Recherche:Corrélation entre les gènes de tRNAs des 3 domaines/Annexe/Tableur
Apparence
Paris le 01.04.19
Introduction
[modifier | modifier le wikicode]Tableau des effectifs des gènes de tRNAs
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Tableau des effectifs des gènes de tRNAs
- Légende: Décompte des gènes tRNAs par codon suivant la base de données gtRNAdb [1].
- 5 : nombre de tRNAs d'un codon se terminant par t. Ce sont les plus faibles.
- 113 : nombre de tRNAs d'un codon se terminant par t: Changement de t en c chez les archées et de c en t chez les eucaryotes.
- 4 366: Effectif élevé de tRNAs d'un codon se terminant par g chez les procaryotes.
- 2622: Effectif faible de tRNAs supérieurs à t et à c .
- 160: Changement de codon g Chez les archées et les eucaryotes.
- Tableaux:
- Nombre de tRNAs, tableaux I II III, décompte de la base gtRNAdb.
- Pour 100 000 tRNAs, tableaux I100 II100 III100, décomptes rapportés à 100 000 tRNAs pour comparaison.
- tRNAs pour 1 génome, tableaux I1 II1 III1, indice de la multiplicité = nombre de tRNAs / nombre des génomes du domaine.
- Tableaux non formatés:
- - Nombres de tRNAs
I;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;;;;II;Nombres de tRNAs. 184 archées;;;;;;;;III;Nombres de tRNAs. 155 eucaryotes;;;;;; ttt;10;tct;5;tat;4;tgt;3;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;66;tct;1 863;tat;155;tgt;233 c;6105;c;4520;c;6420;c;4473;;c;215;c;190;c;190;c;299;;c;1 933;c;113;c;2 216;c;2 755 a;4749;a;5299;a;−;a;1315;;a;191;a;184;a;-;a;18;;a;890;a;1 041;a;-;a;279 g;3999;g;2622;g;−;g;4366;;g;163;g;152;g;-;g;184;;g;1 249;g;749;g;-;g;1 982 ctt;369;cct;10;cat;4;cgt;7478;;ctt;1;cct;0;cat;0;cgt;2;;ctt;1 576;cct;1 638;cat;47;cgt;1 587 c;3849;c;2742;c;4715;c;333;;c;214;c;171;c;185;c;187;;c;37;c;34;c;1 879;c;57 a;4940;a;5453;a;6388;a;887;;a;185;a;184;a;196;a;185;;a;872;a;1 641;a;2 289;a;2 337 g;5186;g;2183;g;2389;g;3355;;g;160;g;151;g;165;g;139;;g;1 296;g;735;g;1 849;g;522 att;5;act;103;aat;5;agt;1;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;2 428;act;2 201;aat;149;agt;53 c;9 203;c;4513;c;8 764;c;4422;;c;212;c;189;c;214;c;187;;c;99;c;154;c;3 524;c;1 895 a;55;a;5878;a;9 105;a;4804;;a;2;a;198;a;197;a;186;;a;851;a;1 494;a;2 640;a;1 762 g;18 026;g;2760;g;2427;g;3452;;g;589;g;169;g;166;g;165;;g;3 862;g;833;g;6 064;g;1 285 gtt;9;gct;2;gat;0;ggt;1;;gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;1;;gtt;2 101;gct;2 962;gat;100;ggt;132 c;4430;c;4166;c;9 023;c;9 273;;c;212;c;184;c;218;c;243;;c;109;c;405;c;2 799;c;3 279 a;8 859;a;10 185;a;9 679;a;5515;;a;186;a;256;a;230;a;189;;a;1 088;a;7 639;a;7 079;a;5 538 g;1313;g;1224;g;1388;g;2266;;g;170;g;159;g;160;g;155;;g;3 123;g;4 737;g;3 754;g;7 052
- - Pour 100 000 tRNAs
I 100;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;;235027;;II 100;Nombres de tRNAs. 184 archées;;;;;;8749;;III 100;Nombres de tRNAs. 155 eucaryotes;;;;;;115111 ttt;4;tct;2;tat;2;tgt;1;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;57;tct;1,618;tat;135;tgt;202 c;2,598;c;1,923;c;2,732;c;1,903;;c;2,457;c;2,172;c;2,172;c;3,418;;c;1,679;c;98;c;1,925;c;2,393 a;2,021;a;2,255;a;−;a;560;;a;2,183;a;2,103;a;-;a;206;;a;773;a;904;a;-;a;242 g;1,702;g;1,116;g;−;g;1,858;;g;1,863;g;1,737;g;-;g;2,103;;g;1,085;g;651;g;-;g;1,722 ctt;157;cct;4;cat;2;cgt;3,182;;ctt;11;cct;0;cat;0;cgt;23;;ctt;1,369;cct;1,423;cat;41;cgt;1,379 c;1,638;c;1,167;c;2,006;c;142;;c;2,446;c;1,955;c;2,115;c;2,137;;c;32;c;30;c;1,632;c;50 a;2,102;a;2,320;a;2,718;a;377;;a;2,115;a;2,103;a;2,240;a;2,115;;a;758;a;1,426;a;1,989;a;2,030 g;2,207;g;929;g;1,016;g;1,427;;g;1,829;g;1,726;g;1,886;g;1,589;;g;1,126;g;639;g;1,606;g;453 att;2;act;44;aat;2;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;2,109;act;1,912;aat;129;agt;46 c;3,916;c;1,920;c;3,729;c;1,881;;c;2,423;c;2,160;c;2,446;c;2,137;;c;86;c;134;c;3,061;c;1,646 a;23;a;2,501;a;3,874;a;2,044;;a;23;a;2,263;a;2,252;a;2,126;;a;739;a;1,298;a;2,293;a;1,531 g;7,670;g;1,174;g;1,033;g;1,469;;g;6,732;g;1,932;g;1,897;g;1,886;;g;3,355;g;724;g;5,268;g;1,116 gtt;4;gct;1;gat;0;ggt;0;;gtt;11;gct;0;gat;0;ggt;11;;gtt;1,825;gct;2,573;gat;87;ggt;115 c;1,885;c;1,773;c;3,839;c;3,946;;c;2,423;c;2,103;c;2,492;c;2,777;;c;95;c;352;c;2,432;c;2,849 a;3,769;a;4,334;a;4,118;a;2,347;;a;2,126;a;2,926;a;2,629;a;2,160;;a;945;a;6,636;a;6,150;a;4,811 g;559;g;521;g;591;g;964;;g;1,943;g;1,817;g;1,829;g;1,772;;g;2,713;g;4,115;g;3,261;g;6,126
- - tRNAs pour 1 génome
I 1;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;;;;II 1;Nombres de tRNAs. 184 archées;;;;;;;;III 1;Nombres de tRNAs. 155 eucaryotes;;;;;; ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0,4;tct;12,0;tat;1,0;tgt;1,5 c;1,51;c;1,12;c;1,59;c;1,11;;c;1,17;c;1,03;c;1,03;c;1,63;;c;12,5;c;0,7;c;14,3;c;17,8 a;1,18;a;1,31;a;-;a;0,33;;a;1,04;a;1,00;a;-;a;0,10;;a;5,7;a;6,7;a;-;a;1,8 g;0,99;g;0,65;g;-;g;1,08;;g;0,89;g;0,83;g;-;g;1,00;;g;8,1;g;4,8;g;-;g;12,8 ctt;0,09;cct;0;cat;0;cgt;1,85;;ctt;0,01;cct;0;cat;0;cgt;0,01;;ctt;10,2;cct;10,6;cat;0,3;cgt;10,2 c;0,95;c;0,68;c;1,17;c;0,08;;c;1,16;c;0,93;c;1,01;c;1,02;;c;0,2;c;0,2;c;12,1;c;0,4 a;1,23;a;1,35;a;1,58;a;0,22;;a;1,01;a;1,00;a;1,07;a;1,01;;a;5,6;a;10,6;a;14,8;a;15,1 g;1,29;g;0,54;g;0,59;g;0,83;;g;0,87;g;0,82;g;0,90;g;0,76;;g;8,4;g;4,7;g;11,9;g;3,4 att;0;act;0,03;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;15,7;act;14,2;aat;1,0;agt;0,3 c;2,28;c;1,12;c;2,17;c;1,10;;c;1,15;c;1,03;c;1,16;c;1,02;;c;0,6;c;1,0;c;22,7;c;12,2 a;0,01;a;1,46;a;2,26;a;1,19;;a;0,01;a;1,08;a;1,07;a;1,01;;a;5,5;a;9,6;a;17,0;a;11,4 g;4,47;g;0,68;g;0,60;g;0,86;;g;3,20;g;0,92;g;0,90;g;0,90;;g;24,9;g;5,4;g;39,1;g;8,3 gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;0,01;gct;0;gat;0;ggt;0,01;;gtt;13,6;gct;19,1;gat;0,6;ggt;0,9 c;1,10;c;1,03;c;2,24;c;2,30;;c;1,15;c;1,00;c;1,18;c;1,32;;c;0,7;c;2,6;c;18,1;c;21,2 a;2,20;a;2,53;a;2,40;a;1,37;;a;1,01;a;1,39;a;1,25;a;1,03;;a;7,0;a;49,3;a;45,7;a;35,7 g;0,33;g;0,30;g;0,34;g;0,56;;g;0,92;g;0,86;g;0,87;g;0,84;;g;20,1;g;30,6;g;24,2;g;45,5
Ordre des codons pour 100 000 tRNAs
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Ordre des codons pour 100 000 tRNAs
- Légende: B bactéries, A archées, E eucaryotes.
- gac: Chez les bactéries le codon se terminant par g n'est pas dernier.
- cag: changement chez les archées par rapport aux bactéries.
- tag: chez les eucaryotes le codon se terminant par g est dernier.
- cag: différence très faible mais toujours non nulle.
- Tableau non formaté
- - Ordre des codons
B;t;c;a;g t;cag;acg;−;cga c;gac;acg;acg;tga a;−;acg;acg;acg g;acg;acg;acg;cag ;;;; A;t;c;a;g t;cag;cag;−;cga c;cag;acg;acg;cag a;−;acg;cag;cag g;cag;acg;acg;cag ;;;; E;t;c;a;g t;cga;tag;−;cga c;tga;atg;acg;atg a;−;tag;gca;cag g;gta;agt;agc;gac
Moyennes et variances pour 100 000 tRNAs des codons
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Moyennes et variances pour 100 000 tRNAs des codons
- Légende:
- Moyenne et écart type sont faits sur les carrés, sauf certains carrés.
- % :rapport de l'écart type par la moyenne en pourcent.
- moyenne par génome: celle du codon pour calculer l'indice de multiplicité. Elle est égale à dom*moyenne/100 000, dom étant le nombre de tRNAs par domaine, 8 731 pour les archées, 119 380 pour les eucaryotes et 239 000 pour les bactéries. Voir les statistiques de la base de données.
- multiplicité moyenne: rapport "moyenne par génome" du codon divisé par le nombre d'espèces du domaine de la base de données, 184 pour les archées, 155 pour les eucaryotes et 4 032 pour les bactéries.
- Tableau non formaté
- - Moyennes sur 100 000 tRNAs
;moyenne;ecart;%;carrés;sauf;;genome;multiplicité Bactéries;;;;;;;; t;2;1.4;74;13;ct ac cg;;-;- c;2,457;945;38;15;cg;;5,775;1.43 a;2,524;1,193;47;14;ta at;;5,933;1.47 g;1,183;501;42;14;ta at;;2,781;0.69 Archées;;;;;;;; t;4;7;193;16;;;-;- c;2,365;350;15;16;;;207;1.12 a;2,257;246;11;13;ta at tg;;197;1.07 g;1,843;120;7;14;ta at;;161;0.88 Eucaryotes;;;;;;;; t;939;912;97;16;;;1,081;6.97 c;1,156;1,150;99;16;;;1,331;8.58 a;2,306;2,027;88;14;ta tg;;2,654;17.12 g;2,264;1,800;80;15;ta;;2,606;16.81 Eucaryotes;;;;;;;; t1;102;55;54;8;;;117;0.75 t2;1,776;421;24;8;;;2,045;13.19 c1;109;104;95;8;;;126;0.81 c2;2,202;564;26;8;;;2,535;16.35 ;;;;;;;; t1+c1;105;81;76;16;;;121;0.78 t2+c2;1,989;529;27;16;;;2,290;14.77
Comparaison des 3 domaines avec les nombres des tRNAs
[modifier | modifier le wikicode]Comparaison globale
[modifier | modifier le wikicode]Codons par ordre de valeurs dans les carrés
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Codons par ordre de valeurs dans les carrés
- Légende: classement des codons par leur ordre des effectifs de gène tRNA, dans les doublets des bactéries (B), des archées (A) et des eucaryotes (E). Les ordres sont ceux des tableaux I100, II100, III100.
- Tableau non formaté
Codons par ordre de valeurs dans les carrés;;;;;;;;;;;;;;; ;B;A;E;;B;A;E;;B;A;E;;B;A;E ttt;4;4;4;tct;4;4;1;tat;4;4;4;tgt;4;4;4 c;1;1;1;c;2;1;4;c;1;1;1;c;1;1;1 a;2;2;3;a;1;2;2;a;−;−;−;a;3;3;3 g;3;3;2;g;3;3;3;g;−;−;−;g;2;2;2 ;;;;;;;;;;;;;;; ctt;4;4;1;cct;4;4;2;cat;4;4;4;cgt;1;4;2 c;3;1;4;c;2;2;4;c;2;2;2;c;4;1;4 a;2;2;3;a;1;1;1;a;1;1;1;a;3;2;1 g;1;3;2;g;3;3;3;g;3;3;3;g;2;3;3 ;;;;;;;;;;;;;;; att;4;4;2;act;4;4;1;aat;4;4;4;agt;4;4;4 c;2;2;4;c;2;2;4;c;2;1;2;c;2;1;1 a;3;3;3;a;1;1;2;a;1;2;3;a;1;2;2 g;1;1;1;g;3;3;3;g;3;3;1;g;3;3;3 ;;;;;;;;;;;;;;; gtt;4;4;2;gct;4;4;3;gat;4;4;4;ggt;4;4;4 c;2;1;4;c;2;2;4;c;2;2;3;c;1;1;3 a;1;2;3;a;1;1;1;a;1;1;1;a;2;2;2 g;3;3;1;g;3;3;2;g;3;3;2;g;3;3;1
Groupes de codons
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Groupes de codons
- Légende: Les effectifs sont ceux des tableaux I100, II100, III100 sauf pour les faibles effectifs des tableaux I II III quand ils sont indiqués.
- − Groupe: Par exemple le groupe 111, est celui des codons classés en 1er dans chaque carré (doublet) des 3 domaines, bactéries (B), archées (A) et eucaryotes (E). L'attribution du groupe à chaque codon est faite dans le tableau des ordres.
- − Les paires de codons qui se ressemblent beaucoup sont soulignés en jaune.
- Tableau non formaté
;Groupes de codons ;;;;; Groupe;;B;A;E;;total 111;Tableaux I II III 100.;;;;; ;cca;2,320;2,103;1,426;;5,849 ;tac;2,732;2,172;1,925;;6,828 ;caa;2,718;2,240;1,989;;6,947 ;ttc;2,598;2,457;1,679;;6,734 ;gaa;4,118;2,629;6,150;;12,897 ;gca;4,334;2,926;6,636;;13,896 ;tgc;1,903;3,418;2,393;;7,714 ;atg;7,670;6,732;3,355;;17,757 ;;B;A;E;;total 444;Tableaux I II III.;;;;; ;cat;4;0;47;;51 ;agt;1;0;53;;54 ;ttt;10;0;66;;76 ;gat;0;0;100;;100 ;ggt;1;1;132;;134 ;aat;5;0;149;;154 ;tat;4;0;155;;159 ;tgt;3;0;233;;236 ;;B;A;E;;total 333;Tableaux I II III 100.;;;;; ;ata;23;23;739;;786 ;tga;560;206;242;;1,008 ;ccg;929;1,726;639;;3,293 ;tcg;1,116;1,737;651;;3,504 ;cag;1,016;1,886;1,606;;4,509 ;agg;1,469;1,886;1,116;;4,471 ;acg;1,174;1,932;724;;3,830 ;;B;A;E;;total 224;Tableaux I II III 100.;;;;; ;ccc;1,167;1,955;30;;3,151 ;gcc;1,773;2,103;352;;4,227 ;acc;1,920;2,160;134;;4,214 ;atc;3,916;2,423;86;;6,425 ;;B;A;E;;total 332;Tableaux I II III 100.;;;;; ;gcg;521;1,817;4,115;;6,453 ;gag;591;1,829;3,261;;5,681 ;ttg;1,702;1,863;1,085;;4,650 Suite;;;;;; suite;;B;A;E;;total 223;Tableaux I II III 100.;;;;; ;cta;2,102;2,115;758;;4,974 ;tta;2,021;2,183;773;;4,977 ;gac;3,839;2,492;2,432;;8,762 441;;;;;; ;tct;2;0;1,618;;1,621 ;act;44;0;1,912;;1,956 ;ctt;157;11;1,369;;1,538 442;;;;;; ;cct;4;0;1,423;;1,427 ;gtt;4;11;1,825;;1,840 ;att;2;0;2,109;;2,111 331;;;;;; ;ggg;964;1,772;6,126;;8,862 ;aag;1,033;1,897;5,268;;8,198 ;gtg;559;1,943;2,713;;5,215 222;;;;;; ;tgg;1,858;2,103;1,722;;5,683 ;cac;2,006;2,115;1,632;;5,753 ;gga;2,347;2,160;4,811;;9,318 ;;B;A;E;;total 214;Tableaux I II III 100.;;;;; ;tcc;1,923;2,172;98;;4,193 ;gtc;1,885;2,423;95;;4,403 123;;;;;; ;gta;3,769;2,126;945;;6,840 ;aaa;3,874;2,252;2,293;;8,419 122;;;;;; ;tca;2,255;2,103;904;;5,262 ;aga;2,044;2,126;1,531;;5,701 ;Tableaux I II III 100.;;;;; 314;ctc;1,638;2,446;32;;4,116 414;cgc;142;2,137;50;;2,329 233;cgg;1,427;1,589;453;;3,470 132;ctg;2,207;1,829;1,126;;5,161 112;aca;2,501;2,263;1,298;;6,062 142;cgt;3,182;23;1,379;;4,583 211;agc;1,881;2,137;1,646;;5,665 321;cga;377;2,115;2,030;;4,522 443;gct;1;0;2,573;;2,574 113;ggc;3,946;2,777;2,849;;9,572 212;aac;3,729;2,446;3,061;;9,236
Comparaison par tri sur E et différences successives en %
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Comparaison par tri sur E et différences successives en %
- Légende
Comparaison par tri sur E et différences successives en %;;;;;;; ;B;A;E;;E%;;Max B% ccc;1,167;1,955;30;;9;;40 ctc;1,638;2,446;32;;54;;1056 cgc;142;2,137;50;;74;;2664 atc;3,916;2,423;86;;10;;108 gtc;1,885;2,423;95;;4;;2 tcc;1,923;2,172;98;;36;;0 acc;1,920;2,160;134;;81;;243 tga;560;206;242;;45;;217 gcc;1,773;2,103;352;;29;;24 cgg;1,427;1,589;453;;41;;54 ccg;929;1,726;639;;2;;20 tcg;1,116;1,737;651;;11;;5 acg;1,174;1,932;724;;2;;4918 ata;23;23;739;;2;;8882 cta;2,102;2,115;758;;2;;4 tta;2,021;2,183;773;;17;;12 tca;2,255;2,103;904;;5;;67 gta;3,769;2,126;945;;15;;122 ttg;1,702;1,863;1,085;;3;;16 agg;1,469;1,886;1,116;;1;;50 ctg;2,207;1,829;1,126;;15;;13 aca;2,501;2,263;1,298;;5;;1493 ctt;157;11;1,369;;1;;1927 cgt;3,182;23;1,379;;3;;74680 cct;4;0;1,423;;0;;54430 cca;2,320;2,103;1,426;;7;;14 aga;2,044;2,126;1,531;;5;;101 cag;1,016;1,886;1,606;;1;;47680 tct;2;0;1,618;;1;;94200 cac;2,006;2,115;1,632;;1;;7 agc;1,881;2,137;1,646;;2;;38 ttc;2,598;2,457;1,679;;3;;40 tgg;1,858;2,103;1,722;;6;;48411 gtt;4;11;1,825;;5;;1044 act;44;0;1,912;;1;;6133 tac;2,732;2,172;1,925;;3;;1 caa;2,718;2,240;1,989;;2;;620 cga;377;2,115;2,030;;4;;17640 att;2;0;2,109;;9;;182000 aaa;3,874;2,252;2,293;;4;;104 tgc;1,903;3,418;2,393;;2;;102 gac;3,839;2,492;2,432;;6;;451050 gct;1;0;2,573;;5;;65550 gtg;559;1,943;2,713;;5;;606 ggc;3,946;2,777;2,849;;7;;6 aac;3,729;2,446;3,061;;7;;531 gag;591;1,829;3,261;;3;;1199 atg;7,670;6,732;3,355;;23;;1373 gcg;521;1,817;4,115;;17;;351 gga;2,347;2,160;4,811;;9;;127 aag;1,033;1,897;5,268;;16;;7 ggg;964;1,772;6,126;;0;;327 gaa;4,118;2,629;6,150;;8;;5 gca;4,334;2,926;6,636;;;;
Diagramme de comparaison globale
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Diagramme de comparaison globale
- Diagramme: tRNA-BAE
Diagramme B et E en fonction de A;;;; ;A;B;E;zero cgg;1,589;1,427;453;0 ccg;1,726;929;639;0 tcg;1,737;1,116;651;0 ggg;1,772;964;6,126;0 gcg;1,817;521;4,115;0 gag;1,829;591;3,261;0 ctg;1,829;2,207;1,126;0 ttg;1,863;1,702;1,085;0 cag;1,886;1,016;1,606;0 agg;1,886;1,469;1,116;0 aag;1,897;1,033;5,268;0 acg;1,932;1,174;724;0 gtg;1,943;559;2,713;0 ccc;1,955;1,167;30;0 gcc;2,103;1,773;352;0 tgg;2,103;1,858;1,722;0 tca;2,103;2,255;904;0 cca;2,103;2,320;1,426;0 cga;2,115;377;2,030;0 cac;2,115;2,006;1,632;0 cta;2,115;2,102;758;0 aga;2,126;2,044;1,531;0 gta;2,126;3,769;945;0 cgc;2,137;142;50;0 agc;2,137;1,881;1,646;0 acc;2,160;1,920;134;0 gga;2,160;2,347;4,811;0 tcc;2,172;1,923;98;0 tac;2,172;2,732;1,925;0 tta;2,183;2,021;773;0 caa;2,240;2,718;1,989;0 aaa;2,252;3,874;2,293;0 aca;2,263;2,501;1,298;0 gtc;2,423;1,885;95;0 atc;2,423;3,916;86;0 ctc;2,446;1,638;32;0 aac;2,446;3,729;3,061;0 ttc;2,457;2,598;1,679;0 gac;2,492;3,839;2,432;0 gaa;2,629;4,118;6,150;0 ggc;2,777;3,946;2,849;0 gca;2,926;4,334;6,636;0 tgc;3,418;1,903;2,393;0 atg;6,732;7,670;3,355;0
Similitude des comportements des codons dans les 3 domaines
[modifier | modifier le wikicode]Corrélations entre nombre de tRNAs des 3 domaines A B E
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Corrélations entre nombre de tRNAs des 3 domaines A B E
- Légende: Les tableaux des corrélations sont faits à partir des tableaux I1, II1 et III1 des nombres de tRNAs par génome.
- Coefficient R 80.9 77.7: coefficient de corrélation respectivement de toute la colonne, des codons colorés en cyan.
- Domaine A B E, Ba Eb Ea: domaine respectivement des archées bactéries eucaryotes, diagramme respectivement de la corrélation AB BE AE.
- permutation: permutation entre le nombre de tRNAs du codon xyt et xyc pour le domaine E, 7 permutations, et le domaine B, 1 permutation. En supposant que les tRNAs des codons xyt de E se comportement relativement de la même façon que les codons xyc de B.
- Retraits:retrait des codons gxa,g et cga aag qui sont surexprimés dans le domaine E.
- X10: multiplication des nombres des tRNAs des domaines A et B pour adapter à l'échelle de E.
;Sans permuter;;1 permutation;;codons xya,g;;Diagramme AB x10;;;;;Sans permuter;;7 permutations;;X10;retraits;Diagramme BE x10;;;;;Sans permuter;;8 permutations;;X10;retraits;Diagramme AE x10;; coeff. R;80.9;;86.6;;84.0;;;86.6;77.7;;;35.6;;52.4;;90.4;;;90.4;75.4;;;34.8;;59.8;;87.4;;;87.4;76.2 dom.;B;A;B;A;B;A;codons;A;Ba;;;B;E;B;E;B;E;codons;B;Eb;;;A;E;A;E;A;E;codons;A;Ea ttt;0.25;0;0.25;0;;;ttt;0;2.5;;ttt;0.25;43;0.25;43;2.48;43;gat;0;65;;ttt;0;43;0;43;0;43;ttt;0;43 ttc;151;117;151;117;;;att;0;1.2;;ttc;151;1,247;151;1,247;1514;1,247;agt;0.25;34;;ttc;117;1,247;117;1,247;1,168;1,247;att;0;64 tta;118;104;118;104;118;104;tct;0;1.2;;tta;118;574;118;574;1178;574;ggt;0.25;85;;tta;104;574;104;574;1,038;574;tct;0;73 ttg;99;89;99;89;99;89;cct;0;2.5;;ttg;99;806;99;806;992;806;gct;0.50;261;;ttg;89;806;89;806;886;806;cct;0;22 ctt;9.2;0.54;9.2;0.54;;;act;0;26;;ctt;9.2;1,017;9.2;24;91.5;24;tgt;0.74;150;;ctt;0.54;1,017;0.54;24;5;24;act;0;99 ctc;95;116;95;116;;;gct;0;0.5;;ctc;95;24;95;1,017;955;1,017;tat;0.99;100;;ctc;116;24;116;1,017;1,163;1,017;gct;0;261 cta;123;101;123;101;123;101;tat;0;1.0;;cta;123;563;123;563;1225;563;cat;0.99;30;;cta;101;563;101;563;1,005;563;tat;0;100 ctg;129;87;129;87;129;87;cat;0;1.0;;ctg;129;836;129;836;1286;836;att;1.24;64;;ctg;87;836;87;836;870;836;cat;0;30 att;0.12;0;0.12;0;;;aat;0;1.2;;att;0.12;1,566;0.12;64;1.24;64;tct;1.24;73;;att;0;1,566;0;64;0;64;aat;0;96 atc;228;115;228;115;;;gat;0;0;;atc;228;64;228;1,566;2282;1,566;aat;1.24;96;;atc;115;64;115;1,566;1,152;1,566;gat;0;65 ata;1.4;1.1;1.4;1.1;1.4;1.1;tgt;0;0.7;;ata;1.4;549;1.4;549;13.6;549;gtt;2.23;70;;ata;1.1;549;1.1;549;11;549;tgt;0;150 atg;447;320;447;320;447;320;agt;0;0.2;;atg;447;2,492;447;2,492;4471;2,492;ttt;2.48;43;;atg;320;2,492;320;2,492;3,201;2,492;agt;0;34 gtt;0.22;0.54;0.22;0.54;;;ctt;5.4;92;;gtt;0.22;1,355;0.22;70;2.23;70;cct;2.48;22;;gtt;0.54;1,355;0.54;70;5;70;ctt;5;24 gtc;110;115;110;115;;;gtt;5.4;2.2;;gtc;110;70;110;1,355;1099;1,355;ata;13.6;549;;gtc;115;70;115;1,355;1,152;1,355;gtt;5;70 gta;220;101;220;101;220;101;ggt;5.4;0.2;;gta;220;702;220;702;;;act;26;99;;gta;101;702;101;702;;;ggt;5;85 gtg;33;92;33;92;33;92;ata;10.9;13.6;;gtg;33;2,015;33;2,015;;;cgc;82.6;37;;gtg;92;2,015;92;2,015;;;ata;11;549 tct;0.12;0;0.12;0;;;cgt;11;83;;tct;0.12;1,202;0.12;73;1.24;73;ctt;91.5;24;;tct;0;1,202;0;73;0;73;cgt;11;37 tcc;112;103;112;103;;;tga;98;326;;tcc;112;73;112;1,202;1121;1,202;tga;326;180;;tcc;103;73;103;1,202;1,033;1,202;tga;98;180 tca;131;100;131;100;131;100;cgg;755;832;;tca;131;672;131;672;1314;672;ccg;541;474;;tca;100;672;100;672;1,000;672;cgg;755;337 tcg;65;83;65;83;65;83;ccg;821;541;;tcg;65;483;65;483;650;483;cag;593;1,193;;tcg;83;483;83;483;826;483;ccg;821;474 cct;0.25;0;0.25;0;;;tcg;826;650;;cct;0.25;1,057;0.25;22;2.48;22;tcg;650;483;;cct;0;1,057;0;22;0;22;tcg;826;483 ccc;68;93;68;93;;;ggg;842;562;;ccc;68;22;68;1,057;680;1,057;ccc;680;1,057;;ccc;93;22;93;1,057;929;1,057;ctg;870;836 cca;135;100;135;100;135;100;gcg;864;304;;cca;135;1,059;135;1,059;1352;1,059;acg;685;537;;cca;100;1,059;100;1,059;1,000;1,059;ttg;886;806 ccg;54;82;54;82;54;82;ctg;870;1,286;;ccg;54;474;54;474;541;474;cgg;832;337;;ccg;82;474;82;474;821;474;cag;897;1,193 act;3;0;3;0;;;gag;870;344;;act;3;1,420;3;99;26;99;agg;856;829;;act;0;1,420;0;99;0;99;agg;897;829 acc;112;103;112;103;;;ttg;886;992;;acc;112;99;112;1,420;1119;1,420;ctc;955;1,017;;acc;103;99;103;1,420;1,027;1,420;acg;918;537 aca;146;108;146;108;146;108;cag;897;593;;aca;146;964;146;964;1458;964;ttg;992;806;;aca;108;964;108;964;1,076;964;ccc;929;1,057 acg;68;92;68;92;68;92;agg;897;856;;acg;68;537;68;537;685;537;tgg;1083;1,279;;acg;92;537;92;537;918;537;tca;1,000;672 gct;0.05;0;0.05;0;;;aag;902;602;;gct;0.05;1,911;0.05;261;0.50;261;agc;1097;1,223;;gct;0;1,911;0;261;0;261;cca;1,000;1,059 gcc;103;100;103;100;;;acg;918;685;;gcc;103;261;103;1,911;;;gtc;1099;1,355;;gcc;100;261;100;1,911;;;tgg;1,000;1,279 gca;253;139;253;139;253;139;gtg;924;326;;gca;253;4,928;253;4,928;;;acc;1119;1,420;;gca;139;4,928;139;4,928;;;cta;1,005;563 gcg;30;86;30;86;30;86;ccc;929;680;;gcg;30;3,056;30;3,056;;;tcc;1121;1,202;;gcg;86;3,056;86;3,056;;;cac;1,005;1,212 tat;0.10;0;0.10;0;;;tca;1,000;1,314;;tat;0.10;100;0.10;100;0.99;100;cac;1169;1,212;;tat;0;100;0;100;0;100;cga;1,005;1,508 tac;159;103;159;103;;;cca;1,000;1,352;;tac;159;1,430;159;1,430;1592;1,430;tta;1178;574;;tac;103;1,430;103;1,430;1,033;1,430;aga;1,011;1,137 cat;0.10;0;0.10;0;;;gcc;1,000;1,033;;cat;0.10;30;0.10;30;0.99;30;aga;1191;1,137;;cat;0;30;0;30;0;30;cgc;1,016;1,024 cac;117;101;117;101;;;tgg;1,000;1,083;;cac;117;1,212;117;1,212;1169;1,212;cta;1225;563;;cac;101;1,212;101;1,212;1,005;1,212;agc;1,016;1,223 caa;158;107;158;107;158;107;cta;1,005;1,225;;caa;158;1,477;158;1,477;1584;1,477;ctg;1286;836;;caa;107;1,477;107;1,477;1,065;1,477;acc;1,027;1,420 cag;59;90;59;90;59;90;cac;1,005;1,169;;cag;59;1,193;59;1,193;593;1,193;tca;1314;672;;cag;90;1,193;90;1,193;897;1,193;tcc;1,033;1,202 aat;0.12;0;0.12;0;;;cga;1,005;220;;aat;0.12;96;0.12;96;1.24;96;cca;1352;1,059;;aat;0;96;0;96;0;96;tac;1,033;1,430 aac;217;116;217;116;;;gta;1,011;2,197;;aac;217;2,274;217;2,274;2174;2,274;aca;1458;964;;aac;116;2,274;116;2,274;1,163;2,274;tta;1,038;574 aaa;226;107;226;107;226;107;aga;1,011;1,191;;aaa;226;1,703;226;1,703;2258;1,703;ttc;1514;1,247;;aaa;107;1,703;107;1,703;1,071;1,703;caa;1,065;1,477 aag;60;90;60;90;60;90;cgc;1,016;1,855;;aag;60;3,912;60;3,912;;;caa;1584;1,477;;aag;90;3,912;90;3,912;;;aaa;1,071;1,703 gat;0;0;0;0;;;agc;1,016;1,097;;gat;0;65;0;65;0;65;tac;1592;1,430;;gat;0;65;0;65;0;65;aca;1,076;964 gac;224;118;224;118;;;acc;1,027;1,119;;gac;224;1,806;224;1,806;2238;1,806;cgt;1855;1,024;;gac;118;1,806;118;1,806;1,185;1,806;atc;1,152;1,566 gaa;240;125;240;125;240;125;gga;1,027;1,368;;gaa;240;4,567;240;4,567;;;aac;2174;2,274;;gaa;125;4,567;125;4,567;;;gtc;1,152;1,355 gag;34;87;34;87;34;87;tcc;1,033;1,121;;gag;34;2,422;34;2,422;;;gac;2238;1,806;;gag;87;2,422;87;2,422;;;ctc;1,163;1,017 tgt;0.07;0;0.07;0;;;tac;1,033;1,592;;tgt;0.07;150;0.07;150;0.74;150;aaa;2258;1,703;;tgt;0;150;0;150;0;150;aac;1,163;2,274 tgc;111;163;111;163;;;tta;1,038;1,178;;tgc;111;1,777;111;1,777;;;atc;2282;1,566;;tgc;163;1,777;163;1,777;1,625;1,777;ttc;1,168;1,247 tga;33;10;33;10;33;10;caa;1,065;1,584;;tga;33;180;33;180;326;180;ggc;2300;2,115;;tga;10;180;10;180;98;180;gac;1,185;1,806 tgg;108;100;108;100;108;100;aaa;1,071;2,258;;tgg;108;1,279;108;1,279;1083;1,279;atg;4471;2,492;;tgg;100;1,279;100;1,279;1,000;1,279;ggc;1,321;2,115 cgt;185;1.1;8.3;1.1;;;aca;1,076;1,458;;cgt;185;1,024;185;1,024;1855;1,024;tgc;;;;cgt;1.1;1,024;1.1;37;11;37;tgc;1,625;1,777 cgc;8.3;102;185;102;;;atc;1,152;2,282;;cgc;8.3;37;8.3;37;82.6;37;gcc;;;;cgc;102;37;102;1,024;1,016;1,024;atg;3,201;2,492 cga;22;101;22;101;22;101;gtc;1,152;1,099;;cga;22;1,508;22;1,508;;;gta;;;;cga;101;1,508;101;1,508;1,005;1,508;gcc;; cgg;83;76;83;76;83;76;ctc;1,163;955;;cgg;83;337;83;337;832;337;gtg;;;;cgg;76;337;76;337;755;337;gta;; agt;0.02;0;0.02;0;;;aac;1,163;2,174;;agt;0.02;34;0.02;34;0.25;34;gca;;;;agt;0;34;0;34;0;34;gtg;; agc;110;102;110;102;;;ttc;1,168;1,514;;agc;110;1,223;110;1,223;1097;1,223;gcg;;;;agc;102;1,223;102;1,223;1,016;1,223;gca;; aga;119;101;119;101;119;101;gac;1,185;2,238;;aga;119;1,137;119;1,137;1191;1,137;aag;;;;aga;101;1,137;101;1,137;1,011;1,137;gcg;; agg;86;90;86;90;86;90;gaa;1,250;2,401;;agg;86;829;86;829;856;829;gaa;;;;agg;90;829;90;829;897;829;aag;; ggt;0.02;0.54;0.02;0.54;;;ggc;1,321;2,300;;ggt;0.02;85;0.02;85;0.25;85;gag;;;;ggt;0.54;85;0.54;85;5;85;gaa;; ggc;230;132;230;132;;;gca;1,391;2,526;;ggc;230;2,115;230;2,115;2300;2,115;cga;;;;ggc;132;2,115;132;2,115;1,321;2,115;gag;; gga;137;103;137;103;137;103;tgc;1,625;1,109;;gga;137;3,573;137;3,573;;;gga;;;;gga;103;3,573;103;3,573;;;gga;; ggg;56;84;56;84;56;84;atg;3,201;4,471;;ggg;56;4,550;56;4,550;;;ggg;;;;ggg;84;4,550;84;4,550;;;ggg;;
Rapport E/B des codons
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Rapport E/B des codons
- Légende: Valeur du codon se terminant par x de E / Valeur du codon se terminant par x de B
- 0.8: t de E / c de B
- Tableau rapport E/B pour 100 000: d'après les valeurs des tableaux III100 / I100
- Tableau rapport E/B par génome: d'après les valeurs des tableaux III1 / I1
- Tableau non formaté
rapport E/B;;Pour 100 000;;;;; ttt;;tct;0.83;tat;;tgt; c;0.63;c;;c;0.69;c;1.23 a;0.38;a;0.39;a;−;a;0.42 g;0.63;g;0.57;g;−;g;0.91 ctt;0.82;cct;1.20;cat;;cgt;0.42 c;;c;;c;0.80;c;0.34 a;0.35;a;0.60;a;0.72;a;5.27 g;0.50;g;0.67;g;1.55;g;0.31 att;0.53;act;0.98;aat;;agt; c;;c;;c;0.81;c;0.86 a;;a;0.51;a;0.58;a;0.73 g;0.43;g;0.60;g;5.00;g;0.75 gtt;0.95;gct;1.42;gat;;ggt; c;;c;;c;0.62;c;0.71 a;0.25;a;1.50;a;1.46;a;2.01 g;4.76;g;7.75;g;5.41;g;6.23
rapport E/B;;Par génome;;;;; ttt;−;tct;11;tat;−;tgt;− c;8;c;0.7;c;9;c;16 a;5;a;5;a;−;a;6 g;8;g;7;g;−;g;12 ctt;11;cct;16;cat;−;cgt;6 c;0.3;c;0.3;c;10;c;4 a;5;a;8;a;9;a;69 g;7;g;9;g;20;g;4 att;5;act;13;aat;−;agt;− c;0.3;c;0.9;c;10;c;11 a;402;a;7;a;8;a;10 g;6;g;8;g;65;g;10 gtt;12;gct;18;gat;−;ggt;− c;0.6;c;2.5;c;8;c;9 a;3.2;a;20;a;19;a;26 g;62;g;101;g;70;g;81
Totaux des carrés pour 100 000 tRNAs
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Totaux des carrés pour 100 000 tRNAs
- Légende: B bactéries, A archées, E eucaryotes. 6 219 , carrés les plus modifiés.
- Tableau non formaté
- - Totaux des carrés
B;t;c;a;g t;6 219;5 208;2 688;4 250 c;6 002;4 346;5 647;5 043 a;11 418;5 546;8 494;5 305 g;6 113;6 518;8 406;7 136 ;;;; A;t;c;a;g t;6 517;6 025;2 176;5 738 c;6 414;5 795;6 254;5 876 a;9 197;6 368;6 609;6 162 g;6 517;6 861;6 964;6 735 ;;;; E;t;c;a;g t;3 466;3 155;1 986;4 397 c;3 167;3 391;5 080;3 772 a;6 065;3 922;10 368;4 184 g;5 379;13 187;11 503;13 403
Variation en % entre la 1ère et la 2ème valeur
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Variation en % entre la 1ère et la 2ème valeur
- Légende:
- -17, variation en % des 2 1ères valeurs; 779 différence en valeur absolue de la base de données de référence. La variation est calculée entre le nombre de codons contenu dans la cellule affichant la variation en % (-17) et celui contenu dans la cellule affichant la différence en valeur absolue (779).
- : 4ème valeur sans changement entre B et A ou E
- : 3ème valeur sans changement entre B et A ou E
- : 4ème valeur après changement entre B et A ou E
- : 3ème valeur après changement entre B et A ou E
- Moyenne des valeurs absolues des variations:
B A E Moy 48.1 18.2 39.1 Ecart 47.4 21.0 24.5 % 98.5 115.2 62.7
- Tableau non formaté
I 100;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;;;;II 100;Nombres de tRNAs. 184 archées;;;;;;;;III 100;Nombres de tRNAs. 155 eucaryotes;;;;;; ttt;;tct;;tat;;tgt;;;ttt;;tct;;tat;;tgt;;;ttt;;tct;79;tat;;tgt; c;29;c;-17;c;;c;2;;c;13;c;3;c;;c;63;;c;55;c;;c;;c;39 a;1 356;a;779;a;-;a;;;a;24;a;6;a;-;a;;;a;;a;822;a;-;a; g;;g;;g;-;g;107;;g;;g;;g;-;g;115;;g;684;g;;g;-;g;773 ctt;;cct;;cat;;cgt;123;;ctt;;cct;;cat;;cgt;;;ctt;22;cct;0;cat;;cgt;-32 c;;c;-99;c;-35;c;;;c;16;c;-8;c;-6;c;1;;c;;c;;c;-22;c; a;-5;a;2 711;a;1 673;a;;;a;29;a;13;a;11;a;2;;a;;a;3;a;410;a;750 g;246;g;;g;;g;4 123;;g;;g;;g;;g;;;g;280;g;;g;;g; att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;-37;act;47;aat;;agt; c;-49;c;-30;c;-4;c;-9;;c;-64;c;-5;c;9;c;1;;c;;c;;c;-42;c;7 a;;a;1 365;a;341;a;382;;a;;a;9;a;17;a;1;;a;;a;707;a;;a;133 g;8 823;g;;g;;g;;;g;377;g;;g;;g;;;g;1 434;g;;g;2 540;g; gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;-33;gct;;gat;;ggt; c;-100;c;-144;c;-7;c;68;;c;14;c;-39;c;-6;c;29;;c;;c;;c;;c; a;4 429;a;6 019;a;656;a;3 758;;a;26;a;72;a;12;a;54;;a;;a;61;a;89;a;-21 g;;g;;g;;g;;;g;;g;;g;;g;;;g;1 022;g;2 902;g;3 325;g;1 514
Nombres de tRNAs des 4032 bactéries
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Nombres de tRNAs des 4032 bactéries
- Base de données gtRNAdb [2]
- Légende:
- I. Nombres de tRNAs. 4032 bactéries.
- 5 : nombre de tRNAs d'un codon se terminant par t. Ils sont tous inférieurs à 11 sauf ctt cgt act.
- 4 366: Effectif élevé de tRNAs d'un codon se terminant par g.
- 2622: Effectif faible de tRNAs.
- II. Nombre de bactéries à tRNAs solitaires de 4 codons (1ère et 2ème base). Total d’une requête: Comptage fait pour les carrés. C’est un nombre de bactéries ayant x tRNAs pour un seul et même codon.
- − Total d'une requête: Le 1er codon se terminant par t n'a pas de solitaire sauf ici pour Arg, et il est remplacé par le total de la requête.
- − a,g,c : Nombre de bactéries à tRNAs solitaires pour les carrés de 4 codons.
- − 106*: solitaires du codon cgt. Le carré de Arg étant complet le total de la requête est représenté par *, il est de 3946.
- − Note: le total des bactéries de la base des tRNA est de 4032. Cependant le total des bactéries comptées est compris entre 3832-3947. Est-ce que ce qui manque est du aux bactéries sans tRNAs pour les codons demandés? Cela ne serait pas vrai pour les aas à 2 codons.
- − Méthode pour compter, cas de la Thr, anti-codons xGT:
- Sélectionner les anticodons pour la requête (ne pas oublier de mettre Bacteria dans Domain). Copier le résultat, ctrl+A, ctrl+C.
- Dans calc ctrl+V, supprimer le dessin en le sélectionnant, supprimer toutes les colonnes sauf la colonne des anticodons, sélectionner le 1er anticodon puis ctrl+schift+fin ce qui sélectionne tous les anticodons et les cellules à blanc. Il n'y a pas de cellule intercalée entre 2 anticodon de la même bactérie.
- Copier,ctrl+v, dans writer (texte non formaté), ctrl+h (expression régulière, $ en ; tout remplacer), ctrl+h (décocher expression régulière, ;; en *;;* tout remplacer). Le tout rechercher de * ;;* donne le total de la requête (nombre total de bactéries moins 1). Mettre un * à la fin mais pas début (le logiciel déplace tout le texte pour insérer *, ce qui prend beaucoup de temps). Repérer le motif du début avant * ;;*. Si le motif concerne une recherche ultérieure, en tenir compte.
- ctrl+h (*GGT* tout rechercher donne 2916, *AGT* donne 41, *GGT;GGT donne 754 . . . ).
- III. Nombre de bactéries à tRNAs solitaires des codons a,g et t,c. Total d’une requête: tRNAs solitaires pour les codons se terminant par a ou g et t ou c; total des bactéries d'une requête de la base de données suivant les codons demandés.
- stc,sag, tt (1ère et 2ème base d'un carré) , tc . . . : Total des bactéries respectivement de la requête pour 2 codons se terminant par t ou c, pour 2 codons se terminant par a ou g.
- a,g,t,c : Nombre de bactéries à tRNAs solitaires pour les codons se terminant par a,g,t,c.
- − Trp-Sec: Les solitaires de Sec sont en fait des Trp (tga).
- IV. Pourcentage des bactéries à tRNAs solitaires: calculés à partir des tableaux II et III précédents.
- tt (1ère et 2ème base d'un carré) , tc . . .
- %4: Pourcentage des bactéries à 1 seul codon à tRNA dans les carrés de 4; toujours a est à plus de 90% sauf pour cgt (Arg) et atg (Met).
- %2: Pourcentage des bactéries à 1 seul codon à tRNA pour les codons se terminant par a ou g. Toujours a est à plus de 90% sauf pour R (cg), L (tt), M et W.
- 1a1g: Nombre de bactéries ayant 1 tRNA pour le codon se terminant par a et 1 tRNA pour le codon se terminant par g. Permet de mettre en exergue les autres bactéries ayant des tRNAs multiples.
- V. Multiplicité des tRNAs en %: Voir les calculs.
- I. Nombres de tRNAs. 4032 bactéries.
;I. Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;; ttt;10;tct;5;tat;4;tgt;3 c;6105;c;4520;c;6420;c;4473 a;4749;a;5299;a;−;a;1315 g;3999;g;2622;g;−;g;4366 ctt;369;cct;10;cat;4;cgt;7478 c;3849;c;2742;c;4715;c;333 a;4940;a;5453;a;6388;a;887 g;5186;g;2183;g;2389;g;3355 att;5;act;103;aat;5;agt;1 c;9,203;c;4513;c;8,764;c;4422 a;55;a;5878;a;9,105;a;4804 g;18,026;g;2760;g;2427;g;3452 gtt;9;gct;2;gat;0;ggt;1 c;4430;c;4166;c;9,023;c;9,273 a;8,859;a;10,185;a;9,679;a;5515 g;1313;g;1224;g;1388;g;2266 II. Nombre de bactéries à tRNAs solitaires des carrés à 4 codons.;;;;;Total d’une requête. ttt;3948;tct;3945;tat;3934;tgt;3947 c;15;c;2;c;3930;c;12 a;0;a;85;a;−;a;0 g;2;g;0;g;−;g;17 ctt;3942;cct;3941;cat;3948;cgt;106* c;7;c;3;c;5;c;1 a;98;a;1173;a;6;a;7 g;0;g;1;g;2;g;7 att;3949;act;3946;aat;3949;agt;3944 c;2;c;2;c;2;c;1 a;0;a;152;a;5;a;0 g;81;g;3;g;1;g;0 gtt;3943;gct;3934;gat;3949;ggt;3948 c;8;c;32;c;5;c;9 a;724;a;877;a;8;a;66 g;1;g;7;g;1;g;0 III. Nombre de bactéries à tRNAs solitaires des codons ag.;;;;;;; tt;−;tc;−;ta;−;tg;− sag;3933;sag;3943;sag;−;sag;3934 a;96;a;1493;a;−;a;15 g;190;g;22;g;−;g;2629 ct;−;cc;−;ca;−;cg;− sag;3935;sag;3939;sag;3943;sag;3833 a;692;a;1813;a;2130;a;539 g;30;g;5;g;18;g;3026 at;−;ac;−;aa;−;ag;− sag;3947;sag;3944;sag;3941;sag;3928 a;0;a;1288;a;1899;a;780 g;3947;g;13;g;9;g;10 gt;−;gc;−;ga;−;gg;− sag;3935;sag;3902;sag;3928;sag;3939 a;2724;a;2721;a;2808;a;1699 g;2;g;11;g;5;g;11 IV. Pourcentage des bactéries à tRNAs solitaires;;;; ;tt;tc;ta;tg %4;−;2,2;−;− 1a1g;2804;2114;−;1238 %2;7;38;−;67 ;ct;cc;ca;cg %4;2,7;29,9;−;3,1 1a1g;962;1911;996;222 %2;18;46;54;93 ;at;ac;aa;ag %4;2,1;4,0;−;− 1a1g;0;2166;1155;2579 %2;100;33;48;20 ;gt;gc;ga;gg %4;18,6;23,3;−;1,9 1a1g;1 051;562;602;1973 %2;69;70;72;43 ;ct;cg;ac;− %4;2,7;3,1;4,0;− 1t1c;8;10;41;− %2;99;99;98;− V. Multipilcité;;;;;;; ;FL;;SS;;YX;;CW t;1,00;;1,00;;1,00;;1,00 c;1,55;;1,18;;1,63;;1,14 a;1,27;;1,35;;-;;1,01 g;1,04;;1,07;;-;;1,11 ;LL;;P;;HQ;;RR t;1,11;;1,00;;1,33;;2,06 c;1,10;;1,03;;1,20;;1,05 a;1,26;;1,39;;1,63;;1,10 g;1,86;;1,03;;1,32;;1,02 ;IM;;T;;NK;;SR t;1,00;;1,11;;1,00;;1,00 c;2,38;;1,21;;2,23;;1,12 a;1,15;;1,50;;2,32;;1,23 g;4,57;;1,04;;1,19;;1,10 ;V;;A;;DE;;G t;1,00;;1,00;;0,00;;1,00 c;1,38;;1,37;;2,29;;2,39 a;2,25;;2,62;;2,47;;1,40 g;1,09;;1,04;;1,24;;1,01
Calcul de la multiplicité des tRNAs
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Calcul de la multiplicité des tRNAs
- Légende: tRNAs, nombre affiché par la requête. lignes, nombre de lignes affiché dans calc après nettoyage. bactéries=lignes - tRNAs. multiplicité= tRNAs / bactéries.
- Tableau non formaté
;;t;;;;;c;;;;;a;;;;;g;;; ;;tRNAs;lignes;bactéries;multiplicité; ;tRNAs;lignes;bactéries;multiplicité; ;tRNAs;lignes;bacteries;multiplicité; ;tRNAs;lignes;bactéries;multiplicité ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; t;t;10;19;10;1,00;;5;9;5;1,00;;4;7;4;1,00;;3;5;3;1,00 ;c;6105;10044;3940;1,55;;4520;8343;3824;1,18;;6420;10353;3934;1,63;;4473;8401;3929;1,14 ;a;4749;8491;3743;1,27;;5299;9221;3923;1,35;;;;1;0,00;;1315;2619;1305;1,01 ;g;3999;7835;3837;1,04;;2622;5071;2450;1,07;;;;1;0,00;;4366;8285;3920;1,11 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; c;t;369;700;332;1,11;;10;19;10;1,00;;4;6;3;1,33;;7478;11102;3625;2,06 ;c;3849;7359;3511;1,10;;2742;5399;2658;1,03;;4715;8649;3935;1,20;;333;650;318;1,05 ;a;4940;8857;3918;1,26;;5453;9386;3934;1,39;;6388;10312;3925;1,63;;887;1693;807;1,10 ;g;5186;7969;2784;1,86;;2183;4307;2125;1,03;;2389;4201;1813;1,32;;3355;6648;3294;1,02 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; a;t;5;9;5;1,00;;103;195;93;1,11;;5;9;5;1,00;;1;1;1;1,00 ;c;9203;13067;3865;2,38;;4513;8246;3734;1,21;;8764;12695;3932;2,23;;4422;8354;3933;1,12 ;a;55;102;48;1,15;;5878;9808;3931;1,50;;9105;13036;3932;2,32;;4804;8721;3918;1,23 ;g;18026;21972;3947;4,57;;2760;5415;2656;1,04;;2427;4468;2042;1,19;;3452;6600;3149;1,10 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; g;t;9;17;9;1,00;;2;3;2;1,00;;0;0;1;0,00;;1;1;1;1,00 ;c;4430;7637;3208;1,38;;4166;7201;3036;1,37;;9023;12957;3935;2,29;;9273;13153;3881;2,39 ;a;8859;12791;3933;2,25;;10185;14075;3891;2,62;;9679;13603;3925;2,47;;5515;9442;3928;1,40 ;g;1313;2521;1209;1,09;;1224;2404;1181;1,04;;1388;2509;1122;1,24;;2266;4505;2240;1,01
Comparaison des codons par les 2 1ères bases
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Comparaison des codons par les 2 1ères bases
- Légende:
- − Voir les tableaux d'origine: Multiplicité , Nombres de tRNAs (Tableau I, totaux; Tableau II, solitaires sur 4; Tableau III, solitaires sur a-g), Moyenne des codons , ordre des codons .
- − 106*: solitaires du codon cgt. Le carré de Arg étant complet le total de la requête est représenté par *, il est de 3946.
- Tableau non formaté
Multiplicité;;NK;DE;HQ;;V;A;;SS;T;;P;G;;RR;;LL;;FL;SR;;IM;CW;;YX ;t;1,00;0,00;1,33;;1,00;1,00;;1,00;1,11;;1,00;1,00;;2,06;;1,11;;1,00;1,00;;1,00;1,00;;1,00 ;c;2,23;2,29;1,20;;1,38;1,37;;1,18;1,21;;1,03;2,39;;1,05;;1,10;;1,55;1,12;;2,38;1,14;;1,63 ;a;2,32;2,47;1,63;;2,25;2,62;;1,35;1,50;;1,39;1,40;;1,10;;1,26;;1,27;1,23;;1,15;1,01;;− ;g;1,19;1,24;1,32;;1,09;1,04;;1,07;1,04;;1,03;1,01;;1,02;;1,86;;1,04;1,10;;4,57;1,11;;− total tRNAs;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;t;5;0;4;;9;2;;5;103;;10;1;;7478;;369;;10;1;;5;3;;4 ;c;8 764;9 023;4715;;4430;4166;;4520;4513;;2742;9 273;;333;;3849;;6105;4422;;9 203;4473;;6420 ;a;9 105;9 679;6388;;8 859;10 185;;5299;5878;;5453;5515;;887;;4940;;4749;4804;;55;1315;;− ;g;2427;1388;2389;;1313;1224;;2622;2760;;2183;2266;;3355;;5186;;3999;3452;;18 026;4366;;− codon solitaire;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;t;0;0;0;;0;0;;0;0;;0;0;;106;;0;;0;0;;0;0;;0 ;c;;;;;8;32;;2;2;;3;9;;1;;7;;;;;;;; ;a;;;;;724;877;;85;152;;1173;66;;7;;98;;;;;;;; ;g;;;;;1;7;;0;3;;1;0;;7;;0;;;;;;;; solitaire a,g;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;total;3950;3950;3950;;3935;3902;;3943;3944;;3939;3939;;3833;;3935;;3950;3950;;3950;3950;;3950 ;a;1899;2808;2130;;2724;2721;;1493;1288;;1813;1699;;539;;692;;96;780;;0;15;;− ;g;9;5;18;;2;11;;22;13;;5;11;;3026;;30;;190;10;;3950;2629;;− moyenne codon;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;t/c %;4;7;-17;;11;-41;;4;-56;;5;-17;;-25;;-7;;-2;-35;;-7;-15;;8 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;a/g %;20;27;-39;;-48;-32;;-15;-8;;-54;49;;-73;;-144;;39;84;;-59;-191;;103 ordre corrélation;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;t;3a;8a;15a;;9a;14a;;17a;11a;;12a;28a;;32a;;27a;;2a;6a;;6a;21a;;1a ;c;13g;1g;4g;;12g;7g;;22g;8g;;20g;3g;;5g;;17g;;2g;9g;;9g;23g;;11g ;a;5a;20a;10a;;22a;13a;;7a;19a;;16a;23a;;31a;;25a;;4a;26a;;26a;26g;;29a ;g;19g;18g;6g;;21g;15g;;16g;24g;;14g;29g;;25g;;10g;;30a;30g;;30g;28g;;31g
Au niveau de l'ADN le code génétique est structuré par doublets.
[modifier | modifier le wikicode]Lignes et colonnes
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Lignes et colonnes
- Légende: Les moyennes des codons de la 3ème base appartenant aux doublets ayant la même 1ère base (ligne) ou ayant la même 2ème base (colonne) sont faites sur 4 codons ou sur 3 codons seulement quand on rencontre les codons stop (taa tag) ou le codon ata lorsqu'il est trop faible ( sauf celui des eucaryotes) ou le codon atg à effectif très élevé (sauf celui des eucaryotes). La moyenne des lignes et colonnes est faite sur 12 codons ou seulement 10 quand on rencontre les codons taa tag ata atguand les codons xyt ont des effectifs élevés ils sont permutés avec les codons xyc ( 1 permutation chez les bactéries et 8 chez les eucaryotes). Aussi les lignes et colonnes xyt contiennent les valeurs faibles après permutation et les lignes et colonnes xyc contiennent les valeurs fortes après permutation.
- n pour nombre de codons, mcod pour moyenne des codons, Lig. pour ligne, Col. pour colonne et car. pour carré ou doublet.
- txt, c, a, g pour respectivement les 4 codons "ttt tct tat tgt" de la 3ème base t, les 4 codons "ttc tcc tac tgc" de la 3ème base c . . . etc. (Ligne Lig.)
- xtt, c, a, g pour respectivement les 4 codons "ttt ctt att gtt" de la 3ème base t, les 4 codons "ttc ctc atc gtc" de la 3ème base c . . . etc. (colonne Col.)
- Tableaux non formatés: voir tableur
- − Lignes et colonnes
III LC;Nombres de tRNAs. 155 eucaryotes;;;;;;I LC;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries;;;;;;II LC;Nombres de tRNAs. 184 archées;;;; Lignes;;;Colon;;115 111;;Lignes;;;Colon;;235 027;;Lignes;;;Colon;;8749 txt;4;123;xtt;4;68;;txt;4;2;xtt;4;42;;txt;4;0;xtt;4;6 c;4;1,904;c;4;1,746;;c;4;2,289;c;4;2,509;;c;4;2,555;c;4;2,437 a;3;640;a;4;804;;a;3;1,612;a;3;2,631;;a;3;1,497;a;3;2,141 g;3;1,153;g;4;2,070;;g;3;1,558;g;3;1,489;;g;3;1,901;g;3;1,878 cxt;4;38;xct;4;153;;cxt;4;76;xct;4;13;;cxt;4;9;xct;4;0 c;4;1,451;c;4;1,882;;c;4;1,998;c;4;1,696;;c;4;2,163;c;4;2,097 a;4;1,550;a;4;2,566;;a;4;1,879;a;4;2,852;;a;4;2,143;a;4;2,349 g;4;956;g;4;1,532;;g;4;1,395;g;4;935;;g;4;1,757;g;4;1,803 axt;4;99;xat;4;98;;axt;4;12;xat;4;1;;axt;4;0;xat;4;0 c;4;2,182;c;4;2,263;;c;4;2,862;c;4;3,076;;c;4;2,292;c;4;2,306 a;4;1,465;a;3;3,477;;a;3;2,806;a;3;3,570;;a;3;2,214;a;3;2,374 g;4;2,616;g;3;3,378;;g;3;1,225;g;3;880;;g;3;1,905;g;3;1,871 gxt;4;162;xgt;4;103;;gxt;4;1;xgt;4;36;;gxt;4;6;xgt;4;9 c;4;2,420;c;4;2,067;;c;4;2,861;c;4;2,728;;c;4;2,449;c;4;2,617 a;4;4,636;a;4;2,154;;a;4;3,642;a;4;1,332;;a;4;2,460;a;4;1,652 g;4;4,054;g;4;2,354;;g;4;659;g;4;1,430;;g;4;1,840;g;4;1,837 Moyenne;;;;;;;Moyenne;;;;;;;Moyenne;;;;; Lignes;;ttt;ctt;att;gtt;;Lignes;;ttt;ctt;att;gtt;;Lignes;;ttt;ctt;att;gtt ;n;10;12;12;12;;;n;10;12;10;12;;;n;10;12;10;12 ;mcod;1,299;1,319;2,088;3,703;;;mcod;1,867;1,757;2,354;2,387;;;mcod;2,041;2,021;2,152;2,250 Moyenne;;;;;;;Moyenne;;;;;;;Moyenne;;;;; Colon;;ttt;tct;tat;tgt;;Colon;;ttt;tct;tat;tgt;;Colon;;ttt;tct;tat;tgt ;n;12;12;10;12;;;n;10;12;10;12;;;n;10;12;10;12 ;mcod;1,540;1,993;2,962;2,192;;;mcod;2,239;1,828;2,566;1,830;;;mcod;2,181;2,083;2,196;2,035 Totaux;;;;;;;Totaux;;;;;;;Totaux;;;;; carrés;1000;t;c;a;g;;carrés;1000;t;c;a;g;;carrés;1000;t;c;a;g ;t;3.59;3.27;2.06;4.56;;;t;6.32;5.30;2.73;4.32;;;t;6.50;6.01;2.17;5.73 ;c;3.28;3.52;5.27;3.91;;;c;6.10;4.42;5.74;5.13;;;c;6.40;5.78;6.24;5.86 ;a;6.29;4.07;10.75;4.34;;;a;11.61;5.64;8.64;5.39;;;a;9.18;6.36;6.60;6.15 ;g;5.58;13.68;11.93;13.90;;;g;6.22;6.63;8.55;7.26;;;g;6.50;6.85;6.95;6.72
Demi-doublets
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Demi-doublets
- Légende:
- − Domaine E: ensemble des 155 eucaryotes avec un total de tRNAs de 115 111.
- − Domaine B: ensemble des 4032 bactéries avec un total de tRNAs de 235 027.
- − Domaine A: ensemble des 184 archées avec un total de tRNAs de 8 749.
- − g/a: rapport des codons xyg sur xya de la ligne x et de la colonne y du tableau des effectifs, 1.4 rapport inverse de g/a.
- − t/c: rapport des codons xyc sur xyt de la ligne x et de la colonne y du tableau des effectifs, 16 rapport inverse de t/c.
- − t c a g: colonnes du tableau des effectifs
III 100;Nombres de tRNAs. 155 eucaryotes;;;;;III 100;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries;;;;;III 100;Nombres de tRNAs. 184 archées;;; ;t;c;a;g;;;t;c;a;g;;;t;c;a;g t/c;29;16;14;12;;t/c;−;−;−;−;;t/c;−;−;−;− g/a;1.40;1.39;−;7.10;;g/a;1.19;2.02;−;3.32;;g/a;1.17;1.21;−;10.22 t/c;43;48;40;28;;t/c;10.43;−;−;22;;t/c;−;−;−;− g/a;1.49;2.23;1.2;4.48;;g/a;1.05;2.50;2.67;3.78;;g/a;1.16;1.22;1.19;1.33 t/c;25;14;24;36;;t/c;−;43.82;−;−;;t/c;−;−;−;− g/a;4.54;1.79;2.30;1.37;;g/a;328;2.13;3.75;1.39;;g/a;295;1.17;1.19;1.13 t/c;19;7.31;28;25;;t/c;−;−;−;−;;t/c;−;−;−;− g/a;2.87;1.61;1.89;1.27;;g/a;6.75;8.32;6.97;2.43;;g/a;1.09;1.61;1.44;1.22
Codons identiques par classement des 3 bases
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Codons identiques par classement des 3 bases
- Légende
- Tableau non formaté:
1ère base;;;;;;;;;2ème base;;;;;;; II 100;Nombres de tRNAs. 184 archées;;;;;;8749;;II 100;Nombres de tRNAs. 184 archées;;;;;;8749 ttt;0;ttc;2,457;tta;2,183;ttg;1,863;;ttt;0;ttc;2,457;tta;2,183;ttg;1,863 ctt;11;ctc;2,446;cta;2,115;ctg;1,829;;tct;0;tcc;2,172;tca;2,103;tcg;1,737 att;0;atc;2,423;ata;23;atg;6,732;;tat;0;tac;2,172;taa;-;tag;- gtt;11;gtc;2,423;gta;2,126;gtg;1,943;;tgt;0;tgc;3,418;tga;206;tgg;2,103 tct;0;tcc;2,172;tca;2,103;tcg;1,737;;ctt;11;ctc;2,446;cta;2,115;ctg;1,829 cct;0;ccc;1,955;cca;2,103;ccg;1,726;;cct;0;ccc;1,955;cca;2,103;ccg;1,726 act;0;acc;2,160;aca;2,263;acg;1,932;;cat;0;cac;2,115;caa;2,240;cag;1,886 gct;0;gcc;2,103;gca;2,926;gcg;1,817;;cgt;23;cgc;2,137;cga;2,115;cgg;1,589 tat;0;tac;2,172;taa;-;tag;-;;att;0;atc;2,423;ata;23;atg;6,732 cat;0;cac;2,115;caa;2,240;cag;1,886;;act;0;acc;2,160;aca;2,263;acg;1,932 aat;0;aac;2,446;aaa;2,252;aag;1,897;;aat;0;aac;2,446;aaa;2,252;aag;1,897 gat;0;gac;2,492;gaa;2,629;gag;1,829;;agt;0;agc;2,137;aga;2,126;agg;1,886 tgt;0;tgc;3,418;tga;206;tgg;2,103;;gtt;11;gtc;2,423;gta;2,126;gtg;1,943 cgt;23;cgc;2,137;cga;2,115;cgg;1,589;;gct;0;gcc;2,103;gca;2,926;gcg;1,817 agt;0;agc;2,137;aga;2,126;agg;1,886;;gat;0;gac;2,492;gaa;2,629;gag;1,829 ggt;11;ggc;2,777;gga;2,160;ggg;1,772;;ggt;11;ggc;2,777;gga;2,160;ggg;1,772 ;;;;;;;;;;;;;;;; I 100;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;;235027;;I 100;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;;235027 ttt;4;ttc;2,598;tta;2,021;ttg;1,702;;ttt;4;ttc;2,598;tta;2,021;ttg;1,702 ctt;157;ctc;1,638;cta;2,102;ctg;2,207;;tct;2;tcc;1,923;tca;2,255;tcg;1,116 att;2;atc;3,916;ata;23;atg;7,670;;tat;2;tac;2,732;taa;−;tag;− gtt;4;gtc;1,885;gta;3,769;gtg;559;;tgt;1;tgc;1,903;tga;560;tgg;1,858 tct;2;tcc;1,923;tca;2,255;tcg;1,116;;ctt;157;ctc;1,638;cta;2,102;ctg;2,207 cct;4;ccc;1,167;cca;2,320;ccg;929;;cct;4;ccc;1,167;cca;2,320;ccg;929 act;44;acc;1,920;aca;2,501;acg;1,174;;cat;2;cac;2,006;caa;2,718;cag;1,016 gct;1;gcc;1,773;gca;4,334;gcg;521;;cgc;142;cgt;3,182;cga;377;cgg;1,427 tat;2;tac;2,732;taa;−;tag;−;;att;2;atc;3,916;ata;23;atg;7,670 cat;2;cac;2,006;caa;2,718;cag;1,016;;act;44;acc;1,920;aca;2,501;acg;1,174 aat;2;aac;3,729;aaa;3,874;aag;1,033;;aat;2;aac;3,729;aaa;3,874;aag;1,033 gat;0;gac;3,839;gaa;4,118;gag;591;;agt;0;agc;1,881;aga;2,044;agg;1,469 tgt;1;tgc;1,903;tga;560;tgg;1,858;;gtt;4;gtc;1,885;gta;3,769;gtg;559 cgt;3,182;cgc;142;cga;377;cgg;1,427;;gct;1;gcc;1,773;gca;4,334;gcg;521 agt;0;agc;1,881;aga;2,044;agg;1,469;;gat;0;gac;3,839;gaa;4,118;gag;591 ggt;0;ggc;3,946;gga;2,347;ggg;964;;ggt;0;ggc;3,946;gga;2,347;ggg;964 ;;;;;;;;;;;;;;;; III 100;Nombres de tRNAs. 155 eucaryotes;;;;;;115111;;III 100;Nombres de tRNAs. 155 eucaryotes;;;;;;115111 ttt;57;ttc;1,679;tta;773;ttg;1,085;;ttt;57;ttc;1,679;tta;773;ttg;1,085 ctt;1,369;ctc;32;cta;758;ctg;1,126;;tct;1,618;tcc;98;tca;904;tcg;1,423 att;2,109;atc;86;ata;739;atg;3,355;;tat;135;tac;1,925;taa;-;tag;41 gtt;1,825;gtc;95;gta;945;gtg;2,713;;tgt;202;tgc;2,393;tga;242;tgg;1,379 tct;1,618;tcc;98;tca;904;tcg;1,423;;ctt;1,369;ctc;32;cta;758;ctg;1,126 cct;1,423;ccc;30;cca;1,426;ccg;639;;cct;1,423;ccc;30;cca;1,426;ccg;639 act;1,912;acc;134;aca;1,298;acg;724;;cat;41;cac;1,632;caa;1,989;cag;1,606 gct;2,573;gcc;352;gca;6,636;gcg;4,115;;cgt;1,379;cgc;50;cga;2,030;cgg;453 tat;135;tac;1,925;taa;-;tag;41;;att;2,109;atc;86;ata;739;atg;3,355 cat;41;cac;1,632;caa;1,989;cag;1,606;;act;1,912;acc;134;aca;1,298;acg;724 aat;129;aac;3,061;aaa;2,293;aag;5,268;;aat;129;aac;3,061;aaa;2,293;aag;5,268 gat;87;gac;2,432;gaa;6,150;gag;3,261;;agt;46;agc;1,646;aga;1,531;agg;1,116 tgt;202;tgc;2,393;tga;242;tgg;1,379;;gtt;1,825;gtc;95;gta;945;gtg;2,713 cgt;1,379;cgc;50;cga;2,030;cgg;453;;gct;2,573;gcc;352;gca;6,636;gcg;4,115 agt;46;agc;1,646;aga;1,531;agg;1,116;;gat;87;gac;2,432;gaa;6,150;gag;3,261 ggt;115;ggc;2,849;gga;4,811;ggg;6,126;;ggt;115;ggc;2,849;gga;4,811;ggg;6,126
Tableau des effectifs élevés des gènes de tRNAs eucaryotes
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Tableau des effectifs élevés des gènes de tRNAs eucaryotes
- Légende
- Tableaux non formatés
Callorhinchus milii;;;;;;;;;Danio rerio (Zebrafish) ;;;;;;; ;;;13,727;;12,380;;1,347;;;;;12,258;;;; ttt;3;tct;26;tat;1;tgt;1;;ttt;10;tct;336;tat;5;tgt;9 c;35;c;1;c;36;c;15;;c;197;c;2;c;236;c;136 a;13;a;54;a;;a;3;;a;73;a;209;a;;a;14 g;31;g;48;g;;g;30;;g;241;g;80;g;;g;44 ctt;20;cct;12;cat;1;cgt;9;;ctt;270;cct;315;cat;10;cgt;203 c;2;c;6;c;37;c;;;c;4;c;2;c;387;c;24 a;20;a;51;a;7;a;25;;a;244;a;205;a;105;a;107 g;25;g;41;g;18;g;2;;g;300;g;180;g;266;g;59 att;31;act;24;aat;2;agt;;;att;258;act;359;aat;24;agt;14 c;;c;12;c;48;c;33;;c;10;c;10;c;1,045;c;424 a;23;a;206;a;43;a;14;;a;75;a;290;a;525;a;252 g;94;g;137;g;36;g;12;;g;522;g;66;g;953;g;104 gtt;22;gct;75;gat;6;ggt;2;;gtt;232;gct;92;gat;1;ggt;11 c;16;c;168;c;49;c;19;;c;6;c;4;c;150;c;836 a;145;a;5,898;a;66;a;66;;a;230;a;368;a;225;a;47 g;1,540;g;3,858;g;428;g;81;;g;227;g;112;g;245;g;268 ;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;; Balaenoptera acutorostrata scammoni ;;;;;;;;;Tursiops truncatus (Dolphin);;;;;;; ;;;7,090;;6,227;;863;;;;;5,845;;5,112;;733 ttt;;tct;10;tat;;tgt;2;;ttt;;tct;12;tat;1;tgt;6 c;13;c;1;c;14;c;24;;c;12;c;;c;18;c;22 a;13;a;5;a;;a;17;;a;6;a;6;a;;a;21 g;8;g;4;g;;g;256;;g;7;g;4;g;;g;217 ctt;6;cct;7;cat;;cgt;9;;ctt;6;cct;7;cat;;cgt;7 c;;c;;c;11;c;;;c;;c;;c;9;c;1 a;4;a;5;a;10;a;9;;a;4;a;5;a;16;a;7 g;7;g;4;g;20;g;21;;g;6;g;4;g;15;g;12 att;12;act;13;aat;;agt;;;att;11;act;9;aat;;agt; c;1;c;;c;24;c;13;;c;;c;1;c;13;c;11 a;8;a;8;a;86;a;65;;a;5;a;6;a;74;a;48 g;21;g;4;g;29;g;67;;g;17;g;3;g;19;g;54 gtt;14;gct;20;gat;20;ggt;12;;gtt;8;gct;19;gat;10;ggt;19 c;1;c;;c;45;c;64;;c;3;c;2;c;49;c;43 a;18;a;42;a;2,368;a;987;;a;16;a;36;a;1,901;a;833 g;32;g;20;g;468;g;2,148;;g;22;g;21;g;395;g;1,766 ;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;; Bos taurus;;;;;;;;;Felis catus (cat);;;;;;; ;;;4,040;;3,060;;980;;;;;3,729;;2,870;;859 ttt;6;tct;13;tat;11;tgt;143;;ttt;1;tct;8;tat;;tgt;1 c;30;c;32;c;39;c;338;;c;12;c;1;c;10;c;32 a;10;a;7;a;;a;29;;a;19;a;14;a;;a;18 g;14;g;7;g;;g;178;;g;8;g;5;g;;g;23 ctt;11;cct;13;cat;4;cgt;13;;ctt;6;cct;8;cat;2;cgt;9 c;;c;;c;19;c;7;;c;;c;1;c;16;c;9 a;5;a;9;a;20;a;12;;a;33;a;68;a;782;a;1,201 g;6;g;4;g;40;g;16;;g;5;g;7;g;47;g;24 att;18;act;14;aat;;agt;4;;att;10;act;9;aat;5;agt;2 c;;c;1;c;30;c;19;;c;;c;;c;28;c;12 a;8;a;10;a;78;a;44;;a;9;a;13;a;50;a;54 g;35;g;7;g;40;g;116;;g;24;g;9;g;887;g;53 gtt;20;gct;31;gat;6;ggt;20;;gtt;8;gct;18;gat;1;ggt;2 c;;c;2;c;42;c;63;;c;;c;1;c;9;c;10 a;21;a;35;a;435;a;391;;a;6;a;10;a;15;a;48 g;39;g;16;g;164;g;1,295;;g;9;g;7;g;44;g;6
Linéarité du code des gènes de tRNA chez les eucaryotes
[modifier | modifier le wikicode]Calculs pour 121 eucaryotes
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Calculs pour 121 eucaryotes
- Linéarité du code des gènes de tRNA chez les eucaryotes.
- Texte
- Légende:
- − ttt ttc . . . nombre de gènes de tRNA des codons ttt ttc . . . relevé de la base de données gtRNAdb au 29.10.17
- − moy : moyenne des codons d'un eucaryote. Si la ligne contient les caractères € ou #, les codons correspondants n'entrent pas dans la moyenne comme le fait le tableur calc. Les codons faibles xyc/t ne rentrent pas dans la moyenne.
- − € pour nombres dépassant 100 dans une 1ère approche du coefficient de détermination R2. Il y en a 61.
- − # pour nombres améliorant le coefficient de détermination. Il y en a 13.
- − Doublons: ce sont les eucaryotes qui sont dans la base mais non utilisés pour les diagrammes car ils concernent 2 individus de la même espèce ou des variantes très proches des espèces retenues (voir texte pour plus de détail).
- − Tableau des diagrammes: Il est fait de 121 espèces et de 43 codons. Ne sont pas concernés les codons à faibles effectifs xyc ou xyt.
- − Données non modifiées: Pour repérer les codons omis, en jaune ceux supérieurs à 100 (€) et en orange les codons d'ajustement (#). Pour comparaison j’ai mis zebrafish sans annotations.
- − codons forts: codons à effectifs élevés. Au total 45. Ne sont pas pris en compte les 16 codons xyc/t faibles et les codons stop tga taa tag.
- + total: total des effectifs restants après suppression des effectifs élevés ou d'ajustement.
- + somme calculée: pente multipliée par la somme des moyennes des eucaryotes ayant perdu le codon omis.
- + totaux + sommes calculées: est le nombre calculé des gènes de tRNA du codon.
- + R2 et pente: coefficient de détermination et pente de la courbe de tendance du diagramme du codon en fonction de la moyenne moy. J'ai opté pour une droite passant par l'origine d'après le tableur calc. R2 a été multiplié par 1000.
- − codons faibles: les 16 codons xyc/t à effectifs faibles.
- + c/t > 3: est le nombre de codons faibles ayant plus de 3 gènes de tRNA.
- + c/t > 3, total: leur total en gènes
- + reste calculé: total des gènes des autres codons plus c/t > 3. C'est la réduction des codons faibles reportés dans la ligne "Totaux des 121 réduits" ci-dessous.
- + multiplicité x 100: division de reste calculé par 121 en %.
- + c/t = 3: est le nombre de codons faibles ayant 3 gènes de tRNA (pour illustration).
- − Totaux des 121 réduits: ils sont reportés dans le tableau synthétique "IV. nombre des 121 eucaryotes".
- − KEGG [3]: nomenclature de l'eucaryote dans la base KEGG, bta par exemple. Surmonté d'un * le code n'est pas celui de KEGG, mais attribué pour homogénéité.
- Tableau des calculs pour 121 eucaryotes sélectionnés.
Gènes de tRNA eucaryotes, doublons.;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; max;total;KEGG;eucaryote;;;;;moy;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg 1327;4180;bta;Bos taurus (cow) (Baylor Btau_4.6.1 Oct 2011);;;;;86.7;7;31;10;14;10;0;5;8;17;0;8;33;23;0;23;46;14;30;6;7;12;0;9;5;15;1;10;7;30;2;36;18;11;38;0;0;4;22;19;43;0;40;83;40;7;47;456;172;156;351;26;187;14;10;12;15;4;18;45;114;20;61;401;1,327 46;758;cre*;Caenorhabditis remanei (WUGSC 15.0.1 May 2007);;;;;16.7;0;18;6;12;24;0;7;4;25;1;14;24;28;0;4;9;16;0;10;6;7;2;41;6;18;0;10;6;27;0;15;6;0;22;0;0;1;22;23;9;1;23;20;33;0;36;23;25;0;14;0;17;25;0;11;1;0;9;13;5;0;28;46;5 38;600;hsa;Homo sapiens (hg19 - NCBI Build 37.1 Feb 2009);;;;;12.8;0;15;9;12;12;0;4;11;18;6;5;20;12;1;8;17;12;1;6;4;10;1;8;4;10;0;6;7;31;1;10;5;5;32;0;0;0;10;18;22;2;34;20;24;1;17;14;10;1;38;3;8;7;0;6;4;1;8;7;5;0;15;9;13 33;508;yli;Yarrowia lipolytica WSH-Z06;;;;;11.3;0;17;1;3;21;0;2;13;26;0;1;18;24;0;2;8;21;0;2;4;21;0;3;2;22;0;3;2;29;0;4;2;0;14;0;0;0;12;3;15;0;16;4;33;0;28;6;27;0;8;0;13;1;0;25;0;0;6;4;1;0;30;11;0 34;484;yli;Yarrowia lipolytica PO1f;;;;;10.8;0;18;1;3;18;0;2;12;26;0;1;18;24;0;2;8;21;0;2;4;21;0;3;2;22;0;3;3;29;0;4;2;0;14;0;0;0;12;3;15;0;15;4;34;0;24;6;22;0;8;0;13;1;0;24;0;0;6;4;1;0;18;11;0 57;432;mmu;Mus musculus (mm9 July 2007);;;;;9.4;0;7;4;4;8;0;3;10;11;1;5;18;8;1;3;11;9;1;3;3;7;0;8;3;9;0;4;5;19;0;11;10;0;10;0;0;1;10;6;10;0;14;11;19;0;16;8;13;0;57;2;8;6;0;3;5;0;8;5;5;1;14;7;7 16;315;dwi;Drosophila willistoni (D. willistoni Feb. 2006);;;;;6.8;0;7;3;7;4;1;2;9;9;2;4;15;8;1;5;5;8;1;3;3;7;0;5;4;7;1;7;4;11;0;6;2;0;8;0;0;0;8;4;6;0;10;8;10;0;16;11;12;0;12;1;7;10;0;7;1;0;6;4;5;0;12;6;0 17;305;dan;Drosophila ananassae (D. ananassae Feb. 2006 Agencourt CAF1);;;;;6.7;0;8;2;4;5;0;2;10;11;0;2;12;7;0;2;7;6;0;3;6;4;0;4;8;9;0;7;3;10;0;4;6;0;9;0;0;0;5;4;8;0;10;7;17;0;13;6;14;1;6;1;6;12;0;8;0;0;6;3;2;0;16;6;3 18;293;dpe;Drosophila persimilis (D. persimilis Oct. 2005 Broad);;;;;6.5;0;7;1;3;5;0;2;10;11;0;2;11;7;0;2;5;9;0;2;5;6;0;6;4;8;0;8;3;11;0;2;3;0;9;0;0;0;7;4;7;0;9;4;14;0;18;6;14;0;8;1;8;13;0;5;0;0;5;2;4;0;13;6;3 18;292;dpo;Drosophila pseudoobscura (D. pseudoobscura Feb. 2006);;;;;6.5;0;7;2;4;5;0;2;9;10;0;2;11;7;0;2;6;11;0;2;3;3;0;6;4;8;0;8;4;12;0;3;3;0;9;0;0;0;5;4;7;0;9;5;12;0;14;6;18;0;11;1;8;9;0;4;0;0;5;3;5;0;14;6;3 15;291;des;Drosophila sechellia (D. sechellia Oct. 2005 Broad);;;;;6.4;0;9;4;4;5;0;2;8;10;0;2;15;8;0;2;8;8;0;2;4;7;0;5;5;9;0;6;5;13;0;2;3;0;9;0;0;0;7;2;8;0;9;4;12;0;13;5;13;0;6;1;8;9;0;7;0;0;6;3;4;0;13;6;0 14;282;der;Drosophila erecta (D. erecta Feb. 2006 Agencourt CAF1);;;;;6.2;0;9;3;4;5;0;2;7;9;0;2;12;7;0;2;7;9;0;2;4;5;0;5;5;8;0;6;3;12;0;2;3;0;8;0;0;0;6;4;8;0;8;5;11;0;14;6;13;1;6;1;8;9;0;7;0;0;6;3;4;0;14;1;6 14;268;dvi;Drosophila virilis (D. virilis Feb. 2006 Agencourt CAF1);;;;;5.9;0;8;2;5;3;0;3;7;9;0;2;12;6;0;2;7;6;0;2;4;4;0;3;5;7;0;7;4;8;0;3;3;0;10;0;0;0;5;4;7;0;7;12;12;0;13;6;10;0;8;1;6;10;0;5;0;0;5;2;2;0;14;6;1 14;262;dmo;Drosophila mojavensis (D. mojavensis Feb. 2006 Agencourt CAF1);;;;;5.8;0;8;2;6;3;0;2;6;8;0;2;12;6;0;2;6;6;0;2;4;6;0;5;3;7;0;8;4;9;0;4;3;0;7;0;0;0;5;4;7;0;8;8;11;0;12;6;11;0;7;1;6;10;0;5;0;0;5;2;2;0;14;6;1 18;259;dgr;Drosophila grimshawi (D. grimshawi Feb. 2006 Agencourt CAF1);;;;;5.7;0;9;2;4;4;0;2;7;7;0;2;10;6;0;2;6;6;0;2;4;4;0;4;5;7;0;8;4;8;0;3;3;0;10;0;0;0;5;3;12;0;7;7;12;0;12;6;10;0;6;1;6;9;0;4;0;0;3;3;2;0;18;4;0 24;296;fpu;Fusarium pseudograminearum CS3096;;;;;6.6;0;9;1;3;17;0;2;5;10;0;2;6;19;0;2;3;11;0;2;2;9;0;3;2;10;0;4;3;14;0;4;3;0;9;0;0;0;6;5;6;0;8;2;17;0;9;4;24;0;5;0;4;11;0;8;1;0;9;1;2;0;13;5;1 19;292;fpu;Fusarium pseudograminearum CS3270;;;;;6.5;0;10;1;3;13;0;2;5;13;0;2;6;17;0;2;3;11;0;2;2;10;0;3;2;10;0;4;3;13;0;4;3;0;8;0;0;0;6;5;6;0;9;2;16;0;13;4;19;0;5;0;4;11;0;9;1;0;8;1;2;0;13;5;1 17;280;sceb*;Saccharomyces sp. boulardii 17;;;;;6.2;0;11;6;9;0;1;3;0;13;0;3;10;15;0;3;2;11;0;3;1;2;0;10;0;9;0;4;1;8;0;5;0;0;9;0;0;0;7;9;1;0;9;7;15;0;17;14;2;0;4;0;6;7;0;0;1;0;4;13;1;1;17;4;2 15;263;sceb*;Saccharomyces sp. boulardii ATCC MYA-796;;;;;5.8;0;11;7;9;0;1;3;0;12;0;2;10;13;0;2;2;10;0;3;1;2;0;10;0;10;0;5;1;11;0;5;0;0;8;0;0;0;8;7;1;0;8;7;13;0;14;13;2;0;4;0;6;6;0;0;1;0;4;10;1;0;15;3;2 14;265;ndi;Naumovozyma dairenensis CBS 421;;;;;5.9;0;9;9;8;1;0;4;0;12;0;2;9;14;0;2;2;11;0;3;1;1;0;11;0;11;0;5;2;10;0;5;0;0;9;0;0;0;7;10;1;0;9;8;12;0;13;13;1;0;5;0;5;5;0;0;2;0;5;11;1;0;12;3;1 13;224;vda;Verticillium dahliae JR2;;;;;4.9;0;7;1;1;8;0;1;4;10;0;0;9;11;0;1;2;6;1;2;4;8;0;3;2;8;0;2;3;11;0;2;4;0;6;0;0;0;6;2;5;0;6;2;12;0;9;2;12;0;5;1;3;9;0;2;2;0;5;3;2;0;13;3;3 11;178;afm;Aspergillus fumigatus Af293;;;;;4.0;0;5;1;2;6;0;0;4;7;0;1;8;7;0;1;2;5;0;1;2;5;0;2;2;6;0;3;2;8;0;3;2;0;5;0;0;0;4;2;6;0;5;1;8;0;9;4;8;0;3;0;3;9;0;2;2;0;4;1;2;0;11;3;1 10;141;cgi;Cryptococcus gattii WM276;;;;;3.1;0;5;1;3;6;0;0;1;6;0;1;6;7;0;0;2;6;0;1;1;6;0;1;0;5;0;1;1;7;0;1;2;0;4;0;0;0;4;2;3;0;4;1;7;0;0;3;10;0;3;0;3;3;0;5;1;0;2;1;3;0;9;3;0 9;139;cne;Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21;;;;;3.1;0;5;1;3;6;0;0;1;6;0;1;6;7;0;0;2;6;0;1;1;5;0;1;0;5;0;1;1;7;0;1;2;0;4;0;0;0;4;2;3;0;4;1;7;0;0;3;9;0;3;0;3;3;0;5;1;0;2;1;3;0;9;3;0 9;137;cnb;Cryptococcus neoformans var. neoformans B-3501A;;;;;3.0;0;5;1;3;6;0;0;1;6;0;1;6;7;0;0;2;4;0;1;1;5;0;1;0;5;0;1;1;7;0;1;2;0;4;0;0;0;4;2;3;0;4;1;7;0;0;3;9;0;3;0;3;3;0;5;1;0;2;1;3;0;9;3;0 8;130;cdu;Candida dubliniensis CD36;;;;;2.9;0;5;5;5;2;0;0;1;6;0;1;4;8;0;1;1;4;0;3;1;1;0;5;0;5;0;2;1;6;0;2;0;0;4;0;0;0;3;4;1;0;4;5;3;0;6;7;1;0;2;0;2;2;0;0;1;0;1;5;1;0;6;2;1 6;123;kpa*;Komagataella pastoris GS115;;;;;2.7;0;5;1;3;2;0;1;2;5;0;1;4;5;0;1;1;4;0;2;1;2;0;4;1;5;0;1;1;5;0;2;0;0;4;0;0;0;3;3;2;0;4;3;5;0;6;5;4;0;2;0;3;2;0;1;1;0;2;4;1;0;5;3;1 2;46;ehe;Encephalitozoon hellem ATCC 50504;;;;;1.0;0;1;1;1;1;0;1;1;1;0;1;2;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;0;1;0;0;0;1;1;1;0;2;1;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;0;1;0;0;1;1;1;0;1;1;1 2;46;ein;Encephalitozoon intestinalis ATCC 50506;;;;;1.0;0;1;1;1;1;0;1;1;1;0;1;2;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;0;1;0;0;0;1;1;1;0;2;1;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;0;1;0;0;1;1;1;0;1;1;1 2;46;ero;Encephalitozoon romaleae SJ-2008;;;;;1.0;0;1;1;1;1;0;1;1;1;0;1;2;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;0;1;0;0;0;1;1;1;0;2;1;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;0;1;0;0;1;1;1;0;1;1;1 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; Tableau des diagrammes des pentes;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; max;total;KEGG;eucaryote;;;;;moy;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg 2;35;pfa;Plasmodium falciparum;;;;;0.78;0;1;1;1;1;0;1;1;1;0;1;2;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;0;0;1;1;1;0;1;1;0;1;0;0;0;0;1;1;0;1;0;0;0;1;1;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;1;0;0;0;1;0 2;46;ecu;Encephalitozoon cuniculi GB-M1;;;;;1.02;0;1;1;1;1;0;1;1;1;0;1;2;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;0;1;0;0;0;1;1;1;0;2;1;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;0;1;0;0;1;1;1;0;1;1;1 2;53;ede*;Exophiala dermatitidis NIH/UT8656;;;;;1.16;0;1;1;1;1;1;1;1;2;0;1;1;2;0;1;1;1;0;1;1;0;0;1;1;2;0;1;1;2;0;1;1;0;1;0;0;0;2;1;1;0;1;1;0;0;2;1;2;0;1;0;0;2;0;2;1;0;1;0;1;0;2;1;2 4;80;opa*;Ogataea parapolymorpha DL-1;;;;;1.78;0;3;1;3;1;0;1;1;4;0;1;4;3;0;0;1;2;0;1;1;0;0;3;0;3;0;1;1;3;0;2;0;0;2;0;0;0;2;2;1;0;2;2;3;0;3;2;3;0;1;0;2;2;0;0;1;0;2;3;1;0;4;2;0 5;82;cot;Candida orthopsilosis Co 90-125;;;;;1.82;0;2;3;1;1;0;0;1;4;0;1;4;4;0;1;1;2;0;2;1;1;0;3;0;4;0;2;1;3;0;2;0;0;3;0;0;0;1;3;1;0;3;4;3;0;5;2;1;0;1;0;1;2;0;0;1;0;1;2;1;0;2;1;0 4;82;lma;Leishmania major;;;;;1.82;0;2;1;1;3;0;1;2;3;0;1;4;2;0;1;2;1;0;1;1;2;0;1;2;3;0;1;2;2;0;1;2;0;3;0;0;0;2;1;3;0;3;1;3;0;3;1;2;0;1;0;1;4;0;1;1;0;2;1;1;0;4;1;1 6;96;sre*;Sporisorium reilianum SRZ2;;;;;2.11;0;4;1;0;4;0;1;2;4;0;1;4;4;0;1;0;2;0;1;2;3;0;1;1;4;0;1;1;3;0;1;1;0;2;0;0;0;3;3;2;0;3;1;5;0;3;2;4;0;2;1;2;4;0;2;0;0;0;1;1;0;6;1;1 6;111;uma;Ustilago maydis 521;;;;;2.40;0;3;1;0;4;0;2;2;4;0;1;4;4;0;1;1;3;0;1;3;4;1;1;1;4;0;1;1;5;0;1;1;0;3;0;0;0;2;2;3;0;3;1;5;0;5;2;5;0;2;2;2;4;0;3;0;0;2;1;1;0;6;2;1 6;123;kpa*;Komagataella pastoris CBS 7435;;;;;2.73;0;5;1;3;2;0;1;2;5;0;1;4;5;0;1;1;4;0;2;1;2;0;4;1;5;0;1;1;5;0;2;0;0;4;0;0;0;3;3;2;0;4;3;5;0;6;5;4;0;2;0;3;2;0;1;1;0;2;4;1;0;5;3;1 6;125;cal;Candida albicans WO-1;;;;;2.78;0;5;5;6;2;0;0;1;6;0;1;4;6;0;1;1;4;0;3;1;1;0;4;0;4;0;2;1;6;0;2;0;0;4;0;0;0;3;5;1;0;3;5;2;0;6;6;1;0;2;0;2;2;0;0;1;0;2;5;1;0;5;2;1 10;143;cneg*;Cryptococcus neoformans var. grubii H99;;;;;3.18;0;5;1;3;6;0;0;1;6;0;1;7;7;0;0;2;6;0;1;1;6;0;1;0;5;0;1;1;8;0;1;2;0;4;0;0;0;4;2;3;0;4;1;7;0;0;3;10;0;3;0;3;3;0;5;1;0;2;1;3;0;9;3;0 10;154;ttt;Thielavia terrestris NRRL 8126;;;;;3.42;0;5;5;1;5;0;1;4;6;0;1;5;6;0;1;3;3;0;1;3;4;0;2;3;4;0;1;2;7;0;2;3;0;4;0;0;0;3;2;4;0;3;2;6;0;6;2;7;0;3;0;4;6;0;1;3;0;3;1;2;0;10;2;2 11;155;mgp;Meleagris gallopavo (turkey) (TGC Turkey_2.01 Dec 2009);;;;;3.42;0;6;1;2;1;0;1;4;3;0;1;11;3;1;2;3;5;0;3;1;7;0;2;1;4;0;2;0;7;0;6;3;0;6;0;0;0;3;1;1;0;4;4;3;0;3;5;6;0;5;0;5;2;0;1;2;0;6;3;3;0;5;4;3 9;156;vma*;Valsa mali 03-8;;;;;3.47;0;4;0;2;5;0;1;4;7;0;1;8;7;0;1;2;5;0;1;2;0;0;2;1;4;0;3;2;7;0;2;2;0;4;0;0;0;5;2;4;0;5;0;9;0;6;3;9;0;3;0;3;6;0;2;2;0;3;1;2;0;9;3;2 9;158;kna*;Kazachstania naganishii CBS 8797;;;;;3.51;0;6;3;5;1;0;3;0;7;0;2;4;7;0;1;2;7;0;1;1;1;0;6;0;7;0;2;1;7;0;1;1;0;5;0;0;0;4;4;2;0;6;4;7;0;8;5;3;0;4;0;4;3;0;0;1;0;3;6;1;0;9;1;2 9;162;kla;Kluyveromyces lactis NRRL Y-1140;;;;;3.58;0;5;3;7;0;1;2;0;7;0;1;6;7;0;1;2;6;0;2;1;1;0;7;0;6;0;2;1;7;0;3;0;0;5;0;0;0;4;6;1;0;6;4;9;0;8;8;2;0;3;0;4;3;0;0;1;0;2;7;1;0;7;2;1 9;168;spo;Schizosaccharomyces pombe 972h-;;;;;3.73;0;5;2;4;5;0;1;1;8;0;1;7;9;0;2;1;7;0;2;1;6;0;2;1;7;0;2;1;6;0;2;1;0;4;0;0;0;4;4;2;0;6;3;9;0;8;4;6;0;3;0;3;8;0;1;1;0;3;2;1;0;8;3;1 10;170;pic;Scheffersomyces stipitis CBS 6054;;;;;3.78;0;6;3;8;3;0;0;1;7;0;1;6;7;0;2;1;6;0;2;2;1;0;6;0;7;0;2;1;7;0;3;0;0;5;0;0;0;4;5;2;0;7;3;9;0;8;8;2;0;3;0;4;3;0;0;1;0;2;7;1;0;10;3;1 11;181;ani;Aspergillus nidulans FGSC A4;;;;;4.02;0;5;1;2;6;0;2;3;7;0;1;7;8;0;1;2;5;0;1;2;6;0;2;2;6;0;2;2;8;0;2;3;0;6;0;0;0;5;2;5;0;6;2;8;0;8;3;8;0;3;0;3;9;0;2;2;0;4;2;2;0;11;3;1 14;190;mgr;Magnaporthe oryzae 70-15;;;;;4.22;0;7;1;2;7;0;1;4;8;0;1;8;6;0;1;2;4;0;2;3;5;0;2;2;6;0;2;2;9;0;3;2;0;5;0;0;0;4;2;6;0;6;2;9;0;10;3;9;0;3;0;4;6;0;2;2;0;3;1;3;0;14;3;3 13;191;mun*;Melopsittacus undulatus (Budgerigar Sep. 2011 WUSTL v6.3/melUnd1);;;;;4.18;0;6;4;3;3;0;0;6;5;0;1;9;3;1;1;4;4;1;3;1;2;0;3;2;5;0;2;0;9;0;5;2;0;7;0;0;0;4;2;4;0;9;3;13;0;9;3;1;0;5;1;4;3;0;1;1;0;8;4;4;0;10;9;1 11;191;cjd*;Cyberlindnera jadinii NBRC 0988 NBRC0988;;;;;4.20;0;8;1;7;4;0;3;1;6;1;1;7;9;0;2;3;7;0;3;1;0;0;7;0;6;0;3;1;6;0;3;0;0;5;0;0;0;6;6;2;0;7;5;8;0;8;4;9;0;3;1;4;6;0;0;1;0;3;7;0;0;11;4;1 12;192;tdl;Torulaspora delbrueckii CBS 1146;;;;;4.24;0;6;3;8;0;1;4;0;8;0;1;7;12;0;1;2;7;0;2;1;1;0;6;0;9;0;2;1;8;0;4;0;0;6;0;0;0;4;6;2;0;7;5;10;0;9;8;4;0;3;0;4;4;0;0;1;0;3;7;1;0;11;2;1 12;192;pch*;Penicillium chrysogenum P2niaD18;;;;;4.22;0;5;0;0;6;1;0;3;10;0;2;10;9;0;1;3;7;0;1;2;0;0;0;1;12;0;3;2;8;0;2;2;0;5;0;0;0;11;3;5;0;6;1;9;0;9;3;10;0;3;1;0;10;0;2;2;0;4;0;2;0;11;4;1 11;192;mth*;Myceliophthora thermophila ATCC 42464;;;;;4.24;0;5;1;2;7;0;1;4;8;0;1;8;7;0;2;3;5;0;3;3;6;0;2;3;6;0;2;3;7;0;2;3;0;6;0;0;0;4;2;5;0;6;3;9;0;10;2;8;0;3;1;4;7;0;1;2;0;5;1;2;0;11;4;2 16;203;gfr;Geospiza fortis (Medium ground finch Apr. 2012 GeoFor_1.0/geoFor1);;;;;4.44;0;6;11;2;4;0;7;0;6;1;2;6;2;1;1;3;2;0;3;1;4;0;5;1;5;0;4;1;16;0;5;2;0;12;0;0;0;4;2;3;1;6;4;7;0;5;4;6;0;10;0;3;6;0;2;0;0;6;3;2;0;8;4;4 11;205;sas*;Saccharomycetaceae sp. Ashbya aceri;;;;;4.51;0;7;3;7;0;1;4;1;9;0;1;10;7;0;3;4;7;0;3;3;1;0;7;0;7;0;3;2;7;0;5;2;0;5;0;0;0;5;4;4;0;8;4;9;0;10;3;8;0;3;1;5;4;0;0;2;0;3;7;1;0;11;2;2 13;206;tpf;Tetrapisispora phaffii CBS 4417;;;;;4.56;0;9;9;2;0;1;2;0;10;0;2;8;10;0;2;1;8;0;2;1;1;0;7;0;9;0;2;1;9;0;3;0;0;6;0;0;0;5;7;1;0;9;6;9;0;12;11;1;0;4;0;4;3;0;0;1;0;3;8;1;0;13;2;1 12;207;cgr;Candida glabrata CBS 138;;;;;4.58;0;6;3;8;0;1;4;0;9;0;2;7;10;0;2;1;9;0;2;1;1;0;7;0;9;0;3;1;10;0;5;0;0;6;0;0;0;6;6;2;0;9;3;12;0;9;9;3;0;3;0;5;4;0;0;1;0;3;9;1;0;12;2;1 12;211;acs;Anolis carolinensis (lizard) (Broad AnoCar2.0 May 2010);;;;;4.64;0;5;2;2;4;0;3;4;6;0;1;12;5;0;2;3;5;0;1;2;3;1;3;2;4;0;3;1;12;0;6;3;0;6;0;0;0;5;3;5;0;10;5;6;0;8;7;5;0;12;1;7;4;0;3;1;0;5;3;3;0;7;8;2 10;212;bfu;Botrytis cinerea B05.10;;;;;4.69;0;7;2;5;6;0;1;1;8;0;1;8;8;0;2;2;7;0;3;2;4;0;7;1;6;0;3;0;8;0;5;2;0;6;0;0;0;4;6;2;0;6;3;10;0;9;6;9;0;5;0;6;6;0;4;2;0;5;5;1;1;8;2;7 11;214;dha;Debaryomyces hansenii CBS767;;;;;4.71;0;8;9;4;2;0;0;1;9;1;2;10;10;0;1;1;6;0;4;1;1;0;7;0;8;0;2;1;7;0;5;1;0;6;0;0;0;6;7;1;0;9;8;10;0;10;9;1;0;4;1;4;5;0;0;1;0;3;10;1;0;11;5;1 13;225;vda;Verticillium dahliae VdLs.17;;;;;4.93;0;7;1;1;8;0;1;4;9;0;0;9;11;0;1;2;6;1;2;4;8;0;3;2;8;0;2;3;11;0;2;4;1;6;0;0;0;6;2;5;0;6;2;12;0;10;2;12;0;5;1;3;9;0;2;2;0;5;3;2;0;13;3;3 15;229;lth;Lachancea thermotolerans CBS 6340;;;;;5.04;0;7;2;8;0;2;3;3;10;0;1;8;11;0;1;3;9;0;2;2;2;0;8;0;9;0;2;1;10;0;3;2;0;6;0;0;0;5;5;5;0;7;4;14;0;10;6;11;0;4;0;5;4;0;0;1;0;3;9;1;0;15;3;2 21;230;tgu;Taeniopygia guttata (Zebra finch Feb. 2013 WashU taeGut324/taeGut2);;;;;4.87;0;10;4;4;1;0;1;7;21;2;1;5;3;2;1;1;3;0;2;1;6;0;1;2;8;1;4;2;18;0;7;3;0;13;0;0;0;5;1;6;2;8;4;5;0;7;2;3;1;9;1;3;6;0;2;0;1;5;3;2;1;8;7;4 15;242;aor;Aspergillus oryzae RIB40;;;;;5.31;0;7;2;0;0;0;1;4;10;0;2;6;10;1;2;3;7;0;1;3;9;0;2;0;10;0;2;2;10;0;3;4;1;13;0;0;0;8;4;7;0;8;3;11;0;13;6;11;1;4;0;4;12;0;2;3;0;6;2;2;0;15;4;1 27;252;mlu*;Myotis lucifugus (Microbat Jul. 2010 Broad Institute Myoluc2.0/myoLuc2);;;;;5.49;0;5;2;3;3;0;5;2;10;0;3;14;5;0;3;5;6;0;2;2;6;0;3;3;5;0;5;3;8;0;1;3;0;5;0;0;5;7;3;7;0;9;3;11;0;8;5;6;0;27;0;4;6;0;5;2;0;5;5;5;0;8;6;3 15;256;dsi;Drosophila simulans (D. simulans Apr. 2005 WUGSC mosaic 1.0);;;;;5.67;0;8;3;4;5;0;2;9;8;0;0;12;7;0;2;6;8;0;2;3;6;0;5;5;8;0;5;4;9;0;5;0;0;10;0;0;0;6;4;8;0;6;4;11;0;6;5;10;0;7;1;9;9;0;5;0;0;3;3;3;0;15;5;0 20;258;mmr*;Microcebus murinus (Mouse lemur) (Jun 2003);;;;;5.71;0;8;3;3;5;0;2;7;4;0;3;14;4;0;2;5;7;0;2;3;7;0;4;3;3;0;3;2;11;0;5;3;0;8;0;0;0;6;4;12;0;9;5;6;0;5;9;8;1;20;0;6;6;0;3;2;0;7;5;3;0;11;7;2 15;258;lkl*;Lachancea kluyveri NRRL Y-12651;;;;;5.69;0;8;3;11;0;1;3;0;12;0;1;10;14;0;1;3;11;0;2;1;1;1;10;0;12;0;2;1;13;0;4;0;0;7;0;0;0;6;10;1;0;9;5;14;0;13;13;3;0;5;0;5;5;0;0;1;0;4;12;1;0;15;2;2 17;266;kaf;Kazachstania africana CBS 2517;;;;;5.91;0;9;14;2;2;0;2;0;13;0;2;9;13;0;2;1;11;0;4;1;1;0;10;0;11;0;3;1;12;0;5;0;0;9;0;0;0;6;9;1;0;10;8;12;0;13;15;2;0;5;0;6;4;0;0;1;0;4;11;1;0;17;3;1 14;270;ncs;Naumovozyma castellii CBS 4309;;;;;6.00;0;10;7;9;2;0;3;0;12;0;2;9;13;0;2;2;12;0;4;1;1;0;10;0;11;0;3;2;12;0;5;0;0;9;0;0;0;8;9;1;0;10;8;14;0;14;13;1;0;4;0;7;5;0;0;2;0;4;10;1;0;13;3;2 16;270;fgr;Fusarium graminearum CS3005;;;;;5.98;0;9;1;3;6;0;2;5;11;0;2;5;16;0;2;3;11;0;2;2;10;0;3;2;11;0;4;3;13;0;3;3;0;6;0;0;0;7;5;7;0;9;2;12;0;10;4;13;0;5;1;4;10;0;9;1;0;8;2;2;0;15;5;1 17;272;zro;Zygosaccharomyces rouxii CBS 732;;;;;6.00;0;8;4;10;0;1;5;0;11;1;1;9;12;0;2;4;12;0;3;2;3;0;10;0;10;0;2;2;12;0;9;0;0;7;0;0;0;6;10;3;0;9;7;14;0;14;10;4;0;4;0;6;5;0;0;1;0;5;8;2;0;17;5;2 15;273;fve*;Flammulina velutipes KACC42780;;;;;5.98;2;15;1;4;6;0;2;2;10;0;2;14;7;0;3;3;7;0;2;3;4;0;4;2;7;0;3;4;13;0;9;5;0;6;0;0;0;3;4;6;1;12;6;11;1;2;6;11;0;4;0;4;13;0;8;2;0;4;2;6;0;11;8;8 16;275;sce;Saccharomyces cerevisiae (S288c Apr 2011);;;;;6.09;0;10;7;10;0;1;3;0;13;0;2;10;14;0;2;2;11;0;3;1;2;0;10;0;11;0;4;1;11;0;5;0;0;8;0;0;0;7;9;1;0;10;7;14;0;16;14;2;0;4;0;6;6;0;0;1;0;4;11;1;0;16;3;2 24;283;gga;Gallus gallus (galGal4 Nov 2011);;;;;6.24;0;10;3;3;3;0;2;7;7;0;2;14;7;1;3;7;9;0;4;2;7;0;4;3;4;0;4;2;24;0;7;4;0;16;0;0;0;6;2;5;0;11;6;6;0;10;9;7;0;11;1;6;8;0;2;2;0;7;4;3;0;7;7;4 16;285;fvr;Fusarium verticillioides 7600;;;;;6.33;0;10;2;4;12;0;2;5;11;0;1;8;13;0;2;3;10;0;2;3;10;0;3;2;11;0;4;2;14;0;3;3;0;8;0;0;0;6;4;8;0;8;2;15;0;14;5;16;0;5;0;5;10;0;7;1;0;7;2;2;0;14;5;1 16;288;mfa*;Millerozyma farinosa CBS 7064;;;;;6.40;0;10;4;14;4;0;0;2;12;0;4;10;12;0;2;4;10;0;4;2;2;0;8;0;10;0;4;2;12;0;8;2;0;10;0;0;0;8;8;4;0;12;6;10;0;14;8;8;0;4;0;6;4;0;0;2;0;6;10;2;0;16;6;2 14;289;dme;Drosophila melanogaster (D. melanogaster Aug. 2014 BDGP Release 6 + ISO1 MT/dm6);;;;;6.40;0;8;4;4;4;0;2;8;9;0;2;12;6;0;2;7;8;0;2;4;7;0;5;5;8;0;6;3;12;0;2;3;0;9;0;0;0;5;4;8;0;10;6;13;0;14;6;13;0;7;1;8;10;0;10;0;0;6;3;3;0;14;6;0 19;305;fgr;Fusarium graminearum PH-1 NRRL 31084;;;;;6.76;0;11;2;3;13;0;2;5;13;0;2;6;19;0;2;3;11;0;2;2;10;0;3;2;11;0;4;3;14;0;4;2;0;8;0;0;0;7;5;7;0;9;3;16;0;14;5;19;0;5;1;4;10;0;9;1;0;8;2;2;0;14;6;1 21;326;oga*;Otolemur garnettii (Bushbaby Mar. 2011 Broad/otoGar3);;;;;6.96;1;6;3;5;4;0;3;9;10;9;11;13;6;0;3;5;6;0;3;3;7;0;4;3;9;0;6;3;13;0;7;3;0;8;0;0;0;8;5;9;0;12;11;9;0;13;5;8;0;21;1;6;6;0;4;3;2;7;4;5;0;12;9;3 18;326;dya;Drosophila yakuba (D. yakuba Nov. 2005 WUGSC 7.1);;;;;7.22;0;9;5;4;5;0;2;8;10;0;2;15;7;0;2;10;9;0;2;5;6;0;8;5;8;0;6;5;18;0;2;5;0;9;0;0;0;5;4;8;0;11;6;16;0;15;7;14;0;8;1;8;12;0;7;0;0;6;3;4;0;16;7;1 23;328;tbl;Tetrapisispora blattae CBS 6284;;;;;7.27;0;12;12;9;0;1;2;0;17;0;2;11;18;0;2;1;16;0;4;2;1;0;13;0;15;0;3;1;19;0;5;0;0;9;0;0;0;7;10;1;0;11;9;15;0;19;16;1;0;5;0;7;4;0;0;1;0;6;13;1;0;23;3;1 19;334;sbq;Saimiri boliviensis (Squirrel monkey Oct. 2011 Broad/saiBol1);;;;;7.27;0;9;8;5;6;0;4;5;10;1;6;14;6;1;4;7;9;1;3;3;9;0;5;4;8;0;6;5;15;0;8;5;1;8;0;0;0;8;6;10;0;11;12;9;0;9;10;5;0;19;3;6;6;0;4;3;0;7;5;5;0;10;6;4 17;338;opr*;Ochotona princeps (Pika May 2012 OchPri3.0/ochPri3);;;;;7.49;0;10;3;4;5;0;5;11;8;0;4;15;7;0;4;7;7;0;3;4;8;0;4;4;7;0;6;7;15;0;7;4;0;10;0;0;0;5;5;12;0;14;9;11;0;14;7;11;0;10;1;6;7;0;6;4;0;7;5;6;0;17;7;5 29;353;meu*;Macropus eugenii (Wallaby Sep. 2009 TWGS Meug_1.1/macEug2);;;;;7.62;1;10;3;8;5;0;4;6;6;0;6;14;8;0;1;7;8;0;4;2;7;0;4;2;8;0;6;3;13;0;6;5;1;8;0;0;1;7;4;7;0;14;10;11;0;13;12;7;0;29;7;8;7;0;3;5;0;10;7;4;0;16;10;5 46;367;hgl;Heterocephalus glaber (Naked mole-rat Jan. 2012 Broad HetGla_female_1.0/hetGla2);;;;;7.62;0;6;4;5;5;0;5;5;8;0;3;14;12;1;4;6;7;0;3;3;13;0;5;3;15;2;4;4;46;6;5;6;0;7;0;0;0;7;3;6;0;9;8;15;2;10;6;4;0;23;7;6;5;0;4;4;2;7;6;5;4;10;4;3 20;373;lcm;Latimeria chalumnae (Coelacanth Aug. 2011 Broad/latCha1);;;;;7.96;0;7;11;4;4;0;5;8;7;0;7;11;3;0;7;4;3;0;6;3;12;0;10;4;11;0;9;2;5;0;20;3;2;8;0;0;0;5;10;9;3;9;20;13;1;19;11;8;5;17;4;15;4;0;1;4;0;8;9;8;0;7;5;2 25;374;san*;Sorex araneus (Shrew Aug. 2008 Broad/sorAra2);;;;;8.24;0;10;4;4;6;1;2;13;15;0;5;15;7;0;5;7;8;0;3;4;8;0;6;2;8;0;5;5;10;0;8;3;0;9;0;0;0;7;5;7;0;12;8;13;0;19;10;14;0;25;2;6;9;0;5;3;0;8;6;6;0;22;12;2 34;383;cpo*;Cavia porcellus (Guinea pig) (Broad Feb 2008);;;;;8.36;0;8;4;6;5;0;3;6;10;0;5;15;6;1;3;6;8;0;3;4;8;0;4;3;10;0;4;3;28;4;9;5;0;15;0;0;0;8;4;8;0;18;11;26;1;10;6;5;0;34;1;8;7;0;4;3;0;10;5;5;0;11;6;6 26;396;ncr;Neurospora crassa OR74A;;;;;8.78;0;12;1;5;17;0;2;6;17;1;1;17;19;0;2;4;14;0;3;4;11;0;4;4;12;0;3;3;19;0;3;5;0;10;0;0;0;9;3;11;0;12;2;24;0;18;5;24;0;7;0;7;21;0;2;3;0;6;5;5;0;26;4;3 40;407;rno;Rattus norvegicus (rn5 Mar 2012);;;;;8.89;1;8;3;0;1;0;1;5;12;0;3;13;8;0;3;7;11;0;4;3;33;0;6;3;9;0;5;4;36;2;9;4;0;2;0;0;0;10;6;10;0;15;1;19;2;15;10;8;0;40;1;8;6;0;3;5;1;12;6;8;0;11;9;5 30;408;cjc;Callithrix jacchus (marmoset) (WUGSC 3.2 Mar 2009);;;;;8.80;0;8;9;6;7;0;3;11;9;2;5;19;6;1;4;10;9;0;5;4;7;0;6;4;9;1;6;4;15;1;5;4;0;19;0;0;1;8;4;12;0;23;14;11;1;13;11;12;0;30;2;6;6;3;4;3;0;8;5;5;0;14;9;4 28;411;pha*;Papio hamadryas (baboon) (Nov 2008);;;;;8.93;0;12;7;7;9;0;3;6;12;2;4;15;9;1;7;12;9;0;5;3;7;0;6;4;10;0;7;6;19;1;9;5;0;15;0;0;0;10;6;11;1;18;12;12;1;10;13;4;2;28;1;8;7;0;6;4;0;9;6;5;0;13;4;8 31;414;aga;Anopheles gambiae;;;;;9.20;0;9;2;3;5;0;3;10;12;0;2;18;31;0;3;29;6;0;2;8;7;0;8;13;8;0;2;5;17;0;3;6;0;22;0;0;0;21;4;11;0;11;8;17;0;20;11;15;0;5;0;6;10;0;8;0;0;6;2;2;0;15;8;0 24;418;ppp;Physcomitrella patens ;;;;;9.18;1;14;2;6;6;1;5;5;12;0;4;24;13;0;2;11;13;0;5;7;13;0;8;4;10;0;5;6;19;0;9;8;0;8;0;0;0;9;9;10;1;14;8;16;0;11;7;14;0;7;1;9;8;1;7;5;0;9;6;10;0;15;9;11 22;421;nle;Nomascus leucogenys (Gibbon Oct. 2012 GGSC Nleu3.0/nomLeu3);;;;;9.04;1;11;7;5;8;0;3;9;12;3;5;16;11;1;6;10;9;1;4;4;9;1;5;4;11;0;4;5;18;1;9;5;0;14;0;0;0;11;9;13;2;14;22;15;0;10;10;8;1;22;3;8;7;0;7;3;0;8;6;5;0;12;6;7 28;435;ggo;Gorilla gorilla gorilla (gorilla) (gorGor3.1 May 2011);;;;;9.42;0;12;8;7;8;0;4;5;11;2;6;17;9;1;8;10;10;1;4;5;8;0;7;4;9;0;6;6;22;2;6;4;1;16;0;0;0;7;7;14;1;24;13;14;0;15;14;7;0;28;3;8;7;0;6;5;0;8;5;6;0;12;3;9 45;446;shr;Sarcophilus harrisii (Tasmanian devil Feb. 2011 WTSI Devil_ref v7.0/sarHar1);;;;;9.87;0;13;6;3;9;0;4;9;11;0;4;22;8;0;4;10;10;0;5;3;10;0;6;3;9;0;7;2;18;0;7;4;0;11;0;0;0;9;45;10;0;13;14;32;0;19;15;10;0;8;2;8;4;0;5;3;0;8;5;4;0;19;9;6 64;455;tsy*;Tarsius syrichta (Tarsier Sep. 2013 Tarsius_syrichta-2.0.1/tarSyr2);;;;;9.25;0;6;#;4;6;0;5;7;8;0;4;12;6;0;4;6;7;0;5;3;7;1;32;4;9;0;4;4;12;0;4;3;0;10;0;0;1;10;64;6;1;15;10;7;1;13;9;10;1;25;1;6;6;0;5;3;0;9;6;4;0;14;6;7 27;458;mcc;Macaca mulatta (Rhesus Oct. 2010 BGI CR_1.0/rheMac3);;;;;9.80;0;9;15;8;9;0;5;6;10;5;7;18;10;3;6;11;9;2;6;4;8;0;8;3;9;0;5;4;21;1;10;5;1;23;0;0;0;14;10;12;2;19;16;13;1;14;11;6;0;27;2;8;6;0;5;4;0;8;6;7;0;14;4;8 60;469;mmu;Mus musculus (mm10 Dec 2011);;;;;10.13;0;7;7;4;5;0;4;10;12;1;5;19;8;1;3;12;10;1;3;3;8;1;8;3;11;0;4;4;23;4;11;10;0;11;0;0;1;10;7;12;0;13;14;26;0;16;8;14;1;60;1;8;6;0;5;3;0;8;6;5;2;15;8;7 27;476;pan*;Papio anubis (Baboon Mar. 2012 Baylor Panu_2.0/papAnu2);;;;;10.20;1;13;8;8;8;0;3;11;14;2;6;19;9;1;7;12;9;1;5;3;8;0;6;4;10;0;7;6;20;1;9;5;3;21;0;0;0;10;9;12;2;21;14;15;2;15;13;9;1;27;3;9;7;0;5;4;0;11;6;5;0;20;8;8 46;481;mdo;Monodelphis domestica (opossum) (Broad Oct 2006);;;;;10.58;0;12;2;4;8;0;6;11;13;0;7;25;9;0;5;9;12;0;6;3;11;0;8;3;12;0;7;3;15;0;9;6;0;15;0;0;0;9;7;11;0;13;13;19;1;24;14;13;4;46;0;9;5;0;5;4;0;9;6;5;0;24;11;8 34;485;eeu*;Erinaceus europaeus (Hedgehog May 2012 EriEur2.0/eriEur2);;;;;7.59;0;8;3;6;6;0;3;6;9;0;4;16;7;0;6;4;7;0;3;3;10;0;5;3;9;0;6;4;14;0;10;4;0;13;0;0;0;5;4;8;0;7;11;€;0;13;8;9;0;34;2;7;6;0;5;3;0;7;5;7;0;14;7;5 51;494;ecb;Equus caballus (horse) (Sep 2007);;;;;10.76;0;12;4;6;7;0;5;3;20;0;5;25;12;3;6;15;12;0;4;4;10;0;7;3;9;0;7;3;27;0;11;8;1;14;0;0;1;11;6;12;1;17;15;16;0;10;11;51;0;25;4;7;10;0;4;4;0;12;5;7;0;10;4;8 86;498;cge;Cricetulus griseus cell line CHO-K1 (Chinese hamster ovary CriGri 1.0 Aug 2011);;;;;10.96;0;8;4;4;5;0;4;10;13;0;5;16;13;0;5;9;6;0;3;3;7;0;6;3;8;1;4;4;22;1;15;6;0;11;0;0;0;14;5;11;0;17;15;86;0;15;7;20;0;41;2;6;6;0;6;3;0;9;5;6;1;14;6;7 28;499;vvi;Vitis vinifera (Grapevine 12X);;;;;10.89;0;14;7;13;10;0;9;7;13;1;7;25;14;0;5;9;13;1;7;3;13;0;16;4;10;2;6;3;11;0;28;5;1;17;0;0;1;12;9;10;1;18;11;13;1;18;14;21;0;11;1;10;8;0;5;4;0;9;6;7;0;17;12;6 30;503;ptr;Pan troglodytes (Chimp Feb. 2011 CSAC 2.1.4/panTro4);;;;;10.82;0;15;10;7;9;0;3;6;14;1;5;21;11;1;10;12;11;1;7;4;9;1;8;5;10;0;6;5;30;1;9;5;2;22;0;0;0;10;8;10;1;27;14;19;1;15;15;11;1;27;2;7;7;1;6;5;3;9;6;5;0;13;6;13 29;506;ocu;Oryctolagus cuniculus (rabbit) (Broad Apr 2009);;;;;10.67;0;14;6;3;5;0;4;16;11;1;7;18;12;0;8;14;10;0;4;5;9;0;5;4;8;1;7;5;21;0;9;4;0;12;0;0;0;9;5;15;1;26;12;29;1;23;18;19;0;25;1;10;7;0;4;5;0;10;6;6;21;0;14;16 34;510;yli;Yarrowia lipolytica CLIB122;;;;;11.33;0;17;1;3;21;0;2;13;26;0;1;18;24;0;2;8;21;0;2;4;21;0;3;2;22;0;3;2;30;0;4;2;0;14;0;0;0;12;3;15;0;16;4;34;0;28;6;27;0;8;0;13;1;0;25;0;0;6;4;1;0;30;11;0 33;517;ppy*;Pongo pygmaeus abelii (Orangutan July 2007 WUGSC 2.0.2/ponAbe2);;;;;11.18;0;13;6;6;10;0;3;11;14;4;6;20;10;1;7;18;10;1;6;5;10;0;7;5;12;0;4;7;22;1;9;4;1;19;0;0;0;10;7;13;2;33;20;22;1;13;22;8;0;30;3;6;7;0;6;7;0;8;8;7;0;14;8;10 77;518;csi*;Ceratotherium simum (White rhinoceros May 2012 CerSimSim1.0/cerSim1);;;;;11.40;0;13;5;6;6;0;4;4;13;0;5;26;11;1;7;15;13;0;5;4;10;0;7;4;10;0;8;5;23;0;13;6;0;11;0;0;0;10;5;12;2;14;15;22;1;13;11;77;0;24;1;8;10;0;5;4;0;13;6;7;0;10;4;9 32;540;tng;Tetraodon nigroviridis (tetraodon) (Genoscope 8.0 Mar 2007);;;;;11.91;1;17;5;7;15;0;6;32;16;0;5;20;10;0;4;15;12;1;7;2;11;1;11;4;26;0;10;13;20;0;10;4;0;13;0;0;0;12;9;18;0;17;9;20;0;18;15;13;0;15;1;10;14;0;6;2;0;11;9;9;0;14;14;6 36;554;cpic;Chrysemys picta bellii (Painted turtle Dec. 2011 v3.0.1/chrPic1);;;;;11.87;2;22;13;7;2;1;4;6;11;1;13;16;16;0;5;6;24;0;15;10;12;1;4;2;17;0;18;5;11;1;15;4;1;5;0;0;0;10;16;11;1;17;36;9;0;14;17;5;5;18;4;10;7;0;5;3;3;20;26;10;0;11;24;2 35;575;tru;Takifugu rubripes (Fugu Oct. 2011 FUGU5/fr3);;;;;12.64;1;18;6;9;10;0;4;21;11;0;6;35;19;0;8;25;11;0;7;3;10;0;7;6;18;0;7;7;10;0;8;6;1;13;0;0;1;19;8;12;0;20;19;19;1;22;13;20;0;15;1;16;16;1;7;4;0;17;13;10;0;18;12;4 37;578;sbi;Sorghum bicolor (Version 1.0);;;;;12.56;0;20;4;9;15;0;9;11;17;0;5;37;16;2;4;10;11;3;12;6;14;0;11;7;12;2;9;6;18;0;13;11;1;14;0;0;1;15;11;13;1;16;9;18;2;24;13;23;0;13;1;13;15;0;4;7;0;13;7;10;0;24;10;6 40;582;mtr;Medicago truncatula (March 2009 Version 3.0);;;;;12.47;0;26;7;14;9;0;10;4;19;0;10;40;17;3;7;7;12;2;8;2;7;0;11;1;10;4;10;1;25;0;16;3;1;12;0;0;0;17;17;5;9;28;18;16;0;28;19;11;0;10;1;14;12;0;5;3;0;15;8;6;1;23;15;3 34;596;cel;Caenorhabditis elegans (WS220 Oct 2010);;;;;13.18;0;15;4;7;20;0;3;5;21;0;7;19;19;0;5;6;15;0;9;6;6;0;31;4;17;0;11;7;22;0;9;4;0;19;0;0;0;19;20;7;0;20;14;30;0;27;17;24;0;13;2;12;18;0;8;1;1;9;8;4;0;14;34;3 40;618;pop;Populus trichocarpa (Jan 2010 Version 2.0) ;;;;;13.53;4;18;7;3;40;1;0;7;20;1;9;26;17;0;8;10;13;1;9;5;14;0;22;4;6;0;11;4;20;0;18;5;0;18;0;0;0;13;11;11;0;22;17;17;0;33;14;21;1;13;1;14;10;0;7;5;0;16;11;11;0;25;17;7 40;622;hsa;Homo sapiens (hg38 - GRCh38 Dec 2013);;;;;13.31;0;18;8;12;12;0;4;11;19;6;5;22;11;1;8;21;12;1;6;5;10;1;8;4;10;0;6;7;35;1;10;5;5;32;0;0;0;10;18;24;2;40;20;24;1;16;17;10;1;38;3;8;7;0;6;4;1;8;7;5;0;15;9;12 55;639;bdi;Brachypodium distachyon (JGI v1.0 8X);;;;;13.82;0;18;4;15;14;0;10;8;20;2;4;55;15;3;5;11;11;4;10;5;15;0;18;8;9;3;10;6;19;0;12;11;1;17;0;0;3;21;15;11;0;16;12;18;0;25;15;19;0;14;0;18;16;1;5;6;0;18;9;9;0;27;9;9 43;674;oni*;Oreochromis niloticus (Nile tilapia Jan. 2011 Broad oreNil1.1/oreNil2);;;;;14.80;0;23;12;7;14;0;7;16;25;0;25;27;8;0;9;9;10;0;10;6;14;0;11;4;18;1;25;8;18;0;11;12;3;18;0;0;0;23;6;11;0;9;16;43;0;10;14;15;1;42;1;12;16;0;7;6;2;10;27;18;0;13;12;9 83;684;ath;Arabidopsis thaliana (TAIR10 Feb 2011);;;;;15.00;0;17;6;12;12;1;11;3;17;2;5;32;14;2;7;8;37;3;12;7;15;0;47;5;10;1;9;5;16;0;10;7;0;83;0;0;0;12;10;9;0;19;15;17;0;29;14;13;0;17;0;16;11;0;6;4;0;16;10;8;0;25;12;5 56;738;osa;Oryza sativa;;;;;15.67;0;20;4;19;15;0;10;10;18;0;5;56;17;16;4;10;12;4;17;8;14;0;14;9;11;8;15;5;20;1;10;12;2;19;0;0;0;26;21;10;0;29;12;20;1;31;16;25;1;17;0;18;24;0;4;8;0;20;12;11;0;28;9;10 36;738;gmx;Glycine max (soybean) (Wm82.a2);;;;;16.31;0;22;9;18;16;0;10;7;31;0;8;36;22;1;9;13;15;0;11;6;21;0;27;5;9;1;10;4;24;0;17;8;0;21;0;0;0;18;13;13;2;22;20;22;0;33;16;24;0;14;0;18;13;0;9;5;0;28;18;13;0;29;18;9 42;743;cbr;Caenorhabditis briggsae (C. briggsae Jan. 2007 WUGSC 1.0/cb3);;;;;16.51;0;22;6;11;26;0;5;7;21;0;24;23;25;0;6;6;17;0;8;8;6;0;41;4;22;0;10;9;29;0;14;7;0;19;0;0;0;21;24;10;0;23;16;40;0;34;19;30;0;16;0;13;22;0;10;0;0;9;10;2;0;21;42;5 37;749;mpu*;Mustela putorius furo (Ferret Apr. 2011 MusPutFur1.0/musFur1);;;;;10.68;0;11;4;6;6;0;4;5;10;0;5;20;8;0;6;7;8;0;4;4;9;0;7;2;10;0;7;5;15;0;8;5;0;9;0;0;1;7;37;17;6;12;31;€;0;8;7;19;0;25;1;11;6;0;29;5;0;12;16;21;0;9;9;4 48;804;str*;Spermophilus tridecemlineatus (Squirrel Nov. 2011 Broad/speTri2);;;;;11.02;1;10;3;10;6;0;3;4;14;6;4;14;18;3;5;39;15;1;7;6;12;1;7;3;34;5;6;7;€;31;39;18;0;9;0;0;0;6;4;6;1;9;10;12;6;8;5;7;0;48;1;7;6;0;5;3;0;7;5;6;7;13;5;20 97;807;ssc;Sus scrofa (Pig Aug. 2011 SGSC Sscrofa10.2/susScr3);;;;;12.68;0;21;4;6;8;0;5;5;13;0;5;23;10;1;11;12;10;0;5;4;9;0;4;3;13;0;8;4;23;0;14;7;0;17;0;0;0;10;9;12;2;18;38;16;10;97;€;13;1;23;0;7;7;0;5;3;0;10;7;4;0;19;10;6 47;827;cja*;Caenorhabditis japonica (WUGSC 3.0.2 Mar 2008);;;;;18.33;1;24;5;7;26;0;6;12;26;0;7;30;23;0;7;13;19;0;7;15;9;0;43;8;24;0;12;11;31;0;11;8;0;24;0;0;0;17;14;16;0;23;30;37;0;41;20;40;0;15;1;18;21;0;11;1;0;15;12;3;0;34;47;2 83;856;oaa;Ornithorhynchus anatinus (platypus) (WUGSC 5.0.1 Mar 2007);;;;;18.56;1;24;10;10;8;0;7;18;27;0;10;32;23;1;15;10;16;4;6;8;19;4;12;7;23;1;18;10;83;0;17;11;0;28;0;0;1;24;11;19;0;21;32;25;0;27;16;27;0;37;5;14;12;0;7;14;2;18;6;9;2;40;15;9 43;906;cfa;Canis familiaris (dog) (CanFam3.1 Sept 2011);;;;;11.23;0;10;4;5;4;0;4;7;9;0;5;23;6;0;5;8;10;0;5;8;8;0;8;4;8;0;4;5;14;0;11;4;0;9;0;0;0;9;43;20;1;21;34;€;2;13;15;22;0;21;1;6;6;0;15;4;0;8;9;29;0;11;11;9 82;1065;spu;Strongylocentrotus purpuratus (Sea urchin) ;;;;;23.56;2;0;14;2;18;0;8;5;69;2;22;73;20;0;11;16;25;0;15;6;19;0;21;9;27;0;21;9;32;0;17;7;0;24;0;0;0;26;17;21;0;39;57;42;0;82;26;29;0;31;0;18;29;0;19;1;1;17;18;19;0;42;33;4 66;1095;cbr*;Caenorhabditis brenneri (WUGSC 6.0.1 Feb 2008);;;;;24.07;0;24;7;14;32;0;8;8;33;1;26;29;33;0;8;15;20;0;14;9;25;2;54;9;31;1;15;10;35;0;11;6;2;28;0;0;1;26;40;11;0;33;29;49;0;34;36;37;2;21;3;22;32;0;17;24;0;14;13;11;0;39;66;25 66;1119;dno*;Dasypus novemcinctus (Armadillo Dec. 2011 Baylor/dasNov3);;;;;15.86;0;12;8;8;5;0;3;10;12;1;6;30;12;1;16;#;10;0;6;6;7;0;7;4;11;0;8;7;23;2;66;17;0;14;0;0;1;10;5;10;0;23;18;43;0;21;20;45;0;22;1;15;10;0;8;5;0;10;9;47;24;19;€;34 61;1176;oas;Ovis aries (sheep) (Feb 2010);;;;;12.50;1;6;5;7;6;0;2;3;6;0;5;18;7;0;8;9;2;3;4;3;4;0;6;1;5;0;5;3;18;3;12;7;2;16;0;0;0;8;7;9;0;13;22;16;2;8;€;60;16;61;4;47;2;2;6;6;0;7;22;33;5;30;€;€ 82;1198;zma;Zea mays (Version 5b.60);;;;;23.18;1;25;5;20;29;0;9;13;69;0;5;79;22;12;4;16;13;22;11;6;15;0;31;9;20;13;14;6;66;0;15;22;0;21;0;0;1;26;22;13;0;49;82;€;1;42;22;30;1;25;0;27;35;0;7;6;0;14;9;11;0;33;11;11 55;1463;aml;Ailuropoda melanoleuca (panda) (BGI-Shenzhen AilMel 1.0 Dec 2009);;;;;13.84;0;11;5;9;7;0;5;7;12;0;6;24;10;0;7;9;10;0;6;4;9;0;11;5;10;0;9;10;17;0;9;5;0;11;0;0;0;8;43;25;6;28;55;€;1;11;11;37;0;25;2;10;8;1;#;7;2;13;17;45;0;10;7;7 63;1492;gmo*;Gadus morhua (Atlantic cod May 2010 Genofisk GadMor_May2010/gadMor1);;;;;30.05;6;36;16;15;33;0;24;47;26;0;18;€;21;0;9;28;30;0;18;14;55;0;21;22;30;0;30;30;55;1;24;26;0;50;0;0;1;26;11;45;2;34;63;43;1;30;51;50;0;27;2;29;31;2;17;10;1;41;21;28;0;30;39;18 76;2002;lav;Loxodonta africana (elephant) (Broad/July 2009);;;;;25.95;1;32;15;17;22;0;11;10;43;0;7;50;41;1;50;35;29;0;7;4;16;0;14;3;14;1;22;10;54;0;53;15;1;19;0;0;3;27;14;28;4;51;60;36;0;20;€;24;1;28;24;23;14;0;18;3;3;76;#;16;4;33;€;# 40;2017;tma*;Trichechus manatus latirostris (Manatee Oct. 2011 Broad v1.0/triMan1);;;;;13.98;1;11;6;10;8;0;5;5;13;1;8;21;11;0;26;16;14;0;6;4;11;0;8;3;16;1;18;4;20;1;40;6;1;15;0;0;0;12;8;10;1;23;31;16;1;15;€;19;5;22;18;13;8;0;12;7;5;36;€;13;9;23;€;# 90;2485;pma*;Petromyzon marinus (Lamprey Sep. 2010 WUGSC 7.0/petMar2);;;;;34.89;2;57;5;#;€;0;40;#;€;0;10;€;€;1;26;#;22;0;20;35;54;0;43;21;62;19;19;23;€;0;31;24;0;90;0;0;1;27;44;€;0;€;24;23;2;90;12;11;0;68;1;9;85;1;26;10;0;65;18;50;1;54;17;6 99;2489;gac*;Gasterosteus aculeatus (stickleback) (Broad 1.0 Feb 2006);;;;;41.18;0;35;12;7;49;0;17;9;€;0;61;€;21;1;12;18;52;0;62;29;63;0;29;18;99;0;35;23;53;0;53;56;0;17;0;0;0;52;60;81;1;€;61;97;0;€;46;53;0;€;1;74;49;0;#;2;0;30;68;26;0;12;61;4 99;2639;xtr;Xenopus tropicalis (frog) (JGI 4.2 Nov 2009);;;;;50.41;2;58;#;22;38;2;25;32;63;5;51;€;55;0;36;53;40;3;41;23;60;1;53;36;€;0;91;29;67;0;47;36;0;€;0;0;1;42;28;40;1;47;72;97;0;59;84;51;2;92;1;33;33;3;33;8;0;99;€;27;0;85;80;€ 68;3729;fca;Felis catus (cat) (Felis_catus-6.2 Sept 2011);;;;;19.40;1;12;19;8;6;0;33;5;10;0;9;24;8;0;6;9;8;1;14;5;8;1;68;7;9;0;13;9;18;1;10;7;0;10;0;0;2;16;€;47;5;28;50;€;1;9;15;44;1;32;18;23;9;9;€;24;2;12;54;53;2;10;48;6 78;4040;bta;Bos taurus (Cow Jun. 2014 Bos_taurus_UMD_3.1.1/bosTau8);;;;;22.58;6;30;10;14;11;0;5;6;18;0;8;35;20;0;21;39;13;32;7;7;13;0;9;4;14;1;10;7;31;2;35;16;11;39;0;0;4;19;20;40;0;30;78;40;6;42;€;€;143;€;29;€;13;7;12;16;4;19;44;€;20;63;€;€ 74;5845;ttr*;Tursiops truncatus (Dolphin Oct. 2011 Baylor Ttru_1.4/turTru2);;;;;16.73;0;12;6;7;6;0;4;6;11;0;5;17;8;3;16;22;12;0;6;4;7;0;5;4;9;1;6;3;19;2;36;21;1;18;0;0;0;9;16;15;0;13;74;19;10;49;€;€;6;22;21;€;7;1;7;12;0;11;48;54;19;43;€;€ 86;7080;bacu;Balaenoptera acutorostrata scammoni (Minke whale Oct. 2013 BalAcu1.0/balAcu1);;;;;18.77;0;13;13;8;6;0;4;7;12;1;8;21;14;1;18;32;10;1;5;4;7;0;5;4;13;0;8;4;20;0;42;20;0;14;0;0;0;11;10;20;0;24;86;29;20;45;€;€;2;24;17;€;9;0;9;21;0;13;55;#;12;64;€;€ 94;13727;cmk;Callorhinchus milii (Elephant shark Dec. 2013 Callorhinchus_milii-6.1.3/calMil1);;;;;32.70;3;35;13;31;20;2;20;25;31;0;23;94;22;16;€;€;26;1;54;48;12;6;51;41;24;12;€;€;75;168;€;€;1;36;0;0;1;37;7;18;2;48;43;36;6;49;66;€;1;15;3;30;9;0;25;2;0;33;14;12;2;19;66;# ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg ;;;total du diagramme;;;;;;45;1,461;617;774;973;22;561;782;1,592;70;675;2,065;1,377;94;645;1,007;1,266;99;715;551;1,123;25;1,244;476;1,376;83;847;535;2,162;240;1,241;682;50;1,554;0;0;34;1,239;1,175;1,210;72;1,748;1,880;2,044;93;2,061;1,303;1,656;209;1,958;249;1,088;1,153;33;656;428;36;1,265;1,051;912;138;2,017;1,185;541 Codons forts;;;pente;;;;;;;1.139;0.463;0.574;0.853;;0.504;0.627;1.334;;0.668;2.025;1.02;;0.591;0.905;0.946;;0.699;0.511;0.991;;1.062;0.469;1.188;;0.848;0.491;1.728;;1.079;0.673;;1.293;;;;0.998;0.925;1.065;;1.442;1.669;1.738;;1.69;1.233;1.375;;1.603;-;0.941;0.948;;0.606;0.321;;1.174;0.964;0.808;;1.476;1.263;0.485 ;;;somme calculée;;;;;;;-;23.3;20.0244;29.8;;-;21.9;101.5;;-;317.0;35.6;;19.3;75.5;-;;-;-;-;;-;-;59.9;;27.7;16.1;79.3;;35.3;22.0;;65.2;;;;-;17.9;37.2;;109.7;-;149.3;;69.6;151.9;124.8;;102.2;-;54.6;-;;45.1;-;;-;87.1;33.4;;-;159.6;93.9 ;;;Totaux + calculés;;;;;;;1,461;640;794;1,003;;561;804;1,693;;675;2,382;1,413;;664;1,083;1,266;;715;551;1,123;;1,244;476;1,436;;875;551;2,241;;1,276;704;;1,619;0;0;;1,239;1,193;1,247;;1,858;1,880;2,193;;2,131;1,455;1,781;;2,060;249;1,143;1,153;;701;428;;1,265;1,138;945;;2,017;1,345;635 ;;;R2;;;;;;;914;734;775;807;;748;697;847;;740;892;840;;723;793;881;;758;743;816;;713;743;803;;788;866;863;;748;809;;748;;;;938;614;822;;913;770;845;;791;880;728;;743;;815;760;;801;570;;797;666;594;;818;795;597 Codons faibles;;;c/t nombre >3;;;;;;3;;;;;0;;;;6;;;;3;;;;5;;;;2;;;;6;;;;4;;;2;;;;2;;;;5;;;;6;;;;7;;;;;2;;;2;;;;9;;; ;;;c/t nombre >3, total;;;;;;16;;;;;0;;;;35;;;;44;;;;66;;;;10;;;;61;;;;209;;;16;;;;9;;;;30;;;;58;;;;184;;;;;16;;;9;;;;120;;; ;;;reste calculé;;;;;;32;;;;;22;;;;41;;;;53;;;;38;;;;17;;;;28;;;;35;;;36;;;;27;;;;47;;;;41;;;;32;;;;;19;;;29;;;;27;;; ;;;multiplicité X 100;;;;;;26;;;;;18;;;;34;;;;44;;;;31;;;;14;;;;23;;;;29;;;30;;;;22;;;;39;;;;34;;;;26;;;;;16;;;24;;;;22;;; ;;;c/t nombre=3;;;;;;1;;;;;0;;;;1;;;;6;;;;4;;;;0;;;;1;;;;1;;;2;;;;2;;;;1;;;;0;;;;0;;;;;2;;;3;;;;0;;; Totaux des 121 réduits;;;;;;;;55829.6931801242;32;1,461;640;794;1,003;22;561;804;1,693;41;675;2,382;1,413;53;664;1,083;1,266;38;715;551;1,123;17;1,244;476;1,436;28;875;551;2,241;35;1,276;704;36;1,619;0;0;27;1,239;1,193;1,247;47;1,858;1,880;2,193;41;2,131;1,455;1,781;32;2,060;249;1,143;1,153;19;701;428;29;1,265;1,138;945;27;2,017;1,345;635 Données non modifiées;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 64;455;tsy*;Tarsius syrichta (Tarsier Sep. 2013 Tarsius_syrichta-2.0.1/tarSyr2);;;;;9.0;0;6;42;4;6;0;5;7;8;0;4;12;6;0;4;6;7;0;5;3;7;1;32;4;9;0;4;4;12;0;4;3;0;10;0;0;1;10;64;6;1;15;10;7;1;13;9;10;1;25;1;6;6;0;5;3;0;9;6;4;0;14;6;7 149;485;eeu*;Erinaceus europaeus (Hedgehog May 2012 EriEur2.0/eriEur2);;;;;10.7;0;8;3;6;6;0;3;6;9;0;4;16;7;0;6;4;7;0;3;3;10;0;5;3;9;0;6;4;14;0;10;4;0;13;0;0;0;5;4;8;0;7;11;149;0;13;8;9;0;34;2;7;6;0;5;3;0;7;5;7;0;14;7;5 271;749;mpu*;Mustela putorius furo (Ferret Apr. 2011 MusPutFur1.0/musFur1);;;;;16.5;0;11;4;6;6;0;4;5;10;0;5;20;8;0;6;7;8;0;4;4;9;0;7;2;10;0;7;5;15;0;8;5;0;9;0;0;1;7;37;17;6;12;31;271;0;8;7;19;0;25;1;11;6;0;29;5;0;12;16;21;0;9;9;4 256;804;str*;Spermophilus tridecemlineatus (Squirrel Nov. 2011 Broad/speTri2);;;;;16.5;1;10;3;10;6;0;3;4;14;6;4;14;18;3;5;39;15;1;7;6;12;1;7;3;34;5;6;7;256;31;39;18;0;9;0;0;0;6;4;6;1;9;10;12;6;8;5;7;0;48;1;7;6;0;5;3;0;7;5;6;7;13;5;20 235;807;ssc;Sus scrofa (Pig Aug. 2011 SGSC Sscrofa10.2/susScr3);;;;;17.6;0;21;4;6;8;0;5;5;13;0;5;23;10;1;11;12;10;0;5;4;9;0;4;3;13;0;8;4;23;0;14;7;0;17;0;0;0;10;9;12;2;18;38;16;10;97;235;13;1;23;0;7;7;0;5;3;0;10;7;4;0;19;10;6 408;906;cfa;Canis familiaris (dog) (CanFam3.1 Sept 2011);;;;;20.0;0;10;4;5;4;0;4;7;9;0;5;23;6;0;5;8;10;0;5;8;8;0;8;4;8;0;4;5;14;0;11;4;0;9;0;0;0;9;43;20;1;21;34;408;2;13;15;22;0;21;1;6;6;0;15;4;0;8;9;29;0;11;11;9 326;1119;dno*;Dasypus novemcinctus (Armadillo Dec. 2011 Baylor/dasNov3);;;;;24.2;0;12;8;8;5;0;3;10;12;1;6;30;12;1;16;81;10;0;6;6;7;0;7;4;11;0;8;7;23;2;66;17;0;14;0;0;1;10;5;10;0;23;18;43;0;21;20;45;0;22;1;15;10;0;8;5;0;10;9;47;24;19;326;34 341;1176;oas;Ovis aries (sheep) (Feb 2010);;;;;25.3;1;6;5;7;6;0;2;3;6;0;5;18;7;0;8;9;2;3;4;3;4;0;6;1;5;0;5;3;18;3;12;7;2;16;0;0;0;8;7;9;0;13;22;16;2;8;139;60;16;61;4;47;2;2;6;6;0;7;22;33;5;30;133;341 127;1198;zma;Zea mays (Version 5b.60);;;;;25.5;1;25;5;20;29;0;9;13;69;0;5;79;22;12;4;16;13;22;11;6;15;0;31;9;20;13;14;6;66;0;15;22;0;21;0;0;1;26;22;13;0;49;82;127;1;42;22;30;1;25;0;27;35;0;7;6;0;14;9;11;0;33;11;11 772;1463;aml;Ailuropoda melanoleuca (panda) (BGI-Shenzhen AilMel 1.0 Dec 2009);;;;;32.2;0;11;5;9;7;0;5;7;12;0;6;24;10;0;7;9;10;0;6;4;9;0;11;5;10;0;9;10;17;0;9;5;0;11;0;0;0;8;43;25;6;28;55;772;1;11;11;37;0;25;2;10;8;1;84;7;2;13;17;45;0;10;7;7 154;1492;gmo*;Gadus morhua (Atlantic cod May 2010 Genofisk GadMor_May2010/gadMor1);;;;;32.8;6;36;16;15;33;0;24;47;26;0;18;154;21;0;9;28;30;0;18;14;55;0;21;22;30;0;30;30;55;1;24;26;0;50;0;0;1;26;11;45;2;34;63;43;1;30;51;50;0;27;2;29;31;2;17;10;1;41;21;28;0;30;39;18 619;2002;lav;Loxodonta africana (elephant) (Broad/July 2009);;;;;43.5;1;32;15;17;22;0;11;10;43;0;7;50;41;1;50;35;29;0;7;4;16;0;14;3;14;1;22;10;54;0;53;15;1;19;0;0;3;27;14;28;4;51;60;36;0;20;114;24;1;28;24;23;14;0;18;3;3;76;90;16;4;33;619;72 1073;2017;tma*;Trichechus manatus latirostris (Manatee Oct. 2011 Broad v1.0/triMan1);;;;;43.8;1;11;6;10;8;0;5;5;13;1;8;21;11;0;26;16;14;0;6;4;11;0;8;3;16;1;18;4;20;1;40;6;1;15;0;0;0;12;8;10;1;23;31;16;1;15;114;19;5;22;18;13;8;0;12;7;5;36;123;13;9;23;1073;90 278;2485;pma*;Petromyzon marinus (Lamprey Sep. 2010 WUGSC 7.0/petMar2);;;;;53.7;2;57;5;42;112;0;40;75;110;0;10;278;166;1;26;71;22;0;20;35;54;0;43;21;62;19;19;23;106;0;31;24;0;90;0;0;1;27;44;108;0;168;24;23;2;90;12;11;0;68;1;9;85;1;26;10;0;65;18;50;1;54;17;6 286;2489;gac*;Gasterosteus aculeatus (stickleback) (Broad 1.0 Feb 2006);;;;;55.2;0;35;12;7;49;0;17;9;101;0;61;286;21;1;12;18;52;0;62;29;63;0;29;18;99;0;35;23;53;0;53;56;0;17;0;0;0;52;60;81;1;123;61;97;0;184;46;53;0;107;1;74;49;0;79;2;0;30;68;26;0;12;61;4 151;2639;xtr;Xenopus tropicalis (frog) (JGI 4.2 Nov 2009);;;;;57.2;2;58;46;22;38;2;25;32;63;5;51;138;55;0;36;53;40;3;41;23;60;1;53;36;151;0;91;29;67;0;47;36;0;107;0;0;1;42;28;40;1;47;72;97;0;59;84;51;2;92;1;33;33;3;33;8;0;99;105;27;0;85;80;105 1201;3729;fca;Felis catus (cat) (Felis_catus-6.2 Sept 2011);;;;;81.9;1;12;19;8;6;0;33;5;10;0;9;24;8;0;6;9;8;1;14;5;8;1;68;7;9;0;13;9;18;1;10;7;0;10;0;0;2;16;782;47;5;28;50;887;1;9;15;44;1;32;18;23;9;9;1,201;24;2;12;54;53;2;10;48;6 1295;4040;bta;Bos taurus (Cow Jun. 2014 Bos_taurus_UMD_3.1.1/bosTau8);;;;;83.9;6;30;10;14;11;0;5;6;18;0;8;35;20;0;21;39;13;32;7;7;13;0;9;4;14;1;10;7;31;2;35;16;11;39;0;0;4;19;20;40;0;30;78;40;6;42;435;164;143;338;29;178;13;7;12;16;4;19;44;116;20;63;391;1,295 1901;5845;ttr*;Tursiops truncatus (Dolphin Oct. 2011 Baylor Ttru_1.4/turTru2);;;;;128.5;0;12;6;7;6;0;4;6;11;0;5;17;8;3;16;22;12;0;6;4;7;0;5;4;9;1;6;3;19;2;36;21;1;18;0;0;0;9;16;15;0;13;74;19;10;49;1,901;395;6;22;21;217;7;1;7;12;0;11;48;54;19;43;833;1,766 2368;7080;bacu;Balaenoptera acutorostrata scammoni (Minke whale Oct. 2013 BalAcu1.0/balAcu1);;;;;156.1;0;13;13;8;6;0;4;7;12;1;8;21;14;1;18;32;10;1;5;4;7;0;5;4;13;0;8;4;20;0;42;20;0;14;0;0;0;11;10;20;0;24;86;29;20;45;2,368;468;2;24;17;256;9;0;9;21;0;13;55;67;12;64;987;2,148 5898;13727;cmk;Callorhinchus milii (Elephant shark Dec. 2013 Callorhinchus_milii-6.1.3/calMil1);;;;;300.1;3;35;13;31;20;2;20;25;31;0;23;94;22;16;145;1,540;26;1;54;48;12;6;51;41;24;12;206;137;75;168;5,898;3,858;1;36;0;0;1;37;7;18;2;48;43;36;6;49;66;428;1;15;3;30;9;0;25;2;0;33;14;12;2;19;66;81 1045;12258;dre;Danio rerio (Zebrafish) (Zv8 Apr 2009);;;;;268.8;10;197;73;241;270;4;244;300;258;10;75;522;232;6;230;227;336;2;209;80;315;2;205;180;359;10;290;66;92;4;368;112;5;236;0;0;10;387;105;266;24;1,045;525;953;1;150;225;245;9;136;14;44;203;24;107;59;14;424;252;104;11;836;47;268 ;92530;;Total des 121 eucaryotes non réduits;;;;;;45;1461;705;816;1085;22;561;857;1803;70;675;2921;1543;94;790;2699;1266;99;715;551;1123;25;1244;476;1527;83;1053;672;2524;240;7139;4540;50;1661;0;0;34;1239;1957;1318;72;2039;1880;4658;93;2245;6609;3111;209;2403;249;1739;1153;33;2020;428;36;1265;1369;1095;138;2017;5547;6439
Lignes et colonnes 121 eucaryotes
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Lignes et colonnes 121 eucaryotes
- Liens: Calculs pour 121 eucaryotes, Tableau des effectifs calculés des 121 eucaryotes
- Légende: Les moyennes des codons de la 3ème base appartenant aux doublets ayant la même 1ère base (ligne) ou ayant la même 2ème base (colonne) sont faites sur 4 codons ou sur 3 codons seulement quand on rencontre les codons stop (taa tag) ou le codon ata lorsqu'il est trop faible ( sauf celui des eucaryotes) ou le codon atg à effectif très élevé (sauf celui des eucaryotes). La moyenne des lignes et colonnes est faite sur 12 codons ou seulement 10 quand on rencontre les codons taa tag ata atg. Quand les codons xyt ont des effectifs élevés ils sont permutés avec les codons xyc ( 1 permutation chez les bactéries et 8 chez les eucaryotes). Aussi les lignes et colonnes xyt contiennent les valeurs faibles après permutation et les lignes et colonnes xyc contiennent les valeurs fortes après permutation.
- n pour nombre de codons, mcod pour moyenne des codons, Lig. pour ligne, Col. pour colonne et car. pour carré ou doublet.
- txt, c, a, g pour respectivement les 4 codons "ttt tct tat tgt" de la 3ème base t, les 4 codons "ttc tcc tac tgc" de la 3ème base c . . . etc. (Ligne Lig.)
- xtt, c, a, g pour respectivement les 4 codons "ttt ctt att gtt" de la 3ème base t, les 4 codons "ttc ctc atc gtc" de la 3ème base c . . . etc. (colonne Col.)
- Tableaux non formatés: voir tableur
IV LC;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;;V LC;Danio rerio (Zebrafish) ;;;;;;I LC;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries;;;; Lignes;;;Colon;;55 830;;Lignes;;;Colon;;12 258;;Lignes;;;Colon;;235 027 txt;4;62;xtt;4;66;;txt;4;53;xtt;4;61;;txt;4;2;xtt;4;42 c;4;2,869;c;4;2,494;;c;4;1,846;c;4;1,952;;c;4;2,289;c;4;2,509 a;3;958;a;4;1,137;;a;3;805;a;4;1,269;;a;3;1,612;a;3;2,631 g;3;1,485;g;4;1,833;;g;3;993;g;4;2,039;;g;3;1,558;g;3;1,489 cxt;4;38;xct;4;53;;cxt;4;82;xct;4;37;;cxt;4;76;xct;4;13 c;4;2,023;c;4;2,716;;c;4;2,396;c;4;2,248;;c;4;1,998;c;4;1,696 a;4;1,656;a;4;1,840;;a;4;1,348;a;4;2,186;;a;4;1,879;a;4;2,852 g;4;1,323;g;4;1,022;;g;4;1,642;g;4;893;;g;4;1,395;g;4;935 axt;4;65;xat;4;68;;axt;4;118;xat;4;82;;axt;4;12;xat;4;1 c;4;2,800;c;4;3,066;;c;4;4,254;c;4;3,708;;c;4;2,862;c;4;3,076 a;4;2,045;a;3;2,703;;a;4;2,329;a;3;2,325;;a;3;2,806;a;3;3,570 g;4;2,719;g;3;3,117;;g;4;3,355;g;3;3,981;;g;3;1,225;g;3;880 gxt;4;70;xgt;4;48;;gxt;4;45;xgt;4;118;;gxt;4;1;xgt;4;36 c;4;3,494;c;4;2,908;;c;4;2,672;c;4;3,261;;c;4;2,861;c;4;2,728 a;4;2,123;a;4;1,537;;a;4;1,774;a;4;857;;a;4;3,642;a;4;1,332 g;4;1,882;g;4;1,411;;g;4;1,738;g;4;969;;g;4;659;g;4;1,430 moyenne;;;;;;;Moyenne;;;;;;;Moyenne;;;;; Lignes;;ttt;ctt;att;gtt;;Lignes;;ttt;ctt;att;gtt;;Lignes;;ttt;ctt;att;gtt ;n;10;12;12;12;;;n;10;12;12;12;;;n;10;12;10;12 ;mcod;1,880;1,668;2,521;2,499;;;mcod;1,278;1,795;3,313;2,061;;;mcod;1,867;1,757;2,354;2,387 moyenne;;;;;;;Moyenne;;;;;;;Moyenne;;;;; Colon;;ttt;tct;tat;tgt;;Colon;;ttt;tct;tat;tgt;;Colon;;ttt;tct;tat;tgt ;n;12;12;10;12;;;n;12;12;10;12;;;n;10;12;10;12 ;mcod;1,966;1,860;2,973;1,952;;;mcod;1,950;1,776;3,375;1,695;;;mcod;2,239;1,828;2,566;1,830 Totaux;;;;;;;Totaux;;;;;;;Totaux;;;;; carrés;1000;t;c;a;g;;carrés;1000;t;c;a;g;;carrés;1000;t;c;a;g ;t;5.24;4.60;2.96;6.24;;;t;4.25;5.12;1.97;1.66;;;t;6.32;5.30;2.73;4.32 ;c;4.28;5.12;6.64;4.12;;;c;6.67;5.73;6.27;3.21;;;c;6.10;4.42;5.74;5.13 ;a;8.58;5.18;10.71;6.05;;;a;7.06;5.91;20.78;6.48;;;a;11.61;5.64;8.64;5.39 ;g;5.75;7.62;9.69;7.21;;;g;5.67;4.70;5.07;9.48;;;g;6.22;6.63;8.55;7.26
Demi-doublets des 121 eucaryotes
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Demi-doublets des 121 eucaryotes
- Légende:
- − 155 eucaryotes, tableau des demi-doublets sur les effectifs des 155 eucaryotes avant sélection des 121.
- − 121 eucaryotes 92530: tableau des demi-doublets sur les effectifs des 121 eucaryotes avant calcul sur les tRNAs surexprimés.
- − 121 eucaryotes 55830: tableau des demi-doublets sur les effectifs des 121 eucaryotes après calcul sur les tRNAs surexprimés.
- − g/a: rapport des codons xyg sur xya de la ligne x et de la colonne y du tableau des effectifs, 1.4 rapport inverse de g/a.
- − t/c: rapport des codons xyc sur xyt de la ligne x et de la colonne y du tableau des effectifs, 16 rapport inverse de t/c.
- − t c a g: colonnes du tableau des effectifs
155 eucaryotes;;;115 111;;;121 eucaryotes;;;92530;;;121 eucaryotes;;;55830; ;t;c;a;g;;;t;c;a;g;;;t;c;a;g t/c;29;16;14;12;;t/c;32;13;33;11;;t/c;46;33;45;64 g/a;1.4;1.4;−;7.1;;g/a;1.2;1.3;−;7.0;;g/a;1.2;1.3;−;4.6 t/c;43;48;40;28;;t/c;49;45;36;35;;t/c;46;66;46;61 g/a;1.5;2.2;1.2;4.5;;g/a;1.5;2.6;1.5;4.7;;g/a;1.4;2.6;1.05;1.6 t/c;25;14;24;36;;t/c;26;18;28;35;;t/c;41;51;40;44 g/a;4.5;1.8;2.3;1.4;;g/a;4.3;1.6;2.5;1.3;;g/a;3.5;1.6;1.2;1.2 t/c;19;7.3;28;25;;t/c;16;11;24;15;;t/c;27;64;52;75 g/a;2.9;1.6;1.9;1.3;;g/a;3.4;1.6;2.1;1.2;;g/a;1.6;1.8;1.2;2.1
Moyennes des doublets 12 23 13
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Moyennes des doublets 12 23 13
- Légende
- Doublets 23 avec processus E
;IV 1 121 eucaryotes;;;;;I 1 4032 bactéries;;;;;IV 1;Duplications processus E;;;;II 1;184 Archées;; doublet;.tt;.ct;.at;.gt;doublet;.tt;.ct;.at;.gt;doublet;.tt;.ct;.at;.gt;doublet;.tt;.ct;.at;.gt m;0.31;0.24;0.31;0.22;m;0.20;0.14;0.08;0.04;m;0.28;0.24;0.31;0.20;m;0.27;0;0;0.41 e;0.11;0.08;0.07;0.05;e;0.10;0.10;0.05;0.03;e;0.15;0.08;0.07;0.09;e;0.31;;;0.52 %;36;32;22;21;%;51;71;68;69;%;52;34;22;43;%;115;;;128 doublet;.tc;.cc;.ac;.gc;doublet;.tc;.cc;.ac;.gc;doublet;.tc;.cc;.ac;.gc;doublet;.tc;.cc;.ac;.gc m;11.51;12.53;14.15;13.42;m;1.46;0.99;1.79;1.59;m;10.05;11.54;12.35;11.83;m;1.16;1.00;1.10;1.24 e;2.37;4.13;3.13;3.98;e;0.60;0.21;0.51;0.59;e;1.89;4.06;2.64;3.94;e;0.01;0.05;0.09;0.29 %;21;33;22;30;%;41;21;28;37;%;19;35;21;33;%;1;5;8;23 doublet;.ta;.ca;.aa;.ga;doublet;.ta;.ca;.aa;.ga;doublet;.ta;.ca;.aa;.ga;doublet;.ta;.ca;.aa;.ga m;5.25;8.49;12.47;8.77;m;1.53;1.66;2.08;0.93;m;4.09;6.83;10.39;7.84;m;1.02;1.12;1.13;1.01 e;0.43;2.29;2.87;2.72;e;0.58;0.58;0.44;0.62;e;1.04;1.99;2.59;2.11;e;0.02;0.19;0.11;0.01 %;8;27;23;31;%;38;35;21;67;%;26;29;25;27;%;2;17;9;1 doublet;.tg;.cg;.ag;.gg;doublet;.tg;.cg;.ag;.gg;doublet;.tg;.cg;.ag;.gg;doublet;.tg;.cg;.ag;.gg m;7.39;4.71;14.38;6.51;m;0.87;0.54;0.51;0.83;m;6.52;4.17;13.87;5.68;m;0.89;0.86;0.89;0.87 e;1.36;0.79;3.92;2.63;e;0.49;0.17;0.15;0.21;e;1.83;0.93;3.93;2.49;e;0.03;0.05;0.02;0.10 %;18;17;27;40;%;57;32;28;26;%;28;22;28;44;%;3;5;2;12 Ligne;..t;..c;..a;..g;Ligne;..t;..c;..a;..g;Ligne;..t;..c;..a;..g;Ligne;..t;..c;..a;..g m;0.27;12.90;8.48;7.87;m;1.34;1.46;1.56;0.69;m;0.26;11.44;7.03;7.18;m;0.17;1.12;1.07;0.88 e;0.08;3.27;3.25;4.23;e;2.94;0.54;0.64;0.29;e;0.10;3.05;2.88;4.29;e;0.33;0.17;0.12;0.06 %;30;25;38;54;%;220;37;41;42;%;39;27;41;60;%;193;15;11;7 colonne;.t.;.c.;.a.;.g.;colonne;.t.;.c.;.a.;.g.;colonne;.t.;.c.;.a.;.g.;colonne;.t.;.c.;.a.;.g. m;8.11;8.58;13.72;9.64;m;1.31;1.07;1.50;1.13;m;6.92;7.51;12.22;8.51;m;1.04;0.99;1.04;1.05 e;3.19;4.17;3.04;4.26;e;0.58;0.58;0.78;0.57;e;3.04;4.00;3.04;3.89;e;0.12;0.15;0.13;0.24 %;39;49;22;44;%;45;55;52;50;%;44;53;25;46;%;11;15;12;23
- Doublets 13
;;;;;;;13;;;;;;; ;IV 1 121 eucaryotes;;;;;I 1 4032 bactéries;;;;;II 1;184 Archées;; doublet;t.t;c.t;a.t;g.t;doublet;t.t;c.t;a.t;g.t;doublet;t.t;c.t;a.t;g.t m;0.29;0.18;0.30;0.32;m;0.14;4.44;0.71;0.07;m;0;0.41;0;0.27 e;0.02;0.04;0.08;0.09;e;0.08;4.94;1.23;0.10;e;0;0.52;0;0.31 %;9;20;26;28;%;57;111;174;136;%;−;128;−;115 doublet;t.c;c.c;a.c;g.c;doublet;t.c;c.c;a.c;g.c;doublet;t.c;c.c;a.c;g.c m;13.24;9.33;12.92;16.12;m;1.33;1.16;1.67;1.67;m;1.215;1.029;1.090;1.164 e;2.79;0.81;2.18;3.06;e;0.25;0.50;0.65;0.70;e;0.281;0.098;0.079;0.132 %;21;9;17;19;%;19;43;39;42;%;23;9;7;11 doublet;t.a;c.a;a.a;g.a;doublet;t.a;c.a;a.a;g.a;doublet;t.a;c.a;a.a;g.a m;5.60;7.64;9.44;9.79;m;1.25;1.10;1.64;2.12;m;1.019;1.019;1.053;1.170 e;0.44;2.85;4.36;2.93;e;0.10;0.60;0.56;0.52;e;0.027;0.031;0.036;0.184 %;8;37;46;30;%;8;55;34;25;%;3;3;3;16 doublet;t.g;c.g;a.g;g.g;doublet;t.g;c.g;a.g;g.g;doublet;t.g;c.g;a.g;g.g m;6.85;6.11;10.16;8.68;m;0.91;0.81;0.71;0.38;m;0.904;0.836;0.906;0.875 e;2.46;3.12;7.08;4.34;e;0.23;0.34;0.13;0.12;e;0.088;0.062;0.011;0.035 %;36;51;70;50;%;25;42;18;31;%;10;7;1;4 Ligne;..t;..c;..a;..g;Ligne;..t;..c;..a;..g;Ligne;..t;..c;..a;..g m;0.27;12.90;8.48;7.87;m;1.34;1.46;1.56;0.69;m;0.17;1.12;1.07;0.88 e;0.08;3.27;3.25;4.23;e;2.94;0.54;0.64;0.29;e;0.33;0.17;0.12;0.06 %;30;25;38;54;%;220;37;41;42;%;193;15;11;7 colonne;.t.;.c.;.a.;.g.;colonne;.t.;.c.;.a.;.g.;colonne;.t.;.c.;.a.;.g. m;9.41;10.90;7.69;11.53;m;1.17;1.37;1.02;1.39;m;1.07;1.02;0.96;1.07 e;4.23;4.45;2.64;4.66;e;0.28;0.65;0.47;0.90;e;0.23;0.10;0.11;0.19 %;45;41;34;40;%;24;47;46;64;%;22;9;12;17
- Doublets 12
;;;;;;;12;;;;;;; ;IV 1 121 eucaryotes;;;;;I 1 4032 bactéries;;;;;II 1;184 Archées;; doublet;tt.;tc.;ta.;tg.;doublet;tt.;tc.;ta.;tg.;doublet;tt.;tc.;ta.;tg. m;7.98;6.98;13.38;13.24;m;1.23;1.03;1.59;1.10;m;1.03;0.95;1.03;1.31 e;3.61;3.10;−;5.36;e;0.26;0.34;−;0.02;e;0.14;0.11;−;0.44 %;45;44;−;40;%;22;33;−;2;%;14;12;−;34 doublet;ct.;cc.;ca.;cg.;doublet;ct.;cc.;ca.;cg.;doublet;ct.;cc.;ca.;cg. m;6.52;7.83;10.13;6.29;m;1.16;0.86;1.12;0.97;m;1.01;0.92;0.99;0.93 e;1.83;3.41;0.24;3.03;e;0.18;0.43;0.50;0.83;e;0.15;0.09;0.09;0.15 %;28;44;2;48;%;15;51;45;85;%;15;10;9;16 doublet;at.;ac.;aa.;ag.;doublet;at.;ac.;aa.;ag.;doublet;at.;ac.;aa.;ag. m;9.79;7.88;16.34;9.22;m;2.28;1.09;1.68;1.05;m;1.15;1.01;1.05;0.97 e;5.95;3.70;1.55;1.33;e;−;0.39;0.93;0.17;e;−;0.08;0.13;0.07 %;61;47;9;14;%;−;36;56;16;%;−;8;13;7 doublet;gt.;gc.;ga.;gg.;doublet;gt.;gc.;ga.;gg.;doublet;gt.;gc.;ga.;gg. m;8.71;11.63;14.79;11.01;m;1.21;1.29;1.66;1.41;m;1.03;1.09;1.10;1.06 e;3.10;6.42;2.79;5.71;e;0.94;1.13;1.14;0.87;e;0.12;0.27;0.20;0.24 %;36;55;19;52;%;78;88;69;62;%;11;25;18;23 Ligne;t..;c..;a..;g..;Ligne;t..;c..;a..;g..;Ligne;t..;c..;a..;g.. m;9.41;10.90;7.69;11.53;m;1.17;1.37;1.02;1.39;m;1.07;1.02;0.96;1.07 e;4.23;4.45;2.64;4.66;e;0.28;0.65;0.47;0.90;e;0.23;0.10;0.11;0.19 %;45;41;34;40;%;24;47;46;64;%;22;9;12;17 colonne;.t.;.c.;.a.;.g.;colonne;.t.;.c.;.a.;.g.;colonne;.t.;.c.;.a.;.g. m;8.11;8.58;13.72;9.64;m;1.31;1.07;1.50;1.13;m;1.04;0.99;1.04;1.05 e;3.19;4.17;3.04;4.26;e;0.58;0.58;0.78;0.57;e;0.12;0.15;0.13;0.24 %;39;49;22;44;%;45;55;52;50;%;11;15;12;23
Doublets 12 23 13
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- Légende
IV 1;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;12;;I 1;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235027;12;;II 1;Nombres de tRNAs. 184 archées;;;;;;12 ttt;0.26;tcc;0.31;tat;0.30;tgt;0.26;;ttt;0.25;tct;0.12;tat;0.10;tgt;0.07;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0 ttc;12.07;tct;10.46;tac;13.38;tgc;17.02;;ttc;1.51;tcc;1.12;tac;1.59;tgc;1.11;;ttc;1.17;tcc;1.03;tac;1.03;tgc;1.63 tta;5.29;tca;5.91;taa;−;tga;2.06;;tta;1.18;tca;1.31;taa;−;tga;0.33;;tta;1.04;tca;1.00;taa;-;tga;0.10 ttg;6.56;tcg;4.55;tag;−;tgg;9.45;;ttg;0.99;tcg;0.65;tag;−;tgg;1.08;;ttg;0.89;tcg;0.83;tag;-;tgg;1.00 ctc;0.18;ccc;0.14;cat;0.22;cgc;0.16;;ctt;9.15;cct;0.25;cat;0.10;cgc;8.26;;ctt;0.54;cct;0;cat;0;cgt;1.09 ctt;8.29;cct;9.28;cac;10.24;cgt;9.53;;ctc;0.95;ccc;0.68;cac;1.17;cgt;1.85;;ctc;1.16;ccc;0.93;cac;1.01;cgc;1.02 cta;4.64;cca;10.28;caa;9.86;cga;5.79;;cta;1.23;cca;1.35;caa;1.58;cga;0.22;;cta;1.01;cca;1.00;caa;1.07;cga;1.01 ctg;6.64;ccg;3.93;cag;10.31;cgg;3.54;;ctg;1.29;ccg;0.54;cag;0.59;cgg;0.83;;ctg;0.87;ccg;0.82;cag;0.90;cgg;0.76 atc;0.34;acc;0.23;aat;0.39;agt;0.24;;att;0.12;act;2.55;aat;0.12;agt;0.02;;att;0;act;0;aat;0;agt;0 att;13.99;act;11.87;aac;15.36;agc;10.45;;atc;2.28;acc;1.12;aac;2.17;agc;1.10;;atc;1.15;acc;1.03;aac;1.16;agc;1.02 ata;5.58;aca;7.23;aaa;15.54;aga;9.40;;ata;0.01;aca;1.46;aaa;2.26;aga;1.19;;ata;0.01;aca;1.08;aaa;1.07;aga;1.01 atg;19.69;acg;4.55;aag;18.12;agg;7.81;;atg;4.47;acg;0.68;aag;0.60;agg;0.86;;atg;3.20;acg;0.92;aag;0.90;agg;0.90 gtc;0.44;gcc;0.29;gat;0.34;ggt;0.22;;gtt;0.22;gct;0.05;gat;0;ggt;0.02;;gtt;0.54;gct;0;gat;0;ggt;0.54 gtt;11.68;gct;18.52;gac;17.61;ggc;16.67;;gtc;1.10;gcc;1.03;gac;2.24;ggc;2.30;;gtc;1.15;gcc;1.00;gac;1.18;ggc;1.32 gta;5.49;gca;10.55;gaa;12.02;gga;11.12;;gta;2.20;gca;2.53;gaa;2.40;gga;1.37;;gta;1.01;gca;1.39;gaa;1.25;gga;1.03 gtg;8.95;gcg;5.82;gag;14.72;ggg;5.25;;gtg;0.33;gcg;0.30;gag;0.34;ggg;0.56;;gtg;0.92;gcg;0.86;gag;0.87;ggg;0.84 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; IV 1;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;23;;I 1;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235027;23;;II 1;Nombres de tRNAs. 184 archées;;;;;;23 ttt;0.26;tcc;0.31;tat;0.30;tgt;0.26;;ttt;0.25;tct;0.12;tat;0.10;tgt;0.07;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0 atc;0.34;acc;0.23;aat;0.39;agt;0.24;;att;0.12;act;2.55;aat;0.12;agt;0.02;;att;0;act;0;aat;0;agt;0 ctc;0.18;ccc;0.14;cat;0.22;cgc;0.16;;ctt;9.15;cct;0.25;cat;0.10;cgc;8.26;;ctt;0.54;cct;0;cat;0;cgt;1.09 gtc;0.44;gcc;0.29;gat;0.34;ggt;0.22;;gtt;0.22;gct;0.05;gat;0;ggt;0.02;;gtt;0.54;gct;0;gat;0;ggt;0.54 ttc;12.07;tct;10.46;tac;13.38;tgc;17.02;;ttc;1.51;tcc;1.12;tac;1.59;tgc;1.11;;ttc;1.17;tcc;1.03;tac;1.03;tgc;1.63 att;13.99;act;11.87;aac;15.36;agc;10.45;;atc;2.28;acc;1.12;aac;2.17;agc;1.10;;atc;1.15;acc;1.03;aac;1.16;agc;1.02 ctt;8.29;cct;9.28;cac;10.24;cgt;9.53;;ctc;0.95;ccc;0.68;cac;1.17;cgt;1.85;;ctc;1.16;ccc;0.93;cac;1.01;cgc;1.02 gtt;11.68;gct;18.52;gac;17.61;ggc;16.67;;gtc;1.10;gcc;1.03;gac;2.24;ggc;2.30;;gtc;1.15;gcc;1.00;gac;1.18;ggc;1.32 tta;5.29;tca;5.91;taa;−;tga;2.06;;tta;1.18;tca;1.31;taa;−;tga;0.33;;tta;1.04;tca;1.00;taa;−;tga;0.10 ata;5.58;aca;7.23;aaa;15.54;aga;9.40;;ata;0.01;aca;1.46;aaa;2.26;aga;1.19;;ata;0.01;aca;1.08;aaa;1.07;aga;1.01 cta;4.64;cca;10.28;caa;9.86;cga;5.79;;cta;1.23;cca;1.35;caa;1.58;cga;0.22;;cta;1.01;cca;1.00;caa;1.07;cga;1.01 gta;5.49;gca;10.55;gaa;12.02;gga;11.12;;gta;2.20;gca;2.53;gaa;2.40;gga;1.37;;gta;1.01;gca;1.39;gaa;1.25;gga;1.03 ttg;6.56;tcg;4.55;tag;−;tgg;9.45;;ttg;0.99;tcg;0.65;tag;−;tgg;1.08;;ttg;0.89;tcg;0.83;tag;−;tgg;1.00 atg;19.69;acg;4.55;aag;18.12;agg;7.81;;atg;4.47;acg;0.68;aag;0.60;agg;0.86;;atg;3.20;acg;0.92;aag;0.90;agg;0.90 ctg;6.64;ccg;3.93;cag;10.31;cgg;3.54;;ctg;1.29;ccg;0.54;cag;0.59;cgg;0.83;;ctg;0.87;ccg;0.82;cag;0.90;cgg;0.76 gtg;8.95;gcg;5.82;gag;14.72;ggg;5.25;;gtg;0.33;gcg;0.30;gag;0.34;ggg;0.56;;gtg;0.92;gcg;0.86;gag;0.87;ggg;0.84 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; IV 1;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;13;;I 1;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235027;13;;II 1;Nombres de tRNAs. 184 archées;;;;;;13 ttt;0.26;atc;0.34;ctc;0.18;gtc;0.44;;ttt;0.25;att;0.12;ctt;9.15;gtt;0.22;;ttt;0;att;0;ctt;0.54;gtt;0.54 tat;0.30;aat;0.39;cat;0.22;gat;0.34;;tat;0.10;aat;0.12;cat;0.10;gat;0.00;;tat;0;aat;0;cat;0;gat;0 tcc;0.31;acc;0.23;ccc;0.14;gcc;0.29;;tct;0.12;act;2.55;cct;0.25;gct;0.05;;tct;0;act;0;cct;0;gct;0 tgt;0.26;agt;0.24;cgc;0.16;ggt;0.22;;tgt;0.07;agt;0.02;cgc;8.26;ggt;0.02;;tgt;0;agt;0;cgt;1.09;ggt;0.54 ttc;12.07;att;13.99;ctt;8.29;gtt;11.68;;ttc;1.51;atc;2.28;ctc;0.95;gtc;1.10;;ttc;1.17;atc;1.15;ctc;1.16;gtc;1.15 tac;13.38;aac;15.36;cac;10.24;gac;17.61;;tac;1.59;aac;2.17;cac;1.17;gac;2.24;;tac;1.03;aac;1.16;cac;1.01;gac;1.18 tct;10.46;act;11.87;cct;9.28;gct;18.52;;tcc;1.12;acc;1.12;ccc;0.68;gcc;1.03;;tcc;1.03;acc;1.03;ccc;0.93;gcc;1.00 tgc;17.02;agc;10.45;cgt;9.53;ggc;16.67;;tgc;1.11;agc;1.10;cgt;1.85;ggc;2.30;;tgc;1.63;agc;1.02;cgc;1.02;ggc;1.32 tta;5.29;ata;5.58;cta;4.64;gta;5.49;;tta;1.18;ata;0.01;cta;1.23;gta;2.20;;tta;1.04;ata;0.01;cta;1.01;gta;1.01 taa;−;aaa;15.54;caa;9.86;gaa;12.02;;taa;−;aaa;2.26;caa;1.58;gaa;2.40;;taa;−;aaa;1.07;caa;1.07;gaa;1.25 tca;5.91;aca;7.23;cca;10.28;gca;10.55;;tca;1.31;aca;1.46;cca;1.35;gca;2.53;;tca;1.00;aca;1.08;cca;1.00;gca;1.39 tga;2.06;aga;9.40;cga;5.79;gga;11.12;;tga;0.33;aga;1.19;cga;0.22;gga;1.37;;tga;0.10;aga;1.01;cga;1.01;gga;1.03 ttg;6.56;atg;19.69;ctg;6.64;gtg;8.95;;ttg;0.99;atg;4.47;ctg;1.29;gtg;0.33;;ttg;0.89;atg;3.20;ctg;0.87;gtg;0.92 tag;−;aag;18.12;cag;10.31;gag;14.72;;tag;−;aag;0.60;cag;0.59;gag;0.34;;tag;−;aag;0.90;cag;0.90;gag;0.87 tcg;4.55;acg;4.55;ccg;3.93;gcg;5.82;;tcg;0.65;acg;0.68;ccg;0.54;gcg;0.30;;tcg;0.83;acg;0.92;ccg;0.82;gcg;0.86 tgg;9.45;agg;7.81;cgg;3.54;ggg;5.25;;tgg;1.08;agg;0.86;cgg;0.83;ggg;0.56;;tgg;1.00;agg;0.90;cgg;0.76;ggg;0.84
Paires de base des codons
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Paires de base des codons
- Légende
I 1.ap;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235027;;;IV 1.ap;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830; ttc;1.51;ctc;0.95;atc;2.28;gtc;1.10;;ttc;12.07;ctc;0.18;atc;0.34;gtc;0.44 aag;0.60;gag;0.34;tag;−;cag;0.59;;aag;18.12;gag;14.72;tag;−;cag;10.31 aac;2.17;gac;2.24;tac;1.59;cac;1.17;;aac;15.36;gac;17.61;tac;13.38;cac;10.24 ttg;0.99;ctg;1.29;atg;4.47;gtg;0.33;;ttg;6.56;ctg;6.64;atg;19.69;gtg;8.95 tcc;1.12;ccc;0.68;acc;1.12;gcc;1.03;;tcc;0.31;ccc;0.14;acc;0.23;gcc;0.29 agg;0.86;ggg;0.56;tgg;1.08;cgg;0.83;;agg;7.81;ggg;5.25;tgg;9.45;cgg;3.54 agc;1.10;ggc;2.30;tgc;1.11;cgc;8.26;;agc;10.45;ggc;16.67;tgc;17.02;cgc;0.16 tcg;0.65;ccg;0.54;acg;0.68;gcg;0.30;;tcg;4.55;ccg;3.93;acg;4.55;gcg;5.82 ttt;0.25;ctt;9.15;att;0.12;gtt;0.22;;ttt;0.26;ctt;8.29;att;13.99;gtt;11.68 aaa;2.26;gaa;2.40;taa;−;caa;1.58;;aaa;15.54;gaa;12.02;taa;−;caa;9.86 aat;0.12;gat;0;tat;0.10;cat;0.10;;aat;0.39;gat;0.34;tat;0.30;cat;0.22 tta;1.18;cta;1.23;ata;0.01;gta;2.20;;tta;5.29;cta;4.64;ata;5.58;gta;5.49 tct;0.12;cct;0.25;act;2.55;gct;0.05;;tct;10.46;cct;9.28;act;11.87;gct;18.52 aga;1.19;gga;1.37;tga;0.33;cga;0.22;;aga;9.40;gga;11.12;tga;2.06;cga;5.79 agt;0.02;ggt;0.02;tgt;0.07;cgt;1.85;;agt;0.24;ggt;0.22;tgt;0.26;cgt;9.53 tca;1.31;cca;1.35;aca;1.46;gca;2.53;;tca;5.91;cca;10.28;aca;7.23;gca;10.55 ;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;; I 1.apr;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;rapports;;;IV 1.apr;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;rapports; ttc;c/g;ctc;c/g;atc;c/g;gtc;c/g;;ttc;c/g;ctc;c/g;atc;c/g;gtc;c/g aag;2.5;gag;2.8;tag;−;cag;1.9;;aag;0.7;gag;0.01;tag;−;cag;0.04 aac;;gac;;tac;;cac;;;aac;;gac;;tac;;cac; ttg;2.2;ctg;1.7;atg;0.4;gtg;3.6;;ttg;2.3;ctg;2.7;atg;0.7;gtg;1.1 tcc;;ccc;;acc;;gcc;;;tcc;;ccc;;acc;;gcc; agg;1.3;ggg;1.2;tgg;1.0;cgg;1.2;;agg;0.04;ggg;0.03;tgg;0.02;cgg;0.08 agc;;ggc;;tgc;;cgc;;;agc;;ggc;;tgc;;cgc; tcg;1.7;ccg;4.2;acg;1.6;gcg;0.3;;tcg;2.3;ccg;4.2;acg;3.7;gcg;0.03 ttt;a/t;ctt;a/t;att;a/t;gtt;a/t;;ttt;a/t;ctt;a/t;att;a/t;gtt;a/t aaa;910;gaa;26;taa;−;caa;710;;aaa;58.8;gaa;1.5;taa;−;caa;0.8 aat;;gat;;tat;;cat;;;aat;;gat;;tat;;cat; tta;950;cta;>>>>;ata;14;gta;2215;;tta;13.6;cta;13.7;ata;18.8;gta;24.6 tct;;cct;;act;;gct;;;tct;;cct;;act;;gct; aga;961;gga;552;tga;13;cga;443;;aga;0.9;gga;1.2;tga;0.2;cga;0.3 agt;;ggt;;tgt;;cgt;;;agt;;ggt;;tgt;;cgt; tca;5299;cca;5453;aca;1959;gca;1.4;;tca;24.7;cca;46.1;aca;27.3;gca;1.1 ;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;; I 1.pc;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;codons/paire;;;IV1.pc;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;codons/paire; ;tat;ttt;tct;tgt;cgc;gat;agt;;;tat;ttt;tct;tgt;cgc;gat;agt paire;ata;aaa;aga;aca;gcg;cta;tca;;paire;ata;aaa;aga;aca;gcg;cta;tca codons;0;2;2;2;2;2;2;;codons;2;2;4;2;2;1;3 ;;;;;;;;;;;;;;;; ;;ttc;ttg;tac;tgg;tcc;tcg;;;;ttc;ttg;tac;tgg;tcc;tcg paire;;aag;aac;atg;acc;agg;agc;;paire;;aag;aac;atg;acc;agg;agc codons;;3;3;3;3;3;3;;codons;;4;4;3;2;3;4 ;;;;;;;;;;;;;;;; ;aat;ggg;ctc;cac;gac;ggc;tgc;;;aat;ggg;ctc;cac;gac;ggc;tgc paire;tta;ccc;gag;gtg;ctg;ccg;acg;;paire;tta;ccc;gag;gtg;ctg;ccg;acg codons;1;4;4;4;4;4;4;;codons;2;2;2;4;3;3;4
Moyennes des doublets à 3 codons homogènes
[modifier | modifier le wikicode]- Lien tableur: Moyennes des doublets à 3 codons homogènes
- Légende: Chez les eucaryotes les codons ttc et cgc sont dans leurs doublets (pas de permutation). De même pour cgc chez les bactéries.
IV1.23;;;;;;I1.23;;;;;;IV1.13;;;;;;I1.13;;;; doublet;.tt;.ct;.ac;.gc;;doublet;.tc;.cc;.ac;.gc;;doublet;t.c;a.c;c.t;g.c;;doublet;t.c;a.c;c.c;g.c sauf;ttc;gct;cac;cgt;;sauf;atc;ccc;cac;cgt;;sauf;tct;−;cac;−;;sauf;tgc;agc;cgt;ggc m;11.32;10.54;15.45;14.72;;m;1.19;1.09;2.00;1.50;;m;14.16;−;9.03;−;;m;1.41;1.86;0.93;1.46 e;2.87;1.29;2.12;3.70;;e;0.29;0.05;0.36;0.69;;e;2.57;−;0.66;−;;e;0.25;0.64;0.25;0.68 %;25;12;14;25;;%;24;5;18;46;;%;18;−;7;−;;%;18;35;26;47 doublet;.ta;.ca;.aa;.ga;;doublet;.ta;.ca;.aa;.ga;;doublet;t.a;a.a;c.a;g.a;;doublet;t.a;a.a;c.a;g.a sauf;cta;tca;taa;tga;;sauf;ata;gca;taa;tga;;sauf;taa;ata;cta;gta;;sauf;taa;ata;cga;gga m;5.45;9.35;12.47;8.77;;m;1.53;1.37;2.08;0.93;;m;4.42;10.72;8.64;11.23;;m;0.94;1.64;1.39;2.37 e;0.15;2.16;2.87;2.72;;e;0.58;0.07;0.44;0.62;;e;2.07;4.31;1.92;0.75;;e;0.54;0.56;0.18;0.17 %;3;23;23;31;;%;38;5;21;67;;%;47;40;22;7;;%;57;34;13;7 doublet;.tg;.cg;.ag;.gg;;doublet;.tg;.cg;.ag;.gg;;doublet;t.g;a.g;c.g;g.g;;doublet;t.g;a.g;c.g;g.g sauf;atg;gcg;tag;cgg;;sauf;atg;gcg;tag;ggg;;sauf;tag;acg;cag;gag;;sauf;tag;atg;ctg;ggg m;7.39;4.35;14.38;7.50;;m;0.87;0.63;0.51;0.92;;m;6.85;15.21;4.71;6.67;;m;0.91;0.71;0.66;0.32 e;1.36;0.36;3.92;2.12;;e;0.49;0.07;0.15;0.14;;e;2.46;6.45;1.69;1.99;;e;0.23;0.13;0.16;0.02 %;18;8;27;28;;%;57;12;28;15;;%;36;42;36;30;;%;25;18;24;6
Genèse des gènes de tRNAs
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux:Genèse des gènes de tRNAs
- Légende
I 1.g;Genèse de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235027;;;IV 1.g;Genèse de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;;;IV1.265;;sensibilité relative;;;7.90;-37.3;265.0 ttt;−;tct;−;tat;−;tgt;−;;ttt;0.21;tcc;0.23;tat;0.22;tgt;0.23;;ttt;0.03;tcc;0.04;tat;0.04;tgt;0.03 att;−;act;0.02;aat;−;agt;−;;atc;0.26;acc;0.19;aat;0.28;agt;0.14;;atc;0.04;acc;0.03;aat;0.05;agt;0.03 ctt;0.09;cct;−;cat;−;cgc;0.08;;ctc;0.16;ccc;0.13;cat;0.18;cgc;0.11;;ctc;0.02;ccc;0.02;cat;0.03;cgc;0.02 gtt;−;gct;−;gat;−;ggt;−;;gtc;0.31;gcc;0.21;gat;0.28;ggt;0.16;;gtc;0.06;gcc;0.04;gat;0.04;ggt;0.03 ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;1;;ttc;0.99;tct;1;tac;1;tgc;0.99;;ttc;1;tct;18;tac;6;tgc;94 atc;1;acc;0.99;aac;1;agc;1;;att;1;act;0.99;aac;1;agc;0.99;;att;-22.4;act;34;aac;-11;agc;20.7 ctc;0.92;ccc;0.67;cac;1;cgt;0.92;;ctt;0.91;cct;0.96;cac;0.99;cgt;0.99;;ctt;10;cct;73;cac;11;cgt;-35 gtc;1;gcc;1;gac;1;ggc;1;;gtt;1;gct;1;gac;0.99;ggc;0.98;;gtt;35;gct;127;gac;0;ggc;-8 tta;0.95;tca;0.99;taa;−;tga;0.33;;tta;0.98;tca;1;taa;−;tga;0.60;;tta;-43;tca;-43;taa;−;tga;-20.1 ata;−;aca;1.00;aaa;1.00;aga;1.00;;ata;0.98;aca;1;aaa;0.98;aga;0.98;;ata;−;aca;-37;aaa;-13;aga;0 cta;0.99;cca;1.00;caa;1.00;cga;0.21;;cta;0.93;cca;0.99;caa;1;cga;0.83;;cta;-52;cca;-4;caa;-21.2;cga;233 gta;1.00;gca;1.00;gaa;1.00;gga;1.00;;gta;0.98;gca;1;gaa;1;gga;1;;gta;-68;gca;-47;gaa;-37;gga;3 ttg;0.98;tcg;0.62;tag;−;tgg;1.00;;ttg;0.96;tcg;1;tag;−;tgg;0.98;;ttg;-16;tcg;-11;tag;−;tgg;10 atg;1;acg;0.67;aag;0.52;agg;0.80;;atg;1;acg;0.98;aag;0.98;agg;0.98;;atg;-44;acg;-16;aag;281;agg;15 ctg;0.82;ccg;0.54;cag;0.46;cgg;0.86;;ctg;0.90;ccg;0.82;cag;1;cgg;0.90;;ctg;-35;ccg;-8;cag;120;cgg;-46 gtg;0.31;gcg;0.30;gag;0.29;ggg;0.57;;gtg;0.99;gcg;0.86;gag;1;ggg;0.93;;gtg;248;gcg;143;gag;441;ggg;18 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; I 1.z;Zéros de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235027;;;IV 1.z;Zéros de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;;;I 1.zb;Bactéries. 4032 bactéries ;;;;;235027; ttt;−;tct;−;tat;−;tgt;−;;ttt;96;tcc;93;tat;94;tgt;93;;ttt;−;tct;−;tat;−;tgt;− att;−;act;3682;aat;−;agt;−;;atc;90;acc;98;aat;87;agt;104;;att;−;act;3775;aat;−;agt;− ctt;3502;cct;−;cat;−;cgc;3614;;ctc;102;ccc;105;cat;99;cgc;108;;ctt;3834;cct;−;cat;−;cgc;3932 gtt;−;gct;−;gat;−;ggt;−;;gtc;83;gcc;96;gat;87;ggt;102;;gtt;−;gct;−;gat;−;ggt;− ttc;0;tcc;0;tac;0;tgc;0;;*ttc;1;tct;0;tac;0;*tgc;1;;ttc;0;tcc;0;tac;0;tgc;0 atc;0;acc;41;aac;0;agc;0;;att;0;act;1;aac;0;agc;1;;atc;0;acc;3775;aac;0;agc;0 ctc;323;ccc;1285;cac;0;cgt;307;;ctt;11;cct;5;*cac;1;cgt;1;;ctc;3834;ccc;3940;cac;0;cgt;3932 gtc;0;gcc;0;gac;0;ggc;0;;gtt;0;gct;0;*gac;1;ggc;2;;gtc;0;gcc;0;gac;0;ggc;0 tta;190;tca;22;taa;−;tga;2629;;tta;2;tca;0;taa;−;tga;48;;tta;3933;tca;3943;taa;−;tga;3934 ata;−;aca;13;aaa;9;aga;10;;ata;2;aca;0;aaa;2;*aga;2;;ata;−;aca;3944;aaa;3941;aga;3928 cta;30;cca;5;caa;18;cga;3026;;cta;9;cca;1;caa;0;cga;20;;cta;3935;cca;3939;caa;3943;cga;3833 gta;2;gca;11;gaa;5;gga;11;;gta;2;gca;0;gaa;0;gga;0;;gta;3935;gca;3902;gaa;3928;gga;3939 ttg;96;tcg;1493;tag;−;tgg;15;;ttg;5;tcg;0;tag;−;*tgg;3;;ttg;3933;tcg;3943;tag;−;tgg;3934 atg;0;acg;1288;aag;1899;agg;780;;atg;0;acg;2;aag;2;agg;2;;atg;0;acg;3944;aag;3941;agg;3928 ctg;692;ccg;1813;cag;2130;cgg;539;;ctg;12;ccg;22;cag;0;cgg;12;;ctg;3935;ccg;3939;cag;3943;cgg;3833 gtg;2724;gcg;2721;gag;2808;ggg;1699;;gtg;1;gcg;17;gag;0;ggg;8;;gtg;3935;gcg;3902;gag;3928;ggg;3939
Genèse et sensibilité
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Genèse et sensibilité
- Légende
table;codon;B;E;z,E;sens,r;sens,E;;table;codon;B;E;z,E;sens,r;sens,E ;genèse constante, neutre;;;;;;;;genèse constante, négative;;;;; ;ttc;1;0,99;1;1;1,53;;;gta;1,00;0,98;2;-68;0,69 ;tac;1;1;0;6;1,69;;;atg;1;1;0;-44;2,49 ;aac;1;1;0;-11;1,94;;;tca;0,99;1;0;-43;0,75 ;cac;1;0,99;1;11;1,30;;;aca;1,00;1;0;-37;0,92 ;gac;1;0,99;1;0;2,23;;;gca;1,00;1;0;-47;1,33 I;tgg;1;0,98;3;10;1,20;;;gaa;1,00;1;0;-37;1,52 ;aaa;1;0,98;2;-13;1,97;;;tta;0,95;0,98;2;-43;0,67 II;caa;1;1;0;-21,2;1,25;;VI;cgt/c;0,92;0,99;1;-35;1,21 ;atc/t;1;1;0;-22,4;1,77;;;ctg;0,82;0,90;12;-35;0,84 ;tcc/t;1;1;0;18;1,32;;;cgg;0,86;0,90;12;-46;0,45 ;agc;1;0,99;1;20,7;1,32;;VII;cta;0,99;0,93;9;-52;0,59 III;ggc;1;0,98;2;-8;2,11;;;genèse constante, sensible;;;;; ;cca;1;0,99;1;-4;1,30;;;gtc/t;1;1;0;35;1,48 ;aga;1;0,98;2;0;1,19;;;acc/t;0,99;0,99;1;34;1,50 IV;gga;1;1;0;3;1,41;;;tgc;1;0,99;1;94;2,16 ;ttg;0,98;0,96;5;-16;0,83;;VIII;gcc/t;1;1;0;127;2,34 ;ctc/t;0,92;0,91;11;10;1,05;;;;;;;; ;ccg;0,54;0,82;22;-8;0,50;;;genèse variable, sensible;;;;; ;ggg;0,57;0,93;8;18;0,66;;;ata;−;0,98;2;−;0,71 V;tga;0,33;0,60;48;-20,1;0,26;;;aag;0,52;0,98;2;281;2,29 ;;;;;;;;;cag;0,46;1;0;120;1,30 ;;;;;;;;;gag;0,29;1;0;441;1,86 ;genèse variable, neutre;;;;;;;b;gtg;0,31;0,99;1;248;1,13 ;tcg;0,62;1;0;-11;0,58;;;gcg;0,30;0,86;17;143;0,74 ;acg;0,67;0,98;2;-16;0,58;;;cga;0,21;0,83;20;233;0,73 a;agg;0,80;0,98;2;15;0,99;;c;cct/c;0,67;0,96;5;73;1,17
Duplications entières du processus E
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Duplications entières du processus E
- Légende
;;;;Duplications entières du processus E;;;;;;;;;; codon;iE;saut;;codon;iE;saut;;codon;iE;saut;;codon;iE;saut cgc;0.07;21;;tga;1.73;56;;agg;6.95;5;;ttc;10.56;0.18 ctc;0.09;53;;cgg;2.71;22;;ctt;7.33;5;;gtt;10.58;1.60 ccc;0.14;49;;gta;3.29;3;;cgt;7.67;4;;act;10.75;9 acc;0.21;8;;ccg;3.39;0.55;;gca;8.02;2.42;;att;11.71;0.67 cat;0.22;0.33;;cta;3.41;13;;aga;8.21;0.75;;tac;11.79;12 ggt;0.22;7;;acg;3.87;0.88;;caa;8.28;1.07;;aac;13.18;0.74 agt;0.24;9;;tcg;3.90;5;;tgg;8.36;3;;aaa;13.28;8 ttt;0.26;0.66;;tta;4.11;12;;cct;8.60;0.28;;ggc;14.37;0.04 tgt;0.26;9;;tca;4.59;1.98;;gtg;8.62;4;;gag;14.37;6 gcc;0.29;3;;ggg;4.69;14;;cca;8.93;1.59;;atg;15.22;1.04 tat;0.30;5;;ctg;5.36;3;;cac;9.07;3;;gac;15.37;4 tcc;0.31;8;;gcg;5.51;0.91;;tct;9.34;0.17;;tgc;15.92;10 atc;0.34;0.37;;ata;5.56;0.10;;agc;9.36;3;;gct;17.49;0.20 gat;0.34;14;;ttg;5.57;0.06;;gaa;9.62;0.93;;aag;17.52; aat;0.39;13;;cga;5.57;4;;cag;9.71;0.36;;;; gtc;0.44;297;;aca;5.77;20;;gga;9.75;8;;;;
Corrélations entre codons des 121 eucaryotes
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Calculs pour 121 eucaryotes
- Tableau des diagrammes
- Légende: corel pour coefficient de corrélation pour 45 codons (-1, atg), 41 codons(-5, atg aag gag tgc gct), 40 codons (-6, +gta)
;-1;-5;-6;;;-1;-5;-6 corel;0.453;0.682;0.745;;corel;0.335;0.589;0.671 ;;;;;;;; ;I1 B;IV1 E;;;;I1 B;IV1-I1 d; ata;0.01;5.58;;;ata;0.01;5.56; cga;0.22;5.79;;;cga;0.22;2.71; gcg;0.30;5.82;;;gcg;0.30;5.51; gtg;0.33;8.95;;;gtg;0.33;8.62; tga;0.33;2.06;;;tga;0.33;1.73; gag;0.34;14.72;;*;gag;0.34;14.37; ccg;0.54;3.93;;;ccg;0.54;3.39; ggg;0.56;5.25;;;ggg;0.56;4.69; cag;0.59;10.31;;;cag;0.59;9.71; aag;0.60;18.12;;*;aag;0.60;17.52; tcg;0.65;4.55;;;tcg;0.65;3.90; ccc;0.68;9.28;;;ccc;0.68;8.60; acg;0.68;4.55;;;acg;0.68;3.87; cgg;0.83;3.54;;;cgg;0.83;5.57; agg;0.86;7.81;;;agg;0.86;6.95; ctc;0.95;8.29;;;ctc;0.95;7.33; ttg;0.99;6.56;;;ttg;0.99;5.57; gcc;1.03;18.52;;*;gcc;1.03;17.49; tgg;1.08;9.45;;;tgg;1.08;8.36; agc;1.10;10.45;;;agc;1.10;9.36; gtc;1.10;11.68;;;gtc;1.10;10.58; tgc;1.11;17.02;;*;tgc;1.11;15.92; acc;1.12;11.87;;;acc;1.12;10.75; tcc;1.12;10.46;;;tcc;1.12;9.34; cac;1.17;10.24;;;cac;1.17;9.07; tta;1.18;5.29;;;tta;1.18;4.11; aga;1.19;9.40;;;aga;1.19;8.21; cta;1.23;4.64;;;cta;1.23;3.41; ctg;1.29;6.64;;;ctg;1.29;5.36; tca;1.31;5.91;;;tca;1.31;4.59; cca;1.35;10.28;;;cca;1.35;8.93; gga;1.37;11.12;;;gga;1.37;9.75; aca;1.46;7.23;;;aca;1.46;5.77; ttc;1.51;12.07;;;ttc;1.51;10.56; caa;1.58;9.86;;;caa;1.58;8.28; tac;1.59;13.38;;;tac;1.59;11.79; cgt;1.85;9.53;;;cgt;1.85;7.67; aac;2.17;15.36;;;aac;2.17;13.18; gta;2.20;5.49;;*;gta;2.20;3.29; gac;2.24;17.61;;;gac;2.24;15.37; aaa;2.26;15.54;;;aaa;2.26;13.28; atc;2.28;13.99;;;atc;2.28;11.71; ggc;2.30;16.67;;;ggc;2.30;14.37; gaa;2.40;12.02;;;gaa;2.40;9.62; gca;2.53;10.55;;;gca;2.53;8.02; atg;4.47;19.69;;*;atg;4.47;15.22;
Distribution des tRNAs de 121 eucaryotes
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Distribution des tRNAs de 121 eucaryotes
- Tableau des cumuls des tRNAs >4
Cumul des fréquences des tRNAs/génome > 4. 121 Eucaryotes.;;;;;;; ttt;2;tct;104;tat;2;tgt;6 c;111;c;2;c;106;c;87 a;55;a;48;a;−;a;9 g;70;g;32;g;−;g;87 ctt;80;cct;85;cat;1;cgt;92 c;0;c;1;c;97;c;2 a;37;a;82;a;78;a;64 g;72;g;24;g;87;g;28 att;111;act;106;aat;4;agt;1 c;5;c;5;c;108;c;88 a;55;a;61;a;83;a;86 g;110;g;43;g;113;g;61 gtt;107;gct;114;gat;6;ggt;8 c;3;c;3;c;112;c;114 a;49;a;83;a;98;a;77 g;71;g;52;g;95;g;53
- Tableau des totaux Ligne/Colonne
Cumul des fréquences des tRNAs/génome > 4. 121 Eucaryotes.;;;;;;;;;; Total colonne;;;;;;Total ligne;;;; ;t;c;a;g;;;t;c;a;g Base 2;938;845;990;863;;Base 1;721;830;1040;1045 t1+c1;10;11;13;17;;t1+c1;12;4;15;20 t2+c2;409;409;423;381;;t2+c2;408;354;413;447 a;196;274;259;236;;a;112;261;285;307 g;323;151;295;229;;g;189;211;327;271
- Tableau des diagrammes et totaux des fréquences 0-4
max;;ttc;tta;ttg;ctt;cta;ctg;att;ata;atg;gtt;gta;gtg;tct;tca;tcg;cct;cca;ccg;act;aca;acg;gct;gca;gcg;tac;cac;caa;cag;aac;aaa;aag;gac;gaa;gag;tgc;tgg;cgt;cga;cgg;agc;aga;agg;ggc;gga;ggg;total;tga; 22;0;1;2;5;11;9;12;0;2;0;0;2;1;0;0;0;5;1;22;1;0;3;0;0;17;0;1;0;0;0;2;2;1;0;0;1;3;1;20;12;1;2;2;2;0;8;152;48;0 33;1;3;19;7;9;18;13;2;33;1;2;25;16;4;15;25;16;8;14;1;10;27;2;9;8;3;2;6;15;2;8;1;2;4;9;5;3;2;10;30;4;10;26;1;7;24;461;41;1 26;2;2;11;10;6;19;7;1;18;2;3;26;12;5;24;18;6;8;16;1;20;18;2;13;13;3;4;12;9;2;8;1;2;8;6;4;4;7;12;18;8;9;16;2;11;18;425;11;2 26;3;2;17;14;5;20;6;2;4;0;5;9;14;4;20;26;3;10;20;3;14;15;3;11;16;3;6;9;5;6;10;4;4;7;5;14;8;6;5;19;13;9;9;0;14;9;408;8;3 25;4;2;17;15;10;18;11;5;9;8;4;10;7;4;14;20;6;12;25;9;16;15;0;5;15;6;11;16;5;3;10;0;0;4;6;10;16;13;10;14;7;5;7;2;12;9;423;4;4 20;5;11;10;8;15;14;14;2;20;3;3;9;3;5;10;8;1;10;8;6;7;13;3;14;16;9;12;12;8;1;6;4;4;10;5;11;6;6;18;10;7;15;14;3;7;6;387;1;5 22;6;11;8;10;18;3;11;8;8;5;10;7;7;9;10;8;10;11;1;7;14;7;3;4;8;13;12;10;6;11;6;4;5;9;5;0;18;22;10;4;10;17;8;2;10;8;388;0;6 15;7;8;9;14;5;3;11;7;8;6;15;9;9;14;8;3;15;15;3;6;8;8;9;5;6;4;10;8;7;5;2;4;1;6;5;4;9;15;10;4;10;9;6;4;7;7;341;2;7 14;8;12;5;10;8;2;5;9;4;7;10;7;3;8;2;5;10;12;2;13;4;1;6;5;4;9;9;4;6;4;7;2;11;6;10;3;13;6;4;2;14;5;3;5;6;6;289;0;8 17;9;7;4;5;5;3;5;8;2;5;7;3;7;10;2;1;9;1;4;17;4;3;4;14;0;9;7;9;4;14;4;12;7;5;6;1;5;7;4;0;9;8;3;4;10;7;265;0;9 15;10;11;3;5;3;4;6;13;3;6;9;1;9;13;2;1;10;6;0;15;6;4;5;7;1;6;12;7;10;5;3;4;14;5;6;3;5;10;2;2;6;5;4;9;3;2;266;0;10 13;11;5;2;2;1;2;7;9;1;3;7;2;3;10;2;0;4;5;0;11;2;1;5;6;3;5;4;4;10;5;4;7;2;8;7;2;1;1;1;0;3;3;4;13;4;2;183;0;11 12;12;9;3;2;3;0;1;12;0;4;7;1;5;9;2;0;4;1;0;6;1;0;7;2;2;3;5;0;10;6;5;6;1;2;2;1;2;4;2;1;4;3;1;5;5;1;150;0;12 11;13;5;3;1;1;0;3;9;1;2;5;0;2;6;0;0;4;1;1;2;1;1;5;2;0;5;1;1;5;5;2;6;11;6;6;3;4;3;0;0;4;3;2;7;0;1;130;0;13 12;14;3;2;4;2;0;0;4;0;8;5;0;1;2;2;1;4;2;0;2;1;0;4;2;0;6;2;2;1;5;6;6;9;7;4;2;3;2;0;1;2;1;0;12;2;0;122;0;14 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2;69;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;69 ;;ttc;tta;ttg;ctt;cta;ctg;att;ata;atg;gtt;gta;gtg;tct;tca;tcg;cct;cca;ccg;act;aca;acg;gct;gca;gcg;tac;cac;caa;cag;aac;aaa;aag;gac;gaa;gag;tgc;tgg;cgt;cga;cgg;agc;aga;agg;ggc;gga;ggg;total;tga; Suite;−;−;−;−;112;−;75;101;−;73;166;145;71;−;−;−;−;−;−;99;91;137;75;5,898;3,858;83;−;782;81;123;72;86;82;84;77;92;74;85;79;−;76;90;116;85;80;72;−;−; Fréquence 1;;;;;;;;110;;79;;;81;;;;;;;151;206;;83;;;90;;;108;168;74;97;90;114;164;107;178;;84;;99;105;;;133;81;;; ;;;;;;;;;;94;;;1540;;;;;;;;;;106;;;107;;;;;78;97;97;114;395;338;217;;1201;;;123;;;326;90;;; ;;;;;;;;;;138;;;;;;;;;;;;;256;;;;;;;;82;127;184;139;428;;256;;;;;;;;391;105;;; ;;;;;;;;;;154;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;86;149;;235;468;;;;;;;;;;619;341;;; ;;;;;;;;;;278;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;271;;435;;;;;;;;;;;833;1,295;;; ;;;;;;;;;;286;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;408;;1,901;;;;;;;;;;;987;1,766;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;772;;2,368;;;;;;;;;;;1073;2,148;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;887;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;ttc;tta;ttg;ctt;cta;ctg;att;ata;atg;gtt;gta;gtg;tct;tca;tcg;cct;cca;ccg;act;aca;acg;gct;gca;gcg;tac;cac;caa;cag;aac;aaa;aag;gac;gaa;gag;tgc;tgg;cgt;cga;cgg;agc;aga;agg;ggc;gga;ggg;total;tga; Total 0-4;;10;66;51;41;84;49;10;66;11;14;72;50;17;73;89;36;39;97;15;60;78;7;38;69;15;24;43;34;13;38;8;9;23;26;34;34;29;57;93;33;35;60;7;44;68;1869;112; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; Distribution c/t;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;ttt;ctc;atc;gtc;tcc;ccc;acc;gcc;tat;cat;aat;gat;tgt;cgc;agt;ggt;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;0;96;102;90;83;93;105;98;96;94;99;87;87;93;108;104;102;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;1;16;16;16;26;17;13;13;14;18;17;17;21;17;7;6;5;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;2;5;3;8;3;2;1;3;5;5;1;11;7;4;2;6;4;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;3;1;0;1;6;4;0;1;1;2;2;1;0;0;2;3;0;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;4;1;0;1;0;3;1;1;2;0;1;1;0;1;0;1;2;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;5;0;0;2;0;0;0;1;0;1;1;1;0;3;0;1;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;6;2;0;2;0;0;1;0;1;0;0;2;3;1;0;0;0;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; Suite;−;−;−;9;12;22;−;8;31;11;−;9;10;16;7;−;7;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; Fréquence 1;;;;;16;32;;12;168;;;;10;143;9;;9;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;16;;;13;;;;;20;;;;12;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;19;;;;;;;;;19;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;20;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;21;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;24;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Caractérisation des codons par les processus de genèse et de duplication des eucaryotes
[modifier | modifier le wikicode]Tableau des effectifs calculés des gènes de tRNAs 121 eucaryotes.
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableur: Tableau des effectifs calculés des gènes de tRNAs 121 eucaryotes.
- Légende: Décompte des gènes tRNAs par codon suivant la base de données gtRNAdb [4].
- 5 : nombre de tRNAs d'un codon se terminant par t. Ce sont les plus faibles.
- 113 : nombre de tRNAs d'un codon se terminant par t: Changement de t en c chez les archées et de c en t chez les eucaryotes.
- 4 366: Effectif élevé de tRNAs d'un codon se terminant par g chez les procaryotes.
- 2622: Effectif faible de tRNAs supérieurs à t et à c .
- 160: Changement de codon g Chez les archées et les eucaryotes.
- Tableaux:
- Nombre de tRNAs, tableaux IV V, décompte de la base gtRNAdb.
- Pour 100 000 tRNAs, tableaux IV100 III100 V100, décomptes rapportés à 100 000 tRNAs pour comparaison.
- tRNAs pour 1 génome, tableaux IV1 III1 , indice de la multiplicité = nombre de tRNAs / nombre de génomes.
- IVp, pentes; IVr, coefficients de détermination R2. Voir les calculs pour les 121 eucaryotes
IV ;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;;55,830;;IV p;Pentes des tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;;;;12,258;V;Nombres Danio rerio (Zebrafish) ;;;;; ttt;32;tct;1,266;tat;36;tgt;32;;ttt;;tct;0.946;tat;;tgt;;;ttt;10;tct;336;tat;5;tgt;9 c;1,461;c;38;c;1,619;c;2,060;;c;1.139;c;;c;1.293;c;1.603;;c;197;c;2;c;236;c;136 a;640;a;715;a;;a;249;;a;0.463;a;0.699;a;;a;;;a;73;a;209;a;;a;14 g;794;g;551;g;;g;1,143;;g;0.574;g;0.511;g;;g;0.941;;g;241;g;80;g;;g;44 ctt;1,003;cct;1,123;cat;27;cgt;1,153;;ctt;0.853;cct;0.991;cat;;cgt;0.948;;ctt;270;cct;315;cat;10;cgt;203 c;22;c;17;c;1,239;c;19;;c;;c;;c;0.998;c;;;c;4;c;2;c;387;c;24 a;561;a;1,244;a;1,193;a;701;;a;0.504;a;1.062;a;0.925;a;0.606;;a;244;a;205;a;105;a;107 g;804;g;476;g;1,247;g;428;;g;0.627;g;0.469;g;1.065;g;0.321;;g;300;g;180;g;266;g;59 att;1,693;act;1,436;aat;47;agt;29;;att;1.334;act;1.188;aat;;agt;;;att;258;act;359;aat;24;agt;14 c;41;c;28;c;1,858;c;1,265;;c;;c;;c;1.442;c;1.174;;c;10;c;10;c;1,045;c;424 a;675;a;875;a;1,880;a;1,138;;a;0.668;a;0.848;a;1.669;a;0.969;;a;75;a;290;a;525;a;252 g;2,382;g;551;g;2,193;g;945;;g;2.025;g;0.491;g;1.738;g;0.808;;g;522;g;66;g;953;g;104 gtt;1,413;gct;2,241;gat;41;ggt;27;;gtt;1.020;gct;1.728;gat;;ggt;;;gtt;232;gct;92;gat;1;ggt;11 c;53;c;35;c;2,131;c;2,017;;c;;c;;c;1.690;c;1.476;;c;6;c;4;c;150;c;836 a;664;a;1,276;a;1,455;a;1,345;;a;0.591;a;1.079;a;1.233;a;1.263;;a;230;a;368;a;225;a;47 g;1,083;g;704;g;1,781;g;635;;g;0.905;g;0.673;g;1.375;g;0.485;;g;227;g;112;g;245;g;268 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; IV 100;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;;;;I 100;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235,027;24.10.17;;;V 100;Danio rerio (Zebrafish) ;;;;; ttt;57;tct;2,268;tat;64;tgt;57;;ttt;4;tct;2;tat;2;tgt;1;;ttt;82;tct;2,741;tat;41;tgt;73 c;2,617;c;68;c;2,900;c;3,690;;c;2,598;c;1,923;c;2,732;c;1,903;;c;1,607;c;16;c;1,925;c;1,109 a;1,146;a;1,281;a;;a;446;;a;2,021;a;2,255;a;−;a;560;;a;596;a;1,705;a;;a;114 g;1,422;g;987;g;;g;2,047;;g;1,702;g;1,116;g;−;g;1,858;;g;1,966;g;653;g;;g;359 ctt;1,797;cct;2,011;cat;48;cgt;2,065;;ctt;157;cct;4;cat;2;cgt;3,182;;ctt;2,203;cct;2,570;cat;82;cgt;1,656 c;39;c;30;c;2,219;c;34;;c;1,638;c;1,167;c;2,006;c;142;;c;33;c;16;c;3,157;c;196 a;1,005;a;2,228;a;2,137;a;1,256;;a;2,102;a;2,320;a;2,718;a;377;;a;1,991;a;1,672;a;857;a;873 g;1,440;g;853;g;2,234;g;767;;g;2,207;g;929;g;1,016;g;1,427;;g;2,447;g;1,468;g;2,170;g;481 att;3,032;act;2,572;aat;84;agt;52;;att;2;act;44;aat;2;agt;0;;att;2,105;act;2,929;aat;196;agt;114 c;73;c;50;c;3,328;c;2,266;;c;3,916;c;1,920;c;3,729;c;1,881;;c;82;c;82;c;8,525;c;3,459 a;1,209;a;1,567;a;3,367;a;2,038;;a;23;a;2,501;a;3,874;a;2,044;;a;612;a;2,366;a;4,283;a;2,056 g;4,267;g;987;g;3,928;g;1,693;;g;7,670;g;1,174;g;1,033;g;1,469;;g;4,258;g;538;g;7,775;g;848 gtt;2,531;gct;4,014;gat;73;ggt;48;;gtt;4;gct;1;gat;0;ggt;0;;gtt;1,893;gct;751;gat;8;ggt;90 c;95;c;63;c;3,817;c;3,613;;c;1,885;c;1,773;c;3,839;c;3,946;;c;49;c;33;c;1,224;c;6,820 a;1,189;a;2,286;a;2,606;a;2,409;;a;3,769;a;4,334;a;4,118;a;2,347;;a;1,876;a;3,002;a;1,836;a;383 g;1,940;g;1,261;g;3,190;g;1,137;;g;559;g;521;g;591;g;964;;g;1,852;g;914;g;1,999;g;2,186 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; IV 1;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;;;;III 1;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;;;;;IV r;R2 des tRNAs. 121 eucaryotes;;;;; ttt;0.26;tct;10.46;tat;0.30;tgt;0.26;;ttt;0.37;tct;10.46;tat;0.41;tgt;1.73;;ttt;;tct;881;tat;;tgt; c;12.07;c;0.31;c;13.38;c;17.02;;c;12.07;c;0.82;c;13.73;c;19.86;;c;914;c;;c;748;c;743 a;5.29;a;5.91;a;0.00;a;2.06;;a;5.83;a;5.91;a;0.00;a;2.06;;a;734;a;758;a;;a; g;6.56;g;4.55;g;0.00;g;9.45;;g;6.74;g;4.55;g;0.00;g;14.37;;g;775;g;731;g;;g;815 ctt;8.29;cct;9.28;cat;0.22;cgt;9.53;;ctt;8.97;cct;9.28;cat;0.28;cgt;9.53;;ctt;807;cct;816;cat;;cgt;760 c;0.18;c;0.14;c;10.24;c;0.16;;c;0.18;c;0.21;c;10.24;c;0.27;;c;;c;;c;938;c; a;4.64;a;10.28;a;9.86;a;5.79;;a;4.64;a;10.28;a;16.17;a;16.69;;a;748;a;713;a;614;a;801 g;6.64;g;3.93;g;10.31;g;3.54;;g;7.08;g;3.93;g;10.89;g;3.54;;g;697;g;743;g;822;g;570 att;13.99;act;11.87;aat;0.39;agt;0.24;;att;14.90;act;12.62;aat;0.60;agt;0.30;;att;847;act;803;aat;;agt; c;0.34;c;0.23;c;15.36;c;10.45;;c;0.58;c;0.69;c;16.85;c;10.45;;c;;c;;c;913;c;797 a;5.58;a;7.23;a;15.54;a;9.40;;a;5.58;a;8.70;a;15.54;a;11.31;;a;740;a;788;a;770;a;666 g;19.69;g;4.55;g;18.12;g;7.81;;g;24.14;g;5.55;g;38.50;g;9.05;;g;892;g;866;g;845;g;594 gtt;11.68;gct;18.52;gat;0.34;ggt;0.22;;gtt;12.75;gct;20.86;gat;0.77;ggt;1.14;;gtt;840;gct;863;gat;;ggt; c;0.44;c;0.29;c;17.61;c;16.67;;c;0.78;c;1.98;c;18.55;c;16.67;;c;;c;;c;791;c;818 a;5.49;a;10.55;a;12.02;a;11.12;;a;6.53;a;59.00;a;54.62;a;45.84;;a;723;a;748;a;880;a;795 g;8.95;g;5.82;g;14.72;g;5.25;;g;22.31;g;37.52;g;25.71;g;53.21;;g;793;g;809;g;728;g;597
Tableau des effectifs des gènes de tRNAs 121 eucaryotes.
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Tableau des effectifs des gènes de tRNAs 121 eucaryotes.
- Liens: Sélection des 121 eucaryotes tableaux synthétiques des 121
- Utilisation de ces tableaux: Le tableau III1 92 530, est comparé au tableau III1 55 948 des tableaux synthétiques, pour l'indice de la multiplicité. Les codons en gras ont un indice multiplié par 3 à 10 par rapport à la tendance de l'ensemble des codons calculée dans III1 55 948. Le processus normal de duplication chez les eucaryotes (et non zebrafish) entre en résonance avec ces codons décuplés. Voilà encore une autre illustration de la résonance dans l'ADN.
- Légende: Décompte des gènes tRNAs par codon suivant la base de données gtRNAdb [5].
- 5 : nombre de tRNAs d'un codon se terminant par t. Ce sont les plus faibles.
- 113 : nombre de tRNAs d'un codon se terminant par t: Changement de t en c chez les archées et de c en t chez les eucaryotes.
- 4 366: Effectif élevé de tRNAs d'un codon se terminant par g chez les procaryotes.
- 2622: Effectif faible de tRNAs supérieurs à t et à c .
- 160: Changement de codon g Chez les archées et les eucaryotes.
- Tableaux:
- Nombre de tRNAs des 121 eucaryotes, tableau III 92 530.
- Pour 100 000 tRNAs des 121 eucaryotes, tableau III100 92 530.
- tRNAs pour 1 génome, tableau III1 92 530, indice de la multiplicité = nombre de tRNAs / 121.
- Tableaux non formatés: voir tableur
III;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;;92,530;;III 100;100000 tRNAs. 121 eucaryotes. 92 530;;;;;;;;III 1;tRNAs par génome de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;;92 530 ttt;45;tct;1,266;tat;50;tgt;209;;ttt;49;tct;1,368;tat;54;tgt;226;;ttt;0.37;tct;10.46;tat;0.41;tgt;1.73 c;1,461;c;99;c;1,661;c;2,403;;c;1,579;c;107;c;1,795;c;2,597;;c;12.07;c;0.82;c;13.73;c;19.86 a;705;a;715;a;;a;249;;a;762;a;773;a;0;a;269;;a;5.83;a;5.91;a;0.00;a;2.06 g;816;g;551;g;;g;1,739;;g;882;g;595;g;0;g;1,879;;g;6.74;g;4.55;g;0.00;g;14.37 ctt;1,085;cct;1,123;cat;34;cgt;1,153;;ctt;1,173;cct;1,214;cat;37;cgt;1,246;;ctt;8.97;cct;9.28;cat;0.28;cgt;9.53 c;22;c;25;c;1,239;c;33;;c;24;c;27;c;1,339;c;36;;c;0.18;c;0.21;c;10.24;c;0.27 a;561;a;1,244;a;1,957;a;2,020;;a;606;a;1,344;a;2,115;a;2,183;;a;4.64;a;10.28;a;16.17;a;16.69 g;857;g;476;g;1,318;g;428;;g;926;g;514;g;1,424;g;463;;g;7.08;g;3.93;g;10.89;g;3.54 att;1,803;act;1,527;aat;72;agt;36;;att;1,949;act;1,650;aat;78;agt;39;;att;14.90;act;12.62;aat;0.60;agt;0.30 c;70;c;83;c;2,039;c;1,265;;c;76;c;90;c;2,204;c;1,367;;c;0.58;c;0.69;c;16.85;c;10.45 a;675;a;1,053;a;1,880;a;1,369;;a;729;a;1,138;a;2,032;a;1,480;;a;5.58;a;8.70;a;15.54;a;11.31 g;2,921;g;672;g;4,658;g;1,095;;g;3,157;g;726;g;5,034;g;1,183;;g;24.14;g;5.55;g;38.50;g;9.05 gtt;1,543;gct;2,524;gat;93;ggt;138;;gtt;1,668;gct;2,728;gat;101;ggt;149;;gtt;12.75;gct;20.86;gat;0.77;ggt;1.14 c;94;c;240;c;2,245;c;2,017;;c;102;c;259;c;2,426;c;2,180;;c;0.78;c;1.98;c;18.55;c;16.67 a;790;a;7,139;a;6,609;a;5,547;;a;854;a;7,715;a;7,143;a;5,995;;a;6.53;a;59.00;a;54.62;a;45.84 g;2,699;g;4,540;g;3,111;g;6,439;;g;2,917;g;4,907;g;3,362;g;6,959;;g;22.31;g;37.52;g;25.71;g;53.21
Processus E et résonance des 121 eucaryotes
[modifier | modifier le wikicode]Processus E et résonance des 121 eucaryotes
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Processus E et résonance des 121 eucaryotes
- Légende
IV 1;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;;;I 1;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;;235027;;IV1-I1;E;;;;;; ttt;0.26;tcc;0.31;tat;0.30;tgt;0.26;;ttt;0.25;tct;0.12;tat;0.10;tgt;0.07;;ttt;0.26;tcc;0.31;tat;0.30;tgt;0.26 atc;0.34;acc;0.23;aat;0.39;agt;0.24;;att;0.12;act;2.55;aat;0.12;agt;0.02;;atc;0.34;acc;0.21;aat;0.39;agt;0.24 ctc;0.18;ccc;0.14;cat;0.22;cgc;0.16;;ctt;9.15;cct;0.25;cat;0.10;cgc;8.26;;ctc;0.09;ccc;0.14;cat;0.22;cgc;0.07 gtc;0.44;gcc;0.29;gat;0.34;ggt;0.22;;gtt;0.22;gct;0.05;gat;0.00;ggt;0.02;;gtc;0.44;gcc;0.29;gat;0.34;ggt;0.22 ttc;12.07;tct;10.46;tac;13.38;tgc;17.02;;ttc;1.51;tcc;1.12;tac;1.59;tgc;1.11;;ttc;10.56;tct;9.34;tac;11.79;tgc;15.92 att;13.99;act;11.87;aac;15.36;agc;10.45;;atc;2.28;acc;1.12;aac;2.17;agc;1.10;;att;11.71;act;10.75;aac;13.18;agc;9.36 ctt;8.29;cct;9.28;cac;10.24;cgt;9.53;;ctc;0.95;ccc;0.68;cac;1.17;cgt;1.85;;ctt;7.33;cct;8.60;cac;9.07;cgt;7.67 gtt;11.68;gct;18.52;gac;17.61;ggc;16.67;;gtc;1.10;gcc;1.03;gac;2.24;ggc;2.30;;gtt;10.58;gct;17.49;gac;15.37;ggc;14.37 tta;5.29;tca;5.91;taa;−;tga;2.06;;tta;1.18;tca;1.31;taa;−;tga;0.33;;tta;4.11;tca;4.59;taa;−;tga;1.73 ata;5.58;aca;7.23;aaa;15.54;aga;9.40;;ata;0.01;aca;1.46;aaa;2.26;aga;1.19;;ata;5.56;aca;5.77;aaa;13.28;aga;8.21 cta;4.64;cca;10.28;caa;9.86;cga;5.79;;cta;1.23;cca;1.35;caa;1.58;cga;0.22;;cta;3.41;cca;8.93;caa;8.28;cga;5.57 gta;5.49;gca;10.55;gaa;12.02;gga;11.12;;gta;2.20;gca;2.53;gaa;2.40;gga;1.37;;gta;3.29;gca;8.02;gaa;9.62;gga;9.75 ttg;6.56;tcg;4.55;tag;−;tgg;9.45;;ttg;0.99;tcg;0.65;tag;−;tgg;1.08;;ttg;5.57;tcg;3.90;tag;−;tgg;8.36 atg;19.69;acg;4.55;aag;18.12;agg;7.81;;atg;4.47;acg;0.68;aag;0.60;agg;0.86;;atg;15.22;acg;3.87;aag;17.52;agg;6.95 ctg;6.64;ccg;3.93;cag;10.31;cgg;3.54;;ctg;1.29;ccg;0.54;cag;0.59;cgg;0.83;;ctg;5.36;ccg;3.39;cag;9.71;cgg;2.71 gtg;8.95;gcg;5.82;gag;14.72;ggg;5.25;;gtg;0.33;gcg;0.30;gag;0.34;ggg;0.56;;gtg;8.62;gcg;5.51;gag;14.37;ggg;4.69 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; III 1;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;92,530;;;IV 1;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;;;III1−IV1.;;R;;;;; ttt;0.37;tcc;0.82;tat;0.41;tgt;1.73;;ttt;0.26;tcc;0.31;tat;0.30;tgt;0.26;;ttt;0.11;tcc;0.50;tat;0.12;tgt;1.46 atc;0.58;acc;0.69;aat;0.60;agt;0.30;;atc;0.34;acc;0.23;aat;0.39;agt;0.24;;atc;0.24;acc;0.45;aat;0.21;agt;0.06 ctc;0.18;ccc;0.21;cat;0.28;cgc;0.27;;ctc;0.18;ccc;0.14;cat;0.22;cgc;0.16;;ctc;0;ccc;0.07;cat;0.06;cgc;0.12 gtc;0.78;gcc;1.98;gat;0.77;ggt;1.14;;gtc;0.44;gcc;0.29;gat;0.34;ggt;0.22;;gtc;0.34;gcc;1.69;gat;0.43;ggt;0.92 ttc;12.07;tct;10.46;tac;13.73;tgc;19.86;;ttc;12.07;tct;10.46;tac;13.38;tgc;17.02;;ttc;0;tct;0;tac;0.35;tgc;2.83 att;14.90;act;12.62;aac;16.85;agc;10.45;;att;13.99;act;11.87;aac;15.36;agc;10.45;;att;0.91;act;0.75;aac;1.50;agc;0 ctt;8.97;cct;9.28;cac;10.24;cgt;9.53;;ctt;8.29;cct;9.28;cac;10.24;cgt;9.53;;ctt;0.68;cct;0;cac;0;cgt;0 gtt;12.75;gct;20.86;gac;18.55;ggc;16.67;;gtt;11.68;gct;18.52;gac;17.61;ggc;16.67;;gtt;1.07;gct;2.34;gac;0.94;ggc;0 tta;5.83;tca;5.91;taa;−;tga;2.06;;tta;5.29;tca;5.91;taa;−;tga;2.06;;tta;0.54;tca;0;taa;−;tga;0 ata;5.58;aca;8.70;aaa;15.54;aga;11.31;;ata;5.58;aca;7.23;aaa;15.54;aga;9.40;;ata;0;aca;1.47;aaa;0;aga;1.91 cta;4.64;cca;10.28;caa;16.17;cga;16.69;;cta;4.64;cca;10.28;caa;9.86;cga;5.79;;cta;0;cca;0.00;caa;6.31;cga;10.90 gta;6.53;gca;59.00;gaa;54.62;gga;45.84;;gta;5.49;gca;10.55;gaa;12.02;gga;11.12;;gta;1.04;gca;48.45;gaa;42.60;gga;34.73 ttg;6.74;tcg;4.55;tag;−;tgg;14.37;;ttg;6.56;tcg;4.55;tag;−;tgg;9.45;;ttg;0.18;tcg;0;tag;−;tgg;4.93 atg;24.14;acg;5.55;aag;38.50;agg;9.05;;atg;19.69;acg;4.55;aag;18.12;agg;7.81;;atg;4.45;acg;1.00;aag;20.37;agg;1.24 ctg;7.08;ccg;3.93;cag;10.89;cgg;3.54;;ctg;6.64;ccg;3.93;cag;10.31;cgg;3.54;;ctg;0.44;ccg;0;cag;0.59;cgg;0 gtg;22.31;gcg;37.52;gag;25.71;ggg;53.21;;gtg;8.95;gcg;5.82;gag;14.72;ggg;5.25;;gtg;13.36;gcg;31.70;gag;10.99;ggg;47.97
Sensibilite du processus E
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux:Sensibilité du processus E
- Légende
IV 1;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;23;;I 1;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235027;23 ttt;0,26;tcc;0,31;tat;0,30;tgt;0,26;;ttt;0,25;tct;0,12;tat;0,10;tgt;0,07 atc;0,34;acc;0,23;aat;0,39;agt;0,24;;att;0,12;act;2,55;aat;0,12;agt;0,02 ctc;0,18;ccc;0,14;cat;0,22;cgc;0,16;;ctt;9,15;cct;0,25;cat;0,10;cgc;8,26 gtc;0,44;gcc;0,29;gat;0,34;ggt;0,22;;gtt;0,22;gct;0,05;gat;0;ggt;0,02 ttc;12,07;tct;10,46;tac;13,38;tgc;17,02;;ttc;1,51;tcc;1,12;tac;1,59;tgc;1,11 att;13,99;act;11,87;aac;15,36;agc;10,45;;atc;2,28;acc;1,12;aac;2,17;agc;1,10 ctt;8,29;cct;9,28;cac;10,24;cgt;9,53;;ctc;0,95;ccc;0,68;cac;1,17;cgt;1,85 gtt;11,68;gct;18,52;gac;17,61;ggc;16,67;;gtc;1,10;gcc;1,03;gac;2,24;ggc;2,30 tta;5,29;tca;5,91;taa;−;tga;2,06;;tta;1,18;tca;1,31;taa;−;tga;0,33 ata;5,58;aca;7,23;aaa;15,54;aga;9,40;;ata;0,01;aca;1,46;aaa;2,26;aga;1,19 cta;4,64;cca;10,28;caa;9,86;cga;5,79;;cta;1,23;cca;1,35;caa;1,58;cga;0,22 gta;5,49;gca;10,55;gaa;12,02;gga;11,12;;gta;2,20;gca;2,53;gaa;2,40;gga;1,37 ttg;6,56;tcg;4,55;tag;−;tgg;9,45;;ttg;0,99;tcg;0,65;tag;−;tgg;1,08 atg;19,69;acg;4,55;aag;18,12;agg;7,81;;atg;4,47;acg;0,68;aag;0,60;agg;0,86 ctg;6,64;ccg;3,93;cag;10,31;cgg;3,54;;ctg;1,29;ccg;0,54;cag;0,59;cgg;0,83 gtg;8,95;gcg;5,82;gag;14,72;ggg;5,25;;gtg;0,33;gcg;0,30;gag;0,34;ggg;0,56 ;;;;;;;;;;;;;;;; 7,90;;;;;;;;;;;;;;;; IV 1.79;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;23;;-37,3;265,0;;;IV1.265;;; ttt;0,03;tcc;0,04;tat;0,04;tgt;0,03;;ttt;12;tcc;31;tat;37;tgt;44 atc;0,04;acc;0,03;aat;0,05;agt;0,03;;atc;34;acc;0,1;aat;39;agt;121 ctc;0,02;ccc;0,02;cat;0,03;cgc;0,02;;ctc;-0,7;ccc;6;cat;27;cgc;-0,8 gtc;0,06;gcc;0,04;gat;0,04;ggt;0,03;;gtc;24;gcc;73;gat;−;ggt;113 ttc;1,53;tct;1,32;tac;1,69;tgc;2,16;;ttc;1;tct;18;tac;6;tgc;94 att;1,77;act;1,50;aac;1,94;agc;1,32;;att;-22,4;act;34;aac;-11;agc;20,7 ctt;1,05;cct;1,17;cac;1,30;cgt;1,21;;ctt;10;cct;73;cac;11;cgt;-35 gtt;1,48;gct;2,34;gac;2,23;ggc;2,11;;gtt;35;gct;127;gac;0;ggc;-8 tta;0,67;tca;0,75;taa;−;tga;0,26;;tta;-43;tca;-43;taa;−;tga;-20,1 ata;0,71;aca;0,92;aaa;1,97;aga;1,19;;ata;−;aca;-37;aaa;-13;aga;0 cta;0,59;cca;1,30;caa;1,25;cga;0,73;;cta;-52;cca;-4;caa;-21,2;cga;233 gta;0,69;gca;1,33;gaa;1,52;gga;1,41;;gta;-68;gca;-47;gaa;-37;gga;3 ttg;0,83;tcg;0,58;tag;−;tgg;1,20;;ttg;-16;tcg;-11;tag;−;tgg;10 atg;2,49;acg;0,58;aag;2,29;agg;0,99;;atg;-44;acg;-16;aag;281;agg;15 ctg;0,84;ccg;0,50;cag;1,30;cgg;0,45;;ctg;-35;ccg;-8;cag;120;cgg;-46 gtg;1,13;gcg;0,74;gag;1,86;ggg;0,66;;gtg;248;gcg;143;gag;441;ggg;18 ;;;;;;;;;;;;;;;; 7,90;;;;;;;;;;;;;;;; IV1.79p;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;23;;-37,3;265,0;;;IV1.265p;;; ttt;0,03;tct;1,32;tat;0,04;tgt;0,03;;ttt;12;tct;1 067;tat;37;tgt;44 att;1,77;act;1,50;aat;0,05;agt;0,03;;att;1 427;act;58;aat;39;agt;121 ctt;1,05;cct;1,17;cat;0,03;cgt;1,21;;ctt;10;cct;473;cat;27;cgt;-35 gtt;1,48;gct;2,34;gat;0,04;ggt;0,03;;gtt;661;gct;4 725;gat;-;ggt;113 ttc;1,53;tcc;0,04;tac;1,69;tgc;2,16;;ttc;1;tcc;-96;tac;6;tgc;94 atc;0,04;acc;0,03;aac;1,94;agc;1,32;;atc;-98;acc;-97;aac;-11;agc;20,7 ctc;0,02;ccc;0,02;cac;1,30;cgc;0,02;;ctc;-98;ccc;-97;cac;11;cgc;-0,8 gtc;0,06;gcc;0,04;gac;2,23;ggc;2,11;;gtc;-95;gcc;-96;gac;0;ggc;-8 tta;0,67;tca;0,75;taa;−;tga;0,26;;tta;-43;tca;-43;taa;−;tga;-20,1 ata;0,71;aca;0,92;aaa;1,97;aga;1,19;;ata;−;aca;-37;aaa;-13;aga;0 cta;0,59;cca;1,30;caa;1,25;cga;0,73;;cta;-52;cca;-4;caa;-21,2;cga;233 gta;0,69;gca;1,33;gaa;1,52;gga;1,41;;gta;-68;gca;-47;gaa;-37;gga;3 ttg;0,83;tcg;0,58;tag;−;tgg;1,20;;ttg;-16;tcg;-11;tag;−;tgg;10 atg;2,49;acg;0,58;aag;2,29;agg;0,99;;atg;-44;acg;-16;aag;281;agg;15 ctg;0,84;ccg;0,50;cag;1,30;cgg;0,45;;ctg;-35;ccg;-8;cag;120;cgg;-46 gtg;1,13;gcg;0,74;gag;1,86;ggg;0,66;;gtg;248;gcg;143;gag;441;ggg;18
Zebrafish
[modifier | modifier le wikicode]Comparaison Zebrafish, 121 Eucaryotes, Bactéries
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IV 100;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;;;;V 100;Danio rerio (Zebrafish) ;;;;12258;;;I 100;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235027; ttt;57;tct;2,268;tat;64;tgt;57;;ttt;82;tct;2,741;tat;41;tgt;73;;ttt;4;tct;2;tat;2;tgt;1 c;2,617;c;68;c;2,900;c;3,690;;c;1,607;c;16;c;1,925;c;1,109;;c;2,598;c;1,923;c;2,732;c;1,903 a;1,146;a;1,281;a;;a;446;;a;596;a;1,705;a;;a;114;;a;2,021;a;2,255;a;−;a;560 g;1,422;g;987;g;;g;2,047;;g;1,966;g;653;g;;g;359;;g;1,702;g;1,116;g;−;g;1,858 ctt;1,797;cct;2,011;cat;48;cgt;2,065;;ctt;2,203;cct;2,570;cat;82;cgt;1,656;;ctt;157;cct;4;cat;2;cgt;3,182 c;39;c;30;c;2,219;c;34;;c;33;c;16;c;3,157;c;196;;c;1,638;c;1,167;c;2,006;c;142 a;1,005;a;2,228;a;2,137;a;1,256;;a;1,991;a;1,672;a;857;a;873;;a;2,102;a;2,320;a;2,718;a;377 g;1,440;g;853;g;2,234;g;767;;g;2,447;g;1,468;g;2,170;g;481;;g;2,207;g;929;g;1,016;g;1,427 att;3,032;act;2,572;aat;84;agt;52;;att;2,105;act;2,929;aat;196;agt;114;;att;2;act;44;aat;2;agt;0 c;73;c;50;c;3,328;c;2,266;;c;82;c;82;c;8,525;c;3,459;;c;3,916;c;1,920;c;3,729;c;1,881 a;1,209;a;1,567;a;3,367;a;2,038;;a;612;a;2,366;a;4,283;a;2,056;;a;23;a;2,501;a;3,874;a;2,044 g;4,267;g;987;g;3,928;g;1,693;;g;4,258;g;538;g;7,775;g;848;;g;7,670;g;1,174;g;1,033;g;1,469 gtt;2,531;gct;4,014;gat;73;ggt;48;;gtt;1,893;gct;751;gat;8;ggt;90;;gtt;4;gct;1;gat;0;ggt;0 c;95;c;63;c;3,817;c;3,613;;c;49;c;33;c;1,224;c;6,820;;c;1,885;c;1,773;c;3,839;c;3,946 a;1,189;a;2,286;a;2,606;a;2,409;;a;1,876;a;3,002;a;1,836;a;383;;a;3,769;a;4,334;a;4,118;a;2,347 g;1,940;g;1,261;g;3,190;g;1,137;;g;1,852;g;914;g;1,999;g;2,186;;g;559;g;521;g;591;g;964 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; IV100−V100;;;;;;;;;V100 − I100;;;;;;;;;IV100−I100. ;;% Processus E des 121 Eucaryotes.;;;;; ttt;-30;tct;-17;tat;37;tgt;-22;;ttt;95;tct;30;tat;96;tgt;98;;ttt;93;tct;15;tat;97;tgt;98 c;39;c;76;c;34;c;70;;c;-38;c;87;c;-30;c;-42;;c;1;c;97;c;6;c;48 a;48;a;-25;a;;a;74;;a;-71;a;-24;a;;a;-80;;a;-43;a;-43;a;−;a;-20 g;-28;g;34;g;;g;82;;g;13;g;-42;g;;g;-81;;g;-16;g;-12;g;−;g;9 ctt;-18;cct;-22;cat;-41;cgt;20;;ctt;26;cct;55;cat;98;cgt;-48;;ctt;9;cct;42;cat;96;cgt;-35 c;17;c;46;c;-30;c;-83;;c;-79;c;74;c;36;c;28;;c;-75;c;86;c;10;c;-76 a;-50;a;25;a;60;a;30;;a;-5;a;-28;a;-68;a;57;;a;-52;a;-4;a;-21;a;70 g;-41;g;-42;g;3;g;37;;g;10;g;37;g;53;g;-66;;g;-35;g;-8;g;54;g;-46 att;31;act;-12;aat;-57;agt;-55;;att;-46;act;34;aat;99;agt;100;;att;-23;act;25;aat;97;agt;99 c;-10;c;-39;c;-61;c;-34;;c;97;c;46;c;56;c;46;;c;97;c;13;c;-11;c;17 a;49;a;-34;a;-21;a;-1;;a;96;a;-5;a;10;a;1;;a;98;a;-37;a;-13;a;0 g;0;g;45;g;-49;g;50;;g;-44;g;-54;g;87;g;-42;;g;-44;g;-16;g;74;g;13 gtt;25;gct;81;gat;89;ggt;-46;;gtt;0;gct;-58;gat;100;ggt;100;;gtt;26;gct;56;gat;100;ggt;99 c;48;c;48;c;68;c;-47;;c;92;c;97;c;-68;c;42;;c;96;c;99;c;-1;c;-8 a;-37;a;-24;a;30;a;84;;a;-50;a;-31;a;-55;a;-84;;a;-68;a;-47;a;-37;a;3 g;5;g;28;g;37;g;-48;;g;70;g;43;g;70;g;56;;g;71;g;59;g;81;g;15
Comparaison de Zebrafish aux eucaryotes à résonance
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;fca;;&emsp ;;;bta;;&emsp ;;;ttr*;;&emsp ;;;bacu;;&emsp ;;;cmk;;&emsp ;;;zebra; code;frq;rup;;code;frq;rup;;code;frq;rup;;code;frq;rup;;code;frq;rup;;code;frq;rup tgc;32;3;;gac;42;5;;tgc;22;64;;gtg;32;31;;gga;66;14;;ctg;300;5 cta;33;33;;aga;44;43;;gca;36;19;;gca;42;7;;gct;75;8;;cct;315;7 gag;44;7;;ggc;63;24;;ggc;43;12;;gac;45;22;;ggg;81;16;;tct;336;7 cag;47;2;;aaa;78;49;;aga;48;2;;aga;55;16;;atg;94;46;;act;359;3 gga;48;4;;agg;116;23;;gac;49;10;;ggc;64;5;;acg;137;6;;gca;368;5 aaa;50;6;;tgt;143;15;;agg;54;37;;agg;67;28;;gta;145;16;;cac;387;10 agg;53;2;;gag;164;9;;aaa;74;193;;aaa;86;198;;gcc;168;23;;agc;424;23 aga;54;26;;tgg;178;90;;tgg;217;82;;tgg;256;83;;aca;206;108;;atg;522;1 cca;68;1050;;tgc;338;16;;gag;395;111;;gag;468;111;;gag;428;260;;aaa;525;59 caa;782;13;;gga;391;11;;gga;833;112;;gga;987;118;;gtg;1,540;151;;ggc;836;14 aag;887;35;;gaa;435;198;;ggg;1,766;8;;ggg;2,148;10;;gcg;3,858;53;;aag;953;10 cga;1,201;;;ggg;1,295;;;gaa;1,901;;;gaa;2,368;;;gca;5,898;;;aac;1,045; &emsp ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; T;3729;;;;4040;;;;5845;;;;7080;;;;13727;;;;12258; X;1201;;;;1295;;;;1901;;;;2368;;;;5898;;;;1045; mpe;19;;;;23;;;;17;;;;20;;;;34;;;;221; epe;17;;;;17;;;;16;;;;19;;;;21;;;;120; % e/m;85;;;;74;;;;96;;;;96;;;;63;;;;55; xpe;68;;;;78;;;;74;;;;86;;;;94;;;;525; X/mpe;62;;;;57;;;;114;;;;119;;;;174;;;;5; X/xpe;18;;;;17;;;;26;;;;28;;;;63;;;;2; sre;2870;;;;3060;;;;5112;;;;6227;;;;12380;;;;2834; spe;859;;;;980;;;;733;;;;853;;;;1347;;;;9424; faibles;3;;;;10;;;;4;;;;3;;;;8;;;;0; minpe;5;;;;4;;;;3;;;;4;;;;2;;;;44;
Zebrafish, distributions des tRNAs sur les chromosomes
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- Légende
max;;;11;25;58;920;108;12;29;50;56;8;5;51;15;4;46;11;28;40;3;201;357;187;2;18;21;;;; ;;;chr1;chr2;chr3;chr4;chr5;chr6;chr7;chr8;chr9;chr10;chr11;chr12;chr13;chr14;chr15;chr16;chr17;chr18;chr19;chr20;chr21;chr22;chr23;chr24;chr25;z8;scaffold;total;vides 6;ttt;PheAAA;;;;6;;;;;;;;;;;;;;;;1;1;;;;1;;1;10; 89;ttc;GAA;;6;58;89;4;2;;1;;;;;;;;;2;1;;2;;1;1;;21;4;5;197; 16;tta;LeuTAA;11;12;;10;;;;;;;;;;;;;16;1;;8;;;;;;14;1;73; 201;ttg;CAA;;;1;4;;;;;2;;;;;;1;;28;;;201;1;2;;;;1;;241;9 191;ctt;LeuAAG;;12;;191;;12;25;;5;1;;;;1;;;;;;;1;4;;;;2;16;270; 4;ctc;GAG;;;;4;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;4; 178;cta;TAG;;6;;178;;10;22;;5;2;;2;;;;;;;;;1;2;;;;2;14;244; 265;ctg;CAG;;;;265;6;;;;;;;1;;;;;1;2;;3;7;2;;1;;;12;300;10 148;att;IleAAT;1;10;46;148;5;2;1;;;;;;;;2;;3;1;1;;1;2;;;21;2;12;258; 8;atc;GAT;;;;8;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;2;10; 20;ata;TAT;;;;9;;;20;;3;;;1;;;;;1;;;3;;3;;;;35;;75; 196;atg;MetCAT;1;2;4;196;13;;;;56;;;2;;;;;3;2;1;3;11;187;;3;;23;15;522;7 172;gtt;ValAAC;;;;172;4;;1;28;;;4;1;4;;;;5;1;;;1;3;;;;1;7;232; 3;gtc;GAC;;;;2;;;;;;;;;;;;;3;;;;;;;;;1;;6; 163;gta;TAC;;;;163;7;;;39;;;;1;;1;;;10;;;;3;2;;;;;4;230; 169;gtg;CAC;;;;169;2;;;25;;;2;;4;;;;12;;;;1;3;;;;1;8;227;13 269;tct;SerAGA;;16;1;269;6;;;;4;;;;;;;1;2;;;15;7;;;;;4;11;336; 1;tcc;GGA;;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;1;;;;;;0;;2; 141;tca;TGA;;8;;141;8;;1;;5;;;;;;;;1;;;16;5;;;;;3;20;208; 58;tcg;CGA;;7;;58;1;1;1;;1;;1;;;;;;3;;;2;;;;;;1;5;81;13 187;cct;ProAGG;2;8;;187;8;;;50;1;;;1;12;;1;;1;4;3;5;;8;;;;2;22;315; 1;ccc;GGG;;1;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;2; 101;cca;TGG;;14;;101;2;2;;47;2;;;1;15;;1;;;1;;1;;;;;;2;16;205; 135;ccg;CGG;;7;;135;5;1;;;;;;1;;;1;;;1;;3;;4;;;;2;20;180;10 243;act;ThrAGT;;22;;243;11;;2;;1;1;;43;;;1;;;;;;1;16;;1;2;1;14;359; 6;acc;GGT;;;;3;;;;;;;;6;;;;;;;;;;;;;;;1;10; 195;aca;TGT;;3;;195;10;1;;;3;;;29;;;;11;2;1;;1;;13;1;;;2;18;290; 51;acg;CGT;;;1;51;1;;;;;;;1;;;;1;2;1;;1;1;1;;;1;1;3;66;6 54;gct;AlaAGC;;;54;10;1;;;;;;;;;4;;;1;;;;5;;;1;15;1;;92; 4;gcc;GGC;;;;4;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;4; 357;gca;TGC;3;;;3;;;;;;;;;;1;;;;1;;1;357;;;;;1;1;368; 106;gcg;CGC;;;;3;;;1;;;;;;;;;;;;;;106;;;;;;2;112;13 3;tat;TyrATA;;;;3;;;;;;;;;;;2;;;;;;;;;1;;;;6; 155;tac;GTA;;;;155;6;;;;;;;;;;46;1;;;;;1;;;;;8;18;235; 8;cat;HisATG;;;;8;;;;;;;;;;;1;;;;;;;;;;;;1;10; 314;cac;GTG;;21;;314;4;;;1;5;;;;1;;1;;2;1;;5;5;;1;;;2;24;387; 49;caa;GlnTTG;1;1;;32;1;1;;49;2;;;;12;;;;;;;;;1;;;1;3;1;105; 162;cag;CTG;2;8;55;162;7;;1;;2;;;2;;1;;1;3;2;1;;3;2;;;;3;11;266;2 23;aat;AsnATT;;;;23;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;24; 920;aac;GTT;;22;;920;21;6;10;;;;;31;1;;10;;1;;;;7;2;2;;;8;4;1045; 416;aaa;LysTTT;1;25;;416;11;1;1;;9;;;;;;1;;4;1;;2;13;;;;;4;36;525; 815;aag;CTT;1;21;;815;38;4;6;;;;;22;1;;13;1;;;1;;8;4;;;;6;12;953;7 1;gat;AspATC;;;;0;;;;;;;;;;;;;1;;;;;;;;;;;1; 108;gac;GTC;;;;25;108;;;;;;;;;;;;;;;;3;2;;;8;4;;150; 170;gaa;GluTTC;;;;170;5;1;;;;;;;;1;16;1;;;;;2;4;1;;;6;18;225; 156;gag;CTC;4;;;156;6;;;;;;;;;;44;5;;;;;1;2;1;;3;7;16;245;13 6;tgt;CysACA;;;;6;;;;;;;;;;;1;;;;;1;;;;;;1;;9; 82;tgc;GCA;;;5;2;2;;;;;;5;;;;;;;;;82;1;;1;;;38;;136; 7;tga;SeCTCA;3;;;7;;;;;;;;;;;1;;1;;;;;;;;;0;2;14; 29;tgg;TrpCCA;;1;2;0;;;29;;;;;;;;1;;;1;1;;1;;;3;;4;1;44;10 127;cgt;ArgACG;;;;127;6;;2;1;;;;;;;40;2;;;;;1;;;;3;6;15;203; 19;cgc;GCG;;2;;19;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;2;24; 65;cga;TCG;5;;;65;2;;19;;;;;2;;;;1;1;;;;1;;;;1;5;5;107; 42;cgg;CCG;8;;;42;1;1;;;;;;;;;;1;1;;;;;;;;;1;4;59;12 13;agt;SerACT;;;;13;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;;14; 327;agc;GCT;;4;;327;25;;12;;;1;5;;;;;;25;;;1;6;2;;;;2;14;424; 143;aga;ArgTCT;1;12;;143;8;;3;;3;;;51;;;1;;;1;;;;17;;1;;1;10;252; 67;agg;CCT;;;1;7;6;2;1;;13;;;2;;;;;;;;;1;67;;;;3;1;104;7 8;ggt;GlyACC;;;;8;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;3;;11; 598;ggc;GCC;;14;;598;39;;;;;8;;;4;1;;;;40;;;4;2;;18;4;;12;744; 30;gga;TCC;;;;30;2;1;;;;;;;;;2;;2;;;;3;4;1;;;;;45; 188;ggg;CCC;;1;;188;22;;;;;;;;;;1;;;23;;;;;;2;;124;1;362;10 2;taa;SupTTA;;;;2;;;;;;;;;;;;;1;;;;;;;;;1;2;6;142 8;tag;CTA;;;;8;;;;;;;;;;;;;;1;;;;;;;;;;9; ;;Undet???;;;;15;1;;;;;;;;;;;;;;;;2;;;;;1;;19; ;;;44;266;228;7825;416;49;159;241;122;13;17;200;54;10;188;26;138;87;8;358;573;362;9;31;81;347;440;12292; ;2 rRNAs;;chr1;chr2;chr3;chr4;chr5;chr6;chr7;chr8;chr9;chr10;chr11;chr12;chr13;chr14;chr15;chr16;chr17;chr18;chr19;chr20;chr21;chr22;chr23;chr24;chr25;Zv8Na10776;scaffold;total; ;Mit;;;;;;1 rRNA;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; NCBI;22;tRNAs;31;76;346;5723;140;52;72;240;60;12;13;123;46;11;135;17;109;5;7;262;253;143;11;18;72;;1,385;9,362; MB;0.02;longueur;59.58;59.64;62.63;78.09;72.5;60.27;74.28;54.3;56.46;45.42;45.48;49.18;52.19;52.66;48.04;55.27;53.46;51.02;48.45;55.2;45.93;39.13;46.22;42.17;37.5;;334;1,679; ;39.9;GC%;36.4;36.7;36.9;38.4;36.4;36.4;36.7;36.5;36.5;36.6;36.4;36.3;36.5;36.6;36.8;36.5;36.6;36.6;36.4;36.6;36.6;37;36.7;36.3;36.6;;37;37; ;13;Protein;2,176;2,229;2,436;2,450;2,713;2,123;2,531;1,986;1,832;1,779;1,596;1,679;1,805;1,481;1,814;1,996;1,703;1,541;1,762;1,890;1,948;1,674;1,755;1,365;1,453;;9,370;57,087; ;−;RNAs au;326;274;362;1252;395;250;322;272;226;186;166;157;230;170;193;308;190;179;185;192;237;293;204;138;129;;1,639;8,475; ;37;gene;1,444;1,464;1,992;7,909;1,679;1,238;1,641;1,452;1,060;1,076;952;1,091;1,046;945;1,229;1,255;1,111;915;1,038;1,376;1,374;1,288;1,015;823;978;;9,570;46,961; ;−;pseudo;22;8;23;70;6;16;14;6;9;14;4;5;6;6;14;11;9;9;7;3;8;8;5;10;4;;67;364; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 75 pb;tRNA/longueur;;0.55;3.35;2.73;75.15;4.30;0.61;1.61;3.33;1.62;0.21;0.28;3.05;0.78;0.14;2.94;0.35;1.94;1.28;0.12;4.86;9.36;6.94;0.15;0.55;1.62;;;;1/10 000
Taurus, distributions des tRNAs sur les chromosomes
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Taurus, distributions des tRNAs sur les chromosomes
- Légende: Bases de données, gtRNAdb.fa [6], NCBI [orgn]
max;;;51;58;62;28;64;42;56;37;28;50;58;31;59;35;36;46;63;48;78;10;37;41;36;20;62;16;26;22;28;67;;; ;;;chr1;chr2;chr3;chr4;chr5;chr6;chr7;chr8;chr9;chr10;chr11;chr12;chr13;chr14;chr15;chr16;chr17;chr18;chr19;chr20;chr21;chr22;chr23;chr24;chr25;chr26;chr27;chr28;chr29;X;total;; 1;ttt;PheAAA;1;;;;1;;;;;;;;;;1;;1;;;1;;;;;;;1;;;;6;;PheAAA 8;ttc;PheGAA;1;;;;;1;1;2;;;;2;2;;3;;1;1;;;;;7;;;;;;1;8;30;;PheGAA 3;tta;LeuTAA;;;;1;;1;;;1;;;;1;;2;;;1;;;;;3;;;;;;;;10;;LeuTAA 6;ttg;LeuCAA;;2;;;;;1;;1;1;;;;1;;;;1;1;;;;6;;;;;;;;14;;LeuCAA 4;ctt;LeuAAG;1;;;;;;1;;;3;;;1;;;;;;;;;;4;;1;;;;;;11;;LeuAAG 0;ctc;LeuGAG;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;;LeuGAG 2;cta;LeuTAG;;;;;;;;1;;2;;;;;;;;;1;;;;;;1;;;;;;5;;LeuTAG 3;ctg;LeuCAG;;;3;;;1;;;;;;;;;;;;1;;;;;1;;;;;;;;6;;LeuCAG 14;att;IleAAT;;;;1;;;;;;;;;;;;;;;2;;1;;14;;;;;;;;18;;IleAAT 0;atc;IleGAT;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;;IleGAT 3;ata;IleTAT;1;;;;;;1;;;1;1;;;;;;;1;;;;;3;;;;;;;;8;;IleTAT 19;atg;MetCAT;1;;1;1;1;;2;;1;;1;1;1;2;;;;2;1;;;;19;;1;;;;;;35;;MetCAT 11;gtt;ValAAC;2;;11;1;;;1;;;;;;;;;;;1;;;;;4;;;;;;;;20;;ValAAC 0;gtc;ValGAC;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;;ValGAC 6;gta;ValTAC;;;6;1;1;;1;;1;;1;;;;1;;1;;3;1;1;;2;;;;;;;1;21;;ValTAC 15;gtg;ValCAC;;2;15;;;;2;1;2;;;1;;;1;2;;2;;1;;;5;;1;;;2;1;1;39;;ValCAC 8;tct;SerAGA;;;;;;;;;;1;;;;1;;;;1;2;;;;8;;;;;;;;13;;SerAGA 4;tcc;SerGGA;4;1;1;3;;2;;1;2;1;3;;;2;;;1;;1;1;1;;;1;1;2;;;;4;32;;SerGGA 3;tca;SerTGA;;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;1;;3;;1;;;1;;;7;;SerTGA 3;tcg;SerCGA;;;1;;1;;;;;;;;;;;;;;1;;;;3;;1;;;;;;7;;SerCGA 7;cct;ProAGG;;;1;1;;;;;;2;;;;;1;;;;;;;;1;;7;;;;;;13;;ProAGG 0;ccc;ProGGG;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;;ProGGG 6;cca;ProTGG;;;;;;;;;;2;;;1;;;;;;;;;;;;6;;;;;;9;;ProTGG 1;ccg;ProCGG;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;1;;;;1;;1;;;;;;4;;ProCGG 7;act;ThrAGT;;1;1;;;;;;;;;;;;;;;1;3;;;;7;;;;;;;1;14;;ThrAGT 1;acc;ThrGGT;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;1;1;;ThrGGT 3;aca;ThrTGT;2;;;1;;;1;;;3;;;;;;1;;1;;1;;;;;;;;;;;10;;ThrTGT 2;acg;ThrCGT;1;;;;;;;1;;;;;1;;;;;;1;;;;2;;1;;;;;;7;;ThrCGT 15;gct;AlaAGC;1;;;;;;2;;;;2;;;1;;;;4;1;;1;;15;;1;1;;;1;1;31;;AlaAGC 1;gcc;AlaGGC;;;;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;1;;2;;AlaGGC 7;gca;AlaTGC;1;2;1;;2;3;3;;1;;2;;1;1;2;;2;1;3;;;;7;1;;1;;;;1;35;;AlaTGC 5;gcg;AlaCGC;2;1;1;;;1;;;1;;1;;;;;;;;;;;1;5;1;;;;;;2;16;;AlaCGC 2;tat;TyrATA;;;;1;;;;;2;;1;2;;1;1;1;;;;;1;;1;;;;;;;;11;;TyrATA 7;tac;TyrGTA;3;1;2;;4;;2;2;1;7;1;;;3;1;;1;;;1;3;;4;1;;1;;;;1;39;;TyrGTA 1;taa;SupTTA;;;;;;;;1;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;1;;;1;4;;SupTTA 2;tag;SupCTA;1;1;1;;;1;;2;2;1;2;;;;1;;;;;;;1;;;;;;;;;13;;SupCTA 2;cat;HisATG;;;;;;;1;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;2;4;;HisATG 11;cac;HisGTG;;;11;;;;;1;;3;1;;;;;;;1;;;;;1;;1;;;;;;19;;HisGTG 6;caa;GlnTTG;1;;1;;1;;1;;1;1;;;;;;;;;5;;;;6;;1;;;;;1;19;;GlnTTG 13;cag;GlnCTG;2;2;13;1;3;1;1;;;1;;1;1;1;;2;;1;2;;1;;5;;1;1;;;;;40;;GlnCTG 0;aat;AsnATT;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;;AsnATT 24;aac;AsnGTT;;;24;1;;;1;;;;;1;1;;;;;;1;;;;1;;;;;;;;30;;AsnGTT 10;aaa;LysTTT;6;1;5;3;2;1;1;1;3;2;;1;1;;4;7;4;;6;3;3;3;10;6;2;;;1;;2;78;;LysTTT 12;aag;LysCTT;1;;3;2;1;2;3;1;1;4;1;;;;1;1;;;2;;2;1;2;;12;;;;;;40;;LysCTT 1;gat;AspATC;;;1;;;;;;;;;1;1;1;;;1;;;;;;;;;;;;;1;6;;AspATC 8;gac;AspGTC;2;;8;;2;;2;1;1;3;1;1;;1;1;;3;3;4;;2;;3;;1;;1;1;;1;42;;AspGTC 31;gaa;GluTTC;14;21;31;12;26;9;18;14;13;17;21;14;20;14;13;14;9;17;20;5;11;12;9;6;18;6;4;6;14;26;434;;GluTTC 12;gag;GluCTC;7;5;9;4;7;4;12;5;5;7;8;3;8;4;3;8;7;4;7;6;5;7;3;4;8;1;1;2;4;6;164;;GluCTC 9;tgt;CysACA;8;6;9;6;8;6;6;4;5;4;8;3;5;4;4;9;2;3;1;9;4;2;3;3;3;1;5;5;3;4;143;;CysACA 27;tgc;CysGCA;13;14;10;27;11;17;7;14;20;17;16;22;11;13;12;3;7;4;16;9;9;6;6;7;3;5;8;6;6;19;338;;CysGCA 5;tga;SeCTCA;1;4;;5;;1;;1;;2;1;1;1;1;1;;;5;;;1;1;;1;;;;1;;1;29;;SeCTCA 17;tgg;TrpCCA;3;3;10;3;4;5;12;3;1;4;11;7;7;6;5;4;5;8;17;1;9;6;9;4;5;2;4;3;2;15;178;;TrpCCA 7;cgt;ArgACG;;;1;1;;;;;;1;;;;1;;;;;;;;1;7;;;;;1;;;13;;ArgACG 1;cgc;ArgGCG;1;1;;1;1;;;1;;1;;;;;;;;;;1;;;;;;;;;;;7;;ArgGCG 3;cga;ArgTCG;1;;;;;;;1;;;1;;;;;;;;1;1;1;;2;;3;;;;;1;12;;ArgTCG 3;cgg;ArgCCG;1;1;;;;;1;1;;2;;;1;;;1;;;2;;;;3;;1;;;;;2;16;;ArgCCG 1;agt;SerACT;;;;;;;;1;;;1;1;;;;;;;;;;;;;;;1;;;;4;;SerACT 10;agc;SerGCT;1;1;;;;1;;;;2;;;1;;;;;;1;1;;;10;;;;;;1;;19;;SerGCT 5;aga;ArgTCT;3;2;2;;4;1;;;3;;1;;5;;3;1;2;1;2;1;1;;4;;2;;1;1;2;2;44;;ArgTCT 10;agg;ArgCCT;4;3;7;5;3;3;10;4;3;2;7;4;7;1;7;2;4;3;10;1;1;4;2;2;7;2;1;1;1;5;116;;ArgCCT 3;ggt;GlyACC;;;;2;1;;;;1;1;1;1;1;1;2;;1;;1;1;;3;;;1;;;;;2;20;;GlyACC 8;ggc;GlyGCC;3;3;4;3;2;1;1;1;;1;3;1;5;;1;2;3;8;2;;2;3;4;1;;1;3;2;1;2;63;;GlyGCC 27;gga;GlyTCC;19;15;14;4;23;11;20;7;8;9;27;12;17;11;12;10;18;23;17;9;9;13;8;6;16;7;11;7;7;21;391;;GlyTCC 78;ggg;GlyCCC;51;58;62;28;64;42;56;37;28;50;58;31;59;35;36;46;63;48;78;10;37;41;36;20;62;16;26;22;28;67;1295;;GlyCCC ;;Undet???;;1;2;1;;;;;;;1;;1;;;;;;1;;;;;;;;;;;;9;;Undet??? ;;total;164;152;273;121;173;116;171;109;108;160;183;111;161;106;119;114;136;147;217;64;107;105;259;64;170;47;68;62;73;202;4064;; ;NCBI;;chr1;chr2;chr3;chr4;chr5;chr6;chr7;chr8;chr9;chr10;chr11;chr12;chr13;chr14;chr15;chr16;chr17;chr18;chr19;chr20;chr21;chr22;chr23;chr24;chr25;chr26;chr27;chr28;chr29;X;MT;Un;Total ;mb;Size;158.34;137.06;121.43;120.83;121.19;119.46;112.64;113.39;105.71;104.31;107.31;91.16;84.24;84.65;85.3;81.72;75.16;66;64.06;72.04;71.6;61.44;52.53;62.71;42.9;51.68;45.41;46.31;51.51;148.82;0.02;9.22;2670.15 ;;GC% ;40.1;40.8;41.9;40.6;41.7;40;42;41.2;40;41.5;42.9;40.4;43.7;41.4;41.8;42.6;42.3;45.4;46;41;43.1;43.4;43.4;41.9;47.1;42.8;41.8;42.2;44.2;40.6;39.4;49.6; ;;Protein ;1981;2085;2922;1673;2753;1420;2791;1573;1068;2014;2176;886;1740;1066;1946;1452;1411;2691;2718;562;1135;1414;1393;751;1684;991;478;798;1427;1994;13;101; ;;rRNA ;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;1;-;-;-;-;-;2;-; ;;tRNA ;67;49;171;59;54;51;55;29;39;65;44;47;42;38;47;30;42;50;70;31;26;23;191;19;66;14;33;23;24;79;22;-; ;; RNA ;405;362;462;386;444;320;474;421;281;369;388;268;377;235;269;324;261;378;428;192;460;276;297;192;259;207;147;111;231;488;-;10; ;;Gene ;1267;1237;1832;1142;1715;953;1814;1097;821;1447;1309;660;1111;734;1491;946;893;1648;1570;508;855;762;1134;469;973;559;377;444;903;1643;13;105; ;;Pseudo ;165;163;223;123;218;134;243;142;142;151;122;72;118;95;264;102;115;156;108;67;98;67;93;61;50;62;33;64;109;328;-;4; ;;compte;164;152;273;121;173;116;171;109;108;160;183;111;161;106;119;114;136;147;217;64;107;105;259;64;170;47;68;62;73;202;;;
Distribution homogène des gènes de tRNA sur les chromosomes, Bos Taurus et Felis catus
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bta;ggg;ggc;gga;gaa;gag;tgc;tgt;gct; ;fca;cga;aag;caa X;67;2;21;26;6;7;4;1;;chrA1;100;57;67 chr1;51;2;19;14;7;13;8;1;;chrA2;80;55;66 chr2;58;3;15;21;5;14;6;0;;chrA3;73;50;44 chr3;62;4;14;31;9;10;9;0;;chrB1;70;49;72 chr4;28;3;4;12;4;27;6;0;;chrB2;71;52;62 chr5;64;2;23;26;7;11;8;0;;chrB3;70;54;45 chr6;42;1;11;9;4;17;6;0;;chrB4;66;61;53 chr7;56;1;20;18;12;14;6;2;;chrC1;109;99;60 chr8;37;1;7;14;5;20;4;0;;chrC2;66;39;48 chr9;28;2;8;13;5;19;5;0;;chrD1;53;40;32 chr10;50;1;9;17;7;17;4;0;;chrD2;40;19;28 chr11;58;3;27;21;8;16;8;2;;chrD3;65;33;29 chr12;31;1;12;14;3;22;3;0;;chrD4;46;34;38 chr13;59;5;17;20;8;11;5;0;;chrE1;61;42;22 chr14;35;0;11;14;4;13;4;1;;chrE2;33;36;18 chr15;36;1;12;13;3;12;4;0;;chrE3;29;37;17 chr16;46;2;10;14;8;3;9;0;;chrF1;41;25;27 chr17;63;3;18;9;7;7;2;0;;chrF2;42;23;17 chr18;48;8;23;17;4;4;3;4;;X;81;80;37 chr19;78;2;17;20;7;16;1;1;;Ud;5;2; chr20;10;0;9;5;6;9;9;0;;;;; chr21;37;2;9;11;5;9;4;1;;;;; chr22;41;3;13;12;7;6;2;0;;;;; chr23;36;4;8;9;3;6;3;15;;;;; chr24;20;1;6;6;4;7;3;0;;;;; chr25;62;0;16;18;8;3;3;1;;;;; chr26;16;1;7;6;1;5;1;1;;;;; chr27;26;3;11;4;1;8;5;0;;;;; chr28;22;2;7;6;2;6;5;0;;;;; chr29;28;1;7;14;4;6;3;1;;;;; bta 30 chromosomes;;;;;;;;;;fca 19 chromosomes;;; ;ggg;ggc;gga;gaa;gag;tgc;tgt;gct;;;cga;aag;caa total;1295;64;391;435;164;338;143;31;;total;1201;887;782 moy;43.2;2.1;13.0;14.5;5.5;11.3;4.8;1.0;;moy;62.9;46.6;41.2 ecartt;17.1;1.7;5.9;6.6;2.5;6.0;2.3;2.8;;ecartt;21.5;19.4;18.2 max;78;8;27;31;12;27;9;15;;max;109;99;72 min;10;0;4;4;1;3;1;0;;min;29;19;17 e/m%;40;78;45;46;46;53;49;270;;e/m%;34;42;44
Exemples de distributions des tRNAs sur les chromosomes
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- Légende: Bases de données, gtRNAdb.fa [7], NCBI [orgn]
- m, moyenne par chromosome, e, écart type.
- KEGG gtRNAdb
- sce Saccharomyces cerevisiae (S288c Apr 2011)
- mmu Mus musculus (mm10 Dec 2011)
- has Homo sapiens (hg38 - GRCh38 Dec 2013)
- oas Ovis aries (sheep) (Feb 2010)
- dre Danio rerio (Zebrafish) (Zv8 Apr 2009)
- bta Bos taurus (Cow Jun. 2014 Bos_taurus_UMD_3.1.1/bosTau8)
;tRNAs;Moyenne par chromosome;;;;NCBI;gtRNAdb; ;sce;mmu;has;oas;dre;bta;dre;bta ;4;37;90;200;31;67;44;164 ;13;8;8;111;76;49;266;152 ;10;40;4;127;346;171;228;273 ;28;8;1;51;5723;59;7825;121 ;20;10;17;65;140;54;416;173 ;10;53;144;52;52;51;49;116 ;36;10;21;66;72;55;159;171 ;11;7;5;42;240;29;241;109 ;10;7;3;38;60;39;122;108 ;24;11;3;31;12;65;13;160 ;16;47;13;77;13;44;17;183 ;21;3;9;37;123;47;200;111 ;21;105;4;34;46;42;54;161 ;14;12;18;45;11;38;10;106 ;20;4;9;40;135;47;188;119 ;17;2;27;20;17;30;26;114 ;−;12;33;42;109;42;138;136 ;−;0;1;34;5;50;87;147 ;−;10;6;20;7;70;8;217 ;−;17;0;184;262;31;358;64 ;−;0;1;22;253;26;573;107 ;−;−;0;19;143;23;362;105 ;−;−;4;26;11;191;9;259 ;−;−;0;69;18;19;31;64 ;−;−;−;20;72;66;81;170 ;−;−;−;20;−;14;−;47 ;−;−;−;75;−;33;−;68 ;−;−;−;−;−;23;−;62 ;−;−;−;−;−;24;−;73 ;−;−;−;−;−;79;−;202 Total;275;403;421;1567;7977;1578;11505;4062 m;17.2;19.2;17.5;58.0;319;52.6;460;144.4 e;8.0;25.0;32.9;47.2;1130;38.7;1542;51.5 e/m %;47;130;187;81;354;74;335;36
Archives exemples NCBI
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http://www.genome.jp/kegg/genome.html;;;;;;24.11.17 Paris ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; KEGG;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; uma;Ustilago maydis 521;;;;*;uma;;ecartt;3;moy;5;%;69;;ttt;;ecartt;13;moy;26;%;48;;;zro;;;ecartt;12;moy;39;%;32;;;;;;;;;;;;;; cal;Candida albicans WO-1;;;;*;Type ;Name ;Size;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ;Gene ;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;tRNA ;Gene ;Pseudo ;;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;;;;;;;;;;;;;; ttt;Thielavia terrestris NRRL 8126;;;;*;;;19.64;54;6783;34;111;6910;;;6;36.9;54.9;9802;156;9958;4;;;;7;9.76;39.2;4991;9;272;51;5323;;;;;;;;;;;;;; cgr;Candida glabrata CBS 138;;;;*;Chr;1;2.48;53.9;877;5;11;892;;Chr;1;10.1;54.2;2650;39;2689;-;;;Chr;A;1.11;39.2;580;-;33;5;618;;;;;;;;;;;;;; zro;Zygosaccharomyces rouxii CBS 732;;;;*;Chr;2;1.88;53.9;652;4;14;668;;Chr;2;9.48;55.1;2573;44;2617;4;;;Chr;B;1.39;38.8;706;-;39;8;753;;;;;;;;;;;;;; sce;Saccharomyces cerevisiae (S288c Apr 2011);;;;*;Chr;3;1.64;53.7;632;3;6;639;;Chr;3;4.79;52.6;1180;23;1203;-;;;Chr;C;1.46;39;774;-;47;8;829;;;;;;;;;;;;;; dme;Drosophila melanogaster (D. melanogaster Aug. 2014 BDGP Release 6 + ISO1 MT/dm6);;;;*;Chr;4;0.88;54.4;273;3;5;280;;Chr;4;4.58;55.2;1205;20;1225;-;;;Chr;D;1.5;39.1;768;-;28;7;803;;;;;;;;;;;;;; tbl;Tetrapisispora blattae CBS 6284;;;;*;Chr;5;1.39;53.8;504;1;7;510;;Chr;5;4.4;55.7;1202;16;1218;-;;;Chr;E;0.88;39.4;416;9;32;10;467;;;;;;;;;;;;;; ncr;Neurospora crassa OR74A;;;;*;Chr;6;1.03;54.1;335;3;7;344;;Chr;6;3.57;56.3;992;14;1006;-;;;Chr;F;1.55;39.3;806;-;30;3;839;;;;;;;;;;;;;; mcc;Macaca mulatta (Rhesus Oct. 2010 BGI CR_1.0/rheMac3);;;;*;Chr;7;0.96;54.1;331;2;8;341;;Max Min Total;;;44;14;156;;;;;Chr;G;1.87;39.3;941;-;63;10;1014;;;;;;;;;;;;;; mmu;Mus musculus (mm10 Dec 2011);;;;*;Chr;8;0.81;54.1;275;1;4;278;;;;;;;;;;;;Max Min Total;;;;63;28;272;;;;;;;;;;;;;;;; ptr;Pan troglodytes (Chimp Feb. 2011 CSAC 2.1.4/panTro4);;;;*;Chr;9;0.73;53.9;259;1;3;263;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; cpic;Chrysemys picta (western painted turtle);;;;*;Chr;10;0.69;54.2;237;-;3;239;;cgr;;;ecartt;6;moy;16;%;39;;sce;;;ecartt;8;moy;17;%;47;;;;;;;;;;;;;; cel;Caenorhabditis elegans (WS220 Oct 2010);;;;*;Chr;11;0.69;54.1;239;1;3;242;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;;;;;;;;;;;; has;Homo sapiens (hg38 - GRCh38 Dec 2013);;;;*;Chr;12;0.65;54;221;-;0;221;;;13;12.32;38.8;5202;4;207;9;5421;;;16;12.07;38.4;5983;12;275;111;6399;18;;;;;;;;;;;;; bdi;Brachypodium distachyon (JGI v1.0 8X);;;;*;Chr;13;0.61;54;207;-;3;209;;Chr;A;0.49;40.1;200;-;9;-;209;;Chr;I;0.23;39.3;94;-;4;2;101;1;;;;;;;;;;;;; ath;Arabidopsis thaliana (TAIR10 Feb 2011);;;;*;Chr;14;0.61;54.1;185;1;7;193;;Chr;B;0.5;38.9;212;-;9;1;222;;Chr;II;0.81;38.3;415;-;13;4;432;-;;;;;;;;;;;;; osa;Oryza sativa;;;;*;Chr;15;0.58;54.5;185;1;3;189;;Chr;C;0.56;39.7;230;-;7;-;237;;Chr;III;0.32;38.5;168;-;10;4;184;2;;;;;;;;;;;;; cbr;Caenorhabditis briggsae (C. briggsae Jan. 2007 WUGSC 1.0/cb3);;;;*;Chr;16;0.55;54.1;185;-;6;191;;Chr;D;0.65;39.1;283;-;18;-;301;;Chr;IV;1.53;37.9;766;-;28;4;799;1;;;;;;;;;;;;; ssc;Sus scrofa (Pig Aug. 2011 SGSC Sscrofa10.2/susScr3);;;;*;Chr;17;0.58;54;200;1;7;208;;Chr;E;0.69;39;278;-;9;-;287;;Chr;V;0.58;38.5;287;-;20;9;317;1;;;;;;;;;;;;; oaa;Ornithorhynchus anatinus (platypus) (WUGSC 5.0.1 Mar 2007);;;;*;Chr;18;0.56;54.3;186;-;1;187;;Chr;F;0.93;38.1;383;-;15;-;398;;Chr;VI;0.27;38.7;128;-;10;4;143;1;;;;;;;;;;;;; cfa;Canis familiaris (dog) (CanFam3.1 Sept 2011);;;;*;Chr;19;0.57;53.8;200;3;5;207;;Chr;G;0.99;38.6;434;-;18;-;451;;Chr;VII;1.09;38.1;539;-;36;10;585;-;;;;;;;;;;;;; oas;Ovis aries (sheep) (Feb 2010);;;;*;Chr;20;0.52;53.9;190;2;1;193;;Chr;H;1.05;38.1;460;-;14;-;474;;Chr;VIII;0.56;38.5;290;-;11;4;305;-;;;;;;;;;;;;; zma;Zea mays (Version 5b.60);;;;*;Chr;21;0.47;54.2;166;1;1;166;;Chr;I;1.1;38.6;462;-;26;1;489;;Chr;IX;0.44;38.9;213;-;10;3;232;6;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;Chr;22;0.4;54.5;123;1;4;128;;Chr;J;1.2;38.9;514;-;17;2;533;;Chr;X;0.75;38.4;362;-;24;6;392;-;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;Chr;23;0.34;54;114;-;2;115;;Chr;K;1.3;38.2;556;-;22;3;581;;Chr;XI;0.67;38.1;317;-;16;5;338;-;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;Un;-;0.02;52.8;7;-;-;;;Chr;L;1.46;38.5;575;4;25;1;605;;Chr;XII;1.08;38.5;519;12;21;18;572;2;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;Max Min Total;;;;14;0;111;;;Chr;M;1.4;38.5;615;-;18;1;634;;Chr;XIII;0.92;38.2;469;-;21;15;505;-;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;MT;0.02;17.6;11;2;23;1;37;;Chr;XIV;0.78;38.6;398;-;14;6;418;-;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;Max Min Total;;;;26;7;230;;;;Chr;XV;1.09;38.2;546;-;20;11;579;2;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;Chr;XVI;0.95;38.1;472;-;17;6;497;2;;;;;;;;;;;;; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/?term=txid9606[orgn];;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;MT;0.09;17.1;19;2;24;1;46;-;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;Max Min Total;;;;36;4;299;;;;;;;;;;;;;;;; ;NCBI;;;ncr;;;ecartt;16;moy;59;%;27;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; uma;5270;;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;mmu;;;ecartt;25;moy;19;%;130;;;;ptr;;;ecartt;29;moy;15;%;194;;;;;;;;;;;; cal;5476;;;;;41;48.3;10785;212;415;176;10533;16;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;;;;;;;;;; ttt;35720;;;group;I;9.8;48.8;2637;6;72;52;2477;2;;;;2725.52;41.9;75959;33;403;32389;45765;9469;;;;;2981.5;40.7;75780;0;367;18258;36235;6329;;;;;;;;;;; cgr;5478;;;group;II;4.48;48.2;1134;22;36;14;1100;-;;Chr;1;195.47;41.3;4731;-;37;2031;2687;579;;;Chr;1;228.57;41.9;7522;-;49;1568;3407;570;;;;;;;;;;; zro;4956;;;group;III;5.27;48.8;1399;9;39;23;1325;1;;Chr;2;182.11;42.2;6282;-;8;2783;3491;609;;;Chr;2A;111.5;41.3;2525;-;4;749;1210;183;;;;;;;;;;; sce;4932;;;group;IV;6.00;48.5;1620;14;76;19;1594;8;;Chr;3;160.04;40.7;3507;-;40;1663;2225;480;;;Chr;2B;133.22;39.8;2975;-;4;666;1225;236;;;;;;;;;;; dme;7227;;;group;V;6.44;48.9;1754;17;64;33;1694;2;;Chr;4;156.51;42.5;4710;-;8;1991;2622;497;;;Chr;3;202.62;39.9;4687;-;4;1133;2032;381;;;;;;;;;;; tbl;1071379;;;group;VI;4.22;48.3;1076;5;56;19;1068;1;;Chr;5;151.84;42.7;4634;-;10;1952;2507;413;;;Chr;4;194.5;38.5;3064;-;1;956;1630;324;;;;;;;;;;; ncr;5141;;;group;VII;4.26;47.7;1164;4;72;16;1139;2;;Chr;6;149.74;41.6;3844;1;53;1572;2597;555;;;Chr;5;181.91;39.7;3116;-;14;940;1749;345;;;;;;;;;;; mcc;9544;;;;MT;0.06;36.1;28;-;28;-;58;2;;Chr;7;145.44;43.2;6336;-;10;2087;3798;935;;;Chr;6;175.4;39.8;3784;-;139;1086;2115;391;;;;;;;;;;; mmu;10090;;;Un;-;0.57;28.1;-;-;-;-;-;-;;Chr;8;129.4;42.6;3653;32;7;1673;2177;376;;;Chr;7;166.21;41;3696;-;12;1148;1994;396;;;;;;;;;;; ptr;9598;;;Max Min Total;;;;76;36;443;;;;;Chr;9;124.6;42.9;4406;-;7;1698;2276;374;;;Chr;8;147.91;40.4;2537;-;6;788;1370;256;;;;;;;;;;; cpic;8479;;;;;;;;;;;;;;Chr;10;130.7;41.6;3546;-;11;1546;2086;391;;;Chr;9;116.77;41.8;3061;-;3;704;1393;253;;;;;;;;;;; cel;6239;;;cpic;;;ecartt;4;moy;2;%;173;;;Chr;11;122.08;44;5650;-;47;2097;2852;381;;;Chr;10;135.93;41.8;3510;-;3;728;1415;248;;;;;;;;;;; has;9606;;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;Chr;12;120.13;42;2621;-;3;1593;2002;516;;;Chr;11;135.75;41.8;4745;-;13;774;2128;349;;cal;;;ecartt;11;moy;16;%;68; bdi;15368;;;;;461.75;45.8;7543;0;44;3644;24356;597;;Chr;13;120.42;41.9;2536;-;105;1513;2127;476;;;Chr;12;137.16;41.1;4112;-;10;927;1832;321;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo ath;3702;;;Chr;1;77.39;43.4;1179;-;16;121;616;17;;Chr;14;124.9;41.4;3007;-;12;1538;2111;455;;;Chr;13;100.45;39;1345;-;4;543;827;171;;;;14.28;33.5;6030;4;126;85;6263;18 osa;4530;;;Chr;2;68.45;42.8;949;-;9;115;496;15;;Chr;15;104.04;42.2;2872;-;4;1349;1620;282;;;Chr;14;91.97;41.2;2375;-;19;667;1226;197;;Chr;1;3.19;33.3;1353;-;23;22;1403;5 cbr;6238;;;Chr;3;75.88;42.9;1132;-;4;108;537;8;;Chr;16;98.21;41.2;2486;-;2;1081;1367;257;;;Chr;15;83.23;42.5;2435;-;8;744;1137;200;;Chr;2;2.23;33.5;997;-;24;15;1038;2 ssc;9823;;;Chr;4;49.33;43.4;998;-;7;86;453;4;;Chr;17;94.99;42.9;3610;-;12;1373;2005;427;;;Chr;16;81.59;44.9;2949;-;30;567;1330;158;;Chr;3;1.8;33.5;739;-;21;4;765;1 oaa;9258;;;Chr;5;4.92;43.8;52;-;0;1;25;-;;Chr;18;90.7;41.7;1855;-;0;966;1218;264;;;Chr;17;83.18;45.7;4213;-;33;742;1806;206;;Chr;4;1.6;33.4;654;-;17;12;685;2 cfa;9612;;;Chr;6;62.6;42.6;1047;-;1;84;456;8;;Chr;19;61.43;43.1;2328;-;10;831;1283;205;;;Chr;18;78.22;40.2;1241;-;1;401;601;113;;Chr;5;1.19;33.3;507;-;6;5;519;1 oas;9940;;;Chr;7;7.28;45.9;55;-;2;5;30;1;;Chr;X;171.03;39.7;3010;-;17;933;2291;912;;;Chr;19;61.31;48.4;4611;-;7;703;1966;210;;Chr;6;1.03;33.6;425;-;4;4;435;2 zma;4577;;;Chr;8;51.56;44.2;878;-;0;79;445;7;;Chr;Y;91.74;39.3;335;-;0;119;423;85;;;Chr;20;66.53;44.3;2063;-;0;484;936;137;;Chr;7;0.95;33.5;393;-;1;3;398;1 ;;;;Chr;10;7.27;48.4;156;-;1;17;65;-;;;MT;0.02;36.7;13;2;22;-;37;-;;;Chr;21;33.45;41.2;736;-;1;269;426;63;;Chr;R;2.29;33.8;962;4;30;20;1020;4 ;;;;Chr;11;5;44.3;116;-;0;9;52;-;;Un;-;93.44;43.6;2471;2;10;1126;2899;501;;;Chr;22;37.82;48.1;1690;-;0;397;749;85;;Max Min Total;;;;30;1;126;;; ;;;;Chr;13;1.22;50;1;-;0;1;2;-;;Max Min Total;;;;105;0;435;;;;;;Chr;X;155.55;39.8;2653;-;2;515;1470;391;;;;;;;;;;; ;;;;Chr;15;19.09;42.3;321;-;1;50;162;2;;;;;;;;;;;;;;Chr;Y;26.35;40.6;135;-;0;59;261;145;;;;;;;;;;; ;;;;Chr;17;4.55;48.5;97;-;0;13;54;-;;has;;;ecartt;33;moy;18;%;187;;;;;MT;0.02;43.7;13;2;22;-;13;-;;dme;;;ecartt;38;moy;42;%;90; ;;;;Chr;19;9.08;48;171;-;1;10;98;1;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;;Un;-;264.05;39.9;4163;-;29;804;2678;425;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo ;;;;Chr;21;1.37;50.9;14;-;0;-;9;-;;;;3088.3;42.1;108596;17;421;46261;53816;15820;;;Max Min Total;;;;139;0;418;;;;;;;137.55;41.0;30463;117;297;3816;17640;305 ;;;;Chr;22;2.51;46.4;22;-;1;5;12;-;;Chr;1;248.96;42.3;11046;17;90;4350;5078;1372;;;ath;;;ecartt;65;moy;125;%;52;;;Chr;X;23.54;42.5;5368;16;26;553;2669;69 ;;;;Chr;24;13.19;46.3;354;-;1;27;191;2;;Chr;2;242.19;40.3;8054;-;8;3638;3862;1166;;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;Chr;2L;23.51;41.8;5683;-;41;917;3490;48 ;;;;Chr;25;1.06;49.9;1;-;0;3;3;-;;Chr;3;198.3;39.7;6790;-;4;2723;2971;887;;;;;119.16;36.0;48148;4;625;7203;37898;4843;;Chr;2R;25.29;42.6;6039;101;100;677;3618;45 ;;;;;MT;0.02;39;13;2;22;-;13;-;;Chr;4;190.22;38.3;4374;-;1;2209;2441;799;;;Chr;1;30.43;35.9;12654;-;238;1969;9701;930;;Chr;3L;28.11;41.7;5867;-;50;750;3454;37 ;;;;Un;-;1904;44.8;35002;-;311;2910;20637;532;;Chr;5;181.54;39.5;4599;-;17;2225;2578;766;;;Chr;2;19.7;35.9;7599;2;95;1341;6312;1047;;Chr;4;1.35;35.4;295;-;0;37;111;6 ;;;;;;;;;;;;;;;Chr;6;170.81;39.6;5338;-;144;2408;3000;876;;;Chr;3;23.46;36.3;9474;2;92;1411;7624;1080;;Chr;3R;32.08;42.6;7186;-;80;854;4185;38 ;;;;;;;;;;;;;;;Chr;7;159.35;40.7;4843;-;21;2232;2774;896;;;Chr;4;18.59;36.2;7426;-;77;1072;5842;835;;Chr;Y;3.67;40.2;25;-;0;28;113;62 ;;;;cel;;;ecartt;89;moy;137;%;65;;;Chr;8;145.14;40.2;3962;-;5;1975;2152;661;;;Chr;5;26.98;35.9;10995;-;123;1410;8419;951;;;MT;0.02;17.8;13;2;22;-;37;- ;;;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;Chr;9;138.4;42.3;4572;-;3;2135;2262;702;;;MT;;0.37;44.8;117;3;21;-;131;-;;Un;-;6.16;41.1;6;-;-;-;5;- ;;;;;;100.26;35.5;28155;21;821;25266;46721;1885;;Chr;10;133.8;41.6;5237;-;3;2053;2174;631;;;Pltd;;0.15;36.3;85;7;37;-;129;-;;Max Min Total;;;;100;0;319;;; ;;;;Chr;I;15.07;35.7;4133;6;76;1221;4187;160;;Chr;11;135.09;41.6;6187;-;13;2267;2920;835;;;Max Min Total;;;;238;77;683;;;;;;;;;;;;;; ;;;;Chr;II;15.28;36.2;4703;-;80;1564;5193;262;;Chr;12;133.28;40.8;5648;-;9;2313;2521;680;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;Chr;III;13.78;35.7;3691;-;97;1060;3827;130;;Chr;13;114.36;40.2;1946;-;4;1235;1381;477;;;osa;;;ecartt;18;moy;51;%;35;;;tbl;;ecartt;21;moy;33;%;66;; ;;;;Chr;IV;17.49;34.6;5158;-;94;16207;19687;374;;Chr;14;107.04;42.2;3252;-;18;1704;2055;583;;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ;Gene ;; ;;;;Chr;V;20.92;35.4;6677;15;169;2210;7836;845;;Chr;15;101.99;43.4;3436;-;9;1778;1814;555;;;;;373.24;43.6;40881;0;615;8932;32915;1655;;;;14.05;31.8;5388;10;327;5725;; ;;;;Chr;X;17.72;35.2;3793;-;305;3004;5991;114;;Chr;16;90.34;45.1;4453;-;27;1700;1920;451;;;Chr;1;43.27;43.8;5673;-;84;1132;4485;171;;Chr;1;2.7;31.8;1042;-;53;1095;; ;;;;;MT;0.01;23.8;12;2;22;-;12;-;;Chr;17;83.26;45.3;6004;-;33;2131;2432;541;;;Chr;2;35.94;43.3;4668;-;69;1131;3626;141;;Chr;2;2.45;31.4;978;-;74;1052;; ;;;;Max Min Total;;;;305;76;843;;;;;Chr;18;80.37;39.8;1812;-;1;1013;988;295;;;Chr;3;36.41;43.7;5036;-;73;818;3848;133;;Chr;3;1.78;31.5;689;-;53;742;; ;;;;;;;;;;;;;;;Chr;19;58.62;47.9;6452;-;6;1750;2481;514;;;Chr;4;35.5;44.3;3570;-;63;737;2894;155;;Chr;4;1.45;32.2;550;5;32;587;; ;;;;bdi;;;ecartt;40;moy;105;%;38;;;Chr;20;64.44;43.9;2794;-;0;1276;1349;329;;;Chr;5;29.96;44;3277;-;55;615;2612;133;;Chr;5;1.32;31.6;481;5;31;517;; ;;;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;Chr;21;46.71;42.2;1240;-;1;687;756;202;;;Chr;6;31.25;43.6;3336;-;33;715;2683;140;;Chr;6;1.05;32;408;-;25;433;; ;;;;;;271.77;46.4;33844;0;525;6415;28911;1506;;Chr;22;50.82;47.7;2493;-;0;965;1172;348;;;Chr;7;29.7;43.5;3165;-;35;675;2581;134;;Chr;7;0.99;31.9;343;-;24;367;; ;;;;Chr;1;75.12;46.3;10003;-;155;1714;8388;385;;Chr;X;156.04;39.6;3739;-;4;1196;2158;859;;;Chr;8;28.44;43.4;2752;-;44;610;2269;129;;Chr;8;0.96;31.1;370;-;21;391;; ;;;;Chr;2;59.38;46.5;7674;-;121;1264;6483;274;;Chr;Y;57.23;45.4;325;-;0;298;577;395;;;Chr;9;23.01;43.5;2201;-;32;556;1843;92;;Chr;9;0.86;32.6;336;-;5;341;; ;;;;Chr;3;59.94;46.4;7537;-;111;1373;6429;311;;;MT;0.02;44.4;13;2;22;-;37;-;;;Chr;10;23.21;43.6;2102;-;47;607;1890;118;;Chr;10;0.49;31.8;191;-;9;200;; ;;;;Chr;4;48.77;46.3;5464;-;93;1251;4821;368;;Un;-;165.56;44.4;5810;17;186;3064;6445;1957;;;Chr;11;29.02;42.9;2643;-;28;709;2216;182;;Max Min Total;;;;74;5;327;;; ;;;;Chr;5;28.56;47;3166;-;45;813;2790;168;;Max Min Total;;;;144;0;629;;;;;;Chr;12;27.53;43;2458;-;52;627;1968;127;;;;;;;;;;; ;;;;Pltd;-;0.14;38.6;81;8;38;-;133;4;;;;;;;;;;;;;;Pltd;;0.13;39;108;8;38;-;159;5;;;;;;;;;;; ;;;;Un;-;0.22;47.2;19;-;-;1;13;3;;;;;;;;;;;;;;MT;;0.49;43.9;53;3;22;-;81;6;;;;;;;;;;; ;;;;Max Min Total;;;;155;45;563;;;;;;;;;;;;;;;;;Plsm;B1;0;44.2;2;-;-;-;-;-;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;Un;-;0.55;45.9;26;-;-;10;30;3;;;;;;;;;;; ;;;;cbr;;ecartt;27;moy;127;%;22;;;;;;;;;;;;;;;;Max Min Total;;;;84;28;675;;;;;;;;;;;;;; ;;;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;tRNA ; RNA ;Gene ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;105.2;;21237;759;28;21999;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;Chr;I;15.46;38;3096;118;4;3212;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;Chr;II;16.63;37.8;3351;98;5;3448;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;Chr;III;14.58;37.8;2909;108;4;3016;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;Chr;IV;17.49;37.4;3292;124;3;3414;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;Chr;V;19.5;37.7;4821;135;6;4962;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;Chr;X;21.54;37.7;3768;176;6;3947;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;Un;-;3.2;36.8;722;15;-;737;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;Max Min Total;;;176;98;774;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;cfa;;;ecartt;17;moy;10;%;169;;;ssc;;;ecartt;33;moy;22;%;148;;;oas;;;ecartt;47;moy;58;%;81;;;;mcc;;;ecartt;30;moy;18;%;170 ;;;;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;;;;;;;2327.62;41.3;58270;0;395;24029;36322;5040;;;;2435.26;41.9;61823;0;448;14074;28224;2365;;;;2584.84;42.4;42387;0;1567;6690;28381;3084;;;;;2835.96;41.6;54294;0;394;11124;32128 ;;;;;Chr;1;122.68;41.6;3540;-;8;1312;2078;257;;Chr;1;274.33;40.2;5392;-;21;1255;2423;260;;Chr;1;275.41;40.9;4492;-;200;593;2813;331;;;Chr;1;225.59;42;5515;-;63;1008;3150 ;;;;;Chr;2;85.43;42.8;2231;-;6;986;1384;152;;Chr;2;151.94;42.5;5641;-;29;988;2683;257;;Chr;2;248.97;41;3655;-;111;555;2139;264;;;Chr;2;204.79;39.9;3417;-;7;667;1857 ;;;;;Chr;3;91.89;40.3;1491;-;5;918;1076;177;;Chr;3;132.85;44.2;4054;-;36;941;1805;109;;Chr;3;224;42.4;4287;-;127;550;2739;295;;;Chr;3;185.82;41;3036;-;20;686;1966 ;;;;;Chr;4;88.28;40.4;1579;-;3;892;1142;183;;Chr;4;130.91;41.6;3628;-;70;868;1650;104;;Chr;4;119.22;40.6;1372;-;51;287;975;121;;;Chr;4;172.59;40;2775;-;136;652;1906 ;;;;;Chr;5;88.92;44.2;3124;-;26;1036;1652;147;;Chr;5;104.53;42.2;3219;-;12;653;1458;103;;Chr;5;107.84;42;2204;-;65;285;1616;174;;;Chr;5;190.43;38.6;2208;-;2;549;1378 ;;;;;Chr;6;77.57;42.6;2651;-;26;898;1514;155;;Chr;6;170.84;44.7;6262;-;16;1282;2724;167;;Chr;6;116.89;40;1361;-;52;206;823;120;;;Chr;6;180.05;39.8;2326;-;17;615;1561 ;;;;;Chr;7;80.97;41.0;2101;-;7;919;1253;170;;Chr;7;121.84;43.1;3720;-;143;889;1978;133;;Chr;7;100.01;41.6;1972;-;66;268;1197;114;;;Chr;7;169.6;41.7;3418;-;31;940;2151 ;;;;;Chr;8;74.33;40.6;1712;-;6;845;1227;198;;Chr;8;138.97;39.5;2216;-;2;644;1096;109;;Chr;8;90.62;40.2;1028;-;42;184;646;80;;;Chr;8;144.31;40.4;1947;-;6;411;1190 ;;;;;Chr;9;61.07;46.0;3224;-;19;886;1651;106;;Chr;9;139.51;41.2;3659;-;8;893;1715;169;;Chr;9;94.58;41.1;1001;-;38;191;690;81;;;Chr;9;129.88;41.9;2479;-;3;487;1267 ;;;;;Chr;10;69.33;42.7;1868;-;8;856;1190;153;;Chr;10;69.36;42.7;1455;-;5;428;664;54;;Chr;10;86.38;40.4;748;-;31;160;521;64;;;Chr;10;92.84;45.8;2563;-;0;480;1493 ;;;;;Chr;11;74.39;40.2;1640;-;9;723;1024;145;;Chr;11;79.17;40.6;1156;-;5;406;559;43;;Chr;11;62.17;46.3;2083;-;77;264;1449;91;;;Chr;11;133.66;41.2;2961;-;8;517;1662 ;;;;;Chr;12;72.5;39.0;1705;-;3;593;1024;165;;Chr;12;61.6;47.7;3151;-;44;708;1468;58;;Chr;12;79.03;42.8;1240;-;37;221;872;85;;;Chr;12;125.51;40.1;1976;-;4;409;1040 ;;;;;Chr;13;63.24;40.0;1164;-;3;620;794;126;;Chr;13;208.34;39.9;4724;-;4;918;1841;200;;Chr;13;82.95;43.8;1572;-;34;252;967;80;;;Chr;13;108.98;41.3;1779;-;4;451;1116 ;;;;;Chr;14;60.97;38.8;1099;-;5;566;799;141;;Chr;14;141.76;43.2;4088;-;11;811;1667;132;;Chr;14;62.57;45.8;1955;-;45;302;1446;106;;;Chr;14;127.89;41.9;3526;-;10;529;1885 ;;;;;Chr;15;64.19;40.2;1534;-;12;788;968;122;;Chr;15;140.41;39.9;2727;-;7;561;1106;115;;Chr;15;80.78;42;1682;-;40;176;1212;153;;;Chr;15;111.34;41.8;2223;-;4;429;1218 ;;;;;Chr;16;59.63;41.0;1305;-;16;556;870;119;;Chr;16;79.94;40.3;940;-;5;390;588;50;;Chr;16;71.69;41.1;631;-;20;139;464;68;;;Chr;16;77.22;45.9;2915;-;33;450;1605 ;;;;;Chr;17;64.29;41.7;1766;-;31;804;1129;123;;Chr;17;63.49;44.7;1823;-;5;459;821;46;;Chr;17;72.25;42.4;1080;-;42;184;739;72;;;Chr;17;95.68;38.9;981;-;4;350;676 ;;;;;Chr;18;55.84;42.8;1988;-;10;595;1214;125;;Chr;18;55.98;43.1;1368;-;17;400;659;41;;Chr;18;68.49;43.1;955;-;34;410;747;81;;;Chr;18;70.24;40;786;-;0;243;488 ;;;;;Chr;19;53.74;38.4;568;-;2;457;469;99;;Chr;X;125.94;40.4;2482;-;8;523;1172;170;;Chr;19;60.45;43.6;1206;-;20;307;685;39;;;Chr;19;53.67;49;3293;-;8;474;1819 ;;;;;Chr;20;58.13;44.3;2673;-;6;604;1377;123;;Chr;Y;43.55;47.5;118;-;0;57;147;45;;Chr;20;51.05;43.6;1203;-;184;186;1022;75;;;Chr;20;74.97;45;2017;-;28;304;1143 ;;;;;Chr;21;50.86;40.2;1367;-;3;439;871;170;;;MT;0.02;39.5;13;2;22;-;13;-;;Chr;21;49.99;44.3;1027;-;22;161;824;87;;;Chr;X;149.15;39.7;2067;-;6;442;1465 ;;;;;Chr;22;61.44;37.9;712;-;4;556;591;117;;Un;-;66.63;43.3;1741;2;62;331;1936;59;;Chr;22;50.78;42.9;841;-;19;96;473;42;;;Chr;Y;11.75;40.1;86;-;0;31;92 ;;;;;Chr;23;52.29;39.9;1006;-;3;512;667;124;;Max Min Total;;;;143;0;532;;;;;Chr;23;62.28;41.9;689;-;26;134;423;42;;;;MT;0.02;43.2;13;2;22;-;13 ;;;;;Chr;24;47.7;44.5;1550;-;2;560;890;74;;;;;;;;;;;;;Chr;24;41.98;47.3;1133;-;69;133;891;50;;;Un;-;400.24;41.3;1059;-;2;87;1077 ;;;;;Chr;25;51.63;41.4;1305;-;4;574;798;109;;zma;;;ecartt;30;moy;86;%;35;;;Chr;25;45.22;42.4;744;-;20;124;456;73;;;Max Min Total;;;;136;0;418;; ;;;;;Chr;26;38.96;45.4;1478;-;10;466;794;76;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;Chr;26;44.05;41.8;461;-;20;102;324;33;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;27;45.88;40.1;1662;-;3;464;858;128;;;;2106.33;46.0;57505;1;859;12070;47001;3591;;Chr;X;135.19;40.5;1765;-;75;220;1228;263;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;28;41.18;43.5;1194;-;0;461;642;70;;Chr;1;307.04;47;8611;-;116;1779;6948;468;;;MT;0.02;38.9;13;2;22;-;13;-;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;29;41.85;38.2;538;-;5;366;474;91;;Chr;2;244.44;47;6964;-;140;1438;5780;447;;Un;-;30.68;45.8;646;-;2;62;716;37;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;30;40.21;41.4;1210;-;5;441;681;86;;Chr;3;235.67;46.9;6181;-;79;1254;4945;368;;Max Min Total;;;;200;19;1591;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;31;39.9;39.5;644;-;0;357;486;71;;Chr;4;247;46.6;6047;-;109;1326;5118;390;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;32;38.81;36.9;706;-;0;302;464;121;;Chr;5;223.9;46.9;6655;-;101;1319;5293;408;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;33;31.38;39.2;694;-;2;330;414;57;;Chr;6;174.03;47.1;4897;1;78;1037;4049;326;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;34;42.12;40.4;627;-;2;380;471;57;;Chr;7;182.38;46.8;4778;-;59;928;3762;284;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;35;26.53;41.4;528;-;102;272;529;66;;Chr;8;181.12;47;5048;-;75;1217;4263;305;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;36;30.81;38.6;551;-;2;342;376;57;;Chr;9;159.77;47;4274;-;53;987;3590;307;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;37;30.9;40.2;712;-;3;438;453;45;;Chr;10;150.98;46.9;4050;-;49;785;3253;288;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;38;23.91;41.0;485;-;28;296;442;63;;;MT;0.57;43.9;163;4;29;-;213;26;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;X;123.87;40.3;2338;-;6;619;1586;472;;;Pltd;0.14;38.5;111;8;38;-;158;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;MT;0.02;39.7;13;2;22;-;13;-;;Un;-;28.03;46.7;512;1;19;108;428;24;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Un;-;83.33;47.2;493;-;2;146;474;;;Max Min Total;;;;140;49;945;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Max Min Total;;;;102;0;419;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;dre;;;ecartt;1130;moy;319;%;354;;;bta;;;ecartt;39;moy;53;%;74;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ;RNA ;Gene ;Pseudo;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ;RNA ;Gene ;Pseudo;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;1345.07;36.8;62823;1;7977;6836;37391;297;;;;2660.91;41.9;48993;1;1578;9712;32314;3888;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;1;59.58;36.4;2176;-;31;326;1444;22;;Chr;1;158.34;40.1;1981;-;67;405;1267;165;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;2;59.64;36.7;2229;-;76;274;1464;8;;Chr;2;137.06;40.8;2085;-;49;362;1237;163;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;3;62.63;36.9;2436;-;346;362;1992;23;;Chr;3;121.43;41.9;2922;-;171;462;1832;223;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;4;78.09;38.4;2450;-;5723;1252;7909;70;;Chr;4;120.83;40.6;1673;-;59;386;1142;123;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;5;72.5;36.4;2713;1;140;395;1679;6;;Chr;5;121.19;41.7;2753;-;54;444;1715;218;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;6;60.27;36.4;2123;-;52;250;1238;16;;Chr;6;119.46;40;1420;-;51;320;953;134;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;7;74.28;36.7;2531;-;72;322;1641;14;;Chr;7;112.64;42;2791;-;55;474;1814;243;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;8;54.3;36.5;1986;-;240;272;1452;6;;Chr;8;113.39;41.2;1573;-;29;421;1097;142;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;9;56.46;36.5;1832;-;60;226;1060;9;;Chr;9;105.71;40;1068;-;39;281;821;142;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;10;45.42;36.6;1779;-;12;186;1076;14;;Chr;10;104.31;41.5;2014;-;65;369;1447;151;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;11;45.48;36.4;1596;-;13;166;952;4;;Chr;11;107.31;42.9;2176;-;44;388;1309;122;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;12;49.18;36.3;1679;-;123;157;1091;5;;Chr;12;91.16;40.4;886;-;47;268;660;72;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;13;52.19;36.5;1805;-;46;230;1046;6;;Chr;13;84.24;43.7;1740;-;42;377;1111;118;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;14;52.66;36.6;1481;-;11;170;945;6;;Chr;14;84.65;41.4;1066;-;38;235;734;95;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;15;48.04;36.8;1814;-;135;193;1229;14;;Chr;15;85.3;41.8;1946;-;47;269;1491;264;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;16;55.27;36.5;1996;-;17;308;1255;11;;Chr;16;81.72;42.6;1452;-;30;324;946;102;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;17;53.46;36.6;1703;-;109;190;1111;9;;Chr;17;75.16;42.3;1411;-;42;261;893;115;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;18;51.02;36.6;1541;-;5;179;915;9;;Chr;18;66;45.4;2691;-;50;378;1648;156;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;19;48.45;36.4;1762;-;7;185;1038;7;;Chr;19;64.06;46;2718;-;70;428;1570;108;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;20;55.2;36.6;1890;-;262;192;1376;3;;Chr;20;72.04;41;562;-;31;192;508;67;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;21;45.93;36.6;1948;-;253;237;1374;8;;Chr;21;71.6;43.1;1135;-;26;460;855;98;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;22;39.13;37;1674;-;143;293;1288;8;;Chr;22;61.44;43.4;1414;-;23;276;762;67;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;23;46.22;36.7;1755;-;11;204;1015;5;;Chr;23;52.53;43.4;1393;-;191;297;1134;93;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;24;42.17;36.3;1365;-;18;138;823;10;;Chr;24;62.71;41.9;751;-;19;192;469;61;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;25;37.5;36.6;1453;-;72;129;978;4;;Chr;25;42.9;47.1;1684;1;66;259;973;50;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;MT;0.02;39.9;13;2;22;-;37;-;;Chr;26;51.68;42.8;991;-;14;207;559;62;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Un;-;334.09;36.5;9370;-;1385;1639;9570;67;;Chr;27;45.41;41.8;478;-;33;147;377;33;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Max Min Total;;;;5723;5;9384;;;;;Chr;28;46.31;42.2;798;-;23;111;444;64;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;Chr;29;51.51;44.2;1427;-;24;231;903;109;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;Chr;X;148.82;40.6;1994;-;79;488;1643;328;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;MT;0.02;39.4;13;2;22;-;13;-;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;Un;-;9.22;49.6;101;-;-;10;105;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;Max Min Total;;;;191;14;1600;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Zebrafish Taurus Catus
[modifier | modifier le wikicode]- Légende: Archive pour la distribution des tRNAs sur les chromosomes. Copie du gtRNAdb le 24.11.17
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Felis_catus_;F$;Bos_taurus_;B$;Danio_rerio_;D$;;24.11.17 Paris;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/eukaryota/Fcatu5/felCat5-tRNAs.fa;;;;;;http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/eukaryota/Btaur8/bosTau8-tRNAs.fa;;;;;;http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/eukaryota/Dreri_v8/danRer6-tRNAs.fa;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;AlaAGC;;D$chr4.trna1-MetCAT;;;D$chr1.trna118-LysCTT;;;D$chr2.trna100-AsnGTT;;;D$chr3.trna100-GlnCTG;;;D$chr5.trna105-LysCTT;;;D$chr6.trna10-LysCTT;;;D$chr7.trna100-IleTAT;;;D$chr8.trna100-GlnTTG;;;D$chr9.trna132-GlnCTG;;;D$chr10.trna177-GlyGCC;;;D$chr12.trna1-ArgTCG;;;D$chr13.trna104-LysCTT;;;D$chr14.trna166-AlaTGC;;;D$chr15.trna100-ProCGG;;;D$chr16.trna128-GluCTC;;;D$chr17.trna11-ThrTGT;;;D$chr18.trna138-TrpCCA;;;D$chr19.trna137-ProAGG;;;D$chr20.trna101-CysGCA;;;D$chr21.trna103-AlaTGC;;;D$chr22.trna100-MetCAT;;;D$chr23.trna13-CysGCA;;;D$chr25.trna100-PheAAA;;;D$Zv8_NA10776.trna10-IleTAT;;;;D$Zv8_scaffold2976.trna1-MetCAT F$chrA3;AlaAGC;;B$chr1;AlaCGC;;D$chr4.trna1000-GlyGCC;;;D$chr1.trna121-ProAGG;;;D$chr2.trna101-LysCTT;;;D$chr3.trna101-PheGAA;;;D$chr5.trna106-LysCTT;;;D$chr6.trna11-AsnGTT;;;D$chr7.trna101-IleTAT;;;D$chr8.trna102-ProTGG;;;D$chr9.trna133-ArgTCT;;;D$chr10.trna178-GlyGCC;;;D$chr12.trna100-LysCTT;;;D$chr13.trna105-AsnGTT;;;D$chr14.trna178-GlnCTG;;;D$chr15.trna102-GluCTC;;;D$chr16.trna129-SerAGA;;;D$chr17.trna110-LeuCAA;;;D$chr18.trna164-MetCAT;;;D$chr19.trna138-ProAGG;;;D$chr20.trna103-CysGCA;;;D$chr21.trna107-MetCAT;;;D$chr22.trna101-MetCAT;;;D$chr23.trna151-ThrTGT;;;D$chr25.trna101-GlnTTG;;;D$Zv8_NA10776.trna11-IleTAT;;;;D$Zv8_scaffold2976.trna2-MetCAT F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;AlaCGC;;D$chr4.trna10002-AsnGTT;;;D$chr1.trna140-GluCTC;;;D$chr2.trna102-AsnGTT;;;D$chr3.trna102-GlnCTG;;;D$chr5.trna107-LysCTT;;;D$chr6.trna111-IleAAT;;;D$chr7.trna102-IleTAT;;;D$chr8.trna103-ProAGG;;;D$chr9.trna134-ThrTGT;;;D$chr10.trna180-GlyGCC;;;D$chr12.trna101-AsnGTT;;;D$chr13.trna138-HisGTG;;;D$chr14.trna193-ValTAC;;;D$chr15.trna103-GluCTC;;;D$chr16.trna175-GluCTC;;;D$chr17.trna111-LeuCAA;;;D$chr18.trna165-ThrCGT;;;D$chr19.trna154-GlnCTG;;;D$chr20.trna105-CysGCA;;;D$chr21.trna113-AlaTGC;;;D$chr22.trna102-MetCAT;;;D$chr23.trna16-GlyTCC;;;D$chr25.trna102-IleAAT;;;D$Zv8_NA10776.trna12-IleTAT;;;;D$Zv8_scaffold2976.trna3-MetCAT F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;AlaTGC;;D$chr4.trna10005-LysCTT;;;D$chr1.trna146-LeuTAA;;;D$chr2.trna103-LysCTT;;;D$chr3.trna103-IleAAT;;;D$chr5.trna11-ProAGG;;;D$chr6.trna13-AsnGTT;;;D$chr7.trna103-IleTAT;;;D$chr8.trna104-GlnTTG;;;D$chr9.trna135-SerAGA;;;D$chr10.trna183-GlyGCC;;;D$chr12.trna102-LysCTT;;;D$chr13.trna144-ValAAC;;;D$chr14.trna199-GluTTC;;;D$chr15.trna104-GluCTC;;;D$chr16.trna176-GluCTC;;;D$chr17.trna112-LeuCAA;;;D$chr18.trna169-ValAAC;;;D$chr19.trna183-IleAAT;;;D$chr20.trna107-CysGCA;;;D$chr21.trna114-AlaTGC;;;D$chr22.trna103-MetCAT;;;D$chr23.trna194-HisGTG;;;D$chr25.trna107-ArgACG;;;D$Zv8_NA10776.trna13-IleTAT;;;;D$Zv8_scaffold2976.trna4-MetCAT F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;ArgCCG;;D$chr4.trna10006-AsnGTT;;;D$chr1.trna147-LeuTAA;;;D$chr2.trna104-AsnGTT;;;D$chr3.trna104-PheGAA;;;D$chr5.trna114-ProAGG;;;D$chr6.trna14-AsnGTT;;;D$chr7.trna105-IleTAT;;;D$chr8.trna106-ProTGG;;;D$chr9.trna136-ArgTCT;;;D$chr10.trna184-GlyGCC;;;D$chr12.trna103-AsnGTT;;;D$chr13.trna145-ValCAC;;;D$chr14.trna23-AlaAGC;;;D$chr15.trna105-GluCTC;;;D$chr16.trna219-GluCTC;;;D$chr17.trna113-LeuCAA;;;D$chr18.trna170-HisGTG;;;D$chr19.trna257-MetCAT;;;D$chr20.trna109-CysGCA;;;D$chr21.trna115-AlaCGC;;;D$chr22.trna105-MetCAT;;;D$chr23.trna45-GluCTC;;;D$chr25.trna108-ArgACG;;;D$Zv8_NA10776.trna14-IleTAT;;;;D$Zv8_scaffold3042.trna1-IleGAT F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;ArgCCT;;D$chr4.trna10008-AsnGTT;;;D$chr1.trna149-LeuTAA;;;D$chr2.trna105-LysCTT;;;D$chr3.trna106-IleAAT;;;D$chr5.trna12-ProCGG;;;D$chr6.trna149-GlnTTG;;;D$chr7.trna106-IleTAT;;;D$chr8.trna107-ProAGG;;;D$chr9.trna137-ThrTGT;;;D$chr10.trna187-GlyGCC;;;D$chr12.trna104-LysCTT;;;D$chr13.trna146-ValAAC;;;D$chr14.trna24-AlaAGC;;;D$chr15.trna106-GluCTC;;;D$chr16.trna253-GluCTC;;;D$chr17.trna114-LeuCAA;;;D$chr18.trna171-ProAGG;;;D$chr19.trna291-TrpCCA;;;D$chr20.trna111-CysGCA;;;D$chr21.trna116-AlaTGC;;;D$chr22.trna107-MetCAT;;;D$chr23.trna47-AsnGTT;;;D$chr25.trna115-AspGTC;;;D$Zv8_NA10776.trna3-IleTAT;;;;D$Zv8_scaffold3042.trna2-AlaTGC F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;ArgCCT;;D$chr4.trna10009-AsnGTT;;;D$chr1.trna150-LeuTAA;;;D$chr2.trna107-AsnGTT;;;D$chr3.trna107-PheGAA;;;D$chr5.trna13-ProCGG;;;D$chr6.trna15-LysCTT;;;D$chr7.trna107-ValAAC;;;D$chr8.trna108-GlnTTG;;;D$chr9.trna138-ThrAGT;;;D$chr10.trna188-GlyGCC;;;D$chr12.trna105-ThrTGT;;;D$chr13.trna147-ValCAC;;;D$chr14.trna25-AlaAGC;;;D$chr15.trna107-GluCTC;;;D$chr16.trna254-LysCTT;;;D$chr17.trna115-LeuCAA;;;D$chr18.trna172-ProAGG;;;D$chr19.trna3-LysCTT;;;D$chr20.trna113-CysGCA;;;D$chr21.trna117-AlaCGC;;;D$chr22.trna108-MetCAT;;;D$chr23.trna48-AsnGTT;;;D$chr25.trna116-AspGTC;;;D$Zv8_NA10776.trna4-IleTAT;;;;D$Zv8_scaffold3042.trna3-MetCAT F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;ArgCCT;;D$chr4.trna1001-GlyGCC;;;D$chr1.trna152-LeuTAA;;;D$chr2.trna108-LysCTT;;;D$chr3.trna108-GlnCTG;;;D$chr5.trna130-AspGTC;;;D$chr6.trna16-AsnGTT;;;D$chr7.trna119-LysCTT;;;D$chr8.trna110-ProTGG;;;D$chr9.trna139-ArgTCT;;;D$chr10.trna191-GlyGCC;;;D$chr12.trna123-LeuTAG;;;D$chr13.trna148-ValAAC;;;D$chr14.trna26-AlaAGC;;;D$chr15.trna108-GluCTC;;;D$chr16.trna255-ArgTCG;;;D$chr17.trna116-LeuCAA;;;D$chr18.trna173-ProTGG;;;D$chr19.trna55-ProAGG;;;D$chr20.trna115-CysGCA;;;D$chr21.trna118-AlaTGC;;;D$chr22.trna109-ArgCCT;;;D$chr23.trna49-PheGAA;;;D$chr25.trna117-AspGTC;;;D$Zv8_NA10776.trna5-IleTAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna1-GluTTC F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;ArgCCT;;D$chr4.trna10010-LysCTT;;;D$chr1.trna153-LeuTAA;;;D$chr2.trna110-AsnGTT;;;D$chr3.trna109-IleAAT;;;D$chr5.trna131-AspGTC;;;D$chr6.trna217-GluTTC;;;D$chr7.trna131-ThrAGT;;;D$chr8.trna111-ProAGG;;;D$chr9.trna140-ThrTGT;;;D$chr10.trna256-LeuTAG;;;D$chr12.trna124-LeuTAG;;;D$chr13.trna149-ValCAC;;;D$chr14.trna290-GlyGCC;;;D$chr15.trna109-GluCTC;;;D$chr16.trna257-GlnCTG;;;D$chr17.trna117-LeuCAA;;;D$chr18.trna174-ProCGG;;;;;;D$chr20.trna117-CysGCA;;;D$chr21.trna119-AlaTGC;;;D$chr22.trna110-MetCAT;;;D$chr23.trna50-GluTTC;;;D$chr25.trna118-GlyGCC;;;D$Zv8_NA10776.trna6-IleTAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna10-HisGTG F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;ArgGCG;;D$chr4.trna10011-AsnGTT;;;D$chr1.trna154-LeuTAA;;;D$chr2.trna111-LysCTT;;;D$chr3.trna110-PheGAA;;;D$chr5.trna132-AspGTC;;;D$chr6.trna292-PheGAA;;;D$chr7.trna189-ThrAGT;;;D$chr8.trna112-GlnTTG;;;D$chr9.trna141-LeuAAG;;;D$chr10.trna257-LeuAAG;;;D$chr12.trna139-ArgCCT;;;D$chr13.trna150-ValAAC;;;D$chr14.trna302-LeuAAG;;;D$chr15.trna110-GluCTC;;;D$chr16.trna259-ArgCCG;;;D$chr17.trna118-LeuCAA;;;D$chr18.trna175-ProAGG;;;;;;D$chr20.trna119-CysGCA;;;D$chr21.trna120-AlaCGC;;;D$chr22.trna111-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna151-ThrAGT;;;D$Zv8_NA10776.trna7-IleTAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna100-ValCAC F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;ArgTCG;;D$chr4.trna10013-LysCTT;;;D$chr1.trna155-LeuTAA;;;D$chr2.trna112-AsnGTT;;;D$chr3.trna111-GlnCTG;;;D$chr5.trna134-AspGTC;;;D$chr6.trna307-LeuTAG;;;D$chr7.trna266-ArgTCG;;;D$chr8.trna114-ProTGG;;;D$chr9.trna142-LeuTAG;;;D$chr10.trna64-SerGCT;;;D$chr12.trna16-LeuCAG;;;D$chr13.trna151-ValCAC;;;;;;D$chr15.trna111-GluCTC;;;D$chr16.trna260-ThrCGT;;;D$chr17.trna119-LeuCAA;;;D$chr18.trna177-ProAGG;;;;;;D$chr20.trna121-CysGCA;;;D$chr21.trna121-AlaTGC;;;D$chr22.trna112-MetCAT;;;D$chr24.trna119-GlyCCC;;;D$chr25.trna152-ThrAGT;;;D$Zv8_NA10776.trna9-ValAAC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna103-GlnCTG F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;ArgTCT;;D$chr4.trna10015-LysCTT;;;D$chr1.trna156-LeuTAA;;;D$chr2.trna113-LysCTT;;;D$chr3.trna112-IleAAT;;;D$chr5.trna136-AspGTC;;;D$chr6.trna309-IleAAT;;;D$chr7.trna267-GlnCTG;;;D$chr8.trna115-ProAGG;;;D$chr9.trna143-LeuAAG;;;D$chr10.trna65-ThrAGT;;;D$chr12.trna18-ArgTCG;;;D$chr13.trna258-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna112-GluCTC;;;D$chr16.trna269-ThrTGT;;;D$chr17.trna12-ThrCGT;;;D$chr18.trna181-ArgTCT;;;;;;D$chr20.trna123-CysGCA;;;D$chr21.trna122-AlaTGC;;;D$chr22.trna114-MetCAT;;;D$chr24.trna124-GlyGCC;;;D$chr25.trna155-GluCTC;;;D$Zv8_NA10976.trna1-LeuTAA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna104-IleAAT F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;ArgTCT;;D$chr4.trna10016-AsnGTT;;;D$chr1.trna157-LeuTAA;;;D$chr2.trna114-AsnGTT;;;D$chr3.trna113-PheGAA;;;D$chr5.trna138-AspGTC;;;D$chr6.trna310-LeuAAG;;;D$chr7.trna269-ArgTCG;;;D$chr8.trna116-GlnTTG;;;D$chr9.trna144-LeuTAG;;;D$chr10.trna66-LeuTAG;;;D$chr12.trna2-MetCAT;;;D$chr13.trna259-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna113-GluCTC;;;D$chr16.trna270-ThrTGT;;;D$chr17.trna120-LeuCAA;;;D$chr18.trna196-MetCAT;;;;;;D$chr20.trna125-CysGCA;;;D$chr21.trna123-AlaCGC;;;D$chr22.trna115-MetCAT;;;D$chr24.trna126-GlyGCC;;;D$chr25.trna156-GluCTC;;;D$Zv8_NA10976.trna2-LeuTAA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna105-PheGAA F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;ArgTCT;;D$chr4.trna10018-GluTTC;;;D$chr1.trna159-LeuTAA;;;D$chr2.trna115-LysCTT;;;D$chr3.trna115-PheGAA;;;D$chr5.trna14-ProAGG;;;D$chr6.trna311-LeuTAG;;;D$chr7.trna271-LysCTT;;;D$chr8.trna118-ProTGG;;;D$chr9.trna145-LeuAAG;;;;;;D$chr12.trna20-GlnCTG;;;D$chr13.trna260-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna114-GluCTC;;;D$chr16.trna271-ThrTGT;;;D$chr17.trna121-LeuCAA;;;D$chr18.trna197-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna127-CysGCA;;;D$chr21.trna124-AlaTGC;;;D$chr22.trna117-MetCAT;;;D$chr24.trna127-GlyCCC;;;D$chr25.trna157-GluCTC;;;D$Zv8_NA10978.trna1-LeuTAA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna106-GlnCTG F$chrC1;AlaAGC;;B$chr1;AspGTC;;D$chr4.trna10019-TyrGTA;;;D$chr1.trna199-AlaTGC;;;D$chr2.trna116-AsnGTT;;;D$chr3.trna116-GlnCTG;;;D$chr5.trna140-AspGTC;;;D$chr6.trna312-LeuAAG;;;D$chr7.trna272-AsnGTT;;;D$chr8.trna119-ProAGG;;;D$chr9.trna146-LeuTAG;;;D$chr11.trna133-SerTGA;;;D$chr12.trna220-ThrAGT;;;D$chr13.trna261-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna115-GluCTC;;;D$chr16.trna272-ThrTGT;;;D$chr17.trna122-LeuCAA;;;D$chr18.trna201-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna129-CysGCA;;;D$chr21.trna125-AlaTGC;;;D$chr22.trna118-MetCAT;;;D$chr24.trna128-GlyGCC;;;D$chr25.trna165-GlyGCC;;;D$Zv8_NA11109.trna1-ArgTCG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna107-IleAAT F$chrD1;AlaAGC;;B$chr1;AspGTC;;D$chr4.trna10020-ArgACG;;;D$chr1.trna200-AlaTGC;;;D$chr2.trna117-LysCTT;;;D$chr3.trna117-PheGAA;;;D$chr5.trna142-AspGTC;;;D$chr6.trna315-LeuAAG;;;D$chr7.trna273-LysCTT;;;D$chr8.trna120-GlnTTG;;;D$chr9.trna147-LeuAAG;;;D$chr11.trna204-ValAAC;;;D$chr12.trna221-ArgTCT;;;D$chr13.trna262-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna116-GluCTC;;;D$chr16.trna273-ThrTGT;;;D$chr17.trna123-LeuCAA;;;D$chr18.trna206-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna131-CysGCA;;;D$chr21.trna126-AlaTGC;;;D$chr22.trna119-ArgCCT;;;D$chr24.trna129-GlyGCC;;;D$chr25.trna174-ArgACG;;;D$Zv8_NA11109.trna2-ArgTCG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna11-SupTTA F$chrE3;AlaAGC;;B$chr1;CysACA;;D$chr4.trna10021-GluTTC;;;D$chr1.trna201-AlaTGC;;;D$chr2.trna118-AsnGTT;;;D$chr3.trna118-GlnCTG;;;D$chr5.trna144-AspGTC;;;D$chr6.trna316-LeuTAG;;;D$chr7.trna274-AsnGTT;;;D$chr8.trna122-ProTGG;;;D$chr9.trna148-LeuTAG;;;D$chr11.trna205-ValAAC;;;D$chr12.trna222-ThrTGT;;;D$chr13.trna263-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna117-GluCTC;;;D$chr16.trna274-ThrTGT;;;D$chr17.trna124-LeuCAA;;;D$chr18.trna207-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna133-CysGCA;;;D$chr21.trna127-AlaCGC;;;D$chr22.trna120-LeuCAA;;;D$chr24.trna130-GlyGCC;;;D$chr25.trna186-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1201.trna1-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna110-PheAAA F$chrF2;AlaAGC;;B$chr1;CysACA;;D$chr4.trna10022-TyrGTA;;;D$chr1.trna224-GluCTC;;;D$chr2.trna119-LysCTT;;;D$chr3.trna119-PheGAA;;;D$chr5.trna146-AspGTC;;;D$chr6.trna317-LeuAAG;;;D$chr7.trna275-LysCTT;;;D$chr8.trna123-ProAGG;;;D$chr9.trna149-LeuAAG;;;D$chr11.trna206-ValAAC;;;D$chr12.trna223-ThrAGT;;;D$chr13.trna264-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna118-GluCTC;;;D$chr16.trna275-ThrTGT;;;D$chr17.trna125-LeuCAA;;;D$chr18.trna208-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna135-CysGCA;;;D$chr21.trna128-AlaTGC;;;D$chr22.trna122-MetCAT;;;D$chr24.trna212-TrpCCA;;;D$chr25.trna187-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1201.trna2-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna111-GlnCTG F$chrB2;AlaCGC;;B$chr1;CysACA;;D$chr4.trna10023-ArgACG;;;D$chr1.trna238-GluCTC;;;D$chr2.trna147-ProAGG;;;D$chr3.trna120-GlnCTG;;;D$chr5.trna148-AspGTC;;;D$chr6.trna318-LeuTAG;;;D$chr7.trna276-AsnGTT;;;D$chr8.trna126-ProTGG;;;D$chr9.trna150-LeuTAG;;;D$chr11.trna207-ValAAC;;;D$chr12.trna224-ArgTCT;;;D$chr13.trna265-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna119-GluCTC;;;D$chr16.trna276-ThrTGT;;;D$chr17.trna126-LeuCAA;;;D$chr18.trna211-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna137-CysGCA;;;D$chr21.trna129-AlaTGC;;;D$chr22.trna124-MetCAT;;;D$chr24.trna213-TrpCCA;;;D$chr25.trna188-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1201.trna3-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna112-IleAAT F$chrB2;AlaCGC;;B$chr1;CysACA;;D$chr4.trna10024-GluTTC;;;D$chr1.trna239-MetCAT;;;D$chr2.trna148-ProCGG;;;D$chr3.trna121-IleAAT;;;D$chr5.trna150-AspGTC;;;D$chr6.trna319-LeuAAG;;;D$chr7.trna277-ArgCCT;;;D$chr8.trna127-ProAGG;;;D$chr9.trna160-MetCAT;;;D$chr11.trna226-CysGCA;;;D$chr12.trna225-ThrTGT;;;D$chr13.trna266-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna120-GluCTC;;;D$chr16.trna74-ThrTGT;;;D$chr17.trna127-LeuCAA;;;D$chr18.trna212-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna139-CysGCA;;;D$chr21.trna130-AlaTGC;;;D$chr22.trna125-MetCAT;;;D$chr24.trna214-TrpCCA;;;D$chr25.trna189-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1201.trna4-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna113-PheGAA F$chrB2;AlaCGC;;B$chr1;CysACA;;D$chr4.trna10025-TyrGTA;;;D$chr1.trna240-LysTTT;;;D$chr2.trna149-ProAGG;;;D$chr3.trna122-PheGAA;;;D$chr5.trna152-AspGTC;;;D$chr6.trna320-LeuAAG;;;D$chr7.trna278-AsnGTT;;;D$chr8.trna128-GlnTTG;;;D$chr9.trna161-MetCAT;;;D$chr11.trna227-CysGCA;;;D$chr12.trna226-ThrAGT;;;D$chr13.trna267-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna121-GluCTC;;;D$chr16.trna75-ThrTGT;;;D$chr17.trna128-LeuCAA;;;D$chr18.trna213-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna141-CysGCA;;;D$chr21.trna131-AlaTGC;;;D$chr22.trna126-MetCAT;;;D$chr24.trna22-MetCAT;;;D$chr25.trna190-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1201.trna5-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna115-IleAAT F$chrB2;AlaCGC;;B$chr1;CysACA;;D$chr4.trna10026-ArgACG;;;D$chr1.trna252-GluCTC;;;D$chr2.trna150-ProTGG;;;D$chr3.trna123-GlnCTG;;;D$chr5.trna153-AspGTC;;;D$chr6.trna321-LeuTAG;;;D$chr7.trna281-SerGCT;;;D$chr8.trna130-ProTGG;;;D$chr9.trna162-MetCAT;;;D$chr11.trna23-SerGCT;;;D$chr12.trna227-ArgTCT;;;D$chr13.trna268-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna122-GluCTC;;;D$chr16.trna76-ThrTGT;;;D$chr17.trna129-LeuCAA;;;D$chr18.trna214-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna143-CysGCA;;;D$chr21.trna132-AlaTGC;;;D$chr22.trna128-MetCAT;;;D$chr24.trna23-MetCAT;;;D$chr25.trna191-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1201.trna6-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna116-PheGAA F$chrB2;AlaCGC;;B$chr1;CysACA;;D$chr4.trna10027-GluTTC;;;D$chr1.trna267-ArgTCT;;;D$chr2.trna151-ProTGG;;;D$chr3.trna124-IleAAT;;;D$chr5.trna155-AspGTC;;;D$chr6.trna323-LeuAAG;;;D$chr7.trna282-SerGCT;;;D$chr8.trna131-ProAGG;;;D$chr9.trna164-MetCAT;;;D$chr11.trna24-SerGCT;;;D$chr12.trna228-ThrTGT;;;D$chr13.trna269-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna123-GluCTC;;;D$chr16.trna85-GluTTC;;;D$chr17.trna130-LeuCAA;;;D$chr18.trna215-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna145-CysGCA;;;D$chr21.trna133-AlaTGC;;;D$chr22.trna130-MetCAT;;;D$chr24.trna24-MetCAT;;;D$chr25.trna192-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1201.trna7-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna118-IleAAT F$chrB4;AlaCGC;;B$chr1;CysACA;;D$chr4.trna10028-TyrGTA;;;D$chr1.trna282-SeCTCA;;;D$chr2.trna152-ProCGG;;;D$chr3.trna125-PheGAA;;;D$chr5.trna157-AspGTC;;;D$chr6.trna324-LeuTAG;;;D$chr7.trna283-SerGCT;;;D$chr8.trna132-GlnTTG;;;D$chr9.trna165-MetCAT;;;D$chr11.trna247-CysGCA;;;D$chr12.trna23-LysCTT;;;D$chr13.trna270-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna124-GluCTC;;;D$chr16.trna86-TyrGTA;;;D$chr17.trna131-LeuCAA;;;D$chr18.trna216-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna147-CysGCA;;;D$chr21.trna134-AlaTGC;;;D$chr22.trna131-ArgCCT;;;D$chr24.trna260-TyrGTA;;;D$chr25.trna193-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1267.trna1-ProAGG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna12-SerAGA F$chrC1;AlaCGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10029-ArgACG;;;D$chr1.trna284-ArgCCG;;;D$chr2.trna153-ProAGG;;;D$chr3.trna126-GlnCTG;;;D$chr5.trna159-AspGTC;;;D$chr6.trna325-LeuAAG;;;D$chr7.trna285-SerGCT;;;D$chr8.trna134-ProTGG;;;D$chr9.trna166-MetCAT;;;D$chr11.trna248-CysGCA;;;D$chr12.trna230-ThrAGT;;;D$chr13.trna271-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna125-GluCTC;;;D$chr16.trna87-ArgACG;;;D$chr17.trna132-LeuCAA;;;D$chr18.trna217-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna149-CysGCA;;;D$chr21.trna135-AlaCGC;;;D$chr22.trna132-MetCAT;;;D$chr24.trna286-ThrAGT;;;D$chr25.trna194-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1389.trna2-TrpCCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna121-IleAAT F$chrC1;AlaGGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna1003-GlyGCC;;;D$chr1.trna285-SeCTCA;;;D$chr2.trna154-SerTGA;;;D$chr3.trna127-IleAAT;;;D$chr5.trna16-ProAGG;;;D$chr6.trna326-LeuTAG;;;D$chr7.trna286-SerGCT;;;D$chr8.trna135-ProAGG;;;D$chr9.trna167-MetCAT;;;D$chr11.trna249-CysGCA;;;D$chr12.trna231-ArgTCT;;;D$chr13.trna272-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna126-GluCTC;;;D$chr16.trna89-ArgACG;;;D$chr17.trna133-LeuCAA;;;D$chr18.trna218-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna15-SerTGA;;;D$chr21.trna136-AlaTGC;;;D$chr22.trna133-ArgCCT;;;D$chr24.trna300-LeuCAG;;;D$chr25.trna195-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1770.trna1-LysCTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna123-GlnCTG F$chrA1;AlaTGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10030-GluTTC;;;D$chr1.trna287-GlnCTG;;;D$chr2.trna155-ProAGG;;;D$chr3.trna128-PheGAA;;;D$chr5.trna160-AspGTC;;;D$chr6.trna327-LeuAAG;;;D$chr7.trna288-SerGCT;;;D$chr8.trna136-GlnTTG;;;D$chr9.trna168-MetCAT;;;D$chr11.trna25-SerGCT;;;D$chr12.trna232-ThrAGT;;;D$chr13.trna273-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna127-GluCTC;;;;;;D$chr17.trna134-LeuCAA;;;D$chr18.trna221-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna151-CysGCA;;;D$chr21.trna137-AlaTGC;;;D$chr22.trna134-ArgCCT;;;D$chr24.trna31-GlyGCC;;;D$chr25.trna196-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1770.trna2-AsnGTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna124-IleAAT F$chrA1;AlaTGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10031-TyrGTA;;;D$chr1.trna288-ArgTCG;;;D$chr2.trna156-LeuAAG;;;D$chr3.trna129-GlnCTG;;;D$chr5.trna162-AspGTC;;;D$chr6.trna328-LeuTAG;;;D$chr7.trna289-SerGCT;;;D$chr8.trna138-ProTGG;;;D$chr9.trna169-MetCAT;;;D$chr11.trna26-SerGCT;;;D$chr12.trna233-ArgTCT;;;D$chr13.trna274-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna128-GluCTC;;;;;;D$chr17.trna135-LeuCAA;;;D$chr18.trna222-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna153-CysGCA;;;D$chr21.trna138-AlaTGC;;;D$chr22.trna136-ArgCCT;;;D$chr24.trna34-GlyGCC;;;D$chr25.trna197-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1770.trna3-LysCTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna125-PheGAA F$chrA1;AlaTGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10032-ArgACG;;;D$chr1.trna290-ArgCCG;;;D$chr2.trna157-LeuAAG;;;D$chr3.trna130-PheGAA;;;D$chr5.trna163-AspGTC;;;D$chr6.trna330-LeuAAG;;;D$chr7.trna29-LysCTT;;;D$chr8.trna139-ProAGG;;;D$chr9.trna170-MetCAT;;;D$chr11.trna52-ValCAC;;;D$chr12.trna234-ThrAGT;;;D$chr13.trna275-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna129-GluCTC;;;;;;D$chr17.trna136-LeuCAA;;;D$chr18.trna223-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna155-CysGCA;;;D$chr21.trna139-AlaCGC;;;D$chr22.trna137-MetCAT;;;D$chr24.trna35-GlyCCC;;;D$chr25.trna218-AspGTC;;;D$Zv8_NA1770.trna4-AsnGTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna126-ThrTGT F$chrB2;AlaTGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10033-GluTTC;;;D$chr1.trna291-ArgTCG;;;D$chr2.trna158-LeuTAG;;;D$chr3.trna131-GlnCTG;;;D$chr5.trna165-AspGTC;;;D$chr6.trna331-LeuTAG;;;D$chr7.trna290-SerGCT;;;D$chr8.trna140-GlnTTG;;;D$chr9.trna171-IleTAT;;;D$chr11.trna54-ValCAC;;;D$chr12.trna235-ArgTCT;;;D$chr13.trna276-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna130-GluCTC;;;;;;D$chr17.trna137-LeuCAA;;;D$chr18.trna225-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna157-CysGCA;;;D$chr21.trna140-AlaTGC;;;D$chr22.trna138-MetCAT;;;D$chr24.trna37-GlyGCC;;;D$chr25.trna219-AspGTC;;;D$Zv8_NA1836.trna1-AsnGTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna127-ThrAGT F$chrB2;AlaTGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10034-TyrGTA;;;D$chr1.trna293-ArgCCG;;;D$chr2.trna159-LeuAAG;;;D$chr3.trna132-PheGAA;;;D$chr5.trna167-AspGTC;;;D$chr6.trna332-LeuAAG;;;D$chr7.trna291-SerGCT;;;D$chr8.trna142-ProTGG;;;D$chr9.trna172-MetCAT;;;D$chr11.trna95-SerGCT;;;D$chr12.trna236-ThrTGT;;;D$chr13.trna277-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna197-IleAAT;;;;;;D$chr17.trna16-LysTTT;;;D$chr18.trna226-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna159-CysGCA;;;D$chr21.trna141-AlaTGC;;;D$chr22.trna139-MetCAT;;;D$chr24.trna38-GlyCCC;;;D$chr25.trna220-AspGTC;;;D$Zv8_NA1927.trna1-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna128-IleAAT F$chrB2;AlaTGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10035-ArgACG;;;D$chr1.trna294-GlnTTG;;;D$chr2.trna160-LeuAAG;;;D$chr3.trna133-GlnCTG;;;D$chr5.trna169-AspGTC;;;D$chr6.trna333-LeuTAG;;;D$chr7.trna292-SerGCT;;;D$chr8.trna143-ProAGG;;;D$chr9.trna173-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna237-ArgTCT;;;D$chr13.trna278-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna198-IleAAT;;;;;;D$chr17.trna17-SerAGA;;;D$chr18.trna227-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna16-HisGTG;;;D$chr21.trna142-AlaCGC;;;D$chr22.trna141-MetCAT;;;D$chr24.trna40-GlyGCC;;;D$chr25.trna221-AspGTC;;;D$Zv8_NA1927.trna10-ValCAC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna129-ThrTGT F$chrB2;AlaTGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10036-GluTTC;;;D$chr1.trna297-ArgCCG;;;D$chr2.trna161-LeuAAG;;;D$chr3.trna134-PheGAA;;;D$chr5.trna17-ProTGG;;;D$chr6.trna335-LeuAAG;;;D$chr7.trna293-LeuAAG;;;D$chr8.trna144-GlnTTG;;;D$chr9.trna174-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna238-ThrTGT;;;D$chr13.trna279-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna199-TrpCCA;;;;;;D$chr17.trna18-HisGTG;;;D$chr18.trna229-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna161-CysGCA;;;D$chr21.trna143-AlaTGC;;;D$chr22.trna142-MetCAT;;;D$chr24.trna43-GlyGCC;;;D$chr25.trna222-AspGTC;;;D$Zv8_NA1927.trna11-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna13-HisGTG F$chrD3;AlaTGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10037-TyrGTA;;;D$chr1.trna298-ArgTCG;;;D$chr2.trna162-LeuAAG;;;D$chr3.trna135-GlnCTG;;;D$chr5.trna171-AspGTC;;;D$chr6.trna358-PheGAA;;;D$chr7.trna294-LeuTAG;;;D$chr8.trna145-ProTGG;;;D$chr9.trna175-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna24-ThrGGT;;;D$chr13.trna280-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna200-GlyTCC;;;;;;D$chr17.trna20-LeuCAG;;;D$chr18.trna230-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna163-CysGCA;;;D$chr21.trna144-AlaTGC;;;D$chr22.trna144-MetCAT;;;D$chr24.trna48-GlyGCC;;;D$chr25.trna223-GlyGCC;;;D$Zv8_NA1927.trna12-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna130-ThrAGT F$chrD3;AlaTGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10038-ArgACG;;;D$chr1.trna300-GlnCTG;;;D$chr2.trna163-LeuAAG;;;D$chr3.trna136-PheGAA;;;D$chr5.trna173-AspGTC;;;D$chr6.trna359-ProCGG;;;D$chr7.trna295-LeuAAG;;;D$chr8.trna146-ProAGG;;;D$chr9.trna176-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna240-ThrAGT;;;D$chr13.trna281-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna217-GlyTCC;;;;;;D$chr17.trna21-SerTGA;;;D$chr18.trna231-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna165-CysGCA;;;D$chr21.trna145-AlaTGC;;;D$chr22.trna150-ArgCCT;;;D$chr24.trna49-GlyCCC;;;D$chr25.trna247-PheGAA;;;D$Zv8_NA1927.trna13-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna131-ArgTCT F$chrD3;AlaTGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10039-GluTTC;;;D$chr1.trna301-ArgTCG;;;D$chr2.trna164-LeuTAG;;;D$chr3.trna137-GlnCTG;;;D$chr5.trna175-AspGTC;;;D$chr6.trna360-ProTGG;;;D$chr7.trna296-LeuTAG;;;D$chr8.trna147-GlnTTG;;;D$chr9.trna177-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna241-ArgTCT;;;D$chr13.trna282-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna245-ProAGG;;;;;;D$chr17.trna23-IleTAT;;;D$chr18.trna232-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna167-CysGCA;;;D$chr21.trna146-AlaCGC;;;D$chr22.trna151-MetCAT;;;D$chr24.trna52-GlyGCC;;;D$chr25.trna248-IleAAT;;;D$Zv8_NA1927.trna14-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna132-ThrTGT F$chrA2;ArgACG;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10040-TyrGTA;;;D$chr1.trna303-ArgCCG;;;D$chr2.trna165-LeuAAG;;;D$chr3.trna138-PheGAA;;;D$chr5.trna177-AspGTC;;;D$chr6.trna363-ProTGG;;;D$chr7.trna297-LeuAAG;;;D$chr8.trna149-ProTGG;;;D$chr9.trna178-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna242-ThrAGT;;;D$chr13.trna283-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna246-ProTGG;;;;;;D$chr17.trna24-SerCGA;;;D$chr18.trna233-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna169-CysGCA;;;D$chr21.trna147-AlaTGC;;;D$chr22.trna152-ArgCCT;;;D$chr24.trna53-GlyCCC;;;D$chr25.trna249-PheGAA;;;D$Zv8_NA1927.trna15-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna133-ThrAGT F$chrB2;ArgACG;;B$chr1;GlnCTG;;D$chr4.trna10041-ArgACG;;;D$chr1.trna304-SeCTCA;;;D$chr2.trna166-LeuTAG;;;D$chr3.trna146-IleAAT;;;D$chr5.trna178-AspGTC;;;D$chr6.trna364-GlyTCC;;;D$chr7.trna298-LeuTAG;;;D$chr8.trna150-ProAGG;;;D$chr9.trna179-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna243-ArgTCT;;;D$chr13.trna284-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna28-LeuCAA;;;;;;D$chr17.trna240-SerAGA;;;D$chr18.trna234-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna17-SerCGA;;;D$chr21.trna148-AlaTGC;;;D$chr22.trna153-MetCAT;;;D$chr24.trna54-GlyCCC;;;D$chr25.trna250-IleAAT;;;D$Zv8_NA1927.trna18-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna134-ArgTCT F$chrB2;ArgACG;;B$chr1;GlnCTG;;D$chr4.trna10042-GluTTC;;;D$chr1.trna306-ArgCCG;;;D$chr2.trna167-LeuAAG;;;D$chr3.trna147-PheGAA;;;D$chr5.trna180-AspGTC;;;D$chr6.trna366-LysCTT;;;D$chr7.trna299-LeuAAG;;;D$chr8.trna151-GlnTTG;;;D$chr9.trna180-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna244-ThrTGT;;;D$chr13.trna285-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna3-LysTTT;;;;;;D$chr17.trna26-LysTTT;;;D$chr18.trna236-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna171-CysGCA;;;D$chr21.trna149-AlaTGC;;;D$chr22.trna154-ArgCCT;;;D$chr24.trna55-GlyGCC;;;D$chr25.trna251-PheGAA;;;D$Zv8_NA1927.trna19-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna135-ThrTGT F$chrB2;ArgACG;;B$chr1;GlnTTG;;D$chr4.trna10043-TyrGTA;;;D$chr1.trna307-ArgCCG;;;D$chr2.trna168-LeuTAG;;;D$chr3.trna148-GlnCTG;;;D$chr5.trna182-AspGTC;;;D$chr6.trna371-ThrTGT;;;D$chr7.trna3-ArgTCT;;;D$chr8.trna153-ProTGG;;;D$chr9.trna181-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna245-ArgTCT;;;D$chr13.trna286-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna302-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna27-SerCGA;;;D$chr18.trna238-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna173-CysGCA;;;D$chr21.trna150-AlaTGC;;;D$chr22.trna155-MetCAT;;;D$chr24.trna94-ArgTCT;;;D$chr25.trna252-IleAAT;;;D$Zv8_NA1927.trna2-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna136-ThrAGT F$chrB2;ArgACG;;B$chr1;GluCTC;;D$chr4.trna10044-ArgACG;;;D$chr1.trna308-ArgTCG;;;D$chr2.trna169-LeuAAG;;;D$chr3.trna149-PheGAA;;;D$chr5.trna184-AspGTC;;;D$chr6.trna387-ArgCCG;;;D$chr7.trna30-AsnGTT;;;D$chr8.trna154-ProAGG;;;D$chr9.trna182-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna246-ThrAGT;;;D$chr13.trna287-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna303-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna278-ValAAC;;;D$chr18.trna239-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna175-CysGCA;;;D$chr21.trna151-AlaTGC;;;D$chr22.trna156-ArgCCT;;;D$chr24.trna97-AlaAGC;;;D$chr25.trna253-PheGAA;;;D$Zv8_NA1927.trna20-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna137-ArgTCT F$chrB2;ArgACG;;B$chr1;GluCTC;;D$chr4.trna10045-GluTTC;;;D$chr1.trna310-ArgCCG;;;D$chr2.trna170-LeuTAG;;;D$chr3.trna150-GlnCTG;;;D$chr5.trna186-AspGTC;;;D$chr6.trna418-LysTTT;;;D$chr7.trna300-LeuTAG;;;D$chr8.trna155-GlnTTG;;;D$chr9.trna183-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna247-ArgTCT;;;D$chr13.trna288-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna304-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna279-ValTAC;;;D$chr18.trna240-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna177-CysGCA;;;D$chr21.trna152-AlaTGC;;;D$chr22.trna157-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna266-ArgTCG;;;D$Zv8_NA1927.trna3-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna138-ThrTGT F$chrB3;ArgACG;;B$chr1;GluCTC;;D$chr4.trna10046-TyrGTA;;;D$chr1.trna333-IleAAT;;;D$chr2.trna172-LeuAAG;;;D$chr3.trna151-IleAAT;;;D$chr5.trna188-AspGTC;;;D$chr6.trna433-SerCGA;;;D$chr7.trna301-LeuAAG;;;D$chr8.trna156-ProTGG;;;D$chr9.trna184-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna248-ThrTGT;;;D$chr13.trna289-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna305-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna28-HisGTG;;;D$chr18.trna241-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna179-CysGCA;;;D$chr21.trna153-AlaTGC;;;D$chr22.trna160-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna39-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1927.trna4-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna139-ThrAGT F$chrB4;ArgACG;;B$chr1;GluCTC;;D$chr4.trna10047-ArgACG;;;D$chr1.trna60-ProAGG;;;D$chr2.trna174-LeuAAG;;;D$chr3.trna152-PheGAA;;;D$chr5.trna19-Undet???;;;D$chr6.trna52-ArgCCT;;;D$chr7.trna302-LeuTAG;;;D$chr8.trna157-ProAGG;;;D$chr9.trna185-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna249-ArgTCT;;;D$chr13.trna290-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna306-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna280-ValAAC;;;D$chr18.trna242-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna18-HisGTG;;;D$chr21.trna154-AlaTGC;;;D$chr22.trna161-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna40-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1927.trna5-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna14-LysTTT F$chrF2;ArgACG;;B$chr1;GluCTC;;D$chr4.trna10048-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna175-SerGCT;;;D$chr3.trna154-GlnCTG;;;D$chr5.trna190-AspGTC;;;D$chr6.trna53-ArgCCT;;;D$chr7.trna303-LeuAAG;;;D$chr8.trna158-GlnTTG;;;D$chr9.trna186-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna250-ThrAGT;;;D$chr13.trna291-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna307-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna281-ValCAC;;;D$chr18.trna244-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna181-CysGCA;;;D$chr21.trna155-AlaTGC;;;D$chr22.trna162-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna41-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1927.trna6-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna140-ArgTCT F$chrA3;ArgCCG;;B$chr1;GluCTC;;D$chr4.trna10049-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna176-SerGCT;;;D$chr3.trna155-IleAAT;;;D$chr5.trna192-AspGTC;;;D$chr6.trna6-AsnGTT;;;D$chr7.trna304-LeuTAG;;;D$chr8.trna160-ProTGG;;;D$chr9.trna187-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna251-ArgTCT;;;D$chr13.trna336-GlyGCC;;;;;;D$chr15.trna308-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna284-ValCAC;;;D$chr18.trna245-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna183-CysGCA;;;D$chr21.trna156-AlaTGC;;;D$chr22.trna163-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna48-ThrCGT;;;D$Zv8_NA1927.trna7-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna141-ThrTGT F$chrB1;ArgCCG;;B$chr1;GluCTC;;D$chr4.trna1005-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna177-SerGCT;;;D$chr3.trna156-PheGAA;;;D$chr5.trna194-AspGTC;;;D$chr6.trna7-AsnATT;;;D$chr7.trna305-LeuAAG;;;D$chr8.trna161-ProAGG;;;D$chr9.trna188-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna252-ThrTGT;;;D$chr13.trna52-GlyGCC;;;;;;D$chr15.trna309-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna285-ValGAC;;;D$chr18.trna246-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna185-CysGCA;;;D$chr21.trna157-AlaTGC;;;D$chr22.trna164-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna57-GlyGCC;;;D$Zv8_NA1927.trna8-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna142-ThrAGT F$chrB2;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10050-ArgACG;;;;;;D$chr2.trna179-SerGCT;;;D$chr3.trna158-GlnCTG;;;D$chr5.trna196-AspGTC;;;D$chr6.trna8-LysCTT;;;D$chr7.trna306-LeuTAG;;;D$chr8.trna162-GlnTTG;;;D$chr9.trna189-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna253-ArgTCT;;;D$chr13.trna53-GlyGCC;;;;;;D$chr15.trna310-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna286-ValCAC;;;D$chr18.trna248-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna187-CysGCA;;;D$chr21.trna158-AlaTGC;;;D$chr22.trna165-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna66-IleAAT;;;D$Zv8_NA1927.trna9-Undet???;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna143-ArgTCT F$chrB2;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10051-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna182-LysCTT;;;D$chr3.trna159-IleAAT;;;D$chr5.trna198-AspGTC;;;D$chr6.trna9-AsnGTT;;;D$chr7.trna307-LeuAAG;;;D$chr8.trna163-ProAGG;;;D$chr9.trna190-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna254-ThrAGT;;;D$chr13.trna54-GlyGCC;;;;;;D$chr15.trna311-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna287-ValTAC;;;D$chr18.trna250-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna189-CysGCA;;;D$chr21.trna159-AlaCGC;;;D$chr22.trna166-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna67-PheGAA;;;D$Zv8_NA2021.trna1-AsnGTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna144-ThrTGT F$chrB3;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10052-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna185-AsnGTT;;;D$chr3.trna160-PheGAA;;;D$chr5.trna20-ProCGG;;;;;;D$chr7.trna308-LeuTAG;;;D$chr8.trna164-GlnTTG;;;D$chr9.trna191-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna255-ArgTCT;;;D$chr13.trna77-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna312-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna289-MetCAT;;;D$chr18.trna251-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna19-SerCGA;;;D$chr21.trna160-AlaTGC;;;D$chr22.trna167-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna68-IleAAT;;;D$Zv8_NA2021.trna2-LysCTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna145-ThrAGT F$chrC2;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10053-ArgACG;;;;;;D$chr2.trna189-GlnCTG;;;D$chr3.trna162-GlnCTG;;;D$chr5.trna202-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna309-LeuAAG;;;D$chr8.trna166-ProTGG;;;D$chr9.trna192-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna256-ThrTGT;;;D$chr13.trna78-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna313-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna29-ThrCGT;;;D$chr18.trna252-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna191-CysGCA;;;D$chr21.trna161-AlaTGC;;;D$chr22.trna168-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna69-PheGAA;;;D$Zv8_NA2021.trna4-AsnGTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna146-ArgTCT F$chrC2;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10054-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna190-IleAAT;;;D$chr3.trna163-IleAAT;;;D$chr5.trna204-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna31-AsnGTT;;;D$chr8.trna167-ProAGG;;;D$chr9.trna193-IleTAT;;;;;;D$chr12.trna257-ArgTCT;;;D$chr13.trna79-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna314-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna290-ValTAC;;;D$chr18.trna254-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna193-CysGCA;;;D$chr21.trna162-AlaTGC;;;D$chr22.trna169-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna70-IleAAT;;;D$Zv8_NA232.trna2-ArgTCG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna149-LysTTT F$chrD2;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10055-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna191-PheGAA;;;D$chr3.trna164-PheGAA;;;D$chr5.trna205-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna310-LeuTAG;;;D$chr8.trna168-GlnTTG;;;D$chr9.trna194-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna258-ThrAGT;;;D$chr13.trna80-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna315-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna293-ValTAC;;;D$chr18.trna256-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna195-CysGCA;;;D$chr21.trna163-AlaTGC;;;D$chr22.trna170-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna71-PheGAA;;;D$Zv8_NA232.trna4-GlnCTG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna15-SerTGA F$chrD2;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10056-ArgACG;;;;;;D$chr2.trna192-GlnCTG;;;D$chr3.trna166-GlnCTG;;;D$chr5.trna207-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna311-LeuAAG;;;D$chr8.trna170-ProTGG;;;D$chr9.trna195-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna259-ArgTCT;;;D$chr13.trna81-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna316-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna295-ValCAC;;;D$chr18.trna257-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna197-CysGCA;;;D$chr21.trna164-AlaTGC;;;D$chr22.trna171-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna72-IleAAT;;;D$Zv8_NA232.trna5-ArgCCG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna150-SerAGA F$chrD3;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10057-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna193-IleAAT;;;D$chr3.trna167-IleAAT;;;D$chr5.trna209-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna312-LeuTAG;;;D$chr8.trna171-ProAGG;;;D$chr9.trna196-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna26-AsnGTT;;;;;;;;;D$chr15.trna317-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna296-ValTAC;;;D$chr18.trna258-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna199-CysGCA;;;D$chr21.trna165-AlaCGC;;;D$chr22.trna172-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna73-PheGAA;;;D$Zv8_NA2419.trna1-LysTTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna151-HisGTG F$chrD4;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10058-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna194-PheGAA;;;D$chr3.trna168-PheGAA;;;D$chr5.trna21-ProCGG;;;;;;D$chr7.trna313-LeuAAG;;;D$chr8.trna172-GlnTTG;;;D$chr9.trna197-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna260-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna318-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna299-ValGAC;;;D$chr18.trna260-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna20-LysTTT;;;D$chr21.trna166-AlaTGC;;;D$chr22.trna173-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna74-PheGAA;;;D$Zv8_NA2419.trna2-SerAGA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna152-LysTTT F$chrD4;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10059-ArgACG;;;;;;D$chr2.trna195-GlnCTG;;;D$chr3.trna170-GlnCTG;;;D$chr5.trna211-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna314-LeuTAG;;;D$chr8.trna174-ProTGG;;;D$chr9.trna198-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna262-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna319-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna300-ValCAC;;;D$chr18.trna261-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna201-CysGCA;;;D$chr21.trna167-AlaTGC;;;D$chr22.trna174-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna75-IleAAT;;;D$Zv8_NA2419.trna3-SerCGA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna153-SerAGA F$chrE1;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna1006-GlyCCC;;;;;;D$chr2.trna196-IleAAT;;;D$chr3.trna171-IleAAT;;;D$chr5.trna213-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna315-LeuAAG;;;D$chr8.trna175-ProAGG;;;D$chr9.trna199-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna263-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna32-AsnGTT;;;;;;D$chr17.trna301-ValTAC;;;D$chr18.trna262-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna203-CysGCA;;;D$chr21.trna168-AlaTGC;;;D$chr22.trna175-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna76-PheGAA;;;D$Zv8_NA2419.trna4-TyrGTA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna154-HisGTG F$chrE1;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10060-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna198-GlnCTG;;;D$chr3.trna172-PheGAA;;;D$chr5.trna215-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna316-LeuTAG;;;D$chr8.trna176-GlnTTG;;;D$chr9.trna200-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna264-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna320-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna303-ValCAC;;;D$chr18.trna263-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna205-CysGCA;;;D$chr21.trna169-AlaCGC;;;D$chr22.trna176-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna77-IleAAT;;;D$Zv8_NA2548.trna2-LeuAAG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna155-LysTTT F$chrE1;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10061-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna199-IleAAT;;;D$chr3.trna174-GlnCTG;;;D$chr5.trna217-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna317-LeuAAG;;;D$chr8.trna178-ProTGG;;;D$chr9.trna201-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna266-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna321-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna304-ValTAC;;;D$chr18.trna264-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna207-CysGCA;;;D$chr21.trna170-AlaTGC;;;D$chr22.trna177-IleTAT;;;;;;D$chr25.trna78-IleAAT;;;D$Zv8_NA2662.trna1-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna156-LeuCAG F$chrE2;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10062-ArgACG;;;;;;D$chr2.trna202-IleAAT;;;D$chr3.trna175-IleAAT;;;D$chr5.trna219-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna318-LeuTAG;;;D$chr8.trna179-ProAGG;;;D$chr9.trna202-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna267-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna322-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna307-ValGAC;;;D$chr18.trna266-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna209-CysGCA;;;D$chr21.trna171-AlaTGC;;;D$chr22.trna178-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna79-PheGAA;;;D$Zv8_NA2662.trna10-GluTTC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna157-LeuCAG F$chrE3;ArgCCG;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10063-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna205-IleAAT;;;D$chr3.trna176-PheGAA;;;D$chr5.trna22-ProAGG;;;;;;D$chr7.trna319-LeuAAG;;;D$chr8.trna180-GlnTTG;;;D$chr9.trna203-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna268-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna323-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna308-ValCAC;;;D$chr18.trna267-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna211-CysGCA;;;D$chr21.trna172-AlaTGC;;;D$chr22.trna179-IleTAT;;;;;;D$chr25.trna80-IleAAT;;;D$Zv8_NA2662.trna11-TyrGTA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna158-LeuCAG F$chrE3;ArgCCG;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10064-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna207-GlnCTG;;;D$chr3.trna178-GlnCTG;;;D$chr5.trna220-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna320-LeuTAG;;;D$chr8.trna182-ProTGG;;;D$chr9.trna204-IleTAT;;;;;;D$chr12.trna269-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna324-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna309-ValTAC;;;D$chr18.trna268-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna213-CysGCA;;;D$chr21.trna173-AlaTGC;;;D$chr22.trna180-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna81-PheGAA;;;D$Zv8_NA2662.trna12-ArgACG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna159-LeuCAG F$chrE3;ArgCCG;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10065-ArgACG;;;;;;D$chr2.trna208-IleAAT;;;D$chr3.trna179-IleAAT;;;D$chr5.trna222-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna321-LeuAAG;;;D$chr8.trna183-ProAGG;;;D$chr9.trna205-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna27-LysCTT;;;;;;;;;D$chr15.trna325-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna310-ValAAC;;;D$chr18.trna269-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna215-CysGCA;;;D$chr21.trna174-AlaTGC;;;D$chr22.trna181-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna82-IleAAT;;;D$Zv8_NA2662.trna2-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna16-ValAAC F$chrF1;ArgCCG;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10066-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna209-PheGAA;;;D$chr3.trna180-PheGAA;;;D$chr5.trna224-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna322-LeuTAG;;;D$chr8.trna184-GlnTTG;;;D$chr9.trna206-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna270-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna326-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna311-ValCAC;;;D$chr18.trna270-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna217-CysGCA;;;D$chr21.trna175-AlaCGC;;;D$chr22.trna182-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna83-PheGAA;;;D$Zv8_NA2662.trna3-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna160-LeuCAG F$chrF1;ArgCCG;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10067-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna210-GlnCTG;;;D$chr3.trna182-GlnCTG;;;D$chr5.trna226-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna323-LeuAAG;;;D$chr8.trna186-ProTGG;;;D$chr9.trna207-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna271-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna327-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna312-MetCAT;;;D$chr18.trna273-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna219-CysGCA;;;D$chr21.trna176-AlaTGC;;;D$chr22.trna183-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna84-IleAAT;;;D$Zv8_NA2662.trna4-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna161-LeuCAG F$chrX;ArgCCG;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10068-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna211-IleAAT;;;D$chr3.trna183-IleAAT;;;D$chr5.trna228-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna324-LeuTAG;;;D$chr8.trna187-ProAGG;;;D$chr9.trna208-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna272-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna328-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna313-AspATC;;;D$chr18.trna274-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna221-CysGCA;;;D$chr21.trna177-AlaTGC;;;D$chr22.trna184-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna85-PheGAA;;;D$Zv8_NA2662.trna5-GluCTC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna162-LeuCAG F$chrX;ArgCCG;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10069-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna212-PheGAA;;;D$chr3.trna184-PheGAA;;;D$chr5.trna23-ProAGG;;;;;;D$chr7.trna325-LeuAAG;;;D$chr8.trna188-GlnTTG;;;D$chr9.trna209-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna274-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna329-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna314-MetCAT;;;D$chr18.trna275-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna223-CysGCA;;;D$chr21.trna178-AlaTGC;;;D$chr22.trna185-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna86-IleAAT;;;D$Zv8_NA2662.trna6-GluCTC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna164-LeuCAG F$chrX;ArgCCG;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna1007-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna213-GlnCTG;;;D$chr3.trna186-GlnCTG;;;D$chr5.trna230-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna326-LeuTAG;;;D$chr8.trna190-ProTGG;;;D$chr9.trna210-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna275-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna330-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna317-ValTAC;;;D$chr18.trna279-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna225-CysGCA;;;D$chr21.trna179-AlaTGC;;;D$chr22.trna186-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna87-PheGAA;;;D$Zv8_NA2662.trna7-GluTTC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna165-LeuCAG F$chrA1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10070-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna214-IleAAT;;;D$chr3.trna187-IleAAT;;;D$chr5.trna232-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna327-LeuAAG;;;D$chr8.trna191-ProAGG;;;D$chr9.trna211-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna276-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna331-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna318-ValAAC;;;D$chr18.trna281-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna227-CysGCA;;;D$chr21.trna180-AlaTGC;;;D$chr22.trna187-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna88-IleAAT;;;D$Zv8_NA2662.trna8-TyrGTA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna166-LeuCAG F$chrA1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10071-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna215-PheGAA;;;D$chr3.trna188-PheGAA;;;D$chr5.trna234-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna329-LeuAAG;;;D$chr8.trna192-GlnTTG;;;D$chr9.trna212-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna277-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna332-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna321-ValCAC;;;D$chr18.trna282-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna229-CysGCA;;;D$chr21.trna181-AlaCGC;;;D$chr22.trna190-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna89-PheGAA;;;D$Zv8_NA2662.trna9-ArgACG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna167-LeuCAG F$chrA2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10072-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna216-GlnCTG;;;D$chr3.trna190-GlnCTG;;;D$chr5.trna236-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna330-LeuTAG;;;D$chr8.trna195-ProAGG;;;D$chr9.trna213-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna278-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna333-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna325-ValTAC;;;D$chr18.trna283-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna231-CysGCA;;;D$chr21.trna182-AlaTGC;;;D$chr22.trna191-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna90-IleAAT;;;D$Zv8_NA2737.trna1-HisGTG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna168-GlnCTG F$chrA2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10073-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna218-PheGAA;;;D$chr3.trna191-IleAAT;;;D$chr5.trna238-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna331-LeuAAG;;;D$chr8.trna196-GlnTTG;;;D$chr9.trna214-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna279-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna334-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna327-ValCAC;;;D$chr18.trna284-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna232-CysGCA;;;D$chr21.trna183-AlaCGC;;;D$chr22.trna194-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna91-PheGAA;;;D$Zv8_NA2737.trna2-LysTTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna169-IleAAT F$chrA2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10074-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna219-ThrAGT;;;D$chr3.trna192-PheGAA;;;D$chr5.trna24-ProCGG;;;;;;D$chr7.trna332-LeuTAG;;;D$chr8.trna198-ProTGG;;;D$chr9.trna215-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna28-AsnGTT;;;;;;;;;D$chr15.trna335-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna33-ProAGG;;;D$chr18.trna285-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna233-CysGCA;;;D$chr21.trna184-AlaTGC;;;D$chr22.trna195-LysCTT;;;;;;D$chr25.trna92-IleAAT;;;D$Zv8_NA2737.trna3-SerTGA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna17-ValCAC F$chrA2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10077-LysTTT;;;;;;D$chr2.trna220-ArgTCT;;;D$chr3.trna194-GlnCTG;;;D$chr5.trna240-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna333-LeuAAG;;;D$chr8.trna199-ProAGG;;;D$chr9.trna216-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna280-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna336-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna34-LysTTT;;;D$chr18.trna286-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna234-PheGAA;;;D$chr21.trna185-AlaTGC;;;D$chr22.trna197-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna93-PheGAA;;;D$Zv8_NA2779.trna1-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna170-AsnGTT F$chrA2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10078-SerAGA;;;;;;D$chr2.trna221-ThrTGT;;;D$chr3.trna195-IleAAT;;;D$chr5.trna242-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna335-SerGCT;;;D$chr8.trna200-GlnTTG;;;D$chr9.trna218-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna281-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna338-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna35-SerCGA;;;D$chr18.trna287-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna237-CysGCA;;;D$chr21.trna186-AlaTGC;;;D$chr22.trna198-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna94-IleAAT;;;D$Zv8_NA2779.trna2-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna171-LysCTT F$chrA3;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10079-HisGTG;;;;;;D$chr2.trna222-ThrAGT;;;D$chr3.trna196-PheGAA;;;D$chr5.trna244-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna44-ArgACG;;;D$chr8.trna202-ProTGG;;;D$chr9.trna219-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna282-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna34-LysCTT;;;;;;D$chr17.trna356-SerGCT;;;D$chr18.trna289-ThrTGT;;;;;;D$chr20.trna240-CysGCA;;;D$chr21.trna187-AlaCGC;;;D$chr22.trna214-LeuAAG;;;;;;D$chr25.trna95-PheGAA;;;D$Zv8_NA2809.trna1-GlyGCC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna172-IleGAT F$chrB1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna1008-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna223-LysTTT;;;D$chr3.trna198-GlnCTG;;;D$chr5.trna246-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna445-LysTTT;;;D$chr8.trna203-ProAGG;;;D$chr9.trna257-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna284-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna340-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna361-SerGCT;;;D$chr18.trna290-LysTTT;;;;;;D$chr20.trna244-LeuCAA;;;D$chr21.trna188-AlaTGC;;;D$chr22.trna215-LeuTAG;;;;;;D$chr25.trna96-IleAAT;;;D$Zv8_NA2809.trna10-GlyCCC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna173-LysCTT F$chrB1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10081-SerTGA;;;;;;D$chr2.trna224-ThrTGT;;;D$chr3.trna199-IleAAT;;;D$chr5.trna248-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna446-SerCGA;;;D$chr8.trna204-GlnTTG;;;D$chr9.trna258-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna285-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna342-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna366-SerGCT;;;D$chr18.trna291-LeuTAA;;;;;;D$chr20.trna246-PheAAA;;;D$chr21.trna189-AlaTGC;;;D$chr22.trna216-LeuAAG;;;;;;D$chr25.trna97-PheGAA;;;D$Zv8_NA2809.trna2-GlyGCC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna174-LysCTT F$chrB2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10082-HisGTG;;;;;;D$chr2.trna225-ThrAGT;;;D$chr3.trna200-PheGAA;;;D$chr5.trna25-ProAGG;;;;;;D$chr7.trna448-AsnGTT;;;D$chr8.trna206-ProTGG;;;D$chr9.trna259-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna286-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna344-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna371-SerGCT;;;D$chr18.trna292-PheGAA;;;;;;D$chr20.trna247-LeuCAA;;;D$chr21.trna190-AlaTGC;;;D$chr22.trna217-LeuTAG;;;;;;D$chr25.trna98-IleAAT;;;D$Zv8_NA2809.trna3-GlyGCC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna175-AsnGTT F$chrB2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10085-ValAAC;;;;;;D$chr2.trna226-ArgTCT;;;D$chr3.trna202-GlnCTG;;;D$chr5.trna250-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna449-LysCTT;;;D$chr8.trna207-ProAGG;;;D$chr9.trna260-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna287-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna345-HisATG;;;;;;D$chr17.trna376-SerGCT;;;D$chr18.trna293-SupCTA;;;;;;D$chr20.trna249-LeuCAA;;;D$chr21.trna191-AlaCGC;;;D$chr22.trna218-GluCTC;;;;;;D$chr25.trna99-PheGAA;;;D$Zv8_NA2809.trna4-ArgCCT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna176-LysCTT F$chrB3;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10086-ValCAC;;;;;;D$chr2.trna232-ArgGCG;;;D$chr3.trna203-IleAAT;;;D$chr5.trna252-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna45-ArgACG;;;D$chr8.trna208-GlnTTG;;;D$chr9.trna261-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna288-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna346-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna381-SerGCT;;;D$chr18.trna294-IleAAT;;;;;;D$chr20.trna250-LeuCAA;;;D$chr21.trna192-AlaCGC;;;D$chr22.trna221-ValAAC;;;;;;;;;D$Zv8_NA2809.trna7-GlyCCC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna177-LysCTT F$chrB3;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10088-SerGCT;;;;;;D$chr2.trna233-GlyGCC;;;D$chr3.trna204-PheGAA;;;D$chr5.trna254-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna450-AsnGTT;;;D$chr8.trna210-ProTGG;;;D$chr9.trna262-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna289-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna347-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna386-SerGCT;;;D$chr18.trna295-GlnCTG;;;;;;D$chr20.trna251-LeuCAA;;;D$chr21.trna193-AlaTGC;;;D$chr22.trna228-ArgTCT;;;;;;;;;D$Zv8_NA2809.trna9-GlyGCC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna178-AsnGTT F$chrB3;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna1009-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna236-GlyGCC;;;D$chr3.trna206-GlnCTG;;;D$chr5.trna256-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna453-LeuAAG;;;D$chr8.trna211-ProAGG;;;D$chr9.trna263-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna29-LysCTT;;;;;;;;;D$chr15.trna348-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna39-LeuTAA;;;D$chr18.trna298-LeuCAG;;;;;;D$chr20.trna253-LeuCAA;;;D$chr21.trna194-AlaTGC;;;D$chr22.trna229-ThrTGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3022.trna3-LeuTAA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna179-LysCTT F$chrB3;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10091-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna237-GlyGCC;;;D$chr3.trna207-IleAAT;;;D$chr5.trna258-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna454-LeuTAG;;;D$chr8.trna212-GlnTTG;;;D$chr9.trna264-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna290-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna349-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna391-SerGCT;;;D$chr18.trna322-AlaTGC;;;;;;D$chr20.trna255-LeuCAA;;;D$chr21.trna195-AlaCGC;;;D$chr22.trna230-ThrAGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3122.trna1-LeuTAA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna18-ValTAC F$chrB4;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10092-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna242-ArgGCG;;;D$chr3.trna208-PheGAA;;;D$chr5.trna260-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna455-LeuAAG;;;D$chr8.trna213-ProAGG;;;D$chr9.trna265-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna291-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna35-LysCTT;;;;;;D$chr17.trna396-SerGCT;;;D$chr18.trna387-GlnCTG;;;;;;D$chr20.trna256-LeuCAA;;;D$chr21.trna196-AlaTGC;;;D$chr22.trna231-ArgTCT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna1-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna182-LysCTT F$chrB4;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10093-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna244-GlyGCC;;;D$chr3.trna210-GlnCTG;;;D$chr5.trna264-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna456-LeuTAG;;;D$chr8.trna216-ProTGG;;;D$chr9.trna267-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna292-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna350-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna40-LeuTAA;;;D$chr18.trna85-LeuCAG;;;;;;D$chr20.trna257-LeuCAA;;;D$chr21.trna197-AlaTGC;;;D$chr22.trna232-ThrTGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna10-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna184-ArgCCT F$chrB4;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10094-ThrAGT;;;;;;D$chr2.trna246-GlyGCC;;;D$chr3.trna211-IleAAT;;;D$chr5.trna266-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna457-LeuAAG;;;D$chr8.trna217-ProAGG;;;D$chr9.trna268-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna294-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna351-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna401-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna258-LeuCAA;;;D$chr21.trna198-AlaTGC;;;D$chr22.trna233-ThrAGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna11-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna185-LysCTT F$chrB4;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10095-ThrAGT;;;;;;D$chr2.trna247-GlyGCC;;;D$chr3.trna212-PheGAA;;;D$chr5.trna268-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna458-LeuTAG;;;D$chr8.trna218-GlnTTG;;;D$chr9.trna269-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna295-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna352-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna406-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna260-LeuCAA;;;D$chr21.trna199-AlaCGC;;;D$chr22.trna234-ArgTCT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna12-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna186-AsnGTT F$chrC1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10096-ArgACG;;;;;;D$chr2.trna251-GlyGCC;;;D$chr3.trna214-GlnCTG;;;D$chr5.trna270-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna46-ArgTCG;;;D$chr8.trna220-ProTGG;;;D$chr9.trna270-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna296-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna353-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna41-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna261-LeuCAA;;;D$chr21.trna200-AlaTGC;;;D$chr22.trna235-ThrTGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna13-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna187-LysCTT F$chrC1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10097-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna253-GlyGCC;;;D$chr3.trna215-IleAAT;;;D$chr5.trna272-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna47-ArgTCG;;;D$chr8.trna221-ProAGG;;;D$chr9.trna295-LysTTT;;;;;;D$chr12.trna298-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna354-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna410-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna262-LeuCAA;;;D$chr21.trna201-AlaTGC;;;D$chr22.trna236-ThrAGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna14-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna19-ValAAC F$chrC1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10098-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna254-GlyGCC;;;D$chr3.trna216-PheGAA;;;D$chr5.trna274-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna48-ArgTCG;;;D$chr8.trna222-GlnTTG;;;D$chr9.trna296-SerTGA;;;;;;D$chr12.trna299-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna356-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna415-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna263-IleTAT;;;D$chr21.trna202-AlaTGC;;;D$chr22.trna237-ArgTCT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna16-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna20-AlaCGC F$chrC1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10099-SerACT;;;;;;D$chr2.trna255-GlyGCC;;;D$chr3.trna218-GlnCTG;;;D$chr5.trna276-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna51-ArgTCG;;;D$chr8.trna224-ProTGG;;;D$chr9.trna297-HisGTG;;;;;;D$chr12.trna30-AsnGTT;;;;;;;;;D$chr15.trna357-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna419-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna264-LeuCAA;;;D$chr21.trna203-AlaTGC;;;D$chr22.trna238-ThrTGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna17-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna22-ValAAC F$chrC1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna1010-GlyCCC;;;;;;D$chr2.trna257-GlyGCC;;;D$chr3.trna219-IleAAT;;;D$chr5.trna278-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna52-ArgTCG;;;D$chr8.trna225-ProAGG;;;D$chr9.trna298-LysTTT;;;;;;D$chr12.trna300-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna358-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna42-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna266-LeuCAA;;;D$chr21.trna204-AlaTGC;;;D$chr22.trna239-ThrAGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna18-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna23-ValCAC F$chrC1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10100-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna258-GlyGCC;;;D$chr3.trna220-PheGAA;;;D$chr5.trna281-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna523-TrpCCA;;;D$chr8.trna226-GlnTTG;;;D$chr9.trna299-SerTGA;;;;;;D$chr12.trna301-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna359-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna424-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna267-LeuCAA;;;D$chr21.trna205-AlaCGC;;;D$chr22.trna240-ArgTCT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna19-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna24-ValTAC F$chrC2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10101-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna261-GlyGCC;;;D$chr3.trna222-GlnCTG;;;D$chr5.trna282-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna524-TrpCCA;;;D$chr8.trna228-ProTGG;;;D$chr9.trna30-ProTGG;;;;;;D$chr12.trna302-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna36-AsnGTT;;;;;;D$chr17.trna429-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna268-LeuCAA;;;D$chr21.trna206-AlaTGC;;;D$chr22.trna241-ThrTGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna2-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna25-ValAAC F$chrC2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10102-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna262-GlyGCC;;;D$chr3.trna223-IleAAT;;;D$chr5.trna284-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna526-TrpCCA;;;D$chr8.trna229-ProAGG;;;D$chr9.trna300-HisGTG;;;;;;D$chr12.trna303-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna360-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna43-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna269-LeuCAA;;;D$chr21.trna207-AlaTGC;;;D$chr22.trna242-ThrAGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna20-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna26-AlaCGC F$chrC2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10103-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna265-ArgTCT;;;D$chr3.trna224-PheGAA;;;D$chr5.trna286-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna527-TrpCCA;;;D$chr8.trna230-GlnTTG;;;D$chr9.trna301-LysTTT;;;;;;D$chr12.trna304-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna361-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna434-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna270-LeuCAA;;;D$chr21.trna208-AlaTGC;;;D$chr22.trna243-ArgTCT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna21-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna28-ValAAC F$chrC2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10104-SerACT;;;;;;D$chr2.trna283-MetCAT;;;D$chr3.trna226-GlnCTG;;;D$chr5.trna288-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna528-TrpCCA;;;D$chr8.trna231-ProAGG;;;D$chr9.trna302-SerTGA;;;;;;D$chr12.trna305-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna362-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna439-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna271-LeuCAA;;;D$chr21.trna209-AlaTGC;;;D$chr22.trna244-ThrTGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna22-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna29-ValCAC F$chrC2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10106-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna291-TrpCCA;;;D$chr3.trna227-IleAAT;;;D$chr5.trna290-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna529-TrpCCA;;;D$chr8.trna232-GlnTTG;;;D$chr9.trna303-HisGTG;;;;;;D$chr12.trna306-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna364-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna445-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna272-LeuCAA;;;D$chr21.trna210-AlaCGC;;;D$chr22.trna245-ThrAGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna23-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna30-MetCAT F$chrD1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10107-GlyCCC;;;;;;D$chr2.trna307-LeuTAA;;;D$chr3.trna228-PheGAA;;;D$chr5.trna292-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna53-ArgTCG;;;D$chr8.trna234-ProTGG;;;D$chr9.trna304-LysTTT;;;;;;D$chr12.trna308-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna365-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna45-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna275-LeuCAA;;;D$chr21.trna211-AlaTGC;;;D$chr22.trna246-ArgTCT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna24-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna31-MetCAT F$chrD1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10108-GlyCCC;;;;;;D$chr2.trna308-LeuTAA;;;D$chr3.trna230-GlnCTG;;;D$chr5.trna293-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna530-TrpCCA;;;D$chr8.trna235-ProAGG;;;D$chr9.trna305-SerTGA;;;;;;D$chr12.trna309-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna375-SeC(e)TCA;;;;;;D$chr17.trna450-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna276-LeuCAA;;;D$chr21.trna212-AlaTGC;;;D$chr22.trna247-ThrTGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna25-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna32-MetCAT F$chrD2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10109-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna309-LeuTAA;;;D$chr3.trna231-IleAAT;;;D$chr5.trna294-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna531-TrpCCA;;;D$chr8.trna236-GlnTTG;;;D$chr9.trna306-LysTTT;;;;;;D$chr12.trna31-AsnGTT;;;;;;;;;D$chr15.trna378-GluTTC;;;;;;D$chr17.trna455-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna278-LeuCAA;;;D$chr21.trna213-AlaCGC;;;D$chr22.trna248-ThrAGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna26-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna33-MetCAT F$chrD4;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna1011-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna310-LeuTAA;;;D$chr3.trna232-PheGAA;;;D$chr5.trna296-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna532-TrpCCA;;;D$chr8.trna238-ProTGG;;;D$chr9.trna307-SerAGA;;;;;;D$chr12.trna310-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna379-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna459-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna279-IleTAT;;;D$chr21.trna214-AlaTGC;;;D$chr22.trna249-ArgTCT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna27-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna34-MetCAT F$chrE1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10110-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna312-LeuTAA;;;D$chr3.trna234-GlnCTG;;;D$chr5.trna297-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna533-TrpCCA;;;D$chr8.trna239-ProAGG;;;D$chr9.trna308-HisGTG;;;;;;D$chr12.trna312-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna38-LysCTT;;;;;;D$chr17.trna46-SupTTA;;;;;;;;;D$chr20.trna280-LeuCAA;;;D$chr21.trna215-AlaTGC;;;D$chr22.trna250-ThrTGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna3-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna35-MetCAT F$chrE1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10117-GlyCCC;;;;;;D$chr2.trna313-LeuTAA;;;D$chr3.trna235-IleAAT;;;D$chr5.trna299-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna534-TrpCCA;;;D$chr8.trna240-GlnTTG;;;D$chr9.trna309-LysTTT;;;;;;D$chr12.trna313-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna380-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna464-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna281-LeuCAA;;;D$chr21.trna216-AlaTGC;;;D$chr22.trna251-ThrAGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna30-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna36-MetCAT F$chrE1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10118-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna315-ThrAGT;;;D$chr3.trna236-PheGAA;;;D$chr5.trna301-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna535-TrpCCA;;;D$chr8.trna242-ProTGG;;;D$chr9.trna310-SerTGA;;;;;;D$chr12.trna314-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna381-GluTTC;;;;;;D$chr17.trna471-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna282-LeuCAA;;;D$chr21.trna217-AlaCGC;;;D$chr22.trna252-ArgTCT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna31-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna37-MetCAT F$chrE1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna1012-GlyCCC;;;;;;D$chr2.trna316-ArgTCT;;;D$chr3.trna238-GlnCTG;;;D$chr5.trna303-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna536-TrpCCA;;;D$chr8.trna243-ProAGG;;;D$chr9.trna311-LysTTT;;;;;;D$chr12.trna315-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna382-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna5-GlyTCC;;;;;;;;;D$chr20.trna283-LeuCAA;;;D$chr21.trna218-AlaTGC;;;D$chr22.trna254-ValAAC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna32-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna38-MetCAT F$chrE1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10120-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna317-ThrAGT;;;D$chr3.trna239-IleAAT;;;D$chr5.trna304-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna537-TrpCCA;;;D$chr8.trna244-GlnTTG;;;D$chr9.trna312-SerAGA;;;;;;D$chr12.trna316-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna383-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna506-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna284-LeuCAA;;;D$chr21.trna219-AlaTGC;;;D$chr22.trna255-ValCAC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna4-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna39-ThrTGT F$chrE2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10124-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna318-ThrAGT;;;D$chr3.trna240-PheGAA;;;D$chr5.trna306-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna538-TrpCCA;;;D$chr8.trna246-ProTGG;;;D$chr9.trna313-HisGTG;;;;;;D$chr12.trna318-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna384-GluTTC;;;;;;D$chr17.trna509-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna285-LeuCAA;;;D$chr21.trna220-AlaTGC;;;D$chr22.trna257-ValCAC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna5-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna4-HisGTG F$chrE2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10125-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna319-ThrAGT;;;D$chr3.trna242-GlnCTG;;;D$chr5.trna308-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna54-ArgTCG;;;D$chr8.trna247-ProAGG;;;D$chr9.trna314-LysTTT;;;;;;D$chr12.trna319-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna385-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna510-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna288-LeuCAA;;;D$chr21.trna221-AlaTGC;;;D$chr22.trna258-ValTAC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna6-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna40-ThrTGT F$chrE3;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10129-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna320-LeuTAG;;;D$chr3.trna243-IleAAT;;;D$chr5.trna312-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna540-TrpCCA;;;D$chr8.trna248-GlnTTG;;;D$chr9.trna315-SerAGA;;;;;;D$chr12.trna320-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna386-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna511-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna289-LeuCAA;;;D$chr21.trna222-AlaTGC;;;D$chr22.trna259-ValAAC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna7-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna41-ThrCGT F$chrE3;ArgCCT;;B$chr1;GlyGCC;;D$chr4.trna1013-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna321-ThrAGT;;;D$chr3.trna244-PheGAA;;;D$chr5.trna313-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna542-TrpCCA;;;D$chr8.trna250-ProTGG;;;D$chr9.trna377-SerCGA;;;;;;D$chr12.trna321-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna387-GluTTC;;;;;;D$chr17.trna513-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna290-LeuCAA;;;D$chr21.trna223-AlaTGC;;;D$chr22.trna260-ValCAC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna8-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna42-ThrAGT F$chrE3;ArgCCT;;B$chr1;GlyGCC;;D$chr4.trna10130-HisGTG;;;;;;D$chr2.trna322-ThrAGT;;;D$chr3.trna246-GlnCTG;;;D$chr5.trna315-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna543-TrpCCA;;;D$chr8.trna251-ProAGG;;;D$chr9.trna379-LeuCAA;;;;;;D$chr12.trna322-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna388-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna514-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna291-LeuCAA;;;D$chr21.trna224-AlaTGC;;;D$chr22.trna261-ValTAC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna9-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna43-ArgTCT F$chrE3;ArgCCT;;B$chr1;GlyGCC;;D$chr4.trna10132-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna323-ThrAGT;;;D$chr3.trna247-IleAAT;;;D$chr5.trna316-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna544-TrpCCA;;;D$chr8.trna252-GlnTTG;;;D$chr9.trna42-LysTTT;;;;;;D$chr12.trna323-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna389-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna515-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna292-IleTAT;;;D$chr21.trna225-AlaCGC;;;D$chr22.trna288-GlyTCC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3307.trna1-AlaAGC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna44-ThrTGT F$chrF1;ArgCCT;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna10133-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna324-ArgTCT;;;D$chr3.trna248-PheGAA;;;D$chr5.trna317-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna545-TrpCCA;;;D$chr8.trna254-ProTGG;;;D$chr9.trna441-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna324-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna39-AsnGTT;;;;;;D$chr17.trna516-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna293-LeuCAA;;;D$chr21.trna226-AlaTGC;;;D$chr22.trna289-GlyTCC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3358.trna1-GlyTCC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna45-MetCAT F$chrF1;ArgCCT;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna10134-ArgACG;;;;;;D$chr2.trna325-ThrAGT;;;D$chr3.trna25-CysGCA;;;D$chr5.trna319-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna546-TrpCCA;;;D$chr8.trna255-ProAGG;;;D$chr9.trna46-ProTGG;;;;;;D$chr12.trna325-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna390-GluTTC;;;;;;D$chr17.trna517-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna294-LeuCAA;;;D$chr21.trna227-AlaTGC;;;D$chr22.trna290-GlyTCC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3556.trna1-GlyGCC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna47-LeuTAG F$chrF1;ArgCCT;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna10135-AlaTGC;;;;;;D$chr2.trna326-ThrAGT;;;D$chr3.trna250-GlnCTG;;;D$chr5.trna320-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna547-TrpCCA;;;D$chr8.trna256-GlnTTG;;;D$chr9.trna47-GlnCTG;;;;;;D$chr12.trna326-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna391-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna545-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna295-LeuCAA;;;D$chr21.trna228-AlaTGC;;;D$chr22.trna293-GluCTC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3563.trna1-LysTTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna48-LeuAAG F$chrF1;ArgCCT;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna10136-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna327-ThrAGT;;;D$chr3.trna251-IleAAT;;;D$chr5.trna322-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna548-TrpCCA;;;D$chr8.trna258-ProTGG;;;D$chr9.trna48-GlnTTG;;;;;;D$chr12.trna327-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna392-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna547-ArgCCG;;;;;;;;;D$chr20.trna296-LeuCAA;;;D$chr21.trna229-AlaTGC;;;D$chr22.trna297-LysCTT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3563.trna10-ProTGG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna49-LeuTAG F$chrX;ArgCCT;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna10137-ArgACG;;;;;;D$chr2.trna328-ArgTCT;;;D$chr3.trna252-PheGAA;;;D$chr5.trna324-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna549-TrpCCA;;;D$chr8.trna259-ProAGG;;;D$chr9.trna49-ProAGG;;;;;;D$chr12.trna328-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna393-GluTTC;;;;;;D$chr17.trna548-SeCTCA;;;;;;;;;D$chr20.trna297-LeuCAA;;;D$chr21.trna230-AlaCGC;;;D$chr22.trna298-LysCTT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3563.trna2-SerAGA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna5-LysTTT F$chrX;ArgCCT;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna10138-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna329-ThrAGT;;;D$chr3.trna254-GlnCTG;;;D$chr5.trna326-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna55-ArgTCG;;;D$chr8.trna260-GlnTTG;;;D$chr9.trna50-GlnTTG;;;;;;D$chr12.trna33-AsnGTT;;;;;;;;;D$chr15.trna394-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna549-ArgTCG;;;;;;;;;D$chr20.trna298-LeuCAA;;;D$chr21.trna231-AlaTGC;;;D$chr22.trna299-AsnGTT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3563.trna4-SupTTA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna50-LeuAAG F$chrX;ArgCCT;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna10139-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna330-ThrAGT;;;D$chr3.trna255-IleAAT;;;D$chr5.trna328-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna550-TrpCCA;;;D$chr8.trna262-ProTGG;;;D$chr9.trna78-LeuCAA;;;;;;D$chr12.trna330-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna395-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna552-AlaAGC;;;;;;;;;D$chr20.trna299-LeuCAA;;;D$chr21.trna232-AlaCGC;;;D$chr22.trna301-AsnGTT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3688.trna1-IleAAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna51-LeuTAG F$chrA3;ArgGCG;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna1014-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna331-ThrAGT;;;D$chr3.trna256-PheGAA;;;D$chr5.trna329-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna551-SerACT;;;D$chr8.trna263-ProAGG;;;;;;;;;D$chr12.trna332-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna396-GluTTC;;;;;;D$chr17.trna553-ValCAC;;;;;;;;;D$chr20.trna300-LeuCAA;;;D$chr21.trna233-AlaTGC;;;D$chr22.trna302-LysCTT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3688.trna2-PheGAA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna52-LeuAAG F$chrB1;ArgGCG;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna10140-ArgACG;;;;;;D$chr2.trna332-ArgTCT;;;D$chr3.trna258-GlnCTG;;;D$chr5.trna330-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna552-TrpCCA;;;D$chr8.trna264-GlnTTG;;;;;;;;;D$chr12.trna333-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna397-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna555-ValAAC;;;;;;;;;D$chr20.trna302-LeuCAA;;;D$chr21.trna234-AlaTGC;;;D$chr22.trna305-GlyTCC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3745.trna1-TrpCCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna54-SerCGA F$chrB3;ArgGCG;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna10141-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna333-ThrAGT;;;D$chr3.trna259-IleAAT;;;D$chr5.trna338-GluTTC;;;;;;D$chr7.trna553-TrpCCA;;;D$chr8.trna266-ProTGG;;;;;;;;;D$chr12.trna334-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna398-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna556-ValCAC;;;;;;;;;D$chr20.trna303-LeuCAA;;;D$chr21.trna235-AlaTGC;;;D$chr22.trna306-ThrTGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3745.trna2-TrpCCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna55-ProTGG F$chrD1;ArgGCG;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna10142-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna334-ArgTCT;;;D$chr3.trna26-CysGCA;;;D$chr5.trna360-SerTGA;;;;;;D$chr7.trna554-TrpCCA;;;D$chr8.trna267-GlnTTG;;;;;;;;;D$chr12.trna335-A
Les introns des 121 eucaryotes
[modifier | modifier le wikicode]Champignons détail des introns
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Champignons détail des introns
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;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg;&emsp ;;total;&emsp ;;DNA;Génome ;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;2;;46;Encephalitozoon cuniculi GB-M1 ;0;1;1;1;1;1;1;0;2;0;1;3;0;0;1;1;1;0;1;1;0;0;1;1;2;0;0;0;2;0;1;1;0;1;0;0;0;2;1;1;0;1;1;0;0;2;1;0;0;1;2;0;1;0;2;1;0;1;0;1;0;2;0;1;;47;;53;Exophiala dermatitidis NIH/UT8656 ;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;7;;80;Ogataea parapolymorpha DL-1 ;0;0;3;1;1;0;0;0;0;0;1;2;0;0;1;1;0;0;2;1;1;0;3;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;3;0;0;0;1;3;1;0;0;0;3;0;0;1;1;0;0;0;1;2;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;;35;;82;Candida orthopsilosis Co 90-125 ;0;4;1;0;4;0;1;2;4;0;1;4;4;0;1;1;2;0;1;2;3;0;1;1;1;0;1;1;3;0;1;1;0;2;0;0;0;3;3;2;0;0;1;5;0;3;2;4;0;2;1;2;4;0;2;0;0;0;1;1;0;6;1;1;;91;;96;Sporisorium reilianum SRZ2 ;0;3;1;0;4;0;1;2;4;0;1;4;4;0;1;1;3;0;1;3;4;0;1;1;0;0;1;1;5;0;1;1;0;3;0;0;0;2;2;3;0;0;1;5;0;5;2;4;0;2;2;2;4;0;3;0;0;2;1;1;0;6;2;1;;101;;111;Ustilago maydis 521 ;0;5;0;3;0;0;1;1;0;0;1;2;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;3;2;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;;29;;123;Komagataella pastoris CBS 7435 ;0;5;5;6;2;0;0;0;6;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;1;1;0;4;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;4;0;0;0;3;5;0;0;3;1;2;0;0;6;0;0;2;0;2;2;0;0;1;0;2;0;1;0;0;0;0;;67;;125;Candida albicans WO-1 ;0;5;1;3;6;0;0;1;6;0;1;6;7;0;0;2;6;0;1;1;6;0;1;1;5;0;1;1;8;0;1;2;0;4;0;0;0;2;2;0;0;4;1;7;0;2;3;10;0;3;0;3;3;0;5;1;0;2;1;3;0;5;1;2;;136;;143;Cryptococcus neoformans var. grubii H99 ;0;5;7;1;5;0;1;4;6;0;1;2;0;0;1;3;0;0;1;0;4;0;2;3;4;0;1;2;7;0;2;3;0;4;0;0;0;3;2;4;0;3;1;6;0;6;0;7;0;0;0;0;6;0;1;1;0;3;0;2;0;0;1;2;;117;;154;Thielavia terrestris NRRL 8126 ;0;4;0;2;5;0;3;4;7;0;1;3;5;0;1;2;2;0;1;2;1;0;2;1;3;0;3;2;7;0;2;2;0;4;0;0;0;4;2;3;0;3;0;9;0;3;2;8;0;0;0;3;5;0;2;2;0;3;0;2;1;8;0;1;;130;;156;Valsa mali 03-8 ;0;6;0;5;1;0;3;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;;40;;158;Kazachstania naganishii CBS 8797 ;0;0;0;7;0;0;2;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;1;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;4;3;0;0;0;0;2;0;0;0;0;2;0;;39;;162;Kluyveromyces lactis NRRL Y-1140 ;0;0;2;4;0;0;1;1;0;0;1;3;9;0;0;0;0;0;2;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;3;0;1;0;0;0;0;;44;;168;Schizosaccharomyces pombe 972h- ;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;1;3;0;0;1;0;0;0;0;2;1;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;3;9;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;;42;;170;Scheffersomyces stipitis CBS 6054 ;0;5;1;2;6;0;2;3;4;0;1;3;0;0;0;1;0;0;1;2;6;0;2;1;1;0;2;2;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;2;5;0;6;2;0;0;8;2;1;0;3;0;0;0;0;2;2;0;4;0;2;0;0;2;1;;93;;181;Aspergillus nidulans FGSC A4 ;0;7;1;2;7;0;1;4;8;0;1;4;6;0;1;2;4;0;2;3;5;0;2;2;4;0;2;2;9;0;3;2;0;5;0;0;0;0;2;6;0;6;0;6;0;0;1;9;0;3;0;0;6;0;2;0;0;3;1;3;0;14;3;3;;157;;190;Magnaporthe oryzae 70-15 ;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;2;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;4;5;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;;25;;191;Cyberlindnera jadinii NBRC 0988 NBRC0988 ;0;6;0;8;0;0;4;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;;45;;192;Torulaspora delbrueckii CBS 1146 ;0;0;2;0;6;1;0;3;0;0;2;10;8;0;1;3;3;0;1;2;0;0;0;1;6;0;2;1;0;0;0;2;0;5;1;0;0;11;3;0;0;1;1;0;0;8;1;0;0;3;1;0;0;0;1;0;0;4;0;1;0;0;4;1;;100;;192;Penicillium chrysogenum P2niaD18 ;0;5;1;2;7;0;1;4;8;0;1;4;0;0;1;3;0;0;2;0;6;0;2;3;2;0;2;2;7;0;2;3;0;6;0;0;0;4;2;3;0;0;0;9;0;8;0;8;0;0;0;2;5;0;0;2;0;5;1;2;0;0;0;2;;127;;192;Myceliophthora thermophila ATCC 42464 ;0;6;0;7;0;0;4;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;4;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;5;4;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;;52;;205;Saccharomycetaceae sp. Ashbya aceri ;0;9;0;2;0;0;2;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;;42;;206;Tetrapisispora phaffii CBS 4417 ;0;6;0;8;0;0;4;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;;45;;207;Candida glabrata CBS 138 ;0;7;2;5;6;0;1;1;8;0;1;4;8;0;2;2;0;0;4;2;4;0;8;1;3;0;2;0;0;0;5;2;0;6;0;0;0;4;0;0;0;6;1;8;0;9;6;9;0;5;0;1;4;0;4;0;0;5;5;0;0;8;0;2;;161;;212;Botrytis cinerea B05.10 ;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;2;4;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;7;10;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;1;0;3;0;0;0;0;0;0;;54;;214;Debaryomyces hansenii CBS767 ;0;7;1;1;8;0;1;0;0;0;0;4;8;0;1;2;0;1;3;1;8;0;3;0;0;0;3;3;11;0;2;1;0;6;0;0;0;6;2;0;0;6;2;0;0;5;2;0;0;1;1;3;4;0;0;0;0;2;2;1;0;0;2;1;;115;;225;Verticillium dahliae VdLs.17 ;0;7;0;8;0;0;3;3;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;5;4;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;;57;;229;Lachancea thermotolerans CBS 6340 ;0;7;0;0;0;0;1;4;0;0;2;4;0;1;1;3;0;0;1;3;9;0;3;0;0;0;2;2;0;0;0;1;0;13;0;0;0;7;4;0;0;0;3;11;0;13;3;0;1;4;0;0;0;0;0;1;0;6;2;2;0;0;0;0;;114;;242;Aspergillus oryzae RIB40 ;0;8;0;11;0;0;3;0;0;0;1;0;0;0;0;0;11;0;0;1;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;1;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;5;5;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;;72;;258;Lachancea kluyveri NRRL Y-12651 ;0;9;0;2;0;0;2;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;;53;;266;Kazachstania africana CBS 2517 ;0;10;0;9;0;0;3;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;;63;;270;Naumovozyma castellii CBS 4309 ;0;9;1;3;6;0;2;5;11;0;3;5;0;0;1;1;0;0;2;2;10;0;3;2;0;0;0;0;12;0;3;3;0;6;0;0;0;7;5;0;0;9;2;12;0;0;4;13;0;0;1;4;0;0;9;0;0;8;2;1;0;15;4;1;;187;;270;Fusarium graminearum CS3005 ;0;8;0;10;0;0;5;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;3;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;;54;;272;Zygosaccharomyces rouxii CBS 732 ;2;12;1;4;6;0;2;2;0;0;2;6;0;0;2;3;3;0;2;3;4;0;4;2;5;0;2;0;2;0;8;1;0;6;0;0;0;7;4;6;1;12;6;11;1;7;4;10;0;1;0;3;11;0;5;2;0;0;0;6;0;10;3;7;;201;;273;Flammulina velutipes KACC42780 ;0;10;0;10;0;0;3;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;;61;;275;Saccharomyces cerevisiae (S288c Apr 2011) ;0;10;2;4;12;0;2;5;11;0;1;5;0;0;1;1;0;0;2;3;10;0;0;2;4;0;0;0;14;0;3;3;0;8;0;0;0;6;4;0;1;8;2;15;1;0;5;16;0;0;0;5;0;0;7;0;0;7;1;0;0;14;2;0;;197;;285;Fusarium verticillioides 7600 ;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;4;6;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;6;10;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;2;0;6;0;0;0;0;0;0;;68;;288;Millerozyma farinosa CBS 7064 ;0;10;1;3;13;0;2;5;13;0;3;6;0;0;1;1;0;0;2;2;10;0;3;2;0;0;0;0;13;0;3;2;0;8;0;0;0;7;5;0;0;9;2;16;0;0;4;19;0;0;1;4;0;0;9;0;0;8;2;1;0;14;4;1;;209;;305;Fusarium graminearum PH-1 NRRL 31084 ;0;12;0;9;0;0;2;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;;71;;328;Tetrapisispora blattae CBS 6284 ;0;12;1;5;16;0;2;6;17;1;1;7;0;0;2;1;0;0;2;4;11;0;1;4;2;0;3;3;19;0;3;5;0;10;0;1;0;9;3;11;0;1;2;5;0;18;1;24;0;0;0;0;0;0;1;0;0;6;1;5;0;0;0;6;;232;;396;Neurospora crassa OR74A ;0;17;0;3;21;0;2;11;26;0;1;0;0;0;0;3;0;0;2;4;21;0;0;2;0;0;3;1;0;0;0;0;0;14;0;0;0;4;3;14;0;16;4;34;0;28;0;27;0;0;0;13;0;0;25;0;0;6;0;0;0;0;11;0;;316;;510;Yarrowia lipolytica CLIB122 &emsp ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; total;2;261;35;151;143;2;68;71;141;1;59;104;59;1;25;37;35;1;43;66;125;0;168;31;42;0;30;25;119;0;43;36;0;250;1;1;0;92;59;65;2;94;131;202;2;125;50;170;1;30;9;124;91;0;80;17;0;144;20;36;1;102;42;33;;;;; ;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg;;;;; zéros;40;7;23;10;21;40;10;22;26;41;1;18;33;41;21;22;33;41;18;5;22;42;9;24;29;42;27;27;28;42;26;24;42;0;41;41;42;23;22;27;40;26;6;21;40;27;24;26;41;30;35;12;20;42;26;30;42;4;30;24;41;31;28;26;;;;; 42−zér;2;35;19;32;21;2;32;20;16;1;41;24;9;1;21;20;9;1;24;37;20;0;33;18;13;0;15;15;14;0;16;18;0;42;1;1;0;19;20;15;2;16;36;21;2;15;18;16;1;12;7;30;22;0;16;12;0;38;12;18;1;11;14;16;;;;;
Champignons détail des tRNAs
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;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg;DNA;KEGG;génome;;;;;moy ;0;1;1;1;1;0;1;1;1;0;1;2;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;0;1;0;0;0;1;1;1;0;2;1;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;0;1;0;0;1;1;1;0;1;1;1;46;ecu;Encephalitozoon cuniculi GB-M1;;;;;1.02 ;0;1;1;1;1;1;1;1;2;0;1;1;2;0;1;1;1;0;1;1;0;0;1;1;2;0;1;1;2;0;1;1;0;1;0;0;0;2;1;1;0;1;1;0;0;2;1;2;0;1;0;0;2;0;2;1;0;1;0;1;0;2;1;2;53;ede*;Exophiala dermatitidis NIH/UT8656;;;;;1.16 ;0;3;1;3;1;0;1;1;4;0;1;4;3;0;0;1;2;0;1;1;0;0;3;0;3;0;1;1;3;0;2;0;0;2;0;0;0;2;2;1;0;2;2;3;0;3;2;3;0;1;0;2;2;0;0;1;0;2;3;1;0;4;2;0;80;opa*;Ogataea parapolymorpha DL-1;;;;;1.78 ;0;2;3;1;1;0;0;1;4;0;1;4;4;0;1;1;2;0;2;1;1;0;3;0;4;0;2;1;3;0;2;0;0;3;0;0;0;1;3;1;0;3;4;3;0;5;2;1;0;1;0;1;2;0;0;1;0;1;2;1;0;2;1;0;82;cot;Candida orthopsilosis Co 90-125;;;;;1.82 ;0;4;1;0;4;0;1;2;4;0;1;4;4;0;1;0;2;0;1;2;3;0;1;1;4;0;1;1;3;0;1;1;0;2;0;0;0;3;3;2;0;3;1;5;0;3;2;4;0;2;1;2;4;0;2;0;0;0;1;1;0;6;1;1;96;sre*;Sporisorium reilianum SRZ2;;;;;2.11 ;0;3;1;0;4;0;2;2;4;0;1;4;4;0;1;1;3;0;1;3;4;1;1;1;4;0;1;1;5;0;1;1;0;3;0;0;0;2;2;3;0;3;1;5;0;5;2;5;0;2;2;2;4;0;3;0;0;2;1;1;0;6;2;1;111;uma;Ustilago maydis 521;;;;;2.40 ;0;5;1;3;2;0;1;2;5;0;1;4;5;0;1;1;4;0;2;1;2;0;4;1;5;0;1;1;5;0;2;0;0;4;0;0;0;3;3;2;0;4;3;5;0;6;5;4;0;2;0;3;2;0;1;1;0;2;4;1;0;5;3;1;123;kpa*;Komagataella pastoris CBS 7435;;;;;2.73 ;0;5;5;6;2;0;0;1;6;0;1;4;6;0;1;1;4;0;3;1;1;0;4;0;4;0;2;1;6;0;2;0;0;4;0;0;0;3;5;1;0;3;5;2;0;6;6;1;0;2;0;2;2;0;0;1;0;2;5;1;0;5;2;1;125;cal;Candida albicans WO-1;;;;;2.78 ;0;5;1;3;6;0;0;1;6;0;1;7;7;0;0;2;6;0;1;1;6;0;1;0;5;0;1;1;8;0;1;2;0;4;0;0;0;4;2;3;0;4;1;7;0;0;3;10;0;3;0;3;3;0;5;1;0;2;1;3;0;9;3;0;143;cneg*;Cryptococcus neoformans var. grubii H99;;;;;3.18 ;0;5;5;1;5;0;1;4;6;0;1;5;6;0;1;3;3;0;1;3;4;0;2;3;4;0;1;2;7;0;2;3;0;4;0;0;0;3;2;4;0;3;2;6;0;6;2;7;0;3;0;4;6;0;1;3;0;3;1;2;0;10;2;2;154;ttt;Thielavia terrestris NRRL 8126;;;;;3.42 ;0;4;0;2;5;0;1;4;7;0;1;8;7;0;1;2;5;0;1;2;0;0;2;1;4;0;3;2;7;0;2;2;0;4;0;0;0;5;2;4;0;5;0;9;0;6;3;9;0;3;0;3;6;0;2;2;0;3;1;2;0;9;3;2;156;vma*;Valsa mali 03-8;;;;;3.47 ;0;6;3;5;1;0;3;0;7;0;2;4;7;0;1;2;7;0;1;1;1;0;6;0;7;0;2;1;7;0;1;1;0;5;0;0;0;4;4;2;0;6;4;7;0;8;5;3;0;4;0;4;3;0;0;1;0;3;6;1;0;9;1;2;158;kna*;Kazachstania naganishii CBS 8797;;;;;3.51 ;0;5;3;7;0;1;2;0;7;0;1;6;7;0;1;2;6;0;2;1;1;0;7;0;6;0;2;1;7;0;3;0;0;5;0;0;0;4;6;1;0;6;4;9;0;8;8;2;0;3;0;4;3;0;0;1;0;2;7;1;0;7;2;1;162;kla;Kluyveromyces lactis NRRL Y-1140;;;;;3.58 ;0;5;2;4;5;0;1;1;8;0;1;7;9;0;2;1;7;0;2;1;6;0;2;1;7;0;2;1;6;0;2;1;0;4;0;0;0;4;4;2;0;6;3;9;0;8;4;6;0;3;0;3;8;0;1;1;0;3;2;1;0;8;3;1;168;spo;Schizosaccharomyces pombe 972h-;;;;;3.73 ;0;6;3;8;3;0;0;1;7;0;1;6;7;0;2;1;6;0;2;2;1;0;6;0;7;0;2;1;7;0;3;0;0;5;0;0;0;4;5;2;0;7;3;9;0;8;8;2;0;3;0;4;3;0;0;1;0;2;7;1;0;10;3;1;170;pic;Scheffersomyces stipitis CBS 6054;;;;;3.78 ;0;5;1;2;6;0;2;3;7;0;1;7;8;0;1;2;5;0;1;2;6;0;2;2;6;0;2;2;8;0;2;3;0;6;0;0;0;5;2;5;0;6;2;8;0;8;3;8;0;3;0;3;9;0;2;2;0;4;2;2;0;11;3;1;181;ani;Aspergillus nidulans FGSC A4;;;;;4.02 ;0;7;1;2;7;0;1;4;8;0;1;8;6;0;1;2;4;0;2;3;5;0;2;2;6;0;2;2;9;0;3;2;0;5;0;0;0;4;2;6;0;6;2;9;0;10;3;9;0;3;0;4;6;0;2;2;0;3;1;3;0;14;3;3;190;mgr;Magnaporthe oryzae 70-15;;;;;4.22 ;0;8;1;7;4;0;3;1;6;1;1;7;9;0;2;3;7;0;3;1;0;0;7;0;6;0;3;1;6;0;3;0;0;5;0;0;0;6;6;2;0;7;5;8;0;8;4;9;0;3;1;4;6;0;0;1;0;3;7;0;0;11;4;1;191;cjd*;Cyberlindnera jadinii NBRC 0988 NBRC0988;;;;;4.20 ;0;6;3;8;0;1;4;0;8;0;1;7;12;0;1;2;7;0;2;1;1;0;6;0;9;0;2;1;8;0;4;0;0;6;0;0;0;4;6;2;0;7;5;10;0;9;8;4;0;3;0;4;4;0;0;1;0;3;7;1;0;11;2;1;192;tdl;Torulaspora delbrueckii CBS 1146;;;;;4.24 ;0;5;0;0;6;1;0;3;10;0;2;10;9;0;1;3;7;0;1;2;0;0;0;1;12;0;3;2;8;0;2;2;0;5;0;0;0;11;3;5;0;6;1;9;0;9;3;10;0;3;1;0;10;0;2;2;0;4;0;2;0;11;4;1;192;pch*;Penicillium chrysogenum P2niaD18;;;;;4.22 ;0;5;1;2;7;0;1;4;8;0;1;8;7;0;2;3;5;0;3;3;6;0;2;3;6;0;2;3;7;0;2;3;0;6;0;0;0;4;2;5;0;6;3;9;0;10;2;8;0;3;1;4;7;0;1;2;0;5;1;2;0;11;4;2;192;mth*;Myceliophthora thermophila ATCC 42464;;;;;4.24 ;0;7;3;7;0;1;4;1;9;0;1;10;7;0;3;4;7;0;3;3;1;0;7;0;7;0;3;2;7;0;5;2;0;5;0;0;0;5;4;4;0;8;4;9;0;10;3;8;0;3;1;5;4;0;0;2;0;3;7;1;0;11;2;2;205;sas*;Saccharomycetaceae sp. Ashbya aceri;;;;;4.51 ;0;9;9;2;0;1;2;0;10;0;2;8;10;0;2;1;8;0;2;1;1;0;7;0;9;0;2;1;9;0;3;0;0;6;0;0;0;5;7;1;0;9;6;9;0;12;11;1;0;4;0;4;3;0;0;1;0;3;8;1;0;13;2;1;206;tpf;Tetrapisispora phaffii CBS 4417;;;;;4.56 ;0;6;3;8;0;1;4;0;9;0;2;7;10;0;2;1;9;0;2;1;1;0;7;0;9;0;3;1;10;0;5;0;0;6;0;0;0;6;6;2;0;9;3;12;0;9;9;3;0;3;0;5;4;0;0;1;0;3;9;1;0;12;2;1;207;cgr;Candida glabrata CBS 138;;;;;4.58 ;0;7;2;5;6;0;1;1;8;0;1;8;8;0;2;2;7;0;3;2;4;0;7;1;6;0;3;0;8;0;5;2;0;6;0;0;0;4;6;2;0;6;3;10;0;9;6;9;0;5;0;6;6;0;4;2;0;5;5;1;1;8;2;7;212;bfu;Botrytis cinerea B05.10;;;;;4.69 ;0;8;9;4;2;0;0;1;9;1;2;10;10;0;1;1;6;0;4;1;1;0;7;0;8;0;2;1;7;0;5;1;0;6;0;0;0;6;7;1;0;9;8;10;0;10;9;1;0;4;1;4;5;0;0;1;0;3;10;1;0;11;5;1;214;dha;Debaryomyces hansenii CBS767;;;;;4.71 ;0;7;1;1;8;0;1;4;9;0;0;9;11;0;1;2;6;1;2;4;8;0;3;2;8;0;2;3;11;0;2;4;1;6;0;0;0;6;2;5;0;6;2;12;0;10;2;12;0;5;1;3;9;0;2;2;0;5;3;2;0;13;3;3;225;vda;Verticillium dahliae VdLs.17;;;;;4.93 ;0;7;2;8;0;2;3;3;10;0;1;8;11;0;1;3;9;0;2;2;2;0;8;0;9;0;2;1;10;0;3;2;0;6;0;0;0;5;5;5;0;7;4;14;0;10;6;11;0;4;0;5;4;0;0;1;0;3;9;1;0;15;3;2;229;lth;Lachancea thermotolerans CBS 6340;;;;;5.04 ;0;7;2;0;0;0;1;4;10;0;2;6;10;1;2;3;7;0;1;3;9;0;2;0;10;0;2;2;10;0;3;4;1;13;0;0;0;8;4;7;0;8;3;11;0;13;6;11;1;4;0;4;12;0;2;3;0;6;2;2;0;15;4;1;242;aor;Aspergillus oryzae RIB40;;;;;5.31 ;0;8;3;11;0;1;3;0;12;0;1;10;14;0;1;3;11;0;2;1;1;1;10;0;12;0;2;1;13;0;4;0;0;7;0;0;0;6;10;1;0;9;5;14;0;13;13;3;0;5;0;5;5;0;0;1;0;4;12;1;0;15;2;2;258;lkl*;Lachancea kluyveri NRRL Y-12651;;;;;5.69 ;0;9;14;2;2;0;2;0;13;0;2;9;13;0;2;1;11;0;4;1;1;0;10;0;11;0;3;1;12;0;5;0;0;9;0;0;0;6;9;1;0;10;8;12;0;13;15;2;0;5;0;6;4;0;0;1;0;4;11;1;0;17;3;1;266;kaf;Kazachstania africana CBS 2517;;;;;5.91 ;0;10;7;9;2;0;3;0;12;0;2;9;13;0;2;2;12;0;4;1;1;0;10;0;11;0;3;2;12;0;5;0;0;9;0;0;0;8;9;1;0;10;8;14;0;14;13;1;0;4;0;7;5;0;0;2;0;4;10;1;0;13;3;2;270;ncs;Naumovozyma castellii CBS 4309;;;;;6.00 ;0;9;1;3;6;0;2;5;11;0;2;5;16;0;2;3;11;0;2;2;10;0;3;2;11;0;4;3;13;0;3;3;0;6;0;0;0;7;5;7;0;9;2;12;0;10;4;13;0;5;1;4;10;0;9;1;0;8;2;2;0;15;5;1;270;fgr;Fusarium graminearum CS3005;;;;;5.98 ;0;8;4;10;0;1;5;0;11;1;1;9;12;0;2;4;12;0;3;2;3;0;10;0;10;0;2;2;12;0;9;0;0;7;0;0;0;6;10;3;0;9;7;14;0;14;10;4;0;4;0;6;5;0;0;1;0;5;8;2;0;17;5;2;272;zro;Zygosaccharomyces rouxii CBS 732;;;;;6.00 ;2;15;1;4;6;0;2;2;10;0;2;14;7;0;3;3;7;0;2;3;4;0;4;2;7;0;3;4;13;0;9;5;0;6;0;0;0;3;4;6;1;12;6;11;1;2;6;11;0;4;0;4;13;0;8;2;0;4;2;6;0;11;8;8;273;fve*;Flammulina velutipes KACC42780;;;;;5.98 ;0;10;7;10;0;1;3;0;13;0;2;10;14;0;2;2;11;0;3;1;2;0;10;0;11;0;4;1;11;0;5;0;0;8;0;0;0;7;9;1;0;10;7;14;0;16;14;2;0;4;0;6;6;0;0;1;0;4;11;1;0;16;3;2;275;sce;Saccharomyces cerevisiae (S288c Apr 2011);;;;;6.09 ;0;10;2;4;12;0;2;5;11;0;1;8;13;0;2;3;10;0;2;3;10;0;3;2;11;0;4;2;14;0;3;3;0;8;0;0;0;6;4;8;0;8;2;15;0;14;5;16;0;5;0;5;10;0;7;1;0;7;2;2;0;14;5;1;285;fvr;Fusarium verticillioides 7600;;;;;6.33 ;0;10;4;14;4;0;0;2;12;0;4;10;12;0;2;4;10;0;4;2;2;0;8;0;10;0;4;2;12;0;8;2;0;10;0;0;0;8;8;4;0;12;6;10;0;14;8;8;0;4;0;6;4;0;0;2;0;6;10;2;0;16;6;2;288;mfa*;Millerozyma farinosa CBS 7064;;;;;6.40 ;0;11;2;3;13;0;2;5;13;0;2;6;19;0;2;3;11;0;2;2;10;0;3;2;11;0;4;3;14;0;4;2;0;8;0;0;0;7;5;7;0;9;3;16;0;14;5;19;0;5;1;4;10;0;9;1;0;8;2;2;0;14;6;1;305;fgr;Fusarium graminearum PH-1 NRRL 31084;;;;;6.76 ;0;12;12;9;0;1;2;0;17;0;2;11;18;0;2;1;16;0;4;2;1;0;13;0;15;0;3;1;19;0;5;0;0;9;0;0;0;7;10;1;0;11;9;15;0;19;16;1;0;5;0;7;4;0;0;1;0;6;13;1;0;23;3;1;328;tbl;Tetrapisispora blattae CBS 6284;;;;;7.27 ;0;12;1;5;17;0;2;6;17;1;1;17;19;0;2;4;14;0;3;4;11;0;4;4;12;0;3;3;19;0;3;5;0;10;0;0;0;9;3;11;0;12;2;24;0;18;5;24;0;7;0;7;21;0;2;3;0;6;5;5;0;26;4;3;396;ncr;Neurospora crassa OR74A;;;;;8.78 ;0;17;1;3;21;0;2;13;26;0;1;18;24;0;2;8;21;0;2;4;21;0;3;2;22;0;3;2;30;0;4;2;0;14;0;0;0;12;3;15;0;16;4;34;0;28;6;27;0;8;0;13;1;0;25;0;0;6;4;1;0;30;11;0;510;yli;Yarrowia lipolytica CLIB122;;;;;11.33 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; tRNAs;2;295;128;188;170;13;72;89;377;4;57;319;401;1;63;93;310;1;90;79;153;2;202;35;332;0;98;66;389;0;140;60;2;249;0;0;0;216;196;148;1;295;155;425;1;401;249;295;1;149;11;173;238;0;93;55;0;154;205;66;1;487;137;69;;;;;;;; ;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg;;;;;;;; zéros;41;0;2;4;11;30;7;11;0;38;1;0;0;41;2;1;0;41;0;0;5;40;1;22;0;42;0;1;0;42;0;16;40;0;42;42;42;0;0;0;41;0;1;1;41;1;0;0;41;0;32;2;0;42;20;4;42;1;2;1;41;0;0;4;;;;;;;; indice;0.05;7.02;3.05;4.48;4.05;0.31;1.71;2.12;8.98;0.10;1.36;7.60;9.55;0.02;1.50;2.21;7.38;0.02;2.14;1.88;3.64;0.05;4.81;0.83;7.90;0;2.33;1.57;9.26;0;3.33;1.43;0.05;5.93;;;0;5.14;4.67;3.52;0.02;7.02;3.69;10.12;0.02;9.55;5.93;7.02;0.02;3.55;0.26;4.12;5.67;0;2.21;1.31;0;3.67;4.88;1.57;0.02;11.60;3.26;1.64;;;;;;;;
Non champignons détail des introns
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;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg;;total;;DNA;KEGG;génome ;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; ;1; ;35;pfa;Plasmodium falciparum ;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;3;;82;lma;Leishmania major ;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;;10;;155;mgp;Meleagris gallopavo (turkey) (TGC Turkey_2.01 Dec 2009) ;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;;12;;191;mun*;Melopsittacus undulatus (Budgerigar Sep. 2011 WUSTL v6.3/melUnd1) ;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;;14;;203;gfr;Geospiza fortis (Medium ground finch Apr. 2012 GeoFor_1.0/geoFor1) ;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;;11;;211;acs;Anolis carolinensis (lizard) (Broad AnoCar2.0 May 2010) ;0;0;0;2;0;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;;18;;230;tgu;Taeniopygia guttata (Zebra finch Feb. 2013 WashU taeGut324/taeGut2) ;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;4;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;21;;252;mlu*;Myotis lucifugus (Microbat Jul. 2010 Broad Institute Myoluc2.0/myoLuc2) ;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;15;;256;dsi;Drosophila simulans (D. simulans Apr. 2005 WUGSC mosaic 1.0) ;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;18;;258;mmr*;Microcebus murinus (Mouse lemur) (Jun 2003) ;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;15;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;;22;;283;gga;Gallus gallus (galGal4 Nov 2011) ;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;15;;289;dme;Drosophila melanogaster (D. melanogaster Aug. 2014 BDGP Release 6 + ISO1 MT/dm6) ;1;0;0;5;0;0;0;0;3;9;10;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;3;0;0;0;0;0;;41;;326;oga*;Otolemur garnettii (Bushbaby Mar. 2011 Broad/otoGar3) ;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;15;;326;dya;Drosophila yakuba (D. yakuba Nov. 2005 WUGSC 7.1) ;0;0;0;6;1;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;26;;334;sbq;Saimiri boliviensis (Squirrel monkey Oct. 2011 Broad/saiBol1) ;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;22;;338;opr*;Ochotona princeps (Pika May 2012 OchPri3.0/ochPri3) ;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;26;;353;meu*;Macropus eugenii (Wallaby Sep. 2009 TWGS Meug_1.1/macEug2) ;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;7;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;22;;367;hgl;Heterocephalus glaber (Naked mole-rat Jan. 2012 Broad HetGla_female_1.0/hetGla2) ;0;0;1;4;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;21;;373;lcm;Latimeria chalumnae (Coelacanth Aug. 2011 Broad/latCha1) ;0;0;0;4;0;0;0;1;0;0;4;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;25;;374;san*;Sorex araneus (Shrew Aug. 2008 Broad/sorAra2) ;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;15;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;28;;383;cpo*;Cavia porcellus (Guinea pig) (Broad Feb 2008) ;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;15;;407;rno;Rattus norvegicus (rn5 Mar 2012) ;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;29;;408;cjc;Callithrix jacchus (marmoset) (WUGSC 3.2 Mar 2009) ;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;15;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;31;;411;pha*;Papio hamadryas (baboon) (Nov 2008) ;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;22;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;27;;414;aga;Anopheles gambiae ;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;21;;418;ppp;Physcomitrella patens ;1;0;0;5;1;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;13;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;31;;421;nle;Nomascus leucogenys (Gibbon Oct. 2012 GGSC Nleu3.0/nomLeu3) ;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;1;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;34;;435;ggo;Gorilla gorilla gorilla (gorilla) (gorGor3.1 May 2011) ;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;22;;446;shr;Sarcophilus harrisii (Tasmanian devil Feb. 2011 WTSI Devil_ref v7.0/sarHar1) ;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;1;26;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;3;0;1;0;60;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;114;;455;tsy*;Tarsius syrichta (Tarsier Sep. 2013 Tarsius_syrichta-2.0.1/tarSyr2) ;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;13;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;34;;458;mcc;Macaca mulatta (Rhesus Oct. 2010 BGI CR_1.0/rheMac3) ;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;25;;469;mmu;Mus musculus (mm10 Dec 2011) ;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;14;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;35;;476;pan*;Papio anubis (Baboon Mar. 2012 Baylor Panu_2.0/papAnu2) ;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;14;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;30;;481;mdo;Monodelphis domestica (opossum) (Broad Oct 2006) ;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;30;;485;eeu*;Erinaceus europaeus (Hedgehog May 2012 EriEur2.0/eriEur2) ;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;14;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;32;;494;ecb;Equus caballus (horse) (Sep 2007) ;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;23;;498;cge;Cricetulus griseus cell line CHO-K1 (Chinese hamster ovary CriGri 1.0 Aug 2011) ;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;1;11;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;10;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;;32;;499;vvi;Vitis vinifera (Grapevine 12X) ;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;13;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;34;;503;ptr;Pan troglodytes (Chimp Feb. 2011 CSAC 2.1.4/panTro4) ;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;1;;27;;506;ocu;Oryctolagus cuniculus (rabbit) (Broad Apr 2009) ;0;0;0;5;1;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;15;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;;40;;517;ppy*;Pongo pygmaeus abelii (Orangutan July 2007 WUGSC 2.0.2/ponAbe2) ;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;27;;518;csi*;Ceratotherium simum (White rhinoceros May 2012 CerSimSim1.0/cerSim1) ;0;0;1;7;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;1;0;20;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;11;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;;58;;540;tng;Tetraodon nigroviridis (tetraodon) (Genoscope 8.0 Mar 2007) ;0;0;0;7;0;0;0;0;0;1;12;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;10;0;0;0;0;0;;36;;554;cpic;Chrysemys picta bellii (Painted turtle Dec. 2011 v3.0.1/chrPic1) ;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;15;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;12;0;0;0;0;0;;43;;575;tru;Takifugu rubripes (Fugu Oct. 2011 FUGU5/fr3) ;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;17;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;12;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;32;;578;sbi;Sorghum bicolor (Version 1.0) ;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;4;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;1;9;0;0;0;0;2;0;1;0;2;0;0;0;3;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;;40;;582;mtr;Medicago truncatula (March 2009 Version 3.0) ;0;0;0;7;2;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;19;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;34;;596;cel;Caenorhabditis elegans (WS220 Oct 2010) ;6;0;0;0;35;1;0;1;0;0;1;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;17;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;74;;618;pop;Populus trichocarpa (Jan 2010 Version 2.0) ;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;13;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;34;;622;hsa;Homo sapiens (hg38 - GRCh38 Dec 2013) ;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;17;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;12;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;1;0;0;0;0;;36;;639;bdi;Brachypodium distachyon (JGI v1.0 8X) ;0;0;0;7;0;0;0;0;1;0;24;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;3;17;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;22;0;0;0;0;0;;76;;674;oni*;Oreochromis niloticus (Nile tilapia Jan. 2011 Broad oreNil1.1/oreNil2) ;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;70;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;83;;684;ath;Arabidopsis thaliana (TAIR10 Feb 2011) ;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;15;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;0;0;1;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;;36;;738;osa;Oryza sativa ;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;18;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;20;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;39;;738;gmx;Glycine max (soybean) (Wm82.a2) ;0;0;0;10;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;19;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;34;;743;cbr;Caenorhabditis briggsae (C. briggsae Jan. 2007 WUGSC 1.0/cb3) ;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;1;0;0;2;1;1;1;1;25;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;8;1;0;0;2;0;;66;;749;mpu*;Mustela putorius furo (Ferret Apr. 2011 MusPutFur1.0/musFur1) ;0;0;0;4;1;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;24;;804;str*;Spermophilus tridecemlineatus (Squirrel Nov. 2011 Broad/speTri2) ;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;16;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;1;17;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;6;0;0;2;0;0;;56;;807;ssc;Sus scrofa (Pig Aug. 2011 SGSC Sscrofa10.2/susScr3) ;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;24;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;35;;827;cja*;Caenorhabditis japonica (WUGSC 3.0.2 Mar 2008) ;0;1;0;10;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;26;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;54;;856;oaa;Ornithorhynchus anatinus (platypus) (WUGSC 5.0.1 Mar 2007) ;0;0;0;4;0;0;0;1;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;8;0;0;0;0;3;1;0;0;2;33;0;0;1;2;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;4;1;0;0;0;0;;68;;906;cfa;Canis familiaris (dog) (CanFam3.1 Sept 2011) ;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;24;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;;38;;1065;spu;Strongylocentrotus purpuratus (Sea urchin) ;0;1;0;14;0;0;0;0;0;1;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;26;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;52;;1095;cbr*;Caenorhabditis brenneri (WUGSC 6.0.1 Feb 2008) ;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;1;2;;31;;1119;dno*;Dasypus novemcinctus (Armadillo Dec. 2011 Baylor/dasNov3) ;0;0;0;4;1;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;3;0;2;;29;;1176;oas;Ovis aries (sheep) (Feb 2010) ;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;22;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;;37;;1198;zma;Zea mays (Version 5b.60) ;0;0;0;9;0;0;0;1;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;1;0;0;3;3;0;1;3;45;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;3;0;0;0;5;2;0;0;0;0;;96;;1463;aml;Ailuropoda melanoleuca (panda) (BGI-Shenzhen AilMel 1.0 Dec 2009) ;2;0;0;12;0;0;0;0;0;0;16;1;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;50;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;19;0;0;0;0;0;;105;;1492;gmo*;Gadus morhua (Atlantic cod May 2010 Genofisk GadMor_May2010/gadMor1) ;0;0;6;17;1;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;19;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;3;0;;60;;2002;lav;Loxodonta africana (elephant) (Broad/July 2009) ;0;0;0;8;1;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;14;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;1;3;0;;41;;2017;tma*;Trichechus manatus latirostris (Manatee Oct. 2011 Broad v1.0/triMan1) ;0;0;0;22;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;86;2;0;0;0;2;0;0;3;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;1;0;0;0;;133;;2485;pma*;Petromyzon marinus (Lamprey Sep. 2010 WUGSC 7.0/petMar2) ;0;0;3;5;0;0;0;0;0;0;58;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;17;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;62;0;0;0;0;0;;146;;2489;gac*;Gasterosteus aculeatus (stickleback) (Broad 1.0 Feb 2006) ;0;0;1;19;0;0;0;0;0;0;43;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;105;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;103;0;0;0;1;0;;275;;2639;xtr;Xenopus tropicalis (frog) (JGI 4.2 Nov 2009) ;0;0;3;7;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;1;7;1;0;0;0;1;0;0;1;1;0;10;3;4;0;2;75;7;1;2;4;214;0;0;0;7;0;0;2;2;0;0;102;2;0;0;5;9;1;0;2;1;;487;;3729;fca;Felis catus (cat) (Felis_catus-6.2 Sept 2011) ;0;0;0;6;1;0;1;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;17;0;0;0;0;1;1;0;0;0;1;0;0;1;1;0;2;0;1;0;0;0;0;0;0;6;0;2;1;3;5;;57;;4040;bta;Bos taurus (Cow Jun. 2014 Bos_taurus_UMD_3.1.1/bosTau8) ;0;0;0;5;0;0;0;1;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;17;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;7;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;3;2;;47;;5845;ttr*;Tursiops truncatus (Dolphin Oct. 2011 Baylor Ttru_1.4/turTru2) ;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;12;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;3;2;;50;;7080;bacu;Balaenoptera acutorostrata scammoni (Minke whale Oct. 2013 BalAcu1.0/balAcu1) ;0;0;0;9;0;0;1;1;0;0;17;0;0;0;1;1;0;0;0;0;12;3;13;8;3;0;0;0;0;0;0;1;1;34;0;0;0;0;0;0;0;0;35;0;0;0;2;0;1;0;0;0;0;0;22;0;0;0;12;0;0;0;0;0;;177;;13727;cmk;Callorhinchus milii (Elephant shark Dec. 2013 Callorhinchus_milii-6.1.3/calMil1) ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; total;11;2;18;400;45;1;2;7;5;14;454;149;3;0;5;6;2;23;13;2;18;5;50;11;10;0;5;7;4;1;2;4;24;1239;8;13;6;11;148;17;4;8;54;321;4;18;28;13;2;14;3;5;0;3;131;4;2;9;469;14;4;7;21;15;;;;;; ;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg;;;;;; −zéros;5;2;8;65;10;1;2;7;3;5;69;11;2;0;5;6;2;4;9;1;6;3;7;4;7;0;3;6;4;1;2;4;17;79;3;10;3;9;8;8;4;5;8;7;3;2;8;6;2;10;2;4;0;3;7;2;2;6;58;5;3;4;9;7;;;;;;
Non champignons détail des tRNAs
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- Légende
;;Non champignons détail tRNAs;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; DNA;KEGG;Génome;;;moy;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg 35;pfa;Plasmodium falciparum;;;0.78;0;1;1;1;1;0;1;1;1;0;1;2;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;0;0;1;1;1;0;1;1;0;1;0;0;0;0;1;1;0;1;0;0;0;1;1;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;1;0;0;0;1;0 82;lma;Leishmania major;;;1.82;0;2;1;1;3;0;1;2;3;0;1;4;2;0;1;2;1;0;1;1;2;0;1;2;3;0;1;2;2;0;1;2;0;3;0;0;0;2;1;3;0;3;1;3;0;3;1;2;0;1;0;1;4;0;1;1;0;2;1;1;0;4;1;1 155;mgp;Meleagris gallopavo (turkey) (TGC Turkey_2.01 Dec 2009);;;3.42;0;6;1;2;1;0;1;4;3;0;1;11;3;1;2;3;5;0;3;1;7;0;2;1;4;0;2;0;7;0;6;3;0;6;0;0;0;3;1;1;0;4;4;3;0;3;5;6;0;5;0;5;2;0;1;2;0;6;3;3;0;5;4;3 191;mun*;Melopsittacus undulatus (Budgerigar Sep. 2011 WUSTL v6.3/melUnd1);;;4.18;0;6;4;3;3;0;0;6;5;0;1;9;3;1;1;4;4;1;3;1;2;0;3;2;5;0;2;0;9;0;5;2;0;7;0;0;0;4;2;4;0;9;3;13;0;9;3;1;0;5;1;4;3;0;1;1;0;8;4;4;0;10;9;1 203;gfr;Geospiza fortis (Medium ground finch Apr. 2012 GeoFor_1.0/geoFor1);;;4.44;0;6;11;2;4;0;7;0;6;1;2;6;2;1;1;3;2;0;3;1;4;0;5;1;5;0;4;1;16;0;5;2;0;12;0;0;0;4;2;3;1;6;4;7;0;5;4;6;0;10;0;3;6;0;2;0;0;6;3;2;0;8;4;4 211;acs;Anolis carolinensis (lizard) (Broad AnoCar2.0 May 2010);;;4.64;0;5;2;2;4;0;3;4;6;0;1;12;5;0;2;3;5;0;1;2;3;1;3;2;4;0;3;1;12;0;6;3;0;6;0;0;0;5;3;5;0;10;5;6;0;8;7;5;0;12;1;7;4;0;3;1;0;5;3;3;0;7;8;2 230;tgu;Taeniopygia guttata (Zebra finch Feb. 2013 WashU taeGut324/taeGut2);;;4.87;0;10;4;4;1;0;1;7;21;2;1;5;3;2;1;1;3;0;2;1;6;0;1;2;8;1;4;2;18;0;7;3;0;13;0;0;0;5;1;6;2;8;4;5;0;7;2;3;1;9;1;3;6;0;2;0;1;5;3;2;1;8;7;4 252;mlu*;Myotis lucifugus (Microbat Jul. 2010 Broad Institute Myoluc2.0/myoLuc2);;;5.49;0;5;2;3;3;0;5;2;10;0;3;14;5;0;3;5;6;0;2;2;6;0;3;3;5;0;5;3;8;0;1;3;0;5;0;0;5;7;3;7;0;9;3;11;0;8;5;6;0;27;0;4;6;0;5;2;0;5;5;5;0;8;6;3 256;dsi;Drosophila simulans (D. simulans Apr. 2005 WUGSC mosaic 1.0);;;5.67;0;8;3;4;5;0;2;9;8;0;0;12;7;0;2;6;8;0;2;3;6;0;5;5;8;0;5;4;9;0;5;0;0;10;0;0;0;6;4;8;0;6;4;11;0;6;5;10;0;7;1;9;9;0;5;0;0;3;3;3;0;15;5;0 258;mmr*;Microcebus murinus (Mouse lemur) (Jun 2003);;;5.71;0;8;3;3;5;0;2;7;4;0;3;14;4;0;2;5;7;0;2;3;7;0;4;3;3;0;3;2;11;0;5;3;0;8;0;0;0;6;4;12;0;9;5;6;0;5;9;8;1;20;0;6;6;0;3;2;0;7;5;3;0;11;7;2 283;gga;Gallus gallus (galGal4 Nov 2011);;;6.24;0;10;3;3;3;0;2;7;7;0;2;14;7;1;3;7;9;0;4;2;7;0;4;3;4;0;4;2;24;0;7;4;0;16;0;0;0;6;2;5;0;11;6;6;0;10;9;7;0;11;1;6;8;0;2;2;0;7;4;3;0;7;7;4 289;dme;Drosophila melanogaster (D. melanogaster Aug. 2014 BDGP Release 6 + ISO1 MT/dm6);;;6.40;0;8;4;4;4;0;2;8;9;0;2;12;6;0;2;7;8;0;2;4;7;0;5;5;8;0;6;3;12;0;2;3;0;9;0;0;0;5;4;8;0;10;6;13;0;14;6;13;0;7;1;8;10;0;10;0;0;6;3;3;0;14;6;0 326;oga*;Otolemur garnettii (Bushbaby Mar. 2011 Broad/otoGar3);;;6.96;1;6;3;5;4;0;3;9;10;9;11;13;6;0;3;5;6;0;3;3;7;0;4;3;9;0;6;3;13;0;7;3;0;8;0;0;0;8;5;9;0;12;11;9;0;13;5;8;0;21;1;6;6;0;4;3;2;7;4;5;0;12;9;3 326;dya;Drosophila yakuba (D. yakuba Nov. 2005 WUGSC 7.1);;;7.22;0;9;5;4;5;0;2;8;10;0;2;15;7;0;2;10;9;0;2;5;6;0;8;5;8;0;6;5;18;0;2;5;0;9;0;0;0;5;4;8;0;11;6;16;0;15;7;14;0;8;1;8;12;0;7;0;0;6;3;4;0;16;7;1 334;sbq;Saimiri boliviensis (Squirrel monkey Oct. 2011 Broad/saiBol1);;;7.27;0;9;8;5;6;0;4;5;10;1;6;14;6;1;4;7;9;1;3;3;9;0;5;4;8;0;6;5;15;0;8;5;1;8;0;0;0;8;6;10;0;11;12;9;0;9;10;5;0;19;3;6;6;0;4;3;0;7;5;5;0;10;6;4 338;opr*;Ochotona princeps (Pika May 2012 OchPri3.0/ochPri3);;;7.49;0;10;3;4;5;0;5;11;8;0;4;15;7;0;4;7;7;0;3;4;8;0;4;4;7;0;6;7;15;0;7;4;0;10;0;0;0;5;5;12;0;14;9;11;0;14;7;11;0;10;1;6;7;0;6;4;0;7;5;6;0;17;7;5 353;meu*;Macropus eugenii (Wallaby Sep. 2009 TWGS Meug_1.1/macEug2);;;7.62;1;10;3;8;5;0;4;6;6;0;6;14;8;0;1;7;8;0;4;2;7;0;4;2;8;0;6;3;13;0;6;5;1;8;0;0;1;7;4;7;0;14;10;11;0;13;12;7;0;29;7;8;7;0;3;5;0;10;7;4;0;16;10;5 367;hgl;Heterocephalus glaber (Naked mole-rat Jan. 2012 Broad HetGla_female_1.0/hetGla2);;;7.62;0;6;4;5;5;0;5;5;8;0;3;14;12;1;4;6;7;0;3;3;13;0;5;3;15;2;4;4;46;6;5;6;0;7;0;0;0;7;3;6;0;9;8;15;2;10;6;4;0;23;7;6;5;0;4;4;2;7;6;5;4;10;4;3 373;lcm;Latimeria chalumnae (Coelacanth Aug. 2011 Broad/latCha1);;;7.96;0;7;11;4;4;0;5;8;7;0;7;11;3;0;7;4;3;0;6;3;12;0;10;4;11;0;9;2;5;0;20;3;2;8;0;0;0;5;10;9;3;9;20;13;1;19;11;8;5;17;4;15;4;0;1;4;0;8;9;8;0;7;5;2 374;san*;Sorex araneus (Shrew Aug. 2008 Broad/sorAra2);;;8.24;0;10;4;4;6;1;2;13;15;0;5;15;7;0;5;7;8;0;3;4;8;0;6;2;8;0;5;5;10;0;8;3;0;9;0;0;0;7;5;7;0;12;8;13;0;19;10;14;0;25;2;6;9;0;5;3;0;8;6;6;0;22;12;2 383;cpo*;Cavia porcellus (Guinea pig) (Broad Feb 2008);;;8.36;0;8;4;6;5;0;3;6;10;0;5;15;6;1;3;6;8;0;3;4;8;0;4;3;10;0;4;3;28;4;9;5;0;15;0;0;0;8;4;8;0;18;11;26;1;10;6;5;0;34;1;8;7;0;4;3;0;10;5;5;0;11;6;6 407;rno;Rattus norvegicus (rn5 Mar 2012);;;8.89;1;8;3;0;1;0;1;5;12;0;3;13;8;0;3;7;11;0;4;3;33;0;6;3;9;0;5;4;36;2;9;4;0;2;0;0;0;10;6;10;0;15;1;19;2;15;10;8;0;40;1;8;6;0;3;5;1;12;6;8;0;11;9;5 408;cjc;Callithrix jacchus (marmoset) (WUGSC 3.2 Mar 2009);;;8.80;0;8;9;6;7;0;3;11;9;2;5;19;6;1;4;10;9;0;5;4;7;0;6;4;9;1;6;4;15;1;5;4;0;19;0;0;1;8;4;12;0;23;14;11;1;13;11;12;0;30;2;6;6;3;4;3;0;8;5;5;0;14;9;4 411;pha*;Papio hamadryas (baboon) (Nov 2008);;;8.93;0;12;7;7;9;0;3;6;12;2;4;15;9;1;7;12;9;0;5;3;7;0;6;4;10;0;7;6;19;1;9;5;0;15;0;0;0;10;6;11;1;18;12;12;1;10;13;4;2;28;1;8;7;0;6;4;0;9;6;5;0;13;4;8 414;aga;Anopheles gambiae;;;9.20;0;9;2;3;5;0;3;10;12;0;2;18;31;0;3;29;6;0;2;8;7;0;8;13;8;0;2;5;17;0;3;6;0;22;0;0;0;21;4;11;0;11;8;17;0;20;11;15;0;5;0;6;10;0;8;0;0;6;2;2;0;15;8;0 418;ppp;Physcomitrella patens ;;;9.18;1;14;2;6;6;1;5;5;12;0;4;24;13;0;2;11;13;0;5;7;13;0;8;4;10;0;5;6;19;0;9;8;0;8;0;0;0;9;9;10;1;14;8;16;0;11;7;14;0;7;1;9;8;1;7;5;0;9;6;10;0;15;9;11 421;nle;Nomascus leucogenys (Gibbon Oct. 2012 GGSC Nleu3.0/nomLeu3);;;9.04;1;11;7;5;8;0;3;9;12;3;5;16;11;1;6;10;9;1;4;4;9;1;5;4;11;0;4;5;18;1;9;5;0;14;0;0;0;11;9;13;2;14;22;15;0;10;10;8;1;22;3;8;7;0;7;3;0;8;6;5;0;12;6;7 435;ggo;Gorilla gorilla gorilla (gorilla) (gorGor3.1 May 2011);;;9.42;0;12;8;7;8;0;4;5;11;2;6;17;9;1;8;10;10;1;4;5;8;0;7;4;9;0;6;6;22;2;6;4;1;16;0;0;0;7;7;14;1;24;13;14;0;15;14;7;0;28;3;8;7;0;6;5;0;8;5;6;0;12;3;9 446;shr;Sarcophilus harrisii (Tasmanian devil Feb. 2011 WTSI Devil_ref v7.0/sarHar1);;;9.87;0;13;6;3;9;0;4;9;11;0;4;22;8;0;4;10;10;0;5;3;10;0;6;3;9;0;7;2;18;0;7;4;0;11;0;0;0;9;45;10;0;13;14;32;0;19;15;10;0;8;2;8;4;0;5;3;0;8;5;4;0;19;9;6 455;tsy*;Tarsius syrichta (Tarsier Sep. 2013 Tarsius_syrichta-2.0.1/tarSyr2);;;9.25;0;6;#;4;6;0;5;7;8;0;4;12;6;0;4;6;7;0;5;3;7;1;32;4;9;0;4;4;12;0;4;3;0;10;0;0;1;10;64;6;1;15;10;7;1;13;9;10;1;25;1;6;6;0;5;3;0;9;6;4;0;14;6;7 458;mcc;Macaca mulatta (Rhesus Oct. 2010 BGI CR_1.0/rheMac3);;;9.80;0;9;15;8;9;0;5;6;10;5;7;18;10;3;6;11;9;2;6;4;8;0;8;3;9;0;5;4;21;1;10;5;1;23;0;0;0;14;10;12;2;19;16;13;1;14;11;6;0;27;2;8;6;0;5;4;0;8;6;7;0;14;4;8 469;mmu;Mus musculus (mm10 Dec 2011);;;10.13;0;7;7;4;5;0;4;10;12;1;5;19;8;1;3;12;10;1;3;3;8;1;8;3;11;0;4;4;23;4;11;10;0;11;0;0;1;10;7;12;0;13;14;26;0;16;8;14;1;60;1;8;6;0;5;3;0;8;6;5;2;15;8;7 476;pan*;Papio anubis (Baboon Mar. 2012 Baylor Panu_2.0/papAnu2);;;10.20;1;13;8;8;8;0;3;11;14;2;6;19;9;1;7;12;9;1;5;3;8;0;6;4;10;0;7;6;20;1;9;5;3;21;0;0;0;10;9;12;2;21;14;15;2;15;13;9;1;27;3;9;7;0;5;4;0;11;6;5;0;20;8;8 481;mdo;Monodelphis domestica (opossum) (Broad Oct 2006);;;10.58;0;12;2;4;8;0;6;11;13;0;7;25;9;0;5;9;12;0;6;3;11;0;8;3;12;0;7;3;15;0;9;6;0;15;0;0;0;9;7;11;0;13;13;19;1;24;14;13;4;46;0;9;5;0;5;4;0;9;6;5;0;24;11;8 485;eeu*;Erinaceus europaeus (Hedgehog May 2012 EriEur2.0/eriEur2);;;7.59;0;8;3;6;6;0;3;6;9;0;4;16;7;0;6;4;7;0;3;3;10;0;5;3;9;0;6;4;14;0;10;4;0;13;0;0;0;5;4;8;0;7;11;€;0;13;8;9;0;34;2;7;6;0;5;3;0;7;5;7;0;14;7;5 494;ecb;Equus caballus (horse) (Sep 2007);;;10.76;0;12;4;6;7;0;5;3;20;0;5;25;12;3;6;15;12;0;4;4;10;0;7;3;9;0;7;3;27;0;11;8;1;14;0;0;1;11;6;12;1;17;15;16;0;10;11;51;0;25;4;7;10;0;4;4;0;12;5;7;0;10;4;8 498;cge;Cricetulus griseus cell line CHO-K1 (Chinese hamster ovary CriGri 1.0 Aug 2011);;;10.96;0;8;4;4;5;0;4;10;13;0;5;16;13;0;5;9;6;0;3;3;7;0;6;3;8;1;4;4;22;1;15;6;0;11;0;0;0;14;5;11;0;17;15;86;0;15;7;20;0;41;2;6;6;0;6;3;0;9;5;6;1;14;6;7 499;vvi;Vitis vinifera (Grapevine 12X);;;10.89;0;14;7;13;10;0;9;7;13;1;7;25;14;0;5;9;13;1;7;3;13;0;16;4;10;2;6;3;11;0;28;5;1;17;0;0;1;12;9;10;1;18;11;13;1;18;14;21;0;11;1;10;8;0;5;4;0;9;6;7;0;17;12;6 503;ptr;Pan troglodytes (Chimp Feb. 2011 CSAC 2.1.4/panTro4);;;10.82;0;15;10;7;9;0;3;6;14;1;5;21;11;1;10;12;11;1;7;4;9;1;8;5;10;0;6;5;30;1;9;5;2;22;0;0;0;10;8;10;1;27;14;19;1;15;15;11;1;27;2;7;7;1;6;5;3;9;6;5;0;13;6;13 506;ocu;Oryctolagus cuniculus (rabbit) (Broad Apr 2009);;;10.67;0;14;6;3;5;0;4;16;11;1;7;18;12;0;8;14;10;0;4;5;9;0;5;4;8;1;7;5;21;0;9;4;0;12;0;0;0;9;5;15;1;26;12;29;1;23;18;19;0;25;1;10;7;0;4;5;0;10;6;6;21;0;14;16 517;ppy*;Pongo pygmaeus abelii (Orangutan July 2007 WUGSC 2.0.2/ponAbe2);;;11.18;0;13;6;6;10;0;3;11;14;4;6;20;10;1;7;18;10;1;6;5;10;0;7;5;12;0;4;7;22;1;9;4;1;19;0;0;0;10;7;13;2;33;20;22;1;13;22;8;0;30;3;6;7;0;6;7;0;8;8;7;0;14;8;10 518;csi*;Ceratotherium simum (White rhinoceros May 2012 CerSimSim1.0/cerSim1);;;11.40;0;13;5;6;6;0;4;4;13;0;5;26;11;1;7;15;13;0;5;4;10;0;7;4;10;0;8;5;23;0;13;6;0;11;0;0;0;10;5;12;2;14;15;22;1;13;11;77;0;24;1;8;10;0;5;4;0;13;6;7;0;10;4;9 540;tng;Tetraodon nigroviridis (tetraodon) (Genoscope 8.0 Mar 2007);;;11.91;1;17;5;7;15;0;6;32;16;0;5;20;10;0;4;15;12;1;7;2;11;1;11;4;26;0;10;13;20;0;10;4;0;13;0;0;0;12;9;18;0;17;9;20;0;18;15;13;0;15;1;10;14;0;6;2;0;11;9;9;0;14;14;6 554;cpic;Chrysemys picta bellii (Painted turtle Dec. 2011 v3.0.1/chrPic1);;;11.87;2;22;13;7;2;1;4;6;11;1;13;16;16;0;5;6;24;0;15;10;12;1;4;2;17;0;18;5;11;1;15;4;1;5;0;0;0;10;16;11;1;17;36;9;0;14;17;5;5;18;4;10;7;0;5;3;3;20;26;10;0;11;24;2 575;tru;Takifugu rubripes (Fugu Oct. 2011 FUGU5/fr3);;;12.64;1;18;6;9;10;0;4;21;11;0;6;35;19;0;8;25;11;0;7;3;10;0;7;6;18;0;7;7;10;0;8;6;1;13;0;0;1;19;8;12;0;20;19;19;1;22;13;20;0;15;1;16;16;1;7;4;0;17;13;10;0;18;12;4 578;sbi;Sorghum bicolor (Version 1.0);;;12.56;0;20;4;9;15;0;9;11;17;0;5;37;16;2;4;10;11;3;12;6;14;0;11;7;12;2;9;6;18;0;13;11;1;14;0;0;1;15;11;13;1;16;9;18;2;24;13;23;0;13;1;13;15;0;4;7;0;13;7;10;0;24;10;6 582;mtr;Medicago truncatula (March 2009 Version 3.0);;;12.47;0;26;7;14;9;0;10;4;19;0;10;40;17;3;7;7;12;2;8;2;7;0;11;1;10;4;10;1;25;0;16;3;1;12;0;0;0;17;17;5;9;28;18;16;0;28;19;11;0;10;1;14;12;0;5;3;0;15;8;6;1;23;15;3 596;cel;Caenorhabditis elegans (WS220 Oct 2010);;;13.18;0;15;4;7;20;0;3;5;21;0;7;19;19;0;5;6;15;0;9;6;6;0;31;4;17;0;11;7;22;0;9;4;0;19;0;0;0;19;20;7;0;20;14;30;0;27;17;24;0;13;2;12;18;0;8;1;1;9;8;4;0;14;34;3 618;pop;Populus trichocarpa (Jan 2010 Version 2.0) ;;;13.53;4;18;7;3;40;1;0;7;20;1;9;26;17;0;8;10;13;1;9;5;14;0;22;4;6;0;11;4;20;0;18;5;0;18;0;0;0;13;11;11;0;22;17;17;0;33;14;21;1;13;1;14;10;0;7;5;0;16;11;11;0;25;17;7 622;hsa;Homo sapiens (hg38 - GRCh38 Dec 2013);;;13.31;0;18;8;12;12;0;4;11;19;6;5;22;11;1;8;21;12;1;6;5;10;1;8;4;10;0;6;7;35;1;10;5;5;32;0;0;0;10;18;24;2;40;20;24;1;16;17;10;1;38;3;8;7;0;6;4;1;8;7;5;0;15;9;12 639;bdi;Brachypodium distachyon (JGI v1.0 8X);;;13.82;0;18;4;15;14;0;10;8;20;2;4;55;15;3;5;11;11;4;10;5;15;0;18;8;9;3;10;6;19;0;12;11;1;17;0;0;3;21;15;11;0;16;12;18;0;25;15;19;0;14;0;18;16;1;5;6;0;18;9;9;0;27;9;9 674;oni*;Oreochromis niloticus (Nile tilapia Jan. 2011 Broad oreNil1.1/oreNil2);;;14.80;0;23;12;7;14;0;7;16;25;0;25;27;8;0;9;9;10;0;10;6;14;0;11;4;18;1;25;8;18;0;11;12;3;18;0;0;0;23;6;11;0;9;16;43;0;10;14;15;1;42;1;12;16;0;7;6;2;10;27;18;0;13;12;9 684;ath;Arabidopsis thaliana (TAIR10 Feb 2011);;;15.00;0;17;6;12;12;1;11;3;17;2;5;32;14;2;7;8;37;3;12;7;15;0;47;5;10;1;9;5;16;0;10;7;0;83;0;0;0;12;10;9;0;19;15;17;0;29;14;13;0;17;0;16;11;0;6;4;0;16;10;8;0;25;12;5 738;osa;Oryza sativa;;;15.67;0;20;4;19;15;0;10;10;18;0;5;56;17;16;4;10;12;4;17;8;14;0;14;9;11;8;15;5;20;1;10;12;2;19;0;0;0;26;21;10;0;29;12;20;1;31;16;25;1;17;0;18;24;0;4;8;0;20;12;11;0;28;9;10 738;gmx;Glycine max (soybean) (Wm82.a2);;;16.31;0;22;9;18;16;0;10;7;31;0;8;36;22;1;9;13;15;0;11;6;21;0;27;5;9;1;10;4;24;0;17;8;0;21;0;0;0;18;13;13;2;22;20;22;0;33;16;24;0;14;0;18;13;0;9;5;0;28;18;13;0;29;18;9 743;cbr;Caenorhabditis briggsae (C. briggsae Jan. 2007 WUGSC 1.0/cb3);;;16.51;0;22;6;11;26;0;5;7;21;0;24;23;25;0;6;6;17;0;8;8;6;0;41;4;22;0;10;9;29;0;14;7;0;19;0;0;0;21;24;10;0;23;16;40;0;34;19;30;0;16;0;13;22;0;10;0;0;9;10;2;0;21;42;5 749;mpu*;Mustela putorius furo (Ferret Apr. 2011 MusPutFur1.0/musFur1);;;10.68;0;11;4;6;6;0;4;5;10;0;5;20;8;0;6;7;8;0;4;4;9;0;7;2;10;0;7;5;15;0;8;5;0;9;0;0;1;7;37;17;6;12;31;€;0;8;7;19;0;25;1;11;6;0;29;5;0;12;16;21;0;9;9;4 804;str*;Spermophilus tridecemlineatus (Squirrel Nov. 2011 Broad/speTri2);;;11.02;1;10;3;10;6;0;3;4;14;6;4;14;18;3;5;39;15;1;7;6;12;1;7;3;34;5;6;7;€;31;39;18;0;9;0;0;0;6;4;6;1;9;10;12;6;8;5;7;0;48;1;7;6;0;5;3;0;7;5;6;7;13;5;20 807;ssc;Sus scrofa (Pig Aug. 2011 SGSC Sscrofa10.2/susScr3);;;12.68;0;21;4;6;8;0;5;5;13;0;5;23;10;1;11;12;10;0;5;4;9;0;4;3;13;0;8;4;23;0;14;7;0;17;0;0;0;10;9;12;2;18;38;16;10;97;€;13;1;23;0;7;7;0;5;3;0;10;7;4;0;19;10;6 827;cja*;Caenorhabditis japonica (WUGSC 3.0.2 Mar 2008);;;18.33;1;24;5;7;26;0;6;12;26;0;7;30;23;0;7;13;19;0;7;15;9;0;43;8;24;0;12;11;31;0;11;8;0;24;0;0;0;17;14;16;0;23;30;37;0;41;20;40;0;15;1;18;21;0;11;1;0;15;12;3;0;34;47;2 856;oaa;Ornithorhynchus anatinus (platypus) (WUGSC 5.0.1 Mar 2007);;;18.56;1;24;10;10;8;0;7;18;27;0;10;32;23;1;15;10;16;4;6;8;19;4;12;7;23;1;18;10;83;0;17;11;0;28;0;0;1;24;11;19;0;21;32;25;0;27;16;27;0;37;5;14;12;0;7;14;2;18;6;9;2;40;15;9 906;cfa;Canis familiaris (dog) (CanFam3.1 Sept 2011);;;11.23;0;10;4;5;4;0;4;7;9;0;5;23;6;0;5;8;10;0;5;8;8;0;8;4;8;0;4;5;14;0;11;4;0;9;0;0;0;9;43;20;1;21;34;€;2;13;15;22;0;21;1;6;6;0;15;4;0;8;9;29;0;11;11;9 1065;spu;Strongylocentrotus purpuratus (Sea urchin) ;;;23.56;2;0;14;2;18;0;8;5;69;2;22;73;20;0;11;16;25;0;15;6;19;0;21;9;27;0;21;9;32;0;17;7;0;24;0;0;0;26;17;21;0;39;57;42;0;82;26;29;0;31;0;18;29;0;19;1;1;17;18;19;0;42;33;4 1095;cbr*;Caenorhabditis brenneri (WUGSC 6.0.1 Feb 2008);;;24.07;0;24;7;14;32;0;8;8;33;1;26;29;33;0;8;15;20;0;14;9;25;2;54;9;31;1;15;10;35;0;11;6;2;28;0;0;1;26;40;11;0;33;29;49;0;34;36;37;2;21;3;22;32;0;17;24;0;14;13;11;0;39;66;25 1119;dno*;Dasypus novemcinctus (Armadillo Dec. 2011 Baylor/dasNov3);;;15.86;0;12;8;8;5;0;3;10;12;1;6;30;12;1;16;#;10;0;6;6;7;0;7;4;11;0;8;7;23;2;66;17;0;14;0;0;1;10;5;10;0;23;18;43;0;21;20;45;0;22;1;15;10;0;8;5;0;10;9;47;24;19;€;34 1176;oas;Ovis aries (sheep) (Feb 2010);;;12.50;1;6;5;7;6;0;2;3;6;0;5;18;7;0;8;9;2;3;4;3;4;0;6;1;5;0;5;3;18;3;12;7;2;16;0;0;0;8;7;9;0;13;22;16;2;8;€;60;16;61;4;47;2;2;6;6;0;7;22;33;5;30;€;€ 1198;zma;Zea mays (Version 5b.60);;;23.18;1;25;5;20;29;0;9;13;69;0;5;79;22;12;4;16;13;22;11;6;15;0;31;9;20;13;14;6;66;0;15;22;0;21;0;0;1;26;22;13;0;49;82;€;1;42;22;30;1;25;0;27;35;0;7;6;0;14;9;11;0;33;11;11 1463;aml;Ailuropoda melanoleuca (panda) (BGI-Shenzhen AilMel 1.0 Dec 2009);;;13.84;0;11;5;9;7;0;5;7;12;0;6;24;10;0;7;9;10;0;6;4;9;0;11;5;10;0;9;10;17;0;9;5;0;11;0;0;0;8;43;25;6;28;55;€;1;11;11;37;0;25;2;10;8;1;#;7;2;13;17;45;0;10;7;7 1492;gmo*;Gadus morhua (Atlantic cod May 2010 Genofisk GadMor_May2010/gadMor1);;;30.05;6;36;16;15;33;0;24;47;26;0;18;€;21;0;9;28;30;0;18;14;55;0;21;22;30;0;30;30;55;1;24;26;0;50;0;0;1;26;11;45;2;34;63;43;1;30;51;50;0;27;2;29;31;2;17;10;1;41;21;28;0;30;39;18 2002;lav;Loxodonta africana (elephant) (Broad/July 2009);;;25.95;1;32;15;17;22;0;11;10;43;0;7;50;41;1;50;35;29;0;7;4;16;0;14;3;14;1;22;10;54;0;53;15;1;19;0;0;3;27;14;28;4;51;60;36;0;20;€;24;1;28;24;23;14;0;18;3;3;76;#;16;4;33;€;# 2017;tma*;Trichechus manatus latirostris (Manatee Oct. 2011 Broad v1.0/triMan1);;;13.98;1;11;6;10;8;0;5;5;13;1;8;21;11;0;26;16;14;0;6;4;11;0;8;3;16;1;18;4;20;1;40;6;1;15;0;0;0;12;8;10;1;23;31;16;1;15;€;19;5;22;18;13;8;0;12;7;5;36;€;13;9;23;€;# 2485;pma*;Petromyzon marinus (Lamprey Sep. 2010 WUGSC 7.0/petMar2);;;34.89;2;57;5;#;€;0;40;#;€;0;10;€;€;1;26;#;22;0;20;35;54;0;43;21;62;19;19;23;€;0;31;24;0;90;0;0;1;27;44;€;0;€;24;23;2;90;12;11;0;68;1;9;85;1;26;10;0;65;18;50;1;54;17;6 2489;gac*;Gasterosteus aculeatus (stickleback) (Broad 1.0 Feb 2006);;;41.18;0;35;12;7;49;0;17;9;€;0;61;€;21;1;12;18;52;0;62;29;63;0;29;18;99;0;35;23;53;0;53;56;0;17;0;0;0;52;60;81;1;€;61;97;0;€;46;53;0;€;1;74;49;0;#;2;0;30;68;26;0;12;61;4 2639;xtr;Xenopus tropicalis (frog) (JGI 4.2 Nov 2009);;;50.41;2;58;#;22;38;2;25;32;63;5;51;€;55;0;36;53;40;3;41;23;60;1;53;36;€;0;91;29;67;0;47;36;0;€;0;0;1;42;28;40;1;47;72;97;0;59;84;51;2;92;1;33;33;3;33;8;0;99;€;27;0;85;80;€ 3729;fca;Felis catus (cat) (Felis_catus-6.2 Sept 2011);;;19.40;1;12;19;8;6;0;33;5;10;0;9;24;8;0;6;9;8;1;14;5;8;1;68;7;9;0;13;9;18;1;10;7;0;10;0;0;2;16;€;47;5;28;50;€;1;9;15;44;1;32;18;23;9;9;€;24;2;12;54;53;2;10;48;6 4040;bta;Bos taurus (Cow Jun. 2014 Bos_taurus_UMD_3.1.1/bosTau8);;;22.58;6;30;10;14;11;0;5;6;18;0;8;35;20;0;21;39;13;32;7;7;13;0;9;4;14;1;10;7;31;2;35;16;11;39;0;0;4;19;20;40;0;30;78;40;6;42;€;€;143;€;29;€;13;7;12;16;4;19;44;€;20;63;€;€ 5845;ttr*;Tursiops truncatus (Dolphin Oct. 2011 Baylor Ttru_1.4/turTru2);;;16.73;0;12;6;7;6;0;4;6;11;0;5;17;8;3;16;22;12;0;6;4;7;0;5;4;9;1;6;3;19;2;36;21;1;18;0;0;0;9;16;15;0;13;74;19;10;49;€;€;6;22;21;€;7;1;7;12;0;11;48;54;19;43;€;€ 7080;bacu;Balaenoptera acutorostrata scammoni (Minke whale Oct. 2013 BalAcu1.0/balAcu1);;;18.77;0;13;13;8;6;0;4;7;12;1;8;21;14;1;18;32;10;1;5;4;7;0;5;4;13;0;8;4;20;0;42;20;0;14;0;0;0;11;10;20;0;24;86;29;20;45;€;€;2;24;17;€;9;0;9;21;0;13;55;#;12;64;€;€ 13727;cmk;Callorhinchus milii (Elephant shark Dec. 2013 Callorhinchus_milii-6.1.3/calMil1);;;32.70;3;35;13;31;20;2;20;25;31;0;23;94;22;16;€;€;26;1;54;48;12;6;51;41;24;12;€;€;75;168;€;€;1;36;0;0;1;37;7;18;2;48;43;36;6;49;66;€;1;15;3;30;9;0;25;2;0;33;14;12;2;19;66;# ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg ;;;total du diagramme;;;43;1,166;489;586;803;9;489;693;1,215;66;618;1,746;976;93;582;914;956;98;625;472;970;23;1,042;441;1,044;83;749;469;1,773;240;1,101;622;48;1,305;0;0;34;1,023;979;1,062;71;1,453;1,725;1,619;92;1,660;1,054;1,361;208;1,809;238;915;915;33;563;373;36;1,111;846;846;137;1,530;1,048;472 Codons forts;;;pente;;;;1.117;0.453;0.554;0.847;;0.513;0.635;1.291;;0.690;2.057;0.955;;0.608;0.932;0.907;;0.714;0.518;0.997;;1.066;0.485;1.153;;0.87;0.501;1.706;;1.101;0.695;;1.294;;;;0.992;0.923;1.08;;1.436;1.72;1.704;;1.663;1.232;1.361;;1.656;-;0.942;0.935;;0.607;0.325;;1.195;0.965;0.837;;1.415;1.298;0.498 ;;;somme calculée;;;;-;27.0;19.3;29.5;;-;22.2;98.2;;-;149.5;21.2;;19.9;77.8;-;;-;-;-;;-;-;58.1;;16.4;55.8;50.5;;22.7;22.7;;65.2;;;;-;17.9;37.7;;109.2;-;146.4;;68.5;151.8;123.5;;105.6;-;54.7;-;;45.2;-;;-;87.2;34.6;;-;164.0;96.4 ;;;Totaux + calculés;;;;1,166;516;605;833;;489;715;1,313;;618;1,895;997;;602;992;956;;625;472;970;;1,042;441;1,102;;765;525;1,824;;1,124;645;;1,370;0;0;;1,023;997;1,100;;1,562;1,725;1,765;;1,728;1,206;1,485;;1,915;238;970;915;;608;373;;1,111;933;881;;1,530;1,212;568 ;;;R2;;;;915;784;818;830;;755;704;843;;755;892;877;;731;803;899;;763;731;828;;713;764;795;;795;874;857;;752;829;;738;;;;938;606;827;;908;783;839;;781;889;728;;754;;809;765;;860;568;;799;665;606;;822;802;606 Codons faibles;;;c/t nombre >3;;;3;;;;;0;;;;6;;;;3;;;;5;;;;2;;;;6;;;;4;;;2;;;;2;;;;5;;;;6;;;;7;;;;;2;;;2;;;;9;;; ;;;c/t nombre >3, total;;;16;;;;;0;;;;35;;;;44;;;;66;;;;10;;;;61;;;;209;;;16;;;;9;;;;30;;;;58;;;;184;;;;;16;;;9;;;;120;;; ;;;reste calculé;;;30;;;;;9;;;;37;;;;52;;;;37;;;;15;;;;28;;;;35;;;34;;;;27;;;;46;;;;40;;;;31;;;;;19;;;29;;;;26;;; ;;;multiplicité X 100;;;38;;;;;11;;;;47;;;;66;;;;47;;;;19;;;;35;;;;44;;;43;;;;34;;;;58;;;;51;;;;39;;;;;24;;;37;;;;33;;; ;;;c/t nombre=3;;;1;;;;;0;;;;1;;;;6;;;;4;;;;0;;;;1;;;;1;;;2;;;;2;;;;1;;;;0;;;;0;;;;;2;;;3;;;;0;;; Totaux des 121 réduits;;;;;46942;30;1,166;516;605;833;9;489;715;1,313;37;618;1,895;997;52;602;992;956;37;625;472;970;15;1,042;441;1,102;28;765;525;1,824;35;1,124;645;34;1,370;0;0;27;1,023;997;1,100;46;1,562;1,725;1,765;40;1,728;1,206;1,485;31;1,915;238;970;915;19;608;373;29;1,111;933;881;26;1,530;1,212;568 zéros tRNAs;;;;;;55;1;0;1;0;72;2;1;0;52;1;0;0;42;0;0;0;52;0;0;0;65;0;0;1;56;0;2;0;54;0;1;54;0;79;79;57;1;0;0;46;0;1;1;46;0;0;0;52;1;16;1;1;66;0;8;62;0;0;1;61;2;0;4 79−zéros;;;;;;24;78;79;78;79;7;77;78;79;27;78;79;79;37;79;79;79;27;79;79;79;14;79;79;78;23;79;77;79;25;79;78;25;79;0;0;22;78;79;79;33;79;78;78;33;79;79;79;27;78;63;78;78;13;79;71;17;79;79;78;18;77;79;75 indices tRNAs;;;;;;0.38;14.76;6.53;7.66;10.54;0.11;6.19;9.05;16.62;0.47;7.82;23.99;12.62;0.66;7.62;12.55;12.10;0.47;7.91;5.97;12.28;0.19;13.19;5.58;13.95;0.35;9.69;6.64;23.08;0.44;14.22;8.16;0.43;17.34;0.00;0.00;0.34;12.95;12.62;13.92;0.58;19.78;21.84;22.35;0.51;21.88;15.26;18.79;0.39;24.24;3.01;12.27;11.58;0.24;7.70;4.72;0.37;14.06;11.81;11.15;0.33;19.37;15.34;7.20 ;;;;;;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg
Introns, Comparaison des introns
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IV 1.79;Introns de tRNAs. 79− fungi;;;;;55 830;;;IV 1.42;Introns de tRNAs. 42 fungi;;;;;55 830;;;IV 1.79;Zintrons de tRNAs. 79− fungi;;;;;55 830;;;IV 1.42;Zintrons de tRNAs. 42 fungi;;;;;55 830; ttt;14;tcc;29;tat;30;tgt;3;;ttt;5;tcc;2;tat;0;tgt;2;;ttt;5;tcc;4;tat;17;tgt;2;;ttt;2;tcc;1;tat;0;tgt;1 atc;18;acc;0;aat;5;agt;3;;atc;2;acc;0;aat;5;agt;0;;atc;5;acc;0;aat;4;agt;2;;atc;1;acc;0;aat;2;agt;0 ctc;1;ccc;6;cat;8;cgc;4;;ctc;5;ccc;0;cat;0;cgc;0;;ctc;1;ccc;3;cat;3;cgc;3;;ctc;2;ccc;0;cat;0;cgc;0 gtc;0;gcc;1;gat;5;ggt;5;;gtc;2;gcc;0;gat;5;ggt;2;;gtc;0;gcc;1;gat;3;ggt;3;;gtc;1;gcc;0;gat;2;ggt;1 ttc;3;tct;3;tac;1568;tgc;18;;ttc;621;tct;83;tac;595;tgc;71;;ttc;2;tct;2;tac;79;tgc;10;;ttc;35;tct;9;tac;42;tgc;12 att;6;act;13;aac;10;agc;11;;att;336;act;100;aac;224;agc;343;;att;3;act;7;aac;5;agc;6;;att;16;act;13;aac;16;agc;38 ctt;57;cct;23;cac;14;cgt;0;;ctt;340;cct;298;cac;219;cgt;217;;ctt;10;cct;6;cac;9;cgt;0;;ctt;21;cct;20;cac;19;cgt;22 gtt;4;gct;5;gac;23;ggc;9;;gtt;140;gct;283;gac;298;ggc;243;;gtt;2;gct;4;gac;2;ggc;4;;gtt;9;gct;14;gac;15;ggc;11 tta;23;tca;16;taa;10;tga;4;;tta;83;tca;102;taa;2;tga;21;;tta;8;tca;9;taa;3;tga;2;;tta;19;tca;24;taa;1;tga;7 ata;575;aca;6;aaa;68;aga;594;;ata;140;aca;71;aaa;312;aga;48;;ata;69;aca;3;aaa;8;aga;58;;ata;41;aca;15;aaa;36;aga;12 cta;3;cca;63;caa;187;cga;166;;cta;162;cca;400;caa;140;cga;190;;cta;2;cca;7;caa;8;cga;7;;cta;32;cca;33;caa;20;cga;16 gta;6;gca;3;gaa;35;gga;27;;gta;60;gca;102;gaa;119;gga;100;;gta;5;gca;2;gaa;8;gga;9;;gta;21;gca;16;gaa;18;gga;14 ttg;506;tcg;3;tag;16;tgg;6;;ttg;360;tcg;157;tag;2;tgg;295;;ttg;65;tcg;1;tag;10;tgg;4;;ttg;32;tcg;37;tag;1;tgg;30 atg;189;acg;9;aag;406;agg;18;;atg;248;acg;60;aag;481;agg;86;;atg;11;acg;6;aag;7;agg;5;;atg;24;acg;15;aag;21;agg;18 ctg;9;ccg;14;cag;22;cgg;5;;ctg;169;ccg;74;cag;155;cgg;40;;ctg;7;ccg;4;cag;8;cgg;2;;ctg;20;ccg;18;cag;15;cgg;12 gtg;8;gcg;5;gag;16;ggg;19;;gtg;88;gcg;86;gag;405;ggg;79;;gtg;6;gcg;4;gag;6;ggg;7;;gtg;20;gcg;18;gag;16;ggg;16
Introns, Comparaison des tRNAs
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IV 1.42;Indices de tRNAs. 42 fungi;;;;;55 830;;;IV 1.79;Indices de tRNAs. 79 −fungi;;;;;55 830;;;IV 1.79;Zindices de tRNAs. 79 −fungi;;;;;55 830;;;IV 1.42;Zindices de tRNAs. 42 fungi;;;;;55 830; ttt;0.05;tcc;0.02;tat;0.05;tgt;0.02;;ttt;0.38;tcc;0.47;tat;0.43;tgt;0.39;;ttt;55;tcc;52;tat;54;tgt;52;;ttt;41;tcc;41;tat;40;tgt;41 atc;0.10;acc;0;aat;0.02;agt;0;;atc;0.47;acc;0.35;aat;0.58;agt;0.37;;atc;52;acc;56;aat;46;agt;62;;atc;38;acc;42;aat;41;agt;42 ctc;0.31;ccc;0.05;cat;0;cgc;0;;ctc;0.11;ccc;0.19;cat;0.34;cgc;0.24;;ctc;72;ccc;65;cat;57;cgc;66;;ctc;30;ccc;40;cat;42;cgc;42 gtc;0.02;gcc;0;gat;0.02;ggt;0.02;;gtc;0.66;gcc;0.44;gat;0.51;ggt;0.33;;gtc;42;gcc;54;gat;46;ggt;61;;gtc;41;gcc;42;gat;41;ggt;41 ttc;7.02;tct;7.38;tac;5.93;tgc;3.55;;ttc;14.76;tct;12.10;tac;17.34;tgc;24.19;;ttc;1;tct;0;tac;0;tgc;1;;ttc;0;tct;0;tac;0;tgc;0 att;8.98;act;7.90;aac;7.02;agc;3.67;;att;16.66;act;13.97;aac;19.78;agc;14.06;;att;0;act;1;aac;0;agc;0;;att;0;act;0;aac;0;agc;1 ctt;4.05;cct;3.64;cac;5.14;cgt;5.67;;ctt;10.54;cct;12.28;cac;12.95;cgt;11.58;;ctt;0;cct;0;cac;1;cgt;1;;ctt;11;cct;5;cac;0;cgt;0 gtt;9.55;gct;9.26;gac;9.55;ggc;11.60;;gtt;12.80;gct;23.45;gac;21.89;ggc;19.37;;gtt;0;gct;0;gac;0;ggc;2;;gtt;0;gct;0;gac;1;ggc;0 tta;3.05;tca;2.14;taa;−;tga;0.26;;tta;6.49;tca;7.91;taa;−;tga;3.01;;tta;0;tca;0;taa;−;tga;16;;tta;2;tca;0;taa;−;tga;32 ata;1.36;aca;2.33;aaa;3.69;aga;4.88;;ata;7.82;aca;9.83;aaa;21.84;aga;11.81;;ata;1;aca;0;aaa;1;aga;0;;ata;1;aca;0;aaa;1;aga;2 cta;1.71;cca;4.81;caa;4.67;cga;2.21;;cta;6.19;cca;13.19;caa;12.62;cga;7.70;;cta;2;cca;0;caa;0;cga;0;;cta;7;cca;1;caa;0;cga;20 gta;1.50;gca;3.33;gaa;5.93;gga;3.26;;gta;7.61;gca;14.38;gaa;15.26;gga;15.29;;gta;0;gca;0;gaa;0;gga;0;;gta;2;gca;0;gaa;0;gga;0 ttg;4.48;tcg;1.88;tag;−;tgg;4.12;;ttg;7.67;tcg;5.97;tag;−;tgg;12.27;;ttg;1;tcg;0;tag;−;tgg;1;;ttg;4;tcg;0;tag;−;tgg;2 atg;7.60;acg;1.57;aag;10.12;agg;1.57;;atg;26.11;acg;6.14;aag;22.38;agg;11.13;;atg;0;acg;2;aag;1;agg;1;;atg;0;acg;1;aag;1;agg;1 ctg;2.12;ccg;0.83;cag;3.52;cgg;1.31;;ctg;9.05;ccg;5.58;cag;13.91;cgg;4.72;;ctg;1;ccg;0;cag;0;cgg;8;;ctg;11;ccg;22;cag;0;cgg;4 gtg;2.21;gcg;1.43;gag;7.02;ggg;1.64;;gtg;12.53;gcg;8.15;gag;18.81;ggg;7.16;;gtg;0;gcg;1;gag;0;ggg;4;;gtg;1;gcg;16;gag;0;ggg;4 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 0.10;0.31;0.83;1.88;2.12;3.69;4.05;5.93;;0.11;0.66;3.01;8.15;9.05;13.19;13.91;19.78;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;7.02;11.60;;;;;;;;21.84;26.11;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Introns, Comparaison des sensibilités relatives
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- Légende
IV 1.42;Indices de tRNAs. 42 fungi;;;;;55 830;;;I 1;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235027; ttt;0.05;tcc;0.02;tat;0.05;tgt;0.02;;ttt;0.25;tct;0.12;tat;0.10;tgt;0.07 atc;0.10;acc;0;aat;0.02;agt;0;;att;0.12;act;2.55;aat;0.12;agt;0.02 ctc;0.31;ccc;0.05;cat;0;cgc;0;;ctt;9.15;cct;0.25;cat;0.10;cgc;8.26 gtc;0.02;gcc;0;gat;0.02;ggt;0.02;;gtt;0.22;gct;0.05;gat;0;ggt;0.02 ttc;7.02;tct;7.38;tac;5.93;tgc;3.55;;ttc;1.51;tcc;1.12;tac;1.59;tgc;1.11 att;8.98;act;7.90;aac;7.02;agc;3.67;;atc;2.28;acc;1.12;aac;2.17;agc;1.10 ctt;4.05;cct;3.64;cac;5.14;cgt;5.67;;ctc;0.95;ccc;0.68;cac;1.17;cgt;1.85 gtt;9.55;gct;9.26;gac;9.55;ggc;11.60;;gtc;1.10;gcc;1.03;gac;2.24;ggc;2.30 tta;3.05;tca;2.14;taa;−;tga;0.26;;tta;1.18;tca;1.31;taa;−;tga;0.33 ata;1.36;aca;2.33;aaa;3.69;aga;4.88;;ata;0.01;aca;1.46;aaa;2.26;aga;1.19 cta;1.71;cca;4.81;caa;4.67;cga;2.21;;cta;1.23;cca;1.35;caa;1.58;cga;0.22 gta;1.50;gca;3.33;gaa;5.93;gga;3.26;;gta;2.20;gca;2.53;gaa;2.40;gga;1.37 ttg;4.48;tcg;1.88;tag;−;tgg;4.12;;ttg;0.99;tcg;0.65;tag;−;tgg;1.08 atg;7.60;acg;1.57;aag;10.12;agg;1.57;;atg;4.47;acg;0.68;aag;0.60;agg;0.86 ctg;2.12;ccg;0.83;cag;3.52;cgg;1.31;;ctg;1.29;ccg;0.54;cag;0.59;cgg;0.83 gtg;2.21;gcg;1.43;gag;7.02;ggg;1.64;;gtg;0.33;gcg;0.30;gag;0.34;ggg;0.56 ;;;;;;;;;;;;;;;; 3.80;;;;;;;;;-24.6;256.0;;;;;; IV 1.4;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;;;IV1.4b;Champigons/bactéries sensibiltés relatives;;;;;; ttt;0.01;tcc;0.01;tat;0.01;tgt;0.01;;ttt;0.01;tcc;0.01;tat;0.01;tgt;0.01 atc;0.03;acc;0;aat;0.01;agt;0;;atc;0.03;acc;0.00;aat;0.01;agt;0.00 ctc;0.08;ccc;0.01;cat;0;cgc;0;;ctc;0.08;ccc;0.01;cat;0.00;cgc;0.00 gtc;0.01;gcc;0;gat;0.01;ggt;0.01;;gtc;0.01;gcc;0.00;gat;0.01;ggt;0.01 ttc;1.85;tct;1.94;tac;1.56;tgc;0.93;;ttc;22;tct;73;tac;-2;tgc;-16 att;2.36;act;2.08;aac;1.85;agc;0.96;;att;3;act;86;aac;-15;agc;-12 ctt;1.07;cct;0.96;cac;1.35;cgt;1.49;;ctt;12;cct;41;cac;16;cgt;-20 gtt;2.51;gct;2.44;gac;2.51;ggc;3.05;;gtt;129;gct;136;gac;12;ggc;33 tta;0.80;tca;0.56;taa;−;tga;0.07;;tta;-32;tca;-57;taa;−;tga;-79 ata;0.36;aca;0.61;aaa;0.97;aga;1.28;;ata;−;aca;-58;aaa;-57;aga;8 cta;0.45;cca;1.27;caa;1.23;cga;0.58;;cta;-63;cca;-6;caa;-22.5;cga;165 gta;0.39;gca;0.88;gaa;1.56;gga;0.86;;gta;-82;gca;-65;gaa;-35;gga;-37 ttg;1.18;tcg;0.49;tag;−;tgg;1.08;;ttg;19;tcg;-23.9;tag;−;tgg;0 atg;2.00;acg;0.41;aag;2.66;agg;0.41;;atg;-55;acg;-40;aag;342;agg;-52 ctg;0.56;ccg;0.22;cag;0.93;cgg;0.34;;ctg;-57;ccg;-59;cag;57;cgg;-59 gtg;0.58;gcg;0.38;gag;1.85;ggg;0.43;;gtg;79;gcg;23.8;gag;437;ggg;-23.1 ;;;;;;;;;;;;;;;; 10.50;;;;;;;;;-4.0;287.9;;;;;; IV1.10;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;;;IV1.10b;;Eucaryotes/bactéries sensibiltés relatives;;;;; ttt;0.04;tcc;0.04;tat;0.04;tgt;0.04;;ttt;0.04;tcc;0.04;tat;0.04;tgt;0.04 atc;0.04;acc;0.03;aat;0.06;agt;0.03;;atc;0.04;acc;0.03;aat;0.06;agt;0.03 ctc;0.01;ccc;0.02;cat;0.03;cgc;0.02;;ctc;0.01;ccc;0.02;cat;0.03;cgc;0.02 gtc;0.06;gcc;0.04;gat;0.05;ggt;0.03;;gtc;0.06;gcc;0.04;gat;0.05;ggt;0.03 ttc;1.41;tct;1.15;tac;1.65;tgc;2.30;;ttc;-7;tct;3;tac;4;tgc;108 att;1.59;act;1.33;aac;1.88;agc;1.34;;att;-30;act;19;aac;-13;agc;22 ctt;1.00;cct;1.17;cac;1.23;cgt;1.10;;ctt;5;cct;72;cac;5;cgt;-41 gtt;1.22;gct;2.23;gac;2.09;ggc;1.84;;gtt;11;gct;116;gac;-7;ggc;-20 tta;0.62;tca;0.75;taa;−;tga;0.29;;tta;-48;tca;-43;taa;−;tga;-12 ata;0.75;aca;0.94;aaa;2.08;aga;1.12;;ata;−;aca;-36;aaa;-8;aga;-6 cta;0.59;cca;1.26;caa;1.20;cga;0.73;;cta;-52;cca;-7;caa;-24.1;cga;233 gta;0.72;gca;1.37;gaa;1.45;gga;1.46;;gta;-67;gca;-46;gaa;-39;gga;6 ttg;0.73;tcg;0.57;tag;−;tgg;1.17;;ttg;-26.3;tcg;-12;tag;−;tgg;8 atg;2.49;acg;0.58;aag;2.13;agg;1.06;;atg;-44;acg;-15;aag;254;agg;23.8 ctg;0.86;ccg;0.53;cag;1.33;cgg;0.45;;ctg;-33;ccg;-2;cag;124;cgg;-46 gtg;1.19;gcg;0.78;gag;1.79;ggg;0.68;;gtg;266;gcg;156;gag;420;ggg;21 ;;;;;;;;;;;;;;;; IV 1.79;Indices de tRNAs. 79 −fungi;;;;;55 830;;;I 1;Indices de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235027; ttt;0.38;tcc;0.47;tat;0.43;tgt;0.39;;ttt;0.25;tct;0.12;tat;0.10;tgt;0.07 atc;0.47;acc;0.35;aat;0.58;agt;0.37;;att;0.12;act;2.55;aat;0.12;agt;0.02 ctc;0.11;ccc;0.19;cat;0.34;cgc;0.24;;ctt;9.15;cct;0.25;cat;0.10;cgc;8.26 gtc;0.66;gcc;0.44;gat;0.51;ggt;0.33;;gtt;0.22;gct;0.05;gat;0;ggt;0.02 ttc;14.76;tct;12.10;tac;17.34;tgc;24.19;;ttc;1.51;tcc;1.12;tac;1.59;tgc;1.11 att;16.66;act;13.97;aac;19.78;agc;14.06;;atc;2.28;acc;1.12;aac;2.17;agc;1.10 ctt;10.54;cct;12.28;cac;12.95;cgt;11.58;;ctc;0.95;ccc;0.68;cac;1.17;cgt;1.85 gtt;12.80;gct;23.45;gac;21.89;ggc;19.37;;gtc;1.10;gcc;1.03;gac;2.24;ggc;2.30 tta;6.49;tca;7.91;taa;−;tga;3.01;;tta;1.18;tca;1.31;taa;−;tga;0.33 ata;7.82;aca;9.83;aaa;21.84;aga;11.81;;ata;0.01;aca;1.46;aaa;2.26;aga;1.19 cta;6.19;cca;13.19;caa;12.62;cga;7.70;;cta;1.23;cca;1.35;caa;1.58;cga;0.22 gta;7.61;gca;14.38;gaa;15.26;gga;15.29;;gta;2.20;gca;2.53;gaa;2.40;gga;1.37 ttg;7.67;tcg;5.97;tag;−;tgg;12.27;;ttg;0.99;tcg;0.65;tag;−;tgg;1.08 atg;26.11;acg;6.14;aag;22.38;agg;11.13;;atg;4.47;acg;0.68;aag;0.60;agg;0.86 ctg;9.05;ccg;5.58;cag;13.91;cgg;4.72;;ctg;1.29;ccg;0.54;cag;0.59;cgg;0.83 gtg;12.53;gcg;8.15;gag;18.81;ggg;7.16;;gtg;0.33;gcg;0.30;gag;0.34;ggg;0.56
Les modifications des tRNAs en 34 et 37.alpha
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Les modifications des tRNAs en 34 et 37.alpha
Compilation pour les bactéries.a
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Compilation pour les bactéries.a
;;;t;;;;;c;;;;;a;;;;;g;; ;;34;;37;;;34;;37;;;34;;37;;;34;;37; t;t;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;c;Gm;G;i6A;m1G;;;G;;A;;Q;G;i6A;m6A;;;G;i6A;m6A ;;2;5;6;1;;;2;;2;;4;1;4;1;;;2;1;1 ;a;cmnmm;;i6A;m6A;;c,mo;U;i6A;m6A;;;;;;;cmnmm;U;i6A;m6A ;;2;;1;1;;2;2;2;2;;;;;;;1;1;1;1 ;g;Cm;C;i6A;m6A;;;C;i6A;;;;;;;;Cm;C;i6A;m6A ;;3;2;2;1;;;1;1;;;;;;;;1;3;2;1 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; c;t;;;;;;;;;;;;;;;;Inosine;;m1G;m2A ;;;;;;;;;;;;;;;;;3;;2;1 ;c;;G;;m1G;;;G;m1G;;;Q;G;m2A;m1G;;;;; ;;;1;;1;;;1;1;;;2;1;2;1;;;;; ;a;cmo;U;;m1G;;c,mo;U;m1G;;;cmnms;;m2A;m6A;;;;; ;;;2;;2;;2;2;4;;;2;;1;1;;;;; ;g;;C;;m1G;;;C;m1G;;;;C;m2A;;;;C;m1G; ;;;4;;3;;;2;2;;;;1;1;;;;2;2; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; a;t;;;;;;;A;t6A;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;1;1;;;;;;;;;;; ;c;;G;t6A;;;;G;t6A;;;Q;G;t6A;;;;G;t6A; ;;;4;4;;;;2;2;;;3;1;4;;;;3;3; ;a;;;;;;mo;U;t6A;;;c,mnms;;t6A;;;c,mnm;U;t6A; ;;;;;;;1;2;2;;;3;;3;;;2;1;3; ;g;k2C;;t6A;m6A;;;;;;;;C;t6A;;;;C;t6A; ;;3;;2;1;;;;;;;;1;1;;;;1;1; ;Met;ac4C;C;t6A;m6A*;;;;;;;;;;;;;;; ;;1;3;1;3;;;;;;;;;;;;;;; ;ini;;C;;A;;;;;;;;;;;;;;; ;;;10;;10;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; g;t;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;c;;G;m6A;A;;;G;;A;;Qg;G;;A;;;G;;A ;;;4;1;3;;;2;;2;;1;2;;3;;;2;;2 ;a;c,mo;U;m6A;;;c,mo;U;m6A;A;;c,mnms;;m2A;A;;c,mnm;U;m6A;A,C ;;2;2;4;;;2;2;3;1;;2;;1;2;;2;4;2;3,2 ;g;;;;;;;;;;;;;;;;;C;;A ;;;;;;;;;;;;;;;;;;3;;3
Compilation pour les eucaryotes.a
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Compilation pour les eucaryotes.a
;;;t;;;;;c;;;;;a;;;;;g;; ;;34;;37;;;34;;37;;;34;;37;;;34;;37; t;t;;;;;;Inosine;;i6A;io6A;;;;;;;;;; ;;;;;;;9;;7;2;;;;;;;;;; ;c;Gm;G;m1G;W;;;;;;;Q9;G;m1G;i6A;;G;;m1G;i6A ;;22;1;5;18;;;;;;;5;9;11;3;;2;;1;1 ;a;ncmm;U;m1G;;;ncm;U;i6A;io6A*;;;;;;;mcm;U;i6A; ;;1;1;3;;;3;2;2;2;;;;;;;3;1;6; ;g;Cm;m5C;m1G;;;;C;i6A;io6A;;;;;;;Cm;;m1G;A ;;2;1;4;;;;5;3;2;;;;;;;5;;4;1 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; c;t;Inosine;;m1G;G;;Inosine;;m1G;;;;;;;;Inosine;;m1G;m2A* ;;7;;6;1;;1;;1;;;;;;;;4;;2;2 ;c;;;;;;;;;;;Q;G;m1G;G;;;;; ;;;;;;;;;;;;1;5;5;1;;;;; ;a;;U;m1G;;;ncm;;m1G;;;mcms;;;;;mcm;;; ;;;1;1;;;1;;2;;;;;;;;;;; ;g;;C;m1G;;;;;;;;Cm;C;m2A;A;;;C;m1G; ;;;3;3;;;;;;;;3;3;1;5;;;2;2; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; a;t;Inosine;;t6A;;;Inosine;;t6A;;;;;;;;;;; ;;5;;5;;;3;;3;;;;;;;;;;; ;c;;;;;;;;;;;Q;G;t6A;;;;G;t6A;i6A ;;;;;;;;;;;;4;2;7;;;;5;4;1 ;a;PAP;;t6A;;;;;;;;mcms;cmnmm;t6A;;;mcms;mcm;t6A; ;;1;;1;;;;;;;;3;1;4;;;1;1;2; ;g;;;;;;;;;;;;C;t6A;;;;C;t6A; ;;;;;;;;;;;;;10;10;;;;1;1; ;Met;Cm;C;t6A;;;;;;;;;;;;;;;; ;;5;1;6;;;;;;;;;;;;;;;; ;ini;;C;t6A;i6A;;;;;;;;;;;;;;; ;;;18;17;1;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; g;t;Inosine;;;A;;Inosine;;m1 Inosine;;;;;;;;;;; ;;7;;;7;;6;;6;;;;;;;;;;; ;c;;;;;;;;;;;Q8;G;m1G;A;;;G;;A ;;;;;;;;;;;;4;3;1;6;;;4;;4 ;a;ncm;;;A;;;;;;;mcms*;U;;A;;mchm;;;A ;;1;;;2;;;;;;;3;1;;5;;1;;;2 ;g;;C;;A;;;;;;;;C;;A;;;C;;A ;;;2;;2;;;;;;;;4;;4;;;1;;1
Détails pour mcac lla eco hvo sce.a
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Détails pour mcac lla eco hvo sce.a
;;mcac;30 tRNAs;;;;;;;;30 gènes tRNA de mcac;;;;;;;;%GC ;;t;;c;;a;;g;;;;t;;c;;a;;g;24 t;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;m1G;;;G;m6A;G;m6A;;c;1;;;;1;;1; ;a;cmnmm;m6A;U;m6A;;;cmnmm;m6A;;a;1;;1;;;;1; ;g;Cm;m6A;;;;;Cm;m6A;;g;1;;;;;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; c;t;;;;;;;Inosine;m1G;;t;;;;;;;1; ;c;;;;;G;m1G;;;;c;;;;;1;;; ;a;U;m1G;U;m1G;cmnms;m6A;;;;a;1;;1;;1;;; ;g;;;;;;;;;;g;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; a;t;;;A;t6A;;;;;;t;;;1;;;;; ;c;G;t6A;;;G;t6A;G;t6A;;c;1;;;;1;;1; ;a;k2C;m6A;U;t6A;cmnms;t6A;cmnm;t6A;;a;;;1;;2;;1; ;g;C;A;;;C;t6A;;;;g;3;;;;1;;; ;i;C;A;;;;;;;;i;;;;;;;; g;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;;;;;G;A;;;;c;;;;;1;;; ;a;U;m6A;U;m6A;cmnms;A;U;m6A;;a;1;;1;;1;;1; ;g;;;;;;;;;;g;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;lla;38 tRNAs;;;;;;;;63 gènes tRNA de lla;;;;;;;;%GC ;;t;;c;;a;;g;;;;t;;c;;a;;g;35 t;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;m1G;G;A;G;i6A;G;i6A;;c;2;;1;;1;;1; ;a;cmnms*;i6A;mo;i6A;;;;;;a;2;;2;;;;; ;g;Cm;i6A;C;A;;;C;i6A;;g;1;;3;;;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; c;t;A;m1G;;;;;Inosine;m2A;;t;2;;;;;;2; ;c;;;;;G;G;;;;c;;;;;1;;; ;a;U;m1G;mo;m1G;U;A;;;;a;2;;2;;2;;; ;g;C;G;;;;;C;G;;g;1;;;;;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; a;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;t6A;G;A;G;t6A;G;A;;c;2;;1;;2;;1; ;a;;;mo;t6A;cmnms;t6A;U;C;;a;;;2;;3;;1; ;g;ac4C*;m6A;C;A;C;t6A;C;A;;g;4;;1;;1;;1; ;i;2 C;A;;;;;;;;i;;;;;;;; g;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;;;;;G;A;G;A;;c;;;;;2;;2; ;a;mo;m1A;mo;m6A;U;A;mo;m6A;;a;3;;6;;2;;2; ;g;;;;;;;;;;g;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;E.coli;40 tRNAs;;strain unknown;;Liepzig*;;;;86 gènes tRNA de eco;;;;K12;;;;%GC t;t;t;;c;;a;;g;;;;t;;c;;a;;g;51 ;c;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;a;G;msi6A;G;A;2 Q; msi6A;G;msi6A;;c;2;;2;;3;;1; ;g;cmnmm;msi6A;cmo;msi6A;;;U;i6A;;a;1;;1;;;;1; ;;Cm;msi6A;C;msi6A;;;C;msi6A;;g;1;;1;;;;1; c;t;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;c;;;;;;;Inosine;m2A;;t;;;;;;;4; ;a;G;m1G;;;Q;m2A;;;;c;1;;1;;1;;; ;g;;;;;cmnms;m2A;;;;a;1;;1;;2;;; ;;C;m1G;C;m1G;C;m2A;C;m1G;;g;4;;1;;2;;1; a;t;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;c;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;a;G;t6A;2 G;m6t6A;Q;t6A;G;t6A;;c;3;;2;;4;;1; ;g;k2C;t6A;;;mnms;t6A;mnm;t6A;;a;;;1;;6;;1; ;i;ac4C;t6A;;;;;;;;g;8;;1;;;;1; g;t;2 C;A;;;;;;;;i;;;;;;;; ;c;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;a;2 G;A;G;A;GluQ;m2A;G;A;;c;2;;2;;3;;4; ;g;cmo;m6A;cmo;A;mnms;m2A;mnm;A;;a;5;;3;;4;;1; ;;;;;;;;C;A;;g;;;;;;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;hvo;41 tRNAs;;codons*;;;;;;53 gènes tRNA de lla;;;;;;;;%GC ;;t;;c;;a;;g;;;;t;;c;;a;;g;66 t;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;m1G;G;A;G;m1G;G;m1G;;c;2;;1;;2;;1; ;a;U;m1G;;;;;;;;a;1;;1;;;;; ;g;C;m1G;ac4C;A;;;Cm;m1G;;g;1;;1;;;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; c;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;m1G;G;m1G;G;m1G;G;m1G;;c;1;;1;;1;;1; ;a;mo;m1G;U;m1G;;;N;m1G;;a;1;;1;;1;;1; ;g;C;m1G;ac4C;m1G;ac4C;m1G;C;m1G;;g;1;;2;;1;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; a;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;t6A;G;t6A;G;t6A;G;t6A;;c;1;;1;;1;;1; ;a;N;t6A;;;N;t6A;;;;a;;;1;;1;;1; ;g;Cm;t6A;C;t6A;ac4C;t6A;;;;g;3;;1;;1;;1; ;i;C;A;;;;;;;;i;;;;;;;; g;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;A;G;A;G;A;2 G;A;;c;2;;1;;2;;2; ;a;;;U;A;N;m1G;N;A;;a;1;;2;;1;;1; ;g;C;A;C;A;ac4C;A;C;A;;g;1;;1;;1;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;sce;34 tRNAs;;;;;;;;275 gènes tRNA de sce;;;;;;;;%GC ;;t;;c;;a;;g;;;;t;;c;;a;;g;38 t;t;;;2 Inosine; i6A;;;;;;t;;;11;;;;; ;c;2 Gm; yW;;;GPA;i6A;G;i6A;;c;10;;;;8;;4; ;a;ncmm;m1G;ncm;i6A;;;;;;a;7;;3;;;;; ;g;m5C;m1G;C;i6A;;;Cm;A;;g;10;;1;;;;6; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; c;t;;;;;;;Inosine;A;;t;;;2;;;;6; ;c;;;;;2 G; m1G;;;;c;1;;;;7;;; ;a;U;m1G;N;m1G;;;;;;a;3;;10;;9;;; ;g;;;;;;;;;;g;;;;;1;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; a;t;Inosine;t6A;2 Inosine; t6A;;;;;;t;13;;11;;;;; ;c;;;;;G;t6A;G;t6A;;c;;;;;10;;4; ;a;PAP;t6A;;;mcms;t6A;mcm;t6A;;a;2;;4;;7;;11; ;g;C;t6A;;;C;t6A;;;;g;10;;1;;14;;1; ;i;C;t6A;;;;;;;;i;;;;;;;; g;t;Inosine;A;Inosine;m1Inos;;;;;;t;14;;11;;;;; ;c;;;;;G;m1G;G;A;;c;;;;;16;;16; ;a;ncm;A;;;mcms;A;N;A;;a;2;;5;;14;;3; ;g;C;A;;;;;;;;g;2;;;;2;;2;
Les modifications des tRNAs
[modifier | modifier le wikicode]Liste des short name trouvés en colonnes 38 et 41
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Liste des short name trouvés en colonnes 38 et 41.
- Légende: utiliser le 2 points ":" comme séparateur du tableur
34::::37:
::Eu et pro caryotes:::
N:xU:::H:xA
<:xC:::;:xG
I:inosine:::O:m1I
3:mcm5s2U:::K:m1G
Q:QtRNA:::6:t6A
1:mcm5U:::/:m2A
8:manQtRNA:::+:i6A
J:Um:::E:m6t6A
2:s2U:::[:ms2t6A
#:Gm:::W:o2yW
&:ncm5U:::Y:yW
,:mchm5U:::`:io6A
P:pseudoU:::=:m6A
°:f5Cm:::≠:ms2io6A
B:Cm:::*:ms2i6A
?:m5C::::
∼:ncm5Um::::
):cmnm5Um::::
9:galQtRNA::::
5:mo5U::::
V:cmo5U::::
{:mnm5U::::
⊄:gluQtRNA::::
S:mnm5s2U::::
}:k2C::::
M:ac4C::::
$:cmnm5s2U::::
Liste des tRNAs de la base gtRNAdb
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- Liste des short name trouvés en colonnes 38 et 41.
µSTXT(N35;41;1)µµµµµµµµµµµ
STXT(N35;38;1)µµµµµµµµµµµµ
38µµ41µµµµgèneµtRNAµaaµcodonµgénomeµmilieuµséquence
IµµOµµµµgctµEucaryµAlaµAGCµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGGCGUGUKGCGUAGDC-GGD--AGCGCRCUCCCUUIGCOPGGGAGAG-------------------GDCUCCGGTPCGAUUCCGGACUCGUCCACCA
IµµOµµµµgctµAµAlaµIGCµBombyx moriµcytosolic µ-GGGGGCGUALCUCAGAD-GGU--AGAGCRCUCGCJUIGCOP#PGAGAG-------------------7UA?CGGGAPCG"UACCCGGCGCCUCCACCA
IµµOµµµµgctµAµAlaµIGCµBombyx moriµcytosolic µ-GGGGGCGUALCUCAGAD-GGU--AGAGCRCUCGCJUIGCOP#PGAGAG-------------------7UA?CGGGAPCG"UACCCGGCGCCUCCACCA
IµµOµµµµgctµAµAlaµIGCµHomo sapiensµcytosolic µ-GGGGGAUUALCUCAAAD-GGD--AGAGCRCUCGCJUIGCOP#CGAGAG-------------------7UAGCGGGAPCG"UGCCCGCAUCCUCCACCA
IµµOµµµµgctµAµAlaµIGCµHomo sapiensµcytosolic µ-GGGGAAUUALCUCAAAD-GGD--AGAGCRCUCGCJUIGCOP#CGAGAG-------------------7UAGCGGGAPCG"UGCCCGCAUUCUCCACCA
IµµOµµµµgctµAµAlaµIGCµPichia jadiniiµcytosolic µ-GGGCGUGUKGCGUAGDD-GGD--AGCGCRPUCGCUUIGCOPGCGAAAG-------------------GDCUCCGGTPCG"CUCCGGACUCGUCCACCA
3µµ6µµµµagaµUµArgµ3CPµBos taurusµcytosolic µ-GGCUCCGUKGCGCAAD--GGAD-AGCGCAPPGGA'U3CP6AUPCAAAG-------------------7DU?CGGGTPCG"GUCCCGGCGGAGUCGCCA
CµµKµµµµcggµCµArgµCCGµBos taurusµcytosolic µ-GACCCAGUKLCCUAAD--#GAD-AAGGCAPCAGCBUCCGKAGCUGGGG-------------------ADUGPGGGTPCG"GUCCCAUCUGGGUCGCCA
CµµKµµµµcggµCµArgµCCGµTriticum aestivumµcytosolic µ-GACCGCGUKGCCUAAD--GGAX-AAGGCRCUCGCBUCCGKAGCGGGAG-------------------ADU?UGGGTPCG"CUCCCAGCGPGGUCGCCA
Cµµ6µµµµaggµCµArgµCCUµBos taurusµcytosolic µ-GCCCCAGUKLCCUAAD--GGAD-AAGGCAPUGGC'UCCU6AGCCAGGG-------------------ADUGPGGGTPCG"GUCCCAUCUGGGGPCCCA
IµµKµµµµcgtµAµArgµICGµMus musculusµcytosolic µ-GGGCCAGUKLCGCAAD--GGAD-AACGCRPCUGABUICGKAPCAGAAG-------------------ADU?PAGGPPCG"CUCCUGGCUGGCUCGCCA
IµµKµµµµcgtµAµArgµICGµMus musculusµcytosolic µ-GGGCCAGUKLCGCAAD--GGAD-AACGCRPCUGABUICGKAPCAGAAG-------------------ADU?PAGGPPCG"CUCCUGGCUGGCUCGCCA
IµµAµµµµcgtµAµArgµICGµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-PUCCUCGUKLCCCAAD--GGDC-ACGGCRPCUGGCUICGAACCAGAAG-------------------ADU?CAGGTPCA"GUCCUGGCGGGGAAGCCA
Iµµ/µµµµcgtµAµArgµICGµTriticum aestivumµcytosolic µ-GACUCCGUKLCCCAAD--#GAX-AAGGCRCUGGUBUICG/AACCAGAG-------------------ADU?UGGGTPCG"UCCCCAGCGGAGUCGCCA
1µµ6µµµµagaµUµArgµUCUµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GCUCGCGUKLCGUAAD--GGC--AACGCRPCUGACU1CU6APCAGAAG-------------------ADUAUGGGTPCG"CCCCCAUCGUGAGUGCCA
Gµµ6µµµµaacµGµAsnµGUUµRattus norvegicusµcytosolic µ-GUCUCUGUKLCGCAADC-GGDX-AGCGCRPPCGGCUGUU6ACCGAAAG-------------------7DUGGUGG.PCG"GCCCACCCAGGGACGCCA
Gµµ6µµµµaacµGµAsnµGUUµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GACUCCAUGLCCAAGDD-GGDD-AAGGCRUGCGACUGUU6APCGCAAG-------------------AD?GUGAGTPCA"CCCUCACUGGGGUCGCCA
Qµµ6µµµµaacµGµAsnµQUUµBos taurusµcytosolic µ-GUCUCUGUKLCGCAADC-GGDX-AGCGCRPPCGGCUQUU6ACCGAAAG-------------------7DUGGUGG@PCG"GCCCACCCAGGGACGCCA
Qµµ6µµµµaacµGµAsnµQUUµHomo sapiensµcytosolic µ-GUCUCUGUKLCGCAADC-GGDX-AGCGCRPPCGGCUQUU6ACCGAAAG-------------------7DUGGUGG.PCG"GCCCACCCAGGGACGCCA
Qµµ6µµµµaacµGµAsnµQUUµLupinus luteusµcytosolic µ-GCCUCAGUALCUCAGD--GGDX-AGAGCRGUCGGBUQUU6ACCGAUAG-------------------7D?GUAGGTPCG"GCCCUACUUGGGGCGCCA
Qµµ6µµµµaacµGµAsnµQUUµRattus norvegicusµcytosolic µ-GUCUCUGUKLCGCAADC-GGDX-AGCGCRPPCGGCUQUU6ACCGAAAG-------------------7DUGGUGG.PCG"GCCCACCCAGGGACGCCA
8µµAµµµµgacµGµAspµ8UCµBos taurusµcytosolic µ-GGUGCCGUALCGPAGD--#GC--A.CG.GACUCUBU8UCAAAGAGUGG-------------------7A?.UGAGTPCG"UACUCAACGGCACCGCCA
8µµAµµµµgacµGµAspµ8UCµOryctolagus cuniculusµcytosolic µ-UCCCGUCUAGUAPAGU--GGDG-AGUAUAUCCGCCU8UCACGCGGGAG-------------------GA??GGGGTPCG"AUCCCCGGACGGGAGCCA
8µµAµµµµgacµGµAspµ8UCµRattus norvegicusµcytosolic µ-UCCUCGUUAGUAPAGU--GGDG-AGUAUCCCCGCUC8UCA?GCGGGAG-------------------A-??GGGGTPCGAUUCCCCGACGGGGAGCCA
8µµAµµµµgacµGµAspµ8UCµXenopus laevisµcytosolic µ-UCCUCLUUKGUAPAGU--GGDG-AGUAUCCCCGCCU8UCA?GCGGGAG-------------------A-??GGGGTPCAAUUCCCCGACGGGGAGCCA
GµµAµµµµgacµGµAspµGUCµEuglena gracilisµcytosolic µ-UCUUCGGUAGUAPAGD--#GDA-AGUAU;PCCGCCUGUCA<GCGGAAG-------------------A-<HCGGGTPCAHUUCCCGGCCGGAGAGCCA
GµµAµµµµgacµGµAspµGUCµRattus norvegicusµcytosolic µAUCCUCGUUAGUAPAGU--GGDG-AGUAUCCCCGCUCGUCA?GCGGGAG-------------------A-??GGGGTPCGAUUCCCCGACGGGGAGCCA
GµµKµµµµgacµGµAspµGUCµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-UCCGUGAUAGUUPAAD--GGDC-AGAAUGGGCGCPUGUCKCGUGCCAG-------------------A-U?GGGGTPCAAUUCCCCGUCGCGGAGCCA
GµµKµµµµtgcµGµCysµGCAµNicotiana rusticaµcytosolic µ-GGGUCCAUAGCUCAGD--#GD--AGAGCAPPUGABUGCAKAPCAAGAG-------------------7DCACCGGUPCG"ACCCGGUUGGGCCCUCCA
Gµµ+µµµµtgcµGµCysµGCAµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GCUCGUAUGGCGCAGD--GGD--AGCGCAGCAGAPUGCA+APCUGUUG-------------------7D?CUUAGTPCG"UCCUGAGUGCGAGCUCCA
Cµµ6µµµµtagµCµGlnµCUAµTetrahymena thermophilaµcytosolic µ-GGUUCUAUALUAPAGC--GCDD-AGUACUGGGGA<UCUA6APCCCUUG-------------------A-C?UGGGUPCG"AUCCCAGUAGGACCUCCA
CµµAµµµµcagµCµGlnµCUGµBos taurusµcytosolic µ-GGUUCCAUKGUGPAAD--#GDD-AGCACUCPGGABUCUGAAPCCAGCG-------------------A-U?CGAGPPCA"AUCUCGGUGGAACCUCCA
CµµAµµµµcagµCµGlnµCUGµMus musculusµcytosolic µ-GGUUCCAUKGUGPAAD--#GDD-AGCACUCPGGABUCUGAAPCCAGCG-------------------A-U??GAGPPCA"AUCUCGGUGGAACCUCCA
CµµAµµµµcagµCµGlnµCUGµRattus norvegicusµcytosolic µ-GGUUCCAUKGUGPAAD--#GDD-AGCACUCUGGABUCUGAAPCCAGCG-------------------A-U??GAGPPCA"AUCUCGGUGGAACCUCCA
Jµµ6µµµµtaaµUµGlnµJUAµTetrahymena thermophilaµcytosolic µ-GGUUCCAUALUAPAGD--GGDD-AGUACUGGGGABUJUA6APCCCUUG-------------------A-C?UGGGUPCG"AUCCCAGUGGGACCUCCA
JµµAµµµµcaaµUµGlnµJUGµMus musculusµcytosolic µ-GGUCCCAUKGUGPAAD--#GDD-AGCACUCPGGABUJUGAAPCCAGCG-------------------A-U??GAGPPCA"AUCUCGGUGGGACCUCCA
Jµµ/µµµµcaaµUµGlnµJUGµNicotiana rusticaµcytosolic µ-GGUUCUAUKGUGPAGD--#GDD-AGCACUCPGGABUJUG/APCCAGCG--------------------ACCUGGGTPCG"CUCCCGGUAGGACCUCCA
JµµAµµµµcaaµUµGlnµJUGµTetrahymena thermophilaµcytosolic µ-GGUUGUAUKLUGPAGC--GGDD-AGCACCGAGGACUJUGAAPCCUCUG-------------------A-C?UGGGUPCG"AUCCCAGUACGACCUCCA
NµµAµµµµcaaµUµGlnµNUGµHomo sapiensµcytosolic µ-GGCCCCAUKGUGPAAU--#GDD-AGCACUCPGGABUNUGAAPCCAGCG-------------------A-U??GAGPPCA"AUCUCGGUGGGACCUCCA
NµµAµµµµcaaµUµGlnµNUGµHomo sapiensµcytosolic µ-GGUCCCAUKGUGPAAU--#GDD-AGCACUCPGGABUNUGAAPCCAGCG-------------------A-U??GAGPPCA"AUCUCGGUGGGACCUCCA
UµµEµµµµtaaµUµGlnµUUAµLupinus luteusµcytosolic µ-..CGUCUUAL...AGD--GG..-A...CR.C.UGBUUUAEACACG.UG-------------------7D?GUGGGTPCG"AUCCCACAGACGAGACCA
2µµAµµµµgaaµUµGluµ2UCµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-UCCCAUAUGGUCPAGD--GGCD-AGGAUAUCUGGBU2UCACCCAGAAG-------------------G-CCCGGGTPCGAUUCCCGGUAUGGGAACCA
3µµAµµµµgaaµUµGluµ3UCµRattus norvegicusµcytosolic µ-UCCCACAUKGUCPAGC--GGDD-AGGAUUCCUGGPU3UCACCCAGGCG-------------------G-C??GGG\PCGACUCCCGGUGUGGGAACCA
3µµAµµµµgaaµUµGluµ3UCµSchizosaccharomyces pombeµcytosolic µ-UCCGUUGUKGUCCAAC--GGCD-AGGAUUCGUCGCU3UCACCGACGGG-------------------A-G?GGGGTPCGACUCCCCGCAACGGAGCCA
CµµAµµµµgagµCµGluµCPCµHordeum vulgareµcytosolic µ-UCCGUCGUAGUCPAGGD-GGDP-AGGAUACUCGGCUCPCACCCGAGAG-------------------A-C?CGGGTPCG"GUCCCGGCGACGGAACCA
CµµAµµµµgagµCµGluµCUCµHomo sapiensµcytosolic µ-UCCCUGGUGLUCPAGU--GGDP-AGGAUUCGGCGCUCUCACCGCCGCG-------------------G-C??GGG\PCGAUUCCCGGUCAGGGAACCA
CµµAµµµµgagµCµGluµCUCµLupinus luteusµcytosolic µ-UCCGUUGUAGUCPAGDD-GGDC-AGGAUAUUCGGCUCUCACCCGAAAG-------------------A-C?CGGGTPCA"GUCCCGGCGACGGAACCA
CµµAµµµµgagµCµGluµCUCµMus musculusµcytosolic µ-UCCCUGGUGLUCPAGU--GGDP-AGGAUUCGGCGCUCUCACCGCCGCG-------------------G-C??GGG\PCGAUUCCCGGUCAGGGAACCA
UµµAµµµµgaaµUµGluµUPCµHordeum vulgareµcytosolic µ-UCCGUCGUAGUCPAGGD-GGDP-AGGAUACUCGGCUUPCACCCGAGAG-------------------A-C?CGGGTPCA"GUCCCGGCGACGGAACCA
3µµAµµµµgaaµUµGluµUUCµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-UCCGAUAUAGUGPAAC--GGCD-AUCACAPCACGCU3UCACCGUGGAG-------------------A-C?GGGGTPCGACUCCCCGUAUCGGAGCCA
,µµAµµµµggaµUµGlyµ,CCµBombyx moriµcytosolic µ-GCGJUGGUKGUGPAAD--GGDC-AGCAUAGPUGCCU,CCAAGCAGUUG-------------------A-U??GGGTPCG"UUCCCGGCCAACGCACCA
CµµAµµµµgggµCµGlyµCCCµHomo sapiensµcytosolic µ-GCGBCLCUGGUGPAGU--GGD--AUCAUGCAAGAJUCCCAUZCUUGCG-------------------A-C??GGGTPCG"UUCCCGGGCGGCGCACCA
GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµBombyx moriµcytosolic µ-GCAJCGGUKGUUCAGU--GGD--AGAAUGCUCGCCUGCCA?GCGGGCG-------------------G-???GGGTPCG"UUCCCGGCCGAUGCACCA
GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµHomo sapiensµcytosolic µ-GCAJULGUGGUUCAGU--GGD--AGAAUUCUCGCCUGCCA?GCGGGAG-------------------G-???GGGTPCG"UUCCCGGCCAAUGCACCA
GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµLupinus luteusµcytosolic µ-GCABCAGUKGUCPAGD--GGU--AGAAUAGUACCCUGCCA?GGUACAG-------------------A-???GGGUPCG"UUCCCGGCUGGUGCACCA
GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GCGBAAGUKGUUPAGD--GGD--AAAAUCCAACGPUGCCAPCGUUGGG---------------------C?CCGGTPCGAUUCCGGGCUUGCGCACCA
GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµTriticum aestivumµcytosolic µ-GCABCAGUKGUCPAGD--GGU--AGAAUAGUACCCUGCCA?GGUACAG-------------------A-???GGGUPCG"UUCCCGGCUGGUGCACCA
NµµAµµµµggaµUµGlyµUCCµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGGCGGUUAGUGPAGD--GGDD-AUCAUCCCACCCUNCCAAGGUGGGG-------------------A-CACGGGTPCGAUUCUCGUACCGCUCACCA
GµµKµµµµcacµGµHisµGUGµDrosophila melanogasterµcytosolic µGGCCGUGAUCGUCPAGD--GGDD-AGGACCCCACGPUGUGKCCGUGGUA-------------------A-CC?AGGUPCG"AUCCUGGUCACGG?ACCA
GµµGµµµµcacµGµHisµGUGµHomo sapiensµcytosolic µ;GCCGUGAUCGUAPAGD--GGDD-AGUACUCUGCGPUGUGGCCGCAGCA-------------------A-??UCGGUPCG"AUCCGAGUCACGGCACCA
GµµKµµµµcacµGµHisµGUGµLupinus luteusµcytosolic µGGUGGCUGUAGUUPAGD--GGDD-AGAACACAACGPUGUGKCCGUUGAA-------------------A-C?UGGGUPCG"AUCCCAGCAGCCACACCA
GµµKµµµµcacµGµHisµGUGµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µGGCC:UCUUAGUAPAGD--#GDD-AGUACACAACAPUGUGKCPGUUGAA-------------------A-C?CUGGTPCGAUUCUAGGAGGUGGCACCA
GµµKµµµµcacµGµHisµGUGµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µGGCC:UCUUAGUAPAGD--#GDD-AGUACACAUCGPUGUGKCCGAUGAA-------------------A-C?CUGGTPCGAUUCUAGGAGAUGGCACCA
QµµKµµµµcacµGµHisµQUGµOvis ariesµcytosolic µGGCCGULAUCGUAPAGD--GGDD-AGUACUCUGCGPUQUGKCCGCAGCA-------------------A-C?UCGGUPCG"AUCCGAGUCACGG?ACCA
Iµµ6µµµµattµAµIleµAAUµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGUCUCUUKLCCCAGDD-GGDD-AAGGCACCGUGCUIAU6ACGCGGGG-------------------AD?AGCGGTPCG"UCCCGCUAGAGACCACCA
Iµµ6µµµµattµAµIleµIAUµBombyx moriµcytosolic µ-GGCCCAUUALCUCAGDD-GGDN-AGAGCRPCGUGCUIAU6ACGCGAAG-------------------7U?G?GGGTPCG"UCCCCUCAUGGGCCACCA
Iµµ6µµµµattµAµIleµIAUµLupinus luteusµcytosolic µ-GGCCCAUUALCCCAGDD-GGDD-AAGGCRPGGUGCUIAU6ACGCCGAA-------------------GD?AGCAGTPCG"UCCUGCUAUGGGCCACCA
Iµµ6µµµµattµAµIleµIAUµMus musculusµcytosolic µ-GGCCGGUUALCUCAGDD-GGDD-AGAGCRPGGPGCUIAU6ACGCCAAG-------------------7D?GCGGGTPCG"UCCCCGUACGGGCCACCA
Iµµ6µµµµattµAµIleµIAUµPichia jadiniiµcytosolic µ-GGUCCCUUGLCCCAGDD-GGDD-AAGGCRPGGUGCUIAU6ACGCCAAG-------------------AD?AGCAGTPCG"UCCUGCUAGGGACCACCA
Pµµ6µµµµataµUµIleµUAUµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GCUCGUGUALCUCAGD--GGDD-AGAGCUPCGUGCUPAP6ACGCGACC-------------------7D?GUGGGTPCA"UCCCCACCPCGAGCACCA
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµAsterina amurensisµcytosolic µ-AGCAGAGUKLCGCAGU--GGA--AGCGUGCUGGGCCCAU6ACCCAGAG-------------------7D?CGAGGAPCG"AACCUCGCUCUGCUACCA
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-AGCAGAGUKLCGCAGU--GGA--AGCGULCUGGGCCCAU6ACCCAGAG-------------------7D?CGAGGAUCG"AACCUUGCUCUGCUACCA
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµEuphausia superbaµcytosolic µ-AGCAGAGUKLCGCAGU--GGA--AGCGULCUGGGCCCAU6ACCCAGAG-------------------7UCGGUAGAPCG"AACUACUCUCUGCUACCA
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµHomo sapiensµcytosolic µ-AGCAGAGUKLCGCAGC--GGA--AGCGULCUGGGCCCAU6ACCCAGAG-------------------7D?GAUGGAUCG"AACCAUCCUCUGCUACCA
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµLupinus luteusµcytosolic µ-AUCAGAGUKLCGCAGC--GGA--AGCGCRGPGGGCCCAU6ACCCACAG-------------------7D?<CAGGAPCG"AACCU.GCUCUGAUACCA
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµMus musculusµcytosolic µ-AGCAGAGUKLCGCAGC--GGA--AGCGULCUGGGCCCAU6ACCCAGAG-------------------7D?GAUGGAUCG"AACCAUCCUCUGCUACCA
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµNeurospora crassaµcytosolic µ-AGCUGCAUKGCGCAGC--GGA--AGCGCRC.GGGCUCAU6ACCCGGAG-------------------7DCACUCGAUCG"AACGA;UUGCAGCUACCA
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµOryctolagus cuniculusµcytosolic µ-AGCAGAGUKLCGCAGC--GGA--AGCGULCUGGGCCCAU6ACCCAGAG-------------------7D?GAUGGAUCG"AACCAUCCUCUGCUACCA
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµOvis ariesµcytosolic µ-AGCAGAGUKLCGCAGC--GGA--AGCGULCUGGGCCCAU6ACCCAGAG-------------------7D?GAUGGAUCG"AACCAUCCUCUGCUACCA
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµPhaseolus vulgarisµcytosolic µ-AUCAGAGUKLCGCAGC--GGA--AGCGULGUGGGCCCAU6ACCCACAG-------------------7D?CCAGGAPCG"AACCU#GCUCUGAUACCA
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµPichia jadiniiµcytosolic µ-AGCGUCUUKLCGCAGD--GGA--AGCGCRCAGGGCUCAU6ACCCUGAU-------------------7D??CUGGAUCG"AACCAℑGAGACGCUACCA
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-AGCGCCGUKLCGCAGD--GGA--AGCGCRCAGGGCUCAU6ACCCUGAU-------------------7D??UCGGAUCG"AACCGˆGCGGCGCUACCA
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµSalmo salarµcytosolic µ-AGCAGAGUKLCGCAGC--GGA--AGCGURCUGGGCCCAU6ACCCAGAG-------------------7D?GAUGGAUCG"AACCAUCCUCUGCUACCA
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµScenedesmus obliquusµcytosolic µ-AGCUGAGUKLCGCAGD--GGA--AGCGPLAPGGGCUCAU6ACCCAUAG-------------------7D?ACAGGAUCG"AACCU;UCUCAGCUACCA
Cµµ+µµµµatgµCµIniµCAUµSchizosaccharomyces pombeµcytosolic µ-PGCGCGGUALGAGAGD--GGA--ACUCCRACGGGCUCAU+ACCCGUAG-------------------7UC?CAGGAUCG"AACCUGGCCGCGCAACCA
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµTetrahymena thermophilaµcytosolic µ-AGCAGGGUKGCGAAAD--#GA--AUCGCGUPGGGCUCAU6ACPCAAAA-------------------7U?AGAGGAPCG"AACCUCUCUCUGCUACCA
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµTriticum aestivumµcytosolic µ-AUCAGAGUKLCGCAGC--GGA--AGCGULGPGGGCCCAU6ACCCACAG-------------------7D??CAGGAPCG"AACCU;GCUCUGAUACCA
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµXenopus laevisµcytosolic µ-AGCAGAGUKLCGCAGC--GGA--AGCGULCUGGGCCCAU6ACCCAGAG-------------------7D?GAUGGAUCG"AACCAUCCUCUGCUACCA
.µµKµµµµtt.µµLeuµ.AAµHomo sapiensµcytosolic µ-GUCAGLAUGLCMGAGU--GGDCPAAGGCRCCAGACU.AAKPPCUGGJ-CPCCG--GA-----UGGAG--?GUGGGTPCG"AUCCCACUUCUGACACCA
.µµKµµµµtt.µµLeuµ.AAµPhaseolus vulgarisµcytosolic µ-GUCAGGAUGLCMGAGD--GGDCXAAGGCRCCAGACU.AAKPPCUGGJ-CUUC---GAGA----GAGGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACUUCUGACACCA
.µµKµµµµtt.µµLeuµ.AAµPhaseolus vulgarisµcytosolic µ-GUCAGGAUGLCMGAGD--GGDCXAAGGCRCCAGACU.AAKPPCUGGJ-CUUC---GAAA----GAGGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACUUCUGACACCA
.µµKµµµµtt.µµLeuµ.AAµPhaseolus vulgarisµcytosolic µ-GCUGGUUUGGCMGAGA--GGDD-AAGGCRGAAGACU.AAKAPCUUCJ-GCAG---UCAA----CUGCG-?AUGGGTPCG"ACCCCAUAGCCAGCACCA
.µµKµµµµtt.µµLeuµ.AAµSolanum tuberosumµcytosolic µ-GUCAGGAUGGCMGAGD--GGDCXAAGGCRCCAGACU.AAKUPCUGGJ-CUUC---GUAA----GAGGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACUUCUGACACCA
.µµKµµµµct.µµLeuµ.AGµPhaseolus vulgarisµcytosolic µ-GAUAGUUUGLCMGAGD--GGDCXAAGGCRCCAGAPU.AGKCPCUGGJ-CCG----AAA------.GGG-?GUGGGUPCA"AUCCCACAGCUGUCACCA
°µµKµµµµttgµCµLeuµ°AAµBos taurusµcytosolic µ-GUCAGLAUGLCMGAGU--GGDCPAAGGCLCCAGACU°AAKPPCUGGJ-CPCC---GUAU----GGAGG-?GUGGGTPCG"AUCCCACUUCUGACACCA
<µµ;µµµµttgµCµLeuµ<AAµRattus norvegicusµcytosolic µAGUCAGLAUGLCMGAGU--GGDCPAAGGCRCCAGACU<AA;PPCUGGN-PCCG---AA------UGGAG-?GUGGGTPCG"AUCCCACUUCUGACACCA
<µµ;µµµµttgµCµLeuµ<AAµRattus norvegicusµcytosolic µAGUCAGLAUGLCMGAGU--GGDCPAAGGCRCCAGACU<AA;PPCUGGN-PCCG---UA------UGGAG-?GUGGGTPCG"AUCCCACUUCUGACACCA
BµµKµµµµttgµCµLeuµBAAµCandida cylindraceaµcytosolic µ-GGCCGUUUGLCMGAGD--#GDCDAAGGCRUCUGABUBAAKAPCAGAJ-CUC----GUAA-----GAGG-?GUGUGTPCG"ACCACACAGCGGUCACCA
BµµKµµµµttgµCµLeuµBAAµPichia jadiniiµcytosolic µ-GGAUCUUUGLCMGAGC--#GDDUAAGGCRCUCGABUBAAKAPCGAGU-AUC----GUAA-----GAUG-?AUGAGTPCG"AUCUCAUAGGAUCCACCA
?µµKµµµµttgµCµLeuµCAAµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGUUGUUUGLCMGAGC--#GDCDAAGGCRCCUGAPU?AAKCPCAGGU-AUC----GUAA-----GAUG-?AAGAGTPCGAAUCUCUUAGCAACCACCA
CµµKµµµµctgµCµLeuµCAGµBos taurusµcytosolic µ-GUCAGLAUGLCMGAGC--GGDDCAAGGCRCUGCGJUCAGK.CGCAGJ-CPCC---CU------GGAGG-?GUGGGTPCG"AUCCCACUUCUGACACCA
CµµKµµµµctgµCµLeuµCAGµCandida albicansµcytosolic µ-GAUACGAUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCRAAGGAUGCAGKPPCCUU--UGGGC--AUU----GCCCG--?GCAGGTPCG"ACCCUGCUCGUGUCGCCA
CµµKµµµµctgµCµLeuµCAGµLupinus luteusµcytosolic µ-GUCAGGAUGLCMGAG-D-GGDCXAAGGCRCCAGUJUCAGKPACUGGJCPCG----AAC------CGGG-?AUGGGTPCG"AUCCCAUUCUUGACACCA
IµµKµµµµcttµAµLeuµIAGµBos taurusµcytosolic µ-GGUAGCGUGLCMGAGC--GGDCPAAGGCRCUGGAZUIAGKCPCCAGU-CPCP---UC------GGGGG-?GUGGGTPCG"AUCCCACCGCUGCCACCA
IµµKµµµµcttµAµLeuµIAGµBos taurusµcytosolic µ-GGUAGCGUGLCMGAGC--GGDCPAAGGCRCUGGAZUIAGKCPCCAGU-CPCP---UC------GGGGG-?GUGGGTPCG"AUCCCACCGCUGCCACCA
IµµGµµµµcttµAµLeuµIAGµCaenorhabditis elegansµcytosolic µ-GGAGAGAUGGCMGAGC--GGDCUAAGGCGCUGGUUUIAGGCACCAGU-CCCU---UC------GGGGG-CGUGGGTUCGAAUCCCACUCUCUUCACCA
IµµKµµµµcttµAµLeuµIAGµCandida cylindraceaµcytosolic µ-GGUUCUCUGGCMGAGD--GGDCDAAGGCRCAUGGPUIAGKPCCAUGU-CUC----UUCG-----GAGG-?GCGAGTPCG"ACCUCGCGGGAAUCACCA
IµµKµµµµcttµAµLeuµIAGµCandida cylindraceaµcytosolic µ-GGCUCUCUGGCMGAGD--GGDCDAAGGCRCUAGGPUIAGKPCCUAGU-CUC----UUCG-----GAGG-?GCGAGTPCG"ACCUCGCGGGAGUCACCA
IµµKµµµµcttµAµLeuµIAGµLupinus luteusµcytosolic µ-GUCAGGAUGLCMGAG-D-GGDCXAAGGCRCCAGAZUIAGKPUCUGGJCPCGA---A-------UCGGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACUCUUGACACCA
IµµKµµµµcttµAµLeuµIAGµLupinus luteusµcytosolic µ-GUCAGGAUGLCMGAG-D-GGDCXAAGGCRCCAGAZUIAGKPUCUGGJCPGA----AUC------UUGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACUCUUGACACCA
NµµKµµµµttaµUµLeuµNAAµCucumis sativusµcytosolic µ-GUCAGGAUGLC?GAG-D-GGDCXAAGGCRCCAGACUNAAKPPCUGGJ-CCUC---UAAG----GAGGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACUUCUGACACCA
UµµKµµµµttaµUµLeuµUAAµLupinus luteusµcytosolic µ-GUCAGGAUGLCMGAG-D-GGDCXAAGGCRCCAGACUUAAKPPCUGGJCPCGA---A-------UCGGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACUUCUGACACCA
∼µµKµµµµttaµUµLeuµUAAµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGAGGGUUGLCMGAGD--#GDCDAAGGCRGCAGABU∼AAKAPCUG-UUGGAC---GGUU----GUCC-G?GCGAGTPCG"ACCUCGCAUCCUUCACCA
UµµKµµµµctaµUµLeuµUAGµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGGAGUUUGLCMGAGD--#GDDDAAGGCRPCAGAPUUAGKCPCUGAU-AUC----UUCG-----GAUG-?AAGGGTPCG"AUCCCUUAGCUCUCACCA
)µµ6µµµµaaaµUµLysµ)UUµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-GCCCGGAUALCUCAGDC-GGD--AGAGCAPPGGACU)UU6APCCAAGG-------------------7D?CAGGG\PCA"GUCCCUGUUCGGGCGCCA
3µµ[µµµµaaaµUµLysµ3UUµOryctolagus cuniculusµcytosolic µ-GCCCGGAUALCUCAGDC-GGD--AGAGCAPCAGACU3UU[APCUGAGG-------------------7D??AGGG\PCA"GUCCCUGUUCGGGCGCCA
3µµ[µµµµaaaµUµLysµ3UUµRattus norvegicusµcytosolic µ-GCCCGLAUALCUCAGDC-GGD--AGAGCAPCAGACU3UU[APCUGAGG-------------------7D??AGGG\PCA"GUCCCUGUUCGGGCGCCA
3µµ6µµµµaaaµUµLysµ3UUµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-PCCUUGUUALCUCAGDD-GGD--AGAGCRPPCGGCU3UU6ACCGAAAU-------------------7D?AGGGGTPCG"GCCCCCUAPGAGGAGCCA
Cµµ6µµµµaagµCµLysµCUNµMus musculusµcytosolic µ-GCCCGLCUALCUCAGDC-GGD--AGAGCAPGGGACUCUN6APCCCAGG-------------------7D?GUGGG\PCG"GCCCCACGUUGGGCGCCA
Cµµ6µµµµaagµCµLysµCUNµRattus norvegicusµcytosolic µ-GCCCGLCUALCUCAGDC-GGD--AGAGCAPGAGACUCUN6APCUCAGG-------------------7D?GUGGG\PCG"GCCCCACGUUGGGCGCCA
Cµµ6µµµµaagµCµLysµCUNµRattus norvegicusµcytosolic µ-GCCCGLCUALCUCAGDC-GGD--AGAGCAPGGGACUCUN6APCCCAGG-------------------7D?GUGGG\PCG"GCCCCACGUUGGGCGCCA
Cµµ6µµµµaagµCµLysµCUUµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-GCCCGGCUALCUCAGDC-GGD--AGAGCAPGAGACUCUU6APCUCAGG-------------------7DCGUGGG\PCG"GCCCCACGUUGGGCGCCA
Cµµ6µµµµaagµCµLysµCUUµLoligo bleekeriµcytosolic µ-UCCCGLCUALCUCAGDC-GGU--AGAGCACGAGA<UCUU6APCUCGGG-------------------7D?GUGGG\PCG"GCCCCACGUUGGGAGCCA
CµµHµµµµaagµCµLysµCUUµMus musculusµcytosolic µ-GCCCGGCUALCUCAGDC-GGU--AGAGCAPGAGACUCUUHAPCUCAGG-------------------7D?GUGGG\PCG"GCCCCACGUUGGGCGCCA
Cµµ6µµµµaagµCµLysµCUUµOryctolagus cuniculusµcytosolic µ-GCCCGGCUALCUCAGDC-GGD--AGAGCAPGGGACUCUU6APCCCAGG-------------------7D?GUGGG\PCG"GCCCCACGUUGGGCGCCA
Cµµ6µµµµaagµCµLysµCUUµOryctolagus cuniculusµcytosolic µ-GCCCGGCUALCUCAGDC-GGD--AGAGCAPGAGACUCUU6APCUCAGG-------------------7D?GUGGG\PCG"GCCCCACGUUGGGCGCCA
Cµµ6µµµµaagµCµLysµCUUµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GCCUUGUUKLCGCAADC-GGD--AGCGCRPAUGACUCUU6APCAUAAG-------------------7UUAGGGGTPCG"GCCCCCUACAGGGCUCCA
Cµµ6µµµµaagµCµLysµCUUµTriticum aestivumµcytosolic µ-GCCCGUCUALCUCAGDD-GGU--AGAGCRCAAGGCUCUU6ACCUUGUG-------------------KD?GUGGGTPCG"GCCCCACGGUPGGCGCCA
NµµHµµµµaaaµUµLysµNUUµLoligo bleekeriµcytosolic µ-GCCUCCAUALCUCAGDC-GGU--AGAGCAPCAGACUNUUHA@CUGAGG-------------------7D?UGGGG\PCG"GUCCCCAULUGGG?UCCA
NµµHµµµµaaaµUµLysµNUUµLoligo bleekeriµcytosolic µ-GCCUUCAUALCUCAGDC-GGU--AGAGCAPCAGACUNUUHA@CUGAGG-------------------7D?UGGGG\PCG"GUCCCCAULCGGG?UCCA
Bµµ6µµµµatgµCµMetµBAUµHomo sapiensµcytosolic µ-GCCUCLUUALCGCAGDA-GGD--AGCGCRPCAGPCUBAU6APCUGAAG-------------------7D?GUGAGTPCG"UCCUCACACGGGGCACCA
BµµEµµµµatgµCµMetµBAUµLupinus luteusµcytosolic µ-GGGGUGGUKLCGCAGDD-GGCX-AGCGCRPAGGPCUBAUEAPCCUGAG-------------------7D?GAGAGTPCG"GCCUCUCUCACCCCACCA
Bµµ6µµµµatgµCµMetµBAUµMus musculusµcytosolic µ-GCCUCLUUALCGCAGDA-GGD--AGCGCRPCAGPCUBAU6APCUGAAG-------------------7D?GUGAGTPCG"UCCUCACACGGGGCACCA
Bµµ6µµµµatgµCµMetµBAUµOryctolagus cuniculusµcytosolic µ-GCCUCLUUALCGCAGDA-GGD--AGCGCRPCAGPCUBAU6APCUGAAG-------------------7D?GUGAGTPCG"UCCUCACACGGGGCACCA
BµµEµµµµatgµCµMetµBAUµTriticum aestivumµcytosolic µ-GGGGUGGUKLCGCAGDD-GGCX-AGCGCRPAGGPCUBAUEAPCCUGAG-------------------7D?GAGAGTPCG"GCCUCUCUCACCCCACCA
Cµµ6µµµµatgµCµMetµCAUµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GCUUCAGUALCUCAGDA-GGA--AGAGCRPCAGPCUCAU6APCUGAAG-------------------7D?GAGAGTPCG"ACCUCUCCUGGAGCACCA
#µµKµµµµttcµGµPheµ#AAµBombyx moriµcytosolic µ-GCCGAAAUALCUCAGDD-GGG--AGAGCRPPAGABU#AAKAPCUAAAG-------------------7D?CCUGGTPCA"UCCCGGGUUUCGGCACCA
#µµKµµµµttcµGµPheµ#AAµBombyx moriµcytosolic µ-GCCGAAAUALCUCAGDD-GGG--AGAGCRPPAGABU#AAKAPCUAAAG-------------------7D?CCUGGTPCG"UCCCGGGUUUCGGCACCA
#µµWµµµµttcµGµPheµ#AAµBos taurusµcytosolic µ-GCCGAAAUALCUC"GDD-GGG--AGAGCRPPAGABU#AAWAPCUAAAG-------------------7DC?CUGGTPCG"UCCCGGGUUUCGGCACCA
#µµWµµµµttcµGµPheµ#AAµBos taurusµcytosolic µ-GCCGAAAUALCUC"GDD-GGG--AGAGCRPPAGABU#AAWAPCUAAAG-------------------7DC?CUGGTPCA"UCCCGGGUUUCGGCACCA
#µµWµµµµttcµGµPheµ#AAµBos taurusµcytosolic µ-GCCGAAAUALCUC"GDD-GGG--AGAGCRPPAGABU#AAWAPCUAAAG-------------------7DC?CUGGTPCG"UCCCGGGUUUCGGCACCA
#µµYµµµµttcµGµPheµ#AAµBrassica napusµcytosolic µ-GCGGGGAUALCUCAGDD-GGG--AGAGCRPCAGABU#AAYAPCUGAAG-------------------7DCGCGUGTPCG"UCCACGCUCACCGCACCA
#µµKµµµµttcµGµPheµ#AAµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-GCCGAAAUALCUCAGDD-GGG--AGAGCRPPAGABU#AAKAPCUAAAG-------------------7DCCCCGGTPCA"UCCCGGGUUUCGGCACCA
#µµYµµµµttcµGµPheµ#AAµEuglena gracilisµcytosolic µ-GCCGACUUALCUBAGDD-GGG--AGAGCRPPAGABU#AAYAPCUAAAG-------------------7UCCCUGGTPCG"UCCCGGGAGPCGGCACCA
#µµWµµµµttcµGµPheµ#AAµHomo sapiensµcytosolic µ-GCCGAAAUALCUC"GDD-GGG--AGAGCRPPAGABU#AAWAPCUAAAG-------------------7DC?CUGGTPCG"UCCCGGGUUUCGGCACCA
#µµWµµµµttcµGµPheµ#AAµHordeum vulgareµcytosolic µ-GCGGGGAUALCUCAGDD-GGG--AGAGCRPCAGABU#AAWAPCUGAAG-------------------7DCGCGUGTPCG"UCCACGCUCACCGCACCA
#µµWµµµµttcµGµPheµ#AAµLupinus luteusµcytosolic µ-GCGGGGAUALCUCAGDD-GGG--AGAGCRPCAGABU#AAWAPCUGAAG-------------------7DCACGUGTPCG"UCCACGUUCACCGCACCA
#µµKµµµµttcµGµPheµ#AAµMus musculusµcytosolic µAGCCGAAAUALCUC"GDD-GGG--AGAGCRPPAGABU#AAKAPCUAAAG-------------------7UC?CUGGTPCG"UCCCGGGUUUCGGCACCA
#µµYµµµµttcµGµPheµ#AAµMus musculusµcytosolic µ-GCCGAAAUALCUC"GDD-GGG--AGAGCRPPAGABU#AAYAPCUAAAG-------------------7UC?CUGGTPCG"UCCCGGGUUUCGGCACCA
#µµYµµµµttcµGµPheµ#AAµMus musculusµcytosolic µ-GCCGAAAUALCUC"GDD-GGG--AGAGCRPPAGABU#AAYAPCUAAAG-------------------7UC?CUGGTPCG"UCCCGGGUUUCGGCACCA
#µµYµµµµttcµGµPheµ#AAµNeurospora crassaµcytosolic µ-GCGGGUUUALCUCHGDD-GGG--AGAGCRPCAGABU#AAYAP?UGAAG-------------------7D?GUGUGTPCG"UCCACACAAACCGCACCA
#µµWµµµµttcµGµPheµ#AAµOryctolagus cuniculusµcytosolic µ-GCCGAAAUALCUC"GDD-GGG--AGAGCRPPAGABU#AAWAPCUAAAG-------------------7DC?CUGGTPCG"UCCCGGGUUUCGGCACCA
#µµWµµµµttcµGµPheµ#AAµPisum sativumµcytosolic µ-GCGGGGAUALCUCAGDD-GGG--AGAGCRPCAGABU#AAWAPCUGAAG-------------------7DCGCGUGTPCG"UCCACGCUCACCGCACCA
#µµYµµµµttcµGµPheµ#AAµSchizosaccharomyces pombeµcytosolic µ-GUCGCAAU;LUGPAGDD-GGG--AGCAPLACAGABU#AAYAPCUGUUG-------------------7NCAUCGGTPCGAUCCCGGUUUGUGACACCA
#µµWµµµµttcµGµPheµ#AAµTriticum aestivumµcytosolic µ-GCGGGGAUALCUCAGDD-GGG--AGAGCRPCAGABU#AAWAPCUGAAG-------------------7DCGCGUGTPCG"UCCACGCUCACCGCACCA
#µµWµµµµttcµGµPheµ#AAµXenopus laevisµcytosolic µ-GCCGAAAUALCUC"GDD-GGG--AGAGCRPPAGABU#AAWAPCUAAAG-------------------7DC?CUGGTPCG"UCCCGGGUUUCGGCACCA
#µµYµµµµttcµGµPheµGAAµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GCGGAUUUALCUCAGDD-GGG--AGAGCRCCAGABU#AAYAP?UGGAG-------------------7UC?UGUGTPCG"UCCACAGAAUUCGCACCA
#µµYµµµµttcµGµPheµGAAµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GCGGACUUALCUCAGDD-GGG--AGAGCRCCAGABU#AAYAP?UGGAG-------------------7UC?UGUGTPCG"UCCACAGAGUUCGCACCA
GµµKµµµµttcµGµPheµGAAµScenedesmus obliquusµcytosolic µ-GGCUUGAUALCUCAGCD-#GG--AGAGCRPPAGABUGAAKAPCUACAG-------------------7.?CCCAGTPCG"U?BUGGGUCAGGCCACCA
&µµKµµµµccaµUµProµ&GGµPichia jadiniiµcytosolic µ-GGCBGCGUKGUCPAGD--GGD--AUGAUACUCGCUU&GGKPGPGAGUG-------------------7D??AGGGTPCA"UUCCCUGCUCGGCCCCCA
IµµKµµµµcctµAµProµIGGµLupinus luteusµcytosolic µ-GGGACAUUKGUCPAGD--GGD--AUGAUUCUCGCUUIGGKPGCGAGAG-------------------7D?CCGAGTPCG"UUCUCGGAUGUCCCCCCA
NµµKµµµµccaµUµProµUGGµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGGBGUGUKGUCPAGD--GGD--AUGAUUCUCGCPUNGGKPGCGAGAG-------------------7CCCUGGGTPCA"UUCCCAGCUCGCCCCCCA
1µµ+µµµµtgaµUµSecµ1CAµBos taurusµcytosolic µ-GCCCGGAU_CCUCAGU--GGUC-UGGGGUGCAGGCU1CA+ACCUGUAGCUGUC--UAGC---GACAG---AGUGGUPCA"UUCCA_UUUCGGGCGCCA
1µµ+µµµµtgaµUµSecµ1CAµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-GCCCCACU_CUUCGGU--GGU-CCGGGGUGCGGACU1CA+AUCCGUAGUCGAU--UUGC---GUCGA---AGUGGUPCGAUUCCA_UGGGGGGCGCCA
1µµ+µµµµtgaµUµSecµ1CAµXenopus laevisµcytosolic µ-GCCCGGAU_CCUCAGU--GGU-CUGGGGUGCAGGCU1CA+ACCUGUAGCUGUC--UAGC---GACAG---AGUGGUPCA"UUCCA_UUUCGGGCGCCA
Nµµ+µµµµtgaµUµSecµNCAµHomo sapiensµcytosolic µ-GCCCGGAU_CCUCAGU--GGUC-UGGGGUGCAGGCUNCA+ACCUGUAGCUGUC--UAGC---GACAG---AGUGGUPCA"UUCCA_UUUCGGGCGCCA
Nµµ+µµµµtgaµUµSecµNCAµMus musculusµcytosolic µ-GCCCGGAU_CCUCAGU--GGUC-UGGGGUGCAGGCUNCA+ACCUGUAGCUGUU--UAGC---GACAG---AGUGGUPCA"UUCCA_UUUCGGGCGCCA
Uµµ+µµµµtgaµUµSecµUCAµChlamydomonas reinhardtiiµcytosolic µ-GCCGCUGU_CUUGGCG--GGU-GCUGAGUGCGGUCUUCA+AACCGUAGAGGCC--GGAA---GGCCU---AGUGGUPCA"UUCCA_UCGGCGGCGCCA
&µµ+µµµµtcaµUµSerµ&GAµCandida cylindraceaµcytosolic µ-GGUGCAAUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCRACGGAPU&GA+CPCCGUJ-GGGA---UUC-----UCCCU-?GCAGGTPCG"AUCCUGUUUGCAUCGCCA
&µµ`µµµµtcaµUµSerµ&GAµNicotiana rusticaµcytosolic µ-GUCGAUAUGUCCGAGD--#GDD-AAGGARACAGA'U&GA`APCUGUJ-GGGC---UUC-----GCCCG-CGCAGGTPCG"ACCCUGCUGUCGACGCCA
CµµAµµµµctgµCµSerµCAGµCandida cylindraceaµcytosolic µ-GACACCGUGLCMCAGD--#GDD-ACGGCRPUGGACGCAGAAPCCAUU-GAGC---UU------GCUCG-?GCGGGTPCG"AUCCCGUCGGUGUCUCCA
Cµµ+µµµµtcgµCµSerµCGAµCandida cylindraceaµcytosolic µ-GGCAACUUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCRUGACA'UCGA+APGUCAJ-GGGU---UU------ACCCG-?GCAGGTPCG"AUCCUGCAGUUGUCGCCA
Cµµ+µµµµtcgµCµSerµCGAµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-GCA#UCGUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCRUCUGA'UCGA+APCAGAJ-UCCC---U'U-----GGGAG-?GUAGGTPCG"AUCCUACCGGCUGCGCCA
Cµµ`µµµµtcgµCµSerµCGAµLupinus luteusµcytosolic µ-GUCAGUAUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCRACAGA'UCGA`APCUGUJ-GAGAU--UU-----GCCUGG-?AGCGGTPCG"AUCCGCUUACUGACGCCA
Cµµ`µµµµtcgµCµSerµCGAµNicotiana rusticaµcytosolic µ-GUCGAUAUGUCCGAGD--#GDD-AAGGARACAGA'UCGA`APCUGUJ-GGGC---UUU-----GCCUG-CGCAGGTPCG"AUCCUGCUGUCGACGCCA
Cµµ+µµµµtcgµCµSerµCGAµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGCACUAUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCRAGAGA'UCGA+APCUCUJ-GGGC---UCU-----GCCCG-?GCUGGTPCAAAUCCUGCUGGUGUCGCCA
Gµµ+µµµµagcµGµSerµGCUµCandida cylindraceaµcytosolic µ-GUUAAUGUGGCMGAGD--GGDD-AAGGCRCUUCC'UGCU+AGGAAGJ-GGGC---UCU-----GCCCG-?GCAGGTPCG"AUCCUGUCAUUAACGCCA
GµµEµµµµagcµGµSerµGCUµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-GACGAGGUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCRPPGGA'UGCUEAPCCAAJ-GUGC---U'U-----GCACG-?GUGGGTPCG"AUCCCAUCCUCGUCGCCA
Gµµ6µµµµagcµGµSerµGCUµNicotiana rusticaµcytosolic µ-GUCGCCUUGGCCGAGD--#GDD-AAGGCRPGUGC'UGCU6AGPACAJ-GGGG---UUU-----CCCCG-CGAGAGTPCG"AUCUCUCAGGCGACGCCA
GµµEµµµµagcµGµSerµGCUµRattus norvegicusµcytosolic µ-GACGAGGUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCRAPGGA'UGCUEAPCCAUJ-GPGC---U'U-----GCACG-?GUGGGTPCG"AUCCCAUCCUCGUCGCCA
Gµµ6µµµµagcµGµSerµGCUµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GUCCCAGUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCRAUGCCCUGCU6AGGCAUJ-GGGU---UUU-----ACCUG-?GCAGGTPCG"AUCCUGUCUGUGACGCCA
Iµµ+µµµµtctµAµSerµIGAµCandida cylindraceaµcytosolic µ-GGCAUCUUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCRAAAGAPUIGA+APCUUUJ-GGGC---UCU-----GCCCG-?GCAGGTPCG"GUCCUGCAGAUGUCGCCA
Iµµ+µµµµtctµAµSerµIGAµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-GCA#UCGUGGCMGAGC--#GDD-AAGGCRUCUGA'UIGA+APCAGAJ-UCCC---U'U-----GGGAG-?GUAGGTPCG"AUCCUACCGACUGCGCCA
Iµµ`µµµµtctµAµSerµIGAµNicotiana rusticaµcytosolic µ-GUGGACGUGCCGGAGD--#GDD-AUCGGRCAUGA'UIGA`APCAUGJ-GGGC---UUU-----GCCCG-CGCAGGTPCG"AUCCUGCCGUCCACGCCA
Iµµ`µµµµtctµAµSerµIGAµNicotiana rusticaµcytosolic µ-GUGGACGUGCCGGAGD--#GDD-AUCGGRCAUGA'UIGA`APCAUGJ-GGGC---UCU-----GCCCG-CGCAGGTPCG"AUCCUGCCGUCCACGCCA
Iµµ+µµµµtctµAµSerµIGAµRattus norvegicusµcytosolic µ-GUAGUCGUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCRAPGGA'UIGA+AZCCAUJ-GGGG---U'U-----CCCCG-?GCAGGTPCG"AUCCUGCCGACUACGCCA
Iµµ+µµµµtctµAµSerµIGAµRattus norvegicusµcytosolic µAGUAGUCGUGGCMGAGD--GGDD-AAGGCRAPGGA'UIGA+AZCCAUJ-GGGG---U'U-----CCCCG-?GCAGGTPCG"AUCCUGCCGACUACGCCA
Iµµ+µµµµtctµAµSerµIGAµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGCAACUUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCRAAAGAPUIGA+APCUUUJ-GGGC---UCU-----GCCCG-?GCAGGTPCAAAUCCUGCAGUUGUCGCCA
Iµµ+µµµµtctµAµSerµIGAµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGCAACUUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCRAAAGAPUIGA+APCUUUJ-GGGC---UUU-----GCCCG-?GCAGGTPCGAGUCCUGCAGUUGUCGCCA
Iµµ+µµµµtctµAµSerµIGAµSpinacia oleraceaµcytosolic µ-GUGGACGUGCCGGAGD--#GDD-AUCGGRCAUGA'UIGA+APCAUGJ-GGGC---UUU-----GCCCG-CGCAGGTPCG"AUCCUGCCGUCCACGCCA
UµµHµµµµtcaµUµSerµUGAµGallus gallusµcytosolic µ-AAGAAAGA"LCAUUAAGUGGDUUGAUGCLGPUGG'UUGAHACCAACAU-------------------G-UGAGGGTPCG"UUCCUUCCUUUCUUGCCA
UµµAµµµµtcaµUµSerµUGAµHomo sapiensµcytosolic µ-GUAGUCGUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCGAPGGACUUGAAAPCCAUJ-GGGG---U'U-----CCCCG-?GCAGGTPCG"AUCCUGCCGACUACGCCA
&µµ+µµµµtcaµUµSerµUGAµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGCACUAUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCRACAGA'U&GA+APCUGUJ-GGGC---UCU-----GCCCG-?GCUGGTPCAAAUCCUGCUGGUGUCGCCA
Iµµ6µµµµactµAµThrµAGUµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GCUUCUAUGLCCAAGDD-GGD--AAGGCRCCACA'UIGU6APGUGGAG-------------------AD?AUCGGTPCA"AUCCGAUUGGAAGCACCA
Iµµ6µµµµactµAµThrµAGUµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GCUUCUAUGLCCAAGDD-GGD--AAGGCRCCACA'UIGU6APGUGGAG-------------------AD?GUCGGTPCA"AUCCGACUGGAAGCACCA
Iµµ6µµµµactµAµThrµIGUµBos taurusµcytosolic µ-GGCCCUGUKLCUAGCD--GGDC-AAAGCRCCUGU'UIGU6AACAGGAG-------------------AD?CUGGGUPCG"AUCCCAGCGGGGC?UCCA
BµµKµµµµtggµCµTrpµBCAµBos taurusµcytosolic µ-GACCUCLUKLCGCAAD--#GD--AGCGCRPCUGABUBCAKAZCAGAAG-------------------7DUGCGUGPPCG"AUCACGUCGGGGUCACCA
BµµKµµµµtggµCµTrpµBCAµGallus gallusµcytosolic µ-GACCUCGUKLCGCAAC--#GD--AGCGCRPCUGABUBCAKAZCAGAAG-------------------7CUGCGUGPPCG"AUCACGUCGGGGUCACCA
BµµKµµµµtggµCµTrpµBCAµNicotiana tabacumµcytosolic µ-GGAUCCGUKGCGCAAD--#GD--AGCGCGPCUGABUBCAKAZCAGAAG-------------------GDNGCGUGTPCG"UUCACGPCGGGUUCACCA
BµµKµµµµtggµCµTrpµBCAµTriticum aestivumµcytosolic µ-GGANCCGUKLCGCAADD-#GD--AGCGCRPCUGABUBCAKAZCAGAAG-------------------GDUGCGUGTPCG"UUCACGPCGGGUCCACCA
BµµAµµµµtggµCµTrpµCCAµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GAAGCGGUKLCUCAAD--#GD--AGAGCPPPCGABUBCAAAPCGAAGG-------------------7DUGCAGGTPCA"UUCCUGPCCGUUUCACCA
9µµKµµµµtacµGµTyrµ9PAµBos taurusµcytosolic µ-CCUUCLAUALCUCAGDD-GGXU-AGAGCRRAGGACU9PAKAZCCUUAG-------------------7D?GCUGGTPCG"UUCCGGCUCGAAGGACCA
9µµKµµµµtacµGµTyrµ9PAµHomo sapiensµcytosolic µ-CCUUCLAUALCUCAGDD-GGX--AGAGCRRAGGACU9PAKA]CCUUAG-------------------7D?GCUGGTPCG"UUCCGGCUCGAAGGACCA
9µµKµµµµtacµGµTyrµ9PAµHomo sapiensµcytosolic µ-CCUUCLAUALCUCAGCD-GGX--AGAGCRRAGGACU9PAKA]CCUUAG-------------------7D?GCUGGTPCG"UUCCGGCUCGAAGGACCA
GµµKµµµµtacµGµTyrµGPAµLupinus albusµcytosolic µ-CCGACCUUALCUCAGDD-#GU--AGAGCRGAGGACUGPAKAPCCUUAG-------------------7XCACUGGUPCG"AUCCGGUAGGUCGGACCA
GµµKµµµµtacµGµTyrµGPAµLupinus luteusµcytosolic µ-CCGACCUUALCUCAGDD-#GU--AGAGCRGAGGACUGPAKAPCCUUAG-------------------7XCACUGGUPCG"AUCCGGUAGGUCGGACCA
GµµKµµµµtacµGµTyrµGPAµNicotiana rusticaµcytosolic µ-CCGACCUUALCUCAGDD-#GU--AGAGCRGAGGACUGPAKAPCCUUAG-------------------7UCACUGGUPCG"AUCCGGUAGGUCGGACCA
GµµKµµµµtacµGµTyrµGPAµNicotiana rusticaµcytosolic µ-CCGACCUUALCUCAGDD-#GU--AGAGCRGAGGACUGPAKAPCCUUAG-------------------7UCGCUGGUPCG"AUCCGGCAGGUCGGACCA
Gµµ+µµµµtacµGµTyrµGPAµPichia jadiniiµcytosolic µ-CUCUCGGUKLCCAAGDD-#GDDDAAGGCRPCAGACUGPA+APCUGAAC-------------------AD?GGGCGTPCG"AUCGCCCCCGAGAGACCA
GµµKµµµµtacµGµTyrµGPAµScenedesmus obliquusµcytosolic µ-CCCCUUGUAGCUCAGDD-#GC--AGAGCRGGAGACUGPAKAPCUCUAG-------------------7.CACUGGTPCG"AUCCGGUCGAGGGGACCA
Gµµ+µµµµtacµGµTyrµGPAµSchizosaccharomyces pombeµcytosolic µ-CUCCUGAUKGUGPAGDD-GGDD-AUCACACCCGGCUGPA+ACCGGUUG-------------------7U?GCUAGTPCG"UUCUGGCUCAGGAGACCA
GµµKµµµµtacµGµTyrµGPAµTriticum aestivumµcytosolic µ-CCGACCUUALCUCAGDD-#GU--AGAGCRGAGGACUGPAKAPCCUUAG-------------------7UCACUGGUPCG"AUCCGGUAGGUCGGACCA
Gµµ+µµµµtacµGµTyrµGUAµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-CUCUCGGUALCCAAGDD-#GDDDAAGGCRCAAGACUGPA+APCUUGAG-------------------AD?GGGCGTPCG"CUCGCCCCCGGGAGACCA
QµµKµµµµtacµGµTyrµQPAµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-CCUUCGAUALCUCAGDD-GGX--AGAGCRGPGGACUQPAKAJCCAUAG-------------------7DCGCUGGTPCA"AUCCGGCUCGAAGGACCA
QµµKµµµµtacµGµTyrµQPAµTriticum aestivumµcytosolic µ-CCGACCUUALCUCAGDD-#GU--AGAGCRGAGGACUQPAKAPCCUUAG-------------------7UCACUGGUPCG"AUCCGGUAGGUCGGACCA
.µµAµµµµgt.µµValµ.ACµHomo sapiensµcytosolic µ-GUUUCCGUAGUGPAGD--GGDD-AUCACLPUCGCCU.ACACGCGAAAG-------------------7D??CCGGUPCG"AACCGGGCGGAAACACCA
.µµAµµµµgt.µµValµ.ACµRattus norvegicusµcytosolic µ-GUUUCCGUAGUGPAGD--#GDD-AUCACLPUCGCCU.ACA?GCGAAAG-------------------7D??CCGGUPCG"AACCGGGCGGAAACACCA
IµµAµµµµgttµAµValµAACµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGUUUCGUKGUCPAGDC-GGDD-AUGGCAPCUGCPUIACACGCAGAAC-------------------7DC?CCAGTPCG"UCCUGGGCGAAAUCACCA
CµµAµµµµgtg µCµValµCACµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-GUUUCCGUAGUGPAGC--GGDX-AUCACGPGUGCUUCACACGCACAAG-------------------7DCCCCGGTPCG"ACCCGGGCGGGAACACCA
CµµAµµµµgtg µCµValµCACµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GUUCCAAUALUGPAGC--GGCD-AUCACLPPGCCPUCACACGGCAAAG-------------------7DC?CGAGTPCG"UCCUCGGUUGGAACACCA
IµµAµµµµgttµAµValµIACµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-GUUJCCGUKGUGPAGC--GGDX-AUCACAPCUGCBUIACA?GCAGAAG-------------------7CC<CCGGTPCG"UCCCGGGCGGAAACACCA
IµµAµµµµgttµAµValµIACµLupinus luteusµcytosolic µ-GGUUUCGUKGUGPAGD--GGDD-AUCACRPCAGUCUIACACACUGAAG-------------------7DCUCCGGTPCG"GUCCGGGCGAAGCCACCA
IµµAµµµµgttµAµValµIACµMus musculusµcytosolic µ-GUUUCCGUAGUGPAGD--GGDD-AUCACLPUCGCBUIACA?GCGAAAG-------------------7D??CCGGUPCG"AACCGGGCGGAAACACCA
IµµAµµµµgttµAµValµIACµOryctolagus cuniculusµcytosolic µ-GUUUCCGUAGUGPAGD--GGDD-AUCACLPUCGCBUIACA?GCGAAAG-------------------7D??CCGGUPCG"AACCGGGCGGAAACACCA
IµµAµµµµgttµAµValµIACµPichia jadiniiµcytosolic µ-GGUUUCGUKGUCPAGDD-GGDC-AUGGCAPCUGCPUIACACGCAGAAC-------------------7DC?CCAGTPCG"UCCUGGGCGAAAUCACCA
IµµAµµµµgttµAµValµIACµRattus norvegicusµcytosolic µAGUUUCCGUAGUGPAGD--GGDD-AUCACLPUCGCBUIACA?GCGAAAG-------------------7D??CCGGUPCG"AACCGGGCGGAAACACCA
NµµAµµµµgtaµUµValµNACµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-GGUJCCAUAGUGPAGC--GGDN-AUCAC;PCUGCPUNACACGCAGAAG-------------------7D?UCCGGTPCG"UCCCGGAUGGAACCACCA
&µµAµµµµgtaµEucaryµValµUACµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGUCCAAUGLUCCAGD--GGDDCAAGACRPCGCCPU&ACACGGCGAAG-------------------ADC?CGAGTPCG"ACCUCGGUUGGAUCACCA
Gµµ6µµµµµmitoµAspµGUCµAedes albopictusµmitochondrial µ-AAAAAAUU"GUUUAAU--CA---AAAACCPPAGUAUGUC6AACUAAAA-------------------A-AAUUAGAUCAU--CUAAUAPPUUUUACCA
Nµµ6µµµµµmitoµGluµNUCµAedes albopictusµmitochondrial µ-AUUUAUAU"GUUUAA---AU---AAAACAPPACAUUNUC6CUGUAAAA-------------------A-UAAAA-AUUUAU--UUUUPAUAAAUACCA
UµµAµµµµµmitoµGlyµUCCµAedes albopictusµmitochondrial µ-AUUUAUAU"GUAUAUA--AU---UGUAUAPGN;ACUUCCAA]CACAAG-------------------G-ACUAA-AUAAUU--UUAGUAPAAAUACCA
Gµµ6µµµµµmitoµIleµGAUµAedes albopictusµmitochondrial µ-AAUGAAUUKCCUGAU---AA---AAAGGAPPACCUUGAU6GGGUAAAU-------------------UAUAAAGAUUUAAU-ACUUPAPUCAUUACCA
Cµµ6µµµµµmitoµLysµCUUµAedes albopictusµmitochondrial µ-CAUUAGAUKACUGAA---AG---CAAGUAAPGAUCUCUU6AAUCAUAA-------------------UAUAGUAAAUUAGC_UUACPPCUAAUGACCA
NµµAµµµµµmitoµGlnµNUGµAedes albopictusµmitochondrial µ-UAUAUUUU"GUGUAU---GA---UGCACAAAAGPUUNUGAAACUUUUA-------------------G-AAAUAGUUUAAUUCUAUUAAAUAUAACCA
Gµµ6µµµµµmitoµSerµGCUµAedes albopictusµmitochondrial µ-GAAAUAU--GUU-----GA--UC--AAG-AAAAGCUGCU6ABUPUUUCUU------------------UAAUGGUUUAAUUCCAUPAUAUUUCU-CCA
Uµµ6µµµµµmitoµValµUACµAedes albopictusµmitochondrial µ-CAAUUUAA"LCUUAAUU-AGU--AAAGUAPPUCAUUUAC6PPGAAAAG-------------------A-AAUUUGUGCAAAUCAAUPPAAAUUGACCA
Cµµ6µµµµµmitoµIniµCAUµAedes albopictusµmitochondrial µ-AAAAAGAU"AGCUAA---UU---AAGCUAPPGGGUUCAU6CCCCACUU-------------------A-UAAAGGUAAUAAUCCUUPPCUUUUUACCA
GµµKµµµµµmitoµPheµGAAµAscaris suumµmitochondrial µ-ACUCUGUU"GUUUAUGU-UUU--AAAAPAPGACPPUGAAKAAGUUGGA-------------------A-AA----UG---------UUAGGAGUGCCA
>µµAµµµµµmitoµMetµ>AUµAscaris suumµmitochondrial µ-AAPAAGAU"GGAUAA---GUUG-AGUCULPGAGGUU>AUACCCUCUUG-------------------G-UG----UUUUU------CUCUUAPUGCCA
AµµKµµµµµmitoµArgµACGµAscaris suumµmitochondrial µ-GGACGUU""AUAGAU---AA---GCUAPGCCPAGPUACGKPCPGGGAA-------------------G-AG---------------AGUCGPCUUCCA
Uµµ6µµµµµmitoµSerµUCUµAscaris suumµmitochondrial µ-GACAAAUG-----------------UUUPCAGGUCUUCU6AAPCUGUUUU--------------------GGA--GAAA-----UCCGPUUGUUUCCA
!µµKµµµµµmitoµGluµ!UCµAscaris suumµmitochondrial µ-GAGAUAUU"GUAUAAAUUUUU--UGUAPAPUPCUPU!UCKAAGAAAAG-------------------G-U-----UUA---------UUAUCPUACCA
!µµ6µµµµµmitoµLysµ!UUµAscaris suumµmitochondrial µ-GGGGUGUU"ACUUAAGUUU----AAAGPRPPAGAUU!UU6APCUGGAA-------------------A-UGG---GUUG------UCACAPCCUGCCA
!µµKµµµµµmitoµGlnµ!UGµAscaris suumµmitochondrial µ-UAUACUUU"GUUUAGGA------AGAAUAPUUAPPU!UGKPGPAAAAG-------------------G-G-----UUG---------UAGUAPAGCCA
$µµ*µµµµµmitoµTrpµ$CAµAscaris suumµmitochondrial µ-ACAGAUUU"AGUUAAGUUU----AAACUCPPGGPPU$CA*AACCAAAA-------------------A-U-----UUU---------ACUCPGUACCA
$µµKµµµµµmitoµLeuµ$AAµAscaris suumµmitochondrial µ-GPUGUUAU"GCAUAAGA------AGUGCAPPUGPPU$AAKCGPAAAAG-------------------A-U-----AUG---------GGACAACUCCA
QµµAµµµµµmitoµAspµQUCµAsterias amurensisµmitochondrial µ-AAGAAACU"GUUAAACUA-----AUAACACUGGAUUQUCAGACCGGAG--------------------UAACUGGUAAACAAUCAGUGUUUCUUGCCA
QµµKµµµµµmitoµHisµQUGµAsterias amurensisµmitochondrial µGACUAAAGU"GUUUAAAU------AAAACCCPAAUPUQUGKPAUUAAAA--------------------UUAUCAGUPAA"AUCUGAUCUAUAGUCCCA
Cµµ6µµµµµmitoµLysµCUUµAsterias amurensisµmitochondrial µ-CUUUGAUA"GCUUAUAAUGG---CAAGCAPUAAACUCUU6APUUAAAU-------------------CAAAGUGAUCUCACCACACUAUCAAAGACCA
Gµµ+µµµµµmitoµAsnµGUUµAsterias amurensisµmitochondrial µ-UGAGUUGU"LCCUAGU--GGA--AAGGCGPPUGGCCGPU+ACPAAAAG-------------------AUAGCAAGAUCA"UACUUGCCAGCUCAGCCA
Gµµ6µµµµµmitoµAsnµGPUµAsterias amurensisµmitochondrial µ-UGGGUUGU"GCCUAAU--GGA--AAGGCAAPUGGCCGPU6ACCAGGAG-------------------AUAACAAGAUCA"UACUUGUCAACUCAGCCA
Gµµ*µµµµµmitoµTyrµGUAµAsterias amurensisµmitochondrial µ-GGCAGGGUKGCAGAA"--GUD--AAUGCACPAAAPUGUA*AUPUAUAA--------------------AUAAAGGUPUAAUUCCUUUUCUUGCCACCA
∃µµAµµµµµmitoµGluµ∃UCµBos taurusµmitochondrial µ-GUUCUUGU"GUUGAA---UG---ACAACLAPGGUUU∃UCAUAPCAUUA-------------------G-U?AUGGUPAG"UUCCAUGUAAGAAUACCA
GµµAµµµµµmitoµPheµGAAµBos taurusµmitochondrial µ-GUUGAUGU"LCUU-AA--CCC--AAAGCAAGGCACUGAAAAPGCCUAG-------------------A-UGAGU-CUCCCA--ACUCCAUAAACACCA
UµµAµµµµµmitoµGlyµUCCµBos taurusµmitochondrial µ-AUUCUUUU"LUAUUAA--CU---AGUACAGCUGACUUCCAAPCAGCUA-------------------G-UUUCGGUCUAGU-CCGAAAAAGAAUACCA
Gµµ6µµµµµmitoµIleµGAUµBos taurusµmitochondrial µ-AGAAAUAUKUCUGACA-------AAAGARPUACAUUGAU6GUGUAAAU-------------------AAUAGAGGUUCA"ACCCUCUUAUUUCUACCA
∃µµ6µµµµµmitoµLysµ∃UUµBos taurusµmitochondrial µ-CACUAAGA"LCUAU---------AUAGCACPAACCU∃UU6AGUUAGAG-------------------AUUGAGAGCCAU"UACUCUCCUUGGUGACCA
ʵµAµµµµµmitoµLeuµÊAAµBos taurusµmitochondrial µ-GUUAAGGUKLCAGAGCCCGGDA-AUUGCAPAAAACUÊAAACPUUUAUA-------------------UC?AGAGAUUCA"AUCCUCUCCUUAACACCA
UµµKµµµµµmitoµLeuµUAGµBos taurusµmitochondrial µ-ACUUUUAA"LGAUAGU--AGDUU-AUCCLPPGGPCUUAGKAACCAAAA---------------------AAUUGGUGCAACUCCAAAUAAAAGUACCA
UµµAµµµµµmitoµArgµUCGµBos taurusµmitochondrial µ-UGGUACUU"GUUUAA---AAU--AAAAUAAAUGAUUUCGACPCAUUAG-------------------A-UUAUGAUUUAAU-UCAUAAUUACCAACCA
Gµµ6µµµµµmitoµSerµGCUµBos taurusµmitochondrial µ-GAAAAAG-U----------------AUGCAAGAACUGCU6AUUC_UGCUC--------------------?CAUAUCUAAU_UAUGGCUUUUUCGCCA
Uµµ+µµµµµmitoµSerµUGAµBos taurusµmitochondrial µ-GAGAGAG-A-CAUAGA--GGD--UAUGAPGPPGG'UUGA+ACCAAUAG-------------------U-AGGGGGUPCG"UUCCUUCCUUUCUUACCA
Uµµ6µµµµµmitoµThrµUGUµBos taurusµmitochondrial µ-GUCUUUGU"GUACAU---CU---AAUAUACUGGU'UUGU6AACCAGAG-------------------A-AGGAGAACAACU_CCUCCCPAAGA?UCCA
UµµAµµµµµmitoµValµUACµBos taurusµmitochondrial µ-CAAGAUAU"LCUUAA---AC---AAAGCAPCCAGUUUACACCUAGAAG-------------------A-CUUCA-UUCAUUA-UGAAUAUCUUGACCA
ʵµ*µµµµµmitoµTrpµÊCAµBos taurusµmitochondrial µ-AGGAAUUU"LGUUAA---AC---AGACCAAGAGCCUÊCA*AGCCCUAA-------------------G-?AAGUACAAUU--UACUUAAUUCCUGCCA
>µµAµµµµµmitoµIniµ>AUµBos taurusµmitochondrial µ-AGUAAGGUCAGCUAAUU------AAGCUAPCGGGCC>AUACCCCGAAA-------------------A-UGPUGGUUUAUAUCCUUCCCGUACUACCA
UµµAµµµµµmitoµAlaµUGCµBos taurusµmitochondrial µ-GAGGAUUU"LCUUAA---UU---AAAGULGPUGAUUUGCAUPCAAUUG-------------------A-UGUAAGGUGPAGUCUUGCAAUCCUUACCA
Gµµ+µµµµµmitoµCysµGCAµBos taurusµmitochondrial µ-AGCCCUGUKGUGAAUU-------UACACGPPGAAPUGCA+APUCAGAG-------------------A-AGCAGCUUCA"U-UCUGCCGGGGCUUCCA
QµµAµµµµµmitoµAspµQUCµBos taurusµmitochondrial µ-GAGGULUU"GUAAAAC-------AUUAUAPAAUPUUQUCAAAGUUAAG-------------------U-UACAAGUGAAAGUCCUGUACACCUCACCA
QµµAµµµµµmitoµHisµQUGµBos taurusµmitochondrial µGGUAAAUAU"LUUUAA---CA---AAAACAPUAGAUUQUGAAPCUAACA-------------------A-UAGAAACUCAUU_CUUCUUAUUUACCCCA
Qµµ6µµµµµmitoµAsnµQUUµBos taurusµmitochondrial µ-UAGAUUGA"LCCAGUU--AGCU-AGGGUGPPUAGCUQUU6ACUAAAGU-------------------UU?GUGGGGGUGGAGCCCACCAGUCUAGCCA
UµµKµµµµµmitoµProµUGGµBos taurusµmitochondrial µ-CAGGGAAU"LUUUAA---AU---AGAACUPCAGCUUUGGKGGUUGAUG-------------------G-UGAGAC-UGCA--GUUUCUUCCUUGACCA
Qµµ*µµµµµmitoµTyrµQUAµBos taurusµmitochondrial µ-GGUAAAAUKLCUGAGC-------AAAGCAUPAGACUQUA*APCUAAAG-------------------A-UAGAGGUPUGACUCCUCUUUUUACCACCA
∃µµKµµµµµmitoµGlnµ∃UGµBos taurusµmitochondrial µ-UAGAAUUUKGUGUAAUU-GGG--AGCACGAAGAGUU∃UGKAPPCUUAG-------------------G-AGUAGGUPCGAUUCCUAUAGUUCUAGCCA
QµµAµµµµµmitoµAspµQUCµDidelphis virginianaµmitochondrial µ-AAGAUAUU"LUAAAA---UUC--AUUACAPAACUPUQUCAUAGUUAAA-------------------U-UAUAGGUPUAACUCCUAUAUAUCUUACCA
>µµAµµµµµmitoµMetµ>AUµGallus gallusµmitochondrial µ-AGUAAGGUCAGCUAA---CU---AAGCUAPCGGGCC>AUACCCCGAAA-------------------A-UGAUGGTPUAACCCCUUCCCCUACUACCA
ʵµAµµµµµmitoµGlyµÊCUµHalocynthia roretziµmitochondrial µ-GCGUULAU"GUUUAA---GU---AAAAUAGAUUCUUÊCUAGGPAUAAG---------------------UUAGGGUUGG---UCCCUUUGAUGCACCA
UµµAµµµµµmitoµGlyµUCCµHalocynthia roretziµmitochondrial µ-GCUGUGUU"GUAUAAA--GU---AAUAPAPGUGAPUUCCAAPCAUGGG---------------------AUCCUU-------UAGGGACGUAGUACCA
GµµAµµµµµmitoµSerµGCUµHalocynthia roretziµmitochondrial µ-AAGGGUGAUUAGGAA---------UGUUAGAAAGPUGCUAPPUUUUUG-------------------AUAUPGAGUUCGAAUCUCGAGGCUCUUGCCA
ʵµUµµµµµmitoµMetµÊAUµHalocynthia roretziµmitochondrial µ-GGUAAUAU"LGUUAAUA--U---AAACCAGAAAGUUÊAUUPCUUUCUA-------------------A-UAACGAA-------UGPUUAUUACUUCCA
ʵµ*µµµµµmitoµTrpµÊCAµHalocynthia roretziµmitochondrial µ-AGGAGAUU"LUUUAAGU--U---AAAUCAAUUGUUUÊCA*AACAGUAG-------------------U-UAUAUAGAAUGAUUAUAUAUUUCCUGCCA
CµµKµµµµµmitoµMetµCAUµHalocynthia roretziµmitochondrial µ-ACAACAGU"AACUAUGAA-AA--AGUUUGUGGGGUUCAUKGUCCUGAU----------------AAUGUGAUAUUAAAAUAUAUUGCCUGUUGAACCA
Gµµ6µµµµµmitoµIleµGAUµHomo sapiensµmitochondrial µ-AGAAAUAUKUCUGAUA-------AAAGARPPACUUUGAU6GAGUAAAU-------------------AAUAGGAGCUUAAACCCCCUUAUUUCUACCA
ʵµAµµµµµmitoµLeuµÊAAµHomo sapiensµmitochondrial µ-GUUAAGAUKLCAGAGCCCGGDA-AUCGCAPAAAACUÊAAAACUUUACA-------------------GU?AGAGGTPCA"UUCCUCUUCUUAACACCA
Gµµ6µµµµµmitoµSerµGCUµHomo sapiensµmitochondrial µ-GAGAAAG-C----------------UCACAAGAACUGCU6ACUCAUGCCC--------------------CCAUGUCUA"C_CAUGGCUUUCUCACCA
∃µµ6µµµµµmitoµLysµ∃UUµHomo sapiensµmitochondrial µ-CACUGUAA"LCUAAC--------UUAGCAPPAACCU∃UU6AGUUAAAG-------------------AUUAAGAGAACCAA_CUCUUUACAGUGACCA
UµµKµµµµµmitoµProµUGGµHomo sapiensµmitochondrial µ-CAGAGAAU"GUUUAAA--UU---AGAAUCPPAGCPUUGGKPGCUAAUG-------------------G-UGGAG-TPAAAGA-CUUUUUCUCUGACCA
QµµAµµµµµmitoµAspµQUCµHomo sapiensµmitochondrial µ-AAGGUAUU"LAAAAA---CC---AUUUCAPAACUUUQUCAAAGUUAAA-------------------U-UAUAGGCUAAAU-CCUAUAUAUCUUACCA
UµµKµµµµµmitoµLeuµUAGµHomo sapiensµmitochondrial µ-ACUUUUAA"LGAUAAC--AGC--UAUCCAPPGGPCUUAGKCCCCAAAA-------------------A-UUUUGGUGCAACUCCAAAUAAAAGUACCA
>µµAµµµµµmitoµMetµµHomo sapiensµmitochondrial µ-AGUAAGGUCAGCUAAAU------AAGCUAPCGGGCC>AUACCCCGAAA-------------------A-UGPUGGUUAUAC-CCUUCCCGUACUACCA
.µµ.µµµµµmitoµLysµ.UUµLoligo bleekeriµmitochondrial µ-GCCUCCAUALCUCAGDC-GGU--AGAGCAPCAGACU.UU.ANCUGAGG-------------------7D?UGGGGUPCG"GUCCCCAULUGGG?UCCA
Cµµ6µµµµµmitoµLysµCUUµLoligo bleekeriµmitochondrial µ-UCCCGLCUALCUCAGDC-GGU--AGAGCACGAGA<UCUU6APCUCGGG-------------------7D?GUGGGTPCG"GCCCCACGUUGGGAGCCA
.µµAµµµµµmitoµLysµ.UUµLoligo bleekeriµmitochondrial µ-GCCUUCAUALCUCAGDC-GGU--AGAGCAPCAGACU.UUAANCUGAGG-------------------7D?UGGGGTPCG"GUCCCCAULCGGG?UCCA
7µµ6µµµµµmitoµSerµ7CUµLoligo bleekeriµmitochondrial µ-AAAGGUAAUUAGGAA---------UAAAAPAAAGCU7CU6ACPUUAUU------------------UUGAGCAACUCAAAACUGUUCUACCUUUUCCA
GµµAµµµµµmitoµAspµGUCµMesocricetus auratusµmitochondrial µ-AAGAUAUU"GUAAAA---UC---AUUACAPAACUUUGUCAGAGUUAAA-------------------U-UAUAGACUAAUC-UCUAUAUAUCUUACCA
Nµµ6µµµµµmitoµLysµNUUµMesocricetus auratusµmitochondrial µ-CACUAUGA"LCUC----------AGAGCLPUAACCUNUU6AGUUAAAA-------------------U-UGAGAGACUUCUAGUCUCCAUGGUGACCA
UµµAµµµµµmitoµArgµUCGµMesocricetus auratusµmitochondrial µ-UGGUGAUU"GUUUAA---CU---AAAAUUAAUGAPUUCGACPCAUUAG-------------------A-UUAUGACAUAUC-UCAUAAUCACCAACCA
Gµµ6µµµµµmitoµSerµGCUµMesocricetus auratusµmitochondrial µ-GAGAAUG-U----------------AUGCAAGAGCUGCU6ACUCCUGCUA--------------------CCAUGUAUAAU_CAUGGCUUUCUUACCA
UµµUµµµµµmitoµAlaµUGCµNeurospora crassaµmitochondrial µ-GGGGGUAUAGUAUAADU-GGD--AGUACAGCAAUCUUGCUCANUGCUU-------------------G-U?AAGGTPCAAAUCCUUGUAUCUCCACCA
NµµAµµµµµmitoµLeuµNAAµNeurospora crassaµmitochondrial µ-AUCCGAGUGAUGGAAD--GGDA-GACAUAACAUGCUNAAAACAUGUG-GGCU---UCA-----AGCUG-UGAAGGTPCAAGUCCUUCUUCGGAUACCA
UµµKµµµµµmitoµLeuµUAGµNeurospora crassaµmitochondrial µ-AUAGGUGUGCUGGAADU-GGDA-GACAGGUUCCGPUUAGKCCGGAAU-GGUUU--AA-----AAACUG-UACAAGTPCAAGUCUUGUCAUCUAUACCA
Uµµ6µµµµµmitoµThrµUGUµNeurospora crassaµmitochondrial µ-GCCUGGUUAGCAUAAA--AGD--AAUGCAAUUGPUUUGU6APCAAUAG-------------------A-AGCAAGTGCGAUACUUGCACUGGGCUCCA
UµµAµµµµµmitoµValµUACµNeurospora crassaµmitochondrial µ-GAGAGAUUAGCUCAGUU-GGD--AGAGCAACCGUUUUACACACGGAAG-------------------GUUGGGUGTPCGAAUCACCCAUUUCUCACCA
NµµHµµµµµmitoµTrpµNCAµNeurospora crassaµmitochondrial µ-AAGAGUAUAGUUUAAU--GGD--AAAACAGAAAGCUNCAHCCUUUAAA-------------------U-UCUUAGTPCGAGUCUAAGUACUCUUGCCA
CµµKµµµµµmitoµIniµCAUµNeurospora crassaµmitochondrial µ-UGCGGAUUAUUGUAAD--AGD--AACAUAUUUGGCUCAUKPCCGAAUG-------------------A-CAUAGGUGCAAAUCCUGUAUCCGCAUCCA
GµµHµµµµµmitoµTyrµGUAµNeurospora crassaµmitochondrial µ-AGGAGGGUUCCGUUUGUUGGDAUGACGGRPUAAGCUGUAHACUUAAU-GACUA--AU-----UAGU?GU<GAAGGTPCAAUUCCUUUCUCUCCUACCA
GµµHµµµµµmitoµPheµGAAµOenothera sp.µmitochondrial µ-GUUUAGGUAGCUCAUCD-GGCD.AGAGCAAAGGACUGAAHAUCCUUGU-------------------7XCAGUGGTPCGAAUCCACUUCUAAGCACCA
Gµµ.µµµµµmitoµPheµGAAµPhaseolus vulgarisµmitochondrial µ-GUUUAGGUAGCUCAGCD-#GD--AGAGCAAAGGACUGAA.APCCUUGU-------------------7XCAGUGGTPCGAAUCCACUUCUAAGCGCCA
.µµKµµµµµmitoµLeuµ.AAµPhaseolus vulgarisµmitochondrial µ-GUCAGGAUGLCMGAGD--#GDCXAAGGCRCCAGACU.AAKPPCUGGJ-CUUC---GAGA----GAGGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACUUCUGACACCA
.µµKµµµµµmitoµLeuµ.AAµPhaseolus vulgarisµmitochondrial µ-GUCAGGAUGLCMGAGD--#GDCXAAGGCRCCAGACU.AAKPPCUGGJ-CUUC---GAAA----GAGGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACUUCUGACACCA
.µµKµµµµµmitoµLeuµ.AGµPhaseolus vulgarisµmitochondrial µ-GAUAGUUUGLCMGAGD--#GDCXAAGGCRCCAGAPU.AGKCPCUGGJ-CCG----AAA------.GGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACAGCUGUCACCA
.µµKµµµµµmitoµLeuµ.AAµPhaseolus vulgarisµmitochondrial µ-GCUGGUUUGGCMGAGA--#GDD-AAGGCRGAAGACU.AAKAPCUUCJ-GCAG---UCAA----CUGCG-?AUGGGTPCG"ACCCCAUAGCCAGCACCA
Cµµ=µµµµµmitoµMetµCAUµPhaseolus vulgarisµmitochondrial µ-ACCUACUUGACUCAGC--#GDD-AGAGUAPCGCPUUCAU=CGGCGAGA-------------------7XCAUUGGTPCAAAUCCAAUAGUAGGUACCA
UµµKµµµµµmitoµProµUGGµPhaseolus vulgarisµmitochondrial µ-CGAGGUGUAGCGCAGUCD#GDC-AGCGCAUCUGUUUUGGKPACAGAGG-------------------7CCAUAGGTPCGAAUCCUGUCACCUUGACCA
BµµHµµµµµmitoµTrpµBCAµPhaseolus vulgarisµmitochondrial µ-GCGCUCUUAGUUCAGUUC#GD--AGAACRCGGGPCUBCAHAACCCGAU-------------------7.CGUAGGTPCAAAUCCUACAGAGCGUGCCA
CµµAµµµµµmitoµIniµCAUµPhaseolus vulgarisµmitochondrial µ-AGCGGGGUAGAGUAGUD-#GUD-AACUCAPCAGGCUCAUAAPCUGAAG-------------------AUDGCAGGTPCGAAUCCUGCCCCCGCCACCA
.µµHµµµµµmitoµTyrµ.UAµPhaseolus vulgarisµmitochondrial µ-GGGAGAGUGGCCGAGD--#GDCAAAAGCLACAGACU.UAHAPCUGUU-GAAG---UU------UUUCUACGUAGGTPCGAAUCCUGCCUCUCCCACCA
QµµAµµµµµmitoµAspµQUCµRattus norvegicusµmitochondrial µ-GAGAUAUU"GUAAAA---UA---AUUACAPAACCUUQUCAAGGUUAAG-------------------U-UAUAGACUUAAA-UCUAUAUAUCUUACCA
GµµAµµµµµmitoµAspµGUCµRattus norvegicusµmitochondrial µAGAGAUAUU"GUAAAA---UA---AUUACAPAACCUUGUCAAGGUUAAG-------------------U-UAUAGACUUAAA-UCUAUAUAUCUUACCA
Gµµ*µµµµµmitoµPheµGAAµRattus norvegicusµmitochondrial µAGUUAAUGU"GCUUAUA--AU---AAAGCAAAGCACUGAA*APGCUUAG-------------------A-UGGAU-UCAAAA--AUCCCAUAAACACCA
Nµµ6µµµµµmitoµLysµNUUµRattus norvegicusµmitochondrial µ-CAUUGCGA"LCUU----------AGAGCLPUAACCUNUU6AGUUAAAG-------------------UUAGAGA-CAACAAA-UCUCCACAAUGACCA
UµµKµµµµµmitoµLeuµUAGµRattus norvegicusµmitochondrial µ-ACUUUUAU"LGAUAGA--AGD--AAUCCAPUGGUCUUAGKAACCAAAA-------------------A-C?UUGGUGCAACUCCAAAUAAAAGUACCA
UµµKµµµµµmitoµLeuµUAGµRattus norvegicusµmitochondrial µAACUUUUAU"LGAUAGA--AGD--AAUCCAPUGGUCUUAGKAACCAAAA-------------------A-C?UUGGUGCAACUCCAAAUAAAAGUACCA
UµµKµµµµµmitoµLeuµUAGµRattus norvegicusµmitochondrial µAACUUGUAU"LGAUAGA--AGD--AAUCCAPUGGUCUUAGKAACCAAAA-------------------A-C?UUGGUGCAACUCCAAAUAAAAGUACCA
UµµAµµµµµmitoµArgµUCGµRattus norvegicusµmitochondrial µAUGGUAAUU"GUUUAA---AU---AAAAUUAAUGAPUUCGACPCAUUAG-------------------A-UUAUGAUAAUAA-UCAUAAUUACCAACCA
UµµAµµµµµmitoµValµUACµRattus norvegicusµmitochondrial µ-CAUAGUGU"LCUUAAUC-AC---AAAGCAPCUGGCCUACACCCAGAAG-------------------A-AUUCA-UAAAAA--UGAACACUUUGACCA
UµµAµµµµµmitoµValµUACµRattus norvegicusµmitochondrial µACAGAUUGU"LCUUAAUC-AC---AAAGCAPCUGGCCUACACCCAGAAG-------------------A-AUUCA-UAAAAA--UGAACACUUUGACCA
Nµµ*µµµµµmitoµTrpµNCAµRattus norvegicusµmitochondrial µAAGAAGUUU"GGAUAU---AC---AGUCCAAGAGCCUNCA*AGCCCUUA-------------------G-AAAAC-AAACAA--GUUUAACUUCUGCCA
Gµµ6µµµµµmitoµIleµGAUµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-GAAACUAUAAUUCAADD-GGDU-AGAAUAGUAUPUUGAU6AGGUACAA-------------------A-UAUAGGTPCAAUCCCUGUUAGUUUCACCA
!µµKµµµµµmitoµLeuµ!AAµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-GCUAUUUUGGUGGAADU-GGDA-GACACRAUACPCU!AAKAPGUAUU-ACU----UUAC-----AGUA-UGAAGGTPCAAGUCCUUUAAAUAGCACCA
$µµ6µµµµµmitoµLysµ$UUµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-GAGAAUAUUGUUUAAD--GGD--AAAACAGPUGPCU$UU6AGCAACCC-------------------A-UGC_GGTPCAACUCCAGCUAUUCUCACCA
Cµµ6µµµµµmitoµMetµCAUµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-GCUUGUAUAGUUUAADD-GGDU-AAAACAUUUGPCUCAU6AAUAAAUA-------------------AUGUAAGGTPCAAUUCCUUCUACAAGUACCA
GµµAµµµµµmitoµSerµGCUµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-GGAAAAUUAACUADA---GGD--AAAGU_AUUAPPUGCUAAGUAAUU-GAAUU--GUA----AAUUCU-UAUGAGTPCGAAUCUCAUAUUUUCCGCCA
Gµµ+µµµµµmitoµTyrµGUAµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-GGAGGGAUUUUCAAUGUDGGDAGUUGGALPUGAGCUGUA+ACUCAAU-GACU---UA------GGUCUUCAUAGGTPCAAUUCCUAUUCCCUUCACCA
CµµKµµµµµmitoµIniµCAUµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-UGCAAUAUGAUGUAADU-GGDU-AACAUUUUAGGGUCAUKACCUAAUU-------------------A-UAUACGTPCAAAUCGUAUUAUUGCPACCA
GµµKµµµµµmitoµPheµGAAµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-GCUUUUAUAGCUUAGD--GGD--AAAGCRAUAAAPUGAAKAPUUAUUU-------------------A-CAU_AGUPCGAUUCUCAUUAAGGGCACCA
Nµµ+µµµµµmitoµGlyµNCCµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-AUAGAUAUAAGUUAAUD-GGD--AAACURGAUGPCUNCC+AACAUUGA-------------------A-UGCGAGTPCGAUUCUCGCUAUCUAUACCA
GµµKµµµµµmitoµHisµGUGµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µGGUGAAUAUAUUUCAAD--GGD--AGAAAAPACGCPUGUGKPGCGUUAA-------------------A-UCUGAGTPCGAUUCUCAGUAUUCACCCCA
UµµKµµµµµmitoµProµUGGµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-CAGAUAGAAGCCAAAA--GGD--CAGGCLCUUUCPUUGGKAGAAAGAC-------------------CUAGUUAGTPCGAGUCUAUCCUAUCUGACCA
AµµAµµµµµmitoµArgµACGµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-AUAUCUUUAAUUUAAD--GGD--AAAAUAPUAGAAUACGAAPCUAAUU-------------------A-UAUAGGTPCAAAUCCUAUAAGAUAUUCCA
Nµµ6µµµµµmitoµArgµNCUµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-GCUCUCUUAGCUUAAD--GGDU-AAAGCAPAAUACUNCU6APAUUAAU-------------------AUUCCAUGTPCAAAUCAUGGAGAGAGUACCA
UµµKµµµµµmitoµSerµUGAµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-GGAUGGUUGACUGAGD--GGDUUAAAGULPGAUAPUUGAKCPAUCAU-UAGUCU-UUAU--UGGCUA--CGUAGGTPCAAAUCCUACAUCAUCCGCCA
UµµKµµµµµmitoµSerµUGAµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-GGAUGGUUGACUGAGD--GGDUUAAAGULUGAUAPUUGAKCPAUCAU-UAGUCU-UUAU--UGGCUA--CGUAGGTPCAAAUCCUACAUCAUCCGCCA
UµµKµµµµµmitoµThrµUAGµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-GUAAAUAUAAUUUAAD--GGD--AAAAULPAUGP_UUAGKPGCAUAUU-------------------A-UCUAAGTPCAAAUCUUAGUAUUUACACCA
!µµHµµµµµmitoµTrpµ!CAµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-AAGGAUAUAGUUUAAD--GGD--AAAACAGUUGAPU!CAHAPCAAUCA-------------------U-UAGGAGTPCGAAUCUCUUUAUCCUUGCCA
<µµAµµµµµmitoµIleµµSolanum tuberosumµmitochondrial µ-GGGCUUAUAGUUPAADD-#GDD-GAAACGPACCGCU<AUAACGGUGAU-------------------AUUGUAGGTPCGAGCCCUACUAAGCCUACCA
.µµAµµµµµmitoµIleµ.AUµSolanum tuberosumµmitochondrial µ-GGGC_UAUAGUUPAADD-#GDD-GAAACGPACCGCU.AUAACGGUGAU-------------------AUUGUAGGTPCGAGCCCUACUAAGCCUACCA
.µµKµµµµµmitoµLeuµ.AAµSolanum tuberosumµmitochondrial µ-GUCAGGAUGGCMGAGD--#GDCXAAGGCRCCAGACU.AAKUPCUGGJ-CUUC---GUAA----GAGGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACUUCUGACACCA
CµµPµµµµµmitoµMetµCAUµTetrahymena pyriformisµmitochondrial µ-GCUGCUU--GAA--U---GGD----UUC_GUGGGCUCAUPPCCCAUUA-------------------CUAUAAAGTPCGAUUCUUUAAAGCGGCCCCA
GµµHµµµµµmitoµPheµGAAµTetrahymena pyriformisµmitochondrial µUGCUUAAGUALCUCAGU--GGD--AGAGCRUCAGGCUGAAHACCPGAAG-------------------GUCAUUGGUCCGAUUCCAUUCUUAGGCACCA
QµµHµµµµµmitoµTyrµQUAµTetrahymena pyriformisµmitochondrial µ-GAGAUGGUGLCUGAGU--GGDD-AAAGCRGPAGACUQUAHAPCPAUJ-GGG----UA-------UCCGUCGUCGGTPCGAGUCCGAUCCAUCUCACCA
!µµ+µµµµµmitoµTrpµ!CAµTetrahymena thermophilaµmitochondrial µ-GGGGGAAUALUUUAAU--GGD--AGAACAACGGUCU!CA+AAPCGUUA-------------------G-CGUGGGUUCGAUUCCUGCUUCUCUCGCCA
NµµAµµµµµmitoµGluµNUCµChlamydomonas reinhardtiiµplastidic µ-GCCCCCAUCGUCUAGA--#GCCDAGGACACCUCCCUNUCACGGAGAAA-------------------A-?GCGGATPCGAAUUCCGCUGGGGGUACCA
UµµKµµµµµmitoµLeuµUA7µChlamydomonas reinhardtiiµplastidic µ-GCCUUCGUGAUC-GGAAU#GDAGA-GAUCCUGGUCUUA7KAACCAGCUG------CUGAA------AGGCGGCGGTPCAAAUCCGCCCGAAGGCACCA
UµµAµµµµµmitoµGlyµUCCµCodium fragileµplastidic µ-GCAGUACUGGUGUAAD--#GDD-AGCGCCUUAGAPUUCCAAPCUAAAG-------------------G-UAGGGGTPCGAUUCCCCUGUACUGCUCCA
Nµµ6µµµµµmitoµLysµNUUµCodium fragileµplastidic µ-GGGUUACUAACUCAAD--#GD--AGAGUAAPCGGCUNUU6ACCGAUAA-------------------7DUCUGGGTPCAAUUCCCAGGUAACUCACCA
CµµHµµµµµmitoµMetµCAUµCodium fragileµplastidic µ-GCCUAUUUALCUCAGDD-#GDD-AGAGCAPCCGPCUCAUHCGCGGGAA-------------------7DGACUAGTPCAAAUCUAGUAAUAGGCACCA
IµµHµµµµµmitoµArgµICGµCodium fragileµplastidic µ-GGGUAUAUAACUCAGD--#GADUAGAGUPPAUGGCUICGHACCAUAAA-------------------7DCGGGGGTPCGAAUCCCUCUAUACUCACCA
Gµµ*µµµµµmitoµPheµGAAµEuglena gracilisµplastidic µ-GCUGGGAUAGCUCAGDU-G#D--AGAGCGGAGGACUGAA*APCCUUGU-------------------7.CACCAGTPCAAAUCUGGUUCCUAGCACCA
BµµHµµµµµmitoµLeuµBAAµGlycine maxµplastidic µ-GCCUUGGUGGUGAAAU--#GDA-GCCACGCGAGACUBAAHAPCUCGU-GCU----ACAG-----AGCG-UGGAGGTPCGAGUCCUCUUCAAGGCACCA
JµµHµµµµµmitoµLeuµJAAµGlycine maxµplastidic µ-GGGGAUAUGGCGAAAUU-#GDA-GACGCPACGGACUJAAHAPCCGUC-GACUU--AAG----AAAUCA-UGAGGGTPCAAGUCCCUCUAUCCCCACCA
UµµKµµµµµmitoµLeuµUA7µGlycine maxµplastidic µ-GCCGCUAUGGUGAAAUU-#GDA-GACACGCUGCUCUUA7KAAGCAGU-GCU----AG-------AGCA-UCUCGGTPCGAGUCCGAGUAGCGGCACCA
GµµHµµµµµmitoµAspµGUCµHordeum vulgareµplastidic µ-GGGAUUGUAGUUCAAUU-#GDC-AGAGCACCGCCCUGUCHAGGCGGAA-------------------G<UGCGGGTPCGAGCCCCGUCAGUCCCGCCA
QµµHµµµµµmitoµAspµQUCµHordeum vulgareµplastidic µ-GGGAUUGUAGUUCAAUU-#GDC-AGAGCACCGCCCUQUCHAGGCGGAA-------------------G<UGCGGGTPCGAGCCCCGUCAGUCCCGCCA
SµµAµµµµµmitoµGluµSPCµHordeum vulgareµplastidic µ-GCCCCUAUCGUMUAGU--GGDDCAGGACAUCUCPCUSPCAAGGAGGCA-------------------G-?GGGGATPCGACUUCCCCPGGGGGUACCA
!µµHµµµµµmitoµGlnµ!UGµHordeum vulgareµplastidic µ-UGGGGCGUGGCCAAGU--#GD--AAGGCAGCGGGUU!UGHUCCCGUUA-------------------UDCGGAGGTPCGAAUCCUUCCGUCCCAGCCA
NµµKµµµµµmitoµGlnµNUGµNicotiana rusticaµplastidic µ-UGGGGCGUGGCPAAGU--#GD--AAGGCAACGGGUUNUGKUCCCGCUA-------------------UUCGGAGGTPCGAAUCCUUCCGUCCCAGCCA
Gµµ+µµµµµmitoµCysµGCAµNicotiana rusticaµplastidic µ-GGCGACAUGGCCGAGU--#GD--AAGGCAGAGGACUGCA+APCCUUUU-------------------UUCCCCAGTPCAAAUCCGGGUGUCGCCUCCA
BµµAµµµµµmitoµTrpµBCAµNicotiana tabacumµplastidic µ-GCGCUCUUAGUUCAGUUC#GD--AGAACGPGGGPCUBCAAAACCCGAU-------------------GNCGUAGGTPCAAAUCCUACAGAGCGUGCCA
Gµµ*µµµµµmitoµPheµGAAµPhaseolus vulgarisµplastidic µ-GUCGGGAUAGCUCAGUD-#GD--AGAGCAGAGGACUGAA*APCCUCGU-------------------7XCACCAGTPCAAAUCUGGUUCCUGGCACCA
BµµHµµµµµmitoµLeuµBAAµPhaseolus vulgarisµplastidic µ-GGCUUGAUGGUGAAAUU-#GDA-GACACGCGAGACUBAAHAUCUCGU-GCU----AAAG-----AGCG-UGGAGGTPCGAGUCCUCUUCAAGUCACCA
NµµHµµµµµmitoµLeuµNAAµPhaseolus vulgarisµplastidic µ-GGGGAUAUGGCGAAAUU-#GDA-GACGCPACGGACUNAAHAPCCGUC-GACUU--AAU----AAAUCA-UGAGGGTPCAAGUCCCUCUAUCCCCACCA
UµµKµµµµµmitoµLeuµUA7µPhaseolus vulgarisµplastidic µ-GCCGCUAUGGUGAAAUU-#GDA-GACACGCUGCUCUUA7KAAGCAGU-GCU----AG-------AGCA-UCUCGGTPCGAGUCCGAGUAGCGGCACCA
BµµHµµµµµmitoµTrpµBCAµPhaseolus vulgarisµplastidic µ-ACGCUCUUAGUUCAGUUC#GC--AGAACGPGGGPCUBCAHAACCCGAU-------------------7UCGUAGGTPCAAAUCCUACAGAGCGUGCCA
CµµAµµµµµmitoµIniµCAUµPhaseolus vulgarisµplastidic µ-CGCGGAGUAGAGCAACUU#GD--AGCUCGCAAGGCUCAUAACCUUGAA-------------------7XUACGGGTPCAAAUCCCGUCUCCGCAACCA
Cµµ/µµµµµmitoµMetµCAUµScenedesmus obliquusµplastidic µ-GCCUGCUPAGCUCAGUD-#GCC-AGAGCAUCCGPPUCAU/CGCGGAAA-------------------7DCACUAGTPCGAAUCUAGUAGCAGGCACCA
CµµAµµµµµmitoµIniµCAUµScenedesmus obliquusµplastidic µ-CGCAGGAUAGAGCAGUCU#GD--AGCUCRPGGGGCUCAUAAPCCCAAU-------------------7DCGCAGGTPCAAAUCCUGCUCCUGCAACCA
Gµµ*µµµµµmitoµTyrµGUAµScenedesmus obliquusµplastidic µ-GGGCCGAUGCCGAAGUN-#GDU-AAUGGGGCGGAPUGUA*APCCGCU-GGU----UAC------GCCUACGUUGGTPCGAAUCCGACUCGGCCCACCA
Gµµ*µµµµµmitoµPheµGAAµSpinacia oleraceaµplastidic µ-GUCGGGAUAGCUCAGCU-#GD--AGAGCAGAGGACUGAA*AUCCUCGU-------------------7XCACCAGTPCAAAUCUGGUUCCUGGCACCA
Gµµ6µµµµµmitoµIleµGAUµSpinacia oleraceaµplastidic µ-GGGCUAUUAGCUCAGU--#GD--AGAGCRCGCCCCUGAU6AGGGCGAG-------------------7XCUCUGGTPCAAGUCCAGGAUGGCCCACCA
<µµ6µµµµµmitoµIleµµSpinacia oleraceaµplastidic µ-GCAUCCAUGGCUGAAU--#GDD-AAAGCRCCCAACU<AU6APPG_GAA-------------------UUCGUAGGTPCAAUUCCUACUGGAUGCACCA
UµµKµµµµµmitoµLeuµUA7µSpinacia oleraceaµplastidic µ-GCCGCUAUGGUGAAAUU-#GDA-GACACGCUGCUCUUA7KAAGCAGU-GC-----GAGA------GCA-UCUCGGTPCGAGUCCGAGUAGCGGCACCA
CµµAµµµµµmitoµMetµCAUµSpinacia oleraceaµplastidic µ-ACCUACUUAACUCAGC--#GDD-AGAGPAPPGCPUUCAUACGGCGGGA-------------------7XCAUUGGTPCAAAUCCAAUAGUAGGUACCA
NµµHµµµµµmitoµProµNGGµSpinacia oleraceaµplastidic µ-AGGGAUGUA;CGCAGCUU#GD--AGCGCPPUUGUPUNGGHPACAAAAU-------------------7UCACGGGTPCAAAUCCUGUCAUCCCUACCA
GµµEµµµµµmitoµThrµGGUµSpinacia oleraceaµplastidic µ-GCCCCUUUAACUCAGU--#GD--AGAGUAACGCCAUGGUEAGGCGUAA-------------------7DCAUCGGTPCAAAUCCGAUAAGGGGCUCCA
NµµAµµµµµmitoµValµNACµSpinacia oleraceaµplastidic µ-AGGGCUAUAGCUCAGUUA#GD--AGAGCACCUCGUUNACACCGAGAAA-------------------7.CUACGGTPCGAGUCCGUAUAGCCCUACCA
CµµHµµµµµmitoµTrpµCCAµSpinacia oleraceaµplastidic µ-GCGCUCUUAGUUCAGUUC#GD--AGAACLPGGGPCUCCAHAACCCGAU-------------------G.CGUAGGTPCAAGUCCUACAGAGCGUGCCA
CµµAµµµµµmitoµIniµCAUµSpinacia oleraceaµplastidic µ-CGCGGGGUAGAGCAGUUU#GD--AGCUCGCAAGGCUCAUAACCUUGAG-------------------7UCACGGGTPCAAAUCCUGUCUCCGCAACCA
SµµAµµµµµmitoµGluµSPCµTriticum aestivumµplastidic µ-GCCCCUAUCGUMUAGU--GGDDCAGGACAUCUCPCUSPCAAGGAGGCA-------------------G-?GGGGATPCGACUUCCCCPGGGGGUACCA
Gµµ6µµµµµmitoµIleµGAUµZea maysµplastidic µ-GGGCUAUUAGCUCAGU--#GD--AGAGCRCGCCCCUGAU6AGGGCGAG-------------------7XCUCUGGTPCAAGUCCAGGAUGGCCCACCA
CµµAµµµµgcgµBacterµAlaµCGCµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGGCCUGUGGCGCAGUCUGGD-DAGCGCACCUCGUUCGCAUCGAGGGG-------------------GUCUGGGGUUCA"AUCCCCACAGGUCCA---
GµµAµµµµgccµGµAlaµGGCµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGGGCUAUAGCUCAGCD-GGG--AGAGCGCUUGCAUGGCAUGCAAGAG-------------------7UCAGCGGTPCGAUCCCGCUUAGCUCCACCA
GµµAµµµµgccµGµAlaµGGCµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GGGGCCAUAGCUCAGCD-GGG--AGAGCGCUACGCUGGCAGCGUAGAG-------------------7UCAGGGGTPCGAGCCCCCUUGGCUCCACCA
GµµAµµµµgccµGµAlaµGGCµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGGGCUAUAGCUBAGUDDGGD-DAGAGCGCCUGCAUGGCAUGCAGGAG-------------------7UCAGGAGUUCA"UUCUCCUUAGCUCCACAA
GµµAµµµµgccµGµAlaµGGCµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGGGCUAUAGCUBAGUDDGGD-DAGAGCGCCUGCAUGGCAUGCAGGAG-------------------7UCAGGAGUUCA"UUCUCCUUAGCUCCA---
5µµ=µµµµgcaµUµAlaµUGCµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GGAGCCUUAGCUCAGCD-GGG--AGAGCGCCUGCUU5GC=CGCAGGAG-------------------7UCAGCGGTPCGAUCCCGCUAGGCUCCACCA
5µµ6µµµµgcaµUµAlaµUGCµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGGGCCU4AGCUCAGCU-GGG--AGAGCGCCUGCUU5GC6CGCAGGAG-------------------7UCAGCGGUUCGAUCCCGCUAGGCUCCA---
Uµµ=µµµµgcaµUµAlaµUGCµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGGCCCU4AGCUCAGCD-GGG--AGAGCACCUGCCUUGC=CGCAGGGG-------------------7UCGACGGUPCGAUCCCGUUAGGGUCCACCA
Uµµ=µµµµgcaµUµAlaµUGCµMycoplasma mycoidesµprokaryotic cytosol µ-GGGCCCUUAGCUCAGCD-GGG--AGAGCACCUGCCUUGC=CGCAGGGG-------------------7UCGACGGUUCGAUCCCGUUAGGGUCCACCA
CµµGµµµµgcaµUµAlaµUGCµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGGGCCUUAGCUBAGUDGGDA-GAGCGCUGCCUUUGCAAGGCAGAU---------------------GUCAGGAGUUCGAAUCUCCUAGGCUCCA---
VµµAµµµµgcaµUµAlaµVGCµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGGGCUAUAGCUCAGCD-GGG--AGAGCGCCUGCUUVGCACGCAGGAG-------------------7UCUGCGGTPCGAUCCCGCAUAGCUCCACCA
!µµ6µµµµagaµUµArgµ!CUµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GCCCAUGUAGCUCAGUA-GGAD-AGAGCACGCGCCU!CU6AGCGUGAG-------------------7UCGGAAGUPCGAGCCUUCUCGUGGGCACCA
IµµAµµµµcgtµAµArgµACGµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GCAGGCGUGGCUCAACDDGGADDAGAGUACCUGACUICGAAUCAGGCG-------------------GUUGUAGGUUCGAAUCCUACCGCUUGCA---
IµµKµµµµcgtµAµArgµACGµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCACUCGUAGCUJAAC--GGADDAGAGCAUCUGACUICGKAUCAGAAG-------------------7UUGCAGGUUCG"AUCCUGCCGAGUGCA---
CµµKµµµµcggµCµArgµCCGµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCGCCCGUAGCUCAGCD-GGAD-AGAGCGCUGCC%UCCGKAGGCAGAG-------------------7UCUCAGGTPCGAAUCCUGUCGGGCGCGCCA
CµµKµµµµcggµCµArgµCCGµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GCGCUCGUAGCUCAGUU-GGAD-AGAGCGGUGGUUUCCGKUACCACGGUCG----------------UCCGGGGGTPCGAAUCCCUCCGAGCGCGCCA
CµµKµµµµcggµCµArgµCCGµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCCCCCGUAGCUBAG#-#GGADDAGAGCAUCGGCCUCCGKAGCCGGGU--------------------GCGCAGGUUCG"AUCCUGCCGGGGGCA---
Cµµ6µµµµaggµCµArgµCCUµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GCUCUAGUAGCACAGC--GGAD-AGUGCAGCAGUUUCCU6AACUGCAG-------------------7UCGGGAGTPCGAAUCUCUCCUAGAGCGCCA
Cµµ6µµµµaggµCµArgµCCUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCCUUCGUAGCUBAG#-#GGADDAGAGCACCGCUCUCCU6AAGCGGGU-------------------GUCGCAGGUUCG"AUCCUGCCGGGGGCA---
Iµµ/µµµµcgtµAµArgµICGµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCAUCCG4AGCUCAGCD-GGAD-AGAGUACUCGG%UICG/ACCGAGCG-------------------7XCGGAGGTPCGAAUCCUCCCGGAUGCACCA
IµµKµµµµcgtµAµArgµICGµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GCGCCCGUAGCUCAAU--GGAD-AGAGCGUUUGACUICGKAUCAAAAG-------------------7UUAGGGGTPCGACUCCCCUCGGGCGCGCCA
IµµKµµµµcgtµAµArgµICGµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GCGCCCG4AGAUCAAUD-GGAD-AGAUCGCUUGACUICGKAPCAAAAG-------------------7UUGGGGGUPCGAGUCCCUCCGGGCGCACCA
{µµ6µµµµagaµUµArgµUCUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCGCCCUUAGCUCAGUU-GGAU-AGAGCAACGAC%U{CU6AGPCGUGG-------------------GCCGCAGGTPCGAAUCCUGCAGGGCGCGCCA
Uµµ6µµµµagaµUµArgµUCUµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GUCCCAGUAGCUCAGCD-GGAD-AGAGCAACGGCCUUCU6AGCCGUCG-------------------7UCGGGAGTPCGAAUCUCUCCUGGGACGCCA
UµµAµµµµagaµUµArgµUCUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGUCCGAUAGCUCAGCU-GGADDAGAGCAUUCGCCUUCUAAGCGAACG-------------------7UCGAGGGUUCGAAUCCCCCUCGGAUCA---
UµµAµµµµagaµUµArgµUCUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCCCCCGUAGCUBAGU--GGADDAGAGCAGGCGCCUUCUAAGCGCUUG-------------------GcCGCAGGUUCGAGUCCUGCCGGGGGCG---
Qµµ6µµµµaacµGµAsnµGUUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-UCCUCUG4AGUUCAGDC-GGD--AGAACGGCGGACUQUU6APCCGUAU-------------------7UCACUGGTPCGAGUCCAGUCAGAGGAGCCA
Gµµ6µµµµaacµGµAsnµGUUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-UGCGGAU4AGCUCAGUU-GGUA-GUAGCGCAUGACUGUU6AUCAUGAU-------------------7UCGUCAGUUCGAGUCUGACAUCCGCAG---
Gµµ6µµµµaacµGµAsnµGUUµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGCUUUU4AGCUCAGCA-GGD--AGAGCAACCGGCUGUU6ACCGGUUU-------------------7UCACAGGUPCGAGCCCUGUAAAAGCCGCCA
Gµµ6µµµµaacµGµAsnµGUUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-UCCCCUGUAGCUBAAU--DGGC-AGAGCAGCCGGCUGUU6ACCGGCAG-------------------7UUACUGGUUCGAGUCCAGUCGGGGGAG---
Gµµ6µµµµaacµGµAsnµGUUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-UCCCCUGUAGCUBAAU--DGGC-AGAGCAUUCGGCUGUU6ACCGGAGG-------------------7UUACUGGUUCGAGUCCAGUCGGGGGAG---
Qµµ6µµµµaacµGµAsnµQUUµAzospirillum lipoferumµprokaryotic cytosol µ-UUCACAGUAGCUCAGU--GGD--AGAGCUAUCGGCUQUU6ACCGAUCG-------------------AUCGUAGGTPCGAGUCCUACCUGUGAAUCCA
Qµµ6µµµµaacµGµAsnµQUUµAzospirillum lipoferumµprokaryotic cytosol µ-UUCACAGUCGCUCAGU--GGD--AGAGCUAUCGGCUQUU6ACCGAUCG-------------------AUCGUAGGTPCGAGUCCUACCUGUGAAUCCA
⊄µµ/µµµµgacµGµAspµ⊄UCµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGAGCGG4AGUUCAGDC-GGDD-AGAAUACCUGCCU⊄UC/CGCAGGGG-------------------7UCGCGGGTPCGAGUCCCGPCCGUUCCGCCA
GµµAµµµµgacµGµAspµGUCµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGUUCUGUAGUGUAGC--GGDDDAUCACGUCGCCCUGUCACGGCGAAG-------------------AUCGCGGGUUCGAUUCCCGUCAGAACCG---
GµµAµµµµgacµGµAspµGUCµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGCCCCA4AGCGAAGUD-GGDD-AUCGCGCCUCCCUGUCACGGAGGAG-------------------AUCACGGGUPCGAGUCCCGUUGGGGUCGCCA
GµµAµµµµgacµGµAspµGUCµThermus thermophilusµprokaryotic cytosol µ-GGCCCCG4GGUGPAGUU-#GDD-AACACACCCGCCUGUCACGPGGGAG-------------------AUCGCGGGFPCG"GUCCCGUCGGGGCCGCCA
Gµµ*µµµµtgcµGµCysµGCAµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGCGCGU4AACAAAGC--GGD--DAUGUAGCGGAPUGCA*APCCGUCU-------------------A-GUCCGGTPCGACUCCGGAACGCGCCUCCA
Gµµ=µµµµtgcµGµCysµGCAµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGCAACA4GGCCAAGC--GGCD-A"GGCAUGGGUCUGCA=CACCCUGA-------------------U-CAUCGGUPCGAAUCCGAUUGUUGCCUCCA
GµµAµµµµtgcµGµCysµGCAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GACCGUGUGCCCGAGA--GGCU-BAGGGGCUCGABUGCAACUCGAGUU-----------------ACACCGGUUCG""UCCGGUCACGGUCUCCG---
Gµµ*µµµµtgcµGµCysµGCAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGUGGAGUGGCCKAGA--GGC--GAGGCAACGGCCUGCA*AGCCGUCU-------------------A-CACGGGUUCAAAUCCCGUCUCCACCUCCA
Gµµ≠µµµµtgcµGµCysµGCAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGUGGAGUGGCCKAGA--GGC--GAGGCAACGGCCUGCA≠AGCCGUCU-------------------A-CACGGGUUCAAAUCCCGUCUCCACCUCCA
$µµ=µµµµcaaµUµGlnµ$UGµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-UGGGCUA4AGCCAAGC--GGD--A"GGCAAGGGACU$UG=CUCCCUCA-------------------UGCGCCGGUPCGAAUCCUGCUAGCCCAACCA
Cµµ/µµµµcagµCµGlnµCUGµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-UGGGGUA4CGCCAAGC--#GD--AAGGCACCGGAJUCUG/PPCCGGCA-------------------UUCCGAGGTPCGAAUCCUCGUACCCCAGCCA
CµµGµµµµcagµCµGlnµCUGµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-UGGGCUAUGBUGUAAUDDGGC--AACACUACGGUUUCUGGUACCGUCA-------------------U-UCUAGGUUCGAGUCCUGGUAGCCCAG---
$µµ/µµµµcaaµUµGlnµUUGµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-UGGGGUA4CGCCAAGC--#GD--AAGGCACCGGUJU$UG/PACCGGCA-------------------UUCCCUGGTPCGAAUCCAGGUACCCCAGCCA
UµµAµµµµcaaµUµGlnµUUGµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-UGGGGUA4AGCCAAGCG-GDA--AGGCAAGGGACUSUUGACUCCCUCA-------------------UGCGUUGGUUCGAAUCCAGCUACCCCAG---
UµµGµµµµcaaµUµGlnµUUGµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-UCCCCCAUGKUGUAAUCAGGC--AGCACUGCGGUUUUUGGUACCGUCU-------------------G-UUCAGGUUCA"AUCCUGAUGGGGGAG---
Sµµ/µµµµgaaµUµGluµ{UCµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GUCCCCU4CGUCPAGA--GGCCCAGGACACCGCCCUSUC/CGGCGGUA-------------------A-CAGGGGTPCGAAUCCCCUAGGGGACGCCA
$µµAµµµµgaaµUµGluµ$UCµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGCCUGUUGGUGAAGC--GGDD-A"CACACACGGUU$UCAUCCGUGGA-------------------CACACGGGUPCGAACCCCGUACAGGCUACCA
CµµAµµµµgagµCµGluµCUCµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCCCCCGUUGUGJAGC--GGCCUAGCACGCUGCCCUCUCACGGCAGUA-------------------G-CGCCGGUUCG""UCCGGUCGGGGGUACAA
CµµAµµµµgagµCµGluµCUCµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCCCCCGUUGUGJAGC--GGCCUAGCACGCUGCCCUCUCACGGCAGUA-------------------G-CGCCGGUUCG""UCCGGUCGGGGGUA---
NµµAµµµµgaaµUµGluµNUCµSynechocystis sp.µprokaryotic cytosol µ-GCCCCCAUCGUCUAGA--GGCCDAGGACACCUCCCUNUCACGGAGGCG-------------------A-CAGGGATPCGAAUUCCCUUGGGGGUACCA
Sµµ/µµµµgaaµUµGluµSUCµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GUCCCCUUCGUCPAGA--GGCCCAGGACACCGCCCUSUC/CGGCGGUA-------------------A-CAGGGGTPCGAAUCCCCUAGGGGACGCCA
UµµAµµµµgaaµUµGluµUUCµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGUCCGUUGGUC"AGG--GGUU-AAGACACCGCCUUUUCACGGCGGUA-------------------A-CACGGGUUCGAAUCCCGUACGGACUA---
!µµAµµµµggaµUµGlyµ!CCµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GCGGGUGUAGUUUAGU--GGD--AAAACCUCAGCCU!CCAAGCUGAUG-------------------U-CGUGAGTPCGAUUCUCAUCACCCGCUCCA
{µµAµµµµggaµUµGlyµ{CCµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCGGGCAUCGUAUAAU--GGCU-AUUACCUCAGCCU{CCAAGCUGAUG-------------------A-UGCGGGTPCGAUUCCCGCUGCCCGCUCCA
Uµµ=µµµµggaµUµGlyµ{CCµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GCAGGUG4AGUUUAAU--GGD--AGAACUUCAGCCUUCC=AGCUGAUU-------------------G-UGAGGGUPCGAUUCCCUUCACCUGCUCCA
Uµµ=µµµµggaµUµGlyµ{CCµMycoplasma mycoidesµprokaryotic cytosol µ-GCAGGUG4AGUUUAAU--GGC--AGAACUUCAGCCUUCC=AGCUGAUU-------------------G-UGAGGGUPCGAUUCCCUUCACCUGCUCCA
UµµCµµµµggaµUµGlyµ{CCµStaphylococcus epidermidisµprokaryotic cytosol µ-GCGGGAG4AUUUCAACU-UUD--AGAAUACGUUCCUUCCCGGAACGAG-------------------A-UAUAGGUGCAAAUCCUAUCUUCCGCUCCA
UµµCµµµµggaµUµGlyµ{CCµStaphylococcus epidermidisµprokaryotic cytosol µ-GCGGGAG4AGUUCAAU--UUD--AGAACACAUUCCUUCCCGGAAUGAG-------------------G-UAUAGGUGCAAGUCCUAUCUUCCGCUCCA
CµµAµµµµgggµCµGlyµCCCµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCGGGCG4AGUUCAAU--GGD--AGAACGAGAGCUUCCCAAGCUCUAU-------------------A-CGAGGGTPCGAUUCCCUUCGCCCGCUCCA
CµµAµµµµgggµCµGlyµCCCµSalmonella typhimuriumµprokaryotic cytosol µ-GCGGGCGUAGUUCAAU--#GD--AGAACGAGAGCUUCCCAAGCUCUAU-------------------A-CGAGGGTPCGAUUCCCUUCGCCCGCUCCA
CµµAµµµµgggµCµGlyµCCCµStreptomyces coelicolor A3(2)µprokaryotic cytosol µ-GCGGGUGUAGUUCAAU--GGD--AGAACAUCAGCUUCCCAAGCUGAGA-------------------G-CGCGAGTPCGAUUCUCGUCACCCGCUCCA
CµµAµµµµgggµCµGlyµCCCµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCGGKUGUAGUUUAAU--GGD-DAGAACAUGAGCUUCCCAAGCUCAGA-------------------G-CGCGAGUUCGAUUCUCGUCACCCGCU---
GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCGGGAA4AGCUCAGDDDGGD-DAGAGCACGACCUUGCCAAGGUCGGG-------------------7UCGCGAGTPCGAGUCUCGUUUCCCGCUCCA
GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GCGGAAGUAGUUCAGU--GGD--AGAACACCACCUUGCCAAGGUGGGG-------------------7UCGCGGGTPCGAAUCCCGUCUUCCGCUCCA
GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GCGAACGUAGUUCAGG--GGU--AGAACACAACCUUGCCAUGGUUGGG-------------------7UCGCGAGUUCGAAUCUCGUCGUUCGCU---
GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCGKACGUAGCUBAGUDDGGD-DAGAGCGCAACCUUGCCAAGGUUGAG-------------------GUCGCCAGUUCGAACCUGGUCGUCCGCUCCA
GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCGKACGUAGCUBAGUDDGGD-DAGAGCGCAACCUUGCCAAGGUUGAG-------------------GUCGCCAGUUCGAACCUGGUCGUCCGCU---
NµµAµµµµggaµUµGlyµNCCµSalmonella typhimuriumµprokaryotic cytosol µ-GCGGGCAUCGUAUAAU--GGCU-AUUACCUCAGCCUNCCAAGCUGAUG-------------------A-UGCGGGTPCGAUUCCCGCUGCCCGCUCCA
Uµµ=µµµµggaµUµGlyµUCCµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GCGGAUGUAGUUUAAU--GGU--AGAACCCCAGCCUUCC=AGCUGGCU-------------------A-CGCGAGUUCGAUUCUCGUCAUCCGCU---
5µµ=µµµµggaµUµGlyµUCCµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GCGGAUGUAGUUUAAU--GGU--AGAACCCCAGCCU5CC=AGCUGGCU-------------------A-CGCGAGUUCGAUUCUCGUCAUCCGCU---
UµµAµµµµggaµUµGlyµUCCµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCGGGCGUAGCUCAAU--GGD-DAGAGCCCUAGUCUUCCAAACUAGCU-------------------A-CGCGGGUUCG"UUCCCGUCGCCCGCUCCA
Qµµ/µµµµcacµGµHisµGUGµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µGGUGGCUA4AGCUCAGDD-GGD--AGAGCCCUGGAUUQUG/PPCCAGUU-------------------7UCGUGGGTPCGAAUCCCAUUAGCCACCCCA
GµµKµµµµcacµGµHisµGUGµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GUGGGUAUAGCUBAGCU-GGC--AGAGCACCUGGUUGUGKUUCAGGAU-------------------7UCGCGGGUUCA"GUCCCGUUACUCACC---
GµµKµµµµcacµGµHisµGUKµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µGGCGUAGGUGGUGAAGU--GGDD-A"CACAUCAGGUUGUGKCPCUGACA-------------------UACGCGGGUPCGAUCCCCGUUCUACGCCCCA
Qµµ/µµµµcacµGµHisµQUGµSalmonella typhimuriumµprokaryotic cytosol µGGUGGCUA4AGCUCAGDD-GGD--AGAGCCCUGGAUUQUG/PPCCAGUU-------------------7UCGUGGGTPCGAAUCCCAUUAGCCACCCCA
}µµ6µµµµatcµGµIleµ}AUµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GGACCUUUAGCUCAGUU-GGUU-AGAGCAGACGGCU}AU6ACCGUCCG-------------------7UCGUAGGTPCGAGUCCUACAAGGUCCACCA
}µµ=µµµµatcµGµIleµ}AUµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGACCUU4AGCUCAGUD-GGDD-AGAGCAUCCGGCU}AU=ACCGGACG-------------------7UCAUUGGUPCAAGUCCAAUAAGGUCCACCA
}µµ6µµµµatgµCµIleµCAUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGCCCCU4AGCUCAGU--#GDD-AGAGCAGGCGACU}AU6APCGCUUG-------------------7XCGCUGGTPCAAGUCCAGCAGGGGCCACCA
Gµµ6µµµµatcµGµIleµGAUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-AGGCUUGUAGCUCAGGD-GGDD-AGAGCGCACCCCUGAU6AGGGUGAG-------------------7XCGGUGGTPCAAGUCCACPCAGGCCUACCA
Gµµ6µµµµatcµGµIleµGAUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGGAGUU4AGCUCAGUU-GGDDDAGAGCACUGUGUUGAU6ACGCAGGG-------------------7UCCCAGGUUCGAAUCCUGGAAUUCCCA---
Gµµ6µµµµatcµGµIleµGAUµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-CGGAAUAUAGCUCAGCD-GGDD-AGAGCAUUCCGCUGAU6ACGGAGAG-------------------7UCGUUGGUPCAAGUCCAAUUAUUCCGACCA
Gµµ6µµµµatcµGµIleµGAUµMycoplasma mycoidesµprokaryotic cytosol µ-CGGAAUA4AGCUCAGCD-GGDD-AGAGCAUUCCGCUGAU6ACGGAGAG-------------------7UCGUUGGUPCAAGUCCAAUUAUUCCGACCA
Gµµ6µµµµatcµGµIleµGAUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGGGCUAUAGCUBAGUDDGGDDDAGAGCGCAUCCCUGAU6AGGAUGAG-------------------------GGUUCA"AUCCUGUUAGCCCCACCA
Gµµ6µµµµatcµGµIleµGAUµThermus thermophilusµprokaryotic cytosol µ-GGGCGAUUAGCUCAGCU-#GUD-AGAGCGCACGCCUGAU6AGCGUGAG-------------------7UCGGUGGFPCA"GUCCACCAUCGCCCACCA
CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-CGCGGGG4GGAGCAGCCUGGD--AGCUCGUCGGGBUCAUAACCCGAAG-------------------7UCGUCGGTPCAAAUCCGGCCCCCGCAACCA
CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-CGCGGGG4GGAGCAGCCUGGD--AGCUCGUCGGGBUCAUAACCCGAAG-------------------AUCGUCGGTPCAAAUCCGGCCCCCGCAACCA
CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-CGCGGGGUGGAGCAGUUCGGD--AGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAG-------------------GUCGCAGGTPCAAAUCCUGCCCCCGCAACCA
CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµMycobacterium smegmatisµprokaryotic cytosol µ-CGCGGGGUGGAGCAGCUCGGD--AGCUCGCUGGGCUCAUAACCCAGAG-------------------7UCGCAGGUPCG"AUCCUGUCCCCGCUACCA
CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-CGCGGGGUAGAGCAGUD-GGD--AGCUCGCCGGGCUCAUAACCCGGAG-------------------GUCGCAGGUPCGAGUCCUGCCCCCGCAACCA
CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµMycoplasma mycoidesµprokaryotic cytosol µ-CGCGGGG4AGAGCAGUD-GGD--AGCUCGCCGGGCUCAUAACCCGGAG-------------------GCCGCAGGUPCGAGUCCUGCCCCCGCAACCA
CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-CGCGGGGUGGAGCAGCUCGGD--AGCUCGCUGGGCUCAUAACCCAGAG-------------------GUCGCAGGUPCA"AUCCUGUCCCCGCUACCA
CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµSynechococcus elongatus PCC 6301µprokaryotic cytosol µ-CGCGGGGUAGAGCAGCCUGGD--AGCUCGUCGGGBUCAUAACCCGAAG-------------------7UCAGAGGTPCAAAUCCUCUCCCCGCCACCA
CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµThermus thermophilusµprokaryotic cytosol µ-CGCGGGG4GGAGCAGCCU#GD--AGCUCGUCGGGBUCAUAACCCGAAG-------------------7UCGCCGGFPCA"AUCCGGCCCCCGCAACCA
CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµThermus thermophilusµprokaryotic cytosol µ-CGCGGGG4GGAGCAGCCU#GD--AGCUCGUCGGGBUCAUAACCCGAAG-------------------7UCGCGGGFPCA"AUCCCGCCCCCGCAACCA
)µµ*µµµµttaµUµLeuµ)AAµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCCCGGA4GGUGGAADC-#GDA-GACACAAGGGAPU)AA*APCCCUC-GGCG---UUCG----CGCUG-UGCGGGTPCAAGUCCCGCUCCGGGUACCA
)µµ=µµµµttaµUµLeuµ)AAµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-CCCCAAG4GGCGGAAUA-GGDA-G"CGCAUUGGACU)AA=APCCAACGGGC----UUAAU---AUCCUGUGCCGGUPCAAGUCCGGCCUUGGGGACCA
Bµµ*µµµµttgµCµLeuµBAAµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCCGAAG4GGCGAAADC-#GDA-GACGCAGUUGAPUBAA*APCAACC-GUA----GAAA-----UACG-UGCCGGTPCGAGUCCGGCCUUCGGCACCA
Bµµ*µµµµttgµCµLeuµBAAµGeobacillus stearothermophilusµprokaryotic cytosol µ-GCCGAUG4GGCGGAAUD-GGCA-G"CGCGCACGACUBAA*APCGUGU-GGGC---UUU-----GCCCG-UGUGGGTPCGACUCCCACCAUCGGCACCA
Bµµ=µµµµttgµCµLeuµBAAµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GCCUUUUUGGCGGAAUD-GGCA-G"CGCAUUAGACUBAA=APCUAACGAA-----GAAA------UUCGUAUCGGUPCGAAUCCGAUAAAGGGCACCA
CµµHµµµµttgµCµLeuµCAAµRhodospirillum rubrumµprokaryotic cytosol µ-GCCUUUGUAGCGGAAD--GGD--AACGCGGCAGACUCAAHAPCUGCU-UUGG---UAAC----CCAGG-UGGUAGTPCGACUCUCCCCAAAGGCACCA
CµµHµµµµttgµCµLeuµCAAµSynechococcus elongatus PCC 6301µprokaryotic cytosol µ-GGGCAAGUGGCGGAAUD-GGDA-GACGCAGCAGACUCAAHAPCUGCC-GCUA---GCGA----UAGUG-UGUGGGTPCGAGUCCCACCUUGCCCACCA
CµµKµµµµctgµCµLeuµCAGµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCGAAGGUGGCGGAADD-#GDA-GACGCGCUAGCUUCAGKPGPUAGU-GUCC---UUAC----GGACG-UGGGGGTPCAAGUCCCCCCCCUCGCACCA
CµµKµµµµctgµCµLeuµCAGµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GCGGGUGUGCGGGAAUD-GGDA-GACCGGCUAGAUUCAGKAPCUAGGGUCU----UUAU----GGACC-UGAGGGTPCA"GUCCCUUCACCCGCACCA
Cµµ;µµµµctgµCµLeuµCAGµSalmonella typhimuriumµprokaryotic cytosol µ-GCGAAGGUGGCGGAADD-#GDA-GACGCGCUAGCUUCAG;PGPUAGU-GUCC---UUAC----GGACG-UGGGGGTPCAAGUCCCCCCCCUCGCACCA
CµµKµµµµctgµCµLeuµCAGµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCGCGAGUGGCGGAAC--GGCA-GACGCGCUGGCUUCAGKUGCCAGUGUCC-----UUAG----GGACGUGGGGGUUCAAAUCCCCCCUCGCGCACGA
CµµKµµµµctgµCµLeuµCAGµSynechococcus elongatus PCC 6301µprokaryotic cytosol µ-GCGGAACUGGCGGAAUD-GGDA-GACGCGCUAGAUUCAGKPPCUAGU-GGUU---UCAC----GACUG-UCCGGGTPCAAGUCCCGGGUUCCGCACCA
GµµKµµµµctcµGµLeuµGAGµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCCGAGGUGGUGGAADD-#GDA-GACACGCUACCUUGAGKPGGUAGU-GCCC---AAUA----GGGCU-UACGGGTPCAAGUCCCGUCCUCGGUACCA
GµµKµµµµctcµGµLeuµGAGµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GUCCGGKUGGCGGAAU--GGCA-GACGCGCUAGCJUGAGKUGCUAGUGCCCU----UUAU---CGGGCGUGGGGGUUCA"GUCCCCCCUCGGACACCA
UµµAµµµµttaµUµLeuµUAAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCCCGGAUGKUGGAAC--GDA--GACACGGCGAGCUUAAACCUCGCUGCCCCU---CGG----GGGCG-UGCCGGUUCGAGUCCGGCUCCGGGCACUA
VµµKµµµµctaµUµLeuµUAGµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCGGGAGUGGCGAAADD-#GUA-GACGCACCAGAUUVAGKPUCUGGCGCC------GCAA-----GGUGUGCGAGTPCAAGUCUCGCCUCCCGCACCA
UµµKµµµµctaµUµLeuµUAGµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GCGGGUGUGGCGGAAUD-GGCA-GACGCGCUAGACUUAGKAPCUAGUGUUUU---AUGA-------CGUUGGGGGTPCAAGUCCCUUCACCCGCACCA
UµµKµµµµctaµUµLeuµUAGµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGGGGAU4GGCGGAAUD-GGCA-G"CGCACUAGACUUAGKAPCUAGCGUC-----UUU-------GACGUAAGGGUPCAAGUCCCUUAUCCCCCACCA
$µµ[µµµµaaaµUµLysµ$UUµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GAGCCAUUAGCUCAGUD-GGD--AGAGCAUCUGACU$UU[APCAGAGG-------------------7UCGAAGGTPCGAGUCCUUCAUGGCUCACCA
$µµ6µµµµaaaµUµLysµ$UUµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GACUCGUUAGCUCAGCC-GGD--AGAGCAACUGGCU$UU6ACCAGUGG-------------------7UCCGGGGUPCGAAUCCCCGACGAGUCACCA
Cµµ6µµµµaagµCµLysµCUUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGCCCGGUAGCUCAGUU-GGU--AGAGCAGUAGACUCUU6AUCUAUGG-------------------7UCCAGGGUUCGAGCCCCUGCCGAGCCA---
Cµµ6µµµµaagµCµLysµCUUµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GUCUGAUUAGCGCAACD-GGC--AGAGCAACUGACUCUU6APCAGUGG-------------------7UUGUGGGUPCGAUUCCCACAUCAGGCACCA
Cµµ6µµµµaagµCµLysµCUUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCGCCKUUAGCUBAGUDDGGDDDAGAGCAGCUGACUCUU6AUCAGCGG-------------------7UCCGGGGUUCGAGUCCCUGACGGCGCACGA
Cµµ6µµµµaagµCµLysµCUUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCGCCKUUAGCUBAGUDDGGDDDAGAGCAGCUGACUCUU6AUCAGCGG-------------------7UCCGGGGUUCGAGUCCCUGACGGCGCA---
Sµµ6µµµµaaaµUµLysµSUUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGGUCGUUAGCUCAGDD-GGD--AGAGCAGUUGACUSUU6APCAAUUG-------------------7XCGCAGGTPCGAAUCCUGCACGACCCACCA
$µµ6µµµµaaaµUµLysµUUUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GACUCGU4AGCUCAGUU-GGU--AGAGCAUUUGACU$UU6AUCAAAGG-------------------7UCGCUGGUUCGAGCCCAGC=CGGGUCACUA
$µµ6µµµµaaaµUµLysµUUUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GACUCGU4AGCUCAGUU-GGU--AGAGCAUUUGACU$UU6AUCAAAGG-------------------7UCGCUGGUUCGAGCCCAGC=CGGGUCA---
UµµAµµµµaaaµUµLysµUUUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGGCCKUUAGCUBAAUDDGGU-CAGAGCAGCGGACUUUUAAUCCGUUG-------------------7UUGUGGGUUCGAGUCCCACACGGCCUACCG
Cµµ=µµµµatgµCµMetµCAUµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GGCGGUGUAGCUCAGC--GGCD-AGAGCGUACGGUUCAU=CCCGUGAG-------------------7DCGGGGGTPCGAUCCCCUCCGCCGCUACCA
}µµ=µµµµatgµCµMetµCAUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGAUCUUUAGCUCAGUU-GGDDDAGAGCUAUCGGCU}AU=ACCGAUCG-------------------7UCGCUGGUUCGAAUCCAGCAAGAUCCA---
Mµµ=µµµµatgµCµMetµCAUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGCGGUGUAGCUCAGCU-GGCU-AGAGCGUUCGGUUMAU=CCCGAGAG-------------------7UCGGGGGUUCGAUCCCCUUCGCCGCUA---
CµµAµµµµatgµCµMetµCAUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-CGCGGGAUGGAGCAGCU-AGGU-AGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAG-------------------7UCAUAGGTUCAAAUCCUAUUCCCGCAA---
CµµAµµµµatgµCµMetµCAUµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGCGGGG4AGCUCAGUD-GGDD-AGAGCGUUCGGUUCAUACCCGAAAG-------------------7UCGAGAGUPCAAAUCUCUCCCCCGCUACCA
CµµAµµµµatgµCµMetµCAUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGGGCGGUAGCUBAGCC-LGDDDAGAGCAGCGGACUCAUAAUCCGUCG-------------------GCCGUGGGUUCGAGUCCCACCCGCCCCACCG
CµµAµµµµatgµCµMetµCAUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-CGCGGGGUGGAGCAGCU-CGGDDAGCUCGCUGGGCUCAUAACCCAGAG-------------------GUCGCAGGUUCA"AUCCUGUCCCCGCUA---
Cµµ6µµµµatgµCµMetµCAUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-AGCGGUGUAGCUBAGUC-GGD-DAGAGCAAGCGGCUCAU6AUCGCUGU-------------------7UCACCGGUUCA"GUCCGGUCACCGCUACUA
CµµAµµµµatgµCµMetµCAUµThermus thermophilusµprokaryotic cytosol µ-CGCGGGG4GGAGCAGCCU#GD--AGCUCGUCGGGBUCAUAACCCGAAG-------------------7UCGCGGGFPCA"AUCCCGCCCCCGCAACCA
Mµµ6µµµµatgµCµMetµMAUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGCUACG4AGCUCAGDD-#GDD-AGAGCACAUCACUMAU6APGAUGGG-------------------7XCACAGGTPCGAAUCCCGUCGUAGCCACCA
#µµ*µµµµttcµGµPheµ#AAµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GGCUCGGUAGCUCAGUD-GGD--AGAGCAACGGACU#AA*APCCGUGU-------------------7UCGGCGGTPCGAUUCCGUCCCGAGCCACCA
#µµ*µµµµttcµGµPheµ#AAµGeobacillus stearothermophilusµprokaryotic cytosol µ-GGCUCGG4AGCUCAGUC-GGD--AGAGCAAAGGACU#AA*APCCUUGU-------------------7UCGGCGGTPCGAUUCCGUCCCGAGCCACCA
Gµµ*µµµµttcµGµPheµGAAµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCCCGGA4AGCUCAGDC-GGD--AGAGCAGGGGAPUGAA*APCCCCGU-------------------7XCCUUGGTPCGAUUCCGAGUCCGGGCACCA
GµµGµµµµttcµGµPheµGAAµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGCUCGGUAGCUCAGUU-GGU--AGAGCAAUGGAUUGAAGCUCCAUGU-------------------7UCGGCGGUUCGAUUCCGUCUCGCGCCA---
GµµKµµµµttcµGµPheµGAAµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGUCGUGUAGCUCAGUC-GGD--AGAGCAGCAGACUGAAKCPCUGCGU-------------------7UCGGCGGUPCAAUUCCGUCCACGACCACCA
Gµµ*µµµµttcµGµPheµGAAµRhodospirillum rubrumµprokaryotic cytosol µ-GCCCGGGUAGCUCAGCD-GGD--AGAGCACGUGACUGAA*APCACGGU-------------------7UCGGUGGTPCGACUCCGCCCCCGGGCACCA
Gµµ≠µµµµttcµGµPheµGAAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGCUGGGUAGCUBAGUDDGGUA-CGAGCGAUCGCCUGAA≠AGCGAUAG-------------------GUCGCCGGUUCGAUCCCGGCCCCAGCCACCA
Gµµ*µµµµttcµGµPheµGAAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGCUGGGUAGCUBAGUDDGGUA-CGAGCGAUCGCCUGAA*AGCGAUAG-------------------GUCGCCGGUUCGAUCCCGGCCCCAGCCACCA
Gµµ*µµµµttcµGµPheµGAAµSynechococcus sp. PCC 7002µprokaryotic cytosol µ-GCCAGGAUAGCNCAGUD-#GD--AGAGCAGAGGACUGAA*APCCUCGU-------------------7UCGGCGGTPCAAUUCCGCCUCCCGGCACCA
Gµµ+µµµµttcµGµPheµGAAµThermus thermophilusµprokaryotic cytosol µ-GCCGALG4AGCUCAGUU-#GD--AGAGCAUGCGACUGAA+APCGCAGU-------------------7UCGGCGGTPCGAUUCCGCUCCUCGGCACCA
5µµKµµµµccaµUµProµ5GGµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-CGGGAAGUAGCUCAGCUUGGD--AGAGCACAUGGPU5GGKACCAUGGG-------------------7UCGCAGGTPCGAAUCCUGUCUUCCCGACCA
CµµKµµµµccgµCµProµCGGµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-CGGUGAUUGGCGCAGCCUGGD--AGCGCACUUCGUUCGGKACGAAGGG-------------------7UCGGAGGTPCGAAUCCUCUAUCACCGACCA
CµµKµµµµccgµCµProµCGGµSalmonella typhimuriumµprokaryotic cytosol µ-CGGUGAU4GGCGCAGCCUGGD--AGCGCACUUCGJUCGGKACGAAGGG-------------------7UCGGAGGTPCGAAUCCUCUAUCACCGACCA
CµµKµµµµccgµCµProµCGGµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-CGGGGUGUAGCGCAGCUUGGC--AGCGCGCUUCGUUCGGKACGAAGAG-------------------GUCGUGGGUUCAAAUCCCGCCACCCCGA---
GµµKµµµµcccµGµProµGGGµSalmonella typhimuriumµprokaryotic cytosol µ-CGGCACG4AGCGCAGCCUGGD--AGCGCACCGUCBUGGGKUPGCGGGG-------------------7UCGGAGGTPCAAAUCCUCUCGUGCCGACCA
GµµGµµµµcccµGµProµGGGµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-CGGGACGUGGCGCAGCUUGGD-DAGCGCACUUGABUGGGGGUCAAGGG-------------------GUCGCAGGUUCA"AUCCUGUCGUCCCGA---
5µµKµµµµccaµUµProµUGGµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-CGGGAAGUAGCUCAGCUUGGU--AGAGUACUUGGUU5GGKACCAAGGU-------------------7UCGCAGGUUCGAAUCCUGUCUUCCCGA---
UµµKµµµµccaµUµProµUGGµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-CGGGAAGUGGCUCAGUUUGGD--AGAGCAUUCGGUUUGGKACCGAAGG-------------------7UCGCAGGUPCAAAUCCUGUCUUCCCGACCA
UµµKµµµµccaµUµProµUGGµMycoplasma mycoidesµprokaryotic cytosol µ-CGGGAAGUGGCUCAGUUUGGD--AGAGCAUUCGGUUUGGKACCGAAGG-------------------GUCGCAGGUUCAAAUCCUGUCUUCCCGACCA
UµµKµµµµccaµUµProµUGGµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-CGGGGUGUGGCGCAGCUUGGD-DAGCGCGUCCGCUUUGGKAGCGGAAG-------------------GUCGUCGGUUCG""UCCGGCCACCCCGACCA
VµµKµµµµccaµUµProµVGGµSalmonella typhimuriumµprokaryotic cytosol µ-CGGCGAG4AGCGCAGCUUGGD--AGCGCAACUGGJUVGGKACCAGUGG-------------------7UCGGAGGTPCGAAUCCUCPCUCGCCGACCA
Uµµ+µµµµtgaµUµSecµUCAµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-_AAGAUCG4CGUCUCC--GGDG-AGGCGGCUGGACUUCA+AUCCAGU-UGGGGCCGC_GCGGUCCCG--GGCAGGTPCGACUCCUGUGAUCUU_GCCA
5µµ+µµµµtcaµUµSerµ5GAµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GGAGGAA4ACCCAAGUCUGGCDGA"GGGAUCGGUCU5GA+AACCGACAGGGUG--UCAA---AGCCCG-CGGGGGTPCGAAUCCCUCUUCCUCCGCCA
Cµµ*µµµµtcgµCµSerµCGAµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGAGAGAUGCCGGAGC--#GCDGAACGGACCGGUCUCGA*AACCGGA-GUAGGG-GCAA--CUCUAC--CGGGGGTPCAAAUCCCCCUCUCUCCGCCA
Cµµ`µµµµtcgµCµSerµCGAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGJAGCGUGUCCGAGC--GGCC#AAGGAGCUCGCCUCGA`AGCGAGUGUGGC----GUAA---CCCGU-CACCGUGGGUUCAAAUCCCACCGCUACCG
Cµµ≠µµµµtcgµCµSerµCGAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGJAGCGUGUCCGAGC--GGCC#AAGGAGCUCGCCUCGA≠AGCGAGUGUGGC----GUAA---CCCGU-CACCGUGGGUUCAAAUCCCACCGCUACCG
Cµµ+µµµµtcgµCµSerµCGAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGJAGCGUGUCCGAGC--GGCC#AAGGAGCUCGCCUCGA+AGCGAGUGUGGC----GUAA---CCCGU-CACCGUGGGUUCAAAUCCCACCGCUACCG
Cµµ*µµµµtcgµCµSerµCGAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGJAGCGUGUCCGAGC--GGCC#AAGGAGCUCGCCUCGA*AGCGAGUGUGGC----GUAA---CCCGU-CACCGUGGGUUCAAAUCCCACCGCUACCG
Gµµ6µµµµagcµGµSerµGCUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGUGAGG4GGCCGAGA--GGCDGAAGGCGCUCCC%UGCU6AGGGAGU-AUGCGGUCAAAAGCUGCAU--CCGGGGTPCGAAUCCCCGCCUCACCGCCA
Gµµ6µµµµagcµGµSerµGCUµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GGAGAAGUACUCAAGU--GGCDGA"GAGGCGCCCCUGCU6AGGGUGUAGGUCGC-GUAA---GCGGCG-CGAGGGTPCAAAUCCCUCCUUCUCCGCCA
Gµµ6µµµµagcµGµSerµGCUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGGGGGUUACUCAAGA--GGCUGAAGAGGACGGUU5GCU6AAAUCGU4AG7UCGG-GAA--ACCGGCG-CGAGGGUUCGAAUCCCUUACCCCCCU---
Gµµ6µµµµagcµGµSerµGCUµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGGUUAA4ACUCAAGUD-GGDG-A"GAGGACACCCUGCU6AGGUGUUAGGUCGG-UCU-----CCGGCGCGAGGGUPCGAGUCCCUCUUAACCCGCCA
Gµµ6µµµµagcµGµSerµGCUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGAGGCGUCGCCUAGUCCGGUCU/UGGCGCCGCACUGCU6AUGCGGUUUGGGUC--UUAA-AGCCCAU-CGAGGGUUCA"AUCCCUCCGCCUCCG---
GµµAµµµµtccµGµSerµGGAµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGUGAGG4GUCCGAGU--#GDDGAAGGAGCACGCCUGGAAAGPGUGU-AUACG--GCAA---CGUAU--CGGGGGTPCGAAUCCCCCCCUCACCGCCA
GµµAµµµµtccµGµSerµGGAµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GGAGAGC4GUCCGAGU--GGDCGA"GGAGCACGAUUGGAAAPCGUGUAGGCGGU-CAAC--UCCGUCU-CAAGGGTPCGAAUCCCUUGCUCUCCGCCA
GµµAµµµµtccµGµSerµGGAµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGAGAAGUGUCCGAGU--GGCCGAAGGAGC=CGCCUGGAAAGUGUGUAUACGUCA-----CAAGCGUAUCGGGGGUUCGAAUCCCCUCUUCUCCU---
Gµµ`µµµµtccµGµSerµGGAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGAGGAUUCGCCUAGU--GGCCUAGGGCGCACGCJUGGA`AGCGUGUUGGGG----GCAA---CCCCU-CACGAGUUCG""UCUCGUAUCCUCCGCCA
Gµµ≠µµµµtccµGµSerµGGAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGAGGAUUCGCCUAGU--GGCCUAGGGCGCACGCJUGGA≠AGCGUGUUGGGG----GCAA---CCCCU-CACGAGUUCG""UCUCGUAUCCUCCGCCA
Gµµ+µµµµtccµGµSerµGGAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGAGGAUUCGCCUAGU--GGCCUAGGGCGCACGCJUGGA+AGCGUGUUGGGG----GCAA---CCCCU-CACGAGUUCG""UCUCGUAUCCUCCGCCA
Gµµ*µµµµtccµGµSerµGGAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGAGGAUUCGCCUAGU--GGCCUAGGGCGCACGCJUGGA*AGCGUGUUGGGG----GCAA---CCCCU-CACGAGUUCG""UCUCGUAUCCUCCGCCA
Vµµ*µµµµtcaµUµSerµUGAµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGAAGUG4GGCCGAGC--#GDDGAAGGCACCGGUBUVGA*AACCGGC-GACCC--GAAA---GGGUU--CCAGAGTPCGAAUCUCUGCGCUUCCGCCA
Uµµ=µµµµtcaµUµSerµUGAµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGAAGAU4ACCCAAGUCCGGCDGA"GGGAUCGGUCUUGA=AACCGAGAGUCGG--GGAAA----CCGAGCGGGGGUPCGAAUCCCUCAUCUUCCGCCA
Uµµ=µµµµtcaµUµSerµUGAµMycoplasma mycoidesµprokaryotic cytosol µ-GGAAGAUUACCCAAGUCCGGCDGA"GGGAUCGGUCUUGA=AACCGAGAGUCGGG-GAAA--CCCGAG--CGGGGGUUCGAAUCCCUCAUCUUCCGCCA
Uµµ*µµµµtcaµUµSerµUGAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGUGGGUUGCCCGAGC--GGCCUAAGGGAACGGUCUUGA*AACCGUCGUGGCA---GCGA--UGUCAC-CGUGGGUUCAAAUCCCACACCCACCG---
5µµ6µµµµacaµUµThrµ5GUµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GCCGGUGUAGCUCAAUD-GGD--AGAGCAACUGACU5GU6APCAGUAG-------------------7UUGGGGGTPCAAGUCCUCUUGCCGGCACCA
Aµµ6µµµµactµAµThrµAGUµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GCUGACU4AGCUCAGUD-GGD--AGAGCAAUUGACUAGU6APCAAUAG-------------------7UCGAAGGUPCAAAUCCUUUAGUCAGCACCA
Cµµ6µµµµacgµCµThrµCGUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GCCGAGU4AGCUCAGUC-GGU--AGAGCACUUCACUCGU6ACGAAGGG-------------------GUCACAGGUUCGAUUCCUGCACUCGGCA---
Cµµ6µµµµacgµCµThrµCGUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCCGCCUUAGCUBAGUDDGGCC-AGAGCAACGCACUCGU6AUGCGUAG-------------------7UCUCGGGUUCGAAUCCCGAAGGCGGCU---
GµµEµµµµaccµGµThrµGGUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCUGAUAUGGCUCAGDD-GGD--AGAGCGCACCCUUGGUEAGGGUGAG-------------------7UCCCCAGTPCGACUCUGGGUAUCAGCACCA
GµµEµµµµaccµGµThrµGGUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCUGAUAUAGCUCAGDD-GGD--AGAGCGCACCCUUGGUEAGGGUGAG-------------------7UCGGCAGTPCGAAUCUGCCUAUCAGCACCA
GµµAµµµµaccµGµThrµGGUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GCCGUUGUAGCUCAGUC-GGU--AGAGCAGCACCAUGGUAAGGUGAAG-------------------7UCGACAGUUCGAUUCUGUUCAAUGGCA---
Gµµ6µµµµaccµGµThrµGGUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCCCCAAUAGCUBAGUC-GGD-DAGAGCGUCUCCAUGGU6AGGAGAAG-------------------GUCUGCGGUUCG"UUCCGCAUUGGGGCU---
Vµµ6µµµµacaµUµThrµUGUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCCGACUUAGCUCAGUA-GGD-DAGAGCAACUGABUVGU6AUCAGUAG-------------------7UCACCAGTPCGAUUCCGGUAGUCGGCACCA
5µµ6µµµµacaµUµThrµUGUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GCCGACU4AGCUCAGUU-GGU--AGAGCAUCUGAUU5GU6AUCAGAGG-------------------7UCGCGUGUUCGAAUCAUGUAGUCGGCA---
Uµµ6µµµµacaµUµThrµUGUµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GCUGACU4AGCUCAGCA-GGC--AGAGCAACUGACUUGU6APCAGUAG-------------------7UCGUAGGUPCGAUUCCUAUAGUCAGCACCA
UµµHµµµµacaµUµThrµUGUµMycoplasma mycoidesµprokaryotic cytosol µ-GCUGACUUAGCUCAGCA-GGC--AGAGCAACUGACUUGUHAPCAGUAG-------------------7UCGUAGGUUCGAUUCCUAUAGUCAGCACCA
UµµAµµµµacaµUµThrµUGUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCCUCCUUAGCUBAGUCCGGCCCAGAGCGAUGUACUUGUAAUACAUAG-------------------GUCGUCGGUUCG""UCCGACAGGAGGCU---
)µµ=µµµµtgaµUµTrpµ)CAµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-AGGGGCAUAGUUCAGUA-GGD--AGAACAUCGGUCU)CA=AACCGAGU-------------------7UCACGAGUPCGAGUCUUGUUGCCCCUGCCA
Bµµ=µµµµtggµCµTrpµBCAµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-AGGAGAGUAGUUCAAU--GGD--AGAACGUCGGUCUBCA=AACCGAGC-------------------7UUGAGGGUPCGAUUCCUUUCUCUCCUGCCA
Cµµ*µµµµtggµCµTrpµCCAµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-AGGGGCG4AGUUCAADD-GGD--AGAGCACCGGUBUCCA*AACCGGGU-------------------7UUGGGAGTPCGAGUCUCUCCGCCCCUGCCA
Cµµ+µµµµtggµCµTrpµCCAµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-AGGGGCAUAGUUUAAC--GGD--AGAACAGAGGPCUCCA+AACCUCCG-------------------G-UGUGGGTPCGAUUCCUACUGCCCCUGCCA
CµµHµµµµtggµCµTrpµCCAµSpiroplasma citriµprokaryotic cytosol µ-AGGGGUGUAGUUUAAU--GGU--AGAACAGCGGUCUCCAHCACCGUAC-------------------GUUGUGGGUPCAAGUCCUGUCACCCCUGCCA
CµµAµµµµtggµCµTrpµCCAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-AGGGUCGUAGCUBAAUDDGGD-DAGAGCACUGGUCUCCAAAACCAGCG-------------------7UUGGGGGUUCA"GUCCCUCCGGCCCUGCUA
Cµµ≠µµµµtggµCµTrpµCCAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-AGGGGCGUAGCUBAGCG-GCC--AGAGCGGCGGUCUCCA≠AAUCGUAU-------------------7UCGCAGGUUCGAUUCCUGCCGCCCCUGCCG
Cµµ*µµµµtggµCµTrpµCCAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-AGGGGCGUAGCUBAGCG-GCC--AGAGCGGCGGUCUCCA*AAUCGUAU-------------------7UCGCAGGUUCGAUUCCUGCCGCCCCUGCCG
NµµHµµµµtgaµUµTrpµNCAµSpiroplasma citriµprokaryotic cytosol µ-AGGGGUAUAGUUCAAUC-GGU--AGAACACCGGACUNCAHAPCCGGGU-------------------7UUGUGGGUPCAAGUCCUGCUACCCCUGCCA
Gµµ+µµµµtacµGµTyrµGUAµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGAAGGGUAGCGAAGA--GGCUAAACGCGGCGGACUGUA+AUCCGCUCCU------UCG------GGUUCGGGGGUUCGAAUCCCUCCCCUUCCA---
Gµµ=µµµµtacµGµTyrµGUAµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGAGGGGUAGCGAAGU--GGCDAA"CGCGGGUGGCUGUA=CCCACUUCC------UUAC------GGUUCGGGGGUPCGAAUCCCUCCCCCUCCACCA
Gµµ≠µµµµtacµGµTyrµGUAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGCGKUGUGCCCGAGU--GGCCAAAGGGAGCAGABUGUA≠AUCUGCCGGC------UCAG-----CCUACCCAGGUUCGAACCCUGGCGCCGCCA---
Gµµ*µµµµtacµGµTyrµGUAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGCGKUGUGCCCGAGU--GGCCAAAGGGAGCAGABUGUA*AUCUGCCGGC------UCAG-----CCUACCCAGGUUCGAACCCUGGCGCCGCCA---
Qµµ*µµµµtacµGµTyrµQUAµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGUGGGG44CCCGAGC--#GCCAAAGGGAGCAGACUQPA*APCUGCC-GUC----AUC------GACUUCGAAGGTPCGAAUCCUUCCCCCACCACCA
Qµµ*µµµµtacµGµTyrµQUAµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGUGGGG44CCCGAGC--#GCCAAAGGGAGCAGACUQPA*APCUGCC-GUC----ACA------GACUUCGAAGGTPCGAAUCCUUCCCCCACCACCA
Qµµ*µµµµtacµGµTyrµQUAµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GGAGGGG4AGCGAAGU--GGCUAA"CGCGGCGGACUQUA*APCCGCU-CCC----UCA------GGGUUCGGCAGTPCGAAUCUGCCCCCCUCCACCA
Qµµ*µµµµtacµGµTyrµQUAµGeobacillus stearothermophilusµprokaryotic cytosol µ-GGAGGGG4AGCGAAGU--#GCUAA"CGCGGCGGACUQUA*APCCGCU-CCC----UUU------GGGUUCGGCGGTPCGAAUCCGUCCCCCUCCACCA
5µµ=µµµµgtaµUµValµ5ACµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GGAGGAUUAGCUCAGCD-GGG--AGAGCAUCUGCCU5AC=AGCAGAGG-------------------7UCGGCGGTPCGAGCCCGUCAUCCUCCACCA
CµµAµµµµgtgµCµValµCACµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGGCGAUUAGCUBAGU--G#G--AGAGCGCUUCGUUCACACCGAAGAG-------------------7UCACUGGUUCGAACCCAGUAUCGCCCACCG
GµµAµµµµgtcµGµValµGACµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCGUCCG4AGCUCAGDD-GGDD-AGAGCACCACCUUGACAUGGUGGGG-------------------7XCGGUGGTPCGAGUCCACUCGGACGCACCA
GµµAµµµµgtcµGµValµGACµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCGUUCA4AGCUCAGDD-GGDD-AGAGCACCACCUUGACAUGGUGGGG-------------------7XCGUUGGTPCGAGUCCAAUUGAACGCACCA
GµµAµµµµgtcµGµValµGACµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GAUUCCGUAGCUCAGCD-GGG--AGAGCGCUACCUUGACAGGGUAGAG-------------------7UCGCUGGTPCGAGCCCAGUCGGAAUCACCA
Gµµ=µµµµgtcµGµValµGACµGeobacillus stearothermophilusµprokaryotic cytosol µ-GAUUCCGUAGCUCAGCD-GGG--AGAGCGCCACCUUGAC=GGGUGGAG-------------------7UCGCUGGTPCGAGCCCAGUCGGAAUCACCA
GµµAµµµµgtcµGµValµGACµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCGCGAUUAGCUBAGC--G#G--AGAGCGCUUCCCUGACACGGAAGAG-------------------7UCACUGGUUCAAUCCCAGUAUCGCGCACCA
GµµAµµµµgtcµGµValµGACµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCGCGAUUAGCUBAGC--G#G--AGAGCGCUUCCCUGACACGGAAGAG-------------------7UCACUGGUUCAAUCCCAGUAUCGCGCA---
GµµAµµµµgtcµGµValµGACµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGACGAUUAGCUBAGC--G#G--AGAGCGCUUCCCUGACACGGAAGAG-------------------7UCACUGGUUCAAUCCCAGUAUCGUCCA---
5µµ=µµµµgtaµUµValµUACµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGGAGUU4AGCUCAGCU-GGG--AGAGCAUCUGCCU5AC=AGCAGAGG-------------------7UCAGCGGUUCGAUCCCGUUAACUCCCA---
Uµµ=µµµµgtaµUµValµUACµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGAGUGUUAGCUCAGCD-GGG--AGAGCUCCUGCCUUAC=AGCAGGCG-------------------7UCAUAGGUPCAAGUCCUAUACACUCCACCA
Uµµ=µµµµgtaµUµValµUACµMycoplasma mycoidesµprokaryotic cytosol µ-GGAGUGU4AGCUCAGCD-GGG--AGAGCUCCUGCCUUAC=AGCAGGCG-------------------GUCAUAGGUUCAAGUCCUAUACACUCCACCA
UµµAµµµµgtaµBacterµValµUACµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGGUGCGUAGCUBAGG--#GD-DAGAGCGCUGCUCUUACAAAGCAGAU-------------------7UCGGCGGUUCGAAACCGUCCGCGCCCA---
Vµµ=µµµµgtaµUµValµVACµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGGUGAU4AGCUCAGCD-GGG--AGAGCACCUCCCUVAC=AGGAGGGG-------------------7UCGGCGGTPCGAUCCCGUCAUCACCCACCA
CµµAµµµµgcgµarchéeµAlaµCGCµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-GGGCUCGUAGAUCAGC--GGU--AGAUCRCUUCCUUCGCAAGGAAGAG-------------------GCC?UGGG]PBOAAUCCCAGCGAGUCCACCA
CµµAµµµµgcgµCµAlaµCGCµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGCUCGUAGAUCAGU--GGC--AGAUCRCUUCCUUCGCAAGGAAGAG-------------------GC??GGGG]PBOAAUCCCCGCGAGUCCACCA
GµµAµµµµgccµGµAlaµGGCµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGCUCGUAGAUCAGG--GGU--AGAUCACUCCCUUGGCAUGGGAGAG-------------------GC??CGGG]PBOAAUCCCGGCGAGUCCACCA
UµµAµµµµgcaµUµAlaµUGCµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGCCCAUAGCUCAGU--GGU--AGAGULCCUCCUUUGCAAGGAGGAU-------------------GC??AGGG]PBGAAUCCCUGUGGGUCCACCA
CµµKµµµµcggµCµArgµCCGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGCCCGUAGCUCA(U--GGAC-AGAGURCUUGGUUCCGKACCAAGAU-------------------GC?GCGGG]PBOAAUCCCGUCGGGUCCGCCA
GµµKµµµµcgcµGµArgµGCGµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-GUCCGGAUARGGPAGU--GGACUAUCCUCUUGGCUUGCGKAGCCAGGG-------------------A-CCGG?G]PBOAAUCGCCGUCCGGACGCCA
GµµKµµµµcgcµGµArgµGCGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GUCCUGAUARGGPAGU--GGACUAUCCUCCUGGCUUGCGKAGCCAGGG-------------------A-C?GGAG]PBOAAUCUCCGUCAGGACGCCA
NµµKµµµµcgaµUµArgµNCGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGCGCUUAGCUCA(UCUGGAC-AGAGULCUUGGCUNCGKACCAAGUU-------------------GC?ACGGG]PBOAAUCCUGUAGCGCCCACCA
;µµ6µµµµaacµGµAsnµ;UUµMethanobacterium thermaggregansµprokaryotic cytosol µ-GCGCCGGUGGCUCA;CCUGGUU-AGAGCUCACGGCU;UU6ACCGUGAG-------------------GCCGCGGGPPBOAAUCCCGCCCGGCGCACCA
Gµµ6µµµµaacµGµAsnµGUUµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-GCCGCCAUAGCUCAGUU-GGU--AGAGCACGUGGUUGUU6CCCACGUU-------------------GU?CCAGG]PBGGACCCUGGUGGCGGCGAAC
Gµµ6µµµµaacµGµAsnµGUUµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCCGCCGUAGCUCA(UU-GGU--AGAGCACCUCGCUGUU6ACGAGGUU-------------------GU??CAGG]PBGAGUCCUGGCGGUGGCGCCA
GµµAµµµµgacµGµAspµGUCµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCCCGGGUGRUGPAGU--GGCCCAUCAUACGACCCUGUCACGGUCGUG-------------------A-CGCGGG]PBOAAUCCCGCCUCGGGCGCCA
GµµKµµµµtgcµGµCysµGCAµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCCAAGGUGGCAGA(UUCGGCCCAACGCAUCCGCCUGCAKAGCGGAAC-------------------C_?GCCGG]PBOAAUCCGGCCCUUGGCUCCA
CµµKµµµµcagµCµGlnµCUGµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-AGUCCCGU.RGGPAGU--GGCCAAUCCUGAAGCCUUCUGKGGGCUUCG-------------------A-CGGAAGPPBGAAUCUUCCCGGGACUACCA
MµµKµµµµcagµCµGlnµMUGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-AGUCCCAUGRGGPAGU--GGCCAAUCCUGUUGCCUUMUGKGGGCAACG-------------------A-CCCAGGPPBGAAUCCUGGUGGGACUACCA
MµµAµµµµgagµCµGluµMUCµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCUCUGUUGRUGPAGUCCGGCCAAUCAUAUCACCCUMUCACGGUGAUG-------------------A-C?AGGG]PBGAAUCCCUGACGGAGCACCA
NµµKµµµµgaaµUµGluµNUCµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCUCGGUUGRUGPAGUCCGGCCAAUCAUCUUGGCCUNUCKAGCCGAGG-------------------A-C?AGGG]PBOAAUCCCUGACCGAGCACCA
CµµAµµµµgggµCµGlyµCCCµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCGCCGAUGLUCCAGU--GGU--AGGACACGAGCUUCCCAAGCUCGGA-------------------G-C?CGGG]PBOAUUCCCGGUCGGCGCACCA
GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-GCGCUGGUALUGPAGU--GGU--AUCACGUGACCUUGCCAUGGUCACA-------------------A-??UGGG]PBOAAUCCCAGCCAGCGCACCA
GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCGUCGGUALUGPAGU--GGU--AUCACGUGACCUUGCCAUGGUCACA-------------------A-C?UGGG]PBOAAUCCCAGCCGACGCACCA
GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCGCUGGUALUGPAGU--GGU--AUCACGUGACCUUGCCAUGGUCACA-------------------A-C?UGGG]PBOAAUCCCAGCCAGCGCACCA
GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµMethanobacterium thermaggregansµprokaryotic cytosol µ-GCGGCGUUAGUCCA;CU-GGU-UAAGACACUGGCCUGCCACGCCAGCG-------------------U-CCCGGGPPBOAAUCCCGGACGCCGCACCA
NµµAµµµµggaµUµGlyµNCCµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCACCGGUGLUCUAAU--GGU--AAGACAUUGGCCUNCCAAGCCAAUU-------------------A-U?UGGG]PBGAUUCCCAGCCGGUGCACCA
GµµKµµµµcacµGµHisµGUGµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µGUCCGGGCU.RGGPAGU--GGACUAUCCUUCAGCCUUGUGKAGGCUGAG-------------------A-CGCGGG]PBGAUUCUCGCGCCUGGACCCA
GµµKµµµµcacµGµHisµGUGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µGUCCGGGUUGRGGPAGU--GGACUAUCCUUCAGCCUUGUGKAGGCUGAG-------------------A-CGCGGGPPBAAUUCUCGCACCUGGACCCA
Gµµ6µµµµatcµGµIleµGAUµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGCCAAUAGCUCAGUCAGGUU--GAGCRCPCGGCUGAU6AC?GGGAG-------------------GCC?GCGG]PBOAAUCCGCGUUGGCCCACCA
Nµµ6µµµµataµUµIleµNAUµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGCCCCUAGCUCA(UCUGGUC-AGAGCRCUCGGCUNAU6ACCGGGUG-------------------GU?AUGGG]PBGAACCCCAUGGGGCCCACCA
CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-AGCGGGAUGGGAPA(CUAGGAG-AUUCCGCCGGGCUCAUAACCCGGAG-------------------AUCGGUAG]PBOAAUCUACCUCCCGCUACCA
CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµHalococcus morrhuaeµprokaryotic cytosol µ-AGCGGGAUGGGAPAGCCAGGAG-AUUCCLGCGGGCUCAUAACCCGCAG-------------------AUCAGUAG]PBOAAUCUACUUCCCGCUACCA
CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-AGCGGGAUGGGAPA(CCAGGAG-AUUCCGCCGGGCUCAUAACCCGGAG-------------------AUCGGUAG]PBOAAUCUACCUCCCGCUACCA
CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµSulfolobus acidocaldariusµprokaryotic cytosol µ-AGCGGCGU.LGGAACUG-GGAGUAUCCC|CA#GGBUCAUAACCCUGAG-------------------GU?CCUGGJUBO"AUCCAGGCGCCGCUACCA
CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµThermoplasma acidophilumµprokaryotic cytosol µ-AGCGGGGUGGGGPAGUCAGGA--AAUCCLAUGGGBUCAUAACCCGUAG-------------------AUCGAUGGPPBH"AUCCAUCCCCCGCUACCA
&µµKµµµµctaµUµLeuµ&AGµThermoplasma acidophilumµprokaryotic cytosol µ-GCGGAGG44GUC(A(ACUGGCCAAAGGCRAUGGAUU&AGKGPCCAUUCCCG-----AAG-----GGGUUC7AGGGPPBA"AUCCCUCCCUCCGCACCA
5µµKµµµµctaµUµLeuµ5AGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCGCGGGUAGCCAA(U--GGCCAAAGGCRCAGCGCU5AGKACGCUGU-GGU----GUAG-----ACCUU?GCAGG]PBGAACCCUGUCCCGCGCACCA
CµµKµµµµttgµCµLeuµCAAµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCGAGGGUAGCUAA(UCAGGAA-AAAGCRGCGGACUCAAKAPCCGCU-CCC----GUAG-----GGGUC?GUGGG]PBOAAUCCCUCCCCUCGCACCA
CµµKµµµµctgµCµLeuµCAGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCAGGGAUAGCCAA(UCUGGCCAACGGCRCAGCGUUCAGKGCGCUGU-CUC----AUAG-----GAGUC?GCAGG]PBOAAUCCUGCUCCCUGCACCA
GµµKµµµµctcµGµLeuµGAGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCGUGGGUAGCCAA(CCAGGCCAACGGCRCAGCGUUGAGKG?GCUGU-CCU----GUAG-----AGGUC?GCCGG]PBOAAUCCGGUCCCACGCACCA
UµµKµµµµttaµUµLeuµUAAµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCGGGGGUGGCUGA(CCAGGCCAAAAGCLGCGGACUUAAKAPCCGCU-CCC----GUAG-----GGGUUCGCGAG]PBGAAUCUCGUCCCCCGCACCA
Mµµ6µµµµaagµCµLysµMUUµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGCCGGUAGCUCA(UUAGGC--AGAGCRUCUGABUMUU6APCAGACG-------------------GU?GCGPG]PBOAAUCGCGUCCGGCCCACCA
Nµµ6µµµµaaaµUµLysµNUUµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGCUGGUAGCUCA(UUAGGC--AGAGCRUCUGGBUNUU6ACCAGACG-------------------GU?GGGGG]PBOAGUCCCUCCCAGCCCGCCA
Bµµ6µµµµatgµCµMetµBAUµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCCCGGGUGGCUPA(CU-GGAC-APAGCGCCGCACUBAU6APGCGGAG-------------------AU?GUGGG]PBGGAGCCCACCCCGGGCACCA
Cµµ6µµµµatgµCµMetµCAUµThermoplasma acidophilumµprokaryotic cytosol µ-GCCGGGG4GGCUCA(CU-GGA--GGAGCRCCGGABUCAU6AUCCGGAG-------------------GUCUCGGGPPBGAUCCCCGAUCCCGGCACCA
GµµKµµµµttcµGµPheµGAAµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCCGCCUUAGCUCA(ACUGGG--AGAGCACUCGACUGAAKAPCGAGCU-------------------GU?CCCGG]PBOAAUCCGGGAGGCGGCACCA
GµµKµµµµcccµGµProµGGGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGACCGUGRGGPAGU--GGU--AUCCUCUGCCGAUGGGKUCGGUAGG-------------------A-C?UGAG]PBGACUCUCAGCGGUCCCACCA
MµµKµµµµccgµCµProµMGGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGCCGGUGRGGPA(CUUGGU--AUCCUUCGGCCUUMGGKPGGCCGUA-------------------A-??UCAG]PBGAAUCUGAGCCGGCCCACCA
UµµKµµµµccaµUµProµUGGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGACCGUGRGUPA(CCUGGU--AUACUUCGGGCCUUGGKUGCCCGUG-------------------A-??CCGG]PBOAAUCCGGGCGGUCCCACCA
CµµAµµµµtagµCµPyrµCUAµMethanosarcina barkeriµprokaryotic cytosol µ-GGAAACC4-GAUCA-U--G-U--AGAUCG_UGGACUCUAAAUCCG_CA---------------------GCCGGG]UAGAUUCCCGGGGUUUCCGCCA
Gµµ6µµµµagcµGµSerµGCUµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GUUGCGGUAGCCAA(CCUGGCCCAAGGCRCUGGGUUGCU6ACUCAGU-GGC----GUCAA----GCCC-??GGGG]PBGAAUCCCCGCCGCAACGCCA
GµµAµµµµtccµGµSerµGGAµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCCAGGAUGGCCGA(C--GGU--AAGGCRCACGCCUGGAAAGCGUGU-UCCC---UCU-----GGGAU-?GGGGG]PBOAAUCCCUCUCCUGGCGCCA
MµµKµµµµtcgµCµSerµMGAµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-GCCGAGGUAGCAPA(CUUGGCC-AAUGCRGUUGCUUMGAKAGCAACG-UUCC---ACAC----GGACU-?AGGAG]PBOAAUCUCCUCCUCGGCGCCA
MµµAµµµµtcgµCµSerµMGAµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCCGAGGUAGCCPA(CCCGGCC-AAGGCRGUAGAUUMGAAAPCUACU-GUCC---AUUC----GGACA-?GUGAG]PBOAAUCUCACCCUCGGCGCCA
Cµµ6µµµµacgµCµThrµCGUµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCCGGUGUAGCUCA(UU-GGC--AGAGCRAUUCCUUCGU6AGGAAUAG-------------------GC?GAGGG]PBOAAUCCCUCCACCGGCUCCA
Gµµ6µµµµaccµGµThrµGGUµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-GCCUGGGUAGCUPAGC--GGU--AAAGCRCGUCCUUGGU6AGGACGAG-------------------ACC??GGA]PBOAAUUCCGGCCUAGGCUCCA
Gµµ6µµµµaccµGµThrµGGUµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCCUGGGUAGCUPA(C--GGU--AAAGCRCGUCCUUGGU6AGGACGAG-------------------AC??CGGG]PBOAAUCCCGGCCUAGGCUCCA
BµµKµµµµtggµCµTrpµBCAµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGGCUGUGGCCAA(CCCGGC--AUGGCRACUGABUBCAKAJCAGUCG-------------------AU?GGGGG]PBOAAUCCCUCCGGCCCCACCA
GµµKµµµµtacµGµTyrµGUAµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-CCGCUCUUAGCUCA(CCUGGC--AGAGCAGCCGABUGUAKAPCGGCUU-------------------GU?CCCCG]PBOAAUCGGGGAGAGCGGACCA
CµµAµµµµgtgµCµValµCACµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-GGGUCGGUKGUCPAGUCCGGUU-AUGACGGCUCCUUCACACGGAGCAG-------------------GUCGG?GG]PBOACUCCGCCCCGACCCACCA
CµµAµµµµgtgµCµValµCACµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-GGGUUGGUKGUCPAGUCAGGCU-AUGACACCUCCUUCACAUGGAGGAG-------------------GUCGG?GG]PBOAAUCCGCCCCAACCCACCA
CµµAµµµµgtgµCµValµCACµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGUUGGUGGUCPA(CCAGGUU-AUGACGGCUCCUUCACACGGAGCAG-------------------GC?GGCGG]PBGAAUCCGCCCCAACCCACCA
GµµAµµµµgtcµGµValµGACµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-GGGUUGGUGGUCPAGUCAGGCU-AUGACACCUCCUUGACAUGGAGGAG-------------------GUCGG?GG]PBOAAUCCGCCCCAACCCACCA
GµµAµµµµgtcµarchéeµValµGACµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGUUGGUGGUCPAGUCUGGUU-AUGACACCUCCUUGACAUGGAGGAG-------------------GC?GGCAG]PBOAAUCUGCCCCAACCCACCA
Bµµ6µµµµµvirusµMetµBAUµAvian myeloblastosis virusµprokaryotic cytosol µ-GCCUCCUUALCGCAGDA-GGN--AGCGCRPCAGPCUBAU6APCUGAAG-------------------7D??UGAGTPCG"ACCUCAGAGGGGGCACCA
BµµKµµµµµvirusµTrpµBCAµAvian myeloblastosis virusµprokaryotic cytosol µ-GACCUCGUKLCGCAAC--#GD--AGCGCRPCUGABUBCAKAZCAGAAG-------------------7CUGCGUGPPCG"AUCACGUCGGGGUCACCA
NµµAµµµµµvirusµGlyµNCCµEnterobacteria phage T4µprokaryotic cytosol µ-GCGGAUAUCGUAUAAU--#GD--AUUACCUCAGACUNCCAAPCUGAUG-------------------A-UGUGAGTPCGAUUCUCAUUAUCCGCUCCA
.µµHµµµµµvirusµIleµ.AUµEnterobacteria phage T4µprokaryotic cytosol µ-GGCCCUGUAGCUCAAU--#GDDAGCAGCAGUCCCCU.AUHAGGGAAAG-------------------7UUACCAGTPCAAAUCUGGUCUGGGUCACCA
Nµµ*µµµµµvirusµLeuµNAAµEnterobacteria phage T4µprokaryotic cytosol µ-GCGAGAA4GGUCAAADU-LGDA-AAGGCACAGCACUNAA*APGCUGC-GGAA---UGAU----UUCCU-UGUGGGTPCGAGUCCCACUUCUCGCACCA
NµµKµµµµµvirusµProµNGGµEnterobacteria phage T4µprokaryotic cytosol µ-CUCCGUG4AGCUCAGUUUGGD--AGAGCGCCUGAJUNGGKAPCAGGAG-------------------7UCCAAGGTPCAAAUCCUUGUAUGGAGACCA
Nµµ/µµµµµvirusµGlnµNUGµEnterobacteria phage T4µprokaryotic cytosol µ-UGGGAAU4AGCCAAGDD-GGD--AAGGCAUAGCACUNUG/CPGCUAGA-------------------UGCAAAGGTPCGAGUCCUUUAUUCCCAGCCA
NµµAµµµµµvirusµArgµNCUµEnterobacteria phage T4µprokaryotic cytosol µ-GUCCCGCUGGUGUAAU--#GAD-AGCAUACGAUCCUNCUAAGPUUGCG-------------------G-UCCUGGTPCGAUCCCAGGGCGGGAUACCA
Nµµ*µµµµµvirusµSerµNGAµEnterobacteria phage T4µprokaryotic cytosol µ-GGAGGCG4GGCAGAGU--#GDDUAAUGCACCGGUBUNGA*AACCGGC-AGUCGC-UCCG--GCGACU--CAUAGGTPCAAAUCCUAUCGCCUCCGCCA
NµµHµµµµµvirusµThrµNGUµEnterobacteria phage T4µprokaryotic cytosol µ-GCUGAUUUAGCUCAGDA-GGD--AGAGCACCUCACUNGUHAPGAGGAU-------------------7UCGGCGGTPCGAUUCCGUCAAUCAGCACCA
GµµAµµµµµvirusµAspµGUCµEnterobacteria phage T5µprokaryotic cytosol µ-GCGACCGGGGCUGGCUU-GGUA-AUGGUACUCCCCUGUCACGGGAGAG-------------------AAUGUGGGTPCAAAUCCCAPCGGUCGCGCCA
Uµµ=µµµµµvirusµLeuµUAGµEnterobacteria phage T5µprokaryotic cytosol µ-GGGGCUAUGCUGGAACD-#GDA-GACAAUACGGCCUUAG=UPCCGUA-GCUU---AA------AUGCG-UGGGAGTPCGAGUCUCCCUAGCCCCACCA
GµµHµµµµµvirusµAsnµGUUµEnterobacteria phage T5µprokaryotic cytosol µ-GGUUCCUUAGCUCUAAU-GGDU-AGAGCCGCAUCUUGUUHAGPUGAGG-------------------7UUGCUGGTPCGAAUCCAGCAGGAACCGCCA
UµµKµµµµµvirusµProµUGGµEnterobacteria phage T5µprokaryotic cytosol µ-CUCCGAUUAGCUCAAUU-GGCD-AGAGUACACCGUUUGGKGCGGUGGG-------------------7UUGAAGGTPCGAGUCCUUCAUUGGAGACCA
UµµAµµµµµvirusµGlnµUUGµEnterobacteria phage T5µprokaryotic cytosol µ-UGGGGAUUAGCUUAGCUUGGCCUAAAGCUUCGGCCUUUGAAGPCGAGA-------------------U-CAUUGGTPCAAAUCCAAUAUCCCCUGCCA
IµµKµµµµµvirusµProµIGGµMoloney murine leukemia virusµprokaryotic cytosol µ-GGCJCLUUKGUCPAGG--GGD--AUGAUUCUCGCJUIGGKPGCGAGAG-------------------7D??CGGGPPCA"AUCCCGGACGAGCCCCCA
NµµKµµµµµvirusµProµNGGµMoloney murine leukemia virusµprokaryotic cytosol µ-GGCJCLUUKGUCPAGG--GGD--AUGAUUCUCGCPUNGGKPGCGAGAG-------------------7D??CGGGPPCA"AUCCCGGACGAGCCCCCA
Compilation des tRNAs des bactéries
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux Tableaux:Compilation des tRNAs des bactéries.
- Légende: utiliser ":" comme séparateur dans le tableur et copier le texte en modification et non directement parce qu'il y a &emsp.
- Une erreur pour UGC de Streptomyces griseus (Ala), la position 34 est un C et non un U, et la position 37 ne correspond pas à G. Voir la liste des tRNAs.
- Voir la liste des modifications pour eucaryotes et procaryotes.
:::t:Phe:Leu:::c:Ser::::a:Tyr:Stp::g:Cys:SeC:Trp ::34::37:::34::37:::34::37:::34::37: t:t: : : : ::Inosine::`+::: : : : :: : : : :: : : : ::9::9::: : : : :: : : : 74:c:#:G:KWY::: :::::9Q:G:K+::::G:K+: 40::22:1:23::: :::::5:9:14::::2:2: 28:a:~.N:U:K:::&:U:`+H:A:: :::::1N:U:+: 26::7:1:8:::3:2:4:1:: :::::5:1:6: :g:B°?<::K ;::::Cleu:`+:Aleu:: :::::B::K:A ::6::6::::6:5:1:: :::::5::4:1 ::::Leu:::::Pro:::::His:Gln::::Arg: c:t:Inosine::K:G::Inosine: :K: :: : : : ::Inosine::K/:A ::7::6:1::1::1::: : : : ::4::3:1 24:c: ::::: :::::Q:G:K:G:: ::: 6:: ::::: :::::1:5:5:1:: ::: 34:a::U:K:::&N::K:::NJ:Utaa:E6 /:A::::: 12:::1:1:::2::2:::6:1:3:4::::: :g::C.:K::: ::::::Ctag:6tag:A:::C:K: :::4:4::: ::::::4:1:3:::2:2: :::Ile:Met:ini::::Thr:::::Asn:Lys::::Ser:Arg a:t:Inosine::t6A:::Inosine: :t6A: :: : : : :: : : : ::5::5:::3::3::: : : : :: : : : 60:c: ::::: :::::Q:G:t6A::::G:6E+: 6:: ::::: :::::4:2:6::::5:5: 44:a:PAP::t6A::: :::::N)3::[6H:::3 1::t6A: 16::1::1::: :::::6::6:::2::2: :g: ::::: ::::::C:6H::::C:t6A: :: ::::: ::::::10:10::::1:1: :Met:B:C:6E::: ::::: ::::: ::: ::5:1:6::: ::::: ::::: ::: :ini::C:+6::: ::::: ::::: ::: :::18:18::: ::::: ::::: ::: ::::Val:::::Ala:::::Asp:Glu::::Gly: g:t:Inosine:: :A::Inosine: :O: :: : : : :: : : : ::7:::7::6::6::: : : : :: : : : 26:c: ::::: :::::manQ:G:K:A:::G::A 12:: ::::: :::::4:3:1:6:::5::5 32:a:&N:::A:: :::::3 2:U::A::,N:::A 16::2:::2:: :::::4:1::5::2:::2 :g::C.::A:: ::::::C::A:::C::A :::4::4:: ::::::4::4:::1::1 456::::::::::::::::::::
Compilation des tRNAs des eucaryotes
[modifier | modifier le wikicode]- Lien au Tableaux:Compilation des tRNAs des eucaryotes.:
- Légende: utiliser ":" comme séparateur dans le tableur et copier le texte en modification et non directement parce qu'il y a &emsp.
- Une erreur pour CAG de Candida cylindracea (Leu), au lieu de CGA (Ser). Voir la liste des tRNAs. Voir la liste des modifications pour eucaryotes et procaryotes
- Deux suppresseurs JUA taa et CUA tag pour Tetrahymena thermophila. Un suppresseur UUA taa pour Lupinus luteus.
:::t:Phe:Leu:::c:Ser::::a:Tyr:Stp::g:Cys:SeC:Trp ::34::37:::34::37:::34::37:::34::37: t:t: : : : ::Inosine::`+::: : : : :: : : : :: : : : ::9::9::: : : : :: : : : 74:c:#:G:KWY::: :::::9Q:G:K+::::G:K+: 40::22:1:23::: :::::5:9:14::::2:2: 28:a:~.N:U:K:::&:U:`+H:A:: :::::1N:U:+: 26::7:1:8:::3:2:4:1:: :::::5:1:6: :g:B°?<::K ;::::Cleu:`+:Aleu:: :::::B::K:A ::6::6::::6:5:1:: :::::5::4:1 ::::Leu:::::Pro:::::His:Gln::::Arg: c:t:Inosine::K:G::Inosine: :K: :: : : : ::Inosine::K/:A ::7::6:1::1::1::: : : : ::4::3:1 24:c: ::::: :::::Q:G:K:G:: ::: 6:: ::::: :::::1:5:5:1:: ::: 34:a::U:K:::&N::K:::NJ:Utaa:6E/:A::::: 12:::1:1:::2::2:::6:1:3:4::::: :g::C.:K::: ::::::Ctag:6tag:A:::C:K: :::4:4::: ::::::4:1:3:::2:2: :::Ile:Met:ini::::Thr:::::Asn:Lys::::Ser:Arg a:t:Inosine::t6A:::Inosine: :t6A: :: : : : :: : : : ::5::5:::3::3::: : : : :: : : : 60:c: ::::: :::::Q:G:t6A::::G:6E+: 6:: ::::: :::::4:2:6::::5:5: 44:a:PAP::t6A::: :::::3N)::6[H:::3 1::t6A: 16::1::1::: :::::6::6:::2::2: :g: ::::: ::::::C:6H::::C:t6A: :: ::::: ::::::10:10::::1:1: :Met:B:C:6E::: ::::: ::::: ::: ::5:1:6::: ::::: ::::: ::: :ini::C:6+::: ::::: ::::: ::: :::18:18::: ::::: ::::: ::: ::::Val:::::Ala:::::Asp:Glu::::Gly: g:t:Inosine:: :A::Inosine: :O: :: : : : :: : : : ::7:::7::6::6::: : : : :: : : : 26:c: ::::: :::::manQ:G:K:A:::G::A 12:: ::::: :::::4:3:1:6:::5::5 32:a:&N:::A:: :::::3 2:U::A::,N:::A 16::2:::2:: :::::4:1::5::2:::2 :g::C.::A:: ::::::C::A:::C::A :::4::4:: ::::::4::4:::1::1 456::::::::::::::::::::
Compilation des tRNAs des archées
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux Tableaux:Compilation des tRNAs des archées.
- Légende: utiliser ":" comme séparateur dans le tableur et copier le texte en modification et non directement parce qu'il y a &emsp.
- Une Pyrolysine CUA tag pour Methanosarcina barkeri . Voir la liste des tRNAs. Voir la liste des modifications pour eucaryotes et procaryotes
:::t:Phe:Leu:::c:Ser::::a:Tyr:Stp::g:Cys:SeC:Trp ::34::37:::34::37:::34::37:::34::37: t:t: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : 6:c::G:K::::G::A:::G:K::::G:K: 6:::1:1::::1::1:::1:1::::1:1: 4:a::U:K::: ::::: ::::: ::: 4:::1:1::: ::::: ::::: ::: :g::C:K:::M::K:A:::C::A::B::K: :::1:1:::2::1:1:::1::1::1::1: ::::Leu:::::Pro:::::His:Gln::::Arg: c:t: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : 8:c::G:K::::G:K::::G:K::::G:K: 6:::1:1::::1:1::::2:2::::2:2: 8:a:5&::K::::U:K::: :::::N::K: 8::2::2::::1:1::: :::::1::1: :g::C:K:::M::K:::M:C:K::::C:K: :::1:1:::1::1:::1:1:2::::1:1: :::Ile:Met:ini::::Thr:::::Asn:Lys::::Ser:Arg a:t: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : 18:c::G:t6A::::G:t6A:::;:G:t6A::::G:t6A: 6:::1:1::::2:2:::1:2:3::::1:1: 10:a:N::t6A::: :::::N::t6A::: ::: 2::1::1::: :::::1::1::: ::: :g: ::::::C:t6A:::M::t6A::: ::: :: ::::::1:1:::1::1::: ::: :Met:B:C:t6A::: ::::: ::::: ::: ::1:1:2::: ::::: ::::: ::: :ini::C::A:: ::::: ::::: ::: :::5::5:: ::::: ::::: ::: ::::Val:::::Ala:::::Asp:Glu::::Gly: g:t: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : 10:c::G::A:::G::A:::G::A:::G::A 8:::2::2:::1::1:::1::1:::4::4 6:a: ::::::U::A::N::K:::N:::A 12:: ::::::1::1::1::1:::1:::1 :g::C::A:::C::A::M:::A:::C::A :::3::3:::2::2::1:::1:::1::1 122::::::::::::::::::::
Détails pour mcac lla eco hvo sce
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Détails pour mcac lla eco hvo sce
- Légende:
;;mcac;30 tRNAs;;;;;;;;30 gènes tRNA de mcac;;;;;;;;%GC ;;t;;c;;a;;g;;;;t;;c;;a;;g;24 t;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;m1G;;;G;m6A;G;m6A;;c;1;;;;1;;1; ;a;cmnm5Um;m6A;U;m6A;;;cmnm5Um;m6A;;a;1;;1;;;;1; ;g;Cm;m6A;;;;;Cm;m6A;;g;1;;;;;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; c;t;;;;;;;Inosine;m1G;;t;;;;;;;1; ;c;;;;;G;m1G;;;;c;;;;;1;;; ;a;U;m1G;U;m1G;cmnm5s2U;m6A;;;;a;1;;1;;1;;; ;g;;;;;;;;;;g;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; a;t;;;A;t6A;;;;;;t;;;1;;;;; ;c;G;t6A;;;G;t6A;G;t6A;;c;1;;;;1;;1; ;a;k2C;m6A;U;t6A;cmnm5s2U;t6A;cmnm5U;t6A;;a;;;1;;2;;1; ;g;C;A;;;C;t6A;;;;g;3;;;;1;;; ;i;C;A;;;;;;;;i;;;;;;;; g;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;;;;;G;A;;;;c;;;;;1;;; ;a;U;m6A;U;m6A;cmnm5s2U;A;U;m6A;;a;1;;1;;1;;1; ;g;;;;;;;;;;g;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;lla;26tRNAs;;;;;;;;63 gènes tRNA de lla;;;;;;;;%GC ;;t;;c;;a;;g;;;;t;;c;;a;;g;35 t;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;G;G;A;G;i6A;;;;c;2;;1;;1;;1; ;a;;;;;;;;;;a;2;;2;;;;; ;g;;;;;;;;;;g;1;;3;;;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; c;t;;;;;;;Inosine;A;;t;2;;;;;;2; ;c;;;;;;;;;;c;;;;;1;;; ;a;;;mo5U;m1G;U;A;;;;a;2;;2;;2;;; ;g;;;;;;;;;;g;1;;;;;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; a;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;t6A;G;A;G;t6A;G;t6A;;c;2;;1;;2;;1; ;a;k2C;m6A;mo5U;t6A;cmnm5s2U; 2 t6A;U;C;;a;;;2;;3;;1; ;g;ac4C;m6A;C;t6A;C;t6A;;;;g;4;;1;;1;;1; ;i;C;A;;;;;;;;i;;;;;;;; g;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;;;;;G;A;G;A;;c;;;;;2;;2; ;a;mo5U;m6A;mo5U;t6A;U;A;U mo5U;2 m6A;;a;3;;6;;2;;2; ;g;;;;;;;;;;g;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;E.coli;43 tRNAs;;strain unknown;;Liepzig*;;;;86 gènes tRNA de eco;;;;K12;;;;%GC t;;t;;c;;a;;g;;;;t;;c;;a;;g;51 ;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;ms2i6A;G;A;2 QtRNA;msi6A;G;ms2i6A;;c;2;;2;;3;;1; ;a;cmnm5Um;ms2i6A;cmo5U;ms2i6A;;;U;i6A;;a;1;;1;;;;1; ;g;Cm;ms2i6A;C;ms2i6A;;;C;ms2i6A;;g;1;;1;;;;1; c;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;t;;;;;;;Inosine;m2A;;t;;;;;;;4; ;c;G;m1G;;;QtRNA;m2A;;;;c;1;;1;;1;;; ;a;cmo5U;m1G;;;cmnm5s2U;m2A;;;;a;1;;1;;2;;; ;g;C;m1G;C;m1G;C;m2A;C;m1G;;g;4;;1;;2;;1; a;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;t6A;2 G;m6t6A;QtRNA;t6A;G;t6A;;c;3;;2;;4;;1; ;a;k2C;t6A;cmo5U;t6A;mnm5s2U;t6A;mnm5U;t6A;;a;;;1;;6;;1; ;g;ac4C;t6A;;;;;;;;g;8;;1;;;;1; g;i;2 C;A;;;;;;;;i;;;;;;;; ;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;2 G;A;G;A;gluQtRNA;m2A;G;A;;c;2;;2;;3;;4; ;a;cmo5U;m6A;cmo5U;A;mnm5s2U;2 m2A;mnm5U;A;;a;5;;3;;4;;1; ;g;;;;;;;C;A;;g;;;;;;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;hvo;41 tRNAs;;codons*;;;;;;53 gènes tRNA de lla;;;;;;;;%GC ;;t;;c;;a;;g;;;;t;;c;;a;;g;66 t;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;m1G;G;A;G;m1G;G;m1G;;c;2;;1;;2;;1; ;a;U;m1G;;;;;;;;a;1;;1;;;;; ;g;C;m1G;ac4C;A;;;Cm;m1G;;g;1;;1;;;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; c;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;m1G;G;m1G;G;m1G;G;m1G;;c;1;;1;;1;;1; ;a;mo5U;m1G;U;m1G;;;xU;m1G;;a;1;;1;;1;;1; ;g;C;m1G;ac4C;m1G;ac4C;m1G;C;m1G;;g;1;;2;;1;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; a;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;t6A;G;t6A;G;t6A;G;t6A;;c;1;;1;;1;;1; ;a;xU;t6A;;;xU;t6A;;;;a;;;1;;1;;1; ;g;Cm;t6A;C;t6A;ac4C;t6A;;;;g;3;;1;;1;;1; ;i;C;A;;;;;;;;i;;;;;;;; g;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;A;G;A;G;A;2 G;A;;c;2;;1;;2;;2; ;a;;;U;A;xU;m1G;xU;A;;a;1;;2;;1;;1; ;g;C;A;C;A;ac4C;A;C;A;;g;1;;1;;1;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;sce;35 tRNAs;;;;;;;;275 gènes tRNA de sce;;;;;;;;%GC ;;t;;c;;a;;g;;;;t;;c;;a;;g;38 t;t;;;2 Inosine; i6A;;;;;;t;;;11;;;;; ;c;2 Gm; yW;;;GPA;i6A;G;i6A;;c;10;;;;8;;4; ;a;ncm5Um;m1G;ncm5U;i6A;;;;;;a;7;;3;;;;; ;g;m5C;m1G;C;i6A;;;Cm;A;;g;10;;1;;;;6; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; c;t;;;;;;;Inosine;A;;t;;;2;;;;6; ;c;;;;;2 G; m1G;;;;c;1;;;;7;;; ;a;U;m1G;xU;m1G;;;;;;a;3;;10;;9;;; ;g;;;;;;;;;;g;;;;;1;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; a;t;Inosine;t6A;2 Inosine; t6A;;;;;;t;13;;11;;;;; ;c;;;;;G;t6A;G;t6A;;c;;;;;10;;4; ;a;PAP;t6A;;;mcm5s2U;t6A;mcm5U;t6A;;a;2;;4;;7;;11; ;g;C;t6A;;;C;t6A;;;;g;10;;1;;14;;1; ;i;C;t6A;;;;;;;;i;;;;;;;; g;t;Inosine;A;Inosine;m1Inosine;;;;;;t;14;;11;;;;; ;c;;;;;G;m1G;G;A;;c;;;;;16;;16; ;a;ncm5U;A;;;mcm5s2U;A;xU;A;;a;2;;5;;14;;3; ;g;C;A;;;;;;;;g;2;;;;2;;2;

