Recherche:Répétition des bases dans l'ADN des procaryotes/Annexe/Tableaux

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Tableaux
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Annexe 2
Recherche : Répétition des bases dans l'ADN des procaryotes
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Répétition des bases dans l'ADN des procaryotes/Annexe/Tableaux
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Paris le 14.9.16

Sommaire

Aléas[modifier | modifier le wikicode]

Résultat[modifier | modifier le wikicode]

  •  %GC (dénominateur; numérateur) et effectif pour la courbe des aléas

Programme perl: repete-alea.pl

6;1;159,662
17;4;1,017,293
29;7;190,657
47;12;751,719
23;6;358,242
37;10;2,268,272
7;2;3,992,906
31;9;1,109,804
43;13;1,777,831
16;5;1,738,790
31;10;2,499,279
3;1;1,800,764
29;10;1,755,993
17;6;2,365,589
11;4;1,190,853
43;16;2,928,879
47;18;1,937,111
41;16;1,171,660
23;9;1,796,846
47;19;1,072,952
29;12;1,044,459
31;13;1,617,544
47;20;2,158,758
37;16;4,168,266
23;10;4,215,606
9;4;3,308,273
31;14;5,728,392
11;5;5,597,590
41;19;5,347,283
21;10;4,653,728
29;14;2,343,476
47;23;2,736,403
2;1;4,701,875
2;1;5,498,450
47;24;4,641,652
37;19;4,683,551
23;12;4,809,037
17;9;2,907,495
17;9;1,139,203
37;20;3,145,677
20;11;4,726,582
37;21;3,551,206
7;4;2,121,359
47;27;5,315,120
47;27;1,156,948
22;13;2,572,069
47;28;3,776,653
5;3;2,560,265
43;26;1,933,695
31;19;4,381,608
8;5;3,908,022
43;27;3,820,344
19;12;3,462,887
17;11;5,429,298
20;13;5,148,708
29;19;4,352,825
3;2;6,264,404
3;2;3,944,163
43;29;8,376,953
22;15;3,497,479
23;16;1,894,877
41;29;9,025,608
41;29;11,936,683
7;5;10,236,715
43;31;8,667,507
43;31;9,784,577
43;31;9,840,102
18;13;8,545,929
47;34;9,360,281
37;27;6,283,032
15;11;6,841,649
19;14;5,277,990
47;35;5,029,329
4;3;5,061,632
4;3;5,013,479

Synthèse des Tableaux des diagrammes[modifier | modifier le wikicode]

r cernarcheota     e euryarcheota     c cyanobactérie     b bactérie     a aléa     E notation nombre scientifique     ^ exposant     cte constante du polynôme
  • >4AT Puissance
	AT   Puissance				
	cren	eury	cyano	bacter	aléa
cte	3.10	4.05	7.89	1.07	1.44
E	-7	-8	-6	-8	-7
^	4.499	5.159	3.883	5.551	4.708
%AT	>4AT r  >4AT e  >4AT c  >4AT b  >4AT a
30	1.4	1.7	4.3	1.7	1.3
32	1.8	2.4	5.5	2.4	1.8
35	2.7	3.7	7.8	4.0	2.7
37	3.5	5.0	9.7	5.4	3.5
40	5.0	7.5	13.1	8.3	5.0
42	6.2	9.6	15.9	10.9	6.3
45	8.5	13.7	20.7	16.0	8.8
47	10.3	17.1	24.6	20.4	10.7
50	13.7	23.6	31.2	28.8	14.4
52	16.3	28.9	36.4	35.8	17.3
55	21.0	38.5	45.2	48.9	22.5
57	24.6	46.3	51.9	59.6	26.6
60	31.0	60.4	63.4	79.2	33.9
62	35.9	71.5	72.0	95.0	39.6
65	44.5	91.3	86.5	123.5	49.4
67	51.0	106.7	97.3	146.1	57.0
  • >4GC Puissance
	GC  Puissace				
	cren	eury	cyano	bacter	aléa
cte	3.47	3.45	1.18	9.62	1.84
E	-5	-3	-4	-5	-7
^	3.333	2.001	3.013	2.887	4.649
%GC	>4GC r  >4GC e  >4GC c  >4GC b  >4GC a
30	2.9	3.1	3.3	1.8	1.4
32	3.6	3.5	4.0	2.1	1.8
35	4.9	4.2	5.3	2.8	2.8
37	5.9	4.7	6.3	3.2	3.6
40	7.6	5.5	7.9	4.1	5.2
42	8.9	6.1	9.2	4.7	6.5
45	11.2	7.0	11.3	5.7	8.9
47	13.0	7.6	12.9	6.5	10.9
50	16.0	8.7	15.5	7.7	14.6
52	18.2	9.4	17.5	8.7	17.5
55	22.0	10.5	20.7	10.2	22.7
57	24.7	11.2	23.0	11.3	26.8
60	29.3	12.5	26.9	13.1	34.0
62	32.7	13.3	29.6	14.4	39.6
65	38.3	14.6	34.2	16.5	49.3
67	42.4	15.5	37.5	18.0	56.8
  • >4AT Polynôme 3°
	AT  Polynôme 3°				
	cren	eury	cyano	bacter	aléa
x3	4.38	-4.60	4.02	3.35	9.60
        -3      -5      -3      -4      -4 
x2	-0.5971	0.0877	-0.5391	0.0037	-9.39
x	27.76	-5.60 	25.42	-0.142 	3.51 
cte	-429.0	94.3	-391.3	-6.07 	-46.5
%AT	>4AT r  >4AT e  >4AT c  >4AT b  >4AT a
30	-15.4	4.0	-5.5	2.1	0.3
32	-8.7	3.4	1.7	4.2	1.3
35	-1.2	3.8	10.2	7.9	2.6
37	2.3	4.8	14.6	10.7	3.6
40	6.1	7.7	20.0	15.6	5.3
42	7.8	10.4	22.9	19.4	6.6
45	9.8	15.7	26.9	25.6	9.0
47	11.1	20.1	29.5	30.3	11.0
50	13.2	27.8	34.0	38.0	14.5
52	15.3	33.8	37.5	43.7	17.4
55	19.6	44.0	44.2	53.1	22.5
57	23.7	51.6	49.8	60.0	26.6
60	32.3	64.1	60.6	71.2	33.8
62	39.8	73.3	69.6	79.3	39.4
65	54.4	88.3	86.2	92.5	49.0
67	66.7	99.0	99.7	101.9	56.3

  • >4GC Polynôme 3°
	GC  Polynôme 3°				
	cren	eury	cyano	bacter	aléa
x3	-2.33	-1.16	8.08	-4.84	7.49
E	-3	-3	-4	-4	-4
x2	0.3372	0.1591	-0.1050	0.0895	-0.0622
x	-14.91	-6.647	5.204	-4.501	1.97
cte	212.8	90.94	-81.84	70.07	-22.07
%GC	>4GC r  >4GC e  >4GC c  >4GC b  >4GC a
30	6.0	3.5	1.6	2.5	1.3
32	4.5	3.2	3.6	1.8	1.9
35	4.0	3.5	6.3	1.4	2.8
37	4.6	4.2	7.9	1.5	3.6
40	6.6	5.5	10.0	2.2	5.2
42	8.6	6.6	11.4	3.0	6.5
45	12.1	8.5	13.3	4.6	8.9
47	14.7	9.8	14.7	5.9	10.9
50	18.7	11.6	16.8	8.2	14.6
52	21.2	12.7	18.4	9.9	17.6
55	24.6	14.0	21.2	12.6	22.8
57	26.4	14.5	23.2	14.5	26.9
60	28.2	14.8	26.9	17.5	34.1
62	28.6	14.4	29.7	19.6	39.6
65	27.6	13.1	34.6	22.6	49.0
67	25.8	11.5	38.4	24.5	56.1

Autre-bactéries[modifier | modifier le wikicode]

Résultats[modifier | modifier le wikicode]

  • 192 Autre-bactéries
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
aae; 1551335; 43.4761673010665; 4828; 4872; 591; 641; 85156; 86380; 64379; 65865; 9170; 9276; 2805; 2659; 0
aba; 5650368; 58.3838433178158; 3007; 2930; 1597; 1568; 216587; 217000; 304448; 306151; 8865; 8986; 8824; 8903; 0
acp; 5029329; 74.7164880245456; 70; 68; 4055; 4183; 64534; 64285; 402195; 403461; 331; 310; 16508; 16660; 0
ade; 5013479; 74.9052703721308; 61; 81; 4074; 4122; 65238; 63038; 405130; 401504; 310; 301; 16805; 16273; 0
afw; 5277990; 73.5314011583955; 92; 82; 5959; 5741; 71624; 72226; 389468; 386090; 379; 347; 19964; 19539; 0
age; 12489432; 69.4486704756061; 594; 616; 17394; 17796; 233470; 236504; 926890; 933683; 2241; 2129; 50084; 51436; 41
amd; 10236715; 71.2927926585824; 411; 428; 6747; 7122; 180162; 183847; 807285; 805867; 2665; 2630; 29195; 29171; 0
amo; 2160700; 47.968065904568; 4344; 4682; 1272; 1205; 102227; 104668; 102592; 102289; 8025; 8552; 4617; 4498; 0
ams; 8773466; 70.8230817786266; 379; 397; 5401; 5398; 139227; 138500; 704093; 704250; 1673; 1687; 24199; 24577; 0
amt; 4929566; 36.8220244946513; 17431; 17352; 1679; 1814; 295221; 295911; 156250; 157282; 28840; 28867; 6178; 6447; 0
ank; 5061632; 74.840683795266; 65; 63; 4202; 4160; 64479; 64002; 406856; 407343; 307; 297; 16744; 16559; 0
apt; 2907495; 53.0368237950538; 5089; 5075; 2049; 1899; 118271; 118841; 154288; 151854; 9506; 9784; 6796; 6187; 0
asd; 4738809; 62.2442474469851; 809; 791; 2730; 2814; 135244; 134760; 271947; 273839; 3713; 3791; 11241; 11546; 0
asf; 1620005; 28.2602214190697; 7804; 7580; 190; 208; 111657; 111705; 33331; 34810; 12965; 12778; 868; 1037; 0
bae; 4168266; 43.2192907074549; 15434; 15431; 1084; 1015; 218137; 217670; 153936; 153615; 23502; 23708; 4593; 4419; 0
bla; 1933695; 60.4903565453704; 419; 379; 700; 836; 61134; 61617; 109473; 110985; 1366; 1339; 3141; 3393; 0
blo; 2256640; 60.1198241633579; 662; 635; 704; 760; 75322; 76641; 141691; 141232; 2257; 2303; 3664; 3582; 0
bmf1; 2121359; 57.1569922865484; 1865; 2061; 754; 666; 82815; 82277; 122246; 121243; 5928; 6089; 3267; 3200; 0
bmf2; 1156948; 57.3407793608702; 1021; 1012; 434; 445; 44644; 44081; 66165; 67936; 3234; 3180; 1743; 1950; 0
bmv; 3497479; 68.1498016142484; 982; 989; 943; 894; 84788; 81415; 198960; 193902; 2239; 2186; 4499; 4246; 0
bpn; 791654; 29.5646835612528; 3809; 4525; 95; 84; 52015; 53074; 15911; 16281; 5077; 5503; 381; 398; 0
bsu; 4215606; 43.5144081301716; 15410; 15183; 1066; 1000; 216530; 216728; 154081; 153437; 23801; 23659; 4406; 4267; 0
buc; 640681; 26.3124706367131; 5646; 6234; 43; 44; 41604; 41023; 11553; 11580; 5552; 5581; 191; 212; 0
cac; 3940880; 30.9257830738312; 18639; 19088; 493; 489; 256916; 256763; 95062; 95746; 30725; 30878; 1994; 2317; 0
cad; 3105335; 29.9346447323719; 13589; 13710; 351; 382; 197260; 197832; 64544; 66221; 21564; 21925; 1581; 1638; 0
cbd; 2158758; 42.4357894678329; 9261; 8893; 986; 960; 123823; 122286; 78415; 77558; 13184; 13043; 3195; 3148; 0
cbl; 3992906; 28.3108593089845; 23180; 21401; 585; 614; 263480; 257895; 91046; 87769; 34866; 32844; 2543; 2501; 0
ccx; 10080619; 69.8969279565074; 409; 469; 10953; 11548; 198087; 199424; 744983; 750904; 1681; 1714; 36616; 37588; 0
cdf; 4290252; 29.0605307100842; 21357; 21908; 444; 473; 279553; 282963; 89624; 91674; 33842; 33777; 1972; 1929; 0
cff; 1773615; 33.3075103672443; 10348; 11285; 93; 114; 93339; 95513; 39680; 41574; 16001; 17039; 565; 658; 0
cft; 1800764; 33.2077384932173; 10619; 11422; 92; 118; 95322; 97208; 40224; 41828; 16406; 17262; 583; 681; 0
cfv; 1866009; 33.2643090145867; 11400; 11624; 105; 124; 99429; 99965; 42196; 43000; 17278; 17556; 655; 680; 0
cgl; 3309401; 53.8102514624248; 3305; 3221; 1287; 1288; 138013; 137649; 172787; 169928; 8758; 8711; 6346; 6370; 0
cgq; 3145677; 54.1471358947533; 3083; 2948; 1185; 1272; 130555; 130090; 165246; 165796; 8350; 8055; 5923; 6266; 0
chp; 1171660; 39.0619292286158; 4007; 4060; 293; 346; 67128; 67026; 35565; 34780; 6958; 6899; 1434; 1423; 0
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tme; 1915238; 31.3998573545429; 13238; 12800; 490; 431; 123522; 121538; 50996; 49107; 17789; 17210; 1638; 1550; 0
tos; 2072393; 68.5534548707702; 717; 721; 11907; 12188; 48268; 48509; 171568; 172114; 2802; 2818; 17743; 17863; 0
tpas; 1139203; 52.7868167482003; 2304; 2372; 998; 992; 43195; 42394; 46858; 47673; 3742; 3707; 2611; 2803; 0
tra; 3260398; 68.1390124763909; 2410; 2266; 7607; 7736; 66922; 67122; 189467; 190505; 4310; 4180; 16345; 16899; 0
tro; 2003006; 63.6471020527168; 316; 314; 1214; 1166; 49694; 49051; 121109; 121935; 1527; 1539; 4698; 4657; 2
tsc; 2346803; 64.8850372187184; 1108; 1259; 8488; 8168; 66287; 66784; 190405; 188915; 4331; 4283; 16711; 16545; 0
tsu; 2731853; 39.1632346249963; 16370; 17375; 212; 175; 160078; 161558; 84833; 85814; 21396; 22170; 1279; 1393; 0
tth; 1894877; 69.4372774591702; 394; 448; 9182; 8911; 42401; 42173; 158752; 159801; 1856; 1919; 16222; 16015; 0
ttl; 1902595; 69.0919507304497; 479; 418; 8933; 9097; 43606; 43369; 159455; 159423; 2251; 2020; 16025; 16091; 0
tts; 1863201; 68.9162897615448; 493; 496; 8785; 8616; 43289; 42827; 155077; 156274; 2193; 2198; 15752; 15744; 0
uur; 751719; 25.4996880483266; 5422; 5640; 38; 46; 58304; 58095; 10982; 11668; 7387; 7301; 189; 215; 0
vin; 4350553; 68.9392589861565; 388; 361; 3617; 3620; 88266; 86551; 320517; 318241; 1260; 1271; 14450; 14284; 0
wbr; 697724; 22.478945829583; 7321; 7233; 29; 35; 47174; 47870; 11482; 11314; 7159; 7091; 170; 169; 0
xac; 5175554; 64.7718872221215; 1468; 1427; 1526; 1434; 140462; 140210; 339957; 339208; 3770; 3692; 7876; 7914; 0
xbo; 4225498; 44.9676227512118; 10957; 10804; 1723; 1421; 212954; 216541; 175188; 164027; 17825; 17986; 6321; 5659; 0
xcb; 5148708; 64.9570338811212; 1531; 1476; 1367; 1328; 137185; 137234; 344611; 341465; 3622; 3618; 7930; 7928; 0
ype; 4653728; 47.6361102324846; 8789; 8951; 2595; 2930; 224229; 225184; 201213; 204623; 16816; 16685; 7641; 8107; 0
ypg; 4504254; 47.5980262214342; 8552; 8784; 2866; 2483; 215402; 219343; 198786; 193360; 16023; 16677; 7858; 7232; 0
zin; 208564; 13.5401332099375; 3112; 3050; 7; 10; 14475; 14621; 2251; 2077; 2574; 2718; 13; 28; 21

Tableau des diagrammes[modifier | modifier le wikicode]

Tableau des diagrammes[modifier | modifier le wikicode]

  • Légende:
>4ATa, >4GCa ce sont les aléas calculés à partir de l’équation des courbes de tendance des aléas où x est %GC
* pour >4ATa l’équation est: −0.000732x3 + 0.1607x2 −11.96x + 302.42
* pour >4GCa l’équation est: 0.000746x3 −0.0609x2 + 1.869x −19.90
<5GCa, <5ATa ce sont les aléas calculés à partir de l’équation des courbes de tendance des aléas où x est %GC
* pour <5GCa l'équation est: 2.86x − 49.02
* pour <5ATa l'équation est: −2.83x + 235.7
dGCa, dATa différences avec l'aléa, dGAa = >4GC − >4GCa, dATa = >4AT − >4ATa.
  • Voir à la suite le tableau non formaté.
Répétitions chez les autre-bactéries							x3 -0.000732 0.000746		
											x2    0.1607  -0.0609		
			Voir méthode d’analyse (3.4.1) dans l’article			x     -11.96    1.869	 2.86	-2.83
         										c     302.42   -19.90  -49.02	235.7
Tableau des diagrammes
dGCa dATa KEGG Chromosome %GC >4GC >4AT <5GC <5AT Ctrl >4ATa >4GCa <5GCa <5ATa
0.41 36.57 aae 1,551,335 43.48 7.94 62.53 87.48 122.46 0 25.96 7.53 75.37 112.50
-24.48 4.39 aba 5,650,368 58.38 5.60 10.51 111.20 79.90 0 6.11 30.08 118.02 70.26
-74.57 -0.13 acp 5,029,329 74.72 16.38 0.27 166.79 25.74 0 0.40 90.95 164.75 23.97
-75.60 -0.08 ade 5,013,479 74.91 16.35 0.28 167.49 25.71 0 0.36 91.95 165.29 23.44
-62.69 -0.32 afw 5,277,990 73.53 22.17 0.33 154.43 27.39 0 0.65 84.86 161.36 27.33
-37.88 -0.55 age 12,489,432 69.45 28.18 0.97 157.10 37.98 41 1.52 66.06 149.68 38.90
-60.59 -0.29 amd 10,236,715 71.29 13.55 0.82 163.29 36.08 0 1.11 74.14 154.95 33.68
-0.48 24.18 amo 2,160,700 47.97 11.46 41.77 99.04 103.43 0 17.59 11.94 88.22 99.77
-59.71 -0.33 ams 8,773,466 70.82 12.31 0.88 166.08 32.04 0 1.21 72.02 153.61 35.01
3.51 27.26 amt 4,929,566 36.82 7.09 70.56 66.16 131.62 0 43.30 3.57 56.33 131.35
-75.09 -0.13 ank 5,061,632 74.84 16.52 0.25 167.44 25.50 0 0.38 91.61 165.10 23.62
-5.62 24.14 apt 2,907,495 53.04 13.58 34.96 109.76 88.19 0 10.81 19.19 102.72 85.41
-28.68 -0.54 asd 4,738,809 62.24 11.70 3.38 119.98 58.56 0 3.91 40.38 129.07 59.32
1.35 18.76 asf 1,620,005 28.26 2.46 94.96 43.24 153.77 0 76.20 1.10 31.83 155.62
-2.29 47.54 bae 4,168,266 43.22 5.04 74.05 75.95 115.88 0 26.51 7.32 74.63 113.23
-27.48 -0.68 bla 1,933,695 60.49 7.94 4.13 117.39 64.88 0 4.81 35.43 124.05 64.29
-27.95 0.73 blo 2,256,640 60.12 6.49 5.75 128.58 69.36 0 5.02 34.44 122.99 65.34
-20.56 11.50 bmf1 2,121,359 57.16 6.69 18.51 117.83 83.49 0 7.00 27.25 114.51 73.73
-20.07 10.71 bmf2 1,156,948 57.34 7.60 17.57 119.10 82.23 0 6.86 27.66 115.04 73.21
-55.50 3.79 bmv 3,497,479 68.15 5.25 5.64 114.83 48.79 0 1.84 60.75 145.96 42.58
0.87 34.95 bpn 791,654 29.56 2.26 105.27 41.65 146.11 0 70.32 1.39 35.57 151.92
-2.66 46.70 bsu 4,215,606 43.51 4.90 72.57 75.00 114.03 0 25.87 7.56 75.48 112.39
0.67 99.83 buc 640,681 26.31 1.36 185.43 36.74 146.34 0 85.60 0.69 26.26 161.14
0.79 31.20 cac 3,940,880 30.93 2.49 95.73 49.51 145.98 0 64.54 1.70 39.46 148.06
0.89 19.20 cad 3,105,335 29.93 2.36 87.91 43.15 141.23 0 68.71 1.47 36.62 150.87
2.28 55.84 cbd 2,158,758 42.44 9.01 84.09 75.19 126.15 0 28.25 6.73 72.39 115.45
1.89 35.69 cbl 3,992,906 28.31 3.00 111.65 46.05 147.53 0 75.96 1.12 31.98 155.47
-45.64 -0.55 ccx 10,080,619 69.90 22.32 0.87 155.75 39.77 0 1.42 67.96 150.96 37.63
0.86 28.29 cdf 4,290,252 29.06 2.14 100.84 43.17 146.88 0 72.55 1.28 34.12 153.35
-1.17 66.74 cff 1,773,615 33.31 1.17 121.97 46.50 125.11 0 55.23 2.34 46.27 141.31
-1.14 66.80 cft 1,800,764 33.21 1.17 122.40 46.27 125.61 0 55.60 2.31 45.99 141.60
-1.10 67.99 cfv 1,866,009 33.26 1.23 123.39 46.37 125.52 0 55.39 2.33 46.15 141.44
-12.77 9.73 cgl 3,309,401 53.81 7.78 19.72 107.40 88.58 0 9.99 20.55 104.93 83.22
-13.35 9.52 cgq 3,145,677 54.15 7.81 19.17 109.11 88.07 0 9.65 21.16 105.90 82.26
0.83 32.11 chp 1,171,660 39.06 5.45 68.85 62.48 126.33 0 36.74 4.63 62.74 125.01
0.52 94.06 cje 1,641,481 30.55 2.14 160.17 43.41 143.58 0 66.10 1.61 38.38 149.13
0.49 94.98 cjr 1,777,831 30.31 2.05 162.10 42.55 144.24 0 67.13 1.56 37.69 149.82
-13.58 21.59 cko 4,720,462 53.83 7.00 31.57 103.14 85.24 0 9.98 20.58 104.98 83.17
1.24 18.94 cle 4,714,237 34.32 3.89 70.51 54.80 138.33 0 51.57 2.65 49.18 138.43
-2.87 36.57 clo 1,809,746 44.21 5.27 60.99 84.54 118.77 29 24.42 8.14 77.47 110.41
-63.61 -0.42 cmi 3,297,891 72.66 16.98 0.40 152.51 23.18 0 0.83 80.59 158.88 29.79
3.47 41.54 cmn 1,072,952 40.34 8.81 74.88 66.27 125.28 0 33.34 5.34 66.39 121.39
-16.35 21.14 cnt 4,876,443 55.10 6.62 29.88 110.29 83.01 0 8.73 22.97 108.63 79.55
-5.16 35.25 cpb 2,736,403 48.93 7.96 51.36 91.95 95.08 0 16.11 13.11 90.96 97.05
-0.37 16.76 cpy 4,847,594 35.35 2.63 64.82 58.92 139.35 0 48.05 3.00 52.11 135.53
0.25 137.74 crp 159,662 16.56 0.25 282.78 22.18 170.47 0 145.05 0.00 0.00 188.76
0.37 166.19 cru 162,589 13.98 0.37 330.82 21.04 164.62 22 164.62 0.00 0.00 196.09
0.08 34.56 cta 1,044,459 41.30 6.02 65.49 67.52 120.86 0 30.92 5.95 69.15 118.66
-0.17 44.64 cth 3,843,301 38.99 4.42 81.59 75.50 128.99 0 36.95 4.59 62.52 125.22
-0.02 34.84 ctr 1,042,519 41.31 5.93 65.75 67.49 120.78 0 30.91 5.95 69.16 118.65
-42.09 7.09 cvi 4,751,080 64.83 6.49 9.94 146.34 56.59 0 2.85 48.58 136.47 51.98
-18.93 23.80 dba 3,942,657 58.65 11.78 29.73 130.14 70.32 0 5.94 30.71 118.77 69.51
-13.03 20.77 dda 4,679,450 55.02 9.77 29.59 110.93 81.22 0 8.82 22.80 108.38 79.80
-27.57 4.68 ddr 2,819,842 63.39 16.30 8.09 140.37 53.47 0 3.41 43.87 132.34 56.07
-26.98 4.87 dge 2,467,205 66.64 27.98 7.14 144.69 47.79 0 2.27 54.96 141.63 46.87
-34.39 6.26 dpd 3,881,839 63.97 11.35 9.43 130.95 56.70 0 3.17 45.74 134.02 54.41
-30.78 6.79 dpt 2,147,060 66.16 22.44 9.20 150.06 48.78 0 2.41 53.23 140.28 48.21
-18.13 1.42 dvl 3,462,887 63.01 24.57 4.99 127.10 58.71 0 3.57 42.70 131.26 57.14
-8.15 24.00 eal 4,701,875 49.70 5.97 38.99 92.32 98.00 0 14.99 14.12 93.16 94.87
-15.14 20.23 ebf 4,762,179 54.02 5.79 30.02 103.41 85.02 0 9.78 20.92 105.53 82.63
-4.26 22.35 ebt 4,158,725 56.51 21.58 29.86 122.41 71.82 0 7.52 25.84 112.65 75.57
-9.95 20.31 eca 5,064,019 50.97 5.96 33.59 92.72 92.02 0 13.27 15.91 96.80 91.27
-15.58 19.72 ecla 4,633,407 55.18 7.54 28.38 108.06 79.43 0 8.66 23.13 108.86 79.33
-10.23 22.54 eco 4,641,652 50.79 5.42 36.04 95.71 95.23 0 13.50 15.65 96.30 91.77
-9.06 24.37 ecs 5,498,450 50.54 6.22 38.21 95.70 94.82 0 13.84 15.28 95.57 92.49
-15.10 34.67 eha 3,008,576 55.56 8.78 42.99 115.87 76.42 0 8.32 23.87 109.94 78.26
-13.63 16.43 eic 3,812,301 57.44 14.25 23.22 117.50 63.95 0 6.79 27.88 115.31 72.94
-14.89 19.44 eno 4,726,582 55.07 8.01 28.21 107.64 79.75 0 8.77 22.90 108.53 79.66
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  • Tableau non formaté
dGCa;dATa;KEGG;Chromosome;%GC;>4GC;>4AT;<5GC;<5AT;Ctrl  ;>4ATa;>4GCa;<5GCa;<5ATa
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-20.00;0.42;sur;10,260,756;67.46;38.05;2.45;151.30;47.32;0;2.03;58.05;143.98;44.54
-29.71;3.44;sus;9,965,640;61.90;9.66;7.51;131.94;67.14;0;4.08;39.38;128.09;60.28
37.14;0.62;tai;1,848,474;63.79;82.29;3.86;164.49;52.48;0;3.25;45.15;133.50;54.93
-0.02;86.75;tde;2,843,201;37.87;4.02;126.87;72.25;127.66;0;40.12;4.04;59.34;128.37
-3.35;28.65;tma;1,860,725;46.25;6.70;49.16;84.62;105.87;0;20.51;10.05;83.30;104.65
2.99;73.35;tme;1,915,238;31.40;4.81;135.95;53.93;146.23;0;62.60;1.82;40.82;146.72
53.90;5.20;tos;2,072,393;68.55;116.27;6.94;183.02;49.41;0;1.74;62.37;147.12;41.44
-1.30;29.96;tpas;1,139,203;52.79;17.47;41.05;87.73;81.67;0;11.09;18.77;102.01;86.12
-13.65;12.50;tra;3,260,398;68.14;47.06;14.34;126.74;43.72;0;1.85;60.71;145.93;42.61
-32.81;-0.16;tro;2,003,006;63.65;11.88;3.15;126.01;50.83;2;3.30;44.69;133.08;55.34
22.22;7.25;tsc;2,346,803;64.89;70.97;10.09;175.80;60.37;0;2.84;48.76;136.62;51.83
-3.26;87.07;tsu;2,731,853;39.16;1.42;123.52;63.44;133.68;0;36.46;4.68;63.03;124.72
29.48;2.92;tth;1,894,877;69.44;95.48;4.44;185.13;46.63;0;1.53;66.01;149.65;38.93
30.20;3.11;ttl;1,902,595;69.09;94.77;4.71;184.48;47.96;0;1.61;64.57;148.66;39.91
29.55;3.66;tts;1,863,201;68.92;93.39;5.31;184.01;48.58;0;1.65;63.84;148.15;40.41
0.60;57.40;uur;751,719;25.50;1.12;147.16;30.67;174.38;0;89.76;0.52;23.94;163.44
-47.30;0.08;vin;4,350,553;68.94;16.63;1.72;153.43;40.76;0;1.65;63.94;148.22;40.34
0.92;102.17;wbr;697,724;22.48;0.92;208.59;33.16;156.64;0;106.42;0.00;15.29;172.00
-42.66;2.72;xac;5,175,554;64.77;5.72;5.59;134.28;55.67;0;2.88;48.37;136.30;52.15
-1.37;28.59;xbo;4,225,498;44.97;7.44;51.50;83.11;110.12;0;22.91;8.81;79.64;108.27
-43.77;3.03;xcb;5,148,708;64.96;5.23;5.84;136.33;54.70;0;2.81;49.00;136.83;51.63
0.32;19.99;ype;4,653,728;47.64;11.87;38.12;90.59;103.77;0;18.13;11.56;87.27;100.71
0.36;20.30;ypg;4,504,254;47.60;11.88;38.49;90.41;103.78;0;18.19;11.51;87.16;100.82
0.82;127.37;zin;208,564;13.54;0.82;295.48;20.95;164.90;21;168.10;0.00;0.00;197.33

Groupes des autre-bactéries selon l'écart relatif par rapport à l'aléa[modifier | modifier le wikicode]

  • Voir tableau non formaté à la suite
  • Légende:
>4GC %: 100*(>4GC − >4GCa)/>4GCa . Voir Tableau des diagrammes des répétitions pour >4GC et >4GCa.
>4AT %: respectivement de même que précédent.
Tableau des diagrammes : écarts relatifs par rapport à l'aléa
KEGG %GC >4GC % >4AT %
uur 25.50 116.1 64.0
ple 26.17 224.6 66.7
buc 26.31 96.3 116.6
fnc 27.12 100.6 77.2
asf 28.26 122.5 24.6
cbl 28.31 169.3 47.0
rip 28.48 23.9 126.0
rty 28.92 -34.3 35.7
rpr 29.00 -24.6 38.1
rpw 29.01 -25.2 37.9
cdf 29.06 67.3 39.0
bpn 29.56 62.8 49.7
cad 29.93 60.3 27.9
cjr 30.31 31.4 141.5
cje 30.55 32.4 142.3
cac 30.93 46.2 48.3
tme 31.40 164.0 117.2
sep 32.10 -11.6 27.7
sepp 32.12 -11.4 26.2
ser 32.15 -9.9 26.5
rri 32.47 -0.4 59.3
cft 33.21 -49.5 120.1
cfv 33.26 -47.2 122.7
cff 33.31 -50.1 120.8
cle 34.32 46.8 36.7
ljf 34.49 -44.8 62.9
lla 35.33 -13.4 112.0
cpy 35.35 -12.3 34.9
lat 36.32 48.3 100.5
amt 36.82 98.3 63.0
liv 37.13 -27.2 113.5
tde 37.87 -0.5 216.2
spi 38.32 -30.7 106.5
pmr 38.90 34.7 83.7
cth 38.99 -3.7 120.8
chp 39.06 17.9 87.4
spl 39.09 -36.3 72.7
tsu 39.16 -69.7 238.8
cmn 40.34 64.9 124.6
psi 41.27 21.8 95.9
cta 41.30 1.3 111.8
ctr 41.31 -0.4 112.7
gva 42.02 -72.4 57.2
cbd 42.44 33.9 197.6
plu 42.83 -2.2 86.5
bae 43.22 -31.3 179.3
sect 43.29 -3.2 131.8
aae 43.48 5.5 140.9
bsu 43.51 -35.2 180.5
men 43.52 -54.3 59.9
ral 44.21 -50.1 77.1
clo 44.21 -35.2 149.8
lpl 44.47 -30.1 52.9
xbo 44.97 -15.6 124.8
ppm 45.24 -25.4 94.7
pfq 45.38 -37.1 88.6
ppoy 45.51 -27.6 95.3
tma 46.25 -33.3 139.7
sbn 46.28 -62.6 82.5
ypg 47.60 3.2 111.6
ype 47.64 2.7 110.3
amo 47.97 -4.0 137.5
pgi 48.29 -38.6 95.8
rho 48.50 -60.1 179.0
cpb 48.93 -39.3 218.9
hav 48.99 -58.4 131.4
eal 49.70 -57.7 160.1
ecs 50.54 -59.3 176.2
eco 50.79 -65.3 166.9
sfo 50.88 -29.4 144.9
sfl 50.89 -64.1 167.0
eca 50.97 -62.6 153.0
sbo 51.21 -65.6 170.2
sbz 51.34 -55.8 205.2
sty 52.09 -61.2 217.8
spq 52.11 -62.6 219.3
raq 52.12 -64.5 189.4
stm 52.22 -63.3 223.1
kin 52.75 -52.6 209.6
tpas 52.79 -6.9 270.1
ent 52.98 -71.1 195.4
apt 53.04 -29.3 223.3
pam 53.69 -70.6 218.5
eta 53.73 -54.4 222.8
ksa 53.74 -75.6 244.6
cgl 53.81 -62.1 97.3
cko 53.83 -66.0 216.5
ebf 54.02 -72.3 206.8
cgq 54.15 -63.1 98.6
dda 55.02 -57.2 235.6
eno 55.07 -65.0 221.7
spe 55.07 -61.4 199.5
cnt 55.10 -71.2 242.0
ecla 55.18 -67.4 227.6
eha 55.56 -63.2 416.5
ror 55.88 -66.3 257.2
koy 55.92 -66.8 281.1
pes 56.06 -54.5 304.6
* ebt 56.51 -16.5 297.3
* say 56.76 -16.3 271.8
* sap 56.76 -16.2 272.1
esa 56.77 -84.0 303.6
bmf1 57.16 -75.4 164.2
bmf2 57.34 -72.5 156.0
eic 57.44 -48.9 241.9
kpn 57.48 -66.4 281.4
* pdo 58.31 -15.3 109.4
aba 58.38 -81.4 71.9
pst 58.40 -79.6 182.7
dba 58.65 -61.6 400.8
pge 59.11 -77.4 332.4
pgd 59.62 -54.9 125.7
pac 60.01 -55.9 7.2
pak 60.10 -56.1 7.1
blo 60.12 -81.2 14.5
bla 60.49 -77.6 -14.2
ret 61.27 -84.0 106.9
sus 61.90 -75.5 84.4
asd 62.24 -71.0 -13.7
* saci 62.27 -35.5 111.4
rer 62.31 -79.0 -42.8
lhk 62.35 -81.0 334.0
* msv 62.36 7.3 291.6
* ipa 62.44 -37.4 67.5
smx 62.65 -82.4 85.5
smk 62.67 -82.3 86.8
* dvl 63.01 -42.5 39.9
* mrb 63.38 9.7 466.4
ddr 63.39 -62.8 137.3
tro 63.65 -73.4 -4.8
* tai 63.79 82.3 19.0
dpd 63.97 -75.2 197.1
gau 64.27 -76.3 16.5
ppk 64.72 -75.8 94.4
xac 64.77 -88.2 94.5
cvi 64.83 -86.6 248.4
* tsc 64.89 45.6 255.7
xcb 64.96 -89.3 107.9
rpa 65.04 -89.3 8.1
* rru 65.45 -44.3 271.6
* dpt 66.16 -57.8 281.9
* gdi 66.43 -60.2 159.2
pae 66.56 -86.3 94.4
* dge 66.64 -49.1 215.1
* roa 67.37 -75.1 -64.0
* sur 67.46 -34.4 20.6
* rha 67.52 -74.2 -61.1
* mhd 68.08 -15.5 257.4
* sti 68.10 -72.3 -57.5
* tra 68.14 -22.5 676.6
bmv 68.15 -91.4 205.6
* tos 68.55 86.4 298.6
* req 68.82 -77.9 -74.6
* mxa 68.89 -66.3 -38.7
* tts 68.92 46.3 221.5
vin 68.94 -74.0 4.6
* ttl 69.09 46.8 193.2
* tth 69.44 44.7 191.2
* age 69.45 -57.3 -36.4
* ccx 69.90 -67.2 -38.6
* opr 70.02 -41.2 162.8
* fra 70.08 -67.8 0.8
* mts 70.28 -63.6 -63.7
* sma 70.72 -66.9 -43.9
* sbh 70.75 -64.6 -31.8
* ams 70.82 -82.9 -27.1
* nfa 70.83 -80.2 -61.8
* amd 71.29 -81.7 -26.4
* scl 71.38 -71.9 11.6
* scb 71.45 -62.2 -45.3
* ssx 71.75 -65.2 -47.5
* sho 72.04 -68.1 -50.4
* sco 72.12 -68.6 -52.1
* sall 72.13 -65.2 -26.9
* sgr 72.23 -61.4 -49.6
* salu 72.32 -66.1 -26.2
* gba 72.56 -86.5 -69.8
* cmi 72.66 -78.9 -51.3
* sct 72.94 -65.1 -31.1
* phm 73.29 -70.3 -15.1
* salb 73.32 -60.1 -34.0
* afw 73.53 -73.9 -49.3
* ksk 74.20 -67.7 -25.4
* acp 74.72 -82.0 -32.2
* ank 74.84 -82.0 -33.2
* ade 74.91 -82.2 -22.4
  • Tableau non formaté
;KEGG;%GC;>4GC %;>4AT %
;uur;25.50;116.1;64.0
;ple;26.17;224.6;66.7
;buc;26.31;96.3;116.6
;fnc;27.12;100.6;77.2
;asf;28.26;122.5;24.6
;cbl;28.31;169.3;47.0
;rip;28.48;23.9;126.0
;rty;28.92;-34.3;35.7
;rpr;29.00;-24.6;38.1
;rpw;29.01;-25.2;37.9
;cdf;29.06;67.3;39.0
;bpn;29.56;62.8;49.7
;cad;29.93;60.3;27.9
;cjr;30.31;31.4;141.5
;cje;30.55;32.4;142.3
;cac;30.93;46.2;48.3
;tme;31.40;164.0;117.2
;sep;32.10;-11.6;27.7
;sepp;32.12;-11.4;26.2
;ser;32.15;-9.9;26.5
;rri;32.47;-0.4;59.3
;cft;33.21;-49.5;120.1
;cfv;33.26;-47.2;122.7
;cff;33.31;-50.1;120.8
;cle;34.32;46.8;36.7
;ljf;34.49;-44.8;62.9
;lla;35.33;-13.4;112.0
;cpy;35.35;-12.3;34.9
;lat;36.32;48.3;100.5
;amt;36.82;98.3;63.0
;liv;37.13;-27.2;113.5
;tde;37.87;-0.5;216.2
;spi;38.32;-30.7;106.5
;pmr;38.90;34.7;83.7
;cth;38.99;-3.7;120.8
;chp;39.06;17.9;87.4
;spl;39.09;-36.3;72.7
;tsu;39.16;-69.7;238.8
;cmn;40.34;64.9;124.6
;psi;41.27;21.8;95.9
;cta;41.30;1.3;111.8
;ctr;41.31;-0.4;112.7
;gva;42.02;-72.4;57.2
;cbd;42.44;33.9;197.6
;plu;42.83;-2.2;86.5
;bae;43.22;-31.3;179.3
;sect;43.29;-3.2;131.8
;aae;43.48;5.5;140.9
;bsu;43.51;-35.2;180.5
;men;43.52;-54.3;59.9
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;clo;44.21;-35.2;149.8
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;pfq;45.38;-37.1;88.6
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;tma;46.25;-33.3;139.7
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;ypg;47.60;3.2;111.6
;ype;47.64;2.7;110.3
;amo;47.97;-4.0;137.5
;pgi;48.29;-38.6;95.8
;rho;48.50;-60.1;179.0
;cpb;48.93;-39.3;218.9
;hav;48.99;-58.4;131.4
;eal;49.70;-57.7;160.1
;ecs;50.54;-59.3;176.2
;eco;50.79;-65.3;166.9
;sfo;50.88;-29.4;144.9
;sfl;50.89;-64.1;167.0
;eca;50.97;-62.6;153.0
;sbo;51.21;-65.6;170.2
;sbz;51.34;-55.8;205.2
;sty;52.09;-61.2;217.8
;spq;52.11;-62.6;219.3
;raq;52.12;-64.5;189.4
;stm;52.22;-63.3;223.1
;kin;52.75;-52.6;209.6
;tpas;52.79;-6.9;270.1
;ent;52.98;-71.1;195.4
;apt;53.04;-29.3;223.3
;pam;53.69;-70.6;218.5
;eta;53.73;-54.4;222.8
;ksa;53.74;-75.6;244.6
;cgl;53.81;-62.1;97.3
;cko;53.83;-66.0;216.5
;ebf;54.02;-72.3;206.8
;cgq;54.15;-63.1;98.6
;dda;55.02;-57.2;235.6
;eno;55.07;-65.0;221.7
;spe;55.07;-61.4;199.5
;cnt;55.10;-71.2;242.0
;ecla;55.18;-67.4;227.6
;eha;55.56;-63.2;416.5
;ror;55.88;-66.3;257.2
;koy;55.92;-66.8;281.1
;pes;56.06;-54.5;304.6
*;ebt;56.51;-16.5;297.3
*;say;56.76;-16.3;271.8
*;sap;56.76;-16.2;272.1
;esa;56.77;-84.0;303.6
;bmf1;57.16;-75.4;164.2
;bmf2;57.34;-72.5;156.0
;eic;57.44;-48.9;241.9
;kpn;57.48;-66.4;281.4
*;pdo;58.31;-15.3;109.4
;aba;58.38;-81.4;71.9
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*;ank;74.84;-82.0;-33.2
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Groupes 22 et 23 des autre-bactéries aux faibles taux >4GC[modifier | modifier le wikicode]

Groupe 22 bactéries au-dessus de l’aléa >4GC    Groupe 23 bactéries sous l’aléa >4GC                    KEGG    %GC     >4GC%   >4AT%
													gva	42.02	-72	57
KEGG	%GC	>4GC    >4AT    DNA             KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA                     tsu     39.16   -70     239
uur	25.50	1.12	147.16	751,719		rty	28.92	0.82	99.29	1,111,496		cff	33.31	-50	121
ple	26.17	2.15	143.87	358,242		rpr	29.00	0.95	100.55	1,111,523		cft	33.21	-49	120
buc	26.31	1.36	185.43	640,681		rpw	29.01	0.95	100.42	1,109,804		cfv	33.26	-47	123
fnc	27.12	1.73	144.60	2,268,272	sep	32.10	1.77	76.43	2,499,279		ljf	34.49	-45	63
asf	28.26	2.46	94.96	1,620,005	sepp	32.12	1.78	75.40	2,490,012		spl	39.09	-36	73
cbl	28.31	3.00	111.65	3,992,906	ser	32.15	1.82	75.39	2,616,530		rty	28.92	-34	36
rip	28.48	1.43	169.87	574,390		rri	32.47	2.09	93.01	1,257,710		spi	38.32	-31	107
cdf	29.06	2.14	100.84	4,290,252	cft	33.21	1.17	122.40	1,800,764		liv	37.13	-27	114
bpn	29.56	2.26	105.27	791,654		cfv	33.26	1.23	123.39	1,866,009		rpw	29.01	-25	38
cad	29.93	2.36	87.91	3,105,335	cff	33.31	1.17	121.97	1,773,615		rpr	29.00	-25	38
cjr	30.31	2.05	162.10	1,777,831	ljf	34.49	1.49	83.08	1,755,993		lla	35.33	-13	112
cje	30.55	2.14	160.17	1,641,481	lla	35.33	2.60	102.02	2,365,589		cpy	35.35	-12	35
cac	30.93	2.49	95.73	3,940,880	cpy	35.35	2.63	64.82	4,847,594		sep	32.10	-12	28
tme	31.40	4.81	135.95	1,915,238	liv	37.13	2.70	90.41	2,928,879		sepp	32.12	-11	26
cle	34.32	3.89	70.51	4,714,237	tde	37.87	4.02	126.87	2,843,201		ser	32.15	-10	26
lat	36.32	5.00	89.97	1,190,853	spi	38.32	2.94	80.21	1,937,111		cth	38.99	-4	121
amt	36.82	7.09	70.56	4,929,566	cth	38.99	4.42	81.59	3,843,301		plu	42.83	-2	86
pmr	38.90	6.12	68.33	4,063,606	spl	39.09	2.96	63.32	1,796,846		tde	37.87	0	216
chp	39.06	5.45	68.85	1,171,660	tsu	39.16	1.42	123.52	2,731,853		rri	32.47	0	59
cmn	40.34	8.81	74.88	1,072,952	cta	41.30	6.02	65.49	1,044,459		ctr	41.31	0	113
psi	41.27	7.21	60.76	4,402,109	ctr	41.31	5.93	65.75	1,042,519		cta	41.30	1	112
cbd	42.44	9.01	84.09	2,158,758	gva	42.02	1.77	45.95	1,617,545		chp	39.06	18	87
						plu	42.83	6.87	51.05	5,688,987		psi	41.27	22	96
moyen.	32	3.8	111	2,335,119								rip	28.48	24	126
ecart	5	2	39	1,542,011	moyen.	36	2.6	88	2,264,375		cjr	30.31	31	141
%    	17	65	35	66		ecart	4	2	24	1,200,989		cje	30.55	32	142
						%   	12	67	27	53			cbd	42.44	34	198
													pmr	38.90	35	84
													cac	30.93	46	48
													cle	34.32	47	37
													lat	36.32	48	100
													cad	29.93	60	28
													bpn	29.56	63	50
													cmn	40.34	65	125
													cdf	29.06	67	39
													buc	26.31	96	117
													amt	36.82	98	63
													fnc	27.12	101	77
													uur	25.50	116	64
													asf	28.26	122	25
													tme	31.40	164	117
													cbl	28.31	169	47
													ple	26.17	225	67

Groupes 33 et 41 des autre-bactéries aux taux >4GC extrêmes[modifier | modifier le wikicode]

Groupe 33 bactéries sous l’aléa >4AT                    Groupe 41 bactéries au-dessus de l’aléa >4AT            KEGG    %GC     >4GC%   >4AT%
                                                                                                                req	68.82	-78	-75
KEGG	%GC     >4GC    >4AT    DNA                     KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA                     gba     72.56   -86     -70
bla	60.49	7.94	4.13	1,933,695		pac	60.01	15.05	5.45	2,560,265		roa	67.37	-75	-64
asd	62.24	11.70	3.38	4,738,809		pak	60.10	15.11	5.39	2,495,334		mts	70.28	-64	-64
rer	62.31	8.50	2.22	6,516,310		blo	60.12	6.49	5.75	2,256,640		nfa	70.83	-80	-62
roa	67.37	14.36	0.74	8,376,953		ret	61.27	6.02	9.09	4,381,608		rha	67.52	-74	-61
rha	67.52	15.01	0.78	7,804,765		sus	61.90	9.66	7.51	9,965,640		sti	68.10	-72	-58
sti	68.10	16.79	0.79	2,741,033		saci	62.27	26.08	8.25	9,629,675		sco	72.12	-69	-52
req	68.82	14.04	0.42	5,043,170		lhk	62.35	7.75	16.77	3,169,329		cmi	72.66	-79	-51
mxa	68.89	21.48	1.02	9,139,763		msv	62.36	43.71	15.11	3,249,394		sho	72.04	-68	-50
age	69.45	28.18	0.97	12,489,432		ipa	62.44	25.63	6.40	5,472,964		sgr	72.23	-61	-50
ccx	69.90	22.32	0.87	10,080,619		smx	62.65	7.31	6.91	3,908,022		afw	73.53	-74	-49
mts	70.28	25.31	0.48	3,982,034		smk	62.67	7.36	6.95	3,820,344		ssx	71.75	-65	-47
sma	70.72	23.65	0.69	9,025,608		dvl	63.01	24.57	4.99	3,462,887		scb	71.45	-62	-45
sbh	70.75	25.40	0.84	11,936,683		mrb	63.38	48.09	19.32	3,097,457		sma	70.72	-67	-44
ams	70.82	12.31	0.88	8,773,466		ddr	63.39	16.30	8.09	2,819,842		rer	62.31	-79	-43
nfa	70.83	14.30	0.46	6,021,225		tro	63.65	11.88	3.15	2,003,006		mxa	68.89	-66	-39
amd	71.29	13.55	0.82	10,236,715		tai	63.79	82.29	3.86	1,848,474		ccx	69.90	-67	-39
scb	71.45	28.28	0.59	10,148,695		dpd	63.97	11.35	9.43	3,881,839		age	69.45	-57	-36
ssx	71.75	26.55	0.53	7,414,440		gau	64.27	11.05	3.56	4,636,964		salb	73.32	-60	-34
sho	72.04	24.73	0.47	9,840,102		ppk	64.72	11.67	5.63	5,429,298		ank	74.84	-82	-33
sco	72.12	24.50	0.45	8,667,507		xac	64.77	5.72	5.59	5,175,554		acp	74.72	-82	-32
sall	72.13	27.12	0.69	9,784,577		cvi	64.83	6.49	9.94	4,751,080		sbh	70.75	-65	-32
sgr	72.23	30.32	0.46	8,545,929		tsc	64.89	70.97	10.09	2,346,803		sct	72.94	-65	-31
salu	72.32	26.75	0.66	9,360,281		xcb	64.96	5.23	5.84	5,148,708		ams	70.82	-83	-27
gba	72.56	10.82	0.26	5,311,527		rpa	65.04	5.26	3.01	5,459,213		sall	72.13	-65	-27
cmi	72.66	16.98	0.40	3,297,891		rru	65.45	28.23	9.81	4,352,825		amd	71.29	-82	-26
sct	72.94	28.63	0.53	6,283,062		dpt	66.16	22.44	9.20	2,147,060		salu	72.32	-66	-26
phm	73.29	24.86	0.59	3,803,225		gdi	66.43	21.58	6.03	3,944,163		ksk	74.20	-68	-25
salb	73.32	33.42	0.46	6,841,649		pae	66.56	7.48	4.45	6,264,404		ade	74.91	-82	-22
afw	73.53	22.17	0.33	5,277,990		dge	66.64	27.98	7.14	2,467,205		phm	73.29	-70	-15
ksk	74.20	28.47	0.38	8,783,278		sur	67.46	38.05	2.45	10,260,756		bla	60.49	-78	-14
acp	74.72	16.38	0.27	5,029,329		mhd	68.08	51.08	6.66	2,269,167		asd	62.24	-71	-14
ank	74.84	16.52	0.25	5,061,632		tra	68.14	47.06	14.34	3,260,398		tro	63.65	-73	-5
ade	74.91	16.35	0.28	5,013,479		bmv	68.15	5.25	5.64	3,497,479		fra	70.08	-68	1
							tos	68.55	116.27	6.94	2,072,393		vin	68.94	-74	5
moy	71	21	0.8	7,191,057		tts	68.92	93.39	5.31	1,863,201		pak	60.10	-56	7
ecart	3.5	7.0	0.8	2,694,790		vin	68.94	16.63	1.72	4,350,553		pac	60.01	-56	7
%   	5	34	102	37			ttl	69.09	94.77	4.71	1,902,595		rpa	65.04	-89	8
							tth	69.44	95.48	4.44	1,894,877		scl	71.38	-72	12
							opr	70.02	40.26	3.65	2,303,940		blo	60.12	-81	14
							fra	70.08	22.11	1.39	5,433,628		gau	64.27	-76	16
							scl	71.38	20.94	1.22	13,033,779		tai	63.79	82	19
														sur	67.46	-34	21
							moy	65	30	6.9	4,202,165		dvl	63.01	-42	40
							ecart	3	30	4	2,530,326		ipa	62.44	-37	67
							%  	5	98	58	60			sus	61.90	-75	84
														smx	62.65	-82	85
														smk	62.67	-82	87
														ppk	64.72	-76	94
														pae	66.56	-86	94
														xac	64.77	-88	95
														ret	61.27	-84	107
														xcb	64.96	-89	108
														saci	62.27	-36	111
														ddr	63.39	-63	137
														gdi	66.43	-60	159
														opr	70.02	-41	163
														tth	69.44	45	191
														ttl	69.09	47	193
														dpd	63.97	-75	197
														bmv	68.15	-91	206
														dge	66.64	-49	215
														tts	68.92	46	222
														cvi	64.83	-87	248
														tsc	64.89	46	256
														mhd	68.08	-16	257
														rru	65.45	-44	272
														dpt	66.16	-58	282
														msv	62.36	7	292
														tos	68.55	86	299
														lhk	62.35	-81	334
														mrb	63.38	10	466
														tra	68.14	-22	677

Le groupe 67 des "autres" bactéries aux taux >4GC moyens[modifier | modifier le wikicode]

				Groupe 67 bactéries sous l’aléa >4AT                                            KEGG    %GC     >4GC%  >4AT%
														esa	56.77	-84	304
KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA                     KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA                     aba     58.38   -81     72
bae	43.22	5.04	74.05	4,168,266		ent	52.98	5.52	32.12	4,518,712		pst	58.40	-80	183
sect	43.29	7.15	61.10	1,441,139		apt	53.04	13.58	34.96	2,907,495		pge	59.11	-77	332
aae	43.48	7.94	62.53	1,551,335		pam	53.69	5.97	32.22	4,703,373		ksa	53.74	-76	245
bsu	43.51	4.90	72.57	4,215,606		eta	53.73	9.30	32.52	3,883,467		bmf1	57.16	-75	164
men	43.52	3.46	41.37	538,294			ksa	53.74	4.99	34.67	4,902,024		bmf2	57.34	-73	156
ral	44.21	4.06	43.28	3,685,408		cgl	53.81	7.78	19.72	3,309,401		ebf	54.02	-72	207
clo	44.21	5.27	60.99	1,809,746		cko	53.83	7.00	31.57	4,720,462		cnt	55.10	-71	242
lpl	44.47	5.84	36.53	3,308,273		ebf	54.02	5.79	30.02	4,762,179		ent	52.98	-71	195
xbo	44.97	7.44	51.50	4,225,498		cgq	54.15	7.81	19.17	3,145,677		pam	53.69	-71	218
ppm	45.24	6.76	43.58	5,728,392		dda	55.02	9.77	29.59	4,679,450		ecla	55.18	-67	228
pfq	45.38	5.78	41.71	4,094,629		eno	55.07	8.01	28.21	4,726,582		koy	55.92	-67	281
ppoy	45.51	6.74	42.70	5,597,590		spe	55.07	8.85	26.24	5,448,853		kpn	57.48	-66	281
tma	46.25	6.70	49.16	1,860,725		cnt	55.10	6.62	29.88	4,876,443		ror	55.88	-66	257
sbn	46.28	3.78	37.32	5,347,283		ecla	55.18	7.54	28.38	4,633,407		cko	53.83	-66	216
ypg	47.60	11.88	38.49	4,504,254		eha	55.56	8.78	42.99	3,008,576		sbo	51.21	-66	170
ype	47.64	11.87	38.12	4,653,728		ror	55.88	8.26	28.72	5,398,151		eco	50.79	-65	167
amo	47.97	11.46	41.77	2,160,700		koy	55.92	8.16	30.51	5,914,407		eno	55.07	-65	222
pgi	48.29	7.57	33.46	2,343,476		pes	56.06	11.34	31.92	4,513,140		raq	52.12	-65	189
rho	48.50	5.02	46.76	3,592,125		ebt	56.51	21.58	29.86	4,158,725		sfl	50.89	-64	167
cpb	48.93	7.96	51.36	2,736,403		say	56.76	22.08	27.19	3,551,206		stm	52.22	-63	223
hav	48.99	5.48	37.06	4,712,721		sap	56.76	22.12	27.21	3,472,898		eha	55.56	-63	417
eal	49.70	5.97	38.99	4,701,875		esa	56.77	4.23	29.49	4,368,373		cgq	54.15	-63	99
ecs	50.54	6.22	38.21	5,498,450		bmf1	57.16	6.69	18.51	2,121,359		spq	52.11	-63	219
eco	50.79	5.42	36.04	4,641,652		bmf2	57.34	7.60	17.57	1,156,948		sbn	46.28	-63	83
sfo	50.88	11.13	32.79	5,488,183		eic	57.44	14.25	23.22	3,812,301		eca	50.97	-63	153
sfl	50.89	5.68	35.71	4,607,202		kpn	57.48	9.41	25.79	5,315,120		cgl	53.81	-62	97
eca	50.97	5.96	33.59	5,064,019		pdo	58.31	25.33	12.90	1,890,857		dba	58.65	-62	401
sbo	51.21	5.60	35.02	4,519,823		aba	58.38	5.60	10.51	5,650,368		spe	55.07	-61	199
sbz	51.34	7.27	39.06	4,683,551		pst	58.40	6.15	17.25	6,397,126		sty	52.09	-61	218
sty	52.09	6.84	37.77	4,809,037		dba	58.65	11.78	29.73	3,942,657		rho	48.50	-60	179
spq	52.11	6.60	37.89	4,858,887		pge	59.11	7.20	24.37	5,489,680		ecs	50.54	-59	176
raq	52.12	6.27	34.30	4,861,101		pgd	59.62	14.95	11.99	3,776,653		hav	48.99	-58	131
stm	52.22	6.55	37.92	4,857,432									eal	49.70	-58	160
kin	52.75	8.87	34.47	5,529,134		moy	52	8.5	35	4,070,018		dda	55.02	-57	236
tpas	52.79	17.47	41.05	1,139,203		ecart	5	5	13	1,332,214		sbz	51.34	-56	205
							%   	9	53	35	33			pgd	59.62	-55	126
														pes	56.06	-54	305
														eta	53.73	-54	223
														men	43.52	-54	60
														kin	52.75	-53	210
														ral	44.21	-50	77
														eic	57.44	-49	242
														cpb	48.93	-39	219
														pgi	48.29	-39	96
														pfq	45.38	-37	89
														clo	44.21	-35	150
														bsu	43.51	-35	180
														tma	46.25	-33	140
														bae	43.22	-31	179
														lpl	44.47	-30	53
														sfo	50.88	-29	145
														apt	53.04	-29	223
														ppoy	45.51	-28	95
														ppm	45.24	-25	95
														ebt	56.51	-16	297
														say	56.76	-16	272
														sap	56.76	-16	272
														xbo	44.97	-16	125
														pdo	58.31	-15	109
														tpas	52.79	-7	270
														amo	47.97	-4	137
														sect	43.29	-3	132
														ype	47.64	3	110
														ypg	47.60	3	112
														aae	43.48	5	141

Groupes des autre-bactéries selon le taux de >4GC[modifier | modifier le wikicode]

Groupes 2 7[modifier | modifier le wikicode]

  • Groupages couplés aux écarts relatifs à l'aléa
Groupe 2: 38 bactéries >4GC 0.8-4.4 %00                                                Groupe 7: 74 bactéries >4GC 5-10 %00	
																
KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA                     KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA                     KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA
rty	28.92	0.82	99.29	1,111,496		tme	31.40	4.81	135.95	1,915,238		ppm	45.24	6.76	43.58	5,728,392
rpw	29.01	0.95	100.42	1,109,804		bsu	43.51	4.90	72.57	4,215,606		sty	52.09	6.84	37.77	4,809,037
rpr	29.00	0.95	100.55	1,111,523		ksa	53.74	4.99	34.67	4,902,024		plu	42.83	6.87	51.05	5,688,987
uur	25.50	1.12	147.16	751,719			lat	36.32	5.00	89.97	1,190,853		cko	53.83	7.00	31.57	4,720,462
cft	33.21	1.17	122.40	1,800,764		rho	48.50	5.02	46.76	3,592,125		amt	36.82	7.09	70.56	4,929,566
cff	33.31	1.17	121.97	1,773,615		bae	43.22	5.04	74.05	4,168,266		sect	43.29	7.15	61.10	1,441,139
cfv	33.26	1.23	123.39	1,866,009		xcb	64.96	5.23	5.84	5,148,708		pge	59.11	7.20	24.37	5,489,680
buc	26.31	1.36	185.43	640,681			bmv	68.15	5.25	5.64	3,497,479		psi	41.27	7.21	60.76	4,402,109
tsu	39.16	1.42	123.52	2,731,853		rpa	65.04	5.26	3.01	5,459,213		sbz	51.34	7.27	39.06	4,683,551
rip	28.48	1.43	169.87	574,390			clo	44.21	5.27	60.99	1,809,746		smx	62.65	7.31	6.91	3,908,022
ljf	34.49	1.49	83.08	1,755,993		eco	50.79	5.42	36.04	4,641,652		smk	62.67	7.36	6.95	3,820,344
fnc	27.12	1.73	144.60	2,268,272		chp	39.06	5.45	68.85	1,171,660		xbo	44.97	7.44	51.50	4,225,498
sep	32.10	1.77	76.43	2,499,279		hav	48.99	5.48	37.06	4,712,721		pae	66.56	7.48	4.45	6,264,404
gva	42.02	1.77	45.95	1,617,545		ent	52.98	5.52	32.12	4,518,712		ecla	55.18	7.54	28.38	4,633,407
sepp	32.12	1.78	75.40	2,490,012		sbo	51.21	5.60	35.02	4,519,823		pgi	48.29	7.57	33.46	2,343,476
ser	32.15	1.82	75.39	2,616,530		aba	58.38	5.60	10.51	5,650,368		bmf2	57.34	7.60	17.57	1,156,948
cjr	30.31	2.05	162.10	1,777,831		sfl	50.89	5.68	35.71	4,607,202		lhk	62.35	7.75	16.77	3,169,329
rri	32.47	2.09	93.01	1,257,710		xac	64.77	5.72	5.59	5,175,554		cgl	53.81	7.78	19.72	3,309,401
cdf	29.06	2.14	100.84	4,290,252		pfq	45.38	5.78	41.71	4,094,629		cgq	54.15	7.81	19.17	3,145,677
cje	30.55	2.14	160.17	1,641,481		ebf	54.02	5.79	30.02	4,762,179		aae	43.48	7.94	62.53	1,551,335
ple	26.17	2.15	143.87	358,242			lpl	44.47	5.84	36.53	3,308,273		bla	60.49	7.94	4.13	1,933,695
bpn	29.56	2.26	105.27	791,654			ctr	41.31	5.93	65.75	1,042,519		cpb	48.93	7.96	51.36	2,736,403
cad	29.93	2.36	87.91	3,105,335		eca	50.97	5.96	33.59	5,064,019		eno	55.07	8.01	28.21	4,726,582
asf	28.26	2.46	94.96	1,620,005		eal	49.70	5.97	38.99	4,701,875		koy	55.92	8.16	30.51	5,914,407
cac	30.93	2.49	95.73	3,940,880		pam	53.69	5.97	32.22	4,703,373		ror	55.88	8.26	28.72	5,398,151
lla	35.33	2.60	102.02	2,365,589		ret	61.27	6.02	9.09	4,381,608		rer	62.31	8.50	2.22	6,516,310
cpy	35.35	2.63	64.82	4,847,594		cta	41.30	6.02	65.49	1,044,459		eha	55.56	8.78	42.99	3,008,576
liv	37.13	2.70	90.41	2,928,879		pmr	38.90	6.12	68.33	4,063,606		cmn	40.34	8.81	74.88	1,072,952
spi	38.32	2.94	80.21	1,937,111		pst	58.40	6.15	17.25	6,397,126		spe	55.07	8.85	26.24	5,448,853
spl	39.09	2.96	63.32	1,796,846		ecs	50.54	6.22	38.21	5,498,450		kin	52.75	8.87	34.47	5,529,134
cbl	28.31	3.00	111.65	3,992,906		raq	52.12	6.27	34.30	4,861,101		cbd	42.44	9.01	84.09	2,158,758
men	43.52	3.46	41.37	538,294			blo	60.12	6.49	5.75	2,256,640		eta	53.73	9.30	32.52	3,883,467
sbn	46.28	3.78	37.32	5,347,283		cvi	64.83	6.49	9.94	4,751,080		kpn	57.48	9.41	25.79	5,315,120
cle	34.32	3.89	70.51	4,714,237		stm	52.22	6.55	37.92	4,857,432		sus	61.90	9.66	7.51	9,965,640
tde	37.87	4.02	126.87	2,843,201		spq	52.11	6.60	37.89	4,858,887		dda	55.02	9.77	29.59	4,679,450
ral	44.21	4.06	43.28	3,685,408		cnt	55.10	6.62	29.88	4,876,443						
esa	56.77	4.23	29.49	4,368,373		bmf1	57.16	6.69	18.51	2,121,359		moy	52	6.8	37	4,104,170
cth	38.99	4.42	81.59	3,843,301		tma	46.25	6.70	49.16	1,860,725		ecart	8	1	24	1,639,023
							ppoy	45.51	6.74	42.70	5,597,590		%   	16	19	66	40
moy	34	2.3	100	2,334,524												
ecart	7	1	38	1,345,668												
%   	19	44	38	58												
  • Groupage avec hypothèse de la résonance
					Groupe G7 A39	n=80							Groupe G2 A158	n=22		
																
KEGG	%GC	>4GC    >4AT    DNA                     KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA                     KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA
tme	31.40	4.81	135.95	1,915,238		raq	52.12	6.27	34.30	4,861,101		zin	13.54	0.82	295.48	208,564
cle	34.32	3.89	70.51	4,714,237		stm	52.22	6.55	37.92	4,857,432		cru	13.98	0.37	330.82	162,589
lat	36.32	5.00	89.97	1,190,853		kin	52.75	8.87	34.47	5,529,134		crp	16.56	0.25	282.78	159,662
amt	36.82	7.09	70.56	4,929,566		ent	52.98	5.52	32.12	4,518,712		wbr	22.48	0.92	208.59	697,724
tde	37.87	4.02	126.87	2,843,201		pam	53.69	5.97	32.22	4,703,373		mcac	23.66	0.64	164.01	1,017,293
pmr	38.90	6.12	68.33	4,063,606		eta	53.73	9.30	32.52	3,883,467		sms	24.00	3.41	174.13	190,657
cth	38.99	4.42	81.59	3,843,301		ksa	53.74	4.99	34.67	4,902,024		uur	25.50	1.12	147.16	751,719
chp	39.06	5.45	68.85	1,171,660		cgl	53.81	7.78	19.72	3,309,401		ple	26.17	2.15	143.87	358,242
cmn	40.34	8.81	74.88	1,072,952		cko	53.83	7.00	31.57	4,720,462		buc	26.31	1.36	185.43	640,681
psi	41.27	7.21	60.76	4,402,109		ebf	54.02	5.79	30.02	4,762,179		fnc	27.12	1.73	144.60	2,268,272
cta	41.30	6.02	65.49	1,044,459		cgq	54.15	7.81	19.17	3,145,677		asf	28.26	2.46	94.96	1,620,005
ctr	41.31	5.93	65.75	1,042,519		dda	55.02	9.77	29.59	4,679,450		cbl	28.31	3.00	111.65	3,992,906
cbd	42.44	9.01	84.09	2,158,758		eno	55.07	8.01	28.21	4,726,582		rip	28.48	1.43	169.87	574,390
plu	42.83	6.87	51.05	5,688,987		spe	55.07	8.85	26.24	5,448,853		rty	28.92	0.82	99.29	1,111,496
bae	43.22	5.04	74.05	4,168,266		cnt	55.10	6.62	29.88	4,876,443		rpr	29.00	0.95	100.55	1,111,523
sect	43.29	7.15	61.10	1,441,139		ecla	55.18	7.54	28.38	4,633,407		rpw	29.01	0.95	100.42	1,109,804
aae	43.48	7.94	62.53	1,551,335		eha	55.56	8.78	42.99	3,008,576		cdf	29.06	2.14	100.84	4,290,252
bsu	43.51	4.90	72.57	4,215,606		ror	55.88	8.26	28.72	5,398,151		bpn	29.56	2.26	105.27	791,654
ral	44.21	4.06	43.28	3,685,408		koy	55.92	8.16	30.51	5,914,407		cad	29.93	2.36	87.91	3,105,335
clo	44.21	5.27	60.99	1,809,746		esa	56.77	4.23	29.49	4,368,373		cjr	30.31	2.05	162.10	1,777,831
lpl	44.47	5.84	36.53	3,308,273		bmf1	57.16	6.69	18.51	2,121,359		cje	30.55	2.14	160.17	1,641,481
xbo	44.97	7.44	51.50	4,225,498		bmf2	57.34	7.60	17.57	1,156,948		cac	30.93	2.49	95.73	3,940,880
ppm	45.24	6.76	43.58	5,728,392		kpn	57.48	9.41	25.79	5,315,120						
pfq	45.38	5.78	41.71	4,094,629		aba	58.38	5.60	10.51	5,650,368		moy	26	1.6	158	1,432,862
ppoy	45.51	6.74	42.70	5,597,590		pst	58.40	6.15	17.25	6,397,126		ecart	5	0.9	69	1,298,284
tma	46.25	6.70	49.16	1,860,725		pge	59.11	7.20	24.37	5,489,680		%   	20	55	43	91
sbn	46.28	3.78	37.32	5,347,283		blo	60.12	6.49	5.75	2,256,640						
pgi	48.29	7.57	33.46	2,343,476		bla	60.49	7.94	4.13	1,933,695			Groupe G2 A86	n=16		
rho	48.50	5.02	46.76	3,592,125		ret	61.27	6.02	9.09	4,381,608						
cpb	48.93	7.96	51.36	2,736,403		sus	61.90	9.66	7.51	9,965,640		KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA
hav	48.99	5.48	37.06	4,712,721		rer	62.31	8.50	2.22	6,516,310		sep	32.10	1.77	76.43	2,499,279
eal	49.70	5.97	38.99	4,701,875		lhk	62.35	7.75	16.77	3,169,329		sepp	32.12	1.78	75.40	2,490,012
ecs	50.54	6.22	38.21	5,498,450		smx	62.65	7.31	6.91	3,908,022		ser	32.15	1.82	75.39	2,616,530
eco	50.79	5.42	36.04	4,641,652		smk	62.67	7.36	6.95	3,820,344		rri	32.47	2.09	93.01	1,257,710
sfl	50.89	5.68	35.71	4,607,202		xac	64.77	5.72	5.59	5,175,554		cft	33.21	1.17	122.40	1,800,764
eca	50.97	5.96	33.59	5,064,019		cvi	64.83	6.49	9.94	4,751,080		cfv	33.26	1.23	123.39	1,866,009
sbo	51.21	5.60	35.02	4,519,823		xcb	64.96	5.23	5.84	5,148,708		cff	33.31	1.17	121.97	1,773,615
sbz	51.34	7.27	39.06	4,683,551		rpa	65.04	5.26	3.01	5,459,213		ljf	34.49	1.49	83.08	1,755,993
sty	52.09	6.84	37.77	4,809,037		pae	66.56	7.48	4.45	6,264,404		lla	35.33	2.60	102.02	2,365,589
spq	52.11	6.60	37.89	4,858,887		bmv	68.15	5.25	5.64	3,497,479		cpy	35.35	2.63	64.82	4,847,594
														liv	37.13	2.70	90.41	2,928,879
							moy	51	6.6	39	4,106,380		spi	38.32	2.94	80.21	1,937,111
							ecart	8	1.4	26	1,590,826		spl	39.09	2.96	63.32	1,796,846
							%   	16	20	69	39			tsu	39.16	1.42	123.52	2,731,853
														gva	42.02	1.77	45.95	1,617,545
														men	43.52	3.46	41.37	538,294
																
														moy	36	2.1	86	2,176,476
														ecart	4	0.7	27	933,080
														%   	10	35	31	43

Groupes 14 25 68[modifier | modifier le wikicode]

  • Groupages couplés aux écarts relatifs à l'aléa
Groupe 14: 31 bactéries >4GC 11-18 %00			Groupe 25: 31 bactéries >4GC 21-33 %00				
										
KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA                     KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA
gba	72.56	10.82	0.26	5,311,527		scl	71.38	20.94	1.22	13,033,779
gau	64.27	11.05	3.56	4,636,964		mxa	68.89	21.48	1.02	9,139,763
sfo	50.88	11.13	32.79	5,488,183		gdi	66.43	21.58	6.03	3,944,163
pes	56.06	11.34	31.92	4,513,140		ebt	56.51	21.58	29.86	4,158,725
dpd	63.97	11.35	9.43	3,881,839		say	56.76	22.08	27.19	3,551,206
amo	47.97	11.46	41.77	2,160,700		fra	70.08	22.11	1.39	5,433,628
ppk	64.72	11.67	5.63	5,429,298		sap	56.76	22.12	27.21	3,472,898
asd	62.24	11.70	3.38	4,738,809		afw	73.53	22.17	0.33	5,277,990
dba	58.65	11.78	29.73	3,942,657		ccx	69.90	22.32	0.87	10,080,619
ype	47.64	11.87	38.12	4,653,728		dpt	66.16	22.44	9.20	2,147,060
ypg	47.60	11.88	38.49	4,504,254		sma	70.72	23.65	0.69	9,025,608
tro	63.65	11.88	3.15	2,003,006		sco	72.12	24.50	0.45	8,667,507
ams	70.82	12.31	0.88	8,773,466		dvl	63.01	24.57	4.99	3,462,887
amd	71.29	13.55	0.82	10,236,715		sho	72.04	24.73	0.47	9,840,102
apt	53.04	13.58	34.96	2,907,495		phm	73.29	24.86	0.59	3,803,225
req	68.82	14.04	0.42	5,043,170		mts	70.28	25.31	0.48	3,982,034
eic	57.44	14.25	23.22	3,812,301		pdo	58.31	25.33	12.90	1,890,857
nfa	70.83	14.30	0.46	6,021,225		sbh	70.75	25.40	0.84	11,936,683
roa	67.37	14.36	0.74	8,376,953		ipa	62.44	25.63	6.40	5,472,964
pgd	59.62	14.95	11.99	3,776,653		saci	62.27	26.08	8.25	9,629,675
rha	67.52	15.01	0.78	7,804,765		ssx	71.75	26.55	0.53	7,414,440
pac	60.01	15.05	5.45	2,560,265		salu	72.32	26.75	0.66	9,360,281
pak	60.10	15.11	5.39	2,495,334		sall	72.13	27.12	0.69	9,784,577
ddr	63.39	16.30	8.09	2,819,842		dge	66.64	27.98	7.14	2,467,205
ade	74.91	16.35	0.28	5,013,479		age	69.45	28.18	0.97	12,489,432
acp	74.72	16.38	0.27	5,029,329		rru	65.45	28.23	9.81	4,352,825
ank	74.84	16.52	0.25	5,061,632		scb	71.45	28.28	0.59	10,148,695
vin	68.94	16.63	1.72	4,350,553		ksk	74.20	28.47	0.38	8,783,278
sti	68.10	16.79	0.79	2,741,033		sct	72.94	28.63	0.53	6,283,062
cmi	72.66	16.98	0.40	3,297,891		sgr	72.23	30.32	0.46	8,545,929
tpas	52.79	17.47	41.05	1,139,203		salb	73.32	33.42	0.46	6,841,649
										
moy	63	13.8	12	4,597,594		moy	68	25.3	5	6,916,863
ecart	8	2	15	2,043,599		ecart	5	3	8	3,238,795
%   	13	16	126	44			%   	8	12	159	47
										
										
Groupe 68: 12 bactéries >4GC 38-116 %00										
										
KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA						
sur	67.46	38.05	2.45	10,260,756						
opr	70.02	40.26	3.65	2,303,940						
msv	62.36	43.71	15.11	3,249,394						
tra	68.14	47.06	14.34	3,260,398						
mrb	63.38	48.09	19.32	3,097,457						
mhd	68.08	51.08	6.66	2,269,167						
tsc	64.89	70.97	10.09	2,346,803						
tai	63.79	82.29	3.86	1,848,474						
tts	68.92	93.39	5.31	1,863,201						
ttl	69.09	94.77	4.71	1,902,595						
tth	69.44	95.48	4.44	1,894,877						
tos	68.55	116.27	6.94	2,072,393						
										
moy	67	68	8	3,030,788						
ecart	3	27	5	2,339,315						
%   	4	39	67	77						
  • Groupage avec hypothèse de la résonance
G14,A1		n=13					G25,A1		n=20					G7,Ar		n=53	
																
KEGG	%GC     >4GC14  >4AT    DNA                     KEGG    %GC     >4GC25  >4AT    DNA                     KEGG    %GC     >4GCr   >4ATr   DNA
acp	74.72	16.38	0.27	5,029,329		afw	73.53	22.17	0.33	5,277,990		aba	58.38	5.60	10.51	5,650,368
ade	74.91	16.35	0.28	5,013,479		age	69.45	28.18	0.97	12,489,432		bla	60.49	7.94	4.13	1,933,695
amd	71.29	13.55	0.82	10,236,715		ccx	69.90	22.32	0.87	10,080,619		blo	60.12	6.49	5.75	2,256,640
ams	70.82	12.31	0.88	8,773,466		fra	70.08	22.11	1.39	5,433,628		bmf1	57.16	6.69	18.51	2,121,359
ank	74.84	16.52	0.25	5,061,632		ksk	74.20	28.47	0.38	8,783,278		bmf2	57.34	7.60	17.57	1,156,948
cmi	72.66	16.98	0.40	3,297,891		mts	70.28	25.31	0.48	3,982,034		bmv	68.15	5.25	5.64	3,497,479
gba	72.56	10.82	0.26	5,311,527		mxa	68.89	21.48	1.02	9,139,763		cgl	53.81	7.78	19.72	3,309,401
nfa	70.83	14.30	0.46	6,021,225		phm	73.29	24.86	0.59	3,803,225		cgq	54.15	7.81	19.17	3,145,677
req	68.82	14.04	0.42	5,043,170		salb	73.32	33.42	0.46	6,841,649		cko	53.83	7.00	31.57	4,720,462
rha	67.52	15.01	0.78	7,804,765		sall	72.13	27.12	0.69	9,784,577		cnt	55.10	6.62	29.88	4,876,443
roa	67.37	14.36	0.74	8,376,953		salu	72.32	26.75	0.66	9,360,281		cpb	48.93	7.96	51.36	2,736,403
sti	68.10	16.79	0.79	2,741,033		sbh	70.75	25.40	0.84	11,936,683		cvi	64.83	6.49	9.94	4,751,080
vin	68.94	16.63	1.72	4,350,553		scb	71.45	28.28	0.59	10,148,695		dda	55.02	9.77	29.59	4,679,450
							scl	71.38	20.94	1.22	13,033,779		eal	49.70	5.97	38.99	4,701,875
moy	71	14.9	0.62	5,927,826		sco	72.12	24.50	0.45	8,667,507		ebf	54.02	5.79	30.02	4,762,179
ecart	3	1.9	0.41	2,22,3175		sct	72.94	28.63	0.53	6,283,062		eca	50.97	5.96	33.59	5,064,019
%   	4	13	66	38			sgr	72.23	30.32	0.46	8,545,929		ecla	55.18	7.54	28.38	4,633,407
							sho	72.04	24.73	0.47	9,840,102		eco	50.79	5.42	36.04	4,641,652
G14,Ar		n=18					sma	70.72	23.65	0.69	9,025,608		ecs	50.54	6.22	38.21	5,498,450
							ssx	71.75	26.55	0.53	7,414,440		eha	55.56	8.78	42.99	3,008,576
KEGG	%GC     >4GC14  >4AT    DNA                                                                             eno     55.07   8.01    28.21   4,726,582
amo	47.97	11.46	41.77	2,160,700		moy	72	26	0.68	8493614.05		ent	52.98	5.52	32.12	4,518,712
apt	53.04	13.58	34.96	2,907,495		ecart	1	3	0.29	2611496.81		esa	56.77	4.23	29.49	4,368,373
asd	62.24	11.70	3.38	4,738,809		%   	2	13	42	31			eta	53.73	9.30	32.52	3,883,467
dba	58.65	11.78	29.73	3,942,657									hav	48.99	5.48	37.06	4,712,721
ddr	63.39	16.30	8.09	2,819,842		G25,Ar		n=11					kin	52.75	8.87	34.47	5,529,134
dpd	63.97	11.35	9.43	3,881,839									koy	55.92	8.16	30.51	5,914,407
eic	57.44	14.25	23.22	3,812,301		KEGG	%GC     >4GC25  >4AT    DNA                     kpn     57.48   9.41    25.79   5,315,120
gau	64.27	11.05	3.56	4,636,964		dge	66.64	27.98	7.14	2,467,205		ksa	53.74	4.99	34.67	4,902,024
pac	60.01	15.05	5.45	2,560,265		dpt	66.16	22.44	9.20	2,147,060		lhk	62.35	7.75	16.77	3,169,329
pak	60.10	15.11	5.39	2,495,334		dvl	63.01	24.57	4.99	3,462,887		pae	66.56	7.48	4.45	6,264,404
pes	56.06	11.34	31.92	4,513,140		ebt	56.51	21.58	29.86	4,158,725		pam	53.69	5.97	32.22	4,703,373
pgd	59.62	14.95	11.99	3,776,653		gdi	66.43	21.58	6.03	3,944,163		pge	59.11	7.20	24.37	5,489,680
ppk	64.72	11.67	5.63	5,429,298		ipa	62.44	25.63	6.40	5,472,964		pgi	48.29	7.57	33.46	2,343,476
sfo	50.88	11.13	32.79	5,488,183		pdo	58.31	25.33	12.90	1,890,857		pst	58.40	6.15	17.25	6,397,126
tpas	52.79	17.47	41.05	1,139,203		rru	65.45	28.23	9.81	4,352,825		raq	52.12	6.27	34.30	4,861,101
tro	63.65	11.88	3.15	2,003,006		saci	62.27	26.08	8.25	9,629,675		rer	62.31	8.50	2.22	6,516,310
ype	47.64	11.87	38.12	4,653,728		sap	56.76	22.12	27.21	3,472,898		ret	61.27	6.02	9.09	4,381,608
ypg	47.60	11.88	38.49	4,504,254		say	56.76	22.08	27.19	3,551,206		rho	48.50	5.02	46.76	3,592,125
														ror	55.88	8.26	28.72	5,398,151
moy	57	13	20	3,636,871		moy	62	24	14	4,050,042		rpa	65.04	5.26	3.01	5,459,213
ecart	6	2	15	1,245,257		ecart	4	3	10	2,121,018		sbo	51.21	5.60	35.02	4,519,823
%   	11	16	75	34		        %       7       10      71      52                      sbz     51.34   7.27    39.06   4,683,551
														sfl	50.89	5.68	35.71	4,607,202
														smk	62.67	7.36	6.95	3,820,344
														smx	62.65	7.31	6.91	3,908,022
														spe	55.07	8.85	26.24	5,448,853
														spq	52.11	6.60	37.89	4,858,887
														stm	52.22	6.55	37.92	4,857,432
														sty	52.09	6.84	37.77	4,809,037
														sus	61.90	9.66	7.51	9,965,640
														xac	64.77	5.72	5.59	5,175,554
														xcb	64.96	5.23	5.84	5,148,708
																
														moy	56	6.9	25	4,554,624
														ecart	5	1.4	13	1,380,587
														%   	9	20	53	30

Groupes des autre-bactéries selon le taux de >4AT[modifier | modifier le wikicode]

Groupes I II III[modifier | modifier le wikicode]

Groupe III: 56 bactéries >4AT 23−52 %00		Groupe II: 47 bactéries >4AT 3−20 %00		        Groupe I: 35 bactéries >4AT 0.3−2.5 %00
																
KEGG	%GC	>4GC    >4AT    DNA                     KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA                     KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA
xbo	44.97	7.44	51.50	4,225,498		cgl	53.81	7.78	19.72	3,309,401		sur	67.46	38.05	2.45	10,260,756
cpb	48.93	7.96	51.36	2,736,403		mrb	63.38	48.09	19.32	3,097,457		rer	62.31	8.50	2.22	6,516,310
plu	42.83	6.87	51.05	5,688,987		cgq	54.15	7.81	19.17	3,145,677		vin	68.94	16.63	1.72	4,350,553
tma	46.25	6.70	49.16	1,860,725		bmf1	57.16	6.69	18.51	2,121,359		fra	70.08	22.11	1.39	5,433,628
rho	48.50	5.02	46.76	3,592,125		bmf2	57.34	7.60	17.57	1,156,948		scl	71.38	20.94	1.22	13,033,779
gva	42.02	1.77	45.95	1,617,545		pst	58.40	6.15	17.25	6,397,126		mxa	68.89	21.48	1.02	9,139,763
ppm	45.24	6.76	43.58	5,728,392		lhk	62.35	7.75	16.77	3,169,329		age	69.45	28.18	0.97	12,489,432
ral	44.21	4.06	43.28	3,685,408		msv	62.36	43.71	15.11	3,249,394		ams	70.82	12.31	0.88	8,773,466
eha	55.56	8.78	42.99	3,008,576		tra	68.14	47.06	14.34	3,260,398		ccx	69.90	22.32	0.87	10,080,619
ppoy	45.51	6.74	42.70	5,597,590		pdo	58.31	25.33	12.90	1,890,857		sbh	70.75	25.40	0.84	11,936,683
amo	47.97	11.46	41.77	2,160,700		pgd	59.62	14.95	11.99	3,776,653		amd	71.29	13.55	0.82	10,236,715
pfq	45.38	5.78	41.71	4,094,629		aba	58.38	5.60	10.51	5,650,368		sti	68.10	16.79	0.79	2,741,033
men	43.52	3.46	41.37	538,294			tsc	64.89	70.97	10.09	2,346,803		rha	67.52	15.01	0.78	7,804,765
tpas	52.79	17.47	41.05	1,139,203		cvi	64.83	6.49	9.94	4,751,080		roa	67.37	14.36	0.74	8,376,953
sbz	51.34	7.27	39.06	4,683,551		rru	65.45	28.23	9.81	4,352,825		sma	70.72	23.65	0.69	9,025,608
eal	49.70	5.97	38.99	4,701,875		dpd	63.97	11.35	9.43	3,881,839		sall	72.13	27.12	0.69	9,784,577
ypg	47.60	11.88	38.49	4,504,254		dpt	66.16	22.44	9.20	2,147,060		salu	72.32	26.75	0.66	9,360,281
ecs	50.54	6.22	38.21	5,498,450		ret	61.27	6.02	9.09	4,381,608		phm	73.29	24.86	0.59	3,803,225
ype	47.64	11.87	38.12	4,653,728		saci	62.27	26.08	8.25	9,629,675		scb	71.45	28.28	0.59	10,148,695
stm	52.22	6.55	37.92	4,857,432		ddr	63.39	16.30	8.09	2,819,842		ssx	71.75	26.55	0.53	7,414,440
spq	52.11	6.60	37.89	4,858,887		sus	61.90	9.66	7.51	9,965,640		sct	72.94	28.63	0.53	6,283,062
sty	52.09	6.84	37.77	4,809,037		dge	66.64	27.98	7.14	2,467,205		mts	70.28	25.31	0.48	3,982,034
sbn	46.28	3.78	37.32	5,347,283		smk	62.67	7.36	6.95	3,820,344		sho	72.04	24.73	0.47	9,840,102
hav	48.99	5.48	37.06	4,712,721		tos	68.55	116.27	6.94	2,072,393		nfa	70.83	14.30	0.46	6,021,225
lpl	44.47	5.84	36.53	3,308,273		smx	62.65	7.31	6.91	3,908,022		sgr	72.23	30.32	0.46	8,545,929
eco	50.79	5.42	36.04	4,641,652		mhd	68.08	51.08	6.66	2,269,167		salb	73.32	33.42	0.46	6,841,649
sfl	50.89	5.68	35.71	4,607,202		ipa	62.44	25.63	6.40	5,472,964		sco	72.12	24.50	0.45	8,667,507
sbo	51.21	5.60	35.02	4,519,823		gdi	66.43	21.58	6.03	3,944,163		req	68.82	14.04	0.42	5,043,170
apt	53.04	13.58	34.96	2,907,495		xcb	64.96	5.23	5.84	5,148,708		cmi	72.66	16.98	0.40	3,297,891
ksa	53.74	4.99	34.67	4,902,024		blo	60.12	6.49	5.75	2,256,640		ksk	74.20	28.47	0.38	8,783,278
kin	52.75	8.87	34.47	5,529,134		bmv	68.15	5.25	5.64	3,497,479		afw	73.53	22.17	0.33	5,277,990
raq	52.12	6.27	34.30	4,861,101		ppk	64.72	11.67	5.63	5,429,298		ade	74.91	16.35	0.28	5,013,479
eca	50.97	5.96	33.59	5,064,019		xac	64.77	5.72	5.59	5,175,554		acp	74.72	16.38	0.27	5,029,329
pgi	48.29	7.57	33.46	2,343,476		pac	60.01	15.05	5.45	2,560,265		gba	72.56	10.82	0.26	5,311,527
sfo	50.88	11.13	32.79	5,488,183		pak	60.10	15.11	5.39	2,495,334		ank	74.84	16.52	0.25	5,061,632
eta	53.73	9.30	32.52	3,883,467		tts	68.92	93.39	5.31	1,863,201						
pam	53.69	5.97	32.22	4,703,373		dvl	63.01	24.57	4.99	3,462,887		moyen.	71	22	1	7,534,602
ent	52.98	5.52	32.12	4,518,712		ttl	69.09	94.77	4.71	1,902,595		ecartt	3	7	1	2,707,907
pes	56.06	11.34	31.92	4,513,140		pae	66.56	7.48	4.45	6,264,404		%   	4	32	68	36
cko	53.83	7.00	31.57	4,720,462		tth	69.44	95.48	4.44	1,894,877						
koy	55.92	8.16	30.51	5,914,407		bla	60.49	7.94	4.13	1,933,695						
ebf	54.02	5.79	30.02	4,762,179		tai	63.79	82.29	3.86	1,848,474						
cnt	55.10	6.62	29.88	4,876,443		opr	70.02	40.26	3.65	2,303,940						
ebt	56.51	21.58	29.86	4,158,725		gau	64.27	11.05	3.56	4,636,964						
dba	58.65	11.78	29.73	3,942,657		asd	62.24	11.70	3.38	4,738,809						
dda	55.02	9.77	29.59	4,679,450		tro	63.65	11.88	3.15	2,003,006						
esa	56.77	4.23	29.49	4,368,373		rpa	65.04	5.26	3.01	5,459,213						
ror	55.88	8.26	28.72	5,398,151												
ecla	55.18	7.54	28.38	4,633,407		moyen.	63	26	9	3,687,892						
eno	55.07	8.01	28.21	4,726,582		ecartt	4	29	5	1,869,769						
sap	56.76	22.12	27.21	3,472,898		%   	6	110	57	51						
say	56.76	22.08	27.19	3,551,206												
spe	55.07	8.85	26.24	5,448,853												
kpn	57.48	9.41	25.79	5,315,120												
pge	59.11	7.20	24.37	5,489,680												
eic	57.44	14.25	23.22	3,812,301												
																
moyen.	51	8	36	4,274,344												
ecartt	4	4	7	1,195,261												
%   	9	52	19	28												

Groupes IV V[modifier | modifier le wikicode]

Groupe IV: 35 bactéries >4AT 61−112 %00			Groupe V: 19 bactéries >4AT 122−330 %00	
										
KEGG	%GC	>4GC    >4AT    DNA                     KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA
cbl	28.31	3.00	111.65	3,992,906		cru	13.98	0.37	330.82	162,589
bpn	29.56	2.26	105.27	791,654			zin	13.54	0.82	295.48	208,564
lla	35.33	2.60	102.02	2,365,589		crp	16.56	0.25	282.78	159,662
cdf	29.06	2.14	100.84	4,290,252		wbr	22.48	0.92	208.59	697,724
rpr	29.00	0.95	100.55	1,111,523		buc	26.31	1.36	185.43	640,681
rpw	29.01	0.95	100.42	1,109,804		sms	24.00	3.41	174.13	190,657
rty	28.92	0.82	99.29	1,111,496		rip	28.48	1.43	169.87	574,390
cac	30.93	2.49	95.73	3,940,880		mcac	23.66	0.64	164.01	1,017,293
asf	28.26	2.46	94.96	1,620,005		cjr	30.31	2.05	162.10	1,777,831
rri	32.47	2.09	93.01	1,257,710		cje	30.55	2.14	160.17	1,641,481
liv	37.13	2.70	90.41	2,928,879		uur	25.50	1.12	147.16	751,719
lat	36.32	5.00	89.97	1,190,853		fnc	27.12	1.73	144.60	2,268,272
cad	29.93	2.36	87.91	3,105,335		ple	26.17	2.15	143.87	358,242
cbd	42.44	9.01	84.09	2,158,758		tme	31.40	4.81	135.95	1,915,238
ljf	34.49	1.49	83.08	1,755,993		tde	37.87	4.02	126.87	2,843,201
cth	38.99	4.42	81.59	3,843,301		tsu	39.16	1.42	123.52	2,731,853
spi	38.32	2.94	80.21	1,937,111		cfv	33.26	1.23	123.39	1,866,009
sep	32.10	1.77	76.43	2,499,279		cft	33.21	1.17	122.40	1,800,764
sepp	32.12	1.78	75.40	2,490,012		cff	33.31	1.17	121.97	1,773,615
ser	32.15	1.82	75.39	2,616,530						
cmn	40.34	8.81	74.88	1,072,952		moyen.	27	2	175	1,230,515
bae	43.22	5.04	74.05	4,168,266		ecartt	7	1	62	894,543
bsu	43.51	4.90	72.57	4,215,606		%   	26	71	36	73
amt	36.82	7.09	70.56	4,929,566						
cle	34.32	3.89	70.51	4,714,237						
chp	39.06	5.45	68.85	1,171,660						
pmr	38.90	6.12	68.33	4,063,606						
ctr	41.31	5.93	65.75	1,042,519						
cta	41.30	6.02	65.49	1,044,459						
cpy	35.35	2.63	64.82	4,847,594						
spl	39.09	2.96	63.32	1,796,846						
aae	43.48	7.94	62.53	1,551,335						
sect	43.29	7.15	61.10	1,441,139						
clo	44.21	5.27	60.99	1,809,746						
psi	41.27	7.21	60.76	4,402,109						
										
moyen.	36	4	81	2,525,415						
ecartt	5	2	15	1,358,428						
%   	15	59	18	54						

Autre-bactéries:ruptures entre les groupes à progression homogène[modifier | modifier le wikicode]

		Autre-bactéries:taux >4GC                                       |                       Autre-bactéries:taux >4AT
KEGG	%GC	>4GC    #%    groupe    KEGG    %GC     >4GC    #%   groupe     |       KEGG    %GC     >4AT    #%  groupe      KEGG    %GC     >4AT    #%  groupe
crp	16.56	0.25	47    **2**	ecla	55.18	7.54	0		|	ank	74.84	0.25	1   ** I **	ebf	54.02	30.02	2	
cru	13.98	0.37	73		pgi	48.29	7.57	0		|	gba	72.56	0.26	7		koy	55.92	30.51	3	
mcac	23.66	0.64	28		bmf2	57.34	7.60	2		|	acp	74.72	0.27	3		cko	53.83	31.57	1	
zin	13.54	0.82	0		lhk	62.35	7.75	0		|	ade	74.91	0.28	14		pes	56.06	31.92	1	
rty	28.92	0.82	12		cgl	53.81	7.78	0		|	afw	73.53	0.33	14		ent	52.98	32.12	0	
wbr	22.48	0.92	3		cgq	54.15	7.81	2		|	ksk	74.20	0.38	5		pam	53.69	32.22	1	
rpw	29.01	0.95	1		aae	43.48	7.94	0		|	cmi	72.66	0.40	5		eta	53.73	32.52	1	
rpr	29.00	0.95	17		bla	60.49	7.94	0		|	req	68.82	0.42	6		sfo	50.88	32.79	2	
uur	25.50	1.12	4		cpb	48.93	7.96	1		|	sco	72.12	0.45	2		pgi	48.29	33.46	0	
cft	33.21	1.17	0		eno	55.07	8.01	2		|	salb	73.32	0.46	1		eca	50.97	33.59	2	
cff	33.31	1.17	5		koy	55.92	8.16	1		|	sgr	72.23	0.46	0		raq	52.12	34.30	0	
cfv	33.26	1.23	11		ror	55.88	8.26	3		|	nfa	70.83	0.46	2		kin	52.75	34.47	1	
buc	26.31	1.36	4		rer	62.31	8.50	3		|	sho	72.04	0.47	2		ksa	53.74	34.67	1	
tsu	39.16	1.42	1		eha	55.56	8.78	0		|	mts	70.28	0.48	9		apt	53.04	34.96	0	
rip	28.48	1.43	5		cmn	40.34	8.81	0		|	sct	72.94	0.53	0		sbo	51.21	35.02	2	
ljf	34.49	1.49	16		spe	55.07	8.85	0		|	ssx	71.75	0.53	10		sfl	50.89	35.71	1	
fnc	27.12	1.73	2		kin	52.75	8.87	2		|	scb	71.45	0.59	1		eco	50.79	36.04	1	
sep	32.10	1.77	0		cbd	42.44	9.01	3		|	phm	73.29	0.59	10		lpl	44.47	36.53	1	
gva	42.02	1.77	0		eta	53.73	9.30	1		|	salu	72.32	0.66	3		hav	48.99	37.06	1	
sepp	32.12	1.78	2		kpn	57.48	9.41	3		|	sall	72.13	0.69	1		sbn	46.28	37.32	1	
ser	32.15	1.82	13		sus	61.90	9.66	1		|	sma	70.72	0.69	6		sty	52.09	37.77	0	
cjr	30.31	2.05	2		dda	55.02	9.77	11		|	roa	67.37	0.74	6		spq	52.11	37.89	0	
rri	32.47	2.09	2		gba	72.56	10.82	2   **14**	|	rha	67.52	0.78	1		stm	52.22	37.92	1	
cdf	29.06	2.14	0		gau	64.27	11.05	1		|	sti	68.10	0.79	4		ype	47.64	38.12	0	
cje	30.55	2.14	1		sfo	50.88	11.13	2		|	amd	71.29	0.82	2		ecs	50.54	38.21	1	
ple	26.17	2.15	5		pes	56.06	11.34	0		|	sbh	70.75	0.84	4		ypg	47.60	38.49	1	
bpn	29.56	2.26	4		dpd	63.97	11.35	1		|	ccx	69.90	0.87	2		eal	49.70	38.99	0	
cad	29.93	2.36	4		amo	47.97	11.46	2		|	ams	70.82	0.88	9		sbz	51.34	39.06	5	
asf	28.26	2.46	1		ppk	64.72	11.67	0		|	age	69.45	0.97	5		tpas	52.79	41.05	1	
cac	30.93	2.49	4		asd	62.24	11.70	1		|	mxa	68.89	1.02	17		men	43.52	41.37	1	
lla	35.33	2.60	1		dba	58.65	11.78	1		|	scl	71.38	1.22	12		pfq	45.38	41.71	0	
cpy	35.35	2.63	2		ype	47.64	11.87	0		|	fra	70.08	1.39	19		amo	47.97	41.77	2	
liv	37.13	2.70	9		ypg	47.60	11.88	0		|	vin	68.94	1.72	22		ppoy	45.51	42.70	1	
spi	38.32	2.94	0		tro	63.65	11.88	4		|	rer	62.31	2.22	9		eha	55.56	42.99	1	
spl	39.09	2.96	2		ams	70.82	12.31	10		|	sur	67.46	2.45	19		ral	44.21	43.28	1	
cbl	28.31	3.00	14		amd	71.29	13.55	0		|	rpa	65.04	3.01	4    ** II **	ppm	45.24	43.58	5	
sms	24.00	3.41	1		apt	53.04	13.58	3		|	tro	63.65	3.15	7		gva	42.02	45.95	2	
men	43.52	3.46	9		req	68.82	14.04	1		|	asd	62.24	3.38	5		rho	48.50	46.76	5	
sbn	46.28	3.78	3		eic	57.44	14.25	0		|	gau	64.27	3.56	3		tma	46.25	49.16	4	
cle	34.32	3.89	3		nfa	70.83	14.30	0		|	opr	70.02	3.65	5		plu	42.83	51.05	1	
tde	37.87	4.02	1		roa	67.37	14.36	4		|	tai	63.79	3.86	6		cpb	48.93	51.36	0	
ral	44.21	4.06	4		pgd	59.62	14.95	0		|	bla	60.49	4.13	7		xbo	44.97	51.50	15	
esa	56.77	4.23	4		rha	67.52	15.01	0		|	tth	69.44	4.44	0		psi	41.27	60.76	0  **IV**
cth	38.99	4.42	9		pac	60.01	15.05	0		|	pae	66.56	4.45	6		clo	44.21	60.99	0	
tme	31.40	4.81	2    **7**	pak	60.10	15.11	8		|	ttl	69.09	4.71	6		sect	43.29	61.10	2	
bsu	43.51	4.90	2		ddr	63.39	16.30	0		|	dvl	63.01	4.99	6		aae	43.48	62.53	1	
ksa	53.74	4.99	0		ade	74.91	16.35	0		|	tts	68.92	5.31	1		spl	39.09	63.32	2	
lat	36.32	5.00	0		acp	74.72	16.38	1		|	pak	60.10	5.39	1		cpy	35.35	64.82	1	
rho	48.50	5.02	0		ank	74.84	16.52	1		|	pac	60.01	5.45	3		cta	41.30	65.49	0	
bae	43.22	5.04	4		vin	68.94	16.63	1		|	xac	64.77	5.59	1		ctr	41.31	65.75	4	
xcb	64.96	5.23	0		sti	68.10	16.79	1		|	ppk	64.72	5.63	0		pmr	38.90	68.33	1	
bmv	68.15	5.25	0		cmi	72.66	16.98	3		|	bmv	68.15	5.64	2		chp	39.06	68.85	2	
rpa	65.04	5.26	0		tpas	52.79	17.47	20		|	blo	60.12	5.75	2		cle	34.32	70.51	0	
clo	44.21	5.27	3		scl	71.38	20.94	3    **25**	|	xcb	64.96	5.84	3		amt	36.82	70.56	3	
eco	50.79	5.42	1		mxa	68.89	21.48	0		|	gdi	66.43	6.03	6		bsu	43.51	72.57	2	
chp	39.06	5.45	1		gdi	66.43	21.58	0		|	ipa	62.44	6.40	4		bae	43.22	74.05	1	
hav	48.99	5.48	1		ebt	56.51	21.58	2		|	mhd	68.08	6.66	4		cmn	40.34	74.88	1	
ent	52.98	5.52	1		say	56.76	22.08	0		|	smx	62.65	6.91	0		ser	32.15	75.39	0	
sbo	51.21	5.60	0		fra	70.08	22.11	0		|	tos	68.55	6.94	0		sepp	32.12	75.40	1	
aba	58.38	5.60	1		sap	56.76	22.12	0		|	smk	62.67	6.95	3		sep	32.10	76.43	5	
sfl	50.89	5.68	1		afw	73.53	22.17	1		|	dge	66.64	7.14	5		spi	38.32	80.21	2	
xac	64.77	5.72	1		ccx	69.90	22.32	1		|	sus	61.90	7.51	7		cth	38.99	81.59	2	
pfq	45.38	5.78	0		dpt	66.16	22.44	5		|	ddr	63.39	8.09	2		ljf	34.49	83.08	1	
ebf	54.02	5.79	1		sma	70.72	23.65	4		|	saci	62.27	8.25	9		cbd	42.44	84.09	4	
lpl	44.47	5.84	1		sco	72.12	24.50	0		|	ret	61.27	9.09	1		cad	29.93	87.91	2	
ctr	41.31	5.93	0		dvl	63.01	24.57	1		|	dpt	66.16	9.20	2		lat	36.32	89.97	0	
eca	50.97	5.96	0		sho	72.04	24.73	1		|	dpd	63.97	9.43	4		liv	37.13	90.41	3	
eal	49.70	5.97	0		phm	73.29	24.86	2		|	rru	65.45	9.81	1		rri	32.47	93.01	2	
pam	53.69	5.97	1		mts	70.28	25.31	0		|	cvi	64.83	9.94	1		asf	28.26	94.96	1	
ret	61.27	6.02	0		pdo	58.31	25.33	0		|	tsc	64.89	10.09	4		cac	30.93	95.73	4	
cta	41.30	6.02	2		sbh	70.75	25.40	1		|	aba	58.38	10.51	12		rty	28.92	99.29	1	
pmr	38.90	6.12	1		ipa	62.44	25.63	2		|	pgd	59.62	11.99	7		rpw	29.01	100.42	0	
pst	58.40	6.15	1		saci	62.27	26.08	2		|	pdo	58.31	12.90	10		rpr	29.00	100.55	0	
ecs	50.54	6.22	1		ssx	71.75	26.55	1		|	tra	68.14	14.34	5		cdf	29.06	100.84	1	
raq	52.12	6.27	3		salu	72.32	26.75	1		|	msv	62.36	15.11	10		lla	35.33	102.02	3	
blo	60.12	6.49	0		sall	72.13	27.12	3		|	lhk	62.35	16.77	3		bpn	29.56	105.27	6	
cvi	64.83	6.49	1		dge	66.64	27.98	1		|	pst	58.40	17.25	2		cbl	28.31	111.65	8	
stm	52.22	6.55	1		age	69.45	28.18	0		|	bmf2	57.34	17.57	5		cff	33.31	121.97	0  **V**
spq	52.11	6.60	0		rru	65.45	28.23	0		|	bmf1	57.16	18.51	3		cft	33.21	122.40	1	
cnt	55.10	6.62	1		scb	71.45	28.28	1		|	cgq	54.15	19.17	1		cfv	33.26	123.39	0	
bmf1	57.16	6.69	0		ksk	74.20	28.47	1		|	mrb	63.38	19.32	2		tsu	39.16	123.52	3	
tma	46.25	6.70	1		sct	72.94	28.63	6		|	cgl	53.81	19.72	15		tde	37.87	126.87	7	
ppoy	45.51	6.74	0		sgr	72.23	30.32	10		|	eic	57.44	23.22	5    **III**	tme	31.40	135.95	6	
ppm	45.24	6.76	1		salb	73.32	33.42	14		|	pge	59.11	24.37	5		ple	26.17	143.87	1	
sty	52.09	6.84	0		sur	67.46	38.05	6    **68**	|	kpn	57.48	25.79	2		fnc	27.12	144.60	2	
plu	42.83	6.87	2		opr	70.02	40.26	9		|	spe	55.07	26.24	3		uur	25.50	147.16	8	
cko	53.83	7.00	1		msv	62.36	43.71	8		|	say	56.76	27.19	0		cje	30.55	160.17	1	
amt	36.82	7.09	1		tra	68.14	47.06	2		|	sap	56.76	27.21	4		cjr	30.31	162.10	1	
sect	43.29	7.15	1		mrb	63.38	48.09	6		|	eno	55.07	28.21	1		mcac	23.66	164.01	3	
pge	59.11	7.20	0		mhd	68.08	51.08	39		|	ecla	55.18	28.38	1		rip	28.48	169.87	2	
psi	41.27	7.21	1		tsc	64.89	70.97	16		|	ror	55.88	28.72	3		sms	24.00	174.13	6	
sbz	51.34	7.27	1		tai	63.79	82.29	13		|	esa	56.77	29.49	0		buc	26.31	185.43	11	
smx	62.65	7.31	1		tts	68.92	93.39	1		|	dda	55.02	29.59	0		wbr	22.48	208.59	26	
smk	62.67	7.36	1		ttl	69.09	94.77	1		|	dba	58.65	29.73	0		crp	16.56	282.78	4	
xbo	44.97	7.44	0		tth	69.44	95.48	22		|	ebt	56.51	29.86	0		zin	13.54	295.48	11	
pae	66.56	7.48	1		tos	68.55	116.27			|	cnt	55.10	29.88	0		cru	13.98	330.82		

Cyanobactéries[modifier | modifier le wikicode]

Résultats[modifier | modifier le wikicode]

  • 49 cyanobactéries
 
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
amr; 6503724; 47.2538502556382; 10416; 10587; 5035; 5129; 326355; 328365; 281253; 278396; 21993; 22178; 15244; 14978; 0
ana; 6413771; 41.3475473321389; 16139; 16308; 2701; 2590; 375551; 373179; 217679; 219026; 32204; 31846; 11639; 11672; 0
anb1; 4329264; 38.1047679236009; 13593; 14177; 1732; 1792; 273098; 273360; 136468; 136365; 25851; 25468; 6772; 6679; 0
awa; 5705437; 38.3934657415374; 18155; 17745; 2918; 2971; 358006; 356146; 181670; 182265; 33948; 33241; 9024; 9078; 0
calo; 7023215; 42.2471617343339; 17692; 17973; 2603; 2775; 394859; 395858; 238674; 236977; 34547; 34477; 12327; 12492; 0
can; 4114099; 34.9583225877647; 19398; 19033; 2471; 2506; 269395; 269454; 115224; 114077; 29524; 29218; 7231; 7224; 0
ceo; 2794318; 33.4134840773312; 13692; 13306; 883; 923; 186877; 187285; 70249; 69932; 19102; 19070; 3401; 3451; 0
cep; 5315554; 40.1620602480946; 14530; 14528; 1940; 1796; 326651; 327212; 167659; 163102; 26922; 27297; 7157; 7088; 0
cgc; 3342364; 68.7071785119754; 327; 352; 7556; 7434; 63268; 65282; 263980; 262377; 1080; 1222; 15352; 15262; 0
ccmp; 6284095; 45.7272208647387; 10774; 10577; 2761; 2828; 322135; 322676; 230737; 229250; 23856; 23875; 10511; 10328; 0
csg; 7003560; 42.3024290503687; 18567; 18625; 3461; 3387; 400542; 399679; 244069; 242873; 35554; 35302; 12278; 12290; 0
cthe; 6315792; 44.4402697238921; 13550; 13261; 3054; 2999; 345476; 344449; 216431; 214522; 28235; 28332; 9321; 9420; 0
cya; 2932766; 60.2373322658541; 2730; 2755; 5483; 5428; 93931; 93463; 187008; 187846; 6399; 6511; 12273; 12232; 0
cyh; 4669813; 39.8213375995998; 15231; 14994; 3554; 3545; 295614; 295114; 153998; 153608; 26465; 26253; 10835; 10669; 0
cytc; 4934271; 37.875402465734; 17294; 17824; 3060; 3064; 318932; 321159; 153124; 153452; 29602; 29800; 10516; 10635; 0
cyu; 1443806; 31.1167843879302; 6935; 7384; 144; 144; 99409; 99718; 32240; 33183; 10273; 10710; 789; 815; 0
dsl; 3781008; 42.438365642178; 10365; 10678; 4065; 3920; 227939; 230652; 129168; 128699; 20654; 20656; 7187; 7180; 0
fis; 5821603; 40.9862884844604; 16150; 16890; 1740; 1912; 339436; 340711; 189937; 191040; 29722; 29769; 8922; 8994; 0
gei; 4681111; 58.4630870748419; 5951; 5828; 5192; 5067; 147413; 145992; 260053; 262737; 12485; 12251; 15289; 15064; 0
gen; 4150181; 33.3448107443989; 19988; 20294; 1321; 1416; 274030; 276293; 109244; 109996; 31237; 31016; 4394; 4405; 0
glp; 5431448; 43.2694375422539; 11624; 11913; 1119; 1099; 318839; 320753; 171681; 171718; 24518; 24693; 5236; 5307; 0
gvi; 4659019; 61.9978583474332; 4727; 4949; 5596; 5574; 139766; 140310; 293549; 293291; 8395; 8595; 13546; 13515; 0
hao; 4179170; 42.9225420358588; 10669; 11153; 2960; 2941; 251074; 255329; 142989; 142124; 20936; 21362; 8889; 8982; 0
lep; 5125950; 43.8673611720754; 13297; 13745; 1417; 1474; 273441; 277369; 188578; 186836; 24163; 24931; 7403; 7344; 0
len; 6244812; 46.6455995792988; 8355; 8414; 1607; 1668; 345998; 345528; 216003; 219001; 21647; 21473; 6689; 6967; 0
mar; 5842795; 42.3306311448545; 20469; 20818; 5798; 5646; 326735; 326500; 212716; 214301; 33221; 33546; 14604; 14099; 0
mic; 7470429; 46.2148157756402; 14670; 14431; 4759; 4741; 402745; 402180; 300621; 299833; 29105; 28538; 15039; 14766; 0
naz; 5354700; 38.4485592096663; 15628; 15844; 1635; 1670; 329014; 329013; 171970; 171683; 30142; 30314; 7535; 7750; 0
non; 6463965; 40.6307583658018; 16414; 16519; 2620; 2600; 385929; 385723; 212318; 212478; 32411; 32181; 10022; 10168; 0
oac; 7689443; 47.6010941234625; 17035; 16687; 9362; 9630; 401162; 397639; 344008; 344310; 32328; 32182; 25811; 25893; 0
oni; 7479014; 45.8676504683639; 19394; 19840; 4057; 4051; 398146; 400028; 284712; 286596; 37104; 37459; 13330; 13360; 0
plp; 4986817; 45.1933367516795; 13027; 13176; 1828; 1829; 271127; 271467; 181279; 180333; 23381; 23911; 8160; 8067; 0
pma; 1751080; 36.4421385659136; 5813; 5830; 332; 306; 116283; 117515; 50854; 51126; 10441; 10544; 1460; 1428; 0
pmg; 1641879; 31.3398855823115; 9967; 9929; 258; 243; 114294; 113247; 40246; 40673; 12449; 11958; 1121; 1070; 0
pmh; 1738790; 31.1450491433698; 10643; 10443; 273; 266; 120591; 119911; 42641; 42436; 13543; 12907; 1153; 1083; 0
pmm; 1657990; 30.7991604291944; 9706; 9560; 296; 249; 116937; 116443; 40236; 39875; 12795; 12503; 1168; 1081; 0
pmt; 2410873; 50.7397738245747; 2292; 3055; 1261; 983; 106121; 122264; 117770; 106083; 5503; 7098; 4762; 3878; 1
pmb; 1669886; 31.3215393146598; 10046; 10071; 267; 266; 115742; 115453; 40731; 41448; 12608; 12330; 1164; 1118; 0
riv; 8698463; 37.5358037391203; 28658; 28772; 2727; 2503; 569332; 570162; 251812; 250448; 53968; 53707; 10338; 10006; 0
scs; 5041209; 35.9532604182846; 19418; 19090; 649; 599; 343770; 342356; 134516; 135265; 32320; 32464; 4180; 4178; 0
syc; 2696255; 55.484329189932; 2387; 2392; 1617; 1558; 108940; 109175; 133191; 132733; 5750; 5659; 6451; 6556; 0
syf; 2695903; 55.4700224748442; 2368; 2411; 1536; 1600; 108960; 109286; 132285; 133380; 5634; 5771; 6521; 6457; 0
syn; 3573470; 47.7202551021836; 9619; 9472; 5690; 5659; 184173; 183791; 174968; 176236; 16661; 16318; 12958; 13031; 0
synd; 2572069; 59.0852733733037; 1561; 1578; 2408; 2369; 89219; 90093; 155100; 155007; 3505; 3630; 7274; 7056; 0
synp; 3510253; 40.6197502003417; 8967; 8869; 1384; 1287; 206958; 207186; 122450; 121593; 17274; 17217; 6357; 6227; 0
syp; 3008047; 49.6310396745796; 8007; 7975; 3993; 3879; 142243; 142250; 143536; 143079; 13099; 13126; 10606; 10643; 0
syq; 3570114; 47.7351983718167; 9600; 9460; 5690; 5657; 183947; 183569; 174876; 176162; 16638; 16300; 12959; 13031; 0
tel; 2593857; 53.917929939854; 3401; 3324; 4511; 4614; 109114; 110208; 132923; 133267; 7053; 7100; 9503; 9446; 0
ter; 7750108; 34.1433564538714; 37143; 37166; 1995; 2070; 492579; 493214; 210252; 212491; 53851; 53094; 8276; 8325; 0

Tableau des diagrammes[modifier | modifier le wikicode]

Tableau des diagrammes[modifier | modifier le wikicode]

  • Légende:
>4ATa, >4GCa ce sont les aléas calculés à partir de l’équation des courbes de tendance des aléas où x est %GC
* pour >4ATa l’équation est: −0.000732x3 + 0.1607x2 −11.96x + 302.42
* pour >4GCa l’équation est: 0.000746x3 −0.0609x2 + 1.869x −19.90
<5GCa, <5ATa ce sont les aléas calculés à partir de l’équation des courbes de tendance des aléas où x est %GC
* pour <5GCa l'équation est: 2.86x − 49.02
* pour <5ATa l'équation est: −2.83x + 235.7
dGCa, dATa différences avec l'aléa, dGAa = >4GC − >4GCa, dATa = >4AT − >4ATa.
  • Voir à la suite le tableau non formaté.
Cyanobactéries, Tableau des diagrammes.
dGCa >dATa KEGG Chromosome %GC >4GC >4AT <5GC <5AT Ctrl base >4ATa >4GCa <5GCa <5ATa
4.50 13.53 amr 6,503,724 47.25 15.63 32.29 90.70 107.46 0 18.76 11.12 86.18 101.79
2.27 19.77 ana 6,413,771 41.35 8.25 50.59 71.72 126.72 0 30.81 5.98 69.28 118.53
3.99 24.70 anb1 4,329,264 38.10 8.14 64.14 66.13 138.08 0 39.45 4.15 60.00 127.72
6.03 24.31 awa 5,705,437 38.39 10.32 62.92 66.96 136.95 0 38.62 4.29 60.83 126.90
1.06 22.09 calo 7,023,215 42.25 7.66 50.78 71.26 122.41 0 28.69 6.59 71.85 115.98
9.23 44.04 can 4,114,099 34.96 12.10 93.41 59.25 145.25 0 49.37 2.86 51.00 136.64
-0.64 12.52 ccmp 6,284,095 45.73 8.89 33.98 76.51 110.21 0 21.46 9.53 81.81 106.12
4.09 41.78 ceo 2,794,318 33.41 6.46 96.62 52.62 147.56 0 54.84 2.37 46.58 141.01
1.79 20.87 cep 5,315,554 40.16 7.03 54.67 64.90 133.21 0 33.79 5.24 65.89 121.89
-18.14 0.33 cgc 3,342,364 68.71 44.85 2.03 166.64 39.15 0 1.70 62.99 147.56 41.00
3.14 24.54 csg 7,003,560 42.30 9.78 53.10 73.04 124.38 0 28.56 6.63 72.01 115.83
1.25 18.50 cthe 6,315,792 44.44 9.58 42.45 71.20 118.19 0 23.95 8.34 78.13 109.77
2.45 13.75 cya 2,932,766 60.24 37.20 18.70 136.17 68.30 0 4.95 34.75 123.32 65.00
10.16 30.04 cyh 4,669,813 39.82 15.20 64.72 70.48 137.79 0 34.69 5.04 64.91 122.86
8.37 31.05 cytc 4,934,271 37.88 12.41 71.17 66.42 141.76 0 40.12 4.04 59.34 128.37
0.24 35.42 cyu 1,443,806 31.12 1.99 99.18 46.42 152.45 0 63.75 1.75 40.01 147.52
14.39 27.41 dsl 3,781,008 42.44 21.12 55.65 72.00 132.21 0 28.25 6.73 72.40 115.44
0.53 25.05 fis 5,821,603 40.99 6.27 56.75 68.52 127.05 0 31.70 5.74 68.24 119.55
-8.35 19.10 gei 4,681,111 58.46 21.92 25.16 118.16 67.96 0 6.06 30.27 118.25 70.03
4.25 41.97 gen 4,150,181 33.34 6.59 97.06 54.95 147.60 0 55.09 2.35 46.38 141.21
-3.28 16.93 glp 5,431,448 43.27 4.08 43.33 65.17 126.82 0 26.40 7.36 74.78 113.08
-15.68 16.74 gvi 4,659,019 62.00 23.98 20.77 131.77 63.76 0 4.03 39.65 128.36 60.01
7.03 25.05 hao 4,179,170 42.92 14.12 52.22 72.50 131.29 0 27.16 7.09 73.78 114.07
-5.22 7.05 len 6,244,812 46.65 5.24 26.85 71.85 117.64 0 19.80 10.47 84.44 103.52
-2.21 27.63 lep 5,125,950 43.87 5.64 52.76 76.11 117.03 0 25.13 7.85 76.49 111.39
12.93 42.17 mar 5,842,795 42.33 19.59 70.66 78.00 123.23 0 28.49 6.65 72.09 115.75
2.70 18.39 mic 7,470,429 46.21 12.72 38.95 84.37 115.46 0 20.57 10.02 83.20 104.74
1.86 20.32 naz 5,354,700 38.45 6.17 58.77 67.03 134.18 0 38.46 4.31 60.98 126.75
2.56 18.36 non 6,463,965 40.63 8.08 50.95 68.84 129.37 0 32.59 5.52 67.23 120.56
13.18 25.67 oac 7,689,443 47.60 24.70 43.85 96.24 112.27 0 18.19 11.52 87.17 100.81
1.17 31.26 oni 7,479,014 45.87 10.84 52.46 79.96 116.69 0 21.20 9.67 82.21 105.72
-1.69 30.07 plp 4,986,817 45.19 7.33 52.54 75.77 118.29 0 22.47 9.02 80.28 107.63
0.23 22.00 pma 1,751,080 36.44 3.64 66.49 59.89 145.50 0 44.49 3.42 55.24 132.43
1.39 57.55 pmb 1,669,886 31.32 3.19 120.47 50.58 153.38 0 62.92 1.80 40.59 146.94
1.25 58.33 pmg 1,641,879 31.34 3.05 121.18 50.62 153.45 0 62.84 1.81 40.64 146.89
1.34 57.63 pmh 1,738,790 31.15 3.10 121.27 50.21 153.53 0 63.64 1.76 40.09 147.44
1.61 51.14 pmm 1,657,990 30.80 3.29 116.20 49.67 156.02 0 65.06 1.67 39.10 148.42
-6.27 8.61 pmt 2,410,872 50.74 9.31 22.18 96.44 99.96 1 N 13.57 15.57 96.15 91.92
2.13 24.90 riv 8,698,463 37.54 6.01 66.02 60.08 143.38 0 41.13 3.88 58.37 129.33
-0.75 30.33 scs 5,041,209 35.95 2.48 76.39 55.17 148.95 0 46.06 3.23 53.84 133.82
-11.95 9.34 syc 2,696,255 55.48 11.78 17.72 103.45 85.13 0 8.39 23.72 109.72 78.47
-12.06 9.32 syf 2,695,903 55.47 11.63 17.73 103.36 85.19 0 8.40 23.70 109.68 78.51
20.11 35.43 syn 3,573,470 47.72 31.76 53.42 105.55 112.20 0 17.99 11.65 87.51 100.47
-13.22 6.55 synd 2,572,069 59.09 18.57 12.20 126.14 72.49 0 5.65 31.79 120.03 68.27
2.10 18.19 synp 3,510,253 40.62 7.61 50.81 73.11 127.81 0 32.62 5.51 67.20 120.59
12.14 38.05 syp 3,008,047 49.63 26.17 53.13 102.35 103.30 0 15.08 14.03 92.98 95.06
20.11 35.42 syq 3,570,114 47.74 31.78 53.39 105.61 112.17 0 17.97 11.67 87.55 100.43
14.44 16.04 tel 2,593,857 53.92 35.18 25.93 109.93 90.01 0 9.88 20.74 105.24 82.91
2.65 43.68 ter 7,750,108 34.14 5.25 95.88 56.69 141.00 0 52.21 2.59 48.67 138.95
  • Tableau non formaté
dGCa;dATa;KEGG;Chromosoe;%GC;>4GC;>4AT;<5GC;<5AT;Ctrl  ;base;>4ATa;>4GCa;<5GCa;<5ATa
4.50;13.53;amr;6,503,724;47.25;15.63;32.29;90.70;107.46;0;;18.76;11.12;86.18;101.79
2.27;19.77;ana;6,413,771;41.35;8.25;50.59;71.72;126.72;0;;30.81;5.98;69.28;118.53
3.99;24.70;anb1;4,329,264;38.10;8.14;64.14;66.13;138.08;0;;39.45;4.15;60.00;127.72
6.03;24.31;awa;5,705,437;38.39;10.32;62.92;66.96;136.95;0;;38.62;4.29;60.83;126.90
1.06;22.09;calo;7,023,215;42.25;7.66;50.78;71.26;122.41;0;;28.69;6.59;71.85;115.98
9.23;44.04;can;4,114,099;34.96;12.10;93.41;59.25;145.25;0;;49.37;2.86;51.00;136.64
-0.64;12.52;ccmp;6,284,095;45.73;8.89;33.98;76.51;110.21;0;;21.46;9.53;81.81;106.12
4.09;41.78;ceo;2,794,318;33.41;6.46;96.62;52.62;147.56;0;;54.84;2.37;46.58;141.01
1.79;20.87;cep;5,315,554;40.16;7.03;54.67;64.90;133.21;0;;33.79;5.24;65.89;121.89
-18.14;0.33;cgc;3,342,364;68.71;44.85;2.03;166.64;39.15;0;;1.70;62.99;147.56;41.00
3.14;24.54;csg;7,003,560;42.30;9.78;53.10;73.04;124.38;0;;28.56;6.63;72.01;115.83
1.25;18.50;cthe;6,315,792;44.44;9.58;42.45;71.20;118.19;0;;23.95;8.34;78.13;109.77
2.45;13.75;cya;2,932,766;60.24;37.20;18.70;136.17;68.30;0;;4.95;34.75;123.32;65.00
10.16;30.04;cyh;4,669,813;39.82;15.20;64.72;70.48;137.79;0;;34.69;5.04;64.91;122.86
8.37;31.05;cytc;4,934,271;37.88;12.41;71.17;66.42;141.76;0;;40.12;4.04;59.34;128.37
0.24;35.42;cyu;1,443,806;31.12;1.99;99.18;46.42;152.45;0;;63.75;1.75;40.01;147.52
14.39;27.41;dsl;3,781,008;42.44;21.12;55.65;72.00;132.21;0;;28.25;6.73;72.40;115.44
0.53;25.05;fis;5,821,603;40.99;6.27;56.75;68.52;127.05;0;;31.70;5.74;68.24;119.55
-8.35;19.10;gei;4,681,111;58.46;21.92;25.16;118.16;67.96;0;;6.06;30.27;118.25;70.03
4.25;41.97;gen;4,150,181;33.34;6.59;97.06;54.95;147.60;0;;55.09;2.35;46.38;141.21
-3.28;16.93;glp;5,431,448;43.27;4.08;43.33;65.17;126.82;0;;26.40;7.36;74.78;113.08
-15.68;16.74;gvi;4,659,019;62.00;23.98;20.77;131.77;63.76;0;;4.03;39.65;128.36;60.01
7.03;25.05;hao;4,179,170;42.92;14.12;52.22;72.50;131.29;0;;27.16;7.09;73.78;114.07
-5.22;7.05;len;6,244,812;46.65;5.24;26.85;71.85;117.64;0;;19.80;10.47;84.44;103.52
-2.21;27.63;lep;5,125,950;43.87;5.64;52.76;76.11;117.03;0;;25.13;7.85;76.49;111.39
12.93;42.17;mar;5,842,795;42.33;19.59;70.66;78.00;123.23;0;;28.49;6.65;72.09;115.75
2.70;18.39;mic;7,470,429;46.21;12.72;38.95;84.37;115.46;0;;20.57;10.02;83.20;104.74
1.86;20.32;naz;5,354,700;38.45;6.17;58.77;67.03;134.18;0;;38.46;4.31;60.98;126.75
2.56;18.36;non;6,463,965;40.63;8.08;50.95;68.84;129.37;0;;32.59;5.52;67.23;120.56
13.18;25.67;oac;7,689,443;47.60;24.70;43.85;96.24;112.27;0;;18.19;11.52;87.17;100.81
1.17;31.26;oni;7,479,014;45.87;10.84;52.46;79.96;116.69;0;;21.20;9.67;82.21;105.72
-1.69;30.07;plp;4,986,817;45.19;7.33;52.54;75.77;118.29;0;;22.47;9.02;80.28;107.63
0.23;22.00;pma;1,751,080;36.44;3.64;66.49;59.89;145.50;0;;44.49;3.42;55.24;132.43
1.39;57.55;pmb;1,669,886;31.32;3.19;120.47;50.58;153.38;0;;62.92;1.80;40.59;146.94
1.25;58.33;pmg;1,641,879;31.34;3.05;121.18;50.62;153.45;0;;62.84;1.81;40.64;146.89
1.34;57.63;pmh;1,738,790;31.15;3.10;121.27;50.21;153.53;0;;63.64;1.76;40.09;147.44
1.61;51.14;pmm;1,657,990;30.80;3.29;116.20;49.67;156.02;0;;65.06;1.67;39.10;148.42
-6.27;8.61;pmt;2,410,872;50.74;9.31;22.18;96.44;99.96;1;N;13.57;15.57;96.15;91.92
2.13;24.90;riv;8,698,463;37.54;6.01;66.02;60.08;143.38;0;;41.13;3.88;58.37;129.33
-0.75;30.33;scs;5,041,209;35.95;2.48;76.39;55.17;148.95;0;;46.06;3.23;53.84;133.82
-11.95;9.34;syc;2,696,255;55.48;11.78;17.72;103.45;85.13;0;;8.39;23.72;109.72;78.47
-12.06;9.32;syf;2,695,903;55.47;11.63;17.73;103.36;85.19;0;;8.40;23.70;109.68;78.51
20.11;35.43;syn;3,573,470;47.72;31.76;53.42;105.55;112.20;0;;17.99;11.65;87.51;100.47
-13.22;6.55;synd;2,572,069;59.09;18.57;12.20;126.14;72.49;0;;5.65;31.79;120.03;68.27
2.10;18.19;synp;3,510,253;40.62;7.61;50.81;73.11;127.81;0;;32.62;5.51;67.20;120.59
12.14;38.05;syp;3,008,047;49.63;26.17;53.13;102.35;103.30;0;;15.08;14.03;92.98;95.06
20.11;35.42;syq;3,570,114;47.74;31.78;53.39;105.61;112.17;0;;17.97;11.67;87.55;100.43
14.44;16.04;tel;2,593,857;53.92;35.18;25.93;109.93;90.01;0;;9.88;20.74;105.24;82.91
2.65;43.68;ter;7,750,108;34.14;5.25;95.88;56.69;141.00;0;;52.21;2.59;48.67;138.95

Tableau des écarts relatifs / aléa[modifier | modifier le wikicode]

  • Voir à la suite, le tableau non formaté.
Répétitions chez 49 cyanobactéries. Voir méthode d’analyse (3.4.1) dans l’article.
  • Légende:
>4GC %: 100*(>4GC − >4GCa)/>4GCa . Voir Tableau des diagrammes des répétitions pour >4GC et >4GCa.
>4AT %: respectivement de même que précédent.
Tableau des diagrammes : écarts relatifs par rapport à l'aléa. Cyanobactéries
%GC >4GC% >4AT%
pmm 30.80 96 79
cyu 31.12 14 56
pmh 31.15 76 91
pmb 31.32 77 91
pmg 31.34 69 93
gen 33.34 181 76
ceo 33.41 173 76
ter 34.14 102 84
can 34.96 322 89
scs 35.95 -23 66
pma 36.44 7 49
riv 37.54 55 61
cytc 37.88 207 77
anb1 38.10 96 63
awa 38.39 141 63
naz 38.45 43 53
cyh 39.82 202 87
cep 40.16 34 62
synp 40.62 38 56
non 40.63 46 56
fis 40.99 9 79
ana 41.35 38 64
calo 42.25 16 77
csg 42.30 47 86
mar 42.33 194 148
dsl 42.44 214 97
hao 42.92 99 92
glp 43.27 -45 64
lep 43.87 -28 110
cthe 44.44 15 77
plp 45.19 -19 134
cmp 45.73 -7 58
oni 45.87 12 147
mic 46.21 27 89
len 46.65 -50 36
amr 47.25 40 72
oac 47.60 114 141
syn 47.72 173 197
syq 47.74 172 197
syp 49.63 87 252
pmt 50.74 -40 63
tel 53.92 70 162
syf 55.47 -51 111
syc 55.48 -50 111
gei 58.46 -28 315
synd 59.09 -42 116
cya 60.24 7 278
gvi 62.00 -40 415
cgc 68.71 -29 19
  • Tableau non formaté
;%GC;>4GC%;>4AT%
pmm;30.80;96;79
cyu;31.12;14;56
pmh;31.15;76;91
pmb;31.32;77;91
pmg;31.34;69;93
gen;33.34;181;76
ceo;33.41;173;76
ter;34.14;102;84
can;34.96;322;89
scs;35.95;-23;66
pma;36.44;7;49
riv;37.54;55;61
cytc;37.88;207;77
anb1;38.10;96;63
awa;38.39;141;63
naz;38.45;43;53
cyh;39.82;202;87
cep;40.16;34;62
synp;40.62;38;56
non;40.63;46;56
fis;40.99;9;79
ana;41.35;38;64
calo;42.25;16;77
csg;42.30;47;86
mar;42.33;194;148
dsl;42.44;214;97
hao;42.92;99;92
glp;43.27;-45;64
lep;43.87;-28;110
cthe;44.44;15;77
plp;45.19;-19;134
cmp;45.73;-7;58
oni;45.87;12;147
mic;46.21;27;89
len;46.65;-50;36
amr;47.25;40;72
oac;47.60;114;141
syn;47.72;173;197
syq;47.74;172;197
syp;49.63;87;252
pmt;50.74;-40;63
tel;53.92;70;162
syf;55.47;-51;111
syc;55.48;-50;111
gei;58.46;-28;315
synd;59.09;-42;116
cya;60.24;7;278
gvi;62.00;-40;415
cgc;68.71;-29;19

Groupes des cyanobactéries selon l'écart relatif par rapport à l'aléa[modifier | modifier le wikicode]

  • Voir à la suite, le tableau non formaté.
Répétitions chez 49 cyanobactéries. Voir méthode d’analyse (3.4.1) dans l’article.
  • Légende:
>4GC %: 100*(>4GC − >4GCa)/>4GCa . Voir Tableau des diagrammes des répétitions pour >4GC et >4GCa.
>4AT %: respectivement de même que précédent.
Cyanobactéries : écarts relatifs par rapport à l'aléa. Les groupes 22c 23c 41c 67c.
groupe 22c n=26       groupe 67c1 n=9
KEGG %GC >4GC >4AT DNA KEGG %GC >4GC% >4AT% KEGG %GC >4GC >4AT DNA
pmm 30.80 3.29 116.20 1,657,990 scs 35.95 -23 66 oni 45.87 10.84 52.46 7,479,014
cyu 31.12 1.99 99.18 1,443,806 pma 36.44 7 49 cthe 44.44 9.58 42.45 6,315,792
pmh 31.15 3.10 121.27 1,738,790 fis 40.99 9 79 mic 46.21 12.72 38.95 7,470,429
pmb 31.32 3.19 120.47 1,669,886 cyu 31.12 14 56 amr 47.25 15.63 32.29 6,503,724
pmg 31.34 3.05 121.18 1,641,879 calo 42.25 16 77 tel 53.92 35.18 25.93 2,593,857
gen 33.34 6.59 97.06 4,150,181 cep 40.16 34 62 syp 49.63 26.17 53.13 3,008,047
ceo 33.41 6.46 96.62 2,794,318 synp 40.62 38 56 oac 47.60 24.70 43.85 7,689,443
ter 34.14 5.25 95.88 7,750,108 ana 41.35 38 64 syq 47.74 31.78 53.39 3,570,114
can 34.96 12.10 93.41 4,114,099 naz 38.45 43 53 syn 47.72 31.76 53.42 3,573,470
pma 36.44 3.64 66.49 1,751,080 non 40.63 46 56
riv 37.54 6.01 66.02 8,698,463 csg 42.30 47 86 moyen. 48 22 44 5,355,988
cytc 37.88 12.41 71.17 4,934,271 riv 37.54 55 61 ecartt 3 10 10 2,126,339
anb1 38.10 8.14 64.14 4,329,264 pmg 31.34 69 93 % 6 45 23 40
awa 38.39 10.32 62.92 5,705,437 pmh 31.15 76 91
naz 38.45 6.17 58.77 5,354,700 pmb 31.32 77 91 groupe 67c2 n=10
cyh 39.82 15.20 64.72 4,669,813 anb1 38.10 96 63 KEGG %GC >4GC >4AT DNA
cep 40.16 7.03 54.67 5,315,554 pmm 30.80 96 79 glp 43.27 4.08 43.33 5,431,448
synp 40.62 7.61 50.81 3,510,253 hao 42.92 99 92 lep 43.87 5.64 52.76 5,125,950
non 40.63 8.08 50.95 6,463,965 ter 34.14 102 84 plp 45.19 7.33 52.54 4,986,817
fis 40.99 6.27 56.75 5,821,603 awa 38.39 141 63 cmp 45.73 8.89 33.98 6,284,095
ana 41.35 8.25 50.59 6,413,771 ceo 33.41 173 76 len 46.65 5.24 26.85 6,244,812
calo 42.25 7.66 50.78 7,023,215 gen 33.34 181 76 pmt 50.74 9.31 22.18 2,410,873
csg 42.30 9.78 53.10 7,003,560 mar 42.33 194 148 syf 55.47 11.63 17.73 2,695,903
mar 42.33 19.59 70.66 5,842,795 cyh 39.82 202 87 syc 55.48 11.78 17.72 2,696,255
dsl 42.44 21.12 55.65 3,781,008 cytc 37.88 207 77 gei 58.46 21.92 25.16 4,681,111
hao 42.92 14.12 52.22 4,179,170 dsl 42.44 214 97 synd 59.09 18.57 12.20 2,572,069
can 34.96 322 89
moyen. 37 8 75 4,529,192 moyen. 50 10 30 4,312,933
ecartt 4 5 25 2,083,497 KEGG %GC >4GC% >4AT% ecartt 6 6 15 1,563,339
% 11 59 33 46 syf 55.47 -51 111 % 12 56 48 36
syc 55.48 -50 111
groupe 23c len 46.65 -50 36
KEGG %GC >4GC >4AT DNA glp 43.27 -45 64
scs 35.95 2.48 76.39 5,041,209 synd 59.09 -42 116
pmt 50.74 -40 63
lep 43.87 -28 110 groupe 41c n=3
gei 58.46 -28 315 KEGG %GC >4GC >4AT DNA
plp 45.19 -19 134 gvi 62.00 23.98 20.77 4,659,019
cmp 45.73 -7 58 cgc 68.71 44.85 2.03 3,342,364
oni 45.87 12 147 cya 60.24 37.20 18.70 2,932,766
cthe 44.44 15 77
mic 46.21 27 89 moyen. 64 35 14 3644716
amr 47.25 40 72 ecartt 4 11 10 901970
tel 53.92 70 162 % 7 30 74 25
syp 49.63 87 252
oac 47.60 114 141
syq 47.74 172 197
syn 47.72 173 197
 
KEGG %GC >4GC% >4AT%
cya 60.24 7 278
cgc 68.71 -29 19
gvi 62.00 -40 415
  • Tableau non formaté.
Groupe; 22c;;N=26;;;;;;;;Groupe; 67c1;;N=9;
KEGG;%GC;>4GC;>4AT;DNA;;KEGG;%GC;>4GC%;>4AT%;;KEGG;%GC;>4GC;>4AT;DNA
pmm;30.80;3.29;116.20;1,657,990;;scs;35.95;-23;66;;oni;45.87;10.84;52.46;7,479,014
cyu;31.12;1.99;99.18;1,443,806;;pma;36.44;7;49;;cthe;44.44;9.58;42.45;6,315,792
pmh;31.15;3.10;121.27;1,738,790;;fis;40.99;9;79;;mic;46.21;12.72;38.95;7,470,429
pmb;31.32;3.19;120.47;1,669,886;;cyu;31.12;14;56;;amr;47.25;15.63;32.29;6,503,724
pmg;31.34;3.05;121.18;1,641,879;;calo;42.25;16;77;;tel;53.92;35.18;25.93;2,593,857
gen;33.34;6.59;97.06;4,150,181;;cep;40.16;34;62;;syp;49.63;26.17;53.13;3,008,047
ceo;33.41;6.46;96.62;2,794,318;;synp;40.62;38;56;;oac;47.60;24.70;43.85;7,689,443
ter;34.14;5.25;95.88;7,750,108;;ana;41.35;38;64;;syq;47.74;31.78;53.39;3,570,114
can;34.96;12.10;93.41;4,114,099;;naz;38.45;43;53;;syn;47.72;31.76;53.42;3,573,470
pma;36.44;3.64;66.49;1,751,080;;non;40.63;46;56;;;;;;
riv;37.54;6.01;66.02;8,698,463;;csg;42.30;47;86;;moyen.;48;22;44;5,355,988
cytc;37.88;12.41;71.17;4,934,271;;riv;37.54;55;61;;ecartt;3;10;10;2,126,339
anb1;38.10;8.14;64.14;4,329,264;;pmg;31.34;69;93;;%  ;6;45;23;40
awa;38.39;10.32;62.92;5,705,437;;pmh;31.15;76;91;;;;;;
naz;38.45;6.17;58.77;5,354,700;;pmb;31.32;77;91;;Groupe; 67c2;;N=10;
cyh;39.82;15.20;64.72;4,669,813;;anb1;38.10;96;63;;KEGG;%GC;>4GC;>4AT;DNA
cep;40.16;7.03;54.67;5,315,554;;pmm;30.80;96;79;;glp;43.27;4.08;43.33;5,431,448
synp;40.62;7.61;50.81;3,510,253;;hao;42.92;99;92;;lep;43.87;5.64;52.76;5,125,950
non;40.63;8.08;50.95;6,463,965;;ter;34.14;102;84;;plp;45.19;7.33;52.54;4,986,817
fis;40.99;6.27;56.75;5,821,603;;awa;38.39;141;63;;cmp;45.73;8.89;33.98;6,284,095
ana;41.35;8.25;50.59;6,413,771;;ceo;33.41;173;76;;len;46.65;5.24;26.85;6,244,812
calo;42.25;7.66;50.78;7,023,215;;gen;33.34;181;76;;pmt;50.74;9.31;22.18;2,410,873
csg;42.30;9.78;53.10;7,003,560;;mar;42.33;194;148;;syf;55.47;11.63;17.73;2,695,903
mar;42.33;19.59;70.66;5,842,795;;cyh;39.82;202;87;;syc;55.48;11.78;17.72;2,696,255
dsl;42.44;21.12;55.65;3,781,008;;cytc;37.88;207;77;;gei;58.46;21.92;25.16;4,681,111
hao;42.92;14.12;52.22;4,179,170;;dsl;42.44;214;97;;synd;59.09;18.57;12.20;2,572,069
;;;;;;can;34.96;322;89;;;;;;
moyen.;37;8;75;4,529,192;;;;;;;moyen.;50;10;30;4,312,933
ecartt;4;5;25;2,083,497;;KEGG;%GC;>4GC%;>4AT%;;ecartt;6;6;15;1,563,339
%  ;11;59;33;46;;syf;55.47;-51;111;;%  ;12;56;48;36
;;;;;;syc;55.48;-50;111;;;;;;
Groupe; 23c;;;;;len;46.65;-50;36;;;;;;
KEGG;%GC;>4GC;>4AT;DNA;;glp;43.27;-45;64;;;;;;
scs;35.95;2.48;76.39;5,041,209;;synd;59.09;-42;116;;;;;;
;;;;;;pmt;50.74;-40;63;;;;;;
;;;;;;lep;43.87;-28;110;;Groupe;41c;;N=3;
;;;;;;gei;58.46;-28;315;;KEGG;%GC;>4GC;>4AT;DNA
;;;;;;plp;45.19;-19;134;;gvi;62.00;23.98;20.77;4,659,019
;;;;;;cmp;45.73;-7;58;;cgc;68.71;44.85;2.03;3,342,364
;;;;;;oni;45.87;12;147;;cya;60.24;37.20;18.70;2,932,766
;;;;;;cthe;44.44;15;77;;;;;;
;;;;;;mic;46.21;27;89;;moyen.;64;35;14;3644716
;;;;;;amr;47.25;40;72;;ecartt;4;11;10;901970
;;;;;;tel;53.92;70;162;;%  ;7;30;74;25
;;;;;;syp;49.63;87;252;;;;;;
;;;;;;oac;47.60;114;141;;;;;;
;;;;;;syq;47.74;172;197;;;;;;
;;;;;;syn;47.72;173;197;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;KEGG;%GC;>4GC%;>4AT%;;;;;;
;;;;;;cya;60.24;7;278;;;;;;
;;;;;;cgc;68.71;-29;19;;;;;;
;;;;;;gvi;62.00;-40;415;;;;;;

Cyanobactéries:ruptures entre les groupes à progression homogène[modifier | modifier le wikicode]

        cyanobactéries:taux >4GC        |               cyanobactéries:taux >4AT
KEGG	%GC	>4GC    #%     groupe   |       KEGG    %GC     >4AT    #%   groupe
cyu	31.12	1.99	19.4   ** 2 **	|	cgc	68.71	2.03	83   ** I **
scs	35.95	2.48	18.9		|	synd	59.09	12.20	31   ** II **
pmg	31.34	3.05	1.6		|	syc	55.48	17.72	0	
pmh	31.15	3.10	2.9		|	syf	55.47	17.73	5	
pmb	31.32	3.19	2.9		|	cya	60.24	18.70	10	
pmm	30.80	3.29	9.8		|	gvi	62.00	20.77	6	
pma	36.44	3.64	10.8		|	pmt	50.74	22.18	12	
glp	43.27	4.08	22.1		|	gei	58.46	25.16	3	
len	46.65	5.24	0.0   ** 7 **	|	tel	53.92	25.93	3	
ter	34.14	5.25	7.0		|	len	46.65	26.85	17	
lep	43.87	5.64	6.2		|	amr	47.25	32.29	5	
riv	37.54	6.01	2.6		|	ccmp	45.73	33.98	13	
naz	38.45	6.17	1.6		|	mic	46.21	38.95	8	
fis	40.99	6.27	2.9		|	cthe	44.44	42.45	2	
ceo	33.41	6.46	2.0		|	glp	43.27	43.33	1	
gen	33.34	6.59	6.2		|	oac	47.60	43.85	13	
cep	40.16	7.03	4.2		|	ana	41.35	50.59	0    ** III **
plp	45.19	7.33	3.6		|	calo	42.25	50.78	0	
synp	40.62	7.61	0.6		|	synp	40.62	50.81	0	
calo	42.25	7.66	5.2		|	non	40.63	50.95	2	
non	40.63	8.08	0.8		|	hao	42.92	52.22	0	
anb1	38.10	8.14	1.3		|	oni	45.87	52.46	0	
ana	41.35	8.25	7.2		|	plp	45.19	52.54	0	
ccmp	45.73	8.89	4.4		|	lep	43.87	52.76	1	
pmt	50.74	9.31	2.9		|	csg	42.30	53.10	0	
cthe	44.44	9.58	2.0		|	syp	49.63	53.13	0	
csg	42.30	9.78	5.3		|	syq	47.74	53.39	0	
awa	38.39	10.32	4.8		|	syn	47.72	53.42	2	
oni	45.87	10.84	6.8		|	cep	40.16	54.67	2	
syf	55.47	11.63	1.2		|	dsl	42.44	55.65	2	
syc	55.48	11.78	2.7		|	fis	40.99	56.75	3	
can	34.96	12.10	2.5		|	naz	38.45	58.77	7	
cytc	37.88	12.41	2.4		|	awa	38.39	62.92	2	
mic	46.21	12.72	9.9		|	anb1	38.10	64.14	1	
hao	42.92	14.12	7.1		|	cyh	39.82	64.72	2	
cyh	39.82	15.20	2.7		|	riv	37.54	66.02	1	
amr	47.25	15.63	15.9		|	pma	36.44	66.49	6	
synd	59.09	18.57	5.2   ** 14 **	|	mar	42.33	70.66	1	
mar	42.33	19.59	7.3		|	cytc	37.88	71.17	7	
dsl	42.44	21.12	3.6		|	scs	35.95	76.39	18	
gei	58.46	21.92	8.6		|	can	34.96	93.41	3    ** IV **
gvi	62.00	23.98	2.9		|	ter	34.14	95.88	1	
oac	47.60	24.70	5.6		|	ceo	33.41	96.62	0	
syp	49.63	26.17	17.6		|	gen	33.34	97.06	2	
syn	47.72	31.76	0.1   ** 25 **	|	cyu	31.12	99.18	15	
syq	47.74	31.78	9.7		|	pmm	30.80	116.20	4    ** V **
tel	53.92	35.18	5.4		|	pmb	31.32	120.47	1	
cya	60.24	37.20	17.0		|	pmg	31.34	121.18	0	
cgc	68.71	44.85	      ** 68 **	|	pmh	31.15	121.27		

Archées[modifier | modifier le wikicode]

Résultats[modifier | modifier le wikicode]

 
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<5T;<5A;<5C;<5G;Ctrl  
abi; 1486778; 39.1579644035626; 4384; 4317; 601; 525; 92031; 92388; 55219; 53398; 0
afu; 2178400; 48.5816654425266; 4176; 4092; 1438; 1352; 114638; 116220; 99861; 101337; 0
aho; 2137654; 34.148136227846; 6312; 6619; 262; 256; 157260; 159314; 64346; 62355; 0
ape; 1669696; 56.3112686381233; 582; 516; 3378; 3384; 56354; 54419; 103690; 101807; 0
asc; 1496453; 57.2173666663771; 429; 415; 1904; 1892; 53301; 52914; 95459; 94733; 0
clg; 1546846; 30.0340176074412; 6897; 7166; 392; 371; 120405; 120159; 39936; 41003; 0
cma; 2077567; 43.0958423964185; 761; 783; 1348; 1335; 134791; 135251; 98064; 97954; 0
csu; 1680938; 51.649674170017; 2545; 2506; 846; 835; 72934; 73153; 84121; 86081; 0
dka; 1365223; 45.3391130972742; 1089; 966; 930; 832; 70167; 66956; 63430; 59083; 0
ffo; 1319206; 37.474207970552; 5874; 5511; 450; 430; 86051; 83717; 41939; 40309; 0
fpl; 2196266; 44.1354098274071; 6258; 6456; 683; 792; 131349; 132255; 81895; 83302; 0
gac; 1860815; 46.8406585286555; 4264; 4505; 807; 824; 94809; 95471; 82733; 81970; 0
hal; 2014239; 67.9130430897227; 273; 326; 1919; 1913; 40356; 40586; 138237; 137574; 0
hbo; 2820544; 61.0636458782419; 807; 672; 1123; 1064; 88807; 89092; 159678; 157997; 0
hbu; 1667163; 53.7367371996619; 494; 505; 1275; 1268; 60711; 61838; 88980; 89036; 0
hla; 2735295; 66.722090304702; 445; 448; 1839; 1924; 58773; 57147; 178744; 179616; 0
hlr; 2789326; 61.9472230926037; 846; 861; 1349; 1255; 79868; 80622; 160647; 159421; 0
hma1; 3131724; 62.363860927719; 796; 733; 1372; 1318; 85627; 85805; 192091; 191723; 0
hmu; 221862; 64.1515897269474; 49; 24; 99; 114; 5125; 4887; 13743; 13384; 0
hru; 3223876; 64.3360352569392; 527; 524; 1652; 1567; 77209; 76668; 201721; 202219; 0
hsu; 2085482; 63.2908843135544; 660; 694; 1761; 1860; 53416; 53852; 133919; 134300; 0
htu; 3889038; 65.8333500469782; 532; 580; 2026; 2019; 86398; 85208; 250013; 249643; 0
hut; 3116795; 62.8999661511264; 711; 670; 1935; 2044; 80005; 82336; 193365; 194203; 0
hvo; 2847757; 66.6385860872258; 601; 578; 1668; 1684; 67985; 65659; 185760; 186125; 0
hwa; 3132494; 47.8639065230452; 2192; 2238; 894; 835; 152471; 153465; 119125; 116558; 0
hxa; 3668009; 65.9817901210166; 574; 552; 1748; 1739; 83739; 83919; 235930; 237368; 0
iag; 1875953; 35.6865550469548; 2602; 2725; 401; 460; 111622; 111901; 54171; 55053; 0
iho; 1297538; 56.5203485369985; 464; 478; 2278; 2367; 57717; 57167; 78708; 78272; 0
kcr; 1590757; 49.000695895099; 1021; 925; 1825; 1918; 67756; 69272; 76187; 79805; 0
mac; 5751492; 42.6808904541639; 22122; 21231; 2295; 2378; 334359; 330098; 238049; 236155; 0
marc; 1937883; 54.0039310938792; 1072; 1196; 1308; 1434; 75183; 76256; 112606; 112958; 0
mba; 4837408; 39.276220519971; 19314; 20134; 1027; 1062; 302213; 305746; 173835; 170335; 23
mbg; 2789774; 60.6400375084147; 1373; 1218; 3971; 3999; 81322; 79763; 182538; 185668; 0
mbn; 2542943; 54.5136088382634; 5077; 5358; 2272; 2321; 97801; 97541; 153408; 154097; 0
mbu; 2575032; 40.7580954333771; 5710; 6047; 572; 608; 155010; 154067; 91624; 94303; 0
mear; 1488669; 49.2056998567176; 2284; 2113; 689; 758; 72713; 68215; 72534; 67941; 0
mel; 2583753; 35.8286569962376; 10576; 10391; 576; 480; 179759; 177238; 86449; 83660; 0
mer; 1931651; 41.2554338231906; 4766; 4577; 337; 350; 110493; 110039; 65001; 65952; 0
mev; 2242317; 36.6288085047743; 9370; 8744; 490; 287; 143318; 140826; 76727; 71850; 0
mfe; 1485061; 32.2099226900444; 8123; 8137; 428; 438; 110638; 110684; 41694; 42664; 0
mfv; 1243342; 31.6369912703021; 7653; 7636; 144; 132; 87637; 88158; 34224; 33668; 0
mhu; 3544738; 45.1493916286523; 8114; 8214; 1719; 1717; 174451; 177892; 166148; 164438; 28
mhz; 2428904; 42.6241218261405; 5318; 5229; 593; 627; 131936; 130969; 96090; 98025; 0
mig; 1854197; 32.2999120373941; 9590; 11328; 616; 815; 136999; 139950; 49368; 56380; 0
mka; 1694969; 61.1591716426672; 351; 307; 1585; 1554; 48694; 49199; 113831; 112631; 0
mla; 1804962; 50.0065929365826; 4272; 4163; 834; 786; 79676; 79575; 88453; 87644; 0
mmh; 2012424; 42.6182057061534; 5607; 5066; 698; 703; 114331; 112751; 86553; 86497; 0
mmp; 1661137; 33.1003403090775; 10599; 10969; 343; 331; 121332; 122394; 43894; 44713; 0
mok; 1662525; 29.2986872377859; 10676; 10400; 398; 416; 121331; 121217; 45939; 45543; 0
mpd; 2957635; 54.9168846054364; 4416; 4501; 1629; 1621; 109790; 108512; 170237; 169499; 0
mpi; 2843290; 47.3991748995002; 6307; 6644; 1418; 1449; 139349; 141885; 131602; 133223; 0
mpl; 2922917; 55.3536757971574; 2593; 2687; 2607; 2609; 102084; 100067; 172981; 173730; 0
mpy; 3072769; 44.6108705210187; 5611; 5530; 796; 792; 162068; 163222; 131433; 132066; 0
mse; 2191517; 46.2253315853813; 2031; 2011; 1218; 1284; 117467; 118872; 104803; 109759; 0
msi; 1853160; 31.0342334175139; 8966; 9739; 258; 122; 137970; 144839; 51066; 44043; 0
mst; 1767403; 27.6337088937837; 8920; 9619; 133; 123; 134614; 137615; 35685; 35763; 0
mth; 1751377; 49.5439302902802; 1933; 1875; 1783; 1858; 77637; 76276; 96360; 96201; 0
mtp; 1879471; 53.5458777833941; 1016; 960; 961; 930; 63224; 63326; 97527; 94394; 21
mzh; 2138444; 39.1560405603327; 6412; 5917; 369; 423; 126620; 124792; 76751; 77178; 0
nbv; 1232128; 33.1577563370039; 6430; 6376; 60; 64; 89551; 89517; 31520; 30667; 0
neq; 490885; 31.559530236206; 2668; 2678; 221; 212; 35758; 35865; 13576; 13650; 0
nga; 2833868; 48.3472060095954; 4630; 4886; 531; 574; 137568; 141686; 121548; 124273; 0
nge; 3788356; 62.2355185204347; 850; 837; 1468; 1630; 101208; 103186; 217768; 219746; 0
nkr; 1639964; 34.1831893870841; 8432; 8113; 163; 150; 115719; 115571; 42612; 42544; 0
nmg; 3751858; 61.4208213637083; 745; 736; 1395; 1369; 105308; 105444; 213119; 212066; 0
nmr; 1645259; 34.1675079729088; 8036; 7467; 150; 129; 118629; 116138; 42722; 41466; 0
nou; 4013216; 64.9358021098291; 860; 864; 2743; 2732; 91605; 91428; 254032; 254155; 0
nph; 2595221; 63.440223395233; 764; 763; 1462; 1517; 70998; 70523; 163166; 164967; 0
pai; 2222430; 51.362517604604; 3690; 4053; 3217; 3341; 100084; 100451; 111038; 114821; 0
pdl; 2023836; 53.9139535021612; 613; 571; 1356; 1345; 70152; 69203; 107700; 105228; 0
pfm; 1843267; 54.9060819161438; 344; 386; 1241; 1199; 65361; 64788; 95338; 96118; 65
pho; 1738505; 41.8789707248469; 3197; 3090; 948; 912; 112634; 112098; 74438; 71596; 0
ppac; 1859370; 43.0442569257329; 5092; 4564; 680; 780; 114466; 112174; 71786; 75522; 0
pto; 1545895; 35.9704248994919; 6033; 6028; 140; 113; 99972; 99987; 55264; 54825; 0
sali; 3255260; 66.5859869872145; 319; 313; 1762; 1727; 66788; 66940; 218355; 218121; 0
smr; 1570485; 35.7265430742732; 3045; 3885; 511; 544; 102867; 107170; 44814; 49028; 0
sso; 2992245; 35.7874276792112; 7301; 6919; 611; 706; 212450; 209582; 94140; 94872; 21
taa; 3430706; 34.1388040828914; 12354; 12415; 574; 536; 241391; 240916; 98138; 97900; 0
tac; 1564906; 45.9943919954298; 1969; 2053; 322; 316; 76970; 78382; 71191; 72154; 0
tag; 1316595; 46.7343412362951; 1504; 1522; 951; 960; 73364; 71953; 57837; 60506; 0
tar; 1461105; 58.302996704549; 422; 473; 1744; 1674; 47042; 48223; 94261; 93375; 0
thg; 1356318; 55.6411549503877; 531; 599; 1685; 1766; 47211; 47340; 73555; 74800; 0
tko; 2088737; 51.9954881825716; 2612; 2550; 1388; 1448; 98105; 99579; 112138; 111757; 0
ton; 1847607; 51.2727003091025; 2003; 2140; 960; 996; 87319; 88895; 96099; 98522; 0
tpe; 1781889; 57.6656570639361; 1115; 1124; 2477; 2343; 62341; 61844; 102484; 100870; 0
tuz; 1936063; 59.6550835380873; 831; 899; 2090; 2152; 57989; 59605; 126490; 129724; 0
vdi; 2374137; 45.4277069941625; 1230; 1198; 629; 582; 138880; 137617; 116457; 120382; 0

Tableau des diagrammes[modifier | modifier le wikicode]

Tableau des diagrammes[modifier | modifier le wikicode]

Les 87 archées[modifier | modifier le wikicode]
Répétitions chez les archées							                 x3 -0.000732 0.000746		
											         x2    0.1607  -0.0609		
			Voir méthode d’analyse (3.4.1) dans l’article			         x     -11.96    1.869	  2.86	-2.83
Différences 										         c     302.42   -19.90  -49.02	235.7
avec l’aléa														
>4GC-   >4AT-                                                                                           Aléas équation  Aléas équation	
>4GCa   >4ATa           KEGG    effectif        %GC     >4GC    >4AT    <5GC    <5AT   Ctrl    base     >4ATa   >4GCa   <5GCa   <5ATa   KEGG   archées
2.90	22.05		abi	1,486,778	39.16	7.57	58.52	73.06	124.04	0		36.47	4.68	63.01	124.74	abi	e
0.13	21.32		afu	2,178,400	48.58	12.81	37.95	92.36	105.98	0		16.63	12.68	89.98	98.03	afu	e
-0.17	8.30		aho	2,137,654	34.15	2.42	60.49	59.27	148.09	0		52.19	2.60	48.68	138.93	aho	c
15.07	-1.10		ape	1,669,696	56.31	40.50	6.58	123.07	66.34	0		7.68	25.42	112.09	76.13	ape	c
-2.02	-1.32		asc	1,496,453	57.22	25.37	5.64	127.10	70.98	0		6.96	27.39	114.68	73.56	asc	c
3.44	22.63		clg	1,546,846	30.03	4.93	90.91	52.33	155.52	0		68.29	1.49	36.91	150.59	clg	c
5.69	-19.35		cma	2,077,567	43.10	12.91	7.43	94.35	129.98	0		26.78	7.23	74.28	113.58	cma	c
-6.94	17.63		csu	1,680,938	51.65	10.00	30.05	101.25	86.91	0		12.42	16.94	98.75	89.34	csu	t
3.75	-7.14		dka	1,365,223	45.34	12.91	15.05	89.74	100.44	0		22.19	9.16	80.70	107.22	dka	c
2.81	44.99		ffo	1,319,206	37.47	6.67	86.30	62.35	128.69	0		41.31	3.86	58.20	129.51	ffo	c
-1.36	33.32		fpl	2,196,266	44.14	6.72	57.89	75.22	120.02	0		24.57	8.07	77.25	110.63	fpl	e
-1.91	27.66		gac	1,860,815	46.84	8.76	47.12	88.51	102.26	0		19.47	10.67	84.99	102.97	gac	e
-40.79	1.07		hal	2,014,239	67.91	19.02	2.97	136.93	40.18	0		1.91	59.82	145.28	43.25	hal	e
-29.24	0.74		hbo	2,820,544	61.06	7.75	5.24	112.63	63.07	0		4.50	36.99	125.69	62.66	hbo	e
-5.16	-4.08		hbu	1,667,163	53.74	15.25	5.99	106.78	73.51	0		10.07	20.42	104.72	83.42	hbu	e
-41.52	1.03		hla	2,735,295	66.72	13.76	3.26	131.01	42.38	0		2.24	55.27	141.88	46.63	hla	e
-30.17	2.07		hlr	2,789,326	61.95	9.34	6.12	114.75	57.54	0		4.05	39.51	128.22	60.16	hlr	e
-32.14	1.02		hma1	3,131,724	62.36	8.59	4.88	122.56	54.74	0		3.86	40.73	129.41	58.98	hma1	e
-36.72	0.18		hmu	221,862		64.15	9.60	3.29	122.27	45.13	0		3.11	46.32	134.52	53.91	hmu	e
-36.94	0.22		hru	3,223,876	64.34	9.98	3.26	125.30	47.73	0		3.04	46.92	135.05	53.39	hru	e
-26.20	3.04		hsu	2,085,482	63.29	17.36	6.49	128.61	51.44	0		3.45	43.56	132.06	56.35	hsu	e
-41.65	0.35		htu	3,889,038	65.83	10.40	2.86	128.48	44.13	0		2.51	52.05	139.33	49.15	htu	e
-29.59	0.81		hut	3,116,795	62.90	12.77	4.43	124.35	52.09	0		3.62	42.35	130.94	57.46	hut	e
-43.19	1.88		hvo	2,847,757	66.64	11.77	4.14	130.59	46.93	0		2.26	54.96	141.64	46.86	hvo	e
-6.30	-3.62		hwa	3,132,494	47.86	5.52	14.14	75.24	97.67	0		17.76	11.82	87.92	100.07	hwa	e
-43.07	0.60		hxa	3,668,009	65.98	9.51	3.07	129.03	45.71	0		2.47	52.58	139.76	48.72	hxa	e
1.46	-18.54		iag	1,875,953	35.69	4.59	28.40	58.22	119.15	0		46.93	3.13	53.08	134.57	iag	c
9.93	-0.25		iho	1,297,538	56.52	35.80	7.26	120.98	88.54	0		7.51	25.87	112.69	75.54	iho	c
10.32	-3.77		kcr	1,590,757	49.00	23.53	12.23	98.06	86.14	0		16.00	13.21	91.17	96.84	kcr	k
1.21	47.68		mac	5,751,492	42.68	8.12	75.38	82.45	115.53	0		27.70	6.91	73.09	114.75	mac	e
-6.75	1.91		marc	1,937,883	54.00	14.15	11.70	116.40	78.15	0		9.80	20.90	105.49	82.67	marc	e
-0.42	45.40		mba	4,837,408	39.28	4.32	81.55	71.15	125.68	23	T	36.15	4.74	63.35	124.40	mba	e
-7.26	4.56		mbg	2,789,774	60.64	28.57	9.29	131.98	57.74	0		4.73	35.83	124.48	63.86	mbg	e
-3.78	31.74		mbn	2,542,943	54.51	18.06	41.04	120.92	76.82	0		9.29	21.84	106.95	81.22	mbn	e
-1.02	13.39		mbu	2,575,032	40.76	4.58	45.66	72.20	120.03	0		32.27	5.60	67.59	120.20	mbu	e
-3.75	13.84		mear	1,488,669	49.21	9.72	29.54	94.36	94.67	0		15.70	13.47	91.76	96.26	mear	e
0.91	34.68		mel	2,583,753	35.83	4.09	81.15	65.84	138.17	0		46.47	3.18	53.49	134.17	mel	e
-2.36	17.33		mer	1,931,651	41.26	3.56	48.37	67.79	114.17	0		31.04	5.92	69.01	118.79	mer	e
-0.03	36.88		mev	2,242,317	36.63	3.47	80.78	66.26	126.72	0		43.90	3.49	55.78	131.90	mev	e
3.80	50.10		mfe	1,485,061	32.21	5.83	109.49	56.80	149.03	0		59.39	2.03	43.13	144.42	mfe	e
0.34	61.32		mfv	1,243,342	31.64	2.22	122.97	54.60	141.39	0		61.65	1.88	41.49	146.05	mfv	e
0.71	23.51		mhu	3,544,738	45.15	9.69	46.06	93.26	99.40	28	A	22.55	8.98	80.16	107.76	mhu	e
-1.85	15.59		mhz	2,428,904	42.62	5.02	43.42	79.92	108.24	0		27.83	6.87	72.93	114.91	mhz	e
5.66	53.77		mig	1,854,197	32.30	7.72	112.81	57.03	149.36	0		59.04	2.05	43.39	144.17	mig	e
-18.74	-0.57		mka	1,694,969	61.16	18.52	3.88	133.61	57.76	0		4.45	37.26	125.96	62.39	mka	e
-5.56	32.18		mla	1,804,962	50.01	8.98	46.73	97.56	88.23	0		14.56	14.54	94.05	93.99	mla	e
0.10	25.19		mmh	2,012,424	42.62	6.96	53.04	85.99	112.84	0		27.84	6.87	72.91	114.93	mmh	e
1.78	73.84		mmp	1,661,137	33.10	4.06	129.84	53.34	146.72	0		56.00	2.28	45.68	141.90	mmp	e
3.57	55.28		mok	1,662,525	29.30	4.90	126.77	55.03	145.89	0		71.49	1.33	34.80	152.67	mok	e
-11.62	21.24		mpd	2,957,635	54.92	10.99	30.15	114.87	73.81	0		8.91	22.61	108.10	80.08	mpd	e
-1.20	27.03		mpi	2,843,290	47.40	10.08	45.55	93.14	98.91	0		18.52	11.29	86.59	101.38	mpi	e
-5.62	9.56		mpl	2,922,917	55.35	17.85	18.06	118.62	69.16	0		8.51	23.46	109.35	78.84	mpl	e
-3.32	12.65		mpy	3,072,769	44.61	5.17	36.26	85.75	105.86	0		23.61	8.49	78.61	109.28	mpy	e
1.39	-2.11		mse	2,191,517	46.23	11.42	18.44	97.91	107.84	0		20.55	10.03	83.23	104.71	mse	c
0.32	36.85		msi	1,853,160	31.03	2.05	100.94	51.32	152.61	0		64.09	1.73	39.77	147.76	msi	e
0.48	25.75		mst	1,767,403	27.63	1.45	104.89	40.43	154.03	0		79.14	0.97	30.04	157.39	mst	e
6.88	6.54		mth	1,751,377	49.54	20.79	21.74	109.95	87.88	0		15.21	13.91	92.73	95.30	mth	e
-10.02	0.25		mtp	1,879,471	53.55	10.06	10.51	102.12	67.33	21	A	10.27	20.08	104.18	83.96	mtp	e
-0.97	21.18		mzh	2,138,444	39.16	3.70	57.65	71.98	117.57	0		36.48	4.68	63.01	124.74	mzh	e
-1.29	48.15		nbv	1,232,128	33.16	1.01	103.93	50.47	145.33	0		55.79	2.29	45.85	141.74	nbv	t
6.96	46.95		neq	490,885		31.56	8.82	108.91	55.46	145.91	0		61.96	1.86	41.27	146.27	neq	n
-8.49	16.59		nga	2,833,868	48.35	3.90	33.58	86.74	98.54	0		16.99	12.39	89.30	98.70	nga	t
-32.18	0.54		nge	3,788,356	62.24	8.18	4.45	115.49	53.95	0		3.92	40.35	129.04	59.34	nge	n
-0.70	48.82		nkr	1,639,964	34.18	1.91	100.89	51.93	141.03	0		52.06	2.61	48.78	138.83	nkr	t
-30.63	-0.37		nmg	3,751,858	61.42	7.37	3.95	113.33	56.17	0		4.31	37.99	126.71	61.65	nmg	e
-0.91	42.11		nmr	1,645,259	34.17	1.70	94.23	51.17	142.69	0		52.12	2.60	48.73	138.88	nmr	t
-35.29	1.48		nou	4,013,216	64.94	13.64	4.30	126.63	45.61	0		2.82	48.93	136.77	51.69	nou	n
-32.55	2.50		nph	2,595,221	63.44	11.48	5.88	126.44	54.53	0		3.39	44.03	132.49	55.93	nph	e
13.01	22.07		pai	2,222,430	51.36	29.51	34.84	101.63	90.23	0		12.77	16.50	97.93	90.15	pai	c
-7.39	-4.04		pdl	2,023,836	53.91	13.35	5.85	105.21	68.86	0		9.89	20.74	105.23	82.92	pdl	c
-9.35	-4.96		pfm	1,843,267	54.91	13.24	3.96	103.87	70.61	65    42T,23A	8.92	22.59	108.07	80.11	pfm	c
4.36	6.62		pho	1,738,505	41.88	10.70	36.16	84.00	129.27	0		29.54	6.34	70.80	117.02	pho	e
0.66	25.04		ppac	1,859,370	43.04	7.85	51.93	79.22	121.89	0		26.89	7.19	74.13	113.72	ppac	e
-1.60	32.02		pto	1,545,895	35.97	1.64	78.02	71.21	129.35	0		46.00	3.23	53.89	133.77	pto	e
-44.05	-0.34		sali	3,255,260	66.59	10.72	1.94	134.08	41.08	0		2.28	54.77	141.49	47.01	sali	e
3.58	-2.67		smr	1,570,485	35.73	6.72	44.13	59.75	133.74	0		46.80	3.14	53.20	134.46	smr	c
1.24	0.92		sso	2,992,245	35.79	4.40	47.52	63.17	141.04	21	A	46.60	3.16	53.37	134.29	sso	c
0.64	19.98		taa	3,430,706	34.14	3.24	72.20	57.14	140.59	0		52.22	2.59	48.65	138.96	taa	t
-5.72	4.73		tac	1,564,906	45.99	4.08	25.70	91.60	99.27	0		20.97	9.80	82.57	105.36	tac	e
3.95	3.33		tag	1,316,595	46.73	14.51	22.98	89.89	110.37	0		19.65	10.56	84.69	103.27	tag	c
-6.49	-0.04		tar	1,461,105	58.30	23.39	6.13	128.42	65.20	0		6.17	29.89	117.79	70.48	tar	e
1.40	0.08		thg	1,356,318	55.64	25.44	8.33	109.38	69.71	0		8.25	24.04	110.17	78.03	thg	c
-3.90	12.71		tko	2,088,737	52.00	13.58	24.71	107.19	94.64	0		12.00	17.48	99.74	88.36	tko	e
-5.78	9.54		ton	1,847,607	51.27	10.59	22.42	105.34	95.37	0		12.89	16.36	97.67	90.41	ton	e
-1.35	5.94		tpe	1,781,889	57.67	27.05	12.57	114.12	69.69	0		6.62	28.40	115.97	72.29	tpe	c
-11.32	3.64		tuz	1,936,063	59.66	21.91	8.94	132.34	60.74	0		5.29	33.23	121.66	66.65	tuz	c
-4.14	-11.80		vdi	2,374,137	45.43	5.10	10.23	99.76	116.46	0		22.02	9.24	80.95	106.97	vdi	c
Les 57 euryarcheota[modifier | modifier le wikicode]
Répétitions chez les archées : 57 Euryarcheota                          x3 -0.000732 0.000746		
								        x2    0.1607  -0.0609		
	Voir méthode d’analyse (3.4.1) dans l’article			x     -11.96    1.869	 2.86	-2.83
									c     302.42   -19.90  -49.02	235.7
										Aléas équation	    Aléas (alea)	
KEGG	effectif	%GC	>4GC    >4AT    <5GC    <5AT    Ctrl            >4ATa   >4GCa   <5GCa   <5ATa
mst	1,767,403	27.63	1.45	104.89	40.43	154.03	0		79.14	0.97	30.04	157.39
mok	1,662,525	29.30	4.90	126.77	55.03	145.89	0		71.49	1.33	34.80	152.67
msi	1,853,160	31.03	2.05	100.94	51.32	152.61	0		64.09	1.73	39.77	147.76
mfv	1,243,342	31.64	2.22	122.97	54.60	141.39	0		61.65	1.88	41.49	146.05
mfe	1,485,061	32.21	5.83	109.49	56.80	149.03	0		59.39	2.03	43.13	144.42
mig	1,854,197	32.30	7.72	112.81	57.03	149.36	0		59.04	2.05	43.39	144.17
mmp	1,661,137	33.10	4.06	129.84	53.34	146.72	0		56.00	2.28	45.68	141.90
mel	2,583,753	35.83	4.09	81.15	65.84	138.17	0		46.47	3.18	53.49	134.17
pto	1,545,895	35.97	1.64	78.02	71.21	129.35	0		46.00	3.23	53.89	133.77
mev	2,242,317	36.63	3.47	80.78	66.26	126.72	0		43.90	3.49	55.78	131.90
mzh	2,138,444	39.16	3.70	57.65	71.98	117.57	0		36.48	4.68	63.01	124.74
abi	1,486,778	39.16	7.57	58.52	73.06	124.04	0		36.47	4.68	63.01	124.74
mba	4,837,408	39.28	4.32	81.55	71.15	125.68	23	T	36.15	4.74	63.35	124.40
mbu	2,575,032	40.76	4.58	45.66	72.20	120.03	0		32.27	5.60	67.59	120.20
mer	1,931,651	41.26	3.56	48.37	67.79	114.17	0		31.04	5.92	69.01	118.79
pho	1,738,505	41.88	10.70	36.16	84.00	129.27	0		29.54	6.34	70.80	117.02
mmh	2,012,424	42.62	6.96	53.04	85.99	112.84	0		27.84	6.87	72.91	114.93
mhz	2,428,904	42.62	5.02	43.42	79.92	108.24	0		27.83	6.87	72.93	114.91
mac	5,751,492	42.68	8.12	75.38	82.45	115.53	0		27.70	6.91	73.09	114.75
ppac	1,859,370	43.04	7.85	51.93	79.22	121.89	0		26.89	7.19	74.13	113.72
fpl	2,196,266	44.14	6.72	57.89	75.22	120.02	0		24.57	8.07	77.25	110.63
mpy	3,072,769	44.61	5.17	36.26	85.75	105.86	0		23.61	8.49	78.61	109.28
mhu	3,544,738	45.15	9.69	46.06	93.26	99.40	28	A	22.55	8.98	80.16	107.76
tac	1,564,906	45.99	4.08	25.70	91.60	99.27	0		20.97	9.80	82.57	105.36
gac	1,860,815	46.84	8.76	47.12	88.51	102.26	0		19.47	10.67	84.99	102.97
mpi	2,843,290	47.40	10.08	45.55	93.14	98.91	0		18.52	11.29	86.59	101.38
hwa	3,132,494	47.86	5.52	14.14	75.24	97.67	0		17.76	11.82	87.92	100.07
afu	2,178,400	48.58	12.81	37.95	92.36	105.98	0		16.63	12.68	89.98	98.03
mear	1,488,669	49.21	9.72	29.54	94.36	94.67	0		15.70	13.47	91.76	96.26
mth	1,751,377	49.54	20.79	21.74	109.95	87.88	0		15.21	13.91	92.73	95.30
mla	1,804,962	50.01	8.98	46.73	97.56	88.23	0		14.56	14.54	94.05	93.99
ton	1,847,607	51.27	10.59	22.42	105.34	95.37	0		12.89	16.36	97.67	90.41
tko	2,088,737	52.00	13.58	24.71	107.19	94.64	0		12.00	17.48	99.74	88.36
mtp	1,879,471	53.55	10.06	10.51	102.12	67.33	21	A	10.27	20.08	104.18	83.96
hbu	1,667,163	53.74	15.25	5.99	106.78	73.51	0		10.07	20.42	104.72	83.42
marc	1,937,883	54.00	14.15	11.70	116.40	78.15	0		9.80	20.90	105.49	82.67
mbn	2,542,943	54.51	18.06	41.04	120.92	76.82	0		9.29	21.84	106.95	81.22
mpd	2,957,635	54.92	10.99	30.15	114.87	73.81	0		8.91	22.61	108.10	80.08
mpl	2,922,917	55.35	17.85	18.06	118.62	69.16	0		8.51	23.46	109.35	78.84
tar	1,461,105	58.30	23.39	6.13	128.42	65.20	0		6.17	29.89	117.79	70.48
mbg	2,789,774	60.64	28.57	9.29	131.98	57.74	0		4.73	35.83	124.48	63.86
hbo	2,820,544	61.06	7.75	5.24	112.63	63.07	0		4.50	36.99	125.69	62.66
mka	1,694,969	61.16	18.52	3.88	133.61	57.76	0		4.45	37.26	125.96	62.39
nmg	3,751,858	61.42	7.37	3.95	113.33	56.17	0		4.31	37.99	126.71	61.65
hlr	2,789,326	61.95	9.34	6.12	114.75	57.54	0		4.05	39.51	128.22	60.16
hma1	3,131,724	62.36	8.59	4.88	122.56	54.74	0		3.86	40.73	129.41	58.98
hut	3,116,795	62.90	12.77	4.43	124.35	52.09	0		3.62	42.35	130.94	57.46
hsu	2,085,482	63.29	17.36	6.49	128.61	51.44	0		3.45	43.56	132.06	56.35
nph	2,595,221	63.44	11.48	5.88	126.44	54.53	0		3.39	44.03	132.49	55.93
hmu	221,862		64.15	9.60	3.29	122.27	45.13	0		3.11	46.32	134.52	53.91
hru	3,223,876	64.34	9.98	3.26	125.30	47.73	0		3.04	46.92	135.05	53.39
htu	3,889,038	65.83	10.40	2.86	128.48	44.13	0		2.51	52.05	139.33	49.15
hxa	3,668,009	65.98	9.51	3.07	129.03	45.71	0		2.47	52.58	139.76	48.72
sali	3,255,260	66.59	10.72	1.94	134.08	41.08	0		2.28	54.77	141.49	47.01
hvo	2,847,757	66.64	11.77	4.14	130.59	46.93	0		2.26	54.96	141.64	46.86
hla	2,735,295	66.72	13.76	3.26	131.01	42.38	0		2.24	55.27	141.88	46.63
hal	2,014,239	67.91	19.02	2.97	136.93	40.18	0		1.91	59.82	145.28	43.25


Les 20 crenarcheota[modifier | modifier le wikicode]
Répétitions chez les archées : 20 Crenarcheota                          x3 -0.000732 0.000746		
								        x2    0.1607  -0.0609		
	Voir méthode d’analyse (3.4.1) dans l’article			x     -11.96    1.869	 2.86	-2.83
									c     302.42   -19.90  -49.02	235.7
										Aléas équation	    Aléas (alea)	
KEGG	effectif	%GC	>4GC    >4AT    <5GC    <5AT    Ctrl            >4ATa   >4GCa   <5GCa   <5ATa
clg	1,546,846	30.03	4.93	90.91	52.33	155.52	0		68.29	1.49	36.91	150.59
aho	2,137,654	34.15	2.42	60.49	59.27	148.09	0		52.19	2.60	48.68	138.93
iag	1,875,953	35.69	4.59	28.40	58.22	119.15	0		46.93	3.13	53.08	134.57
smr	1,570,485	35.73	6.72	44.13	59.75	133.74	0		46.80	3.14	53.20	134.46
sso	2,992,245	35.79	4.40	47.52	63.17	141.04	21	A	46.60	3.16	53.37	134.29
ffo	1,319,206	37.47	6.67	86.30	62.35	128.69	0		41.31	3.86	58.20	129.51
cma	2,077,567	43.10	12.91	7.43	94.35	129.98	0		26.78	7.23	74.28	113.58
dka	1,365,223	45.34	12.91	15.05	89.74	100.44	0		22.19	9.16	80.70	107.22
vdi	2,374,137	45.43	5.10	10.23	99.76	116.46	0		22.02	9.24	80.95	106.97
mse	2,191,517	46.23	11.42	18.44	97.91	107.84	0		20.55	10.03	83.23	104.71
tag	1,316,595	46.73	14.51	22.98	89.89	110.37	0		19.65	10.56	84.69	103.27
pai	2,222,430	51.36	29.51	34.84	101.63	90.23	0		12.77	16.50	97.93	90.15
pdl	2,023,836	53.91	13.35	5.85	105.21	68.86	0		9.89	20.74	105.23	82.92
pfm	1,843,267	54.91	13.24	3.96	103.87	70.61	65   42T,23A	8.92	22.59	108.07	80.11
thg	1,356,318	55.64	25.44	8.33	109.38	69.71	0		8.25	24.04	110.17	78.03
ape	1,669,696	56.31	40.50	6.58	123.07	66.34	0		7.68	25.42	112.09	76.13
iho	1,297,538	56.52	35.80	7.26	120.98	88.54	0		7.51	25.87	112.69	75.54
asc	1,496,453	57.22	25.37	5.64	127.10	70.98	0		6.96	27.39	114.68	73.56
tpe	1,781,889	57.67	27.05	12.57	114.12	69.69	0		6.62	28.40	115.97	72.29
tuz	1,936,063	59.66	21.91	8.94	132.34	60.74	0		5.29	33.23	121.66	66.65
Les 30 autres archées[modifier | modifier le wikicode]
Répétitions chez les archées : 30 autres archées                        x3 -0.000732 0.000746		
								        x2    0.1607  -0.0609		
	Voir méthode d’analyse (3.4.1) dans l’article			x     -11.96    1.869	 2.86	-2.83
									c     302.42   -19.90  -49.02	235.7
										Aléas équation	    Aléas (alea)	
KEGG	effectif	%GC	>4GC    >4AT    <5GC    <5AT    Ctrl            >4ATa   >4GCa   <5GCa   <5ATa
clg	1,546,846	30.03	4.93	90.91	52.33	155.52	0		68.29	1.49	36.91	150.59
neq	490,885		31.56	8.82	108.91	55.46	145.91	0		61.96	1.86	41.27	146.27
nbv	1,232,128	33.16	1.01	103.93	50.47	145.33	0		55.79	2.29	45.85	141.74
taa	3,430,706	34.14	3.24	72.20	57.14	140.59	0		52.22	2.59	48.65	138.96
aho	2,137,654	34.15	2.42	60.49	59.27	148.09	0		52.19	2.60	48.68	138.93
nmr	1,645,259	34.17	1.70	94.23	51.17	142.69	0		52.12	2.60	48.73	138.88
nkr	1,639,964	34.18	1.91	100.89	51.93	141.03	0		52.06	2.61	48.78	138.83
iag	1,875,953	35.69	4.59	28.40	58.22	119.15	0		46.93	3.13	53.08	134.57
smr	1,570,485	35.73	6.72	44.13	59.75	133.74	0		46.80	3.14	53.20	134.46
sso	2,992,245	35.79	4.40	47.52	63.17	141.04	21	A	46.60	3.16	53.37	134.29
ffo	1,319,206	37.47	6.67	86.30	62.35	128.69	0		41.31	3.86	58.20	129.51
cma	2,077,567	43.10	12.91	7.43	94.35	129.98	0		26.78	7.23	74.28	113.58
dka	1,365,223	45.34	12.91	15.05	89.74	100.44	0		22.19	9.16	80.70	107.22
vdi	2,374,137	45.43	5.10	10.23	99.76	116.46	0		22.02	9.24	80.95	106.97
mse	2,191,517	46.23	11.42	18.44	97.91	107.84	0		20.55	10.03	83.23	104.71
tag	1,316,595	46.73	14.51	22.98	89.89	110.37	0		19.65	10.56	84.69	103.27
nga	2,833,868	48.35	3.90	33.58	86.74	98.54	0		16.99	12.39	89.30	98.70
kcr	1,590,757	49.00	23.53	12.23	98.06	86.14	0		16.00	13.21	91.17	96.84
pai	2,222,430	51.36	29.51	34.84	101.63	90.23	0		12.77	16.50	97.93	90.15
csu	1,680,938	51.65	10.00	30.05	101.25	86.91	0		12.42	16.94	98.75	89.34
pdl	2,023,836	53.91	13.35	5.85	105.21	68.86	0		9.89	20.74	105.23	82.92
pfm	1,843,267	54.91	13.24	3.96	103.87	70.61	65   42T,23A	8.92	22.59	108.07	80.11
thg	1,356,318	55.64	25.44	8.33	109.38	69.71	0		8.25	24.04	110.17	78.03
ape	1,669,696	56.31	40.50	6.58	123.07	66.34	0		7.68	25.42	112.09	76.13
iho	1,297,538	56.52	35.80	7.26	120.98	88.54	0		7.51	25.87	112.69	75.54
asc	1,496,453	57.22	25.37	5.64	127.10	70.98	0		6.96	27.39	114.68	73.56
tpe	1,781,889	57.67	27.05	12.57	114.12	69.69	0		6.62	28.40	115.97	72.29
tuz	1,936,063	59.66	21.91	8.94	132.34	60.74	0		5.29	33.23	121.66	66.65
nge	3,788,356	62.24	8.18	4.45	115.49	53.95	0		3.92	40.35	129.04	59.34
nou	4,013,216	64.94	13.64	4.30	126.63	45.61	0		2.82	48.93	136.77	51.69


Tableau des écarts relatifs / aléa[modifier | modifier le wikicode]

Répétitions chez les archées. Voir méthode d’analyse (3.4.1) dans l’article

Euryarcheota					Crenarcheota			
								
KEGG	%GC	>4GC%   >4AT%           KEGG    %GC     >4GC%   >4AT%
mst	27.63	49	33		aho	34.15	-7	16
mok	29.30	268	77		ape	56.31	59	-14
msi	31.03	18	57		asc	57.22	-7	-19
mfv	31.64	18	99		clg	30.03	230	33
mfe	32.21	187	84		cma	43.10	79	-72
mig	32.30	276	91		dka	45.34	41	-32
mmp	33.10	78	132		ffo	37.47	73	109
mel	35.83	29	75		iag	35.69	47	-39
pto	35.97	-49	70		iho	56.52	38	-3
mev	36.63	-1	84		mse	46.23	14	-10
mzh	39.16	-21	58		pai	51.36	79	173
abi	39.16	62	60		pdl	53.91	-36	-41
mba	39.28	-9	126		pfm	54.91	-41	-56
mbu	40.76	-18	41		smr	35.73	114	-6
mer	41.26	-40	56		sso	35.79	39	2
pho	41.88	69	22		tag	46.73	37	17
mmh	42.62	1	90		thg	55.64	6	1
mhz	42.62	-27	56		tpe	57.67	-5	90
mac	42.68	18	172		tuz	59.66	-34	69
ppac	43.04	9	93		vdi	45.43	-45	-54
fpl	44.14	-17	136					
mpy	44.61	-39	54			Autres			
mhu	45.15	8	104					
tac	45.99	-58	23		csu	51.65	-41	142
gac	46.84	-18	142		kcr	49.00	78	-24
mpi	47.40	-11	146		nbv	33.16	-56	86
hwa	47.86	-53	-20		neq	31.56	374	76
afu	48.58	1	128		nga	48.35	-69	98
mear	49.21	-28	88		nge	62.24	-80	14
mth	49.54	49	43		nkr	34.18	-27	94
mla	50.01	-38	221		nmr	34.17	-35	81
ton	51.27	-35	74		nou	64.94	-72	52
tko	52.00	-22	106		taa	34.14	25	38
mtp	53.55	-50	2					
hbu	53.74	-25	-40					
marc	54.00	-32	19					
mbn	54.51	-17	342					
mpd	54.92	-51	238					
mpl	55.35	-24	112					
tar	58.30	-22	-1					
mbg	60.64	-20	96					
hbo	61.06	-79	17					
mka	61.16	-50	-13					
nmg	61.42	-81	-9					
hlr	61.95	-76	51					
hma1	62.36	-79	27					
hut	62.90	-70	22					
hsu	63.29	-60	88					
nph	63.44	-74	74					
hmu	64.15	-79	6					
hru	64.34	-79	7					
htu	65.83	-80	14					
hxa	65.98	-82	24					
sali	66.59	-80	-15					
hvo	66.64	-79	83					
hla	66.72	-75	46					
hal	67.91	-68	56					

Groupes des archées selon l'écart relatif par rapport à l'aléa[modifier | modifier le wikicode]

Euryarcheota[modifier | modifier le wikicode]

Groupe 22ae						euryarcheota	25-43 %GC               Groupe 41ae				
KEGG	%GC     >4GC    >4AT    DNA                     KEGG    %GC     >4GC%   >4AT%           KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA
mst	27.63	1.45	104.89	1,767,403		pto	35.97	-49	70		mbg	60.64	28.57	9.29	2,789,774
msi	31.03	2.05	100.94	1,853,160		mer	41.26	-40	56		hbo	61.06	7.75	5.24	2,820,544
mfv	31.64	2.22	122.97	1,243,342		mhz	42.62	-27	56		mka	61.16	18.52	3.88	1,694,969
mmp	33.10	4.06	129.84	1,661,137		mzh	39.16	-21	58		nmg	61.42	7.37	3.95	3,751,858
mel	35.83	4.09	81.15	2,583,753		mbu	40.76	-18	41		hlr	61.95	9.34	6.12	2,789,326
mok	29.30	4.90	126.77	1,662,525		mba	39.28	-9	126		hma1	62.36	8.59	4.88	3,131,724
mfe	32.21	5.83	109.49	1,485,061		mev	36.63	-1	84		hut	62.90	12.77	4.43	3,116,795
mmh	42.62	6.96	53.04	2,012,424		mmh	42.62	1	90		hsu	63.29	17.36	6.49	2,085,482
abi	39.16	7.57	58.52	1,486,778		ppac	43.04	9	93		nph	63.44	11.48	5.88	2,595,221
mig	32.30	7.72	112.81	1,854,197		msi	31.03	18	57		hmu	64.15	9.60	3.29	221,862
ppac	43.04	7.85	51.93	1,859,370		mfv	31.64	18	99		hru	64.34	9.98	3.26	3,223,876
mac	42.68	8.12	75.38	5,751,492		mac	42.68	18	172		htu	65.83	10.40	2.86	3,889,038
pho	41.88	10.70	36.16	1,738,505		mel	35.83	29	75		hxa	65.98	9.51	3.07	3,668,009
							mst	27.63	49	33		sali	66.59	10.72	1.94	3,255,260
moyen.	36	6	90	2,073,781		abi	39.16	62	60		hvo	66.64	11.77	4.14	2,847,757
ecartt	6	3	32	1,149,592		pho	41.88	69	22		hla	66.72	13.76	3.26	2,735,295
%   	16	50	36	55			mmp	33.10	78	132		hal	67.91	19.02	2.97	2,014,239
							mfe	32.21	187	84						
Groupe 23ae						mok	29.30	268	77		moyen.	64	13	4	2,743,002
KEGG	%GC     >4GC    >4AT    DNA                     mig     32.30   276     91              ecartt  2       5       2       881,493
pto	35.97	1.64	78.02	1,545,895							%   	4	42	40	32
mev	36.63	3.47	80.78	2,242,317											
mzh	39.16	3.70	57.65	2,138,444											
mba	39.28	4.32	81.55	4,837,408											
mbu	40.76	4.58	45.66	2,575,032											
mer	41.26	3.56	48.37	1,931,651											
mhz	42.62	5.02	43.42	2,428,904											
															
moyen.	39	4	62	2,528,522											
ecartt	2	1	17	1,072,297											
%   	6	29	28	42											
															
Groupe 67ae2						euryarcheota	43-60 %GC              euryarcheota	60-75 %GC		
KEGG	%GC     >4GC    >4AT    DNA                     KEGG    %GC     >4GC%   >4AT%          KEGG     %GC     >4GC%   >4AT%	
tac	45.99	4.08	25.70	1,564,906		tac	45.99	-58	23		hxa	65.98	-82	24	
mpy	44.61	5.17	36.26	3,072,769		hwa	47.86	-53	-20		nmg	61.42	-81	-9	
hwa	47.86	5.52	14.14	3,132,494		mpd	54.92	-51	238		htu	65.83	-80	14	
fpl	44.14	6.72	57.89	2,196,266		mtp	53.55	-50	2		sali	66.59	-80	-15	
gac	46.84	8.76	47.12	1,860,815		mpy	44.61	-39	54		hbo	61.06	-79	17	
mla	50.01	8.98	46.73	1,804,962		mla	50.01	-38	221		hma1	62.36	-79	27	
mear	49.21	9.72	29.54	1,488,669		ton	51.27	-35	74		hmu	64.15	-79	6	
mtp	53.55	10.06	10.51	1,879,471		marc	54.00	-32	19		hru	64.34	-79	7	
mpi	47.40	10.08	45.55	2,843,290		mear	49.21	-28	88		hvo	66.64	-79	83	
ton	51.27	10.59	22.42	1,847,607		hbu	53.74	-25	-40		hlr	61.95	-76	51	
mpd	54.92	10.99	30.15	2,957,635		mpl	55.35	-24	112		hla	66.72	-75	46	
tko	52.00	13.58	24.71	2,088,737		tko	52.00	-22	106		nph	63.44	-74	74	
marc	54.00	14.15	11.70	1,937,883		tar	58.30	-22	-1		hut	62.90	-70	22	
hbu	53.74	15.25	5.99	1,667,163		gac	46.84	-18	142		hal	67.91	-68	56	
mpl	55.35	17.85	18.06	2,922,917		fpl	44.14	-17	136		hsu	63.29	-60	88	
mbn	54.51	18.06	41.04	2,542,943		mbn	54.51	-17	342		mka	61.16	-50	-13	
tar	58.30	23.39	6.13	1,461,105		mpi	47.40	-11	146		mbg	60.64	-20	96	
							afu	48.58	1	128						
moyen.	51	11	28	2,192,331		mhu	45.15	8	104						
ecartt	4	5	16	590,374			mth	49.54	49	43						
%   	8	45	57	27											
															
Groupe 67ae1															
KEGG	%GC     >4GC     >4AT   DNA											
mhu	45.15	9.69	46.06	3,544,738											
afu	48.58	12.81	37.95	2,178,400											
mth	49.54	20.79	21.74	1,751,377											
															
moyen.	48	14	35	2,491,505											
ecartt	2	6	12	936,783											
%   	5	40	35	38											

Crenarcheota[modifier | modifier le wikicode]

Groupe 22ac					crenarcheota	25-43 %GC               Groupe 67ac1				
KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA             KEGG    %GC     >4GC%   >4AT%           KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA	
clg	30.03	4.93	90.91	1,546,846	aho	34.15	-7	16		ape	56.31	40.5	6.58	1,669,696
cma	43.1	12.91	7.43	2,077,567	sso	35.79	39	2		dka	45.34	12.91	15.05	1,365,223
ffo	37.47	6.67	86.3	1,319,206	iag	35.69	47	-39		iho	56.52	35.8	7.26	1,297,538
iag	35.69	4.59	28.4	1,875,953	ffo	37.47	73	109		mse	46.23	11.42	18.44	2,191,517
smr	35.73	6.72	44.13	1,570,485	cma	43.1	79	-72		pai	51.36	29.51	34.84	2,222,430
sso	35.79	4.4	47.52	2,992,245	smr	35.73	114	-6		tag	46.73	14.51	22.98	1,316,595
						clg	30.03	230	33		thg	55.64	25.44	8.33	1,356,318
moyen.	36	7	51	1,678,011											
ecartt	5	3	36	298,468		crenarcheota	43-60 %GC               moyen.  51      24      16      1,631,331
%   	13	47	71	18		KEGG    %GC     >4GC%   >4AT%           ecartt  5       12      10      412,634
						vdi	45.43	-45	-54		%   	10	48	63	25
Groupe 23ac					pfm	54.91	-41	-56						
KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA             pdl     53.91   -36     -41             Groupe 67ac2				
aho	34.15	2.42	60.49	2,137,654	tuz	59.66	-34	69		KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA	
						asc	57.22	-7	-19		asc	57.22	25.37	5.64	1,496,453
						tpe	57.67	-5	90		pdl	53.91	13.35	5.85	2,023,836
						thg	55.64	6	1		pfm	54.91	13.24	3.96	1,843,267
						mse	46.23	14	-10		tpe	57.67	27.05	12.57	1,781,889
						tag	46.73	37	17		tuz	59.66	21.91	8.94	1,936,063
						iho	56.52	38	-3		vdi	45.43	5.1	10.23	2,374,137
						dka	45.34	41	-32						
						ape	56.31	59	-14		moyen.	55	18	8	1,909,274
						pai	51.36	79	173		ecartt	5	9	3	290,153
											%   	9	48	41	15

Autre-archeota[modifier | modifier le wikicode]

Autres							Autres 	écarts	
KEGG    %GC     >4GC    >4AT    DNA             ordre   %GC     >4GC%   >4AT%
kcr	49.00	23.53	12.23	1,590,757	kor	49.00	78	-24
neq	31.56	8.82	108.91	490,885		nano	31.56	374	76
nge	62.24	8.18	4.45	3,788,356	nano	62.24	-80	14
nou	64.94	13.64	4.3	4,013,216	nano	64.94	-72	52
nbv	33.16	1.01	103.93	1,232,128	thaum	33.16	-56	86
taa	34.14	3.24	72.2	3,430,706	thaum	34.14	25	38
nmr	34.17	1.7	94.23	1,645,259	thaum	34.17	-35	81
nkr	34.18	1.91	100.89	1,639,964	thaum	34.18	-27	94
nga	48.35	3.9	33.58	2,833,868	thaum	48.35	-69	98
csu	51.65	10	30.05	1,680,938	thaum	51.65	-41	142

Archées: rupture entre les groupes à progression homogène[modifier | modifier le wikicode]

  • Euryarcheota
Euryarcheota:taux >4GC				Euryarcheota:taux >4AT				
KEGG	%GC	>4GC    # %    groupe           KEGG    %GC     >4AT    # %   groupe
mst	27.63	1.45	11     ** 2 **		sali	66.59	1.94	32    ** I **
pto	35.97	1.64	20			htu	65.83	2.86	4	
msi	31.03	2.05	8			hal	67.91	2.97	3	
mfv	31.64	2.22	36			hxa	65.98	3.07	6	
mev	36.63	3.47	3      ** 7 **		hru	64.34	3.26	0	
mer	41.26	3.56	4			hla	66.72	3.26	1	
mzh	39.16	3.70	9			hmu	64.15	3.29	15	
mmp	33.10	4.06	0			mka	61.16	3.88	2    ** II **
tac	45.99	4.08	0			nmg	61.42	3.95	5	
mel	35.83	4.09	5			hvo	66.64	4.14	7	
mba	39.28	4.32	6			hut	62.90	4.43	9	
mbu	40.76	4.58	6			hma1	62.36	4.88	7	
mok	29.30	4.90	3			hbo	61.06	5.24	11	
mhz	42.62	5.02	3			nph	63.44	5.88	2	
mpy	44.61	5.17	6			hbu	53.74	5.99	2	
hwa	47.86	5.52	5			hlr	61.95	6.12	0	
mfe	32.21	5.83	13			tar	58.30	6.13	6	
fpl	44.14	6.72	4     ** 14 **		hsu	63.29	6.49	30	
mmh	42.62	6.96	6			mbg	60.64	9.29	12    ** III **
nmg	61.42	7.37	3			mtp	53.55	10.51	10	
abi	39.16	7.57	2			marc	54.00	11.70	17	
mig	32.30	7.72	0			hwa	47.86	14.14	22	
hbo	61.06	7.75	1			mpl	55.35	18.06	17	
ppac	43.04	7.85	3			mth	49.54	21.74	3	
mac	42.68	8.12	5			ton	51.27	22.42	9	
hma1	62.36	8.59	2			tko	52.00	24.71	4	
gac	46.84	8.76	2			tac	45.99	25.70	13	
mla	50.01	8.98	4			mear	49.21	29.54	2	
hlr	61.95	9.34	2			mpd	54.92	30.15	17	
hxa	65.98	9.51	1			pho	41.88	36.16	0    ** IV **
hmu	64.15	9.60	1			mpy	44.61	36.26	4	
mhu	45.15	9.69	0			afu	48.58	37.95	8	
mear	49.21	9.72	3			mbn	54.51	41.04	5	
hru	64.34	9.98	1			mhz	42.62	43.42	5	
mtp	53.55	10.06	0			mpi	47.40	45.55	0	
mpi	47.40	10.08	3			mbu	40.76	45.66	1	
htu	65.83	10.40	2			mhu	45.15	46.06	1	
ton	51.27	10.59	1			mla	50.01	46.73	1	
pho	41.88	10.70	0			gac	46.84	47.12	3	
sali	66.59	10.72	2			mer	41.26	48.37	7	
mpd	54.92	10.99	4			ppac	43.04	51.93	2	
nph	63.44	11.48	2			mmh	42.62	53.04	8	
hvo	66.64	11.77	8			mzh	39.16	57.65	0	
hut	62.90	12.77	0			fpl	44.14	57.89	1	
afu	48.58	12.81	6			abi	39.16	58.52	22	
tko	52.00	13.58	1			mac	42.68	75.38	3    ** V **
hla	66.72	13.76	3			pto	35.97	78.02	3	
marc	54.00	14.15	7			mev	36.63	80.78	0	
hbu	53.74	15.25	12			mel	35.83	81.15	0	
hsu	63.29	17.36	3     ** 25 **		mba	39.28	81.55	19	
mpl	55.35	17.85	1			msi	31.03	100.94	4    ** VI **
mbn	54.51	18.06	2			mst	27.63	104.89	4	
mka	61.16	18.52	3			mfe	32.21	109.49	3	
hal	67.91	19.02	8			mig	32.30	112.81	8	
mth	49.54	20.79	11			mfv	31.64	122.97	3	
tar	58.30	23.39	18    ** 68 **		mok	29.30	126.77	2	
mbg	60.64	28.57				mmp	33.10	129.84		

  • Crenarcheota
Crenarcheota:taux >4GC				Crenarcheota:taux >4AT				
KEGG	%GC	>4GC    # %   groupe            KEGG    %GC     >4AT    # %     groupe
aho	34.15	2.42	45    ** 2 **		pfm	54.91	3.96	30	** I **
sso	35.79	4.40	4     ** 7 **		asc	57.22	5.64	4	** II **
iag	35.69	4.59	7			pdl	53.91	5.85	11	
clg	30.03	4.93	3			ape	56.31	6.58	9	
vdi	45.43	5.10	24			iho	56.52	7.26	2	
ffo	37.47	6.67	1			cma	43.10	7.43	11	
smr	35.73	6.72	41			thg	55.64	8.33	7	
mse	46.23	11.42	12    ** 14 **		tuz	59.66	8.94	13	
dka	45.34	12.91	0			vdi	45.43	10.23	19	
cma	43.10	12.91	2			tpe	57.67	12.57	17	** III **
pfm	54.91	13.24	1			dka	45.34	15.05	18	
pdl	53.91	13.35	8			mse	46.23	18.44	20	
tag	46.73	14.51	34			tag	46.73	22.98	19	** IV **
tuz	59.66	21.91	14    ** 25 **		iag	35.69	28.40	18	
asc	57.22	25.37	0			pai	51.36	34.84	21	
thg	55.64	25.44	6			smr	35.73	44.13	7	** V **
tpe	57.67	27.05	8			sso	35.79	47.52	21	
pai	51.36	29.51	18			aho	34.15	60.49	30	** VI **
iho	56.52	35.80	12    ** 68 **		ffo	37.47	86.30	5	
ape	56.31	40.50				clg	30.03	90.91		

Plasmides[modifier | modifier le wikicode]

Résultats[modifier | modifier le wikicode]

plasmides cyanobactéries[modifier | modifier le wikicode]

  • Plasmides cyanobactéries:
 
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
ana; 6413771; 41.3475473321389; 16139; 16308; 2701; 2590; 375551; 373179; 217679; 219026; 32204; 31846; 11639; 11672; 0
ana1; 408101; 40.5142354466174; 1101; 1022; 141; 133; 24499; 24656; 12820; 12984; 1999; 2065; 569; 559; 0
ana2; 186614; 40.2279571736311; 401; 604; 61; 50; 10515; 12201; 6252; 5491; 737; 1141; 247; 222; 0
ana3; 101965; 41.0258422007552; 262; 236; 35; 38; 6287; 5798; 3399; 3200; 495; 461; 156; 149; 0
ana4; 55414; 41.610423358718; 136; 145; 39; 24; 3210; 3249; 1863; 1750; 254; 277; 92; 84; 0
ana5; 40340; 40.8552305404065; 117; 128; 25; 15; 2283; 2450; 1326; 1298; 201; 214; 47; 59; 0
ana6; 5584; 44.1797994269341; 5; 16; 1; 2; 242; 306; 168; 245; 22; 35; 6; 11; 0
anb1; 80384; 37.2312898089172; 259; 226; 35; 24; 5357; 5127; 2462; 2251; 486; 441; 125; 117; 0
anb2; 56037; 37.2539572068455; 205; 141; 19; 22; 3673; 3336; 1711; 1556; 359; 360; 93; 96; 0
anb3; 20025; 37.41822721598; 53; 88; 14; 13; 1168; 1264; 538; 583; 111; 139; 35; 34; 0
anba; 4329264; 38.1047679236009; 13593; 14177; 1732; 1792; 273098; 273360; 136468; 136365; 25851; 25468; 6772; 6679; 0
anbb; 819965; 38.2121188099492; 2658; 2671; 345; 365; 51092; 52288; 26118; 25949; 4841; 5038; 1285; 1302; 0
can; 4114099; 34.9583225877647; 19398; 19033; 2471; 2506; 269395; 269454; 115224; 114077; 29524; 29218; 7231; 7224; 0
can1; 62874; 33.1711041129879; 214; 262; 21; 27; 4218; 4489; 1532; 1739; 434; 462; 76; 69; 0
cyt1; 39620; 36.7995961635538; 168; 123; 15; 20; 2700; 2570; 1062; 1204; 271; 198; 56; 56; 0
cyt2; 31856; 41.4584379708689; 68; 53; 11; 43; 1958; 2059; 1127; 1198; 142; 128; 57; 94; 0
cyt3; 14685; 38.0932924753149; 66; 58; 2; 15; 984; 817; 312; 521; 87; 75; 20; 46; 0
cyt4; 10244; 36.9679812573214; 35; 32; 10; 12; 756; 625; 266; 342; 57; 45; 4; 25; 0
cytc; 4934271; 37.875402465734; 17294; 17824; 3060; 3064; 318932; 321159; 153124; 153452; 29602; 29800; 10516; 10635; 0
cytl; 429701; 38.5686791513168; 1366; 1451; 184; 205; 27135; 27802; 13346; 12975; 2255; 2582; 681; 727; 0
syn; 3573470; 47.7202551021836; 9619; 9472; 5690; 5659; 184173; 183791; 174968; 176236; 16661; 16318; 12958; 13031; 0
syn1; 103307; 44.4790769260553; 322; 267; 97; 89; 5689; 5744; 4326; 4296; 520; 468; 317; 309; 0
syn2; 44343; 48.618722233498; 66; 66; 40; 39; 2153; 2100; 1957; 2054; 140; 151; 100; 122; 0
syn3; 119895; 42.950081321156; 363; 309; 99; 94; 6841; 6716; 4758; 4698; 659; 602; 343; 310; 0
syn4; 106004; 42.7153692313498; 286; 408; 124; 109; 5929; 6108; 4032; 4328; 493; 632; 291; 290; 0
len; 6244812; 46.6455995792988; 8355; 8414; 1607; 1668; 345998; 345528; 216003; 219001; 21647; 21473; 6689; 6967; 0
len1; 325675; 47.0134336378291; 451; 450; 82; 87; 17504; 17603; 11313; 11369; 1142; 1094; 357; 368; 0
len2; 98206; 48.5448954239049; 129; 122; 31; 20; 5036; 5057; 3756; 3676; 278; 284; 138; 148; 0
len3; 92964; 47.3467938857395; 133; 132; 30; 21; 4941; 4880; 3196; 3092; 284; 296; 105; 110; 1
mic; 7470429; 46.2148157756402; 14670; 14431; 4759; 4741; 402745; 402180; 300621; 299833; 29105; 28538; 15039; 14766; 0
mic1; 146045; 45.2702934027183; 237; 275; 72; 60; 7844; 8277; 5454; 5124; 502; 600; 235; 226; 0
mic2; 93032; 47.0999226072749; 237; 164; 78; 87; 4854; 5013; 3776; 3827; 364; 326; 172; 230; 0
mic3; 92471; 46.6167771517557; 188; 180; 69; 75; 4984; 5064; 3530; 3704; 360; 328; 246; 240; 0
mic4; 50464; 44.6536144578313; 117; 103; 29; 16; 2839; 2740; 1946; 1784; 223; 186; 79; 64; 0
mic5; 38468; 47.6603930539669; 72; 65; 20; 34; 1981; 1998; 1535; 1641; 141; 132; 61; 75; 0
mic6; 28816; 46.5852304275403; 51; 68; 24; 27; 1515; 1594; 1184; 1155; 113; 121; 49; 62; 0
mic7; 25982; 46.7631437148795; 43; 47; 15; 18; 1395; 1360; 980; 1014; 94; 96; 40; 49; 0
mic8; 20803; 46.454838244484; 36; 57; 18; 17; 1176; 1068; 752; 909; 87; 71; 43; 47; 0
oac; 7689443; 47.6010941234625; 17035; 16687; 9362; 9630; 401162; 397639; 344008; 344310; 32328; 32182; 25811; 25893; 0
oac1; 64128; 47.6157060878243; 138; 165; 59; 70; 3246; 3301; 2878; 2791; 259; 260; 176; 190; 0
oac2; 50699; 49.296830312235; 94; 105; 48; 61; 2469; 2583; 2295; 2464; 174; 208; 160; 165; 0
oni; 7479014; 45.8676504683639; 19394; 19840; 4057; 4051; 398146; 400028; 284712; 286596; 37104; 37459; 13330; 13360; 0
oni1; 300164; 45.1266640902973; 730; 625; 155; 165; 16857; 16586; 10890; 11622; 1378; 1275; 451; 556; 0
oni2; 260268; 44.6090183964222; 571; 697; 142; 123; 14078; 15124; 9227; 9498; 1039; 1244; 481; 445; 0
oni3; 150927; 45.5074307446646; 301; 382; 96; 90; 7968; 8552; 5570; 5803; 630; 669; 267; 286; 0
oni4; 74236; 44.5632846597338; 212; 182; 35; 34; 4405; 3976; 2661; 2524; 417; 336; 127; 115; 0
oni5; 7645; 47.5866579463702; 13; 32; 9; 8; 352; 412; 270; 334; 21; 40; 10; 13; 0
syf; 2695903; 55.4700224748442; 2368; 2411; 1536; 1600; 108960; 109286; 132285; 133380; 5634; 5771; 6521; 6457; 0
syf1; 46366; 52.8878919898201; 37; 43; 37; 23; 1997; 1991; 2299; 1943; 102; 121; 120; 80; 0
synp; 3510253; 40.6197502003417; 8967; 8869; 1384; 1287; 206958; 207186; 122450; 121593; 17274; 17217; 6357; 6227; 0
synp1; 63272; 40.8932861297256; 167; 136; 16; 16; 3848; 3638; 2234; 1956; 297; 271; 69; 96; 0
synp2; 10210; 39.4123408423115; 40; 15; 1; 2; 597; 558; 307; 280; 59; 48; 32; 16; 0

Plasmides autres bactéries[modifier | modifier le wikicode]

  • plasmides autres bactéries
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
cac; 3940880; 30.9257830738312; 18639; 19088; 493; 489; 256916; 256763; 95062; 95746; 30725; 30878; 1994; 2317; 0
cac1; 192000; 30.9114583333333; 998; 867; 13; 16; 12723; 12407; 4809; 4594; 1491; 1469; 106; 86; 0
cje; 1641481; 30.5485716861785; 13069; 13222; 167; 184; 98949; 100335; 34726; 34614; 18044; 18356; 980; 930; 0
cje1; 4013; 30.1520059805632; 15; 55; 1; 3; 191; 311; 68; 80; 40; 51; 2; 7; 0
ecs; 5498450; 50.537060444307; 10559; 10451; 1635; 1787; 241834; 242329; 254721; 256257; 18618; 18564; 7511; 7699; 0
ecs1; 92721; 47.5997886131513; 173; 301; 27; 88; 3966; 4058; 3466; 4617; 309; 398; 118; 198; 0
ecs2; 3306; 43.40592861464; 24; 7; 1; 4; 194; 134; 100; 112; 18; 6; 5; 2; 0
ent; 4518712; 52.9817567483832; 7358; 7158; 1259; 1236; 182660; 182997; 215031; 214183; 14654; 14731; 6272; 6068; 0
ent1; 157749; 50.5702096368281; 243; 316; 55; 86; 6499; 6654; 7018; 7556; 528; 552; 252; 351; 0
kpn; 5315120; 57.4785705684914; 6826; 6881; 2566; 2436; 176067; 174204; 303726; 304645; 12619; 12681; 10259; 10156; 0
kpn3; 175879; 51.6906509588979; 295; 312; 81; 93; 6845; 7254; 8320; 8821; 537; 586; 285; 348; 0
kpn4; 107576; 53.4403584442627; 176; 178; 31; 69; 3951; 4187; 5347; 5835; 306; 362; 186; 262; 0
kpn5; 88582; 53.8168025106681; 143; 161; 47; 49; 3458; 3323; 4646; 4543; 247; 264; 171; 171; 0
kpn6; 4259; 41.4181732801127; 16; 18; 0; 3; 208; 215; 124; 171; 25; 28; 5; 5; 0
kpn7; 3478; 45.6584243818286; 8; 9; 1; 4; 194; 162; 126; 137; 21; 13; 8; 5; 0
pst; 6397126; 58.3988809974979; 5446; 5592; 1994; 1943; 221412; 222767; 358716; 358180; 11560; 11674; 9557; 9458; 0
pst1; 73661; 55.145870949349; 81; 86; 41; 52; 2799; 2747; 3736; 3971; 156; 215; 133; 143; 0
pst2; 67473; 56.1661701717724; 86; 86; 33; 51; 2376; 2390; 3511; 3796; 143; 179; 115; 125; 0
sco; 8667507; 72.1186611098208; 172; 218; 10660; 10577; 127391; 126460; 701446; 707949; 972; 1019; 34063; 33951; 0
sco1; 356023; 69.0593023484438; 11; 17; 472; 385; 6041; 6932; 28091; 25882; 81; 112; 1360; 1092; 0
sco2; 31317; 72.1173803365584; 5; 6; 33; 72; 556; 399; 2360; 2881; 3; 4; 99; 181; 0
sfl; 4607202; 50.8900181956189; 8134; 8316; 1312; 1303; 201549; 201821; 215654; 213169; 15093; 15382; 6312; 5871; 49
sfl1; 221618; 45.7670405833461; 619; 570; 110; 124; 10419; 10128; 8643; 9294; 994; 932; 307; 362; 0
stm; 4857432; 52.2215030493479; 9188; 9233; 1560; 1621; 199721; 198927; 237684; 237879; 16617; 16211; 6925; 6782; 0
stm1; 93939; 53.1280937629738; 160; 185; 44; 76; 3310; 3527; 4736; 5221; 265; 332; 191; 207; 0
tos; 2072393; 68.5534548707702; 717; 721; 11907; 12188; 48268; 48509; 171568; 172114; 2802; 2818; 17743; 17863; 0
tos1; 271713; 68.599956571824; 93; 84; 1499; 1469; 6246; 6222; 23005; 22854; 358; 342; 2212; 2278; 0
tos2; 57223; 68.4305261870227; 14; 24; 317; 315; 1220; 1382; 4374; 4764; 53; 58; 458; 521; 0
xac; 5175554; 64.7718872221215; 1468; 1427; 1526; 1434; 140462; 140210; 339957; 339208; 3770; 3692; 7876; 7914; 0
xac1; 33700; 61.8653372503635; 28; 26; 11; 27; 993; 1062; 2180; 2052; 43; 27; 54; 107; 1
xac2; 64920; 61.392483056069; 41; 29; 40; 24; 2223; 1940; 3816; 4022; 78; 74; 147; 99; 0
ype; 4653728; 47.6361102324846; 8789; 8951; 2595; 2930; 224229; 225184; 201213; 204623; 16816; 16685; 7641; 8107; 0
ype1; 70305; 44.8360714031719; 174; 138; 39; 39; 3711; 3574; 2638; 2648; 284; 254; 119; 125; 0
ype2; 9612; 45.2663337494798; 30; 37; 8; 4; 409; 474; 368; 363; 29; 55; 14; 14; 0
ype3; 96210; 50.2276270657936; 161; 137; 29; 24; 4519; 4021; 4291; 4145; 333; 239; 154; 115; 0

Tableaux des diagrammes[modifier | modifier le wikicode]

Tableaux plasmides cyanobactéries[modifier | modifier le wikicode]

Plasmides %GC[modifier | modifier le wikicode]
					       Aléas équation	
KEGG	effectif	%GC	>4AT    >4GC    >4ATa   >4GCa
ana	6,413,771	41.35	50.59	8.25	30.81	5.98
ana1	408,101		40.51	52.02	6.71	32.89	5.45
ana2	186,614		40.23	53.85	5.95	33.62	5.28
ana3	101,965		41.03	48.84	7.16	31.60	5.77
ana4	55,414		41.61	50.71	11.37	30.18	6.15
ana5	40,340		40.86	60.73	9.92	32.03	5.66
ana6	5,584		44.18	37.61	5.37	24.48	8.11
anb1	80,384		37.23	60.34	7.34	42.04	3.75
anb2	56,037		37.25	61.74	7.32	41.97	3.76
anb3	20,025		37.42	70.41	13.48	41.48	3.83
anba	4,329,264	38.10	64.14	8.14	39.45	4.15
anbb	819,965		38.21	64.99	8.66	39.14	4.20
can	4,114,099	34.96	93.41	12.10	49.37	2.86
can1	62,874		33.17	75.71	7.63	55.74	2.30
cyt1	39,620		36.80	73.45	8.83	43.37	3.56
cyt2	31,856		41.46	37.98	16.95	30.55	6.05
cyt3	14,685		38.09	84.44	11.58	39.48	4.14
cyt4	10,244		36.97	65.40	21.48	42.85	3.64
cytc	4,934,271	37.88	71.17	12.41	40.12	4.04
cytl	429,701		38.57	65.56	9.05	38.12	4.37
len	6,244,812	46.65	26.85	5.24	19.80	10.47
len1	325,675		47.01	27.67	5.19	19.17	10.86
len2	98,206		48.54	25.56	5.19	16.69	12.64
len3	92,964		47.35	28.51	5.49	18.61	11.23
mic	7,470,429	46.21	38.95	12.72	20.57	10.02
mic1	146,045		45.27	35.06	9.04	22.32	9.09
mic2	93,032		47.10	43.10	17.74	19.02	10.95
mic3	92,471		46.62	39.80	15.57	19.85	10.44
mic4	50,464		44.65	43.60	8.92	23.53	8.53
mic5	38,468		47.66	35.61	14.04	18.09	11.58
mic6	28,816		46.59	41.30	17.70	19.91	10.40
mic7	25,982		46.76	34.64	12.70	19.60	10.59
mic8	20,803		46.45	44.71	16.82	20.14	10.27
oac	7,689,443	47.60	43.85	24.70	18.19	11.52
oac1	64,128		47.62	47.25	20.12	18.16	11.53
oac2	50,699	        49.30	39.25	21.50	15.56	13.59
oni	7,479,014	45.87	52.46	10.84	21.20	9.67
oni1	300,164		45.13	45.14	10.66	22.60	8.96
oni2	260,268		44.61	48.72	10.18	23.61	8.49
oni3	150,927		45.51	45.25	12.32	21.87	9.32
oni4	74,236		44.56	53.07	9.29	23.71	8.45
oni5	7,645		47.59	58.86	22.24	18.21	11.50
syf	2,695,903	55.47	17.73	11.63	8.40	23.70
syf1	46,366		52.89	17.25	12.94	10.98	18.94
syn	3,573,470	47.72	53.42	31.76	17.99	11.65
syn1	103,307		44.48	57.01	18.00	23.87	8.37
syn2	44,343		48.62	29.77	17.82	16.57	12.73
syn3	119,895		42.95	56.05	16.10	27.10	7.12
syn4	106,004		42.72	65.47	21.98	27.62	6.94
synp	3,510,253	40.62	50.81	7.61	32.62	5.51
synp1	63,272		40.89	47.89	5.06	31.93	5.68
synp2	10,210		39.41	53.87	2.94	35.78	4.81
Plasmides hôte[modifier | modifier le wikicode]
KEGG	>4ATh   >4AT    diag            KEGG    >4GCh   >4GC    diag
ana1	50.59	52.02	50.59		ana1	8.25	6.71	8.25
ana2	50.59	53.85	50.59		ana2	8.25	5.95	8.25
ana3	50.59	48.84	50.59		ana3	8.25	7.16	8.25
ana4	50.59	50.71	50.59		ana4	8.25	11.37	8.25
ana5	50.59	60.73	50.59		ana5	8.25	9.92	8.25
ana6	50.59	37.61	50.59		ana6	8.25	5.37	8.25
anb1	64.14	60.34	64.14		anb1	8.14	7.34	8.14
anb2	64.14	61.74	64.14		anb2	8.14	7.32	8.14
anb3	64.14	70.41	64.14		anb3	8.14	13.48	8.14
anbb	64.14	64.99	64.14		anbb	8.14	8.66	8.14
can1	93.41	75.71	93.41		can1	12.10	7.63	12.10
cyt1	71.17	73.45	71.17		cyt1	12.41	8.83	12.41
cyt2	71.17	37.98	71.17		cyt2	12.41	16.95	12.41
cyt3	71.17	84.44	71.17		cyt3	12.41	11.58	12.41
cyt4	71.17	65.40	71.17		cyt4	12.41	21.48	12.41
cytl	71.17	65.56	71.17		cytl	12.41	9.05	12.41
len1	26.85	27.67	26.85		len1	5.24	5.19	5.24
len2	26.85	25.56	26.85		len2	5.24	5.19	5.24
len3	26.85	28.51	26.85		len3	5.24	5.49	5.24
mic1	38.95	35.06	38.95		mic1	12.72	9.04	12.72
mic2	38.95	43.10	38.95		mic2	12.72	17.74	12.72
mic3	38.95	39.80	38.95		mic3	12.72	15.57	12.72
mic4	38.95	43.60	38.95		mic4	12.72	8.92	12.72
mic5	38.95	35.61	38.95		mic5	12.72	14.04	12.72
mic6	38.95	41.30	38.95		mic6	12.72	17.70	12.72
mic7	38.95	34.64	38.95		mic7	12.72	12.70	12.72
mic8	38.95	44.71	38.95		mic8	12.72	16.82	12.72
oac1	43.85	47.25	43.85		oac1	24.70	20.12	24.70
oni1	52.46	45.14	52.46		oni1	10.84	10.66	10.84
oni2	52.46	48.72	52.46		oni2	10.84	10.18	10.84
oni3	52.46	45.25	52.46		oni3	10.84	12.32	10.84
oni4	52.46	53.07	52.46		oni4	10.84	9.29	10.84
oni5	52.46	58.86	52.46		oni5	10.84	22.24	10.84
syf1	17.73	17.25	17.73		syf1	11.63	12.94	11.63
syn1	53.42	57.01	53.42		syn1	31.76	18.00	31.76
syn2	53.42	29.77	53.42		syn2	31.76	17.82	31.76
syn3	53.42	56.05	53.42		syn3	31.76	16.10	31.76
syn4	53.42	65.47	53.42		syn4	31.76	21.98	31.76
synp1	50.81	47.89	50.81		synp1	7.61	5.06	7.61
synp2	50.81	53.87	50.81		synp2	7.61	2.94	7.61
oac2	43.85	39.25	43.85		oac2	24.70	21.50	24.70

Tableaux plasmides autres bactéries[modifier | modifier le wikicode]

Plasmides %GC[modifier | modifier le wikicode]
KEGG	DNA		%GC     >4GC    >4AT    >4ATa   >4GCa
cje1	4,013		30.15	9.97	174.43	67.78	1.52
cje	1,641,481	30.55	2.14	160.17	66.10	1.61
cac1	192,000		30.91	1.51	97.14	64.60	1.70
cac	3,940,880	30.93	2.49	95.73	64.54	1.70
kpn6	4,259		41.42	7.04	79.83	30.64	6.02
ecs2	3,306		43.41	15.12	93.77	26.11	7.47
ype1	70,305		44.84	11.09	44.38	23.16	8.69
ype2	9,612		45.27	12.48	69.70	22.33	9.09
kpn7	3,478		45.66	14.38	48.88	21.59	9.46
sfl1	221,618		45.77	10.56	53.65	21.39	9.57
ecs1	92,721		47.60	12.40	51.12	18.19	11.51
ype	4,653,728	47.64	11.87	38.12	18.13	11.56
ype3	96,210		50.23	5.51	30.97	14.25	14.84
ecs	5,498,450	50.54	6.22	38.21	13.84	15.28
ent1	157,749		50.57	8.94	35.44	13.79	15.33
sfl	4,607,202	50.89	5.68	35.71	13.37	15.79
kpn3	175,879		51.69	9.89	34.51	12.37	17.00
stm	4,857,432	52.22	6.55	37.92	11.74	17.84
ent	4,518,712	52.98	5.52	32.12	10.87	19.10
stm1	93,939		53.13	12.77	36.73	10.71	19.35
kpn4	107,576		53.44	9.30	32.91	10.38	19.89
kpn5	88,582		53.82	10.84	34.32	9.99	20.56
pst1	73,661		55.15	12.63	22.67	8.70	23.05
pst2	67,473		56.17	12.45	25.49	7.80	25.12
kpn	5,315,120	57.48	9.41	25.79	6.76	27.97
pst	6,397,126	58.40	6.15	17.25	6.10	30.11
xac2	64,920		61.39	9.86	10.78	4.33	37.91
xac1	33,700		61.87	11.28	16.02	4.09	39.27
xac	5,175,554	64.77	5.72	5.59	2.88	48.37
tos2	57,223		68.43	110.45	6.64	1.77	61.87
tos	2,072,393	68.55	116.27	6.94	1.74	62.37
tos1	271,713		68.60	109.23	6.51	1.73	62.55
sco1	356,023		69.06	24.07	0.79	1.62	64.43
sco2	31,317		72.12	33.53	3.51	0.94	77.97
sco	8,667,507	72.12	24.50	0.45	0.94	77.98
Plasmides hôte[modifier | modifier le wikicode]
hôte	>4GCh           >4GC    diag            hôte    >4ATh           >4AT    diag
cje	2.14	cje1	9.97	2.14		sco	0.45	sco1	0.79	0.45
cac	2.49	cac1	1.51	2.49		sco	0.45	sco2	3.51	0.45
ent	5.52	ent1	8.94	5.52		xac	5.59	xac2	10.78	5.59
sfl	5.68	sfl1	10.56	5.68		xac	5.59	xac1	16.02	5.59
xac	5.72	xac2	9.86	5.72		pst	17.25	pst1	22.67	17.25
xac	5.72	xac1	11.28	5.72		pst	17.25	pst2	25.49	17.25
pst	6.15	pst1	12.63	6.15		kpn	25.79	kpn7	48.88	25.79
pst	6.15	pst2	12.45	6.15		kpn	25.79	kpn6	79.83	25.79
ecs	6.22	ecs2	15.12	6.22		kpn	25.79	kpn3	34.51	25.79
ecs	6.22	ecs1	12.40	6.22		kpn	25.79	kpn4	32.91	25.79
stm	6.55	stm1	12.77	6.55		kpn	25.79	kpn5	34.32	25.79
kpn	9.41	kpn7	14.38	9.41		ent	32.12	ent1	35.44	32.12
kpn	9.41	kpn6	7.04	9.41		sfl	35.70	sfl1	53.65	35.70
kpn	9.41	kpn3	9.89	9.41		stm	37.92	stm1	36.73	37.92
kpn	9.41	kpn4	9.30	9.41		ype	38.12	ype1	44.38	38.12
kpn	9.41	kpn5	10.84	9.41		ype	38.12	ype2	69.70	38.12
ype	11.87	ype1	11.09	11.87		ype	38.12	ype3	30.97	38.12
ype	11.87	ype2	12.48	11.87		ecs	38.21	ecs2	93.77	38.21
ype	11.87	ype3	5.51	11.87		ecs	38.21	ecs1	51.12	38.21
sco	24.50	sco1	24.07	24.50		cac	95.73	cac1	97.14	95.73
sco	24.50	sco2	33.53	24.50		cje	160.17	cje1	174.43	160.17
tos	116.27	tos1	109.23	116.27		tos	6.94	tos1	6.51	6.94
tos	116.27	tos2	110.45	116.27		tos	6.94	tos2	6.64	6.94
Bactérie %GC − Plasmide %GC[modifier | modifier le wikicode]
KEGG	%GC b   plasm.	diag
cje1	30.55	30.15	30.55
cac1	30.93	30.91	30.93
can1	34.96	33.17	34.96
cyt1	37.88	36.80	37.88
cyt4	37.88	36.97	37.88
cyt3	37.88	38.09	37.88
cyt2	37.88	41.46	37.88
anb1	38.10	37.23	38.10
anb2	38.10	37.25	38.10
anb3	38.10	37.42	38.10
ana2	41.35	40.23	41.35
ana1	41.35	40.51	41.35
ana5	41.35	40.86	41.35
ana3	41.35	41.03	41.35
ana4	41.35	41.61	41.35
ana6	41.35	44.18	41.35
ype1	47.64	44.84	47.64
ype2	47.64	45.27	47.64
ype3	47.64	50.23	47.64
syn4	47.72	42.72	47.72
syn3	47.72	42.95	47.72
syn1	47.72	44.48	47.72
syn2	47.72	48.62	47.72
ecs2	50.54	43.41	50.54
ecs1	50.54	47.60	50.54
sfl1	50.89	45.77	50.89
stm1	52.22	53.13	52.22
ent1	52.98	50.57	52.98
kpn6	57.48	41.42	57.48
kpn7	57.48	45.66	57.48
kpn3	57.48	51.69	57.48
kpn4	57.48	53.44	57.48
kpn5	57.48	53.82	57.48
pst1	58.40	55.15	58.40
pst2	58.40	56.17	58.40
xac2	64.77	61.39	64.77
xac1	64.77	61.87	64.77
sco1	72.12	69.06	72.12
sco2	72.12	72.12	72.12
tos2	68.55	68.43	68.55
tos1	68.55	68.60	68.55
len1	46.65	47.01	46.65
len2	46.65	48.54	46.65
len3	46.65	47.35	46.65
mic1	46.21	45.27	46.21
mic2	46.21	47.10	46.21
mic3	46.21	46.62	46.21
mic4	46.21	44.65	46.21
mic5	46.21	47.66	46.21
mic6	46.21	46.59	46.21
mic7	46.21	46.76	46.21
mic8	46.21	46.45	46.21
oac1	47.60	47.62	47.60
oni1	45.87	45.13	45.87
oni2	45.87	44.61	45.87
oni3	45.87	45.51	45.87
oni4	45.87	44.56	45.87
oni5	45.87	47.59	45.87
syf1	55.47	52.89	55.47
synp1	40.62	40.89	40.62
synp2	40.62	39.41	40.62
oac2	47.60	49.30	47.60

Différences hôte − plasmide[modifier | modifier le wikicode]

Cyanobactéries[modifier | modifier le wikicode]

Cyanobactéries plasmides/hôte

Loi binomiale	p=taux de l’hôte	q=taux du plasmide						
2σ = 2*racine(n*p*(10000-p*5))/10000	abs(n*(p-q))/10000				
	n=DNA du plasmide		n*q/10000  n*p/10000		
								
Différence 2σ= abs(2*racine(n*p*(10000-p*5))-abs(n*(p-q)))/10000						
																
−					Différences 2σ	Différences %	
KEGG	DNA	%GC	>4AT    >4GC    >4AT    >4GC    >4AT    >4GC    %GC
Groupe 7									
len	6244812	46.65	26.9	5.2					
len1	325675	47.01	27.7	5.2	32	24	3	-1	1
len2	98206	48.54	25.6	5.2	20	14	-5	-1	4
len3	92964	47.35	28.5	5.5	16	12	6	5	2
synp	3510253	40.62	50.8	7.6					
synp1	63272	40.89	47.9	5.1	17	-2	-6	-34	1
synp2	10210	39.41	53.9	2.9	11	1	6	-61	-3
anba	4329264	38.10	64.1	8.1					
anbb	819965	38.21	65.0	8.7	73	9	1	6	0
anb1	80384	37.23	60.3	7.3	14	10	-6	-10	-2
anb2	56037	37.25	61.7	7.3	24	9	-4	-10	-2
anb3	20025	37.42	70.4	13.5	10	-3	10	66	-2
ana	6413771	41.35	50.6	8.2					
ana1	408101	40.51	52.0	6.7	31	-26	3	-19	-2
ana2	186614	40.23	53.9	5.9	0	-18	6	-28	-3
ana3	101965	41.03	48.8	7.2	27	7	-3	-13	-1
ana4	55414	41.61	50.7	11.4	32	-4	0	38	1
ana5	40340	40.86	60.7	9.9	-13	5	20	20	-1
ana6	5584	44.18	37.6	5.4	3	3	-26	-35	7
Groupe 14									
oni	7479014	45.87	52.5	10.8					
oni1	300164	45.13	45.1	10.7	-141	31	-14	-2	-2
oni2	260268	44.61	48.7	10.2	-24	16	-7	-6	-3
oni3	150927	45.51	45.3	12.3	-53	3	-14	14	-1
oni4	74236	44.56	53.1	9.3	34	6	1	-14	-3
oni5	7645	47.59	58.9	22.2	8	-3	12	105	4
syf	2695903	55.47	17.7	11.6					
syf1	46366	52.89	17.3	12.9	16	9	-3	11	-5
can	4114099	34.96	93.4	12.1					
can1	62874	33.17	75.7	7.6	-64	-11	-19	-37	-5
cytc	4934271	37.88	71.2	12.4					
cytl	429701	38.57	65.6	9.1	-133	-98	-8	-27	2
cyt1	39620	36.80	73.4	8.8	24	0	3	-29	-3
cyt2	31856	41.46	38.0	17.0	-76	-2	-47	37	9
cyt3	14685	38.09	84.4	11.6	1	7	19	-7	1
cyt4	10244	36.97	65.4	21.5	11	-2	-8	73	-2
mic	7470429	46.21	39.0	12.7					
mic1	146045	45.27	35.1	9.0	-10	-27	-10	-29	-2
mic2	93032	47.10	43.1	17.7	-1	-25	11	39	2
mic3	92471	46.62	39.8	15.6	30	-5	2	22	1
mic4	50464	44.65	43.6	8.9	4	-3	12	-30	-3
mic5	38468	47.66	35.6	14.0	11	9	-9	10	3
mic6	28816	46.59	41.3	17.7	14	-2	6	39	1
mic7	25982	46.76	34.6	12.7	9	11	-11	0	1
mic8	20803	46.45	44.7	16.8	6	2	15	32	1
Groupe 25									
oac	7689443	47.60	43.9	24.7					
oac1	64128	47.62	47.2	20.1	11	-4	8	-19	0
oac2	50699	49.30	39.3	21.5	6	6	-10	-13	4
syn	3573470	47.72	53.4	31.8					
syn1	103307	44.48	57.0	18.0	9	-106	7	-43	-7
syn2	44343	48.62	29.8	17.8	-75	-38	-44	-44	2
syn3	119895	42.95	56.0	16.1	18	-149	5	-49	-10
syn4	106004	42.72	65.5	22.0	-81	-67	23	-31	-10

total différence avec  2σ < 0           11      20
total différence avec  2σ < -5          10      11			

Autre-bactéries[modifier | modifier le wikicode]

Autre-bactéries		Plasmides/hôte					
Loi binomiale		q=taux du plasmide	p=taux de l’hôte			
2σ = 2*racine(n*p*(10000-p*5))/10000		n=DNA du plasmide		
n*p/10000	n*q/10000	abs(n*(p-q))/10000				
								
Différence 2σ= abs(2*racine(n*P*(10000-p*5))-abs(n*(p-q)))/10000						
								
−					Différences 2σ	Différences %	
KEGG	DNA	%GC	>4AT    >4GC    >4AT    >4GC    >4AT    >4GC    %GC
Groupe 2									
cje	1641481	30.55	160.2	2.1					
cje1	4013	30.15	174.4	10.0	10	-1	9	366	-1
cac	3940880	30.93	95.7	2.5					
cac1	192000	30.91	97.1	1.5	57	-5	1	-39	0
Groupe 7									
ent	4518712	52.98	32.1	5.5					
ent1	157749	50.57	35.4	8.9	-8	-35	10	62	-5
sfl	4607202	50.89	35.7	5.7					
sfl1	221618	45.77	53.7	10.6	-342	-86	50	86	-10
xac	5175554	64.77	5.6	5.7					
xac1	33700	61.87	16.0	11.3	-26	-10	186	97	-4
xac2	64920	61.39	10.8	9.9	-22	-15	93	72	-5
pst	6397126	58.40	17.3	6.2					
pst1	73661	55.15	22.7	12.6	-17	-34	31	105	-6
pst2	67473	56.17	25.5	12.4	-34	-30	48	102	-4
ecs	5498450	50.54	38.2	6.2					
ecs1	92721	47.60	51.1	12.4	-82	-42	34	99	-6
ecs2	3306	43.41	93.8	15.1	-11	0	145	143	-14
stm	4857432	52.22	37.9	6.5					
stm1	93939	53.13	36.7	12.8	26	-43	-3	95	2
kpn	5315120	57.48	25.8	9.4					
kpn3	175879	51.69	34.5	9.9	-111	17	34	5	-10
kpn4	107576	53.44	32.9	9.3	-43	19	28	-1	-7
kpn5	88582	53.82	34.3	10.8	-46	6	33	15	-6
kpn6	4259	41.42	79.8	7.0	-16	3	210	-25	-28
kpn7	3478	45.66	48.9	14.4	-2	2	90	53	-21
Groupe 14									
ype	4653728	47.64	38.1	11.9					
ype1	70305	44.84	44.4	11.1	-12	13	16	-7	-6
ype2	9612	45.27	69.7	12.5	-18	6	83	5	-5
ype3	96210	50.23	31.0	5.5	-31	-40	-19	-54	5
Groupe 25									
sco	8667507	72.12	0.4	24.5					
sco1	356023	69.06	0.8	24.1	-4	43	75	-2	-4
sco2	31317	72.12	3.5	33.5	-7	-11	681	37	0
Groupe 68									
tos	2072393	68.55	6.9	116.3					
tos1	271713	68.60	6.5	109.2	16	-82	-6	-6	0
tos2	57,223	68.43	6.6	110.4	11	17	-4	-5	0

total différence avec  2σ < 0           18      18			
total différence avec  2σ < -5          16      17			


rRNA[modifier | modifier le wikicode]

Résultat[modifier | modifier le wikicode]

KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
ade; 2985; 55.8793969849246; 0; 2; 1; 2; 74; 155; 140; 198; 3; 14; 8; 17; 0
bla; 3065; 60.652528548124; 0; 2; 4; 12; 74; 112; 161; 211; 2; 6; 14; 16; 0
bsu; 2928; 53.8934426229508; 0; 1; 2; 1; 91; 157; 134; 188; 1; 9; 7; 17; 0
cbl; 2902; 50.5513439007581; 1; 5; 1; 0; 91; 172; 121; 166; 0; 12; 5; 16; 0
cgq; 3080; 53.3116883116883; 3; 1; 1; 2; 114; 132; 118; 199; 5; 11; 8; 20; 0
cje; 2890; 47.3356401384083; 1; 2; 1; 3; 105; 186; 95; 140; 2; 10; 4; 11; 0
crp; 2827; 33.8167668906969; 19; 9; 1; 0; 216; 133; 95; 61; 25; 14; 6; 2; 0
cta; 2869; 48.6929243638899; 1; 3; 0; 5; 99; 187; 110; 159; 7; 13; 4; 12; 0
eco; 2904; 53.236914600551; 0; 4; 1; 7; 88; 170; 114; 177; 2; 7; 9; 11; 0
fnc; 2906; 46.9373709566414; 0; 2; 1; 5; 106; 203; 102; 161; 4; 10; 3; 7; 0
kpn; 2904; 53.030303030303; 0; 3; 1; 7; 92; 171; 114; 177; 1; 8; 9; 12; 0
lla; 2901; 49.6725267149259; 0; 2; 1; 2; 103; 164; 107; 157; 3; 11; 4; 12; 0
pgd; 2824; 53.4702549575071; 0; 2; 1; 4; 85; 145; 123; 169; 2; 6; 11; 12; 0
ple; 2869; 44.9982572324852; 0; 8; 0; 2; 105; 197; 99; 152; 4; 21; 3; 8; 0
roa; 3132; 55.6194125159642; 0; 1; 4; 5; 86; 149; 145; 197; 1; 10; 9; 17; 0
sall; 3909; 56.0245587106677; 2; 1; 7; 3; 180; 130; 268; 181; 8; 2; 22; 7; 0
sbh; 2525; 56.5544554455446; 1; 0; 3; 1; 113; 82; 169; 121; 5; 1; 12; 5; 0
sbn; 2903; 51.3951085084395; 0; 3; 1; 6; 102; 167; 108; 167; 3; 9; 7; 11; 0
ser; 2922; 50.444900752909; 0; 2; 2; 2; 116; 162; 102; 169; 2; 11; 6; 11; 0
sgr; 3129; 56.4077980185363; 1; 1; 5; 2; 141; 94; 206; 144; 6; 1; 16; 7; 0
sma; 3124; 56.8822023047375; 1; 1; 5; 2; 141; 88; 210; 153; 6; 2; 17; 7; 0
smv; 2879; 40.4654393886766; 1; 12; 1; 0; 127; 202; 75; 131; 10; 14; 3; 7; 0
spi; 2903; 49.7760936961764; 0; 1; 2; 2; 100; 158; 107; 152; 5; 14; 4; 13; 0
tth; 2893; 63.6017974421016; 1; 1; 4; 16; 44; 136; 177; 207; 0; 9; 16; 23; 0
tos; 2877; 61.4181438998957; 1; 1; 11; 1; 130; 57; 209; 171; 8; 2; 25; 11; 0
bmv; 2882; 53.4004163775156; 1; 0; 7; 1; 160; 86; 176; 118; 11; 2; 13; 7; 0
zin; 2888; 36.1149584487535; 12; 10; 1; 2; 129; 204; 66; 104; 11; 34; 2; 10; 0
wbr; 2922; 46.0301163586585; 5; 6; 0; 4; 106; 196; 106; 150; 5; 13; 4; 7; 0
tra; 2950; 56.0338983050847; 0; 0; 2; 3; 82; 148; 129; 195; 0; 13; 9; 16; 0
tai; 2972; 58.2436069986541; 1; 0; 5; 2; 131; 71; 211; 142; 8; 0; 21; 10; 0
mrb; 2893; 56.8268233667473; 1; 0; 5; 0; 147; 69; 194; 148; 10; 3; 20; 8; 0
mcac; 2908; 45.8046767537827; 1; 3; 1; 2; 118; 180; 102; 144; 6; 17; 6; 11; 0
mhd; 2917; 62.1186150154268; 0; 1; 1; 9; 63; 129; 171; 214; 1; 8; 12; 26; 0
rpr; 2761; 46.9757334299167; 2; 6; 0; 3; 98; 169; 98; 137; 5; 9; 6; 10; 0
uur; 2903; 45.4357561143645; 1; 1; 0; 4; 123; 196; 90; 133; 5; 10; 4; 10; 0

Tableau des diagrammes 3AT et 3GC[modifier | modifier le wikicode]

				 x3  -0.001241  0.000842
				 x2  0.292481   -0.020776
				 x   -24.200958	0.039846
				 c   692.8194	3.536873
					Aléas équation	
KEGG    Long    %GCb    >3GC    >3AT    >3ATa   >3GCa
ade	2,985	74.91	93.80	63.65	0.0	243.8
bla	3,065	60.49	150.08	32.63	24.4	116.3
bmv	2,882	68.15	97.15	48.58	9.1	176.3
bsu	2,928	43.51	92.21	37.57	91.3	35.3
cbl	2,902	28.31	75.81	62.03	213.9	7.1
cgq	3,080	54.15	100.65	64.94	42.9	78.5
cje	2,890	30.55	65.74	51.90	191.1	9.4
crp	2,827	16.56	31.84	237.00	366.6	2.3
cta	2,869	41.30	73.20	83.65	104.8	29.1
eco	2,904	50.79	96.42	44.77	55.5	62.3
fnc	2,906	27.12	55.06	55.06	226.8	6.1
kpn	2,904	57.48	99.86	41.32	32.4	97.1
lla	2,901	35.33	65.49	55.15	148.2	16.1
mcac	2,908	23.66	68.78	92.85	267.5	4.0
mhd	2,917	68.08	164.55	34.28	9.3	175.6
mrb	2,893	63.38	114.07	48.39	17.9	137.0
pgd	2,824	59.62	99.15	35.41	26.6	110.5
ple	2,869	26.17	45.31	115.02	237.5	5.4
roa	3,132	67.37	111.75	38.31	10.4	169.4
rpr	2,761	29.00	68.82	79.68	206.7	7.8
sall	3,909	72.13	99.77	33.26	3.2	214.3
sbh	2,525	70.75	83.17	27.72	5.1	200.6
sbn	2,903	46.28	86.12	51.67	76.2	44.4
ser	2,922	32.15	71.87	51.33	175.8	11.3
sgr	3,129	72.23	95.88	28.76	3.1	215.3
sma	3,124	70.72	99.23	32.01	5.2	200.2
smv	2,879	24.00	38.21	128.52	263.3	4.2
spi	2,903	38.32	72.34	68.89	125.1	21.9
tai	2,972	63.79	127.86	30.28	17.1	140.1
tos	2,877	68.55	166.84	41.71	8.5	179.9
tra	2,950	68.14	101.69	44.07	9.1	176.2
tth	2,893	69.44	203.94	38.02	7.1	188.0
uur	2,903	25.50	62.00	58.56	245.3	5.0
wbr	2,922	22.48	51.33	99.25	282.5	3.5
zin	2,888	13.54	51.94	231.99	415.7	2.4

Protéines[modifier | modifier le wikicode]

Cyanobactéries[modifier | modifier le wikicode]

Répétitions[modifier | modifier le wikicode]

  • can cyanobactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
carB; 3249; 42.1360418590335; 2; 8; 0; 4; 198; 184; 115; 128; 15; 17; 9; 10; 0
cox1; 1647; 40.5585913782635; 4; 1; 0; 3; 126; 72; 58; 68; 19; 5; 0; 9; 0
dnaE; 2640; 33.7121212121212; 12; 20; 0; 2; 164; 157; 50; 94; 13; 26; 1; 6; 0
dnaE1; 1362; 34.5080763582966; 5; 14; 2; 1; 88; 81; 30; 38; 9; 15; 2; 4; 0
ftsK; 5448; 31.0389133627019; 22; 41; 1; 0; 376; 419; 97; 154; 29; 49; 4; 5; 0
iars; 2907; 40.2820777433781; 5; 8; 3; 1; 177; 176; 85; 109; 10; 21; 7; 9; 0
lars; 2577; 40.7450523864959; 5; 11; 1; 2; 146; 159; 95; 99; 10; 20; 4; 6; 0
rpoB; 3276; 42.3382173382173; 4; 10; 2; 1; 171; 197; 119; 150; 11; 25; 6; 5; 0
rpoC; 3840; 39.9479166666667; 1; 18; 1; 1; 245; 239; 98; 146; 11; 19; 4; 16; 0
mfd; 3594; 37.7851975514747; 8; 20; 3; 2; 235; 216; 109; 114; 15; 29; 7; 7; 0
sbcC; 3024; 30.026455026455; 1; 28; 0; 1; 202; 262; 37; 58; 12; 40; 3; 1; 0
secA; 2820; 39.1489361702128; 5; 24; 2; 0; 148; 188; 69; 108; 13; 13; 7; 9; 0
  • cgc cyanobactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
carB; 3324; 70.2166064981949; 0; 0; 7; 7; 45; 65; 304; 266; 0; 1; 19; 10; 0
cox1; 1671; 64.4524236983842; 0; 0; 3; 6; 57; 31; 137; 113; 1; 0; 7; 2; 0
dnaE; 3531; 67.2330784480317; 0; 0; 5; 5; 51; 94; 299; 259; 0; 1; 16; 13; 0
iars; 2952; 70.5284552845528; 0; 0; 5; 6; 32; 58; 245; 253; 1; 0; 9; 10; 0
lars; 2625; 69.5238095238095; 0; 0; 11; 2; 40; 50; 218; 187; 0; 1; 11; 17; 0
mfd; 3591; 71.1500974658869; 0; 0; 10; 5; 48; 68; 300; 329; 1; 1; 14; 13; 0
recB; 3807; 75.0459679537694; 0; 0; 14; 11; 35; 45; 332; 366; 0; 0; 21; 21; 0
rpoB; 3291; 66.1804922515953; 0; 0; 12; 1; 38; 115; 248; 218; 0; 0; 21; 4; 0
rpoC; 4110; 67.8345498783455; 0; 0; 12; 4; 39; 119; 347; 314; 0; 0; 9; 9; 0
sbcC; 3018; 76.2094102054341; 0; 1; 3; 9; 26; 41; 298; 288; 0; 1; 6; 18; 0
secA; 2835; 66.9135802469136; 0; 0; 7; 2; 34; 84; 207; 219; 0; 0; 11; 8; 0
  • cya cyanobactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
carB; 3225; 62.9457364341085; 0; 1; 4; 11; 86; 93; 228; 210; 2; 5; 21; 13; 0
cox1; 1710; 59.3567251461988; 6; 0; 2; 6; 78; 32; 114; 110; 7; 0; 7; 5; 0
dnaE; 3486; 54.6758462421113; 2; 6; 0; 2; 137; 136; 205; 217; 10; 15; 7; 15; 0
iars; 2811; 62.0419779437922; 2; 2; 5; 3; 61; 85; 208; 195; 7; 8; 12; 12; 0
lars; 2622; 62.3569794050343; 2; 1; 5; 6; 67; 91; 156; 193; 1; 3; 15; 12; 0
mfd; 3471; 60.2420051858254; 1; 6; 11; 2; 105; 110; 232; 240; 13; 12; 16; 10; 0
rpoB; 3402; 62.0223398001176; 5; 6; 1; 9; 75; 112; 208; 251; 3; 7; 16; 9; 0
rpoC; 3909; 63.5456638526477; 1; 6; 5; 11; 88; 119; 255; 309; 1; 6; 8; 19; 0
sbcC; 3291; 64.1750227894257; 0; 1; 2; 5; 66; 127; 266; 196; 2; 6; 8; 10; 0
secA; 2865; 61.4659685863874; 2; 3; 3; 3; 57; 113; 184; 210; 4; 7; 10; 11; 0
  • mar cyanobactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
carB; 3246; 48.1823783117683; 1; 10; 3; 4; 148; 182; 165; 139; 15; 21; 13; 7; 0
cox1; 1677; 47.1675611210495; 4; 0; 4; 2; 112; 58; 77; 85; 13; 3; 5; 3; 0
dnaE; 2625; 38.3619047619048; 6; 14; 0; 0; 160; 155; 85; 101; 12; 25; 3; 5; 0
dnaE1; 1338; 39.237668161435; 7; 6; 0; 0; 69; 77; 39; 50; 5; 25; 1; 2; 0
iars; 2859; 42.2525358516964; 6; 8; 0; 1; 159; 169; 87; 127; 13; 16; 6; 9; 0
lars; 2553; 42.4990207598903; 4; 13; 2; 2; 144; 154; 116; 102; 10; 20; 6; 5; 0
mfd; 3483; 44.7602641401091; 5; 14; 2; 3; 187; 195; 129; 154; 22; 15; 13; 15; 0
rpoB; 3336; 52.4580335731415; 2; 9; 10; 2; 115; 190; 179; 159; 10; 17; 22; 9; 0
rpoC; 4005; 51.1610486891386; 0; 9; 6; 8; 169; 217; 201; 197; 6; 13; 5; 21; 0
sbcC; 3024; 38.2275132275132; 2; 19; 0; 4; 173; 233; 66; 93; 13; 22; 2; 3; 0
secA; 2817; 46.822861199858; 6; 17; 1; 2; 131; 177; 121; 135; 5; 17; 8; 10; 0
  • pmm cyanobactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
carB; 3300; 32.6969696969697; 6; 13; 0; 0; 238; 266; 72; 111; 23; 23; 1; 2; 0
dnaE; 3498; 31.8181818181818; 9; 21; 0; 1; 244; 234; 67; 104; 20; 33; 0; 4; 0
gyrB; 1968; 33.9939024390244; 2; 16; 1; 1; 120; 122; 22; 82; 10; 16; 0; 2; 0
iars; 2898; 31.9875776397516; 10; 20; 1; 0; 206; 190; 56; 101; 14; 22; 1; 3; 0
lars; 2577; 28.9483896003104; 7; 23; 0; 0; 163; 196; 51; 75; 13; 34; 1; 3; 0
mfd; 3516; 28.1854379977247; 5; 40; 0; 1; 219; 307; 58; 87; 16; 32; 0; 0; 0
recB; 3630; 23.8567493112948; 13; 25; 0; 0; 270; 323; 48; 84; 31; 34; 0; 1; 0
rpoB; 3294; 36.8852459016393; 6; 16; 1; 0; 198; 235; 79; 134; 18; 13; 1; 4; 0
rpoC; 4101; 35.5279200195074; 2; 18; 0; 1; 266; 314; 75; 157; 17; 23; 3; 4; 0
secA; 2832; 33.8629943502825; 6; 16; 0; 1; 162; 231; 43; 97; 12; 27; 1; 1; 0
  • syn cyanobactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
carB; 3318; 51.3261000602773; 1; 8; 5; 10; 179; 162; 193; 169; 12; 15; 13; 14; 0
cox1; 1656; 49.8188405797101; 5; 0; 1; 5; 96; 50; 96; 82; 19; 5; 8; 8; 0
dnaE; 2694; 43.5412026726058; 10; 8; 1; 1; 152; 152; 123; 116; 9; 17; 5; 11; 0
dnaE1; 1377; 46.1147421931736; 1; 7; 2; 1; 60; 86; 67; 66; 10; 8; 5; 5; 0
iars; 2967; 46.2756993596225; 4; 13; 4; 3; 167; 164; 131; 165; 14; 16; 9; 9; 0
lars; 2610; 49.1187739463602; 3; 10; 3; 6; 149; 126; 138; 145; 12; 10; 9; 7; 0
mfd; 3600; 47.1944444444444; 6; 16; 4; 2; 201; 170; 149; 213; 15; 16; 11; 16; 0
rpoB; 3309; 52.9465095194923; 3; 13; 10; 6; 138; 177; 187; 180; 7; 8; 18; 11; 0
rpoC; 3954; 54.147698533131; 0; 10; 4; 10; 155; 205; 219; 250; 8; 12; 11; 29; 0
sbcC; 3021; 42.1383647798742; 1; 16; 0; 1; 173; 242; 110; 119; 12; 17; 6; 8; 0
secA; 2799; 49.124687388353; 3; 11; 1; 6; 117; 170; 119; 169; 5; 15; 9; 13; 0
  • tel cyanobactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
carB; 3303; 54.3445352709658; 2; 5; 6; 3; 143; 148; 192; 169; 4; 12; 18; 10; 0
cox1; 1659; 53.2851115129596; 2; 0; 4; 4; 83; 43; 86; 95; 9; 6; 7; 6; 0
dnaE; 2619; 52.8064146620848; 5; 8; 2; 0; 95; 113; 137; 142; 6; 7; 7; 10; 0
dnaE1; 1359; 56.8064753495217; 3; 1; 6; 4; 51; 56; 77; 75; 4; 2; 4; 6; 0
iars; 2946; 54.9219280380177; 1; 5; 5; 4; 118; 122; 151; 152; 6; 15; 12; 12; 0
lars; 2574; 55.9052059052059; 3; 5; 7; 5; 86; 117; 149; 134; 2; 8; 13; 8; 0
mfd; 3429; 56.7512394284048; 0; 2; 9; 9; 141; 143; 183; 204; 12; 8; 10; 9; 0
rpoB; 3327; 54.4334235046589; 2; 10; 8; 5; 134; 137; 183; 172; 1; 12; 13; 12; 0
rpoC; 3975; 55.2452830188679; 0; 9; 6; 9; 154; 181; 207; 242; 6; 13; 11; 12; 0
sbcC; 3012; 56.5737051792829; 0; 5; 4; 4; 102; 173; 202; 119; 5; 6; 5; 6; 0
secA; 2790; 54.8387096774194; 4; 6; 4; 5; 87; 124; 134; 177; 2; 12; 8; 8; 0

Codons[modifier | modifier le wikicode]

  • can cyanobactérie codons:
protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
carB;48;11;5;3;2;11;49;16;27;11;24;8;9;6;12;7;26;10;24;12;7;5;23;3;4;3;13;0;20;13;18;30;12;17;60;33;48;9;22;28;24;22;10;1;26;5;5;34;4;14;23;36;15;8;32;10;8;24;54;7;31;1;0;0;
cox1;39;7;8;2;3;6;10;6;32;13;13;2;10;3;5;5;10;9;13;5;1;0;5;1;3;0;13;4;7;2;8;21;5;12;14;6;11;5;12;17;8;5;2;0;24;17;2;20;1;9;10;8;7;6;16;9;4;8;27;3;14;0;0;1;
dnaE;49;18;6;4;4;1;58;18;25;1;23;5;11;1;2;1;32;5;30;4;14;2;10;6;4;0;18;4;26;8;22;17;10;9;59;15;48;9;17;20;9;4;9;1;28;5;6;19;3;6;22;19;9;2;16;14;4;4;60;15;8;0;1;0;
dnaE1;29;6;1;3;0;2;31;4;17;1;10;5;11;2;6;3;14;2;24;9;6;2;2;3;2;2;4;3;13;7;8;9;2;5;29;4;19;5;9;14;4;5;3;1;9;3;2;6;2;5;13;5;7;3;8;6;0;9;25;7;2;1;0;0;
ftsK;147;15;24;16;6;4;122;11;60;6;47;29;39;6;7;5;56;4;98;20;25;9;33;6;4;5;27;4;111;17;35;30;3;7;134;12;87;11;32;45;13;14;10;3;12;28;14;42;4;5;45;29;7;12;31;29;5;6;104;26;17;1;0;0;
iars;62;8;14;4;1;12;49;18;22;11;18;8;18;1;4;9;29;12;34;11;9;3;16;2;10;1;16;5;29;9;8;34;11;9;53;22;48;11;20;19;6;20;7;3;14;23;10;15;3;17;29;19;12;8;18;12;8;16;26;0;22;1;0;0;
lars;38;8;8;6;2;9;54;9;21;10;14;7;9;4;7;4;30;5;23;15;7;11;9;6;6;0;8;5;26;10;15;17;9;8;55;18;36;17;16;16;5;19;6;2;16;21;2;28;7;10;25;16;16;7;13;11;6;17;29;6;18;1;0;0;
rpoB;62;11;7;7;7;11;55;11;20;7;20;6;11;2;12;3;26;16;25;17;21;7;26;2;15;3;11;10;34;8;29;45;10;9;67;29;49;18;11;20;15;15;3;0;24;9;9;35;3;15;24;29;23;14;18;11;3;23;39;3;16;1;0;0;
rpoC;63;20;6;5;2;6;61;10;14;16;37;5;15;2;7;4;25;5;43;8;14;5;40;2;7;3;8;6;46;20;20;48;12;20;85;27;69;23;16;30;19;11;10;3;19;7;2;28;3;13;46;40;20;10;52;16;3;23;67;2;30;1;0;0;
mfd;88;16;11;7;6;9;66;9;34;6;28;14;20;2;7;13;34;5;35;15;22;4;11;10;12;3;17;2;54;21;21;19;10;15;75;25;39;10;18;24;8;21;6;1;26;13;11;29;4;17;28;21;14;9;26;15;3;21;57;9;21;0;1;0;
sbcC;96;6;11;11;1;5;67;13;19;5;17;8;18;2;5;5;31;4;66;10;32;4;12;6;6;0;8;3;88;27;13;12;3;3;93;22;45;3;17;18;7;9;9;1;4;4;2;4;1;3;11;8;0;1;30;17;2;8;47;15;9;0;1;0;
secA;54;10;11;5;1;6;52;7;23;7;6;5;8;3;5;3;27;8;23;15;23;3;22;5;4;3;9;5;40;8;16;27;7;13;79;20;48;14;23;22;8;16;1;2;31;7;2;13;1;15;25;18;12;13;19;13;5;15;36;6;11;1;0;0;
  • can cyanobactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
carB;80;65;38;66;36;36;45;13;33;77;93;57;96;11;26;5;57;82;74;92;1;
cox1;65;16;45;38;19;18;10;17;9;46;20;16;42;2;24;17;32;31;37;44;1;
dnaE;82;76;26;43;37;34;36;22;34;58;74;57;50;10;28;5;34;52;38;83;1;
dnaE1;41;35;18;37;16;33;17;7;20;24;33;24;32;4;9;3;15;28;23;34;1;
ftsK;212;133;66;133;60;118;82;31;128;75;146;98;104;13;12;28;65;93;71;147;1;
iars;101;67;33;58;41;45;41;21;38;62;75;59;65;10;14;23;45;68;54;48;1;
lars;71;63;31;45;35;38;39;13;36;49;73;53;56;8;16;21;47;64;47;53;1;
rpoB;105;66;27;54;42;42;74;21;42;93;96;67;61;3;24;9;62;90;55;58;1;
rpoC;102;71;30;70;30;51;71;14;66;100;112;92;76;13;19;7;46;116;94;99;1;
mfd;137;75;40;84;39;50;62;19;75;65;100;49;71;7;26;13;61;72;65;87;1;
sbcC;130;80;24;55;35;76;60;11;115;31;115;48;51;10;4;4;10;20;57;71;1;
secA;87;59;30;30;35;38;60;14;48;63;99;62;69;3;31;7;31;68;52;53;1;
  • cgc cyanobactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
carB;0;2;0;0;85;23;2;23;0;33;0;0;1;13;22;19;2;20;2;26;0;1;4;2;51;25;3;10;0;37;3;5;59;18;12;76;13;46;1;1;30;108;2;11;20;8;0;1;25;41;1;1;64;22;0;1;16;51;3;0;62;0;0;1;
cox1;0;1;2;0;43;20;0;7;2;46;0;1;2;4;12;9;7;13;1;18;0;1;1;0;7;11;2;13;0;8;1;5;39;9;3;11;5;5;1;1;6;34;0;3;25;16;1;1;23;18;0;0;36;15;1;0;6;25;2;0;33;0;0;1;
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iars;0;3;1;1;83;28;2;23;1;23;1;0;1;8;14;21;8;22;2;23;0;3;2;2;37;27;8;22;1;37;4;1;55;18;6;59;14;43;2;2;33;77;1;11;8;27;0;1;36;27;2;0;61;13;0;0;12;35;0;0;31;0;0;1;
lars;0;5;2;0;59;18;2;19;1;21;0;2;0;7;15;19;3;23;2;12;0;0;4;1;36;27;4;17;2;39;4;6;38;16;14;42;19;42;2;4;18;73;1;9;13;27;0;3;20;39;2;0;48;17;1;0;8;35;2;0;31;0;0;1;
mfd;0;2;6;0;119;26;1;37;4;30;0;2;3;3;11;25;3;18;1;14;0;0;2;3;50;45;3;21;1;61;2;6;75;15;13;84;16;42;4;2;33;109;3;8;27;15;1;0;41;37;2;1;67;10;0;4;13;34;2;0;39;0;0;1;
recB;0;2;2;1;142;39;1;9;1;25;0;4;1;6;8;35;5;15;2;11;2;4;4;5;44;63;7;26;2;48;7;5;67;42;15;72;22;52;5;3;46;144;1;5;15;30;3;3;35;54;1;0;44;16;0;0;13;33;1;0;20;0;0;1;
rpoB;0;2;2;0;62;38;2;51;0;27;0;2;1;12;22;18;1;35;0;39;0;2;5;1;47;26;0;21;1;52;2;10;72;4;19;65;16;58;1;1;8;57;0;8;21;7;0;3;17;47;0;1;58;36;4;0;3;46;3;0;60;0;0;1;
rpoC;0;0;1;0;85;37;2;63;1;29;0;0;0;22;29;24;1;16;2;29;0;0;10;0;61;18;1;23;0;51;3;14;86;11;22;94;30;63;2;6;27;100;0;11;22;9;1;0;16;41;3;0;76;44;0;0;9;91;0;0;83;0;0;1;
sbcC;0;2;2;1;75;30;2;16;1;16;1;0;1;6;10;17;0;11;1;9;0;4;5;2;39;50;2;11;1;57;2;5;44;31;15;78;15;30;9;9;53;170;0;6;4;6;1;0;18;17;2;1;41;10;0;1;12;30;2;0;21;0;0;1;
secA;0;1;2;0;66;27;1;38;0;27;1;0;2;5;16;11;3;28;3;27;0;0;3;3;48;26;3;9;0;54;1;8;47;7;14;83;13;41;1;2;16;64;0;3;29;8;0;0;19;24;0;0;53;17;0;0;9;37;0;0;44;0;0;1;
  • cgc cyanobactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
carB;110;25;33;55;22;28;83;13;37;85;88;59;140;13;20;8;67;88;68;65;1;
cox1;66;7;48;28;20;19;20;15;8;54;14;10;42;3;25;16;43;51;32;35;1;
dnaE;128;50;34;50;37;28;84;28;42;91;83;76;135;13;33;6;59;91;42;66;1;
iars;116;25;24;45;30;25;71;30;38;78;65;57;114;12;8;27;64;76;47;31;1;
lars;84;21;22;43;26;14;68;21;41;64;56;61;97;10;13;27;62;67;44;33;1;
mfd;153;38;34;44;21;15;100;24;62;98;97;58;148;11;27;15;79;80;51;41;1;
recB;186;10;26;54;20;13;122;33;50;121;87;74;198;6;15;30;95;61;46;21;1;
rpoB;104;53;27;55;36;39;81;21;53;88;84;74;67;8;21;7;67;95;53;63;1;
rpoC;123;65;30;75;17;31;89;24;51;114;116;93;135;11;22;9;58;123;100;83;1;
sbcC;110;18;17;35;11;10;100;13;58;82;93;45;241;6;4;6;36;54;43;23;1;
secA;96;39;27;35;31;30;80;12;54;63;97;54;83;3;29;8;43;70;46;44;1;
  • cya cyanobactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
carB;0;17;7;7;52;15;10;31;22;13;6;1;1;8;16;16;6;23;1;22;1;3;2;2;40;19;2;15;12;42;7;4;42;33;21;65;16;32;3;20;15;78;2;8;21;5;5;7;18;32;9;4;55;21;8;1;10;45;17;1;57;0;1;0;
cox1;0;26;3;4;30;9;2;12;29;17;4;1;2;5;9;14;3;17;1;11;0;0;0;0;7;6;1;16;1;8;3;1;29;15;2;13;6;10;2;9;14;35;1;2;25;18;2;4;14;19;6;1;23;7;5;1;6;20;9;0;29;0;1;0;
dnaE;4;41;7;8;47;22;34;26;21;14;10;0;2;11;17;15;25;23;8;24;2;9;5;2;37;20;5;17;32;32;12;6;43;23;37;51;47;21;9;20;14;52;5;8;23;10;11;8;23;12;17;5;36;15;10;6;10;26;32;0;49;0;1;0;
iars;1;16;2;9;52;24;11;32;18;16;2;0;3;5;24;18;7;32;5;21;2;0;1;1;29;25;3;18;11;38;7;3;35;15;22;50;23;19;3;9;20;52;5;6;8;23;5;6;18;31;5;3;35;20;4;3;7;32;6;1;34;0;0;1;
lars;0;19;2;4;45;14;7;30;14;15;0;1;3;7;15;9;7;22;4;21;1;2;3;5;30;16;3;11;9;35;8;2;25;25;22;46;25;24;5;10;15;54;1;6;16;27;3;6;24;25;8;5;38;16;5;3;18;20;9;0;28;1;0;0;
mfd;2;35;11;2;66;35;24;22;31;9;7;0;2;8;17;20;10;21;4;14;4;5;3;2;42;25;6;13;26;72;9;6;44;17;39;53;28;18;3;20;10;65;1;6;21;20;4;10;26;43;4;3;39;16;9;1;13;33;29;1;27;0;1;0;
rpoB;2;31;2;1;51;21;13;37;16;16;5;1;2;16;18;16;5;36;3;36;0;4;2;2;51;33;3;17;12;29;6;8;55;23;32;65;32;42;3;6;21;43;1;4;21;8;5;15;19;31;7;6;72;20;5;3;9;34;10;0;46;0;0;1;
rpoC;1;30;1;5;81;8;14;34;11;14;7;0;4;13;15;20;8;15;5;29;0;5;3;2;47;43;2;12;25;52;9;7;54;35;28;88;33;48;2;11;30;61;1;6;19;7;5;8;31;23;12;8;93;19;3;1;21;55;17;1;60;0;0;1;
sbcC;3;15;11;6;85;34;8;12;11;6;5;1;1;9;17;18;4;15;3;12;1;6;9;1;66;26;7;32;62;106;14;0;22;16;37;74;17;19;10;17;18;88;1;9;6;15;5;7;10;13;7;4;15;6;1;1;2;26;10;0;34;0;1;0;
secA;0;17;3;5;47;32;16;36;12;18;2;0;0;10;15;12;4;27;1;36;1;0;1;1;34;34;1;18;12;28;4;8;26;20;25;72;17;35;6;8;19;47;1;3;25;7;2;5;10;26;7;3;47;18;4;3;8;28;8;0;39;0;1;0;
  • cya cyanobactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
carB;98;41;35;48;29;23;67;17;54;86;86;48;116;10;21;5;62;89;64;75;1;
cox1;72;14;46;35;20;12;13;17;9;48;15;16;60;3;25;18;39;37;32;38;1;
dnaE;129;60;35;55;48;32;75;22;64;84;88;68;95;13;23;10;54;73;52;81;1;
iars;104;43;34;52;39;26;58;21;49;60;72;42;84;11;8;23;60;63;46;41;1;
lars;84;37;29;35;29;25;57;14;44;60;68;49;84;7;16;27;58;67;46;37;1;
mfd;151;46;40;54;31;18;81;19;98;76;92;46;98;7;21;20;83;62;56;57;1;
rpoB;108;50;32;58;41;39;92;20;41;92;97;74;73;5;21;8;70;105;51;56;1;
rpoC;126;48;25;59;23;34;100;14;77;105;116;81;104;7;19;7;67;132;80;78;1;
sbcC;154;20;17;51;19;15;109;39;168;52;111;36;133;10;6;15;35;32;30;44;1;
secA;104;52;30;39;31;37;71;19;40;58;97;52;80;4;25;7;43;75;43;47;1;
  • mar cyanobactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
carB;27;11;3;16;15;18;54;8;20;18;7;3;8;19;23;7;21;13;19;15;1;10;11;1;18;8;8;3;28;13;14;27;24;14;72;15;43;13;12;19;18;44;10;3;26;6;8;10;13;32;22;19;14;24;21;7;12;26;39;2;46;1;0;0;
cox1;18;12;11;5;11;11;8;1;27;19;6;2;9;6;12;5;12;7;8;6;0;1;6;0;2;4;8;8;6;4;3;21;14;9;16;6;14;1;9;16;4;15;3;1;26;17;5;7;8;14;13;3;7;8;12;1;8;17;20;4;21;1;0;0;
dnaE;53;10;7;9;7;9;60;5;23;4;15;4;4;4;8;4;23;12;24;8;9;4;11;4;6;6;13;11;25;9;19;26;7;7;60;16;48;6;10;20;15;12;6;3;24;5;10;17;1;11;20;9;8;13;15;4;5;15;47;11;13;1;0;0;
dnaE1;24;2;2;8;9;1;31;6;15;0;6;0;5;6;8;3;9;3;20;5;4;4;6;1;4;2;6;2;20;5;9;9;2;4;27;8;19;4;8;14;8;5;3;1;10;3;0;6;2;5;12;6;9;7;6;3;1;10;19;0;8;1;0;0;
iars;44;14;4;10;11;8;50;8;27;13;17;5;21;8;8;5;34;7;41;9;4;3;14;4;14;5;10;7;24;14;18;24;3;10;50;20;45;10;15;29;13;15;8;2;10;23;6;15;8;17;21;9;21;15;18;3;17;13;26;2;23;1;0;0;
lars;36;4;8;9;8;11;49;9;24;10;7;4;6;5;11;6;26;8;22;12;9;4;10;1;6;9;5;7;28;12;24;15;7;6;61;7;39;8;11;21;3;23;7;1;15;21;9;10;10;20;22;9;13;14;19;2;5;27;30;7;18;1;0;0;
mfd;61;19;13;11;12;15;47;14;32;11;14;4;10;14;13;9;26;7;30;8;12;8;18;5;18;13;13;9;45;23;21;23;11;18;63;28;49;6;17;27;21;31;7;1;18;12;11;12;12;28;18;16;18;13;12;12;12;23;49;11;26;0;1;0;
rpoB;19;10;7;18;24;29;44;7;21;9;6;3;4;5;30;9;17;22;20;32;3;9;16;1;39;17;2;14;26;19;13;34;29;13;88;10;38;30;5;11;11;37;4;1;20;8;3;5;7;47;23;10;29;33;6;1;4;44;25;1;39;1;0;0;
rpoC;39;16;4;11;27;21;43;12;12;20;7;3;22;10;31;18;17;16;20;20;3;9;23;2;29;17;6;8;39;32;20;30;28;31;90;37;70;21;11;21;15;41;11;0;19;8;5;7;19;22;19;18;51;30;19;7;10;50;40;0;47;1;0;0;
sbcC;73;13;10;14;12;8;59;15;16;5;6;4;16;7;6;6;23;1;44;6;16;9;18;3;15;10;16;3;81;46;17;15;5;6;73;33;32;11;19;26;8;17;6;2;8;10;2;7;1;6;8;6;6;5;22;4;2;12;49;9;19;0;1;0;
secA;40;10;4;8;17;11;47;9;15;12;5;1;12;6;6;4;24;10;15;22;9;6;17;4;21;11;2;13;31;15;22;15;13;13;86;20;30;24;5;14;12;37;2;1;30;7;1;0;14;19;23;10;20;16;6;4;8;24;33;1;21;1;0;0;
  • mar cyanobactérie acides aminés:
protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
carB;90;62;38;67;34;34;49;11;41;79;87;56;93;13;26;6;63;79;66;87;1;
cox1;68;9;46;40;19;14;13;16;10;47;22;15;44;4;26;17;34;31;38;45;1;
dnaE;95;65;27;39;35;32;40;24;34;59;76;54;57;9;24;5;39;50;39;71;1;
dnaE1;46;37;15;28;12;25;21;8;25;24;35;23;35;4;10;3;13;34;20;27;1;
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lars;76;58;34;39;34;34;39;12;40;52;68;47;58;8;15;21;49;58;53;55;1;
mfd;131;61;43;64;33;38;74;22;68;73;91;55;96;8;18;12;63;65;59;86;1;
rpoB;107;51;30;57;39;52;85;16;45;89;98;68;64;5;20;8;62;95;55;65;1;
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secA;90;56;27;34;34;37;68;15;46;63;106;54;68;3;30;7;34;69;42;55;1;
  • pmm cyanobactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
carB;59;22;18;8;2;4;55;18;34;8;36;24;9;5;6;3;24;6;69;8;28;6;3;3;0;1;12;2;26;7;27;31;8;4;71;15;54;3;26;38;8;5;9;6;19;5;14;28;3;4;44;12;3;4;29;16;4;3;55;38;7;1;0;0;
dnaE;60;12;35;10;1;6;79;28;33;11;33;23;17;5;10;4;34;5;51;7;36;1;5;9;0;1;18;3;32;2;34;22;11;5;48;14;79;17;21;27;2;5;13;4;29;5;19;19;0;1;36;21;2;6;17;16;5;7;64;29;16;1;0;0;
gyrB;23;15;8;5;1;3;45;7;22;2;11;13;8;4;4;0;20;5;29;3;27;3;1;9;0;0;14;0;16;4;20;26;8;4;39;13;40;2;15;15;5;2;3;3;11;3;7;7;1;3;23;11;4;5;15;15;2;0;27;18;6;0;0;1;
iars;51;16;20;8;1;5;60;19;33;5;23;24;12;1;5;0;33;5;60;10;33;2;2;7;0;0;19;2;24;4;17;26;6;7;46;25;55;1;18;16;2;6;11;5;13;28;14;16;2;4;29;16;5;6;21;13;0;4;49;16;4;1;0;0;
lars;46;7;13;5;0;2;75;15;31;5;21;21;10;1;4;2;24;2;62;8;22;3;1;4;0;0;14;1;22;4;13;19;4;1;50;9;48;9;16;11;4;7;8;1;13;22;17;14;2;1;16;19;3;2;18;14;2;4;45;32;9;0;1;0;
mfd;66;8;25;16;3;1;102;16;32;9;18;29;20;3;4;6;34;9;84;18;37;4;2;7;1;0;15;3;33;7;27;13;9;6;74;17;46;12;11;15;4;8;6;1;14;12;24;10;2;2;24;24;0;9;18;28;2;4;62;61;14;1;0;0;
recB;73;18;37;16;0;4;107;23;67;6;24;27;29;4;9;5;41;10;126;12;19;1;1;6;0;0;13;3;27;6;19;12;2;2;68;19;65;5;9;10;3;1;13;6;6;15;8;10;2;4;18;12;2;4;20;12;3;7;83;43;12;0;1;0;
rpoB;46;14;26;12;2;5;51;11;26;3;16;17;12;4;5;5;27;9;42;8;53;4;3;15;0;1;17;4;36;12;26;42;9;10;70;19;63;7;21;31;7;3;5;1;25;7;23;33;2;5;59;23;6;6;24;20;2;4;30;21;7;1;0;0;
rpoC;68;21;21;10;3;4;74;17;24;5;38;38;25;1;6;5;18;2;49;8;42;3;6;18;0;2;18;1;43;12;48;35;6;14;92;26;77;10;30;41;4;5;8;3;22;8;18;25;3;4;56;39;10;5;48;32;2;16;66;22;9;1;0;0;
secA;50;15;19;13;1;4;60;12;21;6;16;15;13;1;2;3;27;4;43;8;36;2;5;11;1;1;14;0;35;8;28;22;2;4;72;26;46;11;24;24;4;3;5;1;26;8;15;12;2;2;28;20;4;7;26;10;3;5;28;20;9;1;0;0;
  • pmm cyanobactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
carB;113;73;42;83;30;77;41;14;33;70;86;57;77;15;19;5;49;63;52;100;1;
dnaE;124;107;44;92;39;58;52;21;34;72;62;96;55;17;29;5;39;65;45;109;1;
gyrB;55;52;24;40;25;32;40;14;20;58;52;42;37;6;11;3;18;43;32;51;1;
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secA;102;72;27;50;31;51;56;14;43;56;98;57;55;6;26;8;31;59;44;57;1;
  • syn cyanobactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
carB;22;29;2;6;21;10;39;16;26;10;8;2;8;5;37;9;22;17;6;26;2;3;6;1;20;20;8;9;23;15;6;13;32;29;75;22;29;29;10;13;23;43;5;7;26;5;8;10;12;33;21;7;44;13;12;7;15;37;59;1;31;0;1;0;
cox1;9;18;4;8;14;11;6;5;34;15;8;0;8;1;12;7;6;10;7;8;0;1;2;0;7;4;8;8;6;3;6;11;15;13;14;6;8;8;5;11;8;21;1;3;27;17;6;7;8;12;11;2;15;8;7;2;8;19;30;0;12;0;1;0;
dnaE;30;27;9;10;13;7;49;13;20;4;10;4;4;1;13;5;23;13;15;14;6;6;7;4;12;12;18;7;21;14;12;17;16;13;62;12;41;22;7;16;14;24;6;5;24;6;8;9;7;16;16;14;20;6;10;3;5;21;56;2;16;1;0;0;
dnaE1;12;8;3;9;8;5;22;6;12;5;4;1;6;4;10;4;5;8;12;10;2;4;8;0;5;5;7;1;21;13;5;7;6;6;33;4;14;6;7;10;8;16;1;3;10;3;6;3;1;9;9;4;18;4;5;1;1;11;14;4;9;0;1;0;
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lars;22;32;4;6;9;4;41;10;18;15;7;1;8;1;14;0;16;15;17;11;0;4;10;0;10;17;8;6;26;22;5;17;17;13;42;16;46;15;8;16;12;38;5;1;18;22;7;7;10;32;18;7;32;8;7;6;11;29;36;0;14;0;1;0;
mfd;56;41;13;13;19;10;52;18;32;5;10;5;22;7;16;8;22;10;22;6;6;9;9;8;17;28;16;5;39;31;11;32;23;15;65;29;47;12;9;28;17;36;7;0;25;15;7;10;16;34;18;12;35;10;17;13;13;25;45;2;16;0;1;0;
rpoB;10;27;9;12;27;18;41;12;13;17;3;0;8;6;34;6;17;19;19;25;0;8;13;4;17;37;5;16;31;15;9;36;25;19;78;22;33;38;3;15;9;41;2;2;22;7;6;11;6;44;20;12;37;13;2;5;4;42;39;0;31;0;1;0;
rpoC;17;30;8;8;39;18;48;21;9;19;7;2;14;4;27;15;19;17;7;23;1;3;15;1;30;32;2;10;36;36;13;30;40;37;92;28;56;46;7;15;20;51;6;5;18;8;7;8;7;24;16;17;67;21;15;1;13;55;49;0;27;1;0;0;
sbcC;51;34;8;21;14;11;46;11;22;4;8;1;14;1;7;7;14;6;25;14;8;10;13;9;17;9;15;4;103;52;10;18;13;7;77;21;34;9;15;27;7;32;10;1;7;8;2;5;1;8;6;3;14;3;14;7;3;23;48;3;11;0;1;0;
secA;15;26;2;10;18;19;40;21;16;14;4;2;4;6;12;7;21;15;18;17;0;2;11;3;17;26;7;8;23;25;6;19;16;20;81;22;33;24;7;11;16;21;0;3;27;10;2;7;8;15;10;11;40;12;10;6;11;24;34;0;17;1;0;0;
  • syn cyanobactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
carB;90;55;36;69;39;32;52;17;38;80;97;58;89;12;26;5;63;85;71;91;1;
cox1;64;11;49;36;16;15;14;16;9;45;20;16;45;4;27;17;33;36;36;42;1;
dnaE;96;62;24;37;36;29;47;25;35;58;74;63;61;11;24;6;40;56;39;74;1;
dnaE1;45;28;17;29;13;22;24;8;34;24;37;20;41;4;10;3;19;35;18;27;1;
iars;92;56;38;49;41;48;46;25;50;59;76;55;76;10;9;25;51;68;59;55;1;
lars;77;51;33;31;31;28;41;14;48;52;58;61;74;6;18;22;56;65;53;50;1;
mfd;152;70;37;68;32;28;77;21;70;81;94;59;90;7;25;15;67;75;68;63;1;
rpoB;103;53;30;57;36;44;79;21;46;89;100;71;68;4;22;7;67;82;53;70;1;
rpoC;120;69;28;69;36;30;82;12;72;120;120;102;93;11;18;8;46;121;84;76;1;
sbcC;139;57;26;38;20;39;66;19;155;48;98;43;81;11;7;8;16;26;47;62;1;
secA;90;61;30;35;36;35;59;15;48;61;103;57;55;3;27;10;32;73;51;51;1;
  • tel cyanobactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
carB;4;18;15;7;32;26;24;21;23;5;7;5;4;10;19;10;17;18;15;17;1;6;11;1;27;18;6;4;32;19;7;22;26;24;51;37;35;14;13;20;19;62;5;6;26;6;6;7;11;43;13;3;35;20;10;6;12;44;68;1;26;1;0;0;
cox1;2;15;4;8;26;13;7;7;23;15;3;4;7;6;4;5;7;14;7;11;0;0;3;0;6;4;6;10;6;4;3;13;21;9;4;11;14;4;9;6;11;19;2;2;23;20;2;5;8;20;5;1;28;6;3;1;11;21;29;2;12;0;0;1;
dnaE;5;20;13;8;33;21;26;20;20;9;0;3;9;5;13;10;19;16;9;14;0;4;7;1;25;12;12;13;28;31;8;17;26;9;30;36;28;19;13;11;17;25;7;4;27;6;5;4;9;24;6;1;29;15;4;3;4;22;35;1;21;0;1;0;
dnaE1;3;9;7;3;18;15;5;12;12;1;0;1;7;2;7;7;5;6;9;7;0;2;4;0;16;6;5;6;11;17;3;6;11;12;14;11;20;10;8;1;11;31;2;2;10;3;5;0;2;15;9;6;19;3;0;1;5;9;18;0;2;0;1;0;
iars;5;14;15;10;32;32;21;21;23;8;5;3;12;5;17;6;26;14;19;12;1;3;4;2;37;10;13;13;29;31;6;18;25;15;40;25;37;16;14;19;18;45;5;6;10;27;2;5;12;36;16;4;32;16;10;7;14;17;28;0;13;0;1;0;
lars;3;10;5;5;26;23;30;9;18;10;3;6;11;3;8;6;14;20;9;10;0;3;5;4;34;15;5;13;30;19;6;13;24;17;38;21;28;20;9;11;7;49;5;2;14;23;10;5;12;29;11;3;28;17;10;6;12;25;30;0;15;1;0;0;
mfd;9;26;11;13;48;35;18;20;26;10;3;3;17;9;10;12;18;12;8;10;0;5;8;1;45;27;13;11;54;34;6;20;24;20;32;49;38;17;14;14;24;54;5;2;20;16;9;3;15;40;23;3;34;22;8;10;15;33;41;1;14;1;0;0;
rpoB;5;18;10;13;32;23;34;20;20;13;10;5;5;6;15;12;17;21;21;21;1;4;9;0;46;24;2;13;27;23;7;24;37;18;43;40;51;29;10;8;10;38;2;3;24;7;8;14;10;39;11;6;45;27;6;4;17;33;53;0;14;1;0;0;
rpoC;6;23;17;5;41;28;37;33;15;13;1;5;12;12;22;15;5;22;12;20;0;3;9;0;45;22;6;14;37;25;8;35;41;26;74;49;58;36;14;23;20;51;3;4;16;7;6;12;6;30;20;10;66;35;14;11;21;40;60;0;23;1;0;0;
sbcC;10;22;16;12;43;43;13;10;14;5;0;0;4;6;4;19;14;13;8;9;1;8;11;3;50;21;19;14;92;78;6;5;11;14;52;38;19;11;14;14;17;70;5;6;3;7;2;1;2;15;4;7;9;10;7;2;9;31;31;1;18;1;0;0;
secA;3;18;5;10;40;19;17;27;18;11;1;7;9;5;7;7;17;16;18;12;0;7;4;0;29;29;7;10;24;28;10;14;20;13;45;51;32;22;12;9;13;42;1;3;31;7;5;2;10;23;4;7;44;16;3;5;7;24;37;0;12;1;0;0;
  • tel cyanobactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
carB;102;45;28;55;35;32;64;10;51;79;88;49;114;11;26;6;67;71;72;95;1;
cox1;68;14;38;29;21;18;13;16;10;46;15;18;45;4;23;20;35;40;36;43;1;
dnaE;100;46;29;40;35;23;49;25;59;60;66;47;66;11;27;6;42;51;33;57;1;
dnaE1;55;17;13;24;11;16;28;11;28;32;25;30;51;4;10;3;22;37;15;20;1;
iars;108;42;31;48;40;31;57;26;60;64;65;53;96;11;10;27;55;68;48;41;1;
lars;72;39;28;37;34;19;61;18;49;60;59;48;76;7;14;23;56;59;53;45;1;
mfd;142;38;36;54;30;18;86;24;88;70;81;55;106;7;20;16;67;82;66;56;1;
rpoB;101;54;33;53;38;42;84;15;50;86;83;80;66;5;24;7;71;89;60;67;1;
rpoC;120;70;28;67;27;32;79;20;62;110;123;94;108;7;16;7;54;131;86;83;1;
sbcC;146;23;19;33;27;17;94;33;170;36;90;30;115;11;3;7;20;30;49;50;1;
secA;95;44;29;36;33;30;69;17;52;57;96;54;76;4;31;7;40;71;39;49;1;

Autre-bactéries[modifier | modifier le wikicode]

Répétitions[modifier | modifier le wikicode]

  • bmv bactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
lars; 2595; 66.5895953757225; 0; 0; 0; 0; 41; 93; 120; 160; 2; 1; 1; 3; 0
iars; 2838; 66.8428470754052; 0; 0; 0; 0; 49; 100; 153; 166; 0; 2; 1; 3; 0
carB; 3255; 66.5745007680491; 0; 0; 0; 1; 47; 99; 151; 209; 0; 3; 1; 1; 0
secA; 2796; 65.5221745350501; 1; 0; 0; 0; 40; 101; 132; 168; 1; 2; 0; 3; 0
rpoC; 4239; 64.071715027129; 1; 0; 0; 0; 69; 191; 183; 258; 0; 2; 0; 2; 0
rpoB; 4107; 63.0630630630631; 0; 0; 0; 0; 79; 193; 204; 218; 0; 3; 0; 2; 0
dnaE1; 4361; 67.5533134602155; 3; 1; 1; 0; 95; 136; 230; 269; 0; 4; 3; 7; 0
ftsK; 2469; 67.6792223572296; 0; 0; 1; 0; 36; 69; 131; 156; 2; 1; 3; 2; 0
mfd; 3474; 69.4012665515256; 0; 0; 1; 0; 58; 88; 193; 183; 1; 0; 2; 1; 0
lhr; 4797; 74.9635188659579; 0; 0; 1; 0; 55; 84; 293; 269; 1; 1; 8; 4; 0
recB; 3813; 73.0396013637556; 0; 1; 0; 2; 64; 57; 174; 237; 0; 1; 1; 5; 0
recC; 4065; 73.9237392373924; 1; 0; 1; 1; 125; 43; 225; 269; 0; 0; 3; 8; 0
  • cft bactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
lars; 2436; 34.1133004926108; 8; 20; 0; 0; 117; 127; 43; 79; 16; 27; 1; 4; 0
iars; 2751; 37.4409305707016; 5; 19; 0; 0; 134; 143; 52; 98; 20; 27; 1; 2; 0
carB; 3255; 38.8018433179723; 3; 23; 0; 0; 149; 183; 75; 106; 18; 28; 0; 1; 0
ftsK; 2148; 33.5195530726257; 10; 22; 1; 0; 112; 114; 43; 59; 17; 18; 0; 1; 0
rpoC; 4527; 36.779324055666; 4; 23; 0; 0; 244; 255; 88; 153; 15; 64; 0; 2; 0
rpoB; 4140; 34.0579710144928; 12; 36; 0; 0; 208; 233; 72; 127; 17; 42; 0; 1; 0
recB; 2766; 30.115690527838; 11; 27; 0; 0; 165; 144; 30; 56; 24; 31; 1; 1; 0
secA; 2568; 35.2414330218069; 5; 27; 0; 0; 124; 138; 36; 74; 10; 26; 0; 3; 0
dnaE; 3996; 34.034034034034; 8; 29; 0; 0; 198; 237; 66; 109; 17; 47; 1; 3; 0
mfd; 2973; 32.4251597712748; 11; 22; 0; 0; 154; 181; 32; 81; 27; 31; 0; 0; 0
  • eco bactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
dnaE; 3483; 54.9526270456503; 1; 6; 0; 0; 115; 146; 162; 210; 7; 13; 3; 11; 0
ftsK; 3990; 54.0100250626566; 1; 10; 0; 3; 166; 184; 222; 180; 10; 5; 4; 7; 0
lhr; 4617; 56.898418886723; 5; 4; 2; 2; 161; 169; 223; 273; 11; 12; 6; 9; 0
mfd; 3447; 54.7722657383232; 1; 7; 0; 0; 131; 142; 157; 172; 5; 13; 3; 5; 0
mukB; 4461; 55.6601658820892; 1; 6; 0; 0; 150; 209; 178; 215; 4; 14; 1; 6; 0
recB; 3543; 54.5582839401637; 2; 6; 1; 1; 148; 152; 168; 184; 7; 5; 2; 6; 0
recC; 3369; 53.606411398041; 2; 3; 0; 0; 149; 135; 162; 180; 9; 8; 5; 8; 0
rpoB; 4029; 52.6185157607347; 0; 8; 0; 0; 138; 212; 201; 189; 2; 7; 2; 1; 0
rpoC; 4224; 53.8352272727273; 1; 6; 0; 1; 130; 214; 193; 224; 2; 9; 3; 0; 0
sbcC; 3147; 53.79726723864; 1; 8; 0; 0; 116; 183; 126; 147; 2; 17; 1; 4; 0
  • mhd bactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
dnaE; 3675; 66.6938775510204; 2; 1; 6; 12; 86; 95; 232; 253; 2; 3; 16; 30; 0
rpoB; 3366; 66.7260843731432; 0; 0; 7; 8; 67; 94; 194; 231; 0; 1; 15; 24; 0
rpoC; 4590; 66.7538126361656; 0; 1; 3; 6; 79; 127; 313; 342; 0; 2; 17; 24; 0
secA; 3018; 64.546056991385; 1; 3; 2; 5; 45; 116; 182; 212; 1; 5; 6; 13; 0
sbcC; 2718; 72.0382634289919; 0; 0; 2; 5; 53; 68; 176; 240; 0; 3; 4; 11; 0
mfd; 2958; 68.3231913455037; 0; 1; 7; 7; 74; 54; 204; 223; 5; 3; 15; 15; 0
ftsK; 2835; 68.7125220458554; 2; 0; 9; 4; 54; 74; 212; 191; 3; 3; 17; 22; 0
pdhA; 2703; 68.3314835368109; 1; 0; 1; 5; 58; 77; 190; 187; 0; 2; 13; 20; 0
topA; 2487; 70.48652995577; 0; 3; 9; 3; 38; 66; 181; 181; 0; 2; 21; 12; 0
nuoG; 2451; 71.4402284781722; 0; 0; 7; 7; 41; 56; 173; 191; 0; 0; 14; 15; 0
cox1; 2385; 64.6540880503145; 0; 2; 4; 0; 76; 41; 187; 153; 1; 2; 16; 8; 0
  • sti bactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
ftsK; 2226; 69.0925426774483; 0; 0; 4; 1; 30; 50; 157; 174; 0; 0; 6; 8; 0
rpoC; 4440; 67.6801801801802; 0; 0; 0; 1; 60; 105; 274; 401; 0; 0; 1; 12; 0
rpoB; 3480; 66.2356321839081; 0; 0; 0; 0; 64; 93; 200; 285; 0; 1; 6; 6; 0
cox1; 1896; 64.3459915611814; 0; 0; 1; 0; 62; 34; 130; 117; 0; 0; 4; 10; 0
aldo; 2829; 69.1763874160481; 0; 0; 1; 3; 53; 49; 190; 250; 2; 0; 7; 8; 0
acnA; 2778; 68.682505399568; 0; 0; 0; 1; 46; 52; 231; 190; 0; 0; 7; 7; 0
sbcC; 2553; 69.3301997649824; 0; 0; 1; 0; 26; 64; 216; 162; 0; 0; 7; 5; 0
secA; 2610; 65.2873563218391; 0; 0; 0; 2; 36; 70; 177; 188; 0; 1; 4; 5; 0
dnaE; 3966; 57.5138678769541; 5; 2; 3; 1; 133; 158; 225; 234; 14; 7; 15; 3; 0
mfd; 3522; 68.5406019307212; 0; 0; 1; 0; 58; 58; 265; 260; 1; 0; 10; 7; 0
  • tos bactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
dnaE; 3666; 67.6759410801964; 1; 1; 13; 20; 76; 79; 296; 310; 4; 7; 27; 29; 0
ftsK; 2607; 70.4257767548907; 1; 3; 22; 19; 46; 61; 241; 206; 4; 5; 26; 16; 0
secA; 2994; 66.3994655978624; 1; 2; 12; 11; 51; 92; 240; 244; 4; 4; 16; 20; 0
rpoB; 3360; 68.8690476190476; 0; 0; 19; 14; 55; 80; 265; 268; 1; 0; 26; 33; 0
rpoC; 4575; 68.1967213114754; 1; 1; 13; 16; 71; 119; 368; 392; 0; 4; 35; 35; 0
lars; 2628; 67.3135464231355; 1; 1; 13; 10; 49; 69; 197; 221; 0; 4; 23; 24; 0
iars; 3129; 67.4017257909875; 0; 2; 21; 8; 67; 85; 231; 273; 2; 5; 25; 29; 0
carB; 3087; 68.0272108843537; 0; 2; 16; 25; 53; 80; 224; 261; 1; 0; 26; 32; 0
sbcC; 2895; 68.5319516407599; 2; 2; 6; 20; 65; 85; 216; 314; 7; 3; 13; 19; 0
mfd; 2955; 70.0507614213198; 1; 2; 20; 21; 70; 52; 251; 246; 2; 3; 28; 24; 0
  • zin bactérie:
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
dnaE; 3396; 13.4275618374558; 25; 86; 0; 0; 218; 256; 20; 42; 30; 54; 0; 0; 0
rpoB; 3876; 14.0866873065015; 29; 97; 0; 1; 257; 281; 35; 53; 35; 48; 0; 1; 0
rpoC; 2346; 15.771526001705; 8; 53; 0; 1; 161; 159; 15; 40; 24; 40; 0; 0; 0
nuoG; 2283; 11.8703460359177; 17; 61; 0; 0; 151; 155; 14; 14; 28; 41; 0; 0; 0
nuoL; 1923; 9.4123764950598; 29; 27; 0; 0; 150; 115; 9; 17; 40; 24; 0; 0; 0
lars; 2424; 9.98349834983498; 21; 67; 0; 0; 156; 177; 20; 17; 23; 28; 0; 1; 0
iars; 2790; 11.6129032258065; 23; 60; 1; 0; 166; 218; 18; 27; 28; 47; 0; 0; 0
cox3; 2439; 16.6871668716687; 37; 25; 0; 1; 174; 173; 23; 42; 31; 18; 0; 0; 0
metE; 2277; 16.2055335968379; 7; 54; 0; 0; 156; 175; 23; 35; 19; 27; 0; 0; 0
gyrB; 2454; 13.121434392828; 15; 71; 0; 0; 144; 194; 13; 31; 16; 32; 0; 0; 0

Codons[modifier | modifier le wikicode]

  • zin bactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
dnaE;103;3;2;3;0;0;217;4;76;2;23;14;11;1;0;2;56;3;141;6;23;0;1;0;0;0;9;0;16;2;15;23;0;1;40;0;27;1;19;14;0;1;11;0;8;0;12;6;0;1;9;14;0;0;10;11;0;0;76;108;0;1;0;6;
rpoB;124;1;2;2;0;0;224;8;91;3;37;25;11;0;0;0;78;0;166;3;25;0;2;0;0;0;13;0;19;0;16;31;0;3;52;0;34;0;7;12;0;0;6;0;16;0;10;25;0;0;23;13;1;0;18;12;1;0;66;107;2;1;0;2;
rpoC;65;1;1;1;0;0;145;1;31;0;28;14;15;0;0;0;32;0;80;0;22;0;0;0;0;0;4;0;11;1;10;29;1;1;30;0;18;0;4;7;1;0;8;1;12;0;5;9;0;1;17;8;0;0;21;12;0;0;69;63;0;1;0;2;
nuoG;61;2;3;2;0;0;140;5;57;1;23;15;10;0;0;1;38;1;106;2;16;0;0;0;0;0;7;0;9;0;4;8;0;0;24;1;13;1;1;5;0;1;13;2;7;0;6;6;0;0;6;5;0;0;14;10;2;0;54;72;0;1;0;6;
nuoL;96;2;2;0;0;0;71;0;84;0;23;13;9;0;1;1;45;2;65;0;3;0;0;1;0;0;4;0;5;0;5;9;0;0;11;0;7;0;3;3;0;0;4;0;8;0;4;3;0;0;7;1;0;0;10;3;0;1;53;76;1;1;0;4;
lars;68;0;1;1;0;0;165;2;61;1;11;7;3;0;1;0;62;2;124;3;12;0;0;0;0;0;8;0;10;0;7;9;0;1;14;0;11;0;1;4;0;0;8;1;13;1;9;9;0;1;5;5;0;0;9;10;0;0;53;78;1;1;0;15;
iars;76;2;0;0;0;0;165;2;70;1;15;19;3;0;1;0;55;4;129;2;17;0;1;0;0;0;11;1;16;0;11;12;1;0;24;0;22;0;4;2;1;0;12;0;8;2;9;9;0;1;8;5;0;0;18;9;0;0;65;103;0;1;0;13;
cox3;88;7;1;0;0;0;60;0;89;4;24;11;9;1;1;0;41;2;60;2;10;0;0;0;0;0;14;0;5;0;21;19;1;1;17;0;10;0;6;11;0;1;6;0;26;0;12;7;1;1;14;12;0;0;19;20;0;0;54;101;1;1;0;22;
metE;68;2;0;0;0;0;129;1;38;0;18;10;8;1;0;0;38;1;84;3;19;0;1;0;0;0;9;0;13;1;12;15;2;1;33;2;17;1;5;7;0;0;9;0;14;1;11;12;0;0;7;10;2;0;14;15;0;0;50;60;0;0;1;14;
gyrB;75;2;0;0;0;0;151;5;42;0;18;20;12;1;0;0;43;4;106;0;18;0;1;0;0;0;6;0;12;0;18;11;0;0;30;0;19;1;7;4;1;1;8;0;11;0;4;6;1;1;6;7;0;0;10;14;0;0;50;89;0;1;0;2;
  • zin bactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
dnaE;111;221;78;51;59;147;24;9;18;39;40;28;34;11;8;0;19;23;21;184;7;
rpoB;129;232;94;73;78;169;27;13;19;50;52;34;19;6;16;0;35;37;31;175;3;
rpoC;68;146;31;57;32;80;22;4;12;41;30;18;12;9;12;0;15;25;33;132;3;
nuoG;68;145;58;49;39;108;16;7;9;12;25;14;7;15;7;0;12;11;26;126;7;
nuoL;100;71;84;47;47;65;4;4;5;14;11;7;6;4;8;0;7;8;14;130;5;
lars;70;167;62;22;64;127;12;8;10;17;14;11;5;9;13;1;19;10;19;132;16;
iars;78;167;71;38;59;131;18;12;16;24;24;22;7;12;8;2;19;13;27;168;14;
cox3;96;60;93;46;43;62;10;14;5;42;17;10;18;6;26;0;21;26;39;156;23;
metE;70;130;38;37;39;87;20;9;14;30;35;18;12;9;14;1;23;19;29;110;15;
gyrB;77;156;42;51;47;106;19;6;12;29;30;20;13;8;11;0;12;13;24;139;3;
  • tos bactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
dnaE;3;6;16;4;56;66;4;58;11;37;1;0;0;4;28;8;3;44;0;20;0;0;1;16;39;38;3;25;3;31;0;1;42;55;4;123;2;60;1;1;35;86;0;4;30;9;1;3;7;61;6;0;64;18;0;0;13;25;2;2;41;0;0;1;
ftsK;0;6;16;6;51;77;9;34;7;26;0;0;0;4;14;16;0;11;0;9;0;1;0;10;25;27;0;13;6;21;3;0;30;38;12;64;2;23;0;0;24;83;0;0;11;7;1;4;11;61;0;1;38;7;0;1;6;25;0;0;27;0;1;0;
secA;0;3;20;4;31;47;4;62;10;24;0;0;0;2;17;6;0;29;1;23;0;0;0;9;42;41;0;20;3;34;0;1;36;31;10;107;0;49;1;0;24;63;0;1;26;6;0;2;11;37;0;0;51;19;0;0;6;34;4;3;43;1;0;0;
rpoB;0;4;6;3;57;47;0;50;9;32;0;0;0;1;32;9;1;32;1;20;0;1;1;4;52;45;1;16;0;35;0;2;47;52;8;96;4;66;0;0;13;69;0;2;23;2;0;2;11;57;2;0;71;26;1;0;4;44;4;0;54;1;0;0;
rpoC;4;6;9;4;59;78;2;86;7;35;0;0;0;5;35;21;0;46;0;28;0;0;2;6;79;45;1;22;1;56;1;6;55;51;10;150;1;73;0;3;35;93;0;11;27;10;0;4;9;64;4;1;106;42;0;0;14;49;6;1;61;0;1;0;
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iars;0;6;20;11;45;45;7;46;6;37;0;0;0;5;12;14;0;43;1;20;1;1;0;10;30;44;1;20;1;18;2;1;29;40;17;100;0;43;0;1;26;71;0;10;12;26;0;3;10;57;0;1;45;24;0;0;10;33;1;0;36;1;0;0;
carB;3;4;17;6;48;40;4;44;9;16;1;0;0;4;29;7;0;37;1;16;1;0;0;18;16;40;0;16;3;21;0;0;30;60;9;99;1;41;0;0;32;70;0;2;21;10;1;1;11;51;2;0;59;30;0;0;9;38;4;1;45;0;0;1;
sbcC;1;22;35;8;62;51;7;50;7;12;0;1;0;3;12;6;3;10;0;2;3;2;6;30;27;42;1;8;3;29;4;2;23;43;29;122;10;29;0;3;28;102;0;3;4;11;0;4;4;25;2;1;29;9;0;2;9;16;1;0;6;0;0;1;
mfd;0;10;21;4;50;78;6;32;6;31;1;0;0;3;16;8;2;33;0;7;1;1;0;13;36;45;1;20;2;24;2;0;33;48;5;93;5;36;0;2;20;73;0;0;7;6;0;5;15;55;4;2;38;20;2;0;7;29;2;0;24;0;0;1;
  • tos bactérie acides aminés:
protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
dnaE;151;62;48;41;47;20;94;28;34;98;127;62;123;4;30;9;72;88;38;45;1;
ftsK;156;43;33;34;11;9;63;13;27;71;76;25;107;0;11;7;77;46;32;27;1;
secA;105;66;34;25;29;24;92;20;37;68;117;49;88;1;26;6;50;70;40;50;1;
rpoB;117;50;41;42;33;21;103;17;35;101;104;70;82;2;23;2;70;99;49;58;1;
rpoC;160;88;42;61;46;28;132;23;57;113;160;74;131;11;27;10;77;153;63;68;1;
lars;80;50;38;16;32;19;66;19;23;62;93;40;77;8;24;28;62;65;40;33;1;
iars;127;53;43;31;43;21;86;21;19;72;117;43;98;10;12;26;70;70;43;37;1;
carB;118;48;25;41;37;17;75;16;24;90;108;42;102;2;21;10;64;91;47;50;1;
sbcC;179;57;19;22;13;2;110;9;32;72;151;39;133;3;4;11;33;41;27;7;1;
mfd;163;38;37;28;35;7;96;21;26;83;98;41;95;0;7;6;75;64;38;26;1;
  • sti bactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
ftsK;1;5;3;3;44;33;3;22;0;15;0;0;0;12;7;10;1;11;2;14;0;2;6;2;37;15;2;8;2;25;3;17;24;18;4;44;8;25;11;9;41;30;0;2;20;7;1;3;36;19;2;2;31;32;2;1;17;14;1;0;32;1;0;0;
rpoC;0;7;3;2;91;39;0;57;1;29;1;0;3;29;14;20;5;26;0;38;0;2;5;1;60;51;6;23;0;68;3;29;61;28;7;144;12;73;8;14;69;57;2;11;33;7;0;2;52;4;7;2;55;65;1;3;31;40;7;0;71;0;1;0;
rpoB;0;10;2;1;59;34;0;43;4;32;1;1;1;27;10;15;3;25;5;33;0;1;4;1;46;52;2;16;3;37;5;12;54;22;10;94;15;65;3;6;40;35;0;3;26;5;0;0;51;7;5;1;47;48;2;0;36;26;10;1;62;0;1;0;
cox1;0;3;2;1;39;31;0;7;4;46;1;2;0;18;9;8;4;17;3;15;0;1;2;0;10;10;2;13;3;15;2;8;23;20;3;11;1;17;4;2;27;22;0;0;28;21;1;2;34;11;1;1;20;27;1;1;18;19;2;1;37;0;0;1;
aldo;0;3;4;2;65;39;1;18;2;39;0;0;1;18;2;17;1;18;5;15;0;4;4;2;31;33;3;12;0;40;5;6;40;29;5;71;15;45;7;7;52;42;0;0;12;9;4;1;38;13;4;1;38;26;1;2;22;27;4;0;37;0;0;1;
acnA;0;4;2;1;48;38;1;11;0;31;3;2;0;13;9;20;2;27;3;25;1;2;10;0;49;14;1;15;0;28;2;8;50;18;6;66;11;40;11;4;25;42;0;4;11;9;4;4;41;18;6;1;44;40;5;2;26;30;1;0;36;0;0;1;
sbcC;0;4;2;8;37;47;3;15;2;16;0;1;2;6;6;8;1;9;0;12;1;5;5;4;69;34;1;12;10;46;5;5;28;2;18;90;7;43;6;5;34;75;0;7;10;2;2;1;4;9;0;1;7;25;2;3;12;32;2;1;46;0;1;0;
secA;0;5;2;2;40;32;1;34;3;19;0;0;1;6;5;11;4;30;2;23;0;3;8;0;39;28;1;24;3;40;2;14;36;16;7;72;10;47;4;2;29;28;1;3;19;4;3;0;29;6;3;2;27;32;1;1;22;25;3;0;55;1;0;0;
dnaE;7;21;11;1;70;15;22;29;29;26;10;4;5;17;12;20;8;41;14;30;1;1;12;3;53;12;17;19;10;36;9;15;49;13;57;55;37;35;12;19;40;49;4;5;37;12;7;17;24;36;15;6;55;16;6;1;15;45;33;2;39;0;0;1;
mfd;1;17;5;6;57;62;1;15;1;22;1;3;1;10;13;18;1;33;3;15;1;7;7;2;64;38;2;23;2;46;6;7;46;19;16;87;14;49;17;4;44;50;0;2;18;9;8;3;53;18;7;3;44;55;1;4;22;28;3;0;59;0;1;0;
  • sti bactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
ftsK;89;25;15;29;12;16;62;10;27;62;48;33;91;2;20;7;59;67;34;33;1;
rpoC;142;57;30;67;31;38;119;29;68;121;151;85;148;13;33;7;58;129;75;78;1;
rpoB;106;43;36;55;28;38;104;18;40;93;104;80;84;3;26;5;58;101;64;73;1;
cox1;76;7;50;38;21;18;23;15;18;53;14;18;55;0;28;21;48;49;39;40;1;
aldo;113;19;41;38;19;20;74;15;40;80;76;60;108;0;12;9;56;69;52;41;1;
acnA;93;12;31;47;29;28;76;16;28;78;72;51;82;4;11;9;67;91;63;37;1;
sbcC;98;18;18;23;10;12;118;13;56;40;108;50;120;7;10;2;16;33;49;49;1;
secA;81;35;22;23;34;25;78;25;43;68;79;57;63;4;19;4;38;64;49;58;1;
dnaE;125;51;55;68;49;44;82;36;46;86;112;72;120;9;37;12;84;92;67;74;1;
mfd;148;16;23;46;34;18;119;25;48;78;103;63;115;2;18;9;82;109;55;62;1;
  • mhd bactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
dnaE;0;25;5;1;47;60;6;52;8;39;0;0;2;8;17;14;1;46;0;27;0;1;4;1;59;33;1;23;1;37;2;4;30;60;13;108;12;55;6;4;72;50;0;5;33;12;0;3;23;34;5;3;43;32;1;1;12;28;6;0;49;1;0;0;
rpoB;0;14;3;2;59;41;5;46;4;36;0;0;1;19;14;12;2;30;0;30;0;1;11;2;54;31;2;17;8;32;4;7;37;51;6;85;20;59;0;4;46;27;0;2;23;3;1;2;34;33;1;3;68;25;0;0;13;31;3;0;57;0;0;1;
rpoC;0;14;7;2;61;62;4;82;5;32;0;0;0;18;23;16;1;49;0;30;0;1;12;2;77;29;2;25;2;55;2;8;66;45;13;138;15;71;3;4;63;67;1;10;33;13;0;4;37;33;11;5;74;45;4;0;20;48;4;0;81;1;0;0;
secA;2;7;5;7;40;33;9;55;7;24;0;0;0;6;10;12;1;31;0;25;0;5;5;1;48;30;0;25;12;28;5;7;34;22;29;85;7;47;1;4;53;36;0;5;23;8;3;0;24;17;1;4;42;22;2;2;21;20;2;0;51;0;1;0;
sbcC;4;19;5;5;33;63;4;17;5;13;0;0;1;8;6;6;1;16;0;8;0;1;5;1;76;43;3;18;10;37;1;3;32;25;30;100;6;25;3;10;73;56;0;4;4;9;1;3;10;12;3;0;43;4;1;0;10;18;0;0;11;0;0;1;
mfd;1;10;15;2;44;59;6;29;10;31;0;1;0;9;8;12;1;34;2;8;0;3;6;0;45;45;3;24;7;24;7;4;36;30;8;74;10;42;0;8;53;36;0;1;8;9;2;10;25;32;3;4;52;23;0;1;19;14;2;0;33;1;0;0;
ftsK;1;18;9;4;49;51;7;28;5;23;1;0;0;21;16;14;2;12;3;16;0;3;8;3;36;24;2;20;3;22;1;5;31;35;19;59;9;26;8;9;50;59;0;1;17;13;2;8;22;41;3;3;30;16;0;0;16;25;1;0;34;0;0;1;
pdhA;2;12;4;3;23;49;1;32;3;32;0;0;0;9;7;14;0;37;0;21;0;0;3;1;49;23;0;24;4;24;1;5;32;39;20;60;6;39;0;6;50;46;0;1;16;14;0;0;27;27;4;1;35;22;0;1;10;21;2;0;38;0;0;1;
topA;1;3;1;2;25;37;12;31;0;27;0;0;1;5;15;17;1;28;0;10;0;3;2;0;51;34;0;10;3;19;1;2;25;23;15;69;1;28;1;5;40;42;0;16;8;9;1;1;17;49;4;0;33;24;0;0;18;35;0;0;23;0;0;1;
nuoG;0;5;1;1;26;52;0;30;3;25;0;0;0;10;4;10;0;26;0;11;0;1;4;1;37;27;0;20;4;17;6;3;33;33;9;64;1;38;1;5;47;46;0;12;12;11;0;3;20;34;5;1;42;16;1;0;9;29;1;0;19;0;0;1;
cox1;1;6;4;2;47;63;10;9;2;62;0;0;0;14;11;9;2;33;0;18;0;0;2;0;17;2;1;23;3;13;4;6;39;22;3;15;2;17;1;0;30;45;0;0;25;33;0;1;17;26;2;2;28;32;2;0;14;35;1;0;38;1;0;0;
  • mhd bactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
dnaE;138;58;47;41;47;27;98;24;38;96;121;67;132;5;33;12;60;83;42;55;1;
rpoB;119;51;40;46;32;30;99;19;40;99;91;79;77;2;23;3;70;97;44;60;1;
rpoC;146;86;37;57;50;30;121;27;57;121;151;86;137;11;33;13;74;135;72;85;1;
secA;94;64;31;28;32;25;89;25;40;68;114;54;94;5;23;8;44;69;45;53;1;
sbcC;129;21;18;21;17;8;126;21;47;61;130;31;142;4;4;9;26;50;29;11;1;
mfd;131;35;41;30;35;10;99;27;31;77;82;52;97;1;8;9;69;82;34;35;1;
ftsK;132;35;28;52;14;19;74;22;25;72;78;35;126;1;17;13;73;52;41;35;1;
pdhA;93;33;35;30;37;21;76;24;28;77;80;45;102;1;16;14;54;62;32;40;1;
topA;69;43;27;38;29;10;90;10;22;51;84;29;88;16;8;9;68;61;53;23;1;
nuoG;85;30;28;24;26;11;70;20;21;75;73;39;99;12;12;11;57;64;39;20;1;
cox1;123;19;64;34;35;18;21;24;16;71;18;19;76;0;25;33;44;64;51;39;1;
  • eco bactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
dnaE;11;13;20;2;64;12;38;20;24;26;7;4;1;11;8;15;20;19;5;27;0;1;36;4;29;8;8;16;12;28;10;31;31;22;61;31;43;43;11;11;55;25;5;7;37;8;8;7;34;5;11;18;26;20;2;3;11;29;12;2;52;1;0;0;
ftsK;10;24;13;7;48;6;39;6;21;14;14;9;6;11;11;16;29;17;16;17;0;3;41;0;21;5;11;6;44;75;3;37;24;12;72;21;47;23;27;28;55;39;3;1;25;19;34;21;68;9;39;17;28;19;15;10;16;20;38;1;18;1;0;0;
lhr;24;23;22;9;78;29;22;4;28;14;14;16;17;24;15;19;20;7;19;13;6;15;38;4;57;27;21;8;35;35;15;28;51;19;76;28;51;29;37;20;56;53;4;3;27;25;18;12;38;19;22;22;30;35;12;9;25;38;39;8;26;0;1;0;
mfd;7;14;16;3;86;14;37;6;17;29;1;5;9;12;3;17;16;11;17;16;0;3;42;1;37;10;19;15;18;41;6;26;24;10;64;29;46;23;22;6;44;37;3;4;30;10;13;7;30;6;11;9;33;14;8;8;21;21;31;0;30;1;0;0;
mukB;8;17;13;5;115;19;41;8;26;21;18;8;10;17;13;32;17;14;11;46;0;5;79;0;57;4;15;17;20;94;5;23;24;7;105;55;58;31;18;18;77;32;3;7;32;8;4;4;25;1;16;7;46;16;8;1;14;33;27;0;31;1;0;0;
recB;14;32;13;7;66;12;24;7;30;14;6;3;17;11;11;16;18;12;15;17;0;6;37;0;40;9;12;17;24;47;4;19;28;13;67;29;48;26;26;13;45;33;3;7;31;23;9;5;30;8;17;9;21;15;6;9;19;26;20;3;31;1;0;0;
recC;18;20;14;12;75;15;18;5;33;17;4;10;11;6;11;27;23;12;7;23;1;6;38;3;26;8;16;6;25;52;8;18;22;12;60;24;41;33;15;11;36;23;6;8;29;27;12;10;40;5;15;3;24;11;7;5;8;17;24;3;23;0;0;1;
rpoB;1;6;6;0;99;15;56;24;11;33;23;0;2;3;31;15;14;29;3;48;0;1;61;0;28;0;1;18;8;50;0;69;35;2;89;33;30;62;22;19;29;9;5;2;37;4;10;8;38;0;41;31;24;13;17;3;6;34;18;0;66;1;0;0;
rpoC;3;1;3;0;125;7;62;25;9;26;24;1;0;5;27;14;7;27;1;47;0;0;75;0;24;0;4;17;3;47;0;85;28;2;83;26;34;47;33;28;52;11;7;8;35;9;9;3;45;0;53;32;17;7;23;1;7;46;17;0;75;1;0;0;
sbcC;24;15;19;7;64;16;30;12;9;11;2;3;9;10;4;23;7;4;16;20;0;4;24;0;28;6;11;16;69;88;2;12;14;11;62;26;31;15;16;10;59;27;4;4;10;15;7;4;11;3;11;7;13;11;10;12;26;28;23;2;11;1;0;0;

  • eco bactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
dnaE;122;58;50;46;39;32;78;24;40;94;92;86;102;12;37;8;54;75;45;66;1;
ftsK;108;45;35;67;46;33;70;17;119;76;93;70;149;4;25;19;132;103;61;57;1;
lhr;185;26;42;105;27;32;147;29;70;113;104;80;166;7;27;25;87;109;84;73;1;
mfd;140;43;46;47;27;33;93;34;59;66;93;69;109;7;30;10;56;67;58;61;1;
mukB;177;49;47;98;31;57;145;32;114;59;160;89;145;10;32;8;34;85;56;58;1;
recB;144;31;44;64;30;32;92;29;71;64;96;74;117;10;31;23;52;62;60;54;1;
recC;154;23;50;69;35;30;82;22;77;60;84;74;85;14;29;27;67;53;37;50;1;
rpoB;127;80;44;74;43;51;90;19;58;106;122;92;79;7;37;4;56;109;60;84;1;
rpoC;139;87;35;71;34;48;99;21;50;115;109;81;124;15;35;9;57;109;77;92;1;
sbcC;145;42;20;51;11;36;62;27;157;39;88;46;112;8;10;15;25;42;76;36;1;
  • cft bactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
lars;26;6;29;8;2;1;65;11;39;2;11;8;18;1;0;13;30;8;38;12;18;0;4;5;1;1;14;1;19;3;21;16;7;4;35;27;40;11;11;28;2;7;7;7;16;18;7;18;6;1;19;16;4;3;12;8;5;4;18;33;6;0;1;0;
iars;29;11;33;15;3;2;69;13;36;4;8;8;17;2;3;22;26;9;34;8;22;1;6;2;4;2;13;4;13;4;20;13;13;7;29;35;52;17;16;37;7;9;6;11;13;21;4;15;12;1;26;15;7;2;21;11;5;1;17;39;11;0;1;0;
carB;21;12;37;9;1;4;72;12;41;5;4;8;28;1;2;32;30;7;40;19;22;3;5;2;4;0;12;1;19;8;22;22;26;3;49;32;46;14;27;40;12;13;6;5;32;4;11;11;21;2;30;24;12;12;25;6;10;12;24;49;21;0;0;1;
ftsK;27;15;30;4;3;4;54;9;31;2;6;5;21;1;3;13;15;4;33;4;10;0;6;3;6;0;6;1;9;6;26;9;7;2;32;17;33;9;10;26;5;3;2;0;15;0;10;17;2;2;19;16;5;5;13;13;3;2;27;42;12;0;0;1;
rpoC;41;10;51;13;7;3;110;27;33;8;14;23;34;6;0;15;40;8;46;18;30;0;32;8;10;0;10;12;27;11;31;47;22;4;73;47;76;15;43;47;6;13;8;5;35;8;17;30;9;1;62;46;8;6;39;21;3;6;42;68;23;1;0;0;
rpoB;47;10;48;16;4;5;102;21;43;2;11;15;15;3;0;20;43;3;57;14;46;1;21;2;3;0;21;6;27;7;29;44;17;1;78;43;80;16;32;37;3;5;3;3;43;6;23;17;7;1;51;45;5;5;29;23;8;7;39;57;9;0;0;1;
recB;38;15;35;12;7;3;73;15;59;5;8;11;33;4;5;18;34;8;52;16;18;0;2;6;1;1;5;3;22;6;15;8;9;4;36;38;55;4;12;20;6;6;5;6;13;2;3;4;3;1;19;13;2;6;12;11;4;3;31;44;11;1;0;0;
secA;20;10;29;8;6;2;67;13;23;7;6;6;21;2;0;9;28;2;36;7;35;2;7;2;4;0;11;5;21;7;24;18;11;4;43;34;59;11;17;25;2;7;1;4;17;1;3;6;6;0;29;17;2;14;15;10;8;6;16;44;5;0;1;0;
dnaE;31;15;45;12;3;4;97;26;49;14;16;12;19;5;3;26;45;13;60;15;29;5;5;5;4;0;19;8;30;8;33;24;14;6;67;39;87;15;26;40;11;14;3;7;36;4;14;10;8;2;29;23;5;3;24;21;5;6;23;87;22;1;0;0;
mfd;43;19;37;16;5;4;75;14;42;5;11;14;33;2;2;22;20;9;49;9;28;2;4;7;1;0;14;2;19;5;14;17;13;3;41;26;62;11;18;26;5;6;2;5;17;2;8;3;7;0;26;20;3;9;23;5;8;4;24;53;16;0;0;1;
  • cft bactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
lars;72;76;41;51;38;50;29;15;22;48;62;51;48;14;16;18;32;42;29;57;1;
iars;93;82;40;60;35;42;37;17;17;53;64;69;69;17;13;21;32;50;38;67;1;
carB;84;84;46;75;37;59;36;13;27;73;81;60;92;11;32;4;45;78;53;94;1;
ftsK;83;63;33;49;19;37;25;7;15;44;49;42;44;2;15;0;31;45;31;81;1;
rpoC;125;137;41;92;48;64;80;22;38;104;120;91;109;13;35;8;57;122;69;133;1;
rpoB;130;123;45;64;46;71;73;27;34;91;121;96;77;6;43;6;48;106;67;105;1;
recB;110;88;64;79;42;68;28;8;28;36;74;59;44;11;13;2;11;40;30;86;1;
secA;75;80;30;44;30;43;50;16;28;57;77;70;51;5;17;1;15;62;39;65;1;
dnaE;110;123;63;81;58;75;48;27;38;77;106;102;91;10;36;4;34;60;56;132;1;
mfd;124;89;47;84;29;58;42;16;24;47;67;73;55;7;17;2;18;58;40;93;1;
  • bmv bactérie codons:
Protein;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
lars;0;1;1;0;35;27;2;49;3;28;0;0;0;16;4;6;3;36;0;28;1;0;1;1;38;6;3;10;2;26;0;4;62;5;13;38;10;48;2;2;69;30;0;10;32;23;0;1;33;12;1;1;42;29;1;0;29;9;2;0;29;0;0;1;
iars;0;4;1;0;44;38;3;45;2;33;0;0;0;33;2;9;7;30;0;25;0;0;1;1;53;6;9;21;7;22;1;1;66;4;22;44;11;47;1;1;79;24;1;10;17;22;0;1;35;11;0;0;27;28;0;1;39;16;1;0;39;1;0;0;
carB;1;3;1;1;39;45;3;53;2;29;0;0;0;43;3;9;7;26;0;27;0;0;6;1;52;5;0;15;2;31;0;3;80;3;17;71;16;50;1;2;89;18;0;15;30;4;1;0;50;5;0;0;47;44;0;1;47;16;1;0;69;1;0;0;
secA;0;4;3;0;40;33;1;38;2;24;0;0;0;26;2;9;2;25;4;29;0;1;5;0;51;12;6;26;4;50;0;2;64;4;26;63;17;37;2;1;74;20;1;4;24;7;0;1;21;4;2;0;31;27;0;2;34;11;3;0;52;0;0;1;
rpoC;0;5;3;1;77;45;1;85;1;41;0;0;0;60;3;3;1;29;2;44;0;1;34;0;64;4;1;17;5;51;0;20;92;1;56;59;21;58;8;2;92;19;0;13;35;6;0;0;54;3;1;0;74;48;0;0;53;27;8;0;84;1;0;0;
rpoB;0;6;1;1;65;52;0;78;2;48;0;1;1;54;6;10;7;32;4;44;0;0;23;0;69;7;2;22;6;47;0;13;87;3;66;44;12;87;6;2;70;20;3;2;37;6;0;3;47;7;4;0;61;57;0;1;42;21;8;0;71;1;0;0;
dnaE1;1;13;13;0;57;75;12;52;8;55;1;3;0;26;4;14;8;28;4;33;0;15;28;4;107;44;10;26;3;54;7;10;106;21;43;76;39;84;18;3;135;73;1;12;33;11;3;1;51;26;9;8;46;50;0;2;36;15;9;4;56;0;0;1;
ftsK;0;4;2;2;47;42;3;32;4;16;0;0;1;30;6;12;5;12;3;16;0;1;1;0;45;16;2;13;1;21;2;0;59;6;13;45;12;24;8;1;58;25;1;2;20;10;0;2;32;11;1;0;28;37;1;1;23;12;7;1;43;0;0;1;
mfd;0;2;4;0;61;61;1;38;0;50;0;1;0;23;7;17;6;24;3;16;0;1;0;0;76;18;4;32;5;49;2;1;67;6;23;56;16;58;2;0;117;30;0;7;20;6;0;1;48;14;0;0;52;21;0;1;36;18;0;0;56;0;1;0;
lhr;0;5;0;0;75;118;2;20;4;37;1;0;0;26;12;17;4;15;2;18;0;1;2;1;122;37;11;30;6;31;0;3;100;17;37;62;26;71;9;2;203;92;0;17;19;25;1;2;69;34;0;0;43;58;1;0;45;15;4;0;46;1;0;0;
recB;0;8;5;0;56;75;4;17;2;41;0;0;3;22;9;12;13;14;4;12;0;4;9;0;85;27;9;23;2;34;3;2;71;10;19;60;27;62;12;1;193;57;2;8;17;25;1;0;43;20;1;2;34;29;0;0;40;7;2;1;31;0;0;1;
recC;0;10;3;3;57;79;1;4;5;61;2;3;2;43;6;16;9;13;4;8;0;5;22;4;79;44;13;18;8;21;0;6;81;12;17;43;23;65;6;1;200;67;0;8;14;29;3;3;66;22;19;3;37;23;1;1;27;6;1;0;27;0;0;1;
  • bmv bactérie acides aminés:
Protein;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
lars;64;51;31;26;39;28;47;13;28;71;51;58;103;10;32;23;46;73;39;31;1;
iars;87;48;35;44;37;25;61;30;29;72;66;58;105;11;17;22;47;55;56;40;1;
carB;90;56;31;55;33;27;64;15;33;86;88;66;110;15;30;4;56;91;64;70;1;
secA;80;39;26;37;27;33;69;32;54;70;89;54;97;5;24;7;26;60;47;55;1;
rpoC;131;86;42;66;30;46;103;18;56;113;115;79;121;13;35;6;57;123;80;92;1;
rpoB;125;78;50;72;39;48;99;24;53;103;110;99;98;5;37;6;57;122;64;79;1;
dnaE1;159;64;63;48;36;37;198;36;57;144;119;123;229;13;33;11;81;113;53;69;1;
ftsK;97;35;20;49;17;19;63;15;22;67;58;36;92;3;20;10;45;66;37;51;1;
mfd;128;39;50;48;30;19;95;36;54;76;79;74;149;7;20;6;63;73;55;56;1;
lhr;198;22;41;56;19;20;163;41;37;120;99;97;306;17;19;25;106;101;61;50;1;
recB;144;21;43;46;27;16;125;32;36;86;79;89;263;10;17;25;64;66;47;34;1;
recC;152;5;66;72;22;12;154;31;29;99;60;88;274;8;14;29;94;82;35;28;1;

Autres bactéries compléments[modifier | modifier le wikicode]

Répétitions[modifier | modifier le wikicode]

  • aae bactérie
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
acnA; 1980; 49.5454545454545; 0; 5; 0; 1; 74; 133; 94; 115; 0; 9; 5; 1; 0
dnaE; 3486; 46.5002868617326; 3; 14; 2; 1; 138; 236; 114; 185; 4; 24; 7; 7; 0
gyrB; 2379; 46.9104665825977; 3; 9; 1; 0; 95; 147; 65; 145; 0; 17; 6; 7; 0
iars; 2871; 47.0567746429815; 5; 7; 2; 0; 116; 174; 97; 168; 5; 19; 9; 6; 0
metE; 2286; 45.2318460192476; 1; 6; 0; 0; 98; 151; 89; 115; 3; 25; 6; 1; 0
rpoB; 4407; 47.2203312911277; 1; 13; 2; 0; 180; 292; 155; 257; 0; 30; 13; 6; 0
rpoC; 4724; 47.0575783234547; 1; 5; 4; 1; 183; 340; 164; 255; 1; 36; 11; 3; 0
sbcC; 2937; 41.3687436159346; 2; 27; 0; 2; 121; 242; 67; 159; 5; 37; 0; 5; 0
secA; 2955; 44.7377326565144; 1; 10; 0; 0; 104; 236; 105; 151; 2; 36; 2; 8; 0
topA; 1623; 43.6845348120764; 2; 11; 0; 0; 64; 114; 52; 84; 4; 14; 3; 4; 0
  • amo bactérie
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
carB; 3129; 53.5314797059764; 4; 8; 4; 4; 129; 130; 152; 195; 11; 10; 10; 7; 0
dnaE; 3414; 49.4434680726421; 3; 9; 0; 0; 161; 163; 136; 218; 7; 8; 5; 12; 0
ftsK; 2322; 48.7941429801895; 5; 0; 0; 1; 107; 106; 99; 135; 6; 11; 6; 6; 0
iars; 2787; 50.8073196986006; 1; 3; 1; 2; 113; 140; 124; 165; 7; 7; 3; 7; 0
lars; 2472; 53.4385113268608; 7; 2; 0; 1; 97; 102; 123; 168; 6; 12; 5; 7; 0
mfd; 3132; 49.1060025542784; 5; 4; 2; 1; 145; 154; 111; 207; 2; 12; 3; 8; 0
rpoB; 3549; 54.043392504931; 2; 2; 4; 2; 133; 163; 169; 253; 3; 9; 7; 11; 0
rpoC; 4962; 52.9423619508263; 2; 6; 3; 4; 188; 240; 212; 332; 7; 9; 7; 11; 0
sbcC; 2673; 43.7710437710438; 3; 9; 0; 1; 146; 185; 77; 138; 8; 15; 3; 3; 0
secA; 2700; 49.1481481481481; 2; 9; 0; 4; 119; 137; 97; 151; 5; 13; 5; 7; 0
  • dal bactérie
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
acnA; 1923; 59.854394175767; 3; 3; 3; 1; 66; 63; 137; 157; 10; 6; 6; 5; 0
carB; 3201; 57.7319587628866; 3; 10; 2; 0; 109; 126; 216; 244; 8; 10; 6; 11; 0
dnaE; 3507; 53.3504419731965; 3; 17; 4; 1; 121; 165; 223; 223; 12; 19; 8; 7; 0
ftsK; 2181; 57.6341127922971; 2; 10; 0; 1; 68; 95; 150; 152; 5; 7; 15; 4; 0
iars; 2799; 58.3422650946767; 3; 7; 2; 0; 80; 123; 195; 190; 6; 9; 8; 4; 0
lars; 2592; 58.3719135802469; 1; 13; 2; 0; 65; 106; 161; 194; 4; 11; 10; 3; 0
pol1; 2670; 55.0561797752809; 4; 16; 0; 1; 73; 125; 187; 181; 11; 17; 7; 3; 0
rpoB; 4095; 57.7777777777778; 4; 9; 6; 1; 135; 181; 248; 294; 7; 17; 11; 8; 0
rpoC; 4479; 59.1203393614646; 3; 8; 6; 2; 123; 207; 295; 348; 8; 12; 8; 8; 0
sbcC; 3672; 51.6884531590414; 1; 30; 2; 2; 121; 214; 228; 243; 3; 41; 3; 2; 0
secA; 2526; 55.5819477434679; 1; 8; 1; 0; 78; 113; 151; 171; 8; 12; 3; 7; 0
  • hmr bactérie
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
acnA; 1992; 41.9176706827309; 0; 7; 0; 0; 110; 124; 62; 94; 1; 17; 1; 1; 0
carB; 3207; 40.0685999376364; 7; 15; 0; 1; 180; 187; 84; 143; 13; 16; 3; 6; 0
dnaE; 3402; 39.6531452087008; 9; 19; 0; 1; 172; 209; 88; 141; 13; 23; 3; 8; 0
ftsK; 2154; 39.4614670380687; 1; 12; 0; 0; 94; 131; 71; 89; 7; 26; 1; 4; 0
iars; 2793; 41.3533834586466; 4; 8; 1; 0; 155; 143; 69; 154; 11; 16; 5; 8; 0
lars; 2445; 40.9815950920245; 2; 12; 2; 0; 145; 127; 73; 128; 11; 18; 1; 7; 0
mfd; 3099; 35.94707970313; 16; 18; 0; 0; 173; 173; 64; 115; 22; 24; 1; 6; 0
rpoB; 4035; 38.8847583643123; 5; 16; 0; 1; 222; 256; 108; 200; 16; 32; 4; 5; 0
rpoC; 4563; 39.7326320403243; 1; 19; 0; 0; 250; 295; 116; 228; 18; 27; 1; 7; 0
secA; 2409; 39.3939393939394; 5; 11; 0; 2; 142; 138; 50; 121; 6; 23; 3; 1; 0
  • hth bactérie
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
acnA; 1983; 47.2012102874433; 1; 6; 2; 1; 77; 101; 77; 123; 4; 7; 3; 3; 0
cox1; 1644; 47.2627737226277; 2; 1; 1; 1; 75; 68; 81; 99; 10; 4; 3; 3; 0
dnaE; 3468; 43.8581314878893; 5; 16; 0; 2; 159; 181; 108; 201; 16; 20; 4; 4; 0
gyrB; 2361; 44.2609063955951; 1; 10; 1; 2; 90; 128; 68; 127; 7; 18; 1; 3; 0
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  • lfc bactérie
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  • mrb bactérie
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  • msv bactérie
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  • nse bactérie
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  • pmh bactérie
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  • tai bactérie
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  • tli bactérie
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  • tma bactérie
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  • tme bactérie
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  • tsc bactérie
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
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dnaE; 4941; 65.5332928556972; 3; 2; 13; 25; 143; 125; 399; 422; 13; 3; 19; 36; 0
ftsK; 2604; 66.3978494623656; 0; 0; 10; 11; 71; 83; 246; 192; 5; 9; 30; 13; 0
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lars; 2652; 64.6681749622926; 2; 0; 7; 9; 56; 79; 198; 226; 4; 9; 22; 18; 0
mfd; 2943; 64.9677200135916; 3; 2; 9; 7; 94; 56; 231; 260; 9; 8; 20; 28; 0
rpoB; 3360; 66.7559523809524; 0; 0; 13; 13; 76; 83; 256; 284; 6; 2; 25; 24; 0
rpoC; 4593; 66.231221423906; 0; 1; 15; 14; 83; 145; 344; 396; 5; 5; 24; 34; 0
sbcC; 2931; 66.9737291026953; 2; 6; 3; 17; 79; 82; 201; 335; 9; 3; 8; 22; 0
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Codons[modifier | modifier le wikicode]

  • aae bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
acnA;5;4;7;6;6;29;18;31;3;20;2;4;2;2;15;2;1;17;2;23;12;0;0;18;0;0;0;15;3;8;33;14;8;3;39;23;5;23;17;14;17;8;6;1;16;5;3;10;7;22;21;19;4;3;6;3;13;8;5;41;7;0;0;1;
dnaE;11;3;30;9;17;56;56;81;17;36;4;5;6;4;11;7;7;50;3;42;16;0;0;22;1;0;0;20;7;22;43;15;7;8;77;42;18;52;20;18;21;15;3;2;25;9;4;7;7;25;30;15;20;15;7;8;18;20;11;48;8;0;1;0;
gyrB;6;0;18;6;8;34;30;49;18;14;5;3;1;3;10;6;3;28;6;17;13;1;1;32;3;1;1;16;2;14;30;13;9;5;49;39;11;36;12;15;14;8;2;2;14;3;5;5;1;13;22;21;18;6;9;5;10;10;8;42;6;1;0;0;
iars;16;0;21;7;15;33;29;63;23;22;4;3;4;4;14;10;4;39;8;25;20;0;1;22;4;0;2;23;3;18;30;11;8;9;60;47;14;33;15;13;12;5;7;10;13;22;8;7;3;28;30;22;17;9;4;10;7;11;10;34;10;0;1;0;
metE;6;0;23;12;8;33;31;38;17;15;4;10;0;3;9;7;0;34;6;24;21;0;2;20;1;0;0;10;5;9;16;10;6;6;63;30;9;27;13;13;3;11;1;2;17;12;3;9;7;19;23;13;7;10;0;9;7;15;9;40;3;0;0;1;
rpoB;8;0;28;15;16;66;47;87;20;39;9;8;5;3;19;7;6;45;8;36;34;0;3;62;1;0;3;20;13;22;58;27;12;6;99;51;21;72;28;15;24;14;8;2;23;8;5;17;8;43;46;45;9;17;13;16;24;20;13;73;21;0;0;1;
rpoC;4;2;32;14;17;70;51;90;21;31;11;11;2;0;29;10;5;45;4;43;49;1;5;43;1;0;0;27;11;33;57;43;12;5;120;54;10;67;23;27;25;14;5;11;24;12;8;10;7;48;51;43;13;14;20;13;20;20;23;81;32;1;0;0;
sbcC;29;6;24;6;21;41;70;78;18;15;11;6;8;3;12;19;2;33;12;14;20;0;2;41;0;1;1;11;12;16;23;3;2;8;132;54;8;21;11;9;11;8;1;1;7;1;4;4;3;4;20;17;12;6;2;7;13;8;13;29;4;1;0;0;
secA;16;2;21;9;14;48;51;51;16;11;3;8;2;0;7;5;4;22;5;36;27;0;0;40;0;0;2;24;8;23;41;4;10;4;99;33;12;37;12;15;10;17;0;0;17;8;8;3;8;9;28;28;11;8;13;5;13;11;10;42;13;0;0;1;
topA;8;7;10;1;8;23;28;41;14;9;2;4;5;4;3;5;4;28;3;9;18;0;1;18;1;0;0;3;1;11;16;3;3;4;47;16;8;9;10;4;5;11;1;0;11;4;7;6;3;7;12;9;11;4;2;7;8;11;7;21;4;0;1;0;
  • aae bactérie acides aminés
Gène;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
acnA;57;49;23;27;18;25;30;15;11;58;62;28;56;7;16;5;42;47;30;53;1;
dnaE;126;137;53;37;57;45;39;20;29;73;119;70;74;5;25;9;43;80;53;67;1;
gyrB;72;79;32;28;31;23;51;17;16;57;88;47;49;4;14;3;24;67;34;56;1;
iars;92;92;45;39;43;33;47;25;21;58;107;47;45;17;13;22;46;78;32;54;1;
metE;82;69;32;33;34;30;44;10;14;38;93;36;40;3;17;12;38;53;31;52;1;
rpoB;133;134;59;51;51;44;100;23;35;103;150;93;81;10;23;8;73;117;73;107;1;
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topA;57;69;23;23;32;12;38;3;12;26;63;17;30;1;11;4;23;36;28;32;1;
  • amo bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
carB;7;20;37;5;21;8;26;37;24;17;10;10;4;13;16;18;12;13;7;18;6;4;7;19;12;4;9;12;8;19;26;14;43;14;34;43;28;22;22;18;14;52;2;15;18;7;14;7;9;25;13;16;17;30;2;8;17;18;12;32;27;1;0;0;
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ftsK;9;25;19;12;17;11;16;22;26;8;6;3;5;13;8;11;9;12;11;8;12;5;3;21;4;3;4;3;6;13;15;8;17;14;33;20;30;19;14;13;10;27;3;2;21;5;11;10;10;16;13;13;15;11;6;6;13;11;13;31;18;0;0;1;
iars;8;20;22;4;20;12;27;38;15;23;9;7;0;5;14;21;18;21;4;17;9;5;1;22;12;0;9;12;13;11;23;3;18;9;29;42;25;43;16;7;8;29;2;18;21;29;5;16;11;14;8;15;19;16;4;7;21;13;9;28;21;0;1;0;
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secA;11;30;20;4;19;9;22;40;12;13;6;4;0;7;10;14;13;16;13;17;6;7;5;30;14;1;14;10;12;18;15;13;22;14;48;41;29;30;14;17;12;30;7;4;26;3;1;8;1;13;16;10;19;14;7;2;9;13;12;33;19;1;0;0;
  • amo bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
carB;98;63;41;71;25;25;52;21;27;97;77;50;106;17;18;7;55;76;45;71;1;
dnaE;121;75;46;68;47;40;60;22;39;84;99;66;88;15;28;6;45;83;31;74;1;
ftsK;93;38;34;46;21;19;48;7;19;54;53;49;64;5;21;5;47;52;36;62;1;
iars;86;65;38;56;39;21;49;21;24;53;71;68;60;20;21;29;46;58;45;58;1;
lars;68;45;39;33;29;27;57;17;24;55;71;47;53;18;22;25;50;57;39;47;1;
mfd;117;63;34;60;37;23;77;18;45;76;77;70;73;6;25;18;46;72;34;72;1;
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rpoC;175;109;39;79;40;43;122;26;61;125;144;107;107;19;37;11;72;139;63;135;1;
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  • dal bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
acnA;2;16;11;1;23;7;9;19;15;7;1;0;1;3;17;13;7;6;6;16;3;0;1;8;7;14;7;5;2;16;13;1;43;8;17;19;13;25;5;7;15;37;0;8;16;3;2;3;10;26;12;1;24;10;0;0;16;23;18;5;17;0;1;0;
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ftsK;6;17;9;1;33;8;25;25;8;13;3;2;2;5;22;7;5;13;4;19;1;0;4;7;18;5;2;5;8;17;13;5;35;7;34;14;6;26;1;10;13;55;2;4;21;6;4;8;12;21;4;5;28;16;2;0;10;21;19;8;22;1;0;0;
iars;1;10;8;1;50;9;21;44;16;23;4;1;1;4;30;9;6;29;8;23;3;0;6;3;26;13;7;18;7;19;7;2;44;3;41;32;14;52;3;5;25;51;3;20;21;21;1;6;7;24;11;5;38;17;3;2;5;24;13;1;31;1;0;0;
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pol1;3;13;9;1;48;13;32;38;16;21;4;0;0;6;21;12;9;19;7;27;2;0;1;6;15;7;4;14;14;27;4;2;37;8;54;26;11;36;3;7;16;48;0;3;32;5;0;8;14;19;8;4;24;21;2;1;15;37;15;4;36;1;0;0;
rpoB;2;22;21;0;62;24;28;60;15;33;7;1;2;14;33;16;12;20;4;32;6;2;12;18;40;17;9;12;10;46;6;6;78;11;83;39;20;70;3;8;25;50;1;4;39;3;0;12;10;41;20;5;58;42;4;1;20;43;29;5;48;1;0;0;
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sbcC;16;26;17;9;67;14;79;61;11;14;5;9;3;7;42;33;6;10;26;27;3;3;5;8;21;25;10;9;41;30;12;5;36;9;93;50;35;34;11;16;24;68;3;14;11;6;0;4;8;11;5;3;12;12;5;3;10;30;19;7;30;0;0;1;
secA;1;17;8;2;27;10;20;39;11;14;1;0;1;3;23;7;8;22;6;25;2;2;8;5;21;14;10;16;3;35;1;4;55;5;52;28;11;52;6;6;9;29;0;5;28;5;1;5;5;11;11;4;26;19;3;1;12;26;19;3;38;0;1;0;
  • dal bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
acnA;60;28;22;35;13;22;33;12;18;65;36;38;64;8;16;3;41;47;39;40;1;
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  • hmr bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
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  • hmr bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
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  • hth bactérie codons
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  • hth bactérie acides aminés
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  • lfc bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
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  • lfc bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
acnA;58;34;23;43;16;23;33;13;20;65;34;36;53;5;17;0;33;48;41;45;1;
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ftsK;99;39;21;74;11;20;44;11;25;49;39;38;48;2;23;7;60;42;42;55;1;
iars;104;45;37;70;24;28;61;32;23;72;74;52;67;16;25;23;63;50;51;53;1;
lars;94;48;35;42;23;28;47;24;35;60;55;48;50;10;18;19;48;54;53;37;1;
pol1;117;38;26;95;19;20;57;22;24;60;58;53;52;2;16;9;51;64;39;46;1;
rpoB;191;120;59;123;47;75;103;30;59;112;150;91;88;2;33;7;86;128;94;121;1;
rpoC;131;119;51;96;30;71;109;26;59;121;144;85;97;13;37;9;66;123;70;126;1;
secA;95;55;35;49;28;36;55;32;30;70;87;63;58;4;28;8;28;57;37;56;1;
  • mrb bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
carB;0;1;5;1;70;32;20;28;8;20;0;0;0;12;22;20;7;30;2;19;0;2;2;6;31;17;1;15;1;26;1;5;56;23;25;73;15;29;5;9;22;71;0;4;19;10;1;3;13;48;5;3;55;17;0;0;6;59;19;2;42;1;0;0;
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ftsK;6;15;9;6;72;34;20;17;12;17;1;1;1;11;7;20;2;13;1;14;2;2;1;6;38;19;3;19;5;27;1;9;45;19;21;44;7;31;6;8;23;78;0;0;15;9;6;5;16;40;5;6;36;13;0;2;5;38;12;0;21;0;1;0;
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  • mrb bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
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  • msv bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
carB;3;11;7;4;36;41;16;31;8;19;4;0;1;11;19;18;4;32;3;20;1;4;2;1;32;23;6;7;8;29;10;7;32;32;24;71;6;38;7;11;13;67;0;4;20;10;2;7;13;39;4;10;55;14;4;0;8;55;6;0;60;0;1;0;
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  • msv bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
carB;102;47;27;53;36;23;63;13;37;81;95;44;98;4;20;10;61;83;67;66;1;
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  • nse bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
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  • nse bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
acnA;82;64;27;65;32;41;44;16;31;63;63;51;52;15;14;7;37;81;58;62;1;
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ftsK;90;78;26;73;20;22;32;16;18;41;71;28;51;8;21;3;39;53;45;74;1;
iars;94;81;57;81;45;52;51;25;26;52;86;54;57;13;24;21;39;69;50;68;1;
lars;75;68;45;67;35;45;35;19;25;53;64;33;48;23;14;15;35;59;34;59;1;
pol1;102;70;33;54;29;52;32;22;34;38;57;41;46;7;16;1;33;40;51;71;1;
rpoB;126;82;61;88;48;51;84;23;33;105;100;94;87;23;33;8;43;135;51;83;1;
rpoC;123;93;45;97;44;49;87;23;38;111;94;73;93;20;33;6;48;129;65;104;1;
secA;82;64;28;54;24;43;50;26;34;41;75;44;55;4;23;4;11;39;37;66;1;
  • pmh bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
carB;49;22;23;10;1;3;56;17;37;6;30;34;10;6;4;5;29;5;54;11;24;0;6;8;0;0;10;1;24;11;29;28;7;6;67;23;45;9;29;36;6;7;14;2;19;5;18;24;3;3;34;19;5;3;24;25;2;5;66;27;12;0;1;0;
dnaE;46;23;40;17;1;3;76;28;39;8;42;21;15;2;4;5;31;7;58;12;33;5;3;8;0;0;14;6;30;7;28;24;7;8;43;22;80;13;21;24;8;3;9;6;27;5;14;19;2;2;46;17;6;6;17;14;5;8;53;34;10;0;1;0;
gyrB;26;11;11;7;1;2;37;9;20;2;14;14;7;1;2;5;20;5;28;7;26;4;0;10;1;0;10;3;13;6;30;21;6;4;46;10;31;6;15;16;3;2;5;1;12;3;8;5;3;2;23;12;2;4;17;12;3;1;32;16;2;0;0;1;
iars;42;8;21;11;5;5;71;13;38;4;24;21;15;9;3;6;33;8;59;10;28;2;3;7;0;0;18;3;27;8;21;19;10;6;52;8;50;5;23;10;5;2;12;2;12;28;17;13;3;2;40;13;3;5;12;17;1;3;42;18;9;1;0;0;
lars;43;10;12;7;0;2;64;19;29;4;16;23;8;2;4;1;31;4;67;7;15;0;2;7;0;1;11;2;24;2;19;11;2;3;45;17;46;7;16;20;1;7;9;1;16;23;16;14;2;4;23;14;6;1;17;16;1;5;43;32;2;1;0;0;
pol1;45;13;32;20;3;5;80;21;36;15;15;21;18;0;2;9;20;4;53;10;24;0;1;9;0;1;11;3;21;9;22;24;5;7;62;19;48;16;19;14;6;6;3;3;12;4;19;12;2;2;22;17;4;4;16;17;3;11;39;21;16;1;0;0;
recB;70;16;27;12;3;9;105;33;70;11;32;22;24;6;5;3;45;6;125;15;22;2;1;6;0;0;20;2;32;4;17;11;3;1;66;14;76;1;9;8;3;1;11;6;4;15;14;6;1;1;13;17;1;5;18;9;1;7;86;47;8;0;1;0;
rpoB;44;13;29;11;4;4;48;9;23;6;22;14;7;4;3;9;25;12;41;11;46;7;4;19;1;0;16;6;33;16;31;32;12;12;68;22;57;13;23;25;4;10;3;3;23;7;22;27;6;9;44;27;9;11;22;15;3;8;36;16;10;1;0;0;
rpoC;50;30;22;11;2;6;70;18;22;8;38;35;24;3;8;3;19;2;54;8;43;5;8;18;0;0;16;2;45;13;40;43;12;4;90;25;83;9;33;37;6;9;10;2;19;8;15;25;4;7;66;35;7;9;48;30;4;10;49;27;17;1;0;0;
secA;47;18;24;10;2;2;61;21;24;5;16;17;14;0;5;0;27;5;41;5;38;3;4;10;2;0;11;2;32;11;23;22;4;4;70;22;56;6;19;25;4;4;5;2;24;8;9;20;1;1;31;14;6;6;24;13;2;3;36;16;6;1;0;0;
  • pmh bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
carB;108;73;43;89;34;65;38;11;35;70;90;54;78;16;19;5;48;61;56;105;1;
dnaE;130;104;47;89;38;70;49;20;37;67;65;93;56;15;27;5;37;75;44;97;1;
gyrB;58;46;22;43;25;35;41;13;19;61;56;37;36;6;12;3;18;41;33;50;1;
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pol1;118;101;51;65;24;63;35;14;30;58;81;64;45;6;12;4;35;47;47;76;1;
recB;137;138;81;92;51;140;31;22;36;32;80;77;21;17;4;15;22;36;35;141;1;
rpoB;105;57;29;59;37;52;77;22;49;87;90;70;62;6;23;7;64;91;48;62;1;
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secA;103;82;29;52;32;46;57;13;43;53;92;62;52;7;24;8;31;57;42;58;1;
  • tli bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
acnA;4;12;10;3;12;13;16;17;13;12;5;7;3;3;15;11;1;10;6;14;5;6;2;12;3;3;7;11;7;10;15;11;21;11;28;18;9;22;11;13;8;23;2;6;17;3;15;10;4;13;9;16;11;10;3;3;8;18;8;34;11;1;0;0;
carB;5;29;25;8;16;6;31;30;21;17;12;12;8;9;18;17;12;11;20;13;18;5;2;22;4;3;7;6;12;10;31;25;27;15;33;54;42;12;11;34;18;29;7;8;19;12;8;23;5;18;32;18;30;15;11;7;7;15;17;46;12;0;0;1;
dnaE;17;36;33;8;18;10;38;40;21;18;17;11;8;9;14;14;20;20;23;14;21;3;4;25;6;2;15;13;13;24;25;21;9;17;41;56;41;33;20;26;17;28;14;6;25;8;13;14;6;16;17;18;35;18;8;4;7;10;19;42;8;1;0;0;
ftsK;16;21;23;15;10;6;27;23;20;15;8;11;9;2;6;11;13;6;11;11;13;0;4;13;5;3;9;6;19;12;18;7;8;9;41;9;23;11;21;20;5;15;2;5;17;3;13;16;4;11;20;16;12;5;12;10;6;10;10;34;14;0;0;1;
iars;14;27;20;9;9;6;32;34;22;14;14;5;8;4;18;9;23;12;18;9;22;3;6;19;3;2;13;8;12;12;19;15;10;8;47;41;44;14;21;12;11;12;15;7;18;26;9;18;9;8;23;15;25;5;11;11;4;14;14;27;10;0;0;1;
lars;4;29;16;6;5;7;25;39;16;18;6;5;4;6;5;6;11;13;16;24;11;3;2;25;6;2;9;7;8;12;19;12;11;11;32;46;28;18;13;12;8;15;7;9;20;26;4;15;7;17;15;13;32;13;6;7;5;15;10;27;7;1;0;0;
pol1;12;32;23;4;14;7;40;27;16;16;10;4;13;5;11;13;16;10;10;14;22;4;1;19;3;1;4;8;14;5;24;13;8;14;41;45;38;8;7;22;10;16;6;2;17;7;7;20;5;6;30;14;16;9;12;10;8;7;16;26;7;0;1;0;
rpoB;7;33;31;6;14;14;16;48;17;18;19;6;5;9;11;10;16;17;17;29;23;6;8;35;9;4;5;10;8;28;26;37;21;18;48;72;56;31;15;15;15;25;4;0;26;10;11;24;9;13;29;27;33;20;19;5;8;20;20;44;11;1;0;0;
rpoC;7;57;33;11;39;21;51;66;19;24;14;11;17;9;19;23;21;18;18;33;29;10;7;48;15;7;16;11;21;39;38;44;25;19;63;93;64;36;26;31;26;31;8;6;30;10;13;29;10;12;46;25;45;37;13;11;22;19;21;75;19;0;1;0;
secA;8;25;26;11;13;8;27;37;11;17;8;8;9;6;7;5;19;9;15;17;22;9;4;25;5;4;15;9;12;19;20;18;15;15;51;52;32;17;8;26;7;17;5;2;21;3;4;7;4;10;19;13;14;17;8;6;6;10;7;41;10;0;1;0;
  • tli bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
acnA;54;33;25;44;11;20;31;18;17;58;46;31;55;8;17;3;42;46;32;53;1;
carB;89;61;38;76;23;33;54;13;22;98;87;54;92;15;19;12;54;95;40;75;1;
dnaE;122;78;39;73;40;37;61;28;37;72;97;74;91;20;25;8;49;88;29;69;1;
ftsK;91;50;35;47;19;22;38;15;31;42;50;34;61;7;17;3;44;53;38;58;1;
iars;85;66;36;58;35;27;55;21;24;52;88;58;56;22;18;26;44;68;40;51;1;
lars;67;64;34;32;24;40;49;16;20;53;78;46;48;16;20;26;43;73;33;44;1;
pol1;92;67;32;56;26;24;50;12;19;59;86;46;55;8;17;7;38;69;37;49;1;
rpoB;105;64;35;60;33;46;85;15;36;102;120;87;70;4;26;10;57;109;52;75;1;
rpoC;168;117;43;93;39;51;116;27;60;126;156;100;114;14;30;10;64;153;65;115;1;
secA;91;64;28;43;28;32;69;24;31;68;103;49;58;7;21;3;25;63;30;58;1;
  • tai bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
dnaE;4;16;23;3;56;19;3;54;7;30;2;1;2;10;37;16;5;34;2;24;3;9;3;47;4;18;4;19;2;26;7;16;27;38;4;88;32;48;2;4;28;50;5;14;34;10;2;5;19;28;16;4;52;22;2;0;4;23;3;45;17;0;1;0;
rpoB;1;6;10;0;62;29;2;50;4;40;2;1;2;6;30;21;1;28;1;35;2;2;9;28;9;54;1;21;0;38;4;14;35;51;3;109;16;76;0;2;17;53;1;3;26;8;2;4;15;35;7;3;74;32;0;0;5;48;1;26;36;1;0;0;
rpoC;1;11;16;7;93;38;1;86;3;39;3;0;1;18;48;25;3;34;1;39;0;1;11;39;11;84;1;23;1;54;7;24;49;57;0;143;16;88;1;6;44;60;3;19;35;11;1;3;24;45;12;2;105;46;1;1;5;51;2;58;40;0;0;1;
iars;0;2;16;4;43;26;2;45;3;37;2;2;2;5;35;13;6;23;0;13;1;2;3;21;7;33;9;12;3;32;6;9;22;29;3;64;16;54;1;4;22;34;4;16;21;25;2;1;10;33;8;1;41;23;0;1;5;27;3;17;23;0;1;0;
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ftsK;1;9;9;7;45;28;2;19;1;21;4;1;2;6;26;9;1;8;3;13;3;4;3;27;3;17;4;4;3;15;10;4;19;40;4;47;15;27;5;5;17;33;2;5;19;9;3;6;13;35;6;4;34;13;1;0;9;21;3;20;17;0;1;0;
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secA;0;4;6;1;53;26;2;44;0;32;1;1;1;9;26;6;1;21;1;22;0;4;5;25;12;36;2;22;2;27;3;9;30;37;1;86;13;43;0;5;21;41;3;8;25;5;0;2;8;17;11;1;38;12;1;1;4;21;1;15;27;0;1;0;
carB;0;21;19;5;58;20;0;15;2;33;3;1;0;12;33;15;1;8;1;14;0;0;4;37;6;43;1;10;0;16;8;14;24;89;1;78;9;49;2;3;37;46;8;11;29;14;0;7;23;34;12;0;84;26;1;0;2;25;0;16;19;0;0;1;
acnA;0;5;4;1;35;9;2;16;0;24;2;1;2;5;16;7;1;11;1;16;1;3;2;17;10;14;2;16;1;19;7;9;26;27;2;38;9;27;1;4;12;36;3;6;15;1;3;3;10;27;13;3;39;17;2;0;6;23;1;15;16;0;1;0;
  • tai bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
dnaE;121;57;37;68;39;26;84;23;28;88;92;80;84;19;34;10;54;94;29;65;1;
rpoB;108;52;44;62;29;36;104;22;38;104;112;92;72;4;26;8;56;116;53;63;1;
rpoC;166;87;42;95;37;40;146;24;55;137;143;104;111;22;35;11;73;165;58;100;1;
iars;91;47;40;59;29;13;67;21;35;66;67;70;61;20;21;25;46;73;33;43;1;
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ftsK;99;21;22;48;9;16;57;8;18;73;51;42;60;7;19;9;57;57;31;40;1;
mfd;121;19;33;68;20;5;102;18;35;90;77;51;83;7;26;19;59;92;28;41;1;
secA;90;46;32;44;22;23;82;24;29;79;87;56;67;11;25;5;27;62;27;43;1;
carB;123;15;35;64;9;15;90;11;16;135;79;58;88;19;29;14;64;122;28;35;1;
acnA;54;18;24;33;12;17;47;18;20;69;40;36;53;9;15;1;43;72;31;32;1;
  • tma bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
carB;0;8;19;1;25;40;31;44;6;31;5;9;5;10;21;5;4;31;5;23;33;0;0;20;1;1;3;8;2;20;46;17;13;4;65;48;23;29;28;14;26;28;3;2;27;8;14;9;17;20;25;9;50;21;6;13;16;24;8;40;35;0;0;1;
dnaE;2;9;21;7;21;30;46;21;13;27;13;7;4;5;7;9;11;22;5;28;32;4;3;15;2;0;6;11;5;13;19;16;11;3;62;16;24;20;10;3;10;18;1;3;14;4;10;12;7;13;27;6;25;15;2;14;10;9;10;19;30;0;1;0;
iars;1;7;17;2;21;28;46;35;9;27;12;5;1;7;16;6;1;40;6;17;31;3;2;12;2;2;7;20;4;14;27;15;4;2;73;26;27;28;12;9;8;11;11;6;18;20;8;7;9;18;18;12;30;16;6;13;13;8;6;26;31;0;0;1;
lars;1;6;18;0;13;25;32;40;5;31;8;1;5;4;9;7;6;32;7;22;23;1;1;16;0;1;2;15;1;24;26;17;6;3;49;34;22;21;8;6;8;16;5;4;16;21;10;12;15;11;13;11;26;19;5;11;8;14;10;23;18;0;0;1;
metE;0;4;18;1;21;23;31;29;11;32;6;5;4;8;8;5;6;24;10;24;23;1;1;10;4;0;1;9;3;12;12;12;9;2;66;27;13;16;6;12;13;10;2;5;17;13;13;8;8;9;15;6;22;7;6;7;6;10;9;18;21;0;0;1;
mfd;2;15;20;5;32;27;39;32;17;26;12;7;4;8;8;7;7;23;7;20;35;5;5;16;7;3;2;11;9;13;25;20;3;6;64;32;35;18;10;5;9;10;3;0;18;2;12;10;12;7;32;8;24;12;5;11;2;12;14;24;24;0;0;1;
rpoB;1;9;29;4;28;54;47;33;14;30;19;8;7;9;16;7;15;41;18;36;44;6;3;27;4;1;3;16;5;23;49;26;12;6;89;33;46;34;16;19;17;18;2;1;26;7;11;15;12;22;41;9;32;22;9;14;17;12;17;42;30;0;0;1;
rpoC;2;17;30;2;34;62;71;79;11;42;16;5;7;13;22;17;10;49;10;47;61;2;3;24;2;0;3;20;4;39;51;40;17;6;114;52;56;33;23;21;43;23;10;2;37;15;19;17;22;16;41;8;59;35;12;30;26;24;28;56;50;0;0;1;
sbcC;1;13;22;2;38;36;61;39;7;26;7;6;7;9;14;11;8;9;11;23;31;5;3;24;1;3;3;6;8;17;17;9;2;10;88;53;24;13;4;8;10;12;1;1;6;3;3;6;2;1;17;4;15;7;3;5;10;7;10;23;27;0;0;1;
secA;0;7;16;1;26;30;45;39;6;30;10;2;6;5;10;8;7;26;8;25;36;1;1;13;5;0;7;11;6;19;25;21;6;5;64;26;36;16;5;8;12;23;2;1;26;7;3;7;5;6;21;5;26;16;2;6;11;13;9;25;27;0;0;1;
  • tma bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
carB;93;75;37;55;35;28;55;11;22;80;113;52;96;5;27;8;60;105;59;83;1;
dnaE;90;67;40;45;33;33;56;17;18;49;78;44;41;4;14;4;42;73;35;59;1;
iars;76;81;36;47;41;23;52;27;18;48;99;55;40;17;18;20;42;76;40;63;1;
lars;63;72;36;34;38;29;42;17;25;52;83;43;38;9;16;21;48;69;38;51;1;
metE;67;60;43;36;30;34;39;10;15;35;93;29;41;7;17;13;38;50;29;48;1;
mfd;101;71;43;46;30;27;71;13;22;54;96;53;34;3;18;2;41;76;30;62;1;
rpoB;125;80;44;66;56;54;85;19;28;93;122;80;70;3;26;7;60;104;52;89;1;
rpoC;147;150;53;80;59;57;92;23;43;114;166;89;110;12;37;15;74;143;92;134;1;
sbcC;112;100;33;54;17;34;67;9;25;38;141;37;34;2;6;3;12;43;25;60;1;
secA;80;84;36;41;33;33;56;18;25;57;90;52;48;3;26;7;21;68;32;61;1;
  • tme bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
dnaE;36;8;19;17;0;4;102;10;34;11;8;21;12;3;8;3;21;20;32;23;13;2;3;3;0;0;4;6;9;1;17;18;2;1;57;10;25;11;20;7;1;5;7;1;8;3;16;6;4;5;7;24;3;4;7;17;2;4;31;59;8;1;0;0;
gyrB;25;9;15;1;1;3;40;20;27;1;13;4;14;1;0;2;16;7;16;6;20;1;1;10;0;0;9;4;9;9;25;17;0;6;49;13;35;2;20;8;3;0;3;0;12;3;6;8;1;0;28;9;7;2;14;11;8;3;21;26;3;1;0;0;
iars;23;13;15;14;1;3;75;16;25;7;12;12;7;2;6;2;25;20;24;14;26;0;1;8;1;0;13;12;19;2;26;17;4;5;75;9;47;7;23;10;3;6;12;4;17;21;24;10;1;4;30;33;8;3;9;19;7;7;30;32;7;1;0;0;
lars;32;12;18;4;0;1;60;24;29;3;9;9;9;4;0;2;28;13;34;6;17;0;1;13;1;0;9;2;16;4;21;19;3;5;60;14;44;4;19;11;8;3;8;1;20;20;20;18;0;3;30;23;6;1;11;16;7;2;31;32;3;0;1;0;
mfd;31;9;26;18;0;3;85;9;29;11;4;25;13;4;4;0;24;9;37;20;29;2;1;11;0;0;7;7;27;0;23;15;7;4;72;8;36;8;24;5;1;6;0;1;15;2;20;10;2;1;24;27;1;1;16;19;1;3;50;47;7;0;1;0;
pol1;44;23;20;3;5;1;68;29;43;3;16;10;14;4;2;3;34;10;39;7;21;3;0;9;0;0;10;1;19;5;16;22;0;5;56;33;42;5;18;14;5;2;3;1;18;3;12;8;1;2;33;19;7;1;16;18;3;3;35;35;8;0;0;1;
rpoB;33;18;41;5;2;6;65;23;32;10;18;13;13;2;4;3;31;11;35;22;46;1;4;18;0;0;9;13;23;5;33;35;2;14;96;16;48;13;36;10;6;5;3;0;25;7;36;16;3;3;44;33;13;5;14;33;10;9;45;44;9;1;0;0;
rpoC;40;25;48;18;3;3;100;52;36;12;20;24;23;8;7;5;38;23;39;18;56;2;3;21;1;0;22;9;34;8;42;49;3;18;121;26;86;17;49;28;9;4;12;0;33;8;37;25;5;4;53;55;25;9;19;51;13;9;54;75;12;1;0;0;
secA;31;15;24;4;1;4;64;29;25;7;11;2;10;1;0;3;23;11;27;14;36;2;1;15;0;0;15;2;16;5;18;16;4;10;73;21;44;5;23;13;6;0;3;1;21;5;10;7;4;0;26;19;13;4;11;25;2;3;30;37;1;0;0;1;
topA;15;5;12;4;2;5;97;14;22;6;10;16;6;1;3;2;13;14;22;11;15;1;1;6;1;0;5;1;11;3;22;6;1;5;63;8;16;11;21;8;5;4;11;3;10;7;12;5;1;6;18;16;5;1;10;23;1;8;18;39;8;0;0;1;
  • tme bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
dnaE;84;112;45;55;41;55;21;10;10;38;67;36;33;8;8;3;31;38;30;98;1;
gyrB;54;60;28;34;23;22;32;13;18;48;62;37;31;3;12;3;15;46;36;50;1;
iars;69;91;32;41;45;38;36;25;21;52;84;54;42;16;17;21;39;74;42;69;1;
lars;67;84;32;33;41;40;32;11;20;48;74;48;41;9;20;20;41;60;36;66;1;
mfd;87;94;40;50;33;57;43;14;27;49;80;44;36;1;15;2;33;53;39;104;1;
pol1;96;97;46;49;44;46;33;11;24;43;89;47;39;4;18;3;23;60;40;78;1;
rpoB;105;88;42;53;42;57;69;22;28;84;112;61;57;3;25;7;58;95;66;98;1;
rpoC;137;152;48;87;61;57;83;31;42;112;147;103;90;12;33;8;71;142;92;141;1;
secA;79;93;32;27;34;41;54;17;21;48;94;49;42;4;21;5;21;62;41;68;1;
topA;43;111;28;38;27;33;24;6;14;34;71;27;38;14;10;7;24;40;42;65;1;
  • tsc bactérie codons
Géne;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga;
dnaE;2;24;50;4;81;55;9;63;25;40;2;1;1;6;34;19;7;51;0;23;0;3;5;29;52;58;12;24;4;32;15;10;55;67;26;141;9;68;3;10;33;117;0;5;32;15;5;10;13;61;9;3;86;19;0;1;12;45;4;6;50;0;1;0;
rpoB;1;12;19;1;53;33;2;48;9;35;0;0;0;0;30;11;4;26;0;25;0;1;5;10;45;42;1;16;2;33;2;9;52;40;6;95;15;57;1;3;15;62;0;2;23;2;1;4;17;47;7;1;74;15;1;0;3;43;2;1;55;1;0;0;
rpoC;2;17;19;0;60;66;2;97;7;35;1;0;2;4;34;20;3;43;0;27;0;0;5;11;67;39;2;22;2;55;8;5;55;50;24;134;17;59;2;5;34;82;0;11;26;10;0;5;17;58;7;0;112;32;1;1;6;59;3;0;65;1;0;0;
iars;1;7;21;5;47;46;12;41;10;29;0;0;0;6;19;20;6;42;2;24;2;1;5;15;27;35;3;19;3;21;2;1;36;25;31;86;5;36;0;6;9;63;1;9;10;26;2;3;5;58;3;4;55;13;0;0;9;36;5;0;35;0;1;0;
lars;1;8;15;0;31;26;4;50;12;25;1;0;0;3;4;9;4;31;0;18;1;0;1;15;27;21;3;16;2;20;5;5;29;25;16;79;4;36;1;2;12;55;0;8;23;26;0;1;9;54;3;1;47;17;0;0;8;34;2;4;29;0;1;0;
secA;2;8;22;4;41;28;3;64;10;23;0;1;0;0;14;9;3;27;2;21;0;2;1;6;42;37;2;18;2;40;5;5;37;21;14;102;5;45;2;4;24;57;0;1;26;6;2;4;10;33;0;0;55;13;1;0;9;32;8;2;43;0;0;1;
carB;2;11;19;5;50;36;8;45;7;17;0;1;0;3;24;11;4;34;0;16;3;1;3;11;23;28;5;12;6;22;4;8;35;42;27;80;6;41;4;5;15;74;0;2;21;10;0;6;10;51;4;4;54;21;1;0;6;43;2;5;47;0;0;1;
ftsK;2;7;28;8;46;53;10;30;7;26;2;1;1;2;25;16;0;15;1;11;0;2;1;12;30;22;2;13;9;23;6;4;30;29;26;46;5;21;4;3;15;66;0;0;13;4;5;14;10;53;1;3;35;13;0;1;4;22;3;0;26;0;0;1;
mfd;1;18;39;4;51;43;8;33;19;18;2;0;1;2;17;10;8;25;1;6;4;2;6;21;27;43;5;15;3;19;8;2;38;34;16;88;12;30;1;11;14;57;0;0;8;8;4;14;12;41;9;1;46;11;0;1;3;29;5;0;26;0;1;0;
sbcC;4;25;41;9;56;37;9;35;9;10;5;0;1;1;14;9;2;11;0;8;2;2;2;41;31;52;1;8;4;29;5;7;15;47;35;129;6;17;3;14;27;70;0;2;7;9;0;3;7;25;4;1;45;8;0;1;2;21;1;1;6;0;1;0;
  • tsc bactérie acides aminés
Géne;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp;
dnaE;216;72;65;63;58;23;147;36;36;147;167;77;163;5;32;15;89;117;58;60;1;
rpoB;119;50;44;41;30;25;103;17;35;103;101;72;81;2;23;2;69;97;47;58;1;
rpoC;164;99;42;61;46;27;122;24;57;118;158;76;123;11;26;10;80;151;67;68;1;
iars;127;53;39;45;48;26;85;22;24;64;117;41;78;10;10;26;68;75;45;40;1;
lars;81;54;37;17;35;18;65;19;22;64;95;40;70;8;23;26;64;68;42;35;1;
secA;105;67;33;24;30;23;88;20;42;68;116;50;87;1;26;6;49;68;42;53;1;
carB;123;53;24;39;38;16;69;17;28;89;107;47;98;2;21;10;67;83;50;54;1;
ftsK;144;40;33;47;15;12;67;15;32;69;72;26;88;0;13;4;82;52;27;29;1;
mfd;156;41;37;32;33;7;103;20;22;82;104;42;83;0;8;8;71;67;33;31;1;
sbcC;172;44;19;30;13;8;130;9;33;74;164;23;114;2;7;9;35;58;24;8;1;

Tableaux pour comparaisons des protéines[modifier | modifier le wikicode]

Cyanobactéries − autres bactéries[modifier | modifier le wikicode]

  • codons des protéines de 7 cyanobactéries "can, cgc, cya, mar, pmm, syn, tel" et de 7 autre-bactéries "bmv, cft, eco, mhd, sti, tos, zin". >4GC et >4AT en "pour 10 000" bases des gènes; les codons en "pour 10 000" acides aminés sur un total de 10 à 12 protéines.
Bactérie        tos	mhd	sti	bmv	eco	cft	zin		Bact.   tos	mhd	sti	bmv	eco	cft	zin

%GC b           68.6	68.1	68.1	68.1	50.8	33.2	13.5            %GC b   68.6    68.1    68.1    68.1    50.8    33.2    13.5
>4GC            100.0   35.9    6.6     2.1     2.6     0.3     1.5             >4GC    100.0   35.9    6.6     2.1     2.6     0.3     1.5
>4AT            7.5     5.1     2.3     1.9     20.6    103.0   309.8           >4AT    7.5     5.1     2.3     1.9     20.6    103.0   309.8
																	
ttt		76	47	46	24	163	377	740		tct	3	1	17	3	89	90	255
ttc		263	311	273	320	161	51	14		tca	2	1	13	6	46	105	171
tta		10	11	9	1	94	307	954		tcc	187	119	86	44	105	17	5
ttg		66	120	78	45	129	117	25		tcg	32	115	155	277	86	26	5
																	
ctt		157	53	36	26	109	356	14		cct	28	32	33	10	63	125	106
cta		48	28	27	6	41	108	10		cca	3	9	30	6	97	95	95
ctc		532	516	367	476	114	30	0		ccc	489	306	140	117	44	10	7
ctg		463	411	545	451	643	39	0		ccg	92	232	359	379	281	77	2
																	
att		23	20	65	32	195	248	683		act	4	10	22	3	85	203	166
ata		8	0	5	4	15	491	992		aca	3	5	18	7	48	123	134
atc		346	393	470	416	284	129	6		acc	307	275	283	119	229	49	1
atg		174	183	212	206	230	225	142		acg	79	147	219	311	120	56	3
																	
gtt		21	38	50	26	185	295	118		gct	9	53	71	12	129	310	80
gta		7	24	20	10	121	224	93		gca	2	22	82	52	178	202	66
gtc		204	236	363	311	126	62	0		gcc	723	461	426	328	226	79	5
gtg		509	443	365	360	205	50	3		gcg	241	522	397	952	398	56	3
																	
−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−
																
Cyanobactéries	cgc	cya	tel	syn	mar	can	pmm		Cyano.	cgc	cya	tel	syn	mar	can	pmm

%GC b           68.7	60.2	53.9    47.7	42.3	35.0	30.8           %GC b    68.7    60.2    53.9    47.7    42.3    35.0    30.8
>4GC            42.3    31.2    36.5    27.5    18.1    9.1     2.5            >4GC     42.3    31.2    36.5    27.5    18.1    9.1     2.5
>4AT            0.3     17.2    25.2    47.6    52.3    76.1    86.7           >4AT     0.3     17.2    25.2    47.6    52.3    76.1    86.7
																	
ttt		10	180	205	219	225	259	307		tct	3	47	32	74	93	212	224
ttc		268	135	97	115	117	78	57		tca	10	5	41	19	32	84	219
tta		0	13	53	264	421	640	515		tcc	151	159	122	186	151	65	52
ttg		19	241	187	285	117	112	141		tcg	83	90	67	38	87	28	28
																	
ctt		19	48	114	63	71	92	211		cct	16	74	56	82	93	225	165
cta		3	50	91	106	115	60	98		cca	7	46	58	62	58	55	151
ctc		283	209	269	122	138	68	36		ccc	322	249	304	241	214	106	28
ctg		779	542	359	184	148	29	13		ccg	237	188	94	85	92	30	18
																	
att		16	143	417	436	366	471	483		act	6	53	73	108	151	230	224
ata		0	4	6	14	47	82	285		aca	6	22	54	54	47	135	167
atc		421	393	165	183	273	164	88		acc	390	311	290	299	253	144	51
atg		187	180	198	204	200	192	169		acg	92	101	123	94	81	42	24
																	
gtt		14	80	118	153	195	248	316		gct	32	127	132	172	211	225	217
gta		3	41	49	100	112	205	187		gca	25	45	126	86	118	176	181
gtc		192	154	181	101	173	77	51		gcc	901	561	471	339	269	133	43
gtg		530	442	358	339	190	117	37		gcg	251	172	162	145	124	104	41

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Bact.	tos	mhd	sti	bmv	eco	cft	zin		Bact.	tos	mhd	sti	bmv	eco	cft	zin

%GC b   68.6	68.1	68.1	68.1	50.8	33.2	13.5            %GC b   68.6    68.1    68.1    68.1    50.8    33.2    13.5
>4GC    100.0   35.9    6.6     2.1     2.6     0.3     1.5             >4GC    100.0   35.9    6.6     2.1     2.6     0.3     1.5
>4AT    7.5     5.1     2.3     1.9     20.6    103.0   309.8           >4AT    7.5     5.1     2.3     1.9     20.6    103.0   309.8
																
tat	8	11	30	50	134	296	565		tgt	0	1	7	6	34	41	98
tac	298	309	235	196	119	68	22		tgc	39	52	37	75	40	50	5
taa	3	4	2	5	8	3	9		tga	4	6	4	6	1	4	100
tag	3	1	4	1	1	3	1		tgg	108	121	84	120	116	63	5
																
cat	8	13	37	48	92	119	98		cgt	11	56	62	91	369	88	7
cac	169	207	164	175	107	41	1		cga	6	17	28	20	34	13	0
caa	22	52	33	35	202	196	134		cgc	353	497	454	580	272	36	0
cag	274	279	378	302	437	62	5		cgg	372	290	284	156	60	4	0
																
aat	4	5	37	21	86	423	1228		agt	0	5	14	5	64	227	105
aac	154	185	218	207	215	116	24		agc	97	123	146	92	152	181	5
aaa	43	58	32	23	288	746	1698		aga	6	0	4	1	5	245	191
aag	479	372	249	353	92	153	32		agg	116	11	15	8	9	40	1
																
gat	27	81	129	159	336	561	206		ggt	12	49	120	45	273	207	192
gac	429	404	435	477	260	117	5		gga	11	31	42	10	42	224	138
gaa	105	149	132	243	579	460	318		ggc	331	357	407	645	220	132	6
gag	979	775	727	456	237	322	3		ggg	426	348	183	63	86	36	9
																
−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−
											
Cyano.	cgc	cya	tel	syn	mar	can	pmm		Cyano.	cgc	cya	tel	syn	mar	can	pmm

%GC b   68.7	60.2	53.9    47.7	42.3	35.0	30.8           %GC b    68.7    60.2    53.9    47.7    42.3    35.0    30.8
>4GC    42.3    31.2    36.5    27.5    18.1    9.1     2.5            >4GC     42.3    31.2    36.5    27.5    18.1    9.1     2.5
>4AT    0.3     17.2    25.2    47.6    52.3    76.1    86.7           >4AT     0.3     17.2    25.2    47.6    52.3    76.1    86.7
																
tat	32	77	154	180	225	281	268		tgt	7	19	41	46	65	63	77
tac	202	225	167	142	103	70	54		tgc	76	57	39	34	16	15	29
taa	0	1	7	3	9	8	7		tga	11	3	1	0	0	1	1
tag	0	6	3	8	2	3	2		tgg	137	137	125	121	116	117	107
																
cat	33	32	91	106	86	125	146		cgt	37	28	73	98	145	172	28
cac	169	165	117	79	82	42	18		cga	14	33	44	55	65	45	28
caa	8	197	359	344	342	408	279		cgc	405	374	349	161	167	64	2
cag	419	431	299	236	186	124	63		cgg	301	241	182	193	99	19	6
																
aat	18	34	131	174	255	362	584		agt	13	20	94	110	113	148	147
aac	200	220	139	162	139	116	85		agc	188	154	106	69	74	51	31
aaa	16	136	225	413	477	556	672		aga	2	12	4	25	68	149	316
aag	288	265	194	137	91	109	158		agg	17	18	12	32	25	43	85
																
gat	156	238	349	364	414	451	544		ggt	62	44	181	211	232	255	236
gac	415	261	192	217	130	111	73		gga	29	77	68	85	175	176	246
gaa	129	258	410	649	665	663	598		ggc	555	366	258	212	139	78	62
gag	632	563	357	193	194	192	174		ggg	164	217	172	179	127	105	54

Autre-bactéries[modifier | modifier le wikicode]

  • codons des autre-bactéries à 68% GC: tos, mhd, sti, bmv (eco à 51% GC). >4GC et >4AT en "pour 10 000" bases des gènes; les codons en "pour 10 000" acides aminés sur un total de 10 à 14 protéines.
Bactérie  tos   mhd   sti  bmv   eco          Bactérie  tos   mhd  sti  bmv   eco     Bactérie  tos   mhd  sti  bmv   eco     Bacterie tos   mhd  sti   bmv   eco

>4GC    100.0  35.9   6.6  2.1   2.6            >4GC  100.0  35.9  6.6  2.1   2.6      >4GC   100.0  35.9  6.6  2.1   2.6       >4GC  100.0  35.9  6.6  2.1   2.6
>4AT      7.5   5.1   2.3  1.9  20.6            >4AT    7.5   5.1  2.3  1.9  20.6      >4AT     7.5   5.1  2.3  1.9  20.6       >4AT    7.5   5.1  2.3  1.9  20.6

ttt  	 76  	 47    46   24   163    	tct     3  	1   17    3    89    	tat  	8      11   30   50  134    	tgt  	0  	1    7    6    34
ttc  	263  	311   273  320   161    	tca     2  	1   13    6    46    	tac   298     309  235  196  119    	tgc    39      52   37   75    40
tta  	 10  	 11     9    1    94    	tcc   187     119   86   44   105    	taa  	3  	4    2    5    8    	tga  	4  	6    4    6     1
ttg  	 66  	120    78   45   129    	tcg    32     115  155  277    86    	tag  	3  	1    4    1    1    	tgg   108     121   84  120   116
                                                    
ctt  	157  	 53    36   26   109    	cct    28      32   33   10    63    	cat  	8      13   37   48   92    	cgt    11      56   62   91   369
cta  	 48  	 28    27    6    41    	cca     3  	9   30    6    97    	cac   169     207  164  175  107    	cga  	6      17   28   20    34
ctc  	532  	516   367  476   114    	ccc   489     306  140  117    44    	caa    22      52   33   35  202    	cgc   353     497  454  580   272
ctg  	463  	411   545  451   643    	ccg    92     232  359  379   281    	cag   274     279  378  302  437    	cgg   372     290  284  156    60
                                                    
att  	 23  	 20    65   32   195    	act     4      10   22    3    85    	aat  	4  	5   37   21   86    	agt  	0  	5   14    5    64
ata  	  8  	  0     5    4    15    	aca     3  	5   18    7    48    	aac   154     185  218  207  215    	agc    97     123  146   92   152
atc  	346  	393   470  416   284    	acc   307     275  283  119   229    	aaa    43      58   32   23  288    	aga  	6  	0    4    1     5
atg  	174  	183   212  206   230    	acg    79     147  219  311   120    	aag   479     372  249  353   92    	agg   116      11   15    8     9
                                                    
gtt  	 21  	 38    50   26   185    	gct     9      53   71   12   129    	gat    27      81  129  159  336    	ggt    12      49  120   45   273
gta  	  7  	 24    20   10   121    	gca     2      22   82   52   178    	gac   429     404  435  477  260    	gga    11      31   42   10    42
gtc  	204  	236   363  311   126    	gcc   723     461  426  328   226    	gaa   105     149  132  243  579    	ggc   331     357  407  645   220
gtg  	509  	443   365  360   205    	gcg   241     522  397  952   398    	gag   979     775  727  456  237    	ggg   426     348  183   63    86

Compléments[modifier | modifier le wikicode]

Comparaisons des protéines[modifier | modifier le wikicode]

Les autre-bactéries utilisées pour ce complément sont: pmh, tme, hmr, nse, aae, hth, tma, tli, amo, lfc, eco, dal, msv, mrb, tai, tsc

Les répétitions des bactéries autres pour les compléments[modifier | modifier le wikicode]

  • Les répétitions
Voir répétitions des génomes des autre-bactéries déjà compilées: tme, tma, aae, amo, eco, msv, mrb, tai, tsc.    Extrait des autre-bactéries
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl
amo; 2160700; 47.968065904568; 4344; 4682; 1272; 1205; 102227; 104668; 102592; 102289; 8025; 8552; 4617; 4498; 0
tma; 1860725; 46.2477260207715; 4488; 4659; 538; 709; 89126; 90023; 74178; 78612; 8868; 8979; 2144; 2517; 0
tme; 1915238; 31.3998573545429; 13238; 12800; 490; 431; 123522; 121538; 50996; 49107; 17789; 17210; 1638; 1550; 0
tsc; 2346803; 64.8850372187184; 1108; 1259; 8488; 8168; 66287; 66784; 190405; 188915; 4331; 4283; 16711; 16545; 0
eco; 4641652; 50.7907098593346; 8441; 8289; 1278; 1239; 205758; 205373; 216669; 215471; 15523; 15380; 6067; 6027; 0
mrb; 3097457; 63.3843827371938; 2995; 2990; 7404; 7492; 82263; 81704; 212870; 215243; 5833; 5674; 14923; 14926; 0
msv; 3249394; 62.3636284180989; 2434; 2476; 6989; 7214; 94468; 93721; 211059; 213652; 5346; 5167; 16759; 17228; 0
tai; 1848474; 63.7925661924377; 375; 339; 8098; 7114; 48029; 46765; 142542; 137838; 1116; 1095; 12183; 11501; 0
aae; 1551335; 43.4761673010665; 4828; 4872; 591; 641; 85156; 86380; 64379; 65865; 9170; 9276; 2805; 2659; 0
Voir répétitions des protéines des 15 autre-bactéries du complément: pmh, tme, hmr, nse, aae, hth, tma, tli, amo, lfc, dal, msv, mrb, tai, tsc.
  • les codons
Voir les codons des protéines des 15 autre-bactéries du complément: pmh, tme, hmr, nse, aae, hth, tma, tli, amo, lfc, dal, msv, mrb, tai, tsc.
  • Tableaux numérique des répétitions des autre-bactéries nouvelles: pmh, hmr, nse, tli, hth, lfc, dal
KEGG;effectif;%GC;>4T;>4A;>4C;>4G;<4T;<4A;<4C;<4G;4T;4A;4C;4G;Ctrl 
dal; 6517073; 54.4848567801159; 17587; 17686; 5674; 5421; 254602; 254345; 412164; 407704; 26656; 26671; 18214; 17436; 31
hmr; 1694430; 37.4742538788855; 7900; 7853; 437; 467; 94543; 95109; 56139; 56577; 11775; 11770; 1953; 1865; 0
hth; 1743135; 44.0002638923549; 5049; 4910; 755; 757; 82142; 80624; 76333; 75300; 9204; 9097; 2386; 2477; 0
lfc; 2559538; 50.0475476433638; 7191; 7295; 2290; 2162; 109904; 110996; 135762; 134514; 10887; 11031; 6806; 6747; 0
nse; 859006; 41.0843463258697; 2891; 2722; 187; 182; 46113; 46003; 28403; 27971; 4597; 4377; 808; 862; 0
pmh; 1738790; 31.1450491433698; 10643; 10443; 273; 266; 120591; 119911; 42641; 42436; 13543; 12907; 1153; 1083; 0
tli; 1967774; 47.0576397492801; 4485; 4562; 1240; 1499; 93405; 94061; 93059; 98130; 9109; 8749; 4439; 4876; 0
  • Tableaux des répétitions >4GC et >4AT des génomes des autre-bactéries nouvelles: pmh, hmr, nse, tli, hth, lfc, dal
						Aléas équation	
KEGG	effectif	%GC	>4GC    >4AT    >4ATa   >4GCa
dal	6517073		54.48	17.02	54.12	9.3	21.8
hmr	1694430		37.47	5.34	92.97	41.3	3.9
hth	1743135		44.00	8.67	57.13	24.9	8.0
lfc	2559538		50.05	17.39	56.60	14.5	14.6
nse	859006		41.08	4.30	65.34	31.5	5.8
pmh	1738790		31.15	3.10	121.27	63.6	1.8
tli	1967774		47.06	13.92	45.98	19.1	10.9
  • Tableaux des répétitions >4GC et >4AT des génomes des autre-bactéries déjà compilées: tme, tma, aae, amo, eco, msv, mrb, tai, tsc.    Extrait des Tableaux des diagrammes
					        Aléas équation	
KEGG    effectif        %GC     >4GC    >4AT    >4ATa   >4GCa
eco	4,641,652	50.79	5.42	36.04	13.5	15.6
amo	2,160,700	47.97	11.46	41.77	17.6	11.9
aae	1,551,335	43.48	7.94	62.53	26.0	7.5
tai	1,848,474	63.79	82.29	3.86	3.2	45.2
tsc	2,346,803	64.89	70.97	10.09	2.8	48.8
msv	3,249,394	62.36	43.71	15.11	3.9	40.7
mrb	3,097,457	63.38	48.09	19.32	3.4	43.9
tme	1,915,238	31.40	4.81	135.95	62.6	1.8
tma	1,860,725	46.25	6.70	49.16	20.5	10.1
  • Tableaux des répétitions >4GC et >4AT des protéines
						Aléas équation		
%GC b	KEGG	 ADN	%GC p	>4AT    >4GC    >4ATa   >4GCa   #GC %
31.15	pmh	31,017	32.65	89.3	1.9	57.7	2.1	-10
31.40	tme	28,056	32.74	116.2	0.7	57.4	2.2	-67
37.47	hmr	30,099	39.61	62.1	2.7	35.3	4.9	-46
41.08	nse	30,408	41.45	61.2	5.3	30.6	6.0	-13
43.48	aae	29,648	46.05	42.5	5.4	20.9	9.9	-45
44.00	hth	29,334	44.60	43.6	8.2	23.6	8.5	-3
46.25	tma	29,991	47.08	48.0	4.0	19.1	10.9	-63
47.06	tli	29,844	46.99	30.8	6.7	19.2	10.8	-38
47.97	amo	31,140	50.78	27.6	10.9	13.5	15.6	-30
50.05	lfc	31,632	46.72	57.9	7.6	19.7	10.5	-28
50.79	eco	38,310	54.54	20.6	2.6	9.3	21.9	-88
54.48	dal	33,645	56.65	47.3	11.0	7.4	26.1	-58
62.36	msv	32,220	62.88	13.3	34.1	3.6	42.3	-19
63.38	mrb	32,235	64.61	17.7	45.0	2.9	47.8	-6
63.79	tai	30,186	64.35	0.7	79.2	3.0	47.0	69
64.89	tsc	33,261	65.56	9.0	67.6	2.6	51.1	32

Tableau des rapports[modifier | modifier le wikicode]

Bactérie	pmh	tme	hmr	nse	aae	hth	tma	tli	amo	lfc	eco	dal	msv	mrb	tai	tsc

#GC %           76      164     38      -26     5       9       -33     28      -4      19      -65     -22     7       10      82      46
%GC b           31      31      37      41      43      44      46      47      48      50      51      54      62      63      64      65
>4GC            1.9     0.7     2.7     5.3     5.4     8.2     4.0     6.7     10.9    7.6     2.6     11.0    34.1    45.0    79.2    67.6
>4AT            89.3    116.2   62.1    61.2    42.5    43.6    48.0    30.8    27.6    57.9    20.6    47.3    13.3    17.7    0.7     9.0
																	
Pro		365	381	384	366	410	404	439	463	447	509	486	433	532	543	526	608
c/g		1.2	1.3	1.0	0.6	4.0	2.7	1.1	2.0	2.1	1.0	0.2	2.5	1.9	2.2	2.1	4.4
																	
Gly		598	595	647	627	633	654	621	735	731	736	621	724	767	754	900	793
g/c		0.8	2.8	0.3	0.9	0.8	0.5	0.6	0.9	0.4	1.1	0.4	0.2	0.8	0.4	1.6	1.0
																	
Thr		454	497	442	478	431	437	433	398	392	502	481	495	434	454	349	393
c/g		2.4	0.9	1.4	0.9	1.0	3.1	1.1	1.7	0.9	1.6	1.9	2.1	7.6	8.7	6.0	5.9
																	
Ala		502	481	619	640	564	551	553	704	726	645	931	836	954	939	731	889
c/g		1.1	0.7	3.3	0.8	0.8	1.7	1.1	1.7	3.2	2.4	0.6	3.0	3.4	4.8	1.8	3.6
																	
Ser		547	537	563	561	525	596	571	667	627	635	702	582	691	727	671	735
tcc/gc*		0.5	0.6	0.4	0.3	1.7	0.7	0.6	0.7	0.8	0.6	0.1	1.0	1.0	1.0	1.1	2.0
																	
Arg		452	457	509	525	586	584	616	612	667	613	751	529	774	741	828	884
gg*/cgc		26.0	28.5	10.0	3.8	26.7	20.2	6.7	4.6	2.6	2.6	0.3	1.0	0.6	0.5	8.0	1.5

0.8-1.2~1	3	1	1	3	3	0	3	1	2	2	0	2	2	1	1	1

Tableau des effectifs[modifier | modifier le wikicode]

	pmh	tme	hmr	nse	aae	hth	tma	tli	amo	lfc	eco	dal	msv	mrb	tai	tsc

#GC %   76      164     38      -26     5       9       -33     28      -4      19      -65     -22     7       10      82      46
%GC b   31      31      37      41      43      44      46      47      48      50      51      54      62      63      64      65
>4GC    1.9     0.7     2.7     5.3     5.4     8.2     4.0     6.7     10.9    7.6     2.6     11.0    34.1    45.0    79.2    67.6
>4AT    89.3    116.2   62.1    61.2    42.5    43.6    48.0    30.8    27.6    57.9    20.6    47.3    13.3    17.7    0.7     9.0
																
ccc	32	30	68	42	221	123	123	125	192	128	44	249	284	339	318	434
acc	59	55	91	75	136	142	133	139	133	150	229	303	349	399	287	329
gcc	49	37	143	89	112	153	169	212	351	212	226	523	596	697	438	635
tcc	39	36	71	92	131	99	131	125	130	209	105	261	124	121	320	194
ccx	333	351	316	324	189	282	315	338	256	381	442	184	248	204	208	174
																
ggg	53	78	57	93	59	80	47	138	123	149	86	84	261	204	436	343
cgg	2	0	6	32	2	6	11	31	28	101	60	131	224	194	363	340
agg	99	122	224	148	322	262	177	245	289	93	9	85	24	29	292	154
tgg	103	85	73	70	85	96	100	109	115	84	116	80	117	113	125	105
ggx	545	517	590	534	574	574	574	597	608	587	534	640	506	550	465	450

cc/ccc	15.0	16.0	9.1	13.7	2.6	5.5	6.1	6.5	4.5	7.4	22.8	5.1	4.6	4.2	3.9	3.1
gg/ggg	14.1	9.3	15.7	8.4	16.7	11.8	18.3	7.1	8.4	5.8	8.4	11.2	3.3	4.3	2.9	3.1

Les tRNAs par codons[modifier | modifier le wikicode]

  • Sont reportés ici les aas à un seul tRNA pour ceux qui sont codés par 4 ou 6 codons, soit 8 aas: colonne tRNA/8. La colonne tRNA affiche le nombre total de tRNA par bactérie. Cette liste ne concerne que les 192 autre-bactéries. Un seul cas, zin (14%GC), où Leu à 6 codons n'a qu'un seul tRNA. Et un seul cas pour la Gly, mcac (24%GC). D'après gtRNAdb [1].
KEGG	%GC	tRNA	tRNA/8		KEGG	%GC	tRNA	tRNA/8		KEGG	%GC	tRNA	tRNA/8		KEGG	%GC	tRNA	tRNA/8
zin	13.54	25	LAPTV		gva	42.02	37	0		eno	55.07	83	0		rpa	65.04	49	0
cru	13.98	28	APTV		cbd	42.44	42	0		spe	55.07	84	0		rru	65.45	55	0
crp	16.56	28	APTV		plu	42.83	85	0		cnt	55.10	82	0		dpt	66.16	46	0
wbr	22.48	34	P		bae	43.22	75	P		ecla	55.18	83	0		gdi	66.43	55	0
mcac	23.66	30	APTVG		sect	43.29	40	0		eha	55.56	60	0		pae	66.56	63	0
sms	24.00	28	APTV		aae	43.48	44	0		ror	55.88	79	A		dge	66.64	49	0
uur	25.50	30	APTV		bsu	43.51	54	P		koy	55.92	87	0		roa	67.37	52	0
ple	26.17	33	AP		men	43.52	41	0		pes	56.06	55	0		sur	67.46	50	0
buc	26.31	32	P		ral	44.21	75	AV		ebt	56.51	89	0		rha	67.52	53	0
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cje	30.55	43	P		pgi	48.29	53	V		pge	59.11	86	0		age	69.45	81	0
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tme	31.40	50	0		cpb	48.93	46	0		pac	60.01	45	0		opr	70.02	46	0
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psi	41.27	76	0		ebf	54.02	86	0		cvi	64.83	98	0		acp	74.72	49	0
cta	41.30	37	0		cgq	54.15	58	0		tsc	64.89	48	0		ank	74.84	49	0
ctr	41.31	37	0		dda	55.02	74	0		xcb	64.96	55	0		ade	74.91	49	0
  • Tableau non formaté
KEGG;%GC;tRNA;tRNA/8;;KEGG;%GC;tRNA;tRNA/8;;KEGG;%GC;tRNA;tRNA/8;;KEGG;%GC;tRNA;tRNA/8
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b10M[modifier | modifier le wikicode]

Ce sont 8 bactéries age, amd, roa, saci, sma, sgr, sho, sus. Ces bactéries ont à peu près la même grande taille qui tourne autour de 10 Mpb, un %GC autour de 68% et un >4GC autour de 28 pour 10 000. Ce qui les différencient de tos, sti et mhd dont le >4GC dépasse les 50 pour 10 000 et même les aléas, le %GC tourne autour de 68% et la taille petite est comprise entre 2 et 3 Mpb.

codons[modifier | modifier le wikicode]

par génome[modifier | modifier le wikicode]

  • age;

Gène;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; a1653;0;2;1;0;59;36;1;20;1;50;0;0;1;15;14;18;3;23;0;14;0;0;0;0;19;9;0;17;1;17;2;10;52;5;1;19;3;19;1;2;43;52;0;4;27;14;0;0;16;10;0;0;48;18;1;0;16;21;2;0;33;0;0;1; a1653m;0;1;3;0;77;27;0;1;0;20;0;0;2;7;7;9;0;3;0;5;0;0;0;1;16;17;1;9;1;12;3;2;27;17;1;19;1;6;0;2;42;31;0;3;18;4;1;0;19;6;0;0;47;3;0;0;11;13;1;0;10;0;0;1; a1653n;0;1;0;0;46;32;0;9;0;31;0;0;1;11;15;10;1;18;0;7;0;0;2;0;17;4;0;4;0;7;2;4;36;2;0;19;1;9;1;3;27;51;0;2;18;5;0;0;8;15;0;0;32;19;0;0;8;23;0;0;18;0;0;1; a2777A;0;0;1;0;57;56;1;97;1;51;0;0;2;15;15;20;0;33;1;30;0;1;2;2;49;13;1;26;1;40;2;7;73;19;4;98;7;62;0;0;39;59;0;10;36;8;0;1;28;25;0;0;55;31;0;0;22;29;1;0;59;0;0;1; a27771;0;7;0;0;78;30;2;51;0;23;0;0;2;10;12;13;1;20;2;18;0;1;1;8;39;22;2;14;2;36;4;2;32;16;3;78;11;41;3;1;61;41;1;2;13;4;1;1;24;21;1;0;63;9;0;0;30;16;3;0;33;0;0;1; a27761;0;1;1;0;59;72;0;106;0;54;3;0;1;19;31;18;0;38;0;51;0;1;9;0;73;8;1;19;0;48;5;17;79;8;5;119;12;85;0;5;28;59;0;7;24;6;0;1;35;24;2;0;62;53;1;0;29;37;1;0;93;0;1;0; a27762;0;0;0;0;51;81;0;102;0;38;2;0;0;19;31;13;0;33;1;49;0;0;14;1;76;14;0;21;0;40;1;22;89;0;7;119;13;67;0;4;26;82;0;14;32;7;0;2;30;29;1;0;60;48;1;0;22;43;2;0;99;0;1;0; a63551;0;1;0;0;66;25;0;52;0;34;1;1;0;18;20;16;0;34;1;21;0;1;4;2;45;26;0;17;0;37;4;7;58;10;4;89;9;46;1;0;57;47;0;9;25;2;0;1;36;22;1;0;79;21;0;0;38;24;3;0;60;0;1;0; a63552;0;3;0;0;10;16;0;17;0;12;0;1;0;5;8;5;1;9;0;11;0;0;2;0;12;7;2;11;0;11;3;5;28;6;2;19;6;12;2;2;11;26;0;2;10;1;0;1;9;11;1;0;29;9;0;0;8;14;1;0;11;0;1;0; a6114;0;0;0;0;28;48;0;39;0;34;2;0;0;16;11;10;3;22;2;14;0;0;3;0;47;11;4;23;1;26;0;3;49;7;3;60;9;37;0;2;16;59;0;3;17;24;2;2;7;46;0;1;28;35;0;0;18;33;1;0;22;0;0;1; a6115;0;3;0;0;72;18;0;64;0;31;0;0;1;15;10;22;0;41;1;19;0;1;0;1;32;26;2;18;0;28;4;5;44;12;4;76;3;52;2;0;72;24;0;19;12;20;0;0;28;21;0;0;66;16;0;1;32;12;2;0;32;0;0;1; a27140;0;1;0;0;31;9;0;24;0;6;1;0;0;9;5;1;0;4;1;14;0;1;0;4;14;17;1;9;0;17;4;0;21;13;2;27;1;23;0;0;37;13;0;5;16;1;0;0;17;8;0;1;43;7;0;0;22;7;1;0;29;0;0;1; aseca;0;0;0;0;46;31;1;56;0;25;0;1;0;12;16;10;0;34;3;29;0;0;9;1;55;14;0;20;0;53;1;8;55;9;5;84;6;52;1;1;23;56;0;6;28;7;0;1;17;11;0;1;39;23;1;0;20;28;1;0;48;0;1;0; a4213;0;1;0;0;53;34;0;54;0;35;0;0;1;8;21;20;0;25;0;35;0;0;5;0;36;2;1;15;0;33;1;5;75;4;1;51;3;43;0;0;22;67;0;6;21;8;0;1;25;29;1;0;61;16;0;0;19;38;2;0;32;0;1;0;

  • amd;

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  • saci;

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  • sma;

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  • sus;

Gène;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; a1653;0;3;2;0;35;30;5;16;5;47;1;1;1;8;16;12;6;17;6;11;0;1;1;0;13;0;5;12;4;5;5;4;53;1;8;5;12;6;1;2;26;38;1;4;27;14;2;1;6;16;4;0;29;24;2;0;4;22;5;3;36;0;0;1; a1653m;0;2;3;0;36;36;3;6;2;34;3;0;1;5;16;10;5;13;7;11;0;1;2;0;11;1;2;10;5;12;2;1;31;1;4;10;3;5;5;2;16;31;1;4;20;15;2;2;18;6;3;0;13;30;2;1;8;11;6;0;28;0;1;0; a1653n;0;2;4;0;27;28;1;13;3;36;2;0;2;3;12;10;6;15;2;9;0;2;1;0;10;1;1;6;0;11;3;2;33;2;4;8;5;9;3;6;22;44;0;2;18;6;0;1;9;13;4;2;15;16;4;1;2;14;6;0;25;0;1;0; a2777A;1;15;2;3;82;13;8;62;8;40;0;0;3;29;4;15;11;26;17;18;1;3;4;3;32;36;10;17;1;42;15;2;30;37;28;65;35;38;10;2;78;4;1;16;37;9;2;0;46;1;1;2;66;12;2;1;37;9;24;1;34;1;0;0; a27771;0;10;4;2;60;15;6;37;7;23;2;0;0;10;7;17;4;16;5;17;3;4;6;2;27;21;6;8;5;20;7;6;27;27;20;53;15;34;7;3;71;20;0;5;22;4;1;1;36;5;3;7;47;6;2;4;30;7;17;0;34;1;0;0; a27761;1;23;8;0;69;25;7;96;8;43;0;2;3;29;7;23;9;28;10;38;0;2;11;3;64;13;4;17;4;44;18;8;69;13;59;52;39;55;3;9;59;26;2;15;33;8;1;7;43;10;8;5;63;26;2;2;38;32;18;0;78;1;0;0; a27762;0;21;7;0;75;25;7;83;3;33;3;0;1;28;11;17;10;30;4;38;1;3;14;0;64;18;7;22;3;50;14;17;78;10;71;53;27;55;2;8;51;30;0;15;35;8;1;3;49;9;10;6;74;20;0;0;45;30;21;0;83;0;1;0; a63551;1;4;8;1;45;33;13;43;2;37;2;0;2;28;9;20;11;19;11;22;1;0;5;0;42;13;3;9;2;24;6;6;62;13;26;50;30;32;2;5;55;46;1;15;27;7;0;1;36;16;4;4;55;26;7;0;21;34;11;0;62;0;0;1; a63552;0;1;1;1;16;16;2;12;3;12;0;0;2;11;6;8;3;7;3;19;0;1;2;1;18;3;2;11;2;7;4;3;17;7;14;9;12;8;3;1;10;11;0;4;4;2;0;1;11;9;4;0;15;14;2;1;4;17;6;0;12;1;0;0; a6114;1;4;5;1;7;35;13;29;3;34;1;2;0;4;17;8;9;21;7;21;0;1;5;1;44;3;3;15;5;22;6;0;46;4;24;41;23;19;3;4;21;45;1;11;22;23;2;3;22;26;3;3;26;23;2;3;5;29;11;0;38;0;0;1; a6115;0;6;8;1;42;32;18;31;5;31;1;0;5;15;14;9;10;27;10;12;0;1;4;1;44;7;7;19;7;20;4;5;55;5;30;30;24;36;1;3;38;54;2;16;20;26;3;3;23;20;4;6;33;23;2;2;10;31;7;1;35;0;0;1; a27140;0;5;3;0;24;7;2;14;6;4;2;0;4;16;3;5;4;5;7;4;0;3;4;0;15;15;4;7;4;12;8;6;15;14;8;15;19;12;5;1;33;14;0;0;10;0;3;1;17;4;2;4;30;11;1;5;15;5;12;1;20;0;1;0; aseca;1;6;3;0;19;52;23;45;1;27;0;1;1;2;20;7;4;33;12;29;0;1;4;0;64;0;3;19;3;47;4;7;60;0;54;42;27;43;0;4;7;47;1;6;29;6;1;3;5;16;7;3;10;52;2;0;4;42;11;1;42;0;1;0; a4213;0;1;3;0;46;32;10;23;6;26;1;2;3;11;13;17;12;17;19;17;0;1;4;0;43;1;3;10;3;28;9;8;61;5;27;18;21;30;7;2;32;48;2;5;26;8;2;2;22;26;5;5;39;31;4;2;12;31;3;0;32;0;1;0;

par gène de protéine[modifier | modifier le wikicode]

  • a1653;

Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; age;0;2;1;0;59;36;1;20;1;50;0;0;1;15;14;18;3;23;0;14;0;0;0;0;19;9;0;17;1;17;2;10;52;5;1;19;3;19;1;2;43;52;0;4;27;14;0;0;16;10;0;0;48;18;1;0;16;21;2;0;33;0;0;1; amd;0;2;1;0;56;25;0;20;0;41;0;1;0;15;13;3;0;22;0;9;0;0;1;2;16;9;1;10;0;12;1;5;57;15;2;11;2;23;1;2;43;30;1;3;23;13;0;1;16;2;1;0;19;33;0;0;12;24;0;0;34;0;0;1; roa;0;1;3;1;50;31;2;10;0;38;0;0;0;15;10;7;2;14;2;7;0;2;4;3;5;12;1;10;2;14;9;12;33;15;7;10;2;21;8;2;44;41;0;4;25;10;2;0;17;6;2;0;30;36;3;2;12;15;2;0;24;0;0;1; saci;2;14;6;0;34;37;4;16;3;47;0;1;1;18;9;13;8;24;4;13;0;4;4;1;7;10;13;19;3;12;3;12;37;22;7;19;8;19;11;10;36;38;0;4;23;14;6;2;21;10;11;1;24;36;1;2;17;19;12;0;35;0;0;1; sma;0;5;0;0;41;36;0;18;0;38;0;1;1;16;10;4;3;16;0;11;0;0;2;4;13;7;2;16;0;12;5;10;53;11;0;18;3;19;1;0;35;38;0;3;25;8;0;2;14;6;0;1;21;39;1;0;14;20;0;0;31;0;0;1; sgr;0;0;0;0;54;22;0;19;0;38;0;1;0;12;13;3;3;14;0;11;0;0;0;3;17;6;0;18;0;13;6;7;58;6;0;18;0;23;0;0;31;44;0;3;26;9;0;0;16;6;1;0;12;47;1;1;10;23;2;0;34;0;0;1; sho;0;1;0;0;54;30;0;16;0;39;0;0;0;10;16;8;1;15;0;10;0;0;0;2;25;5;0;17;0;12;2;8;65;3;1;20;0;22;1;0;33;47;0;3;24;9;0;0;16;9;0;0;15;42;0;0;18;19;0;0;30;0;0;1; sus;0;3;2;0;35;30;5;16;5;47;1;1;1;8;16;12;6;17;6;11;0;1;1;0;13;0;5;12;4;5;5;4;53;1;8;5;12;6;1;2;26;38;1;4;27;14;2;1;6;16;4;0;29;24;2;0;4;22;5;3;36;0;0;1;

  • a1653m;

Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; age;0;1;3;0;77;27;0;1;0;20;0;0;2;7;7;9;0;3;0;5;0;0;0;1;16;17;1;9;1;12;3;2;27;17;1;19;1;6;0;2;42;31;0;3;18;4;1;0;19;6;0;0;47;3;0;0;11;13;1;0;10;0;0;1; amd;0;2;1;0;51;29;0;13;1;35;0;0;1;17;7;5;0;16;0;6;0;0;1;0;8;6;0;4;0;12;3;6;38;11;2;6;1;16;1;0;42;14;0;1;13;7;0;0;22;4;0;0;30;20;2;1;15;8;1;0;37;1;0;0; roa;0;5;0;0;42;24;2;7;0;34;0;0;0;9;3;5;2;17;0;4;0;1;2;1;8;7;1;8;0;13;6;5;26;14;4;8;3;14;5;2;33;26;0;2;17;7;3;0;13;10;2;0;37;31;2;2;14;13;1;0;28;0;0;1; saci;1;13;7;0;25;37;1;4;6;21;3;2;3;17;9;5;5;6;3;5;3;6;4;2;8;8;5;9;1;5;4;9;17;10;7;12;2;5;5;10;20;28;1;6;14;13;3;4;11;10;9;0;7;14;3;2;16;10;7;0;24;1;0;0; sma;0;1;0;0;44;28;0;13;1;32;0;2;1;9;9;3;1;15;0;6;0;1;0;1;11;10;0;8;2;12;3;1;24;14;5;14;1;13;1;1;41;37;1;0;14;8;1;1;19;6;0;2;23;29;0;1;14;17;1;0;30;0;0;1; sgr;0;0;1;0;36;35;1;11;1;34;0;0;2;12;9;4;1;13;0;6;0;1;2;0;11;9;0;6;0;10;2;0;35;7;3;17;0;14;1;0;35;41;0;1;14;8;0;0;18;8;0;1;16;33;0;0;12;20;0;0;32;0;0;1; sho;0;0;0;0;43;25;1;14;1;32;0;0;0;9;10;5;2;13;0;6;0;0;1;1;13;7;0;8;0;13;2;2;31;4;3;15;0;15;1;0;31;42;0;1;15;8;0;1;18;8;0;2;21;31;0;1;14;19;0;0;34;0;0;1; sus;0;2;3;0;36;36;3;6;2;34;3;0;1;5;16;10;5;13;7;11;0;1;2;0;11;1;2;10;5;12;2;1;31;1;4;10;3;5;5;2;16;31;1;4;20;15;2;2;18;6;3;0;13;30;2;1;8;11;6;0;28;0;1;0;

  • a1653n;

Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; age;0;1;0;0;46;32;0;9;0;31;0;0;1;11;15;10;1;18;0;7;0;0;2;0;17;4;0;4;0;7;2;4;36;2;0;19;1;9;1;3;27;51;0;2;18;5;0;0;8;15;0;0;32;19;0;0;8;23;0;0;18;0;0;1; amd;0;5;1;0;60;10;0;10;0;37;0;0;0;29;6;6;1;12;0;3;0;0;2;0;8;7;0;3;0;10;2;6;33;14;3;5;2;14;2;1;59;16;0;4;11;8;1;0;20;0;0;0;35;22;1;0;27;3;2;0;21;0;0;1; roa;0;6;2;0;36;28;1;6;2;34;0;0;4;13;7;10;2;10;0;4;0;0;2;1;9;13;1;3;0;11;11;8;19;10;4;12;1;17;9;1;41;38;0;1;15;4;0;0;16;10;4;2;17;40;0;1;13;19;0;0;22;0;0;1; saci;0;16;16;3;25;29;1;6;3;23;1;3;2;11;6;7;8;12;2;14;1;5;0;1;5;8;4;3;2;9;4;8;15;12;6;5;1;7;8;11;19;37;1;1;22;6;0;7;10;10;6;0;15;25;2;2;16;12;4;0;25;1;0;0; sma;0;1;0;0;40;24;2;12;0;36;0;1;0;14;9;5;0;16;0;4;0;0;1;1;7;8;0;6;1;9;6;5;30;11;3;9;2;14;4;1;51;37;0;1;12;6;0;0;24;3;0;1;34;33;0;2;13;18;2;0;23;0;1;0; sgr;0;0;2;0;44;27;0;11;0;38;0;0;1;16;9;6;0;15;1;5;0;0;0;0;9;9;0;5;0;9;3;2;40;10;1;12;0;16;3;1;45;45;0;1;12;5;0;0;21;4;0;0;22;42;1;2;12;20;2;0;25;0;1;0; sho;0;1;0;0;54;13;0;13;0;38;0;1;0;12;10;5;0;15;0;5;0;1;1;0;12;6;0;6;1;10;2;3;40;6;2;9;0;18;1;0;56;40;0;2;13;6;1;0;22;4;1;1;30;32;0;2;9;19;0;0;26;0;0;1; sus;0;2;4;0;27;28;1;13;3;36;2;0;2;3;12;10;6;15;2;9;0;2;1;0;10;1;1;6;0;11;3;2;33;2;4;8;5;9;3;6;22;44;0;2;18;6;0;1;9;13;4;2;15;16;4;1;2;14;6;0;25;0;1;0;

  • a2777A;

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  • a27771;

Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; age;0;7;0;0;78;30;2;51;0;23;0;0;2;10;12;13;1;20;2;18;0;1;1;8;39;22;2;14;2;36;4;2;32;16;3;78;11;41;3;1;61;41;1;2;13;4;1;1;24;21;1;0;63;9;0;0;30;16;3;0;33;0;0;1; amd;0;1;3;0;74;30;1;33;0;33;0;0;0;26;10;8;1;21;0;17;0;1;1;0;44;14;0;19;0;34;0;5;46;13;15;64;3;55;2;0;61;41;1;0;17;6;0;0;26;5;0;0;19;41;0;0;21;36;1;0;33;0;0;1; roa;0;4;0;0;60;38;2;33;0;28;0;0;1;23;10;12;0;24;1;20;0;1;4;3;28;22;0;18;0;31;1;13;33;19;16;57;5;60;4;2;50;53;0;0;15;7;0;1;21;11;1;2;26;42;0;2;23;31;2;0;27;0;1;0; saci;2;15;10;2;23;62;15;20;6;25;2;0;2;16;4;15;6;13;5;18;2;11;3;2;28;20;6;12;5;29;11;4;28;19;22;44;14;48;2;3;33;46;0;3;15;9;8;3;15;21;9;1;17;42;5;4;17;30;8;0;39;0;0;1; sma;0;3;1;0;67;24;0;36;0;35;0;1;0;18;17;3;2;15;0;22;0;0;5;1;39;17;0;18;0;29;4;8;49;10;6;75;3;55;2;2;86;43;0;0;22;9;0;0;25;8;0;1;26;37;0;1;38;19;0;0;25;0;1;0; sgr;0;1;1;0;63;29;0;34;0;33;0;0;0;13;15;3;5;12;3;20;0;2;5;1;25;30;2;18;0;33;0;7;38;20;3;76;3;54;3;1;65;59;0;0;22;9;0;0;26;13;0;0;30;39;0;0;29;31;1;1;25;0;0;1; sho;0;1;0;0;57;33;0;31;0;36;0;0;0;12;19;5;1;17;0;20;0;0;3;2;45;17;0;20;0;27;2;0;60;8;6;76;0;56;2;2;59;77;0;0;23;9;0;1;15;21;1;0;23;36;0;1;13;43;0;0;28;0;1;0; sus;0;10;4;2;60;15;6;37;7;23;2;0;0;10;7;17;4;16;5;17;3;4;6;2;27;21;6;8;5;20;7;6;27;27;20;53;15;34;7;3;71;20;0;5;22;4;1;1;36;5;3;7;47;6;2;4;30;7;17;0;34;1;0;0;

  • a27761;

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  • a27762;

Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; age;0;0;0;0;51;81;0;102;0;38;2;0;0;19;31;13;0;33;1;49;0;0;14;1;76;14;0;21;0;40;1;22;89;0;7;119;13;67;0;4;26;82;0;14;32;7;0;2;30;29;1;0;60;48;1;0;22;43;2;0;99;0;1;0; amd;0;0;0;1;83;40;0;74;1;34;0;0;0;33;12;3;0;32;0;44;0;1;14;0;58;34;0;22;0;45;0;30;73;6;4;88;1;88;1;3;59;59;1;10;28;11;0;0;58;5;2;0;40;60;0;0;29;44;1;0;71;0;0;1; roa;0;3;2;0;72;45;0;71;0;37;1;0;3;24;20;10;1;33;1;42;0;2;42;0;52;7;0;21;0;58;5;51;47;1;19;83;11;76;10;14;34;62;3;9;30;10;0;1;37;20;10;0;35;66;3;0;21;41;2;0;70;0;1;0; saci;0;16;5;0;40;66;9;89;0;37;0;1;4;28;8;26;4;30;2;46;0;16;10;0;48;32;1;29;3;47;6;25;63;22;40;71;8;76;2;5;28;69;1;15;42;8;0;3;35;29;5;0;26;75;1;1;23;50;7;0;94;1;0;0; sma;0;0;1;0;75;45;0;76;0;39;0;0;0;23;28;6;0;31;0;39;0;1;40;1;58;10;0;20;0;49;2;43;55;0;6;101;1;81;0;2;48;58;2;10;29;9;0;0;39;18;6;0;36;66;1;0;21;49;1;0;73;1;0;0; sgr;0;0;4;0;69;49;0;80;0;41;0;0;0;24;25;4;0;30;0;39;0;1;34;1;60;12;0;18;0;44;4;30;68;0;6;97;0;85;0;1;48;63;2;11;29;8;0;1;40;18;3;0;39;70;1;0;17;56;1;0;66;0;1;0; sho;0;0;4;0;76;42;0;71;0;38;0;0;0;23;30;4;0;32;0;38;0;3;34;0;64;13;0;18;0;50;2;39;63;0;3;106;1;81;0;2;45;64;1;12;28;9;0;0;39;18;2;0;34;71;1;0;18;49;0;0;71;1;0;0; sus;0;21;7;0;75;25;7;83;3;33;3;0;1;28;11;17;10;30;4;38;1;3;14;0;64;18;7;22;3;50;14;17;78;10;71;53;27;55;2;8;51;30;0;15;35;8;1;3;49;9;10;6;74;20;0;0;45;30;21;0;83;0;1;0;

  • a63551;

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  • a63552;

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  • a6114;

Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; age;0;0;0;0;28;48;0;39;0;34;2;0;0;16;11;10;3;22;2;14;0;0;3;0;47;11;4;23;1;26;0;3;49;7;3;60;9;37;0;2;16;59;0;3;17;24;2;2;7;46;0;1;28;35;0;0;18;33;1;0;22;0;0;1; amd;0;1;0;0;65;1;0;36;0;35;0;0;0;21;14;5;1;38;0;26;0;0;3;0;38;23;0;24;0;30;0;6;57;14;14;58;3;65;1;3;45;38;1;2;23;24;1;0;44;13;1;1;26;54;3;1;30;25;0;0;32;0;1;0; roa;0;1;0;0;46;26;0;37;0;30;1;0;0;21;14;9;2;41;0;28;0;0;9;0;35;15;0;27;0;29;5;20;42;9;13;61;9;65;4;3;46;35;0;3;15;23;0;3;30;23;3;0;43;41;1;0;23;33;0;1;29;0;0;1; saci;0;9;5;0;19;42;10;38;1;34;0;0;1;14;6;13;11;22;3;24;0;12;8;0;23;21;5;16;4;23;15;2;38;15;17;47;13;53;8;6;18;57;1;2;22;29;2;5;27;36;5;0;14;57;0;8;11;33;1;0;36;1;0;0; sma;0;0;0;0;75;1;0;36;0;34;1;0;0;14;17;7;1;33;1;28;0;1;7;0;44;11;0;21;0;28;3;14;51;5;3;73;2;63;4;3;34;75;1;3;18;24;0;1;37;21;1;3;21;57;2;0;17;35;0;0;31;0;0;1; sgr;0;0;0;0;76;0;0;29;0;30;0;0;0;12;18;9;0;34;2;29;0;0;6;3;40;17;0;25;0;27;1;9;55;9;2;69;2;66;1;1;41;73;1;3;22;24;0;0;34;24;1;1;21;51;0;1;16;38;1;0;33;0;0;1; sho;0;1;0;0;73;0;0;36;1;33;0;0;0;7;19;8;0;34;0;30;0;0;0;0;48;19;0;24;1;22;0;3;63;3;2;79;0;65;1;2;36;75;1;3;18;24;0;0;40;20;0;1;23;50;1;1;10;44;1;0;37;1;0;0; sus;1;4;5;1;7;35;13;29;3;34;1;2;0;4;17;8;9;21;7;21;0;1;5;1;44;3;3;15;5;22;6;0;46;4;24;41;23;19;3;4;21;45;1;11;22;23;2;3;22;26;3;3;26;23;2;3;5;29;11;0;38;0;0;1;

  • a6115;

Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; age;0;3;0;0;72;18;0;64;0;31;0;0;1;15;10;22;0;41;1;19;0;1;0;1;32;26;2;18;0;28;4;5;44;12;4;76;3;52;2;0;72;24;0;19;12;20;0;0;28;21;0;0;66;16;0;1;32;12;2;0;32;0;0;1; amd;0;2;1;0;60;28;2;28;0;36;0;1;0;28;10;5;2;45;0;32;0;0;5;0;38;27;0;25;0;33;4;1;65;12;15;48;3;79;4;3;57;48;0;5;15;26;1;0;46;9;2;0;36;67;1;0;30;40;0;0;27;0;0;1; roa;0;7;1;0;50;39;0;37;0;37;0;0;1;21;17;10;3;32;1;26;0;1;10;0;31;31;2;22;0;27;9;20;34;15;15;63;10;80;5;7;43;37;0;7;18;29;0;0;43;17;1;0;42;52;0;0;26;28;1;0;36;0;0;1; saci;0;17;6;0;31;40;6;34;2;28;2;2;0;24;9;18;12;23;4;16;0;2;8;1;38;19;8;18;4;32;5;8;31;27;19;48;12;46;2;7;22;51;3;14;16;24;2;5;27;19;8;1;19;44;0;3;24;25;5;0;35;1;0;0; sma;0;0;1;0;52;47;1;35;0;41;0;0;0;18;28;9;2;29;0;24;0;1;9;0;49;9;0;26;1;34;1;11;54;4;8;80;0;61;3;1;51;52;0;11;13;32;1;0;42;16;1;2;28;54;1;3;35;38;0;0;28;1;0;0; sgr;0;0;0;0;66;32;0;32;0;40;0;1;0;25;23;5;0;31;0;27;1;0;4;0;56;14;0;25;0;30;0;4;64;3;8;71;1;64;1;1;59;52;0;12;15;32;0;0;38;20;1;3;20;66;0;2;39;34;0;0;25;0;1;0; sho;0;1;1;0;73;25;0;35;0;39;0;0;0;16;26;8;0;32;0;21;0;0;8;0;39;20;0;27;1;36;2;8;58;4;2;77;1;65;4;4;47;60;0;12;13;32;0;0;49;10;1;0;32;50;0;1;30;45;0;0;32;1;0;0; sus;0;6;8;1;42;32;18;31;5;31;1;0;5;15;14;9;10;27;10;12;0;1;4;1;44;7;7;19;7;20;4;5;55;5;30;30;24;36;1;3;38;54;2;16;20;26;3;3;23;20;4;6;33;23;2;2;10;31;7;1;35;0;0;1;

  • a27140;

Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; age;0;1;0;0;31;9;0;24;0;6;1;0;0;9;5;1;0;4;1;14;0;1;0;4;14;17;1;9;0;17;4;0;21;13;2;27;1;23;0;0;37;13;0;5;16;1;0;0;17;8;0;1;43;7;0;0;22;7;1;0;29;0;0;1; amd;0;0;0;0;28;12;0;16;0;8;0;0;0;10;9;6;0;7;0;12;1;0;0;0;17;14;0;11;0;14;0;4;33;2;3;24;1;35;1;0;16;26;0;3;14;2;0;0;16;6;0;0;16;41;0;0;5;17;0;0;24;1;0;0; roa;0;0;0;1;20;28;2;7;0;10;0;1;1;9;12;3;0;4;3;9;0;7;0;1;20;16;0;14;0;11;5;2;21;10;12;13;2;41;5;0;19;32;0;3;10;4;2;1;11;13;1;4;17;33;3;0;6;35;0;0;27;0;0;1; saci;0;6;3;1;20;24;1;10;1;7;0;1;1;12;4;11;1;3;2;10;0;5;4;1;16;16;0;11;3;8;6;3;20;9;8;22;6;24;0;4;37;31;0;3;11;4;3;2;14;7;3;0;19;28;3;0;9;16;4;0;14;0;1;0; sma;0;0;0;0;26;10;1;25;0;12;0;0;0;9;11;4;1;4;0;15;0;1;3;0;17;9;0;10;0;12;0;5;35;2;1;33;0;32;1;0;19;28;1;4;15;1;0;0;13;10;0;0;24;35;1;0;14;11;0;0;21;0;0;1; sgr;0;0;0;0;27;10;1;23;0;10;0;0;1;7;12;2;1;5;0;13;0;0;4;1;20;7;1;10;0;11;0;5;36;2;2;31;0;34;0;1;22;28;0;5;15;1;0;0;12;12;0;0;17;41;1;0;7;17;0;0;21;0;0;1; sho;0;0;2;0;14;24;1;20;0;11;0;0;0;3;14;7;0;5;1;6;0;2;1;0;25;9;0;12;0;12;3;1;34;4;5;24;1;39;4;0;12;35;1;3;13;2;0;0;15;10;1;3;16;32;0;0;5;26;0;0;20;0;0;1; sus;0;5;3;0;24;7;2;14;6;4;2;0;4;16;3;5;4;5;7;4;0;3;4;0;15;15;4;7;4;12;8;6;15;14;8;15;19;12;5;1;33;14;0;0;10;0;3;1;17;4;2;4;30;11;1;5;15;5;12;1;20;0;1;0;

  • aseca;

Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; age;0;0;0;0;46;31;1;56;0;25;0;1;0;12;16;10;0;34;3;29;0;0;9;1;55;14;0;20;0;53;1;8;55;9;5;84;6;52;1;1;23;56;0;6;28;7;0;1;17;11;0;1;39;23;1;0;20;28;1;0;48;0;1;0; amd;0;2;1;0;50;34;0;48;0;19;0;0;0;13;12;7;1;28;1;36;0;0;6;0;51;20;0;25;0;40;1;13;64;3;11;84;2;62;1;2;39;50;0;2;29;8;0;0;29;6;0;0;17;58;0;1;25;25;0;0;38;0;0;1; roa;0;3;1;0;35;41;0;46;0;21;0;0;0;19;13;9;1;31;1;29;0;1;12;1;41;17;0;20;2;36;8;10;52;3;13;72;5;68;7;2;37;60;0;1;21;7;1;1;14;15;4;0;17;50;0;1;17;31;0;0;43;0;0;1; saci;0;13;8;0;32;57;11;51;3;37;2;2;2;29;16;11;7;27;9;27;0;5;19;1;35;44;8;21;9;33;7;11;39;24;37;85;20;62;2;11;41;65;2;4;34;19;1;5;21;17;10;3;18;36;3;0;21;30;7;0;53;1;0;0; sma;0;0;0;0;43;38;0;55;0;25;0;1;0;9;23;4;4;26;0;28;0;0;12;0;42;13;1;19;0;43;2;9;59;5;9;96;4;68;1;0;32;48;0;2;26;7;0;1;17;8;3;0;17;51;0;0;21;22;0;0;45;0;0;1; sgr;0;0;1;0;37;42;1;51;0;26;0;0;0;10;20;3;4;26;0;33;0;2;14;0;38;14;0;18;0;44;4;11;61;4;8;92;1;68;1;2;28;55;0;2;26;7;0;0;19;5;1;1;19;56;0;0;18;27;0;0;39;0;1;0; sho;0;1;0;0;46;35;0;51;0;23;0;0;0;10;21;4;1;30;0;27;0;0;12;0;44;16;0;20;0;45;1;8;61;5;4;103;1;64;4;0;28;50;0;2;25;7;0;0;21;6;2;0;21;52;0;0;17;24;0;0;44;0;1;0; sus;1;6;3;0;19;52;23;45;1;27;0;1;1;2;20;7;4;33;12;29;0;1;4;0;64;0;3;19;3;47;4;7;60;0;54;42;27;43;0;4;7;47;1;6;29;6;1;3;5;16;7;3;10;52;2;0;4;42;11;1;42;0;1;0;

  • a4213;

Génome;tta;ttg;ctt;cta;ctg;ctc;aaa;aag;ttt;ttc;tct;tca;agt;tcg;tcc;agc;tat;tac;aat;aac;aga;cga;cgt;agg;cgc;cgg;cat;cac;caa;cag;gga;ggt;ggc;ggg;gaa;gag;gat;gac;gca;gct;gcg;gcc;tgt;tgc;atg;tgg;cca;cct;ccg;ccc;gtt;gta;gtg;gtc;act;aca;acg;acc;att;ata;atc;taa;tag;tga; age;0;1;0;0;53;34;0;54;0;35;0;0;1;8;21;20;0;25;0;35;0;0;5;0;36;2;1;15;0;33;1;5;75;4;1;51;3;43;0;0;22;67;0;6;21;8;0;1;25;29;1;0;61;16;0;0;19;38;2;0;32;0;1;0; amd;0;0;0;0;43;25;1;37;0;34;0;2;1;37;13;6;0;30;0;33;0;0;2;0;34;10;0;17;1;24;0;2;82;0;2;61;0;65;2;2;39;49;0;5;18;10;0;0;46;9;0;0;29;49;0;0;19;51;0;0;47;0;1;0; roa;0;3;6;0;22;43;1;41;0;33;0;1;1;24;22;10;0;31;1;36;0;2;7;0;31;0;1;13;0;25;12;12;67;0;13;47;12;53;24;10;17;32;2;3;20;10;2;3;31;18;14;1;11;56;2;0;11;49;2;0;45;0;1;0; saci;0;8;9;0;28;46;4;35;4;26;5;3;1;27;9;13;12;19;4;31;1;2;6;1;23;18;6;9;8;19;8;9;57;17;24;35;18;38;4;5;35;46;1;4;19;9;0;6;25;26;8;0;26;47;4;1;20;37;8;0;32;0;0;1; sma;0;0;1;0;31;37;0;39;0;32;0;0;0;16;26;7;0;30;0;38;0;2;4;0;35;3;0;13;0;29;0;9;74;1;1;58;0;56;0;2;33;55;0;4;16;9;0;0;40;14;0;0;22;58;0;0;15;52;0;0;43;1;0;0; sgr;0;0;0;1;32;34;0;39;0;32;0;0;0;17;30;5;0;30;0;37;0;1;5;0;31;5;0;11;0;27;1;7;81;2;2;56;0;57;0;0;28;60;0;4;16;9;0;0;39;11;0;1;18;63;0;0;11;65;0;0;43;0;1;0; sho;0;0;0;0;41;29;0;39;0;33;0;1;0;11;33;6;0;30;0;37;0;0;3;0;37;3;0;12;0;27;0;9;76;0;1;60;0;56;0;0;18;72;1;3;17;9;0;0;46;7;0;0;17;66;1;0;12;51;0;0;41;1;0;0; sus;0;1;3;0;46;32;10;23;6;26;1;2;3;11;13;17;12;17;19;17;0;1;4;0;43;1;3;10;3;28;9;8;61;5;27;18;21;30;7;2;32;48;2;5;26;8;2;2;22;26;5;5;39;31;4;2;12;31;3;0;32;0;1;0;

acides aminés[modifier | modifier le wikicode]

par génome[modifier | modifier le wikicode]

  • age;

Gène;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; a1653;98;21;51;48;26;14;0;17;18;69;20;22;98;4;27;14;26;66;38;35;1; a1653m;108;1;20;25;3;5;0;10;13;49;20;7;75;3;18;4;26;50;24;11;1; a1653n;79;9;31;37;19;7;0;4;7;44;19;10;82;2;18;5;23;51;31;18;1; a2777A;114;98;52;52;33;31;0;27;41;101;102;69;98;10;36;8;54;86;51;60;1; a27771;115;53;23;37;21;20;0;16;38;54;81;52;106;3;13;4;47;73;46;36;1; a27761;133;106;54;72;38;51;0;20;48;109;124;97;92;7;24;6;60;117;67;94;1; a27762;132;102;38;65;33;50;0;21;40;112;126;80;112;14;32;7;61;109;66;101;1; a63551;92;52;34;56;34;22;0;17;37;79;93;55;105;9;25;2;59;101;62;63;1; a63552;29;17;12;19;10;11;0;13;11;42;21;18;41;2;10;1;21;39;22;12;1; a6114;76;39;34;39;25;16;0;27;27;59;63;46;77;3;17;24;57;64;51;23;1; a6115;93;64;31;48;41;20;0;20;28;65;80;55;98;19;12;20;49;82;45;34;1; a27140;41;24;6;16;4;15;0;10;17;38;29;24;50;5;16;1;25;51;29;30;1; aseca;77;57;25;39;34;32;0;20;53;73;89;58;81;6;28;7;29;63;49;49;1; a4213;88;54;35;50;25;35;0;16;33;85;52;46;89;6;21;8;55;78;57;34;1;

  • amd;

Gène;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; a1653;84;20;41;32;22;9;0;11;12;78;13;25;76;4;23;13;19;53;36;34;1; a1653m;83;13;36;30;16;6;0;4;12;58;8;17;57;1;13;7;26;50;26;38;1; a1653n;76;10;37;41;13;3;0;3;10;55;8;16;78;4;11;8;21;57;31;23;1; a2777A;115;23;37;48;25;18;0;35;33;101;64;78;162;10;18;14;64;93;34;32;1; a27771;108;34;33;44;22;17;0;19;34;64;79;58;104;1;17;6;31;60;57;34;1; a27761;96;55;37;65;25;45;0;21;37;95;105;83;81;6;26;10;60;94;71;75;1; a27762;124;74;35;48;32;44;0;22;45;109;92;89;122;11;28;11;63;102;73;72;1; a63551;91;37;33;59;27;21;0;19;23;102;86;73;116;11;23;3;64;112;71;60;1; a63552;29;8;13;25;9;11;0;9;14;39;21;24;36;3;7;3;22;37;21;15;1; a6114;67;36;35;40;39;26;0;24;30;77;72;68;87;3;23;24;58;82;59;32;1; a6115;91;30;36;44;47;32;0;25;33;82;63;82;112;5;15;26;56;105;71;27;1; a27140;40;16;8;25;7;12;0;11;14;39;27;36;43;3;14;2;22;57;22;24;1; aseca;87;48;19;32;29;37;0;25;40;81;95;64;92;2;29;8;35;75;51;38;1; a4213;68;38;34;59;30;33;0;17;25;84;63;65;92;5;18;10;55;78;70;47;1;

  • roa;

Gène;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; a1653;86;12;38;32;16;9;0;11;16;69;17;23;95;4;25;10;25;68;32;26;1; a1653m;71;9;34;17;19;4;0;9;13;51;12;17;66;2;17;7;26;70;31;29;1; a1653n;72;7;36;34;12;4;0;4;11;48;16;18;89;1;15;4;26;63;33;22;1; a2777A;112;62;37;64;34;36;0;27;30;105;75;91;117;10;34;15;53;82;51;77;1; a27771;102;35;28;46;24;21;0;18;31;66;73;65;109;0;15;7;33;71;56;29;1; a27761;99;53;36;67;23;40;0;20;40;107;97;90;89;6;30;9;59;102;68;71;1; a27762;122;71;37;58;34;43;0;21;58;104;102;87;120;12;30;10;58;111;65;72;1; a63551;48;18;15;46;15;14;0;6;12;58;40;32;71;8;8;0;36;56;44;31;1; a63552;31;10;16;23;8;10;0;10;13;50;21;25;39;2;6;3;15;34;31;17;1; a6114;73;37;30;45;43;28;0;27;29;76;74;74;88;3;15;23;56;87;57;30;1; a6115;97;37;37;49;35;27;0;24;27;78;78;90;92;7;18;29;60;95;54;37;1; a27140;49;9;10;26;4;12;0;14;11;38;25;43;56;3;10;4;27;55;44;27;1; aseca;80;46;21;41;32;30;0;20;38;73;85;73;106;1;21;7;31;71;49;43;1; a4213;74;42;33;58;31;37;0;14;25;91;60;65;83;5;20;10;54;82;62;47;1;

  • saci;

Gène;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; a1653;93;20;50;42;32;17;0;32;15;74;26;27;95;4;23;14;39;72;39;47;1; a1653m;83;5;27;39;11;8;0;14;6;40;19;7;63;7;14;13;28;30;31;31;1; a1653n;89;7;26;30;20;16;0;7;11;39;11;8;75;2;22;6;27;46;32;29;1; a2777A;136;70;43;61;35;31;0;28;36;93;100;71;123;15;28;5;54;86;49;57;1; a27771;114;35;31;39;19;23;0;18;34;62;66;62;84;3;15;9;47;69;56;47;1; a27761;122;73;39;65;36;37;0;21;47;100;112;75;84;7;25;6;65;85;62;85;1; a27762;127;98;37;67;34;48;0;30;50;116;111;84;104;16;42;8;67;106;75;101;1; a63551;95;35;33;64;27;23;0;12;28;88;94;57;128;15;24;6;52;96;59;59;1; a63552;33;15;14;25;9;15;0;13;13;40;21;22;34;2;8;3;22;27;30;18;1; a6114;75;48;35;34;33;27;0;21;27;70;64;66;89;3;22;29;70;76;52;37;1; a6115;94;40;30;55;35;20;0;26;36;71;67;58;82;17;16;24;53;72;52;40;1; a27140;54;11;8;29;4;12;0;11;11;38;30;30;72;3;11;4;26;50;28;18;1; aseca;110;62;40;62;34;36;0;29;42;81;122;82;119;6;34;19;44;67;54;60;1; a4213;91;39;30;58;31;35;0;15;27;91;59;56;90;5;19;9;57;81;62;40;1;

  • sma;

Gène;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; a1653;82;18;38;32;19;11;0;18;12;79;18;22;74;3;25;8;22;61;35;31;1; a1653m;73;13;33;24;16;6;0;8;14;42;19;14;80;1;14;8;27;54;32;31;1; a1653n;65;14;36;29;16;4;0;6;10;52;12;16;93;1;12;6;27;68;33;25;1; a2777A;108;75;44;58;41;33;0;28;43;105;78;85;100;9;40;14;56;82;57;63;1; a27771;95;36;35;39;17;22;0;18;29;71;81;58;133;0;22;9;33;64;58;25;1; a27761;101;53;39;66;26;40;0;19;39;100;102;88;84;4;28;10;64;105;68;65;1; a27762;121;76;39;57;31;39;0;20;49;100;107;82;108;12;29;9;57;108;71;74;1; a63551;91;41;35;59;27;25;0;19;26;103;93;64;123;9;19;3;60;97;71;74;1; a63552;24;10;14;17;11;11;0;12;12;40;22;21;42;2;10;2;22;43;27;10;1; a6114;76;36;34;39;34;29;0;21;28;73;76;65;116;4;18;24;59;82;54;31;1; a6115;100;36;41;55;31;24;0;26;35;70;88;61;107;11;13;32;59;85;77;28;1; a27140;36;26;12;24;5;15;0;10;12;42;34;32;48;5;15;1;23;59;26;21;1; aseca;81;55;25;37;30;28;0;20;43;75;105;72;81;2;26;7;26;71;43;45;1; a4213;69;39;32;49;30;38;0;13;29;84;59;56;90;4;16;9;54;80;67;43;1;

  • sgr;

Gène;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; a1653;76;19;38;29;17;11;0;18;13;77;18;23;75;3;26;9;22;60;35;36;1; a1653m;72;12;35;27;14;6;0;6;10;44;20;14;77;1;14;8;26;50;32;32;1; a1653n;73;11;38;32;15;6;0;5;9;55;13;16;94;1;12;5;25;64;35;27;1; a2777A;100;74;44;57;41;35;0;31;40;105;78;85;95;9;41;14;54;90;60;64;1; a27771;94;34;33;31;17;23;0;20;33;65;79;57;128;0;22;9;39;69;60;27;1; a27761;98;54;41;65;24;41;0;17;40;97;102;88;84;4;28;9;62;101;68;69;1; a27762;122;80;41;53;30;39;0;18;44;102;103;85;112;13;29;8;59;112;74;67;1; a63551;87;40;35;63;28;26;0;19;24;107;85;66;124;9;19;3;57;96;74;77;1; a63552;27;9;15;17;10;9;0;12;14;40;24;22;41;2;9;2;21;39;27;11;1; a6114;76;29;30;39;34;31;0;25;27;74;71;68;116;4;22;24;58;74;55;34;1; a6115;98;32;40;54;31;27;0;25;30;71;79;65;113;12;15;32;58;90;75;25;1; a27140;37;24;10;22;6;13;0;11;11;43;33;34;51;5;15;1;24;58;25;21;1; aseca;80;52;26;33;30;33;0;18;44;80;100;69;86;2;26;7;24;77;45;39;1; a4213;67;39;32;52;30;37;0;11;27;91;58;57;88;4;16;9;50;82;76;43;1;

  • sho;

Gène;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; a1653;85;16;39;34;16;10;0;17;12;78;21;22;81;3;24;9;25;57;37;30;1; a1653m;68;15;33;24;15;6;0;8;13;39;18;15;74;1;15;8;27;54;34;34;1; a1653n;68;13;38;28;15;5;0;6;11;51;11;18;97;2;13;6;27;64;30;26;1; a2777A;102;70;42;57;43;33;0;30;37;106;73;88;100;10;42;14;57;87;59;65;1; a27771;91;31;36;36;18;20;0;20;27;70;82;56;140;0;23;9;37;60;57;28;1; a27761;100;52;38;62;26;42;0;18;41;97;105;82;82;3;28;9;59;99;72;68;1; a27762;122;71;38;57;32;38;0;18;50;104;109;82;111;13;28;9;57;107;68;71;1; a63551;88;42;36;56;28;26;0;20;28;101;94;64;120;9;18;3;61;100;71;72;1; a63552;26;9;15;16;11;8;0;10;14;39;24;26;41;2;7;3;20;38;21;13;1; a6114;74;36;34;34;34;30;0;24;23;69;81;65;114;4;18;24;60;74;56;38;1; a6115;100;35;39;50;32;21;0;27;37;72;79;66;115;12;13;32;59;83;76;32;1; a27140;40;21;11;24;5;7;0;12;12;42;29;40;51;4;13;2;25;52;31;20;1; aseca;82;51;23;35;31;27;0;20;45;75;107;65;82;2;25;7;27;75;41;44;1; a4213;70;39;33;51;30;37;0;12;27;85;61;56;90;4;17;9;53;83;64;41;1;

  • sus;

Gène;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; a1653;70;21;52;39;23;17;0;17;9;63;13;18;67;5;27;14;25;57;28;44;1; a1653m;77;9;36;35;18;18;0;12;17;35;14;8;54;5;20;15;28;46;22;34;1; a1653n;61;14;39;29;21;11;0;7;11;40;12;14;75;2;18;6;23;37;21;31;1; a2777A;116;70;48;51;37;35;0;27;43;84;93;73;94;17;37;9;49;81;49;59;1; a27771;91;43;30;36;20;22;0;14;25;67;73;49;101;5;22;4;43;63;43;51;1; a27761;126;103;51;64;37;48;0;21;48;108;111;94;97;17;33;8;61;102;74;96;1; a27762;128;90;36;60;40;42;0;29;53;119;124;82;91;15;35;8;62;110;75;104;1; a63551;92;56;39;61;30;33;0;12;26;87;76;62;108;16;27;7;53;89;62;73;1; a63552;35;14;15;27;10;22;0;13;9;31;23;20;25;4;4;2;21;33;24;18;1; a6114;53;42;37;32;30;28;0;18;27;56;65;42;73;12;22;23;53;55;39;49;1; a6115;89;49;36;44;37;22;0;26;27;69;60;60;96;18;20;26;49;66;45;43;1; a27140;39;16;10;30;9;11;0;11;16;43;23;31;53;0;10;0;25;47;26;33;1; aseca;81;68;28;31;37;41;0;22;50;71;96;70;58;7;29;6;25;72;48;54;1; a4213;82;33;32;47;29;36;0;13;31;83;45;51;89;7;26;8;52;80;49;35;1;

par gène de protéine[modifier | modifier le wikicode]

  • a1653;

Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;98;21;51;48;26;14;28;17;18;69;20;22;98;4;27;14;26;66;38;35;1; amd;84;20;41;32;22;9;28;11;12;78;13;25;76;4;23;13;19;53;36;34;1; roa;86;12;38;32;16;9;26;11;16;69;17;23;95;4;25;10;25;68;32;26;1; saci;93;20;50;42;32;17;26;32;15;74;26;27;95;4;23;14;39;72;39;47;1; sma;82;18;38;32;19;11;26;18;12;79;18;22;74;3;25;8;22;61;35;31;1; sgr;76;19;38;29;17;11;26;18;13;77;18;23;75;3;26;9;22;60;35;36;1; sho;85;16;39;34;16;10;32;17;12;78;21;22;81;3;24;9;25;57;37;30;1; sus;70;21;52;39;23;17;15;17;9;63;13;18;67;5;27;14;25;57;28;44;1;

  • a1653m;

Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;108;1;20;25;3;5;34;10;13;49;20;7;75;3;18;4;26;50;24;11;1; amd;83;13;36;30;16;6;15;4;12;58;8;17;57;1;13;7;26;50;26;38;1; roa;71;9;34;17;19;4;19;9;13;51;12;17;66;2;17;7;26;70;31;29;1; saci;83;5;27;39;11;8;31;14;6;40;19;7;63;7;14;13;28;30;31;31;1; sma;73;13;33;24;16;6;23;8;14;42;19;14;80;1;14;8;27;54;32;31;1; sgr;72;12;35;27;14;6;23;6;10;44;20;14;77;1;14;8;26;50;32;32;1; sho;68;15;33;24;15;6;22;8;13;39;18;15;74;1;15;8;27;54;34;34;1; sus;77;9;36;35;18;18;15;12;17;35;14;8;54;5;20;15;28;46;22;34;1;

  • a1653n;

Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;79;9;31;37;19;7;23;4;7;44;19;10;82;2;18;5;23;51;31;18;1; amd;76;10;37;41;13;3;17;3;10;55;8;16;78;4;11;8;21;57;31;23;1; roa;72;7;36;34;12;4;25;4;11;48;16;18;89;1;15;4;26;63;33;22;1; saci;89;7;26;30;20;16;20;7;11;39;11;8;75;2;22;6;27;46;32;29;1; sma;65;14;36;29;16;4;17;6;10;52;12;16;93;1;12;6;27;68;33;25;1; sgr;73;11;38;32;15;6;18;5;9;55;13;16;94;1;12;5;25;64;35;27;1; sho;68;13;38;28;15;5;20;6;11;51;11;18;97;2;13;6;27;64;30;26;1; sus;61;14;39;29;21;11;14;7;11;40;12;14;75;2;18;6;23;37;21;31;1;

  • a2777A;

Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;114;98;52;52;33;31;67;27;41;101;102;69;98;10;36;8;54;86;51;60;1; amd;115;23;37;48;25;18;105;35;33;101;64;78;162;10;18;14;64;93;34;32;1; roa;112;62;37;64;34;36;66;27;30;105;75;91;117;10;34;15;53;82;51;77;1; saci;136;70;43;61;35;31;86;28;36;93;100;71;123;15;28;5;54;86;49;57;1; sma;108;75;44;58;41;33;60;28;43;105;78;85;100;9;40;14;56;82;57;63;1; sgr;100;74;44;57;41;35;61;31;40;105;78;85;95;9;41;14;54;90;60;64;1; sho;102;70;42;57;43;33;64;30;37;106;73;88;100;10;42;14;57;87;59;65;1; sus;116;70;48;51;37;35;79;27;43;84;93;73;94;17;37;9;49;81;49;59;1;

  • a27771;

Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;115;53;23;37;21;20;71;16;38;54;81;52;106;3;13;4;47;73;46;36;1; amd;108;34;33;44;22;17;60;19;34;64;79;58;104;1;17;6;31;60;57;34;1; roa;102;35;28;46;24;21;58;18;31;66;73;65;109;0;15;7;33;71;56;29;1; saci;114;35;31;39;19;23;66;18;34;62;66;62;84;3;15;9;47;69;56;47;1; sma;95;36;35;39;17;22;62;18;29;71;81;58;133;0;22;9;33;64;58;25;1; sgr;94;34;33;31;17;23;63;20;33;65;79;57;128;0;22;9;39;69;60;27;1; sho;91;31;36;36;18;20;67;20;27;70;82;56;140;0;23;9;37;60;57;28;1; sus;91;43;30;36;20;22;63;14;25;67;73;49;101;5;22;4;43;63;43;51;1;

  • a27761;

Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;133;106;54;72;38;51;91;20;48;109;124;97;92;7;24;6;60;117;67;94;1; amd;96;55;37;65;25;45;80;21;37;95;105;83;81;6;26;10;60;94;71;75;1; roa;99;53;36;67;23;40;83;20;40;107;97;90;89;6;30;9;59;102;68;71;1; saci;122;73;39;65;36;37;89;21;47;100;112;75;84;7;25;6;65;85;62;85;1; sma;101;53;39;66;26;40;80;19;39;100;102;88;84;4;28;10;64;105;68;65;1; sgr;98;54;41;65;24;41;79;17;40;97;102;88;84;4;28;9;62;101;68;69;1; sho;100;52;38;62;26;42;78;18;41;97;105;82;82;3;28;9;59;99;72;68;1; sus;126;103;51;64;37;48;93;21;48;108;111;94;97;17;33;8;61;102;74;96;1;

  • a27762;

Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;132;102;38;65;33;50;105;21;40;112;126;80;112;14;32;7;61;109;66;101;1; amd;124;74;35;48;32;44;107;22;45;109;92;89;122;11;28;11;63;102;73;72;1; roa;122;71;37;58;34;43;103;21;58;104;102;87;120;12;30;10;58;111;65;72;1; saci;127;98;37;67;34;48;106;30;50;116;111;84;104;16;42;8;67;106;75;101;1; sma;121;76;39;57;31;39;110;20;49;100;107;82;108;12;29;9;57;108;71;74;1; sgr;122;80;41;53;30;39;108;18;44;102;103;85;112;13;29;8;59;112;74;67;1; sho;122;71;38;57;32;38;114;18;50;104;109;82;111;13;28;9;57;107;68;71;1; sus;128;90;36;60;40;42;100;29;53;119;124;82;91;15;35;8;62;110;75;104;1;

  • a63551;

Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;92;52;34;56;34;22;78;17;37;79;93;55;105;9;25;2;59;101;62;63;1; amd;91;37;33;59;27;21;73;19;23;102;86;73;116;11;23;3;64;112;71;60;1; roa;48;18;15;46;15;14;45;6;12;58;40;32;71;8;8;0;36;56;44;31;1; saci;95;35;33;64;27;23;82;12;28;88;94;57;128;15;24;6;52;96;59;59;1; sma;91;41;35;59;27;25;63;19;26;103;93;64;123;9;19;3;60;97;71;74;1; sgr;87;40;35;63;28;26;63;19;24;107;85;66;124;9;19;3;57;96;74;77;1; sho;88;42;36;56;28;26;65;20;28;101;94;64;120;9;18;3;61;100;71;72;1; sus;92;56;39;61;30;33;61;12;26;87;76;62;108;16;27;7;53;89;62;73;1;

  • a63552;

Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;29;17;12;19;10;11;21;13;11;42;21;18;41;2;10;1;21;39;22;12;1; amd;29;8;13;25;9;11;27;9;14;39;21;24;36;3;7;3;22;37;21;15;1; roa;31;10;16;23;8;10;22;10;13;50;21;25;39;2;6;3;15;34;31;17;1; saci;33;15;14;25;9;15;21;13;13;40;21;22;34;2;8;3;22;27;30;18;1; sma;24;10;14;17;11;11;28;12;12;40;22;21;42;2;10;2;22;43;27;10;1; sgr;27;9;15;17;10;9;28;12;14;40;24;22;41;2;9;2;21;39;27;11;1; sho;26;9;15;16;11;8;28;10;14;39;24;26;41;2;7;3;20;38;21;13;1; sus;35;14;15;27;10;22;25;13;9;31;23;20;25;4;4;2;21;33;24;18;1;

  • a6114;

Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;76;39;34;39;25;16;61;27;27;59;63;46;77;3;17;24;57;64;51;23;1; amd;67;36;35;40;39;26;64;24;30;77;72;68;87;3;23;24;58;82;59;32;1; roa;73;37;30;45;43;28;59;27;29;76;74;74;88;3;15;23;56;87;57;30;1; saci;75;48;35;34;33;27;64;21;27;70;64;66;89;3;22;29;70;76;52;37;1; sma;76;36;34;39;34;29;63;21;28;73;76;65;116;4;18;24;59;82;54;31;1; sgr;76;29;30;39;34;31;66;25;27;74;71;68;116;4;22;24;58;74;55;34;1; sho;74;36;34;34;34;30;67;24;23;69;81;65;114;4;18;24;60;74;56;38;1; sus;53;42;37;32;30;28;54;18;27;56;65;42;73;12;22;23;53;55;39;49;1;

  • a6115;

Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;93;64;31;48;41;20;60;20;28;65;80;55;98;19;12;20;49;82;45;34;1; amd;91;30;36;44;47;32;70;25;33;82;63;82;112;5;15;26;56;105;71;27;1; roa;97;37;37;49;35;27;73;24;27;78;78;90;92;7;18;29;60;95;54;37;1; saci;94;40;30;55;35;20;68;26;36;71;67;58;82;17;16;24;53;72;52;40;1; sma;100;36;41;55;31;24;68;26;35;70;88;61;107;11;13;32;59;85;77;28;1; sgr;98;32;40;54;31;27;75;25;30;71;79;65;113;12;15;32;58;90;75;25;1; sho;100;35;39;50;32;21;67;27;37;72;79;66;115;12;13;32;59;83;76;32;1; sus;89;49;36;44;37;22;57;26;27;69;60;60;96;18;20;26;49;66;45;43;1;

  • a27140;

Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;41;24;6;16;4;15;36;10;17;38;29;24;50;5;16;1;25;51;29;30;1; amd;40;16;8;25;7;12;32;11;14;39;27;36;43;3;14;2;22;57;22;24;1; roa;49;9;10;26;4;12;44;14;11;38;25;43;56;3;10;4;27;55;44;27;1; saci;54;11;8;29;4;12;42;11;11;38;30;30;72;3;11;4;26;50;28;18;1; sma;36;26;12;24;5;15;30;10;12;42;34;32;48;5;15;1;23;59;26;21;1; sgr;37;24;10;22;6;13;32;11;11;43;33;34;51;5;15;1;24;58;25;21;1; sho;40;21;11;24;5;7;37;12;12;42;29;40;51;4;13;2;25;52;31;20;1; sus;39;16;10;30;9;11;37;11;16;43;23;31;53;0;10;0;25;47;26;33;1;

  • aseca;

Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;77;57;25;39;34;32;79;20;53;73;89;58;81;6;28;7;29;63;49;49;1; amd;87;48;19;32;29;37;77;25;40;81;95;64;92;2;29;8;35;75;51;38;1; roa;80;46;21;41;32;30;72;20;38;73;85;73;106;1;21;7;31;71;49;43;1; saci;110;62;40;62;34;36;104;29;42;81;122;82;119;6;34;19;44;67;54;60;1; sma;81;55;25;37;30;28;67;20;43;75;105;72;81;2;26;7;26;71;43;45;1; sgr;80;52;26;33;30;33;68;18;44;80;100;69;86;2;26;7;24;77;45;39;1; sho;82;51;23;35;31;27;72;20;45;75;107;65;82;2;25;7;27;75;41;44;1; sus;81;68;28;31;37;41;69;22;50;71;96;70;58;7;29;6;25;72;48;54;1;

  • a4213;

Génome;Leu;Lys;Phe;Ser;Tyr;Asn;Arg;His;Gln;Gly;Glu;Asp;Ala;Cys;Met;Trp;Pro;Val;Thr;Ile;Stp; age;88;54;35;50;25;35;43;16;33;85;52;46;89;6;21;8;55;78;57;34;1; amd;68;38;34;59;30;33;46;17;25;84;63;65;92;5;18;10;55;78;70;47;1; roa;74;42;33;58;31;37;40;14;25;91;60;65;83;5;20;10;54;82;62;47;1; saci;91;39;30;58;31;35;51;15;27;91;59;56;90;5;19;9;57;81;62;40;1; sma;69;39;32;49;30;38;44;13;29;84;59;56;90;4;16;9;54;80;67;43;1; sgr;67;39;32;52;30;37;42;11;27;91;58;57;88;4;16;9;50;82;76;43;1; sho;70;39;33;51;30;37;43;12;27;85;61;56;90;4;17;9;53;83;64;41;1; sus;82;33;32;47;29;36;49;13;31;83;45;51;89;7;26;8;52;80;49;35;1;