Recherche:Répétition des bases dans l'ADN des procaryotes/Annexe/Tableaux
Paris le 14.9.16
Aléas
[modifier | modifier le wikicode]Résultat
[modifier | modifier le wikicode]- %GC (dénominateur; numérateur) et effectif pour la courbe des aléas
Programme perl: repete-alea.pl
6;1;159,662 17;4;1,017,293 29;7;190,657 47;12;751,719 23;6;358,242 37;10;2,268,272 7;2;3,992,906 31;9;1,109,804 43;13;1,777,831 16;5;1,738,790 31;10;2,499,279 3;1;1,800,764 29;10;1,755,993 17;6;2,365,589 11;4;1,190,853 43;16;2,928,879 47;18;1,937,111 41;16;1,171,660 23;9;1,796,846 47;19;1,072,952 29;12;1,044,459 31;13;1,617,544 47;20;2,158,758 37;16;4,168,266 23;10;4,215,606 9;4;3,308,273 31;14;5,728,392 11;5;5,597,590 41;19;5,347,283 21;10;4,653,728 29;14;2,343,476 47;23;2,736,403 2;1;4,701,875 2;1;5,498,450 47;24;4,641,652 37;19;4,683,551 23;12;4,809,037 17;9;2,907,495 17;9;1,139,203 37;20;3,145,677 20;11;4,726,582 37;21;3,551,206 7;4;2,121,359 47;27;5,315,120 47;27;1,156,948 22;13;2,572,069 47;28;3,776,653 5;3;2,560,265 43;26;1,933,695 31;19;4,381,608 8;5;3,908,022 43;27;3,820,344 19;12;3,462,887 17;11;5,429,298 20;13;5,148,708 29;19;4,352,825 3;2;6,264,404 3;2;3,944,163 43;29;8,376,953 22;15;3,497,479 23;16;1,894,877 41;29;9,025,608 41;29;11,936,683 7;5;10,236,715 43;31;8,667,507 43;31;9,784,577 43;31;9,840,102 18;13;8,545,929 47;34;9,360,281 37;27;6,283,032 15;11;6,841,649 19;14;5,277,990 47;35;5,029,329 4;3;5,061,632 4;3;5,013,479
Synthèse des Tableaux des diagrammes
[modifier | modifier le wikicode]- r cernarcheota e euryarcheota c cyanobactérie b bactérie a aléa E notation nombre scientifique ^ exposant cte constante du polynôme
- >4AT Puissance
AT Puissance cren eury cyano bacter aléa cte 3.10 4.05 7.89 1.07 1.44 E -7 -8 -6 -8 -7 ^ 4.499 5.159 3.883 5.551 4.708 %AT >4AT r >4AT e >4AT c >4AT b >4AT a 30 1.4 1.7 4.3 1.7 1.3 32 1.8 2.4 5.5 2.4 1.8 35 2.7 3.7 7.8 4.0 2.7 37 3.5 5.0 9.7 5.4 3.5 40 5.0 7.5 13.1 8.3 5.0 42 6.2 9.6 15.9 10.9 6.3 45 8.5 13.7 20.7 16.0 8.8 47 10.3 17.1 24.6 20.4 10.7 50 13.7 23.6 31.2 28.8 14.4 52 16.3 28.9 36.4 35.8 17.3 55 21.0 38.5 45.2 48.9 22.5 57 24.6 46.3 51.9 59.6 26.6 60 31.0 60.4 63.4 79.2 33.9 62 35.9 71.5 72.0 95.0 39.6 65 44.5 91.3 86.5 123.5 49.4 67 51.0 106.7 97.3 146.1 57.0
- >4GC Puissance
GC Puissace cren eury cyano bacter aléa cte 3.47 3.45 1.18 9.62 1.84 E -5 -3 -4 -5 -7 ^ 3.333 2.001 3.013 2.887 4.649 %GC >4GC r >4GC e >4GC c >4GC b >4GC a 30 2.9 3.1 3.3 1.8 1.4 32 3.6 3.5 4.0 2.1 1.8 35 4.9 4.2 5.3 2.8 2.8 37 5.9 4.7 6.3 3.2 3.6 40 7.6 5.5 7.9 4.1 5.2 42 8.9 6.1 9.2 4.7 6.5 45 11.2 7.0 11.3 5.7 8.9 47 13.0 7.6 12.9 6.5 10.9 50 16.0 8.7 15.5 7.7 14.6 52 18.2 9.4 17.5 8.7 17.5 55 22.0 10.5 20.7 10.2 22.7 57 24.7 11.2 23.0 11.3 26.8 60 29.3 12.5 26.9 13.1 34.0 62 32.7 13.3 29.6 14.4 39.6 65 38.3 14.6 34.2 16.5 49.3 67 42.4 15.5 37.5 18.0 56.8
- >4AT Polynôme 3°
AT Polynôme 3°
cren eury cyano bacter aléa
x3 4.38 -4.60 4.02 3.35 9.60
-3 -5 -3 -4 -4
x2 -0.5971 0.0877 -0.5391 0.0037 -9.39
x 27.76 -5.60 25.42 -0.142 3.51
cte -429.0 94.3 -391.3 -6.07 -46.5
%AT >4AT r >4AT e >4AT c >4AT b >4AT a
30 -15.4 4.0 -5.5 2.1 0.3
32 -8.7 3.4 1.7 4.2 1.3
35 -1.2 3.8 10.2 7.9 2.6
37 2.3 4.8 14.6 10.7 3.6
40 6.1 7.7 20.0 15.6 5.3
42 7.8 10.4 22.9 19.4 6.6
45 9.8 15.7 26.9 25.6 9.0
47 11.1 20.1 29.5 30.3 11.0
50 13.2 27.8 34.0 38.0 14.5
52 15.3 33.8 37.5 43.7 17.4
55 19.6 44.0 44.2 53.1 22.5
57 23.7 51.6 49.8 60.0 26.6
60 32.3 64.1 60.6 71.2 33.8
62 39.8 73.3 69.6 79.3 39.4
65 54.4 88.3 86.2 92.5 49.0
67 66.7 99.0 99.7 101.9 56.3
- >4GC Polynôme 3°
GC Polynôme 3° cren eury cyano bacter aléa x3 -2.33 -1.16 8.08 -4.84 7.49 E -3 -3 -4 -4 -4 x2 0.3372 0.1591 -0.1050 0.0895 -0.0622 x -14.91 -6.647 5.204 -4.501 1.97 cte 212.8 90.94 -81.84 70.07 -22.07 %GC >4GC r >4GC e >4GC c >4GC b >4GC a 30 6.0 3.5 1.6 2.5 1.3 32 4.5 3.2 3.6 1.8 1.9 35 4.0 3.5 6.3 1.4 2.8 37 4.6 4.2 7.9 1.5 3.6 40 6.6 5.5 10.0 2.2 5.2 42 8.6 6.6 11.4 3.0 6.5 45 12.1 8.5 13.3 4.6 8.9 47 14.7 9.8 14.7 5.9 10.9 50 18.7 11.6 16.8 8.2 14.6 52 21.2 12.7 18.4 9.9 17.6 55 24.6 14.0 21.2 12.6 22.8 57 26.4 14.5 23.2 14.5 26.9 60 28.2 14.8 26.9 17.5 34.1 62 28.6 14.4 29.7 19.6 39.6 65 27.6 13.1 34.6 22.6 49.0 67 25.8 11.5 38.4 24.5 56.1
Autre-bactéries
[modifier | modifier le wikicode]Résultats
[modifier | modifier le wikicode]- 192 Autre-bactéries
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl aae; 1551335; 43.4761673010665; 4828; 4872; 591; 641; 85156; 86380; 64379; 65865; 9170; 9276; 2805; 2659; 0 aba; 5650368; 58.3838433178158; 3007; 2930; 1597; 1568; 216587; 217000; 304448; 306151; 8865; 8986; 8824; 8903; 0 acp; 5029329; 74.7164880245456; 70; 68; 4055; 4183; 64534; 64285; 402195; 403461; 331; 310; 16508; 16660; 0 ade; 5013479; 74.9052703721308; 61; 81; 4074; 4122; 65238; 63038; 405130; 401504; 310; 301; 16805; 16273; 0 afw; 5277990; 73.5314011583955; 92; 82; 5959; 5741; 71624; 72226; 389468; 386090; 379; 347; 19964; 19539; 0 age; 12489432; 69.4486704756061; 594; 616; 17394; 17796; 233470; 236504; 926890; 933683; 2241; 2129; 50084; 51436; 41 amd; 10236715; 71.2927926585824; 411; 428; 6747; 7122; 180162; 183847; 807285; 805867; 2665; 2630; 29195; 29171; 0 amo; 2160700; 47.968065904568; 4344; 4682; 1272; 1205; 102227; 104668; 102592; 102289; 8025; 8552; 4617; 4498; 0 ams; 8773466; 70.8230817786266; 379; 397; 5401; 5398; 139227; 138500; 704093; 704250; 1673; 1687; 24199; 24577; 0 amt; 4929566; 36.8220244946513; 17431; 17352; 1679; 1814; 295221; 295911; 156250; 157282; 28840; 28867; 6178; 6447; 0 ank; 5061632; 74.840683795266; 65; 63; 4202; 4160; 64479; 64002; 406856; 407343; 307; 297; 16744; 16559; 0 apt; 2907495; 53.0368237950538; 5089; 5075; 2049; 1899; 118271; 118841; 154288; 151854; 9506; 9784; 6796; 6187; 0 asd; 4738809; 62.2442474469851; 809; 791; 2730; 2814; 135244; 134760; 271947; 273839; 3713; 3791; 11241; 11546; 0 asf; 1620005; 28.2602214190697; 7804; 7580; 190; 208; 111657; 111705; 33331; 34810; 12965; 12778; 868; 1037; 0 bae; 4168266; 43.2192907074549; 15434; 15431; 1084; 1015; 218137; 217670; 153936; 153615; 23502; 23708; 4593; 4419; 0 bla; 1933695; 60.4903565453704; 419; 379; 700; 836; 61134; 61617; 109473; 110985; 1366; 1339; 3141; 3393; 0 blo; 2256640; 60.1198241633579; 662; 635; 704; 760; 75322; 76641; 141691; 141232; 2257; 2303; 3664; 3582; 0 bmf1; 2121359; 57.1569922865484; 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4519823; 51.2128019172432; 7826; 8001; 1209; 1322; 194819; 196163; 211410; 213136; 14646; 14776; 5927; 6038; 0 sbz; 4683551; 51.3411511906244; 9188; 9107; 1746; 1661; 197243; 195799; 225810; 225551; 16324; 15916; 6701; 6366; 0 scb; 10148695; 71.4528321128973; 295; 304; 14620; 14078; 154451; 157500; 808981; 799016; 1345; 1364; 43626; 42200; 0 scl; 13033779; 71.375738379483; 785; 808; 13650; 13645; 205781; 209504; 896064; 897879; 2731; 2736; 43941; 43766; 0 sco; 8667507; 72.1186611098208; 172; 218; 10660; 10577; 127391; 126460; 701446; 707949; 972; 1019; 34063; 33951; 0 sct; 6283062; 72.9398004020989; 183; 151; 8740; 9247; 93209; 92693; 528021; 535072; 789; 712; 28770; 30253; 30 sect; 1441139; 43.2902030963009; 4364; 4442; 544; 486; 68274; 68290; 47482; 47219; 6411; 6589; 1579; 1582; 0 sep; 2499279; 32.0951762488302; 10030; 9072; 256; 186; 173063; 168449; 55041; 52457; 17327; 16269; 1229; 1044; 0 sepp; 2490012; 32.1217327466695; 9663; 9111; 259; 184; 171760; 168935; 54590; 52378; 16927; 16430; 1220; 1041; 0 ser; 2616530; 32.1513607717091; 10386; 9341; 282; 193; 182609; 175931; 58016; 54601; 18123; 16745; 1326; 1062; 0 sfl; 4607202; 50.8900181956189; 8134; 8316; 1312; 1303; 201549; 201821; 215654; 213169; 15093; 15382; 6312; 5871; 49 sfo; 5488183; 50.8788063371794; 9048; 8947; 3028; 3083; 245840; 245460; 267325; 267733; 17291; 17338; 9562; 9634; 0 sgr; 8545929; 72.2274079272131; 197; 198; 13111; 12803; 125513; 127411; 691994; 689222; 1042; 1153; 40312; 40010; 0 sho; 9840102; 72.0397308889684; 248; 219; 12043; 12293; 144995; 146783; 806253; 806814; 1023; 1058; 38926; 38906; 0 sma; 9025608; 70.716554496938; 288; 338; 10689; 10658; 147271; 148799; 697969; 694405; 1497; 1590; 33943; 34035; 0 smk; 3820344; 62.6668959653895; 1275; 1380; 1438; 1375; 115653; 117560; 245820; 242728; 4939; 4981; 7019; 6690; 0 sms; 190657; 24.0038393554918; 1603; 1717; 31; 34; 12715; 12745; 3381; 3575; 1791; 1739; 98; 92; 0 smx; 3908022; 62.6549441123924; 1344; 1357; 1360; 1498; 119845; 118942; 249032; 250823; 5147; 4987; 6769; 7209; 0 spe; 5448853; 55.0735907171656; 7014; 7283; 2505; 2318; 209840; 211117; 304200; 302872; 14411; 14666; 9334; 9218; 0 spi; 1937111; 38.3159251070279; 7601; 7936; 274; 296; 114902; 115665; 59188; 61681; 11590; 12071; 1546; 1675; 0 spl; 1796846; 39.0916639489416; 5598; 5780; 245; 286; 107498; 109043; 58113; 58617; 9461; 9754; 1430; 1421; 0 spq; 4858887; 52.1097527067413; 9141; 9267; 1632; 1577; 200326; 200314; 237126; 236676; 16399; 16469; 6814; 6738; 0 ssx; 7414440; 71.7481563004084; 196; 200; 9816; 9868; 110586; 109061; 597215; 600307; 882; 870; 31666; 31836; 0 sti; 2741033; 68.1027919036363; 118; 98; 2208; 2393; 51671; 51400; 195063; 197399; 465; 503; 9444; 9794; 0 stm; 4857432; 52.2215030493479; 9188; 9233; 1560; 1621; 199721; 198927; 237684; 237879; 16617; 16211; 6925; 6782; 0 sty; 4809037; 52.0927162756286; 9036; 9129; 1610; 1679; 198401; 197326; 233040; 235497; 16417; 16153; 6741; 6819; 0 sur; 10260756; 67.4586453473799; 1270; 1241; 19355; 19692; 239950; 237598; 731507; 733994; 3910; 4044; 43311; 43604; 0 sus; 9965640; 61.9024568417081; 3706; 3782; 5063; 4566; 321828; 322056; 637709; 633071; 12614; 12567; 22278; 21823; 0 tai; 1848474; 63.7925661924377; 375; 339; 8098; 7114; 48029; 46765; 142542; 137838; 1116; 1095; 12183; 11501; 0 tde; 2843201; 37.8737556718642; 18098; 17974; 618; 525; 158790; 159051; 100982; 98334; 22582; 22554; 3102; 3017; 0 tma; 1860725; 46.2477260207715; 4488; 4659; 538; 709; 89126; 90023; 74178; 78612; 8868; 8979; 2144; 2517; 0 tme; 1915238; 31.3998573545429; 13238; 12800; 490; 431; 123522; 121538; 50996; 49107; 17789; 17210; 1638; 1550; 0 tos; 2072393; 68.5534548707702; 717; 721; 11907; 12188; 48268; 48509; 171568; 172114; 2802; 2818; 17743; 17863; 0 tpas; 1139203; 52.7868167482003; 2304; 2372; 998; 992; 43195; 42394; 46858; 47673; 3742; 3707; 2611; 2803; 0 tra; 3260398; 68.1390124763909; 2410; 2266; 7607; 7736; 66922; 67122; 189467; 190505; 4310; 4180; 16345; 16899; 0 tro; 2003006; 63.6471020527168; 316; 314; 1214; 1166; 49694; 49051; 121109; 121935; 1527; 1539; 4698; 4657; 2 tsc; 2346803; 64.8850372187184; 1108; 1259; 8488; 8168; 66287; 66784; 190405; 188915; 4331; 4283; 16711; 16545; 0 tsu; 2731853; 39.1632346249963; 16370; 17375; 212; 175; 160078; 161558; 84833; 85814; 21396; 22170; 1279; 1393; 0 tth; 1894877; 69.4372774591702; 394; 448; 9182; 8911; 42401; 42173; 158752; 159801; 1856; 1919; 16222; 16015; 0 ttl; 1902595; 69.0919507304497; 479; 418; 8933; 9097; 43606; 43369; 159455; 159423; 2251; 2020; 16025; 16091; 0 tts; 1863201; 68.9162897615448; 493; 496; 8785; 8616; 43289; 42827; 155077; 156274; 2193; 2198; 15752; 15744; 0 uur; 751719; 25.4996880483266; 5422; 5640; 38; 46; 58304; 58095; 10982; 11668; 7387; 7301; 189; 215; 0 vin; 4350553; 68.9392589861565; 388; 361; 3617; 3620; 88266; 86551; 320517; 318241; 1260; 1271; 14450; 14284; 0 wbr; 697724; 22.478945829583; 7321; 7233; 29; 35; 47174; 47870; 11482; 11314; 7159; 7091; 170; 169; 0 xac; 5175554; 64.7718872221215; 1468; 1427; 1526; 1434; 140462; 140210; 339957; 339208; 3770; 3692; 7876; 7914; 0 xbo; 4225498; 44.9676227512118; 10957; 10804; 1723; 1421; 212954; 216541; 175188; 164027; 17825; 17986; 6321; 5659; 0 xcb; 5148708; 64.9570338811212; 1531; 1476; 1367; 1328; 137185; 137234; 344611; 341465; 3622; 3618; 7930; 7928; 0 ype; 4653728; 47.6361102324846; 8789; 8951; 2595; 2930; 224229; 225184; 201213; 204623; 16816; 16685; 7641; 8107; 0 ypg; 4504254; 47.5980262214342; 8552; 8784; 2866; 2483; 215402; 219343; 198786; 193360; 16023; 16677; 7858; 7232; 0 zin; 208564; 13.5401332099375; 3112; 3050; 7; 10; 14475; 14621; 2251; 2077; 2574; 2718; 13; 28; 21
Tableau des diagrammes
[modifier | modifier le wikicode]Tableau des diagrammes
[modifier | modifier le wikicode]- Légende:
- − >4ATa, >4GCa ce sont les aléas calculés à partir de l’équation des courbes de tendance des aléas où x est %GC
- * pour >4ATa l’équation est: −0.000732x3 + 0.1607x2 −11.96x + 302.42
- * pour >4GCa l’équation est: 0.000746x3 −0.0609x2 + 1.869x −19.90
- − <5GCa, <5ATa ce sont les aléas calculés à partir de l’équation des courbes de tendance des aléas où x est %GC
- * pour <5GCa l'équation est: 2.86x − 49.02
- * pour <5ATa l'équation est: −2.83x + 235.7
- − dGCa, dATa différences avec l'aléa, dGAa = >4GC − >4GCa, dATa = >4AT − >4ATa.
- Voir à la suite le tableau non formaté.
Répétitions chez les autre-bactéries x3 -0.000732 0.000746
x2 0.1607 -0.0609
Voir méthode d’analyse (3.4.1) dans l’article x -11.96 1.869 2.86 -2.83
c 302.42 -19.90 -49.02 235.7
| dGCa | dATa | KEGG | Chromosome | %GC | >4GC | >4AT | <5GC | <5AT | Ctrl | >4ATa | >4GCa | <5GCa | <5ATa |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 0.41 | 36.57 | aae | 1,551,335 | 43.48 | 7.94 | 62.53 | 87.48 | 122.46 | 0 | 25.96 | 7.53 | 75.37 | 112.50 |
| -24.48 | 4.39 | aba | 5,650,368 | 58.38 | 5.60 | 10.51 | 111.20 | 79.90 | 0 | 6.11 | 30.08 | 118.02 | 70.26 |
| -74.57 | -0.13 | acp | 5,029,329 | 74.72 | 16.38 | 0.27 | 166.79 | 25.74 | 0 | 0.40 | 90.95 | 164.75 | 23.97 |
| -75.60 | -0.08 | ade | 5,013,479 | 74.91 | 16.35 | 0.28 | 167.49 | 25.71 | 0 | 0.36 | 91.95 | 165.29 | 23.44 |
| -62.69 | -0.32 | afw | 5,277,990 | 73.53 | 22.17 | 0.33 | 154.43 | 27.39 | 0 | 0.65 | 84.86 | 161.36 | 27.33 |
| -37.88 | -0.55 | age | 12,489,432 | 69.45 | 28.18 | 0.97 | 157.10 | 37.98 | 41 | 1.52 | 66.06 | 149.68 | 38.90 |
| -60.59 | -0.29 | amd | 10,236,715 | 71.29 | 13.55 | 0.82 | 163.29 | 36.08 | 0 | 1.11 | 74.14 | 154.95 | 33.68 |
| -0.48 | 24.18 | amo | 2,160,700 | 47.97 | 11.46 | 41.77 | 99.04 | 103.43 | 0 | 17.59 | 11.94 | 88.22 | 99.77 |
| -59.71 | -0.33 | ams | 8,773,466 | 70.82 | 12.31 | 0.88 | 166.08 | 32.04 | 0 | 1.21 | 72.02 | 153.61 | 35.01 |
| 3.51 | 27.26 | amt | 4,929,566 | 36.82 | 7.09 | 70.56 | 66.16 | 131.62 | 0 | 43.30 | 3.57 | 56.33 | 131.35 |
| -75.09 | -0.13 | ank | 5,061,632 | 74.84 | 16.52 | 0.25 | 167.44 | 25.50 | 0 | 0.38 | 91.61 | 165.10 | 23.62 |
| -5.62 | 24.14 | apt | 2,907,495 | 53.04 | 13.58 | 34.96 | 109.76 | 88.19 | 0 | 10.81 | 19.19 | 102.72 | 85.41 |
| -28.68 | -0.54 | asd | 4,738,809 | 62.24 | 11.70 | 3.38 | 119.98 | 58.56 | 0 | 3.91 | 40.38 | 129.07 | 59.32 |
| 1.35 | 18.76 | asf | 1,620,005 | 28.26 | 2.46 | 94.96 | 43.24 | 153.77 | 0 | 76.20 | 1.10 | 31.83 | 155.62 |
| -2.29 | 47.54 | bae | 4,168,266 | 43.22 | 5.04 | 74.05 | 75.95 | 115.88 | 0 | 26.51 | 7.32 | 74.63 | 113.23 |
| -27.48 | -0.68 | bla | 1,933,695 | 60.49 | 7.94 | 4.13 | 117.39 | 64.88 | 0 | 4.81 | 35.43 | 124.05 | 64.29 |
| -27.95 | 0.73 | blo | 2,256,640 | 60.12 | 6.49 | 5.75 | 128.58 | 69.36 | 0 | 5.02 | 34.44 | 122.99 | 65.34 |
| -20.56 | 11.50 | bmf1 | 2,121,359 | 57.16 | 6.69 | 18.51 | 117.83 | 83.49 | 0 | 7.00 | 27.25 | 114.51 | 73.73 |
| -20.07 | 10.71 | bmf2 | 1,156,948 | 57.34 | 7.60 | 17.57 | 119.10 | 82.23 | 0 | 6.86 | 27.66 | 115.04 | 73.21 |
| -55.50 | 3.79 | bmv | 3,497,479 | 68.15 | 5.25 | 5.64 | 114.83 | 48.79 | 0 | 1.84 | 60.75 | 145.96 | 42.58 |
| 0.87 | 34.95 | bpn | 791,654 | 29.56 | 2.26 | 105.27 | 41.65 | 146.11 | 0 | 70.32 | 1.39 | 35.57 | 151.92 |
| -2.66 | 46.70 | bsu | 4,215,606 | 43.51 | 4.90 | 72.57 | 75.00 | 114.03 | 0 | 25.87 | 7.56 | 75.48 | 112.39 |
| 0.67 | 99.83 | buc | 640,681 | 26.31 | 1.36 | 185.43 | 36.74 | 146.34 | 0 | 85.60 | 0.69 | 26.26 | 161.14 |
| 0.79 | 31.20 | cac | 3,940,880 | 30.93 | 2.49 | 95.73 | 49.51 | 145.98 | 0 | 64.54 | 1.70 | 39.46 | 148.06 |
| 0.89 | 19.20 | cad | 3,105,335 | 29.93 | 2.36 | 87.91 | 43.15 | 141.23 | 0 | 68.71 | 1.47 | 36.62 | 150.87 |
| 2.28 | 55.84 | cbd | 2,158,758 | 42.44 | 9.01 | 84.09 | 75.19 | 126.15 | 0 | 28.25 | 6.73 | 72.39 | 115.45 |
| 1.89 | 35.69 | cbl | 3,992,906 | 28.31 | 3.00 | 111.65 | 46.05 | 147.53 | 0 | 75.96 | 1.12 | 31.98 | 155.47 |
| -45.64 | -0.55 | ccx | 10,080,619 | 69.90 | 22.32 | 0.87 | 155.75 | 39.77 | 0 | 1.42 | 67.96 | 150.96 | 37.63 |
| 0.86 | 28.29 | cdf | 4,290,252 | 29.06 | 2.14 | 100.84 | 43.17 | 146.88 | 0 | 72.55 | 1.28 | 34.12 | 153.35 |
| -1.17 | 66.74 | cff | 1,773,615 | 33.31 | 1.17 | 121.97 | 46.50 | 125.11 | 0 | 55.23 | 2.34 | 46.27 | 141.31 |
| -1.14 | 66.80 | cft | 1,800,764 | 33.21 | 1.17 | 122.40 | 46.27 | 125.61 | 0 | 55.60 | 2.31 | 45.99 | 141.60 |
| -1.10 | 67.99 | cfv | 1,866,009 | 33.26 | 1.23 | 123.39 | 46.37 | 125.52 | 0 | 55.39 | 2.33 | 46.15 | 141.44 |
| -12.77 | 9.73 | cgl | 3,309,401 | 53.81 | 7.78 | 19.72 | 107.40 | 88.58 | 0 | 9.99 | 20.55 | 104.93 | 83.22 |
| -13.35 | 9.52 | cgq | 3,145,677 | 54.15 | 7.81 | 19.17 | 109.11 | 88.07 | 0 | 9.65 | 21.16 | 105.90 | 82.26 |
| 0.83 | 32.11 | chp | 1,171,660 | 39.06 | 5.45 | 68.85 | 62.48 | 126.33 | 0 | 36.74 | 4.63 | 62.74 | 125.01 |
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| 0.49 | 94.98 | cjr | 1,777,831 | 30.31 | 2.05 | 162.10 | 42.55 | 144.24 | 0 | 67.13 | 1.56 | 37.69 | 149.82 |
| -13.58 | 21.59 | cko | 4,720,462 | 53.83 | 7.00 | 31.57 | 103.14 | 85.24 | 0 | 9.98 | 20.58 | 104.98 | 83.17 |
| 1.24 | 18.94 | cle | 4,714,237 | 34.32 | 3.89 | 70.51 | 54.80 | 138.33 | 0 | 51.57 | 2.65 | 49.18 | 138.43 |
| -2.87 | 36.57 | clo | 1,809,746 | 44.21 | 5.27 | 60.99 | 84.54 | 118.77 | 29 | 24.42 | 8.14 | 77.47 | 110.41 |
| -63.61 | -0.42 | cmi | 3,297,891 | 72.66 | 16.98 | 0.40 | 152.51 | 23.18 | 0 | 0.83 | 80.59 | 158.88 | 29.79 |
| 3.47 | 41.54 | cmn | 1,072,952 | 40.34 | 8.81 | 74.88 | 66.27 | 125.28 | 0 | 33.34 | 5.34 | 66.39 | 121.39 |
| -16.35 | 21.14 | cnt | 4,876,443 | 55.10 | 6.62 | 29.88 | 110.29 | 83.01 | 0 | 8.73 | 22.97 | 108.63 | 79.55 |
| -5.16 | 35.25 | cpb | 2,736,403 | 48.93 | 7.96 | 51.36 | 91.95 | 95.08 | 0 | 16.11 | 13.11 | 90.96 | 97.05 |
| -0.37 | 16.76 | cpy | 4,847,594 | 35.35 | 2.63 | 64.82 | 58.92 | 139.35 | 0 | 48.05 | 3.00 | 52.11 | 135.53 |
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| -0.02 | 34.84 | ctr | 1,042,519 | 41.31 | 5.93 | 65.75 | 67.49 | 120.78 | 0 | 30.91 | 5.95 | 69.16 | 118.65 |
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| -18.93 | 23.80 | dba | 3,942,657 | 58.65 | 11.78 | 29.73 | 130.14 | 70.32 | 0 | 5.94 | 30.71 | 118.77 | 69.51 |
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| -27.57 | 4.68 | ddr | 2,819,842 | 63.39 | 16.30 | 8.09 | 140.37 | 53.47 | 0 | 3.41 | 43.87 | 132.34 | 56.07 |
| -26.98 | 4.87 | dge | 2,467,205 | 66.64 | 27.98 | 7.14 | 144.69 | 47.79 | 0 | 2.27 | 54.96 | 141.63 | 46.87 |
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| -30.78 | 6.79 | dpt | 2,147,060 | 66.16 | 22.44 | 9.20 | 150.06 | 48.78 | 0 | 2.41 | 53.23 | 140.28 | 48.21 |
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| -4.66 | 16.72 | gva | 1,617,545 | 42.02 | 1.77 | 45.95 | 58.51 | 131.47 | 1 | 29.22 | 6.43 | 71.19 | 116.64 |
| -7.71 | 21.05 | hav | 4,712,721 | 48.99 | 5.48 | 37.06 | 87.96 | 100.75 | 0 | 16.01 | 13.19 | 91.14 | 96.87 |
| -15.34 | 2.58 | ipa | 5,472,964 | 62.44 | 25.63 | 6.40 | 139.26 | 72.47 | 0 | 3.82 | 40.97 | 129.64 | 58.75 |
| -9.83 | 23.34 | kin | 5,529,134 | 52.75 | 8.87 | 34.47 | 101.99 | 87.09 | 0 | 11.13 | 18.71 | 101.89 | 86.23 |
| -16.45 | 22.51 | koy | 5,914,407 | 55.92 | 8.16 | 30.51 | 111.73 | 77.45 | 0 | 8.01 | 24.61 | 110.97 | 77.23 |
| -18.56 | 19.03 | kpn | 5,315,120 | 57.48 | 9.41 | 25.79 | 118.30 | 70.66 | 0 | 6.76 | 27.97 | 115.43 | 72.82 |
| -15.44 | 24.61 | ksa | 4,902,024 | 53.74 | 4.99 | 34.67 | 102.65 | 86.85 | 0 | 10.06 | 20.43 | 104.75 | 83.40 |
| -59.78 | -0.13 | ksk | 8,783,278 | 74.20 | 28.47 | 0.38 | 182.69 | 26.97 | 66 | 0.51 | 88.25 | 163.26 | 25.44 |
| 1.63 | 45.09 | lat | 1,190,853 | 36.32 | 5.00 | 89.97 | 55.94 | 128.87 | 0 | 44.88 | 3.37 | 54.90 | 132.77 |
| -32.95 | 12.90 | lhk | 3,169,329 | 62.35 | 7.75 | 16.77 | 144.51 | 58.82 | 0 | 3.86 | 40.70 | 129.37 | 59.01 |
| -1.01 | 48.07 | liv | 2,928,879 | 37.13 | 2.70 | 90.41 | 59.55 | 138.23 | 0 | 42.35 | 3.71 | 57.22 | 130.48 |
| -1.21 | 32.07 | ljf | 1,755,993 | 34.49 | 1.49 | 83.08 | 53.78 | 149.79 | 0 | 51.00 | 2.71 | 49.65 | 137.98 |
| -0.40 | 53.90 | lla | 2,365,589 | 35.33 | 2.60 | 102.02 | 55.09 | 145.88 | 0 | 48.12 | 3.00 | 52.06 | 135.58 |
| -2.52 | 12.63 | lpl | 3,308,273 | 44.47 | 5.84 | 36.53 | 78.64 | 124.71 | 0 | 23.90 | 8.36 | 78.20 | 109.69 |
| 0.54 | 64.36 | mcac | 1,017,293 | 23.66 | 0.64 | 164.01 | 26.62 | 173.87 | 0 | 99.65 | 0.10 | 18.68 | 168.64 |
| -4.11 | 15.51 | men | 538,294 | 43.52 | 3.46 | 41.37 | 75.91 | 112.63 | 0 | 25.87 | 7.56 | 75.49 | 112.38 |
| -9.38 | 4.80 | mhd | 2,269,167 | 68.08 | 51.08 | 6.66 | 152.57 | 47.39 | 0 | 1.86 | 60.46 | 145.75 | 42.79 |
| 4.23 | 15.91 | mrb | 3,097,457 | 63.38 | 48.09 | 19.32 | 147.85 | 56.65 | 0 | 3.41 | 43.86 | 132.33 | 56.09 |
| 2.98 | 11.25 | msv | 3,249,394 | 62.36 | 43.71 | 15.11 | 141.16 | 61.15 | 0 | 3.86 | 40.73 | 129.41 | 58.98 |
| -44.30 | -0.85 | mts | 3,982,034 | 70.28 | 25.31 | 0.48 | 140.02 | 31.95 | 21 | 1.33 | 69.61 | 152.05 | 36.55 |
| -42.26 | -0.64 | mxa | 9,139,763 | 68.89 | 21.48 | 1.02 | 153.18 | 42.83 | 0 | 1.66 | 63.74 | 148.08 | 40.48 |
| -57.77 | -0.75 | nfa | 6,021,225 | 70.83 | 14.30 | 0.46 | 161.02 | 33.91 | 0 | 1.21 | 72.06 | 153.64 | 34.98 |
| -28.25 | 2.26 | opr | 2,303,940 | 70.02 | 40.26 | 3.65 | 155.15 | 42.38 | 0 | 1.39 | 68.51 | 151.33 | 37.27 |
| -19.11 | 0.37 | pac | 2,560,265 | 60.01 | 15.05 | 5.45 | 126.03 | 62.38 | 0 | 5.08 | 34.15 | 122.67 | 65.64 |
| -47.18 | 2.16 | pae | 6,264,404 | 66.56 | 7.48 | 4.45 | 152.72 | 50.63 | 0 | 2.29 | 54.66 | 141.40 | 47.10 |
| -19.29 | 0.36 | pak | 2,495,334 | 60.10 | 15.11 | 5.39 | 126.41 | 61.97 | 0 | 5.03 | 34.40 | 122.94 | 65.38 |
| -14.36 | 22.10 | pam | 4,703,373 | 53.69 | 5.97 | 32.22 | 104.35 | 83.47 | 0 | 10.12 | 20.33 | 104.59 | 83.55 |
| -4.58 | 6.74 | pdo | 1,890,857 | 58.31 | 25.33 | 12.90 | 140.03 | 75.36 | 0 | 6.16 | 29.91 | 117.82 | 70.46 |
| -13.56 | 24.03 | pes | 4,513,140 | 56.06 | 11.34 | 31.92 | 115.51 | 76.55 | 0 | 7.89 | 24.90 | 111.37 | 76.84 |
| -3.41 | 19.59 | pfq | 4,094,629 | 45.38 | 5.78 | 41.71 | 87.27 | 112.08 | 0 | 22.12 | 9.19 | 80.80 | 107.11 |
| -18.20 | 6.68 | pgd | 3,776,653 | 59.62 | 14.95 | 11.99 | 126.43 | 66.59 | 0 | 5.31 | 33.15 | 121.57 | 66.74 |
| -24.64 | 18.74 | pge | 5,489,680 | 59.11 | 7.20 | 24.37 | 122.41 | 66.58 | 0 | 5.64 | 31.84 | 120.09 | 68.21 |
| -4.76 | 16.37 | pgi | 2,343,476 | 48.29 | 7.57 | 33.46 | 91.22 | 96.19 | 0 | 17.09 | 12.32 | 89.13 | 98.86 |
| -58.79 | -0.11 | phm | 3,803,225 | 73.29 | 24.86 | 0.59 | 166.86 | 32.76 | 0 | 0.70 | 83.64 | 160.66 | 28.02 |
| 1.49 | 57.57 | ple | 358,242 | 26.17 | 2.15 | 143.87 | 36.61 | 157.23 | 0 | 86.30 | 0.66 | 25.86 | 161.53 |
| -0.15 | 23.67 | plu | 5,688,987 | 42.83 | 6.87 | 51.05 | 78.56 | 118.84 | 0 | 27.38 | 7.02 | 73.51 | 114.34 |
| 1.58 | 31.14 | pmr | 4,063,606 | 38.90 | 6.12 | 68.33 | 63.86 | 129.32 | 0 | 37.19 | 4.54 | 62.27 | 125.47 |
| -36.53 | 2.73 | ppk | 5,429,298 | 64.72 | 11.67 | 5.63 | 121.87 | 56.46 | 0 | 2.89 | 48.20 | 136.15 | 52.30 |
| -2.31 | 21.19 | ppm | 5,728,392 | 45.24 | 6.76 | 43.58 | 84.33 | 108.79 | 0 | 22.38 | 9.06 | 80.41 | 107.51 |
| -2.58 | 20.84 | ppoy | 5,597,590 | 45.51 | 6.74 | 42.70 | 85.11 | 107.86 | 0 | 21.87 | 9.32 | 81.19 | 106.73 |
| 1.29 | 29.75 | psi | 4,402,109 | 41.27 | 7.21 | 60.76 | 69.06 | 123.88 | 0 | 31.01 | 5.92 | 69.04 | 118.76 |
| -23.96 | 11.15 | pst | 6,397,126 | 58.40 | 6.15 | 17.25 | 115.04 | 73.07 | 0 | 6.10 | 30.11 | 118.06 | 70.21 |
| -4.08 | 18.85 | ral | 3,685,408 | 44.21 | 4.06 | 43.28 | 73.26 | 100.81 | 0 | 24.43 | 8.13 | 77.45 | 110.43 |
| -11.41 | 22.45 | raq | 4,861,101 | 52.12 | 6.27 | 34.30 | 100.97 | 89.16 | 0 | 11.85 | 17.68 | 100.10 | 88.00 |
| -49.42 | -1.25 | req | 5,043,170 | 68.82 | 14.04 | 0.42 | 145.83 | 37.26 | 0 | 1.67 | 63.47 | 147.89 | 40.67 |
| -32.08 | -1.66 | rer | 6,516,310 | 62.31 | 8.50 | 2.22 | 124.05 | 60.56 | 0 | 3.88 | 40.59 | 129.26 | 59.12 |
| -31.56 | 4.70 | ret | 4,381,608 | 61.27 | 6.02 | 9.09 | 127.86 | 66.92 | 0 | 4.39 | 37.58 | 126.28 | 62.07 |
| -43.27 | -1.23 | rha | 7,804,765 | 67.52 | 15.01 | 0.78 | 144.72 | 41.86 | 0 | 2.01 | 58.27 | 144.15 | 44.38 |
| -7.56 | 30.00 | rho | 3,592,125 | 48.50 | 5.02 | 46.76 | 93.69 | 91.95 | 0 | 16.76 | 12.58 | 89.73 | 98.27 |
| 0.28 | 94.69 | rip | 574,390 | 28.48 | 1.43 | 169.87 | 40.06 | 148.36 | 0 | 75.17 | 1.15 | 32.47 | 154.99 |
| -43.36 | -1.31 | roa | 8,376,953 | 67.37 | 14.36 | 0.74 | 144.02 | 42.11 | 67 | 2.05 | 57.73 | 143.74 | 44.78 |
| -16.27 | 20.68 | ror | 5,398,151 | 55.88 | 8.26 | 28.72 | 112.28 | 76.56 | 0 | 8.04 | 24.54 | 110.87 | 77.34 |
| -44.02 | 0.22 | rpa | 5,459,213 | 65.04 | 5.26 | 3.01 | 133.11 | 55.03 | 0 | 2.78 | 49.28 | 137.06 | 51.40 |
| -0.31 | 27.72 | rpr | 1,111,523 | 29.00 | 0.95 | 100.55 | 38.12 | 151.34 | 0 | 72.82 | 1.26 | 33.95 | 153.52 |
| -0.32 | 27.63 | rpw | 1,109,804 | 29.01 | 0.95 | 100.42 | 38.14 | 151.32 | 0 | 72.80 | 1.27 | 33.97 | 153.50 |
| -0.01 | 34.61 | rri | 1,257,710 | 32.47 | 2.09 | 93.01 | 49.20 | 144.70 | 0 | 58.40 | 2.10 | 43.87 | 143.69 |
| -22.46 | 7.17 | rru | 4,352,825 | 65.45 | 28.23 | 9.81 | 151.81 | 56.96 | 0 | 2.64 | 50.69 | 138.23 | 50.24 |
| -0.43 | 26.10 | rty | 1,111,496 | 28.92 | 0.82 | 99.29 | 37.26 | 151.81 | 0 | 73.19 | 1.25 | 33.72 | 153.75 |
| -14.37 | 4.35 | saci | 9,629,675 | 62.27 | 26.08 | 8.25 | 134.54 | 66.46 | 0 | 3.90 | 40.44 | 129.13 | 59.25 |
| -50.39 | -0.24 | salb | 6,841,649 | 73.32 | 33.42 | 0.46 | 178.50 | 27.52 | 29 | 0.69 | 83.81 | 160.76 | 27.93 |
| -50.91 | -0.25 | sall | 9,784,577 | 72.13 | 27.12 | 0.69 | 172.52 | 32.32 | 446 | 0.94 | 78.03 | 157.35 | 31.30 |
| -52.18 | -0.23 | salu | 9,360,281 | 72.32 | 26.75 | 0.66 | 173.39 | 31.79 | 0 | 0.90 | 78.93 | 157.89 | 30.76 |
| -4.28 | 19.89 | sap | 3,472,898 | 56.76 | 22.12 | 27.21 | 132.14 | 82.96 | 21 | 7.31 | 26.39 | 113.39 | 74.84 |
| -4.30 | 19.87 | say | 3,551,206 | 56.76 | 22.08 | 27.19 | 131.93 | 82.92 | 0 | 7.31 | 26.39 | 113.38 | 74.85 |
| -46.31 | -0.39 | sbh | 11,936,683 | 70.75 | 25.40 | 0.84 | 164.63 | 32.56 | 175 | 1.23 | 71.71 | 153.41 | 35.20 |
| -6.31 | 16.87 | sbn | 5,347,283 | 46.28 | 3.78 | 37.32 | 80.09 | 111.79 | 0 | 20.45 | 10.09 | 83.40 | 104.54 |
| -10.67 | 22.06 | sbo | 4,519,823 | 51.21 | 5.60 | 35.02 | 96.58 | 93.01 | 0 | 12.96 | 16.27 | 97.50 | 90.58 |
| -9.19 | 26.26 | sbz | 4,683,551 | 51.34 | 7.27 | 39.06 | 99.16 | 90.80 | 0 | 12.80 | 16.47 | 97.87 | 90.21 |
| -46.60 | -0.49 | scb | 10,148,695 | 71.45 | 28.28 | 0.59 | 166.90 | 31.00 | 0 | 1.08 | 74.87 | 155.41 | 33.22 |
| -53.58 | 0.13 | scl | 13,033,779 | 71.38 | 20.94 | 1.22 | 144.37 | 32.28 | 0 | 1.10 | 74.52 | 155.19 | 33.44 |
| -53.47 | -0.49 | sco | 8,667,507 | 72.12 | 24.50 | 0.45 | 170.45 | 29.52 | 0 | 0.94 | 77.98 | 157.32 | 31.33 |
| -53.30 | -0.24 | sct | 6,283,062 | 72.94 | 28.63 | 0.53 | 178.59 | 29.83 | 30 | 0.77 | 81.93 | 159.67 | 29.01 |
| -0.23 | 34.75 | sect | 1,441,139 | 43.29 | 7.15 | 61.10 | 67.91 | 103.78 | 0 | 26.36 | 7.38 | 74.84 | 113.03 |
| -0.23 | 16.59 | sep | 2,499,279 | 32.10 | 1.77 | 76.43 | 43.92 | 150.09 | 0 | 59.84 | 2.00 | 42.81 | 144.75 |
| -0.23 | 15.66 | sepp | 2,490,012 | 32.12 | 1.78 | 75.40 | 43.87 | 150.22 | 0 | 59.74 | 2.01 | 42.88 | 144.67 |
| -0.20 | 15.77 | ser | 2,616,530 | 32.15 | 1.82 | 75.39 | 43.95 | 150.35 | 0 | 59.62 | 2.02 | 42.97 | 144.59 |
| -10.12 | 22.33 | sfl | 4,607,202 | 50.89 | 5.68 | 35.71 | 95.72 | 94.17 | 49 | 13.37 | 15.79 | 96.58 | 91.49 |
| -4.64 | 19.40 | sfo | 5,488,183 | 50.88 | 11.13 | 32.79 | 100.99 | 95.83 | 0 | 13.39 | 15.78 | 96.55 | 91.52 |
| -48.17 | -0.46 | sgr | 8,545,929 | 72.23 | 30.32 | 0.46 | 171.02 | 29.85 | 0 | 0.92 | 78.49 | 157.63 | 31.03 |
| -52.87 | -0.48 | sho | 9,840,102 | 72.04 | 24.73 | 0.47 | 171.84 | 29.86 | 0 | 0.96 | 77.60 | 157.09 | 31.56 |
| -47.89 | -0.54 | sma | 9,025,608 | 70.72 | 23.65 | 0.69 | 161.80 | 33.15 | 0 | 1.24 | 71.54 | 153.31 | 35.31 |
| -34.28 | 3.23 | smk | 3,820,344 | 62.67 | 7.36 | 6.95 | 131.47 | 63.64 | 0 | 3.72 | 41.64 | 130.27 | 58.12 |
| 3.23 | 76.37 | smsP | 190,657 | 24.00 | 3.41 | 174.13 | 37.48 | 152.05 | 0 | 97.76 | 0.18 | 19.66 | 167.68 |
| -34.30 | 3.19 | smx | 3,908,022 | 62.65 | 7.31 | 6.91 | 131.48 | 63.69 | 0 | 3.73 | 41.61 | 130.24 | 58.15 |
| -14.06 | 17.48 | spe | 5,448,853 | 55.07 | 8.85 | 26.24 | 114.82 | 82.59 | 0 | 8.76 | 22.91 | 108.55 | 79.64 |
| -1.31 | 41.37 | spi | 1,937,111 | 38.32 | 2.94 | 80.21 | 64.06 | 131.24 | 0 | 38.84 | 4.25 | 60.60 | 127.12 |
| -1.69 | 26.67 | spl | 1,796,846 | 39.09 | 2.96 | 63.32 | 66.55 | 131.21 | 0 | 36.66 | 4.64 | 62.82 | 124.92 |
| -11.06 | 26.02 | spq | 4,858,887 | 52.11 | 6.60 | 37.89 | 100.30 | 89.22 | 0 | 11.87 | 17.66 | 100.07 | 88.03 |
| -49.69 | -0.48 | ssx | 7,414,440 | 71.75 | 26.55 | 0.53 | 170.08 | 29.86 | 0 | 1.02 | 76.24 | 156.26 | 32.38 |
| -43.78 | -1.07 | sti | 2,741,033 | 68.10 | 16.79 | 0.79 | 150.20 | 37.96 | 0 | 1.86 | 60.56 | 145.83 | 42.71 |
| -11.29 | 26.19 | stm | 4,857,432 | 52.22 | 6.55 | 37.92 | 100.73 | 88.83 | 0 | 11.74 | 17.84 | 100.39 | 87.72 |
| -10.80 | 25.89 | sty | 4,809,037 | 52.09 | 6.84 | 37.77 | 100.25 | 89.06 | 0 | 11.89 | 17.64 | 100.02 | 88.08 |
| -20.00 | 0.42 | sur | 10,260,756 | 67.46 | 38.05 | 2.45 | 151.30 | 47.32 | 0 | 2.03 | 58.05 | 143.98 | 44.54 |
| -29.71 | 3.44 | sus | 9,965,640 | 61.90 | 9.66 | 7.51 | 131.94 | 67.14 | 0 | 4.08 | 39.38 | 128.09 | 60.28 |
| 37.14 | 0.62 | tai | 1,848,474 | 63.79 | 82.29 | 3.86 | 164.49 | 52.48 | 0 | 3.25 | 45.15 | 133.50 | 54.93 |
| -0.02 | 86.75 | tde | 2,843,201 | 37.87 | 4.02 | 126.87 | 72.25 | 127.66 | 0 | 40.12 | 4.04 | 59.34 | 128.37 |
| -3.35 | 28.65 | tma | 1,860,725 | 46.25 | 6.70 | 49.16 | 84.62 | 105.87 | 0 | 20.51 | 10.05 | 83.30 | 104.65 |
| 2.99 | 73.35 | tme | 1,915,238 | 31.40 | 4.81 | 135.95 | 53.93 | 146.23 | 0 | 62.60 | 1.82 | 40.82 | 146.72 |
| 53.90 | 5.20 | tos | 2,072,393 | 68.55 | 116.27 | 6.94 | 183.02 | 49.41 | 0 | 1.74 | 62.37 | 147.12 | 41.44 |
| -1.30 | 29.96 | tpas | 1,139,203 | 52.79 | 17.47 | 41.05 | 87.73 | 81.67 | 0 | 11.09 | 18.77 | 102.01 | 86.12 |
| -13.65 | 12.50 | tra | 3,260,398 | 68.14 | 47.06 | 14.34 | 126.74 | 43.72 | 0 | 1.85 | 60.71 | 145.93 | 42.61 |
| -32.81 | -0.16 | tro | 2,003,006 | 63.65 | 11.88 | 3.15 | 126.01 | 50.83 | 2 | 3.30 | 44.69 | 133.08 | 55.34 |
| 22.22 | 7.25 | tsc | 2,346,803 | 64.89 | 70.97 | 10.09 | 175.80 | 60.37 | 0 | 2.84 | 48.76 | 136.62 | 51.83 |
| -3.26 | 87.07 | tsu | 2,731,853 | 39.16 | 1.42 | 123.52 | 63.44 | 133.68 | 0 | 36.46 | 4.68 | 63.03 | 124.72 |
| 29.48 | 2.92 | tth | 1,894,877 | 69.44 | 95.48 | 4.44 | 185.13 | 46.63 | 0 | 1.53 | 66.01 | 149.65 | 38.93 |
| 30.20 | 3.11 | ttl | 1,902,595 | 69.09 | 94.77 | 4.71 | 184.48 | 47.96 | 0 | 1.61 | 64.57 | 148.66 | 39.91 |
| 29.55 | 3.66 | tts | 1,863,201 | 68.92 | 93.39 | 5.31 | 184.01 | 48.58 | 0 | 1.65 | 63.84 | 148.15 | 40.41 |
| 0.60 | 57.40 | uur | 751,719 | 25.50 | 1.12 | 147.16 | 30.67 | 174.38 | 0 | 89.76 | 0.52 | 23.94 | 163.44 |
| -47.30 | 0.08 | vin | 4,350,553 | 68.94 | 16.63 | 1.72 | 153.43 | 40.76 | 0 | 1.65 | 63.94 | 148.22 | 40.34 |
| 0.92 | 102.17 | wbr | 697,724 | 22.48 | 0.92 | 208.59 | 33.16 | 156.64 | 0 | 106.42 | 0.00 | 15.29 | 172.00 |
| -42.66 | 2.72 | xac | 5,175,554 | 64.77 | 5.72 | 5.59 | 134.28 | 55.67 | 0 | 2.88 | 48.37 | 136.30 | 52.15 |
| -1.37 | 28.59 | xbo | 4,225,498 | 44.97 | 7.44 | 51.50 | 83.11 | 110.12 | 0 | 22.91 | 8.81 | 79.64 | 108.27 |
| -43.77 | 3.03 | xcb | 5,148,708 | 64.96 | 5.23 | 5.84 | 136.33 | 54.70 | 0 | 2.81 | 49.00 | 136.83 | 51.63 |
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| 0.36 | 20.30 | ypg | 4,504,254 | 47.60 | 11.88 | 38.49 | 90.41 | 103.78 | 0 | 18.19 | 11.51 | 87.16 | 100.82 |
| 0.82 | 127.37 | zin | 208,564 | 13.54 | 0.82 | 295.48 | 20.95 | 164.90 | 21 | 168.10 | 0.00 | 0.00 | 197.33 |
- Tableau non formaté
dGCa;dATa;KEGG;Chromosome;%GC;>4GC;>4AT;<5GC;<5AT;Ctrl ;>4ATa;>4GCa;<5GCa;<5ATa 0.41;36.57;aae;1,551,335;43.48;7.94;62.53;87.48;122.46;0;25.96;7.53;75.37;112.50 -24.48;4.39;aba;5,650,368;58.38;5.60;10.51;111.20;79.90;0;6.11;30.08;118.02;70.26 -74.57;-0.13;acp;5,029,329;74.72;16.38;0.27;166.79;25.74;0;0.40;90.95;164.75;23.97 -75.60;-0.08;ade;5,013,479;74.91;16.35;0.28;167.49;25.71;0;0.36;91.95;165.29;23.44 -62.69;-0.32;afw;5,277,990;73.53;22.17;0.33;154.43;27.39;0;0.65;84.86;161.36;27.33 -37.88;-0.55;age;12,489,432;69.45;28.18;0.97;157.10;37.98;41;1.52;66.06;149.68;38.90 -60.59;-0.29;amd;10,236,715;71.29;13.55;0.82;163.29;36.08;0;1.11;74.14;154.95;33.68 -0.48;24.18;amo;2,160,700;47.97;11.46;41.77;99.04;103.43;0;17.59;11.94;88.22;99.77 -59.71;-0.33;ams;8,773,466;70.82;12.31;0.88;166.08;32.04;0;1.21;72.02;153.61;35.01 3.51;27.26;amt;4,929,566;36.82;7.09;70.56;66.16;131.62;0;43.30;3.57;56.33;131.35 -75.09;-0.13;ank;5,061,632;74.84;16.52;0.25;167.44;25.50;0;0.38;91.61;165.10;23.62 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-24.64;18.74;pge;5,489,680;59.11;7.20;24.37;122.41;66.58;0;5.64;31.84;120.09;68.21 -4.76;16.37;pgi;2,343,476;48.29;7.57;33.46;91.22;96.19;0;17.09;12.32;89.13;98.86 -58.79;-0.11;phm;3,803,225;73.29;24.86;0.59;166.86;32.76;0;0.70;83.64;160.66;28.02 1.49;57.57;ple;358,242;26.17;2.15;143.87;36.61;157.23;0;86.30;0.66;25.86;161.53 -0.15;23.67;plu;5,688,987;42.83;6.87;51.05;78.56;118.84;0;27.38;7.02;73.51;114.34 1.58;31.14;pmr;4,063,606;38.90;6.12;68.33;63.86;129.32;0;37.19;4.54;62.27;125.47 -36.53;2.73;ppk;5,429,298;64.72;11.67;5.63;121.87;56.46;0;2.89;48.20;136.15;52.30 -2.31;21.19;ppm;5,728,392;45.24;6.76;43.58;84.33;108.79;0;22.38;9.06;80.41;107.51 -2.58;20.84;ppoy;5,597,590;45.51;6.74;42.70;85.11;107.86;0;21.87;9.32;81.19;106.73 1.29;29.75;psi;4,402,109;41.27;7.21;60.76;69.06;123.88;0;31.01;5.92;69.04;118.76 -23.96;11.15;pst;6,397,126;58.40;6.15;17.25;115.04;73.07;0;6.10;30.11;118.06;70.21 -4.08;18.85;ral;3,685,408;44.21;4.06;43.28;73.26;100.81;0;24.43;8.13;77.45;110.43 -11.41;22.45;raq;4,861,101;52.12;6.27;34.30;100.97;89.16;0;11.85;17.68;100.10;88.00 -49.42;-1.25;req;5,043,170;68.82;14.04;0.42;145.83;37.26;0;1.67;63.47;147.89;40.67 -32.08;-1.66;rer;6,516,310;62.31;8.50;2.22;124.05;60.56;0;3.88;40.59;129.26;59.12 -31.56;4.70;ret;4,381,608;61.27;6.02;9.09;127.86;66.92;0;4.39;37.58;126.28;62.07 -43.27;-1.23;rha;7,804,765;67.52;15.01;0.78;144.72;41.86;0;2.01;58.27;144.15;44.38 -7.56;30.00;rho;3,592,125;48.50;5.02;46.76;93.69;91.95;0;16.76;12.58;89.73;98.27 0.28;94.69;rip;574,390;28.48;1.43;169.87;40.06;148.36;0;75.17;1.15;32.47;154.99 -43.36;-1.31;roa;8,376,953;67.37;14.36;0.74;144.02;42.11;67;2.05;57.73;143.74;44.78 -16.27;20.68;ror;5,398,151;55.88;8.26;28.72;112.28;76.56;0;8.04;24.54;110.87;77.34 -44.02;0.22;rpa;5,459,213;65.04;5.26;3.01;133.11;55.03;0;2.78;49.28;137.06;51.40 -0.31;27.72;rpr;1,111,523;29.00;0.95;100.55;38.12;151.34;0;72.82;1.26;33.95;153.52 -0.32;27.63;rpw;1,109,804;29.01;0.95;100.42;38.14;151.32;0;72.80;1.27;33.97;153.50 -0.01;34.61;rri;1,257,710;32.47;2.09;93.01;49.20;144.70;0;58.40;2.10;43.87;143.69 -22.46;7.17;rru;4,352,825;65.45;28.23;9.81;151.81;56.96;0;2.64;50.69;138.23;50.24 -0.43;26.10;rty;1,111,496;28.92;0.82;99.29;37.26;151.81;0;73.19;1.25;33.72;153.75 -14.37;4.35;saci;9,629,675;62.27;26.08;8.25;134.54;66.46;0;3.90;40.44;129.13;59.25 -50.39;-0.24;salb;6,841,649;73.32;33.42;0.46;178.50;27.52;29;0.69;83.81;160.76;27.93 -50.91;-0.25;sall;9,784,577;72.13;27.12;0.69;172.52;32.32;446;0.94;78.03;157.35;31.30 -52.18;-0.23;salu;9,360,281;72.32;26.75;0.66;173.39;31.79;0;0.90;78.93;157.89;30.76 -4.28;19.89;sap;3,472,898;56.76;22.12;27.21;132.14;82.96;21;7.31;26.39;113.39;74.84 -4.30;19.87;say;3,551,206;56.76;22.08;27.19;131.93;82.92;0;7.31;26.39;113.38;74.85 -46.31;-0.39;sbh;11,936,683;70.75;25.40;0.84;164.63;32.56;175;1.23;71.71;153.41;35.20 -6.31;16.87;sbn;5,347,283;46.28;3.78;37.32;80.09;111.79;0;20.45;10.09;83.40;104.54 -10.67;22.06;sbo;4,519,823;51.21;5.60;35.02;96.58;93.01;0;12.96;16.27;97.50;90.58 -9.19;26.26;sbz;4,683,551;51.34;7.27;39.06;99.16;90.80;0;12.80;16.47;97.87;90.21 -46.60;-0.49;scb;10,148,695;71.45;28.28;0.59;166.90;31.00;0;1.08;74.87;155.41;33.22 -53.58;0.13;scl;13,033,779;71.38;20.94;1.22;144.37;32.28;0;1.10;74.52;155.19;33.44 -53.47;-0.49;sco;8,667,507;72.12;24.50;0.45;170.45;29.52;0;0.94;77.98;157.32;31.33 -53.30;-0.24;sct;6,283,062;72.94;28.63;0.53;178.59;29.83;30;0.77;81.93;159.67;29.01 -0.23;34.75;sect;1,441,139;43.29;7.15;61.10;67.91;103.78;0;26.36;7.38;74.84;113.03 -0.23;16.59;sep;2,499,279;32.10;1.77;76.43;43.92;150.09;0;59.84;2.00;42.81;144.75 -0.23;15.66;sepp;2,490,012;32.12;1.78;75.40;43.87;150.22;0;59.74;2.01;42.88;144.67 -0.20;15.77;ser;2,616,530;32.15;1.82;75.39;43.95;150.35;0;59.62;2.02;42.97;144.59 -10.12;22.33;sfl;4,607,202;50.89;5.68;35.71;95.72;94.17;49;13.37;15.79;96.58;91.49 -4.64;19.40;sfo;5,488,183;50.88;11.13;32.79;100.99;95.83;0;13.39;15.78;96.55;91.52 -48.17;-0.46;sgr;8,545,929;72.23;30.32;0.46;171.02;29.85;0;0.92;78.49;157.63;31.03 -52.87;-0.48;sho;9,840,102;72.04;24.73;0.47;171.84;29.86;0;0.96;77.60;157.09;31.56 -47.89;-0.54;sma;9,025,608;70.72;23.65;0.69;161.80;33.15;0;1.24;71.54;153.31;35.31 -34.28;3.23;smk;3,820,344;62.67;7.36;6.95;131.47;63.64;0;3.72;41.64;130.27;58.12 3.23;76.37;smsP;190,657;24.00;3.41;174.13;37.48;152.05;0;97.76;0.18;19.66;167.68 -34.30;3.19;smx;3,908,022;62.65;7.31;6.91;131.48;63.69;0;3.73;41.61;130.24;58.15 -14.06;17.48;spe;5,448,853;55.07;8.85;26.24;114.82;82.59;0;8.76;22.91;108.55;79.64 -1.31;41.37;spi;1,937,111;38.32;2.94;80.21;64.06;131.24;0;38.84;4.25;60.60;127.12 -1.69;26.67;spl;1,796,846;39.09;2.96;63.32;66.55;131.21;0;36.66;4.64;62.82;124.92 -11.06;26.02;spq;4,858,887;52.11;6.60;37.89;100.30;89.22;0;11.87;17.66;100.07;88.03 -49.69;-0.48;ssx;7,414,440;71.75;26.55;0.53;170.08;29.86;0;1.02;76.24;156.26;32.38 -43.78;-1.07;sti;2,741,033;68.10;16.79;0.79;150.20;37.96;0;1.86;60.56;145.83;42.71 -11.29;26.19;stm;4,857,432;52.22;6.55;37.92;100.73;88.83;0;11.74;17.84;100.39;87.72 -10.80;25.89;sty;4,809,037;52.09;6.84;37.77;100.25;89.06;0;11.89;17.64;100.02;88.08 -20.00;0.42;sur;10,260,756;67.46;38.05;2.45;151.30;47.32;0;2.03;58.05;143.98;44.54 -29.71;3.44;sus;9,965,640;61.90;9.66;7.51;131.94;67.14;0;4.08;39.38;128.09;60.28 37.14;0.62;tai;1,848,474;63.79;82.29;3.86;164.49;52.48;0;3.25;45.15;133.50;54.93 -0.02;86.75;tde;2,843,201;37.87;4.02;126.87;72.25;127.66;0;40.12;4.04;59.34;128.37 -3.35;28.65;tma;1,860,725;46.25;6.70;49.16;84.62;105.87;0;20.51;10.05;83.30;104.65 2.99;73.35;tme;1,915,238;31.40;4.81;135.95;53.93;146.23;0;62.60;1.82;40.82;146.72 53.90;5.20;tos;2,072,393;68.55;116.27;6.94;183.02;49.41;0;1.74;62.37;147.12;41.44 -1.30;29.96;tpas;1,139,203;52.79;17.47;41.05;87.73;81.67;0;11.09;18.77;102.01;86.12 -13.65;12.50;tra;3,260,398;68.14;47.06;14.34;126.74;43.72;0;1.85;60.71;145.93;42.61 -32.81;-0.16;tro;2,003,006;63.65;11.88;3.15;126.01;50.83;2;3.30;44.69;133.08;55.34 22.22;7.25;tsc;2,346,803;64.89;70.97;10.09;175.80;60.37;0;2.84;48.76;136.62;51.83 -3.26;87.07;tsu;2,731,853;39.16;1.42;123.52;63.44;133.68;0;36.46;4.68;63.03;124.72 29.48;2.92;tth;1,894,877;69.44;95.48;4.44;185.13;46.63;0;1.53;66.01;149.65;38.93 30.20;3.11;ttl;1,902,595;69.09;94.77;4.71;184.48;47.96;0;1.61;64.57;148.66;39.91 29.55;3.66;tts;1,863,201;68.92;93.39;5.31;184.01;48.58;0;1.65;63.84;148.15;40.41 0.60;57.40;uur;751,719;25.50;1.12;147.16;30.67;174.38;0;89.76;0.52;23.94;163.44 -47.30;0.08;vin;4,350,553;68.94;16.63;1.72;153.43;40.76;0;1.65;63.94;148.22;40.34 0.92;102.17;wbr;697,724;22.48;0.92;208.59;33.16;156.64;0;106.42;0.00;15.29;172.00 -42.66;2.72;xac;5,175,554;64.77;5.72;5.59;134.28;55.67;0;2.88;48.37;136.30;52.15 -1.37;28.59;xbo;4,225,498;44.97;7.44;51.50;83.11;110.12;0;22.91;8.81;79.64;108.27 -43.77;3.03;xcb;5,148,708;64.96;5.23;5.84;136.33;54.70;0;2.81;49.00;136.83;51.63 0.32;19.99;ype;4,653,728;47.64;11.87;38.12;90.59;103.77;0;18.13;11.56;87.27;100.71 0.36;20.30;ypg;4,504,254;47.60;11.88;38.49;90.41;103.78;0;18.19;11.51;87.16;100.82 0.82;127.37;zin;208,564;13.54;0.82;295.48;20.95;164.90;21;168.10;0.00;0.00;197.33
Groupes des autre-bactéries selon l'écart relatif par rapport à l'aléa
[modifier | modifier le wikicode]- Voir tableau non formaté à la suite
- Légende:
- >4GC %: 100*(>4GC − >4GCa)/>4GCa . Voir Tableau des diagrammes des répétitions pour >4GC et >4GCa.
- >4AT %: respectivement de même que précédent.
| KEGG | %GC | >4GC % | >4AT % | |
|---|---|---|---|---|
| uur | 25.50 | 116.1 | 64.0 | |
| ple | 26.17 | 224.6 | 66.7 | |
| buc | 26.31 | 96.3 | 116.6 | |
| fnc | 27.12 | 100.6 | 77.2 | |
| asf | 28.26 | 122.5 | 24.6 | |
| cbl | 28.31 | 169.3 | 47.0 | |
| rip | 28.48 | 23.9 | 126.0 | |
| rty | 28.92 | -34.3 | 35.7 | |
| rpr | 29.00 | -24.6 | 38.1 | |
| rpw | 29.01 | -25.2 | 37.9 | |
| cdf | 29.06 | 67.3 | 39.0 | |
| bpn | 29.56 | 62.8 | 49.7 | |
| cad | 29.93 | 60.3 | 27.9 | |
| cjr | 30.31 | 31.4 | 141.5 | |
| cje | 30.55 | 32.4 | 142.3 | |
| cac | 30.93 | 46.2 | 48.3 | |
| tme | 31.40 | 164.0 | 117.2 | |
| sep | 32.10 | -11.6 | 27.7 | |
| sepp | 32.12 | -11.4 | 26.2 | |
| ser | 32.15 | -9.9 | 26.5 | |
| rri | 32.47 | -0.4 | 59.3 | |
| cft | 33.21 | -49.5 | 120.1 | |
| cfv | 33.26 | -47.2 | 122.7 | |
| cff | 33.31 | -50.1 | 120.8 | |
| cle | 34.32 | 46.8 | 36.7 | |
| ljf | 34.49 | -44.8 | 62.9 | |
| lla | 35.33 | -13.4 | 112.0 | |
| cpy | 35.35 | -12.3 | 34.9 | |
| lat | 36.32 | 48.3 | 100.5 | |
| amt | 36.82 | 98.3 | 63.0 | |
| liv | 37.13 | -27.2 | 113.5 | |
| tde | 37.87 | -0.5 | 216.2 | |
| spi | 38.32 | -30.7 | 106.5 | |
| pmr | 38.90 | 34.7 | 83.7 | |
| cth | 38.99 | -3.7 | 120.8 | |
| chp | 39.06 | 17.9 | 87.4 | |
| spl | 39.09 | -36.3 | 72.7 | |
| tsu | 39.16 | -69.7 | 238.8 | |
| cmn | 40.34 | 64.9 | 124.6 | |
| psi | 41.27 | 21.8 | 95.9 | |
| cta | 41.30 | 1.3 | 111.8 | |
| ctr | 41.31 | -0.4 | 112.7 | |
| gva | 42.02 | -72.4 | 57.2 | |
| cbd | 42.44 | 33.9 | 197.6 | |
| plu | 42.83 | -2.2 | 86.5 | |
| bae | 43.22 | -31.3 | 179.3 | |
| sect | 43.29 | -3.2 | 131.8 | |
| aae | 43.48 | 5.5 | 140.9 | |
| bsu | 43.51 | -35.2 | 180.5 | |
| men | 43.52 | -54.3 | 59.9 | |
| ral | 44.21 | -50.1 | 77.1 | |
| clo | 44.21 | -35.2 | 149.8 | |
| lpl | 44.47 | -30.1 | 52.9 | |
| xbo | 44.97 | -15.6 | 124.8 | |
| ppm | 45.24 | -25.4 | 94.7 | |
| pfq | 45.38 | -37.1 | 88.6 | |
| ppoy | 45.51 | -27.6 | 95.3 | |
| tma | 46.25 | -33.3 | 139.7 | |
| sbn | 46.28 | -62.6 | 82.5 | |
| ypg | 47.60 | 3.2 | 111.6 | |
| ype | 47.64 | 2.7 | 110.3 | |
| amo | 47.97 | -4.0 | 137.5 | |
| pgi | 48.29 | -38.6 | 95.8 | |
| rho | 48.50 | -60.1 | 179.0 | |
| cpb | 48.93 | -39.3 | 218.9 | |
| hav | 48.99 | -58.4 | 131.4 | |
| eal | 49.70 | -57.7 | 160.1 | |
| ecs | 50.54 | -59.3 | 176.2 | |
| eco | 50.79 | -65.3 | 166.9 | |
| sfo | 50.88 | -29.4 | 144.9 | |
| sfl | 50.89 | -64.1 | 167.0 | |
| eca | 50.97 | -62.6 | 153.0 | |
| sbo | 51.21 | -65.6 | 170.2 | |
| sbz | 51.34 | -55.8 | 205.2 | |
| sty | 52.09 | -61.2 | 217.8 | |
| spq | 52.11 | -62.6 | 219.3 | |
| raq | 52.12 | -64.5 | 189.4 | |
| stm | 52.22 | -63.3 | 223.1 | |
| kin | 52.75 | -52.6 | 209.6 | |
| tpas | 52.79 | -6.9 | 270.1 | |
| ent | 52.98 | -71.1 | 195.4 | |
| apt | 53.04 | -29.3 | 223.3 | |
| pam | 53.69 | -70.6 | 218.5 | |
| eta | 53.73 | -54.4 | 222.8 | |
| ksa | 53.74 | -75.6 | 244.6 | |
| cgl | 53.81 | -62.1 | 97.3 | |
| cko | 53.83 | -66.0 | 216.5 | |
| ebf | 54.02 | -72.3 | 206.8 | |
| cgq | 54.15 | -63.1 | 98.6 | |
| dda | 55.02 | -57.2 | 235.6 | |
| eno | 55.07 | -65.0 | 221.7 | |
| spe | 55.07 | -61.4 | 199.5 | |
| cnt | 55.10 | -71.2 | 242.0 | |
| ecla | 55.18 | -67.4 | 227.6 | |
| eha | 55.56 | -63.2 | 416.5 | |
| ror | 55.88 | -66.3 | 257.2 | |
| koy | 55.92 | -66.8 | 281.1 | |
| pes | 56.06 | -54.5 | 304.6 | |
| * | ebt | 56.51 | -16.5 | 297.3 |
| * | say | 56.76 | -16.3 | 271.8 |
| * | sap | 56.76 | -16.2 | 272.1 |
| esa | 56.77 | -84.0 | 303.6 | |
| bmf1 | 57.16 | -75.4 | 164.2 | |
| bmf2 | 57.34 | -72.5 | 156.0 | |
| eic | 57.44 | -48.9 | 241.9 | |
| kpn | 57.48 | -66.4 | 281.4 | |
| * | pdo | 58.31 | -15.3 | 109.4 |
| aba | 58.38 | -81.4 | 71.9 | |
| pst | 58.40 | -79.6 | 182.7 | |
| dba | 58.65 | -61.6 | 400.8 | |
| pge | 59.11 | -77.4 | 332.4 | |
| pgd | 59.62 | -54.9 | 125.7 | |
| pac | 60.01 | -55.9 | 7.2 | |
| pak | 60.10 | -56.1 | 7.1 | |
| blo | 60.12 | -81.2 | 14.5 | |
| bla | 60.49 | -77.6 | -14.2 | |
| ret | 61.27 | -84.0 | 106.9 | |
| sus | 61.90 | -75.5 | 84.4 | |
| asd | 62.24 | -71.0 | -13.7 | |
| * | saci | 62.27 | -35.5 | 111.4 |
| rer | 62.31 | -79.0 | -42.8 | |
| lhk | 62.35 | -81.0 | 334.0 | |
| * | msv | 62.36 | 7.3 | 291.6 |
| * | ipa | 62.44 | -37.4 | 67.5 |
| smx | 62.65 | -82.4 | 85.5 | |
| smk | 62.67 | -82.3 | 86.8 | |
| * | dvl | 63.01 | -42.5 | 39.9 |
| * | mrb | 63.38 | 9.7 | 466.4 |
| ddr | 63.39 | -62.8 | 137.3 | |
| tro | 63.65 | -73.4 | -4.8 | |
| * | tai | 63.79 | 82.3 | 19.0 |
| dpd | 63.97 | -75.2 | 197.1 | |
| gau | 64.27 | -76.3 | 16.5 | |
| ppk | 64.72 | -75.8 | 94.4 | |
| xac | 64.77 | -88.2 | 94.5 | |
| cvi | 64.83 | -86.6 | 248.4 | |
| * | tsc | 64.89 | 45.6 | 255.7 |
| xcb | 64.96 | -89.3 | 107.9 | |
| rpa | 65.04 | -89.3 | 8.1 | |
| * | rru | 65.45 | -44.3 | 271.6 |
| * | dpt | 66.16 | -57.8 | 281.9 |
| * | gdi | 66.43 | -60.2 | 159.2 |
| pae | 66.56 | -86.3 | 94.4 | |
| * | dge | 66.64 | -49.1 | 215.1 |
| * | roa | 67.37 | -75.1 | -64.0 |
| * | sur | 67.46 | -34.4 | 20.6 |
| * | rha | 67.52 | -74.2 | -61.1 |
| * | mhd | 68.08 | -15.5 | 257.4 |
| * | sti | 68.10 | -72.3 | -57.5 |
| * | tra | 68.14 | -22.5 | 676.6 |
| bmv | 68.15 | -91.4 | 205.6 | |
| * | tos | 68.55 | 86.4 | 298.6 |
| * | req | 68.82 | -77.9 | -74.6 |
| * | mxa | 68.89 | -66.3 | -38.7 |
| * | tts | 68.92 | 46.3 | 221.5 |
| vin | 68.94 | -74.0 | 4.6 | |
| * | ttl | 69.09 | 46.8 | 193.2 |
| * | tth | 69.44 | 44.7 | 191.2 |
| * | age | 69.45 | -57.3 | -36.4 |
| * | ccx | 69.90 | -67.2 | -38.6 |
| * | opr | 70.02 | -41.2 | 162.8 |
| * | fra | 70.08 | -67.8 | 0.8 |
| * | mts | 70.28 | -63.6 | -63.7 |
| * | sma | 70.72 | -66.9 | -43.9 |
| * | sbh | 70.75 | -64.6 | -31.8 |
| * | ams | 70.82 | -82.9 | -27.1 |
| * | nfa | 70.83 | -80.2 | -61.8 |
| * | amd | 71.29 | -81.7 | -26.4 |
| * | scl | 71.38 | -71.9 | 11.6 |
| * | scb | 71.45 | -62.2 | -45.3 |
| * | ssx | 71.75 | -65.2 | -47.5 |
| * | sho | 72.04 | -68.1 | -50.4 |
| * | sco | 72.12 | -68.6 | -52.1 |
| * | sall | 72.13 | -65.2 | -26.9 |
| * | sgr | 72.23 | -61.4 | -49.6 |
| * | salu | 72.32 | -66.1 | -26.2 |
| * | gba | 72.56 | -86.5 | -69.8 |
| * | cmi | 72.66 | -78.9 | -51.3 |
| * | sct | 72.94 | -65.1 | -31.1 |
| * | phm | 73.29 | -70.3 | -15.1 |
| * | salb | 73.32 | -60.1 | -34.0 |
| * | afw | 73.53 | -73.9 | -49.3 |
| * | ksk | 74.20 | -67.7 | -25.4 |
| * | acp | 74.72 | -82.0 | -32.2 |
| * | ank | 74.84 | -82.0 | -33.2 |
| * | ade | 74.91 | -82.2 | -22.4 |
- Tableau non formaté
;KEGG;%GC;>4GC %;>4AT % ;uur;25.50;116.1;64.0 ;ple;26.17;224.6;66.7 ;buc;26.31;96.3;116.6 ;fnc;27.12;100.6;77.2 ;asf;28.26;122.5;24.6 ;cbl;28.31;169.3;47.0 ;rip;28.48;23.9;126.0 ;rty;28.92;-34.3;35.7 ;rpr;29.00;-24.6;38.1 ;rpw;29.01;-25.2;37.9 ;cdf;29.06;67.3;39.0 ;bpn;29.56;62.8;49.7 ;cad;29.93;60.3;27.9 ;cjr;30.31;31.4;141.5 ;cje;30.55;32.4;142.3 ;cac;30.93;46.2;48.3 ;tme;31.40;164.0;117.2 ;sep;32.10;-11.6;27.7 ;sepp;32.12;-11.4;26.2 ;ser;32.15;-9.9;26.5 ;rri;32.47;-0.4;59.3 ;cft;33.21;-49.5;120.1 ;cfv;33.26;-47.2;122.7 ;cff;33.31;-50.1;120.8 ;cle;34.32;46.8;36.7 ;ljf;34.49;-44.8;62.9 ;lla;35.33;-13.4;112.0 ;cpy;35.35;-12.3;34.9 ;lat;36.32;48.3;100.5 ;amt;36.82;98.3;63.0 ;liv;37.13;-27.2;113.5 ;tde;37.87;-0.5;216.2 ;spi;38.32;-30.7;106.5 ;pmr;38.90;34.7;83.7 ;cth;38.99;-3.7;120.8 ;chp;39.06;17.9;87.4 ;spl;39.09;-36.3;72.7 ;tsu;39.16;-69.7;238.8 ;cmn;40.34;64.9;124.6 ;psi;41.27;21.8;95.9 ;cta;41.30;1.3;111.8 ;ctr;41.31;-0.4;112.7 ;gva;42.02;-72.4;57.2 ;cbd;42.44;33.9;197.6 ;plu;42.83;-2.2;86.5 ;bae;43.22;-31.3;179.3 ;sect;43.29;-3.2;131.8 ;aae;43.48;5.5;140.9 ;bsu;43.51;-35.2;180.5 ;men;43.52;-54.3;59.9 ;ral;44.21;-50.1;77.1 ;clo;44.21;-35.2;149.8 ;lpl;44.47;-30.1;52.9 ;xbo;44.97;-15.6;124.8 ;ppm;45.24;-25.4;94.7 ;pfq;45.38;-37.1;88.6 ;ppoy;45.51;-27.6;95.3 ;tma;46.25;-33.3;139.7 ;sbn;46.28;-62.6;82.5 ;ypg;47.60;3.2;111.6 ;ype;47.64;2.7;110.3 ;amo;47.97;-4.0;137.5 ;pgi;48.29;-38.6;95.8 ;rho;48.50;-60.1;179.0 ;cpb;48.93;-39.3;218.9 ;hav;48.99;-58.4;131.4 ;eal;49.70;-57.7;160.1 ;ecs;50.54;-59.3;176.2 ;eco;50.79;-65.3;166.9 ;sfo;50.88;-29.4;144.9 ;sfl;50.89;-64.1;167.0 ;eca;50.97;-62.6;153.0 ;sbo;51.21;-65.6;170.2 ;sbz;51.34;-55.8;205.2 ;sty;52.09;-61.2;217.8 ;spq;52.11;-62.6;219.3 ;raq;52.12;-64.5;189.4 ;stm;52.22;-63.3;223.1 ;kin;52.75;-52.6;209.6 ;tpas;52.79;-6.9;270.1 ;ent;52.98;-71.1;195.4 ;apt;53.04;-29.3;223.3 ;pam;53.69;-70.6;218.5 ;eta;53.73;-54.4;222.8 ;ksa;53.74;-75.6;244.6 ;cgl;53.81;-62.1;97.3 ;cko;53.83;-66.0;216.5 ;ebf;54.02;-72.3;206.8 ;cgq;54.15;-63.1;98.6 ;dda;55.02;-57.2;235.6 ;eno;55.07;-65.0;221.7 ;spe;55.07;-61.4;199.5 ;cnt;55.10;-71.2;242.0 ;ecla;55.18;-67.4;227.6 ;eha;55.56;-63.2;416.5 ;ror;55.88;-66.3;257.2 ;koy;55.92;-66.8;281.1 ;pes;56.06;-54.5;304.6 *;ebt;56.51;-16.5;297.3 *;say;56.76;-16.3;271.8 *;sap;56.76;-16.2;272.1 ;esa;56.77;-84.0;303.6 ;bmf1;57.16;-75.4;164.2 ;bmf2;57.34;-72.5;156.0 ;eic;57.44;-48.9;241.9 ;kpn;57.48;-66.4;281.4 *;pdo;58.31;-15.3;109.4 ;aba;58.38;-81.4;71.9 ;pst;58.40;-79.6;182.7 ;dba;58.65;-61.6;400.8 ;pge;59.11;-77.4;332.4 ;pgd;59.62;-54.9;125.7 ;pac;60.01;-55.9;7.2 ;pak;60.10;-56.1;7.1 ;blo;60.12;-81.2;14.5 ;bla;60.49;-77.6;-14.2 ;ret;61.27;-84.0;106.9 ;sus;61.90;-75.5;84.4 ;asd;62.24;-71.0;-13.7 *;saci;62.27;-35.5;111.4 ;rer;62.31;-79.0;-42.8 ;lhk;62.35;-81.0;334.0 *;msv;62.36;7.3;291.6 *;ipa;62.44;-37.4;67.5 ;smx;62.65;-82.4;85.5 ;smk;62.67;-82.3;86.8 *;dvl;63.01;-42.5;39.9 *;mrb;63.38;9.7;466.4 ;ddr;63.39;-62.8;137.3 ;tro;63.65;-73.4;-4.8 *;tai;63.79;82.3;19.0 ;dpd;63.97;-75.2;197.1 ;gau;64.27;-76.3;16.5 ;ppk;64.72;-75.8;94.4 ;xac;64.77;-88.2;94.5 ;cvi;64.83;-86.6;248.4 *;tsc;64.89;45.6;255.7 ;xcb;64.96;-89.3;107.9 ;rpa;65.04;-89.3;8.1 *;rru;65.45;-44.3;271.6 *;dpt;66.16;-57.8;281.9 *;gdi;66.43;-60.2;159.2 ;pae;66.56;-86.3;94.4 *;dge;66.64;-49.1;215.1 *;roa;67.37;-75.1;-64.0 *;sur;67.46;-34.4;20.6 *;rha;67.52;-74.2;-61.1 *;mhd;68.08;-15.5;257.4 *;sti;68.10;-72.3;-57.5 *;tra;68.14;-22.5;676.6 ;bmv;68.15;-91.4;205.6 *;tos;68.55;86.4;298.6 *;req;68.82;-77.9;-74.6 *;mxa;68.89;-66.3;-38.7 *;tts;68.92;46.3;221.5 ;vin;68.94;-74.0;4.6 *;ttl;69.09;46.8;193.2 *;tth;69.44;44.7;191.2 *;age;69.45;-57.3;-36.4 *;ccx;69.90;-67.2;-38.6 *;opr;70.02;-41.2;162.8 *;fra;70.08;-67.8;0.8 *;mts;70.28;-63.6;-63.7 *;sma;70.72;-66.9;-43.9 *;sbh;70.75;-64.6;-31.8 *;ams;70.82;-82.9;-27.1 *;nfa;70.83;-80.2;-61.8 *;amd;71.29;-81.7;-26.4 *;scl;71.38;-71.9;11.6 *;scb;71.45;-62.2;-45.3 *;ssx;71.75;-65.2;-47.5 *;sho;72.04;-68.1;-50.4 *;sco;72.12;-68.6;-52.1 *;sall;72.13;-65.2;-26.9 *;sgr;72.23;-61.4;-49.6 *;salu;72.32;-66.1;-26.2 *;gba;72.56;-86.5;-69.8 *;cmi;72.66;-78.9;-51.3 *;sct;72.94;-65.1;-31.1 *;phm;73.29;-70.3;-15.1 *;salb;73.32;-60.1;-34.0 *;afw;73.53;-73.9;-49.3 *;ksk;74.20;-67.7;-25.4 *;acp;74.72;-82.0;-32.2 *;ank;74.84;-82.0;-33.2 *;ade;74.91;-82.2;-22.4
Groupes 22 et 23 des autre-bactéries aux faibles taux >4GC
[modifier | modifier le wikicode]Groupe 22 bactéries au-dessus de l’aléa >4GC Groupe 23 bactéries sous l’aléa >4GC KEGG %GC >4GC% >4AT% gva 42.02 -72 57 KEGG %GC >4GC >4AT DNA KEGG %GC >4GC >4AT DNA tsu 39.16 -70 239 uur 25.50 1.12 147.16 751,719 rty 28.92 0.82 99.29 1,111,496 cff 33.31 -50 121 ple 26.17 2.15 143.87 358,242 rpr 29.00 0.95 100.55 1,111,523 cft 33.21 -49 120 buc 26.31 1.36 185.43 640,681 rpw 29.01 0.95 100.42 1,109,804 cfv 33.26 -47 123 fnc 27.12 1.73 144.60 2,268,272 sep 32.10 1.77 76.43 2,499,279 ljf 34.49 -45 63 asf 28.26 2.46 94.96 1,620,005 sepp 32.12 1.78 75.40 2,490,012 spl 39.09 -36 73 cbl 28.31 3.00 111.65 3,992,906 ser 32.15 1.82 75.39 2,616,530 rty 28.92 -34 36 rip 28.48 1.43 169.87 574,390 rri 32.47 2.09 93.01 1,257,710 spi 38.32 -31 107 cdf 29.06 2.14 100.84 4,290,252 cft 33.21 1.17 122.40 1,800,764 liv 37.13 -27 114 bpn 29.56 2.26 105.27 791,654 cfv 33.26 1.23 123.39 1,866,009 rpw 29.01 -25 38 cad 29.93 2.36 87.91 3,105,335 cff 33.31 1.17 121.97 1,773,615 rpr 29.00 -25 38 cjr 30.31 2.05 162.10 1,777,831 ljf 34.49 1.49 83.08 1,755,993 lla 35.33 -13 112 cje 30.55 2.14 160.17 1,641,481 lla 35.33 2.60 102.02 2,365,589 cpy 35.35 -12 35 cac 30.93 2.49 95.73 3,940,880 cpy 35.35 2.63 64.82 4,847,594 sep 32.10 -12 28 tme 31.40 4.81 135.95 1,915,238 liv 37.13 2.70 90.41 2,928,879 sepp 32.12 -11 26 cle 34.32 3.89 70.51 4,714,237 tde 37.87 4.02 126.87 2,843,201 ser 32.15 -10 26 lat 36.32 5.00 89.97 1,190,853 spi 38.32 2.94 80.21 1,937,111 cth 38.99 -4 121 amt 36.82 7.09 70.56 4,929,566 cth 38.99 4.42 81.59 3,843,301 plu 42.83 -2 86 pmr 38.90 6.12 68.33 4,063,606 spl 39.09 2.96 63.32 1,796,846 tde 37.87 0 216 chp 39.06 5.45 68.85 1,171,660 tsu 39.16 1.42 123.52 2,731,853 rri 32.47 0 59 cmn 40.34 8.81 74.88 1,072,952 cta 41.30 6.02 65.49 1,044,459 ctr 41.31 0 113 psi 41.27 7.21 60.76 4,402,109 ctr 41.31 5.93 65.75 1,042,519 cta 41.30 1 112 cbd 42.44 9.01 84.09 2,158,758 gva 42.02 1.77 45.95 1,617,545 chp 39.06 18 87 plu 42.83 6.87 51.05 5,688,987 psi 41.27 22 96 moyen. 32 3.8 111 2,335,119 rip 28.48 24 126 ecart 5 2 39 1,542,011 moyen. 36 2.6 88 2,264,375 cjr 30.31 31 141 % 17 65 35 66 ecart 4 2 24 1,200,989 cje 30.55 32 142 % 12 67 27 53 cbd 42.44 34 198 pmr 38.90 35 84 cac 30.93 46 48 cle 34.32 47 37 lat 36.32 48 100 cad 29.93 60 28 bpn 29.56 63 50 cmn 40.34 65 125 cdf 29.06 67 39 buc 26.31 96 117 amt 36.82 98 63 fnc 27.12 101 77 uur 25.50 116 64 asf 28.26 122 25 tme 31.40 164 117 cbl 28.31 169 47 ple 26.17 225 67
Groupes 33 et 41 des autre-bactéries aux taux >4GC extrêmes
[modifier | modifier le wikicode]Groupe 33 bactéries sous l’aléa >4AT Groupe 41 bactéries au-dessus de l’aléa >4AT KEGG %GC >4GC% >4AT%
req 68.82 -78 -75
KEGG %GC >4GC >4AT DNA KEGG %GC >4GC >4AT DNA gba 72.56 -86 -70
bla 60.49 7.94 4.13 1,933,695 pac 60.01 15.05 5.45 2,560,265 roa 67.37 -75 -64
asd 62.24 11.70 3.38 4,738,809 pak 60.10 15.11 5.39 2,495,334 mts 70.28 -64 -64
rer 62.31 8.50 2.22 6,516,310 blo 60.12 6.49 5.75 2,256,640 nfa 70.83 -80 -62
roa 67.37 14.36 0.74 8,376,953 ret 61.27 6.02 9.09 4,381,608 rha 67.52 -74 -61
rha 67.52 15.01 0.78 7,804,765 sus 61.90 9.66 7.51 9,965,640 sti 68.10 -72 -58
sti 68.10 16.79 0.79 2,741,033 saci 62.27 26.08 8.25 9,629,675 sco 72.12 -69 -52
req 68.82 14.04 0.42 5,043,170 lhk 62.35 7.75 16.77 3,169,329 cmi 72.66 -79 -51
mxa 68.89 21.48 1.02 9,139,763 msv 62.36 43.71 15.11 3,249,394 sho 72.04 -68 -50
age 69.45 28.18 0.97 12,489,432 ipa 62.44 25.63 6.40 5,472,964 sgr 72.23 -61 -50
ccx 69.90 22.32 0.87 10,080,619 smx 62.65 7.31 6.91 3,908,022 afw 73.53 -74 -49
mts 70.28 25.31 0.48 3,982,034 smk 62.67 7.36 6.95 3,820,344 ssx 71.75 -65 -47
sma 70.72 23.65 0.69 9,025,608 dvl 63.01 24.57 4.99 3,462,887 scb 71.45 -62 -45
sbh 70.75 25.40 0.84 11,936,683 mrb 63.38 48.09 19.32 3,097,457 sma 70.72 -67 -44
ams 70.82 12.31 0.88 8,773,466 ddr 63.39 16.30 8.09 2,819,842 rer 62.31 -79 -43
nfa 70.83 14.30 0.46 6,021,225 tro 63.65 11.88 3.15 2,003,006 mxa 68.89 -66 -39
amd 71.29 13.55 0.82 10,236,715 tai 63.79 82.29 3.86 1,848,474 ccx 69.90 -67 -39
scb 71.45 28.28 0.59 10,148,695 dpd 63.97 11.35 9.43 3,881,839 age 69.45 -57 -36
ssx 71.75 26.55 0.53 7,414,440 gau 64.27 11.05 3.56 4,636,964 salb 73.32 -60 -34
sho 72.04 24.73 0.47 9,840,102 ppk 64.72 11.67 5.63 5,429,298 ank 74.84 -82 -33
sco 72.12 24.50 0.45 8,667,507 xac 64.77 5.72 5.59 5,175,554 acp 74.72 -82 -32
sall 72.13 27.12 0.69 9,784,577 cvi 64.83 6.49 9.94 4,751,080 sbh 70.75 -65 -32
sgr 72.23 30.32 0.46 8,545,929 tsc 64.89 70.97 10.09 2,346,803 sct 72.94 -65 -31
salu 72.32 26.75 0.66 9,360,281 xcb 64.96 5.23 5.84 5,148,708 ams 70.82 -83 -27
gba 72.56 10.82 0.26 5,311,527 rpa 65.04 5.26 3.01 5,459,213 sall 72.13 -65 -27
cmi 72.66 16.98 0.40 3,297,891 rru 65.45 28.23 9.81 4,352,825 amd 71.29 -82 -26
sct 72.94 28.63 0.53 6,283,062 dpt 66.16 22.44 9.20 2,147,060 salu 72.32 -66 -26
phm 73.29 24.86 0.59 3,803,225 gdi 66.43 21.58 6.03 3,944,163 ksk 74.20 -68 -25
salb 73.32 33.42 0.46 6,841,649 pae 66.56 7.48 4.45 6,264,404 ade 74.91 -82 -22
afw 73.53 22.17 0.33 5,277,990 dge 66.64 27.98 7.14 2,467,205 phm 73.29 -70 -15
ksk 74.20 28.47 0.38 8,783,278 sur 67.46 38.05 2.45 10,260,756 bla 60.49 -78 -14
acp 74.72 16.38 0.27 5,029,329 mhd 68.08 51.08 6.66 2,269,167 asd 62.24 -71 -14
ank 74.84 16.52 0.25 5,061,632 tra 68.14 47.06 14.34 3,260,398 tro 63.65 -73 -5
ade 74.91 16.35 0.28 5,013,479 bmv 68.15 5.25 5.64 3,497,479 fra 70.08 -68 1
tos 68.55 116.27 6.94 2,072,393 vin 68.94 -74 5
moy 71 21 0.8 7,191,057 tts 68.92 93.39 5.31 1,863,201 pak 60.10 -56 7
ecart 3.5 7.0 0.8 2,694,790 vin 68.94 16.63 1.72 4,350,553 pac 60.01 -56 7
% 5 34 102 37 ttl 69.09 94.77 4.71 1,902,595 rpa 65.04 -89 8
tth 69.44 95.48 4.44 1,894,877 scl 71.38 -72 12
opr 70.02 40.26 3.65 2,303,940 blo 60.12 -81 14
fra 70.08 22.11 1.39 5,433,628 gau 64.27 -76 16
scl 71.38 20.94 1.22 13,033,779 tai 63.79 82 19
sur 67.46 -34 21
moy 65 30 6.9 4,202,165 dvl 63.01 -42 40
ecart 3 30 4 2,530,326 ipa 62.44 -37 67
% 5 98 58 60 sus 61.90 -75 84
smx 62.65 -82 85
smk 62.67 -82 87
ppk 64.72 -76 94
pae 66.56 -86 94
xac 64.77 -88 95
ret 61.27 -84 107
xcb 64.96 -89 108
saci 62.27 -36 111
ddr 63.39 -63 137
gdi 66.43 -60 159
opr 70.02 -41 163
tth 69.44 45 191
ttl 69.09 47 193
dpd 63.97 -75 197
bmv 68.15 -91 206
dge 66.64 -49 215
tts 68.92 46 222
cvi 64.83 -87 248
tsc 64.89 46 256
mhd 68.08 -16 257
rru 65.45 -44 272
dpt 66.16 -58 282
msv 62.36 7 292
tos 68.55 86 299
lhk 62.35 -81 334
mrb 63.38 10 466
tra 68.14 -22 677
Le groupe 67 des "autres" bactéries aux taux >4GC moyens
[modifier | modifier le wikicode]Groupe 67 bactéries sous l’aléa >4AT KEGG %GC >4GC% >4AT% esa 56.77 -84 304 KEGG %GC >4GC >4AT DNA KEGG %GC >4GC >4AT DNA aba 58.38 -81 72 bae 43.22 5.04 74.05 4,168,266 ent 52.98 5.52 32.12 4,518,712 pst 58.40 -80 183 sect 43.29 7.15 61.10 1,441,139 apt 53.04 13.58 34.96 2,907,495 pge 59.11 -77 332 aae 43.48 7.94 62.53 1,551,335 pam 53.69 5.97 32.22 4,703,373 ksa 53.74 -76 245 bsu 43.51 4.90 72.57 4,215,606 eta 53.73 9.30 32.52 3,883,467 bmf1 57.16 -75 164 men 43.52 3.46 41.37 538,294 ksa 53.74 4.99 34.67 4,902,024 bmf2 57.34 -73 156 ral 44.21 4.06 43.28 3,685,408 cgl 53.81 7.78 19.72 3,309,401 ebf 54.02 -72 207 clo 44.21 5.27 60.99 1,809,746 cko 53.83 7.00 31.57 4,720,462 cnt 55.10 -71 242 lpl 44.47 5.84 36.53 3,308,273 ebf 54.02 5.79 30.02 4,762,179 ent 52.98 -71 195 xbo 44.97 7.44 51.50 4,225,498 cgq 54.15 7.81 19.17 3,145,677 pam 53.69 -71 218 ppm 45.24 6.76 43.58 5,728,392 dda 55.02 9.77 29.59 4,679,450 ecla 55.18 -67 228 pfq 45.38 5.78 41.71 4,094,629 eno 55.07 8.01 28.21 4,726,582 koy 55.92 -67 281 ppoy 45.51 6.74 42.70 5,597,590 spe 55.07 8.85 26.24 5,448,853 kpn 57.48 -66 281 tma 46.25 6.70 49.16 1,860,725 cnt 55.10 6.62 29.88 4,876,443 ror 55.88 -66 257 sbn 46.28 3.78 37.32 5,347,283 ecla 55.18 7.54 28.38 4,633,407 cko 53.83 -66 216 ypg 47.60 11.88 38.49 4,504,254 eha 55.56 8.78 42.99 3,008,576 sbo 51.21 -66 170 ype 47.64 11.87 38.12 4,653,728 ror 55.88 8.26 28.72 5,398,151 eco 50.79 -65 167 amo 47.97 11.46 41.77 2,160,700 koy 55.92 8.16 30.51 5,914,407 eno 55.07 -65 222 pgi 48.29 7.57 33.46 2,343,476 pes 56.06 11.34 31.92 4,513,140 raq 52.12 -65 189 rho 48.50 5.02 46.76 3,592,125 ebt 56.51 21.58 29.86 4,158,725 sfl 50.89 -64 167 cpb 48.93 7.96 51.36 2,736,403 say 56.76 22.08 27.19 3,551,206 stm 52.22 -63 223 hav 48.99 5.48 37.06 4,712,721 sap 56.76 22.12 27.21 3,472,898 eha 55.56 -63 417 eal 49.70 5.97 38.99 4,701,875 esa 56.77 4.23 29.49 4,368,373 cgq 54.15 -63 99 ecs 50.54 6.22 38.21 5,498,450 bmf1 57.16 6.69 18.51 2,121,359 spq 52.11 -63 219 eco 50.79 5.42 36.04 4,641,652 bmf2 57.34 7.60 17.57 1,156,948 sbn 46.28 -63 83 sfo 50.88 11.13 32.79 5,488,183 eic 57.44 14.25 23.22 3,812,301 eca 50.97 -63 153 sfl 50.89 5.68 35.71 4,607,202 kpn 57.48 9.41 25.79 5,315,120 cgl 53.81 -62 97 eca 50.97 5.96 33.59 5,064,019 pdo 58.31 25.33 12.90 1,890,857 dba 58.65 -62 401 sbo 51.21 5.60 35.02 4,519,823 aba 58.38 5.60 10.51 5,650,368 spe 55.07 -61 199 sbz 51.34 7.27 39.06 4,683,551 pst 58.40 6.15 17.25 6,397,126 sty 52.09 -61 218 sty 52.09 6.84 37.77 4,809,037 dba 58.65 11.78 29.73 3,942,657 rho 48.50 -60 179 spq 52.11 6.60 37.89 4,858,887 pge 59.11 7.20 24.37 5,489,680 ecs 50.54 -59 176 raq 52.12 6.27 34.30 4,861,101 pgd 59.62 14.95 11.99 3,776,653 hav 48.99 -58 131 stm 52.22 6.55 37.92 4,857,432 eal 49.70 -58 160 kin 52.75 8.87 34.47 5,529,134 moy 52 8.5 35 4,070,018 dda 55.02 -57 236 tpas 52.79 17.47 41.05 1,139,203 ecart 5 5 13 1,332,214 sbz 51.34 -56 205 % 9 53 35 33 pgd 59.62 -55 126 pes 56.06 -54 305 eta 53.73 -54 223 men 43.52 -54 60 kin 52.75 -53 210 ral 44.21 -50 77 eic 57.44 -49 242 cpb 48.93 -39 219 pgi 48.29 -39 96 pfq 45.38 -37 89 clo 44.21 -35 150 bsu 43.51 -35 180 tma 46.25 -33 140 bae 43.22 -31 179 lpl 44.47 -30 53 sfo 50.88 -29 145 apt 53.04 -29 223 ppoy 45.51 -28 95 ppm 45.24 -25 95 ebt 56.51 -16 297 say 56.76 -16 272 sap 56.76 -16 272 xbo 44.97 -16 125 pdo 58.31 -15 109 tpas 52.79 -7 270 amo 47.97 -4 137 sect 43.29 -3 132 ype 47.64 3 110 ypg 47.60 3 112 aae 43.48 5 141
Groupes des autre-bactéries selon le taux de >4GC
[modifier | modifier le wikicode]Groupes 2 7
[modifier | modifier le wikicode]- Groupages couplés aux écarts relatifs à l'aléa
Groupe 2: 38 bactéries >4GC 0.8-4.4 %00 Groupe 7: 74 bactéries >4GC 5-10 %00 KEGG %GC >4GC >4AT DNA KEGG %GC >4GC >4AT DNA KEGG %GC >4GC >4AT DNA rty 28.92 0.82 99.29 1,111,496 tme 31.40 4.81 135.95 1,915,238 ppm 45.24 6.76 43.58 5,728,392 rpw 29.01 0.95 100.42 1,109,804 bsu 43.51 4.90 72.57 4,215,606 sty 52.09 6.84 37.77 4,809,037 rpr 29.00 0.95 100.55 1,111,523 ksa 53.74 4.99 34.67 4,902,024 plu 42.83 6.87 51.05 5,688,987 uur 25.50 1.12 147.16 751,719 lat 36.32 5.00 89.97 1,190,853 cko 53.83 7.00 31.57 4,720,462 cft 33.21 1.17 122.40 1,800,764 rho 48.50 5.02 46.76 3,592,125 amt 36.82 7.09 70.56 4,929,566 cff 33.31 1.17 121.97 1,773,615 bae 43.22 5.04 74.05 4,168,266 sect 43.29 7.15 61.10 1,441,139 cfv 33.26 1.23 123.39 1,866,009 xcb 64.96 5.23 5.84 5,148,708 pge 59.11 7.20 24.37 5,489,680 buc 26.31 1.36 185.43 640,681 bmv 68.15 5.25 5.64 3,497,479 psi 41.27 7.21 60.76 4,402,109 tsu 39.16 1.42 123.52 2,731,853 rpa 65.04 5.26 3.01 5,459,213 sbz 51.34 7.27 39.06 4,683,551 rip 28.48 1.43 169.87 574,390 clo 44.21 5.27 60.99 1,809,746 smx 62.65 7.31 6.91 3,908,022 ljf 34.49 1.49 83.08 1,755,993 eco 50.79 5.42 36.04 4,641,652 smk 62.67 7.36 6.95 3,820,344 fnc 27.12 1.73 144.60 2,268,272 chp 39.06 5.45 68.85 1,171,660 xbo 44.97 7.44 51.50 4,225,498 sep 32.10 1.77 76.43 2,499,279 hav 48.99 5.48 37.06 4,712,721 pae 66.56 7.48 4.45 6,264,404 gva 42.02 1.77 45.95 1,617,545 ent 52.98 5.52 32.12 4,518,712 ecla 55.18 7.54 28.38 4,633,407 sepp 32.12 1.78 75.40 2,490,012 sbo 51.21 5.60 35.02 4,519,823 pgi 48.29 7.57 33.46 2,343,476 ser 32.15 1.82 75.39 2,616,530 aba 58.38 5.60 10.51 5,650,368 bmf2 57.34 7.60 17.57 1,156,948 cjr 30.31 2.05 162.10 1,777,831 sfl 50.89 5.68 35.71 4,607,202 lhk 62.35 7.75 16.77 3,169,329 rri 32.47 2.09 93.01 1,257,710 xac 64.77 5.72 5.59 5,175,554 cgl 53.81 7.78 19.72 3,309,401 cdf 29.06 2.14 100.84 4,290,252 pfq 45.38 5.78 41.71 4,094,629 cgq 54.15 7.81 19.17 3,145,677 cje 30.55 2.14 160.17 1,641,481 ebf 54.02 5.79 30.02 4,762,179 aae 43.48 7.94 62.53 1,551,335 ple 26.17 2.15 143.87 358,242 lpl 44.47 5.84 36.53 3,308,273 bla 60.49 7.94 4.13 1,933,695 bpn 29.56 2.26 105.27 791,654 ctr 41.31 5.93 65.75 1,042,519 cpb 48.93 7.96 51.36 2,736,403 cad 29.93 2.36 87.91 3,105,335 eca 50.97 5.96 33.59 5,064,019 eno 55.07 8.01 28.21 4,726,582 asf 28.26 2.46 94.96 1,620,005 eal 49.70 5.97 38.99 4,701,875 koy 55.92 8.16 30.51 5,914,407 cac 30.93 2.49 95.73 3,940,880 pam 53.69 5.97 32.22 4,703,373 ror 55.88 8.26 28.72 5,398,151 lla 35.33 2.60 102.02 2,365,589 ret 61.27 6.02 9.09 4,381,608 rer 62.31 8.50 2.22 6,516,310 cpy 35.35 2.63 64.82 4,847,594 cta 41.30 6.02 65.49 1,044,459 eha 55.56 8.78 42.99 3,008,576 liv 37.13 2.70 90.41 2,928,879 pmr 38.90 6.12 68.33 4,063,606 cmn 40.34 8.81 74.88 1,072,952 spi 38.32 2.94 80.21 1,937,111 pst 58.40 6.15 17.25 6,397,126 spe 55.07 8.85 26.24 5,448,853 spl 39.09 2.96 63.32 1,796,846 ecs 50.54 6.22 38.21 5,498,450 kin 52.75 8.87 34.47 5,529,134 cbl 28.31 3.00 111.65 3,992,906 raq 52.12 6.27 34.30 4,861,101 cbd 42.44 9.01 84.09 2,158,758 men 43.52 3.46 41.37 538,294 blo 60.12 6.49 5.75 2,256,640 eta 53.73 9.30 32.52 3,883,467 sbn 46.28 3.78 37.32 5,347,283 cvi 64.83 6.49 9.94 4,751,080 kpn 57.48 9.41 25.79 5,315,120 cle 34.32 3.89 70.51 4,714,237 stm 52.22 6.55 37.92 4,857,432 sus 61.90 9.66 7.51 9,965,640 tde 37.87 4.02 126.87 2,843,201 spq 52.11 6.60 37.89 4,858,887 dda 55.02 9.77 29.59 4,679,450 ral 44.21 4.06 43.28 3,685,408 cnt 55.10 6.62 29.88 4,876,443 esa 56.77 4.23 29.49 4,368,373 bmf1 57.16 6.69 18.51 2,121,359 moy 52 6.8 37 4,104,170 cth 38.99 4.42 81.59 3,843,301 tma 46.25 6.70 49.16 1,860,725 ecart 8 1 24 1,639,023 ppoy 45.51 6.74 42.70 5,597,590 % 16 19 66 40 moy 34 2.3 100 2,334,524 ecart 7 1 38 1,345,668 % 19 44 38 58
- Groupage avec hypothèse de la résonance
Groupe G7 A39 n=80 Groupe G2 A158 n=22 KEGG %GC >4GC >4AT DNA KEGG %GC >4GC >4AT DNA KEGG %GC >4GC >4AT DNA tme 31.40 4.81 135.95 1,915,238 raq 52.12 6.27 34.30 4,861,101 zin 13.54 0.82 295.48 208,564 cle 34.32 3.89 70.51 4,714,237 stm 52.22 6.55 37.92 4,857,432 cru 13.98 0.37 330.82 162,589 lat 36.32 5.00 89.97 1,190,853 kin 52.75 8.87 34.47 5,529,134 crp 16.56 0.25 282.78 159,662 amt 36.82 7.09 70.56 4,929,566 ent 52.98 5.52 32.12 4,518,712 wbr 22.48 0.92 208.59 697,724 tde 37.87 4.02 126.87 2,843,201 pam 53.69 5.97 32.22 4,703,373 mcac 23.66 0.64 164.01 1,017,293 pmr 38.90 6.12 68.33 4,063,606 eta 53.73 9.30 32.52 3,883,467 sms 24.00 3.41 174.13 190,657 cth 38.99 4.42 81.59 3,843,301 ksa 53.74 4.99 34.67 4,902,024 uur 25.50 1.12 147.16 751,719 chp 39.06 5.45 68.85 1,171,660 cgl 53.81 7.78 19.72 3,309,401 ple 26.17 2.15 143.87 358,242 cmn 40.34 8.81 74.88 1,072,952 cko 53.83 7.00 31.57 4,720,462 buc 26.31 1.36 185.43 640,681 psi 41.27 7.21 60.76 4,402,109 ebf 54.02 5.79 30.02 4,762,179 fnc 27.12 1.73 144.60 2,268,272 cta 41.30 6.02 65.49 1,044,459 cgq 54.15 7.81 19.17 3,145,677 asf 28.26 2.46 94.96 1,620,005 ctr 41.31 5.93 65.75 1,042,519 dda 55.02 9.77 29.59 4,679,450 cbl 28.31 3.00 111.65 3,992,906 cbd 42.44 9.01 84.09 2,158,758 eno 55.07 8.01 28.21 4,726,582 rip 28.48 1.43 169.87 574,390 plu 42.83 6.87 51.05 5,688,987 spe 55.07 8.85 26.24 5,448,853 rty 28.92 0.82 99.29 1,111,496 bae 43.22 5.04 74.05 4,168,266 cnt 55.10 6.62 29.88 4,876,443 rpr 29.00 0.95 100.55 1,111,523 sect 43.29 7.15 61.10 1,441,139 ecla 55.18 7.54 28.38 4,633,407 rpw 29.01 0.95 100.42 1,109,804 aae 43.48 7.94 62.53 1,551,335 eha 55.56 8.78 42.99 3,008,576 cdf 29.06 2.14 100.84 4,290,252 bsu 43.51 4.90 72.57 4,215,606 ror 55.88 8.26 28.72 5,398,151 bpn 29.56 2.26 105.27 791,654 ral 44.21 4.06 43.28 3,685,408 koy 55.92 8.16 30.51 5,914,407 cad 29.93 2.36 87.91 3,105,335 clo 44.21 5.27 60.99 1,809,746 esa 56.77 4.23 29.49 4,368,373 cjr 30.31 2.05 162.10 1,777,831 lpl 44.47 5.84 36.53 3,308,273 bmf1 57.16 6.69 18.51 2,121,359 cje 30.55 2.14 160.17 1,641,481 xbo 44.97 7.44 51.50 4,225,498 bmf2 57.34 7.60 17.57 1,156,948 cac 30.93 2.49 95.73 3,940,880 ppm 45.24 6.76 43.58 5,728,392 kpn 57.48 9.41 25.79 5,315,120 pfq 45.38 5.78 41.71 4,094,629 aba 58.38 5.60 10.51 5,650,368 moy 26 1.6 158 1,432,862 ppoy 45.51 6.74 42.70 5,597,590 pst 58.40 6.15 17.25 6,397,126 ecart 5 0.9 69 1,298,284 tma 46.25 6.70 49.16 1,860,725 pge 59.11 7.20 24.37 5,489,680 % 20 55 43 91 sbn 46.28 3.78 37.32 5,347,283 blo 60.12 6.49 5.75 2,256,640 pgi 48.29 7.57 33.46 2,343,476 bla 60.49 7.94 4.13 1,933,695 Groupe G2 A86 n=16 rho 48.50 5.02 46.76 3,592,125 ret 61.27 6.02 9.09 4,381,608 cpb 48.93 7.96 51.36 2,736,403 sus 61.90 9.66 7.51 9,965,640 KEGG %GC >4GC >4AT DNA hav 48.99 5.48 37.06 4,712,721 rer 62.31 8.50 2.22 6,516,310 sep 32.10 1.77 76.43 2,499,279 eal 49.70 5.97 38.99 4,701,875 lhk 62.35 7.75 16.77 3,169,329 sepp 32.12 1.78 75.40 2,490,012 ecs 50.54 6.22 38.21 5,498,450 smx 62.65 7.31 6.91 3,908,022 ser 32.15 1.82 75.39 2,616,530 eco 50.79 5.42 36.04 4,641,652 smk 62.67 7.36 6.95 3,820,344 rri 32.47 2.09 93.01 1,257,710 sfl 50.89 5.68 35.71 4,607,202 xac 64.77 5.72 5.59 5,175,554 cft 33.21 1.17 122.40 1,800,764 eca 50.97 5.96 33.59 5,064,019 cvi 64.83 6.49 9.94 4,751,080 cfv 33.26 1.23 123.39 1,866,009 sbo 51.21 5.60 35.02 4,519,823 xcb 64.96 5.23 5.84 5,148,708 cff 33.31 1.17 121.97 1,773,615 sbz 51.34 7.27 39.06 4,683,551 rpa 65.04 5.26 3.01 5,459,213 ljf 34.49 1.49 83.08 1,755,993 sty 52.09 6.84 37.77 4,809,037 pae 66.56 7.48 4.45 6,264,404 lla 35.33 2.60 102.02 2,365,589 spq 52.11 6.60 37.89 4,858,887 bmv 68.15 5.25 5.64 3,497,479 cpy 35.35 2.63 64.82 4,847,594 liv 37.13 2.70 90.41 2,928,879 moy 51 6.6 39 4,106,380 spi 38.32 2.94 80.21 1,937,111 ecart 8 1.4 26 1,590,826 spl 39.09 2.96 63.32 1,796,846 % 16 20 69 39 tsu 39.16 1.42 123.52 2,731,853 gva 42.02 1.77 45.95 1,617,545 men 43.52 3.46 41.37 538,294 moy 36 2.1 86 2,176,476 ecart 4 0.7 27 933,080 % 10 35 31 43
Groupes 14 25 68
[modifier | modifier le wikicode]- Groupages couplés aux écarts relatifs à l'aléa
Groupe 14: 31 bactéries >4GC 11-18 %00 Groupe 25: 31 bactéries >4GC 21-33 %00 KEGG %GC >4GC >4AT DNA KEGG %GC >4GC >4AT DNA gba 72.56 10.82 0.26 5,311,527 scl 71.38 20.94 1.22 13,033,779 gau 64.27 11.05 3.56 4,636,964 mxa 68.89 21.48 1.02 9,139,763 sfo 50.88 11.13 32.79 5,488,183 gdi 66.43 21.58 6.03 3,944,163 pes 56.06 11.34 31.92 4,513,140 ebt 56.51 21.58 29.86 4,158,725 dpd 63.97 11.35 9.43 3,881,839 say 56.76 22.08 27.19 3,551,206 amo 47.97 11.46 41.77 2,160,700 fra 70.08 22.11 1.39 5,433,628 ppk 64.72 11.67 5.63 5,429,298 sap 56.76 22.12 27.21 3,472,898 asd 62.24 11.70 3.38 4,738,809 afw 73.53 22.17 0.33 5,277,990 dba 58.65 11.78 29.73 3,942,657 ccx 69.90 22.32 0.87 10,080,619 ype 47.64 11.87 38.12 4,653,728 dpt 66.16 22.44 9.20 2,147,060 ypg 47.60 11.88 38.49 4,504,254 sma 70.72 23.65 0.69 9,025,608 tro 63.65 11.88 3.15 2,003,006 sco 72.12 24.50 0.45 8,667,507 ams 70.82 12.31 0.88 8,773,466 dvl 63.01 24.57 4.99 3,462,887 amd 71.29 13.55 0.82 10,236,715 sho 72.04 24.73 0.47 9,840,102 apt 53.04 13.58 34.96 2,907,495 phm 73.29 24.86 0.59 3,803,225 req 68.82 14.04 0.42 5,043,170 mts 70.28 25.31 0.48 3,982,034 eic 57.44 14.25 23.22 3,812,301 pdo 58.31 25.33 12.90 1,890,857 nfa 70.83 14.30 0.46 6,021,225 sbh 70.75 25.40 0.84 11,936,683 roa 67.37 14.36 0.74 8,376,953 ipa 62.44 25.63 6.40 5,472,964 pgd 59.62 14.95 11.99 3,776,653 saci 62.27 26.08 8.25 9,629,675 rha 67.52 15.01 0.78 7,804,765 ssx 71.75 26.55 0.53 7,414,440 pac 60.01 15.05 5.45 2,560,265 salu 72.32 26.75 0.66 9,360,281 pak 60.10 15.11 5.39 2,495,334 sall 72.13 27.12 0.69 9,784,577 ddr 63.39 16.30 8.09 2,819,842 dge 66.64 27.98 7.14 2,467,205 ade 74.91 16.35 0.28 5,013,479 age 69.45 28.18 0.97 12,489,432 acp 74.72 16.38 0.27 5,029,329 rru 65.45 28.23 9.81 4,352,825 ank 74.84 16.52 0.25 5,061,632 scb 71.45 28.28 0.59 10,148,695 vin 68.94 16.63 1.72 4,350,553 ksk 74.20 28.47 0.38 8,783,278 sti 68.10 16.79 0.79 2,741,033 sct 72.94 28.63 0.53 6,283,062 cmi 72.66 16.98 0.40 3,297,891 sgr 72.23 30.32 0.46 8,545,929 tpas 52.79 17.47 41.05 1,139,203 salb 73.32 33.42 0.46 6,841,649 moy 63 13.8 12 4,597,594 moy 68 25.3 5 6,916,863 ecart 8 2 15 2,043,599 ecart 5 3 8 3,238,795 % 13 16 126 44 % 8 12 159 47 Groupe 68: 12 bactéries >4GC 38-116 %00 KEGG %GC >4GC >4AT DNA sur 67.46 38.05 2.45 10,260,756 opr 70.02 40.26 3.65 2,303,940 msv 62.36 43.71 15.11 3,249,394 tra 68.14 47.06 14.34 3,260,398 mrb 63.38 48.09 19.32 3,097,457 mhd 68.08 51.08 6.66 2,269,167 tsc 64.89 70.97 10.09 2,346,803 tai 63.79 82.29 3.86 1,848,474 tts 68.92 93.39 5.31 1,863,201 ttl 69.09 94.77 4.71 1,902,595 tth 69.44 95.48 4.44 1,894,877 tos 68.55 116.27 6.94 2,072,393 moy 67 68 8 3,030,788 ecart 3 27 5 2,339,315 % 4 39 67 77
- Groupage avec hypothèse de la résonance
G14,A1 n=13 G25,A1 n=20 G7,Ar n=53 KEGG %GC >4GC14 >4AT DNA KEGG %GC >4GC25 >4AT DNA KEGG %GC >4GCr >4ATr DNA acp 74.72 16.38 0.27 5,029,329 afw 73.53 22.17 0.33 5,277,990 aba 58.38 5.60 10.51 5,650,368 ade 74.91 16.35 0.28 5,013,479 age 69.45 28.18 0.97 12,489,432 bla 60.49 7.94 4.13 1,933,695 amd 71.29 13.55 0.82 10,236,715 ccx 69.90 22.32 0.87 10,080,619 blo 60.12 6.49 5.75 2,256,640 ams 70.82 12.31 0.88 8,773,466 fra 70.08 22.11 1.39 5,433,628 bmf1 57.16 6.69 18.51 2,121,359 ank 74.84 16.52 0.25 5,061,632 ksk 74.20 28.47 0.38 8,783,278 bmf2 57.34 7.60 17.57 1,156,948 cmi 72.66 16.98 0.40 3,297,891 mts 70.28 25.31 0.48 3,982,034 bmv 68.15 5.25 5.64 3,497,479 gba 72.56 10.82 0.26 5,311,527 mxa 68.89 21.48 1.02 9,139,763 cgl 53.81 7.78 19.72 3,309,401 nfa 70.83 14.30 0.46 6,021,225 phm 73.29 24.86 0.59 3,803,225 cgq 54.15 7.81 19.17 3,145,677 req 68.82 14.04 0.42 5,043,170 salb 73.32 33.42 0.46 6,841,649 cko 53.83 7.00 31.57 4,720,462 rha 67.52 15.01 0.78 7,804,765 sall 72.13 27.12 0.69 9,784,577 cnt 55.10 6.62 29.88 4,876,443 roa 67.37 14.36 0.74 8,376,953 salu 72.32 26.75 0.66 9,360,281 cpb 48.93 7.96 51.36 2,736,403 sti 68.10 16.79 0.79 2,741,033 sbh 70.75 25.40 0.84 11,936,683 cvi 64.83 6.49 9.94 4,751,080 vin 68.94 16.63 1.72 4,350,553 scb 71.45 28.28 0.59 10,148,695 dda 55.02 9.77 29.59 4,679,450 scl 71.38 20.94 1.22 13,033,779 eal 49.70 5.97 38.99 4,701,875 moy 71 14.9 0.62 5,927,826 sco 72.12 24.50 0.45 8,667,507 ebf 54.02 5.79 30.02 4,762,179 ecart 3 1.9 0.41 2,22,3175 sct 72.94 28.63 0.53 6,283,062 eca 50.97 5.96 33.59 5,064,019 % 4 13 66 38 sgr 72.23 30.32 0.46 8,545,929 ecla 55.18 7.54 28.38 4,633,407 sho 72.04 24.73 0.47 9,840,102 eco 50.79 5.42 36.04 4,641,652 G14,Ar n=18 sma 70.72 23.65 0.69 9,025,608 ecs 50.54 6.22 38.21 5,498,450 ssx 71.75 26.55 0.53 7,414,440 eha 55.56 8.78 42.99 3,008,576 KEGG %GC >4GC14 >4AT DNA eno 55.07 8.01 28.21 4,726,582 amo 47.97 11.46 41.77 2,160,700 moy 72 26 0.68 8493614.05 ent 52.98 5.52 32.12 4,518,712 apt 53.04 13.58 34.96 2,907,495 ecart 1 3 0.29 2611496.81 esa 56.77 4.23 29.49 4,368,373 asd 62.24 11.70 3.38 4,738,809 % 2 13 42 31 eta 53.73 9.30 32.52 3,883,467 dba 58.65 11.78 29.73 3,942,657 hav 48.99 5.48 37.06 4,712,721 ddr 63.39 16.30 8.09 2,819,842 G25,Ar n=11 kin 52.75 8.87 34.47 5,529,134 dpd 63.97 11.35 9.43 3,881,839 koy 55.92 8.16 30.51 5,914,407 eic 57.44 14.25 23.22 3,812,301 KEGG %GC >4GC25 >4AT DNA kpn 57.48 9.41 25.79 5,315,120 gau 64.27 11.05 3.56 4,636,964 dge 66.64 27.98 7.14 2,467,205 ksa 53.74 4.99 34.67 4,902,024 pac 60.01 15.05 5.45 2,560,265 dpt 66.16 22.44 9.20 2,147,060 lhk 62.35 7.75 16.77 3,169,329 pak 60.10 15.11 5.39 2,495,334 dvl 63.01 24.57 4.99 3,462,887 pae 66.56 7.48 4.45 6,264,404 pes 56.06 11.34 31.92 4,513,140 ebt 56.51 21.58 29.86 4,158,725 pam 53.69 5.97 32.22 4,703,373 pgd 59.62 14.95 11.99 3,776,653 gdi 66.43 21.58 6.03 3,944,163 pge 59.11 7.20 24.37 5,489,680 ppk 64.72 11.67 5.63 5,429,298 ipa 62.44 25.63 6.40 5,472,964 pgi 48.29 7.57 33.46 2,343,476 sfo 50.88 11.13 32.79 5,488,183 pdo 58.31 25.33 12.90 1,890,857 pst 58.40 6.15 17.25 6,397,126 tpas 52.79 17.47 41.05 1,139,203 rru 65.45 28.23 9.81 4,352,825 raq 52.12 6.27 34.30 4,861,101 tro 63.65 11.88 3.15 2,003,006 saci 62.27 26.08 8.25 9,629,675 rer 62.31 8.50 2.22 6,516,310 ype 47.64 11.87 38.12 4,653,728 sap 56.76 22.12 27.21 3,472,898 ret 61.27 6.02 9.09 4,381,608 ypg 47.60 11.88 38.49 4,504,254 say 56.76 22.08 27.19 3,551,206 rho 48.50 5.02 46.76 3,592,125 ror 55.88 8.26 28.72 5,398,151 moy 57 13 20 3,636,871 moy 62 24 14 4,050,042 rpa 65.04 5.26 3.01 5,459,213 ecart 6 2 15 1,245,257 ecart 4 3 10 2,121,018 sbo 51.21 5.60 35.02 4,519,823 % 11 16 75 34 % 7 10 71 52 sbz 51.34 7.27 39.06 4,683,551 sfl 50.89 5.68 35.71 4,607,202 smk 62.67 7.36 6.95 3,820,344 smx 62.65 7.31 6.91 3,908,022 spe 55.07 8.85 26.24 5,448,853 spq 52.11 6.60 37.89 4,858,887 stm 52.22 6.55 37.92 4,857,432 sty 52.09 6.84 37.77 4,809,037 sus 61.90 9.66 7.51 9,965,640 xac 64.77 5.72 5.59 5,175,554 xcb 64.96 5.23 5.84 5,148,708 moy 56 6.9 25 4,554,624 ecart 5 1.4 13 1,380,587 % 9 20 53 30
Groupes des autre-bactéries selon le taux de >4AT
[modifier | modifier le wikicode]Groupes I II III
[modifier | modifier le wikicode]Groupe III: 56 bactéries >4AT 23−52 %00 Groupe II: 47 bactéries >4AT 3−20 %00 Groupe I: 35 bactéries >4AT 0.3−2.5 %00 KEGG %GC >4GC >4AT DNA KEGG %GC >4GC >4AT DNA KEGG %GC >4GC >4AT DNA xbo 44.97 7.44 51.50 4,225,498 cgl 53.81 7.78 19.72 3,309,401 sur 67.46 38.05 2.45 10,260,756 cpb 48.93 7.96 51.36 2,736,403 mrb 63.38 48.09 19.32 3,097,457 rer 62.31 8.50 2.22 6,516,310 plu 42.83 6.87 51.05 5,688,987 cgq 54.15 7.81 19.17 3,145,677 vin 68.94 16.63 1.72 4,350,553 tma 46.25 6.70 49.16 1,860,725 bmf1 57.16 6.69 18.51 2,121,359 fra 70.08 22.11 1.39 5,433,628 rho 48.50 5.02 46.76 3,592,125 bmf2 57.34 7.60 17.57 1,156,948 scl 71.38 20.94 1.22 13,033,779 gva 42.02 1.77 45.95 1,617,545 pst 58.40 6.15 17.25 6,397,126 mxa 68.89 21.48 1.02 9,139,763 ppm 45.24 6.76 43.58 5,728,392 lhk 62.35 7.75 16.77 3,169,329 age 69.45 28.18 0.97 12,489,432 ral 44.21 4.06 43.28 3,685,408 msv 62.36 43.71 15.11 3,249,394 ams 70.82 12.31 0.88 8,773,466 eha 55.56 8.78 42.99 3,008,576 tra 68.14 47.06 14.34 3,260,398 ccx 69.90 22.32 0.87 10,080,619 ppoy 45.51 6.74 42.70 5,597,590 pdo 58.31 25.33 12.90 1,890,857 sbh 70.75 25.40 0.84 11,936,683 amo 47.97 11.46 41.77 2,160,700 pgd 59.62 14.95 11.99 3,776,653 amd 71.29 13.55 0.82 10,236,715 pfq 45.38 5.78 41.71 4,094,629 aba 58.38 5.60 10.51 5,650,368 sti 68.10 16.79 0.79 2,741,033 men 43.52 3.46 41.37 538,294 tsc 64.89 70.97 10.09 2,346,803 rha 67.52 15.01 0.78 7,804,765 tpas 52.79 17.47 41.05 1,139,203 cvi 64.83 6.49 9.94 4,751,080 roa 67.37 14.36 0.74 8,376,953 sbz 51.34 7.27 39.06 4,683,551 rru 65.45 28.23 9.81 4,352,825 sma 70.72 23.65 0.69 9,025,608 eal 49.70 5.97 38.99 4,701,875 dpd 63.97 11.35 9.43 3,881,839 sall 72.13 27.12 0.69 9,784,577 ypg 47.60 11.88 38.49 4,504,254 dpt 66.16 22.44 9.20 2,147,060 salu 72.32 26.75 0.66 9,360,281 ecs 50.54 6.22 38.21 5,498,450 ret 61.27 6.02 9.09 4,381,608 phm 73.29 24.86 0.59 3,803,225 ype 47.64 11.87 38.12 4,653,728 saci 62.27 26.08 8.25 9,629,675 scb 71.45 28.28 0.59 10,148,695 stm 52.22 6.55 37.92 4,857,432 ddr 63.39 16.30 8.09 2,819,842 ssx 71.75 26.55 0.53 7,414,440 spq 52.11 6.60 37.89 4,858,887 sus 61.90 9.66 7.51 9,965,640 sct 72.94 28.63 0.53 6,283,062 sty 52.09 6.84 37.77 4,809,037 dge 66.64 27.98 7.14 2,467,205 mts 70.28 25.31 0.48 3,982,034 sbn 46.28 3.78 37.32 5,347,283 smk 62.67 7.36 6.95 3,820,344 sho 72.04 24.73 0.47 9,840,102 hav 48.99 5.48 37.06 4,712,721 tos 68.55 116.27 6.94 2,072,393 nfa 70.83 14.30 0.46 6,021,225 lpl 44.47 5.84 36.53 3,308,273 smx 62.65 7.31 6.91 3,908,022 sgr 72.23 30.32 0.46 8,545,929 eco 50.79 5.42 36.04 4,641,652 mhd 68.08 51.08 6.66 2,269,167 salb 73.32 33.42 0.46 6,841,649 sfl 50.89 5.68 35.71 4,607,202 ipa 62.44 25.63 6.40 5,472,964 sco 72.12 24.50 0.45 8,667,507 sbo 51.21 5.60 35.02 4,519,823 gdi 66.43 21.58 6.03 3,944,163 req 68.82 14.04 0.42 5,043,170 apt 53.04 13.58 34.96 2,907,495 xcb 64.96 5.23 5.84 5,148,708 cmi 72.66 16.98 0.40 3,297,891 ksa 53.74 4.99 34.67 4,902,024 blo 60.12 6.49 5.75 2,256,640 ksk 74.20 28.47 0.38 8,783,278 kin 52.75 8.87 34.47 5,529,134 bmv 68.15 5.25 5.64 3,497,479 afw 73.53 22.17 0.33 5,277,990 raq 52.12 6.27 34.30 4,861,101 ppk 64.72 11.67 5.63 5,429,298 ade 74.91 16.35 0.28 5,013,479 eca 50.97 5.96 33.59 5,064,019 xac 64.77 5.72 5.59 5,175,554 acp 74.72 16.38 0.27 5,029,329 pgi 48.29 7.57 33.46 2,343,476 pac 60.01 15.05 5.45 2,560,265 gba 72.56 10.82 0.26 5,311,527 sfo 50.88 11.13 32.79 5,488,183 pak 60.10 15.11 5.39 2,495,334 ank 74.84 16.52 0.25 5,061,632 eta 53.73 9.30 32.52 3,883,467 tts 68.92 93.39 5.31 1,863,201 pam 53.69 5.97 32.22 4,703,373 dvl 63.01 24.57 4.99 3,462,887 moyen. 71 22 1 7,534,602 ent 52.98 5.52 32.12 4,518,712 ttl 69.09 94.77 4.71 1,902,595 ecartt 3 7 1 2,707,907 pes 56.06 11.34 31.92 4,513,140 pae 66.56 7.48 4.45 6,264,404 % 4 32 68 36 cko 53.83 7.00 31.57 4,720,462 tth 69.44 95.48 4.44 1,894,877 koy 55.92 8.16 30.51 5,914,407 bla 60.49 7.94 4.13 1,933,695 ebf 54.02 5.79 30.02 4,762,179 tai 63.79 82.29 3.86 1,848,474 cnt 55.10 6.62 29.88 4,876,443 opr 70.02 40.26 3.65 2,303,940 ebt 56.51 21.58 29.86 4,158,725 gau 64.27 11.05 3.56 4,636,964 dba 58.65 11.78 29.73 3,942,657 asd 62.24 11.70 3.38 4,738,809 dda 55.02 9.77 29.59 4,679,450 tro 63.65 11.88 3.15 2,003,006 esa 56.77 4.23 29.49 4,368,373 rpa 65.04 5.26 3.01 5,459,213 ror 55.88 8.26 28.72 5,398,151 ecla 55.18 7.54 28.38 4,633,407 moyen. 63 26 9 3,687,892 eno 55.07 8.01 28.21 4,726,582 ecartt 4 29 5 1,869,769 sap 56.76 22.12 27.21 3,472,898 % 6 110 57 51 say 56.76 22.08 27.19 3,551,206 spe 55.07 8.85 26.24 5,448,853 kpn 57.48 9.41 25.79 5,315,120 pge 59.11 7.20 24.37 5,489,680 eic 57.44 14.25 23.22 3,812,301 moyen. 51 8 36 4,274,344 ecartt 4 4 7 1,195,261 % 9 52 19 28
Groupes IV V
[modifier | modifier le wikicode]Groupe IV: 35 bactéries >4AT 61−112 %00 Groupe V: 19 bactéries >4AT 122−330 %00 KEGG %GC >4GC >4AT DNA KEGG %GC >4GC >4AT DNA cbl 28.31 3.00 111.65 3,992,906 cru 13.98 0.37 330.82 162,589 bpn 29.56 2.26 105.27 791,654 zin 13.54 0.82 295.48 208,564 lla 35.33 2.60 102.02 2,365,589 crp 16.56 0.25 282.78 159,662 cdf 29.06 2.14 100.84 4,290,252 wbr 22.48 0.92 208.59 697,724 rpr 29.00 0.95 100.55 1,111,523 buc 26.31 1.36 185.43 640,681 rpw 29.01 0.95 100.42 1,109,804 sms 24.00 3.41 174.13 190,657 rty 28.92 0.82 99.29 1,111,496 rip 28.48 1.43 169.87 574,390 cac 30.93 2.49 95.73 3,940,880 mcac 23.66 0.64 164.01 1,017,293 asf 28.26 2.46 94.96 1,620,005 cjr 30.31 2.05 162.10 1,777,831 rri 32.47 2.09 93.01 1,257,710 cje 30.55 2.14 160.17 1,641,481 liv 37.13 2.70 90.41 2,928,879 uur 25.50 1.12 147.16 751,719 lat 36.32 5.00 89.97 1,190,853 fnc 27.12 1.73 144.60 2,268,272 cad 29.93 2.36 87.91 3,105,335 ple 26.17 2.15 143.87 358,242 cbd 42.44 9.01 84.09 2,158,758 tme 31.40 4.81 135.95 1,915,238 ljf 34.49 1.49 83.08 1,755,993 tde 37.87 4.02 126.87 2,843,201 cth 38.99 4.42 81.59 3,843,301 tsu 39.16 1.42 123.52 2,731,853 spi 38.32 2.94 80.21 1,937,111 cfv 33.26 1.23 123.39 1,866,009 sep 32.10 1.77 76.43 2,499,279 cft 33.21 1.17 122.40 1,800,764 sepp 32.12 1.78 75.40 2,490,012 cff 33.31 1.17 121.97 1,773,615 ser 32.15 1.82 75.39 2,616,530 cmn 40.34 8.81 74.88 1,072,952 moyen. 27 2 175 1,230,515 bae 43.22 5.04 74.05 4,168,266 ecartt 7 1 62 894,543 bsu 43.51 4.90 72.57 4,215,606 % 26 71 36 73 amt 36.82 7.09 70.56 4,929,566 cle 34.32 3.89 70.51 4,714,237 chp 39.06 5.45 68.85 1,171,660 pmr 38.90 6.12 68.33 4,063,606 ctr 41.31 5.93 65.75 1,042,519 cta 41.30 6.02 65.49 1,044,459 cpy 35.35 2.63 64.82 4,847,594 spl 39.09 2.96 63.32 1,796,846 aae 43.48 7.94 62.53 1,551,335 sect 43.29 7.15 61.10 1,441,139 clo 44.21 5.27 60.99 1,809,746 psi 41.27 7.21 60.76 4,402,109 moyen. 36 4 81 2,525,415 ecartt 5 2 15 1,358,428 % 15 59 18 54
Autre-bactéries:ruptures entre les groupes à progression homogène
[modifier | modifier le wikicode]Autre-bactéries:taux >4GC | Autre-bactéries:taux >4AT KEGG %GC >4GC #% groupe KEGG %GC >4GC #% groupe | KEGG %GC >4AT #% groupe KEGG %GC >4AT #% groupe crp 16.56 0.25 47 **2** ecla 55.18 7.54 0 | ank 74.84 0.25 1 ** I ** ebf 54.02 30.02 2 cru 13.98 0.37 73 pgi 48.29 7.57 0 | gba 72.56 0.26 7 koy 55.92 30.51 3 mcac 23.66 0.64 28 bmf2 57.34 7.60 2 | acp 74.72 0.27 3 cko 53.83 31.57 1 zin 13.54 0.82 0 lhk 62.35 7.75 0 | ade 74.91 0.28 14 pes 56.06 31.92 1 rty 28.92 0.82 12 cgl 53.81 7.78 0 | afw 73.53 0.33 14 ent 52.98 32.12 0 wbr 22.48 0.92 3 cgq 54.15 7.81 2 | ksk 74.20 0.38 5 pam 53.69 32.22 1 rpw 29.01 0.95 1 aae 43.48 7.94 0 | cmi 72.66 0.40 5 eta 53.73 32.52 1 rpr 29.00 0.95 17 bla 60.49 7.94 0 | req 68.82 0.42 6 sfo 50.88 32.79 2 uur 25.50 1.12 4 cpb 48.93 7.96 1 | sco 72.12 0.45 2 pgi 48.29 33.46 0 cft 33.21 1.17 0 eno 55.07 8.01 2 | salb 73.32 0.46 1 eca 50.97 33.59 2 cff 33.31 1.17 5 koy 55.92 8.16 1 | sgr 72.23 0.46 0 raq 52.12 34.30 0 cfv 33.26 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Cyanobactéries
[modifier | modifier le wikicode]Résultats
[modifier | modifier le wikicode]- 49 cyanobactéries
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl amr; 6503724; 47.2538502556382; 10416; 10587; 5035; 5129; 326355; 328365; 281253; 278396; 21993; 22178; 15244; 14978; 0 ana; 6413771; 41.3475473321389; 16139; 16308; 2701; 2590; 375551; 373179; 217679; 219026; 32204; 31846; 11639; 11672; 0 anb1; 4329264; 38.1047679236009; 13593; 14177; 1732; 1792; 273098; 273360; 136468; 136365; 25851; 25468; 6772; 6679; 0 awa; 5705437; 38.3934657415374; 18155; 17745; 2918; 2971; 358006; 356146; 181670; 182265; 33948; 33241; 9024; 9078; 0 calo; 7023215; 42.2471617343339; 17692; 17973; 2603; 2775; 394859; 395858; 238674; 236977; 34547; 34477; 12327; 12492; 0 can; 4114099; 34.9583225877647; 19398; 19033; 2471; 2506; 269395; 269454; 115224; 114077; 29524; 29218; 7231; 7224; 0 ceo; 2794318; 33.4134840773312; 13692; 13306; 883; 923; 186877; 187285; 70249; 69932; 19102; 19070; 3401; 3451; 0 cep; 5315554; 40.1620602480946; 14530; 14528; 1940; 1796; 326651; 327212; 167659; 163102; 26922; 27297; 7157; 7088; 0 cgc; 3342364; 68.7071785119754; 327; 352; 7556; 7434; 63268; 65282; 263980; 262377; 1080; 1222; 15352; 15262; 0 ccmp; 6284095; 45.7272208647387; 10774; 10577; 2761; 2828; 322135; 322676; 230737; 229250; 23856; 23875; 10511; 10328; 0 csg; 7003560; 42.3024290503687; 18567; 18625; 3461; 3387; 400542; 399679; 244069; 242873; 35554; 35302; 12278; 12290; 0 cthe; 6315792; 44.4402697238921; 13550; 13261; 3054; 2999; 345476; 344449; 216431; 214522; 28235; 28332; 9321; 9420; 0 cya; 2932766; 60.2373322658541; 2730; 2755; 5483; 5428; 93931; 93463; 187008; 187846; 6399; 6511; 12273; 12232; 0 cyh; 4669813; 39.8213375995998; 15231; 14994; 3554; 3545; 295614; 295114; 153998; 153608; 26465; 26253; 10835; 10669; 0 cytc; 4934271; 37.875402465734; 17294; 17824; 3060; 3064; 318932; 321159; 153124; 153452; 29602; 29800; 10516; 10635; 0 cyu; 1443806; 31.1167843879302; 6935; 7384; 144; 144; 99409; 99718; 32240; 33183; 10273; 10710; 789; 815; 0 dsl; 3781008; 42.438365642178; 10365; 10678; 4065; 3920; 227939; 230652; 129168; 128699; 20654; 20656; 7187; 7180; 0 fis; 5821603; 40.9862884844604; 16150; 16890; 1740; 1912; 339436; 340711; 189937; 191040; 29722; 29769; 8922; 8994; 0 gei; 4681111; 58.4630870748419; 5951; 5828; 5192; 5067; 147413; 145992; 260053; 262737; 12485; 12251; 15289; 15064; 0 gen; 4150181; 33.3448107443989; 19988; 20294; 1321; 1416; 274030; 276293; 109244; 109996; 31237; 31016; 4394; 4405; 0 glp; 5431448; 43.2694375422539; 11624; 11913; 1119; 1099; 318839; 320753; 171681; 171718; 24518; 24693; 5236; 5307; 0 gvi; 4659019; 61.9978583474332; 4727; 4949; 5596; 5574; 139766; 140310; 293549; 293291; 8395; 8595; 13546; 13515; 0 hao; 4179170; 42.9225420358588; 10669; 11153; 2960; 2941; 251074; 255329; 142989; 142124; 20936; 21362; 8889; 8982; 0 lep; 5125950; 43.8673611720754; 13297; 13745; 1417; 1474; 273441; 277369; 188578; 186836; 24163; 24931; 7403; 7344; 0 len; 6244812; 46.6455995792988; 8355; 8414; 1607; 1668; 345998; 345528; 216003; 219001; 21647; 21473; 6689; 6967; 0 mar; 5842795; 42.3306311448545; 20469; 20818; 5798; 5646; 326735; 326500; 212716; 214301; 33221; 33546; 14604; 14099; 0 mic; 7470429; 46.2148157756402; 14670; 14431; 4759; 4741; 402745; 402180; 300621; 299833; 29105; 28538; 15039; 14766; 0 naz; 5354700; 38.4485592096663; 15628; 15844; 1635; 1670; 329014; 329013; 171970; 171683; 30142; 30314; 7535; 7750; 0 non; 6463965; 40.6307583658018; 16414; 16519; 2620; 2600; 385929; 385723; 212318; 212478; 32411; 32181; 10022; 10168; 0 oac; 7689443; 47.6010941234625; 17035; 16687; 9362; 9630; 401162; 397639; 344008; 344310; 32328; 32182; 25811; 25893; 0 oni; 7479014; 45.8676504683639; 19394; 19840; 4057; 4051; 398146; 400028; 284712; 286596; 37104; 37459; 13330; 13360; 0 plp; 4986817; 45.1933367516795; 13027; 13176; 1828; 1829; 271127; 271467; 181279; 180333; 23381; 23911; 8160; 8067; 0 pma; 1751080; 36.4421385659136; 5813; 5830; 332; 306; 116283; 117515; 50854; 51126; 10441; 10544; 1460; 1428; 0 pmg; 1641879; 31.3398855823115; 9967; 9929; 258; 243; 114294; 113247; 40246; 40673; 12449; 11958; 1121; 1070; 0 pmh; 1738790; 31.1450491433698; 10643; 10443; 273; 266; 120591; 119911; 42641; 42436; 13543; 12907; 1153; 1083; 0 pmm; 1657990; 30.7991604291944; 9706; 9560; 296; 249; 116937; 116443; 40236; 39875; 12795; 12503; 1168; 1081; 0 pmt; 2410873; 50.7397738245747; 2292; 3055; 1261; 983; 106121; 122264; 117770; 106083; 5503; 7098; 4762; 3878; 1 pmb; 1669886; 31.3215393146598; 10046; 10071; 267; 266; 115742; 115453; 40731; 41448; 12608; 12330; 1164; 1118; 0 riv; 8698463; 37.5358037391203; 28658; 28772; 2727; 2503; 569332; 570162; 251812; 250448; 53968; 53707; 10338; 10006; 0 scs; 5041209; 35.9532604182846; 19418; 19090; 649; 599; 343770; 342356; 134516; 135265; 32320; 32464; 4180; 4178; 0 syc; 2696255; 55.484329189932; 2387; 2392; 1617; 1558; 108940; 109175; 133191; 132733; 5750; 5659; 6451; 6556; 0 syf; 2695903; 55.4700224748442; 2368; 2411; 1536; 1600; 108960; 109286; 132285; 133380; 5634; 5771; 6521; 6457; 0 syn; 3573470; 47.7202551021836; 9619; 9472; 5690; 5659; 184173; 183791; 174968; 176236; 16661; 16318; 12958; 13031; 0 synd; 2572069; 59.0852733733037; 1561; 1578; 2408; 2369; 89219; 90093; 155100; 155007; 3505; 3630; 7274; 7056; 0 synp; 3510253; 40.6197502003417; 8967; 8869; 1384; 1287; 206958; 207186; 122450; 121593; 17274; 17217; 6357; 6227; 0 syp; 3008047; 49.6310396745796; 8007; 7975; 3993; 3879; 142243; 142250; 143536; 143079; 13099; 13126; 10606; 10643; 0 syq; 3570114; 47.7351983718167; 9600; 9460; 5690; 5657; 183947; 183569; 174876; 176162; 16638; 16300; 12959; 13031; 0 tel; 2593857; 53.917929939854; 3401; 3324; 4511; 4614; 109114; 110208; 132923; 133267; 7053; 7100; 9503; 9446; 0 ter; 7750108; 34.1433564538714; 37143; 37166; 1995; 2070; 492579; 493214; 210252; 212491; 53851; 53094; 8276; 8325; 0
Tableau des diagrammes
[modifier | modifier le wikicode]Tableau des diagrammes
[modifier | modifier le wikicode]- Légende:
- − >4ATa, >4GCa ce sont les aléas calculés à partir de l’équation des courbes de tendance des aléas où x est %GC
- * pour >4ATa l’équation est: −0.000732x3 + 0.1607x2 −11.96x + 302.42
- * pour >4GCa l’équation est: 0.000746x3 −0.0609x2 + 1.869x −19.90
- − <5GCa, <5ATa ce sont les aléas calculés à partir de l’équation des courbes de tendance des aléas où x est %GC
- * pour <5GCa l'équation est: 2.86x − 49.02
- * pour <5ATa l'équation est: −2.83x + 235.7
- − dGCa, dATa différences avec l'aléa, dGAa = >4GC − >4GCa, dATa = >4AT − >4ATa.
- Voir à la suite le tableau non formaté.
| dGCa | >dATa | KEGG | Chromosome | %GC | >4GC | >4AT | <5GC | <5AT | Ctrl | base | >4ATa | >4GCa | <5GCa | <5ATa |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4.50 | 13.53 | amr | 6,503,724 | 47.25 | 15.63 | 32.29 | 90.70 | 107.46 | 0 | 18.76 | 11.12 | 86.18 | 101.79 | |
| 2.27 | 19.77 | ana | 6,413,771 | 41.35 | 8.25 | 50.59 | 71.72 | 126.72 | 0 | 30.81 | 5.98 | 69.28 | 118.53 | |
| 3.99 | 24.70 | anb1 | 4,329,264 | 38.10 | 8.14 | 64.14 | 66.13 | 138.08 | 0 | 39.45 | 4.15 | 60.00 | 127.72 | |
| 6.03 | 24.31 | awa | 5,705,437 | 38.39 | 10.32 | 62.92 | 66.96 | 136.95 | 0 | 38.62 | 4.29 | 60.83 | 126.90 | |
| 1.06 | 22.09 | calo | 7,023,215 | 42.25 | 7.66 | 50.78 | 71.26 | 122.41 | 0 | 28.69 | 6.59 | 71.85 | 115.98 | |
| 9.23 | 44.04 | can | 4,114,099 | 34.96 | 12.10 | 93.41 | 59.25 | 145.25 | 0 | 49.37 | 2.86 | 51.00 | 136.64 | |
| -0.64 | 12.52 | ccmp | 6,284,095 | 45.73 | 8.89 | 33.98 | 76.51 | 110.21 | 0 | 21.46 | 9.53 | 81.81 | 106.12 | |
| 4.09 | 41.78 | ceo | 2,794,318 | 33.41 | 6.46 | 96.62 | 52.62 | 147.56 | 0 | 54.84 | 2.37 | 46.58 | 141.01 | |
| 1.79 | 20.87 | cep | 5,315,554 | 40.16 | 7.03 | 54.67 | 64.90 | 133.21 | 0 | 33.79 | 5.24 | 65.89 | 121.89 | |
| -18.14 | 0.33 | cgc | 3,342,364 | 68.71 | 44.85 | 2.03 | 166.64 | 39.15 | 0 | 1.70 | 62.99 | 147.56 | 41.00 | |
| 3.14 | 24.54 | csg | 7,003,560 | 42.30 | 9.78 | 53.10 | 73.04 | 124.38 | 0 | 28.56 | 6.63 | 72.01 | 115.83 | |
| 1.25 | 18.50 | cthe | 6,315,792 | 44.44 | 9.58 | 42.45 | 71.20 | 118.19 | 0 | 23.95 | 8.34 | 78.13 | 109.77 | |
| 2.45 | 13.75 | cya | 2,932,766 | 60.24 | 37.20 | 18.70 | 136.17 | 68.30 | 0 | 4.95 | 34.75 | 123.32 | 65.00 | |
| 10.16 | 30.04 | cyh | 4,669,813 | 39.82 | 15.20 | 64.72 | 70.48 | 137.79 | 0 | 34.69 | 5.04 | 64.91 | 122.86 | |
| 8.37 | 31.05 | cytc | 4,934,271 | 37.88 | 12.41 | 71.17 | 66.42 | 141.76 | 0 | 40.12 | 4.04 | 59.34 | 128.37 | |
| 0.24 | 35.42 | cyu | 1,443,806 | 31.12 | 1.99 | 99.18 | 46.42 | 152.45 | 0 | 63.75 | 1.75 | 40.01 | 147.52 | |
| 14.39 | 27.41 | dsl | 3,781,008 | 42.44 | 21.12 | 55.65 | 72.00 | 132.21 | 0 | 28.25 | 6.73 | 72.40 | 115.44 | |
| 0.53 | 25.05 | fis | 5,821,603 | 40.99 | 6.27 | 56.75 | 68.52 | 127.05 | 0 | 31.70 | 5.74 | 68.24 | 119.55 | |
| -8.35 | 19.10 | gei | 4,681,111 | 58.46 | 21.92 | 25.16 | 118.16 | 67.96 | 0 | 6.06 | 30.27 | 118.25 | 70.03 | |
| 4.25 | 41.97 | gen | 4,150,181 | 33.34 | 6.59 | 97.06 | 54.95 | 147.60 | 0 | 55.09 | 2.35 | 46.38 | 141.21 | |
| -3.28 | 16.93 | glp | 5,431,448 | 43.27 | 4.08 | 43.33 | 65.17 | 126.82 | 0 | 26.40 | 7.36 | 74.78 | 113.08 | |
| -15.68 | 16.74 | gvi | 4,659,019 | 62.00 | 23.98 | 20.77 | 131.77 | 63.76 | 0 | 4.03 | 39.65 | 128.36 | 60.01 | |
| 7.03 | 25.05 | hao | 4,179,170 | 42.92 | 14.12 | 52.22 | 72.50 | 131.29 | 0 | 27.16 | 7.09 | 73.78 | 114.07 | |
| -5.22 | 7.05 | len | 6,244,812 | 46.65 | 5.24 | 26.85 | 71.85 | 117.64 | 0 | 19.80 | 10.47 | 84.44 | 103.52 | |
| -2.21 | 27.63 | lep | 5,125,950 | 43.87 | 5.64 | 52.76 | 76.11 | 117.03 | 0 | 25.13 | 7.85 | 76.49 | 111.39 | |
| 12.93 | 42.17 | mar | 5,842,795 | 42.33 | 19.59 | 70.66 | 78.00 | 123.23 | 0 | 28.49 | 6.65 | 72.09 | 115.75 | |
| 2.70 | 18.39 | mic | 7,470,429 | 46.21 | 12.72 | 38.95 | 84.37 | 115.46 | 0 | 20.57 | 10.02 | 83.20 | 104.74 | |
| 1.86 | 20.32 | naz | 5,354,700 | 38.45 | 6.17 | 58.77 | 67.03 | 134.18 | 0 | 38.46 | 4.31 | 60.98 | 126.75 | |
| 2.56 | 18.36 | non | 6,463,965 | 40.63 | 8.08 | 50.95 | 68.84 | 129.37 | 0 | 32.59 | 5.52 | 67.23 | 120.56 | |
| 13.18 | 25.67 | oac | 7,689,443 | 47.60 | 24.70 | 43.85 | 96.24 | 112.27 | 0 | 18.19 | 11.52 | 87.17 | 100.81 | |
| 1.17 | 31.26 | oni | 7,479,014 | 45.87 | 10.84 | 52.46 | 79.96 | 116.69 | 0 | 21.20 | 9.67 | 82.21 | 105.72 | |
| -1.69 | 30.07 | plp | 4,986,817 | 45.19 | 7.33 | 52.54 | 75.77 | 118.29 | 0 | 22.47 | 9.02 | 80.28 | 107.63 | |
| 0.23 | 22.00 | pma | 1,751,080 | 36.44 | 3.64 | 66.49 | 59.89 | 145.50 | 0 | 44.49 | 3.42 | 55.24 | 132.43 | |
| 1.39 | 57.55 | pmb | 1,669,886 | 31.32 | 3.19 | 120.47 | 50.58 | 153.38 | 0 | 62.92 | 1.80 | 40.59 | 146.94 | |
| 1.25 | 58.33 | pmg | 1,641,879 | 31.34 | 3.05 | 121.18 | 50.62 | 153.45 | 0 | 62.84 | 1.81 | 40.64 | 146.89 | |
| 1.34 | 57.63 | pmh | 1,738,790 | 31.15 | 3.10 | 121.27 | 50.21 | 153.53 | 0 | 63.64 | 1.76 | 40.09 | 147.44 | |
| 1.61 | 51.14 | pmm | 1,657,990 | 30.80 | 3.29 | 116.20 | 49.67 | 156.02 | 0 | 65.06 | 1.67 | 39.10 | 148.42 | |
| -6.27 | 8.61 | pmt | 2,410,872 | 50.74 | 9.31 | 22.18 | 96.44 | 99.96 | 1 | N | 13.57 | 15.57 | 96.15 | 91.92 |
| 2.13 | 24.90 | riv | 8,698,463 | 37.54 | 6.01 | 66.02 | 60.08 | 143.38 | 0 | 41.13 | 3.88 | 58.37 | 129.33 | |
| -0.75 | 30.33 | scs | 5,041,209 | 35.95 | 2.48 | 76.39 | 55.17 | 148.95 | 0 | 46.06 | 3.23 | 53.84 | 133.82 | |
| -11.95 | 9.34 | syc | 2,696,255 | 55.48 | 11.78 | 17.72 | 103.45 | 85.13 | 0 | 8.39 | 23.72 | 109.72 | 78.47 | |
| -12.06 | 9.32 | syf | 2,695,903 | 55.47 | 11.63 | 17.73 | 103.36 | 85.19 | 0 | 8.40 | 23.70 | 109.68 | 78.51 | |
| 20.11 | 35.43 | syn | 3,573,470 | 47.72 | 31.76 | 53.42 | 105.55 | 112.20 | 0 | 17.99 | 11.65 | 87.51 | 100.47 | |
| -13.22 | 6.55 | synd | 2,572,069 | 59.09 | 18.57 | 12.20 | 126.14 | 72.49 | 0 | 5.65 | 31.79 | 120.03 | 68.27 | |
| 2.10 | 18.19 | synp | 3,510,253 | 40.62 | 7.61 | 50.81 | 73.11 | 127.81 | 0 | 32.62 | 5.51 | 67.20 | 120.59 | |
| 12.14 | 38.05 | syp | 3,008,047 | 49.63 | 26.17 | 53.13 | 102.35 | 103.30 | 0 | 15.08 | 14.03 | 92.98 | 95.06 | |
| 20.11 | 35.42 | syq | 3,570,114 | 47.74 | 31.78 | 53.39 | 105.61 | 112.17 | 0 | 17.97 | 11.67 | 87.55 | 100.43 | |
| 14.44 | 16.04 | tel | 2,593,857 | 53.92 | 35.18 | 25.93 | 109.93 | 90.01 | 0 | 9.88 | 20.74 | 105.24 | 82.91 | |
| 2.65 | 43.68 | ter | 7,750,108 | 34.14 | 5.25 | 95.88 | 56.69 | 141.00 | 0 | 52.21 | 2.59 | 48.67 | 138.95 |
- Tableau non formaté
dGCa;dATa;KEGG;Chromosoe;%GC;>4GC;>4AT;<5GC;<5AT;Ctrl ;base;>4ATa;>4GCa;<5GCa;<5ATa 4.50;13.53;amr;6,503,724;47.25;15.63;32.29;90.70;107.46;0;;18.76;11.12;86.18;101.79 2.27;19.77;ana;6,413,771;41.35;8.25;50.59;71.72;126.72;0;;30.81;5.98;69.28;118.53 3.99;24.70;anb1;4,329,264;38.10;8.14;64.14;66.13;138.08;0;;39.45;4.15;60.00;127.72 6.03;24.31;awa;5,705,437;38.39;10.32;62.92;66.96;136.95;0;;38.62;4.29;60.83;126.90 1.06;22.09;calo;7,023,215;42.25;7.66;50.78;71.26;122.41;0;;28.69;6.59;71.85;115.98 9.23;44.04;can;4,114,099;34.96;12.10;93.41;59.25;145.25;0;;49.37;2.86;51.00;136.64 -0.64;12.52;ccmp;6,284,095;45.73;8.89;33.98;76.51;110.21;0;;21.46;9.53;81.81;106.12 4.09;41.78;ceo;2,794,318;33.41;6.46;96.62;52.62;147.56;0;;54.84;2.37;46.58;141.01 1.79;20.87;cep;5,315,554;40.16;7.03;54.67;64.90;133.21;0;;33.79;5.24;65.89;121.89 -18.14;0.33;cgc;3,342,364;68.71;44.85;2.03;166.64;39.15;0;;1.70;62.99;147.56;41.00 3.14;24.54;csg;7,003,560;42.30;9.78;53.10;73.04;124.38;0;;28.56;6.63;72.01;115.83 1.25;18.50;cthe;6,315,792;44.44;9.58;42.45;71.20;118.19;0;;23.95;8.34;78.13;109.77 2.45;13.75;cya;2,932,766;60.24;37.20;18.70;136.17;68.30;0;;4.95;34.75;123.32;65.00 10.16;30.04;cyh;4,669,813;39.82;15.20;64.72;70.48;137.79;0;;34.69;5.04;64.91;122.86 8.37;31.05;cytc;4,934,271;37.88;12.41;71.17;66.42;141.76;0;;40.12;4.04;59.34;128.37 0.24;35.42;cyu;1,443,806;31.12;1.99;99.18;46.42;152.45;0;;63.75;1.75;40.01;147.52 14.39;27.41;dsl;3,781,008;42.44;21.12;55.65;72.00;132.21;0;;28.25;6.73;72.40;115.44 0.53;25.05;fis;5,821,603;40.99;6.27;56.75;68.52;127.05;0;;31.70;5.74;68.24;119.55 -8.35;19.10;gei;4,681,111;58.46;21.92;25.16;118.16;67.96;0;;6.06;30.27;118.25;70.03 4.25;41.97;gen;4,150,181;33.34;6.59;97.06;54.95;147.60;0;;55.09;2.35;46.38;141.21 -3.28;16.93;glp;5,431,448;43.27;4.08;43.33;65.17;126.82;0;;26.40;7.36;74.78;113.08 -15.68;16.74;gvi;4,659,019;62.00;23.98;20.77;131.77;63.76;0;;4.03;39.65;128.36;60.01 7.03;25.05;hao;4,179,170;42.92;14.12;52.22;72.50;131.29;0;;27.16;7.09;73.78;114.07 -5.22;7.05;len;6,244,812;46.65;5.24;26.85;71.85;117.64;0;;19.80;10.47;84.44;103.52 -2.21;27.63;lep;5,125,950;43.87;5.64;52.76;76.11;117.03;0;;25.13;7.85;76.49;111.39 12.93;42.17;mar;5,842,795;42.33;19.59;70.66;78.00;123.23;0;;28.49;6.65;72.09;115.75 2.70;18.39;mic;7,470,429;46.21;12.72;38.95;84.37;115.46;0;;20.57;10.02;83.20;104.74 1.86;20.32;naz;5,354,700;38.45;6.17;58.77;67.03;134.18;0;;38.46;4.31;60.98;126.75 2.56;18.36;non;6,463,965;40.63;8.08;50.95;68.84;129.37;0;;32.59;5.52;67.23;120.56 13.18;25.67;oac;7,689,443;47.60;24.70;43.85;96.24;112.27;0;;18.19;11.52;87.17;100.81 1.17;31.26;oni;7,479,014;45.87;10.84;52.46;79.96;116.69;0;;21.20;9.67;82.21;105.72 -1.69;30.07;plp;4,986,817;45.19;7.33;52.54;75.77;118.29;0;;22.47;9.02;80.28;107.63 0.23;22.00;pma;1,751,080;36.44;3.64;66.49;59.89;145.50;0;;44.49;3.42;55.24;132.43 1.39;57.55;pmb;1,669,886;31.32;3.19;120.47;50.58;153.38;0;;62.92;1.80;40.59;146.94 1.25;58.33;pmg;1,641,879;31.34;3.05;121.18;50.62;153.45;0;;62.84;1.81;40.64;146.89 1.34;57.63;pmh;1,738,790;31.15;3.10;121.27;50.21;153.53;0;;63.64;1.76;40.09;147.44 1.61;51.14;pmm;1,657,990;30.80;3.29;116.20;49.67;156.02;0;;65.06;1.67;39.10;148.42 -6.27;8.61;pmt;2,410,872;50.74;9.31;22.18;96.44;99.96;1;N;13.57;15.57;96.15;91.92 2.13;24.90;riv;8,698,463;37.54;6.01;66.02;60.08;143.38;0;;41.13;3.88;58.37;129.33 -0.75;30.33;scs;5,041,209;35.95;2.48;76.39;55.17;148.95;0;;46.06;3.23;53.84;133.82 -11.95;9.34;syc;2,696,255;55.48;11.78;17.72;103.45;85.13;0;;8.39;23.72;109.72;78.47 -12.06;9.32;syf;2,695,903;55.47;11.63;17.73;103.36;85.19;0;;8.40;23.70;109.68;78.51 20.11;35.43;syn;3,573,470;47.72;31.76;53.42;105.55;112.20;0;;17.99;11.65;87.51;100.47 -13.22;6.55;synd;2,572,069;59.09;18.57;12.20;126.14;72.49;0;;5.65;31.79;120.03;68.27 2.10;18.19;synp;3,510,253;40.62;7.61;50.81;73.11;127.81;0;;32.62;5.51;67.20;120.59 12.14;38.05;syp;3,008,047;49.63;26.17;53.13;102.35;103.30;0;;15.08;14.03;92.98;95.06 20.11;35.42;syq;3,570,114;47.74;31.78;53.39;105.61;112.17;0;;17.97;11.67;87.55;100.43 14.44;16.04;tel;2,593,857;53.92;35.18;25.93;109.93;90.01;0;;9.88;20.74;105.24;82.91 2.65;43.68;ter;7,750,108;34.14;5.25;95.88;56.69;141.00;0;;52.21;2.59;48.67;138.95
Tableau des écarts relatifs / aléa
[modifier | modifier le wikicode]- Voir à la suite, le tableau non formaté.
- Répétitions chez 49 cyanobactéries. Voir méthode d’analyse (3.4.1) dans l’article.
- Légende:
- >4GC %: 100*(>4GC − >4GCa)/>4GCa . Voir Tableau des diagrammes des répétitions pour >4GC et >4GCa.
- >4AT %: respectivement de même que précédent.
| %GC | >4GC% | >4AT% | |
|---|---|---|---|
| pmm | 30.80 | 96 | 79 |
| cyu | 31.12 | 14 | 56 |
| pmh | 31.15 | 76 | 91 |
| pmb | 31.32 | 77 | 91 |
| pmg | 31.34 | 69 | 93 |
| gen | 33.34 | 181 | 76 |
| ceo | 33.41 | 173 | 76 |
| ter | 34.14 | 102 | 84 |
| can | 34.96 | 322 | 89 |
| scs | 35.95 | -23 | 66 |
| pma | 36.44 | 7 | 49 |
| riv | 37.54 | 55 | 61 |
| cytc | 37.88 | 207 | 77 |
| anb1 | 38.10 | 96 | 63 |
| awa | 38.39 | 141 | 63 |
| naz | 38.45 | 43 | 53 |
| cyh | 39.82 | 202 | 87 |
| cep | 40.16 | 34 | 62 |
| synp | 40.62 | 38 | 56 |
| non | 40.63 | 46 | 56 |
| fis | 40.99 | 9 | 79 |
| ana | 41.35 | 38 | 64 |
| calo | 42.25 | 16 | 77 |
| csg | 42.30 | 47 | 86 |
| mar | 42.33 | 194 | 148 |
| dsl | 42.44 | 214 | 97 |
| hao | 42.92 | 99 | 92 |
| glp | 43.27 | -45 | 64 |
| lep | 43.87 | -28 | 110 |
| cthe | 44.44 | 15 | 77 |
| plp | 45.19 | -19 | 134 |
| cmp | 45.73 | -7 | 58 |
| oni | 45.87 | 12 | 147 |
| mic | 46.21 | 27 | 89 |
| len | 46.65 | -50 | 36 |
| amr | 47.25 | 40 | 72 |
| oac | 47.60 | 114 | 141 |
| syn | 47.72 | 173 | 197 |
| syq | 47.74 | 172 | 197 |
| syp | 49.63 | 87 | 252 |
| pmt | 50.74 | -40 | 63 |
| tel | 53.92 | 70 | 162 |
| syf | 55.47 | -51 | 111 |
| syc | 55.48 | -50 | 111 |
| gei | 58.46 | -28 | 315 |
| synd | 59.09 | -42 | 116 |
| cya | 60.24 | 7 | 278 |
| gvi | 62.00 | -40 | 415 |
| cgc | 68.71 | -29 | 19 |
- Tableau non formaté
;%GC;>4GC%;>4AT% pmm;30.80;96;79 cyu;31.12;14;56 pmh;31.15;76;91 pmb;31.32;77;91 pmg;31.34;69;93 gen;33.34;181;76 ceo;33.41;173;76 ter;34.14;102;84 can;34.96;322;89 scs;35.95;-23;66 pma;36.44;7;49 riv;37.54;55;61 cytc;37.88;207;77 anb1;38.10;96;63 awa;38.39;141;63 naz;38.45;43;53 cyh;39.82;202;87 cep;40.16;34;62 synp;40.62;38;56 non;40.63;46;56 fis;40.99;9;79 ana;41.35;38;64 calo;42.25;16;77 csg;42.30;47;86 mar;42.33;194;148 dsl;42.44;214;97 hao;42.92;99;92 glp;43.27;-45;64 lep;43.87;-28;110 cthe;44.44;15;77 plp;45.19;-19;134 cmp;45.73;-7;58 oni;45.87;12;147 mic;46.21;27;89 len;46.65;-50;36 amr;47.25;40;72 oac;47.60;114;141 syn;47.72;173;197 syq;47.74;172;197 syp;49.63;87;252 pmt;50.74;-40;63 tel;53.92;70;162 syf;55.47;-51;111 syc;55.48;-50;111 gei;58.46;-28;315 synd;59.09;-42;116 cya;60.24;7;278 gvi;62.00;-40;415 cgc;68.71;-29;19
Groupes des cyanobactéries selon l'écart relatif par rapport à l'aléa
[modifier | modifier le wikicode]- Voir à la suite, le tableau non formaté.
- Répétitions chez 49 cyanobactéries. Voir méthode d’analyse (3.4.1) dans l’article.
- Légende:
- >4GC %: 100*(>4GC − >4GCa)/>4GCa . Voir Tableau des diagrammes des répétitions pour >4GC et >4GCa.
- >4AT %: respectivement de même que précédent.
| groupe | 22c | n=26 | groupe | 67c1 | n=9 | ||||||||||
| KEGG | %GC | >4GC | >4AT | DNA | KEGG | %GC | >4GC% | >4AT% | KEGG | %GC | >4GC | >4AT | DNA | ||
| pmm | 30.80 | 3.29 | 116.20 | 1,657,990 | scs | 35.95 | -23 | 66 | oni | 45.87 | 10.84 | 52.46 | 7,479,014 | ||
| cyu | 31.12 | 1.99 | 99.18 | 1,443,806 | pma | 36.44 | 7 | 49 | cthe | 44.44 | 9.58 | 42.45 | 6,315,792 | ||
| pmh | 31.15 | 3.10 | 121.27 | 1,738,790 | fis | 40.99 | 9 | 79 | mic | 46.21 | 12.72 | 38.95 | 7,470,429 | ||
| pmb | 31.32 | 3.19 | 120.47 | 1,669,886 | cyu | 31.12 | 14 | 56 | amr | 47.25 | 15.63 | 32.29 | 6,503,724 | ||
| pmg | 31.34 | 3.05 | 121.18 | 1,641,879 | calo | 42.25 | 16 | 77 | tel | 53.92 | 35.18 | 25.93 | 2,593,857 | ||
| gen | 33.34 | 6.59 | 97.06 | 4,150,181 | cep | 40.16 | 34 | 62 | syp | 49.63 | 26.17 | 53.13 | 3,008,047 | ||
| ceo | 33.41 | 6.46 | 96.62 | 2,794,318 | synp | 40.62 | 38 | 56 | oac | 47.60 | 24.70 | 43.85 | 7,689,443 | ||
| ter | 34.14 | 5.25 | 95.88 | 7,750,108 | ana | 41.35 | 38 | 64 | syq | 47.74 | 31.78 | 53.39 | 3,570,114 | ||
| can | 34.96 | 12.10 | 93.41 | 4,114,099 | naz | 38.45 | 43 | 53 | syn | 47.72 | 31.76 | 53.42 | 3,573,470 | ||
| pma | 36.44 | 3.64 | 66.49 | 1,751,080 | non | 40.63 | 46 | 56 | |||||||
| riv | 37.54 | 6.01 | 66.02 | 8,698,463 | csg | 42.30 | 47 | 86 | moyen. | 48 | 22 | 44 | 5,355,988 | ||
| cytc | 37.88 | 12.41 | 71.17 | 4,934,271 | riv | 37.54 | 55 | 61 | ecartt | 3 | 10 | 10 | 2,126,339 | ||
| anb1 | 38.10 | 8.14 | 64.14 | 4,329,264 | pmg | 31.34 | 69 | 93 | % | 6 | 45 | 23 | 40 | ||
| awa | 38.39 | 10.32 | 62.92 | 5,705,437 | pmh | 31.15 | 76 | 91 | |||||||
| naz | 38.45 | 6.17 | 58.77 | 5,354,700 | pmb | 31.32 | 77 | 91 | groupe | 67c2 | n=10 | ||||
| cyh | 39.82 | 15.20 | 64.72 | 4,669,813 | anb1 | 38.10 | 96 | 63 | KEGG | %GC | >4GC | >4AT | DNA | ||
| cep | 40.16 | 7.03 | 54.67 | 5,315,554 | pmm | 30.80 | 96 | 79 | glp | 43.27 | 4.08 | 43.33 | 5,431,448 | ||
| synp | 40.62 | 7.61 | 50.81 | 3,510,253 | hao | 42.92 | 99 | 92 | lep | 43.87 | 5.64 | 52.76 | 5,125,950 | ||
| non | 40.63 | 8.08 | 50.95 | 6,463,965 | ter | 34.14 | 102 | 84 | plp | 45.19 | 7.33 | 52.54 | 4,986,817 | ||
| fis | 40.99 | 6.27 | 56.75 | 5,821,603 | awa | 38.39 | 141 | 63 | cmp | 45.73 | 8.89 | 33.98 | 6,284,095 | ||
| ana | 41.35 | 8.25 | 50.59 | 6,413,771 | ceo | 33.41 | 173 | 76 | len | 46.65 | 5.24 | 26.85 | 6,244,812 | ||
| calo | 42.25 | 7.66 | 50.78 | 7,023,215 | gen | 33.34 | 181 | 76 | pmt | 50.74 | 9.31 | 22.18 | 2,410,873 | ||
| csg | 42.30 | 9.78 | 53.10 | 7,003,560 | mar | 42.33 | 194 | 148 | syf | 55.47 | 11.63 | 17.73 | 2,695,903 | ||
| mar | 42.33 | 19.59 | 70.66 | 5,842,795 | cyh | 39.82 | 202 | 87 | syc | 55.48 | 11.78 | 17.72 | 2,696,255 | ||
| dsl | 42.44 | 21.12 | 55.65 | 3,781,008 | cytc | 37.88 | 207 | 77 | gei | 58.46 | 21.92 | 25.16 | 4,681,111 | ||
| hao | 42.92 | 14.12 | 52.22 | 4,179,170 | dsl | 42.44 | 214 | 97 | synd | 59.09 | 18.57 | 12.20 | 2,572,069 | ||
| can | 34.96 | 322 | 89 | ||||||||||||
| moyen. | 37 | 8 | 75 | 4,529,192 | moyen. | 50 | 10 | 30 | 4,312,933 | ||||||
| ecartt | 4 | 5 | 25 | 2,083,497 | KEGG | %GC | >4GC% | >4AT% | ecartt | 6 | 6 | 15 | 1,563,339 | ||
| % | 11 | 59 | 33 | 46 | syf | 55.47 | -51 | 111 | % | 12 | 56 | 48 | 36 | ||
| syc | 55.48 | -50 | 111 | ||||||||||||
| groupe | 23c | len | 46.65 | -50 | 36 | ||||||||||
| KEGG | %GC | >4GC | >4AT | DNA | glp | 43.27 | -45 | 64 | |||||||
| scs | 35.95 | 2.48 | 76.39 | 5,041,209 | synd | 59.09 | -42 | 116 | |||||||
| pmt | 50.74 | -40 | 63 | ||||||||||||
| lep | 43.87 | -28 | 110 | groupe | 41c | n=3 | |||||||||
| gei | 58.46 | -28 | 315 | KEGG | %GC | >4GC | >4AT | DNA | |||||||
| plp | 45.19 | -19 | 134 | gvi | 62.00 | 23.98 | 20.77 | 4,659,019 | |||||||
| cmp | 45.73 | -7 | 58 | cgc | 68.71 | 44.85 | 2.03 | 3,342,364 | |||||||
| oni | 45.87 | 12 | 147 | cya | 60.24 | 37.20 | 18.70 | 2,932,766 | |||||||
| cthe | 44.44 | 15 | 77 | ||||||||||||
| mic | 46.21 | 27 | 89 | moyen. | 64 | 35 | 14 | 3644716 | |||||||
| amr | 47.25 | 40 | 72 | ecartt | 4 | 11 | 10 | 901970 | |||||||
| tel | 53.92 | 70 | 162 | % | 7 | 30 | 74 | 25 | |||||||
| syp | 49.63 | 87 | 252 | ||||||||||||
| oac | 47.60 | 114 | 141 | ||||||||||||
| syq | 47.74 | 172 | 197 | ||||||||||||
| syn | 47.72 | 173 | 197 | ||||||||||||
| KEGG | %GC | >4GC% | >4AT% | ||||||||||||
| cya | 60.24 | 7 | 278 | ||||||||||||
| cgc | 68.71 | -29 | 19 | ||||||||||||
| gvi | 62.00 | -40 | 415 |
- Tableau non formaté.
Groupe; 22c;;N=26;;;;;;;;Groupe; 67c1;;N=9; KEGG;%GC;>4GC;>4AT;DNA;;KEGG;%GC;>4GC%;>4AT%;;KEGG;%GC;>4GC;>4AT;DNA pmm;30.80;3.29;116.20;1,657,990;;scs;35.95;-23;66;;oni;45.87;10.84;52.46;7,479,014 cyu;31.12;1.99;99.18;1,443,806;;pma;36.44;7;49;;cthe;44.44;9.58;42.45;6,315,792 pmh;31.15;3.10;121.27;1,738,790;;fis;40.99;9;79;;mic;46.21;12.72;38.95;7,470,429 pmb;31.32;3.19;120.47;1,669,886;;cyu;31.12;14;56;;amr;47.25;15.63;32.29;6,503,724 pmg;31.34;3.05;121.18;1,641,879;;calo;42.25;16;77;;tel;53.92;35.18;25.93;2,593,857 gen;33.34;6.59;97.06;4,150,181;;cep;40.16;34;62;;syp;49.63;26.17;53.13;3,008,047 ceo;33.41;6.46;96.62;2,794,318;;synp;40.62;38;56;;oac;47.60;24.70;43.85;7,689,443 ter;34.14;5.25;95.88;7,750,108;;ana;41.35;38;64;;syq;47.74;31.78;53.39;3,570,114 can;34.96;12.10;93.41;4,114,099;;naz;38.45;43;53;;syn;47.72;31.76;53.42;3,573,470 pma;36.44;3.64;66.49;1,751,080;;non;40.63;46;56;;;;;; riv;37.54;6.01;66.02;8,698,463;;csg;42.30;47;86;;moyen.;48;22;44;5,355,988 cytc;37.88;12.41;71.17;4,934,271;;riv;37.54;55;61;;ecartt;3;10;10;2,126,339 anb1;38.10;8.14;64.14;4,329,264;;pmg;31.34;69;93;;% ;6;45;23;40 awa;38.39;10.32;62.92;5,705,437;;pmh;31.15;76;91;;;;;; naz;38.45;6.17;58.77;5,354,700;;pmb;31.32;77;91;;Groupe; 67c2;;N=10; cyh;39.82;15.20;64.72;4,669,813;;anb1;38.10;96;63;;KEGG;%GC;>4GC;>4AT;DNA cep;40.16;7.03;54.67;5,315,554;;pmm;30.80;96;79;;glp;43.27;4.08;43.33;5,431,448 synp;40.62;7.61;50.81;3,510,253;;hao;42.92;99;92;;lep;43.87;5.64;52.76;5,125,950 non;40.63;8.08;50.95;6,463,965;;ter;34.14;102;84;;plp;45.19;7.33;52.54;4,986,817 fis;40.99;6.27;56.75;5,821,603;;awa;38.39;141;63;;cmp;45.73;8.89;33.98;6,284,095 ana;41.35;8.25;50.59;6,413,771;;ceo;33.41;173;76;;len;46.65;5.24;26.85;6,244,812 calo;42.25;7.66;50.78;7,023,215;;gen;33.34;181;76;;pmt;50.74;9.31;22.18;2,410,873 csg;42.30;9.78;53.10;7,003,560;;mar;42.33;194;148;;syf;55.47;11.63;17.73;2,695,903 mar;42.33;19.59;70.66;5,842,795;;cyh;39.82;202;87;;syc;55.48;11.78;17.72;2,696,255 dsl;42.44;21.12;55.65;3,781,008;;cytc;37.88;207;77;;gei;58.46;21.92;25.16;4,681,111 hao;42.92;14.12;52.22;4,179,170;;dsl;42.44;214;97;;synd;59.09;18.57;12.20;2,572,069 ;;;;;;can;34.96;322;89;;;;;; moyen.;37;8;75;4,529,192;;;;;;;moyen.;50;10;30;4,312,933 ecartt;4;5;25;2,083,497;;KEGG;%GC;>4GC%;>4AT%;;ecartt;6;6;15;1,563,339 % ;11;59;33;46;;syf;55.47;-51;111;;% ;12;56;48;36 ;;;;;;syc;55.48;-50;111;;;;;; Groupe; 23c;;;;;len;46.65;-50;36;;;;;; KEGG;%GC;>4GC;>4AT;DNA;;glp;43.27;-45;64;;;;;; scs;35.95;2.48;76.39;5,041,209;;synd;59.09;-42;116;;;;;; ;;;;;;pmt;50.74;-40;63;;;;;; ;;;;;;lep;43.87;-28;110;;Groupe;41c;;N=3; ;;;;;;gei;58.46;-28;315;;KEGG;%GC;>4GC;>4AT;DNA ;;;;;;plp;45.19;-19;134;;gvi;62.00;23.98;20.77;4,659,019 ;;;;;;cmp;45.73;-7;58;;cgc;68.71;44.85;2.03;3,342,364 ;;;;;;oni;45.87;12;147;;cya;60.24;37.20;18.70;2,932,766 ;;;;;;cthe;44.44;15;77;;;;;; ;;;;;;mic;46.21;27;89;;moyen.;64;35;14;3644716 ;;;;;;amr;47.25;40;72;;ecartt;4;11;10;901970 ;;;;;;tel;53.92;70;162;;% ;7;30;74;25 ;;;;;;syp;49.63;87;252;;;;;; ;;;;;;oac;47.60;114;141;;;;;; ;;;;;;syq;47.74;172;197;;;;;; ;;;;;;syn;47.72;173;197;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;KEGG;%GC;>4GC%;>4AT%;;;;;; ;;;;;;cya;60.24;7;278;;;;;; ;;;;;;cgc;68.71;-29;19;;;;;; ;;;;;;gvi;62.00;-40;415;;;;;;
Cyanobactéries:ruptures entre les groupes à progression homogène
[modifier | modifier le wikicode]cyanobactéries:taux >4GC | cyanobactéries:taux >4AT KEGG %GC >4GC #% groupe | KEGG %GC >4AT #% groupe cyu 31.12 1.99 19.4 ** 2 ** | cgc 68.71 2.03 83 ** I ** scs 35.95 2.48 18.9 | synd 59.09 12.20 31 ** II ** pmg 31.34 3.05 1.6 | syc 55.48 17.72 0 pmh 31.15 3.10 2.9 | syf 55.47 17.73 5 pmb 31.32 3.19 2.9 | cya 60.24 18.70 10 pmm 30.80 3.29 9.8 | gvi 62.00 20.77 6 pma 36.44 3.64 10.8 | pmt 50.74 22.18 12 glp 43.27 4.08 22.1 | gei 58.46 25.16 3 len 46.65 5.24 0.0 ** 7 ** | tel 53.92 25.93 3 ter 34.14 5.25 7.0 | len 46.65 26.85 17 lep 43.87 5.64 6.2 | amr 47.25 32.29 5 riv 37.54 6.01 2.6 | ccmp 45.73 33.98 13 naz 38.45 6.17 1.6 | mic 46.21 38.95 8 fis 40.99 6.27 2.9 | cthe 44.44 42.45 2 ceo 33.41 6.46 2.0 | glp 43.27 43.33 1 gen 33.34 6.59 6.2 | oac 47.60 43.85 13 cep 40.16 7.03 4.2 | ana 41.35 50.59 0 ** III ** plp 45.19 7.33 3.6 | calo 42.25 50.78 0 synp 40.62 7.61 0.6 | synp 40.62 50.81 0 calo 42.25 7.66 5.2 | non 40.63 50.95 2 non 40.63 8.08 0.8 | hao 42.92 52.22 0 anb1 38.10 8.14 1.3 | oni 45.87 52.46 0 ana 41.35 8.25 7.2 | plp 45.19 52.54 0 ccmp 45.73 8.89 4.4 | lep 43.87 52.76 1 pmt 50.74 9.31 2.9 | csg 42.30 53.10 0 cthe 44.44 9.58 2.0 | syp 49.63 53.13 0 csg 42.30 9.78 5.3 | syq 47.74 53.39 0 awa 38.39 10.32 4.8 | syn 47.72 53.42 2 oni 45.87 10.84 6.8 | cep 40.16 54.67 2 syf 55.47 11.63 1.2 | dsl 42.44 55.65 2 syc 55.48 11.78 2.7 | fis 40.99 56.75 3 can 34.96 12.10 2.5 | naz 38.45 58.77 7 cytc 37.88 12.41 2.4 | awa 38.39 62.92 2 mic 46.21 12.72 9.9 | anb1 38.10 64.14 1 hao 42.92 14.12 7.1 | cyh 39.82 64.72 2 cyh 39.82 15.20 2.7 | riv 37.54 66.02 1 amr 47.25 15.63 15.9 | pma 36.44 66.49 6 synd 59.09 18.57 5.2 ** 14 ** | mar 42.33 70.66 1 mar 42.33 19.59 7.3 | cytc 37.88 71.17 7 dsl 42.44 21.12 3.6 | scs 35.95 76.39 18 gei 58.46 21.92 8.6 | can 34.96 93.41 3 ** IV ** gvi 62.00 23.98 2.9 | ter 34.14 95.88 1 oac 47.60 24.70 5.6 | ceo 33.41 96.62 0 syp 49.63 26.17 17.6 | gen 33.34 97.06 2 syn 47.72 31.76 0.1 ** 25 ** | cyu 31.12 99.18 15 syq 47.74 31.78 9.7 | pmm 30.80 116.20 4 ** V ** tel 53.92 35.18 5.4 | pmb 31.32 120.47 1 cya 60.24 37.20 17.0 | pmg 31.34 121.18 0 cgc 68.71 44.85 ** 68 ** | pmh 31.15 121.27
Archées
[modifier | modifier le wikicode]Résultats
[modifier | modifier le wikicode]KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<5T;<5A;<5C;<5G;Ctrl abi; 1486778; 39.1579644035626; 4384; 4317; 601; 525; 92031; 92388; 55219; 53398; 0 afu; 2178400; 48.5816654425266; 4176; 4092; 1438; 1352; 114638; 116220; 99861; 101337; 0 aho; 2137654; 34.148136227846; 6312; 6619; 262; 256; 157260; 159314; 64346; 62355; 0 ape; 1669696; 56.3112686381233; 582; 516; 3378; 3384; 56354; 54419; 103690; 101807; 0 asc; 1496453; 57.2173666663771; 429; 415; 1904; 1892; 53301; 52914; 95459; 94733; 0 clg; 1546846; 30.0340176074412; 6897; 7166; 392; 371; 120405; 120159; 39936; 41003; 0 cma; 2077567; 43.0958423964185; 761; 783; 1348; 1335; 134791; 135251; 98064; 97954; 0 csu; 1680938; 51.649674170017; 2545; 2506; 846; 835; 72934; 73153; 84121; 86081; 0 dka; 1365223; 45.3391130972742; 1089; 966; 930; 832; 70167; 66956; 63430; 59083; 0 ffo; 1319206; 37.474207970552; 5874; 5511; 450; 430; 86051; 83717; 41939; 40309; 0 fpl; 2196266; 44.1354098274071; 6258; 6456; 683; 792; 131349; 132255; 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80005; 82336; 193365; 194203; 0 hvo; 2847757; 66.6385860872258; 601; 578; 1668; 1684; 67985; 65659; 185760; 186125; 0 hwa; 3132494; 47.8639065230452; 2192; 2238; 894; 835; 152471; 153465; 119125; 116558; 0 hxa; 3668009; 65.9817901210166; 574; 552; 1748; 1739; 83739; 83919; 235930; 237368; 0 iag; 1875953; 35.6865550469548; 2602; 2725; 401; 460; 111622; 111901; 54171; 55053; 0 iho; 1297538; 56.5203485369985; 464; 478; 2278; 2367; 57717; 57167; 78708; 78272; 0 kcr; 1590757; 49.000695895099; 1021; 925; 1825; 1918; 67756; 69272; 76187; 79805; 0 mac; 5751492; 42.6808904541639; 22122; 21231; 2295; 2378; 334359; 330098; 238049; 236155; 0 marc; 1937883; 54.0039310938792; 1072; 1196; 1308; 1434; 75183; 76256; 112606; 112958; 0 mba; 4837408; 39.276220519971; 19314; 20134; 1027; 1062; 302213; 305746; 173835; 170335; 23 mbg; 2789774; 60.6400375084147; 1373; 1218; 3971; 3999; 81322; 79763; 182538; 185668; 0 mbn; 2542943; 54.5136088382634; 5077; 5358; 2272; 2321; 97801; 97541; 153408; 154097; 0 mbu; 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79676; 79575; 88453; 87644; 0 mmh; 2012424; 42.6182057061534; 5607; 5066; 698; 703; 114331; 112751; 86553; 86497; 0 mmp; 1661137; 33.1003403090775; 10599; 10969; 343; 331; 121332; 122394; 43894; 44713; 0 mok; 1662525; 29.2986872377859; 10676; 10400; 398; 416; 121331; 121217; 45939; 45543; 0 mpd; 2957635; 54.9168846054364; 4416; 4501; 1629; 1621; 109790; 108512; 170237; 169499; 0 mpi; 2843290; 47.3991748995002; 6307; 6644; 1418; 1449; 139349; 141885; 131602; 133223; 0 mpl; 2922917; 55.3536757971574; 2593; 2687; 2607; 2609; 102084; 100067; 172981; 173730; 0 mpy; 3072769; 44.6108705210187; 5611; 5530; 796; 792; 162068; 163222; 131433; 132066; 0 mse; 2191517; 46.2253315853813; 2031; 2011; 1218; 1284; 117467; 118872; 104803; 109759; 0 msi; 1853160; 31.0342334175139; 8966; 9739; 258; 122; 137970; 144839; 51066; 44043; 0 mst; 1767403; 27.6337088937837; 8920; 9619; 133; 123; 134614; 137615; 35685; 35763; 0 mth; 1751377; 49.5439302902802; 1933; 1875; 1783; 1858; 77637; 76276; 96360; 96201; 0 mtp; 1879471; 53.5458777833941; 1016; 960; 961; 930; 63224; 63326; 97527; 94394; 21 mzh; 2138444; 39.1560405603327; 6412; 5917; 369; 423; 126620; 124792; 76751; 77178; 0 nbv; 1232128; 33.1577563370039; 6430; 6376; 60; 64; 89551; 89517; 31520; 30667; 0 neq; 490885; 31.559530236206; 2668; 2678; 221; 212; 35758; 35865; 13576; 13650; 0 nga; 2833868; 48.3472060095954; 4630; 4886; 531; 574; 137568; 141686; 121548; 124273; 0 nge; 3788356; 62.2355185204347; 850; 837; 1468; 1630; 101208; 103186; 217768; 219746; 0 nkr; 1639964; 34.1831893870841; 8432; 8113; 163; 150; 115719; 115571; 42612; 42544; 0 nmg; 3751858; 61.4208213637083; 745; 736; 1395; 1369; 105308; 105444; 213119; 212066; 0 nmr; 1645259; 34.1675079729088; 8036; 7467; 150; 129; 118629; 116138; 42722; 41466; 0 nou; 4013216; 64.9358021098291; 860; 864; 2743; 2732; 91605; 91428; 254032; 254155; 0 nph; 2595221; 63.440223395233; 764; 763; 1462; 1517; 70998; 70523; 163166; 164967; 0 pai; 2222430; 51.362517604604; 3690; 4053; 3217; 3341; 100084; 100451; 111038; 114821; 0 pdl; 2023836; 53.9139535021612; 613; 571; 1356; 1345; 70152; 69203; 107700; 105228; 0 pfm; 1843267; 54.9060819161438; 344; 386; 1241; 1199; 65361; 64788; 95338; 96118; 65 pho; 1738505; 41.8789707248469; 3197; 3090; 948; 912; 112634; 112098; 74438; 71596; 0 ppac; 1859370; 43.0442569257329; 5092; 4564; 680; 780; 114466; 112174; 71786; 75522; 0 pto; 1545895; 35.9704248994919; 6033; 6028; 140; 113; 99972; 99987; 55264; 54825; 0 sali; 3255260; 66.5859869872145; 319; 313; 1762; 1727; 66788; 66940; 218355; 218121; 0 smr; 1570485; 35.7265430742732; 3045; 3885; 511; 544; 102867; 107170; 44814; 49028; 0 sso; 2992245; 35.7874276792112; 7301; 6919; 611; 706; 212450; 209582; 94140; 94872; 21 taa; 3430706; 34.1388040828914; 12354; 12415; 574; 536; 241391; 240916; 98138; 97900; 0 tac; 1564906; 45.9943919954298; 1969; 2053; 322; 316; 76970; 78382; 71191; 72154; 0 tag; 1316595; 46.7343412362951; 1504; 1522; 951; 960; 73364; 71953; 57837; 60506; 0 tar; 1461105; 58.302996704549; 422; 473; 1744; 1674; 47042; 48223; 94261; 93375; 0 thg; 1356318; 55.6411549503877; 531; 599; 1685; 1766; 47211; 47340; 73555; 74800; 0 tko; 2088737; 51.9954881825716; 2612; 2550; 1388; 1448; 98105; 99579; 112138; 111757; 0 ton; 1847607; 51.2727003091025; 2003; 2140; 960; 996; 87319; 88895; 96099; 98522; 0 tpe; 1781889; 57.6656570639361; 1115; 1124; 2477; 2343; 62341; 61844; 102484; 100870; 0 tuz; 1936063; 59.6550835380873; 831; 899; 2090; 2152; 57989; 59605; 126490; 129724; 0 vdi; 2374137; 45.4277069941625; 1230; 1198; 629; 582; 138880; 137617; 116457; 120382; 0
Tableau des diagrammes
[modifier | modifier le wikicode]Tableau des diagrammes
[modifier | modifier le wikicode]Les 87 archées
[modifier | modifier le wikicode]Répétitions chez les archées x3 -0.000732 0.000746 x2 0.1607 -0.0609 Voir méthode d’analyse (3.4.1) dans l’article x -11.96 1.869 2.86 -2.83 Différences c 302.42 -19.90 -49.02 235.7 avec l’aléa >4GC- >4AT- Aléas équation Aléas équation >4GCa >4ATa KEGG effectif %GC >4GC >4AT <5GC <5AT Ctrl base >4ATa >4GCa <5GCa <5ATa KEGG archées 2.90 22.05 abi 1,486,778 39.16 7.57 58.52 73.06 124.04 0 36.47 4.68 63.01 124.74 abi e 0.13 21.32 afu 2,178,400 48.58 12.81 37.95 92.36 105.98 0 16.63 12.68 89.98 98.03 afu e -0.17 8.30 aho 2,137,654 34.15 2.42 60.49 59.27 148.09 0 52.19 2.60 48.68 138.93 aho c 15.07 -1.10 ape 1,669,696 56.31 40.50 6.58 123.07 66.34 0 7.68 25.42 112.09 76.13 ape c -2.02 -1.32 asc 1,496,453 57.22 25.37 5.64 127.10 70.98 0 6.96 27.39 114.68 73.56 asc c 3.44 22.63 clg 1,546,846 30.03 4.93 90.91 52.33 155.52 0 68.29 1.49 36.91 150.59 clg c 5.69 -19.35 cma 2,077,567 43.10 12.91 7.43 94.35 129.98 0 26.78 7.23 74.28 113.58 cma c -6.94 17.63 csu 1,680,938 51.65 10.00 30.05 101.25 86.91 0 12.42 16.94 98.75 89.34 csu t 3.75 -7.14 dka 1,365,223 45.34 12.91 15.05 89.74 100.44 0 22.19 9.16 80.70 107.22 dka c 2.81 44.99 ffo 1,319,206 37.47 6.67 86.30 62.35 128.69 0 41.31 3.86 58.20 129.51 ffo c -1.36 33.32 fpl 2,196,266 44.14 6.72 57.89 75.22 120.02 0 24.57 8.07 77.25 110.63 fpl e -1.91 27.66 gac 1,860,815 46.84 8.76 47.12 88.51 102.26 0 19.47 10.67 84.99 102.97 gac e -40.79 1.07 hal 2,014,239 67.91 19.02 2.97 136.93 40.18 0 1.91 59.82 145.28 43.25 hal e -29.24 0.74 hbo 2,820,544 61.06 7.75 5.24 112.63 63.07 0 4.50 36.99 125.69 62.66 hbo e -5.16 -4.08 hbu 1,667,163 53.74 15.25 5.99 106.78 73.51 0 10.07 20.42 104.72 83.42 hbu e -41.52 1.03 hla 2,735,295 66.72 13.76 3.26 131.01 42.38 0 2.24 55.27 141.88 46.63 hla e -30.17 2.07 hlr 2,789,326 61.95 9.34 6.12 114.75 57.54 0 4.05 39.51 128.22 60.16 hlr e -32.14 1.02 hma1 3,131,724 62.36 8.59 4.88 122.56 54.74 0 3.86 40.73 129.41 58.98 hma1 e -36.72 0.18 hmu 221,862 64.15 9.60 3.29 122.27 45.13 0 3.11 46.32 134.52 53.91 hmu e -36.94 0.22 hru 3,223,876 64.34 9.98 3.26 125.30 47.73 0 3.04 46.92 135.05 53.39 hru e -26.20 3.04 hsu 2,085,482 63.29 17.36 6.49 128.61 51.44 0 3.45 43.56 132.06 56.35 hsu e -41.65 0.35 htu 3,889,038 65.83 10.40 2.86 128.48 44.13 0 2.51 52.05 139.33 49.15 htu e -29.59 0.81 hut 3,116,795 62.90 12.77 4.43 124.35 52.09 0 3.62 42.35 130.94 57.46 hut e -43.19 1.88 hvo 2,847,757 66.64 11.77 4.14 130.59 46.93 0 2.26 54.96 141.64 46.86 hvo e -6.30 -3.62 hwa 3,132,494 47.86 5.52 14.14 75.24 97.67 0 17.76 11.82 87.92 100.07 hwa e -43.07 0.60 hxa 3,668,009 65.98 9.51 3.07 129.03 45.71 0 2.47 52.58 139.76 48.72 hxa e 1.46 -18.54 iag 1,875,953 35.69 4.59 28.40 58.22 119.15 0 46.93 3.13 53.08 134.57 iag c 9.93 -0.25 iho 1,297,538 56.52 35.80 7.26 120.98 88.54 0 7.51 25.87 112.69 75.54 iho c 10.32 -3.77 kcr 1,590,757 49.00 23.53 12.23 98.06 86.14 0 16.00 13.21 91.17 96.84 kcr k 1.21 47.68 mac 5,751,492 42.68 8.12 75.38 82.45 115.53 0 27.70 6.91 73.09 114.75 mac e -6.75 1.91 marc 1,937,883 54.00 14.15 11.70 116.40 78.15 0 9.80 20.90 105.49 82.67 marc e -0.42 45.40 mba 4,837,408 39.28 4.32 81.55 71.15 125.68 23 T 36.15 4.74 63.35 124.40 mba e -7.26 4.56 mbg 2,789,774 60.64 28.57 9.29 131.98 57.74 0 4.73 35.83 124.48 63.86 mbg e -3.78 31.74 mbn 2,542,943 54.51 18.06 41.04 120.92 76.82 0 9.29 21.84 106.95 81.22 mbn e -1.02 13.39 mbu 2,575,032 40.76 4.58 45.66 72.20 120.03 0 32.27 5.60 67.59 120.20 mbu e -3.75 13.84 mear 1,488,669 49.21 9.72 29.54 94.36 94.67 0 15.70 13.47 91.76 96.26 mear e 0.91 34.68 mel 2,583,753 35.83 4.09 81.15 65.84 138.17 0 46.47 3.18 53.49 134.17 mel e -2.36 17.33 mer 1,931,651 41.26 3.56 48.37 67.79 114.17 0 31.04 5.92 69.01 118.79 mer e -0.03 36.88 mev 2,242,317 36.63 3.47 80.78 66.26 126.72 0 43.90 3.49 55.78 131.90 mev e 3.80 50.10 mfe 1,485,061 32.21 5.83 109.49 56.80 149.03 0 59.39 2.03 43.13 144.42 mfe e 0.34 61.32 mfv 1,243,342 31.64 2.22 122.97 54.60 141.39 0 61.65 1.88 41.49 146.05 mfv e 0.71 23.51 mhu 3,544,738 45.15 9.69 46.06 93.26 99.40 28 A 22.55 8.98 80.16 107.76 mhu e -1.85 15.59 mhz 2,428,904 42.62 5.02 43.42 79.92 108.24 0 27.83 6.87 72.93 114.91 mhz e 5.66 53.77 mig 1,854,197 32.30 7.72 112.81 57.03 149.36 0 59.04 2.05 43.39 144.17 mig e -18.74 -0.57 mka 1,694,969 61.16 18.52 3.88 133.61 57.76 0 4.45 37.26 125.96 62.39 mka e -5.56 32.18 mla 1,804,962 50.01 8.98 46.73 97.56 88.23 0 14.56 14.54 94.05 93.99 mla e 0.10 25.19 mmh 2,012,424 42.62 6.96 53.04 85.99 112.84 0 27.84 6.87 72.91 114.93 mmh e 1.78 73.84 mmp 1,661,137 33.10 4.06 129.84 53.34 146.72 0 56.00 2.28 45.68 141.90 mmp e 3.57 55.28 mok 1,662,525 29.30 4.90 126.77 55.03 145.89 0 71.49 1.33 34.80 152.67 mok e -11.62 21.24 mpd 2,957,635 54.92 10.99 30.15 114.87 73.81 0 8.91 22.61 108.10 80.08 mpd e -1.20 27.03 mpi 2,843,290 47.40 10.08 45.55 93.14 98.91 0 18.52 11.29 86.59 101.38 mpi e -5.62 9.56 mpl 2,922,917 55.35 17.85 18.06 118.62 69.16 0 8.51 23.46 109.35 78.84 mpl e -3.32 12.65 mpy 3,072,769 44.61 5.17 36.26 85.75 105.86 0 23.61 8.49 78.61 109.28 mpy e 1.39 -2.11 mse 2,191,517 46.23 11.42 18.44 97.91 107.84 0 20.55 10.03 83.23 104.71 mse c 0.32 36.85 msi 1,853,160 31.03 2.05 100.94 51.32 152.61 0 64.09 1.73 39.77 147.76 msi e 0.48 25.75 mst 1,767,403 27.63 1.45 104.89 40.43 154.03 0 79.14 0.97 30.04 157.39 mst e 6.88 6.54 mth 1,751,377 49.54 20.79 21.74 109.95 87.88 0 15.21 13.91 92.73 95.30 mth e -10.02 0.25 mtp 1,879,471 53.55 10.06 10.51 102.12 67.33 21 A 10.27 20.08 104.18 83.96 mtp e -0.97 21.18 mzh 2,138,444 39.16 3.70 57.65 71.98 117.57 0 36.48 4.68 63.01 124.74 mzh e -1.29 48.15 nbv 1,232,128 33.16 1.01 103.93 50.47 145.33 0 55.79 2.29 45.85 141.74 nbv t 6.96 46.95 neq 490,885 31.56 8.82 108.91 55.46 145.91 0 61.96 1.86 41.27 146.27 neq n -8.49 16.59 nga 2,833,868 48.35 3.90 33.58 86.74 98.54 0 16.99 12.39 89.30 98.70 nga t -32.18 0.54 nge 3,788,356 62.24 8.18 4.45 115.49 53.95 0 3.92 40.35 129.04 59.34 nge n -0.70 48.82 nkr 1,639,964 34.18 1.91 100.89 51.93 141.03 0 52.06 2.61 48.78 138.83 nkr t -30.63 -0.37 nmg 3,751,858 61.42 7.37 3.95 113.33 56.17 0 4.31 37.99 126.71 61.65 nmg e -0.91 42.11 nmr 1,645,259 34.17 1.70 94.23 51.17 142.69 0 52.12 2.60 48.73 138.88 nmr t -35.29 1.48 nou 4,013,216 64.94 13.64 4.30 126.63 45.61 0 2.82 48.93 136.77 51.69 nou n -32.55 2.50 nph 2,595,221 63.44 11.48 5.88 126.44 54.53 0 3.39 44.03 132.49 55.93 nph e 13.01 22.07 pai 2,222,430 51.36 29.51 34.84 101.63 90.23 0 12.77 16.50 97.93 90.15 pai c -7.39 -4.04 pdl 2,023,836 53.91 13.35 5.85 105.21 68.86 0 9.89 20.74 105.23 82.92 pdl c -9.35 -4.96 pfm 1,843,267 54.91 13.24 3.96 103.87 70.61 65 42T,23A 8.92 22.59 108.07 80.11 pfm c 4.36 6.62 pho 1,738,505 41.88 10.70 36.16 84.00 129.27 0 29.54 6.34 70.80 117.02 pho e 0.66 25.04 ppac 1,859,370 43.04 7.85 51.93 79.22 121.89 0 26.89 7.19 74.13 113.72 ppac e -1.60 32.02 pto 1,545,895 35.97 1.64 78.02 71.21 129.35 0 46.00 3.23 53.89 133.77 pto e -44.05 -0.34 sali 3,255,260 66.59 10.72 1.94 134.08 41.08 0 2.28 54.77 141.49 47.01 sali e 3.58 -2.67 smr 1,570,485 35.73 6.72 44.13 59.75 133.74 0 46.80 3.14 53.20 134.46 smr c 1.24 0.92 sso 2,992,245 35.79 4.40 47.52 63.17 141.04 21 A 46.60 3.16 53.37 134.29 sso c 0.64 19.98 taa 3,430,706 34.14 3.24 72.20 57.14 140.59 0 52.22 2.59 48.65 138.96 taa t -5.72 4.73 tac 1,564,906 45.99 4.08 25.70 91.60 99.27 0 20.97 9.80 82.57 105.36 tac e 3.95 3.33 tag 1,316,595 46.73 14.51 22.98 89.89 110.37 0 19.65 10.56 84.69 103.27 tag c -6.49 -0.04 tar 1,461,105 58.30 23.39 6.13 128.42 65.20 0 6.17 29.89 117.79 70.48 tar e 1.40 0.08 thg 1,356,318 55.64 25.44 8.33 109.38 69.71 0 8.25 24.04 110.17 78.03 thg c -3.90 12.71 tko 2,088,737 52.00 13.58 24.71 107.19 94.64 0 12.00 17.48 99.74 88.36 tko e -5.78 9.54 ton 1,847,607 51.27 10.59 22.42 105.34 95.37 0 12.89 16.36 97.67 90.41 ton e -1.35 5.94 tpe 1,781,889 57.67 27.05 12.57 114.12 69.69 0 6.62 28.40 115.97 72.29 tpe c -11.32 3.64 tuz 1,936,063 59.66 21.91 8.94 132.34 60.74 0 5.29 33.23 121.66 66.65 tuz c -4.14 -11.80 vdi 2,374,137 45.43 5.10 10.23 99.76 116.46 0 22.02 9.24 80.95 106.97 vdi c
Les 57 euryarcheota
[modifier | modifier le wikicode]Répétitions chez les archées : 57 Euryarcheota x3 -0.000732 0.000746 x2 0.1607 -0.0609 Voir méthode d’analyse (3.4.1) dans l’article x -11.96 1.869 2.86 -2.83 c 302.42 -19.90 -49.02 235.7 Aléas équation Aléas (alea) KEGG effectif %GC >4GC >4AT <5GC <5AT Ctrl >4ATa >4GCa <5GCa <5ATa mst 1,767,403 27.63 1.45 104.89 40.43 154.03 0 79.14 0.97 30.04 157.39 mok 1,662,525 29.30 4.90 126.77 55.03 145.89 0 71.49 1.33 34.80 152.67 msi 1,853,160 31.03 2.05 100.94 51.32 152.61 0 64.09 1.73 39.77 147.76 mfv 1,243,342 31.64 2.22 122.97 54.60 141.39 0 61.65 1.88 41.49 146.05 mfe 1,485,061 32.21 5.83 109.49 56.80 149.03 0 59.39 2.03 43.13 144.42 mig 1,854,197 32.30 7.72 112.81 57.03 149.36 0 59.04 2.05 43.39 144.17 mmp 1,661,137 33.10 4.06 129.84 53.34 146.72 0 56.00 2.28 45.68 141.90 mel 2,583,753 35.83 4.09 81.15 65.84 138.17 0 46.47 3.18 53.49 134.17 pto 1,545,895 35.97 1.64 78.02 71.21 129.35 0 46.00 3.23 53.89 133.77 mev 2,242,317 36.63 3.47 80.78 66.26 126.72 0 43.90 3.49 55.78 131.90 mzh 2,138,444 39.16 3.70 57.65 71.98 117.57 0 36.48 4.68 63.01 124.74 abi 1,486,778 39.16 7.57 58.52 73.06 124.04 0 36.47 4.68 63.01 124.74 mba 4,837,408 39.28 4.32 81.55 71.15 125.68 23 T 36.15 4.74 63.35 124.40 mbu 2,575,032 40.76 4.58 45.66 72.20 120.03 0 32.27 5.60 67.59 120.20 mer 1,931,651 41.26 3.56 48.37 67.79 114.17 0 31.04 5.92 69.01 118.79 pho 1,738,505 41.88 10.70 36.16 84.00 129.27 0 29.54 6.34 70.80 117.02 mmh 2,012,424 42.62 6.96 53.04 85.99 112.84 0 27.84 6.87 72.91 114.93 mhz 2,428,904 42.62 5.02 43.42 79.92 108.24 0 27.83 6.87 72.93 114.91 mac 5,751,492 42.68 8.12 75.38 82.45 115.53 0 27.70 6.91 73.09 114.75 ppac 1,859,370 43.04 7.85 51.93 79.22 121.89 0 26.89 7.19 74.13 113.72 fpl 2,196,266 44.14 6.72 57.89 75.22 120.02 0 24.57 8.07 77.25 110.63 mpy 3,072,769 44.61 5.17 36.26 85.75 105.86 0 23.61 8.49 78.61 109.28 mhu 3,544,738 45.15 9.69 46.06 93.26 99.40 28 A 22.55 8.98 80.16 107.76 tac 1,564,906 45.99 4.08 25.70 91.60 99.27 0 20.97 9.80 82.57 105.36 gac 1,860,815 46.84 8.76 47.12 88.51 102.26 0 19.47 10.67 84.99 102.97 mpi 2,843,290 47.40 10.08 45.55 93.14 98.91 0 18.52 11.29 86.59 101.38 hwa 3,132,494 47.86 5.52 14.14 75.24 97.67 0 17.76 11.82 87.92 100.07 afu 2,178,400 48.58 12.81 37.95 92.36 105.98 0 16.63 12.68 89.98 98.03 mear 1,488,669 49.21 9.72 29.54 94.36 94.67 0 15.70 13.47 91.76 96.26 mth 1,751,377 49.54 20.79 21.74 109.95 87.88 0 15.21 13.91 92.73 95.30 mla 1,804,962 50.01 8.98 46.73 97.56 88.23 0 14.56 14.54 94.05 93.99 ton 1,847,607 51.27 10.59 22.42 105.34 95.37 0 12.89 16.36 97.67 90.41 tko 2,088,737 52.00 13.58 24.71 107.19 94.64 0 12.00 17.48 99.74 88.36 mtp 1,879,471 53.55 10.06 10.51 102.12 67.33 21 A 10.27 20.08 104.18 83.96 hbu 1,667,163 53.74 15.25 5.99 106.78 73.51 0 10.07 20.42 104.72 83.42 marc 1,937,883 54.00 14.15 11.70 116.40 78.15 0 9.80 20.90 105.49 82.67 mbn 2,542,943 54.51 18.06 41.04 120.92 76.82 0 9.29 21.84 106.95 81.22 mpd 2,957,635 54.92 10.99 30.15 114.87 73.81 0 8.91 22.61 108.10 80.08 mpl 2,922,917 55.35 17.85 18.06 118.62 69.16 0 8.51 23.46 109.35 78.84 tar 1,461,105 58.30 23.39 6.13 128.42 65.20 0 6.17 29.89 117.79 70.48 mbg 2,789,774 60.64 28.57 9.29 131.98 57.74 0 4.73 35.83 124.48 63.86 hbo 2,820,544 61.06 7.75 5.24 112.63 63.07 0 4.50 36.99 125.69 62.66 mka 1,694,969 61.16 18.52 3.88 133.61 57.76 0 4.45 37.26 125.96 62.39 nmg 3,751,858 61.42 7.37 3.95 113.33 56.17 0 4.31 37.99 126.71 61.65 hlr 2,789,326 61.95 9.34 6.12 114.75 57.54 0 4.05 39.51 128.22 60.16 hma1 3,131,724 62.36 8.59 4.88 122.56 54.74 0 3.86 40.73 129.41 58.98 hut 3,116,795 62.90 12.77 4.43 124.35 52.09 0 3.62 42.35 130.94 57.46 hsu 2,085,482 63.29 17.36 6.49 128.61 51.44 0 3.45 43.56 132.06 56.35 nph 2,595,221 63.44 11.48 5.88 126.44 54.53 0 3.39 44.03 132.49 55.93 hmu 221,862 64.15 9.60 3.29 122.27 45.13 0 3.11 46.32 134.52 53.91 hru 3,223,876 64.34 9.98 3.26 125.30 47.73 0 3.04 46.92 135.05 53.39 htu 3,889,038 65.83 10.40 2.86 128.48 44.13 0 2.51 52.05 139.33 49.15 hxa 3,668,009 65.98 9.51 3.07 129.03 45.71 0 2.47 52.58 139.76 48.72 sali 3,255,260 66.59 10.72 1.94 134.08 41.08 0 2.28 54.77 141.49 47.01 hvo 2,847,757 66.64 11.77 4.14 130.59 46.93 0 2.26 54.96 141.64 46.86 hla 2,735,295 66.72 13.76 3.26 131.01 42.38 0 2.24 55.27 141.88 46.63 hal 2,014,239 67.91 19.02 2.97 136.93 40.18 0 1.91 59.82 145.28 43.25
Les 20 crenarcheota
[modifier | modifier le wikicode]Répétitions chez les archées : 20 Crenarcheota x3 -0.000732 0.000746 x2 0.1607 -0.0609 Voir méthode d’analyse (3.4.1) dans l’article x -11.96 1.869 2.86 -2.83 c 302.42 -19.90 -49.02 235.7 Aléas équation Aléas (alea) KEGG effectif %GC >4GC >4AT <5GC <5AT Ctrl >4ATa >4GCa <5GCa <5ATa clg 1,546,846 30.03 4.93 90.91 52.33 155.52 0 68.29 1.49 36.91 150.59 aho 2,137,654 34.15 2.42 60.49 59.27 148.09 0 52.19 2.60 48.68 138.93 iag 1,875,953 35.69 4.59 28.40 58.22 119.15 0 46.93 3.13 53.08 134.57 smr 1,570,485 35.73 6.72 44.13 59.75 133.74 0 46.80 3.14 53.20 134.46 sso 2,992,245 35.79 4.40 47.52 63.17 141.04 21 A 46.60 3.16 53.37 134.29 ffo 1,319,206 37.47 6.67 86.30 62.35 128.69 0 41.31 3.86 58.20 129.51 cma 2,077,567 43.10 12.91 7.43 94.35 129.98 0 26.78 7.23 74.28 113.58 dka 1,365,223 45.34 12.91 15.05 89.74 100.44 0 22.19 9.16 80.70 107.22 vdi 2,374,137 45.43 5.10 10.23 99.76 116.46 0 22.02 9.24 80.95 106.97 mse 2,191,517 46.23 11.42 18.44 97.91 107.84 0 20.55 10.03 83.23 104.71 tag 1,316,595 46.73 14.51 22.98 89.89 110.37 0 19.65 10.56 84.69 103.27 pai 2,222,430 51.36 29.51 34.84 101.63 90.23 0 12.77 16.50 97.93 90.15 pdl 2,023,836 53.91 13.35 5.85 105.21 68.86 0 9.89 20.74 105.23 82.92 pfm 1,843,267 54.91 13.24 3.96 103.87 70.61 65 42T,23A 8.92 22.59 108.07 80.11 thg 1,356,318 55.64 25.44 8.33 109.38 69.71 0 8.25 24.04 110.17 78.03 ape 1,669,696 56.31 40.50 6.58 123.07 66.34 0 7.68 25.42 112.09 76.13 iho 1,297,538 56.52 35.80 7.26 120.98 88.54 0 7.51 25.87 112.69 75.54 asc 1,496,453 57.22 25.37 5.64 127.10 70.98 0 6.96 27.39 114.68 73.56 tpe 1,781,889 57.67 27.05 12.57 114.12 69.69 0 6.62 28.40 115.97 72.29 tuz 1,936,063 59.66 21.91 8.94 132.34 60.74 0 5.29 33.23 121.66 66.65
Les 30 autres archées
[modifier | modifier le wikicode]Répétitions chez les archées : 30 autres archées x3 -0.000732 0.000746 x2 0.1607 -0.0609 Voir méthode d’analyse (3.4.1) dans l’article x -11.96 1.869 2.86 -2.83 c 302.42 -19.90 -49.02 235.7 Aléas équation Aléas (alea) KEGG effectif %GC >4GC >4AT <5GC <5AT Ctrl >4ATa >4GCa <5GCa <5ATa clg 1,546,846 30.03 4.93 90.91 52.33 155.52 0 68.29 1.49 36.91 150.59 neq 490,885 31.56 8.82 108.91 55.46 145.91 0 61.96 1.86 41.27 146.27 nbv 1,232,128 33.16 1.01 103.93 50.47 145.33 0 55.79 2.29 45.85 141.74 taa 3,430,706 34.14 3.24 72.20 57.14 140.59 0 52.22 2.59 48.65 138.96 aho 2,137,654 34.15 2.42 60.49 59.27 148.09 0 52.19 2.60 48.68 138.93 nmr 1,645,259 34.17 1.70 94.23 51.17 142.69 0 52.12 2.60 48.73 138.88 nkr 1,639,964 34.18 1.91 100.89 51.93 141.03 0 52.06 2.61 48.78 138.83 iag 1,875,953 35.69 4.59 28.40 58.22 119.15 0 46.93 3.13 53.08 134.57 smr 1,570,485 35.73 6.72 44.13 59.75 133.74 0 46.80 3.14 53.20 134.46 sso 2,992,245 35.79 4.40 47.52 63.17 141.04 21 A 46.60 3.16 53.37 134.29 ffo 1,319,206 37.47 6.67 86.30 62.35 128.69 0 41.31 3.86 58.20 129.51 cma 2,077,567 43.10 12.91 7.43 94.35 129.98 0 26.78 7.23 74.28 113.58 dka 1,365,223 45.34 12.91 15.05 89.74 100.44 0 22.19 9.16 80.70 107.22 vdi 2,374,137 45.43 5.10 10.23 99.76 116.46 0 22.02 9.24 80.95 106.97 mse 2,191,517 46.23 11.42 18.44 97.91 107.84 0 20.55 10.03 83.23 104.71 tag 1,316,595 46.73 14.51 22.98 89.89 110.37 0 19.65 10.56 84.69 103.27 nga 2,833,868 48.35 3.90 33.58 86.74 98.54 0 16.99 12.39 89.30 98.70 kcr 1,590,757 49.00 23.53 12.23 98.06 86.14 0 16.00 13.21 91.17 96.84 pai 2,222,430 51.36 29.51 34.84 101.63 90.23 0 12.77 16.50 97.93 90.15 csu 1,680,938 51.65 10.00 30.05 101.25 86.91 0 12.42 16.94 98.75 89.34 pdl 2,023,836 53.91 13.35 5.85 105.21 68.86 0 9.89 20.74 105.23 82.92 pfm 1,843,267 54.91 13.24 3.96 103.87 70.61 65 42T,23A 8.92 22.59 108.07 80.11 thg 1,356,318 55.64 25.44 8.33 109.38 69.71 0 8.25 24.04 110.17 78.03 ape 1,669,696 56.31 40.50 6.58 123.07 66.34 0 7.68 25.42 112.09 76.13 iho 1,297,538 56.52 35.80 7.26 120.98 88.54 0 7.51 25.87 112.69 75.54 asc 1,496,453 57.22 25.37 5.64 127.10 70.98 0 6.96 27.39 114.68 73.56 tpe 1,781,889 57.67 27.05 12.57 114.12 69.69 0 6.62 28.40 115.97 72.29 tuz 1,936,063 59.66 21.91 8.94 132.34 60.74 0 5.29 33.23 121.66 66.65 nge 3,788,356 62.24 8.18 4.45 115.49 53.95 0 3.92 40.35 129.04 59.34 nou 4,013,216 64.94 13.64 4.30 126.63 45.61 0 2.82 48.93 136.77 51.69
Tableau des écarts relatifs / aléa
[modifier | modifier le wikicode]Répétitions chez les archées. Voir méthode d’analyse (3.4.1) dans l’article Euryarcheota Crenarcheota KEGG %GC >4GC% >4AT% KEGG %GC >4GC% >4AT% mst 27.63 49 33 aho 34.15 -7 16 mok 29.30 268 77 ape 56.31 59 -14 msi 31.03 18 57 asc 57.22 -7 -19 mfv 31.64 18 99 clg 30.03 230 33 mfe 32.21 187 84 cma 43.10 79 -72 mig 32.30 276 91 dka 45.34 41 -32 mmp 33.10 78 132 ffo 37.47 73 109 mel 35.83 29 75 iag 35.69 47 -39 pto 35.97 -49 70 iho 56.52 38 -3 mev 36.63 -1 84 mse 46.23 14 -10 mzh 39.16 -21 58 pai 51.36 79 173 abi 39.16 62 60 pdl 53.91 -36 -41 mba 39.28 -9 126 pfm 54.91 -41 -56 mbu 40.76 -18 41 smr 35.73 114 -6 mer 41.26 -40 56 sso 35.79 39 2 pho 41.88 69 22 tag 46.73 37 17 mmh 42.62 1 90 thg 55.64 6 1 mhz 42.62 -27 56 tpe 57.67 -5 90 mac 42.68 18 172 tuz 59.66 -34 69 ppac 43.04 9 93 vdi 45.43 -45 -54 fpl 44.14 -17 136 mpy 44.61 -39 54 Autres mhu 45.15 8 104 tac 45.99 -58 23 csu 51.65 -41 142 gac 46.84 -18 142 kcr 49.00 78 -24 mpi 47.40 -11 146 nbv 33.16 -56 86 hwa 47.86 -53 -20 neq 31.56 374 76 afu 48.58 1 128 nga 48.35 -69 98 mear 49.21 -28 88 nge 62.24 -80 14 mth 49.54 49 43 nkr 34.18 -27 94 mla 50.01 -38 221 nmr 34.17 -35 81 ton 51.27 -35 74 nou 64.94 -72 52 tko 52.00 -22 106 taa 34.14 25 38 mtp 53.55 -50 2 hbu 53.74 -25 -40 marc 54.00 -32 19 mbn 54.51 -17 342 mpd 54.92 -51 238 mpl 55.35 -24 112 tar 58.30 -22 -1 mbg 60.64 -20 96 hbo 61.06 -79 17 mka 61.16 -50 -13 nmg 61.42 -81 -9 hlr 61.95 -76 51 hma1 62.36 -79 27 hut 62.90 -70 22 hsu 63.29 -60 88 nph 63.44 -74 74 hmu 64.15 -79 6 hru 64.34 -79 7 htu 65.83 -80 14 hxa 65.98 -82 24 sali 66.59 -80 -15 hvo 66.64 -79 83 hla 66.72 -75 46 hal 67.91 -68 56
Groupes des archées selon l'écart relatif par rapport à l'aléa
[modifier | modifier le wikicode]Euryarcheota
[modifier | modifier le wikicode]Groupe 22ae euryarcheota 25-43 %GC Groupe 41ae KEGG %GC >4GC >4AT DNA KEGG %GC >4GC% >4AT% KEGG %GC >4GC >4AT DNA mst 27.63 1.45 104.89 1,767,403 pto 35.97 -49 70 mbg 60.64 28.57 9.29 2,789,774 msi 31.03 2.05 100.94 1,853,160 mer 41.26 -40 56 hbo 61.06 7.75 5.24 2,820,544 mfv 31.64 2.22 122.97 1,243,342 mhz 42.62 -27 56 mka 61.16 18.52 3.88 1,694,969 mmp 33.10 4.06 129.84 1,661,137 mzh 39.16 -21 58 nmg 61.42 7.37 3.95 3,751,858 mel 35.83 4.09 81.15 2,583,753 mbu 40.76 -18 41 hlr 61.95 9.34 6.12 2,789,326 mok 29.30 4.90 126.77 1,662,525 mba 39.28 -9 126 hma1 62.36 8.59 4.88 3,131,724 mfe 32.21 5.83 109.49 1,485,061 mev 36.63 -1 84 hut 62.90 12.77 4.43 3,116,795 mmh 42.62 6.96 53.04 2,012,424 mmh 42.62 1 90 hsu 63.29 17.36 6.49 2,085,482 abi 39.16 7.57 58.52 1,486,778 ppac 43.04 9 93 nph 63.44 11.48 5.88 2,595,221 mig 32.30 7.72 112.81 1,854,197 msi 31.03 18 57 hmu 64.15 9.60 3.29 221,862 ppac 43.04 7.85 51.93 1,859,370 mfv 31.64 18 99 hru 64.34 9.98 3.26 3,223,876 mac 42.68 8.12 75.38 5,751,492 mac 42.68 18 172 htu 65.83 10.40 2.86 3,889,038 pho 41.88 10.70 36.16 1,738,505 mel 35.83 29 75 hxa 65.98 9.51 3.07 3,668,009 mst 27.63 49 33 sali 66.59 10.72 1.94 3,255,260 moyen. 36 6 90 2,073,781 abi 39.16 62 60 hvo 66.64 11.77 4.14 2,847,757 ecartt 6 3 32 1,149,592 pho 41.88 69 22 hla 66.72 13.76 3.26 2,735,295 % 16 50 36 55 mmp 33.10 78 132 hal 67.91 19.02 2.97 2,014,239 mfe 32.21 187 84 Groupe 23ae mok 29.30 268 77 moyen. 64 13 4 2,743,002 KEGG %GC >4GC >4AT DNA mig 32.30 276 91 ecartt 2 5 2 881,493 pto 35.97 1.64 78.02 1,545,895 % 4 42 40 32 mev 36.63 3.47 80.78 2,242,317 mzh 39.16 3.70 57.65 2,138,444 mba 39.28 4.32 81.55 4,837,408 mbu 40.76 4.58 45.66 2,575,032 mer 41.26 3.56 48.37 1,931,651 mhz 42.62 5.02 43.42 2,428,904 moyen. 39 4 62 2,528,522 ecartt 2 1 17 1,072,297 % 6 29 28 42 Groupe 67ae2 euryarcheota 43-60 %GC euryarcheota 60-75 %GC KEGG %GC >4GC >4AT DNA KEGG %GC >4GC% >4AT% KEGG %GC >4GC% >4AT% tac 45.99 4.08 25.70 1,564,906 tac 45.99 -58 23 hxa 65.98 -82 24 mpy 44.61 5.17 36.26 3,072,769 hwa 47.86 -53 -20 nmg 61.42 -81 -9 hwa 47.86 5.52 14.14 3,132,494 mpd 54.92 -51 238 htu 65.83 -80 14 fpl 44.14 6.72 57.89 2,196,266 mtp 53.55 -50 2 sali 66.59 -80 -15 gac 46.84 8.76 47.12 1,860,815 mpy 44.61 -39 54 hbo 61.06 -79 17 mla 50.01 8.98 46.73 1,804,962 mla 50.01 -38 221 hma1 62.36 -79 27 mear 49.21 9.72 29.54 1,488,669 ton 51.27 -35 74 hmu 64.15 -79 6 mtp 53.55 10.06 10.51 1,879,471 marc 54.00 -32 19 hru 64.34 -79 7 mpi 47.40 10.08 45.55 2,843,290 mear 49.21 -28 88 hvo 66.64 -79 83 ton 51.27 10.59 22.42 1,847,607 hbu 53.74 -25 -40 hlr 61.95 -76 51 mpd 54.92 10.99 30.15 2,957,635 mpl 55.35 -24 112 hla 66.72 -75 46 tko 52.00 13.58 24.71 2,088,737 tko 52.00 -22 106 nph 63.44 -74 74 marc 54.00 14.15 11.70 1,937,883 tar 58.30 -22 -1 hut 62.90 -70 22 hbu 53.74 15.25 5.99 1,667,163 gac 46.84 -18 142 hal 67.91 -68 56 mpl 55.35 17.85 18.06 2,922,917 fpl 44.14 -17 136 hsu 63.29 -60 88 mbn 54.51 18.06 41.04 2,542,943 mbn 54.51 -17 342 mka 61.16 -50 -13 tar 58.30 23.39 6.13 1,461,105 mpi 47.40 -11 146 mbg 60.64 -20 96 afu 48.58 1 128 moyen. 51 11 28 2,192,331 mhu 45.15 8 104 ecartt 4 5 16 590,374 mth 49.54 49 43 % 8 45 57 27 Groupe 67ae1 KEGG %GC >4GC >4AT DNA mhu 45.15 9.69 46.06 3,544,738 afu 48.58 12.81 37.95 2,178,400 mth 49.54 20.79 21.74 1,751,377 moyen. 48 14 35 2,491,505 ecartt 2 6 12 936,783 % 5 40 35 38
Crenarcheota
[modifier | modifier le wikicode]Groupe 22ac crenarcheota 25-43 %GC Groupe 67ac1 KEGG %GC >4GC >4AT DNA KEGG %GC >4GC% >4AT% KEGG %GC >4GC >4AT DNA clg 30.03 4.93 90.91 1,546,846 aho 34.15 -7 16 ape 56.31 40.5 6.58 1,669,696 cma 43.1 12.91 7.43 2,077,567 sso 35.79 39 2 dka 45.34 12.91 15.05 1,365,223 ffo 37.47 6.67 86.3 1,319,206 iag 35.69 47 -39 iho 56.52 35.8 7.26 1,297,538 iag 35.69 4.59 28.4 1,875,953 ffo 37.47 73 109 mse 46.23 11.42 18.44 2,191,517 smr 35.73 6.72 44.13 1,570,485 cma 43.1 79 -72 pai 51.36 29.51 34.84 2,222,430 sso 35.79 4.4 47.52 2,992,245 smr 35.73 114 -6 tag 46.73 14.51 22.98 1,316,595 clg 30.03 230 33 thg 55.64 25.44 8.33 1,356,318 moyen. 36 7 51 1,678,011 ecartt 5 3 36 298,468 crenarcheota 43-60 %GC moyen. 51 24 16 1,631,331 % 13 47 71 18 KEGG %GC >4GC% >4AT% ecartt 5 12 10 412,634 vdi 45.43 -45 -54 % 10 48 63 25 Groupe 23ac pfm 54.91 -41 -56 KEGG %GC >4GC >4AT DNA pdl 53.91 -36 -41 Groupe 67ac2 aho 34.15 2.42 60.49 2,137,654 tuz 59.66 -34 69 KEGG %GC >4GC >4AT DNA asc 57.22 -7 -19 asc 57.22 25.37 5.64 1,496,453 tpe 57.67 -5 90 pdl 53.91 13.35 5.85 2,023,836 thg 55.64 6 1 pfm 54.91 13.24 3.96 1,843,267 mse 46.23 14 -10 tpe 57.67 27.05 12.57 1,781,889 tag 46.73 37 17 tuz 59.66 21.91 8.94 1,936,063 iho 56.52 38 -3 vdi 45.43 5.1 10.23 2,374,137 dka 45.34 41 -32 ape 56.31 59 -14 moyen. 55 18 8 1,909,274 pai 51.36 79 173 ecartt 5 9 3 290,153 % 9 48 41 15
Autre-archeota
[modifier | modifier le wikicode]Autres Autres écarts KEGG %GC >4GC >4AT DNA ordre %GC >4GC% >4AT% kcr 49.00 23.53 12.23 1,590,757 kor 49.00 78 -24 neq 31.56 8.82 108.91 490,885 nano 31.56 374 76 nge 62.24 8.18 4.45 3,788,356 nano 62.24 -80 14 nou 64.94 13.64 4.3 4,013,216 nano 64.94 -72 52 nbv 33.16 1.01 103.93 1,232,128 thaum 33.16 -56 86 taa 34.14 3.24 72.2 3,430,706 thaum 34.14 25 38 nmr 34.17 1.7 94.23 1,645,259 thaum 34.17 -35 81 nkr 34.18 1.91 100.89 1,639,964 thaum 34.18 -27 94 nga 48.35 3.9 33.58 2,833,868 thaum 48.35 -69 98 csu 51.65 10 30.05 1,680,938 thaum 51.65 -41 142
Archées: rupture entre les groupes à progression homogène
[modifier | modifier le wikicode]- Euryarcheota
Euryarcheota:taux >4GC Euryarcheota:taux >4AT KEGG %GC >4GC # % groupe KEGG %GC >4AT # % groupe mst 27.63 1.45 11 ** 2 ** sali 66.59 1.94 32 ** I ** pto 35.97 1.64 20 htu 65.83 2.86 4 msi 31.03 2.05 8 hal 67.91 2.97 3 mfv 31.64 2.22 36 hxa 65.98 3.07 6 mev 36.63 3.47 3 ** 7 ** hru 64.34 3.26 0 mer 41.26 3.56 4 hla 66.72 3.26 1 mzh 39.16 3.70 9 hmu 64.15 3.29 15 mmp 33.10 4.06 0 mka 61.16 3.88 2 ** II ** tac 45.99 4.08 0 nmg 61.42 3.95 5 mel 35.83 4.09 5 hvo 66.64 4.14 7 mba 39.28 4.32 6 hut 62.90 4.43 9 mbu 40.76 4.58 6 hma1 62.36 4.88 7 mok 29.30 4.90 3 hbo 61.06 5.24 11 mhz 42.62 5.02 3 nph 63.44 5.88 2 mpy 44.61 5.17 6 hbu 53.74 5.99 2 hwa 47.86 5.52 5 hlr 61.95 6.12 0 mfe 32.21 5.83 13 tar 58.30 6.13 6 fpl 44.14 6.72 4 ** 14 ** hsu 63.29 6.49 30 mmh 42.62 6.96 6 mbg 60.64 9.29 12 ** III ** nmg 61.42 7.37 3 mtp 53.55 10.51 10 abi 39.16 7.57 2 marc 54.00 11.70 17 mig 32.30 7.72 0 hwa 47.86 14.14 22 hbo 61.06 7.75 1 mpl 55.35 18.06 17 ppac 43.04 7.85 3 mth 49.54 21.74 3 mac 42.68 8.12 5 ton 51.27 22.42 9 hma1 62.36 8.59 2 tko 52.00 24.71 4 gac 46.84 8.76 2 tac 45.99 25.70 13 mla 50.01 8.98 4 mear 49.21 29.54 2 hlr 61.95 9.34 2 mpd 54.92 30.15 17 hxa 65.98 9.51 1 pho 41.88 36.16 0 ** IV ** hmu 64.15 9.60 1 mpy 44.61 36.26 4 mhu 45.15 9.69 0 afu 48.58 37.95 8 mear 49.21 9.72 3 mbn 54.51 41.04 5 hru 64.34 9.98 1 mhz 42.62 43.42 5 mtp 53.55 10.06 0 mpi 47.40 45.55 0 mpi 47.40 10.08 3 mbu 40.76 45.66 1 htu 65.83 10.40 2 mhu 45.15 46.06 1 ton 51.27 10.59 1 mla 50.01 46.73 1 pho 41.88 10.70 0 gac 46.84 47.12 3 sali 66.59 10.72 2 mer 41.26 48.37 7 mpd 54.92 10.99 4 ppac 43.04 51.93 2 nph 63.44 11.48 2 mmh 42.62 53.04 8 hvo 66.64 11.77 8 mzh 39.16 57.65 0 hut 62.90 12.77 0 fpl 44.14 57.89 1 afu 48.58 12.81 6 abi 39.16 58.52 22 tko 52.00 13.58 1 mac 42.68 75.38 3 ** V ** hla 66.72 13.76 3 pto 35.97 78.02 3 marc 54.00 14.15 7 mev 36.63 80.78 0 hbu 53.74 15.25 12 mel 35.83 81.15 0 hsu 63.29 17.36 3 ** 25 ** mba 39.28 81.55 19 mpl 55.35 17.85 1 msi 31.03 100.94 4 ** VI ** mbn 54.51 18.06 2 mst 27.63 104.89 4 mka 61.16 18.52 3 mfe 32.21 109.49 3 hal 67.91 19.02 8 mig 32.30 112.81 8 mth 49.54 20.79 11 mfv 31.64 122.97 3 tar 58.30 23.39 18 ** 68 ** mok 29.30 126.77 2 mbg 60.64 28.57 mmp 33.10 129.84
- Crenarcheota
Crenarcheota:taux >4GC Crenarcheota:taux >4AT KEGG %GC >4GC # % groupe KEGG %GC >4AT # % groupe aho 34.15 2.42 45 ** 2 ** pfm 54.91 3.96 30 ** I ** sso 35.79 4.40 4 ** 7 ** asc 57.22 5.64 4 ** II ** iag 35.69 4.59 7 pdl 53.91 5.85 11 clg 30.03 4.93 3 ape 56.31 6.58 9 vdi 45.43 5.10 24 iho 56.52 7.26 2 ffo 37.47 6.67 1 cma 43.10 7.43 11 smr 35.73 6.72 41 thg 55.64 8.33 7 mse 46.23 11.42 12 ** 14 ** tuz 59.66 8.94 13 dka 45.34 12.91 0 vdi 45.43 10.23 19 cma 43.10 12.91 2 tpe 57.67 12.57 17 ** III ** pfm 54.91 13.24 1 dka 45.34 15.05 18 pdl 53.91 13.35 8 mse 46.23 18.44 20 tag 46.73 14.51 34 tag 46.73 22.98 19 ** IV ** tuz 59.66 21.91 14 ** 25 ** iag 35.69 28.40 18 asc 57.22 25.37 0 pai 51.36 34.84 21 thg 55.64 25.44 6 smr 35.73 44.13 7 ** V ** tpe 57.67 27.05 8 sso 35.79 47.52 21 pai 51.36 29.51 18 aho 34.15 60.49 30 ** VI ** iho 56.52 35.80 12 ** 68 ** ffo 37.47 86.30 5 ape 56.31 40.50 clg 30.03 90.91
Plasmides
[modifier | modifier le wikicode]Résultats
[modifier | modifier le wikicode]plasmides cyanobactéries
[modifier | modifier le wikicode]- Plasmides cyanobactéries:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl ana; 6413771; 41.3475473321389; 16139; 16308; 2701; 2590; 375551; 373179; 217679; 219026; 32204; 31846; 11639; 11672; 0 ana1; 408101; 40.5142354466174; 1101; 1022; 141; 133; 24499; 24656; 12820; 12984; 1999; 2065; 569; 559; 0 ana2; 186614; 40.2279571736311; 401; 604; 61; 50; 10515; 12201; 6252; 5491; 737; 1141; 247; 222; 0 ana3; 101965; 41.0258422007552; 262; 236; 35; 38; 6287; 5798; 3399; 3200; 495; 461; 156; 149; 0 ana4; 55414; 41.610423358718; 136; 145; 39; 24; 3210; 3249; 1863; 1750; 254; 277; 92; 84; 0 ana5; 40340; 40.8552305404065; 117; 128; 25; 15; 2283; 2450; 1326; 1298; 201; 214; 47; 59; 0 ana6; 5584; 44.1797994269341; 5; 16; 1; 2; 242; 306; 168; 245; 22; 35; 6; 11; 0 anb1; 80384; 37.2312898089172; 259; 226; 35; 24; 5357; 5127; 2462; 2251; 486; 441; 125; 117; 0 anb2; 56037; 37.2539572068455; 205; 141; 19; 22; 3673; 3336; 1711; 1556; 359; 360; 93; 96; 0 anb3; 20025; 37.41822721598; 53; 88; 14; 13; 1168; 1264; 538; 583; 111; 139; 35; 34; 0 anba; 4329264; 38.1047679236009; 13593; 14177; 1732; 1792; 273098; 273360; 136468; 136365; 25851; 25468; 6772; 6679; 0 anbb; 819965; 38.2121188099492; 2658; 2671; 345; 365; 51092; 52288; 26118; 25949; 4841; 5038; 1285; 1302; 0 can; 4114099; 34.9583225877647; 19398; 19033; 2471; 2506; 269395; 269454; 115224; 114077; 29524; 29218; 7231; 7224; 0 can1; 62874; 33.1711041129879; 214; 262; 21; 27; 4218; 4489; 1532; 1739; 434; 462; 76; 69; 0 cyt1; 39620; 36.7995961635538; 168; 123; 15; 20; 2700; 2570; 1062; 1204; 271; 198; 56; 56; 0 cyt2; 31856; 41.4584379708689; 68; 53; 11; 43; 1958; 2059; 1127; 1198; 142; 128; 57; 94; 0 cyt3; 14685; 38.0932924753149; 66; 58; 2; 15; 984; 817; 312; 521; 87; 75; 20; 46; 0 cyt4; 10244; 36.9679812573214; 35; 32; 10; 12; 756; 625; 266; 342; 57; 45; 4; 25; 0 cytc; 4934271; 37.875402465734; 17294; 17824; 3060; 3064; 318932; 321159; 153124; 153452; 29602; 29800; 10516; 10635; 0 cytl; 429701; 38.5686791513168; 1366; 1451; 184; 205; 27135; 27802; 13346; 12975; 2255; 2582; 681; 727; 0 syn; 3573470; 47.7202551021836; 9619; 9472; 5690; 5659; 184173; 183791; 174968; 176236; 16661; 16318; 12958; 13031; 0 syn1; 103307; 44.4790769260553; 322; 267; 97; 89; 5689; 5744; 4326; 4296; 520; 468; 317; 309; 0 syn2; 44343; 48.618722233498; 66; 66; 40; 39; 2153; 2100; 1957; 2054; 140; 151; 100; 122; 0 syn3; 119895; 42.950081321156; 363; 309; 99; 94; 6841; 6716; 4758; 4698; 659; 602; 343; 310; 0 syn4; 106004; 42.7153692313498; 286; 408; 124; 109; 5929; 6108; 4032; 4328; 493; 632; 291; 290; 0 len; 6244812; 46.6455995792988; 8355; 8414; 1607; 1668; 345998; 345528; 216003; 219001; 21647; 21473; 6689; 6967; 0 len1; 325675; 47.0134336378291; 451; 450; 82; 87; 17504; 17603; 11313; 11369; 1142; 1094; 357; 368; 0 len2; 98206; 48.5448954239049; 129; 122; 31; 20; 5036; 5057; 3756; 3676; 278; 284; 138; 148; 0 len3; 92964; 47.3467938857395; 133; 132; 30; 21; 4941; 4880; 3196; 3092; 284; 296; 105; 110; 1 mic; 7470429; 46.2148157756402; 14670; 14431; 4759; 4741; 402745; 402180; 300621; 299833; 29105; 28538; 15039; 14766; 0 mic1; 146045; 45.2702934027183; 237; 275; 72; 60; 7844; 8277; 5454; 5124; 502; 600; 235; 226; 0 mic2; 93032; 47.0999226072749; 237; 164; 78; 87; 4854; 5013; 3776; 3827; 364; 326; 172; 230; 0 mic3; 92471; 46.6167771517557; 188; 180; 69; 75; 4984; 5064; 3530; 3704; 360; 328; 246; 240; 0 mic4; 50464; 44.6536144578313; 117; 103; 29; 16; 2839; 2740; 1946; 1784; 223; 186; 79; 64; 0 mic5; 38468; 47.6603930539669; 72; 65; 20; 34; 1981; 1998; 1535; 1641; 141; 132; 61; 75; 0 mic6; 28816; 46.5852304275403; 51; 68; 24; 27; 1515; 1594; 1184; 1155; 113; 121; 49; 62; 0 mic7; 25982; 46.7631437148795; 43; 47; 15; 18; 1395; 1360; 980; 1014; 94; 96; 40; 49; 0 mic8; 20803; 46.454838244484; 36; 57; 18; 17; 1176; 1068; 752; 909; 87; 71; 43; 47; 0 oac; 7689443; 47.6010941234625; 17035; 16687; 9362; 9630; 401162; 397639; 344008; 344310; 32328; 32182; 25811; 25893; 0 oac1; 64128; 47.6157060878243; 138; 165; 59; 70; 3246; 3301; 2878; 2791; 259; 260; 176; 190; 0 oac2; 50699; 49.296830312235; 94; 105; 48; 61; 2469; 2583; 2295; 2464; 174; 208; 160; 165; 0 oni; 7479014; 45.8676504683639; 19394; 19840; 4057; 4051; 398146; 400028; 284712; 286596; 37104; 37459; 13330; 13360; 0 oni1; 300164; 45.1266640902973; 730; 625; 155; 165; 16857; 16586; 10890; 11622; 1378; 1275; 451; 556; 0 oni2; 260268; 44.6090183964222; 571; 697; 142; 123; 14078; 15124; 9227; 9498; 1039; 1244; 481; 445; 0 oni3; 150927; 45.5074307446646; 301; 382; 96; 90; 7968; 8552; 5570; 5803; 630; 669; 267; 286; 0 oni4; 74236; 44.5632846597338; 212; 182; 35; 34; 4405; 3976; 2661; 2524; 417; 336; 127; 115; 0 oni5; 7645; 47.5866579463702; 13; 32; 9; 8; 352; 412; 270; 334; 21; 40; 10; 13; 0 syf; 2695903; 55.4700224748442; 2368; 2411; 1536; 1600; 108960; 109286; 132285; 133380; 5634; 5771; 6521; 6457; 0 syf1; 46366; 52.8878919898201; 37; 43; 37; 23; 1997; 1991; 2299; 1943; 102; 121; 120; 80; 0 synp; 3510253; 40.6197502003417; 8967; 8869; 1384; 1287; 206958; 207186; 122450; 121593; 17274; 17217; 6357; 6227; 0 synp1; 63272; 40.8932861297256; 167; 136; 16; 16; 3848; 3638; 2234; 1956; 297; 271; 69; 96; 0 synp2; 10210; 39.4123408423115; 40; 15; 1; 2; 597; 558; 307; 280; 59; 48; 32; 16; 0
Plasmides autres bactéries
[modifier | modifier le wikicode]- plasmides autres bactéries
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl cac; 3940880; 30.9257830738312; 18639; 19088; 493; 489; 256916; 256763; 95062; 95746; 30725; 30878; 1994; 2317; 0 cac1; 192000; 30.9114583333333; 998; 867; 13; 16; 12723; 12407; 4809; 4594; 1491; 1469; 106; 86; 0 cje; 1641481; 30.5485716861785; 13069; 13222; 167; 184; 98949; 100335; 34726; 34614; 18044; 18356; 980; 930; 0 cje1; 4013; 30.1520059805632; 15; 55; 1; 3; 191; 311; 68; 80; 40; 51; 2; 7; 0 ecs; 5498450; 50.537060444307; 10559; 10451; 1635; 1787; 241834; 242329; 254721; 256257; 18618; 18564; 7511; 7699; 0 ecs1; 92721; 47.5997886131513; 173; 301; 27; 88; 3966; 4058; 3466; 4617; 309; 398; 118; 198; 0 ecs2; 3306; 43.40592861464; 24; 7; 1; 4; 194; 134; 100; 112; 18; 6; 5; 2; 0 ent; 4518712; 52.9817567483832; 7358; 7158; 1259; 1236; 182660; 182997; 215031; 214183; 14654; 14731; 6272; 6068; 0 ent1; 157749; 50.5702096368281; 243; 316; 55; 86; 6499; 6654; 7018; 7556; 528; 552; 252; 351; 0 kpn; 5315120; 57.4785705684914; 6826; 6881; 2566; 2436; 176067; 174204; 303726; 304645; 12619; 12681; 10259; 10156; 0 kpn3; 175879; 51.6906509588979; 295; 312; 81; 93; 6845; 7254; 8320; 8821; 537; 586; 285; 348; 0 kpn4; 107576; 53.4403584442627; 176; 178; 31; 69; 3951; 4187; 5347; 5835; 306; 362; 186; 262; 0 kpn5; 88582; 53.8168025106681; 143; 161; 47; 49; 3458; 3323; 4646; 4543; 247; 264; 171; 171; 0 kpn6; 4259; 41.4181732801127; 16; 18; 0; 3; 208; 215; 124; 171; 25; 28; 5; 5; 0 kpn7; 3478; 45.6584243818286; 8; 9; 1; 4; 194; 162; 126; 137; 21; 13; 8; 5; 0 pst; 6397126; 58.3988809974979; 5446; 5592; 1994; 1943; 221412; 222767; 358716; 358180; 11560; 11674; 9557; 9458; 0 pst1; 73661; 55.145870949349; 81; 86; 41; 52; 2799; 2747; 3736; 3971; 156; 215; 133; 143; 0 pst2; 67473; 56.1661701717724; 86; 86; 33; 51; 2376; 2390; 3511; 3796; 143; 179; 115; 125; 0 sco; 8667507; 72.1186611098208; 172; 218; 10660; 10577; 127391; 126460; 701446; 707949; 972; 1019; 34063; 33951; 0 sco1; 356023; 69.0593023484438; 11; 17; 472; 385; 6041; 6932; 28091; 25882; 81; 112; 1360; 1092; 0 sco2; 31317; 72.1173803365584; 5; 6; 33; 72; 556; 399; 2360; 2881; 3; 4; 99; 181; 0 sfl; 4607202; 50.8900181956189; 8134; 8316; 1312; 1303; 201549; 201821; 215654; 213169; 15093; 15382; 6312; 5871; 49 sfl1; 221618; 45.7670405833461; 619; 570; 110; 124; 10419; 10128; 8643; 9294; 994; 932; 307; 362; 0 stm; 4857432; 52.2215030493479; 9188; 9233; 1560; 1621; 199721; 198927; 237684; 237879; 16617; 16211; 6925; 6782; 0 stm1; 93939; 53.1280937629738; 160; 185; 44; 76; 3310; 3527; 4736; 5221; 265; 332; 191; 207; 0 tos; 2072393; 68.5534548707702; 717; 721; 11907; 12188; 48268; 48509; 171568; 172114; 2802; 2818; 17743; 17863; 0 tos1; 271713; 68.599956571824; 93; 84; 1499; 1469; 6246; 6222; 23005; 22854; 358; 342; 2212; 2278; 0 tos2; 57223; 68.4305261870227; 14; 24; 317; 315; 1220; 1382; 4374; 4764; 53; 58; 458; 521; 0 xac; 5175554; 64.7718872221215; 1468; 1427; 1526; 1434; 140462; 140210; 339957; 339208; 3770; 3692; 7876; 7914; 0 xac1; 33700; 61.8653372503635; 28; 26; 11; 27; 993; 1062; 2180; 2052; 43; 27; 54; 107; 1 xac2; 64920; 61.392483056069; 41; 29; 40; 24; 2223; 1940; 3816; 4022; 78; 74; 147; 99; 0 ype; 4653728; 47.6361102324846; 8789; 8951; 2595; 2930; 224229; 225184; 201213; 204623; 16816; 16685; 7641; 8107; 0 ype1; 70305; 44.8360714031719; 174; 138; 39; 39; 3711; 3574; 2638; 2648; 284; 254; 119; 125; 0 ype2; 9612; 45.2663337494798; 30; 37; 8; 4; 409; 474; 368; 363; 29; 55; 14; 14; 0 ype3; 96210; 50.2276270657936; 161; 137; 29; 24; 4519; 4021; 4291; 4145; 333; 239; 154; 115; 0
Tableaux des diagrammes
[modifier | modifier le wikicode]Tableaux plasmides cyanobactéries
[modifier | modifier le wikicode]Plasmides %GC
[modifier | modifier le wikicode]Aléas équation KEGG effectif %GC >4AT >4GC >4ATa >4GCa ana 6,413,771 41.35 50.59 8.25 30.81 5.98 ana1 408,101 40.51 52.02 6.71 32.89 5.45 ana2 186,614 40.23 53.85 5.95 33.62 5.28 ana3 101,965 41.03 48.84 7.16 31.60 5.77 ana4 55,414 41.61 50.71 11.37 30.18 6.15 ana5 40,340 40.86 60.73 9.92 32.03 5.66 ana6 5,584 44.18 37.61 5.37 24.48 8.11 anb1 80,384 37.23 60.34 7.34 42.04 3.75 anb2 56,037 37.25 61.74 7.32 41.97 3.76 anb3 20,025 37.42 70.41 13.48 41.48 3.83 anba 4,329,264 38.10 64.14 8.14 39.45 4.15 anbb 819,965 38.21 64.99 8.66 39.14 4.20 can 4,114,099 34.96 93.41 12.10 49.37 2.86 can1 62,874 33.17 75.71 7.63 55.74 2.30 cyt1 39,620 36.80 73.45 8.83 43.37 3.56 cyt2 31,856 41.46 37.98 16.95 30.55 6.05 cyt3 14,685 38.09 84.44 11.58 39.48 4.14 cyt4 10,244 36.97 65.40 21.48 42.85 3.64 cytc 4,934,271 37.88 71.17 12.41 40.12 4.04 cytl 429,701 38.57 65.56 9.05 38.12 4.37 len 6,244,812 46.65 26.85 5.24 19.80 10.47 len1 325,675 47.01 27.67 5.19 19.17 10.86 len2 98,206 48.54 25.56 5.19 16.69 12.64 len3 92,964 47.35 28.51 5.49 18.61 11.23 mic 7,470,429 46.21 38.95 12.72 20.57 10.02 mic1 146,045 45.27 35.06 9.04 22.32 9.09 mic2 93,032 47.10 43.10 17.74 19.02 10.95 mic3 92,471 46.62 39.80 15.57 19.85 10.44 mic4 50,464 44.65 43.60 8.92 23.53 8.53 mic5 38,468 47.66 35.61 14.04 18.09 11.58 mic6 28,816 46.59 41.30 17.70 19.91 10.40 mic7 25,982 46.76 34.64 12.70 19.60 10.59 mic8 20,803 46.45 44.71 16.82 20.14 10.27 oac 7,689,443 47.60 43.85 24.70 18.19 11.52 oac1 64,128 47.62 47.25 20.12 18.16 11.53 oac2 50,699 49.30 39.25 21.50 15.56 13.59 oni 7,479,014 45.87 52.46 10.84 21.20 9.67 oni1 300,164 45.13 45.14 10.66 22.60 8.96 oni2 260,268 44.61 48.72 10.18 23.61 8.49 oni3 150,927 45.51 45.25 12.32 21.87 9.32 oni4 74,236 44.56 53.07 9.29 23.71 8.45 oni5 7,645 47.59 58.86 22.24 18.21 11.50 syf 2,695,903 55.47 17.73 11.63 8.40 23.70 syf1 46,366 52.89 17.25 12.94 10.98 18.94 syn 3,573,470 47.72 53.42 31.76 17.99 11.65 syn1 103,307 44.48 57.01 18.00 23.87 8.37 syn2 44,343 48.62 29.77 17.82 16.57 12.73 syn3 119,895 42.95 56.05 16.10 27.10 7.12 syn4 106,004 42.72 65.47 21.98 27.62 6.94 synp 3,510,253 40.62 50.81 7.61 32.62 5.51 synp1 63,272 40.89 47.89 5.06 31.93 5.68 synp2 10,210 39.41 53.87 2.94 35.78 4.81
Plasmides hôte
[modifier | modifier le wikicode]KEGG >4ATh >4AT diag KEGG >4GCh >4GC diag ana1 50.59 52.02 50.59 ana1 8.25 6.71 8.25 ana2 50.59 53.85 50.59 ana2 8.25 5.95 8.25 ana3 50.59 48.84 50.59 ana3 8.25 7.16 8.25 ana4 50.59 50.71 50.59 ana4 8.25 11.37 8.25 ana5 50.59 60.73 50.59 ana5 8.25 9.92 8.25 ana6 50.59 37.61 50.59 ana6 8.25 5.37 8.25 anb1 64.14 60.34 64.14 anb1 8.14 7.34 8.14 anb2 64.14 61.74 64.14 anb2 8.14 7.32 8.14 anb3 64.14 70.41 64.14 anb3 8.14 13.48 8.14 anbb 64.14 64.99 64.14 anbb 8.14 8.66 8.14 can1 93.41 75.71 93.41 can1 12.10 7.63 12.10 cyt1 71.17 73.45 71.17 cyt1 12.41 8.83 12.41 cyt2 71.17 37.98 71.17 cyt2 12.41 16.95 12.41 cyt3 71.17 84.44 71.17 cyt3 12.41 11.58 12.41 cyt4 71.17 65.40 71.17 cyt4 12.41 21.48 12.41 cytl 71.17 65.56 71.17 cytl 12.41 9.05 12.41 len1 26.85 27.67 26.85 len1 5.24 5.19 5.24 len2 26.85 25.56 26.85 len2 5.24 5.19 5.24 len3 26.85 28.51 26.85 len3 5.24 5.49 5.24 mic1 38.95 35.06 38.95 mic1 12.72 9.04 12.72 mic2 38.95 43.10 38.95 mic2 12.72 17.74 12.72 mic3 38.95 39.80 38.95 mic3 12.72 15.57 12.72 mic4 38.95 43.60 38.95 mic4 12.72 8.92 12.72 mic5 38.95 35.61 38.95 mic5 12.72 14.04 12.72 mic6 38.95 41.30 38.95 mic6 12.72 17.70 12.72 mic7 38.95 34.64 38.95 mic7 12.72 12.70 12.72 mic8 38.95 44.71 38.95 mic8 12.72 16.82 12.72 oac1 43.85 47.25 43.85 oac1 24.70 20.12 24.70 oni1 52.46 45.14 52.46 oni1 10.84 10.66 10.84 oni2 52.46 48.72 52.46 oni2 10.84 10.18 10.84 oni3 52.46 45.25 52.46 oni3 10.84 12.32 10.84 oni4 52.46 53.07 52.46 oni4 10.84 9.29 10.84 oni5 52.46 58.86 52.46 oni5 10.84 22.24 10.84 syf1 17.73 17.25 17.73 syf1 11.63 12.94 11.63 syn1 53.42 57.01 53.42 syn1 31.76 18.00 31.76 syn2 53.42 29.77 53.42 syn2 31.76 17.82 31.76 syn3 53.42 56.05 53.42 syn3 31.76 16.10 31.76 syn4 53.42 65.47 53.42 syn4 31.76 21.98 31.76 synp1 50.81 47.89 50.81 synp1 7.61 5.06 7.61 synp2 50.81 53.87 50.81 synp2 7.61 2.94 7.61 oac2 43.85 39.25 43.85 oac2 24.70 21.50 24.70
Tableaux plasmides autres bactéries
[modifier | modifier le wikicode]Plasmides %GC
[modifier | modifier le wikicode]KEGG DNA %GC >4GC >4AT >4ATa >4GCa cje1 4,013 30.15 9.97 174.43 67.78 1.52 cje 1,641,481 30.55 2.14 160.17 66.10 1.61 cac1 192,000 30.91 1.51 97.14 64.60 1.70 cac 3,940,880 30.93 2.49 95.73 64.54 1.70 kpn6 4,259 41.42 7.04 79.83 30.64 6.02 ecs2 3,306 43.41 15.12 93.77 26.11 7.47 ype1 70,305 44.84 11.09 44.38 23.16 8.69 ype2 9,612 45.27 12.48 69.70 22.33 9.09 kpn7 3,478 45.66 14.38 48.88 21.59 9.46 sfl1 221,618 45.77 10.56 53.65 21.39 9.57 ecs1 92,721 47.60 12.40 51.12 18.19 11.51 ype 4,653,728 47.64 11.87 38.12 18.13 11.56 ype3 96,210 50.23 5.51 30.97 14.25 14.84 ecs 5,498,450 50.54 6.22 38.21 13.84 15.28 ent1 157,749 50.57 8.94 35.44 13.79 15.33 sfl 4,607,202 50.89 5.68 35.71 13.37 15.79 kpn3 175,879 51.69 9.89 34.51 12.37 17.00 stm 4,857,432 52.22 6.55 37.92 11.74 17.84 ent 4,518,712 52.98 5.52 32.12 10.87 19.10 stm1 93,939 53.13 12.77 36.73 10.71 19.35 kpn4 107,576 53.44 9.30 32.91 10.38 19.89 kpn5 88,582 53.82 10.84 34.32 9.99 20.56 pst1 73,661 55.15 12.63 22.67 8.70 23.05 pst2 67,473 56.17 12.45 25.49 7.80 25.12 kpn 5,315,120 57.48 9.41 25.79 6.76 27.97 pst 6,397,126 58.40 6.15 17.25 6.10 30.11 xac2 64,920 61.39 9.86 10.78 4.33 37.91 xac1 33,700 61.87 11.28 16.02 4.09 39.27 xac 5,175,554 64.77 5.72 5.59 2.88 48.37 tos2 57,223 68.43 110.45 6.64 1.77 61.87 tos 2,072,393 68.55 116.27 6.94 1.74 62.37 tos1 271,713 68.60 109.23 6.51 1.73 62.55 sco1 356,023 69.06 24.07 0.79 1.62 64.43 sco2 31,317 72.12 33.53 3.51 0.94 77.97 sco 8,667,507 72.12 24.50 0.45 0.94 77.98
Plasmides hôte
[modifier | modifier le wikicode]hôte >4GCh >4GC diag hôte >4ATh >4AT diag cje 2.14 cje1 9.97 2.14 sco 0.45 sco1 0.79 0.45 cac 2.49 cac1 1.51 2.49 sco 0.45 sco2 3.51 0.45 ent 5.52 ent1 8.94 5.52 xac 5.59 xac2 10.78 5.59 sfl 5.68 sfl1 10.56 5.68 xac 5.59 xac1 16.02 5.59 xac 5.72 xac2 9.86 5.72 pst 17.25 pst1 22.67 17.25 xac 5.72 xac1 11.28 5.72 pst 17.25 pst2 25.49 17.25 pst 6.15 pst1 12.63 6.15 kpn 25.79 kpn7 48.88 25.79 pst 6.15 pst2 12.45 6.15 kpn 25.79 kpn6 79.83 25.79 ecs 6.22 ecs2 15.12 6.22 kpn 25.79 kpn3 34.51 25.79 ecs 6.22 ecs1 12.40 6.22 kpn 25.79 kpn4 32.91 25.79 stm 6.55 stm1 12.77 6.55 kpn 25.79 kpn5 34.32 25.79 kpn 9.41 kpn7 14.38 9.41 ent 32.12 ent1 35.44 32.12 kpn 9.41 kpn6 7.04 9.41 sfl 35.70 sfl1 53.65 35.70 kpn 9.41 kpn3 9.89 9.41 stm 37.92 stm1 36.73 37.92 kpn 9.41 kpn4 9.30 9.41 ype 38.12 ype1 44.38 38.12 kpn 9.41 kpn5 10.84 9.41 ype 38.12 ype2 69.70 38.12 ype 11.87 ype1 11.09 11.87 ype 38.12 ype3 30.97 38.12 ype 11.87 ype2 12.48 11.87 ecs 38.21 ecs2 93.77 38.21 ype 11.87 ype3 5.51 11.87 ecs 38.21 ecs1 51.12 38.21 sco 24.50 sco1 24.07 24.50 cac 95.73 cac1 97.14 95.73 sco 24.50 sco2 33.53 24.50 cje 160.17 cje1 174.43 160.17 tos 116.27 tos1 109.23 116.27 tos 6.94 tos1 6.51 6.94 tos 116.27 tos2 110.45 116.27 tos 6.94 tos2 6.64 6.94
Bactérie %GC − Plasmide %GC
[modifier | modifier le wikicode]KEGG %GC b plasm. diag cje1 30.55 30.15 30.55 cac1 30.93 30.91 30.93 can1 34.96 33.17 34.96 cyt1 37.88 36.80 37.88 cyt4 37.88 36.97 37.88 cyt3 37.88 38.09 37.88 cyt2 37.88 41.46 37.88 anb1 38.10 37.23 38.10 anb2 38.10 37.25 38.10 anb3 38.10 37.42 38.10 ana2 41.35 40.23 41.35 ana1 41.35 40.51 41.35 ana5 41.35 40.86 41.35 ana3 41.35 41.03 41.35 ana4 41.35 41.61 41.35 ana6 41.35 44.18 41.35 ype1 47.64 44.84 47.64 ype2 47.64 45.27 47.64 ype3 47.64 50.23 47.64 syn4 47.72 42.72 47.72 syn3 47.72 42.95 47.72 syn1 47.72 44.48 47.72 syn2 47.72 48.62 47.72 ecs2 50.54 43.41 50.54 ecs1 50.54 47.60 50.54 sfl1 50.89 45.77 50.89 stm1 52.22 53.13 52.22 ent1 52.98 50.57 52.98 kpn6 57.48 41.42 57.48 kpn7 57.48 45.66 57.48 kpn3 57.48 51.69 57.48 kpn4 57.48 53.44 57.48 kpn5 57.48 53.82 57.48 pst1 58.40 55.15 58.40 pst2 58.40 56.17 58.40 xac2 64.77 61.39 64.77 xac1 64.77 61.87 64.77 sco1 72.12 69.06 72.12 sco2 72.12 72.12 72.12 tos2 68.55 68.43 68.55 tos1 68.55 68.60 68.55 len1 46.65 47.01 46.65 len2 46.65 48.54 46.65 len3 46.65 47.35 46.65 mic1 46.21 45.27 46.21 mic2 46.21 47.10 46.21 mic3 46.21 46.62 46.21 mic4 46.21 44.65 46.21 mic5 46.21 47.66 46.21 mic6 46.21 46.59 46.21 mic7 46.21 46.76 46.21 mic8 46.21 46.45 46.21 oac1 47.60 47.62 47.60 oni1 45.87 45.13 45.87 oni2 45.87 44.61 45.87 oni3 45.87 45.51 45.87 oni4 45.87 44.56 45.87 oni5 45.87 47.59 45.87 syf1 55.47 52.89 55.47 synp1 40.62 40.89 40.62 synp2 40.62 39.41 40.62 oac2 47.60 49.30 47.60
Différences hôte − plasmide
[modifier | modifier le wikicode]Cyanobactéries
[modifier | modifier le wikicode]Cyanobactéries plasmides/hôte Loi binomiale p=taux de l’hôte q=taux du plasmide 2σ = 2*racine(n*p*(10000-p*5))/10000 abs(n*(p-q))/10000 n=DNA du plasmide n*q/10000 n*p/10000 Différence 2σ= abs(2*racine(n*p*(10000-p*5))-abs(n*(p-q)))/10000 − Différences 2σ Différences % KEGG DNA %GC >4AT >4GC >4AT >4GC >4AT >4GC %GC Groupe 7 len 6244812 46.65 26.9 5.2 len1 325675 47.01 27.7 5.2 32 24 3 -1 1 len2 98206 48.54 25.6 5.2 20 14 -5 -1 4 len3 92964 47.35 28.5 5.5 16 12 6 5 2 synp 3510253 40.62 50.8 7.6 synp1 63272 40.89 47.9 5.1 17 -2 -6 -34 1 synp2 10210 39.41 53.9 2.9 11 1 6 -61 -3 anba 4329264 38.10 64.1 8.1 anbb 819965 38.21 65.0 8.7 73 9 1 6 0 anb1 80384 37.23 60.3 7.3 14 10 -6 -10 -2 anb2 56037 37.25 61.7 7.3 24 9 -4 -10 -2 anb3 20025 37.42 70.4 13.5 10 -3 10 66 -2 ana 6413771 41.35 50.6 8.2 ana1 408101 40.51 52.0 6.7 31 -26 3 -19 -2 ana2 186614 40.23 53.9 5.9 0 -18 6 -28 -3 ana3 101965 41.03 48.8 7.2 27 7 -3 -13 -1 ana4 55414 41.61 50.7 11.4 32 -4 0 38 1 ana5 40340 40.86 60.7 9.9 -13 5 20 20 -1 ana6 5584 44.18 37.6 5.4 3 3 -26 -35 7 Groupe 14 oni 7479014 45.87 52.5 10.8 oni1 300164 45.13 45.1 10.7 -141 31 -14 -2 -2 oni2 260268 44.61 48.7 10.2 -24 16 -7 -6 -3 oni3 150927 45.51 45.3 12.3 -53 3 -14 14 -1 oni4 74236 44.56 53.1 9.3 34 6 1 -14 -3 oni5 7645 47.59 58.9 22.2 8 -3 12 105 4 syf 2695903 55.47 17.7 11.6 syf1 46366 52.89 17.3 12.9 16 9 -3 11 -5 can 4114099 34.96 93.4 12.1 can1 62874 33.17 75.7 7.6 -64 -11 -19 -37 -5 cytc 4934271 37.88 71.2 12.4 cytl 429701 38.57 65.6 9.1 -133 -98 -8 -27 2 cyt1 39620 36.80 73.4 8.8 24 0 3 -29 -3 cyt2 31856 41.46 38.0 17.0 -76 -2 -47 37 9 cyt3 14685 38.09 84.4 11.6 1 7 19 -7 1 cyt4 10244 36.97 65.4 21.5 11 -2 -8 73 -2 mic 7470429 46.21 39.0 12.7 mic1 146045 45.27 35.1 9.0 -10 -27 -10 -29 -2 mic2 93032 47.10 43.1 17.7 -1 -25 11 39 2 mic3 92471 46.62 39.8 15.6 30 -5 2 22 1 mic4 50464 44.65 43.6 8.9 4 -3 12 -30 -3 mic5 38468 47.66 35.6 14.0 11 9 -9 10 3 mic6 28816 46.59 41.3 17.7 14 -2 6 39 1 mic7 25982 46.76 34.6 12.7 9 11 -11 0 1 mic8 20803 46.45 44.7 16.8 6 2 15 32 1 Groupe 25 oac 7689443 47.60 43.9 24.7 oac1 64128 47.62 47.2 20.1 11 -4 8 -19 0 oac2 50699 49.30 39.3 21.5 6 6 -10 -13 4 syn 3573470 47.72 53.4 31.8 syn1 103307 44.48 57.0 18.0 9 -106 7 -43 -7 syn2 44343 48.62 29.8 17.8 -75 -38 -44 -44 2 syn3 119895 42.95 56.0 16.1 18 -149 5 -49 -10 syn4 106004 42.72 65.5 22.0 -81 -67 23 -31 -10 total différence avec 2σ < 0 11 20 total différence avec 2σ < -5 10 11
Autre-bactéries
[modifier | modifier le wikicode]Autre-bactéries Plasmides/hôte Loi binomiale q=taux du plasmide p=taux de l’hôte 2σ = 2*racine(n*p*(10000-p*5))/10000 n=DNA du plasmide n*p/10000 n*q/10000 abs(n*(p-q))/10000 Différence 2σ= abs(2*racine(n*P*(10000-p*5))-abs(n*(p-q)))/10000 − Différences 2σ Différences % KEGG DNA %GC >4AT >4GC >4AT >4GC >4AT >4GC %GC Groupe 2 cje 1641481 30.55 160.2 2.1 cje1 4013 30.15 174.4 10.0 10 -1 9 366 -1 cac 3940880 30.93 95.7 2.5 cac1 192000 30.91 97.1 1.5 57 -5 1 -39 0 Groupe 7 ent 4518712 52.98 32.1 5.5 ent1 157749 50.57 35.4 8.9 -8 -35 10 62 -5 sfl 4607202 50.89 35.7 5.7 sfl1 221618 45.77 53.7 10.6 -342 -86 50 86 -10 xac 5175554 64.77 5.6 5.7 xac1 33700 61.87 16.0 11.3 -26 -10 186 97 -4 xac2 64920 61.39 10.8 9.9 -22 -15 93 72 -5 pst 6397126 58.40 17.3 6.2 pst1 73661 55.15 22.7 12.6 -17 -34 31 105 -6 pst2 67473 56.17 25.5 12.4 -34 -30 48 102 -4 ecs 5498450 50.54 38.2 6.2 ecs1 92721 47.60 51.1 12.4 -82 -42 34 99 -6 ecs2 3306 43.41 93.8 15.1 -11 0 145 143 -14 stm 4857432 52.22 37.9 6.5 stm1 93939 53.13 36.7 12.8 26 -43 -3 95 2 kpn 5315120 57.48 25.8 9.4 kpn3 175879 51.69 34.5 9.9 -111 17 34 5 -10 kpn4 107576 53.44 32.9 9.3 -43 19 28 -1 -7 kpn5 88582 53.82 34.3 10.8 -46 6 33 15 -6 kpn6 4259 41.42 79.8 7.0 -16 3 210 -25 -28 kpn7 3478 45.66 48.9 14.4 -2 2 90 53 -21 Groupe 14 ype 4653728 47.64 38.1 11.9 ype1 70305 44.84 44.4 11.1 -12 13 16 -7 -6 ype2 9612 45.27 69.7 12.5 -18 6 83 5 -5 ype3 96210 50.23 31.0 5.5 -31 -40 -19 -54 5 Groupe 25 sco 8667507 72.12 0.4 24.5 sco1 356023 69.06 0.8 24.1 -4 43 75 -2 -4 sco2 31317 72.12 3.5 33.5 -7 -11 681 37 0 Groupe 68 tos 2072393 68.55 6.9 116.3 tos1 271713 68.60 6.5 109.2 16 -82 -6 -6 0 tos2 57,223 68.43 6.6 110.4 11 17 -4 -5 0 total différence avec 2σ < 0 18 18 total différence avec 2σ < -5 16 17
rRNA
[modifier | modifier le wikicode]Résultat
[modifier | modifier le wikicode]KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl ade; 2985; 55.8793969849246; 0; 2; 1; 2; 74; 155; 140; 198; 3; 14; 8; 17; 0 bla; 3065; 60.652528548124; 0; 2; 4; 12; 74; 112; 161; 211; 2; 6; 14; 16; 0 bsu; 2928; 53.8934426229508; 0; 1; 2; 1; 91; 157; 134; 188; 1; 9; 7; 17; 0 cbl; 2902; 50.5513439007581; 1; 5; 1; 0; 91; 172; 121; 166; 0; 12; 5; 16; 0 cgq; 3080; 53.3116883116883; 3; 1; 1; 2; 114; 132; 118; 199; 5; 11; 8; 20; 0 cje; 2890; 47.3356401384083; 1; 2; 1; 3; 105; 186; 95; 140; 2; 10; 4; 11; 0 crp; 2827; 33.8167668906969; 19; 9; 1; 0; 216; 133; 95; 61; 25; 14; 6; 2; 0 cta; 2869; 48.6929243638899; 1; 3; 0; 5; 99; 187; 110; 159; 7; 13; 4; 12; 0 eco; 2904; 53.236914600551; 0; 4; 1; 7; 88; 170; 114; 177; 2; 7; 9; 11; 0 fnc; 2906; 46.9373709566414; 0; 2; 1; 5; 106; 203; 102; 161; 4; 10; 3; 7; 0 kpn; 2904; 53.030303030303; 0; 3; 1; 7; 92; 171; 114; 177; 1; 8; 9; 12; 0 lla; 2901; 49.6725267149259; 0; 2; 1; 2; 103; 164; 107; 157; 3; 11; 4; 12; 0 pgd; 2824; 53.4702549575071; 0; 2; 1; 4; 85; 145; 123; 169; 2; 6; 11; 12; 0 ple; 2869; 44.9982572324852; 0; 8; 0; 2; 105; 197; 99; 152; 4; 21; 3; 8; 0 roa; 3132; 55.6194125159642; 0; 1; 4; 5; 86; 149; 145; 197; 1; 10; 9; 17; 0 sall; 3909; 56.0245587106677; 2; 1; 7; 3; 180; 130; 268; 181; 8; 2; 22; 7; 0 sbh; 2525; 56.5544554455446; 1; 0; 3; 1; 113; 82; 169; 121; 5; 1; 12; 5; 0 sbn; 2903; 51.3951085084395; 0; 3; 1; 6; 102; 167; 108; 167; 3; 9; 7; 11; 0 ser; 2922; 50.444900752909; 0; 2; 2; 2; 116; 162; 102; 169; 2; 11; 6; 11; 0 sgr; 3129; 56.4077980185363; 1; 1; 5; 2; 141; 94; 206; 144; 6; 1; 16; 7; 0 sma; 3124; 56.8822023047375; 1; 1; 5; 2; 141; 88; 210; 153; 6; 2; 17; 7; 0 smv; 2879; 40.4654393886766; 1; 12; 1; 0; 127; 202; 75; 131; 10; 14; 3; 7; 0 spi; 2903; 49.7760936961764; 0; 1; 2; 2; 100; 158; 107; 152; 5; 14; 4; 13; 0 tth; 2893; 63.6017974421016; 1; 1; 4; 16; 44; 136; 177; 207; 0; 9; 16; 23; 0 tos; 2877; 61.4181438998957; 1; 1; 11; 1; 130; 57; 209; 171; 8; 2; 25; 11; 0 bmv; 2882; 53.4004163775156; 1; 0; 7; 1; 160; 86; 176; 118; 11; 2; 13; 7; 0 zin; 2888; 36.1149584487535; 12; 10; 1; 2; 129; 204; 66; 104; 11; 34; 2; 10; 0 wbr; 2922; 46.0301163586585; 5; 6; 0; 4; 106; 196; 106; 150; 5; 13; 4; 7; 0 tra; 2950; 56.0338983050847; 0; 0; 2; 3; 82; 148; 129; 195; 0; 13; 9; 16; 0 tai; 2972; 58.2436069986541; 1; 0; 5; 2; 131; 71; 211; 142; 8; 0; 21; 10; 0 mrb; 2893; 56.8268233667473; 1; 0; 5; 0; 147; 69; 194; 148; 10; 3; 20; 8; 0 mcac; 2908; 45.8046767537827; 1; 3; 1; 2; 118; 180; 102; 144; 6; 17; 6; 11; 0 mhd; 2917; 62.1186150154268; 0; 1; 1; 9; 63; 129; 171; 214; 1; 8; 12; 26; 0 rpr; 2761; 46.9757334299167; 2; 6; 0; 3; 98; 169; 98; 137; 5; 9; 6; 10; 0 uur; 2903; 45.4357561143645; 1; 1; 0; 4; 123; 196; 90; 133; 5; 10; 4; 10; 0
Tableau des diagrammes 3AT et 3GC
[modifier | modifier le wikicode]x3 -0.001241 0.000842 x2 0.292481 -0.020776 x -24.200958 0.039846 c 692.8194 3.536873 Aléas équation KEGG Long %GCb >3GC >3AT >3ATa >3GCa ade 2,985 74.91 93.80 63.65 0.0 243.8 bla 3,065 60.49 150.08 32.63 24.4 116.3 bmv 2,882 68.15 97.15 48.58 9.1 176.3 bsu 2,928 43.51 92.21 37.57 91.3 35.3 cbl 2,902 28.31 75.81 62.03 213.9 7.1 cgq 3,080 54.15 100.65 64.94 42.9 78.5 cje 2,890 30.55 65.74 51.90 191.1 9.4 crp 2,827 16.56 31.84 237.00 366.6 2.3 cta 2,869 41.30 73.20 83.65 104.8 29.1 eco 2,904 50.79 96.42 44.77 55.5 62.3 fnc 2,906 27.12 55.06 55.06 226.8 6.1 kpn 2,904 57.48 99.86 41.32 32.4 97.1 lla 2,901 35.33 65.49 55.15 148.2 16.1 mcac 2,908 23.66 68.78 92.85 267.5 4.0 mhd 2,917 68.08 164.55 34.28 9.3 175.6 mrb 2,893 63.38 114.07 48.39 17.9 137.0 pgd 2,824 59.62 99.15 35.41 26.6 110.5 ple 2,869 26.17 45.31 115.02 237.5 5.4 roa 3,132 67.37 111.75 38.31 10.4 169.4 rpr 2,761 29.00 68.82 79.68 206.7 7.8 sall 3,909 72.13 99.77 33.26 3.2 214.3 sbh 2,525 70.75 83.17 27.72 5.1 200.6 sbn 2,903 46.28 86.12 51.67 76.2 44.4 ser 2,922 32.15 71.87 51.33 175.8 11.3 sgr 3,129 72.23 95.88 28.76 3.1 215.3 sma 3,124 70.72 99.23 32.01 5.2 200.2 smv 2,879 24.00 38.21 128.52 263.3 4.2 spi 2,903 38.32 72.34 68.89 125.1 21.9 tai 2,972 63.79 127.86 30.28 17.1 140.1 tos 2,877 68.55 166.84 41.71 8.5 179.9 tra 2,950 68.14 101.69 44.07 9.1 176.2 tth 2,893 69.44 203.94 38.02 7.1 188.0 uur 2,903 25.50 62.00 58.56 245.3 5.0 wbr 2,922 22.48 51.33 99.25 282.5 3.5 zin 2,888 13.54 51.94 231.99 415.7 2.4
Protéines
[modifier | modifier le wikicode]Cyanobactéries
[modifier | modifier le wikicode]Répétitions
[modifier | modifier le wikicode]- can cyanobactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl carB; 3249; 42.1360418590335; 2; 8; 0; 4; 198; 184; 115; 128; 15; 17; 9; 10; 0 cox1; 1647; 40.5585913782635; 4; 1; 0; 3; 126; 72; 58; 68; 19; 5; 0; 9; 0 dnaE; 2640; 33.7121212121212; 12; 20; 0; 2; 164; 157; 50; 94; 13; 26; 1; 6; 0 dnaE1; 1362; 34.5080763582966; 5; 14; 2; 1; 88; 81; 30; 38; 9; 15; 2; 4; 0 ftsK; 5448; 31.0389133627019; 22; 41; 1; 0; 376; 419; 97; 154; 29; 49; 4; 5; 0 iars; 2907; 40.2820777433781; 5; 8; 3; 1; 177; 176; 85; 109; 10; 21; 7; 9; 0 lars; 2577; 40.7450523864959; 5; 11; 1; 2; 146; 159; 95; 99; 10; 20; 4; 6; 0 rpoB; 3276; 42.3382173382173; 4; 10; 2; 1; 171; 197; 119; 150; 11; 25; 6; 5; 0 rpoC; 3840; 39.9479166666667; 1; 18; 1; 1; 245; 239; 98; 146; 11; 19; 4; 16; 0 mfd; 3594; 37.7851975514747; 8; 20; 3; 2; 235; 216; 109; 114; 15; 29; 7; 7; 0 sbcC; 3024; 30.026455026455; 1; 28; 0; 1; 202; 262; 37; 58; 12; 40; 3; 1; 0 secA; 2820; 39.1489361702128; 5; 24; 2; 0; 148; 188; 69; 108; 13; 13; 7; 9; 0
- cgc cyanobactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl carB; 3324; 70.2166064981949; 0; 0; 7; 7; 45; 65; 304; 266; 0; 1; 19; 10; 0 cox1; 1671; 64.4524236983842; 0; 0; 3; 6; 57; 31; 137; 113; 1; 0; 7; 2; 0 dnaE; 3531; 67.2330784480317; 0; 0; 5; 5; 51; 94; 299; 259; 0; 1; 16; 13; 0 iars; 2952; 70.5284552845528; 0; 0; 5; 6; 32; 58; 245; 253; 1; 0; 9; 10; 0 lars; 2625; 69.5238095238095; 0; 0; 11; 2; 40; 50; 218; 187; 0; 1; 11; 17; 0 mfd; 3591; 71.1500974658869; 0; 0; 10; 5; 48; 68; 300; 329; 1; 1; 14; 13; 0 recB; 3807; 75.0459679537694; 0; 0; 14; 11; 35; 45; 332; 366; 0; 0; 21; 21; 0 rpoB; 3291; 66.1804922515953; 0; 0; 12; 1; 38; 115; 248; 218; 0; 0; 21; 4; 0 rpoC; 4110; 67.8345498783455; 0; 0; 12; 4; 39; 119; 347; 314; 0; 0; 9; 9; 0 sbcC; 3018; 76.2094102054341; 0; 1; 3; 9; 26; 41; 298; 288; 0; 1; 6; 18; 0 secA; 2835; 66.9135802469136; 0; 0; 7; 2; 34; 84; 207; 219; 0; 0; 11; 8; 0
- cya cyanobactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl carB; 3225; 62.9457364341085; 0; 1; 4; 11; 86; 93; 228; 210; 2; 5; 21; 13; 0 cox1; 1710; 59.3567251461988; 6; 0; 2; 6; 78; 32; 114; 110; 7; 0; 7; 5; 0 dnaE; 3486; 54.6758462421113; 2; 6; 0; 2; 137; 136; 205; 217; 10; 15; 7; 15; 0 iars; 2811; 62.0419779437922; 2; 2; 5; 3; 61; 85; 208; 195; 7; 8; 12; 12; 0 lars; 2622; 62.3569794050343; 2; 1; 5; 6; 67; 91; 156; 193; 1; 3; 15; 12; 0 mfd; 3471; 60.2420051858254; 1; 6; 11; 2; 105; 110; 232; 240; 13; 12; 16; 10; 0 rpoB; 3402; 62.0223398001176; 5; 6; 1; 9; 75; 112; 208; 251; 3; 7; 16; 9; 0 rpoC; 3909; 63.5456638526477; 1; 6; 5; 11; 88; 119; 255; 309; 1; 6; 8; 19; 0 sbcC; 3291; 64.1750227894257; 0; 1; 2; 5; 66; 127; 266; 196; 2; 6; 8; 10; 0 secA; 2865; 61.4659685863874; 2; 3; 3; 3; 57; 113; 184; 210; 4; 7; 10; 11; 0
- mar cyanobactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl carB; 3246; 48.1823783117683; 1; 10; 3; 4; 148; 182; 165; 139; 15; 21; 13; 7; 0 cox1; 1677; 47.1675611210495; 4; 0; 4; 2; 112; 58; 77; 85; 13; 3; 5; 3; 0 dnaE; 2625; 38.3619047619048; 6; 14; 0; 0; 160; 155; 85; 101; 12; 25; 3; 5; 0 dnaE1; 1338; 39.237668161435; 7; 6; 0; 0; 69; 77; 39; 50; 5; 25; 1; 2; 0 iars; 2859; 42.2525358516964; 6; 8; 0; 1; 159; 169; 87; 127; 13; 16; 6; 9; 0 lars; 2553; 42.4990207598903; 4; 13; 2; 2; 144; 154; 116; 102; 10; 20; 6; 5; 0 mfd; 3483; 44.7602641401091; 5; 14; 2; 3; 187; 195; 129; 154; 22; 15; 13; 15; 0 rpoB; 3336; 52.4580335731415; 2; 9; 10; 2; 115; 190; 179; 159; 10; 17; 22; 9; 0 rpoC; 4005; 51.1610486891386; 0; 9; 6; 8; 169; 217; 201; 197; 6; 13; 5; 21; 0 sbcC; 3024; 38.2275132275132; 2; 19; 0; 4; 173; 233; 66; 93; 13; 22; 2; 3; 0 secA; 2817; 46.822861199858; 6; 17; 1; 2; 131; 177; 121; 135; 5; 17; 8; 10; 0
- pmm cyanobactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl carB; 3300; 32.6969696969697; 6; 13; 0; 0; 238; 266; 72; 111; 23; 23; 1; 2; 0 dnaE; 3498; 31.8181818181818; 9; 21; 0; 1; 244; 234; 67; 104; 20; 33; 0; 4; 0 gyrB; 1968; 33.9939024390244; 2; 16; 1; 1; 120; 122; 22; 82; 10; 16; 0; 2; 0 iars; 2898; 31.9875776397516; 10; 20; 1; 0; 206; 190; 56; 101; 14; 22; 1; 3; 0 lars; 2577; 28.9483896003104; 7; 23; 0; 0; 163; 196; 51; 75; 13; 34; 1; 3; 0 mfd; 3516; 28.1854379977247; 5; 40; 0; 1; 219; 307; 58; 87; 16; 32; 0; 0; 0 recB; 3630; 23.8567493112948; 13; 25; 0; 0; 270; 323; 48; 84; 31; 34; 0; 1; 0 rpoB; 3294; 36.8852459016393; 6; 16; 1; 0; 198; 235; 79; 134; 18; 13; 1; 4; 0 rpoC; 4101; 35.5279200195074; 2; 18; 0; 1; 266; 314; 75; 157; 17; 23; 3; 4; 0 secA; 2832; 33.8629943502825; 6; 16; 0; 1; 162; 231; 43; 97; 12; 27; 1; 1; 0
- syn cyanobactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl carB; 3318; 51.3261000602773; 1; 8; 5; 10; 179; 162; 193; 169; 12; 15; 13; 14; 0 cox1; 1656; 49.8188405797101; 5; 0; 1; 5; 96; 50; 96; 82; 19; 5; 8; 8; 0 dnaE; 2694; 43.5412026726058; 10; 8; 1; 1; 152; 152; 123; 116; 9; 17; 5; 11; 0 dnaE1; 1377; 46.1147421931736; 1; 7; 2; 1; 60; 86; 67; 66; 10; 8; 5; 5; 0 iars; 2967; 46.2756993596225; 4; 13; 4; 3; 167; 164; 131; 165; 14; 16; 9; 9; 0 lars; 2610; 49.1187739463602; 3; 10; 3; 6; 149; 126; 138; 145; 12; 10; 9; 7; 0 mfd; 3600; 47.1944444444444; 6; 16; 4; 2; 201; 170; 149; 213; 15; 16; 11; 16; 0 rpoB; 3309; 52.9465095194923; 3; 13; 10; 6; 138; 177; 187; 180; 7; 8; 18; 11; 0 rpoC; 3954; 54.147698533131; 0; 10; 4; 10; 155; 205; 219; 250; 8; 12; 11; 29; 0 sbcC; 3021; 42.1383647798742; 1; 16; 0; 1; 173; 242; 110; 119; 12; 17; 6; 8; 0 secA; 2799; 49.124687388353; 3; 11; 1; 6; 117; 170; 119; 169; 5; 15; 9; 13; 0
- tel cyanobactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl carB; 3303; 54.3445352709658; 2; 5; 6; 3; 143; 148; 192; 169; 4; 12; 18; 10; 0 cox1; 1659; 53.2851115129596; 2; 0; 4; 4; 83; 43; 86; 95; 9; 6; 7; 6; 0 dnaE; 2619; 52.8064146620848; 5; 8; 2; 0; 95; 113; 137; 142; 6; 7; 7; 10; 0 dnaE1; 1359; 56.8064753495217; 3; 1; 6; 4; 51; 56; 77; 75; 4; 2; 4; 6; 0 iars; 2946; 54.9219280380177; 1; 5; 5; 4; 118; 122; 151; 152; 6; 15; 12; 12; 0 lars; 2574; 55.9052059052059; 3; 5; 7; 5; 86; 117; 149; 134; 2; 8; 13; 8; 0 mfd; 3429; 56.7512394284048; 0; 2; 9; 9; 141; 143; 183; 204; 12; 8; 10; 9; 0 rpoB; 3327; 54.4334235046589; 2; 10; 8; 5; 134; 137; 183; 172; 1; 12; 13; 12; 0 rpoC; 3975; 55.2452830188679; 0; 9; 6; 9; 154; 181; 207; 242; 6; 13; 11; 12; 0 sbcC; 3012; 56.5737051792829; 0; 5; 4; 4; 102; 173; 202; 119; 5; 6; 5; 6; 0 secA; 2790; 54.8387096774194; 4; 6; 4; 5; 87; 124; 134; 177; 2; 12; 8; 8; 0
Codons
[modifier | modifier le wikicode]- can cyanobactérie codons:
protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; carB;48;11;5;3;2;11;49;16;27;11;24;8;9;6;12;7;26;10;24;12;7;5;23;3;4;3;13;0;20;13;18;30;12;17;60;33;48;9;22;28;24;22;10;1;26;5;5;34;4;14;23;36;15;8;32;10;8;24;54;7;31;1;0;0; cox1;39;7;8;2;3;6;10;6;32;13;13;2;10;3;5;5;10;9;13;5;1;0;5;1;3;0;13;4;7;2;8;21;5;12;14;6;11;5;12;17;8;5;2;0;24;17;2;20;1;9;10;8;7;6;16;9;4;8;27;3;14;0;0;1; dnaE;49;18;6;4;4;1;58;18;25;1;23;5;11;1;2;1;32;5;30;4;14;2;10;6;4;0;18;4;26;8;22;17;10;9;59;15;48;9;17;20;9;4;9;1;28;5;6;19;3;6;22;19;9;2;16;14;4;4;60;15;8;0;1;0; dnaE1;29;6;1;3;0;2;31;4;17;1;10;5;11;2;6;3;14;2;24;9;6;2;2;3;2;2;4;3;13;7;8;9;2;5;29;4;19;5;9;14;4;5;3;1;9;3;2;6;2;5;13;5;7;3;8;6;0;9;25;7;2;1;0;0; ftsK;147;15;24;16;6;4;122;11;60;6;47;29;39;6;7;5;56;4;98;20;25;9;33;6;4;5;27;4;111;17;35;30;3;7;134;12;87;11;32;45;13;14;10;3;12;28;14;42;4;5;45;29;7;12;31;29;5;6;104;26;17;1;0;0; iars;62;8;14;4;1;12;49;18;22;11;18;8;18;1;4;9;29;12;34;11;9;3;16;2;10;1;16;5;29;9;8;34;11;9;53;22;48;11;20;19;6;20;7;3;14;23;10;15;3;17;29;19;12;8;18;12;8;16;26;0;22;1;0;0; lars;38;8;8;6;2;9;54;9;21;10;14;7;9;4;7;4;30;5;23;15;7;11;9;6;6;0;8;5;26;10;15;17;9;8;55;18;36;17;16;16;5;19;6;2;16;21;2;28;7;10;25;16;16;7;13;11;6;17;29;6;18;1;0;0; rpoB;62;11;7;7;7;11;55;11;20;7;20;6;11;2;12;3;26;16;25;17;21;7;26;2;15;3;11;10;34;8;29;45;10;9;67;29;49;18;11;20;15;15;3;0;24;9;9;35;3;15;24;29;23;14;18;11;3;23;39;3;16;1;0;0; rpoC;63;20;6;5;2;6;61;10;14;16;37;5;15;2;7;4;25;5;43;8;14;5;40;2;7;3;8;6;46;20;20;48;12;20;85;27;69;23;16;30;19;11;10;3;19;7;2;28;3;13;46;40;20;10;52;16;3;23;67;2;30;1;0;0; mfd;88;16;11;7;6;9;66;9;34;6;28;14;20;2;7;13;34;5;35;15;22;4;11;10;12;3;17;2;54;21;21;19;10;15;75;25;39;10;18;24;8;21;6;1;26;13;11;29;4;17;28;21;14;9;26;15;3;21;57;9;21;0;1;0; sbcC;96;6;11;11;1;5;67;13;19;5;17;8;18;2;5;5;31;4;66;10;32;4;12;6;6;0;8;3;88;27;13;12;3;3;93;22;45;3;17;18;7;9;9;1;4;4;2;4;1;3;11;8;0;1;30;17;2;8;47;15;9;0;1;0; secA;54;10;11;5;1;6;52;7;23;7;6;5;8;3;5;3;27;8;23;15;23;3;22;5;4;3;9;5;40;8;16;27;7;13;79;20;48;14;23;22;8;16;1;2;31;7;2;13;1;15;25;18;12;13;19;13;5;15;36;6;11;1;0;0;
- can cyanobactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; carB;80;65;38;66;36;36;45;13;33;77;93;57;96;11;26;5;57;82;74;92;1; cox1;65;16;45;38;19;18;10;17;9;46;20;16;42;2;24;17;32;31;37;44;1; dnaE;82;76;26;43;37;34;36;22;34;58;74;57;50;10;28;5;34;52;38;83;1; dnaE1;41;35;18;37;16;33;17;7;20;24;33;24;32;4;9;3;15;28;23;34;1; ftsK;212;133;66;133;60;118;82;31;128;75;146;98;104;13;12;28;65;93;71;147;1; iars;101;67;33;58;41;45;41;21;38;62;75;59;65;10;14;23;45;68;54;48;1; lars;71;63;31;45;35;38;39;13;36;49;73;53;56;8;16;21;47;64;47;53;1; rpoB;105;66;27;54;42;42;74;21;42;93;96;67;61;3;24;9;62;90;55;58;1; rpoC;102;71;30;70;30;51;71;14;66;100;112;92;76;13;19;7;46;116;94;99;1; mfd;137;75;40;84;39;50;62;19;75;65;100;49;71;7;26;13;61;72;65;87;1; sbcC;130;80;24;55;35;76;60;11;115;31;115;48;51;10;4;4;10;20;57;71;1; secA;87;59;30;30;35;38;60;14;48;63;99;62;69;3;31;7;31;68;52;53;1;
- cgc cyanobactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; carB;0;2;0;0;85;23;2;23;0;33;0;0;1;13;22;19;2;20;2;26;0;1;4;2;51;25;3;10;0;37;3;5;59;18;12;76;13;46;1;1;30;108;2;11;20;8;0;1;25;41;1;1;64;22;0;1;16;51;3;0;62;0;0;1; cox1;0;1;2;0;43;20;0;7;2;46;0;1;2;4;12;9;7;13;1;18;0;1;1;0;7;11;2;13;0;8;1;5;39;9;3;11;5;5;1;1;6;34;0;3;25;16;1;1;23;18;0;0;36;15;1;0;6;25;2;0;33;0;0;1; dnaE;0;2;2;0;83;41;3;47;1;33;0;1;3;10;16;20;4;33;5;23;0;1;3;1;49;30;5;23;1;41;5;7;60;19;16;67;18;58;1;6;21;107;0;13;33;6;1;6;24;28;3;0;66;22;1;1;6;34;3;0;63;0;0;1; iars;0;3;1;1;83;28;2;23;1;23;1;0;1;8;14;21;8;22;2;23;0;3;2;2;37;27;8;22;1;37;4;1;55;18;6;59;14;43;2;2;33;77;1;11;8;27;0;1;36;27;2;0;61;13;0;0;12;35;0;0;31;0;0;1; lars;0;5;2;0;59;18;2;19;1;21;0;2;0;7;15;19;3;23;2;12;0;0;4;1;36;27;4;17;2;39;4;6;38;16;14;42;19;42;2;4;18;73;1;9;13;27;0;3;20;39;2;0;48;17;1;0;8;35;2;0;31;0;0;1; mfd;0;2;6;0;119;26;1;37;4;30;0;2;3;3;11;25;3;18;1;14;0;0;2;3;50;45;3;21;1;61;2;6;75;15;13;84;16;42;4;2;33;109;3;8;27;15;1;0;41;37;2;1;67;10;0;4;13;34;2;0;39;0;0;1; recB;0;2;2;1;142;39;1;9;1;25;0;4;1;6;8;35;5;15;2;11;2;4;4;5;44;63;7;26;2;48;7;5;67;42;15;72;22;52;5;3;46;144;1;5;15;30;3;3;35;54;1;0;44;16;0;0;13;33;1;0;20;0;0;1; rpoB;0;2;2;0;62;38;2;51;0;27;0;2;1;12;22;18;1;35;0;39;0;2;5;1;47;26;0;21;1;52;2;10;72;4;19;65;16;58;1;1;8;57;0;8;21;7;0;3;17;47;0;1;58;36;4;0;3;46;3;0;60;0;0;1; rpoC;0;0;1;0;85;37;2;63;1;29;0;0;0;22;29;24;1;16;2;29;0;0;10;0;61;18;1;23;0;51;3;14;86;11;22;94;30;63;2;6;27;100;0;11;22;9;1;0;16;41;3;0;76;44;0;0;9;91;0;0;83;0;0;1; sbcC;0;2;2;1;75;30;2;16;1;16;1;0;1;6;10;17;0;11;1;9;0;4;5;2;39;50;2;11;1;57;2;5;44;31;15;78;15;30;9;9;53;170;0;6;4;6;1;0;18;17;2;1;41;10;0;1;12;30;2;0;21;0;0;1; secA;0;1;2;0;66;27;1;38;0;27;1;0;2;5;16;11;3;28;3;27;0;0;3;3;48;26;3;9;0;54;1;8;47;7;14;83;13;41;1;2;16;64;0;3;29;8;0;0;19;24;0;0;53;17;0;0;9;37;0;0;44;0;0;1;
- cgc cyanobactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; carB;110;25;33;55;22;28;83;13;37;85;88;59;140;13;20;8;67;88;68;65;1; cox1;66;7;48;28;20;19;20;15;8;54;14;10;42;3;25;16;43;51;32;35;1; dnaE;128;50;34;50;37;28;84;28;42;91;83;76;135;13;33;6;59;91;42;66;1; iars;116;25;24;45;30;25;71;30;38;78;65;57;114;12;8;27;64;76;47;31;1; lars;84;21;22;43;26;14;68;21;41;64;56;61;97;10;13;27;62;67;44;33;1; mfd;153;38;34;44;21;15;100;24;62;98;97;58;148;11;27;15;79;80;51;41;1; recB;186;10;26;54;20;13;122;33;50;121;87;74;198;6;15;30;95;61;46;21;1; rpoB;104;53;27;55;36;39;81;21;53;88;84;74;67;8;21;7;67;95;53;63;1; rpoC;123;65;30;75;17;31;89;24;51;114;116;93;135;11;22;9;58;123;100;83;1; sbcC;110;18;17;35;11;10;100;13;58;82;93;45;241;6;4;6;36;54;43;23;1; secA;96;39;27;35;31;30;80;12;54;63;97;54;83;3;29;8;43;70;46;44;1;
- cya cyanobactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; carB;0;17;7;7;52;15;10;31;22;13;6;1;1;8;16;16;6;23;1;22;1;3;2;2;40;19;2;15;12;42;7;4;42;33;21;65;16;32;3;20;15;78;2;8;21;5;5;7;18;32;9;4;55;21;8;1;10;45;17;1;57;0;1;0; cox1;0;26;3;4;30;9;2;12;29;17;4;1;2;5;9;14;3;17;1;11;0;0;0;0;7;6;1;16;1;8;3;1;29;15;2;13;6;10;2;9;14;35;1;2;25;18;2;4;14;19;6;1;23;7;5;1;6;20;9;0;29;0;1;0; dnaE;4;41;7;8;47;22;34;26;21;14;10;0;2;11;17;15;25;23;8;24;2;9;5;2;37;20;5;17;32;32;12;6;43;23;37;51;47;21;9;20;14;52;5;8;23;10;11;8;23;12;17;5;36;15;10;6;10;26;32;0;49;0;1;0; iars;1;16;2;9;52;24;11;32;18;16;2;0;3;5;24;18;7;32;5;21;2;0;1;1;29;25;3;18;11;38;7;3;35;15;22;50;23;19;3;9;20;52;5;6;8;23;5;6;18;31;5;3;35;20;4;3;7;32;6;1;34;0;0;1; lars;0;19;2;4;45;14;7;30;14;15;0;1;3;7;15;9;7;22;4;21;1;2;3;5;30;16;3;11;9;35;8;2;25;25;22;46;25;24;5;10;15;54;1;6;16;27;3;6;24;25;8;5;38;16;5;3;18;20;9;0;28;1;0;0; mfd;2;35;11;2;66;35;24;22;31;9;7;0;2;8;17;20;10;21;4;14;4;5;3;2;42;25;6;13;26;72;9;6;44;17;39;53;28;18;3;20;10;65;1;6;21;20;4;10;26;43;4;3;39;16;9;1;13;33;29;1;27;0;1;0; rpoB;2;31;2;1;51;21;13;37;16;16;5;1;2;16;18;16;5;36;3;36;0;4;2;2;51;33;3;17;12;29;6;8;55;23;32;65;32;42;3;6;21;43;1;4;21;8;5;15;19;31;7;6;72;20;5;3;9;34;10;0;46;0;0;1; rpoC;1;30;1;5;81;8;14;34;11;14;7;0;4;13;15;20;8;15;5;29;0;5;3;2;47;43;2;12;25;52;9;7;54;35;28;88;33;48;2;11;30;61;1;6;19;7;5;8;31;23;12;8;93;19;3;1;21;55;17;1;60;0;0;1; sbcC;3;15;11;6;85;34;8;12;11;6;5;1;1;9;17;18;4;15;3;12;1;6;9;1;66;26;7;32;62;106;14;0;22;16;37;74;17;19;10;17;18;88;1;9;6;15;5;7;10;13;7;4;15;6;1;1;2;26;10;0;34;0;1;0; secA;0;17;3;5;47;32;16;36;12;18;2;0;0;10;15;12;4;27;1;36;1;0;1;1;34;34;1;18;12;28;4;8;26;20;25;72;17;35;6;8;19;47;1;3;25;7;2;5;10;26;7;3;47;18;4;3;8;28;8;0;39;0;1;0;
- cya cyanobactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; carB;98;41;35;48;29;23;67;17;54;86;86;48;116;10;21;5;62;89;64;75;1; cox1;72;14;46;35;20;12;13;17;9;48;15;16;60;3;25;18;39;37;32;38;1; dnaE;129;60;35;55;48;32;75;22;64;84;88;68;95;13;23;10;54;73;52;81;1; iars;104;43;34;52;39;26;58;21;49;60;72;42;84;11;8;23;60;63;46;41;1; lars;84;37;29;35;29;25;57;14;44;60;68;49;84;7;16;27;58;67;46;37;1; mfd;151;46;40;54;31;18;81;19;98;76;92;46;98;7;21;20;83;62;56;57;1; rpoB;108;50;32;58;41;39;92;20;41;92;97;74;73;5;21;8;70;105;51;56;1; rpoC;126;48;25;59;23;34;100;14;77;105;116;81;104;7;19;7;67;132;80;78;1; sbcC;154;20;17;51;19;15;109;39;168;52;111;36;133;10;6;15;35;32;30;44;1; secA;104;52;30;39;31;37;71;19;40;58;97;52;80;4;25;7;43;75;43;47;1;
- mar cyanobactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; carB;27;11;3;16;15;18;54;8;20;18;7;3;8;19;23;7;21;13;19;15;1;10;11;1;18;8;8;3;28;13;14;27;24;14;72;15;43;13;12;19;18;44;10;3;26;6;8;10;13;32;22;19;14;24;21;7;12;26;39;2;46;1;0;0; cox1;18;12;11;5;11;11;8;1;27;19;6;2;9;6;12;5;12;7;8;6;0;1;6;0;2;4;8;8;6;4;3;21;14;9;16;6;14;1;9;16;4;15;3;1;26;17;5;7;8;14;13;3;7;8;12;1;8;17;20;4;21;1;0;0; dnaE;53;10;7;9;7;9;60;5;23;4;15;4;4;4;8;4;23;12;24;8;9;4;11;4;6;6;13;11;25;9;19;26;7;7;60;16;48;6;10;20;15;12;6;3;24;5;10;17;1;11;20;9;8;13;15;4;5;15;47;11;13;1;0;0; dnaE1;24;2;2;8;9;1;31;6;15;0;6;0;5;6;8;3;9;3;20;5;4;4;6;1;4;2;6;2;20;5;9;9;2;4;27;8;19;4;8;14;8;5;3;1;10;3;0;6;2;5;12;6;9;7;6;3;1;10;19;0;8;1;0;0; iars;44;14;4;10;11;8;50;8;27;13;17;5;21;8;8;5;34;7;41;9;4;3;14;4;14;5;10;7;24;14;18;24;3;10;50;20;45;10;15;29;13;15;8;2;10;23;6;15;8;17;21;9;21;15;18;3;17;13;26;2;23;1;0;0; lars;36;4;8;9;8;11;49;9;24;10;7;4;6;5;11;6;26;8;22;12;9;4;10;1;6;9;5;7;28;12;24;15;7;6;61;7;39;8;11;21;3;23;7;1;15;21;9;10;10;20;22;9;13;14;19;2;5;27;30;7;18;1;0;0; mfd;61;19;13;11;12;15;47;14;32;11;14;4;10;14;13;9;26;7;30;8;12;8;18;5;18;13;13;9;45;23;21;23;11;18;63;28;49;6;17;27;21;31;7;1;18;12;11;12;12;28;18;16;18;13;12;12;12;23;49;11;26;0;1;0; rpoB;19;10;7;18;24;29;44;7;21;9;6;3;4;5;30;9;17;22;20;32;3;9;16;1;39;17;2;14;26;19;13;34;29;13;88;10;38;30;5;11;11;37;4;1;20;8;3;5;7;47;23;10;29;33;6;1;4;44;25;1;39;1;0;0; rpoC;39;16;4;11;27;21;43;12;12;20;7;3;22;10;31;18;17;16;20;20;3;9;23;2;29;17;6;8;39;32;20;30;28;31;90;37;70;21;11;21;15;41;11;0;19;8;5;7;19;22;19;18;51;30;19;7;10;50;40;0;47;1;0;0; sbcC;73;13;10;14;12;8;59;15;16;5;6;4;16;7;6;6;23;1;44;6;16;9;18;3;15;10;16;3;81;46;17;15;5;6;73;33;32;11;19;26;8;17;6;2;8;10;2;7;1;6;8;6;6;5;22;4;2;12;49;9;19;0;1;0; secA;40;10;4;8;17;11;47;9;15;12;5;1;12;6;6;4;24;10;15;22;9;6;17;4;21;11;2;13;31;15;22;15;13;13;86;20;30;24;5;14;12;37;2;1;30;7;1;0;14;19;23;10;20;16;6;4;8;24;33;1;21;1;0;0;
- mar cyanobactérie acides aminés:
protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; carB;90;62;38;67;34;34;49;11;41;79;87;56;93;13;26;6;63;79;66;87;1; cox1;68;9;46;40;19;14;13;16;10;47;22;15;44;4;26;17;34;31;38;45;1; dnaE;95;65;27;39;35;32;40;24;34;59;76;54;57;9;24;5;39;50;39;71;1; dnaE1;46;37;15;28;12;25;21;8;25;24;35;23;35;4;10;3;13;34;20;27;1; iars;91;58;40;64;41;50;44;17;38;55;70;55;72;10;10;23;46;66;51;51;1; lars;76;58;34;39;34;34;39;12;40;52;68;47;58;8;15;21;49;58;53;55;1; mfd;131;61;43;64;33;38;74;22;68;73;91;55;96;8;18;12;63;65;59;86;1; rpoB;107;51;30;57;39;52;85;16;45;89;98;68;64;5;20;8;62;95;55;65;1; rpoC;118;55;32;91;33;40;83;14;71;109;127;91;88;11;19;8;53;118;86;87;1; sbcC;130;74;21;45;24;50;71;19;127;43;106;43;70;8;8;10;16;25;40;77;1; secA;90;56;27;34;34;37;68;15;46;63;106;54;68;3;30;7;34;69;42;55;1;
- pmm cyanobactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; carB;59;22;18;8;2;4;55;18;34;8;36;24;9;5;6;3;24;6;69;8;28;6;3;3;0;1;12;2;26;7;27;31;8;4;71;15;54;3;26;38;8;5;9;6;19;5;14;28;3;4;44;12;3;4;29;16;4;3;55;38;7;1;0;0; dnaE;60;12;35;10;1;6;79;28;33;11;33;23;17;5;10;4;34;5;51;7;36;1;5;9;0;1;18;3;32;2;34;22;11;5;48;14;79;17;21;27;2;5;13;4;29;5;19;19;0;1;36;21;2;6;17;16;5;7;64;29;16;1;0;0; gyrB;23;15;8;5;1;3;45;7;22;2;11;13;8;4;4;0;20;5;29;3;27;3;1;9;0;0;14;0;16;4;20;26;8;4;39;13;40;2;15;15;5;2;3;3;11;3;7;7;1;3;23;11;4;5;15;15;2;0;27;18;6;0;0;1; iars;51;16;20;8;1;5;60;19;33;5;23;24;12;1;5;0;33;5;60;10;33;2;2;7;0;0;19;2;24;4;17;26;6;7;46;25;55;1;18;16;2;6;11;5;13;28;14;16;2;4;29;16;5;6;21;13;0;4;49;16;4;1;0;0; lars;46;7;13;5;0;2;75;15;31;5;21;21;10;1;4;2;24;2;62;8;22;3;1;4;0;0;14;1;22;4;13;19;4;1;50;9;48;9;16;11;4;7;8;1;13;22;17;14;2;1;16;19;3;2;18;14;2;4;45;32;9;0;1;0; mfd;66;8;25;16;3;1;102;16;32;9;18;29;20;3;4;6;34;9;84;18;37;4;2;7;1;0;15;3;33;7;27;13;9;6;74;17;46;12;11;15;4;8;6;1;14;12;24;10;2;2;24;24;0;9;18;28;2;4;62;61;14;1;0;0; recB;73;18;37;16;0;4;107;23;67;6;24;27;29;4;9;5;41;10;126;12;19;1;1;6;0;0;13;3;27;6;19;12;2;2;68;19;65;5;9;10;3;1;13;6;6;15;8;10;2;4;18;12;2;4;20;12;3;7;83;43;12;0;1;0; rpoB;46;14;26;12;2;5;51;11;26;3;16;17;12;4;5;5;27;9;42;8;53;4;3;15;0;1;17;4;36;12;26;42;9;10;70;19;63;7;21;31;7;3;5;1;25;7;23;33;2;5;59;23;6;6;24;20;2;4;30;21;7;1;0;0; rpoC;68;21;21;10;3;4;74;17;24;5;38;38;25;1;6;5;18;2;49;8;42;3;6;18;0;2;18;1;43;12;48;35;6;14;92;26;77;10;30;41;4;5;8;3;22;8;18;25;3;4;56;39;10;5;48;32;2;16;66;22;9;1;0;0; secA;50;15;19;13;1;4;60;12;21;6;16;15;13;1;2;3;27;4;43;8;36;2;5;11;1;1;14;0;35;8;28;22;2;4;72;26;46;11;24;24;4;3;5;1;26;8;15;12;2;2;28;20;4;7;26;10;3;5;28;20;9;1;0;0;
- pmm cyanobactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; carB;113;73;42;83;30;77;41;14;33;70;86;57;77;15;19;5;49;63;52;100;1; dnaE;124;107;44;92;39;58;52;21;34;72;62;96;55;17;29;5;39;65;45;109;1; gyrB;55;52;24;40;25;32;40;14;20;58;52;42;37;6;11;3;18;43;32;51;1; iars;101;79;38;65;38;70;44;21;28;56;71;56;42;16;13;28;36;56;38;69;1; lars;73;90;36;59;26;70;30;15;26;37;59;57;38;9;13;22;34;40;38;86;1; mfd;119;118;41;80;43;102;51;18;40;55;91;58;38;7;14;12;38;57;52;137;1; recB;148;130;73;98;51;138;27;16;33;35;87;70;23;19;6;15;24;36;42;138;1; rpoB;105;62;29;59;36;50;76;21;48;87;89;70;62;6;25;7;63;94;50;58;1; rpoC;127;91;29;113;20;57;71;19;55;103;118;87;80;11;22;8;50;110;98;97;1; secA;102;72;27;50;31;51;56;14;43;56;98;57;55;6;26;8;31;59;44;57;1;
- syn cyanobactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; carB;22;29;2;6;21;10;39;16;26;10;8;2;8;5;37;9;22;17;6;26;2;3;6;1;20;20;8;9;23;15;6;13;32;29;75;22;29;29;10;13;23;43;5;7;26;5;8;10;12;33;21;7;44;13;12;7;15;37;59;1;31;0;1;0; cox1;9;18;4;8;14;11;6;5;34;15;8;0;8;1;12;7;6;10;7;8;0;1;2;0;7;4;8;8;6;3;6;11;15;13;14;6;8;8;5;11;8;21;1;3;27;17;6;7;8;12;11;2;15;8;7;2;8;19;30;0;12;0;1;0; dnaE;30;27;9;10;13;7;49;13;20;4;10;4;4;1;13;5;23;13;15;14;6;6;7;4;12;12;18;7;21;14;12;17;16;13;62;12;41;22;7;16;14;24;6;5;24;6;8;9;7;16;16;14;20;6;10;3;5;21;56;2;16;1;0;0; dnaE1;12;8;3;9;8;5;22;6;12;5;4;1;6;4;10;4;5;8;12;10;2;4;8;0;5;5;7;1;21;13;5;7;6;6;33;4;14;6;7;10;8;16;1;3;10;3;6;3;1;9;9;4;18;4;5;1;1;11;14;4;9;0;1;0; iars;31;25;4;8;10;14;46;10;26;12;8;2;19;4;12;4;23;18;33;15;1;7;8;3;16;11;17;8;30;20;6;20;18;15;57;19;38;17;12;17;17;30;5;5;9;25;6;8;13;24;15;15;31;7;14;5;14;26;45;3;7;0;1;0; lars;22;32;4;6;9;4;41;10;18;15;7;1;8;1;14;0;16;15;17;11;0;4;10;0;10;17;8;6;26;22;5;17;17;13;42;16;46;15;8;16;12;38;5;1;18;22;7;7;10;32;18;7;32;8;7;6;11;29;36;0;14;0;1;0; mfd;56;41;13;13;19;10;52;18;32;5;10;5;22;7;16;8;22;10;22;6;6;9;9;8;17;28;16;5;39;31;11;32;23;15;65;29;47;12;9;28;17;36;7;0;25;15;7;10;16;34;18;12;35;10;17;13;13;25;45;2;16;0;1;0; rpoB;10;27;9;12;27;18;41;12;13;17;3;0;8;6;34;6;17;19;19;25;0;8;13;4;17;37;5;16;31;15;9;36;25;19;78;22;33;38;3;15;9;41;2;2;22;7;6;11;6;44;20;12;37;13;2;5;4;42;39;0;31;0;1;0; rpoC;17;30;8;8;39;18;48;21;9;19;7;2;14;4;27;15;19;17;7;23;1;3;15;1;30;32;2;10;36;36;13;30;40;37;92;28;56;46;7;15;20;51;6;5;18;8;7;8;7;24;16;17;67;21;15;1;13;55;49;0;27;1;0;0; sbcC;51;34;8;21;14;11;46;11;22;4;8;1;14;1;7;7;14;6;25;14;8;10;13;9;17;9;15;4;103;52;10;18;13;7;77;21;34;9;15;27;7;32;10;1;7;8;2;5;1;8;6;3;14;3;14;7;3;23;48;3;11;0;1;0; secA;15;26;2;10;18;19;40;21;16;14;4;2;4;6;12;7;21;15;18;17;0;2;11;3;17;26;7;8;23;25;6;19;16;20;81;22;33;24;7;11;16;21;0;3;27;10;2;7;8;15;10;11;40;12;10;6;11;24;34;0;17;1;0;0;
- syn cyanobactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; carB;90;55;36;69;39;32;52;17;38;80;97;58;89;12;26;5;63;85;71;91;1; cox1;64;11;49;36;16;15;14;16;9;45;20;16;45;4;27;17;33;36;36;42;1; dnaE;96;62;24;37;36;29;47;25;35;58;74;63;61;11;24;6;40;56;39;74;1; dnaE1;45;28;17;29;13;22;24;8;34;24;37;20;41;4;10;3;19;35;18;27;1; iars;92;56;38;49;41;48;46;25;50;59;76;55;76;10;9;25;51;68;59;55;1; lars;77;51;33;31;31;28;41;14;48;52;58;61;74;6;18;22;56;65;53;50;1; mfd;152;70;37;68;32;28;77;21;70;81;94;59;90;7;25;15;67;75;68;63;1; rpoB;103;53;30;57;36;44;79;21;46;89;100;71;68;4;22;7;67;82;53;70;1; rpoC;120;69;28;69;36;30;82;12;72;120;120;102;93;11;18;8;46;121;84;76;1; sbcC;139;57;26;38;20;39;66;19;155;48;98;43;81;11;7;8;16;26;47;62;1; secA;90;61;30;35;36;35;59;15;48;61;103;57;55;3;27;10;32;73;51;51;1;
- tel cyanobactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; carB;4;18;15;7;32;26;24;21;23;5;7;5;4;10;19;10;17;18;15;17;1;6;11;1;27;18;6;4;32;19;7;22;26;24;51;37;35;14;13;20;19;62;5;6;26;6;6;7;11;43;13;3;35;20;10;6;12;44;68;1;26;1;0;0; cox1;2;15;4;8;26;13;7;7;23;15;3;4;7;6;4;5;7;14;7;11;0;0;3;0;6;4;6;10;6;4;3;13;21;9;4;11;14;4;9;6;11;19;2;2;23;20;2;5;8;20;5;1;28;6;3;1;11;21;29;2;12;0;0;1; dnaE;5;20;13;8;33;21;26;20;20;9;0;3;9;5;13;10;19;16;9;14;0;4;7;1;25;12;12;13;28;31;8;17;26;9;30;36;28;19;13;11;17;25;7;4;27;6;5;4;9;24;6;1;29;15;4;3;4;22;35;1;21;0;1;0; dnaE1;3;9;7;3;18;15;5;12;12;1;0;1;7;2;7;7;5;6;9;7;0;2;4;0;16;6;5;6;11;17;3;6;11;12;14;11;20;10;8;1;11;31;2;2;10;3;5;0;2;15;9;6;19;3;0;1;5;9;18;0;2;0;1;0; iars;5;14;15;10;32;32;21;21;23;8;5;3;12;5;17;6;26;14;19;12;1;3;4;2;37;10;13;13;29;31;6;18;25;15;40;25;37;16;14;19;18;45;5;6;10;27;2;5;12;36;16;4;32;16;10;7;14;17;28;0;13;0;1;0; lars;3;10;5;5;26;23;30;9;18;10;3;6;11;3;8;6;14;20;9;10;0;3;5;4;34;15;5;13;30;19;6;13;24;17;38;21;28;20;9;11;7;49;5;2;14;23;10;5;12;29;11;3;28;17;10;6;12;25;30;0;15;1;0;0; mfd;9;26;11;13;48;35;18;20;26;10;3;3;17;9;10;12;18;12;8;10;0;5;8;1;45;27;13;11;54;34;6;20;24;20;32;49;38;17;14;14;24;54;5;2;20;16;9;3;15;40;23;3;34;22;8;10;15;33;41;1;14;1;0;0; rpoB;5;18;10;13;32;23;34;20;20;13;10;5;5;6;15;12;17;21;21;21;1;4;9;0;46;24;2;13;27;23;7;24;37;18;43;40;51;29;10;8;10;38;2;3;24;7;8;14;10;39;11;6;45;27;6;4;17;33;53;0;14;1;0;0; rpoC;6;23;17;5;41;28;37;33;15;13;1;5;12;12;22;15;5;22;12;20;0;3;9;0;45;22;6;14;37;25;8;35;41;26;74;49;58;36;14;23;20;51;3;4;16;7;6;12;6;30;20;10;66;35;14;11;21;40;60;0;23;1;0;0; sbcC;10;22;16;12;43;43;13;10;14;5;0;0;4;6;4;19;14;13;8;9;1;8;11;3;50;21;19;14;92;78;6;5;11;14;52;38;19;11;14;14;17;70;5;6;3;7;2;1;2;15;4;7;9;10;7;2;9;31;31;1;18;1;0;0; secA;3;18;5;10;40;19;17;27;18;11;1;7;9;5;7;7;17;16;18;12;0;7;4;0;29;29;7;10;24;28;10;14;20;13;45;51;32;22;12;9;13;42;1;3;31;7;5;2;10;23;4;7;44;16;3;5;7;24;37;0;12;1;0;0;
- tel cyanobactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; carB;102;45;28;55;35;32;64;10;51;79;88;49;114;11;26;6;67;71;72;95;1; cox1;68;14;38;29;21;18;13;16;10;46;15;18;45;4;23;20;35;40;36;43;1; dnaE;100;46;29;40;35;23;49;25;59;60;66;47;66;11;27;6;42;51;33;57;1; dnaE1;55;17;13;24;11;16;28;11;28;32;25;30;51;4;10;3;22;37;15;20;1; iars;108;42;31;48;40;31;57;26;60;64;65;53;96;11;10;27;55;68;48;41;1; lars;72;39;28;37;34;19;61;18;49;60;59;48;76;7;14;23;56;59;53;45;1; mfd;142;38;36;54;30;18;86;24;88;70;81;55;106;7;20;16;67;82;66;56;1; rpoB;101;54;33;53;38;42;84;15;50;86;83;80;66;5;24;7;71;89;60;67;1; rpoC;120;70;28;67;27;32;79;20;62;110;123;94;108;7;16;7;54;131;86;83;1; sbcC;146;23;19;33;27;17;94;33;170;36;90;30;115;11;3;7;20;30;49;50;1; secA;95;44;29;36;33;30;69;17;52;57;96;54;76;4;31;7;40;71;39;49;1;
Autre-bactéries
[modifier | modifier le wikicode]Répétitions
[modifier | modifier le wikicode]- bmv bactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl lars; 2595; 66.5895953757225; 0; 0; 0; 0; 41; 93; 120; 160; 2; 1; 1; 3; 0 iars; 2838; 66.8428470754052; 0; 0; 0; 0; 49; 100; 153; 166; 0; 2; 1; 3; 0 carB; 3255; 66.5745007680491; 0; 0; 0; 1; 47; 99; 151; 209; 0; 3; 1; 1; 0 secA; 2796; 65.5221745350501; 1; 0; 0; 0; 40; 101; 132; 168; 1; 2; 0; 3; 0 rpoC; 4239; 64.071715027129; 1; 0; 0; 0; 69; 191; 183; 258; 0; 2; 0; 2; 0 rpoB; 4107; 63.0630630630631; 0; 0; 0; 0; 79; 193; 204; 218; 0; 3; 0; 2; 0 dnaE1; 4361; 67.5533134602155; 3; 1; 1; 0; 95; 136; 230; 269; 0; 4; 3; 7; 0 ftsK; 2469; 67.6792223572296; 0; 0; 1; 0; 36; 69; 131; 156; 2; 1; 3; 2; 0 mfd; 3474; 69.4012665515256; 0; 0; 1; 0; 58; 88; 193; 183; 1; 0; 2; 1; 0 lhr; 4797; 74.9635188659579; 0; 0; 1; 0; 55; 84; 293; 269; 1; 1; 8; 4; 0 recB; 3813; 73.0396013637556; 0; 1; 0; 2; 64; 57; 174; 237; 0; 1; 1; 5; 0 recC; 4065; 73.9237392373924; 1; 0; 1; 1; 125; 43; 225; 269; 0; 0; 3; 8; 0
- cft bactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl lars; 2436; 34.1133004926108; 8; 20; 0; 0; 117; 127; 43; 79; 16; 27; 1; 4; 0 iars; 2751; 37.4409305707016; 5; 19; 0; 0; 134; 143; 52; 98; 20; 27; 1; 2; 0 carB; 3255; 38.8018433179723; 3; 23; 0; 0; 149; 183; 75; 106; 18; 28; 0; 1; 0 ftsK; 2148; 33.5195530726257; 10; 22; 1; 0; 112; 114; 43; 59; 17; 18; 0; 1; 0 rpoC; 4527; 36.779324055666; 4; 23; 0; 0; 244; 255; 88; 153; 15; 64; 0; 2; 0 rpoB; 4140; 34.0579710144928; 12; 36; 0; 0; 208; 233; 72; 127; 17; 42; 0; 1; 0 recB; 2766; 30.115690527838; 11; 27; 0; 0; 165; 144; 30; 56; 24; 31; 1; 1; 0 secA; 2568; 35.2414330218069; 5; 27; 0; 0; 124; 138; 36; 74; 10; 26; 0; 3; 0 dnaE; 3996; 34.034034034034; 8; 29; 0; 0; 198; 237; 66; 109; 17; 47; 1; 3; 0 mfd; 2973; 32.4251597712748; 11; 22; 0; 0; 154; 181; 32; 81; 27; 31; 0; 0; 0
- eco bactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl dnaE; 3483; 54.9526270456503; 1; 6; 0; 0; 115; 146; 162; 210; 7; 13; 3; 11; 0 ftsK; 3990; 54.0100250626566; 1; 10; 0; 3; 166; 184; 222; 180; 10; 5; 4; 7; 0 lhr; 4617; 56.898418886723; 5; 4; 2; 2; 161; 169; 223; 273; 11; 12; 6; 9; 0 mfd; 3447; 54.7722657383232; 1; 7; 0; 0; 131; 142; 157; 172; 5; 13; 3; 5; 0 mukB; 4461; 55.6601658820892; 1; 6; 0; 0; 150; 209; 178; 215; 4; 14; 1; 6; 0 recB; 3543; 54.5582839401637; 2; 6; 1; 1; 148; 152; 168; 184; 7; 5; 2; 6; 0 recC; 3369; 53.606411398041; 2; 3; 0; 0; 149; 135; 162; 180; 9; 8; 5; 8; 0 rpoB; 4029; 52.6185157607347; 0; 8; 0; 0; 138; 212; 201; 189; 2; 7; 2; 1; 0 rpoC; 4224; 53.8352272727273; 1; 6; 0; 1; 130; 214; 193; 224; 2; 9; 3; 0; 0 sbcC; 3147; 53.79726723864; 1; 8; 0; 0; 116; 183; 126; 147; 2; 17; 1; 4; 0
- mhd bactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl dnaE; 3675; 66.6938775510204; 2; 1; 6; 12; 86; 95; 232; 253; 2; 3; 16; 30; 0 rpoB; 3366; 66.7260843731432; 0; 0; 7; 8; 67; 94; 194; 231; 0; 1; 15; 24; 0 rpoC; 4590; 66.7538126361656; 0; 1; 3; 6; 79; 127; 313; 342; 0; 2; 17; 24; 0 secA; 3018; 64.546056991385; 1; 3; 2; 5; 45; 116; 182; 212; 1; 5; 6; 13; 0 sbcC; 2718; 72.0382634289919; 0; 0; 2; 5; 53; 68; 176; 240; 0; 3; 4; 11; 0 mfd; 2958; 68.3231913455037; 0; 1; 7; 7; 74; 54; 204; 223; 5; 3; 15; 15; 0 ftsK; 2835; 68.7125220458554; 2; 0; 9; 4; 54; 74; 212; 191; 3; 3; 17; 22; 0 pdhA; 2703; 68.3314835368109; 1; 0; 1; 5; 58; 77; 190; 187; 0; 2; 13; 20; 0 topA; 2487; 70.48652995577; 0; 3; 9; 3; 38; 66; 181; 181; 0; 2; 21; 12; 0 nuoG; 2451; 71.4402284781722; 0; 0; 7; 7; 41; 56; 173; 191; 0; 0; 14; 15; 0 cox1; 2385; 64.6540880503145; 0; 2; 4; 0; 76; 41; 187; 153; 1; 2; 16; 8; 0
- sti bactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl ftsK; 2226; 69.0925426774483; 0; 0; 4; 1; 30; 50; 157; 174; 0; 0; 6; 8; 0 rpoC; 4440; 67.6801801801802; 0; 0; 0; 1; 60; 105; 274; 401; 0; 0; 1; 12; 0 rpoB; 3480; 66.2356321839081; 0; 0; 0; 0; 64; 93; 200; 285; 0; 1; 6; 6; 0 cox1; 1896; 64.3459915611814; 0; 0; 1; 0; 62; 34; 130; 117; 0; 0; 4; 10; 0 aldo; 2829; 69.1763874160481; 0; 0; 1; 3; 53; 49; 190; 250; 2; 0; 7; 8; 0 acnA; 2778; 68.682505399568; 0; 0; 0; 1; 46; 52; 231; 190; 0; 0; 7; 7; 0 sbcC; 2553; 69.3301997649824; 0; 0; 1; 0; 26; 64; 216; 162; 0; 0; 7; 5; 0 secA; 2610; 65.2873563218391; 0; 0; 0; 2; 36; 70; 177; 188; 0; 1; 4; 5; 0 dnaE; 3966; 57.5138678769541; 5; 2; 3; 1; 133; 158; 225; 234; 14; 7; 15; 3; 0 mfd; 3522; 68.5406019307212; 0; 0; 1; 0; 58; 58; 265; 260; 1; 0; 10; 7; 0
- tos bactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl dnaE; 3666; 67.6759410801964; 1; 1; 13; 20; 76; 79; 296; 310; 4; 7; 27; 29; 0 ftsK; 2607; 70.4257767548907; 1; 3; 22; 19; 46; 61; 241; 206; 4; 5; 26; 16; 0 secA; 2994; 66.3994655978624; 1; 2; 12; 11; 51; 92; 240; 244; 4; 4; 16; 20; 0 rpoB; 3360; 68.8690476190476; 0; 0; 19; 14; 55; 80; 265; 268; 1; 0; 26; 33; 0 rpoC; 4575; 68.1967213114754; 1; 1; 13; 16; 71; 119; 368; 392; 0; 4; 35; 35; 0 lars; 2628; 67.3135464231355; 1; 1; 13; 10; 49; 69; 197; 221; 0; 4; 23; 24; 0 iars; 3129; 67.4017257909875; 0; 2; 21; 8; 67; 85; 231; 273; 2; 5; 25; 29; 0 carB; 3087; 68.0272108843537; 0; 2; 16; 25; 53; 80; 224; 261; 1; 0; 26; 32; 0 sbcC; 2895; 68.5319516407599; 2; 2; 6; 20; 65; 85; 216; 314; 7; 3; 13; 19; 0 mfd; 2955; 70.0507614213198; 1; 2; 20; 21; 70; 52; 251; 246; 2; 3; 28; 24; 0
- zin bactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl dnaE; 3396; 13.4275618374558; 25; 86; 0; 0; 218; 256; 20; 42; 30; 54; 0; 0; 0 rpoB; 3876; 14.0866873065015; 29; 97; 0; 1; 257; 281; 35; 53; 35; 48; 0; 1; 0 rpoC; 2346; 15.771526001705; 8; 53; 0; 1; 161; 159; 15; 40; 24; 40; 0; 0; 0 nuoG; 2283; 11.8703460359177; 17; 61; 0; 0; 151; 155; 14; 14; 28; 41; 0; 0; 0 nuoL; 1923; 9.4123764950598; 29; 27; 0; 0; 150; 115; 9; 17; 40; 24; 0; 0; 0 lars; 2424; 9.98349834983498; 21; 67; 0; 0; 156; 177; 20; 17; 23; 28; 0; 1; 0 iars; 2790; 11.6129032258065; 23; 60; 1; 0; 166; 218; 18; 27; 28; 47; 0; 0; 0 cox3; 2439; 16.6871668716687; 37; 25; 0; 1; 174; 173; 23; 42; 31; 18; 0; 0; 0 metE; 2277; 16.2055335968379; 7; 54; 0; 0; 156; 175; 23; 35; 19; 27; 0; 0; 0 gyrB; 2454; 13.121434392828; 15; 71; 0; 0; 144; 194; 13; 31; 16; 32; 0; 0; 0
Codons
[modifier | modifier le wikicode]- zin bactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; dnaE;103;3;2;3;0;0;217;4;76;2;23;14;11;1;0;2;56;3;141;6;23;0;1;0;0;0;9;0;16;2;15;23;0;1;40;0;27;1;19;14;0;1;11;0;8;0;12;6;0;1;9;14;0;0;10;11;0;0;76;108;0;1;0;6; rpoB;124;1;2;2;0;0;224;8;91;3;37;25;11;0;0;0;78;0;166;3;25;0;2;0;0;0;13;0;19;0;16;31;0;3;52;0;34;0;7;12;0;0;6;0;16;0;10;25;0;0;23;13;1;0;18;12;1;0;66;107;2;1;0;2; rpoC;65;1;1;1;0;0;145;1;31;0;28;14;15;0;0;0;32;0;80;0;22;0;0;0;0;0;4;0;11;1;10;29;1;1;30;0;18;0;4;7;1;0;8;1;12;0;5;9;0;1;17;8;0;0;21;12;0;0;69;63;0;1;0;2; nuoG;61;2;3;2;0;0;140;5;57;1;23;15;10;0;0;1;38;1;106;2;16;0;0;0;0;0;7;0;9;0;4;8;0;0;24;1;13;1;1;5;0;1;13;2;7;0;6;6;0;0;6;5;0;0;14;10;2;0;54;72;0;1;0;6; nuoL;96;2;2;0;0;0;71;0;84;0;23;13;9;0;1;1;45;2;65;0;3;0;0;1;0;0;4;0;5;0;5;9;0;0;11;0;7;0;3;3;0;0;4;0;8;0;4;3;0;0;7;1;0;0;10;3;0;1;53;76;1;1;0;4; lars;68;0;1;1;0;0;165;2;61;1;11;7;3;0;1;0;62;2;124;3;12;0;0;0;0;0;8;0;10;0;7;9;0;1;14;0;11;0;1;4;0;0;8;1;13;1;9;9;0;1;5;5;0;0;9;10;0;0;53;78;1;1;0;15; iars;76;2;0;0;0;0;165;2;70;1;15;19;3;0;1;0;55;4;129;2;17;0;1;0;0;0;11;1;16;0;11;12;1;0;24;0;22;0;4;2;1;0;12;0;8;2;9;9;0;1;8;5;0;0;18;9;0;0;65;103;0;1;0;13; cox3;88;7;1;0;0;0;60;0;89;4;24;11;9;1;1;0;41;2;60;2;10;0;0;0;0;0;14;0;5;0;21;19;1;1;17;0;10;0;6;11;0;1;6;0;26;0;12;7;1;1;14;12;0;0;19;20;0;0;54;101;1;1;0;22; metE;68;2;0;0;0;0;129;1;38;0;18;10;8;1;0;0;38;1;84;3;19;0;1;0;0;0;9;0;13;1;12;15;2;1;33;2;17;1;5;7;0;0;9;0;14;1;11;12;0;0;7;10;2;0;14;15;0;0;50;60;0;0;1;14; gyrB;75;2;0;0;0;0;151;5;42;0;18;20;12;1;0;0;43;4;106;0;18;0;1;0;0;0;6;0;12;0;18;11;0;0;30;0;19;1;7;4;1;1;8;0;11;0;4;6;1;1;6;7;0;0;10;14;0;0;50;89;0;1;0;2;
- zin bactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; dnaE;111;221;78;51;59;147;24;9;18;39;40;28;34;11;8;0;19;23;21;184;7; rpoB;129;232;94;73;78;169;27;13;19;50;52;34;19;6;16;0;35;37;31;175;3; rpoC;68;146;31;57;32;80;22;4;12;41;30;18;12;9;12;0;15;25;33;132;3; nuoG;68;145;58;49;39;108;16;7;9;12;25;14;7;15;7;0;12;11;26;126;7; nuoL;100;71;84;47;47;65;4;4;5;14;11;7;6;4;8;0;7;8;14;130;5; lars;70;167;62;22;64;127;12;8;10;17;14;11;5;9;13;1;19;10;19;132;16; iars;78;167;71;38;59;131;18;12;16;24;24;22;7;12;8;2;19;13;27;168;14; cox3;96;60;93;46;43;62;10;14;5;42;17;10;18;6;26;0;21;26;39;156;23; metE;70;130;38;37;39;87;20;9;14;30;35;18;12;9;14;1;23;19;29;110;15; gyrB;77;156;42;51;47;106;19;6;12;29;30;20;13;8;11;0;12;13;24;139;3;
- tos bactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; dnaE;3;6;16;4;56;66;4;58;11;37;1;0;0;4;28;8;3;44;0;20;0;0;1;16;39;38;3;25;3;31;0;1;42;55;4;123;2;60;1;1;35;86;0;4;30;9;1;3;7;61;6;0;64;18;0;0;13;25;2;2;41;0;0;1; ftsK;0;6;16;6;51;77;9;34;7;26;0;0;0;4;14;16;0;11;0;9;0;1;0;10;25;27;0;13;6;21;3;0;30;38;12;64;2;23;0;0;24;83;0;0;11;7;1;4;11;61;0;1;38;7;0;1;6;25;0;0;27;0;1;0; secA;0;3;20;4;31;47;4;62;10;24;0;0;0;2;17;6;0;29;1;23;0;0;0;9;42;41;0;20;3;34;0;1;36;31;10;107;0;49;1;0;24;63;0;1;26;6;0;2;11;37;0;0;51;19;0;0;6;34;4;3;43;1;0;0; rpoB;0;4;6;3;57;47;0;50;9;32;0;0;0;1;32;9;1;32;1;20;0;1;1;4;52;45;1;16;0;35;0;2;47;52;8;96;4;66;0;0;13;69;0;2;23;2;0;2;11;57;2;0;71;26;1;0;4;44;4;0;54;1;0;0; rpoC;4;6;9;4;59;78;2;86;7;35;0;0;0;5;35;21;0;46;0;28;0;0;2;6;79;45;1;22;1;56;1;6;55;51;10;150;1;73;0;3;35;93;0;11;27;10;0;4;9;64;4;1;106;42;0;0;14;49;6;1;61;0;1;0; lars;0;3;7;1;33;36;3;47;9;29;0;1;0;3;4;8;0;32;0;19;0;0;2;7;29;28;0;19;1;22;0;0;27;35;7;86;4;36;0;0;19;58;0;8;24;28;0;2;9;51;2;1;40;22;1;0;6;33;0;2;31;0;1;0; iars;0;6;20;11;45;45;7;46;6;37;0;0;0;5;12;14;0;43;1;20;1;1;0;10;30;44;1;20;1;18;2;1;29;40;17;100;0;43;0;1;26;71;0;10;12;26;0;3;10;57;0;1;45;24;0;0;10;33;1;0;36;1;0;0; carB;3;4;17;6;48;40;4;44;9;16;1;0;0;4;29;7;0;37;1;16;1;0;0;18;16;40;0;16;3;21;0;0;30;60;9;99;1;41;0;0;32;70;0;2;21;10;1;1;11;51;2;0;59;30;0;0;9;38;4;1;45;0;0;1; sbcC;1;22;35;8;62;51;7;50;7;12;0;1;0;3;12;6;3;10;0;2;3;2;6;30;27;42;1;8;3;29;4;2;23;43;29;122;10;29;0;3;28;102;0;3;4;11;0;4;4;25;2;1;29;9;0;2;9;16;1;0;6;0;0;1; mfd;0;10;21;4;50;78;6;32;6;31;1;0;0;3;16;8;2;33;0;7;1;1;0;13;36;45;1;20;2;24;2;0;33;48;5;93;5;36;0;2;20;73;0;0;7;6;0;5;15;55;4;2;38;20;2;0;7;29;2;0;24;0;0;1;
- tos bactérie acides aminés:
protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; dnaE;151;62;48;41;47;20;94;28;34;98;127;62;123;4;30;9;72;88;38;45;1; ftsK;156;43;33;34;11;9;63;13;27;71;76;25;107;0;11;7;77;46;32;27;1; secA;105;66;34;25;29;24;92;20;37;68;117;49;88;1;26;6;50;70;40;50;1; rpoB;117;50;41;42;33;21;103;17;35;101;104;70;82;2;23;2;70;99;49;58;1; rpoC;160;88;42;61;46;28;132;23;57;113;160;74;131;11;27;10;77;153;63;68;1; lars;80;50;38;16;32;19;66;19;23;62;93;40;77;8;24;28;62;65;40;33;1; iars;127;53;43;31;43;21;86;21;19;72;117;43;98;10;12;26;70;70;43;37;1; carB;118;48;25;41;37;17;75;16;24;90;108;42;102;2;21;10;64;91;47;50;1; sbcC;179;57;19;22;13;2;110;9;32;72;151;39;133;3;4;11;33;41;27;7;1; mfd;163;38;37;28;35;7;96;21;26;83;98;41;95;0;7;6;75;64;38;26;1;
- sti bactérie codons:
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- sti bactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; ftsK;89;25;15;29;12;16;62;10;27;62;48;33;91;2;20;7;59;67;34;33;1; rpoC;142;57;30;67;31;38;119;29;68;121;151;85;148;13;33;7;58;129;75;78;1; rpoB;106;43;36;55;28;38;104;18;40;93;104;80;84;3;26;5;58;101;64;73;1; cox1;76;7;50;38;21;18;23;15;18;53;14;18;55;0;28;21;48;49;39;40;1; aldo;113;19;41;38;19;20;74;15;40;80;76;60;108;0;12;9;56;69;52;41;1; acnA;93;12;31;47;29;28;76;16;28;78;72;51;82;4;11;9;67;91;63;37;1; sbcC;98;18;18;23;10;12;118;13;56;40;108;50;120;7;10;2;16;33;49;49;1; secA;81;35;22;23;34;25;78;25;43;68;79;57;63;4;19;4;38;64;49;58;1; dnaE;125;51;55;68;49;44;82;36;46;86;112;72;120;9;37;12;84;92;67;74;1; mfd;148;16;23;46;34;18;119;25;48;78;103;63;115;2;18;9;82;109;55;62;1;
- mhd bactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; dnaE;0;25;5;1;47;60;6;52;8;39;0;0;2;8;17;14;1;46;0;27;0;1;4;1;59;33;1;23;1;37;2;4;30;60;13;108;12;55;6;4;72;50;0;5;33;12;0;3;23;34;5;3;43;32;1;1;12;28;6;0;49;1;0;0; rpoB;0;14;3;2;59;41;5;46;4;36;0;0;1;19;14;12;2;30;0;30;0;1;11;2;54;31;2;17;8;32;4;7;37;51;6;85;20;59;0;4;46;27;0;2;23;3;1;2;34;33;1;3;68;25;0;0;13;31;3;0;57;0;0;1; rpoC;0;14;7;2;61;62;4;82;5;32;0;0;0;18;23;16;1;49;0;30;0;1;12;2;77;29;2;25;2;55;2;8;66;45;13;138;15;71;3;4;63;67;1;10;33;13;0;4;37;33;11;5;74;45;4;0;20;48;4;0;81;1;0;0; secA;2;7;5;7;40;33;9;55;7;24;0;0;0;6;10;12;1;31;0;25;0;5;5;1;48;30;0;25;12;28;5;7;34;22;29;85;7;47;1;4;53;36;0;5;23;8;3;0;24;17;1;4;42;22;2;2;21;20;2;0;51;0;1;0; sbcC;4;19;5;5;33;63;4;17;5;13;0;0;1;8;6;6;1;16;0;8;0;1;5;1;76;43;3;18;10;37;1;3;32;25;30;100;6;25;3;10;73;56;0;4;4;9;1;3;10;12;3;0;43;4;1;0;10;18;0;0;11;0;0;1; mfd;1;10;15;2;44;59;6;29;10;31;0;1;0;9;8;12;1;34;2;8;0;3;6;0;45;45;3;24;7;24;7;4;36;30;8;74;10;42;0;8;53;36;0;1;8;9;2;10;25;32;3;4;52;23;0;1;19;14;2;0;33;1;0;0; ftsK;1;18;9;4;49;51;7;28;5;23;1;0;0;21;16;14;2;12;3;16;0;3;8;3;36;24;2;20;3;22;1;5;31;35;19;59;9;26;8;9;50;59;0;1;17;13;2;8;22;41;3;3;30;16;0;0;16;25;1;0;34;0;0;1; pdhA;2;12;4;3;23;49;1;32;3;32;0;0;0;9;7;14;0;37;0;21;0;0;3;1;49;23;0;24;4;24;1;5;32;39;20;60;6;39;0;6;50;46;0;1;16;14;0;0;27;27;4;1;35;22;0;1;10;21;2;0;38;0;0;1; topA;1;3;1;2;25;37;12;31;0;27;0;0;1;5;15;17;1;28;0;10;0;3;2;0;51;34;0;10;3;19;1;2;25;23;15;69;1;28;1;5;40;42;0;16;8;9;1;1;17;49;4;0;33;24;0;0;18;35;0;0;23;0;0;1; nuoG;0;5;1;1;26;52;0;30;3;25;0;0;0;10;4;10;0;26;0;11;0;1;4;1;37;27;0;20;4;17;6;3;33;33;9;64;1;38;1;5;47;46;0;12;12;11;0;3;20;34;5;1;42;16;1;0;9;29;1;0;19;0;0;1; cox1;1;6;4;2;47;63;10;9;2;62;0;0;0;14;11;9;2;33;0;18;0;0;2;0;17;2;1;23;3;13;4;6;39;22;3;15;2;17;1;0;30;45;0;0;25;33;0;1;17;26;2;2;28;32;2;0;14;35;1;0;38;1;0;0;
- mhd bactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; dnaE;138;58;47;41;47;27;98;24;38;96;121;67;132;5;33;12;60;83;42;55;1; rpoB;119;51;40;46;32;30;99;19;40;99;91;79;77;2;23;3;70;97;44;60;1; rpoC;146;86;37;57;50;30;121;27;57;121;151;86;137;11;33;13;74;135;72;85;1; secA;94;64;31;28;32;25;89;25;40;68;114;54;94;5;23;8;44;69;45;53;1; sbcC;129;21;18;21;17;8;126;21;47;61;130;31;142;4;4;9;26;50;29;11;1; mfd;131;35;41;30;35;10;99;27;31;77;82;52;97;1;8;9;69;82;34;35;1; ftsK;132;35;28;52;14;19;74;22;25;72;78;35;126;1;17;13;73;52;41;35;1; pdhA;93;33;35;30;37;21;76;24;28;77;80;45;102;1;16;14;54;62;32;40;1; topA;69;43;27;38;29;10;90;10;22;51;84;29;88;16;8;9;68;61;53;23;1; nuoG;85;30;28;24;26;11;70;20;21;75;73;39;99;12;12;11;57;64;39;20;1; cox1;123;19;64;34;35;18;21;24;16;71;18;19;76;0;25;33;44;64;51;39;1;
- eco bactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; dnaE;11;13;20;2;64;12;38;20;24;26;7;4;1;11;8;15;20;19;5;27;0;1;36;4;29;8;8;16;12;28;10;31;31;22;61;31;43;43;11;11;55;25;5;7;37;8;8;7;34;5;11;18;26;20;2;3;11;29;12;2;52;1;0;0; ftsK;10;24;13;7;48;6;39;6;21;14;14;9;6;11;11;16;29;17;16;17;0;3;41;0;21;5;11;6;44;75;3;37;24;12;72;21;47;23;27;28;55;39;3;1;25;19;34;21;68;9;39;17;28;19;15;10;16;20;38;1;18;1;0;0; lhr;24;23;22;9;78;29;22;4;28;14;14;16;17;24;15;19;20;7;19;13;6;15;38;4;57;27;21;8;35;35;15;28;51;19;76;28;51;29;37;20;56;53;4;3;27;25;18;12;38;19;22;22;30;35;12;9;25;38;39;8;26;0;1;0; mfd;7;14;16;3;86;14;37;6;17;29;1;5;9;12;3;17;16;11;17;16;0;3;42;1;37;10;19;15;18;41;6;26;24;10;64;29;46;23;22;6;44;37;3;4;30;10;13;7;30;6;11;9;33;14;8;8;21;21;31;0;30;1;0;0; mukB;8;17;13;5;115;19;41;8;26;21;18;8;10;17;13;32;17;14;11;46;0;5;79;0;57;4;15;17;20;94;5;23;24;7;105;55;58;31;18;18;77;32;3;7;32;8;4;4;25;1;16;7;46;16;8;1;14;33;27;0;31;1;0;0; recB;14;32;13;7;66;12;24;7;30;14;6;3;17;11;11;16;18;12;15;17;0;6;37;0;40;9;12;17;24;47;4;19;28;13;67;29;48;26;26;13;45;33;3;7;31;23;9;5;30;8;17;9;21;15;6;9;19;26;20;3;31;1;0;0; recC;18;20;14;12;75;15;18;5;33;17;4;10;11;6;11;27;23;12;7;23;1;6;38;3;26;8;16;6;25;52;8;18;22;12;60;24;41;33;15;11;36;23;6;8;29;27;12;10;40;5;15;3;24;11;7;5;8;17;24;3;23;0;0;1; rpoB;1;6;6;0;99;15;56;24;11;33;23;0;2;3;31;15;14;29;3;48;0;1;61;0;28;0;1;18;8;50;0;69;35;2;89;33;30;62;22;19;29;9;5;2;37;4;10;8;38;0;41;31;24;13;17;3;6;34;18;0;66;1;0;0; rpoC;3;1;3;0;125;7;62;25;9;26;24;1;0;5;27;14;7;27;1;47;0;0;75;0;24;0;4;17;3;47;0;85;28;2;83;26;34;47;33;28;52;11;7;8;35;9;9;3;45;0;53;32;17;7;23;1;7;46;17;0;75;1;0;0; sbcC;24;15;19;7;64;16;30;12;9;11;2;3;9;10;4;23;7;4;16;20;0;4;24;0;28;6;11;16;69;88;2;12;14;11;62;26;31;15;16;10;59;27;4;4;10;15;7;4;11;3;11;7;13;11;10;12;26;28;23;2;11;1;0;0;
- eco bactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; dnaE;122;58;50;46;39;32;78;24;40;94;92;86;102;12;37;8;54;75;45;66;1; ftsK;108;45;35;67;46;33;70;17;119;76;93;70;149;4;25;19;132;103;61;57;1; lhr;185;26;42;105;27;32;147;29;70;113;104;80;166;7;27;25;87;109;84;73;1; mfd;140;43;46;47;27;33;93;34;59;66;93;69;109;7;30;10;56;67;58;61;1; mukB;177;49;47;98;31;57;145;32;114;59;160;89;145;10;32;8;34;85;56;58;1; recB;144;31;44;64;30;32;92;29;71;64;96;74;117;10;31;23;52;62;60;54;1; recC;154;23;50;69;35;30;82;22;77;60;84;74;85;14;29;27;67;53;37;50;1; rpoB;127;80;44;74;43;51;90;19;58;106;122;92;79;7;37;4;56;109;60;84;1; rpoC;139;87;35;71;34;48;99;21;50;115;109;81;124;15;35;9;57;109;77;92;1; sbcC;145;42;20;51;11;36;62;27;157;39;88;46;112;8;10;15;25;42;76;36;1;
- cft bactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; lars;26;6;29;8;2;1;65;11;39;2;11;8;18;1;0;13;30;8;38;12;18;0;4;5;1;1;14;1;19;3;21;16;7;4;35;27;40;11;11;28;2;7;7;7;16;18;7;18;6;1;19;16;4;3;12;8;5;4;18;33;6;0;1;0; iars;29;11;33;15;3;2;69;13;36;4;8;8;17;2;3;22;26;9;34;8;22;1;6;2;4;2;13;4;13;4;20;13;13;7;29;35;52;17;16;37;7;9;6;11;13;21;4;15;12;1;26;15;7;2;21;11;5;1;17;39;11;0;1;0; carB;21;12;37;9;1;4;72;12;41;5;4;8;28;1;2;32;30;7;40;19;22;3;5;2;4;0;12;1;19;8;22;22;26;3;49;32;46;14;27;40;12;13;6;5;32;4;11;11;21;2;30;24;12;12;25;6;10;12;24;49;21;0;0;1; ftsK;27;15;30;4;3;4;54;9;31;2;6;5;21;1;3;13;15;4;33;4;10;0;6;3;6;0;6;1;9;6;26;9;7;2;32;17;33;9;10;26;5;3;2;0;15;0;10;17;2;2;19;16;5;5;13;13;3;2;27;42;12;0;0;1; rpoC;41;10;51;13;7;3;110;27;33;8;14;23;34;6;0;15;40;8;46;18;30;0;32;8;10;0;10;12;27;11;31;47;22;4;73;47;76;15;43;47;6;13;8;5;35;8;17;30;9;1;62;46;8;6;39;21;3;6;42;68;23;1;0;0; rpoB;47;10;48;16;4;5;102;21;43;2;11;15;15;3;0;20;43;3;57;14;46;1;21;2;3;0;21;6;27;7;29;44;17;1;78;43;80;16;32;37;3;5;3;3;43;6;23;17;7;1;51;45;5;5;29;23;8;7;39;57;9;0;0;1; recB;38;15;35;12;7;3;73;15;59;5;8;11;33;4;5;18;34;8;52;16;18;0;2;6;1;1;5;3;22;6;15;8;9;4;36;38;55;4;12;20;6;6;5;6;13;2;3;4;3;1;19;13;2;6;12;11;4;3;31;44;11;1;0;0; secA;20;10;29;8;6;2;67;13;23;7;6;6;21;2;0;9;28;2;36;7;35;2;7;2;4;0;11;5;21;7;24;18;11;4;43;34;59;11;17;25;2;7;1;4;17;1;3;6;6;0;29;17;2;14;15;10;8;6;16;44;5;0;1;0; dnaE;31;15;45;12;3;4;97;26;49;14;16;12;19;5;3;26;45;13;60;15;29;5;5;5;4;0;19;8;30;8;33;24;14;6;67;39;87;15;26;40;11;14;3;7;36;4;14;10;8;2;29;23;5;3;24;21;5;6;23;87;22;1;0;0; mfd;43;19;37;16;5;4;75;14;42;5;11;14;33;2;2;22;20;9;49;9;28;2;4;7;1;0;14;2;19;5;14;17;13;3;41;26;62;11;18;26;5;6;2;5;17;2;8;3;7;0;26;20;3;9;23;5;8;4;24;53;16;0;0;1;
- cft bactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; lars;72;76;41;51;38;50;29;15;22;48;62;51;48;14;16;18;32;42;29;57;1; iars;93;82;40;60;35;42;37;17;17;53;64;69;69;17;13;21;32;50;38;67;1; carB;84;84;46;75;37;59;36;13;27;73;81;60;92;11;32;4;45;78;53;94;1; ftsK;83;63;33;49;19;37;25;7;15;44;49;42;44;2;15;0;31;45;31;81;1; rpoC;125;137;41;92;48;64;80;22;38;104;120;91;109;13;35;8;57;122;69;133;1; rpoB;130;123;45;64;46;71;73;27;34;91;121;96;77;6;43;6;48;106;67;105;1; recB;110;88;64;79;42;68;28;8;28;36;74;59;44;11;13;2;11;40;30;86;1; secA;75;80;30;44;30;43;50;16;28;57;77;70;51;5;17;1;15;62;39;65;1; dnaE;110;123;63;81;58;75;48;27;38;77;106;102;91;10;36;4;34;60;56;132;1; mfd;124;89;47;84;29;58;42;16;24;47;67;73;55;7;17;2;18;58;40;93;1;
- bmv bactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; lars;0;1;1;0;35;27;2;49;3;28;0;0;0;16;4;6;3;36;0;28;1;0;1;1;38;6;3;10;2;26;0;4;62;5;13;38;10;48;2;2;69;30;0;10;32;23;0;1;33;12;1;1;42;29;1;0;29;9;2;0;29;0;0;1; iars;0;4;1;0;44;38;3;45;2;33;0;0;0;33;2;9;7;30;0;25;0;0;1;1;53;6;9;21;7;22;1;1;66;4;22;44;11;47;1;1;79;24;1;10;17;22;0;1;35;11;0;0;27;28;0;1;39;16;1;0;39;1;0;0; carB;1;3;1;1;39;45;3;53;2;29;0;0;0;43;3;9;7;26;0;27;0;0;6;1;52;5;0;15;2;31;0;3;80;3;17;71;16;50;1;2;89;18;0;15;30;4;1;0;50;5;0;0;47;44;0;1;47;16;1;0;69;1;0;0; secA;0;4;3;0;40;33;1;38;2;24;0;0;0;26;2;9;2;25;4;29;0;1;5;0;51;12;6;26;4;50;0;2;64;4;26;63;17;37;2;1;74;20;1;4;24;7;0;1;21;4;2;0;31;27;0;2;34;11;3;0;52;0;0;1; rpoC;0;5;3;1;77;45;1;85;1;41;0;0;0;60;3;3;1;29;2;44;0;1;34;0;64;4;1;17;5;51;0;20;92;1;56;59;21;58;8;2;92;19;0;13;35;6;0;0;54;3;1;0;74;48;0;0;53;27;8;0;84;1;0;0; rpoB;0;6;1;1;65;52;0;78;2;48;0;1;1;54;6;10;7;32;4;44;0;0;23;0;69;7;2;22;6;47;0;13;87;3;66;44;12;87;6;2;70;20;3;2;37;6;0;3;47;7;4;0;61;57;0;1;42;21;8;0;71;1;0;0; dnaE1;1;13;13;0;57;75;12;52;8;55;1;3;0;26;4;14;8;28;4;33;0;15;28;4;107;44;10;26;3;54;7;10;106;21;43;76;39;84;18;3;135;73;1;12;33;11;3;1;51;26;9;8;46;50;0;2;36;15;9;4;56;0;0;1; ftsK;0;4;2;2;47;42;3;32;4;16;0;0;1;30;6;12;5;12;3;16;0;1;1;0;45;16;2;13;1;21;2;0;59;6;13;45;12;24;8;1;58;25;1;2;20;10;0;2;32;11;1;0;28;37;1;1;23;12;7;1;43;0;0;1; mfd;0;2;4;0;61;61;1;38;0;50;0;1;0;23;7;17;6;24;3;16;0;1;0;0;76;18;4;32;5;49;2;1;67;6;23;56;16;58;2;0;117;30;0;7;20;6;0;1;48;14;0;0;52;21;0;1;36;18;0;0;56;0;1;0; lhr;0;5;0;0;75;118;2;20;4;37;1;0;0;26;12;17;4;15;2;18;0;1;2;1;122;37;11;30;6;31;0;3;100;17;37;62;26;71;9;2;203;92;0;17;19;25;1;2;69;34;0;0;43;58;1;0;45;15;4;0;46;1;0;0; recB;0;8;5;0;56;75;4;17;2;41;0;0;3;22;9;12;13;14;4;12;0;4;9;0;85;27;9;23;2;34;3;2;71;10;19;60;27;62;12;1;193;57;2;8;17;25;1;0;43;20;1;2;34;29;0;0;40;7;2;1;31;0;0;1; recC;0;10;3;3;57;79;1;4;5;61;2;3;2;43;6;16;9;13;4;8;0;5;22;4;79;44;13;18;8;21;0;6;81;12;17;43;23;65;6;1;200;67;0;8;14;29;3;3;66;22;19;3;37;23;1;1;27;6;1;0;27;0;0;1;
- bmv bactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; lars;64;51;31;26;39;28;47;13;28;71;51;58;103;10;32;23;46;73;39;31;1; iars;87;48;35;44;37;25;61;30;29;72;66;58;105;11;17;22;47;55;56;40;1; carB;90;56;31;55;33;27;64;15;33;86;88;66;110;15;30;4;56;91;64;70;1; secA;80;39;26;37;27;33;69;32;54;70;89;54;97;5;24;7;26;60;47;55;1; rpoC;131;86;42;66;30;46;103;18;56;113;115;79;121;13;35;6;57;123;80;92;1; rpoB;125;78;50;72;39;48;99;24;53;103;110;99;98;5;37;6;57;122;64;79;1; dnaE1;159;64;63;48;36;37;198;36;57;144;119;123;229;13;33;11;81;113;53;69;1; ftsK;97;35;20;49;17;19;63;15;22;67;58;36;92;3;20;10;45;66;37;51;1; mfd;128;39;50;48;30;19;95;36;54;76;79;74;149;7;20;6;63;73;55;56;1; lhr;198;22;41;56;19;20;163;41;37;120;99;97;306;17;19;25;106;101;61;50;1; recB;144;21;43;46;27;16;125;32;36;86;79;89;263;10;17;25;64;66;47;34;1; recC;152;5;66;72;22;12;154;31;29;99;60;88;274;8;14;29;94;82;35;28;1;
Autres bactéries compléments
[modifier | modifier le wikicode]Répétitions
[modifier | modifier le wikicode]- aae bactérie
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- amo bactérie
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- dal bactérie
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- hmr bactérie
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- hth bactérie
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- lfc bactérie
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- mrb bactérie
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- msv bactérie
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- nse bactérie
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- tai bactérie
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- tli bactérie
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- tma bactérie
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- tme bactérie
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- tsc bactérie
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Codons
[modifier | modifier le wikicode]- aae bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; acnA;5;4;7;6;6;29;18;31;3;20;2;4;2;2;15;2;1;17;2;23;12;0;0;18;0;0;0;15;3;8;33;14;8;3;39;23;5;23;17;14;17;8;6;1;16;5;3;10;7;22;21;19;4;3;6;3;13;8;5;41;7;0;0;1; dnaE;11;3;30;9;17;56;56;81;17;36;4;5;6;4;11;7;7;50;3;42;16;0;0;22;1;0;0;20;7;22;43;15;7;8;77;42;18;52;20;18;21;15;3;2;25;9;4;7;7;25;30;15;20;15;7;8;18;20;11;48;8;0;1;0; gyrB;6;0;18;6;8;34;30;49;18;14;5;3;1;3;10;6;3;28;6;17;13;1;1;32;3;1;1;16;2;14;30;13;9;5;49;39;11;36;12;15;14;8;2;2;14;3;5;5;1;13;22;21;18;6;9;5;10;10;8;42;6;1;0;0; iars;16;0;21;7;15;33;29;63;23;22;4;3;4;4;14;10;4;39;8;25;20;0;1;22;4;0;2;23;3;18;30;11;8;9;60;47;14;33;15;13;12;5;7;10;13;22;8;7;3;28;30;22;17;9;4;10;7;11;10;34;10;0;1;0; metE;6;0;23;12;8;33;31;38;17;15;4;10;0;3;9;7;0;34;6;24;21;0;2;20;1;0;0;10;5;9;16;10;6;6;63;30;9;27;13;13;3;11;1;2;17;12;3;9;7;19;23;13;7;10;0;9;7;15;9;40;3;0;0;1; rpoB;8;0;28;15;16;66;47;87;20;39;9;8;5;3;19;7;6;45;8;36;34;0;3;62;1;0;3;20;13;22;58;27;12;6;99;51;21;72;28;15;24;14;8;2;23;8;5;17;8;43;46;45;9;17;13;16;24;20;13;73;21;0;0;1; rpoC;4;2;32;14;17;70;51;90;21;31;11;11;2;0;29;10;5;45;4;43;49;1;5;43;1;0;0;27;11;33;57;43;12;5;120;54;10;67;23;27;25;14;5;11;24;12;8;10;7;48;51;43;13;14;20;13;20;20;23;81;32;1;0;0; sbcC;29;6;24;6;21;41;70;78;18;15;11;6;8;3;12;19;2;33;12;14;20;0;2;41;0;1;1;11;12;16;23;3;2;8;132;54;8;21;11;9;11;8;1;1;7;1;4;4;3;4;20;17;12;6;2;7;13;8;13;29;4;1;0;0; secA;16;2;21;9;14;48;51;51;16;11;3;8;2;0;7;5;4;22;5;36;27;0;0;40;0;0;2;24;8;23;41;4;10;4;99;33;12;37;12;15;10;17;0;0;17;8;8;3;8;9;28;28;11;8;13;5;13;11;10;42;13;0;0;1; topA;8;7;10;1;8;23;28;41;14;9;2;4;5;4;3;5;4;28;3;9;18;0;1;18;1;0;0;3;1;11;16;3;3;4;47;16;8;9;10;4;5;11;1;0;11;4;7;6;3;7;12;9;11;4;2;7;8;11;7;21;4;0;1;0;
- aae bactérie acides aminés
Gène;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; acnA;57;49;23;27;18;25;30;15;11;58;62;28;56;7;16;5;42;47;30;53;1; dnaE;126;137;53;37;57;45;39;20;29;73;119;70;74;5;25;9;43;80;53;67;1; gyrB;72;79;32;28;31;23;51;17;16;57;88;47;49;4;14;3;24;67;34;56;1; iars;92;92;45;39;43;33;47;25;21;58;107;47;45;17;13;22;46;78;32;54;1; metE;82;69;32;33;34;30;44;10;14;38;93;36;40;3;17;12;38;53;31;52;1; rpoB;133;134;59;51;51;44;100;23;35;103;150;93;81;10;23;8;73;117;73;107;1; rpoC;139;141;52;63;50;47;99;27;44;117;174;77;89;16;24;12;73;121;73;136;1; sbcC;127;148;33;59;35;26;64;12;28;36;186;29;39;2;7;1;15;55;30;46;1; secA;110;102;27;25;26;41;67;26;31;59;132;49;54;0;17;8;28;75;42;65;1; topA;57;69;23;23;32;12;38;3;12;26;63;17;30;1;11;4;23;36;28;32;1;
- amo bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; carB;7;20;37;5;21;8;26;37;24;17;10;10;4;13;16;18;12;13;7;18;6;4;7;19;12;4;9;12;8;19;26;14;43;14;34;43;28;22;22;18;14;52;2;15;18;7;14;7;9;25;13;16;17;30;2;8;17;18;12;32;27;1;0;0; dnaE;9;44;32;5;16;15;30;45;23;23;6;4;2;20;17;19;19;28;11;29;12;1;7;27;10;3;14;8;13;26;20;15;33;16;40;59;44;22;10;21;19;38;5;10;28;6;4;12;13;16;17;20;25;21;4;8;9;10;9;44;21;1;0;0; ftsK;9;25;19;12;17;11;16;22;26;8;6;3;5;13;8;11;9;12;11;8;12;5;3;21;4;3;4;3;6;13;15;8;17;14;33;20;30;19;14;13;10;27;3;2;21;5;11;10;10;16;13;13;15;11;6;6;13;11;13;31;18;0;0;1; iars;8;20;22;4;20;12;27;38;15;23;9;7;0;5;14;21;18;21;4;17;9;5;1;22;12;0;9;12;13;11;23;3;18;9;29;42;25;43;16;7;8;29;2;18;21;29;5;16;11;14;8;15;19;16;4;7;21;13;9;28;21;0;1;0; lars;5;17;24;1;14;7;9;36;21;18;3;1;0;7;10;12;11;18;10;17;10;3;2;26;12;4;8;9;7;17;14;4;24;13;24;47;20;27;8;6;7;32;5;13;22;25;4;11;8;27;15;8;16;18;3;5;16;15;7;25;15;0;1;0; mfd;16;32;28;4;27;10;22;41;21;13;10;7;4;10;11;18;18;19;14;9;19;7;7;32;8;4;8;10;23;22;18;18;29;11;42;35;39;31;15;11;16;31;2;4;25;18;10;9;10;17;12;16;20;24;9;5;12;8;18;36;18;0;1;0; rpoB;9;31;23;2;26;15;14;44;16;23;4;4;1;10;19;15;15;17;6;36;15;8;11;42;18;0;8;16;7;32;39;16;28;14;41;73;32;52;14;9;5;43;1;1;22;8;3;13;10;33;18;15;42;35;6;0;25;22;10;42;23;1;0;0; rpoC;9;43;44;7;44;28;21;88;17;22;12;3;4;17;21;22;14;26;13;30;14;4;15;55;26;8;11;15;16;45;35;21;52;17;55;89;52;55;19;19;10;59;3;16;37;11;6;15;19;32;24;21;42;52;12;8;21;22;26;61;48;1;0;0; sbcC;25;37;31;7;9;11;39;31;15;12;6;2;4;12;9;12;14;4;29;24;16;11;6;26;9;2;7;5;20;16;17;9;21;6;60;22;38;14;14;9;12;23;4;3;16;7;6;7;2;6;17;12;12;19;9;4;10;6;15;18;21;0;0;1; secA;11;30;20;4;19;9;22;40;12;13;6;4;0;7;10;14;13;16;13;17;6;7;5;30;14;1;14;10;12;18;15;13;22;14;48;41;29;30;14;17;12;30;7;4;26;3;1;8;1;13;16;10;19;14;7;2;9;13;12;33;19;1;0;0;
- amo bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; carB;98;63;41;71;25;25;52;21;27;97;77;50;106;17;18;7;55;76;45;71;1; dnaE;121;75;46;68;47;40;60;22;39;84;99;66;88;15;28;6;45;83;31;74;1; ftsK;93;38;34;46;21;19;48;7;19;54;53;49;64;5;21;5;47;52;36;62;1; iars;86;65;38;56;39;21;49;21;24;53;71;68;60;20;21;29;46;58;45;58;1; lars;68;45;39;33;29;27;57;17;24;55;71;47;53;18;22;25;50;57;39;47;1; mfd;117;63;34;60;37;23;77;18;45;76;77;70;73;6;25;18;46;72;34;72;1; rpoB;106;58;39;53;32;42;94;24;39;97;114;84;71;2;22;8;59;110;53;75;1; rpoC;175;109;39;79;40;43;122;26;61;125;144;107;107;19;37;11;72;139;63;135;1; sbcC;120;70;27;45;18;53;70;12;36;53;82;52;58;7;16;7;21;60;29;54;1; secA;93;62;25;41;29;30;63;24;30;64;89;59;73;11;26;3;23;59;31;64;1;
- dal bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; acnA;2;16;11;1;23;7;9;19;15;7;1;0;1;3;17;13;7;6;6;16;3;0;1;8;7;14;7;5;2;16;13;1;43;8;17;19;13;25;5;7;15;37;0;8;16;3;2;3;10;26;12;1;24;10;0;0;16;23;18;5;17;0;1;0; carB;2;20;12;1;48;13;29;35;20;14;1;3;2;12;30;11;10;26;11;25;0;1;4;7;16;18;7;7;8;29;12;1;60;13;42;45;18;42;10;11;18;62;0;11;32;6;2;7;16;28;12;4;41;25;4;3;16;31;26;5;41;0;0;1; dnaE;6;23;22;1;46;19;54;43;30;20;2;0;2;3;23;20;14;22;15;29;1;4;6;6;20;7;12;15;10;28;11;3;50;16;63;35;22;55;7;7;11;71;2;17;43;5;3;11;12;25;12;8;38;21;4;7;14;27;21;5;39;1;0;0; ftsK;6;17;9;1;33;8;25;25;8;13;3;2;2;5;22;7;5;13;4;19;1;0;4;7;18;5;2;5;8;17;13;5;35;7;34;14;6;26;1;10;13;55;2;4;21;6;4;8;12;21;4;5;28;16;2;0;10;21;19;8;22;1;0;0; iars;1;10;8;1;50;9;21;44;16;23;4;1;1;4;30;9;6;29;8;23;3;0;6;3;26;13;7;18;7;19;7;2;44;3;41;32;14;52;3;5;25;51;3;20;21;21;1;6;7;24;11;5;38;17;3;2;5;24;13;1;31;1;0;0; lars;0;6;5;0;42;8;31;38;15;22;1;0;0;5;12;11;7;21;3;24;0;0;0;5;22;9;9;10;5;27;6;2;47;2;43;27;11;52;5;3;13;39;0;21;36;22;0;4;7;35;7;1;34;28;0;1;11;35;10;3;20;0;1;0; pol1;3;13;9;1;48;13;32;38;16;21;4;0;0;6;21;12;9;19;7;27;2;0;1;6;15;7;4;14;14;27;4;2;37;8;54;26;11;36;3;7;16;48;0;3;32;5;0;8;14;19;8;4;24;21;2;1;15;37;15;4;36;1;0;0; rpoB;2;22;21;0;62;24;28;60;15;33;7;1;2;14;33;16;12;20;4;32;6;2;12;18;40;17;9;12;10;46;6;6;78;11;83;39;20;70;3;8;25;50;1;4;39;3;0;12;10;41;20;5;58;42;4;1;20;43;29;5;48;1;0;0; rpoC;1;21;18;0;69;19;22;83;12;25;5;2;0;6;39;14;12;29;6;37;6;0;13;22;46;18;6;16;5;39;16;7;93;12;79;43;21;72;9;14;25;76;1;16;41;8;0;12;12;38;17;7;58;40;6;4;30;43;32;4;65;1;0;0; sbcC;16;26;17;9;67;14;79;61;11;14;5;9;3;7;42;33;6;10;26;27;3;3;5;8;21;25;10;9;41;30;12;5;36;9;93;50;35;34;11;16;24;68;3;14;11;6;0;4;8;11;5;3;12;12;5;3;10;30;19;7;30;0;0;1; secA;1;17;8;2;27;10;20;39;11;14;1;0;1;3;23;7;8;22;6;25;2;2;8;5;21;14;10;16;3;35;1;4;55;5;52;28;11;52;6;6;9;29;0;5;28;5;1;5;5;11;11;4;26;19;3;1;12;26;19;3;38;0;1;0;
- dal bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; acnA;60;28;22;35;13;22;33;12;18;65;36;38;64;8;16;3;41;47;39;40;1; carB;96;64;34;59;36;36;46;14;37;86;87;60;101;11;32;6;53;82;54;72;1; dnaE;117;97;50;50;36;44;44;27;38;80;98;77;96;19;43;5;51;79;52;65;1; ftsK;74;50;21;41;18;23;35;7;25;60;48;32;79;6;21;6;45;53;33;49;1; iars;79;65;39;49;35;31;51;25;26;56;73;66;84;23;21;21;38;71;34;45;1; lars;61;69;37;29;28;27;36;19;32;57;70;63;60;21;36;22;46;70;47;33;1; pol1;87;70;37;43;28;34;31;18;41;51;80;47;74;3;32;5;41;57;55;55;1; rpoB;131;88;48;73;32;36;95;21;56;101;122;90;86;5;39;3;63;125;68;82;1; rpoC;128;105;37;66;41;43;105;22;44;128;122;93;124;17;41;8;62;122;83;101;1; sbcC;149;140;25;99;16;53;65;19;71;62;143;69;119;17;11;6;23;32;48;56;1; secA;65;59;25;35;30;31;52;26;38;65;80;63;50;5;28;5;22;60;42;60;1;
- hmr bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; acnA;7;7;24;5;2;6;32;17;6;15;6;5;6;1;4;8;9;11;11;13;19;0;0;7;0;0;9;4;8;11;21;32;15;0;24;20;27;16;25;18;0;7;4;4;15;4;20;10;3;3;22;20;2;2;4;32;5;2;19;24;10;1;0;0; carB;19;14;29;10;10;5;46;37;37;8;14;18;14;4;4;5;32;8;32;18;23;1;2;17;3;1;7;5;9;21;14;30;21;6;40;55;46;11;21;33;5;16;7;4;26;6;14;15;12;10;43;23;11;8;11;21;9;10;31;50;6;0;0;1; dnaE;14;19;41;12;11;7;67;52;40;17;14;14;8;0;6;13;29;20;27;21;18;0;4;17;5;0;15;9;15;13;9;27;25;12;48;46;47;26;30;25;6;18;5;4;32;2;8;7;10;10;35;15;11;7;10;27;5;10;24;53;11;0;0;1; ftsK;14;7;15;18;8;4;43;19;23;12;7;18;4;2;4;15;12;12;17;15;18;1;1;7;1;1;4;6;17;7;7;14;17;6;34;23;19;12;21;8;5;13;0;1;25;1;14;9;5;6;16;13;6;7;7;18;3;6;13;41;15;0;0;1; iars;15;25;19;5;11;5;32;57;26;8;9;11;8;5;11;7;37;16;16;13;16;1;2;28;1;1;14;9;4;10;12;25;8;5;29;51;55;18;19;21;4;14;12;6;24;20;8;15;5;9;42;12;5;2;4;9;8;8;14;37;7;0;1;0; lars;9;17;22;3;6;1;51;28;32;10;3;4;4;4;6;4;22;18;19;18;5;0;3;22;1;1;13;0;10;10;4;22;15;6;24;41;53;9;12;17;7;18;3;7;20;19;9;14;6;6;38;6;14;4;10;17;5;10;18;24;10;1;0;0; mfd;26;19;43;8;6;5;56;44;60;9;26;11;12;8;10;14;33;4;30;13;25;1;1;29;1;1;10;3;10;13;8;22;13;4;36;50;63;12;17;20;5;12;2;3;14;2;5;16;4;4;29;12;16;5;8;10;7;8;28;55;11;0;1;0; rpoB;21;33;45;10;7;13;66;55;36;12;19;17;14;5;10;7;32;11;36;16;36;0;3;32;5;0;19;6;15;16;23;47;20;7;67;54;73;18;21;25;3;14;4;1;22;7;15;23;12;5;64;39;13;9;11;23;6;16;27;67;11;0;1;0; rpoC;22;34;36;14;10;12;66;73;30;15;27;21;19;5;12;10;37;12;36;21;47;1;3;40;3;0;13;7;18;18;24;55;23;5;74;64;69;17;33;41;7;17;7;5;31;7;13;22;10;10;72;31;12;14;11;32;11;13;43;72;13;1;0;0; secA;19;16;22;7;9;3;38;33;20;6;9;11;3;6;4;4;20;12;19;15;20;2;3;26;3;1;12;8;9;18;7;21;10;6;34;38;56;10;12;14;2;14;0;1;22;5;5;4;4;5;38;8;8;4;3;21;4;8;20;32;8;0;1;0;
- hmr bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; acnA;51;49;21;30;20;24;26;13;19;68;44;43;50;8;15;4;36;46;43;53;1; carB;87;83;45;59;40;50;47;12;30;71;95;57;75;11;26;6;51;85;51;87;1; dnaE;104;119;57;55;49;48;44;24;28;73;94;73;79;9;32;2;35;68;52;88;1; ftsK;66;62;35;50;24;32;29;10;24;44;57;31;47;1;25;1;34;42;34;69;1; iars;80;89;34;51;53;29;49;23;14;50;80;73;58;18;24;20;37;61;29;58;1; lars;58;79;42;25;40;37;32;13;20;47;65;62;54;10;20;19;35;62;42;52;1; mfd;107;100;69;81;37;43;58;13;23;47;86;75;54;5;14;2;29;62;33;94;1; rpoB;129;121;48;72;43;52;76;25;31;97;121;91;63;5;22;7;55;125;56;105;1; rpoC;128;139;45;94;49;57;94;20;36;107;138;86;98;12;31;7;55;129;67;128;1; secA;76;71;26;37;32;34;55;20;27;44;72;66;42;1;22;5;18;58;36;60;1;
- hth bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; acnA;3;9;22;3;11;9;16;27;14;5;9;5;5;1;11;5;11;11;6;15;12;0;1;18;2;0;6;8;5;9;16;26;13;7;24;31;17;13;17;11;7;18;1;6;13;4;8;12;4;15;14;21;11;6;9;6;6;7;11;43;4;0;1;0; cox1;4;1;25;8;8;19;6;13;21;17;5;1;3;1;9;2;11;18;3;18;5;0;0;6;0;0;4;11;2;5;21;18;8;6;8;3;4;10;12;13;9;13;0;0;22;20;7;14;3;8;12;12;16;4;6;11;5;13;4;33;6;0;0;1; dnaE;11;15;55;6;19;26;48;67;39;10;9;10;7;3;12;16;18;29;16;23;24;0;4;17;1;0;16;13;11;28;25;19;25;9;45;64;26;40;19;22;9;14;4;3;28;11;9;11;8;10;28;21;26;6;12;14;3;15;12;54;10;0;1;0; gyrB;7;9;31;6;17;18;35;33;17;8;10;8;2;3;3;13;9;22;7;13;27;0;0;22;1;1;6;12;10;11;15;20;8;9;41;43;25;24;13;14;9;7;5;1;14;3;12;4;3;4;15;20;25;2;8;11;4;16;5;40;5;1;0;0; iars;8;10;40;8;10;14;35;35;29;6;17;7;4;4;7;18;26;31;7;19;30;0;0;30;0;0;8;14;9;20;13;15;19;9;34;50;26;23;7;12;7;16;6;11;16;20;8;19;4;11;12;17;24;7;14;10;1;9;9;42;5;1;0;0; metE;10;7;23;6;10;17;34;27;28;6;13;6;5;2;9;16;16;27;5;14;17;1;1;19;1;1;8;6;9;17;8;11;10;6;33;52;13;19;12;14;2;15;2;4;19;11;8;14;4;12;17;12;17;10;10;7;2;7;7;41;9;1;0;0; rpoB;17;10;44;13;31;21;45;80;44;12;12;12;7;6;16;17;22;38;18;25;47;1;6;45;3;1;5;15;13;26;36;46;13;8;77;72;38;43;16;18;14;25;7;5;25;4;14;29;7;22;19;39;43;21;13;23;10;30;17;69;14;0;0;1; rpoC;8;9;60;14;27;26;55;85;24;20;15;4;3;9;17;20;16;41;14;33;49;0;1;45;2;0;9;20;14;31;36;29;34;10;65;87;30;58;27;31;20;18;10;7;33;9;12;25;6;27;25;41;45;10;11;24;9;28;13;100;15;1;0;0; sbcC;21;11;41;10;17;15;64;50;27;8;13;8;18;3;6;20;15;23;15;21;30;3;2;24;2;2;7;8;32;23;13;5;11;4;67;75;21;20;10;6;2;7;5;0;18;2;7;9;1;3;10;9;16;5;10;11;1;5;16;46;9;1;0;0; secA;8;8;45;7;13;20;33;46;18;10;11;2;0;4;7;6;15;16;13;16;31;0;3;30;1;1;10;12;12;29;16;22;10;10;49;58;23;32;15;10;11;16;1;0;21;10;6;2;5;8;19;24;29;3;8;25;4;9;10;39;9;0;1;0;
- hth bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; acnA;57;43;19;36;22;21;33;14;14;62;55;30;53;7;13;4;39;52;28;58;1; cox1;65;19;38;21;29;21;11;15;7;53;11;14;47;0;22;20;32;44;35;43;1; dnaE;132;115;49;57;47;39;46;29;39;78;109;66;64;7;28;11;38;81;44;76;1; gyrB;88;68;25;39;31;20;51;18;21;52;84;49;43;6;14;3;23;62;39;50;1; iars;90;70;35;57;57;26;60;22;29;56;84;49;42;17;16;20;42;60;34;56;1; metE;73;61;34;51;43;19;40;14;26;35;85;32;43;6;19;11;38;56;26;57;1; rpoB;136;125;56;70;60;43;103;20;39;103;149;81;73;12;25;4;72;122;76;100;1; rpoC;144;140;44;68;57;47;97;29;45;109;152;88;96;17;33;9;70;121;72;128;1; sbcC;115;114;35;68;38;36;63;15;55;33;142;41;25;5;18;2;20;40;27;71;1; secA;101;79;28;30;31;29;66;22;41;58;107;55;52;1;21;10;21;75;46;58;1;
- lfc bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; acnA;0;9;19;1;14;15;11;23;15;8;9;5;3;3;15;8;13;3;13;10;3;1;14;4;7;4;5;8;7;13;15;27;13;10;22;12;28;8;19;9;5;20;5;0;17;0;7;10;11;5;24;1;12;11;9;12;7;13;20;4;21;1;0;0; carB;6;22;45;3;27;14;30;21;27;16;22;12;5;12;17;10;18;3;22;13;14;8;10;14;11;7;8;7;14;19;25;26;8;22;44;43;42;17;19;26;16;27;6;3;25;2;14;13;10;13;35;7;24;29;7;15;14;13;32;8;34;0;1;0; dnaE;2;5;39;3;40;35;51;31;41;20;13;9;1;9;29;13;17;14;19;14;12;12;11;10;10;18;11;10;9;25;36;13;16;20;62;34;46;34;18;12;13;35;2;5;44;5;9;9;14;19;15;4;9;42;4;18;7;24;35;10;43;0;0;1; ftsK;5;10;30;2;24;28;28;11;15;6;8;8;10;6;30;12;5;6;9;11;17;8;0;11;2;6;9;2;13;12;21;9;14;5;30;9;20;18;16;6;8;18;0;2;23;7;15;10;14;21;8;2;11;21;5;14;8;15;22;10;23;0;0;1; iars;3;7;29;1;23;41;26;19;17;20;10;9;3;9;31;8;11;13;11;17;9;7;6;11;6;22;17;15;6;17;33;4;19;16;51;23;18;34;13;8;12;34;5;11;25;23;7;11;21;24;9;3;10;28;2;20;10;19;15;4;34;0;1;0; lars;3;13;27;1;20;30;28;20;23;12;9;4;1;3;19;6;14;9;10;18;11;8;5;9;5;9;16;8;11;24;30;6;17;7;38;17;21;27;9;3;5;33;4;6;18;19;10;5;21;12;22;3;6;23;4;15;10;24;16;2;19;0;1;0; pol1;5;21;47;4;27;13;23;15;21;5;19;18;9;10;36;3;14;5;13;7;10;6;15;9;8;9;16;6;9;15;19;16;7;18;32;26;31;22;14;12;9;17;2;0;16;9;4;16;21;10;24;8;16;16;7;9;14;9;19;5;22;0;0;1; rpoB;56;29;63;13;15;15;89;31;44;15;48;32;9;10;17;7;37;10;59;16;35;20;16;9;11;12;19;11;34;25;43;32;17;20;113;37;63;28;29;39;8;12;2;0;33;7;22;33;12;19;61;25;19;23;37;28;9;20;73;24;24;1;0;0; rpoC;38;29;30;11;11;12;81;38;43;8;40;17;6;8;16;9;21;9;46;25;49;17;10;14;10;9;23;3;45;14;35;49;17;20;96;48;65;20;31;40;10;16;9;4;37;9;31;19;8;8;60;24;14;25;23;25;12;10;83;17;26;0;0;1; secA;10;19;35;2;15;14;40;15;24;11;12;9;7;8;10;3;15;13;25;11;11;9;9;7;9;10;20;12;14;16;24;17;10;19;44;43;50;13;19;22;6;11;3;1;28;8;7;7;10;4;27;4;15;11;9;7;10;11;32;4;20;0;0;1;
- lfc bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; acnA;58;34;23;43;16;23;33;13;20;65;34;36;53;5;17;0;33;48;41;45;1; carB;117;51;43;78;21;35;64;15;33;81;87;59;88;9;25;2;50;95;49;74;1; dnaE;124;82;61;74;31;33;73;21;34;85;96;80;78;7;44;5;51;70;53;88;1; ftsK;99;39;21;74;11;20;44;11;25;49;39;38;48;2;23;7;60;42;42;55;1; iars;104;45;37;70;24;28;61;32;23;72;74;52;67;16;25;23;63;50;51;53;1; lars;94;48;35;42;23;28;47;24;35;60;55;48;50;10;18;19;48;54;53;37;1; pol1;117;38;26;95;19;20;57;22;24;60;58;53;52;2;16;9;51;64;39;46;1; rpoB;191;120;59;123;47;75;103;30;59;112;150;91;88;2;33;7;86;128;94;121;1; rpoC;131;119;51;96;30;71;109;26;59;121;144;85;97;13;37;9;66;123;70;126;1; secA;95;55;35;49;28;36;55;32;30;70;87;63;58;4;28;8;28;57;37;56;1;
- mrb bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; carB;0;1;5;1;70;32;20;28;8;20;0;0;0;12;22;20;7;30;2;19;0;2;2;6;31;17;1;15;1;26;1;5;56;23;25;73;15;29;5;9;22;71;0;4;19;10;1;3;13;48;5;3;55;17;0;0;6;59;19;2;42;1;0;0; dnaE;0;12;4;2;81;40;20;49;21;33;0;1;0;22;9;15;5;39;2;31;2;2;1;3;49;33;1;20;1;43;2;7;56;37;20;94;17;53;2;4;29;86;2;5;30;10;1;3;27;39;5;3;67;13;0;0;6;40;14;2;42;0;0;1; ftsK;6;15;9;6;72;34;20;17;12;17;1;1;1;11;7;20;2;13;1;14;2;2;1;6;38;19;3;19;5;27;1;9;45;19;21;44;7;31;6;8;23;78;0;0;15;9;6;5;16;40;5;6;36;13;0;2;5;38;12;0;21;0;1;0; iars;1;13;5;5;67;28;18;37;20;27;0;0;0;21;13;15;6;33;5;31;0;3;3;5;42;19;4;20;10;35;0;10;49;15;19;81;18;38;4;13;12;64;0;6;22;29;5;1;13;40;7;7;54;14;1;0;7;39;11;0;28;0;1;0; lars;1;4;4;0;53;17;17;44;11;25;0;0;3;5;3;17;6;31;1;23;0;0;0;0;33;12;0;17;4;31;3;4;43;17;16;66;12;28;1;0;10;63;0;6;22;26;1;1;15;35;3;7;37;15;0;0;4;37;9;1;31;1;0;0; mfd;0;7;7;6;92;37;9;23;10;21;2;1;0;8;15;16;5;30;0;11;0;1;2;0;56;32;4;21;5;29;1;5;50;21;20;75;8;35;1;4;13;76;0;2;10;8;0;5;15;46;1;4;54;15;1;1;2;35;2;0;27;0;0;1; rpoB;1;13;9;6;74;25;14;48;20;23;1;1;1;16;19;14;5;27;3;28;1;3;6;4;56;19;2;14;5;39;4;22;49;24;27;69;20;51;2;6;10;57;0;2;22;3;5;7;20;34;6;5;67;12;2;1;5;40;19;1;35;1;0;0; rpoC;0;7;8;6;83;47;20;81;6;33;0;0;2;26;19;31;7;38;0;29;0;2;16;0;69;24;2;25;5;62;3;14;65;36;28;113;16;67;4;5;11;95;2;9;32;10;1;4;27;40;9;9;93;29;0;0;8;67;25;0;56;0;0;1; sbcC;2;3;6;7;64;55;29;27;8;10;0;2;1;9;7;23;6;9;0;6;2;4;6;6;43;22;5;12;13;64;1;2;34;9;37;71;12;29;12;9;18;81;0;3;6;8;3;3;7;17;3;3;22;7;1;0;3;31;5;2;16;0;0;1; secA;1;6;1;3;52;34;21;42;7;22;0;0;1;11;16;17;0;31;2;26;2;1;5;1;68;11;2;18;3;40;0;6;43;18;26;82;12;43;1;7;9;77;0;2;20;8;1;1;9;25;3;4;51;13;1;0;3;42;7;1;48;0;1;0;
- mrb bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; carB;109;48;28;54;37;21;58;16;27;85;98;44;107;4;19;10;65;80;65;63;1; dnaE;139;69;54;47;44;33;90;21;44;102;114;70;121;7;30;10;70;88;46;58;1; ftsK;142;37;29;41;15;15;68;22;32;74;65;38;115;0;15;9;67;60;45;33;1; iars;119;55;47;49;39;36;72;24;45;74;100;56;93;6;22;29;59;82;47;39;1; lars;79;61;36;28;37;24;45;17;35;67;82;40;74;6;22;26;52;62;41;41;1; mfd;149;32;31;42;35;11;91;25;34;77;95;43;94;2;10;8;66;74;39;29;1; rpoB;128;62;43;52;32;31;89;16;44;99;96;71;75;2;22;3;66;90;48;55;1; rpoC;151;101;39;78;45;29;111;27;67;118;141;83;115;11;32;10;72;140;75;81;1; sbcC;137;56;18;42;15;6;83;17;77;46;108;41;120;3;6;8;30;35;35;23;1; secA;97;63;29;45;31;28;88;20;43;67;108;55;94;2;20;8;36;71;46;56;1;
- msv bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; carB;3;11;7;4;36;41;16;31;8;19;4;0;1;11;19;18;4;32;3;20;1;4;2;1;32;23;6;7;8;29;10;7;32;32;24;71;6;38;7;11;13;67;0;4;20;10;2;7;13;39;4;10;55;14;4;0;8;55;6;0;60;0;1;0; dnaE;3;25;11;7;40;46;15;58;12;37;3;0;3;18;14;14;10;40;2;25;1;3;4;5;53;24;6;18;6;33;9;9;45;36;15;92;20;63;5;18;34;70;0;10;28;10;1;6;26;38;3;11;53;22;2;1;3;36;8;2;50;0;1;0; ftsK;4;12;10;12;62;36;12;28;8;24;0;6;2;9;9;17;7;8;4;9;0;5;7;2;33;26;3;13;9;19;6;10;38;24;17;52;12;28;2;23;20;71;0;0;16;12;3;14;16;33;5;13;27;16;4;2;5;28;1;2;34;0;1;0; iars;2;12;12;10;45;35;13;46;9;37;1;0;3;17;10;11;8;37;6;24;2;2;9;5;36;24;8;16;7;20;9;7;32;24;31;83;13;39;6;13;22;61;0;4;23;25;4;11;13;38;4;18;44;17;5;2;6;34;4;2;30;0;0;1; lars;1;13;5;2;22;27;13;42;6;31;2;3;1;8;7;17;3;32;4;17;0;2;2;2;32;13;2;19;8;27;2;3;45;18;12;65;9;37;1;5;11;52;2;3;22;29;0;4;12;32;1;10;29;23;3;1;3;35;8;1;34;1;0;0; mfd;2;12;11;8;51;44;16;24;16;18;2;3;3;10;9;10;8;28;1;8;1;4;12;3;39;25;7;17;9;27;4;12;30;37;21;74;22;26;6;16;23;52;0;2;9;12;3;23;17;21;8;12;30;13;7;1;5;27;11;6;30;1;0;0; rpoB;2;20;13;10;47;30;11;51;15;26;4;2;1;19;15;11;6;26;2;30;1;2;9;2;58;21;3;13;8;35;2;19;52;30;25;73;21;53;0;11;6;54;0;2;19;3;3;3;17;40;4;10;55;22;1;0;4;43;4;1;55;1;0;0; rpoC;0;21;10;6;51;57;18;85;5;40;4;0;2;16;28;24;7;31;1;29;2;3;18;3;69;24;3;25;11;56;4;25;53;31;32;112;25;58;6;24;20;80;2;8;33;11;2;6;23;35;11;23;63;40;5;0;8;52;12;2;72;0;1;0; sbcC;5;22;12;11;37;50;12;38;7;12;2;0;2;12;11;16;3;12;3;4;3;4;7;2;38;37;4;16;11;43;7;5;21;27;42;82;10;19;9;12;25;71;2;2;8;7;1;3;12;13;3;5;27;8;1;0;2;26;0;4;14;0;1;0; secA;3;13;10;4;31;36;18;46;4;27;0;0;0;8;11;14;5;24;5;24;0;3;12;1;49;23;2;17;10;27;6;18;21;21;32;77;18;36;3;15;17;62;0;2;31;7;0;7;14;16;7;12;38;16;4;0;5;38;5;2;41;0;1;0;
- msv bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; carB;102;47;27;53;36;23;63;13;37;81;95;44;98;4;20;10;61;83;67;66;1; dnaE;132;73;49;52;50;27;90;24;39;99;107;83;127;10;28;10;71;89;42;60;1; ftsK;136;40;32;43;15;13;73;16;28;78;69;40;116;0;16;12;66;61;39;37;1; iars;116;59;46;42;45;30;78;24;27;72;114;52;102;4;23;25;66;83;47;36;1; lars;70;55;37;38;35;21;51;21;35;68;77;46;69;5;22;29;48;63;42;43;1; mfd;128;40;34;37;36;9;84;24;36;83;95;48;97;2;9;12;64;63;40;47;1; rpoB;122;62;41;52;32;32;93;16;43;103;98;74;71;2;19;3;63;91;48;60;1; rpoC;145;103;45;74;38;30;119;28;67;113;144;83;130;10;33;11;66;137;65;86;1; sbcC;137;50;19;43;15;7;91;20;54;60;124;29;117;4;8;7;29;43;29;18;1; secA;97;64;31;33;29;29;88;19;37;66;109;54;97;2;31;7;37;73;47;48;1;
- nse bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; acnA;10;9;24;19;9;11;39;25;15;12;21;10;9;7;8;10;18;14;23;18;11;5;9;9;7;3;7;9;20;11;16;24;13;10;40;23;34;17;32;9;4;7;9;6;14;7;11;13;6;7;21;31;16;13;24;19;7;8;20;24;18;1;0;0; carB;12;13;22;13;14;17;34;35;36;14;27;12;17;7;12;6;16;11;36;10;19;2;6;17;2;3;9;4;7;22;13;37;6;15;50;34;39;15;31;16;12;16;10;7;27;3;22;12;9;2;40;27;19;14;18;14;7;9;41;38;15;1;0;0; dnaE;13;23;39;14;12;17;28;34;45;10;16;12;11;10;5;6;26;14;30;15;21;5;15;19;5;3;16;9;15;14;20;27;7;6;39;32;53;17;28;33;13;10;8;7;24;3;12;11;12;6;33;20;14;11;11;15;10;9;38;31;15;0;1;0; ftsK;17;8;27;13;6;19;47;31;13;13;9;22;10;7;11;14;8;12;14;8;13;5;5;7;1;1;9;7;12;6;14;13;10;4;45;26;18;10;29;14;6;2;2;6;21;3;13;9;10;7;17;13;14;9;11;25;6;3;21;28;25;0;1;0; iars;14;14;18;17;12;19;57;24;37;20;21;25;12;5;10;8;27;18;36;16;23;1;5;18;3;1;11;14;19;7;20;15;12;5;55;31;35;19;26;14;7;10;2;11;24;21;16;15;7;1;22;19;14;14;6;28;5;11;21;35;12;0;0;1; lars;18;14;17;10;11;5;44;24;33;12;18;15;9;7;9;9;19;16;30;15;15;5;4;8;2;1;10;9;14;11;19;19;10;5;43;21;24;9;26;12;7;3;15;8;14;15;10;12;6;7;23;16;9;11;9;16;5;4;22;25;12;1;0;0; pol1;11;8;31;19;16;17;52;18;20;13;10;14;11;4;8;7;16;13;24;28;11;6;4;8;3;0;13;9;22;12;16;11;8;3;40;17;25;16;22;8;6;10;3;4;16;1;19;10;1;3;9;19;6;6;11;24;7;9;25;38;8;0;0;1; rpoB;22;33;37;5;17;12;28;54;50;11;27;11;13;25;10;2;30;18;38;13;11;5;24;34;7;3;19;4;13;20;20;57;12;16;46;54;75;19;27;29;21;10;17;6;33;8;13;20;6;4;54;23;33;25;17;11;16;7;32;34;17;0;1;0; rpoC;16;30;38;7;18;14;50;43;30;15;24;13;22;18;15;5;27;17;33;16;22;1;18;25;11;10;15;8;14;24;11;56;18;26;37;57;61;12;34;22;26;11;10;10;33;6;17;14;13;4;64;25;26;14;26;15;15;9;50;31;23;0;1;0; secA;7;11;21;21;9;13;38;26;12;16;12;17;11;4;5;5;10;14;25;18;18;6;7;5;7;7;15;11;25;9;14;15;8;4;49;26;32;12;22;15;7;11;3;1;23;4;7;1;1;2;12;11;9;7;7;20;3;7;12;33;21;0;1;0;
- nse bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; acnA;82;64;27;65;32;41;44;16;31;63;63;51;52;15;14;7;37;81;58;62;1; carB;91;69;50;81;27;46;49;13;29;71;84;54;75;17;27;3;45;100;48;94;1; dnaE;118;62;55;60;40;45;68;25;29;60;71;70;84;15;24;3;41;78;45;84;1; ftsK;90;78;26;73;20;22;32;16;18;41;71;28;51;8;21;3;39;53;45;74;1; iars;94;81;57;81;45;52;51;25;26;52;86;54;57;13;24;21;39;69;50;68;1; lars;75;68;45;67;35;45;35;19;25;53;64;33;48;23;14;15;35;59;34;59;1; pol1;102;70;33;54;29;52;32;22;34;38;57;41;46;7;16;1;33;40;51;71;1; rpoB;126;82;61;88;48;51;84;23;33;105;100;94;87;23;33;8;43;135;51;83;1; rpoC;123;93;45;97;44;49;87;23;38;111;94;73;93;20;33;6;48;129;65;104;1; secA;82;64;28;54;24;43;50;26;34;41;75;44;55;4;23;4;11;39;37;66;1;
- pmh bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; carB;49;22;23;10;1;3;56;17;37;6;30;34;10;6;4;5;29;5;54;11;24;0;6;8;0;0;10;1;24;11;29;28;7;6;67;23;45;9;29;36;6;7;14;2;19;5;18;24;3;3;34;19;5;3;24;25;2;5;66;27;12;0;1;0; dnaE;46;23;40;17;1;3;76;28;39;8;42;21;15;2;4;5;31;7;58;12;33;5;3;8;0;0;14;6;30;7;28;24;7;8;43;22;80;13;21;24;8;3;9;6;27;5;14;19;2;2;46;17;6;6;17;14;5;8;53;34;10;0;1;0; gyrB;26;11;11;7;1;2;37;9;20;2;14;14;7;1;2;5;20;5;28;7;26;4;0;10;1;0;10;3;13;6;30;21;6;4;46;10;31;6;15;16;3;2;5;1;12;3;8;5;3;2;23;12;2;4;17;12;3;1;32;16;2;0;0;1; iars;42;8;21;11;5;5;71;13;38;4;24;21;15;9;3;6;33;8;59;10;28;2;3;7;0;0;18;3;27;8;21;19;10;6;52;8;50;5;23;10;5;2;12;2;12;28;17;13;3;2;40;13;3;5;12;17;1;3;42;18;9;1;0;0; lars;43;10;12;7;0;2;64;19;29;4;16;23;8;2;4;1;31;4;67;7;15;0;2;7;0;1;11;2;24;2;19;11;2;3;45;17;46;7;16;20;1;7;9;1;16;23;16;14;2;4;23;14;6;1;17;16;1;5;43;32;2;1;0;0; pol1;45;13;32;20;3;5;80;21;36;15;15;21;18;0;2;9;20;4;53;10;24;0;1;9;0;1;11;3;21;9;22;24;5;7;62;19;48;16;19;14;6;6;3;3;12;4;19;12;2;2;22;17;4;4;16;17;3;11;39;21;16;1;0;0; recB;70;16;27;12;3;9;105;33;70;11;32;22;24;6;5;3;45;6;125;15;22;2;1;6;0;0;20;2;32;4;17;11;3;1;66;14;76;1;9;8;3;1;11;6;4;15;14;6;1;1;13;17;1;5;18;9;1;7;86;47;8;0;1;0; rpoB;44;13;29;11;4;4;48;9;23;6;22;14;7;4;3;9;25;12;41;11;46;7;4;19;1;0;16;6;33;16;31;32;12;12;68;22;57;13;23;25;4;10;3;3;23;7;22;27;6;9;44;27;9;11;22;15;3;8;36;16;10;1;0;0; rpoC;50;30;22;11;2;6;70;18;22;8;38;35;24;3;8;3;19;2;54;8;43;5;8;18;0;0;16;2;45;13;40;43;12;4;90;25;83;9;33;37;6;9;10;2;19;8;15;25;4;7;66;35;7;9;48;30;4;10;49;27;17;1;0;0; secA;47;18;24;10;2;2;61;21;24;5;16;17;14;0;5;0;27;5;41;5;38;3;4;10;2;0;11;2;32;11;23;22;4;4;70;22;56;6;19;25;4;4;5;2;24;8;9;20;1;1;31;14;6;6;24;13;2;3;36;16;6;1;0;0;
- pmh bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; carB;108;73;43;89;34;65;38;11;35;70;90;54;78;16;19;5;48;61;56;105;1; dnaE;130;104;47;89;38;70;49;20;37;67;65;93;56;15;27;5;37;75;44;97;1; gyrB;58;46;22;43;25;35;41;13;19;61;56;37;36;6;12;3;18;41;33;50;1; iars;92;84;42;78;41;69;40;21;35;56;60;55;40;14;12;28;35;61;33;69;1; lars;74;83;33;54;35;74;25;13;26;35;62;53;44;10;16;23;36;44;39;77;1; pol1;118;101;51;65;24;63;35;14;30;58;81;64;45;6;12;4;35;47;47;76;1; recB;137;138;81;92;51;140;31;22;36;32;80;77;21;17;4;15;22;36;35;141;1; rpoB;105;57;29;59;37;52;77;22;49;87;90;70;62;6;23;7;64;91;48;62;1; rpoC;121;88;30;111;21;62;74;18;58;99;115;92;85;12;19;8;51;117;92;93;1; secA;103;82;29;52;32;46;57;13;43;53;92;62;52;7;24;8;31;57;42;58;1;
- tli bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; acnA;4;12;10;3;12;13;16;17;13;12;5;7;3;3;15;11;1;10;6;14;5;6;2;12;3;3;7;11;7;10;15;11;21;11;28;18;9;22;11;13;8;23;2;6;17;3;15;10;4;13;9;16;11;10;3;3;8;18;8;34;11;1;0;0; carB;5;29;25;8;16;6;31;30;21;17;12;12;8;9;18;17;12;11;20;13;18;5;2;22;4;3;7;6;12;10;31;25;27;15;33;54;42;12;11;34;18;29;7;8;19;12;8;23;5;18;32;18;30;15;11;7;7;15;17;46;12;0;0;1; dnaE;17;36;33;8;18;10;38;40;21;18;17;11;8;9;14;14;20;20;23;14;21;3;4;25;6;2;15;13;13;24;25;21;9;17;41;56;41;33;20;26;17;28;14;6;25;8;13;14;6;16;17;18;35;18;8;4;7;10;19;42;8;1;0;0; ftsK;16;21;23;15;10;6;27;23;20;15;8;11;9;2;6;11;13;6;11;11;13;0;4;13;5;3;9;6;19;12;18;7;8;9;41;9;23;11;21;20;5;15;2;5;17;3;13;16;4;11;20;16;12;5;12;10;6;10;10;34;14;0;0;1; iars;14;27;20;9;9;6;32;34;22;14;14;5;8;4;18;9;23;12;18;9;22;3;6;19;3;2;13;8;12;12;19;15;10;8;47;41;44;14;21;12;11;12;15;7;18;26;9;18;9;8;23;15;25;5;11;11;4;14;14;27;10;0;0;1; lars;4;29;16;6;5;7;25;39;16;18;6;5;4;6;5;6;11;13;16;24;11;3;2;25;6;2;9;7;8;12;19;12;11;11;32;46;28;18;13;12;8;15;7;9;20;26;4;15;7;17;15;13;32;13;6;7;5;15;10;27;7;1;0;0; pol1;12;32;23;4;14;7;40;27;16;16;10;4;13;5;11;13;16;10;10;14;22;4;1;19;3;1;4;8;14;5;24;13;8;14;41;45;38;8;7;22;10;16;6;2;17;7;7;20;5;6;30;14;16;9;12;10;8;7;16;26;7;0;1;0; rpoB;7;33;31;6;14;14;16;48;17;18;19;6;5;9;11;10;16;17;17;29;23;6;8;35;9;4;5;10;8;28;26;37;21;18;48;72;56;31;15;15;15;25;4;0;26;10;11;24;9;13;29;27;33;20;19;5;8;20;20;44;11;1;0;0; rpoC;7;57;33;11;39;21;51;66;19;24;14;11;17;9;19;23;21;18;18;33;29;10;7;48;15;7;16;11;21;39;38;44;25;19;63;93;64;36;26;31;26;31;8;6;30;10;13;29;10;12;46;25;45;37;13;11;22;19;21;75;19;0;1;0; secA;8;25;26;11;13;8;27;37;11;17;8;8;9;6;7;5;19;9;15;17;22;9;4;25;5;4;15;9;12;19;20;18;15;15;51;52;32;17;8;26;7;17;5;2;21;3;4;7;4;10;19;13;14;17;8;6;6;10;7;41;10;0;1;0;
- tli bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; acnA;54;33;25;44;11;20;31;18;17;58;46;31;55;8;17;3;42;46;32;53;1; carB;89;61;38;76;23;33;54;13;22;98;87;54;92;15;19;12;54;95;40;75;1; dnaE;122;78;39;73;40;37;61;28;37;72;97;74;91;20;25;8;49;88;29;69;1; ftsK;91;50;35;47;19;22;38;15;31;42;50;34;61;7;17;3;44;53;38;58;1; iars;85;66;36;58;35;27;55;21;24;52;88;58;56;22;18;26;44;68;40;51;1; lars;67;64;34;32;24;40;49;16;20;53;78;46;48;16;20;26;43;73;33;44;1; pol1;92;67;32;56;26;24;50;12;19;59;86;46;55;8;17;7;38;69;37;49;1; rpoB;105;64;35;60;33;46;85;15;36;102;120;87;70;4;26;10;57;109;52;75;1; rpoC;168;117;43;93;39;51;116;27;60;126;156;100;114;14;30;10;64;153;65;115;1; secA;91;64;28;43;28;32;69;24;31;68;103;49;58;7;21;3;25;63;30;58;1;
- tai bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; dnaE;4;16;23;3;56;19;3;54;7;30;2;1;2;10;37;16;5;34;2;24;3;9;3;47;4;18;4;19;2;26;7;16;27;38;4;88;32;48;2;4;28;50;5;14;34;10;2;5;19;28;16;4;52;22;2;0;4;23;3;45;17;0;1;0; rpoB;1;6;10;0;62;29;2;50;4;40;2;1;2;6;30;21;1;28;1;35;2;2;9;28;9;54;1;21;0;38;4;14;35;51;3;109;16;76;0;2;17;53;1;3;26;8;2;4;15;35;7;3;74;32;0;0;5;48;1;26;36;1;0;0; rpoC;1;11;16;7;93;38;1;86;3;39;3;0;1;18;48;25;3;34;1;39;0;1;11;39;11;84;1;23;1;54;7;24;49;57;0;143;16;88;1;6;44;60;3;19;35;11;1;3;24;45;12;2;105;46;1;1;5;51;2;58;40;0;0;1; iars;0;2;16;4;43;26;2;45;3;37;2;2;2;5;35;13;6;23;0;13;1;2;3;21;7;33;9;12;3;32;6;9;22;29;3;64;16;54;1;4;22;34;4;16;21;25;2;1;10;33;8;1;41;23;0;1;5;27;3;17;23;0;1;0; lars;0;4;4;1;34;29;1;46;1;38;1;0;1;4;27;12;0;23;2;23;0;3;2;16;11;21;3;9;2;22;7;9;21;27;1;57;17;39;0;2;16;38;2;20;27;24;0;2;16;32;7;1;36;20;1;0;5;27;1;20;14;1;0;0; ftsK;1;9;9;7;45;28;2;19;1;21;4;1;2;6;26;9;1;8;3;13;3;4;3;27;3;17;4;4;3;15;10;4;19;40;4;47;15;27;5;5;17;33;2;5;19;9;3;6;13;35;6;4;34;13;1;0;9;21;3;20;17;0;1;0; mfd;0;8;12;8;63;30;0;19;2;31;4;1;3;11;44;5;3;17;1;4;1;4;6;37;9;45;3;15;1;34;12;12;23;43;2;75;13;38;2;5;27;49;1;6;26;19;4;6;15;34;9;2;57;24;2;1;3;22;2;16;23;0;0;1; secA;0;4;6;1;53;26;2;44;0;32;1;1;1;9;26;6;1;21;1;22;0;4;5;25;12;36;2;22;2;27;3;9;30;37;1;86;13;43;0;5;21;41;3;8;25;5;0;2;8;17;11;1;38;12;1;1;4;21;1;15;27;0;1;0; carB;0;21;19;5;58;20;0;15;2;33;3;1;0;12;33;15;1;8;1;14;0;0;4;37;6;43;1;10;0;16;8;14;24;89;1;78;9;49;2;3;37;46;8;11;29;14;0;7;23;34;12;0;84;26;1;0;2;25;0;16;19;0;0;1; acnA;0;5;4;1;35;9;2;16;0;24;2;1;2;5;16;7;1;11;1;16;1;3;2;17;10;14;2;16;1;19;7;9;26;27;2;38;9;27;1;4;12;36;3;6;15;1;3;3;10;27;13;3;39;17;2;0;6;23;1;15;16;0;1;0;
- tai bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; dnaE;121;57;37;68;39;26;84;23;28;88;92;80;84;19;34;10;54;94;29;65;1; rpoB;108;52;44;62;29;36;104;22;38;104;112;92;72;4;26;8;56;116;53;63;1; rpoC;166;87;42;95;37;40;146;24;55;137;143;104;111;22;35;11;73;165;58;100;1; iars;91;47;40;59;29;13;67;21;35;66;67;70;61;20;21;25;46;73;33;43;1; lars;72;47;39;45;23;25;53;12;24;64;58;56;56;22;27;24;50;64;33;35;1; ftsK;99;21;22;48;9;16;57;8;18;73;51;42;60;7;19;9;57;57;31;40;1; mfd;121;19;33;68;20;5;102;18;35;90;77;51;83;7;26;19;59;92;28;41;1; secA;90;46;32;44;22;23;82;24;29;79;87;56;67;11;25;5;27;62;27;43;1; carB;123;15;35;64;9;15;90;11;16;135;79;58;88;19;29;14;64;122;28;35;1; acnA;54;18;24;33;12;17;47;18;20;69;40;36;53;9;15;1;43;72;31;32;1;
- tma bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; carB;0;8;19;1;25;40;31;44;6;31;5;9;5;10;21;5;4;31;5;23;33;0;0;20;1;1;3;8;2;20;46;17;13;4;65;48;23;29;28;14;26;28;3;2;27;8;14;9;17;20;25;9;50;21;6;13;16;24;8;40;35;0;0;1; dnaE;2;9;21;7;21;30;46;21;13;27;13;7;4;5;7;9;11;22;5;28;32;4;3;15;2;0;6;11;5;13;19;16;11;3;62;16;24;20;10;3;10;18;1;3;14;4;10;12;7;13;27;6;25;15;2;14;10;9;10;19;30;0;1;0; iars;1;7;17;2;21;28;46;35;9;27;12;5;1;7;16;6;1;40;6;17;31;3;2;12;2;2;7;20;4;14;27;15;4;2;73;26;27;28;12;9;8;11;11;6;18;20;8;7;9;18;18;12;30;16;6;13;13;8;6;26;31;0;0;1; lars;1;6;18;0;13;25;32;40;5;31;8;1;5;4;9;7;6;32;7;22;23;1;1;16;0;1;2;15;1;24;26;17;6;3;49;34;22;21;8;6;8;16;5;4;16;21;10;12;15;11;13;11;26;19;5;11;8;14;10;23;18;0;0;1; metE;0;4;18;1;21;23;31;29;11;32;6;5;4;8;8;5;6;24;10;24;23;1;1;10;4;0;1;9;3;12;12;12;9;2;66;27;13;16;6;12;13;10;2;5;17;13;13;8;8;9;15;6;22;7;6;7;6;10;9;18;21;0;0;1; mfd;2;15;20;5;32;27;39;32;17;26;12;7;4;8;8;7;7;23;7;20;35;5;5;16;7;3;2;11;9;13;25;20;3;6;64;32;35;18;10;5;9;10;3;0;18;2;12;10;12;7;32;8;24;12;5;11;2;12;14;24;24;0;0;1; rpoB;1;9;29;4;28;54;47;33;14;30;19;8;7;9;16;7;15;41;18;36;44;6;3;27;4;1;3;16;5;23;49;26;12;6;89;33;46;34;16;19;17;18;2;1;26;7;11;15;12;22;41;9;32;22;9;14;17;12;17;42;30;0;0;1; rpoC;2;17;30;2;34;62;71;79;11;42;16;5;7;13;22;17;10;49;10;47;61;2;3;24;2;0;3;20;4;39;51;40;17;6;114;52;56;33;23;21;43;23;10;2;37;15;19;17;22;16;41;8;59;35;12;30;26;24;28;56;50;0;0;1; sbcC;1;13;22;2;38;36;61;39;7;26;7;6;7;9;14;11;8;9;11;23;31;5;3;24;1;3;3;6;8;17;17;9;2;10;88;53;24;13;4;8;10;12;1;1;6;3;3;6;2;1;17;4;15;7;3;5;10;7;10;23;27;0;0;1; secA;0;7;16;1;26;30;45;39;6;30;10;2;6;5;10;8;7;26;8;25;36;1;1;13;5;0;7;11;6;19;25;21;6;5;64;26;36;16;5;8;12;23;2;1;26;7;3;7;5;6;21;5;26;16;2;6;11;13;9;25;27;0;0;1;
- tma bactérie acides aminés
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- tme bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; dnaE;36;8;19;17;0;4;102;10;34;11;8;21;12;3;8;3;21;20;32;23;13;2;3;3;0;0;4;6;9;1;17;18;2;1;57;10;25;11;20;7;1;5;7;1;8;3;16;6;4;5;7;24;3;4;7;17;2;4;31;59;8;1;0;0; gyrB;25;9;15;1;1;3;40;20;27;1;13;4;14;1;0;2;16;7;16;6;20;1;1;10;0;0;9;4;9;9;25;17;0;6;49;13;35;2;20;8;3;0;3;0;12;3;6;8;1;0;28;9;7;2;14;11;8;3;21;26;3;1;0;0; iars;23;13;15;14;1;3;75;16;25;7;12;12;7;2;6;2;25;20;24;14;26;0;1;8;1;0;13;12;19;2;26;17;4;5;75;9;47;7;23;10;3;6;12;4;17;21;24;10;1;4;30;33;8;3;9;19;7;7;30;32;7;1;0;0; lars;32;12;18;4;0;1;60;24;29;3;9;9;9;4;0;2;28;13;34;6;17;0;1;13;1;0;9;2;16;4;21;19;3;5;60;14;44;4;19;11;8;3;8;1;20;20;20;18;0;3;30;23;6;1;11;16;7;2;31;32;3;0;1;0; mfd;31;9;26;18;0;3;85;9;29;11;4;25;13;4;4;0;24;9;37;20;29;2;1;11;0;0;7;7;27;0;23;15;7;4;72;8;36;8;24;5;1;6;0;1;15;2;20;10;2;1;24;27;1;1;16;19;1;3;50;47;7;0;1;0; pol1;44;23;20;3;5;1;68;29;43;3;16;10;14;4;2;3;34;10;39;7;21;3;0;9;0;0;10;1;19;5;16;22;0;5;56;33;42;5;18;14;5;2;3;1;18;3;12;8;1;2;33;19;7;1;16;18;3;3;35;35;8;0;0;1; rpoB;33;18;41;5;2;6;65;23;32;10;18;13;13;2;4;3;31;11;35;22;46;1;4;18;0;0;9;13;23;5;33;35;2;14;96;16;48;13;36;10;6;5;3;0;25;7;36;16;3;3;44;33;13;5;14;33;10;9;45;44;9;1;0;0; rpoC;40;25;48;18;3;3;100;52;36;12;20;24;23;8;7;5;38;23;39;18;56;2;3;21;1;0;22;9;34;8;42;49;3;18;121;26;86;17;49;28;9;4;12;0;33;8;37;25;5;4;53;55;25;9;19;51;13;9;54;75;12;1;0;0; secA;31;15;24;4;1;4;64;29;25;7;11;2;10;1;0;3;23;11;27;14;36;2;1;15;0;0;15;2;16;5;18;16;4;10;73;21;44;5;23;13;6;0;3;1;21;5;10;7;4;0;26;19;13;4;11;25;2;3;30;37;1;0;0;1; topA;15;5;12;4;2;5;97;14;22;6;10;16;6;1;3;2;13;14;22;11;15;1;1;6;1;0;5;1;11;3;22;6;1;5;63;8;16;11;21;8;5;4;11;3;10;7;12;5;1;6;18;16;5;1;10;23;1;8;18;39;8;0;0;1;
- tme bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; dnaE;84;112;45;55;41;55;21;10;10;38;67;36;33;8;8;3;31;38;30;98;1; gyrB;54;60;28;34;23;22;32;13;18;48;62;37;31;3;12;3;15;46;36;50;1; iars;69;91;32;41;45;38;36;25;21;52;84;54;42;16;17;21;39;74;42;69;1; lars;67;84;32;33;41;40;32;11;20;48;74;48;41;9;20;20;41;60;36;66;1; mfd;87;94;40;50;33;57;43;14;27;49;80;44;36;1;15;2;33;53;39;104;1; pol1;96;97;46;49;44;46;33;11;24;43;89;47;39;4;18;3;23;60;40;78;1; rpoB;105;88;42;53;42;57;69;22;28;84;112;61;57;3;25;7;58;95;66;98;1; rpoC;137;152;48;87;61;57;83;31;42;112;147;103;90;12;33;8;71;142;92;141;1; secA;79;93;32;27;34;41;54;17;21;48;94;49;42;4;21;5;21;62;41;68;1; topA;43;111;28;38;27;33;24;6;14;34;71;27;38;14;10;7;24;40;42;65;1;
- tsc bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; dnaE;2;24;50;4;81;55;9;63;25;40;2;1;1;6;34;19;7;51;0;23;0;3;5;29;52;58;12;24;4;32;15;10;55;67;26;141;9;68;3;10;33;117;0;5;32;15;5;10;13;61;9;3;86;19;0;1;12;45;4;6;50;0;1;0; rpoB;1;12;19;1;53;33;2;48;9;35;0;0;0;0;30;11;4;26;0;25;0;1;5;10;45;42;1;16;2;33;2;9;52;40;6;95;15;57;1;3;15;62;0;2;23;2;1;4;17;47;7;1;74;15;1;0;3;43;2;1;55;1;0;0; rpoC;2;17;19;0;60;66;2;97;7;35;1;0;2;4;34;20;3;43;0;27;0;0;5;11;67;39;2;22;2;55;8;5;55;50;24;134;17;59;2;5;34;82;0;11;26;10;0;5;17;58;7;0;112;32;1;1;6;59;3;0;65;1;0;0; iars;1;7;21;5;47;46;12;41;10;29;0;0;0;6;19;20;6;42;2;24;2;1;5;15;27;35;3;19;3;21;2;1;36;25;31;86;5;36;0;6;9;63;1;9;10;26;2;3;5;58;3;4;55;13;0;0;9;36;5;0;35;0;1;0; lars;1;8;15;0;31;26;4;50;12;25;1;0;0;3;4;9;4;31;0;18;1;0;1;15;27;21;3;16;2;20;5;5;29;25;16;79;4;36;1;2;12;55;0;8;23;26;0;1;9;54;3;1;47;17;0;0;8;34;2;4;29;0;1;0; secA;2;8;22;4;41;28;3;64;10;23;0;1;0;0;14;9;3;27;2;21;0;2;1;6;42;37;2;18;2;40;5;5;37;21;14;102;5;45;2;4;24;57;0;1;26;6;2;4;10;33;0;0;55;13;1;0;9;32;8;2;43;0;0;1; carB;2;11;19;5;50;36;8;45;7;17;0;1;0;3;24;11;4;34;0;16;3;1;3;11;23;28;5;12;6;22;4;8;35;42;27;80;6;41;4;5;15;74;0;2;21;10;0;6;10;51;4;4;54;21;1;0;6;43;2;5;47;0;0;1; ftsK;2;7;28;8;46;53;10;30;7;26;2;1;1;2;25;16;0;15;1;11;0;2;1;12;30;22;2;13;9;23;6;4;30;29;26;46;5;21;4;3;15;66;0;0;13;4;5;14;10;53;1;3;35;13;0;1;4;22;3;0;26;0;0;1; mfd;1;18;39;4;51;43;8;33;19;18;2;0;1;2;17;10;8;25;1;6;4;2;6;21;27;43;5;15;3;19;8;2;38;34;16;88;12;30;1;11;14;57;0;0;8;8;4;14;12;41;9;1;46;11;0;1;3;29;5;0;26;0;1;0; sbcC;4;25;41;9;56;37;9;35;9;10;5;0;1;1;14;9;2;11;0;8;2;2;2;41;31;52;1;8;4;29;5;7;15;47;35;129;6;17;3;14;27;70;0;2;7;9;0;3;7;25;4;1;45;8;0;1;2;21;1;1;6;0;1;0;
- tsc bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; dnaE;216;72;65;63;58;23;147;36;36;147;167;77;163;5;32;15;89;117;58;60;1; rpoB;119;50;44;41;30;25;103;17;35;103;101;72;81;2;23;2;69;97;47;58;1; rpoC;164;99;42;61;46;27;122;24;57;118;158;76;123;11;26;10;80;151;67;68;1; iars;127;53;39;45;48;26;85;22;24;64;117;41;78;10;10;26;68;75;45;40;1; lars;81;54;37;17;35;18;65;19;22;64;95;40;70;8;23;26;64;68;42;35;1; secA;105;67;33;24;30;23;88;20;42;68;116;50;87;1;26;6;49;68;42;53;1; carB;123;53;24;39;38;16;69;17;28;89;107;47;98;2;21;10;67;83;50;54;1; ftsK;144;40;33;47;15;12;67;15;32;69;72;26;88;0;13;4;82;52;27;29;1; mfd;156;41;37;32;33;7;103;20;22;82;104;42;83;0;8;8;71;67;33;31;1; sbcC;172;44;19;30;13;8;130;9;33;74;164;23;114;2;7;9;35;58;24;8;1;
Tableaux pour comparaisons des protéines
[modifier | modifier le wikicode]Cyanobactéries − autres bactéries
[modifier | modifier le wikicode]- codons des protéines de 7 cyanobactéries "can, cgc, cya, mar, pmm, syn, tel" et de 7 autre-bactéries "bmv, cft, eco, mhd, sti, tos, zin". >4GC et >4AT en "pour 10 000" bases des gènes; les codons en "pour 10 000" acides aminés sur un total de 10 à 12 protéines.
Bactérie tos mhd sti bmv eco cft zin Bact. tos mhd sti bmv eco cft zin %GC b 68.6 68.1 68.1 68.1 50.8 33.2 13.5 %GC b 68.6 68.1 68.1 68.1 50.8 33.2 13.5 >4GC 100.0 35.9 6.6 2.1 2.6 0.3 1.5 >4GC 100.0 35.9 6.6 2.1 2.6 0.3 1.5 >4AT 7.5 5.1 2.3 1.9 20.6 103.0 309.8 >4AT 7.5 5.1 2.3 1.9 20.6 103.0 309.8 ttt 76 47 46 24 163 377 740 tct 3 1 17 3 89 90 255 ttc 263 311 273 320 161 51 14 tca 2 1 13 6 46 105 171 tta 10 11 9 1 94 307 954 tcc 187 119 86 44 105 17 5 ttg 66 120 78 45 129 117 25 tcg 32 115 155 277 86 26 5 ctt 157 53 36 26 109 356 14 cct 28 32 33 10 63 125 106 cta 48 28 27 6 41 108 10 cca 3 9 30 6 97 95 95 ctc 532 516 367 476 114 30 0 ccc 489 306 140 117 44 10 7 ctg 463 411 545 451 643 39 0 ccg 92 232 359 379 281 77 2 att 23 20 65 32 195 248 683 act 4 10 22 3 85 203 166 ata 8 0 5 4 15 491 992 aca 3 5 18 7 48 123 134 atc 346 393 470 416 284 129 6 acc 307 275 283 119 229 49 1 atg 174 183 212 206 230 225 142 acg 79 147 219 311 120 56 3 gtt 21 38 50 26 185 295 118 gct 9 53 71 12 129 310 80 gta 7 24 20 10 121 224 93 gca 2 22 82 52 178 202 66 gtc 204 236 363 311 126 62 0 gcc 723 461 426 328 226 79 5 gtg 509 443 365 360 205 50 3 gcg 241 522 397 952 398 56 3 −−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−− Cyanobactéries cgc cya tel syn mar can pmm Cyano. cgc cya tel syn mar can pmm %GC b 68.7 60.2 53.9 47.7 42.3 35.0 30.8 %GC b 68.7 60.2 53.9 47.7 42.3 35.0 30.8 >4GC 42.3 31.2 36.5 27.5 18.1 9.1 2.5 >4GC 42.3 31.2 36.5 27.5 18.1 9.1 2.5 >4AT 0.3 17.2 25.2 47.6 52.3 76.1 86.7 >4AT 0.3 17.2 25.2 47.6 52.3 76.1 86.7 ttt 10 180 205 219 225 259 307 tct 3 47 32 74 93 212 224 ttc 268 135 97 115 117 78 57 tca 10 5 41 19 32 84 219 tta 0 13 53 264 421 640 515 tcc 151 159 122 186 151 65 52 ttg 19 241 187 285 117 112 141 tcg 83 90 67 38 87 28 28 ctt 19 48 114 63 71 92 211 cct 16 74 56 82 93 225 165 cta 3 50 91 106 115 60 98 cca 7 46 58 62 58 55 151 ctc 283 209 269 122 138 68 36 ccc 322 249 304 241 214 106 28 ctg 779 542 359 184 148 29 13 ccg 237 188 94 85 92 30 18 att 16 143 417 436 366 471 483 act 6 53 73 108 151 230 224 ata 0 4 6 14 47 82 285 aca 6 22 54 54 47 135 167 atc 421 393 165 183 273 164 88 acc 390 311 290 299 253 144 51 atg 187 180 198 204 200 192 169 acg 92 101 123 94 81 42 24 gtt 14 80 118 153 195 248 316 gct 32 127 132 172 211 225 217 gta 3 41 49 100 112 205 187 gca 25 45 126 86 118 176 181 gtc 192 154 181 101 173 77 51 gcc 901 561 471 339 269 133 43 gtg 530 442 358 339 190 117 37 gcg 251 172 162 145 124 104 41 −−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−− −−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−− Bact. tos mhd sti bmv eco cft zin Bact. tos mhd sti bmv eco cft zin %GC b 68.6 68.1 68.1 68.1 50.8 33.2 13.5 %GC b 68.6 68.1 68.1 68.1 50.8 33.2 13.5 >4GC 100.0 35.9 6.6 2.1 2.6 0.3 1.5 >4GC 100.0 35.9 6.6 2.1 2.6 0.3 1.5 >4AT 7.5 5.1 2.3 1.9 20.6 103.0 309.8 >4AT 7.5 5.1 2.3 1.9 20.6 103.0 309.8 tat 8 11 30 50 134 296 565 tgt 0 1 7 6 34 41 98 tac 298 309 235 196 119 68 22 tgc 39 52 37 75 40 50 5 taa 3 4 2 5 8 3 9 tga 4 6 4 6 1 4 100 tag 3 1 4 1 1 3 1 tgg 108 121 84 120 116 63 5 cat 8 13 37 48 92 119 98 cgt 11 56 62 91 369 88 7 cac 169 207 164 175 107 41 1 cga 6 17 28 20 34 13 0 caa 22 52 33 35 202 196 134 cgc 353 497 454 580 272 36 0 cag 274 279 378 302 437 62 5 cgg 372 290 284 156 60 4 0 aat 4 5 37 21 86 423 1228 agt 0 5 14 5 64 227 105 aac 154 185 218 207 215 116 24 agc 97 123 146 92 152 181 5 aaa 43 58 32 23 288 746 1698 aga 6 0 4 1 5 245 191 aag 479 372 249 353 92 153 32 agg 116 11 15 8 9 40 1 gat 27 81 129 159 336 561 206 ggt 12 49 120 45 273 207 192 gac 429 404 435 477 260 117 5 gga 11 31 42 10 42 224 138 gaa 105 149 132 243 579 460 318 ggc 331 357 407 645 220 132 6 gag 979 775 727 456 237 322 3 ggg 426 348 183 63 86 36 9 −−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−− Cyano. cgc cya tel syn mar can pmm Cyano. cgc cya tel syn mar can pmm %GC b 68.7 60.2 53.9 47.7 42.3 35.0 30.8 %GC b 68.7 60.2 53.9 47.7 42.3 35.0 30.8 >4GC 42.3 31.2 36.5 27.5 18.1 9.1 2.5 >4GC 42.3 31.2 36.5 27.5 18.1 9.1 2.5 >4AT 0.3 17.2 25.2 47.6 52.3 76.1 86.7 >4AT 0.3 17.2 25.2 47.6 52.3 76.1 86.7 tat 32 77 154 180 225 281 268 tgt 7 19 41 46 65 63 77 tac 202 225 167 142 103 70 54 tgc 76 57 39 34 16 15 29 taa 0 1 7 3 9 8 7 tga 11 3 1 0 0 1 1 tag 0 6 3 8 2 3 2 tgg 137 137 125 121 116 117 107 cat 33 32 91 106 86 125 146 cgt 37 28 73 98 145 172 28 cac 169 165 117 79 82 42 18 cga 14 33 44 55 65 45 28 caa 8 197 359 344 342 408 279 cgc 405 374 349 161 167 64 2 cag 419 431 299 236 186 124 63 cgg 301 241 182 193 99 19 6 aat 18 34 131 174 255 362 584 agt 13 20 94 110 113 148 147 aac 200 220 139 162 139 116 85 agc 188 154 106 69 74 51 31 aaa 16 136 225 413 477 556 672 aga 2 12 4 25 68 149 316 aag 288 265 194 137 91 109 158 agg 17 18 12 32 25 43 85 gat 156 238 349 364 414 451 544 ggt 62 44 181 211 232 255 236 gac 415 261 192 217 130 111 73 gga 29 77 68 85 175 176 246 gaa 129 258 410 649 665 663 598 ggc 555 366 258 212 139 78 62 gag 632 563 357 193 194 192 174 ggg 164 217 172 179 127 105 54
Autre-bactéries
[modifier | modifier le wikicode]- codons des autre-bactéries à 68% GC: tos, mhd, sti, bmv (eco à 51% GC). >4GC et >4AT en "pour 10 000" bases des gènes; les codons en "pour 10 000" acides aminés sur un total de 10 à 14 protéines.
Bactérie tos mhd sti bmv eco Bactérie tos mhd sti bmv eco Bactérie tos mhd sti bmv eco Bacterie tos mhd sti bmv eco
>4GC 100.0 35.9 6.6 2.1 2.6 >4GC 100.0 35.9 6.6 2.1 2.6 >4GC 100.0 35.9 6.6 2.1 2.6 >4GC 100.0 35.9 6.6 2.1 2.6
>4AT 7.5 5.1 2.3 1.9 20.6 >4AT 7.5 5.1 2.3 1.9 20.6 >4AT 7.5 5.1 2.3 1.9 20.6 >4AT 7.5 5.1 2.3 1.9 20.6
ttt 76 47 46 24 163 tct 3 1 17 3 89 tat 8 11 30 50 134 tgt 0 1 7 6 34
ttc 263 311 273 320 161 tca 2 1 13 6 46 tac 298 309 235 196 119 tgc 39 52 37 75 40
tta 10 11 9 1 94 tcc 187 119 86 44 105 taa 3 4 2 5 8 tga 4 6 4 6 1
ttg 66 120 78 45 129 tcg 32 115 155 277 86 tag 3 1 4 1 1 tgg 108 121 84 120 116
ctt 157 53 36 26 109 cct 28 32 33 10 63 cat 8 13 37 48 92 cgt 11 56 62 91 369
cta 48 28 27 6 41 cca 3 9 30 6 97 cac 169 207 164 175 107 cga 6 17 28 20 34
ctc 532 516 367 476 114 ccc 489 306 140 117 44 caa 22 52 33 35 202 cgc 353 497 454 580 272
ctg 463 411 545 451 643 ccg 92 232 359 379 281 cag 274 279 378 302 437 cgg 372 290 284 156 60
att 23 20 65 32 195 act 4 10 22 3 85 aat 4 5 37 21 86 agt 0 5 14 5 64
ata 8 0 5 4 15 aca 3 5 18 7 48 aac 154 185 218 207 215 agc 97 123 146 92 152
atc 346 393 470 416 284 acc 307 275 283 119 229 aaa 43 58 32 23 288 aga 6 0 4 1 5
atg 174 183 212 206 230 acg 79 147 219 311 120 aag 479 372 249 353 92 agg 116 11 15 8 9
gtt 21 38 50 26 185 gct 9 53 71 12 129 gat 27 81 129 159 336 ggt 12 49 120 45 273
gta 7 24 20 10 121 gca 2 22 82 52 178 gac 429 404 435 477 260 gga 11 31 42 10 42
gtc 204 236 363 311 126 gcc 723 461 426 328 226 gaa 105 149 132 243 579 ggc 331 357 407 645 220
gtg 509 443 365 360 205 gcg 241 522 397 952 398 gag 979 775 727 456 237 ggg 426 348 183 63 86
Compléments
[modifier | modifier le wikicode]Comparaisons des protéines
[modifier | modifier le wikicode]Les autre-bactéries utilisées pour ce complément sont: pmh, tme, hmr, nse, aae, hth, tma, tli, amo, lfc, eco, dal, msv, mrb, tai, tsc
Les répétitions des bactéries autres pour les compléments
[modifier | modifier le wikicode]- Les répétitions
- Voir répétitions des génomes des autre-bactéries déjà compilées: tme, tma, aae, amo, eco, msv, mrb, tai, tsc. Extrait des autre-bactéries
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl amo; 2160700; 47.968065904568; 4344; 4682; 1272; 1205; 102227; 104668; 102592; 102289; 8025; 8552; 4617; 4498; 0 tma; 1860725; 46.2477260207715; 4488; 4659; 538; 709; 89126; 90023; 74178; 78612; 8868; 8979; 2144; 2517; 0 tme; 1915238; 31.3998573545429; 13238; 12800; 490; 431; 123522; 121538; 50996; 49107; 17789; 17210; 1638; 1550; 0 tsc; 2346803; 64.8850372187184; 1108; 1259; 8488; 8168; 66287; 66784; 190405; 188915; 4331; 4283; 16711; 16545; 0 eco; 4641652; 50.7907098593346; 8441; 8289; 1278; 1239; 205758; 205373; 216669; 215471; 15523; 15380; 6067; 6027; 0 mrb; 3097457; 63.3843827371938; 2995; 2990; 7404; 7492; 82263; 81704; 212870; 215243; 5833; 5674; 14923; 14926; 0 msv; 3249394; 62.3636284180989; 2434; 2476; 6989; 7214; 94468; 93721; 211059; 213652; 5346; 5167; 16759; 17228; 0 tai; 1848474; 63.7925661924377; 375; 339; 8098; 7114; 48029; 46765; 142542; 137838; 1116; 1095; 12183; 11501; 0 aae; 1551335; 43.4761673010665; 4828; 4872; 591; 641; 85156; 86380; 64379; 65865; 9170; 9276; 2805; 2659; 0
- Voir répétitions des protéines des 15 autre-bactéries du complément: pmh, tme, hmr, nse, aae, hth, tma, tli, amo, lfc, dal, msv, mrb, tai, tsc.
- les codons
- Voir les codons des protéines des 15 autre-bactéries du complément: pmh, tme, hmr, nse, aae, hth, tma, tli, amo, lfc, dal, msv, mrb, tai, tsc.
- Tableaux numérique des répétitions des autre-bactéries nouvelles: pmh, hmr, nse, tli, hth, lfc, dal
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl dal; 6517073; 54.4848567801159; 17587; 17686; 5674; 5421; 254602; 254345; 412164; 407704; 26656; 26671; 18214; 17436; 31 hmr; 1694430; 37.4742538788855; 7900; 7853; 437; 467; 94543; 95109; 56139; 56577; 11775; 11770; 1953; 1865; 0 hth; 1743135; 44.0002638923549; 5049; 4910; 755; 757; 82142; 80624; 76333; 75300; 9204; 9097; 2386; 2477; 0 lfc; 2559538; 50.0475476433638; 7191; 7295; 2290; 2162; 109904; 110996; 135762; 134514; 10887; 11031; 6806; 6747; 0 nse; 859006; 41.0843463258697; 2891; 2722; 187; 182; 46113; 46003; 28403; 27971; 4597; 4377; 808; 862; 0 pmh; 1738790; 31.1450491433698; 10643; 10443; 273; 266; 120591; 119911; 42641; 42436; 13543; 12907; 1153; 1083; 0 tli; 1967774; 47.0576397492801; 4485; 4562; 1240; 1499; 93405; 94061; 93059; 98130; 9109; 8749; 4439; 4876; 0
- Tableaux des répétitions >4GC et >4AT des génomes des autre-bactéries nouvelles: pmh, hmr, nse, tli, hth, lfc, dal
Aléas équation KEGG effectif %GC >4GC >4AT >4ATa >4GCa dal 6517073 54.48 17.02 54.12 9.3 21.8 hmr 1694430 37.47 5.34 92.97 41.3 3.9 hth 1743135 44.00 8.67 57.13 24.9 8.0 lfc 2559538 50.05 17.39 56.60 14.5 14.6 nse 859006 41.08 4.30 65.34 31.5 5.8 pmh 1738790 31.15 3.10 121.27 63.6 1.8 tli 1967774 47.06 13.92 45.98 19.1 10.9
- Tableaux des répétitions >4GC et >4AT des génomes des autre-bactéries déjà compilées: tme, tma, aae, amo, eco, msv, mrb, tai, tsc. Extrait des Tableaux des diagrammes
Aléas équation KEGG effectif %GC >4GC >4AT >4ATa >4GCa eco 4,641,652 50.79 5.42 36.04 13.5 15.6 amo 2,160,700 47.97 11.46 41.77 17.6 11.9 aae 1,551,335 43.48 7.94 62.53 26.0 7.5 tai 1,848,474 63.79 82.29 3.86 3.2 45.2 tsc 2,346,803 64.89 70.97 10.09 2.8 48.8 msv 3,249,394 62.36 43.71 15.11 3.9 40.7 mrb 3,097,457 63.38 48.09 19.32 3.4 43.9 tme 1,915,238 31.40 4.81 135.95 62.6 1.8 tma 1,860,725 46.25 6.70 49.16 20.5 10.1
- Tableaux des répétitions >4GC et >4AT des protéines
Aléas équation %GC b KEGG ADN %GC p >4AT >4GC >4ATa >4GCa #GC % 31.15 pmh 31,017 32.65 89.3 1.9 57.7 2.1 -10 31.40 tme 28,056 32.74 116.2 0.7 57.4 2.2 -67 37.47 hmr 30,099 39.61 62.1 2.7 35.3 4.9 -46 41.08 nse 30,408 41.45 61.2 5.3 30.6 6.0 -13 43.48 aae 29,648 46.05 42.5 5.4 20.9 9.9 -45 44.00 hth 29,334 44.60 43.6 8.2 23.6 8.5 -3 46.25 tma 29,991 47.08 48.0 4.0 19.1 10.9 -63 47.06 tli 29,844 46.99 30.8 6.7 19.2 10.8 -38 47.97 amo 31,140 50.78 27.6 10.9 13.5 15.6 -30 50.05 lfc 31,632 46.72 57.9 7.6 19.7 10.5 -28 50.79 eco 38,310 54.54 20.6 2.6 9.3 21.9 -88 54.48 dal 33,645 56.65 47.3 11.0 7.4 26.1 -58 62.36 msv 32,220 62.88 13.3 34.1 3.6 42.3 -19 63.38 mrb 32,235 64.61 17.7 45.0 2.9 47.8 -6 63.79 tai 30,186 64.35 0.7 79.2 3.0 47.0 69 64.89 tsc 33,261 65.56 9.0 67.6 2.6 51.1 32
Tableau des rapports
[modifier | modifier le wikicode]Bactérie pmh tme hmr nse aae hth tma tli amo lfc eco dal msv mrb tai tsc #GC % 76 164 38 -26 5 9 -33 28 -4 19 -65 -22 7 10 82 46 %GC b 31 31 37 41 43 44 46 47 48 50 51 54 62 63 64 65 >4GC 1.9 0.7 2.7 5.3 5.4 8.2 4.0 6.7 10.9 7.6 2.6 11.0 34.1 45.0 79.2 67.6 >4AT 89.3 116.2 62.1 61.2 42.5 43.6 48.0 30.8 27.6 57.9 20.6 47.3 13.3 17.7 0.7 9.0 Pro 365 381 384 366 410 404 439 463 447 509 486 433 532 543 526 608 c/g 1.2 1.3 1.0 0.6 4.0 2.7 1.1 2.0 2.1 1.0 0.2 2.5 1.9 2.2 2.1 4.4 Gly 598 595 647 627 633 654 621 735 731 736 621 724 767 754 900 793 g/c 0.8 2.8 0.3 0.9 0.8 0.5 0.6 0.9 0.4 1.1 0.4 0.2 0.8 0.4 1.6 1.0 Thr 454 497 442 478 431 437 433 398 392 502 481 495 434 454 349 393 c/g 2.4 0.9 1.4 0.9 1.0 3.1 1.1 1.7 0.9 1.6 1.9 2.1 7.6 8.7 6.0 5.9 Ala 502 481 619 640 564 551 553 704 726 645 931 836 954 939 731 889 c/g 1.1 0.7 3.3 0.8 0.8 1.7 1.1 1.7 3.2 2.4 0.6 3.0 3.4 4.8 1.8 3.6 Ser 547 537 563 561 525 596 571 667 627 635 702 582 691 727 671 735 tcc/gc* 0.5 0.6 0.4 0.3 1.7 0.7 0.6 0.7 0.8 0.6 0.1 1.0 1.0 1.0 1.1 2.0 Arg 452 457 509 525 586 584 616 612 667 613 751 529 774 741 828 884 gg*/cgc 26.0 28.5 10.0 3.8 26.7 20.2 6.7 4.6 2.6 2.6 0.3 1.0 0.6 0.5 8.0 1.5 0.8-1.2~1 3 1 1 3 3 0 3 1 2 2 0 2 2 1 1 1
Tableau des effectifs
[modifier | modifier le wikicode]pmh tme hmr nse aae hth tma tli amo lfc eco dal msv mrb tai tsc #GC % 76 164 38 -26 5 9 -33 28 -4 19 -65 -22 7 10 82 46 %GC b 31 31 37 41 43 44 46 47 48 50 51 54 62 63 64 65 >4GC 1.9 0.7 2.7 5.3 5.4 8.2 4.0 6.7 10.9 7.6 2.6 11.0 34.1 45.0 79.2 67.6 >4AT 89.3 116.2 62.1 61.2 42.5 43.6 48.0 30.8 27.6 57.9 20.6 47.3 13.3 17.7 0.7 9.0 ccc 32 30 68 42 221 123 123 125 192 128 44 249 284 339 318 434 acc 59 55 91 75 136 142 133 139 133 150 229 303 349 399 287 329 gcc 49 37 143 89 112 153 169 212 351 212 226 523 596 697 438 635 tcc 39 36 71 92 131 99 131 125 130 209 105 261 124 121 320 194 ccx 333 351 316 324 189 282 315 338 256 381 442 184 248 204 208 174 ggg 53 78 57 93 59 80 47 138 123 149 86 84 261 204 436 343 cgg 2 0 6 32 2 6 11 31 28 101 60 131 224 194 363 340 agg 99 122 224 148 322 262 177 245 289 93 9 85 24 29 292 154 tgg 103 85 73 70 85 96 100 109 115 84 116 80 117 113 125 105 ggx 545 517 590 534 574 574 574 597 608 587 534 640 506 550 465 450 cc/ccc 15.0 16.0 9.1 13.7 2.6 5.5 6.1 6.5 4.5 7.4 22.8 5.1 4.6 4.2 3.9 3.1 gg/ggg 14.1 9.3 15.7 8.4 16.7 11.8 18.3 7.1 8.4 5.8 8.4 11.2 3.3 4.3 2.9 3.1
Les tRNAs par codons
[modifier | modifier le wikicode]- Sont reportés ici les aas à un seul tRNA pour ceux qui sont codés par 4 ou 6 codons, soit 8 aas: colonne tRNA/8. La colonne tRNA affiche le nombre total de tRNA par bactérie. Cette liste ne concerne que les 192 autre-bactéries. Un seul cas, zin (14%GC), où Leu à 6 codons n'a qu'un seul tRNA. Et un seul cas pour la Gly, mcac (24%GC). D'après gtRNAdb [1].
KEGG %GC tRNA tRNA/8 KEGG %GC tRNA tRNA/8 KEGG %GC tRNA tRNA/8 KEGG %GC tRNA tRNA/8 zin 13.54 25 LAPTV gva 42.02 37 0 eno 55.07 83 0 rpa 65.04 49 0 cru 13.98 28 APTV cbd 42.44 42 0 spe 55.07 84 0 rru 65.45 55 0 crp 16.56 28 APTV plu 42.83 85 0 cnt 55.10 82 0 dpt 66.16 46 0 wbr 22.48 34 P bae 43.22 75 P ecla 55.18 83 0 gdi 66.43 55 0 mcac 23.66 30 APTVG sect 43.29 40 0 eha 55.56 60 0 pae 66.56 63 0 sms 24.00 28 APTV aae 43.48 44 0 ror 55.88 79 A dge 66.64 49 0 uur 25.50 30 APTV bsu 43.51 54 P koy 55.92 87 0 roa 67.37 52 0 ple 26.17 33 AP men 43.52 41 0 pes 56.06 55 0 sur 67.46 50 0 buc 26.31 32 P ral 44.21 75 AV ebt 56.51 89 0 rha 67.52 53 0 fnc 27.12 47 APTV clo 44.21 45 0 say 56.76 53 0 mhd 68.08 50 0 asf 28.26 39 APTV lpl 44.47 73 V sap 56.76 54 0 sti 68.10 50 0 cbl 28.31 81 APV xbo 44.97 82 0 esa 56.77 82 0 tra 68.14 45 0 rip 28.48 33 AP ppm 45.24 163 0 bmf1 57.16 55 0 bmv 68.15 56 0 rty 28.92 33 P pfq 45.38 72 0 bmf2 57.34 − − tos 68.55 52 0 rpr 29.00 33 P ppoy 45.51 109 0 eic 57.44 94 0 req 68.82 52 0 rpw 29.01 33 P tma 46.25 46 0 kpn 57.48 86 0 mxa 68.89 66 0 cdf 29.06 88 APTV sbn 46.28 105 0 pdo 58.31 45 0 tts 68.92 47 0 bpn 29.56 40 0 ypg 47.60 69 0 aba 58.38 46 0 vin 68.94 49 0 cad 29.93 81 APV ype 47.64 70 0 pst 58.40 64 0 ttl 69.09 48 0 cjr 30.31 44 P amo 47.97 48 0 dba 58.65 64 0 tth 69.44 48 0 cje 30.55 43 P pgi 48.29 53 V pge 59.11 86 0 age 69.45 81 0 cac 30.93 73 AV rho 48.50 58 0 pgd 59.62 60 0 ccx 69.90 59 0 tme 31.40 50 0 cpb 48.93 46 0 pac 60.01 45 0 opr 70.02 46 0 sep 32.10 59 APV hav 48.99 92 0 pak 60.10 45 0 fra 70.08 45 0 sepp 32.12 59 APV eal 49.70 85 0 blo 60.12 57 0 mts 70.28 46 0 ser 32.15 59 APV ecs 50.54 105 0 bla 60.49 52 0 sma 70.72 71 0 rri 32.47 34 P eco 50.79 87 0 ret 61.27 50 0 sbh 70.75 65 0 cft 33.21 43 P sfo 50.88 77 0 sus 61.90 51 0 ams 70.82 59 0 cfv 33.26 43 P sfl 50.89 98 0 asd 62.24 45 0 nfa 70.83 54 0 cff 33.31 41 P eca 50.97 76 0 saci 62.27 68 0 amd 71.29 52 0 cle 34.32 105 0 sbo 51.21 91 0 rer 62.31 54 0 scl 71.38 63 0 ljf 34.49 55 AV sbz 51.34 86 0 lhk 62.35 78 0 scb 71.45 74 0 lla 35.33 63 APV sty 52.09 79 0 msv 62.36 47 0 ssx 71.75 65 0 cpy 35.35 61 A spq 52.11 85 0 ipa 62.44 47 0 sho 72.04 73 0 lat 36.32 44 P raq 52.12 76 P smx 62.65 57 0 sco 72.12 65 0 amt 36.82 105 0 stm 52.22 85 0 smk 62.67 57 0 sall 72.13 72 0 liv 37.13 67 AP kin 52.75 83 0 dvl 63.01 68 0 sgr 72.23 67 0 tde 37.87 44 0 tpas 52.79 45 0 mrb 63.38 47 0 salu 72.32 71 0 spi 38.32 63 APV ent 52.98 84 0 ddr 63.39 48 0 gba 72.56 48 0 pmr 38.90 83 0 apt 53.04 57 0 tro 63.65 49 0 cmi 72.66 45 0 cth 38.99 56 0 pam 53.69 72 0 tai 63.79 50 0 sct 72.94 64 0 chp 39.06 38 0 eta 53.73 81 0 dpd 63.97 48 0 phm 73.29 46 0 spl 39.09 143 0 ksa 53.74 82 0 gau 64.27 48 0 salb 73.32 66 0 tsu 39.16 48 0 cgl 53.81 60 0 ppk 64.72 65 0 afw 73.53 49 0 cmn 40.34 37 0 cko 53.83 82 0 xac 64.77 54 0 ksk 74.20 78 0 psi 41.27 76 0 ebf 54.02 86 0 cvi 64.83 98 0 acp 74.72 49 0 cta 41.30 37 0 cgq 54.15 58 0 tsc 64.89 48 0 ank 74.84 49 0 ctr 41.31 37 0 dda 55.02 74 0 xcb 64.96 55 0 ade 74.91 49 0
- Tableau non formaté
KEGG;%GC;tRNA;tRNA/8;;KEGG;%GC;tRNA;tRNA/8;;KEGG;%GC;tRNA;tRNA/8;;KEGG;%GC;tRNA;tRNA/8 zin;13.54;25;LAPTV;;gva;42.02;37;0;;eno;55.07;83;0;;rpa;65.04;49;0 cru;13.98;28;APTV;;cbd;42.44;42;0;;spe;55.07;84;0;;rru;65.45;55;0 crp;16.56;28;APTV;;plu;42.83;85;0;;cnt;55.10;82;0;;dpt;66.16;46;0 wbr;22.48;34;P;;bae;43.22;75;P;;ecla;55.18;83;0;;gdi;66.43;55;0 mcac;23.66;30;APTVG;;sect;43.29;40;0;;eha;55.56;60;0;;pae;66.56;63;0 sms;24.00;28;APTV;;aae;43.48;44;0;;ror;55.88;79;A;;dge;66.64;49;0 uur;25.50;30;APTV;;bsu;43.51;54;P;;koy;55.92;87;0;;roa;67.37;52;0 ple;26.17;33;AP;;men;43.52;41;0;;pes;56.06;55;0;;sur;67.46;50;0 buc;26.31;32;P;;ral;44.21;75;AV;;ebt;56.51;89;0;;rha;67.52;53;0 fnc;27.12;47;APTV;;clo;44.21;45;0;;say;56.76;53;0;;mhd;68.08;50;0 asf;28.26;39;APTV;;lpl;44.47;73;V;;sap;56.76;54;0;;sti;68.10;50;0 cbl;28.31;81;APV;;xbo;44.97;82;0;;esa;56.77;82;0;;tra;68.14;45;0 rip;28.48;33;AP;;ppm;45.24;163;0;;bmf1;57.16;55;0;;bmv;68.15;56;0 rty;28.92;33;P;;pfq;45.38;72;0;;bmf2;57.34;−;−;;tos;68.55;52;0 rpr;29.00;33;P;;ppoy;45.51;109;0;;eic;57.44;94;0;;req;68.82;52;0 rpw;29.01;33;P;;tma;46.25;46;0;;kpn;57.48;86;0;;mxa;68.89;66;0 cdf;29.06;88;APTV;;sbn;46.28;105;0;;pdo;58.31;45;0;;tts;68.92;47;0 bpn;29.56;40;0;;ypg;47.60;69;0;;aba;58.38;46;0;;vin;68.94;49;0 cad;29.93;81;APV;;ype;47.64;70;0;;pst;58.40;64;0;;ttl;69.09;48;0 cjr;30.31;44;P;;amo;47.97;48;0;;dba;58.65;64;0;;tth;69.44;48;0 cje;30.55;43;P;;pgi;48.29;53;V;;pge;59.11;86;0;;age;69.45;81;0 cac;30.93;73;AV;;rho;48.50;58;0;;pgd;59.62;60;0;;ccx;69.90;59;0 tme;31.40;50;0;;cpb;48.93;46;0;;pac;60.01;45;0;;opr;70.02;46;0 sep;32.10;59;APV;;hav;48.99;92;0;;pak;60.10;45;0;;fra;70.08;45;0 sepp;32.12;59;APV;;eal;49.70;85;0;;blo;60.12;57;0;;mts;70.28;46;0 ser;32.15;59;APV;;ecs;50.54;105;0;;bla;60.49;52;0;;sma;70.72;71;0 rri;32.47;34;P;;eco;50.79;87;0;;ret;61.27;50;0;;sbh;70.75;65;0 cft;33.21;43;P;;sfo;50.88;77;0;;sus;61.90;51;0;;ams;70.82;59;0 cfv;33.26;43;P;;sfl;50.89;98;0;;asd;62.24;45;0;;nfa;70.83;54;0 cff;33.31;41;P;;eca;50.97;76;0;;saci;62.27;68;0;;amd;71.29;52;0 cle;34.32;105;0;;sbo;51.21;91;0;;rer;62.31;54;0;;scl;71.38;63;0 ljf;34.49;55;AV;;sbz;51.34;86;0;;lhk;62.35;78;0;;scb;71.45;74;0 lla;35.33;63;APV;;sty;52.09;79;0;;msv;62.36;47;0;;ssx;71.75;65;0 cpy;35.35;61;A;;spq;52.11;85;0;;ipa;62.44;47;0;;sho;72.04;73;0 lat;36.32;44;P;;raq;52.12;76;P;;smx;62.65;57;0;;sco;72.12;65;0 amt;36.82;105;0;;stm;52.22;85;0;;smk;62.67;57;0;;sall;72.13;72;0 liv;37.13;67;AP;;kin;52.75;83;0;;dvl;63.01;68;0;;sgr;72.23;67;0 tde;37.87;44;0;;tpas;52.79;45;0;;mrb;63.38;47;0;;salu;72.32;71;0 spi;38.32;63;APV;;ent;52.98;84;0;;ddr;63.39;48;0;;gba;72.56;48;0 pmr;38.90;83;0;;apt;53.04;57;0;;tro;63.65;49;0;;cmi;72.66;45;0 cth;38.99;56;0;;pam;53.69;72;0;;tai;63.79;50;0;;sct;72.94;64;0 chp;39.06;38;0;;eta;53.73;81;0;;dpd;63.97;48;0;;phm;73.29;46;0 spl;39.09;143;0;;ksa;53.74;82;0;;gau;64.27;48;0;;salb;73.32;66;0 tsu;39.16;48;0;;cgl;53.81;60;0;;ppk;64.72;65;0;;afw;73.53;49;0 cmn;40.34;37;0;;cko;53.83;82;0;;xac;64.77;54;0;;ksk;74.20;78;0 psi;41.27;76;0;;ebf;54.02;86;0;;cvi;64.83;98;0;;acp;74.72;49;0 cta;41.30;37;0;;cgq;54.15;58;0;;tsc;64.89;48;0;;ank;74.84;49;0 ctr;41.31;37;0;;dda;55.02;74;0;;xcb;64.96;55;0;;ade;74.91;49;0
b10M
[modifier | modifier le wikicode]Ce sont 8 bactéries age, amd, roa, saci, sma, sgr, sho, sus. Ces bactéries ont à peu près la même grande taille qui tourne autour de 10 Mpb, un %GC autour de 68% et un >4GC autour de 28 pour 10 000. Ce qui les différencient de tos, sti et mhd dont le >4GC dépasse les 50 pour 10 000 et même les aléas, le %GC tourne autour de 68% et la taille petite est comprise entre 2 et 3 Mpb.
codons
[modifier | modifier le wikicode]par génome
[modifier | modifier le wikicode]- age;
Gène;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; a1653;0;2;1;0;59;36;1;20;1;50;0;0;1;15;14;18;3;23;0;14;0;0;0;0;19;9;0;17;1;17;2;10;52;5;1;19;3;19;1;2;43;52;0;4;27;14;0;0;16;10;0;0;48;18;1;0;16;21;2;0;33;0;0;1; a1653m;0;1;3;0;77;27;0;1;0;20;0;0;2;7;7;9;0;3;0;5;0;0;0;1;16;17;1;9;1;12;3;2;27;17;1;19;1;6;0;2;42;31;0;3;18;4;1;0;19;6;0;0;47;3;0;0;11;13;1;0;10;0;0;1; a1653n;0;1;0;0;46;32;0;9;0;31;0;0;1;11;15;10;1;18;0;7;0;0;2;0;17;4;0;4;0;7;2;4;36;2;0;19;1;9;1;3;27;51;0;2;18;5;0;0;8;15;0;0;32;19;0;0;8;23;0;0;18;0;0;1; a2777A;0;0;1;0;57;56;1;97;1;51;0;0;2;15;15;20;0;33;1;30;0;1;2;2;49;13;1;26;1;40;2;7;73;19;4;98;7;62;0;0;39;59;0;10;36;8;0;1;28;25;0;0;55;31;0;0;22;29;1;0;59;0;0;1; a27771;0;7;0;0;78;30;2;51;0;23;0;0;2;10;12;13;1;20;2;18;0;1;1;8;39;22;2;14;2;36;4;2;32;16;3;78;11;41;3;1;61;41;1;2;13;4;1;1;24;21;1;0;63;9;0;0;30;16;3;0;33;0;0;1; a27761;0;1;1;0;59;72;0;106;0;54;3;0;1;19;31;18;0;38;0;51;0;1;9;0;73;8;1;19;0;48;5;17;79;8;5;119;12;85;0;5;28;59;0;7;24;6;0;1;35;24;2;0;62;53;1;0;29;37;1;0;93;0;1;0; a27762;0;0;0;0;51;81;0;102;0;38;2;0;0;19;31;13;0;33;1;49;0;0;14;1;76;14;0;21;0;40;1;22;89;0;7;119;13;67;0;4;26;82;0;14;32;7;0;2;30;29;1;0;60;48;1;0;22;43;2;0;99;0;1;0; a63551;0;1;0;0;66;25;0;52;0;34;1;1;0;18;20;16;0;34;1;21;0;1;4;2;45;26;0;17;0;37;4;7;58;10;4;89;9;46;1;0;57;47;0;9;25;2;0;1;36;22;1;0;79;21;0;0;38;24;3;0;60;0;1;0; a63552;0;3;0;0;10;16;0;17;0;12;0;1;0;5;8;5;1;9;0;11;0;0;2;0;12;7;2;11;0;11;3;5;28;6;2;19;6;12;2;2;11;26;0;2;10;1;0;1;9;11;1;0;29;9;0;0;8;14;1;0;11;0;1;0; a6114;0;0;0;0;28;48;0;39;0;34;2;0;0;16;11;10;3;22;2;14;0;0;3;0;47;11;4;23;1;26;0;3;49;7;3;60;9;37;0;2;16;59;0;3;17;24;2;2;7;46;0;1;28;35;0;0;18;33;1;0;22;0;0;1; a6115;0;3;0;0;72;18;0;64;0;31;0;0;1;15;10;22;0;41;1;19;0;1;0;1;32;26;2;18;0;28;4;5;44;12;4;76;3;52;2;0;72;24;0;19;12;20;0;0;28;21;0;0;66;16;0;1;32;12;2;0;32;0;0;1; a27140;0;1;0;0;31;9;0;24;0;6;1;0;0;9;5;1;0;4;1;14;0;1;0;4;14;17;1;9;0;17;4;0;21;13;2;27;1;23;0;0;37;13;0;5;16;1;0;0;17;8;0;1;43;7;0;0;22;7;1;0;29;0;0;1; aseca;0;0;0;0;46;31;1;56;0;25;0;1;0;12;16;10;0;34;3;29;0;0;9;1;55;14;0;20;0;53;1;8;55;9;5;84;6;52;1;1;23;56;0;6;28;7;0;1;17;11;0;1;39;23;1;0;20;28;1;0;48;0;1;0; a4213;0;1;0;0;53;34;0;54;0;35;0;0;1;8;21;20;0;25;0;35;0;0;5;0;36;2;1;15;0;33;1;5;75;4;1;51;3;43;0;0;22;67;0;6;21;8;0;1;25;29;1;0;61;16;0;0;19;38;2;0;32;0;1;0;
- amd;
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- sus;
Gène;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; a1653;0;3;2;0;35;30;5;16;5;47;1;1;1;8;16;12;6;17;6;11;0;1;1;0;13;0;5;12;4;5;5;4;53;1;8;5;12;6;1;2;26;38;1;4;27;14;2;1;6;16;4;0;29;24;2;0;4;22;5;3;36;0;0;1; a1653m;0;2;3;0;36;36;3;6;2;34;3;0;1;5;16;10;5;13;7;11;0;1;2;0;11;1;2;10;5;12;2;1;31;1;4;10;3;5;5;2;16;31;1;4;20;15;2;2;18;6;3;0;13;30;2;1;8;11;6;0;28;0;1;0; a1653n;0;2;4;0;27;28;1;13;3;36;2;0;2;3;12;10;6;15;2;9;0;2;1;0;10;1;1;6;0;11;3;2;33;2;4;8;5;9;3;6;22;44;0;2;18;6;0;1;9;13;4;2;15;16;4;1;2;14;6;0;25;0;1;0; a2777A;1;15;2;3;82;13;8;62;8;40;0;0;3;29;4;15;11;26;17;18;1;3;4;3;32;36;10;17;1;42;15;2;30;37;28;65;35;38;10;2;78;4;1;16;37;9;2;0;46;1;1;2;66;12;2;1;37;9;24;1;34;1;0;0; a27771;0;10;4;2;60;15;6;37;7;23;2;0;0;10;7;17;4;16;5;17;3;4;6;2;27;21;6;8;5;20;7;6;27;27;20;53;15;34;7;3;71;20;0;5;22;4;1;1;36;5;3;7;47;6;2;4;30;7;17;0;34;1;0;0; a27761;1;23;8;0;69;25;7;96;8;43;0;2;3;29;7;23;9;28;10;38;0;2;11;3;64;13;4;17;4;44;18;8;69;13;59;52;39;55;3;9;59;26;2;15;33;8;1;7;43;10;8;5;63;26;2;2;38;32;18;0;78;1;0;0; a27762;0;21;7;0;75;25;7;83;3;33;3;0;1;28;11;17;10;30;4;38;1;3;14;0;64;18;7;22;3;50;14;17;78;10;71;53;27;55;2;8;51;30;0;15;35;8;1;3;49;9;10;6;74;20;0;0;45;30;21;0;83;0;1;0; a63551;1;4;8;1;45;33;13;43;2;37;2;0;2;28;9;20;11;19;11;22;1;0;5;0;42;13;3;9;2;24;6;6;62;13;26;50;30;32;2;5;55;46;1;15;27;7;0;1;36;16;4;4;55;26;7;0;21;34;11;0;62;0;0;1; a63552;0;1;1;1;16;16;2;12;3;12;0;0;2;11;6;8;3;7;3;19;0;1;2;1;18;3;2;11;2;7;4;3;17;7;14;9;12;8;3;1;10;11;0;4;4;2;0;1;11;9;4;0;15;14;2;1;4;17;6;0;12;1;0;0; a6114;1;4;5;1;7;35;13;29;3;34;1;2;0;4;17;8;9;21;7;21;0;1;5;1;44;3;3;15;5;22;6;0;46;4;24;41;23;19;3;4;21;45;1;11;22;23;2;3;22;26;3;3;26;23;2;3;5;29;11;0;38;0;0;1; a6115;0;6;8;1;42;32;18;31;5;31;1;0;5;15;14;9;10;27;10;12;0;1;4;1;44;7;7;19;7;20;4;5;55;5;30;30;24;36;1;3;38;54;2;16;20;26;3;3;23;20;4;6;33;23;2;2;10;31;7;1;35;0;0;1; a27140;0;5;3;0;24;7;2;14;6;4;2;0;4;16;3;5;4;5;7;4;0;3;4;0;15;15;4;7;4;12;8;6;15;14;8;15;19;12;5;1;33;14;0;0;10;0;3;1;17;4;2;4;30;11;1;5;15;5;12;1;20;0;1;0; aseca;1;6;3;0;19;52;23;45;1;27;0;1;1;2;20;7;4;33;12;29;0;1;4;0;64;0;3;19;3;47;4;7;60;0;54;42;27;43;0;4;7;47;1;6;29;6;1;3;5;16;7;3;10;52;2;0;4;42;11;1;42;0;1;0; a4213;0;1;3;0;46;32;10;23;6;26;1;2;3;11;13;17;12;17;19;17;0;1;4;0;43;1;3;10;3;28;9;8;61;5;27;18;21;30;7;2;32;48;2;5;26;8;2;2;22;26;5;5;39;31;4;2;12;31;3;0;32;0;1;0;
par gène de protéine
[modifier | modifier le wikicode]- a1653;
Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; age;0;2;1;0;59;36;1;20;1;50;0;0;1;15;14;18;3;23;0;14;0;0;0;0;19;9;0;17;1;17;2;10;52;5;1;19;3;19;1;2;43;52;0;4;27;14;0;0;16;10;0;0;48;18;1;0;16;21;2;0;33;0;0;1; amd;0;2;1;0;56;25;0;20;0;41;0;1;0;15;13;3;0;22;0;9;0;0;1;2;16;9;1;10;0;12;1;5;57;15;2;11;2;23;1;2;43;30;1;3;23;13;0;1;16;2;1;0;19;33;0;0;12;24;0;0;34;0;0;1; roa;0;1;3;1;50;31;2;10;0;38;0;0;0;15;10;7;2;14;2;7;0;2;4;3;5;12;1;10;2;14;9;12;33;15;7;10;2;21;8;2;44;41;0;4;25;10;2;0;17;6;2;0;30;36;3;2;12;15;2;0;24;0;0;1; saci;2;14;6;0;34;37;4;16;3;47;0;1;1;18;9;13;8;24;4;13;0;4;4;1;7;10;13;19;3;12;3;12;37;22;7;19;8;19;11;10;36;38;0;4;23;14;6;2;21;10;11;1;24;36;1;2;17;19;12;0;35;0;0;1; sma;0;5;0;0;41;36;0;18;0;38;0;1;1;16;10;4;3;16;0;11;0;0;2;4;13;7;2;16;0;12;5;10;53;11;0;18;3;19;1;0;35;38;0;3;25;8;0;2;14;6;0;1;21;39;1;0;14;20;0;0;31;0;0;1; sgr;0;0;0;0;54;22;0;19;0;38;0;1;0;12;13;3;3;14;0;11;0;0;0;3;17;6;0;18;0;13;6;7;58;6;0;18;0;23;0;0;31;44;0;3;26;9;0;0;16;6;1;0;12;47;1;1;10;23;2;0;34;0;0;1; sho;0;1;0;0;54;30;0;16;0;39;0;0;0;10;16;8;1;15;0;10;0;0;0;2;25;5;0;17;0;12;2;8;65;3;1;20;0;22;1;0;33;47;0;3;24;9;0;0;16;9;0;0;15;42;0;0;18;19;0;0;30;0;0;1; sus;0;3;2;0;35;30;5;16;5;47;1;1;1;8;16;12;6;17;6;11;0;1;1;0;13;0;5;12;4;5;5;4;53;1;8;5;12;6;1;2;26;38;1;4;27;14;2;1;6;16;4;0;29;24;2;0;4;22;5;3;36;0;0;1;
- a1653m;
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- a1653n;
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- a27140;
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- aseca;
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- a4213;
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acides aminés
[modifier | modifier le wikicode]par génome
[modifier | modifier le wikicode]- age;
Gène;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; a1653;98;21;51;48;26;14;0;17;18;69;20;22;98;4;27;14;26;66;38;35;1; a1653m;108;1;20;25;3;5;0;10;13;49;20;7;75;3;18;4;26;50;24;11;1; a1653n;79;9;31;37;19;7;0;4;7;44;19;10;82;2;18;5;23;51;31;18;1; a2777A;114;98;52;52;33;31;0;27;41;101;102;69;98;10;36;8;54;86;51;60;1; a27771;115;53;23;37;21;20;0;16;38;54;81;52;106;3;13;4;47;73;46;36;1; a27761;133;106;54;72;38;51;0;20;48;109;124;97;92;7;24;6;60;117;67;94;1; a27762;132;102;38;65;33;50;0;21;40;112;126;80;112;14;32;7;61;109;66;101;1; a63551;92;52;34;56;34;22;0;17;37;79;93;55;105;9;25;2;59;101;62;63;1; a63552;29;17;12;19;10;11;0;13;11;42;21;18;41;2;10;1;21;39;22;12;1; a6114;76;39;34;39;25;16;0;27;27;59;63;46;77;3;17;24;57;64;51;23;1; a6115;93;64;31;48;41;20;0;20;28;65;80;55;98;19;12;20;49;82;45;34;1; a27140;41;24;6;16;4;15;0;10;17;38;29;24;50;5;16;1;25;51;29;30;1; aseca;77;57;25;39;34;32;0;20;53;73;89;58;81;6;28;7;29;63;49;49;1; a4213;88;54;35;50;25;35;0;16;33;85;52;46;89;6;21;8;55;78;57;34;1;
- amd;
Gène;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; a1653;84;20;41;32;22;9;0;11;12;78;13;25;76;4;23;13;19;53;36;34;1; a1653m;83;13;36;30;16;6;0;4;12;58;8;17;57;1;13;7;26;50;26;38;1; a1653n;76;10;37;41;13;3;0;3;10;55;8;16;78;4;11;8;21;57;31;23;1; a2777A;115;23;37;48;25;18;0;35;33;101;64;78;162;10;18;14;64;93;34;32;1; a27771;108;34;33;44;22;17;0;19;34;64;79;58;104;1;17;6;31;60;57;34;1; a27761;96;55;37;65;25;45;0;21;37;95;105;83;81;6;26;10;60;94;71;75;1; a27762;124;74;35;48;32;44;0;22;45;109;92;89;122;11;28;11;63;102;73;72;1; a63551;91;37;33;59;27;21;0;19;23;102;86;73;116;11;23;3;64;112;71;60;1; a63552;29;8;13;25;9;11;0;9;14;39;21;24;36;3;7;3;22;37;21;15;1; a6114;67;36;35;40;39;26;0;24;30;77;72;68;87;3;23;24;58;82;59;32;1; a6115;91;30;36;44;47;32;0;25;33;82;63;82;112;5;15;26;56;105;71;27;1; a27140;40;16;8;25;7;12;0;11;14;39;27;36;43;3;14;2;22;57;22;24;1; aseca;87;48;19;32;29;37;0;25;40;81;95;64;92;2;29;8;35;75;51;38;1; a4213;68;38;34;59;30;33;0;17;25;84;63;65;92;5;18;10;55;78;70;47;1;
- roa;
Gène;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; a1653;86;12;38;32;16;9;0;11;16;69;17;23;95;4;25;10;25;68;32;26;1; a1653m;71;9;34;17;19;4;0;9;13;51;12;17;66;2;17;7;26;70;31;29;1; a1653n;72;7;36;34;12;4;0;4;11;48;16;18;89;1;15;4;26;63;33;22;1; a2777A;112;62;37;64;34;36;0;27;30;105;75;91;117;10;34;15;53;82;51;77;1; a27771;102;35;28;46;24;21;0;18;31;66;73;65;109;0;15;7;33;71;56;29;1; a27761;99;53;36;67;23;40;0;20;40;107;97;90;89;6;30;9;59;102;68;71;1; a27762;122;71;37;58;34;43;0;21;58;104;102;87;120;12;30;10;58;111;65;72;1; a63551;48;18;15;46;15;14;0;6;12;58;40;32;71;8;8;0;36;56;44;31;1; a63552;31;10;16;23;8;10;0;10;13;50;21;25;39;2;6;3;15;34;31;17;1; a6114;73;37;30;45;43;28;0;27;29;76;74;74;88;3;15;23;56;87;57;30;1; a6115;97;37;37;49;35;27;0;24;27;78;78;90;92;7;18;29;60;95;54;37;1; a27140;49;9;10;26;4;12;0;14;11;38;25;43;56;3;10;4;27;55;44;27;1; aseca;80;46;21;41;32;30;0;20;38;73;85;73;106;1;21;7;31;71;49;43;1; a4213;74;42;33;58;31;37;0;14;25;91;60;65;83;5;20;10;54;82;62;47;1;
- saci;
Gène;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; a1653;93;20;50;42;32;17;0;32;15;74;26;27;95;4;23;14;39;72;39;47;1; a1653m;83;5;27;39;11;8;0;14;6;40;19;7;63;7;14;13;28;30;31;31;1; a1653n;89;7;26;30;20;16;0;7;11;39;11;8;75;2;22;6;27;46;32;29;1; a2777A;136;70;43;61;35;31;0;28;36;93;100;71;123;15;28;5;54;86;49;57;1; a27771;114;35;31;39;19;23;0;18;34;62;66;62;84;3;15;9;47;69;56;47;1; a27761;122;73;39;65;36;37;0;21;47;100;112;75;84;7;25;6;65;85;62;85;1; a27762;127;98;37;67;34;48;0;30;50;116;111;84;104;16;42;8;67;106;75;101;1; a63551;95;35;33;64;27;23;0;12;28;88;94;57;128;15;24;6;52;96;59;59;1; a63552;33;15;14;25;9;15;0;13;13;40;21;22;34;2;8;3;22;27;30;18;1; a6114;75;48;35;34;33;27;0;21;27;70;64;66;89;3;22;29;70;76;52;37;1; a6115;94;40;30;55;35;20;0;26;36;71;67;58;82;17;16;24;53;72;52;40;1; a27140;54;11;8;29;4;12;0;11;11;38;30;30;72;3;11;4;26;50;28;18;1; aseca;110;62;40;62;34;36;0;29;42;81;122;82;119;6;34;19;44;67;54;60;1; a4213;91;39;30;58;31;35;0;15;27;91;59;56;90;5;19;9;57;81;62;40;1;
- sma;
Gène;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; a1653;82;18;38;32;19;11;0;18;12;79;18;22;74;3;25;8;22;61;35;31;1; a1653m;73;13;33;24;16;6;0;8;14;42;19;14;80;1;14;8;27;54;32;31;1; a1653n;65;14;36;29;16;4;0;6;10;52;12;16;93;1;12;6;27;68;33;25;1; a2777A;108;75;44;58;41;33;0;28;43;105;78;85;100;9;40;14;56;82;57;63;1; a27771;95;36;35;39;17;22;0;18;29;71;81;58;133;0;22;9;33;64;58;25;1; a27761;101;53;39;66;26;40;0;19;39;100;102;88;84;4;28;10;64;105;68;65;1; a27762;121;76;39;57;31;39;0;20;49;100;107;82;108;12;29;9;57;108;71;74;1; a63551;91;41;35;59;27;25;0;19;26;103;93;64;123;9;19;3;60;97;71;74;1; a63552;24;10;14;17;11;11;0;12;12;40;22;21;42;2;10;2;22;43;27;10;1; a6114;76;36;34;39;34;29;0;21;28;73;76;65;116;4;18;24;59;82;54;31;1; a6115;100;36;41;55;31;24;0;26;35;70;88;61;107;11;13;32;59;85;77;28;1; a27140;36;26;12;24;5;15;0;10;12;42;34;32;48;5;15;1;23;59;26;21;1; aseca;81;55;25;37;30;28;0;20;43;75;105;72;81;2;26;7;26;71;43;45;1; a4213;69;39;32;49;30;38;0;13;29;84;59;56;90;4;16;9;54;80;67;43;1;
- sgr;
Gène;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; a1653;76;19;38;29;17;11;0;18;13;77;18;23;75;3;26;9;22;60;35;36;1; a1653m;72;12;35;27;14;6;0;6;10;44;20;14;77;1;14;8;26;50;32;32;1; a1653n;73;11;38;32;15;6;0;5;9;55;13;16;94;1;12;5;25;64;35;27;1; a2777A;100;74;44;57;41;35;0;31;40;105;78;85;95;9;41;14;54;90;60;64;1; a27771;94;34;33;31;17;23;0;20;33;65;79;57;128;0;22;9;39;69;60;27;1; a27761;98;54;41;65;24;41;0;17;40;97;102;88;84;4;28;9;62;101;68;69;1; a27762;122;80;41;53;30;39;0;18;44;102;103;85;112;13;29;8;59;112;74;67;1; a63551;87;40;35;63;28;26;0;19;24;107;85;66;124;9;19;3;57;96;74;77;1; a63552;27;9;15;17;10;9;0;12;14;40;24;22;41;2;9;2;21;39;27;11;1; a6114;76;29;30;39;34;31;0;25;27;74;71;68;116;4;22;24;58;74;55;34;1; a6115;98;32;40;54;31;27;0;25;30;71;79;65;113;12;15;32;58;90;75;25;1; a27140;37;24;10;22;6;13;0;11;11;43;33;34;51;5;15;1;24;58;25;21;1; aseca;80;52;26;33;30;33;0;18;44;80;100;69;86;2;26;7;24;77;45;39;1; a4213;67;39;32;52;30;37;0;11;27;91;58;57;88;4;16;9;50;82;76;43;1;
- sho;
Gène;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; a1653;85;16;39;34;16;10;0;17;12;78;21;22;81;3;24;9;25;57;37;30;1; a1653m;68;15;33;24;15;6;0;8;13;39;18;15;74;1;15;8;27;54;34;34;1; a1653n;68;13;38;28;15;5;0;6;11;51;11;18;97;2;13;6;27;64;30;26;1; a2777A;102;70;42;57;43;33;0;30;37;106;73;88;100;10;42;14;57;87;59;65;1; a27771;91;31;36;36;18;20;0;20;27;70;82;56;140;0;23;9;37;60;57;28;1; a27761;100;52;38;62;26;42;0;18;41;97;105;82;82;3;28;9;59;99;72;68;1; a27762;122;71;38;57;32;38;0;18;50;104;109;82;111;13;28;9;57;107;68;71;1; a63551;88;42;36;56;28;26;0;20;28;101;94;64;120;9;18;3;61;100;71;72;1; a63552;26;9;15;16;11;8;0;10;14;39;24;26;41;2;7;3;20;38;21;13;1; a6114;74;36;34;34;34;30;0;24;23;69;81;65;114;4;18;24;60;74;56;38;1; a6115;100;35;39;50;32;21;0;27;37;72;79;66;115;12;13;32;59;83;76;32;1; a27140;40;21;11;24;5;7;0;12;12;42;29;40;51;4;13;2;25;52;31;20;1; aseca;82;51;23;35;31;27;0;20;45;75;107;65;82;2;25;7;27;75;41;44;1; a4213;70;39;33;51;30;37;0;12;27;85;61;56;90;4;17;9;53;83;64;41;1;
- sus;
Gène;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; a1653;70;21;52;39;23;17;0;17;9;63;13;18;67;5;27;14;25;57;28;44;1; a1653m;77;9;36;35;18;18;0;12;17;35;14;8;54;5;20;15;28;46;22;34;1; a1653n;61;14;39;29;21;11;0;7;11;40;12;14;75;2;18;6;23;37;21;31;1; a2777A;116;70;48;51;37;35;0;27;43;84;93;73;94;17;37;9;49;81;49;59;1; a27771;91;43;30;36;20;22;0;14;25;67;73;49;101;5;22;4;43;63;43;51;1; a27761;126;103;51;64;37;48;0;21;48;108;111;94;97;17;33;8;61;102;74;96;1; a27762;128;90;36;60;40;42;0;29;53;119;124;82;91;15;35;8;62;110;75;104;1; a63551;92;56;39;61;30;33;0;12;26;87;76;62;108;16;27;7;53;89;62;73;1; a63552;35;14;15;27;10;22;0;13;9;31;23;20;25;4;4;2;21;33;24;18;1; a6114;53;42;37;32;30;28;0;18;27;56;65;42;73;12;22;23;53;55;39;49;1; a6115;89;49;36;44;37;22;0;26;27;69;60;60;96;18;20;26;49;66;45;43;1; a27140;39;16;10;30;9;11;0;11;16;43;23;31;53;0;10;0;25;47;26;33;1; aseca;81;68;28;31;37;41;0;22;50;71;96;70;58;7;29;6;25;72;48;54;1; a4213;82;33;32;47;29;36;0;13;31;83;45;51;89;7;26;8;52;80;49;35;1;
par gène de protéine
[modifier | modifier le wikicode]- a1653;
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- a1653m;
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- a1653n;
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- a2777A;
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- a27771;
Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;115;53;23;37;21;20;71;16;38;54;81;52;106;3;13;4;47;73;46;36;1; amd;108;34;33;44;22;17;60;19;34;64;79;58;104;1;17;6;31;60;57;34;1; roa;102;35;28;46;24;21;58;18;31;66;73;65;109;0;15;7;33;71;56;29;1; saci;114;35;31;39;19;23;66;18;34;62;66;62;84;3;15;9;47;69;56;47;1; sma;95;36;35;39;17;22;62;18;29;71;81;58;133;0;22;9;33;64;58;25;1; sgr;94;34;33;31;17;23;63;20;33;65;79;57;128;0;22;9;39;69;60;27;1; sho;91;31;36;36;18;20;67;20;27;70;82;56;140;0;23;9;37;60;57;28;1; sus;91;43;30;36;20;22;63;14;25;67;73;49;101;5;22;4;43;63;43;51;1;
- a27761;
Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;133;106;54;72;38;51;91;20;48;109;124;97;92;7;24;6;60;117;67;94;1; amd;96;55;37;65;25;45;80;21;37;95;105;83;81;6;26;10;60;94;71;75;1; roa;99;53;36;67;23;40;83;20;40;107;97;90;89;6;30;9;59;102;68;71;1; saci;122;73;39;65;36;37;89;21;47;100;112;75;84;7;25;6;65;85;62;85;1; sma;101;53;39;66;26;40;80;19;39;100;102;88;84;4;28;10;64;105;68;65;1; sgr;98;54;41;65;24;41;79;17;40;97;102;88;84;4;28;9;62;101;68;69;1; sho;100;52;38;62;26;42;78;18;41;97;105;82;82;3;28;9;59;99;72;68;1; sus;126;103;51;64;37;48;93;21;48;108;111;94;97;17;33;8;61;102;74;96;1;
- a27762;
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- a63551;
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- a63552;
Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;29;17;12;19;10;11;21;13;11;42;21;18;41;2;10;1;21;39;22;12;1; amd;29;8;13;25;9;11;27;9;14;39;21;24;36;3;7;3;22;37;21;15;1; roa;31;10;16;23;8;10;22;10;13;50;21;25;39;2;6;3;15;34;31;17;1; saci;33;15;14;25;9;15;21;13;13;40;21;22;34;2;8;3;22;27;30;18;1; sma;24;10;14;17;11;11;28;12;12;40;22;21;42;2;10;2;22;43;27;10;1; sgr;27;9;15;17;10;9;28;12;14;40;24;22;41;2;9;2;21;39;27;11;1; sho;26;9;15;16;11;8;28;10;14;39;24;26;41;2;7;3;20;38;21;13;1; sus;35;14;15;27;10;22;25;13;9;31;23;20;25;4;4;2;21;33;24;18;1;
- a6114;
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- a6115;
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- a27140;
Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;41;24;6;16;4;15;36;10;17;38;29;24;50;5;16;1;25;51;29;30;1; amd;40;16;8;25;7;12;32;11;14;39;27;36;43;3;14;2;22;57;22;24;1; roa;49;9;10;26;4;12;44;14;11;38;25;43;56;3;10;4;27;55;44;27;1; saci;54;11;8;29;4;12;42;11;11;38;30;30;72;3;11;4;26;50;28;18;1; sma;36;26;12;24;5;15;30;10;12;42;34;32;48;5;15;1;23;59;26;21;1; sgr;37;24;10;22;6;13;32;11;11;43;33;34;51;5;15;1;24;58;25;21;1; sho;40;21;11;24;5;7;37;12;12;42;29;40;51;4;13;2;25;52;31;20;1; sus;39;16;10;30;9;11;37;11;16;43;23;31;53;0;10;0;25;47;26;33;1;
- aseca;
Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;77;57;25;39;34;32;79;20;53;73;89;58;81;6;28;7;29;63;49;49;1; amd;87;48;19;32;29;37;77;25;40;81;95;64;92;2;29;8;35;75;51;38;1; roa;80;46;21;41;32;30;72;20;38;73;85;73;106;1;21;7;31;71;49;43;1; saci;110;62;40;62;34;36;104;29;42;81;122;82;119;6;34;19;44;67;54;60;1; sma;81;55;25;37;30;28;67;20;43;75;105;72;81;2;26;7;26;71;43;45;1; sgr;80;52;26;33;30;33;68;18;44;80;100;69;86;2;26;7;24;77;45;39;1; sho;82;51;23;35;31;27;72;20;45;75;107;65;82;2;25;7;27;75;41;44;1; sus;81;68;28;31;37;41;69;22;50;71;96;70;58;7;29;6;25;72;48;54;1;
- a4213;
Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;88;54;35;50;25;35;43;16;33;85;52;46;89;6;21;8;55;78;57;34;1; amd;68;38;34;59;30;33;46;17;25;84;63;65;92;5;18;10;55;78;70;47;1; roa;74;42;33;58;31;37;40;14;25;91;60;65;83;5;20;10;54;82;62;47;1; saci;91;39;30;58;31;35;51;15;27;91;59;56;90;5;19;9;57;81;62;40;1; sma;69;39;32;49;30;38;44;13;29;84;59;56;90;4;16;9;54;80;67;43;1; sgr;67;39;32;52;30;37;42;11;27;91;58;57;88;4;16;9;50;82;76;43;1; sho;70;39;33;51;30;37;43;12;27;85;61;56;90;4;17;9;53;83;64;41;1; sus;82;33;32;47;29;36;49;13;31;83;45;51;89;7;26;8;52;80;49;35;1;
