Recherche:Genèse et duplication des gènes des tRNAs/Annexe/Tableur
Paris le 01.08.18
Liste des génomes
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tRNAs;KEGG;Génome 1463;aml;Ailuropoda melanoleuca (panda) (BGI-Shenzhen AilMel 1.0 Dec 2009) 211;acs;Anolis carolinensis (lizard) (Broad AnoCar2.0 May 2010) 414;aga;Anopheles gambiae 684;ath;Arabidopsis thaliana (TAIR10 Feb 2011) 7080;bacu;Balaenoptera acutorostrata scammoni (Minke whale Oct. 2013 BalAcu1.0/balAcu1) 4040;bta;Bos taurus (Cow Jun. 2014 Bos_taurus_UMD_3.1.1/bosTau8) 639;bdi;Brachypodium distachyon (JGI v1.0 8X) 1095;cbr*;Caenorhabditis brenneri (WUGSC 6.0.1 Feb 2008) 743;cbr;Caenorhabditis briggsae (C. briggsae Jan. 2007 WUGSC 1.0/cb3) 596;cel;Caenorhabditis elegans (WS220 Oct 2010) 827;cja*;Caenorhabditis japonica (WUGSC 3.0.2 Mar 2008) 408;cjc;Callithrix jacchus (marmoset) (WUGSC 3.2 Mar 2009) 13727;cmk;Callorhinchus milii (Elephant shark Dec. 2013 Callorhinchus_milii-6.1.3/calMil1) 906;cfa;Canis familiaris (dog) (CanFam3.1 Sept 2011) 383;cpo*;Cavia porcellus (Guinea pig) (Broad Feb 2008) 518;csi*;Ceratotherium simum (White rhinoceros May 2012 CerSimSim1.0/cerSim1) 554;cpic;Chrysemys picta bellii (Painted turtle Dec. 2011 v3.0.1/chrPic1) 498;cge;Cricetulus griseus cell line CHO-K1 (Chinese hamster ovary CriGri 1.0 Aug 2011) 1119;dno*;Dasypus novemcinctus (Armadillo Dec. 2011 Baylor/dasNov3) 289;dme;Drosophila melanogaster (D. melanogaster Aug. 2014 BDGP Release 6 + ISO1 MT/dm6) 256;dsi;Drosophila simulans (D. simulans Apr. 2005 WUGSC mosaic 1.0) 326;dya;Drosophila yakuba (D. yakuba Nov. 2005 WUGSC 7.1) 494;ecb;Equus caballus (horse) (Sep 2007) 485;eeu*;Erinaceus europaeus (Hedgehog May 2012 EriEur2.0/eriEur2) 3729;fca;Felis catus (cat) (Felis_catus-6.2 Sept 2011) 1492;gmo*;Gadus morhua (Atlantic cod May 2010 Genofisk GadMor_May2010/gadMor1) 283;gga;Gallus gallus (galGal4 Nov 2011) 2489;gac*;Gasterosteus aculeatus (stickleback) (Broad 1.0 Feb 2006) 203;gfr;Geospiza fortis (Medium ground finch Apr. 2012 GeoFor_1.0/geoFor1) 738;gmx;Glycine max (soybean) (Wm82.a2) 435;ggo;Gorilla gorilla gorilla (gorilla) (gorGor3.1 May 2011) 367;hgl;Heterocephalus glaber (Naked mole-rat Jan. 2012 Broad HetGla_female_1.0/hetGla2) 622;hsa;Homo sapiens (hg38 - GRCh38 Dec 2013) 373;lcm;Latimeria chalumnae (Coelacanth Aug. 2011 Broad/latCha1) 82;lma;Leishmania major 2002;lav;Loxodonta africana (elephant) (Broad/July 2009) 458;mcc;Macaca mulatta (Rhesus Oct. 2010 BGI CR_1.0/rheMac3) 353;meu*;Macropus eugenii (Wallaby Sep. 2009 TWGS Meug_1.1/macEug2) 582;mtr;Medicago truncatula (March 2009 Version 3.0) 155;mgp;Meleagris gallopavo (turkey) (TGC Turkey_2.01 Dec 2009) 191;mun*;Melopsittacus undulatus (Budgerigar Sep. 2011 WUSTL v6.3/melUnd1) 258;mmr*;Microcebus murinus (Mouse lemur) (Jun 2003) 481;mdo;Monodelphis domestica (opossum) (Broad Oct 2006) 469;mmu;Mus musculus (mm10 Dec 2011) 749;mpu*;Mustela putorius furo (Ferret Apr. 2011 MusPutFur1.0/musFur1) 252;mlu*;Myotis lucifugus (Microbat Jul. 2010 Broad Institute Myoluc2.0/myoLuc2) 421;nle;Nomascus leucogenys (Gibbon Oct. 2012 GGSC Nleu3.0/nomLeu3) 338;opr*;Ochotona princeps (Pika May 2012 OchPri3.0/ochPri3) 674;oni*;Oreochromis niloticus (Nile tilapia Jan. 2011 Broad oreNil1.1/oreNil2) 856;oaa;Ornithorhynchus anatinus (platypus) (WUGSC 5.0.1 Mar 2007) 506;ocu;Oryctolagus cuniculus (rabbit) (Broad Apr 2009) 738;osa;Oryza sativa 326;oga*;Otolemur garnettii (Bushbaby Mar. 2011 Broad/otoGar3) 1176;oas;Ovis aries (sheep) (Feb 2010) 503;ptr;Pan troglodytes (Chimp Feb. 2011 CSAC 2.1.4/panTro4) 476;pan*;Papio anubis (Baboon Mar. 2012 Baylor Panu_2.0/papAnu2) 411;pha*;Papio hamadryas (baboon) (Nov 2008) 2485;pma*;Petromyzon marinus (Lamprey Sep. 2010 WUGSC 7.0/petMar2) 418;ppp;Physcomitrella patens 35;pfa;Plasmodium falciparum 517;ppy*;Pongo pygmaeus abelii (Orangutan July 2007 WUGSC 2.0.2/ponAbe2) 618;pop;Populus trichocarpa (Jan 2010 Version 2.0) 407;rno;Rattus norvegicus (rn5 Mar 2012) 334;sbq;Saimiri boliviensis (Squirrel monkey Oct. 2011 Broad/saiBol1) 446;shr;Sarcophilus harrisii (Tasmanian devil Feb. 2011 WTSI Devil_ref v7.0/sarHar1) 374;san*;Sorex araneus (Shrew Aug. 2008 Broad/sorAra2) 578;sbi;Sorghum bicolor (Version 1.0) 804;str*;Spermophilus tridecemlineatus (Squirrel Nov. 2011 Broad/speTri2) 1065;spu;Strongylocentrotus purpuratus (Sea urchin) 807;ssc;Sus scrofa (Pig Aug. 2011 SGSC Sscrofa10.2/susScr3) 230;tgu;Taeniopygia guttata (Zebra finch Feb. 2013 WashU taeGut324/taeGut2) 575;tru;Takifugu rubripes (Fugu Oct. 2011 FUGU5/fr3) 455;tsy*;Tarsius syrichta (Tarsier Sep. 2013 Tarsius_syrichta-2.0.1/tarSyr2) 540;tng;Tetraodon nigroviridis (tetraodon) (Genoscope 8.0 Mar 2007) 2017;tma*;Trichechus manatus latirostris (Manatee Oct. 2011 Broad v1.0/triMan1) 5845;ttr*;Tursiops truncatus (Dolphin Oct. 2011 Baylor Ttru_1.4/turTru2) 499;vvi;Vitis vinifera (Grapevine 12X) 2639;xtr;Xenopus tropicalis (frog) (JGI 4.2 Nov 2009) 1198;zma;Zea mays (Version 5b.60)
E79 décomptes
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acs;;;;aga;;;;aml;;;;ath;;;;bacu;;;;bdi;;;;bta;;;;cbr;;;;cbre;;;;cel;;;;cfa;;;;cge;;;;cjap;;;;cjc;;;;cmk;;;;cpic;;;;cpo;;;;csi;;;;dme;;;;dno;;;;dsi;;;;dya;;;;ecb;;;;eeu;;;;fca;;;;gac;;;;gfr;;;;gga;;;;ggo;;;;gmo;;;;gmx;;;;hgl;;;;hsa-18;;;;lav;;;;lcm;;;;lma;;;;mcc;;;;mdo;;;;meu;;;;mgp;;;;mlu;;;;mmr;;;;mmu;;;;mpu;;;;mtr;;;;mun;;;;nle;;;;oaa;;;;oas;;;;ocu;;;;oga;;;;oni;;;;opr;;;;osa;;;;pan;;;;pfa;;;;pha;;;;pma;;;;pop;;;;ppp;;;;ppy;;;;ptr;;;;rno;;;;san;;;;sbi;;;;sbq;;;;shr;;;;spu;;;;ssc;;;;str;;;;tgu;;;;tma;;;;tng;;;;tru;;;;tsy;;;;ttr;;;;vvi;;;;xtr;;;;zma;;;;;;dre;;;; 5;3;(AAC);;31;7;(AAC);;10;2;(AAC);;15;3;(AAC);;14;9;(AAC);;16;5;(AAC);;6;6;(AAA);;25;7;(AAC);;33;3;(AAC);;19;4;(AAC);;6;4;(AAC);;13;9;(AAC);;1;1;(AAA);;7;4;(AAC);;3;3;(AAA);;2;2;(AAA);;;;;;11;6;(AAC);;6;2;(AAC);;12;8;(AAC);;7;2;(AAC);;7;2;(AAC);;12;5;(AAC);;7;4;(AAC);;1;1;(AAA);;21;12;(AAC);;2;2;(AAC);;7;5;(AAC);;9;7;(AAC);;6;6;(AAA);;22;7;(AAC);;12;11;(AAC);;10;6;(AAC);;1;1;(AAA);;3;3;(AAC);;2;1;(AAC);;10;7;(AAC);;9;3;(AAC);;1;1;(AAA);;3;3;(AAC);;5;2;(AAC);;4;2;(AAC);;8;6;(AAC);;8;5;(AAC);;1;1;(AAA);;4;3;(AAC);;1;1;(AAA);;1;1;(AAA);;1;1;(AAA);;12;8;(AAC);;1;1;(AAA);;8;2;(AAC);;7;5;(AAC);;18;7;(AAC);;1;1;(AAA);;1;1;(AAC);;9;4;(AAC);;2;2;(AAA);;6;5;(AAA);;2;2;(AAA);;10;6;(AAC);;11;5;(AAC);;1;1;(AAA);;;;;;16;7;(AAC);;6;4;(AAC);;8;1;(AAC);;2;2;(AAA);;10;6;(AAC);;1;1;(AAA);;2;2;(AAA);;1;1;(AAA);;1;1;(AAA);;1;1;(AAA);;6;5;(AAC);;8;7;(AAC);;2;2;(AAA);;2;2;(AAA);;1;1;(AAA);;;;10;10;(AAA);; 4;2;(AAG);;5;2;(AAG);;7;5;(AAG);;12;3;(AAG);;6;2;(AAG);;14;7;(AAG);;20;13;(AAC);;26;5;(AAG);;32;3;(AAG);;20;6;(AAG);;4;1;(AAG);;5;2;(AAG);;23;4;(AAC);;8;4;(AAG);;22;16;(AAC);;16;15;(AAC);;6;2;(AAC);;6;3;(AAG);;4;1;(AAG);;5;2;(AAG);;5;1;(AAG);;5;1;(AAG);;7;2;(AAG);;6;2;(AAG);;8;4;(AAC);;49;18;(AAG);;4;3;(AAG);;3;3;(AAG);;9;5;(AAG);;21;13;(AAC);;16;1;(AAG);;5;3;(AAG);;9;4;(AAG);;41;34;(AAC);;4;3;(AAG);;3;1;(AAG);;9;7;(AAC);;8;3;(AAG);;8;3;(AAC);;1;1;(AAG);;3;2;(AAG);;5;2;(AAG);;5;3;(AAG);;6;2;(AAG);;17;6;(AAC);;3;3;(AAG);;11;7;(AAC);;23;16;(AAC);;7;4;(AAC);;5;3;(AAG);;6;3;(AAC);;14;9;(AAG);;5;3;(AAG);;15;4;(AAG);;9;5;(AAC);;1;1;(AAG);;9;5;(AAG);;166;70;(AAC);;17;4;(AAC);;13;3;(AAC);;16;10;(AAG);;11;6;(AAG);;8;5;(AAC);;7;2;(AAC);;15;4;(AAG);;7;3;(AAG);;9;3;(AAG);;20;3;(AAC);;8;3;(AAG);;18;14;(AAC);;9;8;(AAC);;11;8;(AAC);;10;7;(AAC);;19;11;(AAC);;6;3;(AAG);;6;1;(AAG);;15;7;(AAC);;55;19;(AAC);;22;11;(AAC);;;;232;86;(AAC);; 6;2;(AAT);;12;2;(AAT);;12;5;(AAT);;17;2;(AAT);;12;6;(AAT);;20;7;(AAT);;11;5;(AAG);;21;4;(AAT);;33;2;(AAT);;21;2;(AAT);;9;5;(AAT);;13;3;(AAT);;26;4;(AAG);;13;8;(AAT);;20;14;(AAG);;2;2;(AAG);;5;2;(AAG);;13;6;(AAT);;10;2;(AAT);;12;6;(AAT);;9;3;(AAT);;10;2;(AAT);;20;7;(AAT);;9;2;(AAT);;6;1;(AAG);;101;17;(AAT);;6;2;(AAT);;7;1;(AAT);;14;9;(AAT);;33;22;(AAG);;31;19;(AAT);;8;3;(AAT);;15;10;(AAT);;22;18;(AAG);;7;6;(AAT);;3;1;(AAT);;12;8;(AAT);;13;1;(AAT);;5;3;(AAG);;3;2;(AAT);;10;4;(AAT);;4;2;(AAT);;12;5;(AAT);;10;4;(AAT);;9;6;(AAG);;5;2;(AAT);;10;6;(AAG);;8;5;(AAG);;6;3;(AAG);;11;5;(AAT);;4;1;(AAG);;25;13;(AAT);;8;2;(AAT);;18;4;(AAT);;8;4;(AAG);;1;1;(AAT);;12;7;(AAT);;112;56;(AAG);;49;36;(AAG);;6;1;(AAG);;16;9;(AAT);;17;11;(AAT);;1;1;(AAG);;6;2;(AAG);;17;3;(AAT);;11;5;(AAT);;11;1;(AAT);;18;13;(AAG);;13;1;(AAT);;6;3;(AAG);;2;2;(AAG);;8;5;(AAG);;15;13;(AAG);;11;8;(AAG);;8;3;(AAT);;11;6;(AAT);;10;5;(AAG);;38;18;(AAG);;29;10;(AAG);;;;270;146;(AAG);; 4;2;(ACG);;10;1;(ACG);;8;3;(ACG);;11;7;(ACG);;2;2;(ACA);;16;4;(ACG);;18;4;(AAT);;22;5;(ACG);;2;2;(ACA);;18;4;(ACG);;6;5;(ACG);;1;1;(ACC);;26;6;(AAT);;6;2;(ACG);;31;23;(AAT);;11;9;(AAT);;10;3;(AAT);;10;6;(ACG);;10;1;(ACG);;24;24;(ACC);;9;1;(ACG);;12;1;(ACG);;10;4;(ACG);;6;3;(ACG);;10;2;(AAT);;49;12;(ACG);;6;5;(ACG);;8;4;(ACG);;1;1;(ACA);;26;21;(AAT);;13;2;(ACG);;4;4;(ACC);;7;2;(ACG);;43;30;(AAT);;5;5;(ACA);;4;1;(ACG);;2;2;(ACA);;4;4;(ACA);;6;2;(AAT);;2;2;(ACG);;6;5;(ACG);;1;1;(ACA);;1;1;(ACA);;6;3;(ACG);;23;9;(AAT);;3;2;(ACG);;13;9;(AAT);;27;17;(AAT);;6;3;(AAT);;7;3;(ACG);;10;4;(AAT);;1;1;(ACA);;7;3;(ACG);;1;1;(ACA);;14;9;(AAT);;1;1;(AGA);;2;2;(ACA);;110;63;(AAT);;20;6;(AAT);;12;3;(AAT);;7;3;(ACG);;1;1;(ACA);;12;7;(AAT);;15;8;(AAT);;15;4;(ACG);;1;1;(ACA);;4;4;(ACG);;69;12;(AAT);;1;1;(ACA);;14;8;(AAT);;40;35;(AAT);;13;8;(AAT);;18;10;(AAT);;12;3;(AAT);;1;1;(ACA);;6;5;(ACA);;15;6;(AAT);;63;18;(AAT);;69;37;(AAT);;;;258;129;(AAT);; 5;1;(AGA);;6;2;(AGA);;2;2;(ACT);;37;11;(AGA);;12;11;(ACC);;11;3;(AGA);;143;134;(ACA);;17;3;(AGA);;32;4;(ACG);;1;1;(ACT);;10;5;(AGA);;6;3;(ACG);;21;4;(ACG);;9;4;(AGA);;1;1;(ACA);;5;5;(ACA);;7;3;(ACG);;13;5;(AGA);;8;3;(AGA);;10;5;(ACG);;8;3;(AGA);;9;3;(AGA);;12;4;(AGA);;7;2;(AGA);;1;1;(ACA);;52;14;(AGA);;2;1;(AGA);;9;5;(AGA);;7;4;(ACG);;31;23;(ACG);;15;5;(AGA);;5;3;(ACG);;9;4;(AGA);;1;1;(ACA);;4;2;(ACG);;1;1;(AGA);;6;3;(ACG);;5;5;(ACG);;7;5;(ACG);;5;3;(AGA);;6;2;(AGA);;6;4;(ACG);;2;2;(ACC);;8;3;(AGA);;1;1;(ACA);;4;4;(AGA);;1;1;(ACA);;2;2;(ACC);;16;16;(ACA);;10;3;(AGA);;6;4;(ACG);;16;4;(ACG);;7;2;(AGA);;24;7;(ACG);;4;4;(ACA);;1;1;(AGC);;7;4;(ACG);;1;1;(ACC);;1;1;(ACA);;1;1;(ACC);;11;8;(AGA);;7;2;(ACG);;6;3;(ACG);;9;5;(ACG);;11;3;(AGA);;6;2;(ACG);;10;3;(AGA);;29;9;(ACG);;7;2;(ACG);;7;7;(ACC);;1;1;(ACA);;5;5;(ACA);;14;4;(ACG);;16;3;(ACG);;6;3;(ACG);;19;18;(ACC);;1;1;(ACA);;2;2;(ACA);;1;1;(ACA);;;;9;9;(ACA);; 12;6;(AGC);;17;4;(AGC);;10;4;(AGA);;16;3;(AGC);;9;6;(ACG);;19;3;(AGC);;20;20;(ACC);;29;7;(AGC);;20;4;(AGA);;15;4;(AGA);;14;11;(AGC);;6;1;(AGA);;19;5;(AGA);;15;13;(AGC);;2;2;(ACC);;7;5;(ACG);;8;2;(AGA);;23;16;(AGC);;12;2;(AGC);;10;3;(AGA);;9;1;(AGC);;18;4;(AGC);;27;16;(AGC);;14;10;(AGC);;2;2;(ACC);;53;22;(AGC);;16;7;(AGC);;24;11;(AGC);;11;5;(AGA);;1;1;(ACT);;24;3;(AGC);;2;2;(ACT);;26;16;(AGC);;4;4;(ACC);;3;3;(AGA);;2;1;(AGC);;9;4;(AGA);;12;6;(AGA);;8;2;(AGA);;7;3;(AGC);;8;5;(AGC);;7;6;(AGA);;6;3;(ACG);;15;13;(AGC);;1;1;(ACC);;9;2;(AGC);;7;3;(ACG);;12;8;(ACG);;5;5;(ACC);;21;14;(AGC);;2;2;(ACT);;2;2;(ACT);;15;11;(AGC);;12;5;(AGA);;7;3;(ACG);;1;1;(AGG);;9;3;(AGA);;85;30;(ACG);;12;8;(ACG);;8;3;(ACG);;22;19;(AGC);;3;3;(ACT);;1;1;(ACT);;8;4;(AGA);;27;13;(AGC);;9;3;(AGA);;18;8;(AGC);;26;9;(ACT);;10;4;(AGA);;6;3;(ACG);;1;1;(ACC);;9;9;(ACC);;1;1;(ACT);;11;6;(AGA);;7;4;(AGA);;7;5;(ACG);;11;10;(ACG);;33;13;(ACG);;35;10;(ACG);;;;11;11;(ACC);; 3;1;(AGG);;7;5;(AGG);;17;14;(AGC);;16;5;(AGG);;10;7;(AGA);;15;4;(AGG);;13;6;(ACG);;6;4;(AGG);;35;2;(AGC);;22;6;(AGC);;8;1;(AGG);;22;17;(AGC);;31;8;(AGC);;7;1;(AGG);;9;5;(ACG);;3;3;(ACT);;28;24;(AGC);;10;2;(AGG);;7;1;(AGG);;23;16;(AGC);;6;1;(AGG);;6;1;(AGG);;10;1;(AGG);;10;2;(AGG);;9;4;(ACG);;63;5;(AGG);;4;1;(AGG);;7;1;(AGG);;23;20;(AGC);;30;18;(AGA);;21;5;(AGG);;7;5;(AGA);;9;2;(AGG);;14;10;(ACG);;5;2;(AGC);;2;1;(AGG);;22;18;(AGC);;15;6;(AGC);;13;9;(AGC);;7;2;(AGG);;6;1;(AGG);;11;8;(AGC);;10;5;(AGA);;9;1;(AGG);;12;7;(ACG);;3;3;(AGG);;10;7;(AGA);;18;11;(ACT);;2;2;(ACG);;9;1;(AGG);;6;4;(AGA);;10;4;(AGA);;8;1;(AGG);;20;4;(AGC);;10;4;(AGA);;1;1;(CAA);;19;16;(AGC);;22;8;(AGA);;1;1;(ACT);;13;3;(AGA);;11;3;(AGG);;12;6;(AGA);;11;9;(AGA);;10;8;(AGC);;14;5;(AGG);;15;12;(AGC);;10;2;(AGG);;32;11;(AGC);;23;18;(AGC);;15;9;(AGA);;6;4;(ACG);;8;5;(ACG);;14;9;(AGA);;12;5;(AGC);;12;10;(AGC);;12;9;(AGA);;13;9;(AGA);;40;17;(AGA);;13;5;(AGA);;;;203;56;(ACG);; 4;3;(AGT);;8;1;(AGT);;9;2;(AGG);;10;3;(AGT);;20;18;(AGC);;9;7;(AGT);;4;4;(ACT);;22;2;(AGT);;25;12;(AGG);;6;4;(AGG);;8;6;(AGT);;7;1;(AGG);;9;2;(AGG);;10;9;(AGT);;26;14;(AGA);;24;22;(AGA);;8;2;(AGG);;10;7;(AGT);;9;3;(AGT);;7;1;(AGG);;8;1;(AGT);;8;1;(AGT);;9;7;(AGT);;9;7;(AGT);;2;2;(ACT);;99;50;(AGT);;5;3;(AGT);;4;4;(AGT);;10;5;(AGG);;55;31;(AGC);;9;6;(AGT);;46;45;(AGC);;9;6;(AGT);;3;3;(ACT);;12;10;(AGG);;3;1;(AGT);;8;2;(AGG);;11;1;(AGG);;7;3;(AGG);;4;4;(AGT);;5;3;(AGT);;7;1;(AGG);;23;19;(AGC);;10;8;(AGT);;12;5;(AGA);;5;4;(AGT);;19;17;(AGC);;83;51;(AGC);;2;1;(AGA);;8;6;(AGT);;13;8;(AGC);;18;7;(AGC);;7;6;(AGT);;14;4;(AGG);;20;16;(AGC);;1;1;(CAC);;7;2;(AGG);;106;44;(AGC);;14;6;(AGA);;19;9;(AGC);;12;8;(AGT);;31;26;(AGC);;36;31;(AGC);;8;1;(AGG);;12;9;(AGT);;9;4;(AGG);;9;5;(AGT);;19;5;(AGG);;9;1;(AGG);;256;252;(AGC);;3;2;(ACT);;5;5;(ACT);;20;13;(AGC);;10;3;(AGG);;7;2;(AGG);;19;14;(AGC);;11;2;(AGC);;67;17;(AGC);;66;32;(AGC);;;;14;11;(ACT);; 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3;1;(CAC);;29;8;(CAC);;1;1;(ATC);;8;2;(CAC);;13;9;(AGT);;3;3;(ATG);;31;19;(AGC);;6;3;(CAC);;2;2;(ATA);;7;7;(CAA);;1;1;(ATT);;4;4;(CAA);;7;7;(CAA);;1;1;(ATC);;12;11;(AGG);;12;8;(AGG);;1;1;(ATC);;2;2;(ATT);;7;2;(CAC);;1;1;(ATG);;6;2;(CAC);;4;4;(CAA);;1;1;(ATG);;4;2;(CAC);;18;14;(AGC);;7;6;(CAA);;2;2;(CAA);;7;5;(CAC);;4;4;(ATA);;30;20;(AGT);;18;8;(CAA);;15;15;(AGT);;7;7;(CAA);;54;40;(AGC);;2;2;(ATA);;2;1;(CAC);;1;1;(ATA);;1;1;(ATC);;1;1;(ATA);;3;3;(CAC);;3;3;(CAA);;3;3;(CAA);;11;9;(AGT);;6;6;(ATT);;7;1;(AGG);;4;2;(CAC);;12;9;(AGT);;23;16;(AGT);;4;1;(AGG);;1;1;(ATT);;9;8;(AGT);;18;12;(AGT);;7;2;(CAC);;2;2;(ATA);;11;7;(AGT);;2;2;(CAT);;1;1;(ATC);;62;33;(AGT);;14;2;(AGG);;10;2;(AGT);;1;1;(ATC);;10;8;(AGT);;9;7;(AGT);;4;4;(CAA);;2;2;(ATC);;2;2;(ATA);;10;4;(CAC);;18;12;(CAA);;10;9;(ATC);;34;32;(AGT);;18;10;(AGC);;20;16;(AGC);;26;17;(AGT);;1;1;(ATA);;1;1;(ATC);;9;7;(AGT);;10;6;(AGT);;151;75;(AGT);;20;13;(AGT);;;;92;26;(AGC);; 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5;3;(TTT);;;;;;11;8;(TGG);;9;5;(TGT);;5;5;(TGA);;13;6;(TGC);;8;8;(TAT);;;;;;11;4;(TGC);;14;1;(TTT);;3;3;(TTA);;7;5;(TTC);;30;7;(TTT);;4;4;(TCG);;145;116;(TAC);;24;14;(TCC);;4;2;(TGG);;8;6;(TGT);;;;;;7;2;(TGG);;;;;;332;104;3.19;;7;5;(TGT);;485;322;1.51;;9;9;(TAT);;60;13;(TTG);;203;140;1.45;;6;4;(TTT);;5;5;(TCT);;21;19;(TCT);;13;3;(TTG);;5;4;(TGC);;6;4;(TTG);;18;14;(TCG);;10;7;(TGG);;;;;;5;3;(TCC);;13;4;(TTT);;12;6;(TTC);;;;;;252;142;1.77;;258;153;1.69;;6;6;(TCT);;2;2;(TTA);;15;6;(TCC);;3;2;(TTT);;7;7;(TCG);;6;6;(TGA);;6;6;(TCG);;7;6;(TGT);;1;1;(TTA);;25;22;(TGT);;338;188;1.80;;10;1;(TGC);;5;5;(TCG);;;;;;9;9;(TGC);;18;10;(TCT);;23;10;(TGG);;5;3;(TGA);;8;5;(TCC);;4;4;(TAG);;10;5;(TTC);;10;9;(TTC);;10;3;(TCC);;8;7;(TGC);;14;6;(TTT);;1066;427;;;1;1;(TTA);;5;3;(TCC);;4;4;(TGA);;1073;1068;(TCC);;11;9;(TGC);;9;5;(TGG);;32;32;(TGG);;7;7;(TCG);;19;12;(TCC);;80;27;(TCC);;11;5;(TGA);;;;73;54;(TAA);; 211;119;1.77;;;;;;9;8;(TGT);;1;1;(TTA);;42;42;(TGC);;18;10;(TGG);;29;29;(TCA);;;;;;54;6;(TGG);;596;180;;;15;11;(TTC);;5;4;(TTG);;827;220;;;6;6;(TCT);;20;18;(TAG);;5;4;(TCG);;4;3;(TGT);;11;7;(TTC);;;;;;8;7;(TGT);;;;;;;;;;11;6;(TTC);;;;;;18;18;(TCA);;61;31;(TTT);;;;;;283;169;1.67;;5;5;(TGA);;18;15;(TGA);;20;5;(TTT);;5;4;(TGG);;12;8;(TTT);;90;90;(TCT);;9;8;(TGT);;;;;;5;5;(TCG);;481;222;2.17;;4;3;(TTG);;;;;;;;;;;;;;3;2;(TGA);;7;6;(TTC);;5;2;(TCG);;201;149;1.35;;7;7;(TCT);;17;11;(TGC);;22;22;(TCT);;18;9;(TTC);;5;4;(TTC);;14;8;(TTC);;;;;;14;9;(TGG);;6;6;(TCT);;;;;;6;4;(TGG);;20;10;(TGA);;11;6;(TGT);;9;2;(TGC);;6;5;(TCG);;5;5;(TAT);;6;5;(TTG);;5;3;(TTG);;4;1;(TCG);;5;3;(TGG);;448;218;2.06;;;;;;235;205;(TTC);;5;5;(TCG);;7;5;(TGC);;12;12;(TCG);;14;10;(TGG);;7;6;(TGT);;4;4;(TGT);;48;48;(TCT);;6;3;(TCG);;33;8;(TCG);;15;7;(TGC);;;;230;59;(TAC);; 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;;;;;;;;43;42;(TTG);;16;6;(TTT);;24;24;(TTA);;15;8;(TTG);;44;44;(TCT);;;;;;40;11;(TTG);;;;;;912;773;;;;;;;;;;;6;3;(TGG);;66;44;(TCC);;15;12;(TGC);;11;7;(TTT);;519;358;1.45;;;;;;18;14;(TTT);;;;;;;;;;494;300;1.65;;;;;;54;54;(TCT);;;;;;;;;;;;;;6;5;(TGT);;30;24;(TGT);;;;;;3;3;(TTG);;;;;;14;12;(TGG);;10;9;(TTG);;;;;;11;11;(TGC);;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;4;3;(TGT);;756;632;;;16;8;(TGC);;;;;;5;3;(TGG);;3;3;(TTA);;6;4;(TGG);;506;281;;;327;203;1.61;;674;401;1.68;;;;;;21;12;(TTG);;6;4;(TGG);;;;;;13;7;(TTC);;19;9;(TGT);;11;1;(TTG);;7;2;(TTC);;9;7;(TGC);;6;6;(TCG);;;;;;;;;;13;5;(TGC);;21;17;(TTC);;;;;;;;;;808;572;1.41;;39;39;(TGC);;2;2;(TTC);;40;37;(TGC);;9;5;(TTG);;20;13;(TTT);;64;51;(TTG);;5;3;(TGG);;37;21;(TGC);;47;18;(TGC);;22;10;(TTC);;;;14;12;(TCA);; 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0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;;;;;;;;;0;0;(ATA);;;;;;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;;;;;;;;;;;;;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;;;;;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;;;;;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;;;;;;;;;;;;;0;0;(ATC);;;;;;0;0;(ATA);;;;;;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;;;;;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;;;;;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;;;;;0;0;(ATA);;;;;;;;;;0;0;(ATC);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;;;;;;;;;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;;;;;;;;;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;;;;;;;;;;;;;0;0;(ATA);;;;;;;;;;0;0;(ATA);;0;0;(ATA);;;;;;;;(ATA) 0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;;;;;0;0;(ATC);;;;;;0;0;(ATC);;;;;;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;;;;;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;;;;;;;;;0;0;(ATC);;;;;;;;;;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;;;;;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;;;;;0;0;(ATC);;;;;;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;;;;;0;0;(ATG);;;;;;;;;;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;;;;;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;;;;;;;;;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;;;;;;;;;0;0;(ATG);;;;;;;;;;0;0;(ATC);;;;;;;;;;;;;;;;;;0;0;(ATC);;;;;;;;;;0;0;(ATC);;0;0;(ATC);;;;;;;;;;0;0;(ATC);;;;;;0;0;(ATC);;;;;;;;;;;;;;;;;;0;0;(ATC);;;;;;;;;;;;(ATC) 0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;;;;;;;;;0;0;(ATG);;;;;;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;;;;;;;;;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;;;;;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;;;;;0;0;(ATG);;;;;;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;;;;;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;;;;;0;0;(ATG);;0;0;(ATT);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;;;;;0;0;(ATG);;;;;;0;0;(ATG);;;;;;;;;;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;;;;;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATT);;0;0;(ATG);;;;;;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;;;;;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;0;0;(ATG);;;;;;;;;;0;0;(ATG);;;;;;;;;;;;;;;;0;0;(ATG);;(ATG) 0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;;;;;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;;;;;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;;;;;;;;;0;0;(ATT);;;;;;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;;;;;;;;;0;0;(ATT);;;;;;;;;;;;;;0;0;(ATT);;;;;;;;;;;;;;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;;;;;;;;;0;0;(CTA);;;;;;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;;;;;;;;;0;0;(ATT);;;;;;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;;;;;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;;;;;0;0;(CTA);;;;;;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;;;;;;;;;;;;;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;;;;;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;;;;;;;;;;;;;;;;;0;0;(ATT);;0;0;(ATT);;;;;;0;0;(ATT);;;;;;;;;;0;0;(ATT);;;;;;;;(ATT) 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0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;;;;;;;;;;;;;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;;;;;;;;;0;0;(GAC);;;;;;;;;;0;0;(GAC);;;;;;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;;;;;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;;;;;;;;;;;;;;;;;0;0;(GAC);;;;;;;;;;0;0;(GAC);;;;;;0;0;(GAC);;0;0;(GAG);;;;;;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;;;;;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;;;;;0;0;(GAC);;;;;;;;;;;;;;;;;;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;;;;;;;;;0;0;(GAG);;;;;;;;;;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;;;;;;;;;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;;;;;;;;;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;;;;;;;;;;;;;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;;;;;;;;;0;0;(GAC);;;;;;;;;;;;(GAC) 0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;;;;;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;;;;;;;;;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAT);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAT);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;;;;;;;;;;;;;;;;;0;0;(GAG);;;;;;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;;;;;0;0;(GAG);;;;;;;;(GAG) 0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;;;;;;;;;;;;;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;;;;;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;;;;;0;0;(GAT);;;;;;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;;;;;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;;;;;0;0;(GAT);;;;;;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;;;;;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GCG);;;;;;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;;;;;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;;;;;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;;;;;;;;;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;;;;;0;0;(GCG);;;;;;0;0;(GAT);;;;;;0;0;(GAT);;;;;;;;;;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;;;;;0;0;(GAT);;;;;;0;0;(GAT);;;;;;;;;;;;;;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;;;;;;;;;0;0;(GAT);;;;;;;;(GAT) 0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;;;;;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;;;;;;;;;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;;;;;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;;;;;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GGA);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;;;;;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GGA);;0;0;(GCG);;;;;;0;0;(GCG);;;;;;0;0;(GCG);;;;;;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;;;;;;;;;0;0;(GCG);;;;;;0;0;(GCG);;;;;;0;0;(GCG);;;;;;;;(GCG) 0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;;;;;;;;;;;;;;;;;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;;;;;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;;;;;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;;;;;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGC);;;;;;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;;;;;0;0;(GGA);;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;;;;;;;;;0;0;(GGC);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;;;;;0;0;(GGA);;;;;;;;;;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;;;;;;;;;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;;;;;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;;;;;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;;;;;;;;;;;;;;;;;;;(GGA) 0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;;;;;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;;;;;0;0;(GGC);;;;;;;;;;;;;;;;;;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;;;;;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;;;;;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;;;;;;;;;0;0;(GGC);;;;;;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGG);;;;;;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;;;;;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;;;;;0;0;(GGC);;;;;;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;;;;;;;;;0;0;(GGG);;;;;;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;;;;;;;;;;;;;0;0;(GGC);;;;;;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;;;;;0;0;(GGC);;;;;;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;;;;;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;;;;;;;(GGC) ;;;;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;;;;;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;;;;;;;;;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;;;;;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;;;;;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGT);;;;;;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;;;;;0;0;(GGG);;;;;;0;0;(GGG);;;;;;;;;;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGT);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;;;;;;;;;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;;;;;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;;;;;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;;;;;0;0;(GGG);;;;;;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;;;;;0;0;(GGG);;;;;;;;(GGG) 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0;0;(TTA);;;;;;;;;;;;;;;;;;0;0;(TTA);;;;;;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;;;;;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;;;;;;;;;;;;;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;;;;;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;;;;;;;;;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;;;;;;;;;0;0;(TTA);;;;;;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;;;;;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;;;;;0;0;(TTA);;;;;;;;;;;;;;0;0;(TTA);;;;;;;;;;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;;;;;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;;;;;;;;;;;;;;;;;0;0;(TTA);;;;;;;;(TTA)
C42
[modifier | modifier le wikicode]C42 liste
[modifier | modifier le wikicode]- Lien tableaux
tRNAs;KEGG;Génome 181;ani;Aspergillus nidulans FGSC A4 242;aor;Aspergillus oryzae RIB40 212;bfu;Botrytis cinerea B05.10 125;cal;Candida albicans WO-1 207;cgr;Candida glabrata CBS 138 82;cot;Candida orthopsilosis Co 90-125 143;cneg*;Cryptococcus neoformans var. grubii H99 191;cjd*;Cyberlindnera jadinii NBRC 0988 NBRC0988 214;dha;Debaryomyces hansenii CBS767 46;ecu;Encephalitozoon cuniculi GB-M1 53;ede*;Exophiala dermatitidis NIH/UT8656 273;fve*;Flammulina velutipes KACC42780 270;fgr5;Fusarium graminearum CS3005 305;fgr;Fusarium graminearum PH-1 NRRL 31084 285;fvr;Fusarium verticillioides 7600 266;kaf;Kazachstania africana CBS 2517 158;kna*;Kazachstania naganishii CBS 8797 162;kla;Kluyveromyces lactis NRRL Y-1140 123;kpa*;Komagataella pastoris CBS 7435 258;lkl*;Lachancea kluyveri NRRL Y-12651 229;lth;Lachancea thermotolerans CBS 6340 190;mgr;Magnaporthe oryzae 70-15 288;mfa*;Millerozyma farinosa CBS 7064 192;mth*;Myceliophthora thermophila ATCC 42464 270;ncs;Naumovozyma castellii CBS 4309 396;ncr;Neurospora crassa OR74A 80;opa*;Ogataea parapolymorpha DL-1 192;pch*;Penicillium chrysogenum P2niaD18 275;sce;Saccharomyces cerevisiae (S288c Apr 2011) 205;sas*;Saccharomycetaceae sp. Ashbya aceri 170;pic;Scheffersomyces stipitis CBS 6054 168;spo;Schizosaccharomyces pombe 972h- 96;sre*;Sporisorium reilianum SRZ2 328;tbl;Tetrapisispora blattae CBS 6284 206;tpf;Tetrapisispora phaffii CBS 4417 154;ttt;Thielavia terrestris NRRL 8126 192;tdl;Torulaspora delbrueckii CBS 1146 111;uma;Ustilago maydis 521 156;vma*;Valsa mali 03-8 225;vda;Verticillium dahliae VdLs.17 510;yli;Yarrowia lipolytica CLIB122 272;zro;Zygosaccharomyces rouxii CBS 732
C42 décomptes
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0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(GAC);;0;0;(CTA);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(GAC);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;;;;;0;0;(CTA);;0;0;(GAC);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(GAC);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(GAC);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA);;0;0;(CTA) 0;0;(GAC);;;;;;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAG);;0;0;(GAC);;0;0;(GAG);;;;;;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAG);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAG);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAG);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAG);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC);;0;0;(GAC) 0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;;;;;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAT);;0;0;(GAG);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAT);;;;;;0;0;(GAG);;;;;;;;;;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAT);;;;;;0;0;(GAG);;;;;;;;;;0;0;(GAG);;0;0;(GAT);;;;;;;;;;;;;;0;0;(GAG);;0;0;(GAT);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;0;0;(GAG);;;; 0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;;;;;0;0;(GAT);;0;0;(GCG);;;;;;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GCG);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;;;;;;;;;0;0;(GAT);;0;0;(GCG);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;;;;;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GCG);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GCG);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;0;0;(GAT);;;; 0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GGA);;0;0;(GCG);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GGA);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GGA);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GGA);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GGA);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG);;0;0;(GCG) 0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGC);;0;0;(GGA);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGC);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGC);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGC);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGC);;;;;;0;0;(GGA);;0;0;(GGA);;0;0;(GGA) 0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGG);;0;0;(GGC);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGG);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGG);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGG);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGG);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC);;0;0;(GGC) 0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGT);;0;0;(GGG);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGT);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;;;;;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGT);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGT);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGT);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG);;0;0;(GGG) 0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(TCA);;0;0;(GGT);;0;0;(TCA);;;;;;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(TCA);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(TCA);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;;;;;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;;;;;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT);;0;0;(GGT) 0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;;;;;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA);;0;0;(TTA)
B42
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tRNAs;KEGG;Génome 75;bae;Bacillus atrophaeus 1942 91;bcef;Bacillus cereus FT9 84;bcoh*;Bacillus coagulans HM-08 39;bbd;Belliella baltica 111;blr;Brevibacillus laterosporus LMG 15441 81;cbl;Clostridium botulinum A3 Loch Maree 88;dzc;Dickeya zeae EC1 85;eclx;Enterobacter cloacae 34399 83;eno;Enterobacter cloacae subsp. cloacae ENHKU01 85;eal;Escherichia albertii KF1 87;eco;Escherichia coli K-12 MG1655 91;gmc;Geobacillus sp Y41MC1 109;hmo;Heliobacterium modesticaldum Ice1 ATCC 51547 49;hmr;Hippea maritima 78;ksk;Kitasatospora setae KM-6054 86;kpn;Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 81;ksa;Kosakonia sacchari SP1 73;lpl;Lactobacillus plantarum WCFS1 81;mme;Marinomonas mediterranea MMB-1 131;mvs;Moritella viscosa 109;ppoy;Paenibacillus polymyxa Sb3-1 83;pdi;Parabacteroides distasonis ATCC 8503 90;pdix;Peptoclostridium difficile 630 cultivar NCTC_13307_/strain 84;pge;Pluralibacter gergoviae FB2 106;pha;Pseudoalteromonas haloplanktis TAC125 88;pse;Pseudogulbenkiania sp NH8B 85;sbz;Salmonella bongori N268-08 79;sty;Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi CT18 108;sbn;Shewanella baltica OS195 97;sfr;Shewanella frigidimarina NCIMB 400 147;spl;Shewanella pealeana ATCC 700345 61;sep;Singulisphaera acidiphila 71;saci;Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 71;sma;Streptomyces avermitilis MA-4680 73;sho;Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis TL01 105;vag;Vibrio alginolyticus NBRC 15630 ATCC 17749 93;vau;Vibrio anguillarum NB10 121;vha;Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 BB120 130;vpf;Vibrio parahaemolyticus O1_Kuk str.FDA_R31 112;vvm;Vibrio vulnificus MO6-24/O 70;ype;Yersinia pestis CO92 (biovar Orientalis) 82;yrb;Yersinia ruckeri Big Creek 74
B42 décomptes
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cbl;;;;spl;;;;pdi;;;;ppoy;;;;sbn;;;;eal;;;;eco;;;;sbz;;;;eno;;;;kpn;;;;bcef;;;;bcoh;;;;blr;;;;dzc;;;;eclx;;;;gmc;;;;ksa;;;;mme;;;;mvs;;;;pge;;;;pha;;;;pse;;;;sfr;;;;vag;;;;vau;;;;vha;;;;vvm;;;;yrb;;;;bae;;;;saci;;;;sep;;;;hmr;;;;bbd;;;;lpl;;;;sty;;;;sma;;;;sho;;;;ksk;;;;ype;;;;pdix;;;;hmo;;;;vpf;; 1;1;(ACG);;2;2;(ACC);;3;3;(ACG);;4;1;(ACG);;1;1;(AAA);;3;1;(ACG);;4;1;(ACG);;4;1;(ACG);;4;1;(ACG);;4;1;(ACG);;3;2;(ACG);;3;1;(ACG);;5;2;(ACG);;3;1;(ACG);;4;2;(ACG);;4;3;(ACG);;4;1;(ACG);;3;1;(ACG);;5;2;(ACG);;4;1;(ACG);;4;1;(ACG);;3;2;(ACG);;4;2;(ACG);;6;1;(ACG);;5;3;(ACG);;7;1;(ACG);;6;2;(ACG);;3;1;(ACG);;2;1;(ACG);;1;1;(ACA);;2;2;(ACG);;2;2;(CAA);;1;1;(ACG);;1;1;(AAG);;4;2;(ACG);;1;1;(ACG);;1;1;(ACG);;2;1;(ACG);;2;2;(ACG);;1;1;(ACG);;1;1;(AAA);;7;1;(ACG) 1;1;(CAA);;7;2;(ACG);;1;1;(CAA);;3;2;(CAA);;6;1;(ACG);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(AGG);;3;2;(CAA);;1;1;(CAA);;2;2;(CAA);;1;1;(ATA);;1;1;(CAA);;2;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(ATA);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(ACG);;1;1;(CAA);;1;1;(CAC);;1;1;(CAA);;2;1;(ACG);;1;1;(CAA);;1;1;(AGA);;2;2;(ATC);;1;1;(AGT);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;3;1;(ACG);;2;2;(CAA) 7;5;(CAT);;2;2;(ATG);;2;1;(CAG);;3;2;(CAG);;1;1;(CAA);;4;2;(CAG);;4;3;(CAG);;4;2;(CAG);;4;3;(CAG);;4;2;(CAG);;8;6;(CAT);;2;1;(CAA);;1;1;(CAG);;8;2;(CAG);;4;3;(CAG);;1;1;(CAA);;4;4;(CAG);;11;8;(CAT);;11;3;(CAT);;4;1;(CAG);;7;3;(CAT);;2;1;(CAC);;1;1;(CAA);;7;3;(CAT);;8;4;(CAT);;10;5;(CAT);;10;4;(CAT);;4;2;(CAG);;6;3;(CAT);;2;2;(CAA);;4;3;(CAT);;1;1;(CAG);;3;3;(CAT);;1;1;(AGT);;4;2;(CAG);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;1;1;(CAA);;2;2;(CAG);;10;5;(CAT);;1;1;(CAA);;11;4;(CAT) 1;1;(CCA);;1;1;(CAA);;4;3;(CAT);;7;6;(CAT);;2;2;(CAG);;9;5;(CAT);;8;5;(CAT);;6;3;(CAT);;6;3;(CAT);;7;3;(CAT);;2;2;(CCA);;1;1;(CAG);;8;5;(CAT);;6;4;(CAT);;8;4;(CAT);;1;1;(CAG);;6;3;(CAT);;1;1;(CCA);;2;1;(CCA);;7;3;(CAT);;2;1;(CCA);;3;1;(CAG);;1;1;(CAG);;2;1;(CCA);;2;1;(CCA);;2;1;(CCA);;2;1;(CCA);;7;3;(CAT);;2;2;(CCA);;1;1;(CAC);;1;1;(CCA);;3;3;(CAT);;1;1;(CCA);;1;1;(CAA);;6;3;(CAT);;4;4;(CAC);;2;1;(CAC);;2;1;(CAC);;6;3;(CAT);;1;1;(CCA);;1;1;(CAC);;2;1;(CCA) 1;1;(CCC);;13;5;(CAT);;2;2;(CCA);;1;1;(CCA);;10;6;(CAT);;1;1;(CCA);;1;1;(CCA);;1;1;(CCA);;1;1;(CCA);;1;1;(CCA);;1;1;(CCG);;6;3;(CAT);;2;2;(CCA);;1;1;(CCA);;1;1;(CCA);;6;4;(CAT);;1;1;(CCA);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(CCA);;1;1;(CCG);;4;3;(CAT);;9;5;(CAT);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(CCA);;1;1;(CCG);;2;2;(CAG);;1;1;(CCG);;1;1;(CCA);;1;1;(CCT);;1;1;(CAG);;1;1;(CCA);;1;1;(CAG);;1;1;(CAG);;1;1;(CAG);;1;1;(CCA);;3;1;(GAA);;4;3;(CAG);;1;1;(CCG) 1;1;(CCT);;2;1;(CCA);;1;1;(CCC);;1;1;(CCG);;1;1;(CCA);;1;1;(CCC);;1;1;(CCC);;1;1;(CCC);;2;2;(CCC);;1;1;(CCC);;3;2;(GAA);;1;1;(CCA);;1;1;(CCG);;1;1;(CCC);;1;1;(CCC);;1;1;(CCA);;1;1;(CCC);;1;1;(CCT);;1;1;(CCT);;1;1;(CCC);;1;1;(CCT);;1;1;(CCA);;1;1;(CCA);;1;1;(CCT);;1;1;(CCT);;1;1;(CCT);;1;1;(CCT);;1;1;(CCC);;2;2;(CCT);;6;2;(CAT);;1;1;(CGT);;1;1;(CCC);;1;1;(GAA);;5;4;(CAT);;1;1;(CCC);;6;3;(CAT);;8;5;(CAT);;5;3;(CAT);;1;1;(CCC);;1;1;(GAT);;8;4;(CAT);;1;1;(CCT) 1;1;(CTC);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(CGA);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(GAG);;1;1;(CCC);;3;2;(GAA);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(CCC);;1;1;(CCG);;2;1;(GAA);;4;1;(GAA);;1;1;(CCG);;3;2;(GAA);;1;1;(CCC);;1;1;(CCG);;4;2;(GAA);;3;2;(GAA);;4;2;(GAA);;4;2;(GAA);;1;1;(CCG);;3;2;(GAA);;1;1;(CCA);;2;2;(GAA);;1;1;(CCG);;1;1;(GAG);;2;2;(CCA);;1;1;(CCG);;1;1;(CCA);;1;1;(CCA);;1;1;(CCA);;1;1;(CCG);;2;1;(GCA);;2;2;(CCA);;4;2;(GAA) 1;1;(CTG);;1;1;(CCT);;1;1;(CCT);;1;1;(CGT);;1;1;(CCT);;1;1;(CCT);;1;1;(CCT);;2;2;(CCT);;1;1;(CCT);;1;1;(CCT);;4;1;(GAT);;1;1;(CCG);;2;2;(GAC);;1;1;(CCT);;1;1;(CCT);;1;1;(CCG);;1;1;(CCT);;1;1;(GAC);;2;2;(GAC);;1;1;(CCT);;2;2;(GAC);;1;1;(CCG);;1;1;(CCT);;2;2;(GAC);;2;2;(GAC);;2;2;(GAC);;2;2;(GAC);;1;1;(CCT);;1;1;(GAC);;1;1;(CCC);;1;1;(GAG);;1;1;(CCT);;1;1;(GAT);;1;1;(CCC);;2;2;(CCT);;1;1;(CCC);;1;1;(CCC);;2;2;(CCC);;1;1;(CCT);;2;1;(GCC);;1;1;(CCC);;2;2;(GAC) 2;2;(CTT);;4;1;(GAA);;1;1;(CGA);;1;1;(CTT);;3;1;(GAA);;1;1;(CGA);;1;1;(CGA);;1;1;(CGA);;1;1;(CGT);;1;1;(CGA);;1;1;(GCA);;1;1;(CCT);;1;1;(GAG);;1;1;(CGA);;1;1;(CGT);;1;1;(CGA);;1;1;(CGA);;1;1;(GAG);;1;1;(GAG);;1;1;(CGA);;1;1;(GAG);;1;1;(CCT);;2;1;(GAA);;2;2;(GAG);;1;1;(GAG);;2;1;(GAG);;2;1;(GAG);;1;1;(CGA);;1;1;(GAG);;1;1;(CCG);;2;1;(GAT);;1;1;(CGA);;1;1;(GCA);;1;1;(CCG);;2;2;(CGA);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(CCG);;1;1;(CTG);;2;1;(GCT);;2;2;(CCG);;2;1;(GAG) 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2;2;(GAT);;3;1;(GAT);;1;1;(CGT);;2;2;(GAG);;3;1;(GAT);;2;1;(CTG);;2;1;(CTG);;2;1;(CTG);;2;2;(GAC);;2;1;(CTG);;1;1;(GGA);;1;1;(CGG);;5;1;(GCC);;2;1;(CTG);;2;2;(GAC);;1;1;(CGT);;2;2;(CTG);;4;1;(GCC);;5;1;(GCC);;3;1;(CTG);;6;2;(GCC);;2;1;(CGG);;4;2;(GAT);;9;1;(GCC);;7;2;(GCC);;10;1;(GCC);;8;1;(GCC);;2;1;(GAA);;2;1;(GCC);;3;2;(CGC);;1;1;(GCT);;1;1;(CGT);;1;1;(GGA);;1;1;(CGC);;1;1;(CTG);;1;1;(CGC);;1;1;(CGC);;1;1;(CGC);;2;2;(GAC);;4;2;(GTC);;1;1;(CGC);;11;1;(GCC) 2;2;(GCA);;4;1;(GCA);;1;1;(CTC);;3;2;(GAT);;2;1;(GCA);;2;1;(GAA);;2;1;(GAA);;2;1;(GAA);;1;1;(GAG);;2;1;(GAA);;1;1;(GGT);;1;1;(CGT);;2;1;(GCT);;1;1;(CTT);;1;1;(GAG);;2;1;(GAA);;2;1;(GAA);;1;1;(GCT);;2;1;(GCT);;1;1;(CTT);;2;1;(GCT);;1;1;(CGT);;2;2;(GCA);;2;1;(GCT);;2;1;(GCT);;2;1;(GCT);;2;1;(GCT);;3;1;(GAC);;2;1;(GCT);;1;1;(CGT);;1;1;(GGA);;1;1;(CTC);;1;1;(GGC);;1;1;(CGG);;2;1;(GAA);;1;1;(CGG);;1;1;(CGG);;1;1;(CGG);;1;1;(GAG);;2;1;(GTG);;2;2;(CGG);;2;1;(GCT) 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;;;;;;;;1;1;(TGG);;;;;;;;;;4;2;(TTC);;4;1;(TTC);;4;1;(TTC);;5;1;(TTT);;4;1;(TTC);;;;;;4;2;(TTC);;;;;;1;1;(TGT);;5;1;(TTT);;4;2;(TTT);;4;1;(TTC);;;;;;;;;;1;1;(TGT);;;;;;1;1;(TGG);;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;2;1;(TTG);;;;;;1;1;(TCT);;;;;;1;1;(TGA);;;;;;1;1;(TGT);;4;1;(TTC);;2;2;(TGA);;1;1;(TCT);;1;1;(TCT);;4;2;(TTT);;;;;;1;1;(TGG);;;; ;;;;;;;;3;1;(TGT);;;;;;;;;;2;1;(TTG);;2;1;(TTG);;2;1;(TTG);;83;48;1.73;;2;1;(TTG);;;;;;3;3;(TTG);;;;;;4;1;(TTC);;86;52;1.65;;91;61;1.49;;2;1;(TTG);;;;;;;;;;4;2;(TTC);;;;;;1;1;(TGT);;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;5;1;(TTT);;;;;;1;1;(TGA);;;;;;2;1;(TGC);;;;;;2;1;(TTC);;2;1;(TTG);;1;1;(TGC);;1;1;(TGA);;1;1;(TGA);;70;48;1.46;;;;;;2;2;(TGT);;;; ;;;;;;;;2;2;(TTC);;;;;;;;;;4;1;(TTT);;6;1;(TTT);;5;1;(TTT);;;;;;6;1;(TTT);;;;;;4;2;(TTT);;;;;;1;1;(TTG);;;;;;;;;;5;1;(TTT);;;;;;;;;;1;1;(TTG);;;;;;5;4;(TTC);;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;83;47;1.77;;;;;;2;2;(TGC);;;;;;1;1;(TGG);;;;;;2;2;(TTG);;4;2;(TTT);;1;1;(TGG);;1;1;(TGC);;1;1;(TGC);;;;;;;;;;6;2;(TTC);;;; ;;;;;;;;1;1;(TTG);;;;;;;;;;85;52;1.63;;87;50;1.74;;85;49;1.73;;;;;;86;45;1.91;;;;;;84;64;1.31;;;;;;3;1;(TTT);;;;;;;;;;82;49;1.67;;;;;;;;;;5;1;(TTT);;;;;;1;1;(TTG);;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;1;1;(TGG);;;;;;1;1;(TGT);;;;;;2;1;(TTT);;81;53;1.53;;1;1;(TGT);;1;1;(TGG);;1;1;(TGG);;;;;;;;;;4;1;(TTG);;;; ;;;;;;;;2;2;(TTT);;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;89;47;1.89;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;85;48;1.77;;;;;;2;1;(TTT);;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;1;1;(TGT);;;;;;1;1;(TTC);;;;;;70;50;1.40;;;;;;1;1;(TTC);;1;1;(TGT);;1;1;(TGT);;;;;;;;;;5;1;(TTT);;;; ;;;;;;;;83;56;1.48;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;89;52;1.71;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;2;1;(TTC);;;;;;1;1;(TTG);;;;;;;;;;;;;;1;1;(TTG);;1;1;(TTC);;1;1;(TTC);;;;;;;;;;109;65;1.68;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;3;3;(TTG);;;;;;1;1;(TTT);;;;;;;;;;;;;;1;1;(TTT);;1;1;(TTG);;1;1;(TTG);;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;71;61;1.16;;;;;;49;47;1.04;;;;;;;;;;;;;;77;63;1.22;;1;1;(TTT);;1;1;(TTT);;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;74;59;1.25;;77;58;1.33;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 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C42 Les introns
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Champignons, détail des introns
Génome;KEGG;tRNA;total;aaa;aac;aag;aat;aca;acc;acg;act;aga;agc;agg;agt;ata;atc;atg;att;caa;cac;cag;cat;cca;ccc;ccg;cct;cga;cgc;cgg;cgt;cta;ctc;ctg;ctt;gaa;gac;gag;gat;gca;gcc;gcg;gct;gga;ggc;ggg;ggt;gta;gtc;gtg;gtt;taa;tac;tag;tat;tca;tcc;tcg;tct;tga;tgc;tgg;tgt;tta;ttc;ttg;ttt Aspergillus nidulans FGSC A4;ani;181;93;2;6;0;0;2;0;2;1;0;4;2;0;1;0;3;4;2;0;5;0;2;0;1;6;2;0;2;0;2;0;3;6;2;8;1;0;0;0;0;0;2;0;1;0;0;0;1;0;0;6;0;0;1;0;2;0;0;3;0;0;1;5;2;0 Aspergillus oryzae RIB40;aor;242;114;3;0;11;0;2;0;2;0;2;6;2;0;2;0;4;0;4;7;0;0;3;0;0;9;0;0;1;0;1;0;4;0;3;13;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;1;3;0;0;13;0;0;1;0;3;0;0;4;0;1;0;7;0;0 Botrytis cinerea B05.10;bfu;212;161;1;6;8;0;2;0;0;3;5;5;0;0;1;0;4;8;0;4;0;0;8;0;1;4;4;0;0;4;1;0;1;6;6;9;9;0;5;0;2;0;0;8;2;0;2;0;2;8;0;6;0;0;4;0;2;0;0;5;1;0;2;7;5;0 Candida albicans WO-1;cal;125;67;1;3;2;0;0;0;1;0;0;2;1;0;1;0;0;6;5;3;0;0;4;0;0;1;0;0;1;2;0;0;0;2;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;4;0;0;0;0;1;0;0;2;2;0;5;5;6;0 Candida glabrata CBS 138;cgr;207;45;3;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;1;0;0;0;5;0;0;6;8;0 Candida orthopsilosis Co 90-125;cot;82;35;0;0;3;0;0;0;1;0;0;1;0;0;1;0;2;0;3;1;1;0;3;0;0;1;0;0;0;2;0;0;0;1;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;1;0;0;3;0;0;2;0;1;0;0;0;1;0;3;0;1;0 Cryptococcus neoformans var. grubii H99;cneg*;143;136;1;4;7;0;1;0;1;5;1;2;3;0;1;0;6;6;2;2;0;0;1;0;1;6;5;0;1;3;0;0;1;6;3;2;10;0;1;0;2;8;1;5;2;0;0;0;2;7;0;4;0;0;1;0;1;6;0;3;3;0;1;5;3;0 Cyberlindnera jadinii NBRC 0988 NBRC0988;cjd*;191;25;4;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;2;0;1;0;0;0;4;0;0;0;0;0 Debaryomyces hansenii CBS767;dha;214;54;7;0;10;0;0;0;0;0;0;3;0;0;2;0;4;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;1;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;6;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;8;0;0 Encephalitozoon cuniculi GB-M1;ecu;46;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Exophiala dermatitidis NIH/UT8656;ede*;53;47;1;1;0;0;0;0;0;2;0;1;1;0;1;0;2;2;1;2;1;0;1;0;1;0;2;0;1;1;1;1;0;1;1;2;0;0;1;0;1;2;0;2;1;0;1;0;1;0;0;1;0;0;1;0;1;1;1;1;0;0;1;1;1;0 Flammulina velutipes KACC42780;fve*;273;201;6;12;11;1;2;0;0;5;0;0;6;0;2;0;6;0;4;7;6;0;4;0;2;4;5;0;2;11;2;0;2;6;4;7;10;1;8;0;1;2;3;10;7;0;2;0;3;0;0;6;0;0;2;0;3;3;0;1;3;0;1;12;4;2 Fusarium graminearum CS3005;fgr5;270;187;2;9;12;0;0;0;0;0;2;8;1;0;3;0;5;11;5;7;0;0;3;0;2;10;9;0;0;0;2;0;5;6;4;0;13;0;3;0;3;12;4;15;1;0;1;0;1;0;0;6;0;0;2;0;2;0;1;0;4;0;1;9;3;0 Fusarium graminearum PH-1 NRRL 31084;fgr;305;209;2;9;16;0;0;0;0;0;2;8;1;0;3;0;6;13;5;7;0;0;3;0;2;10;9;0;0;0;2;0;5;13;4;0;19;0;3;0;2;13;4;14;1;0;1;0;1;0;0;8;0;0;2;0;2;0;1;0;4;0;1;10;3;0 Fusarium verticillioides 7600;fvr;285;197;2;8;15;1;0;0;0;4;1;7;0;0;1;0;5;11;4;6;0;0;0;0;2;10;7;0;0;0;2;0;5;12;5;0;16;1;3;0;3;14;2;14;0;0;1;0;1;0;0;8;0;0;2;0;3;0;0;0;5;0;2;10;4;0 Kazachstania africana CBS 2517;kaf;266;53;8;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;1;0;0;0;6;0;0;9;2;0 Kazachstania naganishii CBS 8797;kna*;158;40;4;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;1;0;0;0;4;0;0;6;5;0 Kluyveromyces lactis NRRL Y-1140;kla;162;39;4;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;7;0;0;0;0;0;0;3;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;1;0;0;0;4;0;0;0;7;0 Komagataella pastoris CBS 7435;kpa*;123;29;3;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;1;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;2;0;0;0;0;0;3;0;0;5;3;0 Lachancea kluyveri NRRL Y-12651;lkl*;258;72;5;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;10;0;0;0;0;0;0;5;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;1;11;0;0;5;0;0;8;11;0 Lachancea thermotolerans CBS 6340;lth;229;57;4;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;4;3;0;3;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;2;0;0;0;5;0;0;7;8;0 Magnaporthe oryzae 70-15;mgr;190;157;0;6;6;0;2;0;2;4;1;3;3;0;1;0;4;8;2;0;6;0;2;0;2;5;2;0;0;6;1;0;4;7;1;0;9;0;3;0;2;9;3;14;3;0;1;0;2;6;0;5;0;0;2;0;3;4;0;3;0;0;1;7;2;0 Millerozyma farinosa CBS 7064;mfa*;288;68;6;0;10;0;0;0;0;0;0;6;0;0;4;0;6;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;2;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;10;0;0 Myceliophthora thermophila ATCC 42464;mth*;192;127;0;0;9;0;2;0;2;2;1;5;2;0;1;0;4;8;2;4;3;0;2;0;3;6;0;0;2;5;1;0;4;7;0;8;8;0;2;0;3;7;0;0;2;0;1;0;3;0;0;6;0;0;2;0;0;0;0;0;2;0;1;5;2;0 Naumovozyma castellii CBS 4309;ncs;270;63;8;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;1;0;0;0;7;0;0;10;9;0 Neurospora crassa OR74A;ncr;396;232;2;1;5;0;3;0;3;2;1;6;5;0;1;1;7;17;3;9;11;0;1;0;4;11;1;0;0;0;2;0;6;16;1;18;24;0;3;0;5;19;0;0;6;0;2;0;1;0;0;10;1;0;2;0;4;0;0;0;0;0;1;12;5;0 Ogataea parapolymorpha DL-1;opa*;80;7;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0 Penicillium chrysogenum P2niaD18;pch*;192;100;1;1;0;0;2;0;1;6;0;4;1;0;2;0;10;0;3;11;0;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0;1;3;6;1;8;0;0;0;0;2;0;4;0;1;0;1;0;3;8;1;5;0;0;1;0;2;3;1;3;0;0;2;0;0;0 Saccharomyces cerevisiae (S288c Apr 2011);sce;275;61;7;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;1;0;0;0;6;0;0;10;10;0 Saccharomycetaceae sp. Ashbya aceri;sas*;205;52;3;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;1;0;0;0;0;0;4;0;7;0;0;0;0;0;0;4;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;3;0;0;0;5;0;0;6;7;0 Scheffersomyces stipitis CBS 6054;pic;170;42;3;0;9;0;0;0;0;0;0;2;0;0;1;0;3;0;0;0;0;0;6;0;0;1;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;5;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;6;0;0 Schizosaccharomyces pombe 972h-;spo;168;44;0;0;9;0;0;0;0;0;0;3;1;0;1;0;3;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;4;0;0;2;0;1;0;0;0;0;0;2;0;4;0 Sporisorium reilianum SRZ2;sre*;96;91;1;0;5;0;1;0;1;1;1;0;1;0;1;0;4;4;3;3;2;0;1;0;1;3;2;0;0;4;1;0;2;4;2;3;4;0;1;0;1;3;1;6;1;0;1;0;1;4;0;2;0;0;1;0;2;2;1;2;2;0;1;4;0;0 Tetrapisispora blattae CBS 6284;tbl;328;71;9;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;13;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;2;0;0;0;7;0;0;12;9;0 Tetrapisispora phaffii CBS 4417;tpf;206;42;6;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;1;0;0;0;4;0;0;9;2;0 Thielavia terrestris NRRL 8126;ttt;154;117;1;3;6;0;1;0;2;4;0;3;2;0;1;0;2;6;2;3;4;0;2;0;3;4;1;0;1;6;1;0;4;5;0;6;7;0;2;0;3;7;1;0;2;0;1;0;3;0;0;4;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;7;5;1;0 Torulaspora delbrueckii CBS 1146;tdl;192;45;5;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;1;0;0;0;4;0;0;6;8;0 Ustilago maydis 521;uma;111;101;1;0;5;0;1;0;1;0;1;2;1;0;1;0;4;4;2;2;3;0;1;0;1;4;3;0;0;4;1;0;2;4;2;5;4;0;1;0;1;5;2;6;1;0;1;0;1;4;0;3;0;0;1;0;3;3;2;2;2;0;1;3;0;0 Valsa mali 03-8;vma*;156;130;0;3;9;0;3;0;2;3;0;3;2;0;1;0;3;7;2;4;3;0;2;0;1;1;2;0;2;5;3;0;4;5;2;3;8;0;2;0;2;7;0;8;1;1;1;0;2;5;0;4;0;0;1;0;2;2;0;0;3;0;0;4;2;0 Verticillium dahliae VdLs.17;vda;225;115;2;6;0;0;3;0;3;0;2;2;1;0;0;0;4;0;2;6;0;0;3;0;0;8;0;0;0;4;1;0;0;8;2;5;0;0;2;0;1;11;2;0;1;0;1;0;2;8;0;6;0;0;3;1;1;0;1;1;3;0;1;7;1;0 Yarrowia lipolytica CLIB122;yli;510;316;4;16;34;0;3;0;1;0;0;6;0;0;1;0;0;26;3;4;14;0;0;0;2;21;25;0;0;0;2;0;11;21;0;28;27;0;0;0;0;0;11;0;0;0;0;0;3;0;0;14;0;0;2;0;4;0;0;0;13;0;0;17;3;0 Zygosaccharomyces rouxii CBS 732;zro;272;54;7;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;3;0;2;0;0;0;6;0;0;8;10;0 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; total;;;;131;94;202;2;30;0;25;42;20;144;36;0;59;1;104;141;59;92;65;0;168;0;31;125;80;0;17;91;68;2;71;143;50;125;170;2;43;0;36;119;42;102;33;1;25;1;37;59;1;250;1;0;43;1;66;35;9;30;124;1;35;261;151;2 ;;;;aaa;aac;aag;aat;aca;acc;acg;act;aga;agc;agg;agt;ata;atc;atg;att;caa;cac;cag;cat;cca;ccc;ccg;cct;cga;cgc;cgg;cgt;cta;ctc;ctg;ctt;gaa;gac;gag;gat;gca;gcc;gcg;gct;gga;ggc;ggg;ggt;gta;gtc;gtg;gtt;taa;tac;tag;tat;tca;tcc;tcg;tct;tga;tgc;tgg;tgt;tta;ttc;ttg;ttt zéros;;;;6;26;21;40;27;42;27;29;30;4;24;42;1;41;18;26;22;23;27;42;9;42;24;22;26;42;30;20;10;40;22;21;24;27;26;40;26;42;24;28;28;31;26;41;21;41;22;33;41;0;41;42;18;41;5;33;35;30;12;41;23;7;10;41 42−zér;;;;36;16;21;2;15;0;15;13;12;38;18;0;41;1;24;16;20;19;15;0;33;0;18;20;16;0;12;22;32;2;20;21;18;15;16;2;16;0;18;14;14;11;16;1;21;1;20;9;1;42;1;0;24;1;37;9;7;12;30;1;19;35;32;1
E79 Les introns
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: 79 Eucaryotes, détail des introns
génome;KEGG;tRNA;total;aaa;aac;aag;aat;aca;acc;acg;act;aga;agc;agg;agt;ata;atc;atg;att;caa;cac;cag;cat;cca;ccc;ccg;cct;cga;cgc;cgg;cgt;cta;ctc;ctg;ctt;gaa;gac;gag;gat;gca;gcc;gcg;gct;gga;ggc;ggg;ggt;gta;gtc;gtg;gtt;taa;tac;tag;tat;tca;tcc;tcg;tct;tga;tgc;tgg;tgt;tta;ttc;ttg;ttt Ailuropoda melanoleuca (panda) (BGI-Shenzhen AilMel 1.0 Dec 2009);aml;1463;96;3;1;45;0;0;0;0;0;5;0;2;0;5;0;0;0;3;0;3;0;1;0;1;0;3;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0 Anolis carolinensis (lizard) (Broad AnoCar2.0 May 2010);acs;211;11;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0 Anopheles gambiae;aga;414;27;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;22;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0 Arabidopsis thaliana (TAIR10 Feb 2011);ath;684;83;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;70;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Balaenoptera acutorostrata scammoni (Minke whale Oct. 2013 BalAcu1.0/balAcu1);bacu;7080;50;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;12;0;1;1;0;0;0;0;3;0;2;0;0;0;0;0;0;13;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;6;0 Bos taurus (Cow Jun. 2014 Bos_taurus_UMD_3.1.1/bosTau8);bta;4040;57;0;0;1;0;0;0;1;0;6;0;0;0;5;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;1;0;1;0;0;0;0;1;3;1;5;2;0;0;0;0;0;17;0;0;0;0;0;0;0;2;1;0;0;0;6;0 Brachypodium distachyon (JGI v1.0 8X);bdi;639;36;0;0;0;0;0;0;0;1;0;3;1;0;0;0;17;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;12;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Caenorhabditis brenneri (WUGSC 6.0.1 Feb 2008);cbr*;1095;52;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;1;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;26;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;14;0 Caenorhabditis briggsae (C. briggsae Jan. 2007 WUGSC 1.0/cb3);cbr;743;34;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;19;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;10;0 Caenorhabditis elegans (WS220 Oct 2010);cel;596;34;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;19;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0 Caenorhabditis japonica (WUGSC 3.0.2 Mar 2008);cja*;827;35;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;24;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0 Callithrix jacchus (marmoset) (WUGSC 3.2 Mar 2009);cjc;408;29;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;5;0 Callorhinchus milii (Elephant shark Dec. 2013 Callorhinchus_milii-6.1.3/calMil1);cmk;13727;177;35;0;0;0;0;0;0;3;12;0;0;0;17;0;0;0;0;0;0;0;13;3;8;12;22;0;0;0;1;0;1;0;2;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;1;0;0;34;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;9;0 Canis familiaris (dog) (CanFam3.1 Sept 2011);cfa;906;68;2;0;33;0;0;0;0;0;4;0;1;0;5;0;0;0;3;0;1;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;1;0;2;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0 Cavia porcellus (Guinea pig) (Broad Feb 2008);cpo*;383;28;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;15;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0 Ceratotherium simum (White rhinoceros May 2012 CerSimSim1.0/cerSim1);csi*;518;27;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0 Chrysemys picta bellii (Painted turtle Dec. 2011 v3.0.1/chrPic1);cpic;554;36;0;0;0;0;0;0;0;0;10;1;0;0;12;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0 Cricetulus griseus cell line CHO-K1 (Chinese hamster ovary CriGri 1.0 Aug 2011);cge;498;23;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0 Dasypus novemcinctus (Armadillo Dec. 2011 Baylor/dasNov3);dno*;1119;31;0;0;1;0;0;0;0;0;5;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;2;0;1;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;6;0 Drosophila melanogaster (D. melanogaster Aug. 2014 BDGP Release 6 + ISO1 MT/dm6);dme;289;15;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0 Drosophila simulans (D. simulans Apr. 2005 WUGSC mosaic 1.0);dsi;256;15;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0 Drosophila yakuba (D. yakuba Nov. 2005 WUGSC 7.1);dya;326;15;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0 Equus caballus (horse) (Sep 2007);ecb;494;32;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;14;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0 Erinaceus europaeus (Hedgehog May 2012 EriEur2.0/eriEur2);eeu*;485;30;0;0;2;0;0;0;0;1;4;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0 Felis catus (cat) (Felis_catus-6.2 Sept 2011);fca;3729;487;4;2;214;1;0;0;1;0;5;0;9;0;6;0;0;0;75;2;7;0;7;1;1;0;102;0;2;0;0;0;0;0;0;0;7;0;1;0;1;0;2;0;1;1;0;0;0;0;3;10;4;0;4;0;0;0;2;0;2;0;3;0;7;0 Gadus morhua (Atlantic cod May 2010 Genofisk GadMor_May2010/gadMor1);gmo*;1492;105;1;0;0;0;2;0;0;0;19;0;0;0;16;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;50;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;12;2 Gallus gallus (galGal4 Nov 2011);gga;283;22;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;15;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0 Gasterosteus aculeatus (stickleback) (Broad 1.0 Feb 2006);gac*;2489;146;0;0;0;0;0;0;0;0;62;0;0;0;58;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;17;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;5;0 Geospiza fortis (Medium ground finch Apr. 2012 GeoFor_1.0/geoFor1);gfr;203;14;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0 Glycine max (soybean) (Wm82.a2);gmx;738;39;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;18;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;20;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Gorilla gorilla gorilla (gorilla) (gorGor3.1 May 2011);ggo;435;34;0;0;0;0;0;0;2;0;4;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;13;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;6;0 Heterocephalus glaber (Naked mole-rat Jan. 2012 Broad HetGla_female_1.0/hetGla2);hgl;367;22;0;0;0;0;0;0;0;1;4;0;0;0;3;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;4;0 Homo sapiens (hg38 - GRCh38 Dec 2013);hsa;622;34;0;0;0;0;0;0;1;0;5;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;13;1;1;0;0;0;0;0;1;0;1;0;0;5;0 Latimeria chalumnae (Coelacanth Aug. 2011 Broad/latCha1);lcm;373;21;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;4;0 Leishmania major;lma;82;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Loxodonta africana (elephant) (Broad/July 2009);lav;2002;60;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;19;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;17;0 Macaca mulatta (Rhesus Oct. 2010 BGI CR_1.0/rheMac3);mcc;458;34;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;13;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0 Macropus eugenii (Wallaby Sep. 2009 TWGS Meug_1.1/macEug2);meu*;353;26;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0 Medicago truncatula (March 2009 Version 3.0);mtr;582;40;2;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;4;0;13;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;2;0;0;0 Meleagris gallopavo (turkey) (TGC Turkey_2.01 Dec 2009);mgp;155;10;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0 Melopsittacus undulatus (Budgerigar Sep. 2011 WUSTL v6.3/melUnd1);mun*;191;12;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0 Microcebus murinus (Mouse lemur) (Jun 2003);mmr*;258;18;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0 Monodelphis domestica (opossum) (Broad Oct 2006);mdo;481;30;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;14;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0 Mus musculus (mm10 Dec 2011);mmu;469;25;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;10;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;4;0 Mustela putorius furo (Ferret Apr. 2011 MusPutFur1.0/musFur1);mpu*;749;66;1;1;25;1;0;0;0;0;8;0;1;0;5;0;0;0;2;0;1;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;9;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0 Myotis lucifugus (Microbat Jul. 2010 Broad Institute Myoluc2.0/myoLuc2);mlu*;252;21;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;3;0;0;0;0;1;1;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0 Nomascus leucogenys (Gibbon Oct. 2012 GGSC Nleu3.0/nomLeu3);nle;421;31;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;13;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;1 Ochotona princeps (Pika May 2012 OchPri3.0/ochPri3);opr*;338;22;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0 Oreochromis niloticus (Nile tilapia Jan. 2011 Broad oreNil1.1/oreNil2);oni*;674;76;0;0;0;0;0;0;0;2;22;0;0;0;24;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;17;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0 Ornithorhynchus anatinus (platypus) (WUGSC 5.0.1 Mar 2007);oaa;856;54;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;26;0;0;0;0;2;0;0;0;1;0;0;1;10;0 Oryctolagus cuniculus (rabbit) (Broad Apr 2009);ocu;506;27;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0 Oryza sativa;osa;738;36;0;0;0;0;1;0;0;0;0;2;0;0;0;0;15;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;13;0;1;1;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0 Otolemur garnettii (Bushbaby Mar. 2011 Broad/otoGar3);oga*;326;41;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;1;10;9;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;1 Ovis aries (sheep) (Feb 2010);oas;1176;29;0;0;0;0;0;0;0;1;4;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;3;2;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0 Pan troglodytes (Chimp Feb. 2011 CSAC 2.1.4/panTro4);ptr;503;34;0;0;0;0;0;0;1;0;5;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;13;1;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;5;0 Papio anubis (Baboon Mar. 2012 Baylor Panu_2.0/papAnu2);pan*;476;35;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;14;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0 Papio hamadryas (baboon) (Nov 2008);pha*;411;31;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;15;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0 Petromyzon marinus (Lamprey Sep. 2010 WUGSC 7.0/petMar2);pma*;2485;133;6;3;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;9;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;2;86;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;22;0 Physcomitrella patens ;ppp;418;21;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Plasmodium falciparum;pfa;35;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Pongo pygmaeus abelii (Orangutan July 2007 WUGSC 2.0.2/ponAbe2);ppy*;517;40;0;0;0;0;0;0;1;0;7;0;0;0;6;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;15;0;1;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;5;0 Populus trichocarpa (Jan 2010 Version 2.0) ;pop;618;74;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;35;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;17;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6 Rattus norvegicus (rn5 Mar 2012);rno;407;15;0;0;0;0;0;0;0;1;5;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1 Saimiri boliviensis (Squirrel monkey Oct. 2011 Broad/saiBol1);sbq;334;26;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;5;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0 Sarcophilus harrisii (Tasmanian devil Feb. 2011 WTSI Devil_ref v7.0/sarHar1);shr;446;22;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0 Sorex araneus (Shrew Aug. 2008 Broad/sorAra2);san*;374;25;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;9;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;4;0 Sorghum bicolor (Version 1.0);sbi;578;32;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;17;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;12;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Spermophilus tridecemlineatus (Squirrel Nov. 2011 Broad/speTri2);str*;804;24;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0 Strongylocentrotus purpuratus (Sea urchin) ;spu;1065;38;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;24;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Sus scrofa (Pig Aug. 2011 SGSC Sscrofa10.2/susScr3);ssc;807;56;0;1;0;1;0;0;0;0;6;1;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;17;0;1;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;16;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0 Taeniopygia guttata (Zebra finch Feb. 2013 WashU taeGut324/taeGut2);tgu;230;18;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0 Takifugu rubripes (Fugu Oct. 2011 FUGU5/fr3);tru;575;43;0;0;0;0;0;0;0;0;12;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;15;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0 Tarsius syrichta (Tarsier Sep. 2013 Tarsius_syrichta-2.0.1/tarSyr2);tsy*;455;114;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;4;0;0;0;60;0;0;1;26;1;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;8;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0 Tetraodon nigroviridis (tetraodon) (Genoscope 8.0 Mar 2007);tng;540;58;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;5;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;11;0;3;0;20;0;0;0;0;0;0;1;0;7;0 Trichechus manatus latirostris (Manatee Oct. 2011 Broad v1.0/triMan1);tma*;2017;41;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;3;1;0;0;0;0;0;0;0;14;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0 Tursiops truncatus (Dolphin Oct. 2011 Baylor Ttru_1.4/turTru2);ttr*;5845;47;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;7;1;1;0;0;0;0;0;3;0;2;0;0;0;0;0;0;17;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0 Vitis vinifera (Grapevine 12X);vvi;499;32;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;11;0;0;0;2;0;0;0;0;2;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;10;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0 Xenopus tropicalis (frog) (JGI 4.2 Nov 2009);xtr;2639;275;0;0;0;0;0;0;0;0;103;0;0;0;43;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;105;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;19;0 Zea mays (Version 5b.60);zma;1198;37;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;22;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; total;;;;54;8;321;4;5;0;7;10;469;9;14;2;454;14;149;5;148;11;17;6;50;5;11;18;131;3;4;0;2;1;7;45;28;18;13;4;2;1;4;4;21;7;15;4;5;0;6;3;8;1239;13;24;13;23;2;2;3;14;5;2;18;2;400;11 ;;;;aaa;aac;aag;aat;aca;acc;acg;act;aga;agc;agg;agt;ata;atc;atg;att;caa;cac;cag;cat;cca;ccc;ccg;cct;cga;cgc;cgg;cgt;cta;ctc;ctg;ctt;gaa;gac;gag;gat;gca;gcc;gcg;gct;gga;ggc;ggg;ggt;gta;gtc;gtg;gtt;taa;tac;tag;tat;tca;tcc;tcg;tct;tga;tgc;tgg;tgt;tta;ttc;ttg;ttt zéros;;;;71;74;72;75;76;79;73;72;21;73;74;77;10;74;68;76;71;70;71;76;72;76;75;73;72;76;77;79;77;78;72;69;71;77;73;76;77;78;75;75;70;75;72;76;74;79;73;77;76;0;69;62;70;75;78;77;77;69;75;77;71;77;14;74 79−zér;;;;8;5;7;4;3;0;6;7;58;6;5;2;69;5;11;3;8;9;8;3;7;3;4;6;7;3;2;0;2;1;7;10;8;2;6;3;2;1;4;4;9;4;7;3;5;0;6;2;3;79;10;17;9;4;1;2;2;10;4;2;8;2;65;5 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; Danio rerio (Zebrafish) (Zv8 Apr 2009);dre;;;aaa;aac;aag;aat;aca;acc;acg;act;aga;agc;agg;agt;ata;atc;atg;att;caa;cac;cag;cat;cca;ccc;ccg;cct;cga;cgc;cgg;cgt;cta;ctc;ctg;ctt;gaa;gac;gag;gat;gca;gcc;gcg;gct;gga;ggc;ggg;ggt;gta;gtc;gtg;gtt;taa;tac;tag;tat;tca;tcc;tcg;tct;tga;tgc;tgg;tgt;tta;ttc;ttg;ttt intron;;;813;3;;;;;;;;247;;;;61;;2;1;;;;;;;;7;;;;;8;;;4;;1;;;;;;;2;;3;;;;;2;;225;;4;;;;;;;;;8;;234;1 tRNAs;;12258;;525;1,045;953;24;290;10;66;359;252;424;104;14;75;10;522;258;105;387;266;10;205;2;180;315;107;24;59;203;244;4;300;270;225;150;245;1;368;4;112;92;47;836;268;11;230;6;227;232;0;236;0;5;209;2;80;336;14;136;44;9;73;197;241;10
A10
[modifier | modifier le wikicode]A10 liste
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introns;tRNAs;KEGG;Génome 2;49;fpl;Ferroglobus placidus DSM 10642 3;52;hbo;Halogeometricum borinquense DSM 11551 PR 3 2;59;mru;Methanobrevibacter ruminantium M1 6;55;mmet;Methanococcoides methylutens MM1 4;58;mac;Methanosarcina acetivorans C2A 4;62;mbw;Methanosarcina barkeri str. Wiesmoor 4;60;mhor;Methanosarcina horonobensis HB-1 JCM 15518 4;57;mls;Methanosarcina lacustris Z-7289 3;56;mpl;Methanosphaerula palustris E1-9c 3;54;nou;Natronococcus occultus SP4 ;;; 71;46;pcl;Pyrobaculum calidifontis JCM 11548
A10 décomptes
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Tableaux des effectifs
[modifier | modifier le wikicode]E79 effectifs
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336;176;;Ser;tct;AGA;5;1;6;2;10;4;37;11;10;7;11;3;13;5;17;3;20;4;15;4;10;5;6;1;19;5;9;4;26;14;24;22;8;2;13;5;8;3;10;3;8;3;9;3;12;4;7;2;8;3;52;14;2;1;9;5;11;5;30;18;15;5;7;5;9;4;29;20;3;3;1;1;9;4;12;6;8;2;5;3;6;2;7;6;10;5;8;3;12;5;4;4;10;7;0;0;2;1;10;3;6;4;10;4;7;2;12;5;10;4;1;1;9;3;22;8;14;6;13;3;11;8;12;6;11;9;8;4;11;3;9;3;10;3;0;0;10;4;15;9;3;1;14;10;14;9;11;6;7;4;12;9;13;9;40;17;13;5 92;26;;Ala;gct;AGC;12;6;17;4;17;14;16;3;20;18;19;3;31;19;29;7;35;2;22;6;14;11;22;17;31;8;15;13;75;56;11;10;28;24;23;16;12;2;23;16;9;1;18;4;27;16;14;10;18;14;53;22;16;7;24;11;23;20;55;31;24;3;46;45;26;16;54;40;5;2;2;1;22;18;15;6;13;9;7;3;8;5;11;8;23;19;15;13;25;10;9;2;19;17;83;51;18;11;21;14;13;8;18;7;15;11;20;4;20;16;1;1;19;16;106;44;20;2;19;9;22;19;31;26;36;31;10;8;27;13;15;12;18;8;32;11;23;18;256;252;18;10;20;16;20;13;12;5;12;10;19;14;11;2;67;17;66;32 315;138;;Pro;cct;AGG;3;1;7;5;9;2;16;5;7;2;15;4;13;2;6;4;25;12;6;4;8;1;7;1;9;2;7;1;12;11;12;8;8;2;10;2;7;1;7;1;6;1;6;1;10;1;10;2;8;2;63;5;4;1;7;1;10;5;55;30;21;5;13;9;9;2;16;7;12;10;2;1;8;2;11;1;7;3;7;2;6;1;7;1;8;3;9;1;7;1;3;3;9;4;19;6;4;1;9;1;7;1;14;4;8;1;14;4;9;4;1;1;7;2;54;18;14;2;13;2;11;3;11;7;33;23;8;1;14;5;9;4;10;2;19;5;9;1;12;5;6;3;11;4;13;9;10;3;7;2;7;3;15;6;60;18;15;4 359;182;;Thr;act;AGT;4;3;8;1;10;6;10;3;13;9;9;7;14;10;22;2;31;5;17;3;8;6;8;7;24;7;10;9;24;17;17;16;10;10;10;7;9;3;11;10;8;1;8;1;9;7;9;7;9;6;99;50;5;3;4;4;9;7;30;20;9;6;15;15;9;6;14;13;11;8;3;1;10;7;12;6;8;5;4;4;5;3;3;3;11;9;10;8;10;2;5;4;12;9;23;16;5;5;8;6;9;8;18;12;7;6;11;3;11;7;0;0;10;6;62;33;7;5;10;2;12;8;10;8;9;7;8;6;12;9;9;7;9;5;27;13;13;7;34;32;8;6;16;15;26;17;18;11;9;7;9;7;10;6;151;75;20;13 5;4;;Tyr;tat;ATA;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;11;11;0;0;2;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;1;1;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;4;0;0;0;0;0;0;1;1;1;1;2;2;0;0;1;1;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;3;0;0;0;0;0;0;2;2;0;0;0;0;3;3;0;0;2;2;4;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;2;5;5;0;0;0;0;1;1;2;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;4;4;1;1;0;0;1;1;4;4;0;0;0;0 11;7;;Asp;gat;ATC;0;0;0;0;1;1;0;0;20;19;0;0;6;6;0;0;0;0;0;0;2;2;0;0;0;0;1;1;6;6;0;0;1;1;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;2;2;0;0;0;0;1;1;0;0;1;1;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;2;2;1;1;0;0;0;0;0;0;1;1;2;2;0;0;1;1;2;2;0;0;1;1;1;1;1;1;2;1;0;0;2;2;1;1;0;0;0;0;10;9;6;6;0;0;1;1;0;0;1;1;1;1;10;10;3;3;0;0;1;1 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241;118;;Leu;ttg;CAA;2;1;4;4;9;7;12;6;8;8;16;7;14;14;11;10;14;12;7;7;5;5;4;4;7;7;7;7;31;30;7;6;6;6;6;6;4;4;8;7;4;4;4;4;6;6;6;6;8;8;7;6;2;2;3;3;9;9;15;15;18;8;5;5;7;7;17;14;4;4;1;1;9;8;4;3;8;8;2;2;3;3;3;3;4;4;6;6;14;9;3;3;6;6;10;10;7;7;3;3;5;5;7;7;4;4;19;5;9;9;1;1;7;6;42;24;3;3;6;3;7;7;7;7;0;0;4;4;9;5;7;7;3;3;18;12;6;5;10;10;4;4;10;10;12;12;10;10;4;4;7;7;14;10;22;16;20;8 227;96;;Val;gtg;CAC;3;1;29;8;9;2;8;2;32;24;11;3;39;27;6;3;15;8;6;2;8;3;9;6;13;5;11;7;1540;1503;6;6;6;3;15;11;7;2;81;76;6;2;11;3;15;6;4;2;9;3;18;11;3;2;7;5;11;6;28;19;13;2;6;3;13;6;35;26;4;3;2;1;12;8;9;3;7;4;3;3;5;1;5;2;12;8;7;4;7;5;4;2;13;9;10;5;9;7;14;4;5;2;9;2;7;2;11;4;12;6;1;1;12;6;71;25;11;5;11;9;18;11;14;10;7;5;7;4;11;3;8;6;10;4;0;0;12;5;39;36;1;1;16;13;16;9;29;13;6;4;22;19;11;5;53;28;16;3 300;139;;Leu;ctg;CAG;4;2;10;2;7;5;3;1;7;4;8;1;6;3;7;5;8;5;5;2;7;3;10;5;12;7;12;9;25;20;6;4;6;2;4;2;8;1;10;4;9;1;8;1;3;2;6;4;5;3;9;3;7;5;7;5;5;4;47;34;7;1;5;4;9;2;10;6;8;8;2;1;6;4;11;6;6;5;4;3;5;2;7;3;10;4;5;3;4;2;6;6;9;6;18;13;2;2;16;6;9;4;16;8;11;3;10;2;12;6;1;1;6;5;75;38;7;2;5;2;11;8;9;7;5;3;13;10;11;4;5;3;9;4;5;3;5;2;4;2;7;4;5;4;37;19;21;7;7;4;6;5;7;3;32;15;13;3 522;174;;Met;atg;CAT;12;8;18;5;24;13;32;16;21;13;56;31;35;19;23;5;29;5;19;3;23;17;16;9;30;5;20;13;94;74;16;11;15;10;26;15;12;4;30;20;12;4;15;4;25;13;16;6;24;15;286;65;6;4;14;6;17;7;154;112;36;14;14;8;20;9;50;34;11;8;4;2;19;14;25;11;14;7;11;4;14;6;14;6;19;11;20;14;41;23;9;3;17;10;32;18;18;14;18;10;13;8;27;7;15;4;60;29;19;11;2;2;15;6;278;91;26;8;24;9;22;13;23;14;13;6;15;8;39;30;15;7;22;8;73;30;23;11;14;7;5;3;21;14;20;12;36;12;12;5;17;11;26;20;138;39;79;48 44;22;;Trp;tgg;CCA;7;4;6;1;10;7;16;5;256;243;18;6;178;173;13;1;22;3;12;3;6;6;6;4;18;4;11;10;30;20;10;9;8;7;8;4;8;2;15;12;9;2;8;2;7;4;7;5;23;22;74;27;3;3;6;3;9;7;29;19;18;3;6;5;7;5;23;17;15;13;1;1;9;6;9;6;8;7;5;3;4;2;6;4;8;6;11;9;14;7;4;3;10;10;14;9;47;45;10;7;6;6;12;5;6;4;18;7;10;6;0;0;8;5;9;8;14;2;9;1;10;9;8;5;8;7;6;5;13;3;8;7;8;5;18;13;7;4;7;4;3;3;13;11;12;7;17;10;6;4;217;208;10;1;33;12;27;7 268;181;;Gly;ggg;CCC;2;1;0;0;7;5;5;1;2148;2045;9;1;1295;1266;5;5;25;14;3;1;9;7;7;5;2;2;5;4;81;74;2;1;6;5;9;6;0;0;326;322;0;0;1;1;8;5;5;3;6;5;4;3;4;3;4;2;9;5;18;14;9;3;3;2;5;3;72;70;2;1;1;1;8;5;8;2;5;3;3;2;3;2;2;2;7;5;4;3;3;2;1;1;10;9;9;5;341;339;16;11;3;1;9;7;5;2;9;5;9;6;0;0;8;5;6;2;7;1;11;8;13;11;16;14;5;4;2;1;6;2;4;4;6;3;4;3;6;4;20;19;4;4;90;88;6;5;4;3;7;6;1766;1696;6;3;105;35;11;2 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80;44;;Ser;tcg;CGA;2;2;8;1;4;4;7;4;4;4;5;1;7;7;8;4;9;6;6;3;8;7;3;3;15;5;4;4;48;48;10;9;4;3;4;4;4;1;6;6;3;1;5;1;4;4;3;3;5;5;29;6;1;1;2;1;5;5;14;13;6;2;3;3;4;4;4;3;3;3;1;1;4;4;3;3;2;2;1;1;2;2;3;3;3;3;4;4;2;1;2;2;5;5;8;7;3;3;5;4;3;3;6;5;4;3;9;6;3;3;1;1;3;3;35;17;5;4;7;2;6;5;4;4;3;3;4;4;10;6;3;3;3;3;6;5;4;4;6;6;1;1;4;3;3;2;5;5;3;3;4;4;3;1;23;10;6;3 112;26;;Ala;gcg;CGC;3;3;6;2;5;4;7;3;20;19;11;2;16;14;7;5;6;4;4;4;4;4;6;5;8;1;4;3;3858;3758;4;4;5;5;6;5;3;1;17;16;5;2;5;3;8;7;4;4;7;6;56;15;2;2;4;4;5;5;26;20;8;3;6;5;4;4;15;15;3;2;2;1;5;4;6;4;5;3;3;3;3;3;3;3;10;7;5;4;3;3;2;2;5;4;11;8;7;6;4;4;3;2;12;8;4;3;13;5;5;4;1;1;5;4;24;6;5;3;8;2;4;3;5;5;4;4;3;2;11;2;5;4;4;2;7;3;7;6;18;17;3;3;6;5;4;4;6;6;3;2;21;20;5;2;36;21;22;11 180;91;;Pro;ccg;CGG;2;1;13;6;5;2;5;3;4;2;8;3;4;1;4;2;9;5;4;1;4;2;3;1;8;1;4;1;41;41;2;2;3;1;4;2;5;3;4;3;5;3;5;2;3;2;3;1;7;5;18;5;1;1;3;2;4;1;22;12;5;2;3;2;4;2;3;1;4;4;2;1;3;1;3;1;2;1;1;1;3;1;3;1;3;1;2;1;1;1;2;2;4;1;7;3;1;1;4;1;3;1;4;2;4;1;9;6;4;1;1;1;4;1;21;9;4;2;5;5;5;2;5;2;3;1;2;1;8;4;4;1;3;1;9;5;3;1;3;1;2;1;3;1;5;4;6;4;4;3;4;2;4;3;36;17;9;4 66;42;;Thr;acg;CGT;1;1;6;3;10;10;6;4;4;4;6;4;7;7;9;4;10;4;7;5;5;5;4;4;11;3;4;4;137;133;5;5;3;3;5;5;3;1;7;7;4;2;5;1;3;3;4;4;9;9;23;9;1;1;2;2;6;5;30;23;4;2;4;4;5;5;10;10;2;2;2;1;4;4;3;3;3;3;0;0;3;3;2;2;4;4;5;5;1;1;0;0;5;5;10;8;3;3;5;5;3;3;8;7;7;7;5;2;7;7;1;1;6;6;23;12;4;2;6;3;7;7;6;6;4;4;5;5;6;3;5;5;2;2;9;5;4;4;7;7;2;2;4;4;13;10;8;7;4;4;3;3;3;2;29;14;6;2 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24;7;;Arg;cgc;GCG;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;1;1;7;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;9;0;0;0;0;0;0;0;0;2;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;1;1;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;1;1;0;0;1;1;0;0;3;3;0;0 424;263;;Ser;agc;GCT;5;3;6;2;13;10;16;9;13;10;18;6;19;11;9;3;14;5;9;3;8;6;9;6;15;3;8;5;33;23;20;19;10;7;13;6;6;2;10;7;3;2;8;4;12;7;7;3;12;8;30;16;6;3;7;4;8;4;0;0;28;12;7;5;8;6;76;69;8;7;2;2;8;4;9;2;10;4;6;5;5;3;7;5;8;6;12;8;15;9;8;8;9;6;18;12;7;6;10;3;7;5;10;5;7;3;20;6;11;7;1;1;9;5;65;31;16;6;9;3;8;4;9;6;12;7;8;4;13;6;7;4;8;2;17;3;10;4;7;5;5;3;36;34;11;6;19;13;9;7;11;8;9;2;99;59;14;4 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236;100;;Tyr;tac;GTA;6;6;22;21;11;10;83;33;14;14;17;14;39;38;19;6;28;8;19;12;9;9;11;11;24;2;35;25;36;29;5;5;15;11;11;11;9;9;14;11;10;10;9;9;14;10;13;13;10;9;17;13;12;8;16;13;23;22;50;47;21;20;7;7;13;13;19;19;8;8;3;2;31;31;15;13;8;8;6;4;5;5;8;8;11;11;9;9;13;11;7;5;19;19;28;26;16;16;12;12;8;7;18;18;10;10;20;17;24;23;1;1;15;13;90;50;18;16;8;7;29;28;31;29;2;2;9;9;14;14;15;15;11;10;24;17;17;14;9;9;13;10;15;15;13;11;15;14;10;10;18;17;19;19;107;48;21;18 150;43;;Asp;gac;GTC;8;2;20;2;11;6;29;8;45;38;26;5;42;33;34;7;34;3;27;7;13;4;15;5;41;9;14;6;49;35;14;10;10;4;13;7;14;3;21;9;6;1;17;3;10;5;13;4;9;2;184;49;5;4;10;3;15;8;30;15;33;8;10;6;13;3;20;14;19;16;3;1;15;9;24;12;13;12;3;1;8;3;5;2;16;4;8;4;30;14;9;5;13;8;27;14;8;6;23;6;13;4;10;4;14;3;31;11;15;7;1;1;10;4;90;34;34;5;11;3;13;6;17;10;15;3;19;10;24;4;11;5;19;7;82;20;97;83;8;3;7;4;15;11;19;13;24;6;13;7;49;44;23;12;59;13;42;12 387;163;;His;cac;GTG;5;2;21;5;8;1;12;6;11;4;21;7;19;5;21;3;26;5;19;6;9;2;14;3;17;5;9;4;37;27;10;8;8;2;10;2;5;1;10;4;6;2;5;1;11;3;5;1;16;8;52;19;4;4;6;4;7;1;26;16;18;3;7;2;9;1;27;13;5;3;2;1;14;4;9;1;7;1;3;3;7;3;6;3;10;3;7;2;18;8;4;4;11;4;24;20;8;5;9;1;8;1;23;14;5;1;26;10;10;1;0;0;10;1;27;12;13;4;9;3;11;4;10;2;10;1;7;1;15;7;9;4;9;1;26;9;10;3;6;2;5;3;12;5;12;8;19;9;10;5;9;5;14;9;42;18;26;8 1045;470;;Asn;aac;GTT;10;4;12;2;28;18;19;9;24;7;16;6;30;14;23;3;33;5;20;3;21;13;17;9;23;3;27;18;48;32;17;12;18;9;14;4;10;1;23;6;6;1;11;1;17;8;7;2;28;21;123;41;6;5;11;6;29;20;34;18;22;10;9;4;25;17;51;37;9;7;3;1;27;21;13;4;14;4;4;2;9;2;9;5;13;5;12;8;30;16;9;5;21;14;21;11;13;5;26;15;12;4;9;1;14;5;30;13;29;20;1;1;18;10;168;68;24;13;14;5;41;30;33;24;15;7;12;4;16;7;12;7;13;1;39;9;18;8;9;2;8;5;23;18;17;11;23;13;15;9;13;6;21;14;47;19;49;18 73;54;;Leu;tta;TAA;2;2;6;5;5;4;6;3;13;12;4;2;10;10;6;4;7;3;4;3;4;4;4;4;5;5;11;11;13;12;13;13;4;4;5;5;4;4;8;8;3;3;5;4;4;4;3;3;19;19;12;8;11;11;3;3;9;8;16;15;9;5;4;4;4;4;15;14;11;11;1;1;16;15;2;2;3;3;1;1;2;2;3;3;7;5;4;4;8;5;4;3;8;8;10;7;5;5;6;5;3;3;12;12;3;3;4;3;10;10;1;1;7;7;5;3;7;6;2;1;8;8;11;9;3;3;4;4;4;4;9;9;6;6;14;9;4;4;3;3;4;3;6;6;5;4;7;7;42;13;6;6;9;7;46;35;5;3 230;59;;Val;gta;TAC;2;2;3;1;7;7;7;3;18;18;5;3;21;19;6;4;8;5;5;4;5;5;5;4;7;5;6;5;145;116;5;5;3;2;7;7;2;1;16;16;2;1;2;1;6;6;6;6;6;6;12;8;1;1;3;3;8;8;9;9;9;4;4;3;5;4;50;39;7;7;1;1;7;6;5;4;1;1;2;2;3;3;2;2;3;1;6;6;7;5;1;1;6;6;15;13;8;8;8;5;3;2;9;7;4;4;4;1;7;5;1;1;7;5;26;19;8;3;2;1;7;5;10;10;3;2;5;5;4;2;5;4;4;3;11;6;11;9;5;4;2;2;26;26;4;3;9;7;4;3;16;16;5;4;36;19;4;2 244;134;;Leu;cta;TAG;3;3;3;2;5;5;11;5;4;4;10;4;5;5;5;2;8;2;3;1;4;4;4;4;6;4;4;4;20;18;4;4;3;3;4;3;2;1;3;3;2;1;2;1;5;5;3;3;33;33;17;12;0;0;2;2;5;5;24;20;10;3;5;5;3;3;11;11;5;4;1;1;5;5;6;6;4;3;1;1;2;2;2;2;4;4;4;4;10;4;0;0;4;4;7;5;3;3;4;4;3;3;7;6;5;5;10;5;3;3;1;1;3;3;40;14;0;0;6;5;3;3;4;4;1;1;2;2;9;6;4;4;4;4;8;6;5;3;3;3;1;1;5;5;6;6;4;4;5;4;4;4;11;7;25;10;9;5 75;53;;Ile;ata;TAT;1;1;2;2;6;6;5;2;8;8;4;3;8;8;24;16;26;13;7;4;5;5;5;5;7;5;5;5;23;19;13;13;5;5;5;5;2;2;6;6;0;0;2;2;5;5;4;4;9;9;61;15;2;2;2;2;6;6;18;16;8;3;3;3;5;5;7;7;7;7;1;1;7;7;7;7;6;6;1;1;3;3;3;2;5;5;5;5;14;7;1;1;5;5;10;8;5;5;7;7;11;11;25;20;4;4;5;3;7;7;1;1;4;4;10;7;9;3;5;3;6;6;5;5;3;3;5;5;5;4;6;6;4;4;22;16;5;4;4;4;1;1;8;8;5;5;6;6;4;4;5;5;9;6;51;25;5;4 14;12;;SeC;tga;TCA;1;1;0;0;2;2;0;0;17;17;0;0;29;29;0;0;3;2;2;2;1;1;2;2;1;1;2;2;3;3;4;4;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;4;4;2;2;18;18;1;1;0;0;1;1;3;3;2;2;0;0;7;4;2;2;24;24;4;4;0;0;2;2;0;0;7;4;0;0;0;0;0;0;1;1;1;1;1;1;1;1;3;3;5;5;4;4;1;1;1;1;1;1;1;1;0;0;3;3;0;0;1;1;1;1;1;1;1;1;3;3;2;2;1;1;2;2;1;1;3;3;2;2;0;0;0;0;1;1;1;1;18;18;1;1;1;1;1;1;21;21;1;1;1;1;0;0 47;23;;Gly;gga;TCC;8;3;8;1;7;4;13;2;987;962;9;3;391;385;42;9;66;5;34;6;11;4;6;1;47;11;9;3;66;44;24;14;6;4;4;2;6;2;34;24;5;2;7;2;4;2;7;2;48;46;61;21;4;2;7;4;5;4;39;21;18;2;4;3;9;4;619;616;5;5;1;1;5;3;11;7;10;4;4;2;6;2;7;2;8;2;9;7;15;6;11;6;6;2;15;9;133;132;14;2;9;6;12;6;7;2;10;5;8;2;1;1;4;2;17;4;17;7;9;4;8;5;7;5;9;3;12;7;10;3;6;4;9;3;33;14;10;8;5;3;7;3;1073;1068;16;11;12;5;6;4;833;814;19;12;80;27;11;3 107;50;;Arg;cga;TCG;3;3;8;4;84;82;6;2;9;8;5;1;12;11;10;6;17;6;8;4;15;15;6;4;11;5;4;4;25;22;5;4;4;4;5;4;10;4;8;7;5;3;7;2;4;3;5;4;1201;1194;79;14;2;2;2;2;6;5;17;15;9;3;4;4;6;6;18;14;4;4;1;1;5;5;5;3;5;3;1;1;5;4;3;2;5;4;29;28;5;2;1;1;7;7;7;5;6;6;5;3;4;4;7;7;6;5;4;2;5;5;1;1;6;5;26;9;7;2;7;5;6;5;6;6;5;4;5;5;4;1;4;4;5;3;19;10;5;3;5;5;3;3;12;12;7;7;7;7;5;5;7;7;6;3;33;8;7;4 252;139;;Arg;aga;TCT;3;3;2;2;17;17;10;9;55;55;9;7;44;44;10;3;13;3;8;3;9;9;5;5;12;3;6;6;14;14;26;25;5;5;6;6;3;3;9;9;4;4;3;3;5;5;5;5;54;54;68;25;3;3;4;4;5;5;21;19;18;8;6;6;6;6;90;90;9;9;1;1;6;6;6;6;7;6;3;3;5;4;5;5;6;6;16;15;8;6;4;4;7;7;6;6;22;22;6;6;4;4;27;26;5;5;12;6;6;6;1;1;6;6;18;10;11;6;7;3;8;6;6;6;6;6;6;6;8;6;6;6;5;5;18;9;7;6;5;5;4;4;123;122;10;10;13;12;6;6;48;48;6;3;105;53;9;6 209;117;;Ser;tca;TGA;1;1;2;1;6;6;12;6;5;5;10;5;7;7;8;5;14;7;9;7;5;5;3;3;7;3;5;4;54;51;15;15;3;2;5;3;2;2;6;5;2;2;2;2;4;4;3;3;14;13;62;19;3;3;4;3;5;5;18;15;11;5;3;3;4;4;7;7;6;6;1;1;20;16;6;5;4;2;3;3;2;2;2;2;3;2;4;4;8;4;5;4;6;6;6;6;4;4;4;4;3;2;10;9;3;3;17;7;9;9;1;1;5;5;20;10;9;5;5;3;8;8;9;9;4;4;3;3;13;6;6;5;5;5;15;9;5;5;7;7;4;4;6;6;9;9;8;8;5;5;6;6;8;3;41;19;11;5 368;103;;Ala;gca;TGC;6;6;3;2;9;7;10;3;42;42;13;6;35;31;14;1;11;4;9;2;11;8;15;14;11;5;6;5;5898;3009;15;12;9;7;13;12;2;2;66;64;0;0;2;1;11;9;10;10;10;9;53;17;5;5;7;4;7;6;24;20;17;5;5;4;8;7;53;47;20;19;1;1;11;11;9;6;6;6;6;4;1;1;5;5;11;8;8;7;16;8;5;5;11;11;17;11;12;12;9;9;7;5;11;6;7;6;10;1;10;10;1;1;9;9;31;10;21;8;9;2;9;7;10;9;9;6;8;7;13;5;8;7;7;4;17;7;14;12;39;39;7;5;40;37;11;9;8;5;4;4;36;36;37;21;47;18;15;7 205;97;;Pro;cca;TGG;3;1;8;2;11;8;47;6;5;3;18;10;9;3;41;11;54;6;31;8;8;7;6;2;43;10;6;3;51;44;4;3;4;2;7;3;5;1;7;2;5;2;8;1;7;3;5;2;68;64;29;7;5;4;4;3;7;4;21;15;27;7;5;4;7;3;14;12;10;7;1;1;10;7;8;3;4;1;2;2;3;3;4;3;8;5;7;6;11;3;4;3;5;3;12;9;6;4;5;3;4;3;11;5;4;3;14;9;6;4;1;1;6;4;43;14;23;10;8;2;9;6;10;6;6;2;6;4;11;5;5;3;6;1;21;6;4;2;7;5;1;1;8;5;14;10;9;5;32;32;5;3;16;8;53;17;31;18 290;139;;Thr;aca;TGT;3;2;2;1;9;8;9;5;8;7;10;8;10;8;10;4;15;3;11;2;4;3;4;3;12;5;7;7;206;157;18;17;4;3;8;6;6;2;8;7;5;2;6;2;7;5;6;6;13;12;35;16;4;4;4;3;6;5;30;24;10;5;4;4;6;6;22;17;9;8;1;1;6;6;7;2;6;3;2;2;5;3;3;3;4;3;7;6;10;7;2;2;6;6;18;16;5;4;7;6;6;5;25;22;6;5;16;7;8;8;1;1;7;7;19;9;11;6;5;4;4;4;6;5;5;4;5;5;12;8;7;6;7;3;21;10;8;5;6;4;4;3;18;17;12;9;7;6;4;4;6;5;8;6;91;43;14;6 6;5;;Stp;taa;TTA;0;0;1;1;1;1;1;1;24;24;0;0;4;4;0;0;0;0;0;0;3;3;0;0;0;0;1;1;1;1;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;37;36;0;0;0;0;0;0;2;1;1;1;0;0;0;0;0;0;2;2;1;1;0;0;2;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;2;2;32;30;1;1;3;3;3;3;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;3;3;0;0;1;1;2;1;1;1;0;0;1;1;2;2;0;0;0;0;1;1;1;1;2;2;1;1;1;1;0;0;0;0;2;2;0;0;0;0;3;3;20;20;1;1;2;2;0;0 225;97;;Glu;gaa;TTC;7;2;11;3;11;7;16;9;2368;2321;15;7;435;424;19;4;36;9;17;3;15;11;7;5;20;4;21;18;66;59;17;17;6;4;11;7;6;1;20;15;5;3;7;2;11;6;8;5;15;11;46;24;4;4;9;7;16;13;51;39;16;4;6;4;8;5;114;107;11;9;1;1;12;10;14;4;12;6;5;4;5;4;9;6;8;3;7;6;22;9;3;3;14;12;16;13;139;136;18;9;5;4;14;8;7;4;16;6;13;6;1;1;13;7;12;9;14;1;7;2;24;15;18;12;10;5;10;9;13;5;21;17;15;5;26;8;235;205;5;3;2;2;114;112;16;13;13;9;9;7;1901;1872;15;10;84;24;22;10 105;46;;Gln;caa;TTG;3;3;4;2;43;42;10;4;10;8;15;8;20;18;24;5;40;11;20;5;43;42;5;4;14;3;7;7;7;6;16;15;4;2;5;3;4;2;5;3;4;2;4;1;6;4;4;3;782;777;60;13;2;2;2;2;11;10;11;8;13;3;3;3;6;4;14;11;10;9;1;1;16;15;7;7;4;3;1;1;3;3;4;3;7;6;37;35;20;10;2;1;10;8;11;8;7;7;5;3;5;4;6;5;5;3;21;12;14;12;1;1;6;4;44;21;11;1;10;7;13;13;20;17;6;5;5;3;11;8;8;8;45;29;17;7;9;6;4;2;2;2;8;6;9;5;10;7;64;51;16;12;10;7;28;8;22;14 525;250;;Lys;aaa;TTT;5;3;8;5;55;50;16;6;86;82;12;9;78;68;16;5;29;9;14;1;34;28;15;10;30;7;16;11;43;38;36;32;11;7;15;11;6;2;18;14;4;2;6;3;15;8;11;5;50;45;61;31;4;2;6;4;14;11;63;46;20;5;8;5;12;8;60;46;20;13;1;1;19;13;13;4;10;7;4;2;3;2;5;2;14;6;31;25;20;13;3;2;23;15;32;25;22;17;12;8;11;7;16;7;9;6;12;8;19;13;0;0;12;6;24;7;18;5;8;4;23;15;20;14;1;1;8;3;11;8;18;14;14;6;57;20;38;23;10;5;4;1;31;26;15;11;20;13;10;6;74;70;11;6;72;21;82;68 12273;5704;;;;total;211;119;422;138;1474;1302;699;268;7113;6771;648;267;4057;3737;743;213;1095;278;596;180;912;773;498;325;827;220;492;346;13732;10330;557;483;384;244;519;358;293;98;1119;929;258;97;332;104;494;300;485;322;3778;3620;2489;795;203;140;283;169;508;379;1497;1045;738;237;367;282;433;269;2004;1751;377;318;83;49;530;398;481;222;353;209;155;105;252;142;258;153;470;285;756;632;684;365;201;149;508;383;859;583;1179;1100;506;281;327;203;674;401;338;188;750;312;531;357;35;35;412;256;2488;1087;647;260;430;181;613;438;613;452;407;247;375;229;628;294;396;279;448;218;1066;427;808;572;804;658;279;201;2019;1908;614;409;616;345;458;323;5873;5642;583;347;2642;1054;1202;601
C42 effectifs
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- Légende:
- − 6*6*, pour mgr aac, les décomptes à partir du fichier fasta donne 140 au total (tot) et 13 séquences différentes (diff). Le nombre total de tRNAs représenté dans le tableau récapitulatif de la base gtRNAdb [1] donne seulement 6 pour aac au lieu de 140. Ceci est du aux nombreux pseudo-gènes de ce génome. En comparaison avec les décomptes des autres tRNAs de ce génome, la plupart ont tot=diff. Aussi j'ai décidé d'attribuer au codon acc tot=diff=6.
C42;;;ani;;aor;;bfu;;cal;;cgr;;cjd;;cneg;;cot;;dha;;ecu;;ede;;fgr;;fgr5;;fve;;fvr;;kaf;;kpa;;kla;;kna;;lkl;;lth;;mfa;;mgr;;mth;;ncr;;ncs;;opa;;pch;;pic;;sas;;sce;;spo;;sre;;tbl;;tdl;;tpf;;ttt;;uma;;vda;;vma;;yli;;zro; aa;gène;tRNA;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff Phe;ttt;AAA;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Val;gtt;AAC;8;2;10;2;8;8;6;3;10;1;9;2;7;6;4;2;10;2;1;1;2;2;19;8;16;6;7;2;13;2;13;2;5;2;7;1;7;1;14;1;11;2;12;2;6;6;7;3;19;1;13;3;3;1;9;5;7;3;7;2;14;2;9;2;4;4;18;3;12;2;10;1;6;3;4;3;11;9;7;7;24;3;12;2 Leu;ctt;AAG;6;6;0;0;6;5;2;2;0;0;4;1;6;4;1;1;2;2;1;1;1;1;13;2;6;1;6;4;12;5;2;2;2;2;0;0;1;1;;;0;0;4;2;7;6;7;7;17;15;2;2;1;1;6;1;3;1;0;0;0;0;5;2;4;4;0;0;0;0;0;0;5;4;4;3;8;2;5;2;21;12;0;0 Ile;att;AAT;7;5;10;5;8;8;6;6;9;1;6;1;6;5;4;1;9;1;1;1;2;2;13;5;11;5;11;2;11;7;13;1;5;1;7;1;7;1;12;2;10;1;12;2;8;8;8;8;17;17;12;1;4;1;10;3;7;1;9;1;13;1;8;2;4;4;17;4;8;1;10;1;6;6;4;2;9;1;7;7;26;12;11;2 Cys;tgt;ACA;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Gly;ggt;ACC;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0 Arg;cgt;ACG;9;3;12;2;6;5;2;2;4;1;6;3;3;3;2;2;5;2;1;1;2;2;10;2;10;2;13;11;10;2;4;2;2;2;3;1;3;2;5;1;4;2;4;3;6;6;7;7;21;2;5;2;2;2;10;1;3;1;4;1;6;2;8;1;4;4;4;1;4;1;3;1;6;6;4;4;9;5;6;6;1;1;5;2 Ser;agt;ACT;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Ser;tct;AGA;5;1;7;3;7;1;4;1;9;1;7;1;6;5;2;2;6;1;1;1;1;1;11;6;11;6;7;4;10;4;11;3;4;1;6;1;7;1;11;7;9;1;10;3;4;4;5;4;14;2;12;2;2;1;7;4;6;1;7;1;11;2;7;1;2;2;16;3;7;1;8;1;3;1;3;3;6;3;5;3;21;4;12;1 Ala;gct;AGC;8;1;10;2;8;1;6;1;10;1;6;1;8;8;3;1;7;1;1;1;2;2;14;9;13;9;13;3;14;13;12;1;5;1;7;1;7;3;13;2;10;1;12;2;9;9;7;7;19;13;12;2;3;1;8;1;7;1;7;1;11;1;6;1;3;3;19;3;8;1;9;2;7;7;5;4;11;9;7;7;30;2;12;1 Pro;cct;AGG;6;5;9;6;4;4;1;1;1;1;0;0;6;6;1;1;1;1;1;1;0;0;10;6;10;6;4;4;10;9;1;1;2;1;1;1;1;1;1;1;2;1;2;1;5;4;6;6;12;4;1;1;0;0;0;0;1;1;1;1;2;1;6;1;3;3;1;1;1;1;1;1;4;4;4;4;8;4;1;1;21;6;3;2 Thr;act;AGT;6;2;10;2;6;4;4;2;9;1;6;1;5;5;4;1;8;2;1;1;2;2;11;4;11;4;7;7;11;7;11;3;5;2;6;1;7;1;12;3;9;2;10;1;6;5;6;5;12;3;11;1;3;1;12;6;7;1;7;2;11;1;7;2;4;4;15;4;9;2;9;3;4;4;4;1;8;2;4;4;22;1;10;1 Tyr;tat;ATA;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0 Asp;gat;ATC;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 His;cat;ATG;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Asn;aat;ATT;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Leu;ttg;CAA;2;2;0;0;5;5;6;5;8;5;7;1;3;3;1;1;4;1;1;1;1;1;3;3;3;3;4;4;4;4;2;2;3;3;7;3;5;3;11;7;8;7;14;2;2;2;2;2;5;5;9;9;3;1;0;0;8;1;7;3;10;5;4;1;0;0;9;6;8;5;2;1;1;1;0;0;2;2;3;3;3;3;10;10 Val;gtg;CAC;2;2;3;3;2;2;1;1;1;1;3;1;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;3;3;3;3;3;2;3;3;1;1;1;1;2;2;2;2;3;1;3;1;4;2;2;2;3;3;4;4;2;1;1;1;3;1;1;1;4;3;2;1;1;1;1;1;1;1;2;1;1;1;3;3;1;1;2;2;2;2;8;5;4;1 Leu;ctg;CAG;3;3;4;4;1;1;1;1;0;0;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;5;3;5;3;2;1;5;4;0;0;2;2;0;0;0;0;0;0;3;3;2;1;4;4;4;4;6;6;0;0;1;1;3;3;1;1;1;1;0;0;1;1;2;2;0;0;0;0;0;0;4;4;2;2;4;4;4;4;13;7;0;0 Met;atg;CAT;7;5;8;8;8;5;4;2;7;2;7;4;7;6;4;4;10;9;2;2;2;2;6;6;5;5;15;7;8;6;9;4;4;3;6;3;4;2;10;2;8;4;10;5;8;6;8;7;17;8;9;2;4;2;11;10;6;5;10;6;10;2;7;4;4;4;11;6;7;2;8;4;5;5;4;4;9;5;8;5;18;7;9;2 Trp;tgg;CCA;3;1;4;1;6;2;2;2;5;5;4;1;3;3;1;1;4;1;1;1;0;0;4;4;4;4;4;4;5;5;6;2;3;2;4;3;4;4;5;4;5;3;6;1;4;1;4;3;7;2;7;7;2;2;0;0;4;1;5;2;6;1;3;1;2;2;7;6;4;1;4;3;4;3;2;2;3;3;3;3;13;8;6;4 Gly;ggg;CCC;1;1;1;1;2;2;1;1;1;1;1;1;2;2;0;0;1;1;1;1;2;2;1;1;1;1;8;7;1;1;1;1;1;1;1;1;2;1;2;1;2;2;2;1;3;3;2;2;6;6;2;1;0;0;1;1;1;1;2;2;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1;3;3;2;2;0;0;2;2 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B42 effectifs
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Ala;TGC;gca;3;1;3;1;7;2;5;3;3;1;3;1;3;1;3;1;3;1;3;1;5;2;4;2;4;2;3;1;3;1;5;2;3;1;3;1;11;1;3;1;3;1;8;1;3;1;8;1;4;2;7;2;9;3;3;1;3;2;2;2;3;1;2;1;1;1;2;1;3;1;1;1;1;1;1;1;3;1;5;1;2;1;5;1 Pro;TGG;cca;3;1;3;1;1;1;4;2;3;1;1;1;1;1;1;1;2;1;1;1;3;2;2;2;4;2;1;1;2;1;3;1;1;1;2;1;4;1;1;1;3;1;1;1;4;1;3;1;3;1;3;1;3;1;2;1;1;1;1;1;2;2;1;1;2;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;1;3;1;1;1;3;1 Thr;TGT;aca;4;3;4;1;3;1;4;2;3;1;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;3;2;2;2;6;1;1;1;1;1;3;2;1;1;4;2;4;1;1;1;3;1;1;1;2;1;5;1;4;2;5;1;4;1;2;1;3;3;1;1;3;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;1;5;1;2;2;5;1 Stp;TTA;taa;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Glu;TTC;gaa;3;2;13;1;2;2;6;1;7;1;4;2;4;1;4;1;4;1;4;1;7;2;4;2;6;1;4;1;4;1;5;1;4;1;3;1;0;0;4;2;7;2;5;4;6;1;3;1;4;1;5;1;1;1;4;1;6;2;2;1;3;3;1;1;2;1;2;1;4;1;1;1;1;1;1;1;3;1;5;1;6;2;6;1 Gln;TTG;caa;2;1;5;1;1;1;4;1;3;2;2;1;2;1;2;1;2;1;2;1;5;2;3;3;4;2;1;1;2;1;4;3;2;1;3;1;4;1;1;1;4;1;1;1;3;1;1;1;2;2;2;2;5;1;2;1;4;3;3;3;2;2;1;1;1;1;2;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;3;1;4;1;6;2 Lys;TTT;aaa;4;1;12;1;2;2;6;2;10;4;4;1;6;1;5;1;5;1;6;1;6;2;4;2;6;1;3;1;5;1;4;2;5;1;4;1;7;1;5;1;8;2;2;1;6;1;2;1;2;1;4;1;1;1;5;1;3;1;0;0;3;2;1;1;2;1;2;1;4;2;1;1;1;1;1;1;4;2;5;1;5;1;4;1 ;;total;81;47;147;44;83;56;109;55;108;49;85;52;87;50;85;49;83;48;86;45;92;47;84;64;113;53;89;47;86;52;91;61;82;49;81;42;132;41;85;48;106;44;89;52;97;50;105;41;93;49;121;47;112;46;83;47;75;48;71;61;61;48;49;47;40;36;70;50;81;53;77;63;74;59;77;58;70;48;90;39;109;65;131;47
A10 effectifs
[modifier | modifier le wikicode]- Lien tableaux: tableaux
A10;;;fpl;;hbo;;mac;;mbw;;mhor;;mls;;mmet;;mpl;;mru;;nou; aa;tRNA;gène;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff;tot;diff Phe;AAA;ttt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Val;AAC;gtt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Leu;AAG;ctt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Ile;AAT;att;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Cys;ACA;tgt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Gly;ACC;ggt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Arg;ACG;cgt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0 Ser;ACT;agt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Ser;AGA;tct;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Ala;AGC;gct;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Pro;AGG;cct;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Thr;AGT;act;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Tyr;ATA;tat;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Asp;ATC;gat;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 His;ATG;cat;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Asn;ATT;aat;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Leu;CAA;ttg;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1 Val;CAC;gtg;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;0;0;1;1 Leu;CAG;ctg;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;2;2;1;1;1;1;0;0;1;1 Met;CAT;atg;3;3;3;3;4;3;5;3;4;4;4;3;4;3;3;3;3;3;4;4 Trp;CCA;tgg;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1 Gly;CCC;ggg;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;0;0;1;1 Arg;CCG;cgg;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;0;0;1;1 Arg;CCT;agg;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1 Ser;CGA;tcg;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;0;0;1;1;0;0;1;1 Ala;CGC;gcg;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;0;0;1;1 Pro;CGG;ccg;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;0;0;1;1 Thr;CGT;acg;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;0;0;1;1 Stp;CTA;tag;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Glu;CTC;gag;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;0;0;1;1 Gln;CTG;cag;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1 Lys;CTT;aag;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;1;1;1;1;1;1;1 Phe;GAA;ttc;1;1;1;1;2;1;2;1;2;1;2;1;2;2;1;1;2;2;1;1 Val;GAC;gtc;1;1;1;1;2;1;2;1;2;1;2;1;1;1;1;1;2;2;1;1 Leu;GAG;ctc;2;2;1;1;2;2;2;1;2;2;2;2;2;1;1;1;1;1;1;1 Ile;GAT;atc;1;1;1;1;2;1;2;1;2;2;2;1;1;1;1;1;2;2;1;1 Cys;GCA;tgc;1;1;1;1;3;3;4;3;4;4;3;3;4;3;8;6;1;1;1;1 Gly;GCC;ggc;1;1;2;1;3;1;3;2;3;2;2;2;1;1;1;1;1;1;2;1 Arg;GCG;cgc;1;1;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1 Ser;GCT;agc;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1 Ser;GGA;tcc;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1 Ala;GGC;gcc;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1 Pro;GGG;ccc;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;0;0;1;1 Thr;GGT;acc;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2 Tyr;GTA;tac;1;1;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1 Asp;GTC;gac;1;1;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;1;1;1;2;2;2;2 His;GTG;cac;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1 Asn;GTT;aac;1;1;1;1;2;1;2;1;2;1;2;1;1;1;1;1;2;2;1;1 Leu;TAA;tta;1;1;1;1;1;1;3;3;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1 Val;TAC;gta;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;1;1;1 Leu;TAG;cta;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1 Ile;TAT;ata;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 SeC;TCA;tga;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Gly;TCC;gga;1;1;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1 Arg;TCG;cga;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1 Arg;TCT;aga;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1 Ser;TGA;tca;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1 Ala;TGC;gca;1;1;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;3;1;1;1;3;2;4;1 Pro;TGG;cca;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1 Thr;TGT;aca;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1;1;1;1;1;4;2;1;1;1;1 Stp;TTA;taa;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 Glu;TTC;gaa;1;1;1;1;2;1;2;1;2;1;2;1;1;1;1;1;2;2;1;1 Gln;TTG;caa;1;1;1;1;2;2;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1 Lys;TTT;aaa;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;2;2;1;1 ;;total;49;49;52;47;58;50;62;52;60;55;57;51;55;48;56;52;59;57;53;49
Tableaux des codons, corrélations et indice double
[modifier | modifier le wikicode]E79-Codons. Correlations et indices des doublons
[modifier | modifier le wikicode]- Lien tableaux: E79-Codons. Corrélations et indices des doublons.
- 79 eucaryotes: Codons, corrélations et indices des doublons
E79;;Lys;;Asn;;Lys;;Asn;;Thr;;Thr;;Thr;;Thr;;Arg;;Ser;;Arg;;Ser;;Ile;;Ile;;Met;;Ile;;Gln;;His;;Gln;;His;;Pro;;Pro;;Pro;;Pro;;Arg;;Arg;;Arg;;Arg;;Leu;;Leu;;Leu;;Leu;;Glu;;Asp;;Glu;;Asp;;Ala;;Ala;;Ala;;Ala;;Gly;;Gly;;Gly;;Gly;;Val;;Val;;Val;;Val;;Stp;;Tyr;;Stp;;Tyr;;Ser;;Ser;;Ser;;Ser;;SeC;;Cys;;Trp;;Cys;;Leu;;Phe;;Leu;;Phe; ;;TTT;;GTT;;CTT;;ATT;;TGT;;GGT;;CGT;;AGT;;TCT;;GCT;;CCT;;ACT;;TAT;;GAT;;CAT;;AAT;;TTG;;GTG;;CTG;;ATG;;TGG;;GGG;;CGG;;AGG;;TCG;;GCG;;CCG;;ACG;;TAG;;GAG;;CAG;;AAG;;TTC;;GTC;;CTC;;ATC;;TGC;;GGC;;CGC;;AGC;;TCC;;GCC;;CCC;;ACC;;TAC;;GAC;;CAC;;AAC;;TTA;;GTA;;CTA;;ATA;;TGA;;GGA;;CGA;;AGA;;TCA;;GCA;;CCA;;ACA;;TAA;;GAA;;CAA;;AAA; 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;tgu;3;0;3;4;1;4;0;2;1;2;0;4;0;1;2;5;0;3;2;2;0;1;1;1;0;0;0;4;2;2;5;34;0;1;2;2;4;1;0;−;0;0;0;−;1;0;3;2;0;2;0;−;0;−;2;3;0;0;0;−;3;3;0;1;0;1;3;3;1;1;0;−;2;4;0;−;0;2;8;9;4;2;7;4;0;3;0;0;0;1;0;1;0;0;1;7;0;−;3;9;0;−;0;−;0;3;0;−;0;0;2;0;0;0;5;3;0;2;0;0;1;2;6;3;0;3;0;1 ;tma;5;25;5;17;7;8;0;0;1;16;0;0;0;3;1;14;1;121;2;33;0;12;0;4;0;7;0;0;7;13;5;7;2;5;7;4;4;5;0;−;3;4;0;−;2;0;7;3;0;11;0;−;1;5;3;4;0;4;0;−;1;3;3;4;2;111;4;10;0;18;0;0;3;36;0;0;1;4;4;15;5;1067;5;17;2;87;0;8;0;25;0;−;3;12;3;7;0;1;0;14;0;−;0;0;0;5;0;−;1;2;4;9;0;17;2;19;2;10;0;4;0;5;3;7;0;9;0;0 ;tng;4;10;6;10;10;10;0;−;3;8;0;−;3;9;9;16;0;9;5;5;6;4;0;0;0;4;0;−;8;11;8;9;4;4;4;7;13;4;0;−;4;9;0;0;1;3;4;8;0;6;0;0;0;1;10;3;0;5;0;−;18;18;2;12;3;12;6;12;8;4;0;−;2;8;0;−;0;3;7;12;5;10;5;8;1;4;0;−;1;2;0;−;7;8;3;6;0;−;2;10;0;−;0;3;0;8;5;17;1;1;5;8;0;0;7;7;5;6;0;−;1;3;9;9;0;11;0;0 ;tru;7;12;10;12;13;6;0;−;1;5;0;−;1;6;7;10;1;11;6;12;5;4;0;−;0;5;0;−;24;11;9;2;3;6;10;8;8;5;0;1;4;4;0;−;2;3;7;2;0;6;0;0;0;3;13;2;0;3;0;−;14;6;3;7;4;8;18;5;14;6;0;0;3;4;0;−;0;5;7;4;7;4;15;2;1;2;0;−;2;6;0;−;16;12;8;10;0;−;1;13;0;−;0;0;0;7;0;−;0;4;5;5;0;0;5;9;7;9;0;−;0;6;10;12;0;9;0;0 ;tsy;4;5;6;8;0;6;0;0;0;3;0;−;0;3;2;6;0;5;2;6;0;3;0;−;0;3;0;−;7;4;5;2;13;50;5;4;3;2;0;0;0;31;0;0;1;2;5;1;0;4;0;−;1;1;3;2;1;3;0;−;3;3;3;2;2;6;6;6;3;6;0;0;0;3;0;−;1;1;2;9;2;3;9;4;1;5;0;−;1;2;0;−;2;3;1;4;0;2;0;9;0;−;0;−;0;4;0;−;0;2;3;3;0;0;6;18;2;3;0;0;29;12;1;4;0;3;0;− ;ttr;4;69;7;5;3;15;0;−;1;4;0;0;0;2;2;6;0;47;3;7;1;52;0;−;0;4;0;−;6;10;5;5;4;11;4;4;7;7;0;−;2;2;0;−;2;1;4;2;0;6;0;0;0;11;2;4;0;3;0;−;1;4;5;0;29;1871;5;43;8;386;0;9;0;35;0;1;1;19;5;13;19;813;6;36;70;1695;1;17;0;15;0;2;3;18;1;6;0;19;1;16;0;7;0;0;0;5;0;−;0;3;3;8;0;20;2;19;9;207;1;4;0;5;4;7;0;6;0;− ;vvi;5;5;7;13;5;10;0;0;2;5;0;1;1;1;4;5;3;2;7;1;4;3;0;−;3;5;0;1;6;19;9;5;3;6;5;8;3;7;0;0;8;7;0;−;1;2;9;5;3;2;0;−;0;5;1;9;4;6;0;−;4;2;5;4;5;9;11;11;12;13;0;2;16;20;0;−;3;1;9;1;7;11;11;5;3;2;0;−;1;3;0;0;6;4;8;6;0;0;0;18;0;−;0;3;5;2;0;0;2;0;4;8;0;0;5;5;9;0;0;0;2;6;11;11;4;9;0;1 ;xtr;51;20;28;18;74;22;0;0;48;42;0;−;15;13;76;74;52;52;40;58;18;8;0;−;26;24;0;4;99;38;45;17;20;7;24;17;30;9;0;0;36;16;0;0;19;16;42;17;25;7;0;2;2;5;20;12;15;9;1;0;17;14;20;17;60;23;46;12;32;18;0;−;29;17;0;−;15;20;50;16;53;26;70;14;70;34;0;−;17;18;0;−;25;27;36;18;0;1;59;47;0;0;0;−;22;18;1;1;13;9;23;16;0;0;46;45;21;11;0;1;11;34;40;17;6;15;0;1 ;zma;14;67;31;17;36;90;0;−;8;5;8;4;4;1;7;12;3;5;10;3;5;5;0;−;1;3;0;−;31;47;32;36;8;13;18;7;6;6;0;0;13;17;0;−;5;3;11;3;3;3;0;−;3;2;25;9;4;4;0;−;10;2;19;9;12;9;30;11;16;13;0;0;8;6;0;−;11;10;34;31;8;2;30;2;9;1;0;−;2;1;11;0;13;2;11;10;0;−;3;17;0;3;0;−;6;4;10;11;3;2;8;4;0;−;10;14;20;6;0;0;2;2;17;7;12;7;0;0 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; corrélation;;0.19;;0.70;;-0.01;;0.95;;0.78;;0.49;;0.19;;0.79;;0.19;;0.53;;-0.01;;0.78;;0.54;;-0.08;;0.65;;0.43;;0.03;;0.46;;0.49;;#DIV/0 !;;0.16;;-0.10;;0.30;;0.45;;0.06;;-0.15;;0.23;;0.62;;0.29;;-0.13;;0.70;;0.69;;0.53;;0.39;;0.20;;0.59;;1.00;;0.61;;0.90;;0.06;;0.10;;0.10;;0.83;;0.41;;0.82;;0.06;;0.51;;0.75;;0.60;;0.51;;-0.13;;#DIV/0 !;;0.36;;0.80;;0.15;;0.41;;0.00;;0.26;;0.15;;0.99;;0.35;;0.40;;0.36;;0.42; total;;318;481;942;767;950;3242;5;75;295;595;25;39;118;414;477;646;193;899;443;554;212;745;25;37;153;395;6;41;1387;1152;850;539;360;1357;631;319;515;608;0;14;531;444;1;10;211;154;650;252;241;1618;2;18;84;214;543;299;122;288;1;1;368;338;491;366;601;5711;1070;715;697;2075;3;58;3200;3735;8;218;308;4099;822;1240;682;4374;916;569;444;6146;2;97;148;503;27;35;494;2030;594;480;5;126;307;1078;1;81;0;36;178;403;42;100;134;269;506;337;7;167;887;1309;430;1077;10;175;97;416;645;472;114;465;1;23 Indice doublons;;0.66;;1.23;;0.29;;0.07;;0.50;;0.64;;0.29;;0.74;;0.21;;0.80;;0.28;;0.68;;0.39;;0.15;;1.20;;1.58;;0.27;;1.98;;0.85;;0.00;;1.20;;0.10;;1.37;;2.58;;0.15;;0.11;;0.39;;1.82;;0.42;;1.00;;1.09;;1.34;;0.11;;1.50;;0.34;;0.05;;0.86;;0.04;;0.08;;0.66;;0.16;;1.61;;0.07;;0.02;;0.29;;0.77;;0.24;;1.24;;0.04;;0.28;;0.01;;0.00;;0.44;;0.42;;0.50;;1.50;;0.04;;0.68;;0.40;;0.06;;0.23;;1.37;;0.25;;0.04; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;double;aaa;double;aac;double;aag;double;aat;double;aca;double;acc;double;acg;double;act;double;aga;double;agc;double;agg;double;agt;double;ata;double;atc;double;atg;double;att;double;caa;double;cac;double;cag;double;cat;double;cca;double;ccc;double;ccg;double;cct;double;cga;double;cgc;double;cgg;double;cgt;double;cta;double;ctc;double;ctg;double;ctt;double;gaa;double;gac;double;gag;double;gat;double;gca;double;gcc;double;gcg;double;gct;double;gga;double;ggc;double;ggg;double;ggt;double;gta;double;gtc;double;gtg;double;gtt;double;taa;double;tac;double;tag;double;tat;double;tca;double;tcc;double;tcg;double;tct;double;tga;double;tgc;double;tgg;double;tgt;double;tta;double;ttc;double;ttg;double;ttt ;dre;275;249;575;469;490;462;9;14;151;138;0;−;24;41;177;181;113;138;161;262;75;28;3;10;22;52;1;8;348;173;129;128;59;45;224;162;143;122;0;−;108;96;4;7;89;90;177;137;57;49;17;6;24;34;147;55;110;133;2;1;161;138;124;145;128;96;107;42;158;86;4;6;265;102;1;2;86;25;66;25;24;22;391;444;87;180;0;10;171;58;2;3;131;95;146;85;1;4;136;99;3;5;1;3;92;116;0;1;36;43;160;175;2;11;98;37;22;21;0;8;19;53;110;86;123;117;0;9
E79 Repérage des effectifs supérieurs à 49
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux: E79 Repérage des effectifs supérieurs à 49
- Méthode: Recherche dans calc, des cellules du tableau des corrélations et indices de doublons, contenant un nombre inférieur à 40 (ou bien le caractère −); les colorer. Avec la fonction concat() de calc les cellules non colorées ont leur nombre préfixé par * astérisque. Avec toujours la même fonction les codons faibles xyc/t, taa, tag et tga à effectif supérieur à 6 est préfixé par &. Ces préfixes aident à les changer sous writer en bgcolor="#xxxxxx"|.
- Légende:
- aaa1, aaa2, respectivement doublons et gènes différents des gènes tRNAs du codon aaa
- Rouge pour effectif supérieur à 49, Sauf pour les codons faibles xyc/t, taa, tag, tga.
- Cyan pour effectif supérieur à 39, Sauf pour les codons faibles xyc/t, taa, tag, tga. Après le changement d'astérisque en rouge (bgcolor="#ff3300"|) rechercher (bgcolor="#ff3300"|4) et le remplacer par (bgcolor="#66ffff"|4). Cependant il faut rechercher 3 effectifs supérieurs à 400 et leur réattribuer le rouge.
- Jaune pour les codons faibles xyc/t, taa, tag, tga dont l'effectif est supérieur à 6.
- Som− pour somme des tirets qui correspondent au nombre −1 pour les codons à effectif nul lors des décomptes directs( colonne diff et tot). Ce qui permet de calculer ici la ligne diff.
- db,diff: db pour doublon et diff pour différent, tout 2 issus des décomptes directs. diff est calculé ici comme suite: total de la colonne + 79 − "Som−".
- total total des codons correspondant au "tot" du décompte direct, db+diff.
- db+dif: somme de db et des "diff−1".
- Duplications des gènes de tRNAs. E79-codons. Effectifs supérieurs à 49
KEGG;aaa1;aaa2;aac1;aac2;aag1;aag2;aat1;aat2;aca1;aca2;acc1;acc2;acg1;acg2;act1;act2;aga1;aga2;agc1;agc2;agg1;agg2;agt1;agt2;ata1;ata2;atc1;atc2;atg1;atg2;att1;att2;caa1;caa2;cac1;cac2;cag1;cag2;cat1;cat2;cca1;cca2;ccc1;ccc2;ccg1;ccg2;cct1;cct2;cga1;cga2;cgc1;cgc2;cgg1;cgg2;cgt1;cgt2;cta1;cta2;ctc1;ctc2;ctg1;ctg2;ctt1;ctt2;gaa1;gaa2;gac1;gac2;gag1;gag2;gat1;gat2;gca1;gca2;gcc1;gcc2;gcg1;gcg2;gct1;gct2;gga1;gga2;ggc1;ggc2;ggg1;ggg2;ggt1;ggt2;gta1;gta2;gtc1;gtc2;gtg1;gtg2;gtt1;gtt2;taa1;taa2;tac1;tac2;tag1;tag2;tat1;tat2;tca1;tca2;tcc1;tcc2;tcg1;tcg2;tct1;tct2;tga1;tga2;tgc1;tgc2;tgg1;tgg2;tgt1;tgt2;tta1;tta2;ttc1;ttc2;ttg1;ttg2;ttt1;ttt2 acs;2;2;6;3;3;2;0;−;1;1;0;−;0;0;1;2;0;2;2;2;0;2;0;−;0;0;0;−;4;7;4;1;0;2;3;1;2;2;0;−;2;0;0;0;1;0;2;0;0;2;0;−;0;0;2;1;0;2;0;−;2;1;2;1;5;1;6;1;1;3;0;−;0;5;0;−;0;2;6;5;5;2;5;1;1;0;0;−;0;1;0;−;2;0;2;2;0;−;0;5;0;−;0;−;0;0;0;−;0;1;4;0;0;0;8;3;3;3;0;−;0;1;4;0;1;0;0;− aga;3;4;10;1;15;1;0;−;1;0;0;−;3;2;7;0;0;1;4;1;0;1;0;−;0;1;0;−;13;4;10;1;2;1;16;4;5;5;0;−;6;1;0;−;7;5;2;4;4;3;0;−;0;−;9;0;1;1;0;−;8;1;3;1;8;2;18;1;12;2;0;−;1;1;0;−;4;1;13;3;7;0;14;0;0;−;0;−;2;0;0;−;21;7;24;6;0;0;1;20;0;−;0;−;1;0;0;−;7;0;4;1;0;−;4;0;5;0;0;−;1;4;8;0;0;3;0;− aml;5;*49;10;17;12;*759;0;5;1;7;0;−;0;9;4;5;0;16;3;9;1;*43;0;1;0;5;0;−;11;12;7;4;1;*41;7;0;4;20;0;−;3;7;0;−;3;1;7;1;2;*81;0;0;2;4;5;2;0;4;0;−;2;4;2;4;4;6;5;5;3;33;0;0;2;6;0;−;1;3;3;13;3;3;8;1;2;4;0;−;0;6;0;−;7;1;8;1;0;0;1;9;0;&9;0;−;0;5;0;−;0;3;6;3;0;1;13;11;3;6;0;−;1;3;8;2;2;6;0;− ath;10;5;10;8;14;4;0;−;4;4;0;0;2;3;7;2;1;8;7;8;4;3;0;−;3;1;1;0;16;15;15;1;6;3;6;5;4;4;0;−;*41;5;0;−;2;2;11;4;4;1;0;−;1;2;4;6;6;4;0;0;2;0;9;2;7;8;21;7;9;3;0;−;7;2;0;−;4;2;13;2;11;1;16;8;4;0;0;−;4;2;1;0;6;1;12;2;0;0;*50;32;0;−;0;−;6;5;1;1;3;3;26;10;0;−;4;13;11;4;0;−;3;2;16;4;6;5;0;− 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diff;589;1168;942;846;950;3320;5;108;295;674;25;62;118;491;477;724;193;978;443;632;212;823;25;55;153;473;6;68;1387;1231;850;618;360;1436;631;397;515;687;0;36;531;523;1;28;211;233;650;331;241;1697;2;32;84;285;543;377;122;364;1;10;368;417;491;445;601;5790;1070;794;697;2154;3;93;3200;3813;8;242;308;4178;822;1319;682;4453;916;647;444;6221;2;115;148;582;27;72;494;2108;594;559;5;164;307;1157;1;107;0;63;178;482;42;127;134;348;506;414;7;230;887;1387;430;1155;10;206;97;495;645;550;114;543;1;50 total;;1757;;1788;;4270;;113;;969;;87;;609;;1201;;1171;;1075;;1035;;80;;626;;74;;2618;;1468;;1796;;1028;;1202;;36;;1054;;29;;444;;981;;1938;;34;;369;;920;;486;;11;;785;;936;;6391;;1864;;2851;;96;;7013;;250;;4486;;2141;;5135;;1563;;6665;;117;;730;;99;;2602;;1153;;169;;1464;;108;;63;;660;;169;;482;;920;;237;;2274;;1585;;216;;592;;1195;;657;;51 db+dif;;1679;;1709;;4192;;80;;890;;64;;532;;1123;;1092;;997;;957;;62;;548;;47;;2539;;1389;;1717;;950;;1123;;14;;975;;11;;365;;902;;1859;;20;;298;;842;;410;;2;;706;;857;;6312;;1785;;2772;;61;;6935;;226;;4407;;2062;;5056;;1485;;6590;;99;;651;;62;;2524;;1074;;131;;1385;;82;;36;;581;;142;;403;;843;;174;;2196;;1507;;185;;513;;1117;;579;;24
Méthode d'estimation des duplications pour les codons excessifs
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux: Méthode d'estimation des duplications pour les codons excessifs
- Méthode
aga.1;double;aga;;aga.2;double;aga;;aga.3;double;aga lma;0;0;;lma;0;0;;mmu;0;0 pfa;0;0;;pfa;0;0;;gmx;0;0 aga;0;1;;aga;0;1;;pfa;0;1 acs;0;2;;acs;0;2;;lma;0;2 dme;0;2;;dme;0;2;;tgu;0;2 dya;0;2;;dya;0;2;;cpo;0;2 gfr;0;2;;gfr;0;2;;opr;0;2 mgp;0;2;;mgp;0;2;;pha;0;2 dsi;0;3;;vvi;3;2;;lav;3;2 gga;0;3;;ppp;4;2;;ath;4;2 mun;0;3;;cel;5;2;;ppp;5;2 oga;0;3;;cbr;7;2;;mgp;7;2 tgu;0;3;;cjap;9;2;;cjap;9;2 cge;0;4;;cbre;10;2;;vvi;10;2 cpo;0;4;;dsi;0;3;;cge;0;3 ecb;0;4;;gga;0;3;;shr;0;3 eeu;0;4;;mun;0;3;;meu;0;3 ggo;0;4;;oga;0;3;;zma;0;3 mmr;0;4;;tgu;0;3;;gac;0;3 opr;0;4;;mlu;1;3;;ptr;1;3 shr;0;4;;cge;0;4;;cbr;0;4 str;0;4;;cpo;0;4;;mun;0;4 cjc;0;5;;ecb;0;4;;ecb;0;4 csi;0;5;;eeu;0;4;;eeu;0;4 hgl;0;5;;ggo;0;4;;str;0;4 hsa-18;0;5;;mmr;0;4;;rno;0;4 mcc;0;5;;opr;0;4;;osa;0;4 mdo;0;5;;shr;0;4;;aml;0;4 mmu;0;5;;str;0;4;;cpic;0;4 oaa;0;5;;cjc;0;5;;cbre;0;5 ocu;0;5;;csi;0;5;;oga;0;5 pan;0;5;;hgl;0;5;;hgl;0;5 pha;0;5;;hsa-18;0;5;;hsa-18;0;5 ptr;0;5;;mcc;0;5;;oaa;0;5 rno;0;5;;mdo;0;5;;ocu;0;5 san;0;5;;mmu;0;5;;san;0;5 sbq;0;5;;oaa;0;5;;mtr;0;5 tsy;0;5;;ocu;0;5;;sbi;0;5 nle;0;6;;pan;0;5;;bdi;0;5 cfa;0;8;;pha;0;5;;cfa;0;5 dno;0;8;;ptr;0;5;;tng;0;5 lcm;0;8;;rno;0;5;;pma;0;5 tng;0;9;;san;0;5;;tru;0;5 cmk;0;13;;sbq;0;5;;mpu;0;5 aml;0;16;;tsy;0;5;;fca;0;5 oas;0;21;;meu;1;5;;pan;1;5 bta;0;43−11,6;;ssc;1;5;;oas;1;5 ttr;0;47−11,6;;mtr;2;5;;tsy;2;5 fca;0;53−11,6;;ppy;2;5;;spu;2;5 bacu;0;54−11,6;;sbi;2;5;;cmk;2;5 lav;0;89−11,6;;zma;3;5;;bta;3;5 mlu;1;3;;pop;5;5;;lcm;5;5 meu;1;5;;osa;6;5;;nle;6;5 ssc;1;5;;nle;0;6;;ssc;0;6 ath;1;8;;bdi;2;6;;dya;2;6 tru;1;11;;gmx;10;7;;csi;10;7 mpu;1;14;;cfa;0;8;;cel;0;8 cpic;1;24;;dno;0;8;;mlu;0;8 oni;1;25;;lcm;0;8;;mdo;0;8 tma;1;121−15,6;;ath;1;8;;acs;1;8 mtr;2;5;;spu;9;8;;gmo;9;8 ppy;2;5;;tng;0;9;;ttr;0;9 sbi;2;5;;pma;8;9;;dno;8;9 bdi;2;6;;tru;1;11;;xtr;1;11 gmo;2;18;;cmk;0;13;;dsi;0;13 vvi;3;2;;mpu;1;14;;sbq;1;14 zma;3;5;;aml;0;16;;aga;0;16 ppp;4;2;;gmo;2;18;;cjc;2;18 cel;5;2;;oas;0;21;;ppy;0;21 pop;5;5;;cpic;1;24;;gga;1;24 osa;6;5;;gac;43−1,1;24;;mmr;43;24 cbr;7;2;;oni;1;25;;pop;1;25 pma;8;9;;tma;1;121−15,6;;gfr;0;43 cjap;9;2;;bta;0;43−11,6;;bacu;0;47 spu;9;8;;ttr;0;47−11,6;;tma;52;52 cbre;10;2;;xtr;52−1!9;52−23!5;;ggo;0;53 gmx;10;7;;fca;0;53−11,6;;dme;0;54 gac;43−1,1;24;;bacu;0;54−11,6;;mcc;0;89 xtr;52−1!9;52−23!5;;lav;0;89−11,6;;oni;1;121 max;10;25;;;;;;;;
Estimations des effectifs de base. Codons a,c.
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux: Estimations des effectifs de base. Codons a,c.
- Méthode
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- Les couleurs: pour travailler sans les couleurs supprimer dans le tableur, avec ctrl+h, les caractères spéciaux * $ § ? &_emsp;
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Estimations des effectifs de base. Codons g,t.
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux: Estimations des effectifs de base. Codons g,t.
- Légende:
:*double:*gaa:moyn:estim::*double:*gca:moyn:estim::*double:*gga:moyn:estim::*double:*gta:moyn:estim x/R2:*0.72:*41::−:x/R2:*0.72:*17::−:x/R2:*0.44:*27::−:x/R2:*1.71:*40::− max:*47:*38::−:max:*36:*46::−:max:*36:*45::−:max:*29:*38::− bacu:11:$423:5,9:7:cmk:$2889−25:$3008−15:−:25−15:bacu:25:$961:11:11:cmk:29:$115:20:20 cbre:29:$1871:10:10:dno:2:$63:7,8:7:bta:6:$384:4,3:3: :::: cel:$60:23:10,8:9: :::::cbre:$61:4:5,6:5: :::: cjap:7:$106:5,7:6: :::::cmk:22:§43:11:11: :::: gac:3:$135:10,7:8: :::::gac:§40:20:12:12: :::: spu:2:$111:7,7:7: :::::lav:3:$615:3,4:3: :::: ssc:§47:$2320:10:10: :::::oas:1:$131:2,4:3: :::: ttr:30:$204:10:10: :::::tma:5:$1067:4,3:3: :::: xtr:7:$58:5,7:6: :::::ttr:19:$813:11:11: :::: ::::: :::::xtr:$53:26:12:12: :::: :*double:*gac:moyn:estim::*double:*gcc:−:estim::*double:*ggc:moyn:estim::*double:*gtc:−:estim x/R2:*0.43:*30::−:x/R2:*−:*−::−:x/R2:*0.44:*39::−:x/R2:*−:*−::− max:*46:*48::−:max:*4:*6::−:max:*30:*36::−:max:*2:*3::− gac:$135:§48:9:9:cmk:3:?164::6:bacu:13:$50:1,2:1:cmk:0:?15::3 pma:$56:33:8:8:str:1:?29::6:bta:8:$54:3,4:3:osa:?13:3::2 spu:$62:19:10:10: :::::xtr:$70:14:18:18:zma:?11:0::2 ssc:14:$82:16,15:15: ::::: ::::: :::: :*double:*gag:moyn:estim::*double:*gcg:moyn:estim::*double:*ggg:moyn:estim::*double:*gtg:moyn:estim x/R2:*0.56:*28::−:x/R2:*0.8:*25::−:x/R2:*0.91:*34::−:x/R2:*0.89:*47::− max:*34:*47::−:max:*18:*20::−:max:*29:*34::−:max:*37:*35::− bacu:21:$446:17:17:cmk:$100−13:$3757−9:−:13−9:bacu:$103−8:$2044−4::8−4:cmk:37:$1502:12:12 bta:3:$160:22,8:15:gac:§41:14:1:1:bta:29:$1265:4,3:3:dno:5:$75:3,4:3 cmk:22:$405:17:17: :::::cmk:7:$73:1,2:1:pma:§46:24:9,8:8 csi:4:$72:4,8:6: :::::dno:4:$321:7,4:5: :::: oas:3:$56:22,8:15: :::::lav:2:$69:6,4:5: :::: ttr:8:$386:4,6:5: :::::oas:2:$338:6,4:5: :::: ::::: :::::tma:2:$87:6,4:5: :::: ::::: :::::ttr:$70−8:$1695−4:−:8−4: :::: ::::: :::::xtr:$70:34:4:4: :::: :*double:*gat:−:estim::*double:*gct:moyn:estim::*double:*ggt:−:estim::*double:*gtt:moyn:estim x/R2:*−:*−::−:x/R2:*0.72:*35::−:x/R2:*−:*−::−:x/R2:*0.48:*36::− max:*1:*5::−:max:*34:*44::−:max:*1:*8::−:max:*36:*33::− bacu:1:?18::5:cmk:19:$55:4,4:4:bacu:1:?10::8:pma:$96−27 :$69−7 :−:27−7 ssc:1:?8::5:oaa:32:$50:21:21:bta:0:?19::8: :::: ttr:0:?9::5:pma:$62:§43:18,16:17:dno:0:?23::8: :::: :::::str:4:$251:15,13:14:ttr:1:?17::8: :::: :::::xtr:$50:16:3,6:4: ::::: :::: ::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::: :*double:*taa:−:estim::*double:*tca:moyn:estim::*double:*tga:−:estim::*double:*tta:moyn:estim x/R2:*−:*−::−:x/R2:*0.92:*38::−:x/R2:*−:*−::−:x/R2:*0.91:*22::− max:*2:*3::−:max:*22:*18::−:max:*3:*4::−:max:*29:*34::− bacu:0:?23::3:cmk:3:$50:6,5:5:bacu:0:?16::4:rien:::: fca:1:?35::3:gac:§43:18:7:7:bta:0:?28::4: :::: mtr:2:?29::3: :::::fca:0:?17::4: :::: ttr:0:?19::3: :::::lav:0:?23::4: :::: ::::: :::::tma:0:?17::4: :::: ::::: :::::ttr:0:?20::4: :::: :*double:*tac:moyn:estim::*double:*tcc:−:estim::*double:*tgc:moyn:estim::*double:*ttc:moyn:estim x/R2:*1.25:*14::−:x/R2:*−:*−::−:x/R2:*0.86:*59::−:x/R2:*0.57:*55::− max:*22:*47::−:max:*5:*3::−:max:*38:*34::−:max:*40:*24::− ath:$50:32:3,3:3:bta:4:?27::3:bta:25:$312:14:14:rien:::: pma:§40−3:$49−35:−:3−35:gmo:?14:?26::5−3:gac:$72:34:21:21: :::: xtr:$59:§47:3,3:3:tng:5:?17::3:oas:5:$55:14,10:12: :::: :::::zma:?10:?11::5−3:xtr:§46−32:§45−22:−:32−22: :::: :*double:*tag:−:estim::*double:*tcg:moyn:estim::*double:*tgg:moyn:estim::*double:*ttg:moyn:estim x/R2:*−:*−::−:x/R2:*0.53:*32::−:x/R2:*0.56:*20::−:x/R2:*1.06:*27::− max:*1:*4::−:max:*23:*16::−:max:*21:*44::−:max:*18:*29::− aml:0:?9::4:cmk:0:§47:3,3:3:bacu:13:$242:3,3:3:rien:::: bacu:0:?8::4: :::::bta:5:$172:5,5:5: :::: bta:0:?12::4: :::::gac:§47:26:6:6: :::: fca:0:?11::4: :::::ttr:9:$207:5,6:5: :::: :*double:*tat:−:estim::*double:*tct:moyn:estim::*double:*tgt::estim::*double:*ttt:−:estim x/R2:*−:*−::−:x/R2:*0.51:*53::−:x/R2:*−:*−::−:x/R2:*−:*−::− max:*0:*4::−:max:*38:*21::−:max:*1:*4:−:−:max:*1:*5::− bta:0:?10::4:rien:::::bta:?9:?133::1−4:rien:::: ::::: :::::oas:0:?15::4: ::::
E79 codons. Les duplications excessives remplacées par les estimations du processus de base
[modifier | modifier le wikicode]- Lien au tableaux: E79 codons. Les duplications excessives remplacées par les estimations du processus de base.
- Tableau principal
;aaa1;aaa2;aac1;aac2;aag1;aag2;aat1;aat2;;aca1;aca2;acc1;acc2;acg1;acg2;act1;act2;;aga1;aga2;agc1;agc2;agg1;agg2;agt1;agt2;;ata1;ata2;atc1;atc2;atg1;atg2;att1;att2;;caa1;caa2;cac1;cac2;cag1;cag2;cat1;cat2;;cca1;cca2;ccc1;ccc2;ccg1;ccg2;cct1;cct2;;cga1;cga2;cgc1;cgc2;cgg1;cgg2;cgt1;cgt2;;cta1;cta2;ctc1;ctc2;ctg1;ctg2;ctt1;ctt2;;gaa1;gaa2;gac1;gac2;gag1;gag2;gat1;gat2;;gca1;gca2;gcc1;gcc2;gcg1;gcg2;gct1;gct2;;gga1;gga2;ggc1;ggc2;ggg1;ggg2;ggt1;ggt2;;gta1;gta2;gtc1;gtc2;gtg1;gtg2;gtt1;gtt2;;taa1;taa2;tac1;tac2;tag1;tag2;tat1;tat2;;tca1;tca2;tcc1;tcc2;tcg1;tcg2;tct1;tct2;;tga1;tga2;tgc1;tgc2;tgg1;tgg2;tgt1;tgt2;;tta1;tta2;ttc1;ttc2;ttg1;ttg2;ttt1;ttt2 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E79 codons. Les carrés
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- Méthode: macro de calc carre
- Légende:
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Zebra codons. Les carrés
[modifier | modifier le wikicode]- Lien au tableaux: Zebra codons. Les carrés
- Légende:
E79fz-tg;;db,dif;;différents;;;;;E79bz-tg;;db,dif;;doublons;;;;;E79zi;;indice;;doublons/différents;;; ttt;9;tct;175;tat;3;tgt;8;;ttt;0;tct;160;tat;1;tgt;0;;ttt;0;tct;0.91;tat;0.33;tgt;0 atc;8;act;181;aat;14;agt;10;;atc;1;act;177;aat;9;agt;3;;atc;0.13;act;0.98;aat;0.64;agt;0.30 ctt;145;cct;137;cat;−;cgt;55;;ctt;124;cct;177;cat;−;cgt;147;;ctt;0.86;cct;1.29;cat;−;cgt;2.67 gtt;85;gct;25;gat;6;ggc;444;;gtt;146;gct;66;gat;4;ggc;391;;gtt;1.72;gct;2.64;gat;0.67;ggc;0.88 ttc;86;tcc;1;tac;99;tgc;37;;ttc;110;tcc;0;tac;136;tgc;98;;ttc;1.28;tcc;0;tac;1.37;tgc;2.65 att;128;acc;−;aac;469;agc;262;;att;129;acc;−;aac;575;agc;161;;att;1.01;acc;−;aac;1.23;agc;0.61 ctc;1;ccc;7;cac;162;cgc;6;;ctc;2;ccc;4;cac;224;cgc;17;;ctc;2.00;ccc;0.57;cac;1.38;cgc;2.83 gtc;3;gcc;2;gac;42;ggt;10;;gtc;2;gcc;1;gac;107;ggt;0;;gtc;0.67;gcc;0.50;gac;2.55;ggt;0 tta;53;tca;116;taa;4;tga;11;;tta;19;tca;92;taa;1;tga;2;;tta;0.36;tca;0.79;taa;0.25;tga;0.18 ata;52;aca;138;aaa;249;aga;138;;ata;22;aca;151;aaa;275;aga;113;;ata;0.42;aca;1.09;aaa;1.10;aga;0.82 cta;133;cca;96;caa;45;cga;49;;cta;110;cca;108;caa;59;cga;57;;cta;0.83;cca;1.13;caa;1.31;cga;1.16 gta;58;gca;102;gaa;96;gga;22;;gta;171;gca;265;gaa;128;gga;24;;gta;2.95;gca;2.60;gaa;1.33;gga;1.09 ttg;117;tcg;43;tag;5;tgg;21;;ttg;123;tcg;36;tag;3;tgg;22;;ttg;1.05;tcg;0.84;tag;0.60;tgg;1.05 atg;173;acg;41;aag;462;agg;28;;atg;348;acg;24;aag;490;agg;75;;atg;2.01;acg;0.59;aag;1.06;agg;2.68 ctg;138;ccg;90;cag;122;cgg;34;;ctg;161;ccg;89;cag;143;cgg;24;;ctg;1.17;ccg;0.99;cag;1.17;cgg;0.71 gtg;95;gcg;25;gag;86;ggg;180;;gtg;131;gcg;86;gag;158;ggg;87;;gtg;1.38;gcg;3.44;gag;1.84;ggg;0.48
C42-Codons. Correlations et indices des doublons
[modifier | modifier le wikicode]- Lien tableaux: C42-Codons. Corrélations et indices des doublons.
- 42 champignons: Codons, corrélations et indices des doublons
C42;double;aaa;double;aac;double;aag;double;aat;C42;double;aca;double;acc;double;acg;double;act;C42;double;aga;double;agc;double;agg;double;agt;C42;double;ata;double;atc;double;atg;double;att;C42;double;caa;double;cac;double;cag;double;cat;C42;double;cca;double;ccc;double;ccg;double;cct;C42;double;cga;double;cgc;double;cgg;double;cgt;C42;double;cta;double;ctc;double;ctg;double;ctt;C42;double;gaa;double;gac;double;gag;double;gat;C42;double;gca;double;gcc;double;gcg;double;gct;C42;double;gga;double;ggc;double;ggg;double;ggt;C42;double;gta;double;gtc;double;gtg;double;gtt;C42;double;taa;double;tac;double;tag;double;tat;C42;double;tca;double;tcc;double;tcg;double;tct;C42;double;tga;double;tgc;double;tgg;double;tgt;C42;double;tta;double;ttc;double;ttg;double;ttt '''ani;0;1;0;5;7;0;0;−;'''ani;0;1;0;−;0;1;4;1;'''ani;1;0;0;3;0;1;0;−;'''ani;0;0;0;−;2;4;2;4;'''ani;0;1;3;1;1;3;0;−;'''ani;0;1;0;−;0;1;1;4;'''ani;0;1;0;−;0;1;6;2;'''ani;0;1;0;−;0;2;0;5;'''ani;0;2;2;5;5;2;0;−;'''ani;0;1;0;−;2;0;7;0;'''ani;0;2;10;0;0;0;0;−;'''ani;0;0;0;−;0;1;6;1;'''ani;0;−;1;4;0;−;0;−;'''ani;0;0;0;−;0;1;4;0;'''ani;0;−;1;1;2;0;0;−;'''ani;0;0;2;2;0;1;0;− '''aor;0;2;4;3;8;2;0;−;'''aor;0;1;0;−;0;1;8;1;'''aor;0;1;1;4;0;1;0;−;'''aor;0;1;0;−;0;7;5;4;'''aor;1;2;1;6;3;3;0;−;'''aor;0;2;0;−;0;−;3;5;'''aor;1;0;0;−;0;2;10;1;'''aor;0;0;0;−;0;3;0;−;'''aor;1;4;5;7;8;2;0;−;'''aor;1;1;0;−;1;2;8;1;'''aor;2;1;14;0;0;0;0;−;'''aor;0;1;0;0;0;2;8;1;'''aor;0;−;2;10;0;−;0;0;'''aor;0;0;0;−;0;2;4;2;'''aor;0;−;0;3;3;0;0;0;'''aor;0;2;1;5;0;−;0;− 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C42-Codons. Les carrés
[modifier | modifier le wikicode]- Lien tableaux: C42-Codons. Les carrés.
- Légende:
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B42-Codons. Correlations et indices des doublons
[modifier | modifier le wikicode]- Lien tableaux: B42-Codons. Corrélations et indices des doublons.
- 42 bactéries: Codons, corrélations et indices des doublons
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B42-Codons. Les carrés
[modifier | modifier le wikicode]- Lien tableaux: B42-Codons. Les carrés.
- Légende:
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Total des génomes par codon, corrélations et indices des doublons
[modifier | modifier le wikicode]- Lien tableaux: Total des génomes par codon, corrélations et indices des doublons.
- Total des génomes par codon, corrélations et indices des doublons
;;;;;;;;;;;;mtri dif;;;;mtri diff;;;;total;; A10tg;;néant;;B42tg;;2 diags;;C42tg;;2 diags;;E79e-tg;;2 diags;;E79t-tg;;néant;;E79-tg;;néant A10-tg;Ab-tg;Af-tg;;B42-tg;Bb-tg;Bf-tg;;C42o-tg;Cb-tg;Cf-tg;;Ee-tg;Ebe-tg;Efe-tg;;Et-tg;Ebt-tg;Eft-tg;;E79-tg;Eb-tg;Ef-tg ttt;0;0;;ttt;0;0;;tgt;0;0;;cat;0;14;;cat;0;36;;cat;0;14 gtt;0;0;;gtt;0;0;;ggt;0;0;;tat;0;30;;tat;0;57;;tat;0;36 ctt;0;0;;ctt;0;0;;agt;0;0;;ccc;1;10;;ctc;1;10;;ctc;1;1 att;0;0;;att;0;0;;tat;0;0;;ctc;1;1;;ccc;1;28;;ccc;1;10 tgt;0;0;;tgt;0;0;;gat;0;0;;tag;1;54;;ttt;1;50;;ttt;1;23 ggt;0;0;;agt;0;0;;cat;0;0;;ttt;1;23;;tag;1;80;;tag;1;81 cgt;0;0;;tct;0;0;;aat;0;0;;cgc;2;8;;cgc;2;22;;cgc;2;18 agt;0;0;;gct;0;0;;tag;0;0;;ggt;2;60;;tgt;2;66;;ggt;2;97 tct;0;0;;cct;0;0;;gtc;0;0;;tgt;2;35;;ggt;2;78;;gat;3;58 gct;0;0;;act;0;0;;atc;0;0;;gat;3;38;;gat;3;73;;aat;5;75 cct;0;0;;tat;0;0;;cgc;0;0;;aat;5;37;;aat;5;70;;taa;5;126 act;0;0;;aat;0;0;;tcc;0;0;;taa;5;32;;taa;5;70;;atc;6;41 tat;0;0;;cgc;0;0;;gcc;0;0;;atc;6;38;;atc;6;65;;tga;7;167 gat;0;0;;ata;0;0;;ccc;0;0;;gtc;7;23;;gtc;7;60;;gcc;8;218 cat;0;0;;tga;0;0;;acc;0;0;;tga;7;70;;tga;7;133;;tgt;10;175 aat;0;0;;taa;0;0;;taa;0;0;;gcc;8;37;;gcc;8;61;;agt;25;37 gtg;0;0;;ggt;0;1;;ttt;0;1;;acc;19;26;;acc;19;49;;acc;25;39 ggg;0;0;;gat;0;1;;tga;0;1;;agt;25;37;;agt;25;55;;gtc;27;35 cgg;0;0;;cat;0;1;;ctc;5;1;;tcc;28;31;;tcc;28;58;;tcc;42;100 agg;0;0;;tag;0;1;;cgg;5;12;;cgg;84;214;;cgg;84;285;;cgg;84;214 tcg;0;0;;cgg;0;1;;ccg;0;15;;ata;91;395;;ata;91;473;;tta;97;416 gcg;0;0;;ggg;0;2;;ata;2;16;;tta;97;416;;tta;97;495;;ttg;114;465 ccg;0;0;;acg;0;2;;gta;6;18;;aga;108;495;;aga;108;574;;acg;118;414 acg;0;0;;agg;0;5;;acg;5;20;;ttg;114;465;;ttg;114;543;;cta;122;288 tag;0;0;;tcg;0;6;;tta;71;22;;acg;118;285;;acg;118;362;;tcg;134;269 gag;0;0;;gcg;1;1;;agg;5;23;;cta;122;288;;cta;122;364;;gta;148;503 gcc;0;0;;ccg;1;1;;gcg;11;23;;tcg;134;225;;tcg;134;304;;ata;153;395 ccc;0;0;;cga;2;1;;ggg;5;25;;tca;142;358;;tca;142;437;;tca;178;403 cac;0;0;;gtg;3;3;;tca;24;26;;gta;148;408;;gta;148;487;;aga;193;899 ata;0;0;;ttg;4;6;;gtg;21;31;;tac;167;1064;;tac;167;1,143;;ccg;211;154 tga;0;0;;gag;5;1;;cta;7;32;;cga;177;353;;cga;177;432;;agg;212;745 taa;0;0;;ccc;6;2;;tcg;5;33;;gcg;181;351;;gcg;181;430;;cga;241;1618 tgg;0;1;;ctc;6;4;;aga;134;33;;ccg;211;115;;ccg;211;194;;aca;295;595 cag;0;1;;aag;7;2;;aca;22;36;;agg;212;504;;agg;212;582;;tac;307;1078 agc;0;1;;aga;7;6;;cga;30;40;;ggg;221;286;;ggg;221;361;;gcg;308;4099 tcc;0;1;;acc;7;18;;gca;58;41;;aca;224;413;;aca;224;492;;caa;360;1357 acc;0;1;;tgg;8;6;;tgc;61;42;;caa;317;546;;caa;317;625;;ctg;368;338 cta;0;1;;cag;8;6;;ctg;13;45;;gca;336;686;;gca;336;764;;tgg;430;1077 cga;0;1;;gtc;11;27;;caa;97;57;;ctg;346;286;;ctg;346;365;;agc;443;554 aga;0;1;;tcc;12;6;;tct;211;57;;tgg;389;469;;tgg;389;547;;ggg;444;6146 tca;0;1;;cac;17;9;;gga;46;58;;agc;390;442;;agc;390;520;;act;477;646 cca;0;1;;tgc;17;19;;gaa;150;60;;act;398;545;;act;398;623;;ctt;491;366 aaa;0;1;;agc;18;5;;aaa;52;62;;cag;408;608;;cag;408;687;;gtg;494;2030 ttg;0;2;;tta;25;9;;cag;44;63;;gtg;456;468;;gtg;456;546;;tct;506;337 ctg;0;2;;gcc;26;4;;cct;51;66;;ctt;461;317;;ctt;461;396;;cag;515;608 gga;0;2;;ctg;27;21;;cac;112;66;;tct;506;337;;tct;506;414;;cca;531;444 caa;0;2;;gga;28;14;;tgg;64;69;;cgt;507;299;;cgt;507;377;;cgt;543;299 tta;0;3;;tca;35;15;;act;221;69;;gtt;525;418;;gtt;525;497;;aaa;589;1090 aag;1;0;;cta;36;14;;cgt;126;70;;cca;531;385;;cca;531;464;;gtt;594;480 cgc;1;0;;cca;39;6;;ctt;66;73;;gaa;550;547;;gaa;550;626;;gaa;601;5711 gta;1;0;;ttc;44;15;;agc;31;83;;aaa;554;781;;aaa;554;859;;cac;631;319 tac;1;1;;caa;48;16;;gtt;276;83;;gga;557;405;;gga;557;484;;ttc;645;472 gac;2;2;;aca;50;12;;aac;170;85;;cct;577;252;;cct;577;331;;cct;650;252 aca;2;2;;tac;68;12;;ggc;360;85;;cac;631;319;;cac;631;397;;gga;682;4374 ctc;2;4;;cgt;87;17;;ttg;64;88;;ttc;645;472;;ttc;645;550;;gag;697;2075 atc;3;2;;atc;93;9;;gct;248;99;;att;671;488;;att;671;567;;gct;822;1240 gtc;4;1;;aac;100;21;;gac;267;100;;gag;697;625;;gag;697;704;;att;850;539 aac;4;1;;gca;104;13;;att;231;105;;gct;731;923;;gct;731;1,002;;tgc;887;1309 gaa;4;1;;gta;108;16;;aag;279;106;;aac;801;712;;aac;801;791;;ggc;916;569 ttc;4;2;;gac;113;18;;cca;56;108;;tgc;822;945;;tgc;822;1,023;;aac;942;767 tgc;4;16;;gaa;115;14;;tac;91;119;;aag;824;725;;aag;824;803;;aag;950;3242 atg;*5;*22;;aaa;122;12;;gag;133;121;;gac;844;648;;gac;844;727;;gac;1070;715 ggc;6;3;;ggc;127;14;;ttc;111;143;;ggc;864;469;;ggc;864;547;;atg;1387;1152 gca;7;1;;atg;138;123;;atg;132;150;;atg;957;1152;;atg;957;1,231;;gca;3200;3735 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; correl.;0.42;0.27;;;0.66;0.55;;;0.71;0.60;;;0.75;0.52;;;0.76;0.52;;;0.45;0.32 total;46;58;;;1535;415;;;4179;2781;;;18969;22508;;;18969;26546;;;24801;56149 Indice db;0.79;;;;3.70;;;;1.50;;;;0.84;;;;0.71;;;;0.44;
Comparaisons croisées par les corrélations entre totaux
[modifier | modifier le wikicode]Les corrélations diff, intra groupe
[modifier | modifier le wikicode]- Lien tableaux:Les corrélations diff, intra groupe
- Légende:
;db;diff;;;db;diff;;;db;diff ccF;0.518;;;ccF;0.614;;;ccF;0.572; cTc;0.759;;;cTc;0.702;;;cTc;0.704; E79t;Ebt-tg;Eft-tg;;C42t;Cbt-tg;Cft-tg;;B42t;Bbt-tg;Bft-tg cat;0;36;;acc;0;0;;aat;0;0 tat;0;57;;agt;0;0;;agt;0;0 ctc;1;10;;cat;0;0;;ata;0;0 ccc;1;28;;cgc;0;0;;att;0;0 ttt;1;50;;gcc;0;0;;gct;0;0 tag;1;80;;ccc;0;1;;gtt;0;0 cgc;2;22;;gtc;0;1;;taa;0;0 tgt;2;66;;taa;0;1;;cct;0;1 ggt;2;78;;tag;0;1;;ctt;0;1 gat;3;73;;tcc;0;1;;tct;0;1 aat;5;70;;tgt;0;1;;tgt;0;1 taa;5;70;;aat;0;2;;act;0;2 atc;6;65;;gat;0;2;;cat;0;2 gtc;7;60;;ggt;0;2;;cgc;0;2 tga;7;133;;tat;0;2;;gat;0;2 gcc;8;61;;ttt;0;2;;ggt;0;2 acc;19;49;;atc;0;6;;tag;0;2 agt;25;55;;tga;0;12;;tat;0;2 tcc;28;58;;ctc;5;13;;ttt;0;2 cgg;84;285;;ccg;0;36;;tga;0;18 ata;91;473;;gcg;11;49;;acg;0;25 tta;97;495;;cgg;5;50;;ggg;0;26 aga;108;574;;ata;2;57;;tcg;0;27 ttg;114;543;;gta;6;58;;cgg;0;40 acg;118;362;;acg;5;61;;agg;0;41 cta;122;364;;tta;71;61;;gcg;1;12 tcg;134;304;;cga;30;62;;ccg;1;19 tca;142;437;;agg;5;64;;cga;2;7 gta;148;487;;ggg;5;64;;gtg;3;10 tac;167;1,143;;cta;7;68;;ttg;4;48 cga;177;432;;tca;24;68;;gag;5;9 gcg;181;430;;gtg;21;73;;ccc;6;32 ccg;211;194;;aga;134;73;;ctc;6;44 agg;212;582;;tcg;5;75;;aag;7;17 ggg;221;361;;ctg;13;76;;aga;7;47 aca;224;492;;aca;22;78;;acc;7;58 caa;317;625;;tgc;61;82;;cag;8;26 gca;336;764;;gca;58;83;;tgg;8;48 ctg;346;365;;caa;97;99;;gtc;11;63 tgg;389;547;;tct;211;99;;tcc;12;48 agc;390;520;;gga;46;100;;cac;17;51 act;398;623;;gaa;150;102;;tgc;17;61 cag;408;687;;aaa;52;103;;agc;18;47 gtg;456;546;;cct;51;104;;tta;25;51 ctt;461;396;;ctt;66;104;;gcc;26;40 tct;506;414;;cag;44;105;;ctg;27;48 cgt;507;377;;cac;112;108;;gga;28;56 gtt;525;497;;tgg;64;109;;tca;35;57 cca;531;464;;act;221;111;;cta;36;56 gaa;550;626;;cgt;126;112;;cca;39;48 aaa;554;859;;agc;31;124;;ttc;44;57 gga;557;484;;gtt;276;125;;caa;48;58 cct;577;331;;ttg;64;126;;aca;50;54 cac;631;397;;aac;170;127;;tac;68;54 ttc;645;550;;ggc;360;127;;cgt;87;58 att;671;567;;gct;248;141;;atc;93;51 gag;697;704;;gac;267;142;;aac;100;63 gct;731;1,002;;att;231;147;;gca;104;55 aac;801;791;;aag;279;147;;gta;108;58 tgc;822;1,023;;cca;56;149;;gac;113;60 aag;824;803;;tac;91;161;;gaa;115;55 gac;844;727;;gag;133;163;;aaa;122;53 ggc;864;547;;ttc;111;185;;ggc;127;56 atg;957;1,231;;atg;132;192;;atg;138;165
Les corrélations diff, entre groupes
[modifier | modifier le wikicode]- Lien tableaux:Les corrélations diff, entre groupes
- Légende:
;db;diff;db;diff;;;db;diff;db;diff;;;db;diff;db;diff;;;db+diff;db+diff;db+diff ccF;0.684;0.719;0.374;0.592;;ccF;0.353;0.378;0.236;0.432;;ccF;0.436;0.456;0.357;0.477;;ccF;0.404;0.548;0.718 cTc;0.768;0.851;0.580;0.851;;cTc;0.492;0.553;0.494;0.760;;cTc;0.585;0.597;0.665;0.766;;cTc;0.641;0.741;0.852 Eet-Ct;Ebet-tg;Efet-tg;Cbt-tg;Cft-tg;;Bt-Ct;Bbt-tg;Bft-tg;Cbt-tg;Cft-tg;;Eet-Bt;Bbt-tg;Bft-tg;Ebet-tg;Efet-tg;;total;B42t;C42t;E79t cat;0;36;0;0;;agt;0;0;0;0;;aat;0;0;5;70;;§ctc;1;18;11 tat;0;57;0;2;;§gcc;0;0;0;0;;taa;0;0;5;70;;cgc;2;0;24 ctc;1;10;5;13;;§gtc;0;0;0;1;;§atc;0;0;6;65;;§ccc;1;1;29 ccc;1;28;0;1;;taa;0;0;0;1;;§gtc;0;0;7;60;;cat;2;0;36 ttt;1;50;0;2;;aat;0;0;0;2;;§gcc;0;0;8;61;;ttt;2;2;51 tag;1;80;0;1;;§atc;0;0;0;6;;agt;0;0;25;55;;tat;2;2;57 cgc;2;22;0;0;;§ccc;0;1;0;1;;§ctc;0;1;1;10;;§gtc;0;1;67 tgt;2;66;0;1;;§tcc;0;1;0;1;;§ccc;0;1;1;28;;§acc;2;0;68 ggt;2;78;0;2;;tgt;0;1;0;1;;tgt;0;1;2;66;;tgt;1;1;68 gat;3;73;0;2;;§ctc;0;1;5;13;;§tcc;0;1;28;58;;gcc;0;0;69 taa;5;70;0;1;;§acc;0;2;0;0;;cat;0;2;0;36;;atc;0;6;71 aat;5;70;0;2;;cat;0;2;0;0;;tat;0;2;0;57;;taa;0;1;75 atc;6;65;0;6;;cgc;0;2;0;0;;ttt;0;2;1;50;;aat;0;2;75 gtc;7;60;0;1;;tag;0;2;0;1;;tag;0;2;1;80;;gat;2;2;76 tga;7;133;0;12;;gat;0;2;0;2;;cgc;0;2;2;22;;agt;0;0;80 gcc;8;61;0;0;;ggt;0;2;0;2;;ggt;0;2;2;78;;ggt;2;2;80 acc;19;49;0;0;;tat;0;2;0;2;;gat;0;2;3;73;;tag;2;1;81 agt;25;55;0;0;;ttt;0;2;0;2;;§acc;0;2;19;49;;§tcc;1;1;86 tcc;28;58;0;1;;tga;0;18;0;12;;tga;0;18;7;133;;tga;18;12;140 cgg;84;285;5;50;;acg;0;25;5;61;;acg;0;25;118;362;;cgg;40;55;369 ata;91;473;2;57;;ggg;0;26;5;64;;ggg;0;26;221;361;;ccg;20;36;405 tta;97;495;71;61;;tcg;0;27;5;75;;tcg;0;27;134;304;;tcg;27;80;438 aga;108;574;134;73;;cgg;0;40;5;50;;cgg;0;40;84;285;;acg;25;66;480 ttg;114;543;64;126;;agg;0;41;5;64;;agg;0;41;212;582;;cta;92;75;486 acg;118;362;5;61;;gcg;1;12;11;49;;gcg;1;12;181;430;;ata;*0;59;564 cta;122;364;7;68;;ccg;1;19;0;36;;ccg;1;19;211;194;;tca;92;92;579 tcg;134;304;5;75;;cga;2;7;30;62;;cga;2;7;177;432;;ggg;26;69;582 tca;142;437;24;68;;gtg;3;10;21;73;;gtg;3;10;456;546;;tta;76;132;592 gta;148;487;6;58;;ttg;4;48;64;126;;ttg;4;48;114;543;;cga;9;92;609 tac;167;1,143;91;161;;gag;5;9;133;163;;gag;5;9;697;704;;gcg;13;60;611 cga;177;432;30;62;;§cct;6;32;51;104;;§cct;6;32;577;331;;gta;166;64;635 gcg;181;430;11;49;;§ctt;6;44;66;104;;§ctt;6;44;461;396;;ttg;52;190;657 ccg;211;194;0;36;;aag;7;17;279;147;;aag;7;17;824;803;;aga;54;207;682 agg;212;582;5;64;;aga;7;47;134;73;;aga;7;47;108;574;;ctg;75;89;711 ggg;221;361;5;64;;§act;7;58;221;111;;§act;7;58;398;623;;aca;104;100;716 aca;224;492;22;78;;cag;8;26;44;105;;cag;8;26;408;687;;agg;41;69;794 caa;317;625;97;99;;tgg;8;48;64;109;;tgg;8;48;389;547;;§ctt;50;170;857 gca;336;764;58;83;;§gtt;11;63;276;125;;§gtt;11;63;525;497;;cgt;145;238;884 ctg;346;365;13;76;;§tct;12;48;211;99;;§tct;12;48;506;414;;§cct;38;155;908 tgg;389;547;64;109;;cac;17;51;112;108;;cac;17;51;631;397;;agc;65;155;910 agc;390;520;31;124;;tgc;17;61;61;82;;tgc;17;61;822;1,023;;§tct;60;310;920 act;398;623;221;111;;agc;18;47;31;124;;agc;18;47;390;520;;tgg;56;173;936 cag;408;687;44;105;;tta;25;51;71;61;;tta;25;51;97;495;;caa;106;196;942 gtg;456;546;21;73;;§gct;26;40;248;141;;§gct;26;40;731;1,002;;cca;87;205;995 ctt;461;396;66;104;;ctg;27;48;13;76;;ctg;27;48;346;365;;gtg;13;94;1002 tct;506;414;211;99;;gga;28;56;46;100;;gga;28;56;557;484;;§act;65;332;1021 cgt;507;377;126;112;;tca;35;57;24;68;;tca;35;57;142;437;;§gtt;74;401;1022 gtt;525;497;276;125;;cta;36;56;7;68;;cta;36;56;122;364;;cac;68;220;1028 cca;531;464;56;149;;cca;39;48;56;149;;cca;39;48;531;464;;gga;84;146;1041 gaa;550;626;150;102;;ttc;44;57;111;185;;ttc;44;57;645;550;;cag;34;149;1095 aaa;554;859;52;103;;caa;48;58;97;99;;caa;48;58;317;625;;gca;159;141;1100 gga;557;484;46;100;;aca;50;54;22;78;;aca;50;54;224;492;;gaa;170;252;1176 cct;577;331;51;104;;tac;68;54;91;161;;tac;68;54;167;1,143;;ttc;101;296;1195 cac;631;397;112;108;;cgt;87;58;126;112;;cgt;87;58;507;377;;§att;144;378;1238 ttc;645;550;111;185;;§att;93;51;231;147;;§att;93;51;671;567;;tac;122;252;1310 att;671;567;231;147;;aac;100;63;170;127;;aac;100;63;801;791;;gag;14;296;1401 gag;697;704;133;163;;gca;104;55;58;83;;gca;104;55;336;764;;ggc;183;487;1411 gct;731;1,002;248;141;;gta;108;58;6;58;;gta;108;58;148;487;;aaa;175;155;1413 aac;801;791;170;127;;gac;113;60;267;142;;gac;113;60;844;727;;gac;173;409;1571 tgc;822;1,023;61;82;;gaa;115;55;150;102;;gaa;115;55;550;626;;aac;163;297;1592 aag;824;803;279;147;;aaa;122;53;52;103;;aaa;122;53;554;859;;aag;24;426;1627 gac;844;727;267;142;;ggc;127;56;360;127;;ggc;127;56;864;547;;§gct;66;389;1733 ggc;864;547;360;127;;atg;138;165;132;192;;atg;138;165;957;1,231;;tgc;78;143;1845 atg;957;1,231;132;192;;ata;*0;*0;*2;*57;;ata;*0;*0;91;473;;atg;303;324;2188
Tableau synthétique des corrélations diff et dif
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colonnes;;a;b;c;d;;a;b;c;d;;a;b;c;d;;a;b;c corrélation;;a-c;a-d;b-c;b-d;;a-c;a-d;b-c;b-d;;a-c;a-d;b-c;b-d;;a-b;a-c;b-c ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; dif;;E/C;;db;dif;;B/C;;db;dif;;E/B;;db;dif;;total;;db+dif groupes;;Ebe-tg;Efe-tg;Cb-tg;Cf-tg;;Bb-tg;Bf-tg;Cb-tg;Cf-tg;;Bb-tg;Bf-tg;Ebe-tg;Efe-tg;;Be;Ce;Ee ccF;;0.684;0.717;0.374;0.571;;0.353;0.358;0.175;0.410;;0.436;0.455;0.393;0.504;;0.391;0.572;0.713 cTc;;0.768;0.845;0.577;0.789;;0.492;0.537;0.310;0.513;;0.585;0.599;0.502;0.568;;0.549;0.673;0.821 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; diff;;E/C;;db;diff;;B/C;;db;diff;;E/B;;db;diff;;total;;db+diff groupes;;Ebet-tg;Efet-tg;Cbt-tg;Cft-tg;;Bbt-tg;Bft-tg;Cbt-tg;Cft-tg;;Bbt-tg;Bft-tg;Ebet-tg;Efet-tg;;B42t;C42t;E79t ccF;;0.684;0.719;0.374;0.592;;0.353;0.378;0.236;0.432;;0.436;0.456;0.357;0.477;;0.404;0.548;0.718 cTc;;0.768;0.851;0.580;0.851;;0.492;0.553;0.494;0.760;;0.585;0.597;0.665;0.766;;0.641;0.741;0.852 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 100x(diff − dif);;E/C;;;;;B/C;;;;;E/B;;;;;total;; ccF;;0.0;0.2;0.1;2.1;;0.0;2.0;6.1;2.2;;0.0;0.1;-3.6;-2.7;;1.3;-2.4;0.5 cTc;;0.0;0.6;0.3;6.2;;0.0;1.6;18.4;24.7;;0.0;-0.2;16.4;19.7;;9.3;6.8;3.1
Comparaison par les indices de multiplicité
[modifier | modifier le wikicode]Bactéries de la base gtRNAdb et E79t diff
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Légende:
E79tm. Multiplicité de E79t-tg;;;;;;;;;E79tm9. E79tm / 8.91;;;;;;; ttt;&0.65;tcc;@1.09;tat;&0.72;tgt;&0.86;;ttt;&0.07;tcc;@0.12;tat;&0.08;tgt;&0.10 atc;@0.90;acc;@0.86;aat;&0.95;agt;&1.01;;atc;@0.10;acc;@0.10;aat;&0.11;agt;&0.11 ctc;@0.14;ccc;@0.37;cat;&0.46;cgc;@0.30;;ctc;@0.02;ccc;@0.04;cat;&0.05;cgc;@0.03 gtc;@0.85;gcc;@0.87;gat;&0.96;ggt;&1.01;;gtc;@0.10;gcc;@0.10;gat;&0.11;ggt;&0.11 ttc;*15.13;tct;§11.65;tac;*16.58;tgc;$23.35;;ttc;*1.70;tct;§1.31;tac;*1.86;tgc;$2.62 att;*15.67;act;?12.92;aac;$20.15;agc;§11.52;;att;*1.76;act;?1.45;aac;$2.26;agc;§1.29 ctt;§10.85;cct;§11.49;cac;?13.01;cgt;§11.19;;ctt;§1.22;cct;§1.29;cac;?1.46;cgt;§1.26 gtt;?12.94;gct;$21.94;gac;$19.89;ggc;*17.86;;gtt;?1.45;gct;$2.46;gac;$2.23;ggc;*2.00 tta;°7.49;tca;°7.33;taa;ù0.95;tga;ù1.77;;tta;°0.84;tca;°0.82;taa;ù−;tga;ù0.20 ata;°7.14;aca;§9.06;aaa;*17.89;aga;§8.63;;ata;°0.8;aca;§1.02;aaa;*2.01;aga;§0.97 cta;£6.15;cca;?12.59;caa;§11.92;cga;°7.71;;cta;£0.69;cca;?1.41;caa;§1.34;cga;°0.87 gta;°8.04;gca;*13.92;gaa;*14.89;gga;?13.18;;gta;°0.9;gca;*1.56;gaa;*1.67;gga;?1.48 ttg;°8.32;tcg;£5.54;tag;ù1.03;tgg;§11.85;;ttg;°0.93;tcg;£0.62;tag;ù−;tgg;§1.33 atg;$27.7;acg;£6.08;aag;$20.59;agg;§10.05;;atg;$3.11;acg;£0.68;aag;$2.31;agg;§1.13 ctg;§9;ccg;£5.13;cag;*13.86;cgg;£4.67;;ctg;§1.01;ccg;£0.58;cag;*1.56;cgg;£0.52 gtg;?12.68;gcg;°7.73;gag;*17.73;ggg;°7.37;;gtg;?1.42;gcg;°0.87;gag;*1.99;ggg;°0.83 ;;;;;;;;;;;;;;;; I 1;B4032m. Multiplicité des bactéries;;;;;;;;Sensibilité relative en %. -10, 521.;;;;;;; ttt;&0.25;tct;&0.12;tat;&0.10;tgt;&0.07;;ttt;27;tcc;93;tat;77;tgt;123 att;&0.12;act;&2.55;aat;&0.12;agt;&0.02;;atc;77;acc;3;aat;81;agt;436 ctt;&9.15;cct;&0.25;cat;&0.10;cgc;@8.26;;ctc;-1;ccc;15;cat;48;cgc;-1 gtt;&0.22;gct;&0.05;gat;&0;ggt;&0.02;;gtc;40;gcc;187;gat;−;ggt;436 ttc;*1.51;tcc;§1.12;tac;*1.59;tgc;§1.11;;ttc;&12;tct;&17;tac;&17;tgc;*136 atc;$2.28;acc;§1.12;aac;$2.17;agc;§1.10;;att;&-23;act;&30;aac;&4;agc;&18 ctc;§0.95;ccc;£0.68;cac;*1.17;cgt;$1.85;;ctt;&28;cct;?90;cac;&25;cgt;&-32.3 gtc;§1.10;gcc;§1.03;gac;$2.24;ggc;$2.30;;gtt;&32.1;gct;*138;gac;&0;ggc;&-13 tta;*1.18;tca;*1.31;taa;ù−;tga;ù0.33;;tta;&-29;tca;§-37.4;taa;−;tga;-39 ata;ù0.01;aca;*1.46;aaa;$2.26;aga;*1.19;;ata;−;aca;§-30;aaa;&-11;aga;&-19 cta;*1.23;cca;*1.35;caa;*1.58;cga;£0.22;;cta;§-44;cca;&5;caa;&-16;cga;*293 gta;$2.2;gca;$2.53;gaa;$2.4;gga;*1.37;;gta;?-59;gca;§-38;gaa;&-30;gga;&8 ttg;§0.99;tcg;£0.65;tag;ù−;tgg;§1.08;;ttg;&-6;tcg;&-4;tag;−;tgg;&23 atg;$4.47;acg;£0.68;aag;£0.6;agg;§0.86;;atg;&-30;acg;&0;aag;*284;agg;&31.8 ctg;*1.29;ccg;£0.54;cag;£0.59;cgg;§0.83;;ctg;&-21;ccg;&6;cag;*163;cgg;§-37 gtg;£0.33;gcg;£0.3;gag;£0.34;ggg;£0.56;;gtg;*337;gcg;*186;gag;*478;ggg;§47
Bactéries de la base gtRNAdb et champignons C42t diff
[modifier | modifier le wikicode]- Lien tableaux:Bactéries de la base gtRNAdb et champignons C42t diff
Légende:
C42tm. Multiplicité de C42t-tg;;;;;;;;;C42tm4. C42tm / 4.17;;;;;;; ttt;&0.05;tcc;@0.02;tat;&0.05;tgt;&0.02;;ttt;&0.01;tcc;@0;tat;&0.01;tgt;&0 atc;@0.14;acc;@0;aat;&0.05;agt;&0;;atc;@0.03;acc;@0;aat;&0.01;agt;&0 ctc;@0.43;ccc;@0.02;cat;&0;cgc;@0;;ctc;@0.1;ccc;@0;cat;&0;cgc;@0 gtc;@0.02;gcc;@0;gat;&0.05;ggt;&0.05;;gtc;@0;gcc;@0;gat;&0.01;ggt;&0.01 ttc;$7.05;tct;$7.38;tac;*6.00;tgc;§3.4;;ttc;$1.69;tct;$1.77;tac;*1.44;tgc;§0.82 att;$9.00;act;$7.90;aac;$7.07;agc;§3.69;;att;$2.16;act;$1.89;aac;$1.7;agc;§0.88 ctt;*4.05;cct;§3.69;cac;*5.24;cgt;*5.67;;ctt;*0.97;cct;§0.88;cac;*1.26;cgt;*1.36 gtt;$9.55;gct;$9.26;gac;$9.74;ggc;$11.6;;gtt;$2.29;gct;$2.22;gac;$2.34;ggc;$2.78 tta;§3.14;tca;§2.19;taa;ù0.02;tga;ù0.29;;tta;§0.75;tca;§0.53;taa;ù0;tga;ù0.07 ata;£1.4;aca;§2.38;aaa;§3.69;aga;*4.93;;ata;£0.34;aca;§0.57;aaa;§0.88;aga;*1.18 cta;£1.79;cca;*4.88;caa;*4.67;cga;§2.19;;cta;£0.43;cca;*1.17;caa;*1.12;cga;§0.53 gta;£1.52;gca;*3.36;gaa;*6.00;gga;§3.48;;gta;£0.36;gca;§0.81;gaa;*1.44;gga;§0.83 ttg;*4.52;tcg;£1.9;tag;ù0.02;tgg;*4.12;;ttg;*1.08;tcg;£0.46;tag;ù0;tgg;*0.99 atg;$7.71;acg;£1.57;aag;$10.14;agg;£1.64;;atg;$1.85;acg;£0.38;aag;$2.43;agg;£0.39 ctg;§2.12;ccg;£0.86;cag;§3.55;cgg;£1.31;;ctg;§0.51;ccg;£0.21;cag;§0.85;cgg;£0.31 gtg;§2.24;gcg;£1.43;gag;$7.05;ggg;£1.64;;gtg;§0.54;gcg;£0.34;gag;$1.69;ggg;£0.39 ;;;;;;;;;;;;;;;; I 1;B4032m. Multiplicité des bactéries;;;;;;;;Sensibilité relative en %. -16.1, 263.;;;-123;320;;; ttt;&0.25;tct;&0.12;tat;&0.1;tgt;&0.07;;ttt;4;tcc;3;tat;12;tgt;6 att;&0.12;act;&2.55;aat;&0.12;agt;&0.02;;atc;29;acc;-1;aat;10;agt;-1 ctt;&9.15;cct;&0.25;cat;&0.1;cgc;@8.26;;ctc;0;ccc;1;cat;-1;cgc;-1 gtt;&0.22;gct;&0.05;gat;&0;ggt;&0.02;;gtc;1;gcc;-1;gat;-;ggt;52 ttc;*1.51;tcc;§1.12;tac;*1.59;tgc;§1.11;;ttc;&12;tct;?58;tac;&-10;tgc;&-27 atc;$2.28;acc;§1.12;aac;$2.17;agc;§1.10;;att;&-5;act;?69;aac;&-22;agc;&-19 ctc;§0.95;ccc;£0.68;cac;*1.17;cgt;$1.85;;ctt;&2;cct;&30;cac;&7;cgt;&-27 gtc;§1.10;gcc;§1.03;gac;$2.24;ggc;$2.3;;gtt;*108;gct;*115;gac;&4;ggc;&21 tta;*1.18;tca;*1.31;taa;ù−;tga;ù0.33;;tta;§-36;tca;?-60;taa;−;tga;-79 ata;ù0.01;aca;*1.46;aaa;$2.26;aga;*1.19;;ata;−;aca;?-61;aaa;?-61;aga;&-1 cta;*1.23;cca;*1.35;caa;*1.58;cga;£0.22;;cta;?-65;cca;&-13;caa;&-29;cga;*139 gta;$2.2;gca;$2.53;gaa;$2.4;gga;*1.37;;gta;?-83;gca;?-68;gaa;§-40;gga;§-39 ttg;§0.99;tcg;£0.65;tag;ù−;tgg;§1.08;;ttg;&9;tcg;&-30;tag;−;tgg;&-9 atg;$4.47;acg;£0.68;aag;£0.60;agg;§0.86;;atg;?-59;acg;§-45;aag;*304;agg;?-54 ctg;*1.29;ccg;£0.54;cag;£0.59;cgg;§0.83;;ctg;?-60;ccg;?-62;cag;§44;cgg;?-62 gtg;£0.33;gcg;£0.3;gag;£0.34;ggg;£0.56;;gtg;?65;gcg;&13;gag;*391;ggg;&-30
Tableaux des génomes, corrélations et indice double
[modifier | modifier le wikicode]E79-Genomes. Correlations et indices des doublons
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- 79 Eucaryotes: Genomes, corrélations et indices des doublons
E79;;;acs;;aga;;aml;;ath;;bacu;;bdi;;bta;;cbr;;cbre;;cel;;cfa;;cge;;cjap;;cjc;;cmk;;cpic;;cpo;;csi;;dme;;dno;;dsi;;dya;;ecb;;eeu;;fca;;gac;;gfr;;gga;;ggo;;gmo;;gmx;;hgl;;homo-18;;lav;;lcm;;lma;;mcc;;mdo;;meu;;mgp;;mlu;;mmr;;mmu;;mpu;;mtr;;mun;;nle;;oaa;;oas;;ocu;;oga;;oni;;opr;;osa;;pan;;pfa;;pha;;pma;;pop;;ppp;;ppy;;ptr;;rno;;san;;sbi;;sbq;;shr;;spu;;ssc;;str;;tgu;;tma;;tng;;tru;;tsy;;ttr;;vvi;;xtr;;zma;;;dre; ;;;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;;double;dif Phe;AAA;ttt;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;5;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;2;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;5;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;0;0;0;0;0;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;1;1;4;0;1;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;1;0;−;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;−;0;−;0;1;0;1;0;0;;0;9 Val;AAC;gtt;2;2;24;6;8;1;12;2;5;8;11;4;7;12;18;6;30;2;15;3;2;3;4;8;19;3;3;3;6;15;1;14;4;1;5;5;4;1;4;7;5;1;5;1;7;4;3;3;4;3;9;11;0;1;2;4;2;6;8;12;15;6;1;10;4;5;7;33;0;2;1;0;3;6;6;2;5;2;0;2;3;1;2;1;2;5;3;4;11;5;1;2;4;6;7;15;3;3;4;7;3;2;6;1;2;4;11;6;4;4;0;0;5;3;96;69;13;3;10;2;4;5;6;4;3;4;5;1;9;6;2;3;7;0;17;2;4;5;4;13;1;7;3;7;3;6;8;10;1;4;1;6;8;6;36;18;11;10;;146;85 Leu;AAG;ctt;2;1;3;1;2;4;9;2;4;1;7;6;6;4;21;4;29;2;14;5;3;0;3;1;22;3;4;3;6;13;0;1;3;1;3;2;3;0;3;1;4;0;4;0;5;1;4;1;5;0;31;17;1;2;0;2;4;4;11;21;15;0;2;2;5;3;4;17;1;2;2;0;2;6;5;2;2;2;0;0;1;1;3;1;2;2;4;1;3;5;0;2;4;5;3;4;3;2;2;2;3;0;5;8;2;2;11;3;4;3;0;0;4;4;56;55;13;35;5;0;6;9;5;5;0;0;4;1;11;3;4;2;6;2;5;12;5;2;3;2;0;1;3;4;2;12;3;7;3;2;5;0;5;4;20;17;19;9;;124;145 Ile;AAT;att;4;1;10;1;7;4;15;1;6;5;13;6;14;3;17;3;31;1;19;1;4;4;10;2;20;5;5;7;8;22;2;8;7;2;7;5;8;1;6;5;6;2;8;1;13;6;7;1;8;1;84;16;4;1;6;0;5;8;5;20;12;18;5;2;5;9;13;29;1;5;2;0;4;7;12;0;4;1;1;1;6;3;2;1;7;4;6;3;14;8;3;1;4;8;10;16;3;2;6;4;6;3;12;12;6;1;14;3;5;8;0;0;5;6;47;62;14;5;9;2;7;8;6;10;5;6;7;7;14;2;6;4;10;0;57;11;12;0;6;7;5;34;5;7;8;9;9;2;5;2;5;5;9;5;45;17;32;36;;129;128 Cys;ACA;tgt;0;−;0;−;0;−;0;−;0;1;0;−;9;133;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;4;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;4;0;−;0;1;0;3;0;−;0;−;0;−;0;0;0;0;0;−;0;0;0;−;0;0;0;−;0;15;0;−;0;−;0;0;0;−;0;0;0;3;0;−;0;1;0;−;0;0;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;0;0;−;0;0;0;4;0;−;0;−;0;0;1;4;0;0;0;1;0;0;;0;8 Gly;ACC;ggt;0;−;0;−;0;−;0;−;1;10;0;−;0;19;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;23;0;−;0;−;0;−;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;3;0;−;0;3;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;1;0;−;0;0;0;−;0;−;0;1;0;4;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;6;0;0;0;8;0;−;0;−;0;−;1;17;0;−;0;−;0;−;;0;10 Arg;ACG;cgt;2;1;9;0;5;2;4;6;3;5;12;3;7;5;17;4;28;3;14;3;1;4;3;2;17;3;4;1;4;4;2;4;4;2;4;5;9;0;5;4;8;0;11;0;6;3;3;2;5;3;37;11;1;4;4;3;3;3;8;22;11;1;2;2;5;1;4;9;2;1;3;0;3;2;0;4;2;4;0;1;1;4;2;3;3;2;3;2;5;6;1;1;4;2;4;7;0;1;4;2;2;3;12;3;4;2;17;6;4;2;0;−;3;3;55;29;4;7;5;2;4;2;5;1;3;2;4;4;11;3;4;1;0;3;20;8;5;1;3;2;2;3;3;4;10;3;13;2;3;2;2;4;1;9;20;12;25;9;;147;55 Ser;ACT;agt;0;−;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;3;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;2;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;1;0;−;0;2;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;7;10;0;−;0;−;0;1;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;2;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;17;8;0;−;0;−;1;1;0;4;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;;3;10 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Ile;TAT;ata;0;0;0;1;0;5;3;1;0;7;1;2;0;7;8;15;13;12;3;3;0;4;0;4;2;4;0;4;4;18;0;12;0;4;0;4;0;1;0;5;0;−;0;1;0;4;0;3;0;8;46;14;0;1;0;1;0;5;2;15;5;2;0;2;0;4;0;6;0;6;0;0;0;6;0;6;0;5;0;0;0;2;1;1;0;4;0;4;7;6;0;0;0;4;2;7;0;4;0;6;0;10;5;19;0;3;2;2;0;6;0;0;0;3;3;6;6;2;2;2;0;5;0;4;0;2;0;4;1;3;0;5;0;3;6;15;1;3;0;3;0;0;0;7;0;4;0;5;0;3;0;4;3;5;26;24;1;3;;22;52 SeC;TCA;tga;0;0;0;−;0;1;0;−;0;16;0;−;0;28;0;−;1;1;0;1;0;0;0;1;0;0;0;1;0;2;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;1;0;17;0;0;0;−;0;0;0;2;0;1;0;−;3;3;0;1;0;23;0;3;0;−;0;1;0;−;3;3;0;−;0;−;0;−;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;4;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;−;0;2;0;−;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;1;0;0;0;1;0;0;0;2;0;1;0;−;0;−;0;0;0;0;0;17;0;0;0;0;0;0;0;20;0;0;0;0;0;−;;2;11 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Ala;TGC;gca;0;5;1;1;2;6;7;2;0;41;7;5;4;30;13;0;7;3;7;1;3;7;1;13;6;4;1;4;2889;3008;3;11;2;6;1;11;0;1;2;63;0;−;1;0;2;8;0;9;1;8;36;16;0;4;3;3;1;5;4;19;12;4;1;3;1;6;6;46;1;18;0;0;0;10;3;5;0;5;2;3;0;0;0;4;3;7;1;6;8;7;0;4;0;10;6;10;0;11;0;8;2;4;5;5;1;5;9;0;0;9;0;0;0;8;21;9;13;7;7;1;2;6;1;8;3;5;1;6;8;4;1;6;3;3;10;6;2;11;0;38;2;4;3;36;2;8;3;4;0;3;0;35;16;20;29;17;8;6;;265;102 Pro;TGG;cca;2;0;6;1;3;7;41;5;2;2;8;9;6;2;30;10;48;5;23;7;1;6;4;1;33;9;3;2;7;43;1;2;2;1;4;2;4;0;5;1;3;1;7;0;4;2;3;1;4;63;22;6;1;3;1;2;3;3;6;14;20;6;1;3;4;2;2;11;3;6;0;0;3;6;5;2;3;0;0;1;0;2;1;2;3;4;1;5;8;2;1;2;2;2;3;8;2;3;2;2;1;2;6;4;1;2;5;8;2;3;0;0;2;3;29;13;13;9;6;1;3;5;4;5;4;1;2;3;6;4;2;2;5;0;15;5;2;1;2;4;0;0;3;4;4;9;4;4;0;31;2;2;8;7;36;16;13;17;;108;96 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Glu;TTC;gaa;5;1;8;2;4;6;7;8;47;2320;8;6;11;423;15;3;27;8;14;2;4;10;2;4;16;3;3;17;7;58;0;16;2;3;4;6;5;0;5;14;2;2;5;1;5;5;3;4;4;10;22;23;0;3;2;6;3;12;12;38;12;3;2;3;3;4;7;106;2;8;0;0;2;9;10;3;6;5;1;3;1;3;3;5;5;2;1;5;13;8;0;2;2;11;3;12;3;135;9;8;1;3;6;7;3;3;10;5;7;5;0;0;6;6;3;8;13;0;5;1;9;14;6;11;5;4;1;8;8;4;4;16;10;4;18;7;30;204;2;2;0;1;2;111;3;12;4;8;2;6;29;1871;5;9;60;23;12;9;;128;96 Gln;TTG;caa;0;2;2;1;1;41;6;3;2;7;7;7;2;17;19;4;29;10;15;4;1;41;1;3;11;2;0;6;1;5;1;14;2;1;2;2;2;1;2;2;2;1;3;0;2;3;1;2;5;776;47;12;0;1;0;1;1;9;3;7;10;2;0;2;2;3;3;10;1;8;0;0;1;14;0;6;1;2;0;0;0;2;1;2;1;5;2;34;10;9;1;0;2;7;3;7;0;6;2;2;1;3;1;4;2;2;9;11;2;11;0;0;2;3;23;20;10;0;3;6;0;12;3;16;1;4;2;2;3;7;0;7;16;28;10;6;3;5;2;1;0;1;2;5;4;4;3;6;13;50;4;11;3;6;20;7;8;13;;59;45 Lys;TTT;aaa;2;2;3;4;5;49;10;5;4;81;3;8;10;67;11;4;20;8;13;0;6;27;5;9;23;6;5;10;5;37;4;31;4;6;4;10;4;1;4;13;2;1;3;2;7;7;6;4;5;44;30;30;2;1;2;3;3;10;17;45;15;4;3;4;4;7;14;45;7;12;0;0;6;12;9;3;3;6;2;1;1;1;3;1;8;5;6;24;7;12;1;1;8;14;7;24;5;16;4;7;4;6;9;6;3;5;4;7;6;12;0;−;6;5;17;6;13;4;4;3;8;14;6;13;0;0;5;2;3;7;4;13;8;5;37;19;15;22;5;4;3;0;5;25;4;10;7;12;4;5;4;69;5;5;51;20;14;67;;275;249 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; corrélation;;;0.23;;0.10;;0.35;;0.68;;0.88;;0.44;;0.57;;0.25;;0.09;;0.35;;0.36;;0.38;;0.67;;0.56;;0.61;;0.37;;0.43;;0.15;;-0.11;;0.06;;-0.27;;0.02;;0.20;;0.77;;0.30;;0.81;;0.20;;0.44;;0.38;;0.76;;0.17;;0.06;;0.27;;0.06;;0.44;;0.17;;0.31;;0.40;;0.25;;0.30;;0.42;;0.30;;0.67;;0.13;;0.30;;0.29;;0.43;;0.77;;0.14;;0.26;;0.14;;0.14;;-0.11;;0.63;;0.34;;−;;0.35;;0.91;;0.22;;0.23;;0.53;;0.56;;0.44;;0.43;;0.25;;0.26;;0.36;;0.63;;0.76;;0.07;;0.43;;0.19;;0.52;;0.32;;0.40;;0.88;;0.53;;0.71;;0.60;;;0.91; 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idble;;;1.28;;3.02;;0.14;;1.99;;0.05;;1.77;;0.09;;3.14;;3.62;;3.13;;0.19;;0.63;;3.51;;0.50;;0.33;;0.17;;0.72;;0.52;;3.61;;0.22;;2.93;;3.93;;0.78;;0.59;;0.04;;2.27;;0.67;;0.93;;0.40;;0.46;;2.65;;0.37;;0.74;;0.15;;0.22;;8.50;;0.39;;1.48;;0.90;;0.83;;1.15;;0.98;;0.80;;0.21;;1.04;;0.51;;0.38;;0.52;;0.08;;0.97;;0.81;;0.78;;1.06;;1.68;;0.58;;0.00;;0.77;;1.36;;1.86;;1.95;;0.46;;0.41;;0.81;;0.81;;1.41;;0.52;;1.35;;1.68;;0.45;;0.24;;0.53;;0.06;;0.57;;0.92;;0.50;;0.04;;0.81;;1.59;;1.10;;;1.16; total tRNAs;;;164;;378;;1422;;648;;7059;;596;;3998;;699;;1043;;549;;862;;449;;780;;436;;13671;;500;;334;;469;;249;;1068;;216;;286;;444;;439;;3719;;2441;;157;;236;;453;;1442;;690;;315;;385;;1948;;325;;38;;473;;434;;304;;110;;206;;212;;415;;706;;627;;154;;452;;805;;1124;;456;;277;;624;;292;;698;;475;;1;;359;;2433;;595;;377;;556;;553;;358;;327;;571;;343;;401;;1020;;758;;748;;226;;1962;;562;;565;;406;;5817;;526;;2585;;1149;;;; ;;;acs;;aga;;aml;;ath;;bacu;;bdi;;bta;;cbr;;cbre;;cel;;cfa;;cge;;cjap;;cjc;;cmk;;cpic;;cpo;;csi;;dme;;dno;;dsi;;dya;;ecb;;eeu;;fca;;gac;;gfr;;gga;;ggo;;gmo;;gmx;;hgl;;hsa-18;;lav;;lcm;;lma;;mcc;;mdo;;meu;;mgp;;mlu;;mmr;;mmu;;mpu;;mtr;;mun;;nle;;oaa;;oas;;ocu;;oga;;oni;;opr;;osa;;pan;;pfa;;pha;;pma;;pop;;ppp;;ppy;;ptr;;rno;;san;;sbi;;sbq;;shr;;spu;;ssc;;str;;tgu;;tma;;tng;;tru;;tsy;;ttr;;vvi;;xtr;;zma;;;dre; ;;;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;;double;dif
E79 génomes. Les duplications excessives remplacées par les estimations du processus de base
[modifier | modifier le wikicode]- Lien au tableaux: E79 génomes. Les duplications excessives remplacées par les estimations du processus de base
- Méthode: remplacement manuel. S'il faut recalculer les corrélations et les totaux par colonne, il suffit de copier le "lien tableur" de ce tableau dans un tableur puis remplacer tout "*" et ":" par rien (ctrl+H), récupérer les résultats et non le tableau. S'il nécessaire de republier le tableau, reprendre "le lien tableur" sans supprimer les "*" et les ":", puis faire les modifications nécessaires avant de publier.
- Légende:
- Couleurs pour effectif supérieur à 49 remplacé par la méthode des 4 proches voisins (ref.).
- Total des codons par génome:Les duplications excessives remplacées par les estimations du processus de base
E79;double;acs;double;aga;double;aml;double;ath;double;bacu;double;bdi;double;bta;double;cbr;E79;double;cbre;double;cel;double;cfa;double;cge;double;cjap;double;cjc;double;cmk;double;cpic;E79;double;cpo;double;csi;double;dme;double;dno;double;dsi;double;dya;double;ecb;double;eeu;E79;double;fca;double;gac;double;gfr;double;gga;double;ggo;double;gmo;double;gmx;double;hgl;E79;double;hsa-18;double;lav;double;lcm;double;lma;double;mcc;double;mdo;double;meu;double;mgp;E79;double;mlu;double;mmr;double;mmu;double;mpu;double;mtr;double;mun;double;nle;double;oaa;E79;double;oas;double;ocu;double;oga;double;oni;double;opr;double;osa;double;pan;double;pfa;E79;double;pha;double;pma;double;pop;double;ppp;double;ppy;double;ptr;double;rno;double;san;E79;double;sbi;double;sbq;double;shr;double;spu;double;ssc;double;str;double;tgu;double;tma;E79;double;tng;double;tru;double;tsy;double;ttr;double;vvi;double;xtr;double;zma '''aaa;2;2;3;4;5;*17;10;5;4;*11;3;8;10;*5;11;4;'''aaa;20;8;13;0;6;27;5;9;23;6;5;10;5;37;4;31;'''aaa;4;6;4;10;4;1;4;13;2;1;3;2;7;7;6;4;'''aaa;5;44;30;30;2;1;2;3;3;10;17;§9;15;4;3;4;'''aaa;4;7;14;45;7;12;0;0;6;12;9;3;3;6;2;1;'''aaa;1;1;3;1;8;5;6;24;7;12;1;1;8;14;7;24;'''aaa;5;16;4;7;4;6;9;6;3;5;4;7;6;12;0;−;'''aaa;6;5;17;6;13;4;4;3;8;14;6;13;0;0;5;2;'''aaa;3;7;4;13;8;5;37;19;15;22;5;4;3;0;5;25;'''aaa;4;10;7;12;4;5;4;*11;5;5;*16;20;14;*16 '''aac;6;3;10;1;10;17;10;8;17;6;10;5;16;13;20;2;'''aac;28;4;17;2;8;12;8;8;20;2;9;17;16;31;5;11;'''aac;9;8;10;3;9;0;17;5;5;0;10;0;9;7;5;1;'''aac;7;20;*12;40;1;4;5;5;9;19;16;17;12;9;5;3;'''aac;8;16;14;36;2;6;2;0;6;20;9;3;10;3;2;1;'''aac;7;1;4;4;8;4;4;7;14;15;4;4;7;13;10;10;'''aac;8;4;11;14;8;3;8;0;9;4;17;12;9;19;0;0;'''aac;8;9;*29;*12;11;12;9;4;11;29;9;23;8;6;8;3;'''aac;9;6;5;6;12;0;30;8;10;7;7;1;3;4;5;17;'''aac;6;10;10;12;6;8;7;5;7;13;28;18;31;17 '''aag;3;2;15;1;12;*6;14;4;5;23;16;1;15;24;36;3;'''aag;45;3;24;5;10;*11;11;*8;30;6;4;11;11;24;2;6;'''aag;7;18;6;15;12;0;13;29;10;0;12;3;8;7;28;*10;'''aag;8;*15;*11;22;1;5;4;1;5;13;20;22;20;1;4;10;'''aag;5;9;14;21;4;8;2;1;7;8;10;8;8;2;1;1;'''aag;4;6;4;1;7;18;5;*10;13;2;3;9;6;13;10;14;'''aag;5;10;9;19;4;4;22;20;4;6;15;4;6;10;0;−;'''aag;6;5;13;9;15;1;11;4;8;18;8;17;10;8;6;6;'''aag;15;6;3;6;9;22;30;11;7;8;7;4;1;4;7;8;'''aag;10;10;13;6;0;6;3;15;5;10;*11;22;36;*6 '''aat;0;−;0;−;0;5;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;'''aat;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;1;0;0;'''aat;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;0;0;0;0;−;'''aat;0;4;0;0;0;0;0;−;0;1;0;1;0;1;0;−;'''aat;0;−;0;3;0;2;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;'''aat;0;−;0;−;0;−;0;5;4;$5;0;−;0;2;0;−;'''aat;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;1;0;−;'''aat;0;0;0;−;0;−;0;0;1;0;0;1;0;−;0;−;'''aat;0;0;0;−;0;−;0;−;0;1;0;0;0;2;0;0;'''aat;0;−;0;−;0;0;0;−;0;0;0;0;0;− 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'''aga;0;2;0;1;0;16;1;8;0;*8;2;6;0;§8;7;2;'''aga;10;2;5;2;0;8;0;4;9;2;0;5;0;13;1;24;'''aga;0;4;0;5;0;2;0;8;0;3;0;2;0;4;0;4;'''aga;0;*8;§1;24;0;2;0;3;0;4;2;18;10;7;0;5;'''aga;0;5;0;*8;0;8;0;0;0;5;0;5;1;5;0;2;'''aga;1;3;0;4;0;5;1;14;2;5;0;3;0;6;0;5;'''aga;0;21;0;5;0;3;1;25;0;4;6;5;0;5;0;0;'''aga;0;5;8;9;5;5;4;2;2;5;0;5;0;5;0;5;'''aga;2;5;0;5;0;4;9;8;1;5;0;4;0;3;1;*10;'''aga;0;9;1;11;0;5;0;§8;3;2;*9;*5;3;5 '''agc;2;2;4;1;3;9;7;8;3;9;12;5;8;10;6;2;'''agc;9;4;6;2;2;5;3;5;12;2;3;4;10;22;1;18;'''agc;3;6;7;5;4;1;3;6;1;1;4;3;5;6;4;2;'''agc;4;7;14;15;3;2;3;3;4;3;0;−;16;11;2;4;'''agc;2;5;7;*6;1;6;0;1;4;3;7;1;6;3;1;4;'''agc;2;2;2;4;2;5;4;7;6;8;0;7;3;5;6;11;'''agc;1;5;7;2;2;4;5;4;4;2;14;5;4;6;0;0;'''agc;4;4;§7;30;10;5;6;2;4;3;3;5;5;6;4;3;'''agc;7;5;3;3;6;1;14;2;6;3;2;4;2;2;2;33;'''agc;5;5;6;12;2;6;3;7;7;1;§14;*8;10;3 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C42-Genomes. Correlations et indices des doublons
[modifier | modifier le wikicode]- Lien tableaux: C42-Genomes. Corrélations et indices des doublons.
- 42 Champignons: Genomes, corrélations et indices des doublons
C42;;;ani;;aor;;bfu;;cal;;cgr;;cjd;;cneg;;cot;;dha;;ecu;;ede;;fgr;;fgr5;;fve;;fvr;;kaf;;kpa;;kla;;kna;;lkl;;lth;;mfa;;mgr;;mth;;ncr;;ncs;;opa;;pch;;pic;;sas;;sce;;spo;;sre;;tbl;;tdl;;tpf;;ttt;;uma;;vda;;vma;;yli;;zro; ;;;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif Phe;AAA;ttt;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;1;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;− 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Ser;TGA;tca;0;0;0;0;1;2;1;1;1;0;0;2;0;0;0;1;1;2;0;0;0;0;0;1;0;1;0;1;0;1;3;0;1;0;1;0;0;0;1;0;1;0;3;0;0;1;0;2;0;2;2;1;0;0;0;0;1;0;0;2;2;0;0;1;0;0;3;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;1;0;2 Ala;TGC;gca;0;1;1;1;0;4;0;1;4;0;1;1;0;0;1;0;3;1;0;0;0;0;0;3;0;2;3;5;1;1;3;1;1;0;2;0;0;0;3;0;0;2;6;1;0;2;0;1;0;2;3;1;1;0;0;1;2;0;1;4;4;0;1;0;0;0;3;1;3;0;2;0;0;1;0;0;0;1;0;1;3;0;6;2 Pro;TGG;cca;0;1;0;2;0;7;0;3;5;1;6;0;0;0;0;2;2;4;0;0;0;0;0;2;0;2;1;2;0;2;1;8;3;0;1;5;2;3;5;4;1;6;2;5;0;1;0;1;1;2;2;7;1;1;0;−;2;3;3;4;3;6;0;1;0;0;0;12;4;1;0;6;0;1;0;0;0;2;0;1;2;0;9;0 Thr;TGT;aca;0;1;0;1;0;2;1;0;2;0;1;1;0;0;1;0;0;2;0;0;0;0;1;2;1;2;0;2;1;2;2;0;0;0;1;0;0;1;1;0;0;1;3;0;0;1;0;1;0;2;1;1;0;0;0;2;1;0;0;2;2;1;0;1;0;0;1;1;1;0;0;1;0;0;0;0;0;2;0;2;0;2;1;0 Stp;TTA;taa;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;− 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;;;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif
B42-Genomes. Correlations et indices des doublons
[modifier | modifier le wikicode]- Lien tableaux: B42-Genomes. Corrélations et indices des doublons.
- 42 Bactéries: Genomes, corrélations et indices des doublons
B42;;;cbl;;spl;;pdi;;ppoy;;sbn;;eal;;eco;;sbz;;eno;;kpn;;bcef;;bcoh;;blr;;dzc;;eclx;;gmc;;ksa;;mme;;mvs;;pge;;pha;;pse;;sfr;;vag;;vau;;vha;;vvm;;yrb;;bae;;saci;;sep;;hmr;;bbd;;lpl;;sty;;sma;;sho;;ksk;;ype;;pdix;;hmo;;vpf; ;;;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif;double;dif Phe;AAA;ttt;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;− 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Ile;TAT;ata;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;− SeC;TCA;tga;0;0;0;0;0;−;0;−;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;0;0;−;0;−;0;0;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;0;0;−;0;0;0;0;0;0;0;− Gly;TCC;gga;3;0;0;0;1;0;2;1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;1;1;0;3;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;1;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;1;0;2;1;1;0;0;0;1;1;0;0;1;3;0;0;0;0;1;1;0;0;0;2;0;1;0;0;0;0;4;0;0;0;1;0 Arg;TCG;cga;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;−;0;1;0;−;0;0;0;0;0;−;0;−;0;−;0;−;2;0;0;−;0;−;0;−;0;− Arg;TCT;aga;2;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;−;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;2;1;0;0;0;0 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Glu;TTC;gaa;1;1;12;0;0;1;5;0;6;0;2;1;3;0;3;0;3;0;3;0;5;1;2;1;5;0;3;0;3;0;4;0;3;0;2;0;0;−;2;1;5;1;1;3;5;0;2;0;3;0;4;0;0;0;3;0;4;1;1;0;0;2;0;0;1;0;1;0;3;0;0;0;0;0;0;0;2;0;4;0;4;1;5;0 Gln;TTG;caa;1;0;4;0;0;0;3;0;1;1;1;0;1;0;1;0;1;0;1;0;3;1;0;2;2;1;0;0;1;0;1;2;1;0;2;0;3;0;0;0;3;0;0;0;2;0;0;0;0;1;0;1;4;0;1;0;1;2;0;2;0;1;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;3;0;4;1 Lys;TTT;aaa;3;0;11;0;0;1;4;1;6;3;3;0;5;0;4;0;4;0;5;0;4;1;2;1;5;0;2;0;4;0;2;1;4;0;3;0;6;0;4;0;6;1;1;0;5;0;1;0;1;0;3;0;0;0;4;0;2;0;0;−;1;1;0;0;1;0;1;0;2;1;0;0;0;0;0;0;2;1;4;0;4;0;3;0 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; corrélation;;;0.08;;0.19;;0.00;;0.03;;0.31;;0.42;;0.15;;0.04;;0.07;;0.19;;0.12;;0.18;;-0.08;;0.16;;0.26;;0.36;;-0.01;;0.31;;0.05;;0.18;;0.32;;0.14;;0.33;;-0.16;;0.19;;0.09;;0.29;;0.17;;0.21;;0.14;;0.11;;-0.05;;0.11;;0.22;;0.33;;0.04;;0.43;;0.20;;0.20;;0.35;;0.18;;0.25; total;;;34;12;103;8;27;14;54;19;59;13;33;12;37;10;36;9;35;10;41;5;45;19;20;24;60;20;42;6;34;14;30;23;33;9;39;9;91;10;37;7;62;11;37;10;47;15;64;9;44;16;74;15;66;14;36;8;27;16;10;17;13;19;2;3;4;4;20;9;28;13;14;19;15;14;19;13;22;10;51;12;44;23;84;15 indice doublons;;;2.83;;12.88;;1.93;;2.84;;4.54;;2.75;;3.70;;4.00;;3.50;;8.20;;2.37;;0.83;;3.00;;7.00;;2.43;;1.30;;3.67;;4.33;;9.10;;5.29;;5.64;;3.70;;3.13;;7.11;;2.75;;4.93;;4.71;;4.50;;1.69;;0.59;;0.68;;0.67;;1.00;;2.22;;2.15;;0.74;;1.07;;1.46;;2.20;;4.25;;1.91;;5.60;
Total des codons par génome, corrélations et indices des doublons
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- Total des codons par génome, corrélations et indices des doublons
A10-tc;;néant;;B42-tc;;1 diag;;C42-tc;;1 diag;;E79e-tc;;1 diag;;E79o-tc;;néant;;E79-tc;;néant A10-tc;Ab-tc;Af-tc;;B42-tc;Bb-tc;Bf-tc;;C42-tc;Cb-tc;Cf-tc;;Ee-tc;Ebe-tc;Efe-tc;;Eo-tc;Ebo-tc;Efo-tc;;E-tc;Eb-tc;Ef-tc fpl;0;5;;hmr;2;3;;ecu;0;2;;acs;91;77;;acs;91;124;;acs;92;72 hbo;5;3;;bbd;4;4;;ede;0;12;;aga;288;101;;aga;288;145;;aga;284;94 mac;8;6;;saci;10;17;;sre;1;53;;aml;171;383;;aml;171;435;;aml;172;1250 mbw;10;8;;sep;13;19;;uma;15;51;;ath;404;217;;ath;404;268;;ath;431;217 mhor;5;11;;sma;14;19;;ttt;17;94;;bacu;211;471;;bacu;211;525;;bacu;342;6717 mls;6;7;;sho;15;14;;vma;18;103;;bdi;377;219;;bdi;377;271;;bdi;381;215 mmet;7;5;;ksk;19;13;;cneg;22;83;;bta;306;555;;bta;306;614;;bta;320;3678 mpl;4;8;;lpl;20;9;;mgr;22;123;;cbr;527;204;;cbr;527;248;;cbr;530;169 mru;2;22;;bcoh;20;24;;cot;26;16;;cbre;763;228;;cbre;763;280;;cbre;817;226 nou;4;5;;ype;22;10;;mth;28;118;;cel;411;154;;cel;411;201;;cel;416;133 ;;;;pdi;27;14;;opa;33;8;;cfa;142;332;;cfa;142;382;;cfa;139;723 ;;;;bae;27;16;;bfu;39;130;;cge;172;209;;cge;172;258;;cge;173;276 ;;;;sty;28;13;;cal;40;44;;cjap;598;176;;cjap;598;223;;cjap;607;173 ;;;;gmc;30;23;;kpa;56;23;;cjc;153;277;;cjc;153;333;;cjc;146;290 ;;;;ksa;33;9;;ani;69;67;;cmk;413;769;;cmk;413;830;;cmk;3402;10269 ;;;;eal;33;12;;fve;72;166;;cpic;79;411;;cpic;79;468;;cpic;74;426 ;;;;cbl;34;12;;kna;85;32;;cpo;152;193;;cpo;152;243;;cpo;140;194 ;;;;eclx;34;14;;vda;92;90;;csi;162;241;;csi;162;291;;csi;161;308 ;;;;eno;35;10;;kla;100;21;;dme;192;60;;dme;192;104;;dme;195;54 ;;;;yrb;36;8;;spo;100;23;;dno;187;413;;dno;187;464;;dno;190;878 ;;;;sbz;36;9;;pch;100;55;;dsi;164;55;;dsi;164;97;;dsi;161;55 ;;;;pge;37;7;;aor;103;98;;dya;227;63;;dya;227;109;;dya;228;58 ;;;;eco;37;10;;fgr5;103;124;;ecb;207;252;;ecb;207;302;;ecb;194;250 ;;;;pse;37;10;;pic;104;25;;eeu;175;165;;eeu;175;211;;eeu;163;276 ;;;;mme;39;9;;fvr;104;136;;fca;164;535;;fca;164;594;;fca;158;3561 ;;;;kpn;41;5;;sas;116;51;;gac;632;694;;gac;632;742;;gac;1694;747 ;;;;dzc;42;6;;cjd;122;29;;gfr;63;92;;gfr;63;138;;gfr;63;94 ;;;;vau;44;16;;fgr;126;136;;gga;113;119;;gga;113;166;;gga;114;122 ;;;;hmo;44;23;;tdl;127;25;;ggo;129;316;;ggo;129;371;;ggo;129;324 ;;;;bcef;45;19;;dha;130;44;;gmo;435;883;;gmo;435;938;;gmo;452;990 ;;;;sfr;47;15;;lth;132;55;;gmx;498;200;;gmx;498;248;;gmx;501;189 ;;;;pdix;51;12;;tpf;135;30;;hgl;83;230;;hgl;83;282;;hgl;85;230 ;;;;ppoy;54;19;;cgr;150;16;;hsa-18;177;220;;hsa-18;177;268;;hsa-18;164;221 ;;;;sbn;59;13;;lkl;171;45;;lav;248;760;;lav;248;816;;lav;253;1695 ;;;;blr;60;20;;ncs;175;54;;lcm;59;261;;lcm;59;313;;lcm;59;266 ;;;;pha;62;11;;kaf;181;45;;lma;34;4;;lma;34;49;;lma;34;4 ;;;;vag;64;9;;zro;185;45;;mcc;132;335;;mcc;132;392;;mcc;132;341 ;;;;vvm;66;14;;ncr;194;160;;mdo;252;184;;mdo;252;231;;mdo;259;175 ;;;;vha;74;15;;sce;205;29;;meu;141;163;;meu;141;212;;meu;144;160 ;;;;vpf;84;15;;mfa;208;38;;mgp;54;58;;mgp;54;103;;mgp;50;60 ;;;;mvs;91;10;;tbl;210;78;;mlu;114;94;;mlu;114;140;;mlu;110;96 ;;;;spl;103;8;;yli;263;204;;mmr;104;106;;mmr;104;152;;mmr;105;107 ;;;;;;;;;;;;mmu;188;234;;mmu;188;289;;mmu;185;230 ;;;;;;;;;;;;mpu;125;324;;mpu;125;374;;mpu;124;582 ;;;;;;;;;;;;mtr;328;259;;mtr;328;316;;mtr;319;308 ;;;;;;;;;;;;mun;65;100;;mun;65;147;;mun;52;102 ;;;;;;;;;;;;nle;126;319;;nle;126;375;;nle;125;327 ;;;;;;;;;;;;oaa;278;492;;oaa;278;546;;oaa;276;529 ;;;;;;;;;;;;oas;77;359;;oas;77;414;;oas;79;1045 ;;;;;;;;;;;;ocu;218;234;;ocu;218;284;;ocu;225;231 ;;;;;;;;;;;;oga;123;149;;oga;123;199;;oga;124;153 ;;;;;;;;;;;;oni;274;352;;oni;274;402;;oni;273;351 ;;;;;;;;;;;;opr;159;142;;opr;159;188;;opr;150;142 ;;;;;;;;;;;;osa;420;267;;osa;420;319;;osa;438;260 ;;;;;;;;;;;;pan;180;304;;pan;180;360;;pan;174;301 ;;;;;;;;;;;;pfa;0;1;;pfa;0;35;;pfa;0;1 ;;;;;;;;;;;;pha;154;205;;pha;154;258;;pha;156;203 ;;;;;;;;;;;;pma;742;765;;pma;742;820;;pma;1401;1032 ;;;;;;;;;;;;pop;377;225;;pop;377;277;;pop;387;208 ;;;;;;;;;;;;ppp;250;133;;ppp;250;186;;ppp;249;128 ;;;;;;;;;;;;ppy;172;378;;ppy;172;435;;ppy;175;381 ;;;;;;;;;;;;ptr;164;389;;ptr;164;449;;ptr;161;392 ;;;;;;;;;;;;rno;161;201;;rno;161;250;;rno;160;198 ;;;;;;;;;;;;san;147;175;;san;147;223;;san;146;181 ;;;;;;;;;;;;sbi;330;243;;sbi;330;300;;sbi;334;237 ;;;;;;;;;;;;sbq;115;216;;sbq;115;269;;sbq;117;226 ;;;;;;;;;;;;shr;223;179;;shr;223;226;;shr;230;171 ;;;;;;;;;;;;spu;523;381;;spu;523;427;;spu;639;381 ;;;;;;;;;;;;ssc;253;258;;ssc;253;308;;ssc;236;522 ;;;;;;;;;;;;str;152;342;;str;152;398;;str;146;602 ;;;;;;;;;;;;tgu;83;147;;tgu;83;200;;tgu;78;148 ;;;;;;;;;;;;tma;119;473;;tma;119;530;;tma;111;1851 ;;;;;;;;;;;;tng;210;335;;tng;210;387;;tng;205;357 ;;;;;;;;;;;;tru;273;291;;tru;273;342;;tru;271;294 ;;;;;;;;;;;;tsy;134;227;;tsy;134;279;;tsy;135;271 ;;;;;;;;;;;;ttr;170;466;;ttr;170;522;;ttr;231;5586 ;;;;;;;;;;;;vvi;232;289;;vvi;232;346;;vvi;236;290 ;;;;;;;;;;;;xtr;848;763;;xtr;848;820;;xtr;1588;997 ;;;;;;;;;;;;zma;572;412;;zma;572;465;;zma;601;548 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;-0.26;−;;;0.00;−;;;0.14;−;;;0.46;−;;;0.46;−;;;0.58;− ;51;80;;;1673;538;;;4179;2781;;;18969;22508;;;18969;26546;;;24801;56149 ;0.6375;;;;3.11;;;;1.50;;;;0.84;;;;0.71;;;;0.44;
Distribution des fréquences des champignons C42 et des 79 eucaryotes E79
[modifier | modifier le wikicode]Distribution des simples des eucaryotes E79
[modifier | modifier le wikicode]- Lien tableaux: Distribution des simples des eucaryotes E79.
- Légende:
Simples 79;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;Lys;Asn;Lys;Asn;Thr;Thr;Thr;Thr;Arg;Ser;Arg;Ser;Ile;Ile;Met;Ile;Gln;His;Gln;His;Pro;Pro;Pro;Pro;Arg;Arg;Arg;Arg;Leu;Leu;Leu;Leu;Glu;Asp;Glu;Asp;Ala;Ala;Ala;Ala;Gly;Gly;Gly;Gly;Val;Val;Val;Val;Stp;Tyr;Stp;Tyr;Ser;Ser;Ser;Ser;SeC;Cys;Trp;Cys;Leu;Phe;Leu;Phe ;aaa;aac;aag;aat;aca;acc;acg;act;aga;agc;agg;agt;ata;atc;atg;att;caa;cac;cag;cat;cca;ccc;ccg;cct;cga;cgc;cgg;cgt;cta;ctc;ctg;ctt;gaa;gac;gag;gat;gca;gcc;gcg;gct;gga;ggc;ggg;ggt;gta;gtc;gtg;gtt;taa;tac;tag;tat;tca;tcc;tcg;tct;tga;tgc;tgg;tgt;tta;ttc;ttg;ttt acs;3;4;3;0;2;0;1;3;3;3;3;0;1;0;8;2;3;2;3;0;1;1;1;1;3;0;1;2;3;0;2;2;2;2;4;0;6;0;3;6;3;2;1;0;2;0;1;3;0;6;0;0;1;0;2;1;1;4;4;0;2;1;1;0 aga;5;2;2;0;1;0;3;1;2;2;2;0;2;0;5;2;2;5;6;0;2;0;6;5;4;0;0;1;2;0;2;2;3;2;3;0;2;0;2;4;1;1;0;0;1;0;8;7;1;21;0;0;1;0;1;2;0;1;1;0;5;1;4;0 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Distribution des simples des champignons C42
[modifier | modifier le wikicode]- Lien tableaux: Distribution des simples des champignons C42.
- Légende:
Simples 42;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;Lys;Asn;Lys;Asn;Thr;Thr;Thr;Thr;Arg;Ser;Arg;Ser;Ile;Ile;Met;Ile;Gln;His;Gln;His;Pro;Pro;Pro;Pro;Arg;Arg;Arg;Arg;Leu;Leu;Leu;Leu;Glu;Asp;Glu;Asp;Ala;Ala;Ala;Ala;Gly;Gly;Gly;Gly;Val;Val;Val;Val;Stp;Tyr;Stp;Tyr;Ser;Ser;Ser;Ser;SeC;Cys;Trp;Cys;Leu;Phe;Leu;Phe ;aaa;aac;aag;aat;aca;acc;acg;act;aga;agc;agg;agt;ata;atc;atg;att;caa;cac;cag;cat;cca;ccc;ccg;cct;cga;cgc;cgg;cgt;cta;ctc;ctg;ctt;gaa;gac;gag;gat;gca;gcc;gcg;gct;gga;ggc;ggg;ggt;gta;gtc;gtg;gtt;taa;tac;tag;tat;tca;tcc;tcg;tct;tga;tgc;tgg;tgt;tta;ttc;ttg;ttt ani;2;6;1;0;2;0;2;2;1;4;2;0;1;0;5;5;2;2;4;0;2;0;2;5;2;0;2;3;2;0;3;6;3;6;3;0;2;0;1;1;3;1;1;0;1;0;2;2;0;5;0;0;1;0;2;1;0;2;1;0;1;3;2;0 aor;3;4;3;0;2;0;2;2;2;5;2;0;2;0;8;5;3;7;4;0;3;0;0;6;1;0;3;2;1;0;4;0;5;8;3;0;2;0;3;2;2;1;1;0;2;1;3;2;0;11;0;1;1;0;3;3;0;4;1;1;3;6;0;0 bfu;3;5;9;0;3;0;0;4;5;5;1;0;1;0;5;8;4;4;2;0;8;0;1;4;3;0;2;5;1;0;1;5;6;6;9;0;5;0;2;1;4;8;2;1;2;0;2;8;0;5;0;0;3;0;2;1;0;5;2;0;2;5;5;0 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Distribution des doublons des eucaryotes E79
[modifier | modifier le wikicode]- Lien tableaux: Distribution des doublons des eucaryotes E79.
- Légende:
Doublons 79;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;Lys;Asn;Lys;Asn;Thr;Thr;Thr;Thr;Arg;Ser;Arg;Ser;Ile;Ile;Met;Ile;Gln;His;Gln;His;Pro;Pro;Pro;Pro;Arg;Arg;Arg;Arg;Leu;Leu;Leu;Leu;Glu;Asp;Glu;Asp;Ala;Ala;Ala;Ala;Gly;Gly;Gly;Gly;Val;Val;Val;Val;Stp;Tyr;Stp;Tyr;Ser;Ser;Ser;Ser;SeC;Cys;Trp;Cys;Leu;Phe;Leu;Phe ;aaa;aac;aag;aat;aca;acc;acg;act;aga;agc;agg;agt;ata;atc;atg;att;caa;cac;cag;cat;cca;ccc;ccg;cct;cga;cgc;cgg;cgt;cta;ctc;ctg;ctt;gaa;gac;gag;gat;gca;gcc;gcg;gct;gga;ggc;ggg;ggt;gta;gtc;gtg;gtt;taa;tac;tag;tat;tca;tcc;tcg;tct;tga;tgc;tgg;tgt;tta;ttc;ttg;ttt acs;2;6;3;0;1;0;0;1;0;2;0;0;0;0;4;4;0;3;2;0;2;0;1;2;0;0;0;2;0;0;2;2;5;6;1;0;0;0;0;6;5;5;1;0;0;0;2;2;0;0;0;0;0;0;0;4;0;8;3;0;0;4;1;0 aga;3;10;15;0;1;0;3;7;0;4;0;0;0;0;13;10;2;16;5;0;6;0;7;2;4;0;0;9;1;0;8;3;8;18;12;0;1;0;4;13;7;14;0;0;2;0;21;24;0;1;0;0;1;0;7;4;0;4;5;0;1;8;0;0 aml;5;10;12;0;1;0;0;4;0;3;1;0;0;0;11;7;1;7;4;0;3;0;3;7;2;0;2;5;0;0;2;2;4;5;3;0;2;0;1;3;3;8;2;0;0;0;7;8;0;1;0;0;0;0;0;6;0;13;3;0;1;8;2;0 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Distribution des doublons des champignons C42
[modifier | modifier le wikicode]- Lien tableaux: Distribution des doublons des champignons C42.
Légende:
Doublons 42;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;Lys;Asn;Lys;Asn;Thr;Thr;Thr;Thr;Arg;Ser;Arg;Ser;Ile;Ile;Met;Ile;Gln;His;Gln;His;Pro;Pro;Pro;Pro;Arg;Arg;Arg;Arg;Leu;Leu;Leu;Leu;Glu;Asp;Glu;Asp;Ala;Ala;Ala;Ala;Gly;Gly;Gly;Gly;Val;Val;Val;Val;Stp;Tyr;Stp;Tyr;Ser;Ser;Ser;Ser;SeC;Cys;Trp;Cys;Leu;Phe;Leu;Phe ;aaa;aac;aag;aat;aca;acc;acg;act;aga;agc;agg;agt;ata;atc;atg;att;caa;cac;cag;cat;cca;ccc;ccg;cct;cga;cgc;cgg;cgt;cta;ctc;ctg;ctt;gaa;gac;gag;gat;gca;gcc;gcg;gct;gga;ggc;ggg;ggt;gta;gtc;gtg;gtt;taa;tac;tag;tat;tca;tcc;tcg;tct;tga;tgc;tgg;tgt;tta;ttc;ttg;ttt ani;0;0;7;0;0;0;0;4;1;0;0;0;0;0;2;2;0;3;1;0;0;0;0;1;0;0;0;6;0;0;0;0;0;2;5;0;0;0;2;7;0;10;0;0;0;0;0;6;0;1;0;0;0;0;0;4;0;1;2;0;0;2;0;0 aor;0;4;8;0;0;0;0;8;0;1;0;0;0;0;0;5;1;1;3;0;0;0;0;3;1;0;0;10;0;0;0;0;1;5;8;0;1;0;1;8;2;14;0;0;0;0;0;8;0;2;0;0;0;0;0;4;0;0;3;0;0;1;0;0 bfu;0;1;1;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;3;0;2;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;0;0;0;1;0;3;0;0;0;0;0;7;3;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;0;0;6;0;0;4;0;0;2;0;0 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Tableaux pour les diagrammes des simples, E79-C42
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Tableaux pour les diagrammes des doublons, E79-C42
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- Légende:
;Phe;;Leu;;;;Leu;;;;;;Ile;;;;Met;;Val;;;;;;;;Ser;;;;;;Pro;;;;;;Thr;;;;;;Ala;;;;;;;;Tyr;;Stp;;;;His;;Gln;;;;Asn;;Lys;;;;Asp;;Glu;;;;;;Cys;;SeC;;Trp;;Arg;;;;;;Ser;;Arg;;;;Gly;;;;; critère;d79-ttc;d42-ttc;d79-tta;d42-tta;d79-ttg;d42-ttg;d79-ctt;d42-ctt;d79-cta;d42-cta;d79-ctg;d42-ctg;d79-att;d42-att;d79-ata;d42-ata;d79-atg;d42-atg;d79-gtt;d42-gtt;d79-gta;d42-gta;d79-gtg;d42-gtg;;critère;d79-tct;d42-tct;d79-tca;d42-tca;d79-tcg;d42-tcg;d79-cct;d42-cct;d79-cca;d42-cca;d79-ccg;d42-ccg;d79-act;d42-act;d79-aca;d42-aca;d79-acg;d42-acg;d79-gct;d42-gct;d79-gca;d42-gca;d79-gcg;d42-gcg;;critère;d79-tac;d42-tac;d79-taa;d42-taa;d79-tag;d42-tag;d79-cac;d42-cac;d79-caa;d42-caa;d79-cag;d42-cag;d79-aac;d42-aac;d79-aaa;d42-aaa;d79-aag;d42-aag;d79-gac;d42-gac;d79-gaa;d42-gaa;d79-gag;d42-gag;;critère;d79-tgc;d42-tgc;d79-tga;d42-tga;d79-tgg;d42-tgg;d79-cgt;d42-cgt;d79-cga;d42-cga;d79-cgg;d42-cgg;d79-agc;d42-agc;d79-aga;d42-aga;d79-agg;d42-agg;d79-ggc;d42-ggc;d79-gga;d42-gga;d79-ggg;d42-ggg 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Les indices de multiplicité dans les 3 domaines
[modifier | modifier le wikicode]Multiplicité Tableau I
[modifier | modifier le wikicode]- Lien tableaux: Multiplicité Tableau I.
- Légende:
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Multiplicité Tableau II
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- Légende:
Archées;nombres;;184;;;;;;methanococci;;nombres;;16;;;;;alpha bactéries;;Nombres;;354;;;;;cyanobactéries;;Nombres;;83;;; ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;2;tgt;0;;ttt;2;tct;0;tat;0;tgt;0 att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;1;act;1;aat;3;agt;0 ctt;1;cct;0;cat;0;cgt;2;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0;;ctt;1;cct;1;cat;0;cgc;0;;ctt;14;cct;0;cat;2;cgc;1 gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;1;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;0;gct;1;gat;0;ggt;0 ttc;215;tcc;190;tac;190;tgc;299;;ttc;16;tcc;16;tac;16;tgc;16;;ttc;362;tcc;343;tac;354;tgc;358;;ttc;99;tcc;85;tac;101;tgc;94 atc;212;acc;189;aac;214;agc;187;;atc;16;acc;16;aac;16;agc;16;;atc;827;acc;360;aac;379;agc;345;;atc;161;acc;88;aac;97;agc;94 ctc;214;ccc;171;cac;185;cgc;187;;ctc;16;ccc;15;cac;16;cgc;16;;ctc;389;ccc;277;cac;348;cgt;368;;ctc;77;ccc;83;cac;91;cgt;91 gtc;212;gcc;184;gac;218;ggc;243;;gtc;16;gcc;16;gac;25;ggc;16;;gtc;356;gcc;332;gac;511;ggc;448;;gtc;84;gcc;85;gac;100;ggc;92 tta;191;tca;184;taa;0;tga;18;;tta;16;tca;16;taa;0;tga;16;;tta;321;tca;345;taa;1;tga;32;;tta;69;tca;93;taa;2;tga;0 ata;2;aca;198;aaa;197;aga;186;;ata;0;aca;16;aaa;25;aga;16;;ata;4;aca;353;aaa;354;aga;345;;ata;2;aca;96;aaa;97;aga;93 cta;185;cca;184;caa;196;cga;185;;cta;16;cca;16;caa;16;cga;17;;cta;349;cca;354;caa;377;cga;30;;cta;97;cca;97;caa;94;cga;2 gta;186;gca;256;gaa;230;gga;189;;gta;17;gca;22;gaa;32;gga;17;;gta;358;gca;814;gaa;471;gga;351;;gta;90;gca;228;gaa;97;gga;91 ttg;163;tcg;152;tag;1;tgg;184;;ttg;0;tcg;0;tag;0;tgg;16;;ttg;298;tcg;268;tag;0;tgg;347;;ttg;91;tcg;87;tag;2;tgg;91 atg;589;acg;169;aag;166;agg;165;;atg;56;acg;1;aag;0;agg;0;;atg;1536;acg;305;aag;263;agg;250;;atg;264;acg;84;aag;31;agg;64 ctg;160;ccg;151;cag;165;cgg;139;;ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;0;;ctg;307;ccg;239;cag;221;cgg;358;;ctg;76;ccg;69;cag;11;cgg;83 gtg;170;gcg;159;gag;160;ggg;155;;gtg;7;gcg;0;gag;0;ggg;0;;gtg;196;gcg;196;gag;178;ggg;234;;gtg;35;gcg;68;gag;7;ggg;63 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; Archées;Indices;;184;;;;;;methanococci;;Indices;;16;;;;;alpha bactéries;;Indices;;354;;;;;cyanobactéries;;Indices;;83;;; ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0.6;tgt;0;;ttt;2.4;tct;0;tat;0;tgt;0 att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;1.2;act;1.2;aat;3.6;agt;0 ctt;0.5;cct;0;cat;0;cgt;1.1;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0;;ctt;0.3;cct;0.3;cat;0;cgc;0;;ctt;17;cct;0;cat;2.4;cgc;1.2 gtt;0.5;gct;0;gat;0;ggt;0.5;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;0;gct;1.2;gat;0;ggt;0 ttc;117;tcc;103;tac;103;tgc;163;;ttc;100;tcc;100;tac;100;tgc;100;;ttc;102;tcc;97;tac;100;tgc;101;;ttc;119;tcc;102;tac;122;tgc;113 atc;115;acc;103;aac;116;agc;102;;atc;100;acc;100;aac;100;agc;100;;atc;234;acc;102;aac;107;agc;97;;atc;194;acc;106;aac;117;agc;113 ctc;116;ccc;93;cac;101;cgc;102;;ctc;100;ccc;94;cac;100;cgc;100;;ctc;110;ccc;78;cac;98;cgt;104;;ctc;93;ccc;100;cac;110;cgt;110 gtc;115;gcc;100;gac;118;ggc;132;;gtc;100;gcc;100;gac;156;ggc;100;;gtc;101;gcc;94;gac;144;ggc;127;;gtc;101;gcc;102;gac;120;ggc;111 tta;104;tca;100;taa;0;tga;10;;tta;100;tca;100;taa;0;tga;100;;tta;91;tca;97;taa;0.3;tga;9.0;;tta;83;tca;112;taa;2.4;tga;0 ata;1.1;aca;108;aaa;107;aga;101;;ata;0;aca;100;aaa;156;aga;100;;ata;1.1;aca;100;aaa;100;aga;97;;ata;2.4;aca;116;aaa;117;aga;112 cta;101;cca;100;caa;107;cga;101;;cta;100;cca;100;caa;100;cga;106;;cta;99;cca;100;caa;106;cga;8.5;;cta;117;cca;117;caa;113;cga;2.4 gta;101;gca;139;gaa;125;gga;103;;gta;106;gca;138;gaa;200;gga;106;;gta;101;gca;230;gaa;133;gga;99;;gta;108;gca;275;gaa;117;gga;110 ttg;89;tcg;83;tag;0.5;tgg;100;;ttg;0;tcg;0;tag;0;tgg;100;;ttg;84;tcg;76;tag;0;tgg;98;;ttg;110;tcg;105;tag;2.4;tgg;110 atg;320;acg;92;aag;90;agg;90;;atg;350;acg;6.3;aag;0;agg;0;;atg;434;acg;86;aag;74;agg;71;;atg;318;acg;101;aag;37;agg;77 ctg;87;ccg;82;cag;90;cgg;76;;ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;0;;ctg;87;ccg;68;cag;62;cgg;101;;ctg;92;ccg;83;cag;13;cgg;100 gtg;92;gcg;86;gag;87;ggg;84;;gtg;44;gcg;0;gag;0;ggg;0;;gtg;55;gcg;55;gag;50;ggg;66;;gtg;42;gcg;82;gag;8.4;ggg;76
Multiplicité Tableau III
[modifier | modifier le wikicode]- Lien tableaux: Multiplicité Tableau III.
- Légende:
26.5.20 Tanger;;tRNAs total des actino;;;;; ;;;;;;; genomes;;total;;atgf;atgi;5s;cds 434;;21937;;587;450;; ttt;2;tct;1;tat;1;tgt;1 att;0;act;3;aat;0;agt;1 ctt;4;cct;2;cat;4;cgc;6 gtt;1;gct;1;gat;4;ggt;1 ttc;460;tcc;435;tac;451;tgc;510 atc;453;acc;480;aac;546;agc;450 ctc;489;ccc;462;cac;436;cgt;570 gtc;628;gcc;561;gac;598;ggc;798 tta;434;tca;434;taa;0;tga;82 ata;5;aca;432;aaa;452;aga;446 cta;433;cca;432;caa;429;cga;6 gta;427;gca;518;gaa;437;gga;470 ttg;455;tcg;543;tag;4;tgg;471 atgj;444;acg;453;aag;549;agg;450 ctg;436;ccg;428;cag;476;cgg;457 gtg;496;gcg;372;gag;619;ggg;451 ;;;;;;; ;;;;;;; genomes;;total;;atgf;atgi;5s;cds 100;;5055;;135;104;; ttt;0;tct;0,2;tat;0;tgt;0,2 att;0;act;0,7;aat;0;agt;0,2 ctt;0,9;cct;0,5;cat;0,9;cgc;1,4 gtt;0,2;gct;0,2;gat;0,9;ggt;0,2 ttc;106;tcc;100;tac;104;tgc;118 atc;104;acc;111;aac;126;agc;104 ctc;113;ccc;106;cac;100;cgt;131 gtc;145;gcc;129;gac;138;ggc;184 tta;100;tca;100;taa;0;tga;19 ata;1,2;aca;100;aaa;104;aga;103 cta;100;cca;100;caa;99;cga;1,4 gta;98;gca;119;gaa;101;gga;108 ttg;105;tcg;125;tag;0,9;tgg;109 atgj;102;acg;104;aag;126;agg;104 ctg;100;ccg;99;cag;110;cgg;105 gtg;114;gcg;86;gag;143;ggg;104 ;;;;;;; ;;;;;;; ;;;;;;; 27.5.20 Tanger;;tRNAs total des clostridia;;;;; ;;;;;;; genomes;;total;;atgf;atgi;5s;cds 174;;11144;;326;277;; ttt;7;tct;2;tat;0;tgt;1 att;2;act;0;aat;0;agt;1 ctt;27;cct;4;cat;0;cgc;0 gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;0 ttc;358;tcc;179;tac;326;tgc;263 atc;264;acc;178;aac;431;agc;232 ctc;141;ccc;108;cac;243;cgt;202 gtc;92;gcc;106;gac;421;ggc;383 tta;300;tca;247;taa;2;tga;95 ata;5;aca;380;aaa;472;aga;303 cta;257;cca;283;caa;272;cga;83 gta;498;gca;381;gaa;415;gga;422 ttg;188;tcg;144;tag;4;tgg;209 atgj;230;acg;134;aag;208;agg;167 ctg;133;ccg;111;cag;134;cgg;105 gtg;60;gcg;61;gag;144;ggg;122 ;;;;;;; genomes;;total;;atgf;atgi;5s;cds 100;;6405;;187;159;; ttt;4,0;tct;1,1;tat;0;tgt;0,6 att;1,1;act;0;aat;0;agt;0,6 ctt;15,5;cct;2,3;cat;0;cgc;0 gtt;0,6;gct;0;gat;0;ggt;0 ttc;206;tcc;103;tac;187;tgc;151 atc;152;acc;102;aac;248;agc;133 ctc;81;ccc;62;cac;140;cgt;116 gtc;53;gcc;61;gac;242;ggc;220 tta;172;tca;142;taa;1,1;tga;55 ata;2,9;aca;218;aaa;271;aga;174 cta;148;cca;163;caa;156;cga;48 gta;286;gca;219;gaa;239;gga;243 ttg;108;tcg;83;tag;2,3;tgg;120 atgj;132;acg;77;aag;120;agg;96 ctg;76;ccg;64;cag;77;cgg;60 gtg;34;gcg;35;gag;83;ggg;70 ;;;;;;; ;;;;;;; 27.5.20 Tanger;;tRNAs total des gamma;;;;; genomes;;total;;atgf;atgi;5s;cds 1183;;86713;;3454;1540;; ttt;18;tct;20;tat;15;tgt;2 att;1;act;6;aat;2;agt;0 ctt;11;cct;1;cat;3;cgc;0 gtt;6;gct;0;gat;0;ggt;6 ttc;2075;tcc;1795;tac;2687;tgc;1345 atc;3369;acc;1829;aac;3679;agc;1256 ctc;1204;ccc;1012;cac;1362;cgt;3520 gtc;2046;gcc;1973;gac;3421;ggc;4151 tta;1422;tca;1662;taa;12;tga;762 ata;10;aca;1666;aaa;4457;aga;1784 cta;1516;cca;1671;caa;2239;cga;156 gta;3798;gca;3342;gaa;3829;gga;1347 ttg;1214;tcg;984;tag;32;tgg;1340 atgj;2015;acg;845;aag;282;agg;1298 ctg;2977;ccg;729;cag;1208;cgg;1182 gtg;98;gcg;82;gag;90;ggg;855 ;;;;;;; genomes;;total;;atgf;atgi;5s;cds 100;;7330;;292;130;; ttt;1,5;tct;1,7;tat;1,3;tgt;0 att;0,1;act;0,5;aat;0,2;agt;0 ctt;0,9;cct;0;cat;0;cgc;0 gtt;0,5;gct;0;gat;0;ggt;0,5 ttc;175;tcc;152;tac;227;tgc;114 atc;285;acc;155;aac;311;agc;106 ctc;102;ccc;86;cac;115;cgt;298 gtc;173;gcc;167;gac;289;ggc;351 tta;120;tca;140;taa;1,0;tga;64 ata;0,8;aca;141;aaa;377;aga;151 cta;128;cca;141;caa;189;cga;13 gta;321;gca;283;gaa;324;gga;114 ttg;103;tcg;83;tag;2,7;tgg;113 atgj;170;acg;71;aag;24;agg;110 ctg;252;ccg;62;cag;102;cgg;100 gtg;8,3;gcg;6,9;gag;7,6;ggg;72 ;;;;;;; ;;;;;;; 27.5.20 Tanger;;tRNAs total des bacteroides;;;;; genomes;;total;;atgf;atgi;5s;cds 146;;7096;;188;153;; ttt;2;tct;1;tat;1;tgt;1 att;1;act;0;aat;0;agt;0 ctt;1;cct;2;cat;0;cgc;2 gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;1 ttc;188;tcc;143;tac;222;tgc;174 atc;430;acc;149;aac;190;agc;161 ctc;144;ccc;84;cac;167;cgt;195 gtc;51;gcc;121;gac;252;ggc;221 tta;164;tca;182;taa;9;tga;3 ata;1;aca;235;aaa;271;aga;157 cta;159;cca;218;caa;165;cga;62 gta;269;gca;417;gaa;264;gga;206 ttg;147;tcg;31;tag;1;tgg;171 atgj;166;acg;47;aag;69;agg;99 ctg;72;ccg;44;cag;42;cgg;81 gtg;5;gcg;6;gag;37;ggg;50 ;;;;;;; genomes;;total;;atgf;atgi;5s;cds 100;;4860;;129;105;; ttt;1,4;tct;0,7;tat;0,7;tgt;0,7 att;0,7;act;0;aat;0;agt;0 ctt;0,7;cct;1,4;cat;0;cgc;1,4 gtt;0,7;gct;0;gat;0;ggt;0,7 ttc;129;tcc;98;tac;152;tgc;119 atc;295;acc;102;aac;130;agc;110 ctc;99;ccc;58;cac;114;cgt;134 gtc;35;gcc;83;gac;173;ggc;151 tta;112;tca;125;taa;6,2;tga;2,1 ata;0,7;aca;161;aaa;186;aga;108 cta;109;cca;149;caa;113;cga;42 gta;184;gca;286;gaa;181;gga;141 ttg;101;tcg;21;tag;0,7;tgg;117 atgj;114;acg;32;aag;47;agg;68 ctg;49;ccg;30;cag;29;cgg;55 gtg;3,4;gcg;4,1;gag;25;ggg;34
Multiplicité Tableau IV
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- Légende:
29.5.20 Tanger;;tRNAs total des bacilli;;49599;;; ;;;;;;; genomes;;total;;atgf;atgi;5s;cds 618;;49366;;1762;901;; ttt;1;tct;2;tat;3;tgt;0 att;1;act;71;aat;3;agt;0 ctt;292;cct;4;cat;1;cgc;1 gtt;1;gct;3;gat;0;ggt;0 ttc;1683;tcc;739;tac;1475;tgc;726 atc;1915;acc;567;aac;2337;agc;980 ctc;464;ccc;38;cac;1152;cgt;1779 gtc;328;gcc;185;gac;2384;ggc;1913 tta;1301;tca;1506;taa;7;tga;11 ata;13;aca;1818;aaa;2100;aga;736 cta;1227;cca;1501;caa;1846;cga;39 gta;2451;gca;2740;gaa;2895;gga;1884 ttg;770;tcg;292;tag;5;tgg;847 atgj;941;acg;293;aag;452;agg;446 ctg;372;ccg;115;cag;105;cgg;672 gtg;5;gcg;53;gag;98;ggg;114 ;;;;;;; genomes;;total;;atgf;atgi;5s;cds 100;;7988;;285;146;; ttt;0,2;tct;0,3;tat;0,5;tgt;0 att;0,2;act;11;aat;0,5;agt;0 ctt;47;cct;0,6;cat;0,2;cgc;0,2 gtt;0,2;gct;0,5;gat;0;ggt;0 ttc;272;tcc;120;tac;239;tgc;117 atc;310;acc;92;aac;378;agc;159 ctc;75;ccc;6,1;cac;186;cgt;288 gtc;53;gcc;30;gac;386;ggc;310 tta;211;tca;244;taa;1,1;tga;1,8 ata;2,1;aca;294;aaa;340;aga;119 cta;199;cca;243;caa;299;cga;6,3 gta;397;gca;443;gaa;468;gga;305 ttg;125;tcg;47;tag;0,8;tgg;137 atgj;152;acg;47;aag;73;agg;72 ctg;60;ccg;19;cag;17;cgg;109 gtg;0,8;gcg;8,6;gag;16;ggg;18 ;;;;;;; ;;;;;;; ;;;;;;; ;;;;;;; 30.5.20 Tanger;;tRNAs total des alpha;;17165;;; ;;;;;;; genomes;;total;;atgf;atgi;5s;cds 347;;16935;;820;368;; ttt;2;tct;0;tat;3;tgt;1 att;0;act;1;aat;0;agt;0 ctt;4;cct;1;cat;0;cgc;1 gtt;0;gct;0;gat;2;ggt;0 ttc;378;tcc;351;tac;361;tgc;363 atc;838;acc;375;aac;384;agc;349 ctc;401;ccc;283;cac;353;cgt;387 gtc;363;gcc;337;gac;519;ggc;460 tta;327;tca;353;taa;4;tga;36 ata;6;aca;370;aaa;367;aga;356 cta;356;cca;360;caa;391;cga;32 gta;366;gca;829;gaa;489;gga;360 ttg;317;tcg;309;tag;1;tgg;355 atgj;403;acg;315;aag;278;agg;261 ctg;312;ccg;245;cag;225;cgg;370 gtg;203;gcg;203;gag;187;ggg;244 ;;;;;;; genomes;;total;;atgf;atgi;5s;cds 100;;4880;;236;106;; ttt;0,6;tct;0;tat;0,9;tgt;0,3 att;0;act;0,3;aat;0;agt;0 ctt;1,2;cct;0,3;cat;0;cgc;0,3 gtt;0;gct;0;gat;0,6;ggt;0 ttc;109;tcc;101;tac;104;tgc;105 atc;241;acc;108;aac;111;agc;101 ctc;116;ccc;82;cac;102;cgt;112 gtc;105;gcc;97;gac;150;ggc;133 tta;94;tca;102;taa;1,2;tga;10 ata;1,7;aca;107;aaa;106;aga;103 cta;103;cca;104;caa;113;cga;9,2 gta;105;gca;239;gaa;141;gga;104 ttg;91;tcg;89;tag;0,3;tgg;102 atgj;116;acg;91;aag;80;agg;75 ctg;90;ccg;71;cag;65;cgg;107 gtg;59;gcg;59;gag;54;ggg;70
Multiplicité Tableau V
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- Légende:
tener;effectifs;;10.1.21;ttt 1;3535;génomes;112;;spiro;effectifs;;11.1.21;ttt ;2823;génomes;73;;cyano;;ttt;3;nombres;25.11.20;84;3956 atgi;97;tct;;tat;;atgf;107;;atgi;70;tct;;tat;;atgf;70;;atgi;88;tct;0;tat;0;atgf;82 att;1;act;22;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;6;act;2;aat;3;agt;0 ctt;15;cct;;cat;;cgc;43;;ctt;;cct;;cat;;cgc;66;;ctt;14;cct;2;cat;2;cgc;1 gtt;;gct;;gat;;ggt;1;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;0;gct;1;gat;0;ggt;0 ttc;116;tcc;45;tac;112;tgc;111;;ttc;91;tcc;73;tac;73;tgc;73;;ttc;103;tcc;86;tac;99;tgc;95 atc;115;acc;80;aac;116;agc;111;;atc;73;acc;73;aac;73;agc;73;;atc;164;acc;89;aac;98;agc;96 ctc;36;ccc;;cac;112;cgt;81;;ctc;75;ccc;40;cac;73;cgt;9;;ctc;79;ccc;85;cac;92;cgt;93 gtc;2;gcc;1;gac;114;ggc;63;;gtc;40;gcc;43;gac;78;ggc;75;;gtc;86;gcc;91;gac;100;ggc;91 tta;110;tca;112;taa;;tga;101;;tta;73;tca;73;taa;;tga;12;;tta;70;tca;96;taa;2;tga;0 ata;10;aca;115;aaa;136;aga;115;;ata;1;aca;73;aaa;73;aga;74;;ata;8;aca;96;aaa;97;aga;96 cta;112;cca;111;caa;115;cga;42;;cta;73;cca;73;caa;73;cga;67;;cta;99;cca;109;caa;96;cga;2 gta;118;gca;116;gaa;117;gga;114;;gta;74;gca;83;gaa;60;gga;73;;gta;93;gca;162;gaa;99;gga;93 ttg;110;tcg;37;tag;;tgg;112;;ttg;73;tcg;30;tag;;tgg;73;;ttg;100;tcg;95;tag;2;tgg;92 atgj;105;acg;28;aag;69;agg;25;;atgj;71;acg;42;aag;57;agg;48;;atgj;99;acg;86;aag;32;agg;65 ctg;;ccg;;cag;;cgg;3;;ctg;38;ccg;31;cag;31;cgg;34;;ctg;77;ccg;71;cag;11;cgg;84 gtg;;gcg;;gag;;ggg;1;;gtg;25;gcg;30;gag;29;ggg;15;;gtg;36;gcg;69;gag;7;ggg;64 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; tener;indices;;10.1.21;ttt 1;;génomes;112;;spiro;indices;;11.1.21;ttt ;;génomes;73;;cyano;;ttt;3.6;;indices;25.11.20;84 atgi;87;tct;;tat;;atgf;96;;atgi;96;tct;;tat;;atgf;96;;atgi;105;tct;;tat;;atgf;98 att;1;act;20;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;7.1;act;2.4;aat;3.6;agt; ctt;13;cct;;cat;;cgc;38;;ctt;;cct;;cat;;cgc;90;;ctt;17;cct;2.4;cat;2.4;cgc;1.2 gtt;;gct;;gat;;ggt;1;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;1.2;gat;;ggt; ttc;104;tcc;40;tac;100;tgc;99;;ttc;125;tcc;100;tac;100;tgc;100;;ttc;123;tcc;102;tac;118;tgc;113 atc;103;acc;71;aac;104;agc;99;;atc;100;acc;100;aac;100;agc;100;;atc;195;acc;106;aac;117;agc;114 ctc;32;ccc;;cac;100;cgt;72;;ctc;103;ccc;55;cac;100;cgt;12;;ctc;94;ccc;101;cac;110;cgt;111 gtc;2;gcc;1;gac;102;ggc;56;;gtc;55;gcc;59;gac;107;ggc;103;;gtc;102;gcc;108;gac;119;ggc;108 tta;98;tca;100;taa;;tga;90;;tta;100;tca;100;taa;;tga;16;;tta;83;tca;114;taa;2.4;tga; ata;9;aca;103;aaa;121;aga;103;;ata;1;aca;100;aaa;100;aga;101;;ata;9.5;aca;114;aaa;115;aga;114 cta;100;cca;99;caa;103;cga;38;;cta;100;cca;100;caa;100;cga;92;;cta;118;cca;130;caa;114;cga;2.4 gta;105;gca;104;gaa;104;gga;102;;gta;101;gca;114;gaa;82;gga;100;;gta;111;gca;193;gaa;118;gga;111 ttg;98;tcg;33;tag;;tgg;100;;ttg;100;tcg;41;tag;;tgg;100;;ttg;119;tcg;113;tag;2.4;tgg;110 atgj;94;acg;25;aag;62;agg;22;;atgj;97;acg;58;aag;78;agg;66;;atgj;118;acg;102;aag;38;agg;77 ctg;;ccg;;cag;;cgg;3;;ctg;52;ccg;42;cag;42;cgg;47;;ctg;92;ccg;85;cag;13;cgg;100 gtg;;gcg;;gag;;ggg;1;;gtg;34;gcg;41;gag;40;ggg;21;;gtg;43;gcg;82;gag;8.3;ggg;76
Multiplicité Tableau VI
[modifier | modifier le wikicode]- Lien tableaux: Multiplicité Tableau VI.
- Légende:
beta;effectifs;;11.1.21;ttt 14;15707;génomes;268;;epsilon;effectifs;;11.1.21;ttt ;6531;génomes;161;;delta;effectifs;ttt 1;11.1.21;;3550;genomes;65 atgi;264;tct;1;tat;;atgf;474;;atgi;159;tct;;tat;1;atgf;170;;atgi;63;tct;;tat;;atgf;97 att;3;act;2;aat;1;agt;1;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt; ctt;6;cct;;cat;;cgc;2;;ctt;;cct;;cat;;cgc;156;;ctt;1;cct;;cat;;cgc;6 gtt;2;gct;;gat;;ggt;;;gtt;2;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt; ttc;289;tcc;272;tac;288;tgc;380;;ttc;172;tcc;156;tac;166;tgc;162;;ttc;79;tcc;71;tac;77;tgc;70 atc;983;acc;273;aac;492;agc;271;;atc;307;acc;159;aac;181;agc;162;;atc;158;acc;77;aac;79;agc;68 ctc;383;ccc;267;cac;291;cgt;502;;ctc;162;ccc;89;cac;161;cgt;0;;ctc;84;ccc;69;cac;72;cgt;87 gtc;403;gcc;331;gac;660;ggc;599;;gtc;157;gcc;153;gac;224;ggc;225;;gtc;65;gcc;85;gac;107;ggc;114 tta;148;tca;266;taa;;tga;161;;tta;167;tca;163;taa;;tga;97;;tta;70;tca;70;taa;2;tga;56 ata;1;aca;306;aaa;325;aga;306;;ata;;aca;174;aaa;241;aga;200;;ata;;aca;66;aaa;77;aga;69 cta;272;cca;366;caa;330;cga;;;cta;162;cca;162;caa;175;cga;161;;cta;70;cca;68;caa;72;cga;42 gta;315;gca;1000;gaa;542;gga;272;;gta;224;gca;320;gaa;278;gga;178;;gta;75;gca;152;gaa;117;gga;68 ttg;274;tcg;297;tag;7;tgg;274;;ttg;163;tcg;1;tag;1;tgg;161;;ttg;82;tcg;69;tag;1;tgg;72 atgj;287;acg;257;aag;275;agg;264;;atgj;158;acg;3;aag;15;agg;154;;atgj;73;acg;64;aag;55;agg;65 ctg;513;ccg;247;cag;2;cgg;286;;ctg;2;ccg;1;cag;1;cgg;2;;ctg;79;ccg;64;cag;57;cgg;60 gtg;242;gcg;211;gag;1;ggg;220;;gtg;;gcg;;gag;40;ggg;3;;gtg;54;gcg;51;gag;40;ggg;61 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; beta;indices;;11.1.21;ttt 5;;génomes;268;;epsilon;indices;;11.1.21;ttt;;génomes;161;;delta;11.1.21;ttt;1.4;;;genomes;65 atgi;99;tct;0.4;tat;;atgf;177;;atgi;99;tct;;tat;0.6;atgf;106;;atgi;97;tct;;tat;;atgf;149 att;1;act;1;aat;0.4;agt;0.4;;att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt; ctt;2;cct;;cat;;cgc;1;;ctt;;cct;;cat;;cgc;97;;ctt;1.5;cct;;cat;;cgc;9 gtt;0.7;gct;;gat;;ggt;;;gtt;1.2;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt; ttc;108;tcc;101;tac;107;tgc;142;;ttc;107;tcc;97;tac;103;tgc;101;;ttc;122;tcc;109;tac;118;tgc;108 atc;367;acc;102;aac;184;agc;101;;atc;191;acc;99;aac;112;agc;101;;atc;243;acc;118;aac;122;agc;105 ctc;143;ccc;100;cac;109;cgt;187;;ctc;101;ccc;55;cac;100;cgt;0;;ctc;129;ccc;106;cac;111;cgt;134 gtc;150;gcc;124;gac;246;ggc;224;;gtc;98;gcc;95;gac;139;ggc;140;;gtc;100;gcc;131;gac;165;ggc;175 tta;55;tca;99;taa;;tga;60;;tta;104;tca;101;taa;;tga;60;;tta;108;tca;108;taa;3.1;tga;86 ata;0;aca;114;aaa;121;aga;114;;ata;;aca;108;aaa;150;aga;124;;ata;;aca;102;aaa;118;aga;106 cta;101;cca;137;caa;123;cga;;;cta;101;cca;101;caa;109;cga;100;;cta;108;cca;105;caa;111;cga;65 gta;118;gca;373;gaa;202;gga;101;;gta;139;gca;199;gaa;173;gga;111;;gta;115;gca;234;gaa;180;gga;105 ttg;102;tcg;111;tag;3;tgg;102;;ttg;101;tcg;0.6;tag;0.6;tgg;100;;ttg;126;tcg;106;tag;1.5;tgg;111 atgj;107;acg;96;aag;103;agg;99;;atgj;98;acg;1.9;aag;9;agg;96;;atgj;112;acg;98;aag;85;agg;100 ctg;191;ccg;92;cag;0.7;cgg;107;;ctg;1.2;ccg;0.6;cag;0.6;cgg;1.2;;ctg;122;ccg;98;cag;88;cgg;92 gtg;90;gcg;79;gag;0.4;ggg;82;;gtg;;gcg;;gag;25;ggg;1.9;;gtg;83;gcg;78;gag;40;ggg;94
Cinq eucaryotes à effectifs élevés
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Cinq eucaryotes à effectifs élevés.
- Légende:
;;;;;;;13732;;;;;;;;; cmkf;différents;;;db,dif;;;10269;;cmkb;double;;db,dif;;;;3402 ttt;2;tct;13;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;12;tat;0;tgt;0 atc;−;act;16;aat;1;agt;−;;atc;0;act;7;aat;0;agt;0 ctt;13;cct;10;cat;0;cgt;4;;ctt;6;cct;1;cat;0;cgt;4 gtt;15;gct;55;gat;5;ggc;6;;gtt;6;gct;19;gat;0;ggc;12 ttc;24;tcc;0;tac;28;tgc;9;;ttc;10;tcc;0;tac;7;tgc;5 att;22;acc;11;aac;31;agc;22;;att;8;acc;0;aac;16;agc;10 ctc;1;ccc;5;cac;26;cgc;−;;ctc;0;ccc;0;cac;10;cgc;0 gtc;15;gcc;164;gac;34;ggt;1;;gtc;0;gcc;3;gac;14;ggt;0 tta;11;tca;50;taa;0;tga;2;;tta;1;tca;3;taa;0;tga;0 ata;18;aca;156;aaa;37;aga;13;;ata;4;aca;49;aaa;5;aga;0 cta;17;cca;43;caa;5;cga;21;;cta;2;cca;7;caa;1;cga;3 gta;115;gca;3008;gaa;58;gga;43;;gta;29;gca;2889;gaa;7;gga;22 ttg;29;tcg;47;tag;3;tgg;19;;ttg;1;tcg;0;tag;0;tgg;10 atg;73;acg;132;aag;24;agg;6;;atg;20;acg;4;aag;11;agg;5 ctg;19;ccg;40;cag;9;cgg;1;;ctg;5;ccg;0;cag;8;cgg;0 gtg;1502;gcg;3757;gag;405;ggg;73;;gtg;37;gcg;100;gag;22;ggg;7 ;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;7113;;;;;;;;; bacuf;;différents;;;db,dif;;6717;;bacub;;double;;db,dif;;;342 ttt;−;tct;6;tat;−;tgt;1;;ttt;0;tct;3;tat;0;tgt;0 atc;0;act;8;aat;−;agt;−;;atc;0;act;4;aat;0;agt;0 ctt;1;cct;1;cat;−;cgt;5;;ctt;4;cct;5;cat;0;cgt;3 gtt;8;gct;17;gat;18;ggc;50;;gtt;5;gct;2;gat;1;ggc;13 ttc;8;tcc;0;tac;13;tgc;18;;ttc;4;tcc;0;tac;0;tgc;5 att;5;acc;−;aac;6;agc;9;;att;6;acc;0;aac;17;agc;3 ctc;−;ccc;−;cac;3;cgc;−;;ctc;0;ccc;0;cac;7;cgc;0 gtc;0;gcc;−;gac;37;ggt;10;;gtc;0;gcc;0;gac;7;ggt;1 tta;11;tca;4;taa;23;tga;16;;tta;1;tca;0;taa;0;tga;0 ata;7;aca;6;aaa;81;aga;54;;ata;0;aca;1;aaa;4;aga;0 cta;3;cca;2;caa;7;cga;7;;cta;0;cca;2;caa;2;cga;1 gta;17;gca;41;gaa;2320;gga;961;;gta;0;gca;0;gaa;47;gga;25 ttg;7;tcg;3;tag;8;tgg;242;;ttg;0;tcg;0;tag;0;tgg;13 atg;12;acg;3;aag;23;agg;66;;atg;8;acg;0;aag;5;agg;0 ctg;3;ccg;1;cag;15;cgg;19;;ctg;3;ccg;2;cag;4;cgg;1 gtg;23;gcg;18;gag;446;ggg;2044;;gtg;8;gcg;1;gag;21;ggg;103 ;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;5873;;;;;;;;; ttrf;;différents;;;db,dif;;5586;;ttrb;;double;;db,dif;;;231 ttt;−;tct;8;tat;0;tgt;4;;ttt;0;tct;3;tat;0;tgt;1 atc;−;act;6;aat;−;agt;−;;atc;0;act;2;aat;0;agt;0 ctt;0;cct;2;cat;−;cgt;4;;ctt;5;cct;4;cat;0;cgt;2 gtt;6;gct;13;gat;9;ggc;36;;gtt;1;gct;5;gat;0;ggc;6 ttc;7;tcc;−;tac;16;tgc;19;;ttc;4;tcc;0;tac;1;tgc;2 att;5;acc;0;aac;5;agc;7;;att;5;acc;0;aac;7;agc;3 ctc;−;ccc;−;cac;4;cgc;0;;ctc;0;ccc;0;cac;4;cgc;0 gtc;2;gcc;1;gac;43;ggt;17;;gtc;0;gcc;0;gac;5;ggt;1 tta;5;tca;5;taa;19;tga;20;;tta;0;tca;0;taa;0;tga;0 ata;4;aca;4;aaa;69;aga;47;;ata;0;aca;1;aaa;4;aga;0 cta;3;cca;2;caa;11;cga;6;;cta;0;cca;2;caa;4;cga;0 gta;15;gca;35;gaa;1871;gga;813;;gta;0;gca;0;gaa;29;gga;19 ttg;6;tcg;3;tag;7;tgg;207;;ttg;0;tcg;0;tag;0;tgg;9 atg;10;acg;2;aag;15;agg;52;;atg;6;acg;0;aag;3;agg;1 ctg;4;ccg;1;cag;7;cgg;11;;ctg;1;ccg;2;cag;7;cgg;0 gtg;18;gcg;19;gag;386;ggg;1695;;gtg;3;gcg;1;gag;8;ggg;70 ;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;4061;;;;;;;;; btaf;;différents;;;db,dif;;3678;;btab;;double;;db,dif;;;320 ttt;5;tct;4;tat;10;tgt;133;;ttt;0;tct;8;tat;0;tgt;9 atc;−;act;9;aat;−;agt;3;;atc;0;act;4;aat;0;agt;0 ctt;4;cct;1;cat;3;cgt;5;;ctt;6;cct;11;cat;0;cgt;7 gtt;12;gct;18;gat;5;ggc;54;;gtt;7;gct;12;gat;0;ggc;8 ttc;17;tcc;27;tac;37;tgc;312;;ttc;12;tcc;4;tac;1;tgc;25 att;3;acc;0;aac;13;agc;10;;att;14;acc;0;aac;16;agc;8 ctc;−;ccc;−;cac;4;cgc;6;;ctc;0;ccc;0;cac;14;cgc;0 gtc;−;gcc;1;gac;32;ggt;19;;gtc;0;gcc;0;gac;9;ggt;0 tta;9;tca;6;taa;3;tga;28;;tta;0;tca;0;taa;0;tga;0 ata;7;aca;7;aaa;67;aga;43;;ata;0;aca;2;aaa;10;aga;0 cta;4;cca;2;caa;17;cga;10;;cta;0;cca;6;caa;2;cga;1 gta;18;gca;30;gaa;423;gga;384;;gta;2;gca;4;gaa;11;gga;6 ttg;13;tcg;6;tag;12;tgg;172;;ttg;0;tcg;0;tag;0;tgg;5 atg;18;acg;6;aag;24;agg;113;;atg;16;acg;0;aag;15;agg;2 ctg;2;ccg;0;cag;31;cgg;12;;ctg;3;ccg;3;cag;8;cgg;3 gtg;26;gcg;13;gag;160;ggg;1265;;gtg;12;gcg;2;gag;3;ggg;29 ;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;3778;;;;;;;;; fcaf;;différents;;;db,dif;;3561;;fcab;;double;;db,dif;;;158 ttt;0;tct;2;tat;−;tgt;0;;ttt;0;tct;5;tat;0;tgt;0 atc;−;act;5;aat;4;agt;1;;atc;0;act;3;aat;0;agt;0 ctt;0;cct;1;cat;1;cgt;3;;ctt;5;cct;6;cat;0;cgt;5 gtt;3;gct;13;gat;0;ggc;2;;gtt;4;gct;4;gat;0;ggc;7 ttc;7;tcc;0;tac;8;tgc;18;;ttc;4;tcc;0;tac;1;tgc;13 att;1;acc;−;aac;20;agc;7;;att;8;acc;0;aac;7;agc;4 ctc;−;ccc;0;cac;7;cgc;8;;ctc;0;ccc;0;cac;8;cgc;0 gtc;−;gcc;0;gac;1;ggt;1;;gtc;0;gcc;0;gac;7;ggt;0 tta;18;tca;12;taa;35;tga;17;;tta;0;tca;1;taa;1;tga;0 ata;8;aca;11;aaa;44;aga;53;;ata;0;aca;1;aaa;5;aga;0 cta;32;cca;63;caa;776;cga;1193;;cta;0;cca;4;caa;5;cga;7 gta;5;gca;8;gaa;10;gga;45;;gta;0;gca;1;gaa;4;gga;2 ttg;7;tcg;4;tag;11;tgg;21;;ttg;0;tcg;0;tag;0;tgg;1 atg;14;acg;8;aag;878;agg;51;;atg;9;acg;0;aag;8;agg;1 ctg;2;ccg;4;cag;44;cgg;23;;ctg;2;ccg;2;cag;2;cgg;0 gtg;2;gcg;5;gag;40;ggg;4;;gtg;6;gcg;1;gag;3;ggg;1 ;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;433;;;;;;;;; hsa-18f;;dif,db;différents;;;;221;;hsa-18b;;dif,db;double;;;;164 ttt;−;tct;3;tat;0;tgt;−;;ttt;0;tct;5;tat;0;tgt;0 atc;0;act;5;aat;−;agt;−;;atc;2;act;3;aat;0;agt;0 ctt;3;cct;1;cat;−;cgt;1;;ctt;5;cct;7;cat;0;cgt;5 gtt;5;gct;15;gat;−;ggc;4;;gtt;4;gct;10;gat;0;ggc;9 ttc;4;tcc;−;tac;12;tgc;22;;ttc;5;tcc;0;tac;0;tgc;6 att;9;acc;−;aac;16;agc;5;;att;5;acc;0;aac;8;agc;2 ctc;−;ccc;−;cac;0;cgc;−;;ctc;0;ccc;0;cac;8;cgc;0 gtc;−;gcc;−;gac;2;ggt;−;;gtc;0;gcc;0;gac;10;ggt;0 tta;3;tca;3;taa;−;tga;1;;tta;0;tca;0;taa;0;tga;0 ata;4;aca;5;aaa;7;aga;5;;ata;0;aca;0;aaa;4;aga;0 cta;2;cca;2;caa;3;cga;5;;cta;0;cca;4;caa;2;cga;0 gta;3;gca;6;gaa;4;gga;3;;gta;1;gca;1;gaa;3;gga;5 ttg;6;tcg;3;tag;−;tgg;4;;ttg;0;tcg;0;tag;0;tgg;2 atg;8;acg;4;aag;9;agg;4;;atg;11;acg;0;aag;5;agg;0 ctg;1;ccg;1;cag;6;cgg;1;;ctg;7;ccg;2;cag;6;cgg;2 gtg;5;gcg;3;gag;1;ggg;2;;gtg;7;gcg;0;gag;6;ggg;2
La genèse des tRNAs dans les 3 domaines
[modifier | modifier le wikicode]La genèse des 4032 bactéries
[modifier | modifier le wikicode]Les solitaires
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Les solitraires.
- Légende:
;;;Les soliaires;;;;;;;;;;;;;;; ;4;ct;ag;;;4;ct;ag;;;4;ct;ag;;;4;ct;ag total;3948;3938;3933;;total;3945;3825;3943;;total;3932;3932;29;;total;3947;3927;3934 ttt;0;0;;;tct;0;3;;;tat;0;0;;;tgt;0;0; ttc;15;3928;;;tcc;2;3820;;;tac;3899;3928;;;tgc;12;3924; tta;0;;96;;tca;85;;1493;;taa;0;;12;;tga;0;;15 ttg;2;;190;;tcg;0;;22;;tag;0;;16;;tgg;17;;2629 ;;;;;;;;;;;;;;;;;; total;3940;3832;3933;;total;3940;2665;3937;;total;3938;3933;3943;;total;3946;3930;3833 ctt;0;322;;;cct;0;8;;;cat;0;0;;;cgt;106;3610; ctc;7;3501;;;ccc;3;2656;;;cac;5;3930;;;cgc;1;307; cta;98;;1151;;cca;1173;;1813;;caa;6;;2130;;cga;7;;539 ctg;0;;17;;ccg;1;;5;;cag;2;;18;;cgg;7;;3026 ;;;;;;;;;;;;;;;;;; total;3949;3864;3947;;total;3946;3775;3944;;total;3949;3930;3941;;total;3944;3931;3928 att;0;1;;;act;0;41;;;aat;0;0;;;agt;0;0; atc;2;3856;;;acc;2;3682;;;aac;2;3925;;;agc;1;3930; ata;0;;0;;aca;152;;1288;;aaa;5;;1899;;aga;0;;780 atg;81;;3947;;acg;3;;13;;aag;1;;9;;agg;0;;10 ;;;;;;;;;;;;;;;;;; total;3943;3212;3935;;total;3934;3035;3902;;total;3949;3933;3928;;total;3948;3880;3939 gtt;0;5;;;gct;0;0;;;gat;0;0;;;ggt;0;1; gtc;8;3200;;;gcc;32;3033;;;gac;5;3933;;;ggc;9;3879; gta;724;;2724;;gca;877;;2721;;gaa;8;;2808;;gga;66;;1699 gtg;1;;2;;gcg;7;;11;;gag;1;;5;;ggg;0;;11
La genèse
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:La genèse.
- Légende: Prélèvement du 29.10.18
Bactéries ;;4032;;genèse;;;;;Bactéries ;;4032;;Effectifs;;;;;Bactéries ;;4032;genèse;;duplication;;% ttt;10;tct;5;tat;4;tgt;3;;ttt;10;tct;5;tat;4;tgt;3;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0 att;5;act;92;aat;5;agt;1;;att;5;act;101;aat;5;agt;1;;att;0;act;10;aat;0;agt;0 ctt;331;cct;10;cat;3;cgc;318;;ctt;368;cct;10;cat;4;cgc;333;;ctt;11;cct;0;cat;33;cgc;5 gtt;9;gct;2;gat;0;ggt;1;;gtt;9;gct;2;gat;0;ggt;1;;gtt;0;gct;0;gat;-;ggt;0 ttc;3938;tcc;3822;tac;3932;tgc;3927;;ttc;6100;tcc;4517;tac;6416;tgc;4471;;ttc;55;tcc;18;tac;63;tgc;14 atc;3863;acc;3732;aac;3930;agc;3931;;atc;9193;acc;4511;aac;8758;agc;4419;;atc;138;acc;21;aac;123;agc;12 ctc;3510;ccc;2657;cac;3933;cgt;3623;;ctc;3848;ccc;2741;cac;4712;cgt;7473;;ctc;10;ccc;3;cac;20;cgt;106 gtc;3207;gcc;3035;gac;3933;ggc;3879;;gtc;4426;gcc;4164;gac;9017;ggc;9265;;gtc;38;gcc;37;gac;129;ggc;139 tta;3741;tca;3921;taa;12;tga;1304;;tta;4746;tca;5296;taa;12;tga;1314;;tta;27;tca;35;taa;0;tga;1 ata;48;aca;3929;aaa;3930;aga;3916;;ata;55;aca;5874;aaa;9100;aga;4802;;ata;15;aca;50;aaa;132;aga;23 cta;3916;cca;3932;caa;3924;cga;807;;cta;4937;cca;5449;caa;6385;cga;887;;cta;26;cca;39;caa;63;cga;10 gta;3931;gca;3889;gaa;3923;gga;3926;;gta;8853;gca;10177;gaa;9673;gga;5511;;gta;125;gca;162;gaa;147;gga;40 ttg;3835;tcg;2449;tag;17;tgg;3918;;ttg;3997;tcg;2621;tag;18;tgg;4364;;ttg;4;tcg;7;tag;6;tgg;11 atg;3945;acg;2655;aag;2040;agg;3147;;atg;18014;acg;2759;aag;2425;agg;3449;;atg;357;acg;4;aag;19;agg;10 ctg;2782;ccg;2124;cag;1811;cgg;3292;;ctg;5182;ccg;2182;cag;2387;cgg;3353;;ctg;86;ccg;3;cag;32;cgg;2 gtg;1209;gcg;1181;gag;1121;ggg;2238;;gtg;1313;gcg;1224;gag;1387;ggg;2264;;gtg;9;gcg;4;gag;24;ggg;1
Distribution des duplications
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Distribution des duplications.
- Légende: Décompte du 04.12.18. Le séparateur de calc est :. ? * § $ pour les couleurs de la genèse, respectivement de 3,945−3,822 3,741−3,035 2,782−1,811 1,304−807.
occur.;ctt;gtt;tct;act;cct;gct;cgc;ggt;;occur.;ttt;att;tat;aat;cat;gat;tgt;agt 1;295;9;5;83;10;2;304;1;;1;10;5;4;5;2;0;3;1 2;35; ; ;9; ; ;13;;;2; ; ; ; ;1; ; ; 3;1; ; ; ; ; ;1;;;3; ; ; ; ; ; ; ; genèse;331;9;5;92;10;2;318;1;;genèse;10;5;4;5;3;0;3;1 Dup %;11;0;0;10;0;0;5;0;;Dup %;0;0;0;0;33;−;0;0 ;;;;;;;;;;;;;;;;;; occur.;ctc;gtc;tcc;acc;ccc;gcc;cgt;ggc;;occur.;ttc;atc;tac;aac;cac;gac;tgc;agc 1;3192;2189;3165;2965;2586;2055;1623;1359;;1;2281;1329;2373;1753;3208;1402;348;3471 2;307;849;624;755;58;884;910;1008;;2;1304;832;826;770;686;889;377;435 3;7;152;29;12;13;61;551;565;;3;217;1,055;630;466;31;1,087;52;22 4;1;6;3; ; ;20;429;741;;4;125;391;52;706;4;363;12;3 5;2;7;1; ; ;12;50;110;;5;7;135;27;189;2;65;4; 6;0;4; ; ; ;3;45;48;;6;3;77;14;31;1;104;1; 7;1; ; ; ; ; ;5;23;;7;1;26;7;10;1;17;1; 8; ; ; ; ; ; ;6;11;;8; ;14;2;3; ;3; ; 9; ; ; ; ; ; ;2;4;;9; ;1;1;2; ;1; ; 10; ; ; ; ; ; ;0;4;;10; ;2; ; ; ;0; ; 11; ; ; ; ; ; ;0;4;;11; ;0; ; ; ;1; ; 12; ; ; ; ; ; ;0;2;;12; ;0; ; ; ;1; ; 13; ; ; ; ; ; ;1; ;;13; ;1; ; ; ; ; ; 27; ; ; ; ; ; ;1; ;;14; ; ; ; ; ; ; ; genèse;*3510;*3207;?3822;*3732;§2657;*3035;*3623;?3879;;genèse;?3938;?3863;?3932;?3930;?3933;?3933;?3927;?3931 Dup %;10;38;18;21;3;37;106;139;;Dup %;55;138;63;123;20;129;14;12 ;;;;;;;;;;;;;;;;;; occur.;cta;gta;tca;aca;cca;gca;cga;gga;;occur.;tta;ata;taa;aaa;caa;gaa;tga;aga 1;3277;1957;2982;2824;2822;1343;772;3018;;1;2969;44;12;193;2289;1566;1294;3314 2;436;475;654;612;794;582;13;475;;2;576;2; ;724;1,162;837;10;449 3;133;596;165;253;241;1000;8;250;;3;167;1; ;416;185;523; ;97 4;27;525;101;150;64;482;9;141;;4;22;1; ;204;235;569; ;25 5;24;258;13;73;7;250;1;28;;5;6; ; ;393;42;168; ;13 6;2;90;3;17;3;167;4;10;;6;1; ; ;197;10;117; ;5 7;7;20;2; ;1;43; ;3;;7; ; ; ;38;1;118; ;4 8;2;6;0; ; ;16; ;1;;8; ; ; ;16; ;17; ;5 9;0;2;0; ; ;2; ; ;;9; ; ; ;9; ;3; ;4 10;4;0;0; ; ;1; ; ;;10; ; ; ;1; ;1; ; 11;4;2;1; ; ;3; ; ;;11; ; ; ;0; ;2; ; 12; ; ; ; ; ; ; ; ;;12; ; ; ;1; ;1; ; 13; ; ; ; ; ; ; ; ;;13; ; ; ;0; ;1; ; 14; ; ; ; ; ; ; ; ;;14; ; ; ;1; ; ; ; genèse;?3916;?3931;?3921;?3929;?3932;?3889;$807;?3926;;genèse;*3741;48;12;?3930;?3924;?3923;1304;?3916 Dup %;26;125;35;50;39;162;10;40;;Dup %;27;15;0;132;63;147;1;23 ;;;;;;;;;;;;;;;;;; occur.;ctg;gtg;tcg;acg;ccg;gcg;cgg;ggg;;occur.;ttg;atg;tag;aag;cag;gag;tgg;agg 1;1668;1114;23;2556;2069;1145;3241;2214;;1;3696;-;16;1746;1247;915;3539;2846 2;440;88;129;95;53;30;45;22;;2;119;-;1;219;556;152;321;300 3;119;5;17;3;1;5;4;2;;3;17;-; ;65;6;50;51;1 4;530;2;3;1;1;1;1; ;;4;3;-; ;6;1;3;5; 5;5; ; ; ; ; ;0; ;;5; ; ; ;2;0;0;2; 6;15; ; ; ; ; ;1; ;;6; ; ; ;2;1;1; ; 7;1; ; ; ; ; ; ; ;;7; ; ; ; ; ; ; ; 8;2; ; ; ; ; ; ; ;;8; ; ; ; ; ; ; ; 9;1; ; ; ; ; ; ; ;;9; ; ; ; ; ; ; ; 10;1; ; ; ; ; ; ; ;;10; ; ; ; ; ; ; ; genèse;§2782;$1209;§2449;§2655;§2124;$1181;*3292;§2238;;genèse;?3835;-;17;§2040;§1811;$1121;?3918;*3147 Dup %;86;9;7;4;3;4;2;1;;Dup %;4;-;6;19;32;24;11;10
Distribution des gènes de tRNAs du codon atg
[modifier | modifier le wikicode]- Lien au tableur:Distribution des gènes de tRNAs du codon atg.
occur .;atg;fMet;Met;Ile 0;0;0;0;9 1;7;55;78;85 2;54;19;22;6 3;1567;15;1;1 4;848;8;; 5;368;1;; 6;534;1;; 7;238;1;; 8;151;0;; 9;64;1;; 10;45;;; 11;21;;; 12;20;;; 13;17;;; 14;4;;; 15;2;;; 16;2;;; 17;2;;; 18;1;;; genèse;3945;101;101;92 Dup %;357;95;24;9 génomes;3945;101;101;101
Les zéros des 79 eucaryotes
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Les zéros des 79 eucaryotes.
- Légende:
E79z-tg;;zéros;−;;;;zéros;;E79g;;Genèse;;;;;;;E79t-tg;;db,diff;;db + diff;;mtri+1;;;E79d;;taux duplications;;;;; ttt;52;tct;2;tat;52;tgt;48;;ttt;27;tct;77;tat;27;tgt;31;;ttt;51;tct;920;tat;57;tgt;68;;ttt;89;tct;1095;tat;111;tgt;119 atc;52;act;1;aat;46;agt;61;;atc;27;act;78;aat;33;agt;18;;atc;71;act;1021;aat;75;agt;80;;atc;163;act;1209;aat;127;agt;344 ctt;0;cct;0;cat;57;cgt;1;;ctt;79;cct;79;cat;22;cgt;78;;ctt;857;cct;908;cat;36;cgt;884;;ctt;985;cct;1049;cat;64;cgt;1033 gtt;0;gct;0;gat;44;ggc;1;;gtt;79;gct;79;gat;35;ggc;78;;gtt;1022;gct;1733;gat;76;ggc;1411;;gtt;1194;gct;2094;gat;117;ggc;1709 ttc;1;tcc;52;tac;0;tgc;1;;ttc;78;tcc;27;tac;79;tgc;78;;ttc;1195;tcc;86;tac;1310;tgc;1845;;ttc;1432;tcc;219;tac;1558;tgc;2265 att;0;acc;56;aac;0;agc;1;;att;79;acc;23;aac;79;agc;78;;att;1238;acc;68;aac;1592;agc;910;;att;1467;acc;196;aac;1915;agc;1067 ctc;70;ccc;61;cac;1;cgc;65;;ctc;9;ccc;18;cac;78;cgc;14;;ctc;11;ccc;29;cac;1028;cgc;24;;ctc;22;ccc;61;cac;1218;cgc;71 gtc;42;gcc;55;gac;0;ggt;61;;gtc;37;gcc;24;gac;79;ggt;18;;gtc;67;gcc;69;gac;1571;ggt;80;;gtc;81;gcc;188;gac;1889;ggt;344 tta;0;tca;0;taa;41;tga;16;;tta;79;tca;79;taa;38;tga;63;;tta;592;tca;579;taa;75;tga;140;;tta;649;tca;633;taa;97;tga;122 ata;1;aca;0;aaa;1;aga;0;;ata;78;aca;79;aaa;78;aga;79;;ata;564;aca;716;aaa;1413;aga;682;;ata;623;aca;806;aaa;1712;aga;763 cta;3;cca;0;caa;0;cga;0;;cta;76;cca;79;caa;79;cga;79;;cta;486;cca;995;caa;942;cga;609;;cta;539;cca;1159;caa;1092;cga;671 gta;0;gca;1;gaa;0;gga;0;;gta;79;gca;78;gaa;79;gga;79;;gta;635;gca;1100;gaa;1176;gga;1041;;gta;704;gca;1310;gaa;1389;gga;1218 ttg;1;tcg;0;tag;53;tgg;1;;ttg;78;tcg;79;tag;26;tgg;78;;ttg;657;tcg;438;tag;81;tgg;936;;ttg;742;tcg;454;tag;212;tgg;1100 atg;0;acg;2;aag;1;agg;1;;atg;79;acg;77;aag;78;agg;78;;atg;2188;acg;480;aag;1627;agg;794;;atg;2670;acg;523;aag;1986;agg;918 ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;8;;ctg;79;ccg;79;cag;79;cgg;71;;ctg;711;ccg;405;cag;1095;cgg;369;;ctg;800;ccg;413;cag;1286;cgg;420 gtg;1;gcg;0;gag;0;ggg;4;;gtg;78;gcg;79;gag;79;ggg;75;;gtg;1002;gcg;611;gag;1401;ggg;582;;gtg;1185;gcg;673;gag;1673;ggg;676
Les zéros des 42 champignons
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Les zéros des 42 champignons.
- Légende:
C42z-tg;;zéros;−;;;;;;C42g;;Genèse;;;;;;;C42-tg;;effectifs;;;;;;;C42d;;taux duplications;;;;; ttt;41;tct;0;tat;40;tgt;41;;ttt;1;tct;42;tat;2;tgt;1;;ttt;2;tct;310;tat;2;tgt;1;;ttt;100;tct;638;tat;0;tgt;0 atc;36;act;0;aat;40;agt;42;;atc;6;act;42;aat;2;agt;0;;atc;6;act;332;aat;2;agt;0;;atc;0;act;690;aat;0;agt;- ctt;11;cct;4;cat;42;cgt;0;;ctt;31;cct;38;cat;0;cgt;42;;ctt;170;cct;155;cat;0;cgt;238;;ctt;448;cct;308;cat;-;cgt;467 gtt;0;gct;0;gat;40;ggc;0;;gtt;42;gct;42;gat;2;ggc;42;;gtt;401;gct;389;gat;2;ggc;487;;gtt;855;gct;826;gat;0;ggc;1060 ttc;0;tcc;41;tac;0;tgc;2;;ttc;42;tcc;1;tac;42;tgc;40;;ttc;296;tcc;1;tac;252;tgc;143;;ttc;605;tcc;0;tac;500;tgc;258 att;0;acc;42;aac;0;agc;1;;att;42;acc;0;aac;42;agc;41;;att;378;acc;0;aac;297;agc;155;;att;800;acc;-;aac;607;agc;278 ctc;30;ccc;41;cac;0;cgc;42;;ctc;12;ccc;1;cac;42;cgc;0;;ctc;18;ccc;1;cac;220;cgc;0;;ctc;50;ccc;0;cac;424;cgc;- gtc;41;gcc;42;gac;0;ggt;40;;gtc;1;gcc;0;gac;42;ggt;2;;gtc;1;gcc;0;gac;409;ggt;2;;gtc;0;gcc;-;gac;874;ggt;0 tta;3;tca;0;taa;41;tga;31;;tta;39;tca;42;taa;1;tga;11;;tta;132;tca;92;taa;1;tga;12;;tta;238;tca;119;taa;0;tga;9 ata;1;aca;0;aaa;1;aga;2;;ata;41;aca;42;aaa;41;aga;40;;ata;59;aca;100;aaa;155;aga;207;;ata;44;aca;138;aaa;278;aga;418 cta;6;cca;1;caa;0;cga;20;;cta;36;cca;41;caa;42;cga;22;;cta;75;cca;205;caa;196;cga;92;;cta;108;cca;400;caa;367;cga;318 gta;2;gca;0;gaa;0;gga;0;;gta;40;gca;42;gaa;42;gga;42;;gta;64;gca;141;gaa;252;gga;146;;gta;60;gca;236;gaa;500;gga;248 ttg;4;tcg;0;tag;41;tgg;2;;ttg;38;tcg;42;tag;1;tgg;40;;ttg;190;tcg;80;tag;1;tgg;173;;ttg;400;tcg;90;tag;0;tgg;333 atg;0;acg;1;aag;1;agg;1;;atg;42;acg;41;aag;41;agg;41;;atg;324;acg;66;aag;426;agg;69;;atg;671;acg;61;aag;939;agg;68 ctg;11;ccg;21;cag;0;cgg;4;;ctg;31;ccg;21;cag;42;cgg;38;;ctg;89;ccg;36;cag;149;cgg;55;;ctg;187;ccg;71;cag;255;cgg;45 gtg;0;gcg;16;gag;0;ggg;3;;gtg;42;gcg;26;gag;42;ggg;39;;gtg;94;gcg;60;gag;296;ggg;69;;gtg;124;gcg;131;gag;605;ggg;77
La genèse des 184 archées
[modifier | modifier le wikicode]Les effectifs des tRNAs des archées
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Les effectifs des tRNAs des archées.
- Légende:
Archées;nombres;;184;;;;;;methanococci;;nombres;;16;;;;;archée;;;1 methanopyri;;;; ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0 att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0 ctt;1;cct;0;cat;0;cgt;2;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0 gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;1;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0 ttc;215;tcc;190;tac;190;tgc;299;;ttc;16;tcc;16;tac;16;tgc;16;;ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;1 atc;212;acc;189;aac;214;agc;187;;atc;16;acc;16;aac;16;agc;16;;atc;1;acc;1;aac;1;agc;1 ctc;214;ccc;171;cac;185;cgc;187;;ctc;16;ccc;15;cac;16;cgc;16;;ctc;1;ccc;1;cac;1;cgc;1 gtc;212;gcc;184;gac;218;ggc;243;;gtc;16;gcc;16;gac;25;ggc;16;;gtc;1;gcc;1;gac;1;ggc;1 tta;191;tca;184;taa;0;tga;18;;tta;16;tca;16;taa;0;tga;16;;tta;1;tca;1;taa;0;tga;1 ata;2;aca;198;aaa;197;aga;186;;ata;0;aca;16;aaa;25;aga;16;;ata;0;aca;1;aaa;1;aga;1 cta;185;cca;184;caa;196;cga;185;;cta;16;cca;16;caa;16;cga;17;;cta;1;cca;1;caa;1;cga;1 gta;186;gca;256;gaa;230;gga;189;;gta;17;gca;22;gaa;32;gga;17;;gta;1;gca;1;gaa;2;gga;1 ttg;163;tcg;152;tag;1;tgg;184;;ttg;0;tcg;0;tag;0;tgg;16;;ttg;0;tcg;0;tag;0;tgg;1 atg;589;acg;169;aag;166;agg;165;;atg;56;acg;1;aag;0;agg;0;;atg;3;acg;0;aag;0;agg;0 ctg;160;ccg;151;cag;165;cgg;139;;ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;0;;ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;0 gtg;170;gcg;159;gag;160;ggg;155;;gtg;7;gcg;0;gag;0;ggg;0;;gtg;0;gcg;0;gag;0;ggg;0
La genèse des archées
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:La genèse des archées.
- Légende:
Archées;;184;;genèse;;;;;Archées;;184;;Effectifs;;;;;Archées;;184;genèse;;duplication;;% ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;-;tct;-;tat;-;tgt;- att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;-;act;-;aat;-;agt;- ctt;1;cct;0;cat;0;cgt;2;;ctt;1;cct;0;cat;0;cgt;2;;ctt;0;cct;-;cat;-;cgt;0 gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;1;;gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;1;;gtt;0;gct;-;gat;-;ggt;0 ttc;183;tcc;183;tac;183;tgc;183;;ttc;215;tcc;190;tac;190;tgc;299;;ttc;17;tcc;4;tac;4;tgc;63 atc;183;acc;182;aac;183;agc;183;;atc;212;acc;189;aac;214;agc;187;;atc;16;acc;4;aac;17;agc;2 ctc;180;ccc;170;cac;183;cgc;183;;ctc;214;ccc;171;cac;185;cgc;187;;ctc;19;ccc;1;cac;1;cgc;2 gtc;183;gcc;182;gac;183;ggc;181;;gtc;212;gcc;184;gac;218;ggc;243;;gtc;16;gcc;1;gac;19;ggc;34 tta;183;tca;182;taa;0;tga;18;;tta;191;tca;184;taa;0;tga;18;;tta;4;tca;1;taa;-;tga;0 ata;2;aca;183;aaa;182;aga;183;;ata;2;aca;198;aaa;197;aga;186;;ata;0;aca;8;aaa;8;aga;2 cta;183;cca;183;caa;182;cga;183;;cta;185;cca;184;caa;196;cga;185;;cta;1;cca;1;caa;8;cga;1 gta;183;gca;182;gaa;183;gga;182;;gta;186;gca;256;gaa;230;gga;189;;gta;2;gca;41;gaa;26;gga;4 ttg;158;tcg;151;tag;1;tgg;183;;ttg;163;tcg;152;tag;1;tgg;184;;ttg;3;tcg;1;tag;0;tgg;1 atg;183;acg;166;aag;160;agg;164;;atg;589;acg;169;aag;166;agg;165;;atg;222;acg;2;aag;4;agg;1 ctg;154;ccg;149;cag;164;cgg;139;;ctg;160;ccg;151;cag;165;cgg;139;;ctg;4;ccg;1;cag;1;cgg;0 gtg;168;gcg;155;gag;157;ggg;153;;gtg;170;gcg;159;gag;160;ggg;155;;gtg;1;gcg;3;gag;2;ggg;1
Les taux de genèse dans les 3 domaines
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- Légende:
C42g;;Genèse;;Taux;;42;;;E79g;;Genèse;;Taux;;79; ttt;2;tct;100;tat;5;tgt;2;;ttt;34;tct;97;tat;34;tgt;39 atc;14;act;100;aat;5;agt;0;;atc;34;act;99;aat;42;agt;23 ctt;74;cct;90;cat;0;cgt;100;;ctt;100;cct;100;cat;28;cgt;99 gtt;100;gct;100;gat;5;ggc;100;;gtt;100;gct;100;gat;44;ggc;99 ttc;100;tcc;2;tac;100;tgc;95;;ttc;99;tcc;34;tac;100;tgc;99 att;100;acc;0;aac;100;agc;98;;att;100;acc;29;aac;100;agc;99 ctc;29;ccc;2;cac;100;cgc;0;;ctc;11;ccc;23;cac;99;cgc;18 gtc;2;gcc;0;gac;100;ggt;5;;gtc;47;gcc;30;gac;100;ggt;23 tta;93;tca;100;taa;2;tga;26;;tta;100;tca;100;taa;48;tga;80 ata;98;aca;100;aaa;98;aga;95;;ata;99;aca;100;aaa;99;aga;100 cta;86;cca;98;caa;100;cga;52;;cta;96;cca;100;caa;100;cga;100 gta;95;gca;100;gaa;100;gga;100;;gta;100;gca;99;gaa;100;gga;100 ttg;90;tcg;100;tag;2;tgg;95;;ttg;99;tcg;100;tag;33;tgg;99 atg;100;acg;98;aag;98;agg;98;;atg;100;acg;97;aag;99;agg;99 ctg;74;ccg;50;cag;100;cgg;90;;ctg;100;ccg;100;cag;100;cgg;90 gtg;100;gcg;62;gag;100;ggg;93;;gtg;99;gcg;100;gag;100;ggg;95 ;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;; Archées;;genèse;;Taux;;183;;;Bactéries ;;4032;genèse;Taux;;3949; ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0 att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;2;aat;0;agt;0 ctt;1;cct;0;cat;0;cgt;1;;ctt;8;cct;0;cat;0;cgc;8 gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;1;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0 ttc;100;tcc;100;tac;100;tgc;100;;ttc;100;tcc;97;tac;100;tgc;99 atc;100;acc;99;aac;100;agc;100;;atc;98;acc;95;aac;100;agc;100 ctc;98;ccc;93;cac;100;cgc;100;;ctc;89;ccc;67;cac;100;cgt;92 gtc;100;gcc;99;gac;100;ggc;99;;gtc;81;gcc;77;gac;100;ggc;98 tta;100;tca;99;taa;0;tga;10;;tta;95;tca;99;taa;0;tga;33 ata;1;aca;100;aaa;99;aga;100;;ata;1;aca;99;aaa;100;aga;99 cta;100;cca;100;caa;99;cga;100;;cta;99;cca;100;caa;99;cga;20 gta;100;gca;99;gaa;100;gga;99;;gta;100;gca;98;gaa;99;gga;99 ttg;86;tcg;83;tag;1;tgg;100;;ttg;97;tcg;62;tag;0;tgg;99 atg;100;acg;91;aag;87;agg;90;;atg;100;acg;67;aag;52;agg;80 ctg;84;ccg;81;cag;90;cgg;76;;ctg;70;ccg;54;cag;46;cgg;83 gtg;92;gcg;85;gag;86;ggg;84;;gtg;31;gcg;30;gag;28;ggg;57
Les introns des eucaryotes
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Les introns des eucaryotes.
- Légende:
Effectifs;;;;;Effectifs;;;;;Génomes;;;;Génomes;; C42;;;;;E79;;;;;C42;;;;E79;; faibles;%;autres;;;faibles;%;autres;;;faibles;%;autres;;faibles;%;autres 18;<5;;;;11;0-6;14;;;18;<5;;;16;0-6;19 tga;21;;;;5;8-19;14;;;tga;17;;;-;8-14;22 13;40-88;aga 48;;;tcc tat;22-30;5;;;19;21-38;aga 29;;tag tat;13 22; 13;100-190;ata 140;;;tga;4;;;;16;43-57;aag 50;;tga;3; 16;217-405;ttg 360;;;4;35-68;gaa ctt cca aaa;;;8;71-90;ttc ttg;;3;73-87;aga ttg ata 3;481-621;aag tac ttc;;;3;166-189;cga caa atg;;;2;98100;ata tac;;1;100;tac -;;;;;4;406-594;aag ttg ata aga;;;-;;;;-;; -;;;;;1;1568;tac;;;-;;;;-;;
Les introns des eucaryotes. Effectifs
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- Légende: Voir les tableaux des détails
C42;introns;;effectifs;;;;;;C42;introns;;génomes;;;; ttt;2;tct;35;tat;0;tgt;1;;ttt;1;tct;9;tat;0;tgt;1 atc;1;act;42;aat;2;agt;0;;atc;1;act;13;aat;2;agt;0 ctt;143;cct;125;cat;0;cgt;91;;ctt;21;cct;20;cat;0;cgt;22 gtt;59;gct;119;gat;2;ggc;102;;gtt;9;gct;14;gat;2;ggc;11 ttc;261;tcc;1;tac;250;tgc;30;;ttc;35;tcc;1;tac;42;tgc;12 att;141;acc;0;aac;94;agc;144;;att;16;acc;0;aac;16;agc;38 ctc;2;ccc;0;cac;92;cgc;0;;ctc;2;ccc;0;cac;19;cgc;0 gtc;1;gcc;0;gac;125;ggt;1;;gtc;1;gcc;0;gac;15;ggt;1 tta;35;tca;43;taa;1;tga;9;;tta;19;tca;24;taa;1;tga;7 ata;59;aca;30;aaa;131;aga;20;;ata;41;aca;15;aaa;36;aga;12 cta;68;cca;168;caa;59;cga;80;;cta;32;cca;33;caa;20;cga;16 gta;25;gca;43;gaa;50;gga;42;;gta;21;gca;16;gaa;18;gga;14 ttg;151;tcg;66;tag;1;tgg;124;;ttg;32;tcg;37;tag;1;tgg;30 atg;104;acg;25;aag;202;agg;36;;atg;24;acg;15;aag;21;agg;18 ctg;71;ccg;31;cag;65;cgg;17;;ctg;20;ccg;18;cag;15;cgg;12 gtg;37;gcg;36;gag;170;ggg;33;;gtg;20;gcg;18;gag;16;ggg;16 ;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;; E79;introns;;effectifs;;;;;;E79;introns;;génomes;;;; ttt;11;tct;2;tat;24;tgt;2;;ttt;5;tct;2;tat;17;tgt;2 atc;14;act;10;aat;4;agt;2;;atc;5;act;7;aat;4;agt;2 ctt;45;cct;18;cat;6;cgt;0;;ctt;10;cct;6;cat;3;cgt;0 gtt;3;gct;4;gat;4;ggc;7;;gtt;2;gct;4;gat;3;ggc;4 ttc;2;tcc;23;tac;1239;tgc;14;;ttc;2;tcc;4;tac;79;tgc;10 att;5;acc;0;aac;8;agc;9;;att;3;acc;0;aac;5;agc;6 ctc;1;ccc;5;cac;11;cgc;3;;ctc;1;ccc;3;cac;9;cgc;3 gtc;0;gcc;1;gac;18;ggt;4;;gtc;0;gcc;1;gac;2;ggt;3 tta;18;tca;13;taa;8;tga;3;;tta;8;tca;9;taa;3;tga;2 ata;454;aca;5;aaa;54;aga;469;;ata;69;aca;3;aaa;8;aga;58 cta;2;cca;50;caa;148;cga;131;;cta;2;cca;7;caa;8;cga;7 gta;5;gca;2;gaa;28;gga;21;;gta;5;gca;2;gaa;8;gga;9 ttg;400;tcg;2;tag;13;tgg;5;;ttg;65;tcg;1;tag;10;tgg;4 atg;149;acg;7;aag;321;agg;14;;atg;11;acg;6;aag;7;agg;5 ctg;7;ccg;11;cag;17;cgg;4;;ctg;7;ccg;4;cag;8;cgg;2 gtg;6;gcg;4;gag;13;ggg;15;;gtg;6;gcg;4;gag;6;ggg;7
Les introns des eucaryotes. Comparaisons
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Les introns des eucaryotes. Comparaisons.
- Légende: Voir les tableaux des détails
C42;introns;;effectifs;;%;;;;C42;introns;;génomes;;%;; ttt;5;tct;83;tat;0;tgt;2;;ttt;5;tct;21;tat;0;tgt;2 atc;2;act;100;aat;5;agt;0;;atc;2;act;31;aat;5;agt;0 ctt;340;cct;298;cat;0;cgt;217;;ctt;50;cct;48;cat;0;cgt;52 gtt;140;gct;283;gat;5;ggc;243;;gtt;21;gct;33;gat;5;ggc;26 ttc;621;tcc;2;tac;595;tgc;71;;ttc;83;tcc;2;tac;100;tgc;29 att;336;acc;0;aac;224;agc;343;;att;38;acc;0;aac;38;agc;90 ctc;5;ccc;0;cac;219;cgc;0;;ctc;5;ccc;0;cac;45;cgc;0 gtc;2;gcc;0;gac;298;ggt;2;;gtc;2;gcc;0;gac;36;ggt;2 tta;83;tca;102;taa;2;tga;21;;tta;45;tca;57;taa;2;tga;17 ata;140;aca;71;aaa;312;aga;48;;ata;98;aca;36;aaa;86;aga;29 cta;162;cca;400;caa;140;cga;190;;cta;76;cca;79;caa;48;cga;38 gta;60;gca;102;gaa;119;gga;100;;gta;50;gca;38;gaa;43;gga;33 ttg;360;tcg;157;tag;2;tgg;295;;ttg;76;tcg;88;tag;2;tgg;71 atg;248;acg;60;aag;481;agg;86;;atg;57;acg;36;aag;50;agg;43 ctg;169;ccg;74;cag;155;cgg;40;;ctg;48;ccg;43;cag;36;cgg;29 gtg;88;gcg;86;gag;405;ggg;79;;gtg;48;gcg;43;gag;38;ggg;38 ;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;; E79;introns;;effectifs;;%;;;;E79;introns;;génomes;;%;; ttt;14;tct;3;tat;30;tgt;3;;ttt;6;tct;3;tat;22;tgt;3 atc;18;act;13;aat;5;agt;3;;atc;6;act;9;aat;5;agt;3 ctt;57;cct;23;cat;8;cgt;0;;ctt;13;cct;8;cat;4;cgt;0 gtt;4;gct;5;gat;5;ggc;9;;gtt;3;gct;5;gat;4;ggc;5 ttc;3;tcc;29;tac;1568;tgc;18;;ttc;3;tcc;5;tac;100;tgc;13 att;6;acc;0;aac;10;agc;11;;att;4;acc;0;aac;6;agc;8 ctc;1;ccc;6;cac;14;cgc;4;;ctc;1;ccc;4;cac;11;cgc;4 gtc;0;gcc;1;gac;23;ggt;5;;gtc;0;gcc;1;gac;3;ggt;4 tta;23;tca;16;taa;10;tga;4;;tta;10;tca;11;taa;4;tga;3 ata;575;aca;6;aaa;68;aga;594;;ata;87;aca;4;aaa;10;aga;73 cta;3;cca;63;caa;187;cga;166;;cta;3;cca;9;caa;10;cga;9 gta;6;gca;3;gaa;35;gga;27;;gta;6;gca;3;gaa;10;gga;11 ttg;506;tcg;3;tag;16;tgg;6;;ttg;82;tcg;1;tag;13;tgg;5 atg;189;acg;9;aag;406;agg;18;;atg;14;acg;8;aag;9;agg;6 ctg;9;ccg;14;cag;22;cgg;5;;ctg;9;ccg;5;cag;10;cgg;3 gtg;8;gcg;5;gag;16;ggg;19;;gtg;8;gcg;5;gag;8;ggg;9
Les introns des eucaryotes. Corrélation introns/tRNAs
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Les introns des eucaryotes. Corrélation introns/tRNAs.
- Légende:
E79;tRNAs;introns;sans in;%sans;;C42;tRNAs;introns;sans in;%sans ctc;11;1;10;91;;acc;0;0;0;100 cgc;24;3;21;88;;agt;0;0;0;100 ccc;29;5;24;83;;cat;0;0;0;100 cat;36;6;30;83;;cgc;0;0;0;100 ttt;51;11;40;78;;gcc;0;0;0;100 tat;57;24;33;58;;gtc;1;1;0;0 gtc;67;0;67;100;;taa;1;1;0;0 tgt;68;2;66;97;;tag;1;1;0;0 acc;68;0;68;100;;tcc;1;1;0;0 gcc;69;1;68;99;;tgt;1;1;0;0 atc;71;14;57;80;;ccc;1;0;1;100 taa;75;8;67;89;;aat;2;2;0;0 aat;75;4;71;95;;gat;2;2;0;0 gat;76;4;72;95;;ttt;2;2;0;0 ggt;80;4;76;95;;ggt;2;1;1;50 agt;80;2;78;98;;tat;2;0;2;100 tag;81;13;68;84;;atc;6;1;5;83 tcc;86;23;63;73;;tga;12;9;3;25 tga;140;3;137;98;;ctc;18;2;16;89 cgg;369;4;365;99;;ccg;36;31;5;14 ccg;405;11;394;97;;cgg;55;17;38;69 tcg;438;2;436;100;;ata;59;59;0;0 acg;480;7;473;99;;gcg;60;36;24;40 cta;486;2;484;100;;gta;64;25;39;61 ata;564;*454;110;20;;acg;66;25;41;62 tca;579;13;566;98;;agg;69;36;33;48 ggg;582;15;567;97;;ggg;69;33;36;52 tta;592;18;574;97;;cta;75;68;7;9 cga;609;*131;478;78;;tcg;80;66;14;18 gcg;611;4;607;99;;ctg;89;71;18;20 gta;635;5;630;99;;cga;92;80;12;13 ttg;657;*400;257;39;;tca;92;43;49;53 aga;682;*469;213;31;;gtg;94;37;57;61 ctg;711;7;704;99;;aca;100;30;70;70 aca;716;5;711;99;;tta;132;35;97;73 agg;794;14;780;98;;gca;141;43;98;70 ctt;857;*45;812;95;;tgc;143;30;113;79 cgt;884;0;884;100;;gga;146;42;104;71 cct;908;18;890;98;;cag;149;65;84;56 agc;910;9;901;99;;agc;155;144;11;7 tct;920;2;918;100;;aaa;155;131;24;15 tgg;936;5;931;99;;cct;155;125;30;19 caa;942;*148;794;84;;ctt;170;143;27;16 cca;995;*50;945;95;;tgg;173;124;49;28 gtg;1 002;6;996;99;;ttg;190;151;39;21 act;1 021;10;1011;99;;caa;196;59;137;70 gtt;1 022;3;1019;100;;cca;205;168;37;18 cac;1 028;11;1017;99;;aga;207;20;187;90 gga;1 041;21;1020;98;;cac;220;92;128;58 cag;1 095;17;1078;98;;cgt;238;91;147;62 gca;1 100;2;1098;100;;tac;252;250;2;1 gaa;1 176;28;1148;98;;gaa;252;50;202;80 ttc;1 195;2;1193;100;;ttc;296;261;35;12 att;1 238;5;1233;100;;gag;296;170;126;43 tac;1 310;*1239;71;5;;aac;297;94;203;68 gag;1 401;13;1388;99;;tct;310;35;275;89 ggc;1 411;7;1404;100;;atg;324;104;220;68 aaa;1 413;*54;1359;96;;act;332;42;290;87 gac;1 571;18;1553;99;;att;378;141;237;63 aac;1 592;8;1584;99;;gct;389;119;270;69 aag;1 627;*321;1306;80;;gtt;401;59;342;85 gct;1 733;4;1729;100;;gac;409;125;284;69 tgc;1 845;14;1831;99;;aag;426;202;224;53 atg;2 188;*149;2039;93;;ggc;487;102;385;79
Les introns des champignons: genèse duplications et introns
[modifier | modifier le wikicode]Principe du codon obligatoire
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Principe du codon obligatoire.
- Légende:
29.10.18;;;;;;;;;23.2.19;;;;;;;;;;;;;;;; Bactéries ;;4032.0;;genèse;;;;;Bacilli;;genèse;678;;;;;;E79g;;Genèse;;79;;; ttt;10;tct;5;tat;4;tgt;3;;ttt;4;tct;2;tat;1;tgt;1;;ttt;27;tct;77;tat;27;tgt;31 att;5;act;92;aat;5;agt;1;;att;0;act;62;aat;2;agt;0;;atc;27;act;78;aat;33;agt;18 ctt;331;cct;10;cat;3;cgc;318;;ctt;262;cct;4;cat;1;cgc;0;;ctt;79;cct;79;cat;22;cgt;78 gtt;9;gct;2;gat;0;ggt;1;;gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;79;gct;79;gat;35;ggc;78 ttc;3 938;tcc;3 822;tac;3 932;tgc;3 927;;ttc;663;tcc;648;tac;663;tgc;659;;ttc;78;tcc;27;tac;79;tgc;78 atc;3 863;acc;3 732;aac;3 930;agc;3 931;;atc;649;acc;540;aac;661;agc;658;;att;79;acc;23;aac;79;agc;78 ctc;3 510;ccc;2 657;cac;3 933;cgt;3 623;;ctc;396;ccc;38;cac;659;cgt;661;;ctc;9;ccc;18;cac;78;cgc;14 gtc;3 207;gcc;3 035;gac;3 933;ggc;3 879;;gtc;292;gcc;165;gac;663;ggc;658;;gtc;37;gcc;24;gac;79;ggt;18 tta;3 741;tca;3 921;taa;12;tga;1 304;;tta;658;tca;660;taa;1;tga;6;;tta;79;tca;79;taa;38;tga;63 ata;48;aca;3 929;aaa;3 930;aga;3 916;;ata;12;aca;662;aaa;662;aga;646;;ata;78;aca;79;aaa;78;aga;79 cta;3 916;cca;3 932;caa;3 924;cga;807;;cta;656;cca;659;caa;663;cga;35;;cta;76;cca;79;caa;79;cga;79 gta;3 931;gca;3 889;gaa;3 923;gga;3 926;;gta;661;gca;656;gaa;663;gga;662;;gta;79;gca;78;gaa;79;gga;79 ttg;3 835;tcg;2 449;tag;17;tgg;3 918;;ttg;657;tcg;263;tag;1;tgg;653;;ttg;78;tcg;79;tag;26;tgg;78 atg;3 945;acg;2 655;aag;2 040;agg;3 147;;atg;663;acg;275;aag;368;agg;437;;atg;79;acg;77;aag;78;agg;78 ctg;2 782;ccg;2 124;cag;1 811;cgg;3 292;;ctg;287;ccg;106;cag;105;cgg;658;;ctg;79;ccg;79;cag;79;cgg;71 gtg;1 209;gcg;1 181;gag;1 121;ggg;2 238;;gtg;5.2.19;gcg;52;gag;93;ggg;109;;gtg;78;gcg;79;gag;79;ggg;75 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;25.2.19;;;;;;;;;;;;;;;; Archées;;genèse;184;;;;;;Methanococci;;genèse;16;;;;;;C42g;;Genèse;;;;; ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;1;tct;42;tat;2;tgt;1 att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;atc;6;act;42;aat;2;agt;0 ctt;1;cct;0;cat;0;cgt;2;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0;;ctt;31;cct;38;cat;0;cgt;42 gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;1;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;42;gct;42;gat;2;ggc;42 ttc;183;tcc;183;tac;183;tgc;183;;ttc;16;tcc;16;tac;16;tgc;16;;ttc;42;tcc;1;tac;42;tgc;40 atc;183;acc;182;aac;183;agc;183;;atc;16;acc;16;aac;16;agc;16;;att;42;acc;0;aac;42;agc;41 ctc;180;ccc;170;cac;183;cgc;183;;ctc;16;ccc;15;cac;16;cgc;16;;ctc;12;ccc;1;cac;42;cgc;0 gtc;183;gcc;182;gac;183;ggc;181;;gtc;16;gcc;16;gac;16;ggc;16;;gtc;1;gcc;0;gac;42;ggt;2 tta;183;tca;182;taa;0;tga;18;;tta;16;tca;16;taa;0;tga;16;;tta;39;tca;42;taa;1;tga;11 ata;2;aca;183;aaa;182;aga;183;;ata;0;aca;16;aaa;16;aga;16;;ata;41;aca;42;aaa;41;aga;40 cta;183;cca;183;caa;182;cga;183;;cta;16;cca;16;caa;16;cga;16;;cta;36;cca;41;caa;42;cga;22 gta;183;gca;182;gaa;183;gga;182;;gta;16;gca;15;gaa;16;gga;16;;gta;40;gca;42;gaa;42;gga;42 ttg;158;tcg;151;tag;1;tgg;183;;ttg;0;tcg;0;tag;0;tgg;16;;ttg;38;tcg;42;tag;1;tgg;40 atg;183;acg;166;aag;160;agg;164;;atg;16;acg;1;aag;0;agg;0;;atg;42;acg;41;aag;41;agg;41 ctg;154;ccg;149;cag;164;cgg;139;;ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;0;;ctg;31;ccg;21;cag;42;cgg;38 gtg;168;gcg;155;gag;157;ggg;153;;gtg;7;gcg;0;gag;0;ggg;0;;gtg;42;gcg;26;gag;42;ggg;39
C42.GDI Les carrés
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:C42.GDI Les carrés.
- Note: Ici les tableaux des genèses, des duplications et des introns des tRNAs sont présentés sous forme de carrés plus faciles à lire.
- Légende:
C42.GDI tRNAs et introns
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:C42.GDI tRNAs et introns.
- Légende:
tRNAs introns;;;;;;;;;;;;;;;; tRNA;;;;;;;;;sint/tot;X100;;;;;; ttt;2;tct;310;tat;2;tgt;1;;ttt;0;tct;89;tat;0;tgt;0 atc;6;act;332;aat;2;agt;0;;atc;83;act;87;aat;0;agt;0 ctt;170;cct;155;cat;0;cgt;238;;ctt;20;cct;19;cat;0;cgt;62 gtt;401;gct;389;gat;2;ggc;487;;gtt;85;gct;69;gat;0;ggc;79 ttc;296;tcc;1;tac;252;tgc;143;;ttc;12;tcc;0;tac;2;tgc;79 att;378;acc;0;aac;297;agc;155;;att;63;acc;0;aac;68;agc;7 ctc;18;ccc;1;cac;220;cgc;0;;ctc;89;ccc;0;cac;59;cgc;0 gtc;1;gcc;0;gac;409;ggt;2;;gtc;0;gcc;0;gac;69;ggt;0 tta;132;tca;92;taa;1;tga;12;;tta;75;tca;53;taa;0;tga;33 ata;59;aca;100;aaa;155;aga;207;;ata;2;aca;70;aaa;15;aga;90 cta;75;cca;205;caa;196;cga;92;;cta;9;cca;18;caa;70;cga;14 gta;64;gca;141;gaa;252;gga;146;;gta;61;gca;70;gaa;80;gga;71 ttg;190;tcg;80;tag;1;tgg;173;;ttg;21;tcg;18;tag;0;tgg;28 atg;324;acg;66;aag;426;agg;69;;atg;69;acg;62;aag;54;agg;48 ctg;89;ccg;36;cag;149;cgg;55;;ctg;20;ccg;14;cag;56;cgg;69 gtg;94;gcg;60;gag;296;ggg;69;;gtg;61;gcg;42;gag;45;ggg;52 ;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;; in_t;;;;;;;;;sin_t;;;;;;ok; ttt;2;tct;35;tat;0;tgt;1;;ttt;0;tct;275;tat;2;tgt;0 atc;1;act;42;aat;2;agt;0;;atc;5;act;290;aat;0;agt;0 ctt;136;cct;125;cat;0;cgt;91;;ctt;34;cct;30;cat;0;cgt;147 gtt;59;gct;119;gat;2;ggc;101;;gtt;342;gct;270;gat;0;ggc;386 ttc;260;tcc;1;tac;248;tgc;30;;ttc;36;tcc;0;tac;4;tgc;113 att;139;acc;0;aac;94;agc;144;;att;239;acc;0;aac;203;agc;11 ctc;2;ccc;0;cac;90;cgc;0;;ctc;16;ccc;1;cac;130;cgc;0 gtc;1;gcc;0;gac;125;ggt;1;;gtc;0;gcc;0;gac;284;ggt;1 tta;33;tca;43;taa;1;tga;8;;tta;99;tca;49;taa;0;tga;4 ata;59;aca;30;aaa;131;aga;20;;ata;0;aca;70;aaa;24;aga;187 cta;68;cca;168;caa;59;cga;79;;cta;7;cca;37;caa;137;cga;13 gta;25;gca;43;gaa;50;gga;42;;gta;39;gca;98;gaa;202;gga;104 ttg;151;tcg;66;tag;1;tgg;124;;ttg;39;tcg;14;tag;0;tgg;49 atg;102;acg;25;aag;198;agg;36;;atg;222;acg;41;aag;228;agg;33 ctg;71;ccg;31;cag;65;cgg;17;;ctg;18;ccg;5;cag;84;cgg;38 gtg;37;gcg;35;gag;164;ggg;33;;gtg;57;gcg;25;gag;132;ggg;36
C42.GDI Genèse
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:C42.GDI Genèse.
- Légende:
Genèse;;;;;;;;;;;;;;;; gen_in;;;;;;;;;gen_sin;;;;;;; ttt;1;tct;6;tat;0;tgt;1;;ttt;0;tct;33;tat;2;tgt;0 atc;1;act;3;aat;2;agt;0;;atc;5;act;29;aat;0;agt;0 ctt;19;cct;19;cat;0;cgt;14;;ctt;10;cct;18;cat;0;cgt;20 gtt;6;gct;12;gat;2;ggc;7;;gtt;33;gct;28;gat;0;ggc;31 ttc;31;tcc;1;tac;39;tgc;10;;ttc;7;tcc;0;tac;0;tgc;28 att;14;acc;0;aac;13;agc;36;;att;26;acc;0;aac;26;agc;3 ctc;2;ccc;0;cac;15;cgc;0;;ctc;10;ccc;1;cac;23;cgc;0 gtc;1;gcc;0;gac;11;ggt;1;;gtc;0;gcc;0;gac;27;ggt;1 tta;16;tca;21;taa;1;tga;7;;tta;22;tca;18;taa;0;tga;4 ata;41;aca;12;aaa;29;aga;7;;ata;0;aca;27;aaa;5;aga;28 cta;31;cca;31;caa;20;cga;13;;cta;4;cca;8;caa;22;cga;6 gta;13;gca;14;gaa;9;gga;4;;gta;19;gca;26;gaa;24;gga;28 ttg;30;tcg;35;tag;1;tgg;26;;ttg;6;tcg;5;tag;0;tgg;10 atg;4;acg;12;aag;17;agg;13;;atg;18;acg;26;aag;20;agg;23 ctg;18;ccg;17;cag;12;cgg;10;;ctg;11;ccg;3;cag;27;cgg;26 gtg;14;gcg;14;gag;11;ggg;12;;gtg;22;gcg;8;gag;26;ggg;23 ;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;; gen_isi;;;;;;;;;zéros;;;;;;; ttt;0;tct;3;tat;0;tgt;0;;ttt;41;tct;0;tat;40;tgt;41 atc;0;act;10;aat;0;agt;0;;atc;36;act;0;aat;40;agt;42 ctt;2;cct;1;cat;0;cgt;8;;ctt;10;cct;4;cat;42;cgt;0 gtt;3;gct;2;gat;0;ggc;4;;gtt;0;gct;0;gat;40;ggc;0 ttc;4;tcc;0;tac;3;tgc;2;;ttc;0;tcc;41;tac;0;tgc;2 att;2;acc;0;aac;3;agc;2;;att;0;acc;42;aac;0;agc;1 ctc;0;ccc;0;cac;4;cgc;0;;ctc;30;ccc;41;cac;0;cgc;42 gtc;0;gcc;0;gac;4;ggt;0;;gtc;41;gcc;42;gac;0;ggt;40 tta;1;tca;3;taa;0;tga;0;;tta;3;tca;0;taa;41;tga;31 ata;0;aca;3;aaa;7;aga;5;;ata;1;aca;0;aaa;1;aga;2 cta;1;cca;2;caa;0;cga;3;;cta;6;cca;1;caa;0;cga;20 gta;8;gca;2;gaa;9;gga;10;;gta;2;gca;0;gaa;0;gga;0 ttg;2;tcg;2;tag;0;tgg;4;;ttg;4;tcg;0;tag;41;tgg;2 atg;20;acg;3;aag;4;agg;5;;atg;0;acg;1;aag;1;agg;1 ctg;2;ccg;1;cag;3;cgg;2;;ctg;11;ccg;21;cag;0;cgg;4 gtg;6;gcg;4;gag;5;ggg;4;;gtg;0;gcg;16;gag;0;ggg;3
C42.GDI Absence de duplication
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:C42.GDI Absence de duplication.
- Légende:
Absence de duplication;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; unit1;;;;;;;;;in_1;;;;;;;;;sin_1;;;;;;; ttt;0;tct;2;tat;2;tgt;1;;ttt;0;tct;1;tat;0;tgt;1;;ttt;0;tct;1;tat;2;tgt;0 atc;6;act;1;aat;2;agt;0;;atc;2;act;0;aat;2;agt;0;;atc;5;act;1;aat;0;agt;0 ctt;5;cct;16;cat;0;cgt;2;;ctt;3;cct;4;cat;0;cgt;0;;ctt;2;cct;12;cat;0;cgt;2 gtt;1;gct;1;gat;2;ggc;1;;gtt;0;gct;0;gat;2;ggc;0;;gtt;1;gct;1;gat;0;ggc;1 ttc;2;tcc;1;tac;2;tgc;3;;ttc;1;tcc;2;tac;2;tgc;1;;ttc;1;tcc;0;tac;0;tgc;2 att;1;acc;0;aac;1;agc;3;;att;0;acc;0;aac;1;agc;2;;att;1;acc;0;aac;0;agc;1 ctc;10;ccc;1;cac;3;cgc;0;;ctc;2;ccc;0;cac;2;cgc;0;;ctc;8;ccc;1;cac;1;cgc;0 gtc;1;gcc;0;gac;1;ggt;2;;gtc;1;gcc;0;gac;0;ggt;2;;gtc;1;gcc;0;gac;1;ggt;1 tta;14;tca;12;taa;1;tga;10;;tta;8;tca;7;taa;2;tga;6;;tta;5;tca;3;taa;0;tga;4 ata;27;aca;8;aaa;6;aga;8;;ata;26;aca;4;aaa;5;aga;5;;ata;0;aca;4;aaa;1;aga;3 cta;13;cca;5;caa;2;cga;6;;cta;9;cca;4;caa;1;cga;2;;cta;3;cca;1;caa;1;cga;4 gta;18;gca;6;gaa;2;gga;4;;gta;10;gca;4;gaa;1;gga;0;;gta;8;gca;2;gaa;1;gga;4 ttg;4;tcg;19;tag;1;tgg;2;;ttg;3;tcg;17;tag;2;tgg;1;;ttg;1;tcg;2;tag;0;tgg;1 atg;0;acg;23;aag;1;agg;25;;atg;0;acg;5;aag;0;agg;5;;atg;0;acg;18;aag;1;agg;20 ctg;12;ccg;10;cag;13;cgg;24;;ctg;3;ccg;8;cag;4;cgg;5;;ctg;9;ccg;2;cag;9;cgg;19 gtg;15;gcg;7;gag;7;ggg;21;;gtg;4;gcg;4;gag;1;ggg;5;;gtg;11;gcg;3;gag;6;ggg;15
C42.GDI Les duplications
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:C42.GDI Les duplications.
- Légende:
Les duplications;;;;;;;;;;;;;;;; in;dblei;;;;;;;;in;difi;;;;;; ttt;0;tct;5;tat;0;tgt;0;;ttt;1;tct;16;tat;0;tgt;0 atc;0;act;0;aat;0;agt;0;;atc;0;act;8;aat;0;agt;0 ctt;43;cct;33;cat;0;cgt;14;;ctt;52;cct;62;cat;0;cgt;24 gtt;9;gct;14;gat;0;ggc;14;;gtt;23;gct;79;gat;0;ggc;43 ttc;84;tcc;0;tac;83;tgc;1;;ttc;110;tcc;0;tac;111;tgc;17 att;27;acc;0;aac;22;agc;24;;att;83;acc;0;aac;54;agc;79 ctc;0;ccc;0;cac;19;cgc;0;;ctc;0;ccc;0;cac;39;cgc;0 gtc;0;gcc;0;gac;25;ggt;0;;gtc;0;gcc;0;gac;65;ggt;0 tta;5;tca;2;taa;0;tga;0;;tta;11;tca;14;taa;0;tga;1 ata;2;aca;0;aaa;35;aga;0;;ata;16;aca;12;aaa;48;aga;5 cta;6;cca;31;caa;1;cga;25;;cta;30;cca;98;caa;38;cga;34 gta;1;gca;1;gaa;2;gga;1;;gta;2;gca;17;gaa;20;gga;13 ttg;34;tcg;2;tag;0;tgg;32;;ttg;84;tcg;26;tag;0;tgg;59 atg;0;acg;0;aag;71;agg;3;;atg;11;acg;9;aag;79;agg;14 ctg;6;ccg;0;cag;3;cgg;1;;ctg;35;ccg;13;cag;30;cgg;4 gtg;3;gcg;1;gag;36;ggg;0;;gtg;12;gcg;15;gag;81;ggg;11 ;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;; sin;dbles;;;;;;;;sin;difs;;;;;; ttt;0;tct;198;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;33;tat;0;tgt;0 atc;0;act;194;aat;0;agt;0;;atc;0;act;24;aat;0;agt;0 ctt;10;cct;10;cat;0;cgt;99;;ctt;6;cct;1;cat;0;cgt;13 gtt;261;gct;219;gat;0;ggc;340;;gtt;42;gct;10;gat;0;ggc;8 ttc;16;tcc;0;tac;0;tgc;59;;ttc;6;tcc;0;tac;0;tgc;19 att;194;acc;0;aac;135;agc;4;;att;14;acc;0;aac;24;agc;0 ctc;5;ccc;0;cac;85;cgc;0;;ctc;1;ccc;0;cac;9;cgc;0 gtc;0;gcc;0;gac;230;ggt;0;;gtc;0;gcc;0;gac;16;ggt;0 tta;66;tca;22;taa;0;tga;0;;tta;10;tca;6;taa;0;tga;0 ata;0;aca;22;aaa;6;aga;133;;ata;0;aca;18;aaa;2;aga;18 cta;1;cca;21;caa;96;cga;1;;cta;1;cca;4;caa;19;cga;1 gta;5;gca;54;gaa;141;gga;36;;gta;7;gca;16;gaa;20;gga;21 ttg;30;tcg;2;tag;0;tgg;27;;ttg;1;tcg;3;tag;0;tgg;3 atg;85;acg;5;aag;173;agg;2;;atg;40;acg;7;aag;7;agg;1 ctg;1;ccg;0;cag;41;cgg;3;;ctg;3;ccg;1;cag;12;cgg;5 gtg;15;gcg;4;gag;79;ggg;4;;gtg;5;gcg;2;gag;10;ggg;4 ;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;; isi;dbleisi;;;;;;;;isi;difisi;;;;;; ttt;0;tct;8;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;8;tat;0;tgt;0 atc;0;act;27;aat;0;agt;0;;atc;0;act;37;aat;0;agt;0 ctt;13;cct;8;cat;0;cgt;13;;ctt;15;cct;3;cat;0;cgt;33 gtt;6;gct;15;gat;0;ggc;6;;gtt;18;gct;10;gat;0;ggc;34 ttc;11;tcc;0;tac;8;tgc;1;;ttc;27;tcc;0;tac;8;tgc;6 att;10;acc;0;aac;13;agc;3;;att;8;acc;0;aac;7;agc;4 ctc;0;ccc;0;cac;8;cgc;0;;ctc;0;ccc;0;cac;18;cgc;0 gtc;0;gcc;0;gac;12;ggt;0;;gtc;0;gcc;0;gac;19;ggt;0 tta;0;tca;0;taa;0;tga;0;;tta;1;tca;6;taa;0;tga;0 ata;0;aca;0;aaa;11;aga;1;;ata;0;aca;6;aaa;12;aga;10 cta;0;cca;4;caa;0;cga;4;;cta;1;cca;6;caa;0;cga;5 gta;0;gca;3;gaa;7;gga;9;;gta;9;gca;8;gaa;20;gga;24 ttg;0;tcg;1;tag;0;tgg;5;;ttg;3;tcg;4;tag;0;tgg;7 atg;47;acg;0;aag;35;agg;0;;atg;99;acg;4;aag;20;agg;8 ctg;6;ccg;0;cag;0;cgg;1;;ctg;7;ccg;1;cag;21;cgg;3 gtg;3;gcg;6;gag;18;ggg;1;;gtg;14;gcg;6;gag;30;ggg;10 ;;;;;;;;;;;;;;;; tRNAi;;;;;;;;;tRNAs;;;;;;; ttt;0;tct;5;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;11;tat;0;tgt;0 atc;0;act;21;aat;0;agt;0;;att;5;act;43;aat;0;agt;0 ctt;20;cct;10;cat;0;cgt;31;;ctt;8;cct;1;cat;0;cgt;15 gtt;18;gct;12;gat;0;ggc;33;;gtt;6;gct;13;gat;0;ggc;7 ttc;31;tcc;0;tac;12;tgc;0;;ttc;7;tcc;0;tac;4;tgc;7 att;13;acc;0;aac;2;agc;3;;atc;0;acc;0;aac;18;agc;4 ctc;0;ccc;0;cac;13;cgc;0;;ctc;0;ccc;0;cac;13;cgc;0 gtc;0;gcc;0;gac;20;ggt;0;;gtc;0;gcc;0;gac;11;ggt;0 tta;0;tca;3;taa;0;tga;0;;tta;1;tca;3;taa;0;tga;0 ata;0;aca;3;aaa;12;aga;3;;ata;0;aca;3;aaa;11;aga;8 cta;0;cca;6;caa;0;cga;4;;cta;1;cca;4;caa;0;cga;5 gta;1;gca;9;gaa;10;gga;14;;gta;8;gca;2;gaa;17;gga;19 ttg;1;tcg;1;tag;0;tgg;3;;ttg;2;tcg;4;tag;0;tgg;9 atg;67;acg;1;aag;27;agg;1;;atg;79;acg;3;aag;28;agg;7 ctg;10;ccg;0;cag;17;cgg;0;;ctg;3;ccg;1;cag;4;cgg;4 gtg;2;gcg;1;gag;31;ggg;6;;gtg;15;gcg;11;gag;17;ggg;5
C42.GDI Les rapports des duplications doublons-différents
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Les rapports des duplications doublons-différents.
- Légende:
Les rapports;;;;;;;;;;;;;;;; ri;;;;;;;;;1/rs;;;;;;; ttt;0;tct;3.2;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;6.0;tat;0;tgt;0 atc;0;act;8;aat;0;agt;0;;atc;0;act;8.1;aat;0;agt;0 ctt;1.2;cct;1.9;cat;0;cgt;1.7;;ctt;1.7;cct;10;cat;0;cgt;7.6 gtt;2.6;gct;5.6;gat;0;ggc;3.1;;gtt;6.2;gct;22;gat;0;ggc;43 ttc;1.3;tcc;0;tac;1.3;tgc;17;;ttc;2.7;tcc;0;tac;0;tgc;3.1 att;3.1;acc;0;aac;2.5;agc;3.3;;att;14;acc;0;aac;5.6;agc;4 ctc;0;ccc;0;cac;2.1;cgc;0;;ctc;5.0;ccc;0;cac;9.4;cgc;0 gtc;0;gcc;0;gac;2.6;ggt;0;;gtc;0;gcc;0;gac;14;ggt;0 tta;2.2;tca;7.0;taa;0;tga;0;;tta;6.6;tca;3.7;taa;0;tga;0 ata;8;aca;12;aaa;1.4;aga;5;;ata;0;aca;1.2;aaa;3.0;aga;7.4 cta;5.0;cca;3.2;caa;38;cga;1.4;;cta;1.0;cca;5.3;caa;5.1;cga;1.0 gta;2.0;gca;17;gaa;10;gga;13;;gta;0.7;gca;3.4;gaa;7.1;gga;1.7 ttg;2.5;tcg;13;tag;0;tgg;1.8;;ttg;30;tcg;0.7;tag;0;tgg;9.0 atg;11;acg;9;aag;1.1;agg;4.7;;atg;2.1;acg;0.7;aag;25;agg;2.0 ctg;5.8;ccg;13;cag;10;cgg;4.0;;ctg;0.3;ccg;0;cag;3.4;cgg;0.6 gtg;4.0;gcg;15;gag;2.3;ggg;11;;gtg;3.0;gcg;2.0;gag;7.9;ggg;1.0 ;;;;;;;;;;;;;;;; rsi;;;;;;;;;s/i;;;;;;; ttt;0;tct;1.0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;2.2;tat;0;tgt;0 atc;0;act;1.4;aat;0;agt;0;;atc;0;act;2.0;aat;0;agt;0 ctt;1.2;cct;0.4;cat;0;cgt;2.5;;ctt;0.4;cct;0.1;cat;0;cgt;0 gtt;3.0;gct;0.7;gat;0;ggc;5.7;;gtt;0.3;gct;1.1;gat;0;ggc;0 ttc;2.5;tcc;0;tac;1.0;tgc;6.0;;ttc;0.2;tcc;0;tac;0.3;tgc;7 att;0.8;acc;0;aac;0.5;agc;1.3;;att;0.4;acc;0;aac;9.0;agc;1.3 ctc;0;ccc;0;cac;2.3;cgc;0;;ctc;0;ccc;0;cac;1.0;cgc;0 gtc;0;gcc;0;gac;1.6;ggt;0;;gtc;0;gcc;0;gac;0.6;ggt;0 tta;1;tca;6;taa;0;tga;0;;tta;1;tca;1.0;taa;0;tga;0 ata;0;aca;6;aaa;1.1;aga;10;;ata;0;aca;1.0;aaa;0.9;aga;2.7 cta;1;cca;1.5;caa;0;cga;1.3;;cta;1;cca;0.7;caa;0;cga;1.3 gta;9;gca;2.7;gaa;2.9;gga;2.7;;gta;8.0;gca;0.2;gaa;1.7;gga;1.4 ttg;3;tcg;4.0;tag;0;tgg;1.4;;ttg;2.0;tcg;4.0;tag;0;tgg;3.0 atg;2.1;acg;4;aag;0.6;agg;8;;atg;1.2;acg;3.0;aag;1.0;agg;7.0 ctg;1.2;ccg;1;cag;21;cgg;3.0;;ctg;0.3;ccg;1;cag;0.2;cgg;4 gtg;4.7;gcg;1.0;gag;1.7;ggg;10;;gtg;7.5;gcg;11;gag;0.5;ggg;0.8
C42.GDI Total duplications
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:C42.GDI Total duplications.
- Légende:
Total duplications;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; in;dble+dif;;;;;;;;sin;dble+dif;;;;;;;;isi;dble+dif;;;;;; ttt;0;tct;21;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;231;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;16;tat;0;tgt;0 atc;0;act;8;aat;0;agt;0;;atc;0;act;218;aat;0;agt;0;;atc;0;act;64;aat;0;agt;0 ctt;95;cct;95;cat;0;cgt;38;;ctt;16;cct;11;cat;0;cgt;112;;ctt;28;cct;11;cat;0;cgt;46 gtt;32;gct;93;gat;0;ggc;57;;gtt;303;gct;229;gat;0;ggc;348;;gtt;24;gct;25;gat;0;ggc;40 ttc;194;tcc;0;tac;194;tgc;18;;ttc;22;tcc;0;tac;0;tgc;78;;ttc;38;tcc;0;tac;16;tgc;7 att;110;acc;0;aac;76;agc;103;;att;208;acc;0;aac;159;agc;4;;att;18;acc;0;aac;20;agc;7 ctc;0;ccc;0;cac;58;cgc;0;;ctc;0;ccc;0;cac;94;cgc;0;;ctc;0;ccc;0;cac;26;cgc;0 gtc;0;gcc;0;gac;90;ggt;0;;gtc;0;gcc;0;gac;246;ggt;0;;gtc;0;gcc;0;gac;31;ggt;0 tta;16;tca;16;taa;0;tga;1;;tta;76;tca;28;taa;0;tga;0;;tta;1;tca;6;taa;0;tga;0 ata;18;aca;12;aaa;83;aga;5;;ata;0;aca;40;aaa;8;aga;151;;ata;0;aca;6;aaa;23;aga;11 cta;36;cca;129;caa;39;cga;59;;cta;2;cca;25;caa;115;cga;2;;cta;1;cca;10;caa;0;cga;9 gta;3;gca;18;gaa;22;gga;14;;gta;12;gca;70;gaa;161;gga;57;;gta;9;gca;11;gaa;27;gga;33 ttg;118;tcg;28;tag;0;tgg;91;;ttg;31;tcg;5;tag;0;tgg;30;;ttg;3;tcg;5;tag;0;tgg;12 atg;11;acg;9;aag;150;agg;17;;atg;125;acg;12;aag;180;agg;3;;atg;146;acg;4;aag;55;agg;8 ctg;41;ccg;13;cag;33;cgg;5;;ctg;4;ccg;1;cag;53;cgg;8;;ctg;13;ccg;1;cag;21;cgg;4 gtg;15;gcg;16;gag;117;ggg;11;;gtg;20;gcg;6;gag;89;ggg;8;;gtg;17;gcg;12;gag;48;ggg;11 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; in;dble+dif;;%;;;;;;sin;dble+dif;;%;;;;;;isi;dble+dif;;%;;;; ttt;0;tct;8;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;86;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;6;tat;0;tgt;0 atc;0;act;3;aat;0;agt;0;;atc;0;act;75;aat;0;agt;0;;atc;0;act;22;aat;0;agt;0 ctt;68;cct;81;cat;0;cgt;19;;ctt;12;cct;9;cat;0;cgt;57;;ctt;20;cct;9;cat;0;cgt;23 gtt;9;gct;27;gat;0;ggc;13;;gtt;84;gct;66;gat;0;ggc;78;;gtt;7;gct;7;gat;0;ggc;9 ttc;76;tcc;0;tac;92;tgc;17;;ttc;9;tcc;0;tac;0;tgc;76;;ttc;15;tcc;0;tac;8;tgc;7 att;33;acc;0;aac;30;agc;90;;att;62;acc;0;aac;62;agc;4;;att;5;acc;0;aac;8;agc;6 ctc;0;ccc;0;cac;33;cgc;0;;ctc;0;ccc;0;cac;53;cgc;0;;ctc;0;ccc;0;cac;15;cgc;0 gtc;0;gcc;0;gac;25;ggt;0;;gtc;0;gcc;0;gac;67;ggt;0;;gtc;0;gcc;0;gac;8;ggt;0 tta;17;tca;32;taa;0;tga;100;;tta;82;tca;56;taa;0;tga;0;;tta;1;tca;12;taa;0;tga;0 ata;100;aca;21;aaa;73;aga;3;;ata;0;aca;69;aaa;7;aga;90;;ata;0;aca;10;aaa;20;aga;7 cta;92;cca;79;caa;25;cga;84;;cta;5;cca;15;caa;75;cga;3;;cta;3;cca;6;caa;0;cga;13 gta;13;gca;18;gaa;10;gga;13;;gta;50;gca;71;gaa;77;gga;55;;gta;38;gca;11;gaa;13;gga;32 ttg;78;tcg;74;tag;0;tgg;68;;ttg;20;tcg;13;tag;0;tgg;23;;ttg;2;tcg;13;tag;0;tgg;9 atg;4;acg;36;aag;39;agg;61;;atg;44;acg;48;aag;47;agg;11;;atg;52;acg;16;aag;14;agg;29 ctg;71;ccg;87;cag;31;cgg;29;;ctg;7;ccg;7;cag;50;cgg;47;;ctg;22;ccg;7;cag;20;cgg;24 gtg;29;gcg;47;gag;46;ggg;37;;gtg;38;gcg;18;gag;35;ggg;27;;gtg;33;gcg;35;gag;19;ggg;37
C42.GDI Synthèse
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:C42.GDI Synthèse.
- Légende:
C42;;;;;;;;;;intron;;;;;;in;;sin;;isi;;tRNAis;;;;;;total;;;%;;; obligat;aa;Trad;ADN;alpha;zéros;unit1;sint/tot;tRNA;sin_t;in_t;sin_1;in_1;gen_isi;gen sin;gen in;dblei;difi;dbles;difs;dbleisi;difisi;tRNAi;tRNAs;ri;1/rs;rsi;s/i;in;sin;isi;in;sin;isi; 57;Met;12;15;atg;0;0;0.69;324;222;102;0;0;20;18;4;0;11;85;40;47;99;67;79;11;2.1;2.1;1.2;11;125;146;4;44;52;atg 17;Ile;9;7;att;0;1;0.63;378;239;139;1;0;2;26;14;27;83;194;14;10;8;13;5;3.1;14;0.8;0.4;110;208;18;33;62;5;att 13;Asn;42;39;aac;0;1;0.68;297;203;94;0;1;3;26;13;22;54;135;24;13;7;2;18;2.5;5.6;0.5;9.0;76;159;20;30;62;8;aac 24;Ala;29;24;gct;0;1;0.69;389;270;119;1;0;2;28;12;14;79;219;10;15;10;12;13;5.6;22;0.7;1.1;93;229;25;27;66;7;gct 14;Asp;46;40;gac;0;1;0.69;409;284;125;1;0;4;27;11;25;65;230;16;12;19;20;11;2.6;14;1.6;0.6;90;246;31;25;67;8;gac 28;Gly;62;56;ggc;0;1;0.79;487;386;101;1;0;4;31;7;14;43;340;8;6;34;33;7;3.1;43;5.7;0.2;57;348;40;13;78;9;ggc 27;Val;13;8;gtt;0;1;0.85;401;342;59;1;0;3;33;6;9;23;261;42;6;18;18;6;2.6;6.2;3.0;0.3;32;303;24;9;84;7;gtt 23;Thr;25;23;act;0;1;0.87;332;290;42;1;0;10;29;3;0;8;194;24;27;37;21;43;8;8.1;1.4;2.0;8;218;64;3;75;22;act 11;Tyr;34;37;tac;0;2;0.02;252;4;248;0;2;3;0;39;83;111;0;0;8;8;12;4;1.3;0;1.0;0.3;194;0;16;92;0;8;tac 15;Phe;2;5;ttc;0;2;0.12;296;36;260;1;1;4;7;31;84;110;16;6;11;27;31;7;1.3;2.7;2.5;0.2;194;22;38;76;9;15;ttc 26;Arg;53;54;cgt;0;2;0.62;238;147;91;2;0;8;20;14;14;24;99;13;13;33;31;15;1.7;7.6;2.5;0.5;38;112;46;19;57;23;cgt 32;Gln;39;42;caa;0;2;0.70;196;137;59;1;1;0;22;20;1;38;96;19;0;0;0;0;38;5.1;0;0;39;115;0;25;75;0;caa 34;Glu;47;44;gaa;0;2;0.80;252;202;50;1;1;9;24;9;2;20;141;20;7;20;10;17;10;7.1;2.9;1.7;22;161;27;10;77;13;gaa 21;Ser;17;21;tct;0;2;0.89;310;275;35;1;1;3;33;6;5;16;198;33;8;8;5;11;3.2;6.0;1.0;2.2;21;231;16;8;86;6;tct 12;His;38;38;cac;0;3;0.59;220;130;90;1;2;4;23;15;19;39;85;9;8;18;13;13;2.1;9.4;2.3;1.0;58;94;26;33;53;15;cac 48;Gly;63;60;gga;0;4;0.71;146;104;42;4;0;10;28;4;1;13;36;21;9;24;14;19;13;1.7;2.7;1.4;14;57;33;13;55;32;gga 44;Ala;31;28;gca;0;6;0.70;141;98;43;2;4;2;26;14;1;17;54;16;3;8;9;2;17;3.4;2.7;0.2;18;70;11;18;71;11;gca 54;Glu;48;48;gag;0;7;0.45;296;132;164;6;1;5;26;11;36;81;79;10;18;30;31;17;2.3;7.9;1.7;0.5;117;89;48;46;35;19;gag 43;Thr;27;27;aca;0;8;0.70;100;70;30;4;4;3;27;12;0;12;22;18;0;6;3;3;12;1.2;6;1.0;12;40;6;21;69;10;aca 41;Ser;19;25;tca;0;12;0.53;92;49;43;3;7;3;18;21;2;14;22;6;0;6;3;3;7.0;3.7;6;1.0;16;28;6;32;56;12;tca 52;Gln;40;46;cag;0;13;0.56;149;84;65;9;4;3;27;12;3;30;41;12;0;21;17;4;10;3.4;21;0.2;33;53;21;31;50;20;cag 67;Val;16;16;gtg;0;15;0.61;94;57;37;11;4;6;22;14;3;12;15;5;3;14;2;15;4.0;3.0;4.7;7.5;15;20;17;29;38;33;gtg 61;Ser;20;29;tcg;0;19;0.18;80;14;66;2;17;2;5;35;2;26;2;3;1;4;1;4;13;0.7;4.0;4.0;28;5;5;74;13;13;tcg 53;Lys;44;47;aag;1;1;0.54;426;228;198;1;0;4;20;17;71;79;173;7;35;20;27;28;1.1;25;0.6;1.0;150;180;55;39;47;14;aag 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47;Val;15;12;gta;2;18;0.61;64;39;25;8;10;8;19;13;1;2;5;7;0;9;1;8;2.0;0.7;9;8.0;3;12;9;13;50;38;gta 35;Leu;3;9;tta;3;14;0.75;132;99;33;5;8;1;22;16;5;11;66;10;0;1;0;1;2.2;6.6;1;1;16;76;1;17;82;1;tta 68;Gly;64;64;ggg;3;21;0.52;69;36;33;15;5;4;23;12;0;11;4;4;1;10;6;5;11;1.0;10.0;0.8;11;8;11;37;27;37;ggg 55;Leu;4;13;ttg;4;4;0.21;190;39;151;1;3;2;6;30;34;84;30;1;0;3;1;2;2.5;30;3;2.0;118;31;3;78;20;2;ttg 22;Pro;21;22;cct;4;16;0.19;155;30;125;12;4;1;18;19;33;62;10;1;8;3;10;1;1.9;10;0.4;0.1;95;11;11;81;9;9;cct 66;Arg;56;62;cgg;4;24;0.69;55;38;17;19;5;2;26;10;1;4;3;5;1;3;0;4;4.0;0.6;3.0;4;5;8;4;29;47;24;cgg 45;Leu;7;10;cta;6;13;0.09;75;7;68;3;9;1;4;31;6;30;1;1;0;1;0;1;5.0;1.0;1;1;36;2;1;92;5;3;cta 25;Leu;5;6;ctt;10;5;0.20;170;34;136;2;3;2;10;19;43;52;10;6;13;15;20;8;1.2;1.7;1.2;0.4;95;16;28;68;12;20;ctt 65;Leu;8;14;ctg;11;12;0.20;89;18;71;9;3;2;11;18;6;35;1;3;6;7;10;3;5.8;0.3;1.2;0.3;41;4;13;71;7;22;ctg 64;Ala;32;32;gcg;16;7;0.42;60;25;35;3;4;4;8;14;1;15;4;2;6;6;1;11;15;2.0;1.0;11;16;6;12;47;18;35;gcg 46;Arg;55;58;cga;20;6;0.14;92;13;79;4;2;3;6;13;25;34;1;1;4;5;4;5;1.4;1.0;1.3;1.3;59;2;9;84;3;13;cga 62;Pro;24;30;ccg;21;10;0.14;36;5;31;2;8;1;3;17;0;13;0;1;0;1;0;1;13;0;1;1;13;1;1;87;7;7;ccg 85;Leu;6;2;ctc;30;10;0.89;18;16;2;8;2;0;10;2;0;0;5;1;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;ctc 36;SeC;51;57;tga;31;10;0.33;12;4;8;4;6;0;4;7;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;100;0;0;tga 77;Ile;10;3;atc;36;6;0.83;6;5;1;5;2;0;5;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;atc 71;Tyr;33;33;tat;40;2;0;2;2;0;2;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;tat 73;Asn;41;35;aat;40;2;0;2;0;2;0;2;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;aat 74;Asp;45;36;gat;40;2;0;2;0;2;0;2;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;gat 88;Gly;61;52;ggt;40;2;0;2;1;1;1;2;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;ggt 75;Phe;1;1;ttt;41;0;0;2;0;2;0;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;ttt 82;Pro;22;18;ccc;41;1;0;1;1;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;ccc 76;Cys;49;49;tgt;41;1;0;1;0;1;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;tgt 87;Val;14;4;gtc;41;1;0;1;0;1;1;1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;gtc 81;Ser;18;17;tcc;41;1;0;1;0;1;0;2;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;tcc 31;Stp;35;41;taa;41;1;0;1;0;1;0;2;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;taa 51;Stp;36;45;tag;41;1;0;1;0;1;0;2;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;tag 83;Thr;26;19;acc;42;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;acc 84;Ala;30;20;gcc;42;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;gcc 72;His;37;34;cat;42;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;cat 86;Arg;54;50;cgc;42;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;cgc 78;Ser;57;51;agt;42;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;agt
C42.GDI Méthode
[modifier | modifier le wikicode]C42.GDI Niveau 1
[modifier | modifier le wikicode]- exception: 6*? voir les décomptes des duplications
C42;tot;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;6* ?;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;C42;diff;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;6* ?;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;C42;dble;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;6* ?;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;C42;dif;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;6* ?;;;;;;;;;;;;;;;;;;; gène;ani;aor;bfu;cal;cgr;cjd*;cneg*;cot;dha;ecu;ede*;fgr;fgr5;fve*;fvr;kaf;kla;kna*;kpa*;lkl*;lth;mfa*;mgr;mth*;ncr;ncs;opa*;pch*;pic;sas*;sce;spo;sre*;tbl;tdl;tpf;ttt;uma;vda;vma*;yli;zro;unit1;zéros;tRNA;gène;ani;aor;bfu;cal;cgr;cjd*;cneg*;cot;dha;ecu;ede*;fgr;fgr5;fve*;fvr;kaf;kla;kna*;kpa*;lkl*;lth;mfa*;mgr;mth*;ncr;ncs;opa*;pch*;pic;sas*;sce;spo;sre*;tbl;tdl;tpf;ttt;uma;vda;vma*;yli;zro;;;;gène;ani;aor;bfu;cal;cgr;cjd*;cneg*;cot;dha;ecu;ede*;fgr;fgr5;fve*;fvr;kaf;kla;kna*;kpa*;lkl*;lth;mfa*;mgr;mth*;ncr;ncs;opa*;pch*;pic;sas*;sce;spo;sre*;tbl;tdl;tpf;ttt;uma;vda;vma*;yli;zro;;;;gène;ani;aor;bfu;cal;cgr;cjd*;cneg*;cot;dha;ecu;ede*;fgr;fgr5;fve*;fvr;kaf;kla;kna*;kpa*;lkl*;lth;mfa*;mgr;mth*;ncr;ncs;opa*;pch*;pic;sas*;sce;spo;sre*;tbl;tdl;tpf;ttt;uma;vda;vma*;yli;zro 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C42.GDI Niveau 2
[modifier | modifier le wikicode]- Exceptions: ? d’après fasta et non d’après le tableau des introns pour sre* et uma, erreur d’affichage pour ede*. fgr et fgr5 correction des introns dans la base, Relevé du 30.1.19
C42;intron;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; gène;ani;aor;bfu;cal;cgr;cjd*;cneg*;cot;dha;ecu;ede*;fgr;fgr5;fve*;fvr;kaf;kla;kna*;kpa*;lkl*;lth;mfa*;mgr;mth*;ncr;ncs;opa*;pch*;pic;sas*;sce;spo;sre*;tbl;tdl;tpf;ttt;uma;vda;vma*;yli;zro;introns aaa;2;3;1;1;3;4;1;0;7;0;1;2;2;6;2;8;4;4;3;5;4;6;0;0;2;8;2;1;3;3;7;0;1;9;5;6;1;1;2;0;4;7;131 aac;6;0;6;3;0;0;4;0;0;0;1;9;9;12;8;0;0;0;0;0;0;0;6;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;6;3;16;0;94 aag;0;11;8;2;0;0;7;3;10;0;0;12;12?;11;15;0;0;0;0;0;0;10;6;9;5;0;0;0;9;0;0;9;5;0;0;0;6;5;0;9;34;0;198 aat;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2 aca;2;2;2;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;2;2;3;0;0;2;0;0;0;0;1;0;0;0;1;1;3;3;3;0;30 acc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 acg;2;2;0;1;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;2;3;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;2;1;3;2;1;0;25 act;1;0;3;0;0;0;5;0;0;0;2;0;0;5;4;0;0;0;0;0;0;0;4;2;2;0;0;6;0;0;0;0;1;0;0;0;4;0;0;3;0;0;42 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C42.GDI Niveau 3
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C42.GDI Niveau 4
[modifier | modifier le wikicode]- Calculs à droite de tRNAi et tRNAs
;;;;C42;in tot;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;C42;in diff;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;C42;in dble;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;C42;in dif;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;introns-in(tot);;;duplications effectives;;;;;duplications effectives; gen_in;nbsi0;nbvide;;gène;ani;aor;bfu;cal;cgr;cjd*;cneg*;cot;dha;ecu;ede*;fgr;fgr5;fve*;fvr;kaf;kla;kna*;kpa*;lkl*;lth;mfa*;mgr;mth*;ncr;ncs;opa*;pch*;pic;sas*;sce;spo;sre*;tbl;tdl;tpf;ttt;uma;vda;vma*;yli;zro;tot;in;in_1;gène;ani;aor;bfu;cal;cgr;cjd*;cneg*;cot;dha;ecu;ede*;fgr;fgr5;fve*;fvr;kaf;kla;kna*;kpa*;lkl*;lth;mfa*;mgr;mth*;ncr;ncs;opa*;pch*;pic;sas*;sce;spo;sre*;tbl;tdl;tpf;ttt;uma;vda;vma*;yli;zro;diff;in;;gène;ani;aor;bfu;cal;cgr;cjd*;cneg*;cot;dha;ecu;ede*;fgr;fgr5;fve*;fvr;kaf;kla;kna*;kpa*;lkl*;lth;mfa*;mgr;mth*;ncr;ncs;opa*;pch*;pic;sas*;sce;spo;sre*;tbl;tdl;tpf;ttt;uma;vda;vma*;yli;zro;dble;in;;gène;ani;aor;bfu;cal;cgr;cjd*;cneg*;cot;dha;ecu;ede*;fgr;fgr5;fve*;fvr;kaf;kla;kna*;kpa*;lkl*;lth;mfa*;mgr;mth*;ncr;ncs;opa*;pch*;pic;sas*;sce;spo;sre*;tbl;tdl;tpf;ttt;uma;vda;vma*;yli;zro;dif;in;;;;introns isi;;;tRNAi;introns isi − gen_isi;;;;tRNAs;isi dble+isi dif − tRNAi 29;0;13;;aaa;2;3;;;3;;1;;;;1;;2;6;2;8;4;4;3;5;4;6;;;2;8;2;1;3;;7;;1;9;5;6;;1;2;;4;7;aaa;112;5;aaa;2;3;;;1;;1;;;;1;;2;6;2;7;2;3;3;4;2;4;;;2;6;2;1;3;;2;;1;3;3;2;;1;2;;4;2;aaa;77;;aaa;;;;;2;;;;;;;;;;;1;2;1;;1;2;2;;;;2;;;;;5;;;6;2;4;;;;;;5;aaa;35;;aaa;1;2;;;;;;;;;;;1;5;1;6;1;2;2;3;1;3;;;1;5;1;;2;;1;;;2;2;1;;;1;;3;1;aaa;48;;;;19;;;12;;;;;11; 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C42.GDI Niveau 5
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C42.GDI Niveau 6
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C42.GDI Niveau 7
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10;32;0;;tgg;3;4;0;0;0;0;0;0;4;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;4;0;7;0;0;0;4;0;0;3;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;tgg;40;1;tgg;1;1;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;2;0;0;0;1;0;0;1;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;tgg;13;;tgg;2;3;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;3;0;5;0;0;0;3;0;0;2;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;tgg;27;;tgg;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;tgg;3 0;42;0;;tgt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;tgt;0;0;tgt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;tgt;0;;tgt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;tgt;0;;tgt;;0;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;tgt;0 22;20;0;;tta;0;3;0;0;3;1;0;0;10;1;0;0;0;0;0;14;3;3;1;3;2;4;0;0;0;7;1;0;3;3;7;0;0;12;3;9;0;0;0;0;1;4;tta;98;5;tta;0;3;0;0;1;1;0;0;2;1;0;0;0;0;0;3;2;1;1;1;1;2;0;0;0;2;1;0;1;2;1;0;0;2;1;1;0;0;0;0;1;1;tta;32;;tta;0;0;0;0;2;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;11;1;2;0;2;1;2;0;0;0;5;0;0;2;1;6;0;0;10;2;8;0;0;0;0;0;3;tta;66;;tta;0;2;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;2;1;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;;1;0;0;0;;0;;0;0;tta;10 7;35;0;;ttc;0;0;0;0;0;8;0;2;0;1;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;5;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;ttc;29;1;ttc;0;0;0;0;0;4;0;2;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;2;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;ttc;13;;ttc;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;3;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;ttc;16;;ttc;0;0;0;0;0;3;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;ttc;6 6;36;0;;ttg;0;0;0;0;0;7;0;0;4;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;14;0;0;0;0;3;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;ttg;37;1;ttg;0;0;0;0;0;1;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;ttg;7;;ttg;0;0;0;0;0;6;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;12;0;0;0;0;2;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;ttg;30;;ttg;0;;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;;0;0;0;0;;0;0;0;0;;0;0;0;0;ttg;1 0;42;0;;ttt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;ttt;0;0;ttt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;ttt;0;;ttt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;ttt;0;;ttt;;;;;;;;;;;;;;0;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;ttt;0
Les introns des E79 eucaryotes: genèse duplications et introns
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Les introns des E79 eucaryotes: genèse duplications et introns.
- Légende: Pour plus de détails, voir la légende des C42 champignons pour la construction et la coloration de ces tableaux.
- − Source des données pour les codons étudiés ici aag aga ata atg caa cga tac ttg: effectifs des tRNAs, des introns et correspondance entre code KEGG et le nom de l'espèce.
- − Coloration: Ce sont les couleurs des C42 champignons, jaune pour les tRNAs à intron seuls, vert pour les tRNAs sans intron seuls, blanc pour le mélange des 2. Le nombre réduit des codons à étudier permet de sélectionner les zéros affichés du tableau des introns et de les colorer en vert (tRNAs sans intron). Le nombre réduit des cellules avec intron permet de différencier facilement celles qui n'ont que des tRNAs à introns (jaune) de celle qui en contiennent sans (blanc). Après il suffit de copier le tableau des introns coloré ainsi et de coller son format (ctrl+v) sur les tableaux des tRNAs (tot), diff, double (égale tot-diff), dif (égale diff-1).
- − Les décomptes se font manuellement suivant les couleurs sur le tableau tot en sélectionnant les cellules à sommer. On obtient ainsi le tableau des totaux (tot). Il suffit alors de copier et puis coller les formules (ctrl+v) de ce tableau sous les colonnes de diff, intron, double et dif pour obtenir les totaux de diff, introns, double et dif.
- − Les calculs pour les tableaux en fin des données sont expliqués dans les tableaux formatés pour la synthèse.
- Données pour tableur.
E79.GDI Les carrés
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:E79.GDI Les carrés.
- Note: Ici les tableaux des genèses, des duplications et des introns des tRNAs sont présentés sous forme de carrés plus faciles à lire pour contrôler les tableaux de
- Légende:
E79.GDI tRNAs et introns
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:E79.GDI tRNAs et introns.
- Légende:
tRNAs et introns;;;;;;;;;;;;;;;; tRNA;;;;;;;;;sint/tot;X100;;;;;; ttt;51;tct;920;tat;63;tgt;216;;ttt;78;tct;100;tat;63;tgt;100 atc;74;act;1201;aat;113;agt;80;;atc;81;act;99;aat;96;agt;98 ctt;936;cct;981;cat;36;cgt;920;;ctt;95;cct;98;cat;83;cgt;100 gtt;1153;gct;2141;gat;96;ggc;1563;;gtt;100;gct;100;gat;96;ggc;100 ttc;1195;tcc;169;tac;1464;tgc;2274;;ttc;100;tcc;86;tac;15;tgc;99 att;1468;acc;87;aac;1788;agc;1075;;att;100;acc;100;aac;100;agc;99 ctc;11;ccc;29;cac;1028;cgc;34;;ctc;91;ccc;83;cac;99;cgc;91 gtc;99;gcc;250;gac;1864;ggt;117;;gtc;100;gcc;100;gac;99;ggt;97 tta;592;tca;660;taa;169;tga;237;;tta;97;tca;98;taa;95;tga;99 ata;626;aca;969;aaa;1757;aga;1171;;ata;27;aca;99;aaa;97;aga;60 cta;486;cca;1054;caa;1796;cga;1938;;cta;100;cca;95;caa;92;cga;93 gta;730;gca;7013;gaa;6391;gga;5135;;gta;99;gca;100;gaa;100;gga;100 ttg;657;tcg;482;tag;108;tgg;1585;;ttg;39;tcg;100;tag;89;tgg;100 atg;2618;acg;609;aag;4270;agg;1035;;atg;94;acg;99;aag;92;agg;99 ctg;785;ccg;444;cag;1202;cgg;369;;ctg;99;ccg;98;cag;99;cgg;99 gtg;2602;gcg;4486;gag;2851;ggg;6665;;gtg;100;gcg;100;gag;100;ggg;100 ;;;;;;;;;;;;;;;; int;;;;;;;;;sin_t;;;;;;; ttt;11;tct;2;tat;23;tgt;1;;ttt;40;tct;918;tat;40;tgt;215 atc;14;act;10;aat;4;agt;2;;atc;60;act;1191;aat;109;agt;78 ctt;45;cct;17;cat;6;cgt;0;;ctt;891;cct;964;cat;30;cgt;920 gtt;3;gct;4;gat;4;ggc;7;;gtt;1150;gct;2137;gat;92;ggc;1556 ttc;2;tcc;23;tac;1239;tgc;13;;ttc;1193;tcc;146;tac;225;tgc;2261 att;5;acc;0;aac;8;agc;9;;att;1463;acc;87;aac;1780;agc;1066 ctc;1;ccc;5;cac;11;cgc;3;;ctc;10;ccc;24;cac;1017;cgc;31 gtc;0;gcc;1;gac;18;ggt;4;;gtc;99;gcc;249;gac;1846;ggt;113 tta;18;tca;13;taa;8;tga;3;;tta;574;tca;647;taa;161;tga;234 ata;454;aca;5;aaa;54;aga;469;;ata;172;aca;964;aaa;1703;aga;702 cta;2;cca;50;caa;148;cga;131;;cta;484;cca;1004;caa;1648;cga;1807 gta;5;gca;2;gaa;28;gga;21;;gta;725;gca;7011;gaa;6363;gga;5114 ttg;400;tcg;2;tag;12;tgg;5;;ttg;257;tcg;480;tag;96;tgg;1580 atg;149;acg;6;aag;321;agg;14;;atg;2469;acg;603;aag;3949;agg;1021 ctg;7;ccg;11;cag;17;cgg;4;;ctg;778;ccg;433;cag;1185;cgg;365 gtg;6;gcg;4;gag;13;ggg;15;;gtg;2596;gcg;4482;gag;2838;ggg;6650
E79.GDI Genèse
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:E79.GDI Genèse.
- Légende:
Genèse;;;;;;;;;;;;;;;; gen_in;;;;;;;;;gen_sin;;;;;;; ttt;4;tct;0;tat;8;tgt;1;;ttt;22;tct;76;tat;10;tgt;30 atc;4;act;0;aat;0;agt;0;;atc;22;act;71;aat;29;agt;16 ctt;0;cct;1;cat;1;cgt;0;;ctt;69;cct;73;cat;19;cgt;78 gtt;0;gct;0;gat;1;ggc;0;;gtt;77;gct;75;gat;32;ggc;74 ttc;0;tcc;2;tac;38;tgc;0;;ttc;76;tcc;23;tac;0;tgc;68 att;0;acc;0;aac;0;agc;0;;att;76;acc;23;aac;74;agc;72 ctc;1;ccc;2;cac;0;cgc;3;;ctc;8;ccc;15;cac;69;cgc;11 gtc;0;gcc;1;gac;0;ggt;1;;gtc;37;gcc;23;gac;77;ggt;15 tta;0;tca;0;taa;2;tga;1;;tta;71;tca;70;taa;35;tga;61 ata;34;aca;0;aaa;0;aga;1;;ata;9;aca;76;aaa;70;aga;21 cta;0;cca;0;caa;0;cga;0;;cta;74;cca;72;caa;71;cga;72 gta;0;gca;0;gaa;0;gga;0;;gta;74;gca;76;gaa;71;gga;70 ttg;33;tcg;0;tag;2;tgg;0;;ttg;13;tcg;78;tag;18;tgg;74 atg;0;acg;0;aag;0;agg;0;;atg;68;acg;71;aag;71;agg;73 ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;0;;ctg;72;ccg;75;cag;71;cgg;69 gtg;0;gcg;0;gag;0;ggg;0;;gtg;72;gcg;75;gag;73;ggg;68 ;;;;;;;;;;;;;;;; gen_isi;;;;;;;;;zéros;;;;;;; ttt;1;tct;1;tat;8;tgt;0;;ttt;52;tct;2;tat;52;tgt;48 atc;1;act;7;aat;4;agt;2;;atc;52;act;1;aat;46;agt;61 ctt;10;cct;4;cat;2;cgt;0;;ctt;0;cct;0;cat;57;cgt;1 gtt;2;gct;4;gat;2;ggc;4;;gtt;0;gct;0;gat;44;ggc;1 ttc;2;tcc;2;tac;41;tgc;9;;ttc;1;tcc;52;tac;0;tgc;1 att;3;acc;0;aac;5;agc;6;;att;0;acc;56;aac;0;agc;1 ctc;0;ccc;1;cac;9;cgc;0;;ctc;70;ccc;61;cac;1;cgc;65 gtc;0;gcc;0;gac;2;ggt;2;;gtc;42;gcc;55;gac;0;ggt;61 tta;8;tca;9;taa;1;tga;1;;tta;0;tca;0;taa;41;tga;16 ata;35;aca;3;aaa;8;aga;57;;ata;1;aca;0;aaa;1;aga;0 cta;2;cca;7;caa;8;cga;7;;cta;3;cca;0;caa;0;cga;0 gta;5;gca;2;gaa;8;gga;9;;gta;0;gca;1;gaa;0;gga;0 ttg;32;tcg;1;tag;7;tgg;4;;ttg;1;tcg;0;tag;53;tgg;1 atg;11;acg;5;aag;7;agg;5;;atg;0;acg;2;aag;1;agg;1 ctg;7;ccg;4;cag;8;cgg;2;;ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;8 gtg;6;gcg;4;gag;6;ggg;7;;gtg;1;gcg;0;gag;0;ggg;4
E79.GDI Absence de duplication
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:E79.GDI Absence de duplication.
- Légende:
Absence de duplication;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; unit1;;;;;;;;;in 1;;;;;;;;;sin 1;;;;;;; ttt;16;tct;2;tat;13;tgt;18;;ttt;3;tct;0;tat;6;tgt;1;;ttt;13;tct;2;tat;6;tgt;17 atc;10;act;0;aat;15;agt;5;;atc;2;act;0;aat;0;agt;0;;atc;8;act;0;aat;15;agt;5 ctt;3;cct;1;cat;15;cgt;0;;ctt;0;cct;0;cat;1;cgt;0;;ctt;3;cct;1;cat;14;cgt;0 gtt;1;gct;1;gat;21;ggc;0;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggc;0;;gtt;1;gct;1;gat;21;ggc;0 ttc;1;tcc;10;tac;1;tgc;1;;ttc;0;tcc;2;tac;1;tgc;0;;ttc;1;tcc;8;tac;0;tgc;1 att;1;acc;12;aac;1;agc;1;;att;0;acc;0;aac;0;agc;0;;att;1;acc;12;aac;1;agc;1 ctc;7;ccc;13;cac;0;cgc;8;;ctc;1;ccc;2;cac;0;cgc;3;;ctc;6;ccc;11;cac;0;cgc;5 gtc;23;gcc;11;gac;1;ggt;5;;gtc;0;gcc;1;gac;0;ggt;1;;gtc;23;gcc;10;gac;1;ggt;4 tta;3;tca;3;taa;19;tga;32;;tta;0;tca;0;taa;0;tga;1;;tta;3;tca;3;taa;19;tga;31 ata;6;aca;2;aaa;2;aga;2;;ata;4;aca;0;aaa;0;aga;0;;ata;2;aca;2;aaa;2;aga;2 cta;5;cca;3;caa;3;cga;4;;cta;0;cca;0;caa;0;cga;0;;cta;5;cca;3;caa;3;cga;4 gta;5;gca;3;gaa;2;gga;2;;gta;0;gca;0;gaa;0;gga;0;;gta;5;gca;3;gaa;2;gga;2 ttg;2;tcg;5;tag;5;tgg;1;;ttg;0;tcg;0;tag;2;tgg;0;;ttg;2;tcg;5;tag;4;tgg;1 atg;0;acg;4;aag;0;agg;1;;atg;0;acg;0;aag;0;agg;0;;atg;0;acg;4;aag;0;agg;1 ctg;1;ccg;5;cag;2;cgg;7;;ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;0;;ctg;1;ccg;5;cag;2;cgg;7 gtg;2;gcg;1;gag;2;ggg;3;;gtg;0;gcg;0;gag;0;ggg;0;;gtg;2;gcg;1;gag;2;ggg;3
E79.GDI Les duplications
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:E79.GDI Les duplications.
- Légende:
Duplications;;;;;;;;;;;;;;;; dblei;;;;;;;;;difi;;;;;;; ttt;1;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;4;tct;0;tat;3;tgt;0 atc;1;act;0;aat;0;agt;0;;atc;8;act;0;aat;0;agt;0 ctt;0;cct;1;cat;0;cgt;0;;ctt;0;cct;10;cat;0;cgt;0 gtt;0;gct;0;gat;1;ggc;0;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggc;0 ttc;0;tcc;0;tac;79;tgc;0;;ttc;0;tcc;0;tac;352;tgc;0 att;0;acc;0;aac;0;agc;0;;att;0;acc;0;aac;0;agc;0 ctc;0;ccc;0;cac;0;cgc;0;;ctc;0;ccc;0;cac;0;cgc;0 gtc;0;gcc;0;gac;0;ggt;0;;gtc;0;gcc;0;gac;0;ggt;0 tta;0;tca;0;taa;1;tga;0;;tta;0;tca;0;taa;2;tga;0 ata;2;aca;0;aaa;0;aga;0;;ata;93;aca;0;aaa;0;aga;4 cta;0;cca;0;caa;0;cga;0;;cta;0;cca;0;caa;0;cga;0 gta;0;gca;0;gaa;0;gga;0;;gta;0;gca;0;gaa;0;gga;0 ttg;12;tcg;0;tag;0;tgg;0;;ttg;135;tcg;0;tag;0;tgg;0 atg;0;acg;0;aag;0;agg;0;;atg;0;acg;0;aag;0;agg;0 ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;0;;ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;0 gtg;0;gcg;0;gag;0;ggg;0;;gtg;0;gcg;0;gag;0;ggg;0 ;;;;;;;;;;;;;;;; sin;dbles;;;;;;;;sin;difs;;;;;; ttt;0;tct;501;tat;0;tgt;10;;ttt;14;tct;333;tat;13;tgt;175 atc;5;act;458;aat;1;agt;8;;atc;32;act;583;aat;22;agt;28 ctt;431;cct;623;cat;0;cgt;543;;ctt;281;cct;225;cat;9;cgt;299 gtt;580;gct;798;gat;0;ggc;891;;gtt;474;gct;931;gat;32;ggc;463 ttc;621;tcc;37;tac;0;tgc;795;;ttc;450;tcc;82;tac;0;tgc;851 att;827;acc;25;aac;811;agc;394;;att;490;acc;39;aac;649;agc;512 ctc;1;ccc;1;cac;541;cgc;2;;ctc;1;ccc;5;cac;271;cgc;18 gtc;27;gcc;8;gac;1051;ggt;2;;gtc;35;gcc;218;gac;590;ggt;77 tta;75;tca;150;taa;3;tga;7;;tta;321;tca;346;taa;89;tga;150 ata;15;aca;271;aaa;521;aga;78;;ata;15;aca;565;aaa;846;aga;74 cta;120;cca;512;caa;303;cga;228;;cta;267;cca;288;caa;369;cga;275 gta;119;gca;3191;gaa;427;gga;557;;gta;349;gca;3720;gaa;863;gga;434 ttg;73;tcg;133;tag;1;tgg;406;;ttg;65;tcg;263;tag;48;tgg;634 atg;1154;acg;117;aag;859;agg;205;;atg;823;acg;385;aag;770;agg;599 ctg;341;ccg;205;cag;485;cgg;84;;ctg;296;ccg;107;cag;455;cgg;186 gtg;424;gcg;205;gag;653;ggg;230;;gtg;470;gcg;317;gag;981;ggg;469 ;;;;;;;;;;;;;;;; isi;dbleisi;;;;;;;;isi;difisi;;;;;; ttt;0;tct;5;tat;0;tgt;0;;ttt;5;tct;4;tat;20;tgt;0 atc;0;act;19;aat;4;agt;17;;atc;1;act;63;aat;53;agt;9 ctt;60;cct;26;cat;0;cgt;0;;ctt;85;cct;17;cat;5;cgt;0 gtt;14;gct;24;gat;2;ggc;25;;gtt;6;gct;309;gat;26;ggc;106 ttc;24;tcc;5;tac;228;tgc;92;;ttc;22;tcc;18;tac;726;tgc;458 att;23;acc;0;aac;131;agc;49;;att;49;acc;0;aac;118;agc;42 ctc;0;ccc;0;cac;90;cgc;0;;ctc;0;ccc;5;cac;48;cgc;0 gtc;0;gcc;0;gac;19;ggt;0;;gtc;0;gcc;0;gac;125;ggt;20 tta;22;tca;28;taa;1;tga;0;;tta;95;tca;57;taa;35;tga;17 ata;136;aca;24;aaa;68;aga;115;;ata;287;aca;30;aaa;244;aga;821 cta;2;cca;19;caa;57;cga;13;;cta;21;cca;156;caa;988;cga;1343 gta;29;gca;9;gaa;174;gga;125;;gta;154;gca;15;gaa;4848;gga;3940 ttg;29;tcg;1;tag;0;tgg;24;;ttg;265;tcg;6;tag;33;tgg;443 atg;233;acg;1;aag;91;agg;7;;atg;329;acg;29;aag;2472;agg;146 ctg;27;ccg;6;cag;30;cgg;0;;ctg;42;ccg;47;cag;153;cgg;28 gtg;70;gcg;103;gag;44;ggg;214;;gtg;1560;gcg;3782;gag;1094;ggg;5677 ;;;;;;;;;;;;;;;; tRNAi;;;;;;;;;tRNAs;;;;;;; ttt;1;tct;1;tat;4;tgt;0;;ttt;4;tct;8;tat;16;tgt;0 atc;0;act;3;aat;0;agt;0;;atc;1;act;79;aat;57;agt;26 ctt;35;cct;1;cat;3;cgt;0;;ctt;110;cct;42;cat;2;cgt;0 gtt;1;gct;0;gat;0;ggc;3;;gtt;19;gct;333;gat;28;ggc;128 ttc;0;tcc;19;tac;729;tgc;4;;ttc;46;tcc;4;tac;225;tgc;546 att;2;acc;0;aac;3;agc;3;;att;70;acc;0;aac;246;agc;88 ctc;0;ccc;2;cac;2;cgc;0;;ctc;0;ccc;3;cac;136;cgc;0 gtc;0;gcc;0;gac;16;ggt;1;;gtc;0;gcc;0;gac;128;ggt;19 tta;10;tca;4;taa;2;tga;1;;tta;107;tca;81;taa;34;tga;16 ata;290;aca;2;aaa;46;aga;407;;ata;133;aca;52;aaa;266;aga;529 cta;0;cca;43;caa;140;cga;124;;cta;23;cca;132;caa;905;cga;1232 gta;0;gca;0;gaa;20;gga;12;;gta;183;gca;24;gaa;5002;gga;4053 ttg;188;tcg;1;tag;3;tgg;1;;ttg;106;tcg;6;tag;30;tgg;466 atg;138;acg;1;aag;314;agg;9;;atg;424;acg;29;aag;2249;agg;144 ctg;0;ccg;7;cag;9;cgg;2;;ctg;69;ccg;46;cag;174;cgg;26 gtg;0;gcg;0;gag;7;ggg;8;;gtg;1630;gcg;3885;gag;1131;ggg;5883
E79.GDI Les rapports des duplications doublons-différents
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Les rapports des duplications doublons-différents.
- Légende:
Rapports;;;;;;;;;;;;;;;; ri;;;;;;;;;rs;;;;;;; ttt;4.0;tct;0;tat;3;tgt;0;;ttt;14;tct;0.7;tat;13;tgt;18 atc;8.0;act;0;aat;0;agt;0;;atc;6.4;act;1.3;aat;22;agt;3.5 ctt;0;cct;10;cat;0;cgt;0;;ctt;0.7;cct;0.0;cat;9;cgt;0.6 gtt;0;gct;0;gat;0;ggc;0;;gtt;0.8;gct;1.2;gat;32;ggc;0.5 ttc;0;tcc;0;tac;4.5;tgc;0;;ttc;0.7;tcc;2.2;tac;0;tgc;1.1 att;0;acc;0;aac;0;agc;0;;att;0.6;acc;1.6;aac;0.8;agc;1.3 ctc;0;ccc;0;cac;0;cgc;0;;ctc;1.0;ccc;5.0;cac;0.5;cgc;9.0 gtc;0;gcc;0;gac;0;ggt;0;;gtc;1.3;gcc;27;gac;0.6;ggt;39 tta;0;tca;0;taa;2.0;tga;0;;tta;4.3;tca;2.3;taa;30;tga;21 ata;47;aca;0;aaa;0;aga;4;;ata;1.0;aca;2.1;aaa;1.6;aga;0.9 cta;0;cca;0;caa;0;cga;0;;cta;2.2;cca;0.6;caa;1.2;cga;1.2 gta;0;gca;0;gaa;0;gga;0;;gta;2.9;gca;1.2;gaa;2.0;gga;0.8 ttg;11;tcg;0;tag;0;tgg;0;;ttg;0.9;tcg;2.0;tag;48;tgg;1.6 atg;0;acg;0;aag;0;agg;0;;atg;0.7;acg;3.3;aag;0.9;agg;2.9 ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;0;;ctg;0.9;ccg;0.5;cag;0.9;cgg;2.2 gtg;0;gcg;0;gag;0;ggg;0;;gtg;1.1;gcg;1.5;gag;1.5;ggg;2.0 ;;;;;;;;;;;;;;;; rsi;;;;;;;;;s/i;;;;;;; ttt;5;tct;0.8;tat;20;tgt;0;;ttt;4.0;tct;8.0;tat;4.0;tgt;0 atc;1;act;3.3;aat;13;agt;0.5;;atc;1;act;26;aat;57;agt;26 ctt;1.4;cct;0.7;cat;5;cgt;0;;ctt;3.1;cct;42;cat;0.7;cgt;0 gtt;0.0;gct;13;gat;13;ggc;4.2;;gtt;19;gct;333;gat;28;ggc;43 ttc;0.9;tcc;3.6;tac;3.2;tgc;5.0;;ttc;46;tcc;0.2;tac;0.3;tgc;137 att;2.1;acc;0;aac;0.9;agc;0.9;;att;35;acc;0;aac;82;agc;29 ctc;0;ccc;5;cac;0.5;cgc;0;;ctc;0;ccc;1.5;cac;68;cgc;0 gtc;0;gcc;0;gac;6.6;ggt;20;;gtc;0;gcc;0;gac;8.0;ggt;19 tta;4.3;tca;2.0;taa;35;tga;17;;tta;11;tca;20;taa;17;tga;16 ata;2.1;aca;1.3;aaa;3.6;aga;7.0;;ata;0.5;aca;26;aaa;5.8;aga;1.3 cta;11;cca;8.2;caa;17;cga;103;;cta;23;cca;3.1;caa;6.5;cga;9.9 gta;5.3;gca;1.7;gaa;28;gga;32;;gta;183;gca;24;gaa;250;gga;338 ttg;9.1;tcg;6.0;tag;33;tgg;18;;ttg;0.6;tcg;6.0;tag;10;tgg;466 atg;1.4;acg;29;aag;27;agg;21;;atg;3.1;acg;29;aag;7.2;agg;16 ctg;1.6;ccg;7.8;cag;5.1;cgg;28;;ctg;69;ccg;6.6;cag;19;cgg;13 gtg;22;gcg;37;gag;25;ggg;27;;gtg;1630;gcg;3885;gag;162;ggg;735
E79.GDI Total duplications
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:E79.GDI Total duplications.
- Légende:
total duplications;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; in;dble+dif;;;;;;;;sin;dble+dif;;;;;;;;isi;dble+dif;;;;;; ttt;5;tct;0;tat;3;tgt;0;;ttt;14;tct;834;tat;13;tgt;185;;ttt;5;tct;9;tat;20;tgt;0 atc;9;act;0;aat;0;agt;0;;atc;37;act;1041;aat;23;agt;36;;atc;1;act;82;aat;57;agt;26 ctt;0;cct;11;cat;0;cgt;0;;ctt;712;cct;848;cat;9;cgt;842;;ctt;145;cct;43;cat;5;cgt;0 gtt;0;gct;0;gat;1;ggc;0;;gtt;1054;gct;1729;gat;32;ggc;1354;;gtt;20;gct;333;gat;28;ggc;131 ttc;0;tcc;0;tac;431;tgc;0;;ttc;1071;tcc;119;tac;0;tgc;1646;;ttc;46;tcc;23;tac;954;tgc;550 att;0;acc;0;aac;0;agc;0;;att;1317;acc;64;aac;1460;agc;906;;att;72;acc;0;aac;249;agc;91 ctc;0;ccc;0;cac;0;cgc;0;;ctc;2;ccc;6;cac;812;cgc;20;;ctc;0;ccc;5;cac;138;cgc;0 gtc;0;gcc;0;gac;0;ggt;0;;gtc;62;gcc;226;gac;1641;ggt;79;;gtc;0;gcc;0;gac;144;ggt;20 tta;0;tca;0;taa;3;tga;0;;tta;396;tca;496;taa;92;tga;157;;tta;117;tca;85;taa;36;tga;17 ata;95;aca;0;aaa;0;aga;4;;ata;30;aca;836;aaa;1367;aga;152;;ata;423;aca;54;aaa;312;aga;936 cta;0;cca;0;caa;0;cga;0;;cta;387;cca;800;caa;672;cga;503;;cta;23;cca;175;caa;1045;cga;1356 gta;0;gca;0;gaa;0;gga;0;;gta;468;gca;6911;gaa;1290;gga;991;;gta;183;gca;24;gaa;5022;gga;4065 ttg;147;tcg;0;tag;0;tgg;0;;ttg;138;tcg;396;tag;49;tgg;1040;;ttg;294;tcg;7;tag;33;tgg;467 atg;0;acg;0;aag;0;agg;0;;atg;1977;acg;502;aag;1629;agg;804;;atg;562;acg;30;aag;2563;agg;153 ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;0;;ctg;637;ccg;312;cag;940;cgg;270;;ctg;69;ccg;53;cag;183;cgg;28 gtg;0;gcg;0;gag;0;ggg;0;;gtg;894;gcg;522;gag;1634;ggg;699;;gtg;1630;gcg;3885;gag;1138;ggg;5891 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; in%;dble+dif;;;;;;;;sin%;dble+dif;;;;;;;;isi%;dble+dif;;;;;; ttt;21;tct;0;tat;8;tgt;0;;ttt;58;tct;99;tat;36;tgt;100;;ttt;21;tct;1;tat;56;tgt;0 atc;19;act;0;aat;0;agt;0;;atc;79;act;93;aat;29;agt;58;;atc;2;act;7;aat;71;agt;42 ctt;0;cct;1;cat;0;cgt;0;;ctt;83;cct;94;cat;64;cgt;100;;ctt;17;cct;5;cat;36;cgt;0 gtt;0;gct;0;gat;2;ggc;0;;gtt;98;gct;84;gat;52;ggc;91;;gtt;2;gct;16;gat;46;ggc;9 ttc;0;tcc;0;tac;31;tgc;0;;ttc;96;tcc;84;tac;0;tgc;75;;ttc;4;tcc;16;tac;69;tgc;25 att;0;acc;0;aac;0;agc;0;;att;95;acc;100;aac;85;agc;91;;att;5;acc;0;aac;15;agc;9 ctc;0;ccc;0;cac;0;cgc;0;;ctc;100;ccc;55;cac;85;cgc;100;;ctc;0;ccc;45;cac;15;cgc;0 gtc;0;gcc;0;gac;0;ggt;0;;gtc;100;gcc;100;gac;92;ggt;80;;gtc;0;gcc;0;gac;8;ggt;20 tta;0;tca;0;taa;2;tga;0;;tta;77;tca;85;taa;70;tga;90;;tta;23;tca;15;taa;27;tga;10 ata;17;aca;0;aaa;0;aga;0;;ata;5;aca;94;aaa;81;aga;14;;ata;77;aca;6;aaa;19;aga;86 cta;0;cca;0;caa;0;cga;0;;cta;94;cca;82;caa;39;cga;27;;cta;6;cca;18;caa;61;cga;73 gta;0;gca;0;gaa;0;gga;0;;gta;72;gca;100;gaa;20;gga;20;;gta;28;gca;0;gaa;80;gga;80 ttg;25;tcg;0;tag;0;tgg;0;;ttg;24;tcg;98;tag;60;tgg;69;;ttg;51;tcg;2;tag;40;tgg;31 atg;0;acg;0;aag;0;agg;0;;atg;78;acg;94;aag;39;agg;84;;atg;22;acg;6;aag;61;agg;16 ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;0;;ctg;90;ccg;85;cag;84;cgg;91;;ctg;10;ccg;15;cag;16;cgg;9 gtg;0;gcg;0;gag;0;ggg;0;;gtg;35;gcg;12;gag;59;ggg;11;;gtg;65;gcg;88;gag;41;ggg;89
E79.GDI Synthèse
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:E79.GDI Synthèse.
- Légende:
E79;;;;;;;;;;intron;;;;;;in;;sin;;isi;;tRNAis;;;;;;total;;;%;;; obligat;aa;Trad;ADN;alpha;zéros;unit1;sint/tot;tRNA;sin t;int;sin 1;in 1;gen isi;gen sin;gen in;dblei;difi;dbles;difs;dbleisi;difisi;tRNAi;tRNAs;ri;rs;rsi;s/i;in;sin;isi;in;sin;isi; 57;Met;12;15;atg;0;0;0.94;2618;2469;149;0;0;11;68;0;0;0;1154;823;233;329;138;424;0;0.7;1.4;3.1;0;1977;562;0;78;22;atg 11;Tyr;34;37;tac;0;1;0.15;1464;225;1239;0;1;41;0;38;79;352;0;0;228;726;729;225;4.5;0;3.2;0.3;431;0;954;31;0;69;tac 22;Pro;21;22;cct;0;1;0.98;981;964;17;1;0;4;73;1;1;10;623;225;26;17;1;42;10;0.4;0.7;42;11;848;43;1;94;5;cct 14;Asp;46;40;gac;0;1;0.99;1864;1846;18;1;0;2;77;0;0;0;1051;590;19;125;16;128;0;0.6;6.6;8.0;0;1641;144;0;92;8;gac 65;Leu;8;14;ctg;0;1;0.99;785;778;7;1;0;7;72;0;0;0;341;296;27;42;0;69;0;0.9;1.6;69;0;637;69;0;90;10;ctg 13;Asn;42;39;aac;0;1;1.00;1788;1,780;8;1;0;5;74;0;0;0;811;649;131;118;3;246;0;0.8;0.9;82;0;1460;249;0;85;15;aac 17;Ile;9;7;att;0;1;1.00;1468;1463;5;1;0;3;76;0;0;0;827;490;23;49;2;70;0;0.6;2.1;35;0;1317;72;0;95;5;att 27;Val;13;8;gtt;0;1;1.00;1153;1150;3;1;0;2;77;0;0;0;580;474;14;6;1;19;0;0.8;0.4;19;0;1054;20;0;98;2;gtt 24;Ala;29;24;gct;0;1;1.00;2141;2137;4;1;0;4;75;0;0;0;798;931;24;309;0;333;0;1.2;13;333;0;1729;333;0;84;16;gct 64;Ala;32;32;gcg;0;1;1.00;4486;4482;4;1;0;4;75;0;0;0;205;317;103;3782;0;3885;0;1.5;37;3885;0;522;3885;0;12;88;gcg 38;Arg;59;59;aga;0;2;0.60;1171;702;469;2;0;57;21;1;0;4;78;74;115;821;407;529;4;0.9;7.1;1.3;4;152;936;0;14;86;aga 52;Gln;40;46;cag;0;2;0.99;1202;1185;17;2;0;8;71;0;0;0;485;455;30;153;9;174;0;0.9;5.1;19;0;940;183;0;84;16;cag 43;Thr;27;27;aca;0;2;0.99;969;964;5;2;0;3;76;0;0;0;271;565;24;30;2;52;0;2.1;1.3;26;0;836;54;0;94;6;aca 54;Glu;48;48;gag;0;2;1.00;2851;2838;13;2;0;6;73;0;0;0;653;981;44;1094;7;1131;0;1.5;25;162;0;1634;1138;0;59;41;gag 34;Glu;47;44;gaa;0;2;1.00;6391;6,363;28;2;0;8;71;0;0;0;427;863;174;4848;20;5002;0;2.0;28;250;0;1290;5022;0;20;80;gaa 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E79.GDI Méthode
[modifier | modifier le wikicode]E79.GDI Niveau 1
[modifier | modifier le wikicode]E79;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;E79;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;vient;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 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E79.GDI Niveau 2
[modifier | modifier le wikicode]- Exceptions: hsa-18, voir légende de 79.GDI Synthèse
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E79.GDI Niveau 3
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E79.GDI Niveau 4
[modifier | modifier le wikicode]- Calculs à droite de tRNAi et tRNAs
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E79.GDI Niveau 5
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E79.GDI Niveau 6
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E79.GDI Niveau 7
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Les introns des archées
[modifier | modifier le wikicode]Liste des noms et des codes KEGG
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux: Liste des noms et des codes KEGG.
- Légende: Certains archées ne se trouve pas dans la base KEGG, aussi je leurs ai attribué un code à 3 lettre suivi de * comme hme*
Correspondance entre code KEGG et nom; KEGG;Nom gtRNAdb aho;Acidianus hospitalis W1 asc;Acidilobus saccharovorans 345-15 abi;Aciduliprofundum boonei T469 acf;Aciduliprofundum sp. MAR08-339 ape;Aeropyrum pernix K1 afu;Archaeoglobus fulgidus DSM 4304 afg;Archaeoglobus fulgidus DSM 8774 apo;Archaeoglobus profundus DSM 5631 ast;Archaeoglobus sulfaticallidus PM70-1 ave;Archaeoglobus veneficus SNP6 cma;Caldivirga maquilingensis IC-167 kcr;Candidatus Korarchaeum cryptofilum mer;Candidatus Methanomassiliicoccus intestinalis Issoire-Mx1 mear;Candidatus Methanoplasma termitum MpT1 dka;Desulfurococcus kamchatkensis 1221n dmu;Desulfurococcus mucosus DSM 2162 fpl;Ferroglobus placidus DSM 10642 fac;Ferroplasma acidarmanus fer1 gac;Geoglobus acetivorans SBH6 hje;Halalkalicoccus jeotgali B3 hhi;Haloarcula hispanica ATCC 33960 CGMCC 1.2049 hhn;Haloarcula hispanica N601 hma;Haloarcula marismortui ATCC 43049 hab;Haloarcula sp. CBA1115 hsl;Halobacterium salinarum R1 DSM 671 hdl;Halobacterium sp. DL1 hal;Halobacterium sp. NRC-1 hme;Haloferax mediterranei ATCC 33500 hme*;Haloferax mediterranei ATCC 33500 CGMCC 1.2087 hvo;Haloferax volcanii DS2 hbo;Halogeometricum borinquense DSM 11551 PR 3 hmu;Halomicrobium mukohataei DSM 12286 hxa;Halopiger xanaduensis SH-6 hwc;Haloquadratum walsbyi C23 hwa;Haloquadratum walsbyi DSM 16790 HBSQ001 hti;Halorhabdus tiamatea SARL4B hut;Halorhabdus utahensis DSM 12940 hla;Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239 hlr;Halostagnicola larsenii XH-48 htu;Haloterrigena turkmenica DSM 5511 hru;Halovivax ruber XH-70 hbu;Hyperthermus butylicus DSM 5456 iho;Ignicoccus hospitalis KIN4/I iag;Ignisphaera aggregans DSM 17230 mcn;Metallosphaera cuprina Ar-4 mse;Metallosphaera sedula DSM 5348 mfi;Methanobacterium formicicum mfc;Methanobacterium formicicum BRM9 mel;Methanobacterium lacus AL-21 mew;Methanobacterium paludis SWAN1 meth;Methanobacterium sp. MB1 mru;Methanobrevibacter ruminantium M1 msi;Methanobrevibacter smithii ATCC 35061 PS DSMZ 861 meb;Methanobrevibacter sp. AbM4 mfe;Methanocaldococcus fervens AG86 mif;Methanocaldococcus infernus ME mja;Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 mfs;Methanocaldococcus sp. FS406-22 mjh*;Methanocaldococcus sp. JH146 mvu;Methanocaldococcus vulcanius M7 rci;Methanocella arvoryzae MRE50 mez;Methanocella conradii HZ254 mpd;Methanocella paludicola SANAE mbu;Methanococcoides burtonii DSM 6242 mmet;Methanococcoides methylutens MM1 mae;Methanococcus aeolicus Nankai-3 mmq;Methanococcus maripaludis C5 mmx;Methanococcus maripaludis C6 mmz;Methanococcus maripaludis C7 mmp;Methanococcus maripaludis S2 mmd;Methanococcus maripaludis X1 mvn;Methanococcus vannielii SB mvo;Methanococcus voltae A3 mla;Methanocorpusculum labreanum Z mbg;Methanoculleus bourgensis MS2 MS2T mem;Methanoculleus marisnigri JR1 mev;Methanohalobium evestigatum Z-7303 mmh;Methanohalophilus mahii DSM 5219 mpi;Methanolacinia petrolearia DSM 11571 mta*;Methanolinea tarda NOBI-1 mpy;Methanolobus psychrophilus R15 mhz;Methanomethylovorans hollandica DSM 15978 mka;Methanopyrus kandleri AV19 mbn;Methanoregula boonei 6A8 mfo;Methanoregula formicica SMSP mco*;Methanosaeta concilii GP6 mhi;Methanosaeta harundinacea 6Ac mth*;Methanosaeta thermophila PT mzh;Methanosalsum zhilinae DSM 4017 mac;Methanosarcina acetivorans C2A mbar;Methanosarcina barkeri 227 mbak;Methanosarcina barkeri 3 mby;Methanosarcina barkeri MS mba;Methanosarcina barkeri str. Fusaro mbw;Methanosarcina barkeri str. Wiesmoor mhor;Methanosarcina horonobensis HB-1 JCM 15518 mls;Methanosarcina lacustris Z-7289 mmac;Methanosarcina mazei C16 mma;Methanosarcina mazei Go1 mml*;Methanosarcina mazei LYC mmj;Methanosarcina mazei S-6 mma*;Methanosarcina mazei SarPi mmaz;Methanosarcina mazei Tuc01 mmw*;Methanosarcina mazei WWM610 msj;Methanosarcina siciliae C2J msz;Methanosarcina siciliae HI350 msw;Methanosarcina siciliae T4/M mek;Methanosarcina sp. Kolksee metm;Methanosarcina sp. MTP4 mef;Methanosarcina sp. WH1 meq;Methanosarcina sp. WWM596 mthe;Methanosarcina thermophila CHTI-55 mthr;Methanosarcina thermophila TM-1 mvc;Methanosarcina vacuolata Z-761 mst;Methanosphaera stadtmanae DSM 3091 mpl;Methanosphaerula palustris E1-9c mhu;Methanospirillum hungatei JF-1 mmg;Methanothermobacter marburgensis str. Marburg metc;Methanothermobacter sp. CaT2 mth;Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H mok;Methanothermococcus okinawensis IH1 mfv;Methanothermus fervidus DSM 2088 mig;Methanotorris igneus Kol 5 neq;Nanoarchaeum equitans Kin4-M nmg;Natrialba magadii ATCC 43099 npe;Natrinema pellirubrum DSM 15624 nat;Natrinema sp. J7-2 nge;Natronobacterium gregoryi SP2 nou;Natronococcus occultus SP4 nmo;Natronomonas moolapensis 8.8.11 nph;Natronomonas pharaonis DSM 2160 Gabara nmr;Nitrosopumilus maritimus SCM1 ppac;Palaeococcus pacificus DY20341 pto;Picrophilus torridus DSM 9790 pai;Pyrobaculum aerophilum str. IM2 pas;Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514 pcl;Pyrobaculum calidifontis JCM 11548 pis;Pyrobaculum islandicum DSM 4184 pog;Pyrobaculum oguniense TE7 p18*;Pyrobaculum sp. 1860 pfi;Pyrococcus furiosus COM1 pfu;Pyrococcus furiosus DSM 3638 pho;Pyrococcus horikoshii OT3 pyn;Pyrococcus sp. NA2 pys;Pyrococcus sp. ST04 pya;Pyrococcus yayanosii CH1 sali;Salinarchaeum sp. Harcht-Bsk1 shc;Staphylothermus hellenicus DSM 12710 smr;Staphylothermus marinus F1 sai;Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 sii;Sulfolobus islandicus L.D.8.5 sis;Sulfolobus islandicus L.S.2.15 sia;Sulfolobus islandicus M.14.25 sim;Sulfolobus islandicus M.16.27 sid;Sulfolobus islandicus M.16.4 sir;Sulfolobus islandicus REY15A siy;Sulfolobus islandicus Y.G.57.14 sin;Sulfolobus islandicus Y.N.15.51 ss9*;Sulfolobus solfataricus 98/2 ssp*;Sulfolobus solfataricus P2 sto*;Sulfolobus tokodaii str. 7 tba;Thermococcus barophilus MP teu;Thermococcus eurythermalis A501 tga;Thermococcus gammatolerans EJ3 DSM 15229 tko;Thermococcus kodakarensis KOD1 tlt;Thermococcus litoralis DSM 5473 tnu;Thermococcus nautili 30-1 ton;Thermococcus onnurineus NA1 tsi;Thermococcus sibiricus MM 739 the;Thermococcus sp. 4557 tha;Thermococcus sp. AM4 thc*;Thermococcus sp. CL1 ths*;Thermococcus sp. ES1 tpe;Thermofilum pendens Hrk 5 tac;Thermoplasma acidophilum DSM 1728 tvo;Thermoplasma volcanium GSS1 tar;Thermoplasmatales archaeon BRNA1 tne*;Thermoproteus neutrophilus V24Sta ttn;Thermoproteus tenax Kra 1 tuz;Thermoproteus uzoniensis 768-20 tag;Thermosphaera aggregans DSM 11486 vdi;Vulcanisaeta distributa DSM 14429 vmo;Vulcanisaeta moutnovskia 768-28
Liste des introns par codon
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Liste des introns par codon.
- Légende: La recherche des introns se fait par la fonction sifter de gtRNAdb en notant le nombre d'introns, de 0 à 3, portés par le même tRNA, à la case Number of introns in each tRNA.
- I0 à I3 0 à 3 introns portés par le même tRNA.
- tpe, colonne erreurs. Ce génome affiche 2 valeurs différentes: Recherche sur tpe, la liste des introns donne 2 pour GTA alors que dans la liste des tRNAs il n’y a qu’un seul GTA. Mais la recherche sur GTA-I2 n’affiche pas tpe et affiche 7 introns avec 2 introns, au lieu de 8 attendus. Les décomptes par génomes auront donc 1 intron de moins que le décompte par codon.
- ape, colonne erreurs. Ce génome affiche 2 valeurs différentes: Recherche sur GTC-I1 affiche 2 pour ape. Recherche sur ape affiche 1 pour GTC.
Décompte des tRNAs archés par codons;;;;;;;;;décompte par génome;;;;; codon;gene;tRNAs;I3;I2;I1;I0;total;introns;codon;gene;zéros;génomes;introns;erreurs CAA;ttg;163;0;0;25;138;163;25;CAA;ttg;158;25;25; CAC;gtg;170;0;2;7;161;170;9;CAC;gtg;174;9;9; CAG;ctg;160;0;1;8;151;160;9;CAG;ctg;174;9;9; CAT;atg;589;0;11;217;361;589;228;CAT;atg;10;173;228; CCA;tgg;184;0;11;163;10;184;174;CCA;tgg;9;174;174; CCC;ggg;155;0;0;11;144;155;11;CCC;ggg;172;11;11; CCG;cgg;139;0;0;11;128;139;11;CCG;cgg;172;11;11; CCT;agg;165;1;2;26;136;165;29;CCT;agg;154;29;29; CGA;tcg;152;0;2;35;115;152;37;CGA;tcg;146;37;37; CGC;gcg;159;0;2;6;151;159;8;CGC;gcg;175;8;8; CGG;ccg;151;1;6;22;122;151;29;CGG;ccg;154;29;29; CGT;acg;169;0;5;37;127;169;42;CGT;acg;141;42;42; CTA;tag;1;0;0;0;1;1;0;CTA;tag;183;0;0; CTC;gag;160;4;6;20;130;160;30;CTC;gag;153;30;30; CTG;cag;165;1;3;10;151;165;14;CTG;cag;169;14;14; CTT;aag;166;0;3;25;138;166;28;CTT;aag;156;27;28; GAA;ttc;215;0;0;12;203;215;12;GAA;ttc;171;12;12; GAC;gtc;212;0;2;11;199;212;13;GAC;gtc;170;13;13; GAG;ctc;214;0;0;3;211;214;3;GAG;ctc;180;3;3; GAT;atc;212;0;5;23;184;212;28;GAT;atc;155;28;28; GCA;tgc;299;1;17;23;258;299;41;GCA;tgc;143;40;41; GCC;ggc;243;0;1;14;228;243;15;GCC;ggc;168;15;15; GCG;cgc;187;0;1;16;170;187;17;GCG;cgc;166;17;17; GCT;agc;187;0;0;4;183;187;4;GCT;agc;179;4;4; GGA;tcc;190;0;0;17;173;190;17;GGA;tcc;166;17;17; GGC;gcc;184;0;1;4;179;184;5;GGC;gcc;178;5;5; GGG;ccc;171;1;7;35;128;171;43;GGG;ccc;140;43;43; GGT;acc;189;0;1;14;174;189;15;GGT;acc;168;15;15; GTA;tac;190;0;7;99;84;190;106;GTA;tac;78;105;105;tpe GTC;gac;218;1;8;7;202;218;16;GTC;gac;168;15;15;ape GTG;cac;185;0;1;11;173;185;12;GTG;cac;171;12;12; GTT;aac;214;0;7;32;175;214;39;GTT;aac;146;37;39; TAA;tta;191;0;1;21;169;191;22;TAA;tta;162;21;22; TAC;gta;186;0;6;12;168;186;18;TAC;gta;165;18;18; TAG;cta;185;0;0;3;182;185;3;TAG;cta;180;3;3; TAT;ata;2;0;0;2;0;2;2;TAT;ata;181;2;2; TCA;tga;18;0;0;1;17;18;1;TCA;tga;182;1;1; TCC;gga;189;0;3;14;172;189;17;TCC;gga;166;17;17; TCG;cga;185;0;0;42;143;185;42;TCG;cga;141;42;42; TCT;aga;186;0;0;34;152;186;34;TCT;aga;149;34;34; TGA;tca;184;0;1;15;168;184;16;TGA;tca;167;16;16; TGC;gca;256;0;3;13;240;256;16;TGC;gca;167;16;16; TGG;cca;184;3;2;12;167;184;17;TGG;cca;166;17;17; TGT;aca;198;2;6;32;158;198;40;TGT;aca;143;40;40; TTA;taa;0;0;0;0;0;0;0;TTA;taa;183;0;0; TTC;gaa;230;4;7;22;197;230;33;TTC;gaa;151;32;33; TTG;caa;196;1;3;27;165;196;31;TTG;caa;152;31;31; TTT;aaa;197;0;2;23;172;197;25;TTT;aaa;158;25;25; AAA;ttt;0;0;0;0;0;0;0;AAA;ttt;183;0;0; AAC;gtt;1;0;0;1;0;1;1;AAC;gtt;182;1;1; AAG;ctt;0;0;0;0;0;0;0;AAG;ctt;183;0;0; AAT;att;0;0;0;0;0;0;0;AAT;att;183;0;0; ACA;tgt;0;0;0;0;0;0;0;ACA;tgt;183;0;0; ACC;ggt;1;0;0;1;0;1;1;ACC;ggt;182;1;1; ACG;cgt;1;0;0;1;0;1;1;ACG;cgt;182;1;1; ACT;agt;0;0;0;0;0;0;0;ACT;agt;183;0;0; AGA;tct;0;0;0;0;0;0;0;AGA;tct;183;0;0; AGC;gct;0;0;0;0;0;0;0;AGC;gct;183;0;0; AGG;cct;0;0;0;0;0;0;0;AGG;cct;183;0;0; AGT;act;0;0;0;0;0;0;0;AGT;act;183;0;0; ATA;tat;0;0;0;0;0;0;0;ATA;tat;183;0;0; ATC;gat;0;0;0;0;0;0;0;ATC;gat;183;0;0; ATG;cat;0;0;0;0;0;0;0;ATG;cat;183;0;0; ATT;aat;0;0;0;0;0;0;0;ATT;aat;183;0;0;
Liste des introns par génome
[modifier | modifier le wikicode]Thermococci Methanococci
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Thermococci Methanococci.
- Légende:
;Euryarchaeota;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;Thermococci;;19;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;pfi;pfu;pho;ppac;pya;pyn;pys;tba;teu;tga;tha;thc*;the;ths*;tko;tlt;tnu;ton;tsi;moyenne CAT;atg;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1 CCA;tgg;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1 autres;-;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 tRNAs;-;46;46;46;47;46;46;46;46;46;46;46;46;47;46;46;46;46;46;46;46,1 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;Methanococci;;16;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;mae;mfe;mfs;mif;mig;mja;mjh*;mmd;mmp;mmq;mmx;mmz;mok;mvn;mvo;mvu;;;;moyenne CAT;atg;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;;;;1 CCA;tgg;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;;;;1 autres;-;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;;;0 tRNAs;-;39;37;37;38;35;37;37;38;38;38;38;38;38;38;39;37;;;;37,6
Methanobacteria
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux: Methanobacteria.
- Légende: cyan, (mth,ggg) est un gène avec 2 introns.
;Methanobacteria;;;13;;;;;;;;;;; ;;meb;mel;metc;meth;mew;mfc;mfi;mfv;mmg;mru;msi;mst;mth;Total CAT;atg;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;13 CCA;tgg;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;13 GGG;ccc;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;2 GTA;tac;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1 TTG;caa;0;1;1;1;1;1;1;0;1;0;0;0;0;7 autres;-;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 ;;;;;;;;;;;;;;;moyenne tRNA;-;38;43;39;44;48;46;47;41;40;59;36;42;39;43,2 total;-;2;3;3;3;4;3;3;3;3;2;2;2;3;2,8
Methanomicrobia
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux: Methanomicrobia.
- Légende: Il n'y a que des tRNAs à un seul intron quand c'est le cas. Le cas de (mth*,tgc) représente 2 tRNAs avec un intron chacun.
archée;;mac;mba;mbak;mbar;mbg;mbn;mbu;mbw;mby;mco*;mef;mek;mem;meq;metm;mev;mez;mfo;mhi;mhor;mhu;mhz;mla;mls;mma;mma*;mmac;mmaz;mmet;mmh;mmj;mml*;mmw*;mpd;mpi;mpl;mpy;msj;msw;msz;mta*;mth*;mthe;mthr;mvc;mzh;rci;Total CAA;ttg;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; CAC;gtg;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;1 CAG;ctg;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; CAT;atg;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;0;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;46 CCA;tgg;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;47 CCC;ggg;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; CCG;cgg;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1 CCT;agg;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; CGA;tcg;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; CGC;gcg;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; CGG;ccg;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;6 CGT;acg;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;3 CTA;tag;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; CTC;gag;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; CTG;cag;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; CTT;aag;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; GAA;ttc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1 GAC;gtc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; GAG;ctc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; GAT;atc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; GCA;tgc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;3 GCC;ggc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; GCG;cgc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;3 GCT;agc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; GGA;tcc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;5 GGC;gcc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;2 GGG;ccc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; GGT;acc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; GTA;tac;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;47 GTC;gac;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; GTG;cac;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; GTT;aac;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;2 TAA;tta;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; TAC;gta;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1 TAG;cta;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; TAT;ata;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; TCA;tga;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; TCC;gga;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;3 TCG;cga;1;1;1;1;0;0;1;1;1;1;1;1;0;1;1;1;1;0;1;1;0;1;0;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;0;0;0;1;1;1;1;0;1;1;1;1;1;0;36 TCT;aga;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; TGA;tca;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;3 TGC;gca;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; TGG;cca;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; TGT;aca;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;3 TTA;taa;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; TTC;gaa;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; TTG;caa;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; TTT;aaa;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;3 AAC;gtt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;moyenne tRNA;;58;62;60;61;47;49;51;62;59;48;56;62;49;58;57;50;50;49;46;60;51;52;53;57;57;57;58;42;55;54;57;57;57;50;48;56;53;58;57;57;47;47;58;58;62;50;54;54,4 total;;4;4;4;4;3;3;5;4;4;11;4;4;3;4;4;7;6;3;11;4;3;5;2;4;4;4;4;4;6;5;4;4;4;4;3;3;5;5;4;4;3;15;4;4;4;7;3;4,6 archée;;mac;mba;mbak;mbar;mbg;mbn;mbu;mbw;mby;mco*;mef;mek;mem;meq;metm;mev;mez;mfo;mhi;mhor;mhu;mhz;mla;mls;mma;mma*;mmac;mmaz;mmet;mmh;mmj;mml*;mmw*;mpd;mpi;mpl;mpy;msj;msw;msz;mta*;mth*;mthe;mthr;mvc;mzh;rci;
Halobacteria
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Halobacteria.
- Légende: Il n'y a que des tRNAs à un seul intron. Le vert, cas de (hal,atg) représente 2 tRNAs à un seul intron chacun.
archée;;hab;hal;hbo;hdl;hhi;hhn;hje;hla;hlr;hma;hme;hme*;hmu;hru;hsl;hti;htu;hut;hvo;hwa;hwc;hxa;nat;nge;nmg;nmo;nou;npe;nph;sali;Total CAA;ttg;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; CAC;gtg;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; CAG;ctg;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; CAT;atg;1;2;1;2;1;1;1;1;2;1;1;1;1;2;2;1;1;1;1;1;1;1;2;2;2;3;1;1;2;2;42 CCA;tgg;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;30 CCC;ggg;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; CCG;cgg;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; CCT;agg;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; CGA;tcg;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; CGC;gcg;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; CGG;ccg;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2 CGT;acg;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; CTA;tag;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; CTC;gag;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; CTG;cag;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; CTT;aag;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; GAA;ttc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; GAC;gtc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; GAG;ctc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; GAT;atc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; GCA;tgc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; GCC;ggc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;3 GCG;cgc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; GCT;agc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; GGA;tcc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; GGC;gcc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; GGG;ccc;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1 GGT;acc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; GTA;tac;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; GTC;gac;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; GTG;cac;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; GTT;aac;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;2;2;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;8 TAA;tta;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; TAC;gta;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; TAG;cta;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; TAT;ata;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; TCA;tga;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; TCC;gga;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1 TCG;cga;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; TCT;aga;1;0;0;0;1;1;1;0;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;1;1;1;0;0;1;0;11 TGA;tca;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; TGC;gca;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; TGG;cca;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; TGT;aca;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; TTA;taa;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; TTC;gaa;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1 TTG;caa;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;0;0;1;0;1;0;0;1;8 TTT;aaa;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; ACC;ggt;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1 ACG;cgt;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;moyen tRNA;;49;47;52;47;49;49;50;51;48;49;55;57;48;47;47;49;50;46;53;45;45;50;52;49;49;46;54;49;46;47;49,2 total;;3;3;3;4;3;3;5;3;5;3;5;5;3;4;3;2;3;2;4;2;2;5;4;4;7;5;3;3;4;4;3,6 archée;;hab;hal;hbo;hdl;hhi;hhn;hje;hla;hlr;hma;hme;hme*;hmu;hru;hsl;hti;htu;hut;hvo;hwa;hwc;hxa;nat;nge;nmg;nmo;nou;npe;nph;sali;
Crenarchaeota
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Crenarchaeota.
- Lien de la dernière colonne.
- Article sur les introns des archées 2014[1]
- Légende: Pour le tableur on peut conserver les marques ? $ ° pour les couleurs à remplacer avec le code html adéquat. Remplacer § par 0. Les 3 côtes pour gras de wikipédia sont à supprimer aussi. Ne pas enlever les astérisques qui font partie du pseudo code KEGG et @ qui indique les exceptions.
- Chaque tRNA avec, $ rouge 3 introns, ? cyan 2 introns, blanc et ° jaune 1 intron
- I0 I1 I2 I3 pour un tRNA avec 0 1 2 3 introns. Le décompte est obtenu en mettant dans la case Number of introns in each tRNA de sifter de la base de donnée gtRNAdb (ref.) 0 1 2 3.
- Exceptions, représentées par @
- _ (atg,pcl tuz) ont 6 introns chacun pour 3 tRNAs ce qui fait 3 tRNAs à 2 introns chacun.
- _ (atg,pog tpe) ont 4 introns chacun pour 3 tRNAs ce qui fait 1 tRNA à 2 introns chacun et 2 tRNAs à 1 intron.
- _ (atg,p18*) a 5 introns pour 3 tRNAs ce qui fait 2 tRNAs à 2 introns chacun et 1 tRNA à 1 intron.
- _ (atg,tag) a 3 introns pour 3 tRNAs. Après contrôle j'ai 1 tRNAs à 2 introns et 1 tRNA à 1 intron, donc 2 tRNAs à introns.
- _ (ape,gac), ambiguité dans la base de données. Recherche sur GTC avec I1 affiche 2 pour ape. Recherche sur ape avec I1 affiche 1 pour GTC.
- _ (tpe,tac), ambiguïté dans la base de données. Recherche sur tpe, la liste des introns donne 2 pour GTA alors que dans la liste des tRNAs il n’y a qu’un seul GTA. Mais la recherche sur GTA I2 n’affiche pas tpe et affiche 7 introns avec 2 modifications, au lieu de 8 attendus. Les décomptes par génomes auront donc 1 tRNA modifié de moins que le décompte par codon.
- _ (cma,tRNA), ambiguité dans la base de données. Recherche sur total des tRNAs de cma donne 55 mais l'affichage du tableau des tRNAs par codon (recherche sur un tRNA de la liste des 55) donne 47.
crenarchaeota;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;aho;ape;asc;cma;dka;dmu;hbu;iag;iho;mcn;mse;p18*;pai;pas;pcl;pis;pog;sai;shc;sia;sid;sii;sim;sin;sir;sis;siy;smr;ss9*;ssp*;sto*;tag;tne*;tpe;ttn;tuz;vdi;vmo;introns;zéros;génomes;I3;I2;I1;I3+I2;; CAA;ttg;0;0;0;0;1;1;0;0;0;1;1;1;0;0;0;0;0;0;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;0;1;0;0;0;1;21;17;21;§;§;21;§;CAA;ttg CAC;gtg;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;?1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;?1;0;0;0;1;7;31;7;§;2;5;2;CAC;gtg CAG;ctg;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;?1;1;0;1;1;9;29;9;§;1;8;1;CAG;ctg CAT;atg;°2;°2;1;0;1;1;1;1;1;°2;°2;?3@;°3;°3;?3@;°2;?3@;°2;°2;°2;°2;°2;°2;°2;°2;°2;°2;°2;°2;°2;°3;?2@;°2;?3@;°3;?3@;°2;°2;77;1;37;§;?11;66;11;CAT;atg CCA;tgg;1;1;0;0;?1;?1;1;?1;1;1;1;1;0;0;?1;0;0;1;?1;1;1;1;1;1;1;1;1;?1;1;1;1;?1;1;?1;0;?1;0;0;29;9;29;§;?9;20;9;CCA;tgg CCC;ggg;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;1;1;1;0;0;9;29;9;§;§;9;§;CCC;ggg CCG;cgg;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;1;0;0;7;31;7;§;§;7;§;CCG;cgg CCT;agg;1;0;0;0;0;0;0;1;1;1;1;?1;1;0;1;1;0;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;0;1;1;?1;$1;0;0;27;11;27;$1;2;24;3;CCT;agg CGA;tcg;1;1;0;0;1;1;1;0;1;1;1;1;0;?1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;?1;1;1;1;1;34;4;34;§;2;32;2;CGA;tcg CGC;gcg;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;?1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;?1;1;1;0;0;8;30;8;§;2;6;2;CGC;gcg CGG;ccg;0;1;1;1;1;1;1;?1;1;0;0;1;0;0;?1;?1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;?1;$1;?1;1;?1;0;19;19;19;$1;?6;12;7;CGG;ccg CGT;acg;1;1;1;1;1;1;1;0;1;1;1;1;1;1;?1;?1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;?1;1;?1;?1;1;1;37;1;37;§;?5;32;5;CGT;acg CTA;tag;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;§;38;§;§;§;§;§;CTA;tag CTC;gag;0;0;0;0;1;1;0;0;0;1;1;?1;?1;?1;$1;$1;?1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;$1;?1;$1;?1;0;1;30;8;30;$'''4;?6;20;10;CTC;gag CTG;cag;0;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;?1;1;0;$1;?1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;?1;0;1;1;0;0;12;26;12;$1;3;8;4;CTG;cag CTT;aag;1;1;1;0;0;0;1;1;°2;1;1;?1;0;0;1;?1;0;1;0;1;1;1;1;1;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;?1;1;0;0;28;11;27;§;3;25;3;CTT;aag GAA;ttc;0;0;0;0;0;0;0;1;0;1;1;0;0;0;1;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;1;1;0;0;1;0;10;28;10;§;§;10;§;GAA;ttc GAC;gtc;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;1;1;?1;1;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;1;0;0;1;?1;13;25;13;§;2;11;2;GAC;gtc GAG;ctc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;1;0;3;35;3;§;§;3;§;GAG;ctc GAT;atc;1;0;1;1;0;0;0;0;0;1;1;?1;0;0;1;?1;0;0;0;1;1;1;1;1;1;1;1;0;1;1;1;0;?1;?1;1;?1;1;1;25;13;25;§;?5;20;5;GAT;atc GCA;tgc;0;1;1;0;1;1;1;1;1;?1;?1;$1;1;1;?1;?1;1;1;1;?1;?1;?1;?1;?1;?1;?1;?1;1;?1;?1;1;1;?1;?1;1;?1;1;1;36;2;36;$1;?'''17;18;18;GCA;tgc GCC;ggc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;1;1;1;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;1;?1;1;0;0;12;26;12;§;1;11;1;GCC;ggc GCG;cgc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;?1;1;1;1;1;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;0;1;1;1;0;0;0;12;26;12;§;1;11;1;GCG;cgc GCT;agc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;3;35;3;§;§;3;§;GCT;agc GGA;tcc;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;1;0;1;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;1;1;11;27;11;§;§;11;§;GGA;tcc GGC;gcc;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;?1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;3;35;3;§;1;2;1;GGC;gcc GGG;ccc;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;?1;1;1;?1;?1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;$1;?1;?1;?1;1;38;§;38;$1;?6;31;7;GGG;ccc GGT;acc;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;1;?1;1;1;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;1;1;1;0;1;15;23;15;§;1;14;1;GGT;acc GTA;tac;1;1;?1;1;1;1;1;1;1;1;1;?1;1;?1;?1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;°2@;1;?1;?1;?1;39;§;38;§;?7;32;7;GTA;tac GTC;gac;0;°2@;0;0;0;0;0;0;0;0;0;?1;?1;?1;?1;$1;?1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;?1;?1;?1;0;0;0;11;28;10;$1;?8;2;9;GTC;gac GTG;cac;0;0;0;0;1;1;0;1;1;0;0;1;1;0;?1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0;11;27;11;§;1;10;1;GTG;cac GTT;aac;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;1;?1;1;0;?1;?1;0;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;0;?1;?1;?1;1;?1;1;0;26;12;26;§;?7;19;7;GTT;aac TAA;tta;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;1;0;0;0;0;0;0;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;0;0;0;1;0;1;0;1;19;19;19;§;§;19;§;TAA;tta TAC;gta;0;0;0;1;1;1;0;0;1;0;0;?1;1;1;?1;?1;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;?1;?1;1;?1;0;0;17;21;17;§;?6;11;6;TAC;gta TAG;cta;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;3;35;3;§;§;3;§;TAG;cta TAT;ata;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;§;38;§;§;§;§;§;TAT;ata TCA;tga;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;37;1;§;§;1;§;TCA;tga TCC;gga;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;1;?1;1;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;?1;1;?1;1;1;1;13;25;13;§;3;10;3;TCC;gga TCG;cga;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;1;0;0;6;32;6;§;§;6;§;TCG;cga TCT;aga;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;1;1;0;0;1;1;0;1;0;1;1;1;1;1;1;1;1;0;1;1;1;1;1;1;1;1;0;0;23;15;23;§;§;23;§;TCT;aga TGA;tca;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;1;0;1;1;?1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;1;1;0;1;1;1;13;25;13;§;1;12;1;TGA;tca TGC;gca;0;0;0;0;1;?1;0;0;1;1;1;1;1;0;?1;1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;?1;1;1;1;0;16;22;16;§;3;13;3;TGC;gca TGG;cca;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;1;1;$1;$1;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;?1;$1;1;1;?1;1;15;23;15;$'''3;2;10;5;TGG;cca TGT;aca;1;1;1;?1;1;1;0;0;1;1;1;?1;?1;1;$1;?1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;?1;$1;?1;1;1;1;36;2;36;$2;?6;28;8;TGT;aca TTA;taa;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;§;38;§;§;§;§;§;TTA;taa TTC;gaa;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;?1;$1;?1;$1;$1;?1;1;0;1;1;1;1;1;1;1;1;0;1;1;1;0;$1;?1;1;?1;1;0;25;13;25;$'''4;?5;16;9;TTC;gaa TTG;caa;0;0;1;0;1;1;1;0;0;0;0;1;0;0;$1;?1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;?1;0;?1;1;1;0;14;24;14;$1;3;10;4;TTG;caa TTT;aaa;0;1;1;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;1;1;0;1;0;1;1;1;1;1;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;?1;?1;0;0;22;16;22;§;2;20;2;TTT;aaa archée;;aho;ape;asc;cma;dka;dmu;hbu;iag;iho;mcn;mse;p18*;pai;pas;pcl;pis;pog;sai;shc;sia;sid;sii;sim;sin;sir;sis;siy;smr;ss9*;ssp*;sto*;tag;tne*;tpe;ttn;tuz;vdi;vmo;archée;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;moyenne;;;;;;;; tRNA;;47;46;46;55;47;46;46;46;47;46;46;46;46;46;46;46;48;46;46;46;46;46;46;46;48;46;47;46;46;46;46;47;46;46;47;47;46;47;46,6;;;;;;;; total;;16;15;12;10;16;17;10;11;15;23;25;41;24;22;40;32;21;21;26;19;19;19;19;19;19;19;20;26;19;19;24;20;33;42;35;34;22;21;22,2;;;;;;;; I0;;33;35;36;38;32;31;38;37;34;26;24;9;26;28;10;17;29;28;23;30;30;30;30;30;30;30;29;23;30;30;26;29;16;9;15;16;27;28;I0;;;;;;;; I1;;16;15;11;9;15;15;10;9;15;22;24;25;19;17;15;16;17;21;25;18;18;18;18;18;18;18;19;25;18;18;24;19;19;24;25;19;18;19;I1;;;;;;;; I2;;§;§;1;1;1;2;§;2;§;1;1;?15;?4;5;?19;?12;4;§;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;1;§;1;?12;?14;?9;?14;4;2;I2;;;;;;;; I3;;§;§;§;§;§;§;§;§;§;§;§;$1;$1;§;$'''6;$'''4;§;§;§;§;§;§;§;§;§;§;§;§;§;§;§;§;$2;$'''4;$1;$1;§;§;I3;;;;;;;;
Archaeoglobi Thermoplasmata
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Archaeoglobi Thermoplasmata.
- Légende: cyan, (mka,gaa) a 2 tRNA avec 2 introns chacun. Vert, (aciduliprofundum, atg), 2 et 3 tRNAs avec un intron chacun.
;;;archaeoglobi;;7;;;;;;thermoplasmata;;;7;;;;;Pyri 1;;Aciduliprofundum 2;;; archée;;afg;afu;apo;ast;ave;fpl;gac;Total;;tac;tvo;pto;fac;tar;mer;mear;Total;;mka;abi;acf;; CAA;ttg;1;1;0;1;0;0;0;3;ttg;0;0;0;0;0;0;0;;ttg;0;0;0;ttg;CAA CAC;gtg;0;0;0;0;0;0;0;;gtg;0;0;0;0;0;0;0;;gtg;0;0;0;gtg;CAC CAG;ctg;0;0;0;0;0;0;0;;ctg;0;0;0;0;0;0;0;;ctg;0;0;0;ctg;CAG CAT;atg;0;0;0;0;0;0;0;;atg;1;1;1;1;1;0;1;6;atg;1;2;3;atg;CAT CCA;tgg;1;1;1;1;1;1;1;7;tgg;1;1;1;1;1;1;1;7;tgg;1;1;1;tgg;CCA CCC;ggg;0;0;0;0;0;0;0;;ggg;1;1;0;0;0;0;0;2;ggg;0;0;0;ggg;CCC CCG;cgg;0;0;0;0;0;0;0;;cgg;0;0;0;0;0;1;0;1;cgg;0;1;1;cgg;CCG CCT;agg;0;0;0;0;0;0;0;;agg;0;0;0;0;0;1;0;1;agg;0;0;0;agg;CCT CGA;tcg;0;0;0;1;0;0;0;1;tcg;0;0;0;0;0;1;0;1;tcg;0;0;0;tcg;CGA CGC;gcg;0;0;0;0;0;0;0;;gcg;0;0;0;0;0;0;0;;gcg;0;0;0;gcg;CGC CGG;ccg;0;0;0;0;0;0;0;;ccg;0;0;0;0;0;0;0;;ccg;0;1;1;ccg;CGG CGT;acg;0;0;0;0;0;0;0;;acg;0;0;0;0;0;0;0;;acg;0;1;1;acg;CGT CTA;tag;0;0;0;0;0;0;0;;tag;0;0;0;0;0;0;0;;tag;0;0;0;tag;CTA CTC;gag;0;0;0;0;0;0;0;;gag;0;0;0;0;0;0;0;;gag;0;0;0;gag;CTC CTG;cag;0;0;0;0;0;0;0;;cag;0;0;0;0;0;0;0;;cag;0;1;0;cag;CTG CTT;aag;0;0;0;0;0;0;0;;aag;0;0;0;0;0;0;0;;aag;0;0;0;aag;CTT GAA;ttc;0;0;0;0;0;0;0;;ttc;0;0;0;0;0;0;0;;ttc;1;0;0;ttc;GAA GAC;gtc;0;0;0;0;0;0;0;;gtc;0;0;0;0;0;0;0;;gtc;0;0;0;gtc;GAC GAG;ctc;0;0;0;0;0;0;0;;ctc;0;0;0;0;0;0;0;;ctc;0;0;0;ctc;GAG GAT;atc;0;0;0;0;1;0;0;1;atc;0;0;0;0;0;0;0;;atc;0;1;1;atc;GAT GCA;tgc;0;0;0;0;0;0;0;;tgc;0;0;0;0;0;1;0;1;tgc;1;0;0;tgc;GCA GCC;ggc;0;0;0;0;0;0;0;;ggc;0;0;0;0;0;0;0;;ggc;0;0;0;ggc;GCC GCG;cgc;0;0;0;0;0;0;0;;cgc;0;0;0;0;0;0;0;;cgc;0;1;1;cgc;GCG GCT;agc;0;0;0;1;0;0;0;1;agc;0;0;0;0;0;0;0;;agc;0;0;0;agc;GCT GGA;tcc;0;0;0;0;0;0;0;;tcc;0;0;0;0;0;0;0;;tcc;0;0;0;tcc;GGA GGC;gcc;0;0;0;0;0;0;0;;gcc;0;0;0;0;0;0;0;;gcc;0;0;0;gcc;GGC GGG;ccc;0;0;0;1;0;0;0;1;ccc;0;0;0;0;0;0;0;;ccc;1;0;0;ccc;GGG GGT;acc;0;0;0;0;0;0;0;;acc;0;0;0;0;0;0;0;;acc;0;0;0;acc;GGT GTA;tac;1;1;1;1;1;1;1;7;tac;1;1;1;1;1;1;1;7;tac;0;1;1;tac;GTA GTC;gac;1;1;0;0;1;0;0;3;gac;0;0;0;0;0;0;0;;gac;0;1;1;gac;GTC GTG;cac;0;0;0;0;0;0;0;;cac;0;0;0;0;0;0;0;;cac;0;1;0;cac;GTG GTT;aac;0;0;0;0;0;0;0;;aac;0;0;0;0;0;1;0;1;aac;1;0;1;aac;GTT TAA;tta;0;0;0;0;1;0;0;1;tta;0;0;0;0;0;0;1;1;tta;0;0;0;tta;TAA TAC;gta;0;0;0;0;0;0;0;;gta;0;0;0;0;0;0;0;;gta;0;0;0;gta;TAC TAG;cta;0;0;0;0;0;0;0;;cta;0;0;0;0;0;0;0;;cta;0;0;0;cta;TAG TAT;ata;0;0;0;0;0;0;0;;ata;0;0;0;0;0;0;0;;ata;0;0;0;ata;TAT TCA;tga;0;0;0;0;0;0;0;;tga;0;0;0;0;0;0;0;;tga;0;0;0;tga;TCA TCC;gga;0;0;0;0;0;0;0;;gga;0;0;0;0;0;0;0;;gga;0;0;0;gga;TCC TCG;cga;0;0;0;0;0;0;0;;cga;0;0;0;0;0;0;0;;cga;0;0;0;cga;TCG TCT;aga;0;0;0;0;0;0;0;;aga;0;0;0;0;0;0;0;;aga;0;0;0;aga;TCT TGA;tca;0;0;0;0;0;0;0;;tca;0;0;0;0;0;0;0;;tca;0;0;0;tca;TGA TGC;gca;0;0;0;0;0;0;0;;gca;0;0;0;0;0;0;0;;gca;0;0;0;gca;TGC TGG;cca;0;0;0;0;0;0;0;;cca;0;0;0;0;0;0;0;;cca;0;1;1;cca;TGG TGT;aca;0;0;0;0;0;0;0;;aca;0;0;0;0;0;0;0;;aca;0;0;1;aca;TGT TTA;taa;0;0;0;0;0;0;0;;taa;0;0;0;0;0;0;0;;taa;0;0;0;taa;TTA TTC;gaa;1;1;0;0;0;0;0;2;gaa;0;0;0;0;0;0;0;;gaa;2;1;1;gaa;TTC TTG;caa;0;0;0;0;0;0;0;;caa;0;0;0;0;0;0;0;;caa;0;1;1;caa;TTG TTT;aaa;0;0;0;0;0;0;0;;aaa;0;0;0;0;0;0;0;;aaa;0;0;0;aaa;TTT ;;;;;;;;;moyenne;;;;;;;;;moyenne;;;;;; tRNA;;46;46;47;51;46;49;48;47,6;;46;46;47;46;46;45;46;46,0;;35;46;46;;tRNA total;;5;5;2;6;5;2;2;3,9;;4;4;3;3;3;7;4;4,0;;8;15;16;;total archée;;afg;afu;apo;ast;ave;fpl;gac;;;tac;tvo;pto;fac;tar;mer;mear;;;mka;abi;acf;;archée
Nano Thaum Kor archaeota
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Nano Thaum Kor archaeota.
- Lien à la dernière colonne.
- Légende: cyan, (nmr,tgg) est un gène avec 2 introns, jaune (neq,tgg) est un gène avec 1 intron, bleu codon ata rare.
;;Nanoarcheota Thaumarchaeota Korarchaeota;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;CAA;CAC;CAG;CAT;CCA;CCC;CCG;CCT;CGA;CGC;CGG;CGT;CTA;CTC;CTG;CTT;GAA;GAC;GAG;GAT;GCA;GCC;GCG;GCT;GGA;GGC;GGG;GGT;GTA;GTC;GTG;GTT;TAA;TAC;TAG;TAT;TCA;TCC;TCG;TCT;TGA;TGC;TGG;TGT;TTA;TTC;TTG;TTT;;; abrégé;archée;ttg;gtg;ctg;atg;tgg;ggg;cgg;agg;tcg;gcg;ccg;acg;tag;gag;cag;aag;ttc;gtc;ctc;atc;tgc;ggc;cgc;agc;tcc;gcc;ccc;acc;tac;gac;cac;aac;tta;gta;cta;ata;tga;gga;cga;aga;tca;gca;cca;aca;taa;gaa;caa;aaa;tRNA;total;archée nano;neq;0;0;0;?1;?1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;?1;0;0;0;0;0;0;*1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;44;4;neq thaum;nmr;?1;?1;0;?1;$1;0;0;?1;0;0;0;0;0;0;?1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;?1;0;0;0;?1;0;0;0;$1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;?1;0;0;44;10;nmr kor;kcr;0;0;0;?1;$1;0;0;0;?1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;?1;0;0;0;0;0;0;*1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;46;5;kcr
Les totaux des crenarchaeota et des euryarchaeota
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Les totaux des crenarchaeota et des euryarchaeota.
- Voir les détails dans les listes ci-dessus.
- Légende: rouge (nmr,tgg) est un gène avec 3 introns, cyan, (nmr,tgg) est un gène avec 2 introns, jaune (neq,tgg) est un gène avec 1 intron.
décompte par génome des crenarchaeota;;;;;;38;;;décompte par génome des euryarchaeota;;;;;;142;; codon;gene;introns;zéros;génomes;I3;I2;I1;I3+I2;codon;gene;introns;zéros;génomes;I3;I2;I1;I3+I2 CAA;ttg;21;17;21;0;0;21;0;CAA;ttg;3;139;3;0;0;3;0 CAC;gtg;7;31;7;0;2;5;2;CAC;gtg;1;141;1;0;0;1;0 CAG;ctg;9;29;9;0;1;8;1;CAG;ctg;0;142;0;0;0;0;0 CAT;atg;77;1;37;0;11;66;11;CAT;atg;148;9;133;0;0;148;0 CCA;tgg;29;9;29;0;9;20;9;CCA;tgg;142;0;142;0;0;142;0 CCC;ggg;9;29;9;0;0;9;0;CCC;ggg;2;140;2;0;0;2;0 CCG;cgg;7;31;7;0;0;7;0;CCG;cgg;4;138;4;0;0;4;0 CCT;agg;27;11;27;1;2;24;3;CCT;agg;1;141;1;0;0;1;0 CGA;tcg;34;4;34;0;2;32;2;CGA;tcg;2;140;2;0;0;2;0 CGC;gcg;8;30;8;0;2;6;2;CGC;gcg;0;142;0;0;0;0;0 CGG;ccg;19;19;19;1;6;12;7;CGG;ccg;10;132;10;0;0;10;0 CGT;acg;37;1;37;0;5;32;5;CGT;acg;5;137;5;0;0;5;0 CTA;tag;0;38;0;0;0;0;0;CTA;tag;0;142;0;0;0;0;0 CTC;gag;30;8;30;4;6;20;10;CTC;gag;0;142;0;0;0;0;0 CTG;cag;12;26;12;1;3;8;4;CTG;cag;1;141;1;0;0;1;0 CTT;aag;28;11;27;0;3;25;3;CTT;aag;0;142;0;0;0;0;0 GAA;ttc;10;28;10;0;0;10;0;GAA;ttc;2;140;2;0;0;2;0 GAC;gtc;13;25;13;0;2;11;2;GAC;gtc;0;142;0;0;0;0;0 GAG;ctc;3;35;3;0;0;3;0;GAG;ctc;0;142;0;0;0;0;0 GAT;atc;25;13;25;0;5;20;5;GAT;atc;3;139;3;0;0;3;0 GCA;tgc;36;2;36;1;17;18;18;GCA;tgc;5;138;4;0;0;5;0 GCC;ggc;12;26;12;0;1;11;1;GCC;ggc;3;139;3;0;0;3;0 GCG;cgc;12;26;12;0;1;11;1;GCG;cgc;5;137;5;0;0;5;0 GCT;agc;3;35;3;0;0;3;0;GCT;agc;1;141;1;0;0;1;0 GGA;tcc;11;27;11;0;0;11;0;GGA;tcc;5;137;5;0;0;5;0 GGC;gcc;3;35;3;0;1;2;1;GGC;gcc;2;140;2;0;0;2;0 GGG;ccc;38;0;38;1;6;31;7;GGG;ccc;5;137;5;0;1;4;1 GGT;acc;15;23;15;0;1;14;1;GGT;acc;0;142;0;0;0;0;0 GTA;tac;39;0;38;0;7;32;7;GTA;tac;64;78;64;0;0;64;0 GTC;gac;11;28;10;1;8;2;9;GTC;gac;5;137;5;0;0;5;0 GTG;cac;11;27;11;0;1;10;1;GTG;cac;1;141;1;0;0;1;0 GTT;aac;26;12;26;0;7;19;7;GTT;aac;13;131;11;0;0;13;0 TAA;tta;19;19;19;0;0;19;0;TAA;tta;2;141;2;0;0;2;0 TAC;gta;17;21;17;0;6;11;6;TAC;gta;1;141;1;0;0;1;0 TAG;cta;3;35;3;0;0;3;0;TAG;cta;0;142;0;0;0;0;0 TAT;ata;0;38;0;0;0;0;0;TAT;ata;0;142;0;0;0;0;0 TCA;tga;1;37;1;0;0;1;0;TCA;tga;0;142;0;0;0;0;0 TCC;gga;13;25;13;0;3;10;3;TCC;gga;4;138;4;0;0;4;0 TCG;cga;6;32;6;0;0;6;0;TCG;cga;36;106;36;0;0;36;0 TCT;aga;23;15;23;0;0;23;0;TCT;aga;11;131;11;0;0;11;0 TGA;tca;13;25;13;0;1;12;1;TGA;tca;3;139;3;0;0;3;0 TGC;gca;16;22;16;0;3;13;3;TGC;gca;0;142;0;0;0;0;0 TGG;cca;15;23;15;3;2;10;5;TGG;cca;2;140;2;0;0;2;0 TGT;aca;36;2;36;2;6;28;8;TGT;aca;4;138;4;0;0;4;0 TTA;taa;0;38;0;0;0;0;0;TTA;taa;0;142;0;0;0;0;0 TTC;gaa;25;13;25;4;5;16;9;TTC;gaa;7;136;6;0;2;5;2 TTG;caa;14;24;14;1;3;10;4;TTG;caa;17;125;17;0;0;17;0 TTT;aaa;22;16;22;0;2;20;2;TTT;aaa;3;139;3;0;0;3;0 AAA;ttt;0;38;0;0;0;0;0;AAA;ttt;0;142;0;0;0;0;0 AAC;gtt;0;38;0;0;0;0;0;AAC;gtt;1;141;1;0;0;1;0 AAG;ctt;0;38;0;0;0;0;0;AAG;ctt;0;142;0;0;0;0;0 AAT;att;0;38;0;0;0;0;0;AAT;att;0;142;0;0;0;0;0 ACA;tgt;0;38;0;0;0;0;0;ACA;tgt;0;142;0;0;0;0;0 ACC;ggt;0;38;0;0;0;0;0;ACC;ggt;1;141;1;0;0;1;0 ACG;cgt;0;38;0;0;0;0;0;ACG;cgt;1;141;1;0;0;1;0 ACT;agt;0;38;0;0;0;0;0;ACT;agt;0;142;0;0;0;0;0 AGA;tct;0;38;0;0;0;0;0;AGA;tct;0;142;0;0;0;0;0 AGC;gct;0;38;0;0;0;0;0;AGC;gct;0;142;0;0;0;0;0 AGG;cct;0;38;0;0;0;0;0;AGG;cct;0;142;0;0;0;0;0 AGT;act;0;38;0;0;0;0;0;AGT;act;0;142;0;0;0;0;0 ATA;tat;0;38;0;0;0;0;0;ATA;tat;0;142;0;0;0;0;0 ATC;gat;0;38;0;0;0;0;0;ATC;gat;0;142;0;0;0;0;0 ATG;cat;0;38;0;0;0;0;0;ATG;cat;0;142;0;0;0;0;0 ATT;aat;0;38;0;0;0;0;0;ATT;aat;0;142;0;0;0;0;0
Comparaison entre archées
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Comparaison entre archées.
Total introns
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Total introns.
- Légende:
Archées;;183;introns;total;;;;;Crena;38;introns;total;;;; ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0 att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0 ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;1;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0 gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;1;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0 ttc;12;tcc;17;tac;106;tgc;41;;ttc;10;tcc;11;tac;39;tgc;36 atc;28;acc;15;aac;39;agc;4;;atc;25;acc;15;aac;26;agc;3 ctc;3;ccc;43;cac;12;cgc;17;;ctc;3;ccc;38;cac;11;cgc;12 gtc;13;gcc;5;gac;16;ggc;15;;gtc;13;gcc;3;gac;11;ggc;12 tta;22;tca;16;taa;0;tga;1;;tta;19;tca;13;taa;0;tga;1 ata;2;aca;40;aaa;25;aga;34;;ata;0;aca;36;aaa;22;aga;23 cta;3;cca;17;caa;31;cga;42;;cta;3;cca;15;caa;14;cga;6 gta;18;gca;16;gaa;33;gga;17;;gta;17;gca;16;gaa;25;gga;13 ttg;25;tcg;37;tag;0;tgg;174;;ttg;21;tcg;34;tag;0;tgg;29 atg;228;acg;42;aag;28;agg;29;;atg;77;acg;37;aag;28;agg;27 ctg;9;ccg;29;cag;14;cgg;11;;ctg;9;ccg;19;cag;12;cgg;7 gtg;9;gcg;8;gag;30;ggg;11;;gtg;7;gcg;8;gag;30;ggg;9 ;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;; Crena;introns;3+2;;total;;;;;EuryA;142;introns;total;;;; ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0 att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0 ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;1 gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;1 ttc;0;tcc;0;tac;7;tgc;18;;ttc;2;tcc;5;tac;64;tgc;5 atc;5;acc;1;aac;7;agc;0;;atc;3;acc;0;aac;13;agc;1 ctc;0;ccc;7;cac;1;cgc;1;;ctc;0;ccc;5;cac;1;cgc;5 gtc;2;gcc;1;gac;9;ggc;1;;gtc;0;gcc;2;gac;5;ggc;3 tta;0;tca;1;taa;0;tga;0;;tta;2;tca;3;taa;0;tga;0 ata;0;aca;8;aaa;2;aga;0;;ata;0;aca;4;aaa;3;aga;11 cta;0;cca;5;caa;4;cga;0;;cta;0;cca;2;caa;17;cga;36 gta;6;gca;3;gaa;9;gga;3;;gta;1;gca;0;gaa;7;gga;4 ttg;0;tcg;2;tag;0;tgg;9;;ttg;3;tcg;2;tag;0;tgg;142 atg;10;acg;5;aag;3;agg;3;;atg;148;acg;5;aag;0;agg;1 ctg;1;ccg;7;cag;4;cgg;0;;ctg;0;ccg;10;cag;1;cgg;4 gtg;2;gcg;2;gag;10;ggg;0;;gtg;1;gcg;0;gag;0;ggg;2
Introns pour 100 génomes
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Introns pour 100 génomes.
- Légende:
Archées;;183;introns;%;;;;;Crena;38;introns;;;%;;;;EuryA;142;introns;;%;;; ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0 att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0 ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;1;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;1 gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;1;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;1 ttc;7;tcc;9;tac;58;tgc;22;;ttc;26;tcc;29;tac;103;tgc;95;;ttc;1;tcc;4;tac;45;tgc;4 atc;15;acc;8;aac;21;agc;2;;atc;66;acc;39;aac;68;agc;8;;atc;2;acc;0;aac;9;agc;1 ctc;2;ccc;23;cac;7;cgc;9;;ctc;8;ccc;100;cac;29;cgc;32;;ctc;0;ccc;4;cac;1;cgc;4 gtc;7;gcc;3;gac;9;ggc;8;;gtc;34;gcc;8;gac;29;ggc;32;;gtc;0;gcc;1;gac;4;ggc;2 tta;12;tca;9;taa;0;tga;1;;tta;50;tca;34;taa;0;tga;3;;tta;1;tca;2;taa;0;tga;0 ata;1;aca;22;aaa;14;aga;19;;ata;0;aca;95;aaa;58;aga;61;;ata;0;aca;3;aaa;2;aga;8 cta;2;cca;9;caa;17;cga;23;;cta;8;cca;39;caa;37;cga;16;;cta;0;cca;1;caa;12;cga;25 gta;10;gca;9;gaa;18;gga;9;;gta;45;gca;42;gaa;66;gga;34;;gta;1;gca;0;gaa;5;gga;3 ttg;14;tcg;20;tag;0;tgg;95;;ttg;55;tcg;89;tag;0;tgg;76;;ttg;2;tcg;1;tag;0;tgg;100 atg;125;acg;23;aag;15;agg;16;;atg;205;acg;97;aag;74;agg;71;;atg;104;acg;4;aag;0;agg;1 ctg;5;ccg;16;cag;8;cgg;6;;ctg;24;ccg;50;cag;32;cgg;18;;ctg;0;ccg;7;cag;1;cgg;3 gtg;5;gcg;4;gag;16;ggg;6;;gtg;18;gcg;21;gag;79;ggg;24;;gtg;1;gcg;0;gag;0;ggg;1 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; Archées;;183;tRNAs;;;;;;Crena;38;tRNAs;;;;;;;Eury;142;tRNAs;;;;; ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0 att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0 ctt;1;cct;0;cat;0;cgt;2;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0;;ctt;1;cct;0;cat;0;cgt;2 gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;1;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;1 ttc;215;tcc;190;tac;190;tgc;299;;ttc;38;tcc;38;tac;39;tgc;38;;ttc;174;tcc;149;tac;148;tgc;258 atc;212;acc;189;aac;214;agc;187;;atc;38;acc;39;aac;39;agc;38;;atc;171;acc;147;aac;172;agc;146 ctc;214;ccc;171;cac;185;cgc;187;;ctc;38;ccc;38;cac;38;cgc;40;;ctc;173;ccc;130;cac;143;cgc;144 gtc;212;gcc;184;gac;218;ggc;243;;gtc;38;gcc;38;gac;40;ggc;40;;gtc;171;gcc;143;gac;175;ggc;200 tta;191;tca;184;taa;0;tga;18;;tta;38;tca;38;taa;0;tga;1;;tta;150;tca;143;taa;0;tga;17 ata;2;aca;198;aaa;197;aga;186;;ata;0;aca;38;aaa;39;aga;39;;ata;0;aca;157;aaa;155;aga;144 cta;185;cca;184;caa;196;cga;185;;cta;38;cca;38;caa;38;cga;38;;cta;144;cca;143;caa;154;cga;144 gta;186;gca;256;gaa;230;gga;189;;gta;38;gca;39;gaa;40;gga;40;;gta;145;gca;214;gaa;186;gga;146 ttg;163;tcg;152;tag;1;tgg;184;;ttg;38;tcg;38;tag;0;tgg;38;;ttg;122;tcg;111;tag;1;tgg;143 atg;589;acg;169;aag;166;agg;165;;atg;115;acg;38;aag;40;agg;38;;atg;466;acg;128;aag;122;agg;124 ctg;160;ccg;151;cag;165;cgg;139;;ctg;39;ccg;37;cag;38;cgg;38;;ctg;119;ccg;112;cag;124;cgg;100 gtg;170;gcg;159;gag;160;ggg;155;;gtg;38;gcg;39;gag;38;ggg;40;;gtg;129;gcg;117;gag;118;ggg;112
Génomes par codon
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Génomes par codon.
- Légende:
Archées;;183;introns;génomes;;;;;Crena;38;introns;génomes;;;;;;EuryA;142;introns;génomes;;;; ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0 att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0 ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;1;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;1 gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;1;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;1 ttc;12;tcc;17;tac;105;tgc;40;;ttc;10;tcc;11;tac;38;tgc;36;;ttc;2;tcc;5;tac;64;tgc;4 atc;28;acc;15;aac;37;agc;4;;atc;25;acc;15;aac;26;agc;3;;atc;3;acc;0;aac;11;agc;1 ctc;3;ccc;43;cac;12;cgc;17;;ctc;3;ccc;38;cac;11;cgc;12;;ctc;0;ccc;5;cac;1;cgc;5 gtc;13;gcc;5;gac;15;ggc;15;;gtc;13;gcc;3;gac;10;ggc;12;;gtc;0;gcc;2;gac;5;ggc;3 tta;22;tca;16;taa;0;tga;1;;tta;19;tca;13;taa;0;tga;1;;tta;2;tca;3;taa;0;tga;0 ata;2;aca;40;aaa;25;aga;34;;ata;0;aca;36;aaa;22;aga;23;;ata;0;aca;4;aaa;3;aga;11 cta;3;cca;17;caa;31;cga;42;;cta;3;cca;15;caa;14;cga;6;;cta;0;cca;2;caa;17;cga;36 gta;18;gca;16;gaa;32;gga;17;;gta;17;gca;16;gaa;25;gga;13;;gta;1;gca;0;gaa;6;gga;4 ttg;25;tcg;37;tag;0;tgg;174;;ttg;21;tcg;34;tag;0;tgg;29;;ttg;3;tcg;2;tag;0;tgg;142 atg;173;acg;42;aag;27;agg;29;;atg;37;acg;37;aag;27;agg;27;;atg;133;acg;5;aag;0;agg;1 ctg;9;ccg;29;cag;14;cgg;11;;ctg;9;ccg;19;cag;12;cgg;7;;ctg;0;ccg;10;cag;1;cgg;4 gtg;9;gcg;8;gag;30;ggg;11;;gtg;7;gcg;8;gag;30;ggg;9;;gtg;1;gcg;0;gag;0;ggg;2
Taux des génomes à introns
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Taux des génomes à introns.
- Légende:
Archées;;183;introns;génomes;;%;;;Crena;38;introns;génomes;;%;;;;EuryA;142;introns;génomes;;%;; ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0 att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0 ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;1;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;1 gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;1;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;1 ttc;7;tcc;9;tac;57;tgc;22;;ttc;26;tcc;29;tac;100;tgc;95;;ttc;1;tcc;4;tac;45;tgc;3 atc;15;acc;8;aac;20;agc;2;;atc;66;acc;39;aac;68;agc;8;;atc;2;acc;0;aac;8;agc;1 ctc;2;ccc;23;cac;7;cgc;9;;ctc;8;ccc;100;cac;29;cgc;32;;ctc;0;ccc;4;cac;1;cgc;4 gtc;7;gcc;3;gac;8;ggc;8;;gtc;34;gcc;8;gac;26;ggc;32;;gtc;0;gcc;1;gac;4;ggc;2 tta;12;tca;9;taa;0;tga;1;;tta;50;tca;34;taa;0;tga;3;;tta;1;tca;2;taa;0;tga;0 ata;1;aca;22;aaa;14;aga;19;;ata;0;aca;95;aaa;58;aga;61;;ata;0;aca;3;aaa;2;aga;8 cta;2;cca;9;caa;17;cga;23;;cta;8;cca;39;caa;37;cga;16;;cta;0;cca;1;caa;12;cga;25 gta;10;gca;9;gaa;17;gga;9;;gta;45;gca;42;gaa;66;gga;34;;gta;1;gca;0;gaa;4;gga;3 ttg;14;tcg;20;tag;0;tgg;95;;ttg;55;tcg;89;tag;0;tgg;76;;ttg;2;tcg;1;tag;0;tgg;100 atg;95;acg;23;aag;15;agg;16;;atg;97;acg;97;aag;71;agg;71;;atg;94;acg;4;aag;0;agg;1 ctg;5;ccg;16;cag;8;cgg;6;;ctg;24;ccg;50;cag;32;cgg;18;;ctg;0;ccg;7;cag;1;cgg;3 gtg;5;gcg;4;gag;16;ggg;6;;gtg;18;gcg;21;gag;79;ggg;24;;gtg;1;gcg;0;gag;0;ggg;1
Taux des tRNAs avec introns
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Taux des tRNAs avec introns.
- Légende:
- _ Ce taux est égal au nombre de tRNAs d'un codon ayant des introns sur le total des tRNAs de ce codon. Voir les tableaux carrés des Totaux des introns et des tRNAs.
- _ Détails Crenarchaeota et Euryarchaeota Archées
Archées;;183;Taux introns/tRNAs;;;;;;Crena;38;Taux introns/tRNAs;;;;;;;Eury;142;Taux introns/tRNAs;;;;; ttt;−;tct;−;tat;−;tgt;−;;ttt;−;tct;−;tat;−;tgt;−;;ttt;−;tct;−;tat;−;tgt;− att;−;act;−;aat;−;agt;−;;att;−;act;−;aat;−;agt;−;;att;−;act;−;aat;−;agt;− ctt;0;cct;−;cat;−;cgt;50;;ctt;−;cct;−;cat;−;cgt;−;;ctt;0;cct;−;cat;−;cgt;50 gtt;100;gct;−;gat;−;ggt;100;;gtt;−;gct;−;gat;−;ggt;−;;gtt;100;gct;−;gat;−;ggt;100 ttc;6;tcc;9;tac;56;tgc;14;;ttc;26;tcc;29;tac;100;tgc;95;;ttc;1;tcc;3;tac;43;tgc;2 atc;13;acc;8;aac;18;agc;2;;atc;66;acc;38;aac;67;agc;8;;atc;2;acc;0;aac;8;agc;1 ctc;1;ccc;25;cac;6;cgc;9;;ctc;8;ccc;100;cac;29;cgc;30;;ctc;0;ccc;4;cac;1;cgc;3 gtc;6;gcc;3;gac;7;ggc;6;;gtc;34;gcc;8;gac;28;ggc;30;;gtc;0;gcc;1;gac;3;ggc;2 tta;12;tca;9;taa;−;tga;6;;tta;50;tca;34;taa;−;tga;100;;tta;1;tca;2;taa;−;tga;0 ata;100;aca;20;aaa;13;aga;18;;ata;−;aca;95;aaa;56;aga;59;;ata;−;aca;3;aaa;2;aga;8 cta;2;cca;9;caa;16;cga;23;;cta;8;cca;39;caa;37;cga;16;;cta;0;cca;1;caa;11;cga;25 gta;10;gca;6;gaa;14;gga;9;;gta;45;gca;41;gaa;63;gga;33;;gta;1;gca;0;gaa;4;gga;3 ttg;15;tcg;24;tag;0;tgg;95;;ttg;55;tcg;89;tag;−;tgg;76;;ttg;2;tcg;2;tag;0;tgg;99 atg;39;acg;25;aag;17;agg;18;;atg;67;acg;97;aag;70;agg;71;;atg;32;acg;4;aag;0;agg;1 ctg;6;ccg;19;cag;8;cgg;8;;ctg;23;ccg;51;cag;32;cgg;18;;ctg;0;ccg;9;cag;1;cgg;4 gtg;5;gcg;5;gag;19;ggg;7;;gtg;18;gcg;21;gag;79;ggg;23;;gtg;1;gcg;0;gag;0;ggg;2
Les tRNAs des euryarchaeota
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Les tRNAs des euryarchaeota.
- Légende:
Methanomicrobia;;;tRNAs;47;;;;;Halobacteria;;;tRNAs;30;;;;;Thermococci;;;tRNAs;19;;; ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0 att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0 ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0 gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0 ttc;72;tcc;47;tac;47;tgc;158;;ttc;34;tcc;32;tac;34;tgc;30;;ttc;19;tcc;19;tac;19;tgc;19 atc;73;acc;47;aac;71;agc;47;;atc;30;acc;35;aac;32;agc;31;;atc;19;acc;19;aac;19;agc;19 ctc;78;ccc;47;cac;47;cgc;47;;ctc;30;ccc;31;cac;31;cgc;31;;ctc;19;ccc;18;cac;19;cgc;19 gtc;72;gcc;47;gac;51;ggc;94;;gtc;33;gcc;32;gac;49;ggc;41;;gtc;19;gcc;19;gac;19;ggc;19 tta;53;tca;46;taa;0;tga;0;;tta;30;tca;30;taa;0;tga;0;;tta;19;tca;19;taa;0;tga;0 ata;0;aca;60;aaa;48;aga;47;;ata;0;aca;31;aaa;31;aga;31;;ata;0;aca;19;aaa;19;aga;19 cta;48;cca;47;caa;48;cga;47;;cta;30;cca;30;caa;31;cga;30;;cta;19;cca;19;caa;19;cga;19 gta;48;gca;73;gaa;71;gga;47;;gta;30;gca;54;gaa;31;gga;31;;gta;19;gca;20;gaa;19;gga;19 ttg;48;tcg;40;tag;1;tgg;47;;ttg;33;tcg;30;tag;0;tgg;30;;ttg;19;tcg;19;tag;0;tgg;19 atg;167;acg;49;aag;48;agg;46;;atg;96;acg;30;aag;30;agg;29;;atg;57;acg;19;aag;19;agg;19 ctg;51;ccg;47;cag;47;cgg;47;;ctg;30;ccg;30;cag;30;cgg;18;;ctg;18;ccg;19;cag;18;cgg;19 gtg;47;gcg;47;gag;47;ggg;46;;gtg;30;gcg;33;gag;32;ggg;28;;gtg;20;gcg;19;gag;19;ggg;19 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; Methanococci;;tRNAs;;16;;;;;Methanobacteria;;;tRNAs;13;;;;;Archaeoglobi;;;tRNAs;7;;; ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0 att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0 ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;1;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0 gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0 ttc;16;tcc;16;tac;16;tgc;16;;ttc;15;tcc;18;tac;15;tgc;18;;ttc;8;tcc;7;tac;7;tgc;7 atc;16;acc;16;aac;16;agc;16;;atc;15;acc;13;aac;16;agc;16;;atc;8;acc;7;aac;7;agc;7 ctc;16;ccc;15;cac;16;cgc;16;;ctc;13;ccc;2;cac;13;cgc;13;;ctc;8;ccc;7;cac;7;cgc;8 gtc;16;gcc;16;gac;25;ggc;16;;gtc;14;gcc;12;gac;14;ggc;13;;gtc;7;gcc;7;gac;7;ggc;7 tta;16;tca;16;taa;0;tga;16;;tta;15;tca;15;taa;0;tga;0;;tta;7;tca;7;taa;;tga; ata;0;aca;16;aaa;25;aga;16;;ata;0;aca;13;aaa;16;aga;14;;ata;;aca;8;aaa;7;aga;7 cta;16;cca;16;caa;16;cga;17;;cta;14;cca;14;caa;21;cga;13;;cta;7;cca;7;caa;9;cga;8 gta;17;gca;22;gaa;32;gga;17;;gta;14;gca;28;gaa;15;gga;15;;gta;7;gca;7;gaa;7;gga;7 ttg;0;tcg;0;tag;0;tgg;16;;ttg;7;tcg;6;tag;0;tgg;14;;ttg;7;tcg;7;tag;;tgg;7 atg;56;acg;1;aag;0;agg;0;;atg;39;acg;12;aag;9;agg;13;;atg;21;acg;8;aag;7;agg;7 ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;0;;ctg;4;ccg;0;cag;12;cgg;0;;ctg;7;ccg;7;cag;8;cgg;7 gtg;7;gcg;0;gag;0;ggg;0;;gtg;9;gcg;2;gag;4;ggg;3;;gtg;7;gcg;7;gag;7;ggg;7 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; Thermoplasmata;;;tRNAs;7;;;;;Aciduliprofundum;;;tRNAs;2;;;;;Methanopyri;;;tRNAs;1;;; ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0 att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0 ctt;1;cct;0;cat;0;cgt;0;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0 gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0 ttc;7;tcc;7;tac;7;tgc;7;;ttc;2;tcc;2;tac;2;tgc;2;;ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;1 atc;7;acc;7;aac;8;agc;7;;atc;2;acc;2;aac;2;agc;2;;atc;1;acc;1;aac;1;agc;1 ctc;6;ccc;7;cac;7;cgc;7;;ctc;2;ccc;2;cac;2;cgc;2;;ctc;1;ccc;1;cac;1;cgc;1 gtc;7;gcc;7;gac;7;ggc;7;;gtc;2;gcc;2;gac;2;ggc;2;;gtc;1;gcc;1;gac;1;ggc;1 tta;7;tca;7;taa;0;tga;0;;tta;2;tca;2;taa;0;tga;0;;tta;1;tca;1;taa;0;tga;1 ata;0;aca;7;aaa;6;aga;7;;ata;0;aca;2;aaa;2;aga;2;;ata;0;aca;1;aaa;1;aga;1 cta;7;cca;7;caa;7;cga;7;;cta;2;cca;2;caa;2;cga;2;;cta;1;cca;1;caa;1;cga;1 gta;7;gca;7;gaa;7;gga;7;;gta;2;gca;2;gaa;2;gga;2;;gta;1;gca;1;gaa;2;gga;1 ttg;6;tcg;7;tag;0;tgg;7;;ttg;2;tcg;2;tag;0;tgg;2;;ttg;0;tcg;0;tag;0;tgg;1 atg;21;acg;7;aag;7;agg;8;;atg;6;acg;2;aag;2;agg;2;;atg;3;acg;0;aag;0;agg;0 ctg;7;ccg;7;cag;7;cgg;7;;ctg;2;ccg;2;cag;2;cgg;2;;ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;0 gtg;7;gcg;7;gag;7;ggg;7;;gtg;2;gcg;2;gag;2;ggg;2;;gtg;0;gcg;0;gag;0;ggg;0
Protection contre les duplications par les introns
[modifier | modifier le wikicode]- Les Crenarchaeota ont un nombre élevé d'introns qui touchent tous les codons (ref. total introns). Pourtant le décompte de leurs tRNAs (ref. tRNAs) montrent très peu de duplications d'où l'idée de refaire les décomptes des duplications et des introns associés de tous les archées. Les résultats de ce chapitre seront comparés à ceux des eucaryotes en ce qui concerne l’association duplication, à l'identique ou non, et intron.
Décompte des duplications de tous les archées
[modifier | modifier le wikicode]- Les décomptes ont été faits suivant la méthode appliquée aux eucaryotes (ref. méthode) après avoir repéré les codons à doublons. N'ont pas été faits les archées qui n’avaient que le codon atg dupliqué normalement, c'est-à-dire 3 fois (Met Ini Ile). Aussi le résultat anormal de ce codon trouvé chez le génome mmaz ( 2 tRNAs identiques pour un total de 3, ref. future) n'a pas été vérifié pour les archées non décomptés.
- Methanomicrobia 47
introns;total;diff;mac;;introns;total;diff;mbw;;introns;total;diff;meq;;introns;total;diff;mhz;;introns;total;diff;mmaz;;introns;total;diff;mpl;;introns;total;diff;mthe 1;4;3;CAT;;1;5;3;CAT;;0;2;2;CAG;;1;3;3;CAT;;1;3;2;CAT;;1;3;3;CAT;;1;3;3;CAT 0;3;3;GCA;;0;2;1;GAA;;1;4;4;CAT;;0;2;1;CGT;;0;2;2;GAC;;0;8;6;GCA;;0;2;1;GAA 0;3;1;GCC;;0;2;1;GAC;;0;2;1;GAA;;0;4;3;GCA;;0;2;2;GAT;;0;4;2;TGT;;0;2;1;GAC 0;2;1;GAA;;0;2;1;GAG;;0;2;1;GAC;;0;2;1;TGC;;0;3;3;GCA;;introns;;;mpy;;0;2;1;GAG 0;2;1;GAC;;0;2;1;GAT;;0;2;2;GAG;;0;2;2;TTG;;introns;;;mmet;;1;3;3;CAT;;0;2;1;GAT 0;2;2;GAG;;0;4;3;GCA;;0;2;2;GAT;;introns;;;mla;;1;4;3;CAT;;0;2;2;GAG;;0;5;5;GCA 0;2;1;GAT;;0;3;2;GCC;;0;2;1;GCA;;0;3;3;CAT;;0;2;1;CTT;;0;5;3;GCA;;0;3;1;GCC 0;2;1;GTT;;0;2;1;GTT;;0;3;2;GCC;;0;4;2;GCA;;1;2;2;GAA;;0;3;1;TGC;;0;2;2;GTT 0;2;1;TTC;;0;3;3;TAA;;0;2;1;GTT;;0;2;1;GCC;;0;2;1;GAG;;introns;;;msj;;0;2;1;TTC 0;2;2;TTG;;0;2;2;TGT;;0;2;2;TGT;;0;2;1;GTC;;0;4;3;GCA;;1;4;3;CAT;;introns;;;mthe introns;;;mba;;0;2;1;TTC;;0;2;1;TTC;;0;3;1;TGC;;0;2;1;GTC;;0;2;1;GAA;;1;3;3;CAT 1;5;3;CAT;;introns;;;mby;;introns;;;metm;;introns;;;mls;;0;3;1;TGC;;0;2;1;GAC;;0;2;1;GAA 0;2;1;GAA;;1;4;3;CAT;;1;4;3;CAT;;0;2;2;CAG;;introns;;;mmh;;0;2;2;GAG;;0;2;1;GAC 0;2;1;GAC;;0;2;1;GAA;;0;2;1;GAA;;1;4;3;CAT;;1;4;3;CAT;;0;2;1;GAT;;0;2;1;GAG 0;2;1;GAG;;0;2;2;GAC;;0;2;1;GAC;;0;2;1;GAA;;0;5;3;GCA;;0;3;3;GCA;;0;2;1;GAT 0;2;1;GAT;;0;2;1;GAG;;0;3;2;GAG;;0;2;1;GAC;;1;2;2;TAC;;0;3;2;GCC;;0;5;5;GCA 0;4;3;GCA;;0;2;2;GAT;;0;2;2;GAT;;0;2;2;GAG;;0;3;1;TGC;;0;2;1;GTT;;0;3;1;GCC 0;3;2;GCC;;0;4;3;GCA;;0;2;2;GCA;;0;2;1;GAT;;introns;;;mmj;;1;2;2;TGT;;0;2;2;GTT 0;2;1;GTT;;0;3;3;GCC;;0;3;2;GCC;;0;3;3;GCA;;1;4;3;CAT;;0;2;1;TTC;;0;2;1;TTC 0;3;3;TAA;;0;2;1;GTT;;0;2;1;GTT;;0;2;2;GCC;;0;2;1;GAA;;introns;;;msw;;introns;;;mthr 0;2;2;TGT;;0;2;2;TAA;;0;2;1;TTC;;0;2;1;GTT;;0;2;1;GAC;;1;4;3;CAT;;1;3;3;CAT 0;2;1;TTC;;0;2;1;TTC;;introns;;;mev;;0;2;1;TTC;;0;2;2;GAG;;0;2;1;GAA;;0;2;1;GAA introns;;;mbak;;introns;;;mco*;;1;3;3;CAT;;introns;;;mma;;0;2;2;GAT;;0;2;1;GAC;;0;2;1;GAC 1;4;3;CAT;;1;3;3;CAT;;0;3;2;GCA;;1;4;3;CAT;;0;3;3;GCA;;0;2;2;GAG;;0;2;1;GAG 0;2;1;GAA;;0;2;2;GAG;;0;2;2;CGT;;0;2;1;GAA;;0;3;2;GCC;;0;2;2;GAT;;0;2;1;GAT 0;2;1;GAC;;0;2;2;TAG;;0;2;1;TGC;;0;2;1;GAC;;0;2;1;GTT;;0;3;3;GCA;;0;5;5;GCA 0;2;1;GAG;;0;2;1;TGC;;introns;;;mez;;0;2;2;GAG;;0;2;1;TTC;;0;3;1;GCC;;0;3;1;GCC 0;2;2;GAT;;introns;;;mef;;1;3;3;CAT;;0;2;2;GAT;;introns;;;mml*;;0;2;1;GTT;;0;2;2;GTT 0;6;5;GCA;;1;4;4;CAT;;0;3;3;GCA;;0;3;3;GCA;;1;4;3;CAT;;0;2;1;TTC;;0;2;1;TTC 0;3;2;GCC;;0;2;1;GAA;;0;2;2;TCC;;0;3;2;GCC;;0;2;2;GAA;;introns;;;msz;;introns;;;mvc 0;2;1;GTT;;0;2;1;GAC;;0;2;1;TGC;;0;2;1;GTT;;0;2;1;GAC;;1;4;3;CAT;;0;2;2;CAG 0;2;2;TTC;;0;2;2;GAG;;1;2;2;TGT;;0;2;1;TTC;;0;2;2;GAG;;0;2;1;GAA;;1;4;3;CAT introns;;;mbar;;0;2;2;GAT;;introns;;;mfo;;introns;;;mma*;;0;2;2;GAT;;0;2;1;GAC;;0;2;2;CGA 1;4;3;CAT;;0;2;1;GCA;;1;3;3;CAT;;1;4;3;CAT;;0;3;3;GCA;;0;2;2;GAG;;0;2;1;GAA 0;2;1;GAA;;0;3;2;GCC;;0;4;4;GCA;;0;2;1;GAA;;0;3;2;GCC;;0;2;1;GAT;;0;2;1;GAC 0;2;2;GAC;;0;2;1;GTT;;introns;;;mhor;;0;2;1;GAC;;0;2;1;GTT;;0;3;3;GCA;;0;2;1;GAG 0;2;1;GAG;;0;2;1;TTC;;0;2;2;CAA;;0;2;2;GAG;;0;2;1;TTC;;0;3;1;GCC;;0;2;2;GAT 0;2;2;GAT;;introns;;;mek;;0;2;2;CAG;;0;2;2;GAT;;introns;;;mmw*;;0;2;1;GTT;;0;6;5;GCA 0;4;3;GCA;;0;2;2;CAG;;1;4;4;CAT;;0;3;3;GCA;;1;4;4;CAT;;0;2;1;TTC;;0;3;2;GCC 0;3;3;GCC;;1;4;3;CAT;;0;2;1;GAA;;0;3;2;GCC;;0;2;1;GAA;;introns;;;mta*;;0;2;1;GTT 0;2;1;GTT;;0;2;1;GAA;;0;2;1;GAC;;0;2;1;GTT;;0;2;1;GAC;;1;3;3;CAT;;0;2;1;TTC 0;2;2;TAA;;0;2;1;GAC;;0;2;2;GAG;;0;2;1;TTC;;0;2;2;GAG;;0;2;2;TGC;;introns;;;mzh 0;2;1;TGC;;0;2;2;GAG;;0;2;2;GAT;;introns;;;mmac;;0;2;2;GAT;;introns;;;mth*;;1;2;2;CAC 0;2;2;TGT;;0;2;2;GAT;;0;4;4;GCA;;1;4;3;CAT;;0;3;3;GCA;;1;3;3;CAT;;1;3;3;CAT 0;2;1;TTC;;0;7;1;GCA;;0;3;2;GCC;;0;2;1;GAA;;0;3;2;GCC;;2;2;2;GCA;;0;2;2;GAG introns;;;mbg;;0;3;2;GCC;;0;2;1;GTT;;0;2;1;GAC;;0;2;1;GTT;;0;2;1;TGC;;0;3;1;GCA 1;3;3;CAT;;0;2;1;GTT;;0;2;1;TTC;;0;2;2;GAG;;0;2;1;TTC;;1;2;2;TGT;;0;3;1;TGC 0;2;1;GAG;;0;2;1;TTC;;introns;;;mhu;;0;2;2;GAT;;introns;;;mpd;;;;;;;introns;;;rci introns;;;mbn;;introns;;;mem;;1;3;3;CAT;;0;3;3;GCA;;1;3;3;CAT;;;;;;;1;3;3;CAT 1;3;3;CAT;;1;3;3;CAT;;0;2;2;GCA;;0;3;2;GCC;;0;2;2;GCA;;;;;;;0;2;1;GAT 0;4;3;GCA;;0;2;1;GAG;;0;2;1;GTC;;0;2;1;GTT;;0;2;1;TGC;;;;;;;0;5;4;GCA introns;;;mbu;;0;2;2;GGT;;0;4;1;TGC;;0;2;1;TGC;;0;3;3;TGT;;;;;;;0;2;2;GCC 1;3;3;CAT;;0;2;1;TTT;;;;;;;0;2;1;TTC;;introns;;;mpi;;;;;;;0;2;1;TGC 0;2;2;GAG;;;;;;;;;;;;;;;;;1;3;3;CAT;;;;;;;0;2;2;TGT 0;3;1;GCA;;;;;;;;;;;;;;;;;0;2;1;GTC;;;;;;;;;; 0;3;1;TGC;;;;;;;;;;;;;;;;;0;2;1;TGC;;;;;;;;;;
- Halobacteria 30
introns;total;diff;hab;;introns;total;diff;hlr;;introns;total;diff;hru;;introns;total;diff;nat 0;2;2;CAA;;2;3;3;CAT;;2;3;3;CAT;;2;4;1;CAT 1;3;3;CAT;;1;2;2;GGG;;1;2;2;GCC;;1;3;2;GCC 0;2;1;GTC;;0;2;2;GGT;;0;2;1;TGC;;0;2;1;GTC introns;;;hal;;0;2;1;GTC;;introns;;;hsl;;0;2;2;GTG 2;3;3;CAT;;0;2;1;TGC;;2;3;3;CAT;;0;3;2;TGC 0;2;1;CGC;;introns;;;hma;;0;2;1;CGC;;introns;;;nge introns;;;hbo;;1;3;3;CAT;;introns;;;hti;;2;3;3;CAT 1;3;3;CAT;;0;2;2;CTC;;1;3;3;CAT;;0;2;2;CTC 0;2;1;GCC;;0;2;1;GTC;;0;2;2;GAG;;0;2;1;GTC 0;2;1;GCG;;0;2;2;TTT;;0;2;2;GCT;;0;3;1;TGC 0;2;1;GTA;;introns;;;hme;;0;2;2;TTG;;introns;;;nmg 0;2;1;GTC;;1;4;3;CAT;;introns;;;htu;;2;3;3;CAT 1;2;2;TCC;;0;2;1;GAA;;1;4;3;CAT;;1;2;2;GCC 0;2;1;TGC;;0;2;1;GAC;;0;2;1;GCC;;0;2;1;GTC introns;;;hdl;;0;2;2;GCC;;0;2;1;GTC;;0;3;1;TGC 2;3;3;CAT;;0;2;2;GGA;;0;3;1;TGC;;introns;;;nmo 0;2;1;CGC;;0;2;1;GGC;;introns;;;hvo;;3;4;3;CAT introns;;;hhi;;0;2;2;GGT;;1;3;3;CAT;;introns;;;nou 0;2;2;CAA;;0;2;1;GTA;;1;2;2;CGG;;1;4;4;CAT 1;3;3;CAT;;0;2;1;GTC;;0;2;1;GAA;;0;2;1;GCC 0;2;1;GTC;;2;2;2;GTT;;0;2;1;GAC;;0;2;2;GGT introns;;;hhn;;0;2;2;TCT;;0;2;2;GCC;;0;2;2;GTC 0;2;2;CAA;;introns;;;hme*;;0;2;1;GTA;;0;4;1;TGC 1;3;3;CAT;;1;4;3;CAT;;0;2;1;GTC;;introns;;;npe 0;2;1;GTC;;0;2;1;GAA;;0;2;1;TGC;;1;3;3;CAT introns;;;hje;;0;2;1;GAC;;introns;;;hwa;;0;2;1;GTC 1;3;3;CAT;;0;2;2;GCC;;1;3;3;CAT;;0;3;1;TGC 0;2;2;CGG;;0;2;2;GGA;;0;2;1;TGC;;introns;;;sali 0;2;2;TGT;;0;2;1;GGC;;introns;;;hwc;;2;3;3;CAT introns;;;hla;;0;2;2;GGT;;1;3;3;CAT;;0;2;2;TTC 1;3;3;CAT;;0;2;1;GTA;;0;2;1;TGC;;introns;;;hut 0;2;2;GAA;;0;2;1;GTC;;introns;;;hxa;;1;3;3;CAT 0;2;1;GCC;;2;2;2;GTT;;1;3;3;CAT;;introns;;;nph 0;2;1;GTC;;0;2;1;TGC;;0;3;1;GTC;;2;3;3;CAT 0;3;1;TGC;;introns;;;hmu;;0;3;1;TGC;;;;; ;;;;;1;3;3;CAT;;;;;;;;;; ;;;;;0;2;2;GGT;;;;;;;;;; ;;;;;0;2;1;GTC;;;;;;;;;;
- Methanococcus 16
introns;total;diff;mae;;introns;total;diff;mmq 1;4;3;CAT;;1;4;3;CAT 0;2;1;GTC;;0;2;1;GTC 0;2;1;TCC;;0;2;1;TTC 0;2;1;TTC;;0;2;1;TTT 0;2;1;TTT;;introns;;;mmx introns;;;mfe;;1;4;4;CAT 1;3;3;CAT;;0;2;1;GTC 0;2;1;TGC;;0;2;1;TTC 0;2;1;TTC;;0;2;1;TTT introns;;;mfs;;introns;;;mmz 1;3;3;CAT;;1;4;4;CAT 0;2;1;TGC;;0;2;1;GTC 0;2;2;TTC;;0;2;1;TTC introns;;;mif;;0;2;1;TTT 1;3;3;CAT;;introns;;;mok 0;2;1;TGC;;1;3;3;CAT 0;2;1;TTC;;0;2;1;GTC introns;;;mig;;0;2;1;TGC 1;3;3;CAT;;0;2;1;TTC 0;2;2;TTC;;0;2;1;TTT introns;;;mja;;introns;;;mvn 1;3;3;CAT;;1;4;3;CAT 0;2;1;TGC;;0;2;1;GTC 0;2;1;TTC;;0;2;1;TTC introns;;;mjh*;;0;2;1;TTT 1;3;3;CAT;;introns;;;mvo 0;2;1;TGC;;1;4;3;CAT 0;2;1;TTC;;0;2;1;GTC introns;;;mmd;;0;2;1;TAC 1;4;3;CAT;;0;2;1;TCG 0;2;1;GTC;;0;2;1;TTC 0;2;1;TTC;;0;2;1;TTT 0;2;1;TTT;;introns;;;mvu introns;;;mmp;;1;3;3;CAT 1;4;3;CAT;;0;2;1;TGC 0;2;1;GTC;;0;2;1;TTC 0;2;1;TTC;;;;; 0;2;1;TTT;;;;;
- Methanobacteria 13
introns;total ;diff;meb;;introns;total ;diff;mmg 1;3;3;CAT;;1;3;3;CAT 0;2;1;GAT;;0;3;2;GGA 0;2;1;TGC;;0;2;1;TGC introns;;;mel;;1;2;2;TTG 1;3;3;CAT;;introns;;;mru 0;2;2;GCA;;0;2;2;CAA 0;2;1;TGC;;1;3;3;CAT 1;2;2;TTG;;1;2;2;CCA introns;;;metc;;0;2;2;GAA 1;3;3;CAT;;0;2;2;GAC 0;2;1;GGA;;0;2;2;GAT 0;2;1;TGC;;0;2;2;GCT 1;2;2;TTG;;0;2;2;GGA introns;;;meth;;0;2;2;GTA 1;3;3;CAT;;0;2;2;GTC 0;2;2;GCA;;0;2;2;GTT 0;2;1;TGC;;0;2;2;TAA 1;2;2;TTG;;0;2;1;TAC introns;;;mew;;0;2;2;TAG 1;3;3;CAT;;0;2;2;TCC 0;2;1;CTT;;0;2;2;TCT 0;2;2;GCA;;0;2;2;TGA 0;2;2;GCT;;0;3;2;TGC 1;2;2;GTA;;0;2;2;TGG 0;3;1;TGC;;0;2;2;TTC 1;2;2;TTG;;1;2;2;TTG introns;;;mfc;;0;2;2;TTT 1;3;3;CAT;;introns;;;msi 0;2;2;GCA;;1;3;3;CAT 0;2;1;TGC;;0;2;2;GCT 1;2;2;TTG;;0;2;1;TGA 0;2;2;TTT;;introns;;;mst introns;;;mfi;;1;3;3;CAT 1;3;3;CAT;;0;2;1;GAA 0;2;2;GCA;;0;2;1;GTT 0;2;2;GTT;;0;2;1;TAA 0;2;1;TGC;;0;2;1;TCC 1;2;2;TTG;;0;3;1;TGC 0;2;2;TTT;;0;2;1;TTC introns;;;mfv;;introns;;;mth 1;3;3;CAT;;1;3;3;CAT 0;2;1;TGC;;0;2;1;GGA ;;;;;0;2;1;TGC
- Autres Euryarchaeota36
thermococcus;;introns;total;diff;ppac ;;1;3;3;CAT ;;0;2;1;TGC ;;introns;;;tko ;;0;2;2;CAC ;;1;3;3;CAT archaeoglobi;;introns;;;apo ;;0;3;3;CAT ;;0;2;2;GAT ;;introns;;;ast ;;0;3;3;CAT ;;0;2;2;CGT ;;0;2;2;GCG ;;0;2;2;TGT ;;0;2;2;TTG ;;introns;;;fpl ;;0;3;3;CAT ;;0;2;2;CTG ;;0;2;2;GAG ;;0;2;2;TCG ;;introns;;;gac ;;0;3;3;CAT ;;0;2;2;GAA ;;0;2;2;TTG thermoplasmata;;introns;;;pto ;;1;3;3;CAT ;;0;2;2;GTT ;;introns;;;mer ;;0;3;3;CAT ;;1;2;2;CCT methanopyri;;introns;;;mka ;;1;3;3;CAT ;;2*2;2;2;TTC
- Crenarchaeota 38
crenarchaeota;;introns;total;diff;cma ;;0;3;3;CAT ;;0;2;1;CCC ;;0;2;1;CGC ;;0;3;1;GCC ;;0;2;2;GGT ;;0;3;1;TCC ;;0;2;1;TGC ;;0;2;1;TTC ;;introns;;;dka ;;1;3;3;CAT ;;0;2;2;GCG ;;introns;;;iho ;;1;3;3;CAT ;;2;2;1;CTT ;;introns;;;pog ;;1;2;2;CAG ;;2*1+1*2;3;3;CAT ;;0;2;1;TCT ;;introns;;;sir ;;2;3;3;CAT ;;1;2;2;TTC ;;introns;;;siy ;;2;3;3;CAT ;;1;2;2;CCC ;;introns;;;vmo ;;1;3;3;CAT ;;0;2;2;GTT ;;0;2;2;TTT
Synthèse des protections par les introns
[modifier | modifier le wikicode]- Methanomicrobia 47
- Légende: Voir les décomptes des duplications des Methanomicrobia 47, total pour total du décompte et diff pour le décompte des tRNAs différents entre eux. Pour les introns voir le décompte des introns des Methanomicrobia.
- _ double, pour doublon, tRNAs à séquence identique à celle d'un tRNA diff. Les doublons de différents diff pour un même codon sont indistincts entre-eux.
- _ dif, pour le nombre de séquences différentes entre elles et entre la séquence initiale à l'origine des duplications. Donc dif = diff − 1 pour tous les codons sauf CAT (atg) qui contient en principe 3 codons différents (Met Ini Ile) et alors dif est calculé en soustrayant 3; dif CAT = diff − 3.
- _ effectif, pour le total des génomes ayant les caractéristiques des autres colonnes.
- _ -1, anomalie du génome mmaz.
- _ Lien tableaux: Methanomicrobia
mmaz;−1;;;total-diff;diff-1,3; Methanomicrobia 45/47;;;;;; intron;total;diff;;double;dif;effectif 1;2;2;CAA;0;1;1 1;2;2;CAC;0;1;1 0;2;2;CAG;0;1;3 1;2;2;CAG;0;1;2 1;3;2;CAT;1;-1;1 0;4;3;CAT;1;0;2 1;4;3;CAT;1;0;16 1;5;3;CAT;2;0;2 0;4;4;CAT;0;1;1 1;4;4;CAT;0;1;3 0;2;2;CGA;0;1;1 0;2;2;CGT;0;1;2 0;2;1;CTT;1;0;1 0;2;1;GAA;1;0;23 0;2;2;GAA;0;1;1 1;2;2;GAA;0;1;1 0;2;1;GAC;1;0;22 0;2;2;GAC;0;1;3 0;2;1;GAG;1;0;10 1;2;1;GAG;1;0;1 0;2;2;GAG;0;1;18 1;2;2;GAG;0;1;1 0;3;2;GAG;1;1;1 0;2;1;GAT;1;0;9 0;2;2;GAT;0;1;17 0;2;1;GCA;1;0;2 0;3;1;GCA;2;0;2 0;7;1;GCA;6;0;1 0;2;2;GCA;0;1;3 2;2;2;GCA;0;1;1 0;3;2;GCA;1;1;1 0;4;2;GCA;2;1;1 0;3;3;GCA;0;2;13 0;4;3;GCA;1;2;7 0;5;3;GCA;2;2;2 0;4;4;GCA;0;3;2 0;5;4;GCA;1;3;1 0;5;5;GCA;0;4;2 0;6;5;GCA;1;4;2 0;8;6;GCA;2;5;1 0;2;1;GCC;1;0;1 0;3;1;GCC;2;0;5 0;2;2;GCC;0;1;2 0;3;2;GCC;1;1;16 0;3;3;GCC;0;2;2 0;2;2;GGT;0;1;1 0;2;1;GTC;1;0;4 0;2;1;GTT;1;0;22 0;2;2;GTT;0;1;2 0;2;2;TAA;0;1;2 0;3;3;TAA;0;2;2 1;2;2;TAC;0;1;1 0;2;2;TAG;0;1;1 0;2;2;TCC;0;1;1 0;2;1;TGC;1;0;10 0;3;1;TGC;2;0;6 0;4;1;TGC;3;0;1 0;2;2;TGC;0;1;1 0;2;2;TGT;0;1;5 1;2;2;TGT;0;1;3 0;4;2;TGT;2;1;1 0;3;3;TGT;0;2;1 0;2;1;TTC;1;0;23 0;2;2;TTC;0;1;1 0;2;2;TTG;0;1;2 0;2;1;TTT;1;0;1
- Halobacteria 30 Methanobacteria 13
- Lien tableaux: Halobacteria Methanobacteria
- Légende: Voir les décomptes des duplications des Halobacteria 30 et des Methanobacteria 13, total pour total du décompte et diff pour le décompte des tRNAs différents entre eux. Pour les introns voir le décompte des introns des Halobacteria et des Methanobacteria.
- _ double, pour doublon, tRNAs à séquence identique à celle d'un tRNA diff. Les doublons de différents diff pour un même codon sont indistincts entre-eux.
- _ dif, pour le nombre de séquences différentes entre elles et entre la séquence initiale à l'origine des duplications. Donc dif = diff − 1 pour tous les codons sauf CAT (atg) qui contient en principe 3 codons différents (Met Ini Ile) et alors dif est calculé en soustrayant 3; dif CAT = diff − 3.
- _ effectif, pour le total des génomes ayant les caractéristiques des autres colonnes.
- _ -2, anomalie du génome nat.
nat!!!!!!!!!!!!!! Halobacteria 28/30!!!!!!!!Methanobacteria 13/13!!!!!! intron!total!diff!!double!dif!effectif!!intron!total!diff!!double!dif!effectif 0!2!2!CAA!0!1!3!!0!2!2!CAA!0!1!1 2!4!1!CAT!3!-2!1!!1!2!2!CCA!0!1!1 1!4!3!CAT!1!0!3!!0!2!1!CTT!1!0!1 3!4!3!CAT!1!0!1!!0!2!1!GAA!1!0!1 1!4!4!CAT!0!1!1!!0!2!2!GAA!0!1!1 0!2!1!CGC!1!0!3!!0!2!2!GAC!0!1!1 0!2!2!CGG!0!1!1!!0!2!1!GAT!1!0!1 1!2!2!CGG!0!1!1!!0!2!2!GAT!0!1!1 0!2!2!CTC!0!1!2!!0!2!2!GCA!0!1!5 0!2!1!GAA!1!0!3!!0!2!2!GCT!0!1!3 0!2!2!GAA!0!1!1!!0!2!1!GGA!1!0!2 0!2!1!GAC!1!0!3!!0!2!2!GGA!0!1!1 0!2!2!GAG!0!1!1!!0!3!2!GGA!1!1!1 0!2!1!GCC!1!0!4!!0!2!2!GTA!0!1!1 0!2!2!GCC!0!1!3!!1!2!2!GTA!0!1!1 1!2!2!GCC!0!1!2!!0!2!2!GTC!0!1!1 1!3!2!GCC!1!1!1!!0!2!1!GTT!1!0!1 0!2!1!GCG!1!0!1!!0!2!2!GTT!0!1!2 0!2!2!GCT!0!1!1!!0!2!1!TAA!1!0!1 0!2!2!GGA!0!1!2!!0!2!2!TAA!0!1!1 0!2!1!GGC!1!0!2!!0!2!1!TAC!1!0!1 1!2!2!GGG!0!1!1!!0!2!2!TAG!0!1!1 0!2!2!GGT!0!1!5!!0!2!1!TCC!1!0!1 0!2!1!GTA!1!0!4!!0!2!2!TCC!0!1!1 0!2!1!GTC!1!0!16!!0!2!2!TCT!0!1!1 0!3!1!GTC!2!0!1!!0!2!1!TGA!1!0!1 0!2!2!GTC!0!1!1!!0!2!2!TGA!0!1!1 0!2!2!GTG!0!1!1!!0!2!1!TGC!1!0!9 2!2!2!GTT!0!1!2!!0!3!1!TGC!2!0!2 1!2!2!TCC!0!1!1!!0!3!2!TGC!1!1!1 0!2!2!TCT!0!1!1!!0!2!2!TGG!0!1!1 0!2!1!TGC!1!0!7!!0!2!1!TTC!1!0!1 0!3!1!TGC!2!0!6!!0!2!2!TTC!0!1!1 0!4!1!TGC!3!0!1!!1!2!2!TTG!0!1!8 0!3!2!TGC!1!1!1!!0!2!2!TTT!0!1!3 0!2!2!TGT!0!1!1!!!!!!!! 0!2!2!TTC!0!1!1!!!!!!!! 0!2!2!TTG!0!1!1!!!!!!!! 0!2!2!TTT!0!1!1!!!!!!!!
- Methanococci 16, autres Euryarchaeota 36, Crenarchaeota 38
- Lien tableaux: Methanococci autres Euryarchaeota Crenarchaeota
- Légende: Voir les décomptes des duplications des autres Euryarchaeota, Methanococci 16 et des Crenarchaeota 38, total pour total du décompte et diff pour le décompte des tRNAs différents entre eux. Pour les introns voir le décompte des introns des Crenarchaeota, des Thermococci Methanococci et des Archaeoglobi Thermoplasmata Methanopyri Aciduliprofundum.
- _ double, pour doublon, tRNAs à séquence identique à celle d'un tRNA diff. Les doublons de différents diff pour un même codon sont indistincts entre-eux.
- _ dif, pour le nombre de séquences différentes entre elles et entre la séquence initiale à l'origine des duplications. Donc dif = diff − 1 pour tous les codons sauf CAT (atg) qui contient en principe 3 codons différents (Met Ini Ile) et alors dif est calculé en soustrayant 3; dif CAT = diff − 3.
- _ effectif, pour le total des génomes ayant les caractéristiques des autres colonnes.
;;;Autres Eury 9/36;;;;;;;;Methanococci 16/16;;;;;;;;Crenarchaeota 7/38;;;;;; n;clade;génome;intron;total;diff;;double;dif;effectif;;intron;total;diff;;double;dif;effectif;;intron;total;diff;;double;dif;effectif 7;globi;apo;0;2;2;GAT;0;1;1;;1;4;3;CAT;1;0;6;;1;2;2;CAG;0;1;1 ;globi;ast;0;2;2;CGT;0;1;1;;1;4;4;CAT;0;1;2;;0;2;1;CCC;1;0;1 ;globi;ast;0;2;2;GCG;0;1;1;;0;2;1;GTC;1;0;9;;1;2;2;CCC;0;1;1 ;globi;ast;0;2;2;TGT;0;1;1;;0;2;1;TAC;1;0;1;;0;2;1;CGC;1;0;1 ;globi;ast;0;2;2;TTG;0;1;1;;0;2;1;TCC;1;0;1;;2;2;1;CTT;1;0;1 ;globi;fpl;0;2;2;CTG;0;1;1;;0;2;1;TCG;1;0;1;;0;3;1;GCC;2;0;1 ;globi;fpl;0;2;2;GAG;0;1;1;;0;2;1;TGC;1;0;7;;0;2;2;GCG;0;1;1 ;globi;fpl;0;2;2;TCG;0;1;1;;0;2;1;TTC;1;0;14;;0;2;2;GGT;0;1;1 ;globi;gac;0;2;2;GAA;0;1;1;;0;2;2;TTC;0;1;2;;0;2;2;GTT;0;1;1 ;globi;gac;0;2;2;TTG;0;1;1;;0;2;1;TTT;1;0;9;;0;3;1;TCC;2;0;1 1;Mpyri;mka;2*2;2;2;TTC;0;1;1;;;;;;;;;;0;2;1;TCT;1;0;1 19;Tcocci;ppac;0;2;1;TGC;1;0;1;;;;;;;;;;0;2;1;TGC;1;0;1 ;Tcocci;tko;0;2;2;CAC;0;1;1;;;;;;;;;;0;2;1;TTC;1;0;1 7;Tplasma;mer;1;2;2;CCT;0;1;1;;;;;;;;;;1;2;2;TTC;0;1;1 ;Tplasma;pto;0;2;2;GTT;0;1;1;;;;;;;;;;0;2;2;TTT;0;1;1 2;aciduli;néant;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Rapports duplication à l'identique, duplication différente
[modifier | modifier le wikicode]Taux Crenarchaeota 38
[modifier | modifier le wikicode]- Lien au tableaux: cren
- Légende:
Cren 38;;codons à multiple tRNAs;;;;;15;;Cren 38;;codons à multiple tRNAs avec intron;;;;;4;;Cren 38;;codons à multiple tRNAs doublon;;;;;8;;Cren 38;;codons à multiple tRNAs doublon;;;;;% ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;.;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;.;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;.;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;. att;.;act;.;aat;.;agt;.;;att;.;act;.;aat;.;agt;.;;att;.;act;.;aat;.;agt;.;;att;.;act;.;aat;.;agt;. ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;.;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;.;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;.;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;. gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;.;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;.;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;.;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;. ttc;.;tcc;.;tac;.;tgc;.;;ttc;.;tcc;.;tac;.;tgc;.;;ttc;.;tcc;.;tac;.;tgc;.;;ttc;.;tcc;.;tac;.;tgc;. atc;.;acc;1;aac;1;agc;.;;atc;.;acc;0;aac;0;agc;.;;atc;.;acc;0;aac;0;agc;.;;atc;.;acc;0;aac;0;agc;. ctc;.;ccc;.;cac;.;cgc;1;;ctc;.;ccc;.;cac;.;cgc;0;;ctc;.;ccc;.;cac;.;cgc;0;;ctc;.;ccc;.;cac;.;cgc;0 gtc;.;gcc;.;gac;.;ggc;1;;gtc;.;gcc;.;gac;.;ggc;0;;gtc;.;gcc;.;gac;.;ggc;1;;gtc;.;gcc;.;gac;.;ggc;100 tta;.;tca;.;taa;.;tga;.;;tta;.;tca;.;taa;.;tga;.;;tta;.;tca;.;taa;.;tga;.;;tta;.;tca;.;taa;.;tga;. ata;.;aca;.;aaa;1;aga;1;;ata;.;aca;.;aaa;0;aga;0;;ata;.;aca;.;aaa;0;aga;1;;ata;.;aca;.;aaa;0;aga;100 cta;.;cca;.;caa;.;cga;.;;cta;.;cca;.;caa;.;cga;.;;cta;.;cca;.;caa;.;cga;.;;cta;.;cca;.;caa;.;cga;. gta;.;gca;1;gaa;2;gga;1;;gta;.;gca;0;gaa;1;gga;0;;gta;.;gca;1;gaa;1;gga;1;;gta;.;gca;100;gaa;50;gga;100 ttg;.;tcg;.;tag;.;tgg;.;;ttg;.;tcg;.;tag;.;tgg;.;;ttg;.;tcg;.;tag;.;tgg;.;;ttg;.;tcg;.;tag;.;tgg;. atg;.;acg;.;aag;1;agg;.;;atg;.;acg;.;aag;1;agg;.;;atg;.;acg;.;aag;1;agg;.;;atg;.;acg;.;aag;100;agg;. ctg;1;ccg;.;cag;.;cgg;.;;ctg;1;ccg;.;cag;.;cgg;.;;ctg;0;ccg;.;cag;.;cgg;.;;ctg;0;ccg;.;cag;.;cgg;. gtg;.;gcg;1;gag;.;ggg;2;;gtg;.;gcg;0;gag;.;ggg;1;;gtg;.;gcg;1;gag;.;ggg;1;;gtg;.;gcg;100;gag;.;ggg;50 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; Crena;38;tRNAs;;;;;1771;;Crena;38;introns;génomes;;;;802;;Cren 38;;codons à multiple tRNAs dif;;;;;7;;Cren 38;;codons à multiple tRNAs dif;;;;;% ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;.;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;. att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;.;act;.;aat;.;agt;.;;att;.;act;.;aat;.;agt;. ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;.;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;. gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;.;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;. ttc;38;tcc;38;tac;39;tgc;38;;ttc;10;tcc;11;tac;38;tgc;36;;ttc;.;tcc;.;tac;.;tgc;.;;ttc;.;tcc;.;tac;.;tgc;. atc;38;acc;39;aac;39;agc;38;;atc;25;acc;15;aac;26;agc;3;;atc;.;acc;1;aac;1;agc;.;;atc;.;acc;100;aac;100;agc;. ctc;38;ccc;38;cac;38;cgc;40;;ctc;3;ccc;38;cac;11;cgc;12;;ctc;.;ccc;.;cac;.;cgc;1;;ctc;.;ccc;.;cac;.;cgc;100 gtc;38;gcc;38;gac;40;ggc;40;;gtc;13;gcc;3;gac;10;ggc;12;;gtc;.;gcc;.;gac;.;ggc;0;;gtc;.;gcc;.;gac;.;ggc;0 tta;38;tca;38;taa;0;tga;1;;tta;19;tca;13;taa;0;tga;1;;tta;.;tca;.;taa;.;tga;.;;tta;.;tca;.;taa;.;tga;. ata;0;aca;38;aaa;39;aga;39;;ata;0;aca;36;aaa;22;aga;23;;ata;.;aca;.;aaa;1;aga;0;;ata;.;aca;.;aaa;100;aga;0 cta;38;cca;38;caa;38;cga;38;;cta;3;cca;15;caa;14;cga;6;;cta;.;cca;.;caa;.;cga;.;;cta;.;cca;.;caa;.;cga;. gta;38;gca;39;gaa;40;gga;40;;gta;17;gca;16;gaa;25;gga;13;;gta;.;gca;0;gaa;1;gga;0;;gta;.;gca;0;gaa;50;gga;0 ttg;38;tcg;38;tag;0;tgg;38;;ttg;21;tcg;34;tag;0;tgg;29;;ttg;.;tcg;.;tag;.;tgg;.;;ttg;.;tcg;.;tag;.;tgg;. atg;115;acg;38;aag;40;agg;38;;atg;37;acg;37;aag;27;agg;27;;atg;.;acg;.;aag;0;agg;.;;atg;.;acg;.;aag;0;agg;. ctg;39;ccg;37;cag;38;cgg;38;;ctg;9;ccg;19;cag;12;cgg;7;;ctg;1;ccg;.;cag;.;cgg;.;;ctg;100;ccg;.;cag;.;cgg;. gtg;38;gcg;39;gag;38;ggg;40;;gtg;7;gcg;8;gag;30;ggg;9;;gtg;.;gcg;0;gag;.;ggg;1;;gtg;.;gcg;0;gag;.;ggg;50
Taux Euryarchaeota 142
[modifier | modifier le wikicode]- Lien tableaux: Eury 142
- Légende
Eury 142;;codons à multiple tRNAs;;;;;521;;Eury 142;;codons à multiple tRNAs avec introns;;;;;65;;Eury 142;;codons à multiple tRNAs doublon;;;;;330;;Eury 142;;codons à multiple tRNAs doublon;;;;;% ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;.;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;.;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;.;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;. att;.;act;.;aat;.;agt;.;;att;.;act;.;aat;.;agt;.;;att;.;act;.;aat;.;agt;.;;att;.;act;.;aat;.;agt;. ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;.;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;.;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;.;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;. gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;.;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;.;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;.;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;. ttc;32;tcc;6;tac;6;tgc;46;;ttc;1;tcc;0;tac;1;tgc;1;;ttc;27;tcc;3;tac;4;tgc;20;;ttc;84;tcc;50;tac;67;tgc;43 atc;29;acc;6;aac;30;agc;4;;atc;0;acc;0;aac;2;agc;0;;atc;10;acc;0;aac;23;agc;0;;atc;34;acc;.;aac;77;agc;. ctc;33;ccc;1;cac;1;cgc;2;;ctc;0;ccc;1;cac;0;cgc;0;;ctc;12;ccc;0;cac;0;cgc;1;;ctc;36;ccc;0;cac;0;cgc;50 gtc;29;gcc;2;gac;32;ggc;36;;gtc;0;gcc;0;gac;0;ggc;3;;gtc;25;gcc;2;gac;30;ggc;27;;gtc;86;gcc;100;gac;94;ggc;75 tta;6;tca;2;taa;.;tga;.;;tta;0;tca;0;taa;.;tga;.;;tta;1;tca;1;taa;.;tga;.;;tta;17;tca;50;taa;.;tga;− ata;.;aca;12;aaa;14;aga;2;;ata;.;aca;3;aaa;0;aga;0;;ata;.;aca;1;aaa;10;aga;0;;ata;−;aca;8;aaa;71;aga;. cta;2;cca;1;caa;13;cga;2;;cta;0;cca;0;caa;7;cga;0;;cta;0;cca;0;caa;0;cga;1;;cta;.;cca;0;caa;0;cga;50 gta;3;gca;53;gaa;44;gga;5;;gta;1;gca;0;gaa;1;gga;1;;gta;2;gca;52;gaa;38;gga;2;;gta;67;gca;98;gaa;86;gga;40 ttg;5;tcg;1;tag;.;tgg;1;;ttg;0;tcg;0;tag;.;tgg;1;;ttg;0;tcg;0;tag;.;tgg;0;;ttg;.;tcg;0;tag;.;tgg;0 atg;39;acg;3;aag;2;agg;1;;atg;39;acg;0;aag;0;agg;1;;atg;32;acg;1;aag;2;agg;0;;atg;82;acg;33;aag;100;agg;0 ctg;5;ccg;2;cag;1;cgg;0;;ctg;0;ccg;1;cag;0;cgg;0;;ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;0;;ctg;.;ccg;.;cag;0;cgg;− gtg;2;gcg;3;gag;2;ggg;0;;gtg;1;gcg;0;gag;0;ggg;0;;gtg;0;gcg;3;gag;0;ggg;0;;gtg;.;gcg;100;gag;.;ggg;− ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; Eury;142;tRNAs;;;;;6839;;EuryA;142;introns;génomes;;;;507;;Eury 142;;codons à multiple tRNAs dif;;;;;228;;Eury 142;;codons à multiple tRNAs dif;;;;;% ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;.;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;. att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;.;act;.;aat;.;agt;.;;att;.;act;.;aat;.;agt;. ctt;1;cct;0;cat;0;cgt;2;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;1;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;.;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;. gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;1;;gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;1;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;.;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;. ttc;174;tcc;149;tac;148;tgc;258;;ttc;2;tcc;5;tac;64;tgc;4;;ttc;5;tcc;4;tac;2;tgc;41;;ttc;16;tcc;67;tac;33;tgc;89 atc;171;acc;147;aac;172;agc;146;;atc;3;acc;0;aac;11;agc;1;;atc;19;acc;6;aac;7;agc;4;;atc;66;acc;100;aac;23;agc;100 ctc;173;ccc;130;cac;143;cgc;144;;ctc;0;ccc;5;cac;1;cgc;5;;ctc;22;ccc;1;cac;1;cgc;1;;ctc;67;ccc;100;cac;100;cgc;50 gtc;171;gcc;143;gac;175;ggc;200;;gtc;0;gcc;2;gac;5;ggc;3;;gtc;4;gcc;0;gac;2;ggc;26;;gtc;14;gcc;.;gac;6;ggc;72 tta;150;tca;143;taa;0;tga;17;;tta;2;tca;3;taa;0;tga;0;;tta;5;tca;1;taa;.;tga;.;;tta;83;tca;50;taa;.;tga;− ata;0;aca;157;aaa;155;aga;144;;ata;0;aca;4;aaa;3;aga;11;;ata;.;aca;12;aaa;4;aga;2;;ata;−;aca;100;aaa;29;aga;100 cta;144;cca;143;caa;154;cga;144;;cta;0;cca;2;caa;17;cga;36;;cta;2;cca;1;caa;13;cga;1;;cta;100;cca;100;caa;100;cga;50 gta;145;gca;214;gaa;186;gga;146;;gta;1;gca;0;gaa;6;gga;4;;gta;1;gca;3;gaa;6;gga;3;;gta;33;gca;6;gaa;14;gga;60 ttg;122;tcg;111;tag;1;tgg;143;;ttg;3;tcg;2;tag;0;tgg;142;;ttg;5;tcg;1;tag;.;tgg;1;;ttg;100;tcg;100;tag;.;tgg;100 atg;466;acg;128;aag;122;agg;124;;atg;133;acg;5;aag;0;agg;1;;atg;7;acg;2;aag;0;agg;1;;atg;18;acg;67;aag;.;agg;100 ctg;119;ccg;112;cag;124;cgg;100;;ctg;0;ccg;10;cag;1;cgg;4;;ctg;5;ccg;2;cag;1;cgg;0;;ctg;100;ccg;100;cag;100;cgg;− gtg;129;gcg;117;gag;118;ggg;112;;gtg;1;gcg;0;gag;0;ggg;2;;gtg;2;gcg;0;gag;2;ggg;0;;gtg;100;gcg;.;gag;100;ggg;−
Taux Euryarchaeota 36
[modifier | modifier le wikicode]- Lien au tableaux: Eury 36
- Légende:
Eury 36;;codons à multiple tRNAs;;;;;15;;Eury 36;;codons à multiple tRNAs avec intron;;;;;2;;Eury 36;;codons à multiple tRNAs doublon;;;;;1;;Eury 36;;codons à multiple tRNAs doublon;;;;;% ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;.;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;.;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;.;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;. att;.;act;.;aat;.;agt;.;;att;.;act;.;aat;.;agt;.;;att;.;act;.;aat;.;agt;.;;att;.;act;.;aat;.;agt;. ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;.;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;.;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;.;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;. gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;.;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;.;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;.;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;. ttc;1;tcc;.;tac;.;tgc;.;;ttc;0;tcc;.;tac;.;tgc;.;;ttc;0;tcc;.;tac;.;tgc;.;;ttc;0;tcc;.;tac;.;tgc;. atc;1;acc;.;aac;1;agc;.;;atc;0;acc;.;aac;0;agc;.;;atc;0;acc;.;aac;0;agc;.;;atc;0;acc;.;aac;0;agc;. ctc;1;ccc;.;cac;.;cgc;1;;ctc;0;ccc;.;cac;.;cgc;0;;ctc;0;ccc;.;cac;.;cgc;0;;ctc;0;ccc;.;cac;.;cgc;0 gtc;.;gcc;.;gac;.;ggc;.;;gtc;.;gcc;.;gac;.;ggc;.;;gtc;.;gcc;.;gac;0;ggc;.;;gtc;.;gcc;.;gac;.;ggc;. tta;.;tca;.;taa;.;tga;.;;tta;.;tca;.;taa;.;tga;.;;tta;.;tca;.;taa;.;tga;.;;tta;.;tca;.;taa;.;tga;. ata;.;aca;1;aaa;.;aga;.;;ata;.;aca;0;aaa;.;aga;.;;ata;.;aca;0;aaa;.;aga;.;;ata;.;aca;0;aaa;.;aga;. cta;.;cca;.;caa;2;cga;1;;cta;.;cca;.;caa;0;cga;0;;cta;.;cca;.;caa;0;cga;0;;cta;.;cca;.;caa;0;cga;0 gta;.;gca;1;gaa;1;gga;.;;gta;.;gca;0;gaa;1;gga;.;;gta;.;gca;1;gaa;0;gga;.;;gta;.;gca;100;gaa;0;gga;. ttg;.;tcg;.;tag;.;tgg;.;;ttg;.;tcg;.;tag;.;tgg;.;;ttg;.;tcg;.;tag;.;tgg;.;;ttg;.;tcg;.;tag;.;tgg;. atg;.;acg;1;aag;.;agg;1;;atg;.;acg;0;aag;.;agg;1;;atg;.;acg;0;aag;.;agg;0;;atg;.;acg;0;aag;.;agg;0 ctg;.;ccg;.;cag;1;cgg;.;;ctg;.;ccg;.;cag;0;cgg;.;;ctg;.;ccg;.;cag;0;cgg;.;;ctg;.;ccg;.;cag;0;cgg;. gtg;1;gcg;.;gag;.;ggg;.;;gtg;0;gcg;.;gag;.;ggg;.;;gtg;0;gcg;.;gag;.;ggg;.;;gtg;0;gcg;.;gag;.;ggg;. ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; Eury 36;;;tRNAs;;;;1654;;Eury 36;;36;Introns ;;;total;128;;Eury 36;;codons à multiple tRNAs dif;;;;;14;;Eury 36;;codons à multiple tRNAs dif;;;;;% ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;.;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;. att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;.;act;.;aat;.;agt;.;;att;.;act;.;aat;.;agt;. ctt;1;cct;0;cat;0;cgt;0;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;.;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;. gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;.;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;. ttc;37;tcc;36;tac;36;tgc;36;;ttc;1;tcc;0;tac;16;tgc;2;;ttc;1;tcc;.;tac;.;tgc;.;;ttc;100;tcc;.;tac;.;tgc;. atc;37;acc;36;aac;37;agc;36;;atc;3;acc;0;aac;3;agc;1;;atc;1;acc;.;aac;1;agc;.;;atc;100;acc;.;aac;100;agc;. ctc;36;ccc;35;cac;36;cgc;37;;ctc;0;ccc;2;cac;1;cgc;2;;ctc;1;ccc;.;cac;.;cgc;1;;ctc;100;ccc;.;cac;.;cgc;100 gtc;36;gcc;36;gac;36;ggc;36;;gtc;0;gcc;0;gac;5;ggc;0;;gtc;.;gcc;.;gac;.;ggc;.;;gtc;.;gcc;.;gac;.;ggc;. tta;36;tca;36;taa;0;tga;1;;tta;2;tca;0;taa;0;tga;0;;tta;.;tca;.;taa;.;tga;.;;tta;.;tca;.;taa;.;tga;. ata;0;aca;37;aaa;35;aga;36;;ata;0;aca;1;aaa;0;aga;0;;ata;.;aca;1;aaa;.;aga;.;;ata;.;aca;100;aaa;.;aga;. cta;36;cca;36;caa;38;cga;37;;cta;0;cca;2;caa;2;cga;0;;cta;.;cca;.;caa;2;cga;1;;cta;.;cca;.;caa;100;cga;100 gta;36;gca;37;gaa;37;gga;36;;gta;0;gca;0;gaa;5;gga;0;;gta;.;gca;0;gaa;1;gga;.;;gta;.;gca;0;gaa;100;gga;. ttg;34;tcg;35;tag;0;tgg;36;;ttg;3;tcg;2;tag;0;tgg;36;;ttg;.;tcg;.;tag;.;tgg;.;;ttg;.;tcg;.;tag;.;tgg;. atg;108;acg;36;aag;35;agg;36;;atg;28;acg;2;aag;0;agg;1;;atg;.;acg;1;aag;.;agg;1;;atg;.;acg;100;aag;.;agg;100 ctg;34;ccg;35;cag;35;cgg;35;;ctg;0;ccg;2;cag;1;cgg;3;;ctg;.;ccg;.;cag;1;cgg;.;;ctg;.;ccg;.;cag;100;cgg;. gtg;36;gcg;35;gag;35;ggg;35;;gtg;0;gcg;0;gag;0;ggg;2;;gtg;1;gcg;.;gag;.;ggg;.;;gtg;100;gcg;.;gag;.;ggg;.
Taux Methanococci 16
[modifier | modifier le wikicode]- Lien au tableaux: Methanococci 16
- Légende:
Mcocci 16;;codons à multiple tRNAs;;;;;52;;Mcocci 16;;codons à multiple tRNAs avec intron;;;;;8;;Mcocci 16;;codons à multiple tRNAs doublon;;;;;48;;Mcocci 16;;codons à multiple tRNAs doublon;;;;;% ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;.;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;.;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;.;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;. att;.;act;.;aat;.;agt;.;;att;.;act;.;aat;.;agt;.;;att;.;act;.;aat;.;agt;.;;att;.;act;.;aat;.;agt;. ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;.;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;.;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;.;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;. gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;.;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;.;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;.;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;. ttc;.;tcc;.;tac;.;tgc;.;;ttc;.;tcc;.;tac;.;tgc;.;;ttc;.;tcc;.;tac;.;tgc;.;;ttc;.;tcc;.;tac;.;tgc;. atc;.;acc;.;aac;.;agc;.;;atc;.;acc;.;aac;.;agc;.;;atc;.;acc;.;aac;.;agc;.;;atc;.;acc;.;aac;.;agc;. ctc;.;ccc;.;cac;.;cgc;.;;ctc;.;ccc;.;cac;.;cgc;.;;ctc;.;ccc;.;cac;.;cgc;.;;ctc;.;ccc;.;cac;.;cgc;. gtc;.;gcc;.;gac;9;ggc;.;;gtc;.;gcc;.;gac;0;ggc;.;;gtc;.;gcc;.;gac;9;ggc;.;;gtc;.;gcc;.;gac;100;ggc;. tta;.;tca;.;taa;.;tga;.;;tta;.;tca;.;taa;.;tga;.;;tta;.;tca;.;taa;.;tga;.;;tta;.;tca;.;taa;.;tga;. ata;.;aca;.;aaa;9;aga;.;;ata;.;aca;.;aaa;0;aga;.;;ata;.;aca;.;aaa;9;aga;.;;ata;.;aca;.;aaa;100;aga;. cta;.;cca;.;caa;.;cga;1;;cta;.;cca;.;caa;.;cga;0;;cta;.;cca;.;caa;.;cga;1;;cta;.;cca;.;caa;.;cga;100 gta;1;gca;7;gaa;16;gga;1;;gta;0;gca;0;gaa;0;gga;0;;gta;1;gca;7;gaa;14;gga;1;;gta;100;gca;100;gaa;88;gga;100 ttg;.;tcg;.;tag;.;tgg;.;;ttg;.;tcg;.;tag;.;tgg;.;;ttg;.;tcg;.;tag;.;tgg;.;;ttg;.;tcg;.;tag;.;tgg;. atg;8;acg;.;aag;.;agg;.;;atg;8;acg;.;aag;.;agg;.;;atg;6;acg;.;aag;.;agg;.;;atg;75;acg;.;aag;.;agg;. ctg;.;ccg;.;cag;.;cgg;.;;ctg;.;ccg;.;cag;.;cgg;.;;ctg;.;ccg;.;cag;.;cgg;.;;ctg;.;ccg;.;cag;.;cgg;. gtg;.;gcg;.;gag;.;ggg;.;;gtg;.;gcg;.;gag;.;ggg;.;;gtg;.;gcg;.;gag;.;ggg;.;;gtg;.;gcg;.;gag;.;ggg;. ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; Mcocci 16;;tRNAs;;16;;;602;;Mcocci 16;;;Introns ou génomes ;;;total;32;;Mcocci 16;;codons à multiple tRNAs dif;;;;;4;;Mcocci 16;;codons à multiple tRNAs dif;;;;;% ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;.;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;. att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;.;act;.;aat;.;agt;.;;att;.;act;.;aat;.;agt;. ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;.;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;. gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;.;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;. ttc;16;tcc;16;tac;16;tgc;16;;ttc;0;tcc;0;tac;0;tgc;0;;ttc;.;tcc;.;tac;.;tgc;.;;ttc;.;tcc;.;tac;.;tgc;. atc;16;acc;16;aac;16;agc;16;;atc;0;acc;0;aac;0;agc;0;;atc;.;acc;.;aac;.;agc;.;;atc;.;acc;.;aac;.;agc;. ctc;16;ccc;15;cac;16;cgc;16;;ctc;0;ccc;0;cac;0;cgc;0;;ctc;.;ccc;.;cac;.;cgc;.;;ctc;.;ccc;.;cac;.;cgc;. gtc;16;gcc;16;gac;25;ggc;16;;gtc;0;gcc;0;gac;0;ggc;0;;gtc;.;gcc;.;gac;0;ggc;.;;gtc;.;gcc;.;gac;0;ggc;. tta;16;tca;16;taa;0;tga;16;;tta;0;tca;0;taa;0;tga;0;;tta;.;tca;.;taa;.;tga;.;;tta;.;tca;.;taa;.;tga;. ata;0;aca;16;aaa;25;aga;16;;ata;0;aca;0;aaa;0;aga;0;;ata;.;aca;.;aaa;0;aga;.;;ata;.;aca;.;aaa;0;aga;. cta;16;cca;16;caa;16;cga;17;;cta;0;cca;0;caa;0;cga;0;;cta;.;cca;.;caa;.;cga;0;;cta;.;cca;.;caa;.;cga;0 gta;17;gca;22;gaa;32;gga;17;;gta;0;gca;0;gaa;0;gga;0;;gta;0;gca;0;gaa;2;gga;0;;gta;0;gca;0;gaa;13;gga;0 ttg;0;tcg;0;tag;0;tgg;16;;ttg;0;tcg;0;tag;0;tgg;16;;ttg;.;tcg;.;tag;.;tgg;.;;ttg;.;tcg;.;tag;.;tgg;. atg;56;acg;1;aag;0;agg;0;;atg;16;acg;0;aag;0;agg;0;;atg;2;acg;.;aag;.;agg;.;;atg;25;acg;.;aag;.;agg;. ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;0;;ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;0;;ctg;.;ccg;.;cag;.;cgg;.;;ctg;.;ccg;.;cag;.;cgg;. gtg;7;gcg;0;gag;0;ggg;0;;gtg;0;gcg;0;gag;0;ggg;0;;gtg;.;gcg;.;gag;.;ggg;.;;gtg;.;gcg;.;gag;.;ggg;.
Taux Methanobacteria 13
[modifier | modifier le wikicode]- Lien au tableaux: Methanobacteria 13
- Légende:
Mbacteria;;codons à multiple tRNAs;;;;;61;;Mbacteria;;codons à multiple tRNAs avec intron;;;;;9;;Mbacteria;;codons à multiple tRNAs doublon;;;;;24;;Mbacteria;;codons à multiple tRNAs doublon;;;;;% ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;.;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;.;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;.;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;. att;.;act;.;aat;.;agt;.;;att;.;act;.;aat;.;agt;.;;att;.;act;.;aat;.;agt;.;;att;.;act;.;aat;.;agt;. ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;.;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;.;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;.;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;. gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;.;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;.;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;.;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;. ttc;2;tcc;4;tac;2;tgc;5;;ttc;0;tcc;0;tac;1;tgc;0;;ttc;1;tcc;3;tac;0;tgc;0;;ttc;50;tcc;75;tac;0;tgc;0 atc;2;acc;.;aac;3;agc;3;;atc;0;acc;.;aac;0;agc;0;;atc;1;acc;.;aac;1;agc;0;;atc;50;acc;.;aac;33;agc;0 ctc;.;ccc;.;cac;.;cgc;.;;ctc;.;ccc;.;cac;.;cgc;.;;ctc;.;ccc;.;cac;.;cgc;.;;ctc;.;ccc;.;cac;.;cgc;. gtc;1;gcc;.;gac;1;ggc;.;;gtc;0;gcc;.;gac;0;ggc;.;;gtc;0;gcc;.;gac;0;ggc;.;;gtc;0;gcc;.;gac;0;ggc;. tta;2;tca;2;taa;.;tga;.;;tta;0;tca;0;taa;.;tga;.;;tta;1;tca;1;taa;.;tga;.;;tta;50;tca;50;taa;.;tga;. ata;.;aca;.;aaa;3;aga;1;;ata;.;aca;;aaa;0;aga;0;;ata;.;aca;.;aaa;0;aga;0;;ata;.;aca;.;aaa;0;aga;0 cta;1;cca;1;caa;8;cga;.;;cta;0;cca;0;caa;7;cga;.;;cta;0;cca;0;caa;0;cga;.;;cta;0;cca;0;caa;0;cga;. gta;1;gca;12;gaa;2;gga;2;;gta;0;gca;0;gaa;0;gga;0;;gta;1;gca;12;gaa;1;gga;1;;gta;100;gca;100;gaa;50;gga;50 ttg;1;tcg;.;tag;.;tgg;1;;ttg;0;tcg;.;tag;.;tgg;1;;ttg;0;tcg;.;tag;.;tgg;0;;ttg;0;tcg;.;tag;.;tgg;0 atg;.;acg;.;aag;1;agg;.;;atg;.;acg;.;aag;0;agg;.;;atg;.;acg;.;aag;1;agg;.;;atg;.;acg;.;aag;100;agg;. ctg;.;ccg;.;cag;.;cgg;.;;ctg;.;ccg;.;cag;.;cgg;.;;ctg;.;ccg;.;cag;.;cgg;.;;ctg;.;ccg;.;cag;.;cgg;. gtg;.;gcg;.;gag;.;ggg;.;;gtg;.;gcg;.;gag;.;ggg;.;;gtg;.;gcg;.;gag;.;ggg;.;;gtg;.;gcg;.;gag;.;ggg;. ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; Methanobacteria;;;tRNAs;13;;;562;;Mbacteria;;13;Introns ;;;total;36;;Mbacteria;;codons à multiple tRNAs dif;;;;;39;;Mbacteria;;codons à multiple tRNAs dif;;;;;% ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;.;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;. att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;.;act;.;aat;.;agt;.;;att;.;act;.;aat;.;agt;. ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;1;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;.;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;. gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;.;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;. ttc;15;tcc;18;tac;15;tgc;18;;ttc;0;tcc;0;tac;1;tgc;0;;ttc;1;tcc;2;tac;2;tgc;5;;ttc;50;tcc;50;tac;100;tgc;100 atc;15;acc;13;aac;16;agc;16;;atc;0;acc;0;aac;0;agc;0;;atc;1;acc;.;aac;2;agc;3;;atc;50;acc;.;aac;67;agc;100 ctc;13;ccc;2;cac;13;cgc;13;;ctc;0;ccc;2;cac;0;cgc;0;;ctc;.;ccc;.;cac;.;cgc;.;;ctc;.;ccc;.;cac;.;cgc;. gtc;14;gcc;12;gac;14;ggc;13;;gtc;0;gcc;0;gac;0;ggc;0;;gtc;1;gcc;.;gac;1;ggc;.;;gtc;100;gcc;.;gac;100;ggc;. tta;15;tca;15;taa;0;tga;0;;tta;0;tca;0;taa;0;tga;0;;tta;1;tca;1;taa;.;tga;.;;tta;50;tca;50;taa;.;tga;. ata;0;aca;13;aaa;16;aga;14;;ata;0;aca;0;aaa;0;aga;0;;ata;.;aca;.;aaa;3;aga;1;;ata;.;aca;.;aaa;100;aga;100 cta;14;cca;14;caa;21;cga;13;;cta;0;cca;0;caa;7;cga;0;;cta;1;cca;1;caa;8;cga;.;;cta;100;cca;100;caa;100;cga;. gta;14;gca;28;gaa;15;gga;15;;gta;0;gca;0;gaa;0;gga;0;;gta;0;gca;1;gaa;1;gga;1;;gta;0;gca;8;gaa;50;gga;50 ttg;7;tcg;6;tag;0;tgg;14;;ttg;0;tcg;0;tag;0;tgg;13;;ttg;1;tcg;.;tag;.;tgg;1;;ttg;100;tcg;.;tag;.;tgg;100 atg;39;acg;12;aag;9;agg;13;;atg;13;acg;0;aag;0;agg;0;;atg;.;acg;.;aag;0;agg;.;;atg;.;acg;.;aag;0;agg;. ctg;4;ccg;0;cag;12;cgg;0;;ctg;0;ccg;0;cag;0;cgg;0;;ctg;.;ccg;.;cag;.;cgg;.;;ctg;.;ccg;.;cag;.;cgg;. gtg;9;gcg;2;gag;4;ggg;3;;gtg;0;gcg;0;gag;0;ggg;0;;gtg;.;gcg;.;gag;.;ggg;.;;gtg;.;gcg;.;gag;.;ggg;.
Taux Halobacteria 30
[modifier | modifier le wikicode]- Lien au tableaux: Halobacteria 30
- Légende:
Halo 30;;codons à multiple tRNAs;;;;;92;;Halo 30;;codons à multiple tRNAs avec intron;;;;;14;;Halo 30;;codons à multiple tRNAs doublon;;;;;58;;Halo 30;;codons à multiple tRNAs doublon;;;;;% ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;.;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;.;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;.;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;. att;.;act;.;aat;.;agt;.;;att;.;act;.;aat;.;agt;.;;att;.;act;.;aat;.;agt;.;;att;.;act;.;aat;.;agt;. ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;.;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;.;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;.;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;. gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;.;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;.;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;.;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;. ttc;4;tcc;2;tac;4;tgc;.;;ttc;0;tcc;0;tac;0;tgc;.;;ttc;3;tcc;0;tac;4;tgc;.;;ttc;75;tcc;0;tac;100;tgc;. atc;.;acc;5;aac;2;agc;1;;atc;.;acc;0;aac;2;agc;0;;atc;.;acc;0;aac;0;agc;0;;atc;.;acc;0;aac;0;agc;0 ctc;1;ccc;1;cac;1;cgc;1;;ctc;0;ccc;1;cac;0;cgc;0;;ctc;0;ccc;0;cac;0;cgc;1;;ctc;0;ccc;0;cac;0;cgc;100 gtc;3;gcc;2;gac;18;ggc;10;;gtc;0;gcc;0;gac;0;ggc;3;;gtc;3;gcc;2;gac;17;ggc;5;;gtc;100;gcc;100;gac;94;ggc;50 tta;.;tca;.;taa;.;tga;.;;tta;.;tca;.;taa;.;tga;.;;tta;.;tca;.;taa;.;tga;.;;tta;.;tca;.;taa;.;tga;. ata;.;aca;1;aaa;1;aga;1;;ata;.;aca;0;aaa;0;aga;0;;ata;.;aca;0;aaa;0;aga;0;;ata;.;aca;0;aaa;0;aga;0 cta;.;cca;.;caa;1;cga;.;;cta;.;cca;.;caa;0;cga;.;;cta;.;cca;.;caa;0;cga;.;;cta;.;cca;.;caa;0;cga;. gta;.;gca;15;gaa;1;gga;1;;gta;.;gca;0;gaa;0;gga;1;;gta;.;gca;15;gaa;0;gga;0;;gta;.;gca;100;gaa;0;gga;0 ttg;3;tcg;.;tag;.;tgg;.;;ttg;0;tcg;.;tag;.;tgg;.;;ttg;0;tcg;.;tag;.;tgg;.;;ttg;0;tcg;.;tag;.;tgg;. atg;6;acg;.;aag;.;agg;.;;atg;6;acg;.;aag;.;agg;.;;atg;5;acg;.;aag;.;agg;.;;atg;83;acg;.;aag;.;agg;. ctg;.;ccg;2;cag;.;cgg;.;;ctg;.;ccg;1;cag;.;cgg;.;;ctg;.;ccg;0;cag;.;cgg;.;;ctg;.;ccg;0;cag;.;cgg;. gtg;.;gcg;3;gag;2;ggg;.;;gtg;.;gcg;0;gag;0;ggg;.;;gtg;.;gcg;3;gag;0;ggg;.;;gtg;.;gcg;100;gag;0;ggg;. ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; Halobacteria;;;tRNAs;30;;;1465;;Halobacteria;;30;Introns;;;total;100;;Halo 30;;codons à multiple tRNAs dif;;;;;36;;Halo 30;;codons à multiple tRNAs dif;;;;;% ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;.;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;. att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;.;act;.;aat;.;agt;.;;att;.;act;.;aat;.;agt;. ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;1;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;.;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;. gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;1;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;.;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;. ttc;34;tcc;32;tac;34;tgc;30;;ttc;0;tcc;0;tac;0;tgc;0;;ttc;1;tcc;2;tac;0;tgc;.;;ttc;25;tcc;100;tac;0;tgc;. atc;30;acc;35;aac;32;agc;31;;atc;0;acc;0;aac;6;agc;0;;atc;.;acc;5;aac;2;agc;1;;atc;.;acc;100;aac;100;agc;100 ctc;30;ccc;31;cac;31;cgc;31;;ctc;0;ccc;1;cac;0;cgc;0;;ctc;1;ccc;1;cac;1;cgc;0;;ctc;100;ccc;100;cac;100;cgc;0 gtc;33;gcc;32;gac;49;ggc;41;;gtc;0;gcc;3;gac;0;ggc;3;;gtc;0;gcc;;gac;1;ggc;6;;gtc;0;gcc;0;gac;6;ggc;60 tta;30;tca;30;taa;0;tga;0;;tta;0;tca;0;taa;0;tga;0;;tta;.;tca;.;taa;.;tga;.;;tta;.;tca;.;taa;.;tga;. ata;0;aca;31;aaa;31;aga;31;;ata;0;aca;0;aaa;0;aga;11;;ata;.;aca;1;aaa;1;aga;1;;ata;.;aca;100;aaa;100;aga;100 cta;30;cca;30;caa;31;cga;30;;cta;0;cca;0;caa;8;cga;0;;cta;.;cca;.;caa;1;cga;.;;cta;.;cca;.;caa;100;cga;. gta;30;gca;54;gaa;31;gga;31;;gta;0;gca;0;gaa;1;gga;1;;gta;.;gca;1;gaa;1;gga;1;;gta;.;gca;7;gaa;100;gga;100 ttg;33;tcg;30;tag;0;tgg;30;;ttg;0;tcg;0;tag;0;tgg;30;;ttg;3;tcg;.;tag;.;tgg;.;;ttg;100;tcg;.;tag;.;tgg;. atg;96;acg;30;aag;30;agg;29;;atg;30;acg;0;aag;0;agg;0;;atg;1;acg;.;aag;.;agg;.;;atg;17;acg;.;aag;.;agg;. ctg;30;ccg;30;cag;30;cgg;18;;ctg;0;ccg;2;cag;0;cgg;2;;ctg;.;ccg;2;cag;.;cgg;.;;ctg;.;ccg;100;cag;.;cgg;. gtg;30;gcg;33;gag;32;ggg;28;;gtg;0;gcg;0;gag;0;ggg;0;;gtg;.;gcg;0;gag;2;ggg;.;;gtg;.;gcg;0;gag;100;ggg;.
Taux Methanomicrobia 47
[modifier | modifier le wikicode]- Lien au tableaux: Methanomicrobia 47
- Légende:
Mmicrobia 47;;codons à multiple tRNAs;;;;;301;;Mmicrobia 47;;codons à multiple tRNAs avec intron;;;;;32;;Mmicrobia 47;;codons à multiple tRNAs doublon;;;;;199;;Mmicrobia 47;;codons à multiple tRNAs doublon;;;;;% ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;.;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;.;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;.;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;. att;.;act;.;aat;.;agt;.;;att;.;act;.;aat;.;agt;.;;att;.;act;.;aat;.;agt;.;;att;.;act;.;aat;.;agt;. ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;.;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;.;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;.;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;. gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;.;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;.;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;.;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;. ttc;25;tcc;.;tac;.;tgc;41;;ttc;1;tcc;.;tac;.;tgc;1;;ttc;23;tcc;.;tac;.;tgc;20;;ttc;92;tcc;.;tac;.;tgc;49 atc;26;acc;1;aac;24;agc;.;;atc;0;acc;0;aac;0;agc;.;;atc;9;acc;0;aac;22;agc;.;;atc;35;acc;0;aac;92;agc;. ctc;31;ccc;.;cac;.;cgc;.;;ctc;0;ccc;.;cac;.;cgc;.;;ctc;12;ccc;.;cac;.;cgc;.;;ctc;39;ccc;.;cac;.;cgc;. gtc;25;gcc;.;gac;4;ggc;26;;gtc;0;gcc;.;gac;0;ggc;0;;gtc;22;gcc;.;gac;4;ggc;22;;gtc;88;gcc;.;gac;100;ggc;85 tta;4;tca;.;taa;.;tga;.;;tta;0;tca;.;taa;.;tga;.;;tta;0;tca;.;taa;.;tga;.;;tta;0;tca;.;taa;.;tga;. ata;.;aca;10;aaa;1;aga;.;;ata;.;aca;3;aaa;0;aga;.;;ata;.;aca;1;aaa;1;aga;.;;ata;.;aca;10;aaa;100;aga;. cta;1;cca;.;caa;2;cga;.;;cta;0;cca;.;caa;0;cga;.;;cta;0;cca;.;caa;0;cga;.;;cta;0;cca;.;caa;0;cga;. gta;1;gca;18;gaa;24;gga;1;;gta;1;gca;0;gaa;0;gga;0;;gta;0;gca;17;gaa;23;gga;0;;gta;0;gca;94;gaa;96;gga;0 ttg;1;tcg;1;tag;.;tgg;.;;ttg;0;tcg;0;tag;.;tgg;.;;ttg;0;tcg;0;tag;.;tgg;.;;ttg;0;tcg;0;tag;.;tgg;. atg;25;acg;2;aag;1;agg;.;;atg;25;acg;0;aag;0;agg;.;;atg;21;acg;1;aag;1;agg;.;;atg;84;acg;50;aag;100;agg;. ctg;5;ccg;.;cag;.;cgg;.;;ctg;0;ccg;.;cag;.;cgg;.;;ctg;0;ccg;.;cag;.;cgg;.;;ctg;0;ccg;.;cag;.;cgg;. gtg;1;gcg;.;gag;.;ggg;.;;gtg;1;gcg;.;gag;.;ggg;.;;gtg;0;gcg;.;gag;.;ggg;.;;gtg;0;gcg;.;gag;.;ggg;. ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; Mmicrobia 47;;;tRNAs;;;;2554;;Mmicrobia 47;;47;Introns ;;;total;216;;Mmicrobia 47;;codons à multiple tRNAs dif;;;;;135;;Mmicrobia 47;;codons à multiple tRNAs dif;;;;;% ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;.;;ttt;.;tct;.;tat;.;tgt;. att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;.;act;.;aat;.;agt;.;;att;.;act;.;aat;.;agt;. ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0;;ctt;0;cct;0;cat;0;cgt;0;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;.;;ctt;.;cct;.;cat;.;cgt;. gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;.;;gtt;.;gct;.;gat;.;ggt;. ttc;72;tcc;47;tac;47;tgc;158;;ttc;1;tcc;5;tac;47;tgc;2;;ttc;2;tcc;.;tac;.;tgc;36;;ttc;8;tcc;.;tac;.;tgc;88 atc;73;acc;47;aac;71;agc;47;;atc;0;acc;0;aac;2;agc;0;;atc;17;acc;1;aac;2;agc;.;;atc;65;acc;100;aac;8;agc;. ctc;78;ccc;47;cac;47;cgc;47;;ctc;0;ccc;0;cac;0;cgc;3;;ctc;20;ccc;.;cac;.;cgc;.;;ctc;65;ccc;.;cac;.;cgc;. gtc;72;gcc;47;gac;51;ggc;94;;gtc;0;gcc;2;gac;0;ggc;0;;gtc;3;gcc;.;gac;0;ggc;20;;gtc;12;gcc;.;gac;0;ggc;77 tta;53;tca;46;taa;0;tga;0;;tta;0;tca;3;taa;0;tga;0;;tta;4;tca;.;taa;.;tga;.;;tta;100;tca;.;taa;.;tga;. ata;0;aca;60;aaa;48;aga;47;;ata;0;aca;3;aaa;3;aga;0;;ata;.;aca;10;aaa;0;aga;.;;ata;.;aca;100;aaa;0;aga;. cta;48;cca;47;caa;48;cga;47;;cta;0;cca;0;caa;0;cga;36;;cta;1;cca;.;caa;2;cga;.;;cta;100;cca;.;caa;100;cga;. gta;48;gca;73;gaa;71;gga;47;;gta;1;gca;0;gaa;0;gga;3;;gta;1;gca;1;gaa;1;gga;1;;gta;100;gca;6;gaa;4;gga;100 ttg;48;tcg;40;tag;1;tgg;47;;ttg;0;tcg;0;tag;0;tgg;47;;ttg;1;tcg;1;tag;.;tgg;.;;ttg;100;tcg;100;tag;.;tgg;. atg;167;acg;49;aag;48;agg;46;;atg;46;acg;3;aag;0;agg;0;;atg;4;acg;1;aag;0;agg;.;;atg;16;acg;50;aag;0;agg;. ctg;51;ccg;47;cag;47;cgg;47;;ctg;0;ccg;6;cag;0;cgg;1;;ctg;5;ccg;.;cag;.;cgg;.;;ctg;100;ccg;.;cag;.;cgg;. gtg;47;gcg;47;gag;47;ggg;46;;gtg;1;gcg;0;gag;0;ggg;0;;gtg;1;gcg;.;gag;.;ggg;.;;gtg;100;gcg;.;gag;.;ggg;.
Duplications chez les bactéries par les opérons d'ARNs
[modifier | modifier le wikicode]Les duplications par opérons contenant des rRNAs: bsu lmo
[modifier | modifier le wikicode]- Les positions des codons dans les opérons. D'après adressage.
bsu;;;;lmo;; 21aas;16aas;9aas;;21aas;16aas;9aas complement;direct;direct;;complement;complement;direct gaa;16s;16s;;gaa;ttg;16s agc;23s;23s;;agc;tgc;23s aac;5s;5s;;aac;ggc;5s atc;aac;gta;;atc;caa;gta gga;tcc;aca;;gga;cac;aca cac;gaa;aaa;;cac;tgg;aaa ttc;gta;cta;;ttc;tac;cta gac;atgf;ggc;;gac;ttc;ggc atgf;gac;tta;;atgf;gac;tta tca;ttc;cgt;;tca;atgf;cgt atgi;aca;cca;;atgi;gta;cca atg;tac;gca;;atg;gaa;gca gca;tgg;16s;;gca;tcc;16s cca;cac;23s;;cca;aac;23s cgt;caa;5s;;cgt;5s;5s tta;ggc;;;tta;23s; ggc;tgc;;;ggc;gca; ctg;tta;;;cta;atc; aaa;ttg;;;aaa;16s; aca;;;;aca;; gta;;;;gta;; 5s;;;;5s;; 23s;;;;23s;; 16s;;;;16s;;
bsu lmo: Les séquences prélevées des bases de données
[modifier | modifier le wikicode]Liens aux bases de données
[modifier | modifier le wikicode]- bsu : Bacillus subtilis subsp. subtilis 168[2], KEGG.
- lmo : Listeria monocytogenes EGD-e (serotype 1/2a)[7], KEGG.
Adressages
[modifier | modifier le wikicode]bsu adresses
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Archives bsu
[modifier | modifier le wikicode]bsu 21aas
[modifier | modifier le wikicode]- Méthode: les séquences Fasta NCBI des aas sont indiquées par *** au début et à la fin de l'adressage. bsu adresses bsu gtRNAdb.
Bsu 168 21 aas 18.04.19 AGGATCTCCTCTAAATTGATGCCGATTTCCTTTAAACCAGCTTCTACAACATCACGAACACCAAGATTCA TTAAGTTTTGCTCAAGGAGCTGACCGAGCAGAAATTCGATTGATAAATAATATGTCTGCTTCCCGGAATT TGATCTGCTTTTTTCATTCGTTTCGATCCAATCAGCGCTGATATACTCTCTGACCATATTGCCCAACGTT TTATATTGATCCAGCTTGGCAGAATCTTTAAAGCTTTTTCCGCACGTCATTTCCAGACGCTTTAAAAATA AGTCTGCAAAGCGTTCTTTACTCGAGAACATCCCGTCCACTCCTTGTCACCTGCTCGAAAATACGCTGAT ACTCTTTAGCCGACTTCCCCCAGCTGTAATCTGCATTCATAGCGGTCTTCACGATGCTCTTCCATACATC CTGTTGGCAATAAAACGACAGCGCCCTTTCTATCGTAAATTTCAGATCATGCGCATTAAAGGCGGAAAAC GTAAAGCCATTGCCCGTTCCCTCTTCCTCCTGATAGGCACGGACAGTGTCGTAAAGACCGCCCGTTTCCC TGACAATCGGAATGGCGCCATATTGAAGAGCAATGAGCTGCCCCAAACCGCACGGCTCAAATTTCGACGG CATCAAAAACATATCAGAGCCCGCATAAATTTGATGGGCTAGCGGCTCATCAAACCCGATATAAGCCCGG CACTTCTCATGAAAAGCAAATTCTGCATACCGGAAATAATCTTCAAATTCACGTTCTCCTGTGCCTAGCA CAACCAGCTGTATGTCTTGCTCCTCAAGAAGTTCGTGCATAATTCTGCGGACAAGATCAAGCCCCTTTTG TTTAGTGAGCCTTGTCACCATACTGATCAGCGGAATATCGTTTTTCTCTGGAAGCCCCATCCGCTGCTGA 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TGCGTTTTTTGCATAATAATGCAGTTTTTCAGCTTCGTACCCTTTCCGACATGGACCGCCCTGAACAAAA TGCAGTTTTCAACCTCTCCTTCAAGCACACAGCCGTTTGCCACCAAAGAATTTTTGACAGTGCTGTGCTT TCCGTATTTCGTAGGCGGCTCATCCTTCACTTTTGTATAGATCGGCTGCTGCGGCAAAAACACCTGCTGC CAAAAACGAGGCTGAATGAGCTCCATACTGTGGGTATAATATTTTTCCACCGAATCAATGACAGCGGCAT AACCTGAATATTCATAAGGGCAAATGGTCAGGGCGGAAGATTCCTTTTCAACAGCCTCCTGAATGGTTTT ATAGCCTTTTTCGCTATGTCCGTAGATCAGATCCTTTAAAAGCGTTGTTGACATGATATAGATTTGCAGC GACTGGCCGTCCTGAAATACCTCGGTGACGTCGCAGCCAACCTCCTGATGGCGTTTCAGCACATATTGAA ATTGAATGTTGCATACGGTATGGCTGTTGGAGATTACAGCATATTGCTGAGTGCTTCTGTGGAAGTAATC TAGATGGTCCGAAAACTGGCGAAAGGAACCGAATTCATCGTATTCGTGATGAAGATGGGGAGACGGGAAA AAAAAGAGGCCGTCCTTTTTCCGGTGCAAATCCCATTCCTTACCCGCCCCAAGGTGATCCATGAGCGAAC GGTAACGATACTTCGGAAAAATTGCAACACTCCTAATATCCGCATTCACCATGTTGGAAAGCATAAAATC AATCAGTCGGTACCTGCCGGCAAAAGGGATCGCCCCGAGCGACCGCTGTGCTGTTAAATCCTGAAGAGAA TGCTTATATGTGGTTTCATCTATAACACCTAACATTTGATTATTGAACACTGACTCTGCCCCCTCTTCAG TAATTAAATCAATTCTTTTTCTACAAATTCCTCTGAAACGAGCAGCACCTCTTCAATGTCTTTTTCGGAG CGAATCACTGCGCCATCCGGCAGCACCATCCCATTAGGAACGATGGCATTTTCAATGACTACATGCTCCC CAATCGTCACATCCGGCATTATGACGGATGATGTAACAGTCGTATGCTTACCAACAGTCACACCTTGAAA AAGAACGGAGTGAGACACATTTCCATATACAACACAACCTTCGTTCACAAGCGAATCTTGAACCTGCGCA TCAGATGAAATAAATTGCGGAGGCTGATTTGGATTGACGGAGTAAATTTTCCATTTGCGTTCAAACAGCT TCAGCTCCGAGTCCTCTTTTAACAAATCCATATTGGCTTCCCACAAGCTCTGCACCGTTCCGACATCCTT CCAATATCCCTTGAACGGATAAGCAGAAAGCTTCTTTTTCTCTTCCAAAAGCAGTGGAATAATGTCTTTG CCGAAGTCGTGGCTAGAATAAGGGTTTTGATCGTCCATCTCAAGATACTGTTTCAAAAGCGGCCAATTGA ATATATAAATTCCCATTGAGGCAAGATTGCTCTTAGGGAATTTGGGCTTTTCATCAAAATGTGTGATCGT CCCATCTGGATTGGCCTTCATGATGCCGAACCGGCTTGCTTCCTCCCAGCCCACTTCGATGACAGAGATG GTCACATCTGCTTTCTTTTCAATGTGATAATCAAGCATTTTGCCGTAGTCCATTTTGTATATGTGATCTC CTGATAAAATCAGTACATACTCAGGATCATACTGATTCAAATAATTGAGATTTTCATAAATGGAGCTTGC CGTCCCTTTATACCATTTGACTTCTGATGACTCGGCATAAGGGGGTAAAACCGTCACGCCGCCATTATAT CTATCCAGGTCCCATGCACTGCCGATCCCAATATAGGAATTCAGCTCGAGCGGCTGATATTGCGTTAAAA TCCCGACTGTGTCTATGCCTGAATTAGAACAGTTGCTTAGGGTAAAATCAATAATCCTGTATTTTCCCCC 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CCTCCCGGATTCCGACGGAATTTCACGTGTTCCGCCGTACTCAGGATCCACTCAGGAGAGAACGAAGTTT TGACTACAGGGCTGTTACCTCCTATGGCGGGCCTTTCCAGACCTCTTCATCTACCTCGTTCTTTTGTAAC TCCGTACAGAGTGTCCTACAACCCCAAGAGGCAAGCCTCTTGGTTTGGGCTGATCCCGTTTCGCTCGCCG CTACTCAGGGAATCGCATTTGCTTTCTCTTCCTCCGGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCCGGGTCTGCCT TCTCATATCCTATGAATTCAGATATGGATACCACTCCATTACGAGTGGTGGGTTTCCCCATTCGGAAATC TCCGGATCAAAGCTTGCTTACAGCTCCCCGAAGCATATCGGTGTTCGTCCCGTCCTTCATCGGCTCCTAG TGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTTCTAACTTAACCGTTAAAAAGAATCACTATGTGATATCTTGTGT TACTAATTGAATGTGATGTCTACTGTTATCTAGTTTTCAAAGAACACGTTTCGAAGGAATGATCCTTCAA AACTAAACAAGACAGGGAACGTTCTGTTTATAAGACCTTGGGTCTTATATTCCGTATAATATCCTTAGAA AGGAGGTGATCCAGCCGCACCTTCCGATACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTGTCCCAC CTTCGGCGGCTGGCTCCTAAAAGGTTACCTCACCGACTTCGGGTGTTACAAACTCTCGTGGTGTGACGGG CGGTGTGTACAAGGCCCGGGAACGTATTCACCGCGGCATGCTGATCCGCGATTACTAGCGATTCCAGCTT CACGCAGTCGAGTTGCAGACTGCGATCCGAACTGAGAACAGATTTGTGGGATTGGCTTAACCTCGCGGTT TCGCTGCCCTTTGTTCTGTCCATTGTAGCACGTGTGTAGCCCAGGTCATAAGGGGCATGATGATTTGACG TCATCCCCACCTTCCTCCGGTTTGTCACCGGCAGTCACCTTAGAGTGCCCAACTGAATGCTGGCAACTAA GATCAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATCTCACGACACGAGCTGACGACAACCATGCAC CACCTGTCACTCTGCCCCCGAAGGGGACGTCCTATCTCTAGGATTGTCAGAGGATGTCAAGACCTGGTAA GGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCCTTTGA GTTTCAGTCTTGCGACCGTACTCCCCAGGCGGAGTGCTTAATGCGTTAGCTGCAGCACTAAGGGGCGGAA ACCCCCTAACACTTAGCACTCATCGTTTACGGCGTGGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTCGCTCCCCA CGCTTTCGCTCCTCAGCGTCAGTTACAGACCAGAGAGTCGCCTTCGCCACTGGTGTTCCTCCACATCTCT ACGCATTTCACCGCTACACGTGGAATTCCACTCTCCTCTTCTGCACTCAAGTTCCCCAGTTTCCAATGAC CCTCCCCGGTTGAGCCGGGGGCTTTCACATCAGACTTAAGAAACCGCCTGCGAGCCCTTTACGCCCAATA ATTCCGGAAAACGCTTGCCACCTACGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGTAGTTAGCCGTGGCTTTCTGGT TAGGTACCGTCAAGGTACCGCCCTGTTCGAACGGTACTTGTTCTTCCCTAACAACAGAGCTTTACGATCC GAAAACCTTCATCACTCACGCGGCGTTGCTCCGTCAGACTTTCGTCCATTGCGGAAGATTCCCTACTGCT GCCTCCCGTAGGAGTCTGGGCCGTGTCTCAGTCCCAGTGTGGCCGATCACCCTCTCAGGTCGGCTACGCA TCGTTGCCTTGGTGAGCCGTTACCTCACCAACTAGCTAATGCGCCGCGGGTCCATCTGTAAGTGGTAGCC GAAGCCACCTTTTATGTTTGAATCATGCGGTTCAAACAACCATCCGGTATTAGCCCCGGTTTCCCGGAGT TATCCCAGTCTTACAGGCAGGTTACCCACGTGTTACTCACCCGTCCGCCGCTAACATCAGGGAGCAAGCT CCCACCTGTCCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCGTCCTGAGCCAGGATCAAACTC TCCGATAAAT*** fin opéron 21aas voir adresses*** GGATCACAGGTTAAGTTCACCGCATCCTGCGGCGACACCTGTGTGACCTGCGTCGTGCAG GCCCTAGTTTGACTGACTACGCACATCGCAGTGCGATTTTTAAAAACTGAATTAACAGGTACGTTTTGTC TTGTTTAGTTTTCAAAGATCATTTCGTTACTTCTCAATGAAGCAGCTTTACTAATATAACATTCAGCTTC TTTTTTGTCAACAACTTTTTTCAAGTTGTTTTGAAGCATCTAGTTTGTGTCCGCTGTGCATCAGCGACGT TTAATAATATAACACCTGTATTTATTTATTGCAATAGTTTTTTAAAAAAAATCTATAAAACAAATAAACT ATAATCCTCGCCATGATTTCTAAAGCGTGTGTATCATATAAGTTTCTTAAAAGAACATATACATCAGTCA TGTGATCTTGTTGTTTTTTTCGTTTTCTTGTATAGTAGAAACGAACTAAATACTGATGACCACAAGGGGA GCATTAAAGCTGAGAGTGAGCGGTTTCGTTCTGACCCTTTGAACCTGTTAGTTAACGCTGGCGTAGGGAT GTGGCAAAGTCAAATGAATTGCAGATCGTAAAGCAGTGCGTGGAACTTTTCTCATCCTTCCGCGTGCTGC TTTTTTGTTGTCCTTTTGGTTGTCTGTCAATGGAAGGAGATAGATATGAATCAATCTAAGCAACTGGTTC GCCTTATTGAAATTGCCATTATGACAGCGGCAGCCGTTATTTTAGACATTGTCTCAGGAATGTTTCTTAG CATGCCTCAAGGAGGCTCGGTCTCCATCATGATGATTCCGATCTTTTTAATTTCGTTTCGCTGGGGTGTC AAAGCAGGTCTTACTACAGGTTTGTTGACAGGTCTAGTACAAATAGCAATCGGAAACTTGTTTGCTCAAC ATCCTGTACAGCTATTGTTAGATTACATTGTCGCTTTCGCAGCAATCGGCATAAGCGGCTGTTTCGCTTC TTCTGTCCGTAAAGCCGCTGTATCAAAAACAAAAGGGAAATTGATTGTTTCAGTGGTCAGCGCAGTTTTT ATCGGCAGTTTGCTGCGCTATGCCGCGCATGTCATTTCAGGAGCTGTGTTTTTCGGCAGCTTTGCTCCAA AAGGAACACCGGTATGGATTTATTCTTTAACTTATAATGCGACTTACATGGTTCCTTCATTCATTATTTG TGCAATTGTCCTATGTTTATTATTTATGACAGCACCCCGTCTGCTTAAAAGTGACAAAGCGTAAAAGTAA CAATCCCCCAGCGAATTCCGCTGGGGGATTTTTCGTTATCTGTTAAGAAGTGTTTTTAAAGCTGAAAGAT CCGGCCAGCCAAGACCTACTTCTTTCAGCCTTACTCCGGCAATTTCAAAGTTGTCCTCCGCTACTCTTTC AGGTGAATAGGCCTGATAAAATATAATCGAGGGATTCTGCTCAATAACCCAAACAAACATACTTGAAAAA CCATGTTGAAGCAAAAACTCCGCTCCTTTTGCTAAGAGCGCCCTGCCTGCACCTTGCCGCTGGCGCTCTT
bsu 16aas
[modifier | modifier le wikicode]- Méthode: les séquences Fasta NCBI des aas sont indiquées par *** au début et à la fin de l'adressage. bsu adresses bsu gtRNAdb.
Bsu 168 16 aas 21.04.19 GATGCTTCCAGCAGATTCGATTTTGTCACATCCGATCACTATCACGCGATTTGCGAAAACTGCGGTAAAA TTGTGGACTTCCACTACCCGGGCCTTGATGAAGTGGAGCAGCTCGCTGCCCACGTCACGGGCTTCAAGGT AAGCCACCACCGTTTAGAAATTTACGGCGTCTGCCAAGAGTGTTCGAAAAAAGAAAATCATTAAAAATAA GCTGACCGCACGAAACGGTCAGCTTATTTTATTTCGACATTTTCTTTTTATTATAAGACTCATCAAATTC TTTTCCTTCTAATCCCTTATCTAAAGTCAGCGGCTCTCGGCAATGCATGCACATATCGACTACTCCTAAA ACCTTTGTCTCTTTATCACAGCCTGGACAAATGACGCGAACCGCTTTAGTCGAAAGCATTCCGATCCAAA AGTAAACTACCGTGCTGAGACCGATGGATAAAAGCCCAAGTATCATAAACAAACTAGAAAGCAAAACTGA CTCTTTGAAAAAGATCCCGATGTACATAATGATAAACCCAACGAAAACCAAACTTAACGCAAATGTTCTG ATTTTATTAATTTTGCTGGAGTATTTCGCCATGTCCATCCCCCTCTGTTTTAACTATAGCACAAACCCGA TGGGATTTTCTTCATGTTTTCGGTTGAACTGGAATTTACATATGGAGAGTTACTGTGAAATTGTTTATAA TAGTTCAATGTGTTTAGAAAAAAGGAATTTCGTTTTAACCATAGAATTGAATCAAATAGAGAATAAAAAA ATTTGAACAATTGCATTGGAGGAATAGTGATGGAAAATCTTCTCCGTCCAATTTACCAAGAAAGAGCAAG TCACCCCAATACATTGGCTGTCATTATGATTGAGAGAAGAAACAAAACATCTTCCTTAACAGATAACTTT GATGCAGCTTTGCTGGTGATTGTAAAGGATGCTGATGAGCCAGTTTTTATAAAGCATTATGAATTTGATC ATCAAACAGCTTCTTTGCATGTGGTAACAGATTCTCAGATTCAAGAATGGATTTTGCTTGGAACAAATAG AAGAATCATAGATTGGATTGTAAATGGCAGAGTCTTGTTTGACCGTAATGAATACGTAGTTGAACTGATT GACAGGCTGAATACATTTCCGTTTGCCGAACGTAAACTGAAGATCGGACTCGAATACGGCAAATTAATCA GAAGGTATGTTGAAGGGAAAGCTTTTTTTGAAGCCAATCAATTTTTAGATGCCTACAATGCCGTTGTTCA TGCGCTGCATCATTTAGCACGTATTGAAGTAATCGACAGAGGATTCCATCCCGAAACCACGGTGTGGAGC CAAGTGCGCCAGATGGAGCCCCAAGTGTACAAATTATATTCCGAGCTGATTGAAAGTCATGAGAGCCTGG AAAAAAGACTTGAATTATTATTCTTAGCAAATGATTTTCTCATCCATTCCAAAGCCGAGATCGGTTCGGC GCATCTTTTCGAAGTAATGAAAGAAAAAGACATTTGGCAATTCGGTGAGCTTCTTCAACATCATGACCTA AAGCACTTTACCCAAGATCTTGGCGTTATGCTTGATTACTTGACGGAAAAGGGACTTATCAACGTCTGCC AGATAGAAACGAAAGGACAGGCTGTCTATCACCGAGGATATTCTTTTAAAAAAGGTGTTGACTCTGATTC TTGACCGTGTTATATTATTAAACGTCGCTGATGCGCTTCTGAGAAAACAAGCTCACAGCGGCGGGAAAAT AAATCAAAAAAACATTTGACAAAAGAAAGTCAAAATGTTATATTAATAAAGTCGCTTCAACAAGAAGTGA AAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAAATCGCACAGCGA TGTGCGTAGTCAGTCAAACTAGGGCCTGCACGACGCAGGTCACACAGGTGTCGCCGCAGGATGCGGTGAA CTTAACCTGTGATCC***début des 16aas, 16s. voir adresses*** ATTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATA CATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGG GTAACCTGCCTGTAAGACTGGGATAACTCCGGGAAACCGGGGCTAATACCGGATGGTTGTTTGAACCGCA TGGTTCAAACATAAAAGGTGGCTTCGGCTACCACTTACAGATGGACCCGCGGCGCATTAGCTAGTTGGTG AGGTAACGGCTCACCAAGGCAACGATGCGTAGCCGACCTGAGAGGGTGATCGGCCACACTGGGACTGAGA CACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTCCGCAATGGACGAAAGTCTGACGGAGCAA CGCCGCGTGAGTGATGAAGGTTTTCGGATCGTAAAGCTCTGTTGTTAGGGAAGAACAAGTACCGTTCGAA TAGGGCGGTACCTTGACGGTACCTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATAC GTAGGTGGCAAGCGTTGTCCGGAATTATTGGGCGTAAAGGGCTCGCAGGCGGTTTCTTAAGTCTGATGTG AAAGCCCCCGGCTCAACCGGGGAGGGTCATTGGAAACTGGGGAACTTGAGTGCAGAAGAGGAGAGTGGAA TTCCACGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATGTGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTCTCTGGTCTG TAACTGACGCTGAGGAGCGAAAGCGTGGGGAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAA CGATGAGTGCTAAGTGTTAGGGGGTTTCCGCCCCTTAGTGCTGCAGCTAACGCATTAAGCACTCCGCCTG GGGAGTACGGTCGCAAGACTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGT TTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCTCTGACAATCCTAGAGATAGGACGTC CCCTTCGGGGGCAGAGTGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGT CCCGCAACGAGCGCAACCCTTGATCTTAGTTGCCAGCATTCAGTTGGGCACTCTAAGGTGACTGCCGGTG ACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGACCTGGGCTACACACGTGCTA CAATGGACAGAACAAAGGGCAGCGAAACCGCGAGGTTAAGCCAATCCCACAAATCTGTTCTCAGTTCGGA TCGCAGTCTGCAACTCGACTGCGTGAAGCTGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCGGTGAAT ACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACGAGAGTTTGTAACACCCGAAGTCGGTGAGGTA ACCTTTTAGGAGCCAGCCGCCGAAGGTGGGACAGATGATTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTATC GGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTAAGGATATTATACGGAATATAAGACCTTGGGTCTTATAAAC AGAACGTTCCCTGTCTTGTTTAGTTTTGAAGGATCATTCCTTCGAAACGTGTTCTTTGAAAACTAGATAA CAGTAGACATCACATTCAATTAGTAATACAAGATATCACATAGTGATTCTTTTTAACGGTTAAGTTAGAA AGGGCGCACGGTGGATGCCTTGGCACTAGGAGCCGATGAAGGACGGGACGAACACCGATATGCTTCGGGG 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TTAAGTGGAAAAGGATGTGGAGTTGCTTAGACAACCAGGATGTTGGCTTAGAAGCAGCCACCATTTAAAG AGTGCGTAATAGCTCACTGGTCGAGTGACTCTGCGCCGAAAATGTACCGGGGCTAAACGTATCACCGAAG CTGCGGACTGTTCTTCGAACAGTGGTAGGAGAGCGTTCTAAGGGCTGTGAAGCCAGACCGGAAGGACTGG TGGAGCGCTTAGAAGTGAGAATGCCGGTATGAGTAGCGAAAGAGGGGTGAGAATCCCCTCCACCGAATGC CTAAGGTTTCCTGAGGAAGGCTCGTCCGCTCAGGGTTAGTCGGGACCTAAGCCGAGGCCGAAAGGCGTAG GCGATGGACAACAGGTTGATATTCCTGTACCACCTCCTCACCATTTGAGCAATGGGGGGACGCAGGAGGA TAGGGTAAGCGCGGTATTGGATATCCGCGTCCAAGCAGTTAGGCTGGGAAATAGGCAAATCCGTTTCCCA TAAGGCTGAGCTGTGATGGCGAGCGAAATATAGTAGCGAAGTTCCTGATTCCACACTGCCAAGAAAAGCC TCTAGCGAGGTGAGAGGTGCCCGTACCGCAAACCGACACAGGTAGGCGAGGAGAGAATCCTAAGGTGATC GAGAGAACTCTCGTTAAGGAACTCGGCAAAATGACCCCGTAACTTCGGGAGAAGGGGTGCTCTGTTAGGG TGCAAGCCCGAGAGAGCCGCAGTGAATAGGCCCAGGCGACTGTTTAGCAAAAACACAGGTCTCTGCGAAG CCGTAAGGCGAAGTATAGGGGCTGACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTAAGAGGAGCGCTTAGCGTAAGC GAAGGTGCGAATTGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGAAATTCCTT GTCGGGTAAGTTCCGACCCGCACGAAAGGCGCAACGATCTGGGCACTGTCTCAACGAGAGACTCGGTGAA 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AATGTCACTGAAATTGTCTGGTGATGATGGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATGCCGAACACGGAAGTT AAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTTCCCCCTGTGAGAGTAGGACATCGCCAGGCAGACTTCA TTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCG GAGCCATTATTGGAGAGCTGTCCGAGTGGTCGAAGGAGCACGATTGGAAATCGTGTAGGCGGTCAACTCC GTCTCAAGGGTTCGAATCCCTTGCTCTCCGCCACTGATACTTATACATAATTACAATTGAAAGTCTGGGC CCGTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCAT TATATGATGGAGGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAGCCC GTCATCCTCCACCATTATATCATCGCGGGGTGGAGCAGTTCGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAGG TCGCAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCAACCAAATTTTAAAATGGTCCGGTAGTTCAGTTGGTTAGAATGCC TGCCTGTCACGCAGGAGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGGACCGCCATTTGAATACTTAGGCTCGGTAG CTCAGTTGGTAGAGCAACGGACTGAAAATCCGTGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCCCGAGCCACCACCTA TGCCGGTGTAGCTCAATTGGTAGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAGGTTGGGGGTTCAAGTCCTCTTGCC GGCACTGTTTTTTCAAAATTTAATGTGGAGGGGTAGCGAAGTGGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGC TCCCTCAGGGTTCGGCAGTTCGAATCTGCCCCCCTCCACCATTTATAGGGGCATAGTTTAACGGTAGAAC 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TATTTTTTATTAAAGAAAAGGAGCCTCGGCTCCTTTTTATACTTACTCAGCGTATTGGTCTAGGATCTCT TCTAGCACCTCTTCTAGCTCTTCTGTATCTTCAAGCTCTGATTGGCTGAAACGGACGCGTACAAGCTGTT CTCCGTCATTATACATCTCTTCCAACCACCCTCGGAGTCCTCTTGCTCTGCGGTCGACTTCGAAAATGAT TTCCAAACCGTCTTCGTCTAAAAGGAAAATGAGCTCTAATTCATCAAGCATCTGACGATAATATCCGGAA GTCGGAACGAATTCGAATTCTTGAACGAACGGAAGACGACGCTGGAAGTAGGGCGCTTGTTCGCAGTCTG CTTCGTTAAGACGGAAGCCCAGGTTTTCGATTGCTTCAAGCACATTTTCAATCCAAGGGTGCGCTTCAAC GAAAATGCGGTCATGATCGGATTTATCGATACCGCCTTGAATGTCAAGGTCTGTCACCACGGCAACCTCT ACTTTCCCTACAGTGATCGGCGTATCTAGAGGCAGAGTGAATGTGAACGGAAATTGATGCTCTTCACCAG GCTGTATGGTAAATGAACCAGTGACCCGGAAAGAATGAATTGTAGCGTATTTCCGGTGCTCTTCATCGTC TTTTACAATGACATACCGTGTGCTAAGCTGTAAATCGATATAACGGATGTCCTGAGCGATTTTTCCGCCT TTGACATGTACCGTTCCCTGTACTTCTTCTCCTGGAAAATATGCGTCTTTTTCTAAAATTGTATCTACTT TTGCAGCTCCAATTCCGGCACTTGCCGCAAGCTTCTTAAAAAATGACATGTTAGATCTTCCCCTTTTTCT TTTTTCTCAACAGATATACGTAAGAAGGAGGAAAAAAGATTCGTTTGATTCATACTTTTTTCCTATTATT CGTCTCGGCCTAGGGACAGACTAAGAATAATATTGAAAATAAAGGAGTCGATGGAAGTGAATAAAGAAAG 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AGGGGTGACAGATTCAGCCGGACCGCTGACAAGTTTGAAAAGTTTAGGTTTTTTGCAAGGGAGCTTTTGT CCCCATTATGACGGGGAAAAGGATCGGAGACCGGCATACCACCAGCTGATATCTAACAAGTTCTTATGCA GTGGCTATGCAGCGGATGATGGGGCTGCTCTCCATTTCATAAATGATCAGCTGTTTCAGACTGTGAGTTC AAGGTCGGGTGCAAAGGCATATCGGGTGATGATGGCTGAACATGAAATAGCTGAAATCCCGTTGCCGGTC AAATATTTAGGGTGAAATTGGCTGAATATTATCTATATTCCTCTTTTTTTCAGATTGATTTTATGATAAG ATGAGTGCGAAATCAATAGTTACTGGGGGTGCCCGCTTTCGGGCTGAGAGAGAAGGCAAGCTTCTTAACC CTTTGGACCTGATCTGGTTCGTACCAGCGTGGGGAAGTAGAGGAATTGTTTTTGTTATTGTCTTGCTGGG CAATAATATGTTTCTTTCTGACTGTAACCGGGTTCATTTATATGAATCCGGTTTTTTGTGCTGGTTATGG GCTTGATTTTGTCCTTTCAAACGTAGAAAGGGGAAGGAAAAGTAATGCAAAACAATTCAGTGCAGCAAGC CAACATTTCCATTATGTCAAGTTTTTCAGGCAGCAAGAAGGTATACGTGGAGGGTTCTTCTTCGGACATC CAAGTGCCGATGAGGGAGATTGCATTGAGTCCGACGACGGGATCGTTCGGCGAAGAGGAAAACGCGCCTG TGCGTGTCTATGATACAAGCGGACCGTATACGGACCCTGAAGTAACCATTAATATTCAAGAAGGATTAAA GCCGCTCCGCCAAAAATGGATCACAGAGCGCGGTGACGTGGAAGAGTATGAAGGTCGGGCTATAAAACCA GAAGATAACGGTTATAAAAAAGCAAAACCAAACGTAAGCTATCCAGGATTAAAGCGGAAACCGCTGAGGG CGAAGGCAGGTCAAAATGTCACACAAATGCACTATGCAAAAAAGGGGATCATTACACCTGAGATGGAATT TATCGCCATTCGTGAGCATGTGTCTCCTGAATTCGTCAGAGACGAGGTAGCCAGCGGCCGGGCGATTATT CCTTCAAACATTAATCACCCTGAAAGTGAGCCAATGATTATCGGCCGGAATTTTCATGTGAAGATTAATG CAAATATCGGGAATTCAGCGGTTACGTCATCCATTGAAGAAGAAGTGGAAAAAATGACGTGGGCCATCCG CTGGGGAGCGGATACGATGATGGATCTCTCTACCGGAAAAGATATTCATACGACGCGTGAATGGATTATC CGCAATTGCCCCGTGCCTGTGGGAACTGTTCCGATTTATCAGGCGCTTGAAAAAGTAAACGGCGTAGCTG AGGATTTAACGTGGGAGATTTATCGTGATACGCTAATCGAGCAGGCAGAGCAGGGAGTGGATTATTTTAC GATTCACGCGGGTGTTTTGCTTAGGTATGTACCGCTGACTGCCAAACGGACAACTGGTATCGTGTCACGC GGGGGAGCGATTATGGCGCAGTGGTGTCTGGCTCATCATCAAGAAAGCTTTTTATACACACATTTTGAAG AAATATGTGAGATTATGAAAATGTATGATATTGCTTTCTCTCTTGGGGATGGTTTGCGTCCCGGATCAAT TGCTGATGCCAATGACGAAGCGCAGTTTGCTGAATTAGAGACGCTTGGAGAGCTGACGCAAATTGCCTGG AAGCATGATGTTCAGGTGATGATTGAGGGTCCTGGACATGTTCCGATGCATAAAATCAAAGAGAACGTCG ATAAACAAATGGACATTTGTAAAGAAGCGCCTTTTTACACATTGGGGCCGTTGACAACGGATATTGCTCC GGGATATGACCATATTACTTCAGCGATCGGAGCGGCGATGATCGGTTGGTACGGGACAGCAATGCTTTGT TATGTAACGCCGAAGGAGCATTTGGGGCTGCCAAACCGTGATGATGTTCGTGAAGGAGTCATTACATATA AGATCGCTGCGCACGCTGCGGACCTTGCAAAAGGGCATCCCGGAGCGCAAATCCGGGATGATGCGTTATC GAAAGCCCGTTTTGAATTCCGCTGGCGGGATCAGTTTAATTTATCTCTTGATCCGGAGAGAGCCCTTGAA TACCATGATGAAACCCTGCCTGCTGAAGGAGCAAAAACCGCTCACTTTTGTTCCATGTGCGGTCCGAAAT TTTGCAGCATGAGAATTTCACAGGATATTCGGGATTATGCGAAGAAAAACGATCTCAGTGAAGCAGAAGC CATAAATAAAGGATTAAAAGAAAAAGCAAAAGAGTTTGTCGATACGGGAAGCAATTTATATCAATAAAAA AAATGAAGATGGAGAATGCTCCATCTTCATTTTTTTAGAAAAACAGAGAGCGTCGAAGCGGAGGAATACT CTGTTCAAAGCGGAAAACATTTTCTGGATCATATGTCGTTTTGACACGGCGGAGTCGTTCAACGTTTTCG CCGTAATATGTTCTTGGCCAGTTTCTGATTTCGATATCTGGCCAATTTACGTAGTCTCCCATCGTTTCTT TCGAAAGGGACGTTCTCAGCCCCTCAATCCAGCGGACATTTTGTCTTTTTTCTCCAGGGGATGTCCAGTT TGTTAAGTATTCCTGGGCGATGATTGCGTCACGATAATAAAATGCCGTTTGGTCGGGAGCGACCCGTCCG GCTGCCCCGCCGAGTGCTTGCTGCCAGACACTGGCGTTTTGATTCGGAGCGTGCTCTAAAAAGTGTTTTA
bsu 9aas
[modifier | modifier le wikicode]- Méthode: les séquences Fasta NCBI des aas sont indiquées par *** au début et à la fin de l'adressage. bsu adresses bsu gtRNAdb.
Bsu 168 9 aas 25.04.19 CGAAGGCTGCCCGTTTTTGCTTGATTGGCATATAGAGAGGCTTGAACGCGCGCTTAAGGATCTGCAAATC GAATATACTGTTTCAAAGCATGAGATCCTTGAGATGCTGGACAAGCTGCTTAAGCTAAATGATATCAAGG ATGGCAATGCCCGCGTCAGACTGAACATATCAGCGGGAATCAGCGATAAAGGCTTTGTCGCCCAGACGTA CGATAAGCCCACCGTTTTATGCTTTGTGAATCAGCTGAAACCAGAAAGTCTTCCTTTGCAAAAAGAAGGA AAGGTTTTATCGATACGGAGAAACACTCCAGAGGGATCGTTCCGGTTAAAATCTCATCATTATCTAAATA ATATGTATGCGAAACGGGAAATTGGAAATGATCCGCGTGTCGAGGGAATTTTCTTAACGGAGGATGGAGC TGTTGCAGAGGGTATCATATCTAATGTCTTCTGGAGAAAAGGTCGCTGTATCTATACGCCATCGCTTGAT ACCGGTATTCTGGACGGCGTCACGAGACGTTTTATCATAGAAAATGCAAAGGATATCGGCCTGGAGCTCA AAACGGGCCGATATGAGCTAGAAGCTCTCTTGACAGCTGACGAAGCGTGGATGACGAACTCGGTTCTTGA AATCATCCCGTTTACTAAAATAGAAGAAGTAAACTATGGAAGCCAAAGCGGAGAAGCAACCTCCGCTCTT CAATTGTTATACAAAAAAGAAATAAAGAACATGATTCATGAAAAGGGAGGAAGAGCATGGCGCAGCACAC AATAGATCAAACACAAGTAATCCACACTAAGCCCAGCGCTTTATCATATAAAGAGAAGACGCTGGTGATG GGAATTTTAAACGTAACGCCTGACTCTTTCTCGGACGGCGGAAAATATGACAGCTTGGACAAGGCGCTGC TGCACGCGAAAGAGATGATCGATGATGGTGCCCATATCATTGATATTGGAGGGGAATCGACAAGGCCTGG CGCTGAGTGCGTATCTGAGGATGAGGAGATGTCCAGAGTCATTCCGGTGATTGAGCGGATTACGAAAGAG CTTGGTGTTCCTATTTCTGTAGACACGTACAAGGCTTCTGTCGCAGATGAAGCAGTGAAAGCCGGTGCAT CCATTATCAATGATATTTGGGGAGCCAAACATGATCCGAAGATGGCTTCCGTTGCAGCTGAACATAATGT TCCAATTGTACTCATGCATAACCGCCCTGAAAGAAACTACAATGACTTATTGCCGGATATGCTGTCGGAC TTAATGGAGAGTGTAAAAATTGCTGTTGAGGCCGGAGTAGACGAGAAGAACATTATTCTTGATCCTGGTA TCGGTTTCGCGAAAACCTATCACGATAACTTGGCAGTGATGAACAAACTAGAGATTTTCAGCGGATTGGG ATATCCGGTTCTTCTGGCAACCTCCCGAAAAAGATTCATCGGACGTGTTCTGGATCTTCCGCCTGAGGAG CGGGCTGAGGGCACAGGCGCGACTGTGTGTCTCGGCATTCAAAAAGGCTGTGACATTGTCAGGGTCCATG ATGTAAAGCAAATTGCCAGAATGGCGAAAATGATGGACGCGATGCTGAATAAGGGAGGGGTGCACCATGG ATAAAGTTTATGTAGAAGGTATGGAGTTTTACGGATATCACGGTGTGTTCACAGAAGAAAACAAACTTGG CCAGCGGTTTAAAGTCGATTTAACCGCTGAGCTGGATTTAAGCAAAGCTGGACAGACAGACGACCTTGAG CAAACGATCAACTATGCTGAGCTCTATCACGTATGTAAAGATATCGTGGAAGGGGAGCCTGTGAAATTGG TGGAAACGCTGGCGGAACGTATTGCTGGCACTGTTCTCGGAAAATTTCAGCCTGTTCAGCAATGTACGGT GAAAGTGATTAAGCCAGACCCGCCAATTCCCGGACACTATAAATCAGTAGCAATTGAAATTACGAGAAAA AAGTCATGAACAACATAGCTTATATTGCACTTGGATCTAATATTGGAGATAGAGAAACGTATTTAAGGCA AGCAGTGGCTTTACTGCATCAGCATGCTGCGGTGACAGTCACTAAAGTGTCGTCTATTTACGAAACTGAC CCGGTCGGATACGAAGATCAAGCTCAATTTTTGAATATGGCTGTTGAAATCAAGACATCATTGAACCCTT TTGAACTCCTTGAACTGACGCAGCAGATAGAAAATGAATTAGGCAGAACAAGGGAAGTAAGATGGGGGCC GCGGACGGCAGACCTTGACATTTTGTTATTTAATCGTGAAAATATTGAAACAGAGCAACTAATTGTTCCG CATCCGAGAATGTATGAGCGTTTGTTTGTCCTTGCGCCGCTTGCGGAAATTTGCCAGCAGGTTGAAAAAG AGGCTACAAGCGCCGAAACAGACCAAGAAGGTGTAAGAGTATGGAAGCAGAAATCTGGGGTAGACGAATT CGTGCATTCAGAAAGCTGAAAGGTTATACTCAAGAAGGATTTGCAAAAGCATTAGGTATATCAGTTTCTA TTCTCGGCGAAATTGAACGCGGAAACCGATTGCCGTCTGCTGCCATCATTCAAGATGCAGCAGATGTTTT AAATATAAGTGCGGACGAATTGGCGCCGCCAGAAAAATAGAACAAATGAAAGGAGGAGAAAAATTGTTCA AAATCGGAGATATTCAATTGAAAAACCGGGTTGTGCTCGCACCTATGGCTGGTGTCTGCAACTCTGCGTT CAGATTGACTGTAAAGGAATTCGGAGCCGGATTGGTATGCGCTGAAATGGTCAGTGACAAAGCGATCCTT TACAACAATGCAAGAACAATGGGTATGCTTTATATTGATGAACGTGAGAAACCACTGAGCCTTCAAATTT TCGGAGGAAAAAAGGAAACCCTTGTGGAAGCGGCGAAGTTTGTAGACCAAAACACAACTGCTGATATCAT TGATATTAACATGGGATGTCCCGTGCCGAAGATTACAAAATGCGATGCGGGAGCCAAATGGCTTCTCGAT CCTGATAAGATTTACGAAATGGTTTCTGCAGTAGTGGATGCTGTTAATAAGCCAGTTACAGTGAAAATGA GAATGGGCTGGGATGAAGACCACATTTTCGCAGTGAAAAATGCACAGGCTGTAGAACGTGCGGGCGGTAA AGCAGTGGCGCTTCACGGCCGTACGAGAGTGCAGATGTACGAAGGAACGGCAAACTGGGATATCATCAAA GAAGTAAAACAATCAGTATCGATTCCGGTTATCGGAAACGGCGATGTTAAGACACCGCAGGATGCTAAGC GTATGCTCGATGAGACAGGAGTAGACGGGGTCATGATCGGACGCGCTGCATTGGGTAACCCGTGGATGAT TTACCGTACGGTTCAGTATCTTGAAACAGGTAAATTAAAAGAAGAGCCGCAAGTACGCGAAAAAATGGCC GTATGCAAACTGCATCTTGACCGCCTGATTGACTTAAAAGGTGAAAACGTAGCGGTAAGAGAAATGAGAA AGCACGCTGCATGGTATCTGAAAGGCGTGAAAGGCAATGCGAACGTTCGTAATGAAATCAATCATTGCGA GACGAGAGAAGAGTTTGTACAGCTTTTAGATGCATTTACGGTTGAAGTTGAGGCAAAAGAGCTTCAAAAT GCAAAAGTAGGATAATACTCACCTCTATTTGCTGCTCACTGCTAGTTTTACGCTGGCAGTTTTTCTGCTT TTTTCATGAAACAATATCTGTAATGGAGTGATAACAATGAGTCAAGAAGAGCATAACCATGAAGAATTGA ATGATCAGCTGCAAGTCAGACGCGATAAAATGAATCAGCTGAGAGATAACGGCATCGATCCATTCGGCGC ACGTTTTGAAAGAACTCATCAGTCTCAAGAAGTTATTTCGGCATATCAAGATCTAACCAAAGAAGAGTTA GAAGAAAAAGCGATTGAAGTTACAATCGCAGGCCGCATGATGACAAAACGCGGCAAAGGAAAAGCCGGCT TTGCCCATCTTCAGGATTTAGAAGGCCAAATCCAAATCTACGTAAGAAAAGACAGTGTCGGTGACGACCA ATATGAAATCTTCAAGTCTTCTGACCTCGGTGATCTTATCGGCGTAACCGGAAAAGTCTTCAAAACAAAT GTAGGCGAATTGTCTGTTAAAGCAACTTCCTTTGAATTGCTGACAAAAGCGCTTCGTCCGCTTCCTGACA AATACCATGGTTTAAAAGACGTTGAGCAGCGCTACCGTCAGCGCTATCTGGATCTTATCGTAAACCCAGA CAGCAAACATACGTTCATTACACGAAGCAAGATCATTCAAGCTATGAGAAGGTACCTTGATGATCATGGA TACTTAGAAGTAGAAACACCTACAATGCACAGCATTCCTGGGGGAGCTTCTGCACGTCCGTTTATCACTC ACCACAACGCGTTAGACATTCCACTCTATATGCGTATTGCTATCGAACTGCACCTAAAACGTCTAATTGT CGGCGGTTTAGAAAAAGTATATGAAATCGGCCGTGTTTTCCGTAACGAAGGTGTCTCTACACGCCATAAC CCTGAATTTACAATGATTGAGTTATATGAAGCATATGCGGACTATAAAGATATCATGAGCTTAACTGAAA ACCTTGTCGCTCATATCGCCCAAGAAGTGCTTGGCACAACTACGATTCAATACGGGGAAGAGCAAATCGA CCTTAAACCGGAGTGGAAAAGAATCCATATGGTTGACGCAGTCAAAGAAGCGACCGGCGTTGATTTCTGG GAAGAGGTTACTGTTGAGCAGGCGCGTGAATATGCAAAAGAACATGAAGTAGAAATTAAAGACTCTATGA CAGTAGGCCATATCATCAACGAATTCTTCGAACAAAAAATTGAAGAAACGCTTATTCAGCCAACGTTTAT TTACGGGCATCCTGTAGAAATTTCTCCTCTTGCTAAGAAAAACCCTGAGGACCCGCGTTTTACAGACCGT TTTGAGCTGTTTATCGTTGGCCGTGAACATGCCAACGCGTTTACAGAGCTGAATGATCCTATTGATCAAA GAGAACGCTTTGAAGCGCAATTAAAAGAGCGTGAAGCCGGTAATGATGAAGCTCATTTAATGGATGAAGA CTTTGTTGAAGCTCTGGAATACGGTATGCCGCCAACAGGAGGTTTAGGCATCGGTATCGACCGTCTGGTT ATGCTGCTGACGAATGCCCCTTCTATTCGCGATGTGCTGTTATTCCCGCAAATGAGACAACGCTAATAAA AAAGAGCGGTATCCTCCATAGGGAAAGGATGCCGCTCTTTTTAAATCCCTTAGTATTTCTTCAAAAAAAC TATTGCACTATTATTTACTAGGTGGTATATTATTATTCGTTGCCGCTAAACAAGGCGATAACGAAAAAAA GAACTTCAAAAAAAGTTATTGACTTCACTGAGTCAACGAGTTATAATAATAAAGTCGCTTGAACGAAGTG AACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAATCGCACAG CGATGTGCGTAGTCAGTCAAACTAC*** début des 9aas, voir adresses*** TTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCG TGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGATGGGAGCTTGCTCCCTGATGTTAGCGGCGGACGGGTGAGT AACACGTGGGTAACCTGCCTGTAAGACTGGGATAACTCCGGGAAACCGGGGCTAATACCGGATGGTTGTT TGAACCGCATGGTTCAAACATAAAAGGTGGCTTCGGCTACCACTTGCAGATGGACCCGCGGCGCATTAGC TAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCAACGATGCGTAGCCGACCTGAGAGGGTGATCGGCCACACTG GGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTCCGCAATGGACGAAAGTCTG ACGGAGCAACGCCGCGTGAGTGATGAAGGTTTTCGGATCGTAAAGCTCTGTTGTTAGGGAAGAACAAGTG CCGTTCGAATAGGGCGGTACCTTGACGGTACCTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCG CGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTGTCCGGAATTATTGGGCGTAAAGGGCTCGCAGGCGGTTTCTTAAG TCTGATGTGAAAGCCCCCGGCTCAACCGGGGAGGGTCATTGGAAACTGGGGAACTTGAGTGCAGAAGAGG AGAGTGGAATTCCACGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATGTGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTC TCTGGTCTGTAACTGACGCTGAGGAGCGAAAGCGTGGGGAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCA CGCCGTAAACGATGAGTGCTAAGTGTTAGGGGGTTTCCGCCCCTTAGTGCTGCAGCTAACGCATTAAGCA CTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGACTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGA GCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCTCTGACAATCCTAGAGA TAGGACGTCCCCTTCGGGGGCAGAGTGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTT GGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGATCTTAGTTGCCAGCATTCAGTTGGGCACTCTAAGGTGA 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GTGGGATATGATGAAGGCGGTCAATTGACAGAGAAAGTCAGAAGAAAACCTTACTCTGTCGTGCTTCTTG ATGAGATCGAGAAAGCGCACCCTGATGTCTTCAATATCCTTCTGCAAGTTCTTGAAGACGGACGATTGAC TGATTCTAAAGGACGCACAGTCGATTTCCGCAATACCATTCTGATCATGACATCAAACGTCGGAGCAAGT GAGCTAAAACGCAATAAATATGTCGGCTTTAACGTTCAGGATGAAACTCAAAATCATAAAGACATGAAAG ATAAAGTGATGGGTGAATTAAAACGAGCGTTCAGACCTGAGTTCATCAACCGTATTGATGAAATCATTGT CTTCCATTCACTTGAGAAAAAACATCTCACTGAGATTGTGTCATTAATGTCTGATCAATTAACGAAACGC CTGAAAGAACAAGATCTTTCTATCGAATTGACAGATGCTGCAAAAGCGAAAGTCGCGGAAGAGGGCGTTG ACCTGGAATACGGTGCCCGTCCGTTAAGAAGAGCGATCCAAAAACATGTCGAGGATCGTTTATCTGAAGA ACTCCTCAGAGGAAATATTCATAAAGGACAGCATATTGTTCTTGATGTAGAAGATGGCGAATTTGTCGTA AAAACGACTGCTAAAACGAATTAATATAGAAGACGGAAATGAGGCATACAGCATGTAAGTGTATGCCTCA CTTTCATATCAAGAAATAGAACAAGGGAGAGGTCTTACACTATATATGGCTAAAACAAAATCGAAGTTCA TCTGCCAATCCTGCGGCTACGAGTCTCCAAAATGGATGGGGAAATGTCCGGGCTGTGGTGCTTGGAATAC AATGGTGGAAGAAATGATTAAAAAAGCACCGGCCAATCGGAGAGCGGCTTTTTCTCATTCTGTTCAAACT GTACAGAAACCTTCACCTATTACATCAATCGAAACATCAGAAGAACCCCGCGTCAAAACCCAGCTTGGCG AGTTTAACAGAGTACTCGGCGGAGGTGTCGTTAAAGGCTCCCTCGTTTTAATTGGCGGTGATCCTGGTAT CGGAAAGTCAACGCTATTACTGCAGGTTTCCGCTCAATTATCAGGCTCATCAAACAGTGTCCTGTATATT TCGGGAGAAGAATCTGTAAAGCAAACGAAGCTGCGAGCAGACCGTCTCGGCATTAATAATCCGTCACTGC ATGTTTTATCTGAAACCGATATGGAGTATATTTCGTCTGCTATACAAGAGATGAATCCATCGTTTGTCGT TGTTGACTCTATTCAAACGGTTTACCAAAGCGATATTACATCTGCTCCAGGCAGTGTGTCACAGGTCAGA GAATGTACCGCTGAGCTGATGAAAATTGCAAAAACAAAAGGTATTCCGATTTTTATCGTAGGGCACGTGA CGAAAGAAGGGTCTATTGCAGGTCCGAGACTGTTGGAGCATATGGTTGACACTGTTTTATATTTTGAAGG AGAACGCCACCATACTTTCCGTATTTTGCGGGCTGTAAAAAACCGTTTCGGATCTACAAACGAAATGGGC ATTTTCGAAATGCGGGAAGAGGGGCTCACTGAGGTTTTGAATCCTTCGGAAATTTTCTTAGAAGAACGCT CTGCTGGTTCCGCAGGCTCGAGTATCACTGCCTCTATGGAGGGCACTAGACCGATTCTCGTTGAAATTCA GGCACTCATCTCGCCAACAAGTTTTGGCAACCCAAGGCGTATGGCAACGGGAATAGACCATAACAGGGTT TCTCTGTTAATGGCTGTGTTAGAAAAAAGAGTTGGACTGCTGCTGCAAAATCAGGATGCTTATTTGAAAG TGGCTGGCGGCGTTAAGCTTGATGAACCGGCAATTGATCTTGCGATTGTGATTAGTATTGCATCAAGCTT TAGAGACACACCTCCAAATCCTGCAGATTGTTTTATTGGAGAAGTGGGATTAACCGGAGAAGTCCGGCGG GTTTCAAGAATTGAACAGCGTGTGAAAGAAGCGGCAAAGCTTGGTTTTAAACGCATGATCATACCCGCGG
bsu 7 6 5 aas
[modifier | modifier le wikicode]- Archive :
- Méthode: les séquences Fasta NCBI des aas sont indiquées par *** au début et à la fin de l'adressage. bsu adresses bsu gtRNAdb.
**************6aasr ********* CATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCAACGATGCGTAGCCGACCTGAGAGGGTGATCGGC CACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTCCGCAATGGACGAA AGTCTGACGGAGCAACGCCGCGTGAGTGATGAAGGTTTTCGGATCGTAAAGCTCTGTTGTTAGGGAAGAA CAAGTACCGTTCGAATAGGGCGGTACCTTGACGGTACCTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAG CAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCTTTGTCCGGAATTATTGGGCGTAAAGGGCTCGCAGGCGGTTT CTTAAGTCTGATGTGAAAGCCCCCGGCTCAACCGGGGAGGGTCATTGGAAACTGGGGAACTTGAGTGCAG AAGAGGAGAGTGGAATTCCACGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATGTGGAGGAACACCAGTGGCGAAGG CGACTCTCTGGTCTGTAACTGACGCTGAGGAGCGAAAACGTGGGGAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGT AGTCCACGCCGTAAACGATGAGTGCTAAGTGTTAGGGGGTTTCCGCCCCTTAGTGCTGCAGCTAACGCAT TAAGCACTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGACTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGC GGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCTCTGACAATCC TAGAGATAGGACGTCCCCTTCGGGGGCAGAGTGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGA GATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGATCTTAGTTGCCAGCATTCAGTTGGGCACTCTA 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CAGCATGAGCGGGATTTTTGGACTTGCCTTTTGGTAATCGTCTGTCAGTTGGACAGTTTGTTTTGTTGTT TTTACATTTTCTGCAAAAAGGATGATGCCTCCGAATTGATATTTCTTGACGAGGCTGGCGACTTCATCAT TCATTTTTGTAAGGGCTTGCGGAGAGGACTCGCCTTCCTTTTGCCAATTTCTAAAATCAGGCATCAGCAT CTGGCCGAGTTTTTCATCTAACGACATACGATTGACAATCTGATTGGCATCGATTGCACGTTTGGATGCA GAGGCTTCTGTCTGTCTGGCCCCGAAAAAGCATGAAAGAAAGAGAACGGCTGAAAGGATAAGCGGAAAGA CAGGTCTCATAGAAACTTCCTCCTATCGTCTAATCATTCACTCCATCGCTTCATAAATCGCGGTTATGAC ACTTCCATAACTGCCTGTTGGAAATTGGTCACCTTCAAAGACGTTCGGATTTTCTTCCGGATCAATAACT GGTGTATGCTTTTTATTTGTTAACAATGCGATGCCTAAATTGTATGCTGGATCAATAATTGTAACTGTCC CCGTCCAGCCGGTATGCCCGTAAGCATTTTCGCTGGCATGAGGGCCAAACATCCATTCCATGCTTTTACT TCCGTTCCGCCTCCAGCCAAGAGCGAATGTCGGATCTGTTGCTGAAGGTGCTGTAAACAGGTCGGCTGTT TTCTGATCAAATAAAGAAATGTTTCGGTATGAACCTTTGTTTAACATGACTTGCAGCAGTATGGCCATAT CATCTGCATTTGAGAACAATCCGGCATGCCCAGACACGCCGTCCATTGAGTAAAACGCTTTTTCGTCATG CACCTCTCCTTGCAGCGTGTTTGTGCGGATGTTAGGGAATTGAATAACGCCGTCACGTGTATTGCCCATG CGTTCAGTAGCTGCGAACTGTTTCGGTTTAAAGCCCTTTTGCAGCGGATTGTACAAGGTATGCTTCAGCC 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CGATTCCAGCTCCTAAACATGCTGTTAAAAACGGACGGCCAAGCGGCAGCGTGACTCCGAAAATAAGCGG TTCACCAATGCCGAGCAGTCCCGATGGAAGCCCGCCGGCGATTGCTTTCCTCAGTGTTGTTTTTTTCGTC TTCACGAAAACGGCAAAGGCCGCGCCTACCTGTCCTGCACCTCCCATAGCCAAAATAGGGAGCAGAGGAT CATTGCCAATTGAATTGATCAGTTCCATGTGCACAGGCGTCAAGCCTTGATGCAGTCCGGTTACGACGAG AGGAAGGAAGGTTGCGCCCAGAATAAAGCCCGCAGCGATGCCGCCGATGTCCAGGATGGACAGTAGGCCG GATGTAATAGCATCAGAAATGAATCCGCCTAAAGGCATAAATACGACATACGTTACGATTCCGGTGATTA ACAGTGAAACGGTGGGTGTGACAATGATATCAAGTGATTGAGGAATAAAACGGCGAATAAATTGTTCGGT GTAAGCAATGAATATGGCTGCGAAAAGGACGCCGATCAGACCTCCCCTGCCCGGGAGAAGCTCTTCTCCA AATAAACTGATTTTTGCGATCTCCGGATTGATAATCAAGATCCCGGCCAAAGCCCCAAGTGCGGGTGTCC CGCCAAATTCTTTCGAAGCGTTAATACCGACGAGAATGCCGAGATAAGTGAACAGCCCTGATCCGATGAC TGTCAGGATAATCGCAATTTGTGAGTCTGCAGAGAGCCAGCCTGCTTGAATAATTGCTTTGGTAATCCCA GTAATTAAACCGGAAGCGACTAGAGCGGGAATAAGAGGGATAAAAATGCTGGCAATTTTACGTAAGAAAA GTTTAAAAGGAGTGGCATTTTTCCGATTGATATCGGCTTTCTTTTTGGCCGCTGCTTCTTTGACATCGGC ACCTTCTTCTGCTGACACGAGCTTTGAGAAAGCAGCTGTAACATGATTGACAACTCCTGTGCCGAGGATA ATTTGTAAGGTTTCAGCTTCAACGACCCCCAATACGCCGTCAAGCTTTCTTAAAGCCTGAGCATCCGCTT TGCTTTCATCGTAAGGCGTAATGCGCAGGCGTGTCATGCAATGCGTATATGAAGAAATATTGGATTTTCC TCCGCATAGCTCAAGGATTTTCTGTGCGAGATGATGGTAGTTATTTTCTTTGCTCATTAAAACCCCTCCC CTTCAAGATGCCTTATTTTATTCTCATAGATTGTATGGCTGCTCTCGTTTTATCTATATAACCGGTTGTC GTTTCATACTGCTCAGCCGCCATGCCTAAAAACAAAACATCAATTATAAAAAGCTGGGCGAGGCGGGAAG AAGTGGCTGCACTTCGAATCAAGGCTTCATTGGAATGGGCTGTATACAAAGGGACATCAGCCAGTGCGGA GACGGATGTCTGACTGAATTGTGTGAGGCTGATCGTTGTGATGCCTTTTTCCTTAGCCATGGCGAACAGT TCAACGATTTCCTGTGTCTCTCCTGAAAACGAAATGGCGAATACGATGTCGTCTTTATCTGCATTTGCGA TTAAAGATGCCACAAGATGAGTGTCTGTAAACGCGGTTGCTTGTTTATGAATGCGAAGCCACTTTTGCTG GGCGTCCTTGGCGACAATGCCGGAAGCCCCGAGGCCGATAAAATGCACGGTATGAGCTTTGAGAAGCAGA GAAACCGCTCGTTCAAGCTCTTTGTAGTCCATCAGGTCTGAAGTATCCTGAATGGCTTGAATGGCATTGC CGGCCGTTTTTTCGGAAATGGAGGGCAGCGGCTCGTGGGGAACAATATCCCGGTAGCCCTGAAACGTAGG CTTTGCCAGATCGCCTGCTACTCTCATTTTTAAATCTTGAAATCCTTTTAAACCGAGTGATTTGCAGAGC CTGATGACGGCAGCGTCACTTGAATTGGCTAAGGCGCTGATTTCGTTGACCGTGCTTTCGATTGCTTTGT GGGGATGGGCTAGGATATAATCTGCAAGTTTGCGCTCGGATGGAGGGAGCTTATGCTTCATTGATTGGAT GATCGCTAAACCGCCTGTGGCCATTCTAGTTCTCTCCTTATCATGGATGGTAATGTTCGATTGCTTTGTC AATGAAACCGTTTGCTTCATCGAGTAATGTCTGTGCTTGTTTCTGATCTGTGCTTGTTTTGAGCATGACG ATTGCTGTTTTGACGTGATGATCGGCTTGTTCCAGAGTGTATCTGGCTGTGTCGTATGAAGCGTTTGTAA GGCTTTGGATGATGCTGATGGCGCGTTCTTTTAGTTTTTTGTTGCTGACGTTGACGTCTACCATCAAGTT TTCGTAAACCTTGCCGATTTTGACCATTACAGCGGTAGATATCATGTTTAGAATCATTTTATGAGCGGTT GCGGCTTTCATACGTGTTGATCCTGTAATGGCCTCAGGTCCGACGACAACCTCAATGCTGTGATCCGCAT CCTTGCTGATGGCGGAATTTTCATTGCAAGTAAGGGCGATGGTGTGTGCTCCGACTTTACGGGCGTATCT TAGGGCGCCTGCGGCGTAGGGTGTGCGGCCGCTTGCTGCGATGGCAATGACGGTGTCATTTGAAGTGAGC TGTATGTTTCTTAAATCTTCAGCTCCTGCTTCTTCACTGTCTTCAATGCCCTCTGCTGCCTGTAAAAAGG CTTCGGGGCCTCCAGCCATGATTCCGATGACCTGATCTGGGCTTACGCTGTAGGTGGGAGGACATTCAAC AGCATCCATGACGCCGAGTCTGCCGCTTGTGCCGGCGCCTGTATATATGAGCCGGCCTCCATTTTGAAAC GATTCATATGCGCAGTCTACAGCTGTTTTGATGTCGGGGAGAACCTCCTGAACGGCTGCAGCGACTTTCA TATCTTCGTTGTTGATCATTTTAAGGATGCCGAGAGTGTTTGCTTTGTGGATTTCAACTGTTTGACTATT 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AGAAGTTCAGGGCAAGCCATGACTGCTTTCTTTTCATCGACTAGTTTTCTGATTTTCTCCGACGCTGCGT GAGAGCCGTTATATCTGCATTCAATGCCTCCAAGGCAAGAACTGACTAGAATCATATTGGTTTCTCCTCT CTTGCTTTGCTTGTCTCTATCATAAAATAAATGGCTTTAGTTGGGAGGCTTTTTCAGTTAAAAAAGGAGT TAAAAAGTTTGAAAATAAAAAATTTAATTTTCCTCTTTACAAACAGGGGGTGACCTGTATATAATAACTT TTGTCAGCTCGACGAGAACACAAC*******début des 5aas, voir adresses********* GGCCCGTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAA CACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCACCATTTGGAGGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAA GCAGAGGGTCGGCGGTTCGAGCCCGTCATCCTCCACCATCTTGCCGGTGTAGCTCAATTGGTAGAGCAAC TGACTTGTAATCAGTAGGTTGGGGGTTCAAGTCCTCTTGCCGGCACTGTTTTTTCAAAATTTTATGTGGA GGGGTAGCGAAGTGGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCCTCAGGGTTCGGCAGTTCGAATCTGC CCCCCTCCACCATTATTGGGCTATAGCCAAGCGGTAAGGCAACGGACTTTGACTCCGTCATGCGTTGGTT CGAATCCAGCTAGCCCAG*******fin des 5aas, voir adresses********* TCACAGACACCTTTGATCAAAAGGTGTCTTTTTTCTTTTCGGAAAAATCATT CCAACTTCTAACTGTTCAGTCTGTATAATAATTTTAAAAATATGTTAAGGTAGTTTATTCACGAATTACC ATCTACACCCTGCCAAAAATTTGATAAACTTATTTTATAAAAAAATTGAAACCTTTTGAAACGAAGCTCG TATACATACAGACCGGTGAAGGCAGAGGTTAGATAAATATGGAAATGATGATTAAAAAAAGAATTAAACA AGTCAAAAAAGGCGACCAGGATGCATTTGCGGACATCGTAGATATTTACAAAGATAAAATTTATCAGCTT TGCTACCGTATGCTTGGCAATGTGCATGAGGCGGAGGATATTGCACAGGAAGCTTTCATCAGAGCGTACG TTAATATCGACAGTTTTGATATTAACCGGAAATTTTCAACTTGGCTTTATCGAATCGCGACCAATTTGAC CATTGACCGCATTCGCAAAAAGAAGCCGGATTATTACCTCGACGCAGAGGTGGCTGGTACGGAAGGCTTG ACCATGTATTCTCAAATCGTCGCAGATGGTGTTTTGCCTGAAGATGCAGTTGTATCGCTGGAGCTCTCAA ACACGATACAGCAGAAAATTTTAAAGCTTCCTGACAAATACAGAACAGTCATCGTATTAAAGTATATTGA CGAACTCTCATTAATTGAAATCGGGGAGATTCTAAACATTCCTGTGGGGACTGTGAAAACGCGGATTCAC AGAGGCAGAGAGGCTCTTAGAAAACAATTAAGGGATCTTTAAGTGGGGTGATGAAATGAGCTGTCCTGAA CAAATTGTGCAGCTTATGCATATGCATCTTGATGGAGATATCCTTCCAAAAGATGAACACGTATTAAATG AACATCTGGAGACATGCGAGAAATGCAGAAAGCATTTTTACGAGATGGAGAAATCCATAGCGCTCGTACG GAGCACATCGCATGTCGAAGCCCCCGCGGATTTTACCGCTAATGTCATGGCAAAATTGCCTAAGGAGAAG AAAAGAGCTTCTGTAAAAAGATGGTTCAGAACCCATCCCGTTATCGCAGCTGCTGCGGTATTCATCATTT TGATGGGCGGGGGTTTTTTTAACAGCTGGCATAATGACCACAATTTCAGCGTGTCCAAGCAGCCGAATCT TGTGGTTCATAACCATACTGTGACCGTGCCAGAAGGTGAGACGGTCAAAGGTGATGTCACTGTCAAAAAC GGCAAGCTGATTATTAAAGGCAAAATAGACGGGGATGTAACCGTCGTAAACGGCGAAAAGTATATGGCCT CTGCTGGACAAGTCACCGGTCAGATTGAAGAAATCAATCAGTTATTCGACTGGACATGGTACAAGATGAA GTCTGCGGGGAAAAGTGTACTCGATGCATTCAATCCGAACGGAGAAGAGTAAAGCGCGTTAGCCGCTTTG CTCTTTTTTTGCGGGCTGAGAGGGCTGGCACATTTCACTTGCTAAATCGAAATGTGGTATAATGGGCTCG CTATGTAAAGTACATATGCGTAACACGTAAAACACAAAATACGAAATGACTGAAATCTTGGAGGACGAGG AAATGGCTTTTGAGGATATCCCTTTTTTGCAGTACCTCGGCAATGCCGTTGATATTCTCCTTGTTTGGTA TGTGATATATAAATTGATTATGGTGATACGCGGCACGAAAGCGGTTCAGCTGTTAAAAGGAATTGTAGTC ATCGTGCTTGTTCGTATGGCCAGCCAATATTTGGGCCTCAGCACACTTCAATGGCTGATGGACCAAGCGA TAACATGGGGATTTTTAGCAATTATTATTATTTTTCAGCCTGAGCTGAGAAGAGCGCTTGAACAGCTAGG CCGCGGCCGCTTTTTTTCGAGGAGCGGCACGCCTGTTGAAGAAGCGCAGCAGAAAACGATTGAGGCCATT ACAAAAGCAATCAATTATATGGCGAAACGCCGTATAGGCGCCCTGCTGACCATTGAGCGGGATACTGGAA TGGGCGATTATATTGAGACCGGCATACCACTAAATGCCAAAGTCAGCTCTGAGCTGCTGATCAATATTTT 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GTGGAGCCCTCGGTCATCAAGATTACCGTTCCGGTGACAAGCCCGAGTAAAAAAGTGCCCTTTAAAATTG AACGGACAGGAAGCCTTCCTGACGGTGTCAGCATAGCGAATATTGAATCCAGCCCCAGTGAGGTAACGGT TTACGGCTCACAGGATGTGTTGGATTCTCTTGAATTTATTGACGGCGTCAGCCTAGATTTAAGTAAAATT AACAAGGATTCCGATATCGAGGCAGATATTCCGCTTCCTGACGGTGTCAAAAAAATCTCACCGTCAAAGG TGACTTTGCATATAGAAGTCGATAGTGAAGCGGATCAGAAGTTCGAGAATGTCCCTATCAAGACTGTAGG GCTGAGCAGCTCACAAAACATTGAATTTCTTGATCCTGAATCACAAGCGATAGATGTAACGGCTAAAGGC TCTCCCACGAATATAAATAAACTGAAAAAATCAGATATTGAATTGTATGTGAATGTTTCAGATTTAGAGG ACGGGGAGCATAGCGTGAAGCTTGAAGTGAACGGGCCACAGAATGTAACTTGGTCCTTGGGGCGGAAAAA CGCCAAAATCAAGCTGACGTCTAAGAAAAGCAATACATCAACGAATGATAACAGCAGCAATACATCAGGG AACCAGGACACAGATAAACAAACAAATGATCAAAAGAACAATCAGCAAGAAGATACAAAGAACACTGATA AAAACAACAACGATCAAAACCAAGACGGAAATAAAGATCAAAACCAAGATCAGGATGAGGATGAATCCAC TGCGAATTCACAATCCTCATCGGAATAAAAAAGGAGCGATTATAAAATGGGCAAGTATTTTGGAACAGAC GGTGTAAGAGGTGTCGCCAATAGTGAGCTTACACCTGAGCTGGCCTTTAAAGTCGGACGTTTCGGCGGTT ATGTGCTGACAAAAGACAAACAACGTCCAAAAGTGCTGATAGGCCGCGATACACGCATCTCCGGCCATAT GCTGGAGGGAGCCCTTGTCGCCGGACTTTTATCCATTGGCGCAGAAGTCATGCGCCTGGGTGTCATTTCT ACACCAGGTGTATCTTATTTGACAAAAGCGATGGATGCAGAGGCGGGCGTCATGATTTCCGCTTCTCATA ACCCAGTGCAGGATAACGGCATCAAATTCTTTGGGGGAGATGGATTTAAGCTTTCTGATGAACAGGAGGC TGAAATTGAGCGCCTGATGGACGAACCTGAGGATAAGCTGCCAAGACCTGTCGGAGCAGACCTTGGACTT GTAAACGATTATTTTGAAGGCGGACAAAAATATCTGCAATTCTTAAAACAGACAGCTGATGAAGATTTCA CAGGCATTCATGTGGCATTGGACTGTGCCAATGGCGCAACGTCATCCTTGGCGACACACCTGTTTGCTGA TTTAGATGCAGATGTTTCTACAATGGGGACTTCCCCGAACGGATTAAACATTAATGACGGCGTCGGTTCG ACTCATCCCGAAGCGCTCAGCGCGTTTGTCAAAGAGAAAAACGCGGATCTCGGTCTTGCGTTCGACGGTG ACGGCGACCGCCTGATTGCTGTCGATGAAAAAGGAAATATTGTAGACGGCGACCAAATCATGTACATATG CTCAAAACATCTGAAATCAGAGGGCCGTTTAAAGGATGATACAGTGGTTTCAACCGTGATGAGCAACCTC GGCTTCTATAAGGCGCTCGAAAAAGAAGGCATCAAAAGCGTGCAGACAGCTGTCGGCGACCGCTACGTAG TAGAAGCAATGAAAAAAGACGGCTACAACGTCGGCGGAGAGCAGTCAGGACATCTTATTTTCCTTGATTA CAACACGACAGGGGACGGATTATTGTCTGCTATTATGCTGATGAACACTTTAAAAGCAACAGGCAAGCCG CTGTCAGAGCTTGCAGCTGAAATGCAGAAGTTCCCGCAGCTGTTAGTCAATGTGAGAGTGACTGATAAAT ATAAAGTTGAAGAAAATGAAAAAGTAAAAGCAGTTATTTCTGAAGTTGAAAAAGAAATGAACGGCGACGG CCGGATTTTGGTGCGCCCTTCAGGAACTGAACCGCTCGTCCGTGTCATGGCTGAAGCGAAGACGAAAGAG CTGTGCGATGAGTATGTCAATCGCATTGTTGAAGTCGTCCGGTCAGAAATGGGATTAGAGTAACGAAGTC TATTATCAGAGAGTGAACAAGACAAGCGAGGTTTACATAAGATAATTGTGAGACATACGGCAAAGTTGCT TAAAAAACAATTGACCGTTTATGCCACATGTTGTAAAATCAAGCTTGTCTTGTTCTTATTTTCTCAATAG GAAAAGAAGACGGGATTATTGCTTTACCTATAATTATAGCGCCCGAACTAAGCGCCCGGAAAAAGGCTTA GTTGACGAGGATGGAGGTTATCGAATTTTCGGCGGATGCCTCCCGGCTGAGTGTGCAGATCACAGCCGTA AGGATTTCTTCAAACCAAGGGGGTGACTCCTTGAACAAAGAGAAATCACATGATCTTCCAAAAAACATGT AGGAGGGGACGATTGAAAGTCCCCTTGAAATTTGACTTTCTTCGTCTCCTTTTACAATCTTAGGAGGAAG AAAAATATGTGTGGAATCGTAGGTTATATCGGTCAGCTTGATGCGAAGGAAATTTTATTAAAAGGGTTAG AGAAGCTTGAGTATCGCGGTTATGACTCTGCTGGTATTGCTGTTGCCAACGAACAGGGAATCCATGTGTT CAAAGAAAAAGGACGCATTGCAGATCTTCGTGAAGTTGTGGATGCCAATGTAGAAGCGAAAGCCGGAATT GGGCATACTCGCTGGGCGACACACGGCGAACCAAGCTATCTGAACGCTCACCCGCATCAAAGCGCACTGG GCCGCTTTACACTTGTTCACAACGGCGTGATCGAGAACTATGTTCAGCTGAAGCAAGAGTATTTGCAAGA 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AGTTTACGTACTGCTCTGTCGGAAATGTACGGTTTATTCTGCATTCCCCGTCTGGTGAAAGCTTTTATCC TCTGCCGATTTCGGGCTATTTATCAGGCAAGCCGCAAAAATACAAAACGCACACCGCCACCTATGAAAAG GGTTCAAAGTTCATTATACATACAGATGGACTCAACGTACCTGATATCCGCTCCCATTTGAAAAAAGGCC AATCGGTAGAAGAAATATCGAATTCGCTGAAAATGTATACGACATCGAGAAAAGATGACCTGACCTATAT TCTCGGACAGCTGTCCTAAAAAACCAGAAAAAGAAGCTGGACATCCGGCTTCTTTTTTTTGCGGTTGACT ATTAATAAGTGCGCTTATTATAATTAATAAGTGAACTTATCATTCTGGGAGCTTATGGGATGTGGAATTA TGAATACACAGCGATAGCTGATGTGGATGTGGGAAAACCTGGAACTGTTATCAGGAAACAGAAACAATGG ATCAATGGGAGACGGGTATTGCATCAGATTCTTTGAAAGGACAATTTCAAAATGGAACGGAAGGAACATT GCTTCTGCAAGGAAAAACAATTCTCTTATGGCTTGAGCATGTGGAGAAACATCGGGCGTTTTCTGTCATG GTCAACATGCCCGCATAGCAATGTAATAATGGAGTTTTTTCACGTGCTTCAAAAGCAAAAAGAAGATTTG TGTATCACATATGGAATTGTATTAGAAGGCGCTGAAGCAAAAAAGTGGGGAGAAATCATTGGGACTGAAC TGTCTAAAGACATGCCGACGGCTGTCAGCAGGCTTGTCCATCTTTACGGAGGAGTGATAAAATGAACACA AATTACTGGATCGGCGTTGTGTCAGAGCAACATGTATTAAAAGGCGCTGCCGGCGGTTTTGCACAGCTGT GCCATGGAAAAAAAGCCCCGCTCGCCAAAATGAAAGAGGGAGATTGGCTGATTTATTATTCTCCGAGAGA 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ATTTCTGAACGCTGGCAATACATACAAAACCTGAATCAGCGAAAAGAAGAAGTCATCAGGCTGATTGCAG AGCAGGATAAACTGACAGATAATCTAAAACGTAAAATCGAGCAATCGGTGAAGCTTCAGGAAGTGGAAGA CCTTTACCGCCCTTATAAACAAAAACGTAAAACAAAGGCGACAGTCGCCAAAAGCAAAGGCCTTGAGCCG CTTGCCGACTATATCCTGACACTTCCCCAAGATGATCATCTGGCAGCAACTGCAGACCAATACATCAGCG AAGAAAAAGAAGTGTTCACACGAGAAGAAGCGATTGAAGGCGCCAAGCACATTATTGCGGAACAAATCTC AGACGAGCCGACCTTCAGAAAGTGGATTCGCCAGGAAACCTTCAAAAGAGGAACCATTAAGTCTGCAGCC GGAAAGTCGGCAGACACCGATGAGAAAAATGTGTATGAAATGTATTACGAGTATGAAGAGCCAATTGCAA AAGTTGTTCCGCATAGGGTGCTGGCAATGAACCGCGGCGAAAAAGAAGACATTTTAAAGGTAGCGATCGA ACCGCCTGCGGATCACATTAAGGCGTATTTAGAAAAACAAATCATCAAAAATCGCTCAACATCCGTAAGA GAGATTTTGCAGGAGACAATTGAAGACAGCTATAAAAGGCTGATCCAGCCGGCAATCGAGCGTGAAATCA GGAAAGAGCTCTCAGAAAAAGCTGATGAACAGGCGATTCATATTTTCTCAGAGAACTTGAGAAAGCTTCT TTTGCAGCCGCCGATGAAAGGCAAAACCGTTCTCGGTGTTGACCCAGCCTTTCGAACTGGCTGTAAGCTC GCTGTGTCAGATGAGACCGGAAAAGTCTTGAAAATTGATGTGATCTATCCGCATGCGCCAGTCAACAAAA CAAAAGAAGCCCATGAAAAAGTGAAAAAGATTCTTGAGCAGTATCAAGTCGAGATGGTGGCGATCGGAAA 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TTGGAGAAGTACTCAAGTGGCTGAAGAGGCGCCCCTGCTAAGGGTGTAGGTCGCGTAAGCGGCGCGAGGG TTCAAATCCCTCCTTCTCCGCCATAAGATTTCGATATAAGTTCTCAACCATCGGCCCGTTGGTCAAGCGG TTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCATTCCATTTCGTTGGGC TATAGCCAAGCGGTAAGGCAACGGACTTTGACTCCGTCATGCGTTGGTTCGAATCCAGCTAGCCCAGCCA TTTTTATTTTTGAAATCTAATAGTAAGAGCCATTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGAG GGTCGAAGGTTCGAGTCCTTCATGGCTCACCATTTGTCTTTTTGCGGGTGTGGCGGAATTGGCAGACGCG CTAGACTTAGGATCTAGTGTCTTACGACGTGGGGGTTCGAGTCCCTTCACCCGCACTTTATTTACAAAGT GCACGCAAATCTGTTTTACTAGGTTAAGAGCCTACTAAACCAGCACAACACAATTTAATGATCACGCGGT CGTGGCGGAATGGCAGACGCGCTAGGTTGAGGGCCTAGTGGGTGAATAACCCGTGGAGGTTCAAGTCCTC TCGGCCGCA*******fin des 7aas, voir adresses********* TCAATGATACCAAGGGTTTTGACACCCTTGGTATTTTTTTGTGTTTATTTTCAAATGATTT ACTGCCCACAAACTGCCCACTTACCTAAAGTAAGTCATCTAATTTATCAGCCATTTCCTTTTGCTTGTTT GGATATAGGTGTCCATAAACATCAATTGTTGTTTTTACAGAACCATGTCCTAAACGCTCTTTAATTGTTA TGTAATCTTCTCCTTGGTGTATTAATAGTGCAACGTGTGAATGTCTAAAATCATGTAAACGTATAGGAGT AAGATCGCTATCCTTGCAAAAGTATTTAATTTTCCGACTGAAAATATCTTTTCTTGAAGGTGTATCTTTA TATTGAAAGATATAGGTATCATGTGAATGTCTAATACCTAATTCATTAAACAACTCTTCTTGTGCTTCTT TCCAACGTTCTAGTAGCTTAAGCAATTTTTTATTGATGCTAACTCGCCGAATCGAATTTTTAGTTTTTGG AGTAGTAACAACAAATTGACCATCAAGCCAGGTGCACGATTTATGCACATCTATTTCTAATAAGATTTTG TCAATATCTTTCCATTGCAGGGCGAGCATTTCACCACATCTTAGTCCAGTTAAAAAAGCAACAGTGTAAA AGGTTTTAAACAATAATTGATCTTGAGGAATTAAACTAATAAATTTTTTGAATTCTTCTGGTCTCCAAAA CTTCATTTTCTTTCTTGTTAAAGGTAATCGTTTAACGTTGTCACACGGATTTCTTTTTAAGATTTCTTCA TGTACAGCTGTATCAAAAATTTTGCTTAGACTAGTCATTATATTATTAACCGATTTATTGCTTAGACCTG TTTCCATTAAATGTTTTCTGAAATCAGTTATTTCTCTATGTGTGATTTTTTGTATATCAGATTTCAAAAA GTAATCAGATATATGTTTGTTTATAATGTACTTCTGATTCTGATAATAGTTTGGTTTACTATCTATTTCA CAACTTGCTAAATAAATTGAAATTAGAGTCGGAAAGCTTACTGATCTGGACTTTCTTGCTCTTTCTTCTT GAAATTCTCTTCTTAATTTTGCTTCTAATTCTAAAGCCTCTTTTCTGGTTGATGCTACTGGTCTCGTCCT AATTCTTTCTCCAGTAATCGGGTCAAATCCAAAGCTAACGTCAACTTGATATTGACCATTTTCAAGTTTT TTTACAGACATTTTATTTCTCCTTTAACCAAAAGCGCTTATTTCGTGTGAATAGATTCTGTTACTAAATG AGCCAATTTGAGAAAGTTTATAATCAGTAACAAATGATGGTACGTTGAAGTATGCTGCTATTTGTTCTTT GCTAAAACCCTGTATATATGGAAGGGCTTCATTAAGCATTTTATCTGTCAGTATTAATTCTGATGCAAAT AGGCTTGCTTGATGCTCAAGTTTATCTTTTAGAACTTTAGAGCAATTCACAACTTTAAAAGTGTTCAATC TTTTATGGAGAAAGTAATGCCCTAATTCATGGGCAATTACAAATTGTTGATGTTGGAGGTTCTCGTTGAT ATGGATTAAATATTGATCTGTGGCTTTGTCATGTTGTAGTAAACCGTTTGCTTGTCCAAGATCATTTTTG AGTATATAAATTTTTTGGATGTCACAAATTTCATAGACATTATTTGTACCATGTGTCTTAATTACTGATT GCACTTTATGTTTAATTCCTTTGCTTGTATAAATTGTTATCACTCTTTCTTCTTTAATTCGTCAATGAAT TTAATTCCGTTTTTTAATGCTTTTTTAACAAGGCGTGCAGTTTCCTCATCAAATTCACCATCATTCATAA AAAGGAGTGTATCTTCATCCTTTAATTCCTGTATGGCTTCATTAATTGTTTTATTGAGTAAATCAGTTTC GTTTTTCTTGCTTACTTCATCCTTTCCTAATAAATAGTCTGTAGATACGTTATATAAGTTGCTCAATTTT AAGAGTGTGTCTGTATCAGGATCTCTGTAATCTCTTTCGTAATTAGACAAGTTATTGTTACCGATATTAA GTTTCTCTGCGGCTTCTTTCTGAGTGTACCCAGCTTTTTGTCGAGCTTCTTTTAATCGTTTGCCTAGGCT CATTTTTATCATCCATTTCACAAAGAGTTGATTTTTATAAAAATAATAACAACATTTTTTGGAGAATTCA TTAATTTCACCTATAAGTTAAATAAATAATTCTAAATTCTCCTTTTAGGAGTGTTTGTTTCTTCTTTATG 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>Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Arg-ACG-1-4 (tRNAscan-SE ID: chr.trna70) chr:3173138-3173214 (-) Arg (ACG) 77 bp Sc: 79.3 GCGCCCGTAGCTCAATTGGAtAGAGCGTTTGACTACGGATCAAAAGGtTAGGGGTTCGAC TCCTCTCGGGCGCGCCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Arg-CCG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna62) chr:3545889-3545964 (-) Arg (CCG) 76 bp Sc: 66.1 GCGCTCGTAGCTCAGTTGGAtAGAGCGGTGGTTTCCGGTACCACGTCTGtCGGGGGTTCG AATCCCTCCGAGCGCG >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Arg-CCT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna86) chr:2003276-2003348 (-) Arg (CCT) 73 bp Sc: 69.2 GCTCTAGTAGCACAGCGGAtAGTGCAGCAGTTTCCTAAACTGCAGGtCGGGAGTTCGAAT CTCTCCTAGAGCG >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Arg-TCT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna85) chr:2899816-2899889 (-) Arg (TCT) 74 bp Sc: 77.5 GTCCCAGTAGCTCAGCTGGAtAGAGCAACGGCCTTCTAAGCCGTCGGtCGGGAGTTCGAA TCTCTCCTGGGACG >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Asn-GTT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna39) chr:951582-951656 (+) Asn (GTT) 75 bp Sc: 83.0 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>Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Gly-TCC-2-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna36) chr:635200-635273 (+) Gly (TCC) 74 bp Sc: 81.1 GCGGGTGTAGTTTAGTGGTAAAACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGtCGTGAGTTCGATTCT CATCACCCGCTCCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Gly-TCC-2-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna55) chr:967065-967138 (+) Gly (TCC) 74 bp Sc: 81.1 GCGGGTGTAGTTTAGTGGTAAAACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGtCGTGAGTTCGATTCT CATCACCCGCTCCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-His-GTG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna79) chr:3172331-3172406 (-) His (GTG) 76 bp Sc: 69.7 GCGGTTGTGGCGAAGTGGTtAACGCACCAGATTGTGGCTCTGGCATtCGTGGGTTCGATT CCCATCAATCGCCCCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-His-GTG-2-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna49) chr:952495-952570 (+) His (GTG) 76 bp Sc: 67.7 GCGGTTGTGGCGAAGTGGTtAACGCACCAGATTGTGGCTCTGGCACtCGTGGGTTCGATT CCCATCAATCGCCCCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Ile-GAT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna81) chr:3172155-3172231 (-) Ile (GAT) 77 bp Sc: 89.8 GGGCCTGTAGCTCAGCTGGTtAGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAGGtCGATGGTTCGAG TCCATTCAGGCCCACCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Ile-GAT-2-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna1) chr:11464-11540 (+) Ile (GAT) 77 bp Sc: 89.6 GGGCCTGTAGCTCAGCTGGTtAGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAGGtCGGTGGTTCGAG TCCACTCAGGCCCACCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Ile-GAT-2-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna4) chr:31932-32008 (+) Ile (GAT) 77 bp Sc: 89.6 GGGCCTGTAGCTCAGCTGGTtAGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAGGtCGGTGGTTCGAG TCCACTCAGGCCCACCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Ile2-CAT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna74) chr:3172793-3172869 (-) Ile2 (CAT) 77 bp Sc: 87.3 GGACCTTTAGCTCAGTTGGTtAGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCGGtCGTAGGTTCGAG TCCTACAAGGTCCACCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Leu-CAA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna54) chr:953213-953294 (+) Leu (CAA) 82 bp Sc: 57.2 GCCGGTGTGGCGGAATTGGCaGACGCGCACGACTCAAAATCGTGTTCCTTCTGGAGTGTC GGTTCGACCCCGACCACCGGTA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Leu-CAG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna67) chr:3173404-3173490 (-) Leu (CAG) 87 bp Sc: 68.5 GCGGATGTGGCGGAATTGGCaGACGCGCTAGAATCAGGCTCTAGTGTCTTTACAGACGTG GGGGTTCAAGTCCCTTCATCCGCACCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Leu-GAG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna34) chr:529336-529419 (+) Leu (GAG) 84 bp Sc: 56.9 GCGGTCGTGGCGGAATGGCaGACGCGCTAGGTTGAGGGCCTAGTGGGTGAAtAACCCGTG GAGGTTCAAGTCCTCTCGGCCGCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Leu-TAA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna53) chr:952859-952947 (+) Leu (TAA) 89 bp Sc: 77.7 GCCGGGGTGGTGGAATTGGCaGACACACAGGACTTAAAATCCTGCGGTAGGTGACTACCg TGCCGGTTCAAGTCCGGCCCTCGGCACCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Leu-TAA-2-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna13) chr:95861-95946 (+) Leu (TAA) 86 bp Sc: 70.8 GCCGGGGTGGTGGAATTGGCaGACACACAGGACTTAAAATCCTGCGGTAGGTGACTACCg TGCCGGTTCAAGTCCGGCCCTCGGCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Leu-TAA-2-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna69) chr:3173224-3173309 (-) Leu (TAA) 86 bp Sc: 70.8 GCCGGGGTGGTGGAATTGGCaGACACACAGGACTTAAAATCCTGCGGTAGGTGACTACCg TGCCGGTTCAAGTCCGGCCCTCGGCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Leu-TAG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna33) chr:529174-529255 (+) Leu (TAG) 82 bp Sc: 70.1 GCGGGTGTGGCGGAATTGGCaGACGCGCTAGACTTAGGATCTAGTGTCTTACGACGTGGG GGTTCGAGTCCCTTCACCCGCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Leu-TAG-2-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna11) chr:95649-95731 (+) Leu (TAG) 83 bp Sc: 66.4 GCGGGTGTGGCGGAATTGGCaGACGCGCTAGACTTAGGATCTAGTGTCTTTAtGACGTGG GGGTTCAAGTCCCTTCACCCGCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Lys-TTT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna10) chr:95567-95642 (+) Lys (TTT) 76 bp Sc: 92.2 GAGCCATTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGGGtCGAAGGTTCGAGT CCTTCATGGCTCACCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Lys-TTT-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna32) chr:529087-529162 (+) Lys (TTT) 76 bp Sc: 92.2 GAGCCATTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGGGtCGAAGGTTCGAGT CCTTCATGGCTCACCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Lys-TTT-1-3 (tRNAscan-SE ID: chr.trna66) chr:3173501-3173576 (-) Lys (TTT) 76 bp Sc: 92.2 GAGCCATTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGGGtCGAAGGTTCGAGT CCTTCATGGCTCACCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Lys-TTT-1-4 (tRNAscan-SE ID: chr.trna58) chr:4155134-4155209 (-) Lys (TTT) 76 bp Sc: 92.2 GAGCCATTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGGGtCGAAGGTTCGAGT CCTTCATGGCTCACCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Met-CAT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna6) chr:70181-70257 (+) Met (CAT) 77 bp Sc: 72.8 GGCGGTGTAGCTCAGCTGGCtAGAGCGTACGGTTCATACCCGTGAGGtCGGGGGTTCGAT CCCCTCCGCCGCTACCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Met-CAT-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna73) chr:3172872-3172948 (-) Met (CAT) 77 bp Sc: 72.8 GGCGGTGTAGCTCAGCTGGCtAGAGCGTACGGTTCATACCCGTGAGGtCGGGGGTTCGAT CCCCTCCGCCGCTACCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Phe-GAA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna45) chr:952131-952206 (+) Phe (GAA) 76 bp Sc: 89.6 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(tRNAscan-SE ID: chr.trna71) chr:3173046-3173122 (-) Pro (TGG) 77 bp Sc: 85.2 CGGGAAGTAGCTCAGCTtGGTAGAGCACATGGTTTGGGACCATGGGGtCGCAGGTTCGAA TCCTGTCTTCCCGACCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Ser-GCT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna29) chr:528783-528873 (+) Ser (GCT) 91 bp Sc: 81.0 GGAGAAGTACTCAAGTGGCtgAAGAGGCGCCCCTGCTAAGGGTGTAGGTCGCGTAAGCGG CGCGAGGGTTCAAATCCCTCCTTCTCCGCCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Ser-GCT-2-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna83) chr:3171976-3172066 (-) Ser (GCT) 91 bp Sc: 79.1 GGAGAAGTACTCAAGTGGCtgAAGAGGCGCCCCTGCTAAGGGTGTAGGTCGTGTAAGCGG CGCGAGGGTTCAAATCCCTCCTTCTCCGCCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Ser-GGA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna40) chr:951662-951753 (+) Ser (GGA) 92 bp Sc: 78.1 GGAGAGCTGTCCGAGTGGTcgAAGGAGCACGATTGGAAATCGTGTAGGCGGTCAAcTCCG TCTCAAGGGTTCGAATCCCTTGCTCTCCGCCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Ser-TGA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna75) chr:3172694-3172786 (-) Ser (TGA) 93 bp Sc: 81.7 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>Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Thr-TGT-2-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna25) chr:194363-194435 (+) Thr (TGT) 73 bp Sc: 77.3 GCCGGTGTAGCTCAATTGGTAGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAGGtTGGGGGTTCAAGT CCTCTTGCCGGCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Thr-TGT-2-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna46) chr:952212-952284 (+) Thr (TGT) 73 bp Sc: 77.3 GCCGGTGTAGCTCAATTGGTAGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAGGtTGGGGGTTCAAGT CCTCTTGCCGGCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Trp-CCA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna48) chr:952397-952470 (+) Trp (CCA) 74 bp Sc: 74.1 AGGGGCATAGTTTAACGGTAGAACAGAGGTCTCCAAAACCTCCGGTGTGGGTTCGATTCC TACTGCCCCTGCCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Tyr-GTA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna26) chr:194458-194542 (+) Tyr (GTA) 85 bp Sc: 78.0 GGAGGGGTAGCGAAGTGGCtaAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCCTCAGGGTtCGGC AGTTCGAATCTGCCCCCCTCCACCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-Tyr-GTA-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna47) chr:952307-952391 (+) Tyr (GTA) 85 bp Sc: 78.0 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(tRNAscan-SE ID: chr.trna64) chr:3173722-3173797 (-) Val (TAC) 76 bp Sc: 86.5 GGAGGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGtCGGCGGTTCGAGC CCGTCATCCTCCACCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-fMet-CAT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna37) chr:640268-640344 (+) fMet (CAT) 77 bp Sc: 84.8 CGCGGGGTGGAGCAGTTcGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAGGtCGCAGGTTCAAA TCCTGCCCCCGCAACCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-fMet-CAT-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna43) chr:951954-952030 (+) fMet (CAT) 77 bp Sc: 84.8 CGCGGGGTGGAGCAGTTcGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAGGtCGCAGGTTCAAA TCCTGCCCCCGCAACCA >Bacillus_subtilis_subsp_subtilis_str_168_tRNA-fMet-CAT-1-3 (tRNAscan-SE ID: chr.trna76) chr:3172600-3172676 (-) fMet (CAT) 77 bp Sc: 84.8 CGCGGGGTGGAGCAGTTcGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAGGtCGCAGGTTCAAA TCCTGCCCCCGCAACCA
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[modifier | modifier le wikicode]lmo 21aas
[modifier | modifier le wikicode]- Méthode: les séquences Fasta NCBI des aas sont indiquées par *** au début et à la fin de l'adressage. lmo adresses lmo gtRNAdb.
lmo 18.04.19 21aas CACCGAAGCAGTCGTTAATTTAAACGAATAAACCGCATCATTTAAATATTTTTCCCATCTAGCTTGCTTC AGCGGCAAACCTTCACGTAAAGCCGGCTCATCGACTTGAATCACTTTAATACCATTACGTTCTAAGGCTT CTACTTCTTTACGTAACGCGAGTCCAACTTGATTCGCAACAACACTTTCAGGCACATCATCACGAACAAA ACTCCAGTTGATGATTGTTACTGGCGCAGTGAGCATCCCTTTGACCGGACGTTTCGTTAACGACTGGGCA TAGACACTTTCTTTCACCGTAATTTCTTCTGTAAAAGCAACATCTCCGTAGATAAGCGGCGGACGAACTG CTCTCGAACCGTATGATTGCACCCAACCAAATTTCGTTGCTTGGAAACCAGCCAATTTCTGCCCGAAATA TTCTACCATGTCTGTCCGTTCAAATTCGCCGTGGACCAATACATCAATATCTAATTCCTCTTGAATTTTA ATCCAGCGCGCCGTTTCTTTTTCAATAAAAGCATTATATTCCGCATCCGTAATATTACCTTTTAACCAAT CAGCCCGAGTCTTCCGCACTTCCGGCGATTGTGGGAAACTTCCGATTGTCGTTGTTGGAAATAGCGGTAA ATTCAACCAAGCATGCTGCAATTTAATCCGTTCCGCAAATGGCAACTCTCGGTCAACCCGAACATTTCCC AAATTCGCAATCGCTTCTTGTACTTCTAAATTATTTCGATGACTTGATTCATTGAGCGCCGTCACTGCCG CACGAGCATCTTCCAGTTCAGCTGTCACACTTTCCGCACCATCCGTCAAAGCCTTCGTCAAAATAGCAAT CTCGTCTAATTTCTGATCAGCAAACGATAAACCACCGAGAATCACTTCATCCAAATCTGGTTCGCTCAGT 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ACCAGCTGAGCTATAGGCCCCAGTAAAACTATATTCATGGTAAAAAGCGGGTGATGGGAATCGAACCCAC GACAACAGCTTGGAAGGCTGTAGTTTTACCACTAAACTACACCCGCATAATATAATTTTAAAAACAAAGG GCGGATAATGGGAATCGAACCCACGAATGCCTGAACCACAATCAGGTGCGTTAACCACTTCGCCATATCC GCCATAAGGCAAAAATGTTTAAAAAAAGAATGGCTTGGGACAGAATCGAACTGCCGACACCTTGAGCTTC AATCAAGTGCTCTACCAACTGAGCTACCAAGCCATAATGGCGGTCCCGACGGGATTTGAACCCGCGATCT CCTGCGTGACAGGCAGGCATGTTAACCCCTACACCACGGAACCACTATTGCGGGGGCAGGATTTGAACCT ACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGACTGCTCCACCCCGCGACAATAATATTAAATTTTA GTCCACATATCACAAGTGAAAAACGGAGGAAGAGGGATTCGAACCCCCGCGCGGTATTACCCGCCTGTCG GTTTTCAAGACCGATCCCTTCAGCCAGACTTGGGTATTCCTCCATGATAATAATAAAGTGACAAGTGGAC CTTGCAGGACTCGAACCTGCGACCGGACGGTTATGAGCCGTCTGCTCTAACCAACTGAGCTAAAGGTCCA AGATTGAAAATAGCGGCGGAGGGAGTCGAACCCACGACCTTTCGGGTATGAACCGAATGCTCTAGCCAGC TGAGCTACACCGCCATAATAATAAGGCAACTATTTTCTACTTAAATGTGAAACAAGTGGAGCCTAGCGGG ATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTAAGGCCCCTTAATAATAAG GGATTAAACTATCGGGAAGACAGGATTCGAACCTGCGACCCCTTGGTCCCAAACCAAGTGCTCTACCAAG CTGAGCTACTTCCCGTTTAATAAAGTGCGCCCAAGAGGAGTCGAACCTCTAACCGCTTGATTCGTAGTCA AGTACTCTATCCAGTTGAGCTATGGGCGCAAATATAAGTGCCGAGGACCGGAATCGAACCGGTACGGATA TCACTATCCGCAGGATTTTAAGTCCTGTGCGTCTGCCAGTTCCGCCACCCCGGCGTTGCTATAAAATATG GAGCGGAAGACGGGGTTCGAACCCGCGACCCCCACCTTGGCAAGGTGATGTTCTACCACTGAACTACTTC CGCATATTCCATAATAAGTGCGGGTGAAGGGACTTGAACCCCCACGCCTCGCGGCGCCAGATCCTAAATC TGGTGCGTCTGCCAATTCCGCCACACCCGCAAAAGTGAGCCGTGCTGGGTTCGAACCAGCGACCCTCTGA TTAAAAGTCAGATGCTCTACCAACTGAGCTAACGGCTCTCTACAATAAAAAATATGTATTATTATAAAGT TAATATTAATGGTGCCGGCTGCAAGAGTCGAACTCGCGACCTACTGATTACAAATCAGTTGCTCTACCAA CTGAGCTAAGCCGGCATAAAAAATGGAGGTTAACGGGATCGAACCGCTGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGA TGCTCTCCCAGCTGAGCTAAACCTCCAGAAATACTGCCCGGCAGCGACCTACTCTCGCAGGGGGAAGCCC CCAACTACCATTGGCGCAGAGAAGCTTAACTACCGTGTTCGGGATGGGAACGGGTGTGACCTTCTCGCCA TAACTACCAGACAATATTGAAGTTGTTGAAAGATTGCTCTCTCAAAACTAGAGAAGAAAGTGTTCAGTTA GGTAACTTCGTTTCATTTTTTGGTTAAGTCCTCGATCGATTAGTATTTGTCCGCTCCATGTATCGCTACA CTTCCACTCCAAACCTATCTACCTGATCATCTTTCAGGGATCTTACTTTCCGAAGAAATGGGAAATCTCA 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CTATCTCCAAGTTCGATTGGAATTTCTCCGCTACCCACACCTCATCCCCGCACTTTTCAACGTGCGTGGG TTCGGACCTCCAGTAAGTATTACCTTACCTTCATCCTGGACATGGGTAGATCACCTGGTTTCGGGTCTAC GACCTGTTACTTATGCGCCCTATTCAGACTCGCTTTCGCTACGGCTCCGCTTTTTCCGCTTAACCTTGCA ACAAATCGTAACTCGCCGGTTCATTCTACAAAAGGCACGCTATCACCCATTAACGGGCTCTAACTACTTG TAGGCACACGGTTTCAGGAACTGTTTCACTCCCCTTCCGGGGTGCTTTTCACCTTTCCCTCACGGTACTG GTTCACTATCGGTCACTAGGGAGTATTTAGCCTTGGGAGATGGTCCTCCCGGATTCCGACGGAATTTCAC GTGTTCCGCCGTACTCAGGATCCACTCTGGAGGGAAAGCCATTTCAACTACCGGGCTGTTACCGTCTTTG GCGGGCCTTTCCAGACCGCTTCATTTATAACTTTCTTTTGTAACTCCGTATAGAGTGTCCTACAACCCCA AGAAGCAAGCTTCTTGGTTTGGGCTCTTTCCGTTTCGCTCGCCGCTACTCAGGAAATCGATTTTTCTTTC TCTTCCTCCAGGTACTTAGATGTTTCAGTTCCCTGGGTCTGCCTTCCTCACGCTATGTATTCACGTAAGG ATACTATCCGACTAAAGATAGTGGGTTCCCCCATTCGGAAATCTCTGGATCAACGCTTACGTACAGCTCC CCAAAGCATATCGGTGTTAGTCCCGTCCTTCTTCGGCTCCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTT CTAACTTAACCAATTTACTTCTACGAAGTAAAGGTTGTTTTTCTGATTTTCCGTATCAGCGATGATACAT CCAATCAGATGAAAGATTCACTTTCAGATGATTCTCGGTTACTTGTGTCATAAATAATAAATTATCTATG CTAACTTTACTAACTTTCTTATCTAGTTTTCAAAGAACAAACATACTGAGAAGTACTAACCTCTCAAAAC TGAACAAATAGAGAAGAACGAAAACTCACAGGTTTCCTTTTCCTTAGAAAGGAGGTGATCCAGCCGCACC TTCCGATACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATTATCTGTCCCACCTTCGGCGGCTGGCTCCATAA AGGTTACCCTACCGACTTCGGGTGTTACAAACTCTCGTGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCGGGA ACGTATTCACCGTGGCATGCTGATCCACGATTACTAGCGATTCCGGCTTCATGTAGGCGAGTTGCAGCCT ACAATCCGAACTGAGAATAGTTTTATGGGATTAGCTCCACCTCGCGGCTTCGCGACCCTTTGTACTATCC ATTGTAGCACGTGTGTAGCCCAGGTCATAAGGGGCATGATGATTTGACGTCATCCCCACCTTCCTCCGGC TTGCACCGGCAGTCACTTTAGAGTGCCCAACTAAATGCTGGCAACTAAAATCAAGGGTTGCGCTCGTTGC GGGACTTAACCCAACATCTCACGACACGAGCTGACGACAACCATGCACCACCTGTCACTTTGTCCCCGAA GGGAAAGCTCTGTCTCCAGAGTGGTCAAAGGATGTCAAGACCTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAAT TAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAACCTTGCGGTCGTACT CCCCAGGCGGAGTGCTTAATGCGTTAGCTGCAGCACTAAGGGGCGGAAACCCCCTAACACTTAGCACTCA TCGTTTACGGCGTGGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCAGCGTCAG TTACAGACCAGAGAGTCGCCTTCGCCACTGGTGTTCCTCCACATATCTACGCATTTCACCGCTACACGTG GAATTCCACTCTCCTCTTCTGCACTCCAGTCTTCCAGTTTCCAATGACCCTCCCCGGTTAAGCCGGGGGC TTTCACATCAGACTTAAAAGACCGCCTGCGCGCGCTTTACGCCCAATAAATCCGGACAACGCTTGCCACC TACGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGTAGTTAGCCGTGGCTTTCTGGTTAGATACCGTCAAGGGACAAGC AGTTACTCTTATCCTTGTTCTTCTCTAACAACAGTACTTTACGATCCGAAAACCTTCTTCATACACGCGG CGTTGCTCCGTCAGACTTTCGTCCATTGCGGAAGATTCCCTACTGCTGCCTCCCGTAGGAGTCTGGGCCG TGTCTCAGTCCCAGTGTGGCCGATCACCCTCTCAGGTCGGCTATGCATCGTTGCCTTGGTAGGCCATTAC CCTACCAACTAGCTAATGCACCGCGGGCCCATCTGTAAGCGATAGCCGAAACCATCTTTCAAAAGCGTGG CATGCGCCACATTCTATCATTCGGTATTAGCCCCGGTTTCCCGGAGTTATCCCCAACTTACAGGCAGGTT GCCCACGTGTTACTCACCCGTCCGCCACTAACTTTGGAAGAGCAAGCTCTTCCTCCGTTCGTTCGACTTG CATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCGTCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCTTTAAAATATAAATTGAAT TTGAATACTTATTCAACACCGTGAATAAGATTCCTTGCGTCAAATTGACTTCGCTAGCAATTAAATTACT AGTTTGTTTTGTTGAAAACAGCTTTCTGTTTTCTGCCCTGCGATTACCAGTGAGACTTTACGTCTCATTG CTTTTCGTCTTCTTCTTTGTTCAGTTTTCAAAGGTCAGTTAGTCGCTTTCATGCTTGATATGCGAATGTT TTCGTTTGTTTTTTGCGACTTTTAAATCATATCATTTCAGCAACTATCTGTCAACAACTTTTTGAATTTA TTTTATGAATAAAATTCATTTAAATCGCTGCTATCGTAGCGCCGAAAACTAATATATCAAGTTTTGAGAT ATATGTCAACCGAATTATGCATAAAATTAAATAAAAATGAAAAAAATTGCAAAAAAACACCTAGCTAGGC TAAGTGTTTTGATTAATTATTTGATTGTTTTTCTTTACACGCTGGACATATACCATATACTTCCAGTCTG TGATTATCTATTTCATATCCGGTCATATGTGCTGCGAAATGTTCTACTTCATCTAAACCTGGATAATGAA AATCAACTATTTTCCCACACACATTACAAATTGCGTGGTAATGATTAGATGTAGAAAAATCAAATCGACT AGATGCATCACCATAGGATAATTCCTTAATTAGACCAGCATCACGGAAAACGCGTAAATTATTATATACA GTTGCTACACTCATGTTAGGGAAGTTTCCTTCTAAAGCTCGATAAATATCGTCCGCGGTTGGGTGTGTAT GTGAGTTAATTAAGAATTCTAGTATAGCATGACGCTGAGGAGTGATTCTTACTCCTGTTTTCTTCAAGAC ATCTACTGCCTCTTTTAGAGTTGCATTAGACACCGCCATGCACTCCCTTCCA***fin des 21aas, voir adresses*** AAAATAATTATTATATTC ATAATACCGGAAATAACGTTTAACTGTCAATAGAATGGCAGAATTTATAGCTTAATATCCTTTATTTAAA TCAATTTCGTTCCTTAATTTTGTATTTTCTTTCAAGTGATTGATATTTTCAAACCAAATTTCAAAGCTGC GCTCTAAATATTTATCCGAATGTCCAGATACATGTGGTGTAATAGTTACATTATTTGCTTGCCATAAGGA ATTGTCTTCGGAAAGCGGCTCTTCAGATAAAACATCTAAATAAAAATGAGCTATTAATTGGTCTTTTGAT GCTTTCTCTAAGACATTTAACTCTACAGCACTTCCTCGCCCTATATTGATAAAAACTGCATTATTTTTCA TTTTCTCAAAAAATGATAAAGAATAAATACCCATTGTTTCATCTGTATGAGGTAAAACACTAACAAAAAA ATCTGCTAATGGAGCAACTTTTTCGATATTCGTCATTGCATATGTTTCACTAAATGGTTTCGCGGGGTGG CCCGTTGTATTTACCCCTATGATTTCCATATCAAATGCTTGAGCGAACTCGGCCACTTTTGCTCCAATGG CTCCCGTTCCAGCTACTACCAAAGTTTTTCCAGCTAATTCTGTTATTGGTTCTTCACTTGCCCAATTTTT TTCTTTTTGCATTTGATAAAAGAAAGCAGCTTTTTTTACGTGTGCTAACATAAAAGATAGCGCGAATTCA CCCATTGGTATCGCATGGATTCCTCGTACATTAGCAACTTTAATTTTTCTTTCTTGAATTATTTCTCTTG GTAAACTATCTACTCCCGCGGAAAAAACCATGATTAATTTTAAGTTGCTTGCTTGTTTGATTTTGGCTTT GGTAATGTTAGATCCGTATGTGACGATGATATCTATCTCCGCTAAATTGGCAAAATGATCATTGCTCTCA TAATAAAAAGTATCCTCTGGAAATTTCTCTGCTTGCAAAGTCTGTAAATATTCTGGAACTTCCAATGTAA ATAAAATGTTCATTTTGCGCCACACTTCCTTTCTTTAGCTATATATTAATTTTATGCTTTTTTTCATTTA ACAGCAATTAAATTGTTTTTTCAATTGCGGCATCTTATTTTTTCGCATAGAATATAAGAGGTATTAAAAT TTTGAGGAGATGACGAAATGGATCATTCAATGTCAAAAAAATTGCATGATGAAGCACTTTTACATATAGT TGGCGGGGTTAATAGCCCATCTAGGTCAAATAAAGGAGTTGGCGGCGGAATTCCTGTAACGATGGAACGG GCTAGTGGCGCTTATTTTTATGATGTGGATGGCAATAAATATATTGACTATTTAGCTGCATTTGGACCAA TCATTACGGGACATGCACATCCTCATATTACAGAAGCAATTACAAAAGCTGCGCAAAATGGTGTTTTGTA CGGAACACCTACTAAACACGAAATCACTTTTGCGAAAATGTTAAAAGAAGCCATTCCTTCACTTGAGAAA GTTCGTTTTACAAATTCTGGGACGGAAGCTGTCATGACAACTATTCGTGTCGCTCGTGCTTATACAGGCA GAGATAAAATCATTAAATTCGCTGGGTGTTATCACGGCCACTTTGATTTAGTGCTCGTGGAAGCCGGTTC TGGCCCTTCTACGCTTGGCATTCCAGACTCCGCTGGGGTAACAAAATCAACCGCAGAAGAAGTTATCACT GTCCCCTTTAATGATCTTGATTCTTTTAAAGAAGCATTAGCTATTTGGGGCGATCAAGTTGCTGCTGTTT TAGTAGAGCCAATTGTTGGGAATTTTGGAATGGTTGCACCAGAAGATGGATTTTTAGAAGCAGTTAATGA ACTCGCACATGTCAATGGTTCTTTAGTGATTTATGATGAAGTCATTACGGCTTTCCGTTTTATGTACGGC GGCGCGCAGAACTATTTAGGTGTTATTCCCGATTTGACTGCCATGGGTAAAATTATTGGTGGTGGGCTTC CGATTGGTGCTTACGGAGGTCGAATTGATATTATGGAAAAAGTAGCACCACTTGGACCGGCTTATCAAGC TGGGACGCATGCGGGGAATCCAGCATCTATTCTTTCAGGAATCGCGTGTCTCGAAGTTTTACAAGAAGAA GGGCTTTATGAGCGCTTTGAAAAATATGGTTCCATGTTGAAAGATGGCATTGAGAAAGCCGCTGCTAAAC
lmo 16aas
[modifier | modifier le wikicode]- Méthode: les séquences Fasta NCBI des aas sont indiquées par *** au début et à la fin de l'adressage. lmo adresses lmo gtRNAdb.
Lmo 21.04.19 16 aas TTTTTTCCTACTTCTTGGTGGATTTTTATGGTTTTTGCCTGTAGCTTTATGTGCAGCAGAAATGGCGACG GTGGATGGTTGGCAAGAAGGCGGTATTTTTTCTTGGGTGGGAAATACACTCGGGGAACGTTTTGGTTTTG CCGCAATCTTCTTTCAGTGGTTTCAAATAACGGTCGGATTCGTGACAATGATTTACTTTATTCTCGGTGC GCTATCCTATGTATTTGATTTTCCCGCACTCGAATCGAATCCTTTTATTAAATTTATTGGTGTGTTAGTT ATTTTTTGGGGACTTACTTTTTCCCAATTAGGTGGTACGAAAAACACGGCTAAAATCGCAAAATTTGGTT TTATTATCGGTATTCTCATCCCAGCAATTATTTTATTTATTTTAGGTATTGCTTACGTTGCTGGCGGAAA TCCACTTCATGTCACTTTTTCCAAAGAGGCGTTTATCCCGGATTTCTCAAAAGCTTCAACATTAGTCATC TTCGTGTCATTTATACTCGCTTACATGGGTGTTGAAGCTTCCGCGAGCCATGTCAATGAAATGACCAACC CAAAACGCGATTATCCACTAGCAATGATTATGCTCGTTATTTTAGCCATCGCACTGAATACAATCGGTGG CTTAACTATCTCTGCTGTGTTACCTTTAAAAGATTTATCCCTCAGCTCCGGCGTCGTGCAAACATTCCAA GCACTAATTTTACATTTTGGTTCCGGCTTAGGTTGGGCAGTAAAACTAATCGCGATAATGATTGCGCTAG GTGTCATGGGTGAAGTCAGTGCTTGGGTAGTCGGTCCATCACGCGGCATGTACACTGCTGCAGAACAAGG CTTACTTCCCGAAAAAATGAAAAAAGTAAATAAACACGGAGTCCCTGTACCACTTATTATGGTTCAAGGC 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ATTCCGCCACGCCGGCGTAACAATATAATAAATTATAACTTTAAAACATTAATTATGCAAATGGAGGCGC CAACCGGATTTGAACCGGTGATAAAGGTTTTGCAGACCTCTGCCTTACCACTTGGCTATGGCGCCGTACA ATGTTCAATTTAAAAGCGGAAGACGGGGTTCGAACCCGCGACCCCCACCTTGGCAAGGTGATGTTCTACC GCTGAACTACTTCCGCATTAACTGGGCCAGCTGGATTCGAACCAACGCATGACGGAGTCAAAGTCCGTTG CCTTACCGCTTGGCTATGGCCCAACAATTATATTAGAATTAAAAACAAAAAGGGCGGATGATGGGAATCG AACCCACGAATGCCTGAACCACAATCAGGTGCGTTAACCACTTCGCCACATCCGCCATTATTTTAATATA TGGCAGGGGCAGTAGGAATCGAACCCACACTGGAGGTTTTGGAGACCTCAGTTCTACCTTTAAACTATGC CCCTATAATAATGGTGGAGGGGAGTGGATTCGAACCACCGAACCCGAAGGAGCGGATTTACAGTCCGCCG CGTTTAGCCACTTCGCTACCCCTCCATATTAAAAAAGAAAAAAAGTGGCTTGGGACAGAATCGAACTGCC GACACCTTGAGCTTCAATCAAGTGCTCTACCAACTGAGCTACCAAGCCATAATGGCGGTCCCGACGGGAT TTGAACCCGCGATCTCCTGCGTGACAGGCAGGCATGTTAACCCCTACACCACGGAACCACTCTATTGCGG GGGCAGGATTTGAACCTACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGACTGCTCCACCCCGCGAC AATATTATTATAAAATTAATGGTGGAGGTTAACGGGATCGAACCGCTGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGAT GCTCTCCCAGCTGAGCTAAACCTCCATAATTACTATTCTACTCTAAAAACATAAAAATGTCTCTAGTAGA TTAATAATAAATGACCCGTACGGGATTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCT TGACCAACGGGCCTAAGAAAAAATATGATTCTTTATTACGTGTAAACGGAGAGCAAGGGATTCGAACCCT TGAGACAGCTTACACCGCCTACACGGTTTCCAACCGTGCTCCTTCGGCCACTCGGACAGCTCTCCAGAAA ATGGCTCCACAGGCAGGACTCGAACCTGCGACCGATCGGTTAACAGCCGATTGCTCTACCAACTGAGCTA CTGTGGAATAATAAATTGCCCGGCAGCGACCTACTCTCGCAGGGGGAAGCCCCCAACTACCATTGGCGCA GAGAAGCTTAACTACCGTGTTCGGGATGGGAACGGGTGTGACCTTCTCGCCATAACTACCAGACAATATT GAGTTGTTGAAAGATTGCTCTCTCAAAACTAGAGAAGAAAGTGTTCAGTTAGGTAACTTCGTTTCATTTT TTGGTTAAGTCCTCGATCGATTAGTATTTGTCCGCTCCATGTATCGCTACACTTCCACTCCAAACCTATC TACCTGATCATCTTTCAGGGATCTTACTTTCCGAAGAAATGGGAAATCTCATCTTGAGGGGGGCTTCACG CTTAGATGCTTTCAGCGTTTATCCCTGCCACACATAGCTACCCAGCGATGCTCCTGGCGGAACAACTGGT ACACCAGCGGTGTGTCCATCCCGGTCCTCTCGTACTAAGGACAGCTCCTCTCAAATTTCCTGCGCCCGCG ACGGATAGGGACCGAACTGTCTCACGACGTTCTGAACCCAGCTCGCGTGCCGCTTTAATGGGCGAACAGC CCAACCCTTGGGACCGACTACAGCCCCAGGATGCGACGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACCTCCCCGTCG ATGTGGACTCTTGGGGGAGATAAGCCTGTTATCCCCGGGGTAGCTTTTATCCGTTGAGCGATGGCCCTTC CATGCGGAACCACCGGATCACTAAGCCCGACTTTCGTCCCTGCTCGACTTGTCAGTCTCGCAGTCAAGCT CCCTTGTGCCTTTACACTCTGCGAATGATTTCCATCCATTCTGAGGGAACCTTTGGGCGCCTCCGTTACT CTTTAGGAGGCGACCGCCCCAGTCAAACTGCCCACCTGACACTGTCTCCCCACGCGCTAAGCGTGGCGGG TTAGAATGGTCATACAGCCAGGGTAGTATCCCACCATTGCCTCCTCGTATGCTAGCGCACACGTCTCTTC GGCTCCTACCTATCCTGTACAAGCGGTACAAACATTCCATATCAGGTTGCAGTAAAGCTCCACGGGGTCT TTCCGTCCTGTCGCGGGTAACCTGCATCTTCACAGGTACTATAATTTCACCGAGTCTCTCGTTGAGACAG TGCCCAGATCGTTGCGCCTTTCGTGCGGGTCGGAACTTACCCGACAAGGAATTTCGCTACCTTAGGACCG TTATAGTTACGGCCGCCGTTTACTGGGGCTTCAATTCGTACCTTCGCCGAAGCTAAGCACTCCTCTTAAC CTTCCAGCACCGGGCAGGCGTCAGCCCCTATACGTCACCTTACGGTTTTGCAGAGACCTGTGTTTTTGCT AAACAGTCGCCTGGGCCTATTCACTGCGGCTCTCTCGGGCTTGCACCCTAATAGAGCACCCCTTCTCCCG AAGTTACGGGGTCATTTTGCCGAGTTCCTTAACGAGAGTTCTCTCGCTCACCTTAGGATTCTCTCCTCAT CTACCTGTGTCGGTTTGCGGTACGGGCAGTACTACTCTTCCTAGAGGCTTTTCTTGACAGCGTGAAATCA GGAACTTCCGTACTTAATTTCCTTCCCCATCACAGCTCATGCTTCGCGAGAAGCGGATTTGCCTACTTCT CACACTCACTGCTTGGACGCACATTTCCATTCGTGCGATTCCCTATCCTTCTGTGTCACCCCATCGGTTA AACAATTAGCACTGGTACAGGAATCTCTACCTGTTGTCCATCGCCTACGCCTATCGGCCTCGGCTTAGGT CCCGACTAACCCTGAGCGGACGAGCCTTCCTCAGGAAACCTTAGATATTCGGTGGAAGGGATTCTCACCC TTCTTTCGCTACTCATACCGGCATTCTCACTTCTAAGCGCTCCACCAGTCCTTCCGGTCTGACTTCACCG CCCTTAGAACGCTCTCCTACCACGAACCTCTAAAGAGGTTCATCCACAGTTTCGGTAATATGTTTAGCCC CGGTACATTTTCGGCGCGGGGTCACTCGACCAGTGAGCTATTACGCACTCTTTCAATGGTGGCTGCTTCT AAGCCAACATCCTGGTTGTCTAAGCAACCCCACATCCTTTTCCACTTAACATATATTTGGGGACCTTAAC TGGTGGTCTGGGCTGTTTCCCTTTCGACTACGGATCTTATCACTCGCAGTCTGACTCCCGAGTATAAGTA CATGGCATTCGGAGTTTATCTGAATTCGGTAACCCGAGAAGGGCCCCTAGTCCAAACAGTGCTCTACCTC CATGACTCTTTACCTCGAGGCTAGCCCTAAAGCTATTTCGGAGAGAACCAGCTATCTCCAAGTTCGATTG GAATTTCTCCGCTACCCACACCTCATCCCCGCACTTTTCAACGTGCGTGGGTTCGGACCTCCAGTAAGTA TTACCTTACCTTCATCCTGGACATGGGTAGATCACCTGGTTTCGGGTCTACGACCTGTTACTTATGCGCC CTATTCAGACTCGCTTTCGCTACGGCTCCGCTTTTTCCGCTTAACCTTGCAACAAATCGTAACTCGCCGG TTCATTCTACAAAAGGCACGCTATCACCCATTAACGGGCTCTAACTACTTGTAGGCACACGGTTTCAGGA ACTGTTTCACTCCCCTTCCGGGGTGCTTTTCACCTTTCCCTCACGGTACTGGTTCACTATCGGTCACTAG GGAGTATTTAGCCTTGGGAGATGGTCCTCCCGGATTCCGACGGAATTTCACGTGTTCCGCCGTACTCAGG ATCCACTCTGGAGGGAAAGCTATTTCAACTACCGGGCTGTTACCGTCTTTGGCGGGCCTTTCCAGACCGC TTCATTTATAACTTTCTTTTGTAACTCCGTATAGAGTGTCCTACAACCCCAAGAAGCAAGCTTCTTGGTT TGGGCTCTTTCCGTTTCGCTCGCCGCTACTCAGGAAATCGATTTTTCTTTCTCTTCCTCCAGGTACTTAG ATGTTTCAGTTCCCTGGGTCTGCCTTCCTCACGCTATGTATTCACGTAAGGATACTATCCGACTAAAGAT AGTGGGTTCCCCCATTCGGAAATCTCTGGATCAACGCTTACGTACAGCTCCCCAAAGCATATCGGTGTTA GTCCCGTCCTTCTTCGGCTCCTAGTGCCAAGGCATCCACCGTGCGCCCTTTCTAACTTAACCAATTTACT TCTACGAAGTAAAGGTTGTTTTTCTGATTTTCCGTATCAGCGATGATACATCCAATCAGATGAAAGATTC ACTTTCAGATGATTCTCGGTTACTTGTGTCATAAATAATAAATTATCTATGCTAACTTTACTAACTTTCT TATCTAGTTTTCAAAGAACAATTTTGGTGGAGCCTAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAAG CAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTAAGGCCCCATAAAAGGATATGATTATTTGTATTTCTTGCGTCAGAAAG AAAAAGTGGGCCTAAATGGACTCGAACCATCGACCTCACGCTTATCAGGCGTGCGCTCTAACCAGCTGAG CTATAGGCCCGTCAAAAATGTAGTGGCGCGATGCTTCAAGCATAGTGCCTTGCATACTTTATCTGACATA AAAGAGAGTAACCTCTCAAAACTGAACAAATAGAGAAGAACGAAAACTCACAGGTTTCCTTTTCCTTAGA AAGGAGGTGATCCAGCCGCACCTTCCGATACGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATTATCTGTCCCA CCTTCGGCGGCTGGCTCCATAAAGGTTACCCTACCGACTTCGGGTGTTACAAACTCTCGTGGTGTGACGG GCGGTGTGTACAAGGCCCGGGAACGTATTCACCGTGGCATGCTGATCCACGATTACTAGCGATTCCGGCT TCATGTAGGCGAGTTGCAGCCTACAATCCGAACTGAGAATAGTTTTATGGGATTAGCTCCACCTCGCGGC TTCGCGACCCTTTGTACTATCCATTGTAGCACGTGTGTAGCCCAGGTCATAAGGGGCATGATGATTTGAC GTCATCCCCACCTTCCTCCGGCTTGCACCGGCAGTCACTTTAGAGTGCCCAACTAAATGCTGGCAACTAA AATCAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATCTCACGACACGAGCTGACGACAACCATGCAC CACCTGTCACTTTGTCCCCGAAGGGAAAGCTCTGTCTCCAGAGTGGTCAAAGGATGTCAAGACCTGGTAA GGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCCTTTGA GTTTCAACCTTGCGGTCGTACTCCCCAGGCGGAGTGCTTAATGCGTTAGCTGCAGCACTAAGGGGCGGAA ACCCCCTAACACTTAGCACTCATCGTTTACGGCGTGGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCA CGCTTTCGCGCCTCAGCGTCAGTTACAGACCAGAGAGTCGCCTTCGCCACTGGTGTTCCTCCACATATCT ACGCATTTCACCGCTACACGTGGAATTCCACTCTCCTCTTCTGCACTCCAGTCTTCCAGTTTCCAATGAC CCTCCCCGGTTAAGCCGGGGGCTTTCACATCAGACTTAAAAGACCGCCTGCGCGCGCTTTACGCCCAATA AATCCGGACAACGCTTGCCACCTACGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGTAGTTAGCCGTGGCTTTCTGGT TAGATACCGTCAAGGGACAAGCAGTTACTCTTATCCTTGTTCTTCTCTAACAACAGTACTTTACGATCCG AAAACCTTCTTCATACACGCGGCGTTGCTCCGTCAGACTTTCGTCCATTGCGGAAGATTCCCTACTGCTG CCTCCCGTAGGAGTCTGGGCCGTGTCTCAGTCCCAGTGTGGCCGATCACCCTCTCAGGTCGGCTATGCAT CGTTGCCTTGGTAGGCCATTACCCTACCAACTAGCTAATGCACCGCGGGCCCATCTGTAAGCGATAGCCG AAACCATCTTTCAAAAGCGTGGCATGCGCCACACTTTATCATTCGGTATTAGCCCCGGTTTCCCGGAGTT ATCCCCAACTTACAGGCAGGTTGCCCACGTGTTACTCACCCGTCCGCCACTAACTTTGGAAGAGCAAGCT CTTCCTCCGTTCGTTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCGTCCTGAGCCAGGATCAAACT CTCTTTAAAATATAAATTGAATTTGAATACTTATTCAACACCGTGAATAAGATTCCTTGCGTCAAATTGA CTTCGCTAGCAATTAAATTACTAGTTTGTTTTGTTGAAAACAGCTTTCTGTTTTCTGCCCTGCGATTACC AGTGAGACTTTACGTCTCATTGCTTTTCGTCTTCTTCTTTGTTCAGTTTTCAAAGGTCAATTTCTTTTGT TGCGAAAGCGTTTTGTCCGCATCAGCAACGTTTATAAATATACCAAGATTTTTGCCTTTCGTCAATACTT TTTACAAAGTTTTTTAAATAAAGATGAAAAAAGATGAATTCCTTGCATAAATCCGCATTTAAATAAGGAT TTATAGGGGCGAAATCATTATGTTGTATAAATTTGCATTCCTTTTTCTTCAAATTGTTCTTTTAGTACCG GATCTATTTCTTTTCCGGTGATAATGGAAGAGATTTCGTCTAGGGCTGCGTATTTGTAAAGTGAAATGCG GCCGAACTTGGTGTGATCTGTTACTAAGATAACTTCATCAGCTGAGTGGAGCATTTGTTGCTTAGCTGGG ATGAGGTATTCGTCGTAGTGCATTAAACCTTTGTCGATATCGAGAGCTGGTGTGGTTACAAATGCTTTAT GTACGTGAATGCTCTGCAAGGTTCCACTTGTAATCATACCGTTAAGGATGAAAGTTTCTGGGTAGATGAC GCCGCCTGTCACAATTACTTTAGACGGAGAGAAACGCATAATGGAAGCTACGTTGATATCGTTTGTTATG ACGGTTAGTTTGGAACGGTCTTTTAATGCGGTTGCGATGTGTCCGGTTGTTGTTCCGGCGTCAAGAATGA TTGTATCGCCGTCTTTGACCATTGTCGCTGCTAATGTGGCAATGCGTTGTTTTTCTTCGTAGCGCACTTC GCTTCGTTTTTTCCAATTCGGTTCGGAAACTACTTTTTCTTCTATCATAACTCCGCCGTGGGTTCTTTTT AGCTTTTTGTCTTTTTCTAAAGAGGTTAAATCGCGGCGAATGGTTGCTTCGTGGACTTCAAAATGTTTGG CAAGTTCGCTAACTGTTGCTATTTTTCTACTTTTTACATATTGGACGATGGCACGCTTTCGTTCGATAGA TAACACTTCTTCCCCTCCTTTTGTTTAAGTATATGGTAACTCCAATAGAAGAAAATCGCAAACAAACAAA AAACCTTGGAGCGATTGGCCCCAAGG***fin des 16aas, voir adresses*** TTTGGAAATGAAAATTAATCGTTTAAACGTTTTTCTAGTTCTGC TTTTTTGTCTTCGAAGCCTGGTTTGCCAAGCAATGCGAACATGTTGGCTTTGTATGCTTCTACGCCTGGT TGGTCAAATGGATTTACTCCATTTAGGTAACCGCTGATAGCTACTGCTTTTTCAAAGAAGTATACTAGGT AGCCGAAAGTGTAAGCATCTAGTTCTGGTACTTCTACAACAAAGTTTGGAACTTCGCCGTCTGTATGTGC TAAAAGAGTTCCTTCGAATGCTTTTGTGTTAACGAAATCAACCGTTTCGCCAGCAAGATAATTCAATCCA TCTAAATCTACGTCTTCTTTATTGATAGTTAAGTTGTGGCGTGGTTTGTCCACTTTAATAACTGTTTCAA AAAGGTTACGACGGCCATCTTGGATATATTGACCGATAGAATGTAAATCTGTGGAGAAGTTAGCGCTGGA TGGGTAAATACCTTTTTTGTCTTTGCCTTCACTTTCGCCGAATAATTGTTTCCACCACTCGTTAAAGTAT TGCAAGCCTGGCTCATAGCTGATTAGAAGTTCAGTTACTTTGCCTTTACGGTAAAGAACGTTACGAGCTG CTGCATATTGGTATGCAATGTTGTTTTTAAGTTCTGGTTTATCGAAATCTTTGCTTGCTGCTGCTGCTCC GTTCATAAGAGCATCGATATCAACGCCGCTAACTGCGATTGGAAGTAAACCTACTGCAGTTAAAACGGAG AAACGTCCGCCAACGTCATCTGGAACAACAAATGTTTCGTAGCCTTCGTTGTCGGATAATGTTTTTAGAG CGCCTTTTGCTTTATCAGTTGTAGCGTAAATGCGTTTTTTCGCGCCTTCTTCGCCATATTTTTTGATTAA
lmo 9aas
[modifier | modifier le wikicode]- Méthode: les séquences Fasta NCBI des aas sont indiquées par *** au début et à la fin de l'adressage. lmo adresses lmo gtRNAdb.
lmo 25.4.19 9aas TTAAAGCTGTCAGGACGAAATTACCCGATATATGGATTTCCGTTGATTCTTGGCGTGCTGAAGTAGCGGA ACAGGCTATCTTAGCGGGAGCTGATATGATAAATGACCAGTGGGGTGCGAAAAAAGAACCGAAAATTGCC GAAGTTGCTGCAAAATACGATGTACCGATTTGTTTAATGCACAATCGTGAGAACGCGCAATACGACAATT TTTTAGAAGATGTGAAAAAAGACTTGTTAGAAAGTATTGCCATAGCTAAAGCAGCATCAGTACCAGACGA GCATATTATTCTCGATCCAGGTTTTGGTTTTGTTAAGACACCTGCTCAGAATTTAGAAGTGTTACGACGG ATTGATGAGATAGTCGCACTTGGTTACGAGGTTTTACTCGGTACGAGCAGGAAGTCAACTATTGGGCTTG TCCTAGGAACTACTCCTGGAGATAGAATGGAAGGAACTGGAGCAACAACTGTCTATGGATTTTCGAAAGG TTGTACAATTACTCGTGTCCATGATGTACTTCCAATTGCACGTATGGTGCGAATGACAGATGCAATCACT GGCAAATTAGATATTACAAATTTATAAAGAGGTGCTTTAGTTGGATAAAATTTATTTAAACGAATTAGTG TTTTACGGATACCACGGAGTTTTGAAAGAGGAAACAAAACTGGGGCAAACATTTCGCGTGTCACTAATTC TTGGACTTTCTACCAAAAAAGCGGGAATATCAGATAGCGTAGAAGATACAGTCAGCTATGCAGACGTATA TGAAACAGTAAAAGAAATAGTAGAAGGAAAGCCATTCAAATTAATCGAGGCGCTTGCCGAAAAAATTGCA TCGGAAGTTTTAACTGGTTATCCTCTATTAGAAGAAGTGACTGTAAAACTTATTAAACCAAATCCTCCGA TTCCGGGACATTATGATTCTGTTGCAGTAGAAATTGAACGTAAAAGAAGTGATCTGAATGGCTAAGGCGT TTCTATCAATTGGCACAAATATTGGCGAGCGTTTAGAGAATTTAAATGACGCACTAAGAGGTTTAGCGGC TTCGAATCAAATTAATATCACCAACGTATCTAGCGTATACGAAACAGATGCAGTAGGTTACGAAGATCAA GCAGCATTTTTAAATATCGCTGTAGAAATTGAAACGGACTTTCCGCCAATTGATTTATTAGATTTTTGCC TTGCGCTCGAACTTGAATTGGGGCGAGTTCGATTATTTAAGTGGGGTCCGCGACTCATTGATATTGATGT TTTATTATATGATGATGTTAAAACCGATACAGAAAAGCTAAAAATCCCACATCCTTATATGAAAGAACGT GCTTTTGTGATGATTCCATTAATAGAAATTTCACCAGAAAAAAGCAATCTTGTAGAGAATCCGGCCCTTT TGGAAGAACAAGGTGTTCGGAAAATAAAAAATCAAGTCAACTGGTAAAATTGGCACTTGCAGAAAAAACT GATTATGATAACATATCACTAGCGCAATTTAAGAGAAAGGGGTTTTACCATTAATGTTTAAAATAGGTAA CGTAGAAATTAAGAACCAAGTAGTTGTGGCGCCGATGGCAGGTATATCCAATTCCGCATTTCGTCTAACA GTCAAAGAATTCGGAGCAGGCCTCGTTTGCTGTGAAATGATTAGCGACAAAGGAATAGCATACCGCAATG CTAAAACACTTGATATGCTATATATTGATGAAAAAGAAAAACCACTGAGTCTGCAAATTTTCGGCGGCGA GAAAGAAACGCTTGTAGAAGCTGCGAAATTCGTAGCTGAAAACACAACGGCAGATATTATTGATATTAAT ATGGGCTGCCCGGTAAACAAAATTATCAAATGTGAAGCTGGAGCAAAATGGCTACTTGATCCAAATAAAG TGTATGACATGGTAGCTGCTGTAGTGGACGCTGTTGATAAACCAGTTACGGTAAAAATGCGTATTGGCTG GGACGAAGAACATGTCTTTGCTATCGAAAATGCACTTGCTGCTGAACGTGCCGGAGCTGCAGCTGTTGCA ATGCACGGCCGTACTCGTGTGCAAATGTACGAAGGTAGTGCGAACTGGGATGTACTAAGAGACGTAAAAC GCGAACTGAAAATCCCGTTCATGGCAAATGGGGACGTGAGAACCCCAGAAGATGCCAAACGAATTTTAGA ACATACTGGAGCAGATGGAGTAATGATTGGTCGAGCTGCACTTGGAAATCCGTGGATGATTTATCGCACG GTGAAATTCCTAGAAACAGGCGAACTTCTCCTAGAACCAGAACCACGCGAAAAAATGCAAACTGCCATGC TACACCTAAACCGCTTAGTCGAGTTAAAAGGAGAAAACATTGCAGTTCGTGAATTTAGACAACACGCAGC TTATTATCTAAAAGGAGCTCGCGGAAGCACTCGCGCGAAAGTGGCTGCTAACCAAGCGACAAAACAATCA GAGATGGAAGCAATTTTAAATGAATTTGTTCTTCAATATGAAGAAAAAGCATTAGCGAAACAAGACTAAT TAGGATTGCCTCGAGATTTCGGGGCAATTTTTAAATTTATACTAGAAAAACCAGACCGAAAAAGCGTATA ATGGAAACATCTGTAGAAATGAATAGAATAGGAGTGTACCTATATGAGTAACGAGAATCATGAAGAACTA AATGACCAACTCATCGTCCGTCGTGAAAAAGTGGACACATTGCGCGAAGAAGGCATAGATCCTTTTGGCG AAAAATTCATCCGTTCCATCAGCCCGGAAGAAATCGAAACAAAATTCGCTGATAAATCAAAAGAAGAACT TGAAGAAGCTGCTATTGAAGTTTCTGTAGCAGGTCGTATTATGACAAAGCGTGTAAAGGGTAAGGTAGGT TTCACACATATTCAAGACCGTTTCCATCAATTACAAATCTATATCCGTAAAGATGCGATTGGCGAAGATG CTTACGCAGTCTTCAAATTAGCAGATCTAGGTGACATTATTGGTATAAAAGGAACTATTTTCCGTACTAA TACAGGTGAACTTTCTGTTAAAGCAACGGAATTCACTTTGCTTTCCAAATCGTTACGTCCACTTCCTGAT AAATATCATGGTTTAAAAGACGTAGAACAACGCTATCGTCAACGCTATTTAGACTTAATCACAAACGAAG AAAGTCAAAATCGCTTTGTGATGCGCAGTAAAATCTTGAAATACACTCGTGATTATATGGATAACCAAGG ATTCTTAGAAGTAGAAACTCCGGTGCTTCATACAATTGCTGGTGGTGCTGCTGCAAAACCATTTATCACG CACCATAATGCGCTTGATATGGAATTATACTTGCGAATCGCTTTAGAACTACACTTAAAACGTCTAATCG TTGGTGGGATGGATAAAGTGTACGAAATTGGCCGTGTTTTCCGTAATGAAGGAACATCCACGCGTCATAA CCCAGAATTTACAATGCTAGAATCCTATGCAGCATACGAAGATTATGAAGATGTTATGGATCTGGTAGAA GGTTTAGTATCCACGGTATGTAAACAAGTAAATGGAACAACAGAAATAACATACGGTGAATACAAAGTAG ATTTAACTCCTAACTGGCGCCGTATCCACATGGCAGATGCTGTAAAAGAATACGTAGGAGTGGATTTTTG GAACGTAACTTCCGATGAAGAAGCGCGTGAACTAGCAAAAAAACATGATGTGCCAGTAACGGAACACATG ACATACGGGCACATTCTTAATGAGTTTTTCGAAACATACGTAGAAGAAAAGCTCATTCAACCAACCTTTG TTTACGGGCATCCGGTGGAAATTTCCCCATTAGCGAAGAAAAACAAAGAAGATGAACGTTTTACTGACCG TTTTGAATTATTTATCGTTGGTCGTGAACATGCAAATGCATTCTCAGAATTAAACGATCCAATTGATCAA AGAGAACGCTTTGAAGCGCAAATGAAAGAACGTGAGCAAGGTAATGATGAAGCACACGGAATGGATGCAG ATTTCCTTGAAGCTTTAGAATACGGTCTACCGCCAACTGGTGGACTTGGAATAGGTATTGATCGTCTAGT AATGCTATTAACAGATGCCCCGTCTATTCGTGATATCCTATTATTCCCAACTATGAAACACCGCGACTAA TTAAAAATCCAGAGCTGATTATATCGGTTCTGGATTTTGTTGTTTTCCCAGAAAAAAACAAATTTGCCAA AGAGAAACTTTTTCTCAAAAATATGCTTGCAATCCCTATAAAAACATGATATATTTATAAACGTTCCAGT TAAACAAACACAAAATGCTCATCAAGAAATTAAATTTTTTTGAAAAAACATCTTGACTTTGTTAACTAGA TAGAGTAAGATATAAGAGTTGCTGCTAAAGGCAACAAAGAAGAAAAAGTGACCTTTGAAAACTGAACAAA GAAGAAGACGAAAAGCAATGAGACGTAAAGTCTCACTGGTAATCGCAGGGCAGAAAACAGAAAGCTGTTT TCAACAAAACAAACTAGTAATTTAATTGCTAGCGAAGTCAATTTGACGCAAGGAATCTTATTCACGGTGT TGAATAAGTATTCAAATTCAATTTA***début des 9aas, voir adresses*** TATTTTAAAGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGG CGTGCCTAATACATGCAAGTCGAACGAACGGAGGAAGAGCTTGCTCTTCCAATGTTAGTGGCGGACGGGT GAGTAACACGTGGGCAACCTGCCTGTAAGTTGGGGATAACTCCGGGAAACCGGGGCTAATACCGAATGAT AAGATGTGGCGCATGCCACGCCTTTGAAAGATGGTTTCGGCTATCGCTTACAGATGGGCCCGCGGTGCAT TAGCTAGTTGGTAGGGTAATGGCCTACCAAGGCAACGATGCATAGCCGACCTGAGAGGGTGATCGGCCAC ACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTCCGCAATGGACGAAAG TCTGACGGAGCAACGCCGCGTGTATGAAGAAGGTTTTCGGATCGTAAAGTACTGTTGTTAGAGAAGAACA AGGATAAGAGTAACTGCTTGTCCCTTGACGGTATCTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAG CCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTGTCCGGATTTATTGGGCGTAAAGCGCGCGCAGGCGGTCTTTT AAGTCTGATGTGAAAGCCCCCGGCTTAACCGGGGAGGGTCATTGGAAACTGGAAGACTGGAGTGCAGAAG AGGAGAGTGGAATTCCACGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATGTGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGA CTCTCTGGTCTGTAACTGACGCTGAGGCGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGT CCACGCCGTAAACGATGAGTGCTAAGTGTTAGGGGGTTTCCGCCCCTTAGTGCTGCAGCTAACGCATTAA GCACTCCGCCTGGGGAGTACGACCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGT GGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCTTTGACCACTCTGG AGACAGAGCTTTCCCTTCGGGGACAAAGTGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGAT GTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGATTTTAGTTGCCAGCATTTAGTTGGGCACTCTAAAG TGACTGCCGGTGCAAGCCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGACCTGGGCTA CACACGTGCTACAATGGATAGTACAAAGGGTCGCGAAGCCGCGAGGTGGAGCTAATCCCATAAAACTATT CTCAGTTCGGATTGTAGGCTGCAACTCGCCTACATGAAGCCGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCATG CCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACGAGAGTTTGTAACACCCGAAG TCGGTAGGGTAACCTTTATGGAGCCAGCCGCCGAAGGTGGGACAGATAATTGGGGTGAAGTCGTAACAAG GTAGCCGTATCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTAAGGAAAAGGAAACCTGTGAGTTTTCGTTC TTCTCTATTTGTTCAGTTTTGAGAGGTTAGTACTTCTCAGTATGTTTGTTCTTTGAAAACTAGATAAGAA AGTTAGTAAAGTTAGCATAGATAATTTATTATTTATGACACAAGTAACCGAGAATCATCTGAAAGTGAAT CTTTCATCTGATTGGATGTATCATCGCTGATACGGAAAATCAGAAAAACAACCTTTACTTCGTAGAAGTA AATTGGTTAAGTTAGAAAGGGCGCACGGTGGATGCCTTGGCACTAGGAGCCGAAGAAGGACGGGACTAAC ACCGATATGCTTTGGGGAGCTGTACGTAAGCGTTGATCCAGAGATTTCCGAATGGGGGAACCCACTATCT TTAGTCGGATAGTATCCTTACGTGAATACATAGCGTGAGGAAGGCAGACCCAGGGAACTGAAACATCTAA GTACCTGGAGGAAGAGAAAGAAAAATCGATTTCCTGAGTAGCGGCGAGCGAAACGGAAAGAGCCCAAACC AAGAAGCTTGCTTCTTGGGGTTGTAGGACACTCTATACGGAGTTACAAAAGAAAGTTATAAATGAAGCGG TCTGGAAAGGCCCGCCAAAGACGGTAACAGCCCGGTAGTTGAAATAGCTTTCCCTCCAGAGTGGATCCTG AGTACGGCGGAACACGTGAAATTCCGTCGGAATCCGGGAGGACCATCTCCCAAGGCTAAATACTCCCTAG TGACCGATAGTGAACCAGTACCGTGAGGGAAAGGTGAAAAGCACCCCGGAAGGGGAGTGAAACAGTTCCT GAAACCGTGTGCCTACAAGTAGTTAGAGCCCGTTAATGGGTGATAGCGTGCCTTTTGTAGAATGAACCGG CGAGTTACGATTTGTTGCAAGGTTAAGCGGAAAAAGCGGAGCCGTAGCGAAAGCGAGTCTGAATAGGGCG CATAAGTAACAGGTCGTAGACCCGAAACCAGGTGATCTACCCATGTCCAGGATGAAGGTAAGGTAATACT TACTGGAGGTCCGAACCCACGCACGTTGAAAAGTGCGGGGATGAGGTGTGGGTAGCGGAGAAATTCCAAT CGAACTTGGAGATAGCTGGTTCTCTCCGAAATAGCTTTAGGGCTAGCCTCGAGGTAAAGAGTCATGGAGG TAGAGCACTGTTTGGACTAGGGGCCCTTCTCGGGTTACCGAATTCAGATAAACTCCGAATGCCATGTACT TATACTCGGGAGTCAGACTGCGAGTGATAAGATCCGTAGTCGAAAGGGAAACAGCCCAGACCACCAGTTA AGGTCCCCAAATATATGTTAAGTGGAAAAGGATGTGGGGTTGCTTAGACAACCAGGATGTTGGCTTAGAA GCAGCCACCATTGAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTGGTCGAGTGACCCCGCGCCGAAAATGTACCGGGGC TAAACATATTACCGAAACTGTGGATGAACCTCTTTAGAGGTTCGTGGTAGGAGAGCGTTCTAAGGGCGGT GAAGTCAGACCGGAAGGACTGGTGGAGCGCTTAGAAGTGAGAATGCCGGTATGAGTAGCGAAAGAAGGGT GAGAATCCCTTCCACCGAATATCTAAGGTTTCCTGAGGAAGGCTCGTCCGCTCAGGGTTAGTCGGGACCT AAGCCGAGGCCGATAGGCGTAGGCGATGGACAACAGGTAGAGATTCCTGTACCAGTGCTAATTGTTTAAC CGATGGGGTGACACAGAAGGATAGGGAATCGCACGAATGGAAATGTGCGTCCAAGCAGTGAGTGTGAGAA GTAGGCAAATCCGCTTCTCGCGAAGCATGAGCTGTGATGGGGAAGGAAATTAAGTACGGAAGTTCCTGAT TTCACGCTGTCAAGAAAAGCCTCTAGGAAGAGTAGTACTGCCCGTACCGCAAACCGACACAGGTAGATGA GGAGAGAATCCTAAGGTGAGCGAGAGAACTCTCGTTAAGGAACTCGGCAAAATGACCCCGTAACTTCGGG AGAAGGGGTGCTCTATTAGGGTGCAAGCCCGAGAGAGCCGCAGTGAATAGGCCCAGGCGACTGTTTAGCA AAAACACAGGTCTCTGCAAAACCGTAAGGTGACGTATAGGGGCTGACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTTA AGAGGAGTGCTTAGCTTCGGCGAAGGTACGAATTGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGGT CCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCGGGTAAGTTCCGACCCGCACGAAAGGCGCAACGATCTGGGCACTGT CTCAACGAGAGACTCGGTGAAATTATAGTACCTGTGAAGATGCAGGTTACCCGCGACAGGACGGAAAGAC CCCGTGGAGCTTTACTGCAACCTGATATGGAATGTTTGTACCGCTTGTACAGGATAGGTAGGAGCCGAAG AGACGTGTGCGCTAGCATACGAGGAGGCAATGGTGGGATACTACCCTGGCTGTATGACCATTCTAACCCG CCACGCTTAGCGCGTGGGGAGACAGTGTCAGGTGGGCAGTTTGACTGGGGCGGTCGCCTCCTAAAGAGTA ACGGAGGCGCCCAAAGGTTCCCTCAGAATGGATGGAAATCATTCGCAGAGTGTAAAGGCACAAGGGAGCT TGACTGCGAGACTGACAAGTCGAGCAGGGACGAAAGTCGGGCTTAGTGATCCGGTGGTTCCGCATGGAAG GGCCATCGCTCAACGGATAAAAGCTACCCCGGGGATAACAGGCTTATCTCCCCCAAGAGTCCACATCGAC GGGGAGGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCGTCGCATCCTGGGGCTGTAGTCGGTCCCAAGGGTTGGGCTG TTCGCCCATTAAAGCGGCACGCGAGCTGGGTTCAGAACGTCGTGAGACAGTTCGGTCCCTATCCGTCGCG GGCGCAGGAAATTTGAGAGGAGCTGTCCTTAGTACGAGAGGACCGGGATGGACACACCGCTGGTGTACCA GTTGTTCCGCCAGGAGCATCGCTGGGTAGCTATGTGTGGCAGGGATAAACGCTGAAAGCATCTAAGCGTG AAGCCCCCCTCAAGATGAGATTTCCCATTTCTTCGGAAAGTAAGATCCCTGAAAGATGATCAGGTAGATA GGTTTGGAGTGGAAGTGTAGCGATACATGGAGCGGACAAATACTAATCGATCGAGGACTTAACCAAAAAA TGAAACGAAGTTACCTAACTGAACACTTTCTTCTCTAGTTTTGAGAGAGCAATCTTTCAACAACTCAATA TTGTCTGGTAGTTATGGCGAGAAGGTCACACCCGTTCCCATCCCGAACACGGTAGTTAAGCTTCTCTGCG CCAATGGTAGTTGGGGGCTTCCCCCTGCGAGAGTAGGTCGCTGCCGGGCAGTATTTCTGGAGGTTTAGCT CAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCATTTTTTATG CCGGCTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAACTGATTTGTAATCAGTAGGTCGCGAGTTCGACTCTTGCAGCCGG CACCATTAATATTAACTTTATAATAATACATATTTTTTATTGTAGAGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAG CATCTGACTTTTAATCAGAGGGTCGCTGGTTCGAACCCAGCACGGCTCACTTTTGCGGGTGTGGCGGAAT TGGCAGACGCACCAGATTTAGGATCTGGCGCCGCGAGGCGTGGGGGTTCAAGTCCCTTCACCCGCACTTA TTTTAAATATGCGGAAGTAGTTCAGTGGTAGAACATCACCTTGCCAAGGTGGGGGTCGCGGGTTCGAACC CCGTCTTCCGCTTGTTTACAAAAGTTCCAATATGCCGGGGTGGCGGAACTGGCAGACGCACAGGACTTAA AATCCTGCGGATAGTGATATCCGTACCGGTTCGATTCCGGTCCTCGGCATTATTTTTATATGCGCCCATA GCTCAACTGGATAGAGTACTTGACTACGAATCAAGCGGTTAGAGGTTCGACTCCTCTTGGGCGCACTTTA TTAAACGGGAAGTAGCTCAGCTTGGTAGAGCACTTGGTTTGGGACCAAGGGGTCGCAGGTTCGAATCCTG TCTTCCCGATTGTTTTGAATTTTATTATGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAG GAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCAAATTATTTCTAAAAATGTGTTGACATTGTTTAGAGA ATAGAGTAAGATATAAAAGTTGCTGCTAAAGGCAACGAAGAAGAAAAAGTGACCTTTGAAAACTGAACAA AGAAGAAGACGAAAAGCAATGAGACGTAAAGTCTCACTGGTAATCGCAGGGCAGAAAACAGAAAGCTGTT TTCAACAAAACAAACTAGTAATTTAATTGCTAGCGAAGTCAATTTGACGCAAGGAATCTTATTCACGGTG TTGAATAAGTATTCAAATTCAATTTATATTTTAAAGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCG GCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAACGAACGGAGGAAGAGCTTGCTCTTCCAATGTTAGTGGCGGACGGG TGAGTAACACGTGGGCAACCTGCCTGTAAGTTGGGGATAACTCCGGGAAACCGGGGCTAATACCGAATGA TAAAGTGTGGCGCATGCCACGCTTTTGAAAGATGGTTTCGGCTATCGCTTACAGATGGGCCCGCGGTGCA TTAGCTAGTTGGTAGGGTAATGGCCTACCAAGGCAACGATGCATAGCCGACCTGAGAGGGTGATCGGCCA CACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTCCGCAATGGACGAAA GTCTGACGGAGCAACGCCGCGTGTATGAAGAAGGTTTTCGGATCGTAAAGTACTGTTGTTAGAGAAGAAC AAGGATAAGAGTAACTGCTTGTCCCTTGACGGTATCTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCA GCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTGTCCGGATTTATTGGGCGTAAAGCGCGCGCAGGCGGTCTTT TAAGTCTGATGTGAAAGCCCCCGGCTTAACCGGGGAGGGTCATTGGAAACTGGAAGACTGGAGTGCAGAA GAGGAGAGTGGAATTCCACGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATGTGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCG ACTCTCTGGTCTGTAACTGACGCTGAGGCGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAG TCCACGCCGTAAACGATGAGTGCTAAGTGTTAGGGGGTTTCCGCCCCTTAGTGCTGCAGCTAACGCATTA AGCACTCCGCCTGGGGAGTACGACCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGG TGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCTTTGACCACTCTG GAGACAGAGCTTTCCCTTCGGGGACAAAGTGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGA TGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGATTTTAGTTGCCAGCATTTAGTTGGGCACTCTAAA GTGACTGCCGGTGCAAGCCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGACCTGGGCT ACACACGTGCTACAATGGATAGTACAAAGGGTCGCGAAGCCGCGAGGTGGAGCTAATCCCATAAAACTAT TCTCAGTTCGGATTGTAGGCTGCAACTCGCCTACATGAAGCCGGAATCGCTAGTAATCGTGGATCAGCAT GCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACGAGAGTTTGTAACACCCGAA GTCGGTAGGGTAACCTTTATGGAGCCAGCCGCCGAAGGTGGGACAGATAATTGGGGTGAAGTCGTAACAA GGTAGCCGTATCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCTAAGGAAAAGGAAACCTGTGAGTTTTCGTT CTTCTCTATTTGTTCAGTTTTGAGAGGTTAGTACTTCTCAGTATGTTTGTTCTTTGAAAACTAGATAAGA AAGTTAGTAAAGTTAGCATAGATAATTTATTATTTATGACACAAGTAACCGAGAATCATCTGAAAGTGAA TCTTTCATCTGATTGGATGTATCATCGCTGATACGGAAAATCAGAAAAACAACCTTTACTTCGTAGAAGT AAATTGGTTAAGTTAGAAAGGGCGCACGGTGGATGCCTTGGCACTAGGAGCCGAAGAAGGACGGGACTAA CACCGATATGCTTTGGGGAGCTGTACGTAAGCATTGATCCAGAGATTTCCGAATGGGGGAACCCACTATC TTTAGTCGGATAGTATCCTTACGTGAATACATAGCGTGAGGAAGGCAGACCCAGGGAACTGAAACATCTA AGTACCTGGAGGAAGAGAAAGAAAAATCGATTTCCTGAGTAGCGGCGAGCGAAACGGAAAGAGCCCAAAC CAAGAAGCTTGCTTCTTGGGGTTGTAGGACACTCTATACGGAGTTACAAAAGAAAGTTATAAATGAAGCG GTCTGGAAAGGCCCGCCAAAGACGGTAACAGCCCGGTAGTTGAAATAGCTTTCCCTCCAGAGTGGATCCT GAGTACGGCGGAACACGTGAAATTCCGTCGGAATCCGGGAGGACCATCTCCCAAGGCTAAATACTCCCTA GTGACCGATAGTGAACCAGTACCGTGAGGGAAAGGTGAAAAGCACCCCGGAAGGGGAGTGAAACAGTTCC TGAAACCGTGTGCCTACAAGTAGTTAGAGCCCGTTAATGGGTGATAGCGTGCCTTTTGTAGAATGAACCG GCGAGTTACGATTTGTTGCAAGGTTAAGCGGAAAAAGCGGAGCCGTAGCGAAAGCGAGTCTGAATAGGGC GCATAAGTAACAGGTCGTAGACCCGAAACCAGGTGATCTACCCATGTCCAGGATGAAGGTAAGGTAATAC TTACTGGAGGTCCGAACCCACGCACGTTGAAAAGTGCGGGGATGAGGTGTGGGTAGCGGAGAAATTCCAA TCGAACTTGGAGATAGCTGGTTCTCTCCGAAATAGCTTTAGGGCTAGCCTCGAGGTAAAGAGTCATGGAG GTAGAGCACTGTTTGGACTAGGGGCCCTTCTCGGGTTACCGAATTCAGATAAACTCCGAATGCCATGTAC TTATACTCGGGAGTCAGACTGCGAGTGATAAGATCCGTAGTCGAAAGGGAAACAGCCCAGACCACCAGTT AAGGTCCCCAAATATATGTTAAGTGGAAAAGGATGTGGGGTTGCTTAGACAACCAGGATGTTGGCTTAGA AGCAGCCACCATTGAAAGAGTGCGTAATAGCTCACTGGTCGAGTGACCCCGCGCCGAAAATGTACCGGGG CTAAACATATTACCGAAACTGTGGATGAACCTCTTTAGAGGTTCGTGGTAGGAGAGCGTTCTAAGGGCGG TGAAGTCAGACCGGAAGGACTGGTGGAGCGCTTAGAAGTGAGAATGCCGGTATGAGTAGCGAAAGAAGGG TGAGAATCCCTTCCACCGAATATCTAAGGTTTCCTGAGGAAGGCTCGTCCGCTCAGGGTTAGTCGGGACC TAAGCCGAGGCCGATAGGCGTAGGCGATGGACAACAGGTAGAGATTCCTGTACCAGTGCTAATTGTTTAA CCGATGGGGTGACACAGAAGGATAGGGAATCGCACGAATGGAAATGTGCGTCCAAGCAGTGAGTGTGAGA AGTAGGCAAATCCGCTTCTCGCGAAGCATGAGCTGTGATGGGGAAGGAAATTAAGTACGGAAGTTCCTGA TTTCACGCTGTCAAGAAAAGCCTCTAGGAAGAGTAGTACTGCCCGTACCGCAAACCGACACAGGTAGATG AGGAGAGAATCCTAAGGTGAGCGAGAGAACTCTCGTTAAGGAACTCGGCAAAATGACCCCGTAACTTCGG GAGAAGGGGTGCTCTATTAGGGTGCAAGCCCGAGAGAGCCGCAGTGAATAGGCCCAGGCGACTGTTTAGC AAAAACACAGGTCTCTGCAAAACCGTAAGGTGACGTATAGGGGCTGACGCCTGCCCGGTGCTGGAAGGTT AAGAGGAGTGCTTAGCTTCGGCGAAGGTACGAATTGAAGCCCCAGTAAACGGCGGCCGTAACTATAACGG TCCTAAGGTAGCGAAATTCCTTGTCGGGTAAGTTCCGACCCGCACGAAAGGCGCAACGATCTGGGCACTG TCTCAACGAGAGACTCGGTGAAATTATAGTACCTGTGAAGATGCAGGTTACCCGCGACAGGACGGAAAGA CCCCGTGGAGCTTTACTGCAACCTGATATGGAATGTTTGTACCGCTTGTACAGGATAGGTAGGAGCCGAA GAGACGTGTGCGCTAGCATACGAGGAGGCAATGGTGGGATACTACCCTGGCTGTATGACCATTCTAACCC GCCACGCTTAGCGCGTGGGGAGACAGTGTCAGGTGGGCAGTTTGACTGGGGCGGTCGCCTCCTAAAGAGT AACGGAGGCGCCCAAAGGTTCCCTCAGAATGGATGGAAATCATTCGCAGAGTGTAAAGGCACAAGGGAGC TTGACTGCGAGACTGACAAGTCGAGCAGGGACGAAAGTCGGGCTTAGTGATCCGGTGGTTCCGCATGGAA GGGCCATCGCTCAACGGATAAAAGCTACCCCGGGGATAACAGGCTTATCTCCCCCAAGAGTCCACATCGA CGGGGAGGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCGTCGCATCCTGGGGCTGTAGTCGGTCCCAAGGGTTGGGCT GTTCGCCCATTAAAGCGGCACGCGAGCTGGGTTCAGAACGTCGTGAGACAGTTCGGTCCCTATCCGTCGC GGGCGCAGGAAATTTGAGAGGAGCTGTCCTTAGTACGAGAGGACCGGGATGGACACACCGCTGGTGTACC AGTTGTTCCGCCAGGAGCATCGCTGGGTAGCTATGTGTGGCAGGGATAAACGCTGAAAGCATCTAAGCGT GAAGCCCCCCTCAAGATGAGATTTCCCATTTCTTCGGAAAGTAAGATCCCTGAAAGATGATCAGGTAGAT AGGTTTGGAGTGGAAGTGTAGCGATACATGGAGCGGACAAATACTAATCGATCGAGGACTTAACCAAAAA ATGAAACGAAGTTACCTAACTGAACACTTTCTTCTCTAGTTTTGAGAGAGCAATCTTTCAACAACTCAAT ATTGTCTGGTAGTTATGGCGAGAAGGTCACACCCGTTCCCATCCCGAACACGGTAGTTAAGCTTCTCTGC GCCAATGGTAGTTGGGGGCTTCCCCCTGCGAGAGTAGGTCGCTGCCGGGCAATTTGAAAAGTCCTAATTA TTTAGGGCTTTTTTTGTTTGTAAAAGATAAATAAATTGCTAATAGGTGGGGATATCTAGTATAATTAAAG TCAAAAATAGTCAAAGTCAATGATTTGCAAAAAACAGAAAGGAGATTCCTTATAATGAAAAATATTTCTG ATATTATAGAAGCTTATTTGAAACAAGTATTGGAATCTAGTGAAGCAGTTGAAATTAAAAGAAGTGAAAT TGCAGATAAGTTTGAATGTGTACCTTCACAAATTAACTATGTAATAAACACTAGATTTACAATGGAACGA GGGTATATTGTTGAAAGCAAACGTGGTGGTGGTGGATATATTCGGATTATTAAAGTGAAAATGAATGATA AACTTCAATTGTTAGAAGCAATCATTTCAATGGTTCATGATAAAAAGGTCTCTCAATCATTTTCTGAAGA TGTTATTTTGAGGTTGCTTGAAGAAGAAGTAATAACGAAGAAAGAAGCAAGATTAATGGTTGCGGCATTG GACCGTGAAGTTTTAATTTTACCTTTACCGGATAGAGATATTTTGAGAAGTAGGATTTTAGAGGCGATGT TAGTTGCTTTGAAATATGATTAA***fin des 9aas, voir adresses*** GGTGTGATGACGATGATTTGTCAAAGATGTGGAGAAAATAAAGCAGT TATAGCCTTGCAACAATTAAATGAGCTTGGGAAAGTGGAGTCATTGTACCTATGCGAGAATTGTGCTACG GACGAAGCTCTCTCCTCAGAAAAAGATTTAGTTAAAGCGATGGACACTTTTAGTGAGGTTGCTCTTGATT TCTTAACGCTTTTGCAAAAAGAGGAAAATACGCAGAAAGAGGTTGTCTGTGAGAATTGCCAGCTTAGTTT TGAAGAGTTTTTAAAGACTAATCGAGTTGGATGTCCGGAGTGTTATTCGGCTTTTGAGGCACAGTTAGTA CCGATTATTGGTCGAGTGCAAAATGGATATAAAAAACATATTGGTAAGGTTCCAGCAGAAGTTGAACGAG CGGAAGGTGTACAAAATGAAATTAGTCGTTTACAAGAAAAGTTAGCAAAGCTAGTTAAAAATGAGGAGTT TGAGGAAGCTGCTGTTGTCCGTGATGAAATCAAGGCTTTGAAAGCTGGAGGTGAGGATAAATGAATGTAT TTGAACCGCGGCTTAGTTCTTGGTTAGAAAATGCTGGTGATGACGATGATGTCGTTTTAAGCTCACGTAT TAGGCTTGCTAGGAATTTGAAGGATGAACAGTTTCCGATTTATGAGCAGAAGGAAGAGATTGTCGATAAT ATTGCCGAAGTTTTTGATGATAATTTTATTTTGATTAAAATGAATCAAATTTCTTTGTTACAAAAGGCTC TTTTGGTGGAAAAACATTTAATTAGTCCTTATATGATGAATAAGAGTGAATATGGTGCGGTTCTTTTAAA TGAGGAAGAAAATGTGAGTATTATGTTGAATGAAGAAGATCATTTGCGGATACAGTGTATGACGCCTGGC TTGAGATTATTCGATGCGTTAGAGGCAGCGTTGCAAATTGATGGTTATGTGGAAGAGAAGCTTAGTTATG CTTTTGATAAAGAGTTTGGATATTTGACGAGTTGTGTGACTAATATTGGGACTGGGATGCGCGCTTCTGT GATGGTACATTTACCGGGACTTGTAACAACAAAAAGGATTAAAAGTGTGATTGAAGCGATTAGGAGCCTA GGTTTTGTGGTAAGAGGTATATACGGAGAAGGTAGCATGCCTGCAAGTAATATTTTCCAGGTCTCAAATC AAGTAACTCTGGGCAAAACGGAAGCAGAAATTGTGGAAGATTTAACTCAAGTCATGGAACAAATTATCAT GCAAGAGCGTGTCGCTAGAACTACATTGAAGCAAAAATTTCATATTGCACTTGAAGATAGAGTTTTTAGA TCATATGGTTTATTGATGAATTGTCGAATTATTTCTATGAAAGAAGCTGCGGATGCTATTTCGGATATAC GATTTGGTGTAGAATTAGGATTTTTCGAGCATATTTCTCGCCAAAAAATGAATGAATTGGTACTATTCTC GCAACCAGCTTTTTTGAGAAGAGAAGCAGGACGAGATATGGATGAATTAGAAGAGAAAGTAATACGGGCC AAAGTGATTCGCGAGATTTTGGGCGATAAATGATGAGGCTTACGATAAGGAGGAAACAACAATGATGTTT GGACGATTTACGCAAAGAGCTCAGAAAGTACTCGCGTTGTCACAAGAAGAGGCGATGCGTTTGAATCATA GTAATTTAGGAACAGAACATATTTTATTAGGGCTTGTAAGAGAAGGCGAAGGAATTGCGGCGAAAGCTCT CTATGAACTGGGAATTAGTTCTGAAAAAGTGCAGCAAGAGGTAGAGGGATTAATTGGGCATGGGGAAAAA GCTGTGACGACGATCCAATATACACCTCGTGCGAAAAAAGTAATTGAACTTTCCATGGATGAGGCTCGTA AATTAGGCCATACTTACGTTGGGACAGAACATATCTTACTTGGGCTTATTCGTGAAGGCGAAGGAGTTGC GGCACGCGTTTTAAGTAATCTTGGTATTAGTTTGAATAAAGCTCGGCAGCAAGTTCTACAGCTCTTAGGC GGCGGTGATGCTACTGGGGCGGGGAGACAAACAAATACGCAAGCTACACCGACTTTAGATAGTTTGGCAC GTGACTTAACGGTTATTGCTCGGGAAGATAATTTGGATCCGGTTATTGGTCGTTCTAAAGAAATCCAACG TGTGATTGAAGTACTTAGTCGCCGGACGAAAAATAACCCGGTACTCATTGGGGAACCTGGTGTCGGTAAA ACAGCGATTGCTGAAGGCTTAGCGCAACAAATTGTTCGTAATGAAGTACCTGAGACCTTACGTGGAAAAC GTGTAATGACATTGGATATGGGAACTGTTGTGGCAGGTACAAAATATCGTGGTGAATTCGAAGACCGTTT GAAGAAAGTAATGGATGAAATTCGCCAAGCTGGTAATGTTATTCTATTTATTGATGAGTTGCATACTTTA ATTGGTGCTGGTGGGGCGGAAGGTGCGATTGATGCATCGAATATCTTGAAGCCACCTCTAGCTCGTGGAG AGTTGCAATGTATTGGGGCAACAACGCTGGACGAGTACCGTAAATATATTGAAAAAGATGCTGCGCTTGA GAGACGTTTCCAACCGATTAAAGTAGACGAACCAACTGTAGAAGAATCTATTCAAATTTTACATGGATTG CGTGATCGTTATGAAGCGCATCACCGAGTTGCAATTACGGATGAAGCACTTGAGGCCGCTGTTCGTTTAT CTGATCGCTATATTTCAGACCGTTTCTTACCTGATAAAGCGATTGATGTTATCGATGAATCTGGTTCTAA AGTACGTTTGAAATCTTTTACAACGCCAAAAAATGTAAAAGAAATGGAAAATAATTTATCCGATTTGAAA AAAGAAAAAGATGCGGCTGTTCAAGGTCAAGAATTTGAAAAAGCAGCGTCATTACGTGATAAAGAACAAA AACTCAAAAAATCATTAGAAGAAACTAAAGCGAATTGGCAAGAAAAACAAGGGCTTGACCATAGTGAAGT AACAGAAGATATTGTCGCTGAAGTGGTTGCTAGTTGGACTGGGATTCCAGTTGCGAAACTTGCGGAAACA GAGACAAATAAACTGTTAAATATGGAAAAACTTTTACATGAACGTGTGATTGGACAAGATGCAGCGGTTA AAGCTGTATCGCTAGCTGTACGTCGAGCTCGTGCAGGCCTTAAAGATCCGAAACGTCCGATTGGTTCCTT TATTTTCCTTGGACCTACTGGTGTTGGGAAAACAGAACTTGCGCGTGCACTTGCTGAGTCGATGTTTGGC GATGAGGATTCGATGATTCGGATTGATATGTCTGAGTACATGGAGAAATTTTCAACTGCTCGTTTAGTTG GGGCTCCTCCAGGTTATGTAGGATACGAAGAAGGTGGACAGCTGACAGAAAAAGTTCGGCAAAAACCTTA TTCAGTAGTCCTTTTAGATGAAATTGAAAAAGCACATCCGGATGTATTTAATATGTTGCTACAAGTACTG GATGATGGACGTTTGACTGATTCTAAAGGGCGAGTAGTTGATTTTAGAAATACAGTTATCATTATGACTT CCAATATTGGAGCTCAAGAAATGAAACAAGATAAATCAATGGGCTTTAATGTTACTGATCCACTTAAAGA CCATAAAGCGATGGAGCACCGCGTTTTACAAGATTTAAAACAGGCGTTCCGACCAGAATTTATCAACCGA ATTGATGAAACAATTGTATTCCATTCGCTGCAAGAAAAAGAATTGAAACAAATTGTTACTTTACTAACTG CTCAATTAACAAAACGCTTAGCCGAACGCGATATTCACGTGAAATTAACTGAAGGTGCGAAATCCAAAAT CGCTAAAGATGGCTACGATCCAGAGTACGGAGCTCGTCCTTTAAAACGGGCTATTCAAAAAGAAGTGGAA GACATGCTTTCTGAAGAATTGCTTCGTGGTAACATTAAAGTAGGCGATTACGTTGAAATTGGTGTGAAAG ATGGCAAGTTAGAGGTTAGAAAAAAAGATGCTCCTAAAAAGAAAACAACCTCTAAAAAAGTAAAAGCTAA ATAAGTAGAAAGCCTTCCTTAATAAAAAGTTAAGGGAGGTTTTTTATGAAAAATCATGATTCGCGTCAAA AAAACGAATTTGATGAAAAGGGTTAACGCGAACAGATGATCTGTGGTAAAATGGAGCATATGTATGGAGG GATGTATAAATGGCTAAAGCAAAAAGGACAACCAAATTTGTGTGTCAGGCATGTGGATATGAATCGGCAA AATGGATGGGAAAATGTCCGAATTGCAACGAGTGGAATCAGATGGTAGAAGCCTTAGAACCGTCAAAAAA ATCACGCTCAGCTTTCAATCATACAGGAGAGCCTTCAAAAGCGACTCCAATTACTCAAATAGCAAGTGAA ACAGAAAAACGAGTTGAAACAAATATGCCCGAGTTAAATAGAGTTCTTGGTGGCGGTGTGGTTCCTGGGT CTATGGTACTTGTCGGAGGAGACCCTGGTATTGGTAAATCAACATTGTTATTACAAGTATCAGCGCAACT CACACTTACAAATAAAAAAGTATTGTATATCTCAGGAGAAGAATCAATCAAACAAACGAAGCTACGGGCA GAACGCTTGCAAGTTTCGGGAGATAATTTATATGTGTATGCAGAAACAAATTTAGAAGCAGTTCAAGAAA CGATTGATTTTGTAAAACCTGATTTTGTAGTCATTGACTCTATTCAGACTGTTTATCATTCTGATGTTAC AAGTGCAGCAGGGAGTGTTTCTCAAGTTAGGGAATGTACAGCGACATTGATGCGAATTGCTAAAATGCAA AACATCGCTATCTTTATTGTTGGGCATGTAACTAAGGAAGGTGCTATTGCGGGACCGCGCCTATTAGAAC ATATGGTTGATACTGTACTCTATTTTGAAGGGGAGCGTCACCATGCTTACCGGATTTTGCGTGCAGTGAA AAACCGTTTTGGTTCCACTAACGAAATGGGTATATTTGAAATGCGAGATGTAGGACTTGTTGAAGTTGCT AATCCTTCCGAGGTATTCTTGGAAGAACGTCTTGAAGGCGCTTCAGGCTCAACGGTTGTAGCTTCTATGG AAGGAACTCGCCCCGTCCTTGTGGAAATACAAGCGCTTGTTTCGCCAACGATGTTCGGTAATGCTAAGCG AATGGCGACGGGAATAGACTACAACAAAGTTTCGCTAATTATGGCTGTTTTAGAAAAGCGAGTAGGTTTA ATGTTGCAAAACCAAGATGCTTATTTGAAAGCGGCGGGCGGGGTTAAATTGGATGAGCCTGCAGTGGATT TGGCGGTTGCAGTCAGTGTTGCATCTAGTTATCGTGATAAACCAACAAGAAGTACGGACTGCTTTATTGG GGAACTTGGACTTACAGGTGAAATTCGTCGTGTAGCAAGAATTGAACAACGCGTACAAGAAGCAGCAAAA CTTGGCTTTAAGCGAATTTTTATTCCTAAAAATAACGAAGGTAATTGGAAAATACCGAAAGACGTGCAAG TGGTTGGGGTGGAAACGATTGGAGAAGCTTTGAAGAAAGCTTTACCAGATTAAAAATAAATACTTCGTTG ATTCCGTGAGTACTATTTGCGGTATAGTCTTTTAATAGTGTAAAATAGTGCTATATGTATATTTGGTAAT AGCCCAATTATACATATAAATTTAAAAATGGAAAGGAGGAAACTAAATGCTTACATGGGTAATTCGAGTG TGTTTTTTAATTCTAGGTGGGACAACGGGAGTCTTTTCACTACCTGCTCTATGGGTAAAACTTGGAATAG GTCACATTCTGCTAATTAATAATCCTTATACTGATGCTCTGATTGGTGCACTTATATTTTATCTTATTAC TTTCTGGGCGGTGAAATATGTAGAAGCCGCACTTAATTGGTTAGAGGAAAAGTTAGCTAAAATTGCTATT GCAACCCTTGTTTATGGGGGACTTGGTTTATTTGTAGGTTTGGTCATTGCGTTTTTCGCGAGCAATGCAT TAAGTCAAACAAATATTCCGCTTTTAAATTCAGTAGTACCAGTTATTTTAACATTAGTTTTAGGTTATTT AGGGTTCCGTATCGGAATTAGTCGTCGTAACGAATTTGGGAATTTTGTCAATAACAGAAATGCAAAGAAA AGAACACCAGAAGAAGAGAAAACAGAAGAGAAATCTAAGAAAACATATAAAATTTTGGATACGAGCGTAA TTATTGATGGTCGTATTGCAGACATTTTGACTACTGGATTTTTAGATGGAACGGTGGTTATTCCACTATT
lmo gtRNAdb
[modifier | modifier le wikicode]****prélèvements du 4.5.19****** >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Ala-TGC-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna10) chrI:237613-237688 (+) Ala (TGC) 76 bp Sc: 81.8 GGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGtCAGCGGTTCGATC CCGCTAGGCTCCACCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Ala-TGC-1-2 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna31) chrI:2401160-2401235 (-) Ala (TGC) 76 bp Sc: 81.8 GGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGtCAGCGGTTCGATC CCGCTAGGCTCCACCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Ala-TGC-1-3 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna26) chrI:2635054-2635129 (-) Ala (TGC) 76 bp Sc: 81.8 GGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGtCAGCGGTTCGATC CCGCTAGGCTCCACCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Ala-TGC-2-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna54) chrI:1744244-1744316 (-) Ala (TGC) 73 bp Sc: 74.9 GGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGtCAGCGGTTCGATC CCGCTAGGCTCCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Arg-ACG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna8) chrI:237436-237509 (+) Arg (ACG) 74 bp Sc: 72.3 GCGCCCATAGCTCAACTGGAtAGAGTACTTGACTACGAATCAAGCGGtTAGAGGTTCGAC TCCTCTTGGGCGCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Arg-ACG-1-2 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna52) chrI:1744423-1744496 (-) Arg (ACG) 74 bp Sc: 72.3 GCGCCCATAGCTCAACTGGAtAGAGTACTTGACTACGAATCAAGCGGtTAGAGGTTCGAC TCCTCTTGGGCGCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Arg-CCG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna29) chrI:2499138-2499209 (-) Arg (CCG) 72 bp Sc: 58.6 GCCCTCGTGGTGCAACGGAtAGCACGTAAGATTCCGGTTCTTAAAaTGGGGGTTCGATTC CCTCCGAGGGCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Arg-CCT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna17) chrI:1778259-1778330 (+) Arg (CCT) 72 bp Sc: 52.0 GCCCATATAGTTAAACGGAtATAACAAGCCCCTCCTAAGGGCTAGtTCGTGGTTCGATTC CGCGTATGGGCG >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Arg-TCT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna16) chrI:1225644-1225717 (+) Arg (TCT) 74 bp Sc: 76.1 GTCCTGATAGCTCAGCTGGAtAGAGCAACGGCCTTCTAAGCCGTCGGtCGGGGGTTCGAA TCCCTCTCAGGACG >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Asn-GTT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna32) chrI:2397777-2397852 (-) Asn (GTT) 76 bp Sc: 87.0 TCCACAGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATCGGCTGTTAACCGATCGGtCGCAGGTTCGAGT CCTGCCTGTGGAGCCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Asn-GTT-1-2 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna27) chrI:2631670-2631745 (-) Asn (GTT) 76 bp Sc: 87.0 TCCACAGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATCGGCTGTTAACCGATCGGtCGCAGGTTCGAGT CCTGCCTGTGGAGCCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Asn-GTT-2-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna11) chrI:917694-917766 (+) Asn (GTT) 73 bp Sc: 80.2 TCCACAGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATCGGCTGTTAACCGATCGGtCGCAGGTTCGAGT CCTGCCTGTGGAG >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Asn-GTT-2-2 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna64) chrI:1743285-1743357 (-) Asn (GTT) 73 bp Sc: 80.2 TCCACAGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATCGGCTGTTAACCGATCGGtCGCAGGTTCGAGT CCTGCCTGTGGAG >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Asp-GTC-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna59) chrI:1743735-1743810 (-) Asp (GTC) 76 bp Sc: 71.5 GGTTCCGTGGTGTAGGGGTtAACATGCCTGCCTGTCACGCAGGAGAtCGCGGGTTCAAAT CCCGTCGGGACCGCCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Asp-GTC-1-2 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna37) chrI:2397268-2397343 (-) Asp (GTC) 76 bp Sc: 71.5 GGTTCCGTGGTGTAGGGGTtAACATGCCTGCCTGTCACGCAGGAGAtCGCGGGTTCAAAT CCCGTCGGGACCGCCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Asp-GTC-2-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna14) chrI:921918-921990 (+) Asp (GTC) 73 bp Sc: 64.6 GGTTCCGTGGTGTAGGGGTtAACATGCCTGCCTGTCACGCAGGAGAtCGCGGGTTCAAAT CCCGTCGGGACCG >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Cys-GCA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna44) chrI:2396647-2396720 (-) Cys (GCA) 74 bp Sc: 78.9 GGCGCCATAGCCAAGTGGTAAGGCAGAGGTCTGCAAAACCTTTAtCACCGGTTCAAATCC GGTTGGCGCCTCCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Gln-TTG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna22) chrI:2216389-2216460 (+) Gln (TTG) 72 bp Sc: 69.9 TGGGCTATAGCCAAGCGGTAAGGCAACGGATTTTGATTCCGTCATgCGCTGGTTCGAATC CAGCTAGCCCAG >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Gln-TTG-2-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna42) chrI:2396817-2396888 (-) Gln (TTG) 72 bp Sc: 68.9 TGGGCCATAGCCAAGCGGTAAGGCAACGGACTTTGACTCCGTCATgCGTTGGTTCGAATC CAGCTGGCCCAG >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Glu-TTC-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna13) chrI:921820-921891 (+) Glu (TTC) 72 bp Sc: 72.5 GGCCCGTTGGTCAAGCGGTtAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAaCACGGGTTCGAATC CCGTACGGGTCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Glu-TTC-1-2 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna66) chrI:1743083-1743154 (-) Glu (TTC) 72 bp Sc: 72.5 GGCCCGTTGGTCAAGCGGTtAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAaCACGGGTTCGAATC CCGTACGGGTCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Glu-TTC-1-3 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna19) chrI:2215982-2216053 (+) Glu (TTC) 72 bp Sc: 72.5 GGCCCGTTGGTCAAGCGGTtAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAaCACGGGTTCGAATC CCGTACGGGTCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Glu-TTC-1-4 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna34) chrI:2397577-2397648 (-) Glu (TTC) 72 bp Sc: 72.5 GGCCCGTTGGTCAAGCGGTtAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAaCACGGGTTCGAATC CCGTACGGGTCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Gly-GCC-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna50) chrI:1744606-1744680 (-) Gly (GCC) 75 bp Sc: 84.8 GCGGAAGTAGTTCAGTGGTAGAACATCACCTTGCCAAGGTGGGGGtCGCGGGTTCGAACC CCGTCTTCCGCTCCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Gly-GCC-2-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna6) chrI:237245-237316 (+) Gly (GCC) 72 bp Sc: 78.0 GCGGAAGTAGTTCAGTGGTAGAACATCACCTTGCCAAGGTGGGGGtCGCGGGTTCGAACC CCGTCTTCCGCT >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Gly-GCC-3-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna43) chrI:2396740-2396811 (-) Gly (GCC) 72 bp Sc: 77.0 GCGGAAGTAGTTCAGCGGTAGAACATCACCTTGCCAAGGTGGGGGtCGCGGGTTCGAACC CCGTCTTCCGCT >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Gly-TCC-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna15) chrI:952671-952741 (+) Gly (TCC) 71 bp Sc: 74.4 GCGGGTGTAGTTTAGTGGTAAAACTACAGCCTTCCAAGCTGTTGtCGTGGGTTCGATTCC CATCACCCGCT >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Gly-TCC-1-2 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna62) chrI:1743463-1743533 (-) Gly (TCC) 71 bp Sc: 74.4 GCGGGTGTAGTTTAGTGGTAAAACTACAGCCTTCCAAGCTGTTGtCGTGGGTTCGATTCC CATCACCCGCT >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-His-GTG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna41) chrI:2396918-2396990 (-) His (GTG) 73 bp Sc: 68.5 GCGGATGTGGCGAAGTGGTtAACGCACCTGATTGTGGTTCAGGCATtCGTGGGTTCGATT CCCATCATCCGCC >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-His-GTG-2-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna61) chrI:1743557-1743629 (-) His (GTG) 73 bp Sc: 66.7 GCGGATATGGCGAAGTGGTtAACGCACCTGATTGTGGTTCAGGCATtCGTGGGTTCGATT CCCATTATCCGCC >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Ile-GAT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna63) chrI:1743364-1743437 (-) Ile (GAT) 74 bp Sc: 81.2 GGGCCTATAGCTCAGCTGGTtAGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAGGtCGATGGTTCGAG TCCATTTAGGCCCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Ile-GAT-1-2 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna30) chrI:2401282-2401355 (-) Ile (GAT) 74 bp Sc: 81.2 GGGCCTATAGCTCAGCTGGTtAGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAGGtCGATGGTTCGAG TCCATTTAGGCCCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Ile-GAT-1-3 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna25) chrI:2635176-2635249 (-) Ile (GAT) 74 bp Sc: 81.2 GGGCCTATAGCTCAGCTGGTtAGAGCGCACGCCTGATAAGCGTGAGGtCGATGGTTCGAG TCCATTTAGGCCCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Ile2-CAT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna56) chrI:1744043-1744116 (-) Ile2 (CAT) 74 bp Sc: 81.9 GGACCTTTAGCTCAGTTGGTtAGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCGGtCGCAGGTTCGAG TCCTGCAAGGTCCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Leu-CAA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna45) chrI:2396518-2396601 (-) Leu (CAA) 84 bp Sc: 67.0 GCCGGCGTGGCGGAATTGGCaGACGCGCTGGACTCAAAATCCTGTGCCCGCAAGGGCGTG CCGGTTCGACCCCGGCCGCCGGTA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Leu-GAG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna18) chrI:2161315-2161398 (+) Leu (GAG) 84 bp Sc: 58.8 GCGGTCGTGGCGGAATCGGCaGACGCGCTAGGTTGAGGGCCTAGTGGGGTAAaACCCGTG GAGGTTCAAGTCCTCTCGGCCGCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Leu-TAA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna7) chrI:237338-237423 (+) Leu (TAA) 86 bp Sc: 68.4 GCCGGGGTGGCGGAACTGGCaGACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGGATAGTGATATCCG TACCGGTTCGATTCCGGTCCTCGGCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Leu-TAA-1-2 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna51) chrI:1744506-1744591 (-) Leu (TAA) 86 bp Sc: 68.4 GCCGGGGTGGCGGAACTGGCaGACGCACAGGACTTAAAATCCTGCGGATAGTGATATCCG TACCGGTTCGATTCCGGTCCTCGGCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Leu-TAG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna5) chrI:237149-237230 (+) Leu (TAG) 82 bp Sc: 67.5 GCGGGTGTGGCGGAATTGGCaGACGCACCAGATTTAGGATCTGGCGCCGCGAGGCGTGGG GGTTCAAGTCCCTTCACCCGCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Leu-TAG-1-2 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna49) chrI:1744696-1744777 (-) Leu (TAG) 82 bp Sc: 67.5 GCGGGTGTGGCGGAATTGGCaGACGCACCAGATTTAGGATCTGGCGCCGCGAGGCGTGGG GGTTCAAGTCCCTTCACCCGCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Lys-CTT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna1) chrI:80426-80498 (+) Lys (CTT) 73 bp Sc: 78.6 GGGTTGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCTGACTCTTAATCAGCGGGtCGGGGGTTCGAAA CCCTCACAACCCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Lys-TTT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna4) chrI:237071-237143 (+) Lys (TTT) 73 bp Sc: 83.0 GAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGGGtCGCTGGTTCGAAC CCAGCACGGCTCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Lys-TTT-1-2 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna48) chrI:1744783-1744855 (-) Lys (TTT) 73 bp Sc: 83.0 GAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGGGtCGCTGGTTCGAAC CCAGCACGGCTCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Lys-TTT-1-3 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna23) chrI:2216470-2216542 (+) Lys (TTT) 73 bp Sc: 83.0 GAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGGGtCGCTGGTTCGAAC CCAGCACGGCTCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Met-CAT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna55) chrI:1744128-1744201 (-) Met (CAT) 74 bp Sc: 69.4 GGCGGTGTAGCTCAGCTGGCtAGAGCATTCGGTTCATACCCGAAAGGtCGTGGGTTCGAC TCCCTCCGCCGCTA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Phe-GAA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna60) chrI:1743658-1743730 (-) Phe (GAA) 73 bp Sc: 72.3 GGCTTGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACTTGATTGAAGCTCAAGGTGtCGGCAGTTCGATT CTGTCCCAAGCCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Phe-GAA-1-2 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna38) chrI:2397191-2397263 (-) Phe (GAA) 73 bp Sc: 72.3 GGCTTGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACTTGATTGAAGCTCAAGGTGtCGGCAGTTCGATT CTGTCCCAAGCCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Pro-TGG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna9) chrI:237520-237593 (+) Pro (TGG) 74 bp Sc: 79.9 CGGGAAGTAGCTCAGCTtGGTAGAGCACTTGGTTTGGGACCAAGGGGtCGCAGGTTCGAA TCCTGTCTTCCCGA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Pro-TGG-1-2 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna53) chrI:1744339-1744412 (-) Pro (TGG) 74 bp Sc: 79.9 CGGGAAGTAGCTCAGCTtGGTAGAGCACTTGGTTTGGGACCAAGGGGtCGCAGGTTCGAA TCCTGTCTTCCCGA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Ser-CGA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna67) chrI:659138-659227 (-) Ser (CGA) 90 bp Sc: 69.9 GGAGAAATACCCAAGTCcGGCtgAAGGGGACAGACTCGAAATCTGTTAGGTGGTGTATGC CGCGCCGGGGTTCGAATCCCCGTTTCTCCG >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Ser-GCT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna65) chrI:1743160-1743250 (-) Ser (GCT) 91 bp Sc: 71.8 GGGGAAGTACTCAAGTGGCtgAAGAGGCGCCCCTGCTAAGGGTGTAGGTCGCTCGCGCGG CGCGAGGGTTCAAATCCCTCCTTCTCCGCCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Ser-GCT-2-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna12) chrI:917770-917857 (+) Ser (GCT) 88 bp Sc: 63.3 GGGGAAGTACTCAAGTGGCtgAAGAGGTGCCCCTGCTAAGGGTATAGGTCGCTCGCGCGG CGCGAGGGTTCAAATCCCTCCTTCTCCG >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Ser-GGA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna33) chrI:2397682-2397770 (-) Ser (GGA) 89 bp Sc: 73.6 GGAGAGCTGTCCGAGTGGCcgAAGGAGCACGGTTGGAAACCGTGTAGGCGGTGTAAGCTG TCTCAAGGGTTCGAATCCCTTGCTCTCCG >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Ser-TGA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna57) chrI:1743931-1744020 (-) Ser (TGA) 90 bp Sc: 74.2 GGAGGAATACCCAAGTCtGGCtgAAGGGATCGGTCTTGAAAACCGACAGGCGGGTAATAC CGCGCGGGGGTTCGAATCCCTCTTCCTCCG >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Thr-CGT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna20) chrI:2216211-2216284 (+) Thr (CGT) 74 bp Sc: 73.1 GCCGACTTAGCTCAATCtGGTAGAGCAACTGAATCGTAATCAGTAGGtTGCGGGTTCAAT TCCTGCAGTCGGCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Thr-GGT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna28) chrI:2631573-2631645 (-) Thr (GGT) 73 bp Sc: 73.8 GCCGCTTTAGCTCAGTTGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGGGGtCGTCGGTTCAAAT CCGACAAGTGGCT >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Thr-TGT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna3) chrI:236954-237029 (+) Thr (TGT) 76 bp Sc: 90.2 GCCGGCTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAACTGATTTGTAATCAGTAGGtCGCGAGTTCGACT CTTGCAGCCGGCACCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Thr-TGT-1-2 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna47) chrI:1744897-1744972 (-) Thr (TGT) 76 bp Sc: 90.2 GCCGGCTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAACTGATTTGTAATCAGTAGGtCGCGAGTTCGACT CTTGCAGCCGGCACCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Trp-CCA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna40) chrI:2397006-2397079 (-) Trp (CCA) 74 bp Sc: 66.2 AGGGGCATAGTTTAAAGGTAGAACTGAGGTCTCCAAAACCTCCAGTGTGGGTTCGATTCC TACTGCCCCTGCCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Tyr-GTA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna21) chrI:2216294-2216377 (+) Tyr (GTA) 84 bp Sc: 76.2 GGAGGGGTAGCGAAGTGGCtaAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCTTCGGGTtCGGTG GTTCGAATCCACTCCCCTCCACCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Tyr-GTA-1-2 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna39) chrI:2397087-2397170 (-) Tyr (GTA) 84 bp Sc: 76.2 GGAGGGGTAGCGAAGTGGCtaAACGCGGCGGACTGTAAATCCGCTCCTTCGGGTtCGGTG GTTCGAATCCACTCCCCTCCACCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Val-GAC-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna24) chrI:2893028-2893100 (+) Val (GAC) 73 bp Sc: 62.3 GGTCCTGTAGCTCAGTTGGGAGAGTATCACCTTGACATGGTGGGGGtCGCTGGTTCGAGA CCAGTCGGGACCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Val-TAC-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna35) chrI:2397445-2397520 (-) Val (TAC) 76 bp Sc: 83.6 GGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGtCAGCGGTTCGATC CCGTTAACCTCCACCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Val-TAC-2-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna2) chrI:236873-236945 (+) Val (TAC) 73 bp Sc: 76.7 GGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGtCAGCGGTTCGATC CCGTTAACCTCCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-Val-TAC-2-2 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna46) chrI:1744981-1745053 (-) Val (TAC) 73 bp Sc: 76.7 GGAGGTTTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGtCAGCGGTTCGATC CCGTTAACCTCCA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-fMet-CAT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna58) chrI:1743815-1743888 (-) fMet (CAT) 74 bp Sc: 72.7 CGCGGGGTGGAGCAGTCtGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAGGtCGTAGGTTCAAA TCCTGCCCCCGCAA >Listeria_monocytogenes_EGD_tRNA-fMet-CAT-1-2 (tRNAscan-SE ID: chrI.trna36) chrI:2397350-2397423 (-) fMet (CAT) 74 bp Sc: 72.7 CGCGGGGTGGAGCAGTCtGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAGGtCGTAGGTTCAAA TCCTGCCCCCGCAA
Les séquences intercalaires
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux: Les séquences intercalaires
- Légende:
- - Les séquences entre gènes de tRNAs, d'après les repérages du fasta NCBI, ne peuvent être déterminées qu'après avoir marqué les gènes. Aussi je présente ici le format fasta (70 bases par ligne) et j'ai intercalé des symboles pour pourvoir surligner les gènes comme indiqué dans les tableaux. Le nom du codon n'est pas indiqué ici mais on peut le retrouver dans la liste des adresses ci-dessous.
- - Symboles * $ @ ° respectivement pour le début du 1er gène (couleur jaune du tableau), du début du gène alterné (couleur bleu du tableau), du début du gène RNAr 5s si présent et finalement la fin du surlignage. Pour les 16 aas de lmo 2 aas sont séparés par les RNArs et donc j'ai mis les signes +++ pour l'indiquer.
- - Les anti-codons: Ils ne sont pas repérés ici car ce sont les intercalaires qui sont l'objet de ce chapitre. On peut cependant les localiser dans les tableaux en tenant compte des séquences "direct" ou "complement" (voir l’adressage de NCBI). Quand l'adresse est sous forme de "complement" la lecture du tRNA se fait de droite à gauche et à la 33 position l'anti-codon se lit de gauche à droite et est égal au nom du codon. Quand l'adresse est sous forme de "direct" la lecture du tRNA se fait de gauche à droite et à la 33 position l'anti-codon se lit de gauche à droite et est égal au nom de l'anti-codon.
- -Les intercalaires: Je les ai représentés ici sous forme d'une séquence par ligne pour pouvoir dénombrer facilement les bases avec l'outil de recherche.
Opérons à 21 aas
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Opérons à 21 aas
- Légende: voir la légende des intercalaires.
Opérons à 21 aas Bsu 43,6%GC 21 aas 1919 pb A 488 T 414 G 485 C 532 complement AAACAAAAAAACCTTGCAGGATATGCAAGGCTTCTGGA*TGACCCGTACGGGATTCGAACCCGTGTTACCG CCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGACCAACGGGCC°GATAATTATGATATCTGTAATCATA$TGGCG GAGAAGGAGGGATTTGAACCCTCGCGCCGCTTACACGACCTACACCCTTAGCAGGGGCGCCTCTTCAGCC ACTTGAGTACTTCTCC°ATT*TGGCTCCACAGGCAGGATTCGAACCTGCGACCGATCGGTTAACAGCCGATA GCTCTACCACTGAGCTACTGTGGA°ACAAAAGTCA$TGGTGGGCCTGAATGGACTCGAACCATCGACCTCAC GCTTATCAGGCGTGCGCTCTAACCAGCTGAGCTACAGGCCC°ATGACGATATAGAAA*TGGAGCGGGTGATG GGAATCGAACCCACGACATCAGCTTGGAAGGCTGAGGTTTTACCACTAAACTACACCCGC°AATTTTTATT $TGGGGCGATTGATGGGAATCGAACCCACGAATGCCAGAGCCACAATCTGGTGCGTTAACCACTTCGCCAC AACCGC°CAAAGCATATTGATAAA*TGGTGGCTCGGGACGGAATCGAACCGCCGACACACGGATTTTCAGTC CGTTGCTCTACCAACTGAGCTACCGAGCC°TAAGTATTTAAA$TGGCGGTCCGGACGGGACTCGAACCCGCG ACCTCCTGCGTGACAGGCAGGCATTCTAACCAACTGAACTACCGGACC°ATTTTAAAATT*TGGTTGCGGGG GCAGGATTTGAACCTGCGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCGAACTGCTCCACCCCGCGA°TGA TTAGGAATATGTA$TGGCGGAGGAAGAGGGATTCGAACCCCCGCGGGCTTTGACACCCCTGTCGGTTTTCA AGACCGATCCCTTCAGCCAGACTTGGGTATTCCTCC°GTATAG*TGGTGGACCTTGTAGGACTCGAACCTAC GACCGGACGGTTATGAGCCGTCTGCTCTAACCAACTGAGCTAAAGGTCC°AT$TGGTAGCGGCGGAGGGGAT CGAACCCCCGACCTCACGGGTATGAACCGTACGCTCTAGCCAGCTGAGCTACACCGC°CAAATATTTTTGA AATCAAG*TGGAGCCTAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAG CTAAGGCCCC°AAGAA$TGGTCGGGAAGACAGGATTCGAACCTGCGACCCCATGGTCCCAAACCATGTGCTC TACCAAGCTGAGCTACTTCCCG°ATTTCATATAGATCA*TGGCGCGCCCGAGAGGAGTCGAACCCCTAACCT TTTGATCCGTAGTCAAACGCTCTATCCAATTGAGCTACGGGCGC°AAAACTTAA$TGCCGAGGGCCGGACTT GAACCGGCACGGTAGTCACCTACCGCAGGATTTTAAGTCCTGTGTGTCTGCCAATTCCACCACCCCGGC°G TGGATGGTATAGT*TGGAGCGGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCCACCTTGGCAAGGTGGTGTTCTA CCACTGAACTACTTCCGC°AGAAA$TGGTGCGGATGAAGGGACTTGAACCCCCACGTCTGTAAAGACACTAG AGCCTGATTCTAGCGCGTCTGCCAATTCCGCCACATCCGC°AACATGTAAA*TGGTGAGCCATGAAGGACTC GAACCTTCGACCCTCTGATTAAAAGTCAGATGCTCTACCAACTGAGCTAATGGCTC°TTCTTACAATAGAC TTGAATATTATATCATATAAAAG$TGGTGCCGGCAAGAGGACTTGAACCCCCAACCTACTGATTACAAGTC AGTTGCTCTACCAATTGAGCTACACCGGC°ATATATGTAAAACCGATATGTATAATGAAAAA*TGGTGGAGG ATGACGGGCTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCCTCCA°TA CTTGCACTAACGTGCAA@TTGCTTGGCGGCGTCCTACTCTCACAGGGGGAAACCCCCGACTACCATCGGCG CTGAAGAGCTTAACTTCCGTGTTCGGTATGGGAACGGGTGTGACCTCTTCGCTATCGCCACCAAA°CAAAT lmo 37,9%GC 21 aas 1971 pb A 556 T 419 G 461 C 535 complement ACATTGTTTTTAGGA*TGACCCGTACGGGATTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAAC CGCTTGACCAACGGGCC°ATATC$TGGCGGAGAAGGAGGGATTTGAACCCTCGCGCCGCGCGAGCGACCTAC ACCCTTAGCAGGGGCGCCTCTTCAGCCACTTGAGTACTTCCCC°AGATATAAAAAGCTTATTCTCTTTTAA AGAATAA*CTCCACAGGCAGGACTCGAACCTGCGACCGATCGGTTAACAGCCGATTGCTCTACCAACTGAG CTACTGTGGA°ATAAAA$TGGGCCTAAATGGACTCGAACCATCGACCTCACGCTTATCAGGCGTGCGCTCTA ACCAGCTGAGCTATAGGCCC°CAGTAAAACTATATTCATGGTAAAA*AGCGGGTGATGGGAATCGAACCCAC GACAACAGCTTGGAAGGCTGTAGTTTTACCACTAAACTACACCCGC°ATAATATAATTTTAAAAACAAAG$G GCGGATAATGGGAATCGAACCCACGAATGCCTGAACCACAATCAGGTGCGTTAACCACTTCGCCATATCC GC°CATAAGGCAAAAATGTTTAAAAAAAGAA*TGGCTTGGGACAGAATCGAACTGCCGACACCTTGAGCTTC AATCAAGTGCTCTACCAACTGAGCTACCAAGCC°ATAA$TGGCGGTCCCGACGGGATTTGAACCCGCGATCT CCTGCGTGACAGGCAGGCATGTTAACCCCTACACCACGGAACC°ACTA*TTGCGGGGGCAGGATTTGAACCT ACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGACTGCTCCACCCCGCG°ACAATAATATTAAATTTTA GTCCACATATCACAAGTGAAAAA$CGGAGGAAGAGGGATTCGAACCCCCGCGCGGTATTACCCGCCTGTCG GTTTTCAAGACCGATCCCTTCAGCCAGACTTGGGTATTCCTCC°ATGATAATAATAAAGTGACAAG*TGGAC CTTGCAGGACTCGAACCTGCGACCGGACGGTTATGAGCCGTCTGCTCTAACCAACTGAGCTAAAGGTCC°A AGATTGAAAA$TAGCGGCGGAGGGAGTCGAACCCACGACCTTTCGGGTATGAACCGAATGCTCTAGCCAGC TGAGCTACACCGCC°ATAATAATAAGGCAACTATTTTCTACTTAAATGTGAAACAAG*TGGAGCCTAGCGGG ATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTAAGGCCCC°TTAATAATAAG GGATTAAACTA$TCGGGAAGACAGGATTCGAACCTGCGACCCCTTGGTCCCAAACCAAGTGCTCTACCAAG CTGAGCTACTTCCCG°TTTAATAAAG*TGCGCCCAAGAGGAGTCGAACCTCTAACCGCTTGATTCGTAGTCA AGTACTCTATCCAGTTGAGCTATGGGCGC°AAATATAAG$TGCCGAGGACCGGAATCGAACCGGTACGGATA TCACTATCCGCAGGATTTTAAGTCCTGTGCGTCTGCCAGTTCCGCCACCCCGGC°GTTGCTATAAAATA*TG GAGCGGAAGACGGGGTTCGAACCCGCGACCCCCACCTTGGCAAGGTGATGTTCTACCACTGAACTACTTC CGC°ATATTCCATAATAAG$TGCGGGTGAAGGGACTTGAACCCCCACGCCTCGCGGCGCCAGATCCTAAATC TGGTGCGTCTGCCAATTCCGCCACACCCGC°AAAAG*TGAGCCGTGCTGGGTTCGAACCAGCGACCCTCTGA TTAAAAGTCAGATGCTCTACCAACTGAGCTAACGGCTC°TCTACAATAAAAAATATGTATTATTATAAAGT TAATATTAA$TGGTGCCGGCTGCAAGAGTCGAACTCGCGACCTACTGATTACAAATCAGTTGCTCTACCAA CTGAGCTAAGCCGGC°ATAAAAAA*TGGAGGTTAACGGGATCGAACCGCTGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGA TGCTCTCCCAGCTGAGCTAAACCTCC°AGAAATACTGCCC@GGCAGCGACCTACTCTCGCAGGGGGAAGCCC CCAACTACCATTGGCGCAGAGAAGCTTAACTACCGTGTTCGGGATGGGAACGGGTGTGACCTTCTCGCCA TAACTACCA°GACAATATTGAAGTTGTTGAAAGATTGCTCTCTCAAAACTAGAGAAGAAAGTGTTCAGTTA bsu 21aas, séquences entre aas GATAATTATGATATCTGTAATCATA ATT ACAAAAGTCA ATGACGATATAGAAA AATTTTTATT CAAAGCATATTGATAAA TAAGTATTTAAA ATTTTAAAATT ATGATTAGGAATATGTA GTATAG AT AAATATTTTTGAAATCAAG AAGAA ATTTCATATAGATCA AAAACTTAA GTGGATGGTATAGT AGAAA AACATGTAAA TTCTTACAATAGACTTGAATATTATATCATATAAAAG ATATATGTAAAACCGATATGTATAATGAAAAA inter aas A 129 T 92 G 35 C 18 Total 274 19 %GC Total aas + inter A 488 T 414 G 485 C 532 tRNAs A 359 T 322 G 450 C 514 1645 59 %GC lmo 21aas, séquences entre aas ATATC AGATATAAAAAGCTTATTCTCTTTTAAAGAATAA ATAAAA CAGTAAAACTATATTCATGGTAAAA ATAATATAATTTTAAAAACAAAG CATAAGGCAAAAATGTTTAAAAAAAGAA ATAA ACTA ACAATAATATTAAATTTTAGTCCACATATCACAAGTGAAAAA ATGATAATAATAAAGTGACAAG AAGATTGAAAA ATAATAATAAGGCAACTATTTTCTACTTAAATGTGAAACAAG TTAATAATAAGGGATTAAACTA TTTAATAAAG AAATATAAG GTTGCTATAAAATA ATATTCCATAATAAG AAAAG TCTACAATAAAAAATATGTATTATTATAAAGTTAATATTAA ATAAAAAA inter aas A 197 T 108 G 36 C 29 Total 370 18 %GC Total aas + inter A 556 T 419 G 461 C 535 tRNAs A 359 T 311 G 425 C 506 1601 58 %GC
Opérons à 16 aas
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Opérons à 16 aas
- Légende: voir la légende des intercalaires. Ici pour le génome lmo, les 2 derniers aas ne sont pas en séquences avec les 14 1ers. J'ai signalé ceci par les signes ++++.
Opérons à 16 aas Bsu 43,6%GC 16 aas 1713 pb A 398 T 471 G 438 C 406 T*TCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCG GAGCCA°TTATT$GGAGAGCTGTCCGAGTGGTCGAAGGAGCACGATTGGAAATCGTGTAGGCGGTCAACTCC GTCTCAAGGGTTCGAATCCCTTGCTCTCCGCCA°CTGATACTTATACATAATTACAATTGAAAGTCTG*GGC CCGTTGGTCAAGCGGTTAAGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACACGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCA°T TATATGAT$GGAGGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAGCCC GTCATCCTCCACCA°TTATATCAT*CGCGGGGTGGAGCAGTTCGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAGG TCGCAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCAACCA°AATTTTAAAAT$GGTCCGGTAGTTCAGTTGGTTAGAATGCC TGCCTGTCACGCAGGAGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGGACCGCCA°TTTGAATACTTA*GGCTCGGTAG CTCAGTTGGTAGAGCAACGGACTGAAAATCCGTGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCCCGAGCCACCA°CCTA T$GCCGGTGTAGCTCAATTGGTAGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAGGTTGGGGGTTCAAGTCCTCTTGCC GGCA°CTGTTTTTTCAAAATTTAATGT*GGAGGGGTAGCGAAGTGGCTAAACGCGGCGGACTGTAAATCCGC TCCCTCAGGGTTCGGCAGTTCGAATCTGCCCCCCTCCACCA°TTTAT$AGGGGCATAGTTTAACGGTAGAAC AGAGGTCTCCAAAACCTCCGGTGTGGGTTCGATTCCTACTGCCCCTGCCA°AATTTATGACATCTTGAGAT TATG*GCGGTTGTGGCGAAGTGGTTAACGCACCAGATTGTGGCTCTGGCACTCGTGGGTTCGATTCCCATC AATCGCCCCA°TATTATCAT$TGGGCTATAGCCAAGCGGTAAGGCAACGGACTTTGACTCCGTCATGCGTTG GTTCGAATCCAGCTAGCCCAG°TCTCACTTTTTATATCAACTGCATATAATGTATTAAGTCCATTAAAAAT* GCGGAAGTAGTTCAGTGGTAGAACACCACCTTGCCAAGGTGGGGGTCGCGGGTTCGAATCCCGTCTTCCG CTCCA°ATTAC$GGCGGCATAGCCAAGTGGTAAGGCAGAGGTCTGCAAAACCTTTATCCCCGGTTCGAATCC GGGTGTCGCCT°TCTTATT*GCCGGGGTGGTGGAATTGGCAGACACACAGGACTTAAAATCCTGCGGTAGGT GACTACCGTGCCGGTTCAAGTCCGGCCCTCGGCACCA°ATTTTACTTACATGGTAAGTTGAATTGGTGTTT GTGTTTTATCATTATAACTAATCATATTAATGATCTACATAAGTAGATCATTTTTTTAATGCTTTGATTT ATCATAACAAGTTAAGTTCCGAGGCCTATTATAAAGCGGCTGTATAGCTAGTCTTTCAACACTTTTATTT TATATTTCCATAAAAACTTTTTTGAAATACGTTGACACTTTATGAGATCCATGATATATTTATATTCGTC GGTTAGATACGACGTAAAACTT$GCCGGTGTGGCGGAATTGGCAGACGCGCACGACTCAAAATCGTGTTCC TTCTGGAGTGTCGGTTCGACCCCGACCACCGGTA°TACTGAAAAACCCGTTTCTTAACAGAAACGGGTTTT lmo 37,9%GC 14 aas 1335 pb A 372 T 296 G 310 C 357 complement TA*TACCGGCGGCCGGGGTCGAACCGGCACGCCCTTGCGGGCACAGGATTTTGAGTCCAGCGCGTCTGCCA ATTCCGCCACGCCGGC°GTAACAATATAATAAATTATAACTTTAAAACATTAATTATGCAAA$TGGAGGCGC CAACCGGATTTGAACCGGTGATAAAGGTTTTGCAGACCTCTGCCTTACCACTTGGCTATGGCGCC°GTACA ATGTTCAATTTAAA*AGCGGAAGACGGGGTTCGAACCCGCGACCCCCACCTTGGCAAGGTGATGTTCTACC GCTGAACTACTTCCGC°ATTAA$CTGGGCCAGCTGGATTCGAACCAACGCATGACGGAGTCAAAGTCCGTTG CCTTACCGCTTGGCTATGGCCCA°ACAATTATATTAGAATTAAAAACAAAAAG*GGCGGATGATGGGAATCG AACCCACGAATGCCTGAACCACAATCAGGTGCGTTAACCACTTCGCCACATCCGC°CATTATTTTAATATA$ TGGCAGGGGCAGTAGGAATCGAACCCACACTGGAGGTTTTGGAGACCTCAGTTCTACCTTTAAACTATGC CCCT°ATAATAA*TGGTGGAGGGGAGTGGATTCGAACCACCGAACCCGAAGGAGCGGATTTACAGTCCGCCG CGTTTAGCCACTTCGCTACCCCTCC°ATATTAAAAAAGAAAAAAAG$TGGCTTGGGACAGAATCGAACTGCC GACACCTTGAGCTTCAATCAAGTGCTCTACCAACTGAGCTACCAAGCC°ATAA*TGGCGGTCCCGACGGGAT TTGAACCCGCGATCTCCTGCGTGACAGGCAGGCATGTTAACCCCTACACCACGGAACC°ACTCTA$TTGCGG GGGCAGGATTTGAACCTACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGACTGCTCCACCCCGCG°AC AATATTATTATAAAATTAA*TGGTGGAGGTTAACGGGATCGAACCGCTGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGAT GCTCTCCCAGCTGAGCTAAACCTCC°ATAATTACTATTCTACTCTAAAAACATAAAAATGTCTCTAGTAGA TTAATAATAAA$TGACCCGTACGGGATTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCT TGACCAACGGGCC°TAAGAAAAAATATGATTCTTTATTACGTGTAAA*CGGAGAGCAAGGGATTCGAACCCT TGAGACAGCTTACACCGCCTACACGGTTTCCAACCGTGCTCCTTCGGCCACTCGGACAGCTCTCC°AGAAA A$TGGCTCCACAGGCAGGACTCGAACCTGCGACCGATCGGTTAACAGCCGATTGCTCTACCAACTGAGCTA CTGTGGA°ATAATAAATTGCCC@GGCAGCGACCTACTCTCGCAGGGGGAAGCCCCCAACTACCATTGGCGCA GAGAAGCTTAACTACCGTGTTCGGGATGGGAACGGGTGTGACCTTCTCGCCATAACTACCA°GACAATATT++ ++TATCTAGTTTTCAAAGAACAATTT*TGGTGGAGCCTAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAAG CAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTAAGGCCCC°ATAAAAGGATATGATTATTTGTATTTCTTGCGTCAGAAAG AAAAAG$TGGGCCTAAATGGACTCGAACCATCGACCTCACGCTTATCAGGCGTGCGCTCTAACCAGCTGAG CTATAGGCC°CGTCAAAAATGTAGTGGCGCGATGCTTCAAGCATAGTGCCTTGCATACTTTATCTGACATA bsu 16aas, inter aas TTATT CTGATACTTATACATAATTACAATTGAAAGTCTG TTATATGAT TTATATCAT AATTTTAAAAT TTTGAATACTTA CCTAT CTGTTTTTTCAAAATTTAATGT TTTAT AATTTATGACATCTTGAGATTATG TATTATCAT TCTCACTTTTTATATCAACTGCATATAATGTATTAAGTCCATTAAAAAT ATTAC TCTTATT ATTTTACTTACATGGTAAGTTGAATTGGTGTTTGTGTTTTATCATTATAACTAATCATATTAATGATCTACATAAGTAGA TCATTTTTTTAATGCTTTGATTTATCATAACAAGTTAAGTTCCGAGGCCTATTATAAAGCGGCTGTATAGCTAGTCTTTC AACACTTTTATTTTATATTTCCATAAAAACTTTTTTGAAATACGTTGACACTTTATGAGATCCATGATATATTTATATTC GTCGGTTAGATACGACGTAAAACTT inter A 152 T 208 G 52 C 59 Total 471 24 %GC 16aas A 70 T 97 G 15 C 24 Total 206 19 %GC 15aas A 82 T 111 G 37 C 35 Total 265 27 %GC dernier aa Total aas A 398 T 471 G 438 C 406 tRNAs A 246 T 263 G 386 C 347 Total 1242 59 %GC 16aas lmo 14aas, inter aas GTAACAATATAATAAATTATAACTTTAAAACATTAATTATGCAAA GTACAATGTTCAATTTAAA ATTAA ACAATTATATTAGAATTAAAAACAAAAAG CATTATTTTAATATA ATAATAA ATATTAAAAAAGAAAAAAAG ATAA ACTCTA ACAATATTATTATAAAATTAA ATAATTACTATTCTACTCTAAAAACATAAAAATGTCTCTAGTAGATTAATAATAAA TAAGAAAAAATATGATTCTTTATTACGTGTAAA AGAAAA inter A 143 T 86 G 16 C 21 Total 266 14 %GC Total aas A 372 T 296 G 310 C 357 tRNAs A 229 T 210 G 294 C 336 Total 1069 59 %GC
Opérons à 9 aas
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Opérons à 9 aas
- Légende: voir la légende des intercalaires.
Opérons à 9 aas Bsu 43,6%GC 9 aas 847 pb A 188 T 219 G 239 C 201 ACGCCGCCAAGCAATTGCACGTTAGTGCAATTAT*GGAGGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTAC AAGCAGAGGGTCGGCGGTTCGAGCCCGTCATCCTCCACCA°TTAT$GCCGGTGTAGCTCAATTGGTAGAGCA ACTGACTTGTAATCAGTAGGTTGGGGGTTCAAGTCCTCTTGCCGGCACCA°CTTTTATATGATATAATACT CAAGTCTCTTGTAGAA*GAGCCATTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGGGTCGAAGGT TCGAGTCCTTCATGGCTCACCA°TTTTAC$GCGGGTGTGGCGGAATTGGCAGACGCGCTAGACTTAGGATCT AGTGTCTTTATGACGTGGGGGTTCAAGTCCCTTCACCCGCA°TTATATAGGATAACAGTTAGAAAAACTGG ACATCCTGTCT*GCGGAAGTAGTTCAGTGGTAGAACACCACCTTGCCAAGGTGGGGGTCGCGGGTTCGAAT CCCGTCTTCCGCTCCA°ACTATACCATCCAC$GCCGGGGTGGTGGAATTGGCAGACACACAGGACTTAAAAT CCTGCGGTAGGTGACTACCGTGCCGGTTCAAGTCCGGCCCTCGGCA°TTATGTTTT*GCGCCCGTAGCTCAA TTGGATAGAGCGTTTGACTACGGATCAAAAGGTTAGGGGTTCGACTCCTCTCGGGCGCGCCA°TATCTTTT AATAGAATAGATAGGAAAT$CGGGAAGTAGCTCAGCTTGGTAGAGCACATGGTTTGGGACCATGGGGTCGC AGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGACCA°TTTTTTTAT*GGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTG CACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCA°AAAGTTTTTAAAAAAGTTGTTGACTTTGA lmo 37,9%GC 9 aas 816 pb A 178 T 225 G 225 C 188 TTGTC@TGGTAGTTATGGCGAGAAGGTCACACCCGTTCCCATCCCGAACACGGTAGTTAAGCTTCTCTGCG CCAATGGTAGTTGGGGGCTTCCCCCTGCGAGAGTAGGTCGCTGCC°GGGCAGTATTTCT*GGAGGTTTAGCT CAGCTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGAGGGTCAGCGGTTCGATCCCGTTAACCTCCA°TTTTTTAT$G CCGGCTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAACTGATTTGTAATCAGTAGGTCGCGAGTTCGACTCTTGCAGCCGG CACCA°TTAATATTAACTTTATAATAATACATATTTTTTATTGTAGA*GAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAG CATCTGACTTTTAATCAGAGGGTCGCTGGTTCGAACCCAGCACGGCTCA°CTTTT$GCGGGTGTGGCGGAAT TGGCAGACGCACCAGATTTAGGATCTGGCGCCGCGAGGCGTGGGGGTTCAAGTCCCTTCACCCGCA°CTTA TTTTAAATAT*GCGGAAGTAGTTCAGTGGTAGAACATCACCTTGCCAAGGTGGGGGTCGCGGGTTCGAACC CCGTCTTCCGCT°TGTTTACAAAAGTTCCAATAT$GCCGGGGTGGCGGAACTGGCAGACGCACAGGACTTAA AATCCTGCGGATAGTGATATCCGTACCGGTTCGATTCCGGTCCTCGGCA°TTATTTTTATAT*GCGCCCATA GCTCAACTGGATAGAGTACTTGACTACGAATCAAGCGGTTAGAGGTTCGACTCCTCTTGGGCGCA°CTTTA TTAAA$CGGGAAGTAGCTCAGCTTGGTAGAGCACTTGGTTTGGGACCAAGGGGTCGCAGGTTCGAATCCTG TCTTCCCGA°TTGTTTTGAATTTTATTAT*GGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAG GAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCA°AATTATTTCTAAAAATGTGTTGACATTGTTTAGAGA bsu 9aas, inter aas TTAT CTTTTATATGATATAATACTCAAGTCTCTTGTAGAA TTTTAC TTATATAGGATAACAGTTAGAAAAACTGGACATCCTGTCT ACTATACCATCCAC TTATGTTTT TATCTTTTAATAGAATAGATAGGAAAT TTTTTTTAT inter A 48 T 62 G 16 C 19 Total 145 24 %GC Total aas A 188 T 219 G 239 C 201 tRNAs A 140 T 157 G 223 C 182 Total 702 58 %GC lmo 9aas, inter aas TTTTTTAT TTAATATTAACTTTATAATAATACATATTTTTTATTGTAGA CTTTT CTTATTTTAAATAT TGTTTACAAAAGTTCCAATAT TTATTTTTATAT CTTTATTAAA TTGTTTTGAATTTTATTAT inter A 41 T 75 G 6 C 8 Total 130 11 %GC Total aas A 178 T 225 G 225 C 188 tRNAs A 137 T 150 G 219 C 180 Total 686 58 %GC
bsu opérons 7 6 5 aas
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:bsu opérons 7 6 5 aas
- Lien archive: Opérons à 7 6 5 aas
- Liste des adresses à partir de Genbank: adressage bsu lmo eco eal. Les fasta de gtRNAdb: lmo gtRNAdb bsu gtRNAdb.
- Légende: 6aas r, pour opéron avec rRNA.
6aas r 4 CATT 56 TAAATGTATTATTACCAAGGTTTCTCATAAGGAGAAAGCTTTTTTTATTGCGATAT 30 TTTACCTAACGGGATATTGTAAATTGAATT 27 TATCTTTTAATAGAATAGATAGGAAAT 8 TTTTTTAT 5aas 3 TTT 4 TCTT 22 CTGTTTTTTCAAAATTTTATGT 4 TTAT 7aas 4 TATT 29 TAAGATTTCGATATAAGTTCTCAACCATC 11 TTCCATTTCGT 26 TTTTTATTTTTGAAATCTAATAGTAA 11 TTTGTCTTTTT 80 CTTTATTTACAAAGTGCACGCAAATCTGTTTTACTAGGTTAAGAGCCTACTAAACCAGCACAACACAATTTAATGATCAC * intercalaires %GC 7 5 aas A T G C total %GC 56 87 19 32 194 26 29 23 10 18 80 35 27 64 9 14 114 20 6aas r 42 54 18 11 125 23
Longueurs des intercalaires bsu lmo eal eco
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Longueurs des intercalaires bsu lmo eal eco
- Légende: voir la légende des intercalaires.
- - #% pour variation en longueur entre bsu et lmo, calculée sous la forme 200*(b-l)/(b+l)
- - agc' cgg', ce sont les codons hypothétiques non scannés par NCBI, voir les paragraphes agc et tcg dans le chapitre des opérons 5aas de eco et eal.
- - bsu int et eal int: intercalaires longs, rechercher les séquences dans les archives (bsu et eal) et l'adressage (bsu et eal).
;;bsu-lmo=200*(b-l)/(b+l);;;;;plage1;;bsu+lmo;;plage;;;;;;;;;plage;;;eco-eal *;bsu int tgc tta;# %;bsu;long;lmo;long;bsu;lmo;long;fréquence;# %;# %;fréquence;eal int aca-tac;%GC;eal-eco;long;notes;;long;long;fréquence;# % a;82;133;gaa;25;gaa;5;25;5;5;16;133;-150;2;;;;;;;plage1;plage1;;néant t;111;-168;agc;3;agc;34;3;34;10;21;-168;-120;4;a;32;atg;9;;;9;5;1; g;37;50;aac;10;aac;6;10;6;15;14;50;-90;3;t;26;cta;23;;;23;10;3; c;35;-50;atc;15;atc;25;15;25;20;6;-50;-60;5;g;31;caa;34;;;34;15;1; %GC;27;-79;gga;10;gga;23;10;23;25;9;-79;-30;4;c;27;caa;15;;;15;20;1; total;265;-49;cac;17;cac;28;17;28;30;3;-49;0;6;%GC;50;atg;48;;;48;25;1; ;;100;ttc;12;ttc;4;12;4;35;4;100;30;2;total;116;cag;37;32-37;;37;30;0; ;;93;gac;11;gac;4;11;4;40;3;93;60;6;;;cag;-;;;;35;1; ;;-85;atgf;17;atgf;42;17;42;45;5;-85;90;1;;;;;;;;40;1; ;;-114;tca;6;tca;22;6;22;50;2;-114;120;5;;;eal;cgg’;ou;agc’;;45;4; ;;-138;atgi;2;atgi;11;2;11;plage1;2;-138;150;2;;;agc;4;agc;4;;50;1; ;;-75;atg;19;atg;42;19;42;;;-75;;0;;;cgt;61;cgt;42;;;5; ;;-126;gca;5;gca;22;5;22;plage1;;-126;;;;;tcg;61;tcg;61;;;19; ;;40;cca;15;cca;10;15;10;bsu;9;40;;;;;cgt;61;cgt;42;;;; ;;0;cgt;9;cgt;9;9;9;5;12;0;;;;;tcg;61;tcg;61;;;; ;;0;tta;14;tta;14;14;14;10;8;0;;;;;cgt;61;cgt;42;;;; ;;-100;ggc;5;ggc;15;5;15;15;3;-100;;;;;tcg;-;tcg;-;;totale;fréquence; ;;67;ctg;10;cta;5;10;5;20;3;67;;;;;;;;;;5;6; ;;-10;aaa;37;aaa;41;37;41;25;1;-10;;;;;eco;cgg’;ou;agc’;;10;3; ;;120;aca;32;aca;8;32;8;30;2;120;;;;;agc;4;agc;4;4;15;1; ;;;gta;;gta;;;;35;3;;;;;;cgt;61;cgt;42;42;20;1; ;;;;13,7;;18,5;;;40;0;;;;;;tcg;61;tcg;61;61;25;1; ;;;bsu;;lmo;;;;45;1;;;;;;cgt;61;cgt;61;61;30;0; ;;-160;aac;5;ttg;45;5;45;50;1;-160;;;;;cgt;61;cgt;42;42;35;1; ;;57;tcc;34;tgc;19;34;19;plage1;;57;;;;;tcg;61;tcg;61;61;40;1; ;;57;gaa;9;ggc;5;9;5;lmo;7;57;;;;;cgt;61;cgt;42;42;45;5; ;;-105;gta;9;caa;29;9;29;5;9;-105;;;;;tcg;-;tcg;-;;50;4; ;;-31;atgf;11;cac;15;11;15;10;6;-31;;;;;;;;;;;9; ;;53;gac;12;tgg;7;12;7;15;3;53;;;;;;;;;;;32; ;;-120;ttc;5;tac;20;5;20;20;6;-120;;;;;cgg;58;;;58;;; ;;138;aca;22;ttc;4;22;4;25;2;138;;;;;cac;20;;;20;;; ;;-18;tac;5;gac;6;5;6;30;2;-18;;;;;ctg;42;;;42;;; ;;13;tgg;24;atgf;21;24;21;35;0;13;;;;;cca;-;;;;;; ;;-145;cac;9;gta;56;9;56;40;5;-145;;;;;;;;;;;; ;;39;caa;49;gaa;33;49;33;45;1;39;;;;;aca;8;;;8;;; ;;;ggc;5;tcc;6;5;6;50;1;;;;;;tac;116;;;116;;; ;;;tgc;7;aac;;7;;;;;;;;;gga;6;;;6;;; ;;;tta;265;gca;47;265;47;bsu+5;;;;;;;acc;-;;;135;;; ;;;ttg;;atc;;;;5;10;;;;;;;;;;2;;; ;;;;14,7;;22,4;;;10;13;;;;;eco;sans rR;eal;sans rR;;149;;; ;;;;;;;;;15;8;;;;;aaa;135;aaa;48;;3;;; ;;;bsu;;lmo;;;;20;3;;;;;gta;2;gta;5;;146;;; ;;-67;gta;4;gta;8;4;8;25;3;-67;;;;aaa;149;aaa;48;;132;;; ;;-13;aca;36;aca;41;36;41;30;3;-13;;;;gta;3;gta;5;;;;; ;;18;aaa;6;aaa;5;6;5;35;2;18;;;;aaa;146;aaa;;;45;;; ;;96;cta;40;cta;14;40;14;40;3;96;;;;aaa;132;;;;47;;; ;;-40;ggc;14;ggc;21;14;21;45;0;-40;;;;aaa;;;;;5;;; ;;-29;tta;9;tta;12;9;12;50;1;-29;;;;;sans rR;;;;;;; ;;92;cgt;27;cgt;10;27;10;;2;92;;;;gta;45;;;;48;;; ;;-71;cca;9;cca;19;9;19;;;-71;;;;gta;47;;;;5;;; ;;;gca;;gca;;;;;;;;;;gta;5;;;;48;;; ;;;;18,1;;16,3;;;;;;;;;aaa;;;;;5;;; ;;;;;;;plage2;;bsu+lmo;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;bsu;;;;sans rRNA;plage2;;;;;;;;;;;;; ;;;;;aac;4;4;;5;4;;;;;;;;;;;;; ;;;;;acc;56;56;;10;3;;;;;;;;;;;;; ;;;;;ggc;30;30;;15;3;;;;;bsu-lmo;;bsu-lmo;différence;;;;; ;;;;;gct;27;27;;20;0;;;;;long;fréquence;# %;fréquence;;;;; ;;;;;cca;8;8;;25;1;;;;;5;21;-150;2;;;;; ;;;;;gca;rRNA;;;30;2;;;;;10;25;-120;4;;;;; ;;;;;;;plage3;;35;1;;;;;15;17;-90;3;;;;; ;;;;;gaa;3;3;;40;0;;;;;20;6;-60;5;;;;; ;;;;;gta;4;4;;45;0;;;;;25;10;-30;4;;;;; ;;;;;aca;22;22;;50;0;;;;;30;7;0;6;;;;; ;;;;;tac;4;4;;;3;;;;;35;5;30;2;;;;; ;;;;;caa;sans rR;;;;;;;;;40;3;60;6;;;;; ;;;;;;;;;totale;plage3;;;;;45;5;90;1;;;;; ;;;;;aac;4;4;;5;21;;;;;50;2;120;5;;;;; ;;;;;agc;29;29;;10;25;;;;;;6;150;2;;;;; ;;;;;gaa;11;11;;15;17;;;;;;107;;0;;;;; ;;;;;caa;26;26;;20;6;;;;;;;;40;;;;; ;;;;;aaa;11;11;;25;10;;;;;;;;;;;;; ;;;;;cta;80;80;;30;7;;;;;;;;;;;;; ;;;;;ctc;sans rR;;;35;5;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;40;3;;;;;;;;;;;;; ;;;;;aaa;9;9;;45;5;;;;;;;;;;;;; ;;;;;gaa;81;81;;50;2;;;;;;;;;;;;; ;;;;;gac;35;35;;;6;;;;;;;;;;;;; ;;;;;ttc;sans rR;;;;107;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;lmo;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;gaa;157;157;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;acg;9;9;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;tac;11;11;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;caa;6;6;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;aaa;sans rR;;;;;;;;;;;;;;;;;
Évolution interne des longueurs bsu lmo
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Évolution interne des longueurs bsu lmo
- Légende: voir la légende des intercalaires.
exact();;bsu21-9=200*(21-9)/(21+9);;évolution interne des intercalaires en longueur;;;;;;;;;;;; vrai;;# %;;bsu-21;long;bsu-9;long;;plage;gamme;fréquence;;;;; -;;156;;gta;32;gta;4;;156;-150;1;;;;; 1i2s;;3;;aca;37;aca;36;;3;-120;0;;;;; -;;50;;aaa;10;aaa;6;;50;-90;0;;;;; -;;-156;;cta;5;cta;40;;-156;-60;0;;;;; 0;;0;;ggc;14;ggc;14;;0;-30;3;;;;; 1s;;0;;tta;9;tta;9;;0;0;7;;;;; -;;-57;;cgt;15;cgt;27;;-57;30;3;;;;; -;;-57;;cca;5;cca;9;;-57;60;1;;;;; ;;;;gca;;gca;;;;90;0;;;;; ;;;;;;;;;;120;0;;;;; ;;;;lmo-21;long;lmo-9;long;;;150;0;;;;; 0;;0;;gta;8;gta;8;;0;;1;;;;; 0;;0;;aca;41;aca;41;;0;;;;;;; 0;;0;;aaa;5;aaa;5;;0;;;;;;; faux;;7;;cta;15;cta;14;;7;;;;;;; -;;-40;;ggc;14;ggc;21;;-40;;;;;;; faux;;-29;;tta;9;tta;12;;-29;;;;;;; 0;;0;;cgt;10;cgt;10;;0;;;;;;; faux;;15;;cca;22;cca;19;;15;;;;;;; ;;;;gca;;gca;;;;;;;;;; Les séquences contiennent CCA et TGG pour éviter toute confusion;;;;;;;;;;;;;;;; bsu-21;comp;;;;;;;;;;;;;;; gta;;aca;;aaa;;ctg;;ggc;;tta;;cgt;;cca;;gca 76;;76;;76;;87;;75;;86;;77;;77;;73 CCA;;CCA;;CCA;;CCA;;CCA;;-;;CCA;;CCA;;CCA ATATATGTAAAACCGATATGTATAATGAAAAATGG;* 32;TTCTTACAATAGACTTGAATATTATATCATATAAAAGTGG;* 37;AACATGTAAATGG;* 10;AGAAATGG;* 5;GTGGATGGTATAGTTGG;* 14;AAAACTTAA;* 9;ATTTCATATAGATCATGG;* 15;AAGAATGG;* 5; ;;;;;;;;;;;;;;;; bsu-9;direct;;;;;;;;;;;;;;; gta;;aca;;aaa;;cta;;ggc;;tta;;cgt;;cca;;gca 76;;76;;76;;83;;75;;86;;77;;77;;76 CCA;;CCA;;CCA;;-;;CCA;;-;;CCA;;CCA;;CCA CCATTAT;* 4;CCACTTTTATATGATATAATACTCAAGTCTCTTGTAGAA;* 36 1i2s;CCATTTTAC;* 6;TTATATAGGATAACAGTTAGAAAAACTGGACATCCTGTCT;* 40;CCAACTATACCATCCAC;* 14 vrai;TTATGTTTT;* 9 1s;CCATATCTTTTAATAGAATAGATAGGAAAT;* 27;CCATTTTTTTAT;* 9; ;;;;;;;;;;;;;;;; Lmo-21;comp;;;;;;;;;;;;;;; gta;;aca;;aaa;;cta;;ggc;;tta;;cgt;;cca;;gca 73;;76;;73;;82;;75;;86;;74;;74;;73 CCA;;CCA;;-;;-;;CCA;;-;;-;;-;;CCA ATAAAAAATGG;* 8;TCTACAATAAAAAATATGTATTATTATAAAGTTAATATTAATGG;* 41;AAAAG;* 5;ATATTCCATAATAAG;* 15;GTTGCTATAAAATATGG;* 14;AAATATAAG;* 9;TTTAATAAAG;* 10;TTAATAATAAGGGATTAAACTA;* 22; ;;;;;;;;;;;;;;;; Lmo-9;direct;;;;;;;;;;;;;;; gta;;aca;;aaa;;cta;;ggc;;tta;;cgt;;cca;;gca 73;;76;;73;;82;;72;;86;;74;;74;;76 CCA;;CCA;;-;;-;;-;;-;;-;;-;;CCA CCATTTTTTAT;* 8 vrai;CCATTAATATTAACTTTATAATAATACATATTTTTTATTGTAGA;* 41 vrai;CTTTT;* 5 vrai;CTTATTTTAAATAT;* 14 faux;TGTTTACAAAAGTTCCAATAT;* 21;TTATTTTTATAT;* 12 faux;CTTTATTAAA;* 10 vrai;TTGTTTTGAATTTTATTAT;* 19 faux;
Cumuls des pourcentages GC
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Cumuls des pourcentages GC
- Légende
;;A;T;G;C;Total;%GC;;;;;;;; ;21aas 23s;570;781;659;918;2928;54;;;;;;;; ;21aas 16s;315;386;366;488;1555;55;;;;;;;; ;21aas;488;414;485;532;1919;53;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;; ;21aas 23s;590;816;624;901;2931;52;;;;;;;; ;21aas 16s;325;390;352;479;1546;54;;;;;;;; ;21aas;556;419;461;535;1971;51;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;; bsu;rRNA 21aas;885;1167;1025;1406;4483;54;;;;;;;; lmo;rRNA 21aas;915;1206;976;1380;4477;53;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;; ;intercalaires;A;T;G;C;Total;%GC;;tRNAs;A;T;G;C;Total;%GC ;bsu;;;;;;;;bsu;;;;;; ;21aas r;129;92;35;18;274;19;;21;359;322;450;514;1645;59 ;16aas r;152;208;52;59;471;24;;16;246;263;386;347;1242;59 ;;70;97;15;24;206;19;;9;140;157;223;182;702;58 ;;82;111;37;35;265;27;;total;745;742;1059;1043;3589;59 ;9aas r;48;62;16;19;145;24;;*;;;;;; ;6aas r;42;54;18;11;125;23;;*;;;;;; ;total r;289;305;84;72;750;21;;*;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;; ;7 5 aas;56;87;19;32;194;26;;;;;;;; ;;29;23;10;18;80;35;;;;;;;; ;;27;64;9;14;114;20;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;; ;lmo;;;;;;;;lmo;;;;;; ;21;197;108;36;29;370;18;;21;359;311;425;506;1601;58 ;16;143;86;16;21;266;14;;16;229;210;294;336;1069;59 ;9;41;75;6;8;130;11;;9;137;150;219;180;686;58 ;total;381;269;58;58;766;15;;total;725;671;938;1022;3356;61 ;;;;;;;;;;;;;;; ;eal+eco;;;;;;;;eal+eco;;;;;; ;7aas;95;104;57;69;325;39;;7aas;230;237;305;306;1078;57 ;5aas;168;184;122;97;571;38;;5aas;155;128;225;217;725;61 ;4aas;148;132;123;95;498;44;;agc nscan;147;73;165;163;548;60 ;courts;84;80;61;41;266;38;;4aas;246;280;378;354;1258;58 ;long;64;52;62;54;232;50;;total;631;645;908;877;3061;58 ;total;347;368;240;207;1162;38;;*;;;;;;
Cumuls des modifications bsu-lmo
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Cumuls des modifications bsu-lmo
- Légende
21aas;;cumul modifs;;bsu-lmo;;;;16aas et 9aas;;cumul modifs;;bsu-lmo;; ;;;;;;;;;;;;;; ;CCA;;;sub;insert;;;;CCA;;;sub;insert; ;bsu;lmo;modif;modif;bsu;lmo;;;bsu;lmo;modif;-;bsu;lmo gaa;-;-;;0;;;;aac;+;+;;6;;1 agc;+;+;;6;;;;tcc;+;-;1;8;; aac;+;-;1;2; ;1;;gaa;-;-;;0;; atc;++;+;1;2;;;;gta;++;++;;5;; gga;+;-;1;3;;;;atg;+;-;1;3;; cac;+;-;1;8;;;;gac;+;+;;14;1; ttc;++;+;1;13;;;;ttc;++;+;1;13;; gac;+;+;;14;1;;;tac;++;++;;6;;2 atgf;+;+;;3;;;;tgg;+;+;;3;; tca;+;-;1;6;;;;cac;+;-;1;7;; atgi;++;+;1;2;;;;caa;-;-;;2;; atg;+;-;1;7;;;;ggc;+;-;1;3;; gca;+;+;;0;;;;tgc;-;+;1;5;; cca;+;-;1;2;;;;ttg;-;-;;13;;2 cgt;+;-;1;11;;;;16aas;;;6;88;1;5 tta;-;-;;13;;;;gta;++;+;1;5;; ggc;+;+;1;2;;;;aca;+;+;;13;; ctg/cta;+;-;;14;2;;;aaa;+;-;1;8;; aaa;+;-;1;8;;;;cta;-;-;;10;1; aca;+;+;;13;;;;ggc;+;-;1;2;; gta;++;+;1;5;;;;tta;-;-;;13;; 9aas;;;5;68;2;0;;cgt;+;-;1;11;; 21aas;;;13;134;3;1;;cca;+;-;1;2;; ;;;;;;;;gca;+;+;;0;; ;;;;;;;;9aas;;;5;64;1;0
Cumuls des modifications internes de bsu et lmo
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux: Cumuls des modifications internes de bsu et lmo
- Légende: CCA, différence due entre le nombre (++, + ou absence - ) de terminaisons CCA , modif pour modification, sub pour substitution, insert pour insertion d'une base.
;CCA;;;sub;insert;;;;;;;;; bsu;9aas;21aas;modif;-;9aas;21aas;;lmo;9aas;21aas;;sub;9aas;21aas gta;++;++;;0;;;;gta;+;+;;0;; aca;-;+;1;0;;;;aca;+;+;;0;; aaa;+;+;;0;;;;aaa;-;-;;0;; cta;-;+;1;6;;1;;cta;-;-;;0;; ggc;+;+;;0;;;;ggc;-;+;1;0;; tta;-;-;;0;;;;tta;-;-;;0;; cgt;+;+;;0;;;;cgt;-;-;;0;; cca;+;+;;0;;;;cca;-;-;;0;; gca;++;+;1;0;;;;gca;+;+;;0;; ;16aas;21aas;;sub;16aas;21aas;;;16aas;21aas;;-;16aas;21aas ttc;++;++;;0;;;;ttc;+;+;;0;; gac;+;+;;0;;;;gac;+;+;;0;; atgf;+;+;;0;;;;atgf;+;+;;0;; cac;+;+;;1;;;;cac;-;-;;2;; gaa;-;-;;0;;;;gaa;-;-;;0;; aac;+;+;;4;;;;aac;+;-;1;0;; agc/tcc;+;+;;33;1;;;agc/tcc;-;+;;34;1; total;;;3;11;0;1;;total;;;2;2;0;0
Les duplications des tRNAs
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux: Les duplications des tRNAs
Comparaison intra génome
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux: Comparaison intra génome. archivage
opéron;codon;CCA;CCA diff;subtitut;insert;opéron;codon;CCA;CCA diff;subtitut;insert 9aas;aca;-;1;;;9aas;gta;+;1;; 16aas;;+;1;;;16aas;;++;1;; 21aas;;+;;;;21aas;;+;;; 9aas;tta;-;1;;;9aas;gca;+;1;; 16aas;;+;1;;;16aas;;++;1;; 21aas;;-;;;;21aas;;+;;; 9aas;cta;-;1;;;9aas;ggc;-;1;; 21aas;;+;;6;1;16aas;;-;1;1; 9aas;gca;++;1;;;21aas;;+;;; 21aas;;+;;;;;;;;; 16aas;aac;+;0;;;16aas;aac;+;1;; 21aas;;+;;4;;21aas;;-;;opéron; 16aas;cac;+;0;;;16aas;cac;-;0;; 21aas;;+;;1;;21aas;;-;;2; tRNAs identiques;;;;;;tRNAs identiques;;;;; 3;gta;++;0;;;2;aca;+;0;; 2;aaa;+;0;;;2;aaa;-;0;; 3;ggc;+;0;;;2;cta;-;0;; 2;cgt;+;0;;;2;tta;-;0;; 2;cca;+;0;;;2;cgt;-;0;; 2;gaa;-;0;;;2;cca;-;0;; 2;atgf;+;0;;;2;gaa;-;0;; 2;gac;+;0;;;2;atgf;+;0;; 2;ttc;++;0;;;2;gac;+;0;; ;;;;;;2;ttc;+;0;; Comparaisons;;;;;;Comparaisons;;;;; Total;23;;6;11;1;Total;21;;7;3;0
- Comparaison intra, archivage.
- - Liste des adresses à partir de Genbank: adressage bsu lmo eco eal. Les fasta de gtRNAdb: lmo gtRNAdb bsu gtRNAdb.
- - Il faut copier la séquence continue du fasta de gtRNAdb du tRNA correspondant à l'adresse de Genbank, dans une cellule de calc, appliquer la fonction STXT(Z;n;1), où Z est la cellule contenant la séquence (fixer avec $) et n la position d'une base (sans $) dans la séquence. Dupliquer la fonction jusqu'à épuisement. La comparaison se fait avec la fonction =exact(colonne1;colonne2).
bsu;aca;;;;tta;;;;cta;;;gca;;;aac;;;cac;;;;lmo;gta;;;;gca;;;;aac;;;cac;;;ggc;; ;9aas;16aas;21aas;;9aas;16aas;21aas;;9aas;21aas;;9aas;21aas;;16aas;21aas;;16aas;21aas;;;;9aas;16aas;21aas;;9aas;16aas;21aas;;16aas;21aas;;16aas;21aas;;9aas;16aas;21aas ;;;;;;;;;cta;ctg;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 1;G;G;G;;G;G;G;;G;G;;G;G;;T;T;;G;G;;;1;G;G;G;;G;G;G;;T;T;;G;G;;G;G;G 2;C;C;C;;C;C;C;;C;C;;G;G;;C;C;;C;C;;;2;G;G;G;;G;G;G;;C;C;;C;C;;C;C;C 3;C;C;C;;C;C;C;;G;G;;G;G;;C;C;;G;G;;;3;A;A;A;;G;G;G;;C;C;;G;G;;G;G;G 4;G;G;G;;G;G;G;;G;G;;G;G;;G;A;;G;G;;;4;G;G;G;;G;G;G;;A;A;;G;G;;G;G;G 5;G;G;G;;G;G;G;;G;A;;C;C;;C;C;;T;T;;;5;G;G;G;;C;C;C;;C;C;;A;A;;A;A;A 6;T;T;T;;G;G;G;;T;T;;C;C;;A;A;;T;T;;;6;T;T;T;;C;C;C;;A;A;;T;T;;A;A;A 7;G;G;G;;G;G;G;;G;G;;T;T;;G;G;;G;G;;;7;T;T;T;;T;T;T;;G;G;;G;A;;G;G;G 8;T;T;T;;T;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;;8;T;T;T;;T;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;T 9;A;A;A;;G;G;G;;G;G;;A;A;;A;A;;G;G;;;9;A;A;A;;A;A;A;;A;A;;G;G;;A;A;A 10;G;G;G;;G;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;;10;G;G;G;;G;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;G 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Comparaison entre génomes
[modifier | modifier le wikicode]Comparaison entre opérons
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux: Comparaison entre opérons
- Liens aux archives: 21aas, 16aas, 9aas
21aas bsu x lmo;;;; ;avant ;après;bsu CCA;lmo CCA gaa;0;0;0;0 agc;1;5;1;1 aac;1i,1s;1;1;0 atc;1;1;2;1 gga;2;1;1;0 cac;3;5;1;0 ttc;5;8;2;1 gac;1i,10s;4;1;1 atgf;2;1;2;1 tca;0;6;1;0 atgi;0;2;2;1 atg;2;5;1;0 gca;0;0;1;1 cca;1;1;1;0 cgt;5;6;1;0 tta;3;10;0;0 ggc;1;1;1;1 ctg/cta;5;2i,9s;1;0 aaa;1;7;1;0 aca;4;9;1;1 gta;1;4;2;1 ;;;; 16aas bsu x lmo;;;; ;avant ;après;bsu CCA;lmo CCA tcc;3;5;1;0 tac;0;2i,6s;2;2 tgg;2;1;1;1 caa;1;1;0;0 tgc;1;4;0;1 ttg;3;2i,10s;0;0 aac;1i,2s;4;1;1 cac;2;5;1;0 ggc;2;1;1;0 ;;;; 9aas bsu x lmo;;;; ;avant ;après;bsu CCA;lmo CCA cta;3;1i,7s;0;0
- Archive comparaisons opérons 21aas.
- - Liste des adresses à partir de Genbank: adressage bsu lmo eco eal. Les fasta de gtRNAdb: lmo gtRNAdb bsu gtRNAdb.
- - Il faut copier la séquence continue du fasta de gtRNAdb du tRNA correspondant à l'adresse de Genbank, dans une cellule de calc, appliquer la fonction STXT(Z;n;1), où Z est la cellule contenant la séquence (fixer avec $) et n la position d'une base (sans $) dans la séquence. Dupliquer la fonction jusqu'à épuisement. La comparaison se fait avec la fonction =exact(colonne1;colonne2).
;0;0;;1;5;;2;1*;;1;1*;;2;1*;;3;5*;;5;8*;;11;4;;2;1*;;0;6*;;0;2*;;2;5*;;0;0;;1;1*;;5;6*;;3;10;;1;1;;5;11*;;1;7*;;4;9;;1;4* ;1;gaa;;2;agc;;3;aac;;4;atc;;5;gga;;6;cac;;7;ttc;;8;gac;;9;atgf;;10;tca;;11;atg, Ile;;12;atg;;13;gca;;14;cca;;15;cgt;;16;tta;;17;ggc;;18;ctg/cta;;19;aaa;;20;aca;;21;gta ;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 1;G;G;;G;G;;T;T;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;C;C;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;C;C;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G 2;G;G;;G;G;;C;C;;G;G;;C;C;;C;C;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;C;C;;C;C;;C;C;;C;C;;A;A;;C;C;;G;G 3;C;C;;A;G;;C;C;;G;G;;G;G;;G;G;;C;C;;T;T;;C;C;;A;A;;A;A;;C;C;;G;G;;G;G;;G;G;;C;C;;G;G;;G;G;;G;G;;C;C;;A;A 4;C;C;;G;G;;A;A;;C;C;;G;G;;G;G;;T;T;;C;T;;G;G;;G;G;;C;C;;G;G;;G;G;;G;G;;C;C;;G;G;;G;G;;G;G;;C;C;;G;G;;G;G 5;C;C;;A;A;;C;C;;C;C;;G;G;;T;A;;C;T;;C;C;;G;G;;G;G;;C;C;;G;G;;C;C;;A;A;;C;C;;G;G;;A;A;;A;G;;C;C;;G;G;;G;G 6;G;G;;A;A;;A;A;;T;T;;T;T;;T;T;;G;G;;G;C;;G;G;;A;A;;T;T;;T;T;;C;C;;A;A;;C;C;;G;G;;A;A;;T;T;;A;G;;T;C;;A;T 7;T;T;;G;G;;G;G;;G;A;;G;G;;G;A;;G;G;;G;G;;G;G;;A;A;;T;T;;G;G;;T;T;;G;G;;G;A;;G;G;;G;G;;G;G;;T;T;;G;T;;T;T 8;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T 9;G;G;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;G;G;;A;A;;A;G;;G;G;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;G;G;;A;A;;G;G;;A;A;;A;A;;A;A 10;G;G;;C;C;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;C;C;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G 11;T;T;;T;T;;C;C;;C;C;;T;T;;C;C;;C;C;;T;T;;A;A;;C;C;;C;C;;C;C;;C;C;;C;C;;C;C;;T;C;;T;T;;C;C;;C;C;;C;C;;C;C 12;C;C;;C;C;;T;T;;T;T;;T;T;;G;G;;T;T;;T;G;;G;G;;C;C;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;G;G;;T;T;;G;G;;T;T;;T;T;;T;T 13;A;A;;A;A;;C;C;;C;C;;T;T;;A;A;;C;C;;C;T;;C;C;;A;A;;C;C;;C;C;;C;C;;C;C;;C;C;;G;G;;C;C;;G;G;;C;C;;C;C;;C;C 14;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A 15;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;A;A;;A;A;;G;G;;A;A;;G;G;;A;G;;G;G 16;C;C;;T;T;;T;T;;C;C;;T;T;;T;T;;T;T;;T;G;;T;T;;T;T;;T;T;;C;C;;C;C;;C;C;;T;C;;T;C;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;C;C 17;G;G;;G;G;;**;T;;T;T;;G;G;;G;G;;T;T;;T;G;;T;C;;C;C;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;G;G;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T 18;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;C;T;;T;T;;G;G;;G;G;;G;G;;T;T;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G 19;T;T;;C;C;;G;G;;G;G;;T;T;;T;T;;G;G;;G;T;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;T;T;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G 20;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;A;A;;T;T;;T;T;;T;T;;G;G;;G;G;;T;T;;C;C;;G;G;;G;G;;A;A;;C;C;;A;A;;C;C;;T;T;;T;T;;G;G 21;A;A;;G;G;;A;A;;T;T;;A;A;;A;A;;A;A;;T;A;;T;T;;C;C;;T;T;;T;T;;A;A;;T;T;;T;T;;A;A;;G;G;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A 22;A;A;;A;A;;G;G;;A;A;;A;A;;A;A;;G;G;;A;A;;A;A;;T;T;;A;A;;A;A;;G;G;;A;A;;A;A;;G;G;;A;A;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G 23;G;G;;A;A;;A;A;;G;G;;A;A;;C;C;;A;A;;G;C;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;A;A;;G;G;;G;G;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A 24;A;A;;G;G;;G;G;;A;A;;C;C;;G;G;;G;G;;A;**;;C;C;;A;A;;A;A;;A;A;;G;G;;A;A;;A;A;;C;C;;C;C;;C;C;;G;G;;G;G;;G;G 25;C;C;;A;A;;C;C;;G;G;;C;T;;C;C;;C;C;;A;A;;T;T;;A;A;;G;G;;G;G;;C;C;;G;G;;G;G;;A;G;;A;A;;G;G;;C;C;;C;C;;C;C 26;A;A;;G;G;;T;A;;C;C;;T;A;;A;A;;A;A;;T;T;;C;C;;G;G;;C;C;;C;C;;G;G;;C;C;;C;T;;C;C;;C;T;;C;C;;A;A;;A;A;;A;A 27;C;C;;G;G;;A;A;;G;G;;C;C;;C;C;;A;C;;G;G;;G;G;;G;G;;A;A;;G;A;;C;C;;A;A;;G;A;;A;A;;C;C;;G;A;;T;T;;A;A;;T;T 28;C;C;;C;C;;T;T;;C;C;;A;A;;C;C;;C;T;;C;C;;T;T;;G;G;;G;G;;T;T;;C;C;;C;C;;T;C;;C;C;;A;A;;C;C;;C;C;;C;C;;C;C 29;G;G;;G;G;;C;C;;A;A;;G;G;;A;T;;G;T;;C;C;;C;C;;A;A;;A;A;;A;T;;T;T;;A;T;;T;T;;A;A;;C;C;;T;C;;T;T;;T;T;;T;T 30;C;C;;C;C;;G;G;;C;C;;C;C;;G;G;;G;G;;T;T;;G;G;;T;T;;C;C;;C;C;;G;G;;T;T;;T;T;;G;G;;C;C;;A;A;;G;G;;G;G;;G;G 31;C;C;;C;C;;G;G;;G;G;;C;C;;A;A;;A;A;;G;G;;G;G;;C;C;;G;G;;G;G;;C;C;;G;G;;G;G;;G;G;;T;T;;G;G;;A;A;;A;A;;C;C 32;C;C;;C;C;;C;C;;C;C;;T;T;;T;T;;C;T;;C;C;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;T;T;;G;G;;A;A;;A;A;;T;T;;A;A;;C;C;;C;T;;C;C 33;T;T;;C;C;;T;T;;C;C;;T;T;;T;T;;T;T;;C;C;;C;C;;G;G;;C;C;;T;T;;T;T;;T;T;;C;C;;C;C;;G;G;;A;T;;T;T;;T;T;;T;T 34;T;T;;T;T;;G;G;;T;T;;C;C;;G;G;;G;G;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;C;C;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T 35;T;T;;G;G;;T;T;;G;G;;C;C;;T;T;;A;A;;G;G;;C;C;;C;C;;C;C;;C;C;;G;G;;T;T;;A;A;;T;T;;C;C;;C;T;;T;T;;G;G;;A;A 36;C;C;;C;C;;T;T;;A;A;;A;A;;G;G;;A;A;;T;T;;A;A;;T;T;;A;A;;A;A;;C;C;;G;G;;C;C;;A;A;;A;A;;A;A;;T;T;;T;T;;C;C 37;A;A;;T;T;;A;A;;T;T;;A;A;;G;G;;A;G;;C;C;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;A;A;;G;G;;G;G;;A;A;;A;A;;G;G;;A;A;;A;A;;A;A 38;C;C;;A;A;;A;A;;A;A;;G;G;;C;T;;A;C;;A;A;;A;A;;G;G;;A;A;;A;A;;C;C;;G;G;;G;A;;A;A;;G;G;;G;G;;A;A;;A;A;;A;A 39;G;G;;A;A;;C;C;;A;A;;C;C;;T;T;;T;T;;C;C;;A;A;;A;A;;A;A;;C;C;;G;G;;A;A;;A;A;;A;A;;G;G;;C;A;;T;T;;T;T;;G;G 40;G;G;;G;G;;C;C;;G;G;;T;T;;C;C;;C;C;;G;G;;C;C;;A;A;;C;C;;C;C;;C;C;;C;C;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;C;C;;C;C;;C;C 41;C;C;;G;G;;G;G;;C;C;;G;G;;T;A;;C;A;;C;C;;C;C;;A;A;;C;C;;C;C;;A;A;;C;C;;C;C;;C;C;;G;G;;C;C;;A;A;;A;A;;A;A 42;G;G;;G;G;;A;A;;G;G;;A;T;;G;G;;G;A;;A;A;;C;C;;A;A;;G;G;;G;G;;G;G;;A;A;;A;A;;C;C;;G;G;;T;T;;G;G;;G;G;;G;G 43;G;G;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;G;G;;T;G;;G;G;;G;G;;C;C;;T;T;;T;A;;G;G;;T;A;;A;A;;T;T;;G;G;;A;G;;A;A;;T;T;;A;A 44;T;T;;G;G;;C;C;;G;G;;G;G;;C;C;;G;G;;G;G;;A;A;;C;C;;C;C;;G;A;;A;A;;G;G;;A;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;A;A;;G;G 45;A;A;;T;T;;G;G;;A;A;;T;T;;A;A;;T;T;;A;A;;A;A;;G;G;;C;C;;A;A;;G;G;;G;G;;A;C;;C;C;;G;G;;T;C;;G;G;;G;G;;G;G 46;A;A;;A;A;;G;G;;G;G;;C;C;;T;T;;G;G;;G;G;;G;G;;A;A;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;T;T;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G 47;C;C;;G;G;;T;T;;G;G;;G;G;;T;T;;T;T;;G;A;;G;G;;C;C;;G;G;;G;G;;T;T;;G;G;;G;G;;G;G;;C;C;;T;C;;T;T;;T;T;;T;T 48;A;A;;G;G;;C;C;;T;T;;T;T;;C;C;;C;C;;T;T;;T;T;;A;A;;T;T;;T;T;;C;C;;T;T;;T;T;;T;A;;G;G;;C;C;;C;C;;T;C;;C;C 49;C;C;;T;T;;G;G;;C;C;;G;G;;G;G;;G;G;;C;C;;C;C;;G;G;;C;C;;C;C;;A;A;;C;C;;T;T;;A;T;;C;C;;T;G;;G;G;;G;G;;G;A 50;G;G;;C;C;;C;C;;G;G;;G;G;;T;T;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;A;A;;G;A;;G;G;;T;C;;A;C;;G;C;;G;G 51;G;G;;G;G;;A;A;;A;A;;G;G;;G;G;;C;C;;C;C;;C;T;;G;C;;T;C;;G;T;;C;C;;C;C;;G;G;;G;G;;G;G;;T;G;;A;T;;G;G;;C;C 52;G;G;;T;C;;G;G;;T;T;;T;T;;G;G;;G;A;;G;G;;A;A;;G;G;;A;A;;G;G;;G;G;;A;A;;G;A;;T;T;;G;G;;A;A;;G;G;;G;A;;G;G 53;T;T;;G;T;;G;G;;G;G;;T;T;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;T;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;T;T;;C;**;;G;G;;G;G;;G;G 54;T;T;;T;C;;T;T;;G;G;;C;C;;T;T;;T;T;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;T;T;;G;G;;G;G;;A;A;;T;T;;A;**;;T;T;;T;T;;T;T 55;C;C;;A;G;;T;T;;T;T;;G;G;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;C;T;;C;C;;G;G;;T;T;;T;T;;T;T 56;G;G;;A;C;;C;C;;T;T;;A;A;;C;C;;C;C;;T;T;;T;T;;C;A;;T;T;;T;T;;C;C;;T;T;;T;T;;T;A;;G;G;;A;G;;C;C;;C;C;;C;C 57;A;A;;G;G;;G;G;;C;C;;T;T;;G;G;;G;G;;C;C;;C;C;;A;A;;C;C;;C;C;;G;G;;C;C;;C;C;;A;T;;A;A;;C;C;;G;G;;A;G;;G;G 58;A;A;;C;C;;A;A;;G;G;;T;T;;A;A;;A;A;;G;A;;A;A;;A;T;;G;G;;G;G;;A;A;;G;G;;G;G;;C;C;;A;A;;G;G;;A;A;;A;A;;A;A 59;T;T;;G;G;;A;G;;A;A;;C;C;;T;T;;T;T;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;T;T;;A;A;;A;A;;C;C;;T;C;;T;T;;G;A;;G;C;;G;T 60;C;C;;G;G;;T;T;;G;G;;C;C;;T;T;;T;T;;G;A;;A;A;;G;C;;G;G;;T;C;;C;C;;A;A;;C;C;;G;G;;C;C;;G;G;;T;C;;T;T;;C;C 61;C;C;;C;C;;C;C;;T;T;;C;C;;C;C;;C;C;;T;T;;T;T;;C;C;;T;T;;C;T;;C;C;;T;T;;T;T;;T;T;;C;C;;G;G;;C;C;;C;C;;C;C 62;C;C;;G;G;;C;C;;C;C;;A;A;;C;C;;C;T;;C;C;;C;C;;C;G;;C;C;;C;C;;C;C;;C;C;;C;C;;G;A;;C;C;;G;G;;C;C;;C;T;;C;C 63;G;G;;C;C;;T;T;;C;C;;T;T;;C;C;;G;G;;C;C;;C;C;;C;C;;C;C;;C;C;;G;G;;C;C;;C;C;;C;C;;G;G;;G;G;;T;A;;T;T;;G;G 64;T;T;;G;G;;G;G;;A;A;;C;C;;A;A;;T;T;;C;C;;T;T;;G;G;;T;T;;C;C;;C;C;;T;T;;T;T;;C;C;;T;T;;G;G;;T;G;;C;G;;T;T 65;A;A;;A;A;;C;C;;T;T;;A;A;;T;T;;C;C;;G;G;;G;G;;C;C;;A;G;;T;T;;T;T;;G;G;;C;C;;G;G;;C;C;;T;T;;C;C;;T;C;;C;T 66;C;C;;G;G;;C;C;;T;T;;C;C;;C;T;;C;C;;T;T;;C;C;;G;G;;C;C;;C;C;;A;A;;T;T;;T;T;;G;G;;T;T;;T;T;;A;A;;T;A;;A;A 67;G;G;;G;G;;T;T;;C;T;;C;C;;A;A;;C;C;;C;C;;C;C;;G;G;;A;A;;C;C;;G;G;;C;C;;C;T;;T;T;;T;T;;C;C;;T;C;;G;G;;T;A 68;G;G;;G;G;;G;G;;A;A;;C;C;;A;T;;G;A;;C;G;;C;C;;G;G;;A;A;;G;G;;G;G;;T;T;;G;G;;T;T;;C;C;;A;A;;G;G;;C;C;;C;C 69;G;G;;T;T;;T;T;;G;G;;G;G;;T;C;;A;A;;G;G;;C;C;;G;G;;G;G;;C;C;;C;C;;T;T;;G;G;;C;C;;C;C;;A;A;;G;G;;C;C;;C;C 70;T;T;;T;T;;G;G;;G;G;;C;C;;C;C;;G;G;;G;G;;C;C;;G;G;;G;G;;C;C;;T;T;;C;C;;G;G;;A;G;;G;G;;G;G;;C;C;;G;G;;T;T 71;C;C;;C;C;;G;G;;C;C;;T;T;;G;G;;C;C;;A;A;;G;G;;T;T;;T;T;;G;G;;C;C;;C;C;;C;C;;A;A;;C;C;;T;T;;T;T;;G;G;;C;C 72;A;A;;A;A;;A;A;;C;C;;C;;;C;C;;C;C;;C;C;;C;C;;T;T;;C;C;;C;C;;C;C;;C;C;;G;G;;G;T;;T;T;;C;C;;C;C;;C;C;;C;C 73;;;;A;A;;G;G;;C;C;;C;;;C;C;;A;A;;C;C;;A;A;;C;C;;C;C;;T;T;;A;A;;G;G;;C;C;;T;T;;C;C;;C;C;;A;A;;A;A;;A;A 74;;;;A;A;;C;;;A;A;;A;;;C;;;C;;;G;G;;A;A;;G;G;;A;A;;A;A;;;;;A;A;;G;A;;C;C;;C;C;;C;C;;C;;;C;C;;C; 75;;;;T;T;;C;;;C;;;;;;C;;;C;;;C;C;;C;;;A;A;;C;;;C;;;;;;C;;;C;;;C;C;;A;A;;T;T;;C;;;C;C;;C; 76;;;;C;C;;A;;;C;;;;;;A;;;A;;;C;C;;C;;;A;A;;C;;;C;;;;;;C;;;C;;;G;G;;;;;T;T;;A;;;A;A;;A; 77;;;;C;C;;;;;A;;;;;;;;;;;;A;A;;A;;;T;T;;A;;;A;;;;;;A;;;A;;;G;G;;;;;C;C;;;;;;;;; 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92;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;C;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 93;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;A;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 94;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
- Archive comparaisons opérons 16aas.
- - Liste des adresses à partir de Genbank: adressage bsu lmo eco eal. Les fasta de gtRNAdb: lmo gtRNAdb bsu gtRNAdb.
- - Il faut copier la séquence continue du fasta de gtRNAdb du tRNA correspondant à l'adresse de Genbank, dans une cellule de calc, appliquer la fonction STXT(Z;n;1), où Z est la cellule contenant la séquence (fixer avec $) et n la position d'une base (sans $) dans la séquence. Dupliquer la fonction jusqu'à épuisement. La comparaison se fait avec la fonction =exact(colonne1;colonne2).
;1i2s;4;;3;5*;;0;0;;1;4;;2;1*;;1i10s;4;;5;8*;;;;;0;2i6s;;2;1;;2;5*;;1;1;;2;1*;;1;4*;;;;;3;2i10s ;1;aac;;2;tcc;;3;gaa;;4;gta;;5;atg;;6;gac;;7;ttc;;aca;gca;;9;tac;;10;tgg;;11;cac;;12;caa;;13;ggc;;14;tgc;;tta;atc;;16;ttg ;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 1;T;T;;G;G;;G;G;;G;G;;C;C;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;A;A;;G;G;;T;T;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G 2;C;C;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;C;G;;G;G;;G;G;;C;C;;G;G;;C;C;;G;G;;C;G;;C;C 3;C;C;;A;A;;C;C;;A;A;;C;C;;T;T;;C;C;;C;G;;A;A;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;C;C;;C;G;;C;C 4;G;A;;G;G;;C;C;;G;G;;G;G;;C;T;;T;T;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;C;;G;G 5;C;C;;A;A;;C;C;;G;G;;G;G;;C;C;;C;T;;G;C;;G;G;;G;G;;T;A;;C;C;;A;A;;G;C;;G;C;;G;G 6;A;A;;G;G;;G;G;;A;T;;G;G;;G;C;;G;G;;T;C;;G;G;;C;C;;T;T;;T;C;;A;A;;C;C;;G;T;;T;C 7;G;G;;C;C;;T;T;;T;T;;G;G;;G;G;;G;G;;G;T;;G;G;;A;A;;G;G;;A;A;;G;G;;A;A;;G;A;;G;G 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- Archive comparaisons opérons 9aas.
- - Liste des adresses à partir de Genbank: adressage bsu lmo eco eal. Les fasta de gtRNAdb: lmo gtRNAdb bsu gtRNAdb.
- - Il faut copier la séquence continue du fasta de gtRNAdb du tRNA correspondant à l'adresse de Genbank, dans une cellule de calc, appliquer la fonction STXT(Z;n;1), où Z est la cellule contenant la séquence (fixer avec $) et n la position d'une base (sans $) dans la séquence. Dupliquer la fonction jusqu'à épuisement. La comparaison se fait avec la fonction =exact(colonne1;colonne2).
;1;4*;;4;9;;1;7*;;3;8;;1;1*;;3;10;;5;6*;;1;1*;;0;0 ;1;gta;;2;aca;;3;aaa;;4;cta;;5;ggc;;6;tta;;7;cgt;;8;cca;;9;gca ;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo;;bsu;lmo ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 1;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;C;C;;G;G 2;G;G;;C;C;;A;A;;C;C;;C;C;;C;C;;C;C;;G;G;;G;G 3;A;A;;C;C;;G;G;;G;G;;G;G;;C;C;;G;G;;G;G;;G;G 4;G;G;;G;G;;C;C;;G;G;;G;G;;G;G;;C;C;;G;G;;G;G 5;G;G;;G;G;;C;C;;G;G;;A;A;;G;G;;C;C;;A;A;;C;C 6;A;T;;T;C;;A;G;;T;T;;A;A;;G;G;;C;C;;A;A;;C;C 7;T;T;;G;T;;T;T;;G;G;;G;G;;G;G;;G;A;;G;G;;T;T 8;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T 9;A;A;;A;A;;A;A;;G;G;;A;A;;G;G;;A;A;;A;A;;A;A 10;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G 11;C;C;;C;C;;C;C;;C;C;;T;T;;T;C;;C;C;;C;C;;C;C 12;T;T;;T;T;;T;T;;G;G;;T;T;;G;G;;T;T;;T;T;;T;T 13;C;C;;C;C;;C;C;;G;G;;C;C;;G;G;;C;C;;C;C;;C;C 14;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A 15;G;G;;A;G;;G;G;;A;A;;G;G;;A;A;;A;A;;G;G;;G;G 16;C;C;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;T;C;;T;C;;C;C;;C;C 17;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;G;G;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T 18;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;T;T;;G;G 19;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;T;T;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G 20;G;G;;T;T;;T;T;;C;C;;A;A;;C;C;;A;A;;G;G;;G;G 21;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;G;G;;A;A;;T;T;;T;T;;A;A 22;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;A;A;;G;G;;A;A;;A;A;;G;G 23;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;A;A;;G;G;;G;G;;A;A 24;G;G;;G;G;;G;G;;C;C;;C;C;;C;C;;A;A;;A;A;;G;G 25;C;C;;C;C;;C;C;;G;G;;A;A;;A;G;;G;G;;G;G;;C;C 26;A;A;;A;A;;A;A;;C;C;;C;T;;C;C;;C;T;;C;C;;G;G 27;T;T;;A;A;;T;T;;G;A;;C;C;;A;A;;G;A;;A;A;;C;C 28;C;C;;C;C;;C;C;;C;C;;A;A;;C;C;;T;C;;C;C;;C;C 29;T;T;;T;T;;T;T;;T;C;;C;C;;A;A;;T;T;;A;T;;T;T 30;G;G;;G;G;;G;G;;A;A;;C;C;;G;G;;T;T;;T;T;;G;G 31;C;C;;A;A;;A;A;;G;G;;T;T;;G;G;;G;G;;G;G;;C;C 32;C;C;;C;T;;C;C;;A;A;;T;T;;A;A;;A;A;;G;G;;T;T 33;T;T;;T;T;;T;T;;C;T;;G;G;;C;C;;C;C;;T;T;;T;T 34;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;C;C;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T 35;A;A;;G;G;;T;T;;T;T;;C;C;;T;T;;A;A;;T;T;;G;G 36;C;C;;T;T;;T;T;;A;A;;A;A;;A;A;;C;C;;G;G;;C;C 37;A;A;;A;A;;A;A;;G;G;;A;A;;A;A;;G;G;;G;G;;A;A 38;A;A;;A;A;;A;A;;G;G;;G;G;;A;A;;G;A;;G;G;;C;C 39;G;G;;T;T;;T;T;;A;A;;G;G;;A;A;;A;A;;A;A;;G;G 40;C;C;;C;C;;C;C;;T;T;;T;T;;T;T;;T;T;;C;C;;C;C 41;A;A;;A;A;;A;A;;C;C;;G;G;;C;C;;C;C;;C;C;;A;A 42;G;G;;G;G;;G;G;;T;T;;G;G;;C;C;;A;A;;A;A;;G;G 43;A;A;;T;T;;A;A;;A;G;;G;G;;T;T;;A;A;;T;A;;G;G 44;G;G;;A;A;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;A;G;;G;G;;A;A 45;G;G;;G;G;;G;G;;T;C;;G;G;;C;C;;A;C;;G;G;;G;G 46;G;G;;G;G;;G;G;;G;G;;T;T;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G 47;T;T;;T;T;;T;T;;T;C;;C;C;;G;G;;G;G;;G;G;;T;T 48;C;C;;T;C;;C;C;;C;C;;G;G;;T;A;;T;T;;T;T;;C;C 49;G;A;;G;G;;G;G;;T;G;;C;C;;A;T;;T;T;;C;C;;A;A 50;G;G;;G;C;;A;C;;T;C;;G;G;;G;A;;A;A;;G;G;;G;G 51;C;C;;G;G;;A;T;;T;G;;G;G;;G;G;;G;G;;C;C;;C;C 52;G;G;;G;A;;G;G;;A;A;;G;G;;T;T;;G;A;;A;A;;G;G 53;G;G;;G;G;;G;G;;T;G;;T;T;;G;G;;G;G;;G;G;;G;G 54;T;T;;T;T;;T;T;;G;G;;T;T;;A;A;;G;G;;G;G;;T;T 55;T;T;;T;T;;T;T;;A;***;;C;C;;C;T;;T;T;;T;T;;T;T 56;C;C;;C;C;;C;C;;C;C;;G;G;;T;A;;T;T;;T;T;;C;C 57;G;G;;A;G;;G;G;;G;G;;A;A;;A;T;;C;C;;C;C;;G;G 58;A;A;;A;A;;A;A;;T;T;;A;A;;C;C;;G;G;;G;G;;A;A 59;G;T;;G;C;;G;A;;G;G;;T;C;;C;C;;A;A;;A;A;;T;T 60;C;C;;T;T;;T;C;;G;G;;C;C;;G;G;;C;C;;A;A;;C;C 61;C;C;;C;C;;C;C;;G;G;;C;C;;T;T;;T;T;;T;T;;C;C 62;C;C;;C;T;;C;C;;G;G;;C;C;;G;A;;C;C;;C;C;;C;C 63;G;G;;T;T;;T;A;;G;G;;G;G;;C;C;;C;C;;C;C;;G;G 64;T;T;;C;G;;T;G;;T;T;;T;T;;C;C;;T;T;;T;T;;C;C 65;C;T;;T;C;;C;C;;T;T;;C;C;;G;G;;C;C;;G;G;;T;T 66;A;A;;T;A;;A;A;;C;C;;T;T;;G;G;;T;T;;T;T;;A;A 67;T;A;;G;G;;T;C;;A;A;;T;T;;T;T;;C;T;;C;C;;G;G 68;C;C;;C;C;;G;G;;A;A;;C;C;;T;T;;G;G;;T;T;;G;G 69;C;C;;C;C;;G;G;;G;G;;C;C;;C;C;;G;G;;T;T;;C;C 70;T;T;;G;G;;C;C;;T;T;;G;G;;A;G;;G;G;;C;C;;T;T 71;C;C;;G;G;;T;T;;C;C;;C;C;;A;A;;C;C;;C;C;;C;C 72;C;C;;C;C;;C;C;;C;C;;T;T;;G;T;;G;G;;C;C;;C;C 73;A;A;;A;A;;A;A;;C;C;;C;;;T;T;;C;C;;G;G;;A;A 74;C;;;C;C;;C;;;T;T;;C;;;C;C;;G;A;;A;A;;C;C 75;C;;;C;C;;C;;;T;T;;A;;;C;C;;C;;;C;;;C;C 76;A;;;A;A;;A;;;C;C;;;;;G;G;;C;;;C;;;A;A 77;;;;;;;;;;A;A;;;;;G;G;;A;;;A;;;; 78;;;;;;;;;;C;C;;;;;C;T;;;;;;;;; 79;;;;;;;;;;C;C;;;;;C;C;;;;;;;;; 80;;;;;;;;;;C;C;;;;;C;C;;;;;;;;; 81;;;;;;;;;;G;G;;;;;T;T;;;;;;;;; 82;;;;;;;;;;C;C;;;;;C;C;;;;;;;;; 83;;;;;;;;;;A;A;;;;;G;G;;;;;;;;; 84;;;;;;;;;;;;;;;;G;G;;;;;;;;; 85;;;;;;;;;;;;;;;;C;C;;;;;;;;; 86;;;;;;;;;;;;;;;;A;A;;;;;;;;; 87;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Spectre des comparaisons entre opérons
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux: Spectre des comparaisons entre opérons
Opérons 21aas;Opérons 16aas;opérons 9aas;fréquence;occurrence gaa gca;gaa;gca;4;0 atc atgi cca ggc;caa;ggc cca;7;2 aac gga atgf;tgg ggc atgf;;6;3 gta;tgc gta;gta;4;5 agc tca;;;2;6 atg;aac cac;;3;7 cac aaa;tcc tac;aaa;5;8 cgt;;cta cgt;3;11 ttc tta aca;ttc;tta aca;6;13 gac ;ttg gac;;3;15 ctg/cta;;;1;16
Duplications avec le triplet CCA chez les bactéries
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux: Duplications avec le triplet CCA chez les bactéries
- Légende:
Exact;bsu gtRNAdb;;tri;modifs;;Exact;lmo gtRNAdb;;tri;modifs VRAI;Arg-ACG-1-1;;ACG;;;VRAI;Arg-ACG-1-1;;ACG; VRAI;Arg-ACG-1-2;;ACG;;;FAUX;Arg-ACG-1-2;;ACG; VRAI;Arg-ACG-1-3;;ACG;;;FAUX;Leu-CAA-1-1;;CAA; FAUX;Arg-ACG-1-4;;ACG;;;VRAI;fMet-CAT-1-1;;CAT; FAUX;Leu-CAA-1-1;;CAA;;;FAUX;fMet-CAT-1-2;;CAT; FAUX;Leu-CAG-1-1;;CAG;;;FAUX;Ile2-CAT-1-1;;CAT; VRAI;fMet-CAT-1-1;;CAT;;;FAUX;Met-CAT-1-1;;CAT; VRAI;fMet-CAT-1-2;;CAT;;;FAUX;Trp-CCA-1-1;;CCA; FAUX;fMet-CAT-1-3;;CAT;;;FAUX;Arg-CCG-1-1;;CCG; FAUX;Ile2-CAT-1-1;;CAT;;;FAUX;Arg-CCT-1-1;;CCT; VRAI;Met-CAT-1-1;;CAT;;;FAUX;Ser-CGA-1-1;;CGA; FAUX;Met-CAT-1-2;;CAT;;;FAUX;Thr-CGT-1-1;;CGT; FAUX;Trp-CCA-1-1;;CCA;;;FAUX;Lys-CTT-1-1;;CTT; FAUX;Arg-CCG-1-1;;CCG;;;VRAI;Phe-GAA-1-1;;GAA; FAUX;Arg-CCT-1-1;;CCT;;;FAUX;Phe-GAA-1-2;;GAA; FAUX;Phe-GAA-2-1;;GAA;-;;FAUX;Val-GAC-1-1;;GAC; VRAI;Phe-GAA-1-1;;GAA;+;;FAUX;Leu-GAG-1-1;;GAG; FAUX;Phe-GAA-1-2;;GAA;;;VRAI;Ile-GAT-1-1;;GAT; FAUX;Val-GAC-1-1;;GAC;;;VRAI;Ile-GAT-1-2;;GAT; FAUX;Leu-GAG-1-1;;GAG;;;FAUX;Ile-GAT-1-3;;GAT; FAUX;Ile-GAT-1-1;;GAT;2;;FAUX;Cys-GCA-1-1;;GCA; VRAI;Ile-GAT-2-1;;GAT;;;FAUX;Gly-GCC-3-1;;GCC;1 FAUX;Ile-GAT-2-2;;GAT;;;FAUX;Gly-GCC-2-1;;GCC;- FAUX;Cys-GCA-1-1;;GCA;;;FAUX;Gly-GCC-1-1;;GCC;+ VRAI;Gly-GCC-1-1;;GCC;;;FAUX;Ser-GCT-1-1;;GCT; VRAI;Gly-GCC-1-2;;GCC;;;FAUX;Ser-GCT-2-1;;GCT;2 VRAI;Gly-GCC-1-3;;GCC;;;FAUX;Ser-GGA-1-1;;GGA; FAUX;Gly-GCC-1-4;;GCC;;;FAUX;Thr-GGT-1-1;;GGT; FAUX;Ser-GCT-1-1;;GCT;1;;VRAI;Tyr-GTA-1-1;;GTA; FAUX;Ser-GCT-2-1;;GCT;;;FAUX;Tyr-GTA-1-2;;GTA; FAUX;Ser-GGA-1-1;;GGA;;;FAUX;Asp-GTC-2-1;;GTC;- FAUX;Ala-GGC-1-1;;GGC;;;VRAI;Asp-GTC-1-1;;GTC;+ FAUX;Thr-GGT-1-1;;GGT;;;FAUX;Asp-GTC-1-2;;GTC; VRAI;Tyr-GTA-1-1;;GTA;;;FAUX;His-GTG-2-1;;GTG; FAUX;Tyr-GTA-1-2;;GTA;;;FAUX;His-GTG-1-1;;GTG;2 VRAI;Asp-GTC-1-1;;GTC;;;VRAI;Asn-GTT-2-1;;GTT; VRAI;Asp-GTC-1-2;;GTC;;;FAUX;Asn-GTT-2-2;;GTT;- VRAI;Asp-GTC-1-3;;GTC;;;VRAI;Asn-GTT-1-1;;GTT;+ FAUX;Asp-GTC-1-4;;GTC;;;FAUX;Asn-GTT-1-2;;GTT; FAUX;His-GTG-2-1;;GTG;1;;VRAI;Leu-TAA-1-1;;TAA; FAUX;His-GTG-1-1;;GTG;;;FAUX;Leu-TAA-1-2;;TAA; VRAI;Asn-GTT-2-1;;GTT;;;VRAI;Val-TAC-2-1;;TAC; FAUX;Asn-GTT-2-2;;GTT;;;FAUX;Val-TAC-2-2;;TAC;- VRAI;Asn-GTT-1-1;;GTT;4;;FAUX;Val-TAC-1-1;;TAC;+ FAUX;Asn-GTT-1-2;;GTT;;;VRAI;Leu-TAG-1-1;;TAG; VRAI;Leu-TAA-2-1;;TAA;;;FAUX;Leu-TAG-1-2;;TAG; FAUX;Leu-TAA-2-2;;TAA;+;;VRAI;Gly-TCC-1-1;;TCC; FAUX;Leu-TAA-1-1;;TAA;-;;FAUX;Gly-TCC-1-2;;TCC; VRAI;Val-TAC-1-1;;TAC;;;FAUX;Arg-TCT-1-1;;TCT; VRAI;Val-TAC-1-2;;TAC;;;FAUX;Ser-TGA-1-1;;TGA; VRAI;Val-TAC-1-3;;TAC;;;FAUX;Ala-TGC-2-1;;TGC;- FAUX;Val-TAC-1-4;;TAC;;;VRAI;Ala-TGC-1-1;;TGC;+ FAUX;Leu-TAG-1-1;;TAG;1i2s;;VRAI;Ala-TGC-1-2;;TGC; FAUX;Leu-TAG-2-1;;TAG;;;FAUX;Ala-TGC-1-3;;TGC; VRAI;Gly-TCC-2-1;;TCC;;;VRAI;Pro-TGG-1-1;;TGG; FAUX;Gly-TCC-2-2;;TCC;;;FAUX;Pro-TGG-1-2;;TGG; FAUX;Gly-TCC-1-1;;TCC;2;;VRAI;Thr-TGT-1-1;;TGT; FAUX;Arg-TCT-1-1;;TCT;;;FAUX;Thr-TGT-1-2;;TGT; FAUX;Ser-TGA-2-1;;TGA;;;VRAI;Glu-TTC-1-1;;TTC; FAUX;Ser-TGA-1-1;;TGA;1;;VRAI;Glu-TTC-1-2;;TTC; FAUX;Ala-TGC-2-1;;TGC;-;;VRAI;Glu-TTC-1-3;;TTC; VRAI;Ala-TGC-1-1;;TGC;+;;FAUX;Glu-TTC-1-4;;TTC; VRAI;Ala-TGC-1-2;;TGC;;;FAUX;Gln-TTG-2-1;;TTG; VRAI;Ala-TGC-1-3;;TGC;;;FAUX;Gln-TTG-1-1;;TTG;5 FAUX;Ala-TGC-1-4;;TGC;;;VRAI;Lys-TTT-1-1;;TTT; VRAI;Pro-TGG-1-1;;TGG;;;VRAI;Lys-TTT-1-2;;TTT; VRAI;Pro-TGG-1-2;;TGG;;;FAUX;Lys-TTT-1-3;;TTT; FAUX;Pro-TGG-1-3;;TGG;;;;;;; VRAI;Thr-TGT-2-1;;TGT;;;;;;; FAUX;Thr-TGT-2-2;;TGT;-;;Synthèse bsu;;;; VRAI;Thr-TGT-1-1;;TGT;+;;total;86;;; FAUX;Thr-TGT-1-2;;TGT;;;diff;49;;; VRAI;Glu-TTC-2-1;;TTC;;;dble;37;;; VRAI;Glu-TTC-2-2;;TTC;;;dif;14;;; VRAI;Glu-TTC-2-3;;TTC;;;CCA;6;;; VRAI;Glu-TTC-2-4;;TTC;;;indice avec;; 37/14;2,6; FAUX;Glu-TTC-2-5;;TTC;-;;indice sans;;43/8;5,4; FAUX;Glu-TTC-1-1;;TTC;+;;;;;; VRAI;Gln-TTG-2-1;;TTG;;;Synthèse lmo;;;; FAUX;Gln-TTG-2-2;;TTG;-;;total;67;;; FAUX;Gln-TTG-1-1;;TTG;+;;diff;45;;; FAUX;Gln-TTG-3-1;;TTG;1d3s;;dble;22;;; VRAI;Lys-TTT-1-1;;TTT;;;dif;9;;; VRAI;Lys-TTT-1-2;;TTT;;;CCA;5;;; VRAI;Lys-TTT-1-3;;TTT;;;indice avec;;22/9;2,4; FAUX;Lys-TTT-1-4;;TTT;;;indice sans;;27/4;6,8;
Les duplications par opérons sans rRNAs: eco eal
[modifier | modifier le wikicode]eco eal: Les séquences prélevées des bases de données
[modifier | modifier le wikicode]Liens aux bases de données
[modifier | modifier le wikicode]- eco : Escherichia coli str K-12 substr MG1655[12], KEGG.
- eal : Escherichia albertii KF1[17], KEGG.
Adressages
[modifier | modifier le wikicode]- Voir bsu lmo eco eal
eco adresses
[modifier | modifier le wikicode]- Voir eco
eal adresses
[modifier | modifier le wikicode]- Voir eal
Archives eco
[modifier | modifier le wikicode]eco 7aas
[modifier | modifier le wikicode]5.5.19 NCBI >U00096.3 Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655, complete genome ATCTGAATATCTGGACGCGCCGCACGCAGTTTACGGATGATCGCTTTGTACTCCAGCGCCGTATGGGTAC GGCCCATCAGGTTCAGAATGCGATCGGAACCGCTCTGTACCGGCAGATGCAGGAAGCTCACCAGCTCCGG CGTGTCGCGATACACTTCGATGATATCGTCGGTGAATTCGATCGGATGGCTGGTGGTAAAGCGAATACGA TCGATCCCGTCGATCGCAGCAACCAGACGCAGCAGATCGGCAAACGATCCGGTGGTGCCGTCGTAGTTTT CACCACGCCAGGCGTTCACGTTCTGACCGAGCAGGTTGACTTCACGCACGCCCTGAGCCGCAAGCTGGGC AATCTCAAACAGAATATCGTCGGACGGACGGCTTACCTCTTCACCACGGGTGTAAGGCACCACGCAGTAG GTGCAATATTTATTGCAGCCTTCCATGATGGAGACAAACGCGGTCGGCCCTTCGGCGCGCGGTTCCGGTA GACGGTCAAACTTCTCGATTTCCGGGAAGCTGATATCTACAACCGGGCTGCGGTCGCCACGCACGGAGTT GATCATCTCCGGCAGACGGTGCAGCGTTTGCGGCCCAAAAATAATATCGACATAGTGGGCGCGCTGGCGA ATGTGCTCGCCTTCTTGCGATGCCACGCAGCCACCGACGCCGATAATCAGGTCTGGATTCTTCTCTTTTA ACAGTTTCCAGCGACCCAACTGATGGAAGACTTTTTCCTGAGCCTTCTCGCGGATTGAGCAGGTGTTCAG CAGCAGCACATCCGCTTCTTCCGCCACGTCGGTCAGTTGATAGCCGTGGGTGGCATCCAGCAGATCGGCC ATCTTCGATGAATCGTACTCGTTCATCTGACAGCCCCAGGTTTTAATATGGAGTTTTTTGGTCATCGACT TGCTCTTGCGAAATAGTAGCCAGGAATGCAGGGCGCATAGTGTAATGCTTTGCTGCCGTTGTGACCAGTA TGAGCGTTATCAGCCCTTAGGGGTAAAAATCCTGTAAACTTAAAGCATATTGCTAACAGGATGATTGACC ATGACAAATCAACCAACGGAAATTGCCATTGTCGGCGGAGGAATGGTCGGCGGCGCACTGGCGCTGGGGC TGGCACAGCACGGATTTGCGGTAACGGTGATCGAGCACGCAGAACCAGCGCCGTTTGTCGCTGATAGCCA ACCGGACGTGCGGATCTCGGCGATCAGCGCGGCTTCGGTATCATTGCTTAAAGGGTTAGGGGTCTGGGAT GCAGTACAGGCTATGCGTTGCCATCCTTACCGCAGACTGGAAACGTGGGAGTGGGAAACGGCGCATGTGG TGTTTGACGCCGCTGAACTTAAGCTACCGCTGCTTGGCTATATGGTGGAAAACACTGTCCTGCAACAGGC GTTGTGGCAGGCGCTGGAAGCGCATCCGAAAGTAACGTTACGTGTGCCAGGCTCGCTGATTGCGCTGCAT CGCCATGATGATCTTCAGGAGCTGGAGCTGAAAGGCGGTGAAGTGATTCGCGCGAAGCTGGTGATTGGTG CCGACGGCGCAAATTCGCAGGTGCGGCAGATGGCGGGAATTGGCGTTCATGCATGGCAGTATGCGCAGTC GTGCATGTTGATTAGCGTCCAGTGCGAGAACGATCCCGGCGACAGCACCTGGCAGCAATTTACTCCGGAC GGACCGCGTGCGTTTCTGCCGTTGTTTGATAACTGGGCATCGCTGGTGTGGTATGACTCTCCGGCGCGTA TTCGCCAGTTGCAGAATATGAATATGGCACAGCTCCAGGCGGAAATCGCGAAGCATTTCCCGTCGCGTCT GGGTTACGTTACACCGCTTGCCGCTGGTGCGTTTCCGCTGACGCGTCGCCATGCGTTGCAGTACGTGCAG CCAGGGCTTGCGCTGGTGGGCGATGCCGCGCATACCATCCATCCGCTGGCGGGGCAGGGAGTGAATCTTG GTTATCGTGATGTCGATGCCCTGATTGATGTTCTGGTCAACGCCCGCAGCTACGGCGAAGCGTGGGCCAG TTATCCTGTCCTCAAGCGTTACCAGATGCGGCGCATGGCGGATAACTTCATTATGCAAAGCGGTATGGAT CTGTTTTATGCCGGATTCAGCAATAATCTGCCACCACTGCGTTTTATGCGTAATCTCGGGTTAATGGCGG CGGAGCGTGCTGGCGTGTTGAAACGTCAGGCGCTGAAATATGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGC CGGATGCGTGCCAACC***début des 7aas, voir adresses*** GTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTG TCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGT GGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATAC CCCAACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGG AATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGA ACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTG ATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACC AGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGC TTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTT ACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGC ACACCTTGCGGCGCCAGAACCTAAATCTGGTGCGTCTACCAATTTCGCCACTCCCGCAAAAAAAGATGGT GGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTA GCC***fin des 7aas*** ATCTTTTTTTTCGCGATACCTTATCGGCGTTGCGGGGCGCATTATGCGTATAGAGCCTTGCAGCGTC AACCTCTTTTTCAAGGAAAATTGCTCGAAAGTGACTGTTTGGTTAGGTTGCGAACAGCGTGGCGCTATAT TCGTCAATTATTGTTTACTTTGTGTTTTTTCCCACCCTACAGCCATTCTTTTGTCATACAGGATGAAATT CGGAATTTAACAATAGTGGTGGGAAATTAATCTATGAAATACTGGCCTACAGTGATGAGTTGTCAAACAG TGATGTGGCAAACCCGGAACATTTCCTTACTGCATATCAGAATCAACAAGCACCTCAATAACTGAAACAG CCCCGGATTTCACCGGGGCTGTTTCGCATTTCTTACTTATACGCCGACTGGTGAACACCAACCGCGCGAC CAGACGGATCGTCCATTTTCTTGAACGCTTCATCCCATTCGATCGCTTTAGCGGAAGAACAAGCGACGGA AGGACCGCCCGGCACGCACTCAGCGGCGCTCGGAAGCGGGAATAGTTCTTCAAAGATCTCCCGATACAAG TACGCTTCTTTAGAGGTTGGCGTGTTGTACGGGAAGCGGAAGCGGGCAGTTTCCAGTTGCTGATCAGAAA CCTGCTGCGCAGCCACTTCTTTCAGGGTGTCGATCCAACTGTAACCGACGCCATCGGAGAACTGCTCTTT CTGCCGCCAGGCCACGCTTGCAGGCAGATACGCTTCAAAACATTCACGCAGGATGTGTTTTTCCATTTTG CCGTTACCGCACATTTTATCCTGTGGGTTAATACGCATCGCCACATCAAGGAATTTTTTGTCGAGGAACG GAACGCGTGCTTCCACGCCCCAGGCTGACATCGCTTTGTTGGCACGCGCGCAGTCATACATATGCAGGGC CAGCAGTTTACGCACCGTCTCTTCATGCAGTTCTTTGGCATTCGGTGCTTTGTGGAAGTAAAGATAACCG CCGAACACTTCATCAGAACCTTCACCGGACAGCACCATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACA TTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCG GATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTGAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACT TCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGG CTTCAGAGCGTTCCTGATCTTCCACGCGACGGGCTGCGTATTTCTTGGTGATAGCGGAAATAATTGAGGA ATCCAGACCACCAGAAAGCAGCACACCGTAAGGCACATCAGACATCAGATGGCTTTTAACTGAATCTTCC AGTGCCTGACGCAGCTCGTTTTTGTCGGTCACGTTATCTTTCACCGCATCGTAGTCGAACCAGTCGCGAT GATAGTAAGAACGGATTTCGCCGTCCTGGCTCCACAAATAGCTCCCCGCCGGGAACTCTTTAATCGTGCG GCAAACTGGCACCAGCGCTTTCATTTCTGAGGCCACATACAGCTGACCGTGTTCGTCATACCCCATATAC 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eco 4aas
[modifier | modifier le wikicode]- 4aas2 au début
- 4aas1 à la fin
11.5.19 >U00096.3 Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655, complete genome * ***********************4aas2, cca ctg cac cgg, voir adresses********* * TCGTTGGCAAAAGCGTCCTTGTGGACGGCGGCCAGTACACTGGTCAAGATTGGTGCCGGGTTACTGGTCG GTAAGTTGCTGGCGGTGTCATTTGGTCCGGCGGGGCTTGGGCTGGCGGCAAATTTCCGCCAGTTGATTAC CGTGCTCGGCGTGCTTGCCGGGGCTGGCATCTTTAACGGTGTAACCAAATACGTTGCCCAGTACCATGAT AATCCGCAACAGCTGCGCCGCGTGGTCGGCACTTCATCAGCGATGGTACTTGGTTTCTCTACGCTGATGG CGCTGGTTTTTGTGCTGGCAGCTGCGCCAATCAGCCAGGGATTGTTTGGTAATACCGACTATCAGGGGCT GGTGCGTTTAGTGGCGCTGGTGCAAATGGGGATCGCCTGGGGCAACCTGTTACTGGCGCTGATGAAAGGC TTTCGCGATGCCGCAGGTAATGCGTTATCGCTGATTGTCGGCAGCTTGATTGGCGTTCTCGCGTACTACG TCAGTTACCGTTTGGGCGGTTATGAAGGGGCGTTGCTGGGTCTGGCGCTGATTCCCGCGCTGGTGGTAAT TCCTGCCGCCATCATGTTGATCAAACGTGGTGTCATCCCGTTAAGCTATCTGAAACCCAGCTGGGATAAC GGTCTGGCAGGGCAGTTGAGCAAATTTACGCTCATGGCGTTGATTACGTCGGTGACCTTGCCTGTTGCTT ACATCATGATGCGTAAACTGCTGGCGGCGCAGTATAGCTGGGATGAGGTGGGGATCTGGCAAGGGGTGAG CAGTATTTCCGATGCCTACCTGCAATTTATTACGGCATCGTTCAGCGTATATTTGCTGCCCACGTTGTCG 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AACTGATTCCATCGAAAAAGGTCTGCCGATTCCGGTAGTAATCACCGTTTACGCTGACCGTTCTTTCACT TTCGTTACCAAGACCCCGCCGGCAGCAGTTCTGCTGAAAAAAGCGGCTGGTATCAAGTCTGGTTCCGGTA AGCCGAACAAAGACAAAGTGGGTAAAATTTCCCGCGCTCAGCTGCAGGAAATCGCGCAGACCAAAGCTGC CGACATGACTGGTGCCGACATTGAAGCGATGACTCGCTCCATCGAAGGTACTGCACGTTCCATGGGCCTG GTAGTGGAGGACTAAGAAATGGCTAAACTGACCAAGCGCATGCGTGTTATCCGCGAGAAAGTTGATGCAA CCAAACAGTACGACATCAACGAAGCTATCGCACTGCTGAAAGAGCTGGCGACTGCTAAATTCGTAGAAAG CGTGGACGTAGCTGTTAACCTCGGCATCGACGCTCGTAAATCTGACCAGAACGTACGTGGTGCAACTGTA CTGCCGCACGGTACTGGCCGTTCCGTTCGCGTAGCCGTATTTACCCAAGGTGCAAACGCTGAAGCTGCTA AAGCTGCAGGCGCAGAACTGGTAGGTATGGAAGATCTGGCTGACCAGATCAAGAAAGGCGAAATGAACTT TGACGTTGTTATTGCTTCTCCGGATGCAATGCGCGTTGTTGGCCAGCTGGGCCAGGTTCTGGGTCCGCGC GGCCTGATGCCAAACCCGAAAGTGGGTACTGTAACACCGAACGTTGCTGAAGCGGTTAAAAACGCTAAAG CTGGCCAGGTTCGTTACCGTAACGACAAAAACGGCATCATCCACACCACCATCGGTAAAGTGGACTTTGA CGCTGACAAACTGAAAGAAAACCTGGAAGCTCTGCTGGTTGCGCTGAAAAAAGCAAAACCGACTCAGGCG AAAGGCGTGTACATCAAGAAAGTTAGCATCTCCACCACCATGGGTGCAGGTGTTGCAGTTGACCAGGCTG GCCTGAGCGCTTCTGTAAACTAATGCCTTTACGTGGGCGGTGATTTTGTCTACAATCTTACCCCCACGTA TAATGCTTAATGCAGACGTATATCCGAGATATTCGGGTTGTGGCAAGGCGGCAACTGAGTGAGTCGCCAG GAGCATAGCTAACTATGTGACTGGTGCGAATGAAGGAAGCCAACGCCGTCACAAGCTGAATAGCGACGGA TAGAAAAGATTTGTTCGTTGGAGCCTGGCCTATCCAGGCCTCCGTCGAAGACCGCAGGAGTTTCGCAAGA AACTTAATCCCCTGCGTAGACGGTGACAGAACGCTAAGATTATTCTTTTATATTCTGGCTTGTTTCTGCT CACCGTAATTAAGACGCTCTCTCCGTTTGGAGGAGTGAAGTGAGTTCCAGAGATTTTCTCTGGCAAACAT CCAGGAGCAAAGCTAATGGCTTTAAATCTTCAAGACAAACAAGCGATTGTTGCTGAAGTCAGCGAAGTAG CCAAAGGCGCGCTGTCTGCAGTAGTTGCGGATTCCCGTGGCGTAACTGTAGATAAAATGACTGAACTGCG TAAAGCAGGTCGCGAAGCTGGCGTATACATGCGTGTTGTTCGTAACACCCTGCTGCGCCGTGCTGTTGAA GGTACTCCGTTCGAGTGCCTGAAAGACGCGTTTGTTGGTCCGACCCTGATTGCATACTCTATGGAACACC CGGGCGCTGCTGCTCGTCTGTTCAAAGAGTTCGCGAAAGCGAATGCAAAATTTGAGGTCAAAGCCGCTGC CTTTGAAGGTGAGCTGATCCCGGCGTCTCAGATCGACCGCCTGGCAACTCTGCCGACCTACGAAGAAGCA ATTGCACGCCTGATGGCAACCATGAAAGAAGCTTCGGCTGGCAAACTGGTTCGTACTCTGGCTGCTGTAC GCGATGCGAAAGAAGCTGCTTAATCGCAGTTATCTTTTTAACGCATTCGCTTACGTATAAACTTATTCTG ATATTCAGGAACAATTTAAATGTCTATCACTAAAGATCAAATCATTGAAGCAGTTGCAGCTATGTCTGTA ATGGACGTTGTAGAACTGATCTCTGCAATGGAAGAAAAATTCGGTGTTTCCGCTGCTGCTGCTGTAGCTG TAGCTGCTGGCCCGGTTGAAGCTGCTGAAGAAAAAACTGAATTCGACGTAATTCTGAAAGCTGCTGGCGC TAACAAAGTTGCTGTTATCAAAGCAGTACGTGGCGCAACTGGCCTGGGTCTGAAAGAAGCTAAAGACCTG GTAGAATCTGCACCGGCTGCTCTGAAAGAAGGCGTGAGCAAAGACGACGCAGAAGCACTGAAAAAAGCTC TGGAAGAAGCTGGCGCTGAAGTTGAAGTTAAATAAGCCAACCCTTCCGGTTGCAGCCTGAGAAATCAGGC TGATGGCTGGTGACTTTTTAGTCACCAGCCTTTTTGCGCTGTAAGGCGCCAGTAGCGTTTCACACTGTTT GACTACTGCTGTGCCTTTCAATGCTTGTTTCTATCGACGACTTAATATACTGCGACAGGACGTCCGTTCT GTGTAAATCGCAATGAAATGGTTTAAGCGTGATAGCAACAGGCATTGCGGAAAGTGTTCCATTTTCCGGT CAACAAAATAGTGTTGCACAAACTGTCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAA CCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTG GATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGC AGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGTATTCCCGATTCAGAGCTACAGCGGTAATTCCGAGCTGCA ATACGTCAGCTACCGCCTTGGCGAACCGGTGTTTGACGTCCAGGAATGTCAAATCCGTGGCGTGACCTAT TCCGCACCGCTGCGCGTTAAACTGCGTCTGGTGATCTATGAGCGCGAAGCGCCGGAAGGCACCGTAAAAG ACATTAAAGAACAAGAAGTCTACATGGGCGAAATTCCGCTCATGACAGACAACGGTACCTTTGTTATCAA CGGTACTGAGCGTGTTATCGTTTCCCAGCTGCACCGTAGTCCGGGCGTCTTCTTTGACTCCGACAAAGGT AAAACCCACTCTTCGGGTAAAGTGCTGTATAACGCGCGTATCATCCCTTACCGTGGTTCCTGGCTGGACT TCGAATTCGATCCGAAGGACAACCTGTTCGTACGTATCGACCGTCGCCGTAAACTGCCTGCGACCATCAT TCTGCGCGCCCTGAACTACACCACAGAGCAGATCCTCGACCTGTTCTTTGAAAAAGTTATCTTTGAAATC CGTGATAACAAGCTGCAGATGGAACTGGTGCCGGAACGCCTGCGTGGTGAAACCGCATCTTTTGACATCG AAGCTAACGGTAAAGTGTACGTAGAAAAAGGCCGCCGTATCACTGCGCGCCACATTCGCCAGCTGGAAAA AGACGACGTCAAACTGATCGAAGTCCCGGTTGAGTACATCGCAGGTAAAGTGGTTGCTAAAGACTATATT GATGAGTCTACCGGCGAGCTGATCTGCGCAGCGAACATGGAGCTGAGCCTGGATCTGCTGGCTAAGCTGA GCCAGTCTGGTCACAAGCGTATCGAAACGCTGTTCACCAACGATCTGGATCACGGCCCATATATCTCTGA
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[modifier | modifier le wikicode]>Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Ala-GGC-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna14) chr:1181921-1181996 (+) Ala (GGC) 76 bp Sc: 75.0 GGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAGGtCAGCGGTTCGATC CCGCTTAGCTCCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Ala-GGC-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna15) chr:1182036-1182111 (+) Ala (GGC) 76 bp Sc: 75.0 GGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAGGtCAGCGGTTCGATC CCGCTTAGCTCCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Ala-TGC-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna2) chr:273125-273200 (+) Ala (TGC) 76 bp Sc: 78.1 GGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGtCTGCGGTTCGATC CCGCATAGCTCCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Ala-TGC-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna59) chr:3469883-3469958 (-) Ala (TGC) 76 bp Sc: 78.1 GGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGtCTGCGGTTCGATC CCGCATAGCTCCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Ala-TGC-1-3 (tRNAscan-SE ID: chr.trna47) chr:4299658-4299733 (-) Ala (TGC) 76 bp Sc: 78.1 GGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGtCTGCGGTTCGATC CCGCATAGCTCCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Arg-ACG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna8) chr:881606-881682 (+) Arg (ACG) 77 bp Sc: 85.1 GCATCCGTAGCTCAGCTGGAtAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGtCGGAGGTTCGAA TCCTCCCGGATGCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Arg-ACG-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna9) chr:881881-881957 (+) Arg (ACG) 77 bp Sc: 85.1 GCATCCGTAGCTCAGCTGGAtAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGtCGGAGGTTCGAA TCCTCCCGGATGCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Arg-ACG-1-3 (tRNAscan-SE ID: chr.trna10) chr:882020-882096 (+) Arg (ACG) 77 bp Sc: 85.1 GCATCCGTAGCTCAGCTGGAtAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGtCGGAGGTTCGAA TCCTCCCGGATGCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Arg-ACG-1-4 (tRNAscan-SE ID: chr.trna11) chr:882295-882371 (+) Arg (ACG) 77 bp Sc: 85.1 GCATCCGTAGCTCAGCTGGAtAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGtCGGAGGTTCGAA TCCTCCCGGATGCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Arg-CCG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna42) chr:4354542-4354618 (-) Arg (CCG) 77 bp Sc: 82.2 GCGCCCGTAGCTCAGCTGGAtAGAGCGCTGCCCTCCGGAGGCAGAGGtCTCAGGTTCGAA TCCTGTCGGGCGCGCCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Arg-CCT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna79) chr:1233769-1233843 (-) Arg (CCT) 75 bp Sc: 62.5 GTCCTCTTAGTTAAATGGAtATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAAtTGCAGGTTCGATTC CTGCAGGGGACACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Arg-TCT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna64) chr:3130660-3130736 (-) Arg (TCT) 77 bp Sc: 86.6 GCGCCCTTAGCTCAGTTGGAtAGAGCAACGACCTTCTAAGTCGTGGGcCGCAGGTTCGAA TCCTGCAGGGCGCGCCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Asn-GTT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna77) chr:1637816-1637891 (-) Asn (GTT) 76 bp Sc: 79.7 TCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGtCACTGGTTCGAGT CCAGTCAGAGGAGCCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Asn-GTT-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna76) chr:1640225-1640300 (-) Asn (GTT) 76 bp Sc: 79.7 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(tRNAscan-SE ID: chr.trna40) chr:4390045-4390121 (-) Asp (GTC) 77 bp Sc: 85.5 GGAGCGGTAGTTCAGTCGGTtAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGtCGCGGGTTCGAG TCCCGTCCGTTCCGCCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Cys-GCA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna19) chr:1708164-1708237 (+) Cys (GCA) 74 bp Sc: 63.0 GGCGCGTTAACAAAGCGGTTATGTAGCGGATTGCAAATCCGTCTaGTCCGGTTCGACTCC GGAACGCGCCTCCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Gln-CTG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna31) chr:2998843-2998917 (+) Gln (CTG) 75 bp Sc: 70.8 TGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATtCCGAGGTTCGAATC CTCGTACCCCAGCCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Gln-CTG-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna32) chr:2998955-2999029 (+) Gln (CTG) 75 bp Sc: 70.8 TGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATtCCGAGGTTCGAATC CTCGTACCCCAGCCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Gln-TTG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna28) chr:2998520-2998594 (+) Gln (TTG) 75 bp Sc: 70.4 TGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGTTTTTGATACCGGCATtCCCTGGTTCGAATC CAGGTACCCCAGCCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Gln-TTG-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna29) chr:2998629-2998703 (+) Gln (TTG) 75 bp Sc: 70.4 TGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGTTTTTGATACCGGCATtCCCTGGTTCGAATC CAGGTACCCCAGCCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Glu-TTC-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna13) chr:970709-970784 (+) Glu (TTC) 76 bp Sc: 66.6 GTCCCCTTCGTCTAGAGGCccAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAaCAGGGGTTCGAAT CCCCTAGGGGACGCCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Glu-TTC-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna53) chr:4127144-4127219 (-) Glu (TTC) 76 bp Sc: 66.6 GTCCCCTTCGTCTAGAGGCccAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAaCAGGGGTTCGAAT CCCCTAGGGGACGCCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Glu-TTC-1-3 (tRNAscan-SE ID: chr.trna48) chr:4168546-4168621 (-) Glu (TTC) 76 bp Sc: 66.6 GTCCCCTTCGTCTAGAGGCccAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAaCAGGGGTTCGAAT CCCCTAGGGGACGCCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Glu-TTC-1-4 (tRNAscan-SE ID: chr.trna39) chr:4393483-4393558 (-) Glu (TTC) 76 bp Sc: 66.6 GTCCCCTTCGTCTAGAGGCccAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAaCAGGGGTTCGAAT CCCCTAGGGGACGCCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Gly-CCC-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna6) chr:701100-701173 (+) Gly (CCC) 74 bp Sc: 81.1 GCGGGCGTAGTTCAATGGTAGAACGAGAGCTTCCCAAGCTCTATaCGAGGGTTCGATTCC CTTCGCCCGCTCCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Gly-GCC-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna18) chr:1708034-1708109 (+) Gly (GCC) 76 bp Sc: 88.4 GCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGtCGCGAGTTCGAGT CTCGTTTCCCGCTCCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Gly-GCC-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna56) chr:3944446-3944521 (-) Gly (GCC) 76 bp Sc: 88.4 GCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGtCGCGAGTTCGAGT CTCGTTTCCCGCTCCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Gly-GCC-1-3 (tRNAscan-SE ID: chr.trna55) chr:3944557-3944632 (-) Gly (GCC) 76 bp Sc: 88.4 GCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGtCGCGAGTTCGAGT CTCGTTTCCCGCTCCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Gly-GCC-1-4 (tRNAscan-SE ID: chr.trna54) chr:3944669-3944744 (-) Gly (GCC) 76 bp Sc: 88.4 GCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGtCGCGAGTTCGAGT CTCGTTTCCCGCTCCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Gly-TCC-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna51) chr:4161246-4161320 (-) Gly (TCC) 75 bp Sc: 70.6 GCGGGCATCGTATAATGGCtATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGaTGCGGGTTCGATTC CCGCTGCCCGCTCCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-His-GTG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna43) chr:4354408-4354483 (-) His (GTG) 76 bp Sc: 78.7 GTGGCTATAGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGtCGTGGGTTCGAAT CCCATTAGCCACCCCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Ile-GAT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna1) chr:273006-273082 (+) Ile (GAT) 77 bp Sc: 75.8 AGGCTTGTAGCTCAGGTGGTtAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGtCGGTGGTTCAAG TCCACTCAGGCCTACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Ile-GAT-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna58) chr:3470001-3470077 (-) Ile (GAT) 77 bp Sc: 75.8 AGGCTTGTAGCTCAGGTGGTtAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGtCGGTGGTTCAAG TCCACTCAGGCCTACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Ile-GAT-1-3 (tRNAscan-SE ID: chr.trna46) chr:4299776-4299852 (-) Ile (GAT) 77 bp Sc: 75.8 AGGCTTGTAGCTCAGGTGGTtAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGtCGGTGGTTCAAG TCCACTCAGGCCTACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Ile2-CAT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna89) chr:484485-484560 (-) Ile2 (CAT) 76 bp Sc: 85.1 GGCCCCTTAGCTCAGTGGTtAGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTGGtCGCTGGTTCAAGT CCAGCAGGGGCCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Ile2-CAT-2-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna12) chr:914318-914393 (+) Ile2 (CAT) 76 bp Sc: 84.7 GGCCCTTTAGCTCAGTGGTtAGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTGGtCGCTGGTTCAAGT CCAGCAAGGGCCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Leu-CAA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna57) chr:3840615-3840699 (-) Leu (CAA) 85 bp Sc: 79.3 GCCGAAGTGGCGAAATCGGTaGACGCAGTTGATTCAAAATCAACCGTAGAAATACGTGCC GGTTCGAGTCCGGCCTTCGGCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Leu-CAG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna33) chr:3730704-3730790 (+) Leu (CAG) 87 bp Sc: 67.1 GCGAAGGTGGCGGAATTGGTaGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTG GGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Leu-CAG-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna44) chr:4354301-4354387 (-) Leu (CAG) 87 bp Sc: 67.1 GCGAAGGTGGCGGAATTGGTaGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTG GGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Leu-CAG-2-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna34) chr:3730819-3730905 (+) Leu (CAG) 87 bp Sc: 65.0 GCGAAGGTGGCGGAATTGGTaGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTG GGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Leu-CAG-3-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna35) chr:3730940-3731025 (+) Leu (CAG) 86 bp Sc: 59.9 GCGAAGGTGGCGGAATTGGTaGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTG GGGGTTCAAGTCCCCCCCTCGCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Leu-GAG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna4) chr:377999-378085 (+) Leu (GAG) 87 bp Sc: 64.5 GCCGAGGTGGTGGAATTGGTaGACACGCTACCTTGAGGTGGTAGTGCCCAATAGGGCTTA CGGGTTCAAGTCCCGTCCTCGGTACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Leu-TAA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna20) chr:1708250-1708336 (+) Leu (TAA) 87 bp Sc: 71.7 GCCCGGATGGTGGAATCGGTaGACACAAGGGATTTAAAATCCCTCGGCGTTCGCGCTgTG CGGGTTCAAGTCCCGCTCCGGGTACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Leu-TAG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna27) chr:2998412-2998496 (+) Leu (TAG) 85 bp Sc: 74.1 GCGGGAGTGGCGAAATTGGTaGACGCACCAGATTTAGGTTCTGGCGCCGCAAGGTGTGCG AGTTCAAGTCTCGCCTCCCGCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Lys-TTT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna83) chr:1178824-1178899 (-) Lys (TTT) 76 bp Sc: 94.9 GGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGtCGCAGGTTCGAAT CCTGCACGACCCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Lys-TTT-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna72) chr:2913807-2913882 (-) Lys (TTT) 76 bp Sc: 94.9 GGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGtCGCAGGTTCGAAT CCTGCACGACCCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Lys-TTT-1-3 (tRNAscan-SE ID: chr.trna71) chr:2914015-2914090 (-) Lys (TTT) 76 bp Sc: 94.9 GGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGtCGCAGGTTCGAAT CCTGCACGACCCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Lys-TTT-1-4 (tRNAscan-SE ID: chr.trna70) chr:2914237-2914312 (-) Lys (TTT) 76 bp Sc: 94.9 GGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGtCGCAGGTTCGAAT CCTGCACGACCCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Lys-TTT-1-5 (tRNAscan-SE ID: chr.trna68) chr:2914541-2914616 (-) Lys (TTT) 76 bp Sc: 94.9 GGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGtCGCAGGTTCGAAT CCTGCACGACCCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Lys-TTT-1-6 (tRNAscan-SE ID: chr.trna66) chr:2914830-2914905 (-) Lys (TTT) 76 bp Sc: 94.9 GGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGtCGCAGGTTCGAAT CCTGCACGACCCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Met-CAT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna26) chr:2998326-2998402 (+) Met (CAT) 77 bp Sc: 84.4 GGCTACGTAGCTCAGTTGGTtAGAGCACATCACTCATAATGATGGGGtCACAGGTTCGAA TCCCGTCGTAGCCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Met-CAT-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna30) chr:2998719-2998795 (+) Met (CAT) 77 bp Sc: 84.4 GGCTACGTAGCTCAGTTGGTtAGAGCACATCACTCATAATGATGGGGtCACAGGTTCGAA TCCCGTCGTAGCCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Phe-GAA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna88) chr:589716-589791 (-) Phe (GAA) 76 bp Sc: 75.3 GCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGtCCTTGGTTCGATT CCGAGTCCGGGCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Phe-GAA-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna36) chr:3974478-3974553 (+) Phe (GAA) 76 bp Sc: 75.3 GCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGtCCTTGGTTCGATT CCGAGTCCGGGCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Pro-CGG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna37) chr:4628299-4628375 (+) Pro (CGG) 77 bp Sc: 76.0 CGGTGATTGGCGCAGCCtGGTAGCGCACTTCGTTCGGGACGAAGGGGtCGGAGGTTCGAA TCCTCTATCACCGACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Pro-GGG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna78) chr:1413865-1413941 (-) Pro (GGG) 77 bp Sc: 67.3 CGGCACGTAGCGCAGCCtGGTAGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGGGtCGGAGGTTCAAA TCCTCTCGTGCCGACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Pro-TGG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna45) chr:4354182-4354258 (-) Pro (TGG) 77 bp Sc: 82.4 CGGCGAGTAGCGCAGCTtGGTAGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGGGtCGGAGGTTCGAA TCCTCTCTCGCCGACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-SeC-TCA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna38) chr:4500676-4500770 (-) SeC (TCA) 95 bp Sc: 142.5 GGAAGATCGTCGTCTCCGGTGAGGCGGCTGGACTTCAAATCCAGTTGGGGCCGCCAGCGG TCCCGGGCAGGTTCGACTCCTGTGATCTTCCGCCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Ser-CGA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna17) chr:1656594-1656683 (+) Ser (CGA) 90 bp Sc: 90.4 GGAGAGATGCCGGAGCGGCtgAACGGACCGGTCTCGAAAACCGGAGTAGGGGCAACTCTA CCGGGGGTTCAAATCCCCCTCTCTCCGCCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Ser-GCT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna7) chr:881510-881602 (+) Ser (GCT) 93 bp Sc: 83.4 GGTGAGGTGGCCGAGAGGCtgAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAaGCT GCATCCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGCCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Ser-GGA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna23) chr:2597627-2597714 (+) Ser (GGA) 88 bp Sc: 76.9 GGTGAGGTGTCCGAGTGGCtgAAGGAGCACGCCTGGAAAGTGTGTATACGGCAACGTATC GGGGGTTCGAATCCCCCCCTCACCGCCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Ser-GGA-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna25) chr:2769488-2769575 (+) Ser (GGA) 88 bp Sc: 76.9 GGTGAGGTGTCCGAGTGGCtgAAGGAGCACGCCTGGAAAGTGTGTATACGGCAACGTATC GGGGGTTCGAATCCCCCCCTCACCGCCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Ser-TGA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna24) chr:2663747-2663834 (+) Ser (TGA) 88 bp Sc: 83.5 GGAAGTGTGGCCGAGCGGTtgAAGGCACCGGTCTTGAAAACCGGCGACCCGAAAGGGTTC CAGAGTTCGAATCTCTGCGCTTCCGCCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Thr-CGT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna62) chr:3432513-3432588 (-) Thr (CGT) 76 bp Sc: 85.1 GCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGtCGTAGGTTCGACT CCTATTATCGGCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Thr-CGT-2-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna63) chr:3398205-3398275 (-) Thr (CGT) 71 bp Sc: 44.2 GTAGTTAAAAATGCaTTAACATCGCATTCGTAATGCGAAGGtCGTAGGTTCGACTCCTAT TATCGGCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Thr-GGT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna52) chr:4161164-4161239 (-) Thr (GGT) 76 bp Sc: 84.7 GCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGtCGGCAGTTCGAAT CTGCCTATCAGCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Thr-GGT-2-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna3) chr:276503-276578 (+) Thr (GGT) 76 bp Sc: 79.8 GCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGtCCCCAGTTCGACT CTGGGTATCAGCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Thr-TGT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna49) chr:4161530-4161605 (-) Thr (TGT) 76 bp Sc: 81.3 GCCGACTTAGCTCAGTAGGTAGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAGGtCACCAGTTCGATT CCGGTAGTCGGCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Trp-CCA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna41) chr:4389961-4390036 (-) Trp (CCA) 76 bp Sc: 79.9 AGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGtTGGGAGTTCGAGT CTCTCCGCCCCTGCCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Tyr-GTA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna50) chr:4161437-4161521 (-) Tyr (GTA) 85 bp Sc: 73.0 GGTGGGGTTCCCGAGCGGCcaAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTCACAGACTtCGAA GGTTCGAATCCTTCCCCCACCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Tyr-GTA-2-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna21) chr:2407658-2407742 (+) Tyr (GTA) 85 bp Sc: 72.2 GGTGGGGTTCCCGAGCGGCcaAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTCATCGACTtCGAA GGTTCGAATCCTTCCCCCACCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Tyr-GTA-2-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna22) chr:2407952-2408036 (+) Tyr (GTA) 85 bp Sc: 72.2 GGTGGGGTTCCCGAGCGGCcaAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTCATCGACTtCGAA GGTTCGAATCCTTCCCCCACCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Und-NNN-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna65) chr:3109358-3109452 (-) Undet (NNN) 95 bp Sc: 31.7 AGCGCAGAGATGGCGCGGTaagttgttgaCTTAAAAtgtcgttctaggaacttctaagTC GTGGGcCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Und-NNN-2-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna84) chr:944198-944294 (-) Undet (NNN) 97 bp Sc: 29.6 GTCCGCAGCTGGCaAGCGAATGTAAAgactGACTAAGCatGTagtaccgaGGATGTAggA aTTTCgGaCGCGGGTTCAACTCCCGCCAGCTCCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Val-GAC-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna74) chr:1948689-1948765 (-) Val (GAC) 77 bp Sc: 85.9 GCGTCCGTAGCTCAGTTGGTtAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGtCGGTGGTTCGAG TCCACTCGGACGCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Val-GAC-2-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna73) chr:1948770-1948846 (-) Val (GAC) 77 bp Sc: 82.5 GCGTTCATAGCTCAGTTGGTtAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGtCGTTGGTTCGAG TCCAATTGAACGCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Val-TAC-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna82) chr:1178904-1178979 (-) Val (TAC) 76 bp Sc: 84.6 GGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGtCGGCGGTTCGATC CCGTCATCACCCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Val-TAC-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna81) chr:1179026-1179101 (-) Val (TAC) 76 bp Sc: 84.6 GGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGtCGGCGGTTCGATC CCGTCATCACCCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Val-TAC-1-3 (tRNAscan-SE ID: chr.trna80) chr:1179146-1179221 (-) Val (TAC) 76 bp Sc: 84.6 GGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGtCGGCGGTTCGATC CCGTCATCACCCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Val-TAC-1-4 (tRNAscan-SE ID: chr.trna69) chr:2914316-2914391 (-) Val (TAC) 76 bp Sc: 84.6 GGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGtCGGCGGTTCGATC CCGTCATCACCCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-Val-TAC-1-5 (tRNAscan-SE ID: chr.trna67) chr:2914619-2914694 (-) Val (TAC) 76 bp Sc: 84.6 GGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGtCGGCGGTTCGATC CCGTCATCACCCACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-fMet-CAT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna87) chr:752473-752549 (-) fMet (CAT) 77 bp Sc: 77.5 CGCGGGGTGGAGCAGCCtGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAGGtCGTCGGTTCAAA TCCGGCCCCCGCAACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-fMet-CAT-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna86) chr:752583-752659 (-) fMet (CAT) 77 bp Sc: 77.5 CGCGGGGTGGAGCAGCCtGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAGGtCGTCGGTTCAAA TCCGGCCCCCGCAACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-fMet-CAT-1-3 (tRNAscan-SE ID: chr.trna85) chr:752693-752769 (-) fMet (CAT) 77 bp Sc: 77.5 CGCGGGGTGGAGCAGCCtGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAGGtCGTCGGTTCAAA TCCGGCCCCCGCAACCA >Escherichia_coli_str_K-12_substr_MG1655_tRNA-fMet-CAT-2-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna5) chr:381868-381944 (+) fMet (CAT) 77 bp Sc: 75.5 CGCGGGGTGGAGCAGCCtGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAGAtCGTCGGTTCAAA TCCGGCCCCCGCAACCA
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CACCACCAGCGATGACCTGATGAAACAGGGCGTGCACGTAATGCGTGAGTATCTGGCAAAACATCCGAAT CAGGCATTAGGCCTGCATCTGGAAGGTCCGTGGCTGAATCTGGTGAAAAAAGGCACCCATAATCCGAATT TTGTGCGTAAGCCCGATGCTGCACTGGTTGATTTCCTTTGCGAAAATGCAGACGTGATCACCAAAGTCAC TCTGGCGCCGGAAATGGTGCCTGCAGAAGTGATCAGCAAACTGGCAAATGCCGGAATTGTGGTGTCTGCC GGTCACTCCAACGCGACGTTGAAAGAAGCAAAAGCCGGTTTCCGCGCGGGTATTACCTTTGCCACTCATC TGTACAACGCGATGCCGTATATTACAGGCCGCGAACCGGGTTTGGCGGGCGCAGTTCTTGATGAGGCAGA CATTTATTGCGGTATTATCGCCGATGGCCTGCACGTAGATTATGCCAATATTCGCAATGCCAAACGCCTG AAAGGCGACAAGCTGTGTCTGGTTACAGACGCCACTGCGCCTGCTGGGGCCAATATTGAACAGTTCATTT TTGCGGGTAAAACAATATACTACCGTAACGGGCTTTGTGTGGATGAGAACGGCACGTTAAGCGGTTCATC CTTAACCATGATTGAAGGCGTGCGTAATCTGGTCGAACATTGCGGTATCGCACTGGATGAAGTTTTACGT ATGGCGACGCTCTATCCGGCACGTGCCATTGGCGTTGAAAAGCGTCTCGGCACTCTTGGCGAAGGTAAAG TGGCCAACCTGACCGCATTCACATCAGATTTTAAAATCACTAAGACCATCGTTAACGGCAACGAGGTCGT AACTCAATAAGAGAAAGTATGACACCAGGCGGACAAGCTCAGATAGGTAATGTTGATCTCGTAAAACAGC TTAACAGCGCGGCGGTTTATCGCCTGATTGACCAGTACGGGCCAATCTCGCGAATTCAGATCGCCGAGCA AAGCCAGCTTGCCCCTGCTAGCGTAACTAAAATTACGCGTCAGCTTATCGAACGCGGGTTGATCAAAGAA GTTGATCAGCAGGCCTCCACCGGGGGCCGCCGCGCTATCTCCATCATCACCGAAACCCGCAATTTTCACG CAATCGGCGTACGGCTTGGTCGTCATGACGCCACCATCACCCTGTTCGATCTCAGCAGCAAAGTGCTGGC TGAAGAACATTACCCGCTGCCTGAACGTACCCAGCAGACGCTGGAACACGCCCTGCTGAATGCCATTGCT CAGTTTATTGATAGCTACCAGCGCAAGCTGCGGGAGCTGATCGCCATTTCCGTGATCCTGCCAGGGCTTG TTGACCCGGACAGCGGCAAAATTCATTACATGCCGCATATCCAGGTGGAAAACTGGGGGCTGGTAGAAGC GCTGGAAGACCGTTTTAAAGTGACCTGTTTTGTCGGTCACGATATCCGCAGTCTGGCGCTGGCAGAGCAC TACTTCGGTGCAAGTCAGGATTGCGAAGACTCCATTCTGGTGCGAGTCCATCGCGGAACCGGGGCCGGGA TTATCTCTAACGGGCGCATTTTTATCGGTCGCAACGGCAACGTTGGGGAGATTGGTCATATTCAGGTTGA ACCGCTGGGTGAACGCTGCCACTGCGGCAACTTTGGCTGCCTGGAAACTATCGCCGCCAACGCGGCCATT GAACAACGGGTGTTGAATCTGTTAAAGCAGGGCTACCAGAGTCGTGTACCGCTGGACGACTGCACCATCA AAACTATCTGCAAAGCCGCGAACAAAGGCGATAGCCTGGCGTCGGAAGTGATTGAGTATGTTGGTCGTCA TCTGGGCAAAACCATCGCCATTGCTATCAACTTATTTAATCCGCAAAAAATTGTCATTGCCGGTGAGATA ACCGAAGCCGATAAAGTGCTGCTCCCTGCTATTGAAAGCTGCATTAATACCCAGGCGCTGAAAGCGTTTC GCACTAATCTGCCGGTGGTGCGTTCTGAGCTGGATCACCGCTCGGCAATCGGCGCTTTTGCGCTGGTAAA ACGCGCCATGCTCAACGGTATTTTGCTCCAGCATTTGCTGGAAAATTAATGTGCTTTTATAGTGGCGCTT ATTGTTGTCAATATTCTGGGTAGTCCATGACCATTAAAAATGTAATTTGCGATATCGACGGCGTGCTGAT GCACGATAACGTCGCCGTACCGGGTGCAGCGGAATTTTTGCACGGGATTATGGATAAAGGCCTGCCGCTG GTGTTGCTGACCAACTATCCTTCGCAGACCGGGCAAGATCTGGCGAACCGCTTTGCCACGGCTGGTGTCG ATGTGCCAGACAGCGTGTTTTATACCTCCGCGATGGCGACCGCCGATTTCCTGCGTCGCCAGGAAGGCAA GAAAGCCTATGTGGTGGGCGAAGGCGCACTTATCCATGAGCTGTACAAAGCGGGTTTCACCATTACCGAT GTGAATCCTGACTTTGTGATTGTTGGCGAAACGCGCTCCTATAACTGGGAAATGATGCACAAAGCAGCCT ATTTCGTCGCTAACGGTGCACGATTTATCGCGACCAACCCGGATACCCACGGACGCGGTTTTTATCCTGC TTGTGGCGCACTGTGTGCAGGCATTGAGAAAATTTCCGGGCGTAAACCGTTCTATGTTGGTAAGCCCAGC CCGTGGATCATCCGCGCGGCATTAAACAAAATGCAGGCCCACTCGGAAGAAACGGTGATTGTCGGCGATA ACCTGCGTACCGATATTCTGGCGGGCTTCCAGGCCGGTCTGGAAACGATTCTGGTACTCTCCGGCGTTTC GTCGCTTGACGATATCGACAGTATGCCGTTCCGCCCCAGCTGGATTTACCCGTCGGTCGCTGAAATCGAC GTTATCTGAATAGCAACCACGTCTGCGGACGTGGTTGAATGTGATGATAAACACCAAACTGCCTGATGCG CTACGCTTATCAGGCCTACGCAGCTCCCACAATATATTGAATTTTCATGATTTTGTAGGCCAGACAAGGC GTTCACGCCGCATCCAGCATGAACAAAGCGCACTTTGTCAGCAATTTGGTTTCTTATCCCCCAAAATATA TCTATTCAATAAAACCCGCCAAAAATTATCGATCCATCAATAAATACGCCACCGCACCCTATCCTTTTTC ATCGATCAGCAATCGCCATTACGTTTTTTATTTTTCCACCGCCAAATATCTTGCGCACGTTGCGGCTTTG CGGCATTTTTTAAACAAGCAAACACAACAAGCATCACGCAGCAAATTAACGGAGAAGGTTATGTGTTCAA TTTTTGGCGTATTCGATATCAAAACAGACGCAGTTGAGCTGCGTAAGAAAGCACTCGAGCTGTCACGCCT GATGCGTCATCGTGGCCCGGACTGGTCCGGTATTTATGCCAGCGATAACGCCATTCTCGCCCACGAACGT CTGTCAATTGTTGACGTTAACGCGGGAGCGCAACCTCTCTACAACCAACAAAAAACTCACGTACTGGCGG TAAACGGTGAAATCTACAACCACCAGGCCTTACGCGCCGAATATGGCGATCGTTACCAGTTCCAGACCGG GTCTGACTGCGAAGTGATCCTCGCGCTGTATCAGGAAAAAGGGCCGGAATTTCTCGACGACTTGCAGGGC ATGTTCGCTTTTGCCCTGTACGACAGCGAAAAAGATGCCTACCTGATTGGTCGCGACCATCTGGGGATCA TCCCACTGTATATGGGTTATGACGAACACGGTCAGCTGTATGTGGCCTCAGAAATGAAAGCCCTCGTGCC AGTATGCCGCACGATTAAAGAGTTCCCGGCGGGGAGCTATTTATGGAGTCAGGACGGCGAAATCCATTCT TATTATCATCGCGACTGGTTCGACTACGATGCGGTGAAAGATAACGTGACCGACAAAAACGAGCTGCGTC 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AAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCA***fin des adresses des 7aas*** TATTAAAAAAGCTC GCTTCGGCGAGCTTTTTGCTTTTCTGCATATATTCAATGTCGAATGTGATACTGACACGCCTTATCCTTC AATGTCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGACCTACGGTTGGTATGCATCCGGCAATGTTGTGAGGC TACAACCCTAACGCATATTTCAGCGCCTGCCGTTTCAGTACGCCAGCACGTTCCGCCGCCATCAAACCAA GATTACGAACAAAACGCAGCGGCGGCAGATTATTGCTGAATCCGGCGTAAAACAGATCCATACCACTTTG CATAATGAAGTTATCCGCCATGCGCCGCATCTGGTAACGCTTGAGGATTGGATAACTGGCCCACGCTTCG CCATAGCTGCGGGCGTTGACCAGAACATCAATCAGGGCATCGACATCACGATAACCAAGATTCACCCCCT GCCCCGCCAGCGGATGGATGGTATGCGCGGCATCGCCCACCAGTGCAAGCCCAGGCTGCACATACTGCAA CGCATGGCGACGTGTCAGCGGAAACGCGCCTGCGGCAAGTGGTGTCACATAACCCAGACGTGATGGGAAA TGTTTGGCGATTTCTGCCTGTAATTGCGCCATATTCATATTCTGCAACTGGCGAATACGTGCTGGTGAGT CGTACCACACCAGCGATGCCCAGTTATCAAACAACGGCAAAAATGCACGCGGTCCGTTCGGGGTAAACTG CTGCCAGGTGCTGTCACCAGGATCATTCTCACACTGCACGCTAATCAACATACACGACTGCGCATACTGC CAGGCATGAACGCCAATTCCCGCCATCTGCCGCACCTGCGAATTTGCGCCGTCGGCACCAATCACCAGCT 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eal 5aas
[modifier | modifier le wikicode]11.5.19 >CP007025.1 Escherichia albertii KF1, complete genome AGTTCCAGCATTGCGTCCATCACGCTGGCATTTAACGCCACCTGTGGGATGGCGTCATCACGGCGCATCA GATGATGCACTTTGTTCAGCAAGCGAGCGCCCAGCGCTCCGGCTGGATGTGAACGGGCAAAATCTTCTTC ATTAAAACCGCGCGCCTGCATGACCGCCATCGCCAGCGCGTCGCCCATCATCAGGGTATTGACGGTGCTG GAGGTTGGCGCAAGGTGCATCGGACAAGCTTCGCGTTCGACGGAAATATCCAGCACTGCTTTTGCCGCTA ACCCCAGCGGTGAGGTCGGTTTGCCGGTCATCGCCAGCAAGGTAATTGATTTGTCTTCCAGGCGCGGAAT AATCAGATCCAGCTCTTTTGCGCCACCGGAGTAAGAGATAAACAGCATCACATCGCGGCTTTCAATCATC CCCAGATCGCCGTGCAGTGCTTCTGCCGGATGGACAAAAAAAGCTGGTGTGCCGGTGCTGGCAAGCGTTG CAGCGATTTTCTTACCAATGTGGCCCGATTTACCAATTCCCGAAACCACCACTTTGCCTTCGCAGTGCAG GATGATATTGGCGGCGCGAACAAAATCATCGCCCAGACGTTCTGGTAAACGGCTTGCTTCCTGCAACTCC AGCATTAACGTCTGACGTCCCGCGTTCAGTAGTGCTTCACTCATTGCTCTCTCCGGTTAAGGTCCATTCC TTTTTCCAGCCAGGGATTGATGGCCGGGGTGAGCGCACATTATCCAATGCCATGGGAGGTGAAACAACTT ATGTGGGTTTGGTTACAACATTCGTGAAGAAAAAAGATGTGCCAAAAGAAAACATCTGAGAGAAATAGAG 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CAGAAAAAGTTAAGATCCAGCGTTTTCTGCTCTATCGTGGCTATCTGATGGAGGATATCCAGGAAATTTG GCGAAATTTTGCTGACTGAACGCATACGGGATTTTACTTCCCAGTCAAGAAAACTTATCTTATTCCCACT TTTCAGTTACCAGCCGGGCGGTTAACGACGCGCTACTGTTGGTAACGATATTTCGTTAGCTTGATTTCAG GATAATTATGAGCAAGAGCACCGCTGAGATCCGTCAGGCGTTTCTCGACTTTTTCCATAGTAAGGGACAT CAGGTAGTTGCCAGCAGCTCCCTGGTACCCCGTAACGACCCAACTTTGTTGTTTACCAACGCCGGGATGA ACCAGTTCAAGGATGTGTTCCTTGGGCTCGACAAGCGTAATTATTCCCGCGCAACGACCTCCCAGCGCTG TGTGCGTGCAGGTGGTAAACACAACGACCTGGAAAACGTCGGTTACACCGCGCGTCACCATACCTTCTTC GAAATGCTGGGCAACTTCAGCTTCGGCGACTACTTCAAACACGATGCCATTCAGTTTGCATGGGAATTGC TGACCAGCGAAAAATGGTTTGGCCTGCCGAAAGAGCGTCTGTGGGTTACCGTCTATGAAAGCGACGACGA AGCCTACGAAATCTGGGAAAAAGAAGTCGGTATCCCGCGCGAACGTATTATTCGCATCGGCGATAACAAA GGTGCGCCATACGCATCTGACAACTTCTGGCAGATGGGTGACACTGGTCCGTGCGGCCCGTGCACCGAAA TCTTTTACGATCACGGCGACCACATTTGGGGTGGGCCTCCGGGAAGCCCGGAAGAAGACGGCGACCGTTA CATTGAGATCTGGAACATCGTCTTCATGCAGTTCAACCGCCAGGCAGATGGCACGATGGAACCGCTGCCG AAGCCGTCTGTAGATACTGGTATGGGTCTTGAGCGTATTGCTGCGGTGCTGCAACACGTTAACTCTAACT 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eal 4aas
[modifier | modifier le wikicode]- 4aas1 au début acc gga tac aca
- 4aas2 à la fin cca ctg cac cgg
11.5.19 >CP007025.1 Escherichia albertii KF1, complete genome * ***********************4aas1, acc gga tac aca, voir adresses********* * TACAGCACTTTACCCGAAGAGTGGGTTTTACCTTTGTCGGAGTCAAAGAAGACGCCCGGACTACGGTGCA ACTGGGAAACAATAACACGCTCAGTACCGTTGATAACAAAGGTACCGTTGTCAGTCATGAGCGGAATTTC GCCCATGTAGACTTCTTGTTCTTTAATGTCTTTTACGGCGCCTTCCGGCGCTTCGCGCTCATAGATCACC AGACGCAGTTTAACGCGCAGCGGTGCGGAATAGGTCACGCCACGGATTTGACATTCCTGGACGTCAAACA CCGGTTCGCCAAGGCGGTAGCTGACGTATTGCAGCTCGGAATTACCGCTGTAGCTCTGAATCGGGAACAC GGAACGGAAAGCAGCTTCCAGACCATACTGCCCTTCAGGATCTTGCTCGATGAACTTCTGAAACGAGTCA AGCTGGATAGAAAGGAGATAAGGTACATCCAGAACTTGTGGACGTTTACCAAAATCCTTACGAATACGTT TTTTCTCGGTATAGGAGTAAACCATAGGGTTCCTCAGCTCGCTGACAAGTCGACCCATCTGTCCTGCGGG GGACAGTTTGTGCAACACTATTTTGTTGACCGGAAAATGGAACACTTTCCGCAATGCCTGTTGCTATCAC GCTTAAACCATTTCATTGCGATTTACACAGAACGGACGTTCTGTCGCAGTATATTAAGTCGTCGATAGAA ACAAGCATTGAAAGGCACAGCAGTAGTCAAACAGTGTGAAACGCTACTGGCGCCTTACAGCGCAAAAAGG CTGGTGACTAAAAAGTCACCAGCCATCAGCCTGATTTCTCAGGCTGCAACCGGAAGGGTTGGCTTATTTA 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TTCCATAGCGTTTTAGCGCCAGCCAGAACATGCCAACAATCCCCAGCACGCCCGCCACCGCCAGCATCCA CAACGAAATCCAGCCACGAATAATGCCGATAAACAAGAAGATAGCGAATGCGATGATGATATTGGCGCGA GTGCCGCCGACAATCATATAAGTCAACAAACCAAACGCGACGGTGCTGACAAGAAAAAACAGCCACGCTT TGCTGTCCTGGCGCAGAAAGTAGACCACCAGCATCGCCGGGATGAAAAAGTAAAAGAAGCGTTTTAACGC CACACCGGAGACTTCGCTGGAAAAGATTTGACTGTAAGAGTTAAGCCGGAACAGCAAAAAGCCGTTGTGC ATGAAGAAGATGCCGACACTCACCAGCGCGATGCCCATCAGAATCCCCCACGTGAGATTGGTCTCCACGC GATTCATGGTAAACAGCGGACGGCGCGGTACATCGACAACGCGTTTGCGTAGGCGAGTTTTGTAGGTGAC ATAGTAAACCGCATAGAAGCAGCCCGCAGAAAGCAACGCCTGCAACAAGATTTCCGGCAGTGCGACGCTA ACATCAAAGCGAAACACCAGCACGCTGGTCAGCGGGAAGCCAAAGAAAAAAGTGAGCAAAAACAGCAATG AAAAGAAGACATTGAAGTTAAAGCGCACACGGCGGAATTCAAACCAGGTCAGCGTGGCAATAAACAGCGT GCAAAGCAGCCAGACAACAAACAGGCCACTGAATTGCAGCAGACTCATGCGACCTCCCCGGCGGCAATAG CCAGCGCCCGTTGCCAGCCTTGCAGATAGTTCGGGCTAAAGAAGGCAATGGTGTTTTTATCCACCGACGC CAGCTGGCGCTGCGCTTCACGCACAATATCCTCGTTGAGATCGTCGGTAGTAAACAACACCGGCAAATGC TGTTCCGTCATATCCTGCCAGAACGGATTTTCCCGGTTAAGCACACAAGGAATACCCGCCTGAATCAGTA AGCACAGCGTACCAATGCCCTGCTGGCGGGCAAAAATAAAGTAGCCGAGATCGCACTGGCGAAGTAGCGC CAGATAAGCGTCAAACTCCAGTTTTTCGCTCAGAACTTGCAGATTTTCTTCGCTGAATAATTCCAGCCCC ACCTGGCGAACGTCGTTGATGTACGCTTCGTTATTAGGCGGATAGCCCATCGGCACCACCACTTTTACCG TATCGCCAAACTGTTGATGAACAGCGCGCAGAGCGGCGATATGCTCATTGCTACGATCGCCGGAGTTTCC CACAAGGATGGTCATTTTCCCTTCACGTTGCCGATCGTTCGCCATCATATTGAGAGAAGGGTCCATCCGC GTCGGGAAATAGAGCAGTTCGCCCCGCACCTTTGGATGCGTTTTGGCAAAAAAGCTCAAATCACCGCGAG TGGCAAATACGCAGCCGACCCGCTTTTGCGCCAAACGACGAATGGGATAAAATAGTCTAAATTTCAACCC ACTGGAGACTTCATATAAATCTGCCCCCCAGATATGCCAGTAAAACTGACTGGGCTTAATGCCACCGCTA AGCAACGCCAGCCACAGTGCAGTGTTGAACTGACCGTGGAAGAAAAACCGCTGATTGCGATCAGCTTTTG CTTTAGCAATTACCGCTTCTGCCAGCGATTTTTTACCTGGATAAAATTTCACAGAAAGCGCCGGGCAGCT GTCACTTAAGCCGTCGTCCTTACCAGCAACCATAAACTCGCGCGCGTGCTCACTCGTTGCGGCCAGCACG TCGTTGAAAAACCGCAAAACGGTTCGATTATGGTGAGGGATATCCGATCCCAGAACGTGAATCAGTACAG TCATGCCCGCCTACGCCAGAGTAAAAACACGCCACAACAAAGAGAAAAATAGACGATATAGGTTGCCATA TAGGCCTGCGCCGCGCCCAGTGCGCCATGCACGGGGATCAGCCAGTGGGCAAATATCATCAATAAAGTGA ACTGGCTAACTTCCGCCAGAATATAAAGCCGTAGCGACGCTTTGGCGATCACCAGATAACCAAAGACATA AGCGCCCACTTTCAACACATCACCCACCAACTGCCAGGCAAAGAGATCGCGCATGGCGGTAAATTTATTC GACAACAGCAGCCAGATGGCAAAATCACGTAACAGCCAGACGGTAAAACTCGCCGCCGCTACCGCCGGTA AGACGAATTTCAGCGATTTAACCACTTCCCGGGTGATATCGCGCTTTTCCGTTAGCCGCGACAACGTGGG CAGTAAATATACGCTGAATGATGCCGTAATAAATTGCAGGTAGGCGTCGGAAATACTGCTCACCCCTTGC CAGATACCCACTTCATCCCAGCTATACTGCGCCGCCAGTAGCTTACGCATCATGATGTACGCAACGGGCA AGGTCACCGACGTAATCAACGCCATAAGCGTAAACTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGCTATCCCAGCT GGGTTTCAGATAGCTTAACGGGATAACGCCACGCTTCATCAGCATGATGACGGCAGGAATCACCACCAGC GCGGGAATCAACGCCAGCCCCAGCAACGCGCCTTCATAACCGCCCAAACGGTAACTGACGTAATAAGCGA TGACGCCAATCAAGCTGCCGACCATCAGCGATAACGCATTACCTGCGGCATCGCGAAAGCCTTTCATCAA CGCCAGCAACAGGTTGCCCCAGGCGATCCCCATTTGCACCAGCGCCACTAAACGCACCAGTCCCTGATAG TCGATATTACCAAACAATCCCTGGCTGATTGGCGCAGCTGCCAGCACAAAAACCAGCGCCATCAGCGTGG AGAAGCCAAGCACCATTGCAGATGAAGTACCAACCACGCGGCGCAGCTGCTGCGGATTATCATGGTGCTG GGCAACGTACTTAGTTACACCGTTAAAGATACCCGCTCCCGCCAGTACGCCGAGCACGGTAATCAACTGG CGGAAATTCGCCGCCAACCCCAGTCCAGCCGGACCAAATGACACCGCCAGTAATTTACCAACCAGTAACC CGGCACCAATCTTGACCAGCGTACTGGTCGCCGTCCACAAAGACGCTTTTGCCAGTGACATATCAGGAGA AGTAGTTCAATAAGGTCGCAATTACCGTGCGCTGATTGACGGGCGACAGGTTATAGAACAGCGGCAGGCG CAGCAAACGCTCACTCTCTTTGGTGGTGTAACGATCTTCGCCATGGAATTCACCAAAGTGTTCACCCGCC GGGCTTGCGTGTAGCGGAATATAGTGGAACACCGCCATGATTTCCGCTTCTTTCAGGAAGTTTATCAACG CGCTCCGGTCATCAATATCCCGCAGTTTAATGTAGAACATATGCGCATTCTGCACGCAACCATCAGGAAT AGACGGCAGTTCGATACGCCCAGCTTTCGCCAGAGGTGTTAACGCATCGTAGTAGTTTTGCCACAGCGCC AGGCGCTGCTGGTTGATGCGATCCGCCGCTTCCAGTTGCGCCCACAGGTACGCCGCTTGCAGATCGGACA TCAAATAGCTGGAACCGATATCGCGCCAGGTATATTTATCAACCTGCCCACGGAAGAACTGGCTGCGGTT AGTACCTTTTTCGCGGATGATCTCCGCTCGCTCGATCAACGCGTTATCGTTAATCAGCGTCGCACCGCCT TCACCGCCCGCCGTGTAGTTTTTGGTTTCATGGAAGCTAAAGCAGCCAATATGACCAATGGTTCCCAGCG CACGCCCTTTGTAAGTGGACATCACGCCCTGAGCGGCATCTTCCACCACAAACAGATTATGCTTTTTCGC CAACGCCATTATAGTGTCCATTTCACAGGCCACCCCCGCGTAATGCACCGGCACAATAACGCGCGTTTTG TCGGTGATCGCCGCTTCAATCAGCGTTTCGTCGATGTTCATGGTATCCGGGCGAATATCGACAAAGACGA
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[modifier | modifier le wikicode]>Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Ala-GGC-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna30) chr:3782718-3782793 (+) Ala (GGC) 76 bp Sc: 75.0 GGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAGGtCAGCGGTTCGATC CCGCTTAGCTCCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Ala-GGC-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna31) chr:3782833-3782908 (+) Ala (GGC) 76 bp Sc: 75.0 GGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAGGtCAGCGGTTCGATC CCGCTTAGCTCCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Ala-TGC-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna77) chr:1280561-1280636 (-) Ala (TGC) 76 bp Sc: 78.1 GGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGtCTGCGGTTCGATC CCGCATAGCTCCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Ala-TGC-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna72) chr:2009398-2009473 (-) Ala (TGC) 76 bp Sc: 78.1 GGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGtCTGCGGTTCGATC CCGCATAGCTCCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Ala-TGC-1-3 (tRNAscan-SE ID: chr.trna66) chr:2050832-2050907 (-) Ala (TGC) 76 bp Sc: 78.1 GGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGtCTGCGGTTCGATC CCGCATAGCTCCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Arg-ACG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna25) chr:3470010-3470086 (+) Arg (ACG) 77 bp Sc: 85.1 GCATCCGTAGCTCAGCTGGAtAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGtCGGAGGTTCGAA TCCTCCCGGATGCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Arg-ACG-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna26) chr:3470285-3470361 (+) Arg (ACG) 77 bp Sc: 85.1 GCATCCGTAGCTCAGCTGGAtAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGtCGGAGGTTCGAA TCCTCCCGGATGCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Arg-ACG-1-3 (tRNAscan-SE ID: chr.trna27) chr:3470559-3470635 (+) Arg (ACG) 77 bp Sc: 85.1 GCATCCGTAGCTCAGCTGGAtAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGtCGGAGGTTCGAA TCCTCCCGGATGCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Arg-CCG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna60) chr:2267909-2267985 (-) Arg (CCG) 77 bp Sc: 82.2 GCGCCCGTAGCTCAGCTGGAtAGAGCGCTGCCCTCCGGAGGCAGAGGtCTCAGGTTCGAA TCCTGTCGGGCGCGCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Arg-CCT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna46) chr:3810366-3810440 (-) Arg (CCT) 75 bp Sc: 62.5 GTCCTCTTAGTTAAATGGAtATAACGAGCCCCTCCTAAGGGCTAAtTGCAGGTTCGATTC CTGCAGGGGACACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Arg-TCT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna81) chr:968955-969031 (-) Arg (TCT) 77 bp Sc: 86.6 GCGCCCTTAGCTCAGTTGGAtAGAGCAACGACCTTCTAAGTCGTGGGcCGCAGGTTCGAA TCCTGCAGGGCGCGCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Arg-TCT-2-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna35) chr:4256869-4256945 (+) Arg (TCT) 77 bp Sc: 81.3 GCGTTGTTAGCTCAGCCGGAcAGAGCAATTGCCTTCTAAGCAATCGGtCACTGGTTCGAA TCCAGTACAACGCGCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Asn-GTT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna44) chr:4232173-4232248 (-) Asn (GTT) 76 bp Sc: 79.7 TCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGtCACTGGTTCGAGT CCAGTCAGAGGAGCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Asn-GTT-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna32) chr:4233996-4234071 (+) Asn (GTT) 76 bp Sc: 79.7 TCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGtCACTGGTTCGAGT CCAGTCAGAGGAGCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Asn-GTT-1-3 (tRNAscan-SE ID: chr.trna43) chr:4242949-4243024 (-) Asn (GTT) 76 bp Sc: 79.7 TCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGtCACTGGTTCGAGT CCAGTCAGAGGAGCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Asn-GTT-1-4 (tRNAscan-SE ID: chr.trna42) chr:4248339-4248414 (-) Asn (GTT) 76 bp Sc: 79.7 TCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGtCACTGGTTCGAGT CCAGTCAGAGGAGCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Asp-GTC-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna79) chr:1269523-1269599 (-) Asp (GTC) 77 bp Sc: 85.5 GGAGCGGTAGTTCAGTCGGTtAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGtCGCGGGTTCGAG TCCCGTCCGTTCCGCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Asp-GTC-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna78) chr:1277037-1277113 (-) Asp (GTC) 77 bp Sc: 85.5 GGAGCGGTAGTTCAGTCGGTtAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGtCGCGGGTTCGAG TCCCGTCCGTTCCGCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Asp-GTC-1-3 (tRNAscan-SE ID: chr.trna58) chr:2305439-2305515 (-) Asp (GTC) 77 bp Sc: 85.5 GGAGCGGTAGTTCAGTCGGTtAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGtCGCGGGTTCGAG TCCCGTCCGTTCCGCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Cys-GCA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna38) chr:4318109-4318182 (+) Cys (GCA) 74 bp Sc: 63.0 GGCGCGTTAACAAAGCGGTTATGTAGCGGATTGCAAATCCGTCTaGTCCGGTTCGACTCC GGAACGCGCCTCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Gln-CTG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna12) chr:835045-835119 (+) Gln (CTG) 75 bp Sc: 70.8 TGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATtCCGAGGTTCGAATC CTCGTACCCCAGCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Gln-CTG-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna13) chr:835152-835226 (+) Gln (CTG) 75 bp Sc: 70.8 TGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATtCCGAGGTTCGAATC CTCGTACCCCAGCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Gln-TTG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna9) chr:834721-834795 (+) Gln (TTG) 75 bp Sc: 70.4 TGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGTTTTTGATACCGGCATtCCCTGGTTCGAATC CAGGTACCCCAGCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Gln-TTG-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna10) chr:834830-834904 (+) Gln (TTG) 75 bp Sc: 70.4 TGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGTTTTTGATACCGGCATtCCCTGGTTCGAATC CAGGTACCCCAGCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Glu-TTC-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna64) chr:2211713-2211788 (-) Glu (TTC) 76 bp Sc: 66.6 GTCCCCTTCGTCTAGAGGCccAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAaCAGGGGTTCGAAT CCCCTAGGGGACGCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Glu-TTC-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna57) chr:2308975-2309050 (-) Glu (TTC) 76 bp Sc: 66.6 GTCCCCTTCGTCTAGAGGCccAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAaCAGGGGTTCGAAT CCCCTAGGGGACGCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Glu-TTC-1-3 (tRNAscan-SE ID: chr.trna29) chr:3564684-3564759 (+) Glu (TTC) 76 bp Sc: 66.6 GTCCCCTTCGTCTAGAGGCccAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAaCAGGGGTTCGAAT CCCCTAGGGGACGCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Glu-TTC-2-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna19) chr:2812393-2812468 (+) Glu (TTC) 76 bp Sc: 56.4 GTCCCCTTCGTCTAGAGGCccAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAaCAGGGGCTCGAAT CCCCTAGGGGACGCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Gly-CCC-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna23) chr:3301617-3301690 (+) Gly (CCC) 74 bp Sc: 79.7 GCGAGTGTAGCTCAATGGTAGAGCTTTTGGTTCCCAACCAAATGaCGGGGGTTCGATTCC CCTCACTCGCTCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Gly-GCC-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna74) chr:1765398-1765473 (-) Gly (GCC) 76 bp Sc: 88.4 GCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGtCGCGAGTTCGAGT CTCGTTTCCCGCTCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Gly-GCC-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna73) chr:1765630-1765705 (-) Gly (GCC) 76 bp Sc: 88.4 GCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGtCGCGAGTTCGAGT CTCGTTTCCCGCTCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Gly-GCC-1-3 (tRNAscan-SE ID: chr.trna37) chr:4317980-4318055 (+) Gly (GCC) 76 bp Sc: 88.4 GCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGtCGCGAGTTCGAGT CTCGTTTCCCGCTCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Gly-TCC-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna89) chr:489117-489191 (-) Gly (TCC) 75 bp Sc: 70.6 GCGGGCATCGTATAATGGCtATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGaTGCGGGTTCGATTC CCGCTGCCCGCTCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Gly-TCC-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna69) chr:2043438-2043512 (-) Gly (TCC) 75 bp Sc: 70.6 GCGGGCATCGTATAATGGCtATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGaTGCGGGTTCGATTC CCGCTGCCCGCTCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-His-GTG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna61) chr:2267775-2267850 (-) His (GTG) 76 bp Sc: 78.7 GTGGCTATAGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGtCGTGGGTTCGAAT CCCATTAGCCACCCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Ile-GAT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna76) chr:1280679-1280755 (-) Ile (GAT) 77 bp Sc: 75.8 AGGCTTGTAGCTCAGGTGGTtAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGtCGGTGGTTCAAG TCCACTCAGGCCTACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Ile-GAT-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna71) chr:2009516-2009592 (-) Ile (GAT) 77 bp Sc: 75.8 AGGCTTGTAGCTCAGGTGGTtAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGtCGGTGGTTCAAG TCCACTCAGGCCTACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Ile-GAT-1-3 (tRNAscan-SE ID: chr.trna65) chr:2050950-2051026 (-) Ile (GAT) 77 bp Sc: 75.8 AGGCTTGTAGCTCAGGTGGTtAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGtCGGTGGTTCAAG TCCACTCAGGCCTACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Ile2-CAT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna55) chr:3010329-3010404 (-) Ile2 (CAT) 76 bp Sc: 85.1 GGCCCCTTAGCTCAGTGGTtAGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTGGtCGCTGGTTCAAGT CCAGCAGGGGCCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Ile2-CAT-2-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna28) chr:3505321-3505396 (+) Ile2 (CAT) 76 bp Sc: 84.8 GGCCCCTTAGCTCAGTGGTtAGAGCAGGCGACTCATAATCGCCTGGcCGCTGGTTCAAGT CCAGCAGGGGCCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Ile2-CAT-3-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna34) chr:4256696-4256771 (+) Ile2 (CAT) 76 bp Sc: 80.5 GGCCCTTTAGCTCAGTGGTgAGAGCGAGCGACTCATAATCGCCAGGtCGCTGGTTCAAAT CCAGCAAGGGCCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Leu-CAA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna75) chr:1657306-1657390 (-) Leu (CAA) 85 bp Sc: 79.3 GCCGAAGTGGCGAAATCGGTaGACGCAGTTGATTCAAAATCAACCGTAGAAATACGTGCC GGTTCGAGTCCGGCCTTCGGCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Leu-CAG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna14) chr:1567231-1567317 (+) Leu (CAG) 87 bp Sc: 67.1 GCGAAGGTGGCGGAATTGGTaGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTG GGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Leu-CAG-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna16) chr:1567465-1567551 (+) Leu (CAG) 87 bp Sc: 67.1 GCGAAGGTGGCGGAATTGGTaGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTG GGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Leu-CAG-1-3 (tRNAscan-SE ID: chr.trna62) chr:2267668-2267754 (-) Leu (CAG) 87 bp Sc: 67.1 GCGAAGGTGGCGGAATTGGTaGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTG GGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Leu-CAG-2-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna15) chr:1567346-1567432 (+) Leu (CAG) 87 bp Sc: 65.0 GCGAAGGTGGCGGAATTGGTaGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTG GGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Leu-GAG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna21) chr:2911129-2911215 (+) Leu (GAG) 87 bp Sc: 62.4 GCCGAGGTGGTGGAATTGGTaGACACGCTACCTTGAGGTGGTAGTGCTCAATAGGGCTTA CGGGTTCAAGTCCCGTCCTCGGTACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Leu-TAA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna39) chr:4318194-4318280 (+) Leu (TAA) 87 bp Sc: 71.7 GCCCGGATGGTGGAATCGGTaGACACAAGGGATTTAAAATCCCTCGGCGTTCGCGCTgTG CGGGTTCAAGTCCCGCTCCGGGTACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Leu-TAG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna8) chr:834613-834697 (+) Leu (TAG) 85 bp Sc: 74.1 GCGGGAGTGGCGAAATTGGTaGACGCACCAGATTTAGGTTCTGGCGCCGCAAGGTGTGCG AGTTCAAGTCTCGCCTCCCGCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Lys-TTT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna87) chr:756820-756895 (-) Lys (TTT) 76 bp Sc: 94.9 GGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGtCGCAGGTTCGAAT CCTGCACGACCCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Lys-TTT-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna85) chr:757019-757094 (-) Lys (TTT) 76 bp Sc: 94.9 GGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGtCGCAGGTTCGAAT CCTGCACGACCCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Lys-TTT-1-3 (tRNAscan-SE ID: chr.trna83) chr:757218-757293 (-) Lys (TTT) 76 bp Sc: 94.9 GGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGtCGCAGGTTCGAAT CCTGCACGACCCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Lys-TTT-1-4 (tRNAscan-SE ID: chr.trna49) chr:3779747-3779822 (-) Lys (TTT) 76 bp Sc: 94.9 GGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGtCGCAGGTTCGAAT CCTGCACGACCCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Met-CAT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna7) chr:834529-834605 (+) Met (CAT) 77 bp Sc: 84.4 GGCTACGTAGCTCAGTTGGTtAGAGCACATCACTCATAATGATGGGGtCACAGGTTCGAA TCCCGTCGTAGCCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Met-CAT-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna11) chr:834920-834996 (+) Met (CAT) 77 bp Sc: 84.4 GGCTACGTAGCTCAGTTGGTtAGAGCACATCACTCATAATGATGGGGtCACAGGTTCGAA TCCCGTCGTAGCCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Phe-GAA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna17) chr:1795516-1795591 (+) Phe (GAA) 76 bp Sc: 75.3 GCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGtCCTTGGTTCGATT CCGAGTCCGGGCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Phe-GAA-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna54) chr:3177714-3177789 (-) Phe (GAA) 76 bp Sc: 75.3 GCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGtCCTTGGTTCGATT CCGAGTCCGGGCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Pro-CGG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna18) chr:2556305-2556381 (+) Pro (CGG) 77 bp Sc: 76.0 CGGTGATTGGCGCAGCCtGGTAGCGCACTTCGTTCGGGACGAAGGGGtCGGAGGTTCGAA TCCTCTATCACCGACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Pro-GGG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna45) chr:3993497-3993573 (-) Pro (GGG) 77 bp Sc: 67.3 CGGCACGTAGCGCAGCCtGGTAGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGGGtCGGAGGTTCAAA TCCTCTCGTGCCGACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Pro-TGG-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna63) chr:2267551-2267627 (-) Pro (TGG) 77 bp Sc: 82.4 CGGCGAGTAGCGCAGCTtGGTAGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGGGtCGGAGGTTCGAA TCCTCTCTCGCCGACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-SeC-TCA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna56) chr:2426154-2426248 (-) SeC (TCA) 95 bp Sc: 142.5 GGAAGATCGTCGTCTCCGGTGAGGCGGCTGGACTTCAAATCCAGTTGGGGCCGCCAGCGG TCCCGGGCAGGTTCGACTCCTGTGATCTTCCGCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Ser-CGA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna33) chr:4249406-4249495 (+) Ser (CGA) 90 bp Sc: 90.4 GGAGAGATGCCGGAGCGGCtgAACGGACCGGTCTCGAAAACCGGAGTGGGGGCAACTCCA CCGGGGGTTCAAATCCCCCTCTCTCCGCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Ser-GCT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna24) chr:3469914-3470006 (+) Ser (GCT) 93 bp Sc: 83.4 GGTGAGGTGGCCGAGAGGCtgAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAaGCT GCATCCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Ser-GGA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna3) chr:413135-413222 (+) Ser (GGA) 88 bp Sc: 76.9 GGTGAGGTGTCCGAGTGGCtgAAGGAGCACGCCTGGAAAGTGTGTATACGGCAACGTATC GGGGGTTCGAATCCCCCCCTCACCGCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Ser-GGA-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna6) chr:615149-615236 (+) Ser (GGA) 88 bp Sc: 76.9 GGTGAGGTGTCCGAGTGGCtgAAGGAGCACGCCTGGAAAGTGTGTATACGGCAACGTATC GGGGGTTCGAATCCCCCCCTCACCGCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Ser-TGA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna4) chr:462888-462975 (+) Ser (TGA) 88 bp Sc: 83.5 GGAAGTGTGGCCGAGCGGTtgAAGGCACCGGTCTTGAAAACCGGCGACCCGAAAGGGTTC CAGAGTTCGAATCTCTGCGCTTCCGCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Thr-CGT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna80) chr:1192413-1192488 (-) Thr (CGT) 76 bp Sc: 85.1 GCCGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCGCATTCGTAATGCGAAGGtCGTAGGTTCGACT CCTATTATCGGCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Thr-GGT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna70) chr:2043356-2043431 (-) Thr (GGT) 76 bp Sc: 84.7 GCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGtCGGCAGTTCGAAT CTGCCTATCAGCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Thr-GGT-2-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna20) chr:2816027-2816102 (+) Thr (GGT) 76 bp Sc: 79.8 GCTGATATGGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGtCCCCAGTTCGACT CTGGGTATCAGCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Thr-TGT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna88) chr:489195-489270 (-) Thr (TGT) 76 bp Sc: 81.3 GCCGACTTAGCTCAGTAGGTAGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAGGtCACCAGTTCGATT CCGGTAGTCGGCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Thr-TGT-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna67) chr:2043722-2043797 (-) Thr (TGT) 76 bp Sc: 81.3 GCCGACTTAGCTCAGTAGGTAGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAGGtCACCAGTTCGATT CCGGTAGTCGGCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Trp-CCA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna59) chr:2305355-2305430 (-) Trp (CCA) 76 bp Sc: 79.9 AGGGGCGTAGTTCAATTGGTAGAGCACCGGTCTCCAAAACCGGGTGtTGGGAGTTCGAGT CTCTCCGCCCCTGCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Tyr-GTA-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna1) chr:219063-219147 (+) Tyr (GTA) 85 bp Sc: 73.0 GGTGGGGTTCCCGAGCGGCcaAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTCACAGACTtCGAA GGTTCGAATCCTTCCCCCACCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Tyr-GTA-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna68) chr:2043629-2043713 (-) Tyr (GTA) 85 bp Sc: 73.0 GGTGGGGTTCCCGAGCGGCcaAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTCACAGACTtCGAA GGTTCGAATCCTTCCCCCACCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Tyr-GTA-2-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna2) chr:219357-219441 (+) Tyr (GTA) 85 bp Sc: 72.2 GGTGGGGTTCCCGAGCGGCcaAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTCATCGACTtCGAA GGTTCGAATCCTTCCCCCACCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Und-NNN-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna82) chr:952997-953091 (-) Undet (NNN) 95 bp Sc: 31.7 AGCGCAGAGATGGCGCGGTaagttgttgaCTTAAAAtgtcgttctaggaacttctaagTC GTGGGcCGCAGGTTCGAATCCTGCAGGGCGCGCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Und-NNN-2-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna36) chr:4269135-4269224 (+) Undet (NNN) 90 bp Sc: 31.7 ATATATTGATtttAttaacccaTAGCATAGGTCTCGAAAACCGGAGTAGGGGCAACTCTA CCGGGGGTTCAAATCCCCCTCTCTCCGCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Und-NNN-3-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna50) chr:3538285-3538381 (-) Undet (NNN) 97 bp Sc: 29.6 GTCCGCAGCTGGCaAGCGAATGTAAAgactGACTAAGCatGTagtaccgaGGATGTAggA aTTTCgGaCGCGGGTTCAACTCCCGCCAGCTCCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Und-NNN-4-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna5) chr:506134-506225 (+) Undet (NNN) 92 bp Sc: 22.2 GCGTAtTATActgatttttctttatttttcTTCGGTCTTGAAAACCGGCGACCCGAAAGG GTTCCAGAGTTCGAATCTCTGCGCTTCCGCCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Val-GAC-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna41) chr:4556750-4556826 (-) Val (GAC) 77 bp Sc: 85.9 GCGTCCGTAGCTCAGTTGGTtAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGtCGGTGGTTCGAG TCCACTCGGACGCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Val-GAC-2-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna40) chr:4556831-4556907 (-) Val (GAC) 77 bp Sc: 73.5 GCGTTCATAGCTCAGTTGGTtAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGtCGGTGGTTCGAG TCCAATTGAACGCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Val-TAC-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna47) chr:3779947-3780022 (-) Val (TAC) 76 bp Sc: 88.1 GGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGtCGGCGGTTCGATT CCGTCATCACCCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Val-TAC-2-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna86) chr:756898-756973 (-) Val (TAC) 76 bp Sc: 84.6 GGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGtCGGCGGTTCGATC CCGTCATCACCCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Val-TAC-2-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna84) chr:757097-757172 (-) Val (TAC) 76 bp Sc: 84.6 GGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGtCGGCGGTTCGATC CCGTCATCACCCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-Val-TAC-3-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna48) chr:3779827-3779902 (-) Val (TAC) 76 bp Sc: 83.0 GGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCATCTCCCTTACAAGGAGAGGGtCGGCGGTTCGATC CCGTCATCACCCACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-fMet-CAT-1-1 (tRNAscan-SE ID: chr.trna22) chr:2913088-2913164 (+) fMet (CAT) 77 bp Sc: 77.5 CGCGGGGTGGAGCAGCCtGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAGGtCGTCGGTTCAAA TCCGGCCCCCGCAACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-fMet-CAT-1-2 (tRNAscan-SE ID: chr.trna53) chr:3366865-3366941 (-) fMet (CAT) 77 bp Sc: 77.5 CGCGGGGTGGAGCAGCCtGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAGGtCGTCGGTTCAAA TCCGGCCCCCGCAACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-fMet-CAT-1-3 (tRNAscan-SE ID: chr.trna52) chr:3366976-3367052 (-) fMet (CAT) 77 bp Sc: 77.5 CGCGGGGTGGAGCAGCCtGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAGGtCGTCGGTTCAAA TCCGGCCCCCGCAACCA >Escherichia_albertii_KF1_tRNA-fMet-CAT-1-4 (tRNAscan-SE ID: chr.trna51) chr:3367087-3367163 (-) fMet (CAT) 77 bp Sc: 77.5 CGCGGGGTGGAGCAGCCtGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAGGtCGTCGGTTCAAA TCCGGCCCCCGCAACCA
Opérons à 7 aas
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux: Opérons à 7 aas. archivage
- Archivage opéron à 7aas
eal;comparaison avec eco 7;;;;Égaux 2 à 2;;;;;;;;;;;eco;comparaison avec eal 7;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;=;;=;;1;;=;;=;;=;;=;;;eal;entre;eco;;eal;entre;eco;;eal;entre;eco;;eal;entre;eco;;eal;entre;eco;;eal;entre;eco; ;atg;;cta;;caa;;caa;;atg;;cag;;cag;;;atg;;cta;;caa;;caa;;atg;;cag;;cag;;;atg1;2;atg1;;cta;0;cta;;caa1;0;caa1;;caa2;0;caa2;;atg2;1i5s;atg2;;cag1;faux;cag1; ;GGCTACGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACATCACTCATAATGATGGGGTCACAGGTTCGAATCCCGTCGTAGCCACCA;*;GCGGGAGTGGCGAAATTGGTAGACGCACCAGATTTAGGTTCTGGCGCCGCAAGGTGTGCGAGTTCAAGTCTCGCCTCCCGCACCA;*;TGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGTTTTTGATACCGGCATTCCCTGGTTCGAATCCAGGTACCCCAGCCA;*;TGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGTTTTTGATACCGGCATTCCCTGGTTCGAATCCAGGTACCCCAGCCA;*;GGCTACGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACATCACTCATAATGATGGGGTCACAGGTTCGAATCCCGTCGTAGCCACCA;*;TGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCA;*;TGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCA;*;;TGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCC;*;TGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGAACCTAAATCTGGTGCGTCTACCAATTTCGCCACTCCCGC;*;TGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCA;*;TGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCA;*;TGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCC;*;TGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCA;*;TGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCA;*;;TCTTTTT;*;;*;TTCACCAGAAAGCGTTGTACGGA;*;TCCGTACAACGCTTTCTGGTGAA;*;TCTTCTTCGAGTAAGCGGTTCACCGCCCGGTTAT;*;ATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGA;*;TCGAAGAAACAATCT;*;AGATTGTTTCTTCGA;*;AATTCTGAATGTGTCGAACAAGTTCGGCACATTCAAAAACCAATTTGT;*;ACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATT;*;AATTTAAAAGCGTTCTTTGCTGAACGCACAAT;*;ACTGGGTGCACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAAT;* ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 1;G;;G;;T;;T;;G;;T;;T;;;G;;G;;G;;T;;G;;T;;T;;;T;;T;;T;;T;;T;;T;;T;;T;;A;;A;;A;;A; 2;G;;C;;G;;G;;G;;G;;G;;;G;;C;;G;;G;;G;;G;;G;;;C;;C;;T;;T;;C;;C;;C;;C;;A;;A;;A;;T; 3;C;;G;;G;;G;;C;;G;;G;;;C;;G;;G;;G;;C;;G;;G;;;T;;T;;C;;C;;T;;T;;G;;G;;T;;T;;T;;T; 4;T;;G;;G;;G;;T;;G;;G;;;T;;G;;G;;G;;T;;G;;G;;;T;;T;;A;;A;;T;;T;;A;;A;;T;;T;;T;;T; 5;A;;G;;G;;G;;A;;G;;G;;;A;;G;;G;;G;;A;;G;;G;;;T;;T;;C;;C;;C;;C;;A;;A;;C;;C;;T;;A; 6;C;;A;;T;;T;;C;;T;;T;;;C;;A;;T;;T;;C;;T;;T;;;T;;T;;C;;C;;T;;T;;G;;G;;T;;T;;A;;T; 7;G;;G;;A;;A;;G;;A;;A;;;G;;G;;A;;A;;G;;A;;A;;;T;;T;;A;;A;;T;;T;;A;;A;;G;;G;;A;;T; 8;T;;T;;T;;T;;T;;T;;T;;;T;;T;;T;;T;;T;;T;;T;;;;;T;;G;;G;;C;;C;;A;;A;;A;;A;;A;;C; 9;A;;G;;C;;C;;A;;C;;C;;;A;;G;;C;;C;;A;;C;;C;;;;;T;;A;;A;;G;;G;;A;;A;;A;;A;;A;;A; 10;G;;G;;G;;G;;G;;G;;G;;;G;;G;;G;;G;;G;;G;;G;;;;;;;A;;A;;A;;A;;C;;C;;T;;T;;G;;A; 11;C;;C;;C;;C;;C;;C;;C;;;C;;C;;C;;C;;C;;C;;C;;;;;;;A;;A;;G;;G;;A;;A;;G;;G;;C;;G; 12;T;;G;;C;;C;;T;;C;;C;;;T;;G;;C;;C;;T;;C;;C;;;;;;;G;;G;;T;;T;;A;;A;;T;;T;;G;;A; 13;C;;A;;A;;A;;C;;A;;A;;;C;;A;;A;;A;;C;;A;;A;;;;;;;C;;C;;A;;A;;T;;T;;G;;A;;T;;C; 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27;A;;A;;C;;C;;A;;C;;C;;;A;;A;;C;;C;;A;;C;;C;;;;;;;;;;;C;;C;;;;;;G;;G;;C;;G; 28;C;;C;;G;;G;;C;;G;;G;;;C;;C;;G;;G;;C;;G;;G;;;;;;;;;;;C;;C;;;;;;C;;C;;A;;T; 29;A;;C;;G;;G;;A;;G;;G;;;A;;C;;G;;G;;A;;G;;G;;;;;;;;;;;G;;G;;;;;;A;;A;;C;;G; 30;T;;A;;T;;T;;T;;A;;A;;;T;;A;;T;;T;;T;;A;;A;;;;;;;;;;;G;;G;;;;;;C;;A;;A;;C; 31;C;;G;;T;;T;;C;;T;;T;;;C;;G;;T;;T;;C;;T;;T;;;;;;;;;;;T;;T;;;;;;A;;A;;A;;A; 32;A;;A;;T;;T;;A;;T;;T;;;A;;A;;T;;T;;A;;T;;T;;;;;;;;;;;T;;T;;;;;;T;;T;;T;;C; 33;C;;T;;T;;T;;C;;C;;C;;;C;;T;;T;;T;;C;;C;;C;;;;;;;;;;;A;;A;;;;;;T;;T;;;;C; 34;T;;T;;T;;T;;T;;T;;T;;;T;;T;;T;;T;;T;;T;;T;;;;;;;;;;;T;;T;;;;;;C;;C;;;;C; 35;C;;T;;G;;G;;C;;G;;G;;;C;;T;;G;;G;;C;;G;;G;;;;;;;;;;;;;;;;;;;A;;**;;;;A; 36;A;;A;;A;;A;;A;;A;;A;;;A;;A;;A;;A;;A;;A;;A;;;;;;;;;;;;;;;;;;;A;;A;;;;G; 37;T;;G;;T;;T;;T;;T;;T;;;T;;G;;T;;T;;T;;T;;T;;;;;;;;;;;;;;;;;;;A;;A;;;;T; 38;A;;G;;A;;A;;A;;T;;T;;;A;;G;;A;;A;;A;;T;;T;;;;;;;;;;;;;;;;;;;A;;A;;;;; 39;A;;T;;C;;C;;A;;C;;C;;;A;;T;;C;;C;;A;;C;;C;;;;;;;;;;;;;;;;;;;A;;A;;;;; 40;T;;T;;C;;C;;T;;C;;C;;;T;;T;;C;;C;;T;;C;;C;;;;;;;;;;;;;;;;;;;C;;C;;;;; 41;G;;C;;G;;G;;G;;G;;G;;;G;;C;;G;;G;;G;;G;;G;;;;;;;;;;;;;;;;;;;C;;C;;;;; 42;A;;T;;G;;G;;A;;G;;G;;;A;;T;;G;;G;;A;;G;;G;;;;;;;;;;;;;;;;;;;A;;A;;;;; 43;T;;G;;C;;C;;T;;C;;C;;;T;;G;;C;;C;;T;;C;;C;;;;;;;;;;;;;;;;;;;A;;A;;;;; 44;G;;G;;A;;A;;G;;A;;A;;;G;;G;;A;;A;;G;;A;;A;;;;;;;;;;;;;;;;;;;T;;T;;;;; 45;G;;C;;T;;T;;G;;T;;T;;;G;;C;;T;;T;;G;;T;;T;;;;;;;;;;;;;;;;;;;T;;T;;;;; 46;G;;G;;T;;T;;G;;T;;T;;;G;;G;;T;;T;;G;;T;;T;;;;;;;;;;;;;;;;;;;T;;T;;;;; 47;G;;C;;C;;C;;G;;C;;C;;;G;;C;;C;;C;;G;;C;;C;;;;;;;;;;;;;;;;;;;G;;G;;;;; 48;T;;C;;C;;C;;T;;C;;C;;;T;;C;;C;;C;;T;;C;;C;;;;;;;;;;;;;;;;;;;T;;T;;;;; 49;C;;G;;C;;C;;C;;G;;G;;;C;;G;;C;;C;;C;;G;;G;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 50;A;;C;;T;;T;;A;;A;;A;;;A;;C;;T;;T;;A;;A;;A;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 51;C;;A;;G;;G;;C;;G;;G;;;C;;A;;G;;G;;C;;G;;G;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 52;A;;A;;G;;G;;A;;G;;G;;;A;;A;;G;;G;;A;;G;;G;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 53;G;;G;;T;;T;;G;;T;;T;;;G;;G;;T;;T;;G;;T;;T;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 54;G;;G;;T;;T;;G;;T;;T;;;G;;G;;T;;T;;G;;T;;T;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 55;T;;T;;C;;C;;T;;C;;C;;;T;;T;;C;;C;;T;;C;;C;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 56;T;;G;;G;;G;;T;;G;;G;;;T;;G;;G;;G;;T;;G;;G;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 57;C;;T;;A;;A;;C;;A;;A;;;C;;T;;A;;A;;C;;A;;A;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 58;G;;G;;A;;A;;G;;A;;A;;;G;;G;;A;;A;;G;;A;;A;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 59;A;;C;;T;;T;;A;;T;;T;;;A;;C;;T;;T;;A;;T;;T;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 60;A;;G;;C;;C;;A;;C;;C;;;A;;G;;C;;C;;A;;C;;C;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 61;T;;A;;C;;C;;T;;C;;C;;;T;;A;;C;;C;;T;;C;;C;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 62;C;;G;;A;;A;;C;;T;;T;;;C;;G;;A;;A;;C;;T;;T;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 63;C;;T;;G;;G;;C;;C;;C;;;C;;T;;G;;G;;C;;C;;C;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 64;C;;T;;G;;G;;C;;G;;G;;;C;;T;;G;;G;;C;;G;;G;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 65;G;;C;;T;;T;;G;;T;;T;;;G;;C;;T;;T;;G;;T;;T;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 66;T;;A;;A;;A;;T;;A;;A;;;T;;A;;A;;A;;T;;A;;A;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 67;C;;A;;C;;C;;C;;C;;C;;;C;;A;;C;;C;;C;;C;;C;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 68;G;;G;;C;;C;;G;;C;;C;;;G;;G;;C;;C;;G;;C;;C;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 69;T;;T;;C;;C;;T;;C;;C;;;T;;T;;C;;C;;T;;C;;C;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 70;A;;C;;C;;C;;A;;C;;C;;;A;;C;;C;;C;;A;;C;;C;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 71;G;;T;;A;;A;;G;;A;;A;;;G;;T;;A;;A;;G;;A;;A;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 72;C;;C;;G;;G;;C;;G;;G;;;C;;C;;G;;G;;C;;G;;G;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 73;C;;G;;C;;C;;C;;C;;C;;;C;;G;;C;;C;;C;;C;;C;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 74;A;;C;;C;;C;;A;;C;;C;;;A;;C;;C;;C;;A;;C;;C;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 75;C;;C;;A;;A;;C;;A;;A;;;C;;C;;A;;A;;C;;A;;A;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 76;C;;T;;;;;;C;;;;;;;C;;T;;;;;;C;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 77;A;;C;;;;;;A;;;;;;;A;;C;;;;;;A;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 78;;;C;;;;;;;;;;;;;;;C;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 79;;;C;;;;;;;;;;;;;;;C;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 80;;;G;;;;;;;;;;;;;;;G;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 81;;;C;;;;;;;;;;;;;;;C;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 82;;;A;;;;;;;;;;;;;;;A;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 83;;;C;;;;;;;;;;;;;;;C;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 84;;;C;;;;;;;;;;;;;;;C;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 85;;;A;;;;;;;;;;;;;;;A;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 86;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 87;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 88;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 89;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 90;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 91;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 92;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 93;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Opérons à 5 aas
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux: Opérons à 5 aas. archivage
- Légende: Les symboles * § @ repèrent les colonnes en comparaison. Les séquences sont archivées aussi pour pouvoir contrôler. Les modifications sont des substitutions (nombre suivi de s ou non) et des insertions d'une base (nombre suivi de i). Les 2 séquences après tcg3 (ap3) ont 2 fois 5 bases A (2x5A) qu'on ne retrouve pas sur les segments analogues, ap1 et ap2. Voir la méthode de comparaison dans l'annexe Tableaux.
- Mutation du codon agc chez eco: Au dernier tableau de ces comparaisons entre tcg3 de eal et eco (colonnes 3 et 4) l'anti-codon GCT (+34) est muté en GCG qui représente une Arg d'une longueur de 77 pb.
- Archivage opéron à 5aas
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;eal 5;intra;« entre » de 198;;;;;eco 5;intra;« entre » de 198;;;;;entre tcg1 eal-eco;;;;;;;entre tcg2 eal-eco;;;;;;;;intra eal;;« entre » de 198 + tcg3;;;;;;;;intra eco;;« entre » de 198 + tcg3;;;;;;;;entre les 2*352 et §;;;;;entre tcg3 eal-eco;;;;; ;eal;comparaison avec eco 5;;;;;;;eco;comparaison avec eal 5;;;;;;;;;;;;*1;@1;§1;*2;@2;§2;;*1;@1;§1;*2;@2;§2;;*1;*1;@1;@1;§1;§1;;*2;*2;@2;@2;§2;§2;;;*1;@1;§1;*2;@2;§2;*3;@3;§3;;*1;@1;§1;*2;@2;§2;*3;@3;§3;;eco 5;§1;§2;;;*3;*3;@3;@3;§3;§3 ;agc;;cgt;;cgt;;cgt;;cgt;;cgt;;cgt;;cgt;;agc;;;;;;tcg 1;;;tcg 2;;;;tcg 1;;;tcg 2;;;eal;eco;eal;eco;eal;eco;;eal;eco;eal;eco;eal;eco;;;eal;tcg 1;;;tcg 2;;;tcg 3;;;eco;tcg 1;;;tcg 2;;;tcg 3;;;352;tcg 1;tcg 2;;;tcg 3;tcg 3;tcg 3;tcg 3;tcg 3;tcg 3 ;GGTGAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGCCA;*;GCATCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCGGAGGTTCGAATCCTCCCGGATGCACCA;*;GCATCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCGGAGGTTCGAATCCTCCCGGATGCACCA;*;GCATCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCGGAGGTTCGAATCCTCCCGGATGCACCA;*;TGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGC;*;TGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGC;*;TGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGC;*;TGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGC;*;TGGCGGTGAGGCGGGGATTCGAACCCCGGATGCAGCTTTTGACCGCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAGCCTCTCGGCCACCTCACC;*;;;;TATTCTCCGTAATCTTCAGCGATGAAGATTACGGAAGAGGTGGC;GGTAACAACCGCCTGCACCAGGAAGGATAACGTTGCTTCAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGCCGCAAGGCGAGTAATCCTCCCGGATGCACCA;TCTCTTACTTGATATGGCTTTAGTAGCGATATCAATATCAGCAGTAAAATAAGTTTTCCGAT;TATTCTCCGTAATCTTCAGCGATGAAGATATGGAAGAGGTGGC;GGTAACGACCGCTTGCACCAGGAAGGATAACGTTGCTTCAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGCCGCAAGGCGAGTAATCCTCCCGGATGCACCA;TCTCTTACTTGATATGGTTTTAGTAGCGATATCAATATCAGCAGTAAAATAAGTTTTCCGAT;%;GCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAGTACGTAGAATA;TGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACC;ATCGGGAAACTTACTTTACTGCAGATTTTTTGATACCGCTACTAAAGCCGTATCAAGTAAGAGA;GCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATA;TGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCC;ATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGA;%;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;TTTTCTCCGTAATCTTCAGCGATGAAGATATGGAAGAGGTG;GCGGTAACGACCGCCTGCACCAGGAAGGATAACGTTGCTTCAGCAACGGCCCGAAGGGAGAACGCCAGTGAGTCATCCTCCCGGATGCACCA;TCTTCTCTAAAAATTTCCTTTAAAAAATCTCTCATTTCTAAATAACTATTTTCTCCGTTTCC;%;;;;;;;TATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATA;TGGTGCATCCGGGAGGATGACTCACTGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGC;CAGGAAATGGATAAAGGAGTTATTTAGAAATGAGATATTTTTGAAGGAAATTTTTTGGAGAAGA;%;ATCGGGAAATTTATTTTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAAGTAAGAGA;%;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;1i1s;2;1;;;;;1i,6;4;1i,18;;;;;;2i,4;;4,1;;2i,6;;;5;;9,1;;1i,4;;;1i1s;2;1;;;;1;2i,6;2x5A;;1i,6;4;1i,18;;;;3;2i,12;2x5A;;;2i,20;1i,4;;;;7;;9;;2i,7 1;G;;G;;G;;G;;G;;G;;G;;G;;G;résultats;;;;T;G;T;T;G;T;;T;G;T;T;G;T;;T;T;G;G;T;T;;T;T;G;G;T;T;;;T;G;T;T;G;T;T;G;T;;T;G;T;T;G;T;T;G;T;;T;T;T;;;T;T;G;G;T;T 2;G;;C;;C;;C;;C;;C;;C;;C;;G;ok;;;;A;G;C;A;G;C;;A;G;C;A;G;C;;A;A;G;G;C;C;;A;A;G;G;C;C;;;A;G;C;A;G;C;T;G;C;;A;G;C;A;G;C;A;G;C;;C;C;C;;;T;A;G;G;C;C 3;T;;A;;A;;A;;A;;A;;A;;A;;T;agc/agc;;;;T;T;T;T;T;T;;T;T;T;T;A;T;;T;T;T;T;T;T;;T;T;T;A;T;T;;;T;T;T;T;T;T;T;T;T;;T;T;T;T;A;T;T;T;T;;T;T;T;;;T;T;T;T;T;T 4;G;;T;;T;;T;;T;;T;;T;;T;;G;ok;;;;T;A;C;T;A;C;;T;A;C;T;A;C;;T;T;A;A;C;C;;T;T;A;A;C;C;;;T;A;C;T;A;C;T;A;T;;T;A;C;T;A;C;T;A;T;;C;C;C;;;T;T;A;A;T;T 5;A;;C;;C;;C;;C;;C;;C;;C;;A;cgt/cgt;;;;C;A;T;C;A;T;;C;A;T;C;T;T;;C;C;A;A;T;T;;C;C;A;T;T;T;;;C;A;T;C;A;T;C;A;C;;C;A;T;C;T;T;C;T;C;;T;T;T;;;C;C;A;T;C;C 6;G;;C;;C;;C;;C;;C;;C;;C;;G;;;;;T;C;T;T;C;T;;T;T;T;T;T;T;;T;T;C;T;T;T;;T;T;C;T;T;T;;;T;C;T;T;C;T;T;C;T;;T;T;T;T;T;T;T;T;T;;T;T;T;;;T;T;C;T;T;T 7;G;;G;;G;;G;;G;;G;;G;;G;;G;Les 7 cgt sont identiques;;;;C;A;A;C;G;A;;A;A;A;C;A;A;;C;A;A;A;A;A;;C;C;G;A;A;A;;;C;A;A;C;G;A;C;G;C;;A;A;A;C;A;A;C;A;C;;A;A;A;;;C;C;G;A;C;C 8;T;;T;;T;;T;;T;;T;;T;;T;;T;fonction NB.SI;;;;C;A;C;C;A;C;;C;A;C;C;A;A;;C;C;A;A;C;C;;C;C;A;A;C;A;;;C;A;C;C;A;C;C;A;T;;C;A;C;C;A;A;C;A;C;;C;C;A;;;C;C;A;A;T;C 9;G;;A;;A;;A;;A;;A;;A;;A;;G;;;;;G;C;T;G;C;T;;G;C;T;G;C;T;;G;G;C;C;T;T;;G;G;C;C;T;T;;;G;C;T;G;C;T;G;C;A;;G;C;T;G;C;T;G;C;A;;T;T;T;;;G;G;C;C;A;A 10;G;;G;;G;;G;;G;;G;;G;;G;;G;;;;;T;C;T;T;C;T;;T;C;T;A;C;T;;T;T;C;C;T;T;;T;A;C;C;T;T;;;T;C;T;T;C;T;T;C;A;;T;C;T;A;C;T;T;C;A;;T;T;T;;;T;T;C;C;A;A 11;C;;C;;C;;C;;C;;C;;C;;C;;C;;;;;A;G;G;A;G;G;;A;G;G;A;G;G;;A;A;G;G;G;G;;A;A;G;G;G;G;;;A;G;G;A;G;G;A;G;A;;A;G;G;A;G;G;A;G;A;;G;G;G;;;A;A;G;G;A;A 12;C;;T;;T;;T;;T;;T;;T;;T;;C;;;;;A;C;A;A;C;A;;C;C;A;A;C;A;;A;C;C;C;A;A;;A;A;C;C;A;A;;;A;C;A;A;C;A;A;C;A;;C;C;A;A;C;A;A;C;A;;A;A;A;;;A;A;C;C;A;A 13;G;;C;;C;;C;;C;;C;;C;;C;;G;;;;;T;C;T;T;T;T;;T;A;T;T;A;T;;T;T;C;A;T;T;;T;T;T;A;T;T;;;T;C;T;T;T;T;T;C;A;;T;A;T;T;A;T;C;A;A;;T;T;T;;;T;C;C;A;A;A 14;A;;A;;A;;A;;A;;A;;A;;A;;A;;;;;C;T;A;C;T;A;;**;G;A;C;G;A;;C;**;T;G;A;A;;C;C;T;G;A;A;;;C;T;A;C;T;A;C;T;T;;**;G;A;C;G;A;C;G;A;;A;A;A;;;C;C;T;G;**;A 15;G;;G;;G;;G;;G;;G;;G;;G;;G;;;;;T;G;T;T;G;T;;T;G;C;T;G;T;;T;T;G;G;T;C;;T;T;G;G;T;T;;;T;G;T;T;G;T;T;G;T;;T;G;C;T;G;T;T;G;T;;T;C;T;;;T;T;G;G;T;T 16;A;;C;;C;;C;;C;;C;;C;;C;;A;;;;;T;C;G;T;C;G;;T;C;G;T;C;G;;T;T;C;C;G;G;;T;T;C;C;G;G;;;T;C;G;T;C;G;T;C;T;;T;C;G;T;C;G;T;C;T;;G;G;G;;;T;T;C;C;T;T 17;G;;T;;T;;T;;T;;T;;T;;T;;G;;;;;C;A;G;C;A;G;;C;A;G;C;A;G;;C;C;A;A;G;G;;C;C;A;A;G;G;;;C;A;G;C;A;G;C;A;C;;C;A;G;C;A;G;C;A;T;;G;G;G;;;C;C;A;A;T;T 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Opérons à 4 aas
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux: Opérons à 4 aas. archivage 4aas.
- Archivage opéron à 4aas
eal;comparaison avec eco 4,1;;;;;;;;eal;comparaison avec eco 4,2;;;;;;;;;;eco;comparaison avec eal 4,1;;;;;;;;eco;comparaison avec eal 4,2;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;=;;=;;=;;=;;;=;;=;;=;;=;;;eal;entre;eco;;eal;entre;eco;;eal;entre;eco;;eal;entre;eco;;eal;entre;eco;;eal;entre;eco; ;cgg;;cac;;ctg;;cca;;;aca;;tac;;gga;;acc;;;;cgg;;cac;;ctg;;cca;;;aca;;tac;;gga;;acc;;;cgg;0;cgg;;cac;0;cac;;ctg;2i,1s;ctg;;aca;1;aca;;tac;0;tac;;gga;0;gga; ;TGGCGCGCCCGACAGGATTCGAACCTGAGACCTCTGCCTCCGGAGGGCAGCGCTCTATCCAGCTGAGCTACGGGCGC;*;TGGGGTGGCTAATGGGATTCGAACCCACGACAACTGGAATCACAATCCAGGGCTCTACCAACTGAGCTATAGCCAC;*;TGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGC;*;TGGTCGGCGAGAGAGGATTCGAACCTCCGACCCACTGGTCCCAAACCAGTTGCGCTACCAAGCTGCGCTACTCGCCG;*;;TGGTGCCGACTACCGGAATCGAACTGGTGACCTACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCTACTGAGCTAAGTCGGC;*;TGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCTGTGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACC;*;TGGAGCGGGCAGCGGGAATCGAACCCGCATCATCAGCTTGGAAGGCTGAGGTAATAGCCATTATACGATGCCCGC;*;TGGTGCTGATAGGCAGATTCGAACTGCCGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCTATATCAGC;*;;;GCGCCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGCGCTGCCCTCCGGAGGCAGAGGTCTCAGGTTCGAATCCTGTCGGGCGCGCCA;*;GTGGCTATAGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCA;*;GCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCA;*;CGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGGGTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGACCA;*;;GCCGACTTAGCTCAGTAGGTAGAGCAACTGACTTGTAATCAGTAGGTCACCAGTTCGATTCCGGTAGTCGGCACCA;*;GGTGGGGTTCCCGAGCGGCCAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTCACAGACTTCGAAGGTTCGAATCCTTCCCCCACCACCA;*;GCGGGCATCGTATAATGGCTATTACCTCAGCCTTCCAAGCTGATGATGCGGGTTCGATTCCCGCTGCCCGCTCCA;*;GCTGATATAGCTCAGTTGGTAGAGCGCACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCGAATCTGCCTATCAGCACCA;*;;CACTACAAATCTTGTTACGCGGTATTACTACCACCGCAGCTCAAGCGCCGGGACTAAA;*;TTTAGTCCCGGCGCTTGAGCTGCGGTGGTAGTAATACCGCGTAACAAGATTTGTAGTG;*;ATTGTCACAACTTCTAATAA;*;TTATTAGAAGTTGTGACAAT;*;AAATACTGCTTTTTGAATTTTAGTTCAACTCTTTAAGTCG;*;CGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTT;*;GGACTTGA;*;TCAAGTCC;*;ATCCTGGAACTCGGCTACCTGATTTTCATTCTGCACTGAATATCGAGAGAAGCTCTCTTTATTCGAGCCGGTAAGCGAACTTATCGTCTCGGGCTACGCCATCGCGTGGCCGAAAT;*;ATTTCGGCCACGCGATGGCGTAGCCCGAGACGATAAGTTCGCTTACCGGCTCGAATAAAGAGAGCTTCTCTCGATATTCAGTGCAGAATGAAAATCAGGTAGCCGAGTTCCAGGAT;*;ACATCT;*;AGATGT;* ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 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Autres procaryotes
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vpb
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- Liens:
;;;;;;;;;;;;;;gtRNAdb;gtRNAdb;http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/bacteria/Vibr_para_BB22OP/vibrPara_BB22OP-tRNAs.fa;;;;;;; ;1.6.19 Paris ;vibrio a 15 rRNAs 16s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;opéron;19aas;10cta 4atg 5caa;;;;opéron;rRNA 6aas;; vpb;Vibrio_parahaemolyticus BB22OP;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; chr1;https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/CP003972;;;;;;;;;tRNAs;rRNAs;;;769652;769733;;32;cta;;3060927;3061000;tgg;71 ;33641..35115;;;;16s-gaa aaa gta-23s-5s;;;;;3;3;;;769766;769847;;50;cta;;3061072;3061145;gac;28 ;577998..579472;;;;16s-gcc gaa-23s-5s-gac tgg;;;;;4;3;;;769898;769971;;27;atg;;3061174;3061293;5s;89 comp;2741266..2741339;;;;gac-5s-acc-5s-23s-gca atc-16s;;;;;4;4;;;769999;770080;;55;cta;;3061383;3064273;23s;267 comp;2847649..2847722;;;;tgg gac-5s-23s-gaa-16s;;;;;3;3;;;770136;770207;;32;caa;;3064541;3064613;gta;17 comp;3060927..3061000;;;;tgg gac-5s-23s-gta gca aaa gaa-16s-5s-23s-16s;;;;;6;6;;;770240;770321;;56;cta;;3064631;3064703;gca;35 comp;3111076..3111149;;3114606..3116080;;gac-5s-23s-16s;;;;;1;3;;;770378;770451;;27;atg;;3064739;3064811;aaa;5 comp;3116246..3116359;;;;CDS;37 aas;;;;;;;;770479;770560;;55;cta;;3064817;3064889;gaa;140 comp;3116423..3116542;;;;5s-23s-16s;;;;;0;3;;;770616;770687;;32;caa;;3065030;3066504;16s;344 comp;3175947..3176034;;3179779..3181253;;tca-5s-23s-gca atc-16s;;;;;3;3;;;770720;770801;;57;cta;;3066849;3066968;5s;89 comp;3217190..3217263;;3221111..3222585;;gac-5s-23s-gta aaa gaa-16s;;;;;4;3;;;770859;770930;;32;caa;;3067058;3069948;23s;328 ;;;;;;;;;;28;31;;;770963;771044;;38;cta;;3070277;3071751;16s; ;chr1+2;Fichier :GCA_000328405.1_ASM32840v1_genomic.gbff.gz;;;;;;;;;;;;771083;771154;;51;caa;;;;; chr2;;ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCA/000/328/405/GCA_000328405.1_ASM32840v1;;;;;;;;;;;;771206;771287;;34;cta;;;;; ;132908..134407;;138318..138405;;16s-gaa aaa gca gta-23s-5s;;;;;4;3;;;771322;771403;;80;cta;;;;; ;;;;;;;;;;93;;;;771484;771557;;80;atg;;;;; chr1;49997..50070;;50480..50553;;cgg cac cca cac cca;;;;;5;;;;771638;771709;;34;caa;;;;; ;400048..400120;;;;atgi;;;;;1;;;;771744;771825;;43;cta;;;;; ;769652..769733;;771869..771942;;cta cta atg cta caa cta atg cta caa cta caa cta caa cta cta;;;;;19;;;;771869;771942;;;atg;;;;; ;;;;;atg caa cta atg;;;;10 cta 5caa 4 atg;;;;;;;;;;;;;; ;786939..787012;;;;cca;;;;;1;;;;opéron;13aas;;8ggc 5atgf;;;;;; comp;802318..802391;;;;agg;;;;;1;;;;2987488;2987561;;59;atgf;;;;; ;910219..910292;;;;aga;;;;;1;;;;2987621;2987693;;21;ggc;;;;; comp;982092..982173;;982590..982671;;4 tac;;;;;4;;;;2987715;2987788;;38;atgf;;;;; ;1124715..1124799;;;;tcc;;;;;1;;;;2987827;2987899;;53;ggc;;;;; ;1418321..1418394;;1418430..1418503;;2 gta;;;;;2;;;;2987953;2988025;;52;ggc;;;;; comp;1988130..1988202;;1988475..1988545;;ggc tta gcc tgc;;;;;4;;;;2988078;2988150;;52;ggc;;;;; ;2164082..2164154;;;;aac;;;;;1;;;;2988203;2988275;;33;ggc;;;;; ;2193593..2193680;;;;cta;;;;;1;;;;2988309;2988382;;58;atgf;;;;; comp;2547887..2547960;;2548020..2548100;;atgf ctc ;;;;;2;;;;2988441;2988513;;33;ggc;;;;; comp;2652095..2652168;;2653292..2653380;;8 cgt agc;;;8 cgt agc;;9;;;;2988547;2988620;;42;atgf;;;;; ;2653417..2653539;;CDS 40aas;;;;;;;;;;;2988663;2988735;;22;ggc;;;;; comp;2653704..2653777;;2653812..2653900;;cgt agc;;;;;2;;;;2988758;2988831;;38;atgf;;;;; ;2735697..2735769;;2736415..2736487;;tcc aca tcc aac aca tcc aac;;;3tcc 2aca 2aac;;7;;;;2988870;2988942;;;ggc;;;;; ;2736823..2738388;;CDS 579aas;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;2738623..2738695;;2739053..2739125;;tcc aca aac aca aac;;;;;5;;;;;;;;;;;;; comp;2755931..2756012;;;;ttg;;;;;1;;;;;;;;;;;;; comp;2987488..2987561;;2988870..2988942;;atgf ggc atgf 4ggc atgf ggc atgf ggc atgf ggc;;;;5 atgf 8ggc;13;;;;;;;;;;;;; comp;3105097..3105169;;3105417..3105489;;acc gga tac aca;;;;;4;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; chr2;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; comp;192889..192969;;;;ctc;;;;;1;;;;;;;;;;;;; comp;591934..592021;;;;tca;;;;;1;;;;;;;;;;;;; comp;1009460..1009530;;1009607..1009690;;tgc tta;;;;;2;;;;;;;;;;;;; comp;1021571..1021641;;1021718..1021801;;2tgc;;;;;2;;;;;;;;;;;;; comp;1029976..1030048;;1030055..1030125;;ggc tgc;;;;;2;;;;;;;;;;;;; ;1125193..1125264;;;;gga;;;;;1;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; avec rRNA;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; vpb;;;;;;;36;;;;;;;;;;;;;;;; ttt;;tct;;tat;;tgt;;;;;;;;;;;;;;;;; att;;act;;aat;;agt;;;;;;;;;;;;;;;;; ctt;;cct;;cat;;cgc;;;;;;;;;;;;;;;;; gtt;;gct;;gat;;ggt;;;;;;;;;;;;;;;;; ttc;;tcc;;tac;;tgc;;;;;;;;;;;;;;;;; atc;2;acc;1;aac;;agc;;;;;;;;;;;;;;;;; ctc;;ccc;;cac;2;cgt;;;;;;;;;;;;;;;;; gtc;;gcc;1;gac;6;ggc;;;;;;;;;;;;;;;;; tta;;tca;1;taa;;tga;;;;;;;;;;;;;;;;; ata;;aca;;aaa;4;aga;;;;;;;;;;;;;;;;; cta;;cca;2;caa;;cga;;;;;;;;;;;;;;;;; gta;4;gca;4;gaa;6;gga;;;;;;;;;;;;;;;;; ttg;;tcg;;tag;;tgg;3;;;;;;;;;;;;;;;; atg;;acg;;aag;;agg;;;;;;;;;;;;;;;;; ctg;;ccg;;cag;;cgg;;;;;;;;;;;;;;;;; gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; sans rRNA;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; vpb;atgf 6;;;;;;87;;;;;;;;;;;;;;;; ttt;;tct;;tat;;tgt;;;;;;;;;;;;;;;;; att;;act;;aat;;agt;;;;;;;;;;;;;;;;; ctt;;cct;;cat;;cgc;;;;;;;;;;;;;;;;; gtt;;gct;;gat;;ggt;;;;;;;;;;;;;;;;; ttc;;tcc;5;tac;5;tgc;5;;;;;;;;;;;;;;;; atc;;acc;1;aac;5;agc;2;;;;;;;;;;;;;;;; ctc;2;ccc;;cac;2;cgt;9;;;;;;;;;;;;;;;; gtc;;gcc;1;gac;;ggc;10;;;;;;;;;;;;;;;; tta;2;tca;1;taa;;tga;;;;;;;;;;;;;;;;; ata;1;aca;5;aaa;;aga;1;;;;;;;;;;;;;;;; cta;11;cca;3;caa;5;cga;;;;;;;;;;;;;;;;; gta;2;gca;;gaa;;gga;2;;;;;;;;;;;;;;;; ttg;1;tcg;;tag;;tgg;;;;;;;;;;;;;;;;; atg;4;acg;;aag;;agg;1;;;;;;;;;;;;;;;; ctg;;ccg;;cag;;cgg;1;;;;;;;;;;;;;;;; gtg;;gcg;;gag;;ggg;;;;;;;;;;;;;;;;;
mja
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- Liens:
- - NCBI[25],
1.6.19 Paris ;;Opérons tRNAs;;euryarcheota;;introns;Met Trp;;;;;;;;;avec rRNA;;;;;;; Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661;;;;https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/L77117;;;;;;;;;;;;mja;NCBI;;;;;;13 mja;NCBI;comp;154759;157648;;23s;1;;comp;97429..97537;;atg;2;;;ttt;;tct;;tat;;tgt; ;;;157847;157919;;gca;;;-;97629..97713;;ctc;;;;att;;act;;aat;;agt; ;;;157985;159459;;16s;;;;;;;;;;ctt;;cct;;cat;;cgc; ;;;;;;;;;vérifié ok;111768..111852;;tga ;1;;;gtt;;gct;;gat;;ggt; ;10;;637583;637656;;ttc;7;;comp;138347..138419;;gtg;1;;;ttc;1;tcc;;tac;1;tgc; ;32;;637667;637739;;aac;;;;186978..187063;;tcc;1;;;atc;;acc;;aac;1;agc; ;21;;637772;637846;;atg;;;;190832..190905;;ccc;1;;;ctc;;ccc;;cac;1;cgt; ;39;;637868;637942;;gaa;;;;215210..215294;;tta;1;;;gtc;;gcc;;gac;1;ggc; ;14;;637982;638066;;cta;;;comp;227707..227780;;gcc;1;;;tta;;tca;;taa;;tga; ;299;;638081;638152;;cac;;;;303992..304078;;tca;1;;;ata;;aca;1;aaa;1;aga; ;65;;638452;639929;;16s;;;;;;;;;;cta;1;cca;1;caa;;cga; ;207;;639995;640067;;gca;;;;358768..358842;;aga;2;;;gta;;gca;2;gaa;1;gga; ;106;;640275;643223;;23s;;;;358869..358943;;gaa;;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg; ;;;643330;643449;;5s;;;;;;;;;;atg;1;acg;;aag;;agg; ;;;;;;;;;comp;359972..360047;;atg;1;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg; ;17;;863479;863552;;aca;5;;comp;402971..403044;;gtc;1;;;gtg;;gcg;;gag;;ggg; ;11;;863570;863644;;cca;;;comp;619163..619234;;tgc;1;;;;;;;;;; ;86;;863656;863729;;tac;;;;;;;;;;sans rRNA;;;;;;; ;;;863816;863889;;aaa;;;comp;763769..763842;;acc;2;;;mja;NCBI;;;;;;24 ;;;863900;864019;;5s;;;-;764021..764093;;caa;;;;ttt;;tct;;tat;;tgt; ;;;864064;864138;;gac;;;;;;;;;;att;;act;;aat;;agt; ;;;;;;;;;;862590..862661;;cga;1;;;ctt;;cct;;cat;;cgc;1 ;;;;;;;;;comp;873689..873763;;atc;1;;;gtt;;gct;;gat;;ggt; ;;;;;;;;;;883681..883754;;gta;1;;;ttc;;tcc;1;tac;;tgc;1 ;;;;;;;;;comp;1038544..1038620;;cgc;1;;;atc;1;acc;1;aac;;agc;1 ;;;;;;;;;;;;;;;;ctc;1;ccc;1;cac;;cgt; ;;;;;;;;;;1150145..1150217;;ggc;2;;;gtc;1;gcc;1;gac;;ggc;1 ;;;;;;;;;;1150255..1150327;;gga;;;;tta;1;tca;1;taa;;tga;1 ;;;;;;;;;;;;;;;;ata;;aca;;aaa;;aga;1 ;;;;;;;;;;1189945..1190052;;tgg;1;;;cta;;cca;;caa;1;cga;1 ;;;;;;;;;;1313165..1313249;;agc;1;;;gta;1;gca;;gaa;1;gga;1 ;;;;;;;;;;;;;;;;ttg;;tcg;;tag;;tgg;1 ;;;;;;;;;;;;;24;;;atg;2;acg;;aag;;agg; ;;;;;;;;;;;;;;;;ctg;;ccg;;cag;;cgg; ;;;;;;;;;;;;;;;;gtg;1;gcg;;gag;;ggg;
pab
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- Liens:
1.6.19 Paris ;;;;;;;;;;; Pyrobaculum calidifontis JCM 11548;;;71 introns;Crenarcheota;;;;;;; pcl;beaucoup de pseudos, 1 seul 16s-23s et 1 seul 5s, les tRNAs sont des gènes comme mja;;;;;;;;;; ;les opérons ne dépassent pas 2 gènes tRNA;;;;Total 46;;;;;; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/CP000561;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;; 1.6.19 Paris ;;;;;;;;;;; Pyrococcus abyssi;;;;;;;;;;; pab;;Opérons tRNAs;;tout les autres pyrococcus ont « gène » pour leurs tRNAs;;;;;;; pab;euryarcheota;;;;introns;Met Trp;;;;; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/AL096836;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;; ; tRNA complement(149919..149996);;;;;gene direct;?? ggc;2;;; ; /product="tRNA-Gly";;;;;;;;;; ; /anticodon=(pos:complement(149956..149958),aa:Gly,seq:cga);;;;;;;;;; ; tRNA complement(150004..150080);;;;;;?? ttc;;;; ; /product="tRNA-Phe";;;;;;;;;; ; /anticodon=(pos:complement(150042..150044),aa:Phe,seq:aga);;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;; ; rRNA 205039..206541;;;;;;16s;1;;; ; tRNA 206606..206683;;;;;;gca;;;; ; rRNA 206831..209848;;;;;;23s;;;; ;;;;;;;;;;; ; tRNA 296677..296753;;;;;;cac;1;;; ;;;;;;;;;;; ;gene;414888..414945;;;;;ncRNA;;;; ;tRNA;415004..415080;;;;;gta;1;;; ;;;;;;;;;;; ;rRNA;415992..416113;;;;;5s;;;; ;tRNA;416131..416208;;;;;gac;1;;; ;;;;;;;;;;; ;tRNA;463515..463592;;;;;gtg;1;;; ;;503940..504026;;;;;tca;1;;; ;;506290..506377;;;;;cta;1;;; ;;507939..508015;;;;;ccc;1;;; ;;;;;;;;;;; ;;578139..578215;;;;;aca;2;;; ;;578219..578296;;;;;cca;;;; ;;;;;;;;;;; ;;579081..579157;;;;;acc;1;;; ;;601870..601956;;;;;tta;1;;; ;;;;;;;;;;; ; tRNA complement(630583..630660);;;;;;?? atg;2;;; ; /product="tRNA-Met";;;;;;;;;; ; /anticodon=(pos:complement(630621..630623),aa:Met,seq:taa);;;;;;;;;; ; tRNA complement(630669..630744);;;;;;?? aac;;;; ; /product="tRNA-Asn";;;;;;;;;; ; /anticodon=(pos:complement(630707..630709),aa:Asn,seq:taa);;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;; ;tRNA;638589..638675;;;;;tcc;1;;; ;;;;;;;;;;; ; tRNA complement(644645..644753);;;;;;?? atg;1;;; ; /product="tRNA-Met";;;;;;;;;; ; /anticodon=(pos:complement(644714..644716),aa:Met,seq:tag);;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;; ;tRNA;795024..795101;;;;;aag;1;;; ;;823197..823284;;;;;ctg;1;;; ;;;;;;;;;;; ;tRNA;894672..894748;;;;;acg;3;;; ;tRNA;894809..894895;;;;;agc;;;; ;tRNA;894909..894983;;;;;tgc;;;; ;;;;;;;;;;; ; tRNA complement(941729..941806);;;;;;?? tac;1;;; ; /product="tRNA-Tyr";;;;;;;;;; ; /anticodon=(pos:complement(941767..941769),aa:Tyr,seq:aga);;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;; ; tRNA complement(955112..955199);;;;;;?? ctc;1;;; ; /product="tRNA-Leu";;;;;;;;;; ; /anticodon=(pos:complement(955159..955161),aa:Leu,seq:ggg);;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;; ; tRNA complement(1023448..1023524);;;;;;gcg;1;;; ; /product="tRNA-Ala";;;;;;;;;; ; /anticodon=(pos:complement(1023488..1023490),aa:Ala,seq:cgc);;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;; ;tRNA;1029944..1030018;;;;;cgg;1;;; ;;;;;;;;;;; ; tRNA complement(1103024..1103101);;;;;;?? atc;2;;; ; /product="tRNA-Ile";;;;;;;;;; ; /anticodon=(pos:complement(1103062..1103064),aa:Ile,seq:taa);;;;;;;;;; ; tRNA complement(1103105..1103182);;;;;;?? gag;;;; ; /product="tRNA-Glu";;;;;;;;;; ; /anticodon=(pos:complement(1103142..1103144),aa:Glu,seq:cga);;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;; ;tRNA;1180522..1180599;;;;;ggg non gga;1;;; ;;;;;;;;;;; ; tRNA complement(1261323..1261400);;;;;;?? agg;1;;; ; /product="tRNA-Arg";;;;;;;;;; ; /anticodon=(pos:complement(1261361..1261363),aa:Arg,seq:taa);;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;; ;tRNA;1315533..1315610;;;;;gcc;2;;; ;tRNA;1315623..1315700;;;;;gtc;;;; ;;;;;;;;;;; ; tRNA complement(1330476..1330624);;;;;;?? tgg;1;;; ; /product="tRNA-Trp";;;;;;;;;; ; /anticodon=(pos:complement(1330584..1330586),aa:Trp,seq:aga);;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;; ;tRNA;1376125..1376211;;;;;tcg;1;;; ;;;;;;;;;;; ; tRNA complement(1386026..1386103);;;;;;?? aaa;1;;; ; /product="tRNA-Lys";;;;;;;;;; ; /anticodon=(pos:complement(1386064..1386066),aa:Lys,seq:taa);;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;; ; tRNA complement(1397548..1397625);;;;;;?? gaa;1;;; ; /product="tRNA-Glu";;;;;;;;;; ; /anticodon=(pos:complement(1397585..1397587),aa:Glu,seq:cga);;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;; ; tRNA complement(1413209..1413296);;;;;;?? ttg;1;;; ; /product="tRNA-Leu";;;;;;;;;; ; /anticodon=(pos:complement(1413256..1413258),aa:Leu,seq:aga);;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;; ; tRNA complement(1428204..1428279);;;;;;?? cag;1;;; ; /product="tRNA-Gln";;;;;;;;;; ; /anticodon=(pos:complement(1428241..1428243),aa:Gln,seq:gga);;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;; ; tRNA complement(1466395..1466472);;;;;;?? cgc;1;;; ; /product="tRNA-Arg";;;;;;;;;; ; /anticodon=(pos:complement(1466433..1466435),aa:Arg,seq:gga);;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;; ; tRNA complement(1468718..1468795);;;;;;?? ggg;1;;; ; /product="tRNA-Gly";;;;;;;;;; ; /anticodon=(pos:complement(1468755..1468757),aa:Gly,seq:caa);;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;; ;tRNA;1522145..1522220;;;;gene comp;caa;1;;; ;tRNA;1640404..1640481;;;;gene comp;atg;1;;; ;;;;;;;;;;; ; tRNA complement(1685683..1685759);;;;;gene comp;?? aga;1;;; ; /product="tRNA-Arg";;;;;;;;;; ; /anticodon=(pos:complement(1685721..1685723),aa:Arg,seq:taa);;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;; ; tRNA complement(1761923..1761997);;;;;gene comp;?? cga;1;;; ; /product="tRNA-Arg";;;;;;;;;; ; /anticodon=(pos:complement(1761958..1761960),aa:Arg,seq:gga);;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;; ;tRNA;4930..5007;;;;gene direct;ccg;1;;; ;;;;;;;;;;; comp;rRNA;800607..800728;;;;;5s;;;; ;rRNA;56930..57319;;;;article 2003;7s;;;; ;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;46;;; ;;;;;;;total article;46;;; ;;;;;;;total direct;26;;; ;;;;;;;;;;; ??;recherche anti-codon;;;Tous les pyrococcus de gtRNAdb sont comme ça;;;;;;; GCGGTGGTAGTCTAGCCTGGTCTAGGACGCCG*GCCTTCCGAGCCGGCGACCCGGGTTCAAATCCCGGCCACCGCACCA;*;gly ggc comp;;pab;NCBI;;;;;;46 GGGGCCGTAGGGTAGCTTGGCCTATCCTGCGGGCTT*CGGGAGCCCGTGACCCGGGTTCAAATCCCGGCGGCCCCACCA;*;pro ccg direct;;ttt;;tct;;tat;;tgt; GGGGCGGTAGCTCAGCCTGGGAGAGCACCGGACT*GAAGATCCGGGTGTCGGGGGTTCAAATCCCCCCCGCCCCACCA;*;Phe ttc comp ;;att;;act;;aat;;agt; GCGGGGGTTGCCGAGCCTGGTCAAAGGCGCGGGATT*GAGGGTCCCGTCCCGTAGGGGTTCCGGGGTTCAAATCCCCGCCCCCGCACCA;*;Leu ctc comp;;ctt;;cct;;cat;;cgc;1 GGGCCCGTGGCTCAGCCTGGTTAGAGCGCCCGCCT*GATAAGCGGGAGGTCCGGGGTTCGAAGCCCCGCGGGCCCACCA;*;Ile atc ";;gtt;;gct;;gat;;ggt; GCCCCGGTGGTGTAGCCCGGTCAATCATGCGGGA*CTCTCGATCCCGCGACCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGGGCACCA;*;Glu gag;;ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;1 GGACCGGTAGCCTAGCCAGGACAGGGCGGCGGCCT*CCTAAGCCGCAGGTCCGGGGTTCAAATCCCCGCCGGTCCGCCA;*;Arg agg;;atc;1;acc;1;aac;1;agc;1 GCCCCGGTGGTGTAGCCCGGTCAAACATGCGGGCCT*TTCGAGCCCGCGCCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGGGCACCA;*;Glu gaa;;ctc;1;ccc;1;cac;1;cgt; GGGCCGGTAGCTCAGCCTGGTCAGAGCACCGGG*CTTTTAACCCGGTGGTCGCGGGTTCAAATCCCGCCCGGCCCGCCA;*;Lys aag aaa;;gtc;1;gcc;1;gac;1;ggc;1 GCGGGGGTTGCCGAGCCTGGTCAAAGGCGGGGGACT*CAAGATCCCCTCCCGTAGGGGTTCCGGGGTTCAAATCCCCGCCCCCGCACCA;*;Leu ttg;;tta;1;tca;1;taa;;tga; AGCCCCGTGGTGTAGCGGCCAAGCATGCGGGACT*CTGGATCCCGCGACCGGGGTTCGAATCCCCGCGGGGCTACCA;*;Gln cag;;ata;;aca;1;aaa;1;aga;1 GCCCCGGTGGCCTAGCCTGGATAGGGCGCGAGGCT*GCGGACCTCGAGGTCCGGGGTTCAAATCCCCGCCGGGGCGCCA;*;Arg cgc;;cta;1;cca;1;caa;1;cga;1 GCGGTGGTAGTCTAGCCTGGCCTAGGACGCCA*CCCTGCCAAGGTGGAGACCCGGGTTCAAATCCCGGCCACCGCACCA;*;Gly ggg ggc;;gta;1;gca;1;gaa;1;gga;1 GGGCCCGTAGCCTAGCAGGATAGGGCGCCGGCCT*TCTAAGCCGGAGGTCGCGGGTTCGAATCCCGCCGGGCCCGCCA;*;Arg aga;;ttg;1;tcg;1;tag;;tgg;1 GGGCCCGTGGCCTAGTCTGGAGAGGGCGTCGGCCT*TCGGAGCCGAAGGTCGCGGGTTCAAATCCCGCCGGGCCCG;*;Arg agg cga;;atg;3;acg;1;aag;1;agg;1 GCGGTGGTAGTCTAGCCTGGTCTAGGACGCCGGCC*TCCCAAGCCGGCGACCCGGGTTCAAATCCCGGCCACCGCACCA;*;Gly ggg non gga direct;;ctg;1;ccg;1;cag;1;cgg;1 ;;;;gtg;1;gcg;1;gag;1;ggg;1 ;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;; ;5s;;;;;;;;;; article 2003;7s;RNA component of the signal recognition particle;;;;(chapitre Translation §1);;;;; https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1046/j.1365-2958.2003.03381.x?sid=nlm%3Apubmed;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/11381026?dopt=Abstract;;;;;;;;;;; integration tRNA;;This discloses the relative contribution of the major mechanisms that promote genomic plasticity in these Archaea, namely rearrangements ;;;;;;;;; ;;linked to the replication terminus, insertion sequence-mediated recombinations, and DNA integration within tRNA genes. ;;;;;;;;; ;;(dans le résumé);;;;;;;;; ;;;;;;;;;;; synténie;;(chapitre: Mechanisms Involved in Chromosomal. Reorganization in thePyrococcusGenus.);;;;;;;;; In the three Pyrococcus genomes, the tRNA genes are frequently located at the boundaries of synteny blocks along the whole chromosome, strongly suggesting ;;;;;;;;;;; that site-specific recombinations within tRNA genes have occurred many times during the Pyrococcus divergent evolution and have concerned all the regions of the genomes.;;;;;;;;;;;
16 bactéries avec taux GC
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux: 16 bactéries avec taux GC
- Légende: Voici le récapitulatif des opérons pour chaque génome. Les symboles + pour codons doubles dans un opéron, @ pour opérons remarquables.
avec rRNA total opérons avec rRNA 16 23 5s 0 Les 3 types de rRNA existent dans cette séquence et l’opéron ne contient pas de codons. 16 atc gca 16s suivi des 2 codons atc gca puis 23s et 5s, avec ou sans autres codons en dehors de cette séquence. 16 23 5s a Les 3 types de rRNA existent dans cette séquence et les codons peuvent être des 2 côtés. max a opéron ayant le maximum de codons. a doubles Opérons avec rRNA contenant des codons doubles. Notés avec le signe + spéciaux Opérons avec rRNA ne répondant pas aux critères précédents. total aas Total des codons pour l’ensemble des opérons avec rRNA. sans total Opérons sans rRNA 1 aa Codon solitaire max a Opéron ayant le maximum de codons. a doubles Opérons avec des codons doubles. Notés avec le signe + total aas Total des codons pour l’ensemble des opérons sans rRNA. total aas - Total des codons pour l’ensemble du génome remarques : Noté par @ : Opérons spéciaux : Intercalaire distinct pour des opérons à rRNAs qui se répètent. : intercalaire excédent 210 pb pour les opérons sans rRNA
http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/bacteria/Clos_botu_CDC_297/;https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/CP006907.1;28%GC;Clostridium botulinum CDC_297;comp;;comp;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;comp;;comp;;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;;;;comp;comp;;comp;;comp;comp;comp;;;;;;;;;;;;;;comp;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; gtRNAdb;cbc*;30.6.19 Paris;;1309334..1309408;;1385938..1386012;1386021..1386134;1386243..1389140;1389369..1390866;;1392997..1393072;1393080..1393193;1393302..1396199;1396428..1397925;;1408673..1408762;;1412183..1412259;;1415464..1415540;1415625..1415715;1415736..1415826;1416133..1416223;1416244..1416334;;1425969..1426044;1426048..1426124;1426133..1426246;1426326..1427823;1427941..1428051;;1694943..1695017;;1722580..1722664;1722670..1722745;;1841437..1841510;;1842698..1842811;1842920..1845817;1846046..1847543;;1890534..1890608;1890626..1890701;1890711..1890787;1890792..1890867;1890873..1890947;1890966..1891041;1891049..1891125;1891183..1891257;1891275..1891350;1891360..1891436;1891441..1891516;;1948153..1948228;;1969157..1969245;1969250..1969325;1969379..1969454;1969465..1969541;;1987541..1989040;1989267..1992166;1992260..1992375;1992383..1992457;1992485..1992559;;2013239..2013313;2013332..2013407;;2222515..2222590;;2294767..2294842;2294850..2294923;2294930..2295006;2295012..2295087;2295114..2295189;2295219..2295292;2295317..2295393;;2402556..2402631;2402637..2402713;2402717..2402792;2402797..2402871;2402881..2402954;;2517305..2517391;;2548708..2548792;;2583298..2583388;;;avec rRNA;;;;;;;;sans ;;;;;total aas;remarques;;@1;;;@2;;;;;;@3;;;@4;;;;Séquences des doubles : ;; ;;16s 5;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;opérons;16 23 5s 0;16 atc gca;16 23 5s a;max a;a doubles;spéciaux;total aas;opérons;1 aa;max a;a doubles;total aas;;;;Les 4 blocs 16.23.5.aa ont des intercalaires identiques à 1 base près.;- 1 a 0aa, 2 ont 1aa et 1 a 2aas (@3).;;C’est 1 bloc 16.23.5.aa qui a perdu 23s.;- L'intercalaire 5s-aa est le même que pour les 4 blocs de @1.;- Il a 2aas dont le 1er est atgi, rare avec les rRNAs.;- Il est précédé d'une protéine de 36aas avec un intercalaire de 117.;- Est-ce qu'elle appartient à l'opéron?;;C’est 1 bloc 16.23.5.aa de @1 avec 1 aa double.;- L'intercalaire 23-5 est très faible, 14% de moins par rapport à @1, 15/108.;;Dépassement de la règle des intercalaires, 210 bases, 306. ;- Il se trouve entre 2 séquences de 2 aas.;- Est-ce 2 opérons?;;;- 1 opéron à 1 doublet.;- 2 opérons à 2 séquences de 2 aas chacun.;- 1 opéron de 11 aas avec 4 séquences de 3 aas, moins 1 aa. ;;;NCBI;Glu;;Asn;5s;23s;16s;;Phe;5s;23s;16s;;Ser;;Arg;;Arg;Ser;Ser;Ser;Ser;;Ala;Met;5s;16s;MNEGCDRILIVVARWQVSKNKKMLTKIKKRATIIKH;;Gln;;Tyr;Thr;;Cys;;5s;23s;16s;;Glu;Val;Asp;Thr;Glu;Val;Asp;Glu;Val;Asp;Thr;;Pro;;Leu;Met;Met;Met;;16s;23s;5s;Asn;Asn;;Gly;Thr;;Trp;;Pro;Gly;Arg;Lys;Pro;Gly;Arg;;Val;Asp;Phe;Gly;Cys;;Leu;;Leu;;SeC;;;5;1;0;3;2;1;1;6;17;10;11;4;46;52;4;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;52;gtRNAdb;gag;;aac;;;;;ttc;;;;;tcc;;agg;;cgt;agc;tca;agc;tca;;gca;atgi;;;CDS 108pb;;cag;;tac;aca;;tgc;;;;;;gaa;gta;gac;aca;gaa;gta;gac;gaa;gta;gac;aca;;cca;;tta;atgf;atgf;atg;;;;;aac;aac;;ggg;acc;;tgg;;cca;gga;aga;aag;cca;gga;cga;;gta;gac;ttc;ggc;tgc;;ttg;;ctc;;tga;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;doubles;;;;;;;@1;;;;;;;;;;;;+;2 agc;2 tca;@4;;;;;@2;;;;;;;;;;;;;;+;3 gaa;3 gta;3 gac;2 aca;;;;;;;;;;;+;2 atgf;;;@3;;;+;;;;;;;;+;2 cca;2 gga;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;intercalaires;;;;8;108;228;;;7;108;228;;;;;;;84;20;306;20;;;3;8;79;117;;;;;5;;;;;108;228;;;17;9;4;5;18;7;57;17;9;4;;;;;4;53;10;;;226;93;7;27;;;18;;;;;7;6;5;26;29;24;;;5;3;4;9;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/bacteria/Clos_botu_BKT015925/;https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/CP002410;28%GC;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;;comp;;;;;;;;;;;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;;comp;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;;comp;;comp;;comp;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;;sur plasmide;;;avec rRNA;;;;;;;;sans ;;;;;total aas;remarques;;;@1;;@2;;;;;;;;;@3;;;;@4;;;@5;;;;;Séquences des doubles : tous les opérons à plus de 3aas ont des doubles, 6/6.;;;;; gtRNAdb;cbn;30.6.19 Paris;Clostridium botulinum BKT015925;20666..20741;;36413..36487;36500..36575;36589..36665;36671..36746;36765..36839;36852..36927;36941..37017;37023..37098;;137366..137441;;161964..162052;162058..162133;162139..162215;162262..162350;162356..162431;162462..162538;162585..162673;162679..162754;;76258..176332;;180177..181695;181929..184836;184882..184956;184971..185087;185095..185169;;222409..222484;;578417..578492;;944747..944833;;955546..955630;;1026946..1027021;1027039..1027115;1027130..1027205;1027210..1027284;1027293..1027367;1027425..1027499;;2030816..2030890;2030936..2033842;2033939..2034015;2034023..2034098;2034220..2035734;;2283768..2283884;2283980..2286886;2287120..2288638;2289103..2289176;2289192..2289268;2289276..2289351;;2350598..2350674;2350696..2350769;2350798..2350873;2350878..2350952;2350957..2351032;2351038..2351112;2351116..2351192;2351199..2351272;2351277..2351352;2351374..2351449;2351455..2351531;2351537..2351610;2351616..2351690;2351694..2351777;2351800..2351875;2351880..2351954;2351959..2352034;2352040..2352115;2352121..2352197;2352203..2352276;2352282..2352356;2352363..2352438;;2432784..2432859;;2454880..2454964;2455004..2455079;2455088..2455172;2455177..2455252;;2697795..2697911;2697943..2700847;2701081..2702599;;2703946..2704021;2704333..2704408;2704414..2704530;2704867..2704942;2704948..2705064;2705162..2708066;2708300..2709814;;2721253..2721328;2721334..2721450;2721546..2724452;2724686..2726203;;2731902..2731976;2732038..2732112;2732119..2732195;2732200..2732273;2732293..2732376;2732393..2732467;2732472..2732588;2732686..2735592;2735687..2735763;2735767..2735842;2735917..2737435;;2742262..2742351;;2743220..2743312;;2743891..2743967;;2748534..2748610;2748755..2748845;2748869..2748959;2749029..2749119;;2758688..2758763;2758768..2758844;2758848..2758964;2759038..2761942;2762176..2763694;;2150504..2150620;2150652..2153560;2153794..2155308;;2169525..2169641;2169674..2172579;2172813..2174331;;;;;opérons;16 23 5s 0;16 gca atc;16 23 5s a;max a;a doubles;spéciaux;total aas;opérons;1 aa;max a;a doubles;total aas;;;;;Les 3 opérons 16-23-5s ont les mêmes intercalaires, 233-31 bases.;;Les 4 opérons 16-23-5s -aa ont tous à peu près les mêmes intercalaires 233-95-5.;- Mais ils sont tous différents:;+ 1 seul opéron répond au critère des intercalaires, il a 1aa.;+ 1 seul opéron ne répond pas strictement au critère des intercalaires.;Ses 3aas sont du côté du 16s et l’intercalaire avec le 1er aa est très;Élevé, 464.;+ L'opéron à 2aas a l'intercalaire 23-5s très faible de 23% inférieur à 95, 22/95.;+ L'opéron à 3aas répondant aux critères a un 5s en plus.;;Le critère d’un intercalaire entre 2aas, supérieur à 210 bases, se trouve ;dans le 4ème opéron à rRNA, mais il est accompagné d’un intercalaire très;élevé entre 5s et le 1er aa, comme pour le 2ème opéron à rRNA.;;C’est un opéron à rRNA atypique : 2aas double entourant le 5s.;- Mais coserve l’intercalaire 16-23s de 233 bases comme les 7 opérons de ce type.;;Les 2 opérons à 16-atc gca présentent, ici, la particularité d’inverser ses 2 aas, gca-atc.;- Ils ont aussi, à peu près, les mêmes intercalaires 16-gca-atc-23s, 74 4 94.;- L'opéron à rRNA présentant le max d'aas, au nombre de 8, est de ce type.;Il a le même intercalaire 23-5s que tous les autres opérons à rRNA, 97 bases.;;;- Les répétitions vont de 5 à 2.;- 3 opérons sur 6 ont des séquences qui se répètent, avec 22aas et 2 avec 8aas.;- L'opéron contenant le max d'aas, 22, a 2 séquences de 6 aas qui se répètent.;- On peut repérer dans cet opéron d'autres séquences de 3aas.;- Ces séquences sont séparées par 1 ou 2 aas différents. ;;16s 10;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;10;3;2;4;8;1;1;22;18;12;22;6;64;86;5;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;86;;acg;;gaa;gta;gac;aca;gaa;gta;gac;aca;;cca;;tta;atg;atg;tta;atg;atg;tta;atg;;aac;;16s;23s;aac;5s;aac;;acc;;cag;;ttg;;ctt;;gta;gac;ttc;ggc;tgc;tgc;;aac;23s;atc;gca;16s;;5s;23s;16s;gga;atc;gca;;cga;gga;aaa;caa;cac;aag;aga;gga;cca;aag;aga;gga;ggc;cta;aaa;caa;cac;aag;aga;gga;ggc;cca;;tgg;;tac;gta;tac;aca;;5s;23s;16s;;aaa;ttc;5s;ttc;5s;23s;16s;;aaa;5s;23s;16s;;gag;caa;aga;gga;cta;gaa;5s;23s;atc;gca;16s;;tcc;;tcg;;agg;;cgt;agc;tca;tca;;gca;atg;5s;23s;16s;;5s;23s;16s;;5s;23s;16s;;tgg;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;doubles;;;;+;2 gaa;2 gta;2 gac;2 aca;;;;;;;+;3 tta;5 atg;;;;;;;;;@5;;+;;2 aac;;;;;;;;;;;;;;+;2 tgc;;;;;;;;;;@3;;;;;+;4 gga;2 aaa;2 caa;2 cac;3 aag;3 aga;2 cca;2 ggc;;;;;;;;;;;;;;;;;+;2 tac;;;;@1;;;;;;;;;;;;@2;;;;;;;;;;;;@4;;;;;;;;;;;;;+;2 tca;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;intercalaires;;;;12;13;5;18;12;13;5;;;;;5;5;46;5;30;46;5;;;;;233;45;14;7;;;;;;;;;;;17;14;4;8;57;;;45;96;7;121;;;95;233;464;15;7;;;21;28;4;4;5;3;6;4;21;5;5;5;3;22;4;4;5;5;5;5;6;;;;;39;8;4;;;31;233;;;311;5;336;5;97;233;;;5;95;233;;;61;6;4;19;16;4;97;94;3;74;;;;;;;;;144;23;69;;;4;3;73;233;;;31;233;;;32;233;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_015275.1;34.3%GC;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;;;;;;;;;comp;;comp;;comp;;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;comp;;;avec rRNA;;;;;;;;sans ;;;;;total aas;remarques;;;Remarques :;;@1;;;;;@2;;;;@3;;;;;@4;;;;Séquences des doubles : très peu de doublons. ;;;; gtRNAdb;cle;30.6.19 Paris;Clostridium lentocellum DSM 5427;10157..10246;10449..11981;12054..12171;12176..12248;12511..15414;15470..15543;15605..15677;15685..15757;15792..15872;15885..15961;15965..16040;16044..16116;;46235..47767;;69052..71964;;76838..78371;78444..78561;78567..78639;78922..81829;;82734..82851;82856..82928;;84392..85929;86002..86119;86124..86196;86477..89386;;96767..96884;96974..97047;;102130..102204;;104716..104799;104813..104898;;141499..143034;143173..143290;143298..143374;143633..146538;;150968..151085;151090..151161;151619..153160;153766..156671;157147..157219;157229..157299;157306..157379;;161603..161720;161725..161797;;172902..172973;172997..173071;173117..173189;173201..173274;173331..173403;173411..173494;173682..173754;173781..173861;173872..173948;173980..174052;;422551..424086;;537985..540890;;566044..566117;566141..566212;566245..566330;;571984..573519;573592..573709;573714..573786;574069..576975;;602278..603812;603950..604067;;615082..617987;;737502..737619;737624..737696;;740988..741058;;759839..759920;;911999..912083;912232..912316;;1035192..1035265;;1061152..1061225;;1136376..1136448;;1229184..1230718;1230791..1230908;1230916..1230989;1231043..1231115;1231377..1234282;1234393..1234464;1234474..1234545;1234552..1234622;1234646..1234717;1234776..1234846;;1280211..1280283;;1283250..1283320;1283326..1283399;1283405..1283478;1283510..1283581;1283605..1283677;1283708..1283792;1283816..1283886;1283892..1283965;1283972..1284043;;1299560..1299632;1299637..1299711;;1346208..1346290;;1363346..1363428;;1515234..1515305;1515368..1515442;1515465..1515537;;1597292..1597364;;1611976..1612042;;2065352..2065425;;2090478..2090550;;2394421..2394501;2394505..2394577;;2592342..2592422;;2606024..2606104;;2737232..2737304;;2798802..2798874;;2881571..2881642;;3215471..3215545;;3252582..3252655;3252663..3252735;3252740..3252813;3252824..3252896;3252917..3252988;;3253672..3253748;3253756..3253828;3253838..3253910;3253929..3254000;3254061..3256967;;3619605..3619677;3619682..3619755;3619806..3619879;3619907..3619990;3619994..3620069;3620117..3620190;3620213..3620289;3620313..3620385;3620400..3620471;3620481..3620552;3620663..3623568;3623830..3623902;3623956..3624029;3624037..3624154;3624227..3625761;3625911..3625999;3626033..3626118;;3714637..3714709;3714711..3714787;;;opérons;16 5 aa 23;16 5 atc gca;solo;max a;a doubles;indéterminé;total aas;opérons;1 aa;max a;a doubles;total aas;;;;;Pas de blocs 16-23-5s ni de séquence 16-atc-gca-23.;;5 blocs 16-5-aa-23s avec les mêmes intercalaires, à peu près, 72 4 280.;- 4 blocs avec gca dont 3 à 1aa et 1 avec 9aas. ;- Le bloc à 9aas a un aa avant le 16s, compatible.;- 1 bloc avec atc seul et les intercalaires modifiées, 138 7 258.;;2 blocs 16-5-atc-gca-23s, avec les mêmes intercalaires, 72 7 53 261.;- Les 2 blocs contiennent des doubles, 2 paires chacun avec 7 et 14aas.;- Le bloc contenant le max de 14aas a 2aas avant le 16s compatbles.;;Les solos ne contiennent qu’un seul rRNA avec ou sans aas.;- 5s-1aa, il y en a 4 et l'intercalaire est équivalente de celle des blocs.;- 23s, il y en a 4 dont 1 seul avec 4aas;- 16s, 2 sans aas et 1 du 16s5s avec une intercalaire comme le bloc atc, 137.;;Apparemment un trio de solos. Les 3 intercalaires supérieures à 450 permettent;de diviser le groupe en 3 opérons, 5saa avec une intercalaire semblable aux ;autres 5saa, 23s avec 3aas aux petites intercalaires et 1 16s sasns aas.;;;- 2 opérons avec rRNAs ont des doublons sur 5 possédant au moins 2 aas.;- 2 opérons sans rRNAs sur 10 possédant au moins 2 aas.;- 4 doublons pour chaque type d'opérons.;- 1 seule paire répétée chez les opérons sans rRNAs. ;;16s 11;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;19;5;2;11;14;2;1;46;29;19;10;2;59;105;4;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;104;;agc;16s;5s;gca;23s;gac;gta;aca;tac;atg;ttc;aaa;;16s;;23s;;16s;5s;gca;23s;;5s;ggc;;16s;5s;gca;23s;;5s;ggc;;cag;;tta;tca;;16s;5s;atc;23s;;5s;gaa;16s;23s;aaa;gga;aga;;5s;ggc;;gaa;cca;aaa;gac;gta;tta;aca;tac;atg;ttc;;16s;;23s;;cac;caa;tca;;16s;5s;gca;23s;;16s;5s;;23s;;5s;ggc;;gga;;cta;;ctt;ctt;;cga;;agg;;ccc;;16s;5s;atc;gca;23s;aac;gaa;tgc;aac;tgc;;atg;;gga;aga;cac;caa;aaa;cta;gga;aga;caa;;ggc;cca;;ctg;;ctg;;gaa;cca;aaa;;acg;;acg;;ata;;acc;;tac;ttc;;ttg;;ttg;;gcc;;aag;;gag;;cca;;atg;gta;gac;tgg;aac;;atg;gta;tgg;aac;23s;;aca;cgt;cgt;tta;gta;gac;atg;aca;gaa;aac;23s;gca;atc;5s;16s;tcc;tca;;gta;atg;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;doubles;;@1;;;;;;;;;;;;;@3;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;@4;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;+;2 ctt;;;;;;;;@2;;;;;+;2 tgc ;2 aac;;;;;;+;2 gga;2 aga;2 caa;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;+;2 cgt;2 aca;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;intercalaires;;202;72;4;262;55;61;7;34;12;3;3;;30118;21284;;;4873;72;5;282;;904;4;;1463;72;4;280;;7380;89;;5082;;;13;;;138;7;258;;;4;457;605;475;9;6;;4223;4;;11104;23;45;11;56;7;187;26;10;31;;248498;;113898;;25153;23;32;;;72;4;282;;25302;137;;11014;;119514;4;;3291;;;;;148;;;;;;;;;72;7;53;261;110;9;6;23;58;;;;;5;5;31;23;30;23;5;6;;;4;;;;;;;62;22;;;;;;;;;;;3;;;;;;;;;;;;;;;7;4;10;20;;683;7;9;18;60;;362637;4;50;27;3;47;22;23;14;9;110;261;53;7;72;149;33;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/bacteria/Lact_acid_30SC/;https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_015214.1;38%GC;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;;comp;;;;comp;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;;;;;;;;;;comp;comp;;;;;;avec rRNA;;;;;;;;sans ;;;;;total aas;remarques;;;*Remarques : pratiquement pas de doublons, 1 seul triplet dans 1 opéron sur 11.;;;@1;;;;;@2;;;;;;;Séquences des doubles : pratiquement pas de doublons, 1 seul triplet dans 1 opéron sur 11; gtRNAdb;lam*;30.6.19 Paris;Lactobacillus amylovorus strain 30SC;447399..448972;449098..449172;449225..449297;449413..452324;452393..452509;452514..452586;452589..452661;452675..452756;452780..452852;452863..452934;452946..453031;453040..453113;453119..453192;453222..453295;453308..453381;453409..453482;453486..453559;453566..453638;453658..453728;453734..453808;453811..453900;;57091..58664;58790..58864;58917..58989;59105..62016;62085..62201;62215..62287;;469566..471139;471149..471334;471332..474243;474312..474428;474442..474514;;1709284..1709374;1709385..1709457;1709471..1709587;1709656..1712567;1712565..1712750;1712760..1714333;;79386..79458;;79913..79985;;193922..193994;;210866..210939;;287678..287752;287864..287938;288048..288122;288158..288231;;457611..457682;457718..457804;457814..457887;457891..457964;457971..458046;458051..458132;458137..458207;458220..458295;458300..458371;458395..458465;458506..458590;;474442..474514;;507688..507760;;526886..526957;;551550..551631;551666..551737;;567329..567416;;583327..583413;583420..583493;583501..583576;583581..583653;;642034..642106;;729370..729441;;784793..784864;;917887..917975;;1456724..1456800;;1681218..1681301;;1707998..1708070;1708076..1708147;;1987190..1987263;1987272..1987345;;;total;16 23 5s 0;16 atc gca;16 23 5s a;max a;a doubles;spéciaux;total aas;total;1 aa;max a;a doubles;total aas;;;;;;- Que des blocs de type 16 atc gca, il y en a 4.;;Les 2 blocs 16 atc gca sont standard comme dans bsu et lmo (ref.).;- Ils ont les mêmes intercalaires du début, 125 52 115 68 13.;- un opéron avec 1 aa en plus, aac comme dans bsu-lmo.;- un opéron à 18 aas plus grand que celui de lmo avec 16.;;Les 2 blocs 16s-protéine-23s-5s. Ressemblance avec EFTU.;- très petite protéine, 62 aas.;- Dans les 2 cas les intercalaires sont les mêmes, 9 -3 68 13;- Notez le -3 pour le stop.;- les intercalaires 25s-5s-aac sont à peu près les mêmes que les ;Blocs 16 atc gca 23-5s-aa, 68 13.;;;opérons à plus de 2 aas. ;;16s 4;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;4;0;2;0;18;0;2;24;20;12;11;1;39;63;2;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;63;;16s;atc;gca;23s;5s;gta;aaa;cta;aca;ggc;tta;cgt;cca;atg;atgi;atgf;gac;ttc;gga;atc;agc;;16s;atc;gca;23s;5s;aac;;16s;MESRNTKRSIQSKRKHTEKLCLVLRVVPQGVSTLKTEYNPSKKPRQSKRTDCRATEKRILE;23s;5s;aac;;tcc;aac;5s;23s;MESRNTKRSIQSKRKHTEKLCLVLRVVPQRVSTLKTEYNPSKKPRQSKRTDCRATEKRILE;16s;;aag;;aag;;acc;;ggg;;ggc;ggc;ggc;ccg;;gaa;tca;atgf;gac;ttc;tac;tgg;cac;caa;tgc;ttg;;aac;;acg;;caa;;tac;caa;;ctt;;tca;gac;cac;gta;;agg;;cgg;;gag;;tcg;;aga;;ctg;;gta;gaa;;cgt;cca;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;doubles;;@1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;@2;CDS hp 186;;;;;;;;;CDS hp 186;;;;;;;;;;;+;3 ggc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;intercalaire;;125;52;115;68;4;2;13;23;10;11;8;5;29;12;27;3;6;19;5;2;;;125;52;115;68;13;;;9;-3;68;13;;;10;13;68;-3;9;;;;;;;;;;;111;109;35;;;35;9;3;6;4;4;12;4;23;40;;;;;;;;;34;;;;;6;7;4;;;;;;;;;;;;;;;5;;;8;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/bacteria/List_mono_EGD/listMono_EGD-tRNAs.fa;https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/AL591824;37.9%GC;Listeria monocytogenes EGD-e;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;;;;comp;comp;comp;;;;;;;;;;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;;;;;avec rRNA;;;;;;;;sans ;;;;;total aas;remarques;;;*Remarques : lmo-bsu (ref.) sont les 1ers génomes de cette étude qui m’ont poussé à étendre;;;;@1;;;;;;;;;@2;;;;Séquences des doubles : aucun double sur 7 opérons à 2 aas et plus. Comme bsu. gtRNAdb;lmo;7.3.19 Paris;;82705..82777;;237466..239020;239265..242195;242276..242385;242399..242471;242480..242555;242597..242669;242675..242756;242771..242842;242864..242949;242962..243035;243046..243119;243139..243214;243556..245041;245286..248216;248297..248406;;677464..677553;;936656..936728;936732..936819;;940017..940088;940116..940188;;970867..970937;;1266675..1266748;;1740916..1740987;1740993..1741083;1741118..1741190;1741197..1741270;1741296..1741366;1741390..1741462;1741491..1741563;1741568..1741643;1741648..1741721;1741764..1741853;1741876..1741949;1741961..1742034;1742077..1742149;1742172..1742245;1742256..1742329;1742339..1742424;1742439..1742513;1742529..1742610;1742616..1742688;1742730..1742805;1742814..1742886;1742900..1743009;1743091..1746021;1746266..1747811;;1776112..1776183;;1848821..1848930;1849012..1851942;1852187..1853732;;2162187..2162273;;2215375..2215446;2215604..2215677;2215687..2215770;2215782..2215856;2215863..2215935;;2436493..2436576;2436622..2436695;2436715..2436786;2436792..2436863;2436893..2436965;2436981..2437054;2437062..2437145;2437166..2437238;2437243..2437318;2437325..2437398;2437420..2437495;2437552..2437623;2437657..2437745;2437752..2437827;2437842..2437951;2438032..2440962;2441135..2441210;2441257..2441330;2441458..2443003;;2540230..2540301;;2672664..2672736;2672761..2672836;2672851..2672960;2673041..2675971;2676144..2676219;2676266..2676339;2676467..2678012;;2930362..2930434;;;opérons;16 23 5s 0;16 atc gca;16 23 5s a;max a;a doubles;spéciaux;total aas;opérons;1 aa;max a;a doubles;total aas;;;;;;l’échantillon. Lma* lmo et bsu sont des bacilli et donc ont des points communs;en termes d’opréons à RNAs avec des taux %GC très proches 38-44 %.;;Blocs 16-23-5s : il y en a 4 dont 1 sans aas et 2 réunis dans un opéron.;- Dans la 1ère étude ces blocs paraissaient arborer les séquences les plus longues ;d’aas et j’attribuait la longueur de 16 aas de l’opéron 16-act-gca à un remaniement ;entre opérons. Ce n’est plus le cas puisqu’il s’est avéré que ces derniers sont plus ;courants et peuvent être aussi long que les premiers avec 18 aas chez lam (ref.).;- Les intercalaires sont les mêmes pour les 4 blocs 16-23-5s, 244 80 13.;- L'opéron à 2 blocs: le 2ème n'ayant pas d'aa à la suite de 5s et ayant une;intercalaire du côté de 16s, très élevée, 341 bases, pourrait être un solitaire.;;Blocs 16-atc-gca : il y en a 2 dont un le fameux 16aas et l’autre avec 4 aas.;- Les intercalaires sont les mêmes pour les 2 opérons, 127 46 172 80 14.;- Ils partagent les mêmes intercalaires 5s-aa avec les blocs 16-23-5s-aa, 80 13.;; ;;16s 5 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;5;1;2;2;21;0;0;50;11;8;5;0;17;67;2;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;67;;aag;;16s;23s;5s;gta;aca;aaa;cta;ggc;tta;cgt;cca;gca;16s;23s;5s;;tcg;;aac;agc;;gaa;gac;;gga;;aga;;gaa;agc;aac;atc;gga;cac;ttc;gac;atgf;tca;atgi;atg;gca;cca;cgt;tta;ggc;cta;aaa;aca;gta;5s;23s;16s;;cgt;;5s;23s;16s;;ctc;;gaa;acg;tac;caa;aaa;;ttg;tgc;ggc;caa;cac;tgg;tac;ttc;gac;atgf;gta;gaa;tcc;aac;5s;23s;gca;atc;16s;;cgg;;acc;aac;5s;23s;gca;atc;16s;;gtc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;doubles;;;;@1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;@2;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;intercalaires;;;;244;80;13;8;41;5;14;21;12;10;19;341;244;80;;;;;3;;;27;;;;;;;5;34;6;25;23;28;4;4;42;22;11;42;22;10;9;14;15;5;41;8;13;81;244;;;;;81;244;;;;;157;9;11;6;;;45;19;5;29;15;7;20;4;6;21;56;33;6;14;80;172;46;127;;;;;24;14;80;172;46;127;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
http://gtrnadb.ucsc.edu/GtRNAdb2/genomes/bacteria/Shew_peal_ATCC_700345/;https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_009901.1;39.1%GC;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;;comp;comp;comp;comp;;comp;comp;;;;;;;;;;;;;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;;comp;comp;comp;comp;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;comp;;;;;;;;;;;;;;;;comp;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;;comp;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;comp;;comp;comp;comp;;;;comp;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;comp;;;avec rRNA;;;;;;;;sans ;;;;;total aas;remarques;;;Remarques :;;@1;;;;;@2;;;;;@3;;;;;;;;;;;;;;Séquences des doubles : ;le spectre des doubles et leurs séquences. Ainsi les répétitions suivantes sont; caractéristiques de ce génome.;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; gtRNAdb;spl;30.6.19 Paris;Shewanella pealeana;45136..46685;47025..49946;50059..50174;;51490..53039;53379..56298;56413..56528;;182271..183820;183892..183968;184034..184109;184474..187395;187508..187623;187724..187800;;191614..191689;191698..191782;191818..191891;;235182..236731;237106..240025;240140..240255;;243631..245180;245519..248440;248554..248669;248738..248813;248831..248946;;416766..416842;416882..416957;416999..417075;417134..417210;;493711..495260;495600..498519;498634..498749;;641376..641466;642639..642729;;645847..647396;647468..647544;647610..647685;648015..650937;651094..651209;;728115..728199;;1168942..1169018;;1339706..1339781;1339834..1339909;1340449..1340524;1340577..1340652;;1342467..1342542;1342595..1342670;;1456724..1456815;1456837..1456913;1456944..1457020;1457053..1457129;1457160..1457236;1457270..1457346;1457356..1457447;1457524..1457600;1457636..1457712;1457722..1457813;;1627363..1627438;;1770483..1770558;1770596..1770671;1770709..1770784;1770822..1770897;1770935..1771010;1771048..1771123;1771161..1771236;1771274..1771349;1771387..1771462;1771500..1771575;1771615..1771690;;1773910..1773985;1774066..1774141;1774244..1774319;1774422..1774497;1774600..1774675;1774778..1774853;1774956..1775031;1775134..1775209;1775312..1775387;1775641..1775716;1775819..1775894;1775997..1776072;1776175..1776250;1776353..1776428;1776476..1776551;;2081297..2082846;2083185..2086104;2086219..2086334;;2143274..2143350;;2366164..2366240;2366281..2366357;2366398..2366474;2366515..2366591;;2376218..2376308;;2379767..2379842;2379856..2379929;2380015..2380100;;2550857..2550932;2550946..2551019;2551115..2551200;2551835..2551908;2552004..2552089;2552569..2552642;2552775..2552860;;2558019..2558109;;2717566..2717655;;2759730..2759806;2759996..2760072;2760118..2760194;2760197..2760273;2760309..2760385;2760399..2760475;;2858823..2858907;2858938..2859022;2859108..2859192;2859300..2859384;2859492..2859576;;2866268..2866343;2866389..2866464;2866506..2866581;2866608..2866683;2866716..2866791;2866825..2866900;2866941..2867016;;2929429..2929505;2929603..2929679;2929777..2929853;2929937..2930013;;3120289..3120364;3120423..3120498;3120557..3120632;3120691..3120766;3120826..3120901;3120959..3121034;3121093..3121168;3121227..3121302;3121362..3121437;3121496..3121571;3121631..3121706;3121766..3121841;;3269860..3269935;3269944..3270020;3270084..3270160;;3757983..3758059;3758163..3758249;;3835257..3835331;3835383..3835467;3835599..3835673;3835694..3835778;3835875..3835949;3835999..3836083;3836295..3836371;3836377..3836451;3836499..3836583;3836639..3836715;3836721..3836795;3836843..3836927;3836983..3837059;;3862885..3862961;3863129..3863205;;3867049..3867164;3867279..3870198;3870537..3872086;;3882154..3882229;;4331488..4331563;4331694..4331769;4331817..4331892;4332055..4332130;4332147..4332222;4332271..4332346;;4616881..4616996;4617109..4620030;4620395..4620470;4620536..4620612;4620684..4622233;;5129770..5129846;5129947..5130062;5130178..5133097;5133437..5134986;;;opérons;16 23 5s 0;16 atc gca;16 23 5s a;max a;a doubles;spéciaux;total aas;opérons;1 aa;max a;a doubles;total aas;;;;;;;8 blocs 16-23-5s. Ils ont tous les mêmes intercalaires, 338 113 68.;- 6 blocs sont solo avec un dont l'intercalaire 16s-23s fait 11% de plus que le reste,;36/338.;- 2 blocs avec 1 aa dont un possède en plus un 5s, gac et acc-5s.;;Les 2 blocs 16-atc-gca ont les mêmes intercalaires, 71 65 364 112. L’intercalaire ;23s-5s est le même que les 6 autres blocs.;- Les 2 blocs n'ont que 5 aas, soit pour les 8 opérons à rRNA 7 aas au total. Ce qui;quasiment nul.;;Les intercalaires élevés ne touchent que 3 opérons sans rRNAs;;-;intercalires;1172;539;634, 479;;résultats;total opérons;1 aa;max aa;doubles;;;;;;- opéron à 13 gaa avec 11 intercalalires identiques de 102 bases, soit ;11 répétitions d’une séquence de 180 bases environ, longueur de gaa+102.;;- Les répétitions de séquences sont nombreuses. La plus longue est celle de ;l’opéron à 5 cta 5 caa 3 atg. Ce sont 5 séquences caa-cta avec un intercalaire de;50 interrompues par 2 atg et 2 intercalaires de 100 bases environ.;- Les 2 autres opérons à séquences répétées sont, 4atgf 2gtc (2 atgf-gtc) et;6 ggc (2 ggc-ggc séparées par des intercalaires longs);;- Répétitions du même codon avec son intercalaire comme pour le cas de ;l'opéron à 15 codons,;;codon;gaa;gta;tac;aac;gac;aaa;atgf ;;16s 11;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;11;6;3;2;3;0;0;9;29;8;15;15;133;142;3;;;;;;;;;;;;;;;;;anciens;n aas;2;4;6;;ancien ;29;8;15;15;;Les intercalaires excessives ne changent pas fondamentalement ;;;;;;;;;;;;;;;;répétition;13;11;5;7;4;12;4 ;;147;;16s;23s;5s;;16s;23s;5s;;16s;atc;gca;23s;5s;gac;;aca;tac;gga;;16s;23s;5s;;16s;23s;5s;acc;5s;;cgg;cac;cca;cca;;16s;23s;5s;;tca;tca;;16s;atc;gca;23s;5s;;ttg;;atgi;;aca;ttc;aca;ttc;;aca;ttc;;agc;cgt;cgt;cgt;cgt;cgt;agc;cgt;cgt;agc;;agg;;gta;gta;gta;gta;gta;gta;gta;gta;gta;gta;gta;;gcc;gaa;gaa;gaa;gaa;gaa;gaa;gaa;gaa;gaa;gaa;gaa;gaa;gaa;gcc;;16s;23s;5s;;ccc;;atgf;atgf;atgf;atgf;;tca;;ggc;tgc;tta;;ggc;tgc;tta;tgc;tta;tgc;tta;;tca;;tcc;;atgf;atgf;gtc;atgf;gtc;atgf;;tac;tac;tac;tac;tac;;aac;aac;aac;aac;aac;aac;aac;;gac;gac;gac;gac;;aaa;aaa;aaa;aaa;aaa;aaa;aaa;aaa;aaa;aaa;aaa;aaa;;cac;aga;cca;;atgf;ctc;;caa;cta;caa;cta;caa;cta;atg;caa;cta;atg;caa;cta;atg;;tgg;tgg;;5s;23s;16s;;ttc;;ggc;ggc;ggc;ggc;ggc;ggc;;5s;23s;gca;atc;16s;;gac;5s;23s;16s;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;-;doubles;2;2,2;3,3;;nouveau;33;10;15;12;;;;;;;;;;;;;;;;;;intercalaire;102;37;100;35;97;58;40 ;;doubles;;@1;;;;;;;;@2;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;+;2 cca;;;;;;@3;;;;;;;;;;;;;+;2 ttc;2 aca;;;;;;;+;7 cgt;3 agc;;;;;;;;;;+;11 gta;;;;;;;;;;;+;13 gaa;2 gcc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;+;4 atgf;;;;;;;;;;;+;3 tgc;3 tta;;;;;;;;;+;4 atgf;2 gtc;;;;;+;5 tac;;;;;+;7aac;;;;;;;+;4 gac;;;;+;12 aaa;;;;;;;;;;;;;;;;;;;+;5 caa;5 cta;3 atg;;;;;;;;;;;+;2 tgg;;;;;;;;+;6 ggc;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;nouveaux;nv doubles;0;0;0;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;intercalaires;;339;112;;;339;114;;;71;65;364;112;100;;;8;35;;;374;114;;;338;113;68;17;;;39;41;58;;;339;114;;;1172;;;71;65;329;156;;;;;;;52;539;52;;;52;;;21;30;32;30;33;9;76;35;9;;;;;37;37;37;37;37;37;37;37;37;39;;;80;102;102;102;102;102;102;102;253;102;102;102;102;47;;;338;114;;;;;40;40;40;;;;;13;85;;;13;95;634;95;479;132;;;;;;;189;45;2;35;13;;;30;85;107;107;;;45;41;26;32;33;40;;;97;97;83;;;58;58;58;59;57;58;58;59;58;59;59;;;8;63;;;;;;51;131;20;96;49;211;5;47;55;5;47;55;;;167;;;114;338;;;;;130;47;162;16;48;;;112;364;65;71;;;100;115;339;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;-;nv opérons;2;2;3;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/bacteria/Baci_subt_subtilis_168/baciSubt2-tRNAs.fa;https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/AL009126;43.6%GC;Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;;;;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;;comp;;comp;comp;comp;comp;;;avec rRNA;;;;;;;;sans ;;;;;total aas;remarques;;;*Remarques : lmo-bsu (ref.) sont les 1ers génomes de cette étude qui m’ont poussé à étendre;;;;@1;;;;;;;;;;;;;;@2;;;;;;@3;;Séquences des doubles : aucun double sur 7 opérons à 2 aas et plus. Comme lmo. gtRNAdb;bsu;7.3.19 Paris;;9810..11364;11464..11540;11552..11627;11709..14636;14692..14810;; 22292..22384;;30279..31832;31932..32008;32020..32095;32177..35103;35237..35355;;70181..70257;70267..70338;;90536..92089;92254..95181;95237..95354;95375..95450;95455..95530;95567..95642;95649..95731;95772..95846;95861..95946;95956..96032;96060..96136;96146..96221;96392..97945;98110..101037;101093..101211;;160893..162445;162610..165535;165591..165707;165754..165825;165830..165902;165959..166033;166064..166140;166168..166244;166253..166328;166500..168053;168218..171141;171197..171314;171498..173049;173214..176141;176197..176315;;194205..194279;194283..194358;194363..194435;194458..194542;194547..194621;;528704..528778;528783..528873;528903..528974;528986..529060;529087..529162;529174..529255;529336..529422;;635110..635186;635200..635273;635433..636987;637155..640082;640138..640254;640268..640344;640405..640481;;946696..948250;948418..951345;951457..951572;951582..951656;951662..951753;951788..951859;951869..951944;951954..952030;952042..952118;952131..952206;952212..952284;952307..952391;952397..952470;952495..952570;952580..952651;952701..952775;952781..952851;952859..952947;953213..953294;;967065..967138;;1262789..1262861;;2003276..2003348;;2563889..2563959;;2899816..2899889;;3171879.3171950;3171976.3172066;3172070.3172144;3172155.3172231;3172247.3172320;3172331.3172406;3172424.3172499;3172512.3172588;3172600.3172676;3172694.3172786;3172793.3172869;3172872.3172948;3172968.3173040;3173046.3173122;3173138.3173214;3173224.3173309;3173324.3173398;3173404.3173490;3173501.3173576;3173614.3173689;3173722.3173797;3173818.3173935;3173991.3176918;3177086.3178640;;3194455..3194527;;3545889..3545964;;4154787..4154859;4154895..4154971;4155053..4155124;4155134..4155209;;;opérons;16 23 5s 0;16 atc gca;16 23 5s a;max a;a doubles;spéciaux;total aas;opérons;1 aa;max a;a doubles;total aas;;;;;;l’échantillon. Lma* lmo et bsu sont des bacilli et donc ont des points communs;en termes d’opréons à RNAs avec des taux %GC très proches 38-44 %.;;Blocs 16-23-5s : il y en a 8 avec 2 dans l’opéron 9aas et 3 dans 6aas.;Soit le double de lmo.;- Dans la 1ère étude ces blocs paraissaient arborer les séquences les plus longues ;d’aas et j’attribuait la longueur de 16 aas de l’opéron 16-act-gca à un remaniement ;entre opérons. Ce n’est plus le cas puisqu’il s’est avéré que ces derniers sont plus ;courants et peuvent être aussi long que les premiers avec 18 aas chez lam (ref.).;- Les intercalaires sont les mêmes pour les 4 blocs 16-23-5s, 164 55 20.;- L'opéron 16aas a un intercalaire 23s-5s double des autres blocs, 111 contre 55.;- L'opéron 4aas contient 2 aas avant le 16s et 2 après le 5s. L'intercalaire aa-16s ;est à peu près égale à celui de 16s-23s, 159 contre 167.;- Les intercalaires qui séparent les blocs surnuméraires sont aussi du même ordre;que celui de 16s-23s, 170 171 183 contre 164 pour le 16s-23s.;- Les 5 opérons avec ces blocs ont 4 6 9 16 21 aas.;;Blocs 16-atc-gca : il y en a 2 et n’ont pas d’autres aas comme l’opéron ;16aas de lmo.;- Les intercalaires sont les mêmes pour les 2 opérons, 99 11 81, sauf pour celui de ;23s-5s, 55 bases pour l’un, comme 7 blocs 16-23-5s, et le double pour l’autre, ;113 comme pour l’opéron 16aas.;;intercalaire élevé pour 2 aas. Est-ce que le dernier aa est solitaire ?;; ;;16s 10;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;7;0;2;5;21;0;0;60;12;8;7;0;26;86;3;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;86;;16s;atc;gca;23s;5s;;tca;;16s;atc;gca;23s;5s;;atg;gaa;;16s;23s;5s;gta;aca;aaa;cta;ggc;tta;cgt;cca;gca;16s;23s;5s;;16s;23s;5s;aac;acc;ggc;cgt;cca;gca;16s;23s;5s;16s;23s;5s;;gaa;gta;aca;tac;caa;;aac;agc;gaa;caa;aaa;cta;ctc;;cgt;gga;16s;23s;5s;atgf;gac;;16s;23s;5s;aac;tcc;gaa;gta;atgf;gac;ttc;aca;tac;tgg;cac;caa;ggc;tgc;tta;ttg;;gga;;gtc;;agg;;caa;;aga;;gaa;agc;aac;atc;gga;cac;ttc;gac;atgf;tca;atgi;atg;gca;cca;cgt;tta;ggc;ctg;aaa;aca;gta;5s;23s;16s;;gcc;;cgg;;ttc;gac;gaa;aaa;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;doubles;;@2;;;;;;;;;;;;;;;;;@1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;@3;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;intercalaires;;99;11;81;55;;;;;99;11;81;133;;;9;;;164;55;20;4;36;6;40;14;9;27;9;170;164;55;;;164;55;46;4;56;30;27;8;171;164;55;183;164;55;;;3;4;22;4;;;4;29;11;26;11;80;;;13;159;167;55;13;60;;;167;111;9;5;34;9;9;11;12;5;22;5;24;9;49;5;7;265;;;;;;;;;;;;;25;3;10;15;10;17;12;11;17;6;2;19;5;15;9;14;5;10;37;32;20;55;167;;;;;;;35;81;9;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/bacteria/Vibr_para_BB22OP/vibrPara_BB22OP-tRNAs.fa;https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_019955.1;45.3%GC;Vibrio parahaemolyticus BB22OP;;;;;comp;;;;;;;;;;comp;;;;;;;;;;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;;;;comp;;;;comp;comp;comp;comp;;;;;;;comp;comp;comp;comp;;;;;;comp;comp;;;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;;;;;;;;;;;;;;;;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;comp;Vibrio parahaemolyticus BB22OP;;;;;;comp;;;;;comp;;comp;;comp;comp;;comp;comp;;comp;comp;;;;;avec rRNA;;;;;;;;sans ;;;;;total aas;remarques;;;*Remarques : 2 chromosomes circulaires. EFTU et beaucoup de doubles.;;@1;;;;;;@2;;;;@3;;;;;;@4;;;;;;;;;;;@5;;Séquences des doubles : beaucoup de doubles et de séquences répétées comme cbn. ;;;;;;;;;; gtRNAdb;vpb1;6.7.19 Paris;;33614..35175;35256..35331;35334..35409;35440..35515;35571..35768;35828..38743;38817..38932;;49997..50073;50106..50181;50254..50330;50380..50455;50480..50556;;400045..400120;;577971..579532;579621..579696;579709..579784;580043..582958;583032..583147;583178..583254;583290..583366;;769649..769733;769763..769847;769895..769971;769996..770080;770133..770207;770237..770321;770375..770451;770476..770560;770613..770687;770717..770801;770856..770930;770960..771044;771080..771154;771203..771287;771319..771403;771481..771557;771635..771709;771741..771825;771866..771942;;786939..787015;;802315..802391;;910219..910295;;982089..982173;982255..982339;982421..982505;982587..982671;;1124715..1124802;;1418321..1418397;1418430..1418506;;1988127..1988202;1988213..1988299;1988376..1988451;1988472..1988545;;2164082..2164157;;2193593..2193683;;2547884..2547960;2548017..2548100;;2652092..2652168;2652225..2652301;2652359..2652435;2652493..2652569;2652627..2652703;2652761..2652837;2652894..2652970;2653181..2653257;2653289..2653380;2653701..2653777;2653809..2653900;;2735697..2735772;2735837..2735912;2735920..2735995;2736066..2736141;2736213..2736288;2736296..2736371;2736415..2736490;;2738623..2738698;2738750..2738825;2738847..2738922;2738962..2739037;2739053..2739128;;2741263..2741339;2741371..2741487;2741545..2741620;2741721..2741836;2741910..2744825;2745083..2745158;2745200..2745276;2745333..2746894;;2755928..2756012;;2847646..2847722;2847791..2847867;2847898..2848013;2848087..2851002;2851261..2851336;2851417..2852978;;2987485..2987561;2987618..2987693;2987712..2987788;2987824..2987899;2987950..2988025;2988075..2988150;2988200..2988275;2988306..2988382;2988438..2988513;2988544..2988620;2988660..2988735;2988755..2988831;2988867..2988942;;3060924..3061000;3061069..3061145;3061176..3061291;3061365..3064280;3064538..3064613;3064628..3064703;3064736..3064811;3064814..3064889;3064970..3066531;3066851..3066966;3067040..3069955;3070217..3071778;;3105094..3105169;3105183..3105257;3105293..3105377;3105414..3105489;;3111073..3111149;3111180..3111295;3111369..3114284;3114546..3116107;3116425..3116540;3116614..3119529;3119791..3121352;;3175944..3176034;3176104..3176219;3176293..3179211;3179469..3179544;3179586..3179662;3179719..3181280;;3217187..3217263;3217294..3217409;3217483..3220398;3220458..3220655;3220711..3220786;3220817..3220892;3220895..3220970;3221051..3222612;;132908..134469;134550..134625;134628..134703;134720..134795;134810..134885;134940..135122;135142..138059;138133..138248;138318..138408;;192886..192969;;591931..592021;;1009457..1009530;1009604..1009690;;1021568..1021641;1021715..1021801;;1029973..1030048;1030052..1030125;;1125193..1125267;;;opérons;16 23 5s 0;16 atc gca;16 23 5s a;max a;a doubles;spéciaux;total aas;opérons;1 aa;max a;a doubles;total aas;;;;;;;Blocs 16-23-5s, il y en a 3 dont 2 sont sur un opéron avec 1 aa. ;Le 4ème appartient à un opéron spécial. ;- Les 3 ont les mêmes Intercalaires, 73 261. L’intercalaire 23-5s se retrouve ;dans tout les autres opérons.;- Les 2 blocs accolés sont séparés du reste par de grands intercalaires, 320 bases.;;Les opérons 16-atc-gca sont au nombre de 2 avec 3 aas en plus.;- 4 de leurs intercalaires, 73 257 41 56, sont identiques et le 5ème est du même ordre de grandeur, 100 69.;- Un opéron est clasisque et a un aa en plus, le 2ème a la séquence 5s-aa-5s-aa donc 2 aa en +.;;Les opérons analogues aux 16-atc-gca sont au nombre de 3 et ont 2 intercalaires ;en commun avec eux, 257 73 correspondant à aa-23s-5s.;- Un opéron 16-gcc-gaa-23s-5s avec 2 aas entre les 2 rRNAs. Il a 4 aas.;- Un opéron 16-gaa-23s-5s avec 1 aa entre les 2 rRNAs. Il a 3 aas.;- Un opéron 16-gaa-3aas-23s-5s avec 4 aas entre les 2 rRNAs. Il a 6 aas.;;Les opérons analogues aux 16-atc-gca avec une protéine sont au nombre de 3 et ont ;l’intercalaire 73 du 23s-5s comme tous les autres opérons. ;- Différence importante avec lam qui a des opérons analogues, la protéine est dans le brin ;complémentaire du brin des RNAs. Alors que dans lam protéine et RNAs sont sur le même brin.;- La séquence est 16s-gaa-aaa-xxx-gta-protéine-23s-5s et les 3 opérons ont en commun les 4 mêmes ;intercalaires, 16s-80-aaa-2-xxx-gta-55-protéine-23s-73-5s.;- Deux opérons, sans xxx, sont identiques en aas, intercalaires et protéines mais un a un aa en plus ;après 5s. Ils ont respectivement 3 et 4 aas.;- Un opéron a une protéine plus petite, 180 aas au lieu de 198, avec xxx=gca entre les rRNAs plus 1 ;Au-delà du 5s, soit 5 aas au total.;;L’opéron 9cgt 2agc a une intercalaire élevée, 320 bases.;;;- 8 opérons sur 14 à 2aas et plus sont remarquables :;opéron;cgg+4;10cta 5caa 4atg;4 tac;2 gtc;9cgt 2agc;ttc+6;ttc+4;8ggc 5atgf ;https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_019971.1;16s 11 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;9;0;2;1;6;0;6;33;25;11;19;8;93;126;5;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;vpb2;126;chr1;16s;gaa;aaa;gta;MQTRFCRTQIPRTLECVILVFVIKTNIENFTNNNKLLFCQLSKL LKSYVSSQGSTFSKDFQSRRF;23s;5s;;cgg;cac;cca;cac;cca;;atgi;;16s;gcc;gaa;23s;5s;gac;tgg;;cta;cta;atg;cta;caa;cta;atg;cta;caa;cta;caa;cta;caa;cta;cta;atg;caa;cta;atg;;cca;;agg;;aga;;tac;tac;tac;tac;;tcc;;gtc;gtc;;ggc;tta;ggc;tgc;;aac;;tca;;atgf;ctc;;cgt;cgt;cgt;cgt;cgt;cgt;cgt;cgt;agc;cgt;agc;;ttc;aca;ttc;aac;aca;ttc;aac;;ttc;aca;aac;aca;aac;;gac;5s;acc;5s;23s;gca;atc;16s;;ttg;;tgg;gac;5s;23s;gaa;16s;;atgf;ggc;atgf;ggc;ggc;ggc;ggc;atgf;ggc;atgf;ggc;atgf;ggc;;tgg;gac;5s;23s;gta;gca;aaa;gaa;16s;5s;23s;16s;;acc;gga;tac;aca;;gac;5s;23s;16s;5s;23s;16s;;tca;5s;23s;gca;atc;16s;;gac;5s;23s;MQTRFCRTQIPRTLECVILVFVIKTNIENFTNNNKLLFCQLSKL LKSYVSSQGSTFSKDFQSRRF;gta;aaa;gaa;16s;chr2;16s;gaa;aaa;gca;gta;MTSHQSCLQFLNMMQTRFCRTQIPRTLECVILVFVIKTNIENFTNNNKLLFCQLSKLLKS;23s;5s;tca;;ctc;;tca;;tgc;tta;;tgc;tta;;ggc;tgc;;gga;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;n*séquence;2*2;3*4;4*1;2*1;8*1;2*3;2*2;5*2 ;;doubles;;@4;;;;CDS 198;;;;;+;2 cac;2 cca;;;;;;;;;;;;;+;10 cta;4 atg;5 caa;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;+;4 tac;;;;;;+;2gtc;;+;2 ggc;;;;;;;;;;;+;9 cgt;2 agc;;;;;;@5;;;;+;3 ttc;2 aca;2 aac;;;;;;+;2 aca;2 aac;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;+;5 atgf;8 ggc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;@3;;;;;;;;;;;;;@1;;;;;;;;;;@2;;;;;CDS 198;;;;;;;;;;;CDS 180;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;intercalaires;;80;2;30;55;59;73;;;32;72;49;24;;;;;88;12;258;73;30;35;;;29;47;24;52;29;53;24;52;29;54;29;35;48;31;77;77;31;40;;;;;;;;;81;81;81;;;;;32;;;10;76;20;;;;;;;56;;;56;57;57;57;57;56;210;31;320;31;;;64;7;70;71;7;43;;;51;21;39;15;;;31;57;100;73;257;41;56;;;;;68;30;73;258;80;;;56;18;35;50;49;49;30;55;30;39;19;35;;;68;30;73;257;14;32;2;80;319;73;261;;;13;35;36;;;30;73;261;317;73;261;;;69;73;257;41;56;;;30;73;59;55;30;2;80;;;80;2;16;14;54;19;73;69;;;;;;;73;;;73;;;3;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
http://gtrnadb.ucsc.edu/download/GtRNAdb/search/gtrnadb-search13443.fa;https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/CP007025;49.6%GC;Escherichia albertii;;;;;;;;comp;comp;;;;comp;comp;comp;comp;comp;;;;;;;;;;comp;;comp;;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;comp;;;;;;comp;;comp;comp;;;;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;;;;;;;;;;;;;;;comp;;comp;;;;comp;comp;comp;;;;;;;;;;;;;;comp;comp;comp;;;;;comp;;comp;;comp;;;;comp;;comp;;;;;;;;;;;comp;comp;;;avec rRNA;;;;;;;;sans ;;;;;total aas;remarques;;;*Remarques : Pas de blocs 16-23-5s, un nouveau bloc 16-gaa-23-5s, beaucoup de doubles.;;@1;;;;@2;;;;;;@3;;Séquences des doubles : beaucoup de doubles mais peu de séquences répétées.;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; gtRNAdb;eal;10.3.19 Paris;;219063..219144;219357..219438;;413135..413219;;462888..462972;;489120..489191;489198..489270;;615149..615233;;756823..756895;756901..756973;757022..757094;757100..757172;757221..757293;;834529..834602;834613..834694;834721..834792;834830..834901;834920..834993;835045..835116;835152..835223;;968958..969031;;1192416..1192488;;1269526..1269599;;1277040..1277113;1277166..1277285;1277455..1280377;1280564..1280636;1280682..1280755;1280826..1282367;;1567231..1567314;1567346..1567429;1567465..1567548;;1657309..1657390;;1765401..1765473;1765633..1765705;;1795516..1795588;;2006002..2006121;2006291..2009214;2009401..2009473;2009519..2009592;2009663..2011202;;2042057..2043241;2043359..2043431;2043441..2043512;2043632..2043713;2043725..2043797;;2047429..2047548;2047718..2050648;2050835..2050907;2050953..2051026;2051095..2052636;;2208305..2208424;2208594..2211517;2211716..2211788;2211874..2213418;;2267554..2267627;2267671..2267754;2267778..2267850;2267912..2267985;;2305358..2305430;2305442..2305515;2305568..2305687;2305857..2308779;2308978..2309050;2309136..2310676;;2426158..2426248;;2556305..2556378;;2810766..2812307;2812393..2812465;2812664..2815586;2815756..2815875;2816027..2816099;2816140..2816259;;2911129..2911212;; 2913088..2913161;;3010332..3010404;;3177717..3177789;;3301617..3301687;;3366868..3366941;3366979..3367052;3367090..3367163;;3469914..3470003;3470010..3470083;3470285..3470358; 3470559..3470632;;3505321..3505393;;3563056..3564598;3564684..3564756;3564955..3567876;3568046..3568165;;3779750..3779822;3779830..3779902;3779950..3780022;;3782718..3782790;3782833..3782905;;3810369..3810440;;3993500..3993573;;4232176..4232248;;4233996..4234068;;4242952..4243024;;4248342..4248414;;4249406..4249492;;4256696..4256768;4256869..4256942;;4317980..4318052;4318109..4318179;4318194..4318277;;4556753..4556826;4556834..4556907;;;opérons;16 23 5s 0;16 atc gca;16 23 5s a;max a;a doubles;spéciaux;total aas;opérons;1 aa;max a;a doubles;total aas;;;;;;;Les blocs 16-atc gca-23-5s sont au nombre de 3 avec 1 seul aa en plus.;- Les intercalaires sont les mêmes pour les 3 opérons, 70 45 186 169.;- Un seul opéron a un aa en plus.;;4 nouveaux blocs analogues aux précédents, 16-gaa-23-5s. ;- Les intercalaires sont les mêmes pour les 4 opérons, 85 198 169.;- Elles sont, dans le même ordre, analogue à celles des blocs 16-atc gca-23-5s.;- Les aas suplémentaires sont absents pour 2 opérons et sont 2 pour un autre.;- Le 4ème opéron a 1 aa et 1 5s en supplément.;;2 opérons tRNAs+protéine : tactac-tpr et acatacggaacc-tufB;;;- 5 opérons à 2 aas répétés;- 3 opérons à 3 aas répétés;- L'opéron au maximum de 7 aas a 2 répétitions de 2 aas en séquence ;et la 3ème a ses 2 aas séparés : atg cta 2caa atg 2cag.;- Un opéron à 5 aas a une séquence répétée, aaa + 2*2.;- 5 opérons sans répétitions;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/?term=txid208962[orgn];16s 7;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;7;0;3;0;3;0;4;13;38;23;7;10;72;85;3;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;eco;Opérons sans rRNAs avec doubles;2tac;2gtc;2gcc;3ctg;3atgf;atg cta 2caa atg 2cag;Remaniements des répétitions;3ggc;aaa 3gta;agc 4cgt;5aaa 2gta;Opérons sans rRNAs sans doubles;tta tgc ggc;cgg cac ctg cca;aca tac gga acc;Disparition de 2 opérons chez eco;-;- ;genome;89;;tac;tac;;tcc;;tca;;gga;aca;;tcc;;aaa;gta;aaa;gta;aaa;;atg;cta;caa;caa;atg;cag;cag;;aga;;acg;;gac;;gac;5s;23s;gca;atc;16s;;ctg;ctg;ctg;;ttg;;ggc;ggc;;ttc;;5s;23s;gca;atc;16s;;tuf1;acc;gga;tac;aca;;5s;23s;gca;atc;16s;;5s;23s;gaa;16s;;cca;ctg;cac;cgg;;tgg;gac;5s;23s;gaa;16s;;tga;;ccg;;16s;gaa;23s;5s;acc;5s;;ctc;;atgf;;atgi;;ttc;;ggg;;atgf;atgf;atgf;;agc;cgt;cgt;cgt;;atgi;;16s;gaa;23s;5s;;aaa;gta;gta;;gcc;gcc;;agg;;ccc;;aac;;aac;;aac;;aac;;tcg;;atgi;aga;;ggc;tgc;tta;;gtc;gtc;;;1;20;40;60;80;100;120;140;160;180;200;220;;moyenne;variance;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;doubles;;+;2 tac;;;;;;;;;;;+;3 aaa ;2 gta;;;;+;2atg ;2caa ;2 cag;;;;;;;;;;;;@1;;;;;;+;3 ctg;;;;;+;2 ggc;;;;;;;;;;CDS 1185pb;;;;@3;;;;;;;;@2;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;+;3 atgf;;;;+;3 cgt;;;;;;;;;;;+;2 gta;;+;2 gcc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;+;2 gtc;Fréquences;sans rRNAs;0;11;8;7;1;1;1;0;1;0;1;2;33;53;59;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;eal;;2tac;2gtc;2gcc;3ctg;3atgf;atg cta 2caa atg 2cag;;2ggc;aaa 2gta;agc 3cgt;3aaa 2gta;;tta tgc ggc;cgg cac ctg cca;aca tac gga acc;;atgi aga;gga aca ;;intercalaires;;212;;;;;;;6;;;;;5;48;5;48;;;10;26;37;18;51;35;;;;;;;;;52;169;186;45;70;;;31;35;;;;;159;;;;;169;186;45;70;;;117;9;119;11;;;169;186;45;68;;;169;198;85;;;43;23;61;;;11;52;169;198;85;;;;;;;85;198;169;151;40;;;;;;;;;;;;;37;37;;;6;201;200;;;;;85;198;169;;;7;47;;;42;;;;;;;;;;;;;;;;;100;;;56;14;;;7;;;avec rRNAs;-;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/bacteria/Esch_coli_K_12_MG1655_3/eschColi_K_12_MG1655_3-tRNAs.fa;https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/U00096;50.6%GC;Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655;;;;;;;;;;;;;;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;;;;;;;;;;comp;;comp;;comp;;comp;comp;comp;;;;;comp;comp;comp;;comp;;;;comp;;;;;;;;;;comp;comp;;;;;;;comp;comp;comp;comp;;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;;;;;;comp;;;;;;comp;;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;;;;;;;;comp;comp;comp;;;avec rRNA;;;;;;;;sans ;;;;;total aas;remarques;;;*Remarques : Pas de blocs 16-23-5s, un nouveau bloc 16-gaa-23-5s, beaucoup de doubles.;;@1;;;;;;;@2;;;;;;;;@3;;Séquences des doubles : beaucoup de doubles mais peu de séquences répétées.;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; gtRNAdb;eco;10.3.19 Paris;;223771..225312;225381..225457;225500..225575;225759..228662;228756..228875;228928..229004;;236931..237007;;262871..262946;;564723..564799;;696430..696504;696542..696616;696664..696740;696756..696830;696865..696939;696963..697047;697057..697133;;780554..780629;780765..780840;780843..780918;781068..781143;781147..781222;781369..781444;781577..781652;;925884..925971;;1031625..1031712;;1097565..1097652;;1287087..1287176;1287244..1287328;1287538..1287622;; 1746435..1746511; 1746516..1746592;;1991815..1991901;1991914..1991987;1992042..1992117;;2043468..2043557;;2044549..2044624;;2058027..2058102;; 2059851..2059926;;2062260..2062335;;2286211..2286287;;2466309..2466383;;2518041..2518116;2518156..2518231;;2520931..2521006;2521051..2521126;2521173..2521248;2521253..2521328;;2726069..2726188;2726281..2729184;2729369..2729444;2729616..2731157;;2785762..2785837;;2817784..2817860;2818059..2818135;2818198..2818274;2818473..2818549;2818553..2818645;;2947387..2947463;2947497..2947573;2947607..2947683;;2998984..2999057;;3110366..3110441;;3215598..3215673;;3318213..3318289;;3322072..3322158;;3423423..3423542;3423580..3423655;3423668..3423787;3423880..3426783;3426958..3427033;3427076..3427152;3427221..3428762;;3708616..3708692;;3836222..3836316;;3941808..3943349;3943435..3943510;3943704..3946607;3946700..3946819;3946872..3946948;3946957..3947032;;3982375..3982451;3982509..3982585;3982606..3982692;3982735..3982811;;4035531..4037072;4037141..4037217;4037260..4037335;4037519..4040423;4040517..4040636;;4166659..4168200;4168372..4168447;4168641..4171544;4171637..4171756;;4175388..4175463;4175472..4175556;4175673..4175747;4175754..4175829;4175944..4177128;;4208147..4209688;4209774..4209849;4210043..4212946;4213040..4213159;;4362551..4362626;;4392360..4392435;4392472..4392547;4392583..4392658;;4496405..4496489;;4606079..4606165;4606200..4606286;4606315..4606401;;;opérons;16 23 5s 0;16 atc gca;16 23 5s a;max a;a doubles;spéciaux;total aas;opérons;1 aa;max a;a doubles;total aas;;;;;;Comme eal.;Les blocs 16-atc gca-23-5s sont au nombre de 3 avec 1 seul aa en plus.;- Les intercalaires sont les mêmes pour les 3 opérons, 68 42 183 93.;- Cependant les 3 1ers intercalaires diminuent de 3 bases chacun ;et le 4ème est divisé par 2.;- Par rapport à eal un opéron sans aa de plus, s'est transformé avec 1 aa et 1 5s;en plus. Son intercalaire gca-23s a diminué de 5 % par rapport aux 2 autres, 9/183.;;4 nouveaux blocs analogues aux précédents, 16-gaa-23-5s, comme eal.;- Les intercalaires sont les mêmes pour 2 opérons sans aa supplémentaire, ;171 193 92. ;- Pour les 2 autres opérons le 1er intrcalaire est divisé par 2, 85 193 92.;- Elles sont, dans le même ordre, analogue à celles des blocs 16-atc gca-23-5s.;- Par rapport à eal, l'opéron avec 1 aa et 1 5s a perdu ces suppléments. ;et l’on a 3 opérons sans et 1 opéron avec 2 aas en supplément;;2 opérons tRNAs+protéine : tactac-tpr et acatacggaacc-tufB;;;- Il y a 4 remaniements qui consistent tous en une ou 2 répétions de plus;des répétitions déjà existantes;- 2 opérons sans rRNAs et sans doubles ont été perdus de eal à eco.;- Pour eco il y a toujours 10 opérons avec répétition et 3 sans répétitions:;- 3 opérons à 2 aas répétés;- 4 opérons à 3 aas répétés;-1 opéron à 4 aas répétés.;- L'opéron au maximum de 7 aas a 2 répétitions de 2 aas en séquence ;et la 3ème a ses 2 aas séparés : atg cta 2caa atg 2cag.;- Un opéron à 7 aas a une séquence répétée, 3aaa + 2*2.;eco;Opérons sans rRNAs avec doubles;2tac;2gtc;2gcc;3ctg;3atgf;atg cta 2caa atg 2cag;Remaniements des répétitions;3ggc;aaa 3gta;agc 4cgt;5aaa 2gta;Opérons sans rRNAs sans doubles;tta tgc ggc;cgg cac ctg cca;aca tac gga acc;Disparition de 2 opérons chez eco;-;- ;https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/?term=txid562[orgn];16s 7 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;7;0;3;0;3;0;4;14;36;23;7;10;72;86;2;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;genome;89;;16s;atc;gca;23s;5s;gac;;gac;;acg;;aga;;cag;cag;atg;caa;caa;cta;atg;;aaa;gta;aaa;gta;aaa;aaa;aaa;;tcc;;tca;;tcc;;tpr ;tac;tac;;gtc;gtc;;tta;tgc;ggc;;tcg;;aac;;aac;;aac;;aac;;ccc;;agg;;gcc;gcc;;gta;gta;gta;aaa;;5s;23s;gaa;16s;;atgi;;cgt;cgt;cgt;cgt;agc;;atgf;atgf;atgf;;ggg;;ttc;;atgi;;atgf;;ctc;;5s;acc;5s;23s;gca;atc;16s;;ccg;;tga;;16s;gaa;23s;5s;gac;tgg;;cgg;cac;ctg;cca;;16s;atc;gca;23s;5s;;16s;gaa;23s;5s;;aca;tac;gga;acc;tufb;;16s;gaa;23s;5s;;ttc;;ggc;ggc;ggc;;ttg;;ctg;ctg;ctg;;;1;20;40;60;80;100;120;140;160;180;200;220;;moyenne;variance;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;eal;;2tac;2gtc;2gcc;3ctg;3atgf;atg cta 2caa atg 2cag;;2ggc;aaa 2gta;agc 3cgt;3aaa 2gta;;tta tgc ggc;cgg cac ctg cca;aca tac gga acc;;atgi aga;gga aca ;;doubles;;;;;;@1;;;;;;;;;+;2 cag;2 atg;2 caa;;;;;+;5 aaa;2 gta;;;;;;;;;;;;CDS 90pb;+;2 tac;;+;2 gtc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;+;2 gcc;;+;3gta;;;;@2;;;;;;;+;4 cgt;;;;;+;3 atgf;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;@3;;;;CDS 1185 pb;;;;;;;;;+;3 ggc;;;;;+;3 ctg;;Fréquences;sans rRNAs;0;11;10;6;1;0;1;2;2;0;2;1;36;57;60;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;intercalaires;;68;42;183;93;52;;;;;;;;;37;47;15;34;23;9;;;135;2;149;3;146;132;;;;;;;;;67;209;;;4;;;12;54;;;;;;;;;;;;;;;;;39;;;44;46;4;;;92;184;171;;;;;198;62;198;3;;;33;33;;;;;;;;;;;;;37;12;92;174;42;68;;;;;;;85;193;92;52;8;;;57;20;42;;;68;42;183;93;;;171;193;92;;;8;116;6;114;;;85;193;93;;;;;36;35;;;;;34;28;;;avec rRNAs;-;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/bacteria/Acid_ferm_DSM_20731/;https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_013740.1;56%GC;;;;;;;;;;;;;;;;comp;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;;comp;;;;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;;;;comp;;comp;;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;;;;comp;;comp;;comp;;;avec rRNA;;;;;;;;sans ;;;;;total aas;remarques;;;*Remarques : 4 blocs 16-23-5s sans aas et très peu de doubles. Très simple.;;@1;;;;;@2;;;;Séquences des doubles : Très peu de doubles, 2 opérons à 2aas et plus sur 11 ont des doubles. ;;*Notes : gtRNAdb;afn;30.6.19 Paris;Acidaminococcus fermentans DSM 20731;24678..26242;26602..29507;29736..29852;;36819..36894;;57713..59277;59637..62543;62772..62888;;169459..169534;;249791..249867;;274627..274703;;311123..311198;311221..311305;311311..311386;311390..311465;311472..311548;;380482..382046;382298..385204;385434..385550;;461553..461627;461631..461705;461714..461789;461840..461916;461928..462001;462010..462086;;526984..527070;527101..527186;527239..527325;;578049..578123;;636984..638548;638643..638719;638786..638861;639135..642040;642180..642296;;712229..712304;712323..712398;712402..712477;712494..712577;;724421..724497;;774880..774956;774961..775036;775045..775119;775129..775202;775216..775304;;796654..796728;;842393..842469;842472..842547;842556..842630;842640..842713;;889670..889746;;906136..906210;;1022783..1022859;1022862..1022936;1022938..1023011;;1555201..1555277;;1567911..1567999;;1613773..1613863;;1702659..1702744;;1711770..1711886;1712115..1715021;1715381..1716945;;1823852..1823927;1823934..1824008;1824017..1824092;;1909446..1909536;;1911342..1911429;;1974984..1975058;;1984782..1984856;1984869..1984942;1985054..1985127;;2072279..2072395;2072624..2075529;2075828..2075903;2075970..2076046;2076141..2077705;;2148343..2148418;;2287117..2287192;;2303018..2303094;;2323563..2323636;;;opérons;16 23 5s 0;16 atc gca;16 23 5s a;max a;a doubles;spéciaux;total aas;opérons;1 aa;max a;a doubles;total aas;;;;;;;4 blocs 16-23-5s sans aas .;- 3 opérons ont leurs intercalaires identiques, 359 228.;- 1 opéron a son intercalaire 16s-23s diminué de 30%, 108/359,;l’autre intercalaire est commune aux 4 opérons.;;2 blocs 16-atc gca 23s-5s, classiques mais sans aas en plus.;- 3 intercallaires sont identiques et celui entre 23s-5s varie du simple au double, ;94 66 298 228 et 94 66 273 139.;;;- 2 doublets au total: opéron ctc + 2ctg et opéron gag + 2cag.; ;;16s 6;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;6;4;2;0;2;0;0;4;29;20;6;2;56;60;2;;;;;;;;;;;;;;;; ;;60;;16s;23s;5s;;acg;;16s;23s;5s;;gcc;;agg;;cgt;;aca;tac;atg;acc;atgf;;16s;23s;5s;;aac;gaa;gta;cca;gga;aga;;ctg;ctc;ctg;;ggc;;16s;atc;gca;23s;5s;;cac;caa;aaa;cta;;gtc;;gac;ttc;ggc;tgc;tta;;cgg;;gac;ttc;ggc;tgc;;ccc;;aac;;gac;ggc;tgg;;ccg;;tca;;agc;;ttg;;5s;23s;16s;;gta;gaa;aag;;tcc;;tcg;;atgi;;gag;cag;cag;;5s;23s;gca;atc;16s;;gcg;;aaa;;gtg;;ggg;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;doubles;;@1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;+;2 ctg;;;;;@2;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;+;2 cag;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;intercalaires;;359;228;;;;;359;228;;;;;;;;;22;5;3;6;;;251;229;;;3;8;50;11;8;;;30;52;;;;;94;66;273;139;;;18;3;16;;;;;4;8;9;13;;;;;2;8;9;;;;;;;2;1;;;;;;;;;;;228;359;;;6;8;;;;;;;;;12;111;;;228;298;66;94;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
http://gtrnadb.ucsc.edu/GtRNAdb2/genomes/bacteria/Bifi_long_NCC2705/;https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_004307.2;60%GC;;;;;;;;comp;;comp;comp;;comp;;;;;;;;;;;;comp;comp;;;;;;;;;comp;;comp;;;;comp;;;;;;;comp;comp;comp;;comp;;;;comp;;comp;;;;comp;comp;;comp;;;;;;;comp;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;;comp;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;*Remarques : 4 blocs 16-23-5s sans aas, en tout, et très peu de doubles. Très simple.;;@1;;;Séquences des doubles : Très peu de doubles, 4 opérons à 2aas et plus sur 10 ont des doubles. ;;*Notes : gtRNAdb;blo;30.6.19 Paris;Bifidobacterium longum NCC2705;115187..115260;;159243..160772;161203..164268;164437..164556;;207382..207457;;382849..382924;382968..383040;;440078..440150;;503549..503624;503649..503719;503761..503835;503881..503953;503985..504060;;521008..521084;;648764..648851;;747296..747369;747399..747472;;775646..775716;;778709..778784;778871..778946;;793729..793805;;804390..804463;;841055..841136;;937056..937131;;981177..981253;;1202433..1202505;1202593..1202676;;1208139..1208211;;1264390..1264465;1264514..1264585;1264632..1264704;;1280591..1280666;;1295466..1295542;;1350001..1350074;;1388875..1388950;;1410594..1410681;;1424793..1424867;1424904..1424979;;1524142..1524215;;1534802..1534887;;1606163..1606236;1606279..1606351;;1646835..1646911;;1705902..1707431;1707861..1710926;1711095..1711215;;1712083..1713614;1714037..1717102;1717271..1717390;;1769952..1770027;;1905665..1905740;;1908902..1910431;1910860..1913926;1914095..1914214;;1936132..1936205;;1971396..1971477;1971479..1971550;1971555..1971631;;1979312..1979401;;2016025..2016112;;2047072..2047159;;2068637..2068713;;2085402..2085473;;2087969..2088042;2088090..2088165;;2110850..2110926;;2130626..2130699;;2171440..2171512;;;avec rRNA;;;;;;;;sans ;;;;;total aas;remarques;;;;;4 blocs 16-23-5s sans aas .;- Leurs intercalaires sont identiques, 428 168.;;;- 4 doublets au total: 2aac 2cgt 2gcc et (3aas + 2ggc).; ;16s 4;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;opérons;16 23 5s 0;16 atc gca;16 23 5s a;max a;a doubles;spéciaux;total aas;opérons;1 aa;max a;a doubles;total aas;;;;;;;;;;;; ;57;NCBI;;val;;16s;23s;5s;;tgg;;aac;aac;;aac;;gly;tgc;val;val;gly;;pro;;leu;;arg;arg;;gln;;ala;ala;;pro;;leu;;leu;;cac;;arg;;thr;leu;;thr;;val;val;gly;;arg;;atg;;lys;;lys;;ser;;gln;glu;;gly;;leu;;ile;ala;;thr;;16s;23s;5s;;16s;23s;5s;;ala;;tgg;;16s;23s;5s;;gly;;tac;thr;atg;;ser;;ser;;ser;;pro;;glu;;gac;ttc;;gac;;atg;;arg;;;4;4;0;0;0;0;0;0;41;31;5;4;55;55;1;;;;;;;;;; ;;gtRNAdb;;gta;;;;;;tgg;;aac;aac;;aac;;ggc;tgc;gtc;gtg;ggc;;ccc;;ctc;;cgt;cgt;;caa;;gcc;gcc;;cca;;ttg;;tta;;cac;;aga;;acg;cta;;acg;;gtg;gtc;ggc;;cgg;;atgf;;aag;;aaa;;tcc;;cag;gag;;ggg;;ctg;;atc;gca;;aca;;;;;;;;;;gcg;;tgg;;;;;;gga;;tac;acc;atg;;agc;;tcg;;tca;;ccg;;gaa;;gac;ttc;;gac;;atgi;;agg;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;doubles;;;;@1;;;;;;+;2 aac;;;;+;2 ggc;;;;;;;;;+;2 cgt;;;;+;2 gcc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;intercalaires;;;;430;168;;;;;43;;;;;24;41;45;31;;;;;;;29;;;;;86;;;;;;;;;;;;;87;;;;;48;46;;;;;;;;;;;;;36;;;;;;;42;;;;;429;168;;;422;168;;;;;;;428;168;;;;;1;4;;;;;;;;;;;;;47;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
http://gtrnadb.ucsc.edu/GtRNAdb2/genomes/bacteria/Chro_viol_ATCC_12472/;https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_005085.1;65%GC;;;;;;;;;;;;;;comp;;;;comp;;;;;;;;;;;;;comp;comp;comp;comp;;;;;;;;comp;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;comp;comp;;;;;;;;;;;;;;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;;comp;comp;;;;;;;;;;;;comp;comp;comp;comp;comp;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;comp;comp;comp;comp;;;;;;;;;;;;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;;comp;;;;comp;comp;comp;comp;comp;;;;;comp;;comp;;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;;;avec rRNA;;;;;;;;sans ;;;;;total aas;remarques;;;*Remarques : Pas de blocs 16-23-5s et 8 blocs 16-atc gca 23-5s. Beaucoup de doubles.;;@1;;;;;;;@2;;Séquences des doubles : 12 opérons sur 23 à 2aas et plus ont des doubles. ;;;;;;;;;;;2ttc;2tcc;2atg;caa acg 2ccg;gcc gaa gcc gtRNAdb;cvi;30.6.19 Paris;Chromobacterium violaceum ATCC 12472;421217..422762;422942..423018;423105..423180;423430..426324;426450..426564;;502182..503727;503807..503883;503896..503971;504222..507116;507239..507353;;682034..682118;;759824..759908;;878775..878849;;955155..955230;;975612..975696;;1006822..1006897;1006904..1006979;;1058518..1058611;1058618..1058694;1058698..1058772;;1061741..1061815;1061819..1061895;1061903..1061977;1061983..1062059;;1154020..1155565;1155745..1155821;1155908..1155983;1156234..1159128;1159251..1159365;;1263556..1263645;;1273710..1273786;;1377435..1377510;1377534..1377609;1377632..1377707;1377732..1377807;1377837..1377912;1377958..1378031;;1387010..1387094;;1420085..1420161;;1427771..1427847;;1433244..1433319;1433352..1433427;1433459..1433534;;1646821..1648366;1648546..1648622;1648709..1648784;1649034..1651928;1652051..1652165;1652255..1652369;;1746117..1746207;1746261..1746351;;1978844..1978919;;2094372..2094447;2094474..2094549;2094595..2094670;2094698..2094774;2094793..2094869;;2511625..2511712;;2747299..2747375;2747383..2747458;;2853221..2853305;;3187082..3187157;;3257362..3257437;;3262246..3262321;3262330..3262405;3262417..3262492;;3371478..3371592;3371715..3374609;3374860..3374935;3374948..3375024;3375104..3376649;;3472822..3472897;3472910..3472986;3473013..3473088;3473101..3473177;3473204..3473279;3473292..3473368;3473395..3473470;3473483..3473559;3473587..3473663;3473670..3473746;3473774..3473850;3473857..3473933;;3622292..3622365;;3820120..3820234;3820357..3823251;3823501..3823576;3823663..3823739;3823919..3825464;;3828836..3828922;3828974..3829060;3829094..3829180;3829238..3829324;;3854547..3854622;3855180..3855255;3855317..3855393;3855472..3855548;;4059834..4059912;;4244591..4244705;4244828..4247722;4247972..4248047;4248134..4248210;4248390..4249935;;4325718..4325794;;4389268..4389342;;4402077..4402153;;4434130..4434244;4434367..4437261;4437511..4437586;4437673..4437749;4437929..4439474;;4474196..4474272;4474308..4474384;;4529616..4529690;;4532053..4532128;;4533370..4533444;4533469..4533542;4533595..4533679;;4586712..4586787;4586826..4586901;4586937..4587012;4587041..4587116;4587154..4587229;;;opérons;16 23 5s 0;16 atc gca;16 23 5s a;max a;a doubles;spéciaux;total aas;opérons;1 aa;max a;a doubles;total aas;;;;;;;8 blocs 16-atc gca 23-5s tous sans aas supplémentaires.;- Les intercalaires gca-23s-5s sont tous identiques, 250 122.;- Un groupe de 2 opérons aux intercalaires 16s-atc-gca 79 12 très différent du suivant;- Un groupe de 6 opérons aux intercalaires 16s-atc-gca 179 86, ;respectivement 2 et 7 fois plus grands.;- Un opéron présente 1 5s supplémentaire collé au 1er.;;Un intercallaire très élevé, 557 bases, entre 2 aas d’un opéron à 4aas.;;;3 opérons à séquences répétées.;- 12 opérons sans rRNAs sur 15 à 2aas et plus ont des doubles.;- 4 opérons avec 1 doublet chacun;- 1 opéron au doublet séparé (gcc gaa gcc);- 4 opérons à répétitions multiples non séparées, voir ci-dessous.;- 3 opérons avec répétition de séquences;:: 2gaa 2cgt avec 2*2;:: 3aaa 2aag avec 2*2;:: 4gta 6gac 2gtg avec 4*2 + 2*2.;;;;;; ;;16s 8;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;8;0;8;0;2;0;0;16;37;22;12;12;82;98;2;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;3aac;cca aga 3cac;4ctg;tgc 5ggc;- ;;98;;16s;atc;gca;23s;5s;;16s;atc;gca;23s;5s;;ttg;;tac;;agg;;gcg;;ctc;;ttc;ttc;;agc;cgt;gaa;;gaa;cgt;gaa;cgt;;16s;atc;gca;23s;5s;;tcg;;atgf;;ggc;ggc;ggc;ggc;ggc;tgc;;tta;;gtc;;ccc;;aac;aac;aac;;16s;atc;gca;23s;5s;5s;;tcc;tcc;;aac;;cac;cac;cac;aga;cca;;tca;;gac;gta;;cta;;aca;;gcc;;gcc;gaa;gcc;;5s;23s;gca;atc;16s;;gta;gac;gta;gac;gta;gac;gta;gac;gtg;gac;gtg;gac;;ggg;;5s;23s;gca;atc;16s;;ctg;ctg;ctg;ctg;;caa;acg;ccg;ccg;;atgi;;5s;23s;gca;atc;16s;;atgf;;caa;;cgg;;5s;23s;gca;atc;16s;;atg;atg;;acc;;tgg;;acc;gga;tac;;aaa;aag;aaa;aag;aaa;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;doubles;;@1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;+;2 ttc;;;;;;+;2 gaa;2cgt;;;;;;;;;;;;;+;5 ggc;;;;;;;;;;;;+;3 aac;;;;;;;;;;+;2 tcc;;;;+;3 cac;;;;;;;;;;;;;;;;+;2 gcc;;;;;;;;;+;4 gta;6 gac;2 gtg;;;;;;;;;;;;;;;;;;+;4 ctg;;;;@2;;+;2 ccg;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;+;2 atg;;;;;;;;;;+;3 aaa;2 aag;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;2gaa 2cgt;3aaa 2aag;4gta 6gac 2gtg;-;- ;;intercalaires;;179;86;249;125;;;79;12;250;122;;;;;;;;;;;;;6;;;6;3;;;3;7;5;;;179;86;250;122;;;;;;;23;22;24;29;45;;;;;;;;;32;31;;;179;86;249;122;89;;;53;;;;;26;45;27;18;;;;;7;;;;;;;;;8;11;;;122;250;12;79;;;12;26;12;26;12;26;12;27;6;27;6;;;;;122;249;86;179;;;51;33;57;;;557;61;78;;;;;122;249;86;179;;;;;;;;;122;249;86;179;;;35;;;;;;;24;52;;;38;35;28;37;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;2*2;2*2;4*2 + 2*2;-;-
http://gtrnadb.ucsc.edu/GtRNAdb2/genomes/bacteria/Stre_aver_MA_4680_NBRC_14893/;https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_003155.5;70%GC;;;;comp;;comp;;;;comp;;comp;;comp;;comp;;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;;;;comp;;comp;;comp;;;;comp;;;;comp;;comp;comp;comp;;comp;;comp;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;comp;;comp;;comp;;comp;;;;;;comp;;comp;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;;comp;;comp;;comp;;comp;;comp;;comp;;comp;comp;;;;;;;;;;;;;;comp;;;;;;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;;;;;;;;;;;;;avec rRNA;;;;;;;;sans ;;;;;total aas;remarques;;;*Remarques : 6 blocs 16-23-5s. Beaucoup de tRNAs solitaires;;@1;;;;;Séquences des doubles : 48 des 56 opérons à tRNAs sont des tRNAs solitaires.;;;;;;;; gtRNAdb;sma;30.6.19 Paris;Streptomyces avermitilis MA-4680;357776..357847;;1219274..1219346;;1225751..1225823;;1675869..1675942;;1965347..1965423;;1992012..1992088;;2222599..2222686;;3072632..3072707;;3073568..3073684;3073769..3076918;3077207..3078737;;3295252..3295324;3295345..3295416;3295438..3295510;3295573..3295645;3295688..3295759;;3655871..3655942;;3813093..3813166;;3815457..3815530;;4362610..4362695;;4410534..4410608;;4542466..4542542;;4589760..4589835;;4886830..4886906;;5024109..5024225;5024310..5027458;5027747..5029277;;5051970..5052043;;5055486..5055561;;5063087..5063159;5063207..5063281;5063306..5063382;;5068123..5068197;;5081640..5081711;5081791..5081866;;5085779..5085854;;5095224..5095311;;5129698..5129782;;5154937..5155009;5155215..5155305;;5177691..5177777;;5206939..5207028;;5299302..5299378;;5304905..5304977;;5322106..5322192;;5452769..5452842;;5594481..5594554;;5650316..5650389;;5759342..5760872;5761161..5764309;5764394..5764510;;5950170..5950251;;5956602..5956674;5956721..5956793;;5964532..5964607;;6124386..6125916;6126205..6129353;6129438..6129554;;6242261..6242335;;6279029..6279112;;6329202..6329278;;6335068..6335141;;6349312..6349385;;6372705..6372777;;6501509..6501584;;6604435..6604508;6604662..6604738;;6653846..6653918;;6658303..6658375;;6875603..6875675;6875681..6875753;6875920..6875996;;7021984..7022058;;7025336..7025415;;7471270..7471342;;7765513..7767043;7767328..7770477;7770611..7770727;;7937463..7937550;;8122352..8122426;8122467..8122538;8122558..8122629;8122631..8122704;8122743..8122815;;8129564..8129635;;8139938..8140012;;8328596..8330126;8330415..8333563;8333648..8333764;;8576989..8577062;;;opérons;16 23 5s 0;16 atc gca;16 23 5s a;max a;a doubles;spéciaux;total aas;opérons;1 aa;max a;a doubles;total aas;;;;;;;6 blocs 16-23-5s sans aas.;- 5 opérons ont les mêmes intercalaires, 288 84;- 1 opéron a l'intercalaire 23s-5s 58% plus élevée, 49/84.;L'autre est commune aux 6 opérons, 284.;;;- Il n'y a que 3 opérons contenant des doubles:;- (3gag 2cag) avec une répétition de séquence 2*2 ;- (ggc tgc 3gtc), répétition triple;- atgi 2aac avec 1 doublet;- Au total 2 doublets et 3 triplets. Ce qui est très peu, alors que le total des ;tRNAs est de 72. C’est donc que ce sont les opérons qui se répètent ;et non les tRNAs. Les opérons à rRNAs font de même, avec 6 blocs;quasi identiques même dans la longueur de leurs intercalaires. ;;16s 6;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;6;6;0;0;0;0;0;0;56;48;5;3;72;72;2;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;74;;gtg;;gga;;gga;;atgf;;ccc;;ccc;;ctc;;acc;;5s;23s;16s;;gag;cag;gag;gag;cag;;cgg;;atgf;;atgf;;tta;;caa;;gcg;;agg;;aca;;5s;23s;16s;;atgf;;aaa;;gaa;gac;ttc;;gac;;gga;ggc;;ggc;;tcc;;tcg;;cgt;agc;;tca;;agc;;atc;;gca;;ctg;;ggg;;ccg;;acg;;16s;23s;5s;;tac;;acc;atg;;tgg;;16s;23s;5s;;tgc;;cta;;aag;;aag;;aag;;cac;;aga;;gga;cca;;gcc;;gcc;;aac;aac;atgi;;gta;;gtg;;ttg;;16s;23s;5s;;ctc;;gtc;gtc;gtc;tgc;ggc;;gtg;;gtg;;16s;23s;5s;;ccc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;doubles;;;;;;;;;;;;;;;;;;@1;;;;+;3 gag ;2 cag;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;+;2 aac;;;;;;;;;;;;;;;+;3 gtc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;intercalaires;;;;;;;;;;;;;;;;;;84;288;;;20;21;62;42;;;;;;;;;;;;;;;;;;;84;288;;;;;;;47;24;;;;;79;;;;;;;;;205;;;;;;;;;;;;;;;;;;;288;84;;;;;46;;;;;288;84;;;;;;;;;;;;;;;;;153;;;;;;;5;166;;;;;;;;;284;133;;;;;40;19;1;38;;;;;;;288;84;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
http://gtrnadb.ucsc.edu/GtRNAdb2/genomes/bacteria/Kita_seta_KM_6054/;https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_016109.1;72%GC;;comp;;;;comp;comp;;;;;;;;comp;comp;comp;;comp;comp;comp;;;;;;comp;;comp;;comp;comp;;comp;comp;comp;;comp;direct;;comp;comp;comp;;;;;;;;;;;;;;;comp;comp;comp;;comp;;comp;comp;;comp;;comp;;comp;;;;;;;;comp;comp;comp;;comp;;comp;;;;;;;;;;;comp;;comp;comp;comp;;;;comp;;comp;;;;;;;;;;;;;;comp;;;;comp;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;;;;;;;;;;;comp;;;avec rRNA;;;;;;;;sans ;;;;;total aas;remarques;;;*Remarques : 9 blocs 16-23-5s. Beaucoup de tRNAs solitaires. Analogue à sma.;;@1;;;;;@2;;;Séquences des doubles : 48 des 56 opérons à tRNAs sont des tRNAs solitaires.;;;;;;;; gtRNAdb;ksk;30.6.19 Paris;Kitasatospora setae KM-6054;631024..631098;;976172..976245;;1615691..1615765;1615972..1616046;;1621501..1621576;1621653..1621726;1621763..1621834;1621869..1621940;1621978..1622052;;1707344..1707460;1707534..1710667;1710935..1712463;;1888620..1888736;1888810..1891942;1892210..1893738;;1970574..1970661;;2264495..2264580;;2741186..2741257;;2788071..2788147;;2790422..2790494;2790500..2790572;;2887231..2887303;2887573..2887645;2887684..2887756;;2932411..2932487;2932639..2932712;;2982955..2983071;2983145..2986276;2986543..2988071;;3018063..3018138;;3036654..3036730;;3044201..3044277;;3111827..3111900;3112030..3112103;;3157748..3157834;;3210241..3210315;;3289891..3290007;3290081..3293213;3293481..3295009;;3608705..3608777;;3616894..3616969;3617012..3617084;;3618677..3618757;;3851412..3851488;;3987214..3987290;;4071208..4071281;;4095099..4095186;;4142544..4142633;;4160864..4160939;4160975..4161050;4161291..4161381;;4177523..4177608;;4240397..4240470;;4285828..4285900;4285952..4286027;;4383368..4383444;;4385556..4385631;;4401492..4401575;;4622975..4623048;;4640883..4640959;4640994..4641067;4641110..4641182;;4651832..4651904;;4773547..4773620;;4774128..4774201;;4796510..4798038;4798306..4801439;4801511..4801627;;5027433..5027508;;5076388..5076464;;5123784..5123856;;5132819..5132892;;5216466..5216550;;5430075..5430148;;5530949..5531020;;5714968..5715039;5715061..5715133;5715172..5715244;5715258..5715330;5715335..5715409;;5853168..5854696;5854953..5858085;5858159..5858275;;5932168..5933696;5933953..5937085;5937157..5937273;;6074082..6075610;6075875..6079006;6079080..6079196;;6104344..6104419;;6400221..6401749;6402017..6405146;6405253..6405369;;6485836..6485909;;7355279..7355354;7355374..7355449;;7461078..7461165;;;opérons;16 23 5s 0;16 atc gca;16 23 5s a;max a;a doubles;spéciaux;total aas;opérons;1 aa;max a;a doubles;total aas;;;;;;;9 blocs 16-23-5s sans aas.;- 8 opérons ont des intercalaires identiques, 267 73.;- 1 opéron a l'intercalaire 23s-5s 45% plus élevée, 33/73.;L'autre est commune aux 9 opérons, 267.;;Les intercalaires élevés ne touchent que 2 opérons sans rRNAs et sont à la limite;de la règle de 210 bases, et sont équivalents à l’intercalaire 16s-23s, 269 et 240.;;;- Il n'y a que 7 opérons contenant des doubles:;- (3gag 2cag) avec une répétition de séquence 2*2 , comme sma.;- (ggc tgc 3gtc), répétition triple comme sma, plus (3gcc).;- (atgi 2aac) est remplacé par 4 doublets, 2gtg 2aac 2ggc et (agc 2cgt).;- Au total 5 doublets et 3 triplets. Ce qui est très peu, alors que le total des ;tRNAs est de 70. C’est donc que ce sont les opérons qui se répètent ;et non les tRNAs. Les opérons à rRNAs font de même, avec 9 blocs;quasi identiques même dans la longueur de leurs intercalaires. ;;16s 9;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;9;9;0;0;0;0;0;0;49;37;5;7;70;70;2;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;74;;act;;tgc;;gtg;gtg;;ggc;tgc;gtc;gtc;gtc;;5s;23s;16s;;5s;23s;16s;;ctc;;ttg;;gta;;atg;;aac;aac;;gcc;gcc;gcc;;cca;gga;;5s;23s;16s;;cac;;aag;;aag;;aag;aag;;cta;;tgc;;5s;23s;16s;;tgg;;atg;acc;;tac;;aca;;acg;;ccg;;tcc;;tcg;;cgt;cgt;agc;;tca;;ggg;;ggc;ggc;;atc;;gca;;ctg;;gac;;ttc;gac;gaa;;aaa;;atg;;atg;;16s;23s;5s;;agg;;gcg;;acc;;caa;;tta;;atg;;cgg;;cag;gag;gag;gag;cag;;16s;23s;5s;;16s;23s;5s;;16s;23s;5s;;aga;;16s;23s;5s;;ccc;;tgc;ggc;;ctc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;doubles;;;;;;+;2 gtg;;;;+;;;;@1;;;;;;;;;;;;;;;;+;2 aac;;+;3 gcc;@2;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;+;2 cgt;@;;;;;;+;2 ggc;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;+;3 gag;2 cag;;;;;;;;;;;; ;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;intercalaires;;;;;;206;;;76;36;34;37;;;73;267;;;73;267;;;;;;;;;;;5;;;269;38;;;151;;;73;266;;;;;;;;;129;;;;;;;73;267;;;;;42;;;;;;;;;;;;;;;35;240;;;;;;;51;;;;;;;;;;;34;42;;;;;;;;;267;71;;;;;;;;;;;;;;;;;21;38;13;4;;;256;73;;;256;71;;;264;73;;;;;267;106;;;;;19;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
http://gtrnadb.ucsc.edu/GtRNAdb2/genomes/bacteria/Anae_deha_2CP_C/;https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_011891.1;75%GC;;;;;;comp;;comp;comp;;comp;;;;comp;;comp;;;;;;;;;;;;;;;;;;;comp;;comp;;;;comp;;comp;;comp;comp;comp;comp;;;;;;comp;;;;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;;;;;;comp;;;;comp;;comp;comp;comp;comp;comp;;comp;;comp;comp;;;;;;;avec rRNA;;;;;;;;sans ;;;;;total aas;remarques;;;*Remarques : Pas de blocs 16-23-5s, 2 blocs 16-atc-gca-23-5s, pas de doubles.;;@1;;;@2;;;;Séquences des doubles : 27 des 33 opérons à tRNAs sont des tRNAs solitaires.;;;;; gtRNAdb;ade;30.6.19 Paris;Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C;8147..8220;;21040..21112;;433303..433378;;666509..666585;666592..666666;;693146..693229;;851483..851555;;1057311..1057386;;1306222..1306295;;1442379..1442450;;1495545..1497102;1497290..1497367;1497390..1497465;1497660..1500648;1500801..1500917;;1509186..1509259;1509320..1509394;;1691085..1691160;;819377..1819453;;2235670..2235741;;2314981..2315079;;2337031..2337104;;2376009..2376080;;2429718..2429790;;2623942..2624017;;2625463..2625535;2625558..2625633;2625697..2625779;2625826..2625898;;2653452..2653535;;2680790..2680871;;2747806..2747879;;3029047..3029122;;3076236..3076352;3076505..3079493;3079688..3079763;3079786..3079863;3080051..3081608;;3144286..3144357;;3156732..3156804;;3253990..3254063;;3793996..3794069;;3806164..3806249;;3915708..3915789;;3920245..3920317;3920566..3920639;3920780..3920854;3920873..3920946;3921081..3921154;;4121675..4121749;;4195371..4195460;4195739..4195829;;4456675..4456764;4456792..4456883;4456957..4457033;;;opérons;16 23 5s 0;16 atc gca;16 23 5s a;max a;a doubles;spéciaux;total aas;opérons;1 aa;max a;a doubles;total aas;;;;;;;2 blocs 16-atc-gca-23-5s sans aas supplémentaires.;- Intercalaires identiques, 187 22 194 152.;;Les intercalaires élevés ne touchent que 2 opérons sans rRNAs et sont à la limite;de la règle de 210 bases, et sont équivalents à l’intercalaire 16s-23s, 278 et 248.;Comme ksk.;;;- Analogue à ksk;- Pas de doubles du tout;- Ce sont les opérons qui se répètent et non les tRNAs.;Les opérons à rRNAs font de même, avec 2 blocs;quasi identiques même dans la longueur de leurs intercalaires. ;;16s 2;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;2;0;2;0;2;0;0;4;33;27;5;0;45;49;2;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;49;;caa;;ttc;;ggg;;gac;gta;;ctg;;atg;;gcg;;ccc;;tgc;;16s;atc;gca;23s;5s;;cag;gag;;gcc;;atg;;gtc;;tga;;atg;;gtg;;acg;;tgg;;acc;gga;tac;aca;;ttg;;ctc;;agg;;acc;;5s;23s;gca;atc;16s;;aaa;;gaa;;cgg;;ccg;;tta;;cta;;aag;aga;cac;cga;cca;;ggc;;tcc;tcg;;tca;agc;cgt;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;doubles;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;@1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;@2;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;intercalaires;;;;;;;;6;;;;;;;;;;;;;187;22;194;152;;;60;;;;;;;;;;;;;;;;;;;22;63;46;;;;;;;;;;;152;194;22;187;;;;;;;;;;;;;;;248;140;18;134;;;;;278;;;27;73;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Organisation de l'opéron tac-tac-tpr chez eco-eal
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- Lien aux archives des comparaisons: compariasons
eco 51 opéron tac-tac-tpr: L'ordre avec les intercalaires est tac1-intc01-tpr0-intc02-intc03-tac2-intc2-tpr1-intc11-intc12-tpr2-intc21-intc22-tpr3-intc31-intc32. AGCAGGCCAGTAAAAAGCATTACCCCGTGGTGGGGTTCCCGAGCGGCCAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTCATCG ACTTCGAAGGTTCGAATCCTTCCCCCACCACCATAATTCACCACAGCGATGTGGTAACTTCGGTGAGATTGTGAAAGTTT GCACTCATCGGGGAAGGGTGAGAACCTTCGACTAAGGTTCGATTCGAGCGAAAGCGAGAGAACGTTGCCACAGGCAACGG CCCGAAGGGTGAGGAGCGAAGCGACGAATAATCCTTCCCCCACCACCATCTCAAGCATTACCTCAAAATTTGAATTACCC CTGGTGGGGTTCCCGAGCGGCCAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTCATCGACTTCGAAGGTTCGAATCCTTCCCCC ACCACCATCACTTTCAAAAGTCCCTGAACTTCCCAACGAATCCGCAATTAAATATTCTGCCCATGCGGGGAAGGATGAGA AGCTTCGACCAAGGTTCGACTCGAGCGCCAGCGAGAGAGCGTTGCCGCAGGCAACGACCCGAAGGGCGAAGCGCGCAGCG CTGAGTAATCCTTCCCCCACCACCATCACTTTCAAAAGTCCCTGAACTCTCAAGCGAATCCGCAATCAAATATTCTGCCC ATGCGGGGAAGGATGAGAAGCTTCGACTAAGGTTCGGCTCGAGCGTCAGCGAGAGAGCGTTGCCGCAGGCAACGACCCGA AGGGCGAAGCGCGCAGCGCTGAGTAATCCTTCCCCCACCACCATCACTTTCAAAAGCCCCGGAATTCTCAAACGAATCCG CAATCAAATATTCTGCCCAAGCGGGGAAGGATGAGAAGCTTCGACCAAGGTTCGACTTGAGCGCCAGCGAGAGAGCGTTG CCGCAGGCAACGACCCGAAGGGCGAAGCGCGCAGCGCTGAGTAATCCTTCCCCCACCACCATCGCTTCCTTAAATAATCA eal 50 opéron tac-tac-tpr: L'ordre avec les intercalaires est tac1-intc01-tpr0-intc02-intc03-tac2-intc2-tpr1-intc11-intc12-tpr2-intc21-intc22 AAGGGAGCAGGCCAATAAAAGCATTACCCCGTGGTGGGGTTCCCGAGCGGCCAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTC ACAGACTTCGAAGGTTCGAATCCTTCCCCCACCACCATTATTCATCACAGCGATGTGGTAACTTCGGTGAGATTGTTAAA GTTTGCACTCATCGGGGAAGGGTGAGAGCCTTCGATTAAGGTTCGACTCGAGCAAAAGCGAGAGAACGTTGCCGCAGGCA ACGGCCCGAAGGGTGAGGAGCGAAGCGACGAATAATCCTTCCCCCACCACCATCTCAAGCATTATCTCAAAATTTGAATT ACCCTTGGTGGGGTTCCCGAGCGGCCAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTCATCGACTTCGAAGGTTCGAATCCTTC CCCCACCACCATTACTTTCAAAAATCCCTGAATTTCCCAAACAAATCCGTAATTGAATATTCTGCCTATACGGGGAAGGA CGAGAAGCTTCGACTAAGGTTCGACTCGAGCGCCAGCGAGAGAGCGTTGCCGTAGGCAACGACCCGCAGGGCGAAGCGCG CAGCGCTGAGTCATCCTTCCCCCACCACCATTACTTTCAAAAATCCCTGAACTCTCAAACAAATCTGTAATTAAATATTC TCCCCATACGGGAAAGGATGAGAAGCTTCGACTAAGGTTCGACTCGAGCGCCAGCGAGAGAGCGTTGCCGCAGGCAACGA CCCGCAGGGCGAAGCGCGCAGCGCTGAGTCATCCTTCCCCCACCACCATTACTTGATTCCATTCTCACTCCTTCGGCTTT TCCCCCATTCGCCGTAAAAACTGCTGCTGTAGCCTCAACAAATCCGCTAACGTTAACAACCGATAATCCAGCCCTTTTTG CCGGGCGATACCTGCAATAATGCGACTTAACGCAGGGTAATGGCGATGATGCCAGTGAGGGAAAAGATGATGAGTAAGAT
- Archives des comparaisons tpr. Une fois copié dans calc rechercher ° pour colorer les différences et § pour retrouver une insertion.
Les 2 tRNAs tac;;;;;Les répétitions tpr;;;;;;;;;Les 2 intercalaires en clair de tpr0;;;;;Les intercalaires bleus;;;;;;derniers intercalaires bleus;;;Répétitions des intercalaires rouges correspondant à la queue de 21 pb du tRNA tac;;;;;;;;;; tac1;;tac2;identiques;;tpr1 eco;tpr1;tpr2 eco;tpr2;tpr3 eco;tpr0;tpr0;;intc01;intc01;;intc03;intc03;;intc2;intc2;intc12;intc12;intc22;;intc22;intc32;;intc02;intc02;intc11;intc11;intc21;intc21;intc31;tac1-q;tac1-q;tac2-q;tac2-q 219063..219144;;219357..219438;;;comp 1287087..1287176;;;;;5/90 #;6%;;identiques;;;2/34 #;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; eco;eal;eco;eal;;eco;eal;eco;eal;eco;eco;eal;;eco;eal;;eco;eal;;eco;eal;eco;eal;eco;;eal;eco;;eco;eal;eco;eal;eco;eal;eco;eco;eal;eco;eal G;G;G;G;;A;A;A;A;A;G°;G°;;T;T;;T;T;;T;T;T;T;T;;T;T;;A°;A°;G°;G°;G°;G°;G°;C;C;C;C G;G;G;G;;T;C°;T;T;T;T;T;;A;A;;C;C;;C;T°;C;T°;C;;T°;C°;;T°;T°;T°;T°;T°;T°;T°;G;G;G;G T;T;T;T;;G;G;G;G;G;G;G;;A;A;;T;T;;A;A;A;A;A;;A°;G°;;A;A;A;C°;A;C°;A;A;A;A;A G;G;G;G;;A;A;A;A;A;A;A;;T;T;;C;C;;C;C;C;C;C;;C;C;;A;A;A;A;A;A;A;A;A;A;A G;G;G;G;;G;G;G;G;G;G;G;;T;T;;A;A;;T;T;T;T;T;;T;T;;T;T;T;T;T;T;T;T;T;T;T G;G;G;G;;A;A;A;A;A;A;A;;C;C;;A;A;;T;T;T;T;T;;T;T;;C;C;C;C;C;C;C;C;C;C;C G;G;G;G;;A;A;A;A;A;A;G°;;A;A;;G;G;;T;T;T;T;T;;G°;C°;;C;C;C;C;C;C;C;C;C;C;C T;T;T;T;;G;G;G;G;G;C°;C°;;C;C;;C;C;;C;C;C;C;C;;A°;C°;;T;T;T;T;T;T;T;T;T;T;T T;T;T;T;;C;C;C;C;C;C;C;;C;C;;A;A;;A;A;A;A;A;;T;T;;T;T;T;T;T;T;T;T;T;T;T C;C;C;C;;T;T;T;T;T;T;T;;A;A;;T;T;;A;A;A;A;A;;T;T;;C;C;C;C;C;C;C;C;C;C;C C;C;C;C;;T;T;T;T;T;T;T;;C;C;;T;T;;A;A;A;A;A;;C°;A°;;C;C;C;C;C;C;C;C;C;C;C C;C;C;C;;C;C;C;C;C;C;C;;A;A;;A;A;;A;A;A;A;A;;C°;A°;;C;C;C;C;C;C;C;C;C;C;C G;G;G;G;;G;G;G;G;G;G;G;;G;G;;C°;T;;G;A°;G;A°;G;;A;A;;C;C;C;C;C;C;C;C;C;C;C A;A;A;A;;A;A;A;A;A;A;A;;C;C;;C;C;;T;T;T;T;C°;;T;T;;C;C;C;C;C;C;C;C;C;C;C G;G;G;G;;C;C;C;C;C;C;T°;;G;G;;T;T;;C;C;C;C;C;;T°;A°;;A;A;A;A;A;A;A;A;A;A;A C;C;C;C;;C°;T;T;T;C°;T;T;;A;A;;C;C;;C;C;C;C;C;;C°;A°;;C;C;C;C;C;C;C;C;C;C;C G;G;G;G;;A;A;A;A;A;A;A;;T;T;;A;A;;C;C;C;C;C;;T;T;;C;C;C;C;C;C;C;C;C;C;C G;G;G;G;;A;A;A;A;A;A;A;;G;G;;A;A;;T;T;T;T;G°;;C;C;;A;A;A;A;A;A;A;A;A;A;A C;C;C;C;;G;G;G;G;G;G;G;;T;T;;A;A;;G;G;G;G;G;;A;A;;C;C;C;C;C;C;C;C;C;C;C C;C;C;C;;G;G;G;G;G;G;G;;G;G;;A;A;;A;A;A;A;A;;;;;C;C;C;C;C;C;C;C;C;C;C A;A;A;A;;T;T;T;T;T;T;T;;G;G;;T;T;;A;A;A;A;A;;;;;A;A;A;A;A;A;A;A;A;A;A A;A;A;A;;T;T;T;T;T;T;T;;T;T;;T;T;;C;T°;C;C;T°;;;;;;;;;;;;;;; A;A;A;A;;C;C;C;C;C;C;C;;A;A;;T;T;;T;T;T;T;T;;;;;;;;;;;;;;; G;G;G;G;;G;G;G;G;G;G;G;;A;A;;G;G;;§;T°;§;§;§;;;;;;;;;;;;;;; G;G;G;G;;A;A;G°;A;A;A;A;;C;C;;A;A;;T°;C;C;C;C;;;;;;;;;;;;;;; G;G;G;G;;C;C;C;C;C;T°;C;;T;T;;A;A;;C°;C°;T;T;T;;;;;;;;;;;;;;; A;A;A;A;;T;T;T;T;T;T;T;;T;T;;T;T;;C;C;C;C;C;;;;;;;;;;;;;;; G;G;G;G;;C;C;C;C;T°;C;C;;C;C;;T;T;;C°;A;A;A;A;;;;;;;;;;;;;;; C;C;C;C;;G;G;G;G;G;G;G;;G;G;;A;A;;A;A;A;A;A;;;;;;;;;;;;;;; A;A;A;A;;A;A;A;A;A;A;A;;G;G;;C;C;;A;A;G°;A;A;;;;;;;;;;;;;;; G;G;G;G;;G;G;G;G;G;G;G;;T;T;;C;C;;C;C;C;C;C;;;;;;;;;;;;;;; A;A;A;A;;C;C;C;C;C;C;C;;G;G;;C;C;;G;A°;G;A°;G;;;;;;;;;;;;;;; C;C;C;C;;G;G;G;G;G;G;A°;;A;A;;C°;T;;A;A;A;A;A;;;;;;;;;;;;;;; T;T;T;T;;C;C;T°;C;C;A°;A°;;G;G;;T;T;;A;A;A;A;A;;;;;;;;;;;;;;; G;G;G;G;;C;C;C;C;C;A°;A°;;A;A;;;;;T;T;T;T;T;;;;;;;;;;;;;;; T;T;T;T;;A;A;A;A;A;A;A;;T;T;;;;;C;C;C;C;C;;;;;;;;;;;;;;; A;A;A;A;;G;G;G;G;G;G;G;;T;T;;;;;C;C;C;T°;C;;;;;;;;;;;;;;; A;A;A;A;;C;C;C;C;C;C;C;;G;G;;;;;G;G;G;G;G;;;;;;;;;;;;;;; A;A;A;A;;G;G;G;G;G;G;G;;T;T;;;;;C;T°;C;T°;C;;;;;;;;;;;;;;; T;T;T;T;;A;A;A;A;A;A;A;;G;G;;;;;A;A;A;A;A;;;;;;;;;;;;;;; C;C;C;C;;G;G;G;G;G;G;G;;A;A;;;;;A;A;A;A;A;;;;;;;;;;;;;;; T;T;T;T;;A;A;A;A;A;A;A;;A;A;;;;;T;T;T;T;T;;;;;;;;;;;;;;; G;G;G;G;;G;G;G;G;G;G;G;;A;A;;;;;T;T;C°;T;C°;;;;;;;;;;;;;;; C;C;C;C;;A;A;A;A;A;A;A;;G;G;;;;;A;G°;A;A;A;;;;;;;;;;;;;;; C;C;C;C;;G;G;G;G;G;A;A;;T;T;;;;;A;A;A;A;A;;;;;;;;;;;;;;; G;G;G;G;;C;C;C;C;C;C;C;;T;T;;;;;A;A;A;A;A;;;;;;;;;;;;;;; T;T;T;T;;G;G;G;G;G;G;G;;T;T;;;;;T;T;T;T;T;;;;;;;;;;;;;;; C;C;C;C;;T;T;T;T;T;T;T;;G;G;;;;;A;A;A;A;A;;;;;;;;;;;;;;; A;A;A;A;;T;T;T;T;T;T;T;;C;C;;;;;T;T;T;T;T;;;;;;;;;;;;;;; T;C°;T;T;;G;G;G;G;G;G;G;;A;A;;;;;T;T;T;T;T;;;;;;;;;;;;;;; C;A°;C;C;;C;C;C;C;C;C;C;;C;C;;;;;C;C;C;C;C;;;;;;;;;;;;;;; G;G;G;G;;C;C;C;C;C;C;C;;T;T;;;;;T;T;T;T;T;;;;;;;;;;;;;;; A;A;A;A;;G;G;G;G;G;A°;G;;C;C;;;;;G;G;G;C°;G;;;;;;;;;;;;;;; C;C;C;C;;C;T°;C;C;C;C;C;;A;A;;;;;C;C;C;C;C;;;;;;;;;;;;;;; T;T;T;T;;A;A;A;A;A;A;A;;T;T;;;;;C;C;C;C;C;;;;;;;;;;;;;;; T;T;T;T;;G;G;G;G;G;G;G;;C;C;;;;;C;T°;C;C;C;;;;;;;;;;;;;;; C;C;C;C;;G;G;G;G;G;G;G;;G;G;;;;;A;A;A;A;A;;;;;;;;;;;;;;; G;G;G;G;;C;C;C;C;C;C;C;;G;G;;;;;T;T;T;T;A°;;;;;;;;;;;;;;; A;A;A;A;;A;A;A;A;A;A;A;;G;G;;;;;G;A°;G;A°;G;;;;;;;;;;;;;;; A;A;A;A;;A;A;A;A;A;A;A;;G;G;;;;;C;C;C;C;C;;;;;;;;;;;;;;; G;G;G;G;;C;C;C;C;C;C;C;;A;A;;;;;G;G;G;G;G;;;;;;;;;;;;;;; G;G;G;G;;G;G;G;G;G;G;G;;A;A;;;;;G;G;G;G;G;;;;;;;;;;;;;;; T;T;T;T;;A;A;A;A;A;G;G;;G;G;;;;;G;G;G;G;G;;;;;;;;;;;;;;; T;T;T;T;;C;C;C;C;C;C;C;;G;G;;;;;G;G;G;A°;G;;;;;;;;;;;;;;; C;C;C;C;;C;C;C;C;C;C;C;;;;;;;;A;A;A;A;A;;;;;;;;;;;;;;; G;G;G;G;;C;C;C;C;C;C;C;;;;;;;;A;A;A;A;A;;;;;;;;;;;;;;; A;A;A;A;;G;G;G;G;G;G;G;;;;;;;;G;G;G;G;G;;;;;;;;;;;;;;; A;A;A;A;;A;C°;A;C°;A;A;A;;;;;;;;G;G;G;G;G;;;;;;;;;;;;;;; T;T;T;T;;A;A;A;A;A;A;A;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; C;C;C;C;;G;G;G;G;G;G;G;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; C;C;C;C;;G;G;G;G;G;G;G;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; T;T;T;T;;G;G;G;G;G;G;G;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; T;T;T;T;;C;C;C;C;C;T°;T°;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; C;C;C;C;;G;G;G;G;G;G;G;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; C;C;C;C;;A;A;A;A;A;A;A;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; C;C;C;C;;A;A;A;A;A;G°;G°;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; C;C;C;C;;G;G;G;G;G;G;G;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; C;C;C;C;;C;C;C;C;C;A°;A°;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; A;A;A;A;;G;G;G;G;G;G;G;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; C;C;C;C;;C;C;C;C;C;C;C;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; C;C;C;C;;G;G;G;G;G;G;G;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; A;A;A;A;;C;C;C;C;C;A°;A°;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; C;C;C;C;;A;A;A;A;A;A;A;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; C;C;C;C;;G;G;G;G;G;G;G;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; A;A;A;A;;C;C;C;C;C;C;C;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;G;G;G;G;G;G;G;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;C;C;C;C;C;A°;A°;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;T;T;T;T;T;C°;C°;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;G;G;G;G;G;G;G;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;A;A;A;A;A;A;A;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Comparaison entre les 2 types de duplications avec et sans rRNAs
[modifier | modifier le wikicode]Spectre en opérons des 4 génomes bsu lmo eco eal
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux: Spectre en opérons des 4 génomes bsu lmo eco eal.
- Spectre en opérons des 4 génomes bsu lmo eco eal
synthèse bsu;;;;;;synthèse eco;;;;;;; bsu avec r;;;;;;eco avec r;;;;;;; 21aas;21;lien;;;;3aas*3;9;atc gca gac;atc gca acc;gaa gac tgg;;; 16aas;16;lien;;;;2aas;2;atc gca;;;;; 9aas;9;lien;;;;1aa*3;3;3gaa ;;;;; 6aas;6;aac acc ggc cgt cca gca;;;;total;14;;;;;; 4aas;4;cgt gga atgf gac;;;;;;;;;;; 2aas*2;4;atc gca;atc gca;;;eco sans r;;;;;;; total;60;;;;;7aas*2;14;5aaa 2gta;2cag 2atg 2caa cta;;;; bsu sans r;;;;;;5aas;5;4cgt agc;;;;; 7aas;7;aac agc gaa caa aaa cta ctc;;;;4aas*3;12;3gta aaa;cgg cac ctg cca;aca tac gga acc;;; 5aas;5;gaa gta aca tac caa;;;;3aas*4;12;3atgf;3ggc;3ctg;tta tgc ggc;; 4aas;4;aaa gaa gac ttc;;;;2aas*3;6;2tac;2gtc;2gcc;;; 2aas;2;atg gaa;;;;1aa*23;23;4aac 2atgi 2tcc 2ttc ;;;;; 1aa*8;8;aga agg caa cgg gcc gga gtc tca;;;;;;acg aga agg atgf ccc ccg ctc gac ggg tca tcg tga ttg ;;;;; total;26;;;;;total;72;;;;;; ;;;;;;;;;;;;; synthèse lmo;;;;;;synthèse eal;;;;;;; lmo avec r;;;;;;eal avec r;;;;;;; 21aas;21;lien;;;;3aas*2;6;atc gca gac;tgg gac gaa;;;; 16aas;16;lien;;;;2aas*3;6;gaa acc;atc gca;atc gca;;; 9aas;9;lien;;;;1aa*2;2;2gaa ;;;;; 4aas;4;atc gca aac acc;;;;total;14;;;;;; total;50;;;;;eal sans r;;;;;;; ;;;;;;7aas;7;2atg cta 2caa 2cag;;;;; ;;;;;;5aas;5;3aaa 2gta;;;;; ;;;;;;4aas*3;12;3cgt agc;acc gga tac aca;cca ctg cac cgg;;; lmo sans r;;;;;;3aas*4;12;3ctg;3atgf;2gta aaa;ggc tgc tta;; 5aas;5;gaa acg tac caa aaa;;;;2aas*6;12;2tac;2gtc;2gcc;2ggc;gga aca;atgi aga 2aas*2;4;aac agc;gaa gac;;;1aa*23;23;4aac 2atgi 2tcc 2ttc ;;;;; 1aa*8;8;aag aga cgg cgt ctc gga gtc tcg;;;;;;acg aga agg atgf ccc ccg ctc gac ggg tca tcg tga ttg ;;;;; total;17;;;;;total;71;;;;;;
Position des rRNAs dans les opérons
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Position des rRNAs dans les opérons
- Légende:
;Position des rRNAs dans les opérons;;;; ;;;;; aas;bsu r;;;aas;eco avec r 2;16-atc gca-23-5;;;3;16-atc gca-23-5-gac 2;16-atc gca-23-5;;;1;16-gaa-23-5 9;16-23-5-9aas-16-23-5;;;3;16-atc gca-23-5-acc-5 6;16-23-5-6aas-16-23-5-16-23-5;;;3;16-gaa-23-5-gac tgg 4;cgt gga-16-23-5-atgf gac;;;2;16-atc gca-23-5 16;16-23-5-16aas;;;1;16-gaa-23-5 21;16-23-5-21aas;;;1;16-gaa-23-5 60;;;;14; ;;;;aas;eal avec r ;;;;3;16-atc gca-23-5-gac ;;;;2;16-atc gca-23-5 aas;lmo r;;;2;16-atc gca-23-5 9;16-23-5-9aas-16-23-5;;;1;16-gaa-23-5 21;16-23-5-21aas;;;3;16-gaa-23-5-gac tgg 16;16-atc gca-23-5-14aas;;;2;16-gaa-23-5-acc-5 4;16-atc gca-23-5-aac acc;;;1;16-gaa-23-5 50;;;;14;
Adressage bsu lmo eco eal
[modifier | modifier le wikicode]- Adressage
;Adresses NCBI;;;;;;;;;;;Adresses NCBI;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;07/03/19;;;;07/03/19;;;;;;;10/05/19;;;;;10/05/19;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168;;;;Listeria monocytogenes EGD-e;;;;;;;Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655;;;;;Escherichia albertii;;; 86 tRNAs;bsu;;codon;comp;67 tRNAs;lmo;;codon;comp;;86 tRNAs;eco;;codon;comp;85 tRNAs;eal;;codon;comp 2;9810..11364;;16s;;1;82705..82777;;aag;;;;223771..225312;;16s;;2;219063..219144;;tac; ;11464..11540;;atc;;;;;;;;;225381..225457;;atc;;;219357..219438;;tac; ;11552..11627;;gca;;9;237466..239020;;16s;;;3;225500..225575;;gca;;;;;; ;11709..14636;;23s;;;239265..242195;;23s;;;;225759..228662;;23s;;1;413135..413219;;tcc; ;14692..14810;;5s;;;242276..242385;;5s;;;;228756..228875;;5s;;;;;; ;;;;;;242399..242471;;gta;;;;228928..229004;;asp;;1;462888..462972;;tca; 1; 22292..22384;;tca;;;242480..242555;;aca;;;;;;;;;;;; ;;;;;;242597..242669;;aaa;;;1;236931..237007;;asp;;2;489120..489191;;gga;comp 2;30279..31832;;16s;;;242675..242756;;cta;;;;;;;;;489198..489270;;aca;comp ;31932..32008;;atc;;;242771..242842;;ggc;;;1;262871..262946;;acg;;;;;; ;32020..32095;;gca;;;242864..242949;;tta;;;;;;;;1;615149..615233;;tcc; ;32177..35103;;23s;;;242962..243035;;cgt;;;1;564723..564799;;aga;;;;;; 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;;;;;;;;;;;1;4168372..4168447;;gaa;;2;3782718..3782790;;gcc; 1;3194455..3194527;;gcc;comp;;;;;;;;4168641..4171544;;23s;;;3782833..3782905;;gcc; ;;;;;;;;;;;;4171637..4171756;;5s;;;;;; 1;3545889..3545964;;cgg;comp;;;;;;;;;;;;1;3810369..3810440;;agg;comp ;;;;;;;;;;;4;4175388..4175463;;aca;;;;;; 4;4154787..4154859;;ttc;comp;;;;;;;;4175472..4175556;;tac;;1;3993500..3993573;;ccc;comp ;4154895..4154971;;gac;comp;;;;;;;;4175673..4175747;;gga;;;;;; ;4155053..4155124;;gaa;comp;;;;;;;;4175754..4175829;;acc;;1;4232176..4232248;;aac;comp ;4155134..4155209;;aaa;comp;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;1;4208147..4209688;;16s;;1;4233996..4234068;;aac; ;;;;;;;;;;;;4209774..4209849;;gaa;;;;;; ;;;;;;;;;;;;4210043..4212946;;23s;;1;4242952..4243024;;aac;comp ;;;;;;;;;;;;4213040..4213159;;5s;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;1;4248342..4248414;;aac;comp ;;;;;;;;;;;1;4362551..4362626;;ttc;comp;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;1;4249406..4249492;;tcg; ;;;;;;;;;;;3;4392360..4392435;;ggc;;;;;; ;;;;;;;;;;;;4392472..4392547;;ggc;;2;4256696..4256768;;atgi; ;;;;;;;;;;;;4392583..4392658;;ggc;;;4256869..4256942;;aga; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;1;4496405..4496489;;ttg;;3;4317980..4318052;;ggc; ;;;;;;;;;;;;;;;;;4318109..4318179;;tgc; ;;;;;;;;;;;3;4606079..4606165;;ctg;comp;;4318194..4318277;;tta; ;;;;;;;;;;;;4606200..4606286;;ctg;comp;;;;; ;;;;;;;;;;;;4606315..4606401;;ctg;comp;2;4556753..4556826;;gtc;comp ;;;;;;;;;;;;;;;;;4556834..4556907;;gtc;comp
Synthèse des 2 types de duplications avec et sans rRNAs
[modifier | modifier le wikicode]Comparaison avec les duplications des archées et des eucaryotes
[modifier | modifier le wikicode]Macros calc
[modifier | modifier le wikicode]tRNA
[modifier | modifier le wikicode]sub tRNA
rem ----- mise à jour après args2, pour compléter de "2$" à "8$"
rem---- répéter args3(..) jusqu'à args9(..)
rem---- args3(11).Value = "2$" jusqu'à args9(11).Value = "8$"
rem---- args3(12).Value = "2 " jusqu'à args9(12).Value = "8 "
rem ----------------------------------------------------------------------
rem define variables
dim document as object
dim dispatcher as object
rem ----------------------------------------------------------------------
rem get access to the document
document = ThisComponent.CurrentController.Frame
dispatcher = createUnoService("com.sun.star.frame.DispatchHelper")
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args1(21) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args1(0).Name = "SearchItem.StyleFamily"
args1(0).Value = 2
args1(1).Name = "SearchItem.CellType"
args1(1).Value = 0
args1(2).Name = "SearchItem.RowDirection"
args1(2).Value = true
args1(3).Name = "SearchItem.AllTables"
args1(3).Value = false
args1(4).Name = "SearchItem.SearchFiltered"
args1(4).Value = false
args1(5).Name = "SearchItem.Backward"
args1(5).Value = false
args1(6).Name = "SearchItem.Pattern"
args1(6).Value = false
args1(7).Name = "SearchItem.Content"
args1(7).Value = false
args1(8).Name = "SearchItem.AsianOptions"
args1(8).Value = false
args1(9).Name = "SearchItem.AlgorithmType"
args1(9).Value = 1
args1(10).Name = "SearchItem.SearchFlags"
args1(10).Value = 65536
args1(11).Name = "SearchItem.SearchString"
args1(11).Value = "0$"
args1(12).Name = "SearchItem.ReplaceString"
args1(12).Value = "0 "
args1(13).Name = "SearchItem.Locale"
args1(13).Value = 255
args1(14).Name = "SearchItem.ChangedChars"
args1(14).Value = 2
args1(15).Name = "SearchItem.DeletedChars"
args1(15).Value = 2
args1(16).Name = "SearchItem.InsertedChars"
args1(16).Value = 2
args1(17).Name = "SearchItem.TransliterateFlags"
args1(17).Value = 1073743104
args1(18).Name = "SearchItem.Command"
args1(18).Value = 3
args1(19).Name = "SearchItem.SearchFormatted"
args1(19).Value = false
args1(20).Name = "SearchItem.AlgorithmType2"
args1(20).Value = 2
args1(21).Name = "Quiet"
args1(21).Value = true
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:ExecuteSearch", "", 0, args1())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args2(21) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args2(0).Name = "SearchItem.StyleFamily"
args2(0).Value = 2
args2(1).Name = "SearchItem.CellType"
args2(1).Value = 0
args2(2).Name = "SearchItem.RowDirection"
args2(2).Value = true
args2(3).Name = "SearchItem.AllTables"
args2(3).Value = false
args2(4).Name = "SearchItem.SearchFiltered"
args2(4).Value = false
args2(5).Name = "SearchItem.Backward"
args2(5).Value = false
args2(6).Name = "SearchItem.Pattern"
args2(6).Value = false
args2(7).Name = "SearchItem.Content"
args2(7).Value = false
args2(8).Name = "SearchItem.AsianOptions"
args2(8).Value = false
args2(9).Name = "SearchItem.AlgorithmType"
args2(9).Value = 1
args2(10).Name = "SearchItem.SearchFlags"
args2(10).Value = 65536
args2(11).Name = "SearchItem.SearchString"
args2(11).Value = "1$"
args2(12).Name = "SearchItem.ReplaceString"
args2(12).Value = "1 "
args2(13).Name = "SearchItem.Locale"
args2(13).Value = 255
args2(14).Name = "SearchItem.ChangedChars"
args2(14).Value = 2
args2(15).Name = "SearchItem.DeletedChars"
args2(15).Value = 2
args2(16).Name = "SearchItem.InsertedChars"
args2(16).Value = 2
args2(17).Name = "SearchItem.TransliterateFlags"
args2(17).Value = 1073743104
args2(18).Name = "SearchItem.Command"
args2(18).Value = 3
args2(19).Name = "SearchItem.SearchFormatted"
args2(19).Value = false
args2(20).Name = "SearchItem.AlgorithmType2"
args2(20).Value = 2
args2(21).Name = "Quiet"
args2(21).Value = true
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:ExecuteSearch", "", 0, args2())
rem---- répéter args3(..) jusqu'à args9(..)
rem---- args3(11).Value = "2$" jusqu'à args9(11).Value = "8$"
rem---- args3(12).Value = "2 " jusqu'à args9(12).Value = "8 "
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args10(21) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args10(0).Name = "SearchItem.StyleFamily"
args10(0).Value = 2
args10(1).Name = "SearchItem.CellType"
args10(1).Value = 0
args10(2).Name = "SearchItem.RowDirection"
args10(2).Value = true
args10(3).Name = "SearchItem.AllTables"
args10(3).Value = false
args10(4).Name = "SearchItem.SearchFiltered"
args10(4).Value = false
args10(5).Name = "SearchItem.Backward"
args10(5).Value = false
args10(6).Name = "SearchItem.Pattern"
args10(6).Value = false
args10(7).Name = "SearchItem.Content"
args10(7).Value = false
args10(8).Name = "SearchItem.AsianOptions"
args10(8).Value = false
args10(9).Name = "SearchItem.AlgorithmType"
args10(9).Value = 1
args10(10).Name = "SearchItem.SearchFlags"
args10(10).Value = 65536
args10(11).Name = "SearchItem.SearchString"
args10(11).Value = "9$"
args10(12).Name = "SearchItem.ReplaceString"
args10(12).Value = "9 "
args10(13).Name = "SearchItem.Locale"
args10(13).Value = 255
args10(14).Name = "SearchItem.ChangedChars"
args10(14).Value = 2
args10(15).Name = "SearchItem.DeletedChars"
args10(15).Value = 2
args10(16).Name = "SearchItem.InsertedChars"
args10(16).Value = 2
args10(17).Name = "SearchItem.TransliterateFlags"
args10(17).Value = 1073743104
args10(18).Name = "SearchItem.Command"
args10(18).Value = 3
args10(19).Name = "SearchItem.SearchFormatted"
args10(19).Value = false
args10(20).Name = "SearchItem.AlgorithmType2"
args10(20).Value = 2
args10(21).Name = "Quiet"
args10(21).Value = true
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:ExecuteSearch", "", 0, args10())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args11(21) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args11(0).Name = "SearchItem.StyleFamily"
args11(0).Value = 2
args11(1).Name = "SearchItem.CellType"
args11(1).Value = 0
args11(2).Name = "SearchItem.RowDirection"
args11(2).Value = true
args11(3).Name = "SearchItem.AllTables"
args11(3).Value = false
args11(4).Name = "SearchItem.SearchFiltered"
args11(4).Value = false
args11(5).Name = "SearchItem.Backward"
args11(5).Value = false
args11(6).Name = "SearchItem.Pattern"
args11(6).Value = false
args11(7).Name = "SearchItem.Content"
args11(7).Value = false
args11(8).Name = "SearchItem.AsianOptions"
args11(8).Value = false
args11(9).Name = "SearchItem.AlgorithmType"
args11(9).Value = 1
args11(10).Name = "SearchItem.SearchFlags"
args11(10).Value = 65536
args11(11).Name = "SearchItem.SearchString"
args11(11).Value = "$"
args11(12).Name = "SearchItem.ReplaceString"
args11(12).Value = ""
args11(13).Name = "SearchItem.Locale"
args11(13).Value = 255
args11(14).Name = "SearchItem.ChangedChars"
args11(14).Value = 2
args11(15).Name = "SearchItem.DeletedChars"
args11(15).Value = 2
args11(16).Name = "SearchItem.InsertedChars"
args11(16).Value = 2
args11(17).Name = "SearchItem.TransliterateFlags"
args11(17).Value = 1073743104
args11(18).Name = "SearchItem.Command"
args11(18).Value = 3
args11(19).Name = "SearchItem.SearchFormatted"
args11(19).Value = false
args11(20).Name = "SearchItem.AlgorithmType2"
args11(20).Value = 2
args11(21).Name = "Quiet"
args11(21).Value = true
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:ExecuteSearch", "", 0, args11())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args12(21) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args12(0).Name = "SearchItem.StyleFamily"
args12(0).Value = 2
args12(1).Name = "SearchItem.CellType"
args12(1).Value = 0
args12(2).Name = "SearchItem.RowDirection"
args12(2).Value = true
args12(3).Name = "SearchItem.AllTables"
args12(3).Value = false
args12(4).Name = "SearchItem.SearchFiltered"
args12(4).Value = false
args12(5).Name = "SearchItem.Backward"
args12(5).Value = false
args12(6).Name = "SearchItem.Pattern"
args12(6).Value = false
args12(7).Name = "SearchItem.Content"
args12(7).Value = false
args12(8).Name = "SearchItem.AsianOptions"
args12(8).Value = false
args12(9).Name = "SearchItem.AlgorithmType"
args12(9).Value = 1
args12(10).Name = "SearchItem.SearchFlags"
args12(10).Value = 65536
args12(11).Name = "SearchItem.SearchString"
args12(11).Value = ">"
args12(12).Name = "SearchItem.ReplaceString"
args12(12).Value = "\n"
args12(13).Name = "SearchItem.Locale"
args12(13).Value = 255
args12(14).Name = "SearchItem.ChangedChars"
args12(14).Value = 2
args12(15).Name = "SearchItem.DeletedChars"
args12(15).Value = 2
args12(16).Name = "SearchItem.InsertedChars"
args12(16).Value = 2
args12(17).Name = "SearchItem.TransliterateFlags"
args12(17).Value = 1073743104
args12(18).Name = "SearchItem.Command"
args12(18).Value = 3
args12(19).Name = "SearchItem.SearchFormatted"
args12(19).Value = false
args12(20).Name = "SearchItem.AlgorithmType2"
args12(20).Value = 2
args12(21).Name = "Quiet"
args12(21).Value = true
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:ExecuteSearch", "", 0, args12())
end sub
CopieM
[modifier | modifier le wikicode]sub copieM
rem ----------------------------------------------------------------------
rem define variables
dim document as object
dim dispatcher as object
rem ----------------------------------------------------------------------
rem get access to the document
document = ThisComponent.CurrentController.Frame
dispatcher = createUnoService("com.sun.star.frame.DispatchHelper")
rem -------Placer le tableau avec la 1ère cellule sous aaa en $H$85-----------
dim args1(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args1(0).Name = "ToPoint"
args1(0).Value = "$H$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args1())
rem ------------Mettre à jour $H$168 pour le nombre de génomes---------------
dim args2(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args2(0).Name = "ToPoint"
args2(0).Value = "$H$85:$H$168"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args2())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Copy", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args4(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args4(0).Name = "ToPoint"
args4(0).Value = "$J$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args4())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args6(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$L$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args8(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$N$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args10(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$P$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args12(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$R$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args14(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$T$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args16(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$V$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args18(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$X$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args20(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Z$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args22(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$AB$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args24(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$AD$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args26(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$AF$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args28(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$AH$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args30(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$AJ$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args32(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$AL$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args34(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$AN$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
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args6(0).Name = "ToPoint"
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args6(0).Name = "ToPoint"
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args6(0).Name = "ToPoint"
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args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$CB$85"
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rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args76(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$CD$85"
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rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args78(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$CF$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args80(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$CH$85"
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rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args82(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$CJ$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args84(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$CL$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args86(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$CN$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args88(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$CP$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args90(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$CR$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args92(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$CT$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args94(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$CV$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args96(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$CX$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args98(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$CZ$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args100(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$DB$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args102(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$DD$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args104(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$DF$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args106(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$DH$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args108(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$DJ$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args110(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$DL$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args112(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$DN$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args114(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$DP$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args116(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$DR$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args118(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$DT$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args120(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$DV$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args122(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$DX$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args124(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$DZ$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args126(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$EB$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args128(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$ED$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args130(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$EF$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
end sub
CopieM2
[modifier | modifier le wikicode]sub copieM2
rem ----------------------------------------------------------------------
rem define variables
dim document as object
dim dispatcher as object
rem ----------------------------------------------------------------------
rem get access to the document
document = ThisComponent.CurrentController.Frame
dispatcher = createUnoService("com.sun.star.frame.DispatchHelper")
rem --------$G$85 doit correspondre à la cellule sous double du codon aaa--------
dim args1(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args1(0).Name = "ToPoint"
args1(0).Value = "$G$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args1())
rem ----------Mettre à jour $H$165 pour le nombre de génomes-----------------
dim args2(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args2(0).Name = "ToPoint"
args2(0).Value = "$G$85:$H$165"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args2())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Copy", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args4(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args4(0).Name = "ToPoint"
args4(0).Value = "$i$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args4())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args6(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$k$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args8(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$m$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args10(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$o$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args12(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$q$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args14(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$s$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args16(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$u$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args18(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$w$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args20(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$y$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args22(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Aa$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args24(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Ac$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args26(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Ae$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args28(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Ag$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args30(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Ai$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args32(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Ak$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args34(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Am$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args36(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Ao$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args38(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Aq$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args40(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$As$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args42(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Au$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args44(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Aw$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args46(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Ay$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args48(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Ba$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args50(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Bc$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args52(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Be$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args54(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Bg$85"
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rem ----------------------------------------------------------------------
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rem ----------------------------------------------------------------------
dim args56(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Bi$85"
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rem ----------------------------------------------------------------------
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rem ----------------------------------------------------------------------
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rem ----------------------------------------------------------------------
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dim args84(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
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dim args86(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
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rem ----------------------------------------------------------------------
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dim args88(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
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rem ----------------------------------------------------------------------
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rem ----------------------------------------------------------------------
dim args90(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
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rem ----------------------------------------------------------------------
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dim args92(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Cs$85"
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rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args94(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Cu$85"
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rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args96(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Cw$85"
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rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args98(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Cy$85"
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rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args100(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Da$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args102(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Dc$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args104(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$De$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args106(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Dg$85"
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rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args108(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Di$85"
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rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args110(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Dk$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args112(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Dm$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args114(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Do$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args116(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Dq$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args118(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Ds$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args120(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Du$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args122(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Dw$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args124(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Dy$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args126(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Ea$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args128(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "ToPoint"
args6(0).Value = "$Ec$85"
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:GoToCell", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Paste", "", 0, Array())
end sub
Macros writer
[modifier | modifier le wikicode]carre
[modifier | modifier le wikicode]sub carre
rem ----- Exécuter dans un .odt
rem---- Copier les remplacements à faire suivant, en début de page:
rem---- bgcolor="#66ffff"| *
rem---- bgcolor="#ff9900"| $
rem---- bgcolor="#ffcc00"| §
rem---- bgcolor="#ffff99"| ?
rem---- style="border:1px double blue" @
rem ----------------------------------------------------------------------
rem---- expression non régulière:
rem---- argsx(9).Value = 0
rem---- argsx(20).Value = 1
rem---- argsx(11).Value = "ù"
rem---- argsx(12).Value = "<u>" ou bien
rem---- argsx(11).Value = "*"
rem---- argsx(12).Value = "bgcolor="+CHR$(34)+"#66ffff"+CHR$(34)+"|" ou bien
rem---- argsx(11).Value = "°"
rem---- argsx(12).Value = "style="+CHR$(34)+"color: #ffffff;"+CHR$(34)+" "
rem ----------------------------------------------------------------------
rem---- expression régulière: \t et \n|-\n|
rem---- argsx(9).Value = 1
rem---- argsx(20).Value = 2
rem---- argsx(11).Value = "\t"
rem---- argsx(12).Value = "||"
rem ----------------------------------------------------------------------
rem define variables
dim document as object
dim dispatcher as object
rem ----------------------------------------------------------------------
rem get access to the document
document = ThisComponent.CurrentController.Frame
dispatcher = createUnoService("com.sun.star.frame.DispatchHelper")
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args1(21) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args1(0).Name = "SearchItem.StyleFamily"
args1(0).Value = 2
args1(1).Name = "SearchItem.CellType"
args1(1).Value = 0
args1(2).Name = "SearchItem.RowDirection"
args1(2).Value = true
args1(3).Name = "SearchItem.AllTables"
args1(3).Value = false
args1(4).Name = "SearchItem.SearchFiltered"
args1(4).Value = false
args1(5).Name = "SearchItem.Backward"
args1(5).Value = false
args1(6).Name = "SearchItem.Pattern"
args1(6).Value = false
args1(7).Name = "SearchItem.Content"
args1(7).Value = false
args1(8).Name = "SearchItem.AsianOptions"
args1(8).Value = false
args1(9).Name = "SearchItem.AlgorithmType"
args1(9).Value = 1
args1(10).Name = "SearchItem.SearchFlags"
args1(10).Value = 65536
args1(11).Name = "SearchItem.SearchString"
args1(11).Value = "\t"
args1(12).Name = "SearchItem.ReplaceString"
args1(12).Value = "||"
args1(13).Name = "SearchItem.Locale"
args1(13).Value = 255
args1(14).Name = "SearchItem.ChangedChars"
args1(14).Value = 2
args1(15).Name = "SearchItem.DeletedChars"
args1(15).Value = 2
args1(16).Name = "SearchItem.InsertedChars"
args1(16).Value = 2
args1(17).Name = "SearchItem.TransliterateFlags"
args1(17).Value = 1073743104
args1(18).Name = "SearchItem.Command"
args1(18).Value = 3
args1(19).Name = "SearchItem.SearchFormatted"
args1(19).Value = false
args1(20).Name = "SearchItem.AlgorithmType2"
args1(20).Value = 2
args1(21).Name = "Quiet"
args1(21).Value = true
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:ExecuteSearch", "", 0, args1())
rem ----------------------------------------------------------------------
rem dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:ExecuteSearch", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args3(21) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args3(0).Name = "SearchItem.StyleFamily"
args3(0).Value = 2
args3(1).Name = "SearchItem.CellType"
args3(1).Value = 0
args3(2).Name = "SearchItem.RowDirection"
args3(2).Value = true
args3(3).Name = "SearchItem.AllTables"
args3(3).Value = false
args3(4).Name = "SearchItem.SearchFiltered"
args3(4).Value = false
args3(5).Name = "SearchItem.Backward"
args3(5).Value = false
args3(6).Name = "SearchItem.Pattern"
args3(6).Value = false
args3(7).Name = "SearchItem.Content"
args3(7).Value = false
args3(8).Name = "SearchItem.AsianOptions"
args3(8).Value = false
args3(9).Name = "SearchItem.AlgorithmType"
args3(9).Value = 1
args3(10).Name = "SearchItem.SearchFlags"
args3(10).Value = 65536
args3(11).Name = "SearchItem.SearchString"
args3(11).Value = "$"
args3(12).Name = "SearchItem.ReplaceString"
args3(12).Value = "\n|-\n|"
args3(13).Name = "SearchItem.Locale"
args3(13).Value = 255
args3(14).Name = "SearchItem.ChangedChars"
args3(14).Value = 2
args3(15).Name = "SearchItem.DeletedChars"
args3(15).Value = 2
args3(16).Name = "SearchItem.InsertedChars"
args3(16).Value = 2
args3(17).Name = "SearchItem.TransliterateFlags"
args3(17).Value = 1073743104
args3(18).Name = "SearchItem.Command"
args3(18).Value = 3
args3(19).Name = "SearchItem.SearchFormatted"
args3(19).Value = false
args3(20).Name = "SearchItem.AlgorithmType2"
args3(20).Value = 2
args3(21).Name = "Quiet"
args3(21).Value = true
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:ExecuteSearch", "", 0, args3())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Copy", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args5(21) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args5(0).Name = "SearchItem.StyleFamily"
args5(0).Value = 2
args5(1).Name = "SearchItem.CellType"
args5(1).Value = 0
args5(2).Name = "SearchItem.RowDirection"
args5(2).Value = true
args5(3).Name = "SearchItem.AllTables"
args5(3).Value = false
args5(4).Name = "SearchItem.SearchFiltered"
args5(4).Value = false
args5(5).Name = "SearchItem.Backward"
args5(5).Value = false
args5(6).Name = "SearchItem.Pattern"
args5(6).Value = false
args5(7).Name = "SearchItem.Content"
args5(7).Value = false
args5(8).Name = "SearchItem.AsianOptions"
args5(8).Value = false
args5(9).Name = "SearchItem.AlgorithmType"
args5(9).Value = 0
args5(10).Name = "SearchItem.SearchFlags"
args5(10).Value = 65536
args5(11).Name = "SearchItem.SearchString"
args5(11).Value = "*"
args5(12).Name = "SearchItem.ReplaceString"
args5(12).Value = "bgcolor="+CHR$(34)+"#66ffff"+CHR$(34)+"|"
args5(13).Name = "SearchItem.Locale"
args5(13).Value = 255
args5(14).Name = "SearchItem.ChangedChars"
args5(14).Value = 2
args5(15).Name = "SearchItem.DeletedChars"
args5(15).Value = 2
args5(16).Name = "SearchItem.InsertedChars"
args5(16).Value = 2
args5(17).Name = "SearchItem.TransliterateFlags"
args5(17).Value = 1073743104
args5(18).Name = "SearchItem.Command"
args5(18).Value = 3
args5(19).Name = "SearchItem.SearchFormatted"
args5(19).Value = false
args5(20).Name = "SearchItem.AlgorithmType2"
args5(20).Value = 1
args5(21).Name = "Quiet"
args5(21).Value = true
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:ExecuteSearch", "", 0, args5())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Copy", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args7(21) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args7(0).Name = "SearchItem.StyleFamily"
args7(0).Value = 2
args7(1).Name = "SearchItem.CellType"
args7(1).Value = 0
args7(2).Name = "SearchItem.RowDirection"
args7(2).Value = true
args7(3).Name = "SearchItem.AllTables"
args7(3).Value = false
args7(4).Name = "SearchItem.SearchFiltered"
args7(4).Value = false
args7(5).Name = "SearchItem.Backward"
args7(5).Value = false
args7(6).Name = "SearchItem.Pattern"
args7(6).Value = false
args7(7).Name = "SearchItem.Content"
args7(7).Value = false
args7(8).Name = "SearchItem.AsianOptions"
args7(8).Value = false
args7(9).Name = "SearchItem.AlgorithmType"
args7(9).Value = 0
args7(10).Name = "SearchItem.SearchFlags"
args7(10).Value = 65536
args7(11).Name = "SearchItem.SearchString"
args7(11).Value = "$"
args7(12).Name = "SearchItem.ReplaceString"
args7(12).Value = "bgcolor="+CHR$(34)+"#ff9900"+CHR$(34)+"|"
args7(13).Name = "SearchItem.Locale"
args7(13).Value = 255
args7(14).Name = "SearchItem.ChangedChars"
args7(14).Value = 2
args7(15).Name = "SearchItem.DeletedChars"
args7(15).Value = 2
args7(16).Name = "SearchItem.InsertedChars"
args7(16).Value = 2
args7(17).Name = "SearchItem.TransliterateFlags"
args7(17).Value = 1073743104
args7(18).Name = "SearchItem.Command"
args7(18).Value = 3
args7(19).Name = "SearchItem.SearchFormatted"
args7(19).Value = false
args7(20).Name = "SearchItem.AlgorithmType2"
args7(20).Value = 1
args7(21).Name = "Quiet"
args7(21).Value = true
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:ExecuteSearch", "", 0, args7())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Copy", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args9(21) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args9(0).Name = "SearchItem.StyleFamily"
args9(0).Value = 2
args9(1).Name = "SearchItem.CellType"
args9(1).Value = 0
args9(2).Name = "SearchItem.RowDirection"
args9(2).Value = true
args9(3).Name = "SearchItem.AllTables"
args9(3).Value = false
args9(4).Name = "SearchItem.SearchFiltered"
args9(4).Value = false
args9(5).Name = "SearchItem.Backward"
args9(5).Value = false
args9(6).Name = "SearchItem.Pattern"
args9(6).Value = false
args9(7).Name = "SearchItem.Content"
args9(7).Value = false
args9(8).Name = "SearchItem.AsianOptions"
args9(8).Value = false
args9(9).Name = "SearchItem.AlgorithmType"
args9(9).Value = 0
args9(10).Name = "SearchItem.SearchFlags"
args9(10).Value = 65536
args9(11).Name = "SearchItem.SearchString"
args9(11).Value = "§"
args9(12).Name = "SearchItem.ReplaceString"
args9(12).Value = "bgcolor="+CHR$(34)+"#ffcc00"+CHR$(34)+"|"
args9(13).Name = "SearchItem.Locale"
args9(13).Value = 255
args9(14).Name = "SearchItem.ChangedChars"
args9(14).Value = 2
args9(15).Name = "SearchItem.DeletedChars"
args9(15).Value = 2
args9(16).Name = "SearchItem.InsertedChars"
args9(16).Value = 2
args9(17).Name = "SearchItem.TransliterateFlags"
args9(17).Value = 1073743104
args9(18).Name = "SearchItem.Command"
args9(18).Value = 3
args9(19).Name = "SearchItem.SearchFormatted"
args9(19).Value = false
args9(20).Name = "SearchItem.AlgorithmType2"
args9(20).Value = 1
args9(21).Name = "Quiet"
args9(21).Value = true
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:ExecuteSearch", "", 0, args9())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Copy", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args11(21) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args11(0).Name = "SearchItem.StyleFamily"
args11(0).Value = 2
args11(1).Name = "SearchItem.CellType"
args11(1).Value = 0
args11(2).Name = "SearchItem.RowDirection"
args11(2).Value = true
args11(3).Name = "SearchItem.AllTables"
args11(3).Value = false
args11(4).Name = "SearchItem.SearchFiltered"
args11(4).Value = false
args11(5).Name = "SearchItem.Backward"
args11(5).Value = false
args11(6).Name = "SearchItem.Pattern"
args11(6).Value = false
args11(7).Name = "SearchItem.Content"
args11(7).Value = false
args11(8).Name = "SearchItem.AsianOptions"
args11(8).Value = false
args11(9).Name = "SearchItem.AlgorithmType"
args11(9).Value = 0
args11(10).Name = "SearchItem.SearchFlags"
args11(10).Value = 65536
args11(11).Name = "SearchItem.SearchString"
args11(11).Value = "?"
args11(12).Name = "SearchItem.ReplaceString"
args11(12).Value = "bgcolor="+CHR$(34)+"#ffff99"+CHR$(34)+"|"
args11(13).Name = "SearchItem.Locale"
args11(13).Value = 255
args11(14).Name = "SearchItem.ChangedChars"
args11(14).Value = 2
args11(15).Name = "SearchItem.DeletedChars"
args11(15).Value = 2
args11(16).Name = "SearchItem.InsertedChars"
args11(16).Value = 2
args11(17).Name = "SearchItem.TransliterateFlags"
args11(17).Value = 1073743104
args11(18).Name = "SearchItem.Command"
args11(18).Value = 3
args11(19).Name = "SearchItem.SearchFormatted"
args11(19).Value = false
args11(20).Name = "SearchItem.AlgorithmType2"
args11(20).Value = 1
args11(21).Name = "Quiet"
args11(21).Value = true
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:ExecuteSearch", "", 0, args11())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:SwBackspace", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args13(0) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args13(0).Name = "Text"
args13(0).Value = " "
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:InsertText", "", 0, args13())
rem ----------------------------------------------------------------------
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:Copy", "", 0, Array())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args15(21) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args15(0).Name = "SearchItem.StyleFamily"
args15(0).Value = 2
args15(1).Name = "SearchItem.CellType"
args15(1).Value = 0
args15(2).Name = "SearchItem.RowDirection"
args15(2).Value = true
args15(3).Name = "SearchItem.AllTables"
args15(3).Value = false
args15(4).Name = "SearchItem.SearchFiltered"
args15(4).Value = false
args15(5).Name = "SearchItem.Backward"
args15(5).Value = false
args15(6).Name = "SearchItem.Pattern"
args15(6).Value = false
args15(7).Name = "SearchItem.Content"
args15(7).Value = false
args15(8).Name = "SearchItem.AsianOptions"
args15(8).Value = false
args15(9).Name = "SearchItem.AlgorithmType"
args15(9).Value = 0
args15(10).Name = "SearchItem.SearchFlags"
args15(10).Value = 65536
args15(11).Name = "SearchItem.SearchString"
args15(11).Value = "@"
args15(12).Name = "SearchItem.ReplaceString"
args15(12).Value = "style="+CHR$(34)+"border:1px double blue"+CHR$(34)+" "
args15(13).Name = "SearchItem.Locale"
args15(13).Value = 255
args15(14).Name = "SearchItem.ChangedChars"
args15(14).Value = 2
args15(15).Name = "SearchItem.DeletedChars"
args15(15).Value = 2
args15(16).Name = "SearchItem.InsertedChars"
args15(16).Value = 2
args15(17).Name = "SearchItem.TransliterateFlags"
args15(17).Value = 1073743104
args15(18).Name = "SearchItem.Command"
args15(18).Value = 3
args15(19).Name = "SearchItem.SearchFormatted"
args15(19).Value = false
args15(20).Name = "SearchItem.AlgorithmType2"
args15(20).Value = 1
args15(21).Name = "Quiet"
args15(21).Value = true
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:ExecuteSearch", "", 0, args15())
end sub
carred
[modifier | modifier le wikicode]sub carred
rem ----------------------------------------------------------------------
rem define variables
dim document as object
dim dispatcher as object
rem ----------------------------------------------------------------------
rem get access to the document
document = ThisComponent.CurrentController.Frame
dispatcher = createUnoService("com.sun.star.frame.DispatchHelper")
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args1(21) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args1(0).Name = "SearchItem.StyleFamily"
args1(0).Value = 2
args1(1).Name = "SearchItem.CellType"
args1(1).Value = 0
args1(2).Name = "SearchItem.RowDirection"
args1(2).Value = true
args1(3).Name = "SearchItem.AllTables"
args1(3).Value = false
args1(4).Name = "SearchItem.SearchFiltered"
args1(4).Value = false
args1(5).Name = "SearchItem.Backward"
args1(5).Value = false
args1(6).Name = "SearchItem.Pattern"
args1(6).Value = false
args1(7).Name = "SearchItem.Content"
args1(7).Value = false
args1(8).Name = "SearchItem.AsianOptions"
args1(8).Value = false
args1(9).Name = "SearchItem.AlgorithmType"
args1(9).Value = 1
args1(10).Name = "SearchItem.SearchFlags"
args1(10).Value = 65536
args1(11).Name = "SearchItem.SearchString"
args1(11).Value = "\t"
args1(12).Name = "SearchItem.ReplaceString"
args1(12).Value = "||"
args1(13).Name = "SearchItem.Locale"
args1(13).Value = 255
args1(14).Name = "SearchItem.ChangedChars"
args1(14).Value = 2
args1(15).Name = "SearchItem.DeletedChars"
args1(15).Value = 2
args1(16).Name = "SearchItem.InsertedChars"
args1(16).Value = 2
args1(17).Name = "SearchItem.TransliterateFlags"
args1(17).Value = 1280
args1(18).Name = "SearchItem.Command"
args1(18).Value = 3
args1(19).Name = "SearchItem.SearchFormatted"
args1(19).Value = false
args1(20).Name = "SearchItem.AlgorithmType2"
args1(20).Value = 2
args1(21).Name = "Quiet"
args1(21).Value = true
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:ExecuteSearch", "", 0, args1())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args2(21) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args2(0).Name = "SearchItem.StyleFamily"
args2(0).Value = 2
args2(1).Name = "SearchItem.CellType"
args2(1).Value = 0
args2(2).Name = "SearchItem.RowDirection"
args2(2).Value = true
args2(3).Name = "SearchItem.AllTables"
args2(3).Value = false
args2(4).Name = "SearchItem.SearchFiltered"
args2(4).Value = false
args2(5).Name = "SearchItem.Backward"
args2(5).Value = false
args2(6).Name = "SearchItem.Pattern"
args2(6).Value = false
args2(7).Name = "SearchItem.Content"
args2(7).Value = false
args2(8).Name = "SearchItem.AsianOptions"
args2(8).Value = false
args2(9).Name = "SearchItem.AlgorithmType"
args2(9).Value = 1
args2(10).Name = "SearchItem.SearchFlags"
args2(10).Value = 65536
args2(11).Name = "SearchItem.SearchString"
args2(11).Value = "$"
args2(12).Name = "SearchItem.ReplaceString"
args2(12).Value = "\n|-\n|"
args2(13).Name = "SearchItem.Locale"
args2(13).Value = 255
args2(14).Name = "SearchItem.ChangedChars"
args2(14).Value = 2
args2(15).Name = "SearchItem.DeletedChars"
args2(15).Value = 2
args2(16).Name = "SearchItem.InsertedChars"
args2(16).Value = 2
args2(17).Name = "SearchItem.TransliterateFlags"
args2(17).Value = 1280
args2(18).Name = "SearchItem.Command"
args2(18).Value = 3
args2(19).Name = "SearchItem.SearchFormatted"
args2(19).Value = false
args2(20).Name = "SearchItem.AlgorithmType2"
args2(20).Value = 2
args2(21).Name = "Quiet"
args2(21).Value = true
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:ExecuteSearch", "", 0, args2())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args3(21) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args3(0).Name = "SearchItem.StyleFamily"
args3(0).Value = 2
args3(1).Name = "SearchItem.CellType"
args3(1).Value = 0
args3(2).Name = "SearchItem.RowDirection"
args3(2).Value = true
args3(3).Name = "SearchItem.AllTables"
args3(3).Value = false
args3(4).Name = "SearchItem.SearchFiltered"
args3(4).Value = false
args3(5).Name = "SearchItem.Backward"
args3(5).Value = false
args3(6).Name = "SearchItem.Pattern"
args3(6).Value = false
args3(7).Name = "SearchItem.Content"
args3(7).Value = false
args3(8).Name = "SearchItem.AsianOptions"
args3(8).Value = false
args3(9).Name = "SearchItem.AlgorithmType"
args3(9).Value = 0
args3(10).Name = "SearchItem.SearchFlags"
args3(10).Value = 65536
args3(11).Name = "SearchItem.SearchString"
args3(11).Value = "*"
args3(12).Name = "SearchItem.ReplaceString"
args3(12).Value = "bgcolor="+CHR$(34)+"#66ffff"+CHR$(34)+"|"
args3(13).Name = "SearchItem.Locale"
args3(13).Value = 255
args3(14).Name = "SearchItem.ChangedChars"
args3(14).Value = 2
args3(15).Name = "SearchItem.DeletedChars"
args3(15).Value = 2
args3(16).Name = "SearchItem.InsertedChars"
args3(16).Value = 2
args3(17).Name = "SearchItem.TransliterateFlags"
args3(17).Value = 1280
args3(18).Name = "SearchItem.Command"
args3(18).Value = 3
args3(19).Name = "SearchItem.SearchFormatted"
args3(19).Value = false
args3(20).Name = "SearchItem.AlgorithmType2"
args3(20).Value = 1
args3(21).Name = "Quiet"
args3(21).Value = true
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:ExecuteSearch", "", 0, args3())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args4(21) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args4(0).Name = "SearchItem.StyleFamily"
args4(0).Value = 2
args4(1).Name = "SearchItem.CellType"
args4(1).Value = 0
args4(2).Name = "SearchItem.RowDirection"
args4(2).Value = true
args4(3).Name = "SearchItem.AllTables"
args4(3).Value = false
args4(4).Name = "SearchItem.SearchFiltered"
args4(4).Value = false
args4(5).Name = "SearchItem.Backward"
args4(5).Value = false
args4(6).Name = "SearchItem.Pattern"
args4(6).Value = false
args4(7).Name = "SearchItem.Content"
args4(7).Value = false
args4(8).Name = "SearchItem.AsianOptions"
args4(8).Value = false
args4(9).Name = "SearchItem.AlgorithmType"
args4(9).Value = 0
args4(10).Name = "SearchItem.SearchFlags"
args4(10).Value = 65536
args4(11).Name = "SearchItem.SearchString"
args4(11).Value = "$"
args4(12).Name = "SearchItem.ReplaceString"
args4(12).Value = "bgcolor="+CHR$(34)+"#00ff60"+CHR$(34)+"|"
args4(13).Name = "SearchItem.Locale"
args4(13).Value = 255
args4(14).Name = "SearchItem.ChangedChars"
args4(14).Value = 2
args4(15).Name = "SearchItem.DeletedChars"
args4(15).Value = 2
args4(16).Name = "SearchItem.InsertedChars"
args4(16).Value = 2
args4(17).Name = "SearchItem.TransliterateFlags"
args4(17).Value = 1280
args4(18).Name = "SearchItem.Command"
args4(18).Value = 3
args4(19).Name = "SearchItem.SearchFormatted"
args4(19).Value = false
args4(20).Name = "SearchItem.AlgorithmType2"
args4(20).Value = 1
args4(21).Name = "Quiet"
args4(21).Value = true
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:ExecuteSearch", "", 0, args4())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args5(21) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args5(0).Name = "SearchItem.StyleFamily"
args5(0).Value = 2
args5(1).Name = "SearchItem.CellType"
args5(1).Value = 0
args5(2).Name = "SearchItem.RowDirection"
args5(2).Value = true
args5(3).Name = "SearchItem.AllTables"
args5(3).Value = false
args5(4).Name = "SearchItem.SearchFiltered"
args5(4).Value = false
args5(5).Name = "SearchItem.Backward"
args5(5).Value = false
args5(6).Name = "SearchItem.Pattern"
args5(6).Value = false
args5(7).Name = "SearchItem.Content"
args5(7).Value = false
args5(8).Name = "SearchItem.AsianOptions"
args5(8).Value = false
args5(9).Name = "SearchItem.AlgorithmType"
args5(9).Value = 0
args5(10).Name = "SearchItem.SearchFlags"
args5(10).Value = 65536
args5(11).Name = "SearchItem.SearchString"
args5(11).Value = "§"
args5(12).Name = "SearchItem.ReplaceString"
args5(12).Value = "bgcolor="+CHR$(34)+"#ffcc00"+CHR$(34)+"|"
args5(13).Name = "SearchItem.Locale"
args5(13).Value = 255
args5(14).Name = "SearchItem.ChangedChars"
args5(14).Value = 2
args5(15).Name = "SearchItem.DeletedChars"
args5(15).Value = 2
args5(16).Name = "SearchItem.InsertedChars"
args5(16).Value = 2
args5(17).Name = "SearchItem.TransliterateFlags"
args5(17).Value = 1280
args5(18).Name = "SearchItem.Command"
args5(18).Value = 3
args5(19).Name = "SearchItem.SearchFormatted"
args5(19).Value = false
args5(20).Name = "SearchItem.AlgorithmType2"
args5(20).Value = 1
args5(21).Name = "Quiet"
args5(21).Value = true
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:ExecuteSearch", "", 0, args5())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args6(21) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args6(0).Name = "SearchItem.StyleFamily"
args6(0).Value = 2
args6(1).Name = "SearchItem.CellType"
args6(1).Value = 0
args6(2).Name = "SearchItem.RowDirection"
args6(2).Value = true
args6(3).Name = "SearchItem.AllTables"
args6(3).Value = false
args6(4).Name = "SearchItem.SearchFiltered"
args6(4).Value = false
args6(5).Name = "SearchItem.Backward"
args6(5).Value = false
args6(6).Name = "SearchItem.Pattern"
args6(6).Value = false
args6(7).Name = "SearchItem.Content"
args6(7).Value = false
args6(8).Name = "SearchItem.AsianOptions"
args6(8).Value = false
args6(9).Name = "SearchItem.AlgorithmType"
args6(9).Value = 0
args6(10).Name = "SearchItem.SearchFlags"
args6(10).Value = 65536
args6(11).Name = "SearchItem.SearchString"
args6(11).Value = "?"
args6(12).Name = "SearchItem.ReplaceString"
args6(12).Value = "bgcolor="+CHR$(34)+"#ffff99"+CHR$(34)+"|"
args6(13).Name = "SearchItem.Locale"
args6(13).Value = 255
args6(14).Name = "SearchItem.ChangedChars"
args6(14).Value = 2
args6(15).Name = "SearchItem.DeletedChars"
args6(15).Value = 2
args6(16).Name = "SearchItem.InsertedChars"
args6(16).Value = 2
args6(17).Name = "SearchItem.TransliterateFlags"
args6(17).Value = 1280
args6(18).Name = "SearchItem.Command"
args6(18).Value = 3
args6(19).Name = "SearchItem.SearchFormatted"
args6(19).Value = false
args6(20).Name = "SearchItem.AlgorithmType2"
args6(20).Value = 1
args6(21).Name = "Quiet"
args6(21).Value = true
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:ExecuteSearch", "", 0, args6())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args7(21) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args7(0).Name = "SearchItem.StyleFamily"
args7(0).Value = 2
args7(1).Name = "SearchItem.CellType"
args7(1).Value = 0
args7(2).Name = "SearchItem.RowDirection"
args7(2).Value = true
args7(3).Name = "SearchItem.AllTables"
args7(3).Value = false
args7(4).Name = "SearchItem.SearchFiltered"
args7(4).Value = false
args7(5).Name = "SearchItem.Backward"
args7(5).Value = false
args7(6).Name = "SearchItem.Pattern"
args7(6).Value = false
args7(7).Name = "SearchItem.Content"
args7(7).Value = false
args7(8).Name = "SearchItem.AsianOptions"
args7(8).Value = false
args7(9).Name = "SearchItem.AlgorithmType"
args7(9).Value = 0
args7(10).Name = "SearchItem.SearchFlags"
args7(10).Value = 65536
args7(11).Name = "SearchItem.SearchString"
args7(11).Value = "°"
args7(12).Name = "SearchItem.ReplaceString"
args7(12).Value = "bgcolor="+CHR$(34)+"#00ccff"+CHR$(34)+"|"
args7(13).Name = "SearchItem.Locale"
args7(13).Value = 255
args7(14).Name = "SearchItem.ChangedChars"
args7(14).Value = 2
args7(15).Name = "SearchItem.DeletedChars"
args7(15).Value = 2
args7(16).Name = "SearchItem.InsertedChars"
args7(16).Value = 2
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args7(17).Value = 1280
args7(18).Name = "SearchItem.Command"
args7(18).Value = 3
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args7(19).Value = false
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args7(20).Value = 1
args7(21).Name = "Quiet"
args7(21).Value = true
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:ExecuteSearch", "", 0, args7())
rem ----------------------------------------------------------------------
dim args8(21) as new com.sun.star.beans.PropertyValue
args8(0).Name = "SearchItem.StyleFamily"
args8(0).Value = 2
args8(1).Name = "SearchItem.CellType"
args8(1).Value = 0
args8(2).Name = "SearchItem.RowDirection"
args8(2).Value = true
args8(3).Name = "SearchItem.AllTables"
args8(3).Value = false
args8(4).Name = "SearchItem.SearchFiltered"
args8(4).Value = false
args8(5).Name = "SearchItem.Backward"
args8(5).Value = false
args8(6).Name = "SearchItem.Pattern"
args8(6).Value = false
args8(7).Name = "SearchItem.Content"
args8(7).Value = false
args8(8).Name = "SearchItem.AsianOptions"
args8(8).Value = false
args8(9).Name = "SearchItem.AlgorithmType"
args8(9).Value = 0
args8(10).Name = "SearchItem.SearchFlags"
args8(10).Value = 65536
args8(11).Name = "SearchItem.SearchString"
args8(11).Value = "@"
args8(12).Name = "SearchItem.ReplaceString"
args8(12).Value = "style="+CHR$(34)+"border:1px double blue;"+CHR$(34)+" "
args8(13).Name = "SearchItem.Locale"
args8(13).Value = 255
args8(14).Name = "SearchItem.ChangedChars"
args8(14).Value = 2
args8(15).Name = "SearchItem.DeletedChars"
args8(15).Value = 2
args8(16).Name = "SearchItem.InsertedChars"
args8(16).Value = 2
args8(17).Name = "SearchItem.TransliterateFlags"
args8(17).Value = 1280
args8(18).Name = "SearchItem.Command"
args8(18).Value = 3
args8(19).Name = "SearchItem.SearchFormatted"
args8(19).Value = false
args8(20).Name = "SearchItem.AlgorithmType2"
args8(20).Value = 1
args8(21).Name = "Quiet"
args8(21).Value = true
dispatcher.executeDispatch(document, ".uno:ExecuteSearch", "", 0, args8())
end sub
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