Fichier:Intergen51 fc200 rebond.png

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Projet de recherche: Les clusters de gènes tRNA et rRNA chez les procaryotes. L'étude des intercalaires cds..cds permet de les comparer aux intercalaires cds..RNA et RNA..RNA.

- Les diagrammes de cette image sont construits à partir du tableau de classement des diagrammes des fréquences unitaires (freq1) des intercalaires cds..cds positifs continus de xm à 200 pbs, et présentent le rebond (sup) en fonction de la pente de la tangeante en ce point (a'), de l'abscisse du point d'inflexion (flexa) et du taux de la plage flex (%flex) . Le point d'inflexion est celui du polynome de d°3 du diagramme fc200. Voir la définition du rebond et son calcul détaillés, ainsi que le point d'inflexion et du dela plage flex, dans le cas du génome amed.
- Le titre, en cyan, fc+46-200 fait référence au tableau de classement où le xm (fc+xm-200) de chaque génome est remplacé par 46, minimum local du diagramme fc+1-200 (ref.) de la somme des 58 génomes.
- 1ère ligne des diagrammes. Le rebond (sup) en fonction de la pente (a') de la tangeante au point d'inflexion:
* diagramme du milieu: 58 génomes
* 1er diagramme: 48 génomes
* 3ème diagramme: 9 génomes
- 2ème ligne de diagrammes. Le rebond (sup) en fonction de,
* l'abscisse du point d'inflexion flexa: 58 génomes
* la somme des fréquences de xm à flexa, %flex: les 5 génomes avec étiquette sont exclus de la courbe de tendance des 53 génomes restant. Cette courbe est une droite d'équation f(x)=0,384x-25,6 et de coefficient R2=0.759
* l'effectif total des intercalaires cds-cds positifs continus, effect: les 15 génomes en petits points sont exclus de la courbe de tendance des 42 génomes en gros points. Cette courbe est une droite d'équation f(x)=-0,019x+126,7 et de coefficient R2=0.404
- 3ème ligne de diagrammes. Diagrammes en fonction d'effect, total de la somme des intercalaires cds-cds positifs continus (les génomes en petits points sont exclus de la courbe de tendance de plus de 40 génomes en gros points):
* entre les abscisses 1 et "xm-1" (%1): 43 génomes f(x)=-0,043x+449,8 et de coefficient R2=0,322
* entre xm et flexa (%flex): 40 génomes f(x)=-0,047x+412,5 et de coefficient R2=0,408
* au-delà de l'abscisse flexa (%rest): 42 génomes f(x)=0,047x+256,1 et de coefficient R2=0,428
- Les diagrammes fc+xm-200 des génomes indiqués dans les diagrammes se trouvent dans les images regroupées en clade:
abq abqp absp aua pub rpm dans alpha
amed ant vha1 vha2 vpb1 vpb2 dans gamma bde
ase ase ban blo bsu ksk lam lbu pmq ppmp sam dans bacilli actino
cbc cbei cbn hmo mba mfe mfi psor dans clostridia archeo
abra afn fps npu pmg rpl rtb scc dans bcts afn rpl rtb.
Date 04.07.23
Source Travail personnel
Auteur Mekkiwik

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15 juillet 2023 à 08:45Vignette pour la version du 15 juillet 2023 à 08:451 672 × 963 (275 kio)Mekkiwiksuppression des diagrammes supfx, ajout des diagrammes %1 %flex %rest
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4 juillet 2023 à 12:50Vignette pour la version du 4 juillet 2023 à 12:501 246 × 730 (187 kio)Mekkiwik{{Information |Description=Les clusters de gènes tRNA et rRNA chez les procaryotes. L'étude des intercalaires cds..cds permet de les comparer aux intercalaires cds..RNA et RNA..RNA. : - Les diagrammes de cette image sont construits à partir du [[v:fr:Recherche:Les_clusters_de_gènes_tRNA_et_rRNA_chez_les_procaryotes/Annexe/génomes_synthèse#Intergen51._Classement_des_courbes_CDS-CDS_positifs_continus_fc200|'''tableau de...

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