Protides/Liaison peptidique

Leçons de niveau 12
Une page de Wikiversité, la communauté pédagogique libre.
Début de la boite de navigation du chapitre
Liaison peptidique
Icône de la faculté
Chapitre no 2
Leçon : Protides
Chap. préc. :Acide aminé
Chap. suiv. :Structures protidiques
fin de la boite de navigation du chapitre
En raison de limitations techniques, la typographie souhaitable du titre, « Protides : Liaison peptidique
Protides/Liaison peptidique
 », n'a pu être restituée correctement ci-dessus.

Les acides aminés peuvent se lier entre eux grâce à des liaisons peptidiques. C'est ainsi que les autres protides (peptides, protéides, protéines) sont formés.

La liaison peptidique s'installe entre le groupement fonctionnel amine de l'un des acides aminés et le groupement fonctionnel acide de l'autre : le groupement fonctionnel amine libère un hydrogène et le groupement acide libère un hydroxyde qui se combinent pour donner une molécule d'eau.
L'un des acides aminés en bout de chaine présente un groupement fonctionnel acide et l'autre un groupement fonctionnel amine qui pourront permettre l'association avec d'autres acides aminés. Comme, il n'y a qu'un seul exemplaire des deux types de groupements fonctionnels sur les acides aminés, alors il n'y aura pas de ramification de la chaine d'acides aminés.

La réaction est réversible et les deux acides aminés peuvent être libérés mais il faut avant casser une molécule d'eau pour pouvoir compléter le groupement fonctionnel amine de l'un et le groupement fonctionnel acide de l'autre : comme pour faire cela une molécule d'eau est cassée (lyse) cette réaction de séparation de deux acides aminés liés par une liaison peptidique est une hydrolyse. Ainsi, un protide est hydrolysable s'il montre au moins une liaison peptidique c'est-à-dire s'il est composé d'au moins deux acides aminés (liés entre eux par une liaison peptidique).
Ainsi, les acides aminés libres (isolés) ne montrent pas de liaison peptidique et sont non-hydrolysables. Mais les autres protides sont des assemblages d'acides aminés et comme ils présentent des liaisons peptidiques, ils sont hydrolysables.
Les acides aminés sont les protides non hydrolysables.

La mise en place d'une liaison peptidique entre deux acides aminés est catalysée par un complexe enzymatique autour d'un ribosome (voir la synthèse des protides).
L'hydrolyse est elle aussi catalysée par une enzyme. En fait, lors de la digestion selon les deux acides aminés associés ce sont deux enzymes qui interviennent, la trypsine et l'érepsine, l'une rompant certaines liaisons, l'autre celles que la première ne peut défaire.