Fichier:Intergen51 cC12.png

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Description

Description

Projet de recherche: Les clusters de gènes tRNA et rRNA chez les procaryotes. L'étude des intercalaires cds..cds permet de les comparer aux intercalaires cds..RNA et RNA..RNA. Les diagrammes des fréquences des intercalaires cds..cds positifs discontinus de 1 à 400 pbs sont présentés ici regroupés en classes successives de A0 à D33. Ce regroupement est utilisé dans le classement des diagrammes continus et discontinus au chapitre correspondant.

Les abscisses sont la somme de 10 en 10 fréquences successives (fq10) et les ordonnées en pour 1000 (‰) du total des intercalaires positifs discontinus du génome, fx‰. La courbe de tendance est un polynôme de d°3 (poly 3). Y sont ajoutés les effectifs du diagramme (diagr) et du total. L'ordre du diagramme, ou classe, est indiqué entre deux, verticalement, en 1er celui du haut et en 2ème celui du bas. Exemple C12 C16: C12 classe de ase et C16 classe de eal.
Le calcul de l'intercalaire est fait méthodiquement sur le tableur calc de LibreOfiice.
Voir la construction de ces diagrammes dans la page de chaque génome xxx intergen51 où xxx est le code KEGG [1]. Cette page présente
- le gènome en détail dont le lien à la source des donnée NCBI,
- permet de retrouver les 2 colonnes du diagramme dans les données intercalaires
- et présente les courbes de tendances sous forme de plynômes de d°3 dans les diagrammes CDS-CDS positifs.
Série cC12, de la classe C12 à C19. Les liens à ces pages sont    ase    psor    ban    cvi    eal    ecoN    rpm    cbn.
Date 27.01.23
Source Travail personnel
Auteur Mekkiwik

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actuel27 janvier 2023 à 15:53Vignette pour la version du 27 janvier 2023 à 15:531 874 × 589 (198 kio)MekkiwikSuite à une modification globale de ces diagrammes, je les publie ordonnés par classe et non génome par génome non ordonnés.
21 février 2022 à 09:57Vignette pour la version du 21 février 2022 à 09:571 322 × 427 (132 kio)Mekkiwikmise à jour du 20.2.22. Correction des effectifs due à l'erreur sur "autre intercalaire, gene" dans cbei
22 janvier 2022 à 11:36Vignette pour la version du 22 janvier 2022 à 11:361 315 × 445 (135 kio)Mekkiwik{{Information |Description=Projet de recherche: Les clusters de gènes tRNA et rRNA chez les procaryotes. L'étude des intercalaires cds..cds permet de les comparer aux intercalaires cds..RNA et RNA..RNA. Les diagrammes des fréquences des intercalaires cds..cds positifs, continus et discontinus de 1 à 400 pbs et de 31 à 400, sont présentés ici pour montrer la grande différence entre continus et discontinus. Les abscisses...

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