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Description

Description

Projet de recherche: Les clusters de gènes tRNA et rRNA chez les procaryotes. L'étude des intercalaires cds..cds permet de les comparer aux intercalaires cds..RNA et RNA..RNA. Les diagrammes des fréquences des intercalaires cds..cds positifs continus de 1 à 40 pbs présentés ici regroupent 12 génomes de la classe X du tableau du classement des diagrammes fc40. Sur cette image les classes sont indiquées sur l'intercalaire horizontal entre les lignes de diagrammes.

Les abscisses sont les fréquences unitaires et les ordonnées leurs pourcentages en pour 1000 ‰ par rapport au total des intercalaires positifs continus. La courbe de tendance est un polynôme de d°12 (poly 12) représentée par son coefficient de détermination R2. Y est ajouté le total des intercalaires (total).
Le calcul de l'intercalaire est fait méthodiquement sur le tableur calc de LibreOfiice.
Voir la construction de ces diagrammes dans la page de chaque génome xxx intergen51 où xxx est le code KEGG [1]. Cette page présente
- le gènome en détail dont le lien à la source des donnée NCBI,
- permet de retrouver les 2 colonnes du diagramme dans les données intercalaires
- et présente les courbes de tendances sous forme de plynômes de d°3 dans les diagrammes CDS-CDS positifs.
Les liens à ces pages sont
- les classes de X11 à X15     myr    blo    fps    absp    pmg
- les classes de X21 à X28     pub    abq    npu    sma    ksk     rpl    aua
- La classe X25, rtb n'est pas présentée ici parce qu'elle a la même phylogénie que rpl.
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Auteur Mekkiwik

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actuel31 mars 2023 à 09:26Vignette pour la version du 31 mars 2023 à 09:261 689 × 773 (285 kio)MekkiwikChangement des représentations
31 janvier 2022 à 20:05Vignette pour la version du 31 janvier 2022 à 20:05910 × 760 (162 kio)Mekkiwikmise à jour sur les effectifs après le contrôle du 25.1.22. Normalistion des étiquettes.
28 octobre 2021 à 17:30Vignette pour la version du 28 octobre 2021 à 17:30871 × 716 (149 kio)Mekkiwik{{Information |Description=Projet de recherche: Les clusters de gènes tRNA et rRNA chez les procaryotes. L'étude des intercalaires cds..cds permet de les comparer aux intercalaires cds..RNA et RNA..RNA. Les diagrammes des fréquences des intercalaires cds..cds positifs et continus de 1 à 40 pbs se sont révélés intéressants parce qu'ils présentent des courbes semblables. :Le [[v:fr:Recherche:Les_clusters_de_g%C3%A8nes_tR...

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