Fichier:Intergen51 fc40 gbde.png

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Description

Description

Projet de recherche: Les clusters de gènes tRNA et rRNA chez les procaryotes. L'étude des intercalaires cds..cds permet de les comparer aux intercalaires cds..RNA et RNA..RNA. Les diagrammes des fréquences des intercalaires cds..cds positifs discontinus de 1 à 40 pbs sont présentés ici regroupés en clade. Ce regroupement est utilisé dans la comparaison entre les diagrammes continus et discontinus au chapitre correspondant. Les étiquettes représententent les fréquences multiples de 6.

Les abscisses sont les fréquences unitaires et les ordonnées leurs effectifs. La courbe de tendance est un polynôme de d°12 (poly 12) représentée par son coefficient de détermination R2. Y est ajouté l'effectif du diagramme (diagr).
Le calcul de l'intercalaire est fait méthodiquement sur le tableur calc de LibreOfiice.
Voir la construction de ces diagrammes dans la page de chaque génome xxx intergen51 où xxx est le code KEGG [1]. Cette page présente
- le gènome en détail dont le lien à la source des donnée NCBI,
- permet de retrouver les 2 colonnes du diagramme dans les données intercalaires
- et présente les courbes de tendances sous forme de plynômes de d°3 dans les diagrammes CDS-CDS positifs.
Les liens à ces pages sont     spl    cvi    ade    ant
Date 27.01.23
Source Travail personnel
Auteur Mekkiwik

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actuel28 janvier 2023 à 10:14Vignette pour la version du 28 janvier 2023 à 10:141 868 × 285 (97 kio)MekkiwikSuite à une modification globale de ces diagrammes, je les publie regroupés par clade et non génome par génome.
5 janvier 2022 à 15:16Vignette pour la version du 5 janvier 2022 à 15:161 337 × 765 (179 kio)MekkiwikChangement de courbe de tendance pour comparer avec Fc40.png
30 octobre 2021 à 05:36Vignette pour la version du 30 octobre 2021 à 05:36896 × 515 (121 kio)Mekkiwik{{Information |Description=Projet de recherche: Les clusters de gènes tRNA et rRNA chez les procaryotes. L'étude des intercalaires cds..cds permet de les comparer aux intercalaires cds..RNA et RNA..RNA. Les diagrammes des fréquences des intercalaires cds..cds positifs et discontinus de 1 à 40 pbs sont très hétérogènes avec des effectifs très faibles. Seulement 8 génomes sont présentés ici avec des effectifs supérieurs...

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