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Altération des aliments
Il existe de nombreuses espèces différentes de microorganismes dans notre environnement (bactérie, champignon, virus). Ils colonisent nos aliments dont ils se nourrissent. Ils peuvent alors se multiplier si les conditions leurs sont favorables (disponibilité en eau, présence ou non de dioxygène, pH, température). Tous les microorganismes n'ont pas les mêmes exigences, certaines bactéries ont besoin de dioxygène pour vivre:aérobies. Pour d'autres, au contraire, le O² est toxiques : anaérobies. Certains microorganismes transforment nos aliment et modifient ainsi leurs qualités gustatives. Il existe des microorganismes toxiques pour l'homme, soit directement soit par l'intermédiaire de substances qu'ils fabriquent lorsqu'ils se multiplient (toxines bactériennes). Si on les ingère en quantité trop importante, ils peuvent être à l'origine de troubles bénins ou plus graves.
Conservation des aliments
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