Recherche:Corrélation entre les gènes de tRNAs des 3 domaines/Annexe/Tableur
Apparence
Paris le 01.04.19
Introduction
[modifier | modifier le wikicode]Tableau des effectifs des gènes de tRNAs
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Tableau des effectifs des gènes de tRNAs
- Légende: Décompte des gènes tRNAs par codon suivant la base de données gtRNAdb [1].
- 5 : nombre de tRNAs d'un codon se terminant par t. Ce sont les plus faibles.
- 113 : nombre de tRNAs d'un codon se terminant par t: Changement de t en c chez les archées et de c en t chez les eucaryotes.
- 4 366: Effectif élevé de tRNAs d'un codon se terminant par g chez les procaryotes.
- 2622: Effectif faible de tRNAs supérieurs à t et à c .
- 160: Changement de codon g Chez les archées et les eucaryotes.
- Tableaux:
- Nombre de tRNAs, tableaux I II III, décompte de la base gtRNAdb.
- Pour 100 000 tRNAs, tableaux I100 II100 III100, décomptes rapportés à 100 000 tRNAs pour comparaison.
- tRNAs pour 1 génome, tableaux I1 II1 III1, indice de la multiplicité = nombre de tRNAs / nombre des génomes du domaine.
- Tableaux non formatés:
- - Nombres de tRNAs
I;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;;;;II;Nombres de tRNAs. 184 archées;;;;;;;;III;Nombres de tRNAs. 155 eucaryotes;;;;;; ttt;10;tct;5;tat;4;tgt;3;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;66;tct;1 863;tat;155;tgt;233 c;6105;c;4520;c;6420;c;4473;;c;215;c;190;c;190;c;299;;c;1 933;c;113;c;2 216;c;2 755 a;4749;a;5299;a;−;a;1315;;a;191;a;184;a;-;a;18;;a;890;a;1 041;a;-;a;279 g;3999;g;2622;g;−;g;4366;;g;163;g;152;g;-;g;184;;g;1 249;g;749;g;-;g;1 982 ctt;369;cct;10;cat;4;cgt;7478;;ctt;1;cct;0;cat;0;cgt;2;;ctt;1 576;cct;1 638;cat;47;cgt;1 587 c;3849;c;2742;c;4715;c;333;;c;214;c;171;c;185;c;187;;c;37;c;34;c;1 879;c;57 a;4940;a;5453;a;6388;a;887;;a;185;a;184;a;196;a;185;;a;872;a;1 641;a;2 289;a;2 337 g;5186;g;2183;g;2389;g;3355;;g;160;g;151;g;165;g;139;;g;1 296;g;735;g;1 849;g;522 att;5;act;103;aat;5;agt;1;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;2 428;act;2 201;aat;149;agt;53 c;9 203;c;4513;c;8 764;c;4422;;c;212;c;189;c;214;c;187;;c;99;c;154;c;3 524;c;1 895 a;55;a;5878;a;9 105;a;4804;;a;2;a;198;a;197;a;186;;a;851;a;1 494;a;2 640;a;1 762 g;18 026;g;2760;g;2427;g;3452;;g;589;g;169;g;166;g;165;;g;3 862;g;833;g;6 064;g;1 285 gtt;9;gct;2;gat;0;ggt;1;;gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;1;;gtt;2 101;gct;2 962;gat;100;ggt;132 c;4430;c;4166;c;9 023;c;9 273;;c;212;c;184;c;218;c;243;;c;109;c;405;c;2 799;c;3 279 a;8 859;a;10 185;a;9 679;a;5515;;a;186;a;256;a;230;a;189;;a;1 088;a;7 639;a;7 079;a;5 538 g;1313;g;1224;g;1388;g;2266;;g;170;g;159;g;160;g;155;;g;3 123;g;4 737;g;3 754;g;7 052
- - Pour 100 000 tRNAs
I 100;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;;235027;;II 100;Nombres de tRNAs. 184 archées;;;;;;8749;;III 100;Nombres de tRNAs. 155 eucaryotes;;;;;;115111 ttt;4;tct;2;tat;2;tgt;1;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;57;tct;1,618;tat;135;tgt;202 c;2,598;c;1,923;c;2,732;c;1,903;;c;2,457;c;2,172;c;2,172;c;3,418;;c;1,679;c;98;c;1,925;c;2,393 a;2,021;a;2,255;a;−;a;560;;a;2,183;a;2,103;a;-;a;206;;a;773;a;904;a;-;a;242 g;1,702;g;1,116;g;−;g;1,858;;g;1,863;g;1,737;g;-;g;2,103;;g;1,085;g;651;g;-;g;1,722 ctt;157;cct;4;cat;2;cgt;3,182;;ctt;11;cct;0;cat;0;cgt;23;;ctt;1,369;cct;1,423;cat;41;cgt;1,379 c;1,638;c;1,167;c;2,006;c;142;;c;2,446;c;1,955;c;2,115;c;2,137;;c;32;c;30;c;1,632;c;50 a;2,102;a;2,320;a;2,718;a;377;;a;2,115;a;2,103;a;2,240;a;2,115;;a;758;a;1,426;a;1,989;a;2,030 g;2,207;g;929;g;1,016;g;1,427;;g;1,829;g;1,726;g;1,886;g;1,589;;g;1,126;g;639;g;1,606;g;453 att;2;act;44;aat;2;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;2,109;act;1,912;aat;129;agt;46 c;3,916;c;1,920;c;3,729;c;1,881;;c;2,423;c;2,160;c;2,446;c;2,137;;c;86;c;134;c;3,061;c;1,646 a;23;a;2,501;a;3,874;a;2,044;;a;23;a;2,263;a;2,252;a;2,126;;a;739;a;1,298;a;2,293;a;1,531 g;7,670;g;1,174;g;1,033;g;1,469;;g;6,732;g;1,932;g;1,897;g;1,886;;g;3,355;g;724;g;5,268;g;1,116 gtt;4;gct;1;gat;0;ggt;0;;gtt;11;gct;0;gat;0;ggt;11;;gtt;1,825;gct;2,573;gat;87;ggt;115 c;1,885;c;1,773;c;3,839;c;3,946;;c;2,423;c;2,103;c;2,492;c;2,777;;c;95;c;352;c;2,432;c;2,849 a;3,769;a;4,334;a;4,118;a;2,347;;a;2,126;a;2,926;a;2,629;a;2,160;;a;945;a;6,636;a;6,150;a;4,811 g;559;g;521;g;591;g;964;;g;1,943;g;1,817;g;1,829;g;1,772;;g;2,713;g;4,115;g;3,261;g;6,126
- - tRNAs pour 1 génome
I 1;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;;;;II 1;Nombres de tRNAs. 184 archées;;;;;;;;III 1;Nombres de tRNAs. 155 eucaryotes;;;;;; ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0,4;tct;12,0;tat;1,0;tgt;1,5 c;1,51;c;1,12;c;1,59;c;1,11;;c;1,17;c;1,03;c;1,03;c;1,63;;c;12,5;c;0,7;c;14,3;c;17,8 a;1,18;a;1,31;a;-;a;0,33;;a;1,04;a;1,00;a;-;a;0,10;;a;5,7;a;6,7;a;-;a;1,8 g;0,99;g;0,65;g;-;g;1,08;;g;0,89;g;0,83;g;-;g;1,00;;g;8,1;g;4,8;g;-;g;12,8 ctt;0,09;cct;0;cat;0;cgt;1,85;;ctt;0,01;cct;0;cat;0;cgt;0,01;;ctt;10,2;cct;10,6;cat;0,3;cgt;10,2 c;0,95;c;0,68;c;1,17;c;0,08;;c;1,16;c;0,93;c;1,01;c;1,02;;c;0,2;c;0,2;c;12,1;c;0,4 a;1,23;a;1,35;a;1,58;a;0,22;;a;1,01;a;1,00;a;1,07;a;1,01;;a;5,6;a;10,6;a;14,8;a;15,1 g;1,29;g;0,54;g;0,59;g;0,83;;g;0,87;g;0,82;g;0,90;g;0,76;;g;8,4;g;4,7;g;11,9;g;3,4 att;0;act;0,03;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;15,7;act;14,2;aat;1,0;agt;0,3 c;2,28;c;1,12;c;2,17;c;1,10;;c;1,15;c;1,03;c;1,16;c;1,02;;c;0,6;c;1,0;c;22,7;c;12,2 a;0,01;a;1,46;a;2,26;a;1,19;;a;0,01;a;1,08;a;1,07;a;1,01;;a;5,5;a;9,6;a;17,0;a;11,4 g;4,47;g;0,68;g;0,60;g;0,86;;g;3,20;g;0,92;g;0,90;g;0,90;;g;24,9;g;5,4;g;39,1;g;8,3 gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;0,01;gct;0;gat;0;ggt;0,01;;gtt;13,6;gct;19,1;gat;0,6;ggt;0,9 c;1,10;c;1,03;c;2,24;c;2,30;;c;1,15;c;1,00;c;1,18;c;1,32;;c;0,7;c;2,6;c;18,1;c;21,2 a;2,20;a;2,53;a;2,40;a;1,37;;a;1,01;a;1,39;a;1,25;a;1,03;;a;7,0;a;49,3;a;45,7;a;35,7 g;0,33;g;0,30;g;0,34;g;0,56;;g;0,92;g;0,86;g;0,87;g;0,84;;g;20,1;g;30,6;g;24,2;g;45,5
Ordre des codons pour 100 000 tRNAs
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Ordre des codons pour 100 000 tRNAs
- Légende: B bactéries, A archées, E eucaryotes.
- gac: Chez les bactéries le codon se terminant par g n'est pas dernier.
- cag: changement chez les archées par rapport aux bactéries.
- tag: chez les eucaryotes le codon se terminant par g est dernier.
- cag: différence très faible mais toujours non nulle.
- Tableau non formaté
- - Ordre des codons
B;t;c;a;g t;cag;acg;−;cga c;gac;acg;acg;tga a;−;acg;acg;acg g;acg;acg;acg;cag ;;;; A;t;c;a;g t;cag;cag;−;cga c;cag;acg;acg;cag a;−;acg;cag;cag g;cag;acg;acg;cag ;;;; E;t;c;a;g t;cga;tag;−;cga c;tga;atg;acg;atg a;−;tag;gca;cag g;gta;agt;agc;gac
Moyennes et variances pour 100 000 tRNAs des codons
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Moyennes et variances pour 100 000 tRNAs des codons
- Légende:
- Moyenne et écart type sont faits sur les carrés, sauf certains carrés.
- % :rapport de l'écart type par la moyenne en pourcent.
- moyenne par génome: celle du codon pour calculer l'indice de multiplicité. Elle est égale à dom*moyenne/100 000, dom étant le nombre de tRNAs par domaine, 8 731 pour les archées, 119 380 pour les eucaryotes et 239 000 pour les bactéries. Voir les statistiques de la base de données.
- multiplicité moyenne: rapport "moyenne par génome" du codon divisé par le nombre d'espèces du domaine de la base de données, 184 pour les archées, 155 pour les eucaryotes et 4 032 pour les bactéries.
- Tableau non formaté
- - Moyennes sur 100 000 tRNAs
;moyenne;ecart;%;carrés;sauf;;genome;multiplicité Bactéries;;;;;;;; t;2;1.4;74;13;ct ac cg;;-;- c;2,457;945;38;15;cg;;5,775;1.43 a;2,524;1,193;47;14;ta at;;5,933;1.47 g;1,183;501;42;14;ta at;;2,781;0.69 Archées;;;;;;;; t;4;7;193;16;;;-;- c;2,365;350;15;16;;;207;1.12 a;2,257;246;11;13;ta at tg;;197;1.07 g;1,843;120;7;14;ta at;;161;0.88 Eucaryotes;;;;;;;; t;939;912;97;16;;;1,081;6.97 c;1,156;1,150;99;16;;;1,331;8.58 a;2,306;2,027;88;14;ta tg;;2,654;17.12 g;2,264;1,800;80;15;ta;;2,606;16.81 Eucaryotes;;;;;;;; t1;102;55;54;8;;;117;0.75 t2;1,776;421;24;8;;;2,045;13.19 c1;109;104;95;8;;;126;0.81 c2;2,202;564;26;8;;;2,535;16.35 ;;;;;;;; t1+c1;105;81;76;16;;;121;0.78 t2+c2;1,989;529;27;16;;;2,290;14.77
Comparaison des 3 domaines avec les nombres des tRNAs
[modifier | modifier le wikicode]Comparaison globale
[modifier | modifier le wikicode]Codons par ordre de valeurs dans les carrés
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Codons par ordre de valeurs dans les carrés
- Légende: classement des codons par leur ordre des effectifs de gène tRNA, dans les doublets des bactéries (B), des archées (A) et des eucaryotes (E). Les ordres sont ceux des tableaux I100, II100, III100.
- Tableau non formaté
Codons par ordre de valeurs dans les carrés;;;;;;;;;;;;;;; ;B;A;E;;B;A;E;;B;A;E;;B;A;E ttt;4;4;4;tct;4;4;1;tat;4;4;4;tgt;4;4;4 c;1;1;1;c;2;1;4;c;1;1;1;c;1;1;1 a;2;2;3;a;1;2;2;a;−;−;−;a;3;3;3 g;3;3;2;g;3;3;3;g;−;−;−;g;2;2;2 ;;;;;;;;;;;;;;; ctt;4;4;1;cct;4;4;2;cat;4;4;4;cgt;1;4;2 c;3;1;4;c;2;2;4;c;2;2;2;c;4;1;4 a;2;2;3;a;1;1;1;a;1;1;1;a;3;2;1 g;1;3;2;g;3;3;3;g;3;3;3;g;2;3;3 ;;;;;;;;;;;;;;; att;4;4;2;act;4;4;1;aat;4;4;4;agt;4;4;4 c;2;2;4;c;2;2;4;c;2;1;2;c;2;1;1 a;3;3;3;a;1;1;2;a;1;2;3;a;1;2;2 g;1;1;1;g;3;3;3;g;3;3;1;g;3;3;3 ;;;;;;;;;;;;;;; gtt;4;4;2;gct;4;4;3;gat;4;4;4;ggt;4;4;4 c;2;1;4;c;2;2;4;c;2;2;3;c;1;1;3 a;1;2;3;a;1;1;1;a;1;1;1;a;2;2;2 g;3;3;1;g;3;3;2;g;3;3;2;g;3;3;1
Groupes de codons
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Groupes de codons
- Légende: Les effectifs sont ceux des tableaux I100, II100, III100 sauf pour les faibles effectifs des tableaux I II III quand ils sont indiqués.
- − Groupe: Par exemple le groupe 111, est celui des codons classés en 1er dans chaque carré (doublet) des 3 domaines, bactéries (B), archées (A) et eucaryotes (E). L'attribution du groupe à chaque codon est faite dans le tableau des ordres.
- − Les paires de codons qui se ressemblent beaucoup sont soulignés en jaune.
- Tableau non formaté
;Groupes de codons ;;;;; Groupe;;B;A;E;;total 111;Tableaux I II III 100.;;;;; ;cca;2,320;2,103;1,426;;5,849 ;tac;2,732;2,172;1,925;;6,828 ;caa;2,718;2,240;1,989;;6,947 ;ttc;2,598;2,457;1,679;;6,734 ;gaa;4,118;2,629;6,150;;12,897 ;gca;4,334;2,926;6,636;;13,896 ;tgc;1,903;3,418;2,393;;7,714 ;atg;7,670;6,732;3,355;;17,757 ;;B;A;E;;total 444;Tableaux I II III.;;;;; ;cat;4;0;47;;51 ;agt;1;0;53;;54 ;ttt;10;0;66;;76 ;gat;0;0;100;;100 ;ggt;1;1;132;;134 ;aat;5;0;149;;154 ;tat;4;0;155;;159 ;tgt;3;0;233;;236 ;;B;A;E;;total 333;Tableaux I II III 100.;;;;; ;ata;23;23;739;;786 ;tga;560;206;242;;1,008 ;ccg;929;1,726;639;;3,293 ;tcg;1,116;1,737;651;;3,504 ;cag;1,016;1,886;1,606;;4,509 ;agg;1,469;1,886;1,116;;4,471 ;acg;1,174;1,932;724;;3,830 ;;B;A;E;;total 224;Tableaux I II III 100.;;;;; ;ccc;1,167;1,955;30;;3,151 ;gcc;1,773;2,103;352;;4,227 ;acc;1,920;2,160;134;;4,214 ;atc;3,916;2,423;86;;6,425 ;;B;A;E;;total 332;Tableaux I II III 100.;;;;; ;gcg;521;1,817;4,115;;6,453 ;gag;591;1,829;3,261;;5,681 ;ttg;1,702;1,863;1,085;;4,650 Suite;;;;;; suite;;B;A;E;;total 223;Tableaux I II III 100.;;;;; ;cta;2,102;2,115;758;;4,974 ;tta;2,021;2,183;773;;4,977 ;gac;3,839;2,492;2,432;;8,762 441;;;;;; ;tct;2;0;1,618;;1,621 ;act;44;0;1,912;;1,956 ;ctt;157;11;1,369;;1,538 442;;;;;; ;cct;4;0;1,423;;1,427 ;gtt;4;11;1,825;;1,840 ;att;2;0;2,109;;2,111 331;;;;;; ;ggg;964;1,772;6,126;;8,862 ;aag;1,033;1,897;5,268;;8,198 ;gtg;559;1,943;2,713;;5,215 222;;;;;; ;tgg;1,858;2,103;1,722;;5,683 ;cac;2,006;2,115;1,632;;5,753 ;gga;2,347;2,160;4,811;;9,318 ;;B;A;E;;total 214;Tableaux I II III 100.;;;;; ;tcc;1,923;2,172;98;;4,193 ;gtc;1,885;2,423;95;;4,403 123;;;;;; ;gta;3,769;2,126;945;;6,840 ;aaa;3,874;2,252;2,293;;8,419 122;;;;;; ;tca;2,255;2,103;904;;5,262 ;aga;2,044;2,126;1,531;;5,701 ;Tableaux I II III 100.;;;;; 314;ctc;1,638;2,446;32;;4,116 414;cgc;142;2,137;50;;2,329 233;cgg;1,427;1,589;453;;3,470 132;ctg;2,207;1,829;1,126;;5,161 112;aca;2,501;2,263;1,298;;6,062 142;cgt;3,182;23;1,379;;4,583 211;agc;1,881;2,137;1,646;;5,665 321;cga;377;2,115;2,030;;4,522 443;gct;1;0;2,573;;2,574 113;ggc;3,946;2,777;2,849;;9,572 212;aac;3,729;2,446;3,061;;9,236
Comparaison par tri sur E et différences successives en %
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Comparaison par tri sur E et différences successives en %
- Légende
Comparaison par tri sur E et différences successives en %;;;;;;; ;B;A;E;;E%;;Max B% ccc;1,167;1,955;30;;9;;40 ctc;1,638;2,446;32;;54;;1056 cgc;142;2,137;50;;74;;2664 atc;3,916;2,423;86;;10;;108 gtc;1,885;2,423;95;;4;;2 tcc;1,923;2,172;98;;36;;0 acc;1,920;2,160;134;;81;;243 tga;560;206;242;;45;;217 gcc;1,773;2,103;352;;29;;24 cgg;1,427;1,589;453;;41;;54 ccg;929;1,726;639;;2;;20 tcg;1,116;1,737;651;;11;;5 acg;1,174;1,932;724;;2;;4918 ata;23;23;739;;2;;8882 cta;2,102;2,115;758;;2;;4 tta;2,021;2,183;773;;17;;12 tca;2,255;2,103;904;;5;;67 gta;3,769;2,126;945;;15;;122 ttg;1,702;1,863;1,085;;3;;16 agg;1,469;1,886;1,116;;1;;50 ctg;2,207;1,829;1,126;;15;;13 aca;2,501;2,263;1,298;;5;;1493 ctt;157;11;1,369;;1;;1927 cgt;3,182;23;1,379;;3;;74680 cct;4;0;1,423;;0;;54430 cca;2,320;2,103;1,426;;7;;14 aga;2,044;2,126;1,531;;5;;101 cag;1,016;1,886;1,606;;1;;47680 tct;2;0;1,618;;1;;94200 cac;2,006;2,115;1,632;;1;;7 agc;1,881;2,137;1,646;;2;;38 ttc;2,598;2,457;1,679;;3;;40 tgg;1,858;2,103;1,722;;6;;48411 gtt;4;11;1,825;;5;;1044 act;44;0;1,912;;1;;6133 tac;2,732;2,172;1,925;;3;;1 caa;2,718;2,240;1,989;;2;;620 cga;377;2,115;2,030;;4;;17640 att;2;0;2,109;;9;;182000 aaa;3,874;2,252;2,293;;4;;104 tgc;1,903;3,418;2,393;;2;;102 gac;3,839;2,492;2,432;;6;;451050 gct;1;0;2,573;;5;;65550 gtg;559;1,943;2,713;;5;;606 ggc;3,946;2,777;2,849;;7;;6 aac;3,729;2,446;3,061;;7;;531 gag;591;1,829;3,261;;3;;1199 atg;7,670;6,732;3,355;;23;;1373 gcg;521;1,817;4,115;;17;;351 gga;2,347;2,160;4,811;;9;;127 aag;1,033;1,897;5,268;;16;;7 ggg;964;1,772;6,126;;0;;327 gaa;4,118;2,629;6,150;;8;;5 gca;4,334;2,926;6,636;;;;
Diagramme de comparaison globale
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Diagramme de comparaison globale
- Diagramme: tRNA-BAE
Diagramme B et E en fonction de A;;;; ;A;B;E;zero cgg;1,589;1,427;453;0 ccg;1,726;929;639;0 tcg;1,737;1,116;651;0 ggg;1,772;964;6,126;0 gcg;1,817;521;4,115;0 gag;1,829;591;3,261;0 ctg;1,829;2,207;1,126;0 ttg;1,863;1,702;1,085;0 cag;1,886;1,016;1,606;0 agg;1,886;1,469;1,116;0 aag;1,897;1,033;5,268;0 acg;1,932;1,174;724;0 gtg;1,943;559;2,713;0 ccc;1,955;1,167;30;0 gcc;2,103;1,773;352;0 tgg;2,103;1,858;1,722;0 tca;2,103;2,255;904;0 cca;2,103;2,320;1,426;0 cga;2,115;377;2,030;0 cac;2,115;2,006;1,632;0 cta;2,115;2,102;758;0 aga;2,126;2,044;1,531;0 gta;2,126;3,769;945;0 cgc;2,137;142;50;0 agc;2,137;1,881;1,646;0 acc;2,160;1,920;134;0 gga;2,160;2,347;4,811;0 tcc;2,172;1,923;98;0 tac;2,172;2,732;1,925;0 tta;2,183;2,021;773;0 caa;2,240;2,718;1,989;0 aaa;2,252;3,874;2,293;0 aca;2,263;2,501;1,298;0 gtc;2,423;1,885;95;0 atc;2,423;3,916;86;0 ctc;2,446;1,638;32;0 aac;2,446;3,729;3,061;0 ttc;2,457;2,598;1,679;0 gac;2,492;3,839;2,432;0 gaa;2,629;4,118;6,150;0 ggc;2,777;3,946;2,849;0 gca;2,926;4,334;6,636;0 tgc;3,418;1,903;2,393;0 atg;6,732;7,670;3,355;0
Similitude des comportements des codons dans les 3 domaines
[modifier | modifier le wikicode]Corrélations entre nombre de tRNAs des 3 domaines A B E
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Corrélations entre nombre de tRNAs des 3 domaines A B E
- Légende: Les tableaux des corrélations sont faits à partir des tableaux I1, II1 et III1 des nombres de tRNAs par génome.
- Coefficient R 80.9 77.7: coefficient de corrélation respectivement de toute la colonne, des codons colorés en cyan.
- Domaine A B E, Ba Eb Ea: domaine respectivement des archées bactéries eucaryotes, diagramme respectivement de la corrélation AB BE AE.
- permutation: permutation entre le nombre de tRNAs du codon xyt et xyc pour le domaine E, 7 permutations, et le domaine B, 1 permutation. En supposant que les tRNAs des codons xyt de E se comportement relativement de la même façon que les codons xyc de B.
- Retraits:retrait des codons gxa,g et cga aag qui sont surexprimés dans le domaine E.
- X10: multiplication des nombres des tRNAs des domaines A et B pour adapter à l'échelle de E.
;Sans permuter;;1 permutation;;codons xya,g;;Diagramme AB x10;;;;;Sans permuter;;7 permutations;;X10;retraits;Diagramme BE x10;;;;;Sans permuter;;8 permutations;;X10;retraits;Diagramme AE x10;; coeff. R;80.9;;86.6;;84.0;;;86.6;77.7;;;35.6;;52.4;;90.4;;;90.4;75.4;;;34.8;;59.8;;87.4;;;87.4;76.2 dom.;B;A;B;A;B;A;codons;A;Ba;;;B;E;B;E;B;E;codons;B;Eb;;;A;E;A;E;A;E;codons;A;Ea ttt;0.25;0;0.25;0;;;ttt;0;2.5;;ttt;0.25;43;0.25;43;2.48;43;gat;0;65;;ttt;0;43;0;43;0;43;ttt;0;43 ttc;151;117;151;117;;;att;0;1.2;;ttc;151;1,247;151;1,247;1514;1,247;agt;0.25;34;;ttc;117;1,247;117;1,247;1,168;1,247;att;0;64 tta;118;104;118;104;118;104;tct;0;1.2;;tta;118;574;118;574;1178;574;ggt;0.25;85;;tta;104;574;104;574;1,038;574;tct;0;73 ttg;99;89;99;89;99;89;cct;0;2.5;;ttg;99;806;99;806;992;806;gct;0.50;261;;ttg;89;806;89;806;886;806;cct;0;22 ctt;9.2;0.54;9.2;0.54;;;act;0;26;;ctt;9.2;1,017;9.2;24;91.5;24;tgt;0.74;150;;ctt;0.54;1,017;0.54;24;5;24;act;0;99 ctc;95;116;95;116;;;gct;0;0.5;;ctc;95;24;95;1,017;955;1,017;tat;0.99;100;;ctc;116;24;116;1,017;1,163;1,017;gct;0;261 cta;123;101;123;101;123;101;tat;0;1.0;;cta;123;563;123;563;1225;563;cat;0.99;30;;cta;101;563;101;563;1,005;563;tat;0;100 ctg;129;87;129;87;129;87;cat;0;1.0;;ctg;129;836;129;836;1286;836;att;1.24;64;;ctg;87;836;87;836;870;836;cat;0;30 att;0.12;0;0.12;0;;;aat;0;1.2;;att;0.12;1,566;0.12;64;1.24;64;tct;1.24;73;;att;0;1,566;0;64;0;64;aat;0;96 atc;228;115;228;115;;;gat;0;0;;atc;228;64;228;1,566;2282;1,566;aat;1.24;96;;atc;115;64;115;1,566;1,152;1,566;gat;0;65 ata;1.4;1.1;1.4;1.1;1.4;1.1;tgt;0;0.7;;ata;1.4;549;1.4;549;13.6;549;gtt;2.23;70;;ata;1.1;549;1.1;549;11;549;tgt;0;150 atg;447;320;447;320;447;320;agt;0;0.2;;atg;447;2,492;447;2,492;4471;2,492;ttt;2.48;43;;atg;320;2,492;320;2,492;3,201;2,492;agt;0;34 gtt;0.22;0.54;0.22;0.54;;;ctt;5.4;92;;gtt;0.22;1,355;0.22;70;2.23;70;cct;2.48;22;;gtt;0.54;1,355;0.54;70;5;70;ctt;5;24 gtc;110;115;110;115;;;gtt;5.4;2.2;;gtc;110;70;110;1,355;1099;1,355;ata;13.6;549;;gtc;115;70;115;1,355;1,152;1,355;gtt;5;70 gta;220;101;220;101;220;101;ggt;5.4;0.2;;gta;220;702;220;702;;;act;26;99;;gta;101;702;101;702;;;ggt;5;85 gtg;33;92;33;92;33;92;ata;10.9;13.6;;gtg;33;2,015;33;2,015;;;cgc;82.6;37;;gtg;92;2,015;92;2,015;;;ata;11;549 tct;0.12;0;0.12;0;;;cgt;11;83;;tct;0.12;1,202;0.12;73;1.24;73;ctt;91.5;24;;tct;0;1,202;0;73;0;73;cgt;11;37 tcc;112;103;112;103;;;tga;98;326;;tcc;112;73;112;1,202;1121;1,202;tga;326;180;;tcc;103;73;103;1,202;1,033;1,202;tga;98;180 tca;131;100;131;100;131;100;cgg;755;832;;tca;131;672;131;672;1314;672;ccg;541;474;;tca;100;672;100;672;1,000;672;cgg;755;337 tcg;65;83;65;83;65;83;ccg;821;541;;tcg;65;483;65;483;650;483;cag;593;1,193;;tcg;83;483;83;483;826;483;ccg;821;474 cct;0.25;0;0.25;0;;;tcg;826;650;;cct;0.25;1,057;0.25;22;2.48;22;tcg;650;483;;cct;0;1,057;0;22;0;22;tcg;826;483 ccc;68;93;68;93;;;ggg;842;562;;ccc;68;22;68;1,057;680;1,057;ccc;680;1,057;;ccc;93;22;93;1,057;929;1,057;ctg;870;836 cca;135;100;135;100;135;100;gcg;864;304;;cca;135;1,059;135;1,059;1352;1,059;acg;685;537;;cca;100;1,059;100;1,059;1,000;1,059;ttg;886;806 ccg;54;82;54;82;54;82;ctg;870;1,286;;ccg;54;474;54;474;541;474;cgg;832;337;;ccg;82;474;82;474;821;474;cag;897;1,193 act;3;0;3;0;;;gag;870;344;;act;3;1,420;3;99;26;99;agg;856;829;;act;0;1,420;0;99;0;99;agg;897;829 acc;112;103;112;103;;;ttg;886;992;;acc;112;99;112;1,420;1119;1,420;ctc;955;1,017;;acc;103;99;103;1,420;1,027;1,420;acg;918;537 aca;146;108;146;108;146;108;cag;897;593;;aca;146;964;146;964;1458;964;ttg;992;806;;aca;108;964;108;964;1,076;964;ccc;929;1,057 acg;68;92;68;92;68;92;agg;897;856;;acg;68;537;68;537;685;537;tgg;1083;1,279;;acg;92;537;92;537;918;537;tca;1,000;672 gct;0.05;0;0.05;0;;;aag;902;602;;gct;0.05;1,911;0.05;261;0.50;261;agc;1097;1,223;;gct;0;1,911;0;261;0;261;cca;1,000;1,059 gcc;103;100;103;100;;;acg;918;685;;gcc;103;261;103;1,911;;;gtc;1099;1,355;;gcc;100;261;100;1,911;;;tgg;1,000;1,279 gca;253;139;253;139;253;139;gtg;924;326;;gca;253;4,928;253;4,928;;;acc;1119;1,420;;gca;139;4,928;139;4,928;;;cta;1,005;563 gcg;30;86;30;86;30;86;ccc;929;680;;gcg;30;3,056;30;3,056;;;tcc;1121;1,202;;gcg;86;3,056;86;3,056;;;cac;1,005;1,212 tat;0.10;0;0.10;0;;;tca;1,000;1,314;;tat;0.10;100;0.10;100;0.99;100;cac;1169;1,212;;tat;0;100;0;100;0;100;cga;1,005;1,508 tac;159;103;159;103;;;cca;1,000;1,352;;tac;159;1,430;159;1,430;1592;1,430;tta;1178;574;;tac;103;1,430;103;1,430;1,033;1,430;aga;1,011;1,137 cat;0.10;0;0.10;0;;;gcc;1,000;1,033;;cat;0.10;30;0.10;30;0.99;30;aga;1191;1,137;;cat;0;30;0;30;0;30;cgc;1,016;1,024 cac;117;101;117;101;;;tgg;1,000;1,083;;cac;117;1,212;117;1,212;1169;1,212;cta;1225;563;;cac;101;1,212;101;1,212;1,005;1,212;agc;1,016;1,223 caa;158;107;158;107;158;107;cta;1,005;1,225;;caa;158;1,477;158;1,477;1584;1,477;ctg;1286;836;;caa;107;1,477;107;1,477;1,065;1,477;acc;1,027;1,420 cag;59;90;59;90;59;90;cac;1,005;1,169;;cag;59;1,193;59;1,193;593;1,193;tca;1314;672;;cag;90;1,193;90;1,193;897;1,193;tcc;1,033;1,202 aat;0.12;0;0.12;0;;;cga;1,005;220;;aat;0.12;96;0.12;96;1.24;96;cca;1352;1,059;;aat;0;96;0;96;0;96;tac;1,033;1,430 aac;217;116;217;116;;;gta;1,011;2,197;;aac;217;2,274;217;2,274;2174;2,274;aca;1458;964;;aac;116;2,274;116;2,274;1,163;2,274;tta;1,038;574 aaa;226;107;226;107;226;107;aga;1,011;1,191;;aaa;226;1,703;226;1,703;2258;1,703;ttc;1514;1,247;;aaa;107;1,703;107;1,703;1,071;1,703;caa;1,065;1,477 aag;60;90;60;90;60;90;cgc;1,016;1,855;;aag;60;3,912;60;3,912;;;caa;1584;1,477;;aag;90;3,912;90;3,912;;;aaa;1,071;1,703 gat;0;0;0;0;;;agc;1,016;1,097;;gat;0;65;0;65;0;65;tac;1592;1,430;;gat;0;65;0;65;0;65;aca;1,076;964 gac;224;118;224;118;;;acc;1,027;1,119;;gac;224;1,806;224;1,806;2238;1,806;cgt;1855;1,024;;gac;118;1,806;118;1,806;1,185;1,806;atc;1,152;1,566 gaa;240;125;240;125;240;125;gga;1,027;1,368;;gaa;240;4,567;240;4,567;;;aac;2174;2,274;;gaa;125;4,567;125;4,567;;;gtc;1,152;1,355 gag;34;87;34;87;34;87;tcc;1,033;1,121;;gag;34;2,422;34;2,422;;;gac;2238;1,806;;gag;87;2,422;87;2,422;;;ctc;1,163;1,017 tgt;0.07;0;0.07;0;;;tac;1,033;1,592;;tgt;0.07;150;0.07;150;0.74;150;aaa;2258;1,703;;tgt;0;150;0;150;0;150;aac;1,163;2,274 tgc;111;163;111;163;;;tta;1,038;1,178;;tgc;111;1,777;111;1,777;;;atc;2282;1,566;;tgc;163;1,777;163;1,777;1,625;1,777;ttc;1,168;1,247 tga;33;10;33;10;33;10;caa;1,065;1,584;;tga;33;180;33;180;326;180;ggc;2300;2,115;;tga;10;180;10;180;98;180;gac;1,185;1,806 tgg;108;100;108;100;108;100;aaa;1,071;2,258;;tgg;108;1,279;108;1,279;1083;1,279;atg;4471;2,492;;tgg;100;1,279;100;1,279;1,000;1,279;ggc;1,321;2,115 cgt;185;1.1;8.3;1.1;;;aca;1,076;1,458;;cgt;185;1,024;185;1,024;1855;1,024;tgc;;;;cgt;1.1;1,024;1.1;37;11;37;tgc;1,625;1,777 cgc;8.3;102;185;102;;;atc;1,152;2,282;;cgc;8.3;37;8.3;37;82.6;37;gcc;;;;cgc;102;37;102;1,024;1,016;1,024;atg;3,201;2,492 cga;22;101;22;101;22;101;gtc;1,152;1,099;;cga;22;1,508;22;1,508;;;gta;;;;cga;101;1,508;101;1,508;1,005;1,508;gcc;; cgg;83;76;83;76;83;76;ctc;1,163;955;;cgg;83;337;83;337;832;337;gtg;;;;cgg;76;337;76;337;755;337;gta;; agt;0.02;0;0.02;0;;;aac;1,163;2,174;;agt;0.02;34;0.02;34;0.25;34;gca;;;;agt;0;34;0;34;0;34;gtg;; agc;110;102;110;102;;;ttc;1,168;1,514;;agc;110;1,223;110;1,223;1097;1,223;gcg;;;;agc;102;1,223;102;1,223;1,016;1,223;gca;; aga;119;101;119;101;119;101;gac;1,185;2,238;;aga;119;1,137;119;1,137;1191;1,137;aag;;;;aga;101;1,137;101;1,137;1,011;1,137;gcg;; agg;86;90;86;90;86;90;gaa;1,250;2,401;;agg;86;829;86;829;856;829;gaa;;;;agg;90;829;90;829;897;829;aag;; ggt;0.02;0.54;0.02;0.54;;;ggc;1,321;2,300;;ggt;0.02;85;0.02;85;0.25;85;gag;;;;ggt;0.54;85;0.54;85;5;85;gaa;; ggc;230;132;230;132;;;gca;1,391;2,526;;ggc;230;2,115;230;2,115;2300;2,115;cga;;;;ggc;132;2,115;132;2,115;1,321;2,115;gag;; gga;137;103;137;103;137;103;tgc;1,625;1,109;;gga;137;3,573;137;3,573;;;gga;;;;gga;103;3,573;103;3,573;;;gga;; ggg;56;84;56;84;56;84;atg;3,201;4,471;;ggg;56;4,550;56;4,550;;;ggg;;;;ggg;84;4,550;84;4,550;;;ggg;;
Rapport E/B des codons
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Rapport E/B des codons
- Légende: Valeur du codon se terminant par x de E / Valeur du codon se terminant par x de B
- 0.8: t de E / c de B
- Tableau rapport E/B pour 100 000: d'après les valeurs des tableaux III100 / I100
- Tableau rapport E/B par génome: d'après les valeurs des tableaux III1 / I1
- Tableau non formaté
rapport E/B;;Pour 100 000;;;;; ttt;;tct;0.83;tat;;tgt; c;0.63;c;;c;0.69;c;1.23 a;0.38;a;0.39;a;−;a;0.42 g;0.63;g;0.57;g;−;g;0.91 ctt;0.82;cct;1.20;cat;;cgt;0.42 c;;c;;c;0.80;c;0.34 a;0.35;a;0.60;a;0.72;a;5.27 g;0.50;g;0.67;g;1.55;g;0.31 att;0.53;act;0.98;aat;;agt; c;;c;;c;0.81;c;0.86 a;;a;0.51;a;0.58;a;0.73 g;0.43;g;0.60;g;5.00;g;0.75 gtt;0.95;gct;1.42;gat;;ggt; c;;c;;c;0.62;c;0.71 a;0.25;a;1.50;a;1.46;a;2.01 g;4.76;g;7.75;g;5.41;g;6.23
rapport E/B;;Par génome;;;;; ttt;−;tct;11;tat;−;tgt;− c;8;c;0.7;c;9;c;16 a;5;a;5;a;−;a;6 g;8;g;7;g;−;g;12 ctt;11;cct;16;cat;−;cgt;6 c;0.3;c;0.3;c;10;c;4 a;5;a;8;a;9;a;69 g;7;g;9;g;20;g;4 att;5;act;13;aat;−;agt;− c;0.3;c;0.9;c;10;c;11 a;402;a;7;a;8;a;10 g;6;g;8;g;65;g;10 gtt;12;gct;18;gat;−;ggt;− c;0.6;c;2.5;c;8;c;9 a;3.2;a;20;a;19;a;26 g;62;g;101;g;70;g;81
Totaux des carrés pour 100 000 tRNAs
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Totaux des carrés pour 100 000 tRNAs
- Légende: B bactéries, A archées, E eucaryotes. 6 219 , carrés les plus modifiés.
- Tableau non formaté
- - Totaux des carrés
B;t;c;a;g t;6 219;5 208;2 688;4 250 c;6 002;4 346;5 647;5 043 a;11 418;5 546;8 494;5 305 g;6 113;6 518;8 406;7 136 ;;;; A;t;c;a;g t;6 517;6 025;2 176;5 738 c;6 414;5 795;6 254;5 876 a;9 197;6 368;6 609;6 162 g;6 517;6 861;6 964;6 735 ;;;; E;t;c;a;g t;3 466;3 155;1 986;4 397 c;3 167;3 391;5 080;3 772 a;6 065;3 922;10 368;4 184 g;5 379;13 187;11 503;13 403
Variation en % entre la 1ère et la 2ème valeur
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Variation en % entre la 1ère et la 2ème valeur
- Légende:
- -17, variation en % des 2 1ères valeurs; 779 différence en valeur absolue de la base de données de référence. La variation est calculée entre le nombre de codons contenu dans la cellule affichant la variation en % (-17) et celui contenu dans la cellule affichant la différence en valeur absolue (779).
- : 4ème valeur sans changement entre B et A ou E
- : 3ème valeur sans changement entre B et A ou E
- : 4ème valeur après changement entre B et A ou E
- : 3ème valeur après changement entre B et A ou E
- Moyenne des valeurs absolues des variations:
B A E Moy 48.1 18.2 39.1 Ecart 47.4 21.0 24.5 % 98.5 115.2 62.7
- Tableau non formaté
I 100;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;;;;II 100;Nombres de tRNAs. 184 archées;;;;;;;;III 100;Nombres de tRNAs. 155 eucaryotes;;;;;; ttt;;tct;;tat;;tgt;;;ttt;;tct;;tat;;tgt;;;ttt;;tct;79;tat;;tgt; c;29;c;-17;c;;c;2;;c;13;c;3;c;;c;63;;c;55;c;;c;;c;39 a;1 356;a;779;a;-;a;;;a;24;a;6;a;-;a;;;a;;a;822;a;-;a; g;;g;;g;-;g;107;;g;;g;;g;-;g;115;;g;684;g;;g;-;g;773 ctt;;cct;;cat;;cgt;123;;ctt;;cct;;cat;;cgt;;;ctt;22;cct;0;cat;;cgt;-32 c;;c;-99;c;-35;c;;;c;16;c;-8;c;-6;c;1;;c;;c;;c;-22;c; a;-5;a;2 711;a;1 673;a;;;a;29;a;13;a;11;a;2;;a;;a;3;a;410;a;750 g;246;g;;g;;g;4 123;;g;;g;;g;;g;;;g;280;g;;g;;g; att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;-37;act;47;aat;;agt; c;-49;c;-30;c;-4;c;-9;;c;-64;c;-5;c;9;c;1;;c;;c;;c;-42;c;7 a;;a;1 365;a;341;a;382;;a;;a;9;a;17;a;1;;a;;a;707;a;;a;133 g;8 823;g;;g;;g;;;g;377;g;;g;;g;;;g;1 434;g;;g;2 540;g; gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;-33;gct;;gat;;ggt; c;-100;c;-144;c;-7;c;68;;c;14;c;-39;c;-6;c;29;;c;;c;;c;;c; a;4 429;a;6 019;a;656;a;3 758;;a;26;a;72;a;12;a;54;;a;;a;61;a;89;a;-21 g;;g;;g;;g;;;g;;g;;g;;g;;;g;1 022;g;2 902;g;3 325;g;1 514
Nombres de tRNAs des 4032 bactéries
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Nombres de tRNAs des 4032 bactéries
- Base de données gtRNAdb [2]
- Légende:
- I. Nombres de tRNAs. 4032 bactéries.
- 5 : nombre de tRNAs d'un codon se terminant par t. Ils sont tous inférieurs à 11 sauf ctt cgt act.
- 4 366: Effectif élevé de tRNAs d'un codon se terminant par g.
- 2622: Effectif faible de tRNAs.
- II. Nombre de bactéries à tRNAs solitaires de 4 codons (1ère et 2ème base). Total d’une requête: Comptage fait pour les carrés. C’est un nombre de bactéries ayant x tRNAs pour un seul et même codon.
- − Total d'une requête: Le 1er codon se terminant par t n'a pas de solitaire sauf ici pour Arg, et il est remplacé par le total de la requête.
- − a,g,c : Nombre de bactéries à tRNAs solitaires pour les carrés de 4 codons.
- − 106*: solitaires du codon cgt. Le carré de Arg étant complet le total de la requête est représenté par *, il est de 3946.
- − Note: le total des bactéries de la base des tRNA est de 4032. Cependant le total des bactéries comptées est compris entre 3832-3947. Est-ce que ce qui manque est du aux bactéries sans tRNAs pour les codons demandés? Cela ne serait pas vrai pour les aas à 2 codons.
- − Méthode pour compter, cas de la Thr, anti-codons xGT:
- Sélectionner les anticodons pour la requête (ne pas oublier de mettre Bacteria dans Domain). Copier le résultat, ctrl+A, ctrl+C.
- Dans calc ctrl+V, supprimer le dessin en le sélectionnant, supprimer toutes les colonnes sauf la colonne des anticodons, sélectionner le 1er anticodon puis ctrl+schift+fin ce qui sélectionne tous les anticodons et les cellules à blanc. Il n'y a pas de cellule intercalée entre 2 anticodon de la même bactérie.
- Copier,ctrl+v, dans writer (texte non formaté), ctrl+h (expression régulière, $ en ; tout remplacer), ctrl+h (décocher expression régulière, ;; en *;;* tout remplacer). Le tout rechercher de * ;;* donne le total de la requête (nombre total de bactéries moins 1). Mettre un * à la fin mais pas début (le logiciel déplace tout le texte pour insérer *, ce qui prend beaucoup de temps). Repérer le motif du début avant * ;;*. Si le motif concerne une recherche ultérieure, en tenir compte.
- ctrl+h (*GGT* tout rechercher donne 2916, *AGT* donne 41, *GGT;GGT donne 754 . . . ).
- III. Nombre de bactéries à tRNAs solitaires des codons a,g et t,c. Total d’une requête: tRNAs solitaires pour les codons se terminant par a ou g et t ou c; total des bactéries d'une requête de la base de données suivant les codons demandés.
- stc,sag, tt (1ère et 2ème base d'un carré) , tc . . . : Total des bactéries respectivement de la requête pour 2 codons se terminant par t ou c, pour 2 codons se terminant par a ou g.
- a,g,t,c : Nombre de bactéries à tRNAs solitaires pour les codons se terminant par a,g,t,c.
- − Trp-Sec: Les solitaires de Sec sont en fait des Trp (tga).
- IV. Pourcentage des bactéries à tRNAs solitaires: calculés à partir des tableaux II et III précédents.
- tt (1ère et 2ème base d'un carré) , tc . . .
- %4: Pourcentage des bactéries à 1 seul codon à tRNA dans les carrés de 4; toujours a est à plus de 90% sauf pour cgt (Arg) et atg (Met).
- %2: Pourcentage des bactéries à 1 seul codon à tRNA pour les codons se terminant par a ou g. Toujours a est à plus de 90% sauf pour R (cg), L (tt), M et W.
- 1a1g: Nombre de bactéries ayant 1 tRNA pour le codon se terminant par a et 1 tRNA pour le codon se terminant par g. Permet de mettre en exergue les autres bactéries ayant des tRNAs multiples.
- V. Multiplicité des tRNAs en %: Voir les calculs.
- I. Nombres de tRNAs. 4032 bactéries.
;I. Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;; ttt;10;tct;5;tat;4;tgt;3 c;6105;c;4520;c;6420;c;4473 a;4749;a;5299;a;−;a;1315 g;3999;g;2622;g;−;g;4366 ctt;369;cct;10;cat;4;cgt;7478 c;3849;c;2742;c;4715;c;333 a;4940;a;5453;a;6388;a;887 g;5186;g;2183;g;2389;g;3355 att;5;act;103;aat;5;agt;1 c;9,203;c;4513;c;8,764;c;4422 a;55;a;5878;a;9,105;a;4804 g;18,026;g;2760;g;2427;g;3452 gtt;9;gct;2;gat;0;ggt;1 c;4430;c;4166;c;9,023;c;9,273 a;8,859;a;10,185;a;9,679;a;5515 g;1313;g;1224;g;1388;g;2266 II. Nombre de bactéries à tRNAs solitaires des carrés à 4 codons.;;;;;Total d’une requête. ttt;3948;tct;3945;tat;3934;tgt;3947 c;15;c;2;c;3930;c;12 a;0;a;85;a;−;a;0 g;2;g;0;g;−;g;17 ctt;3942;cct;3941;cat;3948;cgt;106* c;7;c;3;c;5;c;1 a;98;a;1173;a;6;a;7 g;0;g;1;g;2;g;7 att;3949;act;3946;aat;3949;agt;3944 c;2;c;2;c;2;c;1 a;0;a;152;a;5;a;0 g;81;g;3;g;1;g;0 gtt;3943;gct;3934;gat;3949;ggt;3948 c;8;c;32;c;5;c;9 a;724;a;877;a;8;a;66 g;1;g;7;g;1;g;0 III. Nombre de bactéries à tRNAs solitaires des codons ag.;;;;;;; tt;−;tc;−;ta;−;tg;− sag;3933;sag;3943;sag;−;sag;3934 a;96;a;1493;a;−;a;15 g;190;g;22;g;−;g;2629 ct;−;cc;−;ca;−;cg;− sag;3935;sag;3939;sag;3943;sag;3833 a;692;a;1813;a;2130;a;539 g;30;g;5;g;18;g;3026 at;−;ac;−;aa;−;ag;− sag;3947;sag;3944;sag;3941;sag;3928 a;0;a;1288;a;1899;a;780 g;3947;g;13;g;9;g;10 gt;−;gc;−;ga;−;gg;− sag;3935;sag;3902;sag;3928;sag;3939 a;2724;a;2721;a;2808;a;1699 g;2;g;11;g;5;g;11 IV. Pourcentage des bactéries à tRNAs solitaires;;;; ;tt;tc;ta;tg %4;−;2,2;−;− 1a1g;2804;2114;−;1238 %2;7;38;−;67 ;ct;cc;ca;cg %4;2,7;29,9;−;3,1 1a1g;962;1911;996;222 %2;18;46;54;93 ;at;ac;aa;ag %4;2,1;4,0;−;− 1a1g;0;2166;1155;2579 %2;100;33;48;20 ;gt;gc;ga;gg %4;18,6;23,3;−;1,9 1a1g;1 051;562;602;1973 %2;69;70;72;43 ;ct;cg;ac;− %4;2,7;3,1;4,0;− 1t1c;8;10;41;− %2;99;99;98;− V. Multipilcité;;;;;;; ;FL;;SS;;YX;;CW t;1,00;;1,00;;1,00;;1,00 c;1,55;;1,18;;1,63;;1,14 a;1,27;;1,35;;-;;1,01 g;1,04;;1,07;;-;;1,11 ;LL;;P;;HQ;;RR t;1,11;;1,00;;1,33;;2,06 c;1,10;;1,03;;1,20;;1,05 a;1,26;;1,39;;1,63;;1,10 g;1,86;;1,03;;1,32;;1,02 ;IM;;T;;NK;;SR t;1,00;;1,11;;1,00;;1,00 c;2,38;;1,21;;2,23;;1,12 a;1,15;;1,50;;2,32;;1,23 g;4,57;;1,04;;1,19;;1,10 ;V;;A;;DE;;G t;1,00;;1,00;;0,00;;1,00 c;1,38;;1,37;;2,29;;2,39 a;2,25;;2,62;;2,47;;1,40 g;1,09;;1,04;;1,24;;1,01
Calcul de la multiplicité des tRNAs
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Calcul de la multiplicité des tRNAs
- Légende: tRNAs, nombre affiché par la requête. lignes, nombre de lignes affiché dans calc après nettoyage. bactéries=lignes - tRNAs. multiplicité= tRNAs / bactéries.
- Tableau non formaté
;;t;;;;;c;;;;;a;;;;;g;;; ;;tRNAs;lignes;bactéries;multiplicité; ;tRNAs;lignes;bactéries;multiplicité; ;tRNAs;lignes;bacteries;multiplicité; ;tRNAs;lignes;bactéries;multiplicité ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; t;t;10;19;10;1,00;;5;9;5;1,00;;4;7;4;1,00;;3;5;3;1,00 ;c;6105;10044;3940;1,55;;4520;8343;3824;1,18;;6420;10353;3934;1,63;;4473;8401;3929;1,14 ;a;4749;8491;3743;1,27;;5299;9221;3923;1,35;;;;1;0,00;;1315;2619;1305;1,01 ;g;3999;7835;3837;1,04;;2622;5071;2450;1,07;;;;1;0,00;;4366;8285;3920;1,11 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; c;t;369;700;332;1,11;;10;19;10;1,00;;4;6;3;1,33;;7478;11102;3625;2,06 ;c;3849;7359;3511;1,10;;2742;5399;2658;1,03;;4715;8649;3935;1,20;;333;650;318;1,05 ;a;4940;8857;3918;1,26;;5453;9386;3934;1,39;;6388;10312;3925;1,63;;887;1693;807;1,10 ;g;5186;7969;2784;1,86;;2183;4307;2125;1,03;;2389;4201;1813;1,32;;3355;6648;3294;1,02 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; a;t;5;9;5;1,00;;103;195;93;1,11;;5;9;5;1,00;;1;1;1;1,00 ;c;9203;13067;3865;2,38;;4513;8246;3734;1,21;;8764;12695;3932;2,23;;4422;8354;3933;1,12 ;a;55;102;48;1,15;;5878;9808;3931;1,50;;9105;13036;3932;2,32;;4804;8721;3918;1,23 ;g;18026;21972;3947;4,57;;2760;5415;2656;1,04;;2427;4468;2042;1,19;;3452;6600;3149;1,10 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; g;t;9;17;9;1,00;;2;3;2;1,00;;0;0;1;0,00;;1;1;1;1,00 ;c;4430;7637;3208;1,38;;4166;7201;3036;1,37;;9023;12957;3935;2,29;;9273;13153;3881;2,39 ;a;8859;12791;3933;2,25;;10185;14075;3891;2,62;;9679;13603;3925;2,47;;5515;9442;3928;1,40 ;g;1313;2521;1209;1,09;;1224;2404;1181;1,04;;1388;2509;1122;1,24;;2266;4505;2240;1,01
Comparaison des codons par les 2 1ères bases
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Comparaison des codons par les 2 1ères bases
- Légende:
- − Voir les tableaux d'origine: Multiplicité , Nombres de tRNAs (Tableau I, totaux; Tableau II, solitaires sur 4; Tableau III, solitaires sur a-g), Moyenne des codons , ordre des codons .
- − 106*: solitaires du codon cgt. Le carré de Arg étant complet le total de la requête est représenté par *, il est de 3946.
- Tableau non formaté
Multiplicité;;NK;DE;HQ;;V;A;;SS;T;;P;G;;RR;;LL;;FL;SR;;IM;CW;;YX ;t;1,00;0,00;1,33;;1,00;1,00;;1,00;1,11;;1,00;1,00;;2,06;;1,11;;1,00;1,00;;1,00;1,00;;1,00 ;c;2,23;2,29;1,20;;1,38;1,37;;1,18;1,21;;1,03;2,39;;1,05;;1,10;;1,55;1,12;;2,38;1,14;;1,63 ;a;2,32;2,47;1,63;;2,25;2,62;;1,35;1,50;;1,39;1,40;;1,10;;1,26;;1,27;1,23;;1,15;1,01;;− ;g;1,19;1,24;1,32;;1,09;1,04;;1,07;1,04;;1,03;1,01;;1,02;;1,86;;1,04;1,10;;4,57;1,11;;− total tRNAs;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;t;5;0;4;;9;2;;5;103;;10;1;;7478;;369;;10;1;;5;3;;4 ;c;8 764;9 023;4715;;4430;4166;;4520;4513;;2742;9 273;;333;;3849;;6105;4422;;9 203;4473;;6420 ;a;9 105;9 679;6388;;8 859;10 185;;5299;5878;;5453;5515;;887;;4940;;4749;4804;;55;1315;;− ;g;2427;1388;2389;;1313;1224;;2622;2760;;2183;2266;;3355;;5186;;3999;3452;;18 026;4366;;− codon solitaire;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;t;0;0;0;;0;0;;0;0;;0;0;;106;;0;;0;0;;0;0;;0 ;c;;;;;8;32;;2;2;;3;9;;1;;7;;;;;;;; ;a;;;;;724;877;;85;152;;1173;66;;7;;98;;;;;;;; ;g;;;;;1;7;;0;3;;1;0;;7;;0;;;;;;;; solitaire a,g;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;total;3950;3950;3950;;3935;3902;;3943;3944;;3939;3939;;3833;;3935;;3950;3950;;3950;3950;;3950 ;a;1899;2808;2130;;2724;2721;;1493;1288;;1813;1699;;539;;692;;96;780;;0;15;;− ;g;9;5;18;;2;11;;22;13;;5;11;;3026;;30;;190;10;;3950;2629;;− moyenne codon;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;t/c %;4;7;-17;;11;-41;;4;-56;;5;-17;;-25;;-7;;-2;-35;;-7;-15;;8 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;a/g %;20;27;-39;;-48;-32;;-15;-8;;-54;49;;-73;;-144;;39;84;;-59;-191;;103 ordre corrélation;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;t;3a;8a;15a;;9a;14a;;17a;11a;;12a;28a;;32a;;27a;;2a;6a;;6a;21a;;1a ;c;13g;1g;4g;;12g;7g;;22g;8g;;20g;3g;;5g;;17g;;2g;9g;;9g;23g;;11g ;a;5a;20a;10a;;22a;13a;;7a;19a;;16a;23a;;31a;;25a;;4a;26a;;26a;26g;;29a ;g;19g;18g;6g;;21g;15g;;16g;24g;;14g;29g;;25g;;10g;;30a;30g;;30g;28g;;31g
Au niveau de l'ADN le code génétique est structuré par doublets.
[modifier | modifier le wikicode]Lignes et colonnes
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Lignes et colonnes
- Légende: Les moyennes des codons de la 3ème base appartenant aux doublets ayant la même 1ère base (ligne) ou ayant la même 2ème base (colonne) sont faites sur 4 codons ou sur 3 codons seulement quand on rencontre les codons stop (taa tag) ou le codon ata lorsqu'il est trop faible ( sauf celui des eucaryotes) ou le codon atg à effectif très élevé (sauf celui des eucaryotes). La moyenne des lignes et colonnes est faite sur 12 codons ou seulement 10 quand on rencontre les codons taa tag ata atguand les codons xyt ont des effectifs élevés ils sont permutés avec les codons xyc ( 1 permutation chez les bactéries et 8 chez les eucaryotes). Aussi les lignes et colonnes xyt contiennent les valeurs faibles après permutation et les lignes et colonnes xyc contiennent les valeurs fortes après permutation.
- n pour nombre de codons, mcod pour moyenne des codons, Lig. pour ligne, Col. pour colonne et car. pour carré ou doublet.
- txt, c, a, g pour respectivement les 4 codons "ttt tct tat tgt" de la 3ème base t, les 4 codons "ttc tcc tac tgc" de la 3ème base c . . . etc. (Ligne Lig.)
- xtt, c, a, g pour respectivement les 4 codons "ttt ctt att gtt" de la 3ème base t, les 4 codons "ttc ctc atc gtc" de la 3ème base c . . . etc. (colonne Col.)
- Tableaux non formatés: voir tableur
- − Lignes et colonnes
III LC;Nombres de tRNAs. 155 eucaryotes;;;;;;I LC;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries;;;;;;II LC;Nombres de tRNAs. 184 archées;;;; Lignes;;;Colon;;115 111;;Lignes;;;Colon;;235 027;;Lignes;;;Colon;;8749 txt;4;123;xtt;4;68;;txt;4;2;xtt;4;42;;txt;4;0;xtt;4;6 c;4;1,904;c;4;1,746;;c;4;2,289;c;4;2,509;;c;4;2,555;c;4;2,437 a;3;640;a;4;804;;a;3;1,612;a;3;2,631;;a;3;1,497;a;3;2,141 g;3;1,153;g;4;2,070;;g;3;1,558;g;3;1,489;;g;3;1,901;g;3;1,878 cxt;4;38;xct;4;153;;cxt;4;76;xct;4;13;;cxt;4;9;xct;4;0 c;4;1,451;c;4;1,882;;c;4;1,998;c;4;1,696;;c;4;2,163;c;4;2,097 a;4;1,550;a;4;2,566;;a;4;1,879;a;4;2,852;;a;4;2,143;a;4;2,349 g;4;956;g;4;1,532;;g;4;1,395;g;4;935;;g;4;1,757;g;4;1,803 axt;4;99;xat;4;98;;axt;4;12;xat;4;1;;axt;4;0;xat;4;0 c;4;2,182;c;4;2,263;;c;4;2,862;c;4;3,076;;c;4;2,292;c;4;2,306 a;4;1,465;a;3;3,477;;a;3;2,806;a;3;3,570;;a;3;2,214;a;3;2,374 g;4;2,616;g;3;3,378;;g;3;1,225;g;3;880;;g;3;1,905;g;3;1,871 gxt;4;162;xgt;4;103;;gxt;4;1;xgt;4;36;;gxt;4;6;xgt;4;9 c;4;2,420;c;4;2,067;;c;4;2,861;c;4;2,728;;c;4;2,449;c;4;2,617 a;4;4,636;a;4;2,154;;a;4;3,642;a;4;1,332;;a;4;2,460;a;4;1,652 g;4;4,054;g;4;2,354;;g;4;659;g;4;1,430;;g;4;1,840;g;4;1,837 Moyenne;;;;;;;Moyenne;;;;;;;Moyenne;;;;; Lignes;;ttt;ctt;att;gtt;;Lignes;;ttt;ctt;att;gtt;;Lignes;;ttt;ctt;att;gtt ;n;10;12;12;12;;;n;10;12;10;12;;;n;10;12;10;12 ;mcod;1,299;1,319;2,088;3,703;;;mcod;1,867;1,757;2,354;2,387;;;mcod;2,041;2,021;2,152;2,250 Moyenne;;;;;;;Moyenne;;;;;;;Moyenne;;;;; Colon;;ttt;tct;tat;tgt;;Colon;;ttt;tct;tat;tgt;;Colon;;ttt;tct;tat;tgt ;n;12;12;10;12;;;n;10;12;10;12;;;n;10;12;10;12 ;mcod;1,540;1,993;2,962;2,192;;;mcod;2,239;1,828;2,566;1,830;;;mcod;2,181;2,083;2,196;2,035 Totaux;;;;;;;Totaux;;;;;;;Totaux;;;;; carrés;1000;t;c;a;g;;carrés;1000;t;c;a;g;;carrés;1000;t;c;a;g ;t;3.59;3.27;2.06;4.56;;;t;6.32;5.30;2.73;4.32;;;t;6.50;6.01;2.17;5.73 ;c;3.28;3.52;5.27;3.91;;;c;6.10;4.42;5.74;5.13;;;c;6.40;5.78;6.24;5.86 ;a;6.29;4.07;10.75;4.34;;;a;11.61;5.64;8.64;5.39;;;a;9.18;6.36;6.60;6.15 ;g;5.58;13.68;11.93;13.90;;;g;6.22;6.63;8.55;7.26;;;g;6.50;6.85;6.95;6.72
Demi-doublets
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Demi-doublets
- Légende:
- − Domaine E: ensemble des 155 eucaryotes avec un total de tRNAs de 115 111.
- − Domaine B: ensemble des 4032 bactéries avec un total de tRNAs de 235 027.
- − Domaine A: ensemble des 184 archées avec un total de tRNAs de 8 749.
- − g/a: rapport des codons xyg sur xya de la ligne x et de la colonne y du tableau des effectifs, 1.4 rapport inverse de g/a.
- − t/c: rapport des codons xyc sur xyt de la ligne x et de la colonne y du tableau des effectifs, 16 rapport inverse de t/c.
- − t c a g: colonnes du tableau des effectifs
III 100;Nombres de tRNAs. 155 eucaryotes;;;;;III 100;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries;;;;;III 100;Nombres de tRNAs. 184 archées;;; ;t;c;a;g;;;t;c;a;g;;;t;c;a;g t/c;29;16;14;12;;t/c;−;−;−;−;;t/c;−;−;−;− g/a;1.40;1.39;−;7.10;;g/a;1.19;2.02;−;3.32;;g/a;1.17;1.21;−;10.22 t/c;43;48;40;28;;t/c;10.43;−;−;22;;t/c;−;−;−;− g/a;1.49;2.23;1.2;4.48;;g/a;1.05;2.50;2.67;3.78;;g/a;1.16;1.22;1.19;1.33 t/c;25;14;24;36;;t/c;−;43.82;−;−;;t/c;−;−;−;− g/a;4.54;1.79;2.30;1.37;;g/a;328;2.13;3.75;1.39;;g/a;295;1.17;1.19;1.13 t/c;19;7.31;28;25;;t/c;−;−;−;−;;t/c;−;−;−;− g/a;2.87;1.61;1.89;1.27;;g/a;6.75;8.32;6.97;2.43;;g/a;1.09;1.61;1.44;1.22
Codons identiques par classement des 3 bases
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Codons identiques par classement des 3 bases
- Légende
- Tableau non formaté:
1ère base;;;;;;;;;2ème base;;;;;;; II 100;Nombres de tRNAs. 184 archées;;;;;;8749;;II 100;Nombres de tRNAs. 184 archées;;;;;;8749 ttt;0;ttc;2,457;tta;2,183;ttg;1,863;;ttt;0;ttc;2,457;tta;2,183;ttg;1,863 ctt;11;ctc;2,446;cta;2,115;ctg;1,829;;tct;0;tcc;2,172;tca;2,103;tcg;1,737 att;0;atc;2,423;ata;23;atg;6,732;;tat;0;tac;2,172;taa;-;tag;- gtt;11;gtc;2,423;gta;2,126;gtg;1,943;;tgt;0;tgc;3,418;tga;206;tgg;2,103 tct;0;tcc;2,172;tca;2,103;tcg;1,737;;ctt;11;ctc;2,446;cta;2,115;ctg;1,829 cct;0;ccc;1,955;cca;2,103;ccg;1,726;;cct;0;ccc;1,955;cca;2,103;ccg;1,726 act;0;acc;2,160;aca;2,263;acg;1,932;;cat;0;cac;2,115;caa;2,240;cag;1,886 gct;0;gcc;2,103;gca;2,926;gcg;1,817;;cgt;23;cgc;2,137;cga;2,115;cgg;1,589 tat;0;tac;2,172;taa;-;tag;-;;att;0;atc;2,423;ata;23;atg;6,732 cat;0;cac;2,115;caa;2,240;cag;1,886;;act;0;acc;2,160;aca;2,263;acg;1,932 aat;0;aac;2,446;aaa;2,252;aag;1,897;;aat;0;aac;2,446;aaa;2,252;aag;1,897 gat;0;gac;2,492;gaa;2,629;gag;1,829;;agt;0;agc;2,137;aga;2,126;agg;1,886 tgt;0;tgc;3,418;tga;206;tgg;2,103;;gtt;11;gtc;2,423;gta;2,126;gtg;1,943 cgt;23;cgc;2,137;cga;2,115;cgg;1,589;;gct;0;gcc;2,103;gca;2,926;gcg;1,817 agt;0;agc;2,137;aga;2,126;agg;1,886;;gat;0;gac;2,492;gaa;2,629;gag;1,829 ggt;11;ggc;2,777;gga;2,160;ggg;1,772;;ggt;11;ggc;2,777;gga;2,160;ggg;1,772 ;;;;;;;;;;;;;;;; I 100;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;;235027;;I 100;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;;235027 ttt;4;ttc;2,598;tta;2,021;ttg;1,702;;ttt;4;ttc;2,598;tta;2,021;ttg;1,702 ctt;157;ctc;1,638;cta;2,102;ctg;2,207;;tct;2;tcc;1,923;tca;2,255;tcg;1,116 att;2;atc;3,916;ata;23;atg;7,670;;tat;2;tac;2,732;taa;−;tag;− gtt;4;gtc;1,885;gta;3,769;gtg;559;;tgt;1;tgc;1,903;tga;560;tgg;1,858 tct;2;tcc;1,923;tca;2,255;tcg;1,116;;ctt;157;ctc;1,638;cta;2,102;ctg;2,207 cct;4;ccc;1,167;cca;2,320;ccg;929;;cct;4;ccc;1,167;cca;2,320;ccg;929 act;44;acc;1,920;aca;2,501;acg;1,174;;cat;2;cac;2,006;caa;2,718;cag;1,016 gct;1;gcc;1,773;gca;4,334;gcg;521;;cgc;142;cgt;3,182;cga;377;cgg;1,427 tat;2;tac;2,732;taa;−;tag;−;;att;2;atc;3,916;ata;23;atg;7,670 cat;2;cac;2,006;caa;2,718;cag;1,016;;act;44;acc;1,920;aca;2,501;acg;1,174 aat;2;aac;3,729;aaa;3,874;aag;1,033;;aat;2;aac;3,729;aaa;3,874;aag;1,033 gat;0;gac;3,839;gaa;4,118;gag;591;;agt;0;agc;1,881;aga;2,044;agg;1,469 tgt;1;tgc;1,903;tga;560;tgg;1,858;;gtt;4;gtc;1,885;gta;3,769;gtg;559 cgt;3,182;cgc;142;cga;377;cgg;1,427;;gct;1;gcc;1,773;gca;4,334;gcg;521 agt;0;agc;1,881;aga;2,044;agg;1,469;;gat;0;gac;3,839;gaa;4,118;gag;591 ggt;0;ggc;3,946;gga;2,347;ggg;964;;ggt;0;ggc;3,946;gga;2,347;ggg;964 ;;;;;;;;;;;;;;;; III 100;Nombres de tRNAs. 155 eucaryotes;;;;;;115111;;III 100;Nombres de tRNAs. 155 eucaryotes;;;;;;115111 ttt;57;ttc;1,679;tta;773;ttg;1,085;;ttt;57;ttc;1,679;tta;773;ttg;1,085 ctt;1,369;ctc;32;cta;758;ctg;1,126;;tct;1,618;tcc;98;tca;904;tcg;1,423 att;2,109;atc;86;ata;739;atg;3,355;;tat;135;tac;1,925;taa;-;tag;41 gtt;1,825;gtc;95;gta;945;gtg;2,713;;tgt;202;tgc;2,393;tga;242;tgg;1,379 tct;1,618;tcc;98;tca;904;tcg;1,423;;ctt;1,369;ctc;32;cta;758;ctg;1,126 cct;1,423;ccc;30;cca;1,426;ccg;639;;cct;1,423;ccc;30;cca;1,426;ccg;639 act;1,912;acc;134;aca;1,298;acg;724;;cat;41;cac;1,632;caa;1,989;cag;1,606 gct;2,573;gcc;352;gca;6,636;gcg;4,115;;cgt;1,379;cgc;50;cga;2,030;cgg;453 tat;135;tac;1,925;taa;-;tag;41;;att;2,109;atc;86;ata;739;atg;3,355 cat;41;cac;1,632;caa;1,989;cag;1,606;;act;1,912;acc;134;aca;1,298;acg;724 aat;129;aac;3,061;aaa;2,293;aag;5,268;;aat;129;aac;3,061;aaa;2,293;aag;5,268 gat;87;gac;2,432;gaa;6,150;gag;3,261;;agt;46;agc;1,646;aga;1,531;agg;1,116 tgt;202;tgc;2,393;tga;242;tgg;1,379;;gtt;1,825;gtc;95;gta;945;gtg;2,713 cgt;1,379;cgc;50;cga;2,030;cgg;453;;gct;2,573;gcc;352;gca;6,636;gcg;4,115 agt;46;agc;1,646;aga;1,531;agg;1,116;;gat;87;gac;2,432;gaa;6,150;gag;3,261 ggt;115;ggc;2,849;gga;4,811;ggg;6,126;;ggt;115;ggc;2,849;gga;4,811;ggg;6,126
Tableau des effectifs élevés des gènes de tRNAs eucaryotes
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Tableau des effectifs élevés des gènes de tRNAs eucaryotes
- Légende
- Tableaux non formatés
Callorhinchus milii;;;;;;;;;Danio rerio (Zebrafish) ;;;;;;; ;;;13,727;;12,380;;1,347;;;;;12,258;;;; ttt;3;tct;26;tat;1;tgt;1;;ttt;10;tct;336;tat;5;tgt;9 c;35;c;1;c;36;c;15;;c;197;c;2;c;236;c;136 a;13;a;54;a;;a;3;;a;73;a;209;a;;a;14 g;31;g;48;g;;g;30;;g;241;g;80;g;;g;44 ctt;20;cct;12;cat;1;cgt;9;;ctt;270;cct;315;cat;10;cgt;203 c;2;c;6;c;37;c;;;c;4;c;2;c;387;c;24 a;20;a;51;a;7;a;25;;a;244;a;205;a;105;a;107 g;25;g;41;g;18;g;2;;g;300;g;180;g;266;g;59 att;31;act;24;aat;2;agt;;;att;258;act;359;aat;24;agt;14 c;;c;12;c;48;c;33;;c;10;c;10;c;1,045;c;424 a;23;a;206;a;43;a;14;;a;75;a;290;a;525;a;252 g;94;g;137;g;36;g;12;;g;522;g;66;g;953;g;104 gtt;22;gct;75;gat;6;ggt;2;;gtt;232;gct;92;gat;1;ggt;11 c;16;c;168;c;49;c;19;;c;6;c;4;c;150;c;836 a;145;a;5,898;a;66;a;66;;a;230;a;368;a;225;a;47 g;1,540;g;3,858;g;428;g;81;;g;227;g;112;g;245;g;268 ;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;; Balaenoptera acutorostrata scammoni ;;;;;;;;;Tursiops truncatus (Dolphin);;;;;;; ;;;7,090;;6,227;;863;;;;;5,845;;5,112;;733 ttt;;tct;10;tat;;tgt;2;;ttt;;tct;12;tat;1;tgt;6 c;13;c;1;c;14;c;24;;c;12;c;;c;18;c;22 a;13;a;5;a;;a;17;;a;6;a;6;a;;a;21 g;8;g;4;g;;g;256;;g;7;g;4;g;;g;217 ctt;6;cct;7;cat;;cgt;9;;ctt;6;cct;7;cat;;cgt;7 c;;c;;c;11;c;;;c;;c;;c;9;c;1 a;4;a;5;a;10;a;9;;a;4;a;5;a;16;a;7 g;7;g;4;g;20;g;21;;g;6;g;4;g;15;g;12 att;12;act;13;aat;;agt;;;att;11;act;9;aat;;agt; c;1;c;;c;24;c;13;;c;;c;1;c;13;c;11 a;8;a;8;a;86;a;65;;a;5;a;6;a;74;a;48 g;21;g;4;g;29;g;67;;g;17;g;3;g;19;g;54 gtt;14;gct;20;gat;20;ggt;12;;gtt;8;gct;19;gat;10;ggt;19 c;1;c;;c;45;c;64;;c;3;c;2;c;49;c;43 a;18;a;42;a;2,368;a;987;;a;16;a;36;a;1,901;a;833 g;32;g;20;g;468;g;2,148;;g;22;g;21;g;395;g;1,766 ;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;; Bos taurus;;;;;;;;;Felis catus (cat);;;;;;; ;;;4,040;;3,060;;980;;;;;3,729;;2,870;;859 ttt;6;tct;13;tat;11;tgt;143;;ttt;1;tct;8;tat;;tgt;1 c;30;c;32;c;39;c;338;;c;12;c;1;c;10;c;32 a;10;a;7;a;;a;29;;a;19;a;14;a;;a;18 g;14;g;7;g;;g;178;;g;8;g;5;g;;g;23 ctt;11;cct;13;cat;4;cgt;13;;ctt;6;cct;8;cat;2;cgt;9 c;;c;;c;19;c;7;;c;;c;1;c;16;c;9 a;5;a;9;a;20;a;12;;a;33;a;68;a;782;a;1,201 g;6;g;4;g;40;g;16;;g;5;g;7;g;47;g;24 att;18;act;14;aat;;agt;4;;att;10;act;9;aat;5;agt;2 c;;c;1;c;30;c;19;;c;;c;;c;28;c;12 a;8;a;10;a;78;a;44;;a;9;a;13;a;50;a;54 g;35;g;7;g;40;g;116;;g;24;g;9;g;887;g;53 gtt;20;gct;31;gat;6;ggt;20;;gtt;8;gct;18;gat;1;ggt;2 c;;c;2;c;42;c;63;;c;;c;1;c;9;c;10 a;21;a;35;a;435;a;391;;a;6;a;10;a;15;a;48 g;39;g;16;g;164;g;1,295;;g;9;g;7;g;44;g;6
Linéarité du code des gènes de tRNA chez les eucaryotes
[modifier | modifier le wikicode]Calculs pour 121 eucaryotes
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Calculs pour 121 eucaryotes
- Linéarité du code des gènes de tRNA chez les eucaryotes.
- Texte
- Légende:
- − ttt ttc . . . nombre de gènes de tRNA des codons ttt ttc . . . relevé de la base de données gtRNAdb au 29.10.17
- − moy : moyenne des codons d'un eucaryote. Si la ligne contient les caractères € ou #, les codons correspondants n'entrent pas dans la moyenne comme le fait le tableur calc. Les codons faibles xyc/t ne rentrent pas dans la moyenne.
- − € pour nombres dépassant 100 dans une 1ère approche du coefficient de détermination R2. Il y en a 61.
- − # pour nombres améliorant le coefficient de détermination. Il y en a 13.
- − Doublons: ce sont les eucaryotes qui sont dans la base mais non utilisés pour les diagrammes car ils concernent 2 individus de la même espèce ou des variantes très proches des espèces retenues (voir texte pour plus de détail).
- − Tableau des diagrammes: Il est fait de 121 espèces et de 43 codons. Ne sont pas concernés les codons à faibles effectifs xyc ou xyt.
- − Données non modifiées: Pour repérer les codons omis, en jaune ceux supérieurs à 100 (€) et en orange les codons d'ajustement (#). Pour comparaison j’ai mis zebrafish sans annotations.
- − codons forts: codons à effectifs élevés. Au total 45. Ne sont pas pris en compte les 16 codons xyc/t faibles et les codons stop tga taa tag.
- + total: total des effectifs restants après suppression des effectifs élevés ou d'ajustement.
- + somme calculée: pente multipliée par la somme des moyennes des eucaryotes ayant perdu le codon omis.
- + totaux + sommes calculées: est le nombre calculé des gènes de tRNA du codon.
- + R2 et pente: coefficient de détermination et pente de la courbe de tendance du diagramme du codon en fonction de la moyenne moy. J'ai opté pour une droite passant par l'origine d'après le tableur calc. R2 a été multiplié par 1000.
- − codons faibles: les 16 codons xyc/t à effectifs faibles.
- + c/t > 3: est le nombre de codons faibles ayant plus de 3 gènes de tRNA.
- + c/t > 3, total: leur total en gènes
- + reste calculé: total des gènes des autres codons plus c/t > 3. C'est la réduction des codons faibles reportés dans la ligne "Totaux des 121 réduits" ci-dessous.
- + multiplicité x 100: division de reste calculé par 121 en %.
- + c/t = 3: est le nombre de codons faibles ayant 3 gènes de tRNA (pour illustration).
- − Totaux des 121 réduits: ils sont reportés dans le tableau synthétique "IV. nombre des 121 eucaryotes".
- − KEGG [3]: nomenclature de l'eucaryote dans la base KEGG, bta par exemple. Surmonté d'un * le code n'est pas celui de KEGG, mais attribué pour homogénéité.
- Tableau des calculs pour 121 eucaryotes sélectionnés.
Gènes de tRNA eucaryotes, doublons.;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; max;total;KEGG;eucaryote;;;;;moy;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg 1327;4180;bta;Bos taurus (cow) (Baylor Btau_4.6.1 Oct 2011);;;;;86.7;7;31;10;14;10;0;5;8;17;0;8;33;23;0;23;46;14;30;6;7;12;0;9;5;15;1;10;7;30;2;36;18;11;38;0;0;4;22;19;43;0;40;83;40;7;47;456;172;156;351;26;187;14;10;12;15;4;18;45;114;20;61;401;1,327 46;758;cre*;Caenorhabditis remanei (WUGSC 15.0.1 May 2007);;;;;16.7;0;18;6;12;24;0;7;4;25;1;14;24;28;0;4;9;16;0;10;6;7;2;41;6;18;0;10;6;27;0;15;6;0;22;0;0;1;22;23;9;1;23;20;33;0;36;23;25;0;14;0;17;25;0;11;1;0;9;13;5;0;28;46;5 38;600;hsa;Homo sapiens (hg19 - NCBI Build 37.1 Feb 2009);;;;;12.8;0;15;9;12;12;0;4;11;18;6;5;20;12;1;8;17;12;1;6;4;10;1;8;4;10;0;6;7;31;1;10;5;5;32;0;0;0;10;18;22;2;34;20;24;1;17;14;10;1;38;3;8;7;0;6;4;1;8;7;5;0;15;9;13 33;508;yli;Yarrowia lipolytica WSH-Z06;;;;;11.3;0;17;1;3;21;0;2;13;26;0;1;18;24;0;2;8;21;0;2;4;21;0;3;2;22;0;3;2;29;0;4;2;0;14;0;0;0;12;3;15;0;16;4;33;0;28;6;27;0;8;0;13;1;0;25;0;0;6;4;1;0;30;11;0 34;484;yli;Yarrowia lipolytica PO1f;;;;;10.8;0;18;1;3;18;0;2;12;26;0;1;18;24;0;2;8;21;0;2;4;21;0;3;2;22;0;3;3;29;0;4;2;0;14;0;0;0;12;3;15;0;15;4;34;0;24;6;22;0;8;0;13;1;0;24;0;0;6;4;1;0;18;11;0 57;432;mmu;Mus musculus (mm9 July 2007);;;;;9.4;0;7;4;4;8;0;3;10;11;1;5;18;8;1;3;11;9;1;3;3;7;0;8;3;9;0;4;5;19;0;11;10;0;10;0;0;1;10;6;10;0;14;11;19;0;16;8;13;0;57;2;8;6;0;3;5;0;8;5;5;1;14;7;7 16;315;dwi;Drosophila willistoni (D. willistoni Feb. 2006);;;;;6.8;0;7;3;7;4;1;2;9;9;2;4;15;8;1;5;5;8;1;3;3;7;0;5;4;7;1;7;4;11;0;6;2;0;8;0;0;0;8;4;6;0;10;8;10;0;16;11;12;0;12;1;7;10;0;7;1;0;6;4;5;0;12;6;0 17;305;dan;Drosophila ananassae (D. ananassae Feb. 2006 Agencourt CAF1);;;;;6.7;0;8;2;4;5;0;2;10;11;0;2;12;7;0;2;7;6;0;3;6;4;0;4;8;9;0;7;3;10;0;4;6;0;9;0;0;0;5;4;8;0;10;7;17;0;13;6;14;1;6;1;6;12;0;8;0;0;6;3;2;0;16;6;3 18;293;dpe;Drosophila persimilis (D. persimilis Oct. 2005 Broad);;;;;6.5;0;7;1;3;5;0;2;10;11;0;2;11;7;0;2;5;9;0;2;5;6;0;6;4;8;0;8;3;11;0;2;3;0;9;0;0;0;7;4;7;0;9;4;14;0;18;6;14;0;8;1;8;13;0;5;0;0;5;2;4;0;13;6;3 18;292;dpo;Drosophila pseudoobscura (D. pseudoobscura Feb. 2006);;;;;6.5;0;7;2;4;5;0;2;9;10;0;2;11;7;0;2;6;11;0;2;3;3;0;6;4;8;0;8;4;12;0;3;3;0;9;0;0;0;5;4;7;0;9;5;12;0;14;6;18;0;11;1;8;9;0;4;0;0;5;3;5;0;14;6;3 15;291;des;Drosophila sechellia (D. sechellia Oct. 2005 Broad);;;;;6.4;0;9;4;4;5;0;2;8;10;0;2;15;8;0;2;8;8;0;2;4;7;0;5;5;9;0;6;5;13;0;2;3;0;9;0;0;0;7;2;8;0;9;4;12;0;13;5;13;0;6;1;8;9;0;7;0;0;6;3;4;0;13;6;0 14;282;der;Drosophila erecta (D. erecta Feb. 2006 Agencourt CAF1);;;;;6.2;0;9;3;4;5;0;2;7;9;0;2;12;7;0;2;7;9;0;2;4;5;0;5;5;8;0;6;3;12;0;2;3;0;8;0;0;0;6;4;8;0;8;5;11;0;14;6;13;1;6;1;8;9;0;7;0;0;6;3;4;0;14;1;6 14;268;dvi;Drosophila virilis (D. virilis Feb. 2006 Agencourt CAF1);;;;;5.9;0;8;2;5;3;0;3;7;9;0;2;12;6;0;2;7;6;0;2;4;4;0;3;5;7;0;7;4;8;0;3;3;0;10;0;0;0;5;4;7;0;7;12;12;0;13;6;10;0;8;1;6;10;0;5;0;0;5;2;2;0;14;6;1 14;262;dmo;Drosophila mojavensis (D. mojavensis Feb. 2006 Agencourt CAF1);;;;;5.8;0;8;2;6;3;0;2;6;8;0;2;12;6;0;2;6;6;0;2;4;6;0;5;3;7;0;8;4;9;0;4;3;0;7;0;0;0;5;4;7;0;8;8;11;0;12;6;11;0;7;1;6;10;0;5;0;0;5;2;2;0;14;6;1 18;259;dgr;Drosophila grimshawi (D. grimshawi Feb. 2006 Agencourt CAF1);;;;;5.7;0;9;2;4;4;0;2;7;7;0;2;10;6;0;2;6;6;0;2;4;4;0;4;5;7;0;8;4;8;0;3;3;0;10;0;0;0;5;3;12;0;7;7;12;0;12;6;10;0;6;1;6;9;0;4;0;0;3;3;2;0;18;4;0 24;296;fpu;Fusarium pseudograminearum CS3096;;;;;6.6;0;9;1;3;17;0;2;5;10;0;2;6;19;0;2;3;11;0;2;2;9;0;3;2;10;0;4;3;14;0;4;3;0;9;0;0;0;6;5;6;0;8;2;17;0;9;4;24;0;5;0;4;11;0;8;1;0;9;1;2;0;13;5;1 19;292;fpu;Fusarium pseudograminearum CS3270;;;;;6.5;0;10;1;3;13;0;2;5;13;0;2;6;17;0;2;3;11;0;2;2;10;0;3;2;10;0;4;3;13;0;4;3;0;8;0;0;0;6;5;6;0;9;2;16;0;13;4;19;0;5;0;4;11;0;9;1;0;8;1;2;0;13;5;1 17;280;sceb*;Saccharomyces sp. boulardii 17;;;;;6.2;0;11;6;9;0;1;3;0;13;0;3;10;15;0;3;2;11;0;3;1;2;0;10;0;9;0;4;1;8;0;5;0;0;9;0;0;0;7;9;1;0;9;7;15;0;17;14;2;0;4;0;6;7;0;0;1;0;4;13;1;1;17;4;2 15;263;sceb*;Saccharomyces sp. boulardii ATCC MYA-796;;;;;5.8;0;11;7;9;0;1;3;0;12;0;2;10;13;0;2;2;10;0;3;1;2;0;10;0;10;0;5;1;11;0;5;0;0;8;0;0;0;8;7;1;0;8;7;13;0;14;13;2;0;4;0;6;6;0;0;1;0;4;10;1;0;15;3;2 14;265;ndi;Naumovozyma dairenensis CBS 421;;;;;5.9;0;9;9;8;1;0;4;0;12;0;2;9;14;0;2;2;11;0;3;1;1;0;11;0;11;0;5;2;10;0;5;0;0;9;0;0;0;7;10;1;0;9;8;12;0;13;13;1;0;5;0;5;5;0;0;2;0;5;11;1;0;12;3;1 13;224;vda;Verticillium dahliae JR2;;;;;4.9;0;7;1;1;8;0;1;4;10;0;0;9;11;0;1;2;6;1;2;4;8;0;3;2;8;0;2;3;11;0;2;4;0;6;0;0;0;6;2;5;0;6;2;12;0;9;2;12;0;5;1;3;9;0;2;2;0;5;3;2;0;13;3;3 11;178;afm;Aspergillus fumigatus Af293;;;;;4.0;0;5;1;2;6;0;0;4;7;0;1;8;7;0;1;2;5;0;1;2;5;0;2;2;6;0;3;2;8;0;3;2;0;5;0;0;0;4;2;6;0;5;1;8;0;9;4;8;0;3;0;3;9;0;2;2;0;4;1;2;0;11;3;1 10;141;cgi;Cryptococcus gattii WM276;;;;;3.1;0;5;1;3;6;0;0;1;6;0;1;6;7;0;0;2;6;0;1;1;6;0;1;0;5;0;1;1;7;0;1;2;0;4;0;0;0;4;2;3;0;4;1;7;0;0;3;10;0;3;0;3;3;0;5;1;0;2;1;3;0;9;3;0 9;139;cne;Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21;;;;;3.1;0;5;1;3;6;0;0;1;6;0;1;6;7;0;0;2;6;0;1;1;5;0;1;0;5;0;1;1;7;0;1;2;0;4;0;0;0;4;2;3;0;4;1;7;0;0;3;9;0;3;0;3;3;0;5;1;0;2;1;3;0;9;3;0 9;137;cnb;Cryptococcus neoformans var. neoformans B-3501A;;;;;3.0;0;5;1;3;6;0;0;1;6;0;1;6;7;0;0;2;4;0;1;1;5;0;1;0;5;0;1;1;7;0;1;2;0;4;0;0;0;4;2;3;0;4;1;7;0;0;3;9;0;3;0;3;3;0;5;1;0;2;1;3;0;9;3;0 8;130;cdu;Candida dubliniensis CD36;;;;;2.9;0;5;5;5;2;0;0;1;6;0;1;4;8;0;1;1;4;0;3;1;1;0;5;0;5;0;2;1;6;0;2;0;0;4;0;0;0;3;4;1;0;4;5;3;0;6;7;1;0;2;0;2;2;0;0;1;0;1;5;1;0;6;2;1 6;123;kpa*;Komagataella pastoris GS115;;;;;2.7;0;5;1;3;2;0;1;2;5;0;1;4;5;0;1;1;4;0;2;1;2;0;4;1;5;0;1;1;5;0;2;0;0;4;0;0;0;3;3;2;0;4;3;5;0;6;5;4;0;2;0;3;2;0;1;1;0;2;4;1;0;5;3;1 2;46;ehe;Encephalitozoon hellem ATCC 50504;;;;;1.0;0;1;1;1;1;0;1;1;1;0;1;2;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;0;1;0;0;0;1;1;1;0;2;1;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;0;1;0;0;1;1;1;0;1;1;1 2;46;ein;Encephalitozoon intestinalis ATCC 50506;;;;;1.0;0;1;1;1;1;0;1;1;1;0;1;2;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;0;1;0;0;0;1;1;1;0;2;1;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;0;1;0;0;1;1;1;0;1;1;1 2;46;ero;Encephalitozoon romaleae SJ-2008;;;;;1.0;0;1;1;1;1;0;1;1;1;0;1;2;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;0;1;0;0;0;1;1;1;0;2;1;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;0;1;0;0;1;1;1;0;1;1;1 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; Tableau des diagrammes des pentes;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; max;total;KEGG;eucaryote;;;;;moy;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg 2;35;pfa;Plasmodium falciparum;;;;;0.78;0;1;1;1;1;0;1;1;1;0;1;2;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;0;0;1;1;1;0;1;1;0;1;0;0;0;0;1;1;0;1;0;0;0;1;1;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;1;0;0;0;1;0 2;46;ecu;Encephalitozoon cuniculi GB-M1;;;;;1.02;0;1;1;1;1;0;1;1;1;0;1;2;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;0;1;0;0;0;1;1;1;0;2;1;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;0;1;0;0;1;1;1;0;1;1;1 2;53;ede*;Exophiala dermatitidis NIH/UT8656;;;;;1.16;0;1;1;1;1;1;1;1;2;0;1;1;2;0;1;1;1;0;1;1;0;0;1;1;2;0;1;1;2;0;1;1;0;1;0;0;0;2;1;1;0;1;1;0;0;2;1;2;0;1;0;0;2;0;2;1;0;1;0;1;0;2;1;2 4;80;opa*;Ogataea parapolymorpha DL-1;;;;;1.78;0;3;1;3;1;0;1;1;4;0;1;4;3;0;0;1;2;0;1;1;0;0;3;0;3;0;1;1;3;0;2;0;0;2;0;0;0;2;2;1;0;2;2;3;0;3;2;3;0;1;0;2;2;0;0;1;0;2;3;1;0;4;2;0 5;82;cot;Candida orthopsilosis Co 90-125;;;;;1.82;0;2;3;1;1;0;0;1;4;0;1;4;4;0;1;1;2;0;2;1;1;0;3;0;4;0;2;1;3;0;2;0;0;3;0;0;0;1;3;1;0;3;4;3;0;5;2;1;0;1;0;1;2;0;0;1;0;1;2;1;0;2;1;0 4;82;lma;Leishmania major;;;;;1.82;0;2;1;1;3;0;1;2;3;0;1;4;2;0;1;2;1;0;1;1;2;0;1;2;3;0;1;2;2;0;1;2;0;3;0;0;0;2;1;3;0;3;1;3;0;3;1;2;0;1;0;1;4;0;1;1;0;2;1;1;0;4;1;1 6;96;sre*;Sporisorium reilianum SRZ2;;;;;2.11;0;4;1;0;4;0;1;2;4;0;1;4;4;0;1;0;2;0;1;2;3;0;1;1;4;0;1;1;3;0;1;1;0;2;0;0;0;3;3;2;0;3;1;5;0;3;2;4;0;2;1;2;4;0;2;0;0;0;1;1;0;6;1;1 6;111;uma;Ustilago maydis 521;;;;;2.40;0;3;1;0;4;0;2;2;4;0;1;4;4;0;1;1;3;0;1;3;4;1;1;1;4;0;1;1;5;0;1;1;0;3;0;0;0;2;2;3;0;3;1;5;0;5;2;5;0;2;2;2;4;0;3;0;0;2;1;1;0;6;2;1 6;123;kpa*;Komagataella pastoris CBS 7435;;;;;2.73;0;5;1;3;2;0;1;2;5;0;1;4;5;0;1;1;4;0;2;1;2;0;4;1;5;0;1;1;5;0;2;0;0;4;0;0;0;3;3;2;0;4;3;5;0;6;5;4;0;2;0;3;2;0;1;1;0;2;4;1;0;5;3;1 6;125;cal;Candida albicans WO-1;;;;;2.78;0;5;5;6;2;0;0;1;6;0;1;4;6;0;1;1;4;0;3;1;1;0;4;0;4;0;2;1;6;0;2;0;0;4;0;0;0;3;5;1;0;3;5;2;0;6;6;1;0;2;0;2;2;0;0;1;0;2;5;1;0;5;2;1 10;143;cneg*;Cryptococcus neoformans var. grubii H99;;;;;3.18;0;5;1;3;6;0;0;1;6;0;1;7;7;0;0;2;6;0;1;1;6;0;1;0;5;0;1;1;8;0;1;2;0;4;0;0;0;4;2;3;0;4;1;7;0;0;3;10;0;3;0;3;3;0;5;1;0;2;1;3;0;9;3;0 10;154;ttt;Thielavia terrestris NRRL 8126;;;;;3.42;0;5;5;1;5;0;1;4;6;0;1;5;6;0;1;3;3;0;1;3;4;0;2;3;4;0;1;2;7;0;2;3;0;4;0;0;0;3;2;4;0;3;2;6;0;6;2;7;0;3;0;4;6;0;1;3;0;3;1;2;0;10;2;2 11;155;mgp;Meleagris gallopavo (turkey) (TGC Turkey_2.01 Dec 2009);;;;;3.42;0;6;1;2;1;0;1;4;3;0;1;11;3;1;2;3;5;0;3;1;7;0;2;1;4;0;2;0;7;0;6;3;0;6;0;0;0;3;1;1;0;4;4;3;0;3;5;6;0;5;0;5;2;0;1;2;0;6;3;3;0;5;4;3 9;156;vma*;Valsa mali 03-8;;;;;3.47;0;4;0;2;5;0;1;4;7;0;1;8;7;0;1;2;5;0;1;2;0;0;2;1;4;0;3;2;7;0;2;2;0;4;0;0;0;5;2;4;0;5;0;9;0;6;3;9;0;3;0;3;6;0;2;2;0;3;1;2;0;9;3;2 9;158;kna*;Kazachstania naganishii CBS 8797;;;;;3.51;0;6;3;5;1;0;3;0;7;0;2;4;7;0;1;2;7;0;1;1;1;0;6;0;7;0;2;1;7;0;1;1;0;5;0;0;0;4;4;2;0;6;4;7;0;8;5;3;0;4;0;4;3;0;0;1;0;3;6;1;0;9;1;2 9;162;kla;Kluyveromyces lactis NRRL Y-1140;;;;;3.58;0;5;3;7;0;1;2;0;7;0;1;6;7;0;1;2;6;0;2;1;1;0;7;0;6;0;2;1;7;0;3;0;0;5;0;0;0;4;6;1;0;6;4;9;0;8;8;2;0;3;0;4;3;0;0;1;0;2;7;1;0;7;2;1 9;168;spo;Schizosaccharomyces pombe 972h-;;;;;3.73;0;5;2;4;5;0;1;1;8;0;1;7;9;0;2;1;7;0;2;1;6;0;2;1;7;0;2;1;6;0;2;1;0;4;0;0;0;4;4;2;0;6;3;9;0;8;4;6;0;3;0;3;8;0;1;1;0;3;2;1;0;8;3;1 10;170;pic;Scheffersomyces stipitis CBS 6054;;;;;3.78;0;6;3;8;3;0;0;1;7;0;1;6;7;0;2;1;6;0;2;2;1;0;6;0;7;0;2;1;7;0;3;0;0;5;0;0;0;4;5;2;0;7;3;9;0;8;8;2;0;3;0;4;3;0;0;1;0;2;7;1;0;10;3;1 11;181;ani;Aspergillus nidulans FGSC A4;;;;;4.02;0;5;1;2;6;0;2;3;7;0;1;7;8;0;1;2;5;0;1;2;6;0;2;2;6;0;2;2;8;0;2;3;0;6;0;0;0;5;2;5;0;6;2;8;0;8;3;8;0;3;0;3;9;0;2;2;0;4;2;2;0;11;3;1 14;190;mgr;Magnaporthe oryzae 70-15;;;;;4.22;0;7;1;2;7;0;1;4;8;0;1;8;6;0;1;2;4;0;2;3;5;0;2;2;6;0;2;2;9;0;3;2;0;5;0;0;0;4;2;6;0;6;2;9;0;10;3;9;0;3;0;4;6;0;2;2;0;3;1;3;0;14;3;3 13;191;mun*;Melopsittacus undulatus (Budgerigar Sep. 2011 WUSTL v6.3/melUnd1);;;;;4.18;0;6;4;3;3;0;0;6;5;0;1;9;3;1;1;4;4;1;3;1;2;0;3;2;5;0;2;0;9;0;5;2;0;7;0;0;0;4;2;4;0;9;3;13;0;9;3;1;0;5;1;4;3;0;1;1;0;8;4;4;0;10;9;1 11;191;cjd*;Cyberlindnera jadinii NBRC 0988 NBRC0988;;;;;4.20;0;8;1;7;4;0;3;1;6;1;1;7;9;0;2;3;7;0;3;1;0;0;7;0;6;0;3;1;6;0;3;0;0;5;0;0;0;6;6;2;0;7;5;8;0;8;4;9;0;3;1;4;6;0;0;1;0;3;7;0;0;11;4;1 12;192;tdl;Torulaspora delbrueckii CBS 1146;;;;;4.24;0;6;3;8;0;1;4;0;8;0;1;7;12;0;1;2;7;0;2;1;1;0;6;0;9;0;2;1;8;0;4;0;0;6;0;0;0;4;6;2;0;7;5;10;0;9;8;4;0;3;0;4;4;0;0;1;0;3;7;1;0;11;2;1 12;192;pch*;Penicillium chrysogenum P2niaD18;;;;;4.22;0;5;0;0;6;1;0;3;10;0;2;10;9;0;1;3;7;0;1;2;0;0;0;1;12;0;3;2;8;0;2;2;0;5;0;0;0;11;3;5;0;6;1;9;0;9;3;10;0;3;1;0;10;0;2;2;0;4;0;2;0;11;4;1 11;192;mth*;Myceliophthora thermophila ATCC 42464;;;;;4.24;0;5;1;2;7;0;1;4;8;0;1;8;7;0;2;3;5;0;3;3;6;0;2;3;6;0;2;3;7;0;2;3;0;6;0;0;0;4;2;5;0;6;3;9;0;10;2;8;0;3;1;4;7;0;1;2;0;5;1;2;0;11;4;2 16;203;gfr;Geospiza fortis (Medium ground finch Apr. 2012 GeoFor_1.0/geoFor1);;;;;4.44;0;6;11;2;4;0;7;0;6;1;2;6;2;1;1;3;2;0;3;1;4;0;5;1;5;0;4;1;16;0;5;2;0;12;0;0;0;4;2;3;1;6;4;7;0;5;4;6;0;10;0;3;6;0;2;0;0;6;3;2;0;8;4;4 11;205;sas*;Saccharomycetaceae sp. Ashbya aceri;;;;;4.51;0;7;3;7;0;1;4;1;9;0;1;10;7;0;3;4;7;0;3;3;1;0;7;0;7;0;3;2;7;0;5;2;0;5;0;0;0;5;4;4;0;8;4;9;0;10;3;8;0;3;1;5;4;0;0;2;0;3;7;1;0;11;2;2 13;206;tpf;Tetrapisispora phaffii CBS 4417;;;;;4.56;0;9;9;2;0;1;2;0;10;0;2;8;10;0;2;1;8;0;2;1;1;0;7;0;9;0;2;1;9;0;3;0;0;6;0;0;0;5;7;1;0;9;6;9;0;12;11;1;0;4;0;4;3;0;0;1;0;3;8;1;0;13;2;1 12;207;cgr;Candida glabrata CBS 138;;;;;4.58;0;6;3;8;0;1;4;0;9;0;2;7;10;0;2;1;9;0;2;1;1;0;7;0;9;0;3;1;10;0;5;0;0;6;0;0;0;6;6;2;0;9;3;12;0;9;9;3;0;3;0;5;4;0;0;1;0;3;9;1;0;12;2;1 12;211;acs;Anolis carolinensis (lizard) (Broad AnoCar2.0 May 2010);;;;;4.64;0;5;2;2;4;0;3;4;6;0;1;12;5;0;2;3;5;0;1;2;3;1;3;2;4;0;3;1;12;0;6;3;0;6;0;0;0;5;3;5;0;10;5;6;0;8;7;5;0;12;1;7;4;0;3;1;0;5;3;3;0;7;8;2 10;212;bfu;Botrytis cinerea B05.10;;;;;4.69;0;7;2;5;6;0;1;1;8;0;1;8;8;0;2;2;7;0;3;2;4;0;7;1;6;0;3;0;8;0;5;2;0;6;0;0;0;4;6;2;0;6;3;10;0;9;6;9;0;5;0;6;6;0;4;2;0;5;5;1;1;8;2;7 11;214;dha;Debaryomyces hansenii CBS767;;;;;4.71;0;8;9;4;2;0;0;1;9;1;2;10;10;0;1;1;6;0;4;1;1;0;7;0;8;0;2;1;7;0;5;1;0;6;0;0;0;6;7;1;0;9;8;10;0;10;9;1;0;4;1;4;5;0;0;1;0;3;10;1;0;11;5;1 13;225;vda;Verticillium dahliae VdLs.17;;;;;4.93;0;7;1;1;8;0;1;4;9;0;0;9;11;0;1;2;6;1;2;4;8;0;3;2;8;0;2;3;11;0;2;4;1;6;0;0;0;6;2;5;0;6;2;12;0;10;2;12;0;5;1;3;9;0;2;2;0;5;3;2;0;13;3;3 15;229;lth;Lachancea thermotolerans CBS 6340;;;;;5.04;0;7;2;8;0;2;3;3;10;0;1;8;11;0;1;3;9;0;2;2;2;0;8;0;9;0;2;1;10;0;3;2;0;6;0;0;0;5;5;5;0;7;4;14;0;10;6;11;0;4;0;5;4;0;0;1;0;3;9;1;0;15;3;2 21;230;tgu;Taeniopygia guttata (Zebra finch Feb. 2013 WashU taeGut324/taeGut2);;;;;4.87;0;10;4;4;1;0;1;7;21;2;1;5;3;2;1;1;3;0;2;1;6;0;1;2;8;1;4;2;18;0;7;3;0;13;0;0;0;5;1;6;2;8;4;5;0;7;2;3;1;9;1;3;6;0;2;0;1;5;3;2;1;8;7;4 15;242;aor;Aspergillus oryzae RIB40;;;;;5.31;0;7;2;0;0;0;1;4;10;0;2;6;10;1;2;3;7;0;1;3;9;0;2;0;10;0;2;2;10;0;3;4;1;13;0;0;0;8;4;7;0;8;3;11;0;13;6;11;1;4;0;4;12;0;2;3;0;6;2;2;0;15;4;1 27;252;mlu*;Myotis lucifugus (Microbat Jul. 2010 Broad Institute Myoluc2.0/myoLuc2);;;;;5.49;0;5;2;3;3;0;5;2;10;0;3;14;5;0;3;5;6;0;2;2;6;0;3;3;5;0;5;3;8;0;1;3;0;5;0;0;5;7;3;7;0;9;3;11;0;8;5;6;0;27;0;4;6;0;5;2;0;5;5;5;0;8;6;3 15;256;dsi;Drosophila simulans (D. simulans Apr. 2005 WUGSC mosaic 1.0);;;;;5.67;0;8;3;4;5;0;2;9;8;0;0;12;7;0;2;6;8;0;2;3;6;0;5;5;8;0;5;4;9;0;5;0;0;10;0;0;0;6;4;8;0;6;4;11;0;6;5;10;0;7;1;9;9;0;5;0;0;3;3;3;0;15;5;0 20;258;mmr*;Microcebus murinus (Mouse lemur) (Jun 2003);;;;;5.71;0;8;3;3;5;0;2;7;4;0;3;14;4;0;2;5;7;0;2;3;7;0;4;3;3;0;3;2;11;0;5;3;0;8;0;0;0;6;4;12;0;9;5;6;0;5;9;8;1;20;0;6;6;0;3;2;0;7;5;3;0;11;7;2 15;258;lkl*;Lachancea kluyveri NRRL Y-12651;;;;;5.69;0;8;3;11;0;1;3;0;12;0;1;10;14;0;1;3;11;0;2;1;1;1;10;0;12;0;2;1;13;0;4;0;0;7;0;0;0;6;10;1;0;9;5;14;0;13;13;3;0;5;0;5;5;0;0;1;0;4;12;1;0;15;2;2 17;266;kaf;Kazachstania africana CBS 2517;;;;;5.91;0;9;14;2;2;0;2;0;13;0;2;9;13;0;2;1;11;0;4;1;1;0;10;0;11;0;3;1;12;0;5;0;0;9;0;0;0;6;9;1;0;10;8;12;0;13;15;2;0;5;0;6;4;0;0;1;0;4;11;1;0;17;3;1 14;270;ncs;Naumovozyma castellii CBS 4309;;;;;6.00;0;10;7;9;2;0;3;0;12;0;2;9;13;0;2;2;12;0;4;1;1;0;10;0;11;0;3;2;12;0;5;0;0;9;0;0;0;8;9;1;0;10;8;14;0;14;13;1;0;4;0;7;5;0;0;2;0;4;10;1;0;13;3;2 16;270;fgr;Fusarium graminearum CS3005;;;;;5.98;0;9;1;3;6;0;2;5;11;0;2;5;16;0;2;3;11;0;2;2;10;0;3;2;11;0;4;3;13;0;3;3;0;6;0;0;0;7;5;7;0;9;2;12;0;10;4;13;0;5;1;4;10;0;9;1;0;8;2;2;0;15;5;1 17;272;zro;Zygosaccharomyces rouxii CBS 732;;;;;6.00;0;8;4;10;0;1;5;0;11;1;1;9;12;0;2;4;12;0;3;2;3;0;10;0;10;0;2;2;12;0;9;0;0;7;0;0;0;6;10;3;0;9;7;14;0;14;10;4;0;4;0;6;5;0;0;1;0;5;8;2;0;17;5;2 15;273;fve*;Flammulina velutipes KACC42780;;;;;5.98;2;15;1;4;6;0;2;2;10;0;2;14;7;0;3;3;7;0;2;3;4;0;4;2;7;0;3;4;13;0;9;5;0;6;0;0;0;3;4;6;1;12;6;11;1;2;6;11;0;4;0;4;13;0;8;2;0;4;2;6;0;11;8;8 16;275;sce;Saccharomyces cerevisiae (S288c Apr 2011);;;;;6.09;0;10;7;10;0;1;3;0;13;0;2;10;14;0;2;2;11;0;3;1;2;0;10;0;11;0;4;1;11;0;5;0;0;8;0;0;0;7;9;1;0;10;7;14;0;16;14;2;0;4;0;6;6;0;0;1;0;4;11;1;0;16;3;2 24;283;gga;Gallus gallus (galGal4 Nov 2011);;;;;6.24;0;10;3;3;3;0;2;7;7;0;2;14;7;1;3;7;9;0;4;2;7;0;4;3;4;0;4;2;24;0;7;4;0;16;0;0;0;6;2;5;0;11;6;6;0;10;9;7;0;11;1;6;8;0;2;2;0;7;4;3;0;7;7;4 16;285;fvr;Fusarium verticillioides 7600;;;;;6.33;0;10;2;4;12;0;2;5;11;0;1;8;13;0;2;3;10;0;2;3;10;0;3;2;11;0;4;2;14;0;3;3;0;8;0;0;0;6;4;8;0;8;2;15;0;14;5;16;0;5;0;5;10;0;7;1;0;7;2;2;0;14;5;1 16;288;mfa*;Millerozyma farinosa CBS 7064;;;;;6.40;0;10;4;14;4;0;0;2;12;0;4;10;12;0;2;4;10;0;4;2;2;0;8;0;10;0;4;2;12;0;8;2;0;10;0;0;0;8;8;4;0;12;6;10;0;14;8;8;0;4;0;6;4;0;0;2;0;6;10;2;0;16;6;2 14;289;dme;Drosophila melanogaster (D. melanogaster Aug. 2014 BDGP Release 6 + ISO1 MT/dm6);;;;;6.40;0;8;4;4;4;0;2;8;9;0;2;12;6;0;2;7;8;0;2;4;7;0;5;5;8;0;6;3;12;0;2;3;0;9;0;0;0;5;4;8;0;10;6;13;0;14;6;13;0;7;1;8;10;0;10;0;0;6;3;3;0;14;6;0 19;305;fgr;Fusarium graminearum PH-1 NRRL 31084;;;;;6.76;0;11;2;3;13;0;2;5;13;0;2;6;19;0;2;3;11;0;2;2;10;0;3;2;11;0;4;3;14;0;4;2;0;8;0;0;0;7;5;7;0;9;3;16;0;14;5;19;0;5;1;4;10;0;9;1;0;8;2;2;0;14;6;1 21;326;oga*;Otolemur garnettii (Bushbaby Mar. 2011 Broad/otoGar3);;;;;6.96;1;6;3;5;4;0;3;9;10;9;11;13;6;0;3;5;6;0;3;3;7;0;4;3;9;0;6;3;13;0;7;3;0;8;0;0;0;8;5;9;0;12;11;9;0;13;5;8;0;21;1;6;6;0;4;3;2;7;4;5;0;12;9;3 18;326;dya;Drosophila yakuba (D. yakuba Nov. 2005 WUGSC 7.1);;;;;7.22;0;9;5;4;5;0;2;8;10;0;2;15;7;0;2;10;9;0;2;5;6;0;8;5;8;0;6;5;18;0;2;5;0;9;0;0;0;5;4;8;0;11;6;16;0;15;7;14;0;8;1;8;12;0;7;0;0;6;3;4;0;16;7;1 23;328;tbl;Tetrapisispora blattae CBS 6284;;;;;7.27;0;12;12;9;0;1;2;0;17;0;2;11;18;0;2;1;16;0;4;2;1;0;13;0;15;0;3;1;19;0;5;0;0;9;0;0;0;7;10;1;0;11;9;15;0;19;16;1;0;5;0;7;4;0;0;1;0;6;13;1;0;23;3;1 19;334;sbq;Saimiri boliviensis (Squirrel monkey Oct. 2011 Broad/saiBol1);;;;;7.27;0;9;8;5;6;0;4;5;10;1;6;14;6;1;4;7;9;1;3;3;9;0;5;4;8;0;6;5;15;0;8;5;1;8;0;0;0;8;6;10;0;11;12;9;0;9;10;5;0;19;3;6;6;0;4;3;0;7;5;5;0;10;6;4 17;338;opr*;Ochotona princeps (Pika May 2012 OchPri3.0/ochPri3);;;;;7.49;0;10;3;4;5;0;5;11;8;0;4;15;7;0;4;7;7;0;3;4;8;0;4;4;7;0;6;7;15;0;7;4;0;10;0;0;0;5;5;12;0;14;9;11;0;14;7;11;0;10;1;6;7;0;6;4;0;7;5;6;0;17;7;5 29;353;meu*;Macropus eugenii (Wallaby Sep. 2009 TWGS Meug_1.1/macEug2);;;;;7.62;1;10;3;8;5;0;4;6;6;0;6;14;8;0;1;7;8;0;4;2;7;0;4;2;8;0;6;3;13;0;6;5;1;8;0;0;1;7;4;7;0;14;10;11;0;13;12;7;0;29;7;8;7;0;3;5;0;10;7;4;0;16;10;5 46;367;hgl;Heterocephalus glaber (Naked mole-rat Jan. 2012 Broad HetGla_female_1.0/hetGla2);;;;;7.62;0;6;4;5;5;0;5;5;8;0;3;14;12;1;4;6;7;0;3;3;13;0;5;3;15;2;4;4;46;6;5;6;0;7;0;0;0;7;3;6;0;9;8;15;2;10;6;4;0;23;7;6;5;0;4;4;2;7;6;5;4;10;4;3 20;373;lcm;Latimeria chalumnae (Coelacanth Aug. 2011 Broad/latCha1);;;;;7.96;0;7;11;4;4;0;5;8;7;0;7;11;3;0;7;4;3;0;6;3;12;0;10;4;11;0;9;2;5;0;20;3;2;8;0;0;0;5;10;9;3;9;20;13;1;19;11;8;5;17;4;15;4;0;1;4;0;8;9;8;0;7;5;2 25;374;san*;Sorex araneus (Shrew Aug. 2008 Broad/sorAra2);;;;;8.24;0;10;4;4;6;1;2;13;15;0;5;15;7;0;5;7;8;0;3;4;8;0;6;2;8;0;5;5;10;0;8;3;0;9;0;0;0;7;5;7;0;12;8;13;0;19;10;14;0;25;2;6;9;0;5;3;0;8;6;6;0;22;12;2 34;383;cpo*;Cavia porcellus (Guinea pig) (Broad Feb 2008);;;;;8.36;0;8;4;6;5;0;3;6;10;0;5;15;6;1;3;6;8;0;3;4;8;0;4;3;10;0;4;3;28;4;9;5;0;15;0;0;0;8;4;8;0;18;11;26;1;10;6;5;0;34;1;8;7;0;4;3;0;10;5;5;0;11;6;6 26;396;ncr;Neurospora crassa OR74A;;;;;8.78;0;12;1;5;17;0;2;6;17;1;1;17;19;0;2;4;14;0;3;4;11;0;4;4;12;0;3;3;19;0;3;5;0;10;0;0;0;9;3;11;0;12;2;24;0;18;5;24;0;7;0;7;21;0;2;3;0;6;5;5;0;26;4;3 40;407;rno;Rattus norvegicus (rn5 Mar 2012);;;;;8.89;1;8;3;0;1;0;1;5;12;0;3;13;8;0;3;7;11;0;4;3;33;0;6;3;9;0;5;4;36;2;9;4;0;2;0;0;0;10;6;10;0;15;1;19;2;15;10;8;0;40;1;8;6;0;3;5;1;12;6;8;0;11;9;5 30;408;cjc;Callithrix jacchus (marmoset) (WUGSC 3.2 Mar 2009);;;;;8.80;0;8;9;6;7;0;3;11;9;2;5;19;6;1;4;10;9;0;5;4;7;0;6;4;9;1;6;4;15;1;5;4;0;19;0;0;1;8;4;12;0;23;14;11;1;13;11;12;0;30;2;6;6;3;4;3;0;8;5;5;0;14;9;4 28;411;pha*;Papio hamadryas (baboon) (Nov 2008);;;;;8.93;0;12;7;7;9;0;3;6;12;2;4;15;9;1;7;12;9;0;5;3;7;0;6;4;10;0;7;6;19;1;9;5;0;15;0;0;0;10;6;11;1;18;12;12;1;10;13;4;2;28;1;8;7;0;6;4;0;9;6;5;0;13;4;8 31;414;aga;Anopheles gambiae;;;;;9.20;0;9;2;3;5;0;3;10;12;0;2;18;31;0;3;29;6;0;2;8;7;0;8;13;8;0;2;5;17;0;3;6;0;22;0;0;0;21;4;11;0;11;8;17;0;20;11;15;0;5;0;6;10;0;8;0;0;6;2;2;0;15;8;0 24;418;ppp;Physcomitrella patens ;;;;;9.18;1;14;2;6;6;1;5;5;12;0;4;24;13;0;2;11;13;0;5;7;13;0;8;4;10;0;5;6;19;0;9;8;0;8;0;0;0;9;9;10;1;14;8;16;0;11;7;14;0;7;1;9;8;1;7;5;0;9;6;10;0;15;9;11 22;421;nle;Nomascus leucogenys (Gibbon Oct. 2012 GGSC Nleu3.0/nomLeu3);;;;;9.04;1;11;7;5;8;0;3;9;12;3;5;16;11;1;6;10;9;1;4;4;9;1;5;4;11;0;4;5;18;1;9;5;0;14;0;0;0;11;9;13;2;14;22;15;0;10;10;8;1;22;3;8;7;0;7;3;0;8;6;5;0;12;6;7 28;435;ggo;Gorilla gorilla gorilla (gorilla) (gorGor3.1 May 2011);;;;;9.42;0;12;8;7;8;0;4;5;11;2;6;17;9;1;8;10;10;1;4;5;8;0;7;4;9;0;6;6;22;2;6;4;1;16;0;0;0;7;7;14;1;24;13;14;0;15;14;7;0;28;3;8;7;0;6;5;0;8;5;6;0;12;3;9 45;446;shr;Sarcophilus harrisii (Tasmanian devil Feb. 2011 WTSI Devil_ref v7.0/sarHar1);;;;;9.87;0;13;6;3;9;0;4;9;11;0;4;22;8;0;4;10;10;0;5;3;10;0;6;3;9;0;7;2;18;0;7;4;0;11;0;0;0;9;45;10;0;13;14;32;0;19;15;10;0;8;2;8;4;0;5;3;0;8;5;4;0;19;9;6 64;455;tsy*;Tarsius syrichta (Tarsier Sep. 2013 Tarsius_syrichta-2.0.1/tarSyr2);;;;;9.25;0;6;#;4;6;0;5;7;8;0;4;12;6;0;4;6;7;0;5;3;7;1;32;4;9;0;4;4;12;0;4;3;0;10;0;0;1;10;64;6;1;15;10;7;1;13;9;10;1;25;1;6;6;0;5;3;0;9;6;4;0;14;6;7 27;458;mcc;Macaca mulatta (Rhesus Oct. 2010 BGI CR_1.0/rheMac3);;;;;9.80;0;9;15;8;9;0;5;6;10;5;7;18;10;3;6;11;9;2;6;4;8;0;8;3;9;0;5;4;21;1;10;5;1;23;0;0;0;14;10;12;2;19;16;13;1;14;11;6;0;27;2;8;6;0;5;4;0;8;6;7;0;14;4;8 60;469;mmu;Mus musculus (mm10 Dec 2011);;;;;10.13;0;7;7;4;5;0;4;10;12;1;5;19;8;1;3;12;10;1;3;3;8;1;8;3;11;0;4;4;23;4;11;10;0;11;0;0;1;10;7;12;0;13;14;26;0;16;8;14;1;60;1;8;6;0;5;3;0;8;6;5;2;15;8;7 27;476;pan*;Papio anubis (Baboon Mar. 2012 Baylor Panu_2.0/papAnu2);;;;;10.20;1;13;8;8;8;0;3;11;14;2;6;19;9;1;7;12;9;1;5;3;8;0;6;4;10;0;7;6;20;1;9;5;3;21;0;0;0;10;9;12;2;21;14;15;2;15;13;9;1;27;3;9;7;0;5;4;0;11;6;5;0;20;8;8 46;481;mdo;Monodelphis domestica (opossum) (Broad Oct 2006);;;;;10.58;0;12;2;4;8;0;6;11;13;0;7;25;9;0;5;9;12;0;6;3;11;0;8;3;12;0;7;3;15;0;9;6;0;15;0;0;0;9;7;11;0;13;13;19;1;24;14;13;4;46;0;9;5;0;5;4;0;9;6;5;0;24;11;8 34;485;eeu*;Erinaceus europaeus (Hedgehog May 2012 EriEur2.0/eriEur2);;;;;7.59;0;8;3;6;6;0;3;6;9;0;4;16;7;0;6;4;7;0;3;3;10;0;5;3;9;0;6;4;14;0;10;4;0;13;0;0;0;5;4;8;0;7;11;€;0;13;8;9;0;34;2;7;6;0;5;3;0;7;5;7;0;14;7;5 51;494;ecb;Equus caballus (horse) (Sep 2007);;;;;10.76;0;12;4;6;7;0;5;3;20;0;5;25;12;3;6;15;12;0;4;4;10;0;7;3;9;0;7;3;27;0;11;8;1;14;0;0;1;11;6;12;1;17;15;16;0;10;11;51;0;25;4;7;10;0;4;4;0;12;5;7;0;10;4;8 86;498;cge;Cricetulus griseus cell line CHO-K1 (Chinese hamster ovary CriGri 1.0 Aug 2011);;;;;10.96;0;8;4;4;5;0;4;10;13;0;5;16;13;0;5;9;6;0;3;3;7;0;6;3;8;1;4;4;22;1;15;6;0;11;0;0;0;14;5;11;0;17;15;86;0;15;7;20;0;41;2;6;6;0;6;3;0;9;5;6;1;14;6;7 28;499;vvi;Vitis vinifera (Grapevine 12X);;;;;10.89;0;14;7;13;10;0;9;7;13;1;7;25;14;0;5;9;13;1;7;3;13;0;16;4;10;2;6;3;11;0;28;5;1;17;0;0;1;12;9;10;1;18;11;13;1;18;14;21;0;11;1;10;8;0;5;4;0;9;6;7;0;17;12;6 30;503;ptr;Pan troglodytes (Chimp Feb. 2011 CSAC 2.1.4/panTro4);;;;;10.82;0;15;10;7;9;0;3;6;14;1;5;21;11;1;10;12;11;1;7;4;9;1;8;5;10;0;6;5;30;1;9;5;2;22;0;0;0;10;8;10;1;27;14;19;1;15;15;11;1;27;2;7;7;1;6;5;3;9;6;5;0;13;6;13 29;506;ocu;Oryctolagus cuniculus (rabbit) (Broad Apr 2009);;;;;10.67;0;14;6;3;5;0;4;16;11;1;7;18;12;0;8;14;10;0;4;5;9;0;5;4;8;1;7;5;21;0;9;4;0;12;0;0;0;9;5;15;1;26;12;29;1;23;18;19;0;25;1;10;7;0;4;5;0;10;6;6;21;0;14;16 34;510;yli;Yarrowia lipolytica CLIB122;;;;;11.33;0;17;1;3;21;0;2;13;26;0;1;18;24;0;2;8;21;0;2;4;21;0;3;2;22;0;3;2;30;0;4;2;0;14;0;0;0;12;3;15;0;16;4;34;0;28;6;27;0;8;0;13;1;0;25;0;0;6;4;1;0;30;11;0 33;517;ppy*;Pongo pygmaeus abelii (Orangutan July 2007 WUGSC 2.0.2/ponAbe2);;;;;11.18;0;13;6;6;10;0;3;11;14;4;6;20;10;1;7;18;10;1;6;5;10;0;7;5;12;0;4;7;22;1;9;4;1;19;0;0;0;10;7;13;2;33;20;22;1;13;22;8;0;30;3;6;7;0;6;7;0;8;8;7;0;14;8;10 77;518;csi*;Ceratotherium simum (White rhinoceros May 2012 CerSimSim1.0/cerSim1);;;;;11.40;0;13;5;6;6;0;4;4;13;0;5;26;11;1;7;15;13;0;5;4;10;0;7;4;10;0;8;5;23;0;13;6;0;11;0;0;0;10;5;12;2;14;15;22;1;13;11;77;0;24;1;8;10;0;5;4;0;13;6;7;0;10;4;9 32;540;tng;Tetraodon nigroviridis (tetraodon) (Genoscope 8.0 Mar 2007);;;;;11.91;1;17;5;7;15;0;6;32;16;0;5;20;10;0;4;15;12;1;7;2;11;1;11;4;26;0;10;13;20;0;10;4;0;13;0;0;0;12;9;18;0;17;9;20;0;18;15;13;0;15;1;10;14;0;6;2;0;11;9;9;0;14;14;6 36;554;cpic;Chrysemys picta bellii (Painted turtle Dec. 2011 v3.0.1/chrPic1);;;;;11.87;2;22;13;7;2;1;4;6;11;1;13;16;16;0;5;6;24;0;15;10;12;1;4;2;17;0;18;5;11;1;15;4;1;5;0;0;0;10;16;11;1;17;36;9;0;14;17;5;5;18;4;10;7;0;5;3;3;20;26;10;0;11;24;2 35;575;tru;Takifugu rubripes (Fugu Oct. 2011 FUGU5/fr3);;;;;12.64;1;18;6;9;10;0;4;21;11;0;6;35;19;0;8;25;11;0;7;3;10;0;7;6;18;0;7;7;10;0;8;6;1;13;0;0;1;19;8;12;0;20;19;19;1;22;13;20;0;15;1;16;16;1;7;4;0;17;13;10;0;18;12;4 37;578;sbi;Sorghum bicolor (Version 1.0);;;;;12.56;0;20;4;9;15;0;9;11;17;0;5;37;16;2;4;10;11;3;12;6;14;0;11;7;12;2;9;6;18;0;13;11;1;14;0;0;1;15;11;13;1;16;9;18;2;24;13;23;0;13;1;13;15;0;4;7;0;13;7;10;0;24;10;6 40;582;mtr;Medicago truncatula (March 2009 Version 3.0);;;;;12.47;0;26;7;14;9;0;10;4;19;0;10;40;17;3;7;7;12;2;8;2;7;0;11;1;10;4;10;1;25;0;16;3;1;12;0;0;0;17;17;5;9;28;18;16;0;28;19;11;0;10;1;14;12;0;5;3;0;15;8;6;1;23;15;3 34;596;cel;Caenorhabditis elegans (WS220 Oct 2010);;;;;13.18;0;15;4;7;20;0;3;5;21;0;7;19;19;0;5;6;15;0;9;6;6;0;31;4;17;0;11;7;22;0;9;4;0;19;0;0;0;19;20;7;0;20;14;30;0;27;17;24;0;13;2;12;18;0;8;1;1;9;8;4;0;14;34;3 40;618;pop;Populus trichocarpa (Jan 2010 Version 2.0) ;;;;;13.53;4;18;7;3;40;1;0;7;20;1;9;26;17;0;8;10;13;1;9;5;14;0;22;4;6;0;11;4;20;0;18;5;0;18;0;0;0;13;11;11;0;22;17;17;0;33;14;21;1;13;1;14;10;0;7;5;0;16;11;11;0;25;17;7 40;622;hsa;Homo sapiens (hg38 - GRCh38 Dec 2013);;;;;13.31;0;18;8;12;12;0;4;11;19;6;5;22;11;1;8;21;12;1;6;5;10;1;8;4;10;0;6;7;35;1;10;5;5;32;0;0;0;10;18;24;2;40;20;24;1;16;17;10;1;38;3;8;7;0;6;4;1;8;7;5;0;15;9;12 55;639;bdi;Brachypodium distachyon (JGI v1.0 8X);;;;;13.82;0;18;4;15;14;0;10;8;20;2;4;55;15;3;5;11;11;4;10;5;15;0;18;8;9;3;10;6;19;0;12;11;1;17;0;0;3;21;15;11;0;16;12;18;0;25;15;19;0;14;0;18;16;1;5;6;0;18;9;9;0;27;9;9 43;674;oni*;Oreochromis niloticus (Nile tilapia Jan. 2011 Broad oreNil1.1/oreNil2);;;;;14.80;0;23;12;7;14;0;7;16;25;0;25;27;8;0;9;9;10;0;10;6;14;0;11;4;18;1;25;8;18;0;11;12;3;18;0;0;0;23;6;11;0;9;16;43;0;10;14;15;1;42;1;12;16;0;7;6;2;10;27;18;0;13;12;9 83;684;ath;Arabidopsis thaliana (TAIR10 Feb 2011);;;;;15.00;0;17;6;12;12;1;11;3;17;2;5;32;14;2;7;8;37;3;12;7;15;0;47;5;10;1;9;5;16;0;10;7;0;83;0;0;0;12;10;9;0;19;15;17;0;29;14;13;0;17;0;16;11;0;6;4;0;16;10;8;0;25;12;5 56;738;osa;Oryza sativa;;;;;15.67;0;20;4;19;15;0;10;10;18;0;5;56;17;16;4;10;12;4;17;8;14;0;14;9;11;8;15;5;20;1;10;12;2;19;0;0;0;26;21;10;0;29;12;20;1;31;16;25;1;17;0;18;24;0;4;8;0;20;12;11;0;28;9;10 36;738;gmx;Glycine max (soybean) (Wm82.a2);;;;;16.31;0;22;9;18;16;0;10;7;31;0;8;36;22;1;9;13;15;0;11;6;21;0;27;5;9;1;10;4;24;0;17;8;0;21;0;0;0;18;13;13;2;22;20;22;0;33;16;24;0;14;0;18;13;0;9;5;0;28;18;13;0;29;18;9 42;743;cbr;Caenorhabditis briggsae (C. briggsae Jan. 2007 WUGSC 1.0/cb3);;;;;16.51;0;22;6;11;26;0;5;7;21;0;24;23;25;0;6;6;17;0;8;8;6;0;41;4;22;0;10;9;29;0;14;7;0;19;0;0;0;21;24;10;0;23;16;40;0;34;19;30;0;16;0;13;22;0;10;0;0;9;10;2;0;21;42;5 37;749;mpu*;Mustela putorius furo (Ferret Apr. 2011 MusPutFur1.0/musFur1);;;;;10.68;0;11;4;6;6;0;4;5;10;0;5;20;8;0;6;7;8;0;4;4;9;0;7;2;10;0;7;5;15;0;8;5;0;9;0;0;1;7;37;17;6;12;31;€;0;8;7;19;0;25;1;11;6;0;29;5;0;12;16;21;0;9;9;4 48;804;str*;Spermophilus tridecemlineatus (Squirrel Nov. 2011 Broad/speTri2);;;;;11.02;1;10;3;10;6;0;3;4;14;6;4;14;18;3;5;39;15;1;7;6;12;1;7;3;34;5;6;7;€;31;39;18;0;9;0;0;0;6;4;6;1;9;10;12;6;8;5;7;0;48;1;7;6;0;5;3;0;7;5;6;7;13;5;20 97;807;ssc;Sus scrofa (Pig Aug. 2011 SGSC Sscrofa10.2/susScr3);;;;;12.68;0;21;4;6;8;0;5;5;13;0;5;23;10;1;11;12;10;0;5;4;9;0;4;3;13;0;8;4;23;0;14;7;0;17;0;0;0;10;9;12;2;18;38;16;10;97;€;13;1;23;0;7;7;0;5;3;0;10;7;4;0;19;10;6 47;827;cja*;Caenorhabditis japonica (WUGSC 3.0.2 Mar 2008);;;;;18.33;1;24;5;7;26;0;6;12;26;0;7;30;23;0;7;13;19;0;7;15;9;0;43;8;24;0;12;11;31;0;11;8;0;24;0;0;0;17;14;16;0;23;30;37;0;41;20;40;0;15;1;18;21;0;11;1;0;15;12;3;0;34;47;2 83;856;oaa;Ornithorhynchus anatinus (platypus) (WUGSC 5.0.1 Mar 2007);;;;;18.56;1;24;10;10;8;0;7;18;27;0;10;32;23;1;15;10;16;4;6;8;19;4;12;7;23;1;18;10;83;0;17;11;0;28;0;0;1;24;11;19;0;21;32;25;0;27;16;27;0;37;5;14;12;0;7;14;2;18;6;9;2;40;15;9 43;906;cfa;Canis familiaris (dog) (CanFam3.1 Sept 2011);;;;;11.23;0;10;4;5;4;0;4;7;9;0;5;23;6;0;5;8;10;0;5;8;8;0;8;4;8;0;4;5;14;0;11;4;0;9;0;0;0;9;43;20;1;21;34;€;2;13;15;22;0;21;1;6;6;0;15;4;0;8;9;29;0;11;11;9 82;1065;spu;Strongylocentrotus purpuratus (Sea urchin) ;;;;;23.56;2;0;14;2;18;0;8;5;69;2;22;73;20;0;11;16;25;0;15;6;19;0;21;9;27;0;21;9;32;0;17;7;0;24;0;0;0;26;17;21;0;39;57;42;0;82;26;29;0;31;0;18;29;0;19;1;1;17;18;19;0;42;33;4 66;1095;cbr*;Caenorhabditis brenneri (WUGSC 6.0.1 Feb 2008);;;;;24.07;0;24;7;14;32;0;8;8;33;1;26;29;33;0;8;15;20;0;14;9;25;2;54;9;31;1;15;10;35;0;11;6;2;28;0;0;1;26;40;11;0;33;29;49;0;34;36;37;2;21;3;22;32;0;17;24;0;14;13;11;0;39;66;25 66;1119;dno*;Dasypus novemcinctus (Armadillo Dec. 2011 Baylor/dasNov3);;;;;15.86;0;12;8;8;5;0;3;10;12;1;6;30;12;1;16;#;10;0;6;6;7;0;7;4;11;0;8;7;23;2;66;17;0;14;0;0;1;10;5;10;0;23;18;43;0;21;20;45;0;22;1;15;10;0;8;5;0;10;9;47;24;19;€;34 61;1176;oas;Ovis aries (sheep) (Feb 2010);;;;;12.50;1;6;5;7;6;0;2;3;6;0;5;18;7;0;8;9;2;3;4;3;4;0;6;1;5;0;5;3;18;3;12;7;2;16;0;0;0;8;7;9;0;13;22;16;2;8;€;60;16;61;4;47;2;2;6;6;0;7;22;33;5;30;€;€ 82;1198;zma;Zea mays (Version 5b.60);;;;;23.18;1;25;5;20;29;0;9;13;69;0;5;79;22;12;4;16;13;22;11;6;15;0;31;9;20;13;14;6;66;0;15;22;0;21;0;0;1;26;22;13;0;49;82;€;1;42;22;30;1;25;0;27;35;0;7;6;0;14;9;11;0;33;11;11 55;1463;aml;Ailuropoda melanoleuca (panda) (BGI-Shenzhen AilMel 1.0 Dec 2009);;;;;13.84;0;11;5;9;7;0;5;7;12;0;6;24;10;0;7;9;10;0;6;4;9;0;11;5;10;0;9;10;17;0;9;5;0;11;0;0;0;8;43;25;6;28;55;€;1;11;11;37;0;25;2;10;8;1;#;7;2;13;17;45;0;10;7;7 63;1492;gmo*;Gadus morhua (Atlantic cod May 2010 Genofisk GadMor_May2010/gadMor1);;;;;30.05;6;36;16;15;33;0;24;47;26;0;18;€;21;0;9;28;30;0;18;14;55;0;21;22;30;0;30;30;55;1;24;26;0;50;0;0;1;26;11;45;2;34;63;43;1;30;51;50;0;27;2;29;31;2;17;10;1;41;21;28;0;30;39;18 76;2002;lav;Loxodonta africana (elephant) (Broad/July 2009);;;;;25.95;1;32;15;17;22;0;11;10;43;0;7;50;41;1;50;35;29;0;7;4;16;0;14;3;14;1;22;10;54;0;53;15;1;19;0;0;3;27;14;28;4;51;60;36;0;20;€;24;1;28;24;23;14;0;18;3;3;76;#;16;4;33;€;# 40;2017;tma*;Trichechus manatus latirostris (Manatee Oct. 2011 Broad v1.0/triMan1);;;;;13.98;1;11;6;10;8;0;5;5;13;1;8;21;11;0;26;16;14;0;6;4;11;0;8;3;16;1;18;4;20;1;40;6;1;15;0;0;0;12;8;10;1;23;31;16;1;15;€;19;5;22;18;13;8;0;12;7;5;36;€;13;9;23;€;# 90;2485;pma*;Petromyzon marinus (Lamprey Sep. 2010 WUGSC 7.0/petMar2);;;;;34.89;2;57;5;#;€;0;40;#;€;0;10;€;€;1;26;#;22;0;20;35;54;0;43;21;62;19;19;23;€;0;31;24;0;90;0;0;1;27;44;€;0;€;24;23;2;90;12;11;0;68;1;9;85;1;26;10;0;65;18;50;1;54;17;6 99;2489;gac*;Gasterosteus aculeatus (stickleback) (Broad 1.0 Feb 2006);;;;;41.18;0;35;12;7;49;0;17;9;€;0;61;€;21;1;12;18;52;0;62;29;63;0;29;18;99;0;35;23;53;0;53;56;0;17;0;0;0;52;60;81;1;€;61;97;0;€;46;53;0;€;1;74;49;0;#;2;0;30;68;26;0;12;61;4 99;2639;xtr;Xenopus tropicalis (frog) (JGI 4.2 Nov 2009);;;;;50.41;2;58;#;22;38;2;25;32;63;5;51;€;55;0;36;53;40;3;41;23;60;1;53;36;€;0;91;29;67;0;47;36;0;€;0;0;1;42;28;40;1;47;72;97;0;59;84;51;2;92;1;33;33;3;33;8;0;99;€;27;0;85;80;€ 68;3729;fca;Felis catus (cat) (Felis_catus-6.2 Sept 2011);;;;;19.40;1;12;19;8;6;0;33;5;10;0;9;24;8;0;6;9;8;1;14;5;8;1;68;7;9;0;13;9;18;1;10;7;0;10;0;0;2;16;€;47;5;28;50;€;1;9;15;44;1;32;18;23;9;9;€;24;2;12;54;53;2;10;48;6 78;4040;bta;Bos taurus (Cow Jun. 2014 Bos_taurus_UMD_3.1.1/bosTau8);;;;;22.58;6;30;10;14;11;0;5;6;18;0;8;35;20;0;21;39;13;32;7;7;13;0;9;4;14;1;10;7;31;2;35;16;11;39;0;0;4;19;20;40;0;30;78;40;6;42;€;€;143;€;29;€;13;7;12;16;4;19;44;€;20;63;€;€ 74;5845;ttr*;Tursiops truncatus (Dolphin Oct. 2011 Baylor Ttru_1.4/turTru2);;;;;16.73;0;12;6;7;6;0;4;6;11;0;5;17;8;3;16;22;12;0;6;4;7;0;5;4;9;1;6;3;19;2;36;21;1;18;0;0;0;9;16;15;0;13;74;19;10;49;€;€;6;22;21;€;7;1;7;12;0;11;48;54;19;43;€;€ 86;7080;bacu;Balaenoptera acutorostrata scammoni (Minke whale Oct. 2013 BalAcu1.0/balAcu1);;;;;18.77;0;13;13;8;6;0;4;7;12;1;8;21;14;1;18;32;10;1;5;4;7;0;5;4;13;0;8;4;20;0;42;20;0;14;0;0;0;11;10;20;0;24;86;29;20;45;€;€;2;24;17;€;9;0;9;21;0;13;55;#;12;64;€;€ 94;13727;cmk;Callorhinchus milii (Elephant shark Dec. 2013 Callorhinchus_milii-6.1.3/calMil1);;;;;32.70;3;35;13;31;20;2;20;25;31;0;23;94;22;16;€;€;26;1;54;48;12;6;51;41;24;12;€;€;75;168;€;€;1;36;0;0;1;37;7;18;2;48;43;36;6;49;66;€;1;15;3;30;9;0;25;2;0;33;14;12;2;19;66;# ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg ;;;total du diagramme;;;;;;45;1,461;617;774;973;22;561;782;1,592;70;675;2,065;1,377;94;645;1,007;1,266;99;715;551;1,123;25;1,244;476;1,376;83;847;535;2,162;240;1,241;682;50;1,554;0;0;34;1,239;1,175;1,210;72;1,748;1,880;2,044;93;2,061;1,303;1,656;209;1,958;249;1,088;1,153;33;656;428;36;1,265;1,051;912;138;2,017;1,185;541 Codons forts;;;pente;;;;;;;1.139;0.463;0.574;0.853;;0.504;0.627;1.334;;0.668;2.025;1.02;;0.591;0.905;0.946;;0.699;0.511;0.991;;1.062;0.469;1.188;;0.848;0.491;1.728;;1.079;0.673;;1.293;;;;0.998;0.925;1.065;;1.442;1.669;1.738;;1.69;1.233;1.375;;1.603;-;0.941;0.948;;0.606;0.321;;1.174;0.964;0.808;;1.476;1.263;0.485 ;;;somme calculée;;;;;;;-;23.3;20.0244;29.8;;-;21.9;101.5;;-;317.0;35.6;;19.3;75.5;-;;-;-;-;;-;-;59.9;;27.7;16.1;79.3;;35.3;22.0;;65.2;;;;-;17.9;37.2;;109.7;-;149.3;;69.6;151.9;124.8;;102.2;-;54.6;-;;45.1;-;;-;87.1;33.4;;-;159.6;93.9 ;;;Totaux + calculés;;;;;;;1,461;640;794;1,003;;561;804;1,693;;675;2,382;1,413;;664;1,083;1,266;;715;551;1,123;;1,244;476;1,436;;875;551;2,241;;1,276;704;;1,619;0;0;;1,239;1,193;1,247;;1,858;1,880;2,193;;2,131;1,455;1,781;;2,060;249;1,143;1,153;;701;428;;1,265;1,138;945;;2,017;1,345;635 ;;;R2;;;;;;;914;734;775;807;;748;697;847;;740;892;840;;723;793;881;;758;743;816;;713;743;803;;788;866;863;;748;809;;748;;;;938;614;822;;913;770;845;;791;880;728;;743;;815;760;;801;570;;797;666;594;;818;795;597 Codons faibles;;;c/t nombre >3;;;;;;3;;;;;0;;;;6;;;;3;;;;5;;;;2;;;;6;;;;4;;;2;;;;2;;;;5;;;;6;;;;7;;;;;2;;;2;;;;9;;; ;;;c/t nombre >3, total;;;;;;16;;;;;0;;;;35;;;;44;;;;66;;;;10;;;;61;;;;209;;;16;;;;9;;;;30;;;;58;;;;184;;;;;16;;;9;;;;120;;; ;;;reste calculé;;;;;;32;;;;;22;;;;41;;;;53;;;;38;;;;17;;;;28;;;;35;;;36;;;;27;;;;47;;;;41;;;;32;;;;;19;;;29;;;;27;;; ;;;multiplicité X 100;;;;;;26;;;;;18;;;;34;;;;44;;;;31;;;;14;;;;23;;;;29;;;30;;;;22;;;;39;;;;34;;;;26;;;;;16;;;24;;;;22;;; ;;;c/t nombre=3;;;;;;1;;;;;0;;;;1;;;;6;;;;4;;;;0;;;;1;;;;1;;;2;;;;2;;;;1;;;;0;;;;0;;;;;2;;;3;;;;0;;; Totaux des 121 réduits;;;;;;;;55829.6931801242;32;1,461;640;794;1,003;22;561;804;1,693;41;675;2,382;1,413;53;664;1,083;1,266;38;715;551;1,123;17;1,244;476;1,436;28;875;551;2,241;35;1,276;704;36;1,619;0;0;27;1,239;1,193;1,247;47;1,858;1,880;2,193;41;2,131;1,455;1,781;32;2,060;249;1,143;1,153;19;701;428;29;1,265;1,138;945;27;2,017;1,345;635 Données non modifiées;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 64;455;tsy*;Tarsius syrichta (Tarsier Sep. 2013 Tarsius_syrichta-2.0.1/tarSyr2);;;;;9.0;0;6;42;4;6;0;5;7;8;0;4;12;6;0;4;6;7;0;5;3;7;1;32;4;9;0;4;4;12;0;4;3;0;10;0;0;1;10;64;6;1;15;10;7;1;13;9;10;1;25;1;6;6;0;5;3;0;9;6;4;0;14;6;7 149;485;eeu*;Erinaceus europaeus (Hedgehog May 2012 EriEur2.0/eriEur2);;;;;10.7;0;8;3;6;6;0;3;6;9;0;4;16;7;0;6;4;7;0;3;3;10;0;5;3;9;0;6;4;14;0;10;4;0;13;0;0;0;5;4;8;0;7;11;149;0;13;8;9;0;34;2;7;6;0;5;3;0;7;5;7;0;14;7;5 271;749;mpu*;Mustela putorius furo (Ferret Apr. 2011 MusPutFur1.0/musFur1);;;;;16.5;0;11;4;6;6;0;4;5;10;0;5;20;8;0;6;7;8;0;4;4;9;0;7;2;10;0;7;5;15;0;8;5;0;9;0;0;1;7;37;17;6;12;31;271;0;8;7;19;0;25;1;11;6;0;29;5;0;12;16;21;0;9;9;4 256;804;str*;Spermophilus tridecemlineatus (Squirrel Nov. 2011 Broad/speTri2);;;;;16.5;1;10;3;10;6;0;3;4;14;6;4;14;18;3;5;39;15;1;7;6;12;1;7;3;34;5;6;7;256;31;39;18;0;9;0;0;0;6;4;6;1;9;10;12;6;8;5;7;0;48;1;7;6;0;5;3;0;7;5;6;7;13;5;20 235;807;ssc;Sus scrofa (Pig Aug. 2011 SGSC Sscrofa10.2/susScr3);;;;;17.6;0;21;4;6;8;0;5;5;13;0;5;23;10;1;11;12;10;0;5;4;9;0;4;3;13;0;8;4;23;0;14;7;0;17;0;0;0;10;9;12;2;18;38;16;10;97;235;13;1;23;0;7;7;0;5;3;0;10;7;4;0;19;10;6 408;906;cfa;Canis familiaris (dog) (CanFam3.1 Sept 2011);;;;;20.0;0;10;4;5;4;0;4;7;9;0;5;23;6;0;5;8;10;0;5;8;8;0;8;4;8;0;4;5;14;0;11;4;0;9;0;0;0;9;43;20;1;21;34;408;2;13;15;22;0;21;1;6;6;0;15;4;0;8;9;29;0;11;11;9 326;1119;dno*;Dasypus novemcinctus (Armadillo Dec. 2011 Baylor/dasNov3);;;;;24.2;0;12;8;8;5;0;3;10;12;1;6;30;12;1;16;81;10;0;6;6;7;0;7;4;11;0;8;7;23;2;66;17;0;14;0;0;1;10;5;10;0;23;18;43;0;21;20;45;0;22;1;15;10;0;8;5;0;10;9;47;24;19;326;34 341;1176;oas;Ovis aries (sheep) (Feb 2010);;;;;25.3;1;6;5;7;6;0;2;3;6;0;5;18;7;0;8;9;2;3;4;3;4;0;6;1;5;0;5;3;18;3;12;7;2;16;0;0;0;8;7;9;0;13;22;16;2;8;139;60;16;61;4;47;2;2;6;6;0;7;22;33;5;30;133;341 127;1198;zma;Zea mays (Version 5b.60);;;;;25.5;1;25;5;20;29;0;9;13;69;0;5;79;22;12;4;16;13;22;11;6;15;0;31;9;20;13;14;6;66;0;15;22;0;21;0;0;1;26;22;13;0;49;82;127;1;42;22;30;1;25;0;27;35;0;7;6;0;14;9;11;0;33;11;11 772;1463;aml;Ailuropoda melanoleuca (panda) (BGI-Shenzhen AilMel 1.0 Dec 2009);;;;;32.2;0;11;5;9;7;0;5;7;12;0;6;24;10;0;7;9;10;0;6;4;9;0;11;5;10;0;9;10;17;0;9;5;0;11;0;0;0;8;43;25;6;28;55;772;1;11;11;37;0;25;2;10;8;1;84;7;2;13;17;45;0;10;7;7 154;1492;gmo*;Gadus morhua (Atlantic cod May 2010 Genofisk GadMor_May2010/gadMor1);;;;;32.8;6;36;16;15;33;0;24;47;26;0;18;154;21;0;9;28;30;0;18;14;55;0;21;22;30;0;30;30;55;1;24;26;0;50;0;0;1;26;11;45;2;34;63;43;1;30;51;50;0;27;2;29;31;2;17;10;1;41;21;28;0;30;39;18 619;2002;lav;Loxodonta africana (elephant) (Broad/July 2009);;;;;43.5;1;32;15;17;22;0;11;10;43;0;7;50;41;1;50;35;29;0;7;4;16;0;14;3;14;1;22;10;54;0;53;15;1;19;0;0;3;27;14;28;4;51;60;36;0;20;114;24;1;28;24;23;14;0;18;3;3;76;90;16;4;33;619;72 1073;2017;tma*;Trichechus manatus latirostris (Manatee Oct. 2011 Broad v1.0/triMan1);;;;;43.8;1;11;6;10;8;0;5;5;13;1;8;21;11;0;26;16;14;0;6;4;11;0;8;3;16;1;18;4;20;1;40;6;1;15;0;0;0;12;8;10;1;23;31;16;1;15;114;19;5;22;18;13;8;0;12;7;5;36;123;13;9;23;1073;90 278;2485;pma*;Petromyzon marinus (Lamprey Sep. 2010 WUGSC 7.0/petMar2);;;;;53.7;2;57;5;42;112;0;40;75;110;0;10;278;166;1;26;71;22;0;20;35;54;0;43;21;62;19;19;23;106;0;31;24;0;90;0;0;1;27;44;108;0;168;24;23;2;90;12;11;0;68;1;9;85;1;26;10;0;65;18;50;1;54;17;6 286;2489;gac*;Gasterosteus aculeatus (stickleback) (Broad 1.0 Feb 2006);;;;;55.2;0;35;12;7;49;0;17;9;101;0;61;286;21;1;12;18;52;0;62;29;63;0;29;18;99;0;35;23;53;0;53;56;0;17;0;0;0;52;60;81;1;123;61;97;0;184;46;53;0;107;1;74;49;0;79;2;0;30;68;26;0;12;61;4 151;2639;xtr;Xenopus tropicalis (frog) (JGI 4.2 Nov 2009);;;;;57.2;2;58;46;22;38;2;25;32;63;5;51;138;55;0;36;53;40;3;41;23;60;1;53;36;151;0;91;29;67;0;47;36;0;107;0;0;1;42;28;40;1;47;72;97;0;59;84;51;2;92;1;33;33;3;33;8;0;99;105;27;0;85;80;105 1201;3729;fca;Felis catus (cat) (Felis_catus-6.2 Sept 2011);;;;;81.9;1;12;19;8;6;0;33;5;10;0;9;24;8;0;6;9;8;1;14;5;8;1;68;7;9;0;13;9;18;1;10;7;0;10;0;0;2;16;782;47;5;28;50;887;1;9;15;44;1;32;18;23;9;9;1,201;24;2;12;54;53;2;10;48;6 1295;4040;bta;Bos taurus (Cow Jun. 2014 Bos_taurus_UMD_3.1.1/bosTau8);;;;;83.9;6;30;10;14;11;0;5;6;18;0;8;35;20;0;21;39;13;32;7;7;13;0;9;4;14;1;10;7;31;2;35;16;11;39;0;0;4;19;20;40;0;30;78;40;6;42;435;164;143;338;29;178;13;7;12;16;4;19;44;116;20;63;391;1,295 1901;5845;ttr*;Tursiops truncatus (Dolphin Oct. 2011 Baylor Ttru_1.4/turTru2);;;;;128.5;0;12;6;7;6;0;4;6;11;0;5;17;8;3;16;22;12;0;6;4;7;0;5;4;9;1;6;3;19;2;36;21;1;18;0;0;0;9;16;15;0;13;74;19;10;49;1,901;395;6;22;21;217;7;1;7;12;0;11;48;54;19;43;833;1,766 2368;7080;bacu;Balaenoptera acutorostrata scammoni (Minke whale Oct. 2013 BalAcu1.0/balAcu1);;;;;156.1;0;13;13;8;6;0;4;7;12;1;8;21;14;1;18;32;10;1;5;4;7;0;5;4;13;0;8;4;20;0;42;20;0;14;0;0;0;11;10;20;0;24;86;29;20;45;2,368;468;2;24;17;256;9;0;9;21;0;13;55;67;12;64;987;2,148 5898;13727;cmk;Callorhinchus milii (Elephant shark Dec. 2013 Callorhinchus_milii-6.1.3/calMil1);;;;;300.1;3;35;13;31;20;2;20;25;31;0;23;94;22;16;145;1,540;26;1;54;48;12;6;51;41;24;12;206;137;75;168;5,898;3,858;1;36;0;0;1;37;7;18;2;48;43;36;6;49;66;428;1;15;3;30;9;0;25;2;0;33;14;12;2;19;66;81 1045;12258;dre;Danio rerio (Zebrafish) (Zv8 Apr 2009);;;;;268.8;10;197;73;241;270;4;244;300;258;10;75;522;232;6;230;227;336;2;209;80;315;2;205;180;359;10;290;66;92;4;368;112;5;236;0;0;10;387;105;266;24;1,045;525;953;1;150;225;245;9;136;14;44;203;24;107;59;14;424;252;104;11;836;47;268 ;92530;;Total des 121 eucaryotes non réduits;;;;;;45;1461;705;816;1085;22;561;857;1803;70;675;2921;1543;94;790;2699;1266;99;715;551;1123;25;1244;476;1527;83;1053;672;2524;240;7139;4540;50;1661;0;0;34;1239;1957;1318;72;2039;1880;4658;93;2245;6609;3111;209;2403;249;1739;1153;33;2020;428;36;1265;1369;1095;138;2017;5547;6439
Lignes et colonnes 121 eucaryotes
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Lignes et colonnes 121 eucaryotes
- Liens: Calculs pour 121 eucaryotes, Tableau des effectifs calculés des 121 eucaryotes
- Légende: Les moyennes des codons de la 3ème base appartenant aux doublets ayant la même 1ère base (ligne) ou ayant la même 2ème base (colonne) sont faites sur 4 codons ou sur 3 codons seulement quand on rencontre les codons stop (taa tag) ou le codon ata lorsqu'il est trop faible ( sauf celui des eucaryotes) ou le codon atg à effectif très élevé (sauf celui des eucaryotes). La moyenne des lignes et colonnes est faite sur 12 codons ou seulement 10 quand on rencontre les codons taa tag ata atg. Quand les codons xyt ont des effectifs élevés ils sont permutés avec les codons xyc ( 1 permutation chez les bactéries et 8 chez les eucaryotes). Aussi les lignes et colonnes xyt contiennent les valeurs faibles après permutation et les lignes et colonnes xyc contiennent les valeurs fortes après permutation.
- n pour nombre de codons, mcod pour moyenne des codons, Lig. pour ligne, Col. pour colonne et car. pour carré ou doublet.
- txt, c, a, g pour respectivement les 4 codons "ttt tct tat tgt" de la 3ème base t, les 4 codons "ttc tcc tac tgc" de la 3ème base c . . . etc. (Ligne Lig.)
- xtt, c, a, g pour respectivement les 4 codons "ttt ctt att gtt" de la 3ème base t, les 4 codons "ttc ctc atc gtc" de la 3ème base c . . . etc. (colonne Col.)
- Tableaux non formatés: voir tableur
IV LC;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;;V LC;Danio rerio (Zebrafish) ;;;;;;I LC;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries;;;; Lignes;;;Colon;;55 830;;Lignes;;;Colon;;12 258;;Lignes;;;Colon;;235 027 txt;4;62;xtt;4;66;;txt;4;53;xtt;4;61;;txt;4;2;xtt;4;42 c;4;2,869;c;4;2,494;;c;4;1,846;c;4;1,952;;c;4;2,289;c;4;2,509 a;3;958;a;4;1,137;;a;3;805;a;4;1,269;;a;3;1,612;a;3;2,631 g;3;1,485;g;4;1,833;;g;3;993;g;4;2,039;;g;3;1,558;g;3;1,489 cxt;4;38;xct;4;53;;cxt;4;82;xct;4;37;;cxt;4;76;xct;4;13 c;4;2,023;c;4;2,716;;c;4;2,396;c;4;2,248;;c;4;1,998;c;4;1,696 a;4;1,656;a;4;1,840;;a;4;1,348;a;4;2,186;;a;4;1,879;a;4;2,852 g;4;1,323;g;4;1,022;;g;4;1,642;g;4;893;;g;4;1,395;g;4;935 axt;4;65;xat;4;68;;axt;4;118;xat;4;82;;axt;4;12;xat;4;1 c;4;2,800;c;4;3,066;;c;4;4,254;c;4;3,708;;c;4;2,862;c;4;3,076 a;4;2,045;a;3;2,703;;a;4;2,329;a;3;2,325;;a;3;2,806;a;3;3,570 g;4;2,719;g;3;3,117;;g;4;3,355;g;3;3,981;;g;3;1,225;g;3;880 gxt;4;70;xgt;4;48;;gxt;4;45;xgt;4;118;;gxt;4;1;xgt;4;36 c;4;3,494;c;4;2,908;;c;4;2,672;c;4;3,261;;c;4;2,861;c;4;2,728 a;4;2,123;a;4;1,537;;a;4;1,774;a;4;857;;a;4;3,642;a;4;1,332 g;4;1,882;g;4;1,411;;g;4;1,738;g;4;969;;g;4;659;g;4;1,430 moyenne;;;;;;;Moyenne;;;;;;;Moyenne;;;;; Lignes;;ttt;ctt;att;gtt;;Lignes;;ttt;ctt;att;gtt;;Lignes;;ttt;ctt;att;gtt ;n;10;12;12;12;;;n;10;12;12;12;;;n;10;12;10;12 ;mcod;1,880;1,668;2,521;2,499;;;mcod;1,278;1,795;3,313;2,061;;;mcod;1,867;1,757;2,354;2,387 moyenne;;;;;;;Moyenne;;;;;;;Moyenne;;;;; Colon;;ttt;tct;tat;tgt;;Colon;;ttt;tct;tat;tgt;;Colon;;ttt;tct;tat;tgt ;n;12;12;10;12;;;n;12;12;10;12;;;n;10;12;10;12 ;mcod;1,966;1,860;2,973;1,952;;;mcod;1,950;1,776;3,375;1,695;;;mcod;2,239;1,828;2,566;1,830 Totaux;;;;;;;Totaux;;;;;;;Totaux;;;;; carrés;1000;t;c;a;g;;carrés;1000;t;c;a;g;;carrés;1000;t;c;a;g ;t;5.24;4.60;2.96;6.24;;;t;4.25;5.12;1.97;1.66;;;t;6.32;5.30;2.73;4.32 ;c;4.28;5.12;6.64;4.12;;;c;6.67;5.73;6.27;3.21;;;c;6.10;4.42;5.74;5.13 ;a;8.58;5.18;10.71;6.05;;;a;7.06;5.91;20.78;6.48;;;a;11.61;5.64;8.64;5.39 ;g;5.75;7.62;9.69;7.21;;;g;5.67;4.70;5.07;9.48;;;g;6.22;6.63;8.55;7.26
Demi-doublets des 121 eucaryotes
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Demi-doublets des 121 eucaryotes
- Légende:
- − 155 eucaryotes, tableau des demi-doublets sur les effectifs des 155 eucaryotes avant sélection des 121.
- − 121 eucaryotes 92530: tableau des demi-doublets sur les effectifs des 121 eucaryotes avant calcul sur les tRNAs surexprimés.
- − 121 eucaryotes 55830: tableau des demi-doublets sur les effectifs des 121 eucaryotes après calcul sur les tRNAs surexprimés.
- − g/a: rapport des codons xyg sur xya de la ligne x et de la colonne y du tableau des effectifs, 1.4 rapport inverse de g/a.
- − t/c: rapport des codons xyc sur xyt de la ligne x et de la colonne y du tableau des effectifs, 16 rapport inverse de t/c.
- − t c a g: colonnes du tableau des effectifs
155 eucaryotes;;;115 111;;;121 eucaryotes;;;92530;;;121 eucaryotes;;;55830; ;t;c;a;g;;;t;c;a;g;;;t;c;a;g t/c;29;16;14;12;;t/c;32;13;33;11;;t/c;46;33;45;64 g/a;1.4;1.4;−;7.1;;g/a;1.2;1.3;−;7.0;;g/a;1.2;1.3;−;4.6 t/c;43;48;40;28;;t/c;49;45;36;35;;t/c;46;66;46;61 g/a;1.5;2.2;1.2;4.5;;g/a;1.5;2.6;1.5;4.7;;g/a;1.4;2.6;1.05;1.6 t/c;25;14;24;36;;t/c;26;18;28;35;;t/c;41;51;40;44 g/a;4.5;1.8;2.3;1.4;;g/a;4.3;1.6;2.5;1.3;;g/a;3.5;1.6;1.2;1.2 t/c;19;7.3;28;25;;t/c;16;11;24;15;;t/c;27;64;52;75 g/a;2.9;1.6;1.9;1.3;;g/a;3.4;1.6;2.1;1.2;;g/a;1.6;1.8;1.2;2.1
Moyennes des doublets 12 23 13
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Moyennes des doublets 12 23 13
- Légende
- Doublets 23 avec processus E
;IV 1 121 eucaryotes;;;;;I 1 4032 bactéries;;;;;IV 1;Duplications processus E;;;;II 1;184 Archées;; doublet;.tt;.ct;.at;.gt;doublet;.tt;.ct;.at;.gt;doublet;.tt;.ct;.at;.gt;doublet;.tt;.ct;.at;.gt m;0.31;0.24;0.31;0.22;m;0.20;0.14;0.08;0.04;m;0.28;0.24;0.31;0.20;m;0.27;0;0;0.41 e;0.11;0.08;0.07;0.05;e;0.10;0.10;0.05;0.03;e;0.15;0.08;0.07;0.09;e;0.31;;;0.52 %;36;32;22;21;%;51;71;68;69;%;52;34;22;43;%;115;;;128 doublet;.tc;.cc;.ac;.gc;doublet;.tc;.cc;.ac;.gc;doublet;.tc;.cc;.ac;.gc;doublet;.tc;.cc;.ac;.gc m;11.51;12.53;14.15;13.42;m;1.46;0.99;1.79;1.59;m;10.05;11.54;12.35;11.83;m;1.16;1.00;1.10;1.24 e;2.37;4.13;3.13;3.98;e;0.60;0.21;0.51;0.59;e;1.89;4.06;2.64;3.94;e;0.01;0.05;0.09;0.29 %;21;33;22;30;%;41;21;28;37;%;19;35;21;33;%;1;5;8;23 doublet;.ta;.ca;.aa;.ga;doublet;.ta;.ca;.aa;.ga;doublet;.ta;.ca;.aa;.ga;doublet;.ta;.ca;.aa;.ga m;5.25;8.49;12.47;8.77;m;1.53;1.66;2.08;0.93;m;4.09;6.83;10.39;7.84;m;1.02;1.12;1.13;1.01 e;0.43;2.29;2.87;2.72;e;0.58;0.58;0.44;0.62;e;1.04;1.99;2.59;2.11;e;0.02;0.19;0.11;0.01 %;8;27;23;31;%;38;35;21;67;%;26;29;25;27;%;2;17;9;1 doublet;.tg;.cg;.ag;.gg;doublet;.tg;.cg;.ag;.gg;doublet;.tg;.cg;.ag;.gg;doublet;.tg;.cg;.ag;.gg m;7.39;4.71;14.38;6.51;m;0.87;0.54;0.51;0.83;m;6.52;4.17;13.87;5.68;m;0.89;0.86;0.89;0.87 e;1.36;0.79;3.92;2.63;e;0.49;0.17;0.15;0.21;e;1.83;0.93;3.93;2.49;e;0.03;0.05;0.02;0.10 %;18;17;27;40;%;57;32;28;26;%;28;22;28;44;%;3;5;2;12 Ligne;..t;..c;..a;..g;Ligne;..t;..c;..a;..g;Ligne;..t;..c;..a;..g;Ligne;..t;..c;..a;..g m;0.27;12.90;8.48;7.87;m;1.34;1.46;1.56;0.69;m;0.26;11.44;7.03;7.18;m;0.17;1.12;1.07;0.88 e;0.08;3.27;3.25;4.23;e;2.94;0.54;0.64;0.29;e;0.10;3.05;2.88;4.29;e;0.33;0.17;0.12;0.06 %;30;25;38;54;%;220;37;41;42;%;39;27;41;60;%;193;15;11;7 colonne;.t.;.c.;.a.;.g.;colonne;.t.;.c.;.a.;.g.;colonne;.t.;.c.;.a.;.g.;colonne;.t.;.c.;.a.;.g. m;8.11;8.58;13.72;9.64;m;1.31;1.07;1.50;1.13;m;6.92;7.51;12.22;8.51;m;1.04;0.99;1.04;1.05 e;3.19;4.17;3.04;4.26;e;0.58;0.58;0.78;0.57;e;3.04;4.00;3.04;3.89;e;0.12;0.15;0.13;0.24 %;39;49;22;44;%;45;55;52;50;%;44;53;25;46;%;11;15;12;23
- Doublets 13
;;;;;;;13;;;;;;; ;IV 1 121 eucaryotes;;;;;I 1 4032 bactéries;;;;;II 1;184 Archées;; doublet;t.t;c.t;a.t;g.t;doublet;t.t;c.t;a.t;g.t;doublet;t.t;c.t;a.t;g.t m;0.29;0.18;0.30;0.32;m;0.14;4.44;0.71;0.07;m;0;0.41;0;0.27 e;0.02;0.04;0.08;0.09;e;0.08;4.94;1.23;0.10;e;0;0.52;0;0.31 %;9;20;26;28;%;57;111;174;136;%;−;128;−;115 doublet;t.c;c.c;a.c;g.c;doublet;t.c;c.c;a.c;g.c;doublet;t.c;c.c;a.c;g.c m;13.24;9.33;12.92;16.12;m;1.33;1.16;1.67;1.67;m;1.215;1.029;1.090;1.164 e;2.79;0.81;2.18;3.06;e;0.25;0.50;0.65;0.70;e;0.281;0.098;0.079;0.132 %;21;9;17;19;%;19;43;39;42;%;23;9;7;11 doublet;t.a;c.a;a.a;g.a;doublet;t.a;c.a;a.a;g.a;doublet;t.a;c.a;a.a;g.a m;5.60;7.64;9.44;9.79;m;1.25;1.10;1.64;2.12;m;1.019;1.019;1.053;1.170 e;0.44;2.85;4.36;2.93;e;0.10;0.60;0.56;0.52;e;0.027;0.031;0.036;0.184 %;8;37;46;30;%;8;55;34;25;%;3;3;3;16 doublet;t.g;c.g;a.g;g.g;doublet;t.g;c.g;a.g;g.g;doublet;t.g;c.g;a.g;g.g m;6.85;6.11;10.16;8.68;m;0.91;0.81;0.71;0.38;m;0.904;0.836;0.906;0.875 e;2.46;3.12;7.08;4.34;e;0.23;0.34;0.13;0.12;e;0.088;0.062;0.011;0.035 %;36;51;70;50;%;25;42;18;31;%;10;7;1;4 Ligne;..t;..c;..a;..g;Ligne;..t;..c;..a;..g;Ligne;..t;..c;..a;..g m;0.27;12.90;8.48;7.87;m;1.34;1.46;1.56;0.69;m;0.17;1.12;1.07;0.88 e;0.08;3.27;3.25;4.23;e;2.94;0.54;0.64;0.29;e;0.33;0.17;0.12;0.06 %;30;25;38;54;%;220;37;41;42;%;193;15;11;7 colonne;.t.;.c.;.a.;.g.;colonne;.t.;.c.;.a.;.g.;colonne;.t.;.c.;.a.;.g. m;9.41;10.90;7.69;11.53;m;1.17;1.37;1.02;1.39;m;1.07;1.02;0.96;1.07 e;4.23;4.45;2.64;4.66;e;0.28;0.65;0.47;0.90;e;0.23;0.10;0.11;0.19 %;45;41;34;40;%;24;47;46;64;%;22;9;12;17
- Doublets 12
;;;;;;;12;;;;;;; ;IV 1 121 eucaryotes;;;;;I 1 4032 bactéries;;;;;II 1;184 Archées;; doublet;tt.;tc.;ta.;tg.;doublet;tt.;tc.;ta.;tg.;doublet;tt.;tc.;ta.;tg. m;7.98;6.98;13.38;13.24;m;1.23;1.03;1.59;1.10;m;1.03;0.95;1.03;1.31 e;3.61;3.10;−;5.36;e;0.26;0.34;−;0.02;e;0.14;0.11;−;0.44 %;45;44;−;40;%;22;33;−;2;%;14;12;−;34 doublet;ct.;cc.;ca.;cg.;doublet;ct.;cc.;ca.;cg.;doublet;ct.;cc.;ca.;cg. m;6.52;7.83;10.13;6.29;m;1.16;0.86;1.12;0.97;m;1.01;0.92;0.99;0.93 e;1.83;3.41;0.24;3.03;e;0.18;0.43;0.50;0.83;e;0.15;0.09;0.09;0.15 %;28;44;2;48;%;15;51;45;85;%;15;10;9;16 doublet;at.;ac.;aa.;ag.;doublet;at.;ac.;aa.;ag.;doublet;at.;ac.;aa.;ag. m;9.79;7.88;16.34;9.22;m;2.28;1.09;1.68;1.05;m;1.15;1.01;1.05;0.97 e;5.95;3.70;1.55;1.33;e;−;0.39;0.93;0.17;e;−;0.08;0.13;0.07 %;61;47;9;14;%;−;36;56;16;%;−;8;13;7 doublet;gt.;gc.;ga.;gg.;doublet;gt.;gc.;ga.;gg.;doublet;gt.;gc.;ga.;gg. m;8.71;11.63;14.79;11.01;m;1.21;1.29;1.66;1.41;m;1.03;1.09;1.10;1.06 e;3.10;6.42;2.79;5.71;e;0.94;1.13;1.14;0.87;e;0.12;0.27;0.20;0.24 %;36;55;19;52;%;78;88;69;62;%;11;25;18;23 Ligne;t..;c..;a..;g..;Ligne;t..;c..;a..;g..;Ligne;t..;c..;a..;g.. m;9.41;10.90;7.69;11.53;m;1.17;1.37;1.02;1.39;m;1.07;1.02;0.96;1.07 e;4.23;4.45;2.64;4.66;e;0.28;0.65;0.47;0.90;e;0.23;0.10;0.11;0.19 %;45;41;34;40;%;24;47;46;64;%;22;9;12;17 colonne;.t.;.c.;.a.;.g.;colonne;.t.;.c.;.a.;.g.;colonne;.t.;.c.;.a.;.g. m;8.11;8.58;13.72;9.64;m;1.31;1.07;1.50;1.13;m;1.04;0.99;1.04;1.05 e;3.19;4.17;3.04;4.26;e;0.58;0.58;0.78;0.57;e;0.12;0.15;0.13;0.24 %;39;49;22;44;%;45;55;52;50;%;11;15;12;23
Doublets 12 23 13
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- Légende
IV 1;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;12;;I 1;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235027;12;;II 1;Nombres de tRNAs. 184 archées;;;;;;12 ttt;0.26;tcc;0.31;tat;0.30;tgt;0.26;;ttt;0.25;tct;0.12;tat;0.10;tgt;0.07;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0 ttc;12.07;tct;10.46;tac;13.38;tgc;17.02;;ttc;1.51;tcc;1.12;tac;1.59;tgc;1.11;;ttc;1.17;tcc;1.03;tac;1.03;tgc;1.63 tta;5.29;tca;5.91;taa;−;tga;2.06;;tta;1.18;tca;1.31;taa;−;tga;0.33;;tta;1.04;tca;1.00;taa;-;tga;0.10 ttg;6.56;tcg;4.55;tag;−;tgg;9.45;;ttg;0.99;tcg;0.65;tag;−;tgg;1.08;;ttg;0.89;tcg;0.83;tag;-;tgg;1.00 ctc;0.18;ccc;0.14;cat;0.22;cgc;0.16;;ctt;9.15;cct;0.25;cat;0.10;cgc;8.26;;ctt;0.54;cct;0;cat;0;cgt;1.09 ctt;8.29;cct;9.28;cac;10.24;cgt;9.53;;ctc;0.95;ccc;0.68;cac;1.17;cgt;1.85;;ctc;1.16;ccc;0.93;cac;1.01;cgc;1.02 cta;4.64;cca;10.28;caa;9.86;cga;5.79;;cta;1.23;cca;1.35;caa;1.58;cga;0.22;;cta;1.01;cca;1.00;caa;1.07;cga;1.01 ctg;6.64;ccg;3.93;cag;10.31;cgg;3.54;;ctg;1.29;ccg;0.54;cag;0.59;cgg;0.83;;ctg;0.87;ccg;0.82;cag;0.90;cgg;0.76 atc;0.34;acc;0.23;aat;0.39;agt;0.24;;att;0.12;act;2.55;aat;0.12;agt;0.02;;att;0;act;0;aat;0;agt;0 att;13.99;act;11.87;aac;15.36;agc;10.45;;atc;2.28;acc;1.12;aac;2.17;agc;1.10;;atc;1.15;acc;1.03;aac;1.16;agc;1.02 ata;5.58;aca;7.23;aaa;15.54;aga;9.40;;ata;0.01;aca;1.46;aaa;2.26;aga;1.19;;ata;0.01;aca;1.08;aaa;1.07;aga;1.01 atg;19.69;acg;4.55;aag;18.12;agg;7.81;;atg;4.47;acg;0.68;aag;0.60;agg;0.86;;atg;3.20;acg;0.92;aag;0.90;agg;0.90 gtc;0.44;gcc;0.29;gat;0.34;ggt;0.22;;gtt;0.22;gct;0.05;gat;0;ggt;0.02;;gtt;0.54;gct;0;gat;0;ggt;0.54 gtt;11.68;gct;18.52;gac;17.61;ggc;16.67;;gtc;1.10;gcc;1.03;gac;2.24;ggc;2.30;;gtc;1.15;gcc;1.00;gac;1.18;ggc;1.32 gta;5.49;gca;10.55;gaa;12.02;gga;11.12;;gta;2.20;gca;2.53;gaa;2.40;gga;1.37;;gta;1.01;gca;1.39;gaa;1.25;gga;1.03 gtg;8.95;gcg;5.82;gag;14.72;ggg;5.25;;gtg;0.33;gcg;0.30;gag;0.34;ggg;0.56;;gtg;0.92;gcg;0.86;gag;0.87;ggg;0.84 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; IV 1;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;23;;I 1;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235027;23;;II 1;Nombres de tRNAs. 184 archées;;;;;;23 ttt;0.26;tcc;0.31;tat;0.30;tgt;0.26;;ttt;0.25;tct;0.12;tat;0.10;tgt;0.07;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0 atc;0.34;acc;0.23;aat;0.39;agt;0.24;;att;0.12;act;2.55;aat;0.12;agt;0.02;;att;0;act;0;aat;0;agt;0 ctc;0.18;ccc;0.14;cat;0.22;cgc;0.16;;ctt;9.15;cct;0.25;cat;0.10;cgc;8.26;;ctt;0.54;cct;0;cat;0;cgt;1.09 gtc;0.44;gcc;0.29;gat;0.34;ggt;0.22;;gtt;0.22;gct;0.05;gat;0;ggt;0.02;;gtt;0.54;gct;0;gat;0;ggt;0.54 ttc;12.07;tct;10.46;tac;13.38;tgc;17.02;;ttc;1.51;tcc;1.12;tac;1.59;tgc;1.11;;ttc;1.17;tcc;1.03;tac;1.03;tgc;1.63 att;13.99;act;11.87;aac;15.36;agc;10.45;;atc;2.28;acc;1.12;aac;2.17;agc;1.10;;atc;1.15;acc;1.03;aac;1.16;agc;1.02 ctt;8.29;cct;9.28;cac;10.24;cgt;9.53;;ctc;0.95;ccc;0.68;cac;1.17;cgt;1.85;;ctc;1.16;ccc;0.93;cac;1.01;cgc;1.02 gtt;11.68;gct;18.52;gac;17.61;ggc;16.67;;gtc;1.10;gcc;1.03;gac;2.24;ggc;2.30;;gtc;1.15;gcc;1.00;gac;1.18;ggc;1.32 tta;5.29;tca;5.91;taa;−;tga;2.06;;tta;1.18;tca;1.31;taa;−;tga;0.33;;tta;1.04;tca;1.00;taa;−;tga;0.10 ata;5.58;aca;7.23;aaa;15.54;aga;9.40;;ata;0.01;aca;1.46;aaa;2.26;aga;1.19;;ata;0.01;aca;1.08;aaa;1.07;aga;1.01 cta;4.64;cca;10.28;caa;9.86;cga;5.79;;cta;1.23;cca;1.35;caa;1.58;cga;0.22;;cta;1.01;cca;1.00;caa;1.07;cga;1.01 gta;5.49;gca;10.55;gaa;12.02;gga;11.12;;gta;2.20;gca;2.53;gaa;2.40;gga;1.37;;gta;1.01;gca;1.39;gaa;1.25;gga;1.03 ttg;6.56;tcg;4.55;tag;−;tgg;9.45;;ttg;0.99;tcg;0.65;tag;−;tgg;1.08;;ttg;0.89;tcg;0.83;tag;−;tgg;1.00 atg;19.69;acg;4.55;aag;18.12;agg;7.81;;atg;4.47;acg;0.68;aag;0.60;agg;0.86;;atg;3.20;acg;0.92;aag;0.90;agg;0.90 ctg;6.64;ccg;3.93;cag;10.31;cgg;3.54;;ctg;1.29;ccg;0.54;cag;0.59;cgg;0.83;;ctg;0.87;ccg;0.82;cag;0.90;cgg;0.76 gtg;8.95;gcg;5.82;gag;14.72;ggg;5.25;;gtg;0.33;gcg;0.30;gag;0.34;ggg;0.56;;gtg;0.92;gcg;0.86;gag;0.87;ggg;0.84 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; IV 1;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;13;;I 1;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235027;13;;II 1;Nombres de tRNAs. 184 archées;;;;;;13 ttt;0.26;atc;0.34;ctc;0.18;gtc;0.44;;ttt;0.25;att;0.12;ctt;9.15;gtt;0.22;;ttt;0;att;0;ctt;0.54;gtt;0.54 tat;0.30;aat;0.39;cat;0.22;gat;0.34;;tat;0.10;aat;0.12;cat;0.10;gat;0.00;;tat;0;aat;0;cat;0;gat;0 tcc;0.31;acc;0.23;ccc;0.14;gcc;0.29;;tct;0.12;act;2.55;cct;0.25;gct;0.05;;tct;0;act;0;cct;0;gct;0 tgt;0.26;agt;0.24;cgc;0.16;ggt;0.22;;tgt;0.07;agt;0.02;cgc;8.26;ggt;0.02;;tgt;0;agt;0;cgt;1.09;ggt;0.54 ttc;12.07;att;13.99;ctt;8.29;gtt;11.68;;ttc;1.51;atc;2.28;ctc;0.95;gtc;1.10;;ttc;1.17;atc;1.15;ctc;1.16;gtc;1.15 tac;13.38;aac;15.36;cac;10.24;gac;17.61;;tac;1.59;aac;2.17;cac;1.17;gac;2.24;;tac;1.03;aac;1.16;cac;1.01;gac;1.18 tct;10.46;act;11.87;cct;9.28;gct;18.52;;tcc;1.12;acc;1.12;ccc;0.68;gcc;1.03;;tcc;1.03;acc;1.03;ccc;0.93;gcc;1.00 tgc;17.02;agc;10.45;cgt;9.53;ggc;16.67;;tgc;1.11;agc;1.10;cgt;1.85;ggc;2.30;;tgc;1.63;agc;1.02;cgc;1.02;ggc;1.32 tta;5.29;ata;5.58;cta;4.64;gta;5.49;;tta;1.18;ata;0.01;cta;1.23;gta;2.20;;tta;1.04;ata;0.01;cta;1.01;gta;1.01 taa;−;aaa;15.54;caa;9.86;gaa;12.02;;taa;−;aaa;2.26;caa;1.58;gaa;2.40;;taa;−;aaa;1.07;caa;1.07;gaa;1.25 tca;5.91;aca;7.23;cca;10.28;gca;10.55;;tca;1.31;aca;1.46;cca;1.35;gca;2.53;;tca;1.00;aca;1.08;cca;1.00;gca;1.39 tga;2.06;aga;9.40;cga;5.79;gga;11.12;;tga;0.33;aga;1.19;cga;0.22;gga;1.37;;tga;0.10;aga;1.01;cga;1.01;gga;1.03 ttg;6.56;atg;19.69;ctg;6.64;gtg;8.95;;ttg;0.99;atg;4.47;ctg;1.29;gtg;0.33;;ttg;0.89;atg;3.20;ctg;0.87;gtg;0.92 tag;−;aag;18.12;cag;10.31;gag;14.72;;tag;−;aag;0.60;cag;0.59;gag;0.34;;tag;−;aag;0.90;cag;0.90;gag;0.87 tcg;4.55;acg;4.55;ccg;3.93;gcg;5.82;;tcg;0.65;acg;0.68;ccg;0.54;gcg;0.30;;tcg;0.83;acg;0.92;ccg;0.82;gcg;0.86 tgg;9.45;agg;7.81;cgg;3.54;ggg;5.25;;tgg;1.08;agg;0.86;cgg;0.83;ggg;0.56;;tgg;1.00;agg;0.90;cgg;0.76;ggg;0.84
Paires de base des codons
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Paires de base des codons
- Légende
I 1.ap;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235027;;;IV 1.ap;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830; ttc;1.51;ctc;0.95;atc;2.28;gtc;1.10;;ttc;12.07;ctc;0.18;atc;0.34;gtc;0.44 aag;0.60;gag;0.34;tag;−;cag;0.59;;aag;18.12;gag;14.72;tag;−;cag;10.31 aac;2.17;gac;2.24;tac;1.59;cac;1.17;;aac;15.36;gac;17.61;tac;13.38;cac;10.24 ttg;0.99;ctg;1.29;atg;4.47;gtg;0.33;;ttg;6.56;ctg;6.64;atg;19.69;gtg;8.95 tcc;1.12;ccc;0.68;acc;1.12;gcc;1.03;;tcc;0.31;ccc;0.14;acc;0.23;gcc;0.29 agg;0.86;ggg;0.56;tgg;1.08;cgg;0.83;;agg;7.81;ggg;5.25;tgg;9.45;cgg;3.54 agc;1.10;ggc;2.30;tgc;1.11;cgc;8.26;;agc;10.45;ggc;16.67;tgc;17.02;cgc;0.16 tcg;0.65;ccg;0.54;acg;0.68;gcg;0.30;;tcg;4.55;ccg;3.93;acg;4.55;gcg;5.82 ttt;0.25;ctt;9.15;att;0.12;gtt;0.22;;ttt;0.26;ctt;8.29;att;13.99;gtt;11.68 aaa;2.26;gaa;2.40;taa;−;caa;1.58;;aaa;15.54;gaa;12.02;taa;−;caa;9.86 aat;0.12;gat;0;tat;0.10;cat;0.10;;aat;0.39;gat;0.34;tat;0.30;cat;0.22 tta;1.18;cta;1.23;ata;0.01;gta;2.20;;tta;5.29;cta;4.64;ata;5.58;gta;5.49 tct;0.12;cct;0.25;act;2.55;gct;0.05;;tct;10.46;cct;9.28;act;11.87;gct;18.52 aga;1.19;gga;1.37;tga;0.33;cga;0.22;;aga;9.40;gga;11.12;tga;2.06;cga;5.79 agt;0.02;ggt;0.02;tgt;0.07;cgt;1.85;;agt;0.24;ggt;0.22;tgt;0.26;cgt;9.53 tca;1.31;cca;1.35;aca;1.46;gca;2.53;;tca;5.91;cca;10.28;aca;7.23;gca;10.55 ;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;; I 1.apr;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;rapports;;;IV 1.apr;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;rapports; ttc;c/g;ctc;c/g;atc;c/g;gtc;c/g;;ttc;c/g;ctc;c/g;atc;c/g;gtc;c/g aag;2.5;gag;2.8;tag;−;cag;1.9;;aag;0.7;gag;0.01;tag;−;cag;0.04 aac;;gac;;tac;;cac;;;aac;;gac;;tac;;cac; ttg;2.2;ctg;1.7;atg;0.4;gtg;3.6;;ttg;2.3;ctg;2.7;atg;0.7;gtg;1.1 tcc;;ccc;;acc;;gcc;;;tcc;;ccc;;acc;;gcc; agg;1.3;ggg;1.2;tgg;1.0;cgg;1.2;;agg;0.04;ggg;0.03;tgg;0.02;cgg;0.08 agc;;ggc;;tgc;;cgc;;;agc;;ggc;;tgc;;cgc; tcg;1.7;ccg;4.2;acg;1.6;gcg;0.3;;tcg;2.3;ccg;4.2;acg;3.7;gcg;0.03 ttt;a/t;ctt;a/t;att;a/t;gtt;a/t;;ttt;a/t;ctt;a/t;att;a/t;gtt;a/t aaa;910;gaa;26;taa;−;caa;710;;aaa;58.8;gaa;1.5;taa;−;caa;0.8 aat;;gat;;tat;;cat;;;aat;;gat;;tat;;cat; tta;950;cta;>>>>;ata;14;gta;2215;;tta;13.6;cta;13.7;ata;18.8;gta;24.6 tct;;cct;;act;;gct;;;tct;;cct;;act;;gct; aga;961;gga;552;tga;13;cga;443;;aga;0.9;gga;1.2;tga;0.2;cga;0.3 agt;;ggt;;tgt;;cgt;;;agt;;ggt;;tgt;;cgt; tca;5299;cca;5453;aca;1959;gca;1.4;;tca;24.7;cca;46.1;aca;27.3;gca;1.1 ;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;; I 1.pc;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;codons/paire;;;IV1.pc;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;codons/paire; ;tat;ttt;tct;tgt;cgc;gat;agt;;;tat;ttt;tct;tgt;cgc;gat;agt paire;ata;aaa;aga;aca;gcg;cta;tca;;paire;ata;aaa;aga;aca;gcg;cta;tca codons;0;2;2;2;2;2;2;;codons;2;2;4;2;2;1;3 ;;;;;;;;;;;;;;;; ;;ttc;ttg;tac;tgg;tcc;tcg;;;;ttc;ttg;tac;tgg;tcc;tcg paire;;aag;aac;atg;acc;agg;agc;;paire;;aag;aac;atg;acc;agg;agc codons;;3;3;3;3;3;3;;codons;;4;4;3;2;3;4 ;;;;;;;;;;;;;;;; ;aat;ggg;ctc;cac;gac;ggc;tgc;;;aat;ggg;ctc;cac;gac;ggc;tgc paire;tta;ccc;gag;gtg;ctg;ccg;acg;;paire;tta;ccc;gag;gtg;ctg;ccg;acg codons;1;4;4;4;4;4;4;;codons;2;2;2;4;3;3;4
Moyennes des doublets à 3 codons homogènes
[modifier | modifier le wikicode]- Lien tableur: Moyennes des doublets à 3 codons homogènes
- Légende: Chez les eucaryotes les codons ttc et cgc sont dans leurs doublets (pas de permutation). De même pour cgc chez les bactéries.
IV1.23;;;;;;I1.23;;;;;;IV1.13;;;;;;I1.13;;;; doublet;.tt;.ct;.ac;.gc;;doublet;.tc;.cc;.ac;.gc;;doublet;t.c;a.c;c.t;g.c;;doublet;t.c;a.c;c.c;g.c sauf;ttc;gct;cac;cgt;;sauf;atc;ccc;cac;cgt;;sauf;tct;−;cac;−;;sauf;tgc;agc;cgt;ggc m;11.32;10.54;15.45;14.72;;m;1.19;1.09;2.00;1.50;;m;14.16;−;9.03;−;;m;1.41;1.86;0.93;1.46 e;2.87;1.29;2.12;3.70;;e;0.29;0.05;0.36;0.69;;e;2.57;−;0.66;−;;e;0.25;0.64;0.25;0.68 %;25;12;14;25;;%;24;5;18;46;;%;18;−;7;−;;%;18;35;26;47 doublet;.ta;.ca;.aa;.ga;;doublet;.ta;.ca;.aa;.ga;;doublet;t.a;a.a;c.a;g.a;;doublet;t.a;a.a;c.a;g.a sauf;cta;tca;taa;tga;;sauf;ata;gca;taa;tga;;sauf;taa;ata;cta;gta;;sauf;taa;ata;cga;gga m;5.45;9.35;12.47;8.77;;m;1.53;1.37;2.08;0.93;;m;4.42;10.72;8.64;11.23;;m;0.94;1.64;1.39;2.37 e;0.15;2.16;2.87;2.72;;e;0.58;0.07;0.44;0.62;;e;2.07;4.31;1.92;0.75;;e;0.54;0.56;0.18;0.17 %;3;23;23;31;;%;38;5;21;67;;%;47;40;22;7;;%;57;34;13;7 doublet;.tg;.cg;.ag;.gg;;doublet;.tg;.cg;.ag;.gg;;doublet;t.g;a.g;c.g;g.g;;doublet;t.g;a.g;c.g;g.g sauf;atg;gcg;tag;cgg;;sauf;atg;gcg;tag;ggg;;sauf;tag;acg;cag;gag;;sauf;tag;atg;ctg;ggg m;7.39;4.35;14.38;7.50;;m;0.87;0.63;0.51;0.92;;m;6.85;15.21;4.71;6.67;;m;0.91;0.71;0.66;0.32 e;1.36;0.36;3.92;2.12;;e;0.49;0.07;0.15;0.14;;e;2.46;6.45;1.69;1.99;;e;0.23;0.13;0.16;0.02 %;18;8;27;28;;%;57;12;28;15;;%;36;42;36;30;;%;25;18;24;6
Genèse des gènes de tRNAs
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux:Genèse des gènes de tRNAs
- Légende
I 1.g;Genèse de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235027;;;IV 1.g;Genèse de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;;;IV1.265;;sensibilité relative;;;7.90;-37.3;265.0 ttt;−;tct;−;tat;−;tgt;−;;ttt;0.21;tcc;0.23;tat;0.22;tgt;0.23;;ttt;0.03;tcc;0.04;tat;0.04;tgt;0.03 att;−;act;0.02;aat;−;agt;−;;atc;0.26;acc;0.19;aat;0.28;agt;0.14;;atc;0.04;acc;0.03;aat;0.05;agt;0.03 ctt;0.09;cct;−;cat;−;cgc;0.08;;ctc;0.16;ccc;0.13;cat;0.18;cgc;0.11;;ctc;0.02;ccc;0.02;cat;0.03;cgc;0.02 gtt;−;gct;−;gat;−;ggt;−;;gtc;0.31;gcc;0.21;gat;0.28;ggt;0.16;;gtc;0.06;gcc;0.04;gat;0.04;ggt;0.03 ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;1;;ttc;0.99;tct;1;tac;1;tgc;0.99;;ttc;1;tct;18;tac;6;tgc;94 atc;1;acc;0.99;aac;1;agc;1;;att;1;act;0.99;aac;1;agc;0.99;;att;-22.4;act;34;aac;-11;agc;20.7 ctc;0.92;ccc;0.67;cac;1;cgt;0.92;;ctt;0.91;cct;0.96;cac;0.99;cgt;0.99;;ctt;10;cct;73;cac;11;cgt;-35 gtc;1;gcc;1;gac;1;ggc;1;;gtt;1;gct;1;gac;0.99;ggc;0.98;;gtt;35;gct;127;gac;0;ggc;-8 tta;0.95;tca;0.99;taa;−;tga;0.33;;tta;0.98;tca;1;taa;−;tga;0.60;;tta;-43;tca;-43;taa;−;tga;-20.1 ata;−;aca;1.00;aaa;1.00;aga;1.00;;ata;0.98;aca;1;aaa;0.98;aga;0.98;;ata;−;aca;-37;aaa;-13;aga;0 cta;0.99;cca;1.00;caa;1.00;cga;0.21;;cta;0.93;cca;0.99;caa;1;cga;0.83;;cta;-52;cca;-4;caa;-21.2;cga;233 gta;1.00;gca;1.00;gaa;1.00;gga;1.00;;gta;0.98;gca;1;gaa;1;gga;1;;gta;-68;gca;-47;gaa;-37;gga;3 ttg;0.98;tcg;0.62;tag;−;tgg;1.00;;ttg;0.96;tcg;1;tag;−;tgg;0.98;;ttg;-16;tcg;-11;tag;−;tgg;10 atg;1;acg;0.67;aag;0.52;agg;0.80;;atg;1;acg;0.98;aag;0.98;agg;0.98;;atg;-44;acg;-16;aag;281;agg;15 ctg;0.82;ccg;0.54;cag;0.46;cgg;0.86;;ctg;0.90;ccg;0.82;cag;1;cgg;0.90;;ctg;-35;ccg;-8;cag;120;cgg;-46 gtg;0.31;gcg;0.30;gag;0.29;ggg;0.57;;gtg;0.99;gcg;0.86;gag;1;ggg;0.93;;gtg;248;gcg;143;gag;441;ggg;18 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; I 1.z;Zéros de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235027;;;IV 1.z;Zéros de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;;;I 1.zb;Bactéries. 4032 bactéries ;;;;;235027; ttt;−;tct;−;tat;−;tgt;−;;ttt;96;tcc;93;tat;94;tgt;93;;ttt;−;tct;−;tat;−;tgt;− att;−;act;3682;aat;−;agt;−;;atc;90;acc;98;aat;87;agt;104;;att;−;act;3775;aat;−;agt;− ctt;3502;cct;−;cat;−;cgc;3614;;ctc;102;ccc;105;cat;99;cgc;108;;ctt;3834;cct;−;cat;−;cgc;3932 gtt;−;gct;−;gat;−;ggt;−;;gtc;83;gcc;96;gat;87;ggt;102;;gtt;−;gct;−;gat;−;ggt;− ttc;0;tcc;0;tac;0;tgc;0;;*ttc;1;tct;0;tac;0;*tgc;1;;ttc;0;tcc;0;tac;0;tgc;0 atc;0;acc;41;aac;0;agc;0;;att;0;act;1;aac;0;agc;1;;atc;0;acc;3775;aac;0;agc;0 ctc;323;ccc;1285;cac;0;cgt;307;;ctt;11;cct;5;*cac;1;cgt;1;;ctc;3834;ccc;3940;cac;0;cgt;3932 gtc;0;gcc;0;gac;0;ggc;0;;gtt;0;gct;0;*gac;1;ggc;2;;gtc;0;gcc;0;gac;0;ggc;0 tta;190;tca;22;taa;−;tga;2629;;tta;2;tca;0;taa;−;tga;48;;tta;3933;tca;3943;taa;−;tga;3934 ata;−;aca;13;aaa;9;aga;10;;ata;2;aca;0;aaa;2;*aga;2;;ata;−;aca;3944;aaa;3941;aga;3928 cta;30;cca;5;caa;18;cga;3026;;cta;9;cca;1;caa;0;cga;20;;cta;3935;cca;3939;caa;3943;cga;3833 gta;2;gca;11;gaa;5;gga;11;;gta;2;gca;0;gaa;0;gga;0;;gta;3935;gca;3902;gaa;3928;gga;3939 ttg;96;tcg;1493;tag;−;tgg;15;;ttg;5;tcg;0;tag;−;*tgg;3;;ttg;3933;tcg;3943;tag;−;tgg;3934 atg;0;acg;1288;aag;1899;agg;780;;atg;0;acg;2;aag;2;agg;2;;atg;0;acg;3944;aag;3941;agg;3928 ctg;692;ccg;1813;cag;2130;cgg;539;;ctg;12;ccg;22;cag;0;cgg;12;;ctg;3935;ccg;3939;cag;3943;cgg;3833 gtg;2724;gcg;2721;gag;2808;ggg;1699;;gtg;1;gcg;17;gag;0;ggg;8;;gtg;3935;gcg;3902;gag;3928;ggg;3939
Genèse et sensibilité
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Genèse et sensibilité
- Légende
table;codon;B;E;z,E;sens,r;sens,E;;table;codon;B;E;z,E;sens,r;sens,E ;genèse constante, neutre;;;;;;;;genèse constante, négative;;;;; ;ttc;1;0,99;1;1;1,53;;;gta;1,00;0,98;2;-68;0,69 ;tac;1;1;0;6;1,69;;;atg;1;1;0;-44;2,49 ;aac;1;1;0;-11;1,94;;;tca;0,99;1;0;-43;0,75 ;cac;1;0,99;1;11;1,30;;;aca;1,00;1;0;-37;0,92 ;gac;1;0,99;1;0;2,23;;;gca;1,00;1;0;-47;1,33 I;tgg;1;0,98;3;10;1,20;;;gaa;1,00;1;0;-37;1,52 ;aaa;1;0,98;2;-13;1,97;;;tta;0,95;0,98;2;-43;0,67 II;caa;1;1;0;-21,2;1,25;;VI;cgt/c;0,92;0,99;1;-35;1,21 ;atc/t;1;1;0;-22,4;1,77;;;ctg;0,82;0,90;12;-35;0,84 ;tcc/t;1;1;0;18;1,32;;;cgg;0,86;0,90;12;-46;0,45 ;agc;1;0,99;1;20,7;1,32;;VII;cta;0,99;0,93;9;-52;0,59 III;ggc;1;0,98;2;-8;2,11;;;genèse constante, sensible;;;;; ;cca;1;0,99;1;-4;1,30;;;gtc/t;1;1;0;35;1,48 ;aga;1;0,98;2;0;1,19;;;acc/t;0,99;0,99;1;34;1,50 IV;gga;1;1;0;3;1,41;;;tgc;1;0,99;1;94;2,16 ;ttg;0,98;0,96;5;-16;0,83;;VIII;gcc/t;1;1;0;127;2,34 ;ctc/t;0,92;0,91;11;10;1,05;;;;;;;; ;ccg;0,54;0,82;22;-8;0,50;;;genèse variable, sensible;;;;; ;ggg;0,57;0,93;8;18;0,66;;;ata;−;0,98;2;−;0,71 V;tga;0,33;0,60;48;-20,1;0,26;;;aag;0,52;0,98;2;281;2,29 ;;;;;;;;;cag;0,46;1;0;120;1,30 ;;;;;;;;;gag;0,29;1;0;441;1,86 ;genèse variable, neutre;;;;;;;b;gtg;0,31;0,99;1;248;1,13 ;tcg;0,62;1;0;-11;0,58;;;gcg;0,30;0,86;17;143;0,74 ;acg;0,67;0,98;2;-16;0,58;;;cga;0,21;0,83;20;233;0,73 a;agg;0,80;0,98;2;15;0,99;;c;cct/c;0,67;0,96;5;73;1,17
Duplications entières du processus E
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Duplications entières du processus E
- Légende
;;;;Duplications entières du processus E;;;;;;;;;; codon;iE;saut;;codon;iE;saut;;codon;iE;saut;;codon;iE;saut cgc;0.07;21;;tga;1.73;56;;agg;6.95;5;;ttc;10.56;0.18 ctc;0.09;53;;cgg;2.71;22;;ctt;7.33;5;;gtt;10.58;1.60 ccc;0.14;49;;gta;3.29;3;;cgt;7.67;4;;act;10.75;9 acc;0.21;8;;ccg;3.39;0.55;;gca;8.02;2.42;;att;11.71;0.67 cat;0.22;0.33;;cta;3.41;13;;aga;8.21;0.75;;tac;11.79;12 ggt;0.22;7;;acg;3.87;0.88;;caa;8.28;1.07;;aac;13.18;0.74 agt;0.24;9;;tcg;3.90;5;;tgg;8.36;3;;aaa;13.28;8 ttt;0.26;0.66;;tta;4.11;12;;cct;8.60;0.28;;ggc;14.37;0.04 tgt;0.26;9;;tca;4.59;1.98;;gtg;8.62;4;;gag;14.37;6 gcc;0.29;3;;ggg;4.69;14;;cca;8.93;1.59;;atg;15.22;1.04 tat;0.30;5;;ctg;5.36;3;;cac;9.07;3;;gac;15.37;4 tcc;0.31;8;;gcg;5.51;0.91;;tct;9.34;0.17;;tgc;15.92;10 atc;0.34;0.37;;ata;5.56;0.10;;agc;9.36;3;;gct;17.49;0.20 gat;0.34;14;;ttg;5.57;0.06;;gaa;9.62;0.93;;aag;17.52; aat;0.39;13;;cga;5.57;4;;cag;9.71;0.36;;;; gtc;0.44;297;;aca;5.77;20;;gga;9.75;8;;;;
Corrélations entre codons des 121 eucaryotes
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Calculs pour 121 eucaryotes
- Tableau des diagrammes
- Légende: corel pour coefficient de corrélation pour 45 codons (-1, atg), 41 codons(-5, atg aag gag tgc gct), 40 codons (-6, +gta)
;-1;-5;-6;;;-1;-5;-6 corel;0.453;0.682;0.745;;corel;0.335;0.589;0.671 ;;;;;;;; ;I1 B;IV1 E;;;;I1 B;IV1-I1 d; ata;0.01;5.58;;;ata;0.01;5.56; cga;0.22;5.79;;;cga;0.22;2.71; gcg;0.30;5.82;;;gcg;0.30;5.51; gtg;0.33;8.95;;;gtg;0.33;8.62; tga;0.33;2.06;;;tga;0.33;1.73; gag;0.34;14.72;;*;gag;0.34;14.37; ccg;0.54;3.93;;;ccg;0.54;3.39; ggg;0.56;5.25;;;ggg;0.56;4.69; cag;0.59;10.31;;;cag;0.59;9.71; aag;0.60;18.12;;*;aag;0.60;17.52; tcg;0.65;4.55;;;tcg;0.65;3.90; ccc;0.68;9.28;;;ccc;0.68;8.60; acg;0.68;4.55;;;acg;0.68;3.87; cgg;0.83;3.54;;;cgg;0.83;5.57; agg;0.86;7.81;;;agg;0.86;6.95; ctc;0.95;8.29;;;ctc;0.95;7.33; ttg;0.99;6.56;;;ttg;0.99;5.57; gcc;1.03;18.52;;*;gcc;1.03;17.49; tgg;1.08;9.45;;;tgg;1.08;8.36; agc;1.10;10.45;;;agc;1.10;9.36; gtc;1.10;11.68;;;gtc;1.10;10.58; tgc;1.11;17.02;;*;tgc;1.11;15.92; acc;1.12;11.87;;;acc;1.12;10.75; tcc;1.12;10.46;;;tcc;1.12;9.34; cac;1.17;10.24;;;cac;1.17;9.07; tta;1.18;5.29;;;tta;1.18;4.11; aga;1.19;9.40;;;aga;1.19;8.21; cta;1.23;4.64;;;cta;1.23;3.41; ctg;1.29;6.64;;;ctg;1.29;5.36; tca;1.31;5.91;;;tca;1.31;4.59; cca;1.35;10.28;;;cca;1.35;8.93; gga;1.37;11.12;;;gga;1.37;9.75; aca;1.46;7.23;;;aca;1.46;5.77; ttc;1.51;12.07;;;ttc;1.51;10.56; caa;1.58;9.86;;;caa;1.58;8.28; tac;1.59;13.38;;;tac;1.59;11.79; cgt;1.85;9.53;;;cgt;1.85;7.67; aac;2.17;15.36;;;aac;2.17;13.18; gta;2.20;5.49;;*;gta;2.20;3.29; gac;2.24;17.61;;;gac;2.24;15.37; aaa;2.26;15.54;;;aaa;2.26;13.28; atc;2.28;13.99;;;atc;2.28;11.71; ggc;2.30;16.67;;;ggc;2.30;14.37; gaa;2.40;12.02;;;gaa;2.40;9.62; gca;2.53;10.55;;;gca;2.53;8.02; atg;4.47;19.69;;*;atg;4.47;15.22;
Distribution des tRNAs de 121 eucaryotes
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Distribution des tRNAs de 121 eucaryotes
- Tableau des cumuls des tRNAs >4
Cumul des fréquences des tRNAs/génome > 4. 121 Eucaryotes.;;;;;;; ttt;2;tct;104;tat;2;tgt;6 c;111;c;2;c;106;c;87 a;55;a;48;a;−;a;9 g;70;g;32;g;−;g;87 ctt;80;cct;85;cat;1;cgt;92 c;0;c;1;c;97;c;2 a;37;a;82;a;78;a;64 g;72;g;24;g;87;g;28 att;111;act;106;aat;4;agt;1 c;5;c;5;c;108;c;88 a;55;a;61;a;83;a;86 g;110;g;43;g;113;g;61 gtt;107;gct;114;gat;6;ggt;8 c;3;c;3;c;112;c;114 a;49;a;83;a;98;a;77 g;71;g;52;g;95;g;53
- Tableau des totaux Ligne/Colonne
Cumul des fréquences des tRNAs/génome > 4. 121 Eucaryotes.;;;;;;;;;; Total colonne;;;;;;Total ligne;;;; ;t;c;a;g;;;t;c;a;g Base 2;938;845;990;863;;Base 1;721;830;1040;1045 t1+c1;10;11;13;17;;t1+c1;12;4;15;20 t2+c2;409;409;423;381;;t2+c2;408;354;413;447 a;196;274;259;236;;a;112;261;285;307 g;323;151;295;229;;g;189;211;327;271
- Tableau des diagrammes et totaux des fréquences 0-4
max;;ttc;tta;ttg;ctt;cta;ctg;att;ata;atg;gtt;gta;gtg;tct;tca;tcg;cct;cca;ccg;act;aca;acg;gct;gca;gcg;tac;cac;caa;cag;aac;aaa;aag;gac;gaa;gag;tgc;tgg;cgt;cga;cgg;agc;aga;agg;ggc;gga;ggg;total;tga; 22;0;1;2;5;11;9;12;0;2;0;0;2;1;0;0;0;5;1;22;1;0;3;0;0;17;0;1;0;0;0;2;2;1;0;0;1;3;1;20;12;1;2;2;2;0;8;152;48;0 33;1;3;19;7;9;18;13;2;33;1;2;25;16;4;15;25;16;8;14;1;10;27;2;9;8;3;2;6;15;2;8;1;2;4;9;5;3;2;10;30;4;10;26;1;7;24;461;41;1 26;2;2;11;10;6;19;7;1;18;2;3;26;12;5;24;18;6;8;16;1;20;18;2;13;13;3;4;12;9;2;8;1;2;8;6;4;4;7;12;18;8;9;16;2;11;18;425;11;2 26;3;2;17;14;5;20;6;2;4;0;5;9;14;4;20;26;3;10;20;3;14;15;3;11;16;3;6;9;5;6;10;4;4;7;5;14;8;6;5;19;13;9;9;0;14;9;408;8;3 25;4;2;17;15;10;18;11;5;9;8;4;10;7;4;14;20;6;12;25;9;16;15;0;5;15;6;11;16;5;3;10;0;0;4;6;10;16;13;10;14;7;5;7;2;12;9;423;4;4 20;5;11;10;8;15;14;14;2;20;3;3;9;3;5;10;8;1;10;8;6;7;13;3;14;16;9;12;12;8;1;6;4;4;10;5;11;6;6;18;10;7;15;14;3;7;6;387;1;5 22;6;11;8;10;18;3;11;8;8;5;10;7;7;9;10;8;10;11;1;7;14;7;3;4;8;13;12;10;6;11;6;4;5;9;5;0;18;22;10;4;10;17;8;2;10;8;388;0;6 15;7;8;9;14;5;3;11;7;8;6;15;9;9;14;8;3;15;15;3;6;8;8;9;5;6;4;10;8;7;5;2;4;1;6;5;4;9;15;10;4;10;9;6;4;7;7;341;2;7 14;8;12;5;10;8;2;5;9;4;7;10;7;3;8;2;5;10;12;2;13;4;1;6;5;4;9;9;4;6;4;7;2;11;6;10;3;13;6;4;2;14;5;3;5;6;6;289;0;8 17;9;7;4;5;5;3;5;8;2;5;7;3;7;10;2;1;9;1;4;17;4;3;4;14;0;9;7;9;4;14;4;12;7;5;6;1;5;7;4;0;9;8;3;4;10;7;265;0;9 15;10;11;3;5;3;4;6;13;3;6;9;1;9;13;2;1;10;6;0;15;6;4;5;7;1;6;12;7;10;5;3;4;14;5;6;3;5;10;2;2;6;5;4;9;3;2;266;0;10 13;11;5;2;2;1;2;7;9;1;3;7;2;3;10;2;0;4;5;0;11;2;1;5;6;3;5;4;4;10;5;4;7;2;8;7;2;1;1;1;0;3;3;4;13;4;2;183;0;11 12;12;9;3;2;3;0;1;12;0;4;7;1;5;9;2;0;4;1;0;6;1;0;7;2;2;3;5;0;10;6;5;6;1;2;2;1;2;4;2;1;4;3;1;5;5;1;150;0;12 11;13;5;3;1;1;0;3;9;1;2;5;0;2;6;0;0;4;1;1;2;1;1;5;2;0;5;1;1;5;5;2;6;11;6;6;3;4;3;0;0;4;3;2;7;0;1;130;0;13 12;14;3;2;4;2;0;0;4;0;8;5;0;1;2;2;1;4;2;0;2;1;0;4;2;0;6;2;2;1;5;6;6;9;7;4;2;3;2;0;1;2;1;0;12;2;0;122;0;14 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2;69;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;69 ;;ttc;tta;ttg;ctt;cta;ctg;att;ata;atg;gtt;gta;gtg;tct;tca;tcg;cct;cca;ccg;act;aca;acg;gct;gca;gcg;tac;cac;caa;cag;aac;aaa;aag;gac;gaa;gag;tgc;tgg;cgt;cga;cgg;agc;aga;agg;ggc;gga;ggg;total;tga; Suite;−;−;−;−;112;−;75;101;−;73;166;145;71;−;−;−;−;−;−;99;91;137;75;5,898;3,858;83;−;782;81;123;72;86;82;84;77;92;74;85;79;−;76;90;116;85;80;72;−;−; Fréquence 1;;;;;;;;110;;79;;;81;;;;;;;151;206;;83;;;90;;;108;168;74;97;90;114;164;107;178;;84;;99;105;;;133;81;;; ;;;;;;;;;;94;;;1540;;;;;;;;;;106;;;107;;;;;78;97;97;114;395;338;217;;1201;;;123;;;326;90;;; ;;;;;;;;;;138;;;;;;;;;;;;;256;;;;;;;;82;127;184;139;428;;256;;;;;;;;391;105;;; ;;;;;;;;;;154;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;86;149;;235;468;;;;;;;;;;619;341;;; ;;;;;;;;;;278;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;271;;435;;;;;;;;;;;833;1,295;;; ;;;;;;;;;;286;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;408;;1,901;;;;;;;;;;;987;1,766;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;772;;2,368;;;;;;;;;;;1073;2,148;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;887;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;ttc;tta;ttg;ctt;cta;ctg;att;ata;atg;gtt;gta;gtg;tct;tca;tcg;cct;cca;ccg;act;aca;acg;gct;gca;gcg;tac;cac;caa;cag;aac;aaa;aag;gac;gaa;gag;tgc;tgg;cgt;cga;cgg;agc;aga;agg;ggc;gga;ggg;total;tga; Total 0-4;;10;66;51;41;84;49;10;66;11;14;72;50;17;73;89;36;39;97;15;60;78;7;38;69;15;24;43;34;13;38;8;9;23;26;34;34;29;57;93;33;35;60;7;44;68;1869;112; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; Distribution c/t;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;ttt;ctc;atc;gtc;tcc;ccc;acc;gcc;tat;cat;aat;gat;tgt;cgc;agt;ggt;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;0;96;102;90;83;93;105;98;96;94;99;87;87;93;108;104;102;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;1;16;16;16;26;17;13;13;14;18;17;17;21;17;7;6;5;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;2;5;3;8;3;2;1;3;5;5;1;11;7;4;2;6;4;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;3;1;0;1;6;4;0;1;1;2;2;1;0;0;2;3;0;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;4;1;0;1;0;3;1;1;2;0;1;1;0;1;0;1;2;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;5;0;0;2;0;0;0;1;0;1;1;1;0;3;0;1;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;6;2;0;2;0;0;1;0;1;0;0;2;3;1;0;0;0;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; Suite;−;−;−;9;12;22;−;8;31;11;−;9;10;16;7;−;7;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; Fréquence 1;;;;;16;32;;12;168;;;;10;143;9;;9;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;16;;;13;;;;;20;;;;12;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;19;;;;;;;;;19;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;20;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;21;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;24;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Caractérisation des codons par les processus de genèse et de duplication des eucaryotes
[modifier | modifier le wikicode]Tableau des effectifs calculés des gènes de tRNAs 121 eucaryotes.
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableur: Tableau des effectifs calculés des gènes de tRNAs 121 eucaryotes.
- Légende: Décompte des gènes tRNAs par codon suivant la base de données gtRNAdb [4].
- 5 : nombre de tRNAs d'un codon se terminant par t. Ce sont les plus faibles.
- 113 : nombre de tRNAs d'un codon se terminant par t: Changement de t en c chez les archées et de c en t chez les eucaryotes.
- 4 366: Effectif élevé de tRNAs d'un codon se terminant par g chez les procaryotes.
- 2622: Effectif faible de tRNAs supérieurs à t et à c .
- 160: Changement de codon g Chez les archées et les eucaryotes.
- Tableaux:
- Nombre de tRNAs, tableaux IV V, décompte de la base gtRNAdb.
- Pour 100 000 tRNAs, tableaux IV100 III100 V100, décomptes rapportés à 100 000 tRNAs pour comparaison.
- tRNAs pour 1 génome, tableaux IV1 III1 , indice de la multiplicité = nombre de tRNAs / nombre de génomes.
- IVp, pentes; IVr, coefficients de détermination R2. Voir les calculs pour les 121 eucaryotes
IV ;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;;55,830;;IV p;Pentes des tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;;;;12,258;V;Nombres Danio rerio (Zebrafish) ;;;;; ttt;32;tct;1,266;tat;36;tgt;32;;ttt;;tct;0.946;tat;;tgt;;;ttt;10;tct;336;tat;5;tgt;9 c;1,461;c;38;c;1,619;c;2,060;;c;1.139;c;;c;1.293;c;1.603;;c;197;c;2;c;236;c;136 a;640;a;715;a;;a;249;;a;0.463;a;0.699;a;;a;;;a;73;a;209;a;;a;14 g;794;g;551;g;;g;1,143;;g;0.574;g;0.511;g;;g;0.941;;g;241;g;80;g;;g;44 ctt;1,003;cct;1,123;cat;27;cgt;1,153;;ctt;0.853;cct;0.991;cat;;cgt;0.948;;ctt;270;cct;315;cat;10;cgt;203 c;22;c;17;c;1,239;c;19;;c;;c;;c;0.998;c;;;c;4;c;2;c;387;c;24 a;561;a;1,244;a;1,193;a;701;;a;0.504;a;1.062;a;0.925;a;0.606;;a;244;a;205;a;105;a;107 g;804;g;476;g;1,247;g;428;;g;0.627;g;0.469;g;1.065;g;0.321;;g;300;g;180;g;266;g;59 att;1,693;act;1,436;aat;47;agt;29;;att;1.334;act;1.188;aat;;agt;;;att;258;act;359;aat;24;agt;14 c;41;c;28;c;1,858;c;1,265;;c;;c;;c;1.442;c;1.174;;c;10;c;10;c;1,045;c;424 a;675;a;875;a;1,880;a;1,138;;a;0.668;a;0.848;a;1.669;a;0.969;;a;75;a;290;a;525;a;252 g;2,382;g;551;g;2,193;g;945;;g;2.025;g;0.491;g;1.738;g;0.808;;g;522;g;66;g;953;g;104 gtt;1,413;gct;2,241;gat;41;ggt;27;;gtt;1.020;gct;1.728;gat;;ggt;;;gtt;232;gct;92;gat;1;ggt;11 c;53;c;35;c;2,131;c;2,017;;c;;c;;c;1.690;c;1.476;;c;6;c;4;c;150;c;836 a;664;a;1,276;a;1,455;a;1,345;;a;0.591;a;1.079;a;1.233;a;1.263;;a;230;a;368;a;225;a;47 g;1,083;g;704;g;1,781;g;635;;g;0.905;g;0.673;g;1.375;g;0.485;;g;227;g;112;g;245;g;268 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; IV 100;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;;;;I 100;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235,027;24.10.17;;;V 100;Danio rerio (Zebrafish) ;;;;; ttt;57;tct;2,268;tat;64;tgt;57;;ttt;4;tct;2;tat;2;tgt;1;;ttt;82;tct;2,741;tat;41;tgt;73 c;2,617;c;68;c;2,900;c;3,690;;c;2,598;c;1,923;c;2,732;c;1,903;;c;1,607;c;16;c;1,925;c;1,109 a;1,146;a;1,281;a;;a;446;;a;2,021;a;2,255;a;−;a;560;;a;596;a;1,705;a;;a;114 g;1,422;g;987;g;;g;2,047;;g;1,702;g;1,116;g;−;g;1,858;;g;1,966;g;653;g;;g;359 ctt;1,797;cct;2,011;cat;48;cgt;2,065;;ctt;157;cct;4;cat;2;cgt;3,182;;ctt;2,203;cct;2,570;cat;82;cgt;1,656 c;39;c;30;c;2,219;c;34;;c;1,638;c;1,167;c;2,006;c;142;;c;33;c;16;c;3,157;c;196 a;1,005;a;2,228;a;2,137;a;1,256;;a;2,102;a;2,320;a;2,718;a;377;;a;1,991;a;1,672;a;857;a;873 g;1,440;g;853;g;2,234;g;767;;g;2,207;g;929;g;1,016;g;1,427;;g;2,447;g;1,468;g;2,170;g;481 att;3,032;act;2,572;aat;84;agt;52;;att;2;act;44;aat;2;agt;0;;att;2,105;act;2,929;aat;196;agt;114 c;73;c;50;c;3,328;c;2,266;;c;3,916;c;1,920;c;3,729;c;1,881;;c;82;c;82;c;8,525;c;3,459 a;1,209;a;1,567;a;3,367;a;2,038;;a;23;a;2,501;a;3,874;a;2,044;;a;612;a;2,366;a;4,283;a;2,056 g;4,267;g;987;g;3,928;g;1,693;;g;7,670;g;1,174;g;1,033;g;1,469;;g;4,258;g;538;g;7,775;g;848 gtt;2,531;gct;4,014;gat;73;ggt;48;;gtt;4;gct;1;gat;0;ggt;0;;gtt;1,893;gct;751;gat;8;ggt;90 c;95;c;63;c;3,817;c;3,613;;c;1,885;c;1,773;c;3,839;c;3,946;;c;49;c;33;c;1,224;c;6,820 a;1,189;a;2,286;a;2,606;a;2,409;;a;3,769;a;4,334;a;4,118;a;2,347;;a;1,876;a;3,002;a;1,836;a;383 g;1,940;g;1,261;g;3,190;g;1,137;;g;559;g;521;g;591;g;964;;g;1,852;g;914;g;1,999;g;2,186 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; IV 1;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;;;;III 1;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;;;;;IV r;R2 des tRNAs. 121 eucaryotes;;;;; ttt;0.26;tct;10.46;tat;0.30;tgt;0.26;;ttt;0.37;tct;10.46;tat;0.41;tgt;1.73;;ttt;;tct;881;tat;;tgt; c;12.07;c;0.31;c;13.38;c;17.02;;c;12.07;c;0.82;c;13.73;c;19.86;;c;914;c;;c;748;c;743 a;5.29;a;5.91;a;0.00;a;2.06;;a;5.83;a;5.91;a;0.00;a;2.06;;a;734;a;758;a;;a; g;6.56;g;4.55;g;0.00;g;9.45;;g;6.74;g;4.55;g;0.00;g;14.37;;g;775;g;731;g;;g;815 ctt;8.29;cct;9.28;cat;0.22;cgt;9.53;;ctt;8.97;cct;9.28;cat;0.28;cgt;9.53;;ctt;807;cct;816;cat;;cgt;760 c;0.18;c;0.14;c;10.24;c;0.16;;c;0.18;c;0.21;c;10.24;c;0.27;;c;;c;;c;938;c; a;4.64;a;10.28;a;9.86;a;5.79;;a;4.64;a;10.28;a;16.17;a;16.69;;a;748;a;713;a;614;a;801 g;6.64;g;3.93;g;10.31;g;3.54;;g;7.08;g;3.93;g;10.89;g;3.54;;g;697;g;743;g;822;g;570 att;13.99;act;11.87;aat;0.39;agt;0.24;;att;14.90;act;12.62;aat;0.60;agt;0.30;;att;847;act;803;aat;;agt; c;0.34;c;0.23;c;15.36;c;10.45;;c;0.58;c;0.69;c;16.85;c;10.45;;c;;c;;c;913;c;797 a;5.58;a;7.23;a;15.54;a;9.40;;a;5.58;a;8.70;a;15.54;a;11.31;;a;740;a;788;a;770;a;666 g;19.69;g;4.55;g;18.12;g;7.81;;g;24.14;g;5.55;g;38.50;g;9.05;;g;892;g;866;g;845;g;594 gtt;11.68;gct;18.52;gat;0.34;ggt;0.22;;gtt;12.75;gct;20.86;gat;0.77;ggt;1.14;;gtt;840;gct;863;gat;;ggt; c;0.44;c;0.29;c;17.61;c;16.67;;c;0.78;c;1.98;c;18.55;c;16.67;;c;;c;;c;791;c;818 a;5.49;a;10.55;a;12.02;a;11.12;;a;6.53;a;59.00;a;54.62;a;45.84;;a;723;a;748;a;880;a;795 g;8.95;g;5.82;g;14.72;g;5.25;;g;22.31;g;37.52;g;25.71;g;53.21;;g;793;g;809;g;728;g;597
Tableau des effectifs des gènes de tRNAs 121 eucaryotes.
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Tableau des effectifs des gènes de tRNAs 121 eucaryotes.
- Liens: Sélection des 121 eucaryotes tableaux synthétiques des 121
- Utilisation de ces tableaux: Le tableau III1 92 530, est comparé au tableau III1 55 948 des tableaux synthétiques, pour l'indice de la multiplicité. Les codons en gras ont un indice multiplié par 3 à 10 par rapport à la tendance de l'ensemble des codons calculée dans III1 55 948. Le processus normal de duplication chez les eucaryotes (et non zebrafish) entre en résonance avec ces codons décuplés. Voilà encore une autre illustration de la résonance dans l'ADN.
- Légende: Décompte des gènes tRNAs par codon suivant la base de données gtRNAdb [5].
- 5 : nombre de tRNAs d'un codon se terminant par t. Ce sont les plus faibles.
- 113 : nombre de tRNAs d'un codon se terminant par t: Changement de t en c chez les archées et de c en t chez les eucaryotes.
- 4 366: Effectif élevé de tRNAs d'un codon se terminant par g chez les procaryotes.
- 2622: Effectif faible de tRNAs supérieurs à t et à c .
- 160: Changement de codon g Chez les archées et les eucaryotes.
- Tableaux:
- Nombre de tRNAs des 121 eucaryotes, tableau III 92 530.
- Pour 100 000 tRNAs des 121 eucaryotes, tableau III100 92 530.
- tRNAs pour 1 génome, tableau III1 92 530, indice de la multiplicité = nombre de tRNAs / 121.
- Tableaux non formatés: voir tableur
III;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;;92,530;;III 100;100000 tRNAs. 121 eucaryotes. 92 530;;;;;;;;III 1;tRNAs par génome de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;;92 530 ttt;45;tct;1,266;tat;50;tgt;209;;ttt;49;tct;1,368;tat;54;tgt;226;;ttt;0.37;tct;10.46;tat;0.41;tgt;1.73 c;1,461;c;99;c;1,661;c;2,403;;c;1,579;c;107;c;1,795;c;2,597;;c;12.07;c;0.82;c;13.73;c;19.86 a;705;a;715;a;;a;249;;a;762;a;773;a;0;a;269;;a;5.83;a;5.91;a;0.00;a;2.06 g;816;g;551;g;;g;1,739;;g;882;g;595;g;0;g;1,879;;g;6.74;g;4.55;g;0.00;g;14.37 ctt;1,085;cct;1,123;cat;34;cgt;1,153;;ctt;1,173;cct;1,214;cat;37;cgt;1,246;;ctt;8.97;cct;9.28;cat;0.28;cgt;9.53 c;22;c;25;c;1,239;c;33;;c;24;c;27;c;1,339;c;36;;c;0.18;c;0.21;c;10.24;c;0.27 a;561;a;1,244;a;1,957;a;2,020;;a;606;a;1,344;a;2,115;a;2,183;;a;4.64;a;10.28;a;16.17;a;16.69 g;857;g;476;g;1,318;g;428;;g;926;g;514;g;1,424;g;463;;g;7.08;g;3.93;g;10.89;g;3.54 att;1,803;act;1,527;aat;72;agt;36;;att;1,949;act;1,650;aat;78;agt;39;;att;14.90;act;12.62;aat;0.60;agt;0.30 c;70;c;83;c;2,039;c;1,265;;c;76;c;90;c;2,204;c;1,367;;c;0.58;c;0.69;c;16.85;c;10.45 a;675;a;1,053;a;1,880;a;1,369;;a;729;a;1,138;a;2,032;a;1,480;;a;5.58;a;8.70;a;15.54;a;11.31 g;2,921;g;672;g;4,658;g;1,095;;g;3,157;g;726;g;5,034;g;1,183;;g;24.14;g;5.55;g;38.50;g;9.05 gtt;1,543;gct;2,524;gat;93;ggt;138;;gtt;1,668;gct;2,728;gat;101;ggt;149;;gtt;12.75;gct;20.86;gat;0.77;ggt;1.14 c;94;c;240;c;2,245;c;2,017;;c;102;c;259;c;2,426;c;2,180;;c;0.78;c;1.98;c;18.55;c;16.67 a;790;a;7,139;a;6,609;a;5,547;;a;854;a;7,715;a;7,143;a;5,995;;a;6.53;a;59.00;a;54.62;a;45.84 g;2,699;g;4,540;g;3,111;g;6,439;;g;2,917;g;4,907;g;3,362;g;6,959;;g;22.31;g;37.52;g;25.71;g;53.21
Processus E et résonance des 121 eucaryotes
[modifier | modifier le wikicode]Processus E et résonance des 121 eucaryotes
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Processus E et résonance des 121 eucaryotes
- Légende
IV 1;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;;;I 1;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;;235027;;IV1-I1;E;;;;;; ttt;0.26;tcc;0.31;tat;0.30;tgt;0.26;;ttt;0.25;tct;0.12;tat;0.10;tgt;0.07;;ttt;0.26;tcc;0.31;tat;0.30;tgt;0.26 atc;0.34;acc;0.23;aat;0.39;agt;0.24;;att;0.12;act;2.55;aat;0.12;agt;0.02;;atc;0.34;acc;0.21;aat;0.39;agt;0.24 ctc;0.18;ccc;0.14;cat;0.22;cgc;0.16;;ctt;9.15;cct;0.25;cat;0.10;cgc;8.26;;ctc;0.09;ccc;0.14;cat;0.22;cgc;0.07 gtc;0.44;gcc;0.29;gat;0.34;ggt;0.22;;gtt;0.22;gct;0.05;gat;0.00;ggt;0.02;;gtc;0.44;gcc;0.29;gat;0.34;ggt;0.22 ttc;12.07;tct;10.46;tac;13.38;tgc;17.02;;ttc;1.51;tcc;1.12;tac;1.59;tgc;1.11;;ttc;10.56;tct;9.34;tac;11.79;tgc;15.92 att;13.99;act;11.87;aac;15.36;agc;10.45;;atc;2.28;acc;1.12;aac;2.17;agc;1.10;;att;11.71;act;10.75;aac;13.18;agc;9.36 ctt;8.29;cct;9.28;cac;10.24;cgt;9.53;;ctc;0.95;ccc;0.68;cac;1.17;cgt;1.85;;ctt;7.33;cct;8.60;cac;9.07;cgt;7.67 gtt;11.68;gct;18.52;gac;17.61;ggc;16.67;;gtc;1.10;gcc;1.03;gac;2.24;ggc;2.30;;gtt;10.58;gct;17.49;gac;15.37;ggc;14.37 tta;5.29;tca;5.91;taa;−;tga;2.06;;tta;1.18;tca;1.31;taa;−;tga;0.33;;tta;4.11;tca;4.59;taa;−;tga;1.73 ata;5.58;aca;7.23;aaa;15.54;aga;9.40;;ata;0.01;aca;1.46;aaa;2.26;aga;1.19;;ata;5.56;aca;5.77;aaa;13.28;aga;8.21 cta;4.64;cca;10.28;caa;9.86;cga;5.79;;cta;1.23;cca;1.35;caa;1.58;cga;0.22;;cta;3.41;cca;8.93;caa;8.28;cga;5.57 gta;5.49;gca;10.55;gaa;12.02;gga;11.12;;gta;2.20;gca;2.53;gaa;2.40;gga;1.37;;gta;3.29;gca;8.02;gaa;9.62;gga;9.75 ttg;6.56;tcg;4.55;tag;−;tgg;9.45;;ttg;0.99;tcg;0.65;tag;−;tgg;1.08;;ttg;5.57;tcg;3.90;tag;−;tgg;8.36 atg;19.69;acg;4.55;aag;18.12;agg;7.81;;atg;4.47;acg;0.68;aag;0.60;agg;0.86;;atg;15.22;acg;3.87;aag;17.52;agg;6.95 ctg;6.64;ccg;3.93;cag;10.31;cgg;3.54;;ctg;1.29;ccg;0.54;cag;0.59;cgg;0.83;;ctg;5.36;ccg;3.39;cag;9.71;cgg;2.71 gtg;8.95;gcg;5.82;gag;14.72;ggg;5.25;;gtg;0.33;gcg;0.30;gag;0.34;ggg;0.56;;gtg;8.62;gcg;5.51;gag;14.37;ggg;4.69 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; III 1;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;92,530;;;IV 1;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;;;III1−IV1.;;R;;;;; ttt;0.37;tcc;0.82;tat;0.41;tgt;1.73;;ttt;0.26;tcc;0.31;tat;0.30;tgt;0.26;;ttt;0.11;tcc;0.50;tat;0.12;tgt;1.46 atc;0.58;acc;0.69;aat;0.60;agt;0.30;;atc;0.34;acc;0.23;aat;0.39;agt;0.24;;atc;0.24;acc;0.45;aat;0.21;agt;0.06 ctc;0.18;ccc;0.21;cat;0.28;cgc;0.27;;ctc;0.18;ccc;0.14;cat;0.22;cgc;0.16;;ctc;0;ccc;0.07;cat;0.06;cgc;0.12 gtc;0.78;gcc;1.98;gat;0.77;ggt;1.14;;gtc;0.44;gcc;0.29;gat;0.34;ggt;0.22;;gtc;0.34;gcc;1.69;gat;0.43;ggt;0.92 ttc;12.07;tct;10.46;tac;13.73;tgc;19.86;;ttc;12.07;tct;10.46;tac;13.38;tgc;17.02;;ttc;0;tct;0;tac;0.35;tgc;2.83 att;14.90;act;12.62;aac;16.85;agc;10.45;;att;13.99;act;11.87;aac;15.36;agc;10.45;;att;0.91;act;0.75;aac;1.50;agc;0 ctt;8.97;cct;9.28;cac;10.24;cgt;9.53;;ctt;8.29;cct;9.28;cac;10.24;cgt;9.53;;ctt;0.68;cct;0;cac;0;cgt;0 gtt;12.75;gct;20.86;gac;18.55;ggc;16.67;;gtt;11.68;gct;18.52;gac;17.61;ggc;16.67;;gtt;1.07;gct;2.34;gac;0.94;ggc;0 tta;5.83;tca;5.91;taa;−;tga;2.06;;tta;5.29;tca;5.91;taa;−;tga;2.06;;tta;0.54;tca;0;taa;−;tga;0 ata;5.58;aca;8.70;aaa;15.54;aga;11.31;;ata;5.58;aca;7.23;aaa;15.54;aga;9.40;;ata;0;aca;1.47;aaa;0;aga;1.91 cta;4.64;cca;10.28;caa;16.17;cga;16.69;;cta;4.64;cca;10.28;caa;9.86;cga;5.79;;cta;0;cca;0.00;caa;6.31;cga;10.90 gta;6.53;gca;59.00;gaa;54.62;gga;45.84;;gta;5.49;gca;10.55;gaa;12.02;gga;11.12;;gta;1.04;gca;48.45;gaa;42.60;gga;34.73 ttg;6.74;tcg;4.55;tag;−;tgg;14.37;;ttg;6.56;tcg;4.55;tag;−;tgg;9.45;;ttg;0.18;tcg;0;tag;−;tgg;4.93 atg;24.14;acg;5.55;aag;38.50;agg;9.05;;atg;19.69;acg;4.55;aag;18.12;agg;7.81;;atg;4.45;acg;1.00;aag;20.37;agg;1.24 ctg;7.08;ccg;3.93;cag;10.89;cgg;3.54;;ctg;6.64;ccg;3.93;cag;10.31;cgg;3.54;;ctg;0.44;ccg;0;cag;0.59;cgg;0 gtg;22.31;gcg;37.52;gag;25.71;ggg;53.21;;gtg;8.95;gcg;5.82;gag;14.72;ggg;5.25;;gtg;13.36;gcg;31.70;gag;10.99;ggg;47.97
Sensibilite du processus E
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux:Sensibilité du processus E
- Légende
IV 1;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;23;;I 1;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235027;23 ttt;0,26;tcc;0,31;tat;0,30;tgt;0,26;;ttt;0,25;tct;0,12;tat;0,10;tgt;0,07 atc;0,34;acc;0,23;aat;0,39;agt;0,24;;att;0,12;act;2,55;aat;0,12;agt;0,02 ctc;0,18;ccc;0,14;cat;0,22;cgc;0,16;;ctt;9,15;cct;0,25;cat;0,10;cgc;8,26 gtc;0,44;gcc;0,29;gat;0,34;ggt;0,22;;gtt;0,22;gct;0,05;gat;0;ggt;0,02 ttc;12,07;tct;10,46;tac;13,38;tgc;17,02;;ttc;1,51;tcc;1,12;tac;1,59;tgc;1,11 att;13,99;act;11,87;aac;15,36;agc;10,45;;atc;2,28;acc;1,12;aac;2,17;agc;1,10 ctt;8,29;cct;9,28;cac;10,24;cgt;9,53;;ctc;0,95;ccc;0,68;cac;1,17;cgt;1,85 gtt;11,68;gct;18,52;gac;17,61;ggc;16,67;;gtc;1,10;gcc;1,03;gac;2,24;ggc;2,30 tta;5,29;tca;5,91;taa;−;tga;2,06;;tta;1,18;tca;1,31;taa;−;tga;0,33 ata;5,58;aca;7,23;aaa;15,54;aga;9,40;;ata;0,01;aca;1,46;aaa;2,26;aga;1,19 cta;4,64;cca;10,28;caa;9,86;cga;5,79;;cta;1,23;cca;1,35;caa;1,58;cga;0,22 gta;5,49;gca;10,55;gaa;12,02;gga;11,12;;gta;2,20;gca;2,53;gaa;2,40;gga;1,37 ttg;6,56;tcg;4,55;tag;−;tgg;9,45;;ttg;0,99;tcg;0,65;tag;−;tgg;1,08 atg;19,69;acg;4,55;aag;18,12;agg;7,81;;atg;4,47;acg;0,68;aag;0,60;agg;0,86 ctg;6,64;ccg;3,93;cag;10,31;cgg;3,54;;ctg;1,29;ccg;0,54;cag;0,59;cgg;0,83 gtg;8,95;gcg;5,82;gag;14,72;ggg;5,25;;gtg;0,33;gcg;0,30;gag;0,34;ggg;0,56 ;;;;;;;;;;;;;;;; 7,90;;;;;;;;;;;;;;;; IV 1.79;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;23;;-37,3;265,0;;;IV1.265;;; ttt;0,03;tcc;0,04;tat;0,04;tgt;0,03;;ttt;12;tcc;31;tat;37;tgt;44 atc;0,04;acc;0,03;aat;0,05;agt;0,03;;atc;34;acc;0,1;aat;39;agt;121 ctc;0,02;ccc;0,02;cat;0,03;cgc;0,02;;ctc;-0,7;ccc;6;cat;27;cgc;-0,8 gtc;0,06;gcc;0,04;gat;0,04;ggt;0,03;;gtc;24;gcc;73;gat;−;ggt;113 ttc;1,53;tct;1,32;tac;1,69;tgc;2,16;;ttc;1;tct;18;tac;6;tgc;94 att;1,77;act;1,50;aac;1,94;agc;1,32;;att;-22,4;act;34;aac;-11;agc;20,7 ctt;1,05;cct;1,17;cac;1,30;cgt;1,21;;ctt;10;cct;73;cac;11;cgt;-35 gtt;1,48;gct;2,34;gac;2,23;ggc;2,11;;gtt;35;gct;127;gac;0;ggc;-8 tta;0,67;tca;0,75;taa;−;tga;0,26;;tta;-43;tca;-43;taa;−;tga;-20,1 ata;0,71;aca;0,92;aaa;1,97;aga;1,19;;ata;−;aca;-37;aaa;-13;aga;0 cta;0,59;cca;1,30;caa;1,25;cga;0,73;;cta;-52;cca;-4;caa;-21,2;cga;233 gta;0,69;gca;1,33;gaa;1,52;gga;1,41;;gta;-68;gca;-47;gaa;-37;gga;3 ttg;0,83;tcg;0,58;tag;−;tgg;1,20;;ttg;-16;tcg;-11;tag;−;tgg;10 atg;2,49;acg;0,58;aag;2,29;agg;0,99;;atg;-44;acg;-16;aag;281;agg;15 ctg;0,84;ccg;0,50;cag;1,30;cgg;0,45;;ctg;-35;ccg;-8;cag;120;cgg;-46 gtg;1,13;gcg;0,74;gag;1,86;ggg;0,66;;gtg;248;gcg;143;gag;441;ggg;18 ;;;;;;;;;;;;;;;; 7,90;;;;;;;;;;;;;;;; IV1.79p;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;23;;-37,3;265,0;;;IV1.265p;;; ttt;0,03;tct;1,32;tat;0,04;tgt;0,03;;ttt;12;tct;1 067;tat;37;tgt;44 att;1,77;act;1,50;aat;0,05;agt;0,03;;att;1 427;act;58;aat;39;agt;121 ctt;1,05;cct;1,17;cat;0,03;cgt;1,21;;ctt;10;cct;473;cat;27;cgt;-35 gtt;1,48;gct;2,34;gat;0,04;ggt;0,03;;gtt;661;gct;4 725;gat;-;ggt;113 ttc;1,53;tcc;0,04;tac;1,69;tgc;2,16;;ttc;1;tcc;-96;tac;6;tgc;94 atc;0,04;acc;0,03;aac;1,94;agc;1,32;;atc;-98;acc;-97;aac;-11;agc;20,7 ctc;0,02;ccc;0,02;cac;1,30;cgc;0,02;;ctc;-98;ccc;-97;cac;11;cgc;-0,8 gtc;0,06;gcc;0,04;gac;2,23;ggc;2,11;;gtc;-95;gcc;-96;gac;0;ggc;-8 tta;0,67;tca;0,75;taa;−;tga;0,26;;tta;-43;tca;-43;taa;−;tga;-20,1 ata;0,71;aca;0,92;aaa;1,97;aga;1,19;;ata;−;aca;-37;aaa;-13;aga;0 cta;0,59;cca;1,30;caa;1,25;cga;0,73;;cta;-52;cca;-4;caa;-21,2;cga;233 gta;0,69;gca;1,33;gaa;1,52;gga;1,41;;gta;-68;gca;-47;gaa;-37;gga;3 ttg;0,83;tcg;0,58;tag;−;tgg;1,20;;ttg;-16;tcg;-11;tag;−;tgg;10 atg;2,49;acg;0,58;aag;2,29;agg;0,99;;atg;-44;acg;-16;aag;281;agg;15 ctg;0,84;ccg;0,50;cag;1,30;cgg;0,45;;ctg;-35;ccg;-8;cag;120;cgg;-46 gtg;1,13;gcg;0,74;gag;1,86;ggg;0,66;;gtg;248;gcg;143;gag;441;ggg;18
Zebrafish
[modifier | modifier le wikicode]Comparaison Zebrafish, 121 Eucaryotes, Bactéries
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IV 100;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;;;;V 100;Danio rerio (Zebrafish) ;;;;12258;;;I 100;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235027; ttt;57;tct;2,268;tat;64;tgt;57;;ttt;82;tct;2,741;tat;41;tgt;73;;ttt;4;tct;2;tat;2;tgt;1 c;2,617;c;68;c;2,900;c;3,690;;c;1,607;c;16;c;1,925;c;1,109;;c;2,598;c;1,923;c;2,732;c;1,903 a;1,146;a;1,281;a;;a;446;;a;596;a;1,705;a;;a;114;;a;2,021;a;2,255;a;−;a;560 g;1,422;g;987;g;;g;2,047;;g;1,966;g;653;g;;g;359;;g;1,702;g;1,116;g;−;g;1,858 ctt;1,797;cct;2,011;cat;48;cgt;2,065;;ctt;2,203;cct;2,570;cat;82;cgt;1,656;;ctt;157;cct;4;cat;2;cgt;3,182 c;39;c;30;c;2,219;c;34;;c;33;c;16;c;3,157;c;196;;c;1,638;c;1,167;c;2,006;c;142 a;1,005;a;2,228;a;2,137;a;1,256;;a;1,991;a;1,672;a;857;a;873;;a;2,102;a;2,320;a;2,718;a;377 g;1,440;g;853;g;2,234;g;767;;g;2,447;g;1,468;g;2,170;g;481;;g;2,207;g;929;g;1,016;g;1,427 att;3,032;act;2,572;aat;84;agt;52;;att;2,105;act;2,929;aat;196;agt;114;;att;2;act;44;aat;2;agt;0 c;73;c;50;c;3,328;c;2,266;;c;82;c;82;c;8,525;c;3,459;;c;3,916;c;1,920;c;3,729;c;1,881 a;1,209;a;1,567;a;3,367;a;2,038;;a;612;a;2,366;a;4,283;a;2,056;;a;23;a;2,501;a;3,874;a;2,044 g;4,267;g;987;g;3,928;g;1,693;;g;4,258;g;538;g;7,775;g;848;;g;7,670;g;1,174;g;1,033;g;1,469 gtt;2,531;gct;4,014;gat;73;ggt;48;;gtt;1,893;gct;751;gat;8;ggt;90;;gtt;4;gct;1;gat;0;ggt;0 c;95;c;63;c;3,817;c;3,613;;c;49;c;33;c;1,224;c;6,820;;c;1,885;c;1,773;c;3,839;c;3,946 a;1,189;a;2,286;a;2,606;a;2,409;;a;1,876;a;3,002;a;1,836;a;383;;a;3,769;a;4,334;a;4,118;a;2,347 g;1,940;g;1,261;g;3,190;g;1,137;;g;1,852;g;914;g;1,999;g;2,186;;g;559;g;521;g;591;g;964 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; IV100−V100;;;;;;;;;V100 − I100;;;;;;;;;IV100−I100. ;;% Processus E des 121 Eucaryotes.;;;;; ttt;-30;tct;-17;tat;37;tgt;-22;;ttt;95;tct;30;tat;96;tgt;98;;ttt;93;tct;15;tat;97;tgt;98 c;39;c;76;c;34;c;70;;c;-38;c;87;c;-30;c;-42;;c;1;c;97;c;6;c;48 a;48;a;-25;a;;a;74;;a;-71;a;-24;a;;a;-80;;a;-43;a;-43;a;−;a;-20 g;-28;g;34;g;;g;82;;g;13;g;-42;g;;g;-81;;g;-16;g;-12;g;−;g;9 ctt;-18;cct;-22;cat;-41;cgt;20;;ctt;26;cct;55;cat;98;cgt;-48;;ctt;9;cct;42;cat;96;cgt;-35 c;17;c;46;c;-30;c;-83;;c;-79;c;74;c;36;c;28;;c;-75;c;86;c;10;c;-76 a;-50;a;25;a;60;a;30;;a;-5;a;-28;a;-68;a;57;;a;-52;a;-4;a;-21;a;70 g;-41;g;-42;g;3;g;37;;g;10;g;37;g;53;g;-66;;g;-35;g;-8;g;54;g;-46 att;31;act;-12;aat;-57;agt;-55;;att;-46;act;34;aat;99;agt;100;;att;-23;act;25;aat;97;agt;99 c;-10;c;-39;c;-61;c;-34;;c;97;c;46;c;56;c;46;;c;97;c;13;c;-11;c;17 a;49;a;-34;a;-21;a;-1;;a;96;a;-5;a;10;a;1;;a;98;a;-37;a;-13;a;0 g;0;g;45;g;-49;g;50;;g;-44;g;-54;g;87;g;-42;;g;-44;g;-16;g;74;g;13 gtt;25;gct;81;gat;89;ggt;-46;;gtt;0;gct;-58;gat;100;ggt;100;;gtt;26;gct;56;gat;100;ggt;99 c;48;c;48;c;68;c;-47;;c;92;c;97;c;-68;c;42;;c;96;c;99;c;-1;c;-8 a;-37;a;-24;a;30;a;84;;a;-50;a;-31;a;-55;a;-84;;a;-68;a;-47;a;-37;a;3 g;5;g;28;g;37;g;-48;;g;70;g;43;g;70;g;56;;g;71;g;59;g;81;g;15
Comparaison de Zebrafish aux eucaryotes à résonance
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;fca;;&emsp ;;;bta;;&emsp ;;;ttr*;;&emsp ;;;bacu;;&emsp ;;;cmk;;&emsp ;;;zebra; code;frq;rup;;code;frq;rup;;code;frq;rup;;code;frq;rup;;code;frq;rup;;code;frq;rup tgc;32;3;;gac;42;5;;tgc;22;64;;gtg;32;31;;gga;66;14;;ctg;300;5 cta;33;33;;aga;44;43;;gca;36;19;;gca;42;7;;gct;75;8;;cct;315;7 gag;44;7;;ggc;63;24;;ggc;43;12;;gac;45;22;;ggg;81;16;;tct;336;7 cag;47;2;;aaa;78;49;;aga;48;2;;aga;55;16;;atg;94;46;;act;359;3 gga;48;4;;agg;116;23;;gac;49;10;;ggc;64;5;;acg;137;6;;gca;368;5 aaa;50;6;;tgt;143;15;;agg;54;37;;agg;67;28;;gta;145;16;;cac;387;10 agg;53;2;;gag;164;9;;aaa;74;193;;aaa;86;198;;gcc;168;23;;agc;424;23 aga;54;26;;tgg;178;90;;tgg;217;82;;tgg;256;83;;aca;206;108;;atg;522;1 cca;68;1050;;tgc;338;16;;gag;395;111;;gag;468;111;;gag;428;260;;aaa;525;59 caa;782;13;;gga;391;11;;gga;833;112;;gga;987;118;;gtg;1,540;151;;ggc;836;14 aag;887;35;;gaa;435;198;;ggg;1,766;8;;ggg;2,148;10;;gcg;3,858;53;;aag;953;10 cga;1,201;;;ggg;1,295;;;gaa;1,901;;;gaa;2,368;;;gca;5,898;;;aac;1,045; &emsp ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; T;3729;;;;4040;;;;5845;;;;7080;;;;13727;;;;12258; X;1201;;;;1295;;;;1901;;;;2368;;;;5898;;;;1045; mpe;19;;;;23;;;;17;;;;20;;;;34;;;;221; epe;17;;;;17;;;;16;;;;19;;;;21;;;;120; % e/m;85;;;;74;;;;96;;;;96;;;;63;;;;55; xpe;68;;;;78;;;;74;;;;86;;;;94;;;;525; X/mpe;62;;;;57;;;;114;;;;119;;;;174;;;;5; X/xpe;18;;;;17;;;;26;;;;28;;;;63;;;;2; sre;2870;;;;3060;;;;5112;;;;6227;;;;12380;;;;2834; spe;859;;;;980;;;;733;;;;853;;;;1347;;;;9424; faibles;3;;;;10;;;;4;;;;3;;;;8;;;;0; minpe;5;;;;4;;;;3;;;;4;;;;2;;;;44;
Zebrafish, distributions des tRNAs sur les chromosomes
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- Légende
max;;;11;25;58;920;108;12;29;50;56;8;5;51;15;4;46;11;28;40;3;201;357;187;2;18;21;;;; ;;;chr1;chr2;chr3;chr4;chr5;chr6;chr7;chr8;chr9;chr10;chr11;chr12;chr13;chr14;chr15;chr16;chr17;chr18;chr19;chr20;chr21;chr22;chr23;chr24;chr25;z8;scaffold;total;vides 6;ttt;PheAAA;;;;6;;;;;;;;;;;;;;;;1;1;;;;1;;1;10; 89;ttc;GAA;;6;58;89;4;2;;1;;;;;;;;;2;1;;2;;1;1;;21;4;5;197; 16;tta;LeuTAA;11;12;;10;;;;;;;;;;;;;16;1;;8;;;;;;14;1;73; 201;ttg;CAA;;;1;4;;;;;2;;;;;;1;;28;;;201;1;2;;;;1;;241;9 191;ctt;LeuAAG;;12;;191;;12;25;;5;1;;;;1;;;;;;;1;4;;;;2;16;270; 4;ctc;GAG;;;;4;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;4; 178;cta;TAG;;6;;178;;10;22;;5;2;;2;;;;;;;;;1;2;;;;2;14;244; 265;ctg;CAG;;;;265;6;;;;;;;1;;;;;1;2;;3;7;2;;1;;;12;300;10 148;att;IleAAT;1;10;46;148;5;2;1;;;;;;;;2;;3;1;1;;1;2;;;21;2;12;258; 8;atc;GAT;;;;8;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;2;10; 20;ata;TAT;;;;9;;;20;;3;;;1;;;;;1;;;3;;3;;;;35;;75; 196;atg;MetCAT;1;2;4;196;13;;;;56;;;2;;;;;3;2;1;3;11;187;;3;;23;15;522;7 172;gtt;ValAAC;;;;172;4;;1;28;;;4;1;4;;;;5;1;;;1;3;;;;1;7;232; 3;gtc;GAC;;;;2;;;;;;;;;;;;;3;;;;;;;;;1;;6; 163;gta;TAC;;;;163;7;;;39;;;;1;;1;;;10;;;;3;2;;;;;4;230; 169;gtg;CAC;;;;169;2;;;25;;;2;;4;;;;12;;;;1;3;;;;1;8;227;13 269;tct;SerAGA;;16;1;269;6;;;;4;;;;;;;1;2;;;15;7;;;;;4;11;336; 1;tcc;GGA;;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;1;;;;;;0;;2; 141;tca;TGA;;8;;141;8;;1;;5;;;;;;;;1;;;16;5;;;;;3;20;208; 58;tcg;CGA;;7;;58;1;1;1;;1;;1;;;;;;3;;;2;;;;;;1;5;81;13 187;cct;ProAGG;2;8;;187;8;;;50;1;;;1;12;;1;;1;4;3;5;;8;;;;2;22;315; 1;ccc;GGG;;1;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;2; 101;cca;TGG;;14;;101;2;2;;47;2;;;1;15;;1;;;1;;1;;;;;;2;16;205; 135;ccg;CGG;;7;;135;5;1;;;;;;1;;;1;;;1;;3;;4;;;;2;20;180;10 243;act;ThrAGT;;22;;243;11;;2;;1;1;;43;;;1;;;;;;1;16;;1;2;1;14;359; 6;acc;GGT;;;;3;;;;;;;;6;;;;;;;;;;;;;;;1;10; 195;aca;TGT;;3;;195;10;1;;;3;;;29;;;;11;2;1;;1;;13;1;;;2;18;290; 51;acg;CGT;;;1;51;1;;;;;;;1;;;;1;2;1;;1;1;1;;;1;1;3;66;6 54;gct;AlaAGC;;;54;10;1;;;;;;;;;4;;;1;;;;5;;;1;15;1;;92; 4;gcc;GGC;;;;4;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;4; 357;gca;TGC;3;;;3;;;;;;;;;;1;;;;1;;1;357;;;;;1;1;368; 106;gcg;CGC;;;;3;;;1;;;;;;;;;;;;;;106;;;;;;2;112;13 3;tat;TyrATA;;;;3;;;;;;;;;;;2;;;;;;;;;1;;;;6; 155;tac;GTA;;;;155;6;;;;;;;;;;46;1;;;;;1;;;;;8;18;235; 8;cat;HisATG;;;;8;;;;;;;;;;;1;;;;;;;;;;;;1;10; 314;cac;GTG;;21;;314;4;;;1;5;;;;1;;1;;2;1;;5;5;;1;;;2;24;387; 49;caa;GlnTTG;1;1;;32;1;1;;49;2;;;;12;;;;;;;;;1;;;1;3;1;105; 162;cag;CTG;2;8;55;162;7;;1;;2;;;2;;1;;1;3;2;1;;3;2;;;;3;11;266;2 23;aat;AsnATT;;;;23;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;24; 920;aac;GTT;;22;;920;21;6;10;;;;;31;1;;10;;1;;;;7;2;2;;;8;4;1045; 416;aaa;LysTTT;1;25;;416;11;1;1;;9;;;;;;1;;4;1;;2;13;;;;;4;36;525; 815;aag;CTT;1;21;;815;38;4;6;;;;;22;1;;13;1;;;1;;8;4;;;;6;12;953;7 1;gat;AspATC;;;;0;;;;;;;;;;;;;1;;;;;;;;;;;1; 108;gac;GTC;;;;25;108;;;;;;;;;;;;;;;;3;2;;;8;4;;150; 170;gaa;GluTTC;;;;170;5;1;;;;;;;;1;16;1;;;;;2;4;1;;;6;18;225; 156;gag;CTC;4;;;156;6;;;;;;;;;;44;5;;;;;1;2;1;;3;7;16;245;13 6;tgt;CysACA;;;;6;;;;;;;;;;;1;;;;;1;;;;;;1;;9; 82;tgc;GCA;;;5;2;2;;;;;;5;;;;;;;;;82;1;;1;;;38;;136; 7;tga;SeCTCA;3;;;7;;;;;;;;;;;1;;1;;;;;;;;;0;2;14; 29;tgg;TrpCCA;;1;2;0;;;29;;;;;;;;1;;;1;1;;1;;;3;;4;1;44;10 127;cgt;ArgACG;;;;127;6;;2;1;;;;;;;40;2;;;;;1;;;;3;6;15;203; 19;cgc;GCG;;2;;19;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;2;24; 65;cga;TCG;5;;;65;2;;19;;;;;2;;;;1;1;;;;1;;;;1;5;5;107; 42;cgg;CCG;8;;;42;1;1;;;;;;;;;;1;1;;;;;;;;;1;4;59;12 13;agt;SerACT;;;;13;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;;14; 327;agc;GCT;;4;;327;25;;12;;;1;5;;;;;;25;;;1;6;2;;;;2;14;424; 143;aga;ArgTCT;1;12;;143;8;;3;;3;;;51;;;1;;;1;;;;17;;1;;1;10;252; 67;agg;CCT;;;1;7;6;2;1;;13;;;2;;;;;;;;;1;67;;;;3;1;104;7 8;ggt;GlyACC;;;;8;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;3;;11; 598;ggc;GCC;;14;;598;39;;;;;8;;;4;1;;;;40;;;4;2;;18;4;;12;744; 30;gga;TCC;;;;30;2;1;;;;;;;;;2;;2;;;;3;4;1;;;;;45; 188;ggg;CCC;;1;;188;22;;;;;;;;;;1;;;23;;;;;;2;;124;1;362;10 2;taa;SupTTA;;;;2;;;;;;;;;;;;;1;;;;;;;;;1;2;6;142 8;tag;CTA;;;;8;;;;;;;;;;;;;;1;;;;;;;;;;9; ;;Undet???;;;;15;1;;;;;;;;;;;;;;;;2;;;;;1;;19; ;;;44;266;228;7825;416;49;159;241;122;13;17;200;54;10;188;26;138;87;8;358;573;362;9;31;81;347;440;12292; ;2 rRNAs;;chr1;chr2;chr3;chr4;chr5;chr6;chr7;chr8;chr9;chr10;chr11;chr12;chr13;chr14;chr15;chr16;chr17;chr18;chr19;chr20;chr21;chr22;chr23;chr24;chr25;Zv8Na10776;scaffold;total; ;Mit;;;;;;1 rRNA;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; NCBI;22;tRNAs;31;76;346;5723;140;52;72;240;60;12;13;123;46;11;135;17;109;5;7;262;253;143;11;18;72;;1,385;9,362; MB;0.02;longueur;59.58;59.64;62.63;78.09;72.5;60.27;74.28;54.3;56.46;45.42;45.48;49.18;52.19;52.66;48.04;55.27;53.46;51.02;48.45;55.2;45.93;39.13;46.22;42.17;37.5;;334;1,679; ;39.9;GC%;36.4;36.7;36.9;38.4;36.4;36.4;36.7;36.5;36.5;36.6;36.4;36.3;36.5;36.6;36.8;36.5;36.6;36.6;36.4;36.6;36.6;37;36.7;36.3;36.6;;37;37; ;13;Protein;2,176;2,229;2,436;2,450;2,713;2,123;2,531;1,986;1,832;1,779;1,596;1,679;1,805;1,481;1,814;1,996;1,703;1,541;1,762;1,890;1,948;1,674;1,755;1,365;1,453;;9,370;57,087; ;−;RNAs au;326;274;362;1252;395;250;322;272;226;186;166;157;230;170;193;308;190;179;185;192;237;293;204;138;129;;1,639;8,475; ;37;gene;1,444;1,464;1,992;7,909;1,679;1,238;1,641;1,452;1,060;1,076;952;1,091;1,046;945;1,229;1,255;1,111;915;1,038;1,376;1,374;1,288;1,015;823;978;;9,570;46,961; ;−;pseudo;22;8;23;70;6;16;14;6;9;14;4;5;6;6;14;11;9;9;7;3;8;8;5;10;4;;67;364; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 75 pb;tRNA/longueur;;0.55;3.35;2.73;75.15;4.30;0.61;1.61;3.33;1.62;0.21;0.28;3.05;0.78;0.14;2.94;0.35;1.94;1.28;0.12;4.86;9.36;6.94;0.15;0.55;1.62;;;;1/10 000
Taurus, distributions des tRNAs sur les chromosomes
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Taurus, distributions des tRNAs sur les chromosomes
- Légende: Bases de données, gtRNAdb.fa [6], NCBI [orgn]
max;;;51;58;62;28;64;42;56;37;28;50;58;31;59;35;36;46;63;48;78;10;37;41;36;20;62;16;26;22;28;67;;; ;;;chr1;chr2;chr3;chr4;chr5;chr6;chr7;chr8;chr9;chr10;chr11;chr12;chr13;chr14;chr15;chr16;chr17;chr18;chr19;chr20;chr21;chr22;chr23;chr24;chr25;chr26;chr27;chr28;chr29;X;total;; 1;ttt;PheAAA;1;;;;1;;;;;;;;;;1;;1;;;1;;;;;;;1;;;;6;;PheAAA 8;ttc;PheGAA;1;;;;;1;1;2;;;;2;2;;3;;1;1;;;;;7;;;;;;1;8;30;;PheGAA 3;tta;LeuTAA;;;;1;;1;;;1;;;;1;;2;;;1;;;;;3;;;;;;;;10;;LeuTAA 6;ttg;LeuCAA;;2;;;;;1;;1;1;;;;1;;;;1;1;;;;6;;;;;;;;14;;LeuCAA 4;ctt;LeuAAG;1;;;;;;1;;;3;;;1;;;;;;;;;;4;;1;;;;;;11;;LeuAAG 0;ctc;LeuGAG;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;;LeuGAG 2;cta;LeuTAG;;;;;;;;1;;2;;;;;;;;;1;;;;;;1;;;;;;5;;LeuTAG 3;ctg;LeuCAG;;;3;;;1;;;;;;;;;;;;1;;;;;1;;;;;;;;6;;LeuCAG 14;att;IleAAT;;;;1;;;;;;;;;;;;;;;2;;1;;14;;;;;;;;18;;IleAAT 0;atc;IleGAT;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;;IleGAT 3;ata;IleTAT;1;;;;;;1;;;1;1;;;;;;;1;;;;;3;;;;;;;;8;;IleTAT 19;atg;MetCAT;1;;1;1;1;;2;;1;;1;1;1;2;;;;2;1;;;;19;;1;;;;;;35;;MetCAT 11;gtt;ValAAC;2;;11;1;;;1;;;;;;;;;;;1;;;;;4;;;;;;;;20;;ValAAC 0;gtc;ValGAC;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;;ValGAC 6;gta;ValTAC;;;6;1;1;;1;;1;;1;;;;1;;1;;3;1;1;;2;;;;;;;1;21;;ValTAC 15;gtg;ValCAC;;2;15;;;;2;1;2;;;1;;;1;2;;2;;1;;;5;;1;;;2;1;1;39;;ValCAC 8;tct;SerAGA;;;;;;;;;;1;;;;1;;;;1;2;;;;8;;;;;;;;13;;SerAGA 4;tcc;SerGGA;4;1;1;3;;2;;1;2;1;3;;;2;;;1;;1;1;1;;;1;1;2;;;;4;32;;SerGGA 3;tca;SerTGA;;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;1;;3;;1;;;1;;;7;;SerTGA 3;tcg;SerCGA;;;1;;1;;;;;;;;;;;;;;1;;;;3;;1;;;;;;7;;SerCGA 7;cct;ProAGG;;;1;1;;;;;;2;;;;;1;;;;;;;;1;;7;;;;;;13;;ProAGG 0;ccc;ProGGG;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;;ProGGG 6;cca;ProTGG;;;;;;;;;;2;;;1;;;;;;;;;;;;6;;;;;;9;;ProTGG 1;ccg;ProCGG;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;1;;;;1;;1;;;;;;4;;ProCGG 7;act;ThrAGT;;1;1;;;;;;;;;;;;;;;1;3;;;;7;;;;;;;1;14;;ThrAGT 1;acc;ThrGGT;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;1;1;;ThrGGT 3;aca;ThrTGT;2;;;1;;;1;;;3;;;;;;1;;1;;1;;;;;;;;;;;10;;ThrTGT 2;acg;ThrCGT;1;;;;;;;1;;;;;1;;;;;;1;;;;2;;1;;;;;;7;;ThrCGT 15;gct;AlaAGC;1;;;;;;2;;;;2;;;1;;;;4;1;;1;;15;;1;1;;;1;1;31;;AlaAGC 1;gcc;AlaGGC;;;;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;1;;2;;AlaGGC 7;gca;AlaTGC;1;2;1;;2;3;3;;1;;2;;1;1;2;;2;1;3;;;;7;1;;1;;;;1;35;;AlaTGC 5;gcg;AlaCGC;2;1;1;;;1;;;1;;1;;;;;;;;;;;1;5;1;;;;;;2;16;;AlaCGC 2;tat;TyrATA;;;;1;;;;;2;;1;2;;1;1;1;;;;;1;;1;;;;;;;;11;;TyrATA 7;tac;TyrGTA;3;1;2;;4;;2;2;1;7;1;;;3;1;;1;;;1;3;;4;1;;1;;;;1;39;;TyrGTA 1;taa;SupTTA;;;;;;;;1;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;1;;;1;4;;SupTTA 2;tag;SupCTA;1;1;1;;;1;;2;2;1;2;;;;1;;;;;;;1;;;;;;;;;13;;SupCTA 2;cat;HisATG;;;;;;;1;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;2;4;;HisATG 11;cac;HisGTG;;;11;;;;;1;;3;1;;;;;;;1;;;;;1;;1;;;;;;19;;HisGTG 6;caa;GlnTTG;1;;1;;1;;1;;1;1;;;;;;;;;5;;;;6;;1;;;;;1;19;;GlnTTG 13;cag;GlnCTG;2;2;13;1;3;1;1;;;1;;1;1;1;;2;;1;2;;1;;5;;1;1;;;;;40;;GlnCTG 0;aat;AsnATT;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;;AsnATT 24;aac;AsnGTT;;;24;1;;;1;;;;;1;1;;;;;;1;;;;1;;;;;;;;30;;AsnGTT 10;aaa;LysTTT;6;1;5;3;2;1;1;1;3;2;;1;1;;4;7;4;;6;3;3;3;10;6;2;;;1;;2;78;;LysTTT 12;aag;LysCTT;1;;3;2;1;2;3;1;1;4;1;;;;1;1;;;2;;2;1;2;;12;;;;;;40;;LysCTT 1;gat;AspATC;;;1;;;;;;;;;1;1;1;;;1;;;;;;;;;;;;;1;6;;AspATC 8;gac;AspGTC;2;;8;;2;;2;1;1;3;1;1;;1;1;;3;3;4;;2;;3;;1;;1;1;;1;42;;AspGTC 31;gaa;GluTTC;14;21;31;12;26;9;18;14;13;17;21;14;20;14;13;14;9;17;20;5;11;12;9;6;18;6;4;6;14;26;434;;GluTTC 12;gag;GluCTC;7;5;9;4;7;4;12;5;5;7;8;3;8;4;3;8;7;4;7;6;5;7;3;4;8;1;1;2;4;6;164;;GluCTC 9;tgt;CysACA;8;6;9;6;8;6;6;4;5;4;8;3;5;4;4;9;2;3;1;9;4;2;3;3;3;1;5;5;3;4;143;;CysACA 27;tgc;CysGCA;13;14;10;27;11;17;7;14;20;17;16;22;11;13;12;3;7;4;16;9;9;6;6;7;3;5;8;6;6;19;338;;CysGCA 5;tga;SeCTCA;1;4;;5;;1;;1;;2;1;1;1;1;1;;;5;;;1;1;;1;;;;1;;1;29;;SeCTCA 17;tgg;TrpCCA;3;3;10;3;4;5;12;3;1;4;11;7;7;6;5;4;5;8;17;1;9;6;9;4;5;2;4;3;2;15;178;;TrpCCA 7;cgt;ArgACG;;;1;1;;;;;;1;;;;1;;;;;;;;1;7;;;;;1;;;13;;ArgACG 1;cgc;ArgGCG;1;1;;1;1;;;1;;1;;;;;;;;;;1;;;;;;;;;;;7;;ArgGCG 3;cga;ArgTCG;1;;;;;;;1;;;1;;;;;;;;1;1;1;;2;;3;;;;;1;12;;ArgTCG 3;cgg;ArgCCG;1;1;;;;;1;1;;2;;;1;;;1;;;2;;;;3;;1;;;;;2;16;;ArgCCG 1;agt;SerACT;;;;;;;;1;;;1;1;;;;;;;;;;;;;;;1;;;;4;;SerACT 10;agc;SerGCT;1;1;;;;1;;;;2;;;1;;;;;;1;1;;;10;;;;;;1;;19;;SerGCT 5;aga;ArgTCT;3;2;2;;4;1;;;3;;1;;5;;3;1;2;1;2;1;1;;4;;2;;1;1;2;2;44;;ArgTCT 10;agg;ArgCCT;4;3;7;5;3;3;10;4;3;2;7;4;7;1;7;2;4;3;10;1;1;4;2;2;7;2;1;1;1;5;116;;ArgCCT 3;ggt;GlyACC;;;;2;1;;;;1;1;1;1;1;1;2;;1;;1;1;;3;;;1;;;;;2;20;;GlyACC 8;ggc;GlyGCC;3;3;4;3;2;1;1;1;;1;3;1;5;;1;2;3;8;2;;2;3;4;1;;1;3;2;1;2;63;;GlyGCC 27;gga;GlyTCC;19;15;14;4;23;11;20;7;8;9;27;12;17;11;12;10;18;23;17;9;9;13;8;6;16;7;11;7;7;21;391;;GlyTCC 78;ggg;GlyCCC;51;58;62;28;64;42;56;37;28;50;58;31;59;35;36;46;63;48;78;10;37;41;36;20;62;16;26;22;28;67;1295;;GlyCCC ;;Undet???;;1;2;1;;;;;;;1;;1;;;;;;1;;;;;;;;;;;;9;;Undet??? ;;total;164;152;273;121;173;116;171;109;108;160;183;111;161;106;119;114;136;147;217;64;107;105;259;64;170;47;68;62;73;202;4064;; ;NCBI;;chr1;chr2;chr3;chr4;chr5;chr6;chr7;chr8;chr9;chr10;chr11;chr12;chr13;chr14;chr15;chr16;chr17;chr18;chr19;chr20;chr21;chr22;chr23;chr24;chr25;chr26;chr27;chr28;chr29;X;MT;Un;Total ;mb;Size;158.34;137.06;121.43;120.83;121.19;119.46;112.64;113.39;105.71;104.31;107.31;91.16;84.24;84.65;85.3;81.72;75.16;66;64.06;72.04;71.6;61.44;52.53;62.71;42.9;51.68;45.41;46.31;51.51;148.82;0.02;9.22;2670.15 ;;GC% ;40.1;40.8;41.9;40.6;41.7;40;42;41.2;40;41.5;42.9;40.4;43.7;41.4;41.8;42.6;42.3;45.4;46;41;43.1;43.4;43.4;41.9;47.1;42.8;41.8;42.2;44.2;40.6;39.4;49.6; ;;Protein ;1981;2085;2922;1673;2753;1420;2791;1573;1068;2014;2176;886;1740;1066;1946;1452;1411;2691;2718;562;1135;1414;1393;751;1684;991;478;798;1427;1994;13;101; ;;rRNA ;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;1;-;-;-;-;-;2;-; ;;tRNA ;67;49;171;59;54;51;55;29;39;65;44;47;42;38;47;30;42;50;70;31;26;23;191;19;66;14;33;23;24;79;22;-; ;; RNA ;405;362;462;386;444;320;474;421;281;369;388;268;377;235;269;324;261;378;428;192;460;276;297;192;259;207;147;111;231;488;-;10; ;;Gene ;1267;1237;1832;1142;1715;953;1814;1097;821;1447;1309;660;1111;734;1491;946;893;1648;1570;508;855;762;1134;469;973;559;377;444;903;1643;13;105; ;;Pseudo ;165;163;223;123;218;134;243;142;142;151;122;72;118;95;264;102;115;156;108;67;98;67;93;61;50;62;33;64;109;328;-;4; ;;compte;164;152;273;121;173;116;171;109;108;160;183;111;161;106;119;114;136;147;217;64;107;105;259;64;170;47;68;62;73;202;;;
Distribution homogène des gènes de tRNA sur les chromosomes, Bos Taurus et Felis catus
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bta;ggg;ggc;gga;gaa;gag;tgc;tgt;gct; ;fca;cga;aag;caa X;67;2;21;26;6;7;4;1;;chrA1;100;57;67 chr1;51;2;19;14;7;13;8;1;;chrA2;80;55;66 chr2;58;3;15;21;5;14;6;0;;chrA3;73;50;44 chr3;62;4;14;31;9;10;9;0;;chrB1;70;49;72 chr4;28;3;4;12;4;27;6;0;;chrB2;71;52;62 chr5;64;2;23;26;7;11;8;0;;chrB3;70;54;45 chr6;42;1;11;9;4;17;6;0;;chrB4;66;61;53 chr7;56;1;20;18;12;14;6;2;;chrC1;109;99;60 chr8;37;1;7;14;5;20;4;0;;chrC2;66;39;48 chr9;28;2;8;13;5;19;5;0;;chrD1;53;40;32 chr10;50;1;9;17;7;17;4;0;;chrD2;40;19;28 chr11;58;3;27;21;8;16;8;2;;chrD3;65;33;29 chr12;31;1;12;14;3;22;3;0;;chrD4;46;34;38 chr13;59;5;17;20;8;11;5;0;;chrE1;61;42;22 chr14;35;0;11;14;4;13;4;1;;chrE2;33;36;18 chr15;36;1;12;13;3;12;4;0;;chrE3;29;37;17 chr16;46;2;10;14;8;3;9;0;;chrF1;41;25;27 chr17;63;3;18;9;7;7;2;0;;chrF2;42;23;17 chr18;48;8;23;17;4;4;3;4;;X;81;80;37 chr19;78;2;17;20;7;16;1;1;;Ud;5;2; chr20;10;0;9;5;6;9;9;0;;;;; chr21;37;2;9;11;5;9;4;1;;;;; chr22;41;3;13;12;7;6;2;0;;;;; chr23;36;4;8;9;3;6;3;15;;;;; chr24;20;1;6;6;4;7;3;0;;;;; chr25;62;0;16;18;8;3;3;1;;;;; chr26;16;1;7;6;1;5;1;1;;;;; chr27;26;3;11;4;1;8;5;0;;;;; chr28;22;2;7;6;2;6;5;0;;;;; chr29;28;1;7;14;4;6;3;1;;;;; bta 30 chromosomes;;;;;;;;;;fca 19 chromosomes;;; ;ggg;ggc;gga;gaa;gag;tgc;tgt;gct;;;cga;aag;caa total;1295;64;391;435;164;338;143;31;;total;1201;887;782 moy;43.2;2.1;13.0;14.5;5.5;11.3;4.8;1.0;;moy;62.9;46.6;41.2 ecartt;17.1;1.7;5.9;6.6;2.5;6.0;2.3;2.8;;ecartt;21.5;19.4;18.2 max;78;8;27;31;12;27;9;15;;max;109;99;72 min;10;0;4;4;1;3;1;0;;min;29;19;17 e/m%;40;78;45;46;46;53;49;270;;e/m%;34;42;44
Exemples de distributions des tRNAs sur les chromosomes
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- Légende: Bases de données, gtRNAdb.fa [7], NCBI [orgn]
- m, moyenne par chromosome, e, écart type.
- KEGG gtRNAdb
- sce Saccharomyces cerevisiae (S288c Apr 2011)
- mmu Mus musculus (mm10 Dec 2011)
- has Homo sapiens (hg38 - GRCh38 Dec 2013)
- oas Ovis aries (sheep) (Feb 2010)
- dre Danio rerio (Zebrafish) (Zv8 Apr 2009)
- bta Bos taurus (Cow Jun. 2014 Bos_taurus_UMD_3.1.1/bosTau8)
;tRNAs;Moyenne par chromosome;;;;NCBI;gtRNAdb; ;sce;mmu;has;oas;dre;bta;dre;bta ;4;37;90;200;31;67;44;164 ;13;8;8;111;76;49;266;152 ;10;40;4;127;346;171;228;273 ;28;8;1;51;5723;59;7825;121 ;20;10;17;65;140;54;416;173 ;10;53;144;52;52;51;49;116 ;36;10;21;66;72;55;159;171 ;11;7;5;42;240;29;241;109 ;10;7;3;38;60;39;122;108 ;24;11;3;31;12;65;13;160 ;16;47;13;77;13;44;17;183 ;21;3;9;37;123;47;200;111 ;21;105;4;34;46;42;54;161 ;14;12;18;45;11;38;10;106 ;20;4;9;40;135;47;188;119 ;17;2;27;20;17;30;26;114 ;−;12;33;42;109;42;138;136 ;−;0;1;34;5;50;87;147 ;−;10;6;20;7;70;8;217 ;−;17;0;184;262;31;358;64 ;−;0;1;22;253;26;573;107 ;−;−;0;19;143;23;362;105 ;−;−;4;26;11;191;9;259 ;−;−;0;69;18;19;31;64 ;−;−;−;20;72;66;81;170 ;−;−;−;20;−;14;−;47 ;−;−;−;75;−;33;−;68 ;−;−;−;−;−;23;−;62 ;−;−;−;−;−;24;−;73 ;−;−;−;−;−;79;−;202 Total;275;403;421;1567;7977;1578;11505;4062 m;17.2;19.2;17.5;58.0;319;52.6;460;144.4 e;8.0;25.0;32.9;47.2;1130;38.7;1542;51.5 e/m %;47;130;187;81;354;74;335;36
Archives exemples NCBI
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http://www.genome.jp/kegg/genome.html;;;;;;24.11.17 Paris ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; KEGG;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; uma;Ustilago maydis 521;;;;*;uma;;ecartt;3;moy;5;%;69;;ttt;;ecartt;13;moy;26;%;48;;;zro;;;ecartt;12;moy;39;%;32;;;;;;;;;;;;;; cal;Candida albicans WO-1;;;;*;Type ;Name ;Size;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ;Gene ;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;tRNA ;Gene ;Pseudo ;;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;;;;;;;;;;;;;; ttt;Thielavia terrestris NRRL 8126;;;;*;;;19.64;54;6783;34;111;6910;;;6;36.9;54.9;9802;156;9958;4;;;;7;9.76;39.2;4991;9;272;51;5323;;;;;;;;;;;;;; cgr;Candida glabrata CBS 138;;;;*;Chr;1;2.48;53.9;877;5;11;892;;Chr;1;10.1;54.2;2650;39;2689;-;;;Chr;A;1.11;39.2;580;-;33;5;618;;;;;;;;;;;;;; zro;Zygosaccharomyces rouxii CBS 732;;;;*;Chr;2;1.88;53.9;652;4;14;668;;Chr;2;9.48;55.1;2573;44;2617;4;;;Chr;B;1.39;38.8;706;-;39;8;753;;;;;;;;;;;;;; sce;Saccharomyces cerevisiae (S288c Apr 2011);;;;*;Chr;3;1.64;53.7;632;3;6;639;;Chr;3;4.79;52.6;1180;23;1203;-;;;Chr;C;1.46;39;774;-;47;8;829;;;;;;;;;;;;;; dme;Drosophila melanogaster (D. melanogaster Aug. 2014 BDGP Release 6 + ISO1 MT/dm6);;;;*;Chr;4;0.88;54.4;273;3;5;280;;Chr;4;4.58;55.2;1205;20;1225;-;;;Chr;D;1.5;39.1;768;-;28;7;803;;;;;;;;;;;;;; tbl;Tetrapisispora blattae CBS 6284;;;;*;Chr;5;1.39;53.8;504;1;7;510;;Chr;5;4.4;55.7;1202;16;1218;-;;;Chr;E;0.88;39.4;416;9;32;10;467;;;;;;;;;;;;;; ncr;Neurospora crassa OR74A;;;;*;Chr;6;1.03;54.1;335;3;7;344;;Chr;6;3.57;56.3;992;14;1006;-;;;Chr;F;1.55;39.3;806;-;30;3;839;;;;;;;;;;;;;; mcc;Macaca mulatta (Rhesus Oct. 2010 BGI CR_1.0/rheMac3);;;;*;Chr;7;0.96;54.1;331;2;8;341;;Max Min Total;;;44;14;156;;;;;Chr;G;1.87;39.3;941;-;63;10;1014;;;;;;;;;;;;;; mmu;Mus musculus (mm10 Dec 2011);;;;*;Chr;8;0.81;54.1;275;1;4;278;;;;;;;;;;;;Max Min Total;;;;63;28;272;;;;;;;;;;;;;;;; ptr;Pan troglodytes (Chimp Feb. 2011 CSAC 2.1.4/panTro4);;;;*;Chr;9;0.73;53.9;259;1;3;263;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; cpic;Chrysemys picta (western painted turtle);;;;*;Chr;10;0.69;54.2;237;-;3;239;;cgr;;;ecartt;6;moy;16;%;39;;sce;;;ecartt;8;moy;17;%;47;;;;;;;;;;;;;; cel;Caenorhabditis elegans (WS220 Oct 2010);;;;*;Chr;11;0.69;54.1;239;1;3;242;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;;;;;;;;;;;; has;Homo sapiens (hg38 - GRCh38 Dec 2013);;;;*;Chr;12;0.65;54;221;-;0;221;;;13;12.32;38.8;5202;4;207;9;5421;;;16;12.07;38.4;5983;12;275;111;6399;18;;;;;;;;;;;;; bdi;Brachypodium distachyon (JGI v1.0 8X);;;;*;Chr;13;0.61;54;207;-;3;209;;Chr;A;0.49;40.1;200;-;9;-;209;;Chr;I;0.23;39.3;94;-;4;2;101;1;;;;;;;;;;;;; ath;Arabidopsis thaliana (TAIR10 Feb 2011);;;;*;Chr;14;0.61;54.1;185;1;7;193;;Chr;B;0.5;38.9;212;-;9;1;222;;Chr;II;0.81;38.3;415;-;13;4;432;-;;;;;;;;;;;;; osa;Oryza sativa;;;;*;Chr;15;0.58;54.5;185;1;3;189;;Chr;C;0.56;39.7;230;-;7;-;237;;Chr;III;0.32;38.5;168;-;10;4;184;2;;;;;;;;;;;;; cbr;Caenorhabditis briggsae (C. briggsae Jan. 2007 WUGSC 1.0/cb3);;;;*;Chr;16;0.55;54.1;185;-;6;191;;Chr;D;0.65;39.1;283;-;18;-;301;;Chr;IV;1.53;37.9;766;-;28;4;799;1;;;;;;;;;;;;; ssc;Sus scrofa (Pig Aug. 2011 SGSC Sscrofa10.2/susScr3);;;;*;Chr;17;0.58;54;200;1;7;208;;Chr;E;0.69;39;278;-;9;-;287;;Chr;V;0.58;38.5;287;-;20;9;317;1;;;;;;;;;;;;; oaa;Ornithorhynchus anatinus (platypus) (WUGSC 5.0.1 Mar 2007);;;;*;Chr;18;0.56;54.3;186;-;1;187;;Chr;F;0.93;38.1;383;-;15;-;398;;Chr;VI;0.27;38.7;128;-;10;4;143;1;;;;;;;;;;;;; cfa;Canis familiaris (dog) (CanFam3.1 Sept 2011);;;;*;Chr;19;0.57;53.8;200;3;5;207;;Chr;G;0.99;38.6;434;-;18;-;451;;Chr;VII;1.09;38.1;539;-;36;10;585;-;;;;;;;;;;;;; oas;Ovis aries (sheep) (Feb 2010);;;;*;Chr;20;0.52;53.9;190;2;1;193;;Chr;H;1.05;38.1;460;-;14;-;474;;Chr;VIII;0.56;38.5;290;-;11;4;305;-;;;;;;;;;;;;; zma;Zea mays (Version 5b.60);;;;*;Chr;21;0.47;54.2;166;1;1;166;;Chr;I;1.1;38.6;462;-;26;1;489;;Chr;IX;0.44;38.9;213;-;10;3;232;6;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;Chr;22;0.4;54.5;123;1;4;128;;Chr;J;1.2;38.9;514;-;17;2;533;;Chr;X;0.75;38.4;362;-;24;6;392;-;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;Chr;23;0.34;54;114;-;2;115;;Chr;K;1.3;38.2;556;-;22;3;581;;Chr;XI;0.67;38.1;317;-;16;5;338;-;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;Un;-;0.02;52.8;7;-;-;;;Chr;L;1.46;38.5;575;4;25;1;605;;Chr;XII;1.08;38.5;519;12;21;18;572;2;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;Max Min Total;;;;14;0;111;;;Chr;M;1.4;38.5;615;-;18;1;634;;Chr;XIII;0.92;38.2;469;-;21;15;505;-;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;MT;0.02;17.6;11;2;23;1;37;;Chr;XIV;0.78;38.6;398;-;14;6;418;-;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;Max Min Total;;;;26;7;230;;;;Chr;XV;1.09;38.2;546;-;20;11;579;2;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;Chr;XVI;0.95;38.1;472;-;17;6;497;2;;;;;;;;;;;;; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/?term=txid9606[orgn];;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;MT;0.09;17.1;19;2;24;1;46;-;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;Max Min Total;;;;36;4;299;;;;;;;;;;;;;;;; ;NCBI;;;ncr;;;ecartt;16;moy;59;%;27;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; uma;5270;;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;mmu;;;ecartt;25;moy;19;%;130;;;;ptr;;;ecartt;29;moy;15;%;194;;;;;;;;;;;; cal;5476;;;;;41;48.3;10785;212;415;176;10533;16;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;;;;;;;;;; ttt;35720;;;group;I;9.8;48.8;2637;6;72;52;2477;2;;;;2725.52;41.9;75959;33;403;32389;45765;9469;;;;;2981.5;40.7;75780;0;367;18258;36235;6329;;;;;;;;;;; cgr;5478;;;group;II;4.48;48.2;1134;22;36;14;1100;-;;Chr;1;195.47;41.3;4731;-;37;2031;2687;579;;;Chr;1;228.57;41.9;7522;-;49;1568;3407;570;;;;;;;;;;; zro;4956;;;group;III;5.27;48.8;1399;9;39;23;1325;1;;Chr;2;182.11;42.2;6282;-;8;2783;3491;609;;;Chr;2A;111.5;41.3;2525;-;4;749;1210;183;;;;;;;;;;; sce;4932;;;group;IV;6.00;48.5;1620;14;76;19;1594;8;;Chr;3;160.04;40.7;3507;-;40;1663;2225;480;;;Chr;2B;133.22;39.8;2975;-;4;666;1225;236;;;;;;;;;;; dme;7227;;;group;V;6.44;48.9;1754;17;64;33;1694;2;;Chr;4;156.51;42.5;4710;-;8;1991;2622;497;;;Chr;3;202.62;39.9;4687;-;4;1133;2032;381;;;;;;;;;;; tbl;1071379;;;group;VI;4.22;48.3;1076;5;56;19;1068;1;;Chr;5;151.84;42.7;4634;-;10;1952;2507;413;;;Chr;4;194.5;38.5;3064;-;1;956;1630;324;;;;;;;;;;; ncr;5141;;;group;VII;4.26;47.7;1164;4;72;16;1139;2;;Chr;6;149.74;41.6;3844;1;53;1572;2597;555;;;Chr;5;181.91;39.7;3116;-;14;940;1749;345;;;;;;;;;;; mcc;9544;;;;MT;0.06;36.1;28;-;28;-;58;2;;Chr;7;145.44;43.2;6336;-;10;2087;3798;935;;;Chr;6;175.4;39.8;3784;-;139;1086;2115;391;;;;;;;;;;; mmu;10090;;;Un;-;0.57;28.1;-;-;-;-;-;-;;Chr;8;129.4;42.6;3653;32;7;1673;2177;376;;;Chr;7;166.21;41;3696;-;12;1148;1994;396;;;;;;;;;;; ptr;9598;;;Max Min Total;;;;76;36;443;;;;;Chr;9;124.6;42.9;4406;-;7;1698;2276;374;;;Chr;8;147.91;40.4;2537;-;6;788;1370;256;;;;;;;;;;; cpic;8479;;;;;;;;;;;;;;Chr;10;130.7;41.6;3546;-;11;1546;2086;391;;;Chr;9;116.77;41.8;3061;-;3;704;1393;253;;;;;;;;;;; cel;6239;;;cpic;;;ecartt;4;moy;2;%;173;;;Chr;11;122.08;44;5650;-;47;2097;2852;381;;;Chr;10;135.93;41.8;3510;-;3;728;1415;248;;;;;;;;;;; has;9606;;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;Chr;12;120.13;42;2621;-;3;1593;2002;516;;;Chr;11;135.75;41.8;4745;-;13;774;2128;349;;cal;;;ecartt;11;moy;16;%;68; bdi;15368;;;;;461.75;45.8;7543;0;44;3644;24356;597;;Chr;13;120.42;41.9;2536;-;105;1513;2127;476;;;Chr;12;137.16;41.1;4112;-;10;927;1832;321;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo ath;3702;;;Chr;1;77.39;43.4;1179;-;16;121;616;17;;Chr;14;124.9;41.4;3007;-;12;1538;2111;455;;;Chr;13;100.45;39;1345;-;4;543;827;171;;;;14.28;33.5;6030;4;126;85;6263;18 osa;4530;;;Chr;2;68.45;42.8;949;-;9;115;496;15;;Chr;15;104.04;42.2;2872;-;4;1349;1620;282;;;Chr;14;91.97;41.2;2375;-;19;667;1226;197;;Chr;1;3.19;33.3;1353;-;23;22;1403;5 cbr;6238;;;Chr;3;75.88;42.9;1132;-;4;108;537;8;;Chr;16;98.21;41.2;2486;-;2;1081;1367;257;;;Chr;15;83.23;42.5;2435;-;8;744;1137;200;;Chr;2;2.23;33.5;997;-;24;15;1038;2 ssc;9823;;;Chr;4;49.33;43.4;998;-;7;86;453;4;;Chr;17;94.99;42.9;3610;-;12;1373;2005;427;;;Chr;16;81.59;44.9;2949;-;30;567;1330;158;;Chr;3;1.8;33.5;739;-;21;4;765;1 oaa;9258;;;Chr;5;4.92;43.8;52;-;0;1;25;-;;Chr;18;90.7;41.7;1855;-;0;966;1218;264;;;Chr;17;83.18;45.7;4213;-;33;742;1806;206;;Chr;4;1.6;33.4;654;-;17;12;685;2 cfa;9612;;;Chr;6;62.6;42.6;1047;-;1;84;456;8;;Chr;19;61.43;43.1;2328;-;10;831;1283;205;;;Chr;18;78.22;40.2;1241;-;1;401;601;113;;Chr;5;1.19;33.3;507;-;6;5;519;1 oas;9940;;;Chr;7;7.28;45.9;55;-;2;5;30;1;;Chr;X;171.03;39.7;3010;-;17;933;2291;912;;;Chr;19;61.31;48.4;4611;-;7;703;1966;210;;Chr;6;1.03;33.6;425;-;4;4;435;2 zma;4577;;;Chr;8;51.56;44.2;878;-;0;79;445;7;;Chr;Y;91.74;39.3;335;-;0;119;423;85;;;Chr;20;66.53;44.3;2063;-;0;484;936;137;;Chr;7;0.95;33.5;393;-;1;3;398;1 ;;;;Chr;10;7.27;48.4;156;-;1;17;65;-;;;MT;0.02;36.7;13;2;22;-;37;-;;;Chr;21;33.45;41.2;736;-;1;269;426;63;;Chr;R;2.29;33.8;962;4;30;20;1020;4 ;;;;Chr;11;5;44.3;116;-;0;9;52;-;;Un;-;93.44;43.6;2471;2;10;1126;2899;501;;;Chr;22;37.82;48.1;1690;-;0;397;749;85;;Max Min Total;;;;30;1;126;;; ;;;;Chr;13;1.22;50;1;-;0;1;2;-;;Max Min Total;;;;105;0;435;;;;;;Chr;X;155.55;39.8;2653;-;2;515;1470;391;;;;;;;;;;; ;;;;Chr;15;19.09;42.3;321;-;1;50;162;2;;;;;;;;;;;;;;Chr;Y;26.35;40.6;135;-;0;59;261;145;;;;;;;;;;; ;;;;Chr;17;4.55;48.5;97;-;0;13;54;-;;has;;;ecartt;33;moy;18;%;187;;;;;MT;0.02;43.7;13;2;22;-;13;-;;dme;;;ecartt;38;moy;42;%;90; ;;;;Chr;19;9.08;48;171;-;1;10;98;1;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;;Un;-;264.05;39.9;4163;-;29;804;2678;425;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo ;;;;Chr;21;1.37;50.9;14;-;0;-;9;-;;;;3088.3;42.1;108596;17;421;46261;53816;15820;;;Max Min Total;;;;139;0;418;;;;;;;137.55;41.0;30463;117;297;3816;17640;305 ;;;;Chr;22;2.51;46.4;22;-;1;5;12;-;;Chr;1;248.96;42.3;11046;17;90;4350;5078;1372;;;ath;;;ecartt;65;moy;125;%;52;;;Chr;X;23.54;42.5;5368;16;26;553;2669;69 ;;;;Chr;24;13.19;46.3;354;-;1;27;191;2;;Chr;2;242.19;40.3;8054;-;8;3638;3862;1166;;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;Chr;2L;23.51;41.8;5683;-;41;917;3490;48 ;;;;Chr;25;1.06;49.9;1;-;0;3;3;-;;Chr;3;198.3;39.7;6790;-;4;2723;2971;887;;;;;119.16;36.0;48148;4;625;7203;37898;4843;;Chr;2R;25.29;42.6;6039;101;100;677;3618;45 ;;;;;MT;0.02;39;13;2;22;-;13;-;;Chr;4;190.22;38.3;4374;-;1;2209;2441;799;;;Chr;1;30.43;35.9;12654;-;238;1969;9701;930;;Chr;3L;28.11;41.7;5867;-;50;750;3454;37 ;;;;Un;-;1904;44.8;35002;-;311;2910;20637;532;;Chr;5;181.54;39.5;4599;-;17;2225;2578;766;;;Chr;2;19.7;35.9;7599;2;95;1341;6312;1047;;Chr;4;1.35;35.4;295;-;0;37;111;6 ;;;;;;;;;;;;;;;Chr;6;170.81;39.6;5338;-;144;2408;3000;876;;;Chr;3;23.46;36.3;9474;2;92;1411;7624;1080;;Chr;3R;32.08;42.6;7186;-;80;854;4185;38 ;;;;;;;;;;;;;;;Chr;7;159.35;40.7;4843;-;21;2232;2774;896;;;Chr;4;18.59;36.2;7426;-;77;1072;5842;835;;Chr;Y;3.67;40.2;25;-;0;28;113;62 ;;;;cel;;;ecartt;89;moy;137;%;65;;;Chr;8;145.14;40.2;3962;-;5;1975;2152;661;;;Chr;5;26.98;35.9;10995;-;123;1410;8419;951;;;MT;0.02;17.8;13;2;22;-;37;- ;;;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;Chr;9;138.4;42.3;4572;-;3;2135;2262;702;;;MT;;0.37;44.8;117;3;21;-;131;-;;Un;-;6.16;41.1;6;-;-;-;5;- ;;;;;;100.26;35.5;28155;21;821;25266;46721;1885;;Chr;10;133.8;41.6;5237;-;3;2053;2174;631;;;Pltd;;0.15;36.3;85;7;37;-;129;-;;Max Min Total;;;;100;0;319;;; ;;;;Chr;I;15.07;35.7;4133;6;76;1221;4187;160;;Chr;11;135.09;41.6;6187;-;13;2267;2920;835;;;Max Min Total;;;;238;77;683;;;;;;;;;;;;;; ;;;;Chr;II;15.28;36.2;4703;-;80;1564;5193;262;;Chr;12;133.28;40.8;5648;-;9;2313;2521;680;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;Chr;III;13.78;35.7;3691;-;97;1060;3827;130;;Chr;13;114.36;40.2;1946;-;4;1235;1381;477;;;osa;;;ecartt;18;moy;51;%;35;;;tbl;;ecartt;21;moy;33;%;66;; ;;;;Chr;IV;17.49;34.6;5158;-;94;16207;19687;374;;Chr;14;107.04;42.2;3252;-;18;1704;2055;583;;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ;Gene ;; ;;;;Chr;V;20.92;35.4;6677;15;169;2210;7836;845;;Chr;15;101.99;43.4;3436;-;9;1778;1814;555;;;;;373.24;43.6;40881;0;615;8932;32915;1655;;;;14.05;31.8;5388;10;327;5725;; ;;;;Chr;X;17.72;35.2;3793;-;305;3004;5991;114;;Chr;16;90.34;45.1;4453;-;27;1700;1920;451;;;Chr;1;43.27;43.8;5673;-;84;1132;4485;171;;Chr;1;2.7;31.8;1042;-;53;1095;; ;;;;;MT;0.01;23.8;12;2;22;-;12;-;;Chr;17;83.26;45.3;6004;-;33;2131;2432;541;;;Chr;2;35.94;43.3;4668;-;69;1131;3626;141;;Chr;2;2.45;31.4;978;-;74;1052;; ;;;;Max Min Total;;;;305;76;843;;;;;Chr;18;80.37;39.8;1812;-;1;1013;988;295;;;Chr;3;36.41;43.7;5036;-;73;818;3848;133;;Chr;3;1.78;31.5;689;-;53;742;; ;;;;;;;;;;;;;;;Chr;19;58.62;47.9;6452;-;6;1750;2481;514;;;Chr;4;35.5;44.3;3570;-;63;737;2894;155;;Chr;4;1.45;32.2;550;5;32;587;; ;;;;bdi;;;ecartt;40;moy;105;%;38;;;Chr;20;64.44;43.9;2794;-;0;1276;1349;329;;;Chr;5;29.96;44;3277;-;55;615;2612;133;;Chr;5;1.32;31.6;481;5;31;517;; ;;;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;Chr;21;46.71;42.2;1240;-;1;687;756;202;;;Chr;6;31.25;43.6;3336;-;33;715;2683;140;;Chr;6;1.05;32;408;-;25;433;; ;;;;;;271.77;46.4;33844;0;525;6415;28911;1506;;Chr;22;50.82;47.7;2493;-;0;965;1172;348;;;Chr;7;29.7;43.5;3165;-;35;675;2581;134;;Chr;7;0.99;31.9;343;-;24;367;; ;;;;Chr;1;75.12;46.3;10003;-;155;1714;8388;385;;Chr;X;156.04;39.6;3739;-;4;1196;2158;859;;;Chr;8;28.44;43.4;2752;-;44;610;2269;129;;Chr;8;0.96;31.1;370;-;21;391;; ;;;;Chr;2;59.38;46.5;7674;-;121;1264;6483;274;;Chr;Y;57.23;45.4;325;-;0;298;577;395;;;Chr;9;23.01;43.5;2201;-;32;556;1843;92;;Chr;9;0.86;32.6;336;-;5;341;; ;;;;Chr;3;59.94;46.4;7537;-;111;1373;6429;311;;;MT;0.02;44.4;13;2;22;-;37;-;;;Chr;10;23.21;43.6;2102;-;47;607;1890;118;;Chr;10;0.49;31.8;191;-;9;200;; ;;;;Chr;4;48.77;46.3;5464;-;93;1251;4821;368;;Un;-;165.56;44.4;5810;17;186;3064;6445;1957;;;Chr;11;29.02;42.9;2643;-;28;709;2216;182;;Max Min Total;;;;74;5;327;;; ;;;;Chr;5;28.56;47;3166;-;45;813;2790;168;;Max Min Total;;;;144;0;629;;;;;;Chr;12;27.53;43;2458;-;52;627;1968;127;;;;;;;;;;; ;;;;Pltd;-;0.14;38.6;81;8;38;-;133;4;;;;;;;;;;;;;;Pltd;;0.13;39;108;8;38;-;159;5;;;;;;;;;;; ;;;;Un;-;0.22;47.2;19;-;-;1;13;3;;;;;;;;;;;;;;MT;;0.49;43.9;53;3;22;-;81;6;;;;;;;;;;; ;;;;Max Min Total;;;;155;45;563;;;;;;;;;;;;;;;;;Plsm;B1;0;44.2;2;-;-;-;-;-;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;Un;-;0.55;45.9;26;-;-;10;30;3;;;;;;;;;;; ;;;;cbr;;ecartt;27;moy;127;%;22;;;;;;;;;;;;;;;;Max Min Total;;;;84;28;675;;;;;;;;;;;;;; ;;;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;tRNA ; RNA ;Gene ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;105.2;;21237;759;28;21999;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;Chr;I;15.46;38;3096;118;4;3212;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;Chr;II;16.63;37.8;3351;98;5;3448;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;Chr;III;14.58;37.8;2909;108;4;3016;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;Chr;IV;17.49;37.4;3292;124;3;3414;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;Chr;V;19.5;37.7;4821;135;6;4962;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;Chr;X;21.54;37.7;3768;176;6;3947;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;Un;-;3.2;36.8;722;15;-;737;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;Max Min Total;;;176;98;774;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;cfa;;;ecartt;17;moy;10;%;169;;;ssc;;;ecartt;33;moy;22;%;148;;;oas;;;ecartt;47;moy;58;%;81;;;;mcc;;;ecartt;30;moy;18;%;170 ;;;;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;;;;;;;2327.62;41.3;58270;0;395;24029;36322;5040;;;;2435.26;41.9;61823;0;448;14074;28224;2365;;;;2584.84;42.4;42387;0;1567;6690;28381;3084;;;;;2835.96;41.6;54294;0;394;11124;32128 ;;;;;Chr;1;122.68;41.6;3540;-;8;1312;2078;257;;Chr;1;274.33;40.2;5392;-;21;1255;2423;260;;Chr;1;275.41;40.9;4492;-;200;593;2813;331;;;Chr;1;225.59;42;5515;-;63;1008;3150 ;;;;;Chr;2;85.43;42.8;2231;-;6;986;1384;152;;Chr;2;151.94;42.5;5641;-;29;988;2683;257;;Chr;2;248.97;41;3655;-;111;555;2139;264;;;Chr;2;204.79;39.9;3417;-;7;667;1857 ;;;;;Chr;3;91.89;40.3;1491;-;5;918;1076;177;;Chr;3;132.85;44.2;4054;-;36;941;1805;109;;Chr;3;224;42.4;4287;-;127;550;2739;295;;;Chr;3;185.82;41;3036;-;20;686;1966 ;;;;;Chr;4;88.28;40.4;1579;-;3;892;1142;183;;Chr;4;130.91;41.6;3628;-;70;868;1650;104;;Chr;4;119.22;40.6;1372;-;51;287;975;121;;;Chr;4;172.59;40;2775;-;136;652;1906 ;;;;;Chr;5;88.92;44.2;3124;-;26;1036;1652;147;;Chr;5;104.53;42.2;3219;-;12;653;1458;103;;Chr;5;107.84;42;2204;-;65;285;1616;174;;;Chr;5;190.43;38.6;2208;-;2;549;1378 ;;;;;Chr;6;77.57;42.6;2651;-;26;898;1514;155;;Chr;6;170.84;44.7;6262;-;16;1282;2724;167;;Chr;6;116.89;40;1361;-;52;206;823;120;;;Chr;6;180.05;39.8;2326;-;17;615;1561 ;;;;;Chr;7;80.97;41.0;2101;-;7;919;1253;170;;Chr;7;121.84;43.1;3720;-;143;889;1978;133;;Chr;7;100.01;41.6;1972;-;66;268;1197;114;;;Chr;7;169.6;41.7;3418;-;31;940;2151 ;;;;;Chr;8;74.33;40.6;1712;-;6;845;1227;198;;Chr;8;138.97;39.5;2216;-;2;644;1096;109;;Chr;8;90.62;40.2;1028;-;42;184;646;80;;;Chr;8;144.31;40.4;1947;-;6;411;1190 ;;;;;Chr;9;61.07;46.0;3224;-;19;886;1651;106;;Chr;9;139.51;41.2;3659;-;8;893;1715;169;;Chr;9;94.58;41.1;1001;-;38;191;690;81;;;Chr;9;129.88;41.9;2479;-;3;487;1267 ;;;;;Chr;10;69.33;42.7;1868;-;8;856;1190;153;;Chr;10;69.36;42.7;1455;-;5;428;664;54;;Chr;10;86.38;40.4;748;-;31;160;521;64;;;Chr;10;92.84;45.8;2563;-;0;480;1493 ;;;;;Chr;11;74.39;40.2;1640;-;9;723;1024;145;;Chr;11;79.17;40.6;1156;-;5;406;559;43;;Chr;11;62.17;46.3;2083;-;77;264;1449;91;;;Chr;11;133.66;41.2;2961;-;8;517;1662 ;;;;;Chr;12;72.5;39.0;1705;-;3;593;1024;165;;Chr;12;61.6;47.7;3151;-;44;708;1468;58;;Chr;12;79.03;42.8;1240;-;37;221;872;85;;;Chr;12;125.51;40.1;1976;-;4;409;1040 ;;;;;Chr;13;63.24;40.0;1164;-;3;620;794;126;;Chr;13;208.34;39.9;4724;-;4;918;1841;200;;Chr;13;82.95;43.8;1572;-;34;252;967;80;;;Chr;13;108.98;41.3;1779;-;4;451;1116 ;;;;;Chr;14;60.97;38.8;1099;-;5;566;799;141;;Chr;14;141.76;43.2;4088;-;11;811;1667;132;;Chr;14;62.57;45.8;1955;-;45;302;1446;106;;;Chr;14;127.89;41.9;3526;-;10;529;1885 ;;;;;Chr;15;64.19;40.2;1534;-;12;788;968;122;;Chr;15;140.41;39.9;2727;-;7;561;1106;115;;Chr;15;80.78;42;1682;-;40;176;1212;153;;;Chr;15;111.34;41.8;2223;-;4;429;1218 ;;;;;Chr;16;59.63;41.0;1305;-;16;556;870;119;;Chr;16;79.94;40.3;940;-;5;390;588;50;;Chr;16;71.69;41.1;631;-;20;139;464;68;;;Chr;16;77.22;45.9;2915;-;33;450;1605 ;;;;;Chr;17;64.29;41.7;1766;-;31;804;1129;123;;Chr;17;63.49;44.7;1823;-;5;459;821;46;;Chr;17;72.25;42.4;1080;-;42;184;739;72;;;Chr;17;95.68;38.9;981;-;4;350;676 ;;;;;Chr;18;55.84;42.8;1988;-;10;595;1214;125;;Chr;18;55.98;43.1;1368;-;17;400;659;41;;Chr;18;68.49;43.1;955;-;34;410;747;81;;;Chr;18;70.24;40;786;-;0;243;488 ;;;;;Chr;19;53.74;38.4;568;-;2;457;469;99;;Chr;X;125.94;40.4;2482;-;8;523;1172;170;;Chr;19;60.45;43.6;1206;-;20;307;685;39;;;Chr;19;53.67;49;3293;-;8;474;1819 ;;;;;Chr;20;58.13;44.3;2673;-;6;604;1377;123;;Chr;Y;43.55;47.5;118;-;0;57;147;45;;Chr;20;51.05;43.6;1203;-;184;186;1022;75;;;Chr;20;74.97;45;2017;-;28;304;1143 ;;;;;Chr;21;50.86;40.2;1367;-;3;439;871;170;;;MT;0.02;39.5;13;2;22;-;13;-;;Chr;21;49.99;44.3;1027;-;22;161;824;87;;;Chr;X;149.15;39.7;2067;-;6;442;1465 ;;;;;Chr;22;61.44;37.9;712;-;4;556;591;117;;Un;-;66.63;43.3;1741;2;62;331;1936;59;;Chr;22;50.78;42.9;841;-;19;96;473;42;;;Chr;Y;11.75;40.1;86;-;0;31;92 ;;;;;Chr;23;52.29;39.9;1006;-;3;512;667;124;;Max Min Total;;;;143;0;532;;;;;Chr;23;62.28;41.9;689;-;26;134;423;42;;;;MT;0.02;43.2;13;2;22;-;13 ;;;;;Chr;24;47.7;44.5;1550;-;2;560;890;74;;;;;;;;;;;;;Chr;24;41.98;47.3;1133;-;69;133;891;50;;;Un;-;400.24;41.3;1059;-;2;87;1077 ;;;;;Chr;25;51.63;41.4;1305;-;4;574;798;109;;zma;;;ecartt;30;moy;86;%;35;;;Chr;25;45.22;42.4;744;-;20;124;456;73;;;Max Min Total;;;;136;0;418;; ;;;;;Chr;26;38.96;45.4;1478;-;10;466;794;76;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;Chr;26;44.05;41.8;461;-;20;102;324;33;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;27;45.88;40.1;1662;-;3;464;858;128;;;;2106.33;46.0;57505;1;859;12070;47001;3591;;Chr;X;135.19;40.5;1765;-;75;220;1228;263;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;28;41.18;43.5;1194;-;0;461;642;70;;Chr;1;307.04;47;8611;-;116;1779;6948;468;;;MT;0.02;38.9;13;2;22;-;13;-;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;29;41.85;38.2;538;-;5;366;474;91;;Chr;2;244.44;47;6964;-;140;1438;5780;447;;Un;-;30.68;45.8;646;-;2;62;716;37;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;30;40.21;41.4;1210;-;5;441;681;86;;Chr;3;235.67;46.9;6181;-;79;1254;4945;368;;Max Min Total;;;;200;19;1591;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;31;39.9;39.5;644;-;0;357;486;71;;Chr;4;247;46.6;6047;-;109;1326;5118;390;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;32;38.81;36.9;706;-;0;302;464;121;;Chr;5;223.9;46.9;6655;-;101;1319;5293;408;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;33;31.38;39.2;694;-;2;330;414;57;;Chr;6;174.03;47.1;4897;1;78;1037;4049;326;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;34;42.12;40.4;627;-;2;380;471;57;;Chr;7;182.38;46.8;4778;-;59;928;3762;284;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;35;26.53;41.4;528;-;102;272;529;66;;Chr;8;181.12;47;5048;-;75;1217;4263;305;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;36;30.81;38.6;551;-;2;342;376;57;;Chr;9;159.77;47;4274;-;53;987;3590;307;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;37;30.9;40.2;712;-;3;438;453;45;;Chr;10;150.98;46.9;4050;-;49;785;3253;288;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;38;23.91;41.0;485;-;28;296;442;63;;;MT;0.57;43.9;163;4;29;-;213;26;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;X;123.87;40.3;2338;-;6;619;1586;472;;;Pltd;0.14;38.5;111;8;38;-;158;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;MT;0.02;39.7;13;2;22;-;13;-;;Un;-;28.03;46.7;512;1;19;108;428;24;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Un;-;83.33;47.2;493;-;2;146;474;;;Max Min Total;;;;140;49;945;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Max Min Total;;;;102;0;419;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;dre;;;ecartt;1130;moy;319;%;354;;;bta;;;ecartt;39;moy;53;%;74;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ;RNA ;Gene ;Pseudo;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ;RNA ;Gene ;Pseudo;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;1345.07;36.8;62823;1;7977;6836;37391;297;;;;2660.91;41.9;48993;1;1578;9712;32314;3888;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;1;59.58;36.4;2176;-;31;326;1444;22;;Chr;1;158.34;40.1;1981;-;67;405;1267;165;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;2;59.64;36.7;2229;-;76;274;1464;8;;Chr;2;137.06;40.8;2085;-;49;362;1237;163;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;3;62.63;36.9;2436;-;346;362;1992;23;;Chr;3;121.43;41.9;2922;-;171;462;1832;223;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;4;78.09;38.4;2450;-;5723;1252;7909;70;;Chr;4;120.83;40.6;1673;-;59;386;1142;123;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;5;72.5;36.4;2713;1;140;395;1679;6;;Chr;5;121.19;41.7;2753;-;54;444;1715;218;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;6;60.27;36.4;2123;-;52;250;1238;16;;Chr;6;119.46;40;1420;-;51;320;953;134;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;7;74.28;36.7;2531;-;72;322;1641;14;;Chr;7;112.64;42;2791;-;55;474;1814;243;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;8;54.3;36.5;1986;-;240;272;1452;6;;Chr;8;113.39;41.2;1573;-;29;421;1097;142;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;9;56.46;36.5;1832;-;60;226;1060;9;;Chr;9;105.71;40;1068;-;39;281;821;142;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;10;45.42;36.6;1779;-;12;186;1076;14;;Chr;10;104.31;41.5;2014;-;65;369;1447;151;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;11;45.48;36.4;1596;-;13;166;952;4;;Chr;11;107.31;42.9;2176;-;44;388;1309;122;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;12;49.18;36.3;1679;-;123;157;1091;5;;Chr;12;91.16;40.4;886;-;47;268;660;72;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;13;52.19;36.5;1805;-;46;230;1046;6;;Chr;13;84.24;43.7;1740;-;42;377;1111;118;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;14;52.66;36.6;1481;-;11;170;945;6;;Chr;14;84.65;41.4;1066;-;38;235;734;95;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;15;48.04;36.8;1814;-;135;193;1229;14;;Chr;15;85.3;41.8;1946;-;47;269;1491;264;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;16;55.27;36.5;1996;-;17;308;1255;11;;Chr;16;81.72;42.6;1452;-;30;324;946;102;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;17;53.46;36.6;1703;-;109;190;1111;9;;Chr;17;75.16;42.3;1411;-;42;261;893;115;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;18;51.02;36.6;1541;-;5;179;915;9;;Chr;18;66;45.4;2691;-;50;378;1648;156;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;19;48.45;36.4;1762;-;7;185;1038;7;;Chr;19;64.06;46;2718;-;70;428;1570;108;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;20;55.2;36.6;1890;-;262;192;1376;3;;Chr;20;72.04;41;562;-;31;192;508;67;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;21;45.93;36.6;1948;-;253;237;1374;8;;Chr;21;71.6;43.1;1135;-;26;460;855;98;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;22;39.13;37;1674;-;143;293;1288;8;;Chr;22;61.44;43.4;1414;-;23;276;762;67;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;23;46.22;36.7;1755;-;11;204;1015;5;;Chr;23;52.53;43.4;1393;-;191;297;1134;93;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;24;42.17;36.3;1365;-;18;138;823;10;;Chr;24;62.71;41.9;751;-;19;192;469;61;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Chr;25;37.5;36.6;1453;-;72;129;978;4;;Chr;25;42.9;47.1;1684;1;66;259;973;50;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;MT;0.02;39.9;13;2;22;-;37;-;;Chr;26;51.68;42.8;991;-;14;207;559;62;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Un;-;334.09;36.5;9370;-;1385;1639;9570;67;;Chr;27;45.41;41.8;478;-;33;147;377;33;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;Max Min Total;;;;5723;5;9384;;;;;Chr;28;46.31;42.2;798;-;23;111;444;64;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;Chr;29;51.51;44.2;1427;-;24;231;903;109;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;Chr;X;148.82;40.6;1994;-;79;488;1643;328;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;MT;0.02;39.4;13;2;22;-;13;-;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;Un;-;9.22;49.6;101;-;-;10;105;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;Max Min Total;;;;191;14;1600;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Zebrafish Taurus Catus
[modifier | modifier le wikicode]- Légende: Archive pour la distribution des tRNAs sur les chromosomes. Copie du gtRNAdb le 24.11.17
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Felis_catus_;F$;Bos_taurus_;B$;Danio_rerio_;D$;;24.11.17 Paris;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/eukaryota/Fcatu5/felCat5-tRNAs.fa;;;;;;http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/eukaryota/Btaur8/bosTau8-tRNAs.fa;;;;;;http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/eukaryota/Dreri_v8/danRer6-tRNAs.fa;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;AlaAGC;;D$chr4.trna1-MetCAT;;;D$chr1.trna118-LysCTT;;;D$chr2.trna100-AsnGTT;;;D$chr3.trna100-GlnCTG;;;D$chr5.trna105-LysCTT;;;D$chr6.trna10-LysCTT;;;D$chr7.trna100-IleTAT;;;D$chr8.trna100-GlnTTG;;;D$chr9.trna132-GlnCTG;;;D$chr10.trna177-GlyGCC;;;D$chr12.trna1-ArgTCG;;;D$chr13.trna104-LysCTT;;;D$chr14.trna166-AlaTGC;;;D$chr15.trna100-ProCGG;;;D$chr16.trna128-GluCTC;;;D$chr17.trna11-ThrTGT;;;D$chr18.trna138-TrpCCA;;;D$chr19.trna137-ProAGG;;;D$chr20.trna101-CysGCA;;;D$chr21.trna103-AlaTGC;;;D$chr22.trna100-MetCAT;;;D$chr23.trna13-CysGCA;;;D$chr25.trna100-PheAAA;;;D$Zv8_NA10776.trna10-IleTAT;;;;D$Zv8_scaffold2976.trna1-MetCAT F$chrA3;AlaAGC;;B$chr1;AlaCGC;;D$chr4.trna1000-GlyGCC;;;D$chr1.trna121-ProAGG;;;D$chr2.trna101-LysCTT;;;D$chr3.trna101-PheGAA;;;D$chr5.trna106-LysCTT;;;D$chr6.trna11-AsnGTT;;;D$chr7.trna101-IleTAT;;;D$chr8.trna102-ProTGG;;;D$chr9.trna133-ArgTCT;;;D$chr10.trna178-GlyGCC;;;D$chr12.trna100-LysCTT;;;D$chr13.trna105-AsnGTT;;;D$chr14.trna178-GlnCTG;;;D$chr15.trna102-GluCTC;;;D$chr16.trna129-SerAGA;;;D$chr17.trna110-LeuCAA;;;D$chr18.trna164-MetCAT;;;D$chr19.trna138-ProAGG;;;D$chr20.trna103-CysGCA;;;D$chr21.trna107-MetCAT;;;D$chr22.trna101-MetCAT;;;D$chr23.trna151-ThrTGT;;;D$chr25.trna101-GlnTTG;;;D$Zv8_NA10776.trna11-IleTAT;;;;D$Zv8_scaffold2976.trna2-MetCAT F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;AlaCGC;;D$chr4.trna10002-AsnGTT;;;D$chr1.trna140-GluCTC;;;D$chr2.trna102-AsnGTT;;;D$chr3.trna102-GlnCTG;;;D$chr5.trna107-LysCTT;;;D$chr6.trna111-IleAAT;;;D$chr7.trna102-IleTAT;;;D$chr8.trna103-ProAGG;;;D$chr9.trna134-ThrTGT;;;D$chr10.trna180-GlyGCC;;;D$chr12.trna101-AsnGTT;;;D$chr13.trna138-HisGTG;;;D$chr14.trna193-ValTAC;;;D$chr15.trna103-GluCTC;;;D$chr16.trna175-GluCTC;;;D$chr17.trna111-LeuCAA;;;D$chr18.trna165-ThrCGT;;;D$chr19.trna154-GlnCTG;;;D$chr20.trna105-CysGCA;;;D$chr21.trna113-AlaTGC;;;D$chr22.trna102-MetCAT;;;D$chr23.trna16-GlyTCC;;;D$chr25.trna102-IleAAT;;;D$Zv8_NA10776.trna12-IleTAT;;;;D$Zv8_scaffold2976.trna3-MetCAT F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;AlaTGC;;D$chr4.trna10005-LysCTT;;;D$chr1.trna146-LeuTAA;;;D$chr2.trna103-LysCTT;;;D$chr3.trna103-IleAAT;;;D$chr5.trna11-ProAGG;;;D$chr6.trna13-AsnGTT;;;D$chr7.trna103-IleTAT;;;D$chr8.trna104-GlnTTG;;;D$chr9.trna135-SerAGA;;;D$chr10.trna183-GlyGCC;;;D$chr12.trna102-LysCTT;;;D$chr13.trna144-ValAAC;;;D$chr14.trna199-GluTTC;;;D$chr15.trna104-GluCTC;;;D$chr16.trna176-GluCTC;;;D$chr17.trna112-LeuCAA;;;D$chr18.trna169-ValAAC;;;D$chr19.trna183-IleAAT;;;D$chr20.trna107-CysGCA;;;D$chr21.trna114-AlaTGC;;;D$chr22.trna103-MetCAT;;;D$chr23.trna194-HisGTG;;;D$chr25.trna107-ArgACG;;;D$Zv8_NA10776.trna13-IleTAT;;;;D$Zv8_scaffold2976.trna4-MetCAT F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;ArgCCG;;D$chr4.trna10006-AsnGTT;;;D$chr1.trna147-LeuTAA;;;D$chr2.trna104-AsnGTT;;;D$chr3.trna104-PheGAA;;;D$chr5.trna114-ProAGG;;;D$chr6.trna14-AsnGTT;;;D$chr7.trna105-IleTAT;;;D$chr8.trna106-ProTGG;;;D$chr9.trna136-ArgTCT;;;D$chr10.trna184-GlyGCC;;;D$chr12.trna103-AsnGTT;;;D$chr13.trna145-ValCAC;;;D$chr14.trna23-AlaAGC;;;D$chr15.trna105-GluCTC;;;D$chr16.trna219-GluCTC;;;D$chr17.trna113-LeuCAA;;;D$chr18.trna170-HisGTG;;;D$chr19.trna257-MetCAT;;;D$chr20.trna109-CysGCA;;;D$chr21.trna115-AlaCGC;;;D$chr22.trna105-MetCAT;;;D$chr23.trna45-GluCTC;;;D$chr25.trna108-ArgACG;;;D$Zv8_NA10776.trna14-IleTAT;;;;D$Zv8_scaffold3042.trna1-IleGAT F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;ArgCCT;;D$chr4.trna10008-AsnGTT;;;D$chr1.trna149-LeuTAA;;;D$chr2.trna105-LysCTT;;;D$chr3.trna106-IleAAT;;;D$chr5.trna12-ProCGG;;;D$chr6.trna149-GlnTTG;;;D$chr7.trna106-IleTAT;;;D$chr8.trna107-ProAGG;;;D$chr9.trna137-ThrTGT;;;D$chr10.trna187-GlyGCC;;;D$chr12.trna104-LysCTT;;;D$chr13.trna146-ValAAC;;;D$chr14.trna24-AlaAGC;;;D$chr15.trna106-GluCTC;;;D$chr16.trna253-GluCTC;;;D$chr17.trna114-LeuCAA;;;D$chr18.trna171-ProAGG;;;D$chr19.trna291-TrpCCA;;;D$chr20.trna111-CysGCA;;;D$chr21.trna116-AlaTGC;;;D$chr22.trna107-MetCAT;;;D$chr23.trna47-AsnGTT;;;D$chr25.trna115-AspGTC;;;D$Zv8_NA10776.trna3-IleTAT;;;;D$Zv8_scaffold3042.trna2-AlaTGC F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;ArgCCT;;D$chr4.trna10009-AsnGTT;;;D$chr1.trna150-LeuTAA;;;D$chr2.trna107-AsnGTT;;;D$chr3.trna107-PheGAA;;;D$chr5.trna13-ProCGG;;;D$chr6.trna15-LysCTT;;;D$chr7.trna107-ValAAC;;;D$chr8.trna108-GlnTTG;;;D$chr9.trna138-ThrAGT;;;D$chr10.trna188-GlyGCC;;;D$chr12.trna105-ThrTGT;;;D$chr13.trna147-ValCAC;;;D$chr14.trna25-AlaAGC;;;D$chr15.trna107-GluCTC;;;D$chr16.trna254-LysCTT;;;D$chr17.trna115-LeuCAA;;;D$chr18.trna172-ProAGG;;;D$chr19.trna3-LysCTT;;;D$chr20.trna113-CysGCA;;;D$chr21.trna117-AlaCGC;;;D$chr22.trna108-MetCAT;;;D$chr23.trna48-AsnGTT;;;D$chr25.trna116-AspGTC;;;D$Zv8_NA10776.trna4-IleTAT;;;;D$Zv8_scaffold3042.trna3-MetCAT F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;ArgCCT;;D$chr4.trna1001-GlyGCC;;;D$chr1.trna152-LeuTAA;;;D$chr2.trna108-LysCTT;;;D$chr3.trna108-GlnCTG;;;D$chr5.trna130-AspGTC;;;D$chr6.trna16-AsnGTT;;;D$chr7.trna119-LysCTT;;;D$chr8.trna110-ProTGG;;;D$chr9.trna139-ArgTCT;;;D$chr10.trna191-GlyGCC;;;D$chr12.trna123-LeuTAG;;;D$chr13.trna148-ValAAC;;;D$chr14.trna26-AlaAGC;;;D$chr15.trna108-GluCTC;;;D$chr16.trna255-ArgTCG;;;D$chr17.trna116-LeuCAA;;;D$chr18.trna173-ProTGG;;;D$chr19.trna55-ProAGG;;;D$chr20.trna115-CysGCA;;;D$chr21.trna118-AlaTGC;;;D$chr22.trna109-ArgCCT;;;D$chr23.trna49-PheGAA;;;D$chr25.trna117-AspGTC;;;D$Zv8_NA10776.trna5-IleTAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna1-GluTTC F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;ArgCCT;;D$chr4.trna10010-LysCTT;;;D$chr1.trna153-LeuTAA;;;D$chr2.trna110-AsnGTT;;;D$chr3.trna109-IleAAT;;;D$chr5.trna131-AspGTC;;;D$chr6.trna217-GluTTC;;;D$chr7.trna131-ThrAGT;;;D$chr8.trna111-ProAGG;;;D$chr9.trna140-ThrTGT;;;D$chr10.trna256-LeuTAG;;;D$chr12.trna124-LeuTAG;;;D$chr13.trna149-ValCAC;;;D$chr14.trna290-GlyGCC;;;D$chr15.trna109-GluCTC;;;D$chr16.trna257-GlnCTG;;;D$chr17.trna117-LeuCAA;;;D$chr18.trna174-ProCGG;;;;;;D$chr20.trna117-CysGCA;;;D$chr21.trna119-AlaTGC;;;D$chr22.trna110-MetCAT;;;D$chr23.trna50-GluTTC;;;D$chr25.trna118-GlyGCC;;;D$Zv8_NA10776.trna6-IleTAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna10-HisGTG F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;ArgGCG;;D$chr4.trna10011-AsnGTT;;;D$chr1.trna154-LeuTAA;;;D$chr2.trna111-LysCTT;;;D$chr3.trna110-PheGAA;;;D$chr5.trna132-AspGTC;;;D$chr6.trna292-PheGAA;;;D$chr7.trna189-ThrAGT;;;D$chr8.trna112-GlnTTG;;;D$chr9.trna141-LeuAAG;;;D$chr10.trna257-LeuAAG;;;D$chr12.trna139-ArgCCT;;;D$chr13.trna150-ValAAC;;;D$chr14.trna302-LeuAAG;;;D$chr15.trna110-GluCTC;;;D$chr16.trna259-ArgCCG;;;D$chr17.trna118-LeuCAA;;;D$chr18.trna175-ProAGG;;;;;;D$chr20.trna119-CysGCA;;;D$chr21.trna120-AlaCGC;;;D$chr22.trna111-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna151-ThrAGT;;;D$Zv8_NA10776.trna7-IleTAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna100-ValCAC F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;ArgTCG;;D$chr4.trna10013-LysCTT;;;D$chr1.trna155-LeuTAA;;;D$chr2.trna112-AsnGTT;;;D$chr3.trna111-GlnCTG;;;D$chr5.trna134-AspGTC;;;D$chr6.trna307-LeuTAG;;;D$chr7.trna266-ArgTCG;;;D$chr8.trna114-ProTGG;;;D$chr9.trna142-LeuTAG;;;D$chr10.trna64-SerGCT;;;D$chr12.trna16-LeuCAG;;;D$chr13.trna151-ValCAC;;;;;;D$chr15.trna111-GluCTC;;;D$chr16.trna260-ThrCGT;;;D$chr17.trna119-LeuCAA;;;D$chr18.trna177-ProAGG;;;;;;D$chr20.trna121-CysGCA;;;D$chr21.trna121-AlaTGC;;;D$chr22.trna112-MetCAT;;;D$chr24.trna119-GlyCCC;;;D$chr25.trna152-ThrAGT;;;D$Zv8_NA10776.trna9-ValAAC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna103-GlnCTG F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;ArgTCT;;D$chr4.trna10015-LysCTT;;;D$chr1.trna156-LeuTAA;;;D$chr2.trna113-LysCTT;;;D$chr3.trna112-IleAAT;;;D$chr5.trna136-AspGTC;;;D$chr6.trna309-IleAAT;;;D$chr7.trna267-GlnCTG;;;D$chr8.trna115-ProAGG;;;D$chr9.trna143-LeuAAG;;;D$chr10.trna65-ThrAGT;;;D$chr12.trna18-ArgTCG;;;D$chr13.trna258-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna112-GluCTC;;;D$chr16.trna269-ThrTGT;;;D$chr17.trna12-ThrCGT;;;D$chr18.trna181-ArgTCT;;;;;;D$chr20.trna123-CysGCA;;;D$chr21.trna122-AlaTGC;;;D$chr22.trna114-MetCAT;;;D$chr24.trna124-GlyGCC;;;D$chr25.trna155-GluCTC;;;D$Zv8_NA10976.trna1-LeuTAA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna104-IleAAT F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;ArgTCT;;D$chr4.trna10016-AsnGTT;;;D$chr1.trna157-LeuTAA;;;D$chr2.trna114-AsnGTT;;;D$chr3.trna113-PheGAA;;;D$chr5.trna138-AspGTC;;;D$chr6.trna310-LeuAAG;;;D$chr7.trna269-ArgTCG;;;D$chr8.trna116-GlnTTG;;;D$chr9.trna144-LeuTAG;;;D$chr10.trna66-LeuTAG;;;D$chr12.trna2-MetCAT;;;D$chr13.trna259-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna113-GluCTC;;;D$chr16.trna270-ThrTGT;;;D$chr17.trna120-LeuCAA;;;D$chr18.trna196-MetCAT;;;;;;D$chr20.trna125-CysGCA;;;D$chr21.trna123-AlaCGC;;;D$chr22.trna115-MetCAT;;;D$chr24.trna126-GlyGCC;;;D$chr25.trna156-GluCTC;;;D$Zv8_NA10976.trna2-LeuTAA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna105-PheGAA F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;ArgTCT;;D$chr4.trna10018-GluTTC;;;D$chr1.trna159-LeuTAA;;;D$chr2.trna115-LysCTT;;;D$chr3.trna115-PheGAA;;;D$chr5.trna14-ProAGG;;;D$chr6.trna311-LeuTAG;;;D$chr7.trna271-LysCTT;;;D$chr8.trna118-ProTGG;;;D$chr9.trna145-LeuAAG;;;;;;D$chr12.trna20-GlnCTG;;;D$chr13.trna260-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna114-GluCTC;;;D$chr16.trna271-ThrTGT;;;D$chr17.trna121-LeuCAA;;;D$chr18.trna197-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna127-CysGCA;;;D$chr21.trna124-AlaTGC;;;D$chr22.trna117-MetCAT;;;D$chr24.trna127-GlyCCC;;;D$chr25.trna157-GluCTC;;;D$Zv8_NA10978.trna1-LeuTAA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna106-GlnCTG F$chrC1;AlaAGC;;B$chr1;AspGTC;;D$chr4.trna10019-TyrGTA;;;D$chr1.trna199-AlaTGC;;;D$chr2.trna116-AsnGTT;;;D$chr3.trna116-GlnCTG;;;D$chr5.trna140-AspGTC;;;D$chr6.trna312-LeuAAG;;;D$chr7.trna272-AsnGTT;;;D$chr8.trna119-ProAGG;;;D$chr9.trna146-LeuTAG;;;D$chr11.trna133-SerTGA;;;D$chr12.trna220-ThrAGT;;;D$chr13.trna261-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna115-GluCTC;;;D$chr16.trna272-ThrTGT;;;D$chr17.trna122-LeuCAA;;;D$chr18.trna201-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna129-CysGCA;;;D$chr21.trna125-AlaTGC;;;D$chr22.trna118-MetCAT;;;D$chr24.trna128-GlyGCC;;;D$chr25.trna165-GlyGCC;;;D$Zv8_NA11109.trna1-ArgTCG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna107-IleAAT F$chrD1;AlaAGC;;B$chr1;AspGTC;;D$chr4.trna10020-ArgACG;;;D$chr1.trna200-AlaTGC;;;D$chr2.trna117-LysCTT;;;D$chr3.trna117-PheGAA;;;D$chr5.trna142-AspGTC;;;D$chr6.trna315-LeuAAG;;;D$chr7.trna273-LysCTT;;;D$chr8.trna120-GlnTTG;;;D$chr9.trna147-LeuAAG;;;D$chr11.trna204-ValAAC;;;D$chr12.trna221-ArgTCT;;;D$chr13.trna262-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna116-GluCTC;;;D$chr16.trna273-ThrTGT;;;D$chr17.trna123-LeuCAA;;;D$chr18.trna206-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna131-CysGCA;;;D$chr21.trna126-AlaTGC;;;D$chr22.trna119-ArgCCT;;;D$chr24.trna129-GlyGCC;;;D$chr25.trna174-ArgACG;;;D$Zv8_NA11109.trna2-ArgTCG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna11-SupTTA F$chrE3;AlaAGC;;B$chr1;CysACA;;D$chr4.trna10021-GluTTC;;;D$chr1.trna201-AlaTGC;;;D$chr2.trna118-AsnGTT;;;D$chr3.trna118-GlnCTG;;;D$chr5.trna144-AspGTC;;;D$chr6.trna316-LeuTAG;;;D$chr7.trna274-AsnGTT;;;D$chr8.trna122-ProTGG;;;D$chr9.trna148-LeuTAG;;;D$chr11.trna205-ValAAC;;;D$chr12.trna222-ThrTGT;;;D$chr13.trna263-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna117-GluCTC;;;D$chr16.trna274-ThrTGT;;;D$chr17.trna124-LeuCAA;;;D$chr18.trna207-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna133-CysGCA;;;D$chr21.trna127-AlaCGC;;;D$chr22.trna120-LeuCAA;;;D$chr24.trna130-GlyGCC;;;D$chr25.trna186-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1201.trna1-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna110-PheAAA F$chrF2;AlaAGC;;B$chr1;CysACA;;D$chr4.trna10022-TyrGTA;;;D$chr1.trna224-GluCTC;;;D$chr2.trna119-LysCTT;;;D$chr3.trna119-PheGAA;;;D$chr5.trna146-AspGTC;;;D$chr6.trna317-LeuAAG;;;D$chr7.trna275-LysCTT;;;D$chr8.trna123-ProAGG;;;D$chr9.trna149-LeuAAG;;;D$chr11.trna206-ValAAC;;;D$chr12.trna223-ThrAGT;;;D$chr13.trna264-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna118-GluCTC;;;D$chr16.trna275-ThrTGT;;;D$chr17.trna125-LeuCAA;;;D$chr18.trna208-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna135-CysGCA;;;D$chr21.trna128-AlaTGC;;;D$chr22.trna122-MetCAT;;;D$chr24.trna212-TrpCCA;;;D$chr25.trna187-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1201.trna2-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna111-GlnCTG F$chrB2;AlaCGC;;B$chr1;CysACA;;D$chr4.trna10023-ArgACG;;;D$chr1.trna238-GluCTC;;;D$chr2.trna147-ProAGG;;;D$chr3.trna120-GlnCTG;;;D$chr5.trna148-AspGTC;;;D$chr6.trna318-LeuTAG;;;D$chr7.trna276-AsnGTT;;;D$chr8.trna126-ProTGG;;;D$chr9.trna150-LeuTAG;;;D$chr11.trna207-ValAAC;;;D$chr12.trna224-ArgTCT;;;D$chr13.trna265-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna119-GluCTC;;;D$chr16.trna276-ThrTGT;;;D$chr17.trna126-LeuCAA;;;D$chr18.trna211-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna137-CysGCA;;;D$chr21.trna129-AlaTGC;;;D$chr22.trna124-MetCAT;;;D$chr24.trna213-TrpCCA;;;D$chr25.trna188-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1201.trna3-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna112-IleAAT F$chrB2;AlaCGC;;B$chr1;CysACA;;D$chr4.trna10024-GluTTC;;;D$chr1.trna239-MetCAT;;;D$chr2.trna148-ProCGG;;;D$chr3.trna121-IleAAT;;;D$chr5.trna150-AspGTC;;;D$chr6.trna319-LeuAAG;;;D$chr7.trna277-ArgCCT;;;D$chr8.trna127-ProAGG;;;D$chr9.trna160-MetCAT;;;D$chr11.trna226-CysGCA;;;D$chr12.trna225-ThrTGT;;;D$chr13.trna266-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna120-GluCTC;;;D$chr16.trna74-ThrTGT;;;D$chr17.trna127-LeuCAA;;;D$chr18.trna212-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna139-CysGCA;;;D$chr21.trna130-AlaTGC;;;D$chr22.trna125-MetCAT;;;D$chr24.trna214-TrpCCA;;;D$chr25.trna189-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1201.trna4-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna113-PheGAA F$chrB2;AlaCGC;;B$chr1;CysACA;;D$chr4.trna10025-TyrGTA;;;D$chr1.trna240-LysTTT;;;D$chr2.trna149-ProAGG;;;D$chr3.trna122-PheGAA;;;D$chr5.trna152-AspGTC;;;D$chr6.trna320-LeuAAG;;;D$chr7.trna278-AsnGTT;;;D$chr8.trna128-GlnTTG;;;D$chr9.trna161-MetCAT;;;D$chr11.trna227-CysGCA;;;D$chr12.trna226-ThrAGT;;;D$chr13.trna267-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna121-GluCTC;;;D$chr16.trna75-ThrTGT;;;D$chr17.trna128-LeuCAA;;;D$chr18.trna213-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna141-CysGCA;;;D$chr21.trna131-AlaTGC;;;D$chr22.trna126-MetCAT;;;D$chr24.trna22-MetCAT;;;D$chr25.trna190-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1201.trna5-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna115-IleAAT F$chrB2;AlaCGC;;B$chr1;CysACA;;D$chr4.trna10026-ArgACG;;;D$chr1.trna252-GluCTC;;;D$chr2.trna150-ProTGG;;;D$chr3.trna123-GlnCTG;;;D$chr5.trna153-AspGTC;;;D$chr6.trna321-LeuTAG;;;D$chr7.trna281-SerGCT;;;D$chr8.trna130-ProTGG;;;D$chr9.trna162-MetCAT;;;D$chr11.trna23-SerGCT;;;D$chr12.trna227-ArgTCT;;;D$chr13.trna268-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna122-GluCTC;;;D$chr16.trna76-ThrTGT;;;D$chr17.trna129-LeuCAA;;;D$chr18.trna214-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna143-CysGCA;;;D$chr21.trna132-AlaTGC;;;D$chr22.trna128-MetCAT;;;D$chr24.trna23-MetCAT;;;D$chr25.trna191-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1201.trna6-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna116-PheGAA F$chrB2;AlaCGC;;B$chr1;CysACA;;D$chr4.trna10027-GluTTC;;;D$chr1.trna267-ArgTCT;;;D$chr2.trna151-ProTGG;;;D$chr3.trna124-IleAAT;;;D$chr5.trna155-AspGTC;;;D$chr6.trna323-LeuAAG;;;D$chr7.trna282-SerGCT;;;D$chr8.trna131-ProAGG;;;D$chr9.trna164-MetCAT;;;D$chr11.trna24-SerGCT;;;D$chr12.trna228-ThrTGT;;;D$chr13.trna269-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna123-GluCTC;;;D$chr16.trna85-GluTTC;;;D$chr17.trna130-LeuCAA;;;D$chr18.trna215-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna145-CysGCA;;;D$chr21.trna133-AlaTGC;;;D$chr22.trna130-MetCAT;;;D$chr24.trna24-MetCAT;;;D$chr25.trna192-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1201.trna7-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna118-IleAAT F$chrB4;AlaCGC;;B$chr1;CysACA;;D$chr4.trna10028-TyrGTA;;;D$chr1.trna282-SeCTCA;;;D$chr2.trna152-ProCGG;;;D$chr3.trna125-PheGAA;;;D$chr5.trna157-AspGTC;;;D$chr6.trna324-LeuTAG;;;D$chr7.trna283-SerGCT;;;D$chr8.trna132-GlnTTG;;;D$chr9.trna165-MetCAT;;;D$chr11.trna247-CysGCA;;;D$chr12.trna23-LysCTT;;;D$chr13.trna270-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna124-GluCTC;;;D$chr16.trna86-TyrGTA;;;D$chr17.trna131-LeuCAA;;;D$chr18.trna216-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna147-CysGCA;;;D$chr21.trna134-AlaTGC;;;D$chr22.trna131-ArgCCT;;;D$chr24.trna260-TyrGTA;;;D$chr25.trna193-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1267.trna1-ProAGG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna12-SerAGA F$chrC1;AlaCGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10029-ArgACG;;;D$chr1.trna284-ArgCCG;;;D$chr2.trna153-ProAGG;;;D$chr3.trna126-GlnCTG;;;D$chr5.trna159-AspGTC;;;D$chr6.trna325-LeuAAG;;;D$chr7.trna285-SerGCT;;;D$chr8.trna134-ProTGG;;;D$chr9.trna166-MetCAT;;;D$chr11.trna248-CysGCA;;;D$chr12.trna230-ThrAGT;;;D$chr13.trna271-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna125-GluCTC;;;D$chr16.trna87-ArgACG;;;D$chr17.trna132-LeuCAA;;;D$chr18.trna217-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna149-CysGCA;;;D$chr21.trna135-AlaCGC;;;D$chr22.trna132-MetCAT;;;D$chr24.trna286-ThrAGT;;;D$chr25.trna194-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1389.trna2-TrpCCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna121-IleAAT F$chrC1;AlaGGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna1003-GlyGCC;;;D$chr1.trna285-SeCTCA;;;D$chr2.trna154-SerTGA;;;D$chr3.trna127-IleAAT;;;D$chr5.trna16-ProAGG;;;D$chr6.trna326-LeuTAG;;;D$chr7.trna286-SerGCT;;;D$chr8.trna135-ProAGG;;;D$chr9.trna167-MetCAT;;;D$chr11.trna249-CysGCA;;;D$chr12.trna231-ArgTCT;;;D$chr13.trna272-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna126-GluCTC;;;D$chr16.trna89-ArgACG;;;D$chr17.trna133-LeuCAA;;;D$chr18.trna218-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna15-SerTGA;;;D$chr21.trna136-AlaTGC;;;D$chr22.trna133-ArgCCT;;;D$chr24.trna300-LeuCAG;;;D$chr25.trna195-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1770.trna1-LysCTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna123-GlnCTG F$chrA1;AlaTGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10030-GluTTC;;;D$chr1.trna287-GlnCTG;;;D$chr2.trna155-ProAGG;;;D$chr3.trna128-PheGAA;;;D$chr5.trna160-AspGTC;;;D$chr6.trna327-LeuAAG;;;D$chr7.trna288-SerGCT;;;D$chr8.trna136-GlnTTG;;;D$chr9.trna168-MetCAT;;;D$chr11.trna25-SerGCT;;;D$chr12.trna232-ThrAGT;;;D$chr13.trna273-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna127-GluCTC;;;;;;D$chr17.trna134-LeuCAA;;;D$chr18.trna221-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna151-CysGCA;;;D$chr21.trna137-AlaTGC;;;D$chr22.trna134-ArgCCT;;;D$chr24.trna31-GlyGCC;;;D$chr25.trna196-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1770.trna2-AsnGTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna124-IleAAT F$chrA1;AlaTGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10031-TyrGTA;;;D$chr1.trna288-ArgTCG;;;D$chr2.trna156-LeuAAG;;;D$chr3.trna129-GlnCTG;;;D$chr5.trna162-AspGTC;;;D$chr6.trna328-LeuTAG;;;D$chr7.trna289-SerGCT;;;D$chr8.trna138-ProTGG;;;D$chr9.trna169-MetCAT;;;D$chr11.trna26-SerGCT;;;D$chr12.trna233-ArgTCT;;;D$chr13.trna274-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna128-GluCTC;;;;;;D$chr17.trna135-LeuCAA;;;D$chr18.trna222-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna153-CysGCA;;;D$chr21.trna138-AlaTGC;;;D$chr22.trna136-ArgCCT;;;D$chr24.trna34-GlyGCC;;;D$chr25.trna197-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1770.trna3-LysCTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna125-PheGAA F$chrA1;AlaTGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10032-ArgACG;;;D$chr1.trna290-ArgCCG;;;D$chr2.trna157-LeuAAG;;;D$chr3.trna130-PheGAA;;;D$chr5.trna163-AspGTC;;;D$chr6.trna330-LeuAAG;;;D$chr7.trna29-LysCTT;;;D$chr8.trna139-ProAGG;;;D$chr9.trna170-MetCAT;;;D$chr11.trna52-ValCAC;;;D$chr12.trna234-ThrAGT;;;D$chr13.trna275-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna129-GluCTC;;;;;;D$chr17.trna136-LeuCAA;;;D$chr18.trna223-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna155-CysGCA;;;D$chr21.trna139-AlaCGC;;;D$chr22.trna137-MetCAT;;;D$chr24.trna35-GlyCCC;;;D$chr25.trna218-AspGTC;;;D$Zv8_NA1770.trna4-AsnGTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna126-ThrTGT F$chrB2;AlaTGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10033-GluTTC;;;D$chr1.trna291-ArgTCG;;;D$chr2.trna158-LeuTAG;;;D$chr3.trna131-GlnCTG;;;D$chr5.trna165-AspGTC;;;D$chr6.trna331-LeuTAG;;;D$chr7.trna290-SerGCT;;;D$chr8.trna140-GlnTTG;;;D$chr9.trna171-IleTAT;;;D$chr11.trna54-ValCAC;;;D$chr12.trna235-ArgTCT;;;D$chr13.trna276-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna130-GluCTC;;;;;;D$chr17.trna137-LeuCAA;;;D$chr18.trna225-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna157-CysGCA;;;D$chr21.trna140-AlaTGC;;;D$chr22.trna138-MetCAT;;;D$chr24.trna37-GlyGCC;;;D$chr25.trna219-AspGTC;;;D$Zv8_NA1836.trna1-AsnGTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna127-ThrAGT F$chrB2;AlaTGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10034-TyrGTA;;;D$chr1.trna293-ArgCCG;;;D$chr2.trna159-LeuAAG;;;D$chr3.trna132-PheGAA;;;D$chr5.trna167-AspGTC;;;D$chr6.trna332-LeuAAG;;;D$chr7.trna291-SerGCT;;;D$chr8.trna142-ProTGG;;;D$chr9.trna172-MetCAT;;;D$chr11.trna95-SerGCT;;;D$chr12.trna236-ThrTGT;;;D$chr13.trna277-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna197-IleAAT;;;;;;D$chr17.trna16-LysTTT;;;D$chr18.trna226-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna159-CysGCA;;;D$chr21.trna141-AlaTGC;;;D$chr22.trna139-MetCAT;;;D$chr24.trna38-GlyCCC;;;D$chr25.trna220-AspGTC;;;D$Zv8_NA1927.trna1-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna128-IleAAT F$chrB2;AlaTGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10035-ArgACG;;;D$chr1.trna294-GlnTTG;;;D$chr2.trna160-LeuAAG;;;D$chr3.trna133-GlnCTG;;;D$chr5.trna169-AspGTC;;;D$chr6.trna333-LeuTAG;;;D$chr7.trna292-SerGCT;;;D$chr8.trna143-ProAGG;;;D$chr9.trna173-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna237-ArgTCT;;;D$chr13.trna278-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna198-IleAAT;;;;;;D$chr17.trna17-SerAGA;;;D$chr18.trna227-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna16-HisGTG;;;D$chr21.trna142-AlaCGC;;;D$chr22.trna141-MetCAT;;;D$chr24.trna40-GlyGCC;;;D$chr25.trna221-AspGTC;;;D$Zv8_NA1927.trna10-ValCAC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna129-ThrTGT F$chrB2;AlaTGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10036-GluTTC;;;D$chr1.trna297-ArgCCG;;;D$chr2.trna161-LeuAAG;;;D$chr3.trna134-PheGAA;;;D$chr5.trna17-ProTGG;;;D$chr6.trna335-LeuAAG;;;D$chr7.trna293-LeuAAG;;;D$chr8.trna144-GlnTTG;;;D$chr9.trna174-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna238-ThrTGT;;;D$chr13.trna279-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna199-TrpCCA;;;;;;D$chr17.trna18-HisGTG;;;D$chr18.trna229-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna161-CysGCA;;;D$chr21.trna143-AlaTGC;;;D$chr22.trna142-MetCAT;;;D$chr24.trna43-GlyGCC;;;D$chr25.trna222-AspGTC;;;D$Zv8_NA1927.trna11-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna13-HisGTG F$chrD3;AlaTGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10037-TyrGTA;;;D$chr1.trna298-ArgTCG;;;D$chr2.trna162-LeuAAG;;;D$chr3.trna135-GlnCTG;;;D$chr5.trna171-AspGTC;;;D$chr6.trna358-PheGAA;;;D$chr7.trna294-LeuTAG;;;D$chr8.trna145-ProTGG;;;D$chr9.trna175-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna24-ThrGGT;;;D$chr13.trna280-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna200-GlyTCC;;;;;;D$chr17.trna20-LeuCAG;;;D$chr18.trna230-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna163-CysGCA;;;D$chr21.trna144-AlaTGC;;;D$chr22.trna144-MetCAT;;;D$chr24.trna48-GlyGCC;;;D$chr25.trna223-GlyGCC;;;D$Zv8_NA1927.trna12-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna130-ThrAGT F$chrD3;AlaTGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10038-ArgACG;;;D$chr1.trna300-GlnCTG;;;D$chr2.trna163-LeuAAG;;;D$chr3.trna136-PheGAA;;;D$chr5.trna173-AspGTC;;;D$chr6.trna359-ProCGG;;;D$chr7.trna295-LeuAAG;;;D$chr8.trna146-ProAGG;;;D$chr9.trna176-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna240-ThrAGT;;;D$chr13.trna281-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna217-GlyTCC;;;;;;D$chr17.trna21-SerTGA;;;D$chr18.trna231-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna165-CysGCA;;;D$chr21.trna145-AlaTGC;;;D$chr22.trna150-ArgCCT;;;D$chr24.trna49-GlyCCC;;;D$chr25.trna247-PheGAA;;;D$Zv8_NA1927.trna13-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna131-ArgTCT F$chrD3;AlaTGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10039-GluTTC;;;D$chr1.trna301-ArgTCG;;;D$chr2.trna164-LeuTAG;;;D$chr3.trna137-GlnCTG;;;D$chr5.trna175-AspGTC;;;D$chr6.trna360-ProTGG;;;D$chr7.trna296-LeuTAG;;;D$chr8.trna147-GlnTTG;;;D$chr9.trna177-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna241-ArgTCT;;;D$chr13.trna282-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna245-ProAGG;;;;;;D$chr17.trna23-IleTAT;;;D$chr18.trna232-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna167-CysGCA;;;D$chr21.trna146-AlaCGC;;;D$chr22.trna151-MetCAT;;;D$chr24.trna52-GlyGCC;;;D$chr25.trna248-IleAAT;;;D$Zv8_NA1927.trna14-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna132-ThrTGT F$chrA2;ArgACG;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10040-TyrGTA;;;D$chr1.trna303-ArgCCG;;;D$chr2.trna165-LeuAAG;;;D$chr3.trna138-PheGAA;;;D$chr5.trna177-AspGTC;;;D$chr6.trna363-ProTGG;;;D$chr7.trna297-LeuAAG;;;D$chr8.trna149-ProTGG;;;D$chr9.trna178-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna242-ThrAGT;;;D$chr13.trna283-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna246-ProTGG;;;;;;D$chr17.trna24-SerCGA;;;D$chr18.trna233-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna169-CysGCA;;;D$chr21.trna147-AlaTGC;;;D$chr22.trna152-ArgCCT;;;D$chr24.trna53-GlyCCC;;;D$chr25.trna249-PheGAA;;;D$Zv8_NA1927.trna15-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna133-ThrAGT F$chrB2;ArgACG;;B$chr1;GlnCTG;;D$chr4.trna10041-ArgACG;;;D$chr1.trna304-SeCTCA;;;D$chr2.trna166-LeuTAG;;;D$chr3.trna146-IleAAT;;;D$chr5.trna178-AspGTC;;;D$chr6.trna364-GlyTCC;;;D$chr7.trna298-LeuTAG;;;D$chr8.trna150-ProAGG;;;D$chr9.trna179-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna243-ArgTCT;;;D$chr13.trna284-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna28-LeuCAA;;;;;;D$chr17.trna240-SerAGA;;;D$chr18.trna234-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna17-SerCGA;;;D$chr21.trna148-AlaTGC;;;D$chr22.trna153-MetCAT;;;D$chr24.trna54-GlyCCC;;;D$chr25.trna250-IleAAT;;;D$Zv8_NA1927.trna18-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna134-ArgTCT F$chrB2;ArgACG;;B$chr1;GlnCTG;;D$chr4.trna10042-GluTTC;;;D$chr1.trna306-ArgCCG;;;D$chr2.trna167-LeuAAG;;;D$chr3.trna147-PheGAA;;;D$chr5.trna180-AspGTC;;;D$chr6.trna366-LysCTT;;;D$chr7.trna299-LeuAAG;;;D$chr8.trna151-GlnTTG;;;D$chr9.trna180-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna244-ThrTGT;;;D$chr13.trna285-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna3-LysTTT;;;;;;D$chr17.trna26-LysTTT;;;D$chr18.trna236-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna171-CysGCA;;;D$chr21.trna149-AlaTGC;;;D$chr22.trna154-ArgCCT;;;D$chr24.trna55-GlyGCC;;;D$chr25.trna251-PheGAA;;;D$Zv8_NA1927.trna19-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna135-ThrTGT F$chrB2;ArgACG;;B$chr1;GlnTTG;;D$chr4.trna10043-TyrGTA;;;D$chr1.trna307-ArgCCG;;;D$chr2.trna168-LeuTAG;;;D$chr3.trna148-GlnCTG;;;D$chr5.trna182-AspGTC;;;D$chr6.trna371-ThrTGT;;;D$chr7.trna3-ArgTCT;;;D$chr8.trna153-ProTGG;;;D$chr9.trna181-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna245-ArgTCT;;;D$chr13.trna286-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna302-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna27-SerCGA;;;D$chr18.trna238-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna173-CysGCA;;;D$chr21.trna150-AlaTGC;;;D$chr22.trna155-MetCAT;;;D$chr24.trna94-ArgTCT;;;D$chr25.trna252-IleAAT;;;D$Zv8_NA1927.trna2-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna136-ThrAGT F$chrB2;ArgACG;;B$chr1;GluCTC;;D$chr4.trna10044-ArgACG;;;D$chr1.trna308-ArgTCG;;;D$chr2.trna169-LeuAAG;;;D$chr3.trna149-PheGAA;;;D$chr5.trna184-AspGTC;;;D$chr6.trna387-ArgCCG;;;D$chr7.trna30-AsnGTT;;;D$chr8.trna154-ProAGG;;;D$chr9.trna182-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna246-ThrAGT;;;D$chr13.trna287-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna303-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna278-ValAAC;;;D$chr18.trna239-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna175-CysGCA;;;D$chr21.trna151-AlaTGC;;;D$chr22.trna156-ArgCCT;;;D$chr24.trna97-AlaAGC;;;D$chr25.trna253-PheGAA;;;D$Zv8_NA1927.trna20-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna137-ArgTCT F$chrB2;ArgACG;;B$chr1;GluCTC;;D$chr4.trna10045-GluTTC;;;D$chr1.trna310-ArgCCG;;;D$chr2.trna170-LeuTAG;;;D$chr3.trna150-GlnCTG;;;D$chr5.trna186-AspGTC;;;D$chr6.trna418-LysTTT;;;D$chr7.trna300-LeuTAG;;;D$chr8.trna155-GlnTTG;;;D$chr9.trna183-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna247-ArgTCT;;;D$chr13.trna288-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna304-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna279-ValTAC;;;D$chr18.trna240-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna177-CysGCA;;;D$chr21.trna152-AlaTGC;;;D$chr22.trna157-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna266-ArgTCG;;;D$Zv8_NA1927.trna3-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna138-ThrTGT F$chrB3;ArgACG;;B$chr1;GluCTC;;D$chr4.trna10046-TyrGTA;;;D$chr1.trna333-IleAAT;;;D$chr2.trna172-LeuAAG;;;D$chr3.trna151-IleAAT;;;D$chr5.trna188-AspGTC;;;D$chr6.trna433-SerCGA;;;D$chr7.trna301-LeuAAG;;;D$chr8.trna156-ProTGG;;;D$chr9.trna184-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna248-ThrTGT;;;D$chr13.trna289-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna305-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna28-HisGTG;;;D$chr18.trna241-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna179-CysGCA;;;D$chr21.trna153-AlaTGC;;;D$chr22.trna160-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna39-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1927.trna4-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna139-ThrAGT F$chrB4;ArgACG;;B$chr1;GluCTC;;D$chr4.trna10047-ArgACG;;;D$chr1.trna60-ProAGG;;;D$chr2.trna174-LeuAAG;;;D$chr3.trna152-PheGAA;;;D$chr5.trna19-Undet???;;;D$chr6.trna52-ArgCCT;;;D$chr7.trna302-LeuTAG;;;D$chr8.trna157-ProAGG;;;D$chr9.trna185-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna249-ArgTCT;;;D$chr13.trna290-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna306-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna280-ValAAC;;;D$chr18.trna242-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna18-HisGTG;;;D$chr21.trna154-AlaTGC;;;D$chr22.trna161-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna40-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1927.trna5-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna14-LysTTT F$chrF2;ArgACG;;B$chr1;GluCTC;;D$chr4.trna10048-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna175-SerGCT;;;D$chr3.trna154-GlnCTG;;;D$chr5.trna190-AspGTC;;;D$chr6.trna53-ArgCCT;;;D$chr7.trna303-LeuAAG;;;D$chr8.trna158-GlnTTG;;;D$chr9.trna186-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna250-ThrAGT;;;D$chr13.trna291-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna307-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna281-ValCAC;;;D$chr18.trna244-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna181-CysGCA;;;D$chr21.trna155-AlaTGC;;;D$chr22.trna162-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna41-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1927.trna6-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna140-ArgTCT F$chrA3;ArgCCG;;B$chr1;GluCTC;;D$chr4.trna10049-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna176-SerGCT;;;D$chr3.trna155-IleAAT;;;D$chr5.trna192-AspGTC;;;D$chr6.trna6-AsnGTT;;;D$chr7.trna304-LeuTAG;;;D$chr8.trna160-ProTGG;;;D$chr9.trna187-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna251-ArgTCT;;;D$chr13.trna336-GlyGCC;;;;;;D$chr15.trna308-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna284-ValCAC;;;D$chr18.trna245-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna183-CysGCA;;;D$chr21.trna156-AlaTGC;;;D$chr22.trna163-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna48-ThrCGT;;;D$Zv8_NA1927.trna7-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna141-ThrTGT F$chrB1;ArgCCG;;B$chr1;GluCTC;;D$chr4.trna1005-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna177-SerGCT;;;D$chr3.trna156-PheGAA;;;D$chr5.trna194-AspGTC;;;D$chr6.trna7-AsnATT;;;D$chr7.trna305-LeuAAG;;;D$chr8.trna161-ProAGG;;;D$chr9.trna188-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna252-ThrTGT;;;D$chr13.trna52-GlyGCC;;;;;;D$chr15.trna309-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna285-ValGAC;;;D$chr18.trna246-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna185-CysGCA;;;D$chr21.trna157-AlaTGC;;;D$chr22.trna164-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna57-GlyGCC;;;D$Zv8_NA1927.trna8-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna142-ThrAGT F$chrB2;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10050-ArgACG;;;;;;D$chr2.trna179-SerGCT;;;D$chr3.trna158-GlnCTG;;;D$chr5.trna196-AspGTC;;;D$chr6.trna8-LysCTT;;;D$chr7.trna306-LeuTAG;;;D$chr8.trna162-GlnTTG;;;D$chr9.trna189-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna253-ArgTCT;;;D$chr13.trna53-GlyGCC;;;;;;D$chr15.trna310-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna286-ValCAC;;;D$chr18.trna248-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna187-CysGCA;;;D$chr21.trna158-AlaTGC;;;D$chr22.trna165-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna66-IleAAT;;;D$Zv8_NA1927.trna9-Undet???;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna143-ArgTCT F$chrB2;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10051-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna182-LysCTT;;;D$chr3.trna159-IleAAT;;;D$chr5.trna198-AspGTC;;;D$chr6.trna9-AsnGTT;;;D$chr7.trna307-LeuAAG;;;D$chr8.trna163-ProAGG;;;D$chr9.trna190-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna254-ThrAGT;;;D$chr13.trna54-GlyGCC;;;;;;D$chr15.trna311-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna287-ValTAC;;;D$chr18.trna250-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna189-CysGCA;;;D$chr21.trna159-AlaCGC;;;D$chr22.trna166-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna67-PheGAA;;;D$Zv8_NA2021.trna1-AsnGTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna144-ThrTGT F$chrB3;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10052-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna185-AsnGTT;;;D$chr3.trna160-PheGAA;;;D$chr5.trna20-ProCGG;;;;;;D$chr7.trna308-LeuTAG;;;D$chr8.trna164-GlnTTG;;;D$chr9.trna191-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna255-ArgTCT;;;D$chr13.trna77-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna312-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna289-MetCAT;;;D$chr18.trna251-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna19-SerCGA;;;D$chr21.trna160-AlaTGC;;;D$chr22.trna167-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna68-IleAAT;;;D$Zv8_NA2021.trna2-LysCTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna145-ThrAGT F$chrC2;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10053-ArgACG;;;;;;D$chr2.trna189-GlnCTG;;;D$chr3.trna162-GlnCTG;;;D$chr5.trna202-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna309-LeuAAG;;;D$chr8.trna166-ProTGG;;;D$chr9.trna192-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna256-ThrTGT;;;D$chr13.trna78-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna313-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna29-ThrCGT;;;D$chr18.trna252-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna191-CysGCA;;;D$chr21.trna161-AlaTGC;;;D$chr22.trna168-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna69-PheGAA;;;D$Zv8_NA2021.trna4-AsnGTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna146-ArgTCT F$chrC2;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10054-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna190-IleAAT;;;D$chr3.trna163-IleAAT;;;D$chr5.trna204-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna31-AsnGTT;;;D$chr8.trna167-ProAGG;;;D$chr9.trna193-IleTAT;;;;;;D$chr12.trna257-ArgTCT;;;D$chr13.trna79-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna314-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna290-ValTAC;;;D$chr18.trna254-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna193-CysGCA;;;D$chr21.trna162-AlaTGC;;;D$chr22.trna169-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna70-IleAAT;;;D$Zv8_NA232.trna2-ArgTCG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna149-LysTTT F$chrD2;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10055-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna191-PheGAA;;;D$chr3.trna164-PheGAA;;;D$chr5.trna205-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna310-LeuTAG;;;D$chr8.trna168-GlnTTG;;;D$chr9.trna194-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna258-ThrAGT;;;D$chr13.trna80-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna315-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna293-ValTAC;;;D$chr18.trna256-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna195-CysGCA;;;D$chr21.trna163-AlaTGC;;;D$chr22.trna170-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna71-PheGAA;;;D$Zv8_NA232.trna4-GlnCTG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna15-SerTGA F$chrD2;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10056-ArgACG;;;;;;D$chr2.trna192-GlnCTG;;;D$chr3.trna166-GlnCTG;;;D$chr5.trna207-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna311-LeuAAG;;;D$chr8.trna170-ProTGG;;;D$chr9.trna195-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna259-ArgTCT;;;D$chr13.trna81-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna316-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna295-ValCAC;;;D$chr18.trna257-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna197-CysGCA;;;D$chr21.trna164-AlaTGC;;;D$chr22.trna171-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna72-IleAAT;;;D$Zv8_NA232.trna5-ArgCCG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna150-SerAGA F$chrD3;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10057-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna193-IleAAT;;;D$chr3.trna167-IleAAT;;;D$chr5.trna209-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna312-LeuTAG;;;D$chr8.trna171-ProAGG;;;D$chr9.trna196-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna26-AsnGTT;;;;;;;;;D$chr15.trna317-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna296-ValTAC;;;D$chr18.trna258-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna199-CysGCA;;;D$chr21.trna165-AlaCGC;;;D$chr22.trna172-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna73-PheGAA;;;D$Zv8_NA2419.trna1-LysTTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna151-HisGTG F$chrD4;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10058-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna194-PheGAA;;;D$chr3.trna168-PheGAA;;;D$chr5.trna21-ProCGG;;;;;;D$chr7.trna313-LeuAAG;;;D$chr8.trna172-GlnTTG;;;D$chr9.trna197-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna260-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna318-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna299-ValGAC;;;D$chr18.trna260-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna20-LysTTT;;;D$chr21.trna166-AlaTGC;;;D$chr22.trna173-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna74-PheGAA;;;D$Zv8_NA2419.trna2-SerAGA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna152-LysTTT F$chrD4;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10059-ArgACG;;;;;;D$chr2.trna195-GlnCTG;;;D$chr3.trna170-GlnCTG;;;D$chr5.trna211-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna314-LeuTAG;;;D$chr8.trna174-ProTGG;;;D$chr9.trna198-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna262-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna319-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna300-ValCAC;;;D$chr18.trna261-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna201-CysGCA;;;D$chr21.trna167-AlaTGC;;;D$chr22.trna174-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna75-IleAAT;;;D$Zv8_NA2419.trna3-SerCGA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna153-SerAGA F$chrE1;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna1006-GlyCCC;;;;;;D$chr2.trna196-IleAAT;;;D$chr3.trna171-IleAAT;;;D$chr5.trna213-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna315-LeuAAG;;;D$chr8.trna175-ProAGG;;;D$chr9.trna199-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna263-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna32-AsnGTT;;;;;;D$chr17.trna301-ValTAC;;;D$chr18.trna262-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna203-CysGCA;;;D$chr21.trna168-AlaTGC;;;D$chr22.trna175-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna76-PheGAA;;;D$Zv8_NA2419.trna4-TyrGTA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna154-HisGTG F$chrE1;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10060-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna198-GlnCTG;;;D$chr3.trna172-PheGAA;;;D$chr5.trna215-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna316-LeuTAG;;;D$chr8.trna176-GlnTTG;;;D$chr9.trna200-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna264-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna320-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna303-ValCAC;;;D$chr18.trna263-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna205-CysGCA;;;D$chr21.trna169-AlaCGC;;;D$chr22.trna176-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna77-IleAAT;;;D$Zv8_NA2548.trna2-LeuAAG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna155-LysTTT F$chrE1;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10061-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna199-IleAAT;;;D$chr3.trna174-GlnCTG;;;D$chr5.trna217-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna317-LeuAAG;;;D$chr8.trna178-ProTGG;;;D$chr9.trna201-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna266-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna321-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna304-ValTAC;;;D$chr18.trna264-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna207-CysGCA;;;D$chr21.trna170-AlaTGC;;;D$chr22.trna177-IleTAT;;;;;;D$chr25.trna78-IleAAT;;;D$Zv8_NA2662.trna1-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna156-LeuCAG F$chrE2;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10062-ArgACG;;;;;;D$chr2.trna202-IleAAT;;;D$chr3.trna175-IleAAT;;;D$chr5.trna219-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna318-LeuTAG;;;D$chr8.trna179-ProAGG;;;D$chr9.trna202-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna267-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna322-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna307-ValGAC;;;D$chr18.trna266-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna209-CysGCA;;;D$chr21.trna171-AlaTGC;;;D$chr22.trna178-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna79-PheGAA;;;D$Zv8_NA2662.trna10-GluTTC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna157-LeuCAG F$chrE3;ArgCCG;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10063-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna205-IleAAT;;;D$chr3.trna176-PheGAA;;;D$chr5.trna22-ProAGG;;;;;;D$chr7.trna319-LeuAAG;;;D$chr8.trna180-GlnTTG;;;D$chr9.trna203-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna268-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna323-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna308-ValCAC;;;D$chr18.trna267-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna211-CysGCA;;;D$chr21.trna172-AlaTGC;;;D$chr22.trna179-IleTAT;;;;;;D$chr25.trna80-IleAAT;;;D$Zv8_NA2662.trna11-TyrGTA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna158-LeuCAG F$chrE3;ArgCCG;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10064-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna207-GlnCTG;;;D$chr3.trna178-GlnCTG;;;D$chr5.trna220-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna320-LeuTAG;;;D$chr8.trna182-ProTGG;;;D$chr9.trna204-IleTAT;;;;;;D$chr12.trna269-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna324-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna309-ValTAC;;;D$chr18.trna268-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna213-CysGCA;;;D$chr21.trna173-AlaTGC;;;D$chr22.trna180-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna81-PheGAA;;;D$Zv8_NA2662.trna12-ArgACG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna159-LeuCAG F$chrE3;ArgCCG;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10065-ArgACG;;;;;;D$chr2.trna208-IleAAT;;;D$chr3.trna179-IleAAT;;;D$chr5.trna222-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna321-LeuAAG;;;D$chr8.trna183-ProAGG;;;D$chr9.trna205-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna27-LysCTT;;;;;;;;;D$chr15.trna325-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna310-ValAAC;;;D$chr18.trna269-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna215-CysGCA;;;D$chr21.trna174-AlaTGC;;;D$chr22.trna181-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna82-IleAAT;;;D$Zv8_NA2662.trna2-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna16-ValAAC F$chrF1;ArgCCG;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10066-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna209-PheGAA;;;D$chr3.trna180-PheGAA;;;D$chr5.trna224-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna322-LeuTAG;;;D$chr8.trna184-GlnTTG;;;D$chr9.trna206-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna270-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna326-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna311-ValCAC;;;D$chr18.trna270-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna217-CysGCA;;;D$chr21.trna175-AlaCGC;;;D$chr22.trna182-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna83-PheGAA;;;D$Zv8_NA2662.trna3-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna160-LeuCAG F$chrF1;ArgCCG;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10067-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna210-GlnCTG;;;D$chr3.trna182-GlnCTG;;;D$chr5.trna226-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna323-LeuAAG;;;D$chr8.trna186-ProTGG;;;D$chr9.trna207-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna271-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna327-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna312-MetCAT;;;D$chr18.trna273-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna219-CysGCA;;;D$chr21.trna176-AlaTGC;;;D$chr22.trna183-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna84-IleAAT;;;D$Zv8_NA2662.trna4-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna161-LeuCAG F$chrX;ArgCCG;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10068-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna211-IleAAT;;;D$chr3.trna183-IleAAT;;;D$chr5.trna228-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna324-LeuTAG;;;D$chr8.trna187-ProAGG;;;D$chr9.trna208-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna272-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna328-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna313-AspATC;;;D$chr18.trna274-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna221-CysGCA;;;D$chr21.trna177-AlaTGC;;;D$chr22.trna184-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna85-PheGAA;;;D$Zv8_NA2662.trna5-GluCTC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna162-LeuCAG F$chrX;ArgCCG;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10069-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna212-PheGAA;;;D$chr3.trna184-PheGAA;;;D$chr5.trna23-ProAGG;;;;;;D$chr7.trna325-LeuAAG;;;D$chr8.trna188-GlnTTG;;;D$chr9.trna209-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna274-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna329-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna314-MetCAT;;;D$chr18.trna275-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna223-CysGCA;;;D$chr21.trna178-AlaTGC;;;D$chr22.trna185-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna86-IleAAT;;;D$Zv8_NA2662.trna6-GluCTC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna164-LeuCAG F$chrX;ArgCCG;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna1007-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna213-GlnCTG;;;D$chr3.trna186-GlnCTG;;;D$chr5.trna230-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna326-LeuTAG;;;D$chr8.trna190-ProTGG;;;D$chr9.trna210-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna275-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna330-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna317-ValTAC;;;D$chr18.trna279-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna225-CysGCA;;;D$chr21.trna179-AlaTGC;;;D$chr22.trna186-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna87-PheGAA;;;D$Zv8_NA2662.trna7-GluTTC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna165-LeuCAG F$chrA1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10070-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna214-IleAAT;;;D$chr3.trna187-IleAAT;;;D$chr5.trna232-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna327-LeuAAG;;;D$chr8.trna191-ProAGG;;;D$chr9.trna211-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna276-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna331-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna318-ValAAC;;;D$chr18.trna281-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna227-CysGCA;;;D$chr21.trna180-AlaTGC;;;D$chr22.trna187-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna88-IleAAT;;;D$Zv8_NA2662.trna8-TyrGTA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna166-LeuCAG F$chrA1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10071-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna215-PheGAA;;;D$chr3.trna188-PheGAA;;;D$chr5.trna234-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna329-LeuAAG;;;D$chr8.trna192-GlnTTG;;;D$chr9.trna212-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna277-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna332-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna321-ValCAC;;;D$chr18.trna282-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna229-CysGCA;;;D$chr21.trna181-AlaCGC;;;D$chr22.trna190-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna89-PheGAA;;;D$Zv8_NA2662.trna9-ArgACG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna167-LeuCAG F$chrA2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10072-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna216-GlnCTG;;;D$chr3.trna190-GlnCTG;;;D$chr5.trna236-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna330-LeuTAG;;;D$chr8.trna195-ProAGG;;;D$chr9.trna213-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna278-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna333-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna325-ValTAC;;;D$chr18.trna283-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna231-CysGCA;;;D$chr21.trna182-AlaTGC;;;D$chr22.trna191-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna90-IleAAT;;;D$Zv8_NA2737.trna1-HisGTG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna168-GlnCTG F$chrA2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10073-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna218-PheGAA;;;D$chr3.trna191-IleAAT;;;D$chr5.trna238-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna331-LeuAAG;;;D$chr8.trna196-GlnTTG;;;D$chr9.trna214-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna279-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna334-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna327-ValCAC;;;D$chr18.trna284-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna232-CysGCA;;;D$chr21.trna183-AlaCGC;;;D$chr22.trna194-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna91-PheGAA;;;D$Zv8_NA2737.trna2-LysTTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna169-IleAAT F$chrA2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10074-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna219-ThrAGT;;;D$chr3.trna192-PheGAA;;;D$chr5.trna24-ProCGG;;;;;;D$chr7.trna332-LeuTAG;;;D$chr8.trna198-ProTGG;;;D$chr9.trna215-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna28-AsnGTT;;;;;;;;;D$chr15.trna335-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna33-ProAGG;;;D$chr18.trna285-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna233-CysGCA;;;D$chr21.trna184-AlaTGC;;;D$chr22.trna195-LysCTT;;;;;;D$chr25.trna92-IleAAT;;;D$Zv8_NA2737.trna3-SerTGA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna17-ValCAC F$chrA2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10077-LysTTT;;;;;;D$chr2.trna220-ArgTCT;;;D$chr3.trna194-GlnCTG;;;D$chr5.trna240-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna333-LeuAAG;;;D$chr8.trna199-ProAGG;;;D$chr9.trna216-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna280-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna336-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna34-LysTTT;;;D$chr18.trna286-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna234-PheGAA;;;D$chr21.trna185-AlaTGC;;;D$chr22.trna197-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna93-PheGAA;;;D$Zv8_NA2779.trna1-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna170-AsnGTT F$chrA2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10078-SerAGA;;;;;;D$chr2.trna221-ThrTGT;;;D$chr3.trna195-IleAAT;;;D$chr5.trna242-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna335-SerGCT;;;D$chr8.trna200-GlnTTG;;;D$chr9.trna218-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna281-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna338-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna35-SerCGA;;;D$chr18.trna287-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna237-CysGCA;;;D$chr21.trna186-AlaTGC;;;D$chr22.trna198-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna94-IleAAT;;;D$Zv8_NA2779.trna2-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna171-LysCTT F$chrA3;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10079-HisGTG;;;;;;D$chr2.trna222-ThrAGT;;;D$chr3.trna196-PheGAA;;;D$chr5.trna244-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna44-ArgACG;;;D$chr8.trna202-ProTGG;;;D$chr9.trna219-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna282-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna34-LysCTT;;;;;;D$chr17.trna356-SerGCT;;;D$chr18.trna289-ThrTGT;;;;;;D$chr20.trna240-CysGCA;;;D$chr21.trna187-AlaCGC;;;D$chr22.trna214-LeuAAG;;;;;;D$chr25.trna95-PheGAA;;;D$Zv8_NA2809.trna1-GlyGCC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna172-IleGAT F$chrB1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna1008-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna223-LysTTT;;;D$chr3.trna198-GlnCTG;;;D$chr5.trna246-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna445-LysTTT;;;D$chr8.trna203-ProAGG;;;D$chr9.trna257-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna284-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna340-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna361-SerGCT;;;D$chr18.trna290-LysTTT;;;;;;D$chr20.trna244-LeuCAA;;;D$chr21.trna188-AlaTGC;;;D$chr22.trna215-LeuTAG;;;;;;D$chr25.trna96-IleAAT;;;D$Zv8_NA2809.trna10-GlyCCC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna173-LysCTT F$chrB1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10081-SerTGA;;;;;;D$chr2.trna224-ThrTGT;;;D$chr3.trna199-IleAAT;;;D$chr5.trna248-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna446-SerCGA;;;D$chr8.trna204-GlnTTG;;;D$chr9.trna258-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna285-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna342-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna366-SerGCT;;;D$chr18.trna291-LeuTAA;;;;;;D$chr20.trna246-PheAAA;;;D$chr21.trna189-AlaTGC;;;D$chr22.trna216-LeuAAG;;;;;;D$chr25.trna97-PheGAA;;;D$Zv8_NA2809.trna2-GlyGCC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna174-LysCTT F$chrB2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10082-HisGTG;;;;;;D$chr2.trna225-ThrAGT;;;D$chr3.trna200-PheGAA;;;D$chr5.trna25-ProAGG;;;;;;D$chr7.trna448-AsnGTT;;;D$chr8.trna206-ProTGG;;;D$chr9.trna259-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna286-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna344-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna371-SerGCT;;;D$chr18.trna292-PheGAA;;;;;;D$chr20.trna247-LeuCAA;;;D$chr21.trna190-AlaTGC;;;D$chr22.trna217-LeuTAG;;;;;;D$chr25.trna98-IleAAT;;;D$Zv8_NA2809.trna3-GlyGCC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna175-AsnGTT F$chrB2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10085-ValAAC;;;;;;D$chr2.trna226-ArgTCT;;;D$chr3.trna202-GlnCTG;;;D$chr5.trna250-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna449-LysCTT;;;D$chr8.trna207-ProAGG;;;D$chr9.trna260-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna287-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna345-HisATG;;;;;;D$chr17.trna376-SerGCT;;;D$chr18.trna293-SupCTA;;;;;;D$chr20.trna249-LeuCAA;;;D$chr21.trna191-AlaCGC;;;D$chr22.trna218-GluCTC;;;;;;D$chr25.trna99-PheGAA;;;D$Zv8_NA2809.trna4-ArgCCT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna176-LysCTT F$chrB3;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10086-ValCAC;;;;;;D$chr2.trna232-ArgGCG;;;D$chr3.trna203-IleAAT;;;D$chr5.trna252-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna45-ArgACG;;;D$chr8.trna208-GlnTTG;;;D$chr9.trna261-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna288-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna346-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna381-SerGCT;;;D$chr18.trna294-IleAAT;;;;;;D$chr20.trna250-LeuCAA;;;D$chr21.trna192-AlaCGC;;;D$chr22.trna221-ValAAC;;;;;;;;;D$Zv8_NA2809.trna7-GlyCCC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna177-LysCTT F$chrB3;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10088-SerGCT;;;;;;D$chr2.trna233-GlyGCC;;;D$chr3.trna204-PheGAA;;;D$chr5.trna254-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna450-AsnGTT;;;D$chr8.trna210-ProTGG;;;D$chr9.trna262-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna289-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna347-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna386-SerGCT;;;D$chr18.trna295-GlnCTG;;;;;;D$chr20.trna251-LeuCAA;;;D$chr21.trna193-AlaTGC;;;D$chr22.trna228-ArgTCT;;;;;;;;;D$Zv8_NA2809.trna9-GlyGCC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna178-AsnGTT F$chrB3;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna1009-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna236-GlyGCC;;;D$chr3.trna206-GlnCTG;;;D$chr5.trna256-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna453-LeuAAG;;;D$chr8.trna211-ProAGG;;;D$chr9.trna263-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna29-LysCTT;;;;;;;;;D$chr15.trna348-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna39-LeuTAA;;;D$chr18.trna298-LeuCAG;;;;;;D$chr20.trna253-LeuCAA;;;D$chr21.trna194-AlaTGC;;;D$chr22.trna229-ThrTGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3022.trna3-LeuTAA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna179-LysCTT F$chrB3;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10091-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna237-GlyGCC;;;D$chr3.trna207-IleAAT;;;D$chr5.trna258-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna454-LeuTAG;;;D$chr8.trna212-GlnTTG;;;D$chr9.trna264-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna290-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna349-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna391-SerGCT;;;D$chr18.trna322-AlaTGC;;;;;;D$chr20.trna255-LeuCAA;;;D$chr21.trna195-AlaCGC;;;D$chr22.trna230-ThrAGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3122.trna1-LeuTAA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna18-ValTAC F$chrB4;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10092-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna242-ArgGCG;;;D$chr3.trna208-PheGAA;;;D$chr5.trna260-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna455-LeuAAG;;;D$chr8.trna213-ProAGG;;;D$chr9.trna265-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna291-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna35-LysCTT;;;;;;D$chr17.trna396-SerGCT;;;D$chr18.trna387-GlnCTG;;;;;;D$chr20.trna256-LeuCAA;;;D$chr21.trna196-AlaTGC;;;D$chr22.trna231-ArgTCT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna1-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna182-LysCTT F$chrB4;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10093-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna244-GlyGCC;;;D$chr3.trna210-GlnCTG;;;D$chr5.trna264-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna456-LeuTAG;;;D$chr8.trna216-ProTGG;;;D$chr9.trna267-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna292-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna350-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna40-LeuTAA;;;D$chr18.trna85-LeuCAG;;;;;;D$chr20.trna257-LeuCAA;;;D$chr21.trna197-AlaTGC;;;D$chr22.trna232-ThrTGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna10-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna184-ArgCCT F$chrB4;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10094-ThrAGT;;;;;;D$chr2.trna246-GlyGCC;;;D$chr3.trna211-IleAAT;;;D$chr5.trna266-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna457-LeuAAG;;;D$chr8.trna217-ProAGG;;;D$chr9.trna268-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna294-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna351-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna401-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna258-LeuCAA;;;D$chr21.trna198-AlaTGC;;;D$chr22.trna233-ThrAGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna11-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna185-LysCTT F$chrB4;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10095-ThrAGT;;;;;;D$chr2.trna247-GlyGCC;;;D$chr3.trna212-PheGAA;;;D$chr5.trna268-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna458-LeuTAG;;;D$chr8.trna218-GlnTTG;;;D$chr9.trna269-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna295-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna352-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna406-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna260-LeuCAA;;;D$chr21.trna199-AlaCGC;;;D$chr22.trna234-ArgTCT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna12-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna186-AsnGTT F$chrC1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10096-ArgACG;;;;;;D$chr2.trna251-GlyGCC;;;D$chr3.trna214-GlnCTG;;;D$chr5.trna270-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna46-ArgTCG;;;D$chr8.trna220-ProTGG;;;D$chr9.trna270-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna296-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna353-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna41-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna261-LeuCAA;;;D$chr21.trna200-AlaTGC;;;D$chr22.trna235-ThrTGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna13-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna187-LysCTT F$chrC1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10097-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna253-GlyGCC;;;D$chr3.trna215-IleAAT;;;D$chr5.trna272-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna47-ArgTCG;;;D$chr8.trna221-ProAGG;;;D$chr9.trna295-LysTTT;;;;;;D$chr12.trna298-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna354-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna410-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna262-LeuCAA;;;D$chr21.trna201-AlaTGC;;;D$chr22.trna236-ThrAGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna14-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna19-ValAAC F$chrC1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10098-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna254-GlyGCC;;;D$chr3.trna216-PheGAA;;;D$chr5.trna274-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna48-ArgTCG;;;D$chr8.trna222-GlnTTG;;;D$chr9.trna296-SerTGA;;;;;;D$chr12.trna299-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna356-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna415-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna263-IleTAT;;;D$chr21.trna202-AlaTGC;;;D$chr22.trna237-ArgTCT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna16-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna20-AlaCGC F$chrC1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10099-SerACT;;;;;;D$chr2.trna255-GlyGCC;;;D$chr3.trna218-GlnCTG;;;D$chr5.trna276-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna51-ArgTCG;;;D$chr8.trna224-ProTGG;;;D$chr9.trna297-HisGTG;;;;;;D$chr12.trna30-AsnGTT;;;;;;;;;D$chr15.trna357-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna419-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna264-LeuCAA;;;D$chr21.trna203-AlaTGC;;;D$chr22.trna238-ThrTGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna17-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna22-ValAAC F$chrC1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna1010-GlyCCC;;;;;;D$chr2.trna257-GlyGCC;;;D$chr3.trna219-IleAAT;;;D$chr5.trna278-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna52-ArgTCG;;;D$chr8.trna225-ProAGG;;;D$chr9.trna298-LysTTT;;;;;;D$chr12.trna300-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna358-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna42-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna266-LeuCAA;;;D$chr21.trna204-AlaTGC;;;D$chr22.trna239-ThrAGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna18-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna23-ValCAC F$chrC1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10100-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna258-GlyGCC;;;D$chr3.trna220-PheGAA;;;D$chr5.trna281-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna523-TrpCCA;;;D$chr8.trna226-GlnTTG;;;D$chr9.trna299-SerTGA;;;;;;D$chr12.trna301-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna359-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna424-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna267-LeuCAA;;;D$chr21.trna205-AlaCGC;;;D$chr22.trna240-ArgTCT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna19-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna24-ValTAC F$chrC2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10101-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna261-GlyGCC;;;D$chr3.trna222-GlnCTG;;;D$chr5.trna282-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna524-TrpCCA;;;D$chr8.trna228-ProTGG;;;D$chr9.trna30-ProTGG;;;;;;D$chr12.trna302-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna36-AsnGTT;;;;;;D$chr17.trna429-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna268-LeuCAA;;;D$chr21.trna206-AlaTGC;;;D$chr22.trna241-ThrTGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna2-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna25-ValAAC F$chrC2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10102-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna262-GlyGCC;;;D$chr3.trna223-IleAAT;;;D$chr5.trna284-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna526-TrpCCA;;;D$chr8.trna229-ProAGG;;;D$chr9.trna300-HisGTG;;;;;;D$chr12.trna303-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna360-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna43-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna269-LeuCAA;;;D$chr21.trna207-AlaTGC;;;D$chr22.trna242-ThrAGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna20-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna26-AlaCGC F$chrC2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10103-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna265-ArgTCT;;;D$chr3.trna224-PheGAA;;;D$chr5.trna286-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna527-TrpCCA;;;D$chr8.trna230-GlnTTG;;;D$chr9.trna301-LysTTT;;;;;;D$chr12.trna304-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna361-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna434-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna270-LeuCAA;;;D$chr21.trna208-AlaTGC;;;D$chr22.trna243-ArgTCT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna21-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna28-ValAAC F$chrC2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10104-SerACT;;;;;;D$chr2.trna283-MetCAT;;;D$chr3.trna226-GlnCTG;;;D$chr5.trna288-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna528-TrpCCA;;;D$chr8.trna231-ProAGG;;;D$chr9.trna302-SerTGA;;;;;;D$chr12.trna305-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna362-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna439-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna271-LeuCAA;;;D$chr21.trna209-AlaTGC;;;D$chr22.trna244-ThrTGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna22-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna29-ValCAC F$chrC2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10106-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna291-TrpCCA;;;D$chr3.trna227-IleAAT;;;D$chr5.trna290-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna529-TrpCCA;;;D$chr8.trna232-GlnTTG;;;D$chr9.trna303-HisGTG;;;;;;D$chr12.trna306-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna364-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna445-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna272-LeuCAA;;;D$chr21.trna210-AlaCGC;;;D$chr22.trna245-ThrAGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna23-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna30-MetCAT F$chrD1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10107-GlyCCC;;;;;;D$chr2.trna307-LeuTAA;;;D$chr3.trna228-PheGAA;;;D$chr5.trna292-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna53-ArgTCG;;;D$chr8.trna234-ProTGG;;;D$chr9.trna304-LysTTT;;;;;;D$chr12.trna308-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna365-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna45-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna275-LeuCAA;;;D$chr21.trna211-AlaTGC;;;D$chr22.trna246-ArgTCT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna24-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna31-MetCAT F$chrD1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10108-GlyCCC;;;;;;D$chr2.trna308-LeuTAA;;;D$chr3.trna230-GlnCTG;;;D$chr5.trna293-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna530-TrpCCA;;;D$chr8.trna235-ProAGG;;;D$chr9.trna305-SerTGA;;;;;;D$chr12.trna309-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna375-SeC(e)TCA;;;;;;D$chr17.trna450-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna276-LeuCAA;;;D$chr21.trna212-AlaTGC;;;D$chr22.trna247-ThrTGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna25-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna32-MetCAT F$chrD2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10109-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna309-LeuTAA;;;D$chr3.trna231-IleAAT;;;D$chr5.trna294-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna531-TrpCCA;;;D$chr8.trna236-GlnTTG;;;D$chr9.trna306-LysTTT;;;;;;D$chr12.trna31-AsnGTT;;;;;;;;;D$chr15.trna378-GluTTC;;;;;;D$chr17.trna455-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna278-LeuCAA;;;D$chr21.trna213-AlaCGC;;;D$chr22.trna248-ThrAGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna26-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna33-MetCAT F$chrD4;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna1011-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna310-LeuTAA;;;D$chr3.trna232-PheGAA;;;D$chr5.trna296-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna532-TrpCCA;;;D$chr8.trna238-ProTGG;;;D$chr9.trna307-SerAGA;;;;;;D$chr12.trna310-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna379-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna459-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna279-IleTAT;;;D$chr21.trna214-AlaTGC;;;D$chr22.trna249-ArgTCT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna27-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna34-MetCAT F$chrE1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10110-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna312-LeuTAA;;;D$chr3.trna234-GlnCTG;;;D$chr5.trna297-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna533-TrpCCA;;;D$chr8.trna239-ProAGG;;;D$chr9.trna308-HisGTG;;;;;;D$chr12.trna312-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna38-LysCTT;;;;;;D$chr17.trna46-SupTTA;;;;;;;;;D$chr20.trna280-LeuCAA;;;D$chr21.trna215-AlaTGC;;;D$chr22.trna250-ThrTGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna3-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna35-MetCAT F$chrE1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10117-GlyCCC;;;;;;D$chr2.trna313-LeuTAA;;;D$chr3.trna235-IleAAT;;;D$chr5.trna299-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna534-TrpCCA;;;D$chr8.trna240-GlnTTG;;;D$chr9.trna309-LysTTT;;;;;;D$chr12.trna313-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna380-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna464-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna281-LeuCAA;;;D$chr21.trna216-AlaTGC;;;D$chr22.trna251-ThrAGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna30-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna36-MetCAT F$chrE1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10118-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna315-ThrAGT;;;D$chr3.trna236-PheGAA;;;D$chr5.trna301-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna535-TrpCCA;;;D$chr8.trna242-ProTGG;;;D$chr9.trna310-SerTGA;;;;;;D$chr12.trna314-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna381-GluTTC;;;;;;D$chr17.trna471-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna282-LeuCAA;;;D$chr21.trna217-AlaCGC;;;D$chr22.trna252-ArgTCT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna31-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna37-MetCAT F$chrE1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna1012-GlyCCC;;;;;;D$chr2.trna316-ArgTCT;;;D$chr3.trna238-GlnCTG;;;D$chr5.trna303-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna536-TrpCCA;;;D$chr8.trna243-ProAGG;;;D$chr9.trna311-LysTTT;;;;;;D$chr12.trna315-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna382-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna5-GlyTCC;;;;;;;;;D$chr20.trna283-LeuCAA;;;D$chr21.trna218-AlaTGC;;;D$chr22.trna254-ValAAC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna32-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna38-MetCAT F$chrE1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10120-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna317-ThrAGT;;;D$chr3.trna239-IleAAT;;;D$chr5.trna304-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna537-TrpCCA;;;D$chr8.trna244-GlnTTG;;;D$chr9.trna312-SerAGA;;;;;;D$chr12.trna316-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna383-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna506-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna284-LeuCAA;;;D$chr21.trna219-AlaTGC;;;D$chr22.trna255-ValCAC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna4-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna39-ThrTGT F$chrE2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10124-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna318-ThrAGT;;;D$chr3.trna240-PheGAA;;;D$chr5.trna306-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna538-TrpCCA;;;D$chr8.trna246-ProTGG;;;D$chr9.trna313-HisGTG;;;;;;D$chr12.trna318-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna384-GluTTC;;;;;;D$chr17.trna509-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna285-LeuCAA;;;D$chr21.trna220-AlaTGC;;;D$chr22.trna257-ValCAC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna5-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna4-HisGTG F$chrE2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10125-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna319-ThrAGT;;;D$chr3.trna242-GlnCTG;;;D$chr5.trna308-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna54-ArgTCG;;;D$chr8.trna247-ProAGG;;;D$chr9.trna314-LysTTT;;;;;;D$chr12.trna319-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna385-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna510-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna288-LeuCAA;;;D$chr21.trna221-AlaTGC;;;D$chr22.trna258-ValTAC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna6-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna40-ThrTGT F$chrE3;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10129-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna320-LeuTAG;;;D$chr3.trna243-IleAAT;;;D$chr5.trna312-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna540-TrpCCA;;;D$chr8.trna248-GlnTTG;;;D$chr9.trna315-SerAGA;;;;;;D$chr12.trna320-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna386-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna511-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna289-LeuCAA;;;D$chr21.trna222-AlaTGC;;;D$chr22.trna259-ValAAC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna7-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna41-ThrCGT F$chrE3;ArgCCT;;B$chr1;GlyGCC;;D$chr4.trna1013-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna321-ThrAGT;;;D$chr3.trna244-PheGAA;;;D$chr5.trna313-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna542-TrpCCA;;;D$chr8.trna250-ProTGG;;;D$chr9.trna377-SerCGA;;;;;;D$chr12.trna321-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna387-GluTTC;;;;;;D$chr17.trna513-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna290-LeuCAA;;;D$chr21.trna223-AlaTGC;;;D$chr22.trna260-ValCAC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna8-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna42-ThrAGT F$chrE3;ArgCCT;;B$chr1;GlyGCC;;D$chr4.trna10130-HisGTG;;;;;;D$chr2.trna322-ThrAGT;;;D$chr3.trna246-GlnCTG;;;D$chr5.trna315-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna543-TrpCCA;;;D$chr8.trna251-ProAGG;;;D$chr9.trna379-LeuCAA;;;;;;D$chr12.trna322-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna388-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna514-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna291-LeuCAA;;;D$chr21.trna224-AlaTGC;;;D$chr22.trna261-ValTAC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna9-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna43-ArgTCT F$chrE3;ArgCCT;;B$chr1;GlyGCC;;D$chr4.trna10132-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna323-ThrAGT;;;D$chr3.trna247-IleAAT;;;D$chr5.trna316-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna544-TrpCCA;;;D$chr8.trna252-GlnTTG;;;D$chr9.trna42-LysTTT;;;;;;D$chr12.trna323-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna389-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna515-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna292-IleTAT;;;D$chr21.trna225-AlaCGC;;;D$chr22.trna288-GlyTCC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3307.trna1-AlaAGC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna44-ThrTGT F$chrF1;ArgCCT;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna10133-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna324-ArgTCT;;;D$chr3.trna248-PheGAA;;;D$chr5.trna317-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna545-TrpCCA;;;D$chr8.trna254-ProTGG;;;D$chr9.trna441-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna324-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna39-AsnGTT;;;;;;D$chr17.trna516-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna293-LeuCAA;;;D$chr21.trna226-AlaTGC;;;D$chr22.trna289-GlyTCC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3358.trna1-GlyTCC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna45-MetCAT F$chrF1;ArgCCT;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna10134-ArgACG;;;;;;D$chr2.trna325-ThrAGT;;;D$chr3.trna25-CysGCA;;;D$chr5.trna319-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna546-TrpCCA;;;D$chr8.trna255-ProAGG;;;D$chr9.trna46-ProTGG;;;;;;D$chr12.trna325-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna390-GluTTC;;;;;;D$chr17.trna517-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna294-LeuCAA;;;D$chr21.trna227-AlaTGC;;;D$chr22.trna290-GlyTCC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3556.trna1-GlyGCC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna47-LeuTAG F$chrF1;ArgCCT;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna10135-AlaTGC;;;;;;D$chr2.trna326-ThrAGT;;;D$chr3.trna250-GlnCTG;;;D$chr5.trna320-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna547-TrpCCA;;;D$chr8.trna256-GlnTTG;;;D$chr9.trna47-GlnCTG;;;;;;D$chr12.trna326-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna391-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna545-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna295-LeuCAA;;;D$chr21.trna228-AlaTGC;;;D$chr22.trna293-GluCTC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3563.trna1-LysTTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna48-LeuAAG F$chrF1;ArgCCT;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna10136-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna327-ThrAGT;;;D$chr3.trna251-IleAAT;;;D$chr5.trna322-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna548-TrpCCA;;;D$chr8.trna258-ProTGG;;;D$chr9.trna48-GlnTTG;;;;;;D$chr12.trna327-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna392-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna547-ArgCCG;;;;;;;;;D$chr20.trna296-LeuCAA;;;D$chr21.trna229-AlaTGC;;;D$chr22.trna297-LysCTT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3563.trna10-ProTGG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna49-LeuTAG F$chrX;ArgCCT;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna10137-ArgACG;;;;;;D$chr2.trna328-ArgTCT;;;D$chr3.trna252-PheGAA;;;D$chr5.trna324-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna549-TrpCCA;;;D$chr8.trna259-ProAGG;;;D$chr9.trna49-ProAGG;;;;;;D$chr12.trna328-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna393-GluTTC;;;;;;D$chr17.trna548-SeCTCA;;;;;;;;;D$chr20.trna297-LeuCAA;;;D$chr21.trna230-AlaCGC;;;D$chr22.trna298-LysCTT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3563.trna2-SerAGA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna5-LysTTT F$chrX;ArgCCT;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna10138-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna329-ThrAGT;;;D$chr3.trna254-GlnCTG;;;D$chr5.trna326-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna55-ArgTCG;;;D$chr8.trna260-GlnTTG;;;D$chr9.trna50-GlnTTG;;;;;;D$chr12.trna33-AsnGTT;;;;;;;;;D$chr15.trna394-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna549-ArgTCG;;;;;;;;;D$chr20.trna298-LeuCAA;;;D$chr21.trna231-AlaTGC;;;D$chr22.trna299-AsnGTT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3563.trna4-SupTTA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna50-LeuAAG F$chrX;ArgCCT;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna10139-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna330-ThrAGT;;;D$chr3.trna255-IleAAT;;;D$chr5.trna328-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna550-TrpCCA;;;D$chr8.trna262-ProTGG;;;D$chr9.trna78-LeuCAA;;;;;;D$chr12.trna330-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna395-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna552-AlaAGC;;;;;;;;;D$chr20.trna299-LeuCAA;;;D$chr21.trna232-AlaCGC;;;D$chr22.trna301-AsnGTT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3688.trna1-IleAAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna51-LeuTAG F$chrA3;ArgGCG;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna1014-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna331-ThrAGT;;;D$chr3.trna256-PheGAA;;;D$chr5.trna329-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna551-SerACT;;;D$chr8.trna263-ProAGG;;;;;;;;;D$chr12.trna332-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna396-GluTTC;;;;;;D$chr17.trna553-ValCAC;;;;;;;;;D$chr20.trna300-LeuCAA;;;D$chr21.trna233-AlaTGC;;;D$chr22.trna302-LysCTT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3688.trna2-PheGAA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna52-LeuAAG F$chrB1;ArgGCG;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna10140-ArgACG;;;;;;D$chr2.trna332-ArgTCT;;;D$chr3.trna258-GlnCTG;;;D$chr5.trna330-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna552-TrpCCA;;;D$chr8.trna264-GlnTTG;;;;;;;;;D$chr12.trna333-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna397-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna555-ValAAC;;;;;;;;;D$chr20.trna302-LeuCAA;;;D$chr21.trna234-AlaTGC;;;D$chr22.trna305-GlyTCC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3745.trna1-TrpCCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna54-SerCGA F$chrB3;ArgGCG;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna10141-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna333-ThrAGT;;;D$chr3.trna259-IleAAT;;;D$chr5.trna338-GluTTC;;;;;;D$chr7.trna553-TrpCCA;;;D$chr8.trna266-ProTGG;;;;;;;;;D$chr12.trna334-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna398-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna556-ValCAC;;;;;;;;;D$chr20.trna303-LeuCAA;;;D$chr21.trna235-AlaTGC;;;D$chr22.trna306-ThrTGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3745.trna2-TrpCCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna55-ProTGG F$chrD1;ArgGCG;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna10142-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna334-ArgTCT;;;D$chr3.trna26-CysGCA;;;D$chr5.trna360-SerTGA;;;;;;D$chr7.trna554-TrpCCA;;;D$chr8.trna267-GlnTTG;;;;;;;;;D$chr12.trna335-A
Les introns des 121 eucaryotes
[modifier | modifier le wikicode]Champignons détail des introns
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Champignons détail des introns
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;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg;&emsp ;;total;&emsp ;;DNA;Génome ;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;2;;46;Encephalitozoon cuniculi GB-M1 ;0;1;1;1;1;1;1;0;2;0;1;3;0;0;1;1;1;0;1;1;0;0;1;1;2;0;0;0;2;0;1;1;0;1;0;0;0;2;1;1;0;1;1;0;0;2;1;0;0;1;2;0;1;0;2;1;0;1;0;1;0;2;0;1;;47;;53;Exophiala dermatitidis NIH/UT8656 ;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;7;;80;Ogataea parapolymorpha DL-1 ;0;0;3;1;1;0;0;0;0;0;1;2;0;0;1;1;0;0;2;1;1;0;3;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;3;0;0;0;1;3;1;0;0;0;3;0;0;1;1;0;0;0;1;2;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;;35;;82;Candida orthopsilosis Co 90-125 ;0;4;1;0;4;0;1;2;4;0;1;4;4;0;1;1;2;0;1;2;3;0;1;1;1;0;1;1;3;0;1;1;0;2;0;0;0;3;3;2;0;0;1;5;0;3;2;4;0;2;1;2;4;0;2;0;0;0;1;1;0;6;1;1;;91;;96;Sporisorium reilianum SRZ2 ;0;3;1;0;4;0;1;2;4;0;1;4;4;0;1;1;3;0;1;3;4;0;1;1;0;0;1;1;5;0;1;1;0;3;0;0;0;2;2;3;0;0;1;5;0;5;2;4;0;2;2;2;4;0;3;0;0;2;1;1;0;6;2;1;;101;;111;Ustilago maydis 521 ;0;5;0;3;0;0;1;1;0;0;1;2;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;3;2;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;;29;;123;Komagataella pastoris CBS 7435 ;0;5;5;6;2;0;0;0;6;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;1;1;0;4;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;4;0;0;0;3;5;0;0;3;1;2;0;0;6;0;0;2;0;2;2;0;0;1;0;2;0;1;0;0;0;0;;67;;125;Candida albicans WO-1 ;0;5;1;3;6;0;0;1;6;0;1;6;7;0;0;2;6;0;1;1;6;0;1;1;5;0;1;1;8;0;1;2;0;4;0;0;0;2;2;0;0;4;1;7;0;2;3;10;0;3;0;3;3;0;5;1;0;2;1;3;0;5;1;2;;136;;143;Cryptococcus neoformans var. grubii H99 ;0;5;7;1;5;0;1;4;6;0;1;2;0;0;1;3;0;0;1;0;4;0;2;3;4;0;1;2;7;0;2;3;0;4;0;0;0;3;2;4;0;3;1;6;0;6;0;7;0;0;0;0;6;0;1;1;0;3;0;2;0;0;1;2;;117;;154;Thielavia terrestris NRRL 8126 ;0;4;0;2;5;0;3;4;7;0;1;3;5;0;1;2;2;0;1;2;1;0;2;1;3;0;3;2;7;0;2;2;0;4;0;0;0;4;2;3;0;3;0;9;0;3;2;8;0;0;0;3;5;0;2;2;0;3;0;2;1;8;0;1;;130;;156;Valsa mali 03-8 ;0;6;0;5;1;0;3;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;;40;;158;Kazachstania naganishii CBS 8797 ;0;0;0;7;0;0;2;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;1;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;4;3;0;0;0;0;2;0;0;0;0;2;0;;39;;162;Kluyveromyces lactis NRRL Y-1140 ;0;0;2;4;0;0;1;1;0;0;1;3;9;0;0;0;0;0;2;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;3;0;1;0;0;0;0;;44;;168;Schizosaccharomyces pombe 972h- ;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;1;3;0;0;1;0;0;0;0;2;1;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;3;9;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;;42;;170;Scheffersomyces stipitis CBS 6054 ;0;5;1;2;6;0;2;3;4;0;1;3;0;0;0;1;0;0;1;2;6;0;2;1;1;0;2;2;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;2;5;0;6;2;0;0;8;2;1;0;3;0;0;0;0;2;2;0;4;0;2;0;0;2;1;;93;;181;Aspergillus nidulans FGSC A4 ;0;7;1;2;7;0;1;4;8;0;1;4;6;0;1;2;4;0;2;3;5;0;2;2;4;0;2;2;9;0;3;2;0;5;0;0;0;0;2;6;0;6;0;6;0;0;1;9;0;3;0;0;6;0;2;0;0;3;1;3;0;14;3;3;;157;;190;Magnaporthe oryzae 70-15 ;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;2;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;4;5;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;;25;;191;Cyberlindnera jadinii NBRC 0988 NBRC0988 ;0;6;0;8;0;0;4;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;;45;;192;Torulaspora delbrueckii CBS 1146 ;0;0;2;0;6;1;0;3;0;0;2;10;8;0;1;3;3;0;1;2;0;0;0;1;6;0;2;1;0;0;0;2;0;5;1;0;0;11;3;0;0;1;1;0;0;8;1;0;0;3;1;0;0;0;1;0;0;4;0;1;0;0;4;1;;100;;192;Penicillium chrysogenum P2niaD18 ;0;5;1;2;7;0;1;4;8;0;1;4;0;0;1;3;0;0;2;0;6;0;2;3;2;0;2;2;7;0;2;3;0;6;0;0;0;4;2;3;0;0;0;9;0;8;0;8;0;0;0;2;5;0;0;2;0;5;1;2;0;0;0;2;;127;;192;Myceliophthora thermophila ATCC 42464 ;0;6;0;7;0;0;4;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;4;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;5;4;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;;52;;205;Saccharomycetaceae sp. Ashbya aceri ;0;9;0;2;0;0;2;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;;42;;206;Tetrapisispora phaffii CBS 4417 ;0;6;0;8;0;0;4;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;;45;;207;Candida glabrata CBS 138 ;0;7;2;5;6;0;1;1;8;0;1;4;8;0;2;2;0;0;4;2;4;0;8;1;3;0;2;0;0;0;5;2;0;6;0;0;0;4;0;0;0;6;1;8;0;9;6;9;0;5;0;1;4;0;4;0;0;5;5;0;0;8;0;2;;161;;212;Botrytis cinerea B05.10 ;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;2;4;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;7;10;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;1;0;3;0;0;0;0;0;0;;54;;214;Debaryomyces hansenii CBS767 ;0;7;1;1;8;0;1;0;0;0;0;4;8;0;1;2;0;1;3;1;8;0;3;0;0;0;3;3;11;0;2;1;0;6;0;0;0;6;2;0;0;6;2;0;0;5;2;0;0;1;1;3;4;0;0;0;0;2;2;1;0;0;2;1;;115;;225;Verticillium dahliae VdLs.17 ;0;7;0;8;0;0;3;3;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;5;4;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;;57;;229;Lachancea thermotolerans CBS 6340 ;0;7;0;0;0;0;1;4;0;0;2;4;0;1;1;3;0;0;1;3;9;0;3;0;0;0;2;2;0;0;0;1;0;13;0;0;0;7;4;0;0;0;3;11;0;13;3;0;1;4;0;0;0;0;0;1;0;6;2;2;0;0;0;0;;114;;242;Aspergillus oryzae RIB40 ;0;8;0;11;0;0;3;0;0;0;1;0;0;0;0;0;11;0;0;1;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;1;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;5;5;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;;72;;258;Lachancea kluyveri NRRL Y-12651 ;0;9;0;2;0;0;2;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;;53;;266;Kazachstania africana CBS 2517 ;0;10;0;9;0;0;3;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;;63;;270;Naumovozyma castellii CBS 4309 ;0;9;1;3;6;0;2;5;11;0;3;5;0;0;1;1;0;0;2;2;10;0;3;2;0;0;0;0;12;0;3;3;0;6;0;0;0;7;5;0;0;9;2;12;0;0;4;13;0;0;1;4;0;0;9;0;0;8;2;1;0;15;4;1;;187;;270;Fusarium graminearum CS3005 ;0;8;0;10;0;0;5;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;3;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;;54;;272;Zygosaccharomyces rouxii CBS 732 ;2;12;1;4;6;0;2;2;0;0;2;6;0;0;2;3;3;0;2;3;4;0;4;2;5;0;2;0;2;0;8;1;0;6;0;0;0;7;4;6;1;12;6;11;1;7;4;10;0;1;0;3;11;0;5;2;0;0;0;6;0;10;3;7;;201;;273;Flammulina velutipes KACC42780 ;0;10;0;10;0;0;3;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;;61;;275;Saccharomyces cerevisiae (S288c Apr 2011) ;0;10;2;4;12;0;2;5;11;0;1;5;0;0;1;1;0;0;2;3;10;0;0;2;4;0;0;0;14;0;3;3;0;8;0;0;0;6;4;0;1;8;2;15;1;0;5;16;0;0;0;5;0;0;7;0;0;7;1;0;0;14;2;0;;197;;285;Fusarium verticillioides 7600 ;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;4;6;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;6;10;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;2;0;6;0;0;0;0;0;0;;68;;288;Millerozyma farinosa CBS 7064 ;0;10;1;3;13;0;2;5;13;0;3;6;0;0;1;1;0;0;2;2;10;0;3;2;0;0;0;0;13;0;3;2;0;8;0;0;0;7;5;0;0;9;2;16;0;0;4;19;0;0;1;4;0;0;9;0;0;8;2;1;0;14;4;1;;209;;305;Fusarium graminearum PH-1 NRRL 31084 ;0;12;0;9;0;0;2;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;;71;;328;Tetrapisispora blattae CBS 6284 ;0;12;1;5;16;0;2;6;17;1;1;7;0;0;2;1;0;0;2;4;11;0;1;4;2;0;3;3;19;0;3;5;0;10;0;1;0;9;3;11;0;1;2;5;0;18;1;24;0;0;0;0;0;0;1;0;0;6;1;5;0;0;0;6;;232;;396;Neurospora crassa OR74A ;0;17;0;3;21;0;2;11;26;0;1;0;0;0;0;3;0;0;2;4;21;0;0;2;0;0;3;1;0;0;0;0;0;14;0;0;0;4;3;14;0;16;4;34;0;28;0;27;0;0;0;13;0;0;25;0;0;6;0;0;0;0;11;0;;316;;510;Yarrowia lipolytica CLIB122 &emsp ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; total;2;261;35;151;143;2;68;71;141;1;59;104;59;1;25;37;35;1;43;66;125;0;168;31;42;0;30;25;119;0;43;36;0;250;1;1;0;92;59;65;2;94;131;202;2;125;50;170;1;30;9;124;91;0;80;17;0;144;20;36;1;102;42;33;;;;; ;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg;;;;; zéros;40;7;23;10;21;40;10;22;26;41;1;18;33;41;21;22;33;41;18;5;22;42;9;24;29;42;27;27;28;42;26;24;42;0;41;41;42;23;22;27;40;26;6;21;40;27;24;26;41;30;35;12;20;42;26;30;42;4;30;24;41;31;28;26;;;;; 42−zér;2;35;19;32;21;2;32;20;16;1;41;24;9;1;21;20;9;1;24;37;20;0;33;18;13;0;15;15;14;0;16;18;0;42;1;1;0;19;20;15;2;16;36;21;2;15;18;16;1;12;7;30;22;0;16;12;0;38;12;18;1;11;14;16;;;;;
Champignons détail des tRNAs
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;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg;DNA;KEGG;génome;;;;;moy ;0;1;1;1;1;0;1;1;1;0;1;2;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;0;1;0;0;0;1;1;1;0;2;1;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;0;1;0;0;1;1;1;0;1;1;1;46;ecu;Encephalitozoon cuniculi GB-M1;;;;;1.02 ;0;1;1;1;1;1;1;1;2;0;1;1;2;0;1;1;1;0;1;1;0;0;1;1;2;0;1;1;2;0;1;1;0;1;0;0;0;2;1;1;0;1;1;0;0;2;1;2;0;1;0;0;2;0;2;1;0;1;0;1;0;2;1;2;53;ede*;Exophiala dermatitidis NIH/UT8656;;;;;1.16 ;0;3;1;3;1;0;1;1;4;0;1;4;3;0;0;1;2;0;1;1;0;0;3;0;3;0;1;1;3;0;2;0;0;2;0;0;0;2;2;1;0;2;2;3;0;3;2;3;0;1;0;2;2;0;0;1;0;2;3;1;0;4;2;0;80;opa*;Ogataea parapolymorpha DL-1;;;;;1.78 ;0;2;3;1;1;0;0;1;4;0;1;4;4;0;1;1;2;0;2;1;1;0;3;0;4;0;2;1;3;0;2;0;0;3;0;0;0;1;3;1;0;3;4;3;0;5;2;1;0;1;0;1;2;0;0;1;0;1;2;1;0;2;1;0;82;cot;Candida orthopsilosis Co 90-125;;;;;1.82 ;0;4;1;0;4;0;1;2;4;0;1;4;4;0;1;0;2;0;1;2;3;0;1;1;4;0;1;1;3;0;1;1;0;2;0;0;0;3;3;2;0;3;1;5;0;3;2;4;0;2;1;2;4;0;2;0;0;0;1;1;0;6;1;1;96;sre*;Sporisorium reilianum SRZ2;;;;;2.11 ;0;3;1;0;4;0;2;2;4;0;1;4;4;0;1;1;3;0;1;3;4;1;1;1;4;0;1;1;5;0;1;1;0;3;0;0;0;2;2;3;0;3;1;5;0;5;2;5;0;2;2;2;4;0;3;0;0;2;1;1;0;6;2;1;111;uma;Ustilago maydis 521;;;;;2.40 ;0;5;1;3;2;0;1;2;5;0;1;4;5;0;1;1;4;0;2;1;2;0;4;1;5;0;1;1;5;0;2;0;0;4;0;0;0;3;3;2;0;4;3;5;0;6;5;4;0;2;0;3;2;0;1;1;0;2;4;1;0;5;3;1;123;kpa*;Komagataella pastoris CBS 7435;;;;;2.73 ;0;5;5;6;2;0;0;1;6;0;1;4;6;0;1;1;4;0;3;1;1;0;4;0;4;0;2;1;6;0;2;0;0;4;0;0;0;3;5;1;0;3;5;2;0;6;6;1;0;2;0;2;2;0;0;1;0;2;5;1;0;5;2;1;125;cal;Candida albicans WO-1;;;;;2.78 ;0;5;1;3;6;0;0;1;6;0;1;7;7;0;0;2;6;0;1;1;6;0;1;0;5;0;1;1;8;0;1;2;0;4;0;0;0;4;2;3;0;4;1;7;0;0;3;10;0;3;0;3;3;0;5;1;0;2;1;3;0;9;3;0;143;cneg*;Cryptococcus neoformans var. grubii H99;;;;;3.18 ;0;5;5;1;5;0;1;4;6;0;1;5;6;0;1;3;3;0;1;3;4;0;2;3;4;0;1;2;7;0;2;3;0;4;0;0;0;3;2;4;0;3;2;6;0;6;2;7;0;3;0;4;6;0;1;3;0;3;1;2;0;10;2;2;154;ttt;Thielavia terrestris NRRL 8126;;;;;3.42 ;0;4;0;2;5;0;1;4;7;0;1;8;7;0;1;2;5;0;1;2;0;0;2;1;4;0;3;2;7;0;2;2;0;4;0;0;0;5;2;4;0;5;0;9;0;6;3;9;0;3;0;3;6;0;2;2;0;3;1;2;0;9;3;2;156;vma*;Valsa mali 03-8;;;;;3.47 ;0;6;3;5;1;0;3;0;7;0;2;4;7;0;1;2;7;0;1;1;1;0;6;0;7;0;2;1;7;0;1;1;0;5;0;0;0;4;4;2;0;6;4;7;0;8;5;3;0;4;0;4;3;0;0;1;0;3;6;1;0;9;1;2;158;kna*;Kazachstania naganishii CBS 8797;;;;;3.51 ;0;5;3;7;0;1;2;0;7;0;1;6;7;0;1;2;6;0;2;1;1;0;7;0;6;0;2;1;7;0;3;0;0;5;0;0;0;4;6;1;0;6;4;9;0;8;8;2;0;3;0;4;3;0;0;1;0;2;7;1;0;7;2;1;162;kla;Kluyveromyces lactis NRRL Y-1140;;;;;3.58 ;0;5;2;4;5;0;1;1;8;0;1;7;9;0;2;1;7;0;2;1;6;0;2;1;7;0;2;1;6;0;2;1;0;4;0;0;0;4;4;2;0;6;3;9;0;8;4;6;0;3;0;3;8;0;1;1;0;3;2;1;0;8;3;1;168;spo;Schizosaccharomyces pombe 972h-;;;;;3.73 ;0;6;3;8;3;0;0;1;7;0;1;6;7;0;2;1;6;0;2;2;1;0;6;0;7;0;2;1;7;0;3;0;0;5;0;0;0;4;5;2;0;7;3;9;0;8;8;2;0;3;0;4;3;0;0;1;0;2;7;1;0;10;3;1;170;pic;Scheffersomyces stipitis CBS 6054;;;;;3.78 ;0;5;1;2;6;0;2;3;7;0;1;7;8;0;1;2;5;0;1;2;6;0;2;2;6;0;2;2;8;0;2;3;0;6;0;0;0;5;2;5;0;6;2;8;0;8;3;8;0;3;0;3;9;0;2;2;0;4;2;2;0;11;3;1;181;ani;Aspergillus nidulans FGSC A4;;;;;4.02 ;0;7;1;2;7;0;1;4;8;0;1;8;6;0;1;2;4;0;2;3;5;0;2;2;6;0;2;2;9;0;3;2;0;5;0;0;0;4;2;6;0;6;2;9;0;10;3;9;0;3;0;4;6;0;2;2;0;3;1;3;0;14;3;3;190;mgr;Magnaporthe oryzae 70-15;;;;;4.22 ;0;8;1;7;4;0;3;1;6;1;1;7;9;0;2;3;7;0;3;1;0;0;7;0;6;0;3;1;6;0;3;0;0;5;0;0;0;6;6;2;0;7;5;8;0;8;4;9;0;3;1;4;6;0;0;1;0;3;7;0;0;11;4;1;191;cjd*;Cyberlindnera jadinii NBRC 0988 NBRC0988;;;;;4.20 ;0;6;3;8;0;1;4;0;8;0;1;7;12;0;1;2;7;0;2;1;1;0;6;0;9;0;2;1;8;0;4;0;0;6;0;0;0;4;6;2;0;7;5;10;0;9;8;4;0;3;0;4;4;0;0;1;0;3;7;1;0;11;2;1;192;tdl;Torulaspora delbrueckii CBS 1146;;;;;4.24 ;0;5;0;0;6;1;0;3;10;0;2;10;9;0;1;3;7;0;1;2;0;0;0;1;12;0;3;2;8;0;2;2;0;5;0;0;0;11;3;5;0;6;1;9;0;9;3;10;0;3;1;0;10;0;2;2;0;4;0;2;0;11;4;1;192;pch*;Penicillium chrysogenum P2niaD18;;;;;4.22 ;0;5;1;2;7;0;1;4;8;0;1;8;7;0;2;3;5;0;3;3;6;0;2;3;6;0;2;3;7;0;2;3;0;6;0;0;0;4;2;5;0;6;3;9;0;10;2;8;0;3;1;4;7;0;1;2;0;5;1;2;0;11;4;2;192;mth*;Myceliophthora thermophila ATCC 42464;;;;;4.24 ;0;7;3;7;0;1;4;1;9;0;1;10;7;0;3;4;7;0;3;3;1;0;7;0;7;0;3;2;7;0;5;2;0;5;0;0;0;5;4;4;0;8;4;9;0;10;3;8;0;3;1;5;4;0;0;2;0;3;7;1;0;11;2;2;205;sas*;Saccharomycetaceae sp. Ashbya aceri;;;;;4.51 ;0;9;9;2;0;1;2;0;10;0;2;8;10;0;2;1;8;0;2;1;1;0;7;0;9;0;2;1;9;0;3;0;0;6;0;0;0;5;7;1;0;9;6;9;0;12;11;1;0;4;0;4;3;0;0;1;0;3;8;1;0;13;2;1;206;tpf;Tetrapisispora phaffii CBS 4417;;;;;4.56 ;0;6;3;8;0;1;4;0;9;0;2;7;10;0;2;1;9;0;2;1;1;0;7;0;9;0;3;1;10;0;5;0;0;6;0;0;0;6;6;2;0;9;3;12;0;9;9;3;0;3;0;5;4;0;0;1;0;3;9;1;0;12;2;1;207;cgr;Candida glabrata CBS 138;;;;;4.58 ;0;7;2;5;6;0;1;1;8;0;1;8;8;0;2;2;7;0;3;2;4;0;7;1;6;0;3;0;8;0;5;2;0;6;0;0;0;4;6;2;0;6;3;10;0;9;6;9;0;5;0;6;6;0;4;2;0;5;5;1;1;8;2;7;212;bfu;Botrytis cinerea B05.10;;;;;4.69 ;0;8;9;4;2;0;0;1;9;1;2;10;10;0;1;1;6;0;4;1;1;0;7;0;8;0;2;1;7;0;5;1;0;6;0;0;0;6;7;1;0;9;8;10;0;10;9;1;0;4;1;4;5;0;0;1;0;3;10;1;0;11;5;1;214;dha;Debaryomyces hansenii CBS767;;;;;4.71 ;0;7;1;1;8;0;1;4;9;0;0;9;11;0;1;2;6;1;2;4;8;0;3;2;8;0;2;3;11;0;2;4;1;6;0;0;0;6;2;5;0;6;2;12;0;10;2;12;0;5;1;3;9;0;2;2;0;5;3;2;0;13;3;3;225;vda;Verticillium dahliae VdLs.17;;;;;4.93 ;0;7;2;8;0;2;3;3;10;0;1;8;11;0;1;3;9;0;2;2;2;0;8;0;9;0;2;1;10;0;3;2;0;6;0;0;0;5;5;5;0;7;4;14;0;10;6;11;0;4;0;5;4;0;0;1;0;3;9;1;0;15;3;2;229;lth;Lachancea thermotolerans CBS 6340;;;;;5.04 ;0;7;2;0;0;0;1;4;10;0;2;6;10;1;2;3;7;0;1;3;9;0;2;0;10;0;2;2;10;0;3;4;1;13;0;0;0;8;4;7;0;8;3;11;0;13;6;11;1;4;0;4;12;0;2;3;0;6;2;2;0;15;4;1;242;aor;Aspergillus oryzae RIB40;;;;;5.31 ;0;8;3;11;0;1;3;0;12;0;1;10;14;0;1;3;11;0;2;1;1;1;10;0;12;0;2;1;13;0;4;0;0;7;0;0;0;6;10;1;0;9;5;14;0;13;13;3;0;5;0;5;5;0;0;1;0;4;12;1;0;15;2;2;258;lkl*;Lachancea kluyveri NRRL Y-12651;;;;;5.69 ;0;9;14;2;2;0;2;0;13;0;2;9;13;0;2;1;11;0;4;1;1;0;10;0;11;0;3;1;12;0;5;0;0;9;0;0;0;6;9;1;0;10;8;12;0;13;15;2;0;5;0;6;4;0;0;1;0;4;11;1;0;17;3;1;266;kaf;Kazachstania africana CBS 2517;;;;;5.91 ;0;10;7;9;2;0;3;0;12;0;2;9;13;0;2;2;12;0;4;1;1;0;10;0;11;0;3;2;12;0;5;0;0;9;0;0;0;8;9;1;0;10;8;14;0;14;13;1;0;4;0;7;5;0;0;2;0;4;10;1;0;13;3;2;270;ncs;Naumovozyma castellii CBS 4309;;;;;6.00 ;0;9;1;3;6;0;2;5;11;0;2;5;16;0;2;3;11;0;2;2;10;0;3;2;11;0;4;3;13;0;3;3;0;6;0;0;0;7;5;7;0;9;2;12;0;10;4;13;0;5;1;4;10;0;9;1;0;8;2;2;0;15;5;1;270;fgr;Fusarium graminearum CS3005;;;;;5.98 ;0;8;4;10;0;1;5;0;11;1;1;9;12;0;2;4;12;0;3;2;3;0;10;0;10;0;2;2;12;0;9;0;0;7;0;0;0;6;10;3;0;9;7;14;0;14;10;4;0;4;0;6;5;0;0;1;0;5;8;2;0;17;5;2;272;zro;Zygosaccharomyces rouxii CBS 732;;;;;6.00 ;2;15;1;4;6;0;2;2;10;0;2;14;7;0;3;3;7;0;2;3;4;0;4;2;7;0;3;4;13;0;9;5;0;6;0;0;0;3;4;6;1;12;6;11;1;2;6;11;0;4;0;4;13;0;8;2;0;4;2;6;0;11;8;8;273;fve*;Flammulina velutipes KACC42780;;;;;5.98 ;0;10;7;10;0;1;3;0;13;0;2;10;14;0;2;2;11;0;3;1;2;0;10;0;11;0;4;1;11;0;5;0;0;8;0;0;0;7;9;1;0;10;7;14;0;16;14;2;0;4;0;6;6;0;0;1;0;4;11;1;0;16;3;2;275;sce;Saccharomyces cerevisiae (S288c Apr 2011);;;;;6.09 ;0;10;2;4;12;0;2;5;11;0;1;8;13;0;2;3;10;0;2;3;10;0;3;2;11;0;4;2;14;0;3;3;0;8;0;0;0;6;4;8;0;8;2;15;0;14;5;16;0;5;0;5;10;0;7;1;0;7;2;2;0;14;5;1;285;fvr;Fusarium verticillioides 7600;;;;;6.33 ;0;10;4;14;4;0;0;2;12;0;4;10;12;0;2;4;10;0;4;2;2;0;8;0;10;0;4;2;12;0;8;2;0;10;0;0;0;8;8;4;0;12;6;10;0;14;8;8;0;4;0;6;4;0;0;2;0;6;10;2;0;16;6;2;288;mfa*;Millerozyma farinosa CBS 7064;;;;;6.40 ;0;11;2;3;13;0;2;5;13;0;2;6;19;0;2;3;11;0;2;2;10;0;3;2;11;0;4;3;14;0;4;2;0;8;0;0;0;7;5;7;0;9;3;16;0;14;5;19;0;5;1;4;10;0;9;1;0;8;2;2;0;14;6;1;305;fgr;Fusarium graminearum PH-1 NRRL 31084;;;;;6.76 ;0;12;12;9;0;1;2;0;17;0;2;11;18;0;2;1;16;0;4;2;1;0;13;0;15;0;3;1;19;0;5;0;0;9;0;0;0;7;10;1;0;11;9;15;0;19;16;1;0;5;0;7;4;0;0;1;0;6;13;1;0;23;3;1;328;tbl;Tetrapisispora blattae CBS 6284;;;;;7.27 ;0;12;1;5;17;0;2;6;17;1;1;17;19;0;2;4;14;0;3;4;11;0;4;4;12;0;3;3;19;0;3;5;0;10;0;0;0;9;3;11;0;12;2;24;0;18;5;24;0;7;0;7;21;0;2;3;0;6;5;5;0;26;4;3;396;ncr;Neurospora crassa OR74A;;;;;8.78 ;0;17;1;3;21;0;2;13;26;0;1;18;24;0;2;8;21;0;2;4;21;0;3;2;22;0;3;2;30;0;4;2;0;14;0;0;0;12;3;15;0;16;4;34;0;28;6;27;0;8;0;13;1;0;25;0;0;6;4;1;0;30;11;0;510;yli;Yarrowia lipolytica CLIB122;;;;;11.33 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; tRNAs;2;295;128;188;170;13;72;89;377;4;57;319;401;1;63;93;310;1;90;79;153;2;202;35;332;0;98;66;389;0;140;60;2;249;0;0;0;216;196;148;1;295;155;425;1;401;249;295;1;149;11;173;238;0;93;55;0;154;205;66;1;487;137;69;;;;;;;; ;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg;;;;;;;; zéros;41;0;2;4;11;30;7;11;0;38;1;0;0;41;2;1;0;41;0;0;5;40;1;22;0;42;0;1;0;42;0;16;40;0;42;42;42;0;0;0;41;0;1;1;41;1;0;0;41;0;32;2;0;42;20;4;42;1;2;1;41;0;0;4;;;;;;;; indice;0.05;7.02;3.05;4.48;4.05;0.31;1.71;2.12;8.98;0.10;1.36;7.60;9.55;0.02;1.50;2.21;7.38;0.02;2.14;1.88;3.64;0.05;4.81;0.83;7.90;0;2.33;1.57;9.26;0;3.33;1.43;0.05;5.93;;;0;5.14;4.67;3.52;0.02;7.02;3.69;10.12;0.02;9.55;5.93;7.02;0.02;3.55;0.26;4.12;5.67;0;2.21;1.31;0;3.67;4.88;1.57;0.02;11.60;3.26;1.64;;;;;;;;
Non champignons détail des introns
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;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg;;total;;DNA;KEGG;génome ;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; ;1; ;35;pfa;Plasmodium falciparum ;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;3;;82;lma;Leishmania major ;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;;10;;155;mgp;Meleagris gallopavo (turkey) (TGC Turkey_2.01 Dec 2009) ;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;;12;;191;mun*;Melopsittacus undulatus (Budgerigar Sep. 2011 WUSTL v6.3/melUnd1) ;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;;14;;203;gfr;Geospiza fortis (Medium ground finch Apr. 2012 GeoFor_1.0/geoFor1) ;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;;11;;211;acs;Anolis carolinensis (lizard) (Broad AnoCar2.0 May 2010) ;0;0;0;2;0;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;;18;;230;tgu;Taeniopygia guttata (Zebra finch Feb. 2013 WashU taeGut324/taeGut2) ;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;4;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;21;;252;mlu*;Myotis lucifugus (Microbat Jul. 2010 Broad Institute Myoluc2.0/myoLuc2) ;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;15;;256;dsi;Drosophila simulans (D. simulans Apr. 2005 WUGSC mosaic 1.0) ;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;18;;258;mmr*;Microcebus murinus (Mouse lemur) (Jun 2003) ;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;15;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;;22;;283;gga;Gallus gallus (galGal4 Nov 2011) ;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;15;;289;dme;Drosophila melanogaster (D. melanogaster Aug. 2014 BDGP Release 6 + ISO1 MT/dm6) ;1;0;0;5;0;0;0;0;3;9;10;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;3;0;0;0;0;0;;41;;326;oga*;Otolemur garnettii (Bushbaby Mar. 2011 Broad/otoGar3) ;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;15;;326;dya;Drosophila yakuba (D. yakuba Nov. 2005 WUGSC 7.1) ;0;0;0;6;1;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;26;;334;sbq;Saimiri boliviensis (Squirrel monkey Oct. 2011 Broad/saiBol1) ;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;22;;338;opr*;Ochotona princeps (Pika May 2012 OchPri3.0/ochPri3) ;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;26;;353;meu*;Macropus eugenii (Wallaby Sep. 2009 TWGS Meug_1.1/macEug2) ;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;7;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;22;;367;hgl;Heterocephalus glaber (Naked mole-rat Jan. 2012 Broad HetGla_female_1.0/hetGla2) ;0;0;1;4;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;21;;373;lcm;Latimeria chalumnae (Coelacanth Aug. 2011 Broad/latCha1) ;0;0;0;4;0;0;0;1;0;0;4;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;25;;374;san*;Sorex araneus (Shrew Aug. 2008 Broad/sorAra2) ;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;15;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;28;;383;cpo*;Cavia porcellus (Guinea pig) (Broad Feb 2008) ;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;15;;407;rno;Rattus norvegicus (rn5 Mar 2012) ;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;29;;408;cjc;Callithrix jacchus (marmoset) (WUGSC 3.2 Mar 2009) ;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;15;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;31;;411;pha*;Papio hamadryas (baboon) (Nov 2008) ;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;22;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;27;;414;aga;Anopheles gambiae ;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;21;;418;ppp;Physcomitrella patens ;1;0;0;5;1;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;13;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;31;;421;nle;Nomascus leucogenys (Gibbon Oct. 2012 GGSC Nleu3.0/nomLeu3) ;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;1;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;34;;435;ggo;Gorilla gorilla gorilla (gorilla) (gorGor3.1 May 2011) ;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;22;;446;shr;Sarcophilus harrisii (Tasmanian devil Feb. 2011 WTSI Devil_ref v7.0/sarHar1) ;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;1;26;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;3;0;1;0;60;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;114;;455;tsy*;Tarsius syrichta (Tarsier Sep. 2013 Tarsius_syrichta-2.0.1/tarSyr2) ;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;13;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;34;;458;mcc;Macaca mulatta (Rhesus Oct. 2010 BGI CR_1.0/rheMac3) ;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;25;;469;mmu;Mus musculus (mm10 Dec 2011) ;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;14;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;35;;476;pan*;Papio anubis (Baboon Mar. 2012 Baylor Panu_2.0/papAnu2) ;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;14;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;30;;481;mdo;Monodelphis domestica (opossum) (Broad Oct 2006) ;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;30;;485;eeu*;Erinaceus europaeus (Hedgehog May 2012 EriEur2.0/eriEur2) ;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;14;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;32;;494;ecb;Equus caballus (horse) (Sep 2007) ;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;23;;498;cge;Cricetulus griseus cell line CHO-K1 (Chinese hamster ovary CriGri 1.0 Aug 2011) ;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;1;11;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;10;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;;32;;499;vvi;Vitis vinifera (Grapevine 12X) ;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;13;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;34;;503;ptr;Pan troglodytes (Chimp Feb. 2011 CSAC 2.1.4/panTro4) ;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;1;;27;;506;ocu;Oryctolagus cuniculus (rabbit) (Broad Apr 2009) ;0;0;0;5;1;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;15;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;;40;;517;ppy*;Pongo pygmaeus abelii (Orangutan July 2007 WUGSC 2.0.2/ponAbe2) ;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;27;;518;csi*;Ceratotherium simum (White rhinoceros May 2012 CerSimSim1.0/cerSim1) ;0;0;1;7;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;1;0;20;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;11;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;;58;;540;tng;Tetraodon nigroviridis (tetraodon) (Genoscope 8.0 Mar 2007) ;0;0;0;7;0;0;0;0;0;1;12;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;10;0;0;0;0;0;;36;;554;cpic;Chrysemys picta bellii (Painted turtle Dec. 2011 v3.0.1/chrPic1) ;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;15;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;12;0;0;0;0;0;;43;;575;tru;Takifugu rubripes (Fugu Oct. 2011 FUGU5/fr3) ;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;17;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;12;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;32;;578;sbi;Sorghum bicolor (Version 1.0) ;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;4;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;1;9;0;0;0;0;2;0;1;0;2;0;0;0;3;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;;40;;582;mtr;Medicago truncatula (March 2009 Version 3.0) ;0;0;0;7;2;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;19;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;34;;596;cel;Caenorhabditis elegans (WS220 Oct 2010) ;6;0;0;0;35;1;0;1;0;0;1;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;17;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;74;;618;pop;Populus trichocarpa (Jan 2010 Version 2.0) ;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;13;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;34;;622;hsa;Homo sapiens (hg38 - GRCh38 Dec 2013) ;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;17;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;12;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;1;0;0;0;0;;36;;639;bdi;Brachypodium distachyon (JGI v1.0 8X) ;0;0;0;7;0;0;0;0;1;0;24;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;3;17;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;22;0;0;0;0;0;;76;;674;oni*;Oreochromis niloticus (Nile tilapia Jan. 2011 Broad oreNil1.1/oreNil2) ;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;70;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;83;;684;ath;Arabidopsis thaliana (TAIR10 Feb 2011) ;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;15;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;0;0;1;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;;36;;738;osa;Oryza sativa ;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;18;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;20;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;39;;738;gmx;Glycine max (soybean) (Wm82.a2) ;0;0;0;10;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;19;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;34;;743;cbr;Caenorhabditis briggsae (C. briggsae Jan. 2007 WUGSC 1.0/cb3) ;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;1;0;0;2;1;1;1;1;25;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;8;1;0;0;2;0;;66;;749;mpu*;Mustela putorius furo (Ferret Apr. 2011 MusPutFur1.0/musFur1) ;0;0;0;4;1;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;24;;804;str*;Spermophilus tridecemlineatus (Squirrel Nov. 2011 Broad/speTri2) ;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;16;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;1;17;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;6;0;0;2;0;0;;56;;807;ssc;Sus scrofa (Pig Aug. 2011 SGSC Sscrofa10.2/susScr3) ;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;24;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;35;;827;cja*;Caenorhabditis japonica (WUGSC 3.0.2 Mar 2008) ;0;1;0;10;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;26;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;54;;856;oaa;Ornithorhynchus anatinus (platypus) (WUGSC 5.0.1 Mar 2007) ;0;0;0;4;0;0;0;1;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;8;0;0;0;0;3;1;0;0;2;33;0;0;1;2;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;4;1;0;0;0;0;;68;;906;cfa;Canis familiaris (dog) (CanFam3.1 Sept 2011) ;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;24;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;;38;;1065;spu;Strongylocentrotus purpuratus (Sea urchin) ;0;1;0;14;0;0;0;0;0;1;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;26;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;52;;1095;cbr*;Caenorhabditis brenneri (WUGSC 6.0.1 Feb 2008) ;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;1;2;;31;;1119;dno*;Dasypus novemcinctus (Armadillo Dec. 2011 Baylor/dasNov3) ;0;0;0;4;1;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;3;0;2;;29;;1176;oas;Ovis aries (sheep) (Feb 2010) ;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;22;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;;37;;1198;zma;Zea mays (Version 5b.60) ;0;0;0;9;0;0;0;1;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;1;0;0;3;3;0;1;3;45;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;3;0;0;0;5;2;0;0;0;0;;96;;1463;aml;Ailuropoda melanoleuca (panda) (BGI-Shenzhen AilMel 1.0 Dec 2009) ;2;0;0;12;0;0;0;0;0;0;16;1;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;50;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;19;0;0;0;0;0;;105;;1492;gmo*;Gadus morhua (Atlantic cod May 2010 Genofisk GadMor_May2010/gadMor1) ;0;0;6;17;1;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;19;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;3;0;;60;;2002;lav;Loxodonta africana (elephant) (Broad/July 2009) ;0;0;0;8;1;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;14;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;1;3;0;;41;;2017;tma*;Trichechus manatus latirostris (Manatee Oct. 2011 Broad v1.0/triMan1) ;0;0;0;22;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;86;2;0;0;0;2;0;0;3;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;1;0;0;0;;133;;2485;pma*;Petromyzon marinus (Lamprey Sep. 2010 WUGSC 7.0/petMar2) ;0;0;3;5;0;0;0;0;0;0;58;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;17;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;62;0;0;0;0;0;;146;;2489;gac*;Gasterosteus aculeatus (stickleback) (Broad 1.0 Feb 2006) ;0;0;1;19;0;0;0;0;0;0;43;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;105;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;103;0;0;0;1;0;;275;;2639;xtr;Xenopus tropicalis (frog) (JGI 4.2 Nov 2009) ;0;0;3;7;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;1;7;1;0;0;0;1;0;0;1;1;0;10;3;4;0;2;75;7;1;2;4;214;0;0;0;7;0;0;2;2;0;0;102;2;0;0;5;9;1;0;2;1;;487;;3729;fca;Felis catus (cat) (Felis_catus-6.2 Sept 2011) ;0;0;0;6;1;0;1;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;17;0;0;0;0;1;1;0;0;0;1;0;0;1;1;0;2;0;1;0;0;0;0;0;0;6;0;2;1;3;5;;57;;4040;bta;Bos taurus (Cow Jun. 2014 Bos_taurus_UMD_3.1.1/bosTau8) ;0;0;0;5;0;0;0;1;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;17;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;7;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;3;2;;47;;5845;ttr*;Tursiops truncatus (Dolphin Oct. 2011 Baylor Ttru_1.4/turTru2) ;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;12;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;3;2;;50;;7080;bacu;Balaenoptera acutorostrata scammoni (Minke whale Oct. 2013 BalAcu1.0/balAcu1) ;0;0;0;9;0;0;1;1;0;0;17;0;0;0;1;1;0;0;0;0;12;3;13;8;3;0;0;0;0;0;0;1;1;34;0;0;0;0;0;0;0;0;35;0;0;0;2;0;1;0;0;0;0;0;22;0;0;0;12;0;0;0;0;0;;177;;13727;cmk;Callorhinchus milii (Elephant shark Dec. 2013 Callorhinchus_milii-6.1.3/calMil1) ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; total;11;2;18;400;45;1;2;7;5;14;454;149;3;0;5;6;2;23;13;2;18;5;50;11;10;0;5;7;4;1;2;4;24;1239;8;13;6;11;148;17;4;8;54;321;4;18;28;13;2;14;3;5;0;3;131;4;2;9;469;14;4;7;21;15;;;;;; ;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg;;;;;; −zéros;5;2;8;65;10;1;2;7;3;5;69;11;2;0;5;6;2;4;9;1;6;3;7;4;7;0;3;6;4;1;2;4;17;79;3;10;3;9;8;8;4;5;8;7;3;2;8;6;2;10;2;4;0;3;7;2;2;6;58;5;3;4;9;7;;;;;;
Non champignons détail des tRNAs
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- Légende
;;Non champignons détail tRNAs;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; DNA;KEGG;Génome;;;moy;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg 35;pfa;Plasmodium falciparum;;;0.78;0;1;1;1;1;0;1;1;1;0;1;2;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;0;0;1;1;1;0;1;1;0;1;0;0;0;0;1;1;0;1;0;0;0;1;1;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;1;0;0;0;1;0 82;lma;Leishmania major;;;1.82;0;2;1;1;3;0;1;2;3;0;1;4;2;0;1;2;1;0;1;1;2;0;1;2;3;0;1;2;2;0;1;2;0;3;0;0;0;2;1;3;0;3;1;3;0;3;1;2;0;1;0;1;4;0;1;1;0;2;1;1;0;4;1;1 155;mgp;Meleagris gallopavo (turkey) (TGC Turkey_2.01 Dec 2009);;;3.42;0;6;1;2;1;0;1;4;3;0;1;11;3;1;2;3;5;0;3;1;7;0;2;1;4;0;2;0;7;0;6;3;0;6;0;0;0;3;1;1;0;4;4;3;0;3;5;6;0;5;0;5;2;0;1;2;0;6;3;3;0;5;4;3 191;mun*;Melopsittacus undulatus (Budgerigar Sep. 2011 WUSTL v6.3/melUnd1);;;4.18;0;6;4;3;3;0;0;6;5;0;1;9;3;1;1;4;4;1;3;1;2;0;3;2;5;0;2;0;9;0;5;2;0;7;0;0;0;4;2;4;0;9;3;13;0;9;3;1;0;5;1;4;3;0;1;1;0;8;4;4;0;10;9;1 203;gfr;Geospiza fortis (Medium ground finch Apr. 2012 GeoFor_1.0/geoFor1);;;4.44;0;6;11;2;4;0;7;0;6;1;2;6;2;1;1;3;2;0;3;1;4;0;5;1;5;0;4;1;16;0;5;2;0;12;0;0;0;4;2;3;1;6;4;7;0;5;4;6;0;10;0;3;6;0;2;0;0;6;3;2;0;8;4;4 211;acs;Anolis carolinensis (lizard) (Broad AnoCar2.0 May 2010);;;4.64;0;5;2;2;4;0;3;4;6;0;1;12;5;0;2;3;5;0;1;2;3;1;3;2;4;0;3;1;12;0;6;3;0;6;0;0;0;5;3;5;0;10;5;6;0;8;7;5;0;12;1;7;4;0;3;1;0;5;3;3;0;7;8;2 230;tgu;Taeniopygia guttata (Zebra finch Feb. 2013 WashU taeGut324/taeGut2);;;4.87;0;10;4;4;1;0;1;7;21;2;1;5;3;2;1;1;3;0;2;1;6;0;1;2;8;1;4;2;18;0;7;3;0;13;0;0;0;5;1;6;2;8;4;5;0;7;2;3;1;9;1;3;6;0;2;0;1;5;3;2;1;8;7;4 252;mlu*;Myotis lucifugus (Microbat Jul. 2010 Broad Institute Myoluc2.0/myoLuc2);;;5.49;0;5;2;3;3;0;5;2;10;0;3;14;5;0;3;5;6;0;2;2;6;0;3;3;5;0;5;3;8;0;1;3;0;5;0;0;5;7;3;7;0;9;3;11;0;8;5;6;0;27;0;4;6;0;5;2;0;5;5;5;0;8;6;3 256;dsi;Drosophila simulans (D. simulans Apr. 2005 WUGSC mosaic 1.0);;;5.67;0;8;3;4;5;0;2;9;8;0;0;12;7;0;2;6;8;0;2;3;6;0;5;5;8;0;5;4;9;0;5;0;0;10;0;0;0;6;4;8;0;6;4;11;0;6;5;10;0;7;1;9;9;0;5;0;0;3;3;3;0;15;5;0 258;mmr*;Microcebus murinus (Mouse lemur) (Jun 2003);;;5.71;0;8;3;3;5;0;2;7;4;0;3;14;4;0;2;5;7;0;2;3;7;0;4;3;3;0;3;2;11;0;5;3;0;8;0;0;0;6;4;12;0;9;5;6;0;5;9;8;1;20;0;6;6;0;3;2;0;7;5;3;0;11;7;2 283;gga;Gallus gallus (galGal4 Nov 2011);;;6.24;0;10;3;3;3;0;2;7;7;0;2;14;7;1;3;7;9;0;4;2;7;0;4;3;4;0;4;2;24;0;7;4;0;16;0;0;0;6;2;5;0;11;6;6;0;10;9;7;0;11;1;6;8;0;2;2;0;7;4;3;0;7;7;4 289;dme;Drosophila melanogaster (D. melanogaster Aug. 2014 BDGP Release 6 + ISO1 MT/dm6);;;6.40;0;8;4;4;4;0;2;8;9;0;2;12;6;0;2;7;8;0;2;4;7;0;5;5;8;0;6;3;12;0;2;3;0;9;0;0;0;5;4;8;0;10;6;13;0;14;6;13;0;7;1;8;10;0;10;0;0;6;3;3;0;14;6;0 326;oga*;Otolemur garnettii (Bushbaby Mar. 2011 Broad/otoGar3);;;6.96;1;6;3;5;4;0;3;9;10;9;11;13;6;0;3;5;6;0;3;3;7;0;4;3;9;0;6;3;13;0;7;3;0;8;0;0;0;8;5;9;0;12;11;9;0;13;5;8;0;21;1;6;6;0;4;3;2;7;4;5;0;12;9;3 326;dya;Drosophila yakuba (D. yakuba Nov. 2005 WUGSC 7.1);;;7.22;0;9;5;4;5;0;2;8;10;0;2;15;7;0;2;10;9;0;2;5;6;0;8;5;8;0;6;5;18;0;2;5;0;9;0;0;0;5;4;8;0;11;6;16;0;15;7;14;0;8;1;8;12;0;7;0;0;6;3;4;0;16;7;1 334;sbq;Saimiri boliviensis (Squirrel monkey Oct. 2011 Broad/saiBol1);;;7.27;0;9;8;5;6;0;4;5;10;1;6;14;6;1;4;7;9;1;3;3;9;0;5;4;8;0;6;5;15;0;8;5;1;8;0;0;0;8;6;10;0;11;12;9;0;9;10;5;0;19;3;6;6;0;4;3;0;7;5;5;0;10;6;4 338;opr*;Ochotona princeps (Pika May 2012 OchPri3.0/ochPri3);;;7.49;0;10;3;4;5;0;5;11;8;0;4;15;7;0;4;7;7;0;3;4;8;0;4;4;7;0;6;7;15;0;7;4;0;10;0;0;0;5;5;12;0;14;9;11;0;14;7;11;0;10;1;6;7;0;6;4;0;7;5;6;0;17;7;5 353;meu*;Macropus eugenii (Wallaby Sep. 2009 TWGS Meug_1.1/macEug2);;;7.62;1;10;3;8;5;0;4;6;6;0;6;14;8;0;1;7;8;0;4;2;7;0;4;2;8;0;6;3;13;0;6;5;1;8;0;0;1;7;4;7;0;14;10;11;0;13;12;7;0;29;7;8;7;0;3;5;0;10;7;4;0;16;10;5 367;hgl;Heterocephalus glaber (Naked mole-rat Jan. 2012 Broad HetGla_female_1.0/hetGla2);;;7.62;0;6;4;5;5;0;5;5;8;0;3;14;12;1;4;6;7;0;3;3;13;0;5;3;15;2;4;4;46;6;5;6;0;7;0;0;0;7;3;6;0;9;8;15;2;10;6;4;0;23;7;6;5;0;4;4;2;7;6;5;4;10;4;3 373;lcm;Latimeria chalumnae (Coelacanth Aug. 2011 Broad/latCha1);;;7.96;0;7;11;4;4;0;5;8;7;0;7;11;3;0;7;4;3;0;6;3;12;0;10;4;11;0;9;2;5;0;20;3;2;8;0;0;0;5;10;9;3;9;20;13;1;19;11;8;5;17;4;15;4;0;1;4;0;8;9;8;0;7;5;2 374;san*;Sorex araneus (Shrew Aug. 2008 Broad/sorAra2);;;8.24;0;10;4;4;6;1;2;13;15;0;5;15;7;0;5;7;8;0;3;4;8;0;6;2;8;0;5;5;10;0;8;3;0;9;0;0;0;7;5;7;0;12;8;13;0;19;10;14;0;25;2;6;9;0;5;3;0;8;6;6;0;22;12;2 383;cpo*;Cavia porcellus (Guinea pig) (Broad Feb 2008);;;8.36;0;8;4;6;5;0;3;6;10;0;5;15;6;1;3;6;8;0;3;4;8;0;4;3;10;0;4;3;28;4;9;5;0;15;0;0;0;8;4;8;0;18;11;26;1;10;6;5;0;34;1;8;7;0;4;3;0;10;5;5;0;11;6;6 407;rno;Rattus norvegicus (rn5 Mar 2012);;;8.89;1;8;3;0;1;0;1;5;12;0;3;13;8;0;3;7;11;0;4;3;33;0;6;3;9;0;5;4;36;2;9;4;0;2;0;0;0;10;6;10;0;15;1;19;2;15;10;8;0;40;1;8;6;0;3;5;1;12;6;8;0;11;9;5 408;cjc;Callithrix jacchus (marmoset) (WUGSC 3.2 Mar 2009);;;8.80;0;8;9;6;7;0;3;11;9;2;5;19;6;1;4;10;9;0;5;4;7;0;6;4;9;1;6;4;15;1;5;4;0;19;0;0;1;8;4;12;0;23;14;11;1;13;11;12;0;30;2;6;6;3;4;3;0;8;5;5;0;14;9;4 411;pha*;Papio hamadryas (baboon) (Nov 2008);;;8.93;0;12;7;7;9;0;3;6;12;2;4;15;9;1;7;12;9;0;5;3;7;0;6;4;10;0;7;6;19;1;9;5;0;15;0;0;0;10;6;11;1;18;12;12;1;10;13;4;2;28;1;8;7;0;6;4;0;9;6;5;0;13;4;8 414;aga;Anopheles gambiae;;;9.20;0;9;2;3;5;0;3;10;12;0;2;18;31;0;3;29;6;0;2;8;7;0;8;13;8;0;2;5;17;0;3;6;0;22;0;0;0;21;4;11;0;11;8;17;0;20;11;15;0;5;0;6;10;0;8;0;0;6;2;2;0;15;8;0 418;ppp;Physcomitrella patens ;;;9.18;1;14;2;6;6;1;5;5;12;0;4;24;13;0;2;11;13;0;5;7;13;0;8;4;10;0;5;6;19;0;9;8;0;8;0;0;0;9;9;10;1;14;8;16;0;11;7;14;0;7;1;9;8;1;7;5;0;9;6;10;0;15;9;11 421;nle;Nomascus leucogenys (Gibbon Oct. 2012 GGSC Nleu3.0/nomLeu3);;;9.04;1;11;7;5;8;0;3;9;12;3;5;16;11;1;6;10;9;1;4;4;9;1;5;4;11;0;4;5;18;1;9;5;0;14;0;0;0;11;9;13;2;14;22;15;0;10;10;8;1;22;3;8;7;0;7;3;0;8;6;5;0;12;6;7 435;ggo;Gorilla gorilla gorilla (gorilla) (gorGor3.1 May 2011);;;9.42;0;12;8;7;8;0;4;5;11;2;6;17;9;1;8;10;10;1;4;5;8;0;7;4;9;0;6;6;22;2;6;4;1;16;0;0;0;7;7;14;1;24;13;14;0;15;14;7;0;28;3;8;7;0;6;5;0;8;5;6;0;12;3;9 446;shr;Sarcophilus harrisii (Tasmanian devil Feb. 2011 WTSI Devil_ref v7.0/sarHar1);;;9.87;0;13;6;3;9;0;4;9;11;0;4;22;8;0;4;10;10;0;5;3;10;0;6;3;9;0;7;2;18;0;7;4;0;11;0;0;0;9;45;10;0;13;14;32;0;19;15;10;0;8;2;8;4;0;5;3;0;8;5;4;0;19;9;6 455;tsy*;Tarsius syrichta (Tarsier Sep. 2013 Tarsius_syrichta-2.0.1/tarSyr2);;;9.25;0;6;#;4;6;0;5;7;8;0;4;12;6;0;4;6;7;0;5;3;7;1;32;4;9;0;4;4;12;0;4;3;0;10;0;0;1;10;64;6;1;15;10;7;1;13;9;10;1;25;1;6;6;0;5;3;0;9;6;4;0;14;6;7 458;mcc;Macaca mulatta (Rhesus Oct. 2010 BGI CR_1.0/rheMac3);;;9.80;0;9;15;8;9;0;5;6;10;5;7;18;10;3;6;11;9;2;6;4;8;0;8;3;9;0;5;4;21;1;10;5;1;23;0;0;0;14;10;12;2;19;16;13;1;14;11;6;0;27;2;8;6;0;5;4;0;8;6;7;0;14;4;8 469;mmu;Mus musculus (mm10 Dec 2011);;;10.13;0;7;7;4;5;0;4;10;12;1;5;19;8;1;3;12;10;1;3;3;8;1;8;3;11;0;4;4;23;4;11;10;0;11;0;0;1;10;7;12;0;13;14;26;0;16;8;14;1;60;1;8;6;0;5;3;0;8;6;5;2;15;8;7 476;pan*;Papio anubis (Baboon Mar. 2012 Baylor Panu_2.0/papAnu2);;;10.20;1;13;8;8;8;0;3;11;14;2;6;19;9;1;7;12;9;1;5;3;8;0;6;4;10;0;7;6;20;1;9;5;3;21;0;0;0;10;9;12;2;21;14;15;2;15;13;9;1;27;3;9;7;0;5;4;0;11;6;5;0;20;8;8 481;mdo;Monodelphis domestica (opossum) (Broad Oct 2006);;;10.58;0;12;2;4;8;0;6;11;13;0;7;25;9;0;5;9;12;0;6;3;11;0;8;3;12;0;7;3;15;0;9;6;0;15;0;0;0;9;7;11;0;13;13;19;1;24;14;13;4;46;0;9;5;0;5;4;0;9;6;5;0;24;11;8 485;eeu*;Erinaceus europaeus (Hedgehog May 2012 EriEur2.0/eriEur2);;;7.59;0;8;3;6;6;0;3;6;9;0;4;16;7;0;6;4;7;0;3;3;10;0;5;3;9;0;6;4;14;0;10;4;0;13;0;0;0;5;4;8;0;7;11;€;0;13;8;9;0;34;2;7;6;0;5;3;0;7;5;7;0;14;7;5 494;ecb;Equus caballus (horse) (Sep 2007);;;10.76;0;12;4;6;7;0;5;3;20;0;5;25;12;3;6;15;12;0;4;4;10;0;7;3;9;0;7;3;27;0;11;8;1;14;0;0;1;11;6;12;1;17;15;16;0;10;11;51;0;25;4;7;10;0;4;4;0;12;5;7;0;10;4;8 498;cge;Cricetulus griseus cell line CHO-K1 (Chinese hamster ovary CriGri 1.0 Aug 2011);;;10.96;0;8;4;4;5;0;4;10;13;0;5;16;13;0;5;9;6;0;3;3;7;0;6;3;8;1;4;4;22;1;15;6;0;11;0;0;0;14;5;11;0;17;15;86;0;15;7;20;0;41;2;6;6;0;6;3;0;9;5;6;1;14;6;7 499;vvi;Vitis vinifera (Grapevine 12X);;;10.89;0;14;7;13;10;0;9;7;13;1;7;25;14;0;5;9;13;1;7;3;13;0;16;4;10;2;6;3;11;0;28;5;1;17;0;0;1;12;9;10;1;18;11;13;1;18;14;21;0;11;1;10;8;0;5;4;0;9;6;7;0;17;12;6 503;ptr;Pan troglodytes (Chimp Feb. 2011 CSAC 2.1.4/panTro4);;;10.82;0;15;10;7;9;0;3;6;14;1;5;21;11;1;10;12;11;1;7;4;9;1;8;5;10;0;6;5;30;1;9;5;2;22;0;0;0;10;8;10;1;27;14;19;1;15;15;11;1;27;2;7;7;1;6;5;3;9;6;5;0;13;6;13 506;ocu;Oryctolagus cuniculus (rabbit) (Broad Apr 2009);;;10.67;0;14;6;3;5;0;4;16;11;1;7;18;12;0;8;14;10;0;4;5;9;0;5;4;8;1;7;5;21;0;9;4;0;12;0;0;0;9;5;15;1;26;12;29;1;23;18;19;0;25;1;10;7;0;4;5;0;10;6;6;21;0;14;16 517;ppy*;Pongo pygmaeus abelii (Orangutan July 2007 WUGSC 2.0.2/ponAbe2);;;11.18;0;13;6;6;10;0;3;11;14;4;6;20;10;1;7;18;10;1;6;5;10;0;7;5;12;0;4;7;22;1;9;4;1;19;0;0;0;10;7;13;2;33;20;22;1;13;22;8;0;30;3;6;7;0;6;7;0;8;8;7;0;14;8;10 518;csi*;Ceratotherium simum (White rhinoceros May 2012 CerSimSim1.0/cerSim1);;;11.40;0;13;5;6;6;0;4;4;13;0;5;26;11;1;7;15;13;0;5;4;10;0;7;4;10;0;8;5;23;0;13;6;0;11;0;0;0;10;5;12;2;14;15;22;1;13;11;77;0;24;1;8;10;0;5;4;0;13;6;7;0;10;4;9 540;tng;Tetraodon nigroviridis (tetraodon) (Genoscope 8.0 Mar 2007);;;11.91;1;17;5;7;15;0;6;32;16;0;5;20;10;0;4;15;12;1;7;2;11;1;11;4;26;0;10;13;20;0;10;4;0;13;0;0;0;12;9;18;0;17;9;20;0;18;15;13;0;15;1;10;14;0;6;2;0;11;9;9;0;14;14;6 554;cpic;Chrysemys picta bellii (Painted turtle Dec. 2011 v3.0.1/chrPic1);;;11.87;2;22;13;7;2;1;4;6;11;1;13;16;16;0;5;6;24;0;15;10;12;1;4;2;17;0;18;5;11;1;15;4;1;5;0;0;0;10;16;11;1;17;36;9;0;14;17;5;5;18;4;10;7;0;5;3;3;20;26;10;0;11;24;2 575;tru;Takifugu rubripes (Fugu Oct. 2011 FUGU5/fr3);;;12.64;1;18;6;9;10;0;4;21;11;0;6;35;19;0;8;25;11;0;7;3;10;0;7;6;18;0;7;7;10;0;8;6;1;13;0;0;1;19;8;12;0;20;19;19;1;22;13;20;0;15;1;16;16;1;7;4;0;17;13;10;0;18;12;4 578;sbi;Sorghum bicolor (Version 1.0);;;12.56;0;20;4;9;15;0;9;11;17;0;5;37;16;2;4;10;11;3;12;6;14;0;11;7;12;2;9;6;18;0;13;11;1;14;0;0;1;15;11;13;1;16;9;18;2;24;13;23;0;13;1;13;15;0;4;7;0;13;7;10;0;24;10;6 582;mtr;Medicago truncatula (March 2009 Version 3.0);;;12.47;0;26;7;14;9;0;10;4;19;0;10;40;17;3;7;7;12;2;8;2;7;0;11;1;10;4;10;1;25;0;16;3;1;12;0;0;0;17;17;5;9;28;18;16;0;28;19;11;0;10;1;14;12;0;5;3;0;15;8;6;1;23;15;3 596;cel;Caenorhabditis elegans (WS220 Oct 2010);;;13.18;0;15;4;7;20;0;3;5;21;0;7;19;19;0;5;6;15;0;9;6;6;0;31;4;17;0;11;7;22;0;9;4;0;19;0;0;0;19;20;7;0;20;14;30;0;27;17;24;0;13;2;12;18;0;8;1;1;9;8;4;0;14;34;3 618;pop;Populus trichocarpa (Jan 2010 Version 2.0) ;;;13.53;4;18;7;3;40;1;0;7;20;1;9;26;17;0;8;10;13;1;9;5;14;0;22;4;6;0;11;4;20;0;18;5;0;18;0;0;0;13;11;11;0;22;17;17;0;33;14;21;1;13;1;14;10;0;7;5;0;16;11;11;0;25;17;7 622;hsa;Homo sapiens (hg38 - GRCh38 Dec 2013);;;13.31;0;18;8;12;12;0;4;11;19;6;5;22;11;1;8;21;12;1;6;5;10;1;8;4;10;0;6;7;35;1;10;5;5;32;0;0;0;10;18;24;2;40;20;24;1;16;17;10;1;38;3;8;7;0;6;4;1;8;7;5;0;15;9;12 639;bdi;Brachypodium distachyon (JGI v1.0 8X);;;13.82;0;18;4;15;14;0;10;8;20;2;4;55;15;3;5;11;11;4;10;5;15;0;18;8;9;3;10;6;19;0;12;11;1;17;0;0;3;21;15;11;0;16;12;18;0;25;15;19;0;14;0;18;16;1;5;6;0;18;9;9;0;27;9;9 674;oni*;Oreochromis niloticus (Nile tilapia Jan. 2011 Broad oreNil1.1/oreNil2);;;14.80;0;23;12;7;14;0;7;16;25;0;25;27;8;0;9;9;10;0;10;6;14;0;11;4;18;1;25;8;18;0;11;12;3;18;0;0;0;23;6;11;0;9;16;43;0;10;14;15;1;42;1;12;16;0;7;6;2;10;27;18;0;13;12;9 684;ath;Arabidopsis thaliana (TAIR10 Feb 2011);;;15.00;0;17;6;12;12;1;11;3;17;2;5;32;14;2;7;8;37;3;12;7;15;0;47;5;10;1;9;5;16;0;10;7;0;83;0;0;0;12;10;9;0;19;15;17;0;29;14;13;0;17;0;16;11;0;6;4;0;16;10;8;0;25;12;5 738;osa;Oryza sativa;;;15.67;0;20;4;19;15;0;10;10;18;0;5;56;17;16;4;10;12;4;17;8;14;0;14;9;11;8;15;5;20;1;10;12;2;19;0;0;0;26;21;10;0;29;12;20;1;31;16;25;1;17;0;18;24;0;4;8;0;20;12;11;0;28;9;10 738;gmx;Glycine max (soybean) (Wm82.a2);;;16.31;0;22;9;18;16;0;10;7;31;0;8;36;22;1;9;13;15;0;11;6;21;0;27;5;9;1;10;4;24;0;17;8;0;21;0;0;0;18;13;13;2;22;20;22;0;33;16;24;0;14;0;18;13;0;9;5;0;28;18;13;0;29;18;9 743;cbr;Caenorhabditis briggsae (C. briggsae Jan. 2007 WUGSC 1.0/cb3);;;16.51;0;22;6;11;26;0;5;7;21;0;24;23;25;0;6;6;17;0;8;8;6;0;41;4;22;0;10;9;29;0;14;7;0;19;0;0;0;21;24;10;0;23;16;40;0;34;19;30;0;16;0;13;22;0;10;0;0;9;10;2;0;21;42;5 749;mpu*;Mustela putorius furo (Ferret Apr. 2011 MusPutFur1.0/musFur1);;;10.68;0;11;4;6;6;0;4;5;10;0;5;20;8;0;6;7;8;0;4;4;9;0;7;2;10;0;7;5;15;0;8;5;0;9;0;0;1;7;37;17;6;12;31;€;0;8;7;19;0;25;1;11;6;0;29;5;0;12;16;21;0;9;9;4 804;str*;Spermophilus tridecemlineatus (Squirrel Nov. 2011 Broad/speTri2);;;11.02;1;10;3;10;6;0;3;4;14;6;4;14;18;3;5;39;15;1;7;6;12;1;7;3;34;5;6;7;€;31;39;18;0;9;0;0;0;6;4;6;1;9;10;12;6;8;5;7;0;48;1;7;6;0;5;3;0;7;5;6;7;13;5;20 807;ssc;Sus scrofa (Pig Aug. 2011 SGSC Sscrofa10.2/susScr3);;;12.68;0;21;4;6;8;0;5;5;13;0;5;23;10;1;11;12;10;0;5;4;9;0;4;3;13;0;8;4;23;0;14;7;0;17;0;0;0;10;9;12;2;18;38;16;10;97;€;13;1;23;0;7;7;0;5;3;0;10;7;4;0;19;10;6 827;cja*;Caenorhabditis japonica (WUGSC 3.0.2 Mar 2008);;;18.33;1;24;5;7;26;0;6;12;26;0;7;30;23;0;7;13;19;0;7;15;9;0;43;8;24;0;12;11;31;0;11;8;0;24;0;0;0;17;14;16;0;23;30;37;0;41;20;40;0;15;1;18;21;0;11;1;0;15;12;3;0;34;47;2 856;oaa;Ornithorhynchus anatinus (platypus) (WUGSC 5.0.1 Mar 2007);;;18.56;1;24;10;10;8;0;7;18;27;0;10;32;23;1;15;10;16;4;6;8;19;4;12;7;23;1;18;10;83;0;17;11;0;28;0;0;1;24;11;19;0;21;32;25;0;27;16;27;0;37;5;14;12;0;7;14;2;18;6;9;2;40;15;9 906;cfa;Canis familiaris (dog) (CanFam3.1 Sept 2011);;;11.23;0;10;4;5;4;0;4;7;9;0;5;23;6;0;5;8;10;0;5;8;8;0;8;4;8;0;4;5;14;0;11;4;0;9;0;0;0;9;43;20;1;21;34;€;2;13;15;22;0;21;1;6;6;0;15;4;0;8;9;29;0;11;11;9 1065;spu;Strongylocentrotus purpuratus (Sea urchin) ;;;23.56;2;0;14;2;18;0;8;5;69;2;22;73;20;0;11;16;25;0;15;6;19;0;21;9;27;0;21;9;32;0;17;7;0;24;0;0;0;26;17;21;0;39;57;42;0;82;26;29;0;31;0;18;29;0;19;1;1;17;18;19;0;42;33;4 1095;cbr*;Caenorhabditis brenneri (WUGSC 6.0.1 Feb 2008);;;24.07;0;24;7;14;32;0;8;8;33;1;26;29;33;0;8;15;20;0;14;9;25;2;54;9;31;1;15;10;35;0;11;6;2;28;0;0;1;26;40;11;0;33;29;49;0;34;36;37;2;21;3;22;32;0;17;24;0;14;13;11;0;39;66;25 1119;dno*;Dasypus novemcinctus (Armadillo Dec. 2011 Baylor/dasNov3);;;15.86;0;12;8;8;5;0;3;10;12;1;6;30;12;1;16;#;10;0;6;6;7;0;7;4;11;0;8;7;23;2;66;17;0;14;0;0;1;10;5;10;0;23;18;43;0;21;20;45;0;22;1;15;10;0;8;5;0;10;9;47;24;19;€;34 1176;oas;Ovis aries (sheep) (Feb 2010);;;12.50;1;6;5;7;6;0;2;3;6;0;5;18;7;0;8;9;2;3;4;3;4;0;6;1;5;0;5;3;18;3;12;7;2;16;0;0;0;8;7;9;0;13;22;16;2;8;€;60;16;61;4;47;2;2;6;6;0;7;22;33;5;30;€;€ 1198;zma;Zea mays (Version 5b.60);;;23.18;1;25;5;20;29;0;9;13;69;0;5;79;22;12;4;16;13;22;11;6;15;0;31;9;20;13;14;6;66;0;15;22;0;21;0;0;1;26;22;13;0;49;82;€;1;42;22;30;1;25;0;27;35;0;7;6;0;14;9;11;0;33;11;11 1463;aml;Ailuropoda melanoleuca (panda) (BGI-Shenzhen AilMel 1.0 Dec 2009);;;13.84;0;11;5;9;7;0;5;7;12;0;6;24;10;0;7;9;10;0;6;4;9;0;11;5;10;0;9;10;17;0;9;5;0;11;0;0;0;8;43;25;6;28;55;€;1;11;11;37;0;25;2;10;8;1;#;7;2;13;17;45;0;10;7;7 1492;gmo*;Gadus morhua (Atlantic cod May 2010 Genofisk GadMor_May2010/gadMor1);;;30.05;6;36;16;15;33;0;24;47;26;0;18;€;21;0;9;28;30;0;18;14;55;0;21;22;30;0;30;30;55;1;24;26;0;50;0;0;1;26;11;45;2;34;63;43;1;30;51;50;0;27;2;29;31;2;17;10;1;41;21;28;0;30;39;18 2002;lav;Loxodonta africana (elephant) (Broad/July 2009);;;25.95;1;32;15;17;22;0;11;10;43;0;7;50;41;1;50;35;29;0;7;4;16;0;14;3;14;1;22;10;54;0;53;15;1;19;0;0;3;27;14;28;4;51;60;36;0;20;€;24;1;28;24;23;14;0;18;3;3;76;#;16;4;33;€;# 2017;tma*;Trichechus manatus latirostris (Manatee Oct. 2011 Broad v1.0/triMan1);;;13.98;1;11;6;10;8;0;5;5;13;1;8;21;11;0;26;16;14;0;6;4;11;0;8;3;16;1;18;4;20;1;40;6;1;15;0;0;0;12;8;10;1;23;31;16;1;15;€;19;5;22;18;13;8;0;12;7;5;36;€;13;9;23;€;# 2485;pma*;Petromyzon marinus (Lamprey Sep. 2010 WUGSC 7.0/petMar2);;;34.89;2;57;5;#;€;0;40;#;€;0;10;€;€;1;26;#;22;0;20;35;54;0;43;21;62;19;19;23;€;0;31;24;0;90;0;0;1;27;44;€;0;€;24;23;2;90;12;11;0;68;1;9;85;1;26;10;0;65;18;50;1;54;17;6 2489;gac*;Gasterosteus aculeatus (stickleback) (Broad 1.0 Feb 2006);;;41.18;0;35;12;7;49;0;17;9;€;0;61;€;21;1;12;18;52;0;62;29;63;0;29;18;99;0;35;23;53;0;53;56;0;17;0;0;0;52;60;81;1;€;61;97;0;€;46;53;0;€;1;74;49;0;#;2;0;30;68;26;0;12;61;4 2639;xtr;Xenopus tropicalis (frog) (JGI 4.2 Nov 2009);;;50.41;2;58;#;22;38;2;25;32;63;5;51;€;55;0;36;53;40;3;41;23;60;1;53;36;€;0;91;29;67;0;47;36;0;€;0;0;1;42;28;40;1;47;72;97;0;59;84;51;2;92;1;33;33;3;33;8;0;99;€;27;0;85;80;€ 3729;fca;Felis catus (cat) (Felis_catus-6.2 Sept 2011);;;19.40;1;12;19;8;6;0;33;5;10;0;9;24;8;0;6;9;8;1;14;5;8;1;68;7;9;0;13;9;18;1;10;7;0;10;0;0;2;16;€;47;5;28;50;€;1;9;15;44;1;32;18;23;9;9;€;24;2;12;54;53;2;10;48;6 4040;bta;Bos taurus (Cow Jun. 2014 Bos_taurus_UMD_3.1.1/bosTau8);;;22.58;6;30;10;14;11;0;5;6;18;0;8;35;20;0;21;39;13;32;7;7;13;0;9;4;14;1;10;7;31;2;35;16;11;39;0;0;4;19;20;40;0;30;78;40;6;42;€;€;143;€;29;€;13;7;12;16;4;19;44;€;20;63;€;€ 5845;ttr*;Tursiops truncatus (Dolphin Oct. 2011 Baylor Ttru_1.4/turTru2);;;16.73;0;12;6;7;6;0;4;6;11;0;5;17;8;3;16;22;12;0;6;4;7;0;5;4;9;1;6;3;19;2;36;21;1;18;0;0;0;9;16;15;0;13;74;19;10;49;€;€;6;22;21;€;7;1;7;12;0;11;48;54;19;43;€;€ 7080;bacu;Balaenoptera acutorostrata scammoni (Minke whale Oct. 2013 BalAcu1.0/balAcu1);;;18.77;0;13;13;8;6;0;4;7;12;1;8;21;14;1;18;32;10;1;5;4;7;0;5;4;13;0;8;4;20;0;42;20;0;14;0;0;0;11;10;20;0;24;86;29;20;45;€;€;2;24;17;€;9;0;9;21;0;13;55;#;12;64;€;€ 13727;cmk;Callorhinchus milii (Elephant shark Dec. 2013 Callorhinchus_milii-6.1.3/calMil1);;;32.70;3;35;13;31;20;2;20;25;31;0;23;94;22;16;€;€;26;1;54;48;12;6;51;41;24;12;€;€;75;168;€;€;1;36;0;0;1;37;7;18;2;48;43;36;6;49;66;€;1;15;3;30;9;0;25;2;0;33;14;12;2;19;66;# ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg ;;;total du diagramme;;;43;1,166;489;586;803;9;489;693;1,215;66;618;1,746;976;93;582;914;956;98;625;472;970;23;1,042;441;1,044;83;749;469;1,773;240;1,101;622;48;1,305;0;0;34;1,023;979;1,062;71;1,453;1,725;1,619;92;1,660;1,054;1,361;208;1,809;238;915;915;33;563;373;36;1,111;846;846;137;1,530;1,048;472 Codons forts;;;pente;;;;1.117;0.453;0.554;0.847;;0.513;0.635;1.291;;0.690;2.057;0.955;;0.608;0.932;0.907;;0.714;0.518;0.997;;1.066;0.485;1.153;;0.87;0.501;1.706;;1.101;0.695;;1.294;;;;0.992;0.923;1.08;;1.436;1.72;1.704;;1.663;1.232;1.361;;1.656;-;0.942;0.935;;0.607;0.325;;1.195;0.965;0.837;;1.415;1.298;0.498 ;;;somme calculée;;;;-;27.0;19.3;29.5;;-;22.2;98.2;;-;149.5;21.2;;19.9;77.8;-;;-;-;-;;-;-;58.1;;16.4;55.8;50.5;;22.7;22.7;;65.2;;;;-;17.9;37.7;;109.2;-;146.4;;68.5;151.8;123.5;;105.6;-;54.7;-;;45.2;-;;-;87.2;34.6;;-;164.0;96.4 ;;;Totaux + calculés;;;;1,166;516;605;833;;489;715;1,313;;618;1,895;997;;602;992;956;;625;472;970;;1,042;441;1,102;;765;525;1,824;;1,124;645;;1,370;0;0;;1,023;997;1,100;;1,562;1,725;1,765;;1,728;1,206;1,485;;1,915;238;970;915;;608;373;;1,111;933;881;;1,530;1,212;568 ;;;R2;;;;915;784;818;830;;755;704;843;;755;892;877;;731;803;899;;763;731;828;;713;764;795;;795;874;857;;752;829;;738;;;;938;606;827;;908;783;839;;781;889;728;;754;;809;765;;860;568;;799;665;606;;822;802;606 Codons faibles;;;c/t nombre >3;;;3;;;;;0;;;;6;;;;3;;;;5;;;;2;;;;6;;;;4;;;2;;;;2;;;;5;;;;6;;;;7;;;;;2;;;2;;;;9;;; ;;;c/t nombre >3, total;;;16;;;;;0;;;;35;;;;44;;;;66;;;;10;;;;61;;;;209;;;16;;;;9;;;;30;;;;58;;;;184;;;;;16;;;9;;;;120;;; ;;;reste calculé;;;30;;;;;9;;;;37;;;;52;;;;37;;;;15;;;;28;;;;35;;;34;;;;27;;;;46;;;;40;;;;31;;;;;19;;;29;;;;26;;; ;;;multiplicité X 100;;;38;;;;;11;;;;47;;;;66;;;;47;;;;19;;;;35;;;;44;;;43;;;;34;;;;58;;;;51;;;;39;;;;;24;;;37;;;;33;;; ;;;c/t nombre=3;;;1;;;;;0;;;;1;;;;6;;;;4;;;;0;;;;1;;;;1;;;2;;;;2;;;;1;;;;0;;;;0;;;;;2;;;3;;;;0;;; Totaux des 121 réduits;;;;;46942;30;1,166;516;605;833;9;489;715;1,313;37;618;1,895;997;52;602;992;956;37;625;472;970;15;1,042;441;1,102;28;765;525;1,824;35;1,124;645;34;1,370;0;0;27;1,023;997;1,100;46;1,562;1,725;1,765;40;1,728;1,206;1,485;31;1,915;238;970;915;19;608;373;29;1,111;933;881;26;1,530;1,212;568 zéros tRNAs;;;;;;55;1;0;1;0;72;2;1;0;52;1;0;0;42;0;0;0;52;0;0;0;65;0;0;1;56;0;2;0;54;0;1;54;0;79;79;57;1;0;0;46;0;1;1;46;0;0;0;52;1;16;1;1;66;0;8;62;0;0;1;61;2;0;4 79−zéros;;;;;;24;78;79;78;79;7;77;78;79;27;78;79;79;37;79;79;79;27;79;79;79;14;79;79;78;23;79;77;79;25;79;78;25;79;0;0;22;78;79;79;33;79;78;78;33;79;79;79;27;78;63;78;78;13;79;71;17;79;79;78;18;77;79;75 indices tRNAs;;;;;;0.38;14.76;6.53;7.66;10.54;0.11;6.19;9.05;16.62;0.47;7.82;23.99;12.62;0.66;7.62;12.55;12.10;0.47;7.91;5.97;12.28;0.19;13.19;5.58;13.95;0.35;9.69;6.64;23.08;0.44;14.22;8.16;0.43;17.34;0.00;0.00;0.34;12.95;12.62;13.92;0.58;19.78;21.84;22.35;0.51;21.88;15.26;18.79;0.39;24.24;3.01;12.27;11.58;0.24;7.70;4.72;0.37;14.06;11.81;11.15;0.33;19.37;15.34;7.20 ;;;;;;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg
Introns, Comparaison des introns
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IV 1.79;Introns de tRNAs. 79− fungi;;;;;55 830;;;IV 1.42;Introns de tRNAs. 42 fungi;;;;;55 830;;;IV 1.79;Zintrons de tRNAs. 79− fungi;;;;;55 830;;;IV 1.42;Zintrons de tRNAs. 42 fungi;;;;;55 830; ttt;14;tcc;29;tat;30;tgt;3;;ttt;5;tcc;2;tat;0;tgt;2;;ttt;5;tcc;4;tat;17;tgt;2;;ttt;2;tcc;1;tat;0;tgt;1 atc;18;acc;0;aat;5;agt;3;;atc;2;acc;0;aat;5;agt;0;;atc;5;acc;0;aat;4;agt;2;;atc;1;acc;0;aat;2;agt;0 ctc;1;ccc;6;cat;8;cgc;4;;ctc;5;ccc;0;cat;0;cgc;0;;ctc;1;ccc;3;cat;3;cgc;3;;ctc;2;ccc;0;cat;0;cgc;0 gtc;0;gcc;1;gat;5;ggt;5;;gtc;2;gcc;0;gat;5;ggt;2;;gtc;0;gcc;1;gat;3;ggt;3;;gtc;1;gcc;0;gat;2;ggt;1 ttc;3;tct;3;tac;1568;tgc;18;;ttc;621;tct;83;tac;595;tgc;71;;ttc;2;tct;2;tac;79;tgc;10;;ttc;35;tct;9;tac;42;tgc;12 att;6;act;13;aac;10;agc;11;;att;336;act;100;aac;224;agc;343;;att;3;act;7;aac;5;agc;6;;att;16;act;13;aac;16;agc;38 ctt;57;cct;23;cac;14;cgt;0;;ctt;340;cct;298;cac;219;cgt;217;;ctt;10;cct;6;cac;9;cgt;0;;ctt;21;cct;20;cac;19;cgt;22 gtt;4;gct;5;gac;23;ggc;9;;gtt;140;gct;283;gac;298;ggc;243;;gtt;2;gct;4;gac;2;ggc;4;;gtt;9;gct;14;gac;15;ggc;11 tta;23;tca;16;taa;10;tga;4;;tta;83;tca;102;taa;2;tga;21;;tta;8;tca;9;taa;3;tga;2;;tta;19;tca;24;taa;1;tga;7 ata;575;aca;6;aaa;68;aga;594;;ata;140;aca;71;aaa;312;aga;48;;ata;69;aca;3;aaa;8;aga;58;;ata;41;aca;15;aaa;36;aga;12 cta;3;cca;63;caa;187;cga;166;;cta;162;cca;400;caa;140;cga;190;;cta;2;cca;7;caa;8;cga;7;;cta;32;cca;33;caa;20;cga;16 gta;6;gca;3;gaa;35;gga;27;;gta;60;gca;102;gaa;119;gga;100;;gta;5;gca;2;gaa;8;gga;9;;gta;21;gca;16;gaa;18;gga;14 ttg;506;tcg;3;tag;16;tgg;6;;ttg;360;tcg;157;tag;2;tgg;295;;ttg;65;tcg;1;tag;10;tgg;4;;ttg;32;tcg;37;tag;1;tgg;30 atg;189;acg;9;aag;406;agg;18;;atg;248;acg;60;aag;481;agg;86;;atg;11;acg;6;aag;7;agg;5;;atg;24;acg;15;aag;21;agg;18 ctg;9;ccg;14;cag;22;cgg;5;;ctg;169;ccg;74;cag;155;cgg;40;;ctg;7;ccg;4;cag;8;cgg;2;;ctg;20;ccg;18;cag;15;cgg;12 gtg;8;gcg;5;gag;16;ggg;19;;gtg;88;gcg;86;gag;405;ggg;79;;gtg;6;gcg;4;gag;6;ggg;7;;gtg;20;gcg;18;gag;16;ggg;16
Introns, Comparaison des tRNAs
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IV 1.42;Indices de tRNAs. 42 fungi;;;;;55 830;;;IV 1.79;Indices de tRNAs. 79 −fungi;;;;;55 830;;;IV 1.79;Zindices de tRNAs. 79 −fungi;;;;;55 830;;;IV 1.42;Zindices de tRNAs. 42 fungi;;;;;55 830; ttt;0.05;tcc;0.02;tat;0.05;tgt;0.02;;ttt;0.38;tcc;0.47;tat;0.43;tgt;0.39;;ttt;55;tcc;52;tat;54;tgt;52;;ttt;41;tcc;41;tat;40;tgt;41 atc;0.10;acc;0;aat;0.02;agt;0;;atc;0.47;acc;0.35;aat;0.58;agt;0.37;;atc;52;acc;56;aat;46;agt;62;;atc;38;acc;42;aat;41;agt;42 ctc;0.31;ccc;0.05;cat;0;cgc;0;;ctc;0.11;ccc;0.19;cat;0.34;cgc;0.24;;ctc;72;ccc;65;cat;57;cgc;66;;ctc;30;ccc;40;cat;42;cgc;42 gtc;0.02;gcc;0;gat;0.02;ggt;0.02;;gtc;0.66;gcc;0.44;gat;0.51;ggt;0.33;;gtc;42;gcc;54;gat;46;ggt;61;;gtc;41;gcc;42;gat;41;ggt;41 ttc;7.02;tct;7.38;tac;5.93;tgc;3.55;;ttc;14.76;tct;12.10;tac;17.34;tgc;24.19;;ttc;1;tct;0;tac;0;tgc;1;;ttc;0;tct;0;tac;0;tgc;0 att;8.98;act;7.90;aac;7.02;agc;3.67;;att;16.66;act;13.97;aac;19.78;agc;14.06;;att;0;act;1;aac;0;agc;0;;att;0;act;0;aac;0;agc;1 ctt;4.05;cct;3.64;cac;5.14;cgt;5.67;;ctt;10.54;cct;12.28;cac;12.95;cgt;11.58;;ctt;0;cct;0;cac;1;cgt;1;;ctt;11;cct;5;cac;0;cgt;0 gtt;9.55;gct;9.26;gac;9.55;ggc;11.60;;gtt;12.80;gct;23.45;gac;21.89;ggc;19.37;;gtt;0;gct;0;gac;0;ggc;2;;gtt;0;gct;0;gac;1;ggc;0 tta;3.05;tca;2.14;taa;−;tga;0.26;;tta;6.49;tca;7.91;taa;−;tga;3.01;;tta;0;tca;0;taa;−;tga;16;;tta;2;tca;0;taa;−;tga;32 ata;1.36;aca;2.33;aaa;3.69;aga;4.88;;ata;7.82;aca;9.83;aaa;21.84;aga;11.81;;ata;1;aca;0;aaa;1;aga;0;;ata;1;aca;0;aaa;1;aga;2 cta;1.71;cca;4.81;caa;4.67;cga;2.21;;cta;6.19;cca;13.19;caa;12.62;cga;7.70;;cta;2;cca;0;caa;0;cga;0;;cta;7;cca;1;caa;0;cga;20 gta;1.50;gca;3.33;gaa;5.93;gga;3.26;;gta;7.61;gca;14.38;gaa;15.26;gga;15.29;;gta;0;gca;0;gaa;0;gga;0;;gta;2;gca;0;gaa;0;gga;0 ttg;4.48;tcg;1.88;tag;−;tgg;4.12;;ttg;7.67;tcg;5.97;tag;−;tgg;12.27;;ttg;1;tcg;0;tag;−;tgg;1;;ttg;4;tcg;0;tag;−;tgg;2 atg;7.60;acg;1.57;aag;10.12;agg;1.57;;atg;26.11;acg;6.14;aag;22.38;agg;11.13;;atg;0;acg;2;aag;1;agg;1;;atg;0;acg;1;aag;1;agg;1 ctg;2.12;ccg;0.83;cag;3.52;cgg;1.31;;ctg;9.05;ccg;5.58;cag;13.91;cgg;4.72;;ctg;1;ccg;0;cag;0;cgg;8;;ctg;11;ccg;22;cag;0;cgg;4 gtg;2.21;gcg;1.43;gag;7.02;ggg;1.64;;gtg;12.53;gcg;8.15;gag;18.81;ggg;7.16;;gtg;0;gcg;1;gag;0;ggg;4;;gtg;1;gcg;16;gag;0;ggg;4 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; 0.10;0.31;0.83;1.88;2.12;3.69;4.05;5.93;;0.11;0.66;3.01;8.15;9.05;13.19;13.91;19.78;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;7.02;11.60;;;;;;;;21.84;26.11;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Introns, Comparaison des sensibilités relatives
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- Légende
IV 1.42;Indices de tRNAs. 42 fungi;;;;;55 830;;;I 1;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235027; ttt;0.05;tcc;0.02;tat;0.05;tgt;0.02;;ttt;0.25;tct;0.12;tat;0.10;tgt;0.07 atc;0.10;acc;0;aat;0.02;agt;0;;att;0.12;act;2.55;aat;0.12;agt;0.02 ctc;0.31;ccc;0.05;cat;0;cgc;0;;ctt;9.15;cct;0.25;cat;0.10;cgc;8.26 gtc;0.02;gcc;0;gat;0.02;ggt;0.02;;gtt;0.22;gct;0.05;gat;0;ggt;0.02 ttc;7.02;tct;7.38;tac;5.93;tgc;3.55;;ttc;1.51;tcc;1.12;tac;1.59;tgc;1.11 att;8.98;act;7.90;aac;7.02;agc;3.67;;atc;2.28;acc;1.12;aac;2.17;agc;1.10 ctt;4.05;cct;3.64;cac;5.14;cgt;5.67;;ctc;0.95;ccc;0.68;cac;1.17;cgt;1.85 gtt;9.55;gct;9.26;gac;9.55;ggc;11.60;;gtc;1.10;gcc;1.03;gac;2.24;ggc;2.30 tta;3.05;tca;2.14;taa;−;tga;0.26;;tta;1.18;tca;1.31;taa;−;tga;0.33 ata;1.36;aca;2.33;aaa;3.69;aga;4.88;;ata;0.01;aca;1.46;aaa;2.26;aga;1.19 cta;1.71;cca;4.81;caa;4.67;cga;2.21;;cta;1.23;cca;1.35;caa;1.58;cga;0.22 gta;1.50;gca;3.33;gaa;5.93;gga;3.26;;gta;2.20;gca;2.53;gaa;2.40;gga;1.37 ttg;4.48;tcg;1.88;tag;−;tgg;4.12;;ttg;0.99;tcg;0.65;tag;−;tgg;1.08 atg;7.60;acg;1.57;aag;10.12;agg;1.57;;atg;4.47;acg;0.68;aag;0.60;agg;0.86 ctg;2.12;ccg;0.83;cag;3.52;cgg;1.31;;ctg;1.29;ccg;0.54;cag;0.59;cgg;0.83 gtg;2.21;gcg;1.43;gag;7.02;ggg;1.64;;gtg;0.33;gcg;0.30;gag;0.34;ggg;0.56 ;;;;;;;;;;;;;;;; 3.80;;;;;;;;;-24.6;256.0;;;;;; IV 1.4;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;;;IV1.4b;Champigons/bactéries sensibiltés relatives;;;;;; ttt;0.01;tcc;0.01;tat;0.01;tgt;0.01;;ttt;0.01;tcc;0.01;tat;0.01;tgt;0.01 atc;0.03;acc;0;aat;0.01;agt;0;;atc;0.03;acc;0.00;aat;0.01;agt;0.00 ctc;0.08;ccc;0.01;cat;0;cgc;0;;ctc;0.08;ccc;0.01;cat;0.00;cgc;0.00 gtc;0.01;gcc;0;gat;0.01;ggt;0.01;;gtc;0.01;gcc;0.00;gat;0.01;ggt;0.01 ttc;1.85;tct;1.94;tac;1.56;tgc;0.93;;ttc;22;tct;73;tac;-2;tgc;-16 att;2.36;act;2.08;aac;1.85;agc;0.96;;att;3;act;86;aac;-15;agc;-12 ctt;1.07;cct;0.96;cac;1.35;cgt;1.49;;ctt;12;cct;41;cac;16;cgt;-20 gtt;2.51;gct;2.44;gac;2.51;ggc;3.05;;gtt;129;gct;136;gac;12;ggc;33 tta;0.80;tca;0.56;taa;−;tga;0.07;;tta;-32;tca;-57;taa;−;tga;-79 ata;0.36;aca;0.61;aaa;0.97;aga;1.28;;ata;−;aca;-58;aaa;-57;aga;8 cta;0.45;cca;1.27;caa;1.23;cga;0.58;;cta;-63;cca;-6;caa;-22.5;cga;165 gta;0.39;gca;0.88;gaa;1.56;gga;0.86;;gta;-82;gca;-65;gaa;-35;gga;-37 ttg;1.18;tcg;0.49;tag;−;tgg;1.08;;ttg;19;tcg;-23.9;tag;−;tgg;0 atg;2.00;acg;0.41;aag;2.66;agg;0.41;;atg;-55;acg;-40;aag;342;agg;-52 ctg;0.56;ccg;0.22;cag;0.93;cgg;0.34;;ctg;-57;ccg;-59;cag;57;cgg;-59 gtg;0.58;gcg;0.38;gag;1.85;ggg;0.43;;gtg;79;gcg;23.8;gag;437;ggg;-23.1 ;;;;;;;;;;;;;;;; 10.50;;;;;;;;;-4.0;287.9;;;;;; IV1.10;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;;;IV1.10b;;Eucaryotes/bactéries sensibiltés relatives;;;;; ttt;0.04;tcc;0.04;tat;0.04;tgt;0.04;;ttt;0.04;tcc;0.04;tat;0.04;tgt;0.04 atc;0.04;acc;0.03;aat;0.06;agt;0.03;;atc;0.04;acc;0.03;aat;0.06;agt;0.03 ctc;0.01;ccc;0.02;cat;0.03;cgc;0.02;;ctc;0.01;ccc;0.02;cat;0.03;cgc;0.02 gtc;0.06;gcc;0.04;gat;0.05;ggt;0.03;;gtc;0.06;gcc;0.04;gat;0.05;ggt;0.03 ttc;1.41;tct;1.15;tac;1.65;tgc;2.30;;ttc;-7;tct;3;tac;4;tgc;108 att;1.59;act;1.33;aac;1.88;agc;1.34;;att;-30;act;19;aac;-13;agc;22 ctt;1.00;cct;1.17;cac;1.23;cgt;1.10;;ctt;5;cct;72;cac;5;cgt;-41 gtt;1.22;gct;2.23;gac;2.09;ggc;1.84;;gtt;11;gct;116;gac;-7;ggc;-20 tta;0.62;tca;0.75;taa;−;tga;0.29;;tta;-48;tca;-43;taa;−;tga;-12 ata;0.75;aca;0.94;aaa;2.08;aga;1.12;;ata;−;aca;-36;aaa;-8;aga;-6 cta;0.59;cca;1.26;caa;1.20;cga;0.73;;cta;-52;cca;-7;caa;-24.1;cga;233 gta;0.72;gca;1.37;gaa;1.45;gga;1.46;;gta;-67;gca;-46;gaa;-39;gga;6 ttg;0.73;tcg;0.57;tag;−;tgg;1.17;;ttg;-26.3;tcg;-12;tag;−;tgg;8 atg;2.49;acg;0.58;aag;2.13;agg;1.06;;atg;-44;acg;-15;aag;254;agg;23.8 ctg;0.86;ccg;0.53;cag;1.33;cgg;0.45;;ctg;-33;ccg;-2;cag;124;cgg;-46 gtg;1.19;gcg;0.78;gag;1.79;ggg;0.68;;gtg;266;gcg;156;gag;420;ggg;21 ;;;;;;;;;;;;;;;; IV 1.79;Indices de tRNAs. 79 −fungi;;;;;55 830;;;I 1;Indices de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235027; ttt;0.38;tcc;0.47;tat;0.43;tgt;0.39;;ttt;0.25;tct;0.12;tat;0.10;tgt;0.07 atc;0.47;acc;0.35;aat;0.58;agt;0.37;;att;0.12;act;2.55;aat;0.12;agt;0.02 ctc;0.11;ccc;0.19;cat;0.34;cgc;0.24;;ctt;9.15;cct;0.25;cat;0.10;cgc;8.26 gtc;0.66;gcc;0.44;gat;0.51;ggt;0.33;;gtt;0.22;gct;0.05;gat;0;ggt;0.02 ttc;14.76;tct;12.10;tac;17.34;tgc;24.19;;ttc;1.51;tcc;1.12;tac;1.59;tgc;1.11 att;16.66;act;13.97;aac;19.78;agc;14.06;;atc;2.28;acc;1.12;aac;2.17;agc;1.10 ctt;10.54;cct;12.28;cac;12.95;cgt;11.58;;ctc;0.95;ccc;0.68;cac;1.17;cgt;1.85 gtt;12.80;gct;23.45;gac;21.89;ggc;19.37;;gtc;1.10;gcc;1.03;gac;2.24;ggc;2.30 tta;6.49;tca;7.91;taa;−;tga;3.01;;tta;1.18;tca;1.31;taa;−;tga;0.33 ata;7.82;aca;9.83;aaa;21.84;aga;11.81;;ata;0.01;aca;1.46;aaa;2.26;aga;1.19 cta;6.19;cca;13.19;caa;12.62;cga;7.70;;cta;1.23;cca;1.35;caa;1.58;cga;0.22 gta;7.61;gca;14.38;gaa;15.26;gga;15.29;;gta;2.20;gca;2.53;gaa;2.40;gga;1.37 ttg;7.67;tcg;5.97;tag;−;tgg;12.27;;ttg;0.99;tcg;0.65;tag;−;tgg;1.08 atg;26.11;acg;6.14;aag;22.38;agg;11.13;;atg;4.47;acg;0.68;aag;0.60;agg;0.86 ctg;9.05;ccg;5.58;cag;13.91;cgg;4.72;;ctg;1.29;ccg;0.54;cag;0.59;cgg;0.83 gtg;12.53;gcg;8.15;gag;18.81;ggg;7.16;;gtg;0.33;gcg;0.30;gag;0.34;ggg;0.56
Les modifications des tRNAs en 34 et 37.alpha
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Les modifications des tRNAs en 34 et 37.alpha
Compilation pour les bactéries.a
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Compilation pour les bactéries.a
;;;t;;;;;c;;;;;a;;;;;g;; ;;34;;37;;;34;;37;;;34;;37;;;34;;37; t;t;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;c;Gm;G;i6A;m1G;;;G;;A;;Q;G;i6A;m6A;;;G;i6A;m6A ;;2;5;6;1;;;2;;2;;4;1;4;1;;;2;1;1 ;a;cmnmm;;i6A;m6A;;c,mo;U;i6A;m6A;;;;;;;cmnmm;U;i6A;m6A ;;2;;1;1;;2;2;2;2;;;;;;;1;1;1;1 ;g;Cm;C;i6A;m6A;;;C;i6A;;;;;;;;Cm;C;i6A;m6A ;;3;2;2;1;;;1;1;;;;;;;;1;3;2;1 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; c;t;;;;;;;;;;;;;;;;Inosine;;m1G;m2A ;;;;;;;;;;;;;;;;;3;;2;1 ;c;;G;;m1G;;;G;m1G;;;Q;G;m2A;m1G;;;;; ;;;1;;1;;;1;1;;;2;1;2;1;;;;; ;a;cmo;U;;m1G;;c,mo;U;m1G;;;cmnms;;m2A;m6A;;;;; ;;;2;;2;;2;2;4;;;2;;1;1;;;;; ;g;;C;;m1G;;;C;m1G;;;;C;m2A;;;;C;m1G; ;;;4;;3;;;2;2;;;;1;1;;;;2;2; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; a;t;;;;;;;A;t6A;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;1;1;;;;;;;;;;; ;c;;G;t6A;;;;G;t6A;;;Q;G;t6A;;;;G;t6A; ;;;4;4;;;;2;2;;;3;1;4;;;;3;3; ;a;;;;;;mo;U;t6A;;;c,mnms;;t6A;;;c,mnm;U;t6A; ;;;;;;;1;2;2;;;3;;3;;;2;1;3; ;g;k2C;;t6A;m6A;;;;;;;;C;t6A;;;;C;t6A; ;;3;;2;1;;;;;;;;1;1;;;;1;1; ;Met;ac4C;C;t6A;m6A*;;;;;;;;;;;;;;; ;;1;3;1;3;;;;;;;;;;;;;;; ;ini;;C;;A;;;;;;;;;;;;;;; ;;;10;;10;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; g;t;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;c;;G;m6A;A;;;G;;A;;Qg;G;;A;;;G;;A ;;;4;1;3;;;2;;2;;1;2;;3;;;2;;2 ;a;c,mo;U;m6A;;;c,mo;U;m6A;A;;c,mnms;;m2A;A;;c,mnm;U;m6A;A,C ;;2;2;4;;;2;2;3;1;;2;;1;2;;2;4;2;3,2 ;g;;;;;;;;;;;;;;;;;C;;A ;;;;;;;;;;;;;;;;;;3;;3
Compilation pour les eucaryotes.a
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Compilation pour les eucaryotes.a
;;;t;;;;;c;;;;;a;;;;;g;; ;;34;;37;;;34;;37;;;34;;37;;;34;;37; t;t;;;;;;Inosine;;i6A;io6A;;;;;;;;;; ;;;;;;;9;;7;2;;;;;;;;;; ;c;Gm;G;m1G;W;;;;;;;Q9;G;m1G;i6A;;G;;m1G;i6A ;;22;1;5;18;;;;;;;5;9;11;3;;2;;1;1 ;a;ncmm;U;m1G;;;ncm;U;i6A;io6A*;;;;;;;mcm;U;i6A; ;;1;1;3;;;3;2;2;2;;;;;;;3;1;6; ;g;Cm;m5C;m1G;;;;C;i6A;io6A;;;;;;;Cm;;m1G;A ;;2;1;4;;;;5;3;2;;;;;;;5;;4;1 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; c;t;Inosine;;m1G;G;;Inosine;;m1G;;;;;;;;Inosine;;m1G;m2A* ;;7;;6;1;;1;;1;;;;;;;;4;;2;2 ;c;;;;;;;;;;;Q;G;m1G;G;;;;; ;;;;;;;;;;;;1;5;5;1;;;;; ;a;;U;m1G;;;ncm;;m1G;;;mcms;;;;;mcm;;; ;;;1;1;;;1;;2;;;;;;;;;;; ;g;;C;m1G;;;;;;;;Cm;C;m2A;A;;;C;m1G; ;;;3;3;;;;;;;;3;3;1;5;;;2;2; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; a;t;Inosine;;t6A;;;Inosine;;t6A;;;;;;;;;;; ;;5;;5;;;3;;3;;;;;;;;;;; ;c;;;;;;;;;;;Q;G;t6A;;;;G;t6A;i6A ;;;;;;;;;;;;4;2;7;;;;5;4;1 ;a;PAP;;t6A;;;;;;;;mcms;cmnmm;t6A;;;mcms;mcm;t6A; ;;1;;1;;;;;;;;3;1;4;;;1;1;2; ;g;;;;;;;;;;;;C;t6A;;;;C;t6A; ;;;;;;;;;;;;;10;10;;;;1;1; ;Met;Cm;C;t6A;;;;;;;;;;;;;;;; ;;5;1;6;;;;;;;;;;;;;;;; ;ini;;C;t6A;i6A;;;;;;;;;;;;;;; ;;;18;17;1;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;; g;t;Inosine;;;A;;Inosine;;m1 Inosine;;;;;;;;;;; ;;7;;;7;;6;;6;;;;;;;;;;; ;c;;;;;;;;;;;Q8;G;m1G;A;;;G;;A ;;;;;;;;;;;;4;3;1;6;;;4;;4 ;a;ncm;;;A;;;;;;;mcms*;U;;A;;mchm;;;A ;;1;;;2;;;;;;;3;1;;5;;1;;;2 ;g;;C;;A;;;;;;;;C;;A;;;C;;A ;;;2;;2;;;;;;;;4;;4;;;1;;1
Détails pour mcac lla eco hvo sce.a
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Détails pour mcac lla eco hvo sce.a
;;mcac;30 tRNAs;;;;;;;;30 gènes tRNA de mcac;;;;;;;;%GC ;;t;;c;;a;;g;;;;t;;c;;a;;g;24 t;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;m1G;;;G;m6A;G;m6A;;c;1;;;;1;;1; ;a;cmnmm;m6A;U;m6A;;;cmnmm;m6A;;a;1;;1;;;;1; ;g;Cm;m6A;;;;;Cm;m6A;;g;1;;;;;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; c;t;;;;;;;Inosine;m1G;;t;;;;;;;1; ;c;;;;;G;m1G;;;;c;;;;;1;;; ;a;U;m1G;U;m1G;cmnms;m6A;;;;a;1;;1;;1;;; ;g;;;;;;;;;;g;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; a;t;;;A;t6A;;;;;;t;;;1;;;;; ;c;G;t6A;;;G;t6A;G;t6A;;c;1;;;;1;;1; ;a;k2C;m6A;U;t6A;cmnms;t6A;cmnm;t6A;;a;;;1;;2;;1; ;g;C;A;;;C;t6A;;;;g;3;;;;1;;; ;i;C;A;;;;;;;;i;;;;;;;; g;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;;;;;G;A;;;;c;;;;;1;;; ;a;U;m6A;U;m6A;cmnms;A;U;m6A;;a;1;;1;;1;;1; ;g;;;;;;;;;;g;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;lla;38 tRNAs;;;;;;;;63 gènes tRNA de lla;;;;;;;;%GC ;;t;;c;;a;;g;;;;t;;c;;a;;g;35 t;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;m1G;G;A;G;i6A;G;i6A;;c;2;;1;;1;;1; ;a;cmnms*;i6A;mo;i6A;;;;;;a;2;;2;;;;; ;g;Cm;i6A;C;A;;;C;i6A;;g;1;;3;;;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; c;t;A;m1G;;;;;Inosine;m2A;;t;2;;;;;;2; ;c;;;;;G;G;;;;c;;;;;1;;; ;a;U;m1G;mo;m1G;U;A;;;;a;2;;2;;2;;; ;g;C;G;;;;;C;G;;g;1;;;;;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; a;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;t6A;G;A;G;t6A;G;A;;c;2;;1;;2;;1; ;a;;;mo;t6A;cmnms;t6A;U;C;;a;;;2;;3;;1; ;g;ac4C*;m6A;C;A;C;t6A;C;A;;g;4;;1;;1;;1; ;i;2 C;A;;;;;;;;i;;;;;;;; g;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;;;;;G;A;G;A;;c;;;;;2;;2; ;a;mo;m1A;mo;m6A;U;A;mo;m6A;;a;3;;6;;2;;2; ;g;;;;;;;;;;g;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;E.coli;40 tRNAs;;strain unknown;;Liepzig*;;;;86 gènes tRNA de eco;;;;K12;;;;%GC t;t;t;;c;;a;;g;;;;t;;c;;a;;g;51 ;c;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;a;G;msi6A;G;A;2 Q; msi6A;G;msi6A;;c;2;;2;;3;;1; ;g;cmnmm;msi6A;cmo;msi6A;;;U;i6A;;a;1;;1;;;;1; ;;Cm;msi6A;C;msi6A;;;C;msi6A;;g;1;;1;;;;1; c;t;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;c;;;;;;;Inosine;m2A;;t;;;;;;;4; ;a;G;m1G;;;Q;m2A;;;;c;1;;1;;1;;; ;g;;;;;cmnms;m2A;;;;a;1;;1;;2;;; ;;C;m1G;C;m1G;C;m2A;C;m1G;;g;4;;1;;2;;1; a;t;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;c;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;a;G;t6A;2 G;m6t6A;Q;t6A;G;t6A;;c;3;;2;;4;;1; ;g;k2C;t6A;;;mnms;t6A;mnm;t6A;;a;;;1;;6;;1; ;i;ac4C;t6A;;;;;;;;g;8;;1;;;;1; g;t;2 C;A;;;;;;;;i;;;;;;;; ;c;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;a;2 G;A;G;A;GluQ;m2A;G;A;;c;2;;2;;3;;4; ;g;cmo;m6A;cmo;A;mnms;m2A;mnm;A;;a;5;;3;;4;;1; ;;;;;;;;C;A;;g;;;;;;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;hvo;41 tRNAs;;codons*;;;;;;53 gènes tRNA de lla;;;;;;;;%GC ;;t;;c;;a;;g;;;;t;;c;;a;;g;66 t;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;m1G;G;A;G;m1G;G;m1G;;c;2;;1;;2;;1; ;a;U;m1G;;;;;;;;a;1;;1;;;;; ;g;C;m1G;ac4C;A;;;Cm;m1G;;g;1;;1;;;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; c;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;m1G;G;m1G;G;m1G;G;m1G;;c;1;;1;;1;;1; ;a;mo;m1G;U;m1G;;;N;m1G;;a;1;;1;;1;;1; ;g;C;m1G;ac4C;m1G;ac4C;m1G;C;m1G;;g;1;;2;;1;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; a;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;t6A;G;t6A;G;t6A;G;t6A;;c;1;;1;;1;;1; ;a;N;t6A;;;N;t6A;;;;a;;;1;;1;;1; ;g;Cm;t6A;C;t6A;ac4C;t6A;;;;g;3;;1;;1;;1; ;i;C;A;;;;;;;;i;;;;;;;; g;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;A;G;A;G;A;2 G;A;;c;2;;1;;2;;2; ;a;;;U;A;N;m1G;N;A;;a;1;;2;;1;;1; ;g;C;A;C;A;ac4C;A;C;A;;g;1;;1;;1;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;sce;34 tRNAs;;;;;;;;275 gènes tRNA de sce;;;;;;;;%GC ;;t;;c;;a;;g;;;;t;;c;;a;;g;38 t;t;;;2 Inosine; i6A;;;;;;t;;;11;;;;; ;c;2 Gm; yW;;;GPA;i6A;G;i6A;;c;10;;;;8;;4; ;a;ncmm;m1G;ncm;i6A;;;;;;a;7;;3;;;;; ;g;m5C;m1G;C;i6A;;;Cm;A;;g;10;;1;;;;6; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; c;t;;;;;;;Inosine;A;;t;;;2;;;;6; ;c;;;;;2 G; m1G;;;;c;1;;;;7;;; ;a;U;m1G;N;m1G;;;;;;a;3;;10;;9;;; ;g;;;;;;;;;;g;;;;;1;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; a;t;Inosine;t6A;2 Inosine; t6A;;;;;;t;13;;11;;;;; ;c;;;;;G;t6A;G;t6A;;c;;;;;10;;4; ;a;PAP;t6A;;;mcms;t6A;mcm;t6A;;a;2;;4;;7;;11; ;g;C;t6A;;;C;t6A;;;;g;10;;1;;14;;1; ;i;C;t6A;;;;;;;;i;;;;;;;; g;t;Inosine;A;Inosine;m1Inos;;;;;;t;14;;11;;;;; ;c;;;;;G;m1G;G;A;;c;;;;;16;;16; ;a;ncm;A;;;mcms;A;N;A;;a;2;;5;;14;;3; ;g;C;A;;;;;;;;g;2;;;;2;;2;
Les modifications des tRNAs
[modifier | modifier le wikicode]Liste des short name trouvés en colonnes 38 et 41
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux tableaux:Liste des short name trouvés en colonnes 38 et 41.
- Légende: utiliser le 2 points ":" comme séparateur du tableur
34::::37: ::Eu et pro caryotes::: N:xU:::H:xA <:xC:::;:xG I:inosine:::O:m1I 3:mcm5s2U:::K:m1G Q:QtRNA:::6:t6A 1:mcm5U:::/:m2A 8:manQtRNA:::+:i6A J:Um:::E:m6t6A 2:s2U:::[:ms2t6A #:Gm:::W:o2yW &:ncm5U:::Y:yW ,:mchm5U:::`:io6A P:pseudoU:::=:m6A °:f5Cm:::≠:ms2io6A B:Cm:::*:ms2i6A ?:m5C:::: ∼:ncm5Um:::: ):cmnm5Um:::: 9:galQtRNA:::: 5:mo5U:::: V:cmo5U:::: {:mnm5U:::: ⊄:gluQtRNA:::: S:mnm5s2U:::: }:k2C:::: M:ac4C:::: $:cmnm5s2U::::
Liste des tRNAs de la base gtRNAdb
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Liste des tRNAs de la base gtRNAdb.
- Légende: utiliser µ comme séparateur du tableur
- Prélever le 15.10.18
- Liste des short name trouvés en colonnes 38 et 41.
µSTXT(N35;41;1)µµµµµµµµµµµ STXT(N35;38;1)µµµµµµµµµµµµ 38µµ41µµµµgèneµtRNAµaaµcodonµgénomeµmilieuµséquence IµµOµµµµgctµEucaryµAlaµAGCµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGGCGUGUKGCGUAGDC-GGD--AGCGCRCUCCCUUIGCOPGGGAGAG-------------------GDCUCCGGTPCGAUUCCGGACUCGUCCACCA IµµOµµµµgctµAµAlaµIGCµBombyx moriµcytosolic µ-GGGGGCGUALCUCAGAD-GGU--AGAGCRCUCGCJUIGCOP#PGAGAG-------------------7UA?CGGGAPCG"UACCCGGCGCCUCCACCA IµµOµµµµgctµAµAlaµIGCµBombyx moriµcytosolic µ-GGGGGCGUALCUCAGAD-GGU--AGAGCRCUCGCJUIGCOP#PGAGAG-------------------7UA?CGGGAPCG"UACCCGGCGCCUCCACCA IµµOµµµµgctµAµAlaµIGCµHomo sapiensµcytosolic µ-GGGGGAUUALCUCAAAD-GGD--AGAGCRCUCGCJUIGCOP#CGAGAG-------------------7UAGCGGGAPCG"UGCCCGCAUCCUCCACCA IµµOµµµµgctµAµAlaµIGCµHomo sapiensµcytosolic µ-GGGGAAUUALCUCAAAD-GGD--AGAGCRCUCGCJUIGCOP#CGAGAG-------------------7UAGCGGGAPCG"UGCCCGCAUUCUCCACCA IµµOµµµµgctµAµAlaµIGCµPichia jadiniiµcytosolic µ-GGGCGUGUKGCGUAGDD-GGD--AGCGCRPUCGCUUIGCOPGCGAAAG-------------------GDCUCCGGTPCG"CUCCGGACUCGUCCACCA 3µµ6µµµµagaµUµArgµ3CPµBos taurusµcytosolic µ-GGCUCCGUKGCGCAAD--GGAD-AGCGCAPPGGA'U3CP6AUPCAAAG-------------------7DU?CGGGTPCG"GUCCCGGCGGAGUCGCCA CµµKµµµµcggµCµArgµCCGµBos taurusµcytosolic µ-GACCCAGUKLCCUAAD--#GAD-AAGGCAPCAGCBUCCGKAGCUGGGG-------------------ADUGPGGGTPCG"GUCCCAUCUGGGUCGCCA CµµKµµµµcggµCµArgµCCGµTriticum aestivumµcytosolic µ-GACCGCGUKGCCUAAD--GGAX-AAGGCRCUCGCBUCCGKAGCGGGAG-------------------ADU?UGGGTPCG"CUCCCAGCGPGGUCGCCA Cµµ6µµµµaggµCµArgµCCUµBos taurusµcytosolic µ-GCCCCAGUKLCCUAAD--GGAD-AAGGCAPUGGC'UCCU6AGCCAGGG-------------------ADUGPGGGTPCG"GUCCCAUCUGGGGPCCCA IµµKµµµµcgtµAµArgµICGµMus musculusµcytosolic µ-GGGCCAGUKLCGCAAD--GGAD-AACGCRPCUGABUICGKAPCAGAAG-------------------ADU?PAGGPPCG"CUCCUGGCUGGCUCGCCA IµµKµµµµcgtµAµArgµICGµMus musculusµcytosolic µ-GGGCCAGUKLCGCAAD--GGAD-AACGCRPCUGABUICGKAPCAGAAG-------------------ADU?PAGGPPCG"CUCCUGGCUGGCUCGCCA IµµAµµµµcgtµAµArgµICGµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-PUCCUCGUKLCCCAAD--GGDC-ACGGCRPCUGGCUICGAACCAGAAG-------------------ADU?CAGGTPCA"GUCCUGGCGGGGAAGCCA Iµµ/µµµµcgtµAµArgµICGµTriticum aestivumµcytosolic µ-GACUCCGUKLCCCAAD--#GAX-AAGGCRCUGGUBUICG/AACCAGAG-------------------ADU?UGGGTPCG"UCCCCAGCGGAGUCGCCA 1µµ6µµµµagaµUµArgµUCUµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GCUCGCGUKLCGUAAD--GGC--AACGCRPCUGACU1CU6APCAGAAG-------------------ADUAUGGGTPCG"CCCCCAUCGUGAGUGCCA Gµµ6µµµµaacµGµAsnµGUUµRattus norvegicusµcytosolic µ-GUCUCUGUKLCGCAADC-GGDX-AGCGCRPPCGGCUGUU6ACCGAAAG-------------------7DUGGUGG.PCG"GCCCACCCAGGGACGCCA Gµµ6µµµµaacµGµAsnµGUUµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GACUCCAUGLCCAAGDD-GGDD-AAGGCRUGCGACUGUU6APCGCAAG-------------------AD?GUGAGTPCA"CCCUCACUGGGGUCGCCA Qµµ6µµµµaacµGµAsnµQUUµBos taurusµcytosolic µ-GUCUCUGUKLCGCAADC-GGDX-AGCGCRPPCGGCUQUU6ACCGAAAG-------------------7DUGGUGG@PCG"GCCCACCCAGGGACGCCA Qµµ6µµµµaacµGµAsnµQUUµHomo sapiensµcytosolic µ-GUCUCUGUKLCGCAADC-GGDX-AGCGCRPPCGGCUQUU6ACCGAAAG-------------------7DUGGUGG.PCG"GCCCACCCAGGGACGCCA Qµµ6µµµµaacµGµAsnµQUUµLupinus luteusµcytosolic µ-GCCUCAGUALCUCAGD--GGDX-AGAGCRGUCGGBUQUU6ACCGAUAG-------------------7D?GUAGGTPCG"GCCCUACUUGGGGCGCCA Qµµ6µµµµaacµGµAsnµQUUµRattus norvegicusµcytosolic µ-GUCUCUGUKLCGCAADC-GGDX-AGCGCRPPCGGCUQUU6ACCGAAAG-------------------7DUGGUGG.PCG"GCCCACCCAGGGACGCCA 8µµAµµµµgacµGµAspµ8UCµBos taurusµcytosolic µ-GGUGCCGUALCGPAGD--#GC--A.CG.GACUCUBU8UCAAAGAGUGG-------------------7A?.UGAGTPCG"UACUCAACGGCACCGCCA 8µµAµµµµgacµGµAspµ8UCµOryctolagus cuniculusµcytosolic µ-UCCCGUCUAGUAPAGU--GGDG-AGUAUAUCCGCCU8UCACGCGGGAG-------------------GA??GGGGTPCG"AUCCCCGGACGGGAGCCA 8µµAµµµµgacµGµAspµ8UCµRattus norvegicusµcytosolic µ-UCCUCGUUAGUAPAGU--GGDG-AGUAUCCCCGCUC8UCA?GCGGGAG-------------------A-??GGGGTPCGAUUCCCCGACGGGGAGCCA 8µµAµµµµgacµGµAspµ8UCµXenopus laevisµcytosolic µ-UCCUCLUUKGUAPAGU--GGDG-AGUAUCCCCGCCU8UCA?GCGGGAG-------------------A-??GGGGTPCAAUUCCCCGACGGGGAGCCA GµµAµµµµgacµGµAspµGUCµEuglena gracilisµcytosolic µ-UCUUCGGUAGUAPAGD--#GDA-AGUAU;PCCGCCUGUCA<GCGGAAG-------------------A-<HCGGGTPCAHUUCCCGGCCGGAGAGCCA GµµAµµµµgacµGµAspµGUCµRattus norvegicusµcytosolic µAUCCUCGUUAGUAPAGU--GGDG-AGUAUCCCCGCUCGUCA?GCGGGAG-------------------A-??GGGGTPCGAUUCCCCGACGGGGAGCCA GµµKµµµµgacµGµAspµGUCµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-UCCGUGAUAGUUPAAD--GGDC-AGAAUGGGCGCPUGUCKCGUGCCAG-------------------A-U?GGGGTPCAAUUCCCCGUCGCGGAGCCA GµµKµµµµtgcµGµCysµGCAµNicotiana rusticaµcytosolic µ-GGGUCCAUAGCUCAGD--#GD--AGAGCAPPUGABUGCAKAPCAAGAG-------------------7DCACCGGUPCG"ACCCGGUUGGGCCCUCCA Gµµ+µµµµtgcµGµCysµGCAµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GCUCGUAUGGCGCAGD--GGD--AGCGCAGCAGAPUGCA+APCUGUUG-------------------7D?CUUAGTPCG"UCCUGAGUGCGAGCUCCA Cµµ6µµµµtagµCµGlnµCUAµTetrahymena thermophilaµcytosolic µ-GGUUCUAUALUAPAGC--GCDD-AGUACUGGGGA<UCUA6APCCCUUG-------------------A-C?UGGGUPCG"AUCCCAGUAGGACCUCCA CµµAµµµµcagµCµGlnµCUGµBos taurusµcytosolic µ-GGUUCCAUKGUGPAAD--#GDD-AGCACUCPGGABUCUGAAPCCAGCG-------------------A-U?CGAGPPCA"AUCUCGGUGGAACCUCCA CµµAµµµµcagµCµGlnµCUGµMus musculusµcytosolic µ-GGUUCCAUKGUGPAAD--#GDD-AGCACUCPGGABUCUGAAPCCAGCG-------------------A-U??GAGPPCA"AUCUCGGUGGAACCUCCA CµµAµµµµcagµCµGlnµCUGµRattus norvegicusµcytosolic µ-GGUUCCAUKGUGPAAD--#GDD-AGCACUCUGGABUCUGAAPCCAGCG-------------------A-U??GAGPPCA"AUCUCGGUGGAACCUCCA Jµµ6µµµµtaaµUµGlnµJUAµTetrahymena thermophilaµcytosolic µ-GGUUCCAUALUAPAGD--GGDD-AGUACUGGGGABUJUA6APCCCUUG-------------------A-C?UGGGUPCG"AUCCCAGUGGGACCUCCA JµµAµµµµcaaµUµGlnµJUGµMus musculusµcytosolic µ-GGUCCCAUKGUGPAAD--#GDD-AGCACUCPGGABUJUGAAPCCAGCG-------------------A-U??GAGPPCA"AUCUCGGUGGGACCUCCA Jµµ/µµµµcaaµUµGlnµJUGµNicotiana rusticaµcytosolic µ-GGUUCUAUKGUGPAGD--#GDD-AGCACUCPGGABUJUG/APCCAGCG--------------------ACCUGGGTPCG"CUCCCGGUAGGACCUCCA JµµAµµµµcaaµUµGlnµJUGµTetrahymena thermophilaµcytosolic µ-GGUUGUAUKLUGPAGC--GGDD-AGCACCGAGGACUJUGAAPCCUCUG-------------------A-C?UGGGUPCG"AUCCCAGUACGACCUCCA NµµAµµµµcaaµUµGlnµNUGµHomo sapiensµcytosolic µ-GGCCCCAUKGUGPAAU--#GDD-AGCACUCPGGABUNUGAAPCCAGCG-------------------A-U??GAGPPCA"AUCUCGGUGGGACCUCCA NµµAµµµµcaaµUµGlnµNUGµHomo sapiensµcytosolic µ-GGUCCCAUKGUGPAAU--#GDD-AGCACUCPGGABUNUGAAPCCAGCG-------------------A-U??GAGPPCA"AUCUCGGUGGGACCUCCA UµµEµµµµtaaµUµGlnµUUAµLupinus luteusµcytosolic µ-..CGUCUUAL...AGD--GG..-A...CR.C.UGBUUUAEACACG.UG-------------------7D?GUGGGTPCG"AUCCCACAGACGAGACCA 2µµAµµµµgaaµUµGluµ2UCµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-UCCCAUAUGGUCPAGD--GGCD-AGGAUAUCUGGBU2UCACCCAGAAG-------------------G-CCCGGGTPCGAUUCCCGGUAUGGGAACCA 3µµAµµµµgaaµUµGluµ3UCµRattus norvegicusµcytosolic µ-UCCCACAUKGUCPAGC--GGDD-AGGAUUCCUGGPU3UCACCCAGGCG-------------------G-C??GGG\PCGACUCCCGGUGUGGGAACCA 3µµAµµµµgaaµUµGluµ3UCµSchizosaccharomyces pombeµcytosolic µ-UCCGUUGUKGUCCAAC--GGCD-AGGAUUCGUCGCU3UCACCGACGGG-------------------A-G?GGGGTPCGACUCCCCGCAACGGAGCCA CµµAµµµµgagµCµGluµCPCµHordeum vulgareµcytosolic µ-UCCGUCGUAGUCPAGGD-GGDP-AGGAUACUCGGCUCPCACCCGAGAG-------------------A-C?CGGGTPCG"GUCCCGGCGACGGAACCA CµµAµµµµgagµCµGluµCUCµHomo sapiensµcytosolic µ-UCCCUGGUGLUCPAGU--GGDP-AGGAUUCGGCGCUCUCACCGCCGCG-------------------G-C??GGG\PCGAUUCCCGGUCAGGGAACCA CµµAµµµµgagµCµGluµCUCµLupinus luteusµcytosolic µ-UCCGUUGUAGUCPAGDD-GGDC-AGGAUAUUCGGCUCUCACCCGAAAG-------------------A-C?CGGGTPCA"GUCCCGGCGACGGAACCA CµµAµµµµgagµCµGluµCUCµMus musculusµcytosolic µ-UCCCUGGUGLUCPAGU--GGDP-AGGAUUCGGCGCUCUCACCGCCGCG-------------------G-C??GGG\PCGAUUCCCGGUCAGGGAACCA UµµAµµµµgaaµUµGluµUPCµHordeum vulgareµcytosolic µ-UCCGUCGUAGUCPAGGD-GGDP-AGGAUACUCGGCUUPCACCCGAGAG-------------------A-C?CGGGTPCA"GUCCCGGCGACGGAACCA 3µµAµµµµgaaµUµGluµUUCµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-UCCGAUAUAGUGPAAC--GGCD-AUCACAPCACGCU3UCACCGUGGAG-------------------A-C?GGGGTPCGACUCCCCGUAUCGGAGCCA ,µµAµµµµggaµUµGlyµ,CCµBombyx moriµcytosolic µ-GCGJUGGUKGUGPAAD--GGDC-AGCAUAGPUGCCU,CCAAGCAGUUG-------------------A-U??GGGTPCG"UUCCCGGCCAACGCACCA CµµAµµµµgggµCµGlyµCCCµHomo sapiensµcytosolic µ-GCGBCLCUGGUGPAGU--GGD--AUCAUGCAAGAJUCCCAUZCUUGCG-------------------A-C??GGGTPCG"UUCCCGGGCGGCGCACCA GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµBombyx moriµcytosolic µ-GCAJCGGUKGUUCAGU--GGD--AGAAUGCUCGCCUGCCA?GCGGGCG-------------------G-???GGGTPCG"UUCCCGGCCGAUGCACCA GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµHomo sapiensµcytosolic µ-GCAJULGUGGUUCAGU--GGD--AGAAUUCUCGCCUGCCA?GCGGGAG-------------------G-???GGGTPCG"UUCCCGGCCAAUGCACCA GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµLupinus luteusµcytosolic µ-GCABCAGUKGUCPAGD--GGU--AGAAUAGUACCCUGCCA?GGUACAG-------------------A-???GGGUPCG"UUCCCGGCUGGUGCACCA GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GCGBAAGUKGUUPAGD--GGD--AAAAUCCAACGPUGCCAPCGUUGGG---------------------C?CCGGTPCGAUUCCGGGCUUGCGCACCA GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµTriticum aestivumµcytosolic µ-GCABCAGUKGUCPAGD--GGU--AGAAUAGUACCCUGCCA?GGUACAG-------------------A-???GGGUPCG"UUCCCGGCUGGUGCACCA NµµAµµµµggaµUµGlyµUCCµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGGCGGUUAGUGPAGD--GGDD-AUCAUCCCACCCUNCCAAGGUGGGG-------------------A-CACGGGTPCGAUUCUCGUACCGCUCACCA GµµKµµµµcacµGµHisµGUGµDrosophila melanogasterµcytosolic µGGCCGUGAUCGUCPAGD--GGDD-AGGACCCCACGPUGUGKCCGUGGUA-------------------A-CC?AGGUPCG"AUCCUGGUCACGG?ACCA GµµGµµµµcacµGµHisµGUGµHomo sapiensµcytosolic µ;GCCGUGAUCGUAPAGD--GGDD-AGUACUCUGCGPUGUGGCCGCAGCA-------------------A-??UCGGUPCG"AUCCGAGUCACGGCACCA GµµKµµµµcacµGµHisµGUGµLupinus luteusµcytosolic µGGUGGCUGUAGUUPAGD--GGDD-AGAACACAACGPUGUGKCCGUUGAA-------------------A-C?UGGGUPCG"AUCCCAGCAGCCACACCA GµµKµµµµcacµGµHisµGUGµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µGGCC:UCUUAGUAPAGD--#GDD-AGUACACAACAPUGUGKCPGUUGAA-------------------A-C?CUGGTPCGAUUCUAGGAGGUGGCACCA GµµKµµµµcacµGµHisµGUGµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µGGCC:UCUUAGUAPAGD--#GDD-AGUACACAUCGPUGUGKCCGAUGAA-------------------A-C?CUGGTPCGAUUCUAGGAGAUGGCACCA QµµKµµµµcacµGµHisµQUGµOvis ariesµcytosolic µGGCCGULAUCGUAPAGD--GGDD-AGUACUCUGCGPUQUGKCCGCAGCA-------------------A-C?UCGGUPCG"AUCCGAGUCACGG?ACCA Iµµ6µµµµattµAµIleµAAUµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGUCUCUUKLCCCAGDD-GGDD-AAGGCACCGUGCUIAU6ACGCGGGG-------------------AD?AGCGGTPCG"UCCCGCUAGAGACCACCA Iµµ6µµµµattµAµIleµIAUµBombyx moriµcytosolic µ-GGCCCAUUALCUCAGDD-GGDN-AGAGCRPCGUGCUIAU6ACGCGAAG-------------------7U?G?GGGTPCG"UCCCCUCAUGGGCCACCA Iµµ6µµµµattµAµIleµIAUµLupinus luteusµcytosolic µ-GGCCCAUUALCCCAGDD-GGDD-AAGGCRPGGUGCUIAU6ACGCCGAA-------------------GD?AGCAGTPCG"UCCUGCUAUGGGCCACCA Iµµ6µµµµattµAµIleµIAUµMus musculusµcytosolic µ-GGCCGGUUALCUCAGDD-GGDD-AGAGCRPGGPGCUIAU6ACGCCAAG-------------------7D?GCGGGTPCG"UCCCCGUACGGGCCACCA Iµµ6µµµµattµAµIleµIAUµPichia jadiniiµcytosolic µ-GGUCCCUUGLCCCAGDD-GGDD-AAGGCRPGGUGCUIAU6ACGCCAAG-------------------AD?AGCAGTPCG"UCCUGCUAGGGACCACCA Pµµ6µµµµataµUµIleµUAUµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GCUCGUGUALCUCAGD--GGDD-AGAGCUPCGUGCUPAP6ACGCGACC-------------------7D?GUGGGTPCA"UCCCCACCPCGAGCACCA Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµAsterina amurensisµcytosolic µ-AGCAGAGUKLCGCAGU--GGA--AGCGUGCUGGGCCCAU6ACCCAGAG-------------------7D?CGAGGAPCG"AACCUCGCUCUGCUACCA Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-AGCAGAGUKLCGCAGU--GGA--AGCGULCUGGGCCCAU6ACCCAGAG-------------------7D?CGAGGAUCG"AACCUUGCUCUGCUACCA Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµEuphausia superbaµcytosolic µ-AGCAGAGUKLCGCAGU--GGA--AGCGULCUGGGCCCAU6ACCCAGAG-------------------7UCGGUAGAPCG"AACUACUCUCUGCUACCA Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµHomo sapiensµcytosolic µ-AGCAGAGUKLCGCAGC--GGA--AGCGULCUGGGCCCAU6ACCCAGAG-------------------7D?GAUGGAUCG"AACCAUCCUCUGCUACCA Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµLupinus luteusµcytosolic µ-AUCAGAGUKLCGCAGC--GGA--AGCGCRGPGGGCCCAU6ACCCACAG-------------------7D?<CAGGAPCG"AACCU.GCUCUGAUACCA Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµMus musculusµcytosolic µ-AGCAGAGUKLCGCAGC--GGA--AGCGULCUGGGCCCAU6ACCCAGAG-------------------7D?GAUGGAUCG"AACCAUCCUCUGCUACCA Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµNeurospora crassaµcytosolic µ-AGCUGCAUKGCGCAGC--GGA--AGCGCRC.GGGCUCAU6ACCCGGAG-------------------7DCACUCGAUCG"AACGA;UUGCAGCUACCA Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµOryctolagus cuniculusµcytosolic µ-AGCAGAGUKLCGCAGC--GGA--AGCGULCUGGGCCCAU6ACCCAGAG-------------------7D?GAUGGAUCG"AACCAUCCUCUGCUACCA Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµOvis ariesµcytosolic µ-AGCAGAGUKLCGCAGC--GGA--AGCGULCUGGGCCCAU6ACCCAGAG-------------------7D?GAUGGAUCG"AACCAUCCUCUGCUACCA Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµPhaseolus vulgarisµcytosolic µ-AUCAGAGUKLCGCAGC--GGA--AGCGULGUGGGCCCAU6ACCCACAG-------------------7D?CCAGGAPCG"AACCU#GCUCUGAUACCA Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµPichia jadiniiµcytosolic µ-AGCGUCUUKLCGCAGD--GGA--AGCGCRCAGGGCUCAU6ACCCUGAU-------------------7D??CUGGAUCG"AACCAℑGAGACGCUACCA Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-AGCGCCGUKLCGCAGD--GGA--AGCGCRCAGGGCUCAU6ACCCUGAU-------------------7D??UCGGAUCG"AACCGˆGCGGCGCUACCA Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµSalmo salarµcytosolic µ-AGCAGAGUKLCGCAGC--GGA--AGCGURCUGGGCCCAU6ACCCAGAG-------------------7D?GAUGGAUCG"AACCAUCCUCUGCUACCA Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµScenedesmus obliquusµcytosolic µ-AGCUGAGUKLCGCAGD--GGA--AGCGPLAPGGGCUCAU6ACCCAUAG-------------------7D?ACAGGAUCG"AACCU;UCUCAGCUACCA Cµµ+µµµµatgµCµIniµCAUµSchizosaccharomyces pombeµcytosolic µ-PGCGCGGUALGAGAGD--GGA--ACUCCRACGGGCUCAU+ACCCGUAG-------------------7UC?CAGGAUCG"AACCUGGCCGCGCAACCA Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµTetrahymena thermophilaµcytosolic µ-AGCAGGGUKGCGAAAD--#GA--AUCGCGUPGGGCUCAU6ACPCAAAA-------------------7U?AGAGGAPCG"AACCUCUCUCUGCUACCA Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµTriticum aestivumµcytosolic µ-AUCAGAGUKLCGCAGC--GGA--AGCGULGPGGGCCCAU6ACCCACAG-------------------7D??CAGGAPCG"AACCU;GCUCUGAUACCA Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµXenopus laevisµcytosolic µ-AGCAGAGUKLCGCAGC--GGA--AGCGULCUGGGCCCAU6ACCCAGAG-------------------7D?GAUGGAUCG"AACCAUCCUCUGCUACCA .µµKµµµµtt.µµLeuµ.AAµHomo sapiensµcytosolic µ-GUCAGLAUGLCMGAGU--GGDCPAAGGCRCCAGACU.AAKPPCUGGJ-CPCCG--GA-----UGGAG--?GUGGGTPCG"AUCCCACUUCUGACACCA .µµKµµµµtt.µµLeuµ.AAµPhaseolus vulgarisµcytosolic µ-GUCAGGAUGLCMGAGD--GGDCXAAGGCRCCAGACU.AAKPPCUGGJ-CUUC---GAGA----GAGGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACUUCUGACACCA .µµKµµµµtt.µµLeuµ.AAµPhaseolus vulgarisµcytosolic µ-GUCAGGAUGLCMGAGD--GGDCXAAGGCRCCAGACU.AAKPPCUGGJ-CUUC---GAAA----GAGGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACUUCUGACACCA .µµKµµµµtt.µµLeuµ.AAµPhaseolus vulgarisµcytosolic µ-GCUGGUUUGGCMGAGA--GGDD-AAGGCRGAAGACU.AAKAPCUUCJ-GCAG---UCAA----CUGCG-?AUGGGTPCG"ACCCCAUAGCCAGCACCA .µµKµµµµtt.µµLeuµ.AAµSolanum tuberosumµcytosolic µ-GUCAGGAUGGCMGAGD--GGDCXAAGGCRCCAGACU.AAKUPCUGGJ-CUUC---GUAA----GAGGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACUUCUGACACCA .µµKµµµµct.µµLeuµ.AGµPhaseolus vulgarisµcytosolic µ-GAUAGUUUGLCMGAGD--GGDCXAAGGCRCCAGAPU.AGKCPCUGGJ-CCG----AAA------.GGG-?GUGGGUPCA"AUCCCACAGCUGUCACCA °µµKµµµµttgµCµLeuµ°AAµBos taurusµcytosolic µ-GUCAGLAUGLCMGAGU--GGDCPAAGGCLCCAGACU°AAKPPCUGGJ-CPCC---GUAU----GGAGG-?GUGGGTPCG"AUCCCACUUCUGACACCA <µµ;µµµµttgµCµLeuµ<AAµRattus norvegicusµcytosolic µAGUCAGLAUGLCMGAGU--GGDCPAAGGCRCCAGACU<AA;PPCUGGN-PCCG---AA------UGGAG-?GUGGGTPCG"AUCCCACUUCUGACACCA <µµ;µµµµttgµCµLeuµ<AAµRattus norvegicusµcytosolic µAGUCAGLAUGLCMGAGU--GGDCPAAGGCRCCAGACU<AA;PPCUGGN-PCCG---UA------UGGAG-?GUGGGTPCG"AUCCCACUUCUGACACCA BµµKµµµµttgµCµLeuµBAAµCandida cylindraceaµcytosolic µ-GGCCGUUUGLCMGAGD--#GDCDAAGGCRUCUGABUBAAKAPCAGAJ-CUC----GUAA-----GAGG-?GUGUGTPCG"ACCACACAGCGGUCACCA BµµKµµµµttgµCµLeuµBAAµPichia jadiniiµcytosolic µ-GGAUCUUUGLCMGAGC--#GDDUAAGGCRCUCGABUBAAKAPCGAGU-AUC----GUAA-----GAUG-?AUGAGTPCG"AUCUCAUAGGAUCCACCA ?µµKµµµµttgµCµLeuµCAAµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGUUGUUUGLCMGAGC--#GDCDAAGGCRCCUGAPU?AAKCPCAGGU-AUC----GUAA-----GAUG-?AAGAGTPCGAAUCUCUUAGCAACCACCA CµµKµµµµctgµCµLeuµCAGµBos taurusµcytosolic µ-GUCAGLAUGLCMGAGC--GGDDCAAGGCRCUGCGJUCAGK.CGCAGJ-CPCC---CU------GGAGG-?GUGGGTPCG"AUCCCACUUCUGACACCA CµµKµµµµctgµCµLeuµCAGµCandida albicansµcytosolic µ-GAUACGAUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCRAAGGAUGCAGKPPCCUU--UGGGC--AUU----GCCCG--?GCAGGTPCG"ACCCUGCUCGUGUCGCCA CµµKµµµµctgµCµLeuµCAGµLupinus luteusµcytosolic µ-GUCAGGAUGLCMGAG-D-GGDCXAAGGCRCCAGUJUCAGKPACUGGJCPCG----AAC------CGGG-?AUGGGTPCG"AUCCCAUUCUUGACACCA IµµKµµµµcttµAµLeuµIAGµBos taurusµcytosolic µ-GGUAGCGUGLCMGAGC--GGDCPAAGGCRCUGGAZUIAGKCPCCAGU-CPCP---UC------GGGGG-?GUGGGTPCG"AUCCCACCGCUGCCACCA IµµKµµµµcttµAµLeuµIAGµBos taurusµcytosolic µ-GGUAGCGUGLCMGAGC--GGDCPAAGGCRCUGGAZUIAGKCPCCAGU-CPCP---UC------GGGGG-?GUGGGTPCG"AUCCCACCGCUGCCACCA IµµGµµµµcttµAµLeuµIAGµCaenorhabditis elegansµcytosolic µ-GGAGAGAUGGCMGAGC--GGDCUAAGGCGCUGGUUUIAGGCACCAGU-CCCU---UC------GGGGG-CGUGGGTUCGAAUCCCACUCUCUUCACCA IµµKµµµµcttµAµLeuµIAGµCandida cylindraceaµcytosolic µ-GGUUCUCUGGCMGAGD--GGDCDAAGGCRCAUGGPUIAGKPCCAUGU-CUC----UUCG-----GAGG-?GCGAGTPCG"ACCUCGCGGGAAUCACCA IµµKµµµµcttµAµLeuµIAGµCandida cylindraceaµcytosolic µ-GGCUCUCUGGCMGAGD--GGDCDAAGGCRCUAGGPUIAGKPCCUAGU-CUC----UUCG-----GAGG-?GCGAGTPCG"ACCUCGCGGGAGUCACCA IµµKµµµµcttµAµLeuµIAGµLupinus luteusµcytosolic µ-GUCAGGAUGLCMGAG-D-GGDCXAAGGCRCCAGAZUIAGKPUCUGGJCPCGA---A-------UCGGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACUCUUGACACCA IµµKµµµµcttµAµLeuµIAGµLupinus luteusµcytosolic µ-GUCAGGAUGLCMGAG-D-GGDCXAAGGCRCCAGAZUIAGKPUCUGGJCPGA----AUC------UUGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACUCUUGACACCA NµµKµµµµttaµUµLeuµNAAµCucumis sativusµcytosolic µ-GUCAGGAUGLC?GAG-D-GGDCXAAGGCRCCAGACUNAAKPPCUGGJ-CCUC---UAAG----GAGGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACUUCUGACACCA UµµKµµµµttaµUµLeuµUAAµLupinus luteusµcytosolic µ-GUCAGGAUGLCMGAG-D-GGDCXAAGGCRCCAGACUUAAKPPCUGGJCPCGA---A-------UCGGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACUUCUGACACCA ∼µµKµµµµttaµUµLeuµUAAµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGAGGGUUGLCMGAGD--#GDCDAAGGCRGCAGABU∼AAKAPCUG-UUGGAC---GGUU----GUCC-G?GCGAGTPCG"ACCUCGCAUCCUUCACCA UµµKµµµµctaµUµLeuµUAGµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic 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BµµAµµµµtggµCµTrpµCCAµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GAAGCGGUKLCUCAAD--#GD--AGAGCPPPCGABUBCAAAPCGAAGG-------------------7DUGCAGGTPCA"UUCCUGPCCGUUUCACCA 9µµKµµµµtacµGµTyrµ9PAµBos taurusµcytosolic µ-CCUUCLAUALCUCAGDD-GGXU-AGAGCRRAGGACU9PAKAZCCUUAG-------------------7D?GCUGGTPCG"UUCCGGCUCGAAGGACCA 9µµKµµµµtacµGµTyrµ9PAµHomo sapiensµcytosolic µ-CCUUCLAUALCUCAGDD-GGX--AGAGCRRAGGACU9PAKA]CCUUAG-------------------7D?GCUGGTPCG"UUCCGGCUCGAAGGACCA 9µµKµµµµtacµGµTyrµ9PAµHomo sapiensµcytosolic µ-CCUUCLAUALCUCAGCD-GGX--AGAGCRRAGGACU9PAKA]CCUUAG-------------------7D?GCUGGTPCG"UUCCGGCUCGAAGGACCA GµµKµµµµtacµGµTyrµGPAµLupinus albusµcytosolic µ-CCGACCUUALCUCAGDD-#GU--AGAGCRGAGGACUGPAKAPCCUUAG-------------------7XCACUGGUPCG"AUCCGGUAGGUCGGACCA GµµKµµµµtacµGµTyrµGPAµLupinus luteusµcytosolic µ-CCGACCUUALCUCAGDD-#GU--AGAGCRGAGGACUGPAKAPCCUUAG-------------------7XCACUGGUPCG"AUCCGGUAGGUCGGACCA GµµKµµµµtacµGµTyrµGPAµNicotiana rusticaµcytosolic 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µ-CUCUCGGUALCCAAGDD-#GDDDAAGGCRCAAGACUGPA+APCUUGAG-------------------AD?GGGCGTPCG"CUCGCCCCCGGGAGACCA QµµKµµµµtacµGµTyrµQPAµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-CCUUCGAUALCUCAGDD-GGX--AGAGCRGPGGACUQPAKAJCCAUAG-------------------7DCGCUGGTPCA"AUCCGGCUCGAAGGACCA QµµKµµµµtacµGµTyrµQPAµTriticum aestivumµcytosolic µ-CCGACCUUALCUCAGDD-#GU--AGAGCRGAGGACUQPAKAPCCUUAG-------------------7UCACUGGUPCG"AUCCGGUAGGUCGGACCA .µµAµµµµgt.µµValµ.ACµHomo sapiensµcytosolic µ-GUUUCCGUAGUGPAGD--GGDD-AUCACLPUCGCCU.ACACGCGAAAG-------------------7D??CCGGUPCG"AACCGGGCGGAAACACCA .µµAµµµµgt.µµValµ.ACµRattus norvegicusµcytosolic µ-GUUUCCGUAGUGPAGD--#GDD-AUCACLPUCGCCU.ACA?GCGAAAG-------------------7D??CCGGUPCG"AACCGGGCGGAAACACCA IµµAµµµµgttµAµValµAACµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGUUUCGUKGUCPAGDC-GGDD-AUGGCAPCUGCPUIACACGCAGAAC-------------------7DC?CCAGTPCG"UCCUGGGCGAAAUCACCA CµµAµµµµgtg µCµValµCACµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-GUUUCCGUAGUGPAGC--GGDX-AUCACGPGUGCUUCACACGCACAAG-------------------7DCCCCGGTPCG"ACCCGGGCGGGAACACCA CµµAµµµµgtg µCµValµCACµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GUUCCAAUALUGPAGC--GGCD-AUCACLPPGCCPUCACACGGCAAAG-------------------7DC?CGAGTPCG"UCCUCGGUUGGAACACCA IµµAµµµµgttµAµValµIACµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-GUUJCCGUKGUGPAGC--GGDX-AUCACAPCUGCBUIACA?GCAGAAG-------------------7CC<CCGGTPCG"UCCCGGGCGGAAACACCA IµµAµµµµgttµAµValµIACµLupinus luteusµcytosolic µ-GGUUUCGUKGUGPAGD--GGDD-AUCACRPCAGUCUIACACACUGAAG-------------------7DCUCCGGTPCG"GUCCGGGCGAAGCCACCA IµµAµµµµgttµAµValµIACµMus musculusµcytosolic µ-GUUUCCGUAGUGPAGD--GGDD-AUCACLPUCGCBUIACA?GCGAAAG-------------------7D??CCGGUPCG"AACCGGGCGGAAACACCA IµµAµµµµgttµAµValµIACµOryctolagus cuniculusµcytosolic µ-GUUUCCGUAGUGPAGD--GGDD-AUCACLPUCGCBUIACA?GCGAAAG-------------------7D??CCGGUPCG"AACCGGGCGGAAACACCA IµµAµµµµgttµAµValµIACµPichia jadiniiµcytosolic µ-GGUUUCGUKGUCPAGDD-GGDC-AUGGCAPCUGCPUIACACGCAGAAC-------------------7DC?CCAGTPCG"UCCUGGGCGAAAUCACCA IµµAµµµµgttµAµValµIACµRattus norvegicusµcytosolic µAGUUUCCGUAGUGPAGD--GGDD-AUCACLPUCGCBUIACA?GCGAAAG-------------------7D??CCGGUPCG"AACCGGGCGGAAACACCA NµµAµµµµgtaµUµValµNACµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-GGUJCCAUAGUGPAGC--GGDN-AUCAC;PCUGCPUNACACGCAGAAG-------------------7D?UCCGGTPCG"UCCCGGAUGGAACCACCA &µµAµµµµgtaµEucaryµValµUACµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGUCCAAUGLUCCAGD--GGDDCAAGACRPCGCCPU&ACACGGCGAAG-------------------ADC?CGAGTPCG"ACCUCGGUUGGAUCACCA Gµµ6µµµµµmitoµAspµGUCµAedes albopictusµmitochondrial µ-AAAAAAUU"GUUUAAU--CA---AAAACCPPAGUAUGUC6AACUAAAA-------------------A-AAUUAGAUCAU--CUAAUAPPUUUUACCA Nµµ6µµµµµmitoµGluµNUCµAedes albopictusµmitochondrial µ-AUUUAUAU"GUUUAA---AU---AAAACAPPACAUUNUC6CUGUAAAA-------------------A-UAAAA-AUUUAU--UUUUPAUAAAUACCA UµµAµµµµµmitoµGlyµUCCµAedes albopictusµmitochondrial µ-AUUUAUAU"GUAUAUA--AU---UGUAUAPGN;ACUUCCAA]CACAAG-------------------G-ACUAA-AUAAUU--UUAGUAPAAAUACCA Gµµ6µµµµµmitoµIleµGAUµAedes albopictusµmitochondrial µ-AAUGAAUUKCCUGAU---AA---AAAGGAPPACCUUGAU6GGGUAAAU-------------------UAUAAAGAUUUAAU-ACUUPAPUCAUUACCA Cµµ6µµµµµmitoµLysµCUUµAedes albopictusµmitochondrial µ-CAUUAGAUKACUGAA---AG---CAAGUAAPGAUCUCUU6AAUCAUAA-------------------UAUAGUAAAUUAGC_UUACPPCUAAUGACCA NµµAµµµµµmitoµGlnµNUGµAedes albopictusµmitochondrial µ-UAUAUUUU"GUGUAU---GA---UGCACAAAAGPUUNUGAAACUUUUA-------------------G-AAAUAGUUUAAUUCUAUUAAAUAUAACCA Gµµ6µµµµµmitoµSerµGCUµAedes albopictusµmitochondrial µ-GAAAUAU--GUU-----GA--UC--AAG-AAAAGCUGCU6ABUPUUUCUU------------------UAAUGGUUUAAUUCCAUPAUAUUUCU-CCA Uµµ6µµµµµmitoµValµUACµAedes albopictusµmitochondrial µ-CAAUUUAA"LCUUAAUU-AGU--AAAGUAPPUCAUUUAC6PPGAAAAG-------------------A-AAUUUGUGCAAAUCAAUPPAAAUUGACCA Cµµ6µµµµµmitoµIniµCAUµAedes albopictusµmitochondrial 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µ-ACAACAGU"AACUAUGAA-AA--AGUUUGUGGGGUUCAUKGUCCUGAU----------------AAUGUGAUAUUAAAAUAUAUUGCCUGUUGAACCA Gµµ6µµµµµmitoµIleµGAUµHomo sapiensµmitochondrial µ-AGAAAUAUKUCUGAUA-------AAAGARPPACUUUGAU6GAGUAAAU-------------------AAUAGGAGCUUAAACCCCCUUAUUUCUACCA ʵµAµµµµµmitoµLeuµÊAAµHomo sapiensµmitochondrial µ-GUUAAGAUKLCAGAGCCCGGDA-AUCGCAPAAAACUÊAAAACUUUACA-------------------GU?AGAGGTPCA"UUCCUCUUCUUAACACCA Gµµ6µµµµµmitoµSerµGCUµHomo sapiensµmitochondrial µ-GAGAAAG-C----------------UCACAAGAACUGCU6ACUCAUGCCC--------------------CCAUGUCUA"C_CAUGGCUUUCUCACCA ∃µµ6µµµµµmitoµLysµ∃UUµHomo sapiensµmitochondrial µ-CACUGUAA"LCUAAC--------UUAGCAPPAACCU∃UU6AGUUAAAG-------------------AUUAAGAGAACCAA_CUCUUUACAGUGACCA UµµKµµµµµmitoµProµUGGµHomo sapiensµmitochondrial µ-CAGAGAAU"GUUUAAA--UU---AGAAUCPPAGCPUUGGKPGCUAAUG-------------------G-UGGAG-TPAAAGA-CUUUUUCUCUGACCA QµµAµµµµµmitoµAspµQUCµHomo sapiensµmitochondrial µ-AAGGUAUU"LAAAAA---CC---AUUUCAPAACUUUQUCAAAGUUAAA-------------------U-UAUAGGCUAAAU-CCUAUAUAUCUUACCA 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µ-GUUUAGGUAGCUCAUCD-GGCD.AGAGCAAAGGACUGAAHAUCCUUGU-------------------7XCAGUGGTPCGAAUCCACUUCUAAGCACCA Gµµ.µµµµµmitoµPheµGAAµPhaseolus vulgarisµmitochondrial µ-GUUUAGGUAGCUCAGCD-#GD--AGAGCAAAGGACUGAA.APCCUUGU-------------------7XCAGUGGTPCGAAUCCACUUCUAAGCGCCA .µµKµµµµµmitoµLeuµ.AAµPhaseolus vulgarisµmitochondrial µ-GUCAGGAUGLCMGAGD--#GDCXAAGGCRCCAGACU.AAKPPCUGGJ-CUUC---GAGA----GAGGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACUUCUGACACCA .µµKµµµµµmitoµLeuµ.AAµPhaseolus vulgarisµmitochondrial µ-GUCAGGAUGLCMGAGD--#GDCXAAGGCRCCAGACU.AAKPPCUGGJ-CUUC---GAAA----GAGGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACUUCUGACACCA .µµKµµµµµmitoµLeuµ.AGµPhaseolus vulgarisµmitochondrial µ-GAUAGUUUGLCMGAGD--#GDCXAAGGCRCCAGAPU.AGKCPCUGGJ-CCG----AAA------.GGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACAGCUGUCACCA .µµKµµµµµmitoµLeuµ.AAµPhaseolus vulgarisµmitochondrial µ-GCUGGUUUGGCMGAGA--#GDD-AAGGCRGAAGACU.AAKAPCUUCJ-GCAG---UCAA----CUGCG-?AUGGGTPCG"ACCCCAUAGCCAGCACCA Cµµ=µµµµµmitoµMetµCAUµPhaseolus vulgarisµmitochondrial µ-ACCUACUUGACUCAGC--#GDD-AGAGUAPCGCPUUCAU=CGGCGAGA-------------------7XCAUUGGTPCAAAUCCAAUAGUAGGUACCA UµµKµµµµµmitoµProµUGGµPhaseolus vulgarisµmitochondrial µ-CGAGGUGUAGCGCAGUCD#GDC-AGCGCAUCUGUUUUGGKPACAGAGG-------------------7CCAUAGGTPCGAAUCCUGUCACCUUGACCA BµµHµµµµµmitoµTrpµBCAµPhaseolus vulgarisµmitochondrial µ-GCGCUCUUAGUUCAGUUC#GD--AGAACRCGGGPCUBCAHAACCCGAU-------------------7.CGUAGGTPCAAAUCCUACAGAGCGUGCCA CµµAµµµµµmitoµIniµCAUµPhaseolus vulgarisµmitochondrial µ-AGCGGGGUAGAGUAGUD-#GUD-AACUCAPCAGGCUCAUAAPCUGAAG-------------------AUDGCAGGTPCGAAUCCUGCCCCCGCCACCA .µµHµµµµµmitoµTyrµ.UAµPhaseolus vulgarisµmitochondrial µ-GGGAGAGUGGCCGAGD--#GDCAAAAGCLACAGACU.UAHAPCUGUU-GAAG---UU------UUUCUACGUAGGTPCGAAUCCUGCCUCUCCCACCA QµµAµµµµµmitoµAspµQUCµRattus norvegicusµmitochondrial µ-GAGAUAUU"GUAAAA---UA---AUUACAPAACCUUQUCAAGGUUAAG-------------------U-UAUAGACUUAAA-UCUAUAUAUCUUACCA GµµAµµµµµmitoµAspµGUCµRattus norvegicusµmitochondrial 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µ-GAGAAUAUUGUUUAAD--GGD--AAAACAGPUGPCU$UU6AGCAACCC-------------------A-UGC_GGTPCAACUCCAGCUAUUCUCACCA Cµµ6µµµµµmitoµMetµCAUµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-GCUUGUAUAGUUUAADD-GGDU-AAAACAUUUGPCUCAU6AAUAAAUA-------------------AUGUAAGGTPCAAUUCCUUCUACAAGUACCA GµµAµµµµµmitoµSerµGCUµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-GGAAAAUUAACUADA---GGD--AAAGU_AUUAPPUGCUAAGUAAUU-GAAUU--GUA----AAUUCU-UAUGAGTPCGAAUCUCAUAUUUUCCGCCA Gµµ+µµµµµmitoµTyrµGUAµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-GGAGGGAUUUUCAAUGUDGGDAGUUGGALPUGAGCUGUA+ACUCAAU-GACU---UA------GGUCUUCAUAGGTPCAAUUCCUAUUCCCUUCACCA CµµKµµµµµmitoµIniµCAUµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-UGCAAUAUGAUGUAADU-GGDU-AACAUUUUAGGGUCAUKACCUAAUU-------------------A-UAUACGTPCAAAUCGUAUUAUUGCPACCA GµµKµµµµµmitoµPheµGAAµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-GCUUUUAUAGCUUAGD--GGD--AAAGCRAUAAAPUGAAKAPUUAUUU-------------------A-CAU_AGUPCGAUUCUCAUUAAGGGCACCA Nµµ+µµµµµmitoµGlyµNCCµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial 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µ-GCUGCUU--GAA--U---GGD----UUC_GUGGGCUCAUPPCCCAUUA-------------------CUAUAAAGTPCGAUUCUUUAAAGCGGCCCCA GµµHµµµµµmitoµPheµGAAµTetrahymena pyriformisµmitochondrial µUGCUUAAGUALCUCAGU--GGD--AGAGCRUCAGGCUGAAHACCPGAAG-------------------GUCAUUGGUCCGAUUCCAUUCUUAGGCACCA QµµHµµµµµmitoµTyrµQUAµTetrahymena pyriformisµmitochondrial µ-GAGAUGGUGLCUGAGU--GGDD-AAAGCRGPAGACUQUAHAPCPAUJ-GGG----UA-------UCCGUCGUCGGTPCGAGUCCGAUCCAUCUCACCA !µµ+µµµµµmitoµTrpµ!CAµTetrahymena thermophilaµmitochondrial µ-GGGGGAAUALUUUAAU--GGD--AGAACAACGGUCU!CA+AAPCGUUA-------------------G-CGUGGGUUCGAUUCCUGCUUCUCUCGCCA NµµAµµµµµmitoµGluµNUCµChlamydomonas reinhardtiiµplastidic µ-GCCCCCAUCGUCUAGA--#GCCDAGGACACCUCCCUNUCACGGAGAAA-------------------A-?GCGGATPCGAAUUCCGCUGGGGGUACCA UµµKµµµµµmitoµLeuµUA7µChlamydomonas reinhardtiiµplastidic µ-GCCUUCGUGAUC-GGAAU#GDAGA-GAUCCUGGUCUUA7KAACCAGCUG------CUGAA------AGGCGGCGGTPCAAAUCCGCCCGAAGGCACCA UµµAµµµµµmitoµGlyµUCCµCodium fragileµplastidic 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UµµKµµµµµmitoµLeuµUA7µGlycine maxµplastidic µ-GCCGCUAUGGUGAAAUU-#GDA-GACACGCUGCUCUUA7KAAGCAGU-GCU----AG-------AGCA-UCUCGGTPCGAGUCCGAGUAGCGGCACCA GµµHµµµµµmitoµAspµGUCµHordeum vulgareµplastidic µ-GGGAUUGUAGUUCAAUU-#GDC-AGAGCACCGCCCUGUCHAGGCGGAA-------------------G<UGCGGGTPCGAGCCCCGUCAGUCCCGCCA QµµHµµµµµmitoµAspµQUCµHordeum vulgareµplastidic µ-GGGAUUGUAGUUCAAUU-#GDC-AGAGCACCGCCCUQUCHAGGCGGAA-------------------G<UGCGGGTPCGAGCCCCGUCAGUCCCGCCA SµµAµµµµµmitoµGluµSPCµHordeum vulgareµplastidic µ-GCCCCUAUCGUMUAGU--GGDDCAGGACAUCUCPCUSPCAAGGAGGCA-------------------G-?GGGGATPCGACUUCCCCPGGGGGUACCA !µµHµµµµµmitoµGlnµ!UGµHordeum vulgareµplastidic µ-UGGGGCGUGGCCAAGU--#GD--AAGGCAGCGGGUU!UGHUCCCGUUA-------------------UDCGGAGGTPCGAAUCCUUCCGUCCCAGCCA NµµKµµµµµmitoµGlnµNUGµNicotiana rusticaµplastidic µ-UGGGGCGUGGCPAAGU--#GD--AAGGCAACGGGUUNUGKUCCCGCUA-------------------UUCGGAGGTPCGAAUCCUUCCGUCCCAGCCA Gµµ+µµµµµmitoµCysµGCAµNicotiana rusticaµplastidic 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µ-GGGCUAUUAGCUCAGU--#GD--AGAGCRCGCCCCUGAU6AGGGCGAG-------------------7XCUCUGGTPCAAGUCCAGGAUGGCCCACCA <µµ6µµµµµmitoµIleµµSpinacia oleraceaµplastidic µ-GCAUCCAUGGCUGAAU--#GDD-AAAGCRCCCAACU<AU6APPG_GAA-------------------UUCGUAGGTPCAAUUCCUACUGGAUGCACCA UµµKµµµµµmitoµLeuµUA7µSpinacia oleraceaµplastidic µ-GCCGCUAUGGUGAAAUU-#GDA-GACACGCUGCUCUUA7KAAGCAGU-GC-----GAGA------GCA-UCUCGGTPCGAGUCCGAGUAGCGGCACCA CµµAµµµµµmitoµMetµCAUµSpinacia oleraceaµplastidic µ-ACCUACUUAACUCAGC--#GDD-AGAGPAPPGCPUUCAUACGGCGGGA-------------------7XCAUUGGTPCAAAUCCAAUAGUAGGUACCA NµµHµµµµµmitoµProµNGGµSpinacia oleraceaµplastidic µ-AGGGAUGUA;CGCAGCUU#GD--AGCGCPPUUGUPUNGGHPACAAAAU-------------------7UCACGGGTPCAAAUCCUGUCAUCCCUACCA GµµEµµµµµmitoµThrµGGUµSpinacia oleraceaµplastidic µ-GCCCCUUUAACUCAGU--#GD--AGAGUAACGCCAUGGUEAGGCGUAA-------------------7DCAUCGGTPCAAAUCCGAUAAGGGGCUCCA NµµAµµµµµmitoµValµNACµSpinacia oleraceaµplastidic µ-AGGGCUAUAGCUCAGUUA#GD--AGAGCACCUCGUUNACACCGAGAAA-------------------7.CUACGGTPCGAGUCCGUAUAGCCCUACCA CµµHµµµµµmitoµTrpµCCAµSpinacia oleraceaµplastidic µ-GCGCUCUUAGUUCAGUUC#GD--AGAACLPGGGPCUCCAHAACCCGAU-------------------G.CGUAGGTPCAAGUCCUACAGAGCGUGCCA CµµAµµµµµmitoµIniµCAUµSpinacia oleraceaµplastidic µ-CGCGGGGUAGAGCAGUUU#GD--AGCUCGCAAGGCUCAUAACCUUGAG-------------------7UCACGGGTPCAAAUCCUGUCUCCGCAACCA SµµAµµµµµmitoµGluµSPCµTriticum aestivumµplastidic µ-GCCCCUAUCGUMUAGU--GGDDCAGGACAUCUCPCUSPCAAGGAGGCA-------------------G-?GGGGATPCGACUUCCCCPGGGGGUACCA Gµµ6µµµµµmitoµIleµGAUµZea maysµplastidic µ-GGGCUAUUAGCUCAGU--#GD--AGAGCRCGCCCCUGAU6AGGGCGAG-------------------7XCUCUGGTPCAAGUCCAGGAUGGCCCACCA CµµAµµµµgcgµBacterµAlaµCGCµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGGCCUGUGGCGCAGUCUGGD-DAGCGCACCUCGUUCGCAUCGAGGGG-------------------GUCUGGGGUUCA"AUCCCCACAGGUCCA--- GµµAµµµµgccµGµAlaµGGCµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGGGCUAUAGCUCAGCD-GGG--AGAGCGCUUGCAUGGCAUGCAAGAG-------------------7UCAGCGGTPCGAUCCCGCUUAGCUCCACCA GµµAµµµµgccµGµAlaµGGCµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GGGGCCAUAGCUCAGCD-GGG--AGAGCGCUACGCUGGCAGCGUAGAG-------------------7UCAGGGGTPCGAGCCCCCUUGGCUCCACCA GµµAµµµµgccµGµAlaµGGCµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGGGCUAUAGCUBAGUDDGGD-DAGAGCGCCUGCAUGGCAUGCAGGAG-------------------7UCAGGAGUUCA"UUCUCCUUAGCUCCACAA GµµAµµµµgccµGµAlaµGGCµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGGGCUAUAGCUBAGUDDGGD-DAGAGCGCCUGCAUGGCAUGCAGGAG-------------------7UCAGGAGUUCA"UUCUCCUUAGCUCCA--- 5µµ=µµµµgcaµUµAlaµUGCµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GGAGCCUUAGCUCAGCD-GGG--AGAGCGCCUGCUU5GC=CGCAGGAG-------------------7UCAGCGGTPCGAUCCCGCUAGGCUCCACCA 5µµ6µµµµgcaµUµAlaµUGCµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGGGCCU4AGCUCAGCU-GGG--AGAGCGCCUGCUU5GC6CGCAGGAG-------------------7UCAGCGGUUCGAUCCCGCUAGGCUCCA--- Uµµ=µµµµgcaµUµAlaµUGCµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGGCCCU4AGCUCAGCD-GGG--AGAGCACCUGCCUUGC=CGCAGGGG-------------------7UCGACGGUPCGAUCCCGUUAGGGUCCACCA Uµµ=µµµµgcaµUµAlaµUGCµMycoplasma mycoidesµprokaryotic cytosol µ-GGGCCCUUAGCUCAGCD-GGG--AGAGCACCUGCCUUGC=CGCAGGGG-------------------7UCGACGGUUCGAUCCCGUUAGGGUCCACCA CµµGµµµµgcaµUµAlaµUGCµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGGGCCUUAGCUBAGUDGGDA-GAGCGCUGCCUUUGCAAGGCAGAU---------------------GUCAGGAGUUCGAAUCUCCUAGGCUCCA--- VµµAµµµµgcaµUµAlaµVGCµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGGGCUAUAGCUCAGCD-GGG--AGAGCGCCUGCUUVGCACGCAGGAG-------------------7UCUGCGGTPCGAUCCCGCAUAGCUCCACCA !µµ6µµµµagaµUµArgµ!CUµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GCCCAUGUAGCUCAGUA-GGAD-AGAGCACGCGCCU!CU6AGCGUGAG-------------------7UCGGAAGUPCGAGCCUUCUCGUGGGCACCA IµµAµµµµcgtµAµArgµACGµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GCAGGCGUGGCUCAACDDGGADDAGAGUACCUGACUICGAAUCAGGCG-------------------GUUGUAGGUUCGAAUCCUACCGCUUGCA--- IµµKµµµµcgtµAµArgµACGµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol 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µ-GCAUCCG4AGCUCAGCD-GGAD-AGAGUACUCGG%UICG/ACCGAGCG-------------------7XCGGAGGTPCGAAUCCUCCCGGAUGCACCA IµµKµµµµcgtµAµArgµICGµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GCGCCCGUAGCUCAAU--GGAD-AGAGCGUUUGACUICGKAUCAAAAG-------------------7UUAGGGGTPCGACUCCCCUCGGGCGCGCCA IµµKµµµµcgtµAµArgµICGµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GCGCCCG4AGAUCAAUD-GGAD-AGAUCGCUUGACUICGKAPCAAAAG-------------------7UUGGGGGUPCGAGUCCCUCCGGGCGCACCA {µµ6µµµµagaµUµArgµUCUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCGCCCUUAGCUCAGUU-GGAU-AGAGCAACGAC%U{CU6AGPCGUGG-------------------GCCGCAGGTPCGAAUCCUGCAGGGCGCGCCA Uµµ6µµµµagaµUµArgµUCUµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GUCCCAGUAGCUCAGCD-GGAD-AGAGCAACGGCCUUCU6AGCCGUCG-------------------7UCGGGAGTPCGAAUCUCUCCUGGGACGCCA UµµAµµµµagaµUµArgµUCUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGUCCGAUAGCUCAGCU-GGADDAGAGCAUUCGCCUUCUAAGCGAACG-------------------7UCGAGGGUUCGAAUCCCCCUCGGAUCA--- UµµAµµµµagaµUµArgµUCUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCCCCCGUAGCUBAGU--GGADDAGAGCAGGCGCCUUCUAAGCGCUUG-------------------GcCGCAGGUUCGAGUCCUGCCGGGGGCG--- Qµµ6µµµµaacµGµAsnµGUUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-UCCUCUG4AGUUCAGDC-GGD--AGAACGGCGGACUQUU6APCCGUAU-------------------7UCACUGGTPCGAGUCCAGUCAGAGGAGCCA Gµµ6µµµµaacµGµAsnµGUUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-UGCGGAU4AGCUCAGUU-GGUA-GUAGCGCAUGACUGUU6AUCAUGAU-------------------7UCGUCAGUUCGAGUCUGACAUCCGCAG--- Gµµ6µµµµaacµGµAsnµGUUµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGCUUUU4AGCUCAGCA-GGD--AGAGCAACCGGCUGUU6ACCGGUUU-------------------7UCACAGGUPCGAGCCCUGUAAAAGCCGCCA Gµµ6µµµµaacµGµAsnµGUUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-UCCCCUGUAGCUBAAU--DGGC-AGAGCAGCCGGCUGUU6ACCGGCAG-------------------7UUACUGGUUCGAGUCCAGUCGGGGGAG--- Gµµ6µµµµaacµGµAsnµGUUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-UCCCCUGUAGCUBAAU--DGGC-AGAGCAUUCGGCUGUU6ACCGGAGG-------------------7UUACUGGUUCGAGUCCAGUCGGGGGAG--- Qµµ6µµµµaacµGµAsnµQUUµAzospirillum lipoferumµprokaryotic cytosol µ-UUCACAGUAGCUCAGU--GGD--AGAGCUAUCGGCUQUU6ACCGAUCG-------------------AUCGUAGGTPCGAGUCCUACCUGUGAAUCCA Qµµ6µµµµaacµGµAsnµQUUµAzospirillum lipoferumµprokaryotic cytosol µ-UUCACAGUCGCUCAGU--GGD--AGAGCUAUCGGCUQUU6ACCGAUCG-------------------AUCGUAGGTPCGAGUCCUACCUGUGAAUCCA ⊄µµ/µµµµgacµGµAspµ⊄UCµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGAGCGG4AGUUCAGDC-GGDD-AGAAUACCUGCCU⊄UC/CGCAGGGG-------------------7UCGCGGGTPCGAGUCCCGPCCGUUCCGCCA GµµAµµµµgacµGµAspµGUCµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGUUCUGUAGUGUAGC--GGDDDAUCACGUCGCCCUGUCACGGCGAAG-------------------AUCGCGGGUUCGAUUCCCGUCAGAACCG--- GµµAµµµµgacµGµAspµGUCµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGCCCCA4AGCGAAGUD-GGDD-AUCGCGCCUCCCUGUCACGGAGGAG-------------------AUCACGGGUPCGAGUCCCGUUGGGGUCGCCA GµµAµµµµgacµGµAspµGUCµThermus thermophilusµprokaryotic cytosol µ-GGCCCCG4GGUGPAGUU-#GDD-AACACACCCGCCUGUCACGPGGGAG-------------------AUCGCGGGFPCG"GUCCCGUCGGGGCCGCCA Gµµ*µµµµtgcµGµCysµGCAµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGCGCGU4AACAAAGC--GGD--DAUGUAGCGGAPUGCA*APCCGUCU-------------------A-GUCCGGTPCGACUCCGGAACGCGCCUCCA Gµµ=µµµµtgcµGµCysµGCAµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGCAACA4GGCCAAGC--GGCD-A"GGCAUGGGUCUGCA=CACCCUGA-------------------U-CAUCGGUPCGAAUCCGAUUGUUGCCUCCA GµµAµµµµtgcµGµCysµGCAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GACCGUGUGCCCGAGA--GGCU-BAGGGGCUCGABUGCAACUCGAGUU-----------------ACACCGGUUCG""UCCGGUCACGGUCUCCG--- Gµµ*µµµµtgcµGµCysµGCAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGUGGAGUGGCCKAGA--GGC--GAGGCAACGGCCUGCA*AGCCGUCU-------------------A-CACGGGUUCAAAUCCCGUCUCCACCUCCA Gµµ≠µµµµtgcµGµCysµGCAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGUGGAGUGGCCKAGA--GGC--GAGGCAACGGCCUGCA≠AGCCGUCU-------------------A-CACGGGUUCAAAUCCCGUCUCCACCUCCA $µµ=µµµµcaaµUµGlnµ$UGµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-UGGGCUA4AGCCAAGC--GGD--A"GGCAAGGGACU$UG=CUCCCUCA-------------------UGCGCCGGUPCGAAUCCUGCUAGCCCAACCA Cµµ/µµµµcagµCµGlnµCUGµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-UGGGGUA4CGCCAAGC--#GD--AAGGCACCGGAJUCUG/PPCCGGCA-------------------UUCCGAGGTPCGAAUCCUCGUACCCCAGCCA CµµGµµµµcagµCµGlnµCUGµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-UGGGCUAUGBUGUAAUDDGGC--AACACUACGGUUUCUGGUACCGUCA-------------------U-UCUAGGUUCGAGUCCUGGUAGCCCAG--- $µµ/µµµµcaaµUµGlnµUUGµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-UGGGGUA4CGCCAAGC--#GD--AAGGCACCGGUJU$UG/PACCGGCA-------------------UUCCCUGGTPCGAAUCCAGGUACCCCAGCCA UµµAµµµµcaaµUµGlnµUUGµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-UGGGGUA4AGCCAAGCG-GDA--AGGCAAGGGACUSUUGACUCCCUCA-------------------UGCGUUGGUUCGAAUCCAGCUACCCCAG--- UµµGµµµµcaaµUµGlnµUUGµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-UCCCCCAUGKUGUAAUCAGGC--AGCACUGCGGUUUUUGGUACCGUCU-------------------G-UUCAGGUUCA"AUCCUGAUGGGGGAG--- Sµµ/µµµµgaaµUµGluµ{UCµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GUCCCCU4CGUCPAGA--GGCCCAGGACACCGCCCUSUC/CGGCGGUA-------------------A-CAGGGGTPCGAAUCCCCUAGGGGACGCCA $µµAµµµµgaaµUµGluµ$UCµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGCCUGUUGGUGAAGC--GGDD-A"CACACACGGUU$UCAUCCGUGGA-------------------CACACGGGUPCGAACCCCGUACAGGCUACCA CµµAµµµµgagµCµGluµCUCµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCCCCCGUUGUGJAGC--GGCCUAGCACGCUGCCCUCUCACGGCAGUA-------------------G-CGCCGGUUCG""UCCGGUCGGGGGUACAA CµµAµµµµgagµCµGluµCUCµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCCCCCGUUGUGJAGC--GGCCUAGCACGCUGCCCUCUCACGGCAGUA-------------------G-CGCCGGUUCG""UCCGGUCGGGGGUA--- NµµAµµµµgaaµUµGluµNUCµSynechocystis sp.µprokaryotic cytosol µ-GCCCCCAUCGUCUAGA--GGCCDAGGACACCUCCCUNUCACGGAGGCG-------------------A-CAGGGATPCGAAUUCCCUUGGGGGUACCA Sµµ/µµµµgaaµUµGluµSUCµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GUCCCCUUCGUCPAGA--GGCCCAGGACACCGCCCUSUC/CGGCGGUA-------------------A-CAGGGGTPCGAAUCCCCUAGGGGACGCCA UµµAµµµµgaaµUµGluµUUCµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGUCCGUUGGUC"AGG--GGUU-AAGACACCGCCUUUUCACGGCGGUA-------------------A-CACGGGUUCGAAUCCCGUACGGACUA--- !µµAµµµµggaµUµGlyµ!CCµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol 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µ-GCGGGCG4AGUUCAAU--GGD--AGAACGAGAGCUUCCCAAGCUCUAU-------------------A-CGAGGGTPCGAUUCCCUUCGCCCGCUCCA CµµAµµµµgggµCµGlyµCCCµSalmonella typhimuriumµprokaryotic cytosol µ-GCGGGCGUAGUUCAAU--#GD--AGAACGAGAGCUUCCCAAGCUCUAU-------------------A-CGAGGGTPCGAUUCCCUUCGCCCGCUCCA CµµAµµµµgggµCµGlyµCCCµStreptomyces coelicolor A3(2)µprokaryotic cytosol µ-GCGGGUGUAGUUCAAU--GGD--AGAACAUCAGCUUCCCAAGCUGAGA-------------------G-CGCGAGTPCGAUUCUCGUCACCCGCUCCA CµµAµµµµgggµCµGlyµCCCµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCGGKUGUAGUUUAAU--GGD-DAGAACAUGAGCUUCCCAAGCUCAGA-------------------G-CGCGAGUUCGAUUCUCGUCACCCGCU--- GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCGGGAA4AGCUCAGDDDGGD-DAGAGCACGACCUUGCCAAGGUCGGG-------------------7UCGCGAGTPCGAGUCUCGUUUCCCGCUCCA GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GCGGAAGUAGUUCAGU--GGD--AGAACACCACCUUGCCAAGGUGGGG-------------------7UCGCGGGTPCGAAUCCCGUCUUCCGCUCCA GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GCGAACGUAGUUCAGG--GGU--AGAACACAACCUUGCCAUGGUUGGG-------------------7UCGCGAGUUCGAAUCUCGUCGUUCGCU--- GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCGKACGUAGCUBAGUDDGGD-DAGAGCGCAACCUUGCCAAGGUUGAG-------------------GUCGCCAGUUCGAACCUGGUCGUCCGCUCCA GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCGKACGUAGCUBAGUDDGGD-DAGAGCGCAACCUUGCCAAGGUUGAG-------------------GUCGCCAGUUCGAACCUGGUCGUCCGCU--- NµµAµµµµggaµUµGlyµNCCµSalmonella typhimuriumµprokaryotic cytosol µ-GCGGGCAUCGUAUAAU--GGCU-AUUACCUCAGCCUNCCAAGCUGAUG-------------------A-UGCGGGTPCGAUUCCCGCUGCCCGCUCCA Uµµ=µµµµggaµUµGlyµUCCµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GCGGAUGUAGUUUAAU--GGU--AGAACCCCAGCCUUCC=AGCUGGCU-------------------A-CGCGAGUUCGAUUCUCGUCAUCCGCU--- 5µµ=µµµµggaµUµGlyµUCCµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GCGGAUGUAGUUUAAU--GGU--AGAACCCCAGCCU5CC=AGCUGGCU-------------------A-CGCGAGUUCGAUUCUCGUCAUCCGCU--- UµµAµµµµggaµUµGlyµUCCµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCGGGCGUAGCUCAAU--GGD-DAGAGCCCUAGUCUUCCAAACUAGCU-------------------A-CGCGGGUUCG"UUCCCGUCGCCCGCUCCA Qµµ/µµµµcacµGµHisµGUGµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µGGUGGCUA4AGCUCAGDD-GGD--AGAGCCCUGGAUUQUG/PPCCAGUU-------------------7UCGUGGGTPCGAAUCCCAUUAGCCACCCCA GµµKµµµµcacµGµHisµGUGµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GUGGGUAUAGCUBAGCU-GGC--AGAGCACCUGGUUGUGKUUCAGGAU-------------------7UCGCGGGUUCA"GUCCCGUUACUCACC--- GµµKµµµµcacµGµHisµGUKµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µGGCGUAGGUGGUGAAGU--GGDD-A"CACAUCAGGUUGUGKCPCUGACA-------------------UACGCGGGUPCGAUCCCCGUUCUACGCCCCA Qµµ/µµµµcacµGµHisµQUGµSalmonella typhimuriumµprokaryotic cytosol µGGUGGCUA4AGCUCAGDD-GGD--AGAGCCCUGGAUUQUG/PPCCAGUU-------------------7UCGUGGGTPCGAAUCCCAUUAGCCACCCCA }µµ6µµµµatcµGµIleµ}AUµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GGACCUUUAGCUCAGUU-GGUU-AGAGCAGACGGCU}AU6ACCGUCCG-------------------7UCGUAGGTPCGAGUCCUACAAGGUCCACCA }µµ=µµµµatcµGµIleµ}AUµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol 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µ-CGCGGGGUAGAGCAGUD-GGD--AGCUCGCCGGGCUCAUAACCCGGAG-------------------GUCGCAGGUPCGAGUCCUGCCCCCGCAACCA CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµMycoplasma mycoidesµprokaryotic cytosol µ-CGCGGGG4AGAGCAGUD-GGD--AGCUCGCCGGGCUCAUAACCCGGAG-------------------GCCGCAGGUPCGAGUCCUGCCCCCGCAACCA CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-CGCGGGGUGGAGCAGCUCGGD--AGCUCGCUGGGCUCAUAACCCAGAG-------------------GUCGCAGGUPCA"AUCCUGUCCCCGCUACCA CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµSynechococcus elongatus PCC 6301µprokaryotic cytosol µ-CGCGGGGUAGAGCAGCCUGGD--AGCUCGUCGGGBUCAUAACCCGAAG-------------------7UCAGAGGTPCAAAUCCUCUCCCCGCCACCA CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµThermus thermophilusµprokaryotic cytosol µ-CGCGGGG4GGAGCAGCCU#GD--AGCUCGUCGGGBUCAUAACCCGAAG-------------------7UCGCCGGFPCA"AUCCGGCCCCCGCAACCA CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµThermus thermophilusµprokaryotic cytosol µ-CGCGGGG4GGAGCAGCCU#GD--AGCUCGUCGGGBUCAUAACCCGAAG-------------------7UCGCGGGFPCA"AUCCCGCCCCCGCAACCA )µµ*µµµµttaµUµLeuµ)AAµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCCCGGA4GGUGGAADC-#GDA-GACACAAGGGAPU)AA*APCCCUC-GGCG---UUCG----CGCUG-UGCGGGTPCAAGUCCCGCUCCGGGUACCA )µµ=µµµµttaµUµLeuµ)AAµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-CCCCAAG4GGCGGAAUA-GGDA-G"CGCAUUGGACU)AA=APCCAACGGGC----UUAAU---AUCCUGUGCCGGUPCAAGUCCGGCCUUGGGGACCA Bµµ*µµµµttgµCµLeuµBAAµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCCGAAG4GGCGAAADC-#GDA-GACGCAGUUGAPUBAA*APCAACC-GUA----GAAA-----UACG-UGCCGGTPCGAGUCCGGCCUUCGGCACCA Bµµ*µµµµttgµCµLeuµBAAµGeobacillus stearothermophilusµprokaryotic cytosol µ-GCCGAUG4GGCGGAAUD-GGCA-G"CGCGCACGACUBAA*APCGUGU-GGGC---UUU-----GCCCG-UGUGGGTPCGACUCCCACCAUCGGCACCA Bµµ=µµµµttgµCµLeuµBAAµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GCCUUUUUGGCGGAAUD-GGCA-G"CGCAUUAGACUBAA=APCUAACGAA-----GAAA------UUCGUAUCGGUPCGAAUCCGAUAAAGGGCACCA CµµHµµµµttgµCµLeuµCAAµRhodospirillum rubrumµprokaryotic cytosol µ-GCCUUUGUAGCGGAAD--GGD--AACGCGGCAGACUCAAHAPCUGCU-UUGG---UAAC----CCAGG-UGGUAGTPCGACUCUCCCCAAAGGCACCA CµµHµµµµttgµCµLeuµCAAµSynechococcus elongatus PCC 6301µprokaryotic cytosol µ-GGGCAAGUGGCGGAAUD-GGDA-GACGCAGCAGACUCAAHAPCUGCC-GCUA---GCGA----UAGUG-UGUGGGTPCGAGUCCCACCUUGCCCACCA CµµKµµµµctgµCµLeuµCAGµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCGAAGGUGGCGGAADD-#GDA-GACGCGCUAGCUUCAGKPGPUAGU-GUCC---UUAC----GGACG-UGGGGGTPCAAGUCCCCCCCCUCGCACCA CµµKµµµµctgµCµLeuµCAGµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GCGGGUGUGCGGGAAUD-GGDA-GACCGGCUAGAUUCAGKAPCUAGGGUCU----UUAU----GGACC-UGAGGGTPCA"GUCCCUUCACCCGCACCA Cµµ;µµµµctgµCµLeuµCAGµSalmonella typhimuriumµprokaryotic cytosol µ-GCGAAGGUGGCGGAADD-#GDA-GACGCGCUAGCUUCAG;PGPUAGU-GUCC---UUAC----GGACG-UGGGGGTPCAAGUCCCCCCCCUCGCACCA CµµKµµµµctgµCµLeuµCAGµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCGCGAGUGGCGGAAC--GGCA-GACGCGCUGGCUUCAGKUGCCAGUGUCC-----UUAG----GGACGUGGGGGUUCAAAUCCCCCCUCGCGCACGA CµµKµµµµctgµCµLeuµCAGµSynechococcus elongatus PCC 6301µprokaryotic cytosol µ-GCGGAACUGGCGGAAUD-GGDA-GACGCGCUAGAUUCAGKPPCUAGU-GGUU---UCAC----GACUG-UCCGGGTPCAAGUCCCGGGUUCCGCACCA GµµKµµµµctcµGµLeuµGAGµEscherichia coliµprokaryotic cytosol 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µ-GAGCCAUUAGCUCAGUD-GGD--AGAGCAUCUGACU$UU[APCAGAGG-------------------7UCGAAGGTPCGAGUCCUUCAUGGCUCACCA $µµ6µµµµaaaµUµLysµ$UUµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GACUCGUUAGCUCAGCC-GGD--AGAGCAACUGGCU$UU6ACCAGUGG-------------------7UCCGGGGUPCGAAUCCCCGACGAGUCACCA Cµµ6µµµµaagµCµLysµCUUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGCCCGGUAGCUCAGUU-GGU--AGAGCAGUAGACUCUU6AUCUAUGG-------------------7UCCAGGGUUCGAGCCCCUGCCGAGCCA--- Cµµ6µµµµaagµCµLysµCUUµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GUCUGAUUAGCGCAACD-GGC--AGAGCAACUGACUCUU6APCAGUGG-------------------7UUGUGGGUPCGAUUCCCACAUCAGGCACCA Cµµ6µµµµaagµCµLysµCUUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCGCCKUUAGCUBAGUDDGGDDDAGAGCAGCUGACUCUU6AUCAGCGG-------------------7UCCGGGGUUCGAGUCCCUGACGGCGCACGA Cµµ6µµµµaagµCµLysµCUUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCGCCKUUAGCUBAGUDDGGDDDAGAGCAGCUGACUCUU6AUCAGCGG-------------------7UCCGGGGUUCGAGUCCCUGACGGCGCA--- Sµµ6µµµµaaaµUµLysµSUUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGGUCGUUAGCUCAGDD-GGD--AGAGCAGUUGACUSUU6APCAAUUG-------------------7XCGCAGGTPCGAAUCCUGCACGACCCACCA $µµ6µµµµaaaµUµLysµUUUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GACUCGU4AGCUCAGUU-GGU--AGAGCAUUUGACU$UU6AUCAAAGG-------------------7UCGCUGGUUCGAGCCCAGC=CGGGUCACUA $µµ6µµµµaaaµUµLysµUUUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GACUCGU4AGCUCAGUU-GGU--AGAGCAUUUGACU$UU6AUCAAAGG-------------------7UCGCUGGUUCGAGCCCAGC=CGGGUCA--- UµµAµµµµaaaµUµLysµUUUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGGCCKUUAGCUBAAUDDGGU-CAGAGCAGCGGACUUUUAAUCCGUUG-------------------7UUGUGGGUUCGAGUCCCACACGGCCUACCG Cµµ=µµµµatgµCµMetµCAUµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GGCGGUGUAGCUCAGC--GGCD-AGAGCGUACGGUUCAU=CCCGUGAG-------------------7DCGGGGGTPCGAUCCCCUCCGCCGCUACCA }µµ=µµµµatgµCµMetµCAUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGAUCUUUAGCUCAGUU-GGDDDAGAGCUAUCGGCU}AU=ACCGAUCG-------------------7UCGCUGGUUCGAAUCCAGCAAGAUCCA--- Mµµ=µµµµatgµCµMetµCAUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGCGGUGUAGCUCAGCU-GGCU-AGAGCGUUCGGUUMAU=CCCGAGAG-------------------7UCGGGGGUUCGAUCCCCUUCGCCGCUA--- CµµAµµµµatgµCµMetµCAUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-CGCGGGAUGGAGCAGCU-AGGU-AGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAG-------------------7UCAUAGGTUCAAAUCCUAUUCCCGCAA--- CµµAµµµµatgµCµMetµCAUµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGCGGGG4AGCUCAGUD-GGDD-AGAGCGUUCGGUUCAUACCCGAAAG-------------------7UCGAGAGUPCAAAUCUCUCCCCCGCUACCA CµµAµµµµatgµCµMetµCAUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGGGCGGUAGCUBAGCC-LGDDDAGAGCAGCGGACUCAUAAUCCGUCG-------------------GCCGUGGGUUCGAGUCCCACCCGCCCCACCG CµµAµµµµatgµCµMetµCAUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-CGCGGGGUGGAGCAGCU-CGGDDAGCUCGCUGGGCUCAUAACCCAGAG-------------------GUCGCAGGUUCA"AUCCUGUCCCCGCUA--- Cµµ6µµµµatgµCµMetµCAUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-AGCGGUGUAGCUBAGUC-GGD-DAGAGCAAGCGGCUCAU6AUCGCUGU-------------------7UCACCGGUUCA"GUCCGGUCACCGCUACUA CµµAµµµµatgµCµMetµCAUµThermus thermophilusµprokaryotic cytosol µ-CGCGGGG4GGAGCAGCCU#GD--AGCUCGUCGGGBUCAUAACCCGAAG-------------------7UCGCGGGFPCA"AUCCCGCCCCCGCAACCA Mµµ6µµµµatgµCµMetµMAUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGCUACG4AGCUCAGDD-#GDD-AGAGCACAUCACUMAU6APGAUGGG-------------------7XCACAGGTPCGAAUCCCGUCGUAGCCACCA #µµ*µµµµttcµGµPheµ#AAµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GGCUCGGUAGCUCAGUD-GGD--AGAGCAACGGACU#AA*APCCGUGU-------------------7UCGGCGGTPCGAUUCCGUCCCGAGCCACCA #µµ*µµµµttcµGµPheµ#AAµGeobacillus stearothermophilusµprokaryotic cytosol µ-GGCUCGG4AGCUCAGUC-GGD--AGAGCAAAGGACU#AA*APCCUUGU-------------------7UCGGCGGTPCGAUUCCGUCCCGAGCCACCA Gµµ*µµµµttcµGµPheµGAAµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCCCGGA4AGCUCAGDC-GGD--AGAGCAGGGGAPUGAA*APCCCCGU-------------------7XCCUUGGTPCGAUUCCGAGUCCGGGCACCA GµµGµµµµttcµGµPheµGAAµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGCUCGGUAGCUCAGUU-GGU--AGAGCAAUGGAUUGAAGCUCCAUGU-------------------7UCGGCGGUUCGAUUCCGUCUCGCGCCA--- GµµKµµµµttcµGµPheµGAAµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGUCGUGUAGCUCAGUC-GGD--AGAGCAGCAGACUGAAKCPCUGCGU-------------------7UCGGCGGUPCAAUUCCGUCCACGACCACCA Gµµ*µµµµttcµGµPheµGAAµRhodospirillum rubrumµprokaryotic cytosol µ-GCCCGGGUAGCUCAGCD-GGD--AGAGCACGUGACUGAA*APCACGGU-------------------7UCGGUGGTPCGACUCCGCCCCCGGGCACCA Gµµ≠µµµµttcµGµPheµGAAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGCUGGGUAGCUBAGUDDGGUA-CGAGCGAUCGCCUGAA≠AGCGAUAG-------------------GUCGCCGGUUCGAUCCCGGCCCCAGCCACCA Gµµ*µµµµttcµGµPheµGAAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGCUGGGUAGCUBAGUDDGGUA-CGAGCGAUCGCCUGAA*AGCGAUAG-------------------GUCGCCGGUUCGAUCCCGGCCCCAGCCACCA Gµµ*µµµµttcµGµPheµGAAµSynechococcus sp. PCC 7002µprokaryotic cytosol µ-GCCAGGAUAGCNCAGUD-#GD--AGAGCAGAGGACUGAA*APCCUCGU-------------------7UCGGCGGTPCAAUUCCGCCUCCCGGCACCA Gµµ+µµµµttcµGµPheµGAAµThermus thermophilusµprokaryotic cytosol µ-GCCGALG4AGCUCAGUU-#GD--AGAGCAUGCGACUGAA+APCGCAGU-------------------7UCGGCGGTPCGAUUCCGCUCCUCGGCACCA 5µµKµµµµccaµUµProµ5GGµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-CGGGAAGUAGCUCAGCUUGGD--AGAGCACAUGGPU5GGKACCAUGGG-------------------7UCGCAGGTPCGAAUCCUGUCUUCCCGACCA CµµKµµµµccgµCµProµCGGµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-CGGUGAUUGGCGCAGCCUGGD--AGCGCACUUCGUUCGGKACGAAGGG-------------------7UCGGAGGTPCGAAUCCUCUAUCACCGACCA CµµKµµµµccgµCµProµCGGµSalmonella typhimuriumµprokaryotic cytosol µ-CGGUGAU4GGCGCAGCCUGGD--AGCGCACUUCGJUCGGKACGAAGGG-------------------7UCGGAGGTPCGAAUCCUCUAUCACCGACCA CµµKµµµµccgµCµProµCGGµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-CGGGGUGUAGCGCAGCUUGGC--AGCGCGCUUCGUUCGGKACGAAGAG-------------------GUCGUGGGUUCAAAUCCCGCCACCCCGA--- GµµKµµµµcccµGµProµGGGµSalmonella typhimuriumµprokaryotic cytosol µ-CGGCACG4AGCGCAGCCUGGD--AGCGCACCGUCBUGGGKUPGCGGGG-------------------7UCGGAGGTPCAAAUCCUCUCGUGCCGACCA GµµGµµµµcccµGµProµGGGµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-CGGGACGUGGCGCAGCUUGGD-DAGCGCACUUGABUGGGGGUCAAGGG-------------------GUCGCAGGUUCA"AUCCUGUCGUCCCGA--- 5µµKµµµµccaµUµProµUGGµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-CGGGAAGUAGCUCAGCUUGGU--AGAGUACUUGGUU5GGKACCAAGGU-------------------7UCGCAGGUUCGAAUCCUGUCUUCCCGA--- UµµKµµµµccaµUµProµUGGµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-CGGGAAGUGGCUCAGUUUGGD--AGAGCAUUCGGUUUGGKACCGAAGG-------------------7UCGCAGGUPCAAAUCCUGUCUUCCCGACCA UµµKµµµµccaµUµProµUGGµMycoplasma mycoidesµprokaryotic cytosol µ-CGGGAAGUGGCUCAGUUUGGD--AGAGCAUUCGGUUUGGKACCGAAGG-------------------GUCGCAGGUUCAAAUCCUGUCUUCCCGACCA UµµKµµµµccaµUµProµUGGµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-CGGGGUGUGGCGCAGCUUGGD-DAGCGCGUCCGCUUUGGKAGCGGAAG-------------------GUCGUCGGUUCG""UCCGGCCACCCCGACCA VµµKµµµµccaµUµProµVGGµSalmonella typhimuriumµprokaryotic cytosol µ-CGGCGAG4AGCGCAGCUUGGD--AGCGCAACUGGJUVGGKACCAGUGG-------------------7UCGGAGGTPCGAAUCCUCPCUCGCCGACCA Uµµ+µµµµtgaµUµSecµUCAµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-_AAGAUCG4CGUCUCC--GGDG-AGGCGGCUGGACUUCA+AUCCAGU-UGGGGCCGC_GCGGUCCCG--GGCAGGTPCGACUCCUGUGAUCUU_GCCA 5µµ+µµµµtcaµUµSerµ5GAµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GGAGGAA4ACCCAAGUCUGGCDGA"GGGAUCGGUCU5GA+AACCGACAGGGUG--UCAA---AGCCCG-CGGGGGTPCGAAUCCCUCUUCCUCCGCCA Cµµ*µµµµtcgµCµSerµCGAµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGAGAGAUGCCGGAGC--#GCDGAACGGACCGGUCUCGA*AACCGGA-GUAGGG-GCAA--CUCUAC--CGGGGGTPCAAAUCCCCCUCUCUCCGCCA Cµµ`µµµµtcgµCµSerµCGAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGJAGCGUGUCCGAGC--GGCC#AAGGAGCUCGCCUCGA`AGCGAGUGUGGC----GUAA---CCCGU-CACCGUGGGUUCAAAUCCCACCGCUACCG Cµµ≠µµµµtcgµCµSerµCGAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGJAGCGUGUCCGAGC--GGCC#AAGGAGCUCGCCUCGA≠AGCGAGUGUGGC----GUAA---CCCGU-CACCGUGGGUUCAAAUCCCACCGCUACCG Cµµ+µµµµtcgµCµSerµCGAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGJAGCGUGUCCGAGC--GGCC#AAGGAGCUCGCCUCGA+AGCGAGUGUGGC----GUAA---CCCGU-CACCGUGGGUUCAAAUCCCACCGCUACCG Cµµ*µµµµtcgµCµSerµCGAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGJAGCGUGUCCGAGC--GGCC#AAGGAGCUCGCCUCGA*AGCGAGUGUGGC----GUAA---CCCGU-CACCGUGGGUUCAAAUCCCACCGCUACCG Gµµ6µµµµagcµGµSerµGCUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGUGAGG4GGCCGAGA--GGCDGAAGGCGCUCCC%UGCU6AGGGAGU-AUGCGGUCAAAAGCUGCAU--CCGGGGTPCGAAUCCCCGCCUCACCGCCA Gµµ6µµµµagcµGµSerµGCUµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GGAGAAGUACUCAAGU--GGCDGA"GAGGCGCCCCUGCU6AGGGUGUAGGUCGC-GUAA---GCGGCG-CGAGGGTPCAAAUCCCUCCUUCUCCGCCA Gµµ6µµµµagcµGµSerµGCUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGGGGGUUACUCAAGA--GGCUGAAGAGGACGGUU5GCU6AAAUCGU4AG7UCGG-GAA--ACCGGCG-CGAGGGUUCGAAUCCCUUACCCCCCU--- Gµµ6µµµµagcµGµSerµGCUµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGGUUAA4ACUCAAGUD-GGDG-A"GAGGACACCCUGCU6AGGUGUUAGGUCGG-UCU-----CCGGCGCGAGGGUPCGAGUCCCUCUUAACCCGCCA Gµµ6µµµµagcµGµSerµGCUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGAGGCGUCGCCUAGUCCGGUCU/UGGCGCCGCACUGCU6AUGCGGUUUGGGUC--UUAA-AGCCCAU-CGAGGGUUCA"AUCCCUCCGCCUCCG--- GµµAµµµµtccµGµSerµGGAµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGUGAGG4GUCCGAGU--#GDDGAAGGAGCACGCCUGGAAAGPGUGU-AUACG--GCAA---CGUAU--CGGGGGTPCGAAUCCCCCCCUCACCGCCA GµµAµµµµtccµGµSerµGGAµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GGAGAGC4GUCCGAGU--GGDCGA"GGAGCACGAUUGGAAAPCGUGUAGGCGGU-CAAC--UCCGUCU-CAAGGGTPCGAAUCCCUUGCUCUCCGCCA GµµAµµµµtccµGµSerµGGAµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGAGAAGUGUCCGAGU--GGCCGAAGGAGC=CGCCUGGAAAGUGUGUAUACGUCA-----CAAGCGUAUCGGGGGUUCGAAUCCCCUCUUCUCCU--- Gµµ`µµµµtccµGµSerµGGAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGAGGAUUCGCCUAGU--GGCCUAGGGCGCACGCJUGGA`AGCGUGUUGGGG----GCAA---CCCCU-CACGAGUUCG""UCUCGUAUCCUCCGCCA Gµµ≠µµµµtccµGµSerµGGAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGAGGAUUCGCCUAGU--GGCCUAGGGCGCACGCJUGGA≠AGCGUGUUGGGG----GCAA---CCCCU-CACGAGUUCG""UCUCGUAUCCUCCGCCA Gµµ+µµµµtccµGµSerµGGAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGAGGAUUCGCCUAGU--GGCCUAGGGCGCACGCJUGGA+AGCGUGUUGGGG----GCAA---CCCCU-CACGAGUUCG""UCUCGUAUCCUCCGCCA Gµµ*µµµµtccµGµSerµGGAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGAGGAUUCGCCUAGU--GGCCUAGGGCGCACGCJUGGA*AGCGUGUUGGGG----GCAA---CCCCU-CACGAGUUCG""UCUCGUAUCCUCCGCCA Vµµ*µµµµtcaµUµSerµUGAµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGAAGUG4GGCCGAGC--#GDDGAAGGCACCGGUBUVGA*AACCGGC-GACCC--GAAA---GGGUU--CCAGAGTPCGAAUCUCUGCGCUUCCGCCA Uµµ=µµµµtcaµUµSerµUGAµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGAAGAU4ACCCAAGUCCGGCDGA"GGGAUCGGUCUUGA=AACCGAGAGUCGG--GGAAA----CCGAGCGGGGGUPCGAAUCCCUCAUCUUCCGCCA Uµµ=µµµµtcaµUµSerµUGAµMycoplasma mycoidesµprokaryotic cytosol µ-GGAAGAUUACCCAAGUCCGGCDGA"GGGAUCGGUCUUGA=AACCGAGAGUCGGG-GAAA--CCCGAG--CGGGGGUUCGAAUCCCUCAUCUUCCGCCA Uµµ*µµµµtcaµUµSerµUGAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGUGGGUUGCCCGAGC--GGCCUAAGGGAACGGUCUUGA*AACCGUCGUGGCA---GCGA--UGUCAC-CGUGGGUUCAAAUCCCACACCCACCG--- 5µµ6µµµµacaµUµThrµ5GUµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GCCGGUGUAGCUCAAUD-GGD--AGAGCAACUGACU5GU6APCAGUAG-------------------7UUGGGGGTPCAAGUCCUCUUGCCGGCACCA Aµµ6µµµµactµAµThrµAGUµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GCUGACU4AGCUCAGUD-GGD--AGAGCAAUUGACUAGU6APCAAUAG-------------------7UCGAAGGUPCAAAUCCUUUAGUCAGCACCA Cµµ6µµµµacgµCµThrµCGUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GCCGAGU4AGCUCAGUC-GGU--AGAGCACUUCACUCGU6ACGAAGGG-------------------GUCACAGGUUCGAUUCCUGCACUCGGCA--- Cµµ6µµµµacgµCµThrµCGUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCCGCCUUAGCUBAGUDDGGCC-AGAGCAACGCACUCGU6AUGCGUAG-------------------7UCUCGGGUUCGAAUCCCGAAGGCGGCU--- GµµEµµµµaccµGµThrµGGUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCUGAUAUGGCUCAGDD-GGD--AGAGCGCACCCUUGGUEAGGGUGAG-------------------7UCCCCAGTPCGACUCUGGGUAUCAGCACCA GµµEµµµµaccµGµThrµGGUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCUGAUAUAGCUCAGDD-GGD--AGAGCGCACCCUUGGUEAGGGUGAG-------------------7UCGGCAGTPCGAAUCUGCCUAUCAGCACCA GµµAµµµµaccµGµThrµGGUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GCCGUUGUAGCUCAGUC-GGU--AGAGCAGCACCAUGGUAAGGUGAAG-------------------7UCGACAGUUCGAUUCUGUUCAAUGGCA--- Gµµ6µµµµaccµGµThrµGGUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCCCCAAUAGCUBAGUC-GGD-DAGAGCGUCUCCAUGGU6AGGAGAAG-------------------GUCUGCGGUUCG"UUCCGCAUUGGGGCU--- Vµµ6µµµµacaµUµThrµUGUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCCGACUUAGCUCAGUA-GGD-DAGAGCAACUGABUVGU6AUCAGUAG-------------------7UCACCAGTPCGAUUCCGGUAGUCGGCACCA 5µµ6µµµµacaµUµThrµUGUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GCCGACU4AGCUCAGUU-GGU--AGAGCAUCUGAUU5GU6AUCAGAGG-------------------7UCGCGUGUUCGAAUCAUGUAGUCGGCA--- Uµµ6µµµµacaµUµThrµUGUµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GCUGACU4AGCUCAGCA-GGC--AGAGCAACUGACUUGU6APCAGUAG-------------------7UCGUAGGUPCGAUUCCUAUAGUCAGCACCA UµµHµµµµacaµUµThrµUGUµMycoplasma mycoidesµprokaryotic cytosol µ-GCUGACUUAGCUCAGCA-GGC--AGAGCAACUGACUUGUHAPCAGUAG-------------------7UCGUAGGUUCGAUUCCUAUAGUCAGCACCA UµµAµµµµacaµUµThrµUGUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCCUCCUUAGCUBAGUCCGGCCCAGAGCGAUGUACUUGUAAUACAUAG-------------------GUCGUCGGUUCG""UCCGACAGGAGGCU--- )µµ=µµµµtgaµUµTrpµ)CAµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-AGGGGCAUAGUUCAGUA-GGD--AGAACAUCGGUCU)CA=AACCGAGU-------------------7UCACGAGUPCGAGUCUUGUUGCCCCUGCCA Bµµ=µµµµtggµCµTrpµBCAµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-AGGAGAGUAGUUCAAU--GGD--AGAACGUCGGUCUBCA=AACCGAGC-------------------7UUGAGGGUPCGAUUCCUUUCUCUCCUGCCA Cµµ*µµµµtggµCµTrpµCCAµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-AGGGGCG4AGUUCAADD-GGD--AGAGCACCGGUBUCCA*AACCGGGU-------------------7UUGGGAGTPCGAGUCUCUCCGCCCCUGCCA Cµµ+µµµµtggµCµTrpµCCAµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-AGGGGCAUAGUUUAAC--GGD--AGAACAGAGGPCUCCA+AACCUCCG-------------------G-UGUGGGTPCGAUUCCUACUGCCCCUGCCA CµµHµµµµtggµCµTrpµCCAµSpiroplasma citriµprokaryotic cytosol µ-AGGGGUGUAGUUUAAU--GGU--AGAACAGCGGUCUCCAHCACCGUAC-------------------GUUGUGGGUPCAAGUCCUGUCACCCCUGCCA CµµAµµµµtggµCµTrpµCCAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol 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µ-GGAGGAUUAGCUCAGCD-GGG--AGAGCAUCUGCCU5AC=AGCAGAGG-------------------7UCGGCGGTPCGAGCCCGUCAUCCUCCACCA CµµAµµµµgtgµCµValµCACµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGGCGAUUAGCUBAGU--G#G--AGAGCGCUUCGUUCACACCGAAGAG-------------------7UCACUGGUUCGAACCCAGUAUCGCCCACCG GµµAµµµµgtcµGµValµGACµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCGUCCG4AGCUCAGDD-GGDD-AGAGCACCACCUUGACAUGGUGGGG-------------------7XCGGUGGTPCGAGUCCACUCGGACGCACCA GµµAµµµµgtcµGµValµGACµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCGUUCA4AGCUCAGDD-GGDD-AGAGCACCACCUUGACAUGGUGGGG-------------------7XCGUUGGTPCGAGUCCAAUUGAACGCACCA GµµAµµµµgtcµGµValµGACµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GAUUCCGUAGCUCAGCD-GGG--AGAGCGCUACCUUGACAGGGUAGAG-------------------7UCGCUGGTPCGAGCCCAGUCGGAAUCACCA Gµµ=µµµµgtcµGµValµGACµGeobacillus stearothermophilusµprokaryotic cytosol µ-GAUUCCGUAGCUCAGCD-GGG--AGAGCGCCACCUUGAC=GGGUGGAG-------------------7UCGCUGGTPCGAGCCCAGUCGGAAUCACCA GµµAµµµµgtcµGµValµGACµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCGCGAUUAGCUBAGC--G#G--AGAGCGCUUCCCUGACACGGAAGAG-------------------7UCACUGGUUCAAUCCCAGUAUCGCGCACCA GµµAµµµµgtcµGµValµGACµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCGCGAUUAGCUBAGC--G#G--AGAGCGCUUCCCUGACACGGAAGAG-------------------7UCACUGGUUCAAUCCCAGUAUCGCGCA--- GµµAµµµµgtcµGµValµGACµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGACGAUUAGCUBAGC--G#G--AGAGCGCUUCCCUGACACGGAAGAG-------------------7UCACUGGUUCAAUCCCAGUAUCGUCCA--- 5µµ=µµµµgtaµUµValµUACµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGGAGUU4AGCUCAGCU-GGG--AGAGCAUCUGCCU5AC=AGCAGAGG-------------------7UCAGCGGUUCGAUCCCGUUAACUCCCA--- Uµµ=µµµµgtaµUµValµUACµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGAGUGUUAGCUCAGCD-GGG--AGAGCUCCUGCCUUAC=AGCAGGCG-------------------7UCAUAGGUPCAAGUCCUAUACACUCCACCA Uµµ=µµµµgtaµUµValµUACµMycoplasma mycoidesµprokaryotic cytosol µ-GGAGUGU4AGCUCAGCD-GGG--AGAGCUCCUGCCUUAC=AGCAGGCG-------------------GUCAUAGGUUCAAGUCCUAUACACUCCACCA UµµAµµµµgtaµBacterµValµUACµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGGUGCGUAGCUBAGG--#GD-DAGAGCGCUGCUCUUACAAAGCAGAU-------------------7UCGGCGGUUCGAAACCGUCCGCGCCCA--- Vµµ=µµµµgtaµUµValµVACµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGGUGAU4AGCUCAGCD-GGG--AGAGCACCUCCCUVAC=AGGAGGGG-------------------7UCGGCGGTPCGAUCCCGUCAUCACCCACCA CµµAµµµµgcgµarchéeµAlaµCGCµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-GGGCUCGUAGAUCAGC--GGU--AGAUCRCUUCCUUCGCAAGGAAGAG-------------------GCC?UGGG]PBOAAUCCCAGCGAGUCCACCA CµµAµµµµgcgµCµAlaµCGCµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGCUCGUAGAUCAGU--GGC--AGAUCRCUUCCUUCGCAAGGAAGAG-------------------GC??GGGG]PBOAAUCCCCGCGAGUCCACCA GµµAµµµµgccµGµAlaµGGCµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGCUCGUAGAUCAGG--GGU--AGAUCACUCCCUUGGCAUGGGAGAG-------------------GC??CGGG]PBOAAUCCCGGCGAGUCCACCA UµµAµµµµgcaµUµAlaµUGCµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGCCCAUAGCUCAGU--GGU--AGAGULCCUCCUUUGCAAGGAGGAU-------------------GC??AGGG]PBGAAUCCCUGUGGGUCCACCA CµµKµµµµcggµCµArgµCCGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGCCCGUAGCUCA(U--GGAC-AGAGURCUUGGUUCCGKACCAAGAU-------------------GC?GCGGG]PBOAAUCCCGUCGGGUCCGCCA GµµKµµµµcgcµGµArgµGCGµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-GUCCGGAUARGGPAGU--GGACUAUCCUCUUGGCUUGCGKAGCCAGGG-------------------A-CCGG?G]PBOAAUCGCCGUCCGGACGCCA GµµKµµµµcgcµGµArgµGCGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GUCCUGAUARGGPAGU--GGACUAUCCUCCUGGCUUGCGKAGCCAGGG-------------------A-C?GGAG]PBOAAUCUCCGUCAGGACGCCA NµµKµµµµcgaµUµArgµNCGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGCGCUUAGCUCA(UCUGGAC-AGAGULCUUGGCUNCGKACCAAGUU-------------------GC?ACGGG]PBOAAUCCUGUAGCGCCCACCA ;µµ6µµµµaacµGµAsnµ;UUµMethanobacterium thermaggregansµprokaryotic cytosol µ-GCGCCGGUGGCUCA;CCUGGUU-AGAGCUCACGGCU;UU6ACCGUGAG-------------------GCCGCGGGPPBOAAUCCCGCCCGGCGCACCA Gµµ6µµµµaacµGµAsnµGUUµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-GCCGCCAUAGCUCAGUU-GGU--AGAGCACGUGGUUGUU6CCCACGUU-------------------GU?CCAGG]PBGGACCCUGGUGGCGGCGAAC Gµµ6µµµµaacµGµAsnµGUUµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCCGCCGUAGCUCA(UU-GGU--AGAGCACCUCGCUGUU6ACGAGGUU-------------------GU??CAGG]PBGAGUCCUGGCGGUGGCGCCA GµµAµµµµgacµGµAspµGUCµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCCCGGGUGRUGPAGU--GGCCCAUCAUACGACCCUGUCACGGUCGUG-------------------A-CGCGGG]PBOAAUCCCGCCUCGGGCGCCA GµµKµµµµtgcµGµCysµGCAµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCCAAGGUGGCAGA(UUCGGCCCAACGCAUCCGCCUGCAKAGCGGAAC-------------------C_?GCCGG]PBOAAUCCGGCCCUUGGCUCCA CµµKµµµµcagµCµGlnµCUGµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-AGUCCCGU.RGGPAGU--GGCCAAUCCUGAAGCCUUCUGKGGGCUUCG-------------------A-CGGAAGPPBGAAUCUUCCCGGGACUACCA MµµKµµµµcagµCµGlnµMUGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-AGUCCCAUGRGGPAGU--GGCCAAUCCUGUUGCCUUMUGKGGGCAACG-------------------A-CCCAGGPPBGAAUCCUGGUGGGACUACCA MµµAµµµµgagµCµGluµMUCµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCUCUGUUGRUGPAGUCCGGCCAAUCAUAUCACCCUMUCACGGUGAUG-------------------A-C?AGGG]PBGAAUCCCUGACGGAGCACCA NµµKµµµµgaaµUµGluµNUCµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCUCGGUUGRUGPAGUCCGGCCAAUCAUCUUGGCCUNUCKAGCCGAGG-------------------A-C?AGGG]PBOAAUCCCUGACCGAGCACCA CµµAµµµµgggµCµGlyµCCCµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCGCCGAUGLUCCAGU--GGU--AGGACACGAGCUUCCCAAGCUCGGA-------------------G-C?CGGG]PBOAUUCCCGGUCGGCGCACCA GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-GCGCUGGUALUGPAGU--GGU--AUCACGUGACCUUGCCAUGGUCACA-------------------A-??UGGG]PBOAAUCCCAGCCAGCGCACCA GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCGUCGGUALUGPAGU--GGU--AUCACGUGACCUUGCCAUGGUCACA-------------------A-C?UGGG]PBOAAUCCCAGCCGACGCACCA GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCGCUGGUALUGPAGU--GGU--AUCACGUGACCUUGCCAUGGUCACA-------------------A-C?UGGG]PBOAAUCCCAGCCAGCGCACCA GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµMethanobacterium thermaggregansµprokaryotic cytosol µ-GCGGCGUUAGUCCA;CU-GGU-UAAGACACUGGCCUGCCACGCCAGCG-------------------U-CCCGGGPPBOAAUCCCGGACGCCGCACCA NµµAµµµµggaµUµGlyµNCCµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCACCGGUGLUCUAAU--GGU--AAGACAUUGGCCUNCCAAGCCAAUU-------------------A-U?UGGG]PBGAUUCCCAGCCGGUGCACCA GµµKµµµµcacµGµHisµGUGµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µGUCCGGGCU.RGGPAGU--GGACUAUCCUUCAGCCUUGUGKAGGCUGAG-------------------A-CGCGGG]PBGAUUCUCGCGCCUGGACCCA GµµKµµµµcacµGµHisµGUGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µGUCCGGGUUGRGGPAGU--GGACUAUCCUUCAGCCUUGUGKAGGCUGAG-------------------A-CGCGGGPPBAAUUCUCGCACCUGGACCCA Gµµ6µµµµatcµGµIleµGAUµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGCCAAUAGCUCAGUCAGGUU--GAGCRCPCGGCUGAU6AC?GGGAG-------------------GCC?GCGG]PBOAAUCCGCGUUGGCCCACCA Nµµ6µµµµataµUµIleµNAUµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGCCCCUAGCUCA(UCUGGUC-AGAGCRCUCGGCUNAU6ACCGGGUG-------------------GU?AUGGG]PBGAACCCCAUGGGGCCCACCA CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-AGCGGGAUGGGAPA(CUAGGAG-AUUCCGCCGGGCUCAUAACCCGGAG-------------------AUCGGUAG]PBOAAUCUACCUCCCGCUACCA CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµHalococcus morrhuaeµprokaryotic cytosol µ-AGCGGGAUGGGAPAGCCAGGAG-AUUCCLGCGGGCUCAUAACCCGCAG-------------------AUCAGUAG]PBOAAUCUACUUCCCGCUACCA CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-AGCGGGAUGGGAPA(CCAGGAG-AUUCCGCCGGGCUCAUAACCCGGAG-------------------AUCGGUAG]PBOAAUCUACCUCCCGCUACCA CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµSulfolobus acidocaldariusµprokaryotic cytosol µ-AGCGGCGU.LGGAACUG-GGAGUAUCCC|CA#GGBUCAUAACCCUGAG-------------------GU?CCUGGJUBO"AUCCAGGCGCCGCUACCA CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµThermoplasma acidophilumµprokaryotic cytosol µ-AGCGGGGUGGGGPAGUCAGGA--AAUCCLAUGGGBUCAUAACCCGUAG-------------------AUCGAUGGPPBH"AUCCAUCCCCCGCUACCA &µµKµµµµctaµUµLeuµ&AGµThermoplasma acidophilumµprokaryotic cytosol µ-GCGGAGG44GUC(A(ACUGGCCAAAGGCRAUGGAUU&AGKGPCCAUUCCCG-----AAG-----GGGUUC7AGGGPPBA"AUCCCUCCCUCCGCACCA 5µµKµµµµctaµUµLeuµ5AGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCGCGGGUAGCCAA(U--GGCCAAAGGCRCAGCGCU5AGKACGCUGU-GGU----GUAG-----ACCUU?GCAGG]PBGAACCCUGUCCCGCGCACCA CµµKµµµµttgµCµLeuµCAAµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCGAGGGUAGCUAA(UCAGGAA-AAAGCRGCGGACUCAAKAPCCGCU-CCC----GUAG-----GGGUC?GUGGG]PBOAAUCCCUCCCCUCGCACCA CµµKµµµµctgµCµLeuµCAGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCAGGGAUAGCCAA(UCUGGCCAACGGCRCAGCGUUCAGKGCGCUGU-CUC----AUAG-----GAGUC?GCAGG]PBOAAUCCUGCUCCCUGCACCA GµµKµµµµctcµGµLeuµGAGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCGUGGGUAGCCAA(CCAGGCCAACGGCRCAGCGUUGAGKG?GCUGU-CCU----GUAG-----AGGUC?GCCGG]PBOAAUCCGGUCCCACGCACCA UµµKµµµµttaµUµLeuµUAAµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCGGGGGUGGCUGA(CCAGGCCAAAAGCLGCGGACUUAAKAPCCGCU-CCC----GUAG-----GGGUUCGCGAG]PBGAAUCUCGUCCCCCGCACCA Mµµ6µµµµaagµCµLysµMUUµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGCCGGUAGCUCA(UUAGGC--AGAGCRUCUGABUMUU6APCAGACG-------------------GU?GCGPG]PBOAAUCGCGUCCGGCCCACCA Nµµ6µµµµaaaµUµLysµNUUµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGCUGGUAGCUCA(UUAGGC--AGAGCRUCUGGBUNUU6ACCAGACG-------------------GU?GGGGG]PBOAGUCCCUCCCAGCCCGCCA Bµµ6µµµµatgµCµMetµBAUµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCCCGGGUGGCUPA(CU-GGAC-APAGCGCCGCACUBAU6APGCGGAG-------------------AU?GUGGG]PBGGAGCCCACCCCGGGCACCA Cµµ6µµµµatgµCµMetµCAUµThermoplasma acidophilumµprokaryotic cytosol µ-GCCGGGG4GGCUCA(CU-GGA--GGAGCRCCGGABUCAU6AUCCGGAG-------------------GUCUCGGGPPBGAUCCCCGAUCCCGGCACCA GµµKµµµµttcµGµPheµGAAµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCCGCCUUAGCUCA(ACUGGG--AGAGCACUCGACUGAAKAPCGAGCU-------------------GU?CCCGG]PBOAAUCCGGGAGGCGGCACCA GµµKµµµµcccµGµProµGGGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGACCGUGRGGPAGU--GGU--AUCCUCUGCCGAUGGGKUCGGUAGG-------------------A-C?UGAG]PBGACUCUCAGCGGUCCCACCA MµµKµµµµccgµCµProµMGGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGCCGGUGRGGPA(CUUGGU--AUCCUUCGGCCUUMGGKPGGCCGUA-------------------A-??UCAG]PBGAAUCUGAGCCGGCCCACCA UµµKµµµµccaµUµProµUGGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGACCGUGRGUPA(CCUGGU--AUACUUCGGGCCUUGGKUGCCCGUG-------------------A-??CCGG]PBOAAUCCGGGCGGUCCCACCA CµµAµµµµtagµCµPyrµCUAµMethanosarcina barkeriµprokaryotic cytosol µ-GGAAACC4-GAUCA-U--G-U--AGAUCG_UGGACUCUAAAUCCG_CA---------------------GCCGGG]UAGAUUCCCGGGGUUUCCGCCA Gµµ6µµµµagcµGµSerµGCUµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GUUGCGGUAGCCAA(CCUGGCCCAAGGCRCUGGGUUGCU6ACUCAGU-GGC----GUCAA----GCCC-??GGGG]PBGAAUCCCCGCCGCAACGCCA GµµAµµµµtccµGµSerµGGAµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCCAGGAUGGCCGA(C--GGU--AAGGCRCACGCCUGGAAAGCGUGU-UCCC---UCU-----GGGAU-?GGGGG]PBOAAUCCCUCUCCUGGCGCCA MµµKµµµµtcgµCµSerµMGAµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-GCCGAGGUAGCAPA(CUUGGCC-AAUGCRGUUGCUUMGAKAGCAACG-UUCC---ACAC----GGACU-?AGGAG]PBOAAUCUCCUCCUCGGCGCCA MµµAµµµµtcgµCµSerµMGAµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCCGAGGUAGCCPA(CCCGGCC-AAGGCRGUAGAUUMGAAAPCUACU-GUCC---AUUC----GGACA-?GUGAG]PBOAAUCUCACCCUCGGCGCCA Cµµ6µµµµacgµCµThrµCGUµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCCGGUGUAGCUCA(UU-GGC--AGAGCRAUUCCUUCGU6AGGAAUAG-------------------GC?GAGGG]PBOAAUCCCUCCACCGGCUCCA Gµµ6µµµµaccµGµThrµGGUµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-GCCUGGGUAGCUPAGC--GGU--AAAGCRCGUCCUUGGU6AGGACGAG-------------------ACC??GGA]PBOAAUUCCGGCCUAGGCUCCA Gµµ6µµµµaccµGµThrµGGUµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCCUGGGUAGCUPA(C--GGU--AAAGCRCGUCCUUGGU6AGGACGAG-------------------AC??CGGG]PBOAAUCCCGGCCUAGGCUCCA BµµKµµµµtggµCµTrpµBCAµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGGCUGUGGCCAA(CCCGGC--AUGGCRACUGABUBCAKAJCAGUCG-------------------AU?GGGGG]PBOAAUCCCUCCGGCCCCACCA GµµKµµµµtacµGµTyrµGUAµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-CCGCUCUUAGCUCA(CCUGGC--AGAGCAGCCGABUGUAKAPCGGCUU-------------------GU?CCCCG]PBOAAUCGGGGAGAGCGGACCA CµµAµµµµgtgµCµValµCACµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-GGGUCGGUKGUCPAGUCCGGUU-AUGACGGCUCCUUCACACGGAGCAG-------------------GUCGG?GG]PBOACUCCGCCCCGACCCACCA CµµAµµµµgtgµCµValµCACµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-GGGUUGGUKGUCPAGUCAGGCU-AUGACACCUCCUUCACAUGGAGGAG-------------------GUCGG?GG]PBOAAUCCGCCCCAACCCACCA CµµAµµµµgtgµCµValµCACµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGUUGGUGGUCPA(CCAGGUU-AUGACGGCUCCUUCACACGGAGCAG-------------------GC?GGCGG]PBGAAUCCGCCCCAACCCACCA GµµAµµµµgtcµGµValµGACµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-GGGUUGGUGGUCPAGUCAGGCU-AUGACACCUCCUUGACAUGGAGGAG-------------------GUCGG?GG]PBOAAUCCGCCCCAACCCACCA GµµAµµµµgtcµarchéeµValµGACµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGUUGGUGGUCPAGUCUGGUU-AUGACACCUCCUUGACAUGGAGGAG-------------------GC?GGCAG]PBOAAUCUGCCCCAACCCACCA Bµµ6µµµµµvirusµMetµBAUµAvian myeloblastosis virusµprokaryotic cytosol µ-GCCUCCUUALCGCAGDA-GGN--AGCGCRPCAGPCUBAU6APCUGAAG-------------------7D??UGAGTPCG"ACCUCAGAGGGGGCACCA BµµKµµµµµvirusµTrpµBCAµAvian myeloblastosis virusµprokaryotic cytosol µ-GACCUCGUKLCGCAAC--#GD--AGCGCRPCUGABUBCAKAZCAGAAG-------------------7CUGCGUGPPCG"AUCACGUCGGGGUCACCA NµµAµµµµµvirusµGlyµNCCµEnterobacteria phage T4µprokaryotic cytosol µ-GCGGAUAUCGUAUAAU--#GD--AUUACCUCAGACUNCCAAPCUGAUG-------------------A-UGUGAGTPCGAUUCUCAUUAUCCGCUCCA .µµHµµµµµvirusµIleµ.AUµEnterobacteria phage T4µprokaryotic cytosol µ-GGCCCUGUAGCUCAAU--#GDDAGCAGCAGUCCCCU.AUHAGGGAAAG-------------------7UUACCAGTPCAAAUCUGGUCUGGGUCACCA Nµµ*µµµµµvirusµLeuµNAAµEnterobacteria phage T4µprokaryotic cytosol µ-GCGAGAA4GGUCAAADU-LGDA-AAGGCACAGCACUNAA*APGCUGC-GGAA---UGAU----UUCCU-UGUGGGTPCGAGUCCCACUUCUCGCACCA NµµKµµµµµvirusµProµNGGµEnterobacteria phage T4µprokaryotic cytosol µ-CUCCGUG4AGCUCAGUUUGGD--AGAGCGCCUGAJUNGGKAPCAGGAG-------------------7UCCAAGGTPCAAAUCCUUGUAUGGAGACCA Nµµ/µµµµµvirusµGlnµNUGµEnterobacteria phage T4µprokaryotic cytosol µ-UGGGAAU4AGCCAAGDD-GGD--AAGGCAUAGCACUNUG/CPGCUAGA-------------------UGCAAAGGTPCGAGUCCUUUAUUCCCAGCCA NµµAµµµµµvirusµArgµNCUµEnterobacteria phage T4µprokaryotic cytosol µ-GUCCCGCUGGUGUAAU--#GAD-AGCAUACGAUCCUNCUAAGPUUGCG-------------------G-UCCUGGTPCGAUCCCAGGGCGGGAUACCA Nµµ*µµµµµvirusµSerµNGAµEnterobacteria phage T4µprokaryotic cytosol µ-GGAGGCG4GGCAGAGU--#GDDUAAUGCACCGGUBUNGA*AACCGGC-AGUCGC-UCCG--GCGACU--CAUAGGTPCAAAUCCUAUCGCCUCCGCCA NµµHµµµµµvirusµThrµNGUµEnterobacteria phage T4µprokaryotic cytosol µ-GCUGAUUUAGCUCAGDA-GGD--AGAGCACCUCACUNGUHAPGAGGAU-------------------7UCGGCGGTPCGAUUCCGUCAAUCAGCACCA GµµAµµµµµvirusµAspµGUCµEnterobacteria phage T5µprokaryotic cytosol µ-GCGACCGGGGCUGGCUU-GGUA-AUGGUACUCCCCUGUCACGGGAGAG-------------------AAUGUGGGTPCAAAUCCCAPCGGUCGCGCCA Uµµ=µµµµµvirusµLeuµUAGµEnterobacteria phage T5µprokaryotic cytosol µ-GGGGCUAUGCUGGAACD-#GDA-GACAAUACGGCCUUAG=UPCCGUA-GCUU---AA------AUGCG-UGGGAGTPCGAGUCUCCCUAGCCCCACCA GµµHµµµµµvirusµAsnµGUUµEnterobacteria phage T5µprokaryotic cytosol µ-GGUUCCUUAGCUCUAAU-GGDU-AGAGCCGCAUCUUGUUHAGPUGAGG-------------------7UUGCUGGTPCGAAUCCAGCAGGAACCGCCA UµµKµµµµµvirusµProµUGGµEnterobacteria phage T5µprokaryotic cytosol µ-CUCCGAUUAGCUCAAUU-GGCD-AGAGUACACCGUUUGGKGCGGUGGG-------------------7UUGAAGGTPCGAGUCCUUCAUUGGAGACCA UµµAµµµµµvirusµGlnµUUGµEnterobacteria phage T5µprokaryotic cytosol µ-UGGGGAUUAGCUUAGCUUGGCCUAAAGCUUCGGCCUUUGAAGPCGAGA-------------------U-CAUUGGTPCAAAUCCAAUAUCCCCUGCCA IµµKµµµµµvirusµProµIGGµMoloney murine leukemia virusµprokaryotic cytosol µ-GGCJCLUUKGUCPAGG--GGD--AUGAUUCUCGCJUIGGKPGCGAGAG-------------------7D??CGGGPPCA"AUCCCGGACGAGCCCCCA NµµKµµµµµvirusµProµNGGµMoloney murine leukemia virusµprokaryotic cytosol µ-GGCJCLUUKGUCPAGG--GGD--AUGAUUCUCGCPUNGGKPGCGAGAG-------------------7D??CGGGPPCA"AUCCCGGACGAGCCCCCA
Compilation des tRNAs des bactéries
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux Tableaux:Compilation des tRNAs des bactéries.
- Légende: utiliser ":" comme séparateur dans le tableur et copier le texte en modification et non directement parce qu'il y a &emsp.
- Une erreur pour UGC de Streptomyces griseus (Ala), la position 34 est un C et non un U, et la position 37 ne correspond pas à G. Voir la liste des tRNAs.
- Voir la liste des modifications pour eucaryotes et procaryotes.
:::t:Phe:Leu:::c:Ser::::a:Tyr:Stp::g:Cys:SeC:Trp ::34::37:::34::37:::34::37:::34::37: t:t: : : : ::Inosine::`+::: : : : :: : : : :: : : : ::9::9::: : : : :: : : : 74:c:#:G:KWY::: :::::9Q:G:K+::::G:K+: 40::22:1:23::: :::::5:9:14::::2:2: 28:a:~.N:U:K:::&:U:`+H:A:: :::::1N:U:+: 26::7:1:8:::3:2:4:1:: :::::5:1:6: :g:B°?<::K ;::::Cleu:`+:Aleu:: :::::B::K:A ::6::6::::6:5:1:: :::::5::4:1 ::::Leu:::::Pro:::::His:Gln::::Arg: c:t:Inosine::K:G::Inosine: :K: :: : : : ::Inosine::K/:A ::7::6:1::1::1::: : : : ::4::3:1 24:c: ::::: :::::Q:G:K:G:: ::: 6:: ::::: :::::1:5:5:1:: ::: 34:a::U:K:::&N::K:::NJ:Utaa:E6 /:A::::: 12:::1:1:::2::2:::6:1:3:4::::: :g::C.:K::: ::::::Ctag:6tag:A:::C:K: :::4:4::: ::::::4:1:3:::2:2: :::Ile:Met:ini::::Thr:::::Asn:Lys::::Ser:Arg a:t:Inosine::t6A:::Inosine: :t6A: :: : : : :: : : : ::5::5:::3::3::: : : : :: : : : 60:c: ::::: :::::Q:G:t6A::::G:6E+: 6:: ::::: :::::4:2:6::::5:5: 44:a:PAP::t6A::: :::::N)3::[6H:::3 1::t6A: 16::1::1::: :::::6::6:::2::2: :g: ::::: ::::::C:6H::::C:t6A: :: ::::: ::::::10:10::::1:1: :Met:B:C:6E::: ::::: ::::: ::: ::5:1:6::: ::::: ::::: ::: :ini::C:+6::: ::::: ::::: ::: :::18:18::: ::::: ::::: ::: ::::Val:::::Ala:::::Asp:Glu::::Gly: g:t:Inosine:: :A::Inosine: :O: :: : : : :: : : : ::7:::7::6::6::: : : : :: : : : 26:c: ::::: :::::manQ:G:K:A:::G::A 12:: ::::: :::::4:3:1:6:::5::5 32:a:&N:::A:: :::::3 2:U::A::,N:::A 16::2:::2:: :::::4:1::5::2:::2 :g::C.::A:: ::::::C::A:::C::A :::4::4:: ::::::4::4:::1::1 456::::::::::::::::::::
Compilation des tRNAs des eucaryotes
[modifier | modifier le wikicode]- Lien au Tableaux:Compilation des tRNAs des eucaryotes.:
- Légende: utiliser ":" comme séparateur dans le tableur et copier le texte en modification et non directement parce qu'il y a &emsp.
- Une erreur pour CAG de Candida cylindracea (Leu), au lieu de CGA (Ser). Voir la liste des tRNAs. Voir la liste des modifications pour eucaryotes et procaryotes
- Deux suppresseurs JUA taa et CUA tag pour Tetrahymena thermophila. Un suppresseur UUA taa pour Lupinus luteus.
:::t:Phe:Leu:::c:Ser::::a:Tyr:Stp::g:Cys:SeC:Trp ::34::37:::34::37:::34::37:::34::37: t:t: : : : ::Inosine::`+::: : : : :: : : : :: : : : ::9::9::: : : : :: : : : 74:c:#:G:KWY::: :::::9Q:G:K+::::G:K+: 40::22:1:23::: :::::5:9:14::::2:2: 28:a:~.N:U:K:::&:U:`+H:A:: :::::1N:U:+: 26::7:1:8:::3:2:4:1:: :::::5:1:6: :g:B°?<::K ;::::Cleu:`+:Aleu:: :::::B::K:A ::6::6::::6:5:1:: :::::5::4:1 ::::Leu:::::Pro:::::His:Gln::::Arg: c:t:Inosine::K:G::Inosine: :K: :: : : : ::Inosine::K/:A ::7::6:1::1::1::: : : : ::4::3:1 24:c: ::::: :::::Q:G:K:G:: ::: 6:: ::::: :::::1:5:5:1:: ::: 34:a::U:K:::&N::K:::NJ:Utaa:6E/:A::::: 12:::1:1:::2::2:::6:1:3:4::::: :g::C.:K::: ::::::Ctag:6tag:A:::C:K: :::4:4::: ::::::4:1:3:::2:2: :::Ile:Met:ini::::Thr:::::Asn:Lys::::Ser:Arg a:t:Inosine::t6A:::Inosine: :t6A: :: : : : :: : : : ::5::5:::3::3::: : : : :: : : : 60:c: ::::: :::::Q:G:t6A::::G:6E+: 6:: ::::: :::::4:2:6::::5:5: 44:a:PAP::t6A::: :::::3N)::6[H:::3 1::t6A: 16::1::1::: :::::6::6:::2::2: :g: ::::: ::::::C:6H::::C:t6A: :: ::::: ::::::10:10::::1:1: :Met:B:C:6E::: ::::: ::::: ::: ::5:1:6::: ::::: ::::: ::: :ini::C:6+::: ::::: ::::: ::: :::18:18::: ::::: ::::: ::: ::::Val:::::Ala:::::Asp:Glu::::Gly: g:t:Inosine:: :A::Inosine: :O: :: : : : :: : : : ::7:::7::6::6::: : : : :: : : : 26:c: ::::: :::::manQ:G:K:A:::G::A 12:: ::::: :::::4:3:1:6:::5::5 32:a:&N:::A:: :::::3 2:U::A::,N:::A 16::2:::2:: :::::4:1::5::2:::2 :g::C.::A:: ::::::C::A:::C::A :::4::4:: ::::::4::4:::1::1 456::::::::::::::::::::
Compilation des tRNAs des archées
[modifier | modifier le wikicode]- Lien aux Tableaux:Compilation des tRNAs des archées.
- Légende: utiliser ":" comme séparateur dans le tableur et copier le texte en modification et non directement parce qu'il y a &emsp.
- Une Pyrolysine CUA tag pour Methanosarcina barkeri . Voir la liste des tRNAs. Voir la liste des modifications pour eucaryotes et procaryotes
:::t:Phe:Leu:::c:Ser::::a:Tyr:Stp::g:Cys:SeC:Trp ::34::37:::34::37:::34::37:::34::37: t:t: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : 6:c::G:K::::G::A:::G:K::::G:K: 6:::1:1::::1::1:::1:1::::1:1: 4:a::U:K::: ::::: ::::: ::: 4:::1:1::: ::::: ::::: ::: :g::C:K:::M::K:A:::C::A::B::K: :::1:1:::2::1:1:::1::1::1::1: ::::Leu:::::Pro:::::His:Gln::::Arg: c:t: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : 8:c::G:K::::G:K::::G:K::::G:K: 6:::1:1::::1:1::::2:2::::2:2: 8:a:5&::K::::U:K::: :::::N::K: 8::2::2::::1:1::: :::::1::1: :g::C:K:::M::K:::M:C:K::::C:K: :::1:1:::1::1:::1:1:2::::1:1: :::Ile:Met:ini::::Thr:::::Asn:Lys::::Ser:Arg a:t: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : 18:c::G:t6A::::G:t6A:::;:G:t6A::::G:t6A: 6:::1:1::::2:2:::1:2:3::::1:1: 10:a:N::t6A::: :::::N::t6A::: ::: 2::1::1::: :::::1::1::: ::: :g: ::::::C:t6A:::M::t6A::: ::: :: ::::::1:1:::1::1::: ::: :Met:B:C:t6A::: ::::: ::::: ::: ::1:1:2::: ::::: ::::: ::: :ini::C::A:: ::::: ::::: ::: :::5::5:: ::::: ::::: ::: ::::Val:::::Ala:::::Asp:Glu::::Gly: g:t: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : :: : : : 10:c::G::A:::G::A:::G::A:::G::A 8:::2::2:::1::1:::1::1:::4::4 6:a: ::::::U::A::N::K:::N:::A 12:: ::::::1::1::1::1:::1:::1 :g::C::A:::C::A::M:::A:::C::A :::3::3:::2::2::1:::1:::1::1 122::::::::::::::::::::
Détails pour mcac lla eco hvo sce
[modifier | modifier le wikicode]- Lien Tableaux: Détails pour mcac lla eco hvo sce
- Légende:
;;mcac;30 tRNAs;;;;;;;;30 gènes tRNA de mcac;;;;;;;;%GC ;;t;;c;;a;;g;;;;t;;c;;a;;g;24 t;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;m1G;;;G;m6A;G;m6A;;c;1;;;;1;;1; ;a;cmnm5Um;m6A;U;m6A;;;cmnm5Um;m6A;;a;1;;1;;;;1; ;g;Cm;m6A;;;;;Cm;m6A;;g;1;;;;;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; c;t;;;;;;;Inosine;m1G;;t;;;;;;;1; ;c;;;;;G;m1G;;;;c;;;;;1;;; ;a;U;m1G;U;m1G;cmnm5s2U;m6A;;;;a;1;;1;;1;;; ;g;;;;;;;;;;g;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; a;t;;;A;t6A;;;;;;t;;;1;;;;; ;c;G;t6A;;;G;t6A;G;t6A;;c;1;;;;1;;1; ;a;k2C;m6A;U;t6A;cmnm5s2U;t6A;cmnm5U;t6A;;a;;;1;;2;;1; ;g;C;A;;;C;t6A;;;;g;3;;;;1;;; ;i;C;A;;;;;;;;i;;;;;;;; g;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;;;;;G;A;;;;c;;;;;1;;; ;a;U;m6A;U;m6A;cmnm5s2U;A;U;m6A;;a;1;;1;;1;;1; ;g;;;;;;;;;;g;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;lla;26tRNAs;;;;;;;;63 gènes tRNA de lla;;;;;;;;%GC ;;t;;c;;a;;g;;;;t;;c;;a;;g;35 t;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;G;G;A;G;i6A;;;;c;2;;1;;1;;1; ;a;;;;;;;;;;a;2;;2;;;;; ;g;;;;;;;;;;g;1;;3;;;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; c;t;;;;;;;Inosine;A;;t;2;;;;;;2; ;c;;;;;;;;;;c;;;;;1;;; ;a;;;mo5U;m1G;U;A;;;;a;2;;2;;2;;; ;g;;;;;;;;;;g;1;;;;;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; a;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;t6A;G;A;G;t6A;G;t6A;;c;2;;1;;2;;1; ;a;k2C;m6A;mo5U;t6A;cmnm5s2U; 2 t6A;U;C;;a;;;2;;3;;1; ;g;ac4C;m6A;C;t6A;C;t6A;;;;g;4;;1;;1;;1; ;i;C;A;;;;;;;;i;;;;;;;; g;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;;;;;G;A;G;A;;c;;;;;2;;2; ;a;mo5U;m6A;mo5U;t6A;U;A;U mo5U;2 m6A;;a;3;;6;;2;;2; ;g;;;;;;;;;;g;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;E.coli;43 tRNAs;;strain unknown;;Liepzig*;;;;86 gènes tRNA de eco;;;;K12;;;;%GC t;;t;;c;;a;;g;;;;t;;c;;a;;g;51 ;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;ms2i6A;G;A;2 QtRNA;msi6A;G;ms2i6A;;c;2;;2;;3;;1; ;a;cmnm5Um;ms2i6A;cmo5U;ms2i6A;;;U;i6A;;a;1;;1;;;;1; ;g;Cm;ms2i6A;C;ms2i6A;;;C;ms2i6A;;g;1;;1;;;;1; c;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;t;;;;;;;Inosine;m2A;;t;;;;;;;4; ;c;G;m1G;;;QtRNA;m2A;;;;c;1;;1;;1;;; ;a;cmo5U;m1G;;;cmnm5s2U;m2A;;;;a;1;;1;;2;;; ;g;C;m1G;C;m1G;C;m2A;C;m1G;;g;4;;1;;2;;1; a;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;t6A;2 G;m6t6A;QtRNA;t6A;G;t6A;;c;3;;2;;4;;1; ;a;k2C;t6A;cmo5U;t6A;mnm5s2U;t6A;mnm5U;t6A;;a;;;1;;6;;1; ;g;ac4C;t6A;;;;;;;;g;8;;1;;;;1; g;i;2 C;A;;;;;;;;i;;;;;;;; ;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;2 G;A;G;A;gluQtRNA;m2A;G;A;;c;2;;2;;3;;4; ;a;cmo5U;m6A;cmo5U;A;mnm5s2U;2 m2A;mnm5U;A;;a;5;;3;;4;;1; ;g;;;;;;;C;A;;g;;;;;;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;hvo;41 tRNAs;;codons*;;;;;;53 gènes tRNA de lla;;;;;;;;%GC ;;t;;c;;a;;g;;;;t;;c;;a;;g;66 t;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;m1G;G;A;G;m1G;G;m1G;;c;2;;1;;2;;1; ;a;U;m1G;;;;;;;;a;1;;1;;;;; ;g;C;m1G;ac4C;A;;;Cm;m1G;;g;1;;1;;;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; c;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;m1G;G;m1G;G;m1G;G;m1G;;c;1;;1;;1;;1; ;a;mo5U;m1G;U;m1G;;;xU;m1G;;a;1;;1;;1;;1; ;g;C;m1G;ac4C;m1G;ac4C;m1G;C;m1G;;g;1;;2;;1;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; a;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;t6A;G;t6A;G;t6A;G;t6A;;c;1;;1;;1;;1; ;a;xU;t6A;;;xU;t6A;;;;a;;;1;;1;;1; ;g;Cm;t6A;C;t6A;ac4C;t6A;;;;g;3;;1;;1;;1; ;i;C;A;;;;;;;;i;;;;;;;; g;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;; ;c;G;A;G;A;G;A;2 G;A;;c;2;;1;;2;;2; ;a;;;U;A;xU;m1G;xU;A;;a;1;;2;;1;;1; ;g;C;A;C;A;ac4C;A;C;A;;g;1;;1;;1;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; ;;sce;35 tRNAs;;;;;;;;275 gènes tRNA de sce;;;;;;;;%GC ;;t;;c;;a;;g;;;;t;;c;;a;;g;38 t;t;;;2 Inosine; i6A;;;;;;t;;;11;;;;; ;c;2 Gm; yW;;;GPA;i6A;G;i6A;;c;10;;;;8;;4; ;a;ncm5Um;m1G;ncm5U;i6A;;;;;;a;7;;3;;;;; ;g;m5C;m1G;C;i6A;;;Cm;A;;g;10;;1;;;;6; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; c;t;;;;;;;Inosine;A;;t;;;2;;;;6; ;c;;;;;2 G; m1G;;;;c;1;;;;7;;; ;a;U;m1G;xU;m1G;;;;;;a;3;;10;;9;;; ;g;;;;;;;;;;g;;;;;1;;1; ;;;;;;;;;;;;;;;;;;; a;t;Inosine;t6A;2 Inosine; t6A;;;;;;t;13;;11;;;;; ;c;;;;;G;t6A;G;t6A;;c;;;;;10;;4; ;a;PAP;t6A;;;mcm5s2U;t6A;mcm5U;t6A;;a;2;;4;;7;;11; ;g;C;t6A;;;C;t6A;;;;g;10;;1;;14;;1; ;i;C;t6A;;;;;;;;i;;;;;;;; g;t;Inosine;A;Inosine;m1Inosine;;;;;;t;14;;11;;;;; ;c;;;;;G;m1G;G;A;;c;;;;;16;;16; ;a;ncm5U;A;;;mcm5s2U;A;xU;A;;a;2;;5;;14;;3; ;g;C;A;;;;;;;;g;2;;;;2;;2;