Recherche:Corrélation entre les gènes de tRNAs des 3 domaines/Annexe/Tableur

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Recherche : Corrélation entre les gènes de tRNAs des 3 domaines
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Corrélation entre les gènes de tRNAs des 3 domaines/Annexe/Tableur
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Paris le 01.04.19

Sommaire

Introduction[modifier | modifier le wikicode]

Tableau des effectifs des gènes de tRNAs[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Tableau des effectifs des gènes de tRNAs
  • Légende: Décompte des gènes tRNAs par codon suivant la base de données gtRNAdb [1].
    1.   5   : nombre de tRNAs d'un codon se terminant par t. Ce sont les plus faibles.
    2.   113   : nombre de tRNAs d'un codon se terminant par t: Changement de t en c chez les archées et de c en t chez les eucaryotes.
    3. 4 366: Effectif élevé de tRNAs d'un codon se terminant par g chez les procaryotes.
    4. 2622: Effectif faible de tRNAs supérieurs à   t   et à   c   .
    5. 160: Changement de codon   g   Chez les archées et les eucaryotes.
  • Tableaux:
    1. Nombre de tRNAs, tableaux I II III, décompte de la base gtRNAdb.
    2. Pour 100 000 tRNAs, tableaux I100 II100 III100, décomptes rapportés à 100 000 tRNAs pour comparaison.
    3. tRNAs pour 1 génome, tableaux I1 II1 III1, indice de la multiplicité = nombre de tRNAs / nombre des génomes du domaine.
  • Tableaux non formatés:
- Nombres de tRNAs
I;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;;;;II;Nombres de tRNAs. 184 archées;;;;;;;;III;Nombres de tRNAs. 155 eucaryotes;;;;;;
ttt;10;tct;5;tat;4;tgt;3;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;66;tct;1 863;tat;155;tgt;233
c;6105;c;4520;c;6420;c;4473;;c;215;c;190;c;190;c;299;;c;1 933;c;113;c;2 216;c;2 755
a;4749;a;5299;a;−;a;1315;;a;191;a;184;a;-;a;18;;a;890;a;1 041;a;-;a;279
g;3999;g;2622;g;−;g;4366;;g;163;g;152;g;-;g;184;;g;1 249;g;749;g;-;g;1 982
ctt;369;cct;10;cat;4;cgt;7478;;ctt;1;cct;0;cat;0;cgt;2;;ctt;1 576;cct;1 638;cat;47;cgt;1 587
c;3849;c;2742;c;4715;c;333;;c;214;c;171;c;185;c;187;;c;37;c;34;c;1 879;c;57
a;4940;a;5453;a;6388;a;887;;a;185;a;184;a;196;a;185;;a;872;a;1 641;a;2 289;a;2 337
g;5186;g;2183;g;2389;g;3355;;g;160;g;151;g;165;g;139;;g;1 296;g;735;g;1 849;g;522
att;5;act;103;aat;5;agt;1;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;2 428;act;2 201;aat;149;agt;53
c;9 203;c;4513;c;8 764;c;4422;;c;212;c;189;c;214;c;187;;c;99;c;154;c;3 524;c;1 895
a;55;a;5878;a;9 105;a;4804;;a;2;a;198;a;197;a;186;;a;851;a;1 494;a;2 640;a;1 762
g;18 026;g;2760;g;2427;g;3452;;g;589;g;169;g;166;g;165;;g;3 862;g;833;g;6 064;g;1 285
gtt;9;gct;2;gat;0;ggt;1;;gtt;1;gct;0;gat;0;ggt;1;;gtt;2 101;gct;2 962;gat;100;ggt;132
c;4430;c;4166;c;9 023;c;9 273;;c;212;c;184;c;218;c;243;;c;109;c;405;c;2 799;c;3 279
a;8 859;a;10 185;a;9 679;a;5515;;a;186;a;256;a;230;a;189;;a;1 088;a;7 639;a;7 079;a;5 538
g;1313;g;1224;g;1388;g;2266;;g;170;g;159;g;160;g;155;;g;3 123;g;4 737;g;3 754;g;7 052
- Pour 100 000 tRNAs
I 100;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;;235027;;II 100;Nombres de tRNAs. 184 archées;;;;;;8749;;III 100;Nombres de tRNAs. 155 eucaryotes;;;;;;115111
ttt;4;tct;2;tat;2;tgt;1;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;57;tct;1,618;tat;135;tgt;202
c;2,598;c;1,923;c;2,732;c;1,903;;c;2,457;c;2,172;c;2,172;c;3,418;;c;1,679;c;98;c;1,925;c;2,393
a;2,021;a;2,255;a;−;a;560;;a;2,183;a;2,103;a;-;a;206;;a;773;a;904;a;-;a;242
g;1,702;g;1,116;g;−;g;1,858;;g;1,863;g;1,737;g;-;g;2,103;;g;1,085;g;651;g;-;g;1,722
ctt;157;cct;4;cat;2;cgt;3,182;;ctt;11;cct;0;cat;0;cgt;23;;ctt;1,369;cct;1,423;cat;41;cgt;1,379
c;1,638;c;1,167;c;2,006;c;142;;c;2,446;c;1,955;c;2,115;c;2,137;;c;32;c;30;c;1,632;c;50
a;2,102;a;2,320;a;2,718;a;377;;a;2,115;a;2,103;a;2,240;a;2,115;;a;758;a;1,426;a;1,989;a;2,030
g;2,207;g;929;g;1,016;g;1,427;;g;1,829;g;1,726;g;1,886;g;1,589;;g;1,126;g;639;g;1,606;g;453
att;2;act;44;aat;2;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;2,109;act;1,912;aat;129;agt;46
c;3,916;c;1,920;c;3,729;c;1,881;;c;2,423;c;2,160;c;2,446;c;2,137;;c;86;c;134;c;3,061;c;1,646
a;23;a;2,501;a;3,874;a;2,044;;a;23;a;2,263;a;2,252;a;2,126;;a;739;a;1,298;a;2,293;a;1,531
g;7,670;g;1,174;g;1,033;g;1,469;;g;6,732;g;1,932;g;1,897;g;1,886;;g;3,355;g;724;g;5,268;g;1,116
gtt;4;gct;1;gat;0;ggt;0;;gtt;11;gct;0;gat;0;ggt;11;;gtt;1,825;gct;2,573;gat;87;ggt;115
c;1,885;c;1,773;c;3,839;c;3,946;;c;2,423;c;2,103;c;2,492;c;2,777;;c;95;c;352;c;2,432;c;2,849
a;3,769;a;4,334;a;4,118;a;2,347;;a;2,126;a;2,926;a;2,629;a;2,160;;a;945;a;6,636;a;6,150;a;4,811
g;559;g;521;g;591;g;964;;g;1,943;g;1,817;g;1,829;g;1,772;;g;2,713;g;4,115;g;3,261;g;6,126
- tRNAs pour 1 génome
I 1;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;;;;II 1;Nombres de tRNAs. 184 archées;;;;;;;;III 1;Nombres de tRNAs. 155 eucaryotes;;;;;;
ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0;;ttt;0,4;tct;12,0;tat;1,0;tgt;1,5
c;1,51;c;1,12;c;1,59;c;1,11;;c;1,17;c;1,03;c;1,03;c;1,63;;c;12,5;c;0,7;c;14,3;c;17,8
a;1,18;a;1,31;a;-;a;0,33;;a;1,04;a;1,00;a;-;a;0,10;;a;5,7;a;6,7;a;-;a;1,8
g;0,99;g;0,65;g;-;g;1,08;;g;0,89;g;0,83;g;-;g;1,00;;g;8,1;g;4,8;g;-;g;12,8
ctt;0,09;cct;0;cat;0;cgt;1,85;;ctt;0,01;cct;0;cat;0;cgt;0,01;;ctt;10,2;cct;10,6;cat;0,3;cgt;10,2
c;0,95;c;0,68;c;1,17;c;0,08;;c;1,16;c;0,93;c;1,01;c;1,02;;c;0,2;c;0,2;c;12,1;c;0,4
a;1,23;a;1,35;a;1,58;a;0,22;;a;1,01;a;1,00;a;1,07;a;1,01;;a;5,6;a;10,6;a;14,8;a;15,1
g;1,29;g;0,54;g;0,59;g;0,83;;g;0,87;g;0,82;g;0,90;g;0,76;;g;8,4;g;4,7;g;11,9;g;3,4
att;0;act;0,03;aat;0;agt;0;;att;0;act;0;aat;0;agt;0;;att;15,7;act;14,2;aat;1,0;agt;0,3
c;2,28;c;1,12;c;2,17;c;1,10;;c;1,15;c;1,03;c;1,16;c;1,02;;c;0,6;c;1,0;c;22,7;c;12,2
a;0,01;a;1,46;a;2,26;a;1,19;;a;0,01;a;1,08;a;1,07;a;1,01;;a;5,5;a;9,6;a;17,0;a;11,4
g;4,47;g;0,68;g;0,60;g;0,86;;g;3,20;g;0,92;g;0,90;g;0,90;;g;24,9;g;5,4;g;39,1;g;8,3
gtt;0;gct;0;gat;0;ggt;0;;gtt;0,01;gct;0;gat;0;ggt;0,01;;gtt;13,6;gct;19,1;gat;0,6;ggt;0,9
c;1,10;c;1,03;c;2,24;c;2,30;;c;1,15;c;1,00;c;1,18;c;1,32;;c;0,7;c;2,6;c;18,1;c;21,2
a;2,20;a;2,53;a;2,40;a;1,37;;a;1,01;a;1,39;a;1,25;a;1,03;;a;7,0;a;49,3;a;45,7;a;35,7
g;0,33;g;0,30;g;0,34;g;0,56;;g;0,92;g;0,86;g;0,87;g;0,84;;g;20,1;g;30,6;g;24,2;g;45,5

Ordre des codons pour 100 000 tRNAs[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Ordre des codons pour 100 000 tRNAs
  • Légende: B bactéries, A archées, E eucaryotes.
    1. gac: Chez les bactéries le codon se terminant par g n'est pas dernier.
    2. cag: changement chez les archées par rapport aux bactéries.
    3. tag: chez les eucaryotes le codon se terminant par g est dernier.
    4. cag: différence très faible mais toujours non nulle.
  • Tableau non formaté
- Ordre des codons
B;t;c;a;g
t;cag;acg;−;cga
c;gac;acg;acg;tga
a;−;acg;acg;acg
g;acg;acg;acg;cag
;;;;
A;t;c;a;g
t;cag;cag;−;cga
c;cag;acg;acg;cag
a;−;acg;cag;cag
g;cag;acg;acg;cag
;;;;
E;t;c;a;g
t;cga;tag;−;cga
c;tga;atg;acg;atg
a;−;tag;gca;cag
g;gta;agt;agc;gac

Moyennes et variances pour 100 000 tRNAs des codons[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Moyennes et variances pour 100 000 tRNAs des codons
  • Légende:
    1. Moyenne et écart type sont faits sur les carrés, sauf certains carrés.
    2. % :rapport de l'écart type par la moyenne en pourcent.
    3. moyenne par génome: celle du codon pour calculer l'indice de multiplicité. Elle est égale à dom*moyenne/100 000, dom étant le nombre de tRNAs par domaine, 8 731 pour les archées, 119 380 pour les eucaryotes et 239 000 pour les bactéries. Voir les statistiques de la base de données.
    4. multiplicité moyenne: rapport "moyenne par génome" du codon divisé par le nombre d'espèces du domaine de la base de données, 184 pour les archées, 155 pour les eucaryotes et 4 032 pour les bactéries.
  • Tableau non formaté
- Moyennes sur 100 000 tRNAs
;moyenne;ecart;%;carrés;sauf;;genome;multiplicité
Bactéries;;;;;;;;
t;2;1.4;74;13;ct ac cg;;-;-
c;2,457;945;38;15;cg;;5,775;1.43
a;2,524;1,193;47;14;ta at;;5,933;1.47
g;1,183;501;42;14;ta at;;2,781;0.69
Archées;;;;;;;;
t;4;7;193;16;;;-;-
c;2,365;350;15;16;;;207;1.12
a;2,257;246;11;13;ta at tg;;197;1.07
g;1,843;120;7;14;ta at;;161;0.88
Eucaryotes;;;;;;;;
t;939;912;97;16;;;1,081;6.97
c;1,156;1,150;99;16;;;1,331;8.58
a;2,306;2,027;88;14;ta tg;;2,654;17.12
g;2,264;1,800;80;15;ta;;2,606;16.81
Eucaryotes;;;;;;;;
t1;102;55;54;8;;;117;0.75
t2;1,776;421;24;8;;;2,045;13.19
c1;109;104;95;8;;;126;0.81
c2;2,202;564;26;8;;;2,535;16.35
;;;;;;;;
t1+c1;105;81;76;16;;;121;0.78
t2+c2;1,989;529;27;16;;;2,290;14.77

Comparaison des 3 domaines avec les nombres des tRNAs[modifier | modifier le wikicode]

Comparaison globale[modifier | modifier le wikicode]

Codons par ordre de valeurs dans les carrés[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Codons par ordre de valeurs dans les carrés
  • Légende: classement des codons par leur ordre des effectifs de gène tRNA, dans les doublets des bactéries (B), des archées (A) et des eucaryotes (E). Les ordres sont ceux des tableaux I100, II100, III100.
  • Tableau non formaté
Codons par ordre de valeurs dans les carrés;;;;;;;;;;;;;;;
;B;A;E;;B;A;E;;B;A;E;;B;A;E
ttt;4;4;4;tct;4;4;1;tat;4;4;4;tgt;4;4;4
c;1;1;1;c;2;1;4;c;1;1;1;c;1;1;1
a;2;2;3;a;1;2;2;a;−;−;−;a;3;3;3
g;3;3;2;g;3;3;3;g;−;−;−;g;2;2;2
;;;;;;;;;;;;;;;
ctt;4;4;1;cct;4;4;2;cat;4;4;4;cgt;1;4;2
c;3;1;4;c;2;2;4;c;2;2;2;c;4;1;4
a;2;2;3;a;1;1;1;a;1;1;1;a;3;2;1
g;1;3;2;g;3;3;3;g;3;3;3;g;2;3;3
;;;;;;;;;;;;;;;
att;4;4;2;act;4;4;1;aat;4;4;4;agt;4;4;4
c;2;2;4;c;2;2;4;c;2;1;2;c;2;1;1
a;3;3;3;a;1;1;2;a;1;2;3;a;1;2;2
g;1;1;1;g;3;3;3;g;3;3;1;g;3;3;3
;;;;;;;;;;;;;;;
gtt;4;4;2;gct;4;4;3;gat;4;4;4;ggt;4;4;4
c;2;1;4;c;2;2;4;c;2;2;3;c;1;1;3
a;1;2;3;a;1;1;1;a;1;1;1;a;2;2;2
g;3;3;1;g;3;3;2;g;3;3;2;g;3;3;1
Groupes de codons[modifier | modifier le wikicode]
  • Lien Tableaux: Groupes de codons
  • Légende: Les effectifs sont ceux des tableaux I100, II100, III100 sauf pour les faibles effectifs des tableaux I II III quand ils sont indiqués.
    Groupe: Par exemple le groupe 111, est celui des codons classés en 1er dans chaque carré (doublet) des 3 domaines, bactéries (B), archées (A) et eucaryotes (E). L'attribution du groupe à chaque codon est faite dans le tableau des ordres.
    − Les paires de codons qui se ressemblent beaucoup sont soulignés en jaune.
  • Tableau non formaté
;Groupes de codons ;;;;;
Groupe;;B;A;E;;total
111;Tableaux I II III  100.;;;;;
;cca;2,320;2,103;1,426;;5,849
;tac;2,732;2,172;1,925;;6,828
;caa;2,718;2,240;1,989;;6,947
;ttc;2,598;2,457;1,679;;6,734
;gaa;4,118;2,629;6,150;;12,897
;gca;4,334;2,926;6,636;;13,896
;tgc;1,903;3,418;2,393;;7,714
;atg;7,670;6,732;3,355;;17,757
;;B;A;E;;total
444;Tableaux I II III.;;;;;
;cat;4;0;47;;51
;agt;1;0;53;;54
;ttt;10;0;66;;76
;gat;0;0;100;;100
;ggt;1;1;132;;134
;aat;5;0;149;;154
;tat;4;0;155;;159
;tgt;3;0;233;;236
;;B;A;E;;total
333;Tableaux I II III  100.;;;;;
;ata;23;23;739;;786
;tga;560;206;242;;1,008
;ccg;929;1,726;639;;3,293
;tcg;1,116;1,737;651;;3,504
;cag;1,016;1,886;1,606;;4,509
;agg;1,469;1,886;1,116;;4,471
;acg;1,174;1,932;724;;3,830
;;B;A;E;;total
224;Tableaux I II III  100.;;;;;
;ccc;1,167;1,955;30;;3,151
;gcc;1,773;2,103;352;;4,227
;acc;1,920;2,160;134;;4,214
;atc;3,916;2,423;86;;6,425
;;B;A;E;;total
332;Tableaux I II III  100.;;;;;
;gcg;521;1,817;4,115;;6,453
;gag;591;1,829;3,261;;5,681
;ttg;1,702;1,863;1,085;;4,650
Suite;;;;;;
suite;;B;A;E;;total
223;Tableaux I II III  100.;;;;;
;cta;2,102;2,115;758;;4,974
;tta;2,021;2,183;773;;4,977
;gac;3,839;2,492;2,432;;8,762
441;;;;;;
;tct;2;0;1,618;;1,621
;act;44;0;1,912;;1,956
;ctt;157;11;1,369;;1,538
442;;;;;;
;cct;4;0;1,423;;1,427
;gtt;4;11;1,825;;1,840
;att;2;0;2,109;;2,111
331;;;;;;
;ggg;964;1,772;6,126;;8,862
;aag;1,033;1,897;5,268;;8,198
;gtg;559;1,943;2,713;;5,215
222;;;;;;
;tgg;1,858;2,103;1,722;;5,683
;cac;2,006;2,115;1,632;;5,753
;gga;2,347;2,160;4,811;;9,318
;;B;A;E;;total
214;Tableaux I II III  100.;;;;;
;tcc;1,923;2,172;98;;4,193
;gtc;1,885;2,423;95;;4,403
123;;;;;;
;gta;3,769;2,126;945;;6,840
;aaa;3,874;2,252;2,293;;8,419
122;;;;;;
;tca;2,255;2,103;904;;5,262
;aga;2,044;2,126;1,531;;5,701
;Tableaux I II III  100.;;;;;
314;ctc;1,638;2,446;32;;4,116
414;cgc;142;2,137;50;;2,329
233;cgg;1,427;1,589;453;;3,470
132;ctg;2,207;1,829;1,126;;5,161
112;aca;2,501;2,263;1,298;;6,062
142;cgt;3,182;23;1,379;;4,583
211;agc;1,881;2,137;1,646;;5,665
321;cga;377;2,115;2,030;;4,522
443;gct;1;0;2,573;;2,574
113;ggc;3,946;2,777;2,849;;9,572
212;aac;3,729;2,446;3,061;;9,236
Comparaison par tri sur E et différences successives en %[modifier | modifier le wikicode]
Comparaison par tri sur E et différences successives en %;;;;;;;
;B;A;E;;E%;;Max B%
ccc;1,167;1,955;30;;9;;40
ctc;1,638;2,446;32;;54;;1056
cgc;142;2,137;50;;74;;2664
atc;3,916;2,423;86;;10;;108
gtc;1,885;2,423;95;;4;;2
tcc;1,923;2,172;98;;36;;0
acc;1,920;2,160;134;;81;;243
tga;560;206;242;;45;;217
gcc;1,773;2,103;352;;29;;24
cgg;1,427;1,589;453;;41;;54
ccg;929;1,726;639;;2;;20
tcg;1,116;1,737;651;;11;;5
acg;1,174;1,932;724;;2;;4918
ata;23;23;739;;2;;8882
cta;2,102;2,115;758;;2;;4
tta;2,021;2,183;773;;17;;12
tca;2,255;2,103;904;;5;;67
gta;3,769;2,126;945;;15;;122
ttg;1,702;1,863;1,085;;3;;16
agg;1,469;1,886;1,116;;1;;50
ctg;2,207;1,829;1,126;;15;;13
aca;2,501;2,263;1,298;;5;;1493
ctt;157;11;1,369;;1;;1927
cgt;3,182;23;1,379;;3;;74680
cct;4;0;1,423;;0;;54430
cca;2,320;2,103;1,426;;7;;14
aga;2,044;2,126;1,531;;5;;101
cag;1,016;1,886;1,606;;1;;47680
tct;2;0;1,618;;1;;94200
cac;2,006;2,115;1,632;;1;;7
agc;1,881;2,137;1,646;;2;;38
ttc;2,598;2,457;1,679;;3;;40
tgg;1,858;2,103;1,722;;6;;48411
gtt;4;11;1,825;;5;;1044
act;44;0;1,912;;1;;6133
tac;2,732;2,172;1,925;;3;;1
caa;2,718;2,240;1,989;;2;;620
cga;377;2,115;2,030;;4;;17640
att;2;0;2,109;;9;;182000
aaa;3,874;2,252;2,293;;4;;104
tgc;1,903;3,418;2,393;;2;;102
gac;3,839;2,492;2,432;;6;;451050
gct;1;0;2,573;;5;;65550
gtg;559;1,943;2,713;;5;;606
ggc;3,946;2,777;2,849;;7;;6
aac;3,729;2,446;3,061;;7;;531
gag;591;1,829;3,261;;3;;1199
atg;7,670;6,732;3,355;;23;;1373
gcg;521;1,817;4,115;;17;;351
gga;2,347;2,160;4,811;;9;;127
aag;1,033;1,897;5,268;;16;;7
ggg;964;1,772;6,126;;0;;327
gaa;4,118;2,629;6,150;;8;;5
gca;4,334;2,926;6,636;;;;
Diagramme de comparaison globale[modifier | modifier le wikicode]
Diagramme B et E en fonction de A;;;;
;A;B;E;zero
cgg;1,589;1,427;453;0
ccg;1,726;929;639;0
tcg;1,737;1,116;651;0
ggg;1,772;964;6,126;0
gcg;1,817;521;4,115;0
gag;1,829;591;3,261;0
ctg;1,829;2,207;1,126;0
ttg;1,863;1,702;1,085;0
cag;1,886;1,016;1,606;0
agg;1,886;1,469;1,116;0
aag;1,897;1,033;5,268;0
acg;1,932;1,174;724;0
gtg;1,943;559;2,713;0
ccc;1,955;1,167;30;0
gcc;2,103;1,773;352;0
tgg;2,103;1,858;1,722;0
tca;2,103;2,255;904;0
cca;2,103;2,320;1,426;0
cga;2,115;377;2,030;0
cac;2,115;2,006;1,632;0
cta;2,115;2,102;758;0
aga;2,126;2,044;1,531;0
gta;2,126;3,769;945;0
cgc;2,137;142;50;0
agc;2,137;1,881;1,646;0
acc;2,160;1,920;134;0
gga;2,160;2,347;4,811;0
tcc;2,172;1,923;98;0
tac;2,172;2,732;1,925;0
tta;2,183;2,021;773;0
caa;2,240;2,718;1,989;0
aaa;2,252;3,874;2,293;0
aca;2,263;2,501;1,298;0
gtc;2,423;1,885;95;0
atc;2,423;3,916;86;0
ctc;2,446;1,638;32;0
aac;2,446;3,729;3,061;0
ttc;2,457;2,598;1,679;0
gac;2,492;3,839;2,432;0
gaa;2,629;4,118;6,150;0
ggc;2,777;3,946;2,849;0
gca;2,926;4,334;6,636;0
tgc;3,418;1,903;2,393;0
atg;6,732;7,670;3,355;0

Similitude des comportements des codons dans les 3 domaines[modifier | modifier le wikicode]

Corrélations entre nombre de tRNAs des 3 domaines A B E[modifier | modifier le wikicode]

  1. Coefficient R 80.9 77.7: coefficient de corrélation respectivement de toute la colonne, des codons colorés en cyan.
  2. Domaine A B E, Ba Eb Ea: domaine respectivement des archées bactéries eucaryotes, diagramme respectivement de la corrélation AB BE AE.
  3. permutation: permutation entre le nombre de tRNAs du codon xyt et xyc pour le domaine E, 7 permutations, et le domaine B, 1 permutation. En supposant que les tRNAs des codons xyt de E se comportement relativement de la même façon que les codons xyc de B.
  4. Retraits:retrait des codons gxa,g et cga aag qui sont surexprimés dans le domaine E.
  5. X10: multiplication des nombres des tRNAs des domaines A et B pour adapter à l'échelle de E.
;Sans permuter;;1 permutation;;codons xya,g;;Diagramme AB  x10;;;;;Sans permuter;;7 permutations;;X10;retraits;Diagramme BE  x10;;;;;Sans permuter;;8 permutations;;X10;retraits;Diagramme AE  x10;;
coeff. R;80.9;;86.6;;84.0;;;86.6;77.7;;;35.6;;52.4;;90.4;;;90.4;75.4;;;34.8;;59.8;;87.4;;;87.4;76.2
dom.;B;A;B;A;B;A;codons;A;Ba;;;B;E;B;E;B;E;codons;B;Eb;;;A;E;A;E;A;E;codons;A;Ea
ttt;0.25;0;0.25;0;;;ttt;0;2.5;;ttt;0.25;43;0.25;43;2.48;43;gat;0;65;;ttt;0;43;0;43;0;43;ttt;0;43
ttc;151;117;151;117;;;att;0;1.2;;ttc;151;1,247;151;1,247;1514;1,247;agt;0.25;34;;ttc;117;1,247;117;1,247;1,168;1,247;att;0;64
tta;118;104;118;104;118;104;tct;0;1.2;;tta;118;574;118;574;1178;574;ggt;0.25;85;;tta;104;574;104;574;1,038;574;tct;0;73
ttg;99;89;99;89;99;89;cct;0;2.5;;ttg;99;806;99;806;992;806;gct;0.50;261;;ttg;89;806;89;806;886;806;cct;0;22
ctt;9.2;0.54;9.2;0.54;;;act;0;26;;ctt;9.2;1,017;9.2;24;91.5;24;tgt;0.74;150;;ctt;0.54;1,017;0.54;24;5;24;act;0;99
ctc;95;116;95;116;;;gct;0;0.5;;ctc;95;24;95;1,017;955;1,017;tat;0.99;100;;ctc;116;24;116;1,017;1,163;1,017;gct;0;261
cta;123;101;123;101;123;101;tat;0;1.0;;cta;123;563;123;563;1225;563;cat;0.99;30;;cta;101;563;101;563;1,005;563;tat;0;100
ctg;129;87;129;87;129;87;cat;0;1.0;;ctg;129;836;129;836;1286;836;att;1.24;64;;ctg;87;836;87;836;870;836;cat;0;30
att;0.12;0;0.12;0;;;aat;0;1.2;;att;0.12;1,566;0.12;64;1.24;64;tct;1.24;73;;att;0;1,566;0;64;0;64;aat;0;96
atc;228;115;228;115;;;gat;0;0;;atc;228;64;228;1,566;2282;1,566;aat;1.24;96;;atc;115;64;115;1,566;1,152;1,566;gat;0;65
ata;1.4;1.1;1.4;1.1;1.4;1.1;tgt;0;0.7;;ata;1.4;549;1.4;549;13.6;549;gtt;2.23;70;;ata;1.1;549;1.1;549;11;549;tgt;0;150
atg;447;320;447;320;447;320;agt;0;0.2;;atg;447;2,492;447;2,492;4471;2,492;ttt;2.48;43;;atg;320;2,492;320;2,492;3,201;2,492;agt;0;34
gtt;0.22;0.54;0.22;0.54;;;ctt;5.4;92;;gtt;0.22;1,355;0.22;70;2.23;70;cct;2.48;22;;gtt;0.54;1,355;0.54;70;5;70;ctt;5;24
gtc;110;115;110;115;;;gtt;5.4;2.2;;gtc;110;70;110;1,355;1099;1,355;ata;13.6;549;;gtc;115;70;115;1,355;1,152;1,355;gtt;5;70
gta;220;101;220;101;220;101;ggt;5.4;0.2;;gta;220;702;220;702;;;act;26;99;;gta;101;702;101;702;;;ggt;5;85
gtg;33;92;33;92;33;92;ata;10.9;13.6;;gtg;33;2,015;33;2,015;;;cgc;82.6;37;;gtg;92;2,015;92;2,015;;;ata;11;549
tct;0.12;0;0.12;0;;;cgt;11;83;;tct;0.12;1,202;0.12;73;1.24;73;ctt;91.5;24;;tct;0;1,202;0;73;0;73;cgt;11;37
tcc;112;103;112;103;;;tga;98;326;;tcc;112;73;112;1,202;1121;1,202;tga;326;180;;tcc;103;73;103;1,202;1,033;1,202;tga;98;180
tca;131;100;131;100;131;100;cgg;755;832;;tca;131;672;131;672;1314;672;ccg;541;474;;tca;100;672;100;672;1,000;672;cgg;755;337
tcg;65;83;65;83;65;83;ccg;821;541;;tcg;65;483;65;483;650;483;cag;593;1,193;;tcg;83;483;83;483;826;483;ccg;821;474
cct;0.25;0;0.25;0;;;tcg;826;650;;cct;0.25;1,057;0.25;22;2.48;22;tcg;650;483;;cct;0;1,057;0;22;0;22;tcg;826;483
ccc;68;93;68;93;;;ggg;842;562;;ccc;68;22;68;1,057;680;1,057;ccc;680;1,057;;ccc;93;22;93;1,057;929;1,057;ctg;870;836
cca;135;100;135;100;135;100;gcg;864;304;;cca;135;1,059;135;1,059;1352;1,059;acg;685;537;;cca;100;1,059;100;1,059;1,000;1,059;ttg;886;806
ccg;54;82;54;82;54;82;ctg;870;1,286;;ccg;54;474;54;474;541;474;cgg;832;337;;ccg;82;474;82;474;821;474;cag;897;1,193
act;3;0;3;0;;;gag;870;344;;act;3;1,420;3;99;26;99;agg;856;829;;act;0;1,420;0;99;0;99;agg;897;829
acc;112;103;112;103;;;ttg;886;992;;acc;112;99;112;1,420;1119;1,420;ctc;955;1,017;;acc;103;99;103;1,420;1,027;1,420;acg;918;537
aca;146;108;146;108;146;108;cag;897;593;;aca;146;964;146;964;1458;964;ttg;992;806;;aca;108;964;108;964;1,076;964;ccc;929;1,057
acg;68;92;68;92;68;92;agg;897;856;;acg;68;537;68;537;685;537;tgg;1083;1,279;;acg;92;537;92;537;918;537;tca;1,000;672
gct;0.05;0;0.05;0;;;aag;902;602;;gct;0.05;1,911;0.05;261;0.50;261;agc;1097;1,223;;gct;0;1,911;0;261;0;261;cca;1,000;1,059
gcc;103;100;103;100;;;acg;918;685;;gcc;103;261;103;1,911;;;gtc;1099;1,355;;gcc;100;261;100;1,911;;;tgg;1,000;1,279
gca;253;139;253;139;253;139;gtg;924;326;;gca;253;4,928;253;4,928;;;acc;1119;1,420;;gca;139;4,928;139;4,928;;;cta;1,005;563
gcg;30;86;30;86;30;86;ccc;929;680;;gcg;30;3,056;30;3,056;;;tcc;1121;1,202;;gcg;86;3,056;86;3,056;;;cac;1,005;1,212
tat;0.10;0;0.10;0;;;tca;1,000;1,314;;tat;0.10;100;0.10;100;0.99;100;cac;1169;1,212;;tat;0;100;0;100;0;100;cga;1,005;1,508
tac;159;103;159;103;;;cca;1,000;1,352;;tac;159;1,430;159;1,430;1592;1,430;tta;1178;574;;tac;103;1,430;103;1,430;1,033;1,430;aga;1,011;1,137
cat;0.10;0;0.10;0;;;gcc;1,000;1,033;;cat;0.10;30;0.10;30;0.99;30;aga;1191;1,137;;cat;0;30;0;30;0;30;cgc;1,016;1,024
cac;117;101;117;101;;;tgg;1,000;1,083;;cac;117;1,212;117;1,212;1169;1,212;cta;1225;563;;cac;101;1,212;101;1,212;1,005;1,212;agc;1,016;1,223
caa;158;107;158;107;158;107;cta;1,005;1,225;;caa;158;1,477;158;1,477;1584;1,477;ctg;1286;836;;caa;107;1,477;107;1,477;1,065;1,477;acc;1,027;1,420
cag;59;90;59;90;59;90;cac;1,005;1,169;;cag;59;1,193;59;1,193;593;1,193;tca;1314;672;;cag;90;1,193;90;1,193;897;1,193;tcc;1,033;1,202
aat;0.12;0;0.12;0;;;cga;1,005;220;;aat;0.12;96;0.12;96;1.24;96;cca;1352;1,059;;aat;0;96;0;96;0;96;tac;1,033;1,430
aac;217;116;217;116;;;gta;1,011;2,197;;aac;217;2,274;217;2,274;2174;2,274;aca;1458;964;;aac;116;2,274;116;2,274;1,163;2,274;tta;1,038;574
aaa;226;107;226;107;226;107;aga;1,011;1,191;;aaa;226;1,703;226;1,703;2258;1,703;ttc;1514;1,247;;aaa;107;1,703;107;1,703;1,071;1,703;caa;1,065;1,477
aag;60;90;60;90;60;90;cgc;1,016;1,855;;aag;60;3,912;60;3,912;;;caa;1584;1,477;;aag;90;3,912;90;3,912;;;aaa;1,071;1,703
gat;0;0;0;0;;;agc;1,016;1,097;;gat;0;65;0;65;0;65;tac;1592;1,430;;gat;0;65;0;65;0;65;aca;1,076;964
gac;224;118;224;118;;;acc;1,027;1,119;;gac;224;1,806;224;1,806;2238;1,806;cgt;1855;1,024;;gac;118;1,806;118;1,806;1,185;1,806;atc;1,152;1,566
gaa;240;125;240;125;240;125;gga;1,027;1,368;;gaa;240;4,567;240;4,567;;;aac;2174;2,274;;gaa;125;4,567;125;4,567;;;gtc;1,152;1,355
gag;34;87;34;87;34;87;tcc;1,033;1,121;;gag;34;2,422;34;2,422;;;gac;2238;1,806;;gag;87;2,422;87;2,422;;;ctc;1,163;1,017
tgt;0.07;0;0.07;0;;;tac;1,033;1,592;;tgt;0.07;150;0.07;150;0.74;150;aaa;2258;1,703;;tgt;0;150;0;150;0;150;aac;1,163;2,274
tgc;111;163;111;163;;;tta;1,038;1,178;;tgc;111;1,777;111;1,777;;;atc;2282;1,566;;tgc;163;1,777;163;1,777;1,625;1,777;ttc;1,168;1,247
tga;33;10;33;10;33;10;caa;1,065;1,584;;tga;33;180;33;180;326;180;ggc;2300;2,115;;tga;10;180;10;180;98;180;gac;1,185;1,806
tgg;108;100;108;100;108;100;aaa;1,071;2,258;;tgg;108;1,279;108;1,279;1083;1,279;atg;4471;2,492;;tgg;100;1,279;100;1,279;1,000;1,279;ggc;1,321;2,115
cgt;185;1.1;8.3;1.1;;;aca;1,076;1,458;;cgt;185;1,024;185;1,024;1855;1,024;tgc;;;;cgt;1.1;1,024;1.1;37;11;37;tgc;1,625;1,777
cgc;8.3;102;185;102;;;atc;1,152;2,282;;cgc;8.3;37;8.3;37;82.6;37;gcc;;;;cgc;102;37;102;1,024;1,016;1,024;atg;3,201;2,492
cga;22;101;22;101;22;101;gtc;1,152;1,099;;cga;22;1,508;22;1,508;;;gta;;;;cga;101;1,508;101;1,508;1,005;1,508;gcc;;
cgg;83;76;83;76;83;76;ctc;1,163;955;;cgg;83;337;83;337;832;337;gtg;;;;cgg;76;337;76;337;755;337;gta;;
agt;0.02;0;0.02;0;;;aac;1,163;2,174;;agt;0.02;34;0.02;34;0.25;34;gca;;;;agt;0;34;0;34;0;34;gtg;;
agc;110;102;110;102;;;ttc;1,168;1,514;;agc;110;1,223;110;1,223;1097;1,223;gcg;;;;agc;102;1,223;102;1,223;1,016;1,223;gca;;
aga;119;101;119;101;119;101;gac;1,185;2,238;;aga;119;1,137;119;1,137;1191;1,137;aag;;;;aga;101;1,137;101;1,137;1,011;1,137;gcg;;
agg;86;90;86;90;86;90;gaa;1,250;2,401;;agg;86;829;86;829;856;829;gaa;;;;agg;90;829;90;829;897;829;aag;;
ggt;0.02;0.54;0.02;0.54;;;ggc;1,321;2,300;;ggt;0.02;85;0.02;85;0.25;85;gag;;;;ggt;0.54;85;0.54;85;5;85;gaa;;
ggc;230;132;230;132;;;gca;1,391;2,526;;ggc;230;2,115;230;2,115;2300;2,115;cga;;;;ggc;132;2,115;132;2,115;1,321;2,115;gag;;
gga;137;103;137;103;137;103;tgc;1,625;1,109;;gga;137;3,573;137;3,573;;;gga;;;;gga;103;3,573;103;3,573;;;gga;;
ggg;56;84;56;84;56;84;atg;3,201;4,471;;ggg;56;4,550;56;4,550;;;ggg;;;;ggg;84;4,550;84;4,550;;;ggg;;

Rapport E/B des codons[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Rapport E/B des codons
  • Légende: Valeur du codon se terminant par x de E / Valeur du codon se terminant par x de B
  1. 0.8: t de E / c de B
  2. Tableau rapport E/B pour 100 000: d'après les valeurs des tableaux III100 / I100
  3. Tableau rapport E/B par génome: d'après les valeurs des tableaux III1 / I1
  • Tableau non formaté
rapport E/B;;Pour 100 000;;;;;
ttt;;tct;0.83;tat;;tgt;
c;0.63;c;;c;0.69;c;1.23
a;0.38;a;0.39;a;−;a;0.42
g;0.63;g;0.57;g;−;g;0.91
ctt;0.82;cct;1.20;cat;;cgt;0.42
c;;c;;c;0.80;c;0.34
a;0.35;a;0.60;a;0.72;a;5.27
g;0.50;g;0.67;g;1.55;g;0.31
att;0.53;act;0.98;aat;;agt;
c;;c;;c;0.81;c;0.86
a;;a;0.51;a;0.58;a;0.73
g;0.43;g;0.60;g;5.00;g;0.75
gtt;0.95;gct;1.42;gat;;ggt;
c;;c;;c;0.62;c;0.71
a;0.25;a;1.50;a;1.46;a;2.01
g;4.76;g;7.75;g;5.41;g;6.23
rapport E/B;;Par génome;;;;;
ttt;−;tct;11;tat;−;tgt;−
c;8;c;0.7;c;9;c;16
a;5;a;5;a;−;a;6
g;8;g;7;g;−;g;12
ctt;11;cct;16;cat;−;cgt;6
c;0.3;c;0.3;c;10;c;4
a;5;a;8;a;9;a;69
g;7;g;9;g;20;g;4
att;5;act;13;aat;−;agt;−
c;0.3;c;0.9;c;10;c;11
a;402;a;7;a;8;a;10
g;6;g;8;g;65;g;10
gtt;12;gct;18;gat;−;ggt;−
c;0.6;c;2.5;c;8;c;9
a;3.2;a;20;a;19;a;26
g;62;g;101;g;70;g;81

Totaux des carrés pour 100 000 tRNAs[modifier | modifier le wikicode]

- Totaux des carrés
B;t;c;a;g
t;6 219;5 208;2 688;4 250
c;6 002;4 346;5 647;5 043
a;11 418;5 546;8 494;5 305
g;6 113;6 518;8 406;7 136
;;;;
A;t;c;a;g
t;6 517;6 025;2 176;5 738
c;6 414;5 795;6 254;5 876
a;9 197;6 368;6 609;6 162
g;6 517;6 861;6 964;6 735
;;;;
E;t;c;a;g
t;3 466;3 155;1 986;4 397
c;3 167;3 391;5 080;3 772
a;6 065;3 922;10 368;4 184
g;5 379;13 187;11 503;13 403

Variation en % entre la 1ère et la 2ème valeur[modifier | modifier le wikicode]

  1. -17, variation en % des 2 1ères valeurs; 779 différence en valeur absolue de la base de données de référence. La variation est calculée entre le nombre de codons contenu dans la cellule affichant la variation en % (-17) et celui contenu dans la cellule affichant la différence en valeur absolue (779).
  2.     : 4ème valeur sans changement entre B et A ou E
  3.     : 3ème valeur sans changement entre B et A ou E
  4.     : 4ème valeur après changement entre B et A ou E
  5.     : 3ème valeur après changement entre B et A ou E
  • Moyenne des valeurs absolues des variations:
	B	A	E
Moy	48.1	18.2	39.1
Ecart	47.4	21.0	24.5
%	98.5	115.2	62.7
  • Tableau non formaté
I 100;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;;;;II 100;Nombres de tRNAs. 184 archées;;;;;;;;III 100;Nombres de tRNAs. 155 eucaryotes;;;;;;
ttt;;tct;;tat;;tgt;;;ttt;;tct;;tat;;tgt;;;ttt;;tct;79;tat;;tgt;
c;29;c;-17;c;;c;2;;c;13;c;3;c;;c;63;;c;55;c;;c;;c;39
a;1 356;a;779;a;-;a;;;a;24;a;6;a;-;a;;;a;;a;822;a;-;a;
g;;g;;g;-;g;107;;g;;g;;g;-;g;115;;g;684;g;;g;-;g;773
ctt;;cct;;cat;;cgt;123;;ctt;;cct;;cat;;cgt;;;ctt;22;cct;0;cat;;cgt;-32
c;;c;-99;c;-35;c;;;c;16;c;-8;c;-6;c;1;;c;;c;;c;-22;c;
a;-5;a;2 711;a;1 673;a;;;a;29;a;13;a;11;a;2;;a;;a;3;a;410;a;750
g;246;g;;g;;g;4 123;;g;;g;;g;;g;;;g;280;g;;g;;g;
att;;act;;aat;;agt;;;att;;act;;aat;;agt;;;att;-37;act;47;aat;;agt;
c;-49;c;-30;c;-4;c;-9;;c;-64;c;-5;c;9;c;1;;c;;c;;c;-42;c;7
a;;a;1 365;a;341;a;382;;a;;a;9;a;17;a;1;;a;;a;707;a;;a;133
g;8 823;g;;g;;g;;;g;377;g;;g;;g;;;g;1 434;g;;g;2 540;g;
gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;;gct;;gat;;ggt;;;gtt;-33;gct;;gat;;ggt;
c;-100;c;-144;c;-7;c;68;;c;14;c;-39;c;-6;c;29;;c;;c;;c;;c;
a;4 429;a;6 019;a;656;a;3 758;;a;26;a;72;a;12;a;54;;a;;a;61;a;89;a;-21
g;;g;;g;;g;;;g;;g;;g;;g;;;g;1 022;g;2 902;g;3 325;g;1 514

Nombres de tRNAs des 4032 bactéries[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Nombres de tRNAs des 4032 bactéries
  • Base de données gtRNAdb [2]
  • Légende:
    1. I. Nombres de tRNAs. 4032 bactéries.
        5   : nombre de tRNAs d'un codon se terminant par t. Ils sont tous inférieurs à 11 sauf ctt cgt act.
      4 366: Effectif élevé de tRNAs d'un codon se terminant par g.
      2622: Effectif faible de tRNAs.
    2. II. Nombre de bactéries à tRNAs solitaires de 4 codons (1ère et 2ème base). Total d’une requête: Comptage fait pour les carrés. C’est un nombre de bactéries ayant x tRNAs pour un seul et même codon.
      Total d'une requête: Le 1er codon se terminant par t n'a pas de solitaire sauf ici pour Arg, et il est remplacé par le total de la requête.
      a,g,c : Nombre de bactéries à tRNAs solitaires pour les carrés de 4 codons.
      106*: solitaires du codon cgt. Le carré de Arg étant complet le total de la requête est représenté par *, il est de 3946.
      Note: le total des bactéries de la base des tRNA est de 4032. Cependant le total des bactéries comptées est compris entre 3832-3947. Est-ce que ce qui manque est du aux bactéries sans tRNAs pour les codons demandés? Cela ne serait pas vrai pour les aas à 2 codons.
      − Méthode pour compter, cas de la Thr, anti-codons xGT:
      • Sélectionner les anticodons pour la requête (ne pas oublier de mettre Bacteria dans Domain). Copier le résultat, ctrl+A, ctrl+C.
      • Dans calc ctrl+V, supprimer le dessin en le sélectionnant, supprimer toutes les colonnes sauf la colonne des anticodons, sélectionner le 1er anticodon puis ctrl+schift+fin ce qui sélectionne tous les anticodons et les cellules à blanc. Il n'y a pas de cellule intercalée entre 2 anticodon de la même bactérie.
      • Copier,ctrl+v, dans writer (texte non formaté), ctrl+h (expression régulière, $ en ; tout remplacer), ctrl+h (décocher expression régulière, ;; en *;;* tout remplacer). Le tout rechercher de * ;;* donne le total de la requête (nombre total de bactéries moins 1). Mettre un * à la fin mais pas début (le logiciel déplace tout le texte pour insérer *, ce qui prend beaucoup de temps). Repérer le motif du début avant * ;;*. Si le motif concerne une recherche ultérieure, en tenir compte.
      • ctrl+h (*GGT* tout rechercher donne 2916, *AGT* donne 41, *GGT;GGT donne 754 . . . ).
    3. III. Nombre de bactéries à tRNAs solitaires des codons a,g et t,c. Total d’une requête: tRNAs solitaires pour les codons se terminant par a ou g et t ou c; total des bactéries d'une requête de la base de données suivant les codons demandés.
      stc,sag, tt (1ère et 2ème base d'un carré) , tc . . . : Total des bactéries respectivement de la requête pour 2 codons se terminant par t ou c, pour 2 codons se terminant par a ou g.
      a,g,t,c : Nombre de bactéries à tRNAs solitaires pour les codons se terminant par a,g,t,c.
      − Trp-Sec: Les solitaires de Sec sont en fait des Trp (tga).
    4. IV. Pourcentage des bactéries à tRNAs solitaires: calculés à partir des tableaux II et III précédents.
      tt (1ère et 2ème base d'un carré) , tc . . .
      %4: Pourcentage des bactéries à 1 seul codon à tRNA dans les carrés de 4; toujours a est à plus de 90% sauf pour cgt (Arg) et atg (Met).
      %2: Pourcentage des bactéries à 1 seul codon à tRNA pour les codons se terminant par a ou g. Toujours a est à plus de 90% sauf pour R (cg), L (tt), M et W.
      1a1g: Nombre de bactéries ayant 1 tRNA pour le codon se terminant par a et 1 tRNA pour le codon se terminant par g. Permet de mettre en exergue les autres bactéries ayant des tRNAs multiples.
    5. V. Multiplicité des tRNAs en %: Voir les calculs.
;I. Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;;
ttt;10;tct;5;tat;4;tgt;3
c;6105;c;4520;c;6420;c;4473
a;4749;a;5299;a;−;a;1315
g;3999;g;2622;g;−;g;4366
ctt;369;cct;10;cat;4;cgt;7478
c;3849;c;2742;c;4715;c;333
a;4940;a;5453;a;6388;a;887
g;5186;g;2183;g;2389;g;3355
att;5;act;103;aat;5;agt;1
c;9,203;c;4513;c;8,764;c;4422
a;55;a;5878;a;9,105;a;4804
g;18,026;g;2760;g;2427;g;3452
gtt;9;gct;2;gat;0;ggt;1
c;4430;c;4166;c;9,023;c;9,273
a;8,859;a;10,185;a;9,679;a;5515
g;1313;g;1224;g;1388;g;2266

II. Nombre de bactéries à tRNAs solitaires des carrés à 4 codons.;;;;;Total d’une requête.
ttt;3948;tct;3945;tat;3934;tgt;3947
c;15;c;2;c;3930;c;12
a;0;a;85;a;−;a;0
g;2;g;0;g;−;g;17
ctt;3942;cct;3941;cat;3948;cgt;106*
c;7;c;3;c;5;c;1
a;98;a;1173;a;6;a;7
g;0;g;1;g;2;g;7
att;3949;act;3946;aat;3949;agt;3944
c;2;c;2;c;2;c;1
a;0;a;152;a;5;a;0
g;81;g;3;g;1;g;0
gtt;3943;gct;3934;gat;3949;ggt;3948
c;8;c;32;c;5;c;9
a;724;a;877;a;8;a;66
g;1;g;7;g;1;g;0

III. Nombre de bactéries à tRNAs solitaires des codons ag.;;;;;;;
tt;−;tc;−;ta;−;tg;−
sag;3933;sag;3943;sag;−;sag;3934
a;96;a;1493;a;−;a;15
g;190;g;22;g;−;g;2629
ct;−;cc;−;ca;−;cg;−
sag;3935;sag;3939;sag;3943;sag;3833
a;692;a;1813;a;2130;a;539
g;30;g;5;g;18;g;3026
at;−;ac;−;aa;−;ag;−
sag;3947;sag;3944;sag;3941;sag;3928
a;0;a;1288;a;1899;a;780
g;3947;g;13;g;9;g;10
gt;−;gc;−;ga;−;gg;−
sag;3935;sag;3902;sag;3928;sag;3939
a;2724;a;2721;a;2808;a;1699
g;2;g;11;g;5;g;11

IV. Pourcentage des bactéries à tRNAs solitaires;;;;
;tt;tc;ta;tg
%4;−;2,2;−;−
1a1g;2804;2114;−;1238
%2;7;38;−;67
;ct;cc;ca;cg
%4;2,7;29,9;−;3,1
1a1g;962;1911;996;222
%2;18;46;54;93
;at;ac;aa;ag
%4;2,1;4,0;−;−
1a1g;0;2166;1155;2579
%2;100;33;48;20
;gt;gc;ga;gg
%4;18,6;23,3;−;1,9
1a1g;1 051;562;602;1973
%2;69;70;72;43
;ct;cg;ac;−
%4;2,7;3,1;4,0;−
1t1c;8;10;41;−
%2;99;99;98;−

V. Multipilcité;;;;;;;
;FL;;SS;;YX;;CW
t;1,00;;1,00;;1,00;;1,00
c;1,55;;1,18;;1,63;;1,14
a;1,27;;1,35;;-;;1,01
g;1,04;;1,07;;-;;1,11
;LL;;P;;HQ;;RR
t;1,11;;1,00;;1,33;;2,06
c;1,10;;1,03;;1,20;;1,05
a;1,26;;1,39;;1,63;;1,10
g;1,86;;1,03;;1,32;;1,02
;IM;;T;;NK;;SR
t;1,00;;1,11;;1,00;;1,00
c;2,38;;1,21;;2,23;;1,12
a;1,15;;1,50;;2,32;;1,23
g;4,57;;1,04;;1,19;;1,10
;V;;A;;DE;;G
t;1,00;;1,00;;0,00;;1,00
c;1,38;;1,37;;2,29;;2,39
a;2,25;;2,62;;2,47;;1,40
g;1,09;;1,04;;1,24;;1,01

Calcul de la multiplicité des tRNAs[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Calcul de la multiplicité des tRNAs
  • Légende: tRNAs, nombre affiché par la requête. lignes, nombre de lignes affiché dans calc après nettoyage. bactéries=lignes - tRNAs. multiplicité= tRNAs / bactéries.
  • Tableau non formaté
;;t;;;;;c;;;;;a;;;;;g;;;
;;tRNAs;lignes;bactéries;multiplicité; ;tRNAs;lignes;bactéries;multiplicité; ;tRNAs;lignes;bacteries;multiplicité; ;tRNAs;lignes;bactéries;multiplicité
 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
t;t;10;19;10;1,00;;5;9;5;1,00;;4;7;4;1,00;;3;5;3;1,00
;c;6105;10044;3940;1,55;;4520;8343;3824;1,18;;6420;10353;3934;1,63;;4473;8401;3929;1,14
;a;4749;8491;3743;1,27;;5299;9221;3923;1,35;;;;1;0,00;;1315;2619;1305;1,01
;g;3999;7835;3837;1,04;;2622;5071;2450;1,07;;;;1;0,00;;4366;8285;3920;1,11
 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
c;t;369;700;332;1,11;;10;19;10;1,00;;4;6;3;1,33;;7478;11102;3625;2,06
;c;3849;7359;3511;1,10;;2742;5399;2658;1,03;;4715;8649;3935;1,20;;333;650;318;1,05
;a;4940;8857;3918;1,26;;5453;9386;3934;1,39;;6388;10312;3925;1,63;;887;1693;807;1,10
;g;5186;7969;2784;1,86;;2183;4307;2125;1,03;;2389;4201;1813;1,32;;3355;6648;3294;1,02
 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
a;t;5;9;5;1,00;;103;195;93;1,11;;5;9;5;1,00;;1;1;1;1,00
;c;9203;13067;3865;2,38;;4513;8246;3734;1,21;;8764;12695;3932;2,23;;4422;8354;3933;1,12
;a;55;102;48;1,15;;5878;9808;3931;1,50;;9105;13036;3932;2,32;;4804;8721;3918;1,23
;g;18026;21972;3947;4,57;;2760;5415;2656;1,04;;2427;4468;2042;1,19;;3452;6600;3149;1,10
 ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
g;t;9;17;9;1,00;;2;3;2;1,00;;0;0;1;0,00;;1;1;1;1,00
;c;4430;7637;3208;1,38;;4166;7201;3036;1,37;;9023;12957;3935;2,29;;9273;13153;3881;2,39
;a;8859;12791;3933;2,25;;10185;14075;3891;2,62;;9679;13603;3925;2,47;;5515;9442;3928;1,40
;g;1313;2521;1209;1,09;;1224;2404;1181;1,04;;1388;2509;1122;1,24;;2266;4505;2240;1,01

Comparaison des codons par les 2 1ères bases[modifier | modifier le wikicode]

Multiplicité;;NK;DE;HQ;;V;A;;SS;T;;P;G;;RR;;LL;;FL;SR;;IM;CW;;YX
;t;1,00;0,00;1,33;;1,00;1,00;;1,00;1,11;;1,00;1,00;;2,06;;1,11;;1,00;1,00;;1,00;1,00;;1,00
;c;2,23;2,29;1,20;;1,38;1,37;;1,18;1,21;;1,03;2,39;;1,05;;1,10;;1,55;1,12;;2,38;1,14;;1,63
;a;2,32;2,47;1,63;;2,25;2,62;;1,35;1,50;;1,39;1,40;;1,10;;1,26;;1,27;1,23;;1,15;1,01;;−
;g;1,19;1,24;1,32;;1,09;1,04;;1,07;1,04;;1,03;1,01;;1,02;;1,86;;1,04;1,10;;4,57;1,11;;−
total tRNAs;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;t;5;0;4;;9;2;;5;103;;10;1;;7478;;369;;10;1;;5;3;;4
;c;8 764;9 023;4715;;4430;4166;;4520;4513;;2742;9 273;;333;;3849;;6105;4422;;9 203;4473;;6420
;a;9 105;9 679;6388;;8 859;10 185;;5299;5878;;5453;5515;;887;;4940;;4749;4804;;55;1315;;−
;g;2427;1388;2389;;1313;1224;;2622;2760;;2183;2266;;3355;;5186;;3999;3452;;18 026;4366;;−
codon solitaire;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;t;0;0;0;;0;0;;0;0;;0;0;;106;;0;;0;0;;0;0;;0
;c;;;;;8;32;;2;2;;3;9;;1;;7;;;;;;;;
;a;;;;;724;877;;85;152;;1173;66;;7;;98;;;;;;;;
;g;;;;;1;7;;0;3;;1;0;;7;;0;;;;;;;;
solitaire  a,g;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;total;3950;3950;3950;;3935;3902;;3943;3944;;3939;3939;;3833;;3935;;3950;3950;;3950;3950;;3950
;a;1899;2808;2130;;2724;2721;;1493;1288;;1813;1699;;539;;692;;96;780;;0;15;;−
;g;9;5;18;;2;11;;22;13;;5;11;;3026;;30;;190;10;;3950;2629;;−
moyenne codon;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;t/c %;4;7;-17;;11;-41;;4;-56;;5;-17;;-25;;-7;;-2;-35;;-7;-15;;8
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;a/g %;20;27;-39;;-48;-32;;-15;-8;;-54;49;;-73;;-144;;39;84;;-59;-191;;103
ordre corrélation;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;t;3a;8a;15a;;9a;14a;;17a;11a;;12a;28a;;32a;;27a;;2a;6a;;6a;21a;;1a
;c;13g;1g;4g;;12g;7g;;22g;8g;;20g;3g;;5g;;17g;;2g;9g;;9g;23g;;11g
;a;5a;20a;10a;;22a;13a;;7a;19a;;16a;23a;;31a;;25a;;4a;26a;;26a;26g;;29a
;g;19g;18g;6g;;21g;15g;;16g;24g;;14g;29g;;25g;;10g;;30a;30g;;30g;28g;;31g

Au niveau de l'ADN le code génétique est structuré par doublets.[modifier | modifier le wikicode]

Lignes et colonnes[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Lignes et colonnes
  • Légende: Les moyennes des codons de la 3ème base appartenant aux doublets ayant la même 1ère base (ligne) ou ayant la même 2ème base (colonne) sont faites sur 4 codons ou sur 3 codons seulement quand on rencontre les codons stop (taa tag) ou le codon ata lorsqu'il est trop faible ( sauf celui des eucaryotes) ou le codon atg à effectif très élevé (sauf celui des eucaryotes). La moyenne des lignes et colonnes est faite sur 12 codons ou seulement 10 quand on rencontre les codons taa tag ata atguand les codons xyt ont des effectifs élevés ils sont permutés avec les codons xyc ( 1 permutation chez les bactéries et 8 chez les eucaryotes). Aussi les lignes et colonnes xyt contiennent les valeurs faibles après permutation et les lignes et colonnes xyc contiennent les valeurs fortes après permutation.
    n pour nombre de codons, mcod pour moyenne des codons, Lig. pour ligne, Col. pour colonne et car. pour carré ou doublet.
    txt, c, a, g pour respectivement les 4 codons "ttt tct tat tgt" de la 3ème base t, les 4 codons "ttc tcc tac tgc" de la 3ème base c . . . etc. (Ligne Lig.)
    xtt, c, a, g pour respectivement les 4 codons "ttt ctt att gtt" de la 3ème base t, les 4 codons "ttc ctc atc gtc" de la 3ème base c . . . etc. (colonne Col.)
  • Tableaux non formatés: voir tableur
− Lignes et colonnes
III LC;Nombres de tRNAs. 155 eucaryotes;;;;;;I LC;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries;;;;;;II LC;Nombres de tRNAs. 184 archées;;;;
Lignes;;;Colon;;115 111;;Lignes;;;Colon;;235 027;;Lignes;;;Colon;;8749
txt;4;123;xtt;4;68;;txt;4;2;xtt;4;42;;txt;4;0;xtt;4;6
c;4;1,904;c;4;1,746;;c;4;2,289;c;4;2,509;;c;4;2,555;c;4;2,437
a;3;640;a;4;804;;a;3;1,612;a;3;2,631;;a;3;1,497;a;3;2,141
g;3;1,153;g;4;2,070;;g;3;1,558;g;3;1,489;;g;3;1,901;g;3;1,878
cxt;4;38;xct;4;153;;cxt;4;76;xct;4;13;;cxt;4;9;xct;4;0
c;4;1,451;c;4;1,882;;c;4;1,998;c;4;1,696;;c;4;2,163;c;4;2,097
a;4;1,550;a;4;2,566;;a;4;1,879;a;4;2,852;;a;4;2,143;a;4;2,349
g;4;956;g;4;1,532;;g;4;1,395;g;4;935;;g;4;1,757;g;4;1,803
axt;4;99;xat;4;98;;axt;4;12;xat;4;1;;axt;4;0;xat;4;0
c;4;2,182;c;4;2,263;;c;4;2,862;c;4;3,076;;c;4;2,292;c;4;2,306
a;4;1,465;a;3;3,477;;a;3;2,806;a;3;3,570;;a;3;2,214;a;3;2,374
g;4;2,616;g;3;3,378;;g;3;1,225;g;3;880;;g;3;1,905;g;3;1,871
gxt;4;162;xgt;4;103;;gxt;4;1;xgt;4;36;;gxt;4;6;xgt;4;9
c;4;2,420;c;4;2,067;;c;4;2,861;c;4;2,728;;c;4;2,449;c;4;2,617
a;4;4,636;a;4;2,154;;a;4;3,642;a;4;1,332;;a;4;2,460;a;4;1,652
g;4;4,054;g;4;2,354;;g;4;659;g;4;1,430;;g;4;1,840;g;4;1,837
Moyenne;;;;;;;Moyenne;;;;;;;Moyenne;;;;;
Lignes;;ttt;ctt;att;gtt;;Lignes;;ttt;ctt;att;gtt;;Lignes;;ttt;ctt;att;gtt
;n;10;12;12;12;;;n;10;12;10;12;;;n;10;12;10;12
;mcod;1,299;1,319;2,088;3,703;;;mcod;1,867;1,757;2,354;2,387;;;mcod;2,041;2,021;2,152;2,250
Moyenne;;;;;;;Moyenne;;;;;;;Moyenne;;;;;
Colon;;ttt;tct;tat;tgt;;Colon;;ttt;tct;tat;tgt;;Colon;;ttt;tct;tat;tgt
;n;12;12;10;12;;;n;10;12;10;12;;;n;10;12;10;12
;mcod;1,540;1,993;2,962;2,192;;;mcod;2,239;1,828;2,566;1,830;;;mcod;2,181;2,083;2,196;2,035
Totaux;;;;;;;Totaux;;;;;;;Totaux;;;;;
carrés;1000;t;c;a;g;;carrés;1000;t;c;a;g;;carrés;1000;t;c;a;g
;t;3.59;3.27;2.06;4.56;;;t;6.32;5.30;2.73;4.32;;;t;6.50;6.01;2.17;5.73
;c;3.28;3.52;5.27;3.91;;;c;6.10;4.42;5.74;5.13;;;c;6.40;5.78;6.24;5.86
;a;6.29;4.07;10.75;4.34;;;a;11.61;5.64;8.64;5.39;;;a;9.18;6.36;6.60;6.15
;g;5.58;13.68;11.93;13.90;;;g;6.22;6.63;8.55;7.26;;;g;6.50;6.85;6.95;6.72

Demi-doublets[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Demi-doublets
  • Légende:
    Domaine E: ensemble des 155 eucaryotes avec un total de tRNAs de 115 111.
    Domaine B: ensemble des 4032 bactéries avec un total de tRNAs de 235 027.
    Domaine A: ensemble des 184 archées avec un total de tRNAs de 8 749.
    g/a: rapport des codons xyg sur xya de la ligne x et de la colonne y du tableau des effectifs,   1.4  rapport inverse de g/a.
    t/c: rapport des codons xyc sur xyt de la ligne x et de la colonne y du tableau des effectifs,   16  rapport inverse de t/c.
    t c a g: colonnes du tableau des effectifs
III 100;Nombres de tRNAs. 155 eucaryotes;;;;;III 100;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries;;;;;III 100;Nombres de tRNAs. 184 archées;;;
;t;c;a;g;;;t;c;a;g;;;t;c;a;g
t/c;29;16;14;12;;t/c;−;−;−;−;;t/c;−;−;−;−
g/a;1.40;1.39;−;7.10;;g/a;1.19;2.02;−;3.32;;g/a;1.17;1.21;−;10.22
t/c;43;48;40;28;;t/c;10.43;−;−;22;;t/c;−;−;−;−
g/a;1.49;2.23;1.2;4.48;;g/a;1.05;2.50;2.67;3.78;;g/a;1.16;1.22;1.19;1.33
t/c;25;14;24;36;;t/c;−;43.82;−;−;;t/c;−;−;−;−
g/a;4.54;1.79;2.30;1.37;;g/a;328;2.13;3.75;1.39;;g/a;295;1.17;1.19;1.13
t/c;19;7.31;28;25;;t/c;−;−;−;−;;t/c;−;−;−;−
g/a;2.87;1.61;1.89;1.27;;g/a;6.75;8.32;6.97;2.43;;g/a;1.09;1.61;1.44;1.22

Codons identiques par classement des 3 bases[modifier | modifier le wikicode]

1ère base;;;;;;;;;2ème base;;;;;;;
II 100;Nombres de tRNAs. 184 archées;;;;;;8749;;II 100;Nombres de tRNAs. 184 archées;;;;;;8749
ttt;0;ttc;2,457;tta;2,183;ttg;1,863;;ttt;0;ttc;2,457;tta;2,183;ttg;1,863
ctt;11;ctc;2,446;cta;2,115;ctg;1,829;;tct;0;tcc;2,172;tca;2,103;tcg;1,737
att;0;atc;2,423;ata;23;atg;6,732;;tat;0;tac;2,172;taa;-;tag;-
gtt;11;gtc;2,423;gta;2,126;gtg;1,943;;tgt;0;tgc;3,418;tga;206;tgg;2,103
tct;0;tcc;2,172;tca;2,103;tcg;1,737;;ctt;11;ctc;2,446;cta;2,115;ctg;1,829
cct;0;ccc;1,955;cca;2,103;ccg;1,726;;cct;0;ccc;1,955;cca;2,103;ccg;1,726
act;0;acc;2,160;aca;2,263;acg;1,932;;cat;0;cac;2,115;caa;2,240;cag;1,886
gct;0;gcc;2,103;gca;2,926;gcg;1,817;;cgt;23;cgc;2,137;cga;2,115;cgg;1,589
tat;0;tac;2,172;taa;-;tag;-;;att;0;atc;2,423;ata;23;atg;6,732
cat;0;cac;2,115;caa;2,240;cag;1,886;;act;0;acc;2,160;aca;2,263;acg;1,932
aat;0;aac;2,446;aaa;2,252;aag;1,897;;aat;0;aac;2,446;aaa;2,252;aag;1,897
gat;0;gac;2,492;gaa;2,629;gag;1,829;;agt;0;agc;2,137;aga;2,126;agg;1,886
tgt;0;tgc;3,418;tga;206;tgg;2,103;;gtt;11;gtc;2,423;gta;2,126;gtg;1,943
cgt;23;cgc;2,137;cga;2,115;cgg;1,589;;gct;0;gcc;2,103;gca;2,926;gcg;1,817
agt;0;agc;2,137;aga;2,126;agg;1,886;;gat;0;gac;2,492;gaa;2,629;gag;1,829
ggt;11;ggc;2,777;gga;2,160;ggg;1,772;;ggt;11;ggc;2,777;gga;2,160;ggg;1,772
;;;;;;;;;;;;;;;;
I 100;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;;235027;;I 100;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;;235027
ttt;4;ttc;2,598;tta;2,021;ttg;1,702;;ttt;4;ttc;2,598;tta;2,021;ttg;1,702
ctt;157;ctc;1,638;cta;2,102;ctg;2,207;;tct;2;tcc;1,923;tca;2,255;tcg;1,116
att;2;atc;3,916;ata;23;atg;7,670;;tat;2;tac;2,732;taa;−;tag;−
gtt;4;gtc;1,885;gta;3,769;gtg;559;;tgt;1;tgc;1,903;tga;560;tgg;1,858
tct;2;tcc;1,923;tca;2,255;tcg;1,116;;ctt;157;ctc;1,638;cta;2,102;ctg;2,207
cct;4;ccc;1,167;cca;2,320;ccg;929;;cct;4;ccc;1,167;cca;2,320;ccg;929
act;44;acc;1,920;aca;2,501;acg;1,174;;cat;2;cac;2,006;caa;2,718;cag;1,016
gct;1;gcc;1,773;gca;4,334;gcg;521;;cgc;142;cgt;3,182;cga;377;cgg;1,427
tat;2;tac;2,732;taa;−;tag;−;;att;2;atc;3,916;ata;23;atg;7,670
cat;2;cac;2,006;caa;2,718;cag;1,016;;act;44;acc;1,920;aca;2,501;acg;1,174
aat;2;aac;3,729;aaa;3,874;aag;1,033;;aat;2;aac;3,729;aaa;3,874;aag;1,033
gat;0;gac;3,839;gaa;4,118;gag;591;;agt;0;agc;1,881;aga;2,044;agg;1,469
tgt;1;tgc;1,903;tga;560;tgg;1,858;;gtt;4;gtc;1,885;gta;3,769;gtg;559
cgt;3,182;cgc;142;cga;377;cgg;1,427;;gct;1;gcc;1,773;gca;4,334;gcg;521
agt;0;agc;1,881;aga;2,044;agg;1,469;;gat;0;gac;3,839;gaa;4,118;gag;591
ggt;0;ggc;3,946;gga;2,347;ggg;964;;ggt;0;ggc;3,946;gga;2,347;ggg;964
;;;;;;;;;;;;;;;;
III 100;Nombres de tRNAs. 155 eucaryotes;;;;;;115111;;III 100;Nombres de tRNAs. 155 eucaryotes;;;;;;115111
ttt;57;ttc;1,679;tta;773;ttg;1,085;;ttt;57;ttc;1,679;tta;773;ttg;1,085
ctt;1,369;ctc;32;cta;758;ctg;1,126;;tct;1,618;tcc;98;tca;904;tcg;1,423
att;2,109;atc;86;ata;739;atg;3,355;;tat;135;tac;1,925;taa;-;tag;41
gtt;1,825;gtc;95;gta;945;gtg;2,713;;tgt;202;tgc;2,393;tga;242;tgg;1,379
tct;1,618;tcc;98;tca;904;tcg;1,423;;ctt;1,369;ctc;32;cta;758;ctg;1,126
cct;1,423;ccc;30;cca;1,426;ccg;639;;cct;1,423;ccc;30;cca;1,426;ccg;639
act;1,912;acc;134;aca;1,298;acg;724;;cat;41;cac;1,632;caa;1,989;cag;1,606
gct;2,573;gcc;352;gca;6,636;gcg;4,115;;cgt;1,379;cgc;50;cga;2,030;cgg;453
tat;135;tac;1,925;taa;-;tag;41;;att;2,109;atc;86;ata;739;atg;3,355
cat;41;cac;1,632;caa;1,989;cag;1,606;;act;1,912;acc;134;aca;1,298;acg;724
aat;129;aac;3,061;aaa;2,293;aag;5,268;;aat;129;aac;3,061;aaa;2,293;aag;5,268
gat;87;gac;2,432;gaa;6,150;gag;3,261;;agt;46;agc;1,646;aga;1,531;agg;1,116
tgt;202;tgc;2,393;tga;242;tgg;1,379;;gtt;1,825;gtc;95;gta;945;gtg;2,713
cgt;1,379;cgc;50;cga;2,030;cgg;453;;gct;2,573;gcc;352;gca;6,636;gcg;4,115
agt;46;agc;1,646;aga;1,531;agg;1,116;;gat;87;gac;2,432;gaa;6,150;gag;3,261
ggt;115;ggc;2,849;gga;4,811;ggg;6,126;;ggt;115;ggc;2,849;gga;4,811;ggg;6,126

Tableau des effectifs élevés des gènes de tRNAs eucaryotes[modifier | modifier le wikicode]

Callorhinchus milii;;;;;;;;;Danio rerio (Zebrafish) ;;;;;;;
;;;13,727;;12,380;;1,347;;;;;12,258;;;;
ttt;3;tct;26;tat;1;tgt;1;;ttt;10;tct;336;tat;5;tgt;9
c;35;c;1;c;36;c;15;;c;197;c;2;c;236;c;136
a;13;a;54;a;;a;3;;a;73;a;209;a;;a;14
g;31;g;48;g;;g;30;;g;241;g;80;g;;g;44
ctt;20;cct;12;cat;1;cgt;9;;ctt;270;cct;315;cat;10;cgt;203
c;2;c;6;c;37;c;;;c;4;c;2;c;387;c;24
a;20;a;51;a;7;a;25;;a;244;a;205;a;105;a;107
g;25;g;41;g;18;g;2;;g;300;g;180;g;266;g;59
att;31;act;24;aat;2;agt;;;att;258;act;359;aat;24;agt;14
c;;c;12;c;48;c;33;;c;10;c;10;c;1,045;c;424
a;23;a;206;a;43;a;14;;a;75;a;290;a;525;a;252
g;94;g;137;g;36;g;12;;g;522;g;66;g;953;g;104
gtt;22;gct;75;gat;6;ggt;2;;gtt;232;gct;92;gat;1;ggt;11
c;16;c;168;c;49;c;19;;c;6;c;4;c;150;c;836
a;145;a;5,898;a;66;a;66;;a;230;a;368;a;225;a;47
g;1,540;g;3,858;g;428;g;81;;g;227;g;112;g;245;g;268
;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;
Balaenoptera acutorostrata scammoni ;;;;;;;;;Tursiops truncatus (Dolphin);;;;;;;
;;;7,090;;6,227;;863;;;;;5,845;;5,112;;733
ttt;;tct;10;tat;;tgt;2;;ttt;;tct;12;tat;1;tgt;6
c;13;c;1;c;14;c;24;;c;12;c;;c;18;c;22
a;13;a;5;a;;a;17;;a;6;a;6;a;;a;21
g;8;g;4;g;;g;256;;g;7;g;4;g;;g;217
ctt;6;cct;7;cat;;cgt;9;;ctt;6;cct;7;cat;;cgt;7
c;;c;;c;11;c;;;c;;c;;c;9;c;1
a;4;a;5;a;10;a;9;;a;4;a;5;a;16;a;7
g;7;g;4;g;20;g;21;;g;6;g;4;g;15;g;12
att;12;act;13;aat;;agt;;;att;11;act;9;aat;;agt;
c;1;c;;c;24;c;13;;c;;c;1;c;13;c;11
a;8;a;8;a;86;a;65;;a;5;a;6;a;74;a;48
g;21;g;4;g;29;g;67;;g;17;g;3;g;19;g;54
gtt;14;gct;20;gat;20;ggt;12;;gtt;8;gct;19;gat;10;ggt;19
c;1;c;;c;45;c;64;;c;3;c;2;c;49;c;43
a;18;a;42;a;2,368;a;987;;a;16;a;36;a;1,901;a;833
g;32;g;20;g;468;g;2,148;;g;22;g;21;g;395;g;1,766
;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;
Bos taurus;;;;;;;;;Felis catus (cat);;;;;;;
;;;4,040;;3,060;;980;;;;;3,729;;2,870;;859
ttt;6;tct;13;tat;11;tgt;143;;ttt;1;tct;8;tat;;tgt;1
c;30;c;32;c;39;c;338;;c;12;c;1;c;10;c;32
a;10;a;7;a;;a;29;;a;19;a;14;a;;a;18
g;14;g;7;g;;g;178;;g;8;g;5;g;;g;23
ctt;11;cct;13;cat;4;cgt;13;;ctt;6;cct;8;cat;2;cgt;9
c;;c;;c;19;c;7;;c;;c;1;c;16;c;9
a;5;a;9;a;20;a;12;;a;33;a;68;a;782;a;1,201
g;6;g;4;g;40;g;16;;g;5;g;7;g;47;g;24
att;18;act;14;aat;;agt;4;;att;10;act;9;aat;5;agt;2
c;;c;1;c;30;c;19;;c;;c;;c;28;c;12
a;8;a;10;a;78;a;44;;a;9;a;13;a;50;a;54
g;35;g;7;g;40;g;116;;g;24;g;9;g;887;g;53
gtt;20;gct;31;gat;6;ggt;20;;gtt;8;gct;18;gat;1;ggt;2
c;;c;2;c;42;c;63;;c;;c;1;c;9;c;10
a;21;a;35;a;435;a;391;;a;6;a;10;a;15;a;48
g;39;g;16;g;164;g;1,295;;g;9;g;7;g;44;g;6

Linéarité du code des gènes de tRNA chez les eucaryotes[modifier | modifier le wikicode]

Calculs pour 121 eucaryotes[modifier | modifier le wikicode]

Texte
  • Légende:
    ttt ttc . . . nombre de gènes de tRNA des codons ttt ttc . . . relevé de la base de données gtRNAdb au 29.10.17
    moy : moyenne des codons d'un eucaryote. Si la ligne contient les caractères € ou #, les codons correspondants n'entrent pas dans la moyenne comme le fait le tableur calc. Les codons faibles xyc/t ne rentrent pas dans la moyenne.
    pour nombres dépassant 100 dans une 1ère approche du coefficient de détermination R2. Il y en a 61.
    # pour nombres améliorant le coefficient de détermination. Il y en a 13.
    − Doublons: ce sont les eucaryotes qui sont dans la base mais non utilisés pour les diagrammes car ils concernent 2 individus de la même espèce ou des variantes très proches des espèces retenues (voir texte pour plus de détail).
    − Tableau des diagrammes: Il est fait de 121 espèces et de 43 codons. Ne sont pas concernés les codons à faibles effectifs xyc ou xyt.
    − Données non modifiées: Pour repérer les codons omis, en jaune ceux supérieurs à 100 () et en orange les codons d'ajustement (#). Pour comparaison j’ai mis zebrafish sans annotations.
    − codons forts: codons à effectifs élevés. Au total 45. Ne sont pas pris en compte les 16 codons xyc/t faibles et les codons stop tga taa tag.
    + total: total des effectifs restants après suppression des effectifs élevés ou d'ajustement.
    + somme calculée: pente multipliée par la somme des moyennes des eucaryotes ayant perdu le codon omis.
    + totaux + sommes calculées: est le nombre calculé des gènes de tRNA du codon.
    + R2 et pente: coefficient de détermination et pente de la courbe de tendance du diagramme du codon en fonction de la moyenne moy. J'ai opté pour une droite passant par l'origine d'après le tableur calc. R2 a été multiplié par 1000.
    − codons faibles: les 16 codons xyc/t à effectifs faibles.
    + c/t > 3: est le nombre de codons faibles ayant plus de 3 gènes de tRNA.
    + c/t > 3, total: leur total en gènes
    + reste calculé: total des gènes des autres codons plus c/t > 3. C'est la réduction des codons faibles reportés dans la ligne "Totaux des 121 réduits" ci-dessous.
    + multiplicité x 100: division de reste calculé par 121 en %.
    + c/t = 3: est le nombre de codons faibles ayant 3 gènes de tRNA (pour illustration).
    − Totaux des 121 réduits: ils sont reportés dans le tableau synthétique "IV. nombre des 121 eucaryotes".
    − KEGG [3]: nomenclature de l'eucaryote dans la base KEGG, bta par exemple. Surmonté d'un * le code n'est pas celui de KEGG, mais attribué pour homogénéité.
  • Tableau des calculs pour 121 eucaryotes sélectionnés.
Gènes de tRNA eucaryotes, doublons.;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
max;total;KEGG;eucaryote;;;;;moy;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg
1327;4180;bta;Bos taurus (cow) (Baylor Btau_4.6.1 Oct 2011);;;;;86.7;7;31;10;14;10;0;5;8;17;0;8;33;23;0;23;46;14;30;6;7;12;0;9;5;15;1;10;7;30;2;36;18;11;38;0;0;4;22;19;43;0;40;83;40;7;47;456;172;156;351;26;187;14;10;12;15;4;18;45;114;20;61;401;1,327
46;758;cre*;Caenorhabditis remanei (WUGSC 15.0.1 May 2007);;;;;16.7;0;18;6;12;24;0;7;4;25;1;14;24;28;0;4;9;16;0;10;6;7;2;41;6;18;0;10;6;27;0;15;6;0;22;0;0;1;22;23;9;1;23;20;33;0;36;23;25;0;14;0;17;25;0;11;1;0;9;13;5;0;28;46;5
38;600;hsa;Homo sapiens (hg19 - NCBI Build 37.1 Feb 2009);;;;;12.8;0;15;9;12;12;0;4;11;18;6;5;20;12;1;8;17;12;1;6;4;10;1;8;4;10;0;6;7;31;1;10;5;5;32;0;0;0;10;18;22;2;34;20;24;1;17;14;10;1;38;3;8;7;0;6;4;1;8;7;5;0;15;9;13
33;508;yli;Yarrowia lipolytica WSH-Z06;;;;;11.3;0;17;1;3;21;0;2;13;26;0;1;18;24;0;2;8;21;0;2;4;21;0;3;2;22;0;3;2;29;0;4;2;0;14;0;0;0;12;3;15;0;16;4;33;0;28;6;27;0;8;0;13;1;0;25;0;0;6;4;1;0;30;11;0
34;484;yli;Yarrowia lipolytica PO1f;;;;;10.8;0;18;1;3;18;0;2;12;26;0;1;18;24;0;2;8;21;0;2;4;21;0;3;2;22;0;3;3;29;0;4;2;0;14;0;0;0;12;3;15;0;15;4;34;0;24;6;22;0;8;0;13;1;0;24;0;0;6;4;1;0;18;11;0
57;432;mmu;Mus musculus (mm9 July 2007);;;;;9.4;0;7;4;4;8;0;3;10;11;1;5;18;8;1;3;11;9;1;3;3;7;0;8;3;9;0;4;5;19;0;11;10;0;10;0;0;1;10;6;10;0;14;11;19;0;16;8;13;0;57;2;8;6;0;3;5;0;8;5;5;1;14;7;7
16;315;dwi;Drosophila willistoni (D. willistoni Feb. 2006);;;;;6.8;0;7;3;7;4;1;2;9;9;2;4;15;8;1;5;5;8;1;3;3;7;0;5;4;7;1;7;4;11;0;6;2;0;8;0;0;0;8;4;6;0;10;8;10;0;16;11;12;0;12;1;7;10;0;7;1;0;6;4;5;0;12;6;0
17;305;dan;Drosophila ananassae (D. ananassae Feb. 2006 Agencourt CAF1);;;;;6.7;0;8;2;4;5;0;2;10;11;0;2;12;7;0;2;7;6;0;3;6;4;0;4;8;9;0;7;3;10;0;4;6;0;9;0;0;0;5;4;8;0;10;7;17;0;13;6;14;1;6;1;6;12;0;8;0;0;6;3;2;0;16;6;3
18;293;dpe;Drosophila persimilis (D. persimilis Oct. 2005 Broad);;;;;6.5;0;7;1;3;5;0;2;10;11;0;2;11;7;0;2;5;9;0;2;5;6;0;6;4;8;0;8;3;11;0;2;3;0;9;0;0;0;7;4;7;0;9;4;14;0;18;6;14;0;8;1;8;13;0;5;0;0;5;2;4;0;13;6;3
18;292;dpo;Drosophila pseudoobscura (D. pseudoobscura Feb. 2006);;;;;6.5;0;7;2;4;5;0;2;9;10;0;2;11;7;0;2;6;11;0;2;3;3;0;6;4;8;0;8;4;12;0;3;3;0;9;0;0;0;5;4;7;0;9;5;12;0;14;6;18;0;11;1;8;9;0;4;0;0;5;3;5;0;14;6;3
15;291;des;Drosophila sechellia (D. sechellia Oct. 2005 Broad);;;;;6.4;0;9;4;4;5;0;2;8;10;0;2;15;8;0;2;8;8;0;2;4;7;0;5;5;9;0;6;5;13;0;2;3;0;9;0;0;0;7;2;8;0;9;4;12;0;13;5;13;0;6;1;8;9;0;7;0;0;6;3;4;0;13;6;0
14;282;der;Drosophila erecta (D. erecta Feb. 2006 Agencourt CAF1);;;;;6.2;0;9;3;4;5;0;2;7;9;0;2;12;7;0;2;7;9;0;2;4;5;0;5;5;8;0;6;3;12;0;2;3;0;8;0;0;0;6;4;8;0;8;5;11;0;14;6;13;1;6;1;8;9;0;7;0;0;6;3;4;0;14;1;6
14;268;dvi;Drosophila virilis (D. virilis Feb. 2006 Agencourt CAF1);;;;;5.9;0;8;2;5;3;0;3;7;9;0;2;12;6;0;2;7;6;0;2;4;4;0;3;5;7;0;7;4;8;0;3;3;0;10;0;0;0;5;4;7;0;7;12;12;0;13;6;10;0;8;1;6;10;0;5;0;0;5;2;2;0;14;6;1
14;262;dmo;Drosophila mojavensis (D. mojavensis Feb. 2006 Agencourt CAF1);;;;;5.8;0;8;2;6;3;0;2;6;8;0;2;12;6;0;2;6;6;0;2;4;6;0;5;3;7;0;8;4;9;0;4;3;0;7;0;0;0;5;4;7;0;8;8;11;0;12;6;11;0;7;1;6;10;0;5;0;0;5;2;2;0;14;6;1
18;259;dgr;Drosophila grimshawi (D. grimshawi Feb. 2006 Agencourt CAF1);;;;;5.7;0;9;2;4;4;0;2;7;7;0;2;10;6;0;2;6;6;0;2;4;4;0;4;5;7;0;8;4;8;0;3;3;0;10;0;0;0;5;3;12;0;7;7;12;0;12;6;10;0;6;1;6;9;0;4;0;0;3;3;2;0;18;4;0
24;296;fpu;Fusarium pseudograminearum CS3096;;;;;6.6;0;9;1;3;17;0;2;5;10;0;2;6;19;0;2;3;11;0;2;2;9;0;3;2;10;0;4;3;14;0;4;3;0;9;0;0;0;6;5;6;0;8;2;17;0;9;4;24;0;5;0;4;11;0;8;1;0;9;1;2;0;13;5;1
19;292;fpu;Fusarium pseudograminearum CS3270;;;;;6.5;0;10;1;3;13;0;2;5;13;0;2;6;17;0;2;3;11;0;2;2;10;0;3;2;10;0;4;3;13;0;4;3;0;8;0;0;0;6;5;6;0;9;2;16;0;13;4;19;0;5;0;4;11;0;9;1;0;8;1;2;0;13;5;1
17;280;sceb*;Saccharomyces sp. boulardii 17;;;;;6.2;0;11;6;9;0;1;3;0;13;0;3;10;15;0;3;2;11;0;3;1;2;0;10;0;9;0;4;1;8;0;5;0;0;9;0;0;0;7;9;1;0;9;7;15;0;17;14;2;0;4;0;6;7;0;0;1;0;4;13;1;1;17;4;2
15;263;sceb*;Saccharomyces sp. boulardii ATCC MYA-796;;;;;5.8;0;11;7;9;0;1;3;0;12;0;2;10;13;0;2;2;10;0;3;1;2;0;10;0;10;0;5;1;11;0;5;0;0;8;0;0;0;8;7;1;0;8;7;13;0;14;13;2;0;4;0;6;6;0;0;1;0;4;10;1;0;15;3;2
14;265;ndi;Naumovozyma dairenensis CBS 421;;;;;5.9;0;9;9;8;1;0;4;0;12;0;2;9;14;0;2;2;11;0;3;1;1;0;11;0;11;0;5;2;10;0;5;0;0;9;0;0;0;7;10;1;0;9;8;12;0;13;13;1;0;5;0;5;5;0;0;2;0;5;11;1;0;12;3;1
13;224;vda;Verticillium dahliae JR2;;;;;4.9;0;7;1;1;8;0;1;4;10;0;0;9;11;0;1;2;6;1;2;4;8;0;3;2;8;0;2;3;11;0;2;4;0;6;0;0;0;6;2;5;0;6;2;12;0;9;2;12;0;5;1;3;9;0;2;2;0;5;3;2;0;13;3;3
11;178;afm;Aspergillus fumigatus Af293;;;;;4.0;0;5;1;2;6;0;0;4;7;0;1;8;7;0;1;2;5;0;1;2;5;0;2;2;6;0;3;2;8;0;3;2;0;5;0;0;0;4;2;6;0;5;1;8;0;9;4;8;0;3;0;3;9;0;2;2;0;4;1;2;0;11;3;1
10;141;cgi;Cryptococcus gattii WM276;;;;;3.1;0;5;1;3;6;0;0;1;6;0;1;6;7;0;0;2;6;0;1;1;6;0;1;0;5;0;1;1;7;0;1;2;0;4;0;0;0;4;2;3;0;4;1;7;0;0;3;10;0;3;0;3;3;0;5;1;0;2;1;3;0;9;3;0
9;139;cne;Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21;;;;;3.1;0;5;1;3;6;0;0;1;6;0;1;6;7;0;0;2;6;0;1;1;5;0;1;0;5;0;1;1;7;0;1;2;0;4;0;0;0;4;2;3;0;4;1;7;0;0;3;9;0;3;0;3;3;0;5;1;0;2;1;3;0;9;3;0
9;137;cnb;Cryptococcus neoformans var. neoformans B-3501A;;;;;3.0;0;5;1;3;6;0;0;1;6;0;1;6;7;0;0;2;4;0;1;1;5;0;1;0;5;0;1;1;7;0;1;2;0;4;0;0;0;4;2;3;0;4;1;7;0;0;3;9;0;3;0;3;3;0;5;1;0;2;1;3;0;9;3;0
8;130;cdu;Candida dubliniensis CD36;;;;;2.9;0;5;5;5;2;0;0;1;6;0;1;4;8;0;1;1;4;0;3;1;1;0;5;0;5;0;2;1;6;0;2;0;0;4;0;0;0;3;4;1;0;4;5;3;0;6;7;1;0;2;0;2;2;0;0;1;0;1;5;1;0;6;2;1
6;123;kpa*;Komagataella pastoris GS115;;;;;2.7;0;5;1;3;2;0;1;2;5;0;1;4;5;0;1;1;4;0;2;1;2;0;4;1;5;0;1;1;5;0;2;0;0;4;0;0;0;3;3;2;0;4;3;5;0;6;5;4;0;2;0;3;2;0;1;1;0;2;4;1;0;5;3;1
2;46;ehe;Encephalitozoon hellem ATCC 50504;;;;;1.0;0;1;1;1;1;0;1;1;1;0;1;2;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;0;1;0;0;0;1;1;1;0;2;1;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;0;1;0;0;1;1;1;0;1;1;1
2;46;ein;Encephalitozoon intestinalis ATCC 50506;;;;;1.0;0;1;1;1;1;0;1;1;1;0;1;2;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;0;1;0;0;0;1;1;1;0;2;1;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;0;1;0;0;1;1;1;0;1;1;1
2;46;ero;Encephalitozoon romaleae SJ-2008;;;;;1.0;0;1;1;1;1;0;1;1;1;0;1;2;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;0;1;0;0;0;1;1;1;0;2;1;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;0;1;0;0;1;1;1;0;1;1;1
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Tableau des diagrammes des pentes;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
max;total;KEGG;eucaryote;;;;;moy;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg
2;35;pfa;Plasmodium falciparum;;;;;0.78;0;1;1;1;1;0;1;1;1;0;1;2;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;0;0;1;1;1;0;1;1;0;1;0;0;0;0;1;1;0;1;0;0;0;1;1;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;1;0;0;0;1;0
2;46;ecu;Encephalitozoon cuniculi GB-M1;;;;;1.02;0;1;1;1;1;0;1;1;1;0;1;2;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;0;1;0;0;0;1;1;1;0;2;1;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;0;1;0;0;1;1;1;0;1;1;1
2;53;ede*;Exophiala dermatitidis NIH/UT8656;;;;;1.16;0;1;1;1;1;1;1;1;2;0;1;1;2;0;1;1;1;0;1;1;0;0;1;1;2;0;1;1;2;0;1;1;0;1;0;0;0;2;1;1;0;1;1;0;0;2;1;2;0;1;0;0;2;0;2;1;0;1;0;1;0;2;1;2
4;80;opa*;Ogataea parapolymorpha DL-1;;;;;1.78;0;3;1;3;1;0;1;1;4;0;1;4;3;0;0;1;2;0;1;1;0;0;3;0;3;0;1;1;3;0;2;0;0;2;0;0;0;2;2;1;0;2;2;3;0;3;2;3;0;1;0;2;2;0;0;1;0;2;3;1;0;4;2;0
5;82;cot;Candida orthopsilosis Co 90-125;;;;;1.82;0;2;3;1;1;0;0;1;4;0;1;4;4;0;1;1;2;0;2;1;1;0;3;0;4;0;2;1;3;0;2;0;0;3;0;0;0;1;3;1;0;3;4;3;0;5;2;1;0;1;0;1;2;0;0;1;0;1;2;1;0;2;1;0
4;82;lma;Leishmania major;;;;;1.82;0;2;1;1;3;0;1;2;3;0;1;4;2;0;1;2;1;0;1;1;2;0;1;2;3;0;1;2;2;0;1;2;0;3;0;0;0;2;1;3;0;3;1;3;0;3;1;2;0;1;0;1;4;0;1;1;0;2;1;1;0;4;1;1
6;96;sre*;Sporisorium reilianum SRZ2;;;;;2.11;0;4;1;0;4;0;1;2;4;0;1;4;4;0;1;0;2;0;1;2;3;0;1;1;4;0;1;1;3;0;1;1;0;2;0;0;0;3;3;2;0;3;1;5;0;3;2;4;0;2;1;2;4;0;2;0;0;0;1;1;0;6;1;1
6;111;uma;Ustilago maydis 521;;;;;2.40;0;3;1;0;4;0;2;2;4;0;1;4;4;0;1;1;3;0;1;3;4;1;1;1;4;0;1;1;5;0;1;1;0;3;0;0;0;2;2;3;0;3;1;5;0;5;2;5;0;2;2;2;4;0;3;0;0;2;1;1;0;6;2;1
6;123;kpa*;Komagataella pastoris CBS 7435;;;;;2.73;0;5;1;3;2;0;1;2;5;0;1;4;5;0;1;1;4;0;2;1;2;0;4;1;5;0;1;1;5;0;2;0;0;4;0;0;0;3;3;2;0;4;3;5;0;6;5;4;0;2;0;3;2;0;1;1;0;2;4;1;0;5;3;1
6;125;cal;Candida albicans WO-1;;;;;2.78;0;5;5;6;2;0;0;1;6;0;1;4;6;0;1;1;4;0;3;1;1;0;4;0;4;0;2;1;6;0;2;0;0;4;0;0;0;3;5;1;0;3;5;2;0;6;6;1;0;2;0;2;2;0;0;1;0;2;5;1;0;5;2;1
10;143;cneg*;Cryptococcus neoformans var. grubii H99;;;;;3.18;0;5;1;3;6;0;0;1;6;0;1;7;7;0;0;2;6;0;1;1;6;0;1;0;5;0;1;1;8;0;1;2;0;4;0;0;0;4;2;3;0;4;1;7;0;0;3;10;0;3;0;3;3;0;5;1;0;2;1;3;0;9;3;0
10;154;ttt;Thielavia terrestris NRRL 8126;;;;;3.42;0;5;5;1;5;0;1;4;6;0;1;5;6;0;1;3;3;0;1;3;4;0;2;3;4;0;1;2;7;0;2;3;0;4;0;0;0;3;2;4;0;3;2;6;0;6;2;7;0;3;0;4;6;0;1;3;0;3;1;2;0;10;2;2
11;155;mgp;Meleagris gallopavo (turkey) (TGC Turkey_2.01 Dec 2009);;;;;3.42;0;6;1;2;1;0;1;4;3;0;1;11;3;1;2;3;5;0;3;1;7;0;2;1;4;0;2;0;7;0;6;3;0;6;0;0;0;3;1;1;0;4;4;3;0;3;5;6;0;5;0;5;2;0;1;2;0;6;3;3;0;5;4;3
9;156;vma*;Valsa mali 03-8;;;;;3.47;0;4;0;2;5;0;1;4;7;0;1;8;7;0;1;2;5;0;1;2;0;0;2;1;4;0;3;2;7;0;2;2;0;4;0;0;0;5;2;4;0;5;0;9;0;6;3;9;0;3;0;3;6;0;2;2;0;3;1;2;0;9;3;2
9;158;kna*;Kazachstania naganishii CBS 8797;;;;;3.51;0;6;3;5;1;0;3;0;7;0;2;4;7;0;1;2;7;0;1;1;1;0;6;0;7;0;2;1;7;0;1;1;0;5;0;0;0;4;4;2;0;6;4;7;0;8;5;3;0;4;0;4;3;0;0;1;0;3;6;1;0;9;1;2
9;162;kla;Kluyveromyces lactis NRRL Y-1140;;;;;3.58;0;5;3;7;0;1;2;0;7;0;1;6;7;0;1;2;6;0;2;1;1;0;7;0;6;0;2;1;7;0;3;0;0;5;0;0;0;4;6;1;0;6;4;9;0;8;8;2;0;3;0;4;3;0;0;1;0;2;7;1;0;7;2;1
9;168;spo;Schizosaccharomyces pombe 972h-;;;;;3.73;0;5;2;4;5;0;1;1;8;0;1;7;9;0;2;1;7;0;2;1;6;0;2;1;7;0;2;1;6;0;2;1;0;4;0;0;0;4;4;2;0;6;3;9;0;8;4;6;0;3;0;3;8;0;1;1;0;3;2;1;0;8;3;1
10;170;pic;Scheffersomyces stipitis CBS 6054;;;;;3.78;0;6;3;8;3;0;0;1;7;0;1;6;7;0;2;1;6;0;2;2;1;0;6;0;7;0;2;1;7;0;3;0;0;5;0;0;0;4;5;2;0;7;3;9;0;8;8;2;0;3;0;4;3;0;0;1;0;2;7;1;0;10;3;1
11;181;ani;Aspergillus nidulans FGSC A4;;;;;4.02;0;5;1;2;6;0;2;3;7;0;1;7;8;0;1;2;5;0;1;2;6;0;2;2;6;0;2;2;8;0;2;3;0;6;0;0;0;5;2;5;0;6;2;8;0;8;3;8;0;3;0;3;9;0;2;2;0;4;2;2;0;11;3;1
14;190;mgr;Magnaporthe oryzae 70-15;;;;;4.22;0;7;1;2;7;0;1;4;8;0;1;8;6;0;1;2;4;0;2;3;5;0;2;2;6;0;2;2;9;0;3;2;0;5;0;0;0;4;2;6;0;6;2;9;0;10;3;9;0;3;0;4;6;0;2;2;0;3;1;3;0;14;3;3
13;191;mun*;Melopsittacus undulatus (Budgerigar Sep. 2011 WUSTL v6.3/melUnd1);;;;;4.18;0;6;4;3;3;0;0;6;5;0;1;9;3;1;1;4;4;1;3;1;2;0;3;2;5;0;2;0;9;0;5;2;0;7;0;0;0;4;2;4;0;9;3;13;0;9;3;1;0;5;1;4;3;0;1;1;0;8;4;4;0;10;9;1
11;191;cjd*;Cyberlindnera jadinii NBRC 0988 NBRC0988;;;;;4.20;0;8;1;7;4;0;3;1;6;1;1;7;9;0;2;3;7;0;3;1;0;0;7;0;6;0;3;1;6;0;3;0;0;5;0;0;0;6;6;2;0;7;5;8;0;8;4;9;0;3;1;4;6;0;0;1;0;3;7;0;0;11;4;1
12;192;tdl;Torulaspora delbrueckii CBS 1146;;;;;4.24;0;6;3;8;0;1;4;0;8;0;1;7;12;0;1;2;7;0;2;1;1;0;6;0;9;0;2;1;8;0;4;0;0;6;0;0;0;4;6;2;0;7;5;10;0;9;8;4;0;3;0;4;4;0;0;1;0;3;7;1;0;11;2;1
12;192;pch*;Penicillium chrysogenum P2niaD18;;;;;4.22;0;5;0;0;6;1;0;3;10;0;2;10;9;0;1;3;7;0;1;2;0;0;0;1;12;0;3;2;8;0;2;2;0;5;0;0;0;11;3;5;0;6;1;9;0;9;3;10;0;3;1;0;10;0;2;2;0;4;0;2;0;11;4;1
11;192;mth*;Myceliophthora thermophila ATCC 42464;;;;;4.24;0;5;1;2;7;0;1;4;8;0;1;8;7;0;2;3;5;0;3;3;6;0;2;3;6;0;2;3;7;0;2;3;0;6;0;0;0;4;2;5;0;6;3;9;0;10;2;8;0;3;1;4;7;0;1;2;0;5;1;2;0;11;4;2
16;203;gfr;Geospiza fortis (Medium ground finch Apr. 2012 GeoFor_1.0/geoFor1);;;;;4.44;0;6;11;2;4;0;7;0;6;1;2;6;2;1;1;3;2;0;3;1;4;0;5;1;5;0;4;1;16;0;5;2;0;12;0;0;0;4;2;3;1;6;4;7;0;5;4;6;0;10;0;3;6;0;2;0;0;6;3;2;0;8;4;4
11;205;sas*;Saccharomycetaceae sp. Ashbya aceri;;;;;4.51;0;7;3;7;0;1;4;1;9;0;1;10;7;0;3;4;7;0;3;3;1;0;7;0;7;0;3;2;7;0;5;2;0;5;0;0;0;5;4;4;0;8;4;9;0;10;3;8;0;3;1;5;4;0;0;2;0;3;7;1;0;11;2;2
13;206;tpf;Tetrapisispora phaffii CBS 4417;;;;;4.56;0;9;9;2;0;1;2;0;10;0;2;8;10;0;2;1;8;0;2;1;1;0;7;0;9;0;2;1;9;0;3;0;0;6;0;0;0;5;7;1;0;9;6;9;0;12;11;1;0;4;0;4;3;0;0;1;0;3;8;1;0;13;2;1
12;207;cgr;Candida glabrata CBS 138;;;;;4.58;0;6;3;8;0;1;4;0;9;0;2;7;10;0;2;1;9;0;2;1;1;0;7;0;9;0;3;1;10;0;5;0;0;6;0;0;0;6;6;2;0;9;3;12;0;9;9;3;0;3;0;5;4;0;0;1;0;3;9;1;0;12;2;1
12;211;acs;Anolis carolinensis (lizard) (Broad AnoCar2.0 May 2010);;;;;4.64;0;5;2;2;4;0;3;4;6;0;1;12;5;0;2;3;5;0;1;2;3;1;3;2;4;0;3;1;12;0;6;3;0;6;0;0;0;5;3;5;0;10;5;6;0;8;7;5;0;12;1;7;4;0;3;1;0;5;3;3;0;7;8;2
10;212;bfu;Botrytis cinerea B05.10;;;;;4.69;0;7;2;5;6;0;1;1;8;0;1;8;8;0;2;2;7;0;3;2;4;0;7;1;6;0;3;0;8;0;5;2;0;6;0;0;0;4;6;2;0;6;3;10;0;9;6;9;0;5;0;6;6;0;4;2;0;5;5;1;1;8;2;7
11;214;dha;Debaryomyces hansenii CBS767;;;;;4.71;0;8;9;4;2;0;0;1;9;1;2;10;10;0;1;1;6;0;4;1;1;0;7;0;8;0;2;1;7;0;5;1;0;6;0;0;0;6;7;1;0;9;8;10;0;10;9;1;0;4;1;4;5;0;0;1;0;3;10;1;0;11;5;1
13;225;vda;Verticillium dahliae VdLs.17;;;;;4.93;0;7;1;1;8;0;1;4;9;0;0;9;11;0;1;2;6;1;2;4;8;0;3;2;8;0;2;3;11;0;2;4;1;6;0;0;0;6;2;5;0;6;2;12;0;10;2;12;0;5;1;3;9;0;2;2;0;5;3;2;0;13;3;3
15;229;lth;Lachancea thermotolerans CBS 6340;;;;;5.04;0;7;2;8;0;2;3;3;10;0;1;8;11;0;1;3;9;0;2;2;2;0;8;0;9;0;2;1;10;0;3;2;0;6;0;0;0;5;5;5;0;7;4;14;0;10;6;11;0;4;0;5;4;0;0;1;0;3;9;1;0;15;3;2
21;230;tgu;Taeniopygia guttata (Zebra finch Feb. 2013 WashU taeGut324/taeGut2);;;;;4.87;0;10;4;4;1;0;1;7;21;2;1;5;3;2;1;1;3;0;2;1;6;0;1;2;8;1;4;2;18;0;7;3;0;13;0;0;0;5;1;6;2;8;4;5;0;7;2;3;1;9;1;3;6;0;2;0;1;5;3;2;1;8;7;4
15;242;aor;Aspergillus oryzae RIB40;;;;;5.31;0;7;2;0;0;0;1;4;10;0;2;6;10;1;2;3;7;0;1;3;9;0;2;0;10;0;2;2;10;0;3;4;1;13;0;0;0;8;4;7;0;8;3;11;0;13;6;11;1;4;0;4;12;0;2;3;0;6;2;2;0;15;4;1
27;252;mlu*;Myotis lucifugus (Microbat Jul. 2010 Broad Institute Myoluc2.0/myoLuc2);;;;;5.49;0;5;2;3;3;0;5;2;10;0;3;14;5;0;3;5;6;0;2;2;6;0;3;3;5;0;5;3;8;0;1;3;0;5;0;0;5;7;3;7;0;9;3;11;0;8;5;6;0;27;0;4;6;0;5;2;0;5;5;5;0;8;6;3
15;256;dsi;Drosophila simulans (D. simulans Apr. 2005 WUGSC mosaic 1.0);;;;;5.67;0;8;3;4;5;0;2;9;8;0;0;12;7;0;2;6;8;0;2;3;6;0;5;5;8;0;5;4;9;0;5;0;0;10;0;0;0;6;4;8;0;6;4;11;0;6;5;10;0;7;1;9;9;0;5;0;0;3;3;3;0;15;5;0
20;258;mmr*;Microcebus murinus (Mouse lemur) (Jun 2003);;;;;5.71;0;8;3;3;5;0;2;7;4;0;3;14;4;0;2;5;7;0;2;3;7;0;4;3;3;0;3;2;11;0;5;3;0;8;0;0;0;6;4;12;0;9;5;6;0;5;9;8;1;20;0;6;6;0;3;2;0;7;5;3;0;11;7;2
15;258;lkl*;Lachancea kluyveri NRRL Y-12651;;;;;5.69;0;8;3;11;0;1;3;0;12;0;1;10;14;0;1;3;11;0;2;1;1;1;10;0;12;0;2;1;13;0;4;0;0;7;0;0;0;6;10;1;0;9;5;14;0;13;13;3;0;5;0;5;5;0;0;1;0;4;12;1;0;15;2;2
17;266;kaf;Kazachstania africana CBS 2517;;;;;5.91;0;9;14;2;2;0;2;0;13;0;2;9;13;0;2;1;11;0;4;1;1;0;10;0;11;0;3;1;12;0;5;0;0;9;0;0;0;6;9;1;0;10;8;12;0;13;15;2;0;5;0;6;4;0;0;1;0;4;11;1;0;17;3;1
14;270;ncs;Naumovozyma castellii CBS 4309;;;;;6.00;0;10;7;9;2;0;3;0;12;0;2;9;13;0;2;2;12;0;4;1;1;0;10;0;11;0;3;2;12;0;5;0;0;9;0;0;0;8;9;1;0;10;8;14;0;14;13;1;0;4;0;7;5;0;0;2;0;4;10;1;0;13;3;2
16;270;fgr;Fusarium graminearum CS3005;;;;;5.98;0;9;1;3;6;0;2;5;11;0;2;5;16;0;2;3;11;0;2;2;10;0;3;2;11;0;4;3;13;0;3;3;0;6;0;0;0;7;5;7;0;9;2;12;0;10;4;13;0;5;1;4;10;0;9;1;0;8;2;2;0;15;5;1
17;272;zro;Zygosaccharomyces rouxii CBS 732;;;;;6.00;0;8;4;10;0;1;5;0;11;1;1;9;12;0;2;4;12;0;3;2;3;0;10;0;10;0;2;2;12;0;9;0;0;7;0;0;0;6;10;3;0;9;7;14;0;14;10;4;0;4;0;6;5;0;0;1;0;5;8;2;0;17;5;2
15;273;fve*;Flammulina velutipes KACC42780;;;;;5.98;2;15;1;4;6;0;2;2;10;0;2;14;7;0;3;3;7;0;2;3;4;0;4;2;7;0;3;4;13;0;9;5;0;6;0;0;0;3;4;6;1;12;6;11;1;2;6;11;0;4;0;4;13;0;8;2;0;4;2;6;0;11;8;8
16;275;sce;Saccharomyces cerevisiae (S288c Apr 2011);;;;;6.09;0;10;7;10;0;1;3;0;13;0;2;10;14;0;2;2;11;0;3;1;2;0;10;0;11;0;4;1;11;0;5;0;0;8;0;0;0;7;9;1;0;10;7;14;0;16;14;2;0;4;0;6;6;0;0;1;0;4;11;1;0;16;3;2
24;283;gga;Gallus gallus (galGal4 Nov 2011);;;;;6.24;0;10;3;3;3;0;2;7;7;0;2;14;7;1;3;7;9;0;4;2;7;0;4;3;4;0;4;2;24;0;7;4;0;16;0;0;0;6;2;5;0;11;6;6;0;10;9;7;0;11;1;6;8;0;2;2;0;7;4;3;0;7;7;4
16;285;fvr;Fusarium verticillioides 7600;;;;;6.33;0;10;2;4;12;0;2;5;11;0;1;8;13;0;2;3;10;0;2;3;10;0;3;2;11;0;4;2;14;0;3;3;0;8;0;0;0;6;4;8;0;8;2;15;0;14;5;16;0;5;0;5;10;0;7;1;0;7;2;2;0;14;5;1
16;288;mfa*;Millerozyma farinosa CBS 7064;;;;;6.40;0;10;4;14;4;0;0;2;12;0;4;10;12;0;2;4;10;0;4;2;2;0;8;0;10;0;4;2;12;0;8;2;0;10;0;0;0;8;8;4;0;12;6;10;0;14;8;8;0;4;0;6;4;0;0;2;0;6;10;2;0;16;6;2
14;289;dme;Drosophila melanogaster (D. melanogaster Aug. 2014 BDGP Release 6 + ISO1 MT/dm6);;;;;6.40;0;8;4;4;4;0;2;8;9;0;2;12;6;0;2;7;8;0;2;4;7;0;5;5;8;0;6;3;12;0;2;3;0;9;0;0;0;5;4;8;0;10;6;13;0;14;6;13;0;7;1;8;10;0;10;0;0;6;3;3;0;14;6;0
19;305;fgr;Fusarium graminearum PH-1 NRRL 31084;;;;;6.76;0;11;2;3;13;0;2;5;13;0;2;6;19;0;2;3;11;0;2;2;10;0;3;2;11;0;4;3;14;0;4;2;0;8;0;0;0;7;5;7;0;9;3;16;0;14;5;19;0;5;1;4;10;0;9;1;0;8;2;2;0;14;6;1
21;326;oga*;Otolemur garnettii (Bushbaby Mar. 2011 Broad/otoGar3);;;;;6.96;1;6;3;5;4;0;3;9;10;9;11;13;6;0;3;5;6;0;3;3;7;0;4;3;9;0;6;3;13;0;7;3;0;8;0;0;0;8;5;9;0;12;11;9;0;13;5;8;0;21;1;6;6;0;4;3;2;7;4;5;0;12;9;3
18;326;dya;Drosophila yakuba (D. yakuba Nov. 2005 WUGSC 7.1);;;;;7.22;0;9;5;4;5;0;2;8;10;0;2;15;7;0;2;10;9;0;2;5;6;0;8;5;8;0;6;5;18;0;2;5;0;9;0;0;0;5;4;8;0;11;6;16;0;15;7;14;0;8;1;8;12;0;7;0;0;6;3;4;0;16;7;1
23;328;tbl;Tetrapisispora blattae CBS 6284;;;;;7.27;0;12;12;9;0;1;2;0;17;0;2;11;18;0;2;1;16;0;4;2;1;0;13;0;15;0;3;1;19;0;5;0;0;9;0;0;0;7;10;1;0;11;9;15;0;19;16;1;0;5;0;7;4;0;0;1;0;6;13;1;0;23;3;1
19;334;sbq;Saimiri boliviensis (Squirrel monkey Oct. 2011 Broad/saiBol1);;;;;7.27;0;9;8;5;6;0;4;5;10;1;6;14;6;1;4;7;9;1;3;3;9;0;5;4;8;0;6;5;15;0;8;5;1;8;0;0;0;8;6;10;0;11;12;9;0;9;10;5;0;19;3;6;6;0;4;3;0;7;5;5;0;10;6;4
17;338;opr*;Ochotona princeps (Pika May 2012 OchPri3.0/ochPri3);;;;;7.49;0;10;3;4;5;0;5;11;8;0;4;15;7;0;4;7;7;0;3;4;8;0;4;4;7;0;6;7;15;0;7;4;0;10;0;0;0;5;5;12;0;14;9;11;0;14;7;11;0;10;1;6;7;0;6;4;0;7;5;6;0;17;7;5
29;353;meu*;Macropus eugenii (Wallaby Sep. 2009 TWGS Meug_1.1/macEug2);;;;;7.62;1;10;3;8;5;0;4;6;6;0;6;14;8;0;1;7;8;0;4;2;7;0;4;2;8;0;6;3;13;0;6;5;1;8;0;0;1;7;4;7;0;14;10;11;0;13;12;7;0;29;7;8;7;0;3;5;0;10;7;4;0;16;10;5
46;367;hgl;Heterocephalus glaber (Naked mole-rat Jan. 2012 Broad HetGla_female_1.0/hetGla2);;;;;7.62;0;6;4;5;5;0;5;5;8;0;3;14;12;1;4;6;7;0;3;3;13;0;5;3;15;2;4;4;46;6;5;6;0;7;0;0;0;7;3;6;0;9;8;15;2;10;6;4;0;23;7;6;5;0;4;4;2;7;6;5;4;10;4;3
20;373;lcm;Latimeria chalumnae (Coelacanth Aug. 2011 Broad/latCha1);;;;;7.96;0;7;11;4;4;0;5;8;7;0;7;11;3;0;7;4;3;0;6;3;12;0;10;4;11;0;9;2;5;0;20;3;2;8;0;0;0;5;10;9;3;9;20;13;1;19;11;8;5;17;4;15;4;0;1;4;0;8;9;8;0;7;5;2
25;374;san*;Sorex araneus (Shrew Aug. 2008 Broad/sorAra2);;;;;8.24;0;10;4;4;6;1;2;13;15;0;5;15;7;0;5;7;8;0;3;4;8;0;6;2;8;0;5;5;10;0;8;3;0;9;0;0;0;7;5;7;0;12;8;13;0;19;10;14;0;25;2;6;9;0;5;3;0;8;6;6;0;22;12;2
34;383;cpo*;Cavia porcellus (Guinea pig) (Broad Feb 2008);;;;;8.36;0;8;4;6;5;0;3;6;10;0;5;15;6;1;3;6;8;0;3;4;8;0;4;3;10;0;4;3;28;4;9;5;0;15;0;0;0;8;4;8;0;18;11;26;1;10;6;5;0;34;1;8;7;0;4;3;0;10;5;5;0;11;6;6
26;396;ncr;Neurospora crassa OR74A;;;;;8.78;0;12;1;5;17;0;2;6;17;1;1;17;19;0;2;4;14;0;3;4;11;0;4;4;12;0;3;3;19;0;3;5;0;10;0;0;0;9;3;11;0;12;2;24;0;18;5;24;0;7;0;7;21;0;2;3;0;6;5;5;0;26;4;3
40;407;rno;Rattus norvegicus (rn5 Mar 2012);;;;;8.89;1;8;3;0;1;0;1;5;12;0;3;13;8;0;3;7;11;0;4;3;33;0;6;3;9;0;5;4;36;2;9;4;0;2;0;0;0;10;6;10;0;15;1;19;2;15;10;8;0;40;1;8;6;0;3;5;1;12;6;8;0;11;9;5
30;408;cjc;Callithrix jacchus (marmoset) (WUGSC 3.2 Mar 2009);;;;;8.80;0;8;9;6;7;0;3;11;9;2;5;19;6;1;4;10;9;0;5;4;7;0;6;4;9;1;6;4;15;1;5;4;0;19;0;0;1;8;4;12;0;23;14;11;1;13;11;12;0;30;2;6;6;3;4;3;0;8;5;5;0;14;9;4
28;411;pha*;Papio hamadryas (baboon) (Nov 2008);;;;;8.93;0;12;7;7;9;0;3;6;12;2;4;15;9;1;7;12;9;0;5;3;7;0;6;4;10;0;7;6;19;1;9;5;0;15;0;0;0;10;6;11;1;18;12;12;1;10;13;4;2;28;1;8;7;0;6;4;0;9;6;5;0;13;4;8
31;414;aga;Anopheles gambiae;;;;;9.20;0;9;2;3;5;0;3;10;12;0;2;18;31;0;3;29;6;0;2;8;7;0;8;13;8;0;2;5;17;0;3;6;0;22;0;0;0;21;4;11;0;11;8;17;0;20;11;15;0;5;0;6;10;0;8;0;0;6;2;2;0;15;8;0
24;418;ppp;Physcomitrella patens ;;;;;9.18;1;14;2;6;6;1;5;5;12;0;4;24;13;0;2;11;13;0;5;7;13;0;8;4;10;0;5;6;19;0;9;8;0;8;0;0;0;9;9;10;1;14;8;16;0;11;7;14;0;7;1;9;8;1;7;5;0;9;6;10;0;15;9;11
22;421;nle;Nomascus leucogenys (Gibbon Oct. 2012 GGSC Nleu3.0/nomLeu3);;;;;9.04;1;11;7;5;8;0;3;9;12;3;5;16;11;1;6;10;9;1;4;4;9;1;5;4;11;0;4;5;18;1;9;5;0;14;0;0;0;11;9;13;2;14;22;15;0;10;10;8;1;22;3;8;7;0;7;3;0;8;6;5;0;12;6;7
28;435;ggo;Gorilla gorilla gorilla (gorilla) (gorGor3.1 May 2011);;;;;9.42;0;12;8;7;8;0;4;5;11;2;6;17;9;1;8;10;10;1;4;5;8;0;7;4;9;0;6;6;22;2;6;4;1;16;0;0;0;7;7;14;1;24;13;14;0;15;14;7;0;28;3;8;7;0;6;5;0;8;5;6;0;12;3;9
45;446;shr;Sarcophilus harrisii (Tasmanian devil Feb. 2011 WTSI Devil_ref v7.0/sarHar1);;;;;9.87;0;13;6;3;9;0;4;9;11;0;4;22;8;0;4;10;10;0;5;3;10;0;6;3;9;0;7;2;18;0;7;4;0;11;0;0;0;9;45;10;0;13;14;32;0;19;15;10;0;8;2;8;4;0;5;3;0;8;5;4;0;19;9;6
64;455;tsy*;Tarsius syrichta (Tarsier Sep. 2013 Tarsius_syrichta-2.0.1/tarSyr2);;;;;9.25;0;6;#;4;6;0;5;7;8;0;4;12;6;0;4;6;7;0;5;3;7;1;32;4;9;0;4;4;12;0;4;3;0;10;0;0;1;10;64;6;1;15;10;7;1;13;9;10;1;25;1;6;6;0;5;3;0;9;6;4;0;14;6;7
27;458;mcc;Macaca mulatta (Rhesus Oct. 2010 BGI CR_1.0/rheMac3);;;;;9.80;0;9;15;8;9;0;5;6;10;5;7;18;10;3;6;11;9;2;6;4;8;0;8;3;9;0;5;4;21;1;10;5;1;23;0;0;0;14;10;12;2;19;16;13;1;14;11;6;0;27;2;8;6;0;5;4;0;8;6;7;0;14;4;8
60;469;mmu;Mus musculus (mm10 Dec 2011);;;;;10.13;0;7;7;4;5;0;4;10;12;1;5;19;8;1;3;12;10;1;3;3;8;1;8;3;11;0;4;4;23;4;11;10;0;11;0;0;1;10;7;12;0;13;14;26;0;16;8;14;1;60;1;8;6;0;5;3;0;8;6;5;2;15;8;7
27;476;pan*;Papio anubis (Baboon Mar. 2012 Baylor Panu_2.0/papAnu2);;;;;10.20;1;13;8;8;8;0;3;11;14;2;6;19;9;1;7;12;9;1;5;3;8;0;6;4;10;0;7;6;20;1;9;5;3;21;0;0;0;10;9;12;2;21;14;15;2;15;13;9;1;27;3;9;7;0;5;4;0;11;6;5;0;20;8;8
46;481;mdo;Monodelphis domestica (opossum) (Broad Oct 2006);;;;;10.58;0;12;2;4;8;0;6;11;13;0;7;25;9;0;5;9;12;0;6;3;11;0;8;3;12;0;7;3;15;0;9;6;0;15;0;0;0;9;7;11;0;13;13;19;1;24;14;13;4;46;0;9;5;0;5;4;0;9;6;5;0;24;11;8
34;485;eeu*;Erinaceus europaeus (Hedgehog May 2012 EriEur2.0/eriEur2);;;;;7.59;0;8;3;6;6;0;3;6;9;0;4;16;7;0;6;4;7;0;3;3;10;0;5;3;9;0;6;4;14;0;10;4;0;13;0;0;0;5;4;8;0;7;11;€;0;13;8;9;0;34;2;7;6;0;5;3;0;7;5;7;0;14;7;5
51;494;ecb;Equus caballus (horse) (Sep 2007);;;;;10.76;0;12;4;6;7;0;5;3;20;0;5;25;12;3;6;15;12;0;4;4;10;0;7;3;9;0;7;3;27;0;11;8;1;14;0;0;1;11;6;12;1;17;15;16;0;10;11;51;0;25;4;7;10;0;4;4;0;12;5;7;0;10;4;8
86;498;cge;Cricetulus griseus cell line CHO-K1 (Chinese hamster ovary CriGri 1.0 Aug 2011);;;;;10.96;0;8;4;4;5;0;4;10;13;0;5;16;13;0;5;9;6;0;3;3;7;0;6;3;8;1;4;4;22;1;15;6;0;11;0;0;0;14;5;11;0;17;15;86;0;15;7;20;0;41;2;6;6;0;6;3;0;9;5;6;1;14;6;7
28;499;vvi;Vitis vinifera (Grapevine 12X);;;;;10.89;0;14;7;13;10;0;9;7;13;1;7;25;14;0;5;9;13;1;7;3;13;0;16;4;10;2;6;3;11;0;28;5;1;17;0;0;1;12;9;10;1;18;11;13;1;18;14;21;0;11;1;10;8;0;5;4;0;9;6;7;0;17;12;6
30;503;ptr;Pan troglodytes (Chimp Feb. 2011 CSAC 2.1.4/panTro4);;;;;10.82;0;15;10;7;9;0;3;6;14;1;5;21;11;1;10;12;11;1;7;4;9;1;8;5;10;0;6;5;30;1;9;5;2;22;0;0;0;10;8;10;1;27;14;19;1;15;15;11;1;27;2;7;7;1;6;5;3;9;6;5;0;13;6;13
29;506;ocu;Oryctolagus cuniculus (rabbit) (Broad Apr 2009);;;;;10.67;0;14;6;3;5;0;4;16;11;1;7;18;12;0;8;14;10;0;4;5;9;0;5;4;8;1;7;5;21;0;9;4;0;12;0;0;0;9;5;15;1;26;12;29;1;23;18;19;0;25;1;10;7;0;4;5;0;10;6;6;21;0;14;16
34;510;yli;Yarrowia lipolytica CLIB122;;;;;11.33;0;17;1;3;21;0;2;13;26;0;1;18;24;0;2;8;21;0;2;4;21;0;3;2;22;0;3;2;30;0;4;2;0;14;0;0;0;12;3;15;0;16;4;34;0;28;6;27;0;8;0;13;1;0;25;0;0;6;4;1;0;30;11;0
33;517;ppy*;Pongo pygmaeus abelii (Orangutan July 2007 WUGSC 2.0.2/ponAbe2);;;;;11.18;0;13;6;6;10;0;3;11;14;4;6;20;10;1;7;18;10;1;6;5;10;0;7;5;12;0;4;7;22;1;9;4;1;19;0;0;0;10;7;13;2;33;20;22;1;13;22;8;0;30;3;6;7;0;6;7;0;8;8;7;0;14;8;10
77;518;csi*;Ceratotherium simum (White rhinoceros May 2012 CerSimSim1.0/cerSim1);;;;;11.40;0;13;5;6;6;0;4;4;13;0;5;26;11;1;7;15;13;0;5;4;10;0;7;4;10;0;8;5;23;0;13;6;0;11;0;0;0;10;5;12;2;14;15;22;1;13;11;77;0;24;1;8;10;0;5;4;0;13;6;7;0;10;4;9
32;540;tng;Tetraodon nigroviridis (tetraodon) (Genoscope 8.0 Mar 2007);;;;;11.91;1;17;5;7;15;0;6;32;16;0;5;20;10;0;4;15;12;1;7;2;11;1;11;4;26;0;10;13;20;0;10;4;0;13;0;0;0;12;9;18;0;17;9;20;0;18;15;13;0;15;1;10;14;0;6;2;0;11;9;9;0;14;14;6
36;554;cpic;Chrysemys picta bellii (Painted turtle Dec. 2011 v3.0.1/chrPic1);;;;;11.87;2;22;13;7;2;1;4;6;11;1;13;16;16;0;5;6;24;0;15;10;12;1;4;2;17;0;18;5;11;1;15;4;1;5;0;0;0;10;16;11;1;17;36;9;0;14;17;5;5;18;4;10;7;0;5;3;3;20;26;10;0;11;24;2
35;575;tru;Takifugu rubripes (Fugu Oct. 2011 FUGU5/fr3);;;;;12.64;1;18;6;9;10;0;4;21;11;0;6;35;19;0;8;25;11;0;7;3;10;0;7;6;18;0;7;7;10;0;8;6;1;13;0;0;1;19;8;12;0;20;19;19;1;22;13;20;0;15;1;16;16;1;7;4;0;17;13;10;0;18;12;4
37;578;sbi;Sorghum bicolor (Version 1.0);;;;;12.56;0;20;4;9;15;0;9;11;17;0;5;37;16;2;4;10;11;3;12;6;14;0;11;7;12;2;9;6;18;0;13;11;1;14;0;0;1;15;11;13;1;16;9;18;2;24;13;23;0;13;1;13;15;0;4;7;0;13;7;10;0;24;10;6
40;582;mtr;Medicago truncatula (March 2009 Version 3.0);;;;;12.47;0;26;7;14;9;0;10;4;19;0;10;40;17;3;7;7;12;2;8;2;7;0;11;1;10;4;10;1;25;0;16;3;1;12;0;0;0;17;17;5;9;28;18;16;0;28;19;11;0;10;1;14;12;0;5;3;0;15;8;6;1;23;15;3
34;596;cel;Caenorhabditis elegans (WS220 Oct 2010);;;;;13.18;0;15;4;7;20;0;3;5;21;0;7;19;19;0;5;6;15;0;9;6;6;0;31;4;17;0;11;7;22;0;9;4;0;19;0;0;0;19;20;7;0;20;14;30;0;27;17;24;0;13;2;12;18;0;8;1;1;9;8;4;0;14;34;3
40;618;pop;Populus trichocarpa (Jan 2010 Version 2.0) ;;;;;13.53;4;18;7;3;40;1;0;7;20;1;9;26;17;0;8;10;13;1;9;5;14;0;22;4;6;0;11;4;20;0;18;5;0;18;0;0;0;13;11;11;0;22;17;17;0;33;14;21;1;13;1;14;10;0;7;5;0;16;11;11;0;25;17;7
40;622;hsa;Homo sapiens (hg38 - GRCh38 Dec 2013);;;;;13.31;0;18;8;12;12;0;4;11;19;6;5;22;11;1;8;21;12;1;6;5;10;1;8;4;10;0;6;7;35;1;10;5;5;32;0;0;0;10;18;24;2;40;20;24;1;16;17;10;1;38;3;8;7;0;6;4;1;8;7;5;0;15;9;12
55;639;bdi;Brachypodium distachyon (JGI v1.0 8X);;;;;13.82;0;18;4;15;14;0;10;8;20;2;4;55;15;3;5;11;11;4;10;5;15;0;18;8;9;3;10;6;19;0;12;11;1;17;0;0;3;21;15;11;0;16;12;18;0;25;15;19;0;14;0;18;16;1;5;6;0;18;9;9;0;27;9;9
43;674;oni*;Oreochromis niloticus (Nile tilapia Jan. 2011 Broad oreNil1.1/oreNil2);;;;;14.80;0;23;12;7;14;0;7;16;25;0;25;27;8;0;9;9;10;0;10;6;14;0;11;4;18;1;25;8;18;0;11;12;3;18;0;0;0;23;6;11;0;9;16;43;0;10;14;15;1;42;1;12;16;0;7;6;2;10;27;18;0;13;12;9
83;684;ath;Arabidopsis thaliana (TAIR10 Feb 2011);;;;;15.00;0;17;6;12;12;1;11;3;17;2;5;32;14;2;7;8;37;3;12;7;15;0;47;5;10;1;9;5;16;0;10;7;0;83;0;0;0;12;10;9;0;19;15;17;0;29;14;13;0;17;0;16;11;0;6;4;0;16;10;8;0;25;12;5
56;738;osa;Oryza sativa;;;;;15.67;0;20;4;19;15;0;10;10;18;0;5;56;17;16;4;10;12;4;17;8;14;0;14;9;11;8;15;5;20;1;10;12;2;19;0;0;0;26;21;10;0;29;12;20;1;31;16;25;1;17;0;18;24;0;4;8;0;20;12;11;0;28;9;10
36;738;gmx;Glycine max (soybean) (Wm82.a2);;;;;16.31;0;22;9;18;16;0;10;7;31;0;8;36;22;1;9;13;15;0;11;6;21;0;27;5;9;1;10;4;24;0;17;8;0;21;0;0;0;18;13;13;2;22;20;22;0;33;16;24;0;14;0;18;13;0;9;5;0;28;18;13;0;29;18;9
42;743;cbr;Caenorhabditis briggsae (C. briggsae Jan. 2007 WUGSC 1.0/cb3);;;;;16.51;0;22;6;11;26;0;5;7;21;0;24;23;25;0;6;6;17;0;8;8;6;0;41;4;22;0;10;9;29;0;14;7;0;19;0;0;0;21;24;10;0;23;16;40;0;34;19;30;0;16;0;13;22;0;10;0;0;9;10;2;0;21;42;5
37;749;mpu*;Mustela putorius furo (Ferret Apr. 2011 MusPutFur1.0/musFur1);;;;;10.68;0;11;4;6;6;0;4;5;10;0;5;20;8;0;6;7;8;0;4;4;9;0;7;2;10;0;7;5;15;0;8;5;0;9;0;0;1;7;37;17;6;12;31;€;0;8;7;19;0;25;1;11;6;0;29;5;0;12;16;21;0;9;9;4
48;804;str*;Spermophilus tridecemlineatus (Squirrel Nov. 2011 Broad/speTri2);;;;;11.02;1;10;3;10;6;0;3;4;14;6;4;14;18;3;5;39;15;1;7;6;12;1;7;3;34;5;6;7;€;31;39;18;0;9;0;0;0;6;4;6;1;9;10;12;6;8;5;7;0;48;1;7;6;0;5;3;0;7;5;6;7;13;5;20
97;807;ssc;Sus scrofa (Pig Aug. 2011 SGSC Sscrofa10.2/susScr3);;;;;12.68;0;21;4;6;8;0;5;5;13;0;5;23;10;1;11;12;10;0;5;4;9;0;4;3;13;0;8;4;23;0;14;7;0;17;0;0;0;10;9;12;2;18;38;16;10;97;€;13;1;23;0;7;7;0;5;3;0;10;7;4;0;19;10;6
47;827;cja*;Caenorhabditis japonica (WUGSC 3.0.2 Mar 2008);;;;;18.33;1;24;5;7;26;0;6;12;26;0;7;30;23;0;7;13;19;0;7;15;9;0;43;8;24;0;12;11;31;0;11;8;0;24;0;0;0;17;14;16;0;23;30;37;0;41;20;40;0;15;1;18;21;0;11;1;0;15;12;3;0;34;47;2
83;856;oaa;Ornithorhynchus anatinus (platypus) (WUGSC 5.0.1 Mar 2007);;;;;18.56;1;24;10;10;8;0;7;18;27;0;10;32;23;1;15;10;16;4;6;8;19;4;12;7;23;1;18;10;83;0;17;11;0;28;0;0;1;24;11;19;0;21;32;25;0;27;16;27;0;37;5;14;12;0;7;14;2;18;6;9;2;40;15;9
43;906;cfa;Canis familiaris (dog) (CanFam3.1 Sept 2011);;;;;11.23;0;10;4;5;4;0;4;7;9;0;5;23;6;0;5;8;10;0;5;8;8;0;8;4;8;0;4;5;14;0;11;4;0;9;0;0;0;9;43;20;1;21;34;€;2;13;15;22;0;21;1;6;6;0;15;4;0;8;9;29;0;11;11;9
82;1065;spu;Strongylocentrotus purpuratus (Sea urchin) ;;;;;23.56;2;0;14;2;18;0;8;5;69;2;22;73;20;0;11;16;25;0;15;6;19;0;21;9;27;0;21;9;32;0;17;7;0;24;0;0;0;26;17;21;0;39;57;42;0;82;26;29;0;31;0;18;29;0;19;1;1;17;18;19;0;42;33;4
66;1095;cbr*;Caenorhabditis brenneri (WUGSC 6.0.1 Feb 2008);;;;;24.07;0;24;7;14;32;0;8;8;33;1;26;29;33;0;8;15;20;0;14;9;25;2;54;9;31;1;15;10;35;0;11;6;2;28;0;0;1;26;40;11;0;33;29;49;0;34;36;37;2;21;3;22;32;0;17;24;0;14;13;11;0;39;66;25
66;1119;dno*;Dasypus novemcinctus (Armadillo Dec. 2011 Baylor/dasNov3);;;;;15.86;0;12;8;8;5;0;3;10;12;1;6;30;12;1;16;#;10;0;6;6;7;0;7;4;11;0;8;7;23;2;66;17;0;14;0;0;1;10;5;10;0;23;18;43;0;21;20;45;0;22;1;15;10;0;8;5;0;10;9;47;24;19;€;34
61;1176;oas;Ovis aries (sheep) (Feb 2010);;;;;12.50;1;6;5;7;6;0;2;3;6;0;5;18;7;0;8;9;2;3;4;3;4;0;6;1;5;0;5;3;18;3;12;7;2;16;0;0;0;8;7;9;0;13;22;16;2;8;€;60;16;61;4;47;2;2;6;6;0;7;22;33;5;30;€;€
82;1198;zma;Zea mays (Version 5b.60);;;;;23.18;1;25;5;20;29;0;9;13;69;0;5;79;22;12;4;16;13;22;11;6;15;0;31;9;20;13;14;6;66;0;15;22;0;21;0;0;1;26;22;13;0;49;82;€;1;42;22;30;1;25;0;27;35;0;7;6;0;14;9;11;0;33;11;11
55;1463;aml;Ailuropoda melanoleuca (panda) (BGI-Shenzhen AilMel 1.0 Dec 2009);;;;;13.84;0;11;5;9;7;0;5;7;12;0;6;24;10;0;7;9;10;0;6;4;9;0;11;5;10;0;9;10;17;0;9;5;0;11;0;0;0;8;43;25;6;28;55;€;1;11;11;37;0;25;2;10;8;1;#;7;2;13;17;45;0;10;7;7
63;1492;gmo*;Gadus morhua (Atlantic cod May 2010 Genofisk GadMor_May2010/gadMor1);;;;;30.05;6;36;16;15;33;0;24;47;26;0;18;€;21;0;9;28;30;0;18;14;55;0;21;22;30;0;30;30;55;1;24;26;0;50;0;0;1;26;11;45;2;34;63;43;1;30;51;50;0;27;2;29;31;2;17;10;1;41;21;28;0;30;39;18
76;2002;lav;Loxodonta africana (elephant) (Broad/July 2009);;;;;25.95;1;32;15;17;22;0;11;10;43;0;7;50;41;1;50;35;29;0;7;4;16;0;14;3;14;1;22;10;54;0;53;15;1;19;0;0;3;27;14;28;4;51;60;36;0;20;€;24;1;28;24;23;14;0;18;3;3;76;#;16;4;33;€;#
40;2017;tma*;Trichechus manatus latirostris (Manatee Oct. 2011 Broad v1.0/triMan1);;;;;13.98;1;11;6;10;8;0;5;5;13;1;8;21;11;0;26;16;14;0;6;4;11;0;8;3;16;1;18;4;20;1;40;6;1;15;0;0;0;12;8;10;1;23;31;16;1;15;€;19;5;22;18;13;8;0;12;7;5;36;€;13;9;23;€;#
90;2485;pma*;Petromyzon marinus (Lamprey Sep. 2010 WUGSC 7.0/petMar2);;;;;34.89;2;57;5;#;€;0;40;#;€;0;10;€;€;1;26;#;22;0;20;35;54;0;43;21;62;19;19;23;€;0;31;24;0;90;0;0;1;27;44;€;0;€;24;23;2;90;12;11;0;68;1;9;85;1;26;10;0;65;18;50;1;54;17;6
99;2489;gac*;Gasterosteus aculeatus (stickleback) (Broad 1.0 Feb 2006);;;;;41.18;0;35;12;7;49;0;17;9;€;0;61;€;21;1;12;18;52;0;62;29;63;0;29;18;99;0;35;23;53;0;53;56;0;17;0;0;0;52;60;81;1;€;61;97;0;€;46;53;0;€;1;74;49;0;#;2;0;30;68;26;0;12;61;4
99;2639;xtr;Xenopus tropicalis (frog) (JGI 4.2 Nov 2009);;;;;50.41;2;58;#;22;38;2;25;32;63;5;51;€;55;0;36;53;40;3;41;23;60;1;53;36;€;0;91;29;67;0;47;36;0;€;0;0;1;42;28;40;1;47;72;97;0;59;84;51;2;92;1;33;33;3;33;8;0;99;€;27;0;85;80;€
68;3729;fca;Felis catus (cat) (Felis_catus-6.2 Sept 2011);;;;;19.40;1;12;19;8;6;0;33;5;10;0;9;24;8;0;6;9;8;1;14;5;8;1;68;7;9;0;13;9;18;1;10;7;0;10;0;0;2;16;€;47;5;28;50;€;1;9;15;44;1;32;18;23;9;9;€;24;2;12;54;53;2;10;48;6
78;4040;bta;Bos taurus (Cow Jun. 2014 Bos_taurus_UMD_3.1.1/bosTau8);;;;;22.58;6;30;10;14;11;0;5;6;18;0;8;35;20;0;21;39;13;32;7;7;13;0;9;4;14;1;10;7;31;2;35;16;11;39;0;0;4;19;20;40;0;30;78;40;6;42;€;€;143;€;29;€;13;7;12;16;4;19;44;€;20;63;€;€
74;5845;ttr*;Tursiops truncatus (Dolphin Oct. 2011 Baylor Ttru_1.4/turTru2);;;;;16.73;0;12;6;7;6;0;4;6;11;0;5;17;8;3;16;22;12;0;6;4;7;0;5;4;9;1;6;3;19;2;36;21;1;18;0;0;0;9;16;15;0;13;74;19;10;49;€;€;6;22;21;€;7;1;7;12;0;11;48;54;19;43;€;€
86;7080;bacu;Balaenoptera acutorostrata scammoni (Minke whale Oct. 2013 BalAcu1.0/balAcu1);;;;;18.77;0;13;13;8;6;0;4;7;12;1;8;21;14;1;18;32;10;1;5;4;7;0;5;4;13;0;8;4;20;0;42;20;0;14;0;0;0;11;10;20;0;24;86;29;20;45;€;€;2;24;17;€;9;0;9;21;0;13;55;#;12;64;€;€
94;13727;cmk;Callorhinchus milii (Elephant shark Dec. 2013 Callorhinchus_milii-6.1.3/calMil1);;;;;32.70;3;35;13;31;20;2;20;25;31;0;23;94;22;16;€;€;26;1;54;48;12;6;51;41;24;12;€;€;75;168;€;€;1;36;0;0;1;37;7;18;2;48;43;36;6;49;66;€;1;15;3;30;9;0;25;2;0;33;14;12;2;19;66;#
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg
;;;total du diagramme;;;;;;45;1,461;617;774;973;22;561;782;1,592;70;675;2,065;1,377;94;645;1,007;1,266;99;715;551;1,123;25;1,244;476;1,376;83;847;535;2,162;240;1,241;682;50;1,554;0;0;34;1,239;1,175;1,210;72;1,748;1,880;2,044;93;2,061;1,303;1,656;209;1,958;249;1,088;1,153;33;656;428;36;1,265;1,051;912;138;2,017;1,185;541
Codons forts;;;pente;;;;;;;1.139;0.463;0.574;0.853;;0.504;0.627;1.334;;0.668;2.025;1.02;;0.591;0.905;0.946;;0.699;0.511;0.991;;1.062;0.469;1.188;;0.848;0.491;1.728;;1.079;0.673;;1.293;;;;0.998;0.925;1.065;;1.442;1.669;1.738;;1.69;1.233;1.375;;1.603;-;0.941;0.948;;0.606;0.321;;1.174;0.964;0.808;;1.476;1.263;0.485
;;;somme calculée;;;;;;;-;23.3;20.0244;29.8;;-;21.9;101.5;;-;317.0;35.6;;19.3;75.5;-;;-;-;-;;-;-;59.9;;27.7;16.1;79.3;;35.3;22.0;;65.2;;;;-;17.9;37.2;;109.7;-;149.3;;69.6;151.9;124.8;;102.2;-;54.6;-;;45.1;-;;-;87.1;33.4;;-;159.6;93.9
;;;Totaux + calculés;;;;;;;1,461;640;794;1,003;;561;804;1,693;;675;2,382;1,413;;664;1,083;1,266;;715;551;1,123;;1,244;476;1,436;;875;551;2,241;;1,276;704;;1,619;0;0;;1,239;1,193;1,247;;1,858;1,880;2,193;;2,131;1,455;1,781;;2,060;249;1,143;1,153;;701;428;;1,265;1,138;945;;2,017;1,345;635
;;;R2;;;;;;;914;734;775;807;;748;697;847;;740;892;840;;723;793;881;;758;743;816;;713;743;803;;788;866;863;;748;809;;748;;;;938;614;822;;913;770;845;;791;880;728;;743;;815;760;;801;570;;797;666;594;;818;795;597
Codons faibles;;;c/t nombre >3;;;;;;3;;;;;0;;;;6;;;;3;;;;5;;;;2;;;;6;;;;4;;;2;;;;2;;;;5;;;;6;;;;7;;;;;2;;;2;;;;9;;;
;;;c/t nombre >3, total;;;;;;16;;;;;0;;;;35;;;;44;;;;66;;;;10;;;;61;;;;209;;;16;;;;9;;;;30;;;;58;;;;184;;;;;16;;;9;;;;120;;;
;;;reste calculé;;;;;;32;;;;;22;;;;41;;;;53;;;;38;;;;17;;;;28;;;;35;;;36;;;;27;;;;47;;;;41;;;;32;;;;;19;;;29;;;;27;;;
;;;multiplicité X 100;;;;;;26;;;;;18;;;;34;;;;44;;;;31;;;;14;;;;23;;;;29;;;30;;;;22;;;;39;;;;34;;;;26;;;;;16;;;24;;;;22;;;
;;;c/t nombre=3;;;;;;1;;;;;0;;;;1;;;;6;;;;4;;;;0;;;;1;;;;1;;;2;;;;2;;;;1;;;;0;;;;0;;;;;2;;;3;;;;0;;;
Totaux des 121 réduits;;;;;;;;55829.6931801242;32;1,461;640;794;1,003;22;561;804;1,693;41;675;2,382;1,413;53;664;1,083;1,266;38;715;551;1,123;17;1,244;476;1,436;28;875;551;2,241;35;1,276;704;36;1,619;0;0;27;1,239;1,193;1,247;47;1,858;1,880;2,193;41;2,131;1,455;1,781;32;2,060;249;1,143;1,153;19;701;428;29;1,265;1,138;945;27;2,017;1,345;635
Données non modifiées;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
64;455;tsy*;Tarsius syrichta (Tarsier Sep. 2013 Tarsius_syrichta-2.0.1/tarSyr2);;;;;9.0;0;6;42;4;6;0;5;7;8;0;4;12;6;0;4;6;7;0;5;3;7;1;32;4;9;0;4;4;12;0;4;3;0;10;0;0;1;10;64;6;1;15;10;7;1;13;9;10;1;25;1;6;6;0;5;3;0;9;6;4;0;14;6;7
149;485;eeu*;Erinaceus europaeus (Hedgehog May 2012 EriEur2.0/eriEur2);;;;;10.7;0;8;3;6;6;0;3;6;9;0;4;16;7;0;6;4;7;0;3;3;10;0;5;3;9;0;6;4;14;0;10;4;0;13;0;0;0;5;4;8;0;7;11;149;0;13;8;9;0;34;2;7;6;0;5;3;0;7;5;7;0;14;7;5
271;749;mpu*;Mustela putorius furo (Ferret Apr. 2011 MusPutFur1.0/musFur1);;;;;16.5;0;11;4;6;6;0;4;5;10;0;5;20;8;0;6;7;8;0;4;4;9;0;7;2;10;0;7;5;15;0;8;5;0;9;0;0;1;7;37;17;6;12;31;271;0;8;7;19;0;25;1;11;6;0;29;5;0;12;16;21;0;9;9;4
256;804;str*;Spermophilus tridecemlineatus (Squirrel Nov. 2011 Broad/speTri2);;;;;16.5;1;10;3;10;6;0;3;4;14;6;4;14;18;3;5;39;15;1;7;6;12;1;7;3;34;5;6;7;256;31;39;18;0;9;0;0;0;6;4;6;1;9;10;12;6;8;5;7;0;48;1;7;6;0;5;3;0;7;5;6;7;13;5;20
235;807;ssc;Sus scrofa (Pig Aug. 2011 SGSC Sscrofa10.2/susScr3);;;;;17.6;0;21;4;6;8;0;5;5;13;0;5;23;10;1;11;12;10;0;5;4;9;0;4;3;13;0;8;4;23;0;14;7;0;17;0;0;0;10;9;12;2;18;38;16;10;97;235;13;1;23;0;7;7;0;5;3;0;10;7;4;0;19;10;6
408;906;cfa;Canis familiaris (dog) (CanFam3.1 Sept 2011);;;;;20.0;0;10;4;5;4;0;4;7;9;0;5;23;6;0;5;8;10;0;5;8;8;0;8;4;8;0;4;5;14;0;11;4;0;9;0;0;0;9;43;20;1;21;34;408;2;13;15;22;0;21;1;6;6;0;15;4;0;8;9;29;0;11;11;9
326;1119;dno*;Dasypus novemcinctus (Armadillo Dec. 2011 Baylor/dasNov3);;;;;24.2;0;12;8;8;5;0;3;10;12;1;6;30;12;1;16;81;10;0;6;6;7;0;7;4;11;0;8;7;23;2;66;17;0;14;0;0;1;10;5;10;0;23;18;43;0;21;20;45;0;22;1;15;10;0;8;5;0;10;9;47;24;19;326;34
341;1176;oas;Ovis aries (sheep) (Feb 2010);;;;;25.3;1;6;5;7;6;0;2;3;6;0;5;18;7;0;8;9;2;3;4;3;4;0;6;1;5;0;5;3;18;3;12;7;2;16;0;0;0;8;7;9;0;13;22;16;2;8;139;60;16;61;4;47;2;2;6;6;0;7;22;33;5;30;133;341
127;1198;zma;Zea mays (Version 5b.60);;;;;25.5;1;25;5;20;29;0;9;13;69;0;5;79;22;12;4;16;13;22;11;6;15;0;31;9;20;13;14;6;66;0;15;22;0;21;0;0;1;26;22;13;0;49;82;127;1;42;22;30;1;25;0;27;35;0;7;6;0;14;9;11;0;33;11;11
772;1463;aml;Ailuropoda melanoleuca (panda) (BGI-Shenzhen AilMel 1.0 Dec 2009);;;;;32.2;0;11;5;9;7;0;5;7;12;0;6;24;10;0;7;9;10;0;6;4;9;0;11;5;10;0;9;10;17;0;9;5;0;11;0;0;0;8;43;25;6;28;55;772;1;11;11;37;0;25;2;10;8;1;84;7;2;13;17;45;0;10;7;7
154;1492;gmo*;Gadus morhua (Atlantic cod May 2010 Genofisk GadMor_May2010/gadMor1);;;;;32.8;6;36;16;15;33;0;24;47;26;0;18;154;21;0;9;28;30;0;18;14;55;0;21;22;30;0;30;30;55;1;24;26;0;50;0;0;1;26;11;45;2;34;63;43;1;30;51;50;0;27;2;29;31;2;17;10;1;41;21;28;0;30;39;18
619;2002;lav;Loxodonta africana (elephant) (Broad/July 2009);;;;;43.5;1;32;15;17;22;0;11;10;43;0;7;50;41;1;50;35;29;0;7;4;16;0;14;3;14;1;22;10;54;0;53;15;1;19;0;0;3;27;14;28;4;51;60;36;0;20;114;24;1;28;24;23;14;0;18;3;3;76;90;16;4;33;619;72
1073;2017;tma*;Trichechus manatus latirostris (Manatee Oct. 2011 Broad v1.0/triMan1);;;;;43.8;1;11;6;10;8;0;5;5;13;1;8;21;11;0;26;16;14;0;6;4;11;0;8;3;16;1;18;4;20;1;40;6;1;15;0;0;0;12;8;10;1;23;31;16;1;15;114;19;5;22;18;13;8;0;12;7;5;36;123;13;9;23;1073;90
278;2485;pma*;Petromyzon marinus (Lamprey Sep. 2010 WUGSC 7.0/petMar2);;;;;53.7;2;57;5;42;112;0;40;75;110;0;10;278;166;1;26;71;22;0;20;35;54;0;43;21;62;19;19;23;106;0;31;24;0;90;0;0;1;27;44;108;0;168;24;23;2;90;12;11;0;68;1;9;85;1;26;10;0;65;18;50;1;54;17;6
286;2489;gac*;Gasterosteus aculeatus (stickleback) (Broad 1.0 Feb 2006);;;;;55.2;0;35;12;7;49;0;17;9;101;0;61;286;21;1;12;18;52;0;62;29;63;0;29;18;99;0;35;23;53;0;53;56;0;17;0;0;0;52;60;81;1;123;61;97;0;184;46;53;0;107;1;74;49;0;79;2;0;30;68;26;0;12;61;4
151;2639;xtr;Xenopus tropicalis (frog) (JGI 4.2 Nov 2009);;;;;57.2;2;58;46;22;38;2;25;32;63;5;51;138;55;0;36;53;40;3;41;23;60;1;53;36;151;0;91;29;67;0;47;36;0;107;0;0;1;42;28;40;1;47;72;97;0;59;84;51;2;92;1;33;33;3;33;8;0;99;105;27;0;85;80;105
1201;3729;fca;Felis catus (cat) (Felis_catus-6.2 Sept 2011);;;;;81.9;1;12;19;8;6;0;33;5;10;0;9;24;8;0;6;9;8;1;14;5;8;1;68;7;9;0;13;9;18;1;10;7;0;10;0;0;2;16;782;47;5;28;50;887;1;9;15;44;1;32;18;23;9;9;1,201;24;2;12;54;53;2;10;48;6
1295;4040;bta;Bos taurus (Cow Jun. 2014 Bos_taurus_UMD_3.1.1/bosTau8);;;;;83.9;6;30;10;14;11;0;5;6;18;0;8;35;20;0;21;39;13;32;7;7;13;0;9;4;14;1;10;7;31;2;35;16;11;39;0;0;4;19;20;40;0;30;78;40;6;42;435;164;143;338;29;178;13;7;12;16;4;19;44;116;20;63;391;1,295
1901;5845;ttr*;Tursiops truncatus (Dolphin Oct. 2011 Baylor Ttru_1.4/turTru2);;;;;128.5;0;12;6;7;6;0;4;6;11;0;5;17;8;3;16;22;12;0;6;4;7;0;5;4;9;1;6;3;19;2;36;21;1;18;0;0;0;9;16;15;0;13;74;19;10;49;1,901;395;6;22;21;217;7;1;7;12;0;11;48;54;19;43;833;1,766
2368;7080;bacu;Balaenoptera acutorostrata scammoni (Minke whale Oct. 2013 BalAcu1.0/balAcu1);;;;;156.1;0;13;13;8;6;0;4;7;12;1;8;21;14;1;18;32;10;1;5;4;7;0;5;4;13;0;8;4;20;0;42;20;0;14;0;0;0;11;10;20;0;24;86;29;20;45;2,368;468;2;24;17;256;9;0;9;21;0;13;55;67;12;64;987;2,148
5898;13727;cmk;Callorhinchus milii (Elephant shark Dec. 2013 Callorhinchus_milii-6.1.3/calMil1);;;;;300.1;3;35;13;31;20;2;20;25;31;0;23;94;22;16;145;1,540;26;1;54;48;12;6;51;41;24;12;206;137;75;168;5,898;3,858;1;36;0;0;1;37;7;18;2;48;43;36;6;49;66;428;1;15;3;30;9;0;25;2;0;33;14;12;2;19;66;81
1045;12258;dre;Danio rerio (Zebrafish) (Zv8 Apr 2009);;;;;268.8;10;197;73;241;270;4;244;300;258;10;75;522;232;6;230;227;336;2;209;80;315;2;205;180;359;10;290;66;92;4;368;112;5;236;0;0;10;387;105;266;24;1,045;525;953;1;150;225;245;9;136;14;44;203;24;107;59;14;424;252;104;11;836;47;268
;92530;;Total des 121 eucaryotes non réduits;;;;;;45;1461;705;816;1085;22;561;857;1803;70;675;2921;1543;94;790;2699;1266;99;715;551;1123;25;1244;476;1527;83;1053;672;2524;240;7139;4540;50;1661;0;0;34;1239;1957;1318;72;2039;1880;4658;93;2245;6609;3111;209;2403;249;1739;1153;33;2020;428;36;1265;1369;1095;138;2017;5547;6439

Lignes et colonnes 121 eucaryotes[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Lignes et colonnes 121 eucaryotes
  • Liens: Calculs pour 121 eucaryotes,  Tableau des effectifs calculés des 121 eucaryotes
  • Légende: Les moyennes des codons de la 3ème base appartenant aux doublets ayant la même 1ère base (ligne) ou ayant la même 2ème base (colonne) sont faites sur 4 codons ou sur 3 codons seulement quand on rencontre les codons stop (taa tag) ou le codon ata lorsqu'il est trop faible ( sauf celui des eucaryotes) ou le codon atg à effectif très élevé (sauf celui des eucaryotes). La moyenne des lignes et colonnes est faite sur 12 codons ou seulement 10 quand on rencontre les codons taa tag ata atg. Quand les codons xyt ont des effectifs élevés ils sont permutés avec les codons xyc ( 1 permutation chez les bactéries et 8 chez les eucaryotes). Aussi les lignes et colonnes xyt contiennent les valeurs faibles après permutation et les lignes et colonnes xyc contiennent les valeurs fortes après permutation.
    n pour nombre de codons, mcod pour moyenne des codons, Lig. pour ligne, Col. pour colonne et car. pour carré ou doublet.
    txt, c, a, g pour respectivement les 4 codons "ttt tct tat tgt" de la 3ème base t, les 4 codons "ttc tcc tac tgc" de la 3ème base c . . . etc. (Ligne Lig.)
    xtt, c, a, g pour respectivement les 4 codons "ttt ctt att gtt" de la 3ème base t, les 4 codons "ttc ctc atc gtc" de la 3ème base c . . . etc. (colonne Col.)
  • Tableaux non formatés: voir tableur
IV LC;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;;V LC;Danio rerio (Zebrafish) ;;;;;;I LC;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries;;;;
Lignes;;;Colon;;55 830;;Lignes;;;Colon;;12 258;;Lignes;;;Colon;;235 027
txt;4;62;xtt;4;66;;txt;4;53;xtt;4;61;;txt;4;2;xtt;4;42
c;4;2,869;c;4;2,494;;c;4;1,846;c;4;1,952;;c;4;2,289;c;4;2,509
a;3;958;a;4;1,137;;a;3;805;a;4;1,269;;a;3;1,612;a;3;2,631
g;3;1,485;g;4;1,833;;g;3;993;g;4;2,039;;g;3;1,558;g;3;1,489
cxt;4;38;xct;4;53;;cxt;4;82;xct;4;37;;cxt;4;76;xct;4;13
c;4;2,023;c;4;2,716;;c;4;2,396;c;4;2,248;;c;4;1,998;c;4;1,696
a;4;1,656;a;4;1,840;;a;4;1,348;a;4;2,186;;a;4;1,879;a;4;2,852
g;4;1,323;g;4;1,022;;g;4;1,642;g;4;893;;g;4;1,395;g;4;935
axt;4;65;xat;4;68;;axt;4;118;xat;4;82;;axt;4;12;xat;4;1
c;4;2,800;c;4;3,066;;c;4;4,254;c;4;3,708;;c;4;2,862;c;4;3,076
a;4;2,045;a;3;2,703;;a;4;2,329;a;3;2,325;;a;3;2,806;a;3;3,570
g;4;2,719;g;3;3,117;;g;4;3,355;g;3;3,981;;g;3;1,225;g;3;880
gxt;4;70;xgt;4;48;;gxt;4;45;xgt;4;118;;gxt;4;1;xgt;4;36
c;4;3,494;c;4;2,908;;c;4;2,672;c;4;3,261;;c;4;2,861;c;4;2,728
a;4;2,123;a;4;1,537;;a;4;1,774;a;4;857;;a;4;3,642;a;4;1,332
g;4;1,882;g;4;1,411;;g;4;1,738;g;4;969;;g;4;659;g;4;1,430
moyenne;;;;;;;Moyenne;;;;;;;Moyenne;;;;;
Lignes;;ttt;ctt;att;gtt;;Lignes;;ttt;ctt;att;gtt;;Lignes;;ttt;ctt;att;gtt
;n;10;12;12;12;;;n;10;12;12;12;;;n;10;12;10;12
;mcod;1,880;1,668;2,521;2,499;;;mcod;1,278;1,795;3,313;2,061;;;mcod;1,867;1,757;2,354;2,387
moyenne;;;;;;;Moyenne;;;;;;;Moyenne;;;;;
Colon;;ttt;tct;tat;tgt;;Colon;;ttt;tct;tat;tgt;;Colon;;ttt;tct;tat;tgt
;n;12;12;10;12;;;n;12;12;10;12;;;n;10;12;10;12
;mcod;1,966;1,860;2,973;1,952;;;mcod;1,950;1,776;3,375;1,695;;;mcod;2,239;1,828;2,566;1,830
Totaux;;;;;;;Totaux;;;;;;;Totaux;;;;;
carrés;1000;t;c;a;g;;carrés;1000;t;c;a;g;;carrés;1000;t;c;a;g
;t;5.24;4.60;2.96;6.24;;;t;4.25;5.12;1.97;1.66;;;t;6.32;5.30;2.73;4.32
;c;4.28;5.12;6.64;4.12;;;c;6.67;5.73;6.27;3.21;;;c;6.10;4.42;5.74;5.13
;a;8.58;5.18;10.71;6.05;;;a;7.06;5.91;20.78;6.48;;;a;11.61;5.64;8.64;5.39
;g;5.75;7.62;9.69;7.21;;;g;5.67;4.70;5.07;9.48;;;g;6.22;6.63;8.55;7.26

Demi-doublets des 121 eucaryotes[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Demi-doublets des 121 eucaryotes
  • Légende:
    155 eucaryotes, tableau des demi-doublets sur les effectifs des 155 eucaryotes avant sélection des 121.
    121 eucaryotes 92530: tableau des demi-doublets sur les effectifs des 121 eucaryotes avant calcul sur les tRNAs surexprimés.
    121 eucaryotes 55830: tableau des demi-doublets sur les effectifs des 121 eucaryotes après calcul sur les tRNAs surexprimés.
    g/a: rapport des codons xyg sur xya de la ligne x et de la colonne y du tableau des effectifs,   1.4  rapport inverse de g/a.
    t/c: rapport des codons xyc sur xyt de la ligne x et de la colonne y du tableau des effectifs,   16  rapport inverse de t/c.
    t c a g: colonnes du tableau des effectifs
155 eucaryotes;;;115 111;;;121 eucaryotes;;;92530;;;121 eucaryotes;;;55830;
;t;c;a;g;;;t;c;a;g;;;t;c;a;g
t/c;29;16;14;12;;t/c;32;13;33;11;;t/c;46;33;45;64
g/a;1.4;1.4;−;7.1;;g/a;1.2;1.3;−;7.0;;g/a;1.2;1.3;−;4.6
t/c;43;48;40;28;;t/c;49;45;36;35;;t/c;46;66;46;61
g/a;1.5;2.2;1.2;4.5;;g/a;1.5;2.6;1.5;4.7;;g/a;1.4;2.6;1.05;1.6
t/c;25;14;24;36;;t/c;26;18;28;35;;t/c;41;51;40;44
g/a;4.5;1.8;2.3;1.4;;g/a;4.3;1.6;2.5;1.3;;g/a;3.5;1.6;1.2;1.2
t/c;19;7.3;28;25;;t/c;16;11;24;15;;t/c;27;64;52;75
g/a;2.9;1.6;1.9;1.3;;g/a;3.4;1.6;2.1;1.2;;g/a;1.6;1.8;1.2;2.1

Moyennes des doublets 12 23 13[modifier | modifier le wikicode]

;IV 1 121 eucaryotes;;;;;I 1 4032 bactéries;;;;;IV 1;Duplications processus E;;;;II 1;184 Archées;;
doublet;.tt;.ct;.at;.gt;doublet;.tt;.ct;.at;.gt;doublet;.tt;.ct;.at;.gt;doublet;.tt;.ct;.at;.gt
m;0.31;0.24;0.31;0.22;m;0.20;0.14;0.08;0.04;m;0.28;0.24;0.31;0.20;m;0.27;0;0;0.41
e;0.11;0.08;0.07;0.05;e;0.10;0.10;0.05;0.03;e;0.15;0.08;0.07;0.09;e;0.31;;;0.52
%;36;32;22;21;%;51;71;68;69;%;52;34;22;43;%;115;;;128
doublet;.tc;.cc;.ac;.gc;doublet;.tc;.cc;.ac;.gc;doublet;.tc;.cc;.ac;.gc;doublet;.tc;.cc;.ac;.gc
m;11.51;12.53;14.15;13.42;m;1.46;0.99;1.79;1.59;m;10.05;11.54;12.35;11.83;m;1.16;1.00;1.10;1.24
e;2.37;4.13;3.13;3.98;e;0.60;0.21;0.51;0.59;e;1.89;4.06;2.64;3.94;e;0.01;0.05;0.09;0.29
%;21;33;22;30;%;41;21;28;37;%;19;35;21;33;%;1;5;8;23
doublet;.ta;.ca;.aa;.ga;doublet;.ta;.ca;.aa;.ga;doublet;.ta;.ca;.aa;.ga;doublet;.ta;.ca;.aa;.ga
m;5.25;8.49;12.47;8.77;m;1.53;1.66;2.08;0.93;m;4.09;6.83;10.39;7.84;m;1.02;1.12;1.13;1.01
e;0.43;2.29;2.87;2.72;e;0.58;0.58;0.44;0.62;e;1.04;1.99;2.59;2.11;e;0.02;0.19;0.11;0.01
%;8;27;23;31;%;38;35;21;67;%;26;29;25;27;%;2;17;9;1
doublet;.tg;.cg;.ag;.gg;doublet;.tg;.cg;.ag;.gg;doublet;.tg;.cg;.ag;.gg;doublet;.tg;.cg;.ag;.gg
m;7.39;4.71;14.38;6.51;m;0.87;0.54;0.51;0.83;m;6.52;4.17;13.87;5.68;m;0.89;0.86;0.89;0.87
e;1.36;0.79;3.92;2.63;e;0.49;0.17;0.15;0.21;e;1.83;0.93;3.93;2.49;e;0.03;0.05;0.02;0.10
%;18;17;27;40;%;57;32;28;26;%;28;22;28;44;%;3;5;2;12
Ligne;..t;..c;..a;..g;Ligne;..t;..c;..a;..g;Ligne;..t;..c;..a;..g;Ligne;..t;..c;..a;..g
m;0.27;12.90;8.48;7.87;m;1.34;1.46;1.56;0.69;m;0.26;11.44;7.03;7.18;m;0.17;1.12;1.07;0.88
e;0.08;3.27;3.25;4.23;e;2.94;0.54;0.64;0.29;e;0.10;3.05;2.88;4.29;e;0.33;0.17;0.12;0.06
%;30;25;38;54;%;220;37;41;42;%;39;27;41;60;%;193;15;11;7
colonne;.t.;.c.;.a.;.g.;colonne;.t.;.c.;.a.;.g.;colonne;.t.;.c.;.a.;.g.;colonne;.t.;.c.;.a.;.g.
m;8.11;8.58;13.72;9.64;m;1.31;1.07;1.50;1.13;m;6.92;7.51;12.22;8.51;m;1.04;0.99;1.04;1.05
e;3.19;4.17;3.04;4.26;e;0.58;0.58;0.78;0.57;e;3.04;4.00;3.04;3.89;e;0.12;0.15;0.13;0.24
%;39;49;22;44;%;45;55;52;50;%;44;53;25;46;%;11;15;12;23
  • Doublets 13
;;;;;;;13;;;;;;;
;IV 1 121 eucaryotes;;;;;I 1 4032 bactéries;;;;;II 1;184 Archées;;
doublet;t.t;c.t;a.t;g.t;doublet;t.t;c.t;a.t;g.t;doublet;t.t;c.t;a.t;g.t
m;0.29;0.18;0.30;0.32;m;0.14;4.44;0.71;0.07;m;0;0.41;0;0.27
e;0.02;0.04;0.08;0.09;e;0.08;4.94;1.23;0.10;e;0;0.52;0;0.31
%;9;20;26;28;%;57;111;174;136;%;−;128;−;115
doublet;t.c;c.c;a.c;g.c;doublet;t.c;c.c;a.c;g.c;doublet;t.c;c.c;a.c;g.c
m;13.24;9.33;12.92;16.12;m;1.33;1.16;1.67;1.67;m;1.215;1.029;1.090;1.164
e;2.79;0.81;2.18;3.06;e;0.25;0.50;0.65;0.70;e;0.281;0.098;0.079;0.132
%;21;9;17;19;%;19;43;39;42;%;23;9;7;11
doublet;t.a;c.a;a.a;g.a;doublet;t.a;c.a;a.a;g.a;doublet;t.a;c.a;a.a;g.a
m;5.60;7.64;9.44;9.79;m;1.25;1.10;1.64;2.12;m;1.019;1.019;1.053;1.170
e;0.44;2.85;4.36;2.93;e;0.10;0.60;0.56;0.52;e;0.027;0.031;0.036;0.184
%;8;37;46;30;%;8;55;34;25;%;3;3;3;16
doublet;t.g;c.g;a.g;g.g;doublet;t.g;c.g;a.g;g.g;doublet;t.g;c.g;a.g;g.g
m;6.85;6.11;10.16;8.68;m;0.91;0.81;0.71;0.38;m;0.904;0.836;0.906;0.875
e;2.46;3.12;7.08;4.34;e;0.23;0.34;0.13;0.12;e;0.088;0.062;0.011;0.035
%;36;51;70;50;%;25;42;18;31;%;10;7;1;4
Ligne;..t;..c;..a;..g;Ligne;..t;..c;..a;..g;Ligne;..t;..c;..a;..g
m;0.27;12.90;8.48;7.87;m;1.34;1.46;1.56;0.69;m;0.17;1.12;1.07;0.88
e;0.08;3.27;3.25;4.23;e;2.94;0.54;0.64;0.29;e;0.33;0.17;0.12;0.06
%;30;25;38;54;%;220;37;41;42;%;193;15;11;7
colonne;.t.;.c.;.a.;.g.;colonne;.t.;.c.;.a.;.g.;colonne;.t.;.c.;.a.;.g.
m;9.41;10.90;7.69;11.53;m;1.17;1.37;1.02;1.39;m;1.07;1.02;0.96;1.07
e;4.23;4.45;2.64;4.66;e;0.28;0.65;0.47;0.90;e;0.23;0.10;0.11;0.19
%;45;41;34;40;%;24;47;46;64;%;22;9;12;17
  • Doublets 12
;;;;;;;12;;;;;;;
;IV 1 121 eucaryotes;;;;;I 1 4032 bactéries;;;;;II 1;184 Archées;;
doublet;tt.;tc.;ta.;tg.;doublet;tt.;tc.;ta.;tg.;doublet;tt.;tc.;ta.;tg.
m;7.98;6.98;13.38;13.24;m;1.23;1.03;1.59;1.10;m;1.03;0.95;1.03;1.31
e;3.61;3.10;−;5.36;e;0.26;0.34;−;0.02;e;0.14;0.11;−;0.44
%;45;44;−;40;%;22;33;−;2;%;14;12;−;34
doublet;ct.;cc.;ca.;cg.;doublet;ct.;cc.;ca.;cg.;doublet;ct.;cc.;ca.;cg.
m;6.52;7.83;10.13;6.29;m;1.16;0.86;1.12;0.97;m;1.01;0.92;0.99;0.93
e;1.83;3.41;0.24;3.03;e;0.18;0.43;0.50;0.83;e;0.15;0.09;0.09;0.15
%;28;44;2;48;%;15;51;45;85;%;15;10;9;16
doublet;at.;ac.;aa.;ag.;doublet;at.;ac.;aa.;ag.;doublet;at.;ac.;aa.;ag.
m;9.79;7.88;16.34;9.22;m;2.28;1.09;1.68;1.05;m;1.15;1.01;1.05;0.97
e;5.95;3.70;1.55;1.33;e;−;0.39;0.93;0.17;e;−;0.08;0.13;0.07
%;61;47;9;14;%;−;36;56;16;%;−;8;13;7
doublet;gt.;gc.;ga.;gg.;doublet;gt.;gc.;ga.;gg.;doublet;gt.;gc.;ga.;gg.
m;8.71;11.63;14.79;11.01;m;1.21;1.29;1.66;1.41;m;1.03;1.09;1.10;1.06
e;3.10;6.42;2.79;5.71;e;0.94;1.13;1.14;0.87;e;0.12;0.27;0.20;0.24
%;36;55;19;52;%;78;88;69;62;%;11;25;18;23
Ligne;t..;c..;a..;g..;Ligne;t..;c..;a..;g..;Ligne;t..;c..;a..;g..
m;9.41;10.90;7.69;11.53;m;1.17;1.37;1.02;1.39;m;1.07;1.02;0.96;1.07
e;4.23;4.45;2.64;4.66;e;0.28;0.65;0.47;0.90;e;0.23;0.10;0.11;0.19
%;45;41;34;40;%;24;47;46;64;%;22;9;12;17
colonne;.t.;.c.;.a.;.g.;colonne;.t.;.c.;.a.;.g.;colonne;.t.;.c.;.a.;.g.
m;8.11;8.58;13.72;9.64;m;1.31;1.07;1.50;1.13;m;1.04;0.99;1.04;1.05
e;3.19;4.17;3.04;4.26;e;0.58;0.58;0.78;0.57;e;0.12;0.15;0.13;0.24
%;39;49;22;44;%;45;55;52;50;%;11;15;12;23

Doublets 12 23 13[modifier | modifier le wikicode]

IV 1;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;12;;I 1;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235027;12;;II 1;Nombres de tRNAs. 184 archées;;;;;;12
ttt;0.26;tcc;0.31;tat;0.30;tgt;0.26;;ttt;0.25;tct;0.12;tat;0.10;tgt;0.07;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0
ttc;12.07;tct;10.46;tac;13.38;tgc;17.02;;ttc;1.51;tcc;1.12;tac;1.59;tgc;1.11;;ttc;1.17;tcc;1.03;tac;1.03;tgc;1.63
tta;5.29;tca;5.91;taa;−;tga;2.06;;tta;1.18;tca;1.31;taa;−;tga;0.33;;tta;1.04;tca;1.00;taa;-;tga;0.10
ttg;6.56;tcg;4.55;tag;−;tgg;9.45;;ttg;0.99;tcg;0.65;tag;−;tgg;1.08;;ttg;0.89;tcg;0.83;tag;-;tgg;1.00
ctc;0.18;ccc;0.14;cat;0.22;cgc;0.16;;ctt;9.15;cct;0.25;cat;0.10;cgc;8.26;;ctt;0.54;cct;0;cat;0;cgt;1.09
ctt;8.29;cct;9.28;cac;10.24;cgt;9.53;;ctc;0.95;ccc;0.68;cac;1.17;cgt;1.85;;ctc;1.16;ccc;0.93;cac;1.01;cgc;1.02
cta;4.64;cca;10.28;caa;9.86;cga;5.79;;cta;1.23;cca;1.35;caa;1.58;cga;0.22;;cta;1.01;cca;1.00;caa;1.07;cga;1.01
ctg;6.64;ccg;3.93;cag;10.31;cgg;3.54;;ctg;1.29;ccg;0.54;cag;0.59;cgg;0.83;;ctg;0.87;ccg;0.82;cag;0.90;cgg;0.76
atc;0.34;acc;0.23;aat;0.39;agt;0.24;;att;0.12;act;2.55;aat;0.12;agt;0.02;;att;0;act;0;aat;0;agt;0
att;13.99;act;11.87;aac;15.36;agc;10.45;;atc;2.28;acc;1.12;aac;2.17;agc;1.10;;atc;1.15;acc;1.03;aac;1.16;agc;1.02
ata;5.58;aca;7.23;aaa;15.54;aga;9.40;;ata;0.01;aca;1.46;aaa;2.26;aga;1.19;;ata;0.01;aca;1.08;aaa;1.07;aga;1.01
atg;19.69;acg;4.55;aag;18.12;agg;7.81;;atg;4.47;acg;0.68;aag;0.60;agg;0.86;;atg;3.20;acg;0.92;aag;0.90;agg;0.90
gtc;0.44;gcc;0.29;gat;0.34;ggt;0.22;;gtt;0.22;gct;0.05;gat;0;ggt;0.02;;gtt;0.54;gct;0;gat;0;ggt;0.54
gtt;11.68;gct;18.52;gac;17.61;ggc;16.67;;gtc;1.10;gcc;1.03;gac;2.24;ggc;2.30;;gtc;1.15;gcc;1.00;gac;1.18;ggc;1.32
gta;5.49;gca;10.55;gaa;12.02;gga;11.12;;gta;2.20;gca;2.53;gaa;2.40;gga;1.37;;gta;1.01;gca;1.39;gaa;1.25;gga;1.03
gtg;8.95;gcg;5.82;gag;14.72;ggg;5.25;;gtg;0.33;gcg;0.30;gag;0.34;ggg;0.56;;gtg;0.92;gcg;0.86;gag;0.87;ggg;0.84
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
IV 1;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;23;;I 1;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235027;23;;II 1;Nombres de tRNAs. 184 archées;;;;;;23
ttt;0.26;tcc;0.31;tat;0.30;tgt;0.26;;ttt;0.25;tct;0.12;tat;0.10;tgt;0.07;;ttt;0;tct;0;tat;0;tgt;0
atc;0.34;acc;0.23;aat;0.39;agt;0.24;;att;0.12;act;2.55;aat;0.12;agt;0.02;;att;0;act;0;aat;0;agt;0
ctc;0.18;ccc;0.14;cat;0.22;cgc;0.16;;ctt;9.15;cct;0.25;cat;0.10;cgc;8.26;;ctt;0.54;cct;0;cat;0;cgt;1.09
gtc;0.44;gcc;0.29;gat;0.34;ggt;0.22;;gtt;0.22;gct;0.05;gat;0;ggt;0.02;;gtt;0.54;gct;0;gat;0;ggt;0.54
ttc;12.07;tct;10.46;tac;13.38;tgc;17.02;;ttc;1.51;tcc;1.12;tac;1.59;tgc;1.11;;ttc;1.17;tcc;1.03;tac;1.03;tgc;1.63
att;13.99;act;11.87;aac;15.36;agc;10.45;;atc;2.28;acc;1.12;aac;2.17;agc;1.10;;atc;1.15;acc;1.03;aac;1.16;agc;1.02
ctt;8.29;cct;9.28;cac;10.24;cgt;9.53;;ctc;0.95;ccc;0.68;cac;1.17;cgt;1.85;;ctc;1.16;ccc;0.93;cac;1.01;cgc;1.02
gtt;11.68;gct;18.52;gac;17.61;ggc;16.67;;gtc;1.10;gcc;1.03;gac;2.24;ggc;2.30;;gtc;1.15;gcc;1.00;gac;1.18;ggc;1.32
tta;5.29;tca;5.91;taa;−;tga;2.06;;tta;1.18;tca;1.31;taa;−;tga;0.33;;tta;1.04;tca;1.00;taa;−;tga;0.10
ata;5.58;aca;7.23;aaa;15.54;aga;9.40;;ata;0.01;aca;1.46;aaa;2.26;aga;1.19;;ata;0.01;aca;1.08;aaa;1.07;aga;1.01
cta;4.64;cca;10.28;caa;9.86;cga;5.79;;cta;1.23;cca;1.35;caa;1.58;cga;0.22;;cta;1.01;cca;1.00;caa;1.07;cga;1.01
gta;5.49;gca;10.55;gaa;12.02;gga;11.12;;gta;2.20;gca;2.53;gaa;2.40;gga;1.37;;gta;1.01;gca;1.39;gaa;1.25;gga;1.03
ttg;6.56;tcg;4.55;tag;−;tgg;9.45;;ttg;0.99;tcg;0.65;tag;−;tgg;1.08;;ttg;0.89;tcg;0.83;tag;−;tgg;1.00
atg;19.69;acg;4.55;aag;18.12;agg;7.81;;atg;4.47;acg;0.68;aag;0.60;agg;0.86;;atg;3.20;acg;0.92;aag;0.90;agg;0.90
ctg;6.64;ccg;3.93;cag;10.31;cgg;3.54;;ctg;1.29;ccg;0.54;cag;0.59;cgg;0.83;;ctg;0.87;ccg;0.82;cag;0.90;cgg;0.76
gtg;8.95;gcg;5.82;gag;14.72;ggg;5.25;;gtg;0.33;gcg;0.30;gag;0.34;ggg;0.56;;gtg;0.92;gcg;0.86;gag;0.87;ggg;0.84
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
IV 1;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;13;;I 1;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235027;13;;II 1;Nombres de tRNAs. 184 archées;;;;;;13
ttt;0.26;atc;0.34;ctc;0.18;gtc;0.44;;ttt;0.25;att;0.12;ctt;9.15;gtt;0.22;;ttt;0;att;0;ctt;0.54;gtt;0.54
tat;0.30;aat;0.39;cat;0.22;gat;0.34;;tat;0.10;aat;0.12;cat;0.10;gat;0.00;;tat;0;aat;0;cat;0;gat;0
tcc;0.31;acc;0.23;ccc;0.14;gcc;0.29;;tct;0.12;act;2.55;cct;0.25;gct;0.05;;tct;0;act;0;cct;0;gct;0
tgt;0.26;agt;0.24;cgc;0.16;ggt;0.22;;tgt;0.07;agt;0.02;cgc;8.26;ggt;0.02;;tgt;0;agt;0;cgt;1.09;ggt;0.54
ttc;12.07;att;13.99;ctt;8.29;gtt;11.68;;ttc;1.51;atc;2.28;ctc;0.95;gtc;1.10;;ttc;1.17;atc;1.15;ctc;1.16;gtc;1.15
tac;13.38;aac;15.36;cac;10.24;gac;17.61;;tac;1.59;aac;2.17;cac;1.17;gac;2.24;;tac;1.03;aac;1.16;cac;1.01;gac;1.18
tct;10.46;act;11.87;cct;9.28;gct;18.52;;tcc;1.12;acc;1.12;ccc;0.68;gcc;1.03;;tcc;1.03;acc;1.03;ccc;0.93;gcc;1.00
tgc;17.02;agc;10.45;cgt;9.53;ggc;16.67;;tgc;1.11;agc;1.10;cgt;1.85;ggc;2.30;;tgc;1.63;agc;1.02;cgc;1.02;ggc;1.32
tta;5.29;ata;5.58;cta;4.64;gta;5.49;;tta;1.18;ata;0.01;cta;1.23;gta;2.20;;tta;1.04;ata;0.01;cta;1.01;gta;1.01
taa;−;aaa;15.54;caa;9.86;gaa;12.02;;taa;−;aaa;2.26;caa;1.58;gaa;2.40;;taa;−;aaa;1.07;caa;1.07;gaa;1.25
tca;5.91;aca;7.23;cca;10.28;gca;10.55;;tca;1.31;aca;1.46;cca;1.35;gca;2.53;;tca;1.00;aca;1.08;cca;1.00;gca;1.39
tga;2.06;aga;9.40;cga;5.79;gga;11.12;;tga;0.33;aga;1.19;cga;0.22;gga;1.37;;tga;0.10;aga;1.01;cga;1.01;gga;1.03
ttg;6.56;atg;19.69;ctg;6.64;gtg;8.95;;ttg;0.99;atg;4.47;ctg;1.29;gtg;0.33;;ttg;0.89;atg;3.20;ctg;0.87;gtg;0.92
tag;−;aag;18.12;cag;10.31;gag;14.72;;tag;−;aag;0.60;cag;0.59;gag;0.34;;tag;−;aag;0.90;cag;0.90;gag;0.87
tcg;4.55;acg;4.55;ccg;3.93;gcg;5.82;;tcg;0.65;acg;0.68;ccg;0.54;gcg;0.30;;tcg;0.83;acg;0.92;ccg;0.82;gcg;0.86
tgg;9.45;agg;7.81;cgg;3.54;ggg;5.25;;tgg;1.08;agg;0.86;cgg;0.83;ggg;0.56;;tgg;1.00;agg;0.90;cgg;0.76;ggg;0.84

Paires de base des codons[modifier | modifier le wikicode]

I 1.ap;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235027;;;IV 1.ap;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;
ttc;1.51;ctc;0.95;atc;2.28;gtc;1.10;;ttc;12.07;ctc;0.18;atc;0.34;gtc;0.44
aag;0.60;gag;0.34;tag;−;cag;0.59;;aag;18.12;gag;14.72;tag;−;cag;10.31
aac;2.17;gac;2.24;tac;1.59;cac;1.17;;aac;15.36;gac;17.61;tac;13.38;cac;10.24
ttg;0.99;ctg;1.29;atg;4.47;gtg;0.33;;ttg;6.56;ctg;6.64;atg;19.69;gtg;8.95
tcc;1.12;ccc;0.68;acc;1.12;gcc;1.03;;tcc;0.31;ccc;0.14;acc;0.23;gcc;0.29
agg;0.86;ggg;0.56;tgg;1.08;cgg;0.83;;agg;7.81;ggg;5.25;tgg;9.45;cgg;3.54
agc;1.10;ggc;2.30;tgc;1.11;cgc;8.26;;agc;10.45;ggc;16.67;tgc;17.02;cgc;0.16
tcg;0.65;ccg;0.54;acg;0.68;gcg;0.30;;tcg;4.55;ccg;3.93;acg;4.55;gcg;5.82
ttt;0.25;ctt;9.15;att;0.12;gtt;0.22;;ttt;0.26;ctt;8.29;att;13.99;gtt;11.68
aaa;2.26;gaa;2.40;taa;−;caa;1.58;;aaa;15.54;gaa;12.02;taa;−;caa;9.86
aat;0.12;gat;0;tat;0.10;cat;0.10;;aat;0.39;gat;0.34;tat;0.30;cat;0.22
tta;1.18;cta;1.23;ata;0.01;gta;2.20;;tta;5.29;cta;4.64;ata;5.58;gta;5.49
tct;0.12;cct;0.25;act;2.55;gct;0.05;;tct;10.46;cct;9.28;act;11.87;gct;18.52
aga;1.19;gga;1.37;tga;0.33;cga;0.22;;aga;9.40;gga;11.12;tga;2.06;cga;5.79
agt;0.02;ggt;0.02;tgt;0.07;cgt;1.85;;agt;0.24;ggt;0.22;tgt;0.26;cgt;9.53
tca;1.31;cca;1.35;aca;1.46;gca;2.53;;tca;5.91;cca;10.28;aca;7.23;gca;10.55
;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;
I 1.apr;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;rapports;;;IV 1.apr;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;rapports;
ttc;c/g;ctc;c/g;atc;c/g;gtc;c/g;;ttc;c/g;ctc;c/g;atc;c/g;gtc;c/g
aag;2.5;gag;2.8;tag;−;cag;1.9;;aag;0.7;gag;0.01;tag;−;cag;0.04
aac;;gac;;tac;;cac;;;aac;;gac;;tac;;cac;
ttg;2.2;ctg;1.7;atg;0.4;gtg;3.6;;ttg;2.3;ctg;2.7;atg;0.7;gtg;1.1
tcc;;ccc;;acc;;gcc;;;tcc;;ccc;;acc;;gcc;
agg;1.3;ggg;1.2;tgg;1.0;cgg;1.2;;agg;0.04;ggg;0.03;tgg;0.02;cgg;0.08
agc;;ggc;;tgc;;cgc;;;agc;;ggc;;tgc;;cgc;
tcg;1.7;ccg;4.2;acg;1.6;gcg;0.3;;tcg;2.3;ccg;4.2;acg;3.7;gcg;0.03
ttt;a/t;ctt;a/t;att;a/t;gtt;a/t;;ttt;a/t;ctt;a/t;att;a/t;gtt;a/t
aaa;910;gaa;26;taa;−;caa;710;;aaa;58.8;gaa;1.5;taa;−;caa;0.8
aat;;gat;;tat;;cat;;;aat;;gat;;tat;;cat;
tta;950;cta;>>>>;ata;14;gta;2215;;tta;13.6;cta;13.7;ata;18.8;gta;24.6
tct;;cct;;act;;gct;;;tct;;cct;;act;;gct;
aga;961;gga;552;tga;13;cga;443;;aga;0.9;gga;1.2;tga;0.2;cga;0.3
agt;;ggt;;tgt;;cgt;;;agt;;ggt;;tgt;;cgt;
tca;5299;cca;5453;aca;1959;gca;1.4;;tca;24.7;cca;46.1;aca;27.3;gca;1.1
;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;
I 1.pc;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;codons/paire;;;IV1.pc;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;codons/paire;
;tat;ttt;tct;tgt;cgc;gat;agt;;;tat;ttt;tct;tgt;cgc;gat;agt
paire;ata;aaa;aga;aca;gcg;cta;tca;;paire;ata;aaa;aga;aca;gcg;cta;tca
codons;0;2;2;2;2;2;2;;codons;2;2;4;2;2;1;3
;;;;;;;;;;;;;;;;
;;ttc;ttg;tac;tgg;tcc;tcg;;;;ttc;ttg;tac;tgg;tcc;tcg
paire;;aag;aac;atg;acc;agg;agc;;paire;;aag;aac;atg;acc;agg;agc
codons;;3;3;3;3;3;3;;codons;;4;4;3;2;3;4
;;;;;;;;;;;;;;;;
;aat;ggg;ctc;cac;gac;ggc;tgc;;;aat;ggg;ctc;cac;gac;ggc;tgc
paire;tta;ccc;gag;gtg;ctg;ccg;acg;;paire;tta;ccc;gag;gtg;ctg;ccg;acg
codons;1;4;4;4;4;4;4;;codons;2;2;2;4;3;3;4

Moyennes des doublets à 3 codons homogènes[modifier | modifier le wikicode]

IV1.23;;;;;;I1.23;;;;;;IV1.13;;;;;;I1.13;;;;
doublet;.tt;.ct;.ac;.gc;;doublet;.tc;.cc;.ac;.gc;;doublet;t.c;a.c;c.t;g.c;;doublet;t.c;a.c;c.c;g.c
sauf;ttc;gct;cac;cgt;;sauf;atc;ccc;cac;cgt;;sauf;tct;−;cac;−;;sauf;tgc;agc;cgt;ggc
m;11.32;10.54;15.45;14.72;;m;1.19;1.09;2.00;1.50;;m;14.16;−;9.03;−;;m;1.41;1.86;0.93;1.46
e;2.87;1.29;2.12;3.70;;e;0.29;0.05;0.36;0.69;;e;2.57;−;0.66;−;;e;0.25;0.64;0.25;0.68
%;25;12;14;25;;%;24;5;18;46;;%;18;−;7;−;;%;18;35;26;47
doublet;.ta;.ca;.aa;.ga;;doublet;.ta;.ca;.aa;.ga;;doublet;t.a;a.a;c.a;g.a;;doublet;t.a;a.a;c.a;g.a
sauf;cta;tca;taa;tga;;sauf;ata;gca;taa;tga;;sauf;taa;ata;cta;gta;;sauf;taa;ata;cga;gga
m;5.45;9.35;12.47;8.77;;m;1.53;1.37;2.08;0.93;;m;4.42;10.72;8.64;11.23;;m;0.94;1.64;1.39;2.37
e;0.15;2.16;2.87;2.72;;e;0.58;0.07;0.44;0.62;;e;2.07;4.31;1.92;0.75;;e;0.54;0.56;0.18;0.17
%;3;23;23;31;;%;38;5;21;67;;%;47;40;22;7;;%;57;34;13;7
doublet;.tg;.cg;.ag;.gg;;doublet;.tg;.cg;.ag;.gg;;doublet;t.g;a.g;c.g;g.g;;doublet;t.g;a.g;c.g;g.g
sauf;atg;gcg;tag;cgg;;sauf;atg;gcg;tag;ggg;;sauf;tag;acg;cag;gag;;sauf;tag;atg;ctg;ggg
m;7.39;4.35;14.38;7.50;;m;0.87;0.63;0.51;0.92;;m;6.85;15.21;4.71;6.67;;m;0.91;0.71;0.66;0.32
e;1.36;0.36;3.92;2.12;;e;0.49;0.07;0.15;0.14;;e;2.46;6.45;1.69;1.99;;e;0.23;0.13;0.16;0.02
%;18;8;27;28;;%;57;12;28;15;;%;36;42;36;30;;%;25;18;24;6

Genèse des gènes de tRNAs[modifier | modifier le wikicode]

I 1.g;Genèse de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235027;;;IV 1.g;Genèse de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;;;IV1.265;;sensibilité relative;;;7.90;-37.3;265.0
ttt;−;tct;−;tat;−;tgt;−;;ttt;0.21;tcc;0.23;tat;0.22;tgt;0.23;;ttt;0.03;tcc;0.04;tat;0.04;tgt;0.03
att;−;act;0.02;aat;−;agt;−;;atc;0.26;acc;0.19;aat;0.28;agt;0.14;;atc;0.04;acc;0.03;aat;0.05;agt;0.03
ctt;0.09;cct;−;cat;−;cgc;0.08;;ctc;0.16;ccc;0.13;cat;0.18;cgc;0.11;;ctc;0.02;ccc;0.02;cat;0.03;cgc;0.02
gtt;−;gct;−;gat;−;ggt;−;;gtc;0.31;gcc;0.21;gat;0.28;ggt;0.16;;gtc;0.06;gcc;0.04;gat;0.04;ggt;0.03
ttc;1;tcc;1;tac;1;tgc;1;;ttc;0.99;tct;1;tac;1;tgc;0.99;;ttc;1;tct;18;tac;6;tgc;94
atc;1;acc;0.99;aac;1;agc;1;;att;1;act;0.99;aac;1;agc;0.99;;att;-22.4;act;34;aac;-11;agc;20.7
ctc;0.92;ccc;0.67;cac;1;cgt;0.92;;ctt;0.91;cct;0.96;cac;0.99;cgt;0.99;;ctt;10;cct;73;cac;11;cgt;-35
gtc;1;gcc;1;gac;1;ggc;1;;gtt;1;gct;1;gac;0.99;ggc;0.98;;gtt;35;gct;127;gac;0;ggc;-8
tta;0.95;tca;0.99;taa;−;tga;0.33;;tta;0.98;tca;1;taa;−;tga;0.60;;tta;-43;tca;-43;taa;−;tga;-20.1
ata;−;aca;1.00;aaa;1.00;aga;1.00;;ata;0.98;aca;1;aaa;0.98;aga;0.98;;ata;−;aca;-37;aaa;-13;aga;0
cta;0.99;cca;1.00;caa;1.00;cga;0.21;;cta;0.93;cca;0.99;caa;1;cga;0.83;;cta;-52;cca;-4;caa;-21.2;cga;233
gta;1.00;gca;1.00;gaa;1.00;gga;1.00;;gta;0.98;gca;1;gaa;1;gga;1;;gta;-68;gca;-47;gaa;-37;gga;3
ttg;0.98;tcg;0.62;tag;−;tgg;1.00;;ttg;0.96;tcg;1;tag;−;tgg;0.98;;ttg;-16;tcg;-11;tag;−;tgg;10
atg;1;acg;0.67;aag;0.52;agg;0.80;;atg;1;acg;0.98;aag;0.98;agg;0.98;;atg;-44;acg;-16;aag;281;agg;15
ctg;0.82;ccg;0.54;cag;0.46;cgg;0.86;;ctg;0.90;ccg;0.82;cag;1;cgg;0.90;;ctg;-35;ccg;-8;cag;120;cgg;-46
gtg;0.31;gcg;0.30;gag;0.29;ggg;0.57;;gtg;0.99;gcg;0.86;gag;1;ggg;0.93;;gtg;248;gcg;143;gag;441;ggg;18
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
I 1.z;Zéros de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235027;;;IV 1.z;Zéros de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;;;I 1.zb;Bactéries. 4032 bactéries ;;;;;235027;
ttt;−;tct;−;tat;−;tgt;−;;ttt;96;tcc;93;tat;94;tgt;93;;ttt;−;tct;−;tat;−;tgt;−
att;−;act;3682;aat;−;agt;−;;atc;90;acc;98;aat;87;agt;104;;att;−;act;3775;aat;−;agt;−
ctt;3502;cct;−;cat;−;cgc;3614;;ctc;102;ccc;105;cat;99;cgc;108;;ctt;3834;cct;−;cat;−;cgc;3932
gtt;−;gct;−;gat;−;ggt;−;;gtc;83;gcc;96;gat;87;ggt;102;;gtt;−;gct;−;gat;−;ggt;−
ttc;0;tcc;0;tac;0;tgc;0;;*ttc;1;tct;0;tac;0;*tgc;1;;ttc;0;tcc;0;tac;0;tgc;0
atc;0;acc;41;aac;0;agc;0;;att;0;act;1;aac;0;agc;1;;atc;0;acc;3775;aac;0;agc;0
ctc;323;ccc;1285;cac;0;cgt;307;;ctt;11;cct;5;*cac;1;cgt;1;;ctc;3834;ccc;3940;cac;0;cgt;3932
gtc;0;gcc;0;gac;0;ggc;0;;gtt;0;gct;0;*gac;1;ggc;2;;gtc;0;gcc;0;gac;0;ggc;0
tta;190;tca;22;taa;−;tga;2629;;tta;2;tca;0;taa;−;tga;48;;tta;3933;tca;3943;taa;−;tga;3934
ata;−;aca;13;aaa;9;aga;10;;ata;2;aca;0;aaa;2;*aga;2;;ata;−;aca;3944;aaa;3941;aga;3928
cta;30;cca;5;caa;18;cga;3026;;cta;9;cca;1;caa;0;cga;20;;cta;3935;cca;3939;caa;3943;cga;3833
gta;2;gca;11;gaa;5;gga;11;;gta;2;gca;0;gaa;0;gga;0;;gta;3935;gca;3902;gaa;3928;gga;3939
ttg;96;tcg;1493;tag;−;tgg;15;;ttg;5;tcg;0;tag;−;*tgg;3;;ttg;3933;tcg;3943;tag;−;tgg;3934
atg;0;acg;1288;aag;1899;agg;780;;atg;0;acg;2;aag;2;agg;2;;atg;0;acg;3944;aag;3941;agg;3928
ctg;692;ccg;1813;cag;2130;cgg;539;;ctg;12;ccg;22;cag;0;cgg;12;;ctg;3935;ccg;3939;cag;3943;cgg;3833
gtg;2724;gcg;2721;gag;2808;ggg;1699;;gtg;1;gcg;17;gag;0;ggg;8;;gtg;3935;gcg;3902;gag;3928;ggg;3939

Genèse et sensibilité[modifier | modifier le wikicode]

table;codon;B;E;z,E;sens,r;sens,E;;table;codon;B;E;z,E;sens,r;sens,E
;genèse constante, neutre;;;;;;;;genèse constante, négative;;;;;
;ttc;1;0,99;1;1;1,53;;;gta;1,00;0,98;2;-68;0,69
;tac;1;1;0;6;1,69;;;atg;1;1;0;-44;2,49
;aac;1;1;0;-11;1,94;;;tca;0,99;1;0;-43;0,75
;cac;1;0,99;1;11;1,30;;;aca;1,00;1;0;-37;0,92
;gac;1;0,99;1;0;2,23;;;gca;1,00;1;0;-47;1,33
I;tgg;1;0,98;3;10;1,20;;;gaa;1,00;1;0;-37;1,52
;aaa;1;0,98;2;-13;1,97;;;tta;0,95;0,98;2;-43;0,67
II;caa;1;1;0;-21,2;1,25;;VI;cgt/c;0,92;0,99;1;-35;1,21
;atc/t;1;1;0;-22,4;1,77;;;ctg;0,82;0,90;12;-35;0,84
;tcc/t;1;1;0;18;1,32;;;cgg;0,86;0,90;12;-46;0,45
;agc;1;0,99;1;20,7;1,32;;VII;cta;0,99;0,93;9;-52;0,59
III;ggc;1;0,98;2;-8;2,11;;;genèse constante, sensible;;;;;
;cca;1;0,99;1;-4;1,30;;;gtc/t;1;1;0;35;1,48
;aga;1;0,98;2;0;1,19;;;acc/t;0,99;0,99;1;34;1,50
IV;gga;1;1;0;3;1,41;;;tgc;1;0,99;1;94;2,16
;ttg;0,98;0,96;5;-16;0,83;;VIII;gcc/t;1;1;0;127;2,34
;ctc/t;0,92;0,91;11;10;1,05;;;;;;;;
;ccg;0,54;0,82;22;-8;0,50;;;genèse variable, sensible;;;;;
;ggg;0,57;0,93;8;18;0,66;;;ata;−;0,98;2;−;0,71
V;tga;0,33;0,60;48;-20,1;0,26;;;aag;0,52;0,98;2;281;2,29
 ;;;;;;;;;cag;0,46;1;0;120;1,30
 ;;;;;;;;;gag;0,29;1;0;441;1,86
;genèse variable, neutre;;;;;;;b;gtg;0,31;0,99;1;248;1,13
;tcg;0,62;1;0;-11;0,58;;;gcg;0,30;0,86;17;143;0,74
;acg;0,67;0,98;2;-16;0,58;;;cga;0,21;0,83;20;233;0,73
a;agg;0,80;0,98;2;15;0,99;;c;cct/c;0,67;0,96;5;73;1,17

Duplications entières du processus E[modifier | modifier le wikicode]

;;;;Duplications entières du processus E;;;;;;;;;;
codon;iE;saut;;codon;iE;saut;;codon;iE;saut;;codon;iE;saut
cgc;0.07;21;;tga;1.73;56;;agg;6.95;5;;ttc;10.56;0.18
ctc;0.09;53;;cgg;2.71;22;;ctt;7.33;5;;gtt;10.58;1.60
ccc;0.14;49;;gta;3.29;3;;cgt;7.67;4;;act;10.75;9
acc;0.21;8;;ccg;3.39;0.55;;gca;8.02;2.42;;att;11.71;0.67
cat;0.22;0.33;;cta;3.41;13;;aga;8.21;0.75;;tac;11.79;12
ggt;0.22;7;;acg;3.87;0.88;;caa;8.28;1.07;;aac;13.18;0.74
agt;0.24;9;;tcg;3.90;5;;tgg;8.36;3;;aaa;13.28;8
ttt;0.26;0.66;;tta;4.11;12;;cct;8.60;0.28;;ggc;14.37;0.04
tgt;0.26;9;;tca;4.59;1.98;;gtg;8.62;4;;gag;14.37;6
gcc;0.29;3;;ggg;4.69;14;;cca;8.93;1.59;;atg;15.22;1.04
tat;0.30;5;;ctg;5.36;3;;cac;9.07;3;;gac;15.37;4
tcc;0.31;8;;gcg;5.51;0.91;;tct;9.34;0.17;;tgc;15.92;10
atc;0.34;0.37;;ata;5.56;0.10;;agc;9.36;3;;gct;17.49;0.20
gat;0.34;14;;ttg;5.57;0.06;;gaa;9.62;0.93;;aag;17.52;
aat;0.39;13;;cga;5.57;4;;cag;9.71;0.36;;;;
gtc;0.44;297;;aca;5.77;20;;gga;9.75;8;;;;

Corrélations entre codons des 121 eucaryotes[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Calculs pour 121 eucaryotes
  • Tableau des diagrammes
  • Légende: corel pour coefficient de corrélation pour 45 codons (-1, atg), 41 codons(-5, atg aag gag tgc gct), 40 codons (-6, +gta)
;-1;-5;-6;;;-1;-5;-6
corel;0.453;0.682;0.745;;corel;0.335;0.589;0.671
;;;;;;;;
;I1 B;IV1 E;;;;I1 B;IV1-I1 d;
ata;0.01;5.58;;;ata;0.01;5.56;
cga;0.22;5.79;;;cga;0.22;2.71;
gcg;0.30;5.82;;;gcg;0.30;5.51;
gtg;0.33;8.95;;;gtg;0.33;8.62;
tga;0.33;2.06;;;tga;0.33;1.73;
gag;0.34;14.72;;*;gag;0.34;14.37;
ccg;0.54;3.93;;;ccg;0.54;3.39;
ggg;0.56;5.25;;;ggg;0.56;4.69;
cag;0.59;10.31;;;cag;0.59;9.71;
aag;0.60;18.12;;*;aag;0.60;17.52;
tcg;0.65;4.55;;;tcg;0.65;3.90;
ccc;0.68;9.28;;;ccc;0.68;8.60;
acg;0.68;4.55;;;acg;0.68;3.87;
cgg;0.83;3.54;;;cgg;0.83;5.57;
agg;0.86;7.81;;;agg;0.86;6.95;
ctc;0.95;8.29;;;ctc;0.95;7.33;
ttg;0.99;6.56;;;ttg;0.99;5.57;
gcc;1.03;18.52;;*;gcc;1.03;17.49;
tgg;1.08;9.45;;;tgg;1.08;8.36;
agc;1.10;10.45;;;agc;1.10;9.36;
gtc;1.10;11.68;;;gtc;1.10;10.58;
tgc;1.11;17.02;;*;tgc;1.11;15.92;
acc;1.12;11.87;;;acc;1.12;10.75;
tcc;1.12;10.46;;;tcc;1.12;9.34;
cac;1.17;10.24;;;cac;1.17;9.07;
tta;1.18;5.29;;;tta;1.18;4.11;
aga;1.19;9.40;;;aga;1.19;8.21;
cta;1.23;4.64;;;cta;1.23;3.41;
ctg;1.29;6.64;;;ctg;1.29;5.36;
tca;1.31;5.91;;;tca;1.31;4.59;
cca;1.35;10.28;;;cca;1.35;8.93;
gga;1.37;11.12;;;gga;1.37;9.75;
aca;1.46;7.23;;;aca;1.46;5.77;
ttc;1.51;12.07;;;ttc;1.51;10.56;
caa;1.58;9.86;;;caa;1.58;8.28;
tac;1.59;13.38;;;tac;1.59;11.79;
cgt;1.85;9.53;;;cgt;1.85;7.67;
aac;2.17;15.36;;;aac;2.17;13.18;
gta;2.20;5.49;;*;gta;2.20;3.29;
gac;2.24;17.61;;;gac;2.24;15.37;
aaa;2.26;15.54;;;aaa;2.26;13.28;
atc;2.28;13.99;;;atc;2.28;11.71;
ggc;2.30;16.67;;;ggc;2.30;14.37;
gaa;2.40;12.02;;;gaa;2.40;9.62;
gca;2.53;10.55;;;gca;2.53;8.02;
atg;4.47;19.69;;*;atg;4.47;15.22;

Distribution des tRNAs de 121 eucaryotes[modifier | modifier le wikicode]

Cumul des fréquences des tRNAs/génome > 4. 121 Eucaryotes.;;;;;;;
ttt;2;tct;104;tat;2;tgt;6
c;111;c;2;c;106;c;87
a;55;a;48;a;−;a;9
g;70;g;32;g;−;g;87
ctt;80;cct;85;cat;1;cgt;92
c;0;c;1;c;97;c;2
a;37;a;82;a;78;a;64
g;72;g;24;g;87;g;28
att;111;act;106;aat;4;agt;1
c;5;c;5;c;108;c;88
a;55;a;61;a;83;a;86
g;110;g;43;g;113;g;61
gtt;107;gct;114;gat;6;ggt;8
c;3;c;3;c;112;c;114
a;49;a;83;a;98;a;77
g;71;g;52;g;95;g;53
  • Tableau des totaux Ligne/Colonne
Cumul des fréquences des tRNAs/génome > 4. 121 Eucaryotes.;;;;;;;;;;
Total colonne;;;;;;Total ligne;;;;
;t;c;a;g;;;t;c;a;g
Base 2;938;845;990;863;;Base 1;721;830;1040;1045
t1+c1;10;11;13;17;;t1+c1;12;4;15;20
t2+c2;409;409;423;381;;t2+c2;408;354;413;447
a;196;274;259;236;;a;112;261;285;307
g;323;151;295;229;;g;189;211;327;271
  • Tableau des diagrammes et totaux des fréquences 0-4
max;;ttc;tta;ttg;ctt;cta;ctg;att;ata;atg;gtt;gta;gtg;tct;tca;tcg;cct;cca;ccg;act;aca;acg;gct;gca;gcg;tac;cac;caa;cag;aac;aaa;aag;gac;gaa;gag;tgc;tgg;cgt;cga;cgg;agc;aga;agg;ggc;gga;ggg;total;tga;
22;0;1;2;5;11;9;12;0;2;0;0;2;1;0;0;0;5;1;22;1;0;3;0;0;17;0;1;0;0;0;2;2;1;0;0;1;3;1;20;12;1;2;2;2;0;8;152;48;0
33;1;3;19;7;9;18;13;2;33;1;2;25;16;4;15;25;16;8;14;1;10;27;2;9;8;3;2;6;15;2;8;1;2;4;9;5;3;2;10;30;4;10;26;1;7;24;461;41;1
26;2;2;11;10;6;19;7;1;18;2;3;26;12;5;24;18;6;8;16;1;20;18;2;13;13;3;4;12;9;2;8;1;2;8;6;4;4;7;12;18;8;9;16;2;11;18;425;11;2
26;3;2;17;14;5;20;6;2;4;0;5;9;14;4;20;26;3;10;20;3;14;15;3;11;16;3;6;9;5;6;10;4;4;7;5;14;8;6;5;19;13;9;9;0;14;9;408;8;3
25;4;2;17;15;10;18;11;5;9;8;4;10;7;4;14;20;6;12;25;9;16;15;0;5;15;6;11;16;5;3;10;0;0;4;6;10;16;13;10;14;7;5;7;2;12;9;423;4;4
20;5;11;10;8;15;14;14;2;20;3;3;9;3;5;10;8;1;10;8;6;7;13;3;14;16;9;12;12;8;1;6;4;4;10;5;11;6;6;18;10;7;15;14;3;7;6;387;1;5
22;6;11;8;10;18;3;11;8;8;5;10;7;7;9;10;8;10;11;1;7;14;7;3;4;8;13;12;10;6;11;6;4;5;9;5;0;18;22;10;4;10;17;8;2;10;8;388;0;6
15;7;8;9;14;5;3;11;7;8;6;15;9;9;14;8;3;15;15;3;6;8;8;9;5;6;4;10;8;7;5;2;4;1;6;5;4;9;15;10;4;10;9;6;4;7;7;341;2;7
14;8;12;5;10;8;2;5;9;4;7;10;7;3;8;2;5;10;12;2;13;4;1;6;5;4;9;9;4;6;4;7;2;11;6;10;3;13;6;4;2;14;5;3;5;6;6;289;0;8
17;9;7;4;5;5;3;5;8;2;5;7;3;7;10;2;1;9;1;4;17;4;3;4;14;0;9;7;9;4;14;4;12;7;5;6;1;5;7;4;0;9;8;3;4;10;7;265;0;9
15;10;11;3;5;3;4;6;13;3;6;9;1;9;13;2;1;10;6;0;15;6;4;5;7;1;6;12;7;10;5;3;4;14;5;6;3;5;10;2;2;6;5;4;9;3;2;266;0;10
13;11;5;2;2;1;2;7;9;1;3;7;2;3;10;2;0;4;5;0;11;2;1;5;6;3;5;4;4;10;5;4;7;2;8;7;2;1;1;1;0;3;3;4;13;4;2;183;0;11
12;12;9;3;2;3;0;1;12;0;4;7;1;5;9;2;0;4;1;0;6;1;0;7;2;2;3;5;0;10;6;5;6;1;2;2;1;2;4;2;1;4;3;1;5;5;1;150;0;12
11;13;5;3;1;1;0;3;9;1;2;5;0;2;6;0;0;4;1;1;2;1;1;5;2;0;5;1;1;5;5;2;6;11;6;6;3;4;3;0;0;4;3;2;7;0;1;130;0;13
12;14;3;2;4;2;0;0;4;0;8;5;0;1;2;2;1;4;2;0;2;1;0;4;2;0;6;2;2;1;5;6;6;9;7;4;2;3;2;0;1;2;1;0;12;2;0;122;0;14
9;15;3;2;2;3;0;0;1;0;5;1;1;4;3;2;1;3;0;0;2;2;0;5;3;1;4;1;1;3;2;4;5;7;7;2;4;2;1;1;0;2;0;0;9;2;0;101;0;15
8;16;3;1;1;1;0;2;1;0;4;3;2;3;2;0;0;1;1;0;1;0;0;2;1;1;3;1;2;1;3;3;8;3;4;1;1;2;3;0;1;2;1;1;4;0;1;75;0;16
4;17;4;0;0;1;1;0;4;0;3;3;0;0;1;1;0;0;0;0;2;0;0;2;3;1;4;2;2;1;4;1;3;0;3;0;3;0;0;2;0;2;1;0;4;2;0;60;1;17
8;18;0;0;1;1;0;1;2;1;5;2;1;2;0;1;0;0;1;1;2;3;0;8;1;1;3;1;1;2;4;2;2;3;1;0;1;5;1;1;0;2;3;1;1;1;1;70;2;18
6;19;0;1;1;0;0;0;2;0;4;4;0;0;1;0;0;2;0;0;0;1;0;6;0;0;6;3;0;1;2;1;5;4;2;5;1;0;0;1;0;1;0;1;4;0;0;59;0;19
6;20;2;0;1;2;1;0;3;0;3;2;0;0;1;1;0;0;0;0;1;0;0;6;1;1;0;0;2;2;2;4;2;2;2;2;1;0;0;0;0;2;0;0;1;0;1;48;0;20
3;21;1;0;0;1;0;1;3;0;3;2;1;1;1;0;0;2;2;1;0;1;0;2;0;1;3;3;1;1;3;0;0;1;0;2;3;0;2;0;1;0;1;1;1;0;0;46;1;21
4;22;3;0;1;1;0;0;0;1;2;3;0;1;1;0;0;0;1;1;2;1;0;4;0;1;2;0;1;0;2;2;3;1;2;1;4;1;1;0;0;0;1;0;1;0;0;45;0;22
5;23;1;0;0;0;0;0;0;1;3;2;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;2;4;0;0;1;1;0;0;5;0;1;1;0;1;2;2;0;0;0;0;0;0;3;0;0;32;0;23
4;24;3;0;0;0;1;0;0;1;3;1;0;0;1;0;0;0;0;0;2;0;0;2;1;1;2;1;1;1;2;1;2;2;0;4;2;0;1;0;2;0;0;0;2;1;0;40;1;24
7;25;1;0;0;0;1;1;1;1;3;1;0;1;1;0;0;1;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;1;1;0;1;7;0;0;2;0;0;0;0;2;0;1;30;0;25
5;26;1;0;0;2;0;0;3;1;2;0;2;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;5;0;0;1;0;2;0;1;0;0;0;0;1;0;0;1;1;1;0;0;27;0;26
5;27;0;0;0;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;1;0;0;1;0;0;0;2;0;0;1;0;0;2;0;2;5;1;0;0;0;0;1;1;1;0;0;21;0;27
3;28;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;2;0;1;1;3;0;0;2;0;0;3;0;0;0;0;1;0;1;1;0;0;18;0;28
2;29;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;1;1;0;1;0;1;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;1;1;2;1;0;1;1;1;1;1;0;0;0;1;1;0;0;20;1;29
3;30;1;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;1;1;2;0;0;0;0;0;0;1;1;1;1;0;2;2;1;0;0;0;1;0;0;3;0;0;22;0;30
2;31;0;0;1;0;0;0;2;0;0;1;0;0;0;0;0;0;2;0;1;0;0;2;1;0;0;0;0;0;0;2;0;1;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;15;0;31
2;32;1;0;0;1;0;2;0;0;2;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;1;0;0;0;0;1;1;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;14;0;32
2;33;0;0;0;1;1;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;2;0;0;0;1;1;1;0;1;0;1;2;1;0;17;0;33
2;34;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;1;2;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;1;1;1;11;0;34
2;35;2;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;1;0;0;1;0;0;0;0;1;0;2;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;35
2;36;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;1;1;1;0;0;0;0;1;2;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;13;0;36
2;37;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;1;0;0;2;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;37
1;38;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;38
2;39;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;7;0;39
2;40;0;0;0;1;1;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;2;1;0;2;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;14;0;40
1;41;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;7;0;41
2;42;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;0;0;0;0;1;2;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;10;0;42
3;43;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;1;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;10;0;43
1;44;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;3;0;44
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1;48;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;1;0;5;0;48
2;49;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;1;2;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;49
1;50;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;6;0;50
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2;53;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;7;0;53
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1;55;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;6;0;55
1;56;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;56
1;57;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;57
1;58;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;58
1;59;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;59
1;60;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;60
1;61;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;4;0;61
1;62;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;62
1;63;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;4;0;63
1;64;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;2;0;64
1;65;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;65
2;66;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;5;0;66
1;67;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;2;0;67
1;68;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;3;0;68
2;69;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;69
;;ttc;tta;ttg;ctt;cta;ctg;att;ata;atg;gtt;gta;gtg;tct;tca;tcg;cct;cca;ccg;act;aca;acg;gct;gca;gcg;tac;cac;caa;cag;aac;aaa;aag;gac;gaa;gag;tgc;tgg;cgt;cga;cgg;agc;aga;agg;ggc;gga;ggg;total;tga;
Suite;−;−;−;−;112;−;75;101;−;73;166;145;71;−;−;−;−;−;−;99;91;137;75;5,898;3,858;83;−;782;81;123;72;86;82;84;77;92;74;85;79;−;76;90;116;85;80;72;−;−;
Fréquence 1;;;;;;;;110;;79;;;81;;;;;;;151;206;;83;;;90;;;108;168;74;97;90;114;164;107;178;;84;;99;105;;;133;81;;;
;;;;;;;;;;94;;;1540;;;;;;;;;;106;;;107;;;;;78;97;97;114;395;338;217;;1201;;;123;;;326;90;;;
;;;;;;;;;;138;;;;;;;;;;;;;256;;;;;;;;82;127;184;139;428;;256;;;;;;;;391;105;;;
;;;;;;;;;;154;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;86;149;;235;468;;;;;;;;;;619;341;;;
;;;;;;;;;;278;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;271;;435;;;;;;;;;;;833;1,295;;;
;;;;;;;;;;286;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;408;;1,901;;;;;;;;;;;987;1,766;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;772;;2,368;;;;;;;;;;;1073;2,148;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;887;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;ttc;tta;ttg;ctt;cta;ctg;att;ata;atg;gtt;gta;gtg;tct;tca;tcg;cct;cca;ccg;act;aca;acg;gct;gca;gcg;tac;cac;caa;cag;aac;aaa;aag;gac;gaa;gag;tgc;tgg;cgt;cga;cgg;agc;aga;agg;ggc;gga;ggg;total;tga;
Total 0-4;;10;66;51;41;84;49;10;66;11;14;72;50;17;73;89;36;39;97;15;60;78;7;38;69;15;24;43;34;13;38;8;9;23;26;34;34;29;57;93;33;35;60;7;44;68;1869;112;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Distribution c/t;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;ttt;ctc;atc;gtc;tcc;ccc;acc;gcc;tat;cat;aat;gat;tgt;cgc;agt;ggt;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;0;96;102;90;83;93;105;98;96;94;99;87;87;93;108;104;102;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;1;16;16;16;26;17;13;13;14;18;17;17;21;17;7;6;5;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;2;5;3;8;3;2;1;3;5;5;1;11;7;4;2;6;4;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;3;1;0;1;6;4;0;1;1;2;2;1;0;0;2;3;0;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;4;1;0;1;0;3;1;1;2;0;1;1;0;1;0;1;2;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;5;0;0;2;0;0;0;1;0;1;1;1;0;3;0;1;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;6;2;0;2;0;0;1;0;1;0;0;2;3;1;0;0;0;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Suite;−;−;−;9;12;22;−;8;31;11;−;9;10;16;7;−;7;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
Fréquence 1;;;;;16;32;;12;168;;;;10;143;9;;9;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;16;;;13;;;;;20;;;;12;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;19;;;;;;;;;19;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;20;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;21;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;24;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;

Caractérisation des codons par les processus de genèse et de duplication des eucaryotes[modifier | modifier le wikicode]

Tableau des effectifs calculés des gènes de tRNAs 121 eucaryotes.[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableur: Tableau des effectifs calculés des gènes de tRNAs 121 eucaryotes.
  • Légende: Décompte des gènes tRNAs par codon suivant la base de données gtRNAdb [4].
    1.   5   : nombre de tRNAs d'un codon se terminant par t. Ce sont les plus faibles.
    2.   113   : nombre de tRNAs d'un codon se terminant par t: Changement de t en c chez les archées et de c en t chez les eucaryotes.
    3. 4 366: Effectif élevé de tRNAs d'un codon se terminant par g chez les procaryotes.
    4. 2622: Effectif faible de tRNAs supérieurs à   t   et à   c   .
    5. 160: Changement de codon   g   Chez les archées et les eucaryotes.
  • Tableaux:
    1. Nombre de tRNAs, tableaux IV V, décompte de la base gtRNAdb.
    2. Pour 100 000 tRNAs, tableaux IV100 III100 V100, décomptes rapportés à 100 000 tRNAs pour comparaison.
    3. tRNAs pour 1 génome, tableaux IV1 III1 , indice de la multiplicité = nombre de tRNAs / nombre de génomes.
    4. IVp, pentes; IVr, coefficients de détermination R2. Voir les calculs pour les 121 eucaryotes
IV ;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;;55,830;;IV p;Pentes des tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;;;;12,258;V;Nombres Danio rerio (Zebrafish) ;;;;;
ttt;32;tct;1,266;tat;36;tgt;32;;ttt;;tct;0.946;tat;;tgt;;;ttt;10;tct;336;tat;5;tgt;9
c;1,461;c;38;c;1,619;c;2,060;;c;1.139;c;;c;1.293;c;1.603;;c;197;c;2;c;236;c;136
a;640;a;715;a;;a;249;;a;0.463;a;0.699;a;;a;;;a;73;a;209;a;;a;14
g;794;g;551;g;;g;1,143;;g;0.574;g;0.511;g;;g;0.941;;g;241;g;80;g;;g;44
ctt;1,003;cct;1,123;cat;27;cgt;1,153;;ctt;0.853;cct;0.991;cat;;cgt;0.948;;ctt;270;cct;315;cat;10;cgt;203
c;22;c;17;c;1,239;c;19;;c;;c;;c;0.998;c;;;c;4;c;2;c;387;c;24
a;561;a;1,244;a;1,193;a;701;;a;0.504;a;1.062;a;0.925;a;0.606;;a;244;a;205;a;105;a;107
g;804;g;476;g;1,247;g;428;;g;0.627;g;0.469;g;1.065;g;0.321;;g;300;g;180;g;266;g;59
att;1,693;act;1,436;aat;47;agt;29;;att;1.334;act;1.188;aat;;agt;;;att;258;act;359;aat;24;agt;14
c;41;c;28;c;1,858;c;1,265;;c;;c;;c;1.442;c;1.174;;c;10;c;10;c;1,045;c;424
a;675;a;875;a;1,880;a;1,138;;a;0.668;a;0.848;a;1.669;a;0.969;;a;75;a;290;a;525;a;252
g;2,382;g;551;g;2,193;g;945;;g;2.025;g;0.491;g;1.738;g;0.808;;g;522;g;66;g;953;g;104
gtt;1,413;gct;2,241;gat;41;ggt;27;;gtt;1.020;gct;1.728;gat;;ggt;;;gtt;232;gct;92;gat;1;ggt;11
c;53;c;35;c;2,131;c;2,017;;c;;c;;c;1.690;c;1.476;;c;6;c;4;c;150;c;836
a;664;a;1,276;a;1,455;a;1,345;;a;0.591;a;1.079;a;1.233;a;1.263;;a;230;a;368;a;225;a;47
g;1,083;g;704;g;1,781;g;635;;g;0.905;g;0.673;g;1.375;g;0.485;;g;227;g;112;g;245;g;268
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
IV 100;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;;;;I 100;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235,027;24.10.17;;;V 100;Danio rerio (Zebrafish) ;;;;;
ttt;57;tct;2,268;tat;64;tgt;57;;ttt;4;tct;2;tat;2;tgt;1;;ttt;82;tct;2,741;tat;41;tgt;73
c;2,617;c;68;c;2,900;c;3,690;;c;2,598;c;1,923;c;2,732;c;1,903;;c;1,607;c;16;c;1,925;c;1,109
a;1,146;a;1,281;a;;a;446;;a;2,021;a;2,255;a;−;a;560;;a;596;a;1,705;a;;a;114
g;1,422;g;987;g;;g;2,047;;g;1,702;g;1,116;g;−;g;1,858;;g;1,966;g;653;g;;g;359
ctt;1,797;cct;2,011;cat;48;cgt;2,065;;ctt;157;cct;4;cat;2;cgt;3,182;;ctt;2,203;cct;2,570;cat;82;cgt;1,656
c;39;c;30;c;2,219;c;34;;c;1,638;c;1,167;c;2,006;c;142;;c;33;c;16;c;3,157;c;196
a;1,005;a;2,228;a;2,137;a;1,256;;a;2,102;a;2,320;a;2,718;a;377;;a;1,991;a;1,672;a;857;a;873
g;1,440;g;853;g;2,234;g;767;;g;2,207;g;929;g;1,016;g;1,427;;g;2,447;g;1,468;g;2,170;g;481
att;3,032;act;2,572;aat;84;agt;52;;att;2;act;44;aat;2;agt;0;;att;2,105;act;2,929;aat;196;agt;114
c;73;c;50;c;3,328;c;2,266;;c;3,916;c;1,920;c;3,729;c;1,881;;c;82;c;82;c;8,525;c;3,459
a;1,209;a;1,567;a;3,367;a;2,038;;a;23;a;2,501;a;3,874;a;2,044;;a;612;a;2,366;a;4,283;a;2,056
g;4,267;g;987;g;3,928;g;1,693;;g;7,670;g;1,174;g;1,033;g;1,469;;g;4,258;g;538;g;7,775;g;848
gtt;2,531;gct;4,014;gat;73;ggt;48;;gtt;4;gct;1;gat;0;ggt;0;;gtt;1,893;gct;751;gat;8;ggt;90
c;95;c;63;c;3,817;c;3,613;;c;1,885;c;1,773;c;3,839;c;3,946;;c;49;c;33;c;1,224;c;6,820
a;1,189;a;2,286;a;2,606;a;2,409;;a;3,769;a;4,334;a;4,118;a;2,347;;a;1,876;a;3,002;a;1,836;a;383
g;1,940;g;1,261;g;3,190;g;1,137;;g;559;g;521;g;591;g;964;;g;1,852;g;914;g;1,999;g;2,186
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
IV 1;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;;;;III 1;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;;;;;IV r;R2 des tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;
ttt;0.26;tct;10.46;tat;0.30;tgt;0.26;;ttt;0.37;tct;10.46;tat;0.41;tgt;1.73;;ttt;;tct;881;tat;;tgt;
c;12.07;c;0.31;c;13.38;c;17.02;;c;12.07;c;0.82;c;13.73;c;19.86;;c;914;c;;c;748;c;743
a;5.29;a;5.91;a;0.00;a;2.06;;a;5.83;a;5.91;a;0.00;a;2.06;;a;734;a;758;a;;a;
g;6.56;g;4.55;g;0.00;g;9.45;;g;6.74;g;4.55;g;0.00;g;14.37;;g;775;g;731;g;;g;815
ctt;8.29;cct;9.28;cat;0.22;cgt;9.53;;ctt;8.97;cct;9.28;cat;0.28;cgt;9.53;;ctt;807;cct;816;cat;;cgt;760
c;0.18;c;0.14;c;10.24;c;0.16;;c;0.18;c;0.21;c;10.24;c;0.27;;c;;c;;c;938;c;
a;4.64;a;10.28;a;9.86;a;5.79;;a;4.64;a;10.28;a;16.17;a;16.69;;a;748;a;713;a;614;a;801
g;6.64;g;3.93;g;10.31;g;3.54;;g;7.08;g;3.93;g;10.89;g;3.54;;g;697;g;743;g;822;g;570
att;13.99;act;11.87;aat;0.39;agt;0.24;;att;14.90;act;12.62;aat;0.60;agt;0.30;;att;847;act;803;aat;;agt;
c;0.34;c;0.23;c;15.36;c;10.45;;c;0.58;c;0.69;c;16.85;c;10.45;;c;;c;;c;913;c;797
a;5.58;a;7.23;a;15.54;a;9.40;;a;5.58;a;8.70;a;15.54;a;11.31;;a;740;a;788;a;770;a;666
g;19.69;g;4.55;g;18.12;g;7.81;;g;24.14;g;5.55;g;38.50;g;9.05;;g;892;g;866;g;845;g;594
gtt;11.68;gct;18.52;gat;0.34;ggt;0.22;;gtt;12.75;gct;20.86;gat;0.77;ggt;1.14;;gtt;840;gct;863;gat;;ggt;
c;0.44;c;0.29;c;17.61;c;16.67;;c;0.78;c;1.98;c;18.55;c;16.67;;c;;c;;c;791;c;818
a;5.49;a;10.55;a;12.02;a;11.12;;a;6.53;a;59.00;a;54.62;a;45.84;;a;723;a;748;a;880;a;795
g;8.95;g;5.82;g;14.72;g;5.25;;g;22.31;g;37.52;g;25.71;g;53.21;;g;793;g;809;g;728;g;597

Tableau des effectifs des gènes de tRNAs 121 eucaryotes.[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableaux: Tableau des effectifs des gènes de tRNAs 121 eucaryotes.
  • Liens: Sélection des 121 eucaryotestableaux synthétiques des 121
  • Utilisation de ces tableaux: Le tableau III1 92 530, est comparé au tableau III1 55 948 des tableaux synthétiques, pour l'indice de la multiplicité. Les codons en gras ont un indice multiplié par 3 à 10 par rapport à la tendance de l'ensemble des codons calculée dans III1 55 948. Le processus normal de duplication chez les eucaryotes (et non zebrafish) entre en résonance avec ces codons décuplés. Voilà encore une autre illustration de la résonance dans l'ADN.
  • Légende: Décompte des gènes tRNAs par codon suivant la base de données gtRNAdb [5].
    1.   5   : nombre de tRNAs d'un codon se terminant par t. Ce sont les plus faibles.
    2.   113   : nombre de tRNAs d'un codon se terminant par t: Changement de t en c chez les archées et de c en t chez les eucaryotes.
    3. 4 366: Effectif élevé de tRNAs d'un codon se terminant par g chez les procaryotes.
    4. 2622: Effectif faible de tRNAs supérieurs à   t   et à   c   .
    5. 160: Changement de codon   g   Chez les archées et les eucaryotes.
  • Tableaux:
    1. Nombre de tRNAs des 121 eucaryotes, tableau III 92 530.
    2. Pour 100 000 tRNAs des 121 eucaryotes, tableau III100 92 530.
    3. tRNAs pour 1 génome, tableau III1 92 530, indice de la multiplicité = nombre de tRNAs / 121.
  • Tableaux non formatés: voir tableur
III;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;;92,530;;III 100;100000  tRNAs. 121 eucaryotes. 92 530;;;;;;;;III 1;tRNAs par génome de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;;92 530
ttt;45;tct;1,266;tat;50;tgt;209;;ttt;49;tct;1,368;tat;54;tgt;226;;ttt;0.37;tct;10.46;tat;0.41;tgt;1.73
c;1,461;c;99;c;1,661;c;2,403;;c;1,579;c;107;c;1,795;c;2,597;;c;12.07;c;0.82;c;13.73;c;19.86
a;705;a;715;a;;a;249;;a;762;a;773;a;0;a;269;;a;5.83;a;5.91;a;0.00;a;2.06
g;816;g;551;g;;g;1,739;;g;882;g;595;g;0;g;1,879;;g;6.74;g;4.55;g;0.00;g;14.37
ctt;1,085;cct;1,123;cat;34;cgt;1,153;;ctt;1,173;cct;1,214;cat;37;cgt;1,246;;ctt;8.97;cct;9.28;cat;0.28;cgt;9.53
c;22;c;25;c;1,239;c;33;;c;24;c;27;c;1,339;c;36;;c;0.18;c;0.21;c;10.24;c;0.27
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Processus E et résonance des 121 eucaryotes[modifier | modifier le wikicode]

Processus E et résonance des 121 eucaryotes[modifier | modifier le wikicode]

IV 1;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;;;I 1;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;;235027;;IV1-I1;E;;;;;;
ttt;0.26;tcc;0.31;tat;0.30;tgt;0.26;;ttt;0.25;tct;0.12;tat;0.10;tgt;0.07;;ttt;0.26;tcc;0.31;tat;0.30;tgt;0.26
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cta;4.64;cca;10.28;caa;9.86;cga;5.79;;cta;1.23;cca;1.35;caa;1.58;cga;0.22;;cta;3.41;cca;8.93;caa;8.28;cga;5.57
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;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
III 1;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;92,530;;;IV 1;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;;;III1−IV1.;;R;;;;;
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atc;0.58;acc;0.69;aat;0.60;agt;0.30;;atc;0.34;acc;0.23;aat;0.39;agt;0.24;;atc;0.24;acc;0.45;aat;0.21;agt;0.06
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Sensibilite du processus E[modifier | modifier le wikicode]

IV 1;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;23;;I 1;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235027;23
ttt;0,26;tcc;0,31;tat;0,30;tgt;0,26;;ttt;0,25;tct;0,12;tat;0,10;tgt;0,07
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gtt;11,68;gct;18,52;gac;17,61;ggc;16,67;;gtc;1,10;gcc;1,03;gac;2,24;ggc;2,30
tta;5,29;tca;5,91;taa;−;tga;2,06;;tta;1,18;tca;1,31;taa;−;tga;0,33
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cta;4,64;cca;10,28;caa;9,86;cga;5,79;;cta;1,23;cca;1,35;caa;1,58;cga;0,22
gta;5,49;gca;10,55;gaa;12,02;gga;11,12;;gta;2,20;gca;2,53;gaa;2,40;gga;1,37
ttg;6,56;tcg;4,55;tag;−;tgg;9,45;;ttg;0,99;tcg;0,65;tag;−;tgg;1,08
atg;19,69;acg;4,55;aag;18,12;agg;7,81;;atg;4,47;acg;0,68;aag;0,60;agg;0,86
ctg;6,64;ccg;3,93;cag;10,31;cgg;3,54;;ctg;1,29;ccg;0,54;cag;0,59;cgg;0,83
gtg;8,95;gcg;5,82;gag;14,72;ggg;5,25;;gtg;0,33;gcg;0,30;gag;0,34;ggg;0,56
;;;;;;;;;;;;;;;;
7,90;;;;;;;;;;;;;;;;
IV 1.79;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;23;;-37,3;265,0;;;IV1.265;;;
ttt;0,03;tcc;0,04;tat;0,04;tgt;0,03;;ttt;12;tcc;31;tat;37;tgt;44
atc;0,04;acc;0,03;aat;0,05;agt;0,03;;atc;34;acc;0,1;aat;39;agt;121
ctc;0,02;ccc;0,02;cat;0,03;cgc;0,02;;ctc;-0,7;ccc;6;cat;27;cgc;-0,8
gtc;0,06;gcc;0,04;gat;0,04;ggt;0,03;;gtc;24;gcc;73;gat;−;ggt;113
ttc;1,53;tct;1,32;tac;1,69;tgc;2,16;;ttc;1;tct;18;tac;6;tgc;94
att;1,77;act;1,50;aac;1,94;agc;1,32;;att;-22,4;act;34;aac;-11;agc;20,7
ctt;1,05;cct;1,17;cac;1,30;cgt;1,21;;ctt;10;cct;73;cac;11;cgt;-35
gtt;1,48;gct;2,34;gac;2,23;ggc;2,11;;gtt;35;gct;127;gac;0;ggc;-8
tta;0,67;tca;0,75;taa;−;tga;0,26;;tta;-43;tca;-43;taa;−;tga;-20,1
ata;0,71;aca;0,92;aaa;1,97;aga;1,19;;ata;−;aca;-37;aaa;-13;aga;0
cta;0,59;cca;1,30;caa;1,25;cga;0,73;;cta;-52;cca;-4;caa;-21,2;cga;233
gta;0,69;gca;1,33;gaa;1,52;gga;1,41;;gta;-68;gca;-47;gaa;-37;gga;3
ttg;0,83;tcg;0,58;tag;−;tgg;1,20;;ttg;-16;tcg;-11;tag;−;tgg;10
atg;2,49;acg;0,58;aag;2,29;agg;0,99;;atg;-44;acg;-16;aag;281;agg;15
ctg;0,84;ccg;0,50;cag;1,30;cgg;0,45;;ctg;-35;ccg;-8;cag;120;cgg;-46
gtg;1,13;gcg;0,74;gag;1,86;ggg;0,66;;gtg;248;gcg;143;gag;441;ggg;18
;;;;;;;;;;;;;;;;
7,90;;;;;;;;;;;;;;;;
IV1.79p;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;23;;-37,3;265,0;;;IV1.265p;;;
ttt;0,03;tct;1,32;tat;0,04;tgt;0,03;;ttt;12;tct;1 067;tat;37;tgt;44
att;1,77;act;1,50;aat;0,05;agt;0,03;;att;1 427;act;58;aat;39;agt;121
ctt;1,05;cct;1,17;cat;0,03;cgt;1,21;;ctt;10;cct;473;cat;27;cgt;-35
gtt;1,48;gct;2,34;gat;0,04;ggt;0,03;;gtt;661;gct;4 725;gat;-;ggt;113
ttc;1,53;tcc;0,04;tac;1,69;tgc;2,16;;ttc;1;tcc;-96;tac;6;tgc;94
atc;0,04;acc;0,03;aac;1,94;agc;1,32;;atc;-98;acc;-97;aac;-11;agc;20,7
ctc;0,02;ccc;0,02;cac;1,30;cgc;0,02;;ctc;-98;ccc;-97;cac;11;cgc;-0,8
gtc;0,06;gcc;0,04;gac;2,23;ggc;2,11;;gtc;-95;gcc;-96;gac;0;ggc;-8
tta;0,67;tca;0,75;taa;−;tga;0,26;;tta;-43;tca;-43;taa;−;tga;-20,1
ata;0,71;aca;0,92;aaa;1,97;aga;1,19;;ata;−;aca;-37;aaa;-13;aga;0
cta;0,59;cca;1,30;caa;1,25;cga;0,73;;cta;-52;cca;-4;caa;-21,2;cga;233
gta;0,69;gca;1,33;gaa;1,52;gga;1,41;;gta;-68;gca;-47;gaa;-37;gga;3
ttg;0,83;tcg;0,58;tag;−;tgg;1,20;;ttg;-16;tcg;-11;tag;−;tgg;10
atg;2,49;acg;0,58;aag;2,29;agg;0,99;;atg;-44;acg;-16;aag;281;agg;15
ctg;0,84;ccg;0,50;cag;1,30;cgg;0,45;;ctg;-35;ccg;-8;cag;120;cgg;-46
gtg;1,13;gcg;0,74;gag;1,86;ggg;0,66;;gtg;248;gcg;143;gag;441;ggg;18

Zebrafish[modifier | modifier le wikicode]

Comparaison Zebrafish, 121 Eucaryotes, Bactéries[modifier | modifier le wikicode]

IV 100;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;;;;V 100;Danio rerio (Zebrafish) ;;;;12258;;;I 100;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235027;
ttt;57;tct;2,268;tat;64;tgt;57;;ttt;82;tct;2,741;tat;41;tgt;73;;ttt;4;tct;2;tat;2;tgt;1
c;2,617;c;68;c;2,900;c;3,690;;c;1,607;c;16;c;1,925;c;1,109;;c;2,598;c;1,923;c;2,732;c;1,903
a;1,146;a;1,281;a;;a;446;;a;596;a;1,705;a;;a;114;;a;2,021;a;2,255;a;−;a;560
g;1,422;g;987;g;;g;2,047;;g;1,966;g;653;g;;g;359;;g;1,702;g;1,116;g;−;g;1,858
ctt;1,797;cct;2,011;cat;48;cgt;2,065;;ctt;2,203;cct;2,570;cat;82;cgt;1,656;;ctt;157;cct;4;cat;2;cgt;3,182
c;39;c;30;c;2,219;c;34;;c;33;c;16;c;3,157;c;196;;c;1,638;c;1,167;c;2,006;c;142
a;1,005;a;2,228;a;2,137;a;1,256;;a;1,991;a;1,672;a;857;a;873;;a;2,102;a;2,320;a;2,718;a;377
g;1,440;g;853;g;2,234;g;767;;g;2,447;g;1,468;g;2,170;g;481;;g;2,207;g;929;g;1,016;g;1,427
att;3,032;act;2,572;aat;84;agt;52;;att;2,105;act;2,929;aat;196;agt;114;;att;2;act;44;aat;2;agt;0
c;73;c;50;c;3,328;c;2,266;;c;82;c;82;c;8,525;c;3,459;;c;3,916;c;1,920;c;3,729;c;1,881
a;1,209;a;1,567;a;3,367;a;2,038;;a;612;a;2,366;a;4,283;a;2,056;;a;23;a;2,501;a;3,874;a;2,044
g;4,267;g;987;g;3,928;g;1,693;;g;4,258;g;538;g;7,775;g;848;;g;7,670;g;1,174;g;1,033;g;1,469
gtt;2,531;gct;4,014;gat;73;ggt;48;;gtt;1,893;gct;751;gat;8;ggt;90;;gtt;4;gct;1;gat;0;ggt;0
c;95;c;63;c;3,817;c;3,613;;c;49;c;33;c;1,224;c;6,820;;c;1,885;c;1,773;c;3,839;c;3,946
a;1,189;a;2,286;a;2,606;a;2,409;;a;1,876;a;3,002;a;1,836;a;383;;a;3,769;a;4,334;a;4,118;a;2,347
g;1,940;g;1,261;g;3,190;g;1,137;;g;1,852;g;914;g;1,999;g;2,186;;g;559;g;521;g;591;g;964
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
IV100−V100;;;;;;;;;V100 − I100;;;;;;;;;IV100−I100. ;;% Processus E des 121 Eucaryotes.;;;;;
ttt;-30;tct;-17;tat;37;tgt;-22;;ttt;95;tct;30;tat;96;tgt;98;;ttt;93;tct;15;tat;97;tgt;98
c;39;c;76;c;34;c;70;;c;-38;c;87;c;-30;c;-42;;c;1;c;97;c;6;c;48
a;48;a;-25;a;;a;74;;a;-71;a;-24;a;;a;-80;;a;-43;a;-43;a;−;a;-20
g;-28;g;34;g;;g;82;;g;13;g;-42;g;;g;-81;;g;-16;g;-12;g;−;g;9
ctt;-18;cct;-22;cat;-41;cgt;20;;ctt;26;cct;55;cat;98;cgt;-48;;ctt;9;cct;42;cat;96;cgt;-35
c;17;c;46;c;-30;c;-83;;c;-79;c;74;c;36;c;28;;c;-75;c;86;c;10;c;-76
a;-50;a;25;a;60;a;30;;a;-5;a;-28;a;-68;a;57;;a;-52;a;-4;a;-21;a;70
g;-41;g;-42;g;3;g;37;;g;10;g;37;g;53;g;-66;;g;-35;g;-8;g;54;g;-46
att;31;act;-12;aat;-57;agt;-55;;att;-46;act;34;aat;99;agt;100;;att;-23;act;25;aat;97;agt;99
c;-10;c;-39;c;-61;c;-34;;c;97;c;46;c;56;c;46;;c;97;c;13;c;-11;c;17
a;49;a;-34;a;-21;a;-1;;a;96;a;-5;a;10;a;1;;a;98;a;-37;a;-13;a;0
g;0;g;45;g;-49;g;50;;g;-44;g;-54;g;87;g;-42;;g;-44;g;-16;g;74;g;13
gtt;25;gct;81;gat;89;ggt;-46;;gtt;0;gct;-58;gat;100;ggt;100;;gtt;26;gct;56;gat;100;ggt;99
c;48;c;48;c;68;c;-47;;c;92;c;97;c;-68;c;42;;c;96;c;99;c;-1;c;-8
a;-37;a;-24;a;30;a;84;;a;-50;a;-31;a;-55;a;-84;;a;-68;a;-47;a;-37;a;3
g;5;g;28;g;37;g;-48;;g;70;g;43;g;70;g;56;;g;71;g;59;g;81;g;15

Comparaison de Zebrafish aux eucaryotes à résonance[modifier | modifier le wikicode]

;fca;;&emsp ;;;bta;;&emsp ;;;ttr*;;&emsp ;;;bacu;;&emsp ;;;cmk;;&emsp ;;;zebra;
code;frq;rup;;code;frq;rup;;code;frq;rup;;code;frq;rup;;code;frq;rup;;code;frq;rup
tgc;32;3;;gac;42;5;;tgc;22;64;;gtg;32;31;;gga;66;14;;ctg;300;5
cta;33;33;;aga;44;43;;gca;36;19;;gca;42;7;;gct;75;8;;cct;315;7
gag;44;7;;ggc;63;24;;ggc;43;12;;gac;45;22;;ggg;81;16;;tct;336;7
cag;47;2;;aaa;78;49;;aga;48;2;;aga;55;16;;atg;94;46;;act;359;3
gga;48;4;;agg;116;23;;gac;49;10;;ggc;64;5;;acg;137;6;;gca;368;5
aaa;50;6;;tgt;143;15;;agg;54;37;;agg;67;28;;gta;145;16;;cac;387;10
agg;53;2;;gag;164;9;;aaa;74;193;;aaa;86;198;;gcc;168;23;;agc;424;23
aga;54;26;;tgg;178;90;;tgg;217;82;;tgg;256;83;;aca;206;108;;atg;522;1
cca;68;1050;;tgc;338;16;;gag;395;111;;gag;468;111;;gag;428;260;;aaa;525;59
caa;782;13;;gga;391;11;;gga;833;112;;gga;987;118;;gtg;1,540;151;;ggc;836;14
aag;887;35;;gaa;435;198;;ggg;1,766;8;;ggg;2,148;10;;gcg;3,858;53;;aag;953;10
cga;1,201;;;ggg;1,295;;;gaa;1,901;;;gaa;2,368;;;gca;5,898;;;aac;1,045;
&emsp ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
T;3729;;;;4040;;;;5845;;;;7080;;;;13727;;;;12258;
X;1201;;;;1295;;;;1901;;;;2368;;;;5898;;;;1045;
mpe;19;;;;23;;;;17;;;;20;;;;34;;;;221;
epe;17;;;;17;;;;16;;;;19;;;;21;;;;120;
% e/m;85;;;;74;;;;96;;;;96;;;;63;;;;55;
xpe;68;;;;78;;;;74;;;;86;;;;94;;;;525;
X/mpe;62;;;;57;;;;114;;;;119;;;;174;;;;5;
X/xpe;18;;;;17;;;;26;;;;28;;;;63;;;;2;
sre;2870;;;;3060;;;;5112;;;;6227;;;;12380;;;;2834;
spe;859;;;;980;;;;733;;;;853;;;;1347;;;;9424;
faibles;3;;;;10;;;;4;;;;3;;;;8;;;;0;
minpe;5;;;;4;;;;3;;;;4;;;;2;;;;44;

Zebrafish, distributions des tRNAs sur les chromosomes[modifier | modifier le wikicode]

max;;;11;25;58;920;108;12;29;50;56;8;5;51;15;4;46;11;28;40;3;201;357;187;2;18;21;;;;
;;;chr1;chr2;chr3;chr4;chr5;chr6;chr7;chr8;chr9;chr10;chr11;chr12;chr13;chr14;chr15;chr16;chr17;chr18;chr19;chr20;chr21;chr22;chr23;chr24;chr25;z8;scaffold;total;vides
6;ttt;PheAAA;;;;6;;;;;;;;;;;;;;;;1;1;;;;1;;1;10;
89;ttc;GAA;;6;58;89;4;2;;1;;;;;;;;;2;1;;2;;1;1;;21;4;5;197;
16;tta;LeuTAA;11;12;;10;;;;;;;;;;;;;16;1;;8;;;;;;14;1;73;
201;ttg;CAA;;;1;4;;;;;2;;;;;;1;;28;;;201;1;2;;;;1;;241;9
191;ctt;LeuAAG;;12;;191;;12;25;;5;1;;;;1;;;;;;;1;4;;;;2;16;270;
4;ctc;GAG;;;;4;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;4;
178;cta;TAG;;6;;178;;10;22;;5;2;;2;;;;;;;;;1;2;;;;2;14;244;
265;ctg;CAG;;;;265;6;;;;;;;1;;;;;1;2;;3;7;2;;1;;;12;300;10
148;att;IleAAT;1;10;46;148;5;2;1;;;;;;;;2;;3;1;1;;1;2;;;21;2;12;258;
8;atc;GAT;;;;8;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;2;10;
20;ata;TAT;;;;9;;;20;;3;;;1;;;;;1;;;3;;3;;;;35;;75;
196;atg;MetCAT;1;2;4;196;13;;;;56;;;2;;;;;3;2;1;3;11;187;;3;;23;15;522;7
172;gtt;ValAAC;;;;172;4;;1;28;;;4;1;4;;;;5;1;;;1;3;;;;1;7;232;
3;gtc;GAC;;;;2;;;;;;;;;;;;;3;;;;;;;;;1;;6;
163;gta;TAC;;;;163;7;;;39;;;;1;;1;;;10;;;;3;2;;;;;4;230;
169;gtg;CAC;;;;169;2;;;25;;;2;;4;;;;12;;;;1;3;;;;1;8;227;13
269;tct;SerAGA;;16;1;269;6;;;;4;;;;;;;1;2;;;15;7;;;;;4;11;336;
1;tcc;GGA;;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;1;;;;;;0;;2;
141;tca;TGA;;8;;141;8;;1;;5;;;;;;;;1;;;16;5;;;;;3;20;208;
58;tcg;CGA;;7;;58;1;1;1;;1;;1;;;;;;3;;;2;;;;;;1;5;81;13
187;cct;ProAGG;2;8;;187;8;;;50;1;;;1;12;;1;;1;4;3;5;;8;;;;2;22;315;
1;ccc;GGG;;1;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;2;
101;cca;TGG;;14;;101;2;2;;47;2;;;1;15;;1;;;1;;1;;;;;;2;16;205;
135;ccg;CGG;;7;;135;5;1;;;;;;1;;;1;;;1;;3;;4;;;;2;20;180;10
243;act;ThrAGT;;22;;243;11;;2;;1;1;;43;;;1;;;;;;1;16;;1;2;1;14;359;
6;acc;GGT;;;;3;;;;;;;;6;;;;;;;;;;;;;;;1;10;
195;aca;TGT;;3;;195;10;1;;;3;;;29;;;;11;2;1;;1;;13;1;;;2;18;290;
51;acg;CGT;;;1;51;1;;;;;;;1;;;;1;2;1;;1;1;1;;;1;1;3;66;6
54;gct;AlaAGC;;;54;10;1;;;;;;;;;4;;;1;;;;5;;;1;15;1;;92;
4;gcc;GGC;;;;4;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;4;
357;gca;TGC;3;;;3;;;;;;;;;;1;;;;1;;1;357;;;;;1;1;368;
106;gcg;CGC;;;;3;;;1;;;;;;;;;;;;;;106;;;;;;2;112;13
3;tat;TyrATA;;;;3;;;;;;;;;;;2;;;;;;;;;1;;;;6;
155;tac;GTA;;;;155;6;;;;;;;;;;46;1;;;;;1;;;;;8;18;235;
8;cat;HisATG;;;;8;;;;;;;;;;;1;;;;;;;;;;;;1;10;
314;cac;GTG;;21;;314;4;;;1;5;;;;1;;1;;2;1;;5;5;;1;;;2;24;387;
49;caa;GlnTTG;1;1;;32;1;1;;49;2;;;;12;;;;;;;;;1;;;1;3;1;105;
162;cag;CTG;2;8;55;162;7;;1;;2;;;2;;1;;1;3;2;1;;3;2;;;;3;11;266;2
23;aat;AsnATT;;;;23;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;24;
920;aac;GTT;;22;;920;21;6;10;;;;;31;1;;10;;1;;;;7;2;2;;;8;4;1045;
416;aaa;LysTTT;1;25;;416;11;1;1;;9;;;;;;1;;4;1;;2;13;;;;;4;36;525;
815;aag;CTT;1;21;;815;38;4;6;;;;;22;1;;13;1;;;1;;8;4;;;;6;12;953;7
1;gat;AspATC;;;;0;;;;;;;;;;;;;1;;;;;;;;;;;1;
108;gac;GTC;;;;25;108;;;;;;;;;;;;;;;;3;2;;;8;4;;150;
170;gaa;GluTTC;;;;170;5;1;;;;;;;;1;16;1;;;;;2;4;1;;;6;18;225;
156;gag;CTC;4;;;156;6;;;;;;;;;;44;5;;;;;1;2;1;;3;7;16;245;13
6;tgt;CysACA;;;;6;;;;;;;;;;;1;;;;;1;;;;;;1;;9;
82;tgc;GCA;;;5;2;2;;;;;;5;;;;;;;;;82;1;;1;;;38;;136;
7;tga;SeCTCA;3;;;7;;;;;;;;;;;1;;1;;;;;;;;;0;2;14;
29;tgg;TrpCCA;;1;2;0;;;29;;;;;;;;1;;;1;1;;1;;;3;;4;1;44;10
127;cgt;ArgACG;;;;127;6;;2;1;;;;;;;40;2;;;;;1;;;;3;6;15;203;
19;cgc;GCG;;2;;19;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;2;24;
65;cga;TCG;5;;;65;2;;19;;;;;2;;;;1;1;;;;1;;;;1;5;5;107;
42;cgg;CCG;8;;;42;1;1;;;;;;;;;;1;1;;;;;;;;;1;4;59;12
13;agt;SerACT;;;;13;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;;14;
327;agc;GCT;;4;;327;25;;12;;;1;5;;;;;;25;;;1;6;2;;;;2;14;424;
143;aga;ArgTCT;1;12;;143;8;;3;;3;;;51;;;1;;;1;;;;17;;1;;1;10;252;
67;agg;CCT;;;1;7;6;2;1;;13;;;2;;;;;;;;;1;67;;;;3;1;104;7
8;ggt;GlyACC;;;;8;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;3;;11;
598;ggc;GCC;;14;;598;39;;;;;8;;;4;1;;;;40;;;4;2;;18;4;;12;744;
30;gga;TCC;;;;30;2;1;;;;;;;;;2;;2;;;;3;4;1;;;;;45;
188;ggg;CCC;;1;;188;22;;;;;;;;;;1;;;23;;;;;;2;;124;1;362;10
2;taa;SupTTA;;;;2;;;;;;;;;;;;;1;;;;;;;;;1;2;6;142
8;tag;CTA;;;;8;;;;;;;;;;;;;;1;;;;;;;;;;9;
;;Undet???;;;;15;1;;;;;;;;;;;;;;;;2;;;;;1;;19;
;;;44;266;228;7825;416;49;159;241;122;13;17;200;54;10;188;26;138;87;8;358;573;362;9;31;81;347;440;12292;
;2 rRNAs;;chr1;chr2;chr3;chr4;chr5;chr6;chr7;chr8;chr9;chr10;chr11;chr12;chr13;chr14;chr15;chr16;chr17;chr18;chr19;chr20;chr21;chr22;chr23;chr24;chr25;Zv8Na10776;scaffold;total;
;Mit;;;;;;1 rRNA;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
NCBI;22;tRNAs;31;76;346;5723;140;52;72;240;60;12;13;123;46;11;135;17;109;5;7;262;253;143;11;18;72;;1,385;9,362;
MB;0.02;longueur;59.58;59.64;62.63;78.09;72.5;60.27;74.28;54.3;56.46;45.42;45.48;49.18;52.19;52.66;48.04;55.27;53.46;51.02;48.45;55.2;45.93;39.13;46.22;42.17;37.5;;334;1,679;
;39.9;GC%;36.4;36.7;36.9;38.4;36.4;36.4;36.7;36.5;36.5;36.6;36.4;36.3;36.5;36.6;36.8;36.5;36.6;36.6;36.4;36.6;36.6;37;36.7;36.3;36.6;;37;37;
;13;Protein;2,176;2,229;2,436;2,450;2,713;2,123;2,531;1,986;1,832;1,779;1,596;1,679;1,805;1,481;1,814;1,996;1,703;1,541;1,762;1,890;1,948;1,674;1,755;1,365;1,453;;9,370;57,087;
;−;RNAs au;326;274;362;1252;395;250;322;272;226;186;166;157;230;170;193;308;190;179;185;192;237;293;204;138;129;;1,639;8,475;
;37;gene;1,444;1,464;1,992;7,909;1,679;1,238;1,641;1,452;1,060;1,076;952;1,091;1,046;945;1,229;1,255;1,111;915;1,038;1,376;1,374;1,288;1,015;823;978;;9,570;46,961;
;−;pseudo;22;8;23;70;6;16;14;6;9;14;4;5;6;6;14;11;9;9;7;3;8;8;5;10;4;;67;364;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
75 pb;tRNA/longueur;;0.55;3.35;2.73;75.15;4.30;0.61;1.61;3.33;1.62;0.21;0.28;3.05;0.78;0.14;2.94;0.35;1.94;1.28;0.12;4.86;9.36;6.94;0.15;0.55;1.62;;;;1/10 000

Taurus, distributions des tRNAs sur les chromosomes[modifier | modifier le wikicode]

max;;;51;58;62;28;64;42;56;37;28;50;58;31;59;35;36;46;63;48;78;10;37;41;36;20;62;16;26;22;28;67;;;
;;;chr1;chr2;chr3;chr4;chr5;chr6;chr7;chr8;chr9;chr10;chr11;chr12;chr13;chr14;chr15;chr16;chr17;chr18;chr19;chr20;chr21;chr22;chr23;chr24;chr25;chr26;chr27;chr28;chr29;X;total;;
1;ttt;PheAAA;1;;;;1;;;;;;;;;;1;;1;;;1;;;;;;;1;;;;6;;PheAAA
8;ttc;PheGAA;1;;;;;1;1;2;;;;2;2;;3;;1;1;;;;;7;;;;;;1;8;30;;PheGAA
3;tta;LeuTAA;;;;1;;1;;;1;;;;1;;2;;;1;;;;;3;;;;;;;;10;;LeuTAA
6;ttg;LeuCAA;;2;;;;;1;;1;1;;;;1;;;;1;1;;;;6;;;;;;;;14;;LeuCAA
4;ctt;LeuAAG;1;;;;;;1;;;3;;;1;;;;;;;;;;4;;1;;;;;;11;;LeuAAG
0;ctc;LeuGAG;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;;LeuGAG
2;cta;LeuTAG;;;;;;;;1;;2;;;;;;;;;1;;;;;;1;;;;;;5;;LeuTAG
3;ctg;LeuCAG;;;3;;;1;;;;;;;;;;;;1;;;;;1;;;;;;;;6;;LeuCAG
14;att;IleAAT;;;;1;;;;;;;;;;;;;;;2;;1;;14;;;;;;;;18;;IleAAT
0;atc;IleGAT;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;;IleGAT
3;ata;IleTAT;1;;;;;;1;;;1;1;;;;;;;1;;;;;3;;;;;;;;8;;IleTAT
19;atg;MetCAT;1;;1;1;1;;2;;1;;1;1;1;2;;;;2;1;;;;19;;1;;;;;;35;;MetCAT
11;gtt;ValAAC;2;;11;1;;;1;;;;;;;;;;;1;;;;;4;;;;;;;;20;;ValAAC
0;gtc;ValGAC;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;;ValGAC
6;gta;ValTAC;;;6;1;1;;1;;1;;1;;;;1;;1;;3;1;1;;2;;;;;;;1;21;;ValTAC
15;gtg;ValCAC;;2;15;;;;2;1;2;;;1;;;1;2;;2;;1;;;5;;1;;;2;1;1;39;;ValCAC
8;tct;SerAGA;;;;;;;;;;1;;;;1;;;;1;2;;;;8;;;;;;;;13;;SerAGA
4;tcc;SerGGA;4;1;1;3;;2;;1;2;1;3;;;2;;;1;;1;1;1;;;1;1;2;;;;4;32;;SerGGA
3;tca;SerTGA;;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;1;;3;;1;;;1;;;7;;SerTGA
3;tcg;SerCGA;;;1;;1;;;;;;;;;;;;;;1;;;;3;;1;;;;;;7;;SerCGA
7;cct;ProAGG;;;1;1;;;;;;2;;;;;1;;;;;;;;1;;7;;;;;;13;;ProAGG
0;ccc;ProGGG;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;;ProGGG
6;cca;ProTGG;;;;;;;;;;2;;;1;;;;;;;;;;;;6;;;;;;9;;ProTGG
1;ccg;ProCGG;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;1;;;;1;;1;;;;;;4;;ProCGG
7;act;ThrAGT;;1;1;;;;;;;;;;;;;;;1;3;;;;7;;;;;;;1;14;;ThrAGT
1;acc;ThrGGT;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;1;1;;ThrGGT
3;aca;ThrTGT;2;;;1;;;1;;;3;;;;;;1;;1;;1;;;;;;;;;;;10;;ThrTGT
2;acg;ThrCGT;1;;;;;;;1;;;;;1;;;;;;1;;;;2;;1;;;;;;7;;ThrCGT
15;gct;AlaAGC;1;;;;;;2;;;;2;;;1;;;;4;1;;1;;15;;1;1;;;1;1;31;;AlaAGC
1;gcc;AlaGGC;;;;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;1;;2;;AlaGGC
7;gca;AlaTGC;1;2;1;;2;3;3;;1;;2;;1;1;2;;2;1;3;;;;7;1;;1;;;;1;35;;AlaTGC
5;gcg;AlaCGC;2;1;1;;;1;;;1;;1;;;;;;;;;;;1;5;1;;;;;;2;16;;AlaCGC
2;tat;TyrATA;;;;1;;;;;2;;1;2;;1;1;1;;;;;1;;1;;;;;;;;11;;TyrATA
7;tac;TyrGTA;3;1;2;;4;;2;2;1;7;1;;;3;1;;1;;;1;3;;4;1;;1;;;;1;39;;TyrGTA
1;taa;SupTTA;;;;;;;;1;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;1;;;1;4;;SupTTA
2;tag;SupCTA;1;1;1;;;1;;2;2;1;2;;;;1;;;;;;;1;;;;;;;;;13;;SupCTA
2;cat;HisATG;;;;;;;1;;;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;2;4;;HisATG
11;cac;HisGTG;;;11;;;;;1;;3;1;;;;;;;1;;;;;1;;1;;;;;;19;;HisGTG
6;caa;GlnTTG;1;;1;;1;;1;;1;1;;;;;;;;;5;;;;6;;1;;;;;1;19;;GlnTTG
13;cag;GlnCTG;2;2;13;1;3;1;1;;;1;;1;1;1;;2;;1;2;;1;;5;;1;1;;;;;40;;GlnCTG
0;aat;AsnATT;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;0;;AsnATT
24;aac;AsnGTT;;;24;1;;;1;;;;;1;1;;;;;;1;;;;1;;;;;;;;30;;AsnGTT
10;aaa;LysTTT;6;1;5;3;2;1;1;1;3;2;;1;1;;4;7;4;;6;3;3;3;10;6;2;;;1;;2;78;;LysTTT
12;aag;LysCTT;1;;3;2;1;2;3;1;1;4;1;;;;1;1;;;2;;2;1;2;;12;;;;;;40;;LysCTT
1;gat;AspATC;;;1;;;;;;;;;1;1;1;;;1;;;;;;;;;;;;;1;6;;AspATC
8;gac;AspGTC;2;;8;;2;;2;1;1;3;1;1;;1;1;;3;3;4;;2;;3;;1;;1;1;;1;42;;AspGTC
31;gaa;GluTTC;14;21;31;12;26;9;18;14;13;17;21;14;20;14;13;14;9;17;20;5;11;12;9;6;18;6;4;6;14;26;434;;GluTTC
12;gag;GluCTC;7;5;9;4;7;4;12;5;5;7;8;3;8;4;3;8;7;4;7;6;5;7;3;4;8;1;1;2;4;6;164;;GluCTC
9;tgt;CysACA;8;6;9;6;8;6;6;4;5;4;8;3;5;4;4;9;2;3;1;9;4;2;3;3;3;1;5;5;3;4;143;;CysACA
27;tgc;CysGCA;13;14;10;27;11;17;7;14;20;17;16;22;11;13;12;3;7;4;16;9;9;6;6;7;3;5;8;6;6;19;338;;CysGCA
5;tga;SeCTCA;1;4;;5;;1;;1;;2;1;1;1;1;1;;;5;;;1;1;;1;;;;1;;1;29;;SeCTCA
17;tgg;TrpCCA;3;3;10;3;4;5;12;3;1;4;11;7;7;6;5;4;5;8;17;1;9;6;9;4;5;2;4;3;2;15;178;;TrpCCA
7;cgt;ArgACG;;;1;1;;;;;;1;;;;1;;;;;;;;1;7;;;;;1;;;13;;ArgACG
1;cgc;ArgGCG;1;1;;1;1;;;1;;1;;;;;;;;;;1;;;;;;;;;;;7;;ArgGCG
3;cga;ArgTCG;1;;;;;;;1;;;1;;;;;;;;1;1;1;;2;;3;;;;;1;12;;ArgTCG
3;cgg;ArgCCG;1;1;;;;;1;1;;2;;;1;;;1;;;2;;;;3;;1;;;;;2;16;;ArgCCG
1;agt;SerACT;;;;;;;;1;;;1;1;;;;;;;;;;;;;;;1;;;;4;;SerACT
10;agc;SerGCT;1;1;;;;1;;;;2;;;1;;;;;;1;1;;;10;;;;;;1;;19;;SerGCT
5;aga;ArgTCT;3;2;2;;4;1;;;3;;1;;5;;3;1;2;1;2;1;1;;4;;2;;1;1;2;2;44;;ArgTCT
10;agg;ArgCCT;4;3;7;5;3;3;10;4;3;2;7;4;7;1;7;2;4;3;10;1;1;4;2;2;7;2;1;1;1;5;116;;ArgCCT
3;ggt;GlyACC;;;;2;1;;;;1;1;1;1;1;1;2;;1;;1;1;;3;;;1;;;;;2;20;;GlyACC
8;ggc;GlyGCC;3;3;4;3;2;1;1;1;;1;3;1;5;;1;2;3;8;2;;2;3;4;1;;1;3;2;1;2;63;;GlyGCC
27;gga;GlyTCC;19;15;14;4;23;11;20;7;8;9;27;12;17;11;12;10;18;23;17;9;9;13;8;6;16;7;11;7;7;21;391;;GlyTCC
78;ggg;GlyCCC;51;58;62;28;64;42;56;37;28;50;58;31;59;35;36;46;63;48;78;10;37;41;36;20;62;16;26;22;28;67;1295;;GlyCCC
;;Undet???;;1;2;1;;;;;;;1;;1;;;;;;1;;;;;;;;;;;;9;;Undet???
;;total;164;152;273;121;173;116;171;109;108;160;183;111;161;106;119;114;136;147;217;64;107;105;259;64;170;47;68;62;73;202;4064;;
;NCBI;;chr1;chr2;chr3;chr4;chr5;chr6;chr7;chr8;chr9;chr10;chr11;chr12;chr13;chr14;chr15;chr16;chr17;chr18;chr19;chr20;chr21;chr22;chr23;chr24;chr25;chr26;chr27;chr28;chr29;X;MT;Un;Total
;mb;Size;158.34;137.06;121.43;120.83;121.19;119.46;112.64;113.39;105.71;104.31;107.31;91.16;84.24;84.65;85.3;81.72;75.16;66;64.06;72.04;71.6;61.44;52.53;62.71;42.9;51.68;45.41;46.31;51.51;148.82;0.02;9.22;2670.15
;;GC% ;40.1;40.8;41.9;40.6;41.7;40;42;41.2;40;41.5;42.9;40.4;43.7;41.4;41.8;42.6;42.3;45.4;46;41;43.1;43.4;43.4;41.9;47.1;42.8;41.8;42.2;44.2;40.6;39.4;49.6;
;;Protein ;1981;2085;2922;1673;2753;1420;2791;1573;1068;2014;2176;886;1740;1066;1946;1452;1411;2691;2718;562;1135;1414;1393;751;1684;991;478;798;1427;1994;13;101;
;;rRNA ;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;-;1;-;-;-;-;-;2;-;
;;tRNA ;67;49;171;59;54;51;55;29;39;65;44;47;42;38;47;30;42;50;70;31;26;23;191;19;66;14;33;23;24;79;22;-;
;; RNA ;405;362;462;386;444;320;474;421;281;369;388;268;377;235;269;324;261;378;428;192;460;276;297;192;259;207;147;111;231;488;-;10;
;;Gene ;1267;1237;1832;1142;1715;953;1814;1097;821;1447;1309;660;1111;734;1491;946;893;1648;1570;508;855;762;1134;469;973;559;377;444;903;1643;13;105;
;;Pseudo ;165;163;223;123;218;134;243;142;142;151;122;72;118;95;264;102;115;156;108;67;98;67;93;61;50;62;33;64;109;328;-;4;
;;compte;164;152;273;121;173;116;171;109;108;160;183;111;161;106;119;114;136;147;217;64;107;105;259;64;170;47;68;62;73;202;;;

Distribution homogène des gènes de tRNA sur les chromosomes, Bos Taurus et Felis catus[modifier | modifier le wikicode]

bta;ggg;ggc;gga;gaa;gag;tgc;tgt;gct; ;fca;cga;aag;caa
X;67;2;21;26;6;7;4;1;;chrA1;100;57;67
chr1;51;2;19;14;7;13;8;1;;chrA2;80;55;66
chr2;58;3;15;21;5;14;6;0;;chrA3;73;50;44
chr3;62;4;14;31;9;10;9;0;;chrB1;70;49;72
chr4;28;3;4;12;4;27;6;0;;chrB2;71;52;62
chr5;64;2;23;26;7;11;8;0;;chrB3;70;54;45
chr6;42;1;11;9;4;17;6;0;;chrB4;66;61;53
chr7;56;1;20;18;12;14;6;2;;chrC1;109;99;60
chr8;37;1;7;14;5;20;4;0;;chrC2;66;39;48
chr9;28;2;8;13;5;19;5;0;;chrD1;53;40;32
chr10;50;1;9;17;7;17;4;0;;chrD2;40;19;28
chr11;58;3;27;21;8;16;8;2;;chrD3;65;33;29
chr12;31;1;12;14;3;22;3;0;;chrD4;46;34;38
chr13;59;5;17;20;8;11;5;0;;chrE1;61;42;22
chr14;35;0;11;14;4;13;4;1;;chrE2;33;36;18
chr15;36;1;12;13;3;12;4;0;;chrE3;29;37;17
chr16;46;2;10;14;8;3;9;0;;chrF1;41;25;27
chr17;63;3;18;9;7;7;2;0;;chrF2;42;23;17
chr18;48;8;23;17;4;4;3;4;;X;81;80;37
chr19;78;2;17;20;7;16;1;1;;Ud;5;2;
chr20;10;0;9;5;6;9;9;0;;;;;
chr21;37;2;9;11;5;9;4;1;;;;;
chr22;41;3;13;12;7;6;2;0;;;;;
chr23;36;4;8;9;3;6;3;15;;;;;
chr24;20;1;6;6;4;7;3;0;;;;;
chr25;62;0;16;18;8;3;3;1;;;;;
chr26;16;1;7;6;1;5;1;1;;;;;
chr27;26;3;11;4;1;8;5;0;;;;;
chr28;22;2;7;6;2;6;5;0;;;;;
chr29;28;1;7;14;4;6;3;1;;;;;
bta 30 chromosomes;;;;;;;;;;fca  19 chromosomes;;;
;ggg;ggc;gga;gaa;gag;tgc;tgt;gct;;;cga;aag;caa
total;1295;64;391;435;164;338;143;31;;total;1201;887;782
moy;43.2;2.1;13.0;14.5;5.5;11.3;4.8;1.0;;moy;62.9;46.6;41.2
ecartt;17.1;1.7;5.9;6.6;2.5;6.0;2.3;2.8;;ecartt;21.5;19.4;18.2
max;78;8;27;31;12;27;9;15;;max;109;99;72
min;10;0;4;4;1;3;1;0;;min;29;19;17
e/m%;40;78;45;46;46;53;49;270;;e/m%;34;42;44

Exemples de distributions des tRNAs sur les chromosomes[modifier | modifier le wikicode]

  • Lien Tableur: Exemples de distributions des tRNAs sur les chromosomes
  • Légende: Bases de données, gtRNAdb.fa [7], NCBI [orgn]
    m, moyenne par chromosome,   e, écart type.
    KEGG   gtRNAdb
    sce   Saccharomyces cerevisiae (S288c Apr 2011)
    mmu   Mus musculus (mm10 Dec 2011)
    has   Homo sapiens (hg38 - GRCh38 Dec 2013)
    oas   Ovis aries (sheep) (Feb 2010)
    dre   Danio rerio (Zebrafish) (Zv8 Apr 2009)
    bta   Bos taurus (Cow Jun. 2014 Bos_taurus_UMD_3.1.1/bosTau8)
;tRNAs;Moyenne par chromosome;;;;NCBI;gtRNAdb;
;sce;mmu;has;oas;dre;bta;dre;bta
;4;37;90;200;31;67;44;164
;13;8;8;111;76;49;266;152
;10;40;4;127;346;171;228;273
;28;8;1;51;5723;59;7825;121
;20;10;17;65;140;54;416;173
;10;53;144;52;52;51;49;116
;36;10;21;66;72;55;159;171
;11;7;5;42;240;29;241;109
;10;7;3;38;60;39;122;108
;24;11;3;31;12;65;13;160
;16;47;13;77;13;44;17;183
;21;3;9;37;123;47;200;111
;21;105;4;34;46;42;54;161
;14;12;18;45;11;38;10;106
;20;4;9;40;135;47;188;119
;17;2;27;20;17;30;26;114
;−;12;33;42;109;42;138;136
;−;0;1;34;5;50;87;147
;−;10;6;20;7;70;8;217
;−;17;0;184;262;31;358;64
;−;0;1;22;253;26;573;107
;−;−;0;19;143;23;362;105
;−;−;4;26;11;191;9;259
;−;−;0;69;18;19;31;64
;−;−;−;20;72;66;81;170
;−;−;−;20;−;14;−;47
;−;−;−;75;−;33;−;68
;−;−;−;−;−;23;−;62
;−;−;−;−;−;24;−;73
;−;−;−;−;−;79;−;202
Total;275;403;421;1567;7977;1578;11505;4062
m;17.2;19.2;17.5;58.0;319;52.6;460;144.4
e;8.0;25.0;32.9;47.2;1130;38.7;1542;51.5
e/m %;47;130;187;81;354;74;335;36

Archives exemples NCBI[modifier | modifier le wikicode]

 http://www.genome.jp/kegg/genome.html;;;;;;24.11.17 Paris ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
KEGG;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
uma;Ustilago maydis 521;;;;*;uma;;ecartt;3;moy;5;%;69;;ttt;;ecartt;13;moy;26;%;48;;;zro;;;ecartt;12;moy;39;%;32;;;;;;;;;;;;;;
cal;Candida albicans WO-1;;;;*;Type ;Name ;Size;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ;Gene ;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;tRNA ;Gene ;Pseudo ;;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;;;;;;;;;;;;;;
ttt;Thielavia terrestris NRRL 8126;;;;*;;;19.64;54;6783;34;111;6910;;;6;36.9;54.9;9802;156;9958;4;;;;7;9.76;39.2;4991;9;272;51;5323;;;;;;;;;;;;;;
cgr;Candida glabrata CBS 138;;;;*;Chr;1;2.48;53.9;877;5;11;892;;Chr;1;10.1;54.2;2650;39;2689;-;;;Chr;A;1.11;39.2;580;-;33;5;618;;;;;;;;;;;;;;
zro;Zygosaccharomyces rouxii CBS 732;;;;*;Chr;2;1.88;53.9;652;4;14;668;;Chr;2;9.48;55.1;2573;44;2617;4;;;Chr;B;1.39;38.8;706;-;39;8;753;;;;;;;;;;;;;;
sce;Saccharomyces cerevisiae (S288c Apr 2011);;;;*;Chr;3;1.64;53.7;632;3;6;639;;Chr;3;4.79;52.6;1180;23;1203;-;;;Chr;C;1.46;39;774;-;47;8;829;;;;;;;;;;;;;;
dme;Drosophila melanogaster (D. melanogaster Aug. 2014 BDGP Release 6 + ISO1 MT/dm6);;;;*;Chr;4;0.88;54.4;273;3;5;280;;Chr;4;4.58;55.2;1205;20;1225;-;;;Chr;D;1.5;39.1;768;-;28;7;803;;;;;;;;;;;;;;
tbl;Tetrapisispora blattae CBS 6284;;;;*;Chr;5;1.39;53.8;504;1;7;510;;Chr;5;4.4;55.7;1202;16;1218;-;;;Chr;E;0.88;39.4;416;9;32;10;467;;;;;;;;;;;;;;
ncr;Neurospora crassa OR74A;;;;*;Chr;6;1.03;54.1;335;3;7;344;;Chr;6;3.57;56.3;992;14;1006;-;;;Chr;F;1.55;39.3;806;-;30;3;839;;;;;;;;;;;;;;
mcc;Macaca mulatta (Rhesus Oct. 2010 BGI CR_1.0/rheMac3);;;;*;Chr;7;0.96;54.1;331;2;8;341;;Max Min Total;;;44;14;156;;;;;Chr;G;1.87;39.3;941;-;63;10;1014;;;;;;;;;;;;;;
mmu;Mus musculus (mm10 Dec 2011);;;;*;Chr;8;0.81;54.1;275;1;4;278;;;;;;;;;;;;Max Min Total;;;;63;28;272;;;;;;;;;;;;;;;;
ptr;Pan troglodytes (Chimp Feb. 2011 CSAC 2.1.4/panTro4);;;;*;Chr;9;0.73;53.9;259;1;3;263;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
cpic;Chrysemys picta (western painted turtle);;;;*;Chr;10;0.69;54.2;237;-;3;239;;cgr;;;ecartt;6;moy;16;%;39;;sce;;;ecartt;8;moy;17;%;47;;;;;;;;;;;;;;
cel;Caenorhabditis elegans (WS220 Oct 2010);;;;*;Chr;11;0.69;54.1;239;1;3;242;;Type ;Name ;Size  ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;;Type ;Name ;Size  ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;;;;;;;;;;;;
has;Homo sapiens (hg38 - GRCh38 Dec 2013);;;;*;Chr;12;0.65;54;221;-;0;221;;;13;12.32;38.8;5202;4;207;9;5421;;;16;12.07;38.4;5983;12;275;111;6399;18;;;;;;;;;;;;;
bdi;Brachypodium distachyon (JGI v1.0 8X);;;;*;Chr;13;0.61;54;207;-;3;209;;Chr;A;0.49;40.1;200;-;9;-;209;;Chr;I;0.23;39.3;94;-;4;2;101;1;;;;;;;;;;;;;
ath;Arabidopsis thaliana (TAIR10 Feb 2011);;;;*;Chr;14;0.61;54.1;185;1;7;193;;Chr;B;0.5;38.9;212;-;9;1;222;;Chr;II;0.81;38.3;415;-;13;4;432;-;;;;;;;;;;;;;
osa;Oryza sativa;;;;*;Chr;15;0.58;54.5;185;1;3;189;;Chr;C;0.56;39.7;230;-;7;-;237;;Chr;III;0.32;38.5;168;-;10;4;184;2;;;;;;;;;;;;;
cbr;Caenorhabditis briggsae (C. briggsae Jan. 2007 WUGSC 1.0/cb3);;;;*;Chr;16;0.55;54.1;185;-;6;191;;Chr;D;0.65;39.1;283;-;18;-;301;;Chr;IV;1.53;37.9;766;-;28;4;799;1;;;;;;;;;;;;;
ssc;Sus scrofa (Pig Aug. 2011 SGSC Sscrofa10.2/susScr3);;;;*;Chr;17;0.58;54;200;1;7;208;;Chr;E;0.69;39;278;-;9;-;287;;Chr;V;0.58;38.5;287;-;20;9;317;1;;;;;;;;;;;;;
oaa;Ornithorhynchus anatinus (platypus) (WUGSC 5.0.1 Mar 2007);;;;*;Chr;18;0.56;54.3;186;-;1;187;;Chr;F;0.93;38.1;383;-;15;-;398;;Chr;VI;0.27;38.7;128;-;10;4;143;1;;;;;;;;;;;;;
cfa;Canis familiaris (dog) (CanFam3.1 Sept 2011);;;;*;Chr;19;0.57;53.8;200;3;5;207;;Chr;G;0.99;38.6;434;-;18;-;451;;Chr;VII;1.09;38.1;539;-;36;10;585;-;;;;;;;;;;;;;
oas;Ovis aries (sheep) (Feb 2010);;;;*;Chr;20;0.52;53.9;190;2;1;193;;Chr;H;1.05;38.1;460;-;14;-;474;;Chr;VIII;0.56;38.5;290;-;11;4;305;-;;;;;;;;;;;;;
zma;Zea mays (Version 5b.60);;;;*;Chr;21;0.47;54.2;166;1;1;166;;Chr;I;1.1;38.6;462;-;26;1;489;;Chr;IX;0.44;38.9;213;-;10;3;232;6;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;Chr;22;0.4;54.5;123;1;4;128;;Chr;J;1.2;38.9;514;-;17;2;533;;Chr;X;0.75;38.4;362;-;24;6;392;-;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;Chr;23;0.34;54;114;-;2;115;;Chr;K;1.3;38.2;556;-;22;3;581;;Chr;XI;0.67;38.1;317;-;16;5;338;-;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;Un;-;0.02;52.8;7;-;-;;;Chr;L;1.46;38.5;575;4;25;1;605;;Chr;XII;1.08;38.5;519;12;21;18;572;2;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;Max Min Total;;;;14;0;111;;;Chr;M;1.4;38.5;615;-;18;1;634;;Chr;XIII;0.92;38.2;469;-;21;15;505;-;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;MT;0.02;17.6;11;2;23;1;37;;Chr;XIV;0.78;38.6;398;-;14;6;418;-;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;Max Min Total;;;;26;7;230;;;;Chr;XV;1.09;38.2;546;-;20;11;579;2;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;Chr;XVI;0.95;38.1;472;-;17;6;497;2;;;;;;;;;;;;;
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/?term=txid9606[orgn];;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;MT;0.09;17.1;19;2;24;1;46;-;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;Max Min Total;;;;36;4;299;;;;;;;;;;;;;;;;
;NCBI;;;ncr;;;ecartt;16;moy;59;%;27;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
uma;5270;;;Type ;Name ;Size  ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;mmu;;;ecartt;25;moy;19;%;130;;;;ptr;;;ecartt;29;moy;15;%;194;;;;;;;;;;;;
cal;5476;;;;;41;48.3;10785;212;415;176;10533;16;;Type ;Name ;Size  ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;;Type ;Name ;Size  ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;;;;;;;;;;
ttt;35720;;;group;I;9.8;48.8;2637;6;72;52;2477;2;;;;2725.52;41.9;75959;33;403;32389;45765;9469;;;;;2981.5;40.7;75780;0;367;18258;36235;6329;;;;;;;;;;;
cgr;5478;;;group;II;4.48;48.2;1134;22;36;14;1100;-;;Chr;1;195.47;41.3;4731;-;37;2031;2687;579;;;Chr;1;228.57;41.9;7522;-;49;1568;3407;570;;;;;;;;;;;
zro;4956;;;group;III;5.27;48.8;1399;9;39;23;1325;1;;Chr;2;182.11;42.2;6282;-;8;2783;3491;609;;;Chr;2A;111.5;41.3;2525;-;4;749;1210;183;;;;;;;;;;;
sce;4932;;;group;IV;6.00;48.5;1620;14;76;19;1594;8;;Chr;3;160.04;40.7;3507;-;40;1663;2225;480;;;Chr;2B;133.22;39.8;2975;-;4;666;1225;236;;;;;;;;;;;
dme;7227;;;group;V;6.44;48.9;1754;17;64;33;1694;2;;Chr;4;156.51;42.5;4710;-;8;1991;2622;497;;;Chr;3;202.62;39.9;4687;-;4;1133;2032;381;;;;;;;;;;;
tbl;1071379;;;group;VI;4.22;48.3;1076;5;56;19;1068;1;;Chr;5;151.84;42.7;4634;-;10;1952;2507;413;;;Chr;4;194.5;38.5;3064;-;1;956;1630;324;;;;;;;;;;;
ncr;5141;;;group;VII;4.26;47.7;1164;4;72;16;1139;2;;Chr;6;149.74;41.6;3844;1;53;1572;2597;555;;;Chr;5;181.91;39.7;3116;-;14;940;1749;345;;;;;;;;;;;
mcc;9544;;;;MT;0.06;36.1;28;-;28;-;58;2;;Chr;7;145.44;43.2;6336;-;10;2087;3798;935;;;Chr;6;175.4;39.8;3784;-;139;1086;2115;391;;;;;;;;;;;
mmu;10090;;;Un;-;0.57;28.1;-;-;-;-;-;-;;Chr;8;129.4;42.6;3653;32;7;1673;2177;376;;;Chr;7;166.21;41;3696;-;12;1148;1994;396;;;;;;;;;;;
ptr;9598;;;Max Min Total;;;;76;36;443;;;;;Chr;9;124.6;42.9;4406;-;7;1698;2276;374;;;Chr;8;147.91;40.4;2537;-;6;788;1370;256;;;;;;;;;;;
cpic;8479;;;;;;;;;;;;;;Chr;10;130.7;41.6;3546;-;11;1546;2086;391;;;Chr;9;116.77;41.8;3061;-;3;704;1393;253;;;;;;;;;;;
cel;6239;;;cpic;;;ecartt;4;moy;2;%;173;;;Chr;11;122.08;44;5650;-;47;2097;2852;381;;;Chr;10;135.93;41.8;3510;-;3;728;1415;248;;;;;;;;;;;
has;9606;;;Type ;Name ;Size  ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;Chr;12;120.13;42;2621;-;3;1593;2002;516;;;Chr;11;135.75;41.8;4745;-;13;774;2128;349;;cal;;;ecartt;11;moy;16;%;68;
bdi;15368;;;;;461.75;45.8;7543;0;44;3644;24356;597;;Chr;13;120.42;41.9;2536;-;105;1513;2127;476;;;Chr;12;137.16;41.1;4112;-;10;927;1832;321;;Type ;Name ;Size  ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo
ath;3702;;;Chr;1;77.39;43.4;1179;-;16;121;616;17;;Chr;14;124.9;41.4;3007;-;12;1538;2111;455;;;Chr;13;100.45;39;1345;-;4;543;827;171;;;;14.28;33.5;6030;4;126;85;6263;18
osa;4530;;;Chr;2;68.45;42.8;949;-;9;115;496;15;;Chr;15;104.04;42.2;2872;-;4;1349;1620;282;;;Chr;14;91.97;41.2;2375;-;19;667;1226;197;;Chr;1;3.19;33.3;1353;-;23;22;1403;5
cbr;6238;;;Chr;3;75.88;42.9;1132;-;4;108;537;8;;Chr;16;98.21;41.2;2486;-;2;1081;1367;257;;;Chr;15;83.23;42.5;2435;-;8;744;1137;200;;Chr;2;2.23;33.5;997;-;24;15;1038;2
ssc;9823;;;Chr;4;49.33;43.4;998;-;7;86;453;4;;Chr;17;94.99;42.9;3610;-;12;1373;2005;427;;;Chr;16;81.59;44.9;2949;-;30;567;1330;158;;Chr;3;1.8;33.5;739;-;21;4;765;1
oaa;9258;;;Chr;5;4.92;43.8;52;-;0;1;25;-;;Chr;18;90.7;41.7;1855;-;0;966;1218;264;;;Chr;17;83.18;45.7;4213;-;33;742;1806;206;;Chr;4;1.6;33.4;654;-;17;12;685;2
cfa;9612;;;Chr;6;62.6;42.6;1047;-;1;84;456;8;;Chr;19;61.43;43.1;2328;-;10;831;1283;205;;;Chr;18;78.22;40.2;1241;-;1;401;601;113;;Chr;5;1.19;33.3;507;-;6;5;519;1
oas;9940;;;Chr;7;7.28;45.9;55;-;2;5;30;1;;Chr;X;171.03;39.7;3010;-;17;933;2291;912;;;Chr;19;61.31;48.4;4611;-;7;703;1966;210;;Chr;6;1.03;33.6;425;-;4;4;435;2
zma;4577;;;Chr;8;51.56;44.2;878;-;0;79;445;7;;Chr;Y;91.74;39.3;335;-;0;119;423;85;;;Chr;20;66.53;44.3;2063;-;0;484;936;137;;Chr;7;0.95;33.5;393;-;1;3;398;1
;;;;Chr;10;7.27;48.4;156;-;1;17;65;-;;;MT;0.02;36.7;13;2;22;-;37;-;;;Chr;21;33.45;41.2;736;-;1;269;426;63;;Chr;R;2.29;33.8;962;4;30;20;1020;4
;;;;Chr;11;5;44.3;116;-;0;9;52;-;;Un;-;93.44;43.6;2471;2;10;1126;2899;501;;;Chr;22;37.82;48.1;1690;-;0;397;749;85;;Max Min Total;;;;30;1;126;;;
;;;;Chr;13;1.22;50;1;-;0;1;2;-;;Max Min Total;;;;105;0;435;;;;;;Chr;X;155.55;39.8;2653;-;2;515;1470;391;;;;;;;;;;;
;;;;Chr;15;19.09;42.3;321;-;1;50;162;2;;;;;;;;;;;;;;Chr;Y;26.35;40.6;135;-;0;59;261;145;;;;;;;;;;;
;;;;Chr;17;4.55;48.5;97;-;0;13;54;-;;has;;;ecartt;33;moy;18;%;187;;;;;MT;0.02;43.7;13;2;22;-;13;-;;dme;;;ecartt;38;moy;42;%;90;
;;;;Chr;19;9.08;48;171;-;1;10;98;1;;Type ;Name ;Size  ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;;Un;-;264.05;39.9;4163;-;29;804;2678;425;;Type ;Name ;Size  ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo
;;;;Chr;21;1.37;50.9;14;-;0;-;9;-;;;;3088.3;42.1;108596;17;421;46261;53816;15820;;;Max Min Total;;;;139;0;418;;;;;;;137.55;41.0;30463;117;297;3816;17640;305
;;;;Chr;22;2.51;46.4;22;-;1;5;12;-;;Chr;1;248.96;42.3;11046;17;90;4350;5078;1372;;;ath;;;ecartt;65;moy;125;%;52;;;Chr;X;23.54;42.5;5368;16;26;553;2669;69
;;;;Chr;24;13.19;46.3;354;-;1;27;191;2;;Chr;2;242.19;40.3;8054;-;8;3638;3862;1166;;;Type ;Name ;Size  ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;Chr;2L;23.51;41.8;5683;-;41;917;3490;48
;;;;Chr;25;1.06;49.9;1;-;0;3;3;-;;Chr;3;198.3;39.7;6790;-;4;2723;2971;887;;;;;119.16;36.0;48148;4;625;7203;37898;4843;;Chr;2R;25.29;42.6;6039;101;100;677;3618;45
;;;;;MT;0.02;39;13;2;22;-;13;-;;Chr;4;190.22;38.3;4374;-;1;2209;2441;799;;;Chr;1;30.43;35.9;12654;-;238;1969;9701;930;;Chr;3L;28.11;41.7;5867;-;50;750;3454;37
;;;;Un;-;1904;44.8;35002;-;311;2910;20637;532;;Chr;5;181.54;39.5;4599;-;17;2225;2578;766;;;Chr;2;19.7;35.9;7599;2;95;1341;6312;1047;;Chr;4;1.35;35.4;295;-;0;37;111;6
;;;;;;;;;;;;;;;Chr;6;170.81;39.6;5338;-;144;2408;3000;876;;;Chr;3;23.46;36.3;9474;2;92;1411;7624;1080;;Chr;3R;32.08;42.6;7186;-;80;854;4185;38
;;;;;;;;;;;;;;;Chr;7;159.35;40.7;4843;-;21;2232;2774;896;;;Chr;4;18.59;36.2;7426;-;77;1072;5842;835;;Chr;Y;3.67;40.2;25;-;0;28;113;62
;;;;cel;;;ecartt;89;moy;137;%;65;;;Chr;8;145.14;40.2;3962;-;5;1975;2152;661;;;Chr;5;26.98;35.9;10995;-;123;1410;8419;951;;;MT;0.02;17.8;13;2;22;-;37;-
;;;;Type ;Name ;Size  ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;Chr;9;138.4;42.3;4572;-;3;2135;2262;702;;;MT;;0.37;44.8;117;3;21;-;131;-;;Un;-;6.16;41.1;6;-;-;-;5;-
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;;;;Chr;III;13.78;35.7;3691;-;97;1060;3827;130;;Chr;13;114.36;40.2;1946;-;4;1235;1381;477;;;osa;;;ecartt;18;moy;51;%;35;;;tbl;;ecartt;21;moy;33;%;66;;
;;;;Chr;IV;17.49;34.6;5158;-;94;16207;19687;374;;Chr;14;107.04;42.2;3252;-;18;1704;2055;583;;;Type ;Name ;Size  ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;Type ;Name ;Size  ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ;Gene ;;
;;;;Chr;V;20.92;35.4;6677;15;169;2210;7836;845;;Chr;15;101.99;43.4;3436;-;9;1778;1814;555;;;;;373.24;43.6;40881;0;615;8932;32915;1655;;;;14.05;31.8;5388;10;327;5725;;
;;;;Chr;X;17.72;35.2;3793;-;305;3004;5991;114;;Chr;16;90.34;45.1;4453;-;27;1700;1920;451;;;Chr;1;43.27;43.8;5673;-;84;1132;4485;171;;Chr;1;2.7;31.8;1042;-;53;1095;;
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;;;;Type ;Name ;Size  ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;Chr;21;46.71;42.2;1240;-;1;687;756;202;;;Chr;6;31.25;43.6;3336;-;33;715;2683;140;;Chr;6;1.05;32;408;-;25;433;;
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;;;;Chr;1;75.12;46.3;10003;-;155;1714;8388;385;;Chr;X;156.04;39.6;3739;-;4;1196;2158;859;;;Chr;8;28.44;43.4;2752;-;44;610;2269;129;;Chr;8;0.96;31.1;370;-;21;391;;
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;;;;Chr;3;59.94;46.4;7537;-;111;1373;6429;311;;;MT;0.02;44.4;13;2;22;-;37;-;;;Chr;10;23.21;43.6;2102;-;47;607;1890;118;;Chr;10;0.49;31.8;191;-;9;200;;
;;;;Chr;4;48.77;46.3;5464;-;93;1251;4821;368;;Un;-;165.56;44.4;5810;17;186;3064;6445;1957;;;Chr;11;29.02;42.9;2643;-;28;709;2216;182;;Max Min Total;;;;74;5;327;;;
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;;;;Pltd;-;0.14;38.6;81;8;38;-;133;4;;;;;;;;;;;;;;Pltd;;0.13;39;108;8;38;-;159;5;;;;;;;;;;;
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;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;Un;-;0.55;45.9;26;-;-;10;30;3;;;;;;;;;;;
;;;;cbr;;ecartt;27;moy;127;%;22;;;;;;;;;;;;;;;;Max Min Total;;;;84;28;675;;;;;;;;;;;;;;
;;;;Type ;Name ;Size  ;GC% ;Protein ;tRNA ; RNA ;Gene ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;105.2;;21237;759;28;21999;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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;;;;Chr;IV;17.49;37.4;3292;124;3;3414;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;Chr;V;19.5;37.7;4821;135;6;4962;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;Chr;X;21.54;37.7;3768;176;6;3947;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;Un;-;3.2;36.8;722;15;-;737;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;Max Min Total;;;176;98;774;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;cfa;;;ecartt;17;moy;10;%;169;;;ssc;;;ecartt;33;moy;22;%;148;;;oas;;;ecartt;47;moy;58;%;81;;;;mcc;;;ecartt;30;moy;18;%;170
;;;;;Type ;Name ;Size  ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;Type ;Name ;Size  ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;Type ;Name ;Size  ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;;Type ;Name ;Size  ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene 
;;;;;;;2327.62;41.3;58270;0;395;24029;36322;5040;;;;2435.26;41.9;61823;0;448;14074;28224;2365;;;;2584.84;42.4;42387;0;1567;6690;28381;3084;;;;;2835.96;41.6;54294;0;394;11124;32128
;;;;;Chr;1;122.68;41.6;3540;-;8;1312;2078;257;;Chr;1;274.33;40.2;5392;-;21;1255;2423;260;;Chr;1;275.41;40.9;4492;-;200;593;2813;331;;;Chr;1;225.59;42;5515;-;63;1008;3150
;;;;;Chr;2;85.43;42.8;2231;-;6;986;1384;152;;Chr;2;151.94;42.5;5641;-;29;988;2683;257;;Chr;2;248.97;41;3655;-;111;555;2139;264;;;Chr;2;204.79;39.9;3417;-;7;667;1857
;;;;;Chr;3;91.89;40.3;1491;-;5;918;1076;177;;Chr;3;132.85;44.2;4054;-;36;941;1805;109;;Chr;3;224;42.4;4287;-;127;550;2739;295;;;Chr;3;185.82;41;3036;-;20;686;1966
;;;;;Chr;4;88.28;40.4;1579;-;3;892;1142;183;;Chr;4;130.91;41.6;3628;-;70;868;1650;104;;Chr;4;119.22;40.6;1372;-;51;287;975;121;;;Chr;4;172.59;40;2775;-;136;652;1906
;;;;;Chr;5;88.92;44.2;3124;-;26;1036;1652;147;;Chr;5;104.53;42.2;3219;-;12;653;1458;103;;Chr;5;107.84;42;2204;-;65;285;1616;174;;;Chr;5;190.43;38.6;2208;-;2;549;1378
;;;;;Chr;6;77.57;42.6;2651;-;26;898;1514;155;;Chr;6;170.84;44.7;6262;-;16;1282;2724;167;;Chr;6;116.89;40;1361;-;52;206;823;120;;;Chr;6;180.05;39.8;2326;-;17;615;1561
;;;;;Chr;7;80.97;41.0;2101;-;7;919;1253;170;;Chr;7;121.84;43.1;3720;-;143;889;1978;133;;Chr;7;100.01;41.6;1972;-;66;268;1197;114;;;Chr;7;169.6;41.7;3418;-;31;940;2151
;;;;;Chr;8;74.33;40.6;1712;-;6;845;1227;198;;Chr;8;138.97;39.5;2216;-;2;644;1096;109;;Chr;8;90.62;40.2;1028;-;42;184;646;80;;;Chr;8;144.31;40.4;1947;-;6;411;1190
;;;;;Chr;9;61.07;46.0;3224;-;19;886;1651;106;;Chr;9;139.51;41.2;3659;-;8;893;1715;169;;Chr;9;94.58;41.1;1001;-;38;191;690;81;;;Chr;9;129.88;41.9;2479;-;3;487;1267
;;;;;Chr;10;69.33;42.7;1868;-;8;856;1190;153;;Chr;10;69.36;42.7;1455;-;5;428;664;54;;Chr;10;86.38;40.4;748;-;31;160;521;64;;;Chr;10;92.84;45.8;2563;-;0;480;1493
;;;;;Chr;11;74.39;40.2;1640;-;9;723;1024;145;;Chr;11;79.17;40.6;1156;-;5;406;559;43;;Chr;11;62.17;46.3;2083;-;77;264;1449;91;;;Chr;11;133.66;41.2;2961;-;8;517;1662
;;;;;Chr;12;72.5;39.0;1705;-;3;593;1024;165;;Chr;12;61.6;47.7;3151;-;44;708;1468;58;;Chr;12;79.03;42.8;1240;-;37;221;872;85;;;Chr;12;125.51;40.1;1976;-;4;409;1040
;;;;;Chr;13;63.24;40.0;1164;-;3;620;794;126;;Chr;13;208.34;39.9;4724;-;4;918;1841;200;;Chr;13;82.95;43.8;1572;-;34;252;967;80;;;Chr;13;108.98;41.3;1779;-;4;451;1116
;;;;;Chr;14;60.97;38.8;1099;-;5;566;799;141;;Chr;14;141.76;43.2;4088;-;11;811;1667;132;;Chr;14;62.57;45.8;1955;-;45;302;1446;106;;;Chr;14;127.89;41.9;3526;-;10;529;1885
;;;;;Chr;15;64.19;40.2;1534;-;12;788;968;122;;Chr;15;140.41;39.9;2727;-;7;561;1106;115;;Chr;15;80.78;42;1682;-;40;176;1212;153;;;Chr;15;111.34;41.8;2223;-;4;429;1218
;;;;;Chr;16;59.63;41.0;1305;-;16;556;870;119;;Chr;16;79.94;40.3;940;-;5;390;588;50;;Chr;16;71.69;41.1;631;-;20;139;464;68;;;Chr;16;77.22;45.9;2915;-;33;450;1605
;;;;;Chr;17;64.29;41.7;1766;-;31;804;1129;123;;Chr;17;63.49;44.7;1823;-;5;459;821;46;;Chr;17;72.25;42.4;1080;-;42;184;739;72;;;Chr;17;95.68;38.9;981;-;4;350;676
;;;;;Chr;18;55.84;42.8;1988;-;10;595;1214;125;;Chr;18;55.98;43.1;1368;-;17;400;659;41;;Chr;18;68.49;43.1;955;-;34;410;747;81;;;Chr;18;70.24;40;786;-;0;243;488
;;;;;Chr;19;53.74;38.4;568;-;2;457;469;99;;Chr;X;125.94;40.4;2482;-;8;523;1172;170;;Chr;19;60.45;43.6;1206;-;20;307;685;39;;;Chr;19;53.67;49;3293;-;8;474;1819
;;;;;Chr;20;58.13;44.3;2673;-;6;604;1377;123;;Chr;Y;43.55;47.5;118;-;0;57;147;45;;Chr;20;51.05;43.6;1203;-;184;186;1022;75;;;Chr;20;74.97;45;2017;-;28;304;1143
;;;;;Chr;21;50.86;40.2;1367;-;3;439;871;170;;;MT;0.02;39.5;13;2;22;-;13;-;;Chr;21;49.99;44.3;1027;-;22;161;824;87;;;Chr;X;149.15;39.7;2067;-;6;442;1465
;;;;;Chr;22;61.44;37.9;712;-;4;556;591;117;;Un;-;66.63;43.3;1741;2;62;331;1936;59;;Chr;22;50.78;42.9;841;-;19;96;473;42;;;Chr;Y;11.75;40.1;86;-;0;31;92
;;;;;Chr;23;52.29;39.9;1006;-;3;512;667;124;;Max Min Total;;;;143;0;532;;;;;Chr;23;62.28;41.9;689;-;26;134;423;42;;;;MT;0.02;43.2;13;2;22;-;13
;;;;;Chr;24;47.7;44.5;1550;-;2;560;890;74;;;;;;;;;;;;;Chr;24;41.98;47.3;1133;-;69;133;891;50;;;Un;-;400.24;41.3;1059;-;2;87;1077
;;;;;Chr;25;51.63;41.4;1305;-;4;574;798;109;;zma;;;ecartt;30;moy;86;%;35;;;Chr;25;45.22;42.4;744;-;20;124;456;73;;;Max Min Total;;;;136;0;418;;
;;;;;Chr;26;38.96;45.4;1478;-;10;466;794;76;;Type ;Name ;Size  ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ; RNA ;Gene ;Pseudo;;Chr;26;44.05;41.8;461;-;20;102;324;33;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;27;45.88;40.1;1662;-;3;464;858;128;;;;2106.33;46.0;57505;1;859;12070;47001;3591;;Chr;X;135.19;40.5;1765;-;75;220;1228;263;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;28;41.18;43.5;1194;-;0;461;642;70;;Chr;1;307.04;47;8611;-;116;1779;6948;468;;;MT;0.02;38.9;13;2;22;-;13;-;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;29;41.85;38.2;538;-;5;366;474;91;;Chr;2;244.44;47;6964;-;140;1438;5780;447;;Un;-;30.68;45.8;646;-;2;62;716;37;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;30;40.21;41.4;1210;-;5;441;681;86;;Chr;3;235.67;46.9;6181;-;79;1254;4945;368;;Max Min Total;;;;200;19;1591;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;31;39.9;39.5;644;-;0;357;486;71;;Chr;4;247;46.6;6047;-;109;1326;5118;390;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;32;38.81;36.9;706;-;0;302;464;121;;Chr;5;223.9;46.9;6655;-;101;1319;5293;408;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;33;31.38;39.2;694;-;2;330;414;57;;Chr;6;174.03;47.1;4897;1;78;1037;4049;326;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;34;42.12;40.4;627;-;2;380;471;57;;Chr;7;182.38;46.8;4778;-;59;928;3762;284;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;35;26.53;41.4;528;-;102;272;529;66;;Chr;8;181.12;47;5048;-;75;1217;4263;305;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;36;30.81;38.6;551;-;2;342;376;57;;Chr;9;159.77;47;4274;-;53;987;3590;307;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;37;30.9;40.2;712;-;3;438;453;45;;Chr;10;150.98;46.9;4050;-;49;785;3253;288;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;38;23.91;41.0;485;-;28;296;442;63;;;MT;0.57;43.9;163;4;29;-;213;26;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;X;123.87;40.3;2338;-;6;619;1586;472;;;Pltd;0.14;38.5;111;8;38;-;158;1;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;MT;0.02;39.7;13;2;22;-;13;-;;Un;-;28.03;46.7;512;1;19;108;428;24;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Un;-;83.33;47.2;493;-;2;146;474;;;Max Min Total;;;;140;49;945;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Max Min Total;;;;102;0;419;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;dre;;;ecartt;1130;moy;319;%;354;;;bta;;;ecartt;39;moy;53;%;74;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ;RNA ;Gene ;Pseudo;;Type ;Name ;Size ;GC% ;Protein ;rRNA ;tRNA ;RNA ;Gene ;Pseudo;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;1345.07;36.8;62823;1;7977;6836;37391;297;;;;2660.91;41.9;48993;1;1578;9712;32314;3888;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;1;59.58;36.4;2176;-;31;326;1444;22;;Chr;1;158.34;40.1;1981;-;67;405;1267;165;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;2;59.64;36.7;2229;-;76;274;1464;8;;Chr;2;137.06;40.8;2085;-;49;362;1237;163;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;3;62.63;36.9;2436;-;346;362;1992;23;;Chr;3;121.43;41.9;2922;-;171;462;1832;223;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;4;78.09;38.4;2450;-;5723;1252;7909;70;;Chr;4;120.83;40.6;1673;-;59;386;1142;123;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;5;72.5;36.4;2713;1;140;395;1679;6;;Chr;5;121.19;41.7;2753;-;54;444;1715;218;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;6;60.27;36.4;2123;-;52;250;1238;16;;Chr;6;119.46;40;1420;-;51;320;953;134;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;7;74.28;36.7;2531;-;72;322;1641;14;;Chr;7;112.64;42;2791;-;55;474;1814;243;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;8;54.3;36.5;1986;-;240;272;1452;6;;Chr;8;113.39;41.2;1573;-;29;421;1097;142;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;9;56.46;36.5;1832;-;60;226;1060;9;;Chr;9;105.71;40;1068;-;39;281;821;142;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;10;45.42;36.6;1779;-;12;186;1076;14;;Chr;10;104.31;41.5;2014;-;65;369;1447;151;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;11;45.48;36.4;1596;-;13;166;952;4;;Chr;11;107.31;42.9;2176;-;44;388;1309;122;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;12;49.18;36.3;1679;-;123;157;1091;5;;Chr;12;91.16;40.4;886;-;47;268;660;72;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;13;52.19;36.5;1805;-;46;230;1046;6;;Chr;13;84.24;43.7;1740;-;42;377;1111;118;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;14;52.66;36.6;1481;-;11;170;945;6;;Chr;14;84.65;41.4;1066;-;38;235;734;95;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;15;48.04;36.8;1814;-;135;193;1229;14;;Chr;15;85.3;41.8;1946;-;47;269;1491;264;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;16;55.27;36.5;1996;-;17;308;1255;11;;Chr;16;81.72;42.6;1452;-;30;324;946;102;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;17;53.46;36.6;1703;-;109;190;1111;9;;Chr;17;75.16;42.3;1411;-;42;261;893;115;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;18;51.02;36.6;1541;-;5;179;915;9;;Chr;18;66;45.4;2691;-;50;378;1648;156;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;19;48.45;36.4;1762;-;7;185;1038;7;;Chr;19;64.06;46;2718;-;70;428;1570;108;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;20;55.2;36.6;1890;-;262;192;1376;3;;Chr;20;72.04;41;562;-;31;192;508;67;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;21;45.93;36.6;1948;-;253;237;1374;8;;Chr;21;71.6;43.1;1135;-;26;460;855;98;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;22;39.13;37;1674;-;143;293;1288;8;;Chr;22;61.44;43.4;1414;-;23;276;762;67;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;23;46.22;36.7;1755;-;11;204;1015;5;;Chr;23;52.53;43.4;1393;-;191;297;1134;93;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;24;42.17;36.3;1365;-;18;138;823;10;;Chr;24;62.71;41.9;751;-;19;192;469;61;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Chr;25;37.5;36.6;1453;-;72;129;978;4;;Chr;25;42.9;47.1;1684;1;66;259;973;50;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;MT;0.02;39.9;13;2;22;-;37;-;;Chr;26;51.68;42.8;991;-;14;207;559;62;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Un;-;334.09;36.5;9370;-;1385;1639;9570;67;;Chr;27;45.41;41.8;478;-;33;147;377;33;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;Max Min Total;;;;5723;5;9384;;;;;Chr;28;46.31;42.2;798;-;23;111;444;64;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;Chr;29;51.51;44.2;1427;-;24;231;903;109;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;Chr;X;148.82;40.6;1994;-;79;488;1643;328;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;MT;0.02;39.4;13;2;22;-;13;-;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;Un;-;9.22;49.6;101;-;-;10;105;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;Max Min Total;;;;191;14;1600;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;

Zebrafish Taurus Catus[modifier | modifier le wikicode]

Felis_catus_;F$;Bos_taurus_;B$;Danio_rerio_;D$;;24.11.17 Paris;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/eukaryota/Fcatu5/felCat5-tRNAs.fa;;;;;;http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/eukaryota/Btaur8/bosTau8-tRNAs.fa;;;;;;http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/eukaryota/Dreri_v8/danRer6-tRNAs.fa;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;AlaAGC;;D$chr4.trna1-MetCAT;;;D$chr1.trna118-LysCTT;;;D$chr2.trna100-AsnGTT;;;D$chr3.trna100-GlnCTG;;;D$chr5.trna105-LysCTT;;;D$chr6.trna10-LysCTT;;;D$chr7.trna100-IleTAT;;;D$chr8.trna100-GlnTTG;;;D$chr9.trna132-GlnCTG;;;D$chr10.trna177-GlyGCC;;;D$chr12.trna1-ArgTCG;;;D$chr13.trna104-LysCTT;;;D$chr14.trna166-AlaTGC;;;D$chr15.trna100-ProCGG;;;D$chr16.trna128-GluCTC;;;D$chr17.trna11-ThrTGT;;;D$chr18.trna138-TrpCCA;;;D$chr19.trna137-ProAGG;;;D$chr20.trna101-CysGCA;;;D$chr21.trna103-AlaTGC;;;D$chr22.trna100-MetCAT;;;D$chr23.trna13-CysGCA;;;D$chr25.trna100-PheAAA;;;D$Zv8_NA10776.trna10-IleTAT;;;;D$Zv8_scaffold2976.trna1-MetCAT
F$chrA3;AlaAGC;;B$chr1;AlaCGC;;D$chr4.trna1000-GlyGCC;;;D$chr1.trna121-ProAGG;;;D$chr2.trna101-LysCTT;;;D$chr3.trna101-PheGAA;;;D$chr5.trna106-LysCTT;;;D$chr6.trna11-AsnGTT;;;D$chr7.trna101-IleTAT;;;D$chr8.trna102-ProTGG;;;D$chr9.trna133-ArgTCT;;;D$chr10.trna178-GlyGCC;;;D$chr12.trna100-LysCTT;;;D$chr13.trna105-AsnGTT;;;D$chr14.trna178-GlnCTG;;;D$chr15.trna102-GluCTC;;;D$chr16.trna129-SerAGA;;;D$chr17.trna110-LeuCAA;;;D$chr18.trna164-MetCAT;;;D$chr19.trna138-ProAGG;;;D$chr20.trna103-CysGCA;;;D$chr21.trna107-MetCAT;;;D$chr22.trna101-MetCAT;;;D$chr23.trna151-ThrTGT;;;D$chr25.trna101-GlnTTG;;;D$Zv8_NA10776.trna11-IleTAT;;;;D$Zv8_scaffold2976.trna2-MetCAT
F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;AlaCGC;;D$chr4.trna10002-AsnGTT;;;D$chr1.trna140-GluCTC;;;D$chr2.trna102-AsnGTT;;;D$chr3.trna102-GlnCTG;;;D$chr5.trna107-LysCTT;;;D$chr6.trna111-IleAAT;;;D$chr7.trna102-IleTAT;;;D$chr8.trna103-ProAGG;;;D$chr9.trna134-ThrTGT;;;D$chr10.trna180-GlyGCC;;;D$chr12.trna101-AsnGTT;;;D$chr13.trna138-HisGTG;;;D$chr14.trna193-ValTAC;;;D$chr15.trna103-GluCTC;;;D$chr16.trna175-GluCTC;;;D$chr17.trna111-LeuCAA;;;D$chr18.trna165-ThrCGT;;;D$chr19.trna154-GlnCTG;;;D$chr20.trna105-CysGCA;;;D$chr21.trna113-AlaTGC;;;D$chr22.trna102-MetCAT;;;D$chr23.trna16-GlyTCC;;;D$chr25.trna102-IleAAT;;;D$Zv8_NA10776.trna12-IleTAT;;;;D$Zv8_scaffold2976.trna3-MetCAT
F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;AlaTGC;;D$chr4.trna10005-LysCTT;;;D$chr1.trna146-LeuTAA;;;D$chr2.trna103-LysCTT;;;D$chr3.trna103-IleAAT;;;D$chr5.trna11-ProAGG;;;D$chr6.trna13-AsnGTT;;;D$chr7.trna103-IleTAT;;;D$chr8.trna104-GlnTTG;;;D$chr9.trna135-SerAGA;;;D$chr10.trna183-GlyGCC;;;D$chr12.trna102-LysCTT;;;D$chr13.trna144-ValAAC;;;D$chr14.trna199-GluTTC;;;D$chr15.trna104-GluCTC;;;D$chr16.trna176-GluCTC;;;D$chr17.trna112-LeuCAA;;;D$chr18.trna169-ValAAC;;;D$chr19.trna183-IleAAT;;;D$chr20.trna107-CysGCA;;;D$chr21.trna114-AlaTGC;;;D$chr22.trna103-MetCAT;;;D$chr23.trna194-HisGTG;;;D$chr25.trna107-ArgACG;;;D$Zv8_NA10776.trna13-IleTAT;;;;D$Zv8_scaffold2976.trna4-MetCAT
F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;ArgCCG;;D$chr4.trna10006-AsnGTT;;;D$chr1.trna147-LeuTAA;;;D$chr2.trna104-AsnGTT;;;D$chr3.trna104-PheGAA;;;D$chr5.trna114-ProAGG;;;D$chr6.trna14-AsnGTT;;;D$chr7.trna105-IleTAT;;;D$chr8.trna106-ProTGG;;;D$chr9.trna136-ArgTCT;;;D$chr10.trna184-GlyGCC;;;D$chr12.trna103-AsnGTT;;;D$chr13.trna145-ValCAC;;;D$chr14.trna23-AlaAGC;;;D$chr15.trna105-GluCTC;;;D$chr16.trna219-GluCTC;;;D$chr17.trna113-LeuCAA;;;D$chr18.trna170-HisGTG;;;D$chr19.trna257-MetCAT;;;D$chr20.trna109-CysGCA;;;D$chr21.trna115-AlaCGC;;;D$chr22.trna105-MetCAT;;;D$chr23.trna45-GluCTC;;;D$chr25.trna108-ArgACG;;;D$Zv8_NA10776.trna14-IleTAT;;;;D$Zv8_scaffold3042.trna1-IleGAT
F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;ArgCCT;;D$chr4.trna10008-AsnGTT;;;D$chr1.trna149-LeuTAA;;;D$chr2.trna105-LysCTT;;;D$chr3.trna106-IleAAT;;;D$chr5.trna12-ProCGG;;;D$chr6.trna149-GlnTTG;;;D$chr7.trna106-IleTAT;;;D$chr8.trna107-ProAGG;;;D$chr9.trna137-ThrTGT;;;D$chr10.trna187-GlyGCC;;;D$chr12.trna104-LysCTT;;;D$chr13.trna146-ValAAC;;;D$chr14.trna24-AlaAGC;;;D$chr15.trna106-GluCTC;;;D$chr16.trna253-GluCTC;;;D$chr17.trna114-LeuCAA;;;D$chr18.trna171-ProAGG;;;D$chr19.trna291-TrpCCA;;;D$chr20.trna111-CysGCA;;;D$chr21.trna116-AlaTGC;;;D$chr22.trna107-MetCAT;;;D$chr23.trna47-AsnGTT;;;D$chr25.trna115-AspGTC;;;D$Zv8_NA10776.trna3-IleTAT;;;;D$Zv8_scaffold3042.trna2-AlaTGC
F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;ArgCCT;;D$chr4.trna10009-AsnGTT;;;D$chr1.trna150-LeuTAA;;;D$chr2.trna107-AsnGTT;;;D$chr3.trna107-PheGAA;;;D$chr5.trna13-ProCGG;;;D$chr6.trna15-LysCTT;;;D$chr7.trna107-ValAAC;;;D$chr8.trna108-GlnTTG;;;D$chr9.trna138-ThrAGT;;;D$chr10.trna188-GlyGCC;;;D$chr12.trna105-ThrTGT;;;D$chr13.trna147-ValCAC;;;D$chr14.trna25-AlaAGC;;;D$chr15.trna107-GluCTC;;;D$chr16.trna254-LysCTT;;;D$chr17.trna115-LeuCAA;;;D$chr18.trna172-ProAGG;;;D$chr19.trna3-LysCTT;;;D$chr20.trna113-CysGCA;;;D$chr21.trna117-AlaCGC;;;D$chr22.trna108-MetCAT;;;D$chr23.trna48-AsnGTT;;;D$chr25.trna116-AspGTC;;;D$Zv8_NA10776.trna4-IleTAT;;;;D$Zv8_scaffold3042.trna3-MetCAT
F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;ArgCCT;;D$chr4.trna1001-GlyGCC;;;D$chr1.trna152-LeuTAA;;;D$chr2.trna108-LysCTT;;;D$chr3.trna108-GlnCTG;;;D$chr5.trna130-AspGTC;;;D$chr6.trna16-AsnGTT;;;D$chr7.trna119-LysCTT;;;D$chr8.trna110-ProTGG;;;D$chr9.trna139-ArgTCT;;;D$chr10.trna191-GlyGCC;;;D$chr12.trna123-LeuTAG;;;D$chr13.trna148-ValAAC;;;D$chr14.trna26-AlaAGC;;;D$chr15.trna108-GluCTC;;;D$chr16.trna255-ArgTCG;;;D$chr17.trna116-LeuCAA;;;D$chr18.trna173-ProTGG;;;D$chr19.trna55-ProAGG;;;D$chr20.trna115-CysGCA;;;D$chr21.trna118-AlaTGC;;;D$chr22.trna109-ArgCCT;;;D$chr23.trna49-PheGAA;;;D$chr25.trna117-AspGTC;;;D$Zv8_NA10776.trna5-IleTAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna1-GluTTC
F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;ArgCCT;;D$chr4.trna10010-LysCTT;;;D$chr1.trna153-LeuTAA;;;D$chr2.trna110-AsnGTT;;;D$chr3.trna109-IleAAT;;;D$chr5.trna131-AspGTC;;;D$chr6.trna217-GluTTC;;;D$chr7.trna131-ThrAGT;;;D$chr8.trna111-ProAGG;;;D$chr9.trna140-ThrTGT;;;D$chr10.trna256-LeuTAG;;;D$chr12.trna124-LeuTAG;;;D$chr13.trna149-ValCAC;;;D$chr14.trna290-GlyGCC;;;D$chr15.trna109-GluCTC;;;D$chr16.trna257-GlnCTG;;;D$chr17.trna117-LeuCAA;;;D$chr18.trna174-ProCGG;;;;;;D$chr20.trna117-CysGCA;;;D$chr21.trna119-AlaTGC;;;D$chr22.trna110-MetCAT;;;D$chr23.trna50-GluTTC;;;D$chr25.trna118-GlyGCC;;;D$Zv8_NA10776.trna6-IleTAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna10-HisGTG
F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;ArgGCG;;D$chr4.trna10011-AsnGTT;;;D$chr1.trna154-LeuTAA;;;D$chr2.trna111-LysCTT;;;D$chr3.trna110-PheGAA;;;D$chr5.trna132-AspGTC;;;D$chr6.trna292-PheGAA;;;D$chr7.trna189-ThrAGT;;;D$chr8.trna112-GlnTTG;;;D$chr9.trna141-LeuAAG;;;D$chr10.trna257-LeuAAG;;;D$chr12.trna139-ArgCCT;;;D$chr13.trna150-ValAAC;;;D$chr14.trna302-LeuAAG;;;D$chr15.trna110-GluCTC;;;D$chr16.trna259-ArgCCG;;;D$chr17.trna118-LeuCAA;;;D$chr18.trna175-ProAGG;;;;;;D$chr20.trna119-CysGCA;;;D$chr21.trna120-AlaCGC;;;D$chr22.trna111-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna151-ThrAGT;;;D$Zv8_NA10776.trna7-IleTAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna100-ValCAC
F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;ArgTCG;;D$chr4.trna10013-LysCTT;;;D$chr1.trna155-LeuTAA;;;D$chr2.trna112-AsnGTT;;;D$chr3.trna111-GlnCTG;;;D$chr5.trna134-AspGTC;;;D$chr6.trna307-LeuTAG;;;D$chr7.trna266-ArgTCG;;;D$chr8.trna114-ProTGG;;;D$chr9.trna142-LeuTAG;;;D$chr10.trna64-SerGCT;;;D$chr12.trna16-LeuCAG;;;D$chr13.trna151-ValCAC;;;;;;D$chr15.trna111-GluCTC;;;D$chr16.trna260-ThrCGT;;;D$chr17.trna119-LeuCAA;;;D$chr18.trna177-ProAGG;;;;;;D$chr20.trna121-CysGCA;;;D$chr21.trna121-AlaTGC;;;D$chr22.trna112-MetCAT;;;D$chr24.trna119-GlyCCC;;;D$chr25.trna152-ThrAGT;;;D$Zv8_NA10776.trna9-ValAAC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna103-GlnCTG
F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;ArgTCT;;D$chr4.trna10015-LysCTT;;;D$chr1.trna156-LeuTAA;;;D$chr2.trna113-LysCTT;;;D$chr3.trna112-IleAAT;;;D$chr5.trna136-AspGTC;;;D$chr6.trna309-IleAAT;;;D$chr7.trna267-GlnCTG;;;D$chr8.trna115-ProAGG;;;D$chr9.trna143-LeuAAG;;;D$chr10.trna65-ThrAGT;;;D$chr12.trna18-ArgTCG;;;D$chr13.trna258-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna112-GluCTC;;;D$chr16.trna269-ThrTGT;;;D$chr17.trna12-ThrCGT;;;D$chr18.trna181-ArgTCT;;;;;;D$chr20.trna123-CysGCA;;;D$chr21.trna122-AlaTGC;;;D$chr22.trna114-MetCAT;;;D$chr24.trna124-GlyGCC;;;D$chr25.trna155-GluCTC;;;D$Zv8_NA10976.trna1-LeuTAA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna104-IleAAT
F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;ArgTCT;;D$chr4.trna10016-AsnGTT;;;D$chr1.trna157-LeuTAA;;;D$chr2.trna114-AsnGTT;;;D$chr3.trna113-PheGAA;;;D$chr5.trna138-AspGTC;;;D$chr6.trna310-LeuAAG;;;D$chr7.trna269-ArgTCG;;;D$chr8.trna116-GlnTTG;;;D$chr9.trna144-LeuTAG;;;D$chr10.trna66-LeuTAG;;;D$chr12.trna2-MetCAT;;;D$chr13.trna259-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna113-GluCTC;;;D$chr16.trna270-ThrTGT;;;D$chr17.trna120-LeuCAA;;;D$chr18.trna196-MetCAT;;;;;;D$chr20.trna125-CysGCA;;;D$chr21.trna123-AlaCGC;;;D$chr22.trna115-MetCAT;;;D$chr24.trna126-GlyGCC;;;D$chr25.trna156-GluCTC;;;D$Zv8_NA10976.trna2-LeuTAA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna105-PheGAA
F$chrB2;AlaAGC;;B$chr1;ArgTCT;;D$chr4.trna10018-GluTTC;;;D$chr1.trna159-LeuTAA;;;D$chr2.trna115-LysCTT;;;D$chr3.trna115-PheGAA;;;D$chr5.trna14-ProAGG;;;D$chr6.trna311-LeuTAG;;;D$chr7.trna271-LysCTT;;;D$chr8.trna118-ProTGG;;;D$chr9.trna145-LeuAAG;;;;;;D$chr12.trna20-GlnCTG;;;D$chr13.trna260-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna114-GluCTC;;;D$chr16.trna271-ThrTGT;;;D$chr17.trna121-LeuCAA;;;D$chr18.trna197-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna127-CysGCA;;;D$chr21.trna124-AlaTGC;;;D$chr22.trna117-MetCAT;;;D$chr24.trna127-GlyCCC;;;D$chr25.trna157-GluCTC;;;D$Zv8_NA10978.trna1-LeuTAA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna106-GlnCTG
F$chrC1;AlaAGC;;B$chr1;AspGTC;;D$chr4.trna10019-TyrGTA;;;D$chr1.trna199-AlaTGC;;;D$chr2.trna116-AsnGTT;;;D$chr3.trna116-GlnCTG;;;D$chr5.trna140-AspGTC;;;D$chr6.trna312-LeuAAG;;;D$chr7.trna272-AsnGTT;;;D$chr8.trna119-ProAGG;;;D$chr9.trna146-LeuTAG;;;D$chr11.trna133-SerTGA;;;D$chr12.trna220-ThrAGT;;;D$chr13.trna261-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna115-GluCTC;;;D$chr16.trna272-ThrTGT;;;D$chr17.trna122-LeuCAA;;;D$chr18.trna201-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna129-CysGCA;;;D$chr21.trna125-AlaTGC;;;D$chr22.trna118-MetCAT;;;D$chr24.trna128-GlyGCC;;;D$chr25.trna165-GlyGCC;;;D$Zv8_NA11109.trna1-ArgTCG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna107-IleAAT
F$chrD1;AlaAGC;;B$chr1;AspGTC;;D$chr4.trna10020-ArgACG;;;D$chr1.trna200-AlaTGC;;;D$chr2.trna117-LysCTT;;;D$chr3.trna117-PheGAA;;;D$chr5.trna142-AspGTC;;;D$chr6.trna315-LeuAAG;;;D$chr7.trna273-LysCTT;;;D$chr8.trna120-GlnTTG;;;D$chr9.trna147-LeuAAG;;;D$chr11.trna204-ValAAC;;;D$chr12.trna221-ArgTCT;;;D$chr13.trna262-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna116-GluCTC;;;D$chr16.trna273-ThrTGT;;;D$chr17.trna123-LeuCAA;;;D$chr18.trna206-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna131-CysGCA;;;D$chr21.trna126-AlaTGC;;;D$chr22.trna119-ArgCCT;;;D$chr24.trna129-GlyGCC;;;D$chr25.trna174-ArgACG;;;D$Zv8_NA11109.trna2-ArgTCG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna11-SupTTA
F$chrE3;AlaAGC;;B$chr1;CysACA;;D$chr4.trna10021-GluTTC;;;D$chr1.trna201-AlaTGC;;;D$chr2.trna118-AsnGTT;;;D$chr3.trna118-GlnCTG;;;D$chr5.trna144-AspGTC;;;D$chr6.trna316-LeuTAG;;;D$chr7.trna274-AsnGTT;;;D$chr8.trna122-ProTGG;;;D$chr9.trna148-LeuTAG;;;D$chr11.trna205-ValAAC;;;D$chr12.trna222-ThrTGT;;;D$chr13.trna263-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna117-GluCTC;;;D$chr16.trna274-ThrTGT;;;D$chr17.trna124-LeuCAA;;;D$chr18.trna207-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna133-CysGCA;;;D$chr21.trna127-AlaCGC;;;D$chr22.trna120-LeuCAA;;;D$chr24.trna130-GlyGCC;;;D$chr25.trna186-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1201.trna1-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna110-PheAAA
F$chrF2;AlaAGC;;B$chr1;CysACA;;D$chr4.trna10022-TyrGTA;;;D$chr1.trna224-GluCTC;;;D$chr2.trna119-LysCTT;;;D$chr3.trna119-PheGAA;;;D$chr5.trna146-AspGTC;;;D$chr6.trna317-LeuAAG;;;D$chr7.trna275-LysCTT;;;D$chr8.trna123-ProAGG;;;D$chr9.trna149-LeuAAG;;;D$chr11.trna206-ValAAC;;;D$chr12.trna223-ThrAGT;;;D$chr13.trna264-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna118-GluCTC;;;D$chr16.trna275-ThrTGT;;;D$chr17.trna125-LeuCAA;;;D$chr18.trna208-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna135-CysGCA;;;D$chr21.trna128-AlaTGC;;;D$chr22.trna122-MetCAT;;;D$chr24.trna212-TrpCCA;;;D$chr25.trna187-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1201.trna2-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna111-GlnCTG
F$chrB2;AlaCGC;;B$chr1;CysACA;;D$chr4.trna10023-ArgACG;;;D$chr1.trna238-GluCTC;;;D$chr2.trna147-ProAGG;;;D$chr3.trna120-GlnCTG;;;D$chr5.trna148-AspGTC;;;D$chr6.trna318-LeuTAG;;;D$chr7.trna276-AsnGTT;;;D$chr8.trna126-ProTGG;;;D$chr9.trna150-LeuTAG;;;D$chr11.trna207-ValAAC;;;D$chr12.trna224-ArgTCT;;;D$chr13.trna265-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna119-GluCTC;;;D$chr16.trna276-ThrTGT;;;D$chr17.trna126-LeuCAA;;;D$chr18.trna211-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna137-CysGCA;;;D$chr21.trna129-AlaTGC;;;D$chr22.trna124-MetCAT;;;D$chr24.trna213-TrpCCA;;;D$chr25.trna188-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1201.trna3-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna112-IleAAT
F$chrB2;AlaCGC;;B$chr1;CysACA;;D$chr4.trna10024-GluTTC;;;D$chr1.trna239-MetCAT;;;D$chr2.trna148-ProCGG;;;D$chr3.trna121-IleAAT;;;D$chr5.trna150-AspGTC;;;D$chr6.trna319-LeuAAG;;;D$chr7.trna277-ArgCCT;;;D$chr8.trna127-ProAGG;;;D$chr9.trna160-MetCAT;;;D$chr11.trna226-CysGCA;;;D$chr12.trna225-ThrTGT;;;D$chr13.trna266-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna120-GluCTC;;;D$chr16.trna74-ThrTGT;;;D$chr17.trna127-LeuCAA;;;D$chr18.trna212-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna139-CysGCA;;;D$chr21.trna130-AlaTGC;;;D$chr22.trna125-MetCAT;;;D$chr24.trna214-TrpCCA;;;D$chr25.trna189-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1201.trna4-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna113-PheGAA
F$chrB2;AlaCGC;;B$chr1;CysACA;;D$chr4.trna10025-TyrGTA;;;D$chr1.trna240-LysTTT;;;D$chr2.trna149-ProAGG;;;D$chr3.trna122-PheGAA;;;D$chr5.trna152-AspGTC;;;D$chr6.trna320-LeuAAG;;;D$chr7.trna278-AsnGTT;;;D$chr8.trna128-GlnTTG;;;D$chr9.trna161-MetCAT;;;D$chr11.trna227-CysGCA;;;D$chr12.trna226-ThrAGT;;;D$chr13.trna267-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna121-GluCTC;;;D$chr16.trna75-ThrTGT;;;D$chr17.trna128-LeuCAA;;;D$chr18.trna213-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna141-CysGCA;;;D$chr21.trna131-AlaTGC;;;D$chr22.trna126-MetCAT;;;D$chr24.trna22-MetCAT;;;D$chr25.trna190-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1201.trna5-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna115-IleAAT
F$chrB2;AlaCGC;;B$chr1;CysACA;;D$chr4.trna10026-ArgACG;;;D$chr1.trna252-GluCTC;;;D$chr2.trna150-ProTGG;;;D$chr3.trna123-GlnCTG;;;D$chr5.trna153-AspGTC;;;D$chr6.trna321-LeuTAG;;;D$chr7.trna281-SerGCT;;;D$chr8.trna130-ProTGG;;;D$chr9.trna162-MetCAT;;;D$chr11.trna23-SerGCT;;;D$chr12.trna227-ArgTCT;;;D$chr13.trna268-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna122-GluCTC;;;D$chr16.trna76-ThrTGT;;;D$chr17.trna129-LeuCAA;;;D$chr18.trna214-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna143-CysGCA;;;D$chr21.trna132-AlaTGC;;;D$chr22.trna128-MetCAT;;;D$chr24.trna23-MetCAT;;;D$chr25.trna191-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1201.trna6-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna116-PheGAA
F$chrB2;AlaCGC;;B$chr1;CysACA;;D$chr4.trna10027-GluTTC;;;D$chr1.trna267-ArgTCT;;;D$chr2.trna151-ProTGG;;;D$chr3.trna124-IleAAT;;;D$chr5.trna155-AspGTC;;;D$chr6.trna323-LeuAAG;;;D$chr7.trna282-SerGCT;;;D$chr8.trna131-ProAGG;;;D$chr9.trna164-MetCAT;;;D$chr11.trna24-SerGCT;;;D$chr12.trna228-ThrTGT;;;D$chr13.trna269-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna123-GluCTC;;;D$chr16.trna85-GluTTC;;;D$chr17.trna130-LeuCAA;;;D$chr18.trna215-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna145-CysGCA;;;D$chr21.trna133-AlaTGC;;;D$chr22.trna130-MetCAT;;;D$chr24.trna24-MetCAT;;;D$chr25.trna192-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1201.trna7-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna118-IleAAT
F$chrB4;AlaCGC;;B$chr1;CysACA;;D$chr4.trna10028-TyrGTA;;;D$chr1.trna282-SeCTCA;;;D$chr2.trna152-ProCGG;;;D$chr3.trna125-PheGAA;;;D$chr5.trna157-AspGTC;;;D$chr6.trna324-LeuTAG;;;D$chr7.trna283-SerGCT;;;D$chr8.trna132-GlnTTG;;;D$chr9.trna165-MetCAT;;;D$chr11.trna247-CysGCA;;;D$chr12.trna23-LysCTT;;;D$chr13.trna270-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna124-GluCTC;;;D$chr16.trna86-TyrGTA;;;D$chr17.trna131-LeuCAA;;;D$chr18.trna216-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna147-CysGCA;;;D$chr21.trna134-AlaTGC;;;D$chr22.trna131-ArgCCT;;;D$chr24.trna260-TyrGTA;;;D$chr25.trna193-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1267.trna1-ProAGG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna12-SerAGA
F$chrC1;AlaCGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10029-ArgACG;;;D$chr1.trna284-ArgCCG;;;D$chr2.trna153-ProAGG;;;D$chr3.trna126-GlnCTG;;;D$chr5.trna159-AspGTC;;;D$chr6.trna325-LeuAAG;;;D$chr7.trna285-SerGCT;;;D$chr8.trna134-ProTGG;;;D$chr9.trna166-MetCAT;;;D$chr11.trna248-CysGCA;;;D$chr12.trna230-ThrAGT;;;D$chr13.trna271-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna125-GluCTC;;;D$chr16.trna87-ArgACG;;;D$chr17.trna132-LeuCAA;;;D$chr18.trna217-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna149-CysGCA;;;D$chr21.trna135-AlaCGC;;;D$chr22.trna132-MetCAT;;;D$chr24.trna286-ThrAGT;;;D$chr25.trna194-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1389.trna2-TrpCCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna121-IleAAT
F$chrC1;AlaGGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna1003-GlyGCC;;;D$chr1.trna285-SeCTCA;;;D$chr2.trna154-SerTGA;;;D$chr3.trna127-IleAAT;;;D$chr5.trna16-ProAGG;;;D$chr6.trna326-LeuTAG;;;D$chr7.trna286-SerGCT;;;D$chr8.trna135-ProAGG;;;D$chr9.trna167-MetCAT;;;D$chr11.trna249-CysGCA;;;D$chr12.trna231-ArgTCT;;;D$chr13.trna272-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna126-GluCTC;;;D$chr16.trna89-ArgACG;;;D$chr17.trna133-LeuCAA;;;D$chr18.trna218-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna15-SerTGA;;;D$chr21.trna136-AlaTGC;;;D$chr22.trna133-ArgCCT;;;D$chr24.trna300-LeuCAG;;;D$chr25.trna195-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1770.trna1-LysCTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna123-GlnCTG
F$chrA1;AlaTGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10030-GluTTC;;;D$chr1.trna287-GlnCTG;;;D$chr2.trna155-ProAGG;;;D$chr3.trna128-PheGAA;;;D$chr5.trna160-AspGTC;;;D$chr6.trna327-LeuAAG;;;D$chr7.trna288-SerGCT;;;D$chr8.trna136-GlnTTG;;;D$chr9.trna168-MetCAT;;;D$chr11.trna25-SerGCT;;;D$chr12.trna232-ThrAGT;;;D$chr13.trna273-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna127-GluCTC;;;;;;D$chr17.trna134-LeuCAA;;;D$chr18.trna221-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna151-CysGCA;;;D$chr21.trna137-AlaTGC;;;D$chr22.trna134-ArgCCT;;;D$chr24.trna31-GlyGCC;;;D$chr25.trna196-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1770.trna2-AsnGTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna124-IleAAT
F$chrA1;AlaTGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10031-TyrGTA;;;D$chr1.trna288-ArgTCG;;;D$chr2.trna156-LeuAAG;;;D$chr3.trna129-GlnCTG;;;D$chr5.trna162-AspGTC;;;D$chr6.trna328-LeuTAG;;;D$chr7.trna289-SerGCT;;;D$chr8.trna138-ProTGG;;;D$chr9.trna169-MetCAT;;;D$chr11.trna26-SerGCT;;;D$chr12.trna233-ArgTCT;;;D$chr13.trna274-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna128-GluCTC;;;;;;D$chr17.trna135-LeuCAA;;;D$chr18.trna222-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna153-CysGCA;;;D$chr21.trna138-AlaTGC;;;D$chr22.trna136-ArgCCT;;;D$chr24.trna34-GlyGCC;;;D$chr25.trna197-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1770.trna3-LysCTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna125-PheGAA
F$chrA1;AlaTGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10032-ArgACG;;;D$chr1.trna290-ArgCCG;;;D$chr2.trna157-LeuAAG;;;D$chr3.trna130-PheGAA;;;D$chr5.trna163-AspGTC;;;D$chr6.trna330-LeuAAG;;;D$chr7.trna29-LysCTT;;;D$chr8.trna139-ProAGG;;;D$chr9.trna170-MetCAT;;;D$chr11.trna52-ValCAC;;;D$chr12.trna234-ThrAGT;;;D$chr13.trna275-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna129-GluCTC;;;;;;D$chr17.trna136-LeuCAA;;;D$chr18.trna223-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna155-CysGCA;;;D$chr21.trna139-AlaCGC;;;D$chr22.trna137-MetCAT;;;D$chr24.trna35-GlyCCC;;;D$chr25.trna218-AspGTC;;;D$Zv8_NA1770.trna4-AsnGTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna126-ThrTGT
F$chrB2;AlaTGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10033-GluTTC;;;D$chr1.trna291-ArgTCG;;;D$chr2.trna158-LeuTAG;;;D$chr3.trna131-GlnCTG;;;D$chr5.trna165-AspGTC;;;D$chr6.trna331-LeuTAG;;;D$chr7.trna290-SerGCT;;;D$chr8.trna140-GlnTTG;;;D$chr9.trna171-IleTAT;;;D$chr11.trna54-ValCAC;;;D$chr12.trna235-ArgTCT;;;D$chr13.trna276-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna130-GluCTC;;;;;;D$chr17.trna137-LeuCAA;;;D$chr18.trna225-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna157-CysGCA;;;D$chr21.trna140-AlaTGC;;;D$chr22.trna138-MetCAT;;;D$chr24.trna37-GlyGCC;;;D$chr25.trna219-AspGTC;;;D$Zv8_NA1836.trna1-AsnGTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna127-ThrAGT
F$chrB2;AlaTGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10034-TyrGTA;;;D$chr1.trna293-ArgCCG;;;D$chr2.trna159-LeuAAG;;;D$chr3.trna132-PheGAA;;;D$chr5.trna167-AspGTC;;;D$chr6.trna332-LeuAAG;;;D$chr7.trna291-SerGCT;;;D$chr8.trna142-ProTGG;;;D$chr9.trna172-MetCAT;;;D$chr11.trna95-SerGCT;;;D$chr12.trna236-ThrTGT;;;D$chr13.trna277-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna197-IleAAT;;;;;;D$chr17.trna16-LysTTT;;;D$chr18.trna226-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna159-CysGCA;;;D$chr21.trna141-AlaTGC;;;D$chr22.trna139-MetCAT;;;D$chr24.trna38-GlyCCC;;;D$chr25.trna220-AspGTC;;;D$Zv8_NA1927.trna1-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna128-IleAAT
F$chrB2;AlaTGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10035-ArgACG;;;D$chr1.trna294-GlnTTG;;;D$chr2.trna160-LeuAAG;;;D$chr3.trna133-GlnCTG;;;D$chr5.trna169-AspGTC;;;D$chr6.trna333-LeuTAG;;;D$chr7.trna292-SerGCT;;;D$chr8.trna143-ProAGG;;;D$chr9.trna173-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna237-ArgTCT;;;D$chr13.trna278-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna198-IleAAT;;;;;;D$chr17.trna17-SerAGA;;;D$chr18.trna227-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna16-HisGTG;;;D$chr21.trna142-AlaCGC;;;D$chr22.trna141-MetCAT;;;D$chr24.trna40-GlyGCC;;;D$chr25.trna221-AspGTC;;;D$Zv8_NA1927.trna10-ValCAC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna129-ThrTGT
F$chrB2;AlaTGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10036-GluTTC;;;D$chr1.trna297-ArgCCG;;;D$chr2.trna161-LeuAAG;;;D$chr3.trna134-PheGAA;;;D$chr5.trna17-ProTGG;;;D$chr6.trna335-LeuAAG;;;D$chr7.trna293-LeuAAG;;;D$chr8.trna144-GlnTTG;;;D$chr9.trna174-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna238-ThrTGT;;;D$chr13.trna279-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna199-TrpCCA;;;;;;D$chr17.trna18-HisGTG;;;D$chr18.trna229-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna161-CysGCA;;;D$chr21.trna143-AlaTGC;;;D$chr22.trna142-MetCAT;;;D$chr24.trna43-GlyGCC;;;D$chr25.trna222-AspGTC;;;D$Zv8_NA1927.trna11-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna13-HisGTG
F$chrD3;AlaTGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10037-TyrGTA;;;D$chr1.trna298-ArgTCG;;;D$chr2.trna162-LeuAAG;;;D$chr3.trna135-GlnCTG;;;D$chr5.trna171-AspGTC;;;D$chr6.trna358-PheGAA;;;D$chr7.trna294-LeuTAG;;;D$chr8.trna145-ProTGG;;;D$chr9.trna175-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna24-ThrGGT;;;D$chr13.trna280-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna200-GlyTCC;;;;;;D$chr17.trna20-LeuCAG;;;D$chr18.trna230-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna163-CysGCA;;;D$chr21.trna144-AlaTGC;;;D$chr22.trna144-MetCAT;;;D$chr24.trna48-GlyGCC;;;D$chr25.trna223-GlyGCC;;;D$Zv8_NA1927.trna12-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna130-ThrAGT
F$chrD3;AlaTGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10038-ArgACG;;;D$chr1.trna300-GlnCTG;;;D$chr2.trna163-LeuAAG;;;D$chr3.trna136-PheGAA;;;D$chr5.trna173-AspGTC;;;D$chr6.trna359-ProCGG;;;D$chr7.trna295-LeuAAG;;;D$chr8.trna146-ProAGG;;;D$chr9.trna176-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna240-ThrAGT;;;D$chr13.trna281-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna217-GlyTCC;;;;;;D$chr17.trna21-SerTGA;;;D$chr18.trna231-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna165-CysGCA;;;D$chr21.trna145-AlaTGC;;;D$chr22.trna150-ArgCCT;;;D$chr24.trna49-GlyCCC;;;D$chr25.trna247-PheGAA;;;D$Zv8_NA1927.trna13-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna131-ArgTCT
F$chrD3;AlaTGC;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10039-GluTTC;;;D$chr1.trna301-ArgTCG;;;D$chr2.trna164-LeuTAG;;;D$chr3.trna137-GlnCTG;;;D$chr5.trna175-AspGTC;;;D$chr6.trna360-ProTGG;;;D$chr7.trna296-LeuTAG;;;D$chr8.trna147-GlnTTG;;;D$chr9.trna177-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna241-ArgTCT;;;D$chr13.trna282-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna245-ProAGG;;;;;;D$chr17.trna23-IleTAT;;;D$chr18.trna232-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna167-CysGCA;;;D$chr21.trna146-AlaCGC;;;D$chr22.trna151-MetCAT;;;D$chr24.trna52-GlyGCC;;;D$chr25.trna248-IleAAT;;;D$Zv8_NA1927.trna14-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna132-ThrTGT
F$chrA2;ArgACG;;B$chr1;CysGCA;;D$chr4.trna10040-TyrGTA;;;D$chr1.trna303-ArgCCG;;;D$chr2.trna165-LeuAAG;;;D$chr3.trna138-PheGAA;;;D$chr5.trna177-AspGTC;;;D$chr6.trna363-ProTGG;;;D$chr7.trna297-LeuAAG;;;D$chr8.trna149-ProTGG;;;D$chr9.trna178-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna242-ThrAGT;;;D$chr13.trna283-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna246-ProTGG;;;;;;D$chr17.trna24-SerCGA;;;D$chr18.trna233-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna169-CysGCA;;;D$chr21.trna147-AlaTGC;;;D$chr22.trna152-ArgCCT;;;D$chr24.trna53-GlyCCC;;;D$chr25.trna249-PheGAA;;;D$Zv8_NA1927.trna15-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna133-ThrAGT
F$chrB2;ArgACG;;B$chr1;GlnCTG;;D$chr4.trna10041-ArgACG;;;D$chr1.trna304-SeCTCA;;;D$chr2.trna166-LeuTAG;;;D$chr3.trna146-IleAAT;;;D$chr5.trna178-AspGTC;;;D$chr6.trna364-GlyTCC;;;D$chr7.trna298-LeuTAG;;;D$chr8.trna150-ProAGG;;;D$chr9.trna179-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna243-ArgTCT;;;D$chr13.trna284-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna28-LeuCAA;;;;;;D$chr17.trna240-SerAGA;;;D$chr18.trna234-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna17-SerCGA;;;D$chr21.trna148-AlaTGC;;;D$chr22.trna153-MetCAT;;;D$chr24.trna54-GlyCCC;;;D$chr25.trna250-IleAAT;;;D$Zv8_NA1927.trna18-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna134-ArgTCT
F$chrB2;ArgACG;;B$chr1;GlnCTG;;D$chr4.trna10042-GluTTC;;;D$chr1.trna306-ArgCCG;;;D$chr2.trna167-LeuAAG;;;D$chr3.trna147-PheGAA;;;D$chr5.trna180-AspGTC;;;D$chr6.trna366-LysCTT;;;D$chr7.trna299-LeuAAG;;;D$chr8.trna151-GlnTTG;;;D$chr9.trna180-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna244-ThrTGT;;;D$chr13.trna285-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna3-LysTTT;;;;;;D$chr17.trna26-LysTTT;;;D$chr18.trna236-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna171-CysGCA;;;D$chr21.trna149-AlaTGC;;;D$chr22.trna154-ArgCCT;;;D$chr24.trna55-GlyGCC;;;D$chr25.trna251-PheGAA;;;D$Zv8_NA1927.trna19-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna135-ThrTGT
F$chrB2;ArgACG;;B$chr1;GlnTTG;;D$chr4.trna10043-TyrGTA;;;D$chr1.trna307-ArgCCG;;;D$chr2.trna168-LeuTAG;;;D$chr3.trna148-GlnCTG;;;D$chr5.trna182-AspGTC;;;D$chr6.trna371-ThrTGT;;;D$chr7.trna3-ArgTCT;;;D$chr8.trna153-ProTGG;;;D$chr9.trna181-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna245-ArgTCT;;;D$chr13.trna286-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna302-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna27-SerCGA;;;D$chr18.trna238-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna173-CysGCA;;;D$chr21.trna150-AlaTGC;;;D$chr22.trna155-MetCAT;;;D$chr24.trna94-ArgTCT;;;D$chr25.trna252-IleAAT;;;D$Zv8_NA1927.trna2-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna136-ThrAGT
F$chrB2;ArgACG;;B$chr1;GluCTC;;D$chr4.trna10044-ArgACG;;;D$chr1.trna308-ArgTCG;;;D$chr2.trna169-LeuAAG;;;D$chr3.trna149-PheGAA;;;D$chr5.trna184-AspGTC;;;D$chr6.trna387-ArgCCG;;;D$chr7.trna30-AsnGTT;;;D$chr8.trna154-ProAGG;;;D$chr9.trna182-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna246-ThrAGT;;;D$chr13.trna287-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna303-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna278-ValAAC;;;D$chr18.trna239-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna175-CysGCA;;;D$chr21.trna151-AlaTGC;;;D$chr22.trna156-ArgCCT;;;D$chr24.trna97-AlaAGC;;;D$chr25.trna253-PheGAA;;;D$Zv8_NA1927.trna20-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna137-ArgTCT
F$chrB2;ArgACG;;B$chr1;GluCTC;;D$chr4.trna10045-GluTTC;;;D$chr1.trna310-ArgCCG;;;D$chr2.trna170-LeuTAG;;;D$chr3.trna150-GlnCTG;;;D$chr5.trna186-AspGTC;;;D$chr6.trna418-LysTTT;;;D$chr7.trna300-LeuTAG;;;D$chr8.trna155-GlnTTG;;;D$chr9.trna183-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna247-ArgTCT;;;D$chr13.trna288-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna304-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna279-ValTAC;;;D$chr18.trna240-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna177-CysGCA;;;D$chr21.trna152-AlaTGC;;;D$chr22.trna157-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna266-ArgTCG;;;D$Zv8_NA1927.trna3-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna138-ThrTGT
F$chrB3;ArgACG;;B$chr1;GluCTC;;D$chr4.trna10046-TyrGTA;;;D$chr1.trna333-IleAAT;;;D$chr2.trna172-LeuAAG;;;D$chr3.trna151-IleAAT;;;D$chr5.trna188-AspGTC;;;D$chr6.trna433-SerCGA;;;D$chr7.trna301-LeuAAG;;;D$chr8.trna156-ProTGG;;;D$chr9.trna184-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna248-ThrTGT;;;D$chr13.trna289-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna305-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna28-HisGTG;;;D$chr18.trna241-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna179-CysGCA;;;D$chr21.trna153-AlaTGC;;;D$chr22.trna160-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna39-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1927.trna4-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna139-ThrAGT
F$chrB4;ArgACG;;B$chr1;GluCTC;;D$chr4.trna10047-ArgACG;;;D$chr1.trna60-ProAGG;;;D$chr2.trna174-LeuAAG;;;D$chr3.trna152-PheGAA;;;D$chr5.trna19-Undet???;;;D$chr6.trna52-ArgCCT;;;D$chr7.trna302-LeuTAG;;;D$chr8.trna157-ProAGG;;;D$chr9.trna185-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna249-ArgTCT;;;D$chr13.trna290-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna306-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna280-ValAAC;;;D$chr18.trna242-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna18-HisGTG;;;D$chr21.trna154-AlaTGC;;;D$chr22.trna161-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna40-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1927.trna5-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna14-LysTTT
F$chrF2;ArgACG;;B$chr1;GluCTC;;D$chr4.trna10048-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna175-SerGCT;;;D$chr3.trna154-GlnCTG;;;D$chr5.trna190-AspGTC;;;D$chr6.trna53-ArgCCT;;;D$chr7.trna303-LeuAAG;;;D$chr8.trna158-GlnTTG;;;D$chr9.trna186-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna250-ThrAGT;;;D$chr13.trna291-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna307-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna281-ValCAC;;;D$chr18.trna244-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna181-CysGCA;;;D$chr21.trna155-AlaTGC;;;D$chr22.trna162-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna41-AlaAGC;;;D$Zv8_NA1927.trna6-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna140-ArgTCT
F$chrA3;ArgCCG;;B$chr1;GluCTC;;D$chr4.trna10049-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna176-SerGCT;;;D$chr3.trna155-IleAAT;;;D$chr5.trna192-AspGTC;;;D$chr6.trna6-AsnGTT;;;D$chr7.trna304-LeuTAG;;;D$chr8.trna160-ProTGG;;;D$chr9.trna187-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna251-ArgTCT;;;D$chr13.trna336-GlyGCC;;;;;;D$chr15.trna308-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna284-ValCAC;;;D$chr18.trna245-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna183-CysGCA;;;D$chr21.trna156-AlaTGC;;;D$chr22.trna163-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna48-ThrCGT;;;D$Zv8_NA1927.trna7-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna141-ThrTGT
F$chrB1;ArgCCG;;B$chr1;GluCTC;;D$chr4.trna1005-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna177-SerGCT;;;D$chr3.trna156-PheGAA;;;D$chr5.trna194-AspGTC;;;D$chr6.trna7-AsnATT;;;D$chr7.trna305-LeuAAG;;;D$chr8.trna161-ProAGG;;;D$chr9.trna188-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna252-ThrTGT;;;D$chr13.trna52-GlyGCC;;;;;;D$chr15.trna309-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna285-ValGAC;;;D$chr18.trna246-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna185-CysGCA;;;D$chr21.trna157-AlaTGC;;;D$chr22.trna164-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna57-GlyGCC;;;D$Zv8_NA1927.trna8-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna142-ThrAGT
F$chrB2;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10050-ArgACG;;;;;;D$chr2.trna179-SerGCT;;;D$chr3.trna158-GlnCTG;;;D$chr5.trna196-AspGTC;;;D$chr6.trna8-LysCTT;;;D$chr7.trna306-LeuTAG;;;D$chr8.trna162-GlnTTG;;;D$chr9.trna189-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna253-ArgTCT;;;D$chr13.trna53-GlyGCC;;;;;;D$chr15.trna310-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna286-ValCAC;;;D$chr18.trna248-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna187-CysGCA;;;D$chr21.trna158-AlaTGC;;;D$chr22.trna165-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna66-IleAAT;;;D$Zv8_NA1927.trna9-Undet???;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna143-ArgTCT
F$chrB2;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10051-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna182-LysCTT;;;D$chr3.trna159-IleAAT;;;D$chr5.trna198-AspGTC;;;D$chr6.trna9-AsnGTT;;;D$chr7.trna307-LeuAAG;;;D$chr8.trna163-ProAGG;;;D$chr9.trna190-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna254-ThrAGT;;;D$chr13.trna54-GlyGCC;;;;;;D$chr15.trna311-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna287-ValTAC;;;D$chr18.trna250-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna189-CysGCA;;;D$chr21.trna159-AlaCGC;;;D$chr22.trna166-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna67-PheGAA;;;D$Zv8_NA2021.trna1-AsnGTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna144-ThrTGT
F$chrB3;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10052-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna185-AsnGTT;;;D$chr3.trna160-PheGAA;;;D$chr5.trna20-ProCGG;;;;;;D$chr7.trna308-LeuTAG;;;D$chr8.trna164-GlnTTG;;;D$chr9.trna191-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna255-ArgTCT;;;D$chr13.trna77-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna312-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna289-MetCAT;;;D$chr18.trna251-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna19-SerCGA;;;D$chr21.trna160-AlaTGC;;;D$chr22.trna167-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna68-IleAAT;;;D$Zv8_NA2021.trna2-LysCTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna145-ThrAGT
F$chrC2;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10053-ArgACG;;;;;;D$chr2.trna189-GlnCTG;;;D$chr3.trna162-GlnCTG;;;D$chr5.trna202-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna309-LeuAAG;;;D$chr8.trna166-ProTGG;;;D$chr9.trna192-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna256-ThrTGT;;;D$chr13.trna78-ProAGG;;;;;;D$chr15.trna313-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna29-ThrCGT;;;D$chr18.trna252-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna191-CysGCA;;;D$chr21.trna161-AlaTGC;;;D$chr22.trna168-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna69-PheGAA;;;D$Zv8_NA2021.trna4-AsnGTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna146-ArgTCT
F$chrC2;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10054-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna190-IleAAT;;;D$chr3.trna163-IleAAT;;;D$chr5.trna204-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna31-AsnGTT;;;D$chr8.trna167-ProAGG;;;D$chr9.trna193-IleTAT;;;;;;D$chr12.trna257-ArgTCT;;;D$chr13.trna79-GlnTTG;;;;;;D$chr15.trna314-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna290-ValTAC;;;D$chr18.trna254-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna193-CysGCA;;;D$chr21.trna162-AlaTGC;;;D$chr22.trna169-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna70-IleAAT;;;D$Zv8_NA232.trna2-ArgTCG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna149-LysTTT
F$chrD2;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10055-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna191-PheGAA;;;D$chr3.trna164-PheGAA;;;D$chr5.trna205-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna310-LeuTAG;;;D$chr8.trna168-GlnTTG;;;D$chr9.trna194-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna258-ThrAGT;;;D$chr13.trna80-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna315-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna293-ValTAC;;;D$chr18.trna256-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna195-CysGCA;;;D$chr21.trna163-AlaTGC;;;D$chr22.trna170-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna71-PheGAA;;;D$Zv8_NA232.trna4-GlnCTG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna15-SerTGA
F$chrD2;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10056-ArgACG;;;;;;D$chr2.trna192-GlnCTG;;;D$chr3.trna166-GlnCTG;;;D$chr5.trna207-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna311-LeuAAG;;;D$chr8.trna170-ProTGG;;;D$chr9.trna195-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna259-ArgTCT;;;D$chr13.trna81-ProTGG;;;;;;D$chr15.trna316-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna295-ValCAC;;;D$chr18.trna257-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna197-CysGCA;;;D$chr21.trna164-AlaTGC;;;D$chr22.trna171-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna72-IleAAT;;;D$Zv8_NA232.trna5-ArgCCG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna150-SerAGA
F$chrD3;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10057-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna193-IleAAT;;;D$chr3.trna167-IleAAT;;;D$chr5.trna209-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna312-LeuTAG;;;D$chr8.trna171-ProAGG;;;D$chr9.trna196-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna26-AsnGTT;;;;;;;;;D$chr15.trna317-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna296-ValTAC;;;D$chr18.trna258-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna199-CysGCA;;;D$chr21.trna165-AlaCGC;;;D$chr22.trna172-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna73-PheGAA;;;D$Zv8_NA2419.trna1-LysTTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna151-HisGTG
F$chrD4;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10058-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna194-PheGAA;;;D$chr3.trna168-PheGAA;;;D$chr5.trna21-ProCGG;;;;;;D$chr7.trna313-LeuAAG;;;D$chr8.trna172-GlnTTG;;;D$chr9.trna197-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna260-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna318-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna299-ValGAC;;;D$chr18.trna260-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna20-LysTTT;;;D$chr21.trna166-AlaTGC;;;D$chr22.trna173-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna74-PheGAA;;;D$Zv8_NA2419.trna2-SerAGA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna152-LysTTT
F$chrD4;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10059-ArgACG;;;;;;D$chr2.trna195-GlnCTG;;;D$chr3.trna170-GlnCTG;;;D$chr5.trna211-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna314-LeuTAG;;;D$chr8.trna174-ProTGG;;;D$chr9.trna198-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna262-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna319-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna300-ValCAC;;;D$chr18.trna261-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna201-CysGCA;;;D$chr21.trna167-AlaTGC;;;D$chr22.trna174-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna75-IleAAT;;;D$Zv8_NA2419.trna3-SerCGA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna153-SerAGA
F$chrE1;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna1006-GlyCCC;;;;;;D$chr2.trna196-IleAAT;;;D$chr3.trna171-IleAAT;;;D$chr5.trna213-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna315-LeuAAG;;;D$chr8.trna175-ProAGG;;;D$chr9.trna199-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna263-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna32-AsnGTT;;;;;;D$chr17.trna301-ValTAC;;;D$chr18.trna262-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna203-CysGCA;;;D$chr21.trna168-AlaTGC;;;D$chr22.trna175-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna76-PheGAA;;;D$Zv8_NA2419.trna4-TyrGTA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna154-HisGTG
F$chrE1;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10060-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna198-GlnCTG;;;D$chr3.trna172-PheGAA;;;D$chr5.trna215-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna316-LeuTAG;;;D$chr8.trna176-GlnTTG;;;D$chr9.trna200-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna264-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna320-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna303-ValCAC;;;D$chr18.trna263-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna205-CysGCA;;;D$chr21.trna169-AlaCGC;;;D$chr22.trna176-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna77-IleAAT;;;D$Zv8_NA2548.trna2-LeuAAG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna155-LysTTT
F$chrE1;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10061-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna199-IleAAT;;;D$chr3.trna174-GlnCTG;;;D$chr5.trna217-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna317-LeuAAG;;;D$chr8.trna178-ProTGG;;;D$chr9.trna201-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna266-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna321-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna304-ValTAC;;;D$chr18.trna264-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna207-CysGCA;;;D$chr21.trna170-AlaTGC;;;D$chr22.trna177-IleTAT;;;;;;D$chr25.trna78-IleAAT;;;D$Zv8_NA2662.trna1-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna156-LeuCAG
F$chrE2;ArgCCG;;B$chr1;GluTTC;;D$chr4.trna10062-ArgACG;;;;;;D$chr2.trna202-IleAAT;;;D$chr3.trna175-IleAAT;;;D$chr5.trna219-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna318-LeuTAG;;;D$chr8.trna179-ProAGG;;;D$chr9.trna202-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna267-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna322-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna307-ValGAC;;;D$chr18.trna266-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna209-CysGCA;;;D$chr21.trna171-AlaTGC;;;D$chr22.trna178-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna79-PheGAA;;;D$Zv8_NA2662.trna10-GluTTC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna157-LeuCAG
F$chrE3;ArgCCG;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10063-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna205-IleAAT;;;D$chr3.trna176-PheGAA;;;D$chr5.trna22-ProAGG;;;;;;D$chr7.trna319-LeuAAG;;;D$chr8.trna180-GlnTTG;;;D$chr9.trna203-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna268-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna323-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna308-ValCAC;;;D$chr18.trna267-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna211-CysGCA;;;D$chr21.trna172-AlaTGC;;;D$chr22.trna179-IleTAT;;;;;;D$chr25.trna80-IleAAT;;;D$Zv8_NA2662.trna11-TyrGTA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna158-LeuCAG
F$chrE3;ArgCCG;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10064-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna207-GlnCTG;;;D$chr3.trna178-GlnCTG;;;D$chr5.trna220-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna320-LeuTAG;;;D$chr8.trna182-ProTGG;;;D$chr9.trna204-IleTAT;;;;;;D$chr12.trna269-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna324-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna309-ValTAC;;;D$chr18.trna268-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna213-CysGCA;;;D$chr21.trna173-AlaTGC;;;D$chr22.trna180-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna81-PheGAA;;;D$Zv8_NA2662.trna12-ArgACG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna159-LeuCAG
F$chrE3;ArgCCG;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10065-ArgACG;;;;;;D$chr2.trna208-IleAAT;;;D$chr3.trna179-IleAAT;;;D$chr5.trna222-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna321-LeuAAG;;;D$chr8.trna183-ProAGG;;;D$chr9.trna205-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna27-LysCTT;;;;;;;;;D$chr15.trna325-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna310-ValAAC;;;D$chr18.trna269-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna215-CysGCA;;;D$chr21.trna174-AlaTGC;;;D$chr22.trna181-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna82-IleAAT;;;D$Zv8_NA2662.trna2-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna16-ValAAC
F$chrF1;ArgCCG;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10066-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna209-PheGAA;;;D$chr3.trna180-PheGAA;;;D$chr5.trna224-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna322-LeuTAG;;;D$chr8.trna184-GlnTTG;;;D$chr9.trna206-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna270-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna326-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna311-ValCAC;;;D$chr18.trna270-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna217-CysGCA;;;D$chr21.trna175-AlaCGC;;;D$chr22.trna182-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna83-PheGAA;;;D$Zv8_NA2662.trna3-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna160-LeuCAG
F$chrF1;ArgCCG;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10067-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna210-GlnCTG;;;D$chr3.trna182-GlnCTG;;;D$chr5.trna226-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna323-LeuAAG;;;D$chr8.trna186-ProTGG;;;D$chr9.trna207-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna271-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna327-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna312-MetCAT;;;D$chr18.trna273-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna219-CysGCA;;;D$chr21.trna176-AlaTGC;;;D$chr22.trna183-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna84-IleAAT;;;D$Zv8_NA2662.trna4-MetCAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna161-LeuCAG
F$chrX;ArgCCG;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10068-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna211-IleAAT;;;D$chr3.trna183-IleAAT;;;D$chr5.trna228-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna324-LeuTAG;;;D$chr8.trna187-ProAGG;;;D$chr9.trna208-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna272-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna328-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna313-AspATC;;;D$chr18.trna274-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna221-CysGCA;;;D$chr21.trna177-AlaTGC;;;D$chr22.trna184-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna85-PheGAA;;;D$Zv8_NA2662.trna5-GluCTC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna162-LeuCAG
F$chrX;ArgCCG;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10069-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna212-PheGAA;;;D$chr3.trna184-PheGAA;;;D$chr5.trna23-ProAGG;;;;;;D$chr7.trna325-LeuAAG;;;D$chr8.trna188-GlnTTG;;;D$chr9.trna209-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna274-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna329-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna314-MetCAT;;;D$chr18.trna275-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna223-CysGCA;;;D$chr21.trna178-AlaTGC;;;D$chr22.trna185-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna86-IleAAT;;;D$Zv8_NA2662.trna6-GluCTC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna164-LeuCAG
F$chrX;ArgCCG;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna1007-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna213-GlnCTG;;;D$chr3.trna186-GlnCTG;;;D$chr5.trna230-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna326-LeuTAG;;;D$chr8.trna190-ProTGG;;;D$chr9.trna210-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna275-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna330-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna317-ValTAC;;;D$chr18.trna279-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna225-CysGCA;;;D$chr21.trna179-AlaTGC;;;D$chr22.trna186-ArgCCT;;;;;;D$chr25.trna87-PheGAA;;;D$Zv8_NA2662.trna7-GluTTC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna165-LeuCAG
F$chrA1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10070-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna214-IleAAT;;;D$chr3.trna187-IleAAT;;;D$chr5.trna232-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna327-LeuAAG;;;D$chr8.trna191-ProAGG;;;D$chr9.trna211-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna276-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna331-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna318-ValAAC;;;D$chr18.trna281-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna227-CysGCA;;;D$chr21.trna180-AlaTGC;;;D$chr22.trna187-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna88-IleAAT;;;D$Zv8_NA2662.trna8-TyrGTA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna166-LeuCAG
F$chrA1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10071-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna215-PheGAA;;;D$chr3.trna188-PheGAA;;;D$chr5.trna234-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna329-LeuAAG;;;D$chr8.trna192-GlnTTG;;;D$chr9.trna212-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna277-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna332-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna321-ValCAC;;;D$chr18.trna282-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna229-CysGCA;;;D$chr21.trna181-AlaCGC;;;D$chr22.trna190-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna89-PheGAA;;;D$Zv8_NA2662.trna9-ArgACG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna167-LeuCAG
F$chrA2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10072-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna216-GlnCTG;;;D$chr3.trna190-GlnCTG;;;D$chr5.trna236-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna330-LeuTAG;;;D$chr8.trna195-ProAGG;;;D$chr9.trna213-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna278-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna333-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna325-ValTAC;;;D$chr18.trna283-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna231-CysGCA;;;D$chr21.trna182-AlaTGC;;;D$chr22.trna191-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna90-IleAAT;;;D$Zv8_NA2737.trna1-HisGTG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna168-GlnCTG
F$chrA2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10073-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna218-PheGAA;;;D$chr3.trna191-IleAAT;;;D$chr5.trna238-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna331-LeuAAG;;;D$chr8.trna196-GlnTTG;;;D$chr9.trna214-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna279-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna334-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna327-ValCAC;;;D$chr18.trna284-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna232-CysGCA;;;D$chr21.trna183-AlaCGC;;;D$chr22.trna194-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna91-PheGAA;;;D$Zv8_NA2737.trna2-LysTTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna169-IleAAT
F$chrA2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10074-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna219-ThrAGT;;;D$chr3.trna192-PheGAA;;;D$chr5.trna24-ProCGG;;;;;;D$chr7.trna332-LeuTAG;;;D$chr8.trna198-ProTGG;;;D$chr9.trna215-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna28-AsnGTT;;;;;;;;;D$chr15.trna335-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna33-ProAGG;;;D$chr18.trna285-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna233-CysGCA;;;D$chr21.trna184-AlaTGC;;;D$chr22.trna195-LysCTT;;;;;;D$chr25.trna92-IleAAT;;;D$Zv8_NA2737.trna3-SerTGA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna17-ValCAC
F$chrA2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10077-LysTTT;;;;;;D$chr2.trna220-ArgTCT;;;D$chr3.trna194-GlnCTG;;;D$chr5.trna240-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna333-LeuAAG;;;D$chr8.trna199-ProAGG;;;D$chr9.trna216-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna280-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna336-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna34-LysTTT;;;D$chr18.trna286-GlyCCC;;;;;;D$chr20.trna234-PheGAA;;;D$chr21.trna185-AlaTGC;;;D$chr22.trna197-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna93-PheGAA;;;D$Zv8_NA2779.trna1-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna170-AsnGTT
F$chrA2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10078-SerAGA;;;;;;D$chr2.trna221-ThrTGT;;;D$chr3.trna195-IleAAT;;;D$chr5.trna242-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna335-SerGCT;;;D$chr8.trna200-GlnTTG;;;D$chr9.trna218-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna281-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna338-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna35-SerCGA;;;D$chr18.trna287-GlyGCC;;;;;;D$chr20.trna237-CysGCA;;;D$chr21.trna186-AlaTGC;;;D$chr22.trna198-MetCAT;;;;;;D$chr25.trna94-IleAAT;;;D$Zv8_NA2779.trna2-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna171-LysCTT
F$chrA3;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10079-HisGTG;;;;;;D$chr2.trna222-ThrAGT;;;D$chr3.trna196-PheGAA;;;D$chr5.trna244-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna44-ArgACG;;;D$chr8.trna202-ProTGG;;;D$chr9.trna219-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna282-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna34-LysCTT;;;;;;D$chr17.trna356-SerGCT;;;D$chr18.trna289-ThrTGT;;;;;;D$chr20.trna240-CysGCA;;;D$chr21.trna187-AlaCGC;;;D$chr22.trna214-LeuAAG;;;;;;D$chr25.trna95-PheGAA;;;D$Zv8_NA2809.trna1-GlyGCC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna172-IleGAT
F$chrB1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna1008-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna223-LysTTT;;;D$chr3.trna198-GlnCTG;;;D$chr5.trna246-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna445-LysTTT;;;D$chr8.trna203-ProAGG;;;D$chr9.trna257-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna284-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna340-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna361-SerGCT;;;D$chr18.trna290-LysTTT;;;;;;D$chr20.trna244-LeuCAA;;;D$chr21.trna188-AlaTGC;;;D$chr22.trna215-LeuTAG;;;;;;D$chr25.trna96-IleAAT;;;D$Zv8_NA2809.trna10-GlyCCC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna173-LysCTT
F$chrB1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10081-SerTGA;;;;;;D$chr2.trna224-ThrTGT;;;D$chr3.trna199-IleAAT;;;D$chr5.trna248-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna446-SerCGA;;;D$chr8.trna204-GlnTTG;;;D$chr9.trna258-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna285-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna342-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna366-SerGCT;;;D$chr18.trna291-LeuTAA;;;;;;D$chr20.trna246-PheAAA;;;D$chr21.trna189-AlaTGC;;;D$chr22.trna216-LeuAAG;;;;;;D$chr25.trna97-PheGAA;;;D$Zv8_NA2809.trna2-GlyGCC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna174-LysCTT
F$chrB2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10082-HisGTG;;;;;;D$chr2.trna225-ThrAGT;;;D$chr3.trna200-PheGAA;;;D$chr5.trna25-ProAGG;;;;;;D$chr7.trna448-AsnGTT;;;D$chr8.trna206-ProTGG;;;D$chr9.trna259-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna286-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna344-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna371-SerGCT;;;D$chr18.trna292-PheGAA;;;;;;D$chr20.trna247-LeuCAA;;;D$chr21.trna190-AlaTGC;;;D$chr22.trna217-LeuTAG;;;;;;D$chr25.trna98-IleAAT;;;D$Zv8_NA2809.trna3-GlyGCC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna175-AsnGTT
F$chrB2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10085-ValAAC;;;;;;D$chr2.trna226-ArgTCT;;;D$chr3.trna202-GlnCTG;;;D$chr5.trna250-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna449-LysCTT;;;D$chr8.trna207-ProAGG;;;D$chr9.trna260-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna287-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna345-HisATG;;;;;;D$chr17.trna376-SerGCT;;;D$chr18.trna293-SupCTA;;;;;;D$chr20.trna249-LeuCAA;;;D$chr21.trna191-AlaCGC;;;D$chr22.trna218-GluCTC;;;;;;D$chr25.trna99-PheGAA;;;D$Zv8_NA2809.trna4-ArgCCT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna176-LysCTT
F$chrB3;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10086-ValCAC;;;;;;D$chr2.trna232-ArgGCG;;;D$chr3.trna203-IleAAT;;;D$chr5.trna252-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna45-ArgACG;;;D$chr8.trna208-GlnTTG;;;D$chr9.trna261-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna288-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna346-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna381-SerGCT;;;D$chr18.trna294-IleAAT;;;;;;D$chr20.trna250-LeuCAA;;;D$chr21.trna192-AlaCGC;;;D$chr22.trna221-ValAAC;;;;;;;;;D$Zv8_NA2809.trna7-GlyCCC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna177-LysCTT
F$chrB3;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10088-SerGCT;;;;;;D$chr2.trna233-GlyGCC;;;D$chr3.trna204-PheGAA;;;D$chr5.trna254-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna450-AsnGTT;;;D$chr8.trna210-ProTGG;;;D$chr9.trna262-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna289-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna347-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna386-SerGCT;;;D$chr18.trna295-GlnCTG;;;;;;D$chr20.trna251-LeuCAA;;;D$chr21.trna193-AlaTGC;;;D$chr22.trna228-ArgTCT;;;;;;;;;D$Zv8_NA2809.trna9-GlyGCC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna178-AsnGTT
F$chrB3;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna1009-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna236-GlyGCC;;;D$chr3.trna206-GlnCTG;;;D$chr5.trna256-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna453-LeuAAG;;;D$chr8.trna211-ProAGG;;;D$chr9.trna263-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna29-LysCTT;;;;;;;;;D$chr15.trna348-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna39-LeuTAA;;;D$chr18.trna298-LeuCAG;;;;;;D$chr20.trna253-LeuCAA;;;D$chr21.trna194-AlaTGC;;;D$chr22.trna229-ThrTGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3022.trna3-LeuTAA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna179-LysCTT
F$chrB3;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10091-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna237-GlyGCC;;;D$chr3.trna207-IleAAT;;;D$chr5.trna258-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna454-LeuTAG;;;D$chr8.trna212-GlnTTG;;;D$chr9.trna264-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna290-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna349-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna391-SerGCT;;;D$chr18.trna322-AlaTGC;;;;;;D$chr20.trna255-LeuCAA;;;D$chr21.trna195-AlaCGC;;;D$chr22.trna230-ThrAGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3122.trna1-LeuTAA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna18-ValTAC
F$chrB4;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10092-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna242-ArgGCG;;;D$chr3.trna208-PheGAA;;;D$chr5.trna260-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna455-LeuAAG;;;D$chr8.trna213-ProAGG;;;D$chr9.trna265-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna291-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna35-LysCTT;;;;;;D$chr17.trna396-SerGCT;;;D$chr18.trna387-GlnCTG;;;;;;D$chr20.trna256-LeuCAA;;;D$chr21.trna196-AlaTGC;;;D$chr22.trna231-ArgTCT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna1-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna182-LysCTT
F$chrB4;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10093-LeuCAG;;;;;;D$chr2.trna244-GlyGCC;;;D$chr3.trna210-GlnCTG;;;D$chr5.trna264-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna456-LeuTAG;;;D$chr8.trna216-ProTGG;;;D$chr9.trna267-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna292-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna350-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna40-LeuTAA;;;D$chr18.trna85-LeuCAG;;;;;;D$chr20.trna257-LeuCAA;;;D$chr21.trna197-AlaTGC;;;D$chr22.trna232-ThrTGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna10-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna184-ArgCCT
F$chrB4;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10094-ThrAGT;;;;;;D$chr2.trna246-GlyGCC;;;D$chr3.trna211-IleAAT;;;D$chr5.trna266-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna457-LeuAAG;;;D$chr8.trna217-ProAGG;;;D$chr9.trna268-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna294-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna351-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna401-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna258-LeuCAA;;;D$chr21.trna198-AlaTGC;;;D$chr22.trna233-ThrAGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna11-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna185-LysCTT
F$chrB4;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10095-ThrAGT;;;;;;D$chr2.trna247-GlyGCC;;;D$chr3.trna212-PheGAA;;;D$chr5.trna268-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna458-LeuTAG;;;D$chr8.trna218-GlnTTG;;;D$chr9.trna269-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna295-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna352-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna406-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna260-LeuCAA;;;D$chr21.trna199-AlaCGC;;;D$chr22.trna234-ArgTCT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna12-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna186-AsnGTT
F$chrC1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10096-ArgACG;;;;;;D$chr2.trna251-GlyGCC;;;D$chr3.trna214-GlnCTG;;;D$chr5.trna270-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna46-ArgTCG;;;D$chr8.trna220-ProTGG;;;D$chr9.trna270-ArgCCT;;;;;;D$chr12.trna296-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna353-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna41-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna261-LeuCAA;;;D$chr21.trna200-AlaTGC;;;D$chr22.trna235-ThrTGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna13-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna187-LysCTT
F$chrC1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10097-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna253-GlyGCC;;;D$chr3.trna215-IleAAT;;;D$chr5.trna272-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna47-ArgTCG;;;D$chr8.trna221-ProAGG;;;D$chr9.trna295-LysTTT;;;;;;D$chr12.trna298-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna354-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna410-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna262-LeuCAA;;;D$chr21.trna201-AlaTGC;;;D$chr22.trna236-ThrAGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna14-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna19-ValAAC
F$chrC1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10098-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna254-GlyGCC;;;D$chr3.trna216-PheGAA;;;D$chr5.trna274-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna48-ArgTCG;;;D$chr8.trna222-GlnTTG;;;D$chr9.trna296-SerTGA;;;;;;D$chr12.trna299-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna356-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna415-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna263-IleTAT;;;D$chr21.trna202-AlaTGC;;;D$chr22.trna237-ArgTCT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna16-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna20-AlaCGC
F$chrC1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10099-SerACT;;;;;;D$chr2.trna255-GlyGCC;;;D$chr3.trna218-GlnCTG;;;D$chr5.trna276-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna51-ArgTCG;;;D$chr8.trna224-ProTGG;;;D$chr9.trna297-HisGTG;;;;;;D$chr12.trna30-AsnGTT;;;;;;;;;D$chr15.trna357-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna419-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna264-LeuCAA;;;D$chr21.trna203-AlaTGC;;;D$chr22.trna238-ThrTGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna17-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna22-ValAAC
F$chrC1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna1010-GlyCCC;;;;;;D$chr2.trna257-GlyGCC;;;D$chr3.trna219-IleAAT;;;D$chr5.trna278-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna52-ArgTCG;;;D$chr8.trna225-ProAGG;;;D$chr9.trna298-LysTTT;;;;;;D$chr12.trna300-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna358-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna42-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna266-LeuCAA;;;D$chr21.trna204-AlaTGC;;;D$chr22.trna239-ThrAGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna18-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna23-ValCAC
F$chrC1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10100-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna258-GlyGCC;;;D$chr3.trna220-PheGAA;;;D$chr5.trna281-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna523-TrpCCA;;;D$chr8.trna226-GlnTTG;;;D$chr9.trna299-SerTGA;;;;;;D$chr12.trna301-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna359-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna424-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna267-LeuCAA;;;D$chr21.trna205-AlaCGC;;;D$chr22.trna240-ArgTCT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna19-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna24-ValTAC
F$chrC2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10101-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna261-GlyGCC;;;D$chr3.trna222-GlnCTG;;;D$chr5.trna282-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna524-TrpCCA;;;D$chr8.trna228-ProTGG;;;D$chr9.trna30-ProTGG;;;;;;D$chr12.trna302-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna36-AsnGTT;;;;;;D$chr17.trna429-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna268-LeuCAA;;;D$chr21.trna206-AlaTGC;;;D$chr22.trna241-ThrTGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna2-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna25-ValAAC
F$chrC2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10102-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna262-GlyGCC;;;D$chr3.trna223-IleAAT;;;D$chr5.trna284-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna526-TrpCCA;;;D$chr8.trna229-ProAGG;;;D$chr9.trna300-HisGTG;;;;;;D$chr12.trna303-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna360-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna43-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna269-LeuCAA;;;D$chr21.trna207-AlaTGC;;;D$chr22.trna242-ThrAGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna20-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna26-AlaCGC
F$chrC2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10103-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna265-ArgTCT;;;D$chr3.trna224-PheGAA;;;D$chr5.trna286-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna527-TrpCCA;;;D$chr8.trna230-GlnTTG;;;D$chr9.trna301-LysTTT;;;;;;D$chr12.trna304-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna361-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna434-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna270-LeuCAA;;;D$chr21.trna208-AlaTGC;;;D$chr22.trna243-ArgTCT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna21-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna28-ValAAC
F$chrC2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10104-SerACT;;;;;;D$chr2.trna283-MetCAT;;;D$chr3.trna226-GlnCTG;;;D$chr5.trna288-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna528-TrpCCA;;;D$chr8.trna231-ProAGG;;;D$chr9.trna302-SerTGA;;;;;;D$chr12.trna305-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna362-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna439-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna271-LeuCAA;;;D$chr21.trna209-AlaTGC;;;D$chr22.trna244-ThrTGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna22-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna29-ValCAC
F$chrC2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10106-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna291-TrpCCA;;;D$chr3.trna227-IleAAT;;;D$chr5.trna290-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna529-TrpCCA;;;D$chr8.trna232-GlnTTG;;;D$chr9.trna303-HisGTG;;;;;;D$chr12.trna306-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna364-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna445-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna272-LeuCAA;;;D$chr21.trna210-AlaCGC;;;D$chr22.trna245-ThrAGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna23-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna30-MetCAT
F$chrD1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10107-GlyCCC;;;;;;D$chr2.trna307-LeuTAA;;;D$chr3.trna228-PheGAA;;;D$chr5.trna292-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna53-ArgTCG;;;D$chr8.trna234-ProTGG;;;D$chr9.trna304-LysTTT;;;;;;D$chr12.trna308-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna365-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna45-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna275-LeuCAA;;;D$chr21.trna211-AlaTGC;;;D$chr22.trna246-ArgTCT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna24-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna31-MetCAT
F$chrD1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10108-GlyCCC;;;;;;D$chr2.trna308-LeuTAA;;;D$chr3.trna230-GlnCTG;;;D$chr5.trna293-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna530-TrpCCA;;;D$chr8.trna235-ProAGG;;;D$chr9.trna305-SerTGA;;;;;;D$chr12.trna309-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna375-SeC(e)TCA;;;;;;D$chr17.trna450-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna276-LeuCAA;;;D$chr21.trna212-AlaTGC;;;D$chr22.trna247-ThrTGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna25-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna32-MetCAT
F$chrD2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10109-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna309-LeuTAA;;;D$chr3.trna231-IleAAT;;;D$chr5.trna294-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna531-TrpCCA;;;D$chr8.trna236-GlnTTG;;;D$chr9.trna306-LysTTT;;;;;;D$chr12.trna31-AsnGTT;;;;;;;;;D$chr15.trna378-GluTTC;;;;;;D$chr17.trna455-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna278-LeuCAA;;;D$chr21.trna213-AlaCGC;;;D$chr22.trna248-ThrAGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna26-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna33-MetCAT
F$chrD4;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna1011-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna310-LeuTAA;;;D$chr3.trna232-PheGAA;;;D$chr5.trna296-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna532-TrpCCA;;;D$chr8.trna238-ProTGG;;;D$chr9.trna307-SerAGA;;;;;;D$chr12.trna310-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna379-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna459-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna279-IleTAT;;;D$chr21.trna214-AlaTGC;;;D$chr22.trna249-ArgTCT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna27-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna34-MetCAT
F$chrE1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10110-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna312-LeuTAA;;;D$chr3.trna234-GlnCTG;;;D$chr5.trna297-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna533-TrpCCA;;;D$chr8.trna239-ProAGG;;;D$chr9.trna308-HisGTG;;;;;;D$chr12.trna312-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna38-LysCTT;;;;;;D$chr17.trna46-SupTTA;;;;;;;;;D$chr20.trna280-LeuCAA;;;D$chr21.trna215-AlaTGC;;;D$chr22.trna250-ThrTGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna3-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna35-MetCAT
F$chrE1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10117-GlyCCC;;;;;;D$chr2.trna313-LeuTAA;;;D$chr3.trna235-IleAAT;;;D$chr5.trna299-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna534-TrpCCA;;;D$chr8.trna240-GlnTTG;;;D$chr9.trna309-LysTTT;;;;;;D$chr12.trna313-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna380-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna464-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna281-LeuCAA;;;D$chr21.trna216-AlaTGC;;;D$chr22.trna251-ThrAGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna30-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna36-MetCAT
F$chrE1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10118-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna315-ThrAGT;;;D$chr3.trna236-PheGAA;;;D$chr5.trna301-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna535-TrpCCA;;;D$chr8.trna242-ProTGG;;;D$chr9.trna310-SerTGA;;;;;;D$chr12.trna314-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna381-GluTTC;;;;;;D$chr17.trna471-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna282-LeuCAA;;;D$chr21.trna217-AlaCGC;;;D$chr22.trna252-ArgTCT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna31-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna37-MetCAT
F$chrE1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna1012-GlyCCC;;;;;;D$chr2.trna316-ArgTCT;;;D$chr3.trna238-GlnCTG;;;D$chr5.trna303-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna536-TrpCCA;;;D$chr8.trna243-ProAGG;;;D$chr9.trna311-LysTTT;;;;;;D$chr12.trna315-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna382-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna5-GlyTCC;;;;;;;;;D$chr20.trna283-LeuCAA;;;D$chr21.trna218-AlaTGC;;;D$chr22.trna254-ValAAC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna32-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna38-MetCAT
F$chrE1;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10120-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna317-ThrAGT;;;D$chr3.trna239-IleAAT;;;D$chr5.trna304-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna537-TrpCCA;;;D$chr8.trna244-GlnTTG;;;D$chr9.trna312-SerAGA;;;;;;D$chr12.trna316-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna383-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna506-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna284-LeuCAA;;;D$chr21.trna219-AlaTGC;;;D$chr22.trna255-ValCAC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna4-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna39-ThrTGT
F$chrE2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10124-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna318-ThrAGT;;;D$chr3.trna240-PheGAA;;;D$chr5.trna306-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna538-TrpCCA;;;D$chr8.trna246-ProTGG;;;D$chr9.trna313-HisGTG;;;;;;D$chr12.trna318-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna384-GluTTC;;;;;;D$chr17.trna509-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna285-LeuCAA;;;D$chr21.trna220-AlaTGC;;;D$chr22.trna257-ValCAC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna5-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna4-HisGTG
F$chrE2;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10125-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna319-ThrAGT;;;D$chr3.trna242-GlnCTG;;;D$chr5.trna308-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna54-ArgTCG;;;D$chr8.trna247-ProAGG;;;D$chr9.trna314-LysTTT;;;;;;D$chr12.trna319-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna385-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna510-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna288-LeuCAA;;;D$chr21.trna221-AlaTGC;;;D$chr22.trna258-ValTAC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna6-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna40-ThrTGT
F$chrE3;ArgCCT;;B$chr1;GlyCCC;;D$chr4.trna10129-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna320-LeuTAG;;;D$chr3.trna243-IleAAT;;;D$chr5.trna312-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna540-TrpCCA;;;D$chr8.trna248-GlnTTG;;;D$chr9.trna315-SerAGA;;;;;;D$chr12.trna320-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna386-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna511-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna289-LeuCAA;;;D$chr21.trna222-AlaTGC;;;D$chr22.trna259-ValAAC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna7-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna41-ThrCGT
F$chrE3;ArgCCT;;B$chr1;GlyGCC;;D$chr4.trna1013-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna321-ThrAGT;;;D$chr3.trna244-PheGAA;;;D$chr5.trna313-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna542-TrpCCA;;;D$chr8.trna250-ProTGG;;;D$chr9.trna377-SerCGA;;;;;;D$chr12.trna321-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna387-GluTTC;;;;;;D$chr17.trna513-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna290-LeuCAA;;;D$chr21.trna223-AlaTGC;;;D$chr22.trna260-ValCAC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna8-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna42-ThrAGT
F$chrE3;ArgCCT;;B$chr1;GlyGCC;;D$chr4.trna10130-HisGTG;;;;;;D$chr2.trna322-ThrAGT;;;D$chr3.trna246-GlnCTG;;;D$chr5.trna315-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna543-TrpCCA;;;D$chr8.trna251-ProAGG;;;D$chr9.trna379-LeuCAA;;;;;;D$chr12.trna322-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna388-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna514-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna291-LeuCAA;;;D$chr21.trna224-AlaTGC;;;D$chr22.trna261-ValTAC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3269.trna9-CysGCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna43-ArgTCT
F$chrE3;ArgCCT;;B$chr1;GlyGCC;;D$chr4.trna10132-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna323-ThrAGT;;;D$chr3.trna247-IleAAT;;;D$chr5.trna316-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna544-TrpCCA;;;D$chr8.trna252-GlnTTG;;;D$chr9.trna42-LysTTT;;;;;;D$chr12.trna323-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna389-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna515-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna292-IleTAT;;;D$chr21.trna225-AlaCGC;;;D$chr22.trna288-GlyTCC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3307.trna1-AlaAGC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna44-ThrTGT
F$chrF1;ArgCCT;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna10133-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna324-ArgTCT;;;D$chr3.trna248-PheGAA;;;D$chr5.trna317-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna545-TrpCCA;;;D$chr8.trna254-ProTGG;;;D$chr9.trna441-MetCAT;;;;;;D$chr12.trna324-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna39-AsnGTT;;;;;;D$chr17.trna516-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna293-LeuCAA;;;D$chr21.trna226-AlaTGC;;;D$chr22.trna289-GlyTCC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3358.trna1-GlyTCC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna45-MetCAT
F$chrF1;ArgCCT;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna10134-ArgACG;;;;;;D$chr2.trna325-ThrAGT;;;D$chr3.trna25-CysGCA;;;D$chr5.trna319-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna546-TrpCCA;;;D$chr8.trna255-ProAGG;;;D$chr9.trna46-ProTGG;;;;;;D$chr12.trna325-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna390-GluTTC;;;;;;D$chr17.trna517-LeuTAA;;;;;;;;;D$chr20.trna294-LeuCAA;;;D$chr21.trna227-AlaTGC;;;D$chr22.trna290-GlyTCC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3556.trna1-GlyGCC;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna47-LeuTAG
F$chrF1;ArgCCT;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna10135-AlaTGC;;;;;;D$chr2.trna326-ThrAGT;;;D$chr3.trna250-GlnCTG;;;D$chr5.trna320-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna547-TrpCCA;;;D$chr8.trna256-GlnTTG;;;D$chr9.trna47-GlnCTG;;;;;;D$chr12.trna326-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna391-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna545-SerGCT;;;;;;;;;D$chr20.trna295-LeuCAA;;;D$chr21.trna228-AlaTGC;;;D$chr22.trna293-GluCTC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3563.trna1-LysTTT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna48-LeuAAG
F$chrF1;ArgCCT;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna10136-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna327-ThrAGT;;;D$chr3.trna251-IleAAT;;;D$chr5.trna322-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna548-TrpCCA;;;D$chr8.trna258-ProTGG;;;D$chr9.trna48-GlnTTG;;;;;;D$chr12.trna327-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna392-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna547-ArgCCG;;;;;;;;;D$chr20.trna296-LeuCAA;;;D$chr21.trna229-AlaTGC;;;D$chr22.trna297-LysCTT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3563.trna10-ProTGG;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna49-LeuTAG
F$chrX;ArgCCT;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna10137-ArgACG;;;;;;D$chr2.trna328-ArgTCT;;;D$chr3.trna252-PheGAA;;;D$chr5.trna324-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna549-TrpCCA;;;D$chr8.trna259-ProAGG;;;D$chr9.trna49-ProAGG;;;;;;D$chr12.trna328-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna393-GluTTC;;;;;;D$chr17.trna548-SeCTCA;;;;;;;;;D$chr20.trna297-LeuCAA;;;D$chr21.trna230-AlaCGC;;;D$chr22.trna298-LysCTT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3563.trna2-SerAGA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna5-LysTTT
F$chrX;ArgCCT;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna10138-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna329-ThrAGT;;;D$chr3.trna254-GlnCTG;;;D$chr5.trna326-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna55-ArgTCG;;;D$chr8.trna260-GlnTTG;;;D$chr9.trna50-GlnTTG;;;;;;D$chr12.trna33-AsnGTT;;;;;;;;;D$chr15.trna394-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna549-ArgTCG;;;;;;;;;D$chr20.trna298-LeuCAA;;;D$chr21.trna231-AlaTGC;;;D$chr22.trna299-AsnGTT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3563.trna4-SupTTA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna50-LeuAAG
F$chrX;ArgCCT;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna10139-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna330-ThrAGT;;;D$chr3.trna255-IleAAT;;;D$chr5.trna328-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna550-TrpCCA;;;D$chr8.trna262-ProTGG;;;D$chr9.trna78-LeuCAA;;;;;;D$chr12.trna330-ThrTGT;;;;;;;;;D$chr15.trna395-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna552-AlaAGC;;;;;;;;;D$chr20.trna299-LeuCAA;;;D$chr21.trna232-AlaCGC;;;D$chr22.trna301-AsnGTT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3688.trna1-IleAAT;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna51-LeuTAG
F$chrA3;ArgGCG;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna1014-GlyGCC;;;;;;D$chr2.trna331-ThrAGT;;;D$chr3.trna256-PheGAA;;;D$chr5.trna329-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna551-SerACT;;;D$chr8.trna263-ProAGG;;;;;;;;;D$chr12.trna332-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna396-GluTTC;;;;;;D$chr17.trna553-ValCAC;;;;;;;;;D$chr20.trna300-LeuCAA;;;D$chr21.trna233-AlaTGC;;;D$chr22.trna302-LysCTT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3688.trna2-PheGAA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna52-LeuAAG
F$chrB1;ArgGCG;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna10140-ArgACG;;;;;;D$chr2.trna332-ArgTCT;;;D$chr3.trna258-GlnCTG;;;D$chr5.trna330-AspGTC;;;;;;D$chr7.trna552-TrpCCA;;;D$chr8.trna264-GlnTTG;;;;;;;;;D$chr12.trna333-ArgTCT;;;;;;;;;D$chr15.trna397-TyrGTA;;;;;;D$chr17.trna555-ValAAC;;;;;;;;;D$chr20.trna302-LeuCAA;;;D$chr21.trna234-AlaTGC;;;D$chr22.trna305-GlyTCC;;;;;;;;;D$Zv8_NA3745.trna1-TrpCCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna54-SerCGA
F$chrB3;ArgGCG;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna10141-GluTTC;;;;;;D$chr2.trna333-ThrAGT;;;D$chr3.trna259-IleAAT;;;D$chr5.trna338-GluTTC;;;;;;D$chr7.trna553-TrpCCA;;;D$chr8.trna266-ProTGG;;;;;;;;;D$chr12.trna334-ThrAGT;;;;;;;;;D$chr15.trna398-ArgACG;;;;;;D$chr17.trna556-ValCAC;;;;;;;;;D$chr20.trna303-LeuCAA;;;D$chr21.trna235-AlaTGC;;;D$chr22.trna306-ThrTGT;;;;;;;;;D$Zv8_NA3745.trna2-TrpCCA;;;;D$Zv8_scaffold3058.trna55-ProTGG
F$chrD1;ArgGCG;;B$chr1;GlyTCC;;D$chr4.trna10142-TyrGTA;;;;;;D$chr2.trna334-ArgTCT;;;D$chr3.trna26-CysGCA;;;D$chr5.trna360-SerTGA;;;;;;D$chr7.trna554-TrpCCA;;;D$chr8.trna267-GlnTTG;;;;;;;;;D$chr12.trna335-A

Les introns des 121 eucaryotes[modifier | modifier le wikicode]

Champignons détail des introns[modifier | modifier le wikicode]

;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg;&emsp ;;total;&emsp ;;DNA;Génome
;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;2;;46;Encephalitozoon cuniculi GB-M1
;0;1;1;1;1;1;1;0;2;0;1;3;0;0;1;1;1;0;1;1;0;0;1;1;2;0;0;0;2;0;1;1;0;1;0;0;0;2;1;1;0;1;1;0;0;2;1;0;0;1;2;0;1;0;2;1;0;1;0;1;0;2;0;1;;47;;53;Exophiala dermatitidis NIH/UT8656
;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;7;;80;Ogataea parapolymorpha DL-1
;0;0;3;1;1;0;0;0;0;0;1;2;0;0;1;1;0;0;2;1;1;0;3;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;3;0;0;0;1;3;1;0;0;0;3;0;0;1;1;0;0;0;1;2;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;;35;;82;Candida orthopsilosis Co 90-125
;0;4;1;0;4;0;1;2;4;0;1;4;4;0;1;1;2;0;1;2;3;0;1;1;1;0;1;1;3;0;1;1;0;2;0;0;0;3;3;2;0;0;1;5;0;3;2;4;0;2;1;2;4;0;2;0;0;0;1;1;0;6;1;1;;91;;96;Sporisorium reilianum SRZ2
;0;3;1;0;4;0;1;2;4;0;1;4;4;0;1;1;3;0;1;3;4;0;1;1;0;0;1;1;5;0;1;1;0;3;0;0;0;2;2;3;0;0;1;5;0;5;2;4;0;2;2;2;4;0;3;0;0;2;1;1;0;6;2;1;;101;;111;Ustilago maydis 521
;0;5;0;3;0;0;1;1;0;0;1;2;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;3;2;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;;29;;123;Komagataella pastoris CBS 7435
;0;5;5;6;2;0;0;0;6;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;1;1;0;4;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;4;0;0;0;3;5;0;0;3;1;2;0;0;6;0;0;2;0;2;2;0;0;1;0;2;0;1;0;0;0;0;;67;;125;Candida albicans WO-1
;0;5;1;3;6;0;0;1;6;0;1;6;7;0;0;2;6;0;1;1;6;0;1;1;5;0;1;1;8;0;1;2;0;4;0;0;0;2;2;0;0;4;1;7;0;2;3;10;0;3;0;3;3;0;5;1;0;2;1;3;0;5;1;2;;136;;143;Cryptococcus neoformans var. grubii H99
;0;5;7;1;5;0;1;4;6;0;1;2;0;0;1;3;0;0;1;0;4;0;2;3;4;0;1;2;7;0;2;3;0;4;0;0;0;3;2;4;0;3;1;6;0;6;0;7;0;0;0;0;6;0;1;1;0;3;0;2;0;0;1;2;;117;;154;Thielavia terrestris NRRL 8126
;0;4;0;2;5;0;3;4;7;0;1;3;5;0;1;2;2;0;1;2;1;0;2;1;3;0;3;2;7;0;2;2;0;4;0;0;0;4;2;3;0;3;0;9;0;3;2;8;0;0;0;3;5;0;2;2;0;3;0;2;1;8;0;1;;130;;156;Valsa mali 03-8
;0;6;0;5;1;0;3;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;;40;;158;Kazachstania naganishii CBS 8797
;0;0;0;7;0;0;2;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;1;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;4;3;0;0;0;0;2;0;0;0;0;2;0;;39;;162;Kluyveromyces lactis NRRL Y-1140
;0;0;2;4;0;0;1;1;0;0;1;3;9;0;0;0;0;0;2;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;1;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;3;0;1;0;0;0;0;;44;;168;Schizosaccharomyces pombe 972h-
;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;1;3;0;0;1;0;0;0;0;2;1;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;3;9;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;;42;;170;Scheffersomyces stipitis CBS 6054
;0;5;1;2;6;0;2;3;4;0;1;3;0;0;0;1;0;0;1;2;6;0;2;1;1;0;2;2;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;2;5;0;6;2;0;0;8;2;1;0;3;0;0;0;0;2;2;0;4;0;2;0;0;2;1;;93;;181;Aspergillus nidulans FGSC A4
;0;7;1;2;7;0;1;4;8;0;1;4;6;0;1;2;4;0;2;3;5;0;2;2;4;0;2;2;9;0;3;2;0;5;0;0;0;0;2;6;0;6;0;6;0;0;1;9;0;3;0;0;6;0;2;0;0;3;1;3;0;14;3;3;;157;;190;Magnaporthe oryzae 70-15
;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;2;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;4;5;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;;25;;191;Cyberlindnera jadinii NBRC 0988 NBRC0988
;0;6;0;8;0;0;4;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;;45;;192;Torulaspora delbrueckii CBS 1146
;0;0;2;0;6;1;0;3;0;0;2;10;8;0;1;3;3;0;1;2;0;0;0;1;6;0;2;1;0;0;0;2;0;5;1;0;0;11;3;0;0;1;1;0;0;8;1;0;0;3;1;0;0;0;1;0;0;4;0;1;0;0;4;1;;100;;192;Penicillium chrysogenum P2niaD18
;0;5;1;2;7;0;1;4;8;0;1;4;0;0;1;3;0;0;2;0;6;0;2;3;2;0;2;2;7;0;2;3;0;6;0;0;0;4;2;3;0;0;0;9;0;8;0;8;0;0;0;2;5;0;0;2;0;5;1;2;0;0;0;2;;127;;192;Myceliophthora thermophila ATCC 42464
;0;6;0;7;0;0;4;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;4;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;5;4;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;;52;;205;Saccharomycetaceae sp. Ashbya aceri
;0;9;0;2;0;0;2;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;;42;;206;Tetrapisispora phaffii CBS 4417
;0;6;0;8;0;0;4;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;;45;;207;Candida glabrata CBS 138
;0;7;2;5;6;0;1;1;8;0;1;4;8;0;2;2;0;0;4;2;4;0;8;1;3;0;2;0;0;0;5;2;0;6;0;0;0;4;0;0;0;6;1;8;0;9;6;9;0;5;0;1;4;0;4;0;0;5;5;0;0;8;0;2;;161;;212;Botrytis cinerea B05.10
;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;2;4;0;0;1;0;0;0;0;1;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;7;10;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;1;0;3;0;0;0;0;0;0;;54;;214;Debaryomyces hansenii CBS767
;0;7;1;1;8;0;1;0;0;0;0;4;8;0;1;2;0;1;3;1;8;0;3;0;0;0;3;3;11;0;2;1;0;6;0;0;0;6;2;0;0;6;2;0;0;5;2;0;0;1;1;3;4;0;0;0;0;2;2;1;0;0;2;1;;115;;225;Verticillium dahliae VdLs.17
;0;7;0;8;0;0;3;3;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;5;4;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;;57;;229;Lachancea thermotolerans CBS 6340
;0;7;0;0;0;0;1;4;0;0;2;4;0;1;1;3;0;0;1;3;9;0;3;0;0;0;2;2;0;0;0;1;0;13;0;0;0;7;4;0;0;0;3;11;0;13;3;0;1;4;0;0;0;0;0;1;0;6;2;2;0;0;0;0;;114;;242;Aspergillus oryzae RIB40
;0;8;0;11;0;0;3;0;0;0;1;0;0;0;0;0;11;0;0;1;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;1;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;5;5;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;;72;;258;Lachancea kluyveri NRRL Y-12651
;0;9;0;2;0;0;2;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;;53;;266;Kazachstania africana CBS 2517
;0;10;0;9;0;0;3;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;;63;;270;Naumovozyma castellii CBS 4309
;0;9;1;3;6;0;2;5;11;0;3;5;0;0;1;1;0;0;2;2;10;0;3;2;0;0;0;0;12;0;3;3;0;6;0;0;0;7;5;0;0;9;2;12;0;0;4;13;0;0;1;4;0;0;9;0;0;8;2;1;0;15;4;1;;187;;270;Fusarium graminearum CS3005
;0;8;0;10;0;0;5;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;3;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;;54;;272;Zygosaccharomyces rouxii CBS 732
;2;12;1;4;6;0;2;2;0;0;2;6;0;0;2;3;3;0;2;3;4;0;4;2;5;0;2;0;2;0;8;1;0;6;0;0;0;7;4;6;1;12;6;11;1;7;4;10;0;1;0;3;11;0;5;2;0;0;0;6;0;10;3;7;;201;;273;Flammulina velutipes KACC42780
;0;10;0;10;0;0;3;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;;61;;275;Saccharomyces cerevisiae (S288c Apr 2011)
;0;10;2;4;12;0;2;5;11;0;1;5;0;0;1;1;0;0;2;3;10;0;0;2;4;0;0;0;14;0;3;3;0;8;0;0;0;6;4;0;1;8;2;15;1;0;5;16;0;0;0;5;0;0;7;0;0;7;1;0;0;14;2;0;;197;;285;Fusarium verticillioides 7600
;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;4;6;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;6;10;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;2;0;6;0;0;0;0;0;0;;68;;288;Millerozyma farinosa CBS 7064
;0;10;1;3;13;0;2;5;13;0;3;6;0;0;1;1;0;0;2;2;10;0;3;2;0;0;0;0;13;0;3;2;0;8;0;0;0;7;5;0;0;9;2;16;0;0;4;19;0;0;1;4;0;0;9;0;0;8;2;1;0;14;4;1;;209;;305;Fusarium graminearum PH-1 NRRL 31084
;0;12;0;9;0;0;2;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;;71;;328;Tetrapisispora blattae CBS 6284
;0;12;1;5;16;0;2;6;17;1;1;7;0;0;2;1;0;0;2;4;11;0;1;4;2;0;3;3;19;0;3;5;0;10;0;1;0;9;3;11;0;1;2;5;0;18;1;24;0;0;0;0;0;0;1;0;0;6;1;5;0;0;0;6;;232;;396;Neurospora crassa OR74A
;0;17;0;3;21;0;2;11;26;0;1;0;0;0;0;3;0;0;2;4;21;0;0;2;0;0;3;1;0;0;0;0;0;14;0;0;0;4;3;14;0;16;4;34;0;28;0;27;0;0;0;13;0;0;25;0;0;6;0;0;0;0;11;0;;316;;510;Yarrowia lipolytica CLIB122
&emsp ;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
total;2;261;35;151;143;2;68;71;141;1;59;104;59;1;25;37;35;1;43;66;125;0;168;31;42;0;30;25;119;0;43;36;0;250;1;1;0;92;59;65;2;94;131;202;2;125;50;170;1;30;9;124;91;0;80;17;0;144;20;36;1;102;42;33;;;;;
;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg;;;;;
zéros;40;7;23;10;21;40;10;22;26;41;1;18;33;41;21;22;33;41;18;5;22;42;9;24;29;42;27;27;28;42;26;24;42;0;41;41;42;23;22;27;40;26;6;21;40;27;24;26;41;30;35;12;20;42;26;30;42;4;30;24;41;31;28;26;;;;;
42−zér;2;35;19;32;21;2;32;20;16;1;41;24;9;1;21;20;9;1;24;37;20;0;33;18;13;0;15;15;14;0;16;18;0;42;1;1;0;19;20;15;2;16;36;21;2;15;18;16;1;12;7;30;22;0;16;12;0;38;12;18;1;11;14;16;;;;;

Champignons détail des tRNAs[modifier | modifier le wikicode]

;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg;DNA;KEGG;génome;;;;;moy
;0;1;1;1;1;0;1;1;1;0;1;2;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;0;1;0;0;0;1;1;1;0;2;1;1;0;1;1;1;0;1;0;1;1;0;1;0;0;1;1;1;0;1;1;1;46;ecu;Encephalitozoon cuniculi GB-M1;;;;;1.02
;0;1;1;1;1;1;1;1;2;0;1;1;2;0;1;1;1;0;1;1;0;0;1;1;2;0;1;1;2;0;1;1;0;1;0;0;0;2;1;1;0;1;1;0;0;2;1;2;0;1;0;0;2;0;2;1;0;1;0;1;0;2;1;2;53;ede*;Exophiala dermatitidis NIH/UT8656;;;;;1.16
;0;3;1;3;1;0;1;1;4;0;1;4;3;0;0;1;2;0;1;1;0;0;3;0;3;0;1;1;3;0;2;0;0;2;0;0;0;2;2;1;0;2;2;3;0;3;2;3;0;1;0;2;2;0;0;1;0;2;3;1;0;4;2;0;80;opa*;Ogataea parapolymorpha DL-1;;;;;1.78
;0;2;3;1;1;0;0;1;4;0;1;4;4;0;1;1;2;0;2;1;1;0;3;0;4;0;2;1;3;0;2;0;0;3;0;0;0;1;3;1;0;3;4;3;0;5;2;1;0;1;0;1;2;0;0;1;0;1;2;1;0;2;1;0;82;cot;Candida orthopsilosis Co 90-125;;;;;1.82
;0;4;1;0;4;0;1;2;4;0;1;4;4;0;1;0;2;0;1;2;3;0;1;1;4;0;1;1;3;0;1;1;0;2;0;0;0;3;3;2;0;3;1;5;0;3;2;4;0;2;1;2;4;0;2;0;0;0;1;1;0;6;1;1;96;sre*;Sporisorium reilianum SRZ2;;;;;2.11
;0;3;1;0;4;0;2;2;4;0;1;4;4;0;1;1;3;0;1;3;4;1;1;1;4;0;1;1;5;0;1;1;0;3;0;0;0;2;2;3;0;3;1;5;0;5;2;5;0;2;2;2;4;0;3;0;0;2;1;1;0;6;2;1;111;uma;Ustilago maydis 521;;;;;2.40
;0;5;1;3;2;0;1;2;5;0;1;4;5;0;1;1;4;0;2;1;2;0;4;1;5;0;1;1;5;0;2;0;0;4;0;0;0;3;3;2;0;4;3;5;0;6;5;4;0;2;0;3;2;0;1;1;0;2;4;1;0;5;3;1;123;kpa*;Komagataella pastoris CBS 7435;;;;;2.73
;0;5;5;6;2;0;0;1;6;0;1;4;6;0;1;1;4;0;3;1;1;0;4;0;4;0;2;1;6;0;2;0;0;4;0;0;0;3;5;1;0;3;5;2;0;6;6;1;0;2;0;2;2;0;0;1;0;2;5;1;0;5;2;1;125;cal;Candida albicans WO-1;;;;;2.78
;0;5;1;3;6;0;0;1;6;0;1;7;7;0;0;2;6;0;1;1;6;0;1;0;5;0;1;1;8;0;1;2;0;4;0;0;0;4;2;3;0;4;1;7;0;0;3;10;0;3;0;3;3;0;5;1;0;2;1;3;0;9;3;0;143;cneg*;Cryptococcus neoformans var. grubii H99;;;;;3.18
;0;5;5;1;5;0;1;4;6;0;1;5;6;0;1;3;3;0;1;3;4;0;2;3;4;0;1;2;7;0;2;3;0;4;0;0;0;3;2;4;0;3;2;6;0;6;2;7;0;3;0;4;6;0;1;3;0;3;1;2;0;10;2;2;154;ttt;Thielavia terrestris NRRL 8126;;;;;3.42
;0;4;0;2;5;0;1;4;7;0;1;8;7;0;1;2;5;0;1;2;0;0;2;1;4;0;3;2;7;0;2;2;0;4;0;0;0;5;2;4;0;5;0;9;0;6;3;9;0;3;0;3;6;0;2;2;0;3;1;2;0;9;3;2;156;vma*;Valsa mali 03-8;;;;;3.47
;0;6;3;5;1;0;3;0;7;0;2;4;7;0;1;2;7;0;1;1;1;0;6;0;7;0;2;1;7;0;1;1;0;5;0;0;0;4;4;2;0;6;4;7;0;8;5;3;0;4;0;4;3;0;0;1;0;3;6;1;0;9;1;2;158;kna*;Kazachstania naganishii CBS 8797;;;;;3.51
;0;5;3;7;0;1;2;0;7;0;1;6;7;0;1;2;6;0;2;1;1;0;7;0;6;0;2;1;7;0;3;0;0;5;0;0;0;4;6;1;0;6;4;9;0;8;8;2;0;3;0;4;3;0;0;1;0;2;7;1;0;7;2;1;162;kla;Kluyveromyces lactis NRRL Y-1140;;;;;3.58
;0;5;2;4;5;0;1;1;8;0;1;7;9;0;2;1;7;0;2;1;6;0;2;1;7;0;2;1;6;0;2;1;0;4;0;0;0;4;4;2;0;6;3;9;0;8;4;6;0;3;0;3;8;0;1;1;0;3;2;1;0;8;3;1;168;spo;Schizosaccharomyces pombe 972h-;;;;;3.73
;0;6;3;8;3;0;0;1;7;0;1;6;7;0;2;1;6;0;2;2;1;0;6;0;7;0;2;1;7;0;3;0;0;5;0;0;0;4;5;2;0;7;3;9;0;8;8;2;0;3;0;4;3;0;0;1;0;2;7;1;0;10;3;1;170;pic;Scheffersomyces stipitis CBS 6054;;;;;3.78
;0;5;1;2;6;0;2;3;7;0;1;7;8;0;1;2;5;0;1;2;6;0;2;2;6;0;2;2;8;0;2;3;0;6;0;0;0;5;2;5;0;6;2;8;0;8;3;8;0;3;0;3;9;0;2;2;0;4;2;2;0;11;3;1;181;ani;Aspergillus nidulans FGSC A4;;;;;4.02
;0;7;1;2;7;0;1;4;8;0;1;8;6;0;1;2;4;0;2;3;5;0;2;2;6;0;2;2;9;0;3;2;0;5;0;0;0;4;2;6;0;6;2;9;0;10;3;9;0;3;0;4;6;0;2;2;0;3;1;3;0;14;3;3;190;mgr;Magnaporthe oryzae 70-15;;;;;4.22
;0;8;1;7;4;0;3;1;6;1;1;7;9;0;2;3;7;0;3;1;0;0;7;0;6;0;3;1;6;0;3;0;0;5;0;0;0;6;6;2;0;7;5;8;0;8;4;9;0;3;1;4;6;0;0;1;0;3;7;0;0;11;4;1;191;cjd*;Cyberlindnera jadinii NBRC 0988 NBRC0988;;;;;4.20
;0;6;3;8;0;1;4;0;8;0;1;7;12;0;1;2;7;0;2;1;1;0;6;0;9;0;2;1;8;0;4;0;0;6;0;0;0;4;6;2;0;7;5;10;0;9;8;4;0;3;0;4;4;0;0;1;0;3;7;1;0;11;2;1;192;tdl;Torulaspora delbrueckii CBS 1146;;;;;4.24
;0;5;0;0;6;1;0;3;10;0;2;10;9;0;1;3;7;0;1;2;0;0;0;1;12;0;3;2;8;0;2;2;0;5;0;0;0;11;3;5;0;6;1;9;0;9;3;10;0;3;1;0;10;0;2;2;0;4;0;2;0;11;4;1;192;pch*;Penicillium chrysogenum P2niaD18;;;;;4.22
;0;5;1;2;7;0;1;4;8;0;1;8;7;0;2;3;5;0;3;3;6;0;2;3;6;0;2;3;7;0;2;3;0;6;0;0;0;4;2;5;0;6;3;9;0;10;2;8;0;3;1;4;7;0;1;2;0;5;1;2;0;11;4;2;192;mth*;Myceliophthora thermophila ATCC 42464;;;;;4.24
;0;7;3;7;0;1;4;1;9;0;1;10;7;0;3;4;7;0;3;3;1;0;7;0;7;0;3;2;7;0;5;2;0;5;0;0;0;5;4;4;0;8;4;9;0;10;3;8;0;3;1;5;4;0;0;2;0;3;7;1;0;11;2;2;205;sas*;Saccharomycetaceae sp. Ashbya aceri;;;;;4.51
;0;9;9;2;0;1;2;0;10;0;2;8;10;0;2;1;8;0;2;1;1;0;7;0;9;0;2;1;9;0;3;0;0;6;0;0;0;5;7;1;0;9;6;9;0;12;11;1;0;4;0;4;3;0;0;1;0;3;8;1;0;13;2;1;206;tpf;Tetrapisispora phaffii CBS 4417;;;;;4.56
;0;6;3;8;0;1;4;0;9;0;2;7;10;0;2;1;9;0;2;1;1;0;7;0;9;0;3;1;10;0;5;0;0;6;0;0;0;6;6;2;0;9;3;12;0;9;9;3;0;3;0;5;4;0;0;1;0;3;9;1;0;12;2;1;207;cgr;Candida glabrata CBS 138;;;;;4.58
;0;7;2;5;6;0;1;1;8;0;1;8;8;0;2;2;7;0;3;2;4;0;7;1;6;0;3;0;8;0;5;2;0;6;0;0;0;4;6;2;0;6;3;10;0;9;6;9;0;5;0;6;6;0;4;2;0;5;5;1;1;8;2;7;212;bfu;Botrytis cinerea B05.10;;;;;4.69
;0;8;9;4;2;0;0;1;9;1;2;10;10;0;1;1;6;0;4;1;1;0;7;0;8;0;2;1;7;0;5;1;0;6;0;0;0;6;7;1;0;9;8;10;0;10;9;1;0;4;1;4;5;0;0;1;0;3;10;1;0;11;5;1;214;dha;Debaryomyces hansenii CBS767;;;;;4.71
;0;7;1;1;8;0;1;4;9;0;0;9;11;0;1;2;6;1;2;4;8;0;3;2;8;0;2;3;11;0;2;4;1;6;0;0;0;6;2;5;0;6;2;12;0;10;2;12;0;5;1;3;9;0;2;2;0;5;3;2;0;13;3;3;225;vda;Verticillium dahliae VdLs.17;;;;;4.93
;0;7;2;8;0;2;3;3;10;0;1;8;11;0;1;3;9;0;2;2;2;0;8;0;9;0;2;1;10;0;3;2;0;6;0;0;0;5;5;5;0;7;4;14;0;10;6;11;0;4;0;5;4;0;0;1;0;3;9;1;0;15;3;2;229;lth;Lachancea thermotolerans CBS 6340;;;;;5.04
;0;7;2;0;0;0;1;4;10;0;2;6;10;1;2;3;7;0;1;3;9;0;2;0;10;0;2;2;10;0;3;4;1;13;0;0;0;8;4;7;0;8;3;11;0;13;6;11;1;4;0;4;12;0;2;3;0;6;2;2;0;15;4;1;242;aor;Aspergillus oryzae RIB40;;;;;5.31
;0;8;3;11;0;1;3;0;12;0;1;10;14;0;1;3;11;0;2;1;1;1;10;0;12;0;2;1;13;0;4;0;0;7;0;0;0;6;10;1;0;9;5;14;0;13;13;3;0;5;0;5;5;0;0;1;0;4;12;1;0;15;2;2;258;lkl*;Lachancea kluyveri NRRL Y-12651;;;;;5.69
;0;9;14;2;2;0;2;0;13;0;2;9;13;0;2;1;11;0;4;1;1;0;10;0;11;0;3;1;12;0;5;0;0;9;0;0;0;6;9;1;0;10;8;12;0;13;15;2;0;5;0;6;4;0;0;1;0;4;11;1;0;17;3;1;266;kaf;Kazachstania africana CBS 2517;;;;;5.91
;0;10;7;9;2;0;3;0;12;0;2;9;13;0;2;2;12;0;4;1;1;0;10;0;11;0;3;2;12;0;5;0;0;9;0;0;0;8;9;1;0;10;8;14;0;14;13;1;0;4;0;7;5;0;0;2;0;4;10;1;0;13;3;2;270;ncs;Naumovozyma castellii CBS 4309;;;;;6.00
;0;9;1;3;6;0;2;5;11;0;2;5;16;0;2;3;11;0;2;2;10;0;3;2;11;0;4;3;13;0;3;3;0;6;0;0;0;7;5;7;0;9;2;12;0;10;4;13;0;5;1;4;10;0;9;1;0;8;2;2;0;15;5;1;270;fgr;Fusarium graminearum CS3005;;;;;5.98
;0;8;4;10;0;1;5;0;11;1;1;9;12;0;2;4;12;0;3;2;3;0;10;0;10;0;2;2;12;0;9;0;0;7;0;0;0;6;10;3;0;9;7;14;0;14;10;4;0;4;0;6;5;0;0;1;0;5;8;2;0;17;5;2;272;zro;Zygosaccharomyces rouxii CBS 732;;;;;6.00
;2;15;1;4;6;0;2;2;10;0;2;14;7;0;3;3;7;0;2;3;4;0;4;2;7;0;3;4;13;0;9;5;0;6;0;0;0;3;4;6;1;12;6;11;1;2;6;11;0;4;0;4;13;0;8;2;0;4;2;6;0;11;8;8;273;fve*;Flammulina velutipes KACC42780;;;;;5.98
;0;10;7;10;0;1;3;0;13;0;2;10;14;0;2;2;11;0;3;1;2;0;10;0;11;0;4;1;11;0;5;0;0;8;0;0;0;7;9;1;0;10;7;14;0;16;14;2;0;4;0;6;6;0;0;1;0;4;11;1;0;16;3;2;275;sce;Saccharomyces cerevisiae (S288c Apr 2011);;;;;6.09
;0;10;2;4;12;0;2;5;11;0;1;8;13;0;2;3;10;0;2;3;10;0;3;2;11;0;4;2;14;0;3;3;0;8;0;0;0;6;4;8;0;8;2;15;0;14;5;16;0;5;0;5;10;0;7;1;0;7;2;2;0;14;5;1;285;fvr;Fusarium verticillioides 7600;;;;;6.33
;0;10;4;14;4;0;0;2;12;0;4;10;12;0;2;4;10;0;4;2;2;0;8;0;10;0;4;2;12;0;8;2;0;10;0;0;0;8;8;4;0;12;6;10;0;14;8;8;0;4;0;6;4;0;0;2;0;6;10;2;0;16;6;2;288;mfa*;Millerozyma farinosa CBS 7064;;;;;6.40
;0;11;2;3;13;0;2;5;13;0;2;6;19;0;2;3;11;0;2;2;10;0;3;2;11;0;4;3;14;0;4;2;0;8;0;0;0;7;5;7;0;9;3;16;0;14;5;19;0;5;1;4;10;0;9;1;0;8;2;2;0;14;6;1;305;fgr;Fusarium graminearum PH-1 NRRL 31084;;;;;6.76
;0;12;12;9;0;1;2;0;17;0;2;11;18;0;2;1;16;0;4;2;1;0;13;0;15;0;3;1;19;0;5;0;0;9;0;0;0;7;10;1;0;11;9;15;0;19;16;1;0;5;0;7;4;0;0;1;0;6;13;1;0;23;3;1;328;tbl;Tetrapisispora blattae CBS 6284;;;;;7.27
;0;12;1;5;17;0;2;6;17;1;1;17;19;0;2;4;14;0;3;4;11;0;4;4;12;0;3;3;19;0;3;5;0;10;0;0;0;9;3;11;0;12;2;24;0;18;5;24;0;7;0;7;21;0;2;3;0;6;5;5;0;26;4;3;396;ncr;Neurospora crassa OR74A;;;;;8.78
;0;17;1;3;21;0;2;13;26;0;1;18;24;0;2;8;21;0;2;4;21;0;3;2;22;0;3;2;30;0;4;2;0;14;0;0;0;12;3;15;0;16;4;34;0;28;6;27;0;8;0;13;1;0;25;0;0;6;4;1;0;30;11;0;510;yli;Yarrowia lipolytica CLIB122;;;;;11.33
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
tRNAs;2;295;128;188;170;13;72;89;377;4;57;319;401;1;63;93;310;1;90;79;153;2;202;35;332;0;98;66;389;0;140;60;2;249;0;0;0;216;196;148;1;295;155;425;1;401;249;295;1;149;11;173;238;0;93;55;0;154;205;66;1;487;137;69;;;;;;;;
;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg;;;;;;;;
zéros;41;0;2;4;11;30;7;11;0;38;1;0;0;41;2;1;0;41;0;0;5;40;1;22;0;42;0;1;0;42;0;16;40;0;42;42;42;0;0;0;41;0;1;1;41;1;0;0;41;0;32;2;0;42;20;4;42;1;2;1;41;0;0;4;;;;;;;;
indice;0.05;7.02;3.05;4.48;4.05;0.31;1.71;2.12;8.98;0.10;1.36;7.60;9.55;0.02;1.50;2.21;7.38;0.02;2.14;1.88;3.64;0.05;4.81;0.83;7.90;0;2.33;1.57;9.26;0;3.33;1.43;0.05;5.93;;;0;5.14;4.67;3.52;0.02;7.02;3.69;10.12;0.02;9.55;5.93;7.02;0.02;3.55;0.26;4.12;5.67;0;2.21;1.31;0;3.67;4.88;1.57;0.02;11.60;3.26;1.64;;;;;;;;

Non champignons détail des introns[modifier | modifier le wikicode]

;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg;;total;;DNA;KEGG;génome
;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0; ;1; ;35;pfa;Plasmodium falciparum
;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;3;;82;lma;Leishmania major
;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;;10;;155;mgp;Meleagris gallopavo (turkey) (TGC Turkey_2.01 Dec 2009)
;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;;12;;191;mun*;Melopsittacus undulatus (Budgerigar Sep. 2011 WUSTL v6.3/melUnd1)
;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;;14;;203;gfr;Geospiza fortis (Medium ground finch Apr. 2012 GeoFor_1.0/geoFor1)
;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;;11;;211;acs;Anolis carolinensis (lizard) (Broad AnoCar2.0 May 2010)
;0;0;0;2;0;0;0;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;;18;;230;tgu;Taeniopygia guttata (Zebra finch Feb. 2013 WashU taeGut324/taeGut2)
;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;4;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;21;;252;mlu*;Myotis lucifugus (Microbat Jul. 2010 Broad Institute Myoluc2.0/myoLuc2)
;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;15;;256;dsi;Drosophila simulans (D. simulans Apr. 2005 WUGSC mosaic 1.0)
;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;18;;258;mmr*;Microcebus murinus (Mouse lemur) (Jun 2003)
;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;15;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;;22;;283;gga;Gallus gallus (galGal4 Nov 2011)
;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;15;;289;dme;Drosophila melanogaster (D. melanogaster Aug. 2014 BDGP Release 6 + ISO1 MT/dm6)
;1;0;0;5;0;0;0;0;3;9;10;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;3;0;0;0;0;0;;41;;326;oga*;Otolemur garnettii (Bushbaby Mar. 2011 Broad/otoGar3)
;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;15;;326;dya;Drosophila yakuba (D. yakuba Nov. 2005 WUGSC 7.1)
;0;0;0;6;1;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;26;;334;sbq;Saimiri boliviensis (Squirrel monkey Oct. 2011 Broad/saiBol1)
;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;22;;338;opr*;Ochotona princeps (Pika May 2012 OchPri3.0/ochPri3)
;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;26;;353;meu*;Macropus eugenii (Wallaby Sep. 2009 TWGS Meug_1.1/macEug2)
;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;7;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;22;;367;hgl;Heterocephalus glaber (Naked mole-rat Jan. 2012 Broad HetGla_female_1.0/hetGla2)
;0;0;1;4;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;21;;373;lcm;Latimeria chalumnae (Coelacanth Aug. 2011 Broad/latCha1)
;0;0;0;4;0;0;0;1;0;0;4;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;25;;374;san*;Sorex araneus (Shrew Aug. 2008 Broad/sorAra2)
;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;15;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;28;;383;cpo*;Cavia porcellus (Guinea pig) (Broad Feb 2008)
;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;15;;407;rno;Rattus norvegicus (rn5 Mar 2012)
;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;29;;408;cjc;Callithrix jacchus (marmoset) (WUGSC 3.2 Mar 2009)
;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;15;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;31;;411;pha*;Papio hamadryas (baboon) (Nov 2008)
;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;22;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;27;;414;aga;Anopheles gambiae
;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;21;;418;ppp;Physcomitrella patens 
;1;0;0;5;1;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;13;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;31;;421;nle;Nomascus leucogenys (Gibbon Oct. 2012 GGSC Nleu3.0/nomLeu3)
;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;1;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;34;;435;ggo;Gorilla gorilla gorilla (gorilla) (gorGor3.1 May 2011)
;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;22;;446;shr;Sarcophilus harrisii (Tasmanian devil Feb. 2011 WTSI Devil_ref v7.0/sarHar1)
;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;1;26;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;8;3;0;1;0;60;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;114;;455;tsy*;Tarsius syrichta (Tarsier Sep. 2013 Tarsius_syrichta-2.0.1/tarSyr2)
;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;13;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;34;;458;mcc;Macaca mulatta (Rhesus Oct. 2010 BGI CR_1.0/rheMac3)
;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;10;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;25;;469;mmu;Mus musculus (mm10 Dec 2011)
;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;14;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;35;;476;pan*;Papio anubis (Baboon Mar. 2012 Baylor Panu_2.0/papAnu2)
;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;14;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;30;;481;mdo;Monodelphis domestica (opossum) (Broad Oct 2006)
;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;30;;485;eeu*;Erinaceus europaeus (Hedgehog May 2012 EriEur2.0/eriEur2)
;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;14;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;32;;494;ecb;Equus caballus (horse) (Sep 2007)
;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;23;;498;cge;Cricetulus griseus cell line CHO-K1 (Chinese hamster ovary CriGri 1.0 Aug 2011)
;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;1;11;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;10;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;;32;;499;vvi;Vitis vinifera (Grapevine 12X)
;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;13;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;34;;503;ptr;Pan troglodytes (Chimp Feb. 2011 CSAC 2.1.4/panTro4)
;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;1;;27;;506;ocu;Oryctolagus cuniculus (rabbit) (Broad Apr 2009)
;0;0;0;5;1;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;15;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;;40;;517;ppy*;Pongo pygmaeus abelii (Orangutan July 2007 WUGSC 2.0.2/ponAbe2)
;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;27;;518;csi*;Ceratotherium simum (White rhinoceros May 2012 CerSimSim1.0/cerSim1)
;0;0;1;7;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;1;0;20;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;11;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;;58;;540;tng;Tetraodon nigroviridis (tetraodon) (Genoscope 8.0 Mar 2007)
;0;0;0;7;0;0;0;0;0;1;12;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;10;0;0;0;0;0;;36;;554;cpic;Chrysemys picta bellii (Painted turtle Dec. 2011 v3.0.1/chrPic1)
;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;15;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;12;0;0;0;0;0;;43;;575;tru;Takifugu rubripes (Fugu Oct. 2011 FUGU5/fr3)
;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;17;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;12;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;32;;578;sbi;Sorghum bicolor (Version 1.0)
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;0;0;0;7;2;0;0;0;0;0;3;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;19;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;34;;596;cel;Caenorhabditis elegans (WS220 Oct 2010)
;6;0;0;0;35;1;0;1;0;0;1;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;17;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;74;;618;pop;Populus trichocarpa (Jan 2010 Version 2.0) 
;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;1;13;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;34;;622;hsa;Homo sapiens (hg38 - GRCh38 Dec 2013)
;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;17;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;12;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;3;0;1;0;0;0;0;;36;;639;bdi;Brachypodium distachyon (JGI v1.0 8X)
;0;0;0;7;0;0;0;0;1;0;24;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;3;17;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;22;0;0;0;0;0;;76;;674;oni*;Oreochromis niloticus (Nile tilapia Jan. 2011 Broad oreNil1.1/oreNil2)
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;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;1;0;0;2;1;1;1;1;25;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;8;1;0;0;2;0;;66;;749;mpu*;Mustela putorius furo (Ferret Apr. 2011 MusPutFur1.0/musFur1)
;0;0;0;4;1;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;;24;;804;str*;Spermophilus tridecemlineatus (Squirrel Nov. 2011 Broad/speTri2)
;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;16;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;1;17;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;6;0;0;2;0;0;;56;;807;ssc;Sus scrofa (Pig Aug. 2011 SGSC Sscrofa10.2/susScr3)
;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;24;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;35;;827;cja*;Caenorhabditis japonica (WUGSC 3.0.2 Mar 2008)
;0;1;0;10;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;26;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;;54;;856;oaa;Ornithorhynchus anatinus (platypus) (WUGSC 5.0.1 Mar 2007)
;0;0;0;4;0;0;0;1;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;8;0;0;0;0;3;1;0;0;2;33;0;0;1;2;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;4;1;0;0;0;0;;68;;906;cfa;Canis familiaris (dog) (CanFam3.1 Sept 2011)
;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;24;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;;38;;1065;spu;Strongylocentrotus purpuratus (Sea urchin) 
;0;1;0;14;0;0;0;0;0;1;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;26;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;;52;;1095;cbr*;Caenorhabditis brenneri (WUGSC 6.0.1 Feb 2008)
;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;1;2;;31;;1119;dno*;Dasypus novemcinctus (Armadillo Dec. 2011 Baylor/dasNov3)
;0;0;0;4;1;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;8;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;3;0;2;;29;;1176;oas;Ovis aries (sheep) (Feb 2010)
;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;22;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;;37;;1198;zma;Zea mays (Version 5b.60)
;0;0;0;9;0;0;0;1;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;1;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;11;0;1;0;0;3;3;0;1;3;45;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;3;0;0;0;5;2;0;0;0;0;;96;;1463;aml;Ailuropoda melanoleuca (panda) (BGI-Shenzhen AilMel 1.0 Dec 2009)
;2;0;0;12;0;0;0;0;0;0;16;1;0;0;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;2;0;0;0;0;0;0;50;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;19;0;0;0;0;0;;105;;1492;gmo*;Gadus morhua (Atlantic cod May 2010 Genofisk GadMor_May2010/gadMor1)
;0;0;6;17;1;0;0;0;0;0;4;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;19;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;3;0;;60;;2002;lav;Loxodonta africana (elephant) (Broad/July 2009)
;0;0;0;8;1;0;0;0;0;0;7;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;14;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;7;0;0;1;3;0;;41;;2017;tma*;Trichechus manatus latirostris (Manatee Oct. 2011 Broad v1.0/triMan1)
;0;0;0;22;0;0;0;0;0;0;9;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;86;2;0;0;0;2;0;0;3;6;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;2;0;1;0;0;0;;133;;2485;pma*;Petromyzon marinus (Lamprey Sep. 2010 WUGSC 7.0/petMar2)
;0;0;3;5;0;0;0;0;0;0;58;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;17;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;62;0;0;0;0;0;;146;;2489;gac*;Gasterosteus aculeatus (stickleback) (Broad 1.0 Feb 2006)
;0;0;1;19;0;0;0;0;0;0;43;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;105;0;1;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;103;0;0;0;1;0;;275;;2639;xtr;Xenopus tropicalis (frog) (JGI 4.2 Nov 2009)
;0;0;3;7;0;0;0;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;0;4;0;0;1;7;1;0;0;0;1;0;0;1;1;0;10;3;4;0;2;75;7;1;2;4;214;0;0;0;7;0;0;2;2;0;0;102;2;0;0;5;9;1;0;2;1;;487;;3729;fca;Felis catus (cat) (Felis_catus-6.2 Sept 2011)
;0;0;0;6;1;0;1;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;1;0;0;0;0;17;0;0;0;0;1;1;0;0;0;1;0;0;1;1;0;2;0;1;0;0;0;0;0;0;6;0;2;1;3;5;;57;;4040;bta;Bos taurus (Cow Jun. 2014 Bos_taurus_UMD_3.1.1/bosTau8)
;0;0;0;5;0;0;0;1;0;0;5;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;17;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;7;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;3;2;;47;;5845;ttr*;Tursiops truncatus (Dolphin Oct. 2011 Baylor Ttru_1.4/turTru2)
;0;0;0;6;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;13;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;1;0;12;1;0;0;0;1;0;0;0;0;0;0;5;0;0;0;3;2;;50;;7080;bacu;Balaenoptera acutorostrata scammoni (Minke whale Oct. 2013 BalAcu1.0/balAcu1)
;0;0;0;9;0;0;1;1;0;0;17;0;0;0;1;1;0;0;0;0;12;3;13;8;3;0;0;0;0;0;0;1;1;34;0;0;0;0;0;0;0;0;35;0;0;0;2;0;1;0;0;0;0;0;22;0;0;0;12;0;0;0;0;0;;177;;13727;cmk;Callorhinchus milii (Elephant shark Dec. 2013 Callorhinchus_milii-6.1.3/calMil1)
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
total;11;2;18;400;45;1;2;7;5;14;454;149;3;0;5;6;2;23;13;2;18;5;50;11;10;0;5;7;4;1;2;4;24;1239;8;13;6;11;148;17;4;8;54;321;4;18;28;13;2;14;3;5;0;3;131;4;2;9;469;14;4;7;21;15;;;;;;
;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg;;;;;;
−zéros;5;2;8;65;10;1;2;7;3;5;69;11;2;0;5;6;2;4;9;1;6;3;7;4;7;0;3;6;4;1;2;4;17;79;3;10;3;9;8;8;4;5;8;7;3;2;8;6;2;10;2;4;0;3;7;2;2;6;58;5;3;4;9;7;;;;;;

Non champignons détail des tRNAs[modifier | modifier le wikicode]

;;Non champignons détail tRNAs;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
DNA;KEGG;Génome;;;moy;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg
35;pfa;Plasmodium falciparum;;;0.78;0;1;1;1;1;0;1;1;1;0;1;2;1;0;1;1;1;0;1;1;1;0;1;1;0;0;1;1;1;0;1;1;0;1;0;0;0;0;1;1;0;1;0;0;0;1;1;1;0;0;0;0;0;0;1;0;0;1;1;0;0;0;1;0
82;lma;Leishmania major;;;1.82;0;2;1;1;3;0;1;2;3;0;1;4;2;0;1;2;1;0;1;1;2;0;1;2;3;0;1;2;2;0;1;2;0;3;0;0;0;2;1;3;0;3;1;3;0;3;1;2;0;1;0;1;4;0;1;1;0;2;1;1;0;4;1;1
155;mgp;Meleagris gallopavo (turkey) (TGC Turkey_2.01 Dec 2009);;;3.42;0;6;1;2;1;0;1;4;3;0;1;11;3;1;2;3;5;0;3;1;7;0;2;1;4;0;2;0;7;0;6;3;0;6;0;0;0;3;1;1;0;4;4;3;0;3;5;6;0;5;0;5;2;0;1;2;0;6;3;3;0;5;4;3
191;mun*;Melopsittacus undulatus (Budgerigar Sep. 2011 WUSTL v6.3/melUnd1);;;4.18;0;6;4;3;3;0;0;6;5;0;1;9;3;1;1;4;4;1;3;1;2;0;3;2;5;0;2;0;9;0;5;2;0;7;0;0;0;4;2;4;0;9;3;13;0;9;3;1;0;5;1;4;3;0;1;1;0;8;4;4;0;10;9;1
203;gfr;Geospiza fortis (Medium ground finch Apr. 2012 GeoFor_1.0/geoFor1);;;4.44;0;6;11;2;4;0;7;0;6;1;2;6;2;1;1;3;2;0;3;1;4;0;5;1;5;0;4;1;16;0;5;2;0;12;0;0;0;4;2;3;1;6;4;7;0;5;4;6;0;10;0;3;6;0;2;0;0;6;3;2;0;8;4;4
211;acs;Anolis carolinensis (lizard) (Broad AnoCar2.0 May 2010);;;4.64;0;5;2;2;4;0;3;4;6;0;1;12;5;0;2;3;5;0;1;2;3;1;3;2;4;0;3;1;12;0;6;3;0;6;0;0;0;5;3;5;0;10;5;6;0;8;7;5;0;12;1;7;4;0;3;1;0;5;3;3;0;7;8;2
230;tgu;Taeniopygia guttata (Zebra finch Feb. 2013 WashU taeGut324/taeGut2);;;4.87;0;10;4;4;1;0;1;7;21;2;1;5;3;2;1;1;3;0;2;1;6;0;1;2;8;1;4;2;18;0;7;3;0;13;0;0;0;5;1;6;2;8;4;5;0;7;2;3;1;9;1;3;6;0;2;0;1;5;3;2;1;8;7;4
252;mlu*;Myotis lucifugus (Microbat Jul. 2010 Broad Institute Myoluc2.0/myoLuc2);;;5.49;0;5;2;3;3;0;5;2;10;0;3;14;5;0;3;5;6;0;2;2;6;0;3;3;5;0;5;3;8;0;1;3;0;5;0;0;5;7;3;7;0;9;3;11;0;8;5;6;0;27;0;4;6;0;5;2;0;5;5;5;0;8;6;3
256;dsi;Drosophila simulans (D. simulans Apr. 2005 WUGSC mosaic 1.0);;;5.67;0;8;3;4;5;0;2;9;8;0;0;12;7;0;2;6;8;0;2;3;6;0;5;5;8;0;5;4;9;0;5;0;0;10;0;0;0;6;4;8;0;6;4;11;0;6;5;10;0;7;1;9;9;0;5;0;0;3;3;3;0;15;5;0
258;mmr*;Microcebus murinus (Mouse lemur) (Jun 2003);;;5.71;0;8;3;3;5;0;2;7;4;0;3;14;4;0;2;5;7;0;2;3;7;0;4;3;3;0;3;2;11;0;5;3;0;8;0;0;0;6;4;12;0;9;5;6;0;5;9;8;1;20;0;6;6;0;3;2;0;7;5;3;0;11;7;2
283;gga;Gallus gallus (galGal4 Nov 2011);;;6.24;0;10;3;3;3;0;2;7;7;0;2;14;7;1;3;7;9;0;4;2;7;0;4;3;4;0;4;2;24;0;7;4;0;16;0;0;0;6;2;5;0;11;6;6;0;10;9;7;0;11;1;6;8;0;2;2;0;7;4;3;0;7;7;4
289;dme;Drosophila melanogaster (D. melanogaster Aug. 2014 BDGP Release 6 + ISO1 MT/dm6);;;6.40;0;8;4;4;4;0;2;8;9;0;2;12;6;0;2;7;8;0;2;4;7;0;5;5;8;0;6;3;12;0;2;3;0;9;0;0;0;5;4;8;0;10;6;13;0;14;6;13;0;7;1;8;10;0;10;0;0;6;3;3;0;14;6;0
326;oga*;Otolemur garnettii (Bushbaby Mar. 2011 Broad/otoGar3);;;6.96;1;6;3;5;4;0;3;9;10;9;11;13;6;0;3;5;6;0;3;3;7;0;4;3;9;0;6;3;13;0;7;3;0;8;0;0;0;8;5;9;0;12;11;9;0;13;5;8;0;21;1;6;6;0;4;3;2;7;4;5;0;12;9;3
326;dya;Drosophila yakuba (D. yakuba Nov. 2005 WUGSC 7.1);;;7.22;0;9;5;4;5;0;2;8;10;0;2;15;7;0;2;10;9;0;2;5;6;0;8;5;8;0;6;5;18;0;2;5;0;9;0;0;0;5;4;8;0;11;6;16;0;15;7;14;0;8;1;8;12;0;7;0;0;6;3;4;0;16;7;1
334;sbq;Saimiri boliviensis (Squirrel monkey Oct. 2011 Broad/saiBol1);;;7.27;0;9;8;5;6;0;4;5;10;1;6;14;6;1;4;7;9;1;3;3;9;0;5;4;8;0;6;5;15;0;8;5;1;8;0;0;0;8;6;10;0;11;12;9;0;9;10;5;0;19;3;6;6;0;4;3;0;7;5;5;0;10;6;4
338;opr*;Ochotona princeps (Pika May 2012 OchPri3.0/ochPri3);;;7.49;0;10;3;4;5;0;5;11;8;0;4;15;7;0;4;7;7;0;3;4;8;0;4;4;7;0;6;7;15;0;7;4;0;10;0;0;0;5;5;12;0;14;9;11;0;14;7;11;0;10;1;6;7;0;6;4;0;7;5;6;0;17;7;5
353;meu*;Macropus eugenii (Wallaby Sep. 2009 TWGS Meug_1.1/macEug2);;;7.62;1;10;3;8;5;0;4;6;6;0;6;14;8;0;1;7;8;0;4;2;7;0;4;2;8;0;6;3;13;0;6;5;1;8;0;0;1;7;4;7;0;14;10;11;0;13;12;7;0;29;7;8;7;0;3;5;0;10;7;4;0;16;10;5
367;hgl;Heterocephalus glaber (Naked mole-rat Jan. 2012 Broad HetGla_female_1.0/hetGla2);;;7.62;0;6;4;5;5;0;5;5;8;0;3;14;12;1;4;6;7;0;3;3;13;0;5;3;15;2;4;4;46;6;5;6;0;7;0;0;0;7;3;6;0;9;8;15;2;10;6;4;0;23;7;6;5;0;4;4;2;7;6;5;4;10;4;3
373;lcm;Latimeria chalumnae (Coelacanth Aug. 2011 Broad/latCha1);;;7.96;0;7;11;4;4;0;5;8;7;0;7;11;3;0;7;4;3;0;6;3;12;0;10;4;11;0;9;2;5;0;20;3;2;8;0;0;0;5;10;9;3;9;20;13;1;19;11;8;5;17;4;15;4;0;1;4;0;8;9;8;0;7;5;2
374;san*;Sorex araneus (Shrew Aug. 2008 Broad/sorAra2);;;8.24;0;10;4;4;6;1;2;13;15;0;5;15;7;0;5;7;8;0;3;4;8;0;6;2;8;0;5;5;10;0;8;3;0;9;0;0;0;7;5;7;0;12;8;13;0;19;10;14;0;25;2;6;9;0;5;3;0;8;6;6;0;22;12;2
383;cpo*;Cavia porcellus (Guinea pig) (Broad Feb 2008);;;8.36;0;8;4;6;5;0;3;6;10;0;5;15;6;1;3;6;8;0;3;4;8;0;4;3;10;0;4;3;28;4;9;5;0;15;0;0;0;8;4;8;0;18;11;26;1;10;6;5;0;34;1;8;7;0;4;3;0;10;5;5;0;11;6;6
407;rno;Rattus norvegicus (rn5 Mar 2012);;;8.89;1;8;3;0;1;0;1;5;12;0;3;13;8;0;3;7;11;0;4;3;33;0;6;3;9;0;5;4;36;2;9;4;0;2;0;0;0;10;6;10;0;15;1;19;2;15;10;8;0;40;1;8;6;0;3;5;1;12;6;8;0;11;9;5
408;cjc;Callithrix jacchus (marmoset) (WUGSC 3.2 Mar 2009);;;8.80;0;8;9;6;7;0;3;11;9;2;5;19;6;1;4;10;9;0;5;4;7;0;6;4;9;1;6;4;15;1;5;4;0;19;0;0;1;8;4;12;0;23;14;11;1;13;11;12;0;30;2;6;6;3;4;3;0;8;5;5;0;14;9;4
411;pha*;Papio hamadryas (baboon) (Nov 2008);;;8.93;0;12;7;7;9;0;3;6;12;2;4;15;9;1;7;12;9;0;5;3;7;0;6;4;10;0;7;6;19;1;9;5;0;15;0;0;0;10;6;11;1;18;12;12;1;10;13;4;2;28;1;8;7;0;6;4;0;9;6;5;0;13;4;8
414;aga;Anopheles gambiae;;;9.20;0;9;2;3;5;0;3;10;12;0;2;18;31;0;3;29;6;0;2;8;7;0;8;13;8;0;2;5;17;0;3;6;0;22;0;0;0;21;4;11;0;11;8;17;0;20;11;15;0;5;0;6;10;0;8;0;0;6;2;2;0;15;8;0
418;ppp;Physcomitrella patens ;;;9.18;1;14;2;6;6;1;5;5;12;0;4;24;13;0;2;11;13;0;5;7;13;0;8;4;10;0;5;6;19;0;9;8;0;8;0;0;0;9;9;10;1;14;8;16;0;11;7;14;0;7;1;9;8;1;7;5;0;9;6;10;0;15;9;11
421;nle;Nomascus leucogenys (Gibbon Oct. 2012 GGSC Nleu3.0/nomLeu3);;;9.04;1;11;7;5;8;0;3;9;12;3;5;16;11;1;6;10;9;1;4;4;9;1;5;4;11;0;4;5;18;1;9;5;0;14;0;0;0;11;9;13;2;14;22;15;0;10;10;8;1;22;3;8;7;0;7;3;0;8;6;5;0;12;6;7
435;ggo;Gorilla gorilla gorilla (gorilla) (gorGor3.1 May 2011);;;9.42;0;12;8;7;8;0;4;5;11;2;6;17;9;1;8;10;10;1;4;5;8;0;7;4;9;0;6;6;22;2;6;4;1;16;0;0;0;7;7;14;1;24;13;14;0;15;14;7;0;28;3;8;7;0;6;5;0;8;5;6;0;12;3;9
446;shr;Sarcophilus harrisii (Tasmanian devil Feb. 2011 WTSI Devil_ref v7.0/sarHar1);;;9.87;0;13;6;3;9;0;4;9;11;0;4;22;8;0;4;10;10;0;5;3;10;0;6;3;9;0;7;2;18;0;7;4;0;11;0;0;0;9;45;10;0;13;14;32;0;19;15;10;0;8;2;8;4;0;5;3;0;8;5;4;0;19;9;6
455;tsy*;Tarsius syrichta (Tarsier Sep. 2013 Tarsius_syrichta-2.0.1/tarSyr2);;;9.25;0;6;#;4;6;0;5;7;8;0;4;12;6;0;4;6;7;0;5;3;7;1;32;4;9;0;4;4;12;0;4;3;0;10;0;0;1;10;64;6;1;15;10;7;1;13;9;10;1;25;1;6;6;0;5;3;0;9;6;4;0;14;6;7
458;mcc;Macaca mulatta (Rhesus Oct. 2010 BGI CR_1.0/rheMac3);;;9.80;0;9;15;8;9;0;5;6;10;5;7;18;10;3;6;11;9;2;6;4;8;0;8;3;9;0;5;4;21;1;10;5;1;23;0;0;0;14;10;12;2;19;16;13;1;14;11;6;0;27;2;8;6;0;5;4;0;8;6;7;0;14;4;8
469;mmu;Mus musculus (mm10 Dec 2011);;;10.13;0;7;7;4;5;0;4;10;12;1;5;19;8;1;3;12;10;1;3;3;8;1;8;3;11;0;4;4;23;4;11;10;0;11;0;0;1;10;7;12;0;13;14;26;0;16;8;14;1;60;1;8;6;0;5;3;0;8;6;5;2;15;8;7
476;pan*;Papio anubis (Baboon Mar. 2012 Baylor Panu_2.0/papAnu2);;;10.20;1;13;8;8;8;0;3;11;14;2;6;19;9;1;7;12;9;1;5;3;8;0;6;4;10;0;7;6;20;1;9;5;3;21;0;0;0;10;9;12;2;21;14;15;2;15;13;9;1;27;3;9;7;0;5;4;0;11;6;5;0;20;8;8
481;mdo;Monodelphis domestica (opossum) (Broad Oct 2006);;;10.58;0;12;2;4;8;0;6;11;13;0;7;25;9;0;5;9;12;0;6;3;11;0;8;3;12;0;7;3;15;0;9;6;0;15;0;0;0;9;7;11;0;13;13;19;1;24;14;13;4;46;0;9;5;0;5;4;0;9;6;5;0;24;11;8
485;eeu*;Erinaceus europaeus (Hedgehog May 2012 EriEur2.0/eriEur2);;;7.59;0;8;3;6;6;0;3;6;9;0;4;16;7;0;6;4;7;0;3;3;10;0;5;3;9;0;6;4;14;0;10;4;0;13;0;0;0;5;4;8;0;7;11;€;0;13;8;9;0;34;2;7;6;0;5;3;0;7;5;7;0;14;7;5
494;ecb;Equus caballus (horse) (Sep 2007);;;10.76;0;12;4;6;7;0;5;3;20;0;5;25;12;3;6;15;12;0;4;4;10;0;7;3;9;0;7;3;27;0;11;8;1;14;0;0;1;11;6;12;1;17;15;16;0;10;11;51;0;25;4;7;10;0;4;4;0;12;5;7;0;10;4;8
498;cge;Cricetulus griseus cell line CHO-K1 (Chinese hamster ovary CriGri 1.0 Aug 2011);;;10.96;0;8;4;4;5;0;4;10;13;0;5;16;13;0;5;9;6;0;3;3;7;0;6;3;8;1;4;4;22;1;15;6;0;11;0;0;0;14;5;11;0;17;15;86;0;15;7;20;0;41;2;6;6;0;6;3;0;9;5;6;1;14;6;7
499;vvi;Vitis vinifera (Grapevine 12X);;;10.89;0;14;7;13;10;0;9;7;13;1;7;25;14;0;5;9;13;1;7;3;13;0;16;4;10;2;6;3;11;0;28;5;1;17;0;0;1;12;9;10;1;18;11;13;1;18;14;21;0;11;1;10;8;0;5;4;0;9;6;7;0;17;12;6
503;ptr;Pan troglodytes (Chimp Feb. 2011 CSAC 2.1.4/panTro4);;;10.82;0;15;10;7;9;0;3;6;14;1;5;21;11;1;10;12;11;1;7;4;9;1;8;5;10;0;6;5;30;1;9;5;2;22;0;0;0;10;8;10;1;27;14;19;1;15;15;11;1;27;2;7;7;1;6;5;3;9;6;5;0;13;6;13
506;ocu;Oryctolagus cuniculus (rabbit) (Broad Apr 2009);;;10.67;0;14;6;3;5;0;4;16;11;1;7;18;12;0;8;14;10;0;4;5;9;0;5;4;8;1;7;5;21;0;9;4;0;12;0;0;0;9;5;15;1;26;12;29;1;23;18;19;0;25;1;10;7;0;4;5;0;10;6;6;21;0;14;16
517;ppy*;Pongo pygmaeus abelii (Orangutan July 2007 WUGSC 2.0.2/ponAbe2);;;11.18;0;13;6;6;10;0;3;11;14;4;6;20;10;1;7;18;10;1;6;5;10;0;7;5;12;0;4;7;22;1;9;4;1;19;0;0;0;10;7;13;2;33;20;22;1;13;22;8;0;30;3;6;7;0;6;7;0;8;8;7;0;14;8;10
518;csi*;Ceratotherium simum (White rhinoceros May 2012 CerSimSim1.0/cerSim1);;;11.40;0;13;5;6;6;0;4;4;13;0;5;26;11;1;7;15;13;0;5;4;10;0;7;4;10;0;8;5;23;0;13;6;0;11;0;0;0;10;5;12;2;14;15;22;1;13;11;77;0;24;1;8;10;0;5;4;0;13;6;7;0;10;4;9
540;tng;Tetraodon nigroviridis (tetraodon) (Genoscope 8.0 Mar 2007);;;11.91;1;17;5;7;15;0;6;32;16;0;5;20;10;0;4;15;12;1;7;2;11;1;11;4;26;0;10;13;20;0;10;4;0;13;0;0;0;12;9;18;0;17;9;20;0;18;15;13;0;15;1;10;14;0;6;2;0;11;9;9;0;14;14;6
554;cpic;Chrysemys picta bellii (Painted turtle Dec. 2011 v3.0.1/chrPic1);;;11.87;2;22;13;7;2;1;4;6;11;1;13;16;16;0;5;6;24;0;15;10;12;1;4;2;17;0;18;5;11;1;15;4;1;5;0;0;0;10;16;11;1;17;36;9;0;14;17;5;5;18;4;10;7;0;5;3;3;20;26;10;0;11;24;2
575;tru;Takifugu rubripes (Fugu Oct. 2011 FUGU5/fr3);;;12.64;1;18;6;9;10;0;4;21;11;0;6;35;19;0;8;25;11;0;7;3;10;0;7;6;18;0;7;7;10;0;8;6;1;13;0;0;1;19;8;12;0;20;19;19;1;22;13;20;0;15;1;16;16;1;7;4;0;17;13;10;0;18;12;4
578;sbi;Sorghum bicolor (Version 1.0);;;12.56;0;20;4;9;15;0;9;11;17;0;5;37;16;2;4;10;11;3;12;6;14;0;11;7;12;2;9;6;18;0;13;11;1;14;0;0;1;15;11;13;1;16;9;18;2;24;13;23;0;13;1;13;15;0;4;7;0;13;7;10;0;24;10;6
582;mtr;Medicago truncatula (March 2009 Version 3.0);;;12.47;0;26;7;14;9;0;10;4;19;0;10;40;17;3;7;7;12;2;8;2;7;0;11;1;10;4;10;1;25;0;16;3;1;12;0;0;0;17;17;5;9;28;18;16;0;28;19;11;0;10;1;14;12;0;5;3;0;15;8;6;1;23;15;3
596;cel;Caenorhabditis elegans (WS220 Oct 2010);;;13.18;0;15;4;7;20;0;3;5;21;0;7;19;19;0;5;6;15;0;9;6;6;0;31;4;17;0;11;7;22;0;9;4;0;19;0;0;0;19;20;7;0;20;14;30;0;27;17;24;0;13;2;12;18;0;8;1;1;9;8;4;0;14;34;3
618;pop;Populus trichocarpa (Jan 2010 Version 2.0) ;;;13.53;4;18;7;3;40;1;0;7;20;1;9;26;17;0;8;10;13;1;9;5;14;0;22;4;6;0;11;4;20;0;18;5;0;18;0;0;0;13;11;11;0;22;17;17;0;33;14;21;1;13;1;14;10;0;7;5;0;16;11;11;0;25;17;7
622;hsa;Homo sapiens (hg38 - GRCh38 Dec 2013);;;13.31;0;18;8;12;12;0;4;11;19;6;5;22;11;1;8;21;12;1;6;5;10;1;8;4;10;0;6;7;35;1;10;5;5;32;0;0;0;10;18;24;2;40;20;24;1;16;17;10;1;38;3;8;7;0;6;4;1;8;7;5;0;15;9;12
639;bdi;Brachypodium distachyon (JGI v1.0 8X);;;13.82;0;18;4;15;14;0;10;8;20;2;4;55;15;3;5;11;11;4;10;5;15;0;18;8;9;3;10;6;19;0;12;11;1;17;0;0;3;21;15;11;0;16;12;18;0;25;15;19;0;14;0;18;16;1;5;6;0;18;9;9;0;27;9;9
674;oni*;Oreochromis niloticus (Nile tilapia Jan. 2011 Broad oreNil1.1/oreNil2);;;14.80;0;23;12;7;14;0;7;16;25;0;25;27;8;0;9;9;10;0;10;6;14;0;11;4;18;1;25;8;18;0;11;12;3;18;0;0;0;23;6;11;0;9;16;43;0;10;14;15;1;42;1;12;16;0;7;6;2;10;27;18;0;13;12;9
684;ath;Arabidopsis thaliana (TAIR10 Feb 2011);;;15.00;0;17;6;12;12;1;11;3;17;2;5;32;14;2;7;8;37;3;12;7;15;0;47;5;10;1;9;5;16;0;10;7;0;83;0;0;0;12;10;9;0;19;15;17;0;29;14;13;0;17;0;16;11;0;6;4;0;16;10;8;0;25;12;5
738;osa;Oryza sativa;;;15.67;0;20;4;19;15;0;10;10;18;0;5;56;17;16;4;10;12;4;17;8;14;0;14;9;11;8;15;5;20;1;10;12;2;19;0;0;0;26;21;10;0;29;12;20;1;31;16;25;1;17;0;18;24;0;4;8;0;20;12;11;0;28;9;10
738;gmx;Glycine max (soybean) (Wm82.a2);;;16.31;0;22;9;18;16;0;10;7;31;0;8;36;22;1;9;13;15;0;11;6;21;0;27;5;9;1;10;4;24;0;17;8;0;21;0;0;0;18;13;13;2;22;20;22;0;33;16;24;0;14;0;18;13;0;9;5;0;28;18;13;0;29;18;9
743;cbr;Caenorhabditis briggsae (C. briggsae Jan. 2007 WUGSC 1.0/cb3);;;16.51;0;22;6;11;26;0;5;7;21;0;24;23;25;0;6;6;17;0;8;8;6;0;41;4;22;0;10;9;29;0;14;7;0;19;0;0;0;21;24;10;0;23;16;40;0;34;19;30;0;16;0;13;22;0;10;0;0;9;10;2;0;21;42;5
749;mpu*;Mustela putorius furo (Ferret Apr. 2011 MusPutFur1.0/musFur1);;;10.68;0;11;4;6;6;0;4;5;10;0;5;20;8;0;6;7;8;0;4;4;9;0;7;2;10;0;7;5;15;0;8;5;0;9;0;0;1;7;37;17;6;12;31;€;0;8;7;19;0;25;1;11;6;0;29;5;0;12;16;21;0;9;9;4
804;str*;Spermophilus tridecemlineatus (Squirrel Nov. 2011 Broad/speTri2);;;11.02;1;10;3;10;6;0;3;4;14;6;4;14;18;3;5;39;15;1;7;6;12;1;7;3;34;5;6;7;€;31;39;18;0;9;0;0;0;6;4;6;1;9;10;12;6;8;5;7;0;48;1;7;6;0;5;3;0;7;5;6;7;13;5;20
807;ssc;Sus scrofa (Pig Aug. 2011 SGSC Sscrofa10.2/susScr3);;;12.68;0;21;4;6;8;0;5;5;13;0;5;23;10;1;11;12;10;0;5;4;9;0;4;3;13;0;8;4;23;0;14;7;0;17;0;0;0;10;9;12;2;18;38;16;10;97;€;13;1;23;0;7;7;0;5;3;0;10;7;4;0;19;10;6
827;cja*;Caenorhabditis japonica (WUGSC 3.0.2 Mar 2008);;;18.33;1;24;5;7;26;0;6;12;26;0;7;30;23;0;7;13;19;0;7;15;9;0;43;8;24;0;12;11;31;0;11;8;0;24;0;0;0;17;14;16;0;23;30;37;0;41;20;40;0;15;1;18;21;0;11;1;0;15;12;3;0;34;47;2
856;oaa;Ornithorhynchus anatinus (platypus) (WUGSC 5.0.1 Mar 2007);;;18.56;1;24;10;10;8;0;7;18;27;0;10;32;23;1;15;10;16;4;6;8;19;4;12;7;23;1;18;10;83;0;17;11;0;28;0;0;1;24;11;19;0;21;32;25;0;27;16;27;0;37;5;14;12;0;7;14;2;18;6;9;2;40;15;9
906;cfa;Canis familiaris (dog) (CanFam3.1 Sept 2011);;;11.23;0;10;4;5;4;0;4;7;9;0;5;23;6;0;5;8;10;0;5;8;8;0;8;4;8;0;4;5;14;0;11;4;0;9;0;0;0;9;43;20;1;21;34;€;2;13;15;22;0;21;1;6;6;0;15;4;0;8;9;29;0;11;11;9
1065;spu;Strongylocentrotus purpuratus (Sea urchin) ;;;23.56;2;0;14;2;18;0;8;5;69;2;22;73;20;0;11;16;25;0;15;6;19;0;21;9;27;0;21;9;32;0;17;7;0;24;0;0;0;26;17;21;0;39;57;42;0;82;26;29;0;31;0;18;29;0;19;1;1;17;18;19;0;42;33;4
1095;cbr*;Caenorhabditis brenneri (WUGSC 6.0.1 Feb 2008);;;24.07;0;24;7;14;32;0;8;8;33;1;26;29;33;0;8;15;20;0;14;9;25;2;54;9;31;1;15;10;35;0;11;6;2;28;0;0;1;26;40;11;0;33;29;49;0;34;36;37;2;21;3;22;32;0;17;24;0;14;13;11;0;39;66;25
1119;dno*;Dasypus novemcinctus (Armadillo Dec. 2011 Baylor/dasNov3);;;15.86;0;12;8;8;5;0;3;10;12;1;6;30;12;1;16;#;10;0;6;6;7;0;7;4;11;0;8;7;23;2;66;17;0;14;0;0;1;10;5;10;0;23;18;43;0;21;20;45;0;22;1;15;10;0;8;5;0;10;9;47;24;19;€;34
1176;oas;Ovis aries (sheep) (Feb 2010);;;12.50;1;6;5;7;6;0;2;3;6;0;5;18;7;0;8;9;2;3;4;3;4;0;6;1;5;0;5;3;18;3;12;7;2;16;0;0;0;8;7;9;0;13;22;16;2;8;€;60;16;61;4;47;2;2;6;6;0;7;22;33;5;30;€;€
1198;zma;Zea mays (Version 5b.60);;;23.18;1;25;5;20;29;0;9;13;69;0;5;79;22;12;4;16;13;22;11;6;15;0;31;9;20;13;14;6;66;0;15;22;0;21;0;0;1;26;22;13;0;49;82;€;1;42;22;30;1;25;0;27;35;0;7;6;0;14;9;11;0;33;11;11
1463;aml;Ailuropoda melanoleuca (panda) (BGI-Shenzhen AilMel 1.0 Dec 2009);;;13.84;0;11;5;9;7;0;5;7;12;0;6;24;10;0;7;9;10;0;6;4;9;0;11;5;10;0;9;10;17;0;9;5;0;11;0;0;0;8;43;25;6;28;55;€;1;11;11;37;0;25;2;10;8;1;#;7;2;13;17;45;0;10;7;7
1492;gmo*;Gadus morhua (Atlantic cod May 2010 Genofisk GadMor_May2010/gadMor1);;;30.05;6;36;16;15;33;0;24;47;26;0;18;€;21;0;9;28;30;0;18;14;55;0;21;22;30;0;30;30;55;1;24;26;0;50;0;0;1;26;11;45;2;34;63;43;1;30;51;50;0;27;2;29;31;2;17;10;1;41;21;28;0;30;39;18
2002;lav;Loxodonta africana (elephant) (Broad/July 2009);;;25.95;1;32;15;17;22;0;11;10;43;0;7;50;41;1;50;35;29;0;7;4;16;0;14;3;14;1;22;10;54;0;53;15;1;19;0;0;3;27;14;28;4;51;60;36;0;20;€;24;1;28;24;23;14;0;18;3;3;76;#;16;4;33;€;#
2017;tma*;Trichechus manatus latirostris (Manatee Oct. 2011 Broad v1.0/triMan1);;;13.98;1;11;6;10;8;0;5;5;13;1;8;21;11;0;26;16;14;0;6;4;11;0;8;3;16;1;18;4;20;1;40;6;1;15;0;0;0;12;8;10;1;23;31;16;1;15;€;19;5;22;18;13;8;0;12;7;5;36;€;13;9;23;€;#
2485;pma*;Petromyzon marinus (Lamprey Sep. 2010 WUGSC 7.0/petMar2);;;34.89;2;57;5;#;€;0;40;#;€;0;10;€;€;1;26;#;22;0;20;35;54;0;43;21;62;19;19;23;€;0;31;24;0;90;0;0;1;27;44;€;0;€;24;23;2;90;12;11;0;68;1;9;85;1;26;10;0;65;18;50;1;54;17;6
2489;gac*;Gasterosteus aculeatus (stickleback) (Broad 1.0 Feb 2006);;;41.18;0;35;12;7;49;0;17;9;€;0;61;€;21;1;12;18;52;0;62;29;63;0;29;18;99;0;35;23;53;0;53;56;0;17;0;0;0;52;60;81;1;€;61;97;0;€;46;53;0;€;1;74;49;0;#;2;0;30;68;26;0;12;61;4
2639;xtr;Xenopus tropicalis (frog) (JGI 4.2 Nov 2009);;;50.41;2;58;#;22;38;2;25;32;63;5;51;€;55;0;36;53;40;3;41;23;60;1;53;36;€;0;91;29;67;0;47;36;0;€;0;0;1;42;28;40;1;47;72;97;0;59;84;51;2;92;1;33;33;3;33;8;0;99;€;27;0;85;80;€
3729;fca;Felis catus (cat) (Felis_catus-6.2 Sept 2011);;;19.40;1;12;19;8;6;0;33;5;10;0;9;24;8;0;6;9;8;1;14;5;8;1;68;7;9;0;13;9;18;1;10;7;0;10;0;0;2;16;€;47;5;28;50;€;1;9;15;44;1;32;18;23;9;9;€;24;2;12;54;53;2;10;48;6
4040;bta;Bos taurus (Cow Jun. 2014 Bos_taurus_UMD_3.1.1/bosTau8);;;22.58;6;30;10;14;11;0;5;6;18;0;8;35;20;0;21;39;13;32;7;7;13;0;9;4;14;1;10;7;31;2;35;16;11;39;0;0;4;19;20;40;0;30;78;40;6;42;€;€;143;€;29;€;13;7;12;16;4;19;44;€;20;63;€;€
5845;ttr*;Tursiops truncatus (Dolphin Oct. 2011 Baylor Ttru_1.4/turTru2);;;16.73;0;12;6;7;6;0;4;6;11;0;5;17;8;3;16;22;12;0;6;4;7;0;5;4;9;1;6;3;19;2;36;21;1;18;0;0;0;9;16;15;0;13;74;19;10;49;€;€;6;22;21;€;7;1;7;12;0;11;48;54;19;43;€;€
7080;bacu;Balaenoptera acutorostrata scammoni (Minke whale Oct. 2013 BalAcu1.0/balAcu1);;;18.77;0;13;13;8;6;0;4;7;12;1;8;21;14;1;18;32;10;1;5;4;7;0;5;4;13;0;8;4;20;0;42;20;0;14;0;0;0;11;10;20;0;24;86;29;20;45;€;€;2;24;17;€;9;0;9;21;0;13;55;#;12;64;€;€
13727;cmk;Callorhinchus milii (Elephant shark Dec. 2013 Callorhinchus_milii-6.1.3/calMil1);;;32.70;3;35;13;31;20;2;20;25;31;0;23;94;22;16;€;€;26;1;54;48;12;6;51;41;24;12;€;€;75;168;€;€;1;36;0;0;1;37;7;18;2;48;43;36;6;49;66;€;1;15;3;30;9;0;25;2;0;33;14;12;2;19;66;#
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg
;;;total du diagramme;;;43;1,166;489;586;803;9;489;693;1,215;66;618;1,746;976;93;582;914;956;98;625;472;970;23;1,042;441;1,044;83;749;469;1,773;240;1,101;622;48;1,305;0;0;34;1,023;979;1,062;71;1,453;1,725;1,619;92;1,660;1,054;1,361;208;1,809;238;915;915;33;563;373;36;1,111;846;846;137;1,530;1,048;472
Codons forts;;;pente;;;;1.117;0.453;0.554;0.847;;0.513;0.635;1.291;;0.690;2.057;0.955;;0.608;0.932;0.907;;0.714;0.518;0.997;;1.066;0.485;1.153;;0.87;0.501;1.706;;1.101;0.695;;1.294;;;;0.992;0.923;1.08;;1.436;1.72;1.704;;1.663;1.232;1.361;;1.656;-;0.942;0.935;;0.607;0.325;;1.195;0.965;0.837;;1.415;1.298;0.498
;;;somme calculée;;;;-;27.0;19.3;29.5;;-;22.2;98.2;;-;149.5;21.2;;19.9;77.8;-;;-;-;-;;-;-;58.1;;16.4;55.8;50.5;;22.7;22.7;;65.2;;;;-;17.9;37.7;;109.2;-;146.4;;68.5;151.8;123.5;;105.6;-;54.7;-;;45.2;-;;-;87.2;34.6;;-;164.0;96.4
;;;Totaux + calculés;;;;1,166;516;605;833;;489;715;1,313;;618;1,895;997;;602;992;956;;625;472;970;;1,042;441;1,102;;765;525;1,824;;1,124;645;;1,370;0;0;;1,023;997;1,100;;1,562;1,725;1,765;;1,728;1,206;1,485;;1,915;238;970;915;;608;373;;1,111;933;881;;1,530;1,212;568
;;;R2;;;;915;784;818;830;;755;704;843;;755;892;877;;731;803;899;;763;731;828;;713;764;795;;795;874;857;;752;829;;738;;;;938;606;827;;908;783;839;;781;889;728;;754;;809;765;;860;568;;799;665;606;;822;802;606
Codons faibles;;;c/t nombre >3;;;3;;;;;0;;;;6;;;;3;;;;5;;;;2;;;;6;;;;4;;;2;;;;2;;;;5;;;;6;;;;7;;;;;2;;;2;;;;9;;;
;;;c/t nombre >3, total;;;16;;;;;0;;;;35;;;;44;;;;66;;;;10;;;;61;;;;209;;;16;;;;9;;;;30;;;;58;;;;184;;;;;16;;;9;;;;120;;;
;;;reste calculé;;;30;;;;;9;;;;37;;;;52;;;;37;;;;15;;;;28;;;;35;;;34;;;;27;;;;46;;;;40;;;;31;;;;;19;;;29;;;;26;;;
;;;multiplicité X 100;;;38;;;;;11;;;;47;;;;66;;;;47;;;;19;;;;35;;;;44;;;43;;;;34;;;;58;;;;51;;;;39;;;;;24;;;37;;;;33;;;
;;;c/t nombre=3;;;1;;;;;0;;;;1;;;;6;;;;4;;;;0;;;;1;;;;1;;;2;;;;2;;;;1;;;;0;;;;0;;;;;2;;;3;;;;0;;;
Totaux des 121 réduits;;;;;46942;30;1,166;516;605;833;9;489;715;1,313;37;618;1,895;997;52;602;992;956;37;625;472;970;15;1,042;441;1,102;28;765;525;1,824;35;1,124;645;34;1,370;0;0;27;1,023;997;1,100;46;1,562;1,725;1,765;40;1,728;1,206;1,485;31;1,915;238;970;915;19;608;373;29;1,111;933;881;26;1,530;1,212;568
zéros tRNAs;;;;;;55;1;0;1;0;72;2;1;0;52;1;0;0;42;0;0;0;52;0;0;0;65;0;0;1;56;0;2;0;54;0;1;54;0;79;79;57;1;0;0;46;0;1;1;46;0;0;0;52;1;16;1;1;66;0;8;62;0;0;1;61;2;0;4
79−zéros;;;;;;24;78;79;78;79;7;77;78;79;27;78;79;79;37;79;79;79;27;79;79;79;14;79;79;78;23;79;77;79;25;79;78;25;79;0;0;22;78;79;79;33;79;78;78;33;79;79;79;27;78;63;78;78;13;79;71;17;79;79;78;18;77;79;75
indices tRNAs;;;;;;0.38;14.76;6.53;7.66;10.54;0.11;6.19;9.05;16.62;0.47;7.82;23.99;12.62;0.66;7.62;12.55;12.10;0.47;7.91;5.97;12.28;0.19;13.19;5.58;13.95;0.35;9.69;6.64;23.08;0.44;14.22;8.16;0.43;17.34;0.00;0.00;0.34;12.95;12.62;13.92;0.58;19.78;21.84;22.35;0.51;21.88;15.26;18.79;0.39;24.24;3.01;12.27;11.58;0.24;7.70;4.72;0.37;14.06;11.81;11.15;0.33;19.37;15.34;7.20
;;;;;;ttt;ttc;tta;ttg;ctt;ctc;cta;ctg;att;atc;ata;atg;gtt;gtc;gta;gtg;tct;tcc;tca;tcg;cct;ccc;cca;ccg;act;acc;aca;acg;gct;gcc;gca;gcg;tat;tac;taa;tag;cat;cac;caa;cag;aat;aac;aaa;aag;gat;gac;gaa;gag;tgt;tgc;tga;tgg;cgt;cgc;cga;cgg;agt;agc;aga;agg;ggt;ggc;gga;ggg

Introns, Comparaison des introns[modifier | modifier le wikicode]

IV 1.79;Introns de tRNAs. 79− fungi;;;;;55 830;;;IV 1.42;Introns de tRNAs. 42 fungi;;;;;55 830;;;IV 1.79;Zintrons de tRNAs. 79− fungi;;;;;55 830;;;IV 1.42;Zintrons de tRNAs. 42 fungi;;;;;55 830;
ttt;14;tcc;29;tat;30;tgt;3;;ttt;5;tcc;2;tat;0;tgt;2;;ttt;5;tcc;4;tat;17;tgt;2;;ttt;2;tcc;1;tat;0;tgt;1
atc;18;acc;0;aat;5;agt;3;;atc;2;acc;0;aat;5;agt;0;;atc;5;acc;0;aat;4;agt;2;;atc;1;acc;0;aat;2;agt;0
ctc;1;ccc;6;cat;8;cgc;4;;ctc;5;ccc;0;cat;0;cgc;0;;ctc;1;ccc;3;cat;3;cgc;3;;ctc;2;ccc;0;cat;0;cgc;0
gtc;0;gcc;1;gat;5;ggt;5;;gtc;2;gcc;0;gat;5;ggt;2;;gtc;0;gcc;1;gat;3;ggt;3;;gtc;1;gcc;0;gat;2;ggt;1
ttc;3;tct;3;tac;1568;tgc;18;;ttc;621;tct;83;tac;595;tgc;71;;ttc;2;tct;2;tac;79;tgc;10;;ttc;35;tct;9;tac;42;tgc;12
att;6;act;13;aac;10;agc;11;;att;336;act;100;aac;224;agc;343;;att;3;act;7;aac;5;agc;6;;att;16;act;13;aac;16;agc;38
ctt;57;cct;23;cac;14;cgt;0;;ctt;340;cct;298;cac;219;cgt;217;;ctt;10;cct;6;cac;9;cgt;0;;ctt;21;cct;20;cac;19;cgt;22
gtt;4;gct;5;gac;23;ggc;9;;gtt;140;gct;283;gac;298;ggc;243;;gtt;2;gct;4;gac;2;ggc;4;;gtt;9;gct;14;gac;15;ggc;11
tta;23;tca;16;taa;10;tga;4;;tta;83;tca;102;taa;2;tga;21;;tta;8;tca;9;taa;3;tga;2;;tta;19;tca;24;taa;1;tga;7
ata;575;aca;6;aaa;68;aga;594;;ata;140;aca;71;aaa;312;aga;48;;ata;69;aca;3;aaa;8;aga;58;;ata;41;aca;15;aaa;36;aga;12
cta;3;cca;63;caa;187;cga;166;;cta;162;cca;400;caa;140;cga;190;;cta;2;cca;7;caa;8;cga;7;;cta;32;cca;33;caa;20;cga;16
gta;6;gca;3;gaa;35;gga;27;;gta;60;gca;102;gaa;119;gga;100;;gta;5;gca;2;gaa;8;gga;9;;gta;21;gca;16;gaa;18;gga;14
ttg;506;tcg;3;tag;16;tgg;6;;ttg;360;tcg;157;tag;2;tgg;295;;ttg;65;tcg;1;tag;10;tgg;4;;ttg;32;tcg;37;tag;1;tgg;30
atg;189;acg;9;aag;406;agg;18;;atg;248;acg;60;aag;481;agg;86;;atg;11;acg;6;aag;7;agg;5;;atg;24;acg;15;aag;21;agg;18
ctg;9;ccg;14;cag;22;cgg;5;;ctg;169;ccg;74;cag;155;cgg;40;;ctg;7;ccg;4;cag;8;cgg;2;;ctg;20;ccg;18;cag;15;cgg;12
gtg;8;gcg;5;gag;16;ggg;19;;gtg;88;gcg;86;gag;405;ggg;79;;gtg;6;gcg;4;gag;6;ggg;7;;gtg;20;gcg;18;gag;16;ggg;16

Introns, Comparaison des tRNAs[modifier | modifier le wikicode]

IV 1.42;Indices de tRNAs. 42 fungi;;;;;55 830;;;IV 1.79;Indices de tRNAs. 79 −fungi;;;;;55 830;;;IV 1.79;Zindices de tRNAs. 79 −fungi;;;;;55 830;;;IV 1.42;Zindices de tRNAs. 42 fungi;;;;;55 830;
ttt;0.05;tcc;0.02;tat;0.05;tgt;0.02;;ttt;0.38;tcc;0.47;tat;0.43;tgt;0.39;;ttt;55;tcc;52;tat;54;tgt;52;;ttt;41;tcc;41;tat;40;tgt;41
atc;0.10;acc;0;aat;0.02;agt;0;;atc;0.47;acc;0.35;aat;0.58;agt;0.37;;atc;52;acc;56;aat;46;agt;62;;atc;38;acc;42;aat;41;agt;42
ctc;0.31;ccc;0.05;cat;0;cgc;0;;ctc;0.11;ccc;0.19;cat;0.34;cgc;0.24;;ctc;72;ccc;65;cat;57;cgc;66;;ctc;30;ccc;40;cat;42;cgc;42
gtc;0.02;gcc;0;gat;0.02;ggt;0.02;;gtc;0.66;gcc;0.44;gat;0.51;ggt;0.33;;gtc;42;gcc;54;gat;46;ggt;61;;gtc;41;gcc;42;gat;41;ggt;41
ttc;7.02;tct;7.38;tac;5.93;tgc;3.55;;ttc;14.76;tct;12.10;tac;17.34;tgc;24.19;;ttc;1;tct;0;tac;0;tgc;1;;ttc;0;tct;0;tac;0;tgc;0
att;8.98;act;7.90;aac;7.02;agc;3.67;;att;16.66;act;13.97;aac;19.78;agc;14.06;;att;0;act;1;aac;0;agc;0;;att;0;act;0;aac;0;agc;1
ctt;4.05;cct;3.64;cac;5.14;cgt;5.67;;ctt;10.54;cct;12.28;cac;12.95;cgt;11.58;;ctt;0;cct;0;cac;1;cgt;1;;ctt;11;cct;5;cac;0;cgt;0
gtt;9.55;gct;9.26;gac;9.55;ggc;11.60;;gtt;12.80;gct;23.45;gac;21.89;ggc;19.37;;gtt;0;gct;0;gac;0;ggc;2;;gtt;0;gct;0;gac;1;ggc;0
tta;3.05;tca;2.14;taa;−;tga;0.26;;tta;6.49;tca;7.91;taa;−;tga;3.01;;tta;0;tca;0;taa;−;tga;16;;tta;2;tca;0;taa;−;tga;32
ata;1.36;aca;2.33;aaa;3.69;aga;4.88;;ata;7.82;aca;9.83;aaa;21.84;aga;11.81;;ata;1;aca;0;aaa;1;aga;0;;ata;1;aca;0;aaa;1;aga;2
cta;1.71;cca;4.81;caa;4.67;cga;2.21;;cta;6.19;cca;13.19;caa;12.62;cga;7.70;;cta;2;cca;0;caa;0;cga;0;;cta;7;cca;1;caa;0;cga;20
gta;1.50;gca;3.33;gaa;5.93;gga;3.26;;gta;7.61;gca;14.38;gaa;15.26;gga;15.29;;gta;0;gca;0;gaa;0;gga;0;;gta;2;gca;0;gaa;0;gga;0
ttg;4.48;tcg;1.88;tag;−;tgg;4.12;;ttg;7.67;tcg;5.97;tag;−;tgg;12.27;;ttg;1;tcg;0;tag;−;tgg;1;;ttg;4;tcg;0;tag;−;tgg;2
atg;7.60;acg;1.57;aag;10.12;agg;1.57;;atg;26.11;acg;6.14;aag;22.38;agg;11.13;;atg;0;acg;2;aag;1;agg;1;;atg;0;acg;1;aag;1;agg;1
ctg;2.12;ccg;0.83;cag;3.52;cgg;1.31;;ctg;9.05;ccg;5.58;cag;13.91;cgg;4.72;;ctg;1;ccg;0;cag;0;cgg;8;;ctg;11;ccg;22;cag;0;cgg;4
gtg;2.21;gcg;1.43;gag;7.02;ggg;1.64;;gtg;12.53;gcg;8.15;gag;18.81;ggg;7.16;;gtg;0;gcg;1;gag;0;ggg;4;;gtg;1;gcg;16;gag;0;ggg;4
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
0.10;0.31;0.83;1.88;2.12;3.69;4.05;5.93;;0.11;0.66;3.01;8.15;9.05;13.19;13.91;19.78;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;7.02;11.60;;;;;;;;21.84;26.11;;;;;;;;;;;;;;;;;;;

Introns, Comparaison des sensibilités relatives[modifier | modifier le wikicode]

IV 1.42;Indices de tRNAs. 42 fungi;;;;;55 830;;;I 1;Nombres de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235027;
ttt;0.05;tcc;0.02;tat;0.05;tgt;0.02;;ttt;0.25;tct;0.12;tat;0.10;tgt;0.07
atc;0.10;acc;0;aat;0.02;agt;0;;att;0.12;act;2.55;aat;0.12;agt;0.02
ctc;0.31;ccc;0.05;cat;0;cgc;0;;ctt;9.15;cct;0.25;cat;0.10;cgc;8.26
gtc;0.02;gcc;0;gat;0.02;ggt;0.02;;gtt;0.22;gct;0.05;gat;0;ggt;0.02
ttc;7.02;tct;7.38;tac;5.93;tgc;3.55;;ttc;1.51;tcc;1.12;tac;1.59;tgc;1.11
att;8.98;act;7.90;aac;7.02;agc;3.67;;atc;2.28;acc;1.12;aac;2.17;agc;1.10
ctt;4.05;cct;3.64;cac;5.14;cgt;5.67;;ctc;0.95;ccc;0.68;cac;1.17;cgt;1.85
gtt;9.55;gct;9.26;gac;9.55;ggc;11.60;;gtc;1.10;gcc;1.03;gac;2.24;ggc;2.30
tta;3.05;tca;2.14;taa;−;tga;0.26;;tta;1.18;tca;1.31;taa;−;tga;0.33
ata;1.36;aca;2.33;aaa;3.69;aga;4.88;;ata;0.01;aca;1.46;aaa;2.26;aga;1.19
cta;1.71;cca;4.81;caa;4.67;cga;2.21;;cta;1.23;cca;1.35;caa;1.58;cga;0.22
gta;1.50;gca;3.33;gaa;5.93;gga;3.26;;gta;2.20;gca;2.53;gaa;2.40;gga;1.37
ttg;4.48;tcg;1.88;tag;−;tgg;4.12;;ttg;0.99;tcg;0.65;tag;−;tgg;1.08
atg;7.60;acg;1.57;aag;10.12;agg;1.57;;atg;4.47;acg;0.68;aag;0.60;agg;0.86
ctg;2.12;ccg;0.83;cag;3.52;cgg;1.31;;ctg;1.29;ccg;0.54;cag;0.59;cgg;0.83
gtg;2.21;gcg;1.43;gag;7.02;ggg;1.64;;gtg;0.33;gcg;0.30;gag;0.34;ggg;0.56
;;;;;;;;;;;;;;;;
3.80;;;;;;;;;-24.6;256.0;;;;;;
IV 1.4;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;;;IV1.4b;Champigons/bactéries sensibiltés relatives;;;;;;
ttt;0.01;tcc;0.01;tat;0.01;tgt;0.01;;ttt;0.01;tcc;0.01;tat;0.01;tgt;0.01
atc;0.03;acc;0;aat;0.01;agt;0;;atc;0.03;acc;0.00;aat;0.01;agt;0.00
ctc;0.08;ccc;0.01;cat;0;cgc;0;;ctc;0.08;ccc;0.01;cat;0.00;cgc;0.00
gtc;0.01;gcc;0;gat;0.01;ggt;0.01;;gtc;0.01;gcc;0.00;gat;0.01;ggt;0.01
ttc;1.85;tct;1.94;tac;1.56;tgc;0.93;;ttc;22;tct;73;tac;-2;tgc;-16
att;2.36;act;2.08;aac;1.85;agc;0.96;;att;3;act;86;aac;-15;agc;-12
ctt;1.07;cct;0.96;cac;1.35;cgt;1.49;;ctt;12;cct;41;cac;16;cgt;-20
gtt;2.51;gct;2.44;gac;2.51;ggc;3.05;;gtt;129;gct;136;gac;12;ggc;33
tta;0.80;tca;0.56;taa;−;tga;0.07;;tta;-32;tca;-57;taa;−;tga;-79
ata;0.36;aca;0.61;aaa;0.97;aga;1.28;;ata;−;aca;-58;aaa;-57;aga;8
cta;0.45;cca;1.27;caa;1.23;cga;0.58;;cta;-63;cca;-6;caa;-22.5;cga;165
gta;0.39;gca;0.88;gaa;1.56;gga;0.86;;gta;-82;gca;-65;gaa;-35;gga;-37
ttg;1.18;tcg;0.49;tag;−;tgg;1.08;;ttg;19;tcg;-23.9;tag;−;tgg;0
atg;2.00;acg;0.41;aag;2.66;agg;0.41;;atg;-55;acg;-40;aag;342;agg;-52
ctg;0.56;ccg;0.22;cag;0.93;cgg;0.34;;ctg;-57;ccg;-59;cag;57;cgg;-59
gtg;0.58;gcg;0.38;gag;1.85;ggg;0.43;;gtg;79;gcg;23.8;gag;437;ggg;-23.1
;;;;;;;;;;;;;;;;
10.50;;;;;;;;;-4.0;287.9;;;;;;
IV1.10;Nombres de tRNAs. 121 eucaryotes;;;;;55 830;;;IV1.10b;;Eucaryotes/bactéries sensibiltés relatives;;;;;
ttt;0.04;tcc;0.04;tat;0.04;tgt;0.04;;ttt;0.04;tcc;0.04;tat;0.04;tgt;0.04
atc;0.04;acc;0.03;aat;0.06;agt;0.03;;atc;0.04;acc;0.03;aat;0.06;agt;0.03
ctc;0.01;ccc;0.02;cat;0.03;cgc;0.02;;ctc;0.01;ccc;0.02;cat;0.03;cgc;0.02
gtc;0.06;gcc;0.04;gat;0.05;ggt;0.03;;gtc;0.06;gcc;0.04;gat;0.05;ggt;0.03
ttc;1.41;tct;1.15;tac;1.65;tgc;2.30;;ttc;-7;tct;3;tac;4;tgc;108
att;1.59;act;1.33;aac;1.88;agc;1.34;;att;-30;act;19;aac;-13;agc;22
ctt;1.00;cct;1.17;cac;1.23;cgt;1.10;;ctt;5;cct;72;cac;5;cgt;-41
gtt;1.22;gct;2.23;gac;2.09;ggc;1.84;;gtt;11;gct;116;gac;-7;ggc;-20
tta;0.62;tca;0.75;taa;−;tga;0.29;;tta;-48;tca;-43;taa;−;tga;-12
ata;0.75;aca;0.94;aaa;2.08;aga;1.12;;ata;−;aca;-36;aaa;-8;aga;-6
cta;0.59;cca;1.26;caa;1.20;cga;0.73;;cta;-52;cca;-7;caa;-24.1;cga;233
gta;0.72;gca;1.37;gaa;1.45;gga;1.46;;gta;-67;gca;-46;gaa;-39;gga;6
ttg;0.73;tcg;0.57;tag;−;tgg;1.17;;ttg;-26.3;tcg;-12;tag;−;tgg;8
atg;2.49;acg;0.58;aag;2.13;agg;1.06;;atg;-44;acg;-15;aag;254;agg;23.8
ctg;0.86;ccg;0.53;cag;1.33;cgg;0.45;;ctg;-33;ccg;-2;cag;124;cgg;-46
gtg;1.19;gcg;0.78;gag;1.79;ggg;0.68;;gtg;266;gcg;156;gag;420;ggg;21
;;;;;;;;;;;;;;;;
IV 1.79;Indices de tRNAs. 79 −fungi;;;;;55 830;;;I 1;Indices de tRNAs. 4032 bactéries ;;;;;235027;
ttt;0.38;tcc;0.47;tat;0.43;tgt;0.39;;ttt;0.25;tct;0.12;tat;0.10;tgt;0.07
atc;0.47;acc;0.35;aat;0.58;agt;0.37;;att;0.12;act;2.55;aat;0.12;agt;0.02
ctc;0.11;ccc;0.19;cat;0.34;cgc;0.24;;ctt;9.15;cct;0.25;cat;0.10;cgc;8.26
gtc;0.66;gcc;0.44;gat;0.51;ggt;0.33;;gtt;0.22;gct;0.05;gat;0;ggt;0.02
ttc;14.76;tct;12.10;tac;17.34;tgc;24.19;;ttc;1.51;tcc;1.12;tac;1.59;tgc;1.11
att;16.66;act;13.97;aac;19.78;agc;14.06;;atc;2.28;acc;1.12;aac;2.17;agc;1.10
ctt;10.54;cct;12.28;cac;12.95;cgt;11.58;;ctc;0.95;ccc;0.68;cac;1.17;cgt;1.85
gtt;12.80;gct;23.45;gac;21.89;ggc;19.37;;gtc;1.10;gcc;1.03;gac;2.24;ggc;2.30
tta;6.49;tca;7.91;taa;−;tga;3.01;;tta;1.18;tca;1.31;taa;−;tga;0.33
ata;7.82;aca;9.83;aaa;21.84;aga;11.81;;ata;0.01;aca;1.46;aaa;2.26;aga;1.19
cta;6.19;cca;13.19;caa;12.62;cga;7.70;;cta;1.23;cca;1.35;caa;1.58;cga;0.22
gta;7.61;gca;14.38;gaa;15.26;gga;15.29;;gta;2.20;gca;2.53;gaa;2.40;gga;1.37
ttg;7.67;tcg;5.97;tag;−;tgg;12.27;;ttg;0.99;tcg;0.65;tag;−;tgg;1.08
atg;26.11;acg;6.14;aag;22.38;agg;11.13;;atg;4.47;acg;0.68;aag;0.60;agg;0.86
ctg;9.05;ccg;5.58;cag;13.91;cgg;4.72;;ctg;1.29;ccg;0.54;cag;0.59;cgg;0.83
gtg;12.53;gcg;8.15;gag;18.81;ggg;7.16;;gtg;0.33;gcg;0.30;gag;0.34;ggg;0.56

Les modifications des tRNAs en 34 et 37.alpha[modifier | modifier le wikicode]

Compilation pour les bactéries.a[modifier | modifier le wikicode]

;;;t;;;;;c;;;;;a;;;;;g;;
;;34;;37;;;34;;37;;;34;;37;;;34;;37;
t;t;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;c;Gm;G;i6A;m1G;;;G;;A;;Q;G;i6A;m6A;;;G;i6A;m6A
;;2;5;6;1;;;2;;2;;4;1;4;1;;;2;1;1
;a;cmnmm;;i6A;m6A;;c,mo;U;i6A;m6A;;;;;;;cmnmm;U;i6A;m6A
;;2;;1;1;;2;2;2;2;;;;;;;1;1;1;1
;g;Cm;C;i6A;m6A;;;C;i6A;;;;;;;;Cm;C;i6A;m6A
;;3;2;2;1;;;1;1;;;;;;;;1;3;2;1
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
c;t;;;;;;;;;;;;;;;;Inosine;;m1G;m2A
;;;;;;;;;;;;;;;;;3;;2;1
;c;;G;;m1G;;;G;m1G;;;Q;G;m2A;m1G;;;;;
;;;1;;1;;;1;1;;;2;1;2;1;;;;;
;a;cmo;U;;m1G;;c,mo;U;m1G;;;cmnms;;m2A;m6A;;;;;
;;;2;;2;;2;2;4;;;2;;1;1;;;;;
;g;;C;;m1G;;;C;m1G;;;;C;m2A;;;;C;m1G;
;;;4;;3;;;2;2;;;;1;1;;;;2;2;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
a;t;;;;;;;A;t6A;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;1;1;;;;;;;;;;;
;c;;G;t6A;;;;G;t6A;;;Q;G;t6A;;;;G;t6A;
;;;4;4;;;;2;2;;;3;1;4;;;;3;3;
;a;;;;;;mo;U;t6A;;;c,mnms;;t6A;;;c,mnm;U;t6A;
;;;;;;;1;2;2;;;3;;3;;;2;1;3;
;g;k2C;;t6A;m6A;;;;;;;;C;t6A;;;;C;t6A;
;;3;;2;1;;;;;;;;1;1;;;;1;1;
;Met;ac4C;C;t6A;m6A*;;;;;;;;;;;;;;;
;;1;3;1;3;;;;;;;;;;;;;;;
;ini;;C;;A;;;;;;;;;;;;;;;
;;;10;;10;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
g;t;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;c;;G;m6A;A;;;G;;A;;Qg;G;;A;;;G;;A
;;;4;1;3;;;2;;2;;1;2;;3;;;2;;2
;a;c,mo;U;m6A;;;c,mo;U;m6A;A;;c,mnms;;m2A;A;;c,mnm;U;m6A;A,C
;;2;2;4;;;2;2;3;1;;2;;1;2;;2;4;2;3,2
;g;;;;;;;;;;;;;;;;;C;;A
;;;;;;;;;;;;;;;;;;3;;3

Compilation pour les eucaryotes.a[modifier | modifier le wikicode]

;;;t;;;;;c;;;;;a;;;;;g;;
;;34;;37;;;34;;37;;;34;;37;;;34;;37;
t;t;;;;;;Inosine;;i6A;io6A;;;;;;;;;;
;;;;;;;9;;7;2;;;;;;;;;;
;c;Gm;G;m1G;W;;;;;;;Q9;G;m1G;i6A;;G;;m1G;i6A
;;22;1;5;18;;;;;;;5;9;11;3;;2;;1;1
;a;ncmm;U;m1G;;;ncm;U;i6A;io6A*;;;;;;;mcm;U;i6A;
;;1;1;3;;;3;2;2;2;;;;;;;3;1;6;
;g;Cm;m5C;m1G;;;;C;i6A;io6A;;;;;;;Cm;;m1G;A
;;2;1;4;;;;5;3;2;;;;;;;5;;4;1
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
c;t;Inosine;;m1G;G;;Inosine;;m1G;;;;;;;;Inosine;;m1G;m2A*
;;7;;6;1;;1;;1;;;;;;;;4;;2;2
;c;;;;;;;;;;;Q;G;m1G;G;;;;;
;;;;;;;;;;;;1;5;5;1;;;;;
;a;;U;m1G;;;ncm;;m1G;;;mcms;;;;;mcm;;;
;;;1;1;;;1;;2;;;;;;;;;;;
;g;;C;m1G;;;;;;;;Cm;C;m2A;A;;;C;m1G;
;;;3;3;;;;;;;;3;3;1;5;;;2;2;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
a;t;Inosine;;t6A;;;Inosine;;t6A;;;;;;;;;;;
;;5;;5;;;3;;3;;;;;;;;;;;
;c;;;;;;;;;;;Q;G;t6A;;;;G;t6A;i6A
;;;;;;;;;;;;4;2;7;;;;5;4;1
;a;PAP;;t6A;;;;;;;;mcms;cmnmm;t6A;;;mcms;mcm;t6A;
;;1;;1;;;;;;;;3;1;4;;;1;1;2;
;g;;;;;;;;;;;;C;t6A;;;;C;t6A;
;;;;;;;;;;;;;10;10;;;;1;1;
;Met;Cm;C;t6A;;;;;;;;;;;;;;;;
;;5;1;6;;;;;;;;;;;;;;;;
;ini;;C;t6A;i6A;;;;;;;;;;;;;;;
;;;18;17;1;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
g;t;Inosine;;;A;;Inosine;;m1 Inosine;;;;;;;;;;;
;;7;;;7;;6;;6;;;;;;;;;;;
;c;;;;;;;;;;;Q8;G;m1G;A;;;G;;A
;;;;;;;;;;;;4;3;1;6;;;4;;4
;a;ncm;;;A;;;;;;;mcms*;U;;A;;mchm;;;A
;;1;;;2;;;;;;;3;1;;5;;1;;;2
;g;;C;;A;;;;;;;;C;;A;;;C;;A
;;;2;;2;;;;;;;;4;;4;;;1;;1

Détails pour mcac lla eco hvo sce.a[modifier | modifier le wikicode]

;;mcac;30 tRNAs;;;;;;;;30 gènes tRNA de mcac;;;;;;;;%GC
;;t;;c;;a;;g;;;;t;;c;;a;;g;24
t;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;;
;c;G;m1G;;;G;m6A;G;m6A;;c;1;;;;1;;1;
;a;cmnmm;m6A;U;m6A;;;cmnmm;m6A;;a;1;;1;;;;1;
;g;Cm;m6A;;;;;Cm;m6A;;g;1;;;;;;1;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
c;t;;;;;;;Inosine;m1G;;t;;;;;;;1;
;c;;;;;G;m1G;;;;c;;;;;1;;;
;a;U;m1G;U;m1G;cmnms;m6A;;;;a;1;;1;;1;;;
;g;;;;;;;;;;g;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
a;t;;;A;t6A;;;;;;t;;;1;;;;;
;c;G;t6A;;;G;t6A;G;t6A;;c;1;;;;1;;1;
;a;k2C;m6A;U;t6A;cmnms;t6A;cmnm;t6A;;a;;;1;;2;;1;
;g;C;A;;;C;t6A;;;;g;3;;;;1;;;
;i;C;A;;;;;;;;i;;;;;;;;
g;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;;
;c;;;;;G;A;;;;c;;;;;1;;;
;a;U;m6A;U;m6A;cmnms;A;U;m6A;;a;1;;1;;1;;1;
;g;;;;;;;;;;g;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;lla;38 tRNAs;;;;;;;;63 gènes tRNA de lla;;;;;;;;%GC
;;t;;c;;a;;g;;;;t;;c;;a;;g;35
t;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;;
;c;G;m1G;G;A;G;i6A;G;i6A;;c;2;;1;;1;;1;
;a;cmnms*;i6A;mo;i6A;;;;;;a;2;;2;;;;;
;g;Cm;i6A;C;A;;;C;i6A;;g;1;;3;;;;1;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
c;t;A;m1G;;;;;Inosine;m2A;;t;2;;;;;;2;
;c;;;;;G;G;;;;c;;;;;1;;;
;a;U;m1G;mo;m1G;U;A;;;;a;2;;2;;2;;;
;g;C;G;;;;;C;G;;g;1;;;;;;1;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
a;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;;
;c;G;t6A;G;A;G;t6A;G;A;;c;2;;1;;2;;1;
;a;;;mo;t6A;cmnms;t6A;U;C;;a;;;2;;3;;1;
;g;ac4C*;m6A;C;A;C;t6A;C;A;;g;4;;1;;1;;1;
;i;2 C;A;;;;;;;;i;;;;;;;;
g;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;;
;c;;;;;G;A;G;A;;c;;;;;2;;2;
;a;mo;m1A;mo;m6A;U;A;mo;m6A;;a;3;;6;;2;;2;
;g;;;;;;;;;;g;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;E.coli;40 tRNAs;;strain unknown;;Liepzig*;;;;86 gènes tRNA de eco;;;;K12;;;;%GC
t;t;t;;c;;a;;g;;;;t;;c;;a;;g;51
;c;;;;;;;;;;t;;;;;;;;
;a;G;msi6A;G;A;2 Q; msi6A;G;msi6A;;c;2;;2;;3;;1;
;g;cmnmm;msi6A;cmo;msi6A;;;U;i6A;;a;1;;1;;;;1;
;;Cm;msi6A;C;msi6A;;;C;msi6A;;g;1;;1;;;;1;
c;t;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;c;;;;;;;Inosine;m2A;;t;;;;;;;4;
;a;G;m1G;;;Q;m2A;;;;c;1;;1;;1;;;
;g;;;;;cmnms;m2A;;;;a;1;;1;;2;;;
;;C;m1G;C;m1G;C;m2A;C;m1G;;g;4;;1;;2;;1;
a;t;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;c;;;;;;;;;;t;;;;;;;;
;a;G;t6A;2 G;m6t6A;Q;t6A;G;t6A;;c;3;;2;;4;;1;
;g;k2C;t6A;;;mnms;t6A;mnm;t6A;;a;;;1;;6;;1;
;i;ac4C;t6A;;;;;;;;g;8;;1;;;;1;
g;t;2 C;A;;;;;;;;i;;;;;;;;
;c;;;;;;;;;;t;;;;;;;;
;a;2 G;A;G;A;GluQ;m2A;G;A;;c;2;;2;;3;;4;
;g;cmo;m6A;cmo;A;mnms;m2A;mnm;A;;a;5;;3;;4;;1;
;;;;;;;;C;A;;g;;;;;;;1;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;hvo;41 tRNAs;;codons*;;;;;;53 gènes tRNA de lla;;;;;;;;%GC
;;t;;c;;a;;g;;;;t;;c;;a;;g;66
t;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;;
;c;G;m1G;G;A;G;m1G;G;m1G;;c;2;;1;;2;;1;
;a;U;m1G;;;;;;;;a;1;;1;;;;;
;g;C;m1G;ac4C;A;;;Cm;m1G;;g;1;;1;;;;1;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
c;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;;
;c;G;m1G;G;m1G;G;m1G;G;m1G;;c;1;;1;;1;;1;
;a;mo;m1G;U;m1G;;;N;m1G;;a;1;;1;;1;;1;
;g;C;m1G;ac4C;m1G;ac4C;m1G;C;m1G;;g;1;;2;;1;;1;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
a;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;;
;c;G;t6A;G;t6A;G;t6A;G;t6A;;c;1;;1;;1;;1;
;a;N;t6A;;;N;t6A;;;;a;;;1;;1;;1;
;g;Cm;t6A;C;t6A;ac4C;t6A;;;;g;3;;1;;1;;1;
;i;C;A;;;;;;;;i;;;;;;;;
g;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;;
;c;G;A;G;A;G;A;2 G;A;;c;2;;1;;2;;2;
;a;;;U;A;N;m1G;N;A;;a;1;;2;;1;;1;
;g;C;A;C;A;ac4C;A;C;A;;g;1;;1;;1;;1;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;sce;34 tRNAs;;;;;;;;275 gènes tRNA de sce;;;;;;;;%GC
;;t;;c;;a;;g;;;;t;;c;;a;;g;38
t;t;;;2 Inosine; i6A;;;;;;t;;;11;;;;;
;c;2 Gm; yW;;;GPA;i6A;G;i6A;;c;10;;;;8;;4;
;a;ncmm;m1G;ncm;i6A;;;;;;a;7;;3;;;;;
;g;m5C;m1G;C;i6A;;;Cm;A;;g;10;;1;;;;6;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
c;t;;;;;;;Inosine;A;;t;;;2;;;;6;
;c;;;;;2 G; m1G;;;;c;1;;;;7;;;
;a;U;m1G;N;m1G;;;;;;a;3;;10;;9;;;
;g;;;;;;;;;;g;;;;;1;;1;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
a;t;Inosine;t6A;2 Inosine; t6A;;;;;;t;13;;11;;;;;
;c;;;;;G;t6A;G;t6A;;c;;;;;10;;4;
;a;PAP;t6A;;;mcms;t6A;mcm;t6A;;a;2;;4;;7;;11;
;g;C;t6A;;;C;t6A;;;;g;10;;1;;14;;1;
;i;C;t6A;;;;;;;;i;;;;;;;;
g;t;Inosine;A;Inosine;m1Inos;;;;;;t;14;;11;;;;;
;c;;;;;G;m1G;G;A;;c;;;;;16;;16;
;a;ncm;A;;;mcms;A;N;A;;a;2;;5;;14;;3;
;g;C;A;;;;;;;;g;2;;;;2;;2;

Les modifications des tRNAs[modifier | modifier le wikicode]

Liste des short name trouvés en colonnes 38 et 41[modifier | modifier le wikicode]

34::::37:
::Eu et pro caryotes:::
N:xU:::H:xA
<:xC:::;:xG
I:inosine:::O:m1I
3:mcm5s2U:::K:m1G
Q:QtRNA:::6:t6A
1:mcm5U:::/:m2A
8:manQtRNA:::+:i6A
J:Um:::E:m6t6A
2:s2U:::[:ms2t6A
#:Gm:::W:o2yW
&:ncm5U:::Y:yW
,:mchm5U:::`:io6A
P:pseudoU:::=:m6A
°:f5Cm:::≠:ms2io6A
B:Cm:::*:ms2i6A
?:m5C::::
∼:ncm5Um::::
):cmnm5Um::::
9:galQtRNA::::
5:mo5U::::
V:cmo5U::::
{:mnm5U::::
⊄:gluQtRNA::::
S:mnm5s2U::::
}:k2C::::
M:ac4C::::
$:cmnm5s2U::::

Liste des tRNAs de la base gtRNAdb[modifier | modifier le wikicode]

µSTXT(N35;41;1)µµµµµµµµµµµ
STXT(N35;38;1)µµµµµµµµµµµµ
38µµ41µµµµgèneµtRNAµaaµcodonµgénomeµmilieuµséquence
IµµOµµµµgctµEucaryµAlaµAGCµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGGCGUGUKGCGUAGDC-GGD--AGCGCRCUCCCUUIGCOPGGGAGAG-------------------GDCUCCGGTPCGAUUCCGGACUCGUCCACCA 
IµµOµµµµgctµAµAlaµIGCµBombyx moriµcytosolic µ-GGGGGCGUALCUCAGAD-GGU--AGAGCRCUCGCJUIGCOP#PGAGAG-------------------7UA?CGGGAPCG"UACCCGGCGCCUCCACCA 
IµµOµµµµgctµAµAlaµIGCµBombyx moriµcytosolic µ-GGGGGCGUALCUCAGAD-GGU--AGAGCRCUCGCJUIGCOP#PGAGAG-------------------7UA?CGGGAPCG"UACCCGGCGCCUCCACCA 
IµµOµµµµgctµAµAlaµIGCµHomo sapiensµcytosolic µ-GGGGGAUUALCUCAAAD-GGD--AGAGCRCUCGCJUIGCOP#CGAGAG-------------------7UAGCGGGAPCG"UGCCCGCAUCCUCCACCA 
IµµOµµµµgctµAµAlaµIGCµHomo sapiensµcytosolic µ-GGGGAAUUALCUCAAAD-GGD--AGAGCRCUCGCJUIGCOP#CGAGAG-------------------7UAGCGGGAPCG"UGCCCGCAUUCUCCACCA 
IµµOµµµµgctµAµAlaµIGCµPichia jadiniiµcytosolic µ-GGGCGUGUKGCGUAGDD-GGD--AGCGCRPUCGCUUIGCOPGCGAAAG-------------------GDCUCCGGTPCG"CUCCGGACUCGUCCACCA 
3µµ6µµµµagaµUµArgµ3CPµBos taurusµcytosolic µ-GGCUCCGUKGCGCAAD--GGAD-AGCGCAPPGGA'U3CP6AUPCAAAG-------------------7DU?CGGGTPCG"GUCCCGGCGGAGUCGCCA 
CµµKµµµµcggµCµArgµCCGµBos taurusµcytosolic µ-GACCCAGUKLCCUAAD--#GAD-AAGGCAPCAGCBUCCGKAGCUGGGG-------------------ADUGPGGGTPCG"GUCCCAUCUGGGUCGCCA 
CµµKµµµµcggµCµArgµCCGµTriticum aestivumµcytosolic µ-GACCGCGUKGCCUAAD--GGAX-AAGGCRCUCGCBUCCGKAGCGGGAG-------------------ADU?UGGGTPCG"CUCCCAGCGPGGUCGCCA 
Cµµ6µµµµaggµCµArgµCCUµBos taurusµcytosolic µ-GCCCCAGUKLCCUAAD--GGAD-AAGGCAPUGGC'UCCU6AGCCAGGG-------------------ADUGPGGGTPCG"GUCCCAUCUGGGGPCCCA 
IµµKµµµµcgtµAµArgµICGµMus musculusµcytosolic µ-GGGCCAGUKLCGCAAD--GGAD-AACGCRPCUGABUICGKAPCAGAAG-------------------ADU?PAGGPPCG"CUCCUGGCUGGCUCGCCA 
IµµKµµµµcgtµAµArgµICGµMus musculusµcytosolic µ-GGGCCAGUKLCGCAAD--GGAD-AACGCRPCUGABUICGKAPCAGAAG-------------------ADU?PAGGPPCG"CUCCUGGCUGGCUCGCCA 
IµµAµµµµcgtµAµArgµICGµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-PUCCUCGUKLCCCAAD--GGDC-ACGGCRPCUGGCUICGAACCAGAAG-------------------ADU?CAGGTPCA"GUCCUGGCGGGGAAGCCA 
Iµµ/µµµµcgtµAµArgµICGµTriticum aestivumµcytosolic µ-GACUCCGUKLCCCAAD--#GAX-AAGGCRCUGGUBUICG/AACCAGAG-------------------ADU?UGGGTPCG"UCCCCAGCGGAGUCGCCA 
1µµ6µµµµagaµUµArgµUCUµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GCUCGCGUKLCGUAAD--GGC--AACGCRPCUGACU1CU6APCAGAAG-------------------ADUAUGGGTPCG"CCCCCAUCGUGAGUGCCA 
Gµµ6µµµµaacµGµAsnµGUUµRattus norvegicusµcytosolic µ-GUCUCUGUKLCGCAADC-GGDX-AGCGCRPPCGGCUGUU6ACCGAAAG-------------------7DUGGUGG.PCG"GCCCACCCAGGGACGCCA 
Gµµ6µµµµaacµGµAsnµGUUµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GACUCCAUGLCCAAGDD-GGDD-AAGGCRUGCGACUGUU6APCGCAAG-------------------AD?GUGAGTPCA"CCCUCACUGGGGUCGCCA 
Qµµ6µµµµaacµGµAsnµQUUµBos taurusµcytosolic µ-GUCUCUGUKLCGCAADC-GGDX-AGCGCRPPCGGCUQUU6ACCGAAAG-------------------7DUGGUGG@PCG"GCCCACCCAGGGACGCCA 
Qµµ6µµµµaacµGµAsnµQUUµHomo sapiensµcytosolic µ-GUCUCUGUKLCGCAADC-GGDX-AGCGCRPPCGGCUQUU6ACCGAAAG-------------------7DUGGUGG.PCG"GCCCACCCAGGGACGCCA 
Qµµ6µµµµaacµGµAsnµQUUµLupinus luteusµcytosolic µ-GCCUCAGUALCUCAGD--GGDX-AGAGCRGUCGGBUQUU6ACCGAUAG-------------------7D?GUAGGTPCG"GCCCUACUUGGGGCGCCA 
Qµµ6µµµµaacµGµAsnµQUUµRattus norvegicusµcytosolic µ-GUCUCUGUKLCGCAADC-GGDX-AGCGCRPPCGGCUQUU6ACCGAAAG-------------------7DUGGUGG.PCG"GCCCACCCAGGGACGCCA 
8µµAµµµµgacµGµAspµ8UCµBos taurusµcytosolic µ-GGUGCCGUALCGPAGD--#GC--A.CG.GACUCUBU8UCAAAGAGUGG-------------------7A?.UGAGTPCG"UACUCAACGGCACCGCCA 
8µµAµµµµgacµGµAspµ8UCµOryctolagus cuniculusµcytosolic µ-UCCCGUCUAGUAPAGU--GGDG-AGUAUAUCCGCCU8UCACGCGGGAG-------------------GA??GGGGTPCG"AUCCCCGGACGGGAGCCA 
8µµAµµµµgacµGµAspµ8UCµRattus norvegicusµcytosolic µ-UCCUCGUUAGUAPAGU--GGDG-AGUAUCCCCGCUC8UCA?GCGGGAG-------------------A-??GGGGTPCGAUUCCCCGACGGGGAGCCA 
8µµAµµµµgacµGµAspµ8UCµXenopus laevisµcytosolic µ-UCCUCLUUKGUAPAGU--GGDG-AGUAUCCCCGCCU8UCA?GCGGGAG-------------------A-??GGGGTPCAAUUCCCCGACGGGGAGCCA 
GµµAµµµµgacµGµAspµGUCµEuglena gracilisµcytosolic µ-UCUUCGGUAGUAPAGD--#GDA-AGUAU;PCCGCCUGUCA<GCGGAAG-------------------A-<HCGGGTPCAHUUCCCGGCCGGAGAGCCA 
GµµAµµµµgacµGµAspµGUCµRattus norvegicusµcytosolic µAUCCUCGUUAGUAPAGU--GGDG-AGUAUCCCCGCUCGUCA?GCGGGAG-------------------A-??GGGGTPCGAUUCCCCGACGGGGAGCCA 
GµµKµµµµgacµGµAspµGUCµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-UCCGUGAUAGUUPAAD--GGDC-AGAAUGGGCGCPUGUCKCGUGCCAG-------------------A-U?GGGGTPCAAUUCCCCGUCGCGGAGCCA 
GµµKµµµµtgcµGµCysµGCAµNicotiana rusticaµcytosolic µ-GGGUCCAUAGCUCAGD--#GD--AGAGCAPPUGABUGCAKAPCAAGAG-------------------7DCACCGGUPCG"ACCCGGUUGGGCCCUCCA 
Gµµ+µµµµtgcµGµCysµGCAµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GCUCGUAUGGCGCAGD--GGD--AGCGCAGCAGAPUGCA+APCUGUUG-------------------7D?CUUAGTPCG"UCCUGAGUGCGAGCUCCA 
Cµµ6µµµµtagµCµGlnµCUAµTetrahymena thermophilaµcytosolic µ-GGUUCUAUALUAPAGC--GCDD-AGUACUGGGGA<UCUA6APCCCUUG-------------------A-C?UGGGUPCG"AUCCCAGUAGGACCUCCA 
CµµAµµµµcagµCµGlnµCUGµBos taurusµcytosolic µ-GGUUCCAUKGUGPAAD--#GDD-AGCACUCPGGABUCUGAAPCCAGCG-------------------A-U?CGAGPPCA"AUCUCGGUGGAACCUCCA 
CµµAµµµµcagµCµGlnµCUGµMus musculusµcytosolic µ-GGUUCCAUKGUGPAAD--#GDD-AGCACUCPGGABUCUGAAPCCAGCG-------------------A-U??GAGPPCA"AUCUCGGUGGAACCUCCA 
CµµAµµµµcagµCµGlnµCUGµRattus norvegicusµcytosolic µ-GGUUCCAUKGUGPAAD--#GDD-AGCACUCUGGABUCUGAAPCCAGCG-------------------A-U??GAGPPCA"AUCUCGGUGGAACCUCCA 
Jµµ6µµµµtaaµUµGlnµJUAµTetrahymena thermophilaµcytosolic µ-GGUUCCAUALUAPAGD--GGDD-AGUACUGGGGABUJUA6APCCCUUG-------------------A-C?UGGGUPCG"AUCCCAGUGGGACCUCCA 
JµµAµµµµcaaµUµGlnµJUGµMus musculusµcytosolic µ-GGUCCCAUKGUGPAAD--#GDD-AGCACUCPGGABUJUGAAPCCAGCG-------------------A-U??GAGPPCA"AUCUCGGUGGGACCUCCA 
Jµµ/µµµµcaaµUµGlnµJUGµNicotiana rusticaµcytosolic µ-GGUUCUAUKGUGPAGD--#GDD-AGCACUCPGGABUJUG/APCCAGCG--------------------ACCUGGGTPCG"CUCCCGGUAGGACCUCCA 
JµµAµµµµcaaµUµGlnµJUGµTetrahymena thermophilaµcytosolic µ-GGUUGUAUKLUGPAGC--GGDD-AGCACCGAGGACUJUGAAPCCUCUG-------------------A-C?UGGGUPCG"AUCCCAGUACGACCUCCA 
NµµAµµµµcaaµUµGlnµNUGµHomo sapiensµcytosolic µ-GGCCCCAUKGUGPAAU--#GDD-AGCACUCPGGABUNUGAAPCCAGCG-------------------A-U??GAGPPCA"AUCUCGGUGGGACCUCCA 
NµµAµµµµcaaµUµGlnµNUGµHomo sapiensµcytosolic µ-GGUCCCAUKGUGPAAU--#GDD-AGCACUCPGGABUNUGAAPCCAGCG-------------------A-U??GAGPPCA"AUCUCGGUGGGACCUCCA 
UµµEµµµµtaaµUµGlnµUUAµLupinus luteusµcytosolic µ-..CGUCUUAL...AGD--GG..-A...CR.C.UGBUUUAEACACG.UG-------------------7D?GUGGGTPCG"AUCCCACAGACGAGACCA 
2µµAµµµµgaaµUµGluµ2UCµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-UCCCAUAUGGUCPAGD--GGCD-AGGAUAUCUGGBU2UCACCCAGAAG-------------------G-CCCGGGTPCGAUUCCCGGUAUGGGAACCA 
3µµAµµµµgaaµUµGluµ3UCµRattus norvegicusµcytosolic µ-UCCCACAUKGUCPAGC--GGDD-AGGAUUCCUGGPU3UCACCCAGGCG-------------------G-C??GGG\PCGACUCCCGGUGUGGGAACCA 
3µµAµµµµgaaµUµGluµ3UCµSchizosaccharomyces pombeµcytosolic µ-UCCGUUGUKGUCCAAC--GGCD-AGGAUUCGUCGCU3UCACCGACGGG-------------------A-G?GGGGTPCGACUCCCCGCAACGGAGCCA 
CµµAµµµµgagµCµGluµCPCµHordeum vulgareµcytosolic µ-UCCGUCGUAGUCPAGGD-GGDP-AGGAUACUCGGCUCPCACCCGAGAG-------------------A-C?CGGGTPCG"GUCCCGGCGACGGAACCA 
CµµAµµµµgagµCµGluµCUCµHomo sapiensµcytosolic µ-UCCCUGGUGLUCPAGU--GGDP-AGGAUUCGGCGCUCUCACCGCCGCG-------------------G-C??GGG\PCGAUUCCCGGUCAGGGAACCA 
CµµAµµµµgagµCµGluµCUCµLupinus luteusµcytosolic µ-UCCGUUGUAGUCPAGDD-GGDC-AGGAUAUUCGGCUCUCACCCGAAAG-------------------A-C?CGGGTPCA"GUCCCGGCGACGGAACCA 
CµµAµµµµgagµCµGluµCUCµMus musculusµcytosolic µ-UCCCUGGUGLUCPAGU--GGDP-AGGAUUCGGCGCUCUCACCGCCGCG-------------------G-C??GGG\PCGAUUCCCGGUCAGGGAACCA 
UµµAµµµµgaaµUµGluµUPCµHordeum vulgareµcytosolic µ-UCCGUCGUAGUCPAGGD-GGDP-AGGAUACUCGGCUUPCACCCGAGAG-------------------A-C?CGGGTPCA"GUCCCGGCGACGGAACCA 
3µµAµµµµgaaµUµGluµUUCµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-UCCGAUAUAGUGPAAC--GGCD-AUCACAPCACGCU3UCACCGUGGAG-------------------A-C?GGGGTPCGACUCCCCGUAUCGGAGCCA 
,µµAµµµµggaµUµGlyµ,CCµBombyx moriµcytosolic µ-GCGJUGGUKGUGPAAD--GGDC-AGCAUAGPUGCCU,CCAAGCAGUUG-------------------A-U??GGGTPCG"UUCCCGGCCAACGCACCA 
CµµAµµµµgggµCµGlyµCCCµHomo sapiensµcytosolic µ-GCGBCLCUGGUGPAGU--GGD--AUCAUGCAAGAJUCCCAUZCUUGCG-------------------A-C??GGGTPCG"UUCCCGGGCGGCGCACCA 
GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµBombyx moriµcytosolic µ-GCAJCGGUKGUUCAGU--GGD--AGAAUGCUCGCCUGCCA?GCGGGCG-------------------G-???GGGTPCG"UUCCCGGCCGAUGCACCA 
GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµHomo sapiensµcytosolic µ-GCAJULGUGGUUCAGU--GGD--AGAAUUCUCGCCUGCCA?GCGGGAG-------------------G-???GGGTPCG"UUCCCGGCCAAUGCACCA 
GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµLupinus luteusµcytosolic µ-GCABCAGUKGUCPAGD--GGU--AGAAUAGUACCCUGCCA?GGUACAG-------------------A-???GGGUPCG"UUCCCGGCUGGUGCACCA 
GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GCGBAAGUKGUUPAGD--GGD--AAAAUCCAACGPUGCCAPCGUUGGG---------------------C?CCGGTPCGAUUCCGGGCUUGCGCACCA 
GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµTriticum aestivumµcytosolic µ-GCABCAGUKGUCPAGD--GGU--AGAAUAGUACCCUGCCA?GGUACAG-------------------A-???GGGUPCG"UUCCCGGCUGGUGCACCA 
NµµAµµµµggaµUµGlyµUCCµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGGCGGUUAGUGPAGD--GGDD-AUCAUCCCACCCUNCCAAGGUGGGG-------------------A-CACGGGTPCGAUUCUCGUACCGCUCACCA 
GµµKµµµµcacµGµHisµGUGµDrosophila melanogasterµcytosolic µGGCCGUGAUCGUCPAGD--GGDD-AGGACCCCACGPUGUGKCCGUGGUA-------------------A-CC?AGGUPCG"AUCCUGGUCACGG?ACCA 
GµµGµµµµcacµGµHisµGUGµHomo sapiensµcytosolic µ;GCCGUGAUCGUAPAGD--GGDD-AGUACUCUGCGPUGUGGCCGCAGCA-------------------A-??UCGGUPCG"AUCCGAGUCACGGCACCA 
GµµKµµµµcacµGµHisµGUGµLupinus luteusµcytosolic µGGUGGCUGUAGUUPAGD--GGDD-AGAACACAACGPUGUGKCCGUUGAA-------------------A-C?UGGGUPCG"AUCCCAGCAGCCACACCA 
GµµKµµµµcacµGµHisµGUGµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µGGCC:UCUUAGUAPAGD--#GDD-AGUACACAACAPUGUGKCPGUUGAA-------------------A-C?CUGGTPCGAUUCUAGGAGGUGGCACCA 
GµµKµµµµcacµGµHisµGUGµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µGGCC:UCUUAGUAPAGD--#GDD-AGUACACAUCGPUGUGKCCGAUGAA-------------------A-C?CUGGTPCGAUUCUAGGAGAUGGCACCA 
QµµKµµµµcacµGµHisµQUGµOvis ariesµcytosolic µGGCCGULAUCGUAPAGD--GGDD-AGUACUCUGCGPUQUGKCCGCAGCA-------------------A-C?UCGGUPCG"AUCCGAGUCACGG?ACCA 
Iµµ6µµµµattµAµIleµAAUµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGUCUCUUKLCCCAGDD-GGDD-AAGGCACCGUGCUIAU6ACGCGGGG-------------------AD?AGCGGTPCG"UCCCGCUAGAGACCACCA 
Iµµ6µµµµattµAµIleµIAUµBombyx moriµcytosolic µ-GGCCCAUUALCUCAGDD-GGDN-AGAGCRPCGUGCUIAU6ACGCGAAG-------------------7U?G?GGGTPCG"UCCCCUCAUGGGCCACCA 
Iµµ6µµµµattµAµIleµIAUµLupinus luteusµcytosolic µ-GGCCCAUUALCCCAGDD-GGDD-AAGGCRPGGUGCUIAU6ACGCCGAA-------------------GD?AGCAGTPCG"UCCUGCUAUGGGCCACCA 
Iµµ6µµµµattµAµIleµIAUµMus musculusµcytosolic µ-GGCCGGUUALCUCAGDD-GGDD-AGAGCRPGGPGCUIAU6ACGCCAAG-------------------7D?GCGGGTPCG"UCCCCGUACGGGCCACCA 
Iµµ6µµµµattµAµIleµIAUµPichia jadiniiµcytosolic µ-GGUCCCUUGLCCCAGDD-GGDD-AAGGCRPGGUGCUIAU6ACGCCAAG-------------------AD?AGCAGTPCG"UCCUGCUAGGGACCACCA 
Pµµ6µµµµataµUµIleµUAUµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GCUCGUGUALCUCAGD--GGDD-AGAGCUPCGUGCUPAP6ACGCGACC-------------------7D?GUGGGTPCA"UCCCCACCPCGAGCACCA 
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµAsterina amurensisµcytosolic µ-AGCAGAGUKLCGCAGU--GGA--AGCGUGCUGGGCCCAU6ACCCAGAG-------------------7D?CGAGGAPCG"AACCUCGCUCUGCUACCA 
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-AGCAGAGUKLCGCAGU--GGA--AGCGULCUGGGCCCAU6ACCCAGAG-------------------7D?CGAGGAUCG"AACCUUGCUCUGCUACCA 
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµEuphausia superbaµcytosolic µ-AGCAGAGUKLCGCAGU--GGA--AGCGULCUGGGCCCAU6ACCCAGAG-------------------7UCGGUAGAPCG"AACUACUCUCUGCUACCA 
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµHomo sapiensµcytosolic µ-AGCAGAGUKLCGCAGC--GGA--AGCGULCUGGGCCCAU6ACCCAGAG-------------------7D?GAUGGAUCG"AACCAUCCUCUGCUACCA 
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµLupinus luteusµcytosolic µ-AUCAGAGUKLCGCAGC--GGA--AGCGCRGPGGGCCCAU6ACCCACAG-------------------7D?<CAGGAPCG"AACCU.GCUCUGAUACCA 
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµMus musculusµcytosolic µ-AGCAGAGUKLCGCAGC--GGA--AGCGULCUGGGCCCAU6ACCCAGAG-------------------7D?GAUGGAUCG"AACCAUCCUCUGCUACCA 
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµNeurospora crassaµcytosolic µ-AGCUGCAUKGCGCAGC--GGA--AGCGCRC.GGGCUCAU6ACCCGGAG-------------------7DCACUCGAUCG"AACGA;UUGCAGCUACCA 
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµOryctolagus cuniculusµcytosolic µ-AGCAGAGUKLCGCAGC--GGA--AGCGULCUGGGCCCAU6ACCCAGAG-------------------7D?GAUGGAUCG"AACCAUCCUCUGCUACCA 
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµOvis ariesµcytosolic µ-AGCAGAGUKLCGCAGC--GGA--AGCGULCUGGGCCCAU6ACCCAGAG-------------------7D?GAUGGAUCG"AACCAUCCUCUGCUACCA 
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµPhaseolus vulgarisµcytosolic µ-AUCAGAGUKLCGCAGC--GGA--AGCGULGUGGGCCCAU6ACCCACAG-------------------7D?CCAGGAPCG"AACCU#GCUCUGAUACCA 
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµPichia jadiniiµcytosolic µ-AGCGUCUUKLCGCAGD--GGA--AGCGCRCAGGGCUCAU6ACCCUGAU-------------------7D??CUGGAUCG"AACCAℑGAGACGCUACCA 
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-AGCGCCGUKLCGCAGD--GGA--AGCGCRCAGGGCUCAU6ACCCUGAU-------------------7D??UCGGAUCG"AACCGˆGCGGCGCUACCA 
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµSalmo salarµcytosolic µ-AGCAGAGUKLCGCAGC--GGA--AGCGURCUGGGCCCAU6ACCCAGAG-------------------7D?GAUGGAUCG"AACCAUCCUCUGCUACCA 
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµScenedesmus obliquusµcytosolic µ-AGCUGAGUKLCGCAGD--GGA--AGCGPLAPGGGCUCAU6ACCCAUAG-------------------7D?ACAGGAUCG"AACCU;UCUCAGCUACCA 
Cµµ+µµµµatgµCµIniµCAUµSchizosaccharomyces pombeµcytosolic µ-PGCGCGGUALGAGAGD--GGA--ACUCCRACGGGCUCAU+ACCCGUAG-------------------7UC?CAGGAUCG"AACCUGGCCGCGCAACCA 
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµTetrahymena thermophilaµcytosolic µ-AGCAGGGUKGCGAAAD--#GA--AUCGCGUPGGGCUCAU6ACPCAAAA-------------------7U?AGAGGAPCG"AACCUCUCUCUGCUACCA 
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµTriticum aestivumµcytosolic µ-AUCAGAGUKLCGCAGC--GGA--AGCGULGPGGGCCCAU6ACCCACAG-------------------7D??CAGGAPCG"AACCU;GCUCUGAUACCA 
Cµµ6µµµµatgµCµIniµCAUµXenopus laevisµcytosolic µ-AGCAGAGUKLCGCAGC--GGA--AGCGULCUGGGCCCAU6ACCCAGAG-------------------7D?GAUGGAUCG"AACCAUCCUCUGCUACCA 
.µµKµµµµtt.µµLeuµ.AAµHomo sapiensµcytosolic µ-GUCAGLAUGLCMGAGU--GGDCPAAGGCRCCAGACU.AAKPPCUGGJ-CPCCG--GA-----UGGAG--?GUGGGTPCG"AUCCCACUUCUGACACCA 
.µµKµµµµtt.µµLeuµ.AAµPhaseolus vulgarisµcytosolic µ-GUCAGGAUGLCMGAGD--GGDCXAAGGCRCCAGACU.AAKPPCUGGJ-CUUC---GAGA----GAGGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACUUCUGACACCA 
.µµKµµµµtt.µµLeuµ.AAµPhaseolus vulgarisµcytosolic µ-GUCAGGAUGLCMGAGD--GGDCXAAGGCRCCAGACU.AAKPPCUGGJ-CUUC---GAAA----GAGGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACUUCUGACACCA 
.µµKµµµµtt.µµLeuµ.AAµPhaseolus vulgarisµcytosolic µ-GCUGGUUUGGCMGAGA--GGDD-AAGGCRGAAGACU.AAKAPCUUCJ-GCAG---UCAA----CUGCG-?AUGGGTPCG"ACCCCAUAGCCAGCACCA 
.µµKµµµµtt.µµLeuµ.AAµSolanum tuberosumµcytosolic µ-GUCAGGAUGGCMGAGD--GGDCXAAGGCRCCAGACU.AAKUPCUGGJ-CUUC---GUAA----GAGGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACUUCUGACACCA 
.µµKµµµµct.µµLeuµ.AGµPhaseolus vulgarisµcytosolic µ-GAUAGUUUGLCMGAGD--GGDCXAAGGCRCCAGAPU.AGKCPCUGGJ-CCG----AAA------.GGG-?GUGGGUPCA"AUCCCACAGCUGUCACCA 
°µµKµµµµttgµCµLeuµ°AAµBos taurusµcytosolic µ-GUCAGLAUGLCMGAGU--GGDCPAAGGCLCCAGACU°AAKPPCUGGJ-CPCC---GUAU----GGAGG-?GUGGGTPCG"AUCCCACUUCUGACACCA 
<µµ;µµµµttgµCµLeuµ<AAµRattus norvegicusµcytosolic µAGUCAGLAUGLCMGAGU--GGDCPAAGGCRCCAGACU<AA;PPCUGGN-PCCG---AA------UGGAG-?GUGGGTPCG"AUCCCACUUCUGACACCA 
<µµ;µµµµttgµCµLeuµ<AAµRattus norvegicusµcytosolic µAGUCAGLAUGLCMGAGU--GGDCPAAGGCRCCAGACU<AA;PPCUGGN-PCCG---UA------UGGAG-?GUGGGTPCG"AUCCCACUUCUGACACCA 
BµµKµµµµttgµCµLeuµBAAµCandida cylindraceaµcytosolic µ-GGCCGUUUGLCMGAGD--#GDCDAAGGCRUCUGABUBAAKAPCAGAJ-CUC----GUAA-----GAGG-?GUGUGTPCG"ACCACACAGCGGUCACCA 
BµµKµµµµttgµCµLeuµBAAµPichia jadiniiµcytosolic µ-GGAUCUUUGLCMGAGC--#GDDUAAGGCRCUCGABUBAAKAPCGAGU-AUC----GUAA-----GAUG-?AUGAGTPCG"AUCUCAUAGGAUCCACCA 
?µµKµµµµttgµCµLeuµCAAµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGUUGUUUGLCMGAGC--#GDCDAAGGCRCCUGAPU?AAKCPCAGGU-AUC----GUAA-----GAUG-?AAGAGTPCGAAUCUCUUAGCAACCACCA 
CµµKµµµµctgµCµLeuµCAGµBos taurusµcytosolic µ-GUCAGLAUGLCMGAGC--GGDDCAAGGCRCUGCGJUCAGK.CGCAGJ-CPCC---CU------GGAGG-?GUGGGTPCG"AUCCCACUUCUGACACCA 
CµµKµµµµctgµCµLeuµCAGµCandida albicansµcytosolic µ-GAUACGAUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCRAAGGAUGCAGKPPCCUU--UGGGC--AUU----GCCCG--?GCAGGTPCG"ACCCUGCUCGUGUCGCCA 
CµµKµµµµctgµCµLeuµCAGµLupinus luteusµcytosolic µ-GUCAGGAUGLCMGAG-D-GGDCXAAGGCRCCAGUJUCAGKPACUGGJCPCG----AAC------CGGG-?AUGGGTPCG"AUCCCAUUCUUGACACCA 
IµµKµµµµcttµAµLeuµIAGµBos taurusµcytosolic µ-GGUAGCGUGLCMGAGC--GGDCPAAGGCRCUGGAZUIAGKCPCCAGU-CPCP---UC------GGGGG-?GUGGGTPCG"AUCCCACCGCUGCCACCA 
IµµKµµµµcttµAµLeuµIAGµBos taurusµcytosolic µ-GGUAGCGUGLCMGAGC--GGDCPAAGGCRCUGGAZUIAGKCPCCAGU-CPCP---UC------GGGGG-?GUGGGTPCG"AUCCCACCGCUGCCACCA 
IµµGµµµµcttµAµLeuµIAGµCaenorhabditis elegansµcytosolic µ-GGAGAGAUGGCMGAGC--GGDCUAAGGCGCUGGUUUIAGGCACCAGU-CCCU---UC------GGGGG-CGUGGGTUCGAAUCCCACUCUCUUCACCA 
IµµKµµµµcttµAµLeuµIAGµCandida cylindraceaµcytosolic µ-GGUUCUCUGGCMGAGD--GGDCDAAGGCRCAUGGPUIAGKPCCAUGU-CUC----UUCG-----GAGG-?GCGAGTPCG"ACCUCGCGGGAAUCACCA 
IµµKµµµµcttµAµLeuµIAGµCandida cylindraceaµcytosolic µ-GGCUCUCUGGCMGAGD--GGDCDAAGGCRCUAGGPUIAGKPCCUAGU-CUC----UUCG-----GAGG-?GCGAGTPCG"ACCUCGCGGGAGUCACCA 
IµµKµµµµcttµAµLeuµIAGµLupinus luteusµcytosolic µ-GUCAGGAUGLCMGAG-D-GGDCXAAGGCRCCAGAZUIAGKPUCUGGJCPCGA---A-------UCGGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACUCUUGACACCA 
IµµKµµµµcttµAµLeuµIAGµLupinus luteusµcytosolic µ-GUCAGGAUGLCMGAG-D-GGDCXAAGGCRCCAGAZUIAGKPUCUGGJCPGA----AUC------UUGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACUCUUGACACCA 
NµµKµµµµttaµUµLeuµNAAµCucumis sativusµcytosolic µ-GUCAGGAUGLC?GAG-D-GGDCXAAGGCRCCAGACUNAAKPPCUGGJ-CCUC---UAAG----GAGGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACUUCUGACACCA 
UµµKµµµµttaµUµLeuµUAAµLupinus luteusµcytosolic µ-GUCAGGAUGLCMGAG-D-GGDCXAAGGCRCCAGACUUAAKPPCUGGJCPCGA---A-------UCGGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACUUCUGACACCA 
∼µµKµµµµttaµUµLeuµUAAµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGAGGGUUGLCMGAGD--#GDCDAAGGCRGCAGABU∼AAKAPCUG-UUGGAC---GGUU----GUCC-G?GCGAGTPCG"ACCUCGCAUCCUUCACCA 
UµµKµµµµctaµUµLeuµUAGµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGGAGUUUGLCMGAGD--#GDDDAAGGCRPCAGAPUUAGKCPCUGAU-AUC----UUCG-----GAUG-?AAGGGTPCG"AUCCCUUAGCUCUCACCA 
)µµ6µµµµaaaµUµLysµ)UUµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-GCCCGGAUALCUCAGDC-GGD--AGAGCAPPGGACU)UU6APCCAAGG-------------------7D?CAGGG\PCA"GUCCCUGUUCGGGCGCCA 
3µµ[µµµµaaaµUµLysµ3UUµOryctolagus cuniculusµcytosolic µ-GCCCGGAUALCUCAGDC-GGD--AGAGCAPCAGACU3UU[APCUGAGG-------------------7D??AGGG\PCA"GUCCCUGUUCGGGCGCCA 
3µµ[µµµµaaaµUµLysµ3UUµRattus norvegicusµcytosolic µ-GCCCGLAUALCUCAGDC-GGD--AGAGCAPCAGACU3UU[APCUGAGG-------------------7D??AGGG\PCA"GUCCCUGUUCGGGCGCCA 
3µµ6µµµµaaaµUµLysµ3UUµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-PCCUUGUUALCUCAGDD-GGD--AGAGCRPPCGGCU3UU6ACCGAAAU-------------------7D?AGGGGTPCG"GCCCCCUAPGAGGAGCCA 
Cµµ6µµµµaagµCµLysµCUNµMus musculusµcytosolic µ-GCCCGLCUALCUCAGDC-GGD--AGAGCAPGGGACUCUN6APCCCAGG-------------------7D?GUGGG\PCG"GCCCCACGUUGGGCGCCA 
Cµµ6µµµµaagµCµLysµCUNµRattus norvegicusµcytosolic µ-GCCCGLCUALCUCAGDC-GGD--AGAGCAPGAGACUCUN6APCUCAGG-------------------7D?GUGGG\PCG"GCCCCACGUUGGGCGCCA 
Cµµ6µµµµaagµCµLysµCUNµRattus norvegicusµcytosolic µ-GCCCGLCUALCUCAGDC-GGD--AGAGCAPGGGACUCUN6APCCCAGG-------------------7D?GUGGG\PCG"GCCCCACGUUGGGCGCCA 
Cµµ6µµµµaagµCµLysµCUUµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-GCCCGGCUALCUCAGDC-GGD--AGAGCAPGAGACUCUU6APCUCAGG-------------------7DCGUGGG\PCG"GCCCCACGUUGGGCGCCA 
Cµµ6µµµµaagµCµLysµCUUµLoligo bleekeriµcytosolic µ-UCCCGLCUALCUCAGDC-GGU--AGAGCACGAGA<UCUU6APCUCGGG-------------------7D?GUGGG\PCG"GCCCCACGUUGGGAGCCA 
CµµHµµµµaagµCµLysµCUUµMus musculusµcytosolic µ-GCCCGGCUALCUCAGDC-GGU--AGAGCAPGAGACUCUUHAPCUCAGG-------------------7D?GUGGG\PCG"GCCCCACGUUGGGCGCCA 
Cµµ6µµµµaagµCµLysµCUUµOryctolagus cuniculusµcytosolic µ-GCCCGGCUALCUCAGDC-GGD--AGAGCAPGGGACUCUU6APCCCAGG-------------------7D?GUGGG\PCG"GCCCCACGUUGGGCGCCA 
Cµµ6µµµµaagµCµLysµCUUµOryctolagus cuniculusµcytosolic µ-GCCCGGCUALCUCAGDC-GGD--AGAGCAPGAGACUCUU6APCUCAGG-------------------7D?GUGGG\PCG"GCCCCACGUUGGGCGCCA 
Cµµ6µµµµaagµCµLysµCUUµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GCCUUGUUKLCGCAADC-GGD--AGCGCRPAUGACUCUU6APCAUAAG-------------------7UUAGGGGTPCG"GCCCCCUACAGGGCUCCA 
Cµµ6µµµµaagµCµLysµCUUµTriticum aestivumµcytosolic µ-GCCCGUCUALCUCAGDD-GGU--AGAGCRCAAGGCUCUU6ACCUUGUG-------------------KD?GUGGGTPCG"GCCCCACGGUPGGCGCCA 
NµµHµµµµaaaµUµLysµNUUµLoligo bleekeriµcytosolic µ-GCCUCCAUALCUCAGDC-GGU--AGAGCAPCAGACUNUUHA@CUGAGG-------------------7D?UGGGG\PCG"GUCCCCAULUGGG?UCCA 
NµµHµµµµaaaµUµLysµNUUµLoligo bleekeriµcytosolic µ-GCCUUCAUALCUCAGDC-GGU--AGAGCAPCAGACUNUUHA@CUGAGG-------------------7D?UGGGG\PCG"GUCCCCAULCGGG?UCCA 
Bµµ6µµµµatgµCµMetµBAUµHomo sapiensµcytosolic µ-GCCUCLUUALCGCAGDA-GGD--AGCGCRPCAGPCUBAU6APCUGAAG-------------------7D?GUGAGTPCG"UCCUCACACGGGGCACCA 
BµµEµµµµatgµCµMetµBAUµLupinus luteusµcytosolic µ-GGGGUGGUKLCGCAGDD-GGCX-AGCGCRPAGGPCUBAUEAPCCUGAG-------------------7D?GAGAGTPCG"GCCUCUCUCACCCCACCA 
Bµµ6µµµµatgµCµMetµBAUµMus musculusµcytosolic µ-GCCUCLUUALCGCAGDA-GGD--AGCGCRPCAGPCUBAU6APCUGAAG-------------------7D?GUGAGTPCG"UCCUCACACGGGGCACCA 
Bµµ6µµµµatgµCµMetµBAUµOryctolagus cuniculusµcytosolic µ-GCCUCLUUALCGCAGDA-GGD--AGCGCRPCAGPCUBAU6APCUGAAG-------------------7D?GUGAGTPCG"UCCUCACACGGGGCACCA 
BµµEµµµµatgµCµMetµBAUµTriticum aestivumµcytosolic µ-GGGGUGGUKLCGCAGDD-GGCX-AGCGCRPAGGPCUBAUEAPCCUGAG-------------------7D?GAGAGTPCG"GCCUCUCUCACCCCACCA 
Cµµ6µµµµatgµCµMetµCAUµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GCUUCAGUALCUCAGDA-GGA--AGAGCRPCAGPCUCAU6APCUGAAG-------------------7D?GAGAGTPCG"ACCUCUCCUGGAGCACCA 
#µµKµµµµttcµGµPheµ#AAµBombyx moriµcytosolic µ-GCCGAAAUALCUCAGDD-GGG--AGAGCRPPAGABU#AAKAPCUAAAG-------------------7D?CCUGGTPCA"UCCCGGGUUUCGGCACCA 
#µµKµµµµttcµGµPheµ#AAµBombyx moriµcytosolic µ-GCCGAAAUALCUCAGDD-GGG--AGAGCRPPAGABU#AAKAPCUAAAG-------------------7D?CCUGGTPCG"UCCCGGGUUUCGGCACCA 
#µµWµµµµttcµGµPheµ#AAµBos taurusµcytosolic µ-GCCGAAAUALCUC"GDD-GGG--AGAGCRPPAGABU#AAWAPCUAAAG-------------------7DC?CUGGTPCG"UCCCGGGUUUCGGCACCA 
#µµWµµµµttcµGµPheµ#AAµBos taurusµcytosolic µ-GCCGAAAUALCUC"GDD-GGG--AGAGCRPPAGABU#AAWAPCUAAAG-------------------7DC?CUGGTPCA"UCCCGGGUUUCGGCACCA 
#µµWµµµµttcµGµPheµ#AAµBos taurusµcytosolic µ-GCCGAAAUALCUC"GDD-GGG--AGAGCRPPAGABU#AAWAPCUAAAG-------------------7DC?CUGGTPCG"UCCCGGGUUUCGGCACCA 
#µµYµµµµttcµGµPheµ#AAµBrassica napusµcytosolic µ-GCGGGGAUALCUCAGDD-GGG--AGAGCRPCAGABU#AAYAPCUGAAG-------------------7DCGCGUGTPCG"UCCACGCUCACCGCACCA 
#µµKµµµµttcµGµPheµ#AAµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-GCCGAAAUALCUCAGDD-GGG--AGAGCRPPAGABU#AAKAPCUAAAG-------------------7DCCCCGGTPCA"UCCCGGGUUUCGGCACCA 
#µµYµµµµttcµGµPheµ#AAµEuglena gracilisµcytosolic µ-GCCGACUUALCUBAGDD-GGG--AGAGCRPPAGABU#AAYAPCUAAAG-------------------7UCCCUGGTPCG"UCCCGGGAGPCGGCACCA 
#µµWµµµµttcµGµPheµ#AAµHomo sapiensµcytosolic µ-GCCGAAAUALCUC"GDD-GGG--AGAGCRPPAGABU#AAWAPCUAAAG-------------------7DC?CUGGTPCG"UCCCGGGUUUCGGCACCA 
#µµWµµµµttcµGµPheµ#AAµHordeum vulgareµcytosolic µ-GCGGGGAUALCUCAGDD-GGG--AGAGCRPCAGABU#AAWAPCUGAAG-------------------7DCGCGUGTPCG"UCCACGCUCACCGCACCA 
#µµWµµµµttcµGµPheµ#AAµLupinus luteusµcytosolic µ-GCGGGGAUALCUCAGDD-GGG--AGAGCRPCAGABU#AAWAPCUGAAG-------------------7DCACGUGTPCG"UCCACGUUCACCGCACCA 
#µµKµµµµttcµGµPheµ#AAµMus musculusµcytosolic µAGCCGAAAUALCUC"GDD-GGG--AGAGCRPPAGABU#AAKAPCUAAAG-------------------7UC?CUGGTPCG"UCCCGGGUUUCGGCACCA 
#µµYµµµµttcµGµPheµ#AAµMus musculusµcytosolic µ-GCCGAAAUALCUC"GDD-GGG--AGAGCRPPAGABU#AAYAPCUAAAG-------------------7UC?CUGGTPCG"UCCCGGGUUUCGGCACCA 
#µµYµµµµttcµGµPheµ#AAµMus musculusµcytosolic µ-GCCGAAAUALCUC"GDD-GGG--AGAGCRPPAGABU#AAYAPCUAAAG-------------------7UC?CUGGTPCG"UCCCGGGUUUCGGCACCA 
#µµYµµµµttcµGµPheµ#AAµNeurospora crassaµcytosolic µ-GCGGGUUUALCUCHGDD-GGG--AGAGCRPCAGABU#AAYAP?UGAAG-------------------7D?GUGUGTPCG"UCCACACAAACCGCACCA 
#µµWµµµµttcµGµPheµ#AAµOryctolagus cuniculusµcytosolic µ-GCCGAAAUALCUC"GDD-GGG--AGAGCRPPAGABU#AAWAPCUAAAG-------------------7DC?CUGGTPCG"UCCCGGGUUUCGGCACCA 
#µµWµµµµttcµGµPheµ#AAµPisum sativumµcytosolic µ-GCGGGGAUALCUCAGDD-GGG--AGAGCRPCAGABU#AAWAPCUGAAG-------------------7DCGCGUGTPCG"UCCACGCUCACCGCACCA 
#µµYµµµµttcµGµPheµ#AAµSchizosaccharomyces pombeµcytosolic µ-GUCGCAAU;LUGPAGDD-GGG--AGCAPLACAGABU#AAYAPCUGUUG-------------------7NCAUCGGTPCGAUCCCGGUUUGUGACACCA 
#µµWµµµµttcµGµPheµ#AAµTriticum aestivumµcytosolic µ-GCGGGGAUALCUCAGDD-GGG--AGAGCRPCAGABU#AAWAPCUGAAG-------------------7DCGCGUGTPCG"UCCACGCUCACCGCACCA 
#µµWµµµµttcµGµPheµ#AAµXenopus laevisµcytosolic µ-GCCGAAAUALCUC"GDD-GGG--AGAGCRPPAGABU#AAWAPCUAAAG-------------------7DC?CUGGTPCG"UCCCGGGUUUCGGCACCA 
#µµYµµµµttcµGµPheµGAAµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GCGGAUUUALCUCAGDD-GGG--AGAGCRCCAGABU#AAYAP?UGGAG-------------------7UC?UGUGTPCG"UCCACAGAAUUCGCACCA 
#µµYµµµµttcµGµPheµGAAµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GCGGACUUALCUCAGDD-GGG--AGAGCRCCAGABU#AAYAP?UGGAG-------------------7UC?UGUGTPCG"UCCACAGAGUUCGCACCA 
GµµKµµµµttcµGµPheµGAAµScenedesmus obliquusµcytosolic µ-GGCUUGAUALCUCAGCD-#GG--AGAGCRPPAGABUGAAKAPCUACAG-------------------7.?CCCAGTPCG"U?BUGGGUCAGGCCACCA 
&µµKµµµµccaµUµProµ&GGµPichia jadiniiµcytosolic µ-GGCBGCGUKGUCPAGD--GGD--AUGAUACUCGCUU&GGKPGPGAGUG-------------------7D??AGGGTPCA"UUCCCUGCUCGGCCCCCA 
IµµKµµµµcctµAµProµIGGµLupinus luteusµcytosolic µ-GGGACAUUKGUCPAGD--GGD--AUGAUUCUCGCUUIGGKPGCGAGAG-------------------7D?CCGAGTPCG"UUCUCGGAUGUCCCCCCA 
NµµKµµµµccaµUµProµUGGµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGGBGUGUKGUCPAGD--GGD--AUGAUUCUCGCPUNGGKPGCGAGAG-------------------7CCCUGGGTPCA"UUCCCAGCUCGCCCCCCA 
1µµ+µµµµtgaµUµSecµ1CAµBos taurusµcytosolic µ-GCCCGGAU_CCUCAGU--GGUC-UGGGGUGCAGGCU1CA+ACCUGUAGCUGUC--UAGC---GACAG---AGUGGUPCA"UUCCA_UUUCGGGCGCCA 
1µµ+µµµµtgaµUµSecµ1CAµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-GCCCCACU_CUUCGGU--GGU-CCGGGGUGCGGACU1CA+AUCCGUAGUCGAU--UUGC---GUCGA---AGUGGUPCGAUUCCA_UGGGGGGCGCCA 
1µµ+µµµµtgaµUµSecµ1CAµXenopus laevisµcytosolic µ-GCCCGGAU_CCUCAGU--GGU-CUGGGGUGCAGGCU1CA+ACCUGUAGCUGUC--UAGC---GACAG---AGUGGUPCA"UUCCA_UUUCGGGCGCCA 
Nµµ+µµµµtgaµUµSecµNCAµHomo sapiensµcytosolic µ-GCCCGGAU_CCUCAGU--GGUC-UGGGGUGCAGGCUNCA+ACCUGUAGCUGUC--UAGC---GACAG---AGUGGUPCA"UUCCA_UUUCGGGCGCCA 
Nµµ+µµµµtgaµUµSecµNCAµMus musculusµcytosolic µ-GCCCGGAU_CCUCAGU--GGUC-UGGGGUGCAGGCUNCA+ACCUGUAGCUGUU--UAGC---GACAG---AGUGGUPCA"UUCCA_UUUCGGGCGCCA 
Uµµ+µµµµtgaµUµSecµUCAµChlamydomonas reinhardtiiµcytosolic µ-GCCGCUGU_CUUGGCG--GGU-GCUGAGUGCGGUCUUCA+AACCGUAGAGGCC--GGAA---GGCCU---AGUGGUPCA"UUCCA_UCGGCGGCGCCA 
&µµ+µµµµtcaµUµSerµ&GAµCandida cylindraceaµcytosolic µ-GGUGCAAUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCRACGGAPU&GA+CPCCGUJ-GGGA---UUC-----UCCCU-?GCAGGTPCG"AUCCUGUUUGCAUCGCCA 
&µµ`µµµµtcaµUµSerµ&GAµNicotiana rusticaµcytosolic µ-GUCGAUAUGUCCGAGD--#GDD-AAGGARACAGA'U&GA`APCUGUJ-GGGC---UUC-----GCCCG-CGCAGGTPCG"ACCCUGCUGUCGACGCCA 
CµµAµµµµctgµCµSerµCAGµCandida cylindraceaµcytosolic µ-GACACCGUGLCMCAGD--#GDD-ACGGCRPUGGACGCAGAAPCCAUU-GAGC---UU------GCUCG-?GCGGGTPCG"AUCCCGUCGGUGUCUCCA 
Cµµ+µµµµtcgµCµSerµCGAµCandida cylindraceaµcytosolic µ-GGCAACUUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCRUGACA'UCGA+APGUCAJ-GGGU---UU------ACCCG-?GCAGGTPCG"AUCCUGCAGUUGUCGCCA 
Cµµ+µµµµtcgµCµSerµCGAµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-GCA#UCGUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCRUCUGA'UCGA+APCAGAJ-UCCC---U'U-----GGGAG-?GUAGGTPCG"AUCCUACCGGCUGCGCCA 
Cµµ`µµµµtcgµCµSerµCGAµLupinus luteusµcytosolic µ-GUCAGUAUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCRACAGA'UCGA`APCUGUJ-GAGAU--UU-----GCCUGG-?AGCGGTPCG"AUCCGCUUACUGACGCCA 
Cµµ`µµµµtcgµCµSerµCGAµNicotiana rusticaµcytosolic µ-GUCGAUAUGUCCGAGD--#GDD-AAGGARACAGA'UCGA`APCUGUJ-GGGC---UUU-----GCCUG-CGCAGGTPCG"AUCCUGCUGUCGACGCCA 
Cµµ+µµµµtcgµCµSerµCGAµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGCACUAUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCRAGAGA'UCGA+APCUCUJ-GGGC---UCU-----GCCCG-?GCUGGTPCAAAUCCUGCUGGUGUCGCCA 
Gµµ+µµµµagcµGµSerµGCUµCandida cylindraceaµcytosolic µ-GUUAAUGUGGCMGAGD--GGDD-AAGGCRCUUCC'UGCU+AGGAAGJ-GGGC---UCU-----GCCCG-?GCAGGTPCG"AUCCUGUCAUUAACGCCA 
GµµEµµµµagcµGµSerµGCUµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-GACGAGGUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCRPPGGA'UGCUEAPCCAAJ-GUGC---U'U-----GCACG-?GUGGGTPCG"AUCCCAUCCUCGUCGCCA 
Gµµ6µµµµagcµGµSerµGCUµNicotiana rusticaµcytosolic µ-GUCGCCUUGGCCGAGD--#GDD-AAGGCRPGUGC'UGCU6AGPACAJ-GGGG---UUU-----CCCCG-CGAGAGTPCG"AUCUCUCAGGCGACGCCA 
GµµEµµµµagcµGµSerµGCUµRattus norvegicusµcytosolic µ-GACGAGGUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCRAPGGA'UGCUEAPCCAUJ-GPGC---U'U-----GCACG-?GUGGGTPCG"AUCCCAUCCUCGUCGCCA 
Gµµ6µµµµagcµGµSerµGCUµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GUCCCAGUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCRAUGCCCUGCU6AGGCAUJ-GGGU---UUU-----ACCUG-?GCAGGTPCG"AUCCUGUCUGUGACGCCA 
Iµµ+µµµµtctµAµSerµIGAµCandida cylindraceaµcytosolic µ-GGCAUCUUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCRAAAGAPUIGA+APCUUUJ-GGGC---UCU-----GCCCG-?GCAGGTPCG"GUCCUGCAGAUGUCGCCA 
Iµµ+µµµµtctµAµSerµIGAµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-GCA#UCGUGGCMGAGC--#GDD-AAGGCRUCUGA'UIGA+APCAGAJ-UCCC---U'U-----GGGAG-?GUAGGTPCG"AUCCUACCGACUGCGCCA 
Iµµ`µµµµtctµAµSerµIGAµNicotiana rusticaµcytosolic µ-GUGGACGUGCCGGAGD--#GDD-AUCGGRCAUGA'UIGA`APCAUGJ-GGGC---UUU-----GCCCG-CGCAGGTPCG"AUCCUGCCGUCCACGCCA 
Iµµ`µµµµtctµAµSerµIGAµNicotiana rusticaµcytosolic µ-GUGGACGUGCCGGAGD--#GDD-AUCGGRCAUGA'UIGA`APCAUGJ-GGGC---UCU-----GCCCG-CGCAGGTPCG"AUCCUGCCGUCCACGCCA 
Iµµ+µµµµtctµAµSerµIGAµRattus norvegicusµcytosolic µ-GUAGUCGUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCRAPGGA'UIGA+AZCCAUJ-GGGG---U'U-----CCCCG-?GCAGGTPCG"AUCCUGCCGACUACGCCA 
Iµµ+µµµµtctµAµSerµIGAµRattus norvegicusµcytosolic µAGUAGUCGUGGCMGAGD--GGDD-AAGGCRAPGGA'UIGA+AZCCAUJ-GGGG---U'U-----CCCCG-?GCAGGTPCG"AUCCUGCCGACUACGCCA 
Iµµ+µµµµtctµAµSerµIGAµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGCAACUUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCRAAAGAPUIGA+APCUUUJ-GGGC---UCU-----GCCCG-?GCAGGTPCAAAUCCUGCAGUUGUCGCCA 
Iµµ+µµµµtctµAµSerµIGAµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGCAACUUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCRAAAGAPUIGA+APCUUUJ-GGGC---UUU-----GCCCG-?GCAGGTPCGAGUCCUGCAGUUGUCGCCA 
Iµµ+µµµµtctµAµSerµIGAµSpinacia oleraceaµcytosolic µ-GUGGACGUGCCGGAGD--#GDD-AUCGGRCAUGA'UIGA+APCAUGJ-GGGC---UUU-----GCCCG-CGCAGGTPCG"AUCCUGCCGUCCACGCCA 
UµµHµµµµtcaµUµSerµUGAµGallus gallusµcytosolic µ-AAGAAAGA"LCAUUAAGUGGDUUGAUGCLGPUGG'UUGAHACCAACAU-------------------G-UGAGGGTPCG"UUCCUUCCUUUCUUGCCA 
UµµAµµµµtcaµUµSerµUGAµHomo sapiensµcytosolic µ-GUAGUCGUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCGAPGGACUUGAAAPCCAUJ-GGGG---U'U-----CCCCG-?GCAGGTPCG"AUCCUGCCGACUACGCCA 
&µµ+µµµµtcaµUµSerµUGAµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGCACUAUGGCMGAGD--#GDD-AAGGCRACAGA'U&GA+APCUGUJ-GGGC---UCU-----GCCCG-?GCUGGTPCAAAUCCUGCUGGUGUCGCCA 
Iµµ6µµµµactµAµThrµAGUµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GCUUCUAUGLCCAAGDD-GGD--AAGGCRCCACA'UIGU6APGUGGAG-------------------AD?AUCGGTPCA"AUCCGAUUGGAAGCACCA 
Iµµ6µµµµactµAµThrµAGUµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GCUUCUAUGLCCAAGDD-GGD--AAGGCRCCACA'UIGU6APGUGGAG-------------------AD?GUCGGTPCA"AUCCGACUGGAAGCACCA 
Iµµ6µµµµactµAµThrµIGUµBos taurusµcytosolic µ-GGCCCUGUKLCUAGCD--GGDC-AAAGCRCCUGU'UIGU6AACAGGAG-------------------AD?CUGGGUPCG"AUCCCAGCGGGGC?UCCA 
BµµKµµµµtggµCµTrpµBCAµBos taurusµcytosolic µ-GACCUCLUKLCGCAAD--#GD--AGCGCRPCUGABUBCAKAZCAGAAG-------------------7DUGCGUGPPCG"AUCACGUCGGGGUCACCA 
BµµKµµµµtggµCµTrpµBCAµGallus gallusµcytosolic µ-GACCUCGUKLCGCAAC--#GD--AGCGCRPCUGABUBCAKAZCAGAAG-------------------7CUGCGUGPPCG"AUCACGUCGGGGUCACCA 
BµµKµµµµtggµCµTrpµBCAµNicotiana tabacumµcytosolic µ-GGAUCCGUKGCGCAAD--#GD--AGCGCGPCUGABUBCAKAZCAGAAG-------------------GDNGCGUGTPCG"UUCACGPCGGGUUCACCA 
BµµKµµµµtggµCµTrpµBCAµTriticum aestivumµcytosolic µ-GGANCCGUKLCGCAADD-#GD--AGCGCRPCUGABUBCAKAZCAGAAG-------------------GDUGCGUGTPCG"UUCACGPCGGGUCCACCA 
BµµAµµµµtggµCµTrpµCCAµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GAAGCGGUKLCUCAAD--#GD--AGAGCPPPCGABUBCAAAPCGAAGG-------------------7DUGCAGGTPCA"UUCCUGPCCGUUUCACCA 
9µµKµµµµtacµGµTyrµ9PAµBos taurusµcytosolic µ-CCUUCLAUALCUCAGDD-GGXU-AGAGCRRAGGACU9PAKAZCCUUAG-------------------7D?GCUGGTPCG"UUCCGGCUCGAAGGACCA 
9µµKµµµµtacµGµTyrµ9PAµHomo sapiensµcytosolic µ-CCUUCLAUALCUCAGDD-GGX--AGAGCRRAGGACU9PAKA]CCUUAG-------------------7D?GCUGGTPCG"UUCCGGCUCGAAGGACCA 
9µµKµµµµtacµGµTyrµ9PAµHomo sapiensµcytosolic µ-CCUUCLAUALCUCAGCD-GGX--AGAGCRRAGGACU9PAKA]CCUUAG-------------------7D?GCUGGTPCG"UUCCGGCUCGAAGGACCA 
GµµKµµµµtacµGµTyrµGPAµLupinus albusµcytosolic µ-CCGACCUUALCUCAGDD-#GU--AGAGCRGAGGACUGPAKAPCCUUAG-------------------7XCACUGGUPCG"AUCCGGUAGGUCGGACCA 
GµµKµµµµtacµGµTyrµGPAµLupinus luteusµcytosolic µ-CCGACCUUALCUCAGDD-#GU--AGAGCRGAGGACUGPAKAPCCUUAG-------------------7XCACUGGUPCG"AUCCGGUAGGUCGGACCA 
GµµKµµµµtacµGµTyrµGPAµNicotiana rusticaµcytosolic µ-CCGACCUUALCUCAGDD-#GU--AGAGCRGAGGACUGPAKAPCCUUAG-------------------7UCACUGGUPCG"AUCCGGUAGGUCGGACCA 
GµµKµµµµtacµGµTyrµGPAµNicotiana rusticaµcytosolic µ-CCGACCUUALCUCAGDD-#GU--AGAGCRGAGGACUGPAKAPCCUUAG-------------------7UCGCUGGUPCG"AUCCGGCAGGUCGGACCA 
Gµµ+µµµµtacµGµTyrµGPAµPichia jadiniiµcytosolic µ-CUCUCGGUKLCCAAGDD-#GDDDAAGGCRPCAGACUGPA+APCUGAAC-------------------AD?GGGCGTPCG"AUCGCCCCCGAGAGACCA 
GµµKµµµµtacµGµTyrµGPAµScenedesmus obliquusµcytosolic µ-CCCCUUGUAGCUCAGDD-#GC--AGAGCRGGAGACUGPAKAPCUCUAG-------------------7.CACUGGTPCG"AUCCGGUCGAGGGGACCA 
Gµµ+µµµµtacµGµTyrµGPAµSchizosaccharomyces pombeµcytosolic µ-CUCCUGAUKGUGPAGDD-GGDD-AUCACACCCGGCUGPA+ACCGGUUG-------------------7U?GCUAGTPCG"UUCUGGCUCAGGAGACCA 
GµµKµµµµtacµGµTyrµGPAµTriticum aestivumµcytosolic µ-CCGACCUUALCUCAGDD-#GU--AGAGCRGAGGACUGPAKAPCCUUAG-------------------7UCACUGGUPCG"AUCCGGUAGGUCGGACCA 
Gµµ+µµµµtacµGµTyrµGUAµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-CUCUCGGUALCCAAGDD-#GDDDAAGGCRCAAGACUGPA+APCUUGAG-------------------AD?GGGCGTPCG"CUCGCCCCCGGGAGACCA 
QµµKµµµµtacµGµTyrµQPAµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-CCUUCGAUALCUCAGDD-GGX--AGAGCRGPGGACUQPAKAJCCAUAG-------------------7DCGCUGGTPCA"AUCCGGCUCGAAGGACCA 
QµµKµµµµtacµGµTyrµQPAµTriticum aestivumµcytosolic µ-CCGACCUUALCUCAGDD-#GU--AGAGCRGAGGACUQPAKAPCCUUAG-------------------7UCACUGGUPCG"AUCCGGUAGGUCGGACCA 
.µµAµµµµgt.µµValµ.ACµHomo sapiensµcytosolic µ-GUUUCCGUAGUGPAGD--GGDD-AUCACLPUCGCCU.ACACGCGAAAG-------------------7D??CCGGUPCG"AACCGGGCGGAAACACCA 
.µµAµµµµgt.µµValµ.ACµRattus norvegicusµcytosolic µ-GUUUCCGUAGUGPAGD--#GDD-AUCACLPUCGCCU.ACA?GCGAAAG-------------------7D??CCGGUPCG"AACCGGGCGGAAACACCA 
IµµAµµµµgttµAµValµAACµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGUUUCGUKGUCPAGDC-GGDD-AUGGCAPCUGCPUIACACGCAGAAC-------------------7DC?CCAGTPCG"UCCUGGGCGAAAUCACCA 
CµµAµµµµgtg µCµValµCACµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-GUUUCCGUAGUGPAGC--GGDX-AUCACGPGUGCUUCACACGCACAAG-------------------7DCCCCGGTPCG"ACCCGGGCGGGAACACCA 
CµµAµµµµgtg µCµValµCACµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GUUCCAAUALUGPAGC--GGCD-AUCACLPPGCCPUCACACGGCAAAG-------------------7DC?CGAGTPCG"UCCUCGGUUGGAACACCA 
IµµAµµµµgttµAµValµIACµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-GUUJCCGUKGUGPAGC--GGDX-AUCACAPCUGCBUIACA?GCAGAAG-------------------7CC<CCGGTPCG"UCCCGGGCGGAAACACCA 
IµµAµµµµgttµAµValµIACµLupinus luteusµcytosolic µ-GGUUUCGUKGUGPAGD--GGDD-AUCACRPCAGUCUIACACACUGAAG-------------------7DCUCCGGTPCG"GUCCGGGCGAAGCCACCA 
IµµAµµµµgttµAµValµIACµMus musculusµcytosolic µ-GUUUCCGUAGUGPAGD--GGDD-AUCACLPUCGCBUIACA?GCGAAAG-------------------7D??CCGGUPCG"AACCGGGCGGAAACACCA 
IµµAµµµµgttµAµValµIACµOryctolagus cuniculusµcytosolic µ-GUUUCCGUAGUGPAGD--GGDD-AUCACLPUCGCBUIACA?GCGAAAG-------------------7D??CCGGUPCG"AACCGGGCGGAAACACCA 
IµµAµµµµgttµAµValµIACµPichia jadiniiµcytosolic µ-GGUUUCGUKGUCPAGDD-GGDC-AUGGCAPCUGCPUIACACGCAGAAC-------------------7DC?CCAGTPCG"UCCUGGGCGAAAUCACCA 
IµµAµµµµgttµAµValµIACµRattus norvegicusµcytosolic µAGUUUCCGUAGUGPAGD--GGDD-AUCACLPUCGCBUIACA?GCGAAAG-------------------7D??CCGGUPCG"AACCGGGCGGAAACACCA 
NµµAµµµµgtaµUµValµNACµDrosophila melanogasterµcytosolic µ-GGUJCCAUAGUGPAGC--GGDN-AUCAC;PCUGCPUNACACGCAGAAG-------------------7D?UCCGGTPCG"UCCCGGAUGGAACCACCA 
&µµAµµµµgtaµEucaryµValµUACµSaccharomyces cerevisiaeµcytosolic µ-GGUCCAAUGLUCCAGD--GGDDCAAGACRPCGCCPU&ACACGGCGAAG-------------------ADC?CGAGTPCG"ACCUCGGUUGGAUCACCA 
Gµµ6µµµµµmitoµAspµGUCµAedes albopictusµmitochondrial µ-AAAAAAUU"GUUUAAU--CA---AAAACCPPAGUAUGUC6AACUAAAA-------------------A-AAUUAGAUCAU--CUAAUAPPUUUUACCA 
Nµµ6µµµµµmitoµGluµNUCµAedes albopictusµmitochondrial µ-AUUUAUAU"GUUUAA---AU---AAAACAPPACAUUNUC6CUGUAAAA-------------------A-UAAAA-AUUUAU--UUUUPAUAAAUACCA 
UµµAµµµµµmitoµGlyµUCCµAedes albopictusµmitochondrial µ-AUUUAUAU"GUAUAUA--AU---UGUAUAPGN;ACUUCCAA]CACAAG-------------------G-ACUAA-AUAAUU--UUAGUAPAAAUACCA 
Gµµ6µµµµµmitoµIleµGAUµAedes albopictusµmitochondrial µ-AAUGAAUUKCCUGAU---AA---AAAGGAPPACCUUGAU6GGGUAAAU-------------------UAUAAAGAUUUAAU-ACUUPAPUCAUUACCA 
Cµµ6µµµµµmitoµLysµCUUµAedes albopictusµmitochondrial µ-CAUUAGAUKACUGAA---AG---CAAGUAAPGAUCUCUU6AAUCAUAA-------------------UAUAGUAAAUUAGC_UUACPPCUAAUGACCA 
NµµAµµµµµmitoµGlnµNUGµAedes albopictusµmitochondrial µ-UAUAUUUU"GUGUAU---GA---UGCACAAAAGPUUNUGAAACUUUUA-------------------G-AAAUAGUUUAAUUCUAUUAAAUAUAACCA 
Gµµ6µµµµµmitoµSerµGCUµAedes albopictusµmitochondrial µ-GAAAUAU--GUU-----GA--UC--AAG-AAAAGCUGCU6ABUPUUUCUU------------------UAAUGGUUUAAUUCCAUPAUAUUUCU-CCA 
Uµµ6µµµµµmitoµValµUACµAedes albopictusµmitochondrial µ-CAAUUUAA"LCUUAAUU-AGU--AAAGUAPPUCAUUUAC6PPGAAAAG-------------------A-AAUUUGUGCAAAUCAAUPPAAAUUGACCA 
Cµµ6µµµµµmitoµIniµCAUµAedes albopictusµmitochondrial µ-AAAAAGAU"AGCUAA---UU---AAGCUAPPGGGUUCAU6CCCCACUU-------------------A-UAAAGGUAAUAAUCCUUPPCUUUUUACCA 
GµµKµµµµµmitoµPheµGAAµAscaris suumµmitochondrial µ-ACUCUGUU"GUUUAUGU-UUU--AAAAPAPGACPPUGAAKAAGUUGGA-------------------A-AA----UG---------UUAGGAGUGCCA 
>µµAµµµµµmitoµMetµ>AUµAscaris suumµmitochondrial µ-AAPAAGAU"GGAUAA---GUUG-AGUCULPGAGGUU>AUACCCUCUUG-------------------G-UG----UUUUU------CUCUUAPUGCCA 
AµµKµµµµµmitoµArgµACGµAscaris suumµmitochondrial µ-GGACGUU""AUAGAU---AA---GCUAPGCCPAGPUACGKPCPGGGAA-------------------G-AG---------------AGUCGPCUUCCA 
Uµµ6µµµµµmitoµSerµUCUµAscaris suumµmitochondrial µ-GACAAAUG-----------------UUUPCAGGUCUUCU6AAPCUGUUUU--------------------GGA--GAAA-----UCCGPUUGUUUCCA 
!µµKµµµµµmitoµGluµ!UCµAscaris suumµmitochondrial µ-GAGAUAUU"GUAUAAAUUUUU--UGUAPAPUPCUPU!UCKAAGAAAAG-------------------G-U-----UUA---------UUAUCPUACCA 
!µµ6µµµµµmitoµLysµ!UUµAscaris suumµmitochondrial µ-GGGGUGUU"ACUUAAGUUU----AAAGPRPPAGAUU!UU6APCUGGAA-------------------A-UGG---GUUG------UCACAPCCUGCCA 
!µµKµµµµµmitoµGlnµ!UGµAscaris suumµmitochondrial µ-UAUACUUU"GUUUAGGA------AGAAUAPUUAPPU!UGKPGPAAAAG-------------------G-G-----UUG---------UAGUAPAGCCA 
$µµ*µµµµµmitoµTrpµ$CAµAscaris suumµmitochondrial µ-ACAGAUUU"AGUUAAGUUU----AAACUCPPGGPPU$CA*AACCAAAA-------------------A-U-----UUU---------ACUCPGUACCA 
$µµKµµµµµmitoµLeuµ$AAµAscaris suumµmitochondrial µ-GPUGUUAU"GCAUAAGA------AGUGCAPPUGPPU$AAKCGPAAAAG-------------------A-U-----AUG---------GGACAACUCCA 
QµµAµµµµµmitoµAspµQUCµAsterias amurensisµmitochondrial µ-AAGAAACU"GUUAAACUA-----AUAACACUGGAUUQUCAGACCGGAG--------------------UAACUGGUAAACAAUCAGUGUUUCUUGCCA 
QµµKµµµµµmitoµHisµQUGµAsterias amurensisµmitochondrial µGACUAAAGU"GUUUAAAU------AAAACCCPAAUPUQUGKPAUUAAAA--------------------UUAUCAGUPAA"AUCUGAUCUAUAGUCCCA 
Cµµ6µµµµµmitoµLysµCUUµAsterias amurensisµmitochondrial µ-CUUUGAUA"GCUUAUAAUGG---CAAGCAPUAAACUCUU6APUUAAAU-------------------CAAAGUGAUCUCACCACACUAUCAAAGACCA 
Gµµ+µµµµµmitoµAsnµGUUµAsterias amurensisµmitochondrial µ-UGAGUUGU"LCCUAGU--GGA--AAGGCGPPUGGCCGPU+ACPAAAAG-------------------AUAGCAAGAUCA"UACUUGCCAGCUCAGCCA 
Gµµ6µµµµµmitoµAsnµGPUµAsterias amurensisµmitochondrial µ-UGGGUUGU"GCCUAAU--GGA--AAGGCAAPUGGCCGPU6ACCAGGAG-------------------AUAACAAGAUCA"UACUUGUCAACUCAGCCA 
Gµµ*µµµµµmitoµTyrµGUAµAsterias amurensisµmitochondrial µ-GGCAGGGUKGCAGAA"--GUD--AAUGCACPAAAPUGUA*AUPUAUAA--------------------AUAAAGGUPUAAUUCCUUUUCUUGCCACCA 
∃µµAµµµµµmitoµGluµ∃UCµBos taurusµmitochondrial µ-GUUCUUGU"GUUGAA---UG---ACAACLAPGGUUU∃UCAUAPCAUUA-------------------G-U?AUGGUPAG"UUCCAUGUAAGAAUACCA 
GµµAµµµµµmitoµPheµGAAµBos taurusµmitochondrial µ-GUUGAUGU"LCUU-AA--CCC--AAAGCAAGGCACUGAAAAPGCCUAG-------------------A-UGAGU-CUCCCA--ACUCCAUAAACACCA 
UµµAµµµµµmitoµGlyµUCCµBos taurusµmitochondrial µ-AUUCUUUU"LUAUUAA--CU---AGUACAGCUGACUUCCAAPCAGCUA-------------------G-UUUCGGUCUAGU-CCGAAAAAGAAUACCA 
Gµµ6µµµµµmitoµIleµGAUµBos taurusµmitochondrial µ-AGAAAUAUKUCUGACA-------AAAGARPUACAUUGAU6GUGUAAAU-------------------AAUAGAGGUUCA"ACCCUCUUAUUUCUACCA 
∃µµ6µµµµµmitoµLysµ∃UUµBos taurusµmitochondrial µ-CACUAAGA"LCUAU---------AUAGCACPAACCU∃UU6AGUUAGAG-------------------AUUGAGAGCCAU"UACUCUCCUUGGUGACCA 
ʵµAµµµµµmitoµLeuµÊAAµBos taurusµmitochondrial µ-GUUAAGGUKLCAGAGCCCGGDA-AUUGCAPAAAACUÊAAACPUUUAUA-------------------UC?AGAGAUUCA"AUCCUCUCCUUAACACCA 
UµµKµµµµµmitoµLeuµUAGµBos taurusµmitochondrial µ-ACUUUUAA"LGAUAGU--AGDUU-AUCCLPPGGPCUUAGKAACCAAAA---------------------AAUUGGUGCAACUCCAAAUAAAAGUACCA 
UµµAµµµµµmitoµArgµUCGµBos taurusµmitochondrial µ-UGGUACUU"GUUUAA---AAU--AAAAUAAAUGAUUUCGACPCAUUAG-------------------A-UUAUGAUUUAAU-UCAUAAUUACCAACCA 
Gµµ6µµµµµmitoµSerµGCUµBos taurusµmitochondrial µ-GAAAAAG-U----------------AUGCAAGAACUGCU6AUUC_UGCUC--------------------?CAUAUCUAAU_UAUGGCUUUUUCGCCA 
Uµµ+µµµµµmitoµSerµUGAµBos taurusµmitochondrial µ-GAGAGAG-A-CAUAGA--GGD--UAUGAPGPPGG'UUGA+ACCAAUAG-------------------U-AGGGGGUPCG"UUCCUUCCUUUCUUACCA 
Uµµ6µµµµµmitoµThrµUGUµBos taurusµmitochondrial µ-GUCUUUGU"GUACAU---CU---AAUAUACUGGU'UUGU6AACCAGAG-------------------A-AGGAGAACAACU_CCUCCCPAAGA?UCCA 
UµµAµµµµµmitoµValµUACµBos taurusµmitochondrial µ-CAAGAUAU"LCUUAA---AC---AAAGCAPCCAGUUUACACCUAGAAG-------------------A-CUUCA-UUCAUUA-UGAAUAUCUUGACCA 
ʵµ*µµµµµmitoµTrpµÊCAµBos taurusµmitochondrial µ-AGGAAUUU"LGUUAA---AC---AGACCAAGAGCCUÊCA*AGCCCUAA-------------------G-?AAGUACAAUU--UACUUAAUUCCUGCCA 
>µµAµµµµµmitoµIniµ>AUµBos taurusµmitochondrial µ-AGUAAGGUCAGCUAAUU------AAGCUAPCGGGCC>AUACCCCGAAA-------------------A-UGPUGGUUUAUAUCCUUCCCGUACUACCA 
UµµAµµµµµmitoµAlaµUGCµBos taurusµmitochondrial µ-GAGGAUUU"LCUUAA---UU---AAAGULGPUGAUUUGCAUPCAAUUG-------------------A-UGUAAGGUGPAGUCUUGCAAUCCUUACCA 
Gµµ+µµµµµmitoµCysµGCAµBos taurusµmitochondrial µ-AGCCCUGUKGUGAAUU-------UACACGPPGAAPUGCA+APUCAGAG-------------------A-AGCAGCUUCA"U-UCUGCCGGGGCUUCCA 
QµµAµµµµµmitoµAspµQUCµBos taurusµmitochondrial µ-GAGGULUU"GUAAAAC-------AUUAUAPAAUPUUQUCAAAGUUAAG-------------------U-UACAAGUGAAAGUCCUGUACACCUCACCA 
QµµAµµµµµmitoµHisµQUGµBos taurusµmitochondrial µGGUAAAUAU"LUUUAA---CA---AAAACAPUAGAUUQUGAAPCUAACA-------------------A-UAGAAACUCAUU_CUUCUUAUUUACCCCA 
Qµµ6µµµµµmitoµAsnµQUUµBos taurusµmitochondrial µ-UAGAUUGA"LCCAGUU--AGCU-AGGGUGPPUAGCUQUU6ACUAAAGU-------------------UU?GUGGGGGUGGAGCCCACCAGUCUAGCCA 
UµµKµµµµµmitoµProµUGGµBos taurusµmitochondrial µ-CAGGGAAU"LUUUAA---AU---AGAACUPCAGCUUUGGKGGUUGAUG-------------------G-UGAGAC-UGCA--GUUUCUUCCUUGACCA 
Qµµ*µµµµµmitoµTyrµQUAµBos taurusµmitochondrial µ-GGUAAAAUKLCUGAGC-------AAAGCAUPAGACUQUA*APCUAAAG-------------------A-UAGAGGUPUGACUCCUCUUUUUACCACCA 
∃µµKµµµµµmitoµGlnµ∃UGµBos taurusµmitochondrial µ-UAGAAUUUKGUGUAAUU-GGG--AGCACGAAGAGUU∃UGKAPPCUUAG-------------------G-AGUAGGUPCGAUUCCUAUAGUUCUAGCCA 
QµµAµµµµµmitoµAspµQUCµDidelphis virginianaµmitochondrial µ-AAGAUAUU"LUAAAA---UUC--AUUACAPAACUPUQUCAUAGUUAAA-------------------U-UAUAGGUPUAACUCCUAUAUAUCUUACCA 
>µµAµµµµµmitoµMetµ>AUµGallus gallusµmitochondrial µ-AGUAAGGUCAGCUAA---CU---AAGCUAPCGGGCC>AUACCCCGAAA-------------------A-UGAUGGTPUAACCCCUUCCCCUACUACCA 
ʵµAµµµµµmitoµGlyµÊCUµHalocynthia roretziµmitochondrial µ-GCGUULAU"GUUUAA---GU---AAAAUAGAUUCUUÊCUAGGPAUAAG---------------------UUAGGGUUGG---UCCCUUUGAUGCACCA 
UµµAµµµµµmitoµGlyµUCCµHalocynthia roretziµmitochondrial µ-GCUGUGUU"GUAUAAA--GU---AAUAPAPGUGAPUUCCAAPCAUGGG---------------------AUCCUU-------UAGGGACGUAGUACCA 
GµµAµµµµµmitoµSerµGCUµHalocynthia roretziµmitochondrial µ-AAGGGUGAUUAGGAA---------UGUUAGAAAGPUGCUAPPUUUUUG-------------------AUAUPGAGUUCGAAUCUCGAGGCUCUUGCCA 
ʵµUµµµµµmitoµMetµÊAUµHalocynthia roretziµmitochondrial µ-GGUAAUAU"LGUUAAUA--U---AAACCAGAAAGUUÊAUUPCUUUCUA-------------------A-UAACGAA-------UGPUUAUUACUUCCA 
ʵµ*µµµµµmitoµTrpµÊCAµHalocynthia roretziµmitochondrial µ-AGGAGAUU"LUUUAAGU--U---AAAUCAAUUGUUUÊCA*AACAGUAG-------------------U-UAUAUAGAAUGAUUAUAUAUUUCCUGCCA 
CµµKµµµµµmitoµMetµCAUµHalocynthia roretziµmitochondrial µ-ACAACAGU"AACUAUGAA-AA--AGUUUGUGGGGUUCAUKGUCCUGAU----------------AAUGUGAUAUUAAAAUAUAUUGCCUGUUGAACCA 
Gµµ6µµµµµmitoµIleµGAUµHomo sapiensµmitochondrial µ-AGAAAUAUKUCUGAUA-------AAAGARPPACUUUGAU6GAGUAAAU-------------------AAUAGGAGCUUAAACCCCCUUAUUUCUACCA 
ʵµAµµµµµmitoµLeuµÊAAµHomo sapiensµmitochondrial µ-GUUAAGAUKLCAGAGCCCGGDA-AUCGCAPAAAACUÊAAAACUUUACA-------------------GU?AGAGGTPCA"UUCCUCUUCUUAACACCA 
Gµµ6µµµµµmitoµSerµGCUµHomo sapiensµmitochondrial µ-GAGAAAG-C----------------UCACAAGAACUGCU6ACUCAUGCCC--------------------CCAUGUCUA"C_CAUGGCUUUCUCACCA 
∃µµ6µµµµµmitoµLysµ∃UUµHomo sapiensµmitochondrial µ-CACUGUAA"LCUAAC--------UUAGCAPPAACCU∃UU6AGUUAAAG-------------------AUUAAGAGAACCAA_CUCUUUACAGUGACCA 
UµµKµµµµµmitoµProµUGGµHomo sapiensµmitochondrial µ-CAGAGAAU"GUUUAAA--UU---AGAAUCPPAGCPUUGGKPGCUAAUG-------------------G-UGGAG-TPAAAGA-CUUUUUCUCUGACCA 
QµµAµµµµµmitoµAspµQUCµHomo sapiensµmitochondrial µ-AAGGUAUU"LAAAAA---CC---AUUUCAPAACUUUQUCAAAGUUAAA-------------------U-UAUAGGCUAAAU-CCUAUAUAUCUUACCA 
UµµKµµµµµmitoµLeuµUAGµHomo sapiensµmitochondrial µ-ACUUUUAA"LGAUAAC--AGC--UAUCCAPPGGPCUUAGKCCCCAAAA-------------------A-UUUUGGUGCAACUCCAAAUAAAAGUACCA 
>µµAµµµµµmitoµMetµµHomo sapiensµmitochondrial µ-AGUAAGGUCAGCUAAAU------AAGCUAPCGGGCC>AUACCCCGAAA-------------------A-UGPUGGUUAUAC-CCUUCCCGUACUACCA 
.µµ.µµµµµmitoµLysµ.UUµLoligo bleekeriµmitochondrial µ-GCCUCCAUALCUCAGDC-GGU--AGAGCAPCAGACU.UU.ANCUGAGG-------------------7D?UGGGGUPCG"GUCCCCAULUGGG?UCCA 
Cµµ6µµµµµmitoµLysµCUUµLoligo bleekeriµmitochondrial µ-UCCCGLCUALCUCAGDC-GGU--AGAGCACGAGA<UCUU6APCUCGGG-------------------7D?GUGGGTPCG"GCCCCACGUUGGGAGCCA 
.µµAµµµµµmitoµLysµ.UUµLoligo bleekeriµmitochondrial µ-GCCUUCAUALCUCAGDC-GGU--AGAGCAPCAGACU.UUAANCUGAGG-------------------7D?UGGGGTPCG"GUCCCCAULCGGG?UCCA 
7µµ6µµµµµmitoµSerµ7CUµLoligo bleekeriµmitochondrial µ-AAAGGUAAUUAGGAA---------UAAAAPAAAGCU7CU6ACPUUAUU------------------UUGAGCAACUCAAAACUGUUCUACCUUUUCCA 
GµµAµµµµµmitoµAspµGUCµMesocricetus auratusµmitochondrial µ-AAGAUAUU"GUAAAA---UC---AUUACAPAACUUUGUCAGAGUUAAA-------------------U-UAUAGACUAAUC-UCUAUAUAUCUUACCA 
Nµµ6µµµµµmitoµLysµNUUµMesocricetus auratusµmitochondrial µ-CACUAUGA"LCUC----------AGAGCLPUAACCUNUU6AGUUAAAA-------------------U-UGAGAGACUUCUAGUCUCCAUGGUGACCA 
UµµAµµµµµmitoµArgµUCGµMesocricetus auratusµmitochondrial µ-UGGUGAUU"GUUUAA---CU---AAAAUUAAUGAPUUCGACPCAUUAG-------------------A-UUAUGACAUAUC-UCAUAAUCACCAACCA 
Gµµ6µµµµµmitoµSerµGCUµMesocricetus auratusµmitochondrial µ-GAGAAUG-U----------------AUGCAAGAGCUGCU6ACUCCUGCUA--------------------CCAUGUAUAAU_CAUGGCUUUCUUACCA 
UµµUµµµµµmitoµAlaµUGCµNeurospora crassaµmitochondrial µ-GGGGGUAUAGUAUAADU-GGD--AGUACAGCAAUCUUGCUCANUGCUU-------------------G-U?AAGGTPCAAAUCCUUGUAUCUCCACCA 
NµµAµµµµµmitoµLeuµNAAµNeurospora crassaµmitochondrial µ-AUCCGAGUGAUGGAAD--GGDA-GACAUAACAUGCUNAAAACAUGUG-GGCU---UCA-----AGCUG-UGAAGGTPCAAGUCCUUCUUCGGAUACCA 
UµµKµµµµµmitoµLeuµUAGµNeurospora crassaµmitochondrial µ-AUAGGUGUGCUGGAADU-GGDA-GACAGGUUCCGPUUAGKCCGGAAU-GGUUU--AA-----AAACUG-UACAAGTPCAAGUCUUGUCAUCUAUACCA 
Uµµ6µµµµµmitoµThrµUGUµNeurospora crassaµmitochondrial µ-GCCUGGUUAGCAUAAA--AGD--AAUGCAAUUGPUUUGU6APCAAUAG-------------------A-AGCAAGTGCGAUACUUGCACUGGGCUCCA 
UµµAµµµµµmitoµValµUACµNeurospora crassaµmitochondrial µ-GAGAGAUUAGCUCAGUU-GGD--AGAGCAACCGUUUUACACACGGAAG-------------------GUUGGGUGTPCGAAUCACCCAUUUCUCACCA 
NµµHµµµµµmitoµTrpµNCAµNeurospora crassaµmitochondrial µ-AAGAGUAUAGUUUAAU--GGD--AAAACAGAAAGCUNCAHCCUUUAAA-------------------U-UCUUAGTPCGAGUCUAAGUACUCUUGCCA 
CµµKµµµµµmitoµIniµCAUµNeurospora crassaµmitochondrial µ-UGCGGAUUAUUGUAAD--AGD--AACAUAUUUGGCUCAUKPCCGAAUG-------------------A-CAUAGGUGCAAAUCCUGUAUCCGCAUCCA 
GµµHµµµµµmitoµTyrµGUAµNeurospora crassaµmitochondrial µ-AGGAGGGUUCCGUUUGUUGGDAUGACGGRPUAAGCUGUAHACUUAAU-GACUA--AU-----UAGU?GU<GAAGGTPCAAUUCCUUUCUCUCCUACCA 
GµµHµµµµµmitoµPheµGAAµOenothera sp.µmitochondrial µ-GUUUAGGUAGCUCAUCD-GGCD.AGAGCAAAGGACUGAAHAUCCUUGU-------------------7XCAGUGGTPCGAAUCCACUUCUAAGCACCA 
Gµµ.µµµµµmitoµPheµGAAµPhaseolus vulgarisµmitochondrial µ-GUUUAGGUAGCUCAGCD-#GD--AGAGCAAAGGACUGAA.APCCUUGU-------------------7XCAGUGGTPCGAAUCCACUUCUAAGCGCCA 
.µµKµµµµµmitoµLeuµ.AAµPhaseolus vulgarisµmitochondrial µ-GUCAGGAUGLCMGAGD--#GDCXAAGGCRCCAGACU.AAKPPCUGGJ-CUUC---GAGA----GAGGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACUUCUGACACCA 
.µµKµµµµµmitoµLeuµ.AAµPhaseolus vulgarisµmitochondrial µ-GUCAGGAUGLCMGAGD--#GDCXAAGGCRCCAGACU.AAKPPCUGGJ-CUUC---GAAA----GAGGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACUUCUGACACCA 
.µµKµµµµµmitoµLeuµ.AGµPhaseolus vulgarisµmitochondrial µ-GAUAGUUUGLCMGAGD--#GDCXAAGGCRCCAGAPU.AGKCPCUGGJ-CCG----AAA------.GGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACAGCUGUCACCA 
.µµKµµµµµmitoµLeuµ.AAµPhaseolus vulgarisµmitochondrial µ-GCUGGUUUGGCMGAGA--#GDD-AAGGCRGAAGACU.AAKAPCUUCJ-GCAG---UCAA----CUGCG-?AUGGGTPCG"ACCCCAUAGCCAGCACCA 
Cµµ=µµµµµmitoµMetµCAUµPhaseolus vulgarisµmitochondrial µ-ACCUACUUGACUCAGC--#GDD-AGAGUAPCGCPUUCAU=CGGCGAGA-------------------7XCAUUGGTPCAAAUCCAAUAGUAGGUACCA 
UµµKµµµµµmitoµProµUGGµPhaseolus vulgarisµmitochondrial µ-CGAGGUGUAGCGCAGUCD#GDC-AGCGCAUCUGUUUUGGKPACAGAGG-------------------7CCAUAGGTPCGAAUCCUGUCACCUUGACCA 
BµµHµµµµµmitoµTrpµBCAµPhaseolus vulgarisµmitochondrial µ-GCGCUCUUAGUUCAGUUC#GD--AGAACRCGGGPCUBCAHAACCCGAU-------------------7.CGUAGGTPCAAAUCCUACAGAGCGUGCCA 
CµµAµµµµµmitoµIniµCAUµPhaseolus vulgarisµmitochondrial µ-AGCGGGGUAGAGUAGUD-#GUD-AACUCAPCAGGCUCAUAAPCUGAAG-------------------AUDGCAGGTPCGAAUCCUGCCCCCGCCACCA 
.µµHµµµµµmitoµTyrµ.UAµPhaseolus vulgarisµmitochondrial µ-GGGAGAGUGGCCGAGD--#GDCAAAAGCLACAGACU.UAHAPCUGUU-GAAG---UU------UUUCUACGUAGGTPCGAAUCCUGCCUCUCCCACCA 
QµµAµµµµµmitoµAspµQUCµRattus norvegicusµmitochondrial µ-GAGAUAUU"GUAAAA---UA---AUUACAPAACCUUQUCAAGGUUAAG-------------------U-UAUAGACUUAAA-UCUAUAUAUCUUACCA 
GµµAµµµµµmitoµAspµGUCµRattus norvegicusµmitochondrial µAGAGAUAUU"GUAAAA---UA---AUUACAPAACCUUGUCAAGGUUAAG-------------------U-UAUAGACUUAAA-UCUAUAUAUCUUACCA 
Gµµ*µµµµµmitoµPheµGAAµRattus norvegicusµmitochondrial µAGUUAAUGU"GCUUAUA--AU---AAAGCAAAGCACUGAA*APGCUUAG-------------------A-UGGAU-UCAAAA--AUCCCAUAAACACCA 
Nµµ6µµµµµmitoµLysµNUUµRattus norvegicusµmitochondrial µ-CAUUGCGA"LCUU----------AGAGCLPUAACCUNUU6AGUUAAAG-------------------UUAGAGA-CAACAAA-UCUCCACAAUGACCA 
UµµKµµµµµmitoµLeuµUAGµRattus norvegicusµmitochondrial µ-ACUUUUAU"LGAUAGA--AGD--AAUCCAPUGGUCUUAGKAACCAAAA-------------------A-C?UUGGUGCAACUCCAAAUAAAAGUACCA 
UµµKµµµµµmitoµLeuµUAGµRattus norvegicusµmitochondrial µAACUUUUAU"LGAUAGA--AGD--AAUCCAPUGGUCUUAGKAACCAAAA-------------------A-C?UUGGUGCAACUCCAAAUAAAAGUACCA 
UµµKµµµµµmitoµLeuµUAGµRattus norvegicusµmitochondrial µAACUUGUAU"LGAUAGA--AGD--AAUCCAPUGGUCUUAGKAACCAAAA-------------------A-C?UUGGUGCAACUCCAAAUAAAAGUACCA 
UµµAµµµµµmitoµArgµUCGµRattus norvegicusµmitochondrial µAUGGUAAUU"GUUUAA---AU---AAAAUUAAUGAPUUCGACPCAUUAG-------------------A-UUAUGAUAAUAA-UCAUAAUUACCAACCA 
UµµAµµµµµmitoµValµUACµRattus norvegicusµmitochondrial µ-CAUAGUGU"LCUUAAUC-AC---AAAGCAPCUGGCCUACACCCAGAAG-------------------A-AUUCA-UAAAAA--UGAACACUUUGACCA 
UµµAµµµµµmitoµValµUACµRattus norvegicusµmitochondrial µACAGAUUGU"LCUUAAUC-AC---AAAGCAPCUGGCCUACACCCAGAAG-------------------A-AUUCA-UAAAAA--UGAACACUUUGACCA 
Nµµ*µµµµµmitoµTrpµNCAµRattus norvegicusµmitochondrial µAAGAAGUUU"GGAUAU---AC---AGUCCAAGAGCCUNCA*AGCCCUUA-------------------G-AAAAC-AAACAA--GUUUAACUUCUGCCA 
Gµµ6µµµµµmitoµIleµGAUµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-GAAACUAUAAUUCAADD-GGDU-AGAAUAGUAUPUUGAU6AGGUACAA-------------------A-UAUAGGTPCAAUCCCUGUUAGUUUCACCA 
!µµKµµµµµmitoµLeuµ!AAµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-GCUAUUUUGGUGGAADU-GGDA-GACACRAUACPCU!AAKAPGUAUU-ACU----UUAC-----AGUA-UGAAGGTPCAAGUCCUUUAAAUAGCACCA 
$µµ6µµµµµmitoµLysµ$UUµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-GAGAAUAUUGUUUAAD--GGD--AAAACAGPUGPCU$UU6AGCAACCC-------------------A-UGC_GGTPCAACUCCAGCUAUUCUCACCA 
Cµµ6µµµµµmitoµMetµCAUµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-GCUUGUAUAGUUUAADD-GGDU-AAAACAUUUGPCUCAU6AAUAAAUA-------------------AUGUAAGGTPCAAUUCCUUCUACAAGUACCA 
GµµAµµµµµmitoµSerµGCUµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-GGAAAAUUAACUADA---GGD--AAAGU_AUUAPPUGCUAAGUAAUU-GAAUU--GUA----AAUUCU-UAUGAGTPCGAAUCUCAUAUUUUCCGCCA 
Gµµ+µµµµµmitoµTyrµGUAµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-GGAGGGAUUUUCAAUGUDGGDAGUUGGALPUGAGCUGUA+ACUCAAU-GACU---UA------GGUCUUCAUAGGTPCAAUUCCUAUUCCCUUCACCA 
CµµKµµµµµmitoµIniµCAUµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-UGCAAUAUGAUGUAADU-GGDU-AACAUUUUAGGGUCAUKACCUAAUU-------------------A-UAUACGTPCAAAUCGUAUUAUUGCPACCA 
GµµKµµµµµmitoµPheµGAAµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-GCUUUUAUAGCUUAGD--GGD--AAAGCRAUAAAPUGAAKAPUUAUUU-------------------A-CAU_AGUPCGAUUCUCAUUAAGGGCACCA 
Nµµ+µµµµµmitoµGlyµNCCµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-AUAGAUAUAAGUUAAUD-GGD--AAACURGAUGPCUNCC+AACAUUGA-------------------A-UGCGAGTPCGAUUCUCGCUAUCUAUACCA 
GµµKµµµµµmitoµHisµGUGµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µGGUGAAUAUAUUUCAAD--GGD--AGAAAAPACGCPUGUGKPGCGUUAA-------------------A-UCUGAGTPCGAUUCUCAGUAUUCACCCCA 
UµµKµµµµµmitoµProµUGGµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-CAGAUAGAAGCCAAAA--GGD--CAGGCLCUUUCPUUGGKAGAAAGAC-------------------CUAGUUAGTPCGAGUCUAUCCUAUCUGACCA 
AµµAµµµµµmitoµArgµACGµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-AUAUCUUUAAUUUAAD--GGD--AAAAUAPUAGAAUACGAAPCUAAUU-------------------A-UAUAGGTPCAAAUCCUAUAAGAUAUUCCA 
Nµµ6µµµµµmitoµArgµNCUµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-GCUCUCUUAGCUUAAD--GGDU-AAAGCAPAAUACUNCU6APAUUAAU-------------------AUUCCAUGTPCAAAUCAUGGAGAGAGUACCA 
UµµKµµµµµmitoµSerµUGAµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-GGAUGGUUGACUGAGD--GGDUUAAAGULPGAUAPUUGAKCPAUCAU-UAGUCU-UUAU--UGGCUA--CGUAGGTPCAAAUCCUACAUCAUCCGCCA 
UµµKµµµµµmitoµSerµUGAµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-GGAUGGUUGACUGAGD--GGDUUAAAGULUGAUAPUUGAKCPAUCAU-UAGUCU-UUAU--UGGCUA--CGUAGGTPCAAAUCCUACAUCAUCCGCCA 
UµµKµµµµµmitoµThrµUAGµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-GUAAAUAUAAUUUAAD--GGD--AAAAULPAUGP_UUAGKPGCAUAUU-------------------A-UCUAAGTPCAAAUCUUAGUAUUUACACCA 
!µµHµµµµµmitoµTrpµ!CAµSaccharomyces cerevisiaeµmitochondrial µ-AAGGAUAUAGUUUAAD--GGD--AAAACAGUUGAPU!CAHAPCAAUCA-------------------U-UAGGAGTPCGAAUCUCUUUAUCCUUGCCA 
<µµAµµµµµmitoµIleµµSolanum tuberosumµmitochondrial µ-GGGCUUAUAGUUPAADD-#GDD-GAAACGPACCGCU<AUAACGGUGAU-------------------AUUGUAGGTPCGAGCCCUACUAAGCCUACCA 
.µµAµµµµµmitoµIleµ.AUµSolanum tuberosumµmitochondrial µ-GGGC_UAUAGUUPAADD-#GDD-GAAACGPACCGCU.AUAACGGUGAU-------------------AUUGUAGGTPCGAGCCCUACUAAGCCUACCA 
.µµKµµµµµmitoµLeuµ.AAµSolanum tuberosumµmitochondrial µ-GUCAGGAUGGCMGAGD--#GDCXAAGGCRCCAGACU.AAKUPCUGGJ-CUUC---GUAA----GAGGG-?GUGGGTPCA"AUCCCACUUCUGACACCA 
CµµPµµµµµmitoµMetµCAUµTetrahymena pyriformisµmitochondrial µ-GCUGCUU--GAA--U---GGD----UUC_GUGGGCUCAUPPCCCAUUA-------------------CUAUAAAGTPCGAUUCUUUAAAGCGGCCCCA 
GµµHµµµµµmitoµPheµGAAµTetrahymena pyriformisµmitochondrial µUGCUUAAGUALCUCAGU--GGD--AGAGCRUCAGGCUGAAHACCPGAAG-------------------GUCAUUGGUCCGAUUCCAUUCUUAGGCACCA 
QµµHµµµµµmitoµTyrµQUAµTetrahymena pyriformisµmitochondrial µ-GAGAUGGUGLCUGAGU--GGDD-AAAGCRGPAGACUQUAHAPCPAUJ-GGG----UA-------UCCGUCGUCGGTPCGAGUCCGAUCCAUCUCACCA 
!µµ+µµµµµmitoµTrpµ!CAµTetrahymena thermophilaµmitochondrial µ-GGGGGAAUALUUUAAU--GGD--AGAACAACGGUCU!CA+AAPCGUUA-------------------G-CGUGGGUUCGAUUCCUGCUUCUCUCGCCA 
NµµAµµµµµmitoµGluµNUCµChlamydomonas reinhardtiiµplastidic µ-GCCCCCAUCGUCUAGA--#GCCDAGGACACCUCCCUNUCACGGAGAAA-------------------A-?GCGGATPCGAAUUCCGCUGGGGGUACCA 
UµµKµµµµµmitoµLeuµUA7µChlamydomonas reinhardtiiµplastidic µ-GCCUUCGUGAUC-GGAAU#GDAGA-GAUCCUGGUCUUA7KAACCAGCUG------CUGAA------AGGCGGCGGTPCAAAUCCGCCCGAAGGCACCA 
UµµAµµµµµmitoµGlyµUCCµCodium fragileµplastidic µ-GCAGUACUGGUGUAAD--#GDD-AGCGCCUUAGAPUUCCAAPCUAAAG-------------------G-UAGGGGTPCGAUUCCCCUGUACUGCUCCA 
Nµµ6µµµµµmitoµLysµNUUµCodium fragileµplastidic µ-GGGUUACUAACUCAAD--#GD--AGAGUAAPCGGCUNUU6ACCGAUAA-------------------7DUCUGGGTPCAAUUCCCAGGUAACUCACCA 
CµµHµµµµµmitoµMetµCAUµCodium fragileµplastidic µ-GCCUAUUUALCUCAGDD-#GDD-AGAGCAPCCGPCUCAUHCGCGGGAA-------------------7DGACUAGTPCAAAUCUAGUAAUAGGCACCA 
IµµHµµµµµmitoµArgµICGµCodium fragileµplastidic µ-GGGUAUAUAACUCAGD--#GADUAGAGUPPAUGGCUICGHACCAUAAA-------------------7DCGGGGGTPCGAAUCCCUCUAUACUCACCA 
Gµµ*µµµµµmitoµPheµGAAµEuglena gracilisµplastidic µ-GCUGGGAUAGCUCAGDU-G#D--AGAGCGGAGGACUGAA*APCCUUGU-------------------7.CACCAGTPCAAAUCUGGUUCCUAGCACCA 
BµµHµµµµµmitoµLeuµBAAµGlycine maxµplastidic µ-GCCUUGGUGGUGAAAU--#GDA-GCCACGCGAGACUBAAHAPCUCGU-GCU----ACAG-----AGCG-UGGAGGTPCGAGUCCUCUUCAAGGCACCA 
JµµHµµµµµmitoµLeuµJAAµGlycine maxµplastidic µ-GGGGAUAUGGCGAAAUU-#GDA-GACGCPACGGACUJAAHAPCCGUC-GACUU--AAG----AAAUCA-UGAGGGTPCAAGUCCCUCUAUCCCCACCA 
UµµKµµµµµmitoµLeuµUA7µGlycine maxµplastidic µ-GCCGCUAUGGUGAAAUU-#GDA-GACACGCUGCUCUUA7KAAGCAGU-GCU----AG-------AGCA-UCUCGGTPCGAGUCCGAGUAGCGGCACCA 
GµµHµµµµµmitoµAspµGUCµHordeum vulgareµplastidic µ-GGGAUUGUAGUUCAAUU-#GDC-AGAGCACCGCCCUGUCHAGGCGGAA-------------------G<UGCGGGTPCGAGCCCCGUCAGUCCCGCCA 
QµµHµµµµµmitoµAspµQUCµHordeum vulgareµplastidic µ-GGGAUUGUAGUUCAAUU-#GDC-AGAGCACCGCCCUQUCHAGGCGGAA-------------------G<UGCGGGTPCGAGCCCCGUCAGUCCCGCCA 
SµµAµµµµµmitoµGluµSPCµHordeum vulgareµplastidic µ-GCCCCUAUCGUMUAGU--GGDDCAGGACAUCUCPCUSPCAAGGAGGCA-------------------G-?GGGGATPCGACUUCCCCPGGGGGUACCA 
!µµHµµµµµmitoµGlnµ!UGµHordeum vulgareµplastidic µ-UGGGGCGUGGCCAAGU--#GD--AAGGCAGCGGGUU!UGHUCCCGUUA-------------------UDCGGAGGTPCGAAUCCUUCCGUCCCAGCCA 
NµµKµµµµµmitoµGlnµNUGµNicotiana rusticaµplastidic µ-UGGGGCGUGGCPAAGU--#GD--AAGGCAACGGGUUNUGKUCCCGCUA-------------------UUCGGAGGTPCGAAUCCUUCCGUCCCAGCCA 
Gµµ+µµµµµmitoµCysµGCAµNicotiana rusticaµplastidic µ-GGCGACAUGGCCGAGU--#GD--AAGGCAGAGGACUGCA+APCCUUUU-------------------UUCCCCAGTPCAAAUCCGGGUGUCGCCUCCA 
BµµAµµµµµmitoµTrpµBCAµNicotiana tabacumµplastidic µ-GCGCUCUUAGUUCAGUUC#GD--AGAACGPGGGPCUBCAAAACCCGAU-------------------GNCGUAGGTPCAAAUCCUACAGAGCGUGCCA 
Gµµ*µµµµµmitoµPheµGAAµPhaseolus vulgarisµplastidic µ-GUCGGGAUAGCUCAGUD-#GD--AGAGCAGAGGACUGAA*APCCUCGU-------------------7XCACCAGTPCAAAUCUGGUUCCUGGCACCA 
BµµHµµµµµmitoµLeuµBAAµPhaseolus vulgarisµplastidic µ-GGCUUGAUGGUGAAAUU-#GDA-GACACGCGAGACUBAAHAUCUCGU-GCU----AAAG-----AGCG-UGGAGGTPCGAGUCCUCUUCAAGUCACCA 
NµµHµµµµµmitoµLeuµNAAµPhaseolus vulgarisµplastidic µ-GGGGAUAUGGCGAAAUU-#GDA-GACGCPACGGACUNAAHAPCCGUC-GACUU--AAU----AAAUCA-UGAGGGTPCAAGUCCCUCUAUCCCCACCA 
UµµKµµµµµmitoµLeuµUA7µPhaseolus vulgarisµplastidic µ-GCCGCUAUGGUGAAAUU-#GDA-GACACGCUGCUCUUA7KAAGCAGU-GCU----AG-------AGCA-UCUCGGTPCGAGUCCGAGUAGCGGCACCA 
BµµHµµµµµmitoµTrpµBCAµPhaseolus vulgarisµplastidic µ-ACGCUCUUAGUUCAGUUC#GC--AGAACGPGGGPCUBCAHAACCCGAU-------------------7UCGUAGGTPCAAAUCCUACAGAGCGUGCCA 
CµµAµµµµµmitoµIniµCAUµPhaseolus vulgarisµplastidic µ-CGCGGAGUAGAGCAACUU#GD--AGCUCGCAAGGCUCAUAACCUUGAA-------------------7XUACGGGTPCAAAUCCCGUCUCCGCAACCA 
Cµµ/µµµµµmitoµMetµCAUµScenedesmus obliquusµplastidic µ-GCCUGCUPAGCUCAGUD-#GCC-AGAGCAUCCGPPUCAU/CGCGGAAA-------------------7DCACUAGTPCGAAUCUAGUAGCAGGCACCA 
CµµAµµµµµmitoµIniµCAUµScenedesmus obliquusµplastidic µ-CGCAGGAUAGAGCAGUCU#GD--AGCUCRPGGGGCUCAUAAPCCCAAU-------------------7DCGCAGGTPCAAAUCCUGCUCCUGCAACCA 
Gµµ*µµµµµmitoµTyrµGUAµScenedesmus obliquusµplastidic µ-GGGCCGAUGCCGAAGUN-#GDU-AAUGGGGCGGAPUGUA*APCCGCU-GGU----UAC------GCCUACGUUGGTPCGAAUCCGACUCGGCCCACCA 
Gµµ*µµµµµmitoµPheµGAAµSpinacia oleraceaµplastidic µ-GUCGGGAUAGCUCAGCU-#GD--AGAGCAGAGGACUGAA*AUCCUCGU-------------------7XCACCAGTPCAAAUCUGGUUCCUGGCACCA 
Gµµ6µµµµµmitoµIleµGAUµSpinacia oleraceaµplastidic µ-GGGCUAUUAGCUCAGU--#GD--AGAGCRCGCCCCUGAU6AGGGCGAG-------------------7XCUCUGGTPCAAGUCCAGGAUGGCCCACCA 
<µµ6µµµµµmitoµIleµµSpinacia oleraceaµplastidic µ-GCAUCCAUGGCUGAAU--#GDD-AAAGCRCCCAACU<AU6APPG_GAA-------------------UUCGUAGGTPCAAUUCCUACUGGAUGCACCA 
UµµKµµµµµmitoµLeuµUA7µSpinacia oleraceaµplastidic µ-GCCGCUAUGGUGAAAUU-#GDA-GACACGCUGCUCUUA7KAAGCAGU-GC-----GAGA------GCA-UCUCGGTPCGAGUCCGAGUAGCGGCACCA 
CµµAµµµµµmitoµMetµCAUµSpinacia oleraceaµplastidic µ-ACCUACUUAACUCAGC--#GDD-AGAGPAPPGCPUUCAUACGGCGGGA-------------------7XCAUUGGTPCAAAUCCAAUAGUAGGUACCA 
NµµHµµµµµmitoµProµNGGµSpinacia oleraceaµplastidic µ-AGGGAUGUA;CGCAGCUU#GD--AGCGCPPUUGUPUNGGHPACAAAAU-------------------7UCACGGGTPCAAAUCCUGUCAUCCCUACCA 
GµµEµµµµµmitoµThrµGGUµSpinacia oleraceaµplastidic µ-GCCCCUUUAACUCAGU--#GD--AGAGUAACGCCAUGGUEAGGCGUAA-------------------7DCAUCGGTPCAAAUCCGAUAAGGGGCUCCA 
NµµAµµµµµmitoµValµNACµSpinacia oleraceaµplastidic µ-AGGGCUAUAGCUCAGUUA#GD--AGAGCACCUCGUUNACACCGAGAAA-------------------7.CUACGGTPCGAGUCCGUAUAGCCCUACCA 
CµµHµµµµµmitoµTrpµCCAµSpinacia oleraceaµplastidic µ-GCGCUCUUAGUUCAGUUC#GD--AGAACLPGGGPCUCCAHAACCCGAU-------------------G.CGUAGGTPCAAGUCCUACAGAGCGUGCCA 
CµµAµµµµµmitoµIniµCAUµSpinacia oleraceaµplastidic µ-CGCGGGGUAGAGCAGUUU#GD--AGCUCGCAAGGCUCAUAACCUUGAG-------------------7UCACGGGTPCAAAUCCUGUCUCCGCAACCA 
SµµAµµµµµmitoµGluµSPCµTriticum aestivumµplastidic µ-GCCCCUAUCGUMUAGU--GGDDCAGGACAUCUCPCUSPCAAGGAGGCA-------------------G-?GGGGATPCGACUUCCCCPGGGGGUACCA 
Gµµ6µµµµµmitoµIleµGAUµZea maysµplastidic µ-GGGCUAUUAGCUCAGU--#GD--AGAGCRCGCCCCUGAU6AGGGCGAG-------------------7XCUCUGGTPCAAGUCCAGGAUGGCCCACCA 
CµµAµµµµgcgµBacterµAlaµCGCµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGGCCUGUGGCGCAGUCUGGD-DAGCGCACCUCGUUCGCAUCGAGGGG-------------------GUCUGGGGUUCA"AUCCCCACAGGUCCA--- 
GµµAµµµµgccµGµAlaµGGCµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGGGCUAUAGCUCAGCD-GGG--AGAGCGCUUGCAUGGCAUGCAAGAG-------------------7UCAGCGGTPCGAUCCCGCUUAGCUCCACCA 
GµµAµµµµgccµGµAlaµGGCµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GGGGCCAUAGCUCAGCD-GGG--AGAGCGCUACGCUGGCAGCGUAGAG-------------------7UCAGGGGTPCGAGCCCCCUUGGCUCCACCA 
GµµAµµµµgccµGµAlaµGGCµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGGGCUAUAGCUBAGUDDGGD-DAGAGCGCCUGCAUGGCAUGCAGGAG-------------------7UCAGGAGUUCA"UUCUCCUUAGCUCCACAA 
GµµAµµµµgccµGµAlaµGGCµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGGGCUAUAGCUBAGUDDGGD-DAGAGCGCCUGCAUGGCAUGCAGGAG-------------------7UCAGGAGUUCA"UUCUCCUUAGCUCCA--- 
5µµ=µµµµgcaµUµAlaµUGCµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GGAGCCUUAGCUCAGCD-GGG--AGAGCGCCUGCUU5GC=CGCAGGAG-------------------7UCAGCGGTPCGAUCCCGCUAGGCUCCACCA 
5µµ6µµµµgcaµUµAlaµUGCµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGGGCCU4AGCUCAGCU-GGG--AGAGCGCCUGCUU5GC6CGCAGGAG-------------------7UCAGCGGUUCGAUCCCGCUAGGCUCCA--- 
Uµµ=µµµµgcaµUµAlaµUGCµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGGCCCU4AGCUCAGCD-GGG--AGAGCACCUGCCUUGC=CGCAGGGG-------------------7UCGACGGUPCGAUCCCGUUAGGGUCCACCA 
Uµµ=µµµµgcaµUµAlaµUGCµMycoplasma mycoidesµprokaryotic cytosol µ-GGGCCCUUAGCUCAGCD-GGG--AGAGCACCUGCCUUGC=CGCAGGGG-------------------7UCGACGGUUCGAUCCCGUUAGGGUCCACCA 
CµµGµµµµgcaµUµAlaµUGCµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGGGCCUUAGCUBAGUDGGDA-GAGCGCUGCCUUUGCAAGGCAGAU---------------------GUCAGGAGUUCGAAUCUCCUAGGCUCCA--- 
VµµAµµµµgcaµUµAlaµVGCµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGGGCUAUAGCUCAGCD-GGG--AGAGCGCCUGCUUVGCACGCAGGAG-------------------7UCUGCGGTPCGAUCCCGCAUAGCUCCACCA 
!µµ6µµµµagaµUµArgµ!CUµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GCCCAUGUAGCUCAGUA-GGAD-AGAGCACGCGCCU!CU6AGCGUGAG-------------------7UCGGAAGUPCGAGCCUUCUCGUGGGCACCA 
IµµAµµµµcgtµAµArgµACGµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GCAGGCGUGGCUCAACDDGGADDAGAGUACCUGACUICGAAUCAGGCG-------------------GUUGUAGGUUCGAAUCCUACCGCUUGCA--- 
IµµKµµµµcgtµAµArgµACGµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCACUCGUAGCUJAAC--GGADDAGAGCAUCUGACUICGKAUCAGAAG-------------------7UUGCAGGUUCG"AUCCUGCCGAGUGCA--- 
CµµKµµµµcggµCµArgµCCGµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCGCCCGUAGCUCAGCD-GGAD-AGAGCGCUGCC%UCCGKAGGCAGAG-------------------7UCUCAGGTPCGAAUCCUGUCGGGCGCGCCA 
CµµKµµµµcggµCµArgµCCGµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GCGCUCGUAGCUCAGUU-GGAD-AGAGCGGUGGUUUCCGKUACCACGGUCG----------------UCCGGGGGTPCGAAUCCCUCCGAGCGCGCCA 
CµµKµµµµcggµCµArgµCCGµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCCCCCGUAGCUBAG#-#GGADDAGAGCAUCGGCCUCCGKAGCCGGGU--------------------GCGCAGGUUCG"AUCCUGCCGGGGGCA--- 
Cµµ6µµµµaggµCµArgµCCUµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GCUCUAGUAGCACAGC--GGAD-AGUGCAGCAGUUUCCU6AACUGCAG-------------------7UCGGGAGTPCGAAUCUCUCCUAGAGCGCCA 
Cµµ6µµµµaggµCµArgµCCUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCCUUCGUAGCUBAG#-#GGADDAGAGCACCGCUCUCCU6AAGCGGGU-------------------GUCGCAGGUUCG"AUCCUGCCGGGGGCA--- 
Iµµ/µµµµcgtµAµArgµICGµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCAUCCG4AGCUCAGCD-GGAD-AGAGUACUCGG%UICG/ACCGAGCG-------------------7XCGGAGGTPCGAAUCCUCCCGGAUGCACCA 
IµµKµµµµcgtµAµArgµICGµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GCGCCCGUAGCUCAAU--GGAD-AGAGCGUUUGACUICGKAUCAAAAG-------------------7UUAGGGGTPCGACUCCCCUCGGGCGCGCCA 
IµµKµµµµcgtµAµArgµICGµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GCGCCCG4AGAUCAAUD-GGAD-AGAUCGCUUGACUICGKAPCAAAAG-------------------7UUGGGGGUPCGAGUCCCUCCGGGCGCACCA 
{µµ6µµµµagaµUµArgµUCUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCGCCCUUAGCUCAGUU-GGAU-AGAGCAACGAC%U{CU6AGPCGUGG-------------------GCCGCAGGTPCGAAUCCUGCAGGGCGCGCCA 
Uµµ6µµµµagaµUµArgµUCUµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GUCCCAGUAGCUCAGCD-GGAD-AGAGCAACGGCCUUCU6AGCCGUCG-------------------7UCGGGAGTPCGAAUCUCUCCUGGGACGCCA 
UµµAµµµµagaµUµArgµUCUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGUCCGAUAGCUCAGCU-GGADDAGAGCAUUCGCCUUCUAAGCGAACG-------------------7UCGAGGGUUCGAAUCCCCCUCGGAUCA--- 
UµµAµµµµagaµUµArgµUCUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCCCCCGUAGCUBAGU--GGADDAGAGCAGGCGCCUUCUAAGCGCUUG-------------------GcCGCAGGUUCGAGUCCUGCCGGGGGCG--- 
Qµµ6µµµµaacµGµAsnµGUUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-UCCUCUG4AGUUCAGDC-GGD--AGAACGGCGGACUQUU6APCCGUAU-------------------7UCACUGGTPCGAGUCCAGUCAGAGGAGCCA 
Gµµ6µµµµaacµGµAsnµGUUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-UGCGGAU4AGCUCAGUU-GGUA-GUAGCGCAUGACUGUU6AUCAUGAU-------------------7UCGUCAGUUCGAGUCUGACAUCCGCAG--- 
Gµµ6µµµµaacµGµAsnµGUUµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGCUUUU4AGCUCAGCA-GGD--AGAGCAACCGGCUGUU6ACCGGUUU-------------------7UCACAGGUPCGAGCCCUGUAAAAGCCGCCA 
Gµµ6µµµµaacµGµAsnµGUUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-UCCCCUGUAGCUBAAU--DGGC-AGAGCAGCCGGCUGUU6ACCGGCAG-------------------7UUACUGGUUCGAGUCCAGUCGGGGGAG--- 
Gµµ6µµµµaacµGµAsnµGUUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-UCCCCUGUAGCUBAAU--DGGC-AGAGCAUUCGGCUGUU6ACCGGAGG-------------------7UUACUGGUUCGAGUCCAGUCGGGGGAG--- 
Qµµ6µµµµaacµGµAsnµQUUµAzospirillum lipoferumµprokaryotic cytosol µ-UUCACAGUAGCUCAGU--GGD--AGAGCUAUCGGCUQUU6ACCGAUCG-------------------AUCGUAGGTPCGAGUCCUACCUGUGAAUCCA 
Qµµ6µµµµaacµGµAsnµQUUµAzospirillum lipoferumµprokaryotic cytosol µ-UUCACAGUCGCUCAGU--GGD--AGAGCUAUCGGCUQUU6ACCGAUCG-------------------AUCGUAGGTPCGAGUCCUACCUGUGAAUCCA 
⊄µµ/µµµµgacµGµAspµ⊄UCµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGAGCGG4AGUUCAGDC-GGDD-AGAAUACCUGCCU⊄UC/CGCAGGGG-------------------7UCGCGGGTPCGAGUCCCGPCCGUUCCGCCA 
GµµAµµµµgacµGµAspµGUCµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGUUCUGUAGUGUAGC--GGDDDAUCACGUCGCCCUGUCACGGCGAAG-------------------AUCGCGGGUUCGAUUCCCGUCAGAACCG--- 
GµµAµµµµgacµGµAspµGUCµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGCCCCA4AGCGAAGUD-GGDD-AUCGCGCCUCCCUGUCACGGAGGAG-------------------AUCACGGGUPCGAGUCCCGUUGGGGUCGCCA 
GµµAµµµµgacµGµAspµGUCµThermus thermophilusµprokaryotic cytosol µ-GGCCCCG4GGUGPAGUU-#GDD-AACACACCCGCCUGUCACGPGGGAG-------------------AUCGCGGGFPCG"GUCCCGUCGGGGCCGCCA 
Gµµ*µµµµtgcµGµCysµGCAµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGCGCGU4AACAAAGC--GGD--DAUGUAGCGGAPUGCA*APCCGUCU-------------------A-GUCCGGTPCGACUCCGGAACGCGCCUCCA 
Gµµ=µµµµtgcµGµCysµGCAµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGCAACA4GGCCAAGC--GGCD-A"GGCAUGGGUCUGCA=CACCCUGA-------------------U-CAUCGGUPCGAAUCCGAUUGUUGCCUCCA 
GµµAµµµµtgcµGµCysµGCAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GACCGUGUGCCCGAGA--GGCU-BAGGGGCUCGABUGCAACUCGAGUU-----------------ACACCGGUUCG""UCCGGUCACGGUCUCCG--- 
Gµµ*µµµµtgcµGµCysµGCAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGUGGAGUGGCCKAGA--GGC--GAGGCAACGGCCUGCA*AGCCGUCU-------------------A-CACGGGUUCAAAUCCCGUCUCCACCUCCA 
Gµµ≠µµµµtgcµGµCysµGCAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGUGGAGUGGCCKAGA--GGC--GAGGCAACGGCCUGCA≠AGCCGUCU-------------------A-CACGGGUUCAAAUCCCGUCUCCACCUCCA 
$µµ=µµµµcaaµUµGlnµ$UGµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-UGGGCUA4AGCCAAGC--GGD--A"GGCAAGGGACU$UG=CUCCCUCA-------------------UGCGCCGGUPCGAAUCCUGCUAGCCCAACCA 
Cµµ/µµµµcagµCµGlnµCUGµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-UGGGGUA4CGCCAAGC--#GD--AAGGCACCGGAJUCUG/PPCCGGCA-------------------UUCCGAGGTPCGAAUCCUCGUACCCCAGCCA 
CµµGµµµµcagµCµGlnµCUGµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-UGGGCUAUGBUGUAAUDDGGC--AACACUACGGUUUCUGGUACCGUCA-------------------U-UCUAGGUUCGAGUCCUGGUAGCCCAG--- 
$µµ/µµµµcaaµUµGlnµUUGµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-UGGGGUA4CGCCAAGC--#GD--AAGGCACCGGUJU$UG/PACCGGCA-------------------UUCCCUGGTPCGAAUCCAGGUACCCCAGCCA 
UµµAµµµµcaaµUµGlnµUUGµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-UGGGGUA4AGCCAAGCG-GDA--AGGCAAGGGACUSUUGACUCCCUCA-------------------UGCGUUGGUUCGAAUCCAGCUACCCCAG--- 
UµµGµµµµcaaµUµGlnµUUGµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-UCCCCCAUGKUGUAAUCAGGC--AGCACUGCGGUUUUUGGUACCGUCU-------------------G-UUCAGGUUCA"AUCCUGAUGGGGGAG--- 
Sµµ/µµµµgaaµUµGluµ{UCµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GUCCCCU4CGUCPAGA--GGCCCAGGACACCGCCCUSUC/CGGCGGUA-------------------A-CAGGGGTPCGAAUCCCCUAGGGGACGCCA 
$µµAµµµµgaaµUµGluµ$UCµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGCCUGUUGGUGAAGC--GGDD-A"CACACACGGUU$UCAUCCGUGGA-------------------CACACGGGUPCGAACCCCGUACAGGCUACCA 
CµµAµµµµgagµCµGluµCUCµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCCCCCGUUGUGJAGC--GGCCUAGCACGCUGCCCUCUCACGGCAGUA-------------------G-CGCCGGUUCG""UCCGGUCGGGGGUACAA 
CµµAµµµµgagµCµGluµCUCµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCCCCCGUUGUGJAGC--GGCCUAGCACGCUGCCCUCUCACGGCAGUA-------------------G-CGCCGGUUCG""UCCGGUCGGGGGUA--- 
NµµAµµµµgaaµUµGluµNUCµSynechocystis sp.µprokaryotic cytosol µ-GCCCCCAUCGUCUAGA--GGCCDAGGACACCUCCCUNUCACGGAGGCG-------------------A-CAGGGATPCGAAUUCCCUUGGGGGUACCA 
Sµµ/µµµµgaaµUµGluµSUCµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GUCCCCUUCGUCPAGA--GGCCCAGGACACCGCCCUSUC/CGGCGGUA-------------------A-CAGGGGTPCGAAUCCCCUAGGGGACGCCA 
UµµAµµµµgaaµUµGluµUUCµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGUCCGUUGGUC"AGG--GGUU-AAGACACCGCCUUUUCACGGCGGUA-------------------A-CACGGGUUCGAAUCCCGUACGGACUA--- 
!µµAµµµµggaµUµGlyµ!CCµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GCGGGUGUAGUUUAGU--GGD--AAAACCUCAGCCU!CCAAGCUGAUG-------------------U-CGUGAGTPCGAUUCUCAUCACCCGCUCCA 
{µµAµµµµggaµUµGlyµ{CCµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCGGGCAUCGUAUAAU--GGCU-AUUACCUCAGCCU{CCAAGCUGAUG-------------------A-UGCGGGTPCGAUUCCCGCUGCCCGCUCCA 
Uµµ=µµµµggaµUµGlyµ{CCµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GCAGGUG4AGUUUAAU--GGD--AGAACUUCAGCCUUCC=AGCUGAUU-------------------G-UGAGGGUPCGAUUCCCUUCACCUGCUCCA 
Uµµ=µµµµggaµUµGlyµ{CCµMycoplasma mycoidesµprokaryotic cytosol µ-GCAGGUG4AGUUUAAU--GGC--AGAACUUCAGCCUUCC=AGCUGAUU-------------------G-UGAGGGUPCGAUUCCCUUCACCUGCUCCA 
UµµCµµµµggaµUµGlyµ{CCµStaphylococcus epidermidisµprokaryotic cytosol µ-GCGGGAG4AUUUCAACU-UUD--AGAAUACGUUCCUUCCCGGAACGAG-------------------A-UAUAGGUGCAAAUCCUAUCUUCCGCUCCA 
UµµCµµµµggaµUµGlyµ{CCµStaphylococcus epidermidisµprokaryotic cytosol µ-GCGGGAG4AGUUCAAU--UUD--AGAACACAUUCCUUCCCGGAAUGAG-------------------G-UAUAGGUGCAAGUCCUAUCUUCCGCUCCA 
CµµAµµµµgggµCµGlyµCCCµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCGGGCG4AGUUCAAU--GGD--AGAACGAGAGCUUCCCAAGCUCUAU-------------------A-CGAGGGTPCGAUUCCCUUCGCCCGCUCCA 
CµµAµµµµgggµCµGlyµCCCµSalmonella typhimuriumµprokaryotic cytosol µ-GCGGGCGUAGUUCAAU--#GD--AGAACGAGAGCUUCCCAAGCUCUAU-------------------A-CGAGGGTPCGAUUCCCUUCGCCCGCUCCA 
CµµAµµµµgggµCµGlyµCCCµStreptomyces coelicolor A3(2)µprokaryotic cytosol µ-GCGGGUGUAGUUCAAU--GGD--AGAACAUCAGCUUCCCAAGCUGAGA-------------------G-CGCGAGTPCGAUUCUCGUCACCCGCUCCA 
CµµAµµµµgggµCµGlyµCCCµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCGGKUGUAGUUUAAU--GGD-DAGAACAUGAGCUUCCCAAGCUCAGA-------------------G-CGCGAGUUCGAUUCUCGUCACCCGCU--- 
GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCGGGAA4AGCUCAGDDDGGD-DAGAGCACGACCUUGCCAAGGUCGGG-------------------7UCGCGAGTPCGAGUCUCGUUUCCCGCUCCA 
GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GCGGAAGUAGUUCAGU--GGD--AGAACACCACCUUGCCAAGGUGGGG-------------------7UCGCGGGTPCGAAUCCCGUCUUCCGCUCCA 
GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GCGAACGUAGUUCAGG--GGU--AGAACACAACCUUGCCAUGGUUGGG-------------------7UCGCGAGUUCGAAUCUCGUCGUUCGCU--- 
GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCGKACGUAGCUBAGUDDGGD-DAGAGCGCAACCUUGCCAAGGUUGAG-------------------GUCGCCAGUUCGAACCUGGUCGUCCGCUCCA 
GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCGKACGUAGCUBAGUDDGGD-DAGAGCGCAACCUUGCCAAGGUUGAG-------------------GUCGCCAGUUCGAACCUGGUCGUCCGCU--- 
NµµAµµµµggaµUµGlyµNCCµSalmonella typhimuriumµprokaryotic cytosol µ-GCGGGCAUCGUAUAAU--GGCU-AUUACCUCAGCCUNCCAAGCUGAUG-------------------A-UGCGGGTPCGAUUCCCGCUGCCCGCUCCA 
Uµµ=µµµµggaµUµGlyµUCCµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GCGGAUGUAGUUUAAU--GGU--AGAACCCCAGCCUUCC=AGCUGGCU-------------------A-CGCGAGUUCGAUUCUCGUCAUCCGCU--- 
5µµ=µµµµggaµUµGlyµUCCµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GCGGAUGUAGUUUAAU--GGU--AGAACCCCAGCCU5CC=AGCUGGCU-------------------A-CGCGAGUUCGAUUCUCGUCAUCCGCU--- 
UµµAµµµµggaµUµGlyµUCCµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCGGGCGUAGCUCAAU--GGD-DAGAGCCCUAGUCUUCCAAACUAGCU-------------------A-CGCGGGUUCG"UUCCCGUCGCCCGCUCCA 
Qµµ/µµµµcacµGµHisµGUGµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µGGUGGCUA4AGCUCAGDD-GGD--AGAGCCCUGGAUUQUG/PPCCAGUU-------------------7UCGUGGGTPCGAAUCCCAUUAGCCACCCCA 
GµµKµµµµcacµGµHisµGUGµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GUGGGUAUAGCUBAGCU-GGC--AGAGCACCUGGUUGUGKUUCAGGAU-------------------7UCGCGGGUUCA"GUCCCGUUACUCACC--- 
GµµKµµµµcacµGµHisµGUKµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µGGCGUAGGUGGUGAAGU--GGDD-A"CACAUCAGGUUGUGKCPCUGACA-------------------UACGCGGGUPCGAUCCCCGUUCUACGCCCCA 
Qµµ/µµµµcacµGµHisµQUGµSalmonella typhimuriumµprokaryotic cytosol µGGUGGCUA4AGCUCAGDD-GGD--AGAGCCCUGGAUUQUG/PPCCAGUU-------------------7UCGUGGGTPCGAAUCCCAUUAGCCACCCCA 
}µµ6µµµµatcµGµIleµ}AUµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GGACCUUUAGCUCAGUU-GGUU-AGAGCAGACGGCU}AU6ACCGUCCG-------------------7UCGUAGGTPCGAGUCCUACAAGGUCCACCA 
}µµ=µµµµatcµGµIleµ}AUµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGACCUU4AGCUCAGUD-GGDD-AGAGCAUCCGGCU}AU=ACCGGACG-------------------7UCAUUGGUPCAAGUCCAAUAAGGUCCACCA 
}µµ6µµµµatgµCµIleµCAUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGCCCCU4AGCUCAGU--#GDD-AGAGCAGGCGACU}AU6APCGCUUG-------------------7XCGCUGGTPCAAGUCCAGCAGGGGCCACCA 
Gµµ6µµµµatcµGµIleµGAUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-AGGCUUGUAGCUCAGGD-GGDD-AGAGCGCACCCCUGAU6AGGGUGAG-------------------7XCGGUGGTPCAAGUCCACPCAGGCCUACCA 
Gµµ6µµµµatcµGµIleµGAUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGGAGUU4AGCUCAGUU-GGDDDAGAGCACUGUGUUGAU6ACGCAGGG-------------------7UCCCAGGUUCGAAUCCUGGAAUUCCCA--- 
Gµµ6µµµµatcµGµIleµGAUµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-CGGAAUAUAGCUCAGCD-GGDD-AGAGCAUUCCGCUGAU6ACGGAGAG-------------------7UCGUUGGUPCAAGUCCAAUUAUUCCGACCA 
Gµµ6µµµµatcµGµIleµGAUµMycoplasma mycoidesµprokaryotic cytosol µ-CGGAAUA4AGCUCAGCD-GGDD-AGAGCAUUCCGCUGAU6ACGGAGAG-------------------7UCGUUGGUPCAAGUCCAAUUAUUCCGACCA 
Gµµ6µµµµatcµGµIleµGAUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGGGCUAUAGCUBAGUDDGGDDDAGAGCGCAUCCCUGAU6AGGAUGAG-------------------------GGUUCA"AUCCUGUUAGCCCCACCA 
Gµµ6µµµµatcµGµIleµGAUµThermus thermophilusµprokaryotic cytosol µ-GGGCGAUUAGCUCAGCU-#GUD-AGAGCGCACGCCUGAU6AGCGUGAG-------------------7UCGGUGGFPCA"GUCCACCAUCGCCCACCA 
CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-CGCGGGG4GGAGCAGCCUGGD--AGCUCGUCGGGBUCAUAACCCGAAG-------------------7UCGUCGGTPCAAAUCCGGCCCCCGCAACCA 
CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-CGCGGGG4GGAGCAGCCUGGD--AGCUCGUCGGGBUCAUAACCCGAAG-------------------AUCGUCGGTPCAAAUCCGGCCCCCGCAACCA 
CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-CGCGGGGUGGAGCAGUUCGGD--AGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAG-------------------GUCGCAGGTPCAAAUCCUGCCCCCGCAACCA 
CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµMycobacterium smegmatisµprokaryotic cytosol µ-CGCGGGGUGGAGCAGCUCGGD--AGCUCGCUGGGCUCAUAACCCAGAG-------------------7UCGCAGGUPCG"AUCCUGUCCCCGCUACCA 
CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-CGCGGGGUAGAGCAGUD-GGD--AGCUCGCCGGGCUCAUAACCCGGAG-------------------GUCGCAGGUPCGAGUCCUGCCCCCGCAACCA 
CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµMycoplasma mycoidesµprokaryotic cytosol µ-CGCGGGG4AGAGCAGUD-GGD--AGCUCGCCGGGCUCAUAACCCGGAG-------------------GCCGCAGGUPCGAGUCCUGCCCCCGCAACCA 
CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-CGCGGGGUGGAGCAGCUCGGD--AGCUCGCUGGGCUCAUAACCCAGAG-------------------GUCGCAGGUPCA"AUCCUGUCCCCGCUACCA 
CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµSynechococcus elongatus PCC 6301µprokaryotic cytosol µ-CGCGGGGUAGAGCAGCCUGGD--AGCUCGUCGGGBUCAUAACCCGAAG-------------------7UCAGAGGTPCAAAUCCUCUCCCCGCCACCA 
CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµThermus thermophilusµprokaryotic cytosol µ-CGCGGGG4GGAGCAGCCU#GD--AGCUCGUCGGGBUCAUAACCCGAAG-------------------7UCGCCGGFPCA"AUCCGGCCCCCGCAACCA 
CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµThermus thermophilusµprokaryotic cytosol µ-CGCGGGG4GGAGCAGCCU#GD--AGCUCGUCGGGBUCAUAACCCGAAG-------------------7UCGCGGGFPCA"AUCCCGCCCCCGCAACCA 
)µµ*µµµµttaµUµLeuµ)AAµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCCCGGA4GGUGGAADC-#GDA-GACACAAGGGAPU)AA*APCCCUC-GGCG---UUCG----CGCUG-UGCGGGTPCAAGUCCCGCUCCGGGUACCA 
)µµ=µµµµttaµUµLeuµ)AAµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-CCCCAAG4GGCGGAAUA-GGDA-G"CGCAUUGGACU)AA=APCCAACGGGC----UUAAU---AUCCUGUGCCGGUPCAAGUCCGGCCUUGGGGACCA 
Bµµ*µµµµttgµCµLeuµBAAµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCCGAAG4GGCGAAADC-#GDA-GACGCAGUUGAPUBAA*APCAACC-GUA----GAAA-----UACG-UGCCGGTPCGAGUCCGGCCUUCGGCACCA 
Bµµ*µµµµttgµCµLeuµBAAµGeobacillus stearothermophilusµprokaryotic cytosol µ-GCCGAUG4GGCGGAAUD-GGCA-G"CGCGCACGACUBAA*APCGUGU-GGGC---UUU-----GCCCG-UGUGGGTPCGACUCCCACCAUCGGCACCA 
Bµµ=µµµµttgµCµLeuµBAAµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GCCUUUUUGGCGGAAUD-GGCA-G"CGCAUUAGACUBAA=APCUAACGAA-----GAAA------UUCGUAUCGGUPCGAAUCCGAUAAAGGGCACCA 
CµµHµµµµttgµCµLeuµCAAµRhodospirillum rubrumµprokaryotic cytosol µ-GCCUUUGUAGCGGAAD--GGD--AACGCGGCAGACUCAAHAPCUGCU-UUGG---UAAC----CCAGG-UGGUAGTPCGACUCUCCCCAAAGGCACCA 
CµµHµµµµttgµCµLeuµCAAµSynechococcus elongatus PCC 6301µprokaryotic cytosol µ-GGGCAAGUGGCGGAAUD-GGDA-GACGCAGCAGACUCAAHAPCUGCC-GCUA---GCGA----UAGUG-UGUGGGTPCGAGUCCCACCUUGCCCACCA 
CµµKµµµµctgµCµLeuµCAGµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCGAAGGUGGCGGAADD-#GDA-GACGCGCUAGCUUCAGKPGPUAGU-GUCC---UUAC----GGACG-UGGGGGTPCAAGUCCCCCCCCUCGCACCA 
CµµKµµµµctgµCµLeuµCAGµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GCGGGUGUGCGGGAAUD-GGDA-GACCGGCUAGAUUCAGKAPCUAGGGUCU----UUAU----GGACC-UGAGGGTPCA"GUCCCUUCACCCGCACCA 
Cµµ;µµµµctgµCµLeuµCAGµSalmonella typhimuriumµprokaryotic cytosol µ-GCGAAGGUGGCGGAADD-#GDA-GACGCGCUAGCUUCAG;PGPUAGU-GUCC---UUAC----GGACG-UGGGGGTPCAAGUCCCCCCCCUCGCACCA 
CµµKµµµµctgµCµLeuµCAGµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCGCGAGUGGCGGAAC--GGCA-GACGCGCUGGCUUCAGKUGCCAGUGUCC-----UUAG----GGACGUGGGGGUUCAAAUCCCCCCUCGCGCACGA 
CµµKµµµµctgµCµLeuµCAGµSynechococcus elongatus PCC 6301µprokaryotic cytosol µ-GCGGAACUGGCGGAAUD-GGDA-GACGCGCUAGAUUCAGKPPCUAGU-GGUU---UCAC----GACUG-UCCGGGTPCAAGUCCCGGGUUCCGCACCA 
GµµKµµµµctcµGµLeuµGAGµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCCGAGGUGGUGGAADD-#GDA-GACACGCUACCUUGAGKPGGUAGU-GCCC---AAUA----GGGCU-UACGGGTPCAAGUCCCGUCCUCGGUACCA 
GµµKµµµµctcµGµLeuµGAGµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GUCCGGKUGGCGGAAU--GGCA-GACGCGCUAGCJUGAGKUGCUAGUGCCCU----UUAU---CGGGCGUGGGGGUUCA"GUCCCCCCUCGGACACCA 
UµµAµµµµttaµUµLeuµUAAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCCCGGAUGKUGGAAC--GDA--GACACGGCGAGCUUAAACCUCGCUGCCCCU---CGG----GGGCG-UGCCGGUUCGAGUCCGGCUCCGGGCACUA 
VµµKµµµµctaµUµLeuµUAGµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCGGGAGUGGCGAAADD-#GUA-GACGCACCAGAUUVAGKPUCUGGCGCC------GCAA-----GGUGUGCGAGTPCAAGUCUCGCCUCCCGCACCA 
UµµKµµµµctaµUµLeuµUAGµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GCGGGUGUGGCGGAAUD-GGCA-GACGCGCUAGACUUAGKAPCUAGUGUUUU---AUGA-------CGUUGGGGGTPCAAGUCCCUUCACCCGCACCA 
UµµKµµµµctaµUµLeuµUAGµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGGGGAU4GGCGGAAUD-GGCA-G"CGCACUAGACUUAGKAPCUAGCGUC-----UUU-------GACGUAAGGGUPCAAGUCCCUUAUCCCCCACCA 
$µµ[µµµµaaaµUµLysµ$UUµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GAGCCAUUAGCUCAGUD-GGD--AGAGCAUCUGACU$UU[APCAGAGG-------------------7UCGAAGGTPCGAGUCCUUCAUGGCUCACCA 
$µµ6µµµµaaaµUµLysµ$UUµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GACUCGUUAGCUCAGCC-GGD--AGAGCAACUGGCU$UU6ACCAGUGG-------------------7UCCGGGGUPCGAAUCCCCGACGAGUCACCA 
Cµµ6µµµµaagµCµLysµCUUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGCCCGGUAGCUCAGUU-GGU--AGAGCAGUAGACUCUU6AUCUAUGG-------------------7UCCAGGGUUCGAGCCCCUGCCGAGCCA--- 
Cµµ6µµµµaagµCµLysµCUUµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GUCUGAUUAGCGCAACD-GGC--AGAGCAACUGACUCUU6APCAGUGG-------------------7UUGUGGGUPCGAUUCCCACAUCAGGCACCA 
Cµµ6µµµµaagµCµLysµCUUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCGCCKUUAGCUBAGUDDGGDDDAGAGCAGCUGACUCUU6AUCAGCGG-------------------7UCCGGGGUUCGAGUCCCUGACGGCGCACGA 
Cµµ6µµµµaagµCµLysµCUUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCGCCKUUAGCUBAGUDDGGDDDAGAGCAGCUGACUCUU6AUCAGCGG-------------------7UCCGGGGUUCGAGUCCCUGACGGCGCA--- 
Sµµ6µµµµaaaµUµLysµSUUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGGUCGUUAGCUCAGDD-GGD--AGAGCAGUUGACUSUU6APCAAUUG-------------------7XCGCAGGTPCGAAUCCUGCACGACCCACCA 
$µµ6µµµµaaaµUµLysµUUUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GACUCGU4AGCUCAGUU-GGU--AGAGCAUUUGACU$UU6AUCAAAGG-------------------7UCGCUGGUUCGAGCCCAGC=CGGGUCACUA 
$µµ6µµµµaaaµUµLysµUUUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GACUCGU4AGCUCAGUU-GGU--AGAGCAUUUGACU$UU6AUCAAAGG-------------------7UCGCUGGUUCGAGCCCAGC=CGGGUCA--- 
UµµAµµµµaaaµUµLysµUUUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGGCCKUUAGCUBAAUDDGGU-CAGAGCAGCGGACUUUUAAUCCGUUG-------------------7UUGUGGGUUCGAGUCCCACACGGCCUACCG 
Cµµ=µµµµatgµCµMetµCAUµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GGCGGUGUAGCUCAGC--GGCD-AGAGCGUACGGUUCAU=CCCGUGAG-------------------7DCGGGGGTPCGAUCCCCUCCGCCGCUACCA 
}µµ=µµµµatgµCµMetµCAUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGAUCUUUAGCUCAGUU-GGDDDAGAGCUAUCGGCU}AU=ACCGAUCG-------------------7UCGCUGGUUCGAAUCCAGCAAGAUCCA--- 
Mµµ=µµµµatgµCµMetµCAUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGCGGUGUAGCUCAGCU-GGCU-AGAGCGUUCGGUUMAU=CCCGAGAG-------------------7UCGGGGGUUCGAUCCCCUUCGCCGCUA--- 
CµµAµµµµatgµCµMetµCAUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-CGCGGGAUGGAGCAGCU-AGGU-AGCUCGUCGGGCUCAUAACCCGAAG-------------------7UCAUAGGTUCAAAUCCUAUUCCCGCAA--- 
CµµAµµµµatgµCµMetµCAUµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGCGGGG4AGCUCAGUD-GGDD-AGAGCGUUCGGUUCAUACCCGAAAG-------------------7UCGAGAGUPCAAAUCUCUCCCCCGCUACCA 
CµµAµµµµatgµCµMetµCAUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGGGCGGUAGCUBAGCC-LGDDDAGAGCAGCGGACUCAUAAUCCGUCG-------------------GCCGUGGGUUCGAGUCCCACCCGCCCCACCG 
CµµAµµµµatgµCµMetµCAUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-CGCGGGGUGGAGCAGCU-CGGDDAGCUCGCUGGGCUCAUAACCCAGAG-------------------GUCGCAGGUUCA"AUCCUGUCCCCGCUA--- 
Cµµ6µµµµatgµCµMetµCAUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-AGCGGUGUAGCUBAGUC-GGD-DAGAGCAAGCGGCUCAU6AUCGCUGU-------------------7UCACCGGUUCA"GUCCGGUCACCGCUACUA 
CµµAµµµµatgµCµMetµCAUµThermus thermophilusµprokaryotic cytosol µ-CGCGGGG4GGAGCAGCCU#GD--AGCUCGUCGGGBUCAUAACCCGAAG-------------------7UCGCGGGFPCA"AUCCCGCCCCCGCAACCA 
Mµµ6µµµµatgµCµMetµMAUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGCUACG4AGCUCAGDD-#GDD-AGAGCACAUCACUMAU6APGAUGGG-------------------7XCACAGGTPCGAAUCCCGUCGUAGCCACCA 
#µµ*µµµµttcµGµPheµ#AAµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GGCUCGGUAGCUCAGUD-GGD--AGAGCAACGGACU#AA*APCCGUGU-------------------7UCGGCGGTPCGAUUCCGUCCCGAGCCACCA 
#µµ*µµµµttcµGµPheµ#AAµGeobacillus stearothermophilusµprokaryotic cytosol µ-GGCUCGG4AGCUCAGUC-GGD--AGAGCAAAGGACU#AA*APCCUUGU-------------------7UCGGCGGTPCGAUUCCGUCCCGAGCCACCA 
Gµµ*µµµµttcµGµPheµGAAµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCCCGGA4AGCUCAGDC-GGD--AGAGCAGGGGAPUGAA*APCCCCGU-------------------7XCCUUGGTPCGAUUCCGAGUCCGGGCACCA 
GµµGµµµµttcµGµPheµGAAµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGCUCGGUAGCUCAGUU-GGU--AGAGCAAUGGAUUGAAGCUCCAUGU-------------------7UCGGCGGUUCGAUUCCGUCUCGCGCCA--- 
GµµKµµµµttcµGµPheµGAAµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGUCGUGUAGCUCAGUC-GGD--AGAGCAGCAGACUGAAKCPCUGCGU-------------------7UCGGCGGUPCAAUUCCGUCCACGACCACCA 
Gµµ*µµµµttcµGµPheµGAAµRhodospirillum rubrumµprokaryotic cytosol µ-GCCCGGGUAGCUCAGCD-GGD--AGAGCACGUGACUGAA*APCACGGU-------------------7UCGGUGGTPCGACUCCGCCCCCGGGCACCA 
Gµµ≠µµµµttcµGµPheµGAAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGCUGGGUAGCUBAGUDDGGUA-CGAGCGAUCGCCUGAA≠AGCGAUAG-------------------GUCGCCGGUUCGAUCCCGGCCCCAGCCACCA 
Gµµ*µµµµttcµGµPheµGAAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGCUGGGUAGCUBAGUDDGGUA-CGAGCGAUCGCCUGAA*AGCGAUAG-------------------GUCGCCGGUUCGAUCCCGGCCCCAGCCACCA 
Gµµ*µµµµttcµGµPheµGAAµSynechococcus sp. PCC 7002µprokaryotic cytosol µ-GCCAGGAUAGCNCAGUD-#GD--AGAGCAGAGGACUGAA*APCCUCGU-------------------7UCGGCGGTPCAAUUCCGCCUCCCGGCACCA 
Gµµ+µµµµttcµGµPheµGAAµThermus thermophilusµprokaryotic cytosol µ-GCCGALG4AGCUCAGUU-#GD--AGAGCAUGCGACUGAA+APCGCAGU-------------------7UCGGCGGTPCGAUUCCGCUCCUCGGCACCA 
5µµKµµµµccaµUµProµ5GGµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-CGGGAAGUAGCUCAGCUUGGD--AGAGCACAUGGPU5GGKACCAUGGG-------------------7UCGCAGGTPCGAAUCCUGUCUUCCCGACCA 
CµµKµµµµccgµCµProµCGGµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-CGGUGAUUGGCGCAGCCUGGD--AGCGCACUUCGUUCGGKACGAAGGG-------------------7UCGGAGGTPCGAAUCCUCUAUCACCGACCA 
CµµKµµµµccgµCµProµCGGµSalmonella typhimuriumµprokaryotic cytosol µ-CGGUGAU4GGCGCAGCCUGGD--AGCGCACUUCGJUCGGKACGAAGGG-------------------7UCGGAGGTPCGAAUCCUCUAUCACCGACCA 
CµµKµµµµccgµCµProµCGGµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-CGGGGUGUAGCGCAGCUUGGC--AGCGCGCUUCGUUCGGKACGAAGAG-------------------GUCGUGGGUUCAAAUCCCGCCACCCCGA--- 
GµµKµµµµcccµGµProµGGGµSalmonella typhimuriumµprokaryotic cytosol µ-CGGCACG4AGCGCAGCCUGGD--AGCGCACCGUCBUGGGKUPGCGGGG-------------------7UCGGAGGTPCAAAUCCUCUCGUGCCGACCA 
GµµGµµµµcccµGµProµGGGµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-CGGGACGUGGCGCAGCUUGGD-DAGCGCACUUGABUGGGGGUCAAGGG-------------------GUCGCAGGUUCA"AUCCUGUCGUCCCGA--- 
5µµKµµµµccaµUµProµUGGµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-CGGGAAGUAGCUCAGCUUGGU--AGAGUACUUGGUU5GGKACCAAGGU-------------------7UCGCAGGUUCGAAUCCUGUCUUCCCGA--- 
UµµKµµµµccaµUµProµUGGµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-CGGGAAGUGGCUCAGUUUGGD--AGAGCAUUCGGUUUGGKACCGAAGG-------------------7UCGCAGGUPCAAAUCCUGUCUUCCCGACCA 
UµµKµµµµccaµUµProµUGGµMycoplasma mycoidesµprokaryotic cytosol µ-CGGGAAGUGGCUCAGUUUGGD--AGAGCAUUCGGUUUGGKACCGAAGG-------------------GUCGCAGGUUCAAAUCCUGUCUUCCCGACCA 
UµµKµµµµccaµUµProµUGGµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-CGGGGUGUGGCGCAGCUUGGD-DAGCGCGUCCGCUUUGGKAGCGGAAG-------------------GUCGUCGGUUCG""UCCGGCCACCCCGACCA 
VµµKµµµµccaµUµProµVGGµSalmonella typhimuriumµprokaryotic cytosol µ-CGGCGAG4AGCGCAGCUUGGD--AGCGCAACUGGJUVGGKACCAGUGG-------------------7UCGGAGGTPCGAAUCCUCPCUCGCCGACCA 
Uµµ+µµµµtgaµUµSecµUCAµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-_AAGAUCG4CGUCUCC--GGDG-AGGCGGCUGGACUUCA+AUCCAGU-UGGGGCCGC_GCGGUCCCG--GGCAGGTPCGACUCCUGUGAUCUU_GCCA 
5µµ+µµµµtcaµUµSerµ5GAµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GGAGGAA4ACCCAAGUCUGGCDGA"GGGAUCGGUCU5GA+AACCGACAGGGUG--UCAA---AGCCCG-CGGGGGTPCGAAUCCCUCUUCCUCCGCCA 
Cµµ*µµµµtcgµCµSerµCGAµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGAGAGAUGCCGGAGC--#GCDGAACGGACCGGUCUCGA*AACCGGA-GUAGGG-GCAA--CUCUAC--CGGGGGTPCAAAUCCCCCUCUCUCCGCCA 
Cµµ`µµµµtcgµCµSerµCGAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGJAGCGUGUCCGAGC--GGCC#AAGGAGCUCGCCUCGA`AGCGAGUGUGGC----GUAA---CCCGU-CACCGUGGGUUCAAAUCCCACCGCUACCG 
Cµµ≠µµµµtcgµCµSerµCGAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGJAGCGUGUCCGAGC--GGCC#AAGGAGCUCGCCUCGA≠AGCGAGUGUGGC----GUAA---CCCGU-CACCGUGGGUUCAAAUCCCACCGCUACCG 
Cµµ+µµµµtcgµCµSerµCGAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGJAGCGUGUCCGAGC--GGCC#AAGGAGCUCGCCUCGA+AGCGAGUGUGGC----GUAA---CCCGU-CACCGUGGGUUCAAAUCCCACCGCUACCG 
Cµµ*µµµµtcgµCµSerµCGAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGJAGCGUGUCCGAGC--GGCC#AAGGAGCUCGCCUCGA*AGCGAGUGUGGC----GUAA---CCCGU-CACCGUGGGUUCAAAUCCCACCGCUACCG 
Gµµ6µµµµagcµGµSerµGCUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGUGAGG4GGCCGAGA--GGCDGAAGGCGCUCCC%UGCU6AGGGAGU-AUGCGGUCAAAAGCUGCAU--CCGGGGTPCGAAUCCCCGCCUCACCGCCA 
Gµµ6µµµµagcµGµSerµGCUµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GGAGAAGUACUCAAGU--GGCDGA"GAGGCGCCCCUGCU6AGGGUGUAGGUCGC-GUAA---GCGGCG-CGAGGGTPCAAAUCCCUCCUUCUCCGCCA 
Gµµ6µµµµagcµGµSerµGCUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGGGGGUUACUCAAGA--GGCUGAAGAGGACGGUU5GCU6AAAUCGU4AG7UCGG-GAA--ACCGGCG-CGAGGGUUCGAAUCCCUUACCCCCCU--- 
Gµµ6µµµµagcµGµSerµGCUµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGGUUAA4ACUCAAGUD-GGDG-A"GAGGACACCCUGCU6AGGUGUUAGGUCGG-UCU-----CCGGCGCGAGGGUPCGAGUCCCUCUUAACCCGCCA 
Gµµ6µµµµagcµGµSerµGCUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGAGGCGUCGCCUAGUCCGGUCU/UGGCGCCGCACUGCU6AUGCGGUUUGGGUC--UUAA-AGCCCAU-CGAGGGUUCA"AUCCCUCCGCCUCCG--- 
GµµAµµµµtccµGµSerµGGAµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGUGAGG4GUCCGAGU--#GDDGAAGGAGCACGCCUGGAAAGPGUGU-AUACG--GCAA---CGUAU--CGGGGGTPCGAAUCCCCCCCUCACCGCCA 
GµµAµµµµtccµGµSerµGGAµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GGAGAGC4GUCCGAGU--GGDCGA"GGAGCACGAUUGGAAAPCGUGUAGGCGGU-CAAC--UCCGUCU-CAAGGGTPCGAAUCCCUUGCUCUCCGCCA 
GµµAµµµµtccµGµSerµGGAµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGAGAAGUGUCCGAGU--GGCCGAAGGAGC=CGCCUGGAAAGUGUGUAUACGUCA-----CAAGCGUAUCGGGGGUUCGAAUCCCCUCUUCUCCU--- 
Gµµ`µµµµtccµGµSerµGGAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGAGGAUUCGCCUAGU--GGCCUAGGGCGCACGCJUGGA`AGCGUGUUGGGG----GCAA---CCCCU-CACGAGUUCG""UCUCGUAUCCUCCGCCA 
Gµµ≠µµµµtccµGµSerµGGAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGAGGAUUCGCCUAGU--GGCCUAGGGCGCACGCJUGGA≠AGCGUGUUGGGG----GCAA---CCCCU-CACGAGUUCG""UCUCGUAUCCUCCGCCA 
Gµµ+µµµµtccµGµSerµGGAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGAGGAUUCGCCUAGU--GGCCUAGGGCGCACGCJUGGA+AGCGUGUUGGGG----GCAA---CCCCU-CACGAGUUCG""UCUCGUAUCCUCCGCCA 
Gµµ*µµµµtccµGµSerµGGAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGAGGAUUCGCCUAGU--GGCCUAGGGCGCACGCJUGGA*AGCGUGUUGGGG----GCAA---CCCCU-CACGAGUUCG""UCUCGUAUCCUCCGCCA 
Vµµ*µµµµtcaµUµSerµUGAµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGAAGUG4GGCCGAGC--#GDDGAAGGCACCGGUBUVGA*AACCGGC-GACCC--GAAA---GGGUU--CCAGAGTPCGAAUCUCUGCGCUUCCGCCA 
Uµµ=µµµµtcaµUµSerµUGAµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGAAGAU4ACCCAAGUCCGGCDGA"GGGAUCGGUCUUGA=AACCGAGAGUCGG--GGAAA----CCGAGCGGGGGUPCGAAUCCCUCAUCUUCCGCCA 
Uµµ=µµµµtcaµUµSerµUGAµMycoplasma mycoidesµprokaryotic cytosol µ-GGAAGAUUACCCAAGUCCGGCDGA"GGGAUCGGUCUUGA=AACCGAGAGUCGGG-GAAA--CCCGAG--CGGGGGUUCGAAUCCCUCAUCUUCCGCCA 
Uµµ*µµµµtcaµUµSerµUGAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGUGGGUUGCCCGAGC--GGCCUAAGGGAACGGUCUUGA*AACCGUCGUGGCA---GCGA--UGUCAC-CGUGGGUUCAAAUCCCACACCCACCG--- 
5µµ6µµµµacaµUµThrµ5GUµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GCCGGUGUAGCUCAAUD-GGD--AGAGCAACUGACU5GU6APCAGUAG-------------------7UUGGGGGTPCAAGUCCUCUUGCCGGCACCA 
Aµµ6µµµµactµAµThrµAGUµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GCUGACU4AGCUCAGUD-GGD--AGAGCAAUUGACUAGU6APCAAUAG-------------------7UCGAAGGUPCAAAUCCUUUAGUCAGCACCA 
Cµµ6µµµµacgµCµThrµCGUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GCCGAGU4AGCUCAGUC-GGU--AGAGCACUUCACUCGU6ACGAAGGG-------------------GUCACAGGUUCGAUUCCUGCACUCGGCA--- 
Cµµ6µµµµacgµCµThrµCGUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCCGCCUUAGCUBAGUDDGGCC-AGAGCAACGCACUCGU6AUGCGUAG-------------------7UCUCGGGUUCGAAUCCCGAAGGCGGCU--- 
GµµEµµµµaccµGµThrµGGUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCUGAUAUGGCUCAGDD-GGD--AGAGCGCACCCUUGGUEAGGGUGAG-------------------7UCCCCAGTPCGACUCUGGGUAUCAGCACCA 
GµµEµµµµaccµGµThrµGGUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCUGAUAUAGCUCAGDD-GGD--AGAGCGCACCCUUGGUEAGGGUGAG-------------------7UCGGCAGTPCGAAUCUGCCUAUCAGCACCA 
GµµAµµµµaccµGµThrµGGUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GCCGUUGUAGCUCAGUC-GGU--AGAGCAGCACCAUGGUAAGGUGAAG-------------------7UCGACAGUUCGAUUCUGUUCAAUGGCA--- 
Gµµ6µµµµaccµGµThrµGGUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCCCCAAUAGCUBAGUC-GGD-DAGAGCGUCUCCAUGGU6AGGAGAAG-------------------GUCUGCGGUUCG"UUCCGCAUUGGGGCU--- 
Vµµ6µµµµacaµUµThrµUGUµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCCGACUUAGCUCAGUA-GGD-DAGAGCAACUGABUVGU6AUCAGUAG-------------------7UCACCAGTPCGAUUCCGGUAGUCGGCACCA 
5µµ6µµµµacaµUµThrµUGUµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GCCGACU4AGCUCAGUU-GGU--AGAGCAUCUGAUU5GU6AUCAGAGG-------------------7UCGCGUGUUCGAAUCAUGUAGUCGGCA--- 
Uµµ6µµµµacaµUµThrµUGUµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GCUGACU4AGCUCAGCA-GGC--AGAGCAACUGACUUGU6APCAGUAG-------------------7UCGUAGGUPCGAUUCCUAUAGUCAGCACCA 
UµµHµµµµacaµUµThrµUGUµMycoplasma mycoidesµprokaryotic cytosol µ-GCUGACUUAGCUCAGCA-GGC--AGAGCAACUGACUUGUHAPCAGUAG-------------------7UCGUAGGUUCGAUUCCUAUAGUCAGCACCA 
UµµAµµµµacaµUµThrµUGUµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCCUCCUUAGCUBAGUCCGGCCCAGAGCGAUGUACUUGUAAUACAUAG-------------------GUCGUCGGUUCG""UCCGACAGGAGGCU--- 
)µµ=µµµµtgaµUµTrpµ)CAµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-AGGGGCAUAGUUCAGUA-GGD--AGAACAUCGGUCU)CA=AACCGAGU-------------------7UCACGAGUPCGAGUCUUGUUGCCCCUGCCA 
Bµµ=µµµµtggµCµTrpµBCAµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-AGGAGAGUAGUUCAAU--GGD--AGAACGUCGGUCUBCA=AACCGAGC-------------------7UUGAGGGUPCGAUUCCUUUCUCUCCUGCCA 
Cµµ*µµµµtggµCµTrpµCCAµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-AGGGGCG4AGUUCAADD-GGD--AGAGCACCGGUBUCCA*AACCGGGU-------------------7UUGGGAGTPCGAGUCUCUCCGCCCCUGCCA 
Cµµ+µµµµtggµCµTrpµCCAµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-AGGGGCAUAGUUUAAC--GGD--AGAACAGAGGPCUCCA+AACCUCCG-------------------G-UGUGGGTPCGAUUCCUACUGCCCCUGCCA 
CµµHµµµµtggµCµTrpµCCAµSpiroplasma citriµprokaryotic cytosol µ-AGGGGUGUAGUUUAAU--GGU--AGAACAGCGGUCUCCAHCACCGUAC-------------------GUUGUGGGUPCAAGUCCUGUCACCCCUGCCA 
CµµAµµµµtggµCµTrpµCCAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-AGGGUCGUAGCUBAAUDDGGD-DAGAGCACUGGUCUCCAAAACCAGCG-------------------7UUGGGGGUUCA"GUCCCUCCGGCCCUGCUA 
Cµµ≠µµµµtggµCµTrpµCCAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-AGGGGCGUAGCUBAGCG-GCC--AGAGCGGCGGUCUCCA≠AAUCGUAU-------------------7UCGCAGGUUCGAUUCCUGCCGCCCCUGCCG 
Cµµ*µµµµtggµCµTrpµCCAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-AGGGGCGUAGCUBAGCG-GCC--AGAGCGGCGGUCUCCA*AAUCGUAU-------------------7UCGCAGGUUCGAUUCCUGCCGCCCCUGCCG 
NµµHµµµµtgaµUµTrpµNCAµSpiroplasma citriµprokaryotic cytosol µ-AGGGGUAUAGUUCAAUC-GGU--AGAACACCGGACUNCAHAPCCGGGU-------------------7UUGUGGGUPCAAGUCCUGCUACCCCUGCCA 
Gµµ+µµµµtacµGµTyrµGUAµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGAAGGGUAGCGAAGA--GGCUAAACGCGGCGGACUGUA+AUCCGCUCCU------UCG------GGUUCGGGGGUUCGAAUCCCUCCCCUUCCA--- 
Gµµ=µµµµtacµGµTyrµGUAµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGAGGGGUAGCGAAGU--GGCDAA"CGCGGGUGGCUGUA=CCCACUUCC------UUAC------GGUUCGGGGGUPCGAAUCCCUCCCCCUCCACCA 
Gµµ≠µµµµtacµGµTyrµGUAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGCGKUGUGCCCGAGU--GGCCAAAGGGAGCAGABUGUA≠AUCUGCCGGC------UCAG-----CCUACCCAGGUUCGAACCCUGGCGCCGCCA--- 
Gµµ*µµµµtacµGµTyrµGUAµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGCGKUGUGCCCGAGU--GGCCAAAGGGAGCAGABUGUA*AUCUGCCGGC------UCAG-----CCUACCCAGGUUCGAACCCUGGCGCCGCCA--- 
Qµµ*µµµµtacµGµTyrµQUAµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGUGGGG44CCCGAGC--#GCCAAAGGGAGCAGACUQPA*APCUGCC-GUC----AUC------GACUUCGAAGGTPCGAAUCCUUCCCCCACCACCA 
Qµµ*µµµµtacµGµTyrµQUAµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGUGGGG44CCCGAGC--#GCCAAAGGGAGCAGACUQPA*APCUGCC-GUC----ACA------GACUUCGAAGGTPCGAAUCCUUCCCCCACCACCA 
Qµµ*µµµµtacµGµTyrµQUAµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GGAGGGG4AGCGAAGU--GGCUAA"CGCGGCGGACUQUA*APCCGCU-CCC----UCA------GGGUUCGGCAGTPCGAAUCUGCCCCCCUCCACCA 
Qµµ*µµµµtacµGµTyrµQUAµGeobacillus stearothermophilusµprokaryotic cytosol µ-GGAGGGG4AGCGAAGU--#GCUAA"CGCGGCGGACUQUA*APCCGCU-CCC----UUU------GGGUUCGGCGGTPCGAAUCCGUCCCCCUCCACCA 
5µµ=µµµµgtaµUµValµ5ACµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GGAGGAUUAGCUCAGCD-GGG--AGAGCAUCUGCCU5AC=AGCAGAGG-------------------7UCGGCGGTPCGAGCCCGUCAUCCUCCACCA 
CµµAµµµµgtgµCµValµCACµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGGCGAUUAGCUBAGU--G#G--AGAGCGCUUCGUUCACACCGAAGAG-------------------7UCACUGGUUCGAACCCAGUAUCGCCCACCG 
GµµAµµµµgtcµGµValµGACµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCGUCCG4AGCUCAGDD-GGDD-AGAGCACCACCUUGACAUGGUGGGG-------------------7XCGGUGGTPCGAGUCCACUCGGACGCACCA 
GµµAµµµµgtcµGµValµGACµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GCGUUCA4AGCUCAGDD-GGDD-AGAGCACCACCUUGACAUGGUGGGG-------------------7XCGUUGGTPCGAGUCCAAUUGAACGCACCA 
GµµAµµµµgtcµGµValµGACµBacillus subtilisµprokaryotic cytosol µ-GAUUCCGUAGCUCAGCD-GGG--AGAGCGCUACCUUGACAGGGUAGAG-------------------7UCGCUGGTPCGAGCCCAGUCGGAAUCACCA 
Gµµ=µµµµgtcµGµValµGACµGeobacillus stearothermophilusµprokaryotic cytosol µ-GAUUCCGUAGCUCAGCD-GGG--AGAGCGCCACCUUGAC=GGGUGGAG-------------------7UCGCUGGTPCGAGCCCAGUCGGAAUCACCA 
GµµAµµµµgtcµGµValµGACµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCGCGAUUAGCUBAGC--G#G--AGAGCGCUUCCCUGACACGGAAGAG-------------------7UCACUGGUUCAAUCCCAGUAUCGCGCACCA 
GµµAµµµµgtcµGµValµGACµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GCGCGAUUAGCUBAGC--G#G--AGAGCGCUUCCCUGACACGGAAGAG-------------------7UCACUGGUUCAAUCCCAGUAUCGCGCA--- 
GµµAµµµµgtcµGµValµGACµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGACGAUUAGCUBAGC--G#G--AGAGCGCUUCCCUGACACGGAAGAG-------------------7UCACUGGUUCAAUCCCAGUAUCGUCCA--- 
5µµ=µµµµgtaµUµValµUACµLactococcus lactisµprokaryotic cytosol µ-GGGAGUU4AGCUCAGCU-GGG--AGAGCAUCUGCCU5AC=AGCAGAGG-------------------7UCAGCGGUUCGAUCCCGUUAACUCCCA--- 
Uµµ=µµµµgtaµUµValµUACµMycoplasma capricolumµprokaryotic cytosol µ-GGAGUGUUAGCUCAGCD-GGG--AGAGCUCCUGCCUUAC=AGCAGGCG-------------------7UCAUAGGUPCAAGUCCUAUACACUCCACCA 
Uµµ=µµµµgtaµUµValµUACµMycoplasma mycoidesµprokaryotic cytosol µ-GGAGUGU4AGCUCAGCD-GGG--AGAGCUCCUGCCUUAC=AGCAGGCG-------------------GUCAUAGGUUCAAGUCCUAUACACUCCACCA 
UµµAµµµµgtaµBacterµValµUACµStreptomyces griseusµprokaryotic cytosol µ-GGGUGCGUAGCUBAGG--#GD-DAGAGCGCUGCUCUUACAAAGCAGAU-------------------7UCGGCGGUUCGAAACCGUCCGCGCCCA--- 
Vµµ=µµµµgtaµUµValµVACµEscherichia coliµprokaryotic cytosol µ-GGGUGAU4AGCUCAGCD-GGG--AGAGCACCUCCCUVAC=AGGAGGGG-------------------7UCGGCGGTPCGAUCCCGUCAUCACCCACCA 
CµµAµµµµgcgµarchéeµAlaµCGCµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-GGGCUCGUAGAUCAGC--GGU--AGAUCRCUUCCUUCGCAAGGAAGAG-------------------GCC?UGGG]PBOAAUCCCAGCGAGUCCACCA 
CµµAµµµµgcgµCµAlaµCGCµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGCUCGUAGAUCAGU--GGC--AGAUCRCUUCCUUCGCAAGGAAGAG-------------------GC??GGGG]PBOAAUCCCCGCGAGUCCACCA 
GµµAµµµµgccµGµAlaµGGCµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGCUCGUAGAUCAGG--GGU--AGAUCACUCCCUUGGCAUGGGAGAG-------------------GC??CGGG]PBOAAUCCCGGCGAGUCCACCA 
UµµAµµµµgcaµUµAlaµUGCµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGCCCAUAGCUCAGU--GGU--AGAGULCCUCCUUUGCAAGGAGGAU-------------------GC??AGGG]PBGAAUCCCUGUGGGUCCACCA 
CµµKµµµµcggµCµArgµCCGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGCCCGUAGCUCA(U--GGAC-AGAGURCUUGGUUCCGKACCAAGAU-------------------GC?GCGGG]PBOAAUCCCGUCGGGUCCGCCA 
GµµKµµµµcgcµGµArgµGCGµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-GUCCGGAUARGGPAGU--GGACUAUCCUCUUGGCUUGCGKAGCCAGGG-------------------A-CCGG?G]PBOAAUCGCCGUCCGGACGCCA 
GµµKµµµµcgcµGµArgµGCGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GUCCUGAUARGGPAGU--GGACUAUCCUCCUGGCUUGCGKAGCCAGGG-------------------A-C?GGAG]PBOAAUCUCCGUCAGGACGCCA 
NµµKµµµµcgaµUµArgµNCGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGCGCUUAGCUCA(UCUGGAC-AGAGULCUUGGCUNCGKACCAAGUU-------------------GC?ACGGG]PBOAAUCCUGUAGCGCCCACCA 
;µµ6µµµµaacµGµAsnµ;UUµMethanobacterium thermaggregansµprokaryotic cytosol µ-GCGCCGGUGGCUCA;CCUGGUU-AGAGCUCACGGCU;UU6ACCGUGAG-------------------GCCGCGGGPPBOAAUCCCGCCCGGCGCACCA 
Gµµ6µµµµaacµGµAsnµGUUµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-GCCGCCAUAGCUCAGUU-GGU--AGAGCACGUGGUUGUU6CCCACGUU-------------------GU?CCAGG]PBGGACCCUGGUGGCGGCGAAC 
Gµµ6µµµµaacµGµAsnµGUUµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCCGCCGUAGCUCA(UU-GGU--AGAGCACCUCGCUGUU6ACGAGGUU-------------------GU??CAGG]PBGAGUCCUGGCGGUGGCGCCA 
GµµAµµµµgacµGµAspµGUCµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCCCGGGUGRUGPAGU--GGCCCAUCAUACGACCCUGUCACGGUCGUG-------------------A-CGCGGG]PBOAAUCCCGCCUCGGGCGCCA 
GµµKµµµµtgcµGµCysµGCAµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCCAAGGUGGCAGA(UUCGGCCCAACGCAUCCGCCUGCAKAGCGGAAC-------------------C_?GCCGG]PBOAAUCCGGCCCUUGGCUCCA 
CµµKµµµµcagµCµGlnµCUGµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-AGUCCCGU.RGGPAGU--GGCCAAUCCUGAAGCCUUCUGKGGGCUUCG-------------------A-CGGAAGPPBGAAUCUUCCCGGGACUACCA 
MµµKµµµµcagµCµGlnµMUGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-AGUCCCAUGRGGPAGU--GGCCAAUCCUGUUGCCUUMUGKGGGCAACG-------------------A-CCCAGGPPBGAAUCCUGGUGGGACUACCA 
MµµAµµµµgagµCµGluµMUCµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCUCUGUUGRUGPAGUCCGGCCAAUCAUAUCACCCUMUCACGGUGAUG-------------------A-C?AGGG]PBGAAUCCCUGACGGAGCACCA 
NµµKµµµµgaaµUµGluµNUCµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCUCGGUUGRUGPAGUCCGGCCAAUCAUCUUGGCCUNUCKAGCCGAGG-------------------A-C?AGGG]PBOAAUCCCUGACCGAGCACCA 
CµµAµµµµgggµCµGlyµCCCµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCGCCGAUGLUCCAGU--GGU--AGGACACGAGCUUCCCAAGCUCGGA-------------------G-C?CGGG]PBOAUUCCCGGUCGGCGCACCA 
GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-GCGCUGGUALUGPAGU--GGU--AUCACGUGACCUUGCCAUGGUCACA-------------------A-??UGGG]PBOAAUCCCAGCCAGCGCACCA 
GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCGUCGGUALUGPAGU--GGU--AUCACGUGACCUUGCCAUGGUCACA-------------------A-C?UGGG]PBOAAUCCCAGCCGACGCACCA 
GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCGCUGGUALUGPAGU--GGU--AUCACGUGACCUUGCCAUGGUCACA-------------------A-C?UGGG]PBOAAUCCCAGCCAGCGCACCA 
GµµAµµµµggcµGµGlyµGCCµMethanobacterium thermaggregansµprokaryotic cytosol µ-GCGGCGUUAGUCCA;CU-GGU-UAAGACACUGGCCUGCCACGCCAGCG-------------------U-CCCGGGPPBOAAUCCCGGACGCCGCACCA 
NµµAµµµµggaµUµGlyµNCCµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCACCGGUGLUCUAAU--GGU--AAGACAUUGGCCUNCCAAGCCAAUU-------------------A-U?UGGG]PBGAUUCCCAGCCGGUGCACCA 
GµµKµµµµcacµGµHisµGUGµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µGUCCGGGCU.RGGPAGU--GGACUAUCCUUCAGCCUUGUGKAGGCUGAG-------------------A-CGCGGG]PBGAUUCUCGCGCCUGGACCCA 
GµµKµµµµcacµGµHisµGUGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µGUCCGGGUUGRGGPAGU--GGACUAUCCUUCAGCCUUGUGKAGGCUGAG-------------------A-CGCGGGPPBAAUUCUCGCACCUGGACCCA 
Gµµ6µµµµatcµGµIleµGAUµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGCCAAUAGCUCAGUCAGGUU--GAGCRCPCGGCUGAU6AC?GGGAG-------------------GCC?GCGG]PBOAAUCCGCGUUGGCCCACCA 
Nµµ6µµµµataµUµIleµNAUµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGCCCCUAGCUCA(UCUGGUC-AGAGCRCUCGGCUNAU6ACCGGGUG-------------------GU?AUGGG]PBGAACCCCAUGGGGCCCACCA 
CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-AGCGGGAUGGGAPA(CUAGGAG-AUUCCGCCGGGCUCAUAACCCGGAG-------------------AUCGGUAG]PBOAAUCUACCUCCCGCUACCA 
CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµHalococcus morrhuaeµprokaryotic cytosol µ-AGCGGGAUGGGAPAGCCAGGAG-AUUCCLGCGGGCUCAUAACCCGCAG-------------------AUCAGUAG]PBOAAUCUACUUCCCGCUACCA 
CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-AGCGGGAUGGGAPA(CCAGGAG-AUUCCGCCGGGCUCAUAACCCGGAG-------------------AUCGGUAG]PBOAAUCUACCUCCCGCUACCA 
CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµSulfolobus acidocaldariusµprokaryotic cytosol µ-AGCGGCGU.LGGAACUG-GGAGUAUCCC|CA#GGBUCAUAACCCUGAG-------------------GU?CCUGGJUBO"AUCCAGGCGCCGCUACCA 
CµµAµµµµatgµCµIniµCAUµThermoplasma acidophilumµprokaryotic cytosol µ-AGCGGGGUGGGGPAGUCAGGA--AAUCCLAUGGGBUCAUAACCCGUAG-------------------AUCGAUGGPPBH"AUCCAUCCCCCGCUACCA 
&µµKµµµµctaµUµLeuµ&AGµThermoplasma acidophilumµprokaryotic cytosol µ-GCGGAGG44GUC(A(ACUGGCCAAAGGCRAUGGAUU&AGKGPCCAUUCCCG-----AAG-----GGGUUC7AGGGPPBA"AUCCCUCCCUCCGCACCA 
5µµKµµµµctaµUµLeuµ5AGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCGCGGGUAGCCAA(U--GGCCAAAGGCRCAGCGCU5AGKACGCUGU-GGU----GUAG-----ACCUU?GCAGG]PBGAACCCUGUCCCGCGCACCA 
CµµKµµµµttgµCµLeuµCAAµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCGAGGGUAGCUAA(UCAGGAA-AAAGCRGCGGACUCAAKAPCCGCU-CCC----GUAG-----GGGUC?GUGGG]PBOAAUCCCUCCCCUCGCACCA 
CµµKµµµµctgµCµLeuµCAGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCAGGGAUAGCCAA(UCUGGCCAACGGCRCAGCGUUCAGKGCGCUGU-CUC----AUAG-----GAGUC?GCAGG]PBOAAUCCUGCUCCCUGCACCA 
GµµKµµµµctcµGµLeuµGAGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCGUGGGUAGCCAA(CCAGGCCAACGGCRCAGCGUUGAGKG?GCUGU-CCU----GUAG-----AGGUC?GCCGG]PBOAAUCCGGUCCCACGCACCA 
UµµKµµµµttaµUµLeuµUAAµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCGGGGGUGGCUGA(CCAGGCCAAAAGCLGCGGACUUAAKAPCCGCU-CCC----GUAG-----GGGUUCGCGAG]PBGAAUCUCGUCCCCCGCACCA 
Mµµ6µµµµaagµCµLysµMUUµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGCCGGUAGCUCA(UUAGGC--AGAGCRUCUGABUMUU6APCAGACG-------------------GU?GCGPG]PBOAAUCGCGUCCGGCCCACCA 
Nµµ6µµµµaaaµUµLysµNUUµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGCUGGUAGCUCA(UUAGGC--AGAGCRUCUGGBUNUU6ACCAGACG-------------------GU?GGGGG]PBOAGUCCCUCCCAGCCCGCCA 
Bµµ6µµµµatgµCµMetµBAUµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCCCGGGUGGCUPA(CU-GGAC-APAGCGCCGCACUBAU6APGCGGAG-------------------AU?GUGGG]PBGGAGCCCACCCCGGGCACCA 
Cµµ6µµµµatgµCµMetµCAUµThermoplasma acidophilumµprokaryotic cytosol µ-GCCGGGG4GGCUCA(CU-GGA--GGAGCRCCGGABUCAU6AUCCGGAG-------------------GUCUCGGGPPBGAUCCCCGAUCCCGGCACCA 
GµµKµµµµttcµGµPheµGAAµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCCGCCUUAGCUCA(ACUGGG--AGAGCACUCGACUGAAKAPCGAGCU-------------------GU?CCCGG]PBOAAUCCGGGAGGCGGCACCA 
GµµKµµµµcccµGµProµGGGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGACCGUGRGGPAGU--GGU--AUCCUCUGCCGAUGGGKUCGGUAGG-------------------A-C?UGAG]PBGACUCUCAGCGGUCCCACCA 
MµµKµµµµccgµCµProµMGGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGCCGGUGRGGPA(CUUGGU--AUCCUUCGGCCUUMGGKPGGCCGUA-------------------A-??UCAG]PBGAAUCUGAGCCGGCCCACCA 
UµµKµµµµccaµUµProµUGGµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGACCGUGRGUPA(CCUGGU--AUACUUCGGGCCUUGGKUGCCCGUG-------------------A-??CCGG]PBOAAUCCGGGCGGUCCCACCA 
CµµAµµµµtagµCµPyrµCUAµMethanosarcina barkeriµprokaryotic cytosol µ-GGAAACC4-GAUCA-U--G-U--AGAUCG_UGGACUCUAAAUCCG_CA---------------------GCCGGG]UAGAUUCCCGGGGUUUCCGCCA 
Gµµ6µµµµagcµGµSerµGCUµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GUUGCGGUAGCCAA(CCUGGCCCAAGGCRCUGGGUUGCU6ACUCAGU-GGC----GUCAA----GCCC-??GGGG]PBGAAUCCCCGCCGCAACGCCA 
GµµAµµµµtccµGµSerµGGAµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCCAGGAUGGCCGA(C--GGU--AAGGCRCACGCCUGGAAAGCGUGU-UCCC---UCU-----GGGAU-?GGGGG]PBOAAUCCCUCUCCUGGCGCCA 
MµµKµµµµtcgµCµSerµMGAµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-GCCGAGGUAGCAPA(CUUGGCC-AAUGCRGUUGCUUMGAKAGCAACG-UUCC---ACAC----GGACU-?AGGAG]PBOAAUCUCCUCCUCGGCGCCA 
MµµAµµµµtcgµCµSerµMGAµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCCGAGGUAGCCPA(CCCGGCC-AAGGCRGUAGAUUMGAAAPCUACU-GUCC---AUUC----GGACA-?GUGAG]PBOAAUCUCACCCUCGGCGCCA 
Cµµ6µµµµacgµCµThrµCGUµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCCGGUGUAGCUCA(UU-GGC--AGAGCRAUUCCUUCGU6AGGAAUAG-------------------GC?GAGGG]PBOAAUCCCUCCACCGGCUCCA 
Gµµ6µµµµaccµGµThrµGGUµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-GCCUGGGUAGCUPAGC--GGU--AAAGCRCGUCCUUGGU6AGGACGAG-------------------ACC??GGA]PBOAAUUCCGGCCUAGGCUCCA 
Gµµ6µµµµaccµGµThrµGGUµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GCCUGGGUAGCUPA(C--GGU--AAAGCRCGUCCUUGGU6AGGACGAG-------------------AC??CGGG]PBOAAUCCCGGCCUAGGCUCCA 
BµµKµµµµtggµCµTrpµBCAµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGGCUGUGGCCAA(CCCGGC--AUGGCRACUGABUBCAKAJCAGUCG-------------------AU?GGGGG]PBOAAUCCCUCCGGCCCCACCA 
GµµKµµµµtacµGµTyrµGUAµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-CCGCUCUUAGCUCA(CCUGGC--AGAGCAGCCGABUGUAKAPCGGCUU-------------------GU?CCCCG]PBOAAUCGGGGAGAGCGGACCA 
CµµAµµµµgtgµCµValµCACµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-GGGUCGGUKGUCPAGUCCGGUU-AUGACGGCUCCUUCACACGGAGCAG-------------------GUCGG?GG]PBOACUCCGCCCCGACCCACCA 
CµµAµµµµgtgµCµValµCACµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-GGGUUGGUKGUCPAGUCAGGCU-AUGACACCUCCUUCACAUGGAGGAG-------------------GUCGG?GG]PBOAAUCCGCCCCAACCCACCA 
CµµAµµµµgtgµCµValµCACµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGUUGGUGGUCPA(CCAGGUU-AUGACGGCUCCUUCACACGGAGCAG-------------------GC?GGCGG]PBGAAUCCGCCCCAACCCACCA 
GµµAµµµµgtcµGµValµGACµHalobacterium salinarumµprokaryotic cytosol µ-GGGUUGGUGGUCPAGUCAGGCU-AUGACACCUCCUUGACAUGGAGGAG-------------------GUCGG?GG]PBOAAUCCGCCCCAACCCACCA 
GµµAµµµµgtcµarchéeµValµGACµHaloferax volcaniiµprokaryotic cytosol µ-GGGUUGGUGGUCPAGUCUGGUU-AUGACACCUCCUUGACAUGGAGGAG-------------------GC?GGCAG]PBOAAUCUGCCCCAACCCACCA 
Bµµ6µµµµµvirusµMetµBAUµAvian myeloblastosis virusµprokaryotic cytosol µ-GCCUCCUUALCGCAGDA-GGN--AGCGCRPCAGPCUBAU6APCUGAAG-------------------7D??UGAGTPCG"ACCUCAGAGGGGGCACCA 
BµµKµµµµµvirusµTrpµBCAµAvian myeloblastosis virusµprokaryotic cytosol µ-GACCUCGUKLCGCAAC--#GD--AGCGCRPCUGABUBCAKAZCAGAAG-------------------7CUGCGUGPPCG"AUCACGUCGGGGUCACCA 
NµµAµµµµµvirusµGlyµNCCµEnterobacteria phage T4µprokaryotic cytosol µ-GCGGAUAUCGUAUAAU--#GD--AUUACCUCAGACUNCCAAPCUGAUG-------------------A-UGUGAGTPCGAUUCUCAUUAUCCGCUCCA 
.µµHµµµµµvirusµIleµ.AUµEnterobacteria phage T4µprokaryotic cytosol µ-GGCCCUGUAGCUCAAU--#GDDAGCAGCAGUCCCCU.AUHAGGGAAAG-------------------7UUACCAGTPCAAAUCUGGUCUGGGUCACCA 
Nµµ*µµµµµvirusµLeuµNAAµEnterobacteria phage T4µprokaryotic cytosol µ-GCGAGAA4GGUCAAADU-LGDA-AAGGCACAGCACUNAA*APGCUGC-GGAA---UGAU----UUCCU-UGUGGGTPCGAGUCCCACUUCUCGCACCA 
NµµKµµµµµvirusµProµNGGµEnterobacteria phage T4µprokaryotic cytosol µ-CUCCGUG4AGCUCAGUUUGGD--AGAGCGCCUGAJUNGGKAPCAGGAG-------------------7UCCAAGGTPCAAAUCCUUGUAUGGAGACCA 
Nµµ/µµµµµvirusµGlnµNUGµEnterobacteria phage T4µprokaryotic cytosol µ-UGGGAAU4AGCCAAGDD-GGD--AAGGCAUAGCACUNUG/CPGCUAGA-------------------UGCAAAGGTPCGAGUCCUUUAUUCCCAGCCA 
NµµAµµµµµvirusµArgµNCUµEnterobacteria phage T4µprokaryotic cytosol µ-GUCCCGCUGGUGUAAU--#GAD-AGCAUACGAUCCUNCUAAGPUUGCG-------------------G-UCCUGGTPCGAUCCCAGGGCGGGAUACCA 
Nµµ*µµµµµvirusµSerµNGAµEnterobacteria phage T4µprokaryotic cytosol µ-GGAGGCG4GGCAGAGU--#GDDUAAUGCACCGGUBUNGA*AACCGGC-AGUCGC-UCCG--GCGACU--CAUAGGTPCAAAUCCUAUCGCCUCCGCCA 
NµµHµµµµµvirusµThrµNGUµEnterobacteria phage T4µprokaryotic cytosol µ-GCUGAUUUAGCUCAGDA-GGD--AGAGCACCUCACUNGUHAPGAGGAU-------------------7UCGGCGGTPCGAUUCCGUCAAUCAGCACCA 
GµµAµµµµµvirusµAspµGUCµEnterobacteria phage T5µprokaryotic cytosol µ-GCGACCGGGGCUGGCUU-GGUA-AUGGUACUCCCCUGUCACGGGAGAG-------------------AAUGUGGGTPCAAAUCCCAPCGGUCGCGCCA 
Uµµ=µµµµµvirusµLeuµUAGµEnterobacteria phage T5µprokaryotic cytosol µ-GGGGCUAUGCUGGAACD-#GDA-GACAAUACGGCCUUAG=UPCCGUA-GCUU---AA------AUGCG-UGGGAGTPCGAGUCUCCCUAGCCCCACCA 
GµµHµµµµµvirusµAsnµGUUµEnterobacteria phage T5µprokaryotic cytosol µ-GGUUCCUUAGCUCUAAU-GGDU-AGAGCCGCAUCUUGUUHAGPUGAGG-------------------7UUGCUGGTPCGAAUCCAGCAGGAACCGCCA 
UµµKµµµµµvirusµProµUGGµEnterobacteria phage T5µprokaryotic cytosol µ-CUCCGAUUAGCUCAAUU-GGCD-AGAGUACACCGUUUGGKGCGGUGGG-------------------7UUGAAGGTPCGAGUCCUUCAUUGGAGACCA 
UµµAµµµµµvirusµGlnµUUGµEnterobacteria phage T5µprokaryotic cytosol µ-UGGGGAUUAGCUUAGCUUGGCCUAAAGCUUCGGCCUUUGAAGPCGAGA-------------------U-CAUUGGTPCAAAUCCAAUAUCCCCUGCCA 
IµµKµµµµµvirusµProµIGGµMoloney murine leukemia virusµprokaryotic cytosol µ-GGCJCLUUKGUCPAGG--GGD--AUGAUUCUCGCJUIGGKPGCGAGAG-------------------7D??CGGGPPCA"AUCCCGGACGAGCCCCCA 
NµµKµµµµµvirusµProµNGGµMoloney murine leukemia virusµprokaryotic cytosol µ-GGCJCLUUKGUCPAGG--GGD--AUGAUUCUCGCPUNGGKPGCGAGAG-------------------7D??CGGGPPCA"AUCCCGGACGAGCCCCCA 

Compilation des tRNAs des bactéries[modifier | modifier le wikicode]

:::t:Phe:Leu:::c:Ser::::a:Tyr:Stp::g:Cys:SeC:Trp
::34::37:::34::37:::34::37:::34::37:
t:t: : : : ::Inosine::`+::: : : : :: : : : 
:: : : : ::9::9::: : : : :: : : : 
74:c:#:G:KWY::: :::::9Q:G:K+::::G:K+:
40::22:1:23::: :::::5:9:14::::2:2:
28:a:~.N:U:K:::&:U:`+H:A:: :::::1N:U:+:
26::7:1:8:::3:2:4:1:: :::::5:1:6:
:g:B°?<::K ;::::Cleu:`+:Aleu:: :::::B::K:A
::6::6::::6:5:1:: :::::5::4:1
::::Leu:::::Pro:::::His:Gln::::Arg:
c:t:Inosine::K:G::Inosine: :K: :: : : : ::Inosine::K/:A
::7::6:1::1::1::: : : : ::4::3:1
24:c: ::::: :::::Q:G:K:G:: :::
6:: ::::: :::::1:5:5:1:: :::
34:a::U:K:::&N::K:::NJ:Utaa:E6 /:A:::::
12:::1:1:::2::2:::6:1:3:4:::::
:g::C.:K::: ::::::Ctag:6tag:A:::C:K:
:::4:4::: ::::::4:1:3:::2:2:
:::Ile:Met:ini::::Thr:::::Asn:Lys::::Ser:Arg
a:t:Inosine::t6A:::Inosine: :t6A: :: : : : :: : : : 
::5::5:::3::3::: : : : :: : : : 
60:c: ::::: :::::Q:G:t6A::::G:6E+:
6:: ::::: :::::4:2:6::::5:5:
44:a:PAP::t6A::: :::::N)3::[6H:::3 1::t6A:
16::1::1::: :::::6::6:::2::2:
:g: ::::: ::::::C:6H::::C:t6A:
:: ::::: ::::::10:10::::1:1:
:Met:B:C:6E::: ::::: ::::: :::
::5:1:6::: ::::: ::::: :::
:ini::C:+6::: ::::: ::::: :::
:::18:18::: ::::: ::::: :::
::::Val:::::Ala:::::Asp:Glu::::Gly:
g:t:Inosine:: :A::Inosine: :O: :: : : : :: : : : 
::7:::7::6::6::: : : : :: : : : 
26:c: ::::: :::::manQ:G:K:A:::G::A
12:: ::::: :::::4:3:1:6:::5::5
32:a:&N:::A:: :::::3 2:U::A::,N:::A
16::2:::2:: :::::4:1::5::2:::2
:g::C.::A:: ::::::C::A:::C::A
:::4::4:: ::::::4::4:::1::1
456::::::::::::::::::::

Compilation des tRNAs des eucaryotes[modifier | modifier le wikicode]

:::t:Phe:Leu:::c:Ser::::a:Tyr:Stp::g:Cys:SeC:Trp
::34::37:::34::37:::34::37:::34::37:
t:t: : : : ::Inosine::`+::: : : : :: : : : 
:: : : : ::9::9::: : : : :: : : : 
74:c:#:G:KWY::: :::::9Q:G:K+::::G:K+:
40::22:1:23::: :::::5:9:14::::2:2:
28:a:~.N:U:K:::&:U:`+H:A:: :::::1N:U:+:
26::7:1:8:::3:2:4:1:: :::::5:1:6:
:g:B°?<::K ;::::Cleu:`+:Aleu:: :::::B::K:A
::6::6::::6:5:1:: :::::5::4:1
::::Leu:::::Pro:::::His:Gln::::Arg:
c:t:Inosine::K:G::Inosine: :K: :: : : : ::Inosine::K/:A
::7::6:1::1::1::: : : : ::4::3:1
24:c: ::::: :::::Q:G:K:G:: :::
6:: ::::: :::::1:5:5:1:: :::
34:a::U:K:::&N::K:::NJ:Utaa:6E/:A:::::
12:::1:1:::2::2:::6:1:3:4:::::
:g::C.:K::: ::::::Ctag:6tag:A:::C:K:
:::4:4::: ::::::4:1:3:::2:2:
:::Ile:Met:ini::::Thr:::::Asn:Lys::::Ser:Arg
a:t:Inosine::t6A:::Inosine: :t6A: :: : : : :: : : : 
::5::5:::3::3::: : : : :: : : : 
60:c: ::::: :::::Q:G:t6A::::G:6E+:
6:: ::::: :::::4:2:6::::5:5:
44:a:PAP::t6A::: :::::3N)::6[H:::3 1::t6A:
16::1::1::: :::::6::6:::2::2:
:g: ::::: ::::::C:6H::::C:t6A:
:: ::::: ::::::10:10::::1:1:
:Met:B:C:6E::: ::::: ::::: :::
::5:1:6::: ::::: ::::: :::
:ini::C:6+::: ::::: ::::: :::
:::18:18::: ::::: ::::: :::
::::Val:::::Ala:::::Asp:Glu::::Gly:
g:t:Inosine:: :A::Inosine: :O: :: : : : :: : : : 
::7:::7::6::6::: : : : :: : : : 
26:c: ::::: :::::manQ:G:K:A:::G::A
12:: ::::: :::::4:3:1:6:::5::5
32:a:&N:::A:: :::::3 2:U::A::,N:::A
16::2:::2:: :::::4:1::5::2:::2
:g::C.::A:: ::::::C::A:::C::A
:::4::4:: ::::::4::4:::1::1
456::::::::::::::::::::

Compilation des tRNAs des archées[modifier | modifier le wikicode]

:::t:Phe:Leu:::c:Ser::::a:Tyr:Stp::g:Cys:SeC:Trp
::34::37:::34::37:::34::37:::34::37:
t:t: : : : :: : : : :: : : : :: : : : 
:: : : : :: : : : :: : : : :: : : : 
6:c::G:K::::G::A:::G:K::::G:K:
6:::1:1::::1::1:::1:1::::1:1:
4:a::U:K::: ::::: ::::: :::
4:::1:1::: ::::: ::::: :::
:g::C:K:::M::K:A:::C::A::B::K:
:::1:1:::2::1:1:::1::1::1::1:
::::Leu:::::Pro:::::His:Gln::::Arg:
c:t: : : : :: : : : :: : : : :: : : : 
:: : : : :: : : : :: : : : :: : : : 
8:c::G:K::::G:K::::G:K::::G:K:
6:::1:1::::1:1::::2:2::::2:2:
8:a:5&::K::::U:K::: :::::N::K:
8::2::2::::1:1::: :::::1::1:
:g::C:K:::M::K:::M:C:K::::C:K:
:::1:1:::1::1:::1:1:2::::1:1:
:::Ile:Met:ini::::Thr:::::Asn:Lys::::Ser:Arg
a:t: : : : :: : : : :: : : : :: : : : 
:: : : : :: : : : :: : : : :: : : : 
18:c::G:t6A::::G:t6A:::;:G:t6A::::G:t6A:
6:::1:1::::2:2:::1:2:3::::1:1:
10:a:N::t6A::: :::::N::t6A::: :::
2::1::1::: :::::1::1::: :::
:g: ::::::C:t6A:::M::t6A::: :::
:: ::::::1:1:::1::1::: :::
:Met:B:C:t6A::: ::::: ::::: :::
::1:1:2::: ::::: ::::: :::
:ini::C::A:: ::::: ::::: :::
:::5::5:: ::::: ::::: :::
::::Val:::::Ala:::::Asp:Glu::::Gly:
g:t: : : : :: : : : :: : : : :: : : : 
:: : : : :: : : : :: : : : :: : : : 
10:c::G::A:::G::A:::G::A:::G::A
8:::2::2:::1::1:::1::1:::4::4
6:a: ::::::U::A::N::K:::N:::A
12:: ::::::1::1::1::1:::1:::1
:g::C::A:::C::A::M:::A:::C::A
:::3::3:::2::2::1:::1:::1::1
122::::::::::::::::::::

Détails pour mcac lla eco hvo sce[modifier | modifier le wikicode]

;;mcac;30 tRNAs;;;;;;;;30 gènes tRNA de mcac;;;;;;;;%GC
;;t;;c;;a;;g;;;;t;;c;;a;;g;24
t;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;;
;c;G;m1G;;;G;m6A;G;m6A;;c;1;;;;1;;1;
;a;cmnm5Um;m6A;U;m6A;;;cmnm5Um;m6A;;a;1;;1;;;;1;
;g;Cm;m6A;;;;;Cm;m6A;;g;1;;;;;;1;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
c;t;;;;;;;Inosine;m1G;;t;;;;;;;1;
;c;;;;;G;m1G;;;;c;;;;;1;;;
;a;U;m1G;U;m1G;cmnm5s2U;m6A;;;;a;1;;1;;1;;;
;g;;;;;;;;;;g;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
a;t;;;A;t6A;;;;;;t;;;1;;;;;
;c;G;t6A;;;G;t6A;G;t6A;;c;1;;;;1;;1;
;a;k2C;m6A;U;t6A;cmnm5s2U;t6A;cmnm5U;t6A;;a;;;1;;2;;1;
;g;C;A;;;C;t6A;;;;g;3;;;;1;;;
;i;C;A;;;;;;;;i;;;;;;;;
g;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;;
;c;;;;;G;A;;;;c;;;;;1;;;
;a;U;m6A;U;m6A;cmnm5s2U;A;U;m6A;;a;1;;1;;1;;1;
;g;;;;;;;;;;g;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;lla;26tRNAs;;;;;;;;63 gènes tRNA de lla;;;;;;;;%GC
;;t;;c;;a;;g;;;;t;;c;;a;;g;35
t;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;;
;c;G;G;G;A;G;i6A;;;;c;2;;1;;1;;1;
;a;;;;;;;;;;a;2;;2;;;;;
;g;;;;;;;;;;g;1;;3;;;;1;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
c;t;;;;;;;Inosine;A;;t;2;;;;;;2;
;c;;;;;;;;;;c;;;;;1;;;
;a;;;mo5U;m1G;U;A;;;;a;2;;2;;2;;;
;g;;;;;;;;;;g;1;;;;;;1;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
a;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;;
;c;G;t6A;G;A;G;t6A;G;t6A;;c;2;;1;;2;;1;
;a;k2C;m6A;mo5U;t6A;cmnm5s2U; 2 t6A;U;C;;a;;;2;;3;;1;
;g;ac4C;m6A;C;t6A;C;t6A;;;;g;4;;1;;1;;1;
;i;C;A;;;;;;;;i;;;;;;;;
g;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;;
;c;;;;;G;A;G;A;;c;;;;;2;;2;
;a;mo5U;m6A;mo5U;t6A;U;A;U mo5U;2 m6A;;a;3;;6;;2;;2;
;g;;;;;;;;;;g;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;E.coli;43 tRNAs;;strain unknown;;Liepzig*;;;;86 gènes tRNA de eco;;;;K12;;;;%GC
t;;t;;c;;a;;g;;;;t;;c;;a;;g;51
;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;;
;c;G;ms2i6A;G;A;2 QtRNA;msi6A;G;ms2i6A;;c;2;;2;;3;;1;
;a;cmnm5Um;ms2i6A;cmo5U;ms2i6A;;;U;i6A;;a;1;;1;;;;1;
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;c;G;m1G;;;QtRNA;m2A;;;;c;1;;1;;1;;;
;a;cmo5U;m1G;;;cmnm5s2U;m2A;;;;a;1;;1;;2;;;
;g;C;m1G;C;m1G;C;m2A;C;m1G;;g;4;;1;;2;;1;
a;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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;c;G;t6A;2 G;m6t6A;QtRNA;t6A;G;t6A;;c;3;;2;;4;;1;
;a;k2C;t6A;cmo5U;t6A;mnm5s2U;t6A;mnm5U;t6A;;a;;;1;;6;;1;
;g;ac4C;t6A;;;;;;;;g;8;;1;;;;1;
g;i;2 C;A;;;;;;;;i;;;;;;;;
;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;;
;c;2 G;A;G;A;gluQtRNA;m2A;G;A;;c;2;;2;;3;;4;
;a;cmo5U;m6A;cmo5U;A;mnm5s2U;2 m2A;mnm5U;A;;a;5;;3;;4;;1;
;g;;;;;;;C;A;;g;;;;;;;1;
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;;hvo;41 tRNAs;;codons*;;;;;;53 gènes tRNA de lla;;;;;;;;%GC
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;a;mo5U;m1G;U;m1G;;;xU;m1G;;a;1;;1;;1;;1;
;g;C;m1G;ac4C;m1G;ac4C;m1G;C;m1G;;g;1;;2;;1;;1;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
a;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;;
;c;G;t6A;G;t6A;G;t6A;G;t6A;;c;1;;1;;1;;1;
;a;xU;t6A;;;xU;t6A;;;;a;;;1;;1;;1;
;g;Cm;t6A;C;t6A;ac4C;t6A;;;;g;3;;1;;1;;1;
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g;t;;;;;;;;;;t;;;;;;;;
;c;G;A;G;A;G;A;2 G;A;;c;2;;1;;2;;2;
;a;;;U;A;xU;m1G;xU;A;;a;1;;2;;1;;1;
;g;C;A;C;A;ac4C;A;C;A;;g;1;;1;;1;;1;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
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;;sce;35 tRNAs;;;;;;;;275 gènes tRNA de sce;;;;;;;;%GC
;;t;;c;;a;;g;;;;t;;c;;a;;g;38
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;c;2 Gm; yW;;;GPA;i6A;G;i6A;;c;10;;;;8;;4;
;a;ncm5Um;m1G;ncm5U;i6A;;;;;;a;7;;3;;;;;
;g;m5C;m1G;C;i6A;;;Cm;A;;g;10;;1;;;;6;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
c;t;;;;;;;Inosine;A;;t;;;2;;;;6;
;c;;;;;2 G; m1G;;;;c;1;;;;7;;;
;a;U;m1G;xU;m1G;;;;;;a;3;;10;;9;;;
;g;;;;;;;;;;g;;;;;1;;1;
;;;;;;;;;;;;;;;;;;;
a;t;Inosine;t6A;2 Inosine; t6A;;;;;;t;13;;11;;;;;
;c;;;;;G;t6A;G;t6A;;c;;;;;10;;4;
;a;PAP;t6A;;;mcm5s2U;t6A;mcm5U;t6A;;a;2;;4;;7;;11;
;g;C;t6A;;;C;t6A;;;;g;10;;1;;14;;1;
;i;C;t6A;;;;;;;;i;;;;;;;;
g;t;Inosine;A;Inosine;m1Inosine;;;;;;t;14;;11;;;;;
;c;;;;;G;m1G;G;A;;c;;;;;16;;16;
;a;ncm5U;A;;;mcm5s2U;A;xU;A;;a;2;;5;;14;;3;
;g;C;A;;;;;;;;g;2;;;;2;;2;