Fichier:Intergen51 cC19a.png

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Description

Description

Projet de recherche: Les clusters de gènes tRNA et rRNA chez les procaryotes. L'étude des intercalaires cds..cds permet de les comparer aux intercalaires cds..RNA et RNA..RNA. Les diagrammes des fréquences des intercalaires cds..cds positifs discontinus de 1 à 400 pbs sont présentés ici regroupés en classes successives de A0 à D33. Ce regroupement est utilisé dans le classement des diagrammes continus et discontinus au chapitre correspondant.

Les abscisses sont la somme de 10 en 10 fréquences successives (fq10) et les ordonnées en pour 1000 (‰) du total des intercalaires positifs discontinus du génome, fx‰. La courbe de tendance est un polynôme de d°3 (poly 3). Y sont ajoutés les effectifs du diagramme (diagr) et du total. L'ordre du diagramme, ou classe, est indiqué entre deux, verticalement, en 1er celui du haut et en 2ème celui du bas. Exemple A2 B1: A2 classe de abq et B1 classe de agrc.
Le calcul de l'intercalaire est fait méthodiquement sur le tableur calc de LibreOfiice.
Voir la construction de ces diagrammes dans la page de chaque génome xxx intergen51 où xxx est le code KEGG [1]. Cette page présente
- le gènome en détail dont le lien à la source des donnée NCBI,
- permet de retrouver les 2 colonnes du diagramme dans les données intercalaires
- et présente les courbes de tendances sous forme de plynômes de d°3 dans les diagrammes CDS-CDS positifs.
Série cC19a, de la classe C19a à C25. Les liens à ces pages sont    eco    myr    lam    amed    vha2    lbu    vpb1    vha1.
Date 27.01.23
Source Travail personnel
Auteur Mekkiwik

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actuel27 janvier 2023 à 15:57Vignette pour la version du 27 janvier 2023 à 15:571 874 × 568 (187 kio)MekkiwikSuite à une modification globale de ces diagrammes, je les publie ordonnés par classe et non génome par génome non ordonnés.
29 janvier 2022 à 11:38Vignette pour la version du 29 janvier 2022 à 11:381 309 × 802 (148 kio)Mekkiwikmise à jour sur les effectifs après le contrôle du 25.1.22
15 décembre 2021 à 17:28Vignette pour la version du 15 décembre 2021 à 17:281 314 × 808 (145 kio)Mekkiwiksuppression du diagramme eco x+ 31-400, inutile
11 décembre 2021 à 21:05Vignette pour la version du 11 décembre 2021 à 21:051 310 × 807 (168 kio)Mekkiwik{{Information |Description=Projet de recherche: Les clusters de gènes tRNA et rRNA chez les procaryotes. L'étude des intercalaires cds..cds permet de les comparer aux intercalaires cds..RNA et RNA..RNA. Les diagrammes des fréquences des intercalaires cds..cds positifs, continus et discontinus de 1 à 400 pbs et de 31 à 400, sont présentés ici pour montrer la grande différence entre continus et discontinus. Les abscisses...

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