12;18;15;13;22;14;48;41;29;30;14;17;12;30;7;4;26;3;1;8;1;13;16;10;19;14;7;2;9;13;12;33;19;1;0;0;
  • amo bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
carB;98;63;41;71;25;25;52;21;27;97;77;50;106;17;18;7;55;76;45;71;1;
dnaE;121;75;46;68;47;40;60;22;39;84;99;66;88;15;28;6;45;83;31;74;1;
ftsK;93;38;34;46;21;19;48;7;19;54;53;49;64;5;21;5;47;52;36;62;1;
iars;86;65;38;56;39;21;49;21;24;53;71;68;60;20;21;29;46;58;45;58;1;
lars;68;45;39;33;29;27;57;17;24;55;71;47;53;18;22;25;50;57;39;47;1;
mfd;117;63;34;60;37;23;77;18;45;76;77;70;73;6;25;18;46;72;34;72;1;
rpoB;106;58;39;53;32;42;94;24;39;97;114;84;71;2;22;8;59;110;53;75;1;
rpoC;175;109;39;79;40;43;122;26;61;125;144;107;107;19;37;11;72;139;63;135;1;
sbcC;120;70;27;45;18;53;70;12;36;53;82;52;58;7;16;7;21;60;29;54;1;
secA;93;62;25;41;29;30;63;24;30;64;89;59;73;11;26;3;23;59;31;64;1;
  • dal bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
acnA;2;16;11;1;23;7;9;19;15;7;1;0;1;3;17;13;7;6;6;16;3;0;1;8;7;14;7;5;2;16;13;1;43;8;17;19;13;25;5;7;15;37;0;8;16;3;2;3;10;26;12;1;24;10;0;0;16;23;18;5;17;0;1;0;
carB;2;20;12;1;48;13;29;35;20;14;1;3;2;12;30;11;10;26;11;25;0;1;4;7;16;18;7;7;8;29;12;1;60;13;42;45;18;42;10;11;18;62;0;11;32;6;2;7;16;28;12;4;41;25;4;3;16;31;26;5;41;0;0;1;
dnaE;6;23;22;1;46;19;54;43;30;20;2;0;2;3;23;20;14;22;15;29;1;4;6;6;20;7;12;15;10;28;11;3;50;16;63;35;22;55;7;7;11;71;2;17;43;5;3;11;12;25;12;8;38;21;4;7;14;27;21;5;39;1;0;0;
ftsK;6;17;9;1;33;8;25;25;8;13;3;2;2;5;22;7;5;13;4;19;1;0;4;7;18;5;2;5;8;17;13;5;35;7;34;14;6;26;1;10;13;55;2;4;21;6;4;8;12;21;4;5;28;16;2;0;10;21;19;8;22;1;0;0;
iars;1;10;8;1;50;9;21;44;16;23;4;1;1;4;30;9;6;29;8;23;3;0;6;3;26;13;7;18;7;19;7;2;44;3;41;32;14;52;3;5;25;51;3;20;21;21;1;6;7;24;11;5;38;17;3;2;5;24;13;1;31;1;0;0;
lars;0;6;5;0;42;8;31;38;15;22;1;0;0;5;12;11;7;21;3;24;0;0;0;5;22;9;9;10;5;27;6;2;47;2;43;27;11;52;5;3;13;39;0;21;36;22;0;4;7;35;7;1;34;28;0;1;11;35;10;3;20;0;1;0;
pol1;3;13;9;1;48;13;32;38;16;21;4;0;0;6;21;12;9;19;7;27;2;0;1;6;15;7;4;14;14;27;4;2;37;8;54;26;11;36;3;7;16;48;0;3;32;5;0;8;14;19;8;4;24;21;2;1;15;37;15;4;36;1;0;0;
rpoB;2;22;21;0;62;24;28;60;15;33;7;1;2;14;33;16;12;20;4;32;6;2;12;18;40;17;9;12;10;46;6;6;78;11;83;39;20;70;3;8;25;50;1;4;39;3;0;12;10;41;20;5;58;42;4;1;20;43;29;5;48;1;0;0;
rpoC;1;21;18;0;69;19;22;83;12;25;5;2;0;6;39;14;12;29;6;37;6;0;13;22;46;18;6;16;5;39;16;7;93;12;79;43;21;72;9;14;25;76;1;16;41;8;0;12;12;38;17;7;58;40;6;4;30;43;32;4;65;1;0;0;
sbcC;16;26;17;9;67;14;79;61;11;14;5;9;3;7;42;33;6;10;26;27;3;3;5;8;21;25;10;9;41;30;12;5;36;9;93;50;35;34;11;16;24;68;3;14;11;6;0;4;8;11;5;3;12;12;5;3;10;30;19;7;30;0;0;1;
secA;1;17;8;2;27;10;20;39;11;14;1;0;1;3;23;7;8;22;6;25;2;2;8;5;21;14;10;16;3;35;1;4;55;5;52;28;11;52;6;6;9;29;0;5;28;5;1;5;5;11;11;4;26;19;3;1;12;26;19;3;38;0;1;0;
  • dal bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
acnA;60;28;22;35;13;22;33;12;18;65;36;38;64;8;16;3;41;47;39;40;1;
carB;96;64;34;59;36;36;46;14;37;86;87;60;101;11;32;6;53;82;54;72;1;
dnaE;117;97;50;50;36;44;44;27;38;80;98;77;96;19;43;5;51;79;52;65;1;
ftsK;74;50;21;41;18;23;35;7;25;60;48;32;79;6;21;6;45;53;33;49;1;
iars;79;65;39;49;35;31;51;25;26;56;73;66;84;23;21;21;38;71;34;45;1;
lars;61;69;37;29;28;27;36;19;32;57;70;63;60;21;36;22;46;70;47;33;1;
pol1;87;70;37;43;28;34;31;18;41;51;80;47;74;3;32;5;41;57;55;55;1;
rpoB;131;88;48;73;32;36;95;21;56;101;122;90;86;5;39;3;63;125;68;82;1;
rpoC;128;105;37;66;41;43;105;22;44;128;122;93;124;17;41;8;62;122;83;101;1;
sbcC;149;140;25;99;16;53;65;19;71;62;143;69;119;17;11;6;23;32;48;56;1;
secA;65;59;25;35;30;31;52;26;38;65;80;63;50;5;28;5;22;60;42;60;1;
  • hmr bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
acnA;7;7;24;5;2;6;32;17;6;15;6;5;6;1;4;8;9;11;11;13;19;0;0;7;0;0;9;4;8;11;21;32;15;0;24;20;27;16;25;18;0;7;4;4;15;4;20;10;3;3;22;20;2;2;4;32;5;2;19;24;10;1;0;0;
carB;19;14;29;10;10;5;46;37;37;8;14;18;14;4;4;5;32;8;32;18;23;1;2;17;3;1;7;5;9;21;14;30;21;6;40;55;46;11;21;33;5;16;7;4;26;6;14;15;12;10;43;23;11;8;11;21;9;10;31;50;6;0;0;1;
dnaE;14;19;41;12;11;7;67;52;40;17;14;14;8;0;6;13;29;20;27;21;18;0;4;17;5;0;15;9;15;13;9;27;25;12;48;46;47;26;30;25;6;18;5;4;32;2;8;7;10;10;35;15;11;7;10;27;5;10;24;53;11;0;0;1;
ftsK;14;7;15;18;8;4;43;19;23;12;7;18;4;2;4;15;12;12;17;15;18;1;1;7;1;1;4;6;17;7;7;14;17;6;34;23;19;12;21;8;5;13;0;1;25;1;14;9;5;6;16;13;6;7;7;18;3;6;13;41;15;0;0;1;
iars;15;25;19;5;11;5;32;57;26;8;9;11;8;5;11;7;37;16;16;13;16;1;2;28;1;1;14;9;4;10;12;25;8;5;29;51;55;18;19;21;4;14;12;6;24;20;8;15;5;9;42;12;5;2;4;9;8;8;14;37;7;0;1;0;
lars;9;17;22;3;6;1;51;28;32;10;3;4;4;4;6;4;22;18;19;18;5;0;3;22;1;1;13;0;10;10;4;22;15;6;24;41;53;9;12;17;7;18;3;7;20;19;9;14;6;6;38;6;14;4;10;17;5;10;18;24;10;1;0;0;
mfd;26;19;43;8;6;5;56;44;60;9;26;11;12;8;10;14;33;4;30;13;25;1;1;29;1;1;10;3;10;13;8;22;13;4;36;50;63;12;17;20;5;12;2;3;14;2;5;16;4;4;29;12;16;5;8;10;7;8;28;55;11;0;1;0;
rpoB;21;33;45;10;7;13;66;55;36;12;19;17;14;5;10;7;32;11;36;16;36;0;3;32;5;0;19;6;15;16;23;47;20;7;67;54;73;18;21;25;3;14;4;1;22;7;15;23;12;5;64;39;13;9;11;23;6;16;27;67;11;0;1;0;
rpoC;22;34;36;14;10;12;66;73;30;15;27;21;19;5;12;10;37;12;36;21;47;1;3;40;3;0;13;7;18;18;24;55;23;5;74;64;69;17;33;41;7;17;7;5;31;7;13;22;10;10;72;31;12;14;11;32;11;13;43;72;13;1;0;0;
secA;19;16;22;7;9;3;38;33;20;6;9;11;3;6;4;4;20;12;19;15;20;2;3;26;3;1;12;8;9;18;7;21;10;6;34;38;56;10;12;14;2;14;0;1;22;5;5;4;4;5;38;8;8;4;3;21;4;8;20;32;8;0;1;0;
  • hmr bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
acnA;51;49;21;30;20;24;26;13;19;68;44;43;50;8;15;4;36;46;43;53;1;
carB;87;83;45;59;40;50;47;12;30;71;95;57;75;11;26;6;51;85;51;87;1;
dnaE;104;119;57;55;49;48;44;24;28;73;94;73;79;9;32;2;35;68;52;88;1;
ftsK;66;62;35;50;24;32;29;10;24;44;57;31;47;1;25;1;34;42;34;69;1;
iars;80;89;34;51;53;29;49;23;14;50;80;73;58;18;24;20;37;61;29;58;1;
lars;58;79;42;25;40;37;32;13;20;47;65;62;54;10;20;19;35;62;42;52;1;
mfd;107;100;69;81;37;43;58;13;23;47;86;75;54;5;14;2;29;62;33;94;1;
rpoB;129;121;48;72;43;52;76;25;31;97;121;91;63;5;22;7;55;125;56;105;1;
rpoC;128;139;45;94;49;57;94;20;36;107;138;86;98;12;31;7;55;129;67;128;1;
secA;76;71;26;37;32;34;55;20;27;44;72;66;42;1;22;5;18;58;36;60;1;
  • hth bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
acnA;3;9;22;3;11;9;16;27;14;5;9;5;5;1;11;5;11;11;6;15;12;0;1;18;2;0;6;8;5;9;16;26;13;7;24;31;17;13;17;11;7;18;1;6;13;4;8;12;4;15;14;21;11;6;9;6;6;7;11;43;4;0;1;0;
cox1;4;1;25;8;8;19;6;13;21;17;5;1;3;1;9;2;11;18;3;18;5;0;0;6;0;0;4;11;2;5;21;18;8;6;8;3;4;10;12;13;9;13;0;0;22;20;7;14;3;8;12;12;16;4;6;11;5;13;4;33;6;0;0;1;
dnaE;11;15;55;6;19;26;48;67;39;10;9;10;7;3;12;16;18;29;16;23;24;0;4;17;1;0;16;13;11;28;25;19;25;9;45;64;26;40;19;22;9;14;4;3;28;11;9;11;8;10;28;21;26;6;12;14;3;15;12;54;10;0;1;0;
gyrB;7;9;31;6;17;18;35;33;17;8;10;8;2;3;3;13;9;22;7;13;27;0;0;22;1;1;6;12;10;11;15;20;8;9;41;43;25;24;13;14;9;7;5;1;14;3;12;4;3;4;15;20;25;2;8;11;4;16;5;40;5;1;0;0;
iars;8;10;40;8;10;14;35;35;29;6;17;7;4;4;7;18;26;31;7;19;30;0;0;30;0;0;8;14;9;20;13;15;19;9;34;50;26;23;7;12;7;16;6;11;16;20;8;19;4;11;12;17;24;7;14;10;1;9;9;42;5;1;0;0;
metE;10;7;23;6;10;17;34;27;28;6;13;6;5;2;9;16;16;27;5;14;17;1;1;19;1;1;8;6;9;17;8;11;10;6;33;52;13;19;12;14;2;15;2;4;19;11;8;14;4;12;17;12;17;10;10;7;2;7;7;41;9;1;0;0;
rpoB;17;10;44;13;31;21;45;80;44;12;12;12;7;6;16;17;22;38;18;25;47;1;6;45;3;1;5;15;13;26;36;46;13;8;77;72;38;43;16;18;14;25;7;5;25;4;14;29;7;22;19;39;43;21;13;23;10;30;17;69;14;0;0;1;
rpoC;8;9;60;14;27;26;55;85;24;20;15;4;3;9;17;20;16;41;14;33;49;0;1;45;2;0;9;20;14;31;36;29;34;10;65;87;30;58;27;31;20;18;10;7;33;9;12;25;6;27;25;41;45;10;11;24;9;28;13;100;15;1;0;0;
sbcC;21;11;41;10;17;15;64;50;27;8;13;8;18;3;6;20;15;23;15;21;30;3;2;24;2;2;7;8;32;23;13;5;11;4;67;75;21;20;10;6;2;7;5;0;18;2;7;9;1;3;10;9;16;5;10;11;1;5;16;46;9;1;0;0;
secA;8;8;45;7;13;20;33;46;18;10;11;2;0;4;7;6;15;16;13;16;31;0;3;30;1;1;10;12;12;29;16;22;10;10;49;58;23;32;15;10;11;16;1;0;21;10;6;2;5;8;19;24;29;3;8;25;4;9;10;39;9;0;1;0;
  • hth bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
acnA;57;43;19;36;22;21;33;14;14;62;55;30;53;7;13;4;39;52;28;58;1;
cox1;65;19;38;21;29;21;11;15;7;53;11;14;47;0;22;20;32;44;35;43;1;
dnaE;132;115;49;57;47;39;46;29;39;78;109;66;64;7;28;11;38;81;44;76;1;
gyrB;88;68;25;39;31;20;51;18;21;52;84;49;43;6;14;3;23;62;39;50;1;
iars;90;70;35;57;57;26;60;22;29;56;84;49;42;17;16;20;42;60;34;56;1;
metE;73;61;34;51;43;19;40;14;26;35;85;32;43;6;19;11;38;56;26;57;1;
rpoB;136;125;56;70;60;43;103;20;39;103;149;81;73;12;25;4;72;122;76;100;1;
rpoC;144;140;44;68;57;47;97;29;45;109;152;88;96;17;33;9;70;121;72;128;1;
sbcC;115;114;35;68;38;36;63;15;55;33;142;41;25;5;18;2;20;40;27;71;1;
secA;101;79;28;30;31;29;66;22;41;58;107;55;52;1;21;10;21;75;46;58;1;
  • lfc bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
acnA;0;9;19;1;14;15;11;23;15;8;9;5;3;3;15;8;13;3;13;10;3;1;14;4;7;4;5;8;7;13;15;27;13;10;22;12;28;8;19;9;5;20;5;0;17;0;7;10;11;5;24;1;12;11;9;12;7;13;20;4;21;1;0;0;
carB;6;22;45;3;27;14;30;21;27;16;22;12;5;12;17;10;18;3;22;13;14;8;10;14;11;7;8;7;14;19;25;26;8;22;44;43;42;17;19;26;16;27;6;3;25;2;14;13;10;13;35;7;24;29;7;15;14;13;32;8;34;0;1;0;
dnaE;2;5;39;3;40;35;51;31;41;20;13;9;1;9;29;13;17;14;19;14;12;12;11;10;10;18;11;10;9;25;36;13;16;20;62;34;46;34;18;12;13;35;2;5;44;5;9;9;14;19;15;4;9;42;4;18;7;24;35;10;43;0;0;1;
ftsK;5;10;30;2;24;28;28;11;15;6;8;8;10;6;30;12;5;6;9;11;17;8;0;11;2;6;9;2;13;12;21;9;14;5;30;9;20;18;16;6;8;18;0;2;23;7;15;10;14;21;8;2;11;21;5;14;8;15;22;10;23;0;0;1;
iars;3;7;29;1;23;41;26;19;17;20;10;9;3;9;31;8;11;13;11;17;9;7;6;11;6;22;17;15;6;17;33;4;19;16;51;23;18;34;13;8;12;34;5;11;25;23;7;11;21;24;9;3;10;28;2;20;10;19;15;4;34;0;1;0;
lars;3;13;27;1;20;30;28;20;23;12;9;4;1;3;19;6;14;9;10;18;11;8;5;9;5;9;16;8;11;24;30;6;17;7;38;17;21;27;9;3;5;33;4;6;18;19;10;5;21;12;22;3;6;23;4;15;10;24;16;2;19;0;1;0;
pol1;5;21;47;4;27;13;23;15;21;5;19;18;9;10;36;3;14;5;13;7;10;6;15;9;8;9;16;6;9;15;19;16;7;18;32;26;31;22;14;12;9;17;2;0;16;9;4;16;21;10;24;8;16;16;7;9;14;9;19;5;22;0;0;1;
rpoB;56;29;63;13;15;15;89;31;44;15;48;32;9;10;17;7;37;10;59;16;35;20;16;9;11;12;19;11;34;25;43;32;17;20;113;37;63;28;29;39;8;12;2;0;33;7;22;33;12;19;61;25;19;23;37;28;9;20;73;24;24;1;0;0;
rpoC;38;29;30;11;11;12;81;38;43;8;40;17;6;8;16;9;21;9;46;25;49;17;10;14;10;9;23;3;45;14;35;49;17;20;96;48;65;20;31;40;10;16;9;4;37;9;31;19;8;8;60;24;14;25;23;25;12;10;83;17;26;0;0;1;
secA;10;19;35;2;15;14;40;15;24;11;12;9;7;8;10;3;15;13;25;11;11;9;9;7;9;10;20;12;14;16;24;17;10;19;44;43;50;13;19;22;6;11;3;1;28;8;7;7;10;4;27;4;15;11;9;7;10;11;32;4;20;0;0;1;
  • lfc bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
acnA;58;34;23;43;16;23;33;13;20;65;34;36;53;5;17;0;33;48;41;45;1;
carB;117;51;43;78;21;35;64;15;33;81;87;59;88;9;25;2;50;95;49;74;1;
dnaE;124;82;61;74;31;33;73;21;34;85;96;80;78;7;44;5;51;70;53;88;1;
ftsK;99;39;21;74;11;20;44;11;25;49;39;38;48;2;23;7;60;42;42;55;1;
iars;104;45;37;70;24;28;61;32;23;72;74;52;67;16;25;23;63;50;51;53;1;
lars;94;48;35;42;23;28;47;24;35;60;55;48;50;10;18;19;48;54;53;37;1;
pol1;117;38;26;95;19;20;57;22;24;60;58;53;52;2;16;9;51;64;39;46;1;
rpoB;191;120;59;123;47;75;103;30;59;112;150;91;88;2;33;7;86;128;94;121;1;
rpoC;131;119;51;96;30;71;109;26;59;121;144;85;97;13;37;9;66;123;70;126;1;
secA;95;55;35;49;28;36;55;32;30;70;87;63;58;4;28;8;28;57;37;56;1;
  • mrb bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
carB;0;1;5;1;70;32;20;28;8;20;0;0;0;12;22;20;7;30;2;19;0;2;2;6;31;17;1;15;1;26;1;5;56;23;25;73;15;29;5;9;22;71;0;4;19;10;1;3;13;48;5;3;55;17;0;0;6;59;19;2;42;1;0;0;
dnaE;0;12;4;2;81;40;20;49;21;33;0;1;0;22;9;15;5;39;2;31;2;2;1;3;49;33;1;20;1;43;2;7;56;37;20;94;17;53;2;4;29;86;2;5;30;10;1;3;27;39;5;3;67;13;0;0;6;40;14;2;42;0;0;1;
ftsK;6;15;9;6;72;34;20;17;12;17;1;1;1;11;7;20;2;13;1;14;2;2;1;6;38;19;3;19;5;27;1;9;45;19;21;44;7;31;6;8;23;78;0;0;15;9;6;5;16;40;5;6;36;13;0;2;5;38;12;0;21;0;1;0;
iars;1;13;5;5;67;28;18;37;20;27;0;0;0;21;13;15;6;33;5;31;0;3;3;5;42;19;4;20;10;35;0;10;49;15;19;81;18;38;4;13;12;64;0;6;22;29;5;1;13;40;7;7;54;14;1;0;7;39;11;0;28;0;1;0;
lars;1;4;4;0;53;17;17;44;11;25;0;0;3;5;3;17;6;31;1;23;0;0;0;0;33;12;0;17;4;31;3;4;43;17;16;66;12;28;1;0;10;63;0;6;22;26;1;1;15;35;3;7;37;15;0;0;4;37;9;1;31;1;0;0;
mfd;0;7;7;6;92;37;9;23;10;21;2;1;0;8;15;16;5;30;0;11;0;1;2;0;56;32;4;21;5;29;1;5;50;21;20;75;8;35;1;4;13;76;0;2;10;8;0;5;15;46;1;4;54;15;1;1;2;35;2;0;27;0;0;1;
rpoB;1;13;9;6;74;25;14;48;20;23;1;1;1;16;19;14;5;27;3;28;1;3;6;4;56;19;2;14;5;39;4;22;49;24;27;69;20;51;2;6;10;57;0;2;22;3;5;7;20;34;6;5;67;12;2;1;5;40;19;1;35;1;0;0;
rpoC;0;7;8;6;83;47;20;81;6;33;0;0;2;26;19;31;7;38;0;29;0;2;16;0;69;24;2;25;5;62;3;14;65;36;28;113;16;67;4;5;11;95;2;9;32;10;1;4;27;40;9;9;93;29;0;0;8;67;25;0;56;0;0;1;
sbcC;2;3;6;7;64;55;29;27;8;10;0;2;1;9;7;23;6;9;0;6;2;4;6;6;43;22;5;12;13;64;1;2;34;9;37;71;12;29;12;9;18;81;0;3;6;8;3;3;7;17;3;3;22;7;1;0;3;31;5;2;16;0;0;1;
secA;1;6;1;3;52;34;21;42;7;22;0;0;1;11;16;17;0;31;2;26;2;1;5;1;68;11;2;18;3;40;0;6;43;18;26;82;12;43;1;7;9;77;0;2;20;8;1;1;9;25;3;4;51;13;1;0;3;42;7;1;48;0;1;0;
  • mrb bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
carB;109;48;28;54;37;21;58;16;27;85;98;44;107;4;19;10;65;80;65;63;1;
dnaE;139;69;54;47;44;33;90;21;44;102;114;70;121;7;30;10;70;88;46;58;1;
ftsK;142;37;29;41;15;15;68;22;32;74;65;38;115;0;15;9;67;60;45;33;1;
iars;119;55;47;49;39;36;72;24;45;74;100;56;93;6;22;29;59;82;47;39;1;
lars;79;61;36;28;37;24;45;17;35;67;82;40;74;6;22;26;52;62;41;41;1;
mfd;149;32;31;42;35;11;91;25;34;77;95;43;94;2;10;8;66;74;39;29;1;
rpoB;128;62;43;52;32;31;89;16;44;99;96;71;75;2;22;3;66;90;48;55;1;
rpoC;151;101;39;78;45;29;111;27;67;118;141;83;115;11;32;10;72;140;75;81;1;
sbcC;137;56;18;42;15;6;83;17;77;46;108;41;120;3;6;8;30;35;35;23;1;
secA;97;63;29;45;31;28;88;20;43;67;108;55;94;2;20;8;36;71;46;56;1;
  • msv bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
carB;3;11;7;4;36;41;16;31;8;19;4;0;1;11;19;18;4;32;3;20;1;4;2;1;32;23;6;7;8;29;10;7;32;32;24;71;6;38;7;11;13;67;0;4;20;10;2;7;13;39;4;10;55;14;4;0;8;55;6;0;60;0;1;0;
dnaE;3;25;11;7;40;46;15;58;12;37;3;0;3;18;14;14;10;40;2;25;1;3;4;5;53;24;6;18;6;33;9;9;45;36;15;92;20;63;5;18;34;70;0;10;28;10;1;6;26;38;3;11;53;22;2;1;3;36;8;2;50;0;1;0;
ftsK;4;12;10;12;62;36;12;28;8;24;0;6;2;9;9;17;7;8;4;9;0;5;7;2;33;26;3;13;9;19;6;10;38;24;17;52;12;28;2;23;20;71;0;0;16;12;3;14;16;33;5;13;27;16;4;2;5;28;1;2;34;0;1;0;
iars;2;12;12;10;45;35;13;46;9;37;1;0;3;17;10;11;8;37;6;24;2;2;9;5;36;24;8;16;7;20;9;7;32;24;31;83;13;39;6;13;22;61;0;4;23;25;4;11;13;38;4;18;44;17;5;2;6;34;4;2;30;0;0;1;
lars;1;13;5;2;22;27;13;42;6;31;2;3;1;8;7;17;3;32;4;17;0;2;2;2;32;13;2;19;8;27;2;3;45;18;12;65;9;37;1;5;11;52;2;3;22;29;0;4;12;32;1;10;29;23;3;1;3;35;8;1;34;1;0;0;
mfd;2;12;11;8;51;44;16;24;16;18;2;3;3;10;9;10;8;28;1;8;1;4;12;3;39;25;7;17;9;27;4;12;30;37;21;74;22;26;6;16;23;52;0;2;9;12;3;23;17;21;8;12;30;13;7;1;5;27;11;6;30;1;0;0;
rpoB;2;20;13;10;47;30;11;51;15;26;4;2;1;19;15;11;6;26;2;30;1;2;9;2;58;21;3;13;8;35;2;19;52;30;25;73;21;53;0;11;6;54;0;2;19;3;3;3;17;40;4;10;55;22;1;0;4;43;4;1;55;1;0;0;
rpoC;0;21;10;6;51;57;18;85;5;40;4;0;2;16;28;24;7;31;1;29;2;3;18;3;69;24;3;25;11;56;4;25;53;31;32;112;25;58;6;24;20;80;2;8;33;11;2;6;23;35;11;23;63;40;5;0;8;52;12;2;72;0;1;0;
sbcC;5;22;12;11;37;50;12;38;7;12;2;0;2;12;11;16;3;12;3;4;3;4;7;2;38;37;4;16;11;43;7;5;21;27;42;82;10;19;9;12;25;71;2;2;8;7;1;3;12;13;3;5;27;8;1;0;2;26;0;4;14;0;1;0;
secA;3;13;10;4;31;36;18;46;4;27;0;0;0;8;11;14;5;24;5;24;0;3;12;1;49;23;2;17;10;27;6;18;21;21;32;77;18;36;3;15;17;62;0;2;31;7;0;7;14;16;7;12;38;16;4;0;5;38;5;2;41;0;1;0;
  • msv bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
carB;102;47;27;53;36;23;63;13;37;81;95;44;98;4;20;10;61;83;67;66;1;
dnaE;132;73;49;52;50;27;90;24;39;99;107;83;127;10;28;10;71;89;42;60;1;
ftsK;136;40;32;43;15;13;73;16;28;78;69;40;116;0;16;12;66;61;39;37;1;
iars;116;59;46;42;45;30;78;24;27;72;114;52;102;4;23;25;66;83;47;36;1;
lars;70;55;37;38;35;21;51;21;35;68;77;46;69;5;22;29;48;63;42;43;1;
mfd;128;40;34;37;36;9;84;24;36;83;95;48;97;2;9;12;64;63;40;47;1;
rpoB;122;62;41;52;32;32;93;16;43;103;98;74;71;2;19;3;63;91;48;60;1;
rpoC;145;103;45;74;38;30;119;28;67;113;144;83;130;10;33;11;66;137;65;86;1;
sbcC;137;50;19;43;15;7;91;20;54;60;124;29;117;4;8;7;29;43;29;18;1;
secA;97;64;31;33;29;29;88;19;37;66;109;54;97;2;31;7;37;73;47;48;1;
  • nse bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
acnA;10;9;24;19;9;11;39;25;15;12;21;10;9;7;8;10;18;14;23;18;11;5;9;9;7;3;7;9;20;11;16;24;13;10;40;23;34;17;32;9;4;7;9;6;14;7;11;13;6;7;21;31;16;13;24;19;7;8;20;24;18;1;0;0;
carB;12;13;22;13;14;17;34;35;36;14;27;12;17;7;12;6;16;11;36;10;19;2;6;17;2;3;9;4;7;22;13;37;6;15;50;34;39;15;31;16;12;16;10;7;27;3;22;12;9;2;40;27;19;14;18;14;7;9;41;38;15;1;0;0;
dnaE;13;23;39;14;12;17;28;34;45;10;16;12;11;10;5;6;26;14;30;15;21;5;15;19;5;3;16;9;15;14;20;27;7;6;39;32;53;17;28;33;13;10;8;7;24;3;12;11;12;6;33;20;14;11;11;15;10;9;38;31;15;0;1;0;
ftsK;17;8;27;13;6;19;47;31;13;13;9;22;10;7;11;14;8;12;14;8;13;5;5;7;1;1;9;7;12;6;14;13;10;4;45;26;18;10;29;14;6;2;2;6;21;3;13;9;10;7;17;13;14;9;11;25;6;3;21;28;25;0;1;0;
iars;14;14;18;17;12;19;57;24;37;20;21;25;12;5;10;8;27;18;36;16;23;1;5;18;3;1;11;14;19;7;20;15;12;5;55;31;35;19;26;14;7;10;2;11;24;21;16;15;7;1;22;19;14;14;6;28;5;11;21;35;12;0;0;1;
lars;18;14;17;10;11;5;44;24;33;12;18;15;9;7;9;9;19;16;30;15;15;5;4;8;2;1;10;9;14;11;19;19;10;5;43;21;24;9;26;12;7;3;15;8;14;15;10;12;6;7;23;16;9;11;9;16;5;4;22;25;12;1;0;0;
pol1;11;8;31;19;16;17;52;18;20;13;10;14;11;4;8;7;16;13;24;28;11;6;4;8;3;0;13;9;22;12;16;11;8;3;40;17;25;16;22;8;6;10;3;4;16;1;19;10;1;3;9;19;6;6;11;24;7;9;25;38;8;0;0;1;
rpoB;22;33;37;5;17;12;28;54;50;11;27;11;13;25;10;2;30;18;38;13;11;5;24;34;7;3;19;4;13;20;20;57;12;16;46;54;75;19;27;29;21;10;17;6;33;8;13;20;6;4;54;23;33;25;17;11;16;7;32;34;17;0;1;0;
rpoC;16;30;38;7;18;14;50;43;30;15;24;13;22;18;15;5;27;17;33;16;22;1;18;25;11;10;15;8;14;24;11;56;18;26;37;57;61;12;34;22;26;11;10;10;33;6;17;14;13;4;64;25;26;14;26;15;15;9;50;31;23;0;1;0;
secA;7;11;21;21;9;13;38;26;12;16;12;17;11;4;5;5;10;14;25;18;18;6;7;5;7;7;15;11;25;9;14;15;8;4;49;26;32;12;22;15;7;11;3;1;23;4;7;1;1;2;12;11;9;7;7;20;3;7;12;33;21;0;1;0;
  • nse bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
acnA;82;64;27;65;32;41;44;16;31;63;63;51;52;15;14;7;37;81;58;62;1;
carB;91;69;50;81;27;46;49;13;29;71;84;54;75;17;27;3;45;100;48;94;1;
dnaE;118;62;55;60;40;45;68;25;29;60;71;70;84;15;24;3;41;78;45;84;1;
ftsK;90;78;26;73;20;22;32;16;18;41;71;28;51;8;21;3;39;53;45;74;1;
iars;94;81;57;81;45;52;51;25;26;52;86;54;57;13;24;21;39;69;50;68;1;
lars;75;68;45;67;35;45;35;19;25;53;64;33;48;23;14;15;35;59;34;59;1;
pol1;102;70;33;54;29;52;32;22;34;38;57;41;46;7;16;1;33;40;51;71;1;
rpoB;126;82;61;88;48;51;84;23;33;105;100;94;87;23;33;8;43;135;51;83;1;
rpoC;123;93;45;97;44;49;87;23;38;111;94;73;93;20;33;6;48;129;65;104;1;
secA;82;64;28;54;24;43;50;26;34;41;75;44;55;4;23;4;11;39;37;66;1;
  • pmh bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
carB;49;22;23;10;1;3;56;17;37;6;30;34;10;6;4;5;29;5;54;11;24;0;6;8;0;0;10;1;24;11;29;28;7;6;67;23;45;9;29;36;6;7;14;2;19;5;18;24;3;3;34;19;5;3;24;25;2;5;66;27;12;0;1;0;
dnaE;46;23;40;17;1;3;76;28;39;8;42;21;15;2;4;5;31;7;58;12;33;5;3;8;0;0;14;6;30;7;28;24;7;8;43;22;80;13;21;24;8;3;9;6;27;5;14;19;2;2;46;17;6;6;17;14;5;8;53;34;10;0;1;0;
gyrB;26;11;11;7;1;2;37;9;20;2;14;14;7;1;2;5;20;5;28;7;26;4;0;10;1;0;10;3;13;6;30;21;6;4;46;10;31;6;15;16;3;2;5;1;12;3;8;5;3;2;23;12;2;4;17;12;3;1;32;16;2;0;0;1;
iars;42;8;21;11;5;5;71;13;38;4;24;21;15;9;3;6;33;8;59;10;28;2;3;7;0;0;18;3;27;8;21;19;10;6;52;8;50;5;23;10;5;2;12;2;12;28;17;13;3;2;40;13;3;5;12;17;1;3;42;18;9;1;0;0;
lars;43;10;12;7;0;2;64;19;29;4;16;23;8;2;4;1;31;4;67;7;15;0;2;7;0;1;11;2;24;2;19;11;2;3;45;17;46;7;16;20;1;7;9;1;16;23;16;14;2;4;23;14;6;1;17;16;1;5;43;32;2;1;0;0;
pol1;45;13;32;20;3;5;80;21;36;15;15;21;18;0;2;9;20;4;53;10;24;0;1;9;0;1;11;3;21;9;22;24;5;7;62;19;48;16;19;14;6;6;3;3;12;4;19;12;2;2;22;17;4;4;16;17;3;11;39;21;16;1;0;0;
recB;70;16;27;12;3;9;105;33;70;11;32;22;24;6;5;3;45;6;125;15;22;2;1;6;0;0;20;2;32;4;17;11;3;1;66;14;76;1;9;8;3;1;11;6;4;15;14;6;1;1;13;17;1;5;18;9;1;7;86;47;8;0;1;0;
rpoB;44;13;29;11;4;4;48;9;23;6;22;14;7;4;3;9;25;12;41;11;46;7;4;19;1;0;16;6;33;16;31;32;12;12;68;22;57;13;23;25;4;10;3;3;23;7;22;27;6;9;44;27;9;11;22;15;3;8;36;16;10;1;0;0;
rpoC;50;30;22;11;2;6;70;18;22;8;38;35;24;3;8;3;19;2;54;8;43;5;8;18;0;0;16;2;45;13;40;43;12;4;90;25;83;9;33;37;6;9;10;2;19;8;15;25;4;7;66;35;7;9;48;30;4;10;49;27;17;1;0;0;
secA;47;18;24;10;2;2;61;21;24;5;16;17;14;0;5;0;27;5;41;5;38;3;4;10;2;0;11;2;32;11;23;22;4;4;70;22;56;6;19;25;4;4;5;2;24;8;9;20;1;1;31;14;6;6;24;13;2;3;36;16;6;1;0;0;
  • pmh bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
carB;108;73;43;89;34;65;38;11;35;70;90;54;78;16;19;5;48;61;56;105;1;
dnaE;130;104;47;89;38;70;49;20;37;67;65;93;56;15;27;5;37;75;44;97;1;
gyrB;58;46;22;43;25;35;41;13;19;61;56;37;36;6;12;3;18;41;33;50;1;
iars;92;84;42;78;41;69;40;21;35;56;60;55;40;14;12;28;35;61;33;69;1;
lars;74;83;33;54;35;74;25;13;26;35;62;53;44;10;16;23;36;44;39;77;1;
pol1;118;101;51;65;24;63;35;14;30;58;81;64;45;6;12;4;35;47;47;76;1;
recB;137;138;81;92;51;140;31;22;36;32;80;77;21;17;4;15;22;36;35;141;1;
rpoB;105;57;29;59;37;52;77;22;49;87;90;70;62;6;23;7;64;91;48;62;1;
rpoC;121;88;30;111;21;62;74;18;58;99;115;92;85;12;19;8;51;117;92;93;1;
secA;103;82;29;52;32;46;57;13;43;53;92;62;52;7;24;8;31;57;42;58;1;
  • tli bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
acnA;4;12;10;3;12;13;16;17;13;12;5;7;3;3;15;11;1;10;6;14;5;6;2;12;3;3;7;11;7;10;15;11;21;11;28;18;9;22;11;13;8;23;2;6;17;3;15;10;4;13;9;16;11;10;3;3;8;18;8;34;11;1;0;0;
carB;5;29;25;8;16;6;31;30;21;17;12;12;8;9;18;17;12;11;20;13;18;5;2;22;4;3;7;6;12;10;31;25;27;15;33;54;42;12;11;34;18;29;7;8;19;12;8;23;5;18;32;18;30;15;11;7;7;15;17;46;12;0;0;1;
dnaE;17;36;33;8;18;10;38;40;21;18;17;11;8;9;14;14;20;20;23;14;21;3;4;25;6;2;15;13;13;24;25;21;9;17;41;56;41;33;20;26;17;28;14;6;25;8;13;14;6;16;17;18;35;18;8;4;7;10;19;42;8;1;0;0;
ftsK;16;21;23;15;10;6;27;23;20;15;8;11;9;2;6;11;13;6;11;11;13;0;4;13;5;3;9;6;19;12;18;7;8;9;41;9;23;11;21;20;5;15;2;5;17;3;13;16;4;11;20;16;12;5;12;10;6;10;10;34;14;0;0;1;
iars;14;27;20;9;9;6;32;34;22;14;14;5;8;4;18;9;23;12;18;9;22;3;6;19;3;2;13;8;12;12;19;15;10;8;47;41;44;14;21;12;11;12;15;7;18;26;9;18;9;8;23;15;25;5;11;11;4;14;14;27;10;0;0;1;
lars;4;29;16;6;5;7;25;39;16;18;6;5;4;6;5;6;11;13;16;24;11;3;2;25;6;2;9;7;8;12;19;12;11;11;32;46;28;18;13;12;8;15;7;9;20;26;4;15;7;17;15;13;32;13;6;7;5;15;10;27;7;1;0;0;
pol1;12;32;23;4;14;7;40;27;16;16;10;4;13;5;11;13;16;10;10;14;22;4;1;19;3;1;4;8;14;5;24;13;8;14;41;45;38;8;7;22;10;16;6;2;17;7;7;20;5;6;30;14;16;9;12;10;8;7;16;26;7;0;1;0;
rpoB;7;33;31;6;14;14;16;48;17;18;19;6;5;9;11;10;16;17;17;29;23;6;8;35;9;4;5;10;8;28;26;37;21;18;48;72;56;31;15;15;15;25;4;0;26;10;11;24;9;13;29;27;33;20;19;5;8;20;20;44;11;1;0;0;
rpoC;7;57;33;11;39;21;51;66;19;24;14;11;17;9;19;23;21;18;18;33;29;10;7;48;15;7;16;11;21;39;38;44;25;19;63;93;64;36;26;31;26;31;8;6;30;10;13;29;10;12;46;25;45;37;13;11;22;19;21;75;19;0;1;0;
secA;8;25;26;11;13;8;27;37;11;17;8;8;9;6;7;5;19;9;15;17;22;9;4;25;5;4;15;9;12;19;20;18;15;15;51;52;32;17;8;26;7;17;5;2;21;3;4;7;4;10;19;13;14;17;8;6;6;10;7;41;10;0;1;0;
  • tli bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
acnA;54;33;25;44;11;20;31;18;17;58;46;31;55;8;17;3;42;46;32;53;1;
carB;89;61;38;76;23;33;54;13;22;98;87;54;92;15;19;12;54;95;40;75;1;
dnaE;122;78;39;73;40;37;61;28;37;72;97;74;91;20;25;8;49;88;29;69;1;
ftsK;91;50;35;47;19;22;38;15;31;42;50;34;61;7;17;3;44;53;38;58;1;
iars;85;66;36;58;35;27;55;21;24;52;88;58;56;22;18;26;44;68;40;51;1;
lars;67;64;34;32;24;40;49;16;20;53;78;46;48;16;20;26;43;73;33;44;1;
pol1;92;67;32;56;26;24;50;12;19;59;86;46;55;8;17;7;38;69;37;49;1;
rpoB;105;64;35;60;33;46;85;15;36;102;120;87;70;4;26;10;57;109;52;75;1;
rpoC;168;117;43;93;39;51;116;27;60;126;156;100;114;14;30;10;64;153;65;115;1;
secA;91;64;28;43;28;32;69;24;31;68;103;49;58;7;21;3;25;63;30;58;1;
  • tai bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
dnaE;4;16;23;3;56;19;3;54;7;30;2;1;2;10;37;16;5;34;2;24;3;9;3;47;4;18;4;19;2;26;7;16;27;38;4;88;32;48;2;4;28;50;5;14;34;10;2;5;19;28;16;4;52;22;2;0;4;23;3;45;17;0;1;0;
rpoB;1;6;10;0;62;29;2;50;4;40;2;1;2;6;30;21;1;28;1;35;2;2;9;28;9;54;1;21;0;38;4;14;35;51;3;109;16;76;0;2;17;53;1;3;26;8;2;4;15;35;7;3;74;32;0;0;5;48;1;26;36;1;0;0;
rpoC;1;11;16;7;93;38;1;86;3;39;3;0;1;18;48;25;3;34;1;39;0;1;11;39;11;84;1;23;1;54;7;24;49;57;0;143;16;88;1;6;44;60;3;19;35;11;1;3;24;45;12;2;105;46;1;1;5;51;2;58;40;0;0;1;
iars;0;2;16;4;43;26;2;45;3;37;2;2;2;5;35;13;6;23;0;13;1;2;3;21;7;33;9;12;3;32;6;9;22;29;3;64;16;54;1;4;22;34;4;16;21;25;2;1;10;33;8;1;41;23;0;1;5;27;3;17;23;0;1;0;
lars;0;4;4;1;34;29;1;46;1;38;1;0;1;4;27;12;0;23;2;23;0;3;2;16;11;21;3;9;2;22;7;9;21;27;1;57;17;39;0;2;16;38;2;20;27;24;0;2;16;32;7;1;36;20;1;0;5;27;1;20;14;1;0;0;
ftsK;1;9;9;7;45;28;2;19;1;21;4;1;2;6;26;9;1;8;3;13;3;4;3;27;3;17;4;4;3;15;10;4;19;40;4;47;15;27;5;5;17;33;2;5;19;9;3;6;13;35;6;4;34;13;1;0;9;21;3;20;17;0;1;0;
mfd;0;8;12;8;63;30;0;19;2;31;4;1;3;11;44;5;3;17;1;4;1;4;6;37;9;45;3;15;1;34;12;12;23;43;2;75;13;38;2;5;27;49;1;6;26;19;4;6;15;34;9;2;57;24;2;1;3;22;2;16;23;0;0;1;
secA;0;4;6;1;53;26;2;44;0;32;1;1;1;9;26;6;1;21;1;22;0;4;5;25;12;36;2;22;2;27;3;9;30;37;1;86;13;43;0;5;21;41;3;8;25;5;0;2;8;17;11;1;38;12;1;1;4;21;1;15;27;0;1;0;
carB;0;21;19;5;58;20;0;15;2;33;3;1;0;12;33;15;1;8;1;14;0;0;4;37;6;43;1;10;0;16;8;14;24;89;1;78;9;49;2;3;37;46;8;11;29;14;0;7;23;34;12;0;84;26;1;0;2;25;0;16;19;0;0;1;
acnA;0;5;4;1;35;9;2;16;0;24;2;1;2;5;16;7;1;11;1;16;1;3;2;17;10;14;2;16;1;19;7;9;26;27;2;38;9;27;1;4;12;36;3;6;15;1;3;3;10;27;13;3;39;17;2;0;6;23;1;15;16;0;1;0;
  • tai bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
dnaE;121;57;37;68;39;26;84;23;28;88;92;80;84;19;34;10;54;94;29;65;1;
rpoB;108;52;44;62;29;36;104;22;38;104;112;92;72;4;26;8;56;116;53;63;1;
rpoC;166;87;42;95;37;40;146;24;55;137;143;104;111;22;35;11;73;165;58;100;1;
iars;91;47;40;59;29;13;67;21;35;66;67;70;61;20;21;25;46;73;33;43;1;
lars;72;47;39;45;23;25;53;12;24;64;58;56;56;22;27;24;50;64;33;35;1;
ftsK;99;21;22;48;9;16;57;8;18;73;51;42;60;7;19;9;57;57;31;40;1;
mfd;121;19;33;68;20;5;102;18;35;90;77;51;83;7;26;19;59;92;28;41;1;
secA;90;46;32;44;22;23;82;24;29;79;87;56;67;11;25;5;27;62;27;43;1;
carB;123;15;35;64;9;15;90;11;16;135;79;58;88;19;29;14;64;122;28;35;1;
acnA;54;18;24;33;12;17;47;18;20;69;40;36;53;9;15;1;43;72;31;32;1;
  • tma bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
carB;0;8;19;1;25;40;31;44;6;31;5;9;5;10;21;5;4;31;5;23;33;0;0;20;1;1;3;8;2;20;46;17;13;4;65;48;23;29;28;14;26;28;3;2;27;8;14;9;17;20;25;9;50;21;6;13;16;24;8;40;35;0;0;1;
dnaE;2;9;21;7;21;30;46;21;13;27;13;7;4;5;7;9;11;22;5;28;32;4;3;15;2;0;6;11;5;13;19;16;11;3;62;16;24;20;10;3;10;18;1;3;14;4;10;12;7;13;27;6;25;15;2;14;10;9;10;19;30;0;1;0;
iars;1;7;17;2;21;28;46;35;9;27;12;5;1;7;16;6;1;40;6;17;31;3;2;12;2;2;7;20;4;14;27;15;4;2;73;26;27;28;12;9;8;11;11;6;18;20;8;7;9;18;18;12;30;16;6;13;13;8;6;26;31;0;0;1;
lars;1;6;18;0;13;25;32;40;5;31;8;1;5;4;9;7;6;32;7;22;23;1;1;16;0;1;2;15;1;24;26;17;6;3;49;34;22;21;8;6;8;16;5;4;16;21;10;12;15;11;13;11;26;19;5;11;8;14;10;23;18;0;0;1;
metE;0;4;18;1;21;23;31;29;11;32;6;5;4;8;8;5;6;24;10;24;23;1;1;10;4;0;1;9;3;12;12;12;9;2;66;27;13;16;6;12;13;10;2;5;17;13;13;8;8;9;15;6;22;7;6;7;6;10;9;18;21;0;0;1;
mfd;2;15;20;5;32;27;39;32;17;26;12;7;4;8;8;7;7;23;7;20;35;5;5;16;7;3;2;11;9;13;25;20;3;6;64;32;35;18;10;5;9;10;3;0;18;2;12;10;12;7;32;8;24;12;5;11;2;12;14;24;24;0;0;1;
rpoB;1;9;29;4;28;54;47;33;14;30;19;8;7;9;16;7;15;41;18;36;44;6;3;27;4;1;3;16;5;23;49;26;12;6;89;33;46;34;16;19;17;18;2;1;26;7;11;15;12;22;41;9;32;22;9;14;17;12;17;42;30;0;0;1;
rpoC;2;17;30;2;34;62;71;79;11;42;16;5;7;13;22;17;10;49;10;47;61;2;3;24;2;0;3;20;4;39;51;40;17;6;114;52;56;33;23;21;43;23;10;2;37;15;19;17;22;16;41;8;59;35;12;30;26;24;28;56;50;0;0;1;
sbcC;1;13;22;2;38;36;61;39;7;26;7;6;7;9;14;11;8;9;11;23;31;5;3;24;1;3;3;6;8;17;17;9;2;10;88;53;24;13;4;8;10;12;1;1;6;3;3;6;2;1;17;4;15;7;3;5;10;7;10;23;27;0;0;1;
secA;0;7;16;1;26;30;45;39;6;30;10;2;6;5;10;8;7;26;8;25;36;1;1;13;5;0;7;11;6;19;25;21;6;5;64;26;36;16;5;8;12;23;2;1;26;7;3;7;5;6;21;5;26;16;2;6;11;13;9;25;27;0;0;1;
  • tma bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
carB;93;75;37;55;35;28;55;11;22;80;113;52;96;5;27;8;60;105;59;83;1;
dnaE;90;67;40;45;33;33;56;17;18;49;78;44;41;4;14;4;42;73;35;59;1;
iars;76;81;36;47;41;23;52;27;18;48;99;55;40;17;18;20;42;76;40;63;1;
lars;63;72;36;34;38;29;42;17;25;52;83;43;38;9;16;21;48;69;38;51;1;
metE;67;60;43;36;30;34;39;10;15;35;93;29;41;7;17;13;38;50;29;48;1;
mfd;101;71;43;46;30;27;71;13;22;54;96;53;34;3;18;2;41;76;30;62;1;
rpoB;125;80;44;66;56;54;85;19;28;93;122;80;70;3;26;7;60;104;52;89;1;
rpoC;147;150;53;80;59;57;92;23;43;114;166;89;110;12;37;15;74;143;92;134;1;
sbcC;112;100;33;54;17;34;67;9;25;38;141;37;34;2;6;3;12;43;25;60;1;
secA;80;84;36;41;33;33;56;18;25;57;90;52;48;3;26;7;21;68;32;61;1;
  • tme bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
dnaE;36;8;19;17;0;4;102;10;34;11;8;21;12;3;8;3;21;20;32;23;13;2;3;3;0;0;4;6;9;1;17;18;2;1;57;10;25;11;20;7;1;5;7;1;8;3;16;6;4;5;7;24;3;4;7;17;2;4;31;59;8;1;0;0;
gyrB;25;9;15;1;1;3;40;20;27;1;13;4;14;1;0;2;16;7;16;6;20;1;1;10;0;0;9;4;9;9;25;17;0;6;49;13;35;2;20;8;3;0;3;0;12;3;6;8;1;0;28;9;7;2;14;11;8;3;21;26;3;1;0;0;
iars;23;13;15;14;1;3;75;16;25;7;12;12;7;2;6;2;25;20;24;14;26;0;1;8;1;0;13;12;19;2;26;17;4;5;75;9;47;7;23;10;3;6;12;4;17;21;24;10;1;4;30;33;8;3;9;19;7;7;30;32;7;1;0;0;
lars;32;12;18;4;0;1;60;24;29;3;9;9;9;4;0;2;28;13;34;6;17;0;1;13;1;0;9;2;16;4;21;19;3;5;60;14;44;4;19;11;8;3;8;1;20;20;20;18;0;3;30;23;6;1;11;16;7;2;31;32;3;0;1;0;
mfd;31;9;26;18;0;3;85;9;29;11;4;25;13;4;4;0;24;9;37;20;29;2;1;11;0;0;7;7;27;0;23;15;7;4;72;8;36;8;24;5;1;6;0;1;15;2;20;10;2;1;24;27;1;1;16;19;1;3;50;47;7;0;1;0;
pol1;44;23;20;3;5;1;68;29;43;3;16;10;14;4;2;3;34;10;39;7;21;3;0;9;0;0;10;1;19;5;16;22;0;5;56;33;42;5;18;14;5;2;3;1;18;3;12;8;1;2;33;19;7;1;16;18;3;3;35;35;8;0;0;1;
rpoB;33;18;41;5;2;6;65;23;32;10;18;13;13;2;4;3;31;11;35;22;46;1;4;18;0;0;9;13;23;5;33;35;2;14;96;16;48;13;36;10;6;5;3;0;25;7;36;16;3;3;44;33;13;5;14;33;10;9;45;44;9;1;0;0;
rpoC;40;25;48;18;3;3;100;52;36;12;20;24;23;8;7;5;38;23;39;18;56;2;3;21;1;0;22;9;34;8;42;49;3;18;121;26;86;17;49;28;9;4;12;0;33;8;37;25;5;4;53;55;25;9;19;51;13;9;54;75;12;1;0;0;
secA;31;15;24;4;1;4;64;29;25;7;11;2;10;1;0;3;23;11;27;14;36;2;1;15;0;0;15;2;16;5;18;16;4;10;73;21;44;5;23;13;6;0;3;1;21;5;10;7;4;0;26;19;13;4;11;25;2;3;30;37;1;0;0;1;
topA;15;5;12;4;2;5;97;14;22;6;10;16;6;1;3;2;13;14;22;11;15;1;1;6;1;0;5;1;11;3;22;6;1;5;63;8;16;11;21;8;5;4;11;3;10;7;12;5;1;6;18;16;5;1;10;23;1;8;18;39;8;0;0;1;
  • tme bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
dnaE;84;112;45;55;41;55;21;10;10;38;67;36;33;8;8;3;31;38;30;98;1;
gyrB;54;60;28;34;23;22;32;13;18;48;62;37;31;3;12;3;15;46;36;50;1;
iars;69;91;32;41;45;38;36;25;21;52;84;54;42;16;17;21;39;74;42;69;1;
lars;67;84;32;33;41;40;32;11;20;48;74;48;41;9;20;20;41;60;36;66;1;
mfd;87;94;40;50;33;57;43;14;27;49;80;44;36;1;15;2;33;53;39;104;1;
pol1;96;97;46;49;44;46;33;11;24;43;89;47;39;4;18;3;23;60;40;78;1;
rpoB;105;88;42;53;42;57;69;22;28;84;112;61;57;3;25;7;58;95;66;98;1;
rpoC;137;152;48;87;61;57;83;31;42;112;147;103;90;12;33;8;71;142;92;141;1;
secA;79;93;32;27;34;41;54;17;21;48;94;49;42;4;21;5;21;62;41;68;1;
topA;43;111;28;38;27;33;24;6;14;34;71;27;38;14;10;7;24;40;42;65;1;
  • tsc bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
dnaE;2;24;50;4;81;55;9;63;25;40;2;1;1;6;34;19;7;51;0;23;0;3;5;29;52;58;12;24;4;32;15;10;55;67;26;141;9;68;3;10;33;117;0;5;32;15;5;10;13;61;9;3;86;19;0;1;12;45;4;6;50;0;1;0;
rpoB;1;12;19;1;53;33;2;48;9;35;0;0;0;0;30;11;4;26;0;25;0;1;5;10;45;42;1;16;2;33;2;9;52;40;6;95;15;57;1;3;15;62;0;2;23;2;1;4;17;47;7;1;74;15;1;0;3;43;2;1;55;1;0;0;
rpoC;2;17;19;0;60;66;2;97;7;35;1;0;2;4;34;20;3;43;0;27;0;0;5;11;67;39;2;22;2;55;8;5;55;50;24;134;17;59;2;5;34;82;0;11;26;10;0;5;17;58;7;0;112;32;1;1;6;59;3;0;65;1;0;0;
iars;1;7;21;5;47;46;12;41;10;29;0;0;0;6;19;20;6;42;2;24;2;1;5;15;27;35;3;19;3;21;2;1;36;25;31;86;5;36;0;6;9;63;1;9;10;26;2;3;5;58;3;4;55;13;0;0;9;36;5;0;35;0;1;0;
lars;1;8;15;0;31;26;4;50;12;25;1;0;0;3;4;9;4;31;0;18;1;0;1;15;27;21;3;16;2;20;5;5;29;25;16;79;4;36;1;2;12;55;0;8;23;26;0;1;9;54;3;1;47;17;0;0;8;34;2;4;29;0;1;0;
secA;2;8;22;4;41;28;3;64;10;23;0;1;0;0;14;9;3;27;2;21;0;2;1;6;42;37;2;18;2;40;5;5;37;21;14;102;5;45;2;4;24;57;0;1;26;6;2;4;10;33;0;0;55;13;1;0;9;32;8;2;43;0;0;1;
carB;2;11;19;5;50;36;8;45;7;17;0;1;0;3;24;11;4;34;0;16;3;1;3;11;23;28;5;12;6;22;4;8;35;42;27;80;6;41;4;5;15;74;0;2;21;10;0;6;10;51;4;4;54;21;1;0;6;43;2;5;47;0;0;1;
ftsK;2;7;28;8;46;53;10;30;7;26;2;1;1;2;25;16;0;15;1;11;0;2;1;12;30;22;2;13;9;23;6;4;30;29;26;46;5;21;4;3;15;66;0;0;13;4;5;14;10;53;1;3;35;13;0;1;4;22;3;0;26;0;0;1;
mfd;1;18;39;4;51;43;8;33;19;18;2;0;1;2;17;10;8;25;1;6;4;2;6;21;27;43;5;15;3;19;8;2;38;34;16;88;12;30;1;11;14;57;0;0;8;8;4;14;12;41;9;1;46;11;0;1;3;29;5;0;26;0;1;0;
sbcC;4;25;41;9;56;37;9;35;9;10;5;0;1;1;14;9;2;11;0;8;2;2;2;41;31;52;1;8;4;29;5;7;15;47;35;129;6;17;3;14;27;70;0;2;7;9;0;3;7;25;4;1;45;8;0;1;2;21;1;1;6;0;1;0;
  • tsc bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
dnaE;216;72;65;63;58;23;147;36;36;147;167;77;163;5;32;15;89;117;58;60;1;
rpoB;119;50;44;41;30;25;103;17;35;103;101;72;81;2;23;2;69;97;47;58;1;
rpoC;164;99;42;61;46;27;122;24;57;118;158;76;123;11;26;10;80;151;67;68;1;
iars;127;53;39;45;48;26;85;22;24;64;117;41;78;10;10;26;68;75;45;40;1;
lars;81;54;37;17;35;18;65;19;22;64;95;40;70;8;23;26;64;68;42;35;1;
secA;105;67;33;24;30;23;88;20;42;68;116;50;87;1;26;6;49;68;42;53;1;
carB;123;53;24;39;38;16;69;17;28;89;107;47;98;2;21;10;67;83;50;54;1;
ftsK;144;40;33;47;15;12;67;15;32;69;72;26;88;0;13;4;82;52;27;29;1;
mfd;156;41;37;32;33;7;103;20;22;82;104;42;83;0;8;8;71;67;33;31;1;
sbcC;172;44;19;30;13;8;130;9;33;74;164;23;114;2;7;9;35;58;24;8;1;

Tableaux pour comparaisons des protéines[modifier | modifier le wikicode]

Cyanobactéries − autres bactéries[modifier | modifier le wikicode]

  • codons des protéines de 7 cyanobactéries "can, cgc, cya, mar, pmm, syn, tel" et de 7 autre-bactéries "bmv, cft, eco, mhd, sti, tos, zin". >4GC et >4AT en "pour 10 000" bases des gènes; les codons en "pour 10 000" acides aminés sur un total de 10 à 12 protéines.
Bactérie        tos     mhd     sti     bmv     eco     cft     zin             Bact.   tos     mhd     sti     bmv     eco     cft     zin

%GC b           68.6    68.1    68.1    68.1    50.8    33.2    13.5            %GC b   68.6    68.1    68.1    68.1    50.8    33.2    13.5
>4GC            100.0   35.9    6.6     2.1     2.6     0.3     1.5             >4GC    100.0   35.9    6.6     2.1     2.6     0.3     1.5
>4AT            7.5     5.1     2.3     1.9     20.6    103.0   309.8           >4AT    7.5     5.1     2.3     1.9     20.6    103.0   309.8
                                                                                                                                        
ttt             76      47      46      24      163     377     740             tct     3       1       17      3       89      90      255
ttc             263     311     273     320     161     51      14              tca     2       1       13      6       46      105     171
tta             10      11      9       1       94      307     954             tcc     187     119     86      44      105     17      5
ttg             66      120     78      45      129     117     25              tcg     32      115     155     277     86      26      5
                                                                                                                                        
ctt             157     53      36      26      109     356     14              cct     28      32      33      10      63      125     106
cta             48      28      27      6       41      108     10              cca     3       9       30      6       97      95      95
ctc             532     516     367     476     114     30      0               ccc     489     306     140     117     44      10      7
ctg             463     411     545     451     643     39      0               ccg     92      232     359     379     281     77      2
                                                                                                                                        
att             23      20      65      32      195     248     683             act     4       10      22      3       85      203     166
ata             8       0       5       4       15      491     992             aca     3       5       18      7       48      123     134
atc             346     393     470     416     284     129     6               acc     307     275     283     119     229     49      1
atg             174     183     212     206     230     225     142             acg     79      147     219     311     120     56      3
                                                                                                                                        
gtt             21      38      50      26      185     295     118             gct     9       53      71      12      129     310     80
gta             7       24      20      10      121     224     93              gca     2       22      82      52      178     202     66
gtc             204     236     363     311     126     62      0               gcc     723     461     426     328     226     79      5
gtg             509     443     365     360     205     50      3               gcg     241     522     397     952     398     56      3
                                                                                                                                        
−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−
                                                                                                                                
Cyanobactéries  cgc     cya     tel     syn     mar     can     pmm             Cyano.  cgc     cya     tel     syn     mar     can     pmm

%GC b           68.7    60.2    53.9    47.7    42.3    35.0    30.8           %GC b    68.7    60.2    53.9    47.7    42.3    35.0    30.8
>4GC            42.3    31.2    36.5    27.5    18.1    9.1     2.5            >4GC     42.3    31.2    36.5    27.5    18.1    9.1     2.5
>4AT            0.3     17.2    25.2    47.6    52.3    76.1    86.7           >4AT     0.3     17.2    25.2    47.6    52.3    76.1    86.7
                                                                                                                                        
ttt             10      180     205     219     225     259     307             tct     3       47      32      74      93      212     224
ttc             268     135     97      115     117     78      57              tca     10      5       41      19      32      84      219
tta             0       13      53      264     421     640     515             tcc     151     159     122     186     151     65      52
ttg             19      241     187     285     117     112     141             tcg     83      90      67      38      87      28      28
                                                                                                                                        
ctt             19      48      114     63      71      92      211             cct     16      74      56      82      93      225     165
cta             3       50      91      106     115     60      98              cca     7       46      58      62      58      55      151
ctc             283     209     269     122     138     68      36              ccc     322     249     304     241     214     106     28
ctg             779     542     359     184     148     29      13              ccg     237     188     94      85      92      30      18
                                                                                                                                        
att             16      143     417     436     366     471     483             act     6       53      73      108     151     230     224
ata             0       4       6       14      47      82      285             aca     6       22      54      54      47      135     167
atc             421     393     165     183     273     164     88              acc     390     311     290     299     253     144     51
atg             187     180     198     204     200     192     169             acg     92      101     123     94      81      42      24
                                                                                                                                        
gtt             14      80      118     153     195     248     316             gct     32      127     132     172     211     225     217
gta             3       41      49      100     112     205     187             gca     25      45      126     86      118     176     181
gtc             192     154     181     101     173     77      51              gcc     901     561     471     339     269     133     43
gtg             530     442     358     339     190     117     37              gcg     251     172     162     145     124     104     41

−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−
−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−

Bact.   tos     mhd     sti     bmv     eco     cft     zin             Bact.   tos     mhd     sti     bmv     eco     cft     zin

%GC b   68.6    68.1    68.1    68.1    50.8    33.2    13.5            %GC b   68.6    68.1    68.1    68.1    50.8    33.2    13.5
>4GC    100.0   35.9    6.6     2.1     2.6     0.3     1.5             >4GC    100.0   35.9    6.6     2.1     2.6     0.3     1.5
>4AT    7.5     5.1     2.3     1.9     20.6    103.0   309.8           >4AT    7.5     5.1     2.3     1.9     20.6    103.0   309.8
                                                                                                                                
tat     8       11      30      50      134     296     565             tgt     0       1       7       6       34      41      98
tac     298     309     235     196     119     68      22              tgc     39      52      37      75      40      50      5
taa     3       4       2       5       8       3       9               tga     4       6       4       6       1       4       100
tag     3       1       4       1       1       3       1               tgg     108     121     84      120     116     63      5
                                                                                                                                
cat     8       13      37      48      92      119     98              cgt     11      56      62      91      369     88      7
cac     169     207     164     175     107     41      1               cga     6       17      28      20      34      13      0
caa     22      52      33      35      202     196     134             cgc     353     497     454     580     272     36      0
cag     274     279     378     302     437     62      5               cgg     372     290     284     156     60      4       0
                                                                                                                                
aat     4       5       37      21      86      423     1228            agt     0       5       14      5       64      227     105
aac     154     185     218     207     215     116     24              agc     97      123     146     92      152     181     5
aaa     43      58      32      23      288     746     1698            aga     6       0       4       1       5       245     191
aag     479     372     249     353     92      153     32              agg     116     11      15      8       9       40      1
                                                                                                                                
gat     27      81      129     159     336     561     206             ggt     12      49      120     45      273     207     192
gac     429     404     435     477     260     117     5               gga     11      31      42      10      42      224     138
gaa     105     149     132     243     579     460     318             ggc     331     357     407     645     220     132     6
gag     979     775     727     456     237     322     3               ggg     426     348     183     63      86      36      9
                                                                                                                                
−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−
                                                                                        
Cyano.  cgc     cya     tel     syn     mar     can     pmm             Cyano.  cgc     cya     tel     syn     mar     can     pmm

%GC b   68.7    60.2    53.9    47.7    42.3    35.0    30.8           %GC b    68.7    60.2    53.9    47.7    42.3    35.0    30.8
>4GC    42.3    31.2    36.5    27.5    18.1    9.1     2.5            >4GC     42.3    31.2    36.5    27.5    18.1    9.1     2.5
>4AT    0.3     17.2    25.2    47.6    52.3    76.1    86.7           >4AT     0.3     17.2    25.2    47.6    52.3    76.1    86.7
                                                                                                                                
tat     32      77      154     180     225     281     268             tgt     7       19      41      46      65      63      77
tac     202     225     167     142     103     70      54              tgc     76      57      39      34      16      15      29
taa     0       1       7       3       9       8       7               tga     11      3       1       0       0       1       1
tag     0       6       3       8       2       3       2               tgg     137     137     125     121     116     117     107
                                                                                                                                
cat     33      32      91      106     86      125     146             cgt     37      28      73      98      145     172     28
cac     169     165     117     79      82      42      18              cga     14      33      44      55      65      45      28
caa     8       197     359     344     342     408     279             cgc     405     374     349     161     167     64      2
cag     419     431     299     236     186     124     63              cgg     301     241     182     193     99      19      6
                                                                                                                                
aat     18      34      131     174     255     362     584             agt     13      20      94      110     113     148     147
aac     200     220     139     162     139     116     85              agc     188     154     106     69      74      51      31
aaa     16      136     225     413     477     556     672             aga     2       12      4       25      68      149     316
aag     288     265     194     137     91      109     158             agg     17      18      12      32      25      43      85
                                                                                                                                
gat     156     238     349     364     414     451     544             ggt     62      44      181     211     232     255     236
gac     415     261     192     217     130     111     73              gga     29      77      68      85      175     176     246
gaa     129     258     410     649     665     663     598             ggc     555     366     258     212     139     78      62
gag     632     563     357     193     194     192     174             ggg     164     217     172     179     127     105     54

Autre-bactéries[modifier | modifier le wikicode]

  • codons des autre-bactéries à 68% GC: tos, mhd, sti, bmv (eco à 51% GC). >4GC et >4AT en "pour 10 000" bases des gènes; les codons en "pour 10 000" acides aminés sur un total de 10 à 14 protéines.
Bactérie  tos   mhd   sti  bmv   eco          Bactérie  tos   mhd  sti  bmv   eco     Bactérie  tos   mhd  sti  bmv   eco     Bacterie tos   mhd  sti   bmv   eco

>4GC    100.0  35.9   6.6  2.1   2.6            >4GC  100.0  35.9  6.6  2.1   2.6      >4GC   100.0  35.9  6.6  2.1   2.6       >4GC  100.0  35.9  6.6  2.1   2.6
>4AT      7.5   5.1   2.3  1.9  20.6            >4AT    7.5   5.1  2.3  1.9  20.6      >4AT     7.5   5.1  2.3  1.9  20.6       >4AT    7.5   5.1  2.3  1.9  20.6

ttt      76      47    46   24   163            tct     3       1   17    3    89       tat     8      11   30   50  134        tgt     0       1    7    6    34
ttc     263     311   273  320   161            tca     2       1   13    6    46       tac   298     309  235  196  119        tgc    39      52   37   75    40
tta      10      11     9    1    94            tcc   187     119   86   44   105       taa     3       4    2    5    8        tga     4       6    4    6     1
ttg      66     120    78   45   129            tcg    32     115  155  277    86       tag     3       1    4    1    1        tgg   108     121   84  120   116
                                                    
ctt     157      53    36   26   109            cct    28      32   33   10    63       cat     8      13   37   48   92        cgt    11      56   62   91   369
cta      48      28    27    6    41            cca     3       9   30    6    97       cac   169     207  164  175  107        cga     6      17   28   20    34
ctc     532     516   367  476   114            ccc   489     306  140  117    44       caa    22      52   33   35  202        cgc   353     497  454  580   272
ctg     463     411   545  451   643            ccg    92     232  359  379   281       cag   274     279  378  302  437        cgg   372     290  284  156    60
                                                    
att      23      20    65   32   195            act     4      10   22    3    85       aat     4       5   37   21   86        agt     0       5   14    5    64
ata       8       0     5    4    15            aca     3       5   18    7    48       aac   154     185  218  207  215        agc    97     123  146   92   152
atc     346     393   470  416   284            acc   307     275  283  119   229       aaa    43      58   32   23  288        aga     6       0    4    1     5
atg     174     183   212  206   230            acg    79     147  219  311   120       aag   479     372  249  353   92        agg   116      11   15    8     9
                                                    
gtt      21      38    50   26   185            gct     9      53   71   12   129       gat    27      81  129  159  336        ggt    12      49  120   45   273
gta       7      24    20   10   121            gca     2      22   82   52   178       gac   429     404  435  477  260        gga    11      31   42   10    42
gtc     204     236   363  311   126            gcc   723     461  426  328   226       gaa   105     149  132  243  579        ggc   331     357  407  645   220
gtg     509     443   365  360   205            gcg   241     522  397  952   398       gag   979     775  727  456  237        ggg   426     348  183   63    86

Compléments[modifier | modifier le wikicode]

Comparaisons des protéines[modifier | modifier le wikicode]

Les autre-bactéries utilisées pour ce complément sont: pmh, tme, hmr, nse, aae, hth, tma, tli, amo, lfc, eco, dal, msv, mrb, tai, tsc

Les répétitions des bactéries autres pour les compléments[modifier | modifier le wikicode]

  • Les répétitions
Voir répétitions des génomes des autre-bactéries déjà compilées: tme, tma, aae, amo, eco, msv, mrb, tai, tsc.    Extrait des autre-bactéries
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl
amo; 2160700; 47.968065904568; 4344; 4682; 1272; 1205; 102227; 104668; 102592; 102289; 8025; 8552; 4617; 4498; 0
tma; 1860725; 46.2477260207715; 4488; 4659; 538; 709; 89126; 90023; 74178; 78612; 8868; 8979; 2144; 2517; 0
tme; 1915238; 31.3998573545429; 13238; 12800; 490; 431; 123522; 121538; 50996; 49107; 17789; 17210; 1638; 1550; 0
tsc; 2346803; 64.8850372187184; 1108; 1259; 8488; 8168; 66287; 66784; 190405; 188915; 4331; 4283; 16711; 16545; 0
eco; 4641652; 50.7907098593346; 8441; 8289; 1278; 1239; 205758; 205373; 216669; 215471; 15523; 15380; 6067; 6027; 0
mrb; 3097457; 63.3843827371938; 2995; 2990; 7404; 7492; 82263; 81704; 212870; 215243; 5833; 5674; 14923; 14926; 0
msv; 3249394; 62.3636284180989; 2434; 2476; 6989; 7214; 94468; 93721; 211059; 213652; 5346; 5167; 16759; 17228; 0
tai; 1848474; 63.7925661924377; 375; 339; 8098; 7114; 48029; 46765; 142542; 137838; 1116; 1095; 12183; 11501; 0
aae; 1551335; 43.4761673010665; 4828; 4872; 591; 641; 85156; 86380; 64379; 65865; 9170; 9276; 2805; 2659; 0
Voir répétitions des protéines des 15 autre-bactéries du complément: pmh, tme, hmr, nse, aae, hth, tma, tli, amo, lfc, dal, msv, mrb, tai, tsc.
  • les codons
Voir les codons des protéines des 15 autre-bactéries du complément: pmh, tme, hmr, nse, aae, hth, tma, tli, amo, lfc, dal, msv, mrb, tai, tsc.
  • Tableaux numérique des répétitions des autre-bactéries nouvelles: pmh, hmr, nse, tli, hth, lfc, dal
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
dal; 6517073; 54.4848567801159; 17587; 17686; 5674; 5421; 254602; 254345; 412164; 407704; 26656; 26671; 18214; 17436; 31
hmr; 1694430; 37.4742538788855; 7900; 7853; 437; 467; 94543; 95109; 56139; 56577; 11775; 11770; 1953; 1865; 0
hth; 1743135; 44.0002638923549; 5049; 4910; 755; 757; 82142; 80624; 76333; 75300; 9204; 9097; 2386; 2477; 0
lfc; 2559538; 50.0475476433638; 7191; 7295; 2290; 2162; 109904; 110996; 135762; 134514; 10887; 11031; 6806; 6747; 0
nse; 859006; 41.0843463258697; 2891; 2722; 187; 182; 46113; 46003; 28403; 27971; 4597; 4377; 808; 862; 0
pmh; 1738790; 31.1450491433698; 10643; 10443; 273; 266; 120591; 119911; 42641; 42436; 13543; 12907; 1153; 1083; 0
tli; 1967774; 47.0576397492801; 4485; 4562; 1240; 1499; 93405; 94061; 93059; 98130; 9109; 8749; 4439; 4876; 0
  • Tableaux des répétitions >4GC et >4AT des génomes des autre-bactéries nouvelles: pmh, hmr, nse, tli, hth, lfc, dal
                                                Aléas équation  
KEGG    effectif        %GC     >4GC    >4AT    >4ATa   >4GCa
dal     6517073         54.48   17.02   54.12   9.3     21.8
hmr     1694430         37.47   5.34    92.97   41.3    3.9
hth     1743135         44.00   8.67    57.13   24.9    8.0
lfc     2559538         50.05   17.39   56.60   14.5    14.6
nse     859006          41.08   4.30    65.34   31.5    5.8
pmh     1738790         31.15   3.10    121.27  63.6    1.8
tli     1967774         47.06   13.92   45.98   19.1    10.9
  • Tableaux des répétitions >4GC et >4AT des génomes des autre-bactéries déjà compilées: tme, tma, aae, amo, eco, msv, mrb, tai, tsc.    Extrait des Tableaux des diagrammes
                                                Aléas équation  
KEGG    effectif        %GC     >4GC    >4AT    >4ATa   >4GCa
eco     4,641,652       50.79   5.42    36.04   13.5    15.6
amo     2,160,700       47.97   11.46   41.77   17.6    11.9
aae     1,551,335       43.48   7.94    62.53   26.0    7.5
tai     1,848,474       63.79   82.29   3.86    3.2     45.2
tsc     2,346,803       64.89   70.97   10.09   2.8     48.8
msv     3,249,394       62.36   43.71   15.11   3.9     40.7
mrb     3,097,457       63.38   48.09   19.32   3.4     43.9
tme     1,915,238       31.40   4.81    135.95  62.6    1.8
tma     1,860,725       46.25   6.70    49.16   20.5    10.1
  • Tableaux des répétitions >4GC et >4AT des protéines
                                                Aléas équation          
%GC b   KEGG     ADN    %GC p   >4AT    >4GC    >4ATa   >4GCa   #GC %
31.15   pmh     31,017  32.65   89.3    1.9     57.7    2.1     -10
31.40   tme     28,056  32.74   116.2   0.7     57.4    2.2     -67
37.47   hmr     30,099  39.61   62.1    2.7     35.3    4.9     -46
41.08   nse     30,408  41.45   61.2    5.3     30.6    6.0     -13
43.48   aae     29,648  46.05   42.5    5.4     20.9    9.9     -45
44.00   hth     29,334  44.60   43.6    8.2     23.6    8.5     -3
46.25   tma     29,991  47.08   48.0    4.0     19.1    10.9    -63
47.06   tli     29,844  46.99   30.8    6.7     19.2    10.8    -38
47.97   amo     31,140  50.78   27.6    10.9    13.5    15.6    -30
50.05   lfc     31,632  46.72   57.9    7.6     19.7    10.5    -28
50.79   eco     38,310  54.54   20.6    2.6     9.3     21.9    -88
54.48   dal     33,645  56.65   47.3    11.0    7.4     26.1    -58
62.36   msv     32,220  62.88   13.3    34.1    3.6     42.3    -19
63.38   mrb     32,235  64.61   17.7    45.0    2.9     47.8    -6
63.79   tai     30,186  64.35   0.7     79.2    3.0     47.0    69
64.89   tsc     33,261  65.56   9.0     67.6    2.6     51.1    32

Tableau des rapports[modifier | modifier le wikicode]

Bactérie        pmh     tme     hmr     nse     aae     hth     tma     tli     amo     lfc     eco     dal     msv     mrb     tai     tsc

#GC %           76      164     38      -26     5       9       -33     28      -4      19      -65     -22     7       10      82      46
%GC b           31      31      37      41      43      44      46      47      48      50      51      54      62      63      64      65
>4GC            1.9     0.7     2.7     5.3     5.4     8.2     4.0     6.7     10.9    7.6     2.6     11.0    34.1    45.0    79.2    67.6
>4AT            89.3    116.2   62.1    61.2    42.5    43.6    48.0    30.8    27.6    57.9    20.6    47.3    13.3    17.7    0.7     9.0
                                                                                                                                        
Pro             365     381     384     366     410     404     439     463     447     509     486     433     532     543     526     608
c/g             1.2     1.3     1.0     0.6     4.0     2.7     1.1     2.0     2.1     1.0     0.2     2.5     1.9     2.2     2.1     4.4
                                                                                                                                        
Gly             598     595     647     627     633     654     621     735     731     736     621     724     767     754     900     793
g/c             0.8     2.8     0.3     0.9     0.8     0.5     0.6     0.9     0.4     1.1     0.4     0.2     0.8     0.4     1.6     1.0
                                                                                                                                        
Thr             454     497     442     478     431     437     433     398     392     502     481     495     434     454     349     393
c/g             2.4     0.9     1.4     0.9     1.0     3.1     1.1     1.7     0.9     1.6     1.9     2.1     7.6     8.7     6.0     5.9
                                                                                                                                        
Ala             502     481     619     640     564     551     553     704     726     645     931     836     954     939     731     889
c/g             1.1     0.7     3.3     0.8     0.8     1.7     1.1     1.7     3.2     2.4     0.6     3.0     3.4     4.8     1.8     3.6
                                                                                                                                        
Ser             547     537     563     561     525     596     571     667     627     635     702     582     691     727     671     735
tcc/gc*         0.5     0.6     0.4     0.3     1.7     0.7     0.6     0.7     0.8     0.6     0.1     1.0     1.0     1.0     1.1     2.0
                                                                                                                                        
Arg             452     457     509     525     586     584     616     612     667     613     751     529     774     741     828     884
gg*/cgc         26.0    28.5    10.0    3.8     26.7    20.2    6.7     4.6     2.6     2.6     0.3     1.0     0.6     0.5     8.0     1.5

0.8-1.2~1       3       1       1       3       3       0       3       1       2       2       0       2       2       1       1       1

Tableau des effectifs[modifier | modifier le wikicode]

        pmh     tme     hmr     nse     aae     hth     tma     tli     amo     lfc     eco     dal     msv     mrb     tai     tsc

#GC %   76      164     38      -26     5       9       -33     28      -4      19      -65     -22     7       10      82      46
%GC b   31      31      37      41      43      44      46      47      48      50      51      54      62      63      64      65
>4GC    1.9     0.7     2.7     5.3     5.4     8.2     4.0     6.7     10.9    7.6     2.6     11.0    34.1    45.0    79.2    67.6
>4AT    89.3    116.2   62.1    61.2    42.5    43.6    48.0    30.8    27.6    57.9    20.6    47.3    13.3    17.7    0.7     9.0
                                                                                                                                
ccc     32      30      68      42      221     123     123     125     192     128     44      249     284     339     318     434
acc     59      55      91      75      136     142     133     139     133     150     229     303     349     399     287     329
gcc     49      37      143     89      112     153     169     212     351     212     226     523     596     697     438     635
tcc     39      36      71      92      131     99      131     125     130     209     105     261     124     121     320     194
ccx     333     351     316     324     189     282     315     338     256     381     442     184     248     204     208     174
                                                                                                                                
ggg     53      78      57      93      59      80      47      138     123     149     86      84      261     204     436     343
cgg     2       0       6       32      2       6       11      31      28      101     60      131     224     194     363     340
agg     99      122     224     148     322     262     177     245     289     93      9       85      24      29      292     154
tgg     103     85      73      70      85      96      100     109     115     84      116     80      117     113     125     105
ggx     545     517     590     534     574     574     574     597     608     587     534     640     506     550     465     450

cc/ccc  15.0    16.0    9.1     13.7    2.6     5.5     6.1     6.5     4.5     7.4     22.8    5.1     4.6     4.2     3.9     3.1
gg/ggg  14.1    9.3     15.7    8.4     16.7    11.8    18.3    7.1     8.4     5.8     8.4     11.2    3.3     4.3     2.9     3.1

Les tRNAs par codons[modifier | modifier le wikicode]

  • Sont reportés ici les aas à un seul tRNA pour ceux qui sont codés par 4 ou 6 codons, soit 8 aas: colonne tRNA/8. La colonne tRNA affiche le nombre total de tRNA par bactérie. Cette liste ne concerne que les 192 autre-bactéries. Un seul cas, zin (14%GC), où Leu à 6 codons n'a qu'un seul tRNA. Et un seul cas pour la Gly, mcac (24%GC). D'après gtRNAdb [1].
KEGG    %GC     tRNA    tRNA/8          KEGG    %GC     tRNA    tRNA/8          KEGG    %GC     tRNA    tRNA/8          KEGG    %GC     tRNA    tRNA/8
zin     13.54   25      LAPTV           gva     42.02   37      0               eno     55.07   83      0               rpa     65.04   49      0
cru     13.98   28      APTV            cbd     42.44   42      0               spe     55.07   84      0               rru     65.45   55      0
crp     16.56   28      APTV            plu     42.83   85      0               cnt     55.10   82      0               dpt     66.16   46      0
wbr     22.48   34      P               bae     43.22   75      P               ecla    55.18   83      0               gdi     66.43   55      0
mcac    23.66   30      APTVG           sect    43.29   40      0               eha     55.56   60      0               pae     66.56   63      0
sms     24.00   28      APTV            aae     43.48   44      0               ror     55.88   79      A               dge     66.64   49      0
uur     25.50   30      APTV            bsu     43.51   54      P               koy     55.92   87      0               roa     67.37   52      0
ple     26.17   33      AP              men     43.52   41      0               pes     56.06   55      0               sur     67.46   50      0
buc     26.31   32      P               ral     44.21   75      AV              ebt     56.51   89      0               rha     67.52   53      0
fnc     27.12   47      APTV            clo     44.21   45      0               say     56.76   53      0               mhd     68.08   50      0
asf     28.26   39      APTV            lpl     44.47   73      V               sap     56.76   54      0               sti     68.10   50      0
cbl     28.31   81      APV             xbo     44.97   82      0               esa     56.77   82      0               tra     68.14   45      0
rip     28.48   33      AP              ppm     45.24   163     0               bmf1    57.16   55      0               bmv     68.15   56      0
rty     28.92   33      P               pfq     45.38   72      0               bmf2    57.34   −       −               tos     68.55   52      0
rpr     29.00   33      P               ppoy    45.51   109     0               eic     57.44   94      0               req     68.82   52      0
rpw     29.01   33      P               tma     46.25   46      0               kpn     57.48   86      0               mxa     68.89   66      0
cdf     29.06   88      APTV            sbn     46.28   105     0               pdo     58.31   45      0               tts     68.92   47      0
bpn     29.56   40      0               ypg     47.60   69      0               aba     58.38   46      0               vin     68.94   49      0
cad     29.93   81      APV             ype     47.64   70      0               pst     58.40   64      0               ttl     69.09   48      0
cjr     30.31   44      P               amo     47.97   48      0               dba     58.65   64      0               tth     69.44   48      0
cje     30.55   43      P               pgi     48.29   53      V               pge     59.11   86      0               age     69.45   81      0
cac     30.93   73      AV              rho     48.50   58      0               pgd     59.62   60      0               ccx     69.90   59      0
tme     31.40   50      0               cpb     48.93   46      0               pac     60.01   45      0               opr     70.02   46      0
sep     32.10   59      APV             hav     48.99   92      0               pak     60.10   45      0               fra     70.08   45      0
sepp    32.12   59      APV             eal     49.70   85      0               blo     60.12   57      0               mts     70.28   46      0
ser     32.15   59      APV             ecs     50.54   105     0               bla     60.49   52      0               sma     70.72   71      0
rri     32.47   34      P               eco     50.79   87      0               ret     61.27   50      0               sbh     70.75   65      0
cft     33.21   43      P               sfo     50.88   77      0               sus     61.90   51      0               ams     70.82   59      0
cfv     33.26   43      P               sfl     50.89   98      0               asd     62.24   45      0               nfa     70.83   54      0
cff     33.31   41      P               eca     50.97   76      0               saci    62.27   68      0               amd     71.29   52      0
cle     34.32   105     0               sbo     51.21   91      0               rer     62.31   54      0               scl     71.38   63      0
ljf     34.49   55      AV              sbz     51.34   86      0               lhk     62.35   78      0               scb     71.45   74      0
lla     35.33   63      APV             sty     52.09   79      0               msv     62.36   47      0               ssx     71.75   65      0
cpy     35.35   61      A               spq     52.11   85      0               ipa     62.44   47      0               sho     72.04   73      0
lat     36.32   44      P               raq     52.12   76      P               smx     62.65   57      0               sco     72.12   65      0
amt     36.82   105     0               stm     52.22   85      0               smk     62.67   57      0               sall    72.13   72      0
liv     37.13   67      AP              kin     52.75   83      0               dvl     63.01   68      0               sgr     72.23   67      0
tde     37.87   44      0               tpas    52.79   45      0               mrb     63.38   47      0               salu    72.32   71      0
spi     38.32   63      APV             ent     52.98   84      0               ddr     63.39   48      0               gba     72.56   48      0
pmr     38.90   83      0               apt     53.04   57      0               tro     63.65   49      0               cmi     72.66   45      0
cth     38.99   56      0               pam     53.69   72      0               tai     63.79   50      0               sct     72.94   64      0
chp     39.06   38      0               eta     53.73   81      0               dpd     63.97   48      0               phm     73.29   46      0
spl     39.09   143     0               ksa     53.74   82      0               gau     64.27   48      0               salb    73.32   66      0
tsu     39.16   48      0               cgl     53.81   60      0               ppk     64.72   65      0               afw     73.53   49      0
cmn     40.34   37      0               cko     53.83   82      0               xac     64.77   54      0               ksk     74.20   78      0
psi     41.27   76      0               ebf     54.02   86      0               cvi     64.83   98      0               acp     74.72   49      0
cta     41.30   37      0               cgq     54.15   58      0               tsc     64.89   48      0               ank     74.84   49      0
ctr     41.31   37      0               dda     55.02   74      0               xcb     64.96   55      0               ade     74.91   49      0
  • Tableau non formaté
KEGG;%GC;tRNA;tRNA/8;;KEGG;%GC;tRNA;tRNA/8;;KEGG;%GC;tRNA;tRNA/8;;KEGG;%GC;tRNA;tRNA/8
zin;13.54;25;LAPTV;;gva;42.02;37;0;;eno;55.07;83;0;;rpa;65.04;49;0
cru;13.98;28;APTV;;cbd;42.44;42;0;;spe;55.07;84;0;;rru;65.45;55;0
crp;16.56;28;APTV;;plu;42.83;85;0;;cnt;55.10;82;0;;dpt;66.16;46;0
wbr;22.48;34;P;;bae;43.22;75;P;;ecla;55.18;83;0;;gdi;66.43;55;0
mcac;23.66;30;APTVG;;sect;43.29;40;0;;eha;55.56;60;0;;pae;66.56;63;0
sms;24.00;28;APTV;;aae;43.48;44;0;;ror;55.88;79;A;;dge;66.64;49;0
uur;25.50;30;APTV;;bsu;43.51;54;P;;koy;55.92;87;0;;roa;67.37;52;0
ple;26.17;33;AP;;men;43.52;41;0;;pes;56.06;55;0;;sur;67.46;50;0
buc;26.31;32;P;;ral;44.21;75;AV;;ebt;56.51;89;0;;rha;67.52;53;0
fnc;27.12;47;APTV;;clo;44.21;45;0;;say;56.76;53;0;;mhd;68.08;50;0
asf;28.26;39;APTV;;lpl;44.47;73;V;;sap;56.76;54;0;;sti;68.10;50;0
cbl;28.31;81;APV;;xbo;44.97;82;0;;esa;56.77;82;0;;tra;68.14;45;0
rip;28.48;33;AP;;ppm;45.24;163;0;;bmf1;57.16;55;0;;bmv;68.15;56;0
rty;28.92;33;P;;pfq;45.38;72;0;;bmf2;57.34;−;−;;tos;68.55;52;0
rpr;29.00;33;P;;ppoy;45.51;109;0;;eic;57.44;94;0;;req;68.82;52;0
rpw;29.01;33;P;;tma;46.25;46;0;;kpn;57.48;86;0;;mxa;68.89;66;0
cdf;29.06;88;APTV;;sbn;46.28;105;0;;pdo;58.31;45;0;;tts;68.92;47;0
bpn;29.56;40;0;;ypg;47.60;69;0;;aba;58.38;46;0;;vin;68.94;49;0
cad;29.93;81;APV;;ype;47.64;70;0;;pst;58.40;64;0;;ttl;69.09;48;0
cjr;30.31;44;P;;amo;47.97;48;0;;dba;58.65;64;0;;tth;69.44;48;0
cje;30.55;43;P;;pgi;48.29;53;V;;pge;59.11;86;0;;age;69.45;81;0
cac;30.93;73;AV;;rho;48.50;58;0;;pgd;59.62;60;0;;ccx;69.90;59;0
tme;31.40;50;0;;cpb;48.93;46;0;;pac;60.01;45;0;;opr;70.02;46;0
sep;32.10;59;APV;;hav;48.99;92;0;;pak;60.10;45;0;;fra;70.08;45;0
sepp;32.12;59;APV;;eal;49.70;85;0;;blo;60.12;57;0;;mts;70.28;46;0
ser;32.15;59;APV;;ecs;50.54;105;0;;bla;60.49;52;0;;sma;70.72;71;0
rri;32.47;34;P;;eco;50.79;87;0;;ret;61.27;50;0;;sbh;70.75;65;0
cft;33.21;43;P;;sfo;50.88;77;0;;sus;61.90;51;0;;ams;70.82;59;0
cfv;33.26;43;P;;sfl;50.89;98;0;;asd;62.24;45;0;;nfa;70.83;54;0
cff;33.31;41;P;;eca;50.97;76;0;;saci;62.27;68;0;;amd;71.29;52;0
cle;34.32;105;0;;sbo;51.21;91;0;;rer;62.31;54;0;;scl;71.38;63;0
ljf;34.49;55;AV;;sbz;51.34;86;0;;lhk;62.35;78;0;;scb;71.45;74;0
lla;35.33;63;APV;;sty;52.09;79;0;;msv;62.36;47;0;;ssx;71.75;65;0
cpy;35.35;61;A;;spq;52.11;85;0;;ipa;62.44;47;0;;sho;72.04;73;0
lat;36.32;44;P;;raq;52.12;76;P;;smx;62.65;57;0;;sco;72.12;65;0
amt;36.82;105;0;;stm;52.22;85;0;;smk;62.67;57;0;;sall;72.13;72;0
liv;37.13;67;AP;;kin;52.75;83;0;;dvl;63.01;68;0;;sgr;72.23;67;0
tde;37.87;44;0;;tpas;52.79;45;0;;mrb;63.38;47;0;;salu;72.32;71;0
spi;38.32;63;APV;;ent;52.98;84;0;;ddr;63.39;48;0;;gba;72.56;48;0
pmr;38.90;83;0;;apt;53.04;57;0;;tro;63.65;49;0;;cmi;72.66;45;0
cth;38.99;56;0;;pam;53.69;72;0;;tai;63.79;50;0;;sct;72.94;64;0
chp;39.06;38;0;;eta;53.73;81;0;;dpd;63.97;48;0;;phm;73.29;46;0
spl;39.09;143;0;;ksa;53.74;82;0;;gau;64.27;48;0;;salb;73.32;66;0
tsu;39.16;48;0;;cgl;53.81;60;0;;ppk;64.72;65;0;;afw;73.53;49;0
cmn;40.34;37;0;;cko;53.83;82;0;;xac;64.77;54;0;;ksk;74.20;78;0
psi;41.27;76;0;;ebf;54.02;86;0;;cvi;64.83;98;0;;acp;74.72;49;0
cta;41.30;37;0;;cgq;54.15;58;0;;tsc;64.89;48;0;;ank;74.84;49;0
ctr;41.31;37;0;;dda;55.02;74;0;;xcb;64.96;55;0;;ade;74.91;49;0

b10M[modifier | modifier le wikicode]

Ce sont 8 bactéries age, amd, roa, saci, sma, sgr, sho, sus. Ces bactéries ont à peu près la même grande taille qui tourne autour de 10 Mpb, un %GC autour de 68% et un >4GC autour de 28 pour 10 000. Ce qui les différencient de tos, sti et mhd dont le >4GC dépasse les 50 pour 10 000 et même les aléas, le %GC tourne autour de 68% et la taille petite est comprise entre 2 et 3 Mpb.

codons[modifier | modifier le wikicode]

par génome[modifier | modifier le wikicode]

  • age;

Gène;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; a1653;0;2;1;0;59;36;1;20;1;50;0;0;1;15;14;18;3;23;0;14;0;0;0;0;19;9;0;17;1;17;2;10;52;5;1;19;3;19;1;2;43;52;0;4;27;14;0;0;16;10;0;0;48;18;1;0;16;21;2;0;33;0;0;1; a1653m;0;1;3;0;77;27;0;1;0;20;0;0;2;7;7;9;0;3;0;5;0;0;0;1;16;17;1;9;1;12;3;2;27;17;1;19;1;6;0;2;42;31;0;3;18;4;1;0;19;6;0;0;47;3;0;0;11;13;1;0;10;0;0;1; a1653n;0;1;0;0;46;32;0;9;0;31;0;0;1;11;15;10;1;18;0;7;0;0;2;0;17;4;0;4;0;7;2;4;36;2;0;19;1;9;1;3;27;51;0;2;18;5;0;0;8;15;0;0;32;19;0;0;8;23;0;0;18;0;0;1; a2777A;0;0;1;0;57;56;1;97;1;51;0;0;2;15;15;20;0;33;1;30;0;1;2;2;49;13;1;26;1;40;2;7;73;19;4;98;7;62;0;0;39;59;0;10;36;8;0;1;28;25;0;0;55;31;0;0;22;29;1;0;59;0;0;1; a27771;0;7;0;0;78;30;2;51;0;23;0;0;2;10;12;13;1;20;2;18;0;1;1;8;39;22;2;14;2;36;4;2;32;16;3;78;11;41;3;1;61;41;1;2;13;4;1;1;24;21;1;0;63;9;0;0;30;16;3;0;33;0;0;1; a27761;0;1;1;0;59;72;0;106;0;54;3;0;1;19;31;18;0;38;0;51;0;1;9;0;73;8;1;19;0;48;5;17;79;8;5;119;12;85;0;5;28;59;0;7;24;6;0;1;35;24;2;0;62;53;1;0;29;37;1;0;93;0;1;0; a27762;0;0;0;0;51;81;0;102;0;38;2;0;0;19;31;13;0;33;1;49;0;0;14;1;76;14;0;21;0;40;1;22;89;0;7;119;13;67;0;4;26;82;0;14;32;7;0;2;30;29;1;0;60;48;1;0;22;43;2;0;99;0;1;0; a63551;0;1;0;0;66;25;0;52;0;34;1;1;0;18;20;16;0;34;1;21;0;1;4;2;45;26;0;17;0;37;4;7;58;10;4;89;9;46;1;0;57;47;0;9;25;2;0;1;36;22;1;0;79;21;0;0;38;24;3;0;60;0;1;0; a63552;0;3;0;0;10;16;0;17;0;12;0;1;0;5;8;5;1;9;0;11;0;0;2;0;12;7;2;11;0;11;3;5;28;6;2;19;6;12;2;2;11;26;0;2;10;1;0;1;9;11;1;0;29;9;0;0;8;14;1;0;11;0;1;0; a6114;0;0;0;0;28;48;0;39;0;34;2;0;0;16;11;10;3;22;2;14;0;0;3;0;47;11;4;23;1;26;0;3;49;7;3;60;9;37;0;2;16;59;0;3;17;24;2;2;7;46;0;1;28;35;0;0;18;33;1;0;22;0;0;1; a6115;0;3;0;0;72;18;0;64;0;31;0;0;1;15;10;22;0;41;1;19;0;1;0;1;32;26;2;18;0;28;4;5;44;12;4;76;3;52;2;0;72;24;0;19;12;20;0;0;28;21;0;0;66;16;0;1;32;12;2;0;32;0;0;1; a27140;0;1;0;0;31;9;0;24;0;6;1;0;0;9;5;1;0;4;1;14;0;1;0;4;14;17;1;9;0;17;4;0;21;13;2;27;1;23;0;0;37;13;0;5;16;1;0;0;17;8;0;1;43;7;0;0;22;7;1;0;29;0;0;1; aseca;0;0;0;0;46;31;1;56;0;25;0;1;0;12;16;10;0;34;3;29;0;0;9;1;55;14;0;20;0;53;1;8;55;9;5;84;6;52;1;1;23;56;0;6;28;7;0;1;17;11;0;1;39;23;1;0;20;28;1;0;48;0;1;0; a4213;0;1;0;0;53;34;0;54;0;35;0;0;1;8;21;20;0;25;0;35;0;0;5;0;36;2;1;15;0;33;1;5;75;4;1;51;3;43;0;0;22;67;0;6;21;8;0;1;25;29;1;0;61;16;0;0;19;38;2;0;32;0;1;0;

  • amd;

Gène;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; a1653;0;2;1;0;56;25;0;20;0;41;0;1;0;15;13;3;0;22;0;9;0;0;1;2;16;9;1;10;0;12;1;5;57;15;2;11;2;23;1;2;43;30;1;3;23;13;0;1;16;2;1;0;19;33;0;0;12;24;0;0;34;0;0;1; a1653m;0;2;1;0;51;29;0;13;1;35;0;0;1;17;7;5;0;16;0;6;0;0;1;0;8;6;0;4;0;12;3;6;38;11;2;6;1;16;1;0;42;14;0;1;13;7;0;0;22;4;0;0;30;20;2;1;15;8;1;0;37;1;0;0; a1653n;0;5;1;0;60;10;0;10;0;37;0;0;0;29;6;6;1;12;0;3;0;0;2;0;8;7;0;3;0;10;2;6;33;14;3;5;2;14;2;1;59;16;0;4;11;8;1;0;20;0;0;0;35;22;1;0;27;3;2;0;21;0;0;1; a2777A;0;6;3;0;47;59;0;23;0;37;1;2;2;15;19;9;1;24;1;17;0;2;3;0;44;56;1;34;0;33;4;5;60;32;27;37;7;71;3;1;71;87;0;10;18;14;0;0;43;21;1;1;33;58;1;0;13;20;0;0;32;0;0;1; a27771;0;1;3;0;74;30;1;33;0;33;0;0;0;26;10;8;1;21;0;17;0;1;1;0;44;14;0;19;0;34;0;5;46;13;15;64;3;55;2;0;61;41;1;0;17;6;0;0;26;5;0;0;19;41;0;0;21;36;1;0;33;0;0;1; a27761;0;1;0;0;65;30;0;55;0;37;2;0;0;32;21;10;0;25;0;45;0;1;4;0;56;19;0;21;0;37;1;15;74;5;18;87;1;82;2;3;44;32;0;6;26;10;0;0;49;11;1;0;22;71;3;0;24;44;1;0;74;0;0;1; a27762;0;0;0;1;83;40;0;74;1;34;0;0;0;33;12;3;0;32;0;44;0;1;14;0;58;34;0;22;0;45;0;30;73;6;4;88;1;88;1;3;59;59;1;10;28;11;0;0;58;5;2;0;40;60;0;0;29;44;1;0;71;0;0;1; a63551;0;3;1;0;54;33;0;37;0;33;2;0;1;24;23;9;0;27;1;20;0;0;2;2;41;28;1;18;0;23;0;7;74;21;19;67;2;71;0;1;53;62;0;11;23;3;0;0;50;14;0;0;49;63;2;0;25;44;0;0;60;0;0;1; a63552;0;3;0;0;19;7;0;8;0;13;1;1;0;11;7;5;2;7;0;11;0;1;0;0;16;10;0;9;0;14;0;2;29;8;7;14;2;22;1;3;19;13;0;3;7;3;0;1;16;5;1;0;21;15;0;0;8;13;0;0;15;0;0;1; a6114;0;1;0;0;65;1;0;36;0;35;0;0;0;21;14;5;1;38;0;26;0;0;3;0;38;23;0;24;0;30;0;6;57;14;14;58;3;65;1;3;45;38;1;2;23;24;1;0;44;13;1;1;26;54;3;1;30;25;0;0;32;0;1;0; a6115;0;2;1;0;60;28;2;28;0;36;0;1;0;28;10;5;2;45;0;32;0;0;5;0;38;27;0;25;0;33;4;1;65;12;15;48;3;79;4;3;57;48;0;5;15;26;1;0;46;9;2;0;36;67;1;0;30;40;0;0;27;0;0;1; a27140;0;0;0;0;28;12;0;16;0;8;0;0;0;10;9;6;0;7;0;12;1;0;0;0;17;14;0;11;0;14;0;4;33;2;3;24;1;35;1;0;16;26;0;3;14;2;0;0;16;6;0;0;16;41;0;0;5;17;0;0;24;1;0;0; aseca;0;2;1;0;50;34;0;48;0;19;0;0;0;13;12;7;1;28;1;36;0;0;6;0;51;20;0;25;0;40;1;13;64;3;11;84;2;62;1;2;39;50;0;2;29;8;0;0;29;6;0;0;17;58;0;1;25;25;0;0;38;0;0;1; a4213;0;0;0;0;43;25;1;37;0;34;0;2;1;37;13;6;0;30;0;33;0;0;2;0;34;10;0;17;1;24;0;2;82;0;2;61;0;65;2;2;39;49;0;5;18;10;0;0;46;9;0;0;29;49;0;0;19;51;0;0;47;0;1;0;

  • roa;

Gène;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; a1653;0;1;3;1;50;31;2;10;0;38;0;0;0;15;10;7;2;14;2;7;0;2;4;3;5;12;1;10;2;14;9;12;33;15;7;10;2;21;8;2;44;41;0;4;25;10;2;0;17;6;2;0;30;36;3;2;12;15;2;0;24;0;0;1; a1653m;0;5;0;0;42;24;2;7;0;34;0;0;0;9;3;5;2;17;0;4;0;1;2;1;8;7;1;8;0;13;6;5;26;14;4;8;3;14;5;2;33;26;0;2;17;7;3;0;13;10;2;0;37;31;2;2;14;13;1;0;28;0;0;1; a1653n;0;6;2;0;36;28;1;6;2;34;0;0;4;13;7;10;2;10;0;4;0;0;2;1;9;13;1;3;0;11;11;8;19;10;4;12;1;17;9;1;41;38;0;1;15;4;0;0;16;10;4;2;17;40;0;1;13;19;0;0;22;0;0;1; a2777A;0;6;2;0;50;54;1;61;0;37;0;1;1;32;23;7;3;31;1;35;0;8;5;2;29;22;3;24;1;29;10;24;58;13;18;57;10;81;2;2;56;57;0;10;34;15;0;0;32;21;2;1;32;47;1;1;15;34;4;1;72;0;0;1; a27771;0;4;0;0;60;38;2;33;0;28;0;0;1;23;10;12;0;24;1;20;0;1;4;3;28;22;0;18;0;31;1;13;33;19;16;57;5;60;4;2;50;53;0;0;15;7;0;1;21;11;1;2;26;42;0;2;23;31;2;0;27;0;1;0; a27761;0;6;3;0;54;36;2;51;0;36;3;0;2;30;20;12;0;23;0;40;1;3;28;1;44;6;0;20;1;39;10;35;59;3;14;83;8;82;9;6;33;41;0;6;30;9;0;2;39;18;10;1;31;60;2;0;20;46;7;0;64;0;1;0; a27762;0;3;2;0;72;45;0;71;0;37;1;0;3;24;20;10;1;33;1;42;0;2;42;0;52;7;0;21;0;58;5;51;47;1;19;83;11;76;10;14;34;62;3;9;30;10;0;1;37;20;10;0;35;66;3;0;21;41;2;0;70;0;1;0; a63551;0;0;0;0;31;17;0;18;0;15;0;0;2;22;14;8;0;15;1;13;2;2;4;2;21;14;0;6;0;12;3;13;35;7;4;36;2;30;2;2;30;37;2;6;8;0;1;2;26;7;1;0;26;29;3;2;13;26;0;0;31;0;0;1; a63552;0;0;0;0;12;19;0;10;0;16;1;0;0;3;8;11;0;8;0;10;0;0;0;0;17;5;0;10;0;13;7;12;22;9;3;18;2;23;2;2;13;22;0;2;6;3;0;0;10;5;0;2;10;22;0;0;4;27;0;0;17;1;0;0; a6114;0;1;0;0;46;26;0;37;0;30;1;0;0;21;14;9;2;41;0;28;0;0;9;0;35;15;0;27;0;29;5;20;42;9;13;61;9;65;4;3;46;35;0;3;15;23;0;3;30;23;3;0;43;41;1;0;23;33;0;1;29;0;0;1; a6115;0;7;1;0;50;39;0;37;0;37;0;0;1;21;17;10;3;32;1;26;0;1;10;0;31;31;2;22;0;27;9;20;34;15;15;63;10;80;5;7;43;37;0;7;18;29;0;0;43;17;1;0;42;52;0;0;26;28;1;0;36;0;0;1; a27140;0;0;0;1;20;28;2;7;0;10;0;1;1;9;12;3;0;4;3;9;0;7;0;1;20;16;0;14;0;11;5;2;21;10;12;13;2;41;5;0;19;32;0;3;10;4;2;1;11;13;1;4;17;33;3;0;6;35;0;0;27;0;0;1; aseca;0;3;1;0;35;41;0;46;0;21;0;0;0;19;13;9;1;31;1;29;0;1;12;1;41;17;0;20;2;36;8;10;52;3;13;72;5;68;7;2;37;60;0;1;21;7;1;1;14;15;4;0;17;50;0;1;17;31;0;0;43;0;0;1; a4213;0;3;6;0;22;43;1;41;0;33;0;1;1;24;22;10;0;31;1;36;0;2;7;0;31;0;1;13;0;25;12;12;67;0;13;47;12;53;24;10;17;32;2;3;20;10;2;3;31;18;14;1;11;56;2;0;11;49;2;0;45;0;1;0;

  • saci;

Gène;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; a1653;2;14;6;0;34;37;4;16;3;47;0;1;1;18;9;13;8;24;4;13;0;4;4;1;7;10;13;19;3;12;3;12;37;22;7;19;8;19;11;10;36;38;0;4;23;14;6;2;21;10;11;1;24;36;1;2;17;19;12;0;35;0;0;1; a1653m;1;13;7;0;25;37;1;4;6;21;3;2;3;17;9;5;5;6;3;5;3;6;4;2;8;8;5;9;1;5;4;9;17;10;7;12;2;5;5;10;20;28;1;6;14;13;3;4;11;10;9;0;7;14;3;2;16;10;7;0;24;1;0;0; a1653n;0;16;16;3;25;29;1;6;3;23;1;3;2;11;6;7;8;12;2;14;1;5;0;1;5;8;4;3;2;9;4;8;15;12;6;5;1;7;8;11;19;37;1;1;22;6;0;7;10;10;6;0;15;25;2;2;16;12;4;0;25;1;0;0; a2777A;0;17;14;2;39;64;11;59;7;36;1;0;3;22;14;21;9;26;5;26;1;5;9;3;30;38;8;20;6;30;1;15;45;32;31;69;18;53;4;8;47;64;2;13;28;5;3;6;25;20;10;0;16;60;1;2;13;33;4;0;53;0;0;1; a27771;2;15;10;2;23;62;15;20;6;25;2;0;2;16;4;15;6;13;5;18;2;11;3;2;28;20;6;12;5;29;11;4;28;19;22;44;14;48;2;3;33;46;0;3;15;9;8;3;15;21;9;1;17;42;5;4;17;30;8;0;39;0;0;1; a27761;0;13;6;0;42;61;12;61;0;39;0;2;1;25;10;27;3;33;4;33;0;8;8;0;37;36;2;19;8;39;5;13;60;22;46;66;7;68;6;7;21;50;0;7;25;6;2;1;38;24;7;2;16;60;5;3;13;41;5;0;80;0;0;1; a27762;0;16;5;0;40;66;9;89;0;37;0;1;4;28;8;26;4;30;2;46;0;16;10;0;48;32;1;29;3;47;6;25;63;22;40;71;8;76;2;5;28;69;1;15;42;8;0;3;35;29;5;0;26;75;1;1;23;50;7;0;94;1;0;0; a63551;0;17;4;0;43;31;4;31;1;32;0;1;1;27;7;28;9;18;1;22;0;1;10;0;27;44;1;11;3;25;5;15;34;34;12;82;6;51;2;1;72;53;3;12;24;6;1;2;32;17;2;1;54;39;2;0;31;26;5;0;54;0;1;0; a63552;0;4;3;1;13;12;4;11;2;12;0;2;0;6;7;10;2;7;1;14;0;4;3;0;10;4;5;8;3;10;7;2;21;10;12;9;4;18;3;3;8;20;0;2;8;3;1;2;9;10;3;0;9;15;2;2;11;15;5;0;13;1;0;0; a6114;0;9;5;0;19;42;10;38;1;34;0;0;1;14;6;13;11;22;3;24;0;12;8;0;23;21;5;16;4;23;15;2;38;15;17;47;13;53;8;6;18;57;1;2;22;29;2;5;27;36;5;0;14;57;0;8;11;33;1;0;36;1;0;0; a6115;0;17;6;0;31;40;6;34;2;28;2;2;0;24;9;18;12;23;4;16;0;2;8;1;38;19;8;18;4;32;5;8;31;27;19;48;12;46;2;7;22;51;3;14;16;24;2;5;27;19;8;1;19;44;0;3;24;25;5;0;35;1;0;0; a27140;0;6;3;1;20;24;1;10;1;7;0;1;1;12;4;11;1;3;2;10;0;5;4;1;16;16;0;11;3;8;6;3;20;9;8;22;6;24;0;4;37;31;0;3;11;4;3;2;14;7;3;0;19;28;3;0;9;16;4;0;14;0;1;0; aseca;0;13;8;0;32;57;11;51;3;37;2;2;2;29;16;11;7;27;9;27;0;5;19;1;35;44;8;21;9;33;7;11;39;24;37;85;20;62;2;11;41;65;2;4;34;19;1;5;21;17;10;3;18;36;3;0;21;30;7;0;53;1;0;0; a4213;0;8;9;0;28;46;4;35;4;26;5;3;1;27;9;13;12;19;4;31;1;2;6;1;23;18;6;9;8;19;8;9;57;17;24;35;18;38;4;5;35;46;1;4;19;9;0;6;25;26;8;0;26;47;4;1;20;37;8;0;32;0;0;1;

  • sma;

Gène;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; a1653;0;5;0;0;41;36;0;18;0;38;0;1;1;16;10;4;3;16;0;11;0;0;2;4;13;7;2;16;0;12;5;10;53;11;0;18;3;19;1;0;35;38;0;3;25;8;0;2;14;6;0;1;21;39;1;0;14;20;0;0;31;0;0;1; a1653m;0;1;0;0;44;28;0;13;1;32;0;2;1;9;9;3;1;15;0;6;0;1;0;1;11;10;0;8;2;12;3;1;24;14;5;14;1;13;1;1;41;37;1;0;14;8;1;1;19;6;0;2;23;29;0;1;14;17;1;0;30;0;0;1; a1653n;0;1;0;0;40;24;2;12;0;36;0;1;0;14;9;5;0;16;0;4;0;0;1;1;7;8;0;6;1;9;6;5;30;11;3;9;2;14;4;1;51;37;0;1;12;6;0;0;24;3;0;1;34;33;0;2;13;18;2;0;23;0;1;0; a2777A;0;1;1;0;54;52;0;75;0;44;0;1;0;25;22;10;4;37;2;31;1;0;6;1;32;20;0;28;1;42;4;12;84;5;4;74;2;83;1;0;42;57;0;9;40;14;0;0;31;25;0;0;32;50;0;1;20;36;1;0;62;0;0;1; a27771;0;3;1;0;67;24;0;36;0;35;0;1;0;18;17;3;2;15;0;22;0;0;5;1;39;17;0;18;0;29;4;8;49;10;6;75;3;55;2;2;86;43;0;0;22;9;0;0;25;8;0;1;26;37;0;1;38;19;0;0;25;0;1;0; a27761;0;1;7;0;53;40;0;53;1;38;2;0;1;24;31;8;1;25;1;39;0;2;18;0;51;9;0;19;1;38;5;29;63;3;4;98;0;88;1;7;31;45;0;4;28;10;0;2;47;15;6;1;23;75;3;0;19;46;1;0;64;0;0;1; a27762;0;0;1;0;75;45;0;76;0;39;0;0;0;23;28;6;0;31;0;39;0;1;40;1;58;10;0;20;0;49;2;43;55;0;6;101;1;81;0;2;48;58;2;10;29;9;0;0;39;18;6;0;36;66;1;0;21;49;1;0;73;1;0;0; a63551;0;0;0;0;50;41;0;41;0;35;0;0;0;19;35;5;0;27;0;25;0;0;5;2;43;13;1;18;0;26;6;11;81;5;6;87;1;63;0;0;54;69;0;9;19;3;0;1;39;20;1;1;27;68;0;0;27;44;0;0;74;0;1;0; a63552;0;0;0;0;12;12;0;10;0;14;0;0;0;3;10;4;0;11;1;10;0;0;4;1;19;4;0;12;0;12;1;1;34;4;2;20;0;21;2;1;13;26;0;2;10;2;0;0;10;12;1;3;16;23;0;0;7;20;0;0;10;1;0;0; a6114;0;0;0;0;75;1;0;36;0;34;1;0;0;14;17;7;1;33;1;28;0;1;7;0;44;11;0;21;0;28;3;14;51;5;3;73;2;63;4;3;34;75;1;3;18;24;0;1;37;21;1;3;21;57;2;0;17;35;0;0;31;0;0;1; a6115;0;0;1;0;52;47;1;35;0;41;0;0;0;18;28;9;2;29;0;24;0;1;9;0;49;9;0;26;1;34;1;11;54;4;8;80;0;61;3;1;51;52;0;11;13;32;1;0;42;16;1;2;28;54;1;3;35;38;0;0;28;1;0;0; a27140;0;0;0;0;26;10;1;25;0;12;0;0;0;9;11;4;1;4;0;15;0;1;3;0;17;9;0;10;0;12;0;5;35;2;1;33;0;32;1;0;19;28;1;4;15;1;0;0;13;10;0;0;24;35;1;0;14;11;0;0;21;0;0;1; aseca;0;0;0;0;43;38;0;55;0;25;0;1;0;9;23;4;4;26;0;28;0;0;12;0;42;13;1;19;0;43;2;9;59;5;9;96;4;68;1;0;32;48;0;2;26;7;0;1;17;8;3;0;17;51;0;0;21;22;0;0;45;0;0;1; a4213;0;0;1;0;31;37;0;39;0;32;0;0;0;16;26;7;0;30;0;38;0;2;4;0;35;3;0;13;0;29;0;9;74;1;1;58;0;56;0;2;33;55;0;4;16;9;0;0;40;14;0;0;22;58;0;0;15;52;0;0;43;1;0;0;

  • sgr;

Gène;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; a1653;0;0;0;0;54;22;0;19;0;38;0;1;0;12;13;3;3;14;0;11;0;0;0;3;17;6;0;18;0;13;6;7;58;6;0;18;0;23;0;0;31;44;0;3;26;9;0;0;16;6;1;0;12;47;1;1;10;23;2;0;34;0;0;1; a1653m;0;0;1;0;36;35;1;11;1;34;0;0;2;12;9;4;1;13;0;6;0;1;2;0;11;9;0;6;0;10;2;0;35;7;3;17;0;14;1;0;35;41;0;1;14;8;0;0;18;8;0;1;16;33;0;0;12;20;0;0;32;0;0;1; a1653n;0;0;2;0;44;27;0;11;0;38;0;0;1;16;9;6;0;15;1;5;0;0;0;0;9;9;0;5;0;9;3;2;40;10;1;12;0;16;3;1;45;45;0;1;12;5;0;0;21;4;0;0;22;42;1;2;12;20;2;0;25;0;1;0; a2777A;0;0;0;0;50;50;1;73;0;44;0;0;0;18;33;6;0;41;0;35;0;0;3;2;30;26;0;31;0;40;4;7;75;19;5;73;1;84;0;1;28;66;0;9;41;14;0;0;28;26;1;0;25;64;1;0;12;47;0;0;64;0;0;1; a27771;0;1;1;0;63;29;0;34;0;33;0;0;0;13;15;3;5;12;3;20;0;2;5;1;25;30;2;18;0;33;0;7;38;20;3;76;3;54;3;1;65;59;0;0;22;9;0;0;26;13;0;0;30;39;0;0;29;31;1;1;25;0;0;1; a27761;0;1;2;0;45;50;0;54;2;39;2;0;2;22;32;7;0;24;1;40;0;2;12;0;55;10;0;17;1;39;5;24;65;3;4;98;2;86;1;7;26;50;0;4;28;9;0;1;43;18;1;1;21;78;0;0;21;47;1;0;68;0;0;1; a27762;0;0;4;0;69;49;0;80;0;41;0;0;0;24;25;4;0;30;0;39;0;1;34;1;60;12;0;18;0;44;4;30;68;0;6;97;0;85;0;1;48;63;2;11;29;8;0;1;40;18;3;0;39;70;1;0;17;56;1;0;66;0;1;0; a63551;0;0;0;0;44;43;0;40;0;35;0;0;0;15;43;5;0;28;0;26;0;1;1;1;46;14;1;18;0;24;3;2;98;4;4;81;1;65;1;0;29;94;1;8;19;3;0;1;35;21;0;2;18;76;0;0;16;58;0;0;77;0;1;0; a63552;0;0;0;0;13;14;0;9;0;15;0;0;0;3;12;2;0;10;0;9;0;0;1;0;22;5;0;12;0;14;1;1;32;6;1;23;0;22;0;0;12;29;0;2;9;2;0;0;7;14;2;2;7;28;0;0;5;22;0;0;11;1;0;0; a6114;0;0;0;0;76;0;0;29;0;30;0;0;0;12;18;9;0;34;2;29;0;0;6;3;40;17;0;25;0;27;1;9;55;9;2;69;2;66;1;1;41;73;1;3;22;24;0;0;34;24;1;1;21;51;0;1;16;38;1;0;33;0;0;1; a6115;0;0;0;0;66;32;0;32;0;40;0;1;0;25;23;5;0;31;0;27;1;0;4;0;56;14;0;25;0;30;0;4;64;3;8;71;1;64;1;1;59;52;0;12;15;32;0;0;38;20;1;3;20;66;0;2;39;34;0;0;25;0;1;0; a27140;0;0;0;0;27;10;1;23;0;10;0;0;1;7;12;2;1;5;0;13;0;0;4;1;20;7;1;10;0;11;0;5;36;2;2;31;0;34;0;1;22;28;0;5;15;1;0;0;12;12;0;0;17;41;1;0;7;17;0;0;21;0;0;1; aseca;0;0;1;0;37;42;1;51;0;26;0;0;0;10;20;3;4;26;0;33;0;2;14;0;38;14;0;18;0;44;4;11;61;4;8;92;1;68;1;2;28;55;0;2;26;7;0;0;19;5;1;1;19;56;0;0;18;27;0;0;39;0;1;0; a4213;0;0;0;1;32;34;0;39;0;32;0;0;0;17;30;5;0;30;0;37;0;1;5;0;31;5;0;11;0;27;1;7;81;2;2;56;0;57;0;0;28;60;0;4;16;9;0;0;39;11;0;1;18;63;0;0;11;65;0;0;43;0;1;0;

  • sho;

Gène;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; a1653;0;1;0;0;54;30;0;16;0;39;0;0;0;10;16;8;1;15;0;10;0;0;0;2;25;5;0;17;0;12;2;8;65;3;1;20;0;22;1;0;33;47;0;3;24;9;0;0;16;9;0;0;15;42;0;0;18;19;0;0;30;0;0;1; a1653m;0;0;0;0;43;25;1;14;1;32;0;0;0;9;10;5;2;13;0;6;0;0;1;1;13;7;0;8;0;13;2;2;31;4;3;15;0;15;1;0;31;42;0;1;15;8;0;1;18;8;0;2;21;31;0;1;14;19;0;0;34;0;0;1; a1653n;0;1;0;0;54;13;0;13;0;38;0;1;0;12;10;5;0;15;0;5;0;1;1;0;12;6;0;6;1;10;2;3;40;6;2;9;0;18;1;0;56;40;0;2;13;6;1;0;22;4;1;1;30;32;0;2;9;19;0;0;26;0;0;1; a2777A;0;0;0;0;51;51;0;70;0;42;0;1;0;16;31;9;1;42;0;33;0;1;0;3;38;22;0;30;1;36;0;8;88;10;4;69;1;87;0;0;35;65;1;9;42;14;0;0;33;24;0;0;38;49;0;0;12;47;0;0;65;0;0;1; a27771;0;1;0;0;57;33;0;31;0;36;0;0;0;12;19;5;1;17;0;20;0;0;3;2;45;17;0;20;0;27;2;0;60;8;6;76;0;56;2;2;59;77;0;0;23;9;0;1;15;21;1;0;23;36;0;1;13;43;0;0;28;0;1;0; a27761;0;2;6;0;56;36;0;52;3;35;0;0;0;24;27;11;0;26;1;41;0;1;22;0;42;13;0;18;0;41;1;33;62;1;2;103;1;81;1;4;24;53;0;3;28;9;0;0;45;14;3;0;21;75;5;0;19;48;1;0;67;0;0;1; a27762;0;0;4;0;76;42;0;71;0;38;0;0;0;23;30;4;0;32;0;38;0;3;34;0;64;13;0;18;0;50;2;39;63;0;3;106;1;81;0;2;45;64;1;12;28;9;0;0;39;18;2;0;34;71;1;0;18;49;0;0;71;1;0;0; a63551;0;0;0;0;55;33;0;42;0;36;0;0;0;16;38;2;1;27;0;26;0;0;3;0;46;16;0;20;0;28;3;4;92;2;2;92;1;63;1;0;39;80;0;9;18;3;0;1;39;21;0;1;25;74;0;0;22;49;0;0;72;0;1;0; a63552;0;0;1;0;13;12;0;9;0;15;0;0;0;1;13;2;0;11;0;8;0;1;1;2;19;5;0;10;0;14;1;0;34;4;1;23;0;26;0;0;12;29;0;2;7;3;0;0;12;8;0;2;11;25;0;0;4;17;0;0;13;1;0;0; a6114;0;1;0;0;73;0;0;36;1;33;0;0;0;7;19;8;0;34;0;30;0;0;0;0;48;19;0;24;1;22;0;3;63;3;2;79;0;65;1;2;36;75;1;3;18;24;0;0;40;20;0;1;23;50;1;1;10;44;1;0;37;1;0;0; a6115;0;1;1;0;73;25;0;35;0;39;0;0;0;16;26;8;0;32;0;21;0;0;8;0;39;20;0;27;1;36;2;8;58;4;2;77;1;65;4;4;47;60;0;12;13;32;0;0;49;10;1;0;32;50;0;1;30;45;0;0;32;1;0;0; a27140;0;0;2;0;14;24;1;20;0;11;0;0;0;3;14;7;0;5;1;6;0;2;1;0;25;9;0;12;0;12;3;1;34;4;5;24;1;39;4;0;12;35;1;3;13;2;0;0;15;10;1;3;16;32;0;0;5;26;0;0;20;0;0;1; aseca;0;1;0;0;46;35;0;51;0;23;0;0;0;10;21;4;1;30;0;27;0;0;12;0;44;16;0;20;0;45;1;8;61;5;4;103;1;64;4;0;28;50;0;2;25;7;0;0;21;6;2;0;21;52;0;0;17;24;0;0;44;0;1;0; a4213;0;0;0;0;41;29;0;39;0;33;0;1;0;11;33;6;0;30;0;37;0;0;3;0;37;3;0;12;0;27;0;9;76;0;1;60;0;56;0;0;18;72;1;3;17;9;0;0;46;7;0;0;17;66;1;0;12;51;0;0;41;1;0;0;

  • sus;

Gène;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; a1653;0;3;2;0;35;30;5;16;5;47;1;1;1;8;16;12;6;17;6;11;0;1;1;0;13;0;5;12;4;5;5;4;53;1;8;5;12;6;1;2;26;38;1;4;27;14;2;1;6;16;4;0;29;24;2;0;4;22;5;3;36;0;0;1; a1653m;0;2;3;0;36;36;3;6;2;34;3;0;1;5;16;10;5;13;7;11;0;1;2;0;11;1;2;10;5;12;2;1;31;1;4;10;3;5;5;2;16;31;1;4;20;15;2;2;18;6;3;0;13;30;2;1;8;11;6;0;28;0;1;0; a1653n;0;2;4;0;27;28;1;13;3;36;2;0;2;3;12;10;6;15;2;9;0;2;1;0;10;1;1;6;0;11;3;2;33;2;4;8;5;9;3;6;22;44;0;2;18;6;0;1;9;13;4;2;15;16;4;1;2;14;6;0;25;0;1;0; a2777A;1;15;2;3;82;13;8;62;8;40;0;0;3;29;4;15;11;26;17;18;1;3;4;3;32;36;10;17;1;42;15;2;30;37;28;65;35;38;10;2;78;4;1;16;37;9;2;0;46;1;1;2;66;12;2;1;37;9;24;1;34;1;0;0; a27771;0;10;4;2;60;15;6;37;7;23;2;0;0;10;7;17;4;16;5;17;3;4;6;2;27;21;6;8;5;20;7;6;27;27;20;53;15;34;7;3;71;20;0;5;22;4;1;1;36;5;3;7;47;6;2;4;30;7;17;0;34;1;0;0; a27761;1;23;8;0;69;25;7;96;8;43;0;2;3;29;7;23;9;28;10;38;0;2;11;3;64;13;4;17;4;44;18;8;69;13;59;52;39;55;3;9;59;26;2;15;33;8;1;7;43;10;8;5;63;26;2;2;38;32;18;0;78;1;0;0; a27762;0;21;7;0;75;25;7;83;3;33;3;0;1;28;11;17;10;30;4;38;1;3;14;0;64;18;7;22;3;50;14;17;78;10;71;53;27;55;2;8;51;30;0;15;35;8;1;3;49;9;10;6;74;20;0;0;45;30;21;0;83;0;1;0; a63551;1;4;8;1;45;33;13;43;2;37;2;0;2;28;9;20;11;19;11;22;1;0;5;0;42;13;3;9;2;24;6;6;62;13;26;50;30;32;2;5;55;46;1;15;27;7;0;1;36;16;4;4;55;26;7;0;21;34;11;0;62;0;0;1; a63552;0;1;1;1;16;16;2;12;3;12;0;0;2;11;6;8;3;7;3;19;0;1;2;1;18;3;2;11;2;7;4;3;17;7;14;9;12;8;3;1;10;11;0;4;4;2;0;1;11;9;4;0;15;14;2;1;4;17;6;0;12;1;0;0; a6114;1;4;5;1;7;35;13;29;3;34;1;2;0;4;17;8;9;21;7;21;0;1;5;1;44;3;3;15;5;22;6;0;46;4;24;41;23;19;3;4;21;45;1;11;22;23;2;3;22;26;3;3;26;23;2;3;5;29;11;0;38;0;0;1; a6115;0;6;8;1;42;32;18;31;5;31;1;0;5;15;14;9;10;27;10;12;0;1;4;1;44;7;7;19;7;20;4;5;55;5;30;30;24;36;1;3;38;54;2;16;20;26;3;3;23;20;4;6;33;23;2;2;10;31;7;1;35;0;0;1; a27140;0;5;3;0;24;7;2;14;6;4;2;0;4;16;3;5;4;5;7;4;0;3;4;0;15;15;4;7;4;12;8;6;15;14;8;15;19;12;5;1;33;14;0;0;10;0;3;1;17;4;2;4;30;11;1;5;15;5;12;1;20;0;1;0; aseca;1;6;3;0;19;52;23;45;1;27;0;1;1;2;20;7;4;33;12;29;0;1;4;0;64;0;3;19;3;47;4;7;60;0;54;42;27;43;0;4;7;47;1;6;29;6;1;3;5;16;7;3;10;52;2;0;4;42;11;1;42;0;1;0; a4213;0;1;3;0;46;32;10;23;6;26;1;2;3;11;13;17;12;17;19;17;0;1;4;0;43;1;3;10;3;28;9;8;61;5;27;18;21;30;7;2;32;48;2;5;26;8;2;2;22;26;5;5;39;31;4;2;12;31;3;0;32;0;1;0;

par gène de protéine[modifier | modifier le wikicode]

  • a1653;

Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; age;0;2;1;0;59;36;1;20;1;50;0;0;1;15;14;18;3;23;0;14;0;0;0;0;19;9;0;17;1;17;2;10;52;5;1;19;3;19;1;2;43;52;0;4;27;14;0;0;16;10;0;0;48;18;1;0;16;21;2;0;33;0;0;1; amd;0;2;1;0;56;25;0;20;0;41;0;1;0;15;13;3;0;22;0;9;0;0;1;2;16;9;1;10;0;12;1;5;57;15;2;11;2;23;1;2;43;30;1;3;23;13;0;1;16;2;1;0;19;33;0;0;12;24;0;0;34;0;0;1; roa;0;1;3;1;50;31;2;10;0;38;0;0;0;15;10;7;2;14;2;7;0;2;4;3;5;12;1;10;2;14;9;12;33;15;7;10;2;21;8;2;44;41;0;4;25;10;2;0;17;6;2;0;30;36;3;2;12;15;2;0;24;0;0;1; saci;2;14;6;0;34;37;4;16;3;47;0;1;1;18;9;13;8;24;4;13;0;4;4;1;7;10;13;19;3;12;3;12;37;22;7;19;8;19;11;10;36;38;0;4;23;14;6;2;21;10;11;1;24;36;1;2;17;19;12;0;35;0;0;1; sma;0;5;0;0;41;36;0;18;0;38;0;1;1;16;10;4;3;16;0;11;0;0;2;4;13;7;2;16;0;12;5;10;53;11;0;18;3;19;1;0;35;38;0;3;25;8;0;2;14;6;0;1;21;39;1;0;14;20;0;0;31;0;0;1; sgr;0;0;0;0;54;22;0;19;0;38;0;1;0;12;13;3;3;14;0;11;0;0;0;3;17;6;0;18;0;13;6;7;58;6;0;18;0;23;0;0;31;44;0;3;26;9;0;0;16;6;1;0;12;47;1;1;10;23;2;0;34;0;0;1; sho;0;1;0;0;54;30;0;16;0;39;0;0;0;10;16;8;1;15;0;10;0;0;0;2;25;5;0;17;0;12;2;8;65;3;1;20;0;22;1;0;33;47;0;3;24;9;0;0;16;9;0;0;15;42;0;0;18;19;0;0;30;0;0;1; sus;0;3;2;0;35;30;5;16;5;47;1;1;1;8;16;12;6;17;6;11;0;1;1;0;13;0;5;12;4;5;5;4;53;1;8;5;12;6;1;2;26;38;1;4;27;14;2;1;6;16;4;0;29;24;2;0;4;22;5;3;36;0;0;1;

  • a1653m;

Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; age;0;1;3;0;77;27;0;1;0;20;0;0;2;7;7;9;0;3;0;5;0;0;0;1;16;17;1;9;1;12;3;2;27;17;1;19;1;6;0;2;42;31;0;3;18;4;1;0;19;6;0;0;47;3;0;0;11;13;1;0;10;0;0;1; amd;0;2;1;0;51;29;0;13;1;35;0;0;1;17;7;5;0;16;0;6;0;0;1;0;8;6;0;4;0;12;3;6;38;11;2;6;1;16;1;0;42;14;0;1;13;7;0;0;22;4;0;0;30;20;2;1;15;8;1;0;37;1;0;0; roa;0;5;0;0;42;24;2;7;0;34;0;0;0;9;3;5;2;17;0;4;0;1;2;1;8;7;1;8;0;13;6;5;26;14;4;8;3;14;5;2;33;26;0;2;17;7;3;0;13;10;2;0;37;31;2;2;14;13;1;0;28;0;0;1; saci;1;13;7;0;25;37;1;4;6;21;3;2;3;17;9;5;5;6;3;5;3;6;4;2;8;8;5;9;1;5;4;9;17;10;7;12;2;5;5;10;20;28;1;6;14;13;3;4;11;10;9;0;7;14;3;2;16;10;7;0;24;1;0;0; sma;0;1;0;0;44;28;0;13;1;32;0;2;1;9;9;3;1;15;0;6;0;1;0;1;11;10;0;8;2;12;3;1;24;14;5;14;1;13;1;1;41;37;1;0;14;8;1;1;19;6;0;2;23;29;0;1;14;17;1;0;30;0;0;1; sgr;0;0;1;0;36;35;1;11;1;34;0;0;2;12;9;4;1;13;0;6;0;1;2;0;11;9;0;6;0;10;2;0;35;7;3;17;0;14;1;0;35;41;0;1;14;8;0;0;18;8;0;1;16;33;0;0;12;20;0;0;32;0;0;1; sho;0;0;0;0;43;25;1;14;1;32;0;0;0;9;10;5;2;13;0;6;0;0;1;1;13;7;0;8;0;13;2;2;31;4;3;15;0;15;1;0;31;42;0;1;15;8;0;1;18;8;0;2;21;31;0;1;14;19;0;0;34;0;0;1; sus;0;2;3;0;36;36;3;6;2;34;3;0;1;5;16;10;5;13;7;11;0;1;2;0;11;1;2;10;5;12;2;1;31;1;4;10;3;5;5;2;16;31;1;4;20;15;2;2;18;6;3;0;13;30;2;1;8;11;6;0;28;0;1;0;

  • a1653n;

Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; age;0;1;0;0;46;32;0;9;0;31;0;0;1;11;15;10;1;18;0;7;0;0;2;0;17;4;0;4;0;7;2;4;36;2;0;19;1;9;1;3;27;51;0;2;18;5;0;0;8;15;0;0;32;19;0;0;8;23;0;0;18;0;0;1; amd;0;5;1;0;60;10;0;10;0;37;0;0;0;29;6;6;1;12;0;3;0;0;2;0;8;7;0;3;0;10;2;6;33;14;3;5;2;14;2;1;59;16;0;4;11;8;1;0;20;0;0;0;35;22;1;0;27;3;2;0;21;0;0;1; roa;0;6;2;0;36;28;1;6;2;34;0;0;4;13;7;10;2;10;0;4;0;0;2;1;9;13;1;3;0;11;11;8;19;10;4;12;1;17;9;1;41;38;0;1;15;4;0;0;16;10;4;2;17;40;0;1;13;19;0;0;22;0;0;1; saci;0;16;16;3;25;29;1;6;3;23;1;3;2;11;6;7;8;12;2;14;1;5;0;1;5;8;4;3;2;9;4;8;15;12;6;5;1;7;8;11;19;37;1;1;22;6;0;7;10;10;6;0;15;25;2;2;16;12;4;0;25;1;0;0; sma;0;1;0;0;40;24;2;12;0;36;0;1;0;14;9;5;0;16;0;4;0;0;1;1;7;8;0;6;1;9;6;5;30;11;3;9;2;14;4;1;51;37;0;1;12;6;0;0;24;3;0;1;34;33;0;2;13;18;2;0;23;0;1;0; sgr;0;0;2;0;44;27;0;11;0;38;0;0;1;16;9;6;0;15;1;5;0;0;0;0;9;9;0;5;0;9;3;2;40;10;1;12;0;16;3;1;45;45;0;1;12;5;0;0;21;4;0;0;22;42;1;2;12;20;2;0;25;0;1;0; sho;0;1;0;0;54;13;0;13;0;38;0;1;0;12;10;5;0;15;0;5;0;1;1;0;12;6;0;6;1;10;2;3;40;6;2;9;0;18;1;0;56;40;0;2;13;6;1;0;22;4;1;1;30;32;0;2;9;19;0;0;26;0;0;1; sus;0;2;4;0;27;28;1;13;3;36;2;0;2;3;12;10;6;15;2;9;0;2;1;0;10;1;1;6;0;11;3;2;33;2;4;8;5;9;3;6;22;44;0;2;18;6;0;1;9;13;4;2;15;16;4;1;2;14;6;0;25;0;1;0;

  • a2777A;

Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; age;0;0;1;0;57;56;1;97;1;51;0;0;2;15;15;20;0;33;1;30;0;1;2;2;49;13;1;26;1;40;2;7;73;19;4;98;7;62;0;0;39;59;0;10;36;8;0;1;28;25;0;0;55;31;0;0;22;29;1;0;59;0;0;1; amd;0;6;3;0;47;59;0;23;0;37;1;2;2;15;19;9;1;24;1;17;0;2;3;0;44;56;1;34;0;33;4;5;60;32;27;37;7;71;3;1;71;87;0;10;18;14;0;0;43;21;1;1;33;58;1;0;13;20;0;0;32;0;0;1; roa;0;6;2;0;50;54;1;61;0;37;0;1;1;32;23;7;3;31;1;35;0;8;5;2;29;22;3;24;1;29;10;24;58;13;18;57;10;81;2;2;56;57;0;10;34;15;0;0;32;21;2;1;32;47;1;1;15;34;4;1;72;0;0;1; saci;0;17;14;2;39;64;11;59;7;36;1;0;3;22;14;21;9;26;5;26;1;5;9;3;30;38;8;20;6;30;1;15;45;32;31;69;18;53;4;8;47;64;2;13;28;5;3;6;25;20;10;0;16;60;1;2;13;33;4;0;53;0;0;1; sma;0;1;1;0;54;52;0;75;0;44;0;1;0;25;22;10;4;37;2;31;1;0;6;1;32;20;0;28;1;42;4;12;84;5;4;74;2;83;1;0;42;57;0;9;40;14;0;0;31;25;0;0;32;50;0;1;20;36;1;0;62;0;0;1; sgr;0;0;0;0;50;50;1;73;0;44;0;0;0;18;33;6;0;41;0;35;0;0;3;2;30;26;0;31;0;40;4;7;75;19;5;73;1;84;0;1;28;66;0;9;41;14;0;0;28;26;1;0;25;64;1;0;12;47;0;0;64;0;0;1; sho;0;0;0;0;51;51;0;70;0;42;0;1;0;16;31;9;1;42;0;33;0;1;0;3;38;22;0;30;1;36;0;8;88;10;4;69;1;87;0;0;35;65;1;9;42;14;0;0;33;24;0;0;38;49;0;0;12;47;0;0;65;0;0;1; sus;1;15;2;3;82;13;8;62;8;40;0;0;3;29;4;15;11;26;17;18;1;3;4;3;32;36;10;17;1;42;15;2;30;37;28;65;35;38;10;2;78;4;1;16;37;9;2;0;46;1;1;2;66;12;2;1;37;9;24;1;34;1;0;0;

  • a27771;

Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; age;0;7;0;0;78;30;2;51;0;23;0;0;2;10;12;13;1;20;2;18;0;1;1;8;39;22;2;14;2;36;4;2;32;16;3;78;11;41;3;1;61;41;1;2;13;4;1;1;24;21;1;0;63;9;0;0;30;16;3;0;33;0;0;1; amd;0;1;3;0;74;30;1;33;0;33;0;0;0;26;10;8;1;21;0;17;0;1;1;0;44;14;0;19;0;34;0;5;46;13;15;64;3;55;2;0;61;41;1;0;17;6;0;0;26;5;0;0;19;41;0;0;21;36;1;0;33;0;0;1; roa;0;4;0;0;60;38;2;33;0;28;0;0;1;23;10;12;0;24;1;20;0;1;4;3;28;22;0;18;0;31;1;13;33;19;16;57;5;60;4;2;50;53;0;0;15;7;0;1;21;11;1;2;26;42;0;2;23;31;2;0;27;0;1;0; saci;2;15;10;2;23;62;15;20;6;25;2;0;2;16;4;15;6;13;5;18;2;11;3;2;28;20;6;12;5;29;11;4;28;19;22;44;14;48;2;3;33;46;0;3;15;9;8;3;15;21;9;1;17;42;5;4;17;30;8;0;39;0;0;1; sma;0;3;1;0;67;24;0;36;0;35;0;1;0;18;17;3;2;15;0;22;0;0;5;1;39;17;0;18;0;29;4;8;49;10;6;75;3;55;2;2;86;43;0;0;22;9;0;0;25;8;0;1;26;37;0;1;38;19;0;0;25;0;1;0; sgr;0;1;1;0;63;29;0;34;0;33;0;0;0;13;15;3;5;12;3;20;0;2;5;1;25;30;2;18;0;33;0;7;38;20;3;76;3;54;3;1;65;59;0;0;22;9;0;0;26;13;0;0;30;39;0;0;29;31;1;1;25;0;0;1; sho;0;1;0;0;57;33;0;31;0;36;0;0;0;12;19;5;1;17;0;20;0;0;3;2;45;17;0;20;0;27;2;0;60;8;6;76;0;56;2;2;59;77;0;0;23;9;0;1;15;21;1;0;23;36;0;1;13;43;0;0;28;0;1;0; sus;0;10;4;2;60;15;6;37;7;23;2;0;0;10;7;17;4;16;5;17;3;4;6;2;27;21;6;8;5;20;7;6;27;27;20;53;15;34;7;3;71;20;0;5;22;4;1;1;36;5;3;7;47;6;2;4;30;7;17;0;34;1;0;0;

  • a27761;

Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; age;0;1;1;0;59;72;0;106;0;54;3;0;1;19;31;18;0;38;0;51;0;1;9;0;73;8;1;19;0;48;5;17;79;8;5;119;12;85;0;5;28;59;0;7;24;6;0;1;35;24;2;0;62;53;1;0;29;37;1;0;93;0;1;0; amd;0;1;0;0;65;30;0;55;0;37;2;0;0;32;21;10;0;25;0;45;0;1;4;0;56;19;0;21;0;37;1;15;74;5;18;87;1;82;2;3;44;32;0;6;26;10;0;0;49;11;1;0;22;71;3;0;24;44;1;0;74;0;0;1; roa;0;6;3;0;54;36;2;51;0;36;3;0;2;30;20;12;0;23;0;40;1;3;28;1;44;6;0;20;1;39;10;35;59;3;14;83;8;82;9;6;33;41;0;6;30;9;0;2;39;18;10;1;31;60;2;0;20;46;7;0;64;0;1;0; saci;0;13;6;0;42;61;12;61;0;39;0;2;1;25;10;27;3;33;4;33;0;8;8;0;37;36;2;19;8;39;5;13;60;22;46;66;7;68;6;7;21;50;0;7;25;6;2;1;38;24;7;2;16;60;5;3;13;41;5;0;80;0;0;1; sma;0;1;7;0;53;40;0;53;1;38;2;0;1;24;31;8;1;25;1;39;0;2;18;0;51;9;0;19;1;38;5;29;63;3;4;98;0;88;1;7;31;45;0;4;28;10;0;2;47;15;6;1;23;75;3;0;19;46;1;0;64;0;0;1; sgr;0;1;2;0;45;50;0;54;2;39;2;0;2;22;32;7;0;24;1;40;0;2;12;0;55;10;0;17;1;39;5;24;65;3;4;98;2;86;1;7;26;50;0;4;28;9;0;1;43;18;1;1;21;78;0;0;21;47;1;0;68;0;0;1; sho;0;2;6;0;56;36;0;52;3;35;0;0;0;24;27;11;0;26;1;41;0;1;22;0;42;13;0;18;0;41;1;33;62;1;2;103;1;81;1;4;24;53;0;3;28;9;0;0;45;14;3;0;21;75;5;0;19;48;1;0;67;0;0;1; sus;1;23;8;0;69;25;7;96;8;43;0;2;3;29;7;23;9;28;10;38;0;2;11;3;64;13;4;17;4;44;18;8;69;13;59;52;39;55;3;9;59;26;2;15;33;8;1;7;43;10;8;5;63;26;2;2;38;32;18;0;78;1;0;0;

  • a27762;

Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; age;0;0;0;0;51;81;0;102;0;38;2;0;0;19;31;13;0;33;1;49;0;0;14;1;76;14;0;21;0;40;1;22;89;0;7;119;13;67;0;4;26;82;0;14;32;7;0;2;30;29;1;0;60;48;1;0;22;43;2;0;99;0;1;0; amd;0;0;0;1;83;40;0;74;1;34;0;0;0;33;12;3;0;32;0;44;0;1;14;0;58;34;0;22;0;45;0;30;73;6;4;88;1;88;1;3;59;59;1;10;28;11;0;0;58;5;2;0;40;60;0;0;29;44;1;0;71;0;0;1; roa;0;3;2;0;72;45;0;71;0;37;1;0;3;24;20;10;1;33;1;42;0;2;42;0;52;7;0;21;0;58;5;51;47;1;19;83;11;76;10;14;34;62;3;9;30;10;0;1;37;20;10;0;35;66;3;0;21;41;2;0;70;0;1;0; saci;0;16;5;0;40;66;9;89;0;37;0;1;4;28;8;26;4;30;2;46;0;16;10;0;48;32;1;29;3;47;6;25;63;22;40;71;8;76;2;5;28;69;1;15;42;8;0;3;35;29;5;0;26;75;1;1;23;50;7;0;94;1;0;0; sma;0;0;1;0;75;45;0;76;0;39;0;0;0;23;28;6;0;31;0;39;0;1;40;1;58;10;0;20;0;49;2;43;55;0;6;101;1;81;0;2;48;58;2;10;29;9;0;0;39;18;6;0;36;66;1;0;21;49;1;0;73;1;0;0; sgr;0;0;4;0;69;49;0;80;0;41;0;0;0;24;25;4;0;30;0;39;0;1;34;1;60;12;0;18;0;44;4;30;68;0;6;97;0;85;0;1;48;63;2;11;29;8;0;1;40;18;3;0;39;70;1;0;17;56;1;0;66;0;1;0; sho;0;0;4;0;76;42;0;71;0;38;0;0;0;23;30;4;0;32;0;38;0;3;34;0;64;13;0;18;0;50;2;39;63;0;3;106;1;81;0;2;45;64;1;12;28;9;0;0;39;18;2;0;34;71;1;0;18;49;0;0;71;1;0;0; sus;0;21;7;0;75;25;7;83;3;33;3;0;1;28;11;17;10;30;4;38;1;3;14;0;64;18;7;22;3;50;14;17;78;10;71;53;27;55;2;8;51;30;0;15;35;8;1;3;49;9;10;6;74;20;0;0;45;30;21;0;83;0;1;0;

  • a63551;

Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; age;0;1;0;0;66;25;0;52;0;34;1;1;0;18;20;16;0;34;1;21;0;1;4;2;45;26;0;17;0;37;4;7;58;10;4;89;9;46;1;0;57;47;0;9;25;2;0;1;36;22;1;0;79;21;0;0;38;24;3;0;60;0;1;0; amd;0;3;1;0;54;33;0;37;0;33;2;0;1;24;23;9;0;27;1;20;0;0;2;2;41;28;1;18;0;23;0;7;74;21;19;67;2;71;0;1;53;62;0;11;23;3;0;0;50;14;0;0;49;63;2;0;25;44;0;0;60;0;0;1; roa;0;0;0;0;31;17;0;18;0;15;0;0;2;22;14;8;0;15;1;13;2;2;4;2;21;14;0;6;0;12;3;13;35;7;4;36;2;30;2;2;30;37;2;6;8;0;1;2;26;7;1;0;26;29;3;2;13;26;0;0;31;0;0;1; saci;0;17;4;0;43;31;4;31;1;32;0;1;1;27;7;28;9;18;1;22;0;1;10;0;27;44;1;11;3;25;5;15;34;34;12;82;6;51;2;1;72;53;3;12;24;6;1;2;32;17;2;1;54;39;2;0;31;26;5;0;54;0;1;0; sma;0;0;0;0;50;41;0;41;0;35;0;0;0;19;35;5;0;27;0;25;0;0;5;2;43;13;1;18;0;26;6;11;81;5;6;87;1;63;0;0;54;69;0;9;19;3;0;1;39;20;1;1;27;68;0;0;27;44;0;0;74;0;1;0; sgr;0;0;0;0;44;43;0;40;0;35;0;0;0;15;43;5;0;28;0;26;0;1;1;1;46;14;1;18;0;24;3;2;98;4;4;81;1;65;1;0;29;94;1;8;19;3;0;1;35;21;0;2;18;76;0;0;16;58;0;0;77;0;1;0; sho;0;0;0;0;55;33;0;42;0;36;0;0;0;16;38;2;1;27;0;26;0;0;3;0;46;16;0;20;0;28;3;4;92;2;2;92;1;63;1;0;39;80;0;9;18;3;0;1;39;21;0;1;25;74;0;0;22;49;0;0;72;0;1;0; sus;1;4;8;1;45;33;13;43;2;37;2;0;2;28;9;20;11;19;11;22;1;0;5;0;42;13;3;9;2;24;6;6;62;13;26;50;30;32;2;5;55;46;1;15;27;7;0;1;36;16;4;4;55;26;7;0;21;34;11;0;62;0;0;1;

  • a63552;

Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; age;0;3;0;0;10;16;0;17;0;12;0;1;0;5;8;5;1;9;0;11;0;0;2;0;12;7;2;11;0;11;3;5;28;6;2;19;6;12;2;2;11;26;0;2;10;1;0;1;9;11;1;0;29;9;0;0;8;14;1;0;11;0;1;0; amd;0;3;0;0;19;7;0;8;0;13;1;1;0;11;7;5;2;7;0;11;0;1;0;0;16;10;0;9;0;14;0;2;29;8;7;14;2;22;1;3;19;13;0;3;7;3;0;1;16;5;1;0;21;15;0;0;8;13;0;0;15;0;0;1; roa;0;0;0;0;12;19;0;10;0;16;1;0;0;3;8;11;0;8;0;10;0;0;0;0;17;5;0;10;0;13;7;12;22;9;3;18;2;23;2;2;13;22;0;2;6;3;0;0;10;5;0;2;10;22;0;0;4;27;0;0;17;1;0;0; saci;0;4;3;1;13;12;4;11;2;12;0;2;0;6;7;10;2;7;1;14;0;4;3;0;10;4;5;8;3;10;7;2;21;10;12;9;4;18;3;3;8;20;0;2;8;3;1;2;9;10;3;0;9;15;2;2;11;15;5;0;13;1;0;0; sma;0;0;0;0;12;12;0;10;0;14;0;0;0;3;10;4;0;11;1;10;0;0;4;1;19;4;0;12;0;12;1;1;34;4;2;20;0;21;2;1;13;26;0;2;10;2;0;0;10;12;1;3;16;23;0;0;7;20;0;0;10;1;0;0; sgr;0;0;0;0;13;14;0;9;0;15;0;0;0;3;12;2;0;10;0;9;0;0;1;0;22;5;0;12;0;14;1;1;32;6;1;23;0;22;0;0;12;29;0;2;9;2;0;0;7;14;2;2;7;28;0;0;5;22;0;0;11;1;0;0; sho;0;0;1;0;13;12;0;9;0;15;0;0;0;1;13;2;0;11;0;8;0;1;1;2;19;5;0;10;0;14;1;0;34;4;1;23;0;26;0;0;12;29;0;2;7;3;0;0;12;8;0;2;11;25;0;0;4;17;0;0;13;1;0;0; sus;0;1;1;1;16;16;2;12;3;12;0;0;2;11;6;8;3;7;3;19;0;1;2;1;18;3;2;11;2;7;4;3;17;7;14;9;12;8;3;1;10;11;0;4;4;2;0;1;11;9;4;0;15;14;2;1;4;17;6;0;12;1;0;0;

  • a6114;

Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; age;0;0;0;0;28;48;0;39;0;34;2;0;0;16;11;10;3;22;2;14;0;0;3;0;47;11;4;23;1;26;0;3;49;7;3;60;9;37;0;2;16;59;0;3;17;24;2;2;7;46;0;1;28;35;0;0;18;33;1;0;22;0;0;1; amd;0;1;0;0;65;1;0;36;0;35;0;0;0;21;14;5;1;38;0;26;0;0;3;0;38;23;0;24;0;30;0;6;57;14;14;58;3;65;1;3;45;38;1;2;23;24;1;0;44;13;1;1;26;54;3;1;30;25;0;0;32;0;1;0; roa;0;1;0;0;46;26;0;37;0;30;1;0;0;21;14;9;2;41;0;28;0;0;9;0;35;15;0;27;0;29;5;20;42;9;13;61;9;65;4;3;46;35;0;3;15;23;0;3;30;23;3;0;43;41;1;0;23;33;0;1;29;0;0;1; saci;0;9;5;0;19;42;10;38;1;34;0;0;1;14;6;13;11;22;3;24;0;12;8;0;23;21;5;16;4;23;15;2;38;15;17;47;13;53;8;6;18;57;1;2;22;29;2;5;27;36;5;0;14;57;0;8;11;33;1;0;36;1;0;0; sma;0;0;0;0;75;1;0;36;0;34;1;0;0;14;17;7;1;33;1;28;0;1;7;0;44;11;0;21;0;28;3;14;51;5;3;73;2;63;4;3;34;75;1;3;18;24;0;1;37;21;1;3;21;57;2;0;17;35;0;0;31;0;0;1; sgr;0;0;0;0;76;0;0;29;0;30;0;0;0;12;18;9;0;34;2;29;0;0;6;3;40;17;0;25;0;27;1;9;55;9;2;69;2;66;1;1;41;73;1;3;22;24;0;0;34;24;1;1;21;51;0;1;16;38;1;0;33;0;0;1; sho;0;1;0;0;73;0;0;36;1;33;0;0;0;7;19;8;0;34;0;30;0;0;0;0;48;19;0;24;1;22;0;3;63;3;2;79;0;65;1;2;36;75;1;3;18;24;0;0;40;20;0;1;23;50;1;1;10;44;1;0;37;1;0;0; sus;1;4;5;1;7;35;13;29;3;34;1;2;0;4;17;8;9;21;7;21;0;1;5;1;44;3;3;15;5;22;6;0;46;4;24;41;23;19;3;4;21;45;1;11;22;23;2;3;22;26;3;3;26;23;2;3;5;29;11;0;38;0;0;1;

  • a6115;

Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; age;0;3;0;0;72;18;0;64;0;31;0;0;1;15;10;22;0;41;1;19;0;1;0;1;32;26;2;18;0;28;4;5;44;12;4;76;3;52;2;0;72;24;0;19;12;20;0;0;28;21;0;0;66;16;0;1;32;12;2;0;32;0;0;1; amd;0;2;1;0;60;28;2;28;0;36;0;1;0;28;10;5;2;45;0;32;0;0;5;0;38;27;0;25;0;33;4;1;65;12;15;48;3;79;4;3;57;48;0;5;15;26;1;0;46;9;2;0;36;67;1;0;30;40;0;0;27;0;0;1; roa;0;7;1;0;50;39;0;37;0;37;0;0;1;21;17;10;3;32;1;26;0;1;10;0;31;31;2;22;0;27;9;20;34;15;15;63;10;80;5;7;43;37;0;7;18;29;0;0;43;17;1;0;42;52;0;0;26;28;1;0;36;0;0;1; saci;0;17;6;0;31;40;6;34;2;28;2;2;0;24;9;18;12;23;4;16;0;2;8;1;38;19;8;18;4;32;5;8;31;27;19;48;12;46;2;7;22;51;3;14;16;24;2;5;27;19;8;1;19;44;0;3;24;25;5;0;35;1;0;0; sma;0;0;1;0;52;47;1;35;0;41;0;0;0;18;28;9;2;29;0;24;0;1;9;0;49;9;0;26;1;34;1;11;54;4;8;80;0;61;3;1;51;52;0;11;13;32;1;0;42;16;1;2;28;54;1;3;35;38;0;0;28;1;0;0; sgr;0;0;0;0;66;32;0;32;0;40;0;1;0;25;23;5;0;31;0;27;1;0;4;0;56;14;0;25;0;30;0;4;64;3;8;71;1;64;1;1;59;52;0;12;15;32;0;0;38;20;1;3;20;66;0;2;39;34;0;0;25;0;1;0; sho;0;1;1;0;73;25;0;35;0;39;0;0;0;16;26;8;0;32;0;21;0;0;8;0;39;20;0;27;1;36;2;8;58;4;2;77;1;65;4;4;47;60;0;12;13;32;0;0;49;10;1;0;32;50;0;1;30;45;0;0;32;1;0;0; sus;0;6;8;1;42;32;18;31;5;31;1;0;5;15;14;9;10;27;10;12;0;1;4;1;44;7;7;19;7;20;4;5;55;5;30;30;24;36;1;3;38;54;2;16;20;26;3;3;23;20;4;6;33;23;2;2;10;31;7;1;35;0;0;1;

  • a27140;

Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; age;0;1;0;0;31;9;0;24;0;6;1;0;0;9;5;1;0;4;1;14;0;1;0;4;14;17;1;9;0;17;4;0;21;13;2;27;1;23;0;0;37;13;0;5;16;1;0;0;17;8;0;1;43;7;0;0;22;7;1;0;29;0;0;1; amd;0;0;0;0;28;12;0;16;0;8;0;0;0;10;9;6;0;7;0;12;1;0;0;0;17;14;0;11;0;14;0;4;33;2;3;24;1;35;1;0;16;26;0;3;14;2;0;0;16;6;0;0;16;41;0;0;5;17;0;0;24;1;0;0; roa;0;0;0;1;20;28;2;7;0;10;0;1;1;9;12;3;0;4;3;9;0;7;0;1;20;16;0;14;0;11;5;2;21;10;12;13;2;41;5;0;19;32;0;3;10;4;2;1;11;13;1;4;17;33;3;0;6;35;0;0;27;0;0;1; saci;0;6;3;1;20;24;1;10;1;7;0;1;1;12;4;11;1;3;2;10;0;5;4;1;16;16;0;11;3;8;6;3;20;9;8;22;6;24;0;4;37;31;0;3;11;4;3;2;14;7;3;0;19;28;3;0;9;16;4;0;14;0;1;0; sma;0;0;0;0;26;10;1;25;0;12;0;0;0;9;11;4;1;4;0;15;0;1;3;0;17;9;0;10;0;12;0;5;35;2;1;33;0;32;1;0;19;28;1;4;15;1;0;0;13;10;0;0;24;35;1;0;14;11;0;0;21;0;0;1; sgr;0;0;0;0;27;10;1;23;0;10;0;0;1;7;12;2;1;5;0;13;0;0;4;1;20;7;1;10;0;11;0;5;36;2;2;31;0;34;0;1;22;28;0;5;15;1;0;0;12;12;0;0;17;41;1;0;7;17;0;0;21;0;0;1; sho;0;0;2;0;14;24;1;20;0;11;0;0;0;3;14;7;0;5;1;6;0;2;1;0;25;9;0;12;0;12;3;1;34;4;5;24;1;39;4;0;12;35;1;3;13;2;0;0;15;10;1;3;16;32;0;0;5;26;0;0;20;0;0;1; sus;0;5;3;0;24;7;2;14;6;4;2;0;4;16;3;5;4;5;7;4;0;3;4;0;15;15;4;7;4;12;8;6;15;14;8;15;19;12;5;1;33;14;0;0;10;0;3;1;17;4;2;4;30;11;1;5;15;5;12;1;20;0;1;0;

  • aseca;

Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; age;0;0;0;0;46;31;1;56;0;25;0;1;0;12;16;10;0;34;3;29;0;0;9;1;55;14;0;20;0;53;1;8;55;9;5;84;6;52;1;1;23;56;0;6;28;7;0;1;17;11;0;1;39;23;1;0;20;28;1;0;48;0;1;0; amd;0;2;1;0;50;34;0;48;0;19;0;0;0;13;12;7;1;28;1;36;0;0;6;0;51;20;0;25;0;40;1;13;64;3;11;84;2;62;1;2;39;50;0;2;29;8;0;0;29;6;0;0;17;58;0;1;25;25;0;0;38;0;0;1; roa;0;3;1;0;35;41;0;46;0;21;0;0;0;19;13;9;1;31;1;29;0;1;12;1;41;17;0;20;2;36;8;10;52;3;13;72;5;68;7;2;37;60;0;1;21;7;1;1;14;15;4;0;17;50;0;1;17;31;0;0;43;0;0;1; saci;0;13;8;0;32;57;11;51;3;37;2;2;2;29;16;11;7;27;9;27;0;5;19;1;35;44;8;21;9;33;7;11;39;24;37;85;20;62;2;11;41;65;2;4;34;19;1;5;21;17;10;3;18;36;3;0;21;30;7;0;53;1;0;0; sma;0;0;0;0;43;38;0;55;0;25;0;1;0;9;23;4;4;26;0;28;0;0;12;0;42;13;1;19;0;43;2;9;59;5;9;96;4;68;1;0;32;48;0;2;26;7;0;1;17;8;3;0;17;51;0;0;21;22;0;0;45;0;0;1; sgr;0;0;1;0;37;42;1;51;0;26;0;0;0;10;20;3;4;26;0;33;0;2;14;0;38;14;0;18;0;44;4;11;61;4;8;92;1;68;1;2;28;55;0;2;26;7;0;0;19;5;1;1;19;56;0;0;18;27;0;0;39;0;1;0; sho;0;1;0;0;46;35;0;51;0;23;0;0;0;10;21;4;1;30;0;27;0;0;12;0;44;16;0;20;0;45;1;8;61;5;4;103;1;64;4;0;28;50;0;2;25;7;0;0;21;6;2;0;21;52;0;0;17;24;0;0;44;0;1;0; sus;1;6;3;0;19;52;23;45;1;27;0;1;1;2;20;7;4;33;12;29;0;1;4;0;64;0;3;19;3;47;4;7;60;0;54;42;27;43;0;4;7;47;1;6;29;6;1;3;5;16;7;3;10;52;2;0;4;42;11;1;42;0;1;0;

  • a4213;

Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; age;0;1;0;0;53;34;0;54;0;35;0;0;1;8;21;20;0;25;0;35;0;0;5;0;36;2;1;15;0;33;1;5;75;4;1;51;3;43;0;0;22;67;0;6;21;8;0;1;25;29;1;0;61;16;0;0;19;38;2;0;32;0;1;0; amd;0;0;0;0;43;25;1;37;0;34;0;2;1;37;13;6;0;30;0;33;0;0;2;0;34;10;0;17;1;24;0;2;82;0;2;61;0;65;2;2;39;49;0;5;18;10;0;0;46;9;0;0;29;49;0;0;19;51;0;0;47;0;1;0; roa;0;3;6;0;22;43;1;41;0;33;0;1;1;24;22;10;0;31;1;36;0;2;7;0;31;0;1;13;0;25;12;12;67;0;13;47;12;53;24;10;17;32;2;3;20;10;2;3;31;18;14;1;11;56;2;0;11;49;2;0;45;0;1;0; saci;0;8;9;0;28;46;4;35;4;26;5;3;1;27;9;13;12;19;4;31;1;2;6;1;23;18;6;9;8;19;8;9;57;17;24;35;18;38;4;5;35;46;1;4;19;9;0;6;25;26;8;0;26;47;4;1;20;37;8;0;32;0;0;1; sma;0;0;1;0;31;37;0;39;0;32;0;0;0;16;26;7;0;30;0;38;0;2;4;0;35;3;0;13;0;29;0;9;74;1;1;58;0;56;0;2;33;55;0;4;16;9;0;0;40;14;0;0;22;58;0;0;15;52;0;0;43;1;0;0; sgr;0;0;0;1;32;34;0;39;0;32;0;0;0;17;30;5;0;30;0;37;0;1;5;0;31;5;0;11;0;27;1;7;81;2;2;56;0;57;0;0;28;60;0;4;16;9;0;0;39;11;0;1;18;63;0;0;11;65;0;0;43;0;1;0; sho;0;0;0;0;41;29;0;39;0;33;0;1;0;11;33;6;0;30;0;37;0;0;3;0;37;3;0;12;0;27;0;9;76;0;1;60;0;56;0;0;18;72;1;3;17;9;0;0;46;7;0;0;17;66;1;0;12;51;0;0;41;1;0;0; sus;0;1;3;0;46;32;10;23;6;26;1;2;3;11;13;17;12;17;19;17;0;1;4;0;43;1;3;10;3;28;9;8;61;5;27;18;21;30;7;2;32;48;2;5;26;8;2;2;22;26;5;5;39;31;4;2;12;31;3;0;32;0;1;0;

acides aminés[modifier | modifier le wikicode]

par génome[modifier | modifier le wikicode]

  • age;

Gène;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; a1653;98;21;51;48;26;14;0;17;18;69;20;22;98;4;27;14;26;66;38;35;1; a1653m;108;1;20;25;3;5;0;10;13;49;20;7;75;3;18;4;26;50;24;11;1; a1653n;79;9;31;37;19;7;0;4;7;44;19;10;82;2;18;5;23;51;31;18;1; a2777A;114;98;52;52;33;31;0;27;41;101;102;69;98;10;36;8;54;86;51;60;1; a27771;115;53;23;37;21;20;0;16;38;54;81;52;106;3;13;4;47;73;46;36;1; a27761;133;106;54;72;38;51;0;20;48;109;124;97;92;7;24;6;60;117;67;94;1; a27762;132;102;38;65;33;50;0;21;40;112;126;80;112;14;32;7;61;109;66;101;1; a63551;92;52;34;56;34;22;0;17;37;79;93;55;105;9;25;2;59;101;62;63;1; a63552;29;17;12;19;10;11;0;13;11;42;21;18;41;2;10;1;21;39;22;12;1; a6114;76;39;34;39;25;16;0;27;27;59;63;46;77;3;17;24;57;64;51;23;1; a6115;93;64;31;48;41;20;0;20;28;65;80;55;98;19;12;20;49;82;45;34;1; a27140;41;24;6;16;4;15;0;10;17;38;29;24;50;5;16;1;25;51;29;30;1; aseca;77;57;25;39;34;32;0;20;53;73;89;58;81;6;28;7;29;63;49;49;1; a4213;88;54;35;50;25;35;0;16;33;85;52;46;89;6;21;8;55;78;57;34;1;

  • amd;

Gène;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; a1653;84;20;41;32;22;9;0;11;12;78;13;25;76;4;23;13;19;53;36;34;1; a1653m;83;13;36;30;16;6;0;4;12;58;8;17;57;1;13;7;26;50;26;38;1; a1653n;76;10;37;41;13;3;0;3;10;55;8;16;78;4;11;8;21;57;31;23;1; a2777A;115;23;37;48;25;18;0;35;33;101;64;78;162;10;18;14;64;93;34;32;1; a27771;108;34;33;44;22;17;0;19;34;64;79;58;104;1;17;6;31;60;57;34;1; a27761;96;55;37;65;25;45;0;21;37;95;105;83;81;6;26;10;60;94;71;75;1; a27762;124;74;35;48;32;44;0;22;45;109;92;89;122;11;28;11;63;102;73;72;1; a63551;91;37;33;59;27;21;0;19;23;102;86;73;116;11;23;3;64;112;71;60;1; a63552;29;8;13;25;9;11;0;9;14;39;21;24;36;3;7;3;22;37;21;15;1; a6114;67;36;35;40;39;26;0;24;30;77;72;68;87;3;23;24;58;82;59;32;1; a6115;91;30;36;44;47;32;0;25;33;82;63;82;112;5;15;26;56;105;71;27;1; a27140;40;16;8;25;7;12;0;11;14;39;27;36;43;3;14;2;22;57;22;24;1; aseca;87;48;19;32;29;37;0;25;40;81;95;64;92;2;29;8;35;75;51;38;1; a4213;68;38;34;59;30;33;0;17;25;84;63;65;92;5;18;10;55;78;70;47;1;

  • roa;

Gène;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; a1653;86;12;38;32;16;9;0;11;16;69;17;23;95;4;25;10;25;68;32;26;1; a1653m;71;9;34;17;19;4;0;9;13;51;12;17;66;2;17;7;26;70;31;29;1; a1653n;72;7;36;34;12;4;0;4;11;48;16;18;89;1;15;4;26;63;33;22;1; a2777A;112;62;37;64;34;36;0;27;30;105;75;91;117;10;34;15;53;82;51;77;1; a27771;102;35;28;46;24;21;0;18;31;66;73;65;109;0;15;7;33;71;56;29;1; a27761;99;53;36;67;23;40;0;20;40;107;97;90;89;6;30;9;59;102;68;71;1; a27762;122;71;37;58;34;43;0;21;58;104;102;87;120;12;30;10;58;111;65;72;1; a63551;48;18;15;46;15;14;0;6;12;58;40;32;71;8;8;0;36;56;44;31;1; a63552;31;10;16;23;8;10;0;10;13;50;21;25;39;2;6;3;15;34;31;17;1; a6114;73;37;30;45;43;28;0;27;29;76;74;74;88;3;15;23;56;87;57;30;1; a6115;97;37;37;49;35;27;0;24;27;78;78;90;92;7;18;29;60;95;54;37;1; a27140;49;9;10;26;4;12;0;14;11;38;25;43;56;3;10;4;27;55;44;27;1; aseca;80;46;21;41;32;30;0;20;38;73;85;73;106;1;21;7;31;71;49;43;1; a4213;74;42;33;58;31;37;0;14;25;91;60;65;83;5;20;10;54;82;62;47;1;

  • saci;

Gène;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; a1653;93;20;50;42;32;17;0;32;15;74;26;27;95;4;23;14;39;72;39;47;1; a1653m;83;5;27;39;11;8;0;14;6;40;19;7;63;7;14;13;28;30;31;31;1; a1653n;89;7;26;30;20;16;0;7;11;39;11;8;75;2;22;6;27;46;32;29;1; a2777A;136;70;43;61;35;31;0;28;36;93;100;71;123;15;28;5;54;86;49;57;1; a27771;114;35;31;39;19;23;0;18;34;62;66;62;84;3;15;9;47;69;56;47;1; a27761;122;73;39;65;36;37;0;21;47;100;112;75;84;7;25;6;65;85;62;85;1; a27762;127;98;37;67;34;48;0;30;50;116;111;84;104;16;42;8;67;106;75;101;1; a63551;95;35;33;64;27;23;0;12;28;88;94;57;128;15;24;6;52;96;59;59;1; a63552;33;15;14;25;9;15;0;13;13;40;21;22;34;2;8;3;22;27;30;18;1; a6114;75;48;35;34;33;27;0;21;27;70;64;66;89;3;22;29;70;76;52;37;1; a6115;94;40;30;55;35;20;0;26;36;71;67;58;82;17;16;24;53;72;52;40;1; a27140;54;11;8;29;4;12;0;11;11;38;30;30;72;3;11;4;26;50;28;18;1; aseca;110;62;40;62;34;36;0;29;42;81;122;82;119;6;34;19;44;67;54;60;1; a4213;91;39;30;58;31;35;0;15;27;91;59;56;90;5;19;9;57;81;62;40;1;

  • sma;

Gène;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; a1653;82;18;38;32;19;11;0;18;12;79;18;22;74;3;25;8;22;61;35;31;1; a1653m;73;13;33;24;16;6;0;8;14;42;19;14;80;1;14;8;27;54;32;31;1; a1653n;65;14;36;29;16;4;0;6;10;52;12;16;93;1;12;6;27;68;33;25;1; a2777A;108;75;44;58;41;33;0;28;43;105;78;85;100;9;40;14;56;82;57;63;1; a27771;95;36;35;39;17;22;0;18;29;71;81;58;133;0;22;9;33;64;58;25;1; a27761;101;53;39;66;26;40;0;19;39;100;102;88;84;4;28;10;64;105;68;65;1; a27762;121;76;39;57;31;39;0;20;49;100;107;82;108;12;29;9;57;108;71;74;1; a63551;91;41;35;59;27;25;0;19;26;103;93;64;123;9;19;3;60;97;71;74;1; a63552;24;10;14;17;11;11;0;12;12;40;22;21;42;2;10;2;22;43;27;10;1; a6114;76;36;34;39;34;29;0;21;28;73;76;65;116;4;18;24;59;82;54;31;1; a6115;100;36;41;55;31;24;0;26;35;70;88;61;107;11;13;32;59;85;77;28;1; a27140;36;26;12;24;5;15;0;10;12;42;34;32;48;5;15;1;23;59;26;21;1; aseca;81;55;25;37;30;28;0;20;43;75;105;72;81;2;26;7;26;71;43;45;1; a4213;69;39;32;49;30;38;0;13;29;84;59;56;90;4;16;9;54;80;67;43;1;

  • sgr;

Gène;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; a1653;76;19;38;29;17;11;0;18;13;77;18;23;75;3;26;9;22;60;35;36;1; a1653m;72;12;35;27;14;6;0;6;10;44;20;14;77;1;14;8;26;50;32;32;1; a1653n;73;11;38;32;15;6;0;5;9;55;13;16;94;1;12;5;25;64;35;27;1; a2777A;100;74;44;57;41;35;0;31;40;105;78;85;95;9;41;14;54;90;60;64;1; a27771;94;34;33;31;17;23;0;20;33;65;79;57;128;0;22;9;39;69;60;27;1; a27761;98;54;41;65;24;41;0;17;40;97;102;88;84;4;28;9;62;101;68;69;1; a27762;122;80;41;53;30;39;0;18;44;102;103;85;112;13;29;8;59;112;74;67;1; a63551;87;40;35;63;28;26;0;19;24;107;85;66;124;9;19;3;57;96;74;77;1; a63552;27;9;15;17;10;9;0;12;14;40;24;22;41;2;9;2;21;39;27;11;1; a6114;76;29;30;39;34;31;0;25;27;74;71;68;116;4;22;24;58;74;55;34;1; a6115;98;32;40;54;31;27;0;25;30;71;79;65;113;12;15;32;58;90;75;25;1; a27140;37;24;10;22;6;13;0;11;11;43;33;34;51;5;15;1;24;58;25;21;1; aseca;80;52;26;33;30;33;0;18;44;80;100;69;86;2;26;7;24;77;45;39;1; a4213;67;39;32;52;30;37;0;11;27;91;58;57;88;4;16;9;50;82;76;43;1;

  • sho;

Gène;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; a1653;85;16;39;34;16;10;0;17;12;78;21;22;81;3;24;9;25;57;37;30;1; a1653m;68;15;33;24;15;6;0;8;13;39;18;15;74;1;15;8;27;54;34;34;1; a1653n;68;13;38;28;15;5;0;6;11;51;11;18;97;2;13;6;27;64;30;26;1; a2777A;102;70;42;57;43;33;0;30;37;106;73;88;100;10;42;14;57;87;59;65;1; a27771;91;31;36;36;18;20;0;20;27;70;82;56;140;0;23;9;37;60;57;28;1; a27761;100;52;38;62;26;42;0;18;41;97;105;82;82;3;28;9;59;99;72;68;1; a27762;122;71;38;57;32;38;0;18;50;104;109;82;111;13;28;9;57;107;68;71;1; a63551;88;42;36;56;28;26;0;20;28;101;94;64;120;9;18;3;61;100;71;72;1; a63552;26;9;15;16;11;8;0;10;14;39;24;26;41;2;7;3;20;38;21;13;1; a6114;74;36;34;34;34;30;0;24;23;69;81;65;114;4;18;24;60;74;56;38;1; a6115;100;35;39;50;32;21;0;27;37;72;79;66;115;12;13;32;59;83;76;32;1; a27140;40;21;11;24;5;7;0;12;12;42;29;40;51;4;13;2;25;52;31;20;1; aseca;82;51;23;35;31;27;0;20;45;75;107;65;82;2;25;7;27;75;41;44;1; a4213;70;39;33;51;30;37;0;12;27;85;61;56;90;4;17;9;53;83;64;41;1;

  • sus;

Gène;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; a1653;70;21;52;39;23;17;0;17;9;63;13;18;67;5;27;14;25;57;28;44;1; a1653m;77;9;36;35;18;18;0;12;17;35;14;8;54;5;20;15;28;46;22;34;1; a1653n;61;14;39;29;21;11;0;7;11;40;12;14;75;2;18;6;23;37;21;31;1; a2777A;116;70;48;51;37;35;0;27;43;84;93;73;94;17;37;9;49;81;49;59;1; a27771;91;43;30;36;20;22;0;14;25;67;73;49;101;5;22;4;43;63;43;51;1; a27761;126;103;51;64;37;48;0;21;48;108;111;94;97;17;33;8;61;102;74;96;1; a27762;128;90;36;60;40;42;0;29;53;119;124;82;91;15;35;8;62;110;75;104;1; a63551;92;56;39;61;30;33;0;12;26;87;76;62;108;16;27;7;53;89;62;73;1; a63552;35;14;15;27;10;22;0;13;9;31;23;20;25;4;4;2;21;33;24;18;1; a6114;53;42;37;32;30;28;0;18;27;56;65;42;73;12;22;23;53;55;39;49;1; a6115;89;49;36;44;37;22;0;26;27;69;60;60;96;18;20;26;49;66;45;43;1; a27140;39;16;10;30;9;11;0;11;16;43;23;31;53;0;10;0;25;47;26;33;1; aseca;81;68;28;31;37;41;0;22;50;71;96;70;58;7;29;6;25;72;48;54;1; a4213;82;33;32;47;29;36;0;13;31;83;45;51;89;7;26;8;52;80;49;35;1;

par gène de protéine[modifier | modifier le wikicode]

  • a1653;

Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;98;21;51;48;26;14;28;17;18;69;20;22;98;4;27;14;26;66;38;35;1; amd;84;20;41;32;22;9;28;11;12;78;13;25;76;4;23;13;19;53;36;34;1; roa;86;12;38;32;16;9;26;11;16;69;17;23;95;4;25;10;25;68;32;26;1; saci;93;20;50;42;32;17;26;32;15;74;26;27;95;4;23;14;39;72;39;47;1; sma;82;18;38;32;19;11;26;18;12;79;18;22;74;3;25;8;22;61;35;31;1; sgr;76;19;38;29;17;11;26;18;13;77;18;23;75;3;26;9;22;60;35;36;1; sho;85;16;39;34;16;10;32;17;12;78;21;22;81;3;24;9;25;57;37;30;1; sus;70;21;52;39;23;17;15;17;9;63;13;18;67;5;27;14;25;57;28;44;1;

  • a1653m;

Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;108;1;20;25;3;5;34;10;13;49;20;7;75;3;18;4;26;50;24;11;1; amd;83;13;36;30;16;6;15;4;12;58;8;17;57;1;13;7;26;50;26;38;1; roa;71;9;34;17;19;4;19;9;13;51;12;17;66;2;17;7;26;70;31;29;1; saci;83;5;27;39;11;8;31;14;6;40;19;7;63;7;14;13;28;30;31;31;1; sma;73;13;33;24;16;6;23;8;14;42;19;14;80;1;14;8;27;54;32;31;1; sgr;72;12;35;27;14;6;23;6;10;44;20;14;77;1;14;8;26;50;32;32;1; sho;68;15;33;24;15;6;22;8;13;39;18;15;74;1;15;8;27;54;34;34;1; sus;77;9;36;35;18;18;15;12;17;35;14;8;54;5;20;15;28;46;22;34;1;

  • a1653n;

Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;79;9;31;37;19;7;23;4;7;44;19;10;82;2;18;5;23;51;31;18;1; amd;76;10;37;41;13;3;17;3;10;55;8;16;78;4;11;8;21;57;31;23;1; roa;72;7;36;34;12;4;25;4;11;48;16;18;89;1;15;4;26;63;33;22;1; saci;89;7;26;30;20;16;20;7;11;39;11;8;75;2;22;6;27;46;32;29;1; sma;65;14;36;29;16;4;17;6;10;52;12;16;93;1;12;6;27;68;33;25;1; sgr;73;11;38;32;15;6;18;5;9;55;13;16;94;1;12;5;25;64;35;27;1; sho;68;13;38;28;15;5;20;6;11;51;11;18;97;2;13;6;27;64;30;26;1; sus;61;14;39;29;21;11;14;7;11;40;12;14;75;2;18;6;23;37;21;31;1;

  • a2777A;

Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;114;98;52;52;33;31;67;27;41;101;102;69;98;10;36;8;54;86;51;60;1; amd;115;23;37;48;25;18;105;35;33;101;64;78;162;10;18;14;64;93;34;32;1; roa;112;62;37;64;34;36;66;27;30;105;75;91;117;10;34;15;53;82;51;77;1; saci;136;70;43;61;35;31;86;28;36;93;100;71;123;15;28;5;54;86;49;57;1; sma;108;75;44;58;41;33;60;28;43;105;78;85;100;9;40;14;56;82;57;63;1; sgr;100;74;44;57;41;35;61;31;40;105;78;85;95;9;41;14;54;90;60;64;1; sho;102;70;42;57;43;33;64;30;37;106;73;88;100;10;42;14;57;87;59;65;1; sus;116;70;48;51;37;35;79;27;43;84;93;73;94;17;37;9;49;81;49;59;1;

  • a27771;

Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;115;53;23;37;21;20;71;16;38;54;81;52;106;3;13;4;47;73;46;36;1; amd;108;34;33;44;22;17;60;19;34;64;79;58;104;1;17;6;31;60;57;34;1; roa;102;35;28;46;24;21;58;18;31;66;73;65;109;0;15;7;33;71;56;29;1; saci;114;35;31;39;19;23;66;18;34;62;66;62;84;3;15;9;47;69;56;47;1; sma;95;36;35;39;17;22;62;18;29;71;81;58;133;0;22;9;33;64;58;25;1; sgr;94;34;33;31;17;23;63;20;33;65;79;57;128;0;22;9;39;69;60;27;1; sho;91;31;36;36;18;20;67;20;27;70;82;56;140;0;23;9;37;60;57;28;1; sus;91;43;30;36;20;22;63;14;25;67;73;49;101;5;22;4;43;63;43;51;1;

  • a27761;

Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;133;106;54;72;38;51;91;20;48;109;124;97;92;7;24;6;60;117;67;94;1; amd;96;55;37;65;25;45;80;21;37;95;105;83;81;6;26;10;60;94;71;75;1; roa;99;53;36;67;23;40;83;20;40;107;97;90;89;6;30;9;59;102;68;71;1; saci;122;73;39;65;36;37;89;21;47;100;112;75;84;7;25;6;65;85;62;85;1; sma;101;53;39;66;26;40;80;19;39;100;102;88;84;4;28;10;64;105;68;65;1; sgr;98;54;41;65;24;41;79;17;40;97;102;88;84;4;28;9;62;101;68;69;1; sho;100;52;38;62;26;42;78;18;41;97;105;82;82;3;28;9;59;99;72;68;1; sus;126;103;51;64;37;48;93;21;48;108;111;94;97;17;33;8;61;102;74;96;1;

  • a27762;

Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;132;102;38;65;33;50;105;21;40;112;126;80;112;14;32;7;61;109;66;101;1; amd;124;74;35;48;32;44;107;22;45;109;92;89;122;11;28;11;63;102;73;72;1; roa;122;71;37;58;34;43;103;21;58;104;102;87;120;12;30;10;58;111;65;72;1; saci;127;98;37;67;34;48;106;30;50;116;111;84;104;16;42;8;67;106;75;101;1; sma;121;76;39;57;31;39;110;20;49;100;107;82;108;12;29;9;57;108;71;74;1; sgr;122;80;41;53;30;39;108;18;44;102;103;85;112;13;29;8;59;112;74;67;1; sho;122;71;38;57;32;38;114;18;50;104;109;82;111;13;28;9;57;107;68;71;1; sus;128;90;36;60;40;42;100;29;53;119;124;82;91;15;35;8;62;110;75;104;1;

  • a63551;

Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;92;52;34;56;34;22;78;17;37;79;93;55;105;9;25;2;59;101;62;63;1; amd;91;37;33;59;27;21;73;19;23;102;86;73;116;11;23;3;64;112;71;60;1; roa;48;18;15;46;15;14;45;6;12;58;40;32;71;8;8;0;36;56;44;31;1; saci;95;35;33;64;27;23;82;12;28;88;94;57;128;15;24;6;52;96;59;59;1; sma;91;41;35;59;27;25;63;19;26;103;93;64;123;9;19;3;60;97;71;74;1; sgr;87;40;35;63;28;26;63;19;24;107;85;66;124;9;19;3;57;96;74;77;1; sho;88;42;36;56;28;26;65;20;28;101;94;64;120;9;18;3;61;100;71;72;1; sus;92;56;39;61;30;33;61;12;26;87;76;62;108;16;27;7;53;89;62;73;1;

  • a63552;

Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;29;17;12;19;10;11;21;13;11;42;21;18;41;2;10;1;21;39;22;12;1; amd;29;8;13;25;9;11;27;9;14;39;21;24;36;3;7;3;22;37;21;15;1; roa;31;10;16;23;8;10;22;10;13;50;21;25;39;2;6;3;15;34;31;17;1; saci;33;15;14;25;9;15;21;13;13;40;21;22;34;2;8;3;22;27;30;18;1; sma;24;10;14;17;11;11;28;12;12;40;22;21;42;2;10;2;22;43;27;10;1; sgr;27;9;15;17;10;9;28;12;14;40;24;22;41;2;9;2;21;39;27;11;1; sho;26;9;15;16;11;8;28;10;14;39;24;26;41;2;7;3;20;38;21;13;1; sus;35;14;15;27;10;22;25;13;9;31;23;20;25;4;4;2;21;33;24;18;1;

  • a6114;

Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;76;39;34;39;25;16;61;27;27;59;63;46;77;3;17;24;57;64;51;23;1; amd;67;36;35;40;39;26;64;24;30;77;72;68;87;3;23;24;58;82;59;32;1; roa;73;37;30;45;43;28;59;27;29;76;74;74;88;3;15;23;56;87;57;30;1; saci;75;48;35;34;33;27;64;21;27;70;64;66;89;3;22;29;70;76;52;37;1; sma;76;36;34;39;34;29;63;21;28;73;76;65;116;4;18;24;59;82;54;31;1; sgr;76;29;30;39;34;31;66;25;27;74;71;68;116;4;22;24;58;74;55;34;1; sho;74;36;34;34;34;30;67;24;23;69;81;65;114;4;18;24;60;74;56;38;1; sus;53;42;37;32;30;28;54;18;27;56;65;42;73;12;22;23;53;55;39;49;1;

  • a6115;

Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;93;64;31;48;41;20;60;20;28;65;80;55;98;19;12;20;49;82;45;34;1; amd;91;30;36;44;47;32;70;25;33;82;63;82;112;5;15;26;56;105;71;27;1; roa;97;37;37;49;35;27;73;24;27;78;78;90;92;7;18;29;60;95;54;37;1; saci;94;40;30;55;35;20;68;26;36;71;67;58;82;17;16;24;53;72;52;40;1; sma;100;36;41;55;31;24;68;26;35;70;88;61;107;11;13;32;59;85;77;28;1; sgr;98;32;40;54;31;27;75;25;30;71;79;65;113;12;15;32;58;90;75;25;1; sho;100;35;39;50;32;21;67;27;37;72;79;66;115;12;13;32;59;83;76;32;1; sus;89;49;36;44;37;22;57;26;27;69;60;60;96;18;20;26;49;66;45;43;1;

  • a27140;

Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;41;24;6;16;4;15;36;10;17;38;29;24;50;5;16;1;25;51;29;30;1; amd;40;16;8;25;7;12;32;11;14;39;27;36;43;3;14;2;22;57;22;24;1; roa;49;9;10;26;4;12;44;14;11;38;25;43;56;3;10;4;27;55;44;27;1; saci;54;11;8;29;4;12;42;11;11;38;30;30;72;3;11;4;26;50;28;18;1; sma;36;26;12;24;5;15;30;10;12;42;34;32;48;5;15;1;23;59;26;21;1; sgr;37;24;10;22;6;13;32;11;11;43;33;34;51;5;15;1;24;58;25;21;1; sho;40;21;11;24;5;7;37;12;12;42;29;40;51;4;13;2;25;52;31;20;1; sus;39;16;10;30;9;11;37;11;16;43;23;31;53;0;10;0;25;47;26;33;1;

  • aseca;

Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;77;57;25;39;34;32;79;20;53;73;89;58;81;6;28;7;29;63;49;49;1; amd;87;48;19;32;29;37;77;25;40;81;95;64;92;2;29;8;35;75;51;38;1; roa;80;46;21;41;32;30;72;20;38;73;85;73;106;1;21;7;31;71;49;43;1; saci;110;62;40;62;34;36;104;29;42;81;122;82;119;6;34;19;44;67;54;60;1; sma;81;55;25;37;30;28;67;20;43;75;105;72;81;2;26;7;26;71;43;45;1; sgr;80;52;26;33;30;33;68;18;44;80;100;69;86;2;26;7;24;77;45;39;1; sho;82;51;23;35;31;27;72;20;45;75;107;65;82;2;25;7;27;75;41;44;1; sus;81;68;28;31;37;41;69;22;50;71;96;70;58;7;29;6;25;72;48;54;1;

  • a4213;

Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;88;54;35;50;25;35;43;16;33;85;52;46;89;6;21;8;55;78;57;34;1; amd;68;38;34;59;30;33;46;17;25;84;63;65;92;5;18;10;55;78;70;47;1; roa;74;42;33;58;31;37;40;14;25;91;60;65;83;5;20;10;54;82;62;47;1; saci;91;39;30;58;31;35;51;15;27;91;59;56;90;5;19;9;57;81;62;40;1; sma;69;39;32;49;30;38;44;13;29;84;59;56;90;4;16;9;54;80;67;43;1; sgr;67;39;32;52;30;37;42;11;27;91;58;57;88;4;16;9;50;82;76;43;1; sho;70;39;33;51;30;37;43;12;27;85;61;56;90;4;17;9;53;83;64;41;1; sus;82;33;32;47;29;36;49;13;31;83;45;51;89;7;26;8;52;80;49;35;1;